MX2008010605A - Marcadores de tumores vasculares - Google Patents

Marcadores de tumores vasculares

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MX2008010605A
MX2008010605A MX/A/2008/010605A MX2008010605A MX2008010605A MX 2008010605 A MX2008010605 A MX 2008010605A MX 2008010605 A MX2008010605 A MX 2008010605A MX 2008010605 A MX2008010605 A MX 2008010605A
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MX/A/2008/010605A
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Neri Dario
Rosli Christoph
Raybak Jaschanikolai
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Neri Dario
Philogen Spa
Raybak Jaschanikolai
Roesli Chistoph
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La presente invención se refiere a un método para identificar estructuras neovasculares en tejido de mamífero, en donde las estructuras neovasculares son identificadas por la detección de al menos una proteína específica en dicho tejido.Ésta se refiere también a un método para identificar enfermedades o condiciones asociadas con la neovascularización, los métodos para dirigir y/o formar de imágenes de estructuras neovasculares y los métodos para dirigir esas enfermedades o condiciones asociadas con la neovascularización. Además, la presente invención estádirigida al uso de los nuevos y/o conocido ligandos, preferentemente anticuerpos, dirigidos contra proteínas objetivo nuevas y/o conocidas para identificar células tumorales en tejido de mamífero, preferentemente tejido real de mamífero, más preferentemente tejido renal vascular de mamífero. La presente invención también se refiere a nuevos ligandos, preferentemente anticuerpos, proteínas de fusión que comprenden los ligandos o anticuerpos, composiciones farmacéuticas y de diagnostico que comprenden los ligandos, anticuerpos o proteínas de fusión, métodos de diagnóstico y terapéuticos, asícomo las nuevas proteínas y polinucleótidos correspondientes, vectores y células hospederas.

Description

MARCADORES DE TUMORES VASCULARES CAMPO DE LA INVENCION La presente invención se refiere a un método para identificar estructuras neovasculares en tejidos de mamífero, en donde las estructuras neovasculares son identificadas por la detección de al menos una proteína específica en el tejido. Esta se refiere también a un método para identificar enfermedades o condiciones asociadas con la neovascularización, los métodos para la dirección al objetivo y/o la formación de imágenes de las estructuras neovasculares y los métodos para dirigirse a las enfermedades o condiciones asociadas con la neovascularización. Además, la presente invención está dirigida al uso de ligandos nuevos y/o conocidos, preferentemente anticuerpos, dirigidos contra proteínas objetivo nuevas y/o conocidas para identificar las células tumorales en el tejido de mamífero, preferentemente tejidos de riñon de mamífero, más preferentemente tejido renal vascular de mamífero. La presente invención también se refiere a los nuevos ligandos, preferentemente anticuerpos, proteínas de fusión que comprenden los ligandos o anticuerpos, las composiciones farmacéuticas y de diagnóstico que comprenden dichos ligandos, los anticuerpos o las proteínas de fusión, los métodos de diagnóstico terapéuticos, así como las nuevas proteínas y los polinucleótidos correspondientes, REF. : 194256 vectores y células hospederas. ANTECEDENTES DE LA INVENCION Es bien conocido en el campo de la oncología que el crecimiento de los tumores sólidos dependen de su capacidad para adquirir un suministro sanguíneo de soporte o apoyo. Los antiangiogénicos que previenen la vascularización en una etapa temprana han sido un enfoque antitumoral promisorio. Un consejo terapéutico más reciente es la destrucción dirigida de las vasculatura tumoral establecida. La dirección a los objetivos vasculares ha mostrado ya que es una estrategia antitumoral efectiva en modelos animales (Neri, D. y Bicknell, R., Nature reviews. Cáncer, vol . 5, 436-446, Junio 2005) y la prueba clínica para un número de compuestos promisorios ha iniciado. La dirección al objetivo de la vasculatura tumoral establecida presenta una alternativa, posiblemente complementaria y ciertamente una terapia de amplio intervalo. Ha sido ampliamente conocido que el endotelio y el estroma establecido en tumores difiere de aquel en el tejido normal, pero sólo recientemente estas diferencias han comenzando a ser caracterizadas a nivel molecular. Las proteínas que son expresadas sobre las células endoteliales o en el estroma circunvecino de los tumores han sido sugeridas para el objetivo terapéutico (Neri y Bicknell, 2005, supra) . Por ejemplo, la toxina ricina fue conjugada a anticuerpos de alta afinidad dirigidas a un antigeno MHC de la clase II de ratón, en tumores sólidos. El conjugado fue inyectado dentro de ratones intravenosamente y el anticuerpo distribuyó la ricina específicamente al endotelio tumoral donde ésta, fue internalizada, promoviendo la muerte celular con un colapso subsecuente de la vasculatura y la erradicación del tumor sólido (Burrows, F.J. y Thorpe, P. E . , PNAS USA 90, 8996-9000 (1993) . Las proteínas expresadas específicamente sobre la vasculatura tumoral pero no en la vasculatura de tejidos normales no puede ser únicamente realizada para la dirección al objetivo antitumoral sino también para fines de diagnóstico, en particular de formación de imágenes. Para identificar los objetivos vasculares tumorales, la mayoría de los estudios están basados en aislados de células endoteliales in vitro, que están expuestas a condiciones de cultivo aunque para imitar aquellas en tejidos normales y tumorales y una gama de técnicas moleculares fueron luego empleadas para identificar los genes diferencialmente expresados. Aunque las diferencias en la expresión de los genes eran aparentes, probó ser difícil el identificar las proteínas diferencialmente expresadas ¦ al nivel molecular. Otro procedimiento popular ha sido producir anticuerpos para diferentes estructuras endoteliales que conducen a la identificación de nuevos marcadores endoteliales pero fallaron en identificar los genes diferencialmente expresados, posiblemente debido a que tales proteínas son un componente menor de los componentes abundantes sobre la superficie celular. En otro procedimiento reciente, la vasculatura ha sido también tomada como objetivo in vivo con anticuerpos dirigidos a los antígenos vasculares. En otro procedimiento de dirección al objetivo in vivo reciente, los presentes inventores identificaron antígenos accesibles en órganos normales y en tumores basados en perfusión terminal de ratones que poseen tumores, con derivados de ésteres reactivos de biotina (Rybak et al., Nat . Methods 2, 291, Abril 2005) . Los objetivos vasculares específicos del tumor proporcionan información importante de diagnóstico del tumor y también permiten dirigirse específicamente a los compuestos antitumorales . La acumulación específica en la vasculatura tumoral reduce activamente los efectos colaterales tóxicos que están típicamente asociados con los compuestos antitumorales en otros sitios en el tejido normal y, en consecuencia, permiten la reducción de la concentración de los agentes tóxicos. Además, los agentes antitumorales específicos de la vasculatura tumoral pueden ser microinyectados en el flujo arterial de la sangre hacia un tumor sólido, acoplarse a la vasculatura y, con esto proporcionar un mínimo del eflujo tóxico.
En resumen, los objetivos vasculares para tumores en general y, en particular, para tumores específicos, tumores específicos de órganos, etc., proporcionan una herramienta importante para el diagnóstico y terapia de tumores. BREVE DESCRIPCION DE LA INVENCION Un objetivo de la presente invención es identificar las estructuras neovasculares en tejidos de mamífero, en particular en tejidos maduros. Otro objetivo más es la identificación de una enfermedad o condición relacionada a la neovascularización en un mamífero. Un objetivo adicional es la provisión de métodos para dirigirse al objetivo y/o formar la imagen de estructuras neovasculares en tejidos de mamífero, en particular tejidos maduros, más particularmente en tejidos detectados por una enfermedad. También, un objetivo de la presente invención es proporcionar objetivos tumorales específicos y los usos para los mismos. Otro objetivo más subyacente a la presente invención es la provisión de objetivos tumorales específicos de los ríñones, en particular objetivos tumorales renales vasculares. La presente invención proporciona los nuevos objetivos polipeptídicos para identificar las estructuras neovasculares, en particular estructuras neovasculares en enfermedades asociadas con la neovascularización en tejidos de mamífero tales como tumores, degeneración macular, artritis y ateroesclerosis .
Las estructuras de la neovasculatura, como son definidas en la presente, son células endoteliales, matriz extracelular , pericitos, otros componentes del estroma y/o células enfermas en estrecha proximidad de los vasos. Tales estructuras de la neovascultura pueden ser encontradas en tumores, pero también en otros trastornos relacionados a la angiogénesis tales como, por ejemplo, degeneración macular, arterioesclerosis , artritis reumatoide, etc. Estos nuevos objetivos polipept idicos vasculares son seleccionados del grupo que consiste de: (1) Periostina [precursor] incluyendo las isoformas de la misma y las nuevas variantes de empalme A, B, D, E, (2) el receptor 42 acoplado a la proteina G putativa, incluyendo las isoformas del mismo, (3) la familia 2 de portadores de solutos, 'el miembro 1 de transportador facilitado de glucosa, (4) la proteina de núcleo versican [precursor], (5) CEACAM3 incluyendo isoformas del mismo, (6) Fibromodulina , (7) Homólogo de peroxidasina [fragmento], (8) probable receptor 37 acoplado a la proteina G [precursor], (9) Proteina sidekick-1 (patada lateral-1) [precursor], (10) Canal de calcio dependiente del voltaje alfa 1A, (11) Proteina EMILIN2 [fragmento], (12) Proteina 8 de la región critica del síndrome de Down, incluyendo isoformas de la misma, (13) Probable receptor 113 acoplada a la proteína G [precursor] , (14) Proteína ANXA4 [fragmento] incluyendo isoformas de la misma, (15) Uromodulina similar a 1 [precursor] incluyendo isoformas de la mismas, (16) El miembro 2 de la clase F de receptor depurador [precursor], (17) Proteina 2 que contiene el dominio de Sushi [precursor], (18) Proteina tumoral, traduccionalmente controlada 1, (19) Receptor Q8TDU0 acoplado a la proteina G putativa, (20) Proteina hipotética DKFZp686K0275 [fragmento], (21) Proteina transmembranal TMEM55A, (22) Proteina hipotética Q8WYY4, (23) Familia con similitud de secuencia 116, miembro A, (24) Proteina C6orf66 de UPF0240, (25) CDNA fis FLJ45811, clon NT2RP7014778 , (26) Proteina hipotética DKFZp77901248 , (27) Beta-ureidopropionasa, (28) Proteina hipotética DKFZp434F1919 incluyendo isoformas de la misma, (29) Rica en cisteina con proteina 2 del dominio similar a EGF [precursor] incluyendo isoformas de la misma, (30) Proteina KIAA0100 de la familia UPF0378 [precursor] (31 ) Miembro 1 de la subfamilia H del canal con compuerta de entrada por voltaje, de potasio, incluyendo isoformas de la misma . Algunos de los objetivos neovasculares anteriores son proteínas conocidas, mientras que otras han sido postuladas como proteínas provenientes de la identificación de secuencias nucleotídicas que pueden codificar para tal proteína. Una lista de (i) las treinta y un proteínas anteriormente mencionadas y (ii) los números de acceso correspondientes de las secuencias de aminoácidos y nucleótidos disponibles que codifican para ellas (Swiss. Prot.) asi como (iii) los números de identificación de secuencia (SEQ ID Nos.) relacionadas a la secuencia listadas más adelante, se proporcionan en la siguiente Tabla 1. Tabla 1 # Nombre (sinónimos) (comentarios Swiss . SEQ ID Prot . Nos . : Acceso AA, NA** No. 1 Periostina [precursor] Q150631 1, 2 factor 2 especifico de osteoblastos, OSF-2) (Otra isoformas OTTHUMP00000018269 (Periostina, Q5VSY8 3, 4 factor especifico de osteoblastos, isoforma CRA_a, proteina POSTN) OTTHUMP00000018270 Q5VSY7 5, 6 OTTHU P00000018271 Q5VSY6 7, 8 Variante A 9, 10 Variante B 11, 12 Variante D 13, 14 Variante E 15, 16 Receptor 42 acoplado a la 015529 17, 18 proteina G putativa (Otras isoformas:) Receptor 3 de ácido graso libre 014843 19, 20 (receptor 41 acoplado a la proteina G) Familia 2 del portador de soluto, P11166 21, 22 miembro 1 del transportador facilitado de glucosa (transportador de glucosa tipo 1, eritrocito/cerebro; transportador de glucosa HepG2 ) Proteina de núcleo versican P13611 23, 24 [precursor] (proteoglicano de fibroblasto grande, proteina 2 del núcleo de proteoglicano de sulfato de condroitina, PG-M, proteina de enlace al hialuronato de glial, GHAP) CEACAM 3 Q6UY47 25, 26 (Otras isoformas:) Molécula 21 de adhesión celular Q3KP10 27, 28 relacionada al antigeno carcinoembrionario R29124_l 075296 29, 30 Fibromodulina ( Fibromodulina, Q81V47 31, 32 isoforma CRA_a) Homólogo de peroxidasina Q92626 33, 34 [fragmento] (antigeno MG 50 asociado al melanoma) Probable receptor 37 acoplado a 015354 35, 36 la proteina G [precursor] (proteína 1 similar al receptor de endotelina B, ETBR-LP-1, receptor similar al receptor de endotelina asociada a Parkin, PAELR) Proteina sidekick-1 [precursor] Q8TEN9 37, 38 (antiguamente identificada como proteína FLJ00154) Canal de calcio dependiente del Q9NS88 39, 40 voltaje alfalA Proteina EMILIN2 [fragmento] Q8N5L1 41, 42 Proteina 8 de la región critica Q96T75 43, 44 del síndrome de Do n (proteína 1 asociada al melanoma maligno, MMA-1, proteína MTAG2 ) (Otras isoformas:) Proteina asociada al melanoma Q6EXA9 45 maligno (gen 8 de la región crítica del síndrome de Down, isoforma CRA_b) Proteina asociada al melanoma Q96T75-2 47 maligno MTAG6 Q96T75-3 48 MMA-l3 Q96T75-4 49 MMA-lb Receptor 113 probable acoplado a Q81ZF5 50, 51 la proteina G [precursor] (receptor PGR23 acoplado a la proteína G) Proteina ANXA4 [fragmento] Q6LES2 52, 53 (proteína hipotética ANXA4 , proteína 28 inductora de proliferación) (Otras isoformas:) Anexina A4 (anexina IV, P09525 54, 55 lipocortina IV, endonexina I; cromobindina-4 , proteína II, P32.5, proteína anticoagulante placentaria II, PAP-II, PP4-X, calcimedina 35-beta, proteína P33/P41 de enlace a los carbohidratos, P33/41) 1 similar a uromodulina Q5D1D0 56, 57 [precursor] (olfactorin) (Otras isoformas:) Q5DID0-2 Q5D1D0-2 58 UMOLD1S Q5D1D0-3 59 UMOLD1L Q5D1D0-4 60 Miembro 2 de la clase F del Q96GP6 61, 62 receptor depurador [precursor] (receptor depurador expresado por la proteína de células endoteliales 2, SREC-II, SRECRP-1) Proteina 2 que contiene el Q9UGT4 63, 64 dominio de Sushi [precursor] (antiguamente identificada como BK65A6.2) Proteina tumoral, Q5W0H4 65,66 traduccionalmente controlada 1 Receptor Q8TDU0 acoplada a la Q8TDU0 67, 68 proteina G putativa (HCG2044627) Proteina hipotética DKFZp686K0275 Q7Z3A1 69, 70 [fragmento] 21 Proteina transmembranal TMEM55A Q8N4L2 71, 72 (proteina hipotética TMEM55A, EC 3.1.3-tipo II fosfatidilinositol- , 5-biofosfato 4-fosfatasa, Ptdlns-4, 5-P24-Ptasa II) 22 Proteina hipotética Q8WYY4 Q8WYY4 73, 74 23 Familia con similitud secuencial Q8IWOF6 75, 76 116, miembro A (proteina hipotética FLJ34969) 24 Proteina C60rf66 de UPF0240 Q9P032 77, 78 CDNA FLJ45811 fis, clon Q6ZS59 79, 80 NT2RP7014778 (antiguamente identificada como proteina FLJ45811) 26 Proteina hipotética DKFZp77901248 Q6AHZ8 81, 82 27 Beta-ureidopropionasa (EC 3.5.1.6 Q9UBR1 83, 84 beta-alanina-sintasa, N- carbamoil-beta-alanina- amidohidrolasa , BUP-1) 28 Proteina hipotética DKFZp434F1919 Q9GZU6 85, 86 (proteina hipotética MDS025, dominio de cola enrollada que contiene 90B, CUA003) (Otra isoforma : ) DS011 (dominio de cola enrollada Q9GZT6 87, 88 que contiene 90B, MDS025) Rico en cisteina con la proteina Q6UXH1 89, 90 2 del dominio similar a EGF [precursor] (proteina CRELD2) (Q9BU47, Q86UCO y Q 6UXH1 eran entradas antiguamente separadas en Swiss . Prot . ) (Otras isoformas:) Alfa Q6UXH1-2 91 Beta Q6UXH1-3 92 Gamma Q6UXH1-4 93 Epsilon Q6UXH1-5 94 Zeta Q6UXH1-6 95 Proteina KIAA0100 de la familia Q5H9T4 96, 97 UPF0378 [precursor] (proteina del gen 1 sobreexpresado en cáncer de mama, antigeno MIaa-22) ( *antiguamente identificada como proteina hipotética DKFZp686M0843) 31 Subfamilia H del canal de 095259 98, 99 compuerta de voltaje de potasio, miembro 1 (subunidad KvlO.l del canal de potasio de compuerta de voltaje, canal 1 de potasio éter- a-go-go hEAGl, h-eag) ( *antiguamente identificado como miembro 1 de la familia H de canal de compuerta de voltaje de potasio ( KCNH1 ) ) (Otras isoformas:) hEAG 095259-2 100 * previamente identificado bajo este nombre en el documento de prioridad ** AA, NA = secuencia de aminoácidos , secuencia de ácido nucleico Los términos "[fragmento]" y "[precursor]" en el contexto de las proteínas anteriormente listadas son parte de su nombre, efectivo en la entrada de la base de datos de la proteína respectiva y no deben ser considerados como limitantes de ningún modo para el alcance de la invención. Además, es conocimiento común en la técnica que las entradas de las bases de datos algunas veces contienen errores de secuenciamiento menores, y pueden ser sometidos a revisiones y cambios. Además, las proteínas pueden ser sometidas a modificaciones post-traduccionales y a empalme diferencial. Por lo tanto, se prefiere que cualquier referencia en éstas a cualquiera de las treinta y un proteínas marcadoras tumorales vasculares, anteriores también se refiera a cualesquiera fragmentos secuenciales , variantes de empalme, variantes post-traduccionalmente modificadas y/o secuencias de las mismas que contienen extensiones adicionales, así como otros sinónimos de las proteínas anteriormente listadas. De manera más preferida en la presente, la referencia a las proteínas marcadoras tumorales, vasculares, anteriores abarcan las variantes de las mismas que pueden ser identificadas mediante análisis espectrométrico de masa debido a que contienen las secuencias peptídicas identificadas en la Tabla al final de los ejemplos en letras negritas. Los objetivos polipeptídicos vasculares nuevos, anteriormente mencionados fueron identificados por una perfusión vascular ex vivo de ríñones quirúrgicamente removidos con un reactivo de biotinilación que marca las estructuras vasculares accesibles que contienen amina primaria, con biotina. El aislamiento, la caracterización y la comparación subsiguiente de muchas estructuras de amina marcadas con biotina en la vasculatura de los ríñones con y sin tumores, tarde o temprano condujeron a la identificación de los objetivos tumorales vasculares, anteriormente mencionados. Para detalles del procedimiento de identificación ver el ejemplo 1 más adelante. Los objetivos vasculares anteriores permiten ahora la preparación de ligandos específicos del objetivo vascular. Los ligandos para el uso de acuerdo a la presente invención incluyen anticuerpos, fragmentos de anticuerpo o derivados funcionales de los mismos, así como moléculas de enlace similares a antígeno, péptidos, moléculas orgánicas pequeñas, aptámeros y otras moléculas de enlace como se describe más adelante, que tienen una afinidad de enlace a una de las proteínas anteriormente listadas en la tabla 1. Estos ligandos específicos del objetivo vascular son útiles para los métodos y usos de la presente invención. En un primer aspecto, la presente invención se refiere a un método para identificar las estructuras neovasculares en tejido de mamífero, en donde las estructuras neovasculares son identificadas por la detección de al menos una proteína en dicho tejido, al menos una proteína que se selecciona de las proteínas identificadas en la tabla 1 anterior. Preferentemente, el tejido de mamífero es el tejido de mamífero maduro, más preferentemente tejido maduro humano, lo más preferentemente tejido de riñon. El término "tejido maduro" como se utiliza en la presente, se entiende que significa el tejido completamente diferenciado proveniente de mamíferos nacidos, preferentemente mamíferos adultos y específicamente excluye al tejido prenatal. Otro aspecto más de la presente invención proporciona un método para identificar una enfermedad o condición en un mamífero, seleccionada del grupo que consiste de tumores, degeneración macular, artritis y/o ateroesclerosis , en donde la enfermedad o condición es identificada por la detección de al menos una proteína dentro de y/o en estrecha proximidad del tejido de mamífero de interés, al menos una proteína que se selecciona de las proteínas identificadas por la Tabla 1 anterior. Preferentemente, la enfermedad es un tumor, más preferentemente un tumor humano, lo más preferentemente un tumor renal humano. La presente invención también abarca un método para dirigirse a y/o formar la imagen de estructuras neovasculares en tejido de mamífero, en donde las estructuras neovasculares son el objetivo y/o son formadas en imagen por un ligando que tiene la afinidad de enlace específica para al menos una proteína en dicha estructura neovascular, al menos una proteína que se selecciona de las proteínas identificadas en la Tabla 1 anterior. Preferentemente, el tejido de mamífero es tejido de mamífero maduro, más preferentemente tejido maduro humano, lo más preferentemente tejido renal.
Un aspecto adicional de la invención está dirigido a un método para dirigirse a y/o formar la imagen de un tejido afectado por una enfermedad o condición en un mamífero, seleccionada del grupo que consiste de tumores, degeneración macular, artritis y/o ateroesclerosis , en donde la enfermedad o condición es el objetivo y/o es formado en imagen por un ligando que tiene una afinidad de enlace específica al menos a una proteína dentro de y/o en estrecha proximidad del tejido de mamífero de interés, al menos una proteína seleccionada de las proteínas identificadas en la Tabla 1 anterior. Preferentemente, la enfermedad es un tumor, preferentemente un tumor de riñon, más preferentemente un tumor de riñon humano. Mientras que los anticuerpos monoclonales y sus derivados son todavía moléculas/ligandos de enlace preferidos, para aplicaciones biotecnológicas farmacéuticas, otras clases de moléculas/ligandos de enlace con propiedades de enlace similares a los anticuerpos, han sido utilizadas cada vez más como alternativas a los anticuerpos para muchas aplicaciones. Tales análogos funcionales incluyen aptámeros (Brody EN, Gold L., Aptamers as therapeutic and diagnostic agents. J. Biotechnol. 2000 Mar., 74(1):5-13. Review) , proteínas globulares pequeñas manipuladas por ingeniería genética (por ejemplo, mediante mutagénesis de los rizos) para reconocer antígenos cognados (por ejemplo, anticalinas, anticuerpos, repeticiones de anquirina, etc. [Binz HK, Amstutz P, Pluckthun A; Engineering novel binding proteins from nonimmunoglobulin domains. Nat Biotechnol. 2005 Oct . , 23 ( 10 ) : 1257-68. Review.]) . Proteínas globulares que tienen proteínas similares a anticuerpos, pueden ser derivadas de bibliotecas grandes de mutantes por ejemplo, pueden ser visualizadas panorámicamente a partir de bibliotecas grandes de visualizacion de fagos y pueden ser aisladas en analogía a los anticuerpos regulares. También, las proteínas de enlace similares al anticuerpo pueden ser obtenidas mediante mutagénesis combinatoria de los residuos expuestos en las superficies en proteína globulares. Además, las moléculas orgánicas específicas de bajo peso molecular pueden ser utilizadas como agentes de dirección a tumores vasculares, con la condición de que tengan suficiente afinidad de enlace y especificidad para el antígeno, así como propiedades farmacocinéticas adecuadas. Por lo tanto, en otro aspecto más, la presente invención se refiere al uso de al menos un ligando, preferentemente al menos un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo, que tiene afinidad de enlace específica a una proteína seleccionada de la Tabla 1 para identificar estructuras neovasculares , preferentemente para identificar tumores, en tejido de mamífero. En una modalidad preferida al menos un ligando, preferentemente un anticuerpo o derivado funcional del mismo, tiene afinidad de enlace especifica para una proteina seleccionada de: 1A, IB, ID, 1E, 2, 5, 7-13, 15-17, 19-23, 25-30. Las proteínas en la Tabla 1 anterior y las proteínas preferidas listadas directamente arriba fueron específicamente identificadas en la estructura de neovasculatura de tejido tumoral humano. Por lo tanto, en una modalidad más preferida la presente invención se refiere al uso de acuerdo a la presente invención para identificar tumores en tejido humano. Las proteínas de la Tabla 1 fueron identificadas en estructuras de la neovasculatura de tejido tumoral renal humano. Por lo tanto, en una modalidad adicional más preferida, la presente invención se refiere al uso de acuerdo a la invención para identificar estructuras neovasculares , en particular para identificar tumores, en tejido renal de mamífero, preferentemente tejido renal humano. Las proteínas preferidas para identificar las estructuras de la neovasculatura en tejido renal de mamífero, preferentemente tejido renal humano, se seleccionan del grupo que consisten de: 1, 2, 4-13, 15-31. Todas las proteínas en la Tabla 1 fueron específicamente identificadas en las estructuras de la neovasculatura de tumores renales humanos. Estas representan objetivos específicos en los ríñones que son accesibles a partir de la corriente sanguínea. Por lo tanto, en una modalidad más preferida, la presente invención se refiere al uso de un ligando, preferentemente al menos un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo, que tiene afinidad de enlace específica a una proteína seleccionada de la Tabla 1, para identificar estructuras neovasculares , en particular tumores, en tejido renal vascular de mamífero, preferentemente tejido renal vascular de humano. Los usos anteriores de acuerdo a la presente invención proporcionan métodos de diagnóstico de tumores in vitro e in vivo. Por ejemplo, los ligandos tales como los anticuerpos que tienen afinidad de enlace específico para al menos uno de los objetivos tumorales de la neovasculatura de la Tabla 1, pueden ser puestos en contacto con las células, tejidos y/o órganos bajo condiciones que permiten el enlace de los ligandos, preferentemente los anticuerpos, a su correspondiente proteína objetivo. Las células, el tejido y/o los órganos enlazados al ligando, preferentemente enlazados al anticuerpo, son luego identificados como tumores o células, tejidos y/o órganos asociados al tumor. La identificación de los ligandos/anticuerpos enlazados puede ser realizada mediante cualquiera de muchas técnicas rutinarias disponibles para la persona experta, que se han vuelto rutinarias en la materia tales como, por ejemplo, anticuerpos secundarios o la identificación de marcadores conjugados a los ligandos/anticuerpos tales como radiomarcadores y marcadores químicos. El paso de poner en contacto los ligandos/anticuerpos y/o la identificación de las células tumorales, tejidos y/o órganos enlazados al ligando/anticuerpo, puede ser realizada in vivo, por ejemplo, mediante un método de radioformación de imagen. No obstante, el paso de puesta en contacto puede también ser realizado en células in vivo en un mamífero, aislando subsecuentemente las células, el tejido y/o el órgano de interés e identificando las células tumorales enlazadas al anticuerpo in vitro/ex vivo . Preferentemente, los ligandos/anticuerpos utilizados para identificar las células tumorales in vitro únicamente. El término " in vitro" se entiende que indica que el uso de tales ligandos/anticuerpos de acuerdo a la invención está limitado a los métodos que no son practicados sobre el cuerpo humano o animal y por lo tanto no violan el Artículo 52(4) del EPC. En otro aspecto más, la presente invención está también dirigida a un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo, que tiene afinidad de enlace específica a una proteína seleccionada del grupo que consiste de las proteínas en la Tabla 1 anterior. Preferentemente, el ligando, preferentemente un anticuerpo o fragmento o derivado funcional de acuerdo a la invención tiene una afinidad de enlace especifico a una proteina seleccionada del grupo que consiste de: (1) Las variantes de empalme A, B, D, E de la periostina (5) CEACA 3 e incluyendo isoformas de la misma, (7) Homólogos de peroxidasina [fragmento], (9) Proteina sidekick-l [precursor], (12) Proteina 8 de la región critica del síndrome de Down incluyendo isoformas de la misma, (13) probable precursor 113 acoplado a la proteína G [precursor], (15) 1 similar a la uromodulina [precursor] incluyendo isoformas del mismo, (16) miembro 2 de la clase F del receptor depurador [precursor] , (17) proteína 2 que contiene el dominio de Sushi [precursor], (19) receptor Q8TDU0 acoplado a la proteína G putativa, (20) proteína hipotética DKFZp686K0275 [fragmento], (21) proteína transmembranal TMEM55A, (22) proteína hipotética Q8WYY4, (23) familia con similitud de secuencia 116, miembro A, (25) CDNA FLJ45811 fis, clon NT2RP7014778, (28) proteína hipotética DKFZp434F1919 incluyendo isoformas de la misma, (30) proteína KIAA0100 de la familia UPF0378 [precursor] . El término "afinidad de enlace específica" como se utiliza en la presente, se debe entender que significa que el ligando/anticuerpo se enlaza específicamente a una proteína diana u objetivo con afinidad significativa, y no a otras proteínas con afinidad significativa que están también localizadas en el mismo ambiente, por ejemplo, el sistema de ensayo, el equipo de diagnóstico o terapéutico in vivo o in vitro, en un órgano, por ejemplo, riñon, y bajo las mismas condiciones, por ejemplo, pH, una temperatura, amortiguador, etc. En general, una especificidad de enlace es probada por la regresión de un ensayo de enlace con una molécula objetivo especifica y con un número grande de sustancias no relacionadas. Además, las pruebas funcionales, la inmunohistoquimica y otros procedimientos pueden ser utilizados para evaluar la especificidad de enlace de un cierto ligando (por ejemplo, un anticuerpo) . Para muchos bioensayos (por ejemplo, ELISA) basados en ligandos, por ejemplo, los anticuerpos o proteínas globulares, capaces de enlazarse específicamente, una constante de disociación de 1 micromolar o menor, es requerida para producir señales de enlace detectables que son a menudo asociadas con un modo de enlace específico. Preferentemente, los ligandos/anticuerpos para el uso en la presente invención tienen una afinidad de enlace específico correspondiente a una constante de disociación menor de aproximadamente 5, preferentemente de aproximadamente 1 o menos micromolar (µ?) , más preferentemente aproximadamente 0.1 µ? o menor, lo más preferentemente aproximadamente 1 nM o menor o incluso 1 pM o menor. Los ligandos tales como los anticuerpos y fragmentos de acuerdo a la invención son rutinariamente disponibles por tecnología de hibridoma (Kohler, G. y Milstein, C. Nature 256, 495-497, 1975), visualización de fago de anticuerpos (Winter et al., Annu. Rev. Immunol. 12, 433-455, 1994), visualización de ribosomas (Schaffitzel et al., J. Immunol. Methods, 231, 119-135, 1999) y selección de filtro iterativo de colonias (Giovannoni et al., Nucleic Acids Res. 29, E27, 2001) una vez que está disponible el antígeno objetivo. Las proteasas típicas para fragmentar anticuerpos en productos funcionales, son bien conocidas. Otras técnicas de fragmentación pueden ser utilizadas, siempre y cuando el fragmento resultante tenga una afinidad específica alta y, preferentemente, una constante de disociación en el intervalo micromolar a picomolar. El funcionamiento de dirección al tumor vascular de los fragmentos de anticuerpo en el formato scFv ha mostrado que depende crucialmente (al menos para una constante de disociación de micromolar a picomolar) de la afinidad del anticuerpo al objetivo. Por ejemplo, el fragmento de anticuerpo de alta afinidad scFv(L19), específico para el dominio EDB de la fibronectina , un marcador de la angiogénesis , se mostró que se dirige a la neovasculatura tumoral0 más eficientemente que el fragmento de anticuerpo progenitor scFv(El), con una menor afinidad para el antígeno [Viti F, Tarli L, Giovannoni L, Zardi L, Neri D. ; Increased binding affinity and valence of recombinant antibody fragments lead to improved targeting of tumoral angiogenesis . Cáncer Res. 1999 Enero 15; 59 (2 ) : 347-52. ] . En ciertos casos, la avidez de enlace (por ejemplo, asociada con ciertos formatos de anticuerpo homobivalente ) pueden compensar una afinidad de enlace monomérica moderada [Nielsen UB, Adams GP, Weiner LM, Marks JD; Targeting of bivalent anti-ErbB2 diabody antibody fragments to tumor cells is independent of the intrinsic antibody affinity. Cáncer Res. 2000 Nov. 15, 60 (22) : 6434-40. ] . Un fragmento de anticuerpo muy conveniente para aplicaciones de dirección del objetivo es el fragmento Fv de cadena simple, en el cual un dominio pesado y variable y un dominio ligero variable están unidos entre si por un ligador peptidico. Otros fragmentos de anticuerpos para las aplicaciones de dirección vascular incluyen los fragmentos Fab, fragmentos Fab2, minianticuerpos (también llamados proteínas inmunitarias pequeñas), fusiones en tándem de scFv-scFv, así como fusiones de scFv con dominios adecuados (por ejemplo, con la porción Fe de una inmunoglobulina ) . Para una revisión sobre ciertos formatos de anticuerpo, por favor ver Holliger P, Hudson PJ. ; Engineered antibody fragments and the rise of single domains. Nat Biotechnol. 2005 Sep., 23 (9) : 1126-36. Revisión. El término "derivado funcional" de un anticuerpo para el uso en la presente invención se entiende que incluye cualquier anticuerpo o fragmento del mismo que ha sido químicamente modificado en su secuencia de aminoácidos, por ejemplo, por adición, sustitución y/o supresión del o de los residuos de aminoácidos y/o ácido químicamente modificado en al menos uno de sus átomos y/o grupos químicos funcionales, por ejemplo mediante adiciones supresiones, reacomodo, oxidación, reducción, etc., siempre y cuando el derivado tenga sustancialmente la misma afinidad de enlace al antígeno correspondiente de la Tabla 1 y, preferentemente, tenga una constante de disociación en el intervalo micro-, nano- o picomolar. Un derivado más preferido de los anticuerpos para el uso en la presente invención es una proteína de fusión de anticuerpo que será definida con más detalle más adelante. En una modalidad preferida, el anticuerpo, fragmento, o derivado funcional del mismo de acuerdo a la invención es uno que se selecciona del grupo que consiste de anticuerpos policlonales , anticuerpos monoclonales , anticuerpos quiméricos, anticuerpos inmunizados, anticuerpos injertados con CDR, fragmentos Fv, fragmentos Fab y fragmentos Fab2 y las proteínas de enlace similares a los anticuerpos . Junto a dichos ligandos, preferentemente los anticuerpos, fragmentos y derivados un aspecto adicional de la presente invención está dirigida a las proteínas de fusión que comprenden un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo, de acuerdo a la presente invención. El término "proteína de fusión" como se utiliza en el contexto de la presente invención se entiende que abarca todos los conjugados, en donde un ligando/anticuerpo, fragmento o derivado funcional de acuerdo a la presente invención está en cierto modo enlazado a cualquier componente adicional tal como, por ejemplo, polipétidos, factor de señal, por ejemplo, interleucina , proteína, porción azúcar, nucleótido, molécula biológicamente activa pequeña, toxina, marcador, radiomarcador , etc., por ejemplo, mediante enlaces covalentes y/o no covalentes, por ejemplo, iónicos. Preferentemente, la proteína de fusión de acuerdo a la presente invención comprende además un componente que tiene actividad antitumoral. Esto facilitará en gran medida la selectividad así como la especificidad del compuesto antitumoral, y permitiendo de este modo, la reducción de la cantidad efectiva del mismo que va a ser administrada a un paciente en necesidad del mismo, así como para reducir los efectos colaterales tóxicos asociados con dicho compuesto. Los anticuerpos monoclonales intactos representan una clase bien establecida de productos farmacéuticos con un potencial terapéutico amplio para diversas indicaciones. La presión constante del anticuerpo a menudo contribuye al potencial terapéutico y la glucosilación puede influenciar la bioactividad (Li H, Sethuraman N, Stadheim TA, Zha D, Prinz B, Ballew N, Bobrowicz P, Choi BK, Cook WJ, Cukan M, Houston-Cummings NR, Davidson R, Gong B, Hamilton SR, Hoopes JP, Jiang Y, Kim N, Mansfield R, Nett JH, Rios S, Strawbridge R, Wildt S, Gerngross TU; Optimization of humanized IgGs in glycoengineered Pichia pastoris. Nat Biotechnol. January 2006) . Además, un número de derivados de anticuerpo de dirección vascular, pueden ser considerados para la intervención farmacéutica. Estos incluyen conjugados de anticuerpo con radionúclidos, fotosensibilizadores , liposomas y fármacos, asi como proteínas de fusión enlazadas a anticuerpos con agentes pro-coagulantes, citocinas, quimiocinas, toxinas, fusiones de Fe, así como anticuerpos biespecí fieos . Más preferentemente, la proteína de fusión de acuerdo a la presente invención comprende un componente que tiene actividad antitumoral que se selecciona del grupo que consiste de anticuerpos intactos, fragmentos de anticuerpo que contiene Fe o derivados funcionales de Fe de los mismos, radionucleótidos , fotosensibilizadores , liposomas, fármacos, agentes procoagulatorios, citocinas, quimiocinas, toxinas, así como anticuerpos biespecí fieos . Está bien establecido que los ligandos tales como los derivados de anticuerpo pueden contribuir al diagnóstico y/o a la formación de imagen molecular de una enfermedad. La mayoría de las rutas establecidas para la formación de imagen macroscópica de localización del ligando/anticuerpo in vivo incluyen el uso de los ligandos/anticuerpos radiomarcados (por ejemplo para aplicación de PET o SPECT) y el uso de los ligandos/anticuerpos marcados con fluoróforos infrarrojos (por ejemplo, para la formación de imagen de fluorescencia superficial, para formación de imagen endoscópica, para tomografía óptica difusa, etc.)- Además, los conjugados ligando/anticuerpo/microburbuj a (para ser utilizados como agentes de contraste en procedimientos de formación de imagen basados en ultrasonido; Joseph S, Olbrich C, Kirsch J, Hasbach M, Briel A, Schirner M. ; A real-time in vitro assay for studying functional characteristics of target-specific ultrasound contrast agents. Pharm Res. 2004 Jun . , 21 (6) :920-6.) y/o conjugados ligando/anticuerpo para mejorar la formación de imagen MRI (Kiessling F, Heilmann M, Lammers T, Ulbrich K, Subr V, Peschke P, aengler B, Mier W, Schrenk HH, Bock M, Schad L, Semmler W. Synthesis and characterization of HE-24.8: a polymeric contrast agent for magnetic resonance angiography. Bioconjug Chem. 2006 Enero-Febrero; 17(1 ):42-51.) pueden ser también utilizados. En otra modalidad más preferida, la proteína de fusión de acuerdo a la presente invención comprende un componente que tiene actividad de diagnóstico, por ejemplo, que permite la identificación selectiva del componente de anticuerpo in vivo y/o ex vivo. Preferentemente, el componente que tiene actividad de diagnóstico se selecciona del grupo que consiste de radiomarcadores , fluoróforos, biotina, metales quelados o compuestos metálicos, y microburbuj as . La proteina de fusión de la presente invención tiene un componente antitumoral es útil para preparar un medicamento que es eficientemente dirigido a la vasculatura de los tumores, preferentemente a los tumores renales. Por lo tanto, un aspecto adicional de la presente invención se refiere al uso de una proteina de fusión de acuerdo a la invención para preparar un medicamento para el tratamiento del cáncer en un mamífero, preferentemente en un humano. Preferentemente, dicho medicamento es para el tratamiento del cáncer de riñon, preferentemente el cáncer de riñon humano. La proteína de fusión de la presente invención comprende un componente que tiene actividad de diagnóstico, es útil para preparar un medicamento que es eficientemente dirigido a la vasculatura de los tumores, preferentemente a los tumores de riñon. Por lo tanto, un aspecto adicional de la presente invención se refiere al uso de una proteína de fusión de acuerdo a la invención para preparar una composición de diagnóstico para la identificación de tumores en un mamífero, preferentemente un humano.
Preferentemente, la composición y diagnóstico es para la identificación de tumores en un riñon de mamífero, preferentemente un riñon humano. Otro aspecto más de la presente invención se refiere a una composición farmacéutica, que comprende un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado del mismo, o una proteína de fusión de acuerdo a la presente invención, y un portador y/o diluyente farmacéuticamente aceptable . Un aspecto adicional de la presente invención se refiere a una composición de diagnóstico, que comprende un ligando, preferentemente un anticuerpo, un fragmento o derivado del mismo, o una proteína de fusión de acuerdo a la invención . Otro aspecto más de la presente invención está dirigido a un método para identificar los tumores en el tejido de mamífero, preferentemente tejido humano que comprende : (i) Poner en contacto un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo y/o una proteína de fusión que comprende un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo, que tiene afinidad de enlace específica para al menos una proteína seleccionada del grupo listado anteriormente en la tabla 1, con el tejido del mamífero de interés, preferentemente el tejido humano de interés, in vivo y/o ex vivo bajo condiciones que permiten el enlace específico del ligando y/o la proteína de fusión al menos a una de las proteínas 1 a 31, y (ii) La identificación del ligando y/o proteína de interés específicamente enlazados. Preferentemente, al menos una proteína tisular es seleccionada del grupo que consiste de: (Todos los números de acuerdo a la Tabla 1) 1A, IB, ID, 1E, 2, 5, 7-13, 15-17, 19-23, 25-30. Más preferentemente, al menos una proteína tisular se selecciona del grupo que consiste de: 1-2, 4-13, 15-31, y el tejido de mamífero de interés es tejido renal. También, se prefiere que el tejido de mamífero de interés sea tejido renal vascular, preferentemente tejido renal vascular humano. Más preferentemente, los pasos (i) y/o (ii) del método de acuerdo a la invención son realizados ex vivo, por ejemplo, in vitro. Lo más preferentemente, el método de acuerdo a la presente invención es un método de formación de imagen neovascular, en particular un método de formación de imagen de células tumorales, preferentemente tumores renales, más preferentemente tumores renales vasculares in vivo.
La presente invención también identifica un número de novedosas proteínas que tienen utilidad como nuevos marcadores tumorales, nuevos marcadores específicos del riñon, nuevos y específicos marcadores de la vasculatura de tumores renales, y que pueden ser utilizados como antígenos para la provisión de anticuerpos selectivos y de alta afinidad como medios de diagnóstico terapéuticos. Cuatro nuevas variantes de empalme de la periostina La periostina es una proteína 90 kDa inicialmente identificada como el factor-2 específico de osteoblastos (OSF-2, también llamado PN) , secretado por los osteoblastos (Takeshita et al., Biochem J, 294 (Pt 1), 271-8, 1993) . Tai y colaboradores produjeron un anticuerpo ant i-periost ina monoclonal mediante tecnología de hibridoma y detectaron, mediante transferencia de Western, la expresión de la periostina humana en las glándulas adrenales, el pulmón, la tiroides, el útero, la vagina, los ovarios, los testículos, la próstata, y en el tracto gastrointestinal, con una expresión preferencial en el estómago y el colorrecto, mientras que fueron percibidos niveles menores en el intestino delgado y el esófago (Tai et al., Carcinogenesis , 26, 908- 15, 2005) . Han existido observaciones de la periostina que está asociada en un número de cánceres. No obstante, la periostina no ha sido asociada con tumores renales en la técnica anterior. Para la periostina humana, Takeshita y colaboradores (Takeshita, Kikuno et al., Biochem J, 294 (Pt 1), 271-8, 1993) han reportado que pueden ser producidos cinco transcritos empalmados, alternativos, y que todos los eventos de empalme de la periostina ocurren dentro de la región C-terminal. El mismo grupo encontrado en el ratón cuatro posibles isoformas de la periostina generadas por una combinación de seis diferentes casetes (Horiuchi, Amizuka et al., J. Bone Miner Res., 14, 1239-49, 1999) . La función de las isoformas no ha sido todavía elucidada. Litvin y colaboradores identificaron otra isoforma de la periostina de ratón y la denominaron factor similar a periostina (PLF) (Litvin et al., J. Cell Biochem., 92, 1044-61, 2004) . Un análisis de secuencia del ADNc de PLF de longitud completa y predijeron la secuencia de aminoácidos mostró que ésta se asemeja más a la isoforma 3 por Horuichi de la periostina de ratón (Litvin, Selim et al., J Cell Biochem, 92, 1044-61, 2004) . La presente invención demuestra por primera vez que la periostina es una proteína sobreexpresada en cáncer de riñon. Por lo tanto, ésta puede ser utilizada como una excelente marcadora de tumor renal, fácilmente accesible desde la corriente sanguínea, y de este modo, es también un objetivo útil para las estrategias de dirección a tumores basados en ligandos. Un análisis inmunohistoquimico con un anticuerpo anti-periostina probó además que la periostina fue altamente sobreexpresada en el estroma tumoral del carcinoma de células claras renales, en comparación al tejido renal normal. Una amplificación por PCR de la región C terminal de la periostina reveló al menos ocho diferentes variantes de empalme. En las bases de datos de proteínas, públicas (Expasy y NCBI), únicamente cuatro isoformas diferentes de la periostina humana son descritas (la forma de longitud completa y las tres isoformas de empalme Q5VSY8, Q5VSY7 y Q5VSY6) . Junto a todas las isoformas publicadas, cuatro nuevas isoformas, denominadas isoformas A, B, D y E (ver SEQ ID Nos: 9, 11, 13, 15, respectivamente) fueron identificadas. El análisis correspondiente mostró una distribución diferente de los transcritos de isoformas en los diversos tejidos. Se encontró que los transcritos de la periostina son únicamente débilmente expresados (o escasamente detectables) en el ADNc de riñon de adulto normal, pero puede ser amplificado a partir del espécimen de carcinoma de células claras en isoformas de diferentes longitudes. Este hallazgo es compatible con la identificación de la periostina en un análisis proteómico en el tejido tumoral únicamente. El riñon fetal fue también positivo para la periostina, pero la distribución de las isoformas fue diferente de aquella registrada en todos los tejidos tumorales examinados. La expresión de los transcritos de periostina puede también ser observada en el cerebro adulto normal y en hígado. Sin embargo, la distribución de las isoformas de la periostina en las bibliotecas de ADNc de cerebro e hígado mostró diferencias entre los especímenes de tumores, fetales y de adulto normal. El transcrito detectado más pequeño de la periostina fue predominantemente expresado en especímenes tumorales, estando presente en al menos cuatro diferentes tumores renales y de hígado, pero no detectable en especímenes normales y solo escasamente detectable en el cerebro de adulto normal y en riñon fetal. Sorprendentemente, un análisis espectrométrico de masa reveló tres péptidos EIPVTVYKPIIKK, El PVTVYRPTLTK e IITGPEIK, que son específicos de isoforma, debido a que éstos abarcan uniones de dos exones que únicamente existen en ciertas isoformas. Se espera que los ligandos, preferentemente anticuerpos dirigidos/reducidos contra los "péptidos de unión" que existen únicamente en las nuevas isoformas de periostina específicamente expresadas en tumores (o incluso un tipo particular de tumor) proporcionarán una herramienta muy poderosa para la dirección selectiva al objetivo, y la destrucción de estos tumores. En un aspecto, la presente invención está dirigida a una proteina variante de empalme de periostina, un fragmento o derivado funcional que comprende un péptido que tiene la secuencia de aminoácidos EIPVTVYGPEIK. Preferentemente, este aspecto de la presente invención se refiere a una proteina variante de empalme de periostina A, B, D o E que tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada de la SEQ ID Nos: 9, 11 , 13, 15, respectivamente, un fragmento o un derivado funcional de la misma, en donde la secuencia de aminoácidos del fragmento o el derivado funcional del mismo comprende al menos 20, preferentemente al menos 30, más preferentemente al menos 50 aminoácidos, y los más preferentemente al menos 75 aminoácidos, y a) en donde el fragmento o derivado funcional de la SEQ ID No: 9 tiene una secuencia de aminoácidos que refleja las supresiones en la SEQ ID No: 1 en las posiciones 670-756, o en las posiciones 670-756 y 783-810; b) en donde el fragmento o derivado funcional de la SEQ ID No: 11 tiene una secuencia de aminoácidos que refleja las supresiones en la SEQ ID No: 1 en las posiciones 670-726 y 784-810 o en las posiciones 784-810; preferentemente, esta variante de empalme comprende un péptido que tiene la secuencia de aminoácidos EIPVTVYGPEIK. c) en donde el fragmento o derivado funcional de la SEQ ID No: 13 tiene una secuencia de aminoácidos que refleja una supresión en la SEQ ID No: 1 en las posiciones 670-756; d) en donde el fragmento o derivado funcional de la SEQ ID No: 15 tiene una secuencia de aminoácidos que comprende el aminoácido valina en la posición 421 en la SEQ ID No: 15 y una secuencia de aminoácidos que refleja una supresión en la SEQ ID No: 1 en las posiciones 671-697. Una modalidad preferida se refiere a una variante de empalme de periostina de acuerdo a la invención que tiene al menos 80, preferentemente 85, más preferentemente 90, lo más preferentemente al menos 95 ó 98% de identidad en la secuencia de aminoácidos a la proteina anterior, el fragmento o el derivado funcional de acuerdo a la invención, en donde la secuencia no es una secuencia de cualquiera de las SEQ ID Nos : 1 , 3 , 5 y 7. Además, la presente invención se refiere a un polinucleótido que codifica para una proteina anteriormente descrita, fragmento o derivado funcional de la presente invención de cualquiera de las 4 nuevas variantes de empalme. Se entiende que un derivado funcional de una proteina de acuerdo a la invención abarca cualquier derivado químico y/o de secuencia de aminoácidos, que tenga residuos de aminoácidos sustancialmente suficientemente accesibles para establecer la misma afinidad de enlace a un anticuerpo que tiene una afinidad a la proteína original. Preferentemente, el derivado funcional es uno que tiene supresiones (incluyendo truncamientos N-terminales o extermínales), adiciones y/o sustituciones, más preferentemente sustituciones conservadoras de aminoácidos. Un fragmento o un derivado funcional de acuerdo a la presente invención tiene al menos 10, al menos 20, al menos 30, al menos 40, al menos 50, al menos 75 ó al menos 100 aminoácidos de la proteína de longitud completa original. Para determinar la identidad de secuencia entre los polipéptidos , la persona experta puede recurrir a un número de algoritmos estándar conocidos por aquellos de experiencia ordinaria en la técnica. Preferentemente, los programas BLAST a http://www.expasy.org/tools/blast/ y http://www.ncbi. nlm. nih. gov/BLAST/Blast . egi ?CMD=Web&LAYOUT=TwoWindow s&AUT0_F0RMAT=Semiauto&ALIGNMENTS=250 &ALIGNMENT_VIEW=Pairwi se&CDD_SEARCH=on&CLIENT=web&DATABASE=nr&DESCRIPTIONS=500& ENTREZ_QUERY=%28none%29&EXPECT=10 & FILTER=L& FORMAT_OBJECT =Alignment&FORMAT_TYPE=HTML&1_THRESH=0.005 &MATRIX_NAME=BLO SUM62&NCBI_GI=on&PAGE=Proteins&PROGRAM=blastp&SERVICE=plain&S ET_DEFAULTS . x=41 &SET_DEFAULTS . y=5&SHOW_OVERVIEW=on&END_OF _HTTPGET=Yes&SHOW_LINKOUT=yes&GET_SEQUENCE=yes , más preferentemente con los ajustes por omisión, se utilizan para identificar la identidad de la secuencia de aminoácidos de una proteína, fragmento de proteína o derivado de proteína de la presente invención. En algunos casos, la presente invención también proporciona novedosos polinucleótidos que codifican para las proteínas, fragmentos o derivados funcionales de los mismos de la presente invención, caracterizados porque tienen la habilidad para hibridarse a una secuencia de ácido nucleico específicamente referida, bajo condiciones estrictas o exigentes. Junto a los protocolos comunes y/o estándares en la técnica anterior para determinar la habilidad para hibridarse a una secuencia de ácido nucleico específicamente referida, bajo condiciones severas, se prefiere analizar y determinar la habilidad para hibridarse a una secuencia de ácido nucleico específicamente referida, bajo condiciones severas, al comparar las secuencias nucleotídicas de las dos proteínas, que pueden ser encontradas en las bases de datos (por ejemplo, http : //www . ncbi . nlm. nih . gov/entrez/querv . fcqi7db =nucleotide) con herramientas de alineación (por ejemplo, http: //www. ncbi . nlm. nih . qov/blast/Blast . cqi?CMD=Web&LAYOUT =TwoWindows&AUTO FORMAT=Semiauto&PAGE=Nucleotides&NCBI Gl=yes &FILTER=L&HITLIST SIZE=I 00&SHO OVERVI EW=yes&AUTO FORMAT=V es&SHOW LINKOUT=yes ) . El término "polinucleótido que codifica para una proteína" como se utiliza en el contexto de la presente invención, se entiende que incluye las variantes alélicas y las redundancias en el código genético. Además, la presente invención proporciona nuevas proteínas, fragmentos y derivados de las mismas, así como los nucleótidos que las codifican, de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 40 a 93. Más específicamente, la presente invención proporciona las proteínas 5 (3 x), 7, 9, 12 (6 x) , 13, 15 (4 x) , 16, 19-23, 25, 28 (2 x) , 30, 31 (2x) que tienen una secuencia de aminoácidos como se indica en la SEQ ID No: correspondiente (ver Tabla 1 para asignación) , fragmentos o derivados funcionales de las mismas. Además, en una modalidad preferida la presente invención se refiere a las proteínas, fragmentos o derivados funcionales de las mismas que tienen al menos 70, preferentemente 80, más preferentemente 90, más preferentemente al menos 95% de identidad de la secuencia de aminoácidos a las proteínas anteriores 5 (3x), 7, 9, 12 (6x), 13, 15 (4x), 16, 19-23, 25, 28 (2x), 30, 31 (2x) , fragmentos o derivados funcionales de las mismas. Además, la presente invención está dirigida a los polinucleótidos que codifican para cualquiera de las proteínas anteriores 5 (3x), 7, 9, 12 (6x), 13, 15 (4x), 16, 19-23, 25, 28 (2x) , 30, 31 (2x) , fragmentos o derivados funcionales de las mismas, mencionados anteriormente de acuerdo con la presente invención, que tienen la habilidad para hibridarse a la secuencia de ácido nucleico correspondiente (ver Tabla 1 para asignación) que codifican para la proteina completa, bajo condiciones severas. También, La presente invención abarca los vectores que comprenden los polinucleótidos que codifican para las proteínas, fragmentos y derivados funcionales de acuerdo a la presente invención, así como las células hospederas que comprenden dichas proteínas, fragmentos y derivados funcionales y/o vectores de la presente invención. Al final pero no menos, un aspecto adicional de la presente invención está dirigido a los métodos para producir recombinantemente proteínas, fragmentos y derivados funcionales de la presente invención empleando polinucleótidos, vectores y/o células hospederas de acuerdo a la presente invención. En lo subsiguiente, las proteínas objetivo que han demostrado su utilidad como objetivos tumorales, en particular los objetivos tumorales, renales, vasculares, de acuerdo a la presente invención, son brevemente discutidos. Proteína # 2 El péptido identificado puede ser derivado de una o ambas de las isoformas de proteína (Tabla 1:2) : receptor 3 de ácido graso libre (014843) y/o el receptor 42 acoplado a la proteína G putativa (015529), respectivamente. Dentro de la familia A de la superfamilia de genes del receptor acoplado a la proteína G (también clasificada como familia 1), existe un grupo filogenéticamente relacionado de -90 receptores que corresponden a una variedad inusualmente amplia de tipos de ligandos, considerando la similitud relativamente estrecha de sus secuencias primarias (Bockaert y Pin, Embo J, 18, 1723-9, 1999) . El receptor 3 de ácido graso libre fue detectado en adiposis en los tres estudios publicados sobre este receptor (Brown et al., J. Biol. Chem. , 278, 11312-9, 2003; Le Poul et al., J. Biol. Chem., 278, 25481-9, 2003; Xiong et al., Proc. Nati. Acad. Sci. U S A, 101 , 1045-50, 2004) . Hasta ahora, es desconocido un anticuerpo para discriminar entre GPR41 y GPR42. Una expresión o incluso la sobreexpresión de cualquiera de estas proteínas en tumores no ha sido todavía reportada . Proteína # 3 La familia 3 portadora de solutos, el miembro 1 transportador facilitado de glucosa (SLC2A1) (= transporte de glucosa tipo 1, eritrocito/cerebro (GLUT1 ) ) (P11166) La absorción o captación incrementada de glucosa es uno de los cambios metabólicos principales encontrados en el tejido maligno. Esta absorción es mediada por las proteínas transportadoras de glucosa (Glut) , que son proteínas membranales responsables del transporte de la glucosa a través de las membranas celulares. Estos transportadores de glucosa humanos tienen una distribución tisular distinta y contribuyen a la disposición de la glucosa bajo diversas condiciones (Pessin y Bell, Annu Rev Physiol, 54, 911-30, 1992) . Una familia de siete transportadores de glucosa ha sido clonada. Entre éstas, Glutl (que es también llamada familia 2 portadora de solutos, miembro 1 del transportador facilitado de glucosa (SLC2A1) ) es expresado en eritrocitos, la barrera sangre-cerebro, el perineurio de los nervios periféricos y la placenta (Froehner et al., J. Neurocytol., 17, 173-8, 1988; Pardridge et al., J Biol Chem, 265, 18035-40, 1990; Pessin y Bell, Annu. Rev. Physiol., 54, 911-30, 1992; Takata et al., Cell Tissue Res, 267, 407-12, 1992) . Glutl ha estado asociado con un número de tumores en la técnica anterior. Se mostró también que Glutl, mediante inmunoistoquimica, es expresado en cáncer de riñon (Nagase et al., J Urol, 153, 798-801, 1995; North et al., Clin Neuropathol, 19, 131-7, 2000) . La presente invención demuestra por primera vez que Glutl es una proteina fácilmente accesible desde la corriente sanguínea, indicando que este marcador tumoral es un objetivo útil para las estrategias de dirección a tumores, basados en ligando . Proteína # 4 La proteína de núcleo versican [precursor] (13611) es un proteoglicano de matriz extracelular grande que está presente en una variedad de tejidos, y juega un papel en la regulación de la adhesión celular y la supervivencia celular, la proliferación celular, la migración celular y el ensamblaje de la matriz extracelular (Wight, Curr Opin Cell Biol, 14, 617-23, 2002) . Además, existe evidencia de que versican es sobreexpresada en angiogénesis y en tumores. La presente invención demuestra sorprendentemente la expresión de proteina de núcleo versican en cáncer de riñon, indicando que este marcador tumoral es un objetivo útil para las estrategias de dirección a objetivos tumorales basadas en ligando. Proteina # 5 Sorprendentemente, el péptido SDPLKLTVK fue identificado en tumor únicamente pero no en muestras de riñon normal. Este péptido es parte de tres diferentes entradas de secuencia en la base de datos SwissProt: CEACAM3 con 292 residuos de aminoácidos (Q6UY47), la molécula de adhesión celular relacionada al antigeno carcinoembronario (nombre del gen: CEACAM21 ) con 293 residuos de aminoácidos (Q3KPI0), y R29124_l con 235 residuos de aminoácidos (075296) . La existencia de estas proteínas fue postulada con base en el análisis de la secuencia de ADN, pero nunca experimentalmente probada. Las tras secuencias que comparten más del 98% de identidad con un máximo de 3 malos acoplamientos. Estos datos indican que las tres secuencias pertenecen ya sea a la misma proteína y las diferencias son debidas a los errores de secuenciamiento o bien que los errores corresponden a diferentes isoformas de la misma proteina. Las secuencias muestran similitud significativa a otras proteínas de la familia CEACAM, un subgrupo de la familia de proteínas del antígeno carcinoembrionario humano Ag (CEA) (Beauchemin et al., Exp Cell Res, 252, 243-9, 1999) . Mientras que un número de CEACAM han sido estudiados al nivel de las proteínas, esto no parece ser el caso para las proteínas identificadas en esta invención. La similitud más alta a una CEACAM que ha sido efectivamente estudiada al nivel de las proteínas, es el precursor de glucoproteína (CEACAM1) y es únicamente 44% máximo. Además, la secuencia de CEACAM1 no contiene el péptido identificado. La presente invención identifica sorprendentemente el péptido SDPLKLTVK y, de este modo, prueba la existencia de una proteína Q6UY47, Q3KPI0, y 075296. Hasta ahora, no existen anticuerpos disponibles los cuales reconozcan de manera específica a esta proteína. Además, la presente invención identifica al péptido anteriormente mencionado en tumores pero no en riñon normal, indicando de este modo a la proteína como un novedoso marcador sobreexpresado en tumores humanos, más preferentemente como un marcador de tumor renal humano, lo más preferentemente como un marcador de tumor renal humano fácilmente accesible desde la corriente sanguínea, y de este modo útil con un objetivo para aplicaciones de dirección a tumores basados en ligandos. Proteina #6 En la presente invención el péptido YLPFVPSR fue identificado como parte de la proteina fibromodulina (Q8IV47). La fibromodulina fue primeramente descrita como una proteina de 59-kDa (Heinegard et al., J Biol Chem, 261, 13866-72, 1986) que interactúa con los colágenos tipo I y II (Hedbom and Heinegard, J Biol Chem, 264, 6898-905, 1989) y está presente sobre las fibras de colágeno en el cartílago (Hedlund et al., Matrix Biol., 14, 227-32, 1994). Se piensa que la fibromodulina juega un papel importante en la formación de las fibras de colágeno como es mostrada por la observación de que los ratones nulos en FM forman fibrillas de colágeno anormales en los tendones (Svensson et al., J. Biol. Chem., 274, 9636-47, 1999). La proteína ha estado asociada con un número de tumores. Sorprendentemente, esta invención revela la sobreexpresión de la proteína fibromodulina en cáncer de riñon, indicando de este modo a dicha proteína como un novedoso marcador tumoral de riñon humano, más preferentemente como un marcador tumoral de riñon humano fácilmente accesible desde la corriente sanguínea y, de este modo útil como un objetivo para aplicaciones de dirección a tumores basados en ligando.
Proteina #7 El homólogo de peroxidasina [fragmento] (también designado antigeno asociado al melanoma MG50) (Q92626) fue originalmente identificado por un procedimiento de sustracción de ADNc, en el cual los clones de ADNc fueron aislados con una sonda de ADNc de melanoma sustraído (línea celular de melanoma menos la línea celular de carcinoma pulmonar) después de seleccionar una biblioteca de expresión de melanoma mediante hibridación en placa in situ (Hutchins et al., Cáncer Res, 51, 1418-25, 1991) . De manera sorprendente, la presente invención demuestra que el homólogo de peroxidasina [fragmento] fue únicamente identificado en espécimen tumoral pero no en tejido normal de riñon, e indica un uso de esta proteína como un marcador tumoral, más preferentemente como un marcador tumoral de riñon, más preferentemente como un marcador tumoral fácilmente accesible desde la corriente sanguínea. Se nota que el homólogo de peroxidasina [fragmento] ha sido hasta ahora únicamente postulado a partir de la demostración de ciertas de mARN pero la existencia de la proteína no ha sido todavía demostrada en la naturaleza. Proteina # 8 El péptido MRAPGALLAR, sorprendentemente identificado en tumores renales únicamente, concuerda con la secuencia proteica del receptor 37 acoplado a la proteína G probable [precursor] (015354) . El receptor GPR37 acoplado a la proteína G, huérfano, y los genes relacionados codifican una subfamilia de receptores acoplados a la proteína G putativa, que son altamente expresados en el sistema nervioso central de mamíferos . Toyota y colaboradores encontraron que GPR37 es uno de los genes que muestran hipermetilación de las regiones ricas en CpG asociadas al promotor, denominadas islas de CpG, en la leucemia mieloide aguda (AML) (Toyota et al., Blood, 97, 2823-9, 2001) . Tal hipermetilación puede dar como resultado el silenciamiento del gen que es clonalmente propagado a través de la mitosis por la acción de las enzimas ADN-metiltransferasa . Tal silenciamiento asociado a la metilación juega un papel patológico en el silenciamiento de los genes supresores de tumores en neoplasia. Sorprendentemente, la presente invención identifica a GPR37 en tumor pero no en riñon y demuestra una sobreexpresión de esta proteína en tumores, indicando de este modo a esta proteína como un nuevo marcador sobreexpresado en tumores humanos, más preferentemente como un marcador tumoral del embrión humano, lo más preferentemente como un marcador tumoral del riñon humano fácilmente accesible desde la corriente sanguínea, y de este modo útil como un objetivo para aplicaciones de dirección del objetivo tumoral basado en ligando . Proteína #9 La existencia de la proteína sidekick-l [precursor] (Q8TEN9) ha sido postulada con base en el secuenciamiento de los ADNcs de longitud completa (Nagase, T et al., Kazusa DNA Research Institute, envío directo a la base de datos NCBI), pero no son nunca experimentalmente probada. Sorprendentemente, se ha demostrado que tal proteína existe (por la identificación del péptido AELTDLK, que es específico para esta proteína) , y que es sobreexpresado en y/o alrededor de las estructuras de la neo-vasculatura tumoral, abriendo de este modo aplicaciones biomédicas para dirección a objetivos vasculares. Proteina # 10 El canal de calcio dependiente del voltaje de la proteína alfa 1A demostró que está mutado en una enfermedad llamada ataxia espinocerebelar tipo 6 (SCA6) , que es una enfermedad neurodegenerativa dominante autonómica (Toru, S et al., J. Biol. Chem. 275, 10893-8, 2000) . Hasta ahora, no están disponibles datos concernientes a la expresión en tejido normal o tejido tumoral. Sorprendentemente, por la identificación del péptido tríptico RGALVGAPR la presente invención demuestra la sobreexpresión en y/o alrededor de las estructuras de la neo-vasculatura, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección a objetivos vasculares. Proteína # 11 La proteína EMILIN2 [fragmento] (Proteína 2 localizada en la interfaz de elastina-microfibrilla, Q8N5L1) es una glucoproteína asociada a las fibras elásticas. La expresión del mARN de la proteína EMILIN2 ha sido mostrada por el grupo de Colombatti (Doliana, R et al., J Biol Chem. 276, 12003-11, 2001) . La proteína tiene un patrón de expresión restringido a la médula espinal, a leucocitos periféricos, pulmón, placenta y corazón fetal. Además, el grupo presentó una inmunoistoquímica de las células de leiomiosarcoma humano que muestran la co-localización parcial de EMILIN1 y EMILIN2. El grupo de Forrest (Amma, LL et al., Mol Cell Neurosci. 23, 460-72, 2003) confirmó con un análisis de transferencia de northern, que el patrón de expresión restringido de la proteína EMILIN2 al corazón, al pulmón y la cóclea . Mediante la identificación del péptido tríptico específico de la proteína RGALVGAPR la sobre-expresión en y/o alrededor de las estructuras de la neo-vasculatura tumoral fue sorprendentemente demostrada, indicando de este modo, aplicaciones biomédicas de dirección a objetivos vasculares. Proteína # 12 La proteína 8 de la región crítica del síndrome de Down (también designada proteína 1 asociada al melanoma- maligno) (Q96T75) tiene 6 diferentes isoformas de empalme. El péptido tríptico LFMPRPK es específico para 5 de las 6 isoformas de empalme (ver tabla 1). Sorprendentemente, la sobreexpresión de una o más de las 5 isoformas de empalme Q96T75, Q6EXA9, Q684H4, Q96T75-2, y Q96T75-3 de la proteína 8 de la región crítica del síndrome de Down (de la cual en total están publicadas 6 isoformas), en y/o alrededor de las estructuras de la neo-vasculatura, fue demostrada, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección de objetivo vascular. Proteína # 13 El receptor 113 acoplado a la proteína G probable, proteico [precursor] (Q8IZF5) fue identificado en el curso de un estudio BLAST a gran escala enfocado sobre nuevos receptores acoplados a la proteína G humana ( Fredriksson, R et al., FEBS Lett. 531, 407-14, 2002). Sorprendentemente, esta invención identifica el probable receptor 113 acoplado a la proteína G [precursor] en tumores. Para la identificación del péptido tríptico específico de la proteína, NKISYFR fue demostrada la sobreexpresión en y/o alrededor de las estructuras de la neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biológicas de dirección a objetivos vasculares. Proteínas # 14 Las entradas en la base de datos de proteínas anexina A4 (P09525) y proteina ANXA4 [fragmento] (Q6LES2) tienen la misma secuencia de aminoácidos excepto para los primeros 2 aminoácidos de Q6LES2. De este modo, la diferencia en estas dos entradas de base de datos puede ser ya sea una consecuencia de un error de secuenciamiento o bien existe dos isoformas de esta proteina existen. Zimmermann et al. (Zimmermann, U et al., Cáncer Lett. 209, 111-8, 2004) mostraron en su documento concerniente al carcinoma celular renal de células claras, que en las células normales la anexina A4 está concentrada alrededor del núcleo, mientras que la proteina está localizada hacia la membrana basolateral en células tumorales. Esto sugiere que la distribución subcelular de la anexina IV correlacione con la naturaleza del acoplamiento de la célula a su vecindario. Estos resultados indican la posibilidad de que la anexina IV juega un papel importante en la diversificación morfológica y en la diseminación del carcinoma celular renal de células claras. Sorprendentemente, la presente invención demuestra la sobreexpresión en y/o alrededor de las estructuras de la neo-vasculatura tumoral por la identificación del péptido tríptico específico de proteína, ISQTYQQQYGR, indicando de este modo las aplicaciones biomédicas de dirección de objetivos vasculares. Proteína # 15 (4 x) La proteína 1 similar a la uromodulina [precursor] (también designada olfactorina) (Q5DID0, Q5DID0-2, Q5DID0-3, y Q5DID0-3) fue identificada como una novedosa proteina enlazada a la membrana, expresada específicamente por las neuronas sensoriales olfatorias y vomeronasales (Di Schiavi, E . et al., Eur. J. Neurosci. 21, 3291-300, 2005). El grupo transfectado a células HEK con olfactorina fusionada a un marcador de bandera e identificó esta proteína de fusión como un anticuerpo anti-bandera . Sorprendentemente, la presente invención demuestra la sobreexpresión en y/o alrededor las estructuras de neo-vasculatura tumoral, por la identificación del péptido tríptico específico de la proteína IVNHNLTEKLLNR, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. En la técnica anterior, la proteína olfactorina es también conocida como proteína similar a la uromodulina, que tiene también cuatro isoformas de empalme diferentes (ver tabla 1) . Proteína # 16 El miembro 2 de la clase F de receptores depuradores de proteína [precursor] (Q96GP6) ha demostrado que es expresado en el ratón durante la embriogénesis en el folículo piloso, en la piel y en el epitelio nasal, así como en la lengua y en los epitelios orales, el hueso de las costillas que sufren osificación y en la región medular del timo (Hwang, M et al., Gene Expr Patterns. 5, 801-8, 2005).
Sorprendentemente, la sobreexpresion en y/o alrededor de las estructuras de neo-vasculatura tumoral fue demostrada por la identificación del péptido tríptico específico de la proteína GAGPARRR, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. Proteína # 17 La proteína 2 que contiene el dominio de sushi [precursor] (Q9UGT4) fue no ambiguamente identificada por PAGE bidimensional y espectrometría de masa MALDI por el grupo de Lubec (Lubec, G. et al., J. Chem. Neuroanat. 26, 171-8, 2003) en la línea de células neuronales corticales humanas HCN-2. Sorprendentemente, fue demostrada la sobreexpresion en y/o alrededor las estructuras de neo-vasculatura tumoral por la identificación del péptido tríptico específico de la proteína VAHQLHQR, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. Proteina # 18 La proteína tumoral 1, traduccionalmente controlada (TCTP) ha sido conocida por más de 20 años. En la revisión de Bommer y Thiele (Int. J. Biochem. Cell Biol. 36, 379-85, 2004) se subraya la importancia de TCTP para el crecimiento celular y su actividad antiapoptótica . Sorprendentemente, la sobreexpresion en y/o alrededor las estructuras de neo-vasculatura tumoral fue demostrada por la identificación del péptido tríptico específico de la proteína KWVKINNVK, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. Proteína # 19 La existencia del receptor acoplado a la proteína G putativa (Q8TDU0) fue postulada con base en las búsquedas de homología secuencial en el genoma humano (Takeda, S et al., FEBS Lett. 520, 97-101, 2002), pero nunca fue experimentalmente probada. La presente invención demuestra sorprendentemente que tal proteína existe efectivamente (por la identificación del péptido LS EAPCR, que es específico para esta proteína) , y también muestra que ésta es sobreexpresada . en y/o alrededor de las estructuras de la neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares . Proteína # 20 La existencia de la proteína hipotética DKFZp686K0275 (Q7Z3A1) fue postulada con base en el secuenciamiento de los ADNcs de longitud completa (Wiemann, S et al., Molecular Genome Analysis, Germán Cáncer Research Center (DKFZ), envío directo a la página doméstica de NCBI), pero nunca fue probada experimentalmente. La presente invención demuestra sorprendentemente que tal proteína efectivamente existe (por la identificación del péptido AGQGFGLR, que es especifico para esta proteina) , y también demuestra que es sobreexpresada en y/o alrededor las estructuras de neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. Proteina # 21 La existencia de la proteina transmembranal TMEM55A (Q8N4L2) fue postulada con base en el secuenciamiento de los ADNcs de longitud completa (Strausberg, RL. et al., Proc. Nati. Acad. Sci. EUA. 99, 16899-903, 2002), pero nunca fue probada experimentalmente . La presente invención demuestra sorprendentemente que tal proteina efectivamente existe (por la identificación del péptido KISSVGSALPR, que es especifica para esta proteina), y también demuestra que es sobreexpresada en y/o alrededor de las estructuras de neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. Proteina # 22 La existencia de la proteina hipotética (Q8WYY4) fue postulada con base en el secuenciamiento de los ADNcs de longitud completa (Gu, JR. et al., National Laboratory For Oncogenes & Related Genes, Shanghai Cáncer Institute, envío directo a la página doméstica de NCBI), pero nunca fue probada experimentalmente.
La presente invención demuestra sorprendentemente que tal proteina efectivamente existe (por la identificación del péptido VLTAMVGK, que es especifico para esta proteina) , también demuestra que es sobreexpresada en y/o alrededor de las estructuras de la neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares . Proteina # 23 La existencia de la familia con similitud secuencial 116, miembro A (Q8I F6) fue postulada con base en el secuenciamiento de los ADNcs de longitud completa (Strausberg, RL. et al., Proc. Nati. Acad. Sci . EUA. 99, 16899-903, 2002), pero nunca fue probada experimentalmente . La presente invención demuestra sorprendentemente que tal proteina efectivamente existe (por la identificación del péptido GPAGLGPGSR, que es especifico para esta proteina) , y también demuestra que es sobreexpresada en y/o alrededor de las estructuras de neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. Proteina # 24 La proteina UPF0260 proteina C6orf66 (Q9P032), que es también conocida como HRPAP20 (proteina de 20 kDa asociada a la proliferación regulada por hormonas), ha sido demostrada como poseedora como proliferación incrementada en ausencia de la estimulación hormonal y supervivencia aumentada en ausencia de suero en células MCF-7 transfectadas estables (carcinoma de mama humano) . Karp et al. (Karp, C et al., Cáncer Res. 64, 1016-25, 2004) concluyen que HRPAP20 es una fosfo-proteína que es requerida para la proliferación y supervivencia de las células tumorales dependientes de hormonas . La presente invención demuestra por primera vez la sobreexpresión de la proteína (por la identificación del péptido tríptico específico de la proteína, en MGALVIR) en un tumor humano y más preferentemente en las estructuras de la neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. ¦ Proteína # 25 La existencia de la proteína CDNA FLJ45811 fis, clon NT2RP7014778 (Q6ZS59) fue postulada con base en el secuenciamiento de los ADNcs de longitud completa (Isogai, T et al., NEDO human cDNA sequencing project, envío directo a la página doméstica de NCBI), pero nunca fue probada experimentalmente . La presente invención demuestra sorprendentemente que tal proteína efectivamente existe (por la identificación del péptido QF LGGVAR, que es específico para esta proteína) , y también demuestra que es sobreexpresada en y/o alrededor las estructuras de neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares . Proteínas # 26 y 27 El péptido identificado ( EAFEAASR) no permite distinguir entre las dos proteínas hipotéticas DKFZp77901248 (Q6AHZ8) y la beta-ureidopropionasa (Q9UBR1) . La página doméstica de RZPD (http://www.rzpd.de) vincula la proteína hipotética DKFZp77901248 a la beta-ureidopropionasa. La beta-ureidopropionasa es una proteína cuya deficiencia conduce a errores en el nacimiento de la vía de la degradación de la pirimidina (van Kuilenburg, AB et al., Hum Mol Genet. 13, 2793-801, 2004) . No existen datos publicados que impliquen a la beta-ureidopropionasa y al cáncer. Sorprendentemente, la presente invención demuestra la sobreexpresión en y/o alrededor de las estructuras de neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares. Proteína # 28 La existencia de la proteína hipotética DKFZp434F1919 (Q9GZU6) y su isoforma MDS011 (Q9GZT6) (la dos proteínas tienen 99.6% de identidad de la secuencia de aminoácidos) fue postulada con base en el secuenciamiento de los ADNcs de longitud completa (Ota, T et al., Nature Genetics 36, 40-45, 2004), pero nunca fue probada experimentalmente .
La presente invención demuestra sorprendentemente que tal proteina efectivamente existe (por la identificación del péptido IDAEIASLK, que es especifico para esta proteina) , y también demuestra que es sobreexpresada en y/o alrededor de las estructuras de neo-vasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vasculares . Proteina # 29 La expresión de la proteina rica en cisteina con la proteina 2 del dominio similar a EGF [precursor] (seis isoformas, ver Tabla 1) ha sido estudiada para diferentes tejidos humanos normales (transferencia de northern) y cerebro ( inmuno-histoquimica ) (Ortiz, JA et al., J Neurochem. 95, 1585-96, 2005) , pero no están disponibles datos respecto al tejido tumoral. Sorprendentemente, la presente invención demuestra la sobreexpresión en y/o alrededor de las estructuras de la neovasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección al objetivo vascular. Proteina # 30 La existencia de la proteina KIAAOIOO de la familia UPF0378 [precursor] (Q5H9T4) fue postulada con base en el secuenciamiento de los ADNcs (Ottenwaelder, B. et al., The Germán cDNA Consortium, envío directo a la base de datos de NCBI), pero nunca fue probada experimentalmente .
La presente invención demuestra sorprendentemente que tal proteina efectivamente existe (pero la identificación del péptido KLQAELK, que es especifico para esta proteina) , y también demuestra que es sobreexpresada en y/o alrededor de las estructuras de la neovasculatura tumoral, indicando de este modo aplicaciones biomédicas de dirección del objetivo vascular . Proteina # 31 En la presente invención, el péptido SPILAEVK fue identificado como parte del miembro 1 de la subfamilia H de canal de compuerta de voltaje de potasio proteico (095259) . Existen también dos isoformas de esta proteina, las cuales contienen este péptido (095259 y 095259-2 (hEAG) ) . Pardo y colaboradores (Pardo et al., EMBO J. , 18, 5540-5547, 1999) mostraron que la inhibición de esta expresión proteica provoca una reducción significativa de la proliferación celular. Ellos mostraron la expresión de KCNH1 en células tumorales de mama y de cerebro. Además, la expresión fue detectada mediante inmunohistoquimica en cáncer de cervix (Farias et al., Cáncer Res., 64, 6996-7001, 2004). Sorprendentemente, esta invención revela la sobreexpresión del miembro 1 de la subfamilia H de canal de compuerta de voltaje de potasio, proteico, en cáncer de riñon, indicando de este modo que dicha proteina es un novedoso marcador de tumor renal humano, más preferentemente como un marcador de tumor renal humano fácilmente accesible desde la corriente sanguínea y, de este modo, útil como un objetivo para las aplicaciones de dirección a objetivos tumorales basados en ligando. BREVE DESCRIPCION DE LAS FIGURAS Figura 1A Es una representación esquemática del procedimiento de perfusión renal ex vivo empleado para identificar marcadores tumorales en la vasculatura del riñon. Dentro de dos minutos después de la nefrectomía, el riñon que posee tumores perfundido con un derivado de este reactivo de biotina, despejando de este modo los componentes sanguíneos y biotinilando las proteínas accesibles. Los especímenes titulares biotinilados pueden ser cortados, procesados separadamente para la purificación de las proteínas biotiniladas , produciendo péptidos trípticos que son separados mediante nano-CLAR y analizados mediante espectrometría de masa tipo de vuelo, de ionización en tándem, de deserción láser, asistida por matriz (MALDI-TOF/TOF) . (Fig. IB) Riñon que posee tumor, cortado a la mitad, después de la perfusión ex vivo. Las estructuras biotiniladas en las secciones tisulares son detectadas en la porción tumoral (Fig. 1C) y en la porción de riñon normal (Fig. ID) utilizando protocolos de tensión basados en peroxidasa de rábano-avidina . Las estructuras vasculares son preferentemente biotiniladas en la masa neoplásica.
Figura 2 muestra la validación de objetivo mediante análisis de PCR semi-cuantitativo de las bibliotecas de ADNc [carcinoma de células claras, banda 1; carcinoma de células granulares, banda 2; carcinoma de células transicionales , banda 3; riñon fetal normal, banda 4; riñon de adulto normal, banda 5] . (*) De manera contraria a otras proteínas, la confianza de la asignación de CEACA 3 con el software MASCOT estuvo por debajo de 95% para el mejor ión peptídico y es no ambiguo incluso después de la inspección visual de los espectros de MS-MS. Figuras 3A-3B son el resultado del análisis inmunohistoquímico del riñon normal y de las secciones tumorales con antibióticos específicos para la periostina (Fig. 3A) y versican (Fig. 3B) . La tinción con el anticuerpo anti-periostina mostró una tinción de bajo antecedente en muestras de ríñones normales, pero reveló una sobreexpresión fuerte en ocho 8 de 8 tumores investigados. Versican fue fuertemente sobreexpresado en 6 de 8 tumores, pero no tiñó ríñones normales y otros tejidos normales. Las reacciones de tinción estuvieron ausentes en los experimentos control negativo, omitiendo los anticuerpos primarios. Barras de escala = XXX. Figura 4A muestra la alineación de las secuencias de proteína de las diversas isoformas de la periostina limitada a la región carboxilo-terminal de la proteína, donde ocurre el empalme alternativo. Figura 4B es una representación gráfica de las diferentes combinaciones de exones que corresponden a las regiones que muestran en la figura 4A. Las isoformas identificadas en este estudio son nombradas «A» a «E». El rectángulo azul pálido corresponde al péptido especifico de la isoforma EIPVTVYKPIIKK que identificamos (ver las figuras 5A-5D) . Figuras 5A-5D identificación de los péptidos específicos de isoforma de la periostina. (Fig. 5A) Espectro MALDI-TOF de una fracción de CLAR que contiene un péptido con una proporción de masa a carga de 1527.98. (Fig. 5B) La secuencia de este péptido (EIPVTVYKPIIKK) fue determinada mediante MALDI-TOF/TOF . En la Tabla de los iones del fragmento peptídico (Fig. 5C) y los iones de fragmento interno (Fig. 5D) teóricos, los iones identificados están marcados en negritas. El péptido EIPVTVYKPIIKK (rectángulo azul pálido en la figura SI, figura 5B) abarca la unión entre los dos exones que están únicamente presentes en las isoformas Q15063-2 y «B». Figura 6A. El análisis de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) el fragmento recombinante purificado (47 kDa) de la periostina que fue utilizado como antígeno en selecciones de visualización de fago de anticuerpo. (fig. 6B) Representación gráfica de los resultados de ELISA con los clones seleccionados de scFv después de 2 rondas de visualización panorámica contra FAS2-FAS4 ó FAS4. Las señales positivas de ELISA muestran afinidad de enlace del clon del anticuerpo particular al antigeno. Los mejores clones fueron seleccionados para la caracterización posterior. (fig. 6C) Representación gráfica de los resultados de la selección de ELISA después de la primera ronda de maduración de afinidad del clon C2 contra FAS2-FAS4. Figuras 7A-7B. Tinción inmunohistoquimica sobre secciones tisulares de un tumor renal humano. (fig. 7A) Tinción con el anticuerpo scFv monoclonal humano seleccionado (clon C2) contra los dominios de periostina FAS2-FAS4 mostraron fuerte tinción positiva de las estructuras extracelulares, principalmente alrededor de los vasos sanguíneos tumorales (la flecha blanca señala hacia la tinción positiva de un vaso sanguíneo tumoral) . (Fig. 7B) Un control negativo utilizando el mismo protocolo de tinción, pero omitiendo la scFv no dio como resultado tinción específica. Figura 8. Detección inmmunohistoquímica de la periostina en varios pacientes con carcinoma de células claras renales. La tinción inmunohistoquimica reveló una fuerte sobreexpresión de la periostina en 8/8 tumores investigados. Las flechas negras apuntan a las áreas seleccionadas con tinción positiva. Barras de escala, 100 µ??. Figura 9. La detección inmunohistoquimica del versican en varios pacientes con carcinoma de células claras renales. La tinción inmunohistoquimica reveló una fuerte sobreexpresión de versican en 6/8 tumores investigados. La tinción está localizada en la matriz extracelular , también alrededor de los vasos sanguíneos tumorales. Las flechas negras apuntan hacia las áreas seleccionadas con tinción positiva. Barras de escala, 25 µp?. Figura 10. Análisis de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) del fragmento recombinante purificado (26 kDa) de CEACAM3. Figura 11. Análisis de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) del fragmento recombinante purificado (27 kDa) de fibromodulina . Figura 12A. Análisis de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) del fragmento recombinante purificado (12 kDa) del antígeno MG50 asociado al melanoma, que fue utilizado como antígeno en las selecciones de visualización de fago de anticuerpo. (fig. 12B) Representación gráfica de los resultados de ELISA con los clones de scFv seleccionados después de 3 rondas de visualización panorámica contra el fragmento MG50 del antígeno asociado al melanoma. Las señales de ELISA positivas muestran afinidad de enlace del clon de anticuerpo particular al antigeno. Los mejores clones fueron seleccionados para la caracterización adicional. Figuras 13A-13B. Tinción inmunohistoquimica sobre secciones tisulares de un tumor renal humano. (fig. 13A) Tinción con el anticuerpo scFv monoclonal humano seleccionado (clon F6) contra el fragmento de los dominios MG50 de antigeno asociado al melanoma, mostró una fuerte tinción positiva, principalmente alrededor de los vasos sanguíneos tumorales (las flechas negras apuntan hacia algunos de los puntos de la tinción positiva alrededor de los vasos sanguíneos tumorales) . (fig. 13B) Un control negativo utilizando el mismo protocolo de tinción pero omitiendo el scFv, dio como resultado tinción no específica. Figura 14A. Análisis de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) del fragmento recombinante purificado (24 kDa) de la proteína sidekick-1 que fue utilizada como antígeno en selecciones de visualización de fago de anticuerpo, (fig. 14B) Representación gráfica de los resultados de ELISA con los clones de scFv seleccionados después de 2 rondas de visualización panorámica contra el fragmento de la proteína sidekick-1. Las señales de ELISA positivas muestran la afinidad de enlace del clon de anticuerpo particular al antígeno. Los mejores clones son seleccionados para la caracterización posterior. Figura 15A. Análisis de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) del fragmento recómbinante purificado (24 kDa) de la proteina sidekick-1 que fue utilizada como antígeno en selecciones de visualización de fago de anticuerpo, (fig. 15B) Representación gráfica de los resultados de ELISA con los clones de scFv seleccionados después de 2 rondas de visualización panorámica contra la proteina ANXA4 recómbinante. Las señales de ELISA positivas muestran la afinidad de enlace del clon de anticuerpo particular al antigeno. Los mejores clones son seleccionados para la caracterización posterior. Figuras 16A-16B. Tinción inmunohistoquimica sobre secciones tisulares de un tumor renal humano. (fig. 16A) Tinción con el anticuerpo monoclonal scFv humano, seleccionado (clon Ell ) contra la proteina ANXA4 recómbinante mostró fuerte tinción positiva de las células tumorales, incluyendo aquellas alrededor de los vasos sanguíneos tumorales (las flechas blancas apuntan hacia algunos de los puntos con tinción positiva; de hecho, la mayor parte del tejido es positivo) , (fig. 16B) Un control negativo utilizando el mismo protocolo de tinción pero omitiendo el scFv, dio como resultado únicamente pocas áreas con tinción débil. Barras a escala, 100 µp?. Figura 17. Análisis de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) del fragmento recómbinante purificado (27 kDa) de la proteína KIAA0100 de la familia UPF0378. Figura 18A. Representación esquemática del miembro 1 de la subfamilia H de canal de compuerta de voltaje de potasio. El péptido utilizado como antigeno en secciones de visualización de fago correspondieron al segundo bucle extracelular de esta proteina membranal (ver flecha roja) , (fig. 18B) La representación gráfica de los resultados de la selección de ELISA después de la primera ronda de maduración de afinidad del clon H9 contra el péptido del miembro 1 de la subfamilia H de canal de compuerta de voltaje de potasio. Las señales de ELISA positivas muestran afinidad de enlace del clon de anticuerpo particular hacia el antigeno. Figuras 19A-19D. Tinción inmunohistoquimica sobre secciones tisulares de tumores humanos. La tinción con el anticuerpo scFv monoclonal humano seleccionado (clon H9) contra el miembro 1 de la subfamilia H de canal de compuerta de voltaje de potasio mostró fuerte tinción positiva de las membranas celulares tumorales en sección tisular de tumores renales humanos (fig. 19A) y de tumores pulmonares humanos (fig. 19C) (las flechas negras apuntan hacia la tinción positiva de las membranas celulares) . Los controles negativos utilizando el mismo protocolo de tinción pero omitiendo el scFv dieron como resultado tinción no especifica en el tejido tumoral renal (fig. 19B) y en el tejido tumoral pulmonar (fig. 19D) .
Figura 20. Experimento de FACS con células HeLa. El tratamiento de las células con scFv(H9) seleccionadas contra el miembro 1 de la subfamilia H del canal de compuerta de voltaje de potasio como anticuerpo primario, Ig de ratón anti-c-myc (clon 9E10) como secundario e Ig anti-ratón marcado con FITC como el anticuerpo terciario revelaron un desplazamiento en el FACS (panel izquierdo) en comparación a las células tratadas con el mismo procedimiento únicamente omitiendo el scFv (panel derecho) , indicando un enlace exitoso de scFv(H9) a las células HeLa. Figuras 21A-21B. Experimento de inmunocitoquimica con células HeLa . La tinción de las células HeLa cultivadas con el anticuerpo scFv monoclonal humano seleccionado (clon H9) contra el miembro 1 de la subfamilia H del canal de compuerta de voltaje de potasio, mostró tinción positiva fuerte de las membranas de células tumorales (fig. 21A) (la flecha blanca apunta hacia la tinción positiva de las membranas celulares) . Los controles negativos utilizando el mismo protocolo de tinción pero omitiendo el scFv, dieron como resultado tinción no especifica (fig. 21B) . DESCRIPCION DETALLADA DE LA INVENCION Los siguientes ejemplos fueron proporcionados para ilustrar mejor la presente invención con más detalle. Estos no deben ser considerados como limitantes del alcance de las reivindicaciones de ninguna manera.
En la especificación y las reivindicaciones anexas, aparte de los ejemplos operativos, o donde se indica de otro modo, todos los números que expresan cantidades de ingredientes, condiciones de reacción, identidad porcentual, números de aminoácidos, números de nucleótidos, etc., tienen que entenderse como que están modificados en todos los casos por el término "aproximadamente". Además, todos los intervalos numéricos citados en la presente deben entenderse para abarcar específicamente todos los subintervalos concebibles de los mismos. El ejemplo 1 siguiente demuestra la sobreexperesion de las proteínas marcadoras identificadas de acuerdo a la invención en estructuras neovasculares , en particular su sobreexpresión en tumores, más específicamente en tumores renales. Además, los ejemplos 2 al 10 siguientes demuestran la producción recombinante de las proteínas marcadoras vasculares seleccionadas (o fragmentos de las mismas) de la presente invención y su utilidad como antígenos para producir anticuerpos contra estas proteínas marcadoras vasculares. Tales anticuerpos (u otros ligandos con la misma afinidad selectiva) son útiles para caracterizaciones posteriores y aplicaciones biomédicas de estas proteínas marcadoras. Además, algunos de los ejemplos prueban la utilidad práctica de las proteínas marcadoras seleccionadas de la presente invención para identificar las estructuras neovasculares, en particular estructuras neovasculares en tumores. Ejemplos Ejemplo 1 Introducción Un procedimiento proteómico químico basado en la perfusión ex vivo y en la biotinilación de estructuras accesibles dentro de los ríñones humanos quirúrgicamente seccionados con el tumor, se utilizó para obtener información respecto a los antígenos accesibles y abundantes que son sobreexpresados en el cáncer humano. Las proteínas biotiniladas fueron purificadas sobre resina de estreptavidina e identificadas utilizando metodologías espectrométricas de base, revelando 637 proteínas, de las cuales 184 fueron encontradas en especímenes tumorales únicamente, y 223 en porciones de ríñones normales únicamente Treinta de los antígenos accesibles asociados al tumor, identificados con esta metodología son objetivos adecuados para las terapias anticancerígenas basadas en anticuerpo. El método específico utilizado para la identificación de los antígenos accesibles en órganos normales y en tumores, está basado en la perfusión terminal de ratones que poseen tumores, con derivados de éster reactivos de biotina, que fue recientemente publicado por los presentes inventores (Rybak et al. 2005 supra) . Esta metodología permite la biotinilación eficiente entre las proteínas accesibles sobre la membrana de células endoteliales y sobre otras estructuras (por ejemplo, componentes de la matriz extracelular ) que son fácilmente accesibles de la corriente sanguínea. La purificación de las proteínas biotiniladas a partir de los lisados y órganos sobre resina de estreptavidina, seguido por un análisis proteómico comparativo basado en espectrometría de masa, permitió la identificación de cientos de proteínas accesibles, algunas de las cuales fueron encontradas como diferencialmente expresadas en órganos y en tumores. El procedimiento de biotinilación anteriormente mencionado fue aplicado a la perfusión ex vivo de tres ríñones quirúrgicamente resecados de pacientes con carcinoma de células renales (figuras 1A-1D y Tabla 2) . Este procedimiento duró 7-9 minutos y permitió la marcación eficiente y selectiva de las estructuras vasculares en las porciones tumorales (figura 1C) , mientras que las estructuras vasculares y tubulares fueron marcadas en las porciones renales normales (figura 1 D) . Después de la biotinilación y apagado del reactivo de biotinilación en exceso con una solución que contenía amina primaria (Tris), los especímenes fueron extirpados, homogeneizados en presencia de SDS y cargados sobre resina de estreptavidina, enriqueciendo de este modo las proteínas biotiniladas . Una digestión proteolitica subsecuente, seguida por la separación de péptidos por nanoCLAR y análisis espectrométrico de masa mediante MALDI-TOF/TOF permitió la identificación total de 637 proteínas en todos los especímenes. Como se esperaba, abundantes proteínas observadas en los especímenes normales y neoplásicos incluyeron componentes de la matriz extracelular , tales como colágenos, laminina, perlecan, lumican, vitronect ina , fibronectina, y tenascina. Las proteínas encontradas exclusivamente en las porciones renales normales incluyendo la caderina 16 específica del riñon, varios transportadores, apolipoproteína E y uromodulina. Un número de proteínas fueron encontradas exclusivamente en los especímenes tumorales. Se había reportado previamente que algunas de estas eran sobreexpresadas en ciertas estructuras neoplásicas [por ejemplo, anhidrasa carbónica IX, TEM4 , homólogo de peroxidasina [fragmento], proteína 8 de la región crítica del síndrome de Down, integrina alfa-1, pirofosfatasa/fosfodiesterasa 3 de ectonucleótido] . Únicamente una porción pequeña de los antígenos tumorales identificados en este análisis (por ejemplo, receptor DCC de netrina, familia 2 de portadores solubles, miembro 1 del transportador facilitado de glucosa, molécula 1 de adhesión a las células neurales) han sido reportadas hasta la fecha en "Human Proteina Atlas": una iniciativa a nivel de genoma para la caracterización de patrones de expresión de proteínas en tejidos normales y en cáncer. Ya que la detección de una proteína en los especímenes tumorales puede, en principio, reflejar no solamente un patrón preferencial de expresión, sino también una accesibilidad diferencial al reactivo de biotinilación, los candidatos proteicos seleccionados fueron caracterizados mediante inmunohistoquímica y mediante análisis de PCR de las bibliotecas de ADNc. La periostina fue el antígeno asociado al tumor, más abundante en este análisis, y representa un marcador particularmente interesante, habiendo sido encontrado que es suprarregulado en tumores de ovario epiteliales, cáncer de mama, en la periferia de los carcinomas pulmonares, y en cánceres colorrectales y sus metástasis hepáticas. La existencia de cinco diferentes isoformas de empalme de la periostina en humanos han sido reportadas, pero las secuencias únicamente de tres isoformas son publicadas ( Swiss-Prot /TrEMBL y NCBI protein) . No obstante, las seis secuencias de las isoformas fueron identificadas en el análisis de PCR de las bibliotecas de ADNc, con diferente abundancia relativa en riñon normal, fetal y tumoral (figura 2 y figuras 4A-4B) . Un análisis inmunohistoquímico de riñon normal y especímenes de carcinoma de células claras, reveló una sobreexpresión sorprendente de la periostina en los tumores, con un patrón vascular y estromal prominente de tinción (figuras 3A-3B) . Similarmente, se encontró que el versican es más abundante en especímenes fetales y tumorales, mediante PCR (figura 2) y mediante análisis inmunohistoquímico (figuras 3A-3B) . Algunos de los antígenos asociados al tumor putativos fueron encontrados presentes también en las bibliotecas de ADNc de riñon normal (figura 2), incluyendo fibulines, el candidato supresor tumoral 3 (proteína N33) y la proteína hipotética DKFZp686K0275 [fragmento] (figura 2) . En contraste, un número de marcadores interesantes produjo bandas de PCR sustancialmente más fuertes en especímenes fetales y tumorales, incluyendo la anhidrasa carbónica IX, TEM-4, el homólogo de peroxidasina [fragmento], la integrina alfa-1, la trombospondina 2, el receptor 42 acoplado a la proteína G putativa, agrecan, el receptor 37 probable acoplado a la proteína G [precursor] , fibromodulina , familia 2 de portadores de soluto, miembro 1 del transportador facilitado de glucosa, y proteína sidekick-l [precursor] (figura 2) . Entre las 637 proteínas identificadas en este análisis, aproximadamente 20% correspondieron a proteínas intracelulares . Mientras que algunas proteínas extracelulares más abundantes (por ejemplo, actina, tubulina, queratina, histonas) pudieran ser recuperadas ya sea por adherencia a la resina de estreptavidina o como una consecuencia de la biotinilación de las estructuras necróticas ex vivo, se ha reportado que algunas proteínas extracelulares se vuelven accesible sobre la superficie de las células endoteliales en proliferación. Materiales y Métodos Pacientes Este estudio fue comenzado después de la aprobación por el comité ético del Hospital de la Universidad de Liége (Bélgica) . Los criterios adoptados para la selección de pacientes fueron como sigue: 1) diagnóstico de un tumor altamente compatible con un carcinoma de células claras del riñon, como fue evaluado por ultrasonido rutinario y exploración de CT abdominal; 2) una indicación terapéutica para una nefrectomía total; 3) un tamaño tumoral y localización que permitieron distinguir claramente las porciones saludables del riñon que van a ser utilizadas como controles normales. Los procedimientos inmunohistoquímicos compatibles con la detección de las proteínas específicas sin interferencia de la biotina fueron adoptados para análisis histopatológico de diagnóstico. Se obtuvo el consentimiento informado de los pacientes y se realizó la serología para la negatividad al VIH y para las hepatitis A, B y C. Para información específica respecto a los pacientes ver la Tabla SI.
Perfusión vascular ex vivo La cirugía fue realizada de acuerdo a un procedimiento estándar, el cual incluye la ligadura y la sección de la arteria renal, la vena y el uréter, y la nefrectomía subsiguiente. La arteria renal llevó una estructura más larga para la identificación inmediata en el paso de perfusión. Dentro de dos minutos después de la nefrectomía, la arteria renal fue canulada, la vena renal fue abierta (al retirar la sutura) para permitir el flujo hacia afuera del perfundido, y se inició la prefusión vía la arteria renal. Los ríñones fueron primeramente prefundidos en 7-9 minutos con 500 mi de una solución a 1 mg/ml de sulfo-NHS-LC-biotina en PBS, lavando los componentes sanguíneos y marcando las estructuras que contienen la amina primaria, y accesibles con biotina. Inmediatamente después de esto, se realizó un segundo paso de perfusión con 450 mi de PBS que contenían una solución 50 mM de la amina primaria Tris- (hidroximetil ) -aminometano (Tris), por 8-9 minutos para apagar el reactivo de biot inilación sin reaccionar. Todas las soluciones de perfusión contenían 10% de dextrano-40 como un expansor plasmático, y fueron precalentados a 40°C. Ambos pasos de perfusión fueron realizados con una presión de 100-150 mm Hg. La perfusión exitosa fue indicada por el lavado de la sangre durante los primeros minutos de perfusión y el flujo subsiguiente del prefundido claro fuera de la vena renal. Después de la perfusión, los órganos fueron lavados con Tris 50 mM en PBS, secado, frotados con tinta negra para permitir que la investigación patológica posterior de los márgenes quirúrgicos, y cortados a la mitad a lo largo del eje sagital (comenzando en el borde medio externo) con un bisturí. La perfusión exitosa dio como resultado un color blanquecino del tejido. Los especímenes provenientes del tejido tumoral y del tejido renal normal (no afectado por el tumor) fueron extirpados (de las partes blanquecinas, bien prefundidas ) , e inmediatamente congelados para los análisis proteómico e histoquímico, o fijados con paraformaldehído e incrustados en parafina para los análisis histoquímicos . Como un control negativo, los órganos no perfundidos después de la nefrectomía fueron cortados a la mitad y los especímenes fueron tomados como se describe anteriormente del tumor y del tejido renal normal. Para información específica respecto a los órganos examinados, ver la Tabla 2. Tinción histoquimica de las secciones titulares con el complejo de avidina- biotina-peroxidasa Las secciones provenientes de los especímenes tisulares incrustados en parafina, fijados con paraformaldehído, fueron teñidas con el complejo de avidina-biotina-peroxidasa (equipo Vectastain Elite ABC (Vector Laboratories, Burlingame, CA, USA) ) de acuerdo a los procedimientos estándares.
Preparación de los extractos proteicos para el análisis proteómico Especímenes provenientes de riñon saludable y tejido de carcinoma renal claro de pacientes humanos con cáncer fueron resuspendidos en 40 µ? por mg de tejido de un amortiguador de lisis que contenía 2% de SDS, Tris 50 mM, EDTA 10 mM, cóctel inhibidor de Proteinasa con Complemento E (Roche Diagnostics, Mannheim, Alemania) en PBS, pH 7.4 y se homogenizaron utilizando un dispersor Ultra-Turrax T8 (IKA- erke, Staufen, Alemania) aplicando seis intervalos de 2 minutos de energía plena y 2 minutos de espera a enfriamiento moderado. Los homogeneizados fueron sonicados (6 intervalos de 30 segundos y 1 minuto de espera a enfriamiento moderado) utilizando un Vibra-cel (Sonics, New Town, CT, Estados Unidos de América) , seguido por 15 minutos de incubación a 99°C y 20 minutos de centrifugación a 15000 x g. El sobrenadante fue utilizado como extracto proteico total. La concentración de proteína fue determinada utilizando el equipo de reactivo de ensayo de proteínas BCA (Pierce) . Purificación de las proteínas biotiniladas La suspensión de SA-sefaróse (64 µ?/mg de proteína total) fue lavada tres veces en amortiguador A (NP40 1%, SDS 0.1% en PBS), centrifugada, y el sobrenadante fue retirado. Se necesitaron quince miligramos de extracto de proteína total proveniente de diferentes especímenes, con el botón de la SA-Sefaróse. La captura de las proteínas biotiniladas fue dejada proceder por 2 horas a temperatura ambiente en un mezclador de revoltura. El sobrenadante fue retirado y la resina fue lavada tres veces con amortiguador A, dos veces con amortiguador B (NP40 0.1%, NaCI 1 M en PBS), y una vez con bicarbonato de amonio 50 mM. Finalmente, la resina fue resuspendida en 400 µ? de una solución 50 mM de bicarbonato de amonio y se agregaron 20 µ? de la tripsina porcina modificada grado secuenciamiento (solución de reserva de 40 ng/µ? en bicarbonato de amonio 50 mM) (Promega, Madison, WI, EUA) . La digestión con protesasa fue llevada toda la noche a 37°C bajo agitación constante. Los sobrenadantes fueron recolectados y se agregó ácido trifluoacét ico hasta una concentración final de 0.1%. Los péptidos fueron desalados, purificados y concentrados con microcolumna C18 (ZipTip C18, Millipore, Billerica, MA, EUA) . Después de la liofilización los péptidos fueron almacenados a -20°C. CLAR nanocapilar con transferencia con puntos automatizada de la fracción en línea sobre placas objetivo MALDI Los péptidos trípticos fueron separados mediante cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa (RP-CLAR, por sus siglas en inglés) utilizando un sistema LC nanoescalar de UltiMate y un microautomuestrador FAMOS (LC Packings, Amsterdam, Holanda) controlado por el software Chromeleon (Dionex, Sunnyvale, CA, EUA) . La fase A móvil consistió de 2% de acetonitrilo y 0.1% de ácido trifluoroacético (TFA) en agua, la fase móvil B fue 80% de acetonitrilo y 0.1% de TFA en agua. La velocidad de flujo fue de 300 nl/minuto, conduciendo una presión de fase móvil A de ~ 170 bar. Los péptidos liofilizados derivados de la digestión de las proteínas biotiniladas purificadas por afinidad a partir de 1.5 mg de proteína total, fueron disueltos en 5 µ? de amortiguador A y cargados sobre la columna (diámetro interno: 75 µ??, longitud 15 cm, llenado con C18 PepMap 100, 3 µp?, esferas de 100 Á LC Packings) . Los péptidos fueron eluidos con un gradiente de 0 a 30% de B por 7 minutos, 30-80% de B por 67 minutos, 80-100% de B por 3 minutos y 100% de B por 5 minutos; la columna fue luego equilibrada con 100% de A por 20 minutos antes de analizar la siguiente muestra. Las fracciones de elusión fueron mezcladas con una solución de 3 mg/ml de ácido a-ciano-4-hidroxi-cinámico, 277 pmol/ml de neurotensina (estándar interno), 0.1% de TFA, y 70% acetonitrilo en agua y depositada sobre una placa de objetivo MALDI de 192 pozos utilizando un sistema Probot en línea (Dionex) . El flujo de la solución de matriz MALDI fue ajustado a 1.083 µ?/minuto. De este modo, cada fracción recolectada durante 20 segundos contenía 361 ni de la solución de matriz MALDI y 100 ni de muestra. La concentración final de neurotensina fue de 100 fmol por pozo de muestra.
Espectrometría de masa MALDI-TOF/TOF El análisis espectrométrico de masa en tándem en tiempo de vuelo, de ionización por desorción láser asistido por matriz (MALDI-TOF/TOF) fue llevado a cabo con el Analizador 4700 Proteomics (Applied Biosystems, Framingham, MA) . Todos los espectros fueron adquiridos con un láser Nd:YAG que funciona a una frecuencia de láser de 200 Hz. Para la selección de iones precursores, todas las fracciones fueron medidas en el modo MS antes de que se realizara la MS/MS. Se seleccionó un máximo de 15 precursores por punto de muestra para la fragmentación subsiguiente mediante la disociación inducida por colisión. Los criterios para la selección de los precursores fueron una S/N mínima de 60 y la tolerancia de masa de precursor de disparo a disparo de 120 ppm. Los espectros fueron procesados y analizados por la estación de trabajo Global Protein Server Workstation (Applied Biosystems), que utiliza el software interno MASCOT (Matrix Science, Reino Unido) para equiparar los datos de MS y MS/MS contra las bases de datos de las proteínas digeridas en sílice. Los datos obtenidos fueron seleccionados contra una base de datos humana descargada de la página doméstica de NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) . El número de escisiones faltantes fue ajustado a 2. Las indicaciones de proteína, realizadas por medio del software MASCOT, fueron consideradas por ser llamadas correctas dentro del intervalo de confianza del 95% para el mejor ion peptídico. Los aciertos seleccionados dentro del intervalo de confianza entre 90% y 95% fueron verificados mediante inspección manual de los espectros . Tinción inmunohistoquímica Secciones provenientes de especímenes tisulares incrustados en parafinas, fijados para formaldehído, fueron teñidos por la técnica de inmunoperoxidasa (Equipo Vectastain Elite ABC (Vector Laboratories, Burlingame, CA, EUA) ) de acuerdo a los procedimientos estándares. El anticuerpo policlonal de conejo ant i-periost ina purificado por inmunoafinidad (Biovendor, Heidelberg, Alemania) y el anticuerpo monoclonal anti-versican (clon 12C5; Banco de Hibridomas de Estudios del Desarrollo, Universidad de Iowa, Ames, IA, EUA) fueron utilizados en una dilución de 1:500. Análisis de PCR Un panel de ADNc de tumor renal humano que contenía ADNcs provenientes de carcinoma de células claras, carcinoma de células granulares, carcinoma de células transicionales , riñon normal de adulto y fetal, fueron adquiridos de BioChain (Hayward, CA, EUA) . La reacción en cadena de polimerasa (PCR) fue realizada utilizando el equipo de Polimerasa Hot Start Taq (Qiagen, Hilden, Alemania) . Las condiciones de PCR fueron como sigue: desnaturalización a 95°C por 15 minutos, seguido por 35 ciclos de desnaturalización a 94°C por 1 minuto, recocido a 54°C por 1 minuto y alargamiento a 72°C por 1 minuto. Se realizó un paso final de alargamiento a 72°C por 10 minutos. Las secuencias cebadoras son disponibles a petición. Los productos de la reacción de PCR fueron analizados mediante electroforesis en gel de agarosa teñidos al 2% con bromuro de etidio y formados en imagen utilizando el sistema de formación de imagen BioDoc-It (UVP, Upland, CA, EUA) . Para el análisis de las isoformas de empalme de periostina, las bandas fueron cortadas del gel de agarosa y secuenciadas (equipo de Secuenciamiento por Ciclos Big Dye Terminator vl.l; Analizador Genético ABI PRIS 310; Applied Biosystems, Foster City, CA, EUA) . Identificación de nuevas variantes de empalme de periodicidad Para la periostina humana, Takeshita y colaboradores han reportado que pueden ser producidos cinco transcritos empalmados alternativos, y que todos los eventos de empalme de la periostina ocurren dentro de la región C-terminal. La posibilidad de que alguna isoforma particular pueda ser selectivamente expresada en tumores y no expresada en tejido normal (en analogía al patrón de expresión de la isoforma que contiene ED-B bien caracterizada de la fibronectina y la isoforma de la tenascina C grande, que contiene el dominio C) conduce al diseño de cebadores para la amplificación de los dominios empalmados alternativos por PCR sobre bibliotecas de ADNc humanas. La amplificación por PCR de la región C-terminal de la periostina (las figuras 5A-5B) reveló al menos cinco diferentes variantes de empalme. Esto podría ser consistente con los hallazgos de Takeshita y colaboradores (supra), quienes no obstante, no han publicado las secuencias de las isoformas que ellos han encontrado. Un análisis de las bases de datos existentes revela la existencia de tres isoformas (SwissProt números Q15063, Q15063-2 y Q15063-3) y de un clon EST (OTTHUMP 0018271) , correspondiente a una cuarta isoforma diferente de la periostina. No obstante, la extirpación de las bandas amplificadas mostradas en la figura 2 y su secuenciamient o produjeron seis isoformas diferentes, cuatro de las cuales no correspondieron a ninguna de las conocidas; La periostina de longitud completa y una isoforma correspondiente a la isoforma Q15063-3 fueron también identificadas por secuenciamiento en el análisis. Identificación de los péptidos de periostina específicos de la isoforma Es importante hacer notar que el análisis proteómico anterior fue capaz de identificar los péptidos que son específicos de isoforma que están específicamente presentes en las muestras tumorales únicamente, lo que significa que éstos abarcan uniones de exones (o porciones de exones) que únicamente existen en una isoforma particular y no en otras, (ver figura 5A espectro MALDI-TOF de una fracción de CLAR que contiene un péptido de 1527.5797 m/z. (fig. 5B y fig. 5C) ) . La secuencia (EIPVTVYKPllKK) fue determinada mediante disociación inducida por condición en un experimento MALDI-TOF/TOF. El péptido EIPVTVYK llKK (rectángulo azul pálido en la Figura 4B) abarca la unión entre dos exones que están únicamente presentes en las isoformas Q15063-2 y «B». Otro ejemplo más de un péptido especifico de isoforma es representado por el péptido de la secuencia AELTDLK que abarca una unión de dominio únicamente presente en la proteina hipotética FLJ00154, una proteina específicamente detectada únicamente en la porción tumoral de los ríñones humanos, y que representa un transcrito menor del homólogo humano de la proteína 1 similar a Sidekick-like (datos no mostrados) . La identificación de las isoformas específicas del tumor de las proteínas de otro modo presentes en los otros tejidos normales, permite la producción de anticuerpos específicos de isoforma que son selectivos ya que éstos son capaces de discriminar entre las diversas isoformas de la misma proteína, y éstos anticuerpos proporcionarán objetivos potenciales para la terapia tumoral.
Resultados Tabla 2. Especificación de casos involucrados en este estudio. Los ríñones de cinco pacientes de diferentes edades y sexos afectados con tumores del tamaño y etapa especificados, fueron analizados. Tres órganos fueron biotinilados ex vivo como se describen anteriormente, mientras que los otros dos especímenes de riñon no prefundidos fueron recolectados y analizados como controles negativos .
Tabla 3. Selección de proteínas membranales putativas y proteínas de matriz extracelular identificadas en riñon normal, en la porción tumoral, o ambas. Los números indican en cuántos de los tres pacientes, cuyos ríñones fueron biotinilados ex vivo, fue identificada la proteína. # de pacientes (total Ejemplo 2 Introducción Para evaluar la utilidad de la periostina como marcador tumoral, los fragmentos recombinantes de esta proteina fueron clonados y expresados. Los anticuerpos monoclonales humanos contra los fragmentos recombinantes fueron producidos y probados en experimentos de ELISA y de inmunohistoquimica . Materiales y Métodos Los fragmentos de proteina recombinante correspondientes a las posiciones de las secuencias de aminoácidos 232-632 ( FAS2 -FAS4 ) y 496-632 ( FAS4 ) de la periostina (SEQ ID No: 1) fueron clonados para el uso como antigeno para experimentos de biovisualización panorámica. Los fragmentos fueron expresados en E. coli cepa TG1 utilizando el vector pQE12 (Qiagen, Hilden, Alemania) . Las proteínas fueron purificadas de listados de E. coli utilizando las columnas de Ni-NTA (Qiagen) . Los anticuerpos en el formato Fv de cadena simple (scFv) contra los fragmentos de periostina fueron seleccionados de la biblioteca de visualización de fago ???-2-Gold de acuerdo por el procedimiento reportado por Silacci et al., Proteomics. 2005 Jun; 5 ( 9) : 2340-50. La selección de ELISA para los clones que expresan el anticuerpo scFv que se enlaza al antígeno y la tinción inmunohistoquimica utilizando las preparaciones de Fv de cadena simple sobre secciones de muestra titulares recién congeladas se realizaron como se describió previamente en Silacci et al., Proteomics. 2005 Junio; 5(9):2340-50 y Brack et al., Clin. Cáncer Res. 2006 Mayo 15; 12 (10) : 3200-8. La maduración por afinidad de los anticuerpos seleccionados fue realizada como se describe en Brack et al., Clin. Cáncer Res. 2006 Mayo 15; 12 ( 10 ) : 3200-8. Las tinciones inmunohistoquimicas con el anticuerpo policlonal de conejo anti-periostina, purificado por inmunoafinidad, comercial (Biovendor, Heidelberg, Alemania) fueron realizadas como se describen en el Ejemplo 1. Resultados Los dominios de periostina FAS2-FAS4 o el dominio FAS4 fueron clonados y expresados. La Figura 6A muestra un análisis de SDS-PAGE de la proteina recombinante purificada FAS2-FAS4 (banda a 47 kDa) . Las selecciones de visualización de fago contra esta proteina dieron como resultado numerosos clones que expresan anticuerpos scFv específicos para FAS2-4 y para FAS4 como se muestra por ELISA sobre la proteína recombinante recubierta (ver figura 6B) . El mejor clon C2 contra FAS2-4 fue además madurado por afinidad para obtener un anticuerpo con mayor afinidad (ver resultados de ELISA en la figura 6C) . El anticuerpo C2 anti-periostina seleccionado fue utilizado en un análisis inmunohistoquímico, el cual mostró tinción positiva de las estructuras de matriz extracelulares y vasculares sobre secciones titulares de tumores renales humanos (ver figura 7A) . El control negativo para el cual las secciones provenientes del mismo tejido fueron sometidas al mismo protocolo de tinción omitiendo únicamente el scFv, no mostró tinción positiva (ver figura 7B) . Además, un anticuerpo comercial contra la periostina (ver también Ejemplo 1) fue utilizado para evaluar la expresión de periostina en tumores renales de diferentes pacientes (ver Figuras 8A-8B) . Ocho de ocho pacientes probados mostraron tinción anti-periostina positiva en el tumor renal. Estos resultados demuestran que los anticuerpos monoclonales humanos contra la periostina pueden ser producidos y utilizados para la detección de este antigeno en estructuras neovasculares de tejidos de cáncer humano. Los resultados inmunohistoquimicos indican que la periostina es expresadas a altos niveles en tumores renales humanos de la mayoría, sino es que de todos los pacientes. Ejemplo 3 Introducción Para estudiar adicionalmente el antígeno versican, se ha realizado un análisis inmunohistoquímico sobre secciones de tumor renal de diferentes pacientes. Materiales y métodos Las tinciones inmunohistoquímicas con anticuerpo monoclonal anti-versican (clon 12C5) sobre secciones incrustadas en parafina, fijadas con paraformaldehído de tumores renales humanos, se realizaron como se describe en el Ejemplo 1. Resultados Además, fue utilizado un anticuerpo comercial contra versican (ver también Ejemplo 1) para evaluar la expresión de la periostina en tumores renales de diferentes pacientes (ver Figura 9) . Seis de los ocho pacientes probados mostraron tinción positiva anti-versican en el tumor renal, ya sea más difuso en la matriz extracelular o más restringido a áreas alrededor de loa vasos sanguíneos tumorales. Estos resultados indican que versican es expresado a altos niveles en tumores renales humanos de la mayoría de los pacientes y es probablemente accesible desde la vasculatura. Ejemplo 4 Introducción Para evaluar el antígeno CEACAM3, un fragmento recombinante de esta proteína fue clonado y expresado para el uso como un antígeno para la selección de anticuerpos por visualización de fago. Materiales y Métodos Un fragmento de proteína recombinante correspondiente a las posiciones de secuencia de aminoácidos 36-236 de CEACAM3 (SEQ ID No: 25) fue clonado y expresado como se describe en el ejemplo 2 para el uso como antígeno para experimentos de biovisualizacion panorámica. Resul tados Los dominios de CEACAM3 correspondientes de las posiciones 36-236 de la secuencia de aminoácidos, fueron clonados y expresados. La figura 10 muestra un análisis de SDS-PAGE de la proteina recombinante purificada (banda a 26 kDa) . Estos resultados indican que los fragmentos de CEACAM3 pueden ser preparados con el fin de utilizarlos como antigeno en la selección de anticuerpo. Tales anticuerpos podrían ser utilizados para una validación posterior de CEACAM3 como un marcador tumoral vascular similar al ejemplo 2. Ejemplo 5 Introducción Para evaluar la utilidad de la fibromodulina como antígeno, un fragmento recombinante de esta proteína fue clonado y expresado para la selección de anticuerpos por visualización de fago. Materiales y Métodos Un fragmento de proteína recombinante correspondiente a la secuencia de aminoácidos en las posiciones 94-315 de CEACAM3 (SEQ ID No: 25) fue clonado y expresado como se describe en el ejemplo 2 para el uso como antígeno para experimentos de visualización panorámica. Resultados El fragmento de fibromodulina correspondiente a las posiciones 94-315 de la secuencia de aminoácidos, fue clonado y expresado. La figura 11 muestra un análisis de SDS-PAGE de la proteína recombinante purificada (banda a 27 kDa) . Este resultado indica que los fragmentos de fibromodulina pueden ser preparados con el fin de utilizarlos como antigeno en selecciones de anticuerpo. Tales anticuerpos podrían ser utilizados para una validación posterior de la fibromodulina como un marcador tumoral vascular similar al ejemplo 2. Ejemplo 6 Introducción Para evaluar el homólogo de peroxidasina [fragmento] para el uso como marcador tumoral, un fragmento recombinante de esta proteína fue clonado y expresado. Los anticuerpos monoclonales humanos contra el fragmento recombinante fueron producidos y probados en experimentos de ELISA y de inmunohistoquímica . Materiales y Métodos Un fragmento de proteína recombinante correspondientes a las posiciones 539-632 de la secuencia de aminoácidos del homólogo de peroxidasina [fragmento] (SEQ ID No.: 33) fue clonado y expresado, y las selecciones de visualización de fago de anticuerpo, la selección por ELISA y la inmunohistoquímica fueron realizadas como se describe en el ejemplo 2. Resultados El fragmento homólogo de peroxidasina fue clonado y expresado. La Figura 12A muestra un análisis de SDS-PAGE del fragmento de proteína recombinante purificada (banda a 12 kDa) . Las selecciones de visualización de fago contra esta proteina dieron como resultado numerosos clones que expresan anticuerpos scFv específicos para el fragmento homólogo de peroxidasina recombinante como es mostrado por ELISA sobre la proteína recombinante recubierta (ver figura 12B) . Se utiliza un anticuerpo homólogo anti- peroxidasina seleccionado [fragmento] en un análisis inmunohistoquímico, el cual mostró tinción positiva principalmente alrededor de los vasos sanguíneos tumorales sobre secciones tisulares de tumores renales humanos (ver figura 13A) . El control negativo, omitiendo el scFv, no mostró tinción positiva (ver figura 13B) . Estos resultados demuestran que los anticuerpos monoclonales contra el homólogo de peroxidasina [fragmento] pueden ser producidos y utilizados para la detección de este antígeno en estructuras neovasculares de tejidos de cáncer humano. Los resultados inmunohistoquímicos indican que el homólogo de peroxidasina [fragmento] es expresado a altos niveles en la neovasculatura tumoral humana. Ejemplo 7 Introducción Para evaluar el potencial de la proteína sidekick-1 como marcador tumoral, un fragmento recombinante de esta proteína fue clonado y expresado. Los anticuerpos monoclonales humanos contra el fragmento recombinante fueron producidos y probados en ELISA.
Materiales y Métodos Un fragmento de proteína recombinante correspondiente a las posiciones 851-1052 de la secuencia de aminoácidos de la proteína sidekick-1 (SEQ ID No.: 37) fue clonado y expresado, y las selecciones de visualización de fago de anticuerpo y la selección por ELISA fueron realizadas como se describe en el ejemplo 2. Resul tados El fragmento de la proteína sidekick-1 fue clonado y expresado. La figura 14A muestra un análisis de SDS-PAGE del fragmento de proteína recombinante purificada (banda a 24 kDa) . Las selecciones de visualización de fago contra esta proteína dieron como resultado varios clones que expresan los anticuerpos para scFv específicos para el fragmento sidekick-1 de la proteína como es mostrado por ELISA sobre la proteína recombinante recubierta (ver figura 14B) . Estos resultados demuestran que los anticuerpos monoclonales contra la proteína sidekick-1 pueden ser producidos contra fragmentos de anticuerpo recombinante. Estos anticuerpos podrían ser utilizados para una validación posterior de la proteína sidekick-1 como un marcador tumoral, similar del proceso descrito en el ejemplo 2. Ejemplo 8 Introducción Para evaluar la proteína ANXA4 para el uso como marcador tumoral, un fragmento recombinante de esta proteina fue clonado y expresado. Los anticuerpos monoclonales humanos contra los fragmentos recombinantes fueron producidos y probados en experimentos de ELISA y de inmuno-histoquimica . Materiales y Métodos Un fragmento de proteina recombinante correspondiente a las posiciones 3-321 de la secuencia de aminoácidos de la proteina ANXA4 (SEQ ID No. : 52) fue clonado y expresado, y las selecciones de visualización de fago de anticuerpo, la selección por ELISA y la inmunohistoquimica fueron realizadas como se describe en el ejemplo 2. Resul tados Casi la proteina ANXA4 completa fue clonada y expresada. La figura 15A muestra un análisis de SDS-PAGE de la proteina ANXA4 recombinante purificada (banda a 37 kDa) . Las selecciones de visualización de fago contra esta proteina dieron como resultado numerosos clones que expresan anticuerpos de scFv específicos para la proteína ANXA4 como es mostrado por ELISA sobre la proteína recombinante recubierta (ver figura 15B) . El mejor clon Ell contra la proteína ANXA4 fue utilizado en un análisis inmunohistoquímico, el cual mostró tinción positiva de las células tumorales (también aquellas células localizadas alrededor de los vasos sanguíneos tumorales) sobre secciones tisulares de los tumores renales humanos (ver figura 16A) .
El control negativo, para el cual las secciones provenientes del mismo tejido fueron sometidas al mismo protocolo de tinción, omitiendo únicamente el scFv, no mostraron tinción positiva (ver figura 16B) . Estos resultados demuestran que los anticuerpos monoclonales contra la proteina ANXA4 pueden ser producidos y utilizados para la detección de este antigeno en tejidos de cáncer humano. Los resultados inmunohistoquimicos indican que este antigeno es expresado a altos niveles en tumores humanos (también alrededor de la neovasculatura) . Ejemplo 9 Introducción Para estudiar adicionalmente la proteina KIAA0100 de la familia de antigeno UPF0378, se ha clonado y expresado un fragmento recombinante de esta proteina, con el fin de utilizarlo como antigeno, para la selección de anticuerpos por visualizacion de fago. Materiales y Métodos Un fragmento de proteina recombinante correspondiente a las posiciones 755-968 de la secuencia de aminoácidos de la proteina KIAA0100 de la familia UPF0378 (SEQ ID No.: 96) fue clonado y expresado como se describe en el ejemplo 2 para el uso como antigenos para experimentos de biovisualización panorámica.
Resultados y discusión El fragmento de la proteina KIAA0100 de la familia UPF0378 correspondiente a las posiciones 755-968 de la secuencia de aminoácidos, fue clonado y expresado. La figura 17 muestra un análisis de SDS-PAGE de la proteina recombinante purificada (banda a 32 kDa) . Este resultado indica que los fragmentos de la proteina KIAA0100 de la familia UPF0378 pueden ser preparados con el fin de utilizarlos como antigeno en selecciones de anticuerpo. Tales anticuerpos podrían ser utilizados para una validación adicional de este antígeno como un marcador tumoral vascular similar al ejemplo 2. Ejemplo 10 Introducción Para evaluar la utilidad del miembro 1 de la subfamilia H del canal de compuesto de voltaje de potasio como marcador tumoral, los anticuerpos monoclonales humanos fueron producidos contra un péptido sintético correspondiente a la secuencia de aminoácidos de un bucle extracelular de esta proteína membranal. Estos anticuerpos fueron probados en experimentos de ELISA, inmunohistoquímica , FACS e inmunocitoquímica . Materiales y Métodos Un péptido sintético correspondiente al segundo bucle extracelular (posiciones 316-349 de la secuencia de aminoácidos; ver figura 18A para una representación gráfica) del miembro 1 de la subfamilia H del canal de compuerta de voltaje de potasio (SEQ ID No.: 98) se utilizó como el antigeno para experimentos de biovisualización panorámica. Los anticuerpos en el formato FV de cadena simple (scFv) fueron seleccionados de la biblioteca de visualización de fago ???-2-Gold contra el péptido biotinilado de acuerdo al procedimiento descrito en Silacci et al., Proteomics. 2005 Jun;5 (9) :2340-50. La selección por ELISA, la tinción inmunohistoo^imica y la maduración por afinidad de los anticuerpos seleccionados se realizaron como se describe en el Ejemplo 2. FACS y tinción inmunohistoquimica de las células cultivadas se realizaron de acuerdo a los procedimientos estándares utilizando el scFv seleccionado como anticuerpo primario, anti-c-myc de ratón (clon 9E10) como anticuerpo secundario y anti-Ig de ratón marcado con FITC, como anticuerpo terciario. Resultados Las selecciones de visualización de fago contra el péptido del miembro 1 de la subfamilia H de canal de compuerta de voltaje de potasio, biotinilado (ver arriba y figura 18A) , dio como resultado numerosos clones que expresan anticuerpos scFv de enlace como es probado por ELISA sobre el péptido recubierto (datos no mostrados) . El mejor clon H9 nuevamente fue madurado además por afinidad para obtener un anticuerpo de mayor afinidad (ver los resultados de ELISA en la figura 18B) . El anticuerpo H9 seleccionado anti-miembro 1 de la subfamilia H de canal de cubierta de voltaje de potasio, fue utilizado en un análisis inmunohistoquirnico, el cual mostró tinción positiva de las membranas de células tumorales sobre secciones titulares de los tumores de riñon humano (ver figura 19A) y de tumores de pulmón humano (ver figura 19C) . Los controles negativos, para los cuales las secciones provenientes de los mismos tejidos fueron sometidas al mismo protocolo de tinción, omitiendo únicamente el scFv, no mostraron tinción positiva (ver figuras 19B y 19D) . Estudios adicionales sobre células HeLa (una linea celular de carcinoma de cervix humano) mostró que el anticuerpo H9 para scFv puede reconocer estas células en FACS (ver figura 20) y da una tinción positiva de las membranas celulares en inmunocitoquimica (ver figuras 21A-21B) . Estos resultados demuestran que los anticuerpos monoclonales contra el miembro 1 de la subfamilia H de canal de compuerta de voltaje de potasio puede ser producido y que el antigeno es expresado sobre la membrana de células tumorales de tejidos de cáncer humano (también aquellas células tumorales que están en estrecha proximidad a la neovasculatura ) y sobre las membranas de las lineas celulares tumorales humanas. De este modo, es probable que este antigeno sea un objetivo derivado para procedimientos de dirección a tumores vasculares. La siguiente Tabla es una lista de las secuencias de aminoácidos de los marcadores tumorales vasculares identificados de acuerdo a la invención. Las secuencias parciales de aminoácidos identificadas en el Ejemplo 1 son ilustradas en letras negritas. La SEQ ID Nos., en ésta corresponden al listado de secuencias anexo que es parte de la descripción de la presente invención.
Nombre Swiss Prot. Acc. No. 1 Periostina [precursor] Q15063 {+ isoformas) SEQ ID NO: 1 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGT KKYFSTC KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLES VNVELL AXiHSHMINKRMLTKDLK NGMI IPSMYNNLGLFINHYPNGWTVNCARIIHGNQIATNGWHVIDRVLTQIGTSIQDF IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERFMGDKVASEAL M YHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM VQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHWDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQI FVRGST FKEIPVTVYTTKI ITKVVEP IKVIEGSLQPI IKTEGPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETI TEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEKETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLL QEEVT VT FIEGGDGHLFEDEEI RLLQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ SEQ ID NO: 3 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDN1)SDIRRGLESNVNVELI-NALHSHMINKRMLTKDLK NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGWHVIDRVLTQIGTSIQDF lEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERFMGDKVASEAL MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST FKEIPVTVYKPIIKKYTKIIDGVPVEITEKETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLK KLLQEEVTKVTKFIEGGDGHLFEDEEIKRLLQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ SEQ ID NO: 5 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGWHVIDRVLTQIGTSIQDF IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERFMGDKVASEAL MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHWDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST FKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITE IHGEPI I KYTKIIDGVPVEITEK ETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEEVTKVTKFIEGGDGHLFEDEEI RL LQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ SEQ ID NO: 7 MIPFLP FSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC K WYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEG KGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNIJ3SDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGWHVIDRVLTQIGTSIQDF IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERFMGDKVASEAL MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVT GVIHL IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM DQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEV D TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHWDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST FKEIPVTVYTTKI ITKVVEPKIKVIEGSLQPI IKTEGPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETI TEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEKETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLL QEDTPVRKLQA KKVQGSRRRLREGRSQ SEQ ID NO: 9 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNIJDSDIRRGLESNV VELLNALHSHMI KRMLTKDLK NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGWTV CARIIHGNQIATNGWHVIDRVLTQIGTSIQDF IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERFMGDKVASEAL MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM VQRLLKLILQ HILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST FKEIPVTVYGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRS Q SEQ ID NO: 11 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLES VNVELLNALHSHMINKRMLTKDLK NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGWHVIDRVLTQIGTSIQDF IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERFMGDKVASEAL MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVIHL IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM VQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEVND TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHWDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST FKEIPVTVYKPIIKKYTKIIDGVPVEITEKETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLK KLLQEEDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ SEQ ID NO: 13 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC KNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGI^SNVNVELLNALHSHMIN RMLTKDLK NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGWHVIDRVLTQIGTSIQDF IEAEDDLSSFRAAAITSDIIiEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERFMGDKVASEAL MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTNNGVTHL IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM VQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG RNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTLFVPTNDA FKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFLKEV D TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILNKLIKYIQIKFVRGST FKEIPVTVYGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEEVTKVTKFIEGGDGHLFEDEEIKRL LQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ SEQ ID NO: 15 MIPFLPMFSLLLLLIVNPINANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKKYFSTC KNWYKKSICGQ TTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQRYSDAS KLREEIEGKGSETYFAPS EAWDNLDSDIRRGLES VNVELLNALHSHMI KRMLTKDLK NGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATN6WHVIDRVLTQIGTSIQDF IEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERFMGDKVASEAL MKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIK VNKKDIVTN GVIHL IDQVLIPDSAKQVIELAGKQQTTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAFSDDTLSM VQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCMEKGSKQG RNGAIHIFWÍIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLIUU^DLKELLTQPGDWTLFVPTNDA FKGMTSEE EILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKIFL EVND TLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYPADTPVGNDQLLEILN LIKYIQIKFVRGST FKEIPV VYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIIDGVPVEITEK ETREERIITGPEIKYTRISTGGGETEETLKKLLQEEVTKVTKFIEGGDGHLFEDEEI RL LQGDTPVRKLQANKKVQGSRRRLREGRSQ receptor 42 acoplado a la proteína G putativa 015529 (+ isoformas) SEQ ID NO: 17 MDTGPDQSYFSGNHWFVFSVYLLTFLVGLPLNLLALVVFVGKLRCRPVAVDVLLLNLTAS DLLLLLFLPFRMVEAANGMHWPLPFILCPLSGFIFFTTIYLTALFLAAVSIERFLSVAHP LWYKTRPRLGQAGLVSVACWLLASAHCSVVYVIEFSGDISHSQGTNGTCYLEFWKDQLAI LLPVRLEMAVVLFWPLI ITSYCYSRLVWILGRGGSHRRQRRVAGLVAATLLNFLVCFGP YNVSHVVGYICGESPVWRIYVTLLSTLNSCVDPFVYYFSSSGFQADFHELLRRLCGLWGQ WQQESSMELKEQKGGEEQRADRPAERKTSEHSQGCGTGGQVACAEN SEQ ID NO: 19 MDTGPDQSYFSGNHWFVFSVYLLTFLVGLPLNLLALVVFVGKLQRRPVAVDVLLLNLTAS DLLLLLFLPFRMVEAANGMHWPLPFILCPLSGFIFFTTIYLTALFLAAVSIERFLSVAHP LWYKTRPRLGQAGLVSVACWLLASAHCSVVYVIEFSGDISHSQGTNGTCYLEFRKDQLAI LLPVRLEMAVVLFWPLIITSYCYSRLVWILGRGGSHRRQRRVAGLLAATLLNFLVCFGP YNVSHWGYICGESPAWRIYVTLLSTLNSCVDPFVYYFSSSGFQADFHELLRRLCGL GQ WQQESSMELKEQKGGEEQRADRPAERKTSEHSQGCGTGGQVACAES familia 2 de portadores de solutos P11166 miembro 1 de transportador SEQ ID NO: 21 MEPSSK LTGRLMLAVGGAVLGSLQFGYNTGVINAPQKVIEEFYNQTWVHRYGESILPTT LTTLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLM LLAFVSAVLMGFSKLGKSFE MLILGRFIIGVYCGLTTGFVPMYVGEVSPTAFRGALGTLHQLGIVVGILIAQVFGLDSIM GNKDLWPLLLSIIFIPALLQCIVLPFCPESPRFLLINRNEENRAKSVLKKLRGTADVTHD LQEMKEESRQMMREKKVTILELPRSPAYRQPILIAVVLQLSQQLSGINAVFYYSTSI EK AGVQQPVYATIGSGIVNTAFTVVSLFWERAGRRTLHLIGLAGMAGCAILMTIALALLEQ LPWMSYLSIVAIFGFVAFFEVGPGPIP FIVAELFSQGPRPAAIAVAGFSNWTSNFIVG CFQYVEQLCGPYVFIIFTVLLVLFFIFTYFKVPETKGRTFDEIASGFRQGGASQSDKTPE ELFHPLGADSQV 4 I proteína de núcleo versican [precursor] P13611 SEQ ID NO: 23 MFINIKSILWMCSTLIVTHALHKVKVGKSPPVRGSLSGKVSLPCHFST PTLPPSYNTSE FLRIKWSKIEVDKNG DL ETTVLVAQNGNIKIGQDYKGRVSVPTHPEAVGDASLTWKL IASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLTVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAQKACLDVGAVIA TPEQLFAAYEDGFEQCDAGWLADQTVRYPIRAPRVGCYGDKMGKAGVRTYGFRSPQETYD VYCYVDHLDGDVFHLTVPSKFTFEEAAKECENQDARIATVGELQAAWR GFDQCDYG LS DASVRHPV VARAQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPPPDSRFDAYCFKPKEATTIDLSILA ETASPSLSKEPQMVSDRTTPIIPLVDELPVIPTEFPPVGNIVSFEQKATVQPQAITDSLA TKLPTPTGSTKKPWDMDDYSPSASGPLGKLDISEIKEEVLQSTTGVSHYATDSWDGVVED KQTQESVTQIEQIEVGPLVTSMEIL HIPSKEFPVTETPLVTARMILESKTEKKMVSTVS ELVTTGHYGFTLGEEDDEDRTLTVGSDESTLIFDQIPEVITVSKTSEDTIHTHLEDLESV SASTTVSPLIMPDNNGSSMDDWEERQTSGRITEEFLGKYLSTTPFPSQHRTEIELFPYSG DKILVEGISTVIYPSLQTEMTHRRERTETLIPEMRTDTYTDEIQEEITKSPFMGKTEEEV FSGMKLSTSLSEPIHVTESSVEMTKSFDFPTLITKLSAEPTEVRDMEEDFTATPGTTKYD ENITTVLLAHGTLSVEAATVSKWSWDEDNTTSKPLESTEPSASS LPPALLTTVGMNGKD KDIPSFTEDGADEFTLIPDSTQ QLEEVTDEDIAAHG FTIRFQPTTSTGIAEKSTLRDS TTEEKVPPITSTEGQVYATMEGSALGEVEDVDLSKPVSTVPQFAHTSEVEGLAFVSYSST QEPTTYVDSSHTIPLSVIPKTD GVLVPSVPSEDEVLGEPSQDILVIDQTRLEATISPET MRTTKITEGTTQEEFPWKEQTAEKPVPALSSTAWTPKEAVTPLDEQEGDGSAYTVSEDEL LTGSERVPVLETTPVGKIDHSVSYPPGAVTEHKVKTDEVVTLTPRIGPKVSLSPGPEQKY ETEGSSTTGFTSSLSPFSTHITQLMEETTTEKTSLEDIDLGSGLFEKPKATELIEFSTIK VTVPSDITTAFSSVDRLHTTSAFKPSSAITKKPPLIDREPGEETTSDMVIIGESTSHVPP TTLEDIVAKETETDIDREYFTTSSPPATQPTRPPTVEDKEAFGPQALSTPQPPASTKFHP DINVYIIEVRENKTGRMSDLSVIGHPIDSES EDEPCSEETDPVHDL AEILPEFPDIIE IDLYHSEENEEEEEECANATDVTTTPSVQYINGKHLVTTVPKDPEAAEARRGQFESVAPS QNFSDSSESDTHPFVIA TELSTAVQPNESTETTESLEVTWKPETYPETSEHFSGGEPDV FPTVPFHEEFESGTAKKGAESVTERDTEVGHQAHEHTEPVSLFPEESSGEIAIDQESQKI AFARATEVTFGEEVEKSTSVTYTPTIVPSSASAYVSEEEAVTLIGNPWPDDLLSTKESWV EATPRQVVELSGSSSIPITEGSGEAEEDEDTMFTMVTDLSQRNTTDTLITLDTSRIITES FFEVPATTIYPVSEQPSAKVVPTKFVSETDTSEWISSTTVEEKKRKEEEGTTGTASTFEV YSSTQRSDQLILPFELESPNVATSSDSGTR SFMSLTTPTQSERE TDSTPVFTETNTLE NLGAQTTEHSSIHQPGVQEGLTTLPRSPASVFMEQGSGEAAADPETTTVSSFSLNVEYAI QAEKEVAGTLSPHVETTFSTEPTGLVLSTVMDRVVAENITQTSREIVISERLGEPNYGAE IRGFSTGFPLEEDFSGDFREYSTVSHPIAKEETVMMEGSGDAAFRDTQTSPSTVPTSVHI SHISDSEGPSSTMVSTSAFPWEEFTSSAEGSGEQLVTVSSSVVPVLPSAVQKFSGTASSI IDEGLGEVGTVNEIDRRSTILPTAEVEGT APVEKEEVKVSGTVSTNFPQTIEPAKL SR QEVNPVRQEIESETTSEEQIQEEKSFESPQNSPATEQTIFDSQTFTETELKTTDYSVLTT KKTYSDDKEMKEEDTSLVNMSTPDPDA GLESYTTLPEATEKSHFFLATALVTESIPAEH WTDSPIKKEESTKHFPKGMRPTIQESDTELLFSGLGSGEEVLPTLPTESVNFTEVEQIN NTLYPHTSQVESTSSDKIEDFNRMENVAKEVGPLVSQTDIFEGSGSVTSTTLIEILSDTG AEGPTVAPLPFSTDIGHPQNQTVRWAEEIQTSRPQTITEQDSNKNSSTAEINETTTSSTD FLARAYGFEMAKEFVTSAPKPSDLYYEPSGEGSGEVDIVDSFHTSATTQATRQESSTTFV SDGSLEKHPEVPSAKAVTADGFPTVSVMLPLHSEQNKSSPDPTSTLSNTVSYERSTDGSF QDRFREFEDSTLKPNR KPTENIIIDLDKEDKDLILTITESTILEILPELTSDKNTIIDI DHTKPVYEDILGMQTDIDTEVPSEPHDSNDESNDDSTQVQEIYEAAVNLSLTEETFEGSA DVLASYTQATHDESMTYEDRSQLDHMGFHFTTGIPAPSTETELDVLLPTATSLPIPRKSA TVIPEIEGIKAEAKALDDMFESSTLSDGQAIADQSEIIPTLGQFERTQEEYEDKKHAGPS FQPEFSSGAEEALVDHTPYLSIATTHLMDQSVTEVPDVMEGSNPPYYTDTTLAVSTFAKL SSQTPSSPLTIYSGSEASGHTEIPQPSALPGIDVGSSVMSPQDSFKEIHVNIEATFKPSS EEYLHITEPPSLSPDTKLEPSEDDGKPELLEEMEASPTELIAVEGTEILQDFQNKTDGQV SGEAIKMFPTIKTPEAGTVITTADEIELEGATQWPHSTSASATYGVEAGVVPWLSPQTSE RPTLSSSPEINPETQAALIRGQDSTIAASEQQVAARILDSNDQATVNPVEFNTEVATPPF SLLETSNETDFLIGINEESVEGTAIYLPGPDRC MNPCLNGGTCYPTETSYVCTCVPGYS GDQCELDFDECHSNPCRNGATCVDGFNTFRCLCLPSYVGALCEQDTETCDYG HKFQGQC YKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQMFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFRWT DGSTLQYENWRPNQPDSFFSAGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPP VVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWAIPKITCMNPSAYQR TYSMKYFKNSSSAKDNSINTSKHDHR SRRWQESRR CEACAM3 Q6UY47 (+ isoformas) SEQ ID NO: 25 MGPPSACPHRECIPWQGLLLTASLLTFWNAPTTAWLFIASAPFEVAEGENVHLSWYLPE NLYSYGWYKGKTVEPNQLIAAYVIDTHVRTPGPAYSGRETISPSGDLHFQNVTLEDTGYY NLQVTYRNSQIEQASHHLRVYESVAQPSIQASSTTVTEKGSVVLTCHTNNTGTSFQWIFN NQRLQVTKRM LSWFNHVLTIDPIRQEDAGEYQCEVSNPVSSNRSDPLKLTVKYDNTLGI LIGVLVGSLLVAALVCFLLLRKTGRASDQSDFREQQPPASTPGHGPSDSSIS SEQ ID NO: 27 MGPPSACPHRECIPWQGLLLTASLLTFWNAPTTAWLFIASAPFEVAEGENVHLSVVYLPE NLYSYGWYKGKTVEPNQLIAAYVIDTHVRTPGPAYSGRETISPSGDLHFQNVTLEDTGYY NLQVTYRNSQIEQASHHLRVYESVAQPSIQASSTTVTEKGSWLTCHTNNTGTSFQWIFN NQRLQVTKRMKLSWFNHVLTIDPIRQEDAGE QCEVSNPVSSNRSDPLKLTVKSDDNTLG ILIGVLVGSLLVAALVCFLLLRKTGRASDQSDFREQQPPASTPGHGPSDSSIS SEQ ID NO: 29 MGPPSACPHRECIP QGLLLTASLLTFWNAPTTA LFIASAPFEVAEGENVHLSWYLPE NLYSYGWYKGKTVEPNQLIAAYVIDTHVRTPGPAYSGRETISPSGDLHFQNVTLEDTGYY TLQVTYRNSQIEQASHHLRVYESVAQPSIQASSTTVTEKGSVVLTCHTNNTGTSFQWIFN NQRLQVTKRMKLSWFNHMLTIDPIRQEDAGE QCEVS PVSS RSDPLKLTVKCE Q8IV47 SEQ ID NO: 31 MQWTSLLLLAGLFSLSQAQYEDDPHWWFHYLRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEG PAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQNNQITSI QEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDHNNLTR PGPLPRSLRE LHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQEVGSSMRGLRSLILLDLSYNHLRKVPD GLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAP LLYVRLSHNSLTNNGLASNTFNSSSLLELDL SYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAM PADAPLCLRLASLIEI Homologo de peroxidasina [fragmento] Q92626 SEQ ID NO: 33 SRPWWLRASERPSAPSAMAKRSRGPGRRCLLALVLFCA GTLAWAQ PGAGCPSRCLCF RTTVRCMHLLLEAVPAVAPQTSILDLRF RIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPS GAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERL FLHNNRITHLVPGTFNHLESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICE YPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNN NELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPT FVIQPQNTEVLVGESVTLECSATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVV QGDSGEYACSATNNIDSVHATAFIIVQALPQFTVTPQDRWIEGQTVDFQCEAKGNPPPV IA TKGGSQLSVDRRHLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAV IIGSQKVVAHLTVQPRV TPVFASIPSDTTVEVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTIND VGPADAGRYECVARNTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTR THLFDSRPRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSY HYNDLVSPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSD CFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAF ERLLKSVYENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIGTETVTPDEQFTHMLMQWGQ FLDHDLDSTVVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSP VCGSGMTSLLMNSVYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQR SGKPLLPFATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTL FREHNRIATELL KLNPHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFN AFATAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQDHLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFG VAGKMRVPSQLLNTELTERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAH TFEDLKNEIKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRL RDGDRLWYENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDE IPRVDLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQG EHLSNSTSAFSTRSDASGTNDFREFVLEMQKTITDLRTQIKKLESRLSTTECVDAGGESH ANNTKWKKDACTICECKDGQVTCFVEACPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP 8 probable receptor 37 acoplado a la proteína G 015354 [precursor] SEQ ID NO: 35 MRAPGALIARMSRLLLLLLLKVSASSALGVAPASRNETCLGESCAPTVIQRRGRDAWGPG NSARDVLRARAPREEQGAAFLAGPS DLPAAPGRDPAAGRGAEASAAGPPGPPTRPPGPW R KGARGQEPSETLGRGNPTALQLFLQISEEEEKGPRGAGISGRSQEQSVKTVPGASDLF YWPRRAGKLQGSHHKPLSKTANGLAGHEGWTIALPGRALAQNGSLGEGIHEPGGPRRGNS TNRRVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMCLSWIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYYMRSISNSLL ANLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFTLCALCIDRF RAATNVQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEWLRQLSKEDLGFSGRAPAERCI IKISPDLPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLPTLFTITCSLVTARKIRKAEKACTRGN RQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQQTMDLLNIISQFLLFF SCVTPVLLFCLCKPFSRAFMECCCCCCEECIQKSSTVTSDDNDNEYTTELELSPFSTIR REMSTFASVGTHC Proteína sidekick-1 [precursor] Q8TEN9 SEQ ID NO: 37 PE TGVTVSGLTPARTYQFRVCAVNEVGRGQYSAETSRLMLPEEPPSAPPKNIVASGRTN QSIMVQWQPPPETEHNGVLRGYILRYRLAGLPGEYQQR ITSPEVNYCLVTDLI IWTQYE IQVAAYNGAGLGVFSRAVTEYTLQGVPTAPPQNVQTEAVNSTTIQFLWNPPPQQFINGIN QGYKLLAWPADAPEAVTWTIAPDFHGVHHGHITNLKKFTAYFTSVLCFTTPGDGPPSTP QLV TQEDKPGAVGHLSFTEILDTSL VSWQEPLEKNGIITGYQISWEVYGRNNSRLTHT LNSTTHEYKIQGLSSLTTYTIDVAAVTAVGTGLVTSSTISSGVPPDLPGAPSNLVISNIS PRSATLQFRPGYDGKTSISRWIVEGQVGAIGDEEEWVTLYEEENEPDAQMLEIPNLTPYT HYRFRMKQVNIVGPSPYSPSSRVIQTLQAPPDVAPTSVTVRTASETSLRLRWVPLPDSQY NGNPESVGYRIKYWRSDLQSSAVAQVVSDRLEREFTIEELEEWMEYELQMQAFNAVGAGP WSEVVRGRTRESVPSAAPENVSAEAVSSTQILLTWTSVPEQDQNGLILGY ILFRAKDLD PEPRSHIVRGNHTQSALLAGLRKFVLYELQVLAFTRIGNGVPSTPLILERTKDDAPGPPV RLVFPEVRLTSVRIVWQPPEEPNGIILGYQIAYRLASSSPHTFTTVEVGATVRQFTATDL APESAYIFRLSAKTRQGWGEPLEATVITTEKRERPAPPRELLVPQAEVTARSLRLQWVPG SDGASPIRYFT QVRELPRGEWQTYSSSISHEATACWDRLRPFTSY LRLKATNDIGDS DFSSETEAVTTLQDVPGEPPGSVSATPHTTSSVLIQWQPPRDESLNGLLQGYRIYYRELE YEAGSGTEAKTLKNPIALRAELTDLKKYRRYEVIMTAY I IGESPASAPVEVFVGEAAPA MAPQNVQVTPLTASQLEVTWDPPPPESQNGNIQGYKIYYWEADSQNETEKM VLFLPEPV VRLKNLTSHTKYLVSISAFNAAGDGPKSDPQQGRTHQAAPGAPSFLAFSEITSTTLNVSW GEPAAANGILQGYRWYEPLAPVQGVSKVVTVEVRGNWQRWL VRDLTKGVTYFFRVQAR TITYGPELQANITAGPAEGSPGSPRDVLVTKSASELTLQWTEGHSGDTPTTGYVIEARPS DEGLWDMFV DIPRSATSYTLSLDKLRQGVTYEFRVVAVNEAGYGEPSNPSTAVSAQVEA PFYEEWWFLLVMALSSLIVILLVVFALVLHGQNKKYKNCSTGKGISTMEESVTLDNGGFA ALELSSRHLNVKSTFSKKNGTRSPPRPSPGGLHYSDEDICN YNGAVLTESVSLKEKSAD ASESEATDSDYEDALPKHSFVNHY SDPTYYNSWKRRAQGRAPAPHRYEAVAGSEAGAQL HPVITTQSAGGVYTPAGPGARTPLTGFSSFV 10 I Canal de calcio dependiente del voltaje alfa 1A Q9NS88 SEQ ID NO: 39 MARFGDEMPARYGGGGSGAAAGWVGSGGGRGAGGSRQGGQPGAQRMYKQSMAQRARTMA LYNPIPVRQNCLTVNRSLFLFSEDNVVRKYAKKITEWPPFEY ILATIIANCIVLALEQH LPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALGFAFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTG ILATVGTEFDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVLKSIMKAMIPLLQIGLLLFFAILIF AIIGLEFYMGKFHTTCFEEGTDDIQGESPAPCGTEEPARTCPNGTKCQPYWEGPNNGITQ FDNILFAVLTVFQCITMEG TDLLYNSNDASGNTWN LYFIPLIIIGSFFMLNLVLGVLS GEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERELNGYMEWISKAEEVILAEDETDGEQRHPFDAL RRTTIKKS TDLLNPEEAEDQLADIASVGSPFARASIKSAKLENSTFFHKKERRMRFYIR RMVKTQAFYWTVLSLVALNTLCVAIVHYNQPE LSDFLYYAEFIFLGLFMSEMFIK YGL GTRPYFHSSFNCFDCGVIIGSIFEVIWAVIKPGTSFGISVLRALRLLRIFKVTKYWASLR NLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIWFALLGMQLFGGQFNFDEGTPPTNFDTFPAAIMTV FQILTGEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQ ELTKDEQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVWEQRTSE MRKQNLIASREALYNEMDPDERWKAAYTRHLRPDMKTHLDRPLVVDPQENRNNNTNKSRA AEPTVDQRLGQQRAEDFLRKQARYHDRARDPSGSAGLDARRPWAGSQEAELSREDPYGRE SDHHAREGSLEQPGF EGEAERGKAGDPHRRHVHRQGGSRESRSGSPRTGANGEHRRHRA HRSPGEEGPEDKAERRARHREGSRPARGGEGEGEGPDGGERRRRHRHGAPATYEGDARRE DKERRHRRRKENQGSGVPVSGPNLSTTRPIQQDLGRQDPPLAEDIDN KNNKLATAESAA 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KTGTWSPEQGPPTDMPNSQPNSQSVEMREMGRDGYSDSEHYLPMEGQGRAASMPRLPAEN QRRRGRPRGNNLSTISDTSPMKRSASVLGPKARRLDDYSLERVPPEENQRHHQRRRDRSH RASERSLGRYTDVDTGLGTDLSMTTQSGDLPSKERDQERGRPKDRKHRQHHHHHHHHHHP PPPDKDRYAQERPDHGRARARDQRWSRSPSEGREHMAHRQGSSSVSGSPAPSTSGTSTPR RGRRQLPQTPSTPRPHVSYSPVIRKAGGSGPPQQQQQQQQQQQQQAVARPGRAATSGPRR YPGPTAEPLAGDRPPTGGHSSGRSPRMERRVPGPARSESPRACRHGGARWPASGPHVSEG PPGPRHHGYYRGSDYDEADGPGSGGGEEA AGAYDAPPPVRHASSGATGRSPRTPRASGP ACASPSRHGRRLPNGYYPAHGLARPRGPGSRKGLHEPYSESDDDWC 11 I Proteina E ILIN2 [fragmento] Q8N5L1 SEQ ID NO: 41 RGALVGAPRSARASCLRGRRPGRRQPCGRCPDPPRSGPGQAGRARCARDVAAQTALAPRA LALGAGAAGPGWRGAVPRRPAARVSRAAQRQEQELVRLHREQECELQPEPAPPRPSGPAT AEDPGRRPVLPQRPPEERPPQPPGSTGVIAETGQAGPPAGAGAPGYPKSPPVASPGAPVP SLVSFSAGLTQKPFPSDGGVVLFNKVLVNDGDVYNPSTGVFTAPYDGRYLITATLTPERD AYVEAVLSVSNASVAQLHTAGYRREFLEYHRPPGALHTCGGPGAFHLIVHLKAGDAVNVV VTGG LAHTDFDEMYSTFSGVFLYPFLSHL 12 Proteina 8 de la región crítica del síndrome de Down Q96T75 (+ isoformas) SEQ ID NO: 43 MKEPGPNFVTVRKGLHSFKMAFVKHLLLFLSPRLECSGSITDHCSLHLPVQEILMSQPPE QLGLQTNLGNQESSGMMKLFMPRPKVLAQYESIQFMP SEQ ID NO: 45 MHNIMMVKL KK STTNLGNQESSGMMKLFMPRPKVLAQYESIQFMP SEQ ID NO: 46 MSQPPEQLGLQTNLGNQESSGMMKLFMPRPKVLAQYESIQFMP SEQ ID NO: 47 MYSYWRLECSGSITDHCSLHLPVQEILMSQPPEQLGLQTNLGNQESSGMMKLFMPRPKVL AQYESIQFMP SEQ ID NO: 48 MKEPGPNFVTVRKGLHSFKMAFVKHLLLECSGSITDHCSLHLPVQEILMSQPPEQLGLQT NLGNQESSGMMKLFMPRPKVLAQYESIQFMP SEQ ID NO: 49 MKEPGPNFVTVRKGLHSFKMAFVKHLLQTLEIKKVLE 13 Probable receptor 113 acoplada a la proteína G Q8IZF5 [precursor] SEQ ID NO: 50 MVCSAAPLLLLATTLPLLGSPVAQASQPVSETGVRPREGLQRRQ GPLIGRDKAWNERID RPFPACPIPLSSSFGRWPKGQTMWAQTSTLTLTEEELGQSQAGGESGSGQLLDQENGAGE SALVSVYVHLDFPDKTWPPELSRTLTLPAASASSSPRPLLTGLRLTTECNVNH GNFYCA CLSGYQWNTSICLHYPPCQSLHNHQPCGCLVFSHPEPGYCQLLPPGSPVTCLPAVPGILN LNSQLQ PGDTLSLTLHLSQEATNLSWFLRHPGSPSPILLQPGTQVSVTSSHGQAALSVS NMSHHWAGEYMSCFEAQGFKWNLYEVVRVPLKATDVARLPYQLSISCATSPGFQLSCCIP STNLAYTAA SPGEGSKASSFNESGSQCFVLAVQRCPMADTTYACDLQSLGLAPLRVPIS ITIIQDGDITCPEDASVLTWNVTKAGHVAQAPCPESKRGIVRRLCGADGVWGPVHSSCTD ARLLALFTRTKLLQAGQGSPAEEVPQILAQLPGQAAEASSPSDLLTLLSTMKYVA VVAE ARIQLDRRALKNLLIATDKVLDMDTRSLWTLAQARKPWAGSTLLLAVETLACSLCPQDHP FAFSLPNVLLQSQLFGPTFPADYSISFPTRPPLQAQIPRHSLAPLVRNGTEISITSLVLR KLDHLLPSNYGQGLGDSLYATPGLVLVISIMAGDRAFSQGEVIMDFGNTDGSPHCVFWDH SLFQGRGGWSKEGCQAQVASASPTAQCLCQHLTAFSVL SPHTVPEEPALALLTQVGLGA SILALLVCLGVYWLVWRVVVRNKISYFRHAALLNMVFCLLAADTCFLGAPFLSPGPRSPL CLAAAFLCHFLYLATFFWMLAQALVLAHQLLFVFHQLAKHRVLPLMVLLGYLCPLGLAGV TLGLYLPQGQYLREGECWLDGKGGALYTFVGPVLAI IGVNGLVLAMAMLKLLRPSLSEGP PAEKRQALLGVIKALLILTPIFGLTWGLGLATLLEEVSTVPHYIFTILNTLQGVFILLFG CLMDRKIQEALRKRFCRAQAPSSTISLVSCCLQILSCAS SMSEGIPWPSSEDMGTARS 14 Proteina ANXA4 [fragmento] Q6LES2 (+ isoformas) SEQ ID NO: 52 MAMATKGGTVKAASGFNAMEDAQTLRKAMKGLGTDEDAIISVLAYRNTAQRQEIRTAYKS TIGRDLIDDL SELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRTP EEIRRISQTYQQQYGRSLEDDIRSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDALVRQDAQDL YEAGEK WGTDEVKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQ DIEQSIKSETSGSFEDALLA IVKCMRNKSAYFAEKLYKSMKGLGTDDNTLIRVMVSRAEIDMLDIRAHFKRLYG SLYSF IKGDTSGDYRKVLLVLCGGDD SEQ ID NO: 54 ATKGGTVKAASGFNAMEDAQTLRKAMKGLGTDEDAIISVLAYRNTAQRQEIRTAYKSTIG RDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRTPEEI RRISQTYQQQYGRSLEDDIRSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDALVRQDAQDLYEA SEQ ID NO: 56 LRTSGLALLALVSAVGPSQASGFTEKGLSLLGYQLCSHRVTHTVQKVEAVQTSYTSYVS CGGWIPWRRCPKMVYRTQYLVVEVPESRNVTDCCEGYEQLGLYCVLPLNQSGQFTSRPGA CPAEGPEPSTSPCSLDIDCPGLEKCCPWSGGRYCMAPAPQAPERDPVGSWYNVTILVKMD FKELQQVDPRLLNHMRLLHSLVTSALQPMASTVHHLHSAPGNASTTVSRLLLGLPRPLPV ADVSTLLGDIAKRVYEVISVQVQDVNECFYEELNACSGRELCANLEGSYWCVCHQEAPAT SPRKLNLEWEDCPPVSDYWLNVTSDSFQVSWRLNSTQNHTFHVRVYRGMELLRSARTQS QALAVAGLEAGVLYRVKTSYQGCGADVSTTLTIKTNAQVFEVTI IVNHNLTEKLLNRSS VEYQDFSRQLLHEVESSFPPVVSDLYRSGKLRMQIVSLQAGSVVVRLKLTVQDPGFPMGI STLAPILQPLLASTVFQIDRQGTRVQDWDECVDSAEHDCSPAAWCINLEGSYTCQCRTTR DATPSRAGRACEGDLVSPMGGGLSAATGVTVPGLGTGTAALGLENFTLSPSPGYPQGTPA AGQAWTPEPSPRRGGSNVVGYDRNNTGKGVEQELQGNSIMEPPSWPSPTEDPTGHFLWHA TRSTRETLLNPTWLRNEDSGPSGSVDLPLTSTLTALKTPACVPVSIGRIMVSNVTSTGFH LAWEADLA DSTFQLTLTSMWSPAVVLETWNTSVTLSGLEPGVLHLVEIMAKACGKEGAR AHLKVRTAARKLIGKVRIKNVRYSESFRNASSQEYRDFLELFFRMVRGSLPATMCQHMDA GGVRMEVVSVTNGSIVVEFHLLI IADVDVQEVSAAFLTAFQTVPLLEVIRGDTFIQDYDE CERKEDDCVPGTSCRNTLGSFTCSCEGGAPDFPVEYSERPCEGDSPGNETWATSPERPLT TAGTKAAFVQGTSPTPQGLPQRLNLTGAVRVLCEIEKVWAIQKRFLQQESIPESSLYLS HPSCNVSHSNGTHVLLEAGWSECGTLMQSNMTNTVVRTTLRNDLSQEGIIHHLKILSPI CAFQNDLLTSSGFTLEWGVYTIIEDLHGAGNFVTEMQLFIGDSPIPQNYSVSASDDVRIE VGLYRQKSNLKVVLTECWATPSSNARDPITFSFINNSCPVPNTYTNVIENGNSNKAQFKL RIFSFINDSIVYLHC LRVCMESPGATCKINCNNFRLLQNSETSATHQ S GPLIRSEGE PPHAEAGLGAGYVVLIVVAIFVLVAGTATLLIVRYQRMNGRYNFKIQSNNFSYQVFYE SEQ ID NO: 58 MLRTSGLALLALVSAVGPSQASGFTE GLSLLGYQLCSHRVTHTVQ VEAVQTSYTSYVS CGGWIPWRRCPKMVYRTQYLVVEVPESRNVTDCCEGYEQLGLYCVLPLNQSGQFTSRPGA CPAEGPEPSTSPCSLDIDCPGLEKCCPWSGGRYCMAPAPQAPERDPVGSWYNVTILVKMD FKELQQVDPRLLNHMRLLHSLVTSALQPMASTVHHLHSAPGNASTTVSRLLLGLPRPLPV ADVSTLLGDIAKRVYEVISVQVQDVNECFYEELNACSGRELCANLEGSYWCVCHQEAPAT SPR LNLEWEDCPPVSDYWLNVTSDSFQVSWRLNSTQNHTFHVRVYRGMELLRSARTQS QALAVAGLEAGVLYRVKTSYQGCGADVSTTLTIKTNAQVFEVTIKIVNHNLTEKLLNRSS VEYQDFSRQLLHEVESSFPPVVSDLYRSGKLRMQIVSLQAGSVVVRLKLTVQDPGFPMGI STLAPILQPLLASTVFQIDRQGTRVQDWDECVDSAEHDCSPAAWCINLEGSYTCQCRTTR DATPSRAGRACEGDLVSPMGGGLSAATGVTVPGLGTGTAALGLENFTLSPSPGYPQGTPA AGQAWTPEPSPRRGGSNWGYDRNNTGKGVEQEVPSTAPGLGMDQGSPSQVNPSQGSPSQ GSLRQESTSQASPSQRSTSQGSPSQVNPSQGSTSHANSSQGSPSQGSPSQESPSQGSTSQ ASPSHRNTIGVIGTTSSPKATGSTHSFPPGATDGPLALPGQLQGNSIMEPPS PSPTEDP TGHFLWHATRSTRETLLNPTWLRNEDSGPSGSVDLPLTSTLTALKTPACVPVSIGRI VS NVTSTGFHLAWEADLAMDSTFQLTLTSMWSPAVVLETWNTSVTLSGLEPGVLHLVEIMAK ACGKEGARAHLKVRTAARKLIGKVRIKNVRYSESFRNASSQEYRDFLELFFRMVRGSLPA TMCQHMDAGGVRMEVVSVTNGSIVVEFHLLI IADVDVQEVSAAFLTAFQTVPLLEVIRGD TFIQDYDECERKEDDCVPGTSCRNTLGSFTCSCEGGAPDFPVEYSERPCEGDSPGNETWA TSPERPLTTAGTKAAFVQGTSPTPQGLPQRLNLTGAVRVLCEIEKWVAIQKRFLQQESI PESSLYLSHPSCNVSHSNGTHVLLEAG SECGTLMQSNMTNTVVRTTLRNDLSQEGIIHH L ILSPIYCAFQNDLLTSSGFTLE GVYTIIEDLHGAGNFVTEMQLFIGDSPIPQNYSVS ASDDVRIEVGLYRQKSNLKVVLTECWATPSSNARDPITFSFINNSCPVPNTYTNVIENGN SNKAQF LRIFSFINDSIVYLHCKLRVCMESPGATCKINCNNFRLLQNSETSATHQMSWG PLIRSEGEPPHAEAGLGAGYVVLIVVAI VLVAGTATLLIVRYQRM GRYNFKIQSNNFS YQVFYE SEQ 10 NO: 59 MVYRTQYLVVEVPESRNVTDCCEGYEQLGLYCVLPLNQSGQFTSRPGACPAEGPEPSTSP CSLDIDCPGLEKCCPWSGGRYCMAPAPQAPERDPVGSWYNVTILVKMDFKELQQVDPRLL NHMRLLHSLVTSALQPMASTVHHLHSAPGNASTTVSRLLLGLPRPLPVADVSTLLGDIA RVYEVISVQVQDVNECFYEELNACSGRELCANLEGSYWCVCHQEAPATSPRKLNLEWEDC PPVSDY VLNVTSDSFQVSWRLNSTQNHTFHVRVYRGMELLRSARTQSQALAVAGLEAGV LYRVKTSYQGCGADVSTTLTIKTNAQVFEVTIKIVNHNLTEKLLNRSSVEYQDFSRQLLH EVESSFPP VSDLYRSGKLRMQIVSLQAGSWVRLKLTVQDPGFPMGISTLAPILQPLLA STVFQIDRQGTRVQDWDECVDSAEHDCSPAAWCINLEGSYTCQCRTTRDATPSRAGRACE GDLVSPMGGGLSAATGVTVPGLGTGTAALGLENFTLSPSPGYPQGTPAAGQAWTPEPSPR RGGSNVVGYDRNNTG GVEQELQGNSIMEPPSWPSPTEDPTGHFLWHATRSTRETLLNPT WLRNEDSGPSGSVDLPLTSTLTALKTPACVPVSIGRIMVSNVTSTGFHLAWEADLAMDST FQLTLTSMWSPAVVLETWNTSVTLSGLEPGVLHLVEIMAKACGKEGARAHLKVRTAARKL IGKVRIKNVRYSESFRNASSQEYRDFLELFFRMVRGSLPATMCQHMDAGGVRMEVVSVTN GSIVVEFHLLI IADVDVQEVSAAFLTAFQTVPLLEVIRGDTFIQDYDECERKEDDCVPGT SCRNTLGSFTCSCEGGAPDFPVEYSERPCEGDSPGNETWATSPERPLTTAGTKAAFVQGT SPTPQGLPQRLNLTGAVRVLCEIEKWVAIQKRFLQQESIPESSLYLSHPSCNVSHSNGT HVLLEAGWSECGTLMQSNMTNTVVRTTLR DLSQEGIIHHLKILSPIYCAFQNDLLTSSG FTLEWGVYTIIEDLHGAGNFVTEMQLFIGDSPIPQNYSVSASDDVRIEVGLYRQKSNL V VLTEC ATPSSNARDPITFSFINNSCPVPNTYTNVIENGNSNKAQFKLRIFSFINDSIVY LHCKLRVCMESPGATCKINCNNFRLLQNSETSATHQMSWGPLIRSEGEPPHAEAGLGAGY VVLIVVAIFVLVAGTATLLIVRYQRMNGRYNFKIQSNNFSYQVFYE SEQ ID NO: 60 MVYRTQYLWEVPESRNVTDCCEGYEQLGLYCVLPLNQSGQFTSRPGACPAEGPEPSTSP CSLDIDCPGLEKCCPWSGGRYCMAPAPQAPERDPVGSWYNVTILVKMDFKELQQVDPRLL NHMRLLHSLVTSALQPMASTVHHLHSAPGNASTTVSRLLLGLPRPLPVADVSTLLGDIAK RVYEVISVQVQDVNECFYEELNACSGRELCANLEGSYWCVCHQEAPATSPRKLNLEWEDC PPVSDY VLNVTSDSFQVS RLNSTQNHTFHVRVYRGMELLRSARTQSQALAVAGLEAGV LYRVKTSYQGCGADVSTTLTIKTNAQVFEVTIKIVNHNLTEKLLNRSSVEYQDFSRQLLH EVESSFPPVVSDLYRSGKLR QIVSLQAGSVWRLKLTVQDPGFPMGISTLAPILQPLLA STVFQIDRQGTRVQDWDECVDSAEHDCSPAAWCINLEGSYTCQCRTTRDATPSRAGRACE GDLVSPMGGGLSAATGVTVPGLGTGTAALGLENFTLSPSPGYPQGTPAAGQAWTPEPSPR RGGSNVVGYDRNNTGKGVEQEVPSTAPGLGMDQGSPSQVNPSQGSPSQGSLRQESTSQAS PSQRSTSQGSPSQVNPSQGSTSHANSSQGSPSQGSPSQESPSQGSTSQASPSHRNTIGVI GTTSSPKATGSTHSFPPGATDGPLALPGQLQGNSIMEPPSWPSPTEDPTGHFL HATRST RETLLNPTWLRNEDSGPSGSVDLPLTSTLTALKTPACVPVSIGRIMVSNVTSTGFHLAWE ADLAMDSTFQLTLTSM SPAWLETWNTSVTLSGLEPGVLHLVEI AKACGKEGARAHLK VRTAARKLIGKVRIKNVRYSESFRNASSQEYRDFLELFFRMVRGSLPATMCQHMDAGGVR MEWSVTNGSIWEFHLLIIADVDVQEVSAAFLTAFQTVPLLEVIRGDTFIQDYDECERK EDDCVPGTSCRNTLGSFTCSCEGGAPDFPVEYSERPCEGDSPGNETWATSPERPLTTAGT KAAFVQGTSPTPQGLPQRLNLTGAVRVLCEIEKWVAIQKRFLQQESIPESSLYLSHPSC NVSHSNGTHVLLEAGWSECGTLMQSNMTNTVVRTTLRNDLSQEGIIHHLKILSPIYCAFQ NDLLTSSGFTLE GVYTIIEDLHGAGNFVTE QLFIGDSPIPQNYSVSASDDVRIEVGLY RQKSNLKVVLTECWATPSSNARDPITFSFINNSCPVPNTYTNVIENGNSNKAQFKLRIFS FINDSIVYLHC LRVCMESPGATCKINCNNFRLLQNSETSATHQMSWGPLIRSEGEPPHA EAGLGAGYVVLIVVAIFVLVAGTATLLIVRYQRMNGRYNF IQSNNFSYQVFYE 16 miembro 2 de la clase F de receptor depurador Q96GP6 [precursor] SEQ ID NO: 61 MEGAGPRGAGPARRRGAGGPPSPLLPSLLLLLLLWMLPDTVAPQELNPRGRNVCRAPGSQ VPTCCAGWRQQGDECGIAVCEGNSTCSENEVCVRPGECRCRHGYFGANCDTKCPRQFWGP DCKELCSCHPHGQCEDVTGQCTCHARRWGARCEHACQCQHGTCHPRSGACRCEPGWWGAQ CASACYCSATSRCDPQTGACLCHAGWWGRSCNNQCACNSSPCEQQSGRCQCRERTFGARC DRYCQCFRGRCHPVDGTCACEPGYRGKYCREPCPAGFYGLGCRRRCGQCKGQQPCTVAEG RCLTCEPGWNGTKCDQPCATGFYGEGCSHRCPPCRDGHACNHVTGKCTRCNAGWIGDRCE TKCSNGTYGEDCAFVCADCGSGHCDFQSGRCLCSPGVHGPHCNVTCPPGLHGADCAQACS CHEDTCDPVTGACHLETNQRKGVMGAGALLVLLVCLLLSLLGCCCACRGKDPTRRELSLG RKKAPHRLCGRFSRIS KLPRIPLRRQKLPKVVVAHHDLDNTLNCSFLEPPSGLEQPSPS WSSRASFSSFDTTDEGPVYCVPHEEAPAESRDPEVPTVPAEAPAPSPVPLTTPASAEEAI PLPASSDSERSASSVEGPGGALYARVARREARPARARGEIGGLSLSPSPERRKPPPPDPA TKPKVSWIHGKHSAAAAGRAPSPPPPGSEAAPSPSKRKRTPSDKSAHTVEHGSPRTRDPT PRPPGLPEEATALAAPSPPRARARGRGPGLLEPTDAGGPPRSAPEAASMLAAELRGKTRS LGRAEVALGAQGPREKPAPPQKAKRSVPPASPARAPPATETPGPEKAATDLPAPETPRKK TPIQKPPRKKSREAAGELGRAGAPTL 17 iProteina 2 que contiene el dominio de Sushi [precursor] Q9UGT4 SEQ ID NO: 63 MKPALLPWALLLLATALGPGPGPTADAQESCSMRCGALDGPCSCHPTCSGLGTCCLDFRD FCLEILPYSGSMMGGKDFVVRHFKMSSPTDASVICRFKDSIQTLGHVDSSGQVHCVSPLL YESGRIPFTVSLDNGHSFPRAGT LAVHPN VSMMEKSELVNETRWQYYGTANTSGNLSL TWHVKSLPTQTITIELWGYEETGMPYSQEWTAKWSYLYPLATHIPNSGSFTFTPKPAPPS YQRWRVGALRIIDSKNYAGQKDVQALWTNDHALAWHLSDDFREDPVAWARTQCQAWEELE DQLPNFLEELPDCPCTLTQARADSGRFFTDYGCDMEQGSVCTYHPGAVHCVRSVQASLRY GSGQQCCYTADGTQLLTADSSGGSTPDRGHDWGAPPFRTPPRVPSMSHWLYDVLSFYYCC LWAPDCPRYMQRRPSNDCRNYRPPRLASAFGDPHFVTFDGTNFTFNGRGEYVLLEAALTD LRVQARAQPGTMSNGTETRGTGLTAVAVQEGNSD VEVRLANRTGGLEVLLNQEVLSFTE QSWMDLKGMFLSVAAGDRVSIMLASGAGLEVSVQGPFLSVSVLLPEKFLTHTHGLLGTLN NDPTDDFTLHSGRVLPPGTSPQELFLFGANWTVHNASSLLTYDSWFLVHNFLYQPKHDPT FEPLFPSETTLNPSLAQEAAKLCGDDHFCNFDVAATGSLSTGTATRVAHQLHQRRMQSLQ PVVSCGWLAPPPNGQKEGNRYLAGSTIYFHCDNGYSLAGAETSTCQADGTWSSPTPKCQP GRSYAVLLGIIFGGLAVVAAVALVYVLLRRRKGNTHVWGAQP 18 Proteína tumoral, traduccionalmente controlada 1 Q5W0H4 SEQ ID NO: 65 MilYRDLISHDEMFSDIYKIREIADGLCLEVEGKMVSRTEG IDDSLIGGNASAEGPEGE GTESTVITGVDIVM HHLQETSFTKEAY KYIKDYMKSIKGKLEEQRPERVKPFMTGAAE QIKHILANFKNYQFFIGENM PDGMVALLDYREDGVTPYMIFFKDGLEMEKCVSTRKWVK INNVKKTF 19 | Receptor Q8TDU0 acoplado a la proteína G putativa | Q8TDU0 SEQ ID NO: 67 MVLCCRGSLLWMVLCCGWFSVIEGLCCGGSLLWMVLCCGWVSVVGGSLLWRVLCCGGFSV VEGSLLWRVSVGDGSLLWRLSWEVLCCGGSLLWMVLCCGGFCVVEGSLLWRVSWDGSL SWRLSWEAPCRGGSLSWRVSWGGSLLWRVSVVDGSLL RVSVVEGLCCGGFSVVEGLC CGGFSVVEGCLLWRVLCCGASLLWRVSVVEGSLLWRVCCGGFSWESLCCGWFSWEGSL LWRVLCCGWFSV EGSLLWRVLSCGWFSVVDGSLLWRVSVVEGLCCGESVVDGSLLWRVS VVEGLCCGWFFVVGGSLLWMVLCCGWFSVVNGSLLWMGLCCGGFSVVDGSLLWMGLCCGG SLLWMVLCFG VSWEVLCCGSSLLYLLQIC IRCLGASTH 20 Proteína hipotética DKFZp686K0275 Q7Z3A1 [fragmentol SEQ ID NO: 69 DRSRWRGRAGQGFGLRRREMAAGGRMEDGSLDITQSIEDDPLLDAQLLPHHSLQAHFRPR FHPLPTVIIVNLLWFIHLVFVVLAFLTGVLCSYPNPNEDKCPGNYTNPLKVQAVI ILGKV ILWILHLLLECYIQYHHSKIRNRGYNLIYRSTRHLKRLALMIQSSGNTVLLLILCMQHSF PKPGRLYLDLILAILALELICSLICLLIYTVKIRRFNKAKPEPDILEEEKIYAYPSNITS ETGFRTISSLEEIVEKQGDTIEYLKRHNALLSKRLLALTSSDLGCQPSRT 21 Proteína transmembranal TMEM55A Q8N4L2 SEQ ID NO: 71 MAADGVDERSPLLSASHSGNVTPTAPPYLQESSPRAELPPPYTAIASPDASGIPVINCRV CQSLINLDGKLHQHWKCTVCNEATPIKNPPTGKKYVRCPCNCLLICKDTSRRIGCPRPN CRRIINLGPVMLISEEQPAQPALPIQPEGTRVVCGHCGNTFLWMELRFNTLAKCPHCKKI SSVGSALPRRRCCAYITIGMICIFIGVGLTVGTPDFARRFRATYVSWAIAYLLGLICLIR ACYWGAIRVSYPEHSFA 22 I Proteína hipotética Q8WYY4 Q8WYY4 SEQ ID NO: 73 MVLTAMVGKIHRKRLTYTNAGRIKKLTQTNVADVVKLHKGDMHGCAWWLVPVILALGGAG AGGSLEARSSRPAWPTWRSPVSTKNTRVGQAWWSMPVISATWETEVGGSLGPRRQRVQ 23 Familia con similitud de secuencia 116 miembro Q8IWF6 SEQ ID NO: 75 MALRGPAGLGPGSRRPLDEAVAGAEGREAPALVAAGGAPEDDEEDDGRGRGLLRWDSFSA WLHCVCVVGFDLELGQAVEVIYPQHSKLTDREKTNICYLSFPDSNSGCLGDTQFCFRFRQ SSGRRVSLHCLLDQFDKDLPVYLKKDPAYFYGYVYFRQVRDKTLKRGYFQKSLVLISKLP YIHFFHTVLKQIAPEYFEKNEPYLEAACNDVDRWPAPVPGKTLHLPIMGVVMKVRIPTCH D PGTTQIVQLTQQVDTNISVILPTVHEVDIFRCFCPVFLHSQMLWELVLLGEPLVV AP SPSESSETVLALVNCISPLKYFSDFRPYFTIHDSEFKEYTTRTQAPPSVILGVTNPFFAK TLQHWPHIIRIGDL PTGEIPKQVKVKKLKNLKTLDSKPGVYTSYKPYLNRDEEIIKQLQ KGVQQKRPSEAQSVILRRYFLELTQSFIIPLERYVASLMPLQKSISPWKSPPQLRQFLPE EFMKTLEKTGPQLTSRIKGDWIGLYRHFLKSPNFDGWFKTRR EMTQKLEALHLEALCEE DLLLWIQKHTEVETVDLVLKLKNKLLQADREHLPVKPDTMEKLRTHIDAIILALPEDLQG ILLKTGMT 24 Proteína C6orf66 de UPF0240 Q9P032 SEQ ID NO: 77 MGALVIRGIRNFNLENRAEREISKMKPSVAPRHPSTNSLLREQISLYPEVKGEIARKDEK LLSFLKDVYVDSKDPVSSLQVKAAETCQEPKEFRLPKDHHFDMINI SIP G ISIVEAL TLLNNHKLFPETWTAEKIMQEYQLEQKDVNSLLKYFVTFEVEIFPPEDKKAIRSK 25 I CDNA f¡6 FLJ45811 , clon NT2RP7014778 Q6ZS59 SEQ ID NO: 79 MVFYCMHLKYYSEKAP GPQGKNNYDPIGLGTQYPKVWHFGMLSALNQRRLEGLRRKVSL NLSYSPVSDFFFPYKGSHRNQNSSSV YHEI IPFCPVTFLQGCPFFMECKHKNRQFWLGG VARACNPSTLGG 26 iProteína hipotética DKFZp77901248 Q6AHZ8 SEQ ID NO: 81 MAGAEWKSLEECLEKHLPLPDLQEVKRVLYGKELRKLDLPREAFEAASREDFELQGYAFE AAEEQLRRPRIVHVGLVQNRIPLPANAPVAEQVSALHRRIKAIVEVAAMCGVNIICFQEA WILRPHHQEPRPPCCYAPSCCLIPSVFPHRSESIRSSPSLYHHLVQAPGSSPLAFVIPSS WSPVPS 27 | Beta-ureidopropionasa Q9UBR1 SEQ ID NO: 83 MAGAEWKSLEECLEKHLPLPDLQEVKRVLYGKELRKLDLPREAFEAASREDFELQGYAFE AAEEQLRRPRIVHVGLVQNRIPLPANAPVAEQVSALHRRI AIVEVAAMCGVNI ICFQEA WTMPFAFCTREKLPWTEFAESAEDGPTTRFCQKLAKNHDMVWSPILERDSEHGDVL NT AVVISNSGAVLGKTRKNHIPRVGDFNESTYYMEGNLGHPVFQTQFGRIAVNICYGRHHPL NWLMYSINGAEIIFNPSATIGALSESLWPIEARNAAIANHCFTCAINRVGTEHFPNEFTS GDGKKAHQDFGYFYGSSYVAAPDSSRTPGLSRSRDGLLVAKLDLNLCQQVNDVWNFKMTG RYEMYARELAEAVKSNYSPTIVKE 28 Proteína hipotética DKFZp434F1919 Q9GZU6 (+ isoformasl SEQ ID NO: 85 MNSRQA RLFLSQGRGDRWVSRPRGHFSPALRREFFTTTTKEGYDRRPVDITPLEQRKLT FDTHALVQDLETHGFDKTQAETIVSALTALSNVSLDTI KEMVTQAQQEITVQQLMAHLD AIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQV QQLMHETSRIRADNKLDINLERSRVTDM FTDQEKQLMETTTEFTKKDTQTKSIISETSNKIDAEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVF TCLAIALGFYRFWK SEQ ID NO: 87 MNSRQAWRLLLSQGRGDRWVSRPRGHFSPALRREFFTTTTKEGYDRRPVDITPLEQR LT FDTHALVQDLETHGFDKTQAETIVSALTALSNVSLDTIYKEMVTQAQQEITVQQLMAHLD AIRKDMVILE SEFANLRAENEKMKIELDQVKQQLMHETSRIRADNKLDINLERSRVTDM FTDQEKQLMETTTEFTKKDTQTKSIISETSN IDAEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVF TCLAIALGFYRFWK 29 Rica en cisteina con proteina 2 del dominio similar a EGF Q6UXH1 [precursor] (+ isoformas) SEQ ID NO: 89 MRLPRRAALGLLPLLLLLPPAPEAAKKPTPCHRCRGLVDKFNQGMVDTAKKNFGGGNTAW EEKTLSKYESSEIRLLEILEGLCESSDFECNQMLEAQEEHLEAWWLQLKSEYPDLFEWFC VKTLKVCCSPGTYGPDCLACQGGSQRPCSGNGHCSGDGSRQGDGSCRCHMGYQGPLCTDC MDGYFSSLRNETHSICTACDESCKTCSGLTNRDCGECEVG VLDEGACVDVDECAAEPPP CSAAQFCKNANGSYTCEECDSSCVGCTGEGPGNCKECISGYAREHGQCADVDECSLAEKT CVRKNENCYNTPGSYVCVCPDGFEETEDACVPPAEAEATEGESPTQLPSREDL SEQ ID NO: 91 RLPRRAALGLLPLLLLLPPAPEAAKKPTPCHRCRGLVDKFNQGMVDTAKKNFGGGNTAW EEKTLSKYESSEIRLLEILEGLCESSDFECNQMLEAQEEHLEAWWLQLKSEYPDLFEWFC VKTLKVCCSPGTYGPDCLACQGGSQRPCSGNGHCSGDGSRQGDGSCRCHMGYQGPLCTDC MDGYFSSLRNETHSICTACDESCKTCSGLTNRDCGECEVGWVLDEGACVDVDECAAEPPP CSAAQFC NANGSYTCEDVDECSLAEKTCVRKNENCYNTPGSYVCVCPDGFEETEDACVP PAEAEATEGESPTQLPSREDL SEQ ID NO: 92 MRLPRRAALGLLPLLLLLPPAPEAAKKPTPCHRCRGLVDKFNQGMVDTAKKNFGGGNTAW EEKTLSKYESSEIRLLEILEGLCESSDFECNQMLEAQEEHLEAWWLQLKSEYPDLFEWFC VKTLKVCCSPGTYGPDCLACQGGSQRPCSGNGHCSGDGSRQGDGSCRCHMGYQGPLCTDC DGYFSSLRNETHSICTACDESCKTCSGLTNRDCGECEVGWVLDEGACVDVDECAAEPPP CSAAQFCKNANGSYTCEGGPGGRVCTPGPAGFRCCLCQHSFMAS SEQ ID NO: 93 MRLPRRAALGLLPLLLLLPPAPEAAKKPTPCHRCRGLVDKFNQGMVDTAKKNFGGGNTAW EE TLSKYESSEIRLLEILEGLCESSDFECNQMLEAQEEHLEAW LQL SEYPDLFEWFC V TLKVCCSPGTYGPDCLACQGGSQRPCSGNGHCSGDGSRQGDGSCRCHMGYQGPLCTDC MDGYFSSLRNETHSICTACDESCKTCSGLTNRDCGECEVGWVLDEGACVECDSSCVGCTG EGPGNCKECISGYAREHGQCADVDECSLAEKTCVR NENCYNTPGSYVCVCPDGFEETED ACVPPAEAEATEGESPTQLPSREDL SEQ ID NO: 94 MRLPRRAALGLLPLLLLLPPAPEAAKKPTPCHRCRGLVDKFNQGMVDTAKKNFGGGNTAW EEKTLSKYESSEIRLLEILEGLCESSDFECNQMLEAQEEHLEAW LQLKSEYPDLFEWFC VKTL VCCSPGTYGPDCLACQGGSQRPCSGNGHCSGDGSRQGDGSCRCHMGYQGPLCTDC MDGYFSSLRNETHSICTVRTGLSDSYPPCCLSLGCWRGVGHAWIRGRNTHTQPGYSSRVW IAAFSPACDESCKTCSGLTNRDCGECEVG VLDEGACVDVDECAAEPPPCSAAQFCKNAN GSYTCEECDSSCVGCTGEGPGNCKECISGYAREHGQCADVDECSLAE TCVRKNENCYNT PGSYVCVCPDGFEETEDACVPPAEAEATEGESPTQLPSREDL SEQ IO NO: 95 RLPRRAALGLLPLLLLLPPAPEAA KPTPCHRCRGLVDKFNQGMVDTAKKNFGGGNTAW EEKTLSKYESSEIRLLEILEGLCESSDFECNQMLEAQEEHLEAWWLQLKSEYPDLFEWFC VKTLKVCCSPGTYGPDCLACQGGSQRPCSGNGHCSGDGSRQGDGSCRCHMGYQGPLCTDC MDGYFSSLRNETHSICTACDESCKTCSGLTNRDCGECEVGWVLDEGACVDVDECAAEPPP CSAAQFCKNANGSYTCEECDSSCVGCTGEGPGNCKECISGYAREHGQCADVDECSLAEKT CVRKNENCYNTPGSYVCVCPDGFEETEDACVPPAEAGEWHGCPPHRLPSPGPQGLHVDWL LGLKSTQMVALRW 30 Proteína KIAA0100 de la familia UPF0378 Q5H9T4 [precursor] SEQ ID NO: 96 MPLFFSALLVLLLVALSALFLGR LVVRLATKWCQRKLQAELKIGSFRFFWIQNVSLKFQ QHQQTVEIDNLWISSKPLSHDLPHYVALCFGEVRIRTDLQKVSDLSAPFSQSAGVDQKEL SFSPSLLKIFCQLFSIHVDAINIMVL VDTSESL HIQISRSRFLLDSDGKRLICEVSLC KINSKVLKSGQLEDTCLVELSLALDLCLKVGISSRHLTAITVDVWTLHAELHEGLFQSQL LCQGPSLASKPVPCSEVTENLVEPTLPGLFLLQQLPDQVKVKMENTSVVLSMNSQKRHLT WTLKLLQFLYHRDEDQLPLRSFTANSDMAQMSTELLLEDGLLLSQSRQRIVCL SLKASV QVTTIDLSASLVLNTCIIHYRHQEFSHWLHLLALETQGSSSPVLKQRKKRTFPQILAPII FSTSISNV ISIQLGDTPPFALGFNSISLDYQHLRPQSIHQRGVLTVDHLCWRVGSDSHI QRAPHPPNMHVWGEALVLDSFTLQGSYNQPLVLSSTQSDTLFLDCTIRGLQVEASDTCAQ CLSRILSLMGPQSG SAVSRHSS GESVSLLWKVDLKVEDMNLFTLSALVGASEVRLDTL AILGSAETSTVGIQGLVLALVKSVTEKMQPCCKAPDIPTPVLSLSMLSITYHSSIRSLEV QCGAGLTLLWSPPDHMYLYQHVLATLQCRDLLRATVFPETVPSLALETSGTTSELEGRAP EPLPPKRLLNLTLEVSTAKLTAFVAEDKFITLAAESVSLSRHGGSLQAYCPELAAGFDGN SIFNFKEVEVQLLPELEFPYQYDFSRTLDEAVGVQKWLKGLHQGTRAWASPSPVPLPPDL LLKVEHFSWVFLDDVFEVKLHDNYELMKDESKESAKRLQLLDAKVAALRKQHGELLPARK IEELYASLERKNIEIYIQRSRRLYGNTPMRRALLT SLAGLELVALADASFHGPEHVVEQ VQELDPGSPFPPEGLDLVIQWCRMLKCNVKSFLVRIRDYPRYLFEIRD RLMGRLVGTEQ SGQPCSRRRQILHLGLPWGNVAVERN PPLKFYHDFHSEIFQYTVVWGPCWDPAWTLIGQ CVDLLTKPSADPSPPLPWWDKSRLLFHGDWHMDIEQANLHQLATEDPYNTTENMHWE SH LSFHWKPGQFVFKGDLDINVRTASKYDDCCFLHLPDLCMTLDLQWLCHGNPHDHHSVTLR APEFLPEVPLGQLHDSYRAFRSENLNLSIKMDLARHSGTISQPRILLYSSTLRWMQNFWA TWTSVTRPICRGKLFNNLKPSK KLGQHY QLSYTALFPQLQVHYWASFAQQRGIQIECS QGHVFTRGTQRLIPQAGTVMRRLISDWSVTQ VSDLSQVTVHLMASPTEENADHCLDPLV TKTHLLSLSSLTYQRHSNRTAEEELSARDGDPTFHTHQLHLVDLRISWTTTNRDIAFGLY DGYKKAAVL RNLSTEALKGLKIDPQMPAKKPKRGVPTSASAPPRVNTPSFSGQPDKGSS GGAYMLQKLIEETDRLVVFTEEESGMSDQLCGIAACQTDDIYNRNCLIELVNCQMVLRGA ETEGCVIVSAAKAQLLQCQHHPAWYGDTLKQKTS TCLLDGMQYFATTESSPTEQDGRQL WLEVKNIEEHRQRSLDSVQELMESGQAVGGMVTTTTDWNQPAEAQQAQQVQRIISRCNCR MYYISYSHDIDPELATQIKPPEVLENQEKEDLLKKQEGAVDTFTLIHHELEISNPAQYAM ILDIVNNLLLHVEPKR EHSEKKQRVRFQLEISSNPEEQRSSILHLQEAVRQHVAQIRQL EKQMYSTMKSLQDDS NENLLDLNQKLQLQLNQEKANLQLESEELNILIRCFKDFQLQRA NKMELRKQQEDVSVVRRTEFYFAQARWRLTEEDGQLGIAELELQRFLYSKVNKSDDTAEH LLELGWFTM NLLPNAVYKVVLRPQSSCQSGRQLALRLFSKVRPPVGGISVKEHFEVNVV PLTIQLTHQFFHRMMGFFFPGRSVEDDEVGDEEDKSKLVTTGIPVVKPRQLIATDDAVPL GPGKGVAQGLTRSSGVRRSFRKSPEHPVDDIDKMKERAAMNNSFIYIKIPQVPLCVSYKG EKNSVDWGDLNLVLPCLEYHNNT TWLDFAMAVKRDSRKALVAQVIKEKLRLKSATGSEV RGKLETKSDLNMQQQEEEEKARLLIGLSVGDKNPGKKSIFGRRK 31 Miembro 1 de la subfamilia H del canal-compuerta de entrada por voltaje de potasio 095259 (+ soformas) SEQ ID NO: 98 MTMAGGRRGLVAPQNTFLENIVRRSNDTNFVLGNAQIVDWPIVYSNDGFCKLSGYHRAEV MQKSSTCSFMYGELTDKDTIE VRQTFENYEMNSFEILMYKKNRTPVWFFVKIAPIRNEQ DKVVLFLCTFSDITAFKQPIEDDSC GWGKFARLTRALTSSRGVLQQLAPSVQKGENVHK HSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILHYCVFKTTWD IILILTFYTAILVPYNVS F TRQNNVAWLWDSIVDVIFLVDIVLNFHTTFVGPAGEVISDPKLIRMNYLKTWFVIDL LSCLPYDVINAFENVDEVSAFMGDPGKIGFADQIPPPLEGRESQGISSLFSSLKVVRLLR LGRVARKLDHYIEYGAAVLVLLVCVFGLAAHWMACIWYSIGDYEIFDEDTKTIRNNSWLY QLAMDIGTPYQFNGSGSGKWEGGPSKNSVYISSLYFTMTSLTSVGFGNIAPSTDIE IFA VAIMMIGSLLYATIFGNVT IFQQMYANTNRYHEMLNSVRDFLKLYQVPKGLSERVMDYI VSTWSMSRGIDTEKVLQICPKDMRADICVHLNR VFKEHPAFRLASDGCLRALAMEFQTV HCAPGDLIYHAGESVDSLCFVVSGSLEVIQDDEVVAILGKGDVFGDVFWKEATLAQSCAN VRALTYCDLHVIKRDALQKVLEFYTAFSHSFSRNLILTYNLRKRIVFRKISDV REEEER MKRKNEAPLILPPDHPVRRLFQRFRQQKEARLAAERGGRDLDDLDVEKGNVLTEHASANH SLVKAS VTVRESPATPVSFQAASTSGVPDHA LQAPGSECLGPKGGGGDCAKRKSWARF DACGKSED NKVSKAESMETLPERTKASGEATLKKTDSCDSGIT SDLRLDNVGEARSP QDRSPILAEVKHSFYPIPEQTLQATVLEVRHELKEDIKALNAKMT IEKQLSEILRILTS RRSSQSPQELFEISRPQSPESERDIFGAS SEQ ID NO: 100 MTMAGGRRGLVAPQNTFLENIVRRSNDTNFVLGNAQIVDWPIVYSNDGFCKLSGYHRAEV MQKSSTCSFMYGELTDKDTIEKVRQTFENYEM SFEILMYKKNRTPVWFFVKIAPIRNEQ DKVVLFLCTFSDITAFKQPIEDDSCKGWG FARLTRALTSSRGVLQQLAPSVQKGENVHK HSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILHYCVFKTTWDWIILILTFYTAILVPYNVS FKTRQNNVA LWDSIVDVIFLVDIVLNFHTTFVGPAGEVISDP LIRMNYLKTWFVIDL LSCLPYDVINAFENVDEGISSLFSSLKVVRLLRLGRVARKLDHYIEYGAAVLVLLVCVFG LAAHWMACI YSIGDYEIFDEDTKTIRNNSWLYQLAMDIGTPYQFNGSGSGKWEGGPS N SVYISSLYFTMTSLTSVGFGNIAPSTDIEKIFAVAIMMIGSLLYATIFGNVTTIFQQMYA NTNRYHEMLNSVRDFLKLYQVPKGLSERVMDYIVST SMSRGIDTEKVLQICP DMRADI CVHLNRKVFKEHPAFRLASDGCLRALAMEFQTVHCAPGDLIYHAGESVDSLCFVVSGSLE VIQDDEVVAILGKGDVFGDVF KEATLAQSCANVRALTYCDLHVIKRDALQKVLEFYTAF SHSFSRNLILTYNLRKRIVFR ISDVKREEEERMKRKNEAPLILPPDHPVRRLFQRFRQQ KEARLAAERGGRDLDDLDVEKGNVLTEHASANHSLVKASVVTVRESPATPVSFQAASTSG VPDHAKLQAPGSECLGPKGGGGDCAKRKSWARFKDACGKSEDWNKVSKAESMETLPERTK ASGEATLKKTDSCDSGITKSDLRLDNVGEARSPQDRSPILAEVKHSFYPIPEQTLQATVL EVRHELKEDIKALNA MTNIEKQLSEILRILTSRRSSQSPQELFEISRPQSPESERDIFG AS Se hace constar que con relación a esta fecha el mejor método conocido por la solicitante para llevar a la práctica la citada invención, es el que resulta claro de la presente descripción de la invención.

Claims (15)

  1. REIVINDICACIONES Habiéndose descrito la invención como antecede, se reclama como propiedad lo contenido en las siguientes reivindicaciones: 1. Una proteina, caracterizada porque es designada homólogo de peroxidasina [fragmento] que tiene una secuencia de aminoácidos como se indica en la SEQ ID No.: 33, un fragmento o un derivado funcional de la misma.
  2. 2. La proteina, fragmento o derivado funcional de conformidad con la reivindicación 1, caracterizados porque tienen al menos 70, preferentemente 80, más preferentemente 90, lo más preferentemente al menos 95% de identidad en la secuencia de aminoácidos a la proteina de la SEQ ID No. : 33.
  3. 3. Un polinucleótido, caracterizado porque codifica para la proteina de la SEQ ID No. : 33, un fragmento o un derivado funcional del mismo, que tiene la habilidad para hibridarse a la secuencia de ácido nucleico de la SEQ ID No.: 34 bajo condiciones severas.
  4. 4. Un vector, caracterizado porque comprende los polinucleótidos que codifican para las proteínas, fragmentos y derivados funcionales de los mismos, de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones previas.
  5. 5. Una célula hospedera, caracterizada porque comprende una proteína recombinante , un ácido nucleico y/o vector de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones previas .
  6. 6. Un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo, caracterizados porque tiene afinidad de enlace especifica a una proteina de conformidad con la reivindicación 1.
  7. 7. El anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo de conformidad con la reivindicación 6, caracterizados porque se seleccionan del grupo que consiste de anticuerpos policlonales , anticuerpos monoclonales , anticuerpos quiméricos, anticuerpos humanizados, anticuerpos insertados con CDR, fragmentos Fv, fragmentos Fab, fragmentos Fab2 y proteínas de enlace similares al anticuerpo.
  8. 8. Una proteína de fusión, caracterizada porque comprende un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo, de conformidad con las reivindicaciones 6 ó 7.
  9. 9. La proteína de fusión de conformidad con la reivindicación 8, caracterizada porque comprende un componente que tiene actividad anti-tumoral o que tiene actividad de diagnóstico, por ejemplo que permite la identificación selectiva in vivo y/o ex vivo.
  10. 10. El uso de una proteína de fusión de conformidad con las reivindicaciones 8 ó 9, para preparar un medicamento para el tratamiento del cáncer, preferentemente cáncer de riñon en un mamífero.
  11. 11. El uso de una proteina de fusión de conformidad con las reivindicaciones 8 ó 9, para la preparación de una composición y diagnóstico para la identificación de tumores, preferentemente tumores renales, en un mamífero.
  12. 12. Una composición farmacéutica, caracterizada porque comprende un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado del mismo de conformidad con las reivindicaciones 6 ó 7 y/o una proteína de fusión de conformidad con las reivindicaciones 8 ó 9 y un portador o diluyente farmacéuticamente aceptable.
  13. 13. Una composición de diagnóstico, caracterizada porque comprende un ligando preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado del mismo, de conformidad con las reivindicaciones 6 ó 7 y/o una proteína de fusión de conformidad con las reivindicaciones 8 ó 9. Í4. Un método para identificar tumores en tejido de mamífero, preferentemente tejido renal vascular, caracterizado porque comprende: (i) poner en contacto un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo y/o una proteína de fusión que comprende un ligando, preferentemente un anticuerpo, fragmento o derivado funcional del mismo, que tiene afinidad de enlace específica a la proteína de conformidad con la 1 reivindicación 1 (homólogo de peroxidasina [fragmento] con el tejido de mamífero de interés, bajo condiciones que permiten el enlace específico del ligando y/o la proteína de fusión a la proteína de conformidad con la reivindicación 1, y (ii) la identificación del ligando y/o proteína de fusión específicamente enlazada, en donde los pasos (i) y (ii) son realizados ex vivo. 15. Un método para identificar estructuras neovasculares en tejido de mamífero, preferentemente en tejido de mamífero maduro, más preferentemente en tejido humano maduro, lo más preferentemente en tejido renal, caracterizado porque las estructuras neovasculares son identificadas por la detección de la proteína de conformidad con la reivindicación 1 (homólogo de peroxidasina) [fragmento] en el tejido in vitro.
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