LU508286B1 - Probe for leukemia detection and design method thereof - Google Patents

Probe for leukemia detection and design method thereof Download PDF

Info

Publication number
LU508286B1
LU508286B1 LU508286A LU508286A LU508286B1 LU 508286 B1 LU508286 B1 LU 508286B1 LU 508286 A LU508286 A LU 508286A LU 508286 A LU508286 A LU 508286A LU 508286 B1 LU508286 B1 LU 508286B1
Authority
LU
Luxembourg
Prior art keywords
probe
leukemia
fluorescent
detection
aptamer
Prior art date
Application number
LU508286A
Other languages
English (en)
Inventor
Yi Xiao
Original Assignee
Tongji Hospital Affiliated To Tongji Medical College Of Huazhong Univ Of Science & Technology
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Tongji Hospital Affiliated To Tongji Medical College Of Huazhong Univ Of Science & Technology filed Critical Tongji Hospital Affiliated To Tongji Medical College Of Huazhong Univ Of Science & Technology
Priority to LU508286A priority Critical patent/LU508286B1/en
Application granted granted Critical
Publication of LU508286B1 publication Critical patent/LU508286B1/en

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1034Isolating an individual clone by screening libraries
    • C12N15/1044Preparation or screening of libraries displayed on scaffold proteins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/16Aptamers

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (7)

REVENDICATIONS LU508286
1. Sonde de détection de leucémie et procédé de conception de celle-ci, caractérisée en ce qu'elle comprend les étapes suivantes : étape 1, criblage et optimisation d'aptamères : les aptamères d'acide nucléique qui se lient spécifiquement aux marqueurs de surface des cellules leucémiques ont été criblés par la technologie SELEX ; les aptamères ont une affinité et une spécificité élevées, et reconnaissent et se lient aux cellules leucémiques sans liaison non spécifique aux cellules normales ; étape 2, marquage fluorescent : les aptamères sélectionnés sont marqués avec des molécules fluorescentes pour former des sondes fluorescentes ; les marqueurs fluorescents émettent des signaux fluorescents après que les aptamères se lient aux marqueurs de surface des cellules leucémiques ; étape 3, modification du nanotransporteur et assemblage de la sonde : les aptamères marqués par fluorescence ont été modifiés sur les nanotransporteurs pour améliorer leur stabilité et leur biocompatibilité ; étape 4, capacités de détection multiples : en ajustant la séquence et les marqueurs fluorescents de l'aptamère, une détection multiplex peut être effectuée, c'est-à-dire que plusieurs marqueurs de cellules leucémiques peuvent être identifiés simultanément.
2. Sonde de détection de leucémie et son procédé de conception selon la revendication 1, caractérisée en ce que le procédé de criblage et d'optimisation d'aptamères d'acide nucléique est le suivant : (1) criblage préliminaire en utilisant la technologie SELEX, des aptamères d'acide nucléique ayant une affinité élevée pour des marqueurs de surface cellulaire leucémique spécifiques ont été initialement criblés ; comprenant plusieurs cycles d'étapes de liaison, de séparation et d'enrichissement pour cribler la séquence d'aptamères optimale à partir d'une bibliothèque d'oligonucléotides aléatoires ; LUS08286 (2) optimisation de la séquence d'aptamères les séquences d'aptamères criblées ont été encore optimisées structurellement et des modifications chimiques ont été introduites pour améliorer la résistance de l'aptamère à la dégradation enzymatique et la stabilité de liaison.
3. Sonde de détection de leucémie et son procédé de conception selon la revendication 1, dans laquelle le marqueur fluorescent : (1) marquage moléculaire fluorescent sélectionner des colorants fluorescents appropriés et marquer les molécules fluorescentes sur l'extrémité 5' ou l'extrémité 3' de l'aptamère optimisé par des liaisons covalentes pour préparer des sondes marquées par fluorescence ; (2) vérification de la sonde la spécificité et la sensibilité de la sonde marquée par fluorescence ont été vérifiées par des expériences in vitro pour garantir que la sonde pouvait reconnaître et se lier spécifiquement aux cellules leucémiques cibles et émettre un signal fluorescent puissant après la liaison.
4. Sonde de détection de leucémie et procédé de conception de celle-ci selon la revendication 1, caractérisée en ce que la modification du nanotransporteur et l'assemblage de la sonde : 1) sélection et préparation des nanotransporteurs sélection d'un matériau nanotransporteur approprié avec des groupes actifs sur sa surface auxquels l'aptamère marqué par fluorescence peut se lier ; 2) modification et assemblage de sondes fluorescentes l'aptamère marqué par fluorescence est modifié sur la surface du nanotransporteur par liaison chimique ou adsorption physique pour former un complexe de sondes nanofluorescentes ; la densité de surface de l'aptamère doit être contrôlée pendant le processus de modification pour garantir que chaque nanotransporteur porte un nombre suffisant d'aptameres ;
3) vérification fonctionnelle de la sonde LUS08286 les fonctions de la sonde nanofluorescente, y compris sa stabilité dans des environnements biologiques complexes et sa capacité a se lier spécifiquement aux cellules leucémiques cibles, ont été vérifiées par des tests de biocompatibilité et des expériences de reconnaissance spécifique in vivo et in vitro.
5. Sonde de détection de leucémie et procédé de conception de celle-ci selon la revendication 1, dans laquelle la capacité de détection multiple : 1) conception d'aptamères multiples différents aptamères d'acide nucléique sont conçus pour divers marqueurs à la surface des cellules leucémiques, et différentes molécules fluorescentes sont respectivement marquées ; chaque molécule fluorescente doit avoir des spectres d'excitation et d'émission différents ; 2) combinaisons de sondes multiples une sonde nanofluorescente multifonctionnelle est préparée en combinant une variété d'aptamères marqués par fluorescence avec des nanotransporteurs ; la sonde peut identifier simultanément plusieurs marqueurs de cellules leucémiques et effectuer une analyse de fluorescence multicolore par microscopie à fluorescence ou cytométrie de flux pour obtenir une détection simultanée de différents sous-types de cellules ou de plusieurs marqueurs ; 3) analyse et identification des données.
6. Sonde de détection de leucémie et son procédé de conception selon la revendication 5, caractérisée en ce que l'analyse et l'identification des données : un logiciel ou des algorithmes dédiés sont utilisés pour analyser et interpréter les signaux fluorescents obtenus à partir de multiples tests afin de distinguer différents types de cellules leucémiques ou d'identifier des sous-populations cellulaires présentant différents profils d'expression de marqueurs.
7. Système de conception de sonde pour la détection de leucémie mettant en œuvre 8508286 sonde de détection de leucémie et son procédé de conception selon l'une quelconque des revendications 1 à 6, caractérisé en ce que le système de conception de sonde pour la détection de leucémie comprend : un module de criblage est utilisé pour cribler des aptamères d'acide nucléique qui se lient spécifiquement aux marqueurs de surface des cellules leucémiques par la technologie SELEX ; les aptamères ont une affinité et une spécificité élevées, reconnaissent et se lient aux cellules leucémiques sans liaison non spécifique aux cellules normales ; le module de marquage fluorescent est utilisé pour marquer les aptamères sélectionnés avec des molécules fluorescentes pour former des sondes fluorescentes ; le marquage fluorescent émet un signal fluorescent après que l'aptamère se lie au marqueur de surface des cellules leucémiques ; un module de modification, utilisé pour modifier l'aptamère marqué par fluorescence sur le nanotransporteur afin d'améliorer sa stabilité et sa biocompatibilité ; le module de détection multiplex est utilisé pour effectuer une détection multiplex en ajustant la séquence de l'aptamère et du marqueur fluorescent, c'est-à-dire pour identifier simultanément plusieurs marqueurs de cellules leucémiques.
LU508286A 2024-09-17 2024-09-17 Probe for leukemia detection and design method thereof LU508286B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
LU508286A LU508286B1 (en) 2024-09-17 2024-09-17 Probe for leukemia detection and design method thereof

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
LU508286A LU508286B1 (en) 2024-09-17 2024-09-17 Probe for leukemia detection and design method thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
LU508286B1 true LU508286B1 (en) 2025-03-18

Family

ID=95025115

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
LU508286A LU508286B1 (en) 2024-09-17 2024-09-17 Probe for leukemia detection and design method thereof

Country Status (1)

Country Link
LU (1) LU508286B1 (fr)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Eivazzadeh-Keihan et al. Recent advances on nanomaterial based electrochemical and optical aptasensors for detection of cancer biomarkers
US20200217850A1 (en) Heterogeneous single cell profiling using molecular barcoding
US6492125B2 (en) Method to assess library X library interactions
JP2006501817A (ja) 新規高密度アレイおよび検体分析方法
US8101368B2 (en) Quantitation of cellular DNA and cell numbers using element labeling
JP4533536B2 (ja) 複数色の標識
US20200116711A1 (en) Method and kit for simultaneous detection of multi target molecules using magnetic bead-aptamer conjugate
AU2016297513A1 (en) Simultaneous quantification of a plurality of proteins in a user-defined region of a cross-sectioned tissue
JP2006525517A (ja) 糖類センサーシステム
CN119709943A (zh) 改进的测定方法
Zhang et al. Single molecule fluorescent colocalization of split aptamers for ultrasensitive detection of biomolecules
CN105393118A (zh) 改进的测定方法
US20080287666A1 (en) Detecting nucleic acid strands and inter-substance binding or interaction detecting method
Tanner et al. Multiplex bio-assay with inductively coupled plasma mass spectrometry: towards a massively multivariate single-cell technology
US12188022B2 (en) Aptamer for specifically recognizing soluble ST2 protein and application of the same
Xia et al. Biosensors based on sandwich assays
US20030013116A1 (en) Multiplex protein interaction determinations using glutathione-GST binding
US20040038318A1 (en) Creatine kinase isoenzyme determination in multiplexed assays
US20220381775A1 (en) Analyte detection and quantification by discrete enumeration of particle complexes
LU508286B1 (en) Probe for leukemia detection and design method thereof
Wang et al. Constructions, purifications and applications of DNA-antibody conjugates: a review
WO2022251419A1 (fr) Procédés et systèmes pour une analyse de protéines unicellulaires
CA2642575C (fr) Quantification d'adn cellulaire et de cellules au moyen d'elements de marquage
WO2024034371A1 (fr) Procédé de mesure
Guo et al. Novel strategies in liquid biopsy

Legal Events

Date Code Title Description
FG Patent granted

Effective date: 20250318