MX2008014502A - Compuestos de union a dominio de repeticion de proteinas inhibidoras de apoptosis baculovirales de las proteinas inhibidoras de apoptosis. - Google Patents

Compuestos de union a dominio de repeticion de proteinas inhibidoras de apoptosis baculovirales de las proteinas inhibidoras de apoptosis.

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MX2008014502A
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Alain Boudreault
Patrick Bureau
Alain Laurent
Scott Jarvis
Jamers Jaquith
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Aegera Therapeutics Inc
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Abstract

La presente invención describe un isómero, enantiómero, diastereoisómero, tautómero, profármaco, sal farmacéuticamente aceptable de un compuesto de la fórmula I (ver fórmula (I)) y composiciones farmacéuticas del mismo útiles para modular la función de IAP al prevenir la unión de una proteína de unión de BIR a un dominio de BIR de IAP y para tratar enfermedades proliferativas tales como cáncer; también, se describe un compuesto de la fórmula I marcado con un marcador detectable o etiqueta de afinidad útil como una sonda para identificar compuestos que se unen a un dominio de BIR de IAP.

Description

COMPUESTOS DE UNION A DOMINIO DE REPETICION DE PROTEINAS INHIBIDORAS DE APOPTOSIS BACULOVIRALES DE LAS PROTEINAS INHIBIDORAS DE APOPTOSIS CAMPO DE LA INVENCION La presente invención se refiere a compuestos de puente que se unen a dominios de BIR de IAP, y que son útiles para tratar trastornos proliferativos y trastornos de apoptosis desregulada, tales como cáncer.
ANTECEDENTES DE LA INVENCION La apoptosis, o muerte celular programada, típicamente ocurre en el desarrollo y mantenimiento normales de tejidos sanos en organismos multicelulares. Es un proceso complejo que da por resultado la remoción de células dañadas, enfermas o redundantes en desarrollo, en ausencia de signos de inflamación o necrosis. Se sabe que las vías apoptóticas intrínsecas son desreguladas muy particularmente en cáncer y síndromes linfoproliferativos, así como trastornos autoinmunes tales como esclerosis múltiple, en enfermedades neurodegenerativas y en inflamación. También, alteraciones en una respuesta apoptótica del hospedero se han descrito en el desarrollo o mantenimiento de infecciones virales y bacterianas.
Las caspasas son una familia de enzimas proteolíticas de la clase de cisteína proteasas que se sabe que inician y ejecutan apoptosis. En células normales, las caspasas están presentes como zimógenos inactivos, que son catalíticamente activados después de señales externas, por ejemplo aquellas que resultan de activación de receptor de muerte impulsada por ligando, tal como citocinas o agentes inmunológicos, o mediante la liberación de factores mitocondriales, tales como citocromo C después de lesión celular genotóxica, quimiotóxica, o inducida por radiación. Las proteínas inhibidoras de apoptosis (lAPs) constituyen una familia de proteínas que son capaces de unirse a las caspasas e inhibirlas, suprimiendo así la apoptosis celular. Debido a su papel central en la regulación de la actividad de caspasa, las lAPs son capaces de inhibir muerte celular programada de una amplia variedad de disparadores, que incluyen pérdida de mecanismos de control de crecimiento celular homeostáticos o endógenos, así como fármacos quimioterapéuticos e irradiación. Las lAPs contienen uno a tres dominios estructurales homólogos conocidos como dominios de repetición de IAP baculovirales (BIR). También pueden contener un dominio de dedo de zinc RING en el C-terminal, con una capacidad de inducir ubiquilinilación de moléculas de unión a IAP mediante su función de E3 ligasa. Las lAPs, XIAP, HIAP1 humanos (también referidas como clAP2), y HIAP2 (clAP1 ) tienen cada uno de ellos tres dominios de BIR y un dedo de zinc RING carboxi terminal. Otra IAP, la NAIP, tiene tres dominios de BIR (BIR1 , BIR2 y BIR3), pero no tiene dominio de RING, mientras que Livin, TslAP y MUAP tienen un solo dominio de BIR y un dominio de RING. El inhibidor enlazador de cromosoma X de apoptosis (XIAP) es un ejemplo de un IAP que puede inhibir la caspasa de iniciador, conocida como caspasa-9, y las caspasas de efector, Caspasa-3 y Caspasa-7, por unión directa. XIAP también puede inducir la remoción de caspasas a través de la vía de proteosoma mediada por ubiquitilación por medio de la actividad de E3 ligasa de un dominio de dedo de zinc RING. Además, el dominio de BIR3 de XIAP se une a e inhibe la caspasa-9. El dominio de enlazador-BIR2 de XIAP inhibe la actividad de caspasas-3 y -7. Los dominios de BIR también han sido asociados con las interacciones de lAPs con factor asociado a receptor de factor de necrosis tumoral (TRAFs)-1 y -2, y a TAB1 , como proteínas adaptadoras que efectúan señalización de supervivencia a través de activación de NFkB. Los lAPs por lo tanto funcionan como un freno directo sobre la cascada de apoptosis, al prevenir la acción de, o inhibición de caspasas activas y al redirigir señalización celular a un modo de prosupervivencia. El progreso en el campo de cáncer ha conducido a un nuevo paradigma en biología de cáncer en donde la neoplasia se puede visualizar como una falla de células cancerosas para ejecutar vías normales de apoptosis. Las células normales reciben retroalimentación continua de su ambiente a través de varios factores intracelulares y extracelulares, y "se suicidan" si son removidas de su contexto. Esta inducción de apoptosis se logra por activación de la cascada de caspasa. Las células cancerosas, sin embargo, ganan la capacidad para superar o desviarse de esta regulación de apoptosis y continúan con la proliferación inapropiada. La mayoría de los tratamientos para cáncer inducen por lo menos una respuesta apoptótica parcial en la célula objetivo de cáncer, dando por resultado la remisión o inicio de regresión tumoral. En muchos casos, sin embargo, las células residuales que son resistentes a apoptosis son capaces de escapar a la terapia y continúan el progreso de cambio oncogénico/genético, dando por resultado la emergencia de enfermedad metastático altamente resistente a fármaco, enfermedad metastática que supera la capacidad que se tiene para tratar efectivamente la enfermedad. Además, la mayoría de las terapias de cáncer, incluyendo terapia de radiación y quimioterapia tradicional inducen apoptosis en células cancerosas, pero causan lesión celular adicional, debido a su falta de especificidad en inducir apoptosis únicamente en células cancerosas. La necesidad de mejorar la especificidad/potencia de agentes pro-apoptosis usados para tratar cáncer, y de hecho otros trastornos proliferativos, es importante debido a los beneficios en la disminución de los efectos colaterales asociados con la administración de estos agentes. Por lo tanto, el hallazgo de nuevos medios de inducir apoptosis en células cancerosas es una necesidad médica altamente deseada y su solución ofrece la posibilidad de tratamientos completamente nuevos para cáncer. Un cuerpo creciente de datos indica que las células cancerosas pueden evitar la apoptosis por la sobreexpresión sostenida de uno o más miembros de la familia de proteínas de IAP, como se documenta en muchas muestras de biopsia de tumor primario, asi como las líneas de células cancerosas más establecidas. Estudios epidemiológicos han demostrado que la sobreexpresión de los varios lAPs está asociada con pronóstico clínico y supervivencia pobres. Para XIAP esto se muestra en cánceres tan diversos como leucemia y cáncer de ovario. La sobreexpresión de HIAP1 y HIAP2 que resulta de la amplificación de cromosoma frecuente de la región 1 1q21 -q23, que abarca ambas, se ha observado en una variedad de malignidades, incluyendo meduloblastomas, carcinomas de células renales, glioblastomas, y carcinomas gástricos. Moléculas reguladoras (X)IAP negativas tales como XAF, parecen ser supresoras de tumor, que muy frecuentemente se pierden en cánceres clínicos. Por lo tanto, por su capacidad para suprimir la activación y ejecución de los mediadores intrínsecos de apoptosis, las caspasas, las lAPs pueden contribuir directamente a la progresión de tumor y resistencia a intervención farmacéutica. La inducción de apoptosis en células cancerosas mediante el uso de moléculas pequeñas potentes que se unen a dominios de IAP específicos es el tema de esta invención. Los inventores de la presente y otros han demostrado la importancia crítica de los dominios de SIR individuales para afectar la función antiapoptótica de las lAPs. Los inventores de la presente han propuesto que los antagonistas de las lAPs, que se pueden unir a los dominios de SIR individuales, alterarían la función antiapoptótica de las lAPs. De hecho, los SIRs individuales sirven como sitios de unión críticos para los residuos Ser-Gly-Val-Asp, Ser-Gly-Pro-lle y Ala-Thr-Pro-lle N-terminales de las caspasas 3, 7 y 9, respectivamente, y dicha unión es imperativa para la función inhibidora de caspasa de las lAPs. La unión de residuos de tetrapéptidos AxPy N-terminales a XIAP da por resultado la liberación de las caspases activas 3, 7 y 9. En el caso de los otros lAPs, tales como C-IAP1 y C-IAP2, las funciones de los BIRs, cuando se unen a ligando, parecen dirigir la activación de la función de RING de ubiquitina ligasa de las lAPs a un objetivo unido, o las lAPs individuales mismas, para causar pérdida proteosómica. En cualquier caso, los antagonistas de molécula pequeña de las lAPs deben ser excelentes agentes pro-apoptóticos, con usos potenciales en cáncer, varios trastornos proliferativos e inflamación. Una proteína mitocondrial de mamífero, a saber segundo activador derivado de mitrocondria de caspasas (SMAC) que antagoniza la función de IAP, se une principalmente a los sitios 3 ó 2 de BIR sobre las lAPs respectivas mediante el tetrapéptido de AxPy amino-terminal. Cuatro proteínas ¡nductoras de muerte de Drosophila, Reaper, HID, Grim y Sickle, que antagonizan la capacidad de las lAPs de Drosophila para inhibir caspasas, también se unen a los dominios de BIR de las lAPs de Drosophila análogos mediante un tetrapéptido amino-terminal de AxPy corto, una secuencia que se ajusta a la bolsa de unión a BIR y altera las interacciones de IAP-caspasa. La topología global de dominios de BIR individuales es altamente conservada entre las lAPs humanas y entre dominios de BIR individuales de las lAPs humanas, cada BIR siendo un dominio de polipéptido de dedo de zinc, bloqueado en un átomo de Zn coordinado por tres cisteínas y un residuo de histidina. Las estructuras cristalográficas de rayos X de BIR2 y BIR3 de XIAP revelan una bolsa de unión crítica para un motivo de AxPy sobre la superficie de cada dominio de BIR. Hay alteraciones en las secuencias de aminoácidos de intervención que forman la bolsa de unión y ranura tanto en BIR2 como en BIR3. Asimismo, los inventores de la presente han descrito dominios homólogos en los BIRs de otros lAPs clAP1 y clAP2. Esto abre la posibilidad de obtener varias clases de compuestos de unión naturales y sintéticos que tendrán diferentes afinidades de especificidad y unión entre cada uno de los dominios de BIR para cada una de las lAPs. Discerniendo de la forma en la cual dichos compuestos afectarán la función biológica de las lAPs en células cancerosas en comparación con células normales es un nuevo desafío importante en el descubrimiento de agentes de mecanismo novedosos para tratar cáncer y otros trastornos proliferativos en donde se observa la función de IAP desregulada. Los inventores de la presente han encontrado que ciertas clases de compuestos de unión a BIR se pueden unir a BIRs de IAP, con selectividad y potencia inesperada, dando por resultado distintas ventajas terapéuticas para ciertas clases estructurales, que resultan potencialmente ya sea de pérdida de función de IAP o pérdida de proteína de IAP celular, o ambas. Se ha descrito un número de compuestos similares a AxPy peptídícos y compuestos peptídicos de AxPy modificados heterocíclicos que activan caspasa celular 3 al unirse a BIR3 de XIAP. Para una revisión reciente, véase Elmore et al., Annual Reports in Medicinal Chemistry, 40 (2006) 245-262; Sun et al., Bioorg. Med. Chem. Let. 15 (2005) 793-797; Oost et al., J. Med. Chem., 2004, 47(18), 4417-4426; Park et al., Bioorg. Med. Chem. Lett. 15 (2005) 771-775; Franklin et al., Biochemistry, Vol. 42, No. 27, 2003, 8223-8231 ; Kip et al., Biochemistry 2002, 41 , 7344-7349; Wu et al., Chemistry and Biology, Vol. 10, 759-767 (2003); Glover et al., Analytical Biochemistry, 320 (2003) 157-169; solicitud de patente publicada de los Estados Unidos número 20020177557; y solicitud de patente publicada de los Estados Unidos con caso de apoderado No. L80003177WO número 20040180828; solicitud de patente publicada de los Estados Unidos número US2006/0025347A1 ; solicitud de patente publicada de los Estados Unidos número US2005/0197403A1 ; y solicitud de patente publicada de los Estados Unidos número US2006/0194741 A1. Se ha mostrado que los compuestos antes mencionados son dirigidos a un dominio de BIR3 aislado de XIAP por desplazamiento de una sonsa fluorescentemente marcada y parecen inducir un evento apoptótico en un conjunto selecto de líneas de células cancerosas con potencia en el intervalo micromolar-nanomolar bajo. Estos compuestos desplegaron actividad in vivo deficiente, probablemente debido a biodisponibilidad mejorada y por lo tanto pueden tener aplicación terapéutica limitada. Por lo tanto, los dominios de BIR de IAP representan un objetivo atractivo para el descubrimiento y desarrollo de agentes terapéuticos novedosos, especialmente para el tratamiento de trastornos proliferativos tales como cáncer.
BREVE DESCRIPCION DE LA INVENCION Los inventores han descrito anteriormente una serie de compuestos que se unen a las unidades de BIR de las lAPs e inducen apoptosis en varias líneas de células cancerosas (número de solicitud de patente publicada de E.U.A. 20060264379). Los inventores de la presente aquí describen que el enlace de dos unidades de unión a BIR, con preferencia para el sitio, orientación y naturaleza química del enlace, provee clases de compuestos novedosas y distintamente ventajosas con hasta 1000 veces de incremento en potencia contra varias líneas de células cancerosas, sobre sus compuestos de unión a BIR sin puente correspondientes. Estos compuestos despliegan la potencia requerida, estabilidad y propiedades farmacéuticas para el tratamiento de cánceres humanos. Ventajosamente, la naturaleza química del grupo de unión se puede escoger para causar la traducción de la potencia celular intrínseca alta a potencia en microgramos/kg en inhibir y/o suprimiendo lAPs en muestras de tumor. Además, los compuestos descritos tienen estabilidad farmacéuticamente aceptable en el intervalo de tejidos y fluidos de mamífero y tienen propiedades farmacéuticas que aseguran solubilidad y biodisponibilidad adecuadas usando varias vías de administración, adecuadas para uso clínico. Dicha administración da por resultado efectos in vivo sostenidos en mamíferos como se mide en tejidos normales y tumorales. En una modalidad de la presente invención, se provee un isómero, enantiómero, diastereoisómero o tautómero de un compuesto representado por la fórmula I: en donde: n es 0 ó 1 ; m es 0, 1 ó 2; Y es NH, O o S; W es en donde X es alquilo de C1-C3 que forma parte de un sistema de anillo, el sistema de anillo siendo opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R11; o X es parte de un sistema de anillo heterocíclico de 5, 6 ó 7 miembros que incluye opcionalmente uno, dos o tres heteroátomos seleccionados de O, N o S, el sistema de anillo siendo opcionalmente sustituido con uno o más R11¡ o X es -C(O)-; y G es un sistema de anillo de 5, 6 ó 7 miembros que incluye opcionalmente uno o más heteroátomos seleccionados de O, N o S, el sistema de anillo siendo opcionalmente sustituido con uno o más R11¡ y W1 es en donde R300, R400, R500, R500a, X1, G1 se definen como R3, R4, R5, X y G respectivamente; o W y W1 se seleccionan independientemente de en donde R3, R4 se definen como R300, R400 respectivamente; B es Q y Q se seleccionan independientemente de 1 ) -CH2-, 3) -CH(alquilo de CrC6)-, 4) -CH(cicloalquilo de C3-C7)-, 5) -cicloalquilo de C3-C7-, 6) -CH(alquilo de Ci-C6-cicloalquilo de C3-C7)-; o 7) -C(O)-; A y A1 se seleccionan independientemente de 1) NR , o 2) NR 600.
BG es 1) -?1 i_- v?110??0- .; ? 2) -L-; o BG es -Y1-|_1-Z-L100-Y100-, en donde L y L 00 son iguales o L1 y entes; Y1 y Y100 se seleccionan independientemente de 1) -C(O)-, 2) -S(O)2-, o 3) -C(0)N(R8)-; L, L1 y L100 se seleccionan de: 1) -alquilo de C Ci2- 2) -alquenilo de C2-Ci2- 3) -alquinilo de C2-Ci2-, 4) -cicloalquilo de C3-C7-, 5) -cicloalquenilo de C3-C7-, 5) -arilo-, 6) -bifenilo-, 7) -heteroarilo-, 8) -heterociclilo-, 9) -alquilo de Ci-C6-(alquenilo de C2-C6)-alquiloCrC6- 10) -alquilo de Ci-C6-(alquinilo de C2-C4)-alquiloC1-C6-, 11) -alquilo de C C6-(cicloalquilo de C3-C7)-alquiloCi-C6-, 12) -alquilo de d-Ce-arilo-alquiloCrCe-, 13) -alquilo de Ci-C6-bifenilo-alquiloCrC6-, 14) -alquilo de Ci-C6-heteroarilo-alquiloCrC6-, 15) -alquilo de CrCe-heterocicilo-alquiloCrCe-, o 16) -alquilo de Ci-C6-O-alquiloCrC6-; o L, L1 y L 00 se seleccionan de: 1) - N(R8)C(O)N(R8)-, o 2) -alquilo de CrCe-Z-alquilo de C C6-; en donde el alquilo, el alquenilo, el alquinilo, el cicloalquenilo y el cicloalquilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R7¡ y el arilo, el heteroarilo, el bifenilo y el heterociclilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R 1; Z se selecciona de: 1 ) -N(R8)CON(R8)-, 2) -N(R8)C(O)-arilo-C(0)N(R8)-, 3) -N(R8)C(O)-heteroarilo-C(0)N(R8)-, 4) -C(O)-, 5) -S(O)2-, 6) -N(R8)C(0)-, 7) -C(0)N(R8)-, 8) -OC(O)N(R8)-, 9) -S(O)2N(R8)-, 10) -N(R8) -alquilo de C C12-N(R8)-, 1 1 ) -N(R8) -C(O)C(O)-N(R8)-, 12) -N(R8) -C(0)-alquilo de CrC12-C(O)-N(R8)-, 13) -N(R8) -C(0)-arilo-C(O)-N(R8)-, 14) -N(R8) -C(O)-arilo-0-arilo-C(0)-N(R8)-, 15) -N(R8) -C(O)-heteroarilo-C(O)-N(R8)-, 16) -N(R8) -C(0)-bifenilo-C(0)-N(R8)-, 17) -N(R8) -S(O)2-alquilo de C C12-S(O)2-N(R8)- 18) -N(R8) -S(0)2-arilo-S(O)2-N(R8)-, 19) -N(R8) -S(0)2-heteroarilo-S(0)2-N(R8)-, 20) -N(R8) -S(0)2-bifenilo-S(0)2-N(R8)-, 21 ) -N(R8) -alquilo de C C12-N(R8)-, 22) -N(R8] -arilo-N(R8)-, 23) -N(R8] -heteroarilo-N(R8)-, o 24) -N(R8¡ -bifenilo-N(R8)-; en donde el alquilo y el cicloalquilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R7, y el arilo, el heteroarilo y el heterociclilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R11; R1 y R100 se seleccionan independientemente de 1 ) H, o 2) alquilo de C C6 opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7¡ R2, R3, R4, R5, R5A, R200, R300, R400, R500 y R500A son cada uno independientemente H o alquilo de C C6 opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7¡ R6 y R600 son cada uno independientemente 1 ) H, 2) halogenoalquilo, 3) <— alquilo de CrC6, 4) -alquenilo de C2-C6, 5) <— alquinilo de C2-C4, 6) <— cicloalquilo de C3-C7, 7) -cicloalquenilo deC3-C7, 8) <— arilo, 9) -heteroarilo, 10) <-heterociclilo, 1 1) <-heterobiciclilo, 12) <-(0)(O)N-R12, 13) -(=Y)NR9R10, o 14) <-S(O)2-R12, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R1 ; R7 es 1 ) halógeno, 2) N02, 3) CN, 4) halogenoalquilo, 5) alquilo de C1 -C6, 6) alquenilo de C2-C6, 7) alquinilo de C2-C4, 8) cicloalquilo de C3-C7, 9) cicloalquenilo de C3-C7, 10) arilo, 11 ) heteroarilo, 12) heterociclilo, 13) heterobiciclilo, 14) OR8, 15) S(O)m R8, 16) NR9R10, 17) NR9S(O)2R12, 18) COR8, 19) C(O)OR8, 20) CONR9R10, 21 ) S(O)2NR9R10, 22) OC(O)R8, 23) OC(O)Y-R12, 24) SC(O)R8, o 25) NC(Y)R9R10, en donde el arilo, heteroanlo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R11 ; R8 es 1 ) H, 2) halogenoalquilo, 3) alquilo de C-\-C&, 4) alquenilo de C2-C6, 5) alquinilo de C2-C4, 6) cicloalquilo de C3-C7, 7) cicloalquenilo de C3-C7, 8) arilo, 9) heteroarilo, 10) heterociclilo, 1 1 ) heterobiciclilo, 12) R9R10NC(=Y), o 13) alquilo de CrC6-alquenilo de C2-C4, o 14) alquilo de CrC6-alquinilo de C2-C4, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R11; R9 y R10 son cada uno independientemente 1 ) H, 2) halogenoalquilo, 3) alquilo de C C6, 4) alquenilo de C2-C6, 5) alquinilo de C2-C4, 6) cicloalquilo de C3-C7> 7) cicloalquenilo de C3-C7, 8) arilo, 9) heteroarilo, 10) heterociclilo, 11) heterobiciclilo, 12) C(0)R12, 13) C(O)Y-R12, o 14) S(O)2- R12, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R11; o R9 y R10 junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos forman un anillo heterociclico de cinco, seis o siete miembros opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes R7; ) halógeno, ) NO2, ) CN, ) B(OR13)(OR14), ) alquilo de Ci-C6, ) alquenilo de C2-C6, ) aiquiniio de C2-C4, ) cicloalquilo de C3-C7l ) cicloalquenilo de C3-C7l 0) halogenoalquilo, ) OR8, 2) NR9R10, 3) SR8, 4) COR8, 5) C(O)OR8, 6) S(O)mR8, 7) CONR9R10, 8) S(O)2NR9R10, 9) arilo, 0) heteroarilo, 1 ) heterociclilo, o 2) heterobiciclilo, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo y cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7¡ R12 es 1) halogenoalquilo, 2) alquilo de Ci-C6, 3) alquenilo de C2-C6, 4) alquinilo de C2-C4, 5) cicloalquilo de C3-C7, 6) cicloalquenilo de C3-C7, 7) arilo, 8) heteroarilo, 9) heterociclilo, o 10) heterobiciclilo, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7¡ y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R11; R13 y R14 son cada uno independientemente 1) H, o 2) alquilo de C C6; o R13 y R14 se combinan para formar un sistema de anillo; o un profármaco, o una sal farmacéuticamente aceptable, o marcado con un marcador detectable o una etiqueta de afinidad del mismo.
En otro aspecto de la presente invención, se provee un compuesto intermediario representado por la fórmula 1 -v: 1-v en donde PG3, R1, R2, R3, R4, R5, R5a, X y R6 son como se define aquí. En otro aspecto de la presente invención, se provee un compuesto intermediario representado por la fórmula 5-i: 5-i en donde PG3, R1, R2, R3, R4, R5, R5a, X y Rb son como se define aquí. En otro aspecto de la presente invención, se provee un compuesto intermediario representado por la fórmula 6-iv: 6-iv en donde R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R 51 00a X, X y L son como se define aquí. En otro aspecto de la presente invención, se provee ui procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 2-descrita, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representados por la fórmula 1 -v: 1 -v y LG-C(O)-L-C(O)-LG en un solvente con a base; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 2-i: en donde PG3, R , R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R5ooa x ?? y |_ son como se def¡ne aqU¡ En otro aspecto de la presente invención, se provee un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 3-i, descrita, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representados por la fórmula 1 -v: 1-v y LG-S(O)2-L-S(0)2-LG en un solvente con una base; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 3-i en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, ?? X1 y L son como se define aquí. En otro aspecto de la presente invención, se provee un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 4-i, descrita, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representado por la fórmula 1 -v: 1-v y LG-L-LG en un solvente con una base; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 4-i: 4-i en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R5ooa x x y L son como se define aquí. En otro aspecto de la presente invención, se provee un procedimiento para producir compuestos representado por la fórmula 5-ii, described, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representado por la fórmula 5-i: 5-i y LG-L-LG en un solvente con una base; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 5-ii: 5-ii en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a R6 R600 R8 R800 ? ?1 y L SQn CQmo se defjne aqu j En otro aspecto de ia presente invención, se provee un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 6-v, descrita, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representado por la fórmula 6-iv: 6-iv R • 1 t ?,? PG RJ en un solvente con un agente acoplador; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 6- 6-v en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a R6 R600 R8 R800 ? ?1 y L ^ CQmo ^ En otro aspecto de la presente invención, se provee un compuesto intermediario representado por la fórmula l-ia: l-ia en donde PG4, R1, R2, R3, R4, R5, R5a, X, C y R6 son como se define aquí. En otro aspecto de la presente invención, se provee un compuesto intermediario representado por la fórmula l-iia: l-iia en donde PG4, PG400, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a R500 R500a A ^ Q q1 ? ?1 y QQ SQN COMQ GE DEFJNE AQUJ En otro aspecto de la presente invención, se provee un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula I, descrita anteriormente, el procedimiento comprende: a) poner en puente dos intermediarios representados por la fórmula 1-ia: R6 l-ia en donde PG4, R1, R2, R3, R4, R5, R5a, X, Q, y R6 son como se define aquí, en un solvente para proveer un intermediario representado por I-iia l-iia en donde PG4, PG400, R , R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, A, A1 , Qi Q1 , X, X1 y BG son como se define aquí, y b) remover los grupos protectores PG4 y PG400 para formar compuestos de la fórmula 1. En otro aspecto de la presente invención, se provee un compuesto intermediario representado por la fórmula l-ib: PG4 O R3 R2 H O Q H N' R6 l-ib en donde PG4, R1 , R2, R3, R4, R5, R5a, X, Q, y R6 son como se define aquí.
En otro aspecto de la presente invención, se provee un compuesto intermediario representado por la fórmula l-iib: l-iib en donde PG4, PG400, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, A, A1, Q, Q1, X, X1 y BG son como se define aquí.
En otro aspecto de la presente invención, se provee un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula I, descritos anteriormente, el procedimiento comprende: a) poner en puente dos intermediarios representados por la fórmula l-ib: l-ib en donde PG4, R1 , R2, R3, R4, R5, R5a, X, Q, y R6 son como se define aquí, en un solvente para proveer un intermediario representado por I- l-iib en donde PG4, PG400, R1 , R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a R500 R500a A A1 Q Q1 ? ?1 y gQ gon comQ se def|ne aq u ¡ ¡ y b) remover los grupos protectores PG4 y PG400 para formar compuestos de la fórmula 1. En otro aspecto de la presente invención, se provee un método para la preparación de una sal farmacéuticamente aceptable del compuesto de la fórmula I, mediante el tratamiento de un compuesto de la fórmula I con 1 a 2 equivalentes de un ácido farmacéuticamente aceptable, como se define aquí. En otro aspecto de la presente invención, se provee una composición farmacéutica que comprende un compuesto, como se describió antes, mezclado con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable. En otro aspecto de la presente invención, se provee una composición farmacéutica adaptada para administración como un agente para tratar un trastorno proliferativo en un sujeto, que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de un compuesto, como se describió antes. En otro aspecto de la presente invención, se provee una composición farmacéutica que comprende un compuesto de la fórmula I en combinación con uno o más agonistas de receptor de muerte, por ejemplo, un agonista de receptor de TRAIL En otro aspecto de la presente invención, se provee una composición farmacéutica que comprende un compuesto de la fórmula I en combinación con cualquier agente terapéutico que incrementa la respuesta de uno o más agonistas de receptor de muerte, por ejemplo citocinas citotóxicas tales como ¡nterferones. En otro aspecto de la presente invención, se provee un método para preparar una composición farmacéutica, el método comprende: mezclar un compuesto, como se describió antes, con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable. En otro aspecto de la presente invención, se provee un método para tratar un estado de enfermedad caracterizado por apoptosis insuficiente, el método comprende: administrar a un sujeto que necesita el mismo, una cantidad terapéuticamente efectiva de una composición farmacéutica, como se describió antes, para tratar el estado de enfermedad.
En otro aspecto de la presente invención, se provee un método para modular la función de IAP, el método comprende: poner en contacto una célula con un compuesto de la presente invención para prevenir la unión de una proteína de unión de BIR a un dominio de BIR de IAP modulando asi la función de IAP. En otro aspecto de la presente invención, se provee un método para tratar una enfermedad proliferativa, el método comprende: administrar a un sujeto que necesita el mismo, una cantidad terapéuticamente efectiva de la composición farmacéutica, como se describió antes, para tratar la enfermedad proliferativa. En otro aspecto de la presente invención, se provee un método para tratar cáncer, el método comprende: administrar a un sujeto que necesita el mismo, una cantidad terapéuticamente efectiva de la composición farmacéutica, como se describió antes, para tratar el cáncer. En otro aspecto de la presente invención, se provee un método para tratar cáncer, el método comprende, administrar al sujeto que necesita el mismo, una cantidad terapéuticamente efectiva de una composición farmacéutica, como se describió antes, en combinación o secuencialmente con un agente seleccionado de: a) un modulador de receptor de estrógeno, b) un modulador de receptor de andrógeno, c) un modulador de receptor de retinoide, d) un agente citotóxico, e) un agente antiproliferativo, f) un inhibidor de prenil-proteína transferasa, g) un inhibidor de HMG-CoA reductasa, h) un inhibidor de proteasa de VIH, i) un inhibidor de transcriptasa inversa, k) un inhibidor de angiogénesis, I) un agonista de PPAR-?, m) un agonista de PPAR-d, n) un inhibidor de resistencia a fármacos múltiples inherente, o) un agente antiemético, p) un agente útil en el tratamiento de anemia, q) agentes útiles en el tratamiento de neutropenia, r) un fármaco inmunológico-incrementador. s) un inhibidor de proteosoma; t) un inhibidor de HDCA; u) un inhibidor de la actividad similar a quimiotripsina en el proteosoma; o v) inhibidores de E3 ligasa, w) un modulador del sistema inmune tal como, pero sin limitarse a, interferón-alfa, Bacillus de Calmette-Guerin (BCG), y radiación ionizante (UVB) que puede inducir la liberación de citocinas, tales como las interleucinas, FNT, o inducir la liberación de ligandos de receptor de muerte tales como TRAIL; x) un modulador de TRAIL de receptores de muerte y agonistas de TRAIL tales como los anticuerpos humanizados HGS-ETR1 y HGS-ETR2; o en combinación o secuencialmente con terapia de radiación, para tratar el cáncer. En otro aspecto de la presente invención, se provee a método para el tratamiento o prevención de un trastorno proliferativo en un sujeto, el método comprende: administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente efectiva de la composición, descrita anteriormente. En otro aspecto de la presente invención, el método además comprende administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente efectiva de un agente quimioterapéutico antes de, simultáneamente con o después de la administración de la composición. En otro aspecto más, el método además comprende administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente efectiva de un agonista de receptor de muerte antes de, simultáneamente con o después de la administración de la composición. El agonista de receptor de muerte es TFRAIL o el agonista de receptor de muerte es un anticuerpo de TRAIL. El agonista de receptor de muerte se administra típicamente en una cantidad que produce un efecto sinergístico. En otro aspecto más, se provee el uso del compuesto como se describió antes para la fabricación de un medicamento para tratar o prevenir a estado de enfermedad caracterizado por apoptosis insuficiente. En otro aspecto más, se provee el uso del compuesto como se describió antes para la fabricación de un medicamento para tratar o prevenir un trastorno proliferativo. En otro aspecto más, se provee el uso del compuesto como se describió antes en combinación con un agente para la fabricación de un medicamento para tratar o prevenir un trastorno proliferativo, en donde el agente se selecciona de: a) un modulador de receptor de estrógeno, modulador de receptor de andrógeno c) un modulador de receptor de retinoide, d) un agente citotóxico, agente antiproliferativo, inhibidor de prenil-proteína transferasa g) un inhibidor de HMG-CoA reductasa, h) un inhibidor de proteasa de VIH, i) un inhibidor de transcriptasa inversa, inhibidor de angiogénesis, I) un agonista de PPAR-?, m) un agonista de PPAR-d, n) un inhibidor de resistencia a fármacos múltiples inherente o) un agente antiemético, p) un agente útil en el tratamiento de anemia, q) agentes útiles en el tratamiento de neutropenia fármaco inmunológico-incrementador, s) un inhibidor de proteosoma, t) un inhibidor de HDCA, u) un inhibidor de la actividad similar a quimiotripsina en el proteosoma; o v) inhibidores de E3 ligasa; w) un modulador del sistema inmune tal como, pero sin limitarse a, interferón-alfa, Bacillus de Calmette-Guerin (BCG), y radiación ionizante (UVB) que puede inducir la liberación de citocinas, tales como las interleucinas, FNT, o inducir liberación de ligandos de receptor de muerte tales como TRAIL; x) un modulador de TRAIL de receptores de muerte y agonistas de TRAIL tales como los anticuerpos humanizados HGS-ETR1 y HGS-ETR2; o en combinación o secuencialmente con terapia de radiación. En otro aspecto más, se provee el uso del compuesto como se describió antes en combinación con un agonista de receptor de muerte para la fabricación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno proliferativo en un sujeto. En otro aspecto más, se provee una composición farmacéutica que comprende el compuesto como se describió antes, mezclado con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable, para tratar o prevenir un estado de enfermedad caracterizado por apoptosis insuficiente. En otro aspecto más, se provee una composición farmacéutica que comprende el compuesto como se describió antes en combinación con cualquier compuesto que incrementa el nivel circulante de uno o más agonistas de receptor de muerte para prevenir o tratar un trastorno proliferativo. En otro aspecto más, se provee un método para preparar una composición farmacéutica, el método comprende: mezclar el compuesto como se describió antes, con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable. En otro aspecto de la presente invención, se provee una sonda, la sonda siendo un compuesto de la fórmula I anterior, el compuesto siendo marcado con un marcador detectable o una etiqueta de afinidad. En otro aspecto de la presente invención, se provee a método para identificar compuestos que se unen a un dominio de BIR de IAP, la prueba comprende: a) poner en contacto un dominio de BIR de IAP con una sonda para formar un complejo de sonda:dominio de BIR, la sonda siendo desplazable por un compuesto de prueba; b) medir una señal de la sonda para establecer un nivel de referencia; c) incubar el complejo de sonda:dominio de BIR con el compuesto de prueba; d) medir la señal de la soda; e) comparar la señal del paso d) con el nivel de referencia, una modulación de la señal siendo una indicación de que el compuesto de prueba se une al dominio de BIR, en donde la sonda es un compuesto de la fórmula I marcada con un marcador detectable o un marcador de afinidad. En otro aspecto de la presente invención, se provee un método para detectar pérdida de función o supresión de lAPs in vivo, el método comprende: a) administrar a un sujeto, una cantidad terapéuticamente efectiva de una composición farmacéutica, como se definió antes; b) aislar una muestra de tejido del sujeto; y c) detectar una pérdida de función o supresión de lAPs de la muestra.
DESCRIPCION DETALLADA DE LA INVENCION En muchos cánceres y otras enfermedades, la regulación ascendente de lAPs en las células, inducida por defectos genéticos o en respuesta a agentes quimioterapéuticos, se ha correlacionado con una resistencia incrementada a apoptosis. De manera interesante, los resultados de los inventores de la presente muestran que las células cancerosas cuyos niveles de IAP se reducen son más sensibles a agentes quimioterapéuticos o apoptosis inducida por TRAIL. En esta invención, los inventores describen compuestos que se pueden unir directamente a varias lAPs, antagonizan sus funciones y además, causan una regulación descendente de ciertas proteínas IAP en las células, sensibilizándolas así a la apoptosis. Dichas moléculas, al inducir pérdida de IAP de larga duración de las células implicadas en la patogénesis o progreso de enfermedad, serán útiles como agentes terapéuticos, ya sea solos o en una combinación sinergística con otros inductores de apoptosis. Esta combinación de efectos es anticipada para proveer ventajas clínicas de los compuestos de la presente invención en términos de superar la resistencia a la terapia. También ventajoso sería el uso de los compuestos descritos en terapia de combinación con otros agentes. En un aspecto de la presente invención, los compuestos de la presente invención también pueden ser representados por la siguiente fórmula II en la cual M1 y M2 representan dominios de unión a BIR independientes.
M 1 M2 En un subconjunto de la fórmula II, M1 es el mismo que M2 y la línea punteada denota una línea de simetría. En otro subconjunto, M1 es diferente de M2. En un subconjunto, los compuestos de la fórmula II son asimétricos alrededor de la línea punteada. En otro subconjunto, los sustituyentes en M1 y M2 son los mismos. En otro subconjunto, los sustituyentes en M1 y M2 son diferentes. Un experto en la técnica reconocerá que cuando M1 y M2 son los mismos, los sustituyentes de R1 , R1 a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R1 , R12, R13, R14, n, m, Y1, Q, y X en M1 tienen el mismo significado que los sustituyentes de R100, R100a, R200, R300, R400, R500, R600, R700, R800, R900, Riooo R oo R 3oo R1400 ) n mi ???? q 1 y ?? respectivamente en M2. Cuando M1 y M2 son diferentes, por lo menos uno de los sustituyentes anteriores es diferente en cualquiera de M1 o M2. Alternativamente los sustituyentes en M1 se pueden definir como R1, R1 a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R11 , R 2, R13, R14, n, m, Y1, Q, y X , y los de M2 se pueden definir como R100, R100a, R200 R300, R400, R500, R600, R7oo R300) R9OO R 1OOO_ Riioo Ri 3oo R 14OO_ n_ m> ???? Qi y ?1 respectivamente.
En el caso en donde M1 y M2 son los mismos, los sustituyentes de R1, R1a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R11, R12, R13, R14, n, m, Y1, Q, y X en M1 tienen los mismos significados que R100, R100a, R200, R300, R400, R500, R600, R700 R800 R900 R1000 R1 100 R1300 R1400 R M G100 Q1 Y ?1 RESPECTJVA ME NTE en M2. En el caso en donde M1 y M2 son diferentes, por lo menos uno de los sustituyentes antes mencionado es diferente. Los compuestos de la presente invención son útiles como compuestos de unión a dominio de BIR en lAPs de mamífero y son representados por la fórmula I.
W v W1 En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, W es en donde R300, R400, R500, R500a, X1 se definen como R3, R4, R5, R5a, y X respectivamente. En un subconjunto alternativo de compuestos de la fórmula I, W es y W1 es en donde R500, R500a, X1 , G1 se definen como R5, Ra, X y G respectivamente. En un subconjunto alternativo de compuestos de la fórmula I, W es y W1 es en donde R500, R500a, G1 se definen como R5, R5a, y G respectivamente. En otro subconjunto alternativo de compuestos de la fórmula I, W es y W1 es en donde R3, R4 se definen como R300, R400 respectivamente. Cualquiera y cada definición individual de W y W1 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de R1, R1 a, R2, R 00, R100a, R2, R200, B.
B En un ejemplo de los compuestos de la fórmula I, B es I Q A — BG A1 Q en donde A, A , Qi Q1 y BG son como se define aquí. Cualquiera y cada definición individual de B como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de R1 , R1 a, R2, R100, R100a, R2, R200, W y W1 como se expone aquí.
Q v Q1 En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, Q y Q1 son ambos -CH2-. En un subconjunto alternativo de compuestos de la fórmula I, Q y Q son ambos -C(O)-. Cualquiera y cada definición individual de Q y Q1 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de R1, R1a, R2, R 00, R100a, R200, W y W1 como se expone aquí.
A y A1 En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, A y A1 se seleccionan independientemente de 1 ) NR6, o 2) NR600¡ en donde R6 y R600 son como se define aquí.
Cualquiera y cada definición individual de A y A1 como expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual R1, R1a, R2, R100, R100a, R200, W y W1 como se expone aquí.
En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, BG Y 100 En un subconjunto alternativo de compuestos de la fórmula I, BG es -L-. En otro subconjunto alternativo, BG es -Y1-L1-Z-L100-Y100-, en donde L y L100 son iguales o L1 y L100 son diferentes. Cualquiera y cada definición individual de BG como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de R1, R1a, R2, R 00, R100a, R200, W y W1 como se expone aquí.
Núcleo Por lo tanto, en un subconjunto, los compuestos de la presente comprenden compuestos de la fórmula 1A. en donde R1, R1a, R2, R2, R3, R4, R5, R5a, X, X1 , A, A1, BG, R100, R100a R200) R300 R400 R500 y R500a ^ comQ se def|ne ^ En un subconjunto, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1A1 : en donde R1 , R1 a, R2, R2, R3, R4, R5, R5a, Q, Q1, A, A1, BG, X, X1, R100 R100a i R200 r300 R400 R500 y R500a ^ CQmQ SQ ^ En otro subconjunto, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1A2: en donde R1, R1a, R2, R2, R3, R4, R5, R5a, Q, Q , A, A1, BG, X, X1, R100 , DK100a , R D200 , DR300 , DR400 , DR500 , ,y, DR500a s „o„n co mmo„ „ se„ aquí. En otro subconjunto, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1A3: 1A3 en donde R1, R1a, R2, R2, R3, R4, R5, R5a, Q, Q1, BG, X, X1, R100, R100a R200 R300 R400) R500 R500a R6 y R600 SQn comQ se defjne aqu¡ En otro subconjunto, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1A4: 1A4 en donde R1 , R1a, R2, R2, R3, R4, R5, R5a, Q, Q1, L, X, X1, R100, R100a R200 R300 R400 R500| pSCXta R6 y R600 SQn CQmo se defjne aqu¡ En otro subconjunto, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1A5: 1A5 en donde R1, R1a, R2, R2, R3, R4, R5, R5a, Q, Q1, L, X, X1, R100, K , K , K , K , R , K , R yR son como se define aquí. En otro subconjunto, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1A6: 1A6 en donde R1, R1a, R2, R2, R3, R4, R5, R5a, Q, Q1, X, X1, L, R1 R100a R200i R300 R400 R500 R500a R6 y R600 ^ comQ se defjne ^ En un subconjunto alternativo, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1B: 1B en donde R1, R1a, R2, R200, R5, R5a, G, G1, Q, Q1, X, X1, A, A1, R100, R100a, R200, R500 y R500a son como se define aquí. En otro subconjunto, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1B1: 1B1 en donde R1, R1 a, R2, R200, R5, R5a, G, G1, Q, Q1, BG, X, X1, A, A1, R100, R100a, R200, R500 y R500a son como se define aquí. En otro subconjunto, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1 B2: 1 B2 en donde R1, R1a, R2, R200, R5, R5a, G, G1 , L, Q, Q1 , X, X1 , A, A1 , R100 R100a R200 R500 y R500a SQn como SQ defíne aqu¡ En otro subconjunto alternativo, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1 C: 1C en donde R1, R1a, R2, R200, R5, R5a, G, G1, BG, Q, Q1, X, X1, A, A1, R100, R100a, R200, R500 y R500a son como se define aquí. En otro subconjunto alternativo, los compuestos de la presente invención comprenden compuestos de la fórmula 1 D: 1D en donde R1, R1a, R2, R2, R5, R5a, BG, G, G1, Q, Q1, A, A1, R100, R100a R200 R500 R500a R6 y R600 ^ CQmQ SQ aq(jj Y1 y Y100 En un subconjunto, Y1 y Y100 son ambos -C(O)-. En otro subconjunto, Y1 y Y100 son ambos -S(0)2-. En otro subconjunto, Y1 y Y100 son ambos -C(O)N(R8)-, en donde R8 es como se define aquí. Cualquiera y cada definición individual de Y1 y Y100 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de Z, R1, R1a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R1 , R12, R13, R14, n, m, Q, X, R100 D100a D200 D300 D400 D500 D600 D700 D800 D90Q D1000 D1100 D1300 , , G\ , G? , ? , ? , , , , R 400, ?, m, Y100, Q1, y X1 como se expone aquí.
L, L1 y L100 En un subconjunto, L, L1 y L100 se seleccionan de: 1) -alquilo de C Ci2-, 2) -cicloalquilo de C3-C7-, 3) -arilo-, 4) -bifenilo-, 5) -heteroarilo-, 6) -heterociclilo-, 7) -alquilo de C C6-(cicloalquilo de C3-C7)-alquilo de C Ce, 8) -alquilo de C C6-arilo-alquilo de C C6, 9) -alquilo de CrC6-bifenilo-alquilo de C C6, 10) -alquilo de CrC6-heteroarilo-alquilo de CrC6, 11 ) -alquilo de CrCe-heterociclilo-alquilo de C i-C6, o 12) -alquilo de C C6-0-alquilo de CrC6. en donde el alquilo, y el cicloalquilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R7; y el arilo, el heteroarilo, el bifenilo y el heterociclilo son opcionalmente sustituidos con uno o más R11 sustituyentes. En otro subconjunto, L, L1, y L 00 son -N(R8)C(0)N(R8)-, en donde R8 es como se define aquí. En otro subconjunto, L, L1 y L100 son -alquilo de CrCe-Z-alquilo en donde el alquilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7, y Z es como se define aquí. Cualquiera y cada definición individual de L, L1, L100 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de Z, R1, R a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R11, R12, R13, R14, n, m, Y, Q, v D 100 o 100a r>200 D300 D400 D500 D600 D700 D800 D900 D 1000 D 1100 D 1300 ? , , rv , r\ , r\ , , G\ , , , ? , , G? , G\ , ? , R1400, ?, m, Y100, Q1 , y X1 como se expone aquí.
Z En un subconjunto, Z se selecciona de: 1) -N(R8)CON(R8)-, 2) -N(R8)C(0)-arilo-C(0)N(R8)-, 3) -N(R3)C(0)-heteroarilo-C(O)N(R8)-, 4) -C(O)-, 5) -N(R8)-alquilo de CrC12-N(R8)-, 6) -N(R8)-C(0)C(0)-N(R8)-, 7) -N(R8)-C(0)-alquilo de d-dz-CÍOJ-NÍR8)-, 8) -N(R8)-C(0)-arilo-C(O)-N(R8)-, 9) -N(R8)-C(0)-arilo-O-arilo-C(O)-N(R8)-, 10) -N(R8)-C(O)-heteroarilo-C(0)-N(R8)-, 11 ) -N(R8)-C(0)-bifenilo-C(O)-N(R8)-, 12) -N(R8)-S(O)2-alquilo de C Ci2-S(O)2-N(R8)- 13) -N(R8)-S(O)2-arilo-S(0)2-N(R8)-, 14) -N(R8)-S(O)2-heteroarilo-S(0)2-N(R8)-, o 25) -N(R8)-S(O)2-bifenilo-S(O)2-N(R8)-, en donde el alquilo y el cicloalquilo son opcionalmente sustituidos con uno o más R7 sustituyentes, y el arilo, el heteroarilo y el heterociclilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R11; y en donde R8 es como se define aquí. Cualquiera y cada definición individual de Z como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de L, L , L100, R1, R1a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R11, R12, R 3, R14, n, m, Y, Q X R100 R100a R200 R300 R400 R500 R600 R700 R800 R900 R1000 pl 100 p1300 R1400, n, m, Y100, Q1, y X1 como se expone aquí.
R1, R1a. R100 v R100 En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, R1, R1a, R100 y R100 se seleccionan independientemente de H o CH3. Cualquiera y cada definición individual de R1, R1a, R100, R100a como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de L, L1, L100, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R11, R12, R13, R14 n m Y Q X R200 R300 R400 R500 R600 R700 R800 R900 R1000 R 100 R1300, R1400, n, m, Y100, Q1, y X1 como se expone aquí.
R2 y R 200 En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, tanto R2 como R200 despliegan estereoquímica (S). Cualquiera y cada definición individual de R2 y R200 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de L, L1, L100, R1, R1a, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R11 R12 R13 R14, n, m, Y Q ? p100 p100a p300 p400 p500 p600 p700 800 p900 p1000 1100 p1300 R1400, n, m, Y100, Q1, y X1 como se expone aquí.
R3 y R3Q0 En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, R3 y R300 se seleccionan independientemente de 1 ) H, o 2) alquilo de C1-C6 opcionalmente sustituido con un sustituyente de R' ; y en donde R' escomo se describe aquí. Ejemplos típicos de R3 y R300 incluyen H, (S)-metilo, (S)-etilo, (S)-ter-butilo, (S)-ciclohexilmetílo, (S)-2-feniletilo y (S)-butilcarbamato de bencilo. Cualquiera y cada definición individual de R3 y R300 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de L, L1, L R1, R1a, R2, R4, R5, R5a, R6 R7, R8, R9, R10, R1 , R12 R13, R14 n, m, Y Q X R100 R100a R200 R400 500 R600 R700 R800 R900 R1000 R1 °0 p1300 R1400 n, m, Y100, Q1 , y X1 como se expone aquí.
R6 y R600 En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, R6 y R600 son cada uno independientemente 1) H, 2) <-alquilo de C C6, 3) <-arilo, o en donde el alquilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R11. Ejemplos típicos de R6 y R600 incluyen Cualquiera y cada definición individual de R6 y R600 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de L, L1, L100, R1, R1 a, R2, R3, R4, R5, R5a, R7, R8, R9, R10, R11, R12, R13, R14, n, m, Y Q X R100 R100a R200 R300 R400 R500 R700 R800 R900 R1000 ?1 °0 p1300 R1400, n, m, Y100, Q , y X1 como se expone aquí.
En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, R7 es 1) cicloalquilo de C3-C7, 2) arilo, 3) heteroarilo, o 4) NHC(O)OCH2fenilo, en donde el arilo y el heteroarilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R11¡ y en donde R9 y R10 son como se define aquí. Cualquiera y cada definición individual de R7 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de L, L1, l_ R1, R1a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R8, R9, R10, R11, R12, R13, R14, n, m, Y, Q, X R100 R100a R200 R300 R400 R500 R600 R700 R800 R900 R1000 R11°0 ^1300 R1400, n, m, Y100, Q1, y X1 como se expone aquí.
En un subconjunto, R8 se selecciona de 1) H, 2) halogenoalquilo, 3) alquilo de C C6, 4) cicloalquilo de C3-C7, 5) arilo, 6) heteroarilo, 7) heterociclilo, o 8) heterobiciclilo, en donde el alquilo, cicloalquilo, son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes R 1. Cualquiera y cada definición individual de R8 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de L, L1 , L 00 R1 , R1 a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R9, R10, R11 , R12, R13, R14, n, m, Y, Q, X p 100 p100a p200 p300 p400 p500 p600 p700 p800 p900 p1000 p1 100 p1300 R 400, n, m, Y100, Q1, y X1 como se expone aquí.
En un subconjunto de compuestos de la fórmula I, R11 es 1 ) halógeno, 2) CF3, 3) OH, 4) OMe, 5) arilo, o 6) heteroarilo.
Ejemplos de R11 incluyen F, Cl, Br, OH, OMe, CF3, fenilo y tetrazol.
Cualquiera y cada definición individual de R11 como se expone aquí se puede combinar con cualquiera y cada definición individual de L, L1 , L R1 , R1a, R2, R3, R4, R5, R5a, R6, R7, R8, R9, R10, R12, R13, R14, n, m, Y, Q, X R100 R100a R200 R300 R400 R500 R600 R700 R800 R900 R1000 p^HOO p 1300 R1400, n, m, Y100, Q1, y X1 como se expone aquí.
De conformidad con otros ejemplos de la presente invención, W y W1 se pueden definir cada uno como: en donde R3, R300, R4 y R401 son como se definió antes. Un subconjunto de compuestos de la presente invención i compuestos en los cuales W y W1 se definen como: en donde R3, R300, R4 y R400 son como se definió antes. Muy específicamente, un subconjunto de compuestos de la presente invención incluye compuestos en los cuales W y W1 se definen como: En otro aspecto de la presente invención W y W1 cada uno se puede definir como un mimético de giro ß tal como: en donde G, G1, X, X1, R5, R5a, R500 y R500a son como se definió antes. De manera más específica, ejemplos de miméticos de giro ß por lo tanto pueden ser caracterizados por los siguientes sistemas de anillo bicíclicos y tricíclicos: La síntesis de sistemas de anillo biciclicos y tricíclicos que son capaces de actuar como miméticos de giro ß ha sido revisada y los métodos de síntesis para su preparación se puede encontrar en el siguiente artículo de revisión: Cluzeau, J.¡ Lubell, W. D. Biopolymers-Peptide Synthesis, 2005, 80, 98 y referencias en la misma, incorporada en su totalidad. Si cualquier variable, tal como R3, R4 y similares, ocurren más de una vez en cualquier estructura constituyente, la definición de la variable en cada ocurrencia es independiente en cada otra ocurrencia. Si un sustituyente es sustituido con uno o más sustituyentes, se entiende que uno o más sustituyentes pueden ser unidos al mismo átomo de carbono o diferentes átomos de carbono. Combinaciones de sustituyentes y variables definidas aquí son permitidas sólo si producen compuestos químicamente estables. Un experto en la técnica entenderá que los patrones de sustitución y sustituyentes en compuestos de la presente invención se pueden seleccionar para proveer compuestos que son químicamente estables y pueden ser fácilmente sintetizados usando la química expuesta en los ejemplos y técnicas de química bien conocidas en la técnica usando materiales fácilmente disponibles. Cabe entender que muchos sustituyentes o grupos descritos aquí tienen equivalentes de grupo funcional, lo que significa que el grupo o sustituyente puede ser reemplazado por otro grupo o sustituyente que tiene propiedades electrónicas, de hibridización o de unión.
Definiciones A menos que se especifique otra cosa, aplican las siguientes definiciones: Las formas singulares "un", "una", "el" y "las" incluyen referencias plurales correspondientes a menos que el contexto claramente dictae otra cosa. Como se usa aquí, el término "que comprende" significa que los elementos listados después de la palabra "que comprende" son requeridos o son obligatorios excepto que otros elementos son opcionales y pueden o no estar presentes. Como se usa aquí, el término "que consiste de" significa que incluye y limitado a lo que sigue a la frase "que consiste de". Por lo tanto, la frase "que consiste de" indica que los elementos listados son requeridos o son obligatorios y que ningún otro elemento puede estar presente. Como se usa aquí, el término "alquilo" incluye tanto grupos alifáticos saturados de cadena recta como de cadena ramificada que tienen el número especificado de átomos de carbono, por ejemplo, C C6 como en alquilo de Ci-C6- se define como que incluye grupos que tienen 1 , 2, 3, 4, 5 ó 6 carbonos en un ordenamiento lineal o ramificado, y alquilo de C C4 como en alquilo de Ci-C4 se define como incluyendo grupos que tienen 1 , 2, 3 ó 4 carbonos en un ordenamiento linea o ramificado, y CrC3 como en alquilo de C 1-C3 se define como que incluye grupos que tiene 1 , 2 ó 3 carbonos en un ordenamiento lineal o ramificado, y C Ci2 como en alquilo de C Ci2 se define como que incluye grupos que tienen 1 , 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 y 12 carbonos en un ordenamiento lineal o ramificado. Ejemplos de alquilo como se definió antes incluyen, pero no se limitan a, metilo, etilo, n-propilo, /-propilo, n- butilo, /-butilo, /-butilo, pentilo y hexilo. Como se usa aquí, el término "alquenilo" significa grupos hidrocarburo de cadena recta o ramificada insaturados que tienen el número especificado de átomos de carbono en los mismos, y en los cuales por lo menos dos de los átomos de carbono se unen unos a otros por un doble enlace, y que tienen ya sea regioquímica E o Z y combinaciones de los mismos. Por ejemplo, C2-C6 como en alquenilo de C2-C6 se define como que incluye grupos que tienen 2, 3, 4, 5 ó 6 carbonos en un ordenamiento lineal o ramificado, por lo menos dos de los átomos de carbono siendo unidos entre sí por un doble enlace. Ejemplos de alquenilo de C2-C6 incluyen etenilo (vinilo), 1 -propenilo, 2-propenilo, 1-buten¡lo y similares. Como se usa aquí, el término "alquinilo" significa grupos de hidrocarburo de cadena recta insaturados que tiene el número especificado de átomos de carbono en el mismo y en el cual por lo menos dos átomos de carbono son unidos entre si por un triple enlace. Por ejemplo, C2-C4 como en alquinilo de C2-C4 se define como incluyendo grupos que tienen 2, 3 ó 4 átomos de carbono en una cadena, por lo menos dos de los átomos de carbono siendo unidos entre sí por un triple enlace. Como se usa aquí, el término "cicloalquilo" significa un grupo hidrocarburo alifático saturado monocíclico que tiene el número especificado de átomos de carbono en el mismo, por ejemplo, C3-C7 como en cicloalquilo de C3-C7 se define como que incluye grupos que tienen 3, 4, 5, 6 ó 7 carbonos en un ordenamiento monocíclico. Ejemplos de cicloalquilo de C3-C7 como se definió antes incluyen, pero no se limitan a, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo y cicloheptilo. Como se usa aquí, el término "cicloalquenilo" significa un grupo hidrocarburo alifático saturado monocíclico que tiene el número especificado de átomos de carbono en el mismo, por ejemplo, C3-C7 como en cicloalquenilo de C3-C7 se define como que incluye grupos que tienen 3, 4, 5, 6 ó 7 carbonos en un ordenamiento monocíclico. Ejemplos de cicloalquenilo de C3-C7 como se definió antes incluyen, pero no se limitan a, ciclopentenilo, y ciclohexenilo. Como se usa aquí, el término "halo" o "halógeno" significa flúor, cloro, bromo y yodo. Como se usa aquí, el término "halogenoalquilo" significa un alquilo como se definió antes, en el cual cada átomo de hidrógeno puede ser sucesivamente reemplazado por un átomo de halógeno. Ejemplos de halogenoalquilos incluyen, pero no se limitan a, CH2F, CHF2 y CF3. Como se usa aquí, el término "arilo", ya sea solo o en combinación con otro radical, significa un grupo monocíclico aromático carbocíclico que contiene 6 átomos de carbono que además pueden ser fusionados a un segundo grupo carbocíclico de 5 ó 6 miembros que pueden ser aromáticos, saturados o insaturados. El arilo includye, pero no se limita a, fenilo, indanilo, 1-naftilo, 2-naftilo y tetrahidronaftilo. Los arilos fusionados pueden ser conectados a otro grupo ya sea en una posición adecuada en el anillo de cicloalquilo o el anillo aromático. Por ejemplo: Las líneas con flecha trazadas desde el sistema de anillo indican que la unión se puede hacer a cualquiera de los átomos de anillo adecuados. Como se usa aquí, el término "heteroarilo" significa un sistema de anillo monocíclico o bicíclico de hasta diez átomos, en donde por lo menos un anillo es aromático, y contiene de 1 a 4 heteroátomos seleccionados del grupo que consiste de O, N y S. El sustituyente heteroarilo se puede unir ya sea mediante un átomo de carbono de anillo o uno de los heteroátomos. Ejemplos de grupos heteroarilo incluyen, pero no se limitan a tienilo, benzimidazolilo, benzo[b]tienilo, furilo, benzofuranilo, piranilo, isobenzofuranilo, cromenilo, xantenilo, 2H-pirrolilo, pirrolilo, imidazolilo, pirazolilo, piridilo, pirazinilo, pirimidinilo, piridazinilo, indolizinílo, isoindolilo, 3H-indolilo, indolilo, indazolilo, purinilo, 4H-quinolizinilo, isoquinolilo, quinolilo, ftalazinilo, naftiridinilo, quinoxalinilo, quinazolinilo, cínnolinilo, pteridinilo, isotiazolilo, isocromanilo, cromanilo, isoxazolilo, furazanilo, indolinilo, isoindolinilo, tiazolo[4,5-b]-piridina y derivados de fluoresceína tales como: Como se usa aquí, el término "heterociclo", "heterocíclico" o "heterociclilo" significa un sistema de anillo no aromático de 5, 6 ó 7 miembros que contiene de 1 a 4 heteroátomos seleccionados del grupo que consiste de O, N y S. Ejemplos de heterociclos incluyen, pero no se limitan a derivados de pirrolidinilo, tetrahidrofuranilo, piperidilo, pirrolinilo, piperazinilo, imidazolidinilo, morfolinilo, imidazolinilo, pirazolidinilo, pirazolinilo y biotinilo. Como se usa aquí, el término "heterobiciclo" ya sea solo o en combinación con otro radical, significa un heterociclo como se definió antes fusionado a otro ciclo, ya sea un heterociclo, un arilo o cualquier otro ciclo definido aquí. Ejemplos de dichos heterobiciclos incluyen, pero no se limitan a, cumarina, benzo[d][1 ,3]dioxol, 2,3-dihidrobenzo[b][1 ,4]dioxina y 3,4-dihidro-2H-benzo[b][1 ,4]dioepina. Como se usa aquí, el término "marcador detectable" significa un grupo que puede ser ligado a un compuesto de la presente invención para producir una sonda o a un dominio de BIR de IAP, de tal manera que cuando la sonda está asociada con el dominio de BIR, el marcador permite reconocimiento ya sea directo o indirecto de la sonda de modo que pueda ser detectada, medida y cuantificada. Como se usa aquí, el término "etiqueta de afinidad" significa un ligando o grupo, que es ligada ya sea a un compuesto de la presente invención o a un dominio de BIR de IAP para permitir que otro compuesto sea extraído de una solución a la cual el ligando o grupo es unido. Como se usa aquí, el término "sonda" significa un compuesto de la fórmula I que es marcado ya sea con un marcador detectable o una etiqueta de afinidad, y que es capaz de unirse, ya sea covalentemente o no covalentemente, a un dominio de BIR de IAP. Cuando, por ejemplo, la sonda es unida no covalentemente, puede ser desplazada por un compuesto de prueba. Cuando, por ejemplo, la sonda es unida covalentemente, se puede usar para formar aducios entrelazados, que pueden ser cuantificados e inhibidos por un compuesto de prueba. Como se usa aquí, el término "opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes" o su término equivalente "opcionalmente sustituido con por lo menos un sustituyente" significa que el evento de circunstancias subsecuentemente descrito puede o no ocurrir, y que la descripción incluye casos en donde el evento o circunstancia ocurre y casos en los cuales no ocurre. La definición significa de cero a cinco sustituyentes. Si los sustituyentes mismos son incompatibles con los métodos de síntesis de la presente invención, el sustituyente puede ser protegido con un grupo protector adecuado (PG) que es estable a las condiciones de reacción usadas en estos métodos. El grupo protector puede ser removido en un punto adecuado en la secuencia de reacción del método para proveer un intermediario deseado o compuesto objetivo. Los grupos protectores adecuados y los métodos para proteger y deproteger diferentes sustituyentes usando dichos grupos protectores adecuados son bien conocidos por los expertos en la técnica; ejemplos de los cuales se pueden encontrar en T.
Greene y P. Wuts, Protecting Groups in Chemicai Synthesis (3a ed.), John Wiley & Sons, NY (1999), que se incorpora aquí por referencia en su totalidad Ejemplos de grupos protectores usados a lo largo de la descripción incluyen, pero no se limitan a Alloc, Fmoc, Bn, Boc, CBz y COCF3. En algunos casos, un sustituyente puede ser específicamente seleccionado para ser reactivo bajo las condiciones de reacción usadas en los métodos de esta invención.
Bajo estas circunstancias, las condiciones de reacción convierten el sustituyente seleccionado a otro sustituyente que es ya sea útil en un compuesto intermediario en los métodos de esta invención o es un sustituyente deseado en un compuesto objetivo.
Abreviaturas para a-aminoácidos usados a lo largo de la descripción son como sigue: Aminoácido Abreviatura Acido a-aminobutírico Abu Alanina Ala Arginina Arg Acido aspártico Asp Asparagina Asn Cisteína Cys Acido glutámico Glu Glutamina Gln Glicina Gly Isoleucina He Histidina His Leucina Leu Lisina Lys Metionina Met Fenilalanina Phe Prolina Pro Serina Ser Treonina Thr Triptofano Trp Tirosina Tyr Valina Val Como se usa aquí, el término "residuo", cuando se refiere a a- aminoácidos significa un radical derivado del a-aminoácido correspondiente eliminando el hidroxilo del grupo carboxi y un hidrógeno del grupo a-amino.
Por ejemplo, los términos Gln, Ala, Gly, He, Arg, Asp, Phe, Ser, Leu, Cys, Asn y Tyr representan los residuos de L-glutamina, L-alanina, glicina, L-isoleucina, L-arginina, ácido L-aspártico, L-fenilalanina, L-serina, L- leucina, L-cisteína, L- asparagina, y L-tirosina, respectivamente.
Como se usa aquí, el término "sujeto" significa mamíferos humanos y no humanos tales como primates, gatos, perros, cerdos, ganado vacuno, ovejas, cabras, caballos, conejos, ratas, ratones y similares.
Como se usa aquí, el término "profármaco" significa un compuesto que puede ser convertido bajo condiciones fisiológicas o por solvólisis a un compuesto biológicamente activo de la presente invención. Por lo tanto, el término "profármaco" se refiere a un precursor de un compuesto de la invención que es farmacéuticamente aceptable. Un profármaco puede ser inactivo o puede desplegar actividad limitada cuando se administra a un sujeto que necesita el mismo, pero es convertido in vivo a un compuesto activo de la presente invención. Típicamente, los profármacos son transformados in vivo para dar el compuesto de la invención, por ejemplo, por hidrólisis en la sangre u otros órganos por procesamiento enzimático. El compuesto de profármaco a menudo ofrece ventajas de solubilidad, compatibilidad de tejido o liberación retardada en el sujeto (véase, Bundgard, H., Design of Prodrugs (1985), pp. 7-9, 21-24 (Elsevier, Amsterdam). La definición de profármaco incluye cualesquiera vehículos covalentemente unidos que liberan el compuesto activo de la invención in vivo cuando dicho profármaco se administra a un sujeto. Los profármacos de un compuesto de la presente invención se pueden preparar modificando los grupos funcionales presentes en el compuesto de la invención de tal manera que las modificaciones son digeridas, ya sea en manipulación de rutina o in vivo, a un compuesto progenitor de la invención. Como se usa aquí, el término "vehículo, díluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable" significa, sin limitación, cualquier adyuvante, vehículo, excipiente, resbalante, agente edulcorante, diluyente, conservador, tinte/colorante, incrementador de sabor, agente tensoactivo, agente humectante, agente dispersante, agente de suspensión, estabilizador, agente isotónico, solvente, emulsionante o agente encapsulante, tal como un liposoma, ciclodextrinas, sistemas de suministro poliméricos encapsulantes o matriz de polietilenglicol, que es aceptable para usarse en el sujeto, preferiblemente humanos. Como se usa aquí, el término "sal farmacéuticamente aceptable" significa sales de adición tanto acidas como básicas. Como se usa aquí, el término "sal de adición ácida farmacéuticamente aceptable" significa aquellas sales que retienen la efectividad y propiedades biológicas de las bases libres, que no son biológicamente o de otra manera no deseables, y que se forman con ácidos inorgánicos tales como ácido clorhídrico, ácido bromhídrico, ácido sulfúrico, ácido nítrico, ácido fosfórico y similares, y ácidos orgánicos tales como ácido acético, ácido trifluoroacético, ácido propiónico, ácido glicólico, ácido pirúvico, ácido oxálico, ácido maleico, ácido malónico, ácido succínico, ácido fumárico, ácido tartárico, ácido cítrico, ácido benzoico, ácido cinámico, ácido mandélico, ácido metansulfónico, ácido etansulfónico, ácido p-toluensulfónico, ácido salicilico y similares. Como se usa aquí, el término "sal de adición básica farmacéuticamente aceptable" significa aquellas sales que retienen la efectividad y propiedades biológicas de los ácidos libres, que no son biológicamente o de otra manera no deseables. Estas sales se preparan a partir de la adición de una base inorgánica o una base orgánica al ácido libre. Las sales derivadas de bases inorgánicas incluyen, pero no se limitan a, las sales de sodio, potasio, litio, amonio, calcio, magnesio, hierro, zinc, cobre, manganeso, aluminio y similares. Las sales derivadas de bases orgánicas incluyen, pero no se limitan a, sales de aminas primarias, secundarias y terciarias, las aminas sustituidas incluyendo aminas sustituidas que ocurren naturalmente, aminas cíclicas y resinas de intyercambio de iones básicas, tales como isopropilamina, trimetilamina, dietilamina, trietilamina, tripropilamina, ethanolamina, 2-dimetilaminoetanol, 2-dietilaminoetanol, diciclohexilamina, lisina, arginina, histidina, cafeína, procaína, hidrabamina, colina, betaína, etilendiamina, glucosamina, metilglucamina, teobromo, purines, piperazina, piperidina, N-etilpiperidina, resinas de poliamina y similares. Como se usa aquí, el término "unión de dominio a BIR" significa la acción de un compuesto de la presente invención bajo un dominio de BIR de IAP, que bloquea o disminuye la unión de proteínas de unión de lAPs a BIR o está implicado en el desplazamiento de proteínas de unión a BIR de un IAP. Ejemplos de proteínas de unión a BIR incluyen, pero no se limitan a, caspasas y proteínas de unión a BIR mitocondrialmente derivadas tales como Smac, Omi/WTR2A y similares. Como se usa aquí, el término "apoptosis insuficiente" significa un estado en donde una enfermedad es causada o continúa debido a que las células deletéreas al sujeto no han sufrido apoptosis. Esta incluye, pero no se limita a, células cancerosas que sobreviven en un sujeto sin tratamiento, células cancerosas que sobreviven en un sujeto durante o después de tratamiento anti-cáncer, o células inmunes cuya acción es deletérea al sujeto, e incluye, neutrófilos, monocitos y células T auto-reactivas. Como se usa aquí, el término "cantidad terapéuticamente efectiva" significa una cantidad de un compuesto de la fórmula I que, cuando se administra a un sujeto es suficiente para efectuar el tratamiento para un estado de enfermedad asociado con apoptosis insuficiente. La cantidad del compuesto de la fórmula I variará dependiendo del compuesto, la condición y su severidad, y la edad del sujeto que se ha de tratar, pero puede ser determinada rutinariamente por un experto en la técnica con respecto a su conocimiento y a esta descripción. Como se usa aquí, el término "tratar" o "tratamiento" significa tratamiento de un estado de enfermedad asociado con apoptosis insuficiente, como se describe aquí, en un sujeto, y incluye: (i) previniendo una enfermedad o condición asociada con apoptosis insuficiente de que ocurra en un sujeto, en particular, cuando dicho mamífero está predispuesto a la enfermedad o condición pero que no se ha diagnosticado que la tenga; (ii) inhibir una enfermedad o condición asociada con apoptosis insuficiente, es decir, detener su desarrollo; o (iii) aliviar una enfermedad o condición asociada con apoptosis insuficiente, es decir, causando regresión de la condición. Como se usa aquí, el término "tratamiento de cáncer" significa la administración de una composición farmacéutica de la presente invención a un sujeto, preferiblemente un humano, que es afectado con cáncer para causar un alivio del cáncer al matar, inhibir el crecimiento, o inhibir la metástasis de las células cancerosas. Como se usa aquí, el término "prevención de enfermedad" significa, en el caso de cáncer, la administración post-quirúrgica, post- quimioterapia o post-radioterapia de una composición farmacéutica de la presente invención a un sujeto, preferiblemente un humano, que fue afectado con cáncer para prevenir el recrecimiento del cáncer al matar, inhibir el crecimiento, o inhibir la metástasis de cualesquiera células cancerosas restantes. En esta definición también se incluye la prevención de condiciones de pro-supervivencia que conduzcan a enfermedades tales como asma, MS y similares. Como se usa aquí, el término "apoptosis" o "muerte celular programada" significa el proceso regulado de muerte celular en donde una célula moribunda despliega un conjunto de marcas bioquímicas bien caracterizadas que incluyen formación de burbujas en la membrana celular, encogimiento del soma celular, condensación de cromatina y formación de escalera del ADN, así como cualquier muerte celular mediada por caspasa. Como se usa aquí, el término "dominio de BIR" o "BIR" se usan indistintamente a lo largo de la descripción y significan un dominio que se caracteriza por un número de residuos de aminoácidos invariable incluyendo cisternas conservadas y un residuo de hisitidina conservada dentro de la secuencia Cys-(Xaa1 )2Cys-(Xaa1 )i6His-(Xaa1 )6-8Cys. Típicamente, la secuencia de aminoácidos de la secuencia de consenso es: Xaa1-Xaa1-Xaa1 -Arg-Leu-Xaa 1 -Thr-Phe-Xaa 1 -Xaa 1 -Trp-Pro-Xaa2-Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa2-Xaa2-Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Leu-Ala-Xaa 1 -Ala-Gly-Phe-Tyr-Tyr-Xaa 1 -Gly-Xaa 1 -Xaa1-Asp-Xaa1 -Val-Xaa1 -Cys-Phe-Xaa1 -Cys-Xaa1 -Xaa1-Xaa1-Xaa1 -Xaal-Xaa 1 -Trp-Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Asp-Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -His-Xaa-1 - Xaa1-Xaa1 -Xaa1-Pro-Xaa1-Cys-Xaa1-Phe-Val, en donde Xaa1 es cualquier aminoácido y Xaa2 es cualquier aminoácido o está ausente. Preferiblemente, la secuencia es sustancialmente idéntica a una de las secuencias de dominio de BIR provistas para XIAP, HIAP1 o HIAP2 aquí. Los residuos de dominio de BIR se listan más adelante (véase Genome Biology (2001 )1-10): Como se usa aquí, el término "dedo de zinc de tipo RING" o "RZF" significa un dominio que tiene la secuencia de aminoácidos de la secuencia de consenso: Glu-Xaa1-Xaa1-Xaa1 -Xaa1 -Xaa1- Xaa-1-Xaa2-Xaa1-Xaa 1 -Xaa 1 -Cys-Lys-Xaa3-Cys-Met-Xaa1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa3-X-aa 1 -Phe-Xaa 1 -Pro-Cys-Gly-His-Xaa 1 -Xaa 1 -Xaa 1 -Cys-Xaa 1 -Xaa 1 -Cys-Ala-Xaa1 -Xaa-1-Xaa1 -Xaa1-Xaa1-Cys-Pro-Xaa1-Cys, en donde Xaa1 es cualquier aminoácido, Xaa2 es Glu o Asp, y Xaa3 es Val o He. Como se usa aquí, el término "IAP" significa un polipéptido o proteína, o fragmento de la misma, codificada por un gen de IAP. Ejemplos de lAPs incluyen, pero no se limitan a NAIP humano o de ratón (Birc 1 ), HIAP-1 (clAP2, Birc 3), HIAP-2 (clAP1 , Birc 2), XIAP (Birc 4), survivin (Birc 5), livin (ML-IAP, Birc 7), ILP-2 (Birc 8) y Apollon/BRUCE (Birc 6) (véase, por ejemplo, patentes de E.U.A. números 6,107,041 ; 6,133,437; 6,156,535; 6,541 ,457; 6,656,704; 6,689,562; Deveraux y Reed, Genes Dev. 13, 239-252, 1999; Kasof y Gomes, J. Biol. Chem., 276, 3238-3246, 2001 ; Vucico et al., Curr. Biol. 10, 1359-1366, 2000; Ashab et al. FEBS Lett., 495, 56-60, 2001 , cuyos contenidos se incorporan aquí por referencia). Como se usa aquí, el término "gen de IAP" significa un gen que codifica un polipéptido que tiene por lo menos un dominio de BIR y que es capaz de modular (inhibir o incrementar) apoptosis en una célula o tejido. El gen de IAP es un gen que tiene aproximadamente 50% o más de identidad de secuencia de núcleótidos para por lo menos uno de NAIP humano o de ratón (Birc 1), HIAP- (clAP2, Birc 3), HIAP-2 (clAP1 , Birc 2), XIAP (Birc 4), survivin (Birc 5), livin (ML-IAP, Birc 7), ILP-2 (Birc 8) y Apollon/BRUCE (Birc 6). La región de secuencia sobre cuya identidad se mide es una región que codifica por lo menos un dominio de BIR y un dedo de zinc de dominio de tipo RING.
Los genes de IAP de mamífero incluyen secuencias de núcleótidos aisladas de cualquier fuente de mamífero. Como se usa aquí, el término "CI5o" significa una cantidad, concentración o dosis de un compuesto particular de la presente invención que logra un 50% de inhibición de una respuesta máxima, tal como desplazamiento de unión de sonda fluorescente máxima en una prueba que mide dicha respuesta. Como se usa aquí, el término "CE50" significa una cantidad, concentración o dosis de un compuesto particular de la presente invención que logra un 50% de inhibición de supervivencia de células. Como se usa aquí, el término "modular" o "modulación" significa el tratamiento, prevención, supresión, incremento o inducción de una función o condición usando los compuestos de la presente invención. Por ejemplo, los compuestos de la presente invención pueden modular la función de IAP en un sujeto, incrementando asi la apoptosis al reducir significativamente, o eliminar esencialmente la interacción de proteínas apoptóticas activadas, tales como caspasa-3, 7 y 9, con los dominios de BIR de lAPs de mamífero o al inducir la pérdida de proteína de XIAP en una célula. Como se usa aquí, el término "incremento de apoptosis" significa incremento del número de células que sufren apoptosis en una población de células dada ya sea in vitro o in vivo. Ejemplos de poblaciones de células incluyen, pero no se limitan a, células cancerosas de ovario, células cancerosas de colon, células cancerosas de mama, células cancerosas de pulmón, células cancerosas pancreáticas, o células T y similares. Se apreciará que el grado de incremento de apoptosis provisto por un compuesto incrementador de apoptosis de la presente invención en una prueba dada variará, pero un experto en la técnica puede determinar el cambio estadísticamente significativo en el nivel de apoptosis que identifica un compuesto que incrementa la apoptosis de otra manera limitada por un IAP. Preferiblemente "incremento de apoptosis" significa que el incremento en el número de células que sufren apoptosis es por lo menos 25%, muy preferiblemente el incremento es 50%, y muy preferiblemente el incremento es por lo menos de una vez. Preferiblemente la muestra monitoreada es una muestra de células que normalmente sufren apoptosis insuficiente (es decir, células cancerosas). Los métodos para detectar los cambios en el nivel de apoptosis (es decir, incremento o reducción) se describen en los ejemplos e incluyen métodos que cuantifican la fragmentación de ADN, métodos que cuantifican la translocación de fosfatoilserina del lado citoplásmico al lado extracelular de la membrana, determinación de activación de las caspasas y métodos que cuantifican la liberación de citocromo C y el factor inhibidor de apoptosis en el citoplasma por las mitocondrias. Como se usa aquí, el término "enfermedad proliferativa" o "trastorno proliferativo" significa una enfermedad que es causada por o da por resultado niveles inapropiadamente altos de división celular, niveles inapropiadamente bajos de apoptosis, o ambos. Por ejemplo, cánceres tales como linfoma, leucemia, melanoma, cáncer de ovario, cáncer de mama, cáncer pancreático, y cáncer de pulmón, y trastornos autoinmunes son todos ellos ejemplos de enfermedades proliferativas. Los compuestos de la presente invención, o sus sales farmacéuticamente aceptables pueden contener uno o más centros asimétricos, ejes quirales y planos quirales y por lo tanto pueden dar origen a enantiómeros, diastereómeros, y otras formas estereoisoméricas y se pueden definir en términos de estereoquímica absoluta, tal como (R)- o (S)- o, como (D)- o (L)- para aminoácidos. La presente invención incluye todos los posibles isómeros, asi como, sus formas racémicas y ópticamente puras. Los isómeros ópticamente activos (+) y (-), (R)- y (S)-, o (D)- y (L)- se pueden preparar usando sintonas quirales o reactivos quirales, o resolver usando técnicas convencionales, tales como CLAR de fase inversa. Las mezclas racémicas se pueden preparar y posteriormente separar en isómeros ópticos individuales o estos isómeros ópticos se pueden preparar por síntesis quiral. Los enantiomeros se pueden resolver por métodos conocidos por los expertos en la técnica, por ejemplo por formación de sales diastereoisoméricas que después pueden ser separadas por cristalización, cromatografía de gas-líquidos o de líquidos, reacción selectiva de un enantiomero con un reactivo específico de enantiomero. Los expertos en la técnica también apreciarán que en donde el enantiomero deseado es convertido a otra entidad química por una técnica de separación, un paso adicional se requiere después para formar la forma enantiomérica deseada. Los enantiomeros alternativamente específicos pueden ser sintetizados por síntesis asimétrica usando reactivos ópticamente activos, sustratos, catalizadores o solventes o convirtiendo un enantiomero a otro por transformación asimétrica. Ciertos compuestos de la presente invención pueden existir en forma zwitteriónica y la presente invención incluye formas zwitteriónicas de estos compuestos y mezclas de los mismos.
Utilidades Los compuestos de la presente invención son útiles como compuestos de unión a dominio de BIR de IAP y como tales los compuestos, composiciones y método de la presente invención incluyen la aplicación a las células o sujetos afectados con o que tienen una predisposición hacia el desarrollo de un estado de enfermedad particular, que se caracteriza por apoptosis insuficiente. Por lo tanto, los compuestos, composiciones y métodos de la presente invención se usan para tratar enfermedades/trastornos proliferativos celulares, que incluyen, pero no se limitan a, i) cáncer, ii) enfermedad autoinmune, iii) trastornos inflamatorios, iv) procedimientos postmédicos inducidos por proliferación, incluyendo, pero sin limitarse a, cirugía, angioplastia y similares. Los compuestos de la presente invención también pueden ser útiles como agentes antiulcerosos. La regulación descendente del sistema TRAIL (ligando inductor de apoptosis relacionado con FNT), en el contexto de infección por H. pylori, puede limitar la apoptosis exagerada de células epiteliales gástricas y destrucción de tejido y, por lo tanto, pueden permitir que H. pylori mantenga su nicho, por lo que los compuestos de la presente invención pueden ser útiles en el tratamiento de infección bacteriana y/o infección recurrente que puede haberse desarrollado debido a la regulación descendente del sistema TRAIL, (véase Nou et al. J. Infectious Diseases (2005) 571-8). Los compuestos de la presente invención también pueden ser útiles en el tratamiento de varicosis primaria. Los datos sugieren (véase Ducass et al. Eur. J. Vase. Endovac. Surg (2005) 316-323) que las venas varicosas primarias están asociadas con inhibición de muerte celular programada que implica el defecto en la vía apoptótica intrínseca. Por lo tanto, la unión de compuestos de unión a dominio deBIR de la presente invención puede ser útil en el tratamiento de esta patología. Los compuestos de la presente invención también pueden ser útiles en el tratamiento de enfermedades en las cuales hay un defecto en la muerte celular programada o la maquinaria apoptótica (TRAIL, FAS, apoptosoma), tal como esclerosis múltiple, asma, arterosclerosis, inflamación, autoinmunidad y similares. El tratamiento implica la administración a un sujeto que necesita el mismo de un compuesto de la presente invención o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, o una composición farmacéutica que comprende un vehículo farmacéutico y una cantidad terapéuticamente efectiva de un compuesto de la presente invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En particular, los compuestos, composiciones y métodos de la presente invención son útiles para el tratamiento de cáncer incluyendo tumores sólidos tales como carcinomas de la piel, mama, cerebro, pulmón, testicular y similares. Los cánceres que pueden ser tratados por los compuestos, composiciones y métodos de la invención incluyen, pero no se limitan a los siguientes: Tejido Ejemplo Glándula neuroblastoma suprarrenal Hueso Sarcoma osteogénico (osteosarcoma), fibrosarcoma, histocitoma fibroso maligno, condrosarcoma, sarcoma de Ewing, linfoma maligno (sarcoma de retículo endoplásmico), mieloma múltiple, condroma de células gigantes malignas, osteocronfroma (exostosis osteocartilaginosa), condroma benigno, condroblastoma, condromixofibroma, osteoma osteoide y tumores de células gigantes Cardiaco sarcoma (angiosarcoma, fibrosarcoma, rabdomiosarcoma, liposarcoma), mixoma, rabdomioma, fibroma, lipoma y teratoma Gastrointestinal esófago (carcinoma de células escamosas, adenocarcinoma, leiomiosarcoma, linfoma), estómago (carcinoma, linfoma, leiomiosarcoma), páncreas (adenocarcinoma ductal, insulinoma, glucagonoma, gastrinoma, tumores carcinoides, vipoma), intestino delgado (adenocarcinoma, linfoma, tumores carcinoides, sarcoma de Karposi, leiomioma, hemangioma, lipoma, neurofibroma, fibroma), intestino grueso (adenocarcinoma, adenoma tubular, adenoma velloso, hamartoma, leiomioma) Tracto riñon (adenocarcinoma, tumor de Wilm [nefroblastoma], genitourinario linfoma, leucemia), vejiga y uretra (carcinoma de células escamosas, carcinoma de células transicionales, adenocarcinoma), próstata (adenocarcinoma, sarcoma), testículos (seminoma, teratoma, carcinoma embrionario, teratocarcinoma, coriocarcinoma, sarcoma, carcinoma de células intersticiales, fibroma, fibroadenoma, tumores adenomatoides, lipoma) Ginecológico útero (carcinoma endometrial), cuello uterino (carcinoma cervical, displasia cervical de pre-tumor), ovarios (carcinoma de ovario [cistadenocarcinoma seroso, cistadenocarcinoma mucinoso, carcinoma no clasificado], tumores de granulosa-células fecales, tumores de células de Sertoli-Leydig, disgerminoma, teratoma maligno), vulva (carcinoma de células escamosas, carcinoma intraepitelial, adenocarcinoma, fibrosarcoma, melanoma), vagina (carcinoma de células claras, carcinoma de células escamosas, sarcoma botrioide (rabdomiosarcoma embrionario), trompas de Falopio (carcinoma) Hematológico sangre (leucemia mieloide [aguda y crónica], leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfocítica crónica, enfermedades mieloproliferativas, mieloma múltiple, síndrome mielodisplásico), enfermedad de Hodgkin, linfoma no Hodgkin [linfoma maligno] Hígado hepatoma (carcinoma hepatocelular), colangiocarcinoma, hepatoblastoma, angiosarcoma, adenoma hepatocelular, hemangioma Pulmón Carcinoma broncogénico (célula escamosa, célula pequeña indiferenciada, célula grande indiferenciada, adenocarcinoma), carcinoma alveolar (bronquiolar), adenoma bronquial, sarcoma, linfoma, hamartoma condromatoso, mesotelioma Sistema Cráneo (osteoma, hemangioma, granuloma, xantoma, nervioso osteítis deformans), meninges (meningioma, meningiosarcoma, gliomatosis), cerebro (astrocitoma, meduloblastoma, glioma, ependimoma, germinoma [pinealoma], glioblastoma multiforme, olígodendroglioma, schwannoma, retinoblastoma, tumores congénitos), neurofibroma de médula espinal, meningioma, glioma, sarcoma) Piel Melanoma maligno, carcinoma de células básales, carcinoma de células escamosas, sarcoma de Karposi, molas, nevos displásicos, lipoma, angioma, dermatofibroma, queloides Los compuestos de la presente invención, o sus sales farmacéuticamente aceptables o sus profármacos, se pueden administrar en forma pura o en una composición farmacéutica apropiada, y se pueden llevar a cabo mediante cualquiera de los modos aceptados de práctica farmacéutica galénica.
Las composiciones farmacéuticas de la presente invención se pueden preparar mezclando un compuesto de la presente invención con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable apropiado, y se pueden formular en preparaciones en formas sólida, semi-sólida, líquida o gaseosa, tales como tabletas, cápsulas, polvos, gránulos, pomadas, soluciones, supositorios, inyecciones, inhalantes, geles, microesferas y aerosoles. Las vías típicas de administrar dichas composiciones farmacéuticas incluyen, sin limitación, oral, tópica, transdérmica, inhalación, parenteral (inyecciones subcutáneas, intravenosa, intramuscular, inyección intraesternal o técnicas de infusión), sublingual, ocular, rectal, vaginal e intranasal. Las composiciones farmacéuticas de la presente invención se formulan para permitir los ingredientes activos contenidos en las mismas que han de estar biodisponibles bajo administración de la composición a un sujeto. Las composiciones que serán administradas a un sujeto o paciente adoptan la forma de una o más unidades de dosis, en donde por ejemplo, una tableta puede ser una unidad de dosis individual, y un contenedor de un compuesto de la presente invención en forma de aerosol puede contener una pluralidad de unidades de dosis. Los métodos reales de preparación de dichas formas de dosis son conocidas, o serán evidentes, para los expertos en la técnica; por ejemplo, véase Remington's Pharmaceutical Sciences, 18a. Ed., (Mack Publishing Company, Easton, Pa., 1990). La composición que se ha de administrar, en cualquier caso, contendrá una cantidad terapéuticamente efectiva de un compuesto de la presente invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para tratamiento de un estado de enfermedad como se describió antes. Una composición farmacéutica de la presente invención puede estar en forma de un sólido o líquido. En un aspecto, los vehículos) son partículas, de modo que las composiciones están, por ejemplo, en forma de tableta o polvo. Los vehículos pueden ser líquidos, con las composiciones siendo, por ejemplo, un jarabe oral, líquido inyectable o un aerosol, que es útil, por ejemplo, en administración inhaladora. Para administración oral, la composición farmacéutica es preferiblemente ya sea en forma sólida o líquido, en donde las formas semi-sólida, semi-líquida, suspensión y de gel se incluyen dentro de las formas consideradas aquí ya sea como sólido o líquido. Como una composición sólida para administración oral, la composición farmacéutica puede ser formulada en un polvo, gránulo, tableta comprimida, pildora, cápsula, goma de mascar, oblea o forma similar. Dicha composición sólida típicamente contendrá uno o más diluyentes inertes o vehículos comestibles. Además, uno o más de los siguientes pueden estar presentes: aglutinantes tales como carboximetilcelulosa, etilcelulosa, celulosa microcristalina, goma tragacanto o gelatina; excipientes tales como almidón, lactosa o dextrinas, agentes desintegrantes tales como ácido algínico, alginato de sodio, Primogel, almidón de maíz y similares; lubricantes tales como estearato de magnesio o Sterotex; resbalantes tales como dióxido de silicio coloidal; agentes edulcorantes tales como sacarosa o sacarina; un agente saborizante tal como menta, salicilato de metilo o saborizante de naranja; y un agente colorante. Cuando la composición farmacéutica está en forma de una cápsula, v.gr., una cápsula de gelatina, puede contener, además de materiales del tipo anterior, un vehículo liquido tal como polietilenglicol o aceite tal como aceite de soya o aceite vegetal. La composición farmacéutica puede estar en forma de un liquido, v.gr., un elíxir, jarabe, solución, emulsión o suspensión. El líquido puede ser para administración oral o para suministro por inyección, como dos ejemplos. Cuando se diseña para administración oral, la composición preferida contiene, además de los presentes compuestos, uno o más de un agente edulcorante, conservadores, tinte/colorante e incrementador de sabor. En una composición diseñada para ser administrada por inyección, uno o más de un agente tensoactivo, conservador, agente humectante, agente dispersante, agente de suspensión, regulador de pH, estabilizados y agente isotónico puede ser incluido. Las composiciones farmacéuticas líquidas de la presente invención, ya sean soluciones, suspensiones u otras formas similares, pueden incluir uno o más de los siguientes adyuvantes: diluyentes estériles tales como agua para inyección, solución salina, preferiblemente solución salina fisiológica, solución de Ringer, cloruro de sodio isotónico, aceites fijados tales como mono- o diglicéridos sintéticos que pueden servir como el solvente o medio de suspensión, polietilenglicoles, glicerina, propilenglicol u otros solventes; agentes antibacterianos tales como alcohol bencílico o metilparabeno; antioxidantes tales como ácido ascórbico o bisulfito de sodio; agentes quelatadores tales como ácido etilendiaminotetraacético; reguladores de pH tales como acetatos, citratos o fosfatos y agentes para el ajuste de tonicidad tal como cloruro de sodio o dextrosa. Los agentes de solubilización pueden incluir ciclodextrinas tales como hidroxipropil-beta-ciclodextrina. La preparación parenteral puede ser encerrada en ampolletas, jeringas desechables o frascos de dosis múltiples hechos de vidrio o plástico. Una composición farmacéutica inyectable es preferiblemente estéril. Una composición farmacéutica líquida de la presente invención usada ya sea para administración parenteral u oral contendría una cantidad de un compuesto de la presente invención de tal manera que obtendrá una dosis adecuada. Típicamente, esta cantidad es por lo menos 0.01 % de un compuesto de la presente invención en la composición. Cuando está diseñada para administración oral, esta cantidad se puede variar para que sea entre 0.1 y aproximadamente 70% del peso de la composición. Para el uso parenteral, composiciones y preparaciones de conformidad con la presente invención se preparan de manera que una unidad de dosis parenteral contiene entre 0.01 a 1 % en peso del compuesto de la presente invención. La composición farmacéutica de la presente invención se puede usar para la administración tópica, en cuyo caso el vehículo puede comprender adecuadamente una solución, emulsión, pomada o base de gel. La base, por ejemplo, puede comprender uno o más de los siguientes: petrolato, lanolina, polietilenglicoles, cera de abeja, aceite mineral, diluyentes tales como agua y alcohol, y emulsionantes y estabilizadores. Los agentes espesantes pueden estar presentes en una composición farmacéutica para administración tópica. Sí está diseñada para administración transdérmica, la composición puede incluir un parche transdérmico o dispositivo de iontoforesis. Las formulaciones tópicas pueden contener una concentración del compuesto de la presente invención de aproximadamente 0.1 a aproximadamente 10% p/v (peso por volumen unitario). La composición farmacéutica de la presente invención se puede usar para administración rectal para tratar por ejemplo, cáncer de colon, en forma, v.gr., de un supositorio, que se derretirá en el recto y liberará el fármaco. La composición para administración rectal puede contener una base oleaginosa como un excipiente no irritante adecuado. Dichas bases incluyen, sin limitación, lanolina, manteca de cacao y polietilenglicol. La composición farmacéutica de la presente invención puede incluir varios materiales, que modifican la forma física de una unidad de dosis sólida o líquida. Por ejemplo, la composición puede incluir materiales que forman una coraza de revestimiento alrededor de los ingredientes activos. Los materiales que forman la coraza de revestimiento son típicamente inertes, y se pueden seleccionar de, por ejemplo, azúcar, laca y otros agentes de revestimiento entérico. Alternativamente, los ingredientes activos pueden ser contenidos en una cápsula de gelatina. La composición farmacéutica de la presente invención en forma sólida o líquida puede incluir un agente que se une al compuesto de la presente invención y ayuda así en el suministro del compuesto. Agentes adecuados que pueden actuar en esta capacidad incluyen, pero no se limitan a, un anticuerpo monoclonal o policlonal, una proteína o un liposoma.
La composición farmacéutica de la presente invención puede consistir de unidades de dosis que se pueden administrar como un aerosol. El término aerosol se usa para denotar una variedad de sistemas que varían de aquellos de naturaleza coloidal a sistemas que consisten de paquetes presurizados. El suministro puede ser por un gas licuado o comprimido o por un sistema de bomba adecuado que suministra los ingredientes activos. Los aerosoles de compuestos de la presente invención se pueden suministrar en sistemas de una sola fase, bifásicos o trifásicos a fin de suministrar los ingredientes activos. El suministro del aerosol incluye el contenedor, activadores, válvulas, subcontenedores necesarios, y similares, que juntos pueden formar un equipo. Un experto en la técnica, sin experimentación extraordinaria puede determinar aerosoles preferidos. Las composiciones farmacéuticas de la presente invención se pueden preparar por metodología bien conocida en la técnica farmacéutica. Por ejemplo, una composición farmacéutica diseñado para ser administrado por inyección puede ser preparado mezclando un compuesto de la presente invención con estéril, agua destilada para formar una solución. Un agente tensoactivo se puede añadir para facilitar la formación de una solución o suspensión homogénea. Los agentes tensoactivos son compuestos que interactúan no covalentemente con el compuesto de la presente invención para facilitar la disolución o suspensión homogénea del compuesto en el sistema de suministro acuoso. Los compuestos de la presente invención, o sus sales farmacéuticamente aceptables, se administran en una cantidad terapéuticamente efectiva, que variará dependiendo de una variedad de factores incluyendo la actividad del compuesto específico utilizado; La estabilidad metabólica y duración de acción del compuesto, la edad, peso corporal, salud general, sexo, y dieta del paciente; el modo y tiempo de administración; la velocidad de excreción; la combinación de fármaco; la severidad del trastorno o condición particular; y el sujeto que recibe la terapia. Generalmente, una dosis diaria terapéuticamente efectiva puede ser de aproximadamente 0.1 mg a aproximadamente 40 mg/kg de peso corporal por día o dos veces al día de un compuesto de la presente invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
Terapia de combinación Los compuestos de la presente invención, o sales farmacéuticamente aceptables de los mismos, también se pueden administrar simultáneamente con, antes o después de la administración de uno o más de los agentes terapéuticos descritas más adelante. Dicha terapia de combinación puede incluir administración de una formulación de dosis farmacéutica individual que contiene un compuesto de la presente invención y uno o más agentes adicionales dadas más adelante, así como administración del compuesto de la presente invención y cada uno de agente adicional en su propia formulación de dosis farmacéutica separada. Por ejemplo, un compuesto de la presente invención y otro agente therapeutico se puede administrar al paciente y sea juntos en una composición de dosis individual tal como una tableta o cápsula, o cada agente administrada en formulaciones de dosis oral separadas o mediante inyección intravenosa. En donde se usan formulaciones de dosis separadas, los compuestos de la presente invención y uno o más agentes adicionales se pueden administrar esencialmente al mismo tiempo, es decir, concurrentemente, o en tiempos separadamente escalonados, es decir, secuencialmente; la terapia de combinación se entiende que incluye todos estos regímenes. Por lo tanto, la presente invención también abarca el uso de los compuestos de la presente invención en combinación con terapia de radiación o uno o más agentes adicionales tales como aquellos descritos en WO 03/09921 1 (PCT/US03/15861 ), que se incorpora aquí por referencia. Ejemplos de dichos agentes terapéuticos adicionales incluyen, pero no se limitan a los siguientes: a) un modulador de receptor de estrógeno, b) un modulador de receptor de andrógeno, c) un modulador de receptor de retinoide, d) un agente citotóxico, e) un agente antiproliferativo, f) un inhibidor de prenil-proteína transferasa, g) un inhibidor de HMG-CoA reductasa, h) un inhibidor de proteasa de VIH, i) un inhibidor de transcriptasa inversa, k) un inhibidor de angiogénesis, I) un agonista de PPAR-?, m) un agonista de PPAR-d, n) un inhibidor de resistencia a fármacos múltiples inherente, o) un agente antiemético, p) un agente útil en el tratamiento de anemia, q) agentes útiles en el tratamiento de neutropenia, r) un fármaco inmunológico-incrementador. s) un inhibidor de proteosoma tal como Velcade y MG132 (7-Leu-Leu-aldehido) (véase He et al. en Oncogene (2004) 23, 2554-2558); t) un inhibidor de HDCA, tal como butirato de sodio, butirato de fenilo, ácidos hidroámicos, tetrapéptido de ciclina y similares (véase Rosato et al., Molecular Cáncer Therapeutics 2003, 1273-1284); u) un inhibidor de la actividad similar a quimiotripsina en el proteosoma; y v) inhibidores de E3 ligasa. De manera más específica, los compuestos de la presente invención también se pueden usar en combinación con uno o más agentes quimioterapéuticos que alteran o estabilizan microtúbulos y son particularmente efectivos en el tratamiento de cáncer y otros neopolasmas. Los agentes alteradores de microtúbulos (v.gr., alcaloides de vinca) y agentes estabilizadores de microtúbulos (v.gr., taxanos) se describen con mayor detalle más adelante.
Alcaloides de vinca y compuestos relacionados Los alcaloides de vinca que se pueden usar en combinación con los oligómeros de nucleobase de la invención para tratar cáncer y otros neoplasmas incluyen vincristina, vinblastina, vindesina, vinflunina, vinorelbina, y anhidrovinblastina. Las dolastatinas son oligopéptidos que interfieren principalmente con tubulina en el dominio de unión de alcaloide de vinca. Estos compuestos también se pueden usar en combinación con los compuestos de la invención para tratar cáncer y otros neoplasmas. Las dolastatinas incluyen dolastatina-10 (NCS 376128), dolastatina-15, ILX651 , TZT-1027, simplostatina 1 , simplostatina 3, y LU 103793 (cemadotina). Las criptoficinas (v.gr., criptoficina 1 y criptoficina 52 (LY355703)) unen la tubulina dentro del dominio de unión de alcaloide de vinca e inducen detención de G2/M y apoptosis. Cualquiera de estos compuestos se puede usar en combinación con los compuestos de la invención para tratar cáncer y otros neoplasmas. Otros compuestos que alteran los microtúbulos que se pueden usar junto con los compuestos de la invención para tratar cáncer y otros neoplasmas se describen en las patentes de E.U.A. Nos. 6,458,765; 6,433,187; 6,323,315; 6,258,841 ; 6, 143,721 ; 6,127,377; 6, 103,698; 6,023,626; 5,985,837; 5,965,537; 5,955,423; 5,952,298; 5,939,527; 5,886,025; 5,831 ,002; 5,741 ,892; 5,665,860; 5,654,399; 5,635,483; 5,599,902; 5,530,097; 5,521 ,284; 5,504, 191 ; 4,879,278; y 4,816,444, y publicaciones de solicitude de patente de E.U.A. Nos. 2003/0153505 A1 ; 2003/0083263 A1 ; y 2003/0055002 A1 , cada uno de los cuales se incorpora aquí por referencia.
Taxanos y otros compuestos estabilizadores de microtúbulos Los taxanos tales como paclitaxel, doxetaxel, RPR 109881 A, SB-T- 213, SB-T-1250, SB-T-10 187, B S-275183, BRT 216, DJ-927, MAC-321 , IDN5109 y IDN5390 se puede usar en combinación con los compuestos de la invención para tratar cáncer y otros neoplasmas. Los análogos de taxano (v.gr., BMS-184476, BMS- 188797) y no taxanos funcionalmente relacionados (v.gr., epotilonas (v.gr., epotilona A, epotailona B (EPO906), desoxiepotilona B, y epotilona B lactama (BMS-247550)), eleuterobina, discodermolida, 2-epi-discodermolida, 2-des-metildiscodermolida, 5-hidroximetildiscoder-molida, 19-des-aminocarbonildiscodermolida, 9(13)-ciclodiscodermolida, y laulimalide) también se puede usar en los métodos y composiciones de la invención. Otros compuestos estabilizadores de microtúbulos que se pueden usar en combinación con los compuestos de la invención para tratar cáncer y otros neoplasmas se describen en patentes de E.U.A. Nos. 6,624,317; 6,610,736; 6,605,599; 6,589,968; 6,583,290; 6,576,658; 6,515,017; 6,531 ,497; 6,500,858; 6,498,257; 6,495,594; 6,489,314; 6,458,976; 6,441 ,186; 6,441 ,025; 6,414,015; 6,387,927; 6,380,395; 6,380,394; 6,362,217; 6,359, 140; 6,306,893; 6,302,838; 6,300,355; 6,291 ,690; 6,291 ,684; 6,268,381 ; 6,262, 107; 6,262,094; 6, 147,234; 6, 136,808; 6, 127,406; 6,100,41 1 ; 6,096,909; 6,025,385; 6,011 ,056; 5,965,718; 5,955,489; 5,919,815; 5,912,263; 5,840,750; 5,821 ,263; 5,767,297; 5,728,725; 5,721 ,268; 5,719, 177; 5,714,513; 5,587,489; 5,473,057; 5,407,674; 5,250,722; 5,010,099; y 4,939, 168; y publicación de solicitud de patente de E.UA Nos. 2003/0186965 A1 ; 2003/0176710 A1 ; 2003/0176473 A1 ; 2003/0144523 A1 ; 2003/0134883 A1 ; 2003/0087888 A1 ; 2003/0060623 A1 ; 2003/004571 1 A1 ; 2003/0023082 A1 ; 2002/0198256 A1 ; 2002/0193361 A1 ; 2002/0188014 A1 ; 2002/0165257 A1 ; 2002/01561 10 A1 ; 2002/0128471 A1 ; 2002/0045609 A1 ; 2002/0022651 A1 ; 2002/0016356 A1 ; 2002/0002292 A1 , cada uno de los cuales se incorpora aquí por referencia.
Otros agentes quimioterapéuticos que se pueden administrar con un compuesto de la presente invención se listan en el siguiente cuadro: Agentes Ciclofosfamida Mecloretamina alquilantes lomustina tiotepa busulfan estreptozocina procarbazina clorambucil ifosfamida temozolomida altretamina dacarbazina melfalan semustina fosfato de estramustina carmustina hexametilmelamina Agentes de cisplatin tetraplatin platino carboplatino BBR-3464 (Hoffmann-La oxaliplatin Roche) ZD-0473 (AnorMED) Ormiplatin espiroplatino SM-1 1355 (Sumitomo) lobaplatin (Aeterna) iproplatin carboxiftalatoplatino AP-5280 (Access) satraplatin (Johnson Matthey) Antimetaboli- azacitidina 6-mercaptopurina tos tomudex hidroxiurea gemcitabine 6-tioguanina trimetrexato decitabine (SuperGen) capecitabina citarabin deoxicoformicina clofarabine (Bioenvision) 5-fluorouracilo 2-fluorodeoxi fludarabina citidina floxuridina irofulven (MGI Pharma) pentostatin metotrexato 2-chlorodesoxiadenosina DMDC (Hoffmann-La Roche) raltitrexed idatrexato etinilcitidina (Taiho) Inhibidores amsacrine TAS-103 (Taiho) de topo- rubitecan (SuperGen) Topotecan isomerasa epirubicina elsamitrucin (Spectrum) mesilato de exatecan dexrazoxanet (TopoTarget) (Daiichi) J-107088 (Merck & Co) etopósido pixantrona (Novuspharma) quinamed (ChemGenex) BNP- 350 (BioNumerik) tenipósido o mitoxantrona análogo de rebecamicina gimatecan (Sigma-Tau) (Exelixis) irinotecan (CPT-1 ) CKD-602 (Chong Kun Dang) diflomotecan (Beaufour- BBR-3576 (Novuspharma) Ipsen) KW-2170 (Kyowa Hakko) 7-etil-10-hidroxi-camptotecina Antibióticos dactinomicina (actinomicina Acido bleomicínico anti- D) amonafide idarubicina tumorales doxorubicina (adriamicina) bleomicina A azonafide rubidazona desoxirubicina bleomicina B antrapirazol plicamicinp valrubicina mitomicina C oxantrazol porfiromicina daunorubicina (daunomicina) MEN-10755 (Menarini) losoxantrona cianomorfolinodoxorubicina epirubicina GPX-100 (Gem sulfato de bleomicina Pharmaceuticals) (blenoxano) terarubicina mitoxantrona (novantrona) Agentes paclitaxel RPR 109881 A (Aventis) antimicóticos SB 408075 ZD 6126 (AstraZeneca) (GlaxoSmithKline) docetaxel TXD 258 (Aventis) E7010 (Abbott) PEG-paclitaxel (Enzon) Colchicinas epothilone B (Novartis) PG-TXL (Cell Therapeutics) AZ10992 (Asahi) vinblastina T 900607 (Tularik) IDN 5109 (Bayer) IDN-5109 (Indena) Vincristina T 138067 (Tularik) A 105972 (Abbott) AVLB (Prescient Vinorelbina NeuroPharma) A 204 97 (Abbott) criptoficina 52 (Eli Lilly) Vindesina azaepotilona B (BMS) LU 223651 (BASF) vinflunine (Fabre) dolastatin 10 (NCI) BNP-7787 (BioNumerik) D 24851 (ASTAMedica) auristatin PE (Teikoku rhizoxin (Fujisawa) Hormone) ER-86526 (Eisai) CA-4 profármaco (OXiGENE) mivobulin (Warner-Lambert) BMS 247550 (BMS) combretastatin A4 (BMS) dolastatin-10 (NIH) cemadotin (BASF) BMS 184476(BMS) isohomohalicondrin-B CA-4 (OXiGENE) (PharmaMar) BMS 188797 (BMS) taxoprexin (Protarga) Inhibidores Aminoglutetimida anastrazol de Exemestano YM-51 1 (Yamanouchi) aromatasa Letrozol Formestane atamestano (BioMedicines) Inhibidores pemetrexed (Eli Lilly) ZD-9331 (BTG) de timidilato nolatrexed (Eximias) CoFactor™ (BioKeys) sintasa Antagonistas trabectedin (PharmaMar) albúmina + 32P (soluciones de ADN mafosfamida (Baxter de isótopo) International) O6 bencil guanina (Paligent) glufosfamida (Baxter timectacin (NewBiotics) International) edotreótido (Novartis) apaziquona (Spectrum Pharmaceuticals) Inhibidores arglabin (NuOncology Labs) Alcohol perilílico (DOR de farnesil tipifarnib (Johnson & BioPharma) BAY-43-9006 transferasa Johnson) lonafarnib (Bayer) (Schering-Plough) Inhibidores CBT-1 (CBA Pharma) tariquidar (Xenova) de bomba zosuquidar trihydrochloride dicitrato biricodar (Vértex) (Eli Lilly) MS-209 (Schering AG) Inhibidores tacedinalina (Pfizer) butirato depsipéptido (Fujisawa) de histona de pivaloiloximetil (Titán) MS-275 (Schering AG) acetiltransfera SAHA (Aton Pharma) Inhibidores Neovastat (Aeterna marimastat (British Biotech) de Laboratories) CMT-3 BMS-275291 (Celltech) metalopro- (CollaGenex) teinasa Inhibidores Maltolato de galio (Titán) triapine (Vion) de tezacitabine (Aventis) didox (Moléculas para salud) ribonucleó-sido reductasa Agonistas/ virulizin (Lorus Therapeutics) CDC-394 (Celgene) antagonistas revimid (Celgene) de FNT alfa Antagonista atrasentan (Abbott) ZD-4054 (AstraZeneca) de receptor YM-598 (Yamanouchi) de endotelina Agonistas de fenretinida (Johnson & LGD-1550 (Ligand) receptor de Johnson) alitretinoin (Ligand) ácido retinoico Inmuno- Interferon norelin (Biostar) moduladores Terapia con dexosoma IRX-2 (Immuno-Rx) (Anosys) oncófago BLP-25 (Biomira) (Antigenics) PEP-005 (Peplin Biotech) pentrix (Australian Cáncer MGV (Progenies) Technology) Vacunas de synchrovax (CTL GMK (Progenies) Immuno) ISF-154 (Tragen) beta.-aletina (Dovetail) Vacuna contra vacuna contra melanoma adenocarcinoma (Biomira) (CTL Immuno) terapia de CLL vacuna contra cáncer (Vasogen) (Intercell) vacuna de p21 RAS CTP-37 (A VI BioPharma) (GemVax) Agentes estrógenos bicalutamida hormonales Prednisona propionato de testosterona; y antihormoEstrógenos conjugados fluoximesterona nales metilprednisolona flutamida ethinil estradiol metiltestosterona prednisolona octreótida clortrianisen dietilstilbestrol aminoglutetimida nilutamida idenestrol megestrol leuprólido mitotano tamoxifen caproato de P-04 (Novogen) hidroxiprogesterona Toremofine goserelin 2-metoxiestradiol (EntreMed) medroxiprogesterona dexametasona leuporelin arzoxifeno (Eli Lilly) testosterona Agentes talaporfin (Light Sciences) motexafin foto- Pd-bacteriofeoforbide (Yeda) gadolinio (Pharmacyclics) dinámicos Theralux (Theratechnologies) hipericin lutetio texafirina (Pharmacyclics) Inhibidores imatinib (Novartis) C225 (ImClone) de tirosina kahalide F (PharmaMar) ZD4190 (AstraZeneca) cinasa leflunomida rhu-Mab (Genentech) (Sugen/Pharmacia) ZD6474 (AstraZeneca) CEP-701 (Cephalon) MDX-H210 (Medarex) ZD1839 (AstraZeneca) vatalanib (Novartis) CEP-75 (Cephalon) 2C4 (Genentech) erlotinib (Oncogene Science) PKI 166 (Novartis) MLN518 (Millenium) MDX-447 (Medarex) canertinib (Pfizer) GW2016 (GlaxoSmithKIine) PKC412 (Novartis) ABX-EGF (Abgenix) escualamina (Genaera) EKB-509 (Wyeth) fenoxodiol () IMC-1 C1 1 (ImClone) SU5416 (Pharmacia) EKB-569 (Wyeth) trastuzumab (Genentech) SU6668 (Pharmacia) Agentes diversos SR-27897 (inhibidor de CCK A, gemtuzumab (CD33 antibody, Wyeth Sanofi-Synthelabo) Ayerst) BCX-1777 (inhibidor de PNP, CCI-779 (inhibidor de mTOR cinasa, BioCryst) tocladesine (inhibidores de Wyeth) AMP cíclico, Ribapharm) PG2 (incrementador de ranpirnasa (estimulante de hematopoyesis, Pharmagenesis) ribonucleasa, Alfacell) alvocidib exisulind (inhibidor de PDE V, Cell (inhibidor de CDK, Aventis) Pathways) Immunol™ (enjuague oral galarubicin (inhibidor de síntesis de con triclosan, Endo) ARN, Dong-A) CP-461 (inhibidor de PDE V, Cell CV-247 (inhibidor de COX-2, Ivy Pathways) triacetiluridine (profármaco Medical) tirapazamina (agente de uridina, Wellstat) reductor, SRI International) AG-2037 (inhibidor de GART, Pfizer) P54 (inhibidor de COX-2, SN-4071 (agente contra sarcoma, Phytopharm) Signature BioScience) WX-UK1 N-acetilcísteína (agente reductor, (inhibidor de activador de Zambón) CapCell (estimulante de plasminógeno, Wilex) CYP450, Bavarian Nordic) TransMID-107 .TM. (immunotoxin, R-flurbiprofen (inhibidor de NF- KS Biomedix) kappaB, Encoré) PBI-1402 (estimulante de PMN, GCS-100 (antagonista de gal3, ProMetic LifeSciences) GlycoGenesys) 3CPA (inhibidor de PCK-3145 (promotor de apoptosis, NF-kappaB, Active Biotech) Procyon) bortezomib (inhibidor de Inmunógeno de G17DT (inhibidor de proteosoma, Millennium) gastrina, Aphton) doranidazol (promotor de apoptosis, seocalcitol (agonista de receptor de Pola) vitamina D, Leo) SRL-172 (estimulante de células T, efaproxiral (oxygenator, Allos SR Pharma) CHS-828 (agente Therapeutics) citotóxico, Leo) 131-I-TM-601 (agonista de ADN, TLK-286 (inhibidor de glutation S TransMolecular) transferasa, Telik) PI-88 (inhibidor de heparanasa, Ácido trans-retinoico (diferenciador, Progen) eflornitina (inhibidor de ODC, NIH) ILEX Oncology) PT-100 (agonista de factor de tesmilifeno (antagonista de histamina, crecimiento, Point Therapeutics) YM BioSciences) MX6 (promotor de apoptosis, MAXIA) ácido de minodronico (inhibidor de midostaurina (inhibidor de PKC, osteoclasto, Yamanouchi) Novartis) histamina (agonista de receptor de apomina (promotor de apoptosis, histamina H2, Maxim) ILEX Oncology) briostatin-1 (estimulante de PKC, GPC Biotech) urocidin (promotor de apoptosis, Bioniche) indisulam (estimulante de p53, Eisai) CDA-II (promotor de apoptosis, tiazofurin (inhibidor de IMPDH, Everlife) Ribapharm) aplidina (inhibidor de Ro-31-7453 (promotor de apoptosis, PPT, PharmaMar) La Roche) cilengitide (antagonista de integrina, SDX-101 (promotor de apoptosis, Merck KGaA) Salmedix) brostallicin (apoptosis rituximab (anticuerpo de CD20, promotor, Pharmacia) Genentech) ceflatonina (promotor de apoptosis, SR-31747 (antagonista delL-1 , ChemGenex) Sanofi-Synthelabo) Combinaciones adicionales también pueden incluir agentes que reducen la toxicidad de los agentes antes mencionados, tales como toxicidad hepática, toxicidad neuronal, nefrotoxicidad y similares.
Más aún, los resultados in vitro de los inventores de la presente sugieren que los compuestos de la presente invención pueden funcionar bien con TRAIL. En un ejemplo, la co-administración de uno de los compuestos de la fórmula I de la presente invención con un agonista de receptor de muerte tal como TRAIL, tal como una molécula pequeña o un anticuerpo que simula TRAIL puede causar un efecto sinergístico ventajoso de 2 a 3 logs en potencia. Más aún, los compuestos de la presente invención se pueden usar en combinación con cualesquiera compuestos que causen un incremento en niveles circulantes de TRAIL.
Pruebas de determinación selectiva Los compuestos de la presente invención también se pueden usar en un método para la determinación selectiva de otros compuestos que se unen a un dominio de BIR de IAP. Hablando en términos generales, para usar los compuestos de la invención en un método de identificación de compuestos que se unen a un dominio de BIR de IAP, el IAP se une a un soporte, y un compuesto de la invención se añade a la prueba. Alternativamente, el compuesto de la invención se puede unir al soporte y el IAP se añade. Existe un número de formas en las cuales se determina la unión de un compuesto de la presente invención al dominio de BIR. En una forma, el compuesto de la invención, por ejemplo, puede ser fluorescentemente o radioactivamente marcado y la unión determinada directamente. Por ejemplo, esto se puede hacer atrayendo el IAP a un soporte sólido, añadiendo un compuesto detectablemente marcado de la invención, lavando el exceso de reactivo, y determinando si la cantidad del marcador detectable es aquel presente sobre el soporte sólido. Numerosos pasos de bloqueo y lavado se pueden usar, que son conocidos por los expertos en la técnica. En algunos casos, sólo uno de los componentes es marcado.
Por ejemplo, residuos específicos en el dominio de BIR puede ser marcado. Alternativamente, más de un componente puede ser marcado con diferentes marcadores; por ejemplo, usando I125 para el dominio de BIR, y un marcador fluorescente para la sonda. Los compuestos de la invención también se pueden usar como competidores para determinar selectivamente candidatos a fármaco adicionales o compuestos de prueba. Como se usa aquí, los términos "candidato a fármaco" o "compuestos de prueba" se usan indistintamente y describen cualquier molécula, por ejemplo, proteina, oligopéptido, molécula orgánica pequeña, polisacárido, polinucleotido, y similares, que han de ser probadas para bioactividad. Los compuestos pueden ser capaces de alterar directamente o indirectamente la actividad biológica de IAP. Los candidatos a fármaco pueden incluir varias clases químicas, aunque típicamente son moléculas orgánicas pequeñas que tienen un peso molecular de más de 100 y menos de aproximadamente 2,500 Daltons. Los agentes candidatos típicamente incluyen grupos funcionales necesarios para interacción estructural con proteínas, por ejemplo, enlace de hidrógeno y unión lipofílica, y típicamente incluyen por lo menos un grupo amina, carbonilo, hidroxilo, éter o carboxilo. Los candidatos a fármaco a menudo incluyen estructuras de carbono cíclicas o heterocíclicas y/o estructuras aromáticas o poliaromáticas sustituidas con uno o más grupos funcionales. Los candidatos a fármaco se pueden obtener de cualquier número de fuentes que incluyen genotecas de compuestos sintéticos o naturales. Por ejemplo, numerosos medios están disponibles para síntesis aleatoria y directa de una amplia variedad de compuestos y biomoléculas orgánicas, incluyendo la expresión de oligonucleótidos distribuidos aleatoriamente. Alternativamente, las genotecas de compuestos naturales en forma de extractos de bacterias, hongos, plantas y animales están disponibles o son fácilmente producidas. Además, las genotecas y compuestos naturales o sintéticamente producidos son fácilmente modificados a través de medios químicos, físicos y bioquímicos convencionales.
Las pruebas de determinación selectiva competitivas se pueden hacer combinando un dominio de BIR de IAP y una sonda para formar un complejo de sonda:dominio de BIR en una primera muestra seguido por la adición de un compuesto de prueba de una segunda muestra. La unión de la prueba se determina, y un cambio, o diferencia en unión entre las dos muestras indica la presencia de un compuesto de prueba capaz de unirse al dominio de BIR y que modula potencialmente la actividad de los IAP. En un caso, la unión del compuesto de prueba se determina a través del uso de pruebas de unión competitivas. En esta modalidad, la sonda se marca con un marcador de afinidad tal como biotina. Bajo ciertas circunstancias, puede haber unión competitiva entre los compuestos de prueba y la sonda, con la sonda desplazando el agente candidato. En un caso, el compuesto de prueba puede ser marcado. Ya se el compuesto de prueba, o un compuesto de la presente invención, o ambos, se añade primero al dominio de BIR de IAP durante un tiempo suficiente para permitir la unión para formar un complejo. La formación del complejo de sonda:dominio de BIR típicamente requiere incubaciones de entre 4°C y 40°C durante 10 minutos a aproximadamente 1 hora para permitir determinación selectiva de alto rendimiento. Cualquier exceso de reactivos es generalmente removido o lavado. El compuesto de prueba después se añade, y la presencia o ausencia del componente marcado es seguido, para indicar la unión al dominio de BIR. En un caso, la sonda se añade primero, seguida por el compuesto de prueba. El desplazamiento de la sonda es una indicación de que el compuesto de prueba se está uniendo al dominio de BIR y por lo tanto es capaz de unirse a, y potencialmente modulando, la actividad de IAP. Cualquier componente puede ser marcado. Por ejemplo, la presencia de sonda en la solución de lavado indica el desplazamiento por el compuesto de prueba. Alternativamente, si el compuesto de prueba es marcado, la presencia de la sonda sobre el soporte indica desplazamiento. En un caso, el compuesto de prueba se puede añadir primero, con incubación y lavado, seguido por la sonda. La ausencia de unión por la sonda puede indicar el compuesto de prueba se une al dominio de BIR con una afinidad superior. Por lo tanto, si la sonda es detectada sobre el soporte, acoplado con una falta de unión de compuesto de prueba, puede indicar que el compuesto de prueba es capaz de unirse al dominio de BIR. La modulación se prueba determinando selectivamente la capacidad de un compuesto de prueba para modular la actividad de IAP e incluye combinar un compuesto de prueba con un dominio de BIR de IAP, como se describió antes, y determinando una alteración en la actividad biológica del IAP. Por lo tanto, en este caso, el compuesto de prueba se debe unir al dominio de BIR (aunque esto puede no ser necesario), y alterando su actividad biológica como se define aquí. Los controles positivos y controles negativos se pueden usar en las pruebas. Todas las muestras de control y prueba se realizan en tiempos múltiples para obtener resultados estadísticamente significativos. Después de la incubación, todas las muestras se lavaron libres de material no específicamente unido y la cantidad de sonda de unión se determina. Por ejemplo, en donde se utiliza un radiomarcador, las muestras se pueden contar en un contador de escintilación para determinar la cantidad de compuesto de unión. Típicamente, las señales que son detectadas en la prueba pueden incluir fluorescencia, transferencia de energía de resonancia, fluorescencia resuelta en el tiempo, radioactividad, polarización de fluorescencia, resonancia de plasma, o quimioluminescencia y similares, dependiendo de la naturaleza del marcador. Los marcadores detectables útiles en la realización de pruebas de determinación selectiva en esta invención incluyen un marcador fluorescente tal como fluoresceína, verde de Oregon, dansilo, rodamina, tetrametilrodamina, rojo de Texas, Eu3+; un marcador quimioluminescente tal como luciferasa; marcadores colorimétricos; marcadores enzimáticos; o radioisótopos tales como tritio, I125 y similares. Los inventores de la presente describen aquí el uso de dos compuestos de unión a BIR fluorescentemente marcados que pueden actuar como sondas en una prueba de polarización fluorescente, como se describe más adelante. Etiquetas de afinidad, que pueden ser útiles para realizar las pruebas de determinación selectiva de la presente invención incluyen biotina, polihistidina y similares.
Síntesis y metodología Los métodos generales para la síntesis de los compuestos de la presente invención se muestran más adelante y se describen simplemente para el propósito de ilustración y no deben interpretarse como limitantes de los procedimientos para hacer los compuestos por cualesquiera otros métodos. Los expertos en la técnica fácilmente apreciarán que un número de métodos están disponibles para la preparación de los compuestos de la presente invención.
Procedimientos generales Los esquemas 1 , 2, 3, 4, 5 y 6 ilustran procedimientos de síntesis generales para la preparación de compuestos de la presente invención. El esquema 1 ilustra procedimientos generales para la preparación de intermediarios de la fórmula general -v. El intermediario 1-i¡ se preparó mediante una secuencia de aminacíón reductiva. Como tal, el compuesto de la fórmula general 1 -i se trató con amina R6NH2, seguido por reducción con un hidruro apropiado para proveer intermediario 1 -ii. La protección de 1-ii con grupo protector PG5, seguido por desprotección de PG1 da intermediario 1-iii. PG2(H)N(R3)CHCO2H se acopla a -íií usando agentes de acoplamiento de aminoácidos, seguido por desprotección de PG2 da el intermediario 1-iv. De manera similar, PG3(R1)N(R2)CHCO2H se acopla a 1-iv usando agentes de acoplamiento de aminoácido, seguido por desprotección de PG5 da el intermediario 1-v.
ESQUEMA1 1-i 1-ii 1 -iii 1-iv El esquema 2 ¡lustra procedimientos generales para la preparación de compuestos de puente de bis-amida de la presente invención. El tratamiento de intermediario 1-v con 0.5 equiv de LG- C(0)-L-C(O)-LG y desprotección de PG3 provee el compuesto 2-i.
ESQUEMA 2 El esquema 3 ¡lustra procedimientos generales para la preparación de compuestos en puente de bis-sulfonilo de la presente invención. El tratamiento del intermediario 1-v con 0.5 equiv de LG-S(0)2-L- S(0)2-LG y desprotección de PG3 provee el compuesto 3-i.
ESQUEMA 3 El esquema 4 ilustra procedimientos generales para la preparación de compuestos en puente de alquilo de la presente invención. El tratamiento del intermediario 1-v con 0.5 equiv de LG-L-LG y desprotección de PG3 provee el compuesto 4-i.
ESQUEMA 4 El esquema 5 ilustra el uso de aminoácidos funcionalizados como grupos de puente. PG4(H)N(R8)CHCO2H es acoplado a 1-v usando agentes de acoplamiento de aminoácidos, seguido por desprotección de PG4 da el intermediario 4-i. El tratamiento de 4-i con LG-Z-LG seguido por desprotección de PG3 da el compuesto 5-ii.
ESQUEMA 5 Las estrategias de puente similares se pueden usar preparar compuestos de la fórmula I a partir de intermediarios l-ia y l-ib. El esquema 6 ilustra procedimientos generales para la preparación de compuestos de puente de la fórmula general 6-v. El intermediario 6-i se preparó por una secuencia de aminación reductiva. Un Bis-aldehído se trató con amina R6NH2, seguido por una reducción con un hidruro apropiado para proveer el intermediario 6-i. Un compuesto de fórmula general 6-ii es acoplado a 6-i usando agentes de acoplamiento de aminoácido, seguido por desprotección de PG1 da el intermediario 6-iii. PG2(H)N(R3)CHCO2H es acoplado a 6-iii usando agentes de acoplamiento de aminoácido, seguido por desprotección de PG2 da el intermediario 6-iv. De manera similar, PG3(R1)N(R2)CHCO2H es acoplado a 6-iv usando agentes de acoplamiento de aminoácido, seguido por desprotección de PG5 da el compuesto 6-v.
ESQUEMA 6 1) H2NR6 , 6 OHC-L-CHO ,L^NH 2) hidruro H 6-i 6-iv 6-v Los esquemas anteriores también son aplicables en donde R3 y R4 se unen para formar un sistema de anillo heterociclico, y R1, R2, W, R5, R5a, X, L y similares, son como se define aquí. LG es un grupo residual tal como, por ejemplo, Cl, Br, I, OTs o OMs.
EJEMPLOS Las siguientes abreviaturas se usan a lo largo de la descripción: Boc: f-butoxicarbonilo; CBz: benciloxicarbonilo; DCM: diclorometano, CH2CI2; DIPEA: diisopropiletilamina; DMAP: 4-(dimetilamino)piridina; DMF: N,N-dimetilformamida¡ DTT: ditiotreitol; EDC: clorhidrato de 3-(dimetilaminopropil)-3-etilcarbodiimida; EDTA: ácido etilendiaminotetracético; Fmoc: N-(9-fluorenilmetoxicarbonilo)¡ HBTU: hexafluorofosfato de 0-(benzotriazol-1-il)-N,N,N' tetrametiluronio; HCI: ácido clorhídrico; HOAc: ácido acético; HOBt: 1 -hidroxibenzotriazol; CLAR: cromatografía de líquidos de alto rendimiento; CL-EM: cromatografía de líquidos-espectrometría de masa; MeOH: metanol; MgS04: sulfato de magnesio; EM: espectro de masa; Ms: metansulfonilo; NaHC03 bicarbonato de sodio; Pd/C: paladio sobre carbón; TEA: trietilamina; TFA: ácido trifluoroacético; THF: tetrahidrofurano; TMEDA: ?,?,?,?-tetrametiletilendiamina; Ts: para-toluensulfonilo.
Métodos de Síntesis Preparación de ejemplos representativos La preparación del intermediario 7-7 se ilustra en el esquema 7. La conversión del intermediario 7-7 a los compuestos 1 , 13, 20 y 23 se resume en los esquemas 8, 9, 10 y 11. El compuesto 7-7 se preparó de una manera similar a aquella descrita en la solicitud de patente de E.U.A. de propiedad común no. 11/434,166. La aminación reductiva de Boc-prolinal usando fenetilamina y Na(AcO)3BH provee el intermediario 7-1 que después se aciló con cloroformiato de bencilo, y Boc-desprotegido usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano para proveer el intermediario 7-3-HCI. La activación del grupo carboxilo de Boc-L-Tle-Gly-OH mediante tratamiento con los agentes acopladores de amida HBTU, HOBt, y DIPEA en solvente DMF fue seguido por la adición de 7-3*HCI para proveer el intermediario 7-4. Desprotección de Boc usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano dio 7-5»HCI. La activación del grupo carboxilo de Boc-NMe-Ala-OH mediante tratamiento con los agentes acopladores de amida HBTU, HOBt, y DIPEA en colvente DMF fue seguido por la adición de 7-5»HCI para proveer el intermediario 7-6. Desprotección de Cbz usando Pd/C bajo una atmósfera de hidrógeno en MeOH dio 7-7.
ESQUEMA 7 Boc' El tratamiento de una solución de 7-7 con cloruro de tereftaloilo y TEA en THF dio el intermediario 8-1. La Boc-desprotección del intermediario 8-1 usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano da el compuesto 1 como su sal de bis-clorhidrato.
ESQUEMA 8 El tratamiento de una solución de 7-7 con cloruro de 4,4'- bifenildisulfonilo y TEA en THF dio el intermediario 9-1. La Boc-desprotección del intermediario 9-1 usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano dio el compuesto 13 como su sal de bis-clorhidrato.
ESQUEMA 9 El tratamiento de una solución de 7-7 con diisocianato de 1 ,4-fenileno en CH2CI2 dio el intermediario 10-1. La Boc-desprotección del intermediario 9-1 usando 50% de TFA en DCM dio el compuesto 20 como su sal de bis-TFA.
ESQUEMA 10 El tratamiento de una solución de 7-7 con a,a'-dibromo-p-xileno y TEA en DMF dio el intermediario 11-1. La Boc-desprotección del intermediario 11-1 usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano dio el compuesto 23 como su sal de bis-clorhidrato.
ESQUEMA 11 La preparación del intermediario 12-2 se ilustra en el esquema 12. La conversión del intermediario 12-2 a los compuestos 35, 87, y 104 se resume en los esquemas 13, 14 y 15. La activación del grupo carboxilo de Cbz-Gly-OH mediante tratamiento con el agente acoplador de amida HBTU y DIPEA en solvente DMF fue seguido por la adición de 7-7 para proveer el intermediario 12-1. La desprotección de Cbz usando Pd/C bajo una atmósfera de hidrógeno en MeOH dio el intermediario 12-2.
ESQUEMA 12 El tratamiento de una solución de 12-2 con cloruro de tereftaloilo y TEA en CH2CI2 dio el intermediario 13-1. La Boc-desprotección del intermediario 13-1 usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano dio el compuesto 91 como su sal de bis-clorhidrato.
ESQUEMA 13 El tratamiento de una solución de 12-2 con cloruro de 2,6- naftalendisulfonilo y TEA en CH2CI2 dio el intermediario 14-1. La Boc- desprotección del intermediario 14-1 usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano dio el compuesto 87 como su sal de bis-clorhidrato.
El tratamiento de una solución de 12-2 con diisocianato de 1 ,4- fenileno en DMF dio el intermediario 15-1. La Boc-desprotección del intermediario 15-1 usando 50% de TFA en CH2CI2 dio el compuesto 104 como su sal de bis-TFA.
ESQUEMA 15 La preparación del compuesto 94 se ilustra en el esquema 16. La aminación reductiva de 4,4'- bifenildicarboxaldehído usando fenetilamina y Na(AcO)3BH dio el intermediario 16-2. La activación del grupo carboxilo de prolina mediante tratamiento con el agente acoplador de amida HBTU, HOBt, y DIPEA en solvente DMF fue seguido por la adición de 16-2 para proveer el intermediario 16-3. La desprotección de Boc de 16-3 usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano dio 16-4«2HCI. La activación del grupo carboxilo de Boc-L-Tle-OH mediante tratamiento con los agentes acopladores de amida HBTU, HOBt, y DIPEA en solvente DMF fue seguido por la adición de 16-4«2HCI para proveer el intermediario 16-5. La desprotección de Boc usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano dio 16-6*2HCI. La activación del grupo carboxilo de Boc-N-Me-Ala-OH mediante tratamiento con los agentes acopladores de amida EDC, HOBt, y DIPEA en solvente de CH2CI2 fue seguido por la adición de 16-6-2HCI para proveer el intermediario 16-7. La desprotección de Boc usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano dio el compuesto 94*2HCI. ESQUEMA 16 Métodos preparativos INTERMEDIARIO 7-1 A una solución de N-(ter-butoxicarbonil)-L-prolinal (10.0 g, 50.2 mmoles) en cloruro de metileno (150 mi) se añadió fenetilamina (6.52 mi, 50.2 mmoles). Después de agitarse durante 1 hora a temperatura ambiente triacetoxiborhidruro de sodio (21.0 g, 100.3 mmoles) y metanol (50 mi) se añadieron y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Se añadieron NaHC03 acuoso saturado y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con 95:5 a 50:50 de hexano/EtOAc, dio el intermediario 7-1 como aceite incoloro. EM (m/z) M+ =305.4 INTERMEDIARIO 7-2 A una solución de 7-1 (8.10 g, 26.6 mmoles) en cloruro de metileno (80 mi) enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente TEA (7.4 mi, 53.3 mmoles), cloroformiato de bencilo (4.10 mi, 29.3 mmoles) y la mezcla de reacción se agitó durante 3 horas a temperatura ambiente. Se añadieron NaHC03 acuoso y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con salmuera, se secó sobre MgSO4 y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/EtOAc, dio el intermediario 7-2 como aceite incoloro.
INTERMEDIARIO 7-3'HCI HCI 4N en 1 ,4-dioxano (20 mi) se añadió al intermediario 7-2 (1 1 .5 g, 26.2 mmoles) y la solución se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer el intermediario 7-3*HCI como un sólido blanco. EM (m/z) M+1 =339.2 INTERMEDIARIO 7-4 A una solución de Boc-L-Tle-OH (5.70 g, 24.5 mmoles) en DMF enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente DIPEA (16.9 mi, 94.3 mmoles), HOBt (3.3 g, 24.5 mmoles) y HBTU (9.30 g, 24.5 mmoles). Después de agitarse durante 10 minutos, se añadió el intermediario 7-3. HCI (7.04 g, 18.8 mmoles) y la mezcla de reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgS04 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/EtOAc, dio el intermediario 7-4 como aceite incoloro.
INTERMEDIARIO 7-5'HCI HCI 4N en 1 ,4 dioxano (20 mi) se añadió al intermediario 7-4 (8.30 g, 15.0 mmoles) y la solución se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer el intermediario 7-5«HCI como un sólido blanco. EM (m/z) M+1 =452.2.
INTERMEDIARIO 7-6 A una solución de Boc-N-Me-Ala-OH (4.20 g, 20.7 mmoles) en DMF enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente DIPEA (14.3 mi, 79.8 mmoles), HOBt (2.8 g, 20.7 mmoles) y HBTU (7.90 g, 20.7 mmoles). Después de agitarse durante 10 minutos, se añadió el intermediario 7-5«HCI (7.76 g, 15.9 mmoles) se añadió y la mezcla de reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgS04 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/THF, dio el intermediario 7-6 como aceite incoloro.
INTERMEDIARIO 7-7 A una solución del intermediario 7-6 (3.00 g, 4.7 mmoles) en MeOH anhidro (100 mi) y agitado bajo N2 se añadió 10% de Pd/C (200 mg). La mezcla de reacción se purgó con H2 y se agitó durante 1 hora. La reacción después se filtró a través de celite y el filtrado se concentró bajo vacio. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/THF, dio el intermediario 7-7 como aceite incoloro. EM (m/z) M+1 =503.4 INTERMEDIARIO 8-1 A una solución del intermediario 7-7 (250 mg, 0.49 mmoles) en THF enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente TEA (134 ul, 0.96 mmoles) y cloruro de tereftaloilo (49.7 mg, 0.24 mmoles) y la reacción se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/THF, dio el intermediario 8-1 como un sólido blanco.
COMPUESTO 1»2HCI HCI 4N en 1 ,4-dioxano (3 mi) se añadió al intermediario 8-1 (120 mg, 0.10 mmoles) y la solución se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietilico para proveer compuesto 1 -2HCI como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 9-1 A una solución del intermediario 7-7 (1.22 g, 2.42 mmoles) en THF enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente TEA (1 .35 mi, 9.70 mmoles) y cloruro de 4,4'-bifenildisulfonilo (425 mg, 1.21 mmoles) y la reacción se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano THF, dio el intermediario 9-1 como un sólido blanco.
COMPUESTO 13»2HCI HCI 4N en 1 ,4-dioxano (5 mi) se añadió al intermediario 9-1 (450 mg, 0.35 mmoles) y la solución se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer compuesto 13*2HCI como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 10-1 A una solución del intermediario 7-7 (180 mg, 0.36 mmoles) en CH2CI2 se añadió diisocianato de 1 ,4-fenileno (25 mg, 0.16 mmoles) y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se purificó por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/THF, para proveer el intermediario 10-1 como un sólido blanco.
COMPUESTO 20»2TFA El intermediario 10-1 (175 mg, 0.15 mmoles) se disolvió en una mezcla de CH2CI2 (3.0 mi) y TFA (3.0 mi). La solución se agitó durante 3 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer compuesto 20*2TFA como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 11-1 A una solución del intermediario 7-7 (210 mg, 0.42 mmoles) en DMF se añadieron secuencialmente DIPEA (435 µ?, 2.50 mmoles) y ,a'-dibromo-p-xileno (49 mg, 0.18 mmoles) y la reacción se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgS04 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 30:70 de hexano/THF, dio el intermediario 11-1 como un sólido blanco.
COMPUESTO 23-2HCI HCI 4N en 1 ,4-dioxano (2 mi) se añadió al intermediario 11 -1 (33 mg, 0.03 mmoles) y la solución se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer compuesto 23»2HCI como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 12-1 A una solución de Cbz-Gly-OH (4.16 g, 19.9 mmoles) en DMF enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente DIPEA (14.0 mi, 80.4 mmoles) y HBTU (7.01 g, 18.5 mmoles). Después de agitarse durante 5 minutos se añadió el intermediario 7-7 (8.11 g, 16.1 mmoles) y la mezcla de reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano THF, dio el intermediario 12-1 como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 12-2 A una solución del intermediario 12-1 (4.21 g, 6.07 mmoles) en MeOH anhidro (120 mi) y agitado bajo N2 se añadió 10% de Pd/C (500 mg). La mezcla de reacción se purgó con H2 y se agitó durante 6 horas. La reacción después se filtró a través de celite y los filtrados se concentraron bajo vacío para proveer el intermediario 12-2 como un sólido blanco. EM (miz) M+1 =560.4 INTERMEDIARI0 13-1 A una solución del intermediario 12-2 (200 mg, 0.36 mmoles) en DCM enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente TEA (100 ul, 0.71 mmoles) y cloruro de tereftaloilo (36 mg, 0.18 mmoles) y la reacción se agitó durante 6 horas a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacio. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/THF, dio el intermediario 13-1 como un sólido blanco.
COMPUESTO 35«2HCI HCI 4N en 1 ,4-dioxano (3.0 mi) se añadió al intermediario 13-1 (195 mg, 0.18 mmoles) y la solución se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer compuesto 35*2HCI como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 14-1 A una solución del intermediario 12-2 (245 mg, 0.44 mmoles) en DCM enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente TEA (130 ul, 0.93 mmoles), cloruro de 2,6-naftalendisulfonilo (66 mg, 0.20 mmoles) y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/THF, dio el intermediario 14-1 como un sólido blanco.
COMPUESTO 87 2HCI HCI 4N en ,4-dioxano (5.0 mi) se añadió al intermediario 14-1 (160 mg, 0.1 1 mmoles) y la solución se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietilico para proveer compuesto 87*2HCI como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 15-1 A una solución del intermediario 12-2 (142 mg, 0.25 mmoles) en THF se añadió diisocianato de 1 ,4-fenileno (41 mg, 0.25 mmoles) y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 3 horas. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se purificó por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/THF, para proveer el intermediario 15-1 como un sólido blanco.
COMPUESTO 104-2TFA El intermediario 15-1 (96 mg, 0.07 mmoles) se disolvió en una mezcla de CH2CI2 (1.0 mi) y TFA (1.0 mi). La solución se agitó durante 1 hora a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer compuesto 104*2TFA como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 18-2 A una solución de 4,4'-bifenildicarboxaldehido (1.50 g, 7.13 mmoles) en cloruro de metileno (25 mi.) se añadió fenetilamina (1.72 g, 14.3 mmoles). Después de agitarse durante 1 hora a temperatura ambiente triacetoxiborhidruro de sodio (4.53 g, 21.4 mmoles) y metanol (25 rnl) se añadieron y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. NaHCOs acuoso saturado y acetato de etilo se añadieron, la capa orgánica se separó, se lavó con salmuera, se secó sobre MgS04 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/EtOAc, dio el intermediario 6-2 como un sólido amarillo.
INTERMEDIARIO 16-3 A una solución de Boc-Pro-OH (3.64 g, 16.1 mmoles) en DMF enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente DIPEA (11.06 mi, 61.8 mmoles), HOBt (2.50 g, 18.5 mmoles) y HBTU (7.03 g, 18.5 mmoles). Después de agitarse durante 10 minutos, el intermediario 16-2 (2.60 g, 6.18 mmoles) se añadió y la mezcla de reacción se agitó durante 3 días a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/EtOAc, dio el intermediario 16-3 como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 16-4»2HCI HCI 4N en 1 ,4 dioxano (10 mi) se añadió al intermediario 16-3 (3.10 g, 3.80 mmoles) y la solución se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílíco para proveer el intermediario 16-4«2HCI como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 16-5 A una solución de Boc-L-Tle-OH (2.18 g, 9.45 mmoles) en DMF enfriada a 0°C se añadieron secuencialmente DIPEA (6.50 mi, 36.3 mmoles), HOBt (1.47 g, 10.89 mmoles) y HBTU (4.12 g, 10.89 mmoles). Después de agitarse durante 10 minutos, se añadió el intermediario 16-4 2HCI (2.50 g, 3.63 mmoles) y la mezcla de reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHC03 acuoso y salmuera, se secó sobre MgSO4 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/EtOAc, dio el intermediario 16-5 como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 16-6-2HCI HCI 4N en 1.4 dioxano (5 mi) se añadió al intermediario 16-5 (1.60 g, 1.54 mmoles) y la solución se agitó durante 2 hr a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer el intermediario 16-6«2HCI como un sólido blanco.
INTERMEDIARIO 16-7 A una solución de Boc-N-Me-Ala-OH (404 mg, 1.99 mmoles) en CH2CI2 enfriado a 0°C se añadieron secuencialmente DIPEA (1.36 mi, 7.60 mmoles), HOBt (308 mg, 2.28 mmoles) y EDC (437 mg, 2.28 mmoles). Después de agitarse durante 10 minutos, se añadió el intermediario 16-6»2HCI (700 mg, 0.76 mmoles) y la mezcla de reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Se añadieron agua y acetato de etilo, la capa orgánica se separó, se lavó con ácido cítrico al 10%, NaHCO3 acuoso y salmuera, se secó sobre MgS04 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío. La purificación por cromatografía de gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 95:5 a 50:50 de hexano/THF, dio el intermediario 16-7 como un sólido blanco.
COMPUESTO 94«2HCI HCI 4N en 1 ,4-dioxano (3 mi) se añadió al intermediario 16-7 (243 g, 0.20 mmoles) y la solución se agitó durante 2 hr a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer compuesto 94*2HCI como un sólido blanco.
COMPUESTO 94-2HCI HCI 4N en ,4-dioxano (3 mi) se añadió al intermediario 16-7 (243 g, 0.20 mmoles) y la solución se agitó durante 2 hr a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico para proveer compuesto 94-2HCI como un sólido blanco.
COMPUESTO 49 49-1 y 49-2 se acoplaron usando HOBt, HBTU y DIPEA en solvente DMF, de una manera similar a aquella descrita para la conversión de 75- a 7-6, para proveer el intermediario 49-3. El intermediario 9-3 se desprotegió usando HCI 4N en 1 ,4-dioxano para proveer compuesto 49»2HCI. EM (m/z) (M+2)/2=519.0.
COMPUESTO 106 - SONDA P2 Paso a) El intermediario 49-3 y 5% de Pd/C (10% en peso) se suspendieron en MeOH y se colocaron bajo una atmósfera de hidrógeno (1 atm). Después de agitarse durante 16 horas, la solución se filtró a través de celite y se concentró bajo presión reducida para proveer el intermediario 106-1.
Paso b) A una solución de 106-1 (100 mg, 0.09 mmoles) en diclorometano anhidro (5 mi) agitada bajo N2 se añadió isotiocianato de fluoresceina (35 mg, 0.09 mmoles) y trietilamina (20 µ?). La mezcla de reacción después se agitó durante 2 horas a temperatura ambiente. Se añadió acetato de etilo y se lavó dos veces con ácido cítrico al 10%, la capa orgánica se separó, se lavó con salmuera, se secó sobre MgS04 anhidro, se filtró y se concentró bajo vacío para proveer el intermediario 106-2 como un sólido amarillo. EM (m/z) (M+2)/2=746.6.
Paso c) Diclorometano (3 mi) y TFA (3 mi) se añadieron a 106-2 (60 mg, 0.04 mmoles) y la solución se agitó durante 40 min a temperatura ambiente. Los compuestos volátiles se removieron bajo presión reducida y el residuo se trituró con éter dietílico. La purificación por cromatografía de fase inversa eluyendo con un gradiente de agua/acetonitrilo dio el compuesto esperado 106-2TFA como un sólido amarillo. EM (m/z) M+1 =1291.6. Compuestos representativos de la presente invención sE prepararon de conformidad con los procedimientos anteriores y se ilustran en el cuadro 1 : CUADRO 1 M+1 =1095.8 97 (M+2)/2=548.6 M+1 =1043.8 98 (M+2)/2=522.6 M+1 = 1023.8 99 (M+2)/2=512.4 M+1 = 1079.6 100 (M+2)/2=540.4 ' CF3 Compuestos representativos de la presente invención que se pueden preparar por modificación simple de los procedimientos anteriores se ilustran en el cuadro 2.
CUADRO 2 X se puede escoger de CH2, CF2, O o S; y n puede ser 1 , 2, ó 3; y BG se puede escoger de los grupos que consisten de: n = 1 a 10 y j/juu Son como se define aquí R bUU se escogen independientemente de H, alquilo Compuestos representativos de la presente invención que se pueden preparar por modificación simple del procedimiento anterior se ilustran a continuación: En donde R4, R5, R5a, R6, R400, R500, R600, X, X100 y BG son como se define aquí; y R3 y R300 se escogen independientemente de los siguientes: -CHOR7, -C(CH3)OR7, o -CH2CH2OR7; en donde R7 se define como -C(0)R8, y R8 es alquilo, arilo, o heteroarilo, en donde el alquilo puede ser sustituido además por R7, y el arilo y heteroarilo puede ser sustituidos adicionalmente por R11.
Pruebas Construcciones moleculares para expresión Secuencia codificadora de GST-XIAP BIR3RING: XIAP a partir de los aminoácidos 246-497 clonados en PGEX2T1 a través de BamHI y AVA I. El plásmido fue transformado a DH5a de E. coli para usarse en expresión y purificación de proteína. Secuencia codificadora de GST-HIAP2 (clAP-l)BIR 3: HIAP2 a partir de los aminoácidos 251-363 clonados en PGex4T3 a través de BamHI y Xhol. El plásmido fue transformado a DH5a de E. coli para usarse en expresión y purificación de proteína. Secuencia codificadora de GST-H IAP1 (clAP-2) BIR 3: HIAP1 a partir de ¡os aminoácidos 236-349, clonados en PGex4T3 a través de BamHI y Xhol. El plásmido fue transformado a DH5a de E. coli para usarse en expresión y purificación de proteína. Secuencia codificadora de GST-enlazador BIR2BIR3Ring: XIAP a partir de los aminoácidos 93-497 clonados en PGex4T1 a través de BamHI y Xhol. Los aminoácidos 93-497 fueron amplificados a partir de XIAP de longitud completa en pGex4t3, usando los iniciadores: TTAATAGGATCCATCAACGGCTTTTATC y GCTGCATGTGTGTCAGAGG, usando condiciones de PCR estándares. El fragmento de PCR fue TA clonado en pCR-2.1 (Invitrogen). Enlazador BIR 2BIR 3Ring fue subclonado en pGex4T1 por digestión con BamHI/Xhol. El plásmido fue transformado a DH5a de E. coli para usarse en expresión y purificación de proteína. XIAP humano de longitud completa, número de plásmido 23 de AEG. Secuencia codificadora de XIAP a partir de los aminoácidos 1-497 clonados en vector de fusión de GST, PGEX4T1 a través de sitios de restricción BamH1 y Xho I. El plásmido fue transformado a DH5a de E. coli para usarse en expresión y purificación de proteína. Secuencia codificadora de enlazador GST-XIAP BIR 2: enlazador XIAP BIR 2 a partir de los aminoácidos 93-497 clonados en pGex4T3 a través de BamHI y Xhol. El plásmido fue transformado a DH5a de E. coli para usarse en expresión y purificación de proteína.
Síntesis de sonda fluorescente para prueba de FP Una sonda de péptido fluorescente, Fmoc-Ala-Val-Pro-Phe-Tyr(t-Bu)-Leu-Pro-Gly(t-Bu)-Gly-OH se preparó usando química de Fmoc estándar sobre resina de cloruro de 2-clorotrítilo (Int. J. Pept. Prot. Res. 38:555-561 , 1991). La digestión de la resina se realizó usando 20% de ácido acético en diclorometano (DCM), que dejó la cadena lateral aún bloqueada. El ácido carboxílico protegido C-terminal se acopló a 4'-(aminometil)fluoresceína (Molecular Probes, A-1351 ; Eugene, Oreg.) usando exceso de diisopropilcarbodiimida (DIC) en dimetilformamida (DMF) a temperatura ambiente y se purificó por cromatografía sobre gel de sílice (10% de metanol en DCM). El grupo protector de Fmoc N-terminal se removió usando piperidina (20%) en DMF, y se purificó por cromatografía sobre gel de sílice (20% de metanol en DCM, 0.5% de HOAc). Finalmente, los grupos protectores de cadena lateral de t-butilo se removieron usando 95% de ácido trifluoroacético que contenia 2.5% de agua y 2.5% de triisopropil silano. El péptido obtenido desplegó un solo pico por CLAR (>95% puro). Las sondas fluorescentes se pueden preparar usando unidades de unión a BIR monoméricas o compuestos de unión a BIR en puente de la presente invención por medio de las químicas descritas aquí, para dar sondas caracterizadas por el compuesto 106.
Sonda P2: 106 Expresión y purificación def proteínas recombinantes A. Expresión de proteínas recombinantes Proteínas etiquetadas con glutation S-transferasa (GST) se expresaron en cepas DH5-alfa de Escherichia coli. Para expresión de XIAP de longitud completa, individuales o combinaciones de dominios de XIAP- BIR, clAP-1 , clAP-2 y bacterias transformadas de Livin se cultivaron durante la noche a 37°C en un medio de caldo de Luria (LB) complementado con 50 ug/ml de ampicilina. El cultivo durante la noche se diluyó después 25 veces en un medio complementado con ampicilina LB fresco y las bacterias se hicieron crecer hasta A6oo = 0.6 después fueron inducidas con 1 mM de isopropil-D-1-tiogalactopiranósido durante 3 horas. Bajo inducción, las células 5000 RPM durante 10 minutos y los medios fueron removidos. Cada pastilla obtenida de un cultivo de 1 litro recibió 10 mi de regulador de pH de lisis (50 mM de Tris-HCI, 200 mM de NaCh 1 mM de DTT, 1 mM de PMSF, 2 mg/ml de lisosima, 100 pg/ml)), se incubó a 4°C con agitación suave. Después de 20 minutos de incubación, la suspensión de células se colocaron a -80°C durante la noche o hasta que era necesario.
B. Purificación de proteínas recombinantes Para la purificación de proteínas recombinantes, el lisado de células inducido por IPTG se descongeló y se sometió a acción de remolino y después se perturbó por congelamiento instantáneo en nitrógeno líquido dos veces con acción de remolino después de cada descongelamiento. Las células fueron perturbadas la hacer pasar después el extracto cuatro veces a través de un dispositivo perturbador Bio-Neb Cell (Glas-col) fijado a 7.03 kg/cm2 con nitrógeno gaseoso. El extracto se clarificó por centrifugación a 4°C a 15000 RPM en un rotor SS-34 Beckman durante 30 minutos. El sobrenadante resultante se mezcló después con 2 mi de esferas de glutation-Sepharose (Pharmacia) por 500 mi de cultivo de células (por 1000 mi de cultivo para XIAP de longitud completa) durante 1 hora a 4°C. Posteriormente, las esferas se lavaron 3 veces con 1X de solución salina refulada en su pH con Tris (TBS) para remover proteínas no ligadas. Las proteínas retenidas fueron eluidas con 2 lavados de 2 mi de TRIS 50 mM a pH 8.0 que contenía 10 mM de glutation reducido. Las proteínas eluidas se pusieron en acervo y se precipitaron con 604 g/litro de sulfato de amonio y la pastilla resultante se re-suspendió en un regulador de pH apropiado. Como se juzga por SDS-PAGE las proteínas purificadas fueron >90% puras. La concentración proteina de proteínas purificadas se determinó a partir de método de Bradford. Proteínas His-tag se expresaron en las células de la cepa AD494 de E. Coli usando una construcción pet28ACPP32. La fracción de proteína soluble se preparó como se describió antes. Para purificación de proteína, el sobrenadante se purificó por cromatografía de afinidad usando Sepharose quelatador (Pharmacia) cargado con NiSO4 de conformidad con las instrucciones del fabricante. La pureza de la proteína eluida fue >90% pura que la determinada por SDS-PAGE. La concentración de proteína de proteínas purificadas se determinó a partir de la prueba de Bradford.
Prueba de unión Prueba de competencia basada en polarización por fluorescencia Para todas las pruebas, la fluorescencia y polarización por fluorescencia se evaluó usando un instrumento Tecan Polarion con el filtro de excitación fijado a 485 nm y el filtro de emisión fijado a 535 nm. Para cada prueba, la concentración de la proteína objetivo se estableció primero por titulación de la proteína seleccionada a fin de producir una señal de respuesta a la dosis lineal cuando se incubó por sí sola en presencia de la sonda fluorescente. Al establecer estas condiciones, los compuestos potencia (Cl50) y selectividad, se evaluaron en presencia de una cantidad definida fija de proteína objetivo y sonda fluorescente y una dilución en serie de 10 puntos de los compuestos seleccionados. Para cada curva de CI50, las pruebas se realizaron como sigue: 25 ul/pozo de compuesto diluido en 50 mM de regulador de pH MES a pH 6.5 se añadieron en una placa de 96 pozos negra, después 25 ul/pozo de albúmina de suero de bovino (BSA) a 0.5 mg/ml en 50 mM de MES a pH 6.5. La auto-fluorescencia para cada compuesto se evaluó primero al realizar una lectura de la solución de compuesto/BSA sola. Después 25 ul de la sonda de fluoresceína diluida en 50 mM de MES que contenia 0.05 mg/ml BSA se añadieron y se hizo una lectura para detectar extinción de fluoresceína. Finalmente, 25 ul/pozo de la proteína objetivo o de control (GST-BIRs) diluida a la concentración apropiada en 50 mM de MES que contenían 0.05 mg/ml de BSA se añadieron y la polarización por fluorescencia se evaluó.
Determinación de Clso y constantes inhibidoras Para cada prueba, las unidades de polarización-fluorescencia relativas se graficaron contra las concentraciones finales de compuesto y la Cl50 se calculó usando el software Grad pad prism y/o Cambridge soft. El valor de k¡ se derivó del valor de Cl50 calculado como se describió antes y de conformidad con la ecuación descrita en Nikolovska-Coleska, Z. (2004) Anal Biochem 332, 261-273. El compuesto seleccionado de la presente invención se mostró que se une al dominio de BIR3 de C-IAP1 , C-IAP2 y XIAP, y al enlazador-BIR2-BIR3-RING de XIAP con k¡S de < 1 uM.
Prueba de depresión de XIAP de longitud completa de caspasa-3. enlazador BIR2 o enlazador-BIR2-BIR3-RING A fin de determinar la actividad relativa del compuesto seleccionado contra XIAP-Bir2, se preparó una prueba in vitro en donde la caspasa-3 fue inhibida por proteínas de fusión a GST de XIAP en!azador-Bir2, XIAP enlazador Bir2-Bir3-RING o XIAP de longitud completa. La caspas 3 (0.125 ul) y 12.25-34.25 nM (concentración final) de proteína de fusión a GST-XIAP (GST-Bir2, GST-Bir2Bir3RING o XIAP de longitud completa) se co-incubaron con diluciones en serie de compuesto (200 uM-5 pM). La actividad de la caspasa 3 se midió sobreponiendo 25 ul de una solución 0.4 mM de DEVD-AMC. El volumen de reacción final fue de 100 ul. Todas las diluciones se realizaron en regulador de pH de caspasa (50 mM Hepes pH 7.4, 100 mM NaCl, 10% de sacarosa, 1 mM de EDTA, 10 mM de DTT, 0.1% de CHAPS (Stennicke, H. R., y Salvesen, G.S. (1997). Biochemical characteristics of caspase-3, -6, -7, y -8. J. Biol. Chem. 272, 25719-25723). La AMC fluorescente liberada de la hidrólisis de caspasa-3 del sustrato se midió en un espectrofotómetro TECAN a 360 nmde excitación y 444 nm de emisión, después de 15 minutos de incubación a temperatura ambiente. Los valores de CI50 se calcularon en un modelo de competencia de uno o dos sitios usando GraphPad v4.0, usando los valores de fluorescencia después de 15 minutos de incubación graficado contra el Iog10 de la concentración del compuesto.
Prueba libre de células Prueba de de-represión de caspasa usando extractos de células (apoptosoma) 100 ug de extracto de 293 células S100 y 0.25 uM a 20 uM de proteína de fusión GST-XIAP (XIAP- Bir3R!NG, XIAP-Bir2Bir3RING, o XIAP de longitud completa) fueron co-incubados con diluciones en serie de compuesto (40 uM - 50 pM). Las caspasas presentes en los extractos fueron activadas añadiendo 1 mM de dATP, 0.1 mM de ALLN, 133 ug de Citocromo C (concentraciones finales), e incubando a 37 °C durante 25 minutos. Todas las reacciones y diluciones usadron regulador de pH S100 (50 mM de Pipes pH 7.0, 50 mM de KCI, 0.5 mM de EGTA pH 8.0, 2 mM de MgCI2 complementado con diluciones de 1/1000 de 2 mg/ml Citocalisina B, 2 mg/ml de quimoestatina, Leupeptina, Pepstatina, Antipaina, 0.1 M de PMSF, 1 M de DTT). El volumen de reacción final fue de 30 ul. La actividad de caspasa-3 se midió sobreponiendo 30 ul de una solución 0.4 mM de DEVD-AMC. La digestión de AMC liberado se midió en un espectrofotómetro TECAN a 360 nm de excitación y 444 nm de emisiones, en un ciclo cinético de 1 hora con lecturas tomadas cada 5 minutos. La actividad de la caspasa se calculó como V0 de AMC fluorescencia/seg. La de-represión de la caspasa por los compuestos de la presente invención se comparó con extracto completamente activado y extracto activado reprimido por la presencia de proteina de fusión XIAP.
Pruebas de cultivo de células y muerte celular A. Cultivo de células Células cancerosas MDA-MD-231 (mama), SKOV-3 (ovario) y H460 (pulmón) se cultivaron en un medio RPM1 1640 complementado con 10% FBS y 100 unidades/ml de penicilina y estreptomicina.
B. Pruebas Las pruebas de supervivencia se realizaron sobre las siguientes lineas de células cancerosas humanas transformadas, células MDA-MB-231 , SKOV-3, H460, PC3, HCT-1 16 y SW480. Las células se sembraron en placas de 96 pozos a una densidad respectiva de 5000 y 2000 células por pozo y se incubaron a 37 °C en presencia de 5% de CO2 durante 24 horas. Los compuestos seleccionados se diluyeron en el medio a varias concentraciones que variaban de 0.00001 uM hasta 100 uM. Los compuestos diluidos se añadieron al medio de cultivo. Para las células MDA-MB-231 SKOV3, H460, PC3, HCT-1 16, y SW480, los compuestos se añadieron ya sea solos o en presencia de 1-3 ng/ml de TRAIL. Después de 48-72 horas la viabilidad celular se evaluó mediante pruebas basadas en MTS. Una solución de [3-(4,5-dimetiltiazol-2-il)-5-(3-carboximetoxifenil)-2-(4-sulfofenil)-2H-tetrazolio, sal interna; MTS] se añadió a células durante un periodo de 1 a 4 horas. Bajo incubación, la cantidad de MTS convertido se evaluó usando un espectrofotómetro Tecan fijado a 570 nm. Células MDA-MB-231 y SKOV-3 se trataron con compuestos seleccionados de la presente invención y se ha encontrado que tiene CE50 por abajo de 200 nM.
Prueba de MTT de supervivencia Un día antes del tratamiento con compuesto, 2000 a 4000 células por pozo se colocaron en una placa de formato de 96 pozos tratada con cultivo de tejido con 100 ul de medio y se incubaron a 37°C, 5% CO2. El día de tratamiento de compuesto, los compuestos se diluyeron con medio de cultivo de células a una concentración de abastecimiento de trabajo de 2X. 100 ul de compuesto diluido se añadieron después a cada pozo. La placa tratada se incubó durante 72 horas a 37°C, 5% de CO2. Bajo incubación, la viabilidad de las células se evaluó como sigue; 20 ul de reactivo MTT (5 mg/ml) se añadieron por pozo a la placa con células. La placa se incubó durante 2 hr a 37°C en presencia de 5% de CO2. El sobrenadante se removió después de la placa y se añadieron 100 ul de isopropanol. La absorbancia se midió en un espectrofotómetro TECAN a 570 nm. El porcentaje de viabilidad se expresó en porcentaje de la señal obtenida con células no tratadas. El cuadro 7 resume algo de SAR de compuestos representados en el cuadro 1 anterior. Como tales, los compuestos desplegaron valores de CE50 contra células MDA-MB-231 y SKOV-3 de <1 µ? con muchos compuestos que despliegan CE50 de <50 nM.
CUADRO 7 43 B 44 A 45 A 46 A 48 B 50 B 56 A 57 B 58 B 59 A 62 C 63 A 64 B 71 A 73 A 75 B 76 A 77 B 79 B 81 C 83 A 85 A 88 C 90 B 91 B 92 A A-CE50<10nM B-CE5010-25 nM C - CE50 >25 nM Además, el tratamiento de células con 10 nM de compuestos 31 y 35 potenciaron la eficacia de TRAIL sobre células HCT 16 colorrectales y A2780S de ovario por aproximadamente 2 logs, respectivamente.
Prueba de apoptosis: Medición de actividad de caspasa-3 de células cultivadas. Un día, antes del tratamiento, 10 000 células por pozo se colocaron en una placa de 96 pozos tratada con cultivo de tejido blanca con 100 ul de medio. El día de tratamiento con el compuesto, los compuestos se diluyeron con medio de cultivo de células a una concentración de abastecimiento de trabajo de 2X y 100 ul de compuesto diluido se añadieron después a cada pozo y la placa se incubó durante 5 hr a 37°C en presencia de 5% de CO2. Bajo incubación, la placa se lavó dos veces con regulador de pH de solución salina regulada en su pH conTRIS fría (200 ul de TBS). Las células se lisaron con 50 ul de regulador de pH de prueba de caspasa (20 mM), Tris-HCI pH 7.4, 0.1 % de NP-40, 0.1 % de Chaps, 1 mM de DTT, 0.1 mM de EDTA, 0.1 mM de PMSF, 2 mg/ml de quimotstatina, Leupeptina, Pepstatina, Antipaina) después se incubaron a 4°C con agitación durante 30 minutos. El regulador de pH de prueba de caspasa (45 ul) y Ac-DEVD-AMC (5 ul, 1 mg/ml) se añadieron a cada pozo y la placa se agitó y se incubó durante 16 horas a 37°C. La cantidad de AMC liberadas se midió en un espectrofotómetro TECAN con el filtro de excitación y emisión fijado a 360 nm y 444 nm. El porcentaje de actividad de caspasa-3 se expresó en comparación de la señal obtenida con las células no tratadas.
Bioquímica celular: A. Detección de XIAP, C-IAP1 , C-IAP2, PARP, Caspasa-3 v Caspasa-9 La detección de XIAP y PARP expresadas en células se hicieron por Western blot. Las células se colocaron en placas a 300 000 células/pozo en pozos de 60 mm (placa de 6 pozos). El día siguiente las células se trataron con compuesto seleccionado a la concentración indicada. 24 horas más tarde, las células se tripsinizaron, se formó una pastilla con ellas por centrifugación a 1800 rpm a 4°C. La pastilla resultante se enjuagó dos veces con TBS frío. La pastilla de células lavada final se lisó después con 250 ul de regulador de pH de lisis (NP-40, glicerol, 1 % de un cóctel de inhibidor de proteasa (Sigma)), colocado a 4°C durante 25 min con agitación suave. El extracto de células se centrifugó a 4°C durante 10 min a 10000 rpm. Tanto el sobrenadante como la pastilla se mantuvieron para análisis de Western blot como se describe más adelante. Del sobrenadante, el contenido de proteina se evaluó y aproximadamente 50 ug de proteína se fraccionó sobre 10% de SDS-PAGE. Las pastillas se lavaron con el regulador de pH de lisis y se re-suspendió en 50 ul de regulador de pH Lamelli 1X, se hirvió y se fraccionó sobre SDS-PAGE. Bajo electroforesis, cada gel fue electro-transferido sobre una membrana de nitrocelulosa a 0.6A durante 2 horas. Los sitios no específicos de membrana fueron bloqueados durante 1 hora con 5% de leche descremada en TBST (TBS que contenía 0.1 % (v/v) de Tween-20) a temperatura ambiente. Para ¡munodetección de proteína, las membranas se incubaron durante la noche con anticuerpos primarios producidos contra varios lAPs o anticuerpos primarios de caspasa-3 o caspasa-9 se incubaron a 4°C con agitación a diluciones como sigue: Bajo incubación durante la noche, las membranas recibieron tres lavados de 15 min en TBST, después se incubaron durante 1 hora a temperatura ambiente en presencia de un anticuerpo secundario acoplado con HRP-enzima (Chemicon) y se diluyeron a 1/5 000. Bajo incubación, cada membrana se lavó tres veces con TBST y las bandas inmunorreactivas se detectaron por adición de un sustrato luminiscente (ECL kit Amersham) y captura de señal sobre una película de rayos X durante varios tiempos de exposición. Se mostró que los compuestos activos indujeron la digestión de PARP e indujeron una pérdida de C-IAP1 y C-IAP2 de las células. De manera más específica, los niveles de C-IAP1 se redujeron en células HCT1 16 después de tratamiento durante la noche con compuestos 45, 100, 31 , 59, 44, 40, 67, 91.
Modelo de fibra hueca Un modelo de fibra hueca in vivo se usó para demostrar eficacia in vivo de compuestos seleccionados contra líneas de células seleccionadas como terapia de un solo agente o en combinación con agentes citotóxicos seleccionados. El día 1 , líneas de células seleccionadas se cultivaron y las fibras se llenaron a una densidad de células de aproximadamente 40,000 células/fibra. El día de la operación (día 4), tres fibras se implantaron por vía subcutánea en 28-35 ratones macho Nu/Nu CD-1. El día 5, los ratones empezaron a recibir diariamente inyección por vía subcutánea de vehículo de control o vehículo que contenía el compuesto seleccionado a la concentración apropiada y/o inyección de agente citotóxico por vía ¡ntraperitoneal. A los 4 días de tratamientos consecutivos, los animales fueron sacrificados, cada fibra se removió y la viabilidad metabólica de las células restantes se determinó por prueba de MTT. La eficacia del compuesto se define como la diferencia entre el animal tratado con vehículo y el animal tratado con el compuesto solo o el compuesto dado en combinación del agente citotóxico. El compuesto 31 y el compuesto 56 causaron un 70% de disminución en señal de MTT en fibras de ratones tratados en comparación con fibras de ratones de control tratados con vehículo.
Terapia anticancerosa de combinación in vivo con taxotero Ratones sin pelo CD-1 hembras (aproximadamente 20-25 g) fueron inyectados por vía subcutánea con 1x106 de células H460 en el flanco derecho. Los animales se equilibraron en grupos basados en tamaño de tumor y la terapia de fármaco empezó cuando los tumores tenían -30-50 mm3. Los animales que no tenían tumor o que se consideraron fuera de contexto debido al tamaño de tumor excesivo en este tiempo fueron removidos del estudio. Los animales restantes recibieron Taxotero (o volumen equivalente de vehículo) a 30 mg/kg, ip 2 veces, con una separación de una semana. El compuesto se dio dos veces al día (a 10 mg/kg, se, aproximadamente 6 hr de separación), empezando en el tiempo de Taxotero, y continuando diariamente mientras duraba el experimento. El tamaño del tumor se midió tres veces por semana. Las evaluaciones de salud se realizaron en el tiempo de suministro del compuesto.
Estudio de xenoinjerto de linea de células de cáncer de ovario humanas SKOV-3 Ratones sin pelo CD-1 hembras (aproximadamente 20-25 g) fueron inyectados por vía subcutánea con 5 x 106 de células de tumor de ovario humanas SKOV-3 en 50% de matrigel por via subcutánea en el flanco derecho. El día 55, cuando los tumores tenían aproximadamente 100 mm3, el tratamiento se inició con compuesto en un programa de tratamiento de 5 encendido/2 apagado mientras duraba el experimento. El tamaño del tumor se midió con calibrador digital y se calculó como V= (a x b2)/2, en donde, a era la dimensión más larga y b era la anchura.
Estudio de xenoinjerto de linea de células de cáncer de mama humanas MDA-MB-231 Ratones sin pelo CD-1 hembras (aproximadamente 20-25 g) fueron inyectados por vía subcutánea con 1 x 106 de células de tumor de mama humanas MDA-MB-231 en el flanco derecho. El día 71 , cuando los tumores tenían aproximadamente 90 mm3, el tratamiento se inició con compuesto 3 en un programa de tratamiento de 5 encendido/2 apagado mientras duraba el experimento. El tamaño del tumor se midió con calibrador digital y se calculó como V=(a x b2)/2, en donde, a era la dimensión más larga y b era la anchura.
Estudios farmacocinéticas Los compuestos seleccionados se disolvieron en medio acuoso y se dieron a varias dosis usando diferentes vías de administración, incluyendo bolo intravenoso, infusión intravenosa, oral e inyección subcutánea. Los compuestos de la presente invención despliegan perfiles farmacocinéticos aceptables cuando fueron administrados por varias vías clínicamente relevantes.
Discusión Sin desear estar limitados por la teoría, los inventores de la presente creen que los compuestos de la presente invención se unen dentro de los dominios de BIR de XIAP y evitan la interacción de las caspasas activadas con XIAP y causan una pérdida de proteína XIAP en las células. De manera especifica, los datos de los inventores soportan la noción de que los compuestos de la presente invención pueden reducir significativamente o eliminar esencialmente la interacción de XIAP con caspasa-9 activa y con caspasa-3 activa. Puesto que la caspasa-7 también se puede unir al sitio de BIR2 de XIAP, es posible que los compuestos también puedan evitar que la caspasa-7 activada se una a XIAP. Otros datos muestran también que los compuestos de la presente invención inducen una pérdida de clAP-1 y -2 en células dentro de 1 a 5 horas de adición de compuesto. Por lo tanto, un posible mecanismo es que en muchas células cancerosas, los compuestos de la presente invención se unen a clAPs y mediante degradación mediada por ubiquitina inducen una pérdida de su función y facilitan o inician a las células objetivo para apopotosis. En resumen, los compuestos de la presente invención a través de un contacto directo sobre lAPs, inhiben la función de IAP en las células, inducen o inician a las células para apoptosis, y en ciertas células, sinergizan la actividad de inductores de apoptosis. Toda la literatura, patentes, solicitudes de patente publicadas citadas aquí son incorporadas aquí por referencia en su totalidad. Aunque se han descrito modalidades específicas, los expertos en la técnica reconocerán muchas alteraciones que se podrían hacer dentro del espíritu de la invención, que está definida únicamente de conformidad con las siguientes reivindicaciones:

Claims (8)

NOVEDAD DE LA INVENCION REIVINDICACIONES 1.- Un isómero, enantiómero, diastereoisómero o tautómero de un compuesto representado por la fórmula I: en donde: n es 0 ó 1 ; m es 0, 1 ó 2; Y es NH, O o S; W es en donde X es alquilo de C1-C3 que forma parte de un sistema de anillo, el sistema de anillo siendo opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R 1; o X es parte de un sistema de anillo heterocíclico de 5, 6 ó 7 miembros que incluye opcionalmente uno, dos o tres heteroatomos seleccionados de O, N o S, el sistema de anillo siendo opcionalmente sustituido con uno o más R11; o X es -C(O)-; y G es un sistema de anillo de 5, 6 ó 7 miembros que incluye opcionalmente uno o más heteroátomos seleccionados de O, N o S, el sistema de anillo siendo opcionalmente sustituido con uno o más R1 ; y W1 es en donde R300, R400, R500, R500a, X1, G1 se definen como R3, R4, R5, X y G respectivamente; o W y W se seleccionan independientemente de en donde R3, R4 se definen como R300, R400 respectivamente; B es Q y Q1 se seleccionan independientemente de 1) -CH2-, 2) -CH2CH2-, 3) -CH(alquilo de C C6)-, 4) -CH(cicloalquilo de C3-C7)-, 5) -cicloalquilo de C3-C7-, 6) -CH(alquilo de Ci-C6-cicloalquilo de C3-C7)-; o 7) -C(O)-; A y A1 se seleccionan independientemente de 1) NR6, o 2) NR600; BG es 1) -Y1-L-Y100-; o 2) -L-; o BG es -Y -L1-Z-L100-Y100-, en donde L y L 00 son iguales o L1 y L 00 son diferentes; Y1 y Y100 se seleccionan independientemente de 1) -C(O)-, 2) -S(O)2-, o 3) -C(0)N(R8)-; L, L1 y L100 se seleccionan de: 1) -alquilo de d-C 2-, 2) -alquenilo de C2-C 2-, 3) -alquinilo de C2-C12-, 4) -cicloalquilo de C3-C7-, 5) -cicloalquenilo de C3-C7-, 5) -arilo-, 6) -bifenilo-, 7) -heteroarilo-, 8) -heterociclilo-, 9) -alquilo de C C6-(alquenilo de C2-C6)-alqu¡loCrC6-, 10) -alquilo de Ci-C6-(alquinilo de C2-C4)-alquiloCrC6-, 11) -alquilo de C C6-(cicloalquilo de C3-C7)-alquiloCi-C6-, 12) -alquilo de Ci-C6-arilo-alquiloCi-C6-, 13) -alquilo de Ci-C6-bifenilo-alquiloCrC6-, 14) -alquilo de Ci-C6-heteroarilo-alquiloCrC6-, 15) -alquilo de Ci-C6-heterocicilo-alquiloCrC6-, o 16) -alquilo de CrCg-O-alquilod-Ce-; o L, L1 y L100 se seleccionan de: 1) - N(R°)C(O)N(R8)-, o 2) -alquilo de C C6-Z-alquilo de Ci-C6-; en donde el alquilo, el alquenilo, el alquinilo, el cicloalquenilo y el cicloalquilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R7; y el arilo, el heteroarilo, el bifenilo y el heterociclilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R11; Z se selecciona de: 1) -N(R8)CON(R8)-, 2) -N(R8)C(O)-arilo-C(0)N(R8)-, 3) -N(R8)C(0)-heteroarilo-C(0)N(R8)-, 4) -C(O)-, 5) -S(0)2-, 6) -N(R8)C(O)-, 7) -C(0)N(R8)-, 8) -OC(0)N(R8)-, 9) -S(O)2N(R8)-, 10) -N(R8)-alquilo de C Ci2-N(R8)-, 11) -N(R8)-C(0)C(0)-N(R8)-, 12) -N(R8)-C(0)-alquilo de Ci-C12-C(0)-N(R8)-, 13) -N(R8)-C(0)-arilo-C(O)-N(R8)-, 14) -N(R8)-C(0)-arilo-O-arilo-C(0)-N(R8)-, 15) -N(R8)-C(0)-heteroarilo-C(0)-N(R8)-, 16) -N(R8)-C(0)-bifenilo-C(0)-N(R8)-, 17) -N(R8)-S(O)2-alquilo de C Ci2-S(O)2-N(R8)-, 18) -N(R8)-S(0)2-arilo-S(0)2-N(R8)-, 19) -N(R8)-S(O)2-heteroarilo-S(0)2-N(R8)-, 20) -N(R8)-S(0)2-bifenilo-S(O)2-N(R8)-, 21) -N(R8)-alquilo de C C12-N(R8)-, 22) -N(R8)-arilo-N(R8)-, 23) -N(R8)-heteroarilo-N(R8)-, o 24) -N(R8)-bifenilo-N(R8)-; en donde el alquilo y el cicloalquilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R7, y el arilo, el heteroarilo y el heterociclilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R 1; R y R 00 se seleccionan independientemente de 1) H, o 2) alquilo de C C6 opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; R2, R3, R4, R5, R5a, R200, R300, R4oo R5oo y R5ooa SQn cada uno independientemente H o alquilo de d-C6 opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; R6 y R600 son cada uno independientemente 1) H, 2) halogenoalquilo, 3) «-alquilo de Ci-C6, 4) «-alquenilo de C2-C6, 5) «-alquinilo de C2-C4, 6) «-cicloalquilo de C3-C7, 7) «-cicloalquenilo deC3-C7, 8) — arilo, 9) «-heteroarilo, 10) «-heterociclilo, 11) -heterob¡ciclilo, 12) «-(O)(O)n-R12, 13) «-(=Y)NR9R10, o 14) <-S(O)2-R12, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R 1; R7 es 1) halógeno, 2) N02, 3) CN, 4) halogenoalquilo, 5) alquilo de CrC6, 6) alquenilo de C2-C6, 7) alquinilo de C2-C4, 8) cicloalquilo de C3-C7, 9) cicloalquenilo de C3-C7, 10) arilo, 11) heteroarilo, 12) heterociclilo, 13) heterobiciclilo, 14) OR8, 15) S(O)m R8, 16) NR9R10, 17) NR9S(0)2R12, 18) COR8, 19) C(O)OR8, 20) CONR9R10, 21) S(O)2NR9R10, 22) OC(O)R8, 23) OC(O)Y-R12, 24) SC(O)R8, o 25) NC(Y)R9R10, en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R1 ¡ R8 es 1) H, 2) halogenoalquilo, 3) alquilo de C1-C6, 4) alquenilo de C2-C6, 5) alquinilo de C2-C4, 6) cicloalquilo de C3-C7, 7) cicloalquenilo de C3-C7, 8) arilo, 9) heteroarilo, 10) heterociclilo, 1) heterobiciclilo, 12) R9R10NC(=Y), o 13) alquilo de C C6-alquenilo de C2-C , o 14) alquilo de CrC6-alquin¡lo de C2-C4, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R11; R9 y R 0 son cada uno independientemente
1) H, 2) halogenoalquilo, 3) alquilo de C C6, 4) alquenilo de C2-C6, 5) alquinilo de C2-C4, 6) cicloalquilo de C3-C7, 7) cicloalquenilo de C3-C7, 8) arilo, 9) heteroarilo, 10) heterociclilo, 11) heterobiciclilo, 12) C(O)R12, 13) C(0)Y-R12, o 14) S(O)2- R12, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R11; o R9 y R 0 junto con el átomo de nitrógeno al cual están unidos forman un anillo heterociclico de cinco, seis o siete miembros opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes R7; R11 es 1) halógeno, 2) N02, 3) CN, 4) B(OR 3)(OR14), 5) alquilo de d-C6, 6) alquenilo de C2-C6, 7) alquinilo de C2-C4> 8) cicloalquilo de C3-C7, 9) cicloalquenilo de C3-C7, 10) halogenoalquilo, 11) OR8, 12) NR9R10, 13) SR8, 14) COR8, 15) C(O)OR8, 16) S(O)mR8, 17) CONR9R10, 18) S(O)2NR9R10, 19) arilo, 20) heteroarilo, 21) heterociclilo, o 22) heterobiciclilo, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo y cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; R 2 es 1) halogenoalquilo,
2) alquilo de CrC6, 3) alquenilo de C2-C6, 4) alquinilo de C2-C4, 5) cicloalquilo de C3-C7, 6) cicloalquenilo de C3-C7, 7) arilo, 8) heteroarilo, 9) heterociclilo, o 10) heterobiciclilo, en donde el alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R1 ; R 3 y R14 son cada uno independientemente 1) H, o 2) alquilo de C1-C6; o R13 y R14 se combinan para formar un sistema de anillo; o un profármaco, o una sal farmacéuticamente aceptable, o marcado con un marcador detectable o una etiqueta de afinidad del mismo. 2. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque es una sal farmacéuticamente aceptable. 3. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque es un profármaco. 4. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque W es y W1 es en donde R300, R400 R500, R500a, X1 se definen como R3, R4, R5, R5a, y X respectivamente. 5.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque W es y W es en donde R500, R500a, X1 , G1 se definen como R5, Ra, X y G respectivamente. 6 - El compuesto de conformidad con la reivindicación caracterizado además porque W es en donde R500, R500a, G1 se definen como R5, R5a, y G respectivamente. 7 - El compuesto de conformidad con la reivindicación caracterizado además porque W es en donde R3, R4 se definen como R300, R400 respectivamente. 8.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 caracterizado además porque B es 9. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 8, caracterizado además porque Q y Q1 son ambos -CH2-. 10. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 8, caracterizado además porque Q y Q1 son ambos -C(O)-. 1 1. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 8, caracterizado además porque A y A1 se seleccionan independientemente de 1 ) NR6, o 2) NR600. 12. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 8, caracterizado además porque BG es -Y1-L-Y100-. 13. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 8, caracterizado además porque BG es -L-. 14.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 8, caracterizado además porque BG es -Y1-|_1-Z-L100-Y100-, en donde L1 y L100 son iguales o L y L 00 son diferentes. 15.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1A. 16.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1A1 : 17 - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1A2: 18.- El compuesto de conformidad con la reivindicación caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1A3: 1A3. 19. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1A4: 1A4. 20. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1A5: 1A5. 21.- El compuesto de conformidad con la reivindicación aracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1A6: 1A6. 22.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1 B: 1 B. 23.- El compuesto de conformidad con la reivindicación racterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1 B1 : 1 B1. 24 - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1 B2: 1 B2. 25.- El compuesto de conformidad con la reivindicación racterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1 C: 1 C. 26. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque comprende compuestos de la fórmula 1 D: 1 D 27. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque Y1 y Y100 son ambos -C(O)-. 28. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque Y1 y Y100 son ambos -S(0)2-. 29. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque Y1 y Y100 son ambos -C(O)N(R8)-. 30.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque L, L1 y L100 se seleccionan de: 1 ) -alquilo de C C-I2-, 2) -cicloalquilo de C3-C7-, 3) -arilo-, 4) -bifenilo-, 5) -heteroarilo-, 6) -heterociclilo-, 7) -alquilo de CrC6-(cicloalquilo de C3-C7)-alquilo de Ci-C6, 8) -alquilo de CrC6-arilo-alquilo de CrC6, 9) -alquilo de CrC6-bifenilo-alquilo de Ci-C6, 10) -alquilo de CrC6-heteroarilo-alquilo de C C6, 11) -alquilo de d-C6-heterociclilo-alquilo de CrC6, o 12) -alquilo de C C6-0-alquilo de C-|-C6, en donde el alquilo, y el cicloalquilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R7; y el arilo, el heteroarilo, el bifenilo y el heterociclilo son opcionalmente sustituidos con uno o más R11 sustituyentes. 31 - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque L, L1, y L100 son -N(R8)C(O)N(R8)-. 32. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque L, L1 y L100 son -alquilo de CrCe-Z-alquilo de
Ci-C6-, en donde el alquilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7. 33. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 32, caracterizado además porque Z se selecciona de: 1) -N(R8)CON(R8)-, 2) -N(R8)C(0)-arilo-C(0)N(R8)-, 3) -N(R8)C(0)-heteroarilo-C(O)N(R8)-, 4) -C(O)-, 5) -N(R8)-alquilo de C Ci2-N(R8)-, 6) -N(R8)-C(0)C(0)-N(R8)-, 7) -N(R8)-C(0)-alquilo de C C12-C(0)-N(R8)-, 8) -N(R8)-C(0)-arilo-C(O)-N(R8)-, 9) -N(R8)-C(0)-arilo-O-arilo-C(O)-N(R8)-, 10) -N(R8)-C(O)-heteroarilo-C(O)-N(R8)-, 11) -N(R8)-C(0)-bifenilo-C(0)-N(R8)-, 12) -N(R8)-S(O)2-alquilo de C C12-S(O)2-N(R8)-, 13) -N(R8)-S(O)2-arilo-S(O)2-N(R8)-, 14) -N(R8)-S(O)2-heteroarilo-S(0)2-N(R8)-, o 15) -N(R8)-S(O)2-bifenilo-S(O)2-N(R8)-, en donde el alquilo y el cicloalquilo son opcionalmente sustituidos con uno o más R7 sustituyentes, y el arilo, el heteroarilo y el heterociclilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R11. 34.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque R1, R1a, R100 y R100 se seleccionan independientemente de H o CH3. 35.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque tanto R2 como R200 despliegan estereoquímica (S). 36. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque R3 y R300 se seleccionan independientemente se seleccionan independientemente de 1) H, o 2) alquilo de C C6 opcionalmente sustituido con un sustituyente de R7. 37. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 36, caracterizado además porque R3 y R300 incluyen H, (S)-metilo, (S)-etilo, (S)-ter-butilo, (S)-ciclohexilmetilo, (S)-2-feniletilo y (S)-butilcarbamato de bencilo. 38.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque R6 y R600 son cada uno independientemente 1) H, 2) <-alquilo de Ci-C6, 3) <-arilo, o en donde el alquilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R7; y en donde el arilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes de R 1. 39.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 38, caracterizado además porque R6 y R600 incluyen H, -CH(CH3)2, -CH2CH2C(CH3)3, 40. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque R7 es 1) cicloalquilo de C3-C7, 2) arilo, 3) heteroarilo, o 4) NHC(O)OCH2fenilo, en donde el arilo y el heteroarilo son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes de R 1. 41. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque R8 se selecciona de 1) H, 2) halogenoalquilo, 3) alquilo de CrC6,
4) cicloalquilo de C3-C7,
5) arilo,
6) heteroarilo,
7) heterociclilo, o
8) heterobiciclilo, en donde el alquilo, cicloalquilo, son opcionalmente sustituidos con uno o más sustituyentes R7; y en donde el arilo, heteroarilo, heterociclilo y heterobiciclilo es opcionalmente sustituido con uno o más sustituyentes R11. 42 - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque R 1 es 1 ) halógeno, 2) CF3, 3) OH, 4) OMe, 5) arilo, o 6) heteroarilo. 43.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 42, caracterizado además porque R11 incluye F, Cl, Br, OH, OMe, CF3, fenilo y tetrazol. 44 - El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , seleccionado del grupo que consiste de: Comp Estructura # 1 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 ?33 45.- Un compuesto intermediario representado por la fórmula 1-v: 1-v en donde PG3, R1 , R2, R3, R4, R5, R5a, X y R6 son como se define en la reivindicación 1. 46.- Un compuesto intermediario representado por la fórmula 5-i: 5-i en donde PG3, R1 , R2, R3, R4, R5, R5a, X y R6 son como se define en la reivindicación 1. 47.- Un compuesto intermediario representado por la fórmula 6- 6-iv en donde R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, X, X1 y L son como se define en la reivindicación 1. 48.- Un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 2-i, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representados por la fórmula 1-v: 1-v y LG-C(O)-L-C(O)-LG en un solvente con a base; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 2-i: 2-¡ l-ii en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, X, X1 y L son como se define aquí. 49.- Un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 3-i, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representados por la fórmula 1-v: 1-v y LG-S(O)2-L-S(0)2-LG en un solvente con una base; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 3-i en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, X1 X1 y L son como se define aquí. 50.- Un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 4-i, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representados por la fórmula 1-v: 1-v y LG-L-LG en un solvente con una base; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 4-i: 4-i en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, X, X1 y L son como se define aquí. 51.- Un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 5-ii, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representados por la fórmula 5-i: 5-ii en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, R6, Reoo R8 R8OO x ?? y L SON COMO SE DEFINE AQU¡ 52.- Un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula 6-v, el procedimiento comprende: a) mezclar dos intermediarios representados por la fórmula 6-¡v: 6-¡v -C02H PG R3 en un solvente con un agente acoplador; y b) desproteger PG3 para proveer un compuesto de la fórmula 6-v: 6-v en donde PG3, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, Reoo Ra Rsoo x x y i_ son como se define aqui 53.- Un compuesto intermediario representado por la fórmula I en donde PG4, R1, R2, R3, R4, R5, R5a, X, y R6 son como se define en la reivindicación 1. 54.- Un compuesto intermediario representado por la fórmula I- l-iia en donde PG4, PG400, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, A, A1, Q, Q , X, X1 y BG son como se define en la reivindicación 1. 55.- Un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula I, descritos anteriormente, el procedimiento comprende: a) poner en puente dos intermediarios representados por la fórmula -ia: R6 l ia en donde PG4, R1, R2, R3, R4, R5, R5a, X, Q, y R6 son como se define aquí, en un solvente para proveer un intermediario representado por l-iia l-iia en donde PG4, PG400, R1, R100, R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, A, A1, Qi Q1 , X, X1 y BG son como se define aquí, y b) remover los grupos protectores PG4 y PG400 para formar compuestos de la fórmula 1. 56. - Un compuesto intermediario representado por la fórmula l-ib: PG4 o R3 R2 H O QX H N' R6 I-ib en donde PG4, R1, R2, R3, R4, R5, R5a, X, Q, y R6 son como se define en la reivindicación 1. 57. - Un compuesto intermediario representado por la fórmula I-iib: l-iib en donde PG4, PG400, R1, R 00, R2, R200, R3, R300, R4 R400 R5 R5a Rsoo R5ooa A, A1, Q, Q1, X, X1 y BG son como se define en la reivindicación 1. 58 - Un procedimiento para producir compuestos representados por la fórmula I, descritos anteriormente, el procedimiento comprende: a) poner en puente dos intermediarios representados por la fórmula l-ib: PG4 O R3 R R2 H O Q H R6 I-ib en donde PG4, R1, R2, R3, R4, R5, R5a, X, Q, y R6 son como se define aquí, en un solvente para proveer un intermediario representado por l-iib l-iib en donde PG4, PG400, R1, R100 R2, R200, R3, R300, R4, R400, R5, R5a, R500, R500a, A, A1, Q, Q1, X, X1 y BG son como se define aquí; y b) remover los grupos protectores PG4 y PG400 para formar compuestos de la fórmula 1. 59. - Un método para la preparación de una sal farmacéuticamente aceptable de compuesto de la fórmula I, de la reivindicación 1 , mediante el tratamiento de un compuesto de la fórmula I con 1 a 2 equivalentes de un ácido farmacéuticamente aceptable. 60. - Una composición farmacéutica que comprende un compuesto de la fórmula I, de la reivindicación 1 , mezclado con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable. 61. - Una composición farmacéutica adaptada para administración como un agente para tratar un trastorno proliferativo en un sujeto, que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de un compuesto, de la reivindicación 1. 62. - Una composición farmacéutica que comprende un compuesto de la fórmula I, de la reivindicación 1 , en combinación con uno o más agonistas de receptor de muerte, por ejemplo, un agonista de receptor de TRAIL. 63. - Una composición farmacéutica que comprende un compuesto de la fórmula I, de la reivindicación 1 , en combinación con cualquier agente terapéutico que incrementa la respuesta de uno o más agonistas de receptor de muerte. 64.- La composición de conformidad con la reivindicación 63, caracterizada además porque el agente terapéutico es una citocina citotóxica. 65. - La composición de conformidad con la reivindicación 64, caracterizada además porque la citocina es un interferón. 66. - Un método para preparar una composición farmacéutica, el método comprende: mezclar un compuesto, de conformidad con la reivindicación 1 , con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable. 67. - El uso de una composición farmacéutica de la reivindicación 60, en la elaboración de un medicamento útil para tratar un estado de enfermedad determinado por apoptosis insuficiente. 68. - Un método para modular la función de IAP, el método comprende: poner en contacto una célula con un compuesto, de la reivindicación 1 , para prevenir la unión de una proteína de unión de BIR a un dominio de BIR de IAP modulando asi la función de IAP. 69. - El uso de la composición farmacéutica de la reivindicación 60, en la elaboración de un medicamento útil para tratar una enfermedad proliferativa. 70.- El uso de la composición farmacéutica de la reivindicación 60, en la elaboración de un medicamento útil para tratar cáncer. 71 - El uso de una composición farmacéutica de la reivindicación 60, y un agente seleccionado de: a) un modulador de receptor de estrógeno, b) un modulador de receptor de andrógeno, c) un modulador de receptor de retinoide, d) un agente citotóxico, e) un agente antiproliferativo, f) un inhibidor de prenil-proteina transferasa, g) un inhibidor de HMG-CoA reductasa, h) un inhibidor de proteasa de VIH, i) un inhibidor de transcriptasa inversa, k) un inhibidor de angiogénesis, I) un agonista de PPAR-?, m) un agonista de PPAR-d, n) un inhibidor de resistencia a fármacos múltiples inherente, o) un agente antiemético, p) un agente útil en el tratamiento de anemia, q) agentes útiles en el tratamiento de neutropenia, r) un fármaco inmunológico-incrementador, s) un inhibidor de proteosoma; t) un inhibidor de HDCA; u) un inhibidor de la actividad similar a quimiotripsina en el proteosoma; o v) inhibidores de E3 ligasa; w) un modulador del sistema inmune tal como, pero sin limitarse a, interferón-alfa, Bacillus de Calmette-Guerin (BCG), y radiación ionizante (UVB) que puede inducir la liberación de citocinas, tales como las interleucinas, FNT, o inducir la liberación de ligandos de receptor de muerte tales como TRAIL; x) un modulador de TRAIL de receptores de muerte y agonistas de TRAIL tales como los anticuerpos humanizados HGS-ETR1 y HGS-ETR2, en la elaboración de un medicamento útil para tratar el cáncer, en donde el medicamento está adaptado para ser administrable en combinación o secuencialmente con terapia de radiación. 72.- El uso de la composición de la reivindicación 60, en la elaboración de un medicamento útil para el tratamiento o prevención de un trastorno proliferativo en un sujeto. 73. - El uso como el que se reclama en la reivindicación 72, en donde el medicamento está además adaptado para ser administrable antes de, simultáneamente con o después de un agente quimioterapéutico. 74. - El uso como el que se reclama en la reivindicación 72, en donde el medicamento está además adaptado para ser administrable antes de, simultáneamente con o después de un agonista de receptor de muerte. 75. - El uso como el que se reclama en la reivindicación 74, en el cual el agonista de receptor de muerte es TRAIL o el agonista de receptor de muerte es un anticuerpo de TRAIL. 76 - El uso como el que se reclama en la reivindicación 74, en el cual el agonista de receptor de muerte es administrable en una cantidad que produce un efecto sinergístico. 77.- El uso del compuesto de la reivindicación 1 , para la elaboración de un medicamento, útil para tratar o prevenir un estado de enfermedad determinado por apoptosis insuficiente. 78.- El uso del compuesto déla reivindicación 1 , para la elaboración de un medicamento útilpara tratar o prevenir un trastorno proliferativo. 79.- El uso del compuesto de la reivindicación 1 , en combinación con un agente para la fabricación de un medicamento para tratar o prevenir un trastorno proliferativo, en donde el agente se selecciona de: a) un modulador de receptor de estrógeno, b) un modulador de receptor de andrógeno, c) un modulador de receptor de retinoide, d) un agente citotóxico, e) un agente antiproliferativo, f) un inhibidor de prenil-proteína transferasa, g) un inhibidor de HMG-CoA reductasa, h) un inhibidor de proteasa de VIH, i) un inhibidor de transcriptasa inversa, k) un inhibidor de angiogénesis, I) un agonista de PPAR-?, m) un agonista de PPAR-d, n) un inhibidor de resistencia a fármacos múltiples inherente, o) un agente antiemético, p) un agente útil en el tratamiento de anemia, q) agentes útiles en el tratamiento de neutropenia, r) un fármaco inmunológico-incrementador, s) un inhibidor de proteosoma, t) un inhibidor de HDCA, u) un inhibidor de la actividad similar a quimiotripsina en el proteosoma; o v) inhibidores de E3 ligasa; w) un modulador del sistema inmune tal como, pero sin limitarse a, interferón-alfa, Bacillus de Calmette-Guerin (BCG), y radiación ionizante (UVB) que puede inducir la liberación de citocinas, tales como las interleucinas, FNT, o inducir liberación de ligandos de receptor de muerte tales como TRAIL; x) un modulador de TRAIL de receptores de muerte y agonistas de TRAIL tales como los anticuerpos humanizados HGS-ETR1 y HGS-ETR2; en donde el medicamento está adaptado para ser administrable en combinación o secuencialmente con terapia de radiación. 80.- El uso del compuesto de la reivindicación 1 , en combinación con un agonista de receptor de muerte para la fabricación de un medicamento para el tratamiento o prevención de un trastorno proliferativo en un sujeto. 81.- Una composición farmacéutica que comprende el compuesto de la reivindicación 1 , mezclado con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable, para tratar o prevenir un estado de enfermedad caracterizado por apoptosis insuficiente. 82. - Una composición farmacéutica que comprende el compuesto de la reivindicación 1 , en combinación con cualquier compuesto que incrementa el nivel circulante de uno o más agonistas de receptor de muerte para prevenir o tratar un trastorno proliferativo. 83. - Un método para preparar una composición farmacéutica, el método comprende: mezclar el compuesto, de la reivindicación 1 , con un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable. 84. - Una sonda, la sonda siendo un compuesto de la fórmula I, de la reivindicación 1 , el compuesto siendo marcado con un marcador detectable o una etiqueta de afinidad. 85.- La sonda de conformidad con la reivindicación caracterizada además porque tiene la siguiente fórmula: 86.- Un método para identificar compuestos que se unen a un dominio de BIR de IAP, la prueba comprende: a) poner en contacto un dominio de BIR de IAP con una sonda para formar un complejo de sonda:dominio de BIR, la sonda siendo desplazable por un compuesto de prueba; b) medir una señal de la sonda para establecer un nivel de referencia; c) incubar el complejo de sonda:dominio de BIR con el compuesto de prueba; d) medir la señal de la soda; e) comparar la señal del paso d) con el nivel de referencia, una modulación de la señal siendo una indicación de que el compuesto de prueba se une al dominio de BIR, en donde la sonda es un compuesto de la fórmula I marcado con un marcador detectable o un marcador de afinidad.
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