KR20230134487A - Rna 구조체 - Google Patents

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KR20230134487A
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마이클 왓슨
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임피리얼 컬리지 이노베이션스 리미티드
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Abstract

본 발명은 RNA 구조체에 관한 것이며, 특히, 배타적인 것은 아니지만, mRNA 구조체 및 saRNA 레플리콘, 및 이러한 RNA 구조체를 암호화하는 핵산 및 발현 벡터에 관한 것이다. 본 발명은 이러한 RNA 구조체를 치료법에, 예를 들면 질환의 치료 및/또는 백신 운반에 사용하는 용도로 확장된다. 본 발명은 이러한 RNA 구조체를 포함하는 약학적 조성물, 및 그의 방법 및 용도로 확장된다.

Description

RNA 구조체
본 발명은 RNA 구조체(construct)에 관한 것이며, 특히, 배타적인 것은 아니지만, mRNA 구조체 및 saRNA 레플리콘(replicon), 및 이러한 RNA 구조체를 암호화하는 핵산 및 발현 벡터(expression vector)에 관한 것이다. 본 발명은 이러한 RNA 구조체를 치료법에, 예를 들면 질환의 치료 및/또는 백신 운반에 사용하는 용도로 확장된다. 본 발명은 이러한 RNA 구조체를 포함하는 약학적 조성물, 및 그의 방법 및 용도로 확장된다.
메신저 RNA(mRNA)는 생물치료제(biotherapeutics)를 위한 유망한 도구이다. 그러나, mRNA 치료제는 소동물에서 매우 효과적인 것으로 나타났지만, 그 결과는 상기 제형이 인간에서 용량-증량 연구로 번역될 때 선형으로 규모가 커지지는 않는다. 아울러, 인터페론 반응의 유도와 연관된 부작용은 증가된 용량의 RNA가 인간에서 효과적일 가능성과 관련한 속도-제한요인(rate-limiting)인 것으로 나타나 있다. 이러한 불일치의 이유는 명확하지 않지만, 본 발명자들은 인간 선천적 감지(innate sensing)에서의 내재하는 차이가 실험실로부터 임상으로 RNA 치료제를 번역하기 위한 장애물을 제공한다는 가설을 세운다. 아울러, RNA의 선천적 감지는 단백질 발현의 억제와 연관된다. 지금까지, 외인성(exogenous) RNA의 선천적 인식을 극복하기 위한 주된 접근법은 선천적 감지 메커니즘에 의해 검출이 덜되는 변형된 리보뉴클레오티드를 사용하는 것이다. 그러나, 변형된 mRNA는 완전히 검출불가능하지는 않으며, 인간에게 사용할 때 여전히 인터페론 생산의 일부 유도, 단백질 사일런싱(silencing) 및 감소된 내약성(tolerability)을 야기한다(도 2 참조).
다른 접근법은 전형적으로 그 비-구조 단백질 내에 폴리머라아제(polymerase) 활성을 암호화함으로써 그 자신의 RNA를 자가-증폭하는 능력을 갖고 있는 알파바이러스 백본(alphavirus backbone)에 기반하는 자가-증폭형(self-amplifying) 또는 saRNA 벡터를 이용하는 것이다. 종래 기술의 방법은 상기 벡터의 구조 단백질을, 예를 들면 관심있는 항원을 암호화하는 관심있는 유전자(GOI)로 교체하여 이를 백신 구조체로 하거나, 치료 단백질을 암호화하는 것을 수반한다. 다른 버전의 saRNA는 피코르나바이러스(picornavirus), 플라비바이러스(flavivirus), 및 코로나바이러스(coronavirus)에 기반한다. saRNA가 표적 세포의 세포질 내로 들어갈 때, 이것은 상기 암호화된 폴리머라아제 기구(machinery)에 의한 RNA의 증폭 및 GOI의 매우 높은 발현 레벨(level)을 유도한다. 결과적으로, saRNA는 mRNA보다 낮은(10 내지 100배 낮은) 용량의 saRNA로 면역 반응을 유도하는 것으로 나타났고, 마우스에서 최대 60일까지 연장된 단백질 발현을 야기한다.
그러나, 도 3에 나타낸 것과 같이, saRNA를 이용하는 결점은 이것은 또한 선천적 감지 패턴 인식 수용체에 의해 감지되어 상기 종래 기술의 saRNA의 단백질 발현 및 자가-증폭을 제한하는 항-바이러스(인터페론) 반응을 촉발하게 된다는 것이다. saRNA의 선천적 감지는 그 큰 크기(전형적으로 >5,000 염기) 및 이중 가닥 영역(dsRNA)을 포함하는 고도한 2차 구조로 인해 mRNA의 경우와 상이하다. 길고 이중 가닥인 RNA는 다른 센서들 중에서도 DA5(흑색종 분화-연관 단백질 5) 경로를 통해 선천적 반응을 촉발한다. 이것은 길고 dsRNA인 RNA에 대한 PACT(PKR 활성화 단백질)의 결합에 의해 MDA5의 올리고머화(oligomerization)를 촉진하고, 이어서 saRNA의 복제 및 발현을 억제하는 하류의 신호전달 캐스케이드(cascade)를 촉발함으로써 용이하게 된다.
따라서, 본 기술분야에는 RNA 치료제가 mRNA- 또는 saRNA 기반이고, 환자에게 운반 및 발현되어 선천적 면역 시스템 감지를 극복할 수 있는 새로운 수단을 생성하기 위한 필요성이 있다.
본 발명자들은 면역 시스템 기구의 활성을 차단 또는 감소시키는 바이러스 면역 억제제 단백질을 발현함으로써 RNA를 감지하는 선천적 면역 시스템을 유리하게 극복하고, 숙주 세포에서 개선된 번역(mRNA의 경우) 및 증가된 자가-증폭 및 이후의 번역(saRNA 시스템의 경우)과, 이에 따른 관심있는 유전자, 예컨대 항원의 더 큰 단백질 발현 레벨을 야기하는 신규한 RNA 구조체(saRNA 및 mRNA)를 개발하였다.
따라서, 본 발명의 제1 측면에서, (ⅰ) 적어도 하나의 치료 생체분자(biomolecule); 및 (ⅱ) 적어도 하나의 바이러스 선천적 억제제 단백질(innate inhibitor protein, IIP);을 암호화하는 RNA 구조체가 제공된다.
RNA 구조체, 예컨대 mRNA 및 saRNA 레플리콘은 백신 및 치료제에 대한 관심있는 유전자의 운반 및 발현을 위한 잠재적인 도구로 상정되어 왔다. 그러나, 단일 가닥 mRNA(ssRNA) 및 이중 가닥 RNA(dsRNA)는 단백질 번역을 억제하는 반응을 촉발하는 선천적 감지 메커니즘에 의해 세포내에서 검출된다. 결과적으로, RNA 구조체에 의해 암호화되는 관심있는 유전자의 발현은 현저하게 손상되고, 따라서 saRNA 및 mRNA를 포함하는 RNA 구조체의 면역원성 또는 치료 잠재력은 제한된다. 유리하게는, 본 발명의 RNA 구조체는 숙주 세포 내에서 전이유전자(transgene) 발현의 하류 선천적 억제를 감소시키거나 제거하는 하나 이상의 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP)을 암호화하기 때문에 이러한 문제점을 극복한다.
인터페론의 유도는 선천적 인식의 하류 결과 중 하나이지만, 아래에 논의된 것과 같이, 다른 분자 및 경로가 유도되거나 유도될 수 있고, 이들 중 임의의 것은 RNA 구조체가 갖고 있는 하나 이상의 바이러스 선천적 면역 억제제 단백질에 의해 억제될 것임이 인식될 것이다. 따라서, 바람직하게는 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 본 발명의 RNA 구조체로 처리된 대상체에서 RNA에 대한 선천적 면역 반응을 억제할 수 있다. 따라서, 상기 IIP는 선천적 면역의 억제제로서 기술될 수 있다. 이것은 또한 일부 구현예에서 인터페론 억제 분자로 기술될 수 있다.
saRNA를 이용해 인터페론 반응을 제거하는 이전에 공개된 한 접근법은 백시니아(vaccinia) 바이러스 유래의 인터페론 억제 단백질인 E3, K3 및 B18을 이용하였다. 그러나, 상기 연구에서, 인터페론 억제 단백질은 saRNA와 조합된 별도의 mRNA 분자로서 운반 및 제형화되었다. 이것은 saRNA 및 mRNA 모두의 제조를 필요로 하고, 단백질 발현에서 임의의 관찰가능한 향상을 제공하기 위하여 본 발명에 따른 saRNA 레플리콘 구조체보다 적어도 3-6배 더 많은 백시니아 mRNA를 사용하는 것을 필요하게 하였다.
유리하게는, 제1 측면의 RNA 구조체에서, 하나 이상의 바이러스 선천적 억제제 단백질의 존재는 생물치료제 분자, 즉 관심있는 펩티드 또는 단백질을 이용한 이중 단백질 발현을 가능하게 한다. 종래 기술에서 기술된 것과 같이 하나는 관심있는 펩티드/단백질을 암호화하고 하나는 선천적 조절 단백질을 암호화하는 2개의 상이한 가닥의 RNA를 운반하는 것과 대조적으로, 본 발명의 RNA 구조체를 이용할 때 단지 하나의 단일 가닥만이 표적 세포로 운반되고, 이로 인해 RNA 분자 및 바이러스 면역 억제제 단백질의 동시국소화(colocalization)를 보장한다. 상기 바이러스 면역 억제제 단백질은 숙주 세포에서 RNA의 선천적 감지를 억제하고, 이로 인해 더 높은 단백질 발현 및 번역을 가능하게 하며, 상기 바이러스 면역 억제제 단백질의 발현 자체는 치료 생체분자와 동일한 RNA 분자로부터 공동-발현 및 번역된다.
실시예에 기술된 것과 같이, (GOI로서) ("스틸티콘(Stealthicon)"으로도 알려져 있는) 루시퍼라아제(luciferase) 또는 VEGF-A를 암호화하는 본 발명의 RNA 구조체는 놀랍게도 온전한 선천적 감지 시스템을 갖는 인간 세포주에서 시험관내 루시퍼라아제 또는 VEGF-A 단백질 발현 레벨을 최대 12배까지 증가시키는 것으로 나타났다. 상기 RNA 구조체는 본 발명의 RNA 분자가 갖고 있는 유전자를 발현할 수 있는 것으로 판명되었기 때문에, 숙련된 기술자는 루시퍼라아제 리포터(reporter)가 치료 생체분자를 정확히 대표함을 용이하게 인식할 것이다. 이와 같이, 상기 루시퍼라아제는 본 발명의 RNA 구조체가 임의의 치료적으로 활성인 생체분자를 발현하기 위해 사용될 수 있다는 개념 증명(proof of concept)의 강력한 증거를 제공한다. 또한, VEGF-A(도 11 참조)는 GOI로서 루시퍼라아제에 대한 대안적 예를 나타낸다.
제1 측면의 RNA 구조체는 단일 가닥 RNA 또는 이중 가닥 RNA일 수 있다.
상기 RNA 구조체는 mRNA 분자 또는 saRNA 분자를 포함할 수 있다.
한 구현예에서, 상기 RNA 구조체는 mRNA를 포함한다. 도 1(오른쪽)은 mRNA 분자로서 RNA 구조체의 다양한 구현예를 실증한다.
그러나, 바람직한 구현예에서, 상기 RNA 구조체는 자가-증폭형 RNA(saRNA)를 포함한다. 도 1(왼쪽)은 saRNA 분자로서 RNA 구조체의 다양한 구현예를 실증한다. 숙련된 기술자는 이러한 RNA 구조체가 또한 자가-복제(self-replicating) RNA 바이러스 벡터, 또는 RNA 레플리콘으로 나타낼 수 있음을 이해할 것이다.
바람직하게는, 상기 saRNA 구조체는 알파바이러스; 피코르나바이러스; 플라비바이러스; 루비바이러스(rubivirus); 페스티바이러스(pestivirus); 헤파시바이러스(hepacivirus); 칼리시바이러스(calicivirus); 및 코로나바이러스;로 이루어진 속(genus)의 군으로부터 선택되는 양성 가닥(positive stranded) RNA 바이러스를 포함하거나 이로부터 유래된다.
바람직하게는, 상기 RNA 구조체는 알파바이러스를 포함하거나 이로부터 유래된다. 적합한 야생형 알파바이러스 서열은 잘 알려져 있다. 적합한 알파바이러스의 대표적인 예는 아우라(Aura), 베바루(Bebaru) 바이러스, 카바소우(Cabassou), 치쿤군야(Chikungunya) 바이러스, 동부 말 뇌척수염 바이러스, 포트 모건(Fort Morgan), 게타(Getah) 바이러스, 키질라가치(Kyzylagach), 마야로(Mayaro), 마야로 바이러스, 미들버그(Middleburg), 무캄보(Mucambo) 바이러스, 은두무(Ndumu), 픽수나(Pixuna) 바이러스, 로스 리버(Ross River) 바이러스, 셈리키 포레스트(Semliki Forest), 신드비스(Sindbis) 바이러스, 토나테(Tonate), 트리니티(Triniti), 우나(Una), 베네주엘라 말 뇌척수염, 서부 말 뇌척수염, 와타로아(Whataroa Whataroa), 및 Y-62-33을 포함한다. 따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 임의의 상기 알파바이러스를 포함하거나 이로부터 유래된다.
바람직하게는, 상기 RNA 구조체는 베네주엘라 말 뇌염 바이러스(VEEV); 엔테로바이러스(enterovirus) 71; 뇌심근염 바이러스; 쿤진(Kunjin) 바이러스; 및 중동 호흡기 증후군 바이러스;로 이루어진 종의 군으로부터 선택되는 바이러스를 포함하거나 이로부터 유래된다. 한 바람직한 구현예에서, 상기 RNA 구조체는 쿤진 바이러스를 포함하거나 이로부터 유래된다. 바람직하게는, 상기 RNA 구조체는 VEEV로부터 유래된다.
바람직하게는, 상기 RNA 구조체는 RNA에 대한 선천적 면역 반응을 감소, 제거, 또는 차단할 수 있는 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 따라서, 상기 IIP는 선천적 면역의 억제제이고, 따라서 바이러스 선천적 면역 억제제 단백질로 기술될 수 있다. 상기 IIP는 또한 인터페론 신호전달의 억제제일 수 있다.
해당 RNA 분자(즉, 비-내인성으로 생산된 RNA)로 형질전환된 숙주 세포에서 RNA에 대한 선천적 면역 반응의 감소, 제거, 또는 차단은 선천적 신호전달 경로를 억제하고, 및/또는 RNA 인식을 억제하는 IIP 조절성 인터페론 생산에 의해 달성될 수 있다. 인터페론 생산의 조절은 선천적 신호전달의 억제로서 기술될 수 있음이 인식될 것이다. 따라서, 선천적 감지 및 선천적 신호전달 시스템은 (a) RNA 인식 시스템, (b) 인터페론 생산을 유도하고 인터페론-자극 유전자의 자극을 야기하는 경로, 및 (c) 인터페론 신호전달 시스템을 포함한다.
따라서, 상기 IIP는 다음의 4가지 넓은 카테고리 중 하나에 속할 수 있다:
(ⅰ) 카테고리 1: 인터페론 조절 인자 활성의 억제제;
(ⅱ) 카테고리 2: 인터페론 생산을 유도하고 인터페론-자극 유전자의 자극을 야기하는 경로의 억제제;
(ⅲ) 카테고리 3: 인터페론 신호전달의 억제제; 및/또는
(ⅳ) 카테고리 4: RNA 인식 시스템의 억제제.
일부 IIP는 다수의 작용을 가질 수 있음이 인식될 것이다. 예를 들어, 카테고리 4의 IIP는 또한 카테고리 2의 IIP(예컨대, IRF3, IRF7) 및 카테고리 3의 IIP(예컨대, IRF9)로 분류될 수 있다.
한 구현예에서, RNA에 대한 선천적 면역 반응의 감소, 제거, 또는 차단은 바람직하게는 다양한 항-바이러스 유전자(예컨대, RNA 발현을 저해하는 것으로 알려진 IFIT1-3, Mx1, Mx2), 그 생성물이 선천적 면역 반응을 조직하는 전염증성(proinflammatory) 유전자, 및 임의의 인터페론 의존성 캐스케이드 상류의 정규적(canonically) IFN-자극 유전자(ISG)의 직접적인 활성화를 직접 촉발하는 인터페론 조절 인자 3 및 7(IRF3 및 IRF7) 및 NF-κB 전사 인자의 활성화를 유도하는 패턴 인식 수용체에 의한 세포기질 RNA의 인식을 감소 또는 방지함으로써 IIP에 의해 달성된다. 상기 경로는 많은 항-바이러스 반응을 추가로 증폭하는 양성 피드백 루프(feedback loop)를 제공하는 타입 I & III 인터페론을 유도함으로써 향상될 수 있다.
적어도 하나의 IIP는 헤르페스 심플렉스 바이러스(herpes simplex virus)로부터 유래될 수 있다. 상기 IIP는 간염 바이러스, 임의적으로 C형 간염 바이러스로부터 유래될 수 있다. 상기 IIP는 백시니아 바이러스로부터 유래될 수 있다. 상기 IIP는 코로나바이러스, 임의적으로 중동 호흡기 증후군(MERS) 바이러스 또는 중증 급성 호흡기 증후군(SARS) 바이러스로부터 유래될 수 있다. 상기 SARS 바이러스는 SARS-Cov 또는 SARS-CoV-2일 수 있다. 상기 IIP는 카포시 육종(Kaposi's sarcoma)-연관 헤르페스바이러스(KSHV)로부터 유래될 수 있다. 상기 IIP는 에볼라 바이러스(Ebola virus)로부터 유래될 수 있다.
적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 HPV16 E6; HSV ICP34.5; HCV E2; HCV NS5a; VACV E3L; VACV K3L; MERS ORF8B; KSHV ORF52; EBOV VP35; SARS-2 ORF3b 및 VACV C6; 또는 그의 동원체(orthologue)로 이루어진 바이러스 IIP의 군으로부터 선택될 수 있다. 상기 IIP는 IFN 생산을 유도하는 선천적 신호전달 시스템의 억제를 일으킬 수 있음이 인식될 것이다.
한 구현예에서, 적어도 하나의 IIP는 HPV16 E6(인간 파필로마바이러스 E6; NP_041325.1; 접근 번호 - NCBI 참조 서열: NC_001526.4; UniProtKB - P03126(VE6_HPV16)), 또는 그의 동원체일 수 있다. 상기 단백질은 PKR, IRF3 및 IRF9를 포함하는 선천적 신호전달 캐스케이드 내의 다수의 단백질에 대해 작용함으로써 세포의 항-바이러스 상태의 확립을 방지하는 것으로 여겨진다. [Warren CJ, Pyeon D. (2017). Evasion of host immune defenses by human papillomavirus. Virus Res. 2017 231, 21-33. doi: 10.1016/j.virusres.2016.11.023]; [Noguchi T, Satoh S, Noshi T, Hatada E, Fukuda R, Kawai A, Ikeda S, Hijikata M, Shimotohno K (2001). Effects of Mutation in Hepatitis C Virus Nonstructural Protein 5A on Interferon Resistance Mediated by Inhibition of PKR Kinase Activity in Mammalian Cells. Microbiol. Immunol., 45, 829-840. doi: 10.1111/j.1348-0421.2001.tb01322.x.].
상기 HPV16 E6 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 1로 나타낸다:
MHQKRTAMFQDPQERPRKLPQLCTELQTTIHDIILECVYCKQQLLRREVYDFAFRDLCIVYRDGNPYAVCDKCLKFYSKISEYRHYCYSLYGTTLEQQYNKPLCDLLIRCINCQKPLCPEEKQRHLDKKQRFHNIRGRWTGRCMSCCRSSRTRRETQL [서열번호 1]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 서열번호 1에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HPV16 E6 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 2의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGCACCAAAAGAGAACTGCAATGTTTCAGGACCCACAGGAGCGACCCAGAAAGTTACCACAGTTATGCACAGAGCTGCAAACAACTATACATGATATAATATTAGAATGTGTGTACTGCAAGCAACAGTTACTGCGACGTGAGGTATATGACTTTGCTTTTCGGGATTTATGCATAGTATATAGAGATGGGAATCCATATGCTGTATGTGATAAATGTTTAAAGTTTTATTCTAAAATTAGTGAGTATAGACATTATTGTTATAGTTTGTATGGAACAACATTAGAACAGCAATACAACAAACCGTTGTGTGATTTGTTAATTAGGTGTATTAACTGTCAAAAGCCACTGTGTCCTGAAGAAAAGCAAAGACATCTGGACAAAAAGCAAAGATTCCATAATATAAGGGGTCGGTGGACCGGTCGATGTATGTCTTGTTGCAGATCATCAAGAACACGTAGAGAAACCCAGCTG [서열번호 2]
따라서, 바람직하게는 상기 HPV16 E6 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 2에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 3의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGCACCAAAAGAGAACUGCAAUGUUUCAGGACCCACAGGAGCGACCCAGAAAGUUACCACAGUUAUGCACAGAGCUGCAAACAACUAUACAUGAUAUAAUAUUAGAAUGUGUGUACUGCAAGCAACAGUUACUGCGACGUGAGGUAUAUGACUUUGCUUUUCGGGAUUUAUGCAUAGUAUAUAGAGAUGGGAAUCCAUAUGCUGUAUGUGAUAAAUGUUUAAAGUUUUAUUCUAAAAUUAGUGAGUAUAGACAUUAUUGUUAUAGUUUGUAUGGAACAACAUUAGAACAGCAAUACAACAAACCGUUGUGUGAUUUGUUAAUUAGGUGUAUUAACUGUCAAAAGCCACUGUGUCCUGAAGAAAAGCAAAGACAUCUGGACAAAAAGCAAAGAUUCCAUAAUAUAAGGGGUCGGUGGACCGGUCGAUGUAUGUCUUGUUGCAGAUCAUCAAGAACACGUAGAGAAACCCAGCUG [서열번호 3]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 3에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 1의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화(codon optimisation)를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 4로 제공된다:
ATGCACCAGAAACGGACCGCCATGTTCCAGGATCCTCAAGAGAGGCCCAGAAAGCTGCCTCAGCTGTGTACCGAGCTGCAGACCACCATCCACGACATCATCCTGGAATGCGTGTACTGCAAGCAGCAGCTCCTGCGGAGAGAGGTGTACGATTTCGCCTTCCGGGACCTGTGCATCGTGTACAGAGATGGCAACCCCTACGCCGTGTGCGACAAGTGCCTGAAGTTCTACAGCAAGATCAGCGAGTACCGGCACTACTGCTACAGCCTGTACGGCACCACACTGGAACAGCAGTACAACAAGCCCCTGTGCGACCTGCTGATCCGGTGCATCAACTGCCAGAAACCTCTGTGCCCCGAGGAAAAGCAGCGGCACCTGGACAAGAAGCAGCGGTTCCACAACATCAGAGGCCGGTGGACCGGCAGATGCATGAGCTGTTGTCGGAGCAGCAGAACCAGACGGGAAACCCAGCTGTGA [서열번호 4]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 4에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 4의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 5로 제공된다:
AUGCACCAGAAACGGACCGCCAUGUUCCAGGAUCCUCAAGAGAGGCCCAGAAAGCUGCCUCAGCUGUGUACCGAGCUGCAGACCACCAUCCACGACAUCAUCCUGGAAUGCGUGUACUGCAAGCAGCAGCUCCUGCGGAGAGAGGUGUACGAUUUCGCCUUCCGGGACCUGUGCAUCGUGUACAGAGAUGGCAACCCCUACGCCGUGUGCGACAAGUGCCUGAAGUUCUACAGCAAGAUCAGCGAGUACCGGCACUACUGCUACAGCCUGUACGGCACCACACUGGAACAGCAGUACAACAAGCCCCUGUGCGACCUGCUGAUCCGGUGCAUCAACUGCCAGAAACCUCUGUGCCCCGAGGAAAAGCAGCGGCACCUGGACAAGAAGCAGCGGUUCCACAACAUCAGAGGCCGGUGGACCGGCAGAUGCAUGAGCUGUUGUCGGAGCAGCAGAACCAGACGGGAAACCCAGCUGUGA [서열번호 5]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 5에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HSV ICP34.5(헤르페스 심플렉스 바이러스 ICP34.5; YP_009137073.1; 접근 번호 - NCBI 참조 서열: NC_001806.2; UniProtKB - P36313(ICP34_HHV11)), 또는 그의 동원체일 수 있다. HSV ICP34.5는 TBK1을 격리하고 TBK1 및 IRF3 사이의 상호작용을 간섭하여, 최종적으로 IRF3의 불활성화를 유도하는 것으로 나타났다. [Zhu H, Zheng C (2020). The race between host antiviral innate immunity and the immune evasion strategies of Herpes simplex virus 1. Microbiol Mol Biol Rev., 84(4): e00099-20]. 상기 HSV ICP34.5 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 6으로 나타낸다:
MARRRRHRGPRRPRPPGPTGAVPTAQSQVTSTPNSEPAVRSAPAAAPPPPPAGGPPPSCSLLLRQWLHVPESASDDDDDDDWPDSPPPEPAPEARPTAAAPRPRPPPPGVGPGGGADPSHPPSRPFRLPPRLALRLRVTAEHLARLRLRRAGGEGAPEPPATPATPATPATPATPARVRFSPHVRVRHLVVWASAARLARRGSWARERADRARFRRRVAEAEAVIGPCLGPEARARALARGAGPANSV [서열번호 6]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 6에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HSV ICP34.5 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 7의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCCCGCCGCCGCCGCCATCGCGGCCCCCGCCGCCCCCGGCCGCCCGGGCCCACGGGCGCCGTCCCAACCGCACAGTCCCAGGTAACCTCCACGCCCAACTCGGAACCCGCGGTCAGGAGCGCGCCCGCGGCCGCCCCGCCGCCGCCCCCCGCCGGTGGGCCCCCGCCTTCTTGTTCGCTGCTGCTGCGCCAGTGGCTCCACGTTCCCGAGTCCGCGTCCGACGACGACGATGACGACGACTGGCCGGACAGCCCCCCGCCCGAGCCGGCGCCAGAGGCCCGGCCCACCGCCGCCGCCCCCCGGCCCCGGCCCCCACCGCCCGGCGTGGGCCCGGGGGGCGGGGCTGACCCCTCCCACCCCCCCTCGCGCCCCTTCCGCCTTCCGCCGCGCCTCGCCCTCCGCCTGCGCGTCACCGCGGAGCACCTGGCGCGCCTGCGCCTGCGACGCGCGGGCGGGGAGGGGGCGCCGGAGCCCCCCGCGACCCCCGCGACCCCCGCGACCCCCGCGACCCCCGCGACCCCCGCGCGGGTGCGCTTCTCGCCCCACGTCCGGGTGCGCCACCTGGTGGTCTGGGCCTCGGCCGCCCGCCTGGCGCGCCGCGGCTCGTGGGCCCGCGAGCGGGCCGACCGGGCTCGGTTCCGGCGCCGGGTGGCGGAGGCCGAGGCGGTCATCGGGCCGTGCCTGGGGCCCGAGGCCCGTGCCCGGGCCCTGGCCCGCGGAGCCGGCCCGGCGAACTCGGTC [서열번호 7]
따라서, 바람직하게는 상기 HSV ICP34.5 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 7에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 8의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGGCCCGCCGCCGCCGCCAUCGCGGCCCCCGCCGCCCCCGGCCGCCCGGGCCCACGGGCGCCGUCCCAACCGCACAGUCCCAGGUAACCUCCACGCCCAACUCGGAACCCGCGGUCAGGAGCGCGCCCGCGGCCGCCCCGCCGCCGCCCCCCGCCGGUGGGCCCCCGCCUUCUUGUUCGCUGCUGCUGCGCCAGUGGCUCCACGUUCCCGAGUCCGCGUCCGACGACGACGAUGACGACGACUGGCCGGACAGCCCCCCGCCCGAGCCGGCGCCAGAGGCCCGGCCCACCGCCGCCGCCCCCCGGCCCCGGCCCCCACCGCCCGGCGUGGGCCCGGGGGGCGGGGCUGACCCCUCCCACCCCCCCUCGCGCCCCUUCCGCCUUCCGCCGCGCCUCGCCCUCCGCCUGCGCGUCACCGCGGAGCACCUGGCGCGCCUGCGCCUGCGACGCGCGGGCGGGGAGGGGGCGCCGGAGCCCCCCGCGACCCCCGCGACCCCCGCGACCCCCGCGACCCCCGCGACCCCCGCGCGGGUGCGCUUCUCGCCCCACGUCCGGGUGCGCCACCUGGUGGUCUGGGCCUCGGCCGCCCGCCUGGCGCGCCGCGGCUCGUGGGCCCGCGAGCGGGCCGACCGGGCUCGGUUCCGGCGCCGGGUGGCGGAGGCCGAGGCGGUCAUCGGGCCGUGCCUGGGGCCCGAGGCCCGUGCCCGGGCCCUGGCCCGCGGAGCCGGCCCGGCGAACUCGGUC [서열번호 8]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 8에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 6의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 9로 제공된다:
ATGGCCAGAAGAAGGCGGCACAGAGGACCCAGAAGGCCTAGACCTCCTGGACCAACAGGTGCCGTTCCTACCGCTCAGAGCCAAGTGACCAGCACACCCAATTCTGAACCTGCCGTCAGAAGCGCCCCTGCTGCTGCTCCTCCACCTCCACCAGCTGGCGGACCTCCACCTTCTTGTTCTCTGCTGCTGAGACAGTGGCTGCACGTGCCAGAGTCCGCCTCCGACGATGATGACGATGACGACTGGCCTGACAGCCCTCCTCCAGAACCTGCTCCTGAAGCCAGACCTACAGCCGCTGCTCCTAGACCTAGACCACCACCTCCAGGTGTTGGACCTGGTGGCGGAGCTGATCCTTCTCACCCTCCTAGCAGACCCTTCCGGCTTCCTCCTAGACTGGCCCTGAGACTGAGAGTGACAGCCGAACACCTGGCCAGACTGAGACTTCGTAGAGCAGGCGGAGAAGGCGCTCCTGAACCTCCTGCTACACCAGCCACACCAGCTACTCCCGCAACTCCTGCCACTCCTGCTAGAGTGCGGTTTAGCCCTCACGTCCGCGTCAGACATCTGGTCGTTTGGGCCTCTGCTGCCCGGCTTGCTAGAAGAGGATCTTGGGCCAGAGAGAGAGCCGACCGGGCTAGATTTCGGAGAAGAGTGGCCGAAGCCGAGGCCGTGATTGGACCTTGTCTTGGCCCTGAAGCTCGGGCTAGAGCACTTGCTAGAGGTGCCGGACCTGCCAACAGCGTGTGA [서열번호 9]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 9에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 9의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 10으로 제공된다:
AUGGCCAGAAGAAGGCGGCACAGAGGACCCAGAAGGCCUAGACCUCCUGGACCAACAGGUGCCGUUCCUACCGCUCAGAGCCAAGUGACCAGCACACCCAAUUCUGAACCUGCCGUCAGAAGCGCCCCUGCUGCUGCUCCUCCACCUCCACCAGCUGGCGGACCUCCACCUUCUUGUUCUCUGCUGCUGAGACAGUGGCUGCACGUGCCAGAGUCCGCCUCCGACGAUGAUGACGAUGACGACUGGCCUGACAGCCCUCCUCCAGAACCUGCUCCUGAAGCCAGACCUACAGCCGCUGCUCCUAGACCUAGACCACCACCUCCAGGUGUUGGACCUGGUGGCGGAGCUGAUCCUUCUCACCCUCCUAGCAGACCCUUCCGGCUUCCUCCUAGACUGGCCCUGAGACUGAGAGUGACAGCCGAACACCUGGCCAGACUGAGACUUCGUAGAGCAGGCGGAGAAGGCGCUCCUGAACCUCCUGCUACACCAGCCACACCAGCUACUCCCGCAACUCCUGCCACUCCUGCUAGAGUGCGGUUUAGCCCUCACGUCCGCGUCAGACAUCUGGUCGUUUGGGCCUCUGCUGCCCGGCUUGCUAGAAGAGGAUCUUGGGCCAGAGAGAGAGCCGACCGGGCUAGAUUUCGGAGAAGAGUGGCCGAAGCCGAGGCCGUGAUUGGACCUUGUCUUGGCCCUGAAGCUCGGGCUAGAGCACUUGCUAGAGGUGCCGGACCUGCCAACAGCGUGUGA [서열번호 10]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 10에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HCV E2(C형 간염 바이러스 E2; 폴리단백질(polyprotein) ADC54662.1로부터의 NS1 단백질; 접근 번호 - 게놈 RNA 번역 ADC54662.1; UniProtKB - D3W8R2(D3W8R2_9HEPC)), 또는 그의 동원체일 수 있다.
HCV E2의 한 작용은 PKR을 억제하는 것이다. [Taylor DR, Shi ST, Romano PR, Barber GN, Lai MMC (1999). Inhibition of the interferon-inducible protein kinase PKR by HCV E2 protein. Science, 285, 107-110. doi: 10.1126/science.285.5424.107]. 상기 HCV E2 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 11로 나타낸다:
METHVTGGSAGHTVSGFVSLLAPGAKQNVQLINTNGSWHLNSTALNCNDSLNTGWLAGLFYHHKFNSSGCPERLASCRPLTDFDQGWGPISYANGSGPDQRPYCWHYPPKPCGIVPAKSVCGPVYCFTPSPVVVGTTDRSGAPTYSWGENDTDVFVLNNTRPPLGNWFGCTWMNSTGFTKVCGAPPCVIGGAGNNTLHCPTDCFRKHPDATYSRCGSGPWITPRCLVDYPYRLWHYPCTINYTIFKIRMYVGGVEHRLEAACNWTRGERCDLEDRDRSELSPLLLTTTQWQVLPCSFTTLPALSTGLIHLHQNIVDVQYLYGVGSSIASWAIKWEYVVLLFLLLADARVCSCLWMMLLISQAEA [서열번호 11]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 11에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HCV E2 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 12의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGAAACCCACGTCACCGGGGGAAGTGCCGGCCACACTGTGTCTGGATTTGTTAGCCTCCTCGCACCAGGCGCCAAGCAGAACGTCCAGCTGATCAACACCAACGGCAGTTGGCACCTCAATAGCACGGCCCTGAACTGCAATGATAGCCTTAACACCGGCTGGTTAGCAGGGCTTTTCTATCACCACAAGTTCAACTCTTCAGGCTGTCCTGAGAGGCTAGCCAGCTGCCGACCCCTTACCGATTTTGACCAGGGCTGGGGCCCTATCAGTTATGCCAACGGAAGCGGCCCCGACCAGCGCCCCTACTGCTGGCACTACCCCCCTAAACCTTGCGGTGTTGTGCCCGCGAAGAGTGTGTGTGGTCCGGTATATTGCTTCACTCCCAGCCCCGTGGTGGTGGGAACGACCGACAGGTCGGGCGCGCCTACCTACAGCTGGGGTGAAAATGATACGGACGTCTTCGTCCTTAACAATACCAGGCCACCGCTGGGCAATTGGTTCGGTTGTACCTGGATGAACTCAACTGGATTCACCAAAGTGTGCGGAGCGCCTCCCTGTGTCATCGGAGGGGCGGGCAACAACACCCTGCACTGCCCCACTGATTGCTTCCGCAAGCATCCGGACGCCACATACTCTCGGTGCGGCTCCGGTCCCTGGATCACACCCAGGTGCCTGGTCGACTACCCGTATAGGCTTTGGCATTATCCTTGTACCATCAACTACACCATATTTAAAATCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACAGGCTGGAAGCTGCTTGCAACTGGACGCGGGGCGAACGTTGCGATCTGGAAGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGTTACTGCTGACCACTACACAGTGGCAGGTCCTCCCGTGTTCCTTCACAACCCTGCCAGCCTTGTCCACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATTGTGGACGTGCAGTACTTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATCGCGTCCTGGGCCATTAAGTGGGAGTACGTCGTTCTCCTGTTCCTTCTGCTTGCAGACGCGCGCGTCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGCTACTCATATCCCAAGCGGAGGCG [서열번호 12]
따라서, 바람직하게는 상기 HCV E2 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 12에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 13의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGGAAACCCACGUCACCGGGGGAAGUGCCGGCCACACUGUGUCUGGAUUUGUUAGCCUCCUCGCACCAGGCGCCAAGCAGAACGUCCAGCUGAUCAACACCAACGGCAGUUGGCACCUCAAUAGCACGGCCCUGAACUGCAAUGAUAGCCUUAACACCGGCUGGUUAGCAGGGCUUUUCUAUCACCACAAGUUCAACUCUUCAGGCUGUCCUGAGAGGCUAGCCAGCUGCCGACCCCUUACCGAUUUUGACCAGGGCUGGGGCCCUAUCAGUUAUGCCAACGGAAGCGGCCCCGACCAGCGCCCCUACUGCUGGCACUACCCCCCUAAACCUUGCGGUGUUGUGCCCGCGAAGAGUGUGUGUGGUCCGGUAUAUUGCUUCACUCCCAGCCCCGUGGUGGUGGGAACGACCGACAGGUCGGGCGCGCCUACCUACAGCUGGGGUGAAAAUGAUACGGACGUCUUCGUCCUUAACAAUACCAGGCCACCGCUGGGCAAUUGGUUCGGUUGUACCUGGAUGAACUCAACUGGAUUCACCAAAGUGUGCGGAGCGCCUCCCUGUGUCAUCGGAGGGGCGGGCAACAACACCCUGCACUGCCCCACUGAUUGCUUCCGCAAGCAUCCGGACGCCACAUACUCUCGGUGCGGCUCCGGUCCCUGGAUCACACCCAGGUGCCUGGUCGACUACCCGUAUAGGCUUUGGCAUUAUCCUUGUACCAUCAACUACACCAUAUUUAAAAUCAGGAUGUACGUGGGAGGGGUCGAGCACAGGCUGGAAGCUGCUUGCAACUGGACGCGGGGCGAACGUUGCGAUCUGGAAGACAGGGACAGGUCCGAGCUCAGCCCGUUACUGCUGACCACUACACAGUGGCAGGUCCUCCCGUGUUCCUUCACAACCCUGCCAGCCUUGUCCACCGGCCUCAUCCACCUCCACCAGAACAUUGUGGACGUGCAGUACUUGUACGGGGUGGGGUCAAGCAUCGCGUCCUGGGCCAUUAAGUGGGAGUACGUCGUUCUCCUGUUCCUUCUGCUUGCAGACGCGCGCGUCUGCUCCUGCUUGUGGAUGAUGCUACUCAUAUCCCAAGCGGAGGCG [서열번호 13]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 13에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 11의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 14로 제공된다:
ATGGAAACCCACGTGACAGGCGGATCTGCCGGCCATACAGTGTCCGGCTTTGTGTCTCTTCTGGCCCCTGGCGCCAAGCAGAATGTGCAGCTGATCAACACCAACGGCAGCTGGCACCTGAACAGCACAGCCCTGAACTGCAACGACAGCCTGAATACCGGATGGCTGGCCGGCCTGTTCTACCACCACAAGTTCAATAGCAGCGGCTGCCCCGAGAGACTGGCCTCTTGTAGACCTCTGACCGACTTCGATCAAGGCTGGGGCCCTATCAGCTACGCCAATGGCTCTGGACCTGACCAGAGGCCTTACTGCTGGCACTACCCTCCAAAGCCTTGCGGAATCGTGCCTGCCAAGTCTGTGTGTGGCCCCGTGTACTGCTTCACCCCATCTCCAGTGGTCGTGGGCACCACCGATAGATCTGGCGCCCCAACATATAGCTGGGGCGAGAACGACACCGACGTGTTCGTGCTGAACAACACCCGGCCTCCACTCGGAAATTGGTTCGGCTGCACCTGGATGAACTCCACCGGCTTCACAAAAGTGTGCGGAGCCCCTCCTTGTGTGATTGGCGGAGCCGGAAACAATACCCTGCACTGCCCTACCGACTGCTTCAGAAAGCACCCCGACGCCACCTACAGCAGATGTGGATCTGGCCCTTGGATCACCCCTAGATGCCTGGTGGACTACCCCTACCGGCTGTGGCACTATCCCTGCACCATCAACTACACCATCTTCAAGATCCGTATGTACGTCGGCGGCGTGGAACACAGACTGGAAGCCGCCTGTAACTGGACCAGGGGCGAGAGATGCGACCTGGAAGATAGAGACAGAAGCGAGCTGAGCCCTCTGCTGCTGACCACCACACAGTGGCAGGTCCTGCCTTGCAGCTTCACCACACTGCCTGCTCTGAGCACCGGCCTGATTCATCTGCACCAGAACATCGTGGACGTGCAGTACCTGTACGGCGTGGGAAGCTCTATTGCCAGCTGGGCCATCAAGTGGGAGTACGTGGTGCTGCTGTTCCTGCTGCTGGCCGATGCCAGAGTGTGTAGCTGCCTGTGGATGATGCTGCTGATCTCTCAGGCCGAGGCCTGA [서열번호 14]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 14에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 14의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 15로 제공된다:
AUGGAAACCCACGUGACAGGCGGAUCUGCCGGCCAUACAGUGUCCGGCUUUGUGUCUCUUCUGGCCCCUGGCGCCAAGCAGAAUGUGCAGCUGAUCAACACCAACGGCAGCUGGCACCUGAACAGCACAGCCCUGAACUGCAACGACAGCCUGAAUACCGGAUGGCUGGCCGGCCUGUUCUACCACCACAAGUUCAAUAGCAGCGGCUGCCCCGAGAGACUGGCCUCUUGUAGACCUCUGACCGACUUCGAUCAAGGCUGGGGCCCUAUCAGCUACGCCAAUGGCUCUGGACCUGACCAGAGGCCUUACUGCUGGCACUACCCUCCAAAGCCUUGCGGAAUCGUGCCUGCCAAGUCUGUGUGUGGCCCCGUGUACUGCUUCACCCCAUCUCCAGUGGUCGUGGGCACCACCGAUAGAUCUGGCGCCCCAACAUAUAGCUGGGGCGAGAACGACACCGACGUGUUCGUGCUGAACAACACCCGGCCUCCACUCGGAAAUUGGUUCGGCUGCACCUGGAUGAACUCCACCGGCUUCACAAAAGUGUGCGGAGCCCCUCCUUGUGUGAUUGGCGGAGCCGGAAACAAUACCCUGCACUGCCCUACCGACUGCUUCAGAAAGCACCCCGACGCCACCUACAGCAGAUGUGGAUCUGGCCCUUGGAUCACCCCUAGAUGCCUGGUGGACUACCCCUACCGGCUGUGGCACUAUCCCUGCACCAUCAACUACACCAUCUUCAAGAUCCGUAUGUACGUCGGCGGCGUGGAACACAGACUGGAAGCCGCCUGUAACUGGACCAGGGGCGAGAGAUGCGACCUGGAAGAUAGAGACAGAAGCGAGCUGAGCCCUCUGCUGCUGACCACCACACAGUGGCAGGUCCUGCCUUGCAGCUUCACCACACUGCCUGCUCUGAGCACCGGCCUGAUUCAUCUGCACCAGAACAUCGUGGACGUGCAGUACCUGUACGGCGUGGGAAGCUCUAUUGCCAGCUGGGCCAUCAAGUGGGAGUACGUGGUGCUGCUGUUCCUGCUGCUGGCCGAUGCCAGAGUGUGUAGCUGCCUGUGGAUGAUGCUGCUGAUCUCUCAGGCCGAGGCCUGA [서열번호 15]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 15에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 may be HCV NS5a(C형 간염 바이러스 NS5a; 단리물(isolate) H - 게놈 RNA 번역: AAA45534.1; UniProtKB - P27958(POLG_HCV77)), 또는 그의 동원체일 수 있다. 상기 HCV NS5a 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 16으로 나타낸다:
MSGSWLRDIWDWICEVLSDFKTWLKAKLMPQLPGIPFVSCQRGYRGVWRGDGIMHTRCHCGAEITGHVKNGTMRIVGPRTCKNMWSGTFFINAYTTGPCTPLPAPNYKFALWRVSAEEYVEIRRVGDFHYVSGMTTDNLKCPCQIPSPEFFTELDGVRLHRFAPPCKPLLREEVSFRVGLHEYPVGSQLPCEPEPDVAVLTSMLTDPSHITAEAAGRRLARGSPPSMASSSASQLSAPSLKATCTANHDSPDAELIEANLLWRQEMGGNITRVESENKVVILDSFDPLVAEEDEREVSVPAEILRKSRRFAPALPVWARPDYNPLLVETWKKPDYEPPVVHGCPLPPPRSPPVPPPRKKRTVVLTESTLPTALAELATKSFGSSSTSGITGDNTTTSSEPAPSGCPPDSDVESYSSMPPLEGEPGDPDLSDGSWSTVSSGADTEDVVCC [서열번호 16]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 16에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HCV NS5a 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 17의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGTCCGGTTCCTGGCTAAGGGACATCTGGGACTGGATATGCGAGGTGCTGAGCGACTTTAAGACCTGGCTGAAAGCCAAGCTCATGCCACAACTGCCTGGGATTCCCTTTGTGTCCTGCCAGCGCGGGTATAGGGGGGTCTGGCGAGGAGACGGCATTATGCACACTCGCTGCCACTGTGGAGCTGAGATCACTGGACATGTCAAAAACGGGACGATGAGGATCGTCGGTCCTAGGACCTGCAAGAACATGTGGAGTGGGACGTTCTTCATTAATGCCTACACCACGGGCCCCTGTACTCCCCTTCCTGCGCCGAACTATAAGTTCGCGCTGTGGAGGGTGTCTGCAGAGGAATACGTGGAGATAAGGCGGGTGGGGGACTTCCACTACGTATCGGGCATGACTACTGACAATCTCAAATGCCCGTGCCAGATCCCATCGCCCGAATTTTTCACAGAATTGGACGGGGTGCGCCTACATAGGTTTGCGCCCCCTTGCAAGCCCTTGCTGCGGGAGGAGGTATCATTCAGAGTAGGACTCCACGAGTACCCGGTGGGGTCGCAATTACCTTGCGAGCCCGAACCGGACGTAGCCGTGTTGACGTCCATGCTCACTGATCCCTCCCATATAACAGCAGAGGCGGCCGGGAGAAGGTTGGCGAGAGGGTCACCCCCTTCTATGGCCAGCTCCTCGGCTAGCCAGCTGTCCGCTCCATCTCTCAAGGCAACTTGCACCGCCAACCATGACTCCCCTGACGCCGAGCTCATAGAGGCTAACCTCCTGTGGAGGCAGGAGATGGGCGGCAACATCACCAGGGTTGAGTCAGAGAACAAAGTGGTGATTCTGGACTCCTTCGATCCGCTTGTGGCAGAGGAGGATGAGCGGGAGGTCTCCGTACCCGCAGAAATTCTGCGGAAGTCTCGGAGATTCGCCCCAGCCCTGCCCGTCTGGGCGCGGCCGGACTACAACCCCCTGCTAGTAGAGACGTGGAAAAAGCCTGACTACGAACCACCTGTGGTCCATGGCTGCCCGCTACCACCTCCACGGTCCCCTCCTGTGCCTCCGCCTCGGAAAAAGCGTACGGTGGTCCTCACCGAATCAACCCTACCTACTGCCTTGGCCGAGCTTGCCACCAAAAGTTTTGGCAGCTCCTCAACTTCCGGCATTACGGGCGACAATACGACAACATCCTCTGAGCCCGCCCCTTCTGGCTGCCCCCCCGACTCCGACGTTGAGTCCTATTCTTCCATGCCCCCCCTGGAGGGGGAGCCTGGGGATCCGGATCTCAGCGACGGGTCATGGTCGACGGTCAGTAGTGGGGCCGACACGGAAGATGTCGTGTGCTGC [서열번호 17]
따라서, 바람직하게는 상기 HCV NS5a 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 17에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 18의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGUCCGGUUCCUGGCUAAGGGACAUCUGGGACUGGAUAUGCGAGGUGCUGAGCGACUUUAAGACCUGGCUGAAAGCCAAGCUCAUGCCACAACUGCCUGGGAUUCCCUUUGUGUCCUGCCAGCGCGGGUAUAGGGGGGUCUGGCGAGGAGACGGCAUUAUGCACACUCGCUGCCACUGUGGAGCUGAGAUCACUGGACAUGUCAAAAACGGGACGAUGAGGAUCGUCGGUCCUAGGACCUGCAAGAACAUGUGGAGUGGGACGUUCUUCAUUAAUGCCUACACCACGGGCCCCUGUACUCCCCUUCCUGCGCCGAACUAUAAGUUCGCGCUGUGGAGGGUGUCUGCAGAGGAAUACGUGGAGAUAAGGCGGGUGGGGGACUUCCACUACGUAUCGGGCAUGACUACUGACAAUCUCAAAUGCCCGUGCCAGAUCCCAUCGCCCGAAUUUUUCACAGAAUUGGACGGGGUGCGCCUACAUAGGUUUGCGCCCCCUUGCAAGCCCUUGCUGCGGGAGGAGGUAUCAUUCAGAGUAGGACUCCACGAGUACCCGGUGGGGUCGCAAUUACCUUGCGAGCCCGAACCGGACGUAGCCGUGUUGACGUCCAUGCUCACUGAUCCCUCCCAUAUAACAGCAGAGGCGGCCGGGAGAAGGUUGGCGAGAGGGUCACCCCCUUCUAUGGCCAGCUCCUCGGCUAGCCAGCUGUCCGCUCCAUCUCUCAAGGCAACUUGCACCGCCAACCAUGACUCCCCUGACGCCGAGCUCAUAGAGGCUAACCUCCUGUGGAGGCAGGAGAUGGGCGGCAACAUCACCAGGGUUGAGUCAGAGAACAAAGUGGUGAUUCUGGACUCCUUCGAUCCGCUUGUGGCAGAGGAGGAUGAGCGGGAGGUCUCCGUACCCGCAGAAAUUCUGCGGAAGUCUCGGAGAUUCGCCCCAGCCCUGCCCGUCUGGGCGCGGCCGGACUACAACCCCCUGCUAGUAGAGACGUGGAAAAAGCCUGACUACGAACCACCUGUGGUCCAUGGCUGCCCGCUACCACCUCCACGGUCCCCUCCUGUGCCUCCGCCUCGGAAAAAGCGUACGGUGGUCCUCACCGAAUCAACCCUACCUACUGCCUUGGCCGAGCUUGCCACCAAAAGUUUUGGCAGCUCCUCAACUUCCGGCAUUACGGGCGACAAUACGACAACAUCCUCUGAGCCCGCCCCUUCUGGCUGCCCCCCCGACUCCGACGUUGAGUCCUAUUCUUCCAUGCCCCCCCUGGAGGGGGAGCCUGGGGAUCCGGAUCUCAGCGACGGGUCAUGGUCGACGGUCAGUAGUGGGGCCGACACGGAAGAUGUCGUGUGCUGC [서열번호 18]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 18에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 16의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 19로 제공된다:
ATGTCTGGCAGCTGGCTGAGAGACATCTGGGACTGGATTTGCGAGGTGCTGAGCGACTTCAAGACCTGGCTGAAGGCCAAGCTGATGCCTCAGCTGCCTGGCATCCCTTTCGTGTCCTGTCAGAGGGGCTATAGAGGCGTTTGGAGAGGCGACGGCATCATGCACACCAGATGTCACTGTGGCGCCGAGATCACAGGCCACGTGAAGAACGGCACCATGAGAATCGTGGGCCCCAGAACCTGCAAGAATATGTGGAGCGGCACCTTCTTCATCAACGCCTACACCACCGGACCTTGCACACCTCTGCCTGCTCCTAACTACAAGTTCGCCCTGTGGCGGGTGTCCGCCGAGGAATACGTGGAAATCAGAAGAGTGGGCGACTTCCACTACGTGTCCGGCATGACCACCGACAACCTGAAGTGCCCCTGTCAGATCCCATCTCCTGAGTTCTTCACCGAGCTGGATGGCGTGCGGCTGCACAGATTTGCCCCTCCATGTAAACCCCTGCTGAGAGAAGAGGTGTCCTTTAGAGTGGGCCTGCACGAGTACCCTGTGGGTTCTCAGCTCCCTTGCGAGCCTGAACCTGATGTGGCCGTGCTGACCTCCATGCTGACAGACCCTTCTCACATCACAGCCGAGGCCGCTGGAAGAAGGCTGGCTAGAGGATCTCCTCCTAGCATGGCCTCTAGCAGCGCCTCTCAACTGTCTGCCCCAAGCCTGAAAGCCACCTGTACCGCCAATCACGACAGCCCTGATGCCGAGCTGATCGAGGCTAACCTGCTGTGGCGGCAAGAGATGGGCGGCAACATCACCAGAGTGGAAAGCGAGAACAAGGTGGTCATCCTGGATAGCTTCGACCCTCTGGTGGCCGAAGAGGACGAGAGGGAAGTGTCTGTGCCTGCCGAGATCCTGAGAAAGAGCAGAAGATTCGCCCCTGCTCTGCCCGTGTGGGCCAGACCTGATTACAATCCCCTGCTGGTGGAAACATGGAAGAAGCCCGACTACGAGCCTCCTGTGGTGCACGGATGTCCACTGCCTCCACCTAGATCTCCACCTGTGCCACCTCCACGGAAGAAAAGAACCGTGGTGCTGACCGAGAGCACCCTGCCTACAGCTCTGGCTGAGCTGGCCACAAAGAGCTTTGGCAGCAGCAGCACCTCTGGCATCACCGGCGATAATACCACCACCAGCTCTGAGCCTGCTCCAAGCGGATGTCCTCCTGACTCCGACGTGGAAAGCTACAGCAGCATGCCTCCTCTGGAAGGCGAACCCGGCGATCCTGATCTGTCTGATGGCTCTTGGAGCACCGTGTCCTCTGGCGCCGATACAGAGGATGTCGTGTGCTGCTGA [서열번호 19]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 19에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 19의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 20으로 제공된다:
AUGUCUGGCAGCUGGCUGAGAGACAUCUGGGACUGGAUUUGCGAGGUGCUGAGCGACUUCAAGACCUGGCUGAAGGCCAAGCUGAUGCCUCAGCUGCCUGGCAUCCCUUUCGUGUCCUGUCAGAGGGGCUAUAGAGGCGUUUGGAGAGGCGACGGCAUCAUGCACACCAGAUGUCACUGUGGCGCCGAGAUCACAGGCCACGUGAAGAACGGCACCAUGAGAAUCGUGGGCCCCAGAACCUGCAAGAAUAUGUGGAGCGGCACCUUCUUCAUCAACGCCUACACCACCGGACCUUGCACACCUCUGCCUGCUCCUAACUACAAGUUCGCCCUGUGGCGGGUGUCCGCCGAGGAAUACGUGGAAAUCAGAAGAGUGGGCGACUUCCACUACGUGUCCGGCAUGACCACCGACAACCUGAAGUGCCCCUGUCAGAUCCCAUCUCCUGAGUUCUUCACCGAGCUGGAUGGCGUGCGGCUGCACAGAUUUGCCCCUCCAUGUAAACCCCUGCUGAGAGAAGAGGUGUCCUUUAGAGUGGGCCUGCACGAGUACCCUGUGGGUUCUCAGCUCCCUUGCGAGCCUGAACCUGAUGUGGCCGUGCUGACCUCCAUGCUGACAGACCCUUCUCACAUCACAGCCGAGGCCGCUGGAAGAAGGCUGGCUAGAGGAUCUCCUCCUAGCAUGGCCUCUAGCAGCGCCUCUCAACUGUCUGCCCCAAGCCUGAAAGCCACCUGUACCGCCAAUCACGACAGCCCUGAUGCCGAGCUGAUCGAGGCUAACCUGCUGUGGCGGCAAGAGAUGGGCGGCAACAUCACCAGAGUGGAAAGCGAGAACAAGGUGGUCAUCCUGGAUAGCUUCGACCCUCUGGUGGCCGAAGAGGACGAGAGGGAAGUGUCUGUGCCUGCCGAGAUCCUGAGAAAGAGCAGAAGAUUCGCCCCUGCUCUGCCCGUGUGGGCCAGACCUGAUUACAAUCCCCUGCUGGUGGAAACAUGGAAGAAGCCCGACUACGAGCCUCCUGUGGUGCACGGAUGUCCACUGCCUCCACCUAGAUCUCCACCUGUGCCACCUCCACGGAAGAAAAGAACCGUGGUGCUGACCGAGAGCACCCUGCCUACAGCUCUGGCUGAGCUGGCCACAAAGAGCUUUGGCAGCAGCAGCACCUCUGGCAUCACCGGCGAUAAUACCACCACCAGCUCUGAGCCUGCUCCAAGCGGAUGUCCUCCUGACUCCGACGUGGAAAGCUACAGCAGCAUGCCUCCUCUGGAAGGCGAACCCGGCGAUCCUGAUCUGUCUGAUGGCUCUUGGAGCACCGUGUCCUCUGGCGCCGAUACAGAGGAUGUCGUGUGCUGCUGA [서열번호 20]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 20에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 VACV E3L(백시니아 바이러스 E3L; AEY72868.1; 접근 번호 - 게놈 DNA 번역: AEY72868.1; UniProtKB - H2DSW3(H2DSW3_9POXV)), 또는 그의 동원체일 수 있다. VACV E3L은 PKR 및 IRF3 및 7의 억제를 통해 선천적 감지 시스템을 억제할 것이다. [Perdiuero B, Esteban M (2009) The interferon system and vaccinia virus evasion mechanisms. J Interferon Cytokine Res, 29, 9, 581-198].
상기 VACV E3L 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 21로 나타낸다:
MSKIYIDERSDAEIVCAAIKNIGIEGATAAQLTRQLNMEKREVNKALYDLQRSAMVYSSDDIPPRWFMTTEADKPDADAMADVIIDDVSREKSMREDHKSFDDVIPAKKIIDWKDANPVTIINEYCQITKRDWSFRIESVGPSNSPTFYACVDIDGRVFDKADGKSKRDAKNNAAKLAVDKLLGYVIIRF [서열번호 21]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 21에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 VACV E3L 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 22의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGTCTAAGATCTATATCGACGAGCGTTCTGACGCAGAGATTGTGTGTGCGGCTATTAAAAACATTGGAATCGAAGGAGCTACTGCTGCACAACTAACTAGACAACTTAATATGGAGAAGCGAGAAGTTAATAAAGCTCTGTACGATCTTCAACGTAGTGCTATGGTGTACAGCTCCGACGATATTCCTCCTCGTTGGTTTATGACAACGGAGGCGGATAAGCCGGATGCTGATGCTATGGCTGACGTCATAATAGATGATGTATCCCGCGAAAAATCAATGAGAGAGGATCATAAGTCTTTTGATGATGTTATTCCGGCTAAAAAAATTATTGATTGGAAAGATGCTAACCCTGTCACCATTATTAATGAGTACTGCCAAATAACTAAGAGAGATTGGTCTTTTCGTATTGAATCAGTTGGGCCTAGTAACTCTCCTACATTTTATGCCTGTGTAGATATCGACGGAAGAGTATTCGATAAGGCCGATGGAAAATCTAAACGAGATGCTAAAAATAATGCAGCTAAATTGGCTGTAGATAAACTTCTTGGGTACGTCATCATTAGATTC [서열번호 22]
따라서, 바람직하게는 상기 VACV E3L 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 22에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 23의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGUCUAAGAUCUAUAUCGACGAGCGUUCUGACGCAGAGAUUGUGUGUGCGGCUAUUAAAAACAUUGGAAUCGAAGGAGCUACUGCUGCACAACUAACUAGACAACUUAAUAUGGAGAAGCGAGAAGUUAAUAAAGCUCUGUACGAUCUUCAACGUAGUGCUAUGGUGUACAGCUCCGACGAUAUUCCUCCUCGUUGGUUUAUGACAACGGAGGCGGAUAAGCCGGAUGCUGAUGCUAUGGCUGACGUCAUAAUAGAUGAUGUAUCCCGCGAAAAAUCAAUGAGAGAGGAUCAUAAGUCUUUUGAUGAUGUUAUUCCGGCUAAAAAAAUUAUUGAUUGGAAAGAUGCUAACCCUGUCACCAUUAUUAAUGAGUACUGCCAAAUAACUAAGAGAGAUUGGUCUUUUCGUAUUGAAUCAGUUGGGCCUAGUAACUCUCCUACAUUUUAUGCCUGUGUAGAUAUCGACGGAAGAGUAUUCGAUAAGGCCGAUGGAAAAUCUAAACGAGAUGCUAAAAAUAAUGCAGCUAAAUUGGCUGUAGAUAAACUUCUUGGGUACGUCAUCAUUAGAUUC [서열번호 23]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 23에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 21의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 24로 제공된다:
ATGAGCAAGATCTACATCGACGAGCGGAGCGACGCCGAGATTGTGTGTGCCGCCATCAAGAACATCGGCATCGAAGGCGCTACAGCCGCTCAGCTGACCAGACAGCTGAACATGGAAAAGCGGGAAGTGAACAAGGCCCTGTACGACCTGCAGAGAAGCGCCATGGTGTACAGCAGCGACGACATCCCTCCTCGGTGGTTTATGACCACAGAGGCCGACAAGCCCGACGCCGATGCTATGGCCGATGTGATCATCGACGACGTGTCCCGCGAGAAGTCCATGAGAGAGGACCACAAGAGCTTCGATGACGTGATCCCCGCCAAGAAGATCATCGATTGGAAGGACGCCAATCCTGTGACCATCATCAACGAGTACTGCCAGATCACCAAGCGCGACTGGTCCTTCAGAATCGAGAGCGTGGGCCCCAGCAACAGCCCTACCTTTTATGCCTGCGTGGACATCGACGGCCGGGTGTTCGATAAGGCCGATGGCAAGAGCAAGCGGGACGCCAAAAACAACGCCGCCAAACTGGCCGTGGATAAGCTGCTGGGCTACGTGATCATCCGGTTCTGA [서열번호 24]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 24에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 24의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 25로 제공된다:
AUGAGCAAGAUCUACAUCGACGAGCGGAGCGACGCCGAGAUUGUGUGUGCCGCCAUCAAGAACAUCGGCAUCGAAGGCGCUACAGCCGCUCAGCUGACCAGACAGCUGAACAUGGAAAAGCGGGAAGUGAACAAGGCCCUGUACGACCUGCAGAGAAGCGCCAUGGUGUACAGCAGCGACGACAUCCCUCCUCGGUGGUUUAUGACCACAGAGGCCGACAAGCCCGACGCCGAUGCUAUGGCCGAUGUGAUCAUCGACGACGUGUCCCGCGAGAAGUCCAUGAGAGAGGACCACAAGAGCUUCGAUGACGUGAUCCCCGCCAAGAAGAUCAUCGAUUGGAAGGACGCCAAUCCUGUGACCAUCAUCAACGAGUACUGCCAGAUCACCAAGCGCGACUGGUCCUUCAGAAUCGAGAGCGUGGGCCCCAGCAACAGCCCUACCUUUUAUGCCUGCGUGGACAUCGACGGCCGGGUGUUCGAUAAGGCCGAUGGCAAGAGCAAGCGGGACGCCAAAAACAACGCCGCCAAACUGGCCGUGGAUAAGCUGCUGGGCUACGUGAUCAUCCGGUUCUGA [서열번호 25]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 25에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 VACV K3L(백시니아 바이러스 K3L; P20639.1; 접근 번호 - 게놈 DNA 번역: AAA48009.1; UniProtKB - P20639(K3_VACCC)), 또는 그의 동원체일 수 있다. VACV K3L은 PKR을 억제한다. [Perdiuero B, Esteban M (2009) The interferon system and vaccinia virus evasion mechanisms. J Interferon Cytokine Res, 29, 9, 581-198]. 상기 VACV K3L 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 26으로 나타낸다:
MLAFCYSLPNAGDVIKGRVYEKDYALYIYLFDYPHSEAILAESVKMHMDRYVEYRDKLVGKTVKVKVIRVDYTKGYIDVNYKRMCRHQ [서열번호 26]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 26에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 VACV K3L 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 27의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGCTTGCATTTTGTTATTCGTTGCCCAATGCGGGCGATGTAATAAAGGGCAGAGTATACGAGAAGGATTATGCTCTATACATTTATCTTTTTGACTATCCTCACTCTGAAGCTATCTTGGCAGAGAGTGTTAAGATGCATATGGATAGATATGTTGAATATAGGGATAAACTGGTAGGGAAAACTGTAAAAGTTAAAGTGATTAGAGTTGATTATACAAAAGGATATATAGATGTCAATTACAAAAGGATGTGTAGACATCAA [서열번호 27]
따라서, 바람직하게는 상기 VACV K3L 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 27에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 28의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGCUUGCAUUUUGUUAUUCGUUGCCCAAUGCGGGCGAUGUAAUAAAGGGCAGAGUAUACGAGAAGGAUUAUGCUCUAUACAUUUAUCUUUUUGACUAUCCUCACUCUGAAGCUAUCUUGGCAGAGAGUGUUAAGAUGCAUAUGGAUAGAUAUGUUGAAUAUAGGGAUAAACUGGUAGGGAAAACUGUAAAAGUUAAAGUGAUUAGAGUUGAUUAUACAAAAGGAUAUAUAGAUGUCAAUUACAAAAGGAUGUGUAGACAUCAA [서열번호 28]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 28에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 26의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 29로 제공된다:
ATGCTGGCCTTCTGCTACAGCCTGCCTAATGCCGGCGACGTGATCAAGGGCAGAGTGTACGAGAAGGACTACGCCCTGTACATCTACCTGTTCGACTACCCTCACAGCGAGGCCATCCTGGCCGAGTCTGTGAAGATGCACATGGACAGATACGTGGAATACCGGGACAAGCTCGTGGGCAAGACCGTGAAAGTGAAAGTCATCAGAGTGGACTACACCAAGGGCTACATCGACGTGAACTACAAGCGGATGTGCAGGCACCAGTGA [서열번호 29]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 29에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 29의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 30으로 제공된다:
AUGCUGGCCUUCUGCUACAGCCUGCCUAAUGCCGGCGACGUGAUCAAGGGCAGAGUGUACGAGAAGGACUACGCCCUGUACAUCUACCUGUUCGACUACCCUCACAGCGAGGCCAUCCUGGCCGAGUCUGUGAAGAUGCACAUGGACAGAUACGUGGAAUACCGGGACAAGCUCGUGGGCAAGACCGUGAAAGUGAAAGUCAUCAGAGUGGACUACACCAAGGGCUACAUCGACGUGAACUACAAGCGGAUGUGCAGGCACCAGUGA [서열번호 30]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 30에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 백시니아 C6(VACV C6 - 백시니아 바이러스 C6; 접근 번호 - 게놈 DNA 번역: AAA69602.1; UniProtKB - P17362(C6_VACCW)), 또는 그의 동원체일 수 있다. 상기 단백질은 인터페론 알파 및 베타의 유도를 위해 핵심적인 전사 인자인 인터페론 조절 인자 3/IRF3 및 7/IRF7의 바이러스-유도성 인산화 및 활성화를 차단함으로써 세포의 항-바이러스 상태의 확립을 방지하는 것으로 여겨진다. 상기 차단은 숙주의 TBK1 어댑터(adapter) 단백질 TBKBP1 및 AZI2에 결합하고, 이로 인해 IRF3 및 IRF7의 인산화 및 활성화의 강한 억제를 생성함으로써, 숙주 TBK1의 억제를 통해 생성될 수 있다. 이것은 또한 숙주 STAT2와 상호작용함으로써 타입 I IFN에 대한 세포 반응의 억제제로서 작용할 수 있다. 기계론적으로, 이것은 인터페론 자극 반응 요소에 대한 숙주 ISGF3 복합체(STAT1, STAT2 및 IRF9로 구성됨) 결합 후에 그 억제 효과를 추가로 발휘할 수 있다. [Smith GL. Vaccinia Virus Protein C6: A Multifunctional Interferon Antagonist. Adv Exp Med Biol. 2018; 1052:1-7. doi: 10.1007/978-981-10-7572-8_1. PMID: 29785476]. 상기 백시니아 C6 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 31로 나타낸다:
MNAYNKADSFSLESDSIKDVIHDYICWLSMTDEMRPSIGNVFKAMETFKIDAVRYYDGNIYELAKDINAMSFDGFIRSLQTIASKKDKLTVYGTMGLLSIVVDINKGCDISNIKFAAGIIILMEYIFDDTDMSHLKVALYRRIQRRDDVDR [서열번호 31]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 31에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 백시니아 C6 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 32의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGAATGCGTATAATAAAGCCGATTCGTTTTCTTTAGAGTCTGATTCTATCAAAGATGTTATACACGATTATATTTGTTGGCTCAGTATGACTGATGAAATGAGACCATCTATCGGAAACGTCTTTAAAGCGATGGAAACGTTTAAGATAGACGCGGTTAGATATTACGATGGTAACATATATGAATTAGCTAAAGATATAAATGCGATGTCGTTTGACGGTTTTATAAGATCTCTACAAACTATCGCTTCAAAGAAAGATAAACTCACTGTTTATGGAACCATGGGACTGCTGTCTATTGTCGTAGATATTAACAAAGGTTGTGATATATCCAATATCAAGTTCGCTGCCGGAATAATCATTTTAATGGAGTATATTTTTGATGACACGGATATGTCTCATCTTAAAGTAGCACTCTATCGTAGAATACAGAGACGTGATGATGTAGATAGA [서열번호 32]
따라서, 바람직하게는 상기 백시니아 C6 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 32에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 33의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGAAUGCGUAUAAUAAAGCCGAUUCGUUUUCUUUAGAGUCUGAUUCUAUCAAAGAUGUUAUACACGAUUAUAUUUGUUGGCUCAGUAUGACUGAUGAAAUGAGACCAUCUAUCGGAAACGUCUUUAAAGCGAUGGAAACGUUUAAGAUAGACGCGGUUAGAUAUUACGAUGGUAACAUAUAUGAAUUAGCUAAAGAUAUAAAUGCGAUGUCGUUUGACGGUUUUAUAAGAUCUCUACAAACUAUCGCUUCAAAGAAAGAUAAACUCACUGUUUAUGGAACCAUGGGACUGCUGUCUAUUGUCGUAGAUAUUAACAAAGGUUGUGAUAUAUCCAAUAUCAAGUUCGCUGCCGGAAUAAUCAUUUUAAUGGAGUAUAUUUUUGAUGACACGGAUAUGUCUCAUCUUAAAGUAGCACUCUAUCGUAGAAUACAGAGACGUGAUGAUGUAGAUAGA [서열번호 33]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 33에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 31의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 34로 제공된다:
ATGAACGCCTACAACAAGGCCGACAGCTTCAGCCTGGAAAGCGACAGCATCAAGGACGTGATCCACGACTACATCTGCTGGCTGAGCATGACCGACGAGATGAGGCCCAGCATCGGCAACGTGTTCAAGGCCATGGAAACCTTCAAGATCGACGCCGTGCGGTACTACGACGGCAACATCTATGAGCTGGCCAAGGACATCAACGCCATGAGCTTCGACGGCTTCATCAGAAGCCTGCAGACAATCGCCAGCAAGAAAGACAAGCTGACCGTGTACGGCACCATGGGCCTGCTGTCTATCGTGGTGGATATCAACAAGGGCTGCGACATCAGCAACATCAAGTTCGCCGCTGGCATCATCATCCTGATGGAGTACATCTTCGACGACACCGACATGAGCCACCTGAAGGTGGCCCTGTACAGAAGAATCCAGCGGAGGGACGACGTGGACAGATGA [서열번호 34]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 34에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 34의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 35로 제공된다:
AUGAACGCCUACAACAAGGCCGACAGCUUCAGCCUGGAAAGCGACAGCAUCAAGGACGUGAUCCACGACUACAUCUGCUGGCUGAGCAUGACCGACGAGAUGAGGCCCAGCAUCGGCAACGUGUUCAAGGCCAUGGAAACCUUCAAGAUCGACGCCGUGCGGUACUACGACGGCAACAUCUAUGAGCUGGCCAAGGACAUCAACGCCAUGAGCUUCGACGGCUUCAUCAGAAGCCUGCAGACAAUCGCCAGCAAGAAAGACAAGCUGACCGUGUACGGCACCAUGGGCCUGCUGUCUAUCGUGGUGGAUAUCAACAAGGGCUGCGACAUCAGCAACAUCAAGUUCGCCGCUGGCAUCAUCAUCCUGAUGGAGUACAUCUUCGACGACACCGACAUGAGCCACCUGAAGGUGGCCCUGUACAGAAGAAUCCAGCGGAGGGACGACGUGGACAGAUGA [서열번호 35]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 35에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 MERS ORF8b(중동 호흡기 증후군 바이러스 ORF8b; 접근 번호 - 진뱅크(GenBank): ANF29170.1; UniProtKB - A0A1W5LGP6(A0A1W5LGP6_MERS)), 또는 그의 동원체일 수 있다. MERS ORF8b는 MDA5-매개 NF-κB 활성화 및 IRF3 활성화의 길항제(antagonist)인 것으로 여겨진다. [Lee J-Y, Bae S, Myoung J (2019) Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus-Encoded Accessory Proteins Impair MDA5-and TBK1-Mediated Activation of NF-κB. J Microbiol Biotechnol, 29, 8,1316-1323 doi: 10.4014/jmb.1908.08004]; [Wong, L-yR, Ye ZW, Lui P-Y, Zheng X, Yuan S, Zhu L, Fung S-Y et al. (2020) Middle East respiratory syndrome coronavirus ORF8b accessory protein suppresses type I IFN expression by impeding HSP70-dependent activation of IRF3 kinase IKK€. J Immunol, 205, 6, 1564-1579].
상기 MERS ORF8b 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 36으로 나타낸다:
MPIPPLRKMLGIGGDRTEKLIPGMELSNWLPGGTSTTLELDPKQHSHSGLLRMASFGSMKMAPLMLLQLLGRGTLTMIQLLLHNSRPVLSFLKTSTLRGLEAIVNHLQEPLAQAETLPDLVHKVQDQETLPAALLQVHLESEQ [서열번호 36]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 36에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 MERS ORF8b 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 37의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGCCAATTCCACCCCTGCGCAAAATGCTGGGTATTGGCGGAGACAGGACAGAAAAATTAATACCGGGAATGGAATTAAGCAACTGGCTCCCAGGTGGTACTTCTACTACACTGGAACTGGACCCGAAGCAGCACTCCCATTCCGGGCTGTTAAGGATGGCATCGTTTGGGTCCATGAAGATGGCGCCACTGATGCTCCTTCAACTTTTGGGACGCGGAACCCTAACAATGATTCAGCTATTGTTACACAATTCGCGCCCGGTACTAAGCTTCCTAAAAACTTCCACATTGAGGGGACTGGAGGCAATAGTCAATCATCTTCAAGAGCCTCTAGCGCAAGCAGAAACTCTTCCAGATCTAGTTCACAAGGTTCAAGATCAGGAAACTCTACCCGCGGCACTTCTCCAGGTCCATCTGGAATCGGAGCAG [서열번호 37]
따라서, 바람직하게는 상기 MERS ORF8b 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 37에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 38의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGCCAAUUCCACCCCUGCGCAAAAUGCUGGGUAUUGGCGGAGACAGGACAGAAAAAUUAAUACCGGGAAUGGAAUUAAGCAACUGGCUCCCAGGUGGUACUUCUACUACACUGGAACUGGACCCGAAGCAGCACUCCCAUUCCGGGCUGUUAAGGAUGGCAUCGUUUGGGUCCAUGAAGAUGGCGCCACUGAUGCUCCUUCAACUUUUGGGACGCGGAACCCUAACAAUGAUUCAGCUAUUGUUACACAAUUCGCGCCCGGUACUAAGCUUCCUAAAAACUUCCACAUUGAGGGGACUGGAGGCAAUAGUCAAUCAUCUUCAAGAGCCUCUAGCGCAAGCAGAAACUCUUCCAGAUCUAGUUCACAAGGUUCAAGAUCAGGAAACUCUACCCGCGGCACUUCUCCAGGUCCAUCUGGAAUCGGAGCAG [서열번호 38]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 38에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 36의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 39로 제공된다:
ATGCCCATTCCTCCACTGAGAAAGATGCTCGGCATCGGCGGCGACAGAACCGAGAAGCTGATCCCTGGCATGGAACTGAGCAACTGGCTGCCTGGCGGCACCAGCACAACACTGGAACTGGATCCTAAGCAGCACAGCCACAGCGGCCTGCTGAGAATGGCCAGCTTTGGCAGCATGAAGATGGCCCCTCTGATGCTGCTGCAGCTGCTCGGAAGAGGCACCCTGACAATGATCCAGCTGCTGCTCCACAACAGCAGACCCGTGCTGAGCTTCCTGAAAACCAGCACACTGAGAGGCCTGGAAGCCATCGTGAACCATCTGCAAGAGCCCCTGGCTCAGGCCGAGACACTGCCTGATCTGGTGCACAAGGTGCAGGACCAAGAAACCCTGCCTGCCGCTCTGCTGCAGGTCCACCTGGAATCTGAGCAGTGA [서열번호 39]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 39에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 39의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 40으로 제공된다:
AUGCCCAUUCCUCCACUGAGAAAGAUGCUCGGCAUCGGCGGCGACAGAACCGAGAAGCUGAUCCCUGGCAUGGAACUGAGCAACUGGCUGCCUGGCGGCACCAGCACAACACUGGAACUGGAUCCUAAGCAGCACAGCCACAGCGGCCUGCUGAGAAUGGCCAGCUUUGGCAGCAUGAAGAUGGCCCCUCUGAUGCUGCUGCAGCUGCUCGGAAGAGGCACCCUGACAAUGAUCCAGCUGCUGCUCCACAACAGCAGACCCGUGCUGAGCUUCCUGAAAACCAGCACACUGAGAGGCCUGGAAGCCAUCGUGAACCAUCUGCAAGAGCCCCUGGCUCAGGCCGAGACACUGCCUGAUCUGGUGCACAAGGUGCAGGACCAAGAAACCCUGCCUGCCGCUCUGCUGCAGGUCCACCUGGAAUCUGAGCAGUGA [서열번호 40]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 40에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 KSHV ORF52(카포시 육종-연관 헤르페스바이러스 ORF52; 접근 번호 - 게놈 DNA 번역: ACY00451.1; UniProtKB - F5HBL8(F5HBL8_HHV8)), 또는 그의 동원체일 수 있다. 카포시 육종-연관 헤르페스바이러스(KSHV)의 ORF52 단백질은 cGAS 효소 활성을 직접 억제하고, 이에 따라 cGAS 및 DNA 모두에 대한 결합에 의해 신호전달 분자 cGAMP의 생성을 방지하는 것으로 여겨진다. [Wu J-J, Li W, Shao Y, Avey D et al. (2015) Inhibition of cGAS DNA Sensing by a Herpesvirus Virion Protein. Cell Host Microbe. 18, 3, 333-344.. doi: 10.1016/j.chom.2015.07.015].
상기 KSHV ORF52 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 41로 나타낸다:
MAAPRGRPKKDLTMEDLTAKISQLTVENRELRKALGSTADPRDRPLTATEKEAQLTATVGALSAAAAKKIEARVRTIFSKVVTQKQVDDALKGLSLRIDVCMSDGGTAKPPPGANNRRRRGASTTRAGVDD [서열번호 41]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 41에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 KSHV ORF52 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 42의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCCGCGCCCAGGGGCAGACCCAAAAAGGACCTTACGATGGAAGACCTAACCGCAAAGATAAGCCAATTGACTGTGGAGAATCGGGAGCTTCGGAAAGCACTGGGATCCACTGCCGATCCGAGAGATCGGCCTCTGACGGCCACCGAGAAGGAAGCGCAGCTTACCGCTACTGTGGGTGCACTGAGTGCGGCGGCCGCTAAGAAAATCGAAGCCAGGGTCAGGACAATATTCAGCAAGGTTGTAACACAAAAGCAAGTGGACGATGCCCTGAAGGGACTTTCGCTTAGAATCGACGTCTGCATGTCAGACGGGGGCACCGCTAAACCGCCTCCTGGTGCCAATAACAGGCGACGAAGAGGAGCCTCGACAACACGGGCGGGGGTTGATGAC [서열번호 42]
따라서, 바람직하게는 상기 KSHV ORF52 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 42에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 43의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGGCCGCGCCCAGGGGCAGACCCAAAAAGGACCUUACGAUGGAAGACCUAACCGCAAAGAUAAGCCAAUUGACUGUGGAGAAUCGGGAGCUUCGGAAAGCACUGGGAUCCACUGCCGAUCCGAGAGAUCGGCCUCUGACGGCCACCGAGAAGGAAGCGCAGCUUACCGCUACUGUGGGUGCACUGAGUGCGGCGGCCGCUAAGAAAAUCGAAGCCAGGGUCAGGACAAUAUUCAGCAAGGUUGUAACACAAAAGCAAGUGGACGAUGCCCUGAAGGGACUUUCGCUUAGAAUCGACGUCUGCAUGUCAGACGGGGGCACCGCUAAACCGCCUCCUGGUGCCAAUAACAGGCGACGAAGAGGAGCCUCGACAACACGGGCGGGGGUUGAUGAC [서열번호 43]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 43에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 41의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 44로 제공된다:
ATGGCTGCTCCTAGAGGCAGACCCAAGAAAGACCTGACCATGGAAGATCTGACCGCCAAGATCAGCCAGCTGACCGTGGAAAACAGAGAGCTGAGAAAGGCCCTGGGCAGCACCGCCGATCCTAGAGATAGACCTCTGACAGCCACCGAGAAAGAGGCCCAGCTGACAGCTACAGTGGGAGCCCTTTCTGCCGCCGCTGCCAAGAAAATTGAAGCCAGAGTGCGGACCATCTTCAGCAAGGTGGTCACCCAGAAACAGGTGGACGATGCCCTGAAGGGCCTGAGCCTGAGAATCGACGTGTGTATGTCTGACGGCGGCACCGCCAAACCTCCACCTGGCGCTAACAACAGAAGAAGAAGAGGCGCCAGCACCACCAGAGCTGGCGTGGACGATTGA [서열번호 44]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 44에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 44의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 45로 제공된다:
AUGGCUGCUCCUAGAGGCAGACCCAAGAAAGACCUGACCAUGGAAGAUCUGACCGCCAAGAUCAGCCAGCUGACCGUGGAAAACAGAGAGCUGAGAAAGGCCCUGGGCAGCACCGCCGAUCCUAGAGAUAGACCUCUGACAGCCACCGAGAAAGAGGCCCAGCUGACAGCUACAGUGGGAGCCCUUUCUGCCGCCGCUGCCAAGAAAAUUGAAGCCAGAGUGCGGACCAUCUUCAGCAAGGUGGUCACCCAGAAACAGGUGGACGAUGCCCUGAAGGGCCUGAGCCUGAGAAUCGACGUGUGUAUGUCUGACGGCGGCACCGCCAAACCUCCACCUGGCGCUAACAACAGAAGAAGAAGAGGCGCCAGCACCACCAGAGCUGGCGUGGACGAUUGA [서열번호 45]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 45에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 에볼라 VP35(EBOV VP35; NP_066244.1; 접근 번호 - NCBI 참조 서열: NC_002549.1; UniProtKB - Q05127(VP35_EBOZM)), 또는 그의 동원체일 수 있다. 에볼라 바이러스 VP35 단백질은 (선천적 신호전달 캐스케이드에 대한 다른 효과들 중에서도) RIG-I의 활성화를 위해 필요한 세포 dsRNA 결합 단백질인 세포 단백질 PACT에 결합하고, IRF3 및 IRF7 활성을 억제하는 것으로 생각된다. [Luthra P, Raman P, Mire CE, Weisand C, Isuda Y et al. (2013) Mutual antagonism between Ebola virus VP35 protein and the RIG-I activator PACT determines infection outcome. Cell Host Microbe., 14(1):74-84. doi: 10.1016/j.chom.2013.06.010]; [Hartman AL, Bird BH, Towner JS, Anoniadou Z-A, Zaki SR, Nichol ST (2008) Inhibition of IRF-3 activation by VP35 is critical for the high level of virulence of Ebola virus. J Virol. 82, 6, 2699-2704. Audet J, Kobinger GP (2015). Immune evasion in ebolavirus infections. Viral Immunol., 28, 1, 10-18].
상기 에볼라 VP35 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 46으로 나타낸다:
MTTRTKGRGHTAATTQNDRMPGPELSGWISEQLMTGRIPVSDIFCDIENNPGLCYASQMQQTKPNPKTRNSQTQTDPICNHSFEEVVQTLASLATVVQQQTIASESLEQRITSLENGLKPVYDMAKTISSLNRVCAEMVAKYDLLVMTTGRATATAAATEAYWAEHGQPPPGPSLYEESAIRGKIESRDETVPQSVREAFNNLNSTTSLTEENFGKPDISAKDLRNIMYDHLPGFGTAFHQLVQVICKLGKDSNSLDIIHAEFQASLAEGDSPQCALIQITKRVPIFQDAAPPVIHIRSRGDIPRACQKSLRPVPPSPKIDRGWVCVFQLQDGKTLGLKI [서열번호 46]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 46에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화되는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 에볼라 VP35 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 47의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGACAACTAGAACAAAGGGCAGGGGCCATACTGCGGCCACGACTCAAAACGACAGAATGCCAGGCCCTGAGCTTTCGGGCTGGATCTCTGAGCAGCTAATGACCGGAAGAATTCCTGTAAGCGACATCTTCTGTGATATTGAGAACAATCCAGGATTATGCTACGCATCCCAAATGCAACAAACGAAGCCAAACCCGAAGACGCGCAACAGTCAAACCCAAACGGACCCAATTTGCAATCATAGTTTTGAGGAGGTAGTACAAACATTGGCTTCATTGGCTACTGTTGTGCAACAACAAACCATCGCATCAGAATCATTAGAACAACGCATTACGAGTCTTGAGAATGGTCTAAAGCCAGTTTATGATATGGCAAAAACAATCTCCTCATTGAACAGGGTTTGTGCTGAGATGGTTGCAAAATATGATCTTCTGGTGATGACAACCGGTCGGGCAACAGCAACCGCTGCGGCAACTGAGGCTTATTGGGCCGAACATGGTCAACCACCACCTGGACCATCACTTTATGAAGAAAGTGCGATTCGGGGTAAGATTGAATCTAGAGATGAGACCGTCCCTCAAAGTGTTAGGGAGGCATTCAACAATCTAAACAGTACCACTTCACTAACTGAGGAAAATTTTGGGAAACCTGACATTTCGGCAAAGGATTTGAGAAACATTATGTATGATCACTTGCCTGGTTTTGGAACTGCTTTCCACCAATTAGTACAAGTGATTTGTAAATTGGGAAAAGATAGCAACTCATTGGACATCATTCATGCTGAGTTCCAGGCCAGCCTGGCTGAAGGAGACTCTCCTCAATGTGCCCTAATTCAAATTACAAAAAGAGTTCCAATCTTCCAAGATGCTGCTCCACCTGTCATCCACATCCGCTCTCGAGGTGACATTCCCCGAGCTTGCCAGAAAAGCTTGCGTCCAGTCCCACCATCGCCCAAGATTGATCGAGGTTGGGTATGTGTTTTTCAGCTTCAAGATGGTAAAACACTTGGACTCAAAATT [서열번호 47]
따라서, 바람직하게는 상기 에볼라 VP35 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 47에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 48의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGACAACUAGAACAAAGGGCAGGGGCCAUACUGCGGCCACGACUCAAAACGACAGAAUGCCAGGCCCUGAGCUUUCGGGCUGGAUCUCUGAGCAGCUAAUGACCGGAAGAAUUCCUGUAAGCGACAUCUUCUGUGAUAUUGAGAACAAUCCAGGAUUAUGCUACGCAUCCCAAAUGCAACAAACGAAGCCAAACCCGAAGACGCGCAACAGUCAAACCCAAACGGACCCAAUUUGCAAUCAUAGUUUUGAGGAGGUAGUACAAACAUUGGCUUCAUUGGCUACUGUUGUGCAACAACAAACCAUCGCAUCAGAAUCAUUAGAACAACGCAUUACGAGUCUUGAGAAUGGUCUAAAGCCAGUUUAUGAUAUGGCAAAAACAAUCUCCUCAUUGAACAGGGUUUGUGCUGAGAUGGUUGCAAAAUAUGAUCUUCUGGUGAUGACAACCGGUCGGGCAACAGCAACCGCUGCGGCAACUGAGGCUUAUUGGGCCGAACAUGGUCAACCACCACCUGGACCAUCACUUUAUGAAGAAAGUGCGAUUCGGGGUAAGAUUGAAUCUAGAGAUGAGACCGUCCCUCAAAGUGUUAGGGAGGCAUUCAACAAUCUAAACAGUACCACUUCACUAACUGAGGAAAAUUUUGGGAAACCUGACAUUUCGGCAAAGGAUUUGAGAAACAUUAUGUAUGAUCACUUGCCUGGUUUUGGAACUGCUUUCCACCAAUUAGUACAAGUGAUUUGUAAAUUGGGAAAAGAUAGCAACUCAUUGGACAUCAUUCAUGCUGAGUUCCAGGCCAGCCUGGCUGAAGGAGACUCUCCUCAAUGUGCCCUAAUUCAAAUUACAAAAAGAGUUCCAAUCUUCCAAGAUGCUGCUCCACCUGUCAUCCACAUCCGCUCUCGAGGUGACAUUCCCCGAGCUUGCCAGAAAAGCUUGCGUCCAGUCCCACCAUCGCCCAAGAUUGAUCGAGGUUGGGUAUGUGUUUUUCAGCUUCAAGAUGGUAAAACACUUGGACUCAAAAUU [서열번호 48]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 48에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 46의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 49로 제공된다:
ATGACCACCAGGACCAAAGGCAGAGGACACACCGCCGCCACCACACAGAACGACAGAATGCCTGGACCTGAGCTGAGCGGCTGGATCTCTGAGCAGCTGATGACAGGCAGAATCCCCGTGTCCGACATCTTCTGCGACATCGAGAACAACCCCGGCCTGTGTTACGCCAGCCAGATGCAGCAGACCAAGCCTAATCCTAAGACACGGAACAGCCAGACACAGACAGACCCCATCTGCAACCACAGCTTCGAGGAAGTGGTGCAGACACTGGCCAGCCTGGCTACAGTTGTGCAGCAGCAGACAATCGCCAGCGAGAGCCTGGAACAGAGAATCACCAGCCTGGAAAACGGCCTGAAGCCTGTGTACGACATGGCCAAGACCATCAGCTCCCTGAACAGAGTGTGCGCCGAGATGGTGGCCAAATACGACCTGCTCGTGATGACCACCGGCAGAGCCACAGCTACAGCCGCTGCCACAGAAGCCTATTGGGCCGAACATGGACAGCCTCCACCTGGACCTAGCCTGTACGAGGAATCTGCCATCCGGGGCAAGATCGAGAGCAGGGATGAGACAGTGCCCCAGTCTGTGCGCGAGGCCTTCAACAACCTGAACAGCACCACAAGCCTGACCGAGGAAAACTTCGGCAAGCCCGACATCAGCGCCAAGGACCTGCGGAACATTATGTACGACCATCTGCCTGGCTTCGGCACCGCCTTCCATCAGCTGGTGCAAGTGATCTGCAAGCTGGGCAAAGACAGCAACAGCCTGGACATCATCCACGCCGAGTTTCAGGCCTCTCTGGCCGAAGGCGATTCTCCTCAGTGTGCCCTGATCCAGATCACCAAGCGGGTGCCCATCTTCCAGGATGCTGCCCCTCCTGTGATCCACATCAGAAGCAGAGGCGACATCCCCAGAGCCTGCCAGAAATCTCTCAGACCCGTGCCTCCATCTCCTAAGATCGACAGAGGCTGGGTCTGCGTGTTCCAGCTGCAAGATGGCAAGACCCTGGGCCTGAAGATCTGA [서열번호 49]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 49에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 49의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 50으로 제공된다:
AUGACCACCAGGACCAAAGGCAGAGGACACACCGCCGCCACCACACAGAACGACAGAAUGCCUGGACCUGAGCUGAGCGGCUGGAUCUCUGAGCAGCUGAUGACAGGCAGAAUCCCCGUGUCCGACAUCUUCUGCGACAUCGAGAACAACCCCGGCCUGUGUUACGCCAGCCAGAUGCAGCAGACCAAGCCUAAUCCUAAGACACGGAACAGCCAGACACAGACAGACCCCAUCUGCAACCACAGCUUCGAGGAAGUGGUGCAGACACUGGCCAGCCUGGCUACAGUUGUGCAGCAGCAGACAAUCGCCAGCGAGAGCCUGGAACAGAGAAUCACCAGCCUGGAAAACGGCCUGAAGCCUGUGUACGACAUGGCCAAGACCAUCAGCUCCCUGAACAGAGUGUGCGCCGAGAUGGUGGCCAAAUACGACCUGCUCGUGAUGACCACCGGCAGAGCCACAGCUACAGCCGCUGCCACAGAAGCCUAUUGGGCCGAACAUGGACAGCCUCCACCUGGACCUAGCCUGUACGAGGAAUCUGCCAUCCGGGGCAAGAUCGAGAGCAGGGAUGAGACAGUGCCCCAGUCUGUGCGCGAGGCCUUCAACAACCUGAACAGCACCACAAGCCUGACCGAGGAAAACUUCGGCAAGCCCGACAUCAGCGCCAAGGACCUGCGGAACAUUAUGUACGACCAUCUGCCUGGCUUCGGCACCGCCUUCCAUCAGCUGGUGCAAGUGAUCUGCAAGCUGGGCAAAGACAGCAACAGCCUGGACAUCAUCCACGCCGAGUUUCAGGCCUCUCUGGCCGAAGGCGAUUCUCCUCAGUGUGCCCUGAUCCAGAUCACCAAGCGGGUGCCCAUCUUCCAGGAUGCUGCCCCUCCUGUGAUCCACAUCAGAAGCAGAGGCGACAUCCCCAGAGCCUGCCAGAAAUCUCUCAGACCCGUGCCUCCAUCUCCUAAGAUCGACAGAGGCUGGGUCUGCGUGUUCCAGCUGCAAGAUGGCAAGACCCUGGGCCUGAAGAUCUGA [서열번호 50]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 50에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 SARS-CoV-2 ORF3b(접근 번호 - NCBI 참조 서열: NC_045512.2) 또는 그의 동원체로부터 유래될 수 있다. 적어도 하나의 IIP가 유래될 수 있는 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 서열번호 51로 나타낸다. 별표는 야생형 서열에서 종결 코돈을 나타내고, 이들 중 하나 이상은 상기 유래된 IIP에서 돌연변이될 수 있다. 서열번호 51은 다음과 같다:
MMPTIFFAGILIVTTIVYLTIV*LLQLSLLQVMAQQVLFLNMTTRLVVILKNGNLE*KTVLYYTVTSLQTITSCTQLN*VQTLVLNMLPSSSTIKLLMSLKNMSKFTQSTVHPELLIQ*WNQFMMNRRRLLACLCKHKLMSTNLCTHSFRKRQVR* [서열번호 51]
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*57 변이체, 또는 그의 동원체일 수 있다. 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*57 변이체 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 52로 나타낸다:
MMPTIFFAGILIVTTIVYLTIVQLLQLSLLQVMAQQVLFLNMTTRLVVILKNGNLE [서열번호 52]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 52에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*57 변이체 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 53의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGATGCCAACTATTTTCTTTGCTGGCATACTAATTGTTACGACTATTGTATACCTTACAATAGTGCAACTTCTTCAATTGTCATTACTTCAGGTGATGGCACAACAAGTCCTATTTCTGAACATGACTACCAGATTGGTGGTTATACTGAAAAATGGGAATCTGGAG [서열번호 53]
따라서, 바람직하게는 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*57 변이체 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 53에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 54의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGAUGCCAACUAUUUUCUUUGCUGGCAUACUAAUUGUUACGACUAUUGUAUACCUUACAAUAGUGCAACUUCUUCAAUUGUCAUUACUUCAGGUGAUGGCACAACAAGUCCUAUUUCUGAACAUGACUACCAGAUUGGUGGUUAUACUGAAAAAUGGGAAUCUGGAG [서열번호 54]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 54에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 52의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 55로 제공된다:
ATGATGCCGACCATCTTCTTCGCCGGCATCCTGATCGTGACCACCATCGTGTACCTGACCATCGTGCAGCTGCTGCAGCTCAGCCTGCTGCAAGTGATGGCTCAGCAGGTCCTGTTCCTGAATATGACCACCAGACTGGTCGTGATCCTGAAGAACGGCAACCTGGAATGA [서열번호 55]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 55에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 55의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 56으로 제공된다:
AUGAUGCCGACCAUCUUCUUCGCCGGCAUCCUGAUCGUGACCACCAUCGUGUACCUGACCAUCGUGCAGCUGCUGCAGCUCAGCCUGCUGCAAGUGAUGGCUCAGCAGGUCCUGUUCCUGAAUAUGACCACCAGACUGGUCGUGAUCCUGAAGAACGGCAACCUGGAAUGA [서열번호 56]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 56에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*79 변이체, 또는 그의 동원체일 수 있다. 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*79 변이체 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 57로 나타낸다:
MMPTIFFAGILIVTTIVYLTIVQLLQLSLLQVMAQQVLFLNMTTRLVVILKNGNLELKTVLYYTVTSLQTITSCTQLN [서열번호 57]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 57에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*79 변이체 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 58의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGATGCCAACTATTTTCTTTGCTGGCATACTAATTGTTACGACTATTGTATACCTTACAATAGTGCAACTTCTTCAATTGTCATTACTTCAGGTGATGGCACAACAAGTCCTATTTCTGAACATGACTACCAGATTGGTGGTTATACTGAAAAATGGGAATCTGGAGTTAAAGACTGTGTTGTATTACACAGTTACTTCACTTCAGACTATTACCAGCTGTACTCAACTCAAT [서열번호 58]
따라서, 바람직하게는 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*79 변이체 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 58에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 59의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGAUGCCAACUAUUUUCUUUGCUGGCAUACUAAUUGUUACGACUAUUGUAUACCUUACAAUAGUGCAACUUCUUCAAUUGUCAUUACUUCAGGUGAUGGCACAACAAGUCCUAUUUCUGAACAUGACUACCAGAUUGGUGGUUAUACUGAAAAAUGGGAAUCUGGAGUUAAAGACUGUGUUGUAUUACACAGUUACUUCACUUCAGACUAUUACCAGCUGUACUCAACUCAAU [서열번호 59]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 59에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 57의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 60으로 제공된다:
ATGATGCCGACCATCTTCTTCGCCGGCATCCTGATCGTGACCACCATCGTGTACCTGACCATCGTGCAGCTGCTGCAGCTCAGCCTGCTGCAAGTGATGGCTCAGCAGGTCCTGTTCCTGAATATGACCACCAGACTGGTCGTGATCCTGAAGAACGGCAACCTGGAACTGAAAACCGTGCTGTACTACACCGTGACCAGCCTGCAGACCATCACCAGCTGCACCCAGCTGAACTGA [서열번호 60]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 60에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 60의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 61로 제공된다:
AUGAUGCCGACCAUCUUCUUCGCCGGCAUCCUGAUCGUGACCACCAUCGUGUACCUGACCAUCGUGCAGCUGCUGCAGCUCAGCCUGCUGCAAGUGAUGGCUCAGCAGGUCCUGUUCCUGAAUAUGACCACCAGACUGGUCGUGAUCCUGAAGAACGGCAACCUGGAACUGAAAACCGUGCUGUACUACACCGUGACCAGCCUGCAGACCAUCACCAGCUGCACCCAGCUGAACUGA [서열번호 61]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 61에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
또 다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*57 에콰도르 변이체, 또는 그의 동원체일 수 있다. 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*57 에콰도르 변이체 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 62로 나타낸다:
MMPTIFFAGILIVTTIVYLTIVQMLQLSLLQVMAQQVLFLNMTTRLVVILKNGNLE [서열번호 62]
따라서, 바람직하게는 제1 측면의 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 62에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*57 에콰도르 변이체 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 63의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGATGCCAACTATTTTCTTTGCTGGCATACTAATTGTTACGACTATTGTATACCTTACAATAGTGCAAATGCTTCAATTGTCATTACTTCAGGTGATGGCACAACAAGTCCTATTTCTGAACATGACTACCAGATTGGTGGTTATACTGAAAAATGGGAATCTGGAGTAA [서열번호 63]
따라서, 바람직하게는 상기 SARS-CoV-2 ORF3b*57 에콰도르 변이체 폴리펩티드는 서열번호 63에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 64의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGAUGCCAACUAUUUUCUUUGCUGGCAUACUAAUUGUUACGACUAUUGUAUACCUUACAAUAGUGCAAAUGCUUCAAUUGUCAUUACUUCAGGUGAUGGCACAACAAGUCCUAUUUCUGAACAUGACUACCAGAUUGGUGGUUAUACUGAAAAAUGGGAAUCUGGAGUAA [서열번호 64]
아울러, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 64에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 62의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 65로 제공된다:
ATGATGCCGACCATCTTCTTCGCCGGCATCCTGATCGTGACCACCATCGTGTACCTGACCATCGTGCAGATGCTGCAGCTGAGCCTGCTGCAAGTGATGGCCCAGCAGGTCCTGTTCCTGAATATGACCACCAGACTGGTCGTGATCCTGAAGAACGGCAACCTGGAATGA [서열번호 65]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 65에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 65의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 66으로 제공된다:
AUGAUGCCGACCAUCUUCUUCGCCGGCAUCCUGAUCGUGACCACCAUCGUGUACCUGACCAUCGUGCAGAUGCUGCAGCUGAGCCUGCUGCAAGUGAUGGCCCAGCAGGUCCUGUUCCUGAAUAUGACCACCAGACUGGUCGUGAUCCUGAAGAACGGCAACCUGGAAUGA [서열번호 66]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 66에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 MDA-5의 활성을 차단 또는 억제하는 바이러스 억제성 단백질일 수 있고, 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
(ⅰ) 파라믹소비리대 V 단백질; 임의적으로 SV5B, PIV2, 볼거리, SeV, 홍역, 또는 NiV;
(ⅱ) 뇌심근염 바이러스 2C;
(ⅲ) 버나바이러스(Birnavirus) VP3; 및
(ⅳ) 돼지 델타 코로나바이러스 NS6.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 LASV; DANV; LCMV; LUJV; CHPV; MACV; GTOV; JUNV; 및 SABV;로 이루어진 군으로부터 선택되는 아레나바이러스(Arenavirus) Z 단백질일 수 있다. 상기 IIP는 RLR, RIG-I 및 MDA-5와 상호작용하고, 미토콘드리아 항-바이러스 신호전달(MAVS)과의 상호작용을 억제하는 것으로 여겨진다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 콕사키바이러스(Coxsackievirus) CV-A16 또는 CV-A6; EV D-68 또는 71; 및 폴리오바이러스(Poliovirus) HEV-C;로 이루어진 군으로부터 선택되는 3C 프로테아제(protease) 단백질일 수 있다. 상기 IIP는 MAVS와 MDA의 상호작용을 억제하는 것으로 여겨진다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 폴리오바이러스 HEV-C; CVB3; 및 EV71;로 이루어진 군으로부터 선택되는 2A 프로테아제 단백질일 수 있다. 상기 IIP는 MDA-5 및 MAVS의 절단에 의해 RLR 경로를 억제하는 것으로 여겨진다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 RIG-I를 분해하거나 여기에 작용하고, hMPV G; CVB3 3C 프로테아제; 폴리오 바이러스 3Cpro; C형 간염 NS3/4A; DENV NS3; EV71 3Cpro; FMDV Lpro 및 3Cpro; 토스카나 바이러스(Toscana virus) NSS; 인플루엔자(Influenza) A/PR/8/34 NS1; 및 MERS ORF8b;로 이루어진 군으로부터 선택되는 단백질일 수 있다. 상기 IIP는 RNA 구조체가 saRNA 또는 mRNA를 포함하는 구현예에서 바람직하다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 SARS CoV N 단백질; 및 MHV N;으로 이루어진 군으로부터 선택되는 PACT에 작용하는 단백질일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는, 예를 들면, FMDV Lpro, 3Cpro 및 2B를 포함하는 (MDA2 신호전달을 향상시키는) LGP2에 대해 작용하는 단백질일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는, 예를 들면, MERS CoV M을 포함하는 TRAF3의 활성에 영향을 미치는 단백질일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 인플루엔자 바이러스 A PB1-F2; A형 간염 ABC; B형 간염 X; C형 간염 NS3/4A; SARS-CoV NSP15; SARS CoV ORF9 (96); 콕사키바이러스 B3 2Apro 및 3Cpro; 리노바이러스(Rhinovirus) 2Apro 및 3Cpro; 로타바이러스(Rotavirus) VP3; GB 바이러스 B NS3/4A; EV71 2Apro; HAV 3Cpro; 인간 메타뉴모바이러스(metapneumovirus) M2-2; 및 엔테로바이러스 EV71 2A;로 이루어진 군으로부터 선택되는 MAVS에 작용하는 단백질일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HCV 및 NSP1B; 에볼라 vNS3; HPV16 E6; E형 간염 메틸트랜스퍼라아제(methyltransferase); PRV Npro; HSV1 Us3; HSV2 Us1; CSFV Npro; BDV Npro; 소 RV NS1 및 NS2; B형 간염 바이러스 Orf3; PBoV NP1; E형 간염 ORF3; 및 MERS ORF8b;로 이루어진 군으로부터 선택되는 IRF-3 활성을 차단하는 단백질일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 로타바이러스 NSP1; KSHV ORF45; EBV BZLF-1; 에볼라 VP35; 및 엔테로바이러스 71 및 68 3CPro;로 이루어진 군으로부터 선택되는 IRF7 활성을 억제하는 단백질일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 폴리오 3C; FMDV Lpro; MERS CoV ORF4b(246aa); MuHV ORF73; 토크 테노 바이러스(Torque Teno virus) ORF2; EBV EBNA1; 및 SV5 및 hPIV2 V 단백질;로 이루어진 군으로부터 선택되는 NF-kβ 활성에 영향을 미치는 단백질일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 TBK-1 또는 IKKε 활성에 영향을 미치고, BDV P; HPV E6 및 HPV E7; 아레나바이러스 NP1; HCV NS3 단백질; DENV1 NS4A; DENV1, 2 및 4 NS2A 및 NS2B; WNV NS4A; 에볼라 VP35; 광견병 바이러스 PP; PEDV N 단백질; 및 HSV1 ICP27 및 VP24;로 이루어진 군으로부터 선택되는 단백질일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는, 예를 들면, 뮤린(murine) CTMV M45과 같은 NEMO의 활성에 영향을 미치는 단백질일 수 있다.
다음의 바이러스 IIP는 MDA-5의 활성화를 차단 또는 억제하는 것으로 여겨진다.
상기 V 단백질은 MDA-5의 헬리카아제 도메인(helicase domain)에 결합하고, dsRNA 결합 및 결과적인 자가-연합(self-association)을 억제함으로써 그 활성화를 차단한다. [Childs KS, Andresjeva J, Randall RE & Goobourn S (2009) Mechanism of MDA-5 inhibition by paramyxovirus V proteins. J Virol 83, 3, 1465-1473]. 한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 SV5B, 또는 그의 동원체이다. 원숭이 바이러스 5의 폴리펩티드 서열(PIV5 비-구조 단백질 V)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 95로 나타낸다:
MDPTDLSFSPDEINKLIETGLNTVEYFTSQQVTGTSSLGKNTIPPGVTGLLTNAAEAKIQESTNHQKGSVGGGAKPKKPRPKIAIVPADDKTVPGKPIPNPLLGLDSTPSTQTVLDLSGKTLPSGSYKGVKLAKFGKENLMTRFIEEPRENPIATSSPIDFKRGRDTGGFHRREYSIGWVGDEVKVTEWCNPSCSPITAAARRFECTCHQCPVTCSECERDT [서열번호 95]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 95에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SV5B 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 96의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGATCCCACTGATCTGAGCTTCTCCCCAGATGAGATCAATAAGCTCATAGAGACAGGCCTGAATACTGTAGAGTATTTTACTTCCCAACAAGTCACAGGAACATCCTCTCTTGGAAAGAATACAATACCACCAGGGGTCACAGGACTACTAACCAATGCTGCAGAGGCAAAGATCCAAGAGTCAACTAACCATCAGAAGGGCTCAGTTGGTGGGGGTGCAAAACCAAAGAAACCGCGACCAAAAATTGCCATTGTGCCAGCAGATGACAAAACAGTGCCCGGAAAGCCGATCCCAAACCCTCTATTAGGTCTGGACTCCACCCCGAGCACCCAAACTGTGCTTGATCTAAGTGGGAAAACATTACCATCAGGATCCTATAAGGGGGTTAAGCTTGCGAAATTTGGAAAAGAAAATCTGATGACACGGTTCATCGAGGAACCCAGAGAGAATCCTATCGCAACCAGTTCCCCCATCGATTTTAAGAGGGGCAGGGATACCGGCGGGTTCCATAGAAGGGAGTACTCAATCGGATGGGTGGGAGATGAAGTCAAGGTCACTGAGTGGTGCAATCCATCCTGTTCTCCAATCACCGCTGCAGCAAGGCGATTTGAATGCACTTGTCACCAGTGTCCAGTCACTTGCTCTGAATGTGAACGAGATACT [서열번호 96]
따라서, 바람직하게는 상기 SV5B 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 96에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 SV5B 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 97로 제공된다:
ATGGACCCTACCGACCTGAGCTTCAGCCCCGACGAGATCAACAAGCTGATCGAGACAGGCCTGAACACCGTGGAATACTTCACCAGCCAGCAAGTGACCGGCACAAGCAGCCTGGGCAAGAACACAATTCCTCCAGGCGTGACCGGCCTGCTGACAAATGCTGCCGAGGCCAAGATCCAAGAGAGCACCAACCACCAGAAGGGCTCTGTTGGAGGCGGAGCCAAGCCTAAGAAGCCCAGACCTAAGATCGCCATCGTGCCCGCCGACGATAAGACAGTGCCTGGCAAGCCCATTCCTAATCCTCTGCTGGGCCTCGACAGCACCCCTAGCACACAGACAGTGCTGGATCTGAGCGGCAAGACACTGCCTAGCGGCAGCTATAAGGGCGTGAAGCTGGCCAAGTTCGGCAAAGAAAACCTGATGACCCGGTTCATCGAGGAACCCAGAGAGAACCCTATCGCCACCAGCTCTCCCATCGACTTCAAGAGAGGCAGAGACACCGGCGGCTTCCACAGAAGAGAGTACAGCATTGGCTGGGTCGGAGATGAAGTGAAAGTGACCGAGTGGTGCAACCCCAGCTGCAGCCCTATTACAGCCGCCGCTAGAAGATTCGAGTGCACCTGTCACCAGTGTCCTGTGACCTGTAGCGAGTGCGAGAGAGACACA [서열번호 97]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 97에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 97의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 98로 제공된다:
AUGGACCCUACCGACCUGAGCUUCAGCCCCGACGAGAUCAACAAGCUGAUCGAGACAGGCCUGAACACCGUGGAAUACUUCACCAGCCAGCAAGUGACCGGCACAAGCAGCCUGGGCAAGAACACAAUUCCUCCAGGCGUGACCGGCCUGCUGACAAAUGCUGCCGAGGCCAAGAUCCAAGAGAGCACCAACCACCAGAAGGGCUCUGUUGGAGGCGGAGCCAAGCCUAAGAAGCCCAGACCUAAGAUCGCCAUCGUGCCCGCCGACGAUAAGACAGUGCCUGGCAAGCCCAUUCCUAAUCCUCUGCUGGGCCUCGACAGCACCCCUAGCACACAGACAGUGCUGGAUCUGAGCGGCAAGACACUGCCUAGCGGCAGCUAUAAGGGCGUGAAGCUGGCCAAGUUCGGCAAAGAAAACCUGAUGACCCGGUUCAUCGAGGAACCCAGAGAGAACCCUAUCGCCACCAGCUCUCCCAUCGACUUCAAGAGAGGCAGAGACACCGGCGGCUUCCACAGAAGAGAGUACAGCAUUGGCUGGGUCGGAGAUGAAGUGAAAGUGACCGAGUGGUGCAACCCCAGCUGCAGCCCUAUUACAGCCGCCGCUAGAAGAUUCGAGUGCACCUGUCACCAGUGUCCUGUGACCUGUAGCGAGUGCGAGAGAGACACA [서열번호 98]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 98에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 PIV2 비-구조 단백질 V(P19847), 또는 그의 동원체이다. PIV2의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 99로 나타낸다:
MAEEPTYTTEQVDELIHAGLGTVDFFLSRPIDAQSSLGKGSIPPGVTAVLTSAAEAKSKPVAAGPVKPRRKKVISNTTPYTIADNIPPEKLPINTPIPNPLLPLARPHGKMTDIDIVTGNITEGSYKGVELAKLGKQTLLTRFTSNEPVSSAGSAQDPNFKRGGANRERARGNHRREWSIAWVGDQVKVFEWCNPRCAPVTASARKFTCTCGSCPSICGECEGDH [서열번호 99]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 99에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 PIV2 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 100의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCCGAGGAACCAACATACACCACTGAGCAAGTTGATGAATTAATCCATGCTGGACTGGGAACAGTAGATTTCTTCCTATCTAGACCCATAGATGCTCAGTCTTCTTTAGGCAAAGGCAGCATCCCACCAGGTGTCACAGCTGTTCTAACTAGTGCAGCGGAGGCAAAATCCAAACCAGTTGCTGCTGGTCCAGTTAAACCCAGGCGGAAGAAAGTGATCAGCAATACTACTCCATACACTATTGCAGACAATATTCCACCTGAGAAGCTACCGATCAACACTCCAATACCCAATCCATTACTTCCACTGGCACGCCCTCACGGAAAGATGACAGACATTGACATTGTCACTGGGAACATTACAGAAGGATCGTACAAAGGTGTGGAGCTTGCTAAATTAGGGAAGCAGACACTACTCACAAGGTTCACCTCGAATGAGCCAGTCTCCTCAGCTGGATCCGCCCAAGACCCCAACTTTAAGAGGGGGGGAGCTAATAGAGAAAGAGCAAGAGGCAACCATAGGAGAGAATGGAGTATTGCATGGGTCGGAGATCAGGTCAAAGTCTTCGAGTGGTGTAATCCCAGGTGTGCCCCAGTCACGGCCTCAGCTCGCAAGTTCACCTGCACATGCGGATCCTGCCCCAGCATCTGCGGAGAATGTGAAGGAGATCAT [서열번호 100]
따라서, 바람직하게는 상기 PIV2 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 100에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 PIV2 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 101로 제공된다:
ATGGCCGAGGAACCTACCTACACCACCGAACAGGTGGACGAGCTGATTCACGCCGGACTGGGAACCGTGGACTTCTTTCTGTCCCGGCCTATCGATGCCCAGAGCAGCCTCGGCAAGGGATCTATTCCTCCTGGCGTGACAGCCGTGCTGACATCTGCCGCCGAGGCCAAGTCTAAACCTGTGGCTGCTGGACCCGTGAAGCCCAGACGGAAGAAAGTGATCAGCAACACCACACCTTACACGATCGCCGACAACATCCCTCCTGAGAAGCTGCCCATCAACACCCCTATTCCTAATCCTCTGCTGCCCCTGGCCAGACCTCACGGCAAGATGACCGACATCGATATCGTGACCGGCAACATCACCGAGGGCAGCTACAAAGGCGTGGAACTGGCCAAGCTGGGCAAGCAGACACTGCTGACCAGATTCACCAGCAACGAGCCTGTGTCTAGCGCCGGCTCTGCCCAGGATCCTAACTTCAAAAGAGGCGGAGCCAACAGAGAGAGAGCCAGAGGCAACCATCGGAGAGAGTGGTCTATTGCCTGGGTCGGAGATCAAGTGAAGGTGTTCGAGTGGTGCAACCCCAGATGTGCCCCTGTGACAGCCAGCGCCAGAAAGTTCACCTGTACCTGCGGCAGCTGTCCCAGCATTTGCGGAGAGTGTGAAGGCGACCAT [서열번호 101]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 101에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 101의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 102로 제공된다:
AUGGCCGAGGAACCUACCUACACCACCGAACAGGUGGACGAGCUGAUUCACGCCGGACUGGGAACCGUGGACUUCUUUCUGUCCCGGCCUAUCGAUGCCCAGAGCAGCCUCGGCAAGGGAUCUAUUCCUCCUGGCGUGACAGCCGUGCUGACAUCUGCCGCCGAGGCCAAGUCUAAACCUGUGGCUGCUGGACCCGUGAAGCCCAGACGGAAGAAAGUGAUCAGCAACACCACACCUUACACGAUCGCCGACAACAUCCCUCCUGAGAAGCUGCCCAUCAACACCCCUAUUCCUAAUCCUCUGCUGCCCCUGGCCAGACCUCACGGCAAGAUGACCGACAUCGAUAUCGUGACCGGCAACAUCACCGAGGGCAGCUACAAAGGCGUGGAACUGGCCAAGCUGGGCAAGCAGACACUGCUGACCAGAUUCACCAGCAACGAGCCUGUGUCUAGCGCCGGCUCUGCCCAGGAUCCUAACUUCAAAAGAGGCGGAGCCAACAGAGAGAGAGCCAGAGGCAACCAUCGGAGAGAGUGGUCUAUUGCCUGGGUCGGAGAUCAAGUGAAGGUGUUCGAGUGGUGCAACCCCAGAUGUGCCCCUGUGACAGCCAGCGCCAGAAAGUUCACCUGUACCUGCGGCAGCUGUCCCAGCAUUUGCGGAGAGUGUGAAGGCGACCAU [서열번호 102]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 102에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 볼거리(Mumps) 비-구조 단백질 V(P30928), 또는 그의 동원체이다. 볼거리 V 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 103으로 나타낸다:
MDQFIKQDETGDLIETGMNVANHFLSAPIQGTNSLSKATIIPGVAPVLIGNPEQKNIQYPTTSHQGSKSKGRGSGARPIIVSSSEGGTGGTQVPEPLFAQTGQGGIVTTVYQDPTIQPTGSYRSVELAKIGKERMINRFVEKPRTSTPVTEFKRGAGSGCSRPDNPRGGHRREWSLSWVQGEVRVFEWCNPICSPITAAARFHSCKCGNCPAKCDQCERDYGPP [서열번호 103]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 103에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 볼거리 V 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 104의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGACCAATTTATAAAACAAGATGAGACTGGTGATTTAATTGAGACAGGAATGAACGTTGCAAATCATTTCCTATCCGCCCCCATTCAGGGAACCAACTCGTTGAGCAAGGCCACAATCATCCCTGGCGTTGCACCAGTACTCATTGGCAATCCAGAGCAAAAGAACATTCAGTACCCCACCACATCACATCAGGGATCCAAGTCAAAGGGCAGAGGCTCAGGGGCCAGGCCCATCATAGTCTCATCCTCCGAAGGAGGCACTGGAGGGACTCAGGTTCCTGAGCCCCTTTTCGCACAAACAGGACAAGGTGGCATTGTCACCACCGTTTATCAGGATCCAACTATCCAACCAACAGGTTCATATCGAAGTGTGGAATTGGCTAAGATAGGAAAAGAGAGAATGATTAATCGATTTGTTGAAAAACCAAGAACCTCAACGCCGGTAACAGAATTTAAGAGGGGGGCCGGGAGCGGCTGCTCAAGGCCAGACAATCCAAGAGGAGGGCATAGACGGGAATGGAGCCTCAGCTGGGTCCAAGGAGAGGTCCGGGTCTTTGAGTGGTGCAACCCCATATGCTCACCTATCACTGCCGCAGCAAGATTCCACTCCTGCAAATGTGGGAATTGCCCCGCAAAGTGCGATCAGTGCGAACGAGATTATGGACCTCCT [서열번호 104]
따라서, 바람직하게는 상기 볼거리 V 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 104에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 볼거리 V 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 105로 제공된다:
ATGGACCAGTTCATCAAGCAGGACGAGACAGGCGACCTGATCGAAACCGGCATGAACGTGGCCAACCACTTCCTGTCTGCCCCTATCCAGGGCACCAACAGCCTGAGCAAGGCCACAATTATCCCTGGCGTGGCCCCTGTGCTGATCGGCAATCCTGAGCAGAAGAACATTCAGTACCCCACCACCAGCCACCAGGGCAGCAAGTCTAAAGGCAGAGGCTCTGGCGCTCGGCCCATCATCGTTTCTAGTAGCGAAGGCGGCACCGGCGGAACACAGGTTCCAGAACCTCTGTTTGCCCAGACAGGCCAAGGCGGCATCGTGACCACAGTGTACCAGGATCCTACCATCCAGCCTACCGGCAGCTACAGAAGCGTGGAACTGGCCAAGATCGGCAAAGAACGGATGATCAACCGCTTCGTGGAAAAGCCCAGAACCAGCACACCCGTGACCGAGTTCAAAAGAGGCGCCGGAAGCGGCTGCAGCAGACCCGATAATCCTAGAGGCGGCCATCGGAGAGAGTGGTCCCTGTCTTGGGTTCAGGGCGAAGTGCGGGTGTTCGAGTGGTGCAATCCTATCTGCAGCCCCATCACAGCCGCCGCTAGATTCCACAGCTGCAAGTGCGGAAACTGCCCCGCCAAGTGTGACCAGTGCGAGAGAGATTACGGCCCTCCT [서열번호 105]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 105에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 105의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 106으로 제공된다:
AUGGACCAGUUCAUCAAGCAGGACGAGACAGGCGACCUGAUCGAAACCGGCAUGAACGUGGCCAACCACUUCCUGUCUGCCCCUAUCCAGGGCACCAACAGCCUGAGCAAGGCCACAAUUAUCCCUGGCGUGGCCCCUGUGCUGAUCGGCAAUCCUGAGCAGAAGAACAUUCAGUACCCCACCACCAGCCACCAGGGCAGCAAGUCUAAAGGCAGAGGCUCUGGCGCUCGGCCCAUCAUCGUUUCUAGUAGCGAAGGCGGCACCGGCGGAACACAGGUUCCAGAACCUCUGUUUGCCCAGACAGGCCAAGGCGGCAUCGUGACCACAGUGUACCAGGAUCCUACCAUCCAGCCUACCGGCAGCUACAGAAGCGUGGAACUGGCCAAGAUCGGCAAAGAACGGAUGAUCAACCGCUUCGUGGAAAAGCCCAGAACCAGCACACCCGUGACCGAGUUCAAAAGAGGCGCCGGAAGCGGCUGCAGCAGACCCGAUAAUCCUAGAGGCGGCCAUCGGAGAGAGUGGUCCCUGUCUUGGGUUCAGGGCGAAGUGCGGGUGUUCGAGUGGUGCAAUCCUAUCUGCAGCCCCAUCACAGCCGCCGCUAGAUUCCACAGCUGCAAGUGCGGAAACUGCCCCGCCAAGUGUGACCAGUGCGAGAGAGAUUACGGCCCUCCU [서열번호 106]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 106에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP 센다이 바이러스(Sendai virus) 단백질 V(Fushimi 바이러스주)(P69284), 또는 그의 동원체이다. 센다이 바이러스 단백질 V(SeV V 단백질)의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 107로 나타낸다:
MDQDAFILKEDSEVEREAPGGRESLSDVIGFLDAVLSSEPTDIGGDRSWLHNTINTPQGPGSAHRAKSEGEGEVSTPSTQDNRSGEESRVSGRTSKPEAEAHAGNLDKQNIHRAFGGRTGTNSVSQDLGDGGDSGILENPPNERGYPRSGIEDENREMAAHPDKRGEDQAEGLPEEVRGGTSLPDEGEGGASNNGRSMEPGSSHSARVTGVLVIPSPELEEAVLRRNKRRPTNSGSKPLTPATVPGTRSPPLNRYNSTGSPPGKPPSTQDEHINSGDTPAVRVKDRKPPIGTRSVSDCPANGRPIHPGLETDSTKKGHRREHIIYERDGYIVDESWCNPVCSRIRVIPRRELCVCKTCPKVCKLCRDDIQCMRPDPFCREIFRS [서열번호 107]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 107에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SeV V 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 108의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGATCAAGATGCCTTCATTCTTAAAGAAGATTCTGAAGTTGAGAGGGAGGCGCCAGGAGGAAGAGAGTCGCTCTCGGATGTTATCGGATTCCTCGATGCTGTCCTGTCGAGTGAACCAACTGACATCGGAGGGGACAGAAGCTGGCTCCACAACACCATCAACACTCCCCAAGGACCAGGCTCTGCCCATAGAGCCAAAAGTGAGGGCGAAGGAGAAGTCTCAACACCGTCGACCCAAGATAATCGATCAGGTGAGGAGAGTAGAGTCTCTGGGAGAACAAGCAAGCCAGAGGCAGAAGCACATGCTGGAAACCTTGATAAACAAAATATACACCGGGCCTTTGGGGGAAGAACTGGTACAAACTCTGTATCTCAGGATCTGGGCGATGGAGGAGACTCCGGAATCCTTGAAAATCCCCCAAATGAGAGAGGATATCCGAGATCAGGTATTGAAGATGAAAACAGAGAGATGGCTGCGCACCCTGATAAGAGGGGAGAAGACCAAGCTGAAGGACTTCCAGAAGAGGTACGAGGAGGTACATCCCTACCTGATGAAGGAGAAGGTGGAGCAAGTAATAATGGAAGAAGCATGGAGCCTGGCAGCTCACATAGTGCAAGAGTAACTGGGGTCCTGGTGATTCCTAGCCCCGAACTCGAAGAGGCTGTGCTACGGAGGAACAAAAGAAGACCTACCAACAGTGGGTCCAAACCTCTTACTCCAGCAACCGTGCCTGGCACCCGGTCCCCACCGCTGAATCGTTACAACAGCACAGGGTCACCACCAGGAAAACCCCCATCTACACAGGATGAGCACATCAACTCTGGGGACACCCCCGCCGTCAGGGTCAAAGACCGGAAACCACCAATAGGGACCCGCTCTGTCTCAGATTGTCCAGCCAACGGCCGCCCAATCCACCCGGGTCTAGAGACCGACTCAACAAAAAAGGGgCATAGGAGAGAACACATCATCTATGAAAGAGATGGCTACATTGTTGACGAGTCTTGGTGTAATCCAGTCTGCTCAAGAATTCGAGTCATCCCGAGACGCGAGTTATGTGTTTGCAAGACGTGCCCTAAAGTCTGCAAACTATGCAGAGATGACATTCAATGTATGCGGCCTGATCCTTTCTGCCGAGAAATCTTCCGCTCG [서열번호 108]
따라서, 바람직하게는 상기 SeV V 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 108에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 SeV V 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 109로 제공된다:
ATGGACCAGGACGCCTTCATCCTGAAAGAGGACAGCGAGGTCGAGAGAGAAGCCCCTGGCGGAAGAGAAAGCCTGTCCGATGTGATCGGCTTCCTGGATGCCGTGCTGAGCAGCGAGCCTACAGATATCGGCGGCGATAGAAGCTGGCTGCACAACACCATCAACACCCCTCAAGGCCCTGGCTCTGCCCACAGAGCTAAGTCTGAAGGCGAGGGCGAAGTGTCTACCCCTAGCACACAGGACAACAGAAGCGGCGAGGAATCCAGAGTGTCCGGCAGAACAAGCAAGCCTGAGGCCGAAGCTCACGCCGGCAATCTGGACAAGCAGAACATCCACAGAGCCTTCGGCGGCAGAACCGGCACAAATAGCGTGTCACAGGACCTCGGAGATGGCGGCGATTCTGGCATCCTGGAAAACCCTCCAAACGAGCGGGGCTACCCTAGAAGCGGAATCGAGGACGAGAACAGAGAGATGGCCGCTCATCCCGACAAGAGAGGCGAAGATCAGGCCGAGGGACTGCCTGAAGAAGTGCGCGGAGGAACAAGCCTGCCTGACGAAGGCGAAGGCGGAGCCTCTAACAACGGCAGATCTATGGAACCCGGCAGCAGCCATAGCGCCAGAGTTACAGGCGTGCTGGTCATCCCATCTCCAGAGCTGGAAGAGGCTGTGCTGAGGCGGAACAAGAGAAGGCCTACCAACAGCGGCAGCAAGCCTCTGACACCAGCTACAGTGCCTGGCACAAGAAGCCCTCCACTGAACCGGTACAACAGCACAGGCTCTCCACCTGGCAAGCCTCCATCCACACAGGATGAGCACATCAACTCCGGCGATACCCCTGCCGTCAGAGTGAAGGACAGAAAGCCTCCTATCGGCACCAGAAGCGTGTCCGACTGTCCTGCCAATGGCAGACCTATTCACCCCGGCCTGGAAACCGACAGCACCAAGAAGGGACACAGACGGGAACACATCATCTACGAGCGCGACGGCTACATCGTGGACGAGAGCTGGTGCAACCCTGTGTGCAGCCGGATCAGAGTGATCCCTCGGAGAGAACTGTGCGTGTGCAAGACATGCCCCAAAGTGTGCAAGCTGTGCCGGGACGACATCCAGTGTATGCGGCCCGATCCTTTCTGCAGAGAGATCTTCAGAAGC [서열번호 109]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 109에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 109의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 110으로 제공된다:
AUGGACCAGGACGCCUUCAUCCUGAAAGAGGACAGCGAGGUCGAGAGAGAAGCCCCUGGCGGAAGAGAAAGCCUGUCCGAUGUGAUCGGCUUCCUGGAUGCCGUGCUGAGCAGCGAGCCUACAGAUAUCGGCGGCGAUAGAAGCUGGCUGCACAACACCAUCAACACCCCUCAAGGCCCUGGCUCUGCCCACAGAGCUAAGUCUGAAGGCGAGGGCGAAGUGUCUACCCCUAGCACACAGGACAACAGAAGCGGCGAGGAAUCCAGAGUGUCCGGCAGAACAAGCAAGCCUGAGGCCGAAGCUCACGCCGGCAAUCUGGACAAGCAGAACAUCCACAGAGCCUUCGGCGGCAGAACCGGCACAAAUAGCGUGUCACAGGACCUCGGAGAUGGCGGCGAUUCUGGCAUCCUGGAAAACCCUCCAAACGAGCGGGGCUACCCUAGAAGCGGAAUCGAGGACGAGAACAGAGAGAUGGCCGCUCAUCCCGACAAGAGAGGCGAAGAUCAGGCCGAGGGACUGCCUGAAGAAGUGCGCGGAGGAACAAGCCUGCCUGACGAAGGCGAAGGCGGAGCCUCUAACAACGGCAGAUCUAUGGAACCCGGCAGCAGCCAUAGCGCCAGAGUUACAGGCGUGCUGGUCAUCCCAUCUCCAGAGCUGGAAGAGGCUGUGCUGAGGCGGAACAAGAGAAGGCCUACCAACAGCGGCAGCAAGCCUCUGACACCAGCUACAGUGCCUGGCACAAGAAGCCCUCCACUGAACCGGUACAACAGCACAGGCUCUCCACCUGGCAAGCCUCCAUCCACACAGGAUGAGCACAUCAACUCCGGCGAUACCCCUGCCGUCAGAGUGAAGGACAGAAAGCCUCCUAUCGGCACCAGAAGCGUGUCCGACUGUCCUGCCAAUGGCAGACCUAUUCACCCCGGCCUGGAAACCGACAGCACCAAGAAGGGACACAGACGGGAACACAUCAUCUACGAGCGCGACGGCUACAUCGUGGACGAGAGCUGGUGCAACCCUGUGUGCAGCCGGAUCAGAGUGAUCCCUCGGAGAGAACUGUGCGUGUGCAAGACAUGCCCCAAAGUGUGCAAGCUGUGCCGGGACGACAUCCAGUGUAUGCGGCCCGAUCCUUUCUGCAGAGAGAUCUUCAGAAGC [서열번호 110]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 110에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 홍역 비-구조 단백질 V(Ichinose-B95a 바이러스주)(P0C774), 또는 그의 동원체이다. 홍역 V 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 111로 나타낸다:
MAEEQARHVKNGLECIRALKAEPIGSLAVEEAMAAWSEISDNPGQDRATCKEEEAGSSGLSKPCLSAIGSTEGGAPRIRGQGSGESDDDAETLGIPSRNLQASSTGLQCYHVYDHSGEAVKGIQDADSIMVQSGLDGDSTLSGGDDESENSDVDIGEPDTEGYAITDRGSAPISMGFRASDVETAEGGEIHELLKLQSRGNNFPKLGKTLNVPPPPNPSRASTSETPIKKGHRREIGLIWNGDRVFIDRWCNPMCSKVTLGTIRARCTCGECPRVCEQCRTDTGVDTRIWYHNLPEIPE [서열번호 111]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 111에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 홍역 V 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 112의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCAGAAGAGCAGGCACGCCATGTCAAAAACGGACTGGAATGCATCCGGGCTCTCAAGGCCGAGCCCATCGGCTCACTGGCCGTCGAGGAAGCCATGGCAGCATGGTCAGAAATATCAGACAACCCAGGACAGGACCGAGCCACCTGCAAGGAAGAGGAGGCAGGCAGTTCGGGTCTCAGCAAACCATGCCTCTCAGCAATTGGATCAACTGAAGGCGGTGCACCTCGCATCCGCGGTCAGGGATCTGGAGAAAGCGATGACGACGCTGAAACTTTGGGAATCCCCTCAAGAAATCTCCAGGCATCAAGCACTGGGTTACAGTGTTATCATGTTTATGATCACAGCGGTGAAGCGGTTAAGGGAATCCAAGATGCTGACTCTATCATGGTTCAATCAGGCCTTGATGGTGATAGCACCCTCTCAGGAGGAGACGATGAATCTGAAAACAGCGATGTGGATATTGGCGAACCTGATACCGAGGGATATGCTATCACTGACCGGGGATCTGCTCCCATCTCTATGGGGTTCAGGGCTTCTGATGTTGAAACTGCAGAAGGAGGGGAGATCCACGAGCTCCTGAAACTCCAATCCAGAGGCAACAACTTTCCGAAGCTTGGGAAAACTCTCAATGTTCCTCCGCCCCCGAACCCCAGTAGGGCCAGCACTTCCGAGACACCCATTAAAAAGGGgCACAGACGCGAGATTGGCCTCATTTGGAACGGAGATCGCGTCTTTATTGACAGGTGGTGCAACCCAATGTGCTCGAAAGTCACCCTCGGAACCATCAGGGCCAGGTGCACCTGCGGGGAATGTCCCCGAGTGTGTGAGCAATGCCGCACTGATACAGGAGTGGACACCCGAATCTGGTACCACAATCTCCCCGAGATCCCAGAA [서열번호 112]
따라서, 바람직하게는 상기 홍역 V 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 112에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 홍역 V 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 113으로 제공된다:
ATGGCCGAAGAACAGGCCAGACACGTGAAGAACGGCCTGGAATGCATCAGAGCCCTGAAGGCCGAGCCTATCGGATCTCTGGCTGTGGAAGAAGCCATGGCCGCTTGGAGCGAGATCAGCGATAATCCCGGCCAGGACCGGGCCACCTGTAAAGAAGAAGAGGCCGGATCTAGCGGCCTGAGCAAGCCTTGTCTGTCTGCCATCGGCTCTACAGAAGGCGGCGCTCCTAGAATCAGAGGCCAAGGATCTGGCGAGAGCGACGACGATGCTGAGACACTGGGCATCCCCAGCAGAAATCTGCAGGCCAGCTCTACCGGCCTGCAGTGCTATCACGTGTACGATCACTCTGGCGAGGCCGTGAAGGGAATCCAGGATGCCGATAGCATCATGGTGCAGAGCGGCCTGGATGGCGACTCTACACTTAGCGGCGGAGATGACGAGAGCGAGAACTCCGATGTGGACATCGGCGAGCCTGATACAGAGGGCTACGCCATCACAGACAGAGGCAGCGCCCCTATCAGCATGGGCTTTAGAGCCAGCGACGTGGAAACAGCCGAAGGCGGAGAGATTCACGAGCTGCTGAAGCTGCAGAGCCGGGGCAACAACTTTCCCAAGCTGGGCAAGACCCTGAACGTGCCACCTCCTCCAAATCCTAGCAGAGCCAGCACCAGCGAGACACCCATCAAGAAGGGCCACAGAAGAGAGATCGGCCTGATCTGGAACGGCGACCGGGTGTTCATCGACAGATGGTGCAACCCCATGTGCAGCAAAGTGACCCTGGGCACCATCCGGGCCAGATGTACATGCGGAGAGTGCCCTAGAGTGTGCGAGCAGTGCAGAACCGATACCGGCGTGGACACCCGGATCTGGTATCACAACCTGCCTGAGATCCCCGAG [서열번호 113]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 113에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 113의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 114로 제공된다:
AUGGCCGAAGAACAGGCCAGACACGUGAAGAACGGCCUGGAAUGCAUCAGAGCCCUGAAGGCCGAGCCUAUCGGAUCUCUGGCUGUGGAAGAAGCCAUGGCCGCUUGGAGCGAGAUCAGCGAUAAUCCCGGCCAGGACCGGGCCACCUGUAAAGAAGAAGAGGCCGGAUCUAGCGGCCUGAGCAAGCCUUGUCUGUCUGCCAUCGGCUCUACAGAAGGCGGCGCUCCUAGAAUCAGAGGCCAAGGAUCUGGCGAGAGCGACGACGAUGCUGAGACACUGGGCAUCCCCAGCAGAAAUCUGCAGGCCAGCUCUACCGGCCUGCAGUGCUAUCACGUGUACGAUCACUCUGGCGAGGCCGUGAAGGGAAUCCAGGAUGCCGAUAGCAUCAUGGUGCAGAGCGGCCUGGAUGGCGACUCUACACUUAGCGGCGGAGAUGACGAGAGCGAGAACUCCGAUGUGGACAUCGGCGAGCCUGAUACAGAGGGCUACGCCAUCACAGACAGAGGCAGCGCCCCUAUCAGCAUGGGCUUUAGAGCCAGCGACGUGGAAACAGCCGAAGGCGGAGAGAUUCACGAGCUGCUGAAGCUGCAGAGCCGGGGCAACAACUUUCCCAAGCUGGGCAAGACCCUGAACGUGCCACCUCCUCCAAAUCCUAGCAGAGCCAGCACCAGCGAGACACCCAUCAAGAAGGGCCACAGAAGAGAGAUCGGCCUGAUCUGGAACGGCGACCGGGUGUUCAUCGACAGAUGGUGCAACCCCAUGUGCAGCAAAGUGACCCUGGGCACCAUCCGGGCCAGAUGUACAUGCGGAGAGUGCCCUAGAGUGUGCGAGCAGUGCAGAACCGAUACCGGCGUGGACACCCGGAUCUGGUAUCACAACCUGCCUGAGAUCCCCGAG [서열번호 114]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 114에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 니파 바이러스(Nipah virus) 비-구조 단백질 V(NiV V 단백질)(Q997F2; V_NIPAV), 또는 그의 동원체이다. NiV V 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 115로 나타낸다:
MDKLELVNDGLNIIDFIQKNQKEIQKTYGRSSIQQPSIKDQTKAWEDFLQCTSGESEQVEGGMSKDDGDVERRNLEDLSSTSPTDGTIGKRVSNTRDWAEGSDDIQLDPVVTDVVYHDHGGECTGYGFTSSPERGWSDYTSGANNGNVCLVSDAKMLSYAPEIAVSKEDRETDLVHLENKLSTTGLNPTAVPFTLRNLSDPAKDSPVIAEHYYGLGVKEQNVGPQTSRNVNLDSIKLYTSDDEEADQLEFEDEFAGSSSEVIVGISPEDEEPSSVGGKPNESIGRTIEGQSIRDNLQAKDNKSTDVPGAGPKDSAVKEEPPQKRLPMLAEEFECSGSEDPIIRELLKENSLINCQQGKDAQPPYHWSIERSISPDKTEIVNGAVQTADRQRPGTPMPKSRGIPIKKGHRREISICWDGKRAWVEEWCNPACSRITPLPRRQECQCGECPTECFHCG [서열번호 115]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 115에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열을 암호화하는 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 NiV V 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 116의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGATAAATTGGAACTAGTCAATGATGGCCTCAATATTATTGACTTTATTCAGAAGAACCAAAAAGAAATACAGAAGACATACGGACGATCAAGTATTCAACAACCCAGCATCAAAGATCAAACAAAAGCCTGGGAAGATTTTCTGCAGTGCACCAGTGGAGAATCTGAACAAGTTGAGGGGGGAATGTCTAAGGATGATGGAGATGTTGAAAGAAGAAACTTGGAGGATCTATCCAGTACTTCTCCCACAGATGGAACTATTGGAAAGAGAGTGTCGAACACCCGTGACTGGGCAGAAGGTTCAGATGACATACAACTGGACCCAGTGGTTACAGACGTTGTATACCATGATCATGGAGGAGAATGTACCGGATATGGATTTACTTCAAGCCCTGAGAGAGGGTGGAGTGATTACACATCAGGAGCAAACAATGGGAATGTATGTCTTGTATCTGATGCAAAGATGCTGTCCTATGCTCCCGAAATTGCAGTTTCTAAAGAAGATCGGGAAACTGATCTAGTTCATCTTGAGAATAAACTATCTACTACAGGACTGAATCCCACAGCAGTACCGTTCACTCTGAGAAACCTGTCTGATCCTGCAAAAGACTCTCCTGTGATTGCTGAACACTACTACGGACTAGGAGTTAAAGAGCAAAACGTTGGCCCTCAGACTAGCAGAAATGTCAATTTGGACAGCATCAAATTGTACACATCAGATGACGAAGAGGCAGATCAGCTTGAATTCGAAGATGAGTTTGCAGGAAGCTCAAGTGAAGTGATAGTCGGCATTTCTCCTGAAGATGAAGAGCCTTCAAGTGTTGGCGGAAAACCCAATGAATCCATTGGACGTACAATCGAAGGCCAATCAATCCGAGACAACCTTCAAGCCAAGGACAACAAATCAACAGATGTACCAGGAGCAGGACCGAAAGATTCAGCAGTGAAGGAAGAACCACCCCAGAAGAGGCTACCTATGTTAGCTGAAGAATTTGAGTGCTCTGGATCGGAAGACCCAATCATTCGGGAGCTGCTGAAGGAGAACTCACTCATAAATTGTCAGCAAGGGAAAGATGCTCAGCCTCCATATCATTGGAGCATCGAGAGGTCAATAAGCCCGGATAAAACTGAGATCGTCAACGGTGCTGTGCAAACTGCTGACAGGCAAAGACCAGGAACTCCGATGCCAAAGTCCCGAGGTATTCCCATTAAAAAGGGGCACAGACGCGAAATATCCATCTGCTGGGACGGAAAACGTGCCTGGGTCGAAGAGTGGTGCAACCCGGCATGTTCGAGGATCACCCCCCTACCAAGAAGGCAAGAGTGTCAATGCGGAGAATGTCCAACTGAATGCTTCCACTGCGGT [서열번호 116]
따라서, 바람직하게는 상기 NiV V 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 116에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 NiV V 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 117로 제공된다:
ATGGACAAGCTGGAACTGGTCAACGACGGCCTGAACATCATCGACTTCATCCAGAAGAACCAGAAAGAGATCCAGAAAACCTACGGCCGGTCCAGCATCCAGCAGCCTAGCATCAAGGATCAGACCAAGGCCTGGGAAGATTTCCTGCAGTGTACCAGCGGCGAGAGCGAACAGGTTGAAGGCGGCATGAGCAAGGACGACGGCGACGTGGAAAGACGGAACCTGGAAGATCTGAGCAGCACAAGCCCTACCGATGGCACCATCGGCAAGCGGGTGTCCAACACAAGAGATTGGGCCGAGGGCAGCGACGACATTCAGCTGGATCCTGTGGTCACCGATGTGGTGTACCACGATCACGGCGGCGAGTGTACAGGCTACGGCTTTACAAGCAGCCCCGAGAGAGGCTGGAGCGATTATACAAGCGGCGCCAACAACGGCAACGTGTGCCTGGTGTCTGACGCCAAGATGCTGAGCTACGCCCCTGAGATCGCCGTGTCCAAAGAGGACAGAGAAACCGACCTGGTGCACCTGGAAAACAAGCTGAGCACCACCGGACTGAACCCTACCGCCGTGCCTTTCACACTGAGAAACCTGAGCGACCCCGCCAAGGACTCTCCTGTGATTGCCGAGCACTACTACGGCCTGGGCGTGAAAGAACAGAACGTGGGCCCTCAGACCAGCCGGAACGTGAACCTGGATTCCATCAAGCTGTACACCTCCGACGACGAGGAAGCCGACCAGCTGGAATTCGAGGATGAGTTTGCCGGCAGCAGCAGCGAAGTGATTGTGGGCATCAGCCCTGAGGACGAGGAACCTAGCTCTGTTGGCGGCAAGCCCAATGAGAGCATCGGCAGAACAATCGAGGGCCAGAGCATCCGGGATAACCTGCAGGCCAAGGACAACAAGAGCACCGATGTTCCAGGCGCTGGCCCTAAGGATAGCGCCGTGAAAGAGGAACCACCTCAGAAACGGCTGCCCATGCTGGCCGAGGAATTTGAGTGTAGCGGCAGCGAGGACCCCATCATCAGAGAGCTGCTGAAAGAGAACAGCCTGATCAACTGCCAGCAGGGCAAAGACGCCCAGCCTCCTTACCACTGGTCCATCGAGAGATCTATCAGCCCCGACAAGACCGAGATCGTGAATGGCGCTGTGCAGACCGCCGATAGACAGAGGCCTGGAACTCCCATGCCTAAGAGCAGAGGCATCCCCATCAAGAAGGGCCACAGAAGAGAGATCAGCATCTGCTGGGACGGCAAGCGCGCCTGGGTTGAAGAGTGGTGTAATCCCGCCTGCAGCCGGATCACACCTCTGCCTAGAAGGCAAGAGTGCCAGTGTGGCGAGTGTCCCACCGAGTGTTTTCACTGTGGA [서열번호 117]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 117에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 117의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 118로 제공된다:
AUGGACAAGCUGGAACUGGUCAACGACGGCCUGAACAUCAUCGACUUCAUCCAGAAGAACCAGAAAGAGAUCCAGAAAACCUACGGCCGGUCCAGCAUCCAGCAGCCUAGCAUCAAGGAUCAGACCAAGGCCUGGGAAGAUUUCCUGCAGUGUACCAGCGGCGAGAGCGAACAGGUUGAAGGCGGCAUGAGCAAGGACGACGGCGACGUGGAAAGACGGAACCUGGAAGAUCUGAGCAGCACAAGCCCUACCGAUGGCACCAUCGGCAAGCGGGUGUCCAACACAAGAGAUUGGGCCGAGGGCAGCGACGACAUUCAGCUGGAUCCUGUGGUCACCGAUGUGGUGUACCACGAUCACGGCGGCGAGUGUACAGGCUACGGCUUUACAAGCAGCCCCGAGAGAGGCUGGAGCGAUUAUACAAGCGGCGCCAACAACGGCAACGUGUGCCUGGUGUCUGACGCCAAGAUGCUGAGCUACGCCCCUGAGAUCGCCGUGUCCAAAGAGGACAGAGAAACCGACCUGGUGCACCUGGAAAACAAGCUGAGCACCACCGGACUGAACCCUACCGCCGUGCCUUUCACACUGAGAAACCUGAGCGACCCCGCCAAGGACUCUCCUGUGAUUGCCGAGCACUACUACGGCCUGGGCGUGAAAGAACAGAACGUGGGCCCUCAGACCAGCCGGAACGUGAACCUGGAUUCCAUCAAGCUGUACACCUCCGACGACGAGGAAGCCGACCAGCUGGAAUUCGAGGAUGAGUUUGCCGGCAGCAGCAGCGAAGUGAUUGUGGGCAUCAGCCCUGAGGACGAGGAACCUAGCUCUGUUGGCGGCAAGCCCAAUGAGAGCAUCGGCAGAACAAUCGAGGGCCAGAGCAUCCGGGAUAACCUGCAGGCCAAGGACAACAAGAGCACCGAUGUUCCAGGCGCUGGCCCUAAGGAUAGCGCCGUGAAAGAGGAACCACCUCAGAAACGGCUGCCCAUGCUGGCCGAGGAAUUUGAGUGUAGCGGCAGCGAGGACCCCAUCAUCAGAGAGCUGCUGAAAGAGAACAGCCUGAUCAACUGCCAGCAGGGCAAAGACGCCCAGCCUCCUUACCACUGGUCCAUCGAGAGAUCUAUCAGCCCCGACAAGACCGAGAUCGUGAAUGGCGCUGUGCAGACCGCCGAUAGACAGAGGCCUGGAACUCCCAUGCCUAAGAGCAGAGGCAUCCCCAUCAAGAAGGGCCACAGAAGAGAGAUCAGCAUCUGCUGGGACGGCAAGCGCGCCUGGGUUGAAGAGUGGUGUAAUCCCGCCUGCAGCCGGAUCACACCUCUGCCUAGAAGGCAAGAGUGCCAGUGUGGCGAGUGUCCCACCGAGUGUUUUCACUGUGGA [서열번호 118]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 118에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 POLG_EMCV(뇌심근염 바이러스 2C) 게놈 폴리단백질(Li L, Fan H, Song Z, Liu X, Bai J, Jiang P (2019) Encephalomyocarditis virus 2C protein antagonizes interferon-B signaling pathway through interaction with MDA5 Antiviral Res, 161, 70-84), 또는 그의 동원체이다. EMCV의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 119로 나타낸다:
LKARDINDIFAILKNGEWLVKLILAIRDWIKAWIASEEKFVTMTDLVPGILEKQRDLNDPSKYKEAKEWLDNARQACLKSGNVHIANLCKVVAPAPSKSRPEPVVVCLRGKSGQGKSFLANVLAQAISTHFTGRIDSVWYCPPDPDHFDGYNQQTVVVMDDLGQNPDGKDFKYFAQMVSTTGFIPPMASLEDKGKPFNSKVIIATTNLYSGFTPRTMVCPDALNRRFHFDIDVSAKDGYKINSKLDIIKALEDTHANPVAMFQYDCALLNGMAVEMKRMQQDMFKPQPPLQNVYQLVQEVIDRVELHEKVSSHPIFKQ [서열번호 119]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 119에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 EMCV 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 120의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
CTCAAAGCACGTGACATCAACGACATCTTCGCCATTCTCAAGAACGGCGAGTGGCTGGTCAAACTGATCCTTGCCATCCGCGACTGGATTAAGGCTTGGATCGCCTCAGAAGAGAAGTTTGTCACCATGACAGACTTGGTGCCTGGCATCCTTGAAAAGCAGCGGGACCTGAACGACCCGAGCAAGTACAAGGAAGCCAAGGAGTGGCTCGACAACGCGCGCCAAGCGTGTTTGAAGAGCGGGAACGTCCACATTGCCAACCTGTGCAAAGTGGTCGCACCAGCACCCAGCAAGTCGAGGCCCGAACCCGTGGTTGTTTGCCTCCGCGGCAAATCTGGCCAGGGCAAGAGCTTCCTTGCAAACGTGCTTGCACAGGCAATTTCCACCCACTTCACCGGCAGAATCGACTCAGTGTGGTACTGCCCACCTGACCCTGACCACTTCGACGGTTACAACCAGCAAACCGTTGTTGTGATGGATGATTTGGGCCAGAACCCTGACGGCAAGGACTTCAAATACTTTGCCCAAATGGTCTCGACCACAGGGTTTATCCCGCCCATGGCATCACTCGAGGACAAAGGTAAACCTTTCAACAGCAAAGTCATCATCGCGACCACCAACTTGTACTCGGGCTTCACCCCGAGGACCATGGTATGTCCCGACGCACTGAACCGGAGGTTTCACTTTGACATCGATGTGAGTGCTAAGGATGGGTACAAAATTAACAGCAAATTGGACATTATCAAAGCACTCGAAGACACCCACGCCAACCCAGTGGCAATGTTTCAATACGACTGTGCCCTTCTCAACGGCATGGCCGTTGAAATGAAGAGAATGCAACAAGACATGTTCAAGCCTCAACCACCCCTCCAGAATGTGTACCAGCTTGTTCAGGAGGTGATCGATCGGGTCGAGCTCCACGAGAAAGTGTCGAGTCACCCGATCTTCAAGCAG [서열번호 120]
따라서, 바람직하게는 상기 EMCV 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 120에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 EMCV 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 121로 제공된다:
CTGAAGGCCAGAGACATCAACGACATCTTCGCCATCCTGAAGAACGGCGAGTGGCTGGTCAAGCTGATCCTGGCCATCAGAGACTGGATCAAGGCCTGGATCGCCAGCGAAGAGAAGTTCGTGACCATGACCGATCTGGTGCCCGGCATCCTGGAAAAGCAGAGGGACCTGAACGACCCCAGCAAGTACAAAGAGGCCAAAGAATGGCTGGACAACGCCAGACAGGCCTGCCTGAAGTCCGGCAATGTGCATATCGCCAACCTGTGCAAGGTGGTGGCCCCTGCTCCTAGCAAGTCTAGACCTGAGCCTGTGGTCGTGTGCCTGAGAGGCAAATCTGGCCAGGGCAAGAGCTTCCTGGCCAATGTTCTGGCCCAGGCCATCAGCACCCACTTCACCGGAAGAATCGACAGCGTGTGGTACTGCCCTCCTGATCCTGACCACTTCGACGGCTACAACCAGCAGACCGTGGTGGTCATGGACGACCTGGGACAGAACCCCGACGGCAAGGACTTCAAGTACTTCGCCCAGATGGTGTCCACCACCGGCTTCATTCCTCCAATGGCCAGCCTGGAAGATAAGGGCAAGCCCTTCAACAGCAAAGTGATCATTGCCACCACCAACCTGTACAGCGGCTTCACCCCTAGAACCATGGTCTGCCCCGACGCTCTGAACAGACGGTTCCACTTTGACATCGACGTGTCCGCCAAGGATGGCTACAAGATCAACTCCAAGCTGGACATCATCAAGGCCCTCGAGGACACCCACGCCAATCCTGTGGCCATGTTCCAGTACGATTGCGCCCTGCTGAATGGCATGGCCGTGGAAATGAAGCGGATGCAGCAGGACATGTTCAAGCCCCAGCCTCCACTGCAGAACGTGTACCAGCTCGTGCAAGAAGTGATCGACCGGGTCGAGCTGCACGAGAAGGTGTCCTCTCATCCCATCTTCAAGCAG [서열번호 121]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 121에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 121의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 122로 제공된다:
CUGAAGGCCAGAGACAUCAACGACAUCUUCGCCAUCCUGAAGAACGGCGAGUGGCUGGUCAAGCUGAUCCUGGCCAUCAGAGACUGGAUCAAGGCCUGGAUCGCCAGCGAAGAGAAGUUCGUGACCAUGACCGAUCUGGUGCCCGGCAUCCUGGAAAAGCAGAGGGACCUGAACGACCCCAGCAAGUACAAAGAGGCCAAAGAAUGGCUGGACAACGCCAGACAGGCCUGCCUGAAGUCCGGCAAUGUGCAUAUCGCCAACCUGUGCAAGGUGGUGGCCCCUGCUCCUAGCAAGUCUAGACCUGAGCCUGUGGUCGUGUGCCUGAGAGGCAAAUCUGGCCAGGGCAAGAGCUUCCUGGCCAAUGUUCUGGCCCAGGCCAUCAGCACCCACUUCACCGGAAGAAUCGACAGCGUGUGGUACUGCCCUCCUGAUCCUGACCACUUCGACGGCUACAACCAGCAGACCGUGGUGGUCAUGGACGACCUGGGACAGAACCCCGACGGCAAGGACUUCAAGUACUUCGCCCAGAUGGUGUCCACCACCGGCUUCAUUCCUCCAAUGGCCAGCCUGGAAGAUAAGGGCAAGCCCUUCAACAGCAAAGUGAUCAUUGCCACCACCAACCUGUACAGCGGCUUCACCCCUAGAACCAUGGUCUGCCCCGACGCUCUGAACAGACGGUUCCACUUUGACAUCGACGUGUCCGCCAAGGAUGGCUACAAGAUCAACUCCAAGCUGGACAUCAUCAAGGCCCUCGAGGACACCCACGCCAAUCCUGUGGCCAUGUUCCAGUACGAUUGCGCCCUGCUGAAUGGCAUGGCCGUGGAAAUGAAGCGGAUGCAGCAGGACAUGUUCAAGCCCCAGCCUCCACUGCAGAACGUGUACCAGCUCGUGCAAGAAGUGAUCGACCGGGUCGAGCUGCACGAGAAGGUGUCCUCUCAUCCCAUCUUCAAGCAG [서열번호 122]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 122에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 버나바이러스 VP3(조류 전염성 파브리우스낭병 바이러스(IBDV)(감보로(Gumboro) 질환 바이러스) 캡시드 단백질 VP3), 또는 그의 동원체이다. [Ye C, Jia L, Sun Y, Hu B, Wang L, Xingmeng L, Zu J (2014) Inhibition of antiviral innate immunity by birnavirus VP3 protein via blockage of viral double-stranded RNA binding to the host cytoplasmic RNA detector MDA5. J Virol. 88, 18, 11154-11156]. 버나바이러스 VP3의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 123으로 나타낸다:
ASEFKETPELESAVRAMEAAANVDPLFQSALSVFMWLEENGIVTDMANFALSDPNAHRMRNFLANAPQAGSKSQRAKYGTAGYGVEARGPTPEEAQREKDTRISKKMETMGIYFATPEWVALNGHRGPSPGQLKYWQNTREIPDPNEDYLDYVHAEKSRLASEEQILRAATSIYGAPGQAEPPQAFIDEVAKVYEINHGRGPNQEQMKDLLLTAMEMKHRNPRRALPKPKPKPNAPTQRPPGRLGRWIRTVSDEDLE [서열번호 123]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 123에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 버나바이러스 VP3 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 124의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GCATCAGAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGTGCCGTCAGAGCAATGGAAGCAGCAGCCAACGTGGACCCACTATTCCAATCTGCACTCAGTGTGTTCATGTGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGACATGGCCAACTTCGCACTCAGCGACCCGAACGCCCATCGGATGCGAAATTTTCTTGCAAACGCACCACAAGCAGGCAGCAAGTCGCAAAGGGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTGGAGGCTCGGGGCCCCACACCAGAGGAAGCACAGAGGGAAAAAGACACACGGATCTCAAAGAAGATGGAGACCATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAATGGGTAGCACTCAATGGGCACCGAGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTAAAGTACTGGCAGAACACACGAGAAATACCGGACCCAAACGAGGACTATCTAGACTACGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCATCAGAAGAACAAATCCTAAGGGCAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCTTTCATAGACGAAGTTGCCAAAGTCTATGAAATCAACCATGGACGTGGCCCAAACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGCATCGCAATCCCAGGCGGGCTCTACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGCTCCAACACAGAGACCCCCTGGTCGGCTGGGCCGCTGGATCAGGACCGTCTCTGATGAGGACCTTGAG [서열번호 124]
따라서, 바람직하게는 상기 버나바이러스 VP3 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 124에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 버나바이러스 VP3 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 125로 제공된다:
GCCAGCGAGTTCAAAGAGACACCCGAGCTGGAAAGCGCCGTCAGAGCTATGGAAGCCGCCGCTAATGTGGACCCTCTGTTTCAGTCTGCCCTGAGCGTGTTCATGTGGCTGGAAGAGAACGGCATCGTGACCGACATGGCCAACTTCGCCCTGTCTGACCCCAACGCTCACCGGATGAGAAACTTTCTGGCCAACGCTCCTCAGGCCGGCAGCAAGTCTCAGAGAGCCAAATACGGCACAGCCGGCTACGGCGTGGAAGCCAGAGGACCTACACCTGAGGAAGCCCAGAGAGAGAAGGACACCCGGATCAGCAAGAAAATGGAAACCATGGGCATCTACTTCGCCACACCTGAGTGGGTCGCCCTGAATGGACACAGAGGACCATCTCCAGGCCAGCTGAAGTACTGGCAGAACACCAGAGAGATCCCCGATCCTAACGAGGACTACCTGGACTACGTGCACGCCGAGAAAAGCAGACTGGCCAGCGAGGAACAGATCCTGAGAGCCGCCACATCCATCTATGGCGCTCCAGGACAAGCCGAACCTCCACAGGCCTTTATCGACGAGGTGGCCAAGGTGTACGAGATCAACCACGGCAGAGGCCCCAATCAAGAGCAGATGAAGGACCTGCTGCTGACCGCCATGGAAATGAAGCACAGAAACCCCAGACGGGCCCTGCCTAAGCCAAAGCCTAAACCTAACGCTCCCACACAGCGGCCTCCAGGCAGACTCGGAAGATGGATCAGAACCGTGTCCGACGAGGACCTGGAA [서열번호 125]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 125에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 125의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 126으로 제공된다:
GCCAGCGAGUUCAAAGAGACACCCGAGCUGGAAAGCGCCGUCAGAGCUAUGGAAGCCGCCGCUAAUGUGGACCCUCUGUUUCAGUCUGCCCUGAGCGUGUUCAUGUGGCUGGAAGAGAACGGCAUCGUGACCGACAUGGCCAACUUCGCCCUGUCUGACCCCAACGCUCACCGGAUGAGAAACUUUCUGGCCAACGCUCCUCAGGCCGGCAGCAAGUCUCAGAGAGCCAAAUACGGCACAGCCGGCUACGGCGUGGAAGCCAGAGGACCUACACCUGAGGAAGCCCAGAGAGAGAAGGACACCCGGAUCAGCAAGAAAAUGGAAACCAUGGGCAUCUACUUCGCCACACCUGAGUGGGUCGCCCUGAAUGGACACAGAGGACCAUCUCCAGGCCAGCUGAAGUACUGGCAGAACACCAGAGAGAUCCCCGAUCCUAACGAGGACUACCUGGACUACGUGCACGCCGAGAAAAGCAGACUGGCCAGCGAGGAACAGAUCCUGAGAGCCGCCACAUCCAUCUAUGGCGCUCCAGGACAAGCCGAACCUCCACAGGCCUUUAUCGACGAGGUGGCCAAGGUGUACGAGAUCAACCACGGCAGAGGCCCCAAUCAAGAGCAGAUGAAGGACCUGCUGCUGACCGCCAUGGAAAUGAAGCACAGAAACCCCAGACGGGCCCUGCCUAAGCCAAAGCCUAAACCUAACGCUCCCACACAGCGGCCUCCAGGCAGACUCGGAAGAUGGAUCAGAACCGUGUCCGACGAGGACCUGGAA [서열번호 126]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 126에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 돼지 델타 코로나바이러스 NS6 단백질(A0A0K2D1N4), 또는 그의 동원체이다. [Fang P, Fang L, Ren J, Hong Y, Liu X, Zhao Y, Wang D, Peng G, Xiai S (2018) Porcine deltacoronavirus accessory protein NS6 antagonises interferon beta production by interfering with the binding of RIG-I/MDA-5 to double stranded RNA. J Virol., 92, 15, e00712-18]. 돼지 델타 코로나바이러스 NS6의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 127로 나타낸다:
MCNCHLQLRDLYRLCNKLHIRRDDVPELIDPLVKTRCFAYSLVVLANANPIAFSILPRKILINGEPLLLEYGSIYGKDFIIRPSLQVILEDELN [서열번호 127]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 127에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 돼지 델타 코로나바이러스 NS6 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 128의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGTGCAACTGCCATCTGCAGCTGCGAGATTTATATAGATTGTGCAATAAGCTGCACATCAGAAGAGACGATGTTCCTGAGCTTATTGACCCTCTCGTTAAAACTCGCTGTTTTGCTTACAGTCTCGTGGTTCTTGCTAATGCTAATCCAATTGCATTTAGCATACTACCTCGGAAAATTCTTATCAATGGTGAGCCTTTACTGCTTGAATATGGTAGCATATATGGTAAAGACTTTATCATTAGACCATCGCTCCAAGTCATTCTTGAAGATGAATTAAAT [서열번호 128]
따라서, 바람직하게는 상기 돼지 델타 코로나바이러스 NS6 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 128에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 돼지 델타 코로나바이러스 NS6 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 129로 제공된다:
ATGTGCAACTGCCATCTGCAGCTGCGGGACCTGTACCGGCTGTGTAACAAGCTGCACATCAGACGGGACGACGTGCCCGAGCTGATCGATCCTCTGGTCAAGACCAGATGCTTCGCCTACAGCCTGGTGGTGCTGGCCAACGCCAATCCTATCGCCTTCAGCATCCTGCCTCGGAAGATCCTGATCAACGGCGAGCCTCTGCTGCTGGAATACGGCAGCATCTACGGCAAGGACTTCATCATCAGACCCAGCCTGCAAGTGATCCTGGAAGATGAGCTGAACTGA [서열번호 129]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 129에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 129의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 130으로 제공된다:
AUGUGCAACUGCCAUCUGCAGCUGCGGGACCUGUACCGGCUGUGUAACAAGCUGCACAUCAGACGGGACGACGUGCCCGAGCUGAUCGAUCCUCUGGUCAAGACCAGAUGCUUCGCCUACAGCCUGGUGGUGCUGGCCAACGCCAAUCCUAUCGCCUUCAGCAUCCUGCCUCGGAAGAUCCUGAUCAACGGCGAGCCUCUGCUGCUGGAAUACGGCAGCAUCUACGGCAAGGACUUCAUCAUCAGACCCAGCCUGCAAGUGAUCCUGGAAGAUGAGCUGAACUGA [서열번호 130]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 130에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 LASV Z 단백질(O73557|RING 핑거(finger) 단백질 Z 라사 바이러스(Lassa virus)(마우스/시에라리온/조시아/1976 바이러스주), 또는 그의 동원체이다. [Xing J, Ly H, Liang YJ (2015) The Z proteins of pathogenic but not nonpathogenic arenaviruses inhibit RIG-I-like receptor-dependent interferon production. J Virol., 89, 5, 2944-2955]. LASV Z의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 131로 나타낸다:
MGNKQAKAPESKDSPRASLIPDATHLGPQFCKSCWFENKGLVECNNHYLCLNCLTLLLSVSNRCPICKMPLPTKLRPSAAPTAPPTGAADSIRPPPYSP [서열번호 131]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 131에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 LASV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 132의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGAAACAAGCAAGCCAAAGCCCCAGAATCAAAAGACAGTCCGAGAGCCAGCCTGATCCCAGATGCCACACATCTAGGGCCACAGTTCTGTAAGAGCTGCTGGTTCGAAAACAAGGGCCTGGTTGAGTGCAACAACCACTATCTGTGTCTCAACTGCCTCACCTTACTTCTAAGTGTCAGCAACAGGTGTCCCATTTGCAAGATGCCTCTCCCCACAAAACTGAGACCATCAGCCGCTCCAACAGCACCTCCAACCGGAGCAGCGGACAGCATCAGACCCCCACCCTACAGTCCC [서열번호 132]
따라서, 바람직하게는 상기 LASV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 132에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 LASV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 133으로 제공된다:
ATGGGCAACAAGCAGGCCAAGGCTCCCGAGAGCAAGGATAGCCCTAGAGCCTCTCTGATCCCCGACGCCACACATCTGGGACCCCAGTTCTGCAAGAGCTGTTGGTTCGAGAACAAAGGCCTGGTGGAATGCAACAACCACTACCTGTGCCTGAACTGTCTGACCCTGCTGCTGAGCGTGTCCAACAGATGCCCCATCTGCAAGATGCCCCTGCCTACCAAGCTGAGGCCTTCTGCTGCTCCTACAGCTCCTCCAACAGGCGCCGCTGATAGCATCAGACCTCCACCTTATAGCCCC [서열번호 133]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 133에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 133의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 134로 제공된다:
AUGGGCAACAAGCAGGCCAAGGCUCCCGAGAGCAAGGAUAGCCCUAGAGCCUCUCUGAUCCCCGACGCCACACAUCUGGGACCCCAGUUCUGCAAGAGCUGUUGGUUCGAGAACAAAGGCCUGGUGGAAUGCAACAACCACUACCUGUGCCUGAACUGUCUGACCCUGCUGCUGAGCGUGUCCAACAGAUGCCCCAUCUGCAAGAUGCCCCUGCCUACCAAGCUGAGGCCUUCUGCUGCUCCUACAGCUCCUCCAACAGGCGCCGCUGAUAGCAUCAGACCUCCACCUUAUAGCCCC [서열번호 134]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 134에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DANV Z 단백질(B1NX60; RING 핑거 단백질 Z 단데농 바이러스(Dandenong virus)), 또는 그의 동원체이다. DANV Z의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 135로 나타낸다:
MGQAKSKETKLSKKEDRAEVLPDATYLGPLNCKSCWQRFDSLVRCHDHYLCRQCLNLLLTVSDRCPLCKHPLPTKLRVSTAPSSPPPYEE [서열번호 135]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 135에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DANV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 136의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGTCAAGCAAAATCCAAAGAAACAAAGCTCTCCAAGAAAGAGGACAGAGCAGAGGTTCTACCTGACGCAACCTATCTTGGTCCTCTGAACTGCAAATCATGCTGGCAAAGGTTCGACAGTTTGGTTAGGTGCCATGACCACTACCTATGCAGGCAATGTCTGAACCTTTTGTTGACAGTCTCAGACAGATGCCCTCTCTGCAAACACCCTCTACCGACCAAGCTGAGGGTGTCGACAGCCCCCAGCTCACCTCCCCCCTACGAGGAG [서열번호 136]
따라서, 바람직하게는 상기 DANV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 136에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DANV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 137로 제공된다:
ATGGGCCAAGCCAAGAGCAAAGAGACAAAGCTGAGCAAGAAAGAGGACCGCGCCGAGGTTCTGCCCGATGCCACATATCTGGGCCCTCTGAACTGCAAGAGCTGCTGGCAGAGATTCGACAGCCTCGTGCGGTGCCACGATCACTACCTGTGCAGACAGTGCCTGAACCTGCTGCTGACCGTGTCCGATAGATGCCCTCTGTGCAAGCACCCTCTGCCTACCAAGCTGAGAGTGTCCACCGCTCCTAGCAGCCCTCCACCTTATGAGGAA [서열번호 137]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 137에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 137의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 138로 제공된다:
AUGGGCCAAGCCAAGAGCAAAGAGACAAAGCUGAGCAAGAAAGAGGACCGCGCCGAGGUUCUGCCCGAUGCCACAUAUCUGGGCCCUCUGAACUGCAAGAGCUGCUGGCAGAGAUUCGACAGCCUCGUGCGGUGCCACGAUCACUACCUGUGCAGACAGUGCCUGAACCUGCUGCUGACCGUGUCCGAUAGAUGCCCUCUGUGCAAGCACCCUCUGCCUACCAAGCUGAGAGUGUCCACCGCUCCUAGCAGCCCUCCACCUUAUGAGGAA [서열번호 138]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 138에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 LCMV Z 단백질(P18541; RING 핑거 단백질 Z 림프구성 맥락수막염 바이러스(암스트롱 바이러스주), 또는 그의 동원체이다. LCMV Z 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 139로 제공된다:
MGQGKSREEKGTNSTNRAEILPDTTYLGPLSCKSCWQKFDSLVRCHDHYLCRHCLNLLLSVSDRCPLCKYPLPTRLKISTAPSSPPPYEE [서열번호 139]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 139에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 LCMV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 140의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGTCAAGGCAAGTCCAGAGAGGAGAAAGGCACCAATAGTACAAACAGGGCCGAAATCCTACCAGATACCACCTATCTTGGCCCTTTAAGCTGCAAATCTTGCTGGCAGAAATTTGACAGCTTGGTAAGATGCCATGACCACTACCTTTGCAGGCACTGTTTAAACCTTCTGCTGTCAGTATCCGACAGGTGTCCTCTTTGTAAATATCCATTACCAACCAGATTGAAGATATCAACAGCCCCAAGCTCTCCACCTCCCTACGAAGAG [서열번호 140]
따라서, 바람직하게는 상기 LCMV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 140에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 LCMV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 141로 제공된다:
ATGGGCCAGGGCAAGTCCAGAGAGGAAAAGGGCACCAACTCCACCAACCGGGCCGAGATCCTGCCTGACACCACATATCTGGGCCCTCTGAGCTGCAAGAGCTGCTGGCAGAAATTCGACAGCCTCGTGCGGTGCCACGACCACTACCTGTGTAGACACTGCCTGAACCTGCTGCTGAGCGTGTCCGATAGATGCCCTCTGTGCAAGTACCCTCTGCCTACCAGACTGAAGATCAGCACAGCCCCTAGCAGCCCTCCACCTTACGAAGAA [서열번호 141]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 141에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 141의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 142로 제공된다:
AUGGGCCAGGGCAAGUCCAGAGAGGAAAAGGGCACCAACUCCACCAACCGGGCCGAGAUCCUGCCUGACACCACAUAUCUGGGCCCUCUGAGCUGCAAGAGCUGCUGGCAGAAAUUCGACAGCCUCGUGCGGUGCCACGACCACUACCUGUGUAGACACUGCCUGAACCUGCUGCUGAGCGUGUCCGAUAGAUGCCCUCUGUGCAAGUACCCUCUGCCUACCAGACUGAAGAUCAGCACAGCCCCUAGCAGCCCUCCACCUUACGAAGAA [서열번호 142]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 142에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 LUJV Z 단백질(C5ILC3; 다기능성 매트릭스-유사 단백질 Z Lujp 맘마레나바이러스(mammarenavirus)), 또는 그의 동원체이다. LUJV Z 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 143으로 나타낸다:
MGQRHSSGSGQPNPKPSDSDHEARRSELHSDASHLGPLNCKSCWKSKKALVKCYDHYLCLNCLSLLMGITPRCPFCYRELPKNLDLAEAPSAPPL [서열번호 143]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 143에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 LUJV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 144의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGTCAGAGACATTCCTCTGGCTCCGGCCAACCCAACCCCAAGCCGAGTGACAGCGATCATGAAGCGAGAAGGTCAGAGCTTCACTCGGACGCCTCCCATCTCGGACCTCTGAACTGCAAATCTTGCTGGAAGTCAAAGAAGGCACTGGTGAAGTGCTATGATCACTACCTCTGTCTAAACTGCTTAAGCCTTCTAATGGGCATCACCCCAAGATGTCCCTTCTGTTACAGAGAGCTACCCAAAAATCTGGACCTTGCAGAGGCACCAAGCGCACCACCCCTC [서열번호 144]
따라서, 바람직하게는 상기 LUJV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 144에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 LUJV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 145로 제공된다:
ATGGGCCAGAGACACAGCTCTGGAAGCGGCCAGCCTAATCCTAAGCCTAGCGACAGCGATCACGAGGCCAGAAGAAGCGAGCTGCACTCCGATGCCTCTCACCTGGGACCTCTGAACTGCAAGAGCTGCTGGAAGTCCAAGAAAGCCCTGGTCAAGTGCTACGACCACTACCTGTGCCTGAACTGCCTGAGCCTGCTGATGGGCATTACCCCTAGATGCCCCTTCTGCTACAGAGAGCTGCCCAAGAACCTGGACCTGGCCGAAGCTCCTTCTGCTCCTCCTCTG [서열번호 145]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 145에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 145의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 146으로 제공된다:
AUGGGCCAGAGACACAGCUCUGGAAGCGGCCAGCCUAAUCCUAAGCCUAGCGACAGCGAUCACGAGGCCAGAAGAAGCGAGCUGCACUCCGAUGCCUCUCACCUGGGACCUCUGAACUGCAAGAGCUGCUGGAAGUCCAAGAAAGCCCUGGUCAAGUGCUACGACCACUACCUGUGCCUGAACUGCCUGAGCCUGCUGAUGGGCAUUACCCCUAGAUGCCCCUUCUGCUACAGAGAGCUGCCCAAGAACCUGGACCUGGCCGAAGCUCCUUCUGCUCCUCCUCUG [서열번호 146]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 146에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 CHPV Z 단백질(B2C4J2; RING 핑거 단백질 Z 차파레(Chapare) 맘마레나바이러스(인간/볼리비아/810419/2003 단리물)), 또는 그의 동원체이다. CHPV Z 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 147로 나타낸다:
MGNTKTKDRQYQSNSSQPTNTSAPVLLRRQAEPSLYGRHNCRCCWFADTNLVNCSNHYLCLKCLNTMLRRSNLCDICGEELPTTIIVPVEPSAPLPGQ [서열번호 147]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 147에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 CHPV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 148의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGTAACACCAAAACAAAGGACAGACAGTATCAATCGAACTCAAGCCAACCCACAAACACATCTGCACCAGTTCTGCTGAGAAGGCAGGCAGAACCAAGTCTGTATGGGAGACACAACTGCAGATGCTGTTGGTTTGCAGACACAAACCTAGTCAATTGTTCCAACCACTACCTTTGCCTTAAATGTCTGAACACAATGTTAAGAAGATCCAATCTCTGTGACATATGCGGTGAAGAACTTCCCACAACAATCATTGTTCCAGTGGAACCATCAGCACCACTGCCCGGACAA [서열번호 148]
따라서, 바람직하게는 상기 CHPV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 148에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 CHPV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 149로 제공된다:
ATGGGCAACACCAAGACCAAGGACCGGCAGTACCAGAGCAACAGCAGCCAGCCTACCAACACATCTGCCCCTGTGCTGCTGAGAAGGCAGGCCGAGCCTTCTCTGTACGGCAGACACAACTGCCGGTGCTGTTGGTTCGCCGACACCAACCTGGTCAACTGCAGCAACCACTACCTGTGCCTGAAGTGTCTGAACACCATGCTGCGGCGGAGCAACCTGTGCGATATCTGTGGCGAGGAACTGCCCACCACCATCATCGTGCCTGTGGAACCTTCTGCTCCTCTGCCTGGACAG [서열번호 149]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 149에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 149의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 150으로 제공된다:
AUGGGCAACACCAAGACCAAGGACCGGCAGUACCAGAGCAACAGCAGCCAGCCUACCAACACAUCUGCCCCUGUGCUGCUGAGAAGGCAGGCCGAGCCUUCUCUGUACGGCAGACACAACUGCCGGUGCUGUUGGUUCGCCGACACCAACCUGGUCAACUGCAGCAACCACUACCUGUGCCUGAAGUGUCUGAACACCAUGCUGCGGCGGAGCAACCUGUGCGAUAUCUGUGGCGAGGAACUGCCCACCACCAUCAUCGUGCCUGUGGAACCUUCUGCUCCUCUGCCUGGACAG [서열번호 150]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 150에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 MACV Z 단백질(Q6IUF9; RING 핑거 단백질 Z 마추포 바이러스(Machupo virus)), 또는 그의 동원체이다. MACV Z 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 151로 나타낸다:
MGNCNKPPKRPPNTQTSAAQPSAEFRRTALPSLYGRYNCKCCWFADTNLITCNDHYLCLRCHQTMLRNSELCHICWKPLPTSITVPVEPSAPPP [서열번호 151]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 151에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 MACV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 152의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGCAACTGTAACAAGCCTCCCAAGAGGCCTCCCAACACACAAACATCAGCCGCCCAGCCCTCAGCAGAGTTCAGGAGAACAGCCCTACCCAGTCTCTATGGTCGCTACAACTGCAAATGTTGTTGGTTTGCCGACACAAACTTGATTACATGTAACGACCACTACTTGTGTCTGAGATGTCATCAAACAATGCTCAGGAATTCTGAACTCTGTCACATATGCTGGAAACCACTACCGACATCCATCACAGTCCCCGTGGAGCCAAGCGCCCCCCCACCA [서열번호 152]
따라서, 바람직하게는 상기 MACV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 152에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 MACV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 153으로 제공된다:
ATGGGCAACTGCAACAAGCCTCCTAAGCGGCCTCCTAACACACAGACATCTGCCGCTCAGCCTAGCGCCGAGTTCAGAAGAACAGCCCTGCCTAGCCTGTACGGCCGGTACAACTGCAAGTGCTGTTGGTTCGCCGACACCAACCTGATCACCTGTAACGACCACTACCTGTGCCTGCGGTGCCACCAGACCATGCTGAGAAATAGCGAGCTGTGCCACATCTGCTGGAAGCCCCTGCCTACCAGCATCACCGTGCCTGTGGAACCTTCTGCTCCTCCTCCT [서열번호 153]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 153에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 153의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 154로 제공된다:
AUGGGCAACUGCAACAAGCCUCCUAAGCGGCCUCCUAACACACAGACAUCUGCCGCUCAGCCUAGCGCCGAGUUCAGAAGAACAGCCCUGCCUAGCCUGUACGGCCGGUACAACUGCAAGUGCUGUUGGUUCGCCGACACCAACCUGAUCACCUGUAACGACCACUACCUGUGCCUGCGGUGCCACCAGACCAUGCUGAGAAAUAGCGAGCUGUGCCACAUCUGCUGGAAGCCCCUGCCUACCAGCAUCACCGUGCCUGUGGAACCUUCUGCUCCUCCUCCU [서열번호 154]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 154에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 GTOV Z 단백질(Q6UY71; RING 핑거 단백질 Z 구아나리토(Guanarito) 맘마레나바이러스(인간/베네수엘라/NH-95551/1990 단리물)), 또는 그의 동원체이다. GTOV Z 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 155로 나타낸다:
MGNSKSKSNPSSSSESQKGAPTVTEFRRTAIHSLYGRYNCKCCWFADKNLIKCSDHYLCLRCLNVMLKNSDLCNICWEQLPTCITVPEEPSAPPE [서열번호 155]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 155에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 GTOV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 156의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGCAATTCAAAATCTAAATCCAACCCATCCAGTTCCTCAGAGTCTCAAAAAGGGGCACCAACAGTCACAGAATTTAGGAGGACTGCCATTCACAGTCTCTATGGGAGGTACAACTGCAAGTGTTGCTGGTTTGCTGACAAGAATCTGATTAAATGCTCTGATCATTACCTCTGCTTGAGGTGTTTAAATGTCATGCTGAAAAACTCTGATCTTTGCAACATTTGTTGGGAGCAGCTGCCCACATGCATCACAGTTCCGGAGGAGCCAAGCGCTCCACCGGAA [서열번호 156]
따라서, 바람직하게는 상기 GTOV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 156에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 GTOV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 157로 제공된다:
ATGGGCAACAGCAAGTCCAAGAGCAACCCCAGCAGCAGCTCCGAGTCTCAGAAAGGCGCTCCTACCGTGACCGAGTTCAGAAGAACAGCCATCCACAGCCTGTACGGCCGGTACAACTGCAAGTGCTGTTGGTTCGCCGACAAGAACCTGATCAAGTGCAGCGACCACTACCTGTGCCTGCGGTGCCTGAACGTGATGCTGAAGAACTCCGACCTGTGCAACATCTGCTGGGAGCAGCTGCCTACCTGCATCACCGTGCCTGAGGAACCTTCTGCTCCTCCTGAA [서열번호 157]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 157에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 157의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 158로 제공된다:
AUGGGCAACAGCAAGUCCAAGAGCAACCCCAGCAGCAGCUCCGAGUCUCAGAAAGGCGCUCCUACCGUGACCGAGUUCAGAAGAACAGCCAUCCACAGCCUGUACGGCCGGUACAACUGCAAGUGCUGUUGGUUCGCCGACAAGAACCUGAUCAAGUGCAGCGACCACUACCUGUGCCUGCGGUGCCUGAACGUGAUGCUGAAGAACUCCGACCUGUGCAACAUCUGCUGGGAGCAGCUGCCUACCUGCAUCACCGUGCCUGAGGAACCUUCUGCUCCUCCUGAA [서열번호 158]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 158에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 JUNV Z 단백질(Q6IVU5; RING 핑거 단백질 Z OS=주닌(Junin) 맘마레나바이러스), 또는 그의 동원체이다. JUNV Z의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 159로 나타낸다:
MGNCNGASKSNQPDSSRVTQPAAEFRRVAHSSLYGRYNCKCCWFADTNLITCNDHYLCLRCHQVMLRNSDLCNICWKPLPTTITVPVEPTAPPP [서열번호 159]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 159에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 JUNV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 160의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGCAACTGCAACGGGGCATCCAAGTCAAACCAGCCAGACTCTTCAAGGGTCACACAGCCAGCCGCAGAATTCAGGAGGGTGGCTCACAGCAGTCTATATGGTAGATACAACTGCAAGTGCTGCTGGTTTGCTGACACCAATCTGATAACCTGCAATGATCACTACCTTTGTTTAAGGTGCCATCAGGTTATGTTAAGGAATTCGGACCTCTGCAATATCTGTTGGAAGCCCCTACCTACCACAATCACAGTGCCGGTGGAGCCAACAGCACCACCACCA [서열번호 160]
따라서, 바람직하게는 상기 JUNV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 160에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 JUNV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 161로 제공된다:
ATGGGCAATTGCAACGGCGCCAGCAAGAGCAACCAGCCTGATAGCAGCAGAGTGACACAGCCTGCCGCCGAGTTTAGAAGAGTGGCCCACAGCAGCCTGTACGGCCGGTACAATTGCAAGTGCTGTTGGTTCGCCGACACCAACCTGATCACCTGTAACGACCACTACCTGTGCCTGCGGTGCCACCAAGTGATGCTGAGAAACAGCGACCTGTGCAACATCTGCTGGAAGCCCCTGCCTACCACCATCACCGTGCCTGTGGAACCTACAGCTCCTCCTCCT [서열번호 161]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 161에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 161의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 162로 제공된다:
AUGGGCAAUUGCAACGGCGCCAGCAAGAGCAACCAGCCUGAUAGCAGCAGAGUGACACAGCCUGCCGCCGAGUUUAGAAGAGUGGCCCACAGCAGCCUGUACGGCCGGUACAAUUGCAAGUGCUGUUGGUUCGCCGACACCAACCUGAUCACCUGUAACGACCACUACCUGUGCCUGCGGUGCCACCAAGUGAUGCUGAGAAACAGCGACCUGUGCAACAUCUGCUGGAAGCCCCUGCCUACCACCAUCACCGUGCCUGUGGAACCUACAGCUCCUCCUCCU [서열번호 162]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 162에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 SABV Z 단백질(Q6UY62; RING 핑거 단백질 Z 사비아(Sabia) 맘마레나바이러스(인간/브라질/SPH114202/1990) 단리물), 또는 그의 동원체이다. SABV Z 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 163으로 나타낸다:
MGNSKSKSKLSANQYEQQTVNSTKQVAILKRQAEPSLYGRHNCRCCWFANTNLIKCSDHYICLKCLNIMLGKSSFCDICGEELPTSIVVPIEPSAPPPED [서열번호 163]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 163에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SABV Z 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 164의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGTAACTCCAAGTCAAAATCAAAGCTGTCTGCTAACCAGTATGAACAGCAAACAGTCAATAGCACCAAACAGGTAGCCATTTTAAAGAGACAGGCTGAACCTAGTCTGTATGGAAGACACAACTGCAGGTGCTGCTGGTTCGCCAATACAAATCTAATAAAATGTTCCGACCATTATATTTGTCTAAAATGTTTGAACATAATGTTGGGGAAGTCTTCTTTTTGTGACATTTGTGGTGAAGAGCTCCCCACATCCATTGTGGTGCCCATCGAACCAAGTGCTCCACCTCCAGAAGAC [서열번호 164]
따라서, 바람직하게는 상기 SABV Z 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 164에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 SABV Z 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 165로 제공된다:
ATGGGCAACAGCAAGAGCAAGTCCAAGCTGAGCGCCAACCAGTACGAGCAGCAGACCGTGAACAGCACCAAACAGGTGGCCATCCTGAAGAGACAGGCCGAGCCTAGCCTGTACGGCAGACACAACTGCCGGTGTTGTTGGTTCGCCAACACCAACCTGATCAAGTGCAGCGACCACTACATCTGCCTGAAGTGCCTGAACATCATGCTGGGCAAGAGCAGCTTCTGCGACATCTGCGGAGAGGAACTGCCCACCTCTATCGTGGTGCCTATCGAGCCTTCTGCTCCTCCACCTGAGGAT [서열번호 165]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 165에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 165의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 166으로 제공된다:
AUGGGCAACAGCAAGAGCAAGUCCAAGCUGAGCGCCAACCAGUACGAGCAGCAGACCGUGAACAGCACCAAACAGGUGGCCAUCCUGAAGAGACAGGCCGAGCCUAGCCUGUACGGCAGACACAACUGCCGGUGUUGUUGGUUCGCCAACACCAACCUGAUCAAGUGCAGCGACCACUACAUCUGCCUGAAGUGCCUGAACAUCAUGCUGGGCAAGAGCAGCUUCUGCGACAUCUGCGGAGAGGAACUGCCCACCUCUAUCGUGGUGCCUAUCGAGCCUUCUGCUCCUCCACCUGAGGAU [서열번호 166]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 166에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 3C 프로테아제 단백질일 수 있다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 CV-A16 3C 프로테아제(Q9QF31; 콕사키바이러스 A16(타이난/5079/98 프로테아제 3C 바이러스주), 또는 그의 동원체이다. [Rui Y, Su Jm Wang H, Chang J, Wang S, Zhenf W, Cai Y, Gordy JT, Markham R, Kong W, Zhang W, Yu X-F. (2017) Disruption of MDA5-Mediated Innate Immune Responses by the 3C Proteins of Coxsackievirus A16, Coxsackievirus A6, and Enterovirus D68. J Virol 91, 13, e00546-17]. CV-A16 3C 프로테아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 167로 나타낸다:
GPSLDFALSLLRRNIRQVQTDQGHFTMLGVRDRLAILPRHSQPGKTIWVEHKLINVLDAVELVDEQGVNLELTLVTLDTNEKFRDVTKFIPETITGASDATLVINTEHMPSMFVPVGDVVQYGFLNLSGKPTHRTMMYNFPTKAGQCGGVVTSVGKIIGIHIGGNGRQGFCAGLKRGYFASEQ [서열번호 167]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 167에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 CV-A16 3C 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 168의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGACCGAGCTTAGACTTTGCCTTATCCCTCCTAAGGCGCAACATTAGACAGGTGCAAACCGACCAAGGACACTTCACTATGTTAGGGGTGCGAGATCGCCTAGCCATTTTGCCACGCCACTCGCAACCAGGAAAAACTATCTGGGTGGAGCACAAGTTAATTAATGTGCTGGATGCTGTCGAATTAGTGGATGAGCAAGGTGTAAACTTGGAACTCACACTAGTAACCTTAGACACCAACGAAAAGTTTAGGGATGTTACCAAGTTTATTCCAGAGACGATCACCGGGGCAAGCGACGCAACCTTGGTCATCAACACTGAGCACATGCCCTCAATGTTCGTTCCAGTGGGTGATGTTGTACAATATGGATTTCTGAATCTCAGCGGTAAGCCCACACACCGAACCATGATGTACAATTTCCCCACAAAGGCAGGACAGTGTGGAGGGGTGGTCACCTCAGTCGGTAAGATCATAGGAATTCACATTGGTGGGAATGGACGCCAGGGTTTCTGCGCTGGACTGAAGAGAGGCTATTTTGCCAGTGAACAG [서열번호 168]
따라서, 바람직하게는 상기 CV-A16 3C 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 168에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 CV-A16 3C 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 169로 제공된다:
GGCCCTTCTCTGGATTTTGCCCTGAGCCTGCTGCGGCGGAACATCAGACAGGTGCAGACAGATCAGGGCCACTTCACCATGCTGGGCGTCAGAGACAGACTGGCCATCCTGCCTAGACACAGCCAGCCTGGCAAGACCATCTGGGTCGAGCACAAGCTGATCAACGTGCTGGACGCCGTGGAACTGGTGGATGAACAGGGCGTGAACCTGGAACTGACCCTGGTCACCCTGGACACCAACGAGAAGTTCCGGGACGTGACCAAGTTCATCCCCGAGACAATCACCGGCGCCTCCGATGCCACACTGGTCATCAATACCGAGCACATGCCCTCCATGTTCGTGCCTGTGGGAGATGTGGTGCAGTACGGCTTCCTGAACCTGAGCGGCAAGCCCACACACCGGACCATGATGTACAACTTCCCTACCAAGGCCGGCCAGTGCGGCGGAGTGGTTACATCTGTGGGCAAGATCATCGGCATCCACATCGGCGGCAATGGCAGACAGGGATTTTGTGCCGGCCTGAAGAGAGGCTACTTCGCCTCTGAACAG [서열번호 169]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 169에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 169의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 170으로 제공된다:
GGCCCUUCUCUGGAUUUUGCCCUGAGCCUGCUGCGGCGGAACAUCAGACAGGUGCAGACAGAUCAGGGCCACUUCACCAUGCUGGGCGUCAGAGACAGACUGGCCAUCCUGCCUAGACACAGCCAGCCUGGCAAGACCAUCUGGGUCGAGCACAAGCUGAUCAACGUGCUGGACGCCGUGGAACUGGUGGAUGAACAGGGCGUGAACCUGGAACUGACCCUGGUCACCCUGGACACCAACGAGAAGUUCCGGGACGUGACCAAGUUCAUCCCCGAGACAAUCACCGGCGCCUCCGAUGCCACACUGGUCAUCAAUACCGAGCACAUGCCCUCCAUGUUCGUGCCUGUGGGAGAUGUGGUGCAGUACGGCUUCCUGAACCUGAGCGGCAAGCCCACACACCGGACCAUGAUGUACAACUUCCCUACCAAGGCCGGCCAGUGCGGCGGAGUGGUUACAUCUGUGGGCAAGAUCAUCGGCAUCCACAUCGGCGGCAAUGGCAGACAGGGAUUUUGUGCCGGCCUGAAGAGAGGCUACUUCGCCUCUGAACAG [서열번호 170]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 170에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 CV-A6 3C 프로테아제(L7P6C4; 게놈 폴리단백질 콕사키바이러스 A6 프로테아제 3C), 또는 그의 동원체이다. CV-A6 3C 프로테아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 171로 나타낸다:
GPSLDFALSLLRRNIRQVQTDQGHFTMLGVRDRLAVLPRHSQPGKTIWVEHKLVNVVDAVELVDEQGVNLELTLITLDTNEKFRDITKFIPENISAASDATLVINTEHMPSMFVPVGDVVQYGFLNLSGKPTHRTMMYNFPTKAGQCGGVVTSVGKVIGIHIGGNGRQGFCAGLKRSYF [서열번호 171]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 171에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 CV-A6 3C 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 172의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGACCTAGCCTTGATTTTGCCCTATCCCTACTGAGAAGGAACATCAGACAAGTTCAAACGGACCAAGGGCACTTCACCATGCTAGGAGTCAGAGATCGCTTGGCCGTCCTCCCACGACACTCACAACCCGGAAAAACTATCTGGGTAGAGCACAAGCTAGTGAATGTTGTGGATGCTGTCGAACTAGTGGATGAGCAGGGGGTCAACTTAGAGCTGACTTTAATCACCCTCGACACTAATGAGAAGTTTAGAGACATCACCAAATTTATTCCAGAGAATATCAGCGCTGCCAGCGATGCCACTCTAGTGATTAATACAGAGCACATGCCTTCTATGTTTGTGCCAGTAGGTGATGTTGTTCAGTATGGTTTCCTGAATCTTAGTGGGAAACCAACCCACCGCACTATGATGTATAACTTCCCTACCAAGGCAGGACAGTGTGGAGGGGTAGTCACATCAGTTGGAAAGGTCATTGGTATCCACATAGGAGGCAATGGCAGGCAAGGTTTCTGTGCAGGGCTCAAGAGAAGCTACTTT [서열번호 172]
따라서, 바람직하게는 상기 CV-A6 3C 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 172에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 CV-A6 3C 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 173으로 제공된다:
GGCCCTTCTCTGGATTTTGCCCTGAGCCTGCTGCGGCGGAACATCAGACAGGTGCAGACAGATCAGGGCCACTTCACCATGCTGGGCGTCAGAGATAGACTGGCCGTGCTGCCTAGACACAGCCAGCCTGGAAAGACCATCTGGGTCGAGCACAAGCTGGTCAACGTGGTGGATGCCGTGGAACTGGTGGATGAGCAGGGCGTGAACCTGGAACTGACCCTGATCACCCTGGACACCAACGAGAAGTTCCGGGACATCACCAAGTTCATCCCCGAGAACATCAGCGCCGCCTCCGATGCCACACTGGTCATCAATACCGAGCACATGCCCTCCATGTTCGTGCCTGTGGGAGATGTGGTGCAGTACGGCTTCCTGAACCTGAGCGGCAAGCCCACACACCGGACCATGATGTACAACTTCCCTACCAAGGCCGGCCAGTGCGGCGGAGTGGTTACATCTGTGGGCAAAGTGATCGGAATCCACATCGGCGGCAATGGCAGACAGGGCTTTTGTGCCGGCCTGAAGAGAAGCTACTTC [서열번호 173]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 173에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 173의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 174로 제공된다:
GGCCCUUCUCUGGAUUUUGCCCUGAGCCUGCUGCGGCGGAACAUCAGACAGGUGCAGACAGAUCAGGGCCACUUCACCAUGCUGGGCGUCAGAGAUAGACUGGCCGUGCUGCCUAGACACAGCCAGCCUGGAAAGACCAUCUGGGUCGAGCACAAGCUGGUCAACGUGGUGGAUGCCGUGGAACUGGUGGAUGAGCAGGGCGUGAACCUGGAACUGACCCUGAUCACCCUGGACACCAACGAGAAGUUCCGGGACAUCACCAAGUUCAUCCCCGAGAACAUCAGCGCCGCCUCCGAUGCCACACUGGUCAUCAAUACCGAGCACAUGCCCUCCAUGUUCGUGCCUGUGGGAGAUGUGGUGCAGUACGGCUUCCUGAACCUGAGCGGCAAGCCCACACACCGGACCAUGAUGUACAACUUCCCUACCAAGGCCGGCCAGUGCGGCGGAGUGGUUACAUCUGUGGGCAAAGUGAUCGGAAUCCACAUCGGCGGCAAUGGCAGACAGGGCUUUUGUGCCGGCCUGAAGAGAAGCUACUUC [서열번호 174]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 174에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 EV D-68 3C 프로테아제(Q68T42; 게놈 폴리단백질 인간 엔테로바이러스 D68; IRF7 절단), 또는 그의 동원체이다. [Xiang Z, Liu L, Lei X, Zhou Z, He B, Wang J (2015) 3C protease of enterovirus D68 inhibits cellular defense mediated interferon regulatory factor. J Virol., 90, 3, 1613-2161. doi: 10.1128/JVI.02395-15. Print 2016 Feb 1]. EV D-68 3C 프로테아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 175로 나타낸다:
GPGFDFAQAIMKKNTVIARTEKGEFTMLGVYDRVAVIPTHASVGEIIYINDVETRVLDACALRDLTDTNLEITIVKLDRNQKFRDIRHFLPRCEDDYNDAVLSVHTSKFPNMYIPVGQVTNYGFLNLGGTPTHRILMYNFPTRAGQCGGVVTTTGKVIGIHVGGNGAQGFAAMLLHSYFTDTQ [서열번호 175]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 175에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 EV D-68 3C 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 176의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGACCAGGATTTGATTTTGCGCAAGCCATAATGAAGAAAAATACTGTTATTGCTAGAACTGAAAAAGGCGAGTTCACAATGCTTGGTGTGTATGATAGAGTGGCAGTCATTCCAACACATGCATCTGTTGGAGAAATCATTTACATCAACGATGTAGAAACCAGAGTTCTAGATGCATGTGCACTTAGAGACTTGACAGACACAAACCTAGAAATAACTATAGTCAAATTGGATCGCAATCAAAAATTTAGAGACATCAGACACTTTTTACCCAGATGTGAGGATGATTACAATGATGCTGTGCTTAGTGTACATACATCAAAATTCCCTAACATGTACATTCCAGTTGGACAAGTCACTAACTACGGCTTCTTGAACCTGGGCGGCACACCAACACATCGGATTTTAATGTATAATTTTCCAACAAGAGCTGGTCAGTGTGGTGGTGTGGTGACAACCACAGGTAAAGTGATAGGAATACACGTGGGCGGGAATGGAGCTCAGGGATTCGCAGCAATGTTGCTCCACTCTTACTTTACTGATACACAA [서열번호 176]
따라서, 바람직하게는 상기 EV D-68 3C 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 176에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 EV D-68 3C 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 177로 제공된다:
GGCCCTGGCTTTGATTTTGCCCAGGCCATCATGAAGAAAAACACCGTGATCGCCCGGACCGAGAAGGGCGAGTTTACAATGCTGGGCGTGTACGACAGAGTGGCCGTGATTCCTACACACGCCTCTGTGGGCGAGATCATCTACATCAACGACGTGGAAACCAGAGTGCTGGACGCCTGCGCTCTGAGAGATCTGACCGACACCAACCTGGAAATCACCATCGTGAAGCTGGACCGGAACCAGAAGTTCCGGGACATCCGGCACTTTCTGCCCAGATGCGAGGACGACTACAACGACGCTGTGCTGAGCGTGCACACCAGCAAGTTCCCCAACATGTACATCCCCGTGGGCCAAGTGACCAACTACGGCTTCCTGAATCTCGGCGGCACCCCTACACACCGGATCCTGATGTACAACTTCCCCACCAGAGCCGGCCAGTGTGGCGGAGTGGTTACCACAACAGGCAAAGTGATCGGCATCCACGTCGGCGGAAATGGCGCTCAGGGATTTGCTGCCATGCTGCTGCACAGCTACTTCACCGACACACAG [서열번호 177]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 177에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 177의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 178로 제공된다:
GGCCCUGGCUUUGAUUUUGCCCAGGCCAUCAUGAAGAAAAACACCGUGAUCGCCCGGACCGAGAAGGGCGAGUUUACAAUGCUGGGCGUGUACGACAGAGUGGCCGUGAUUCCUACACACGCCUCUGUGGGCGAGAUCAUCUACAUCAACGACGUGGAAACCAGAGUGCUGGACGCCUGCGCUCUGAGAGAUCUGACCGACACCAACCUGGAAAUCACCAUCGUGAAGCUGGACCGGAACCAGAAGUUCCGGGACAUCCGGCACUUUCUGCCCAGAUGCGAGGACGACUACAACGACGCUGUGCUGAGCGUGCACACCAGCAAGUUCCCCAACAUGUACAUCCCCGUGGGCCAAGUGACCAACUACGGCUUCCUGAAUCUCGGCGGCACCCCUACACACCGGAUCCUGAUGUACAACUUCCCCACCAGAGCCGGCCAGUGUGGCGGAGUGGUUACCACAACAGGCAAAGUGAUCGGCAUCCACGUCGGCGGAAAUGGCGCUCAGGGAUUUGCUGCCAUGCUGCUGCACAGCUACUUCACCGACACACAG [서열번호 178]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 178에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 EVD-71 3C 프로테아제(Q0JRV3; 게놈 폴리단백질 인간 엔테로바이러스 71 프로테아제 3C), 또는 그의 동원체이다. EVD-71 3C 프로테아제 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 179로 나타낸다:
GPSLDFALSLLRRNIRQVQTDQGHFTMLGVRDHLAVLPRHSQPGKTIWVEHKLVKIVDAVELVDEQGVNLELTLVTLDTNEKFRDITRFIPETISPASDATLVINTEHMPSMFVPVGDVVQYGFLNLSGKPTHRTMMYNFPTKAGQCGGAVTAVGKVIGIHIGGNGRQGFCAALKRGYF [서열번호 179]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 179에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 EVD-71 3C 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 180의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGGCCGAGCTTGGACTTCGCCCTATCTCTACTTAGGAGGAACATTAGGCAGGTCCAAACCGACCAGGGCCACTTTACAATGTTAGGAGTGCGAGACCACTTGGCTGTGCTCCCCAGACACTCCCAACCAGGAAAGACCATCTGGGTTGAACACAAATTAGTGAAGATCGTAGACGCTGTGGAGCTAGTAGATGAACAAGGGGTTAACCTAGAGCTCACACTGGTAACGCTTGACACCAACGAAAAATTTAGAGACATCACAAGATTCATACCAGAAACAATTAGTCCTGCTAGTGATGCCACTTTAGTTATAAATACTGAACATATGCCCAGTATGTTTGTGCCAGTTGGAGATGTGGTCCAGTATGGATTTTTGAACCTTAGTGGTAAGCCCACTCACAGGACTATGATGTACAATTTCCCAACAAAAGCAGGACAGTGTGGTGGTGCTGTGACTGCCGTAGGTAAAGTGATTGGGATTCACATTGGTGGCAACGGTAGACAAGGTTTCTGCGCTGCCCTGAAGAGGGGTTACTTT [서열번호 180]
따라서, 바람직하게는 상기 EVD-71 3C 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 180에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 EVD-71 3C 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 181로 제공된다:
GGCCCTTCTCTGGATTTTGCCCTGAGCCTGCTGCGGCGGAACATCAGACAGGTGCAGACAGATCAGGGCCACTTCACCATGCTGGGCGTCAGAGATCATCTGGCCGTGCTGCCTAGACACAGCCAGCCTGGAAAGACCATCTGGGTCGAGCACAAGCTGGTCAAGATCGTGGACGCCGTGGAACTGGTGGATGAGCAGGGCGTTAACCTGGAACTGACCCTGGTCACCCTGGACACCAACGAGAAGTTCCGGGACATCACCCGGTTCATCCCCGAGACAATTAGCCCTGCCTCCGACGCCACACTGGTCATCAATACCGAGCACATGCCCTCCATGTTCGTGCCTGTGGGAGATGTGGTGCAGTACGGCTTCCTGAACCTGAGCGGCAAGCCCACACACCGGACCATGATGTACAACTTCCCTACCAAGGCCGGCCAGTGCGGCGGAGCTGTTACAGCTGTGGGAAAAGTGATCGGCATCCACATCGGCGGCAATGGCAGACAGGGATTCTGTGCCGCTCTGAAGAGAGGCTACTTC [서열번호 181]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 181에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 181의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 182로 제공된다:
GGCCCUUCUCUGGAUUUUGCCCUGAGCCUGCUGCGGCGGAACAUCAGACAGGUGCAGACAGAUCAGGGCCACUUCACCAUGCUGGGCGUCAGAGAUCAUCUGGCCGUGCUGCCUAGACACAGCCAGCCUGGAAAGACCAUCUGGGUCGAGCACAAGCUGGUCAAGAUCGUGGACGCCGUGGAACUGGUGGAUGAGCAGGGCGUUAACCUGGAACUGACCCUGGUCACCCUGGACACCAACGAGAAGUUCCGGGACAUCACCCGGUUCAUCCCCGAGACAAUUAGCCCUGCCUCCGACGCCACACUGGUCAUCAAUACCGAGCACAUGCCCUCCAUGUUCGUGCCUGUGGGAGAUGUGGUGCAGUACGGCUUCCUGAACCUGAGCGGCAAGCCCACACACCGGACCAUGAUGUACAACUUCCCUACCAAGGCCGGCCAGUGCGGCGGAGCUGUUACAGCUGUGGGAAAAGUGAUCGGCAUCCACAUCGGCGGCAAUGGCAGACAGGGAUUCUGUGCCGCUCUGAAGAGAGGCUACUUC [서열번호 182]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 182에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 폴리오 바이러스 HEV-C 3C 프로테아제(P03300; 게놈 폴리단백질 폴리오바이러스 타입 1(마호니(Mahoney) 바이러스주) 인간 엔테로바이러스), 또는 그의 동원체이다. [Lei X, Xiao X, Wang J (2016) Innate Immunity Evasion by Enteroviruses: Insights into Virus-Host Interaction. Viruses 8, 22; doi:10.3390/v8010022]. 폴리오 바이러스 HEV-C 3C 프로테아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 183으로 나타낸다:
GPGFDYAVAMAKRNIVTATTSKGEFTMLGVHDNVAILPTHASPGESIVIDGKEVEILDAKALEDQAGTNLEITIITLKRNEKFRDIRPHIPTQITETNDGVLIVNTSKYPNMYVPVGAVTEQGYLNLGGRQTARTLMYNFPTRAGQCGGVITCTGKVIGMHVGGNGSHGFAAALKRSYFTQSQ [서열번호 183]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 183에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 폴리오 바이러스 HEV-C 3C 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 184의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGACCAGGGTTCGATTACGCAGTGGCTATGGCTAAAAGAAACATTGTTACAGCAACTACTAGCAAGGGAGAGTTCACTATGTTAGGAGTCCACGACAACGTGGCTATTTTACCAACCCACGCTTCACCTGGTGAAAGCATTGTGATCGATGGCAAAGAAGTGGAGATCTTGGATGCCAAAGCGCTCGAAGATCAAGCAGGAACCAATCTTGAAATCACTATAATCACTCTAAAGAGAAATGAAAAGTTCAGAGACATTAGACCACATATACCTACTCAAATCACTGAGACAAATGATGGAGTCTTGATCGTGAACACTAGCAAGTACCCCAATATGTATGTTCCTGTCGGTGCTGTGACTGAACAGGGATATCTAAATCTCGGTGGGCGCCAAACTGCTCGTACTCTAATGTACAACTTTCCAACCAGAGCAGGACAGTGTGGTGGAGTCATCACATGTACTGGGAAAGTCATCGGGATGCATGTTGGTGGGAACGGTTCACACGGGTTTGCAGCGGCCCTGAAGCGATCATACTTCACTCAGAGTCAA [서열번호 184]
따라서, 바람직하게는 상기 폴리오 바이러스 HEV-C 3C 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 184에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 폴리오 바이러스 HEV-C 3C 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 185로 제공된다:
GGCCCTGGCTTTGATTATGCCGTGGCCATGGCTAAGCGGAACATCGTGACAGCCACCACCAGCAAGGGCGAGTTTACAATGCTGGGCGTGCACGACAACGTGGCCATCCTGCCTACACATGCTAGCCCTGGCGAGAGCATCGTGATCGACGGCAAAGAGGTGGAAATCCTGGACGCCAAGGCTCTGGAAGATCAGGCCGGCACCAACCTGGAAATCACCATCATCACCCTGAAGCGGAACGAGAAGTTCCGGGACATCAGACCTCACATCCCCACACAGATCACCGAGACAAACGACGGCGTGCTGATCGTGAATACCAGCAAGTACCCCAATATGTACGTGCCCGTGGGCGCCGTGACAGAGCAGGGATATCTGAATCTCGGCGGCAGACAGACCGCCAGAACACTGATGTACAACTTCCCCACCAGAGCCGGCCAGTGCGGCGGAGTGATTACATGTACCGGCAAAGTGATCGGCATGCACGTCGGCGGCAATGGCTCTCACGGATTTGCTGCCGCTCTGAAGAGAAGCTACTTCACCCAGAGCCAG [서열번호 185]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 185에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 185의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 186으로 제공된다:
GGCCCUGGCUUUGAUUAUGCCGUGGCCAUGGCUAAGCGGAACAUCGUGACAGCCACCACCAGCAAGGGCGAGUUUACAAUGCUGGGCGUGCACGACAACGUGGCCAUCCUGCCUACACAUGCUAGCCCUGGCGAGAGCAUCGUGAUCGACGGCAAAGAGGUGGAAAUCCUGGACGCCAAGGCUCUGGAAGAUCAGGCCGGCACCAACCUGGAAAUCACCAUCAUCACCCUGAAGCGGAACGAGAAGUUCCGGGACAUCAGACCUCACAUCCCCACACAGAUCACCGAGACAAACGACGGCGUGCUGAUCGUGAAUACCAGCAAGUACCCCAAUAUGUACGUGCCCGUGGGCGCCGUGACAGAGCAGGGAUAUCUGAAUCUCGGCGGCAGACAGACCGCCAGAACACUGAUGUACAACUUCCCCACCAGAGCCGGCCAGUGCGGCGGAGUGAUUACAUGUACCGGCAAAGUGAUCGGCAUGCACGUCGGCGGCAAUGGCUCUCACGGAUUUGCUGCCGCUCUGAAGAGAAGCUACUUCACCCAGAGCCAG [서열번호 186]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 186에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 폴리오바이러스 HEV-C 2A 프로테아제(P03300; 게놈 폴리단백질 폴리오바이러스 타입 1(마호니 바이러스주) 인간 엔테로바이러스), 또는 그의 동원체이다. [Feng Q, Langeris MA, Lork M, Nguyen M, Hato SV, Lanke K, Endad L, Bhoopathi P, Fisher PB, Lloyd RE, van Kuppeveld FJM (2014) Enterovirus 2Apro targets MDA5 and MAVS in infected cells. J Virol., 88, 6, 3369-3377]. 폴리오바이러스 HEV-C 2A 프로테아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 187로 나타낸다:
GFGHQNKAVYTAGYKICNYHLATQDDLQNAVNVMWSRDLLVTESRAQGTDSIARCNCNAGVYYCESRRKYYPVSFVGPTFQYMEANNYYPARYQSHMLIGHGFASPGDCGGILRCHHGVIGIITAGGEGLVAFSDIRDLYAYEEEAMEQ [서열번호 187]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 187에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 폴리오바이러스 HEV-C 2A 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 188의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGATTCGGACACCAAAACAAAGCGGTGTACACTGCAGGTTACAAAATTTGCAACTACCACTTGGCCACTCAGGATGATTTGCAAAACGCAGTGAACGTCATGTGGAGTAGAGACCTCTTAGTCACAGAATCAAGAGCCCAGGGCACCGATTCAATCGCAAGGTGCAATTGCAACGCAGGGGTGTACTACTGCGAGTCTAGAAGGAAATACTACCCAGTATCCTTCGTTGGCCCAACGTTCCAGTACATGGAGGCTAATAACTATTACCCAGCTAGGTACCAGTCCCATATGCTCATTGGCCATGGATTCGCATCTCCAGGGGATTGTGGTGGCATACTCAGATGTCACCACGGGGTGATAGGGATCATTACTGCTGGTGGCGAAGGGTTGGTTGCATTTTCAGACATTAGAGACTTGTATGCCTACGAAGAAGAAGCCATGGAACAA [서열번호 188]
따라서, 바람직하게는 상기 폴리오바이러스 HEV-C 2A 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 188에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 폴리오바이러스 HEV-C 2A 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 189로 제공된다:
GGCTTTGGCCACCAGAACAAGGCCGTGTACACAGCCGGCTACAAGATCTGCAACTACCACCTGGCCACACAGGACGACCTGCAGAACGCCGTGAATGTGATGTGGTCCAGGGACCTGCTGGTCACCGAATCTAGAGCCCAGGGCACCGACTCTATCGCCAGATGCAACTGTAATGCCGGCGTGTACTACTGCGAGAGCCGGCGGAAGTACTACCCCGTGTCTTTTGTGGGCCCCACCTTCCAGTACATGGAAGCCAACAACTACTACCCTGCCAGATACCAGAGCCACATGCTGATCGGCCACGGCTTTGCTAGCCCTGGCGATTGTGGCGGCATCCTGAGATGTCACCATGGCGTGATCGGCATCATCACCGCTGGCGGAGAAGGACTGGTGGCCTTCAGCGACATCAGAGATCTGTACGCCTACGAAGAGGAAGCCATGGAACAG [서열번호 189]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 189에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 189의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 190으로 제공된다:
GGCUUUGGCCACCAGAACAAGGCCGUGUACACAGCCGGCUACAAGAUCUGCAACUACCACCUGGCCACACAGGACGACCUGCAGAACGCCGUGAAUGUGAUGUGGUCCAGGGACCUGCUGGUCACCGAAUCUAGAGCCCAGGGCACCGACUCUAUCGCCAGAUGCAACUGUAAUGCCGGCGUGUACUACUGCGAGAGCCGGCGGAAGUACUACCCCGUGUCUUUUGUGGGCCCCACCUUCCAGUACAUGGAAGCCAACAACUACUACCCUGCCAGAUACCAGAGCCACAUGCUGAUCGGCCACGGCUUUGCUAGCCCUGGCGAUUGUGGCGGCAUCCUGAGAUGUCACCAUGGCGUGAUCGGCAUCAUCACCGCUGGCGGAGAAGGACUGGUGGCCUUCAGCGACAUCAGAGAUCUGUACGCCUACGAAGAGGAAGCCAUGGAACAG [서열번호 190]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 190에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 CVB3 2A 프로테아제(P03313; 게놈 폴리단백질 콕사키바이러스 B3(낸시(Nancy) 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. CVB3 2A 프로테아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 191로 나타낸다:
GAFGQQSGAVYVGNYRVVNRHLATSADWQNCVWESYNRDLLVSTTTAHGCDIIARCQCTTGVYFCASKNKHYPISFEGPGLVEVQESEYYPRRYQSHVLLAAGFSEPGDCGGILRCEHGVIGIVTMGGEGVVGFADIRDLLWLEDDAMEQ [서열번호 191]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 191에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 CVB3 2A 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 192의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGCGCATTTGGACAACAATCAGGGGCAGTGTATGTGGGGAACTACAGGGTGGTAAATAGACATCTAGCTACCAGTGCTGACTGGCAAAACTGTGTGTGGGAAAGTTACAACAGAGACCTCTTAGTGAGCACGACCACAGCACATGGATGTGATATTATAGCCAGATGTCAGTGCACAACGGGAGTGTACTTTTGTGCGTCCAAAAACAAGCACTACCCAATTTCGTTTGAAGGACCAGGTCTAGTAGAGGTCCAAGAGAGTGAATACTACCCCAGGAGATACCAATCCCATGTGCTTTTAGCAGCTGGATTTTCCGAACCAGGTGACTGTGGCGGTATCCTAAGGTGTGAGCATGGTGTCATTGGCATTGTGACCATGGGGGGTGAAGGCGTGGTCGGCTTTGCAGACATCCGTGATCTCCTGTGGCTGGAAGATGATGCAATGGAACAG [서열번호 192]
따라서, 바람직하게는 상기 CVB3 2A 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 192에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 CVB3 2A 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 193으로 제공된다:
GGAGCTTTTGGACAGCAGTCTGGCGCCGTGTACGTGGGCAATTACCGGGTCGTGAATAGACACCTGGCCACCTCTGCCGACTGGCAGAATTGTGTGTGGGAGAGCTACAACCGGGACCTGCTGGTGTCTACCACAACAGCCCACGGCTGCGACATCATTGCCAGATGCCAGTGTACAACCGGCGTGTACTTCTGCGCCAGCAAGAACAAGCACTACCCCATCAGCTTCGAAGGCCCTGGCCTGGTGGAAGTGCAAGAGAGCGAGTACTACCCTCGGAGATACCAGAGCCACGTGCTGCTGGCCGCTGGCTTTTCTGAACCTGGCGATTGTGGCGGCATCCTGAGATGTGAACACGGCGTGATCGGCATCGTGACCATGGGCGGAGAAGGCGTTGTGGGCTTCGCCGACATTAGAGATCTGCTGTGGCTGGAAGATGACGCCATGGAACAG [서열번호 193]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 193에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 193의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 194로 제공된다:
GGAGCUUUUGGACAGCAGUCUGGCGCCGUGUACGUGGGCAAUUACCGGGUCGUGAAUAGACACCUGGCCACCUCUGCCGACUGGCAGAAUUGUGUGUGGGAGAGCUACAACCGGGACCUGCUGGUGUCUACCACAACAGCCCACGGCUGCGACAUCAUUGCCAGAUGCCAGUGUACAACCGGCGUGUACUUCUGCGCCAGCAAGAACAAGCACUACCCCAUCAGCUUCGAAGGCCCUGGCCUGGUGGAAGUGCAAGAGAGCGAGUACUACCCUCGGAGAUACCAGAGCCACGUGCUGCUGGCCGCUGGCUUUUCUGAACCUGGCGAUUGUGGCGGCAUCCUGAGAUGUGAACACGGCGUGAUCGGCAUCGUGACCAUGGGCGGAGAAGGCGUUGUGGGCUUCGCCGACAUUAGAGAUCUGCUGUGGCUGGAAGAUGACGCCAUGGAACAG [서열번호 194]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 194에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 EV71 2A 프로테아제(B9VUU3; 게놈 폴리단백질 인간 엔테로바이러스 71), 또는 그의 동원체이다. EV71 2A 프로테아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 195로 나타낸다:
GKFGQQSGAIYVGNFRVVNRHLATHNDWANLVWEDSSRDLLVSSTTAQGCDTIARCNCQTGVYYCNSRRKHYPVSFSKPSLIYVEASEYYPARYQSHLMLAQGHSEPGDCGGILRCQHGVVGIVSTGGNGLVGFADVRDLLWLDEEAMEQ [서열번호 195]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 195에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 EV71 2A 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 196의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGAAAATTTGGGCAACAGTCTGGGGCCATTTATGTGGGTAACTTTAGAGTGGTCAACCGTCATCTTGCCACTCACAATGATTGGGCAAATCTTGTTTGGGAAGACAGCTCTCGCGACTTACTCGTGTCATCCACCACCGCCCAAGGTTGTGACACGATTGCCCGCTGCAATTGCCAGACAGGGGTGTACTACTGTAACTCGAGGAGAAAACACTACCCAGTCAGTTTTTCAAAACCCAGTCTGATCTATGTAGAGGCTAGCGAGTATTACCCAGCCAGGTACCAGTCACATCTTATGCTCGCACAGGGCCACTCAGAGCCTGGTGATTGCGGTGGTATCCTTAGATGCCAACATGGCGTCGTCGGTATAGTGTCAACTGGTGGTAACGGGCTCGTTGGCTTTGCAGACGTCAGGGACCTCTTGTGGTTAGATGAAGAAGCTATGGAGCAG [서열번호 196]
따라서, 바람직하게는 상기 EV71 2A 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 196에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 EV71 2A 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 197로 제공된다:
GGCAAGTTTGGACAGCAGAGCGGCGCCATCTACGTGGGCAATTTCCGGGTCGTGAACCGGCACCTGGCCACACATAACGACTGGGCCAATCTCGTGTGGGAAGATAGCAGCAGGGACCTGCTGGTGTCCAGCACAACAGCCCAGGGCTGCGATACAATCGCCAGATGCAATTGCCAGACCGGCGTGTACTACTGCAACAGCAGACGGAAGCACTACCCCGTGTCCTTCAGCAAGCCCAGCCTGATCTATGTGGAAGCCAGCGAGTACTACCCCGCCAGATACCAGTCTCACCTGATGCTGGCCCAGGGCCATTCTGAGCCAGGCGATTGTGGCGGAATCCTGAGATGCCAGCATGGCGTCGTGGGCATTGTGTCTACCGGCGGAAATGGCCTCGTGGGATTTGCCGATGTTCGCGACCTGCTGTGGCTGGACGAAGAGGCTATGGAACAG [서열번호 197]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 197에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 197의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 198로 제공된다:
GGCAAGUUUGGACAGCAGAGCGGCGCCAUCUACGUGGGCAAUUUCCGGGUCGUGAACCGGCACCUGGCCACACAUAACGACUGGGCCAAUCUCGUGUGGGAAGAUAGCAGCAGGGACCUGCUGGUGUCCAGCACAACAGCCCAGGGCUGCGAUACAAUCGCCAGAUGCAAUUGCCAGACCGGCGUGUACUACUGCAACAGCAGACGGAAGCACUACCCCGUGUCCUUCAGCAAGCCCAGCCUGAUCUAUGUGGAAGCCAGCGAGUACUACCCCGCCAGAUACCAGUCUCACCUGAUGCUGGCCCAGGGCCAUUCUGAGCCAGGCGAUUGUGGCGGAAUCCUGAGAUGCCAGCAUGGCGUCGUGGGCAUUGUGUCUACCGGCGGAAAUGGCCUCGUGGGAUUUGCCGAUGUUCGCGACCUGCUGUGGCUGGACGAAGAGGCUAUGGAACAG [서열번호 198]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 198에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 hMPV G 단백질(Q6WB94; 주요 표면 당단백질 G 인간 메타뉴모바이러스(CAN97-83 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. [Bao X, Liu T, Shan Y, Li K, Garofolo RP, Casola A (2008) Human Metapneumovirus Glycoprotein G Inhibits Innate Immune Responses. PLOS Pathogens, 4, 5, e1000077]. hMPV G 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 199로 제공된다:
MEVKVENIRAIDMLKARVKNRVARSKCFKNASLILIGITTLSIALNIYLIINYTIQKTSSESEHHTSSPPTESNKEASTISTDNPDINPNSQHPTQQSTENPTLNPAASVSPSETEPASTPDTTNRLSSVDRSTAQPSESRTKTKPTVHTRNNPSTASSTQSPPRATTKAIRRATTFRMSSTGKRPTTTSVQSDSSTTTQNHEETGSANPQASVSTMQN [서열번호 199]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 199에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 hMPV G 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 200의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGAGGTGAAAGTAGAGAACATTCGAGCAATAGACATGCTCAAAGCAAGAGTGAAAAATCGTGTGGCACGTAGCAAATGCTTTAAAAATGCTTCTTTAATCCTCATAGGAATAACTACACTGAGTATAGCTCTCAATATCTATCTGATCATAAACTACACAATACAAAAAACCTCATCTGAATCAGAACACCACACCAGCTCACCACCCACAGAATCCAACAAGGAAGCTTCAACAATCTCCACAGACAACCCAGACATCAATCCAAACTCACAGCATCCAACTCAACAGTCCACAGAAAACCCCACACTCAACCCCGCAGCATCAGTGAGCCCATCAGAAACAGAACCAGCATCAACACCAGACACAACAAACCGCCTGTCCTCCGTAGACAGGTCCACAGCACAACCAAGTGAAAGCAGAACAAAGACAAAACCGACAGTCCACACAAGAAACAACCCAAGCACAGCTTCCAGTACACAATCCCCACCACGGGCAACAACGAAGGCAATCCGCAGAGCCACCACTTTCCGCATGAGCAGCACAGGAAAAAGACCAACCACAACATCAGTCCAGTCCGACAGCAGCACCACAACCCAAAATCATGAAGAAACAGGTTCAGCGAACCCACAGGCATCTGTAAGCACAATGCAAAAC [서열번호 200]
따라서, 바람직하게는 상기 hMPV G 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 200에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 hMPV G 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 201로 제공된다:
ATGGAAGTGAAGGTCGAGAACATCCGGGCCATCGACATGCTGAAGGCCAGAGTGAAGAACAGAGTGGCCCGGTCCAAGTGCTTCAAGAACGCCAGCCTGATCCTGATCGGCATCACCACACTGTCTATCGCCCTGAACATCTACCTGATCATCAACTACACCATCCAGAAAACCAGCAGCGAGAGCGAGCACCACACAAGCTCTCCACCTACCGAGAGCAACAAAGAGGCCAGCACCATCAGCACCGACAATCCCGACATCAACCCCAACTCTCAGCACCCCACACAGCAGTCCACCGAGAATCCCACACTGAACCCTGCCGCCTCTGTGTCCCCATCTGAGACAGAACCTGCCAGCACACCCGACACCACCAACAGACTGTCTAGCGTGGACAGAAGCACAGCCCAGCCTAGCGAGAGCCGGACCAAGACAAAACCTACCGTGCACACCCGGAACAACCCTAGCACAGCCAGCTCTACACAGAGCCCTCCAAGAGCCACCACCAAGGCCATTAGAAGGGCCACCACCTTCCGGATGAGCAGCACCGGCAAAAGACCTACCACCACCAGCGTGCAGAGCGACAGCAGCACAACCACACAGAACCACGAGGAAACCGGCAGCGCCAATCCTCAGGCTAGCGTGTCCACCATGCAGAAC [서열번호 201]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 201에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 201의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 202로 제공된다:
AUGGAAGUGAAGGUCGAGAACAUCCGGGCCAUCGACAUGCUGAAGGCCAGAGUGAAGAACAGAGUGGCCCGGUCCAAGUGCUUCAAGAACGCCAGCCUGAUCCUGAUCGGCAUCACCACACUGUCUAUCGCCCUGAACAUCUACCUGAUCAUCAACUACACCAUCCAGAAAACCAGCAGCGAGAGCGAGCACCACACAAGCUCUCCACCUACCGAGAGCAACAAAGAGGCCAGCACCAUCAGCACCGACAAUCCCGACAUCAACCCCAACUCUCAGCACCCCACACAGCAGUCCACCGAGAAUCCCACACUGAACCCUGCCGCCUCUGUGUCCCCAUCUGAGACAGAACCUGCCAGCACACCCGACACCACCAACAGACUGUCUAGCGUGGACAGAAGCACAGCCCAGCCUAGCGAGAGCCGGACCAAGACAAAACCUACCGUGCACACCCGGAACAACCCUAGCACAGCCAGCUCUACACAGAGCCCUCCAAGAGCCACCACCAAGGCCAUUAGAAGGGCCACCACCUUCCGGAUGAGCAGCACCGGCAAAAGACCUACCACCACCAGCGUGCAGAGCGACAGCAGCACAACCACACAGAACCACGAGGAAACCGGCAGCGCCAAUCCUCAGGCUAGCGUGUCCACCAUGCAGAAC [서열번호 202]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 202에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다음의 바이러스 IIP는 RIG-I의 절단을 유발하는 것으로 여겨진다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 CVB3 3C 프로테아제(P03313; 게놈 폴리단백질 콕사키바이러스 B3(낸시 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. [Xiao H, Li J, Yang X, Li Z, Wang Y, Rui Y, Liu R, Zhang W (2021) Ectopic Expression of TRIM25 Restores RIG-I Expression and IFN Production Reduced by Multiple Enteroviruses 3Cpro. Virol Sin,: 1-12.doi: 10.1007/s12250-021-00410-x]. CVB3 3C 프로테아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 203으로 나타낸다:
GPAFEFAVAMMKRNSSTVKTEYGEFTMLGIYDRWAVLPRHAKPGPTILMNDQEVGVLDAKELVDKDGTNLELTLLKLNRNEKFRDIRGFLAKEEVEVNEAVLAINTSKFPNMYIPVGQVTEYGFLNLGGTPTKRMLMYNFPTRAGQCGGVLMSTGKVLGIHVGGNGHQGFSAALLKHYFNDEQ [서열번호 203]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 203에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 CVB3 3C 프로테아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 204의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGCCCTGCCTTTGAGTTCGCCGTCGCAATGATGAAAAGGAACTCAAGCACGGTGAAAACTGAATATGGCGAGTTTACCATGCTGGGCATCTATGACAGGTGGGCCGTTTTGCCACGCCACGCCAAACCTGGGCCAACCATCTTGATGAATGATCAAGAGGTTGGTGTGCTAGATGCCAAGGAGCTAGTAGACAAGGACGGCACCAACTTAGAACTGACACTACTCAAATTGAACCGGAATGAGAAGTTCAGAGACATCAGAGGCTTCTTAGCCAAGGAGGAAGTGGAGGTTAATGAGGCAGTGCTAGCAATTAACACCAGCAAGTTTCCCAACATGTACATTCCAGTAGGACAGGTCACAGAATACGGCTTCCTAAACCTAGGTGGCACACCCACCAAGAGAATGCTTATGTACAACTTCCCCACAAGAGCAGGCCAGTGTGGTGGAGTGCTCATGTCCACCGGCAAGGTACTGGGTATCCATGTTGGTGGAAATGGCCATCAGGGCTTCTCAGCAGCACTCCTCAAACACTACTTCAATGATGAGCAA [서열번호 204]
따라서, 바람직하게는 상기 CVB3 3C 프로테아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 204에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 CVB3 3C 프로테아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 205로 제공된다:
GGACCTGCCTTTGAATTCGCCGTGGCCATGATGAAGCGGAACAGCAGCACCGTGAAAACCGAGTACGGCGAGTTCACCATGCTGGGCATCTACGACAGATGGGCCGTGCTGCCTAGACACGCCAAACCTGGACCTACCATCCTGATGAACGACCAAGAAGTGGGCGTTCTGGACGCCAAAGAACTGGTGGACAAGGACGGCACCAACCTGGAACTGACCCTGCTGAAGCTGAACCGGAACGAGAAGTTCCGGGATATCAGAGGCTTCCTGGCCAAAGAAGAGGTGGAAGTCAACGAAGCCGTGCTGGCCATCAACACCAGCAAGTTCCCCAACATGTACATCCCCGTGGGCCAAGTGACAGAGTACGGCTTCCTGAATCTCGGCGGCACCCCTACCAAGCGGATGCTGATGTACAACTTCCCCACCAGAGCCGGCCAGTGTGGCGGAGTTCTTATGTCTACCGGCAAGGTGCTGGGAATCCACGTTGGCGGAAATGGCCACCAGGGCTTTTCTGCCGCTCTGCTGAAACACTACTTCAACGACGAGCAG [서열번호 205]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 205에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 205의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 206으로 제공된다:
GGACCUGCCUUUGAAUUCGCCGUGGCCAUGAUGAAGCGGAACAGCAGCACCGUGAAAACCGAGUACGGCGAGUUCACCAUGCUGGGCAUCUACGACAGAUGGGCCGUGCUGCCUAGACACGCCAAACCUGGACCUACCAUCCUGAUGAACGACCAAGAAGUGGGCGUUCUGGACGCCAAAGAACUGGUGGACAAGGACGGCACCAACCUGGAACUGACCCUGCUGAAGCUGAACCGGAACGAGAAGUUCCGGGAUAUCAGAGGCUUCCUGGCCAAAGAAGAGGUGGAAGUCAACGAAGCCGUGCUGGCCAUCAACACCAGCAAGUUCCCCAACAUGUACAUCCCCGUGGGCCAAGUGACAGAGUACGGCUUCCUGAAUCUCGGCGGCACCCCUACCAAGCGGAUGCUGAUGUACAACUUCCCCACCAGAGCCGGCCAGUGUGGCGGAGUUCUUAUGUCUACCGGCAAGGUGCUGGGAAUCCACGUUGGCGGAAAUGGCCACCAGGGCUUUUCUGCCGCUCUGCUGAAACACUACUUCAACGACGAGCAG [서열번호 206]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 206에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 C형 간염 NS3/4A(O39929; 게놈 폴리단백질 C형 간염 바이러스 유전자형 4a(ED43 단리물)), 또는 그의 동원체이다. C형 간염 NS3/4A의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 207로 나타낸다:
APITAYAQQTRGLFSTIVTSLTGRDTNENCGEVQVLSTATQSFLGTAVNGVMWTVYHGAGAKTISGPKGPVNQMYTNVDQDLVGWPAPPGVRSLAPCTCGSADLYLVTRHADVIPVRRRGDTRGALLSPRPISILKGSSGGPLLCPMGHRAGIFRAAVCTRGVAKAVDFVPVESLETTMRSPVFTDNSTPPAVPQTYQVAHLHAPTGSGKSTKVPAAHAAQGYKVLVLNPSVAATLGFGVYMSKAYGIDPNIRSGVRTITTGAPITYSTYGKFLADGGCSGGAYDIIICDECYSTDSTTILGIGTVLDQAETAGVRLTVLATATPPGSVTTPHSNIEEVALPTTGEIPFYGKAIPLELIKGGRHLIFCHSKKKCDELARQLTSLGLNAVAYYRGLDVSVIPTSGDVVVCATDALMTGFTGDFDSVIDCNTSVIQTVDFSLDPTFSIEITTVPQDAVSRSQRRGRTGRGRLGTYRYVTPGERPSGMFDTAELCECYDAGCAWYELTPAETTTRLKAYFDTPGLPVCQDHLEFWESVFTGLTHIDGHFLSQTKQSGENFPYLVAYQATVSAKVWLAPPSWDTMWKCLIRLKPTLHGPTPLLYRLGSVQNEVVLTHPITKYIMACMSADLEVVT [서열번호 207]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 207에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 C형 간염 NS3/4A 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 208의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GCCCCCATCACAGCATACGCaCAGCAGACCCGCGGCTTGTTCAGCACCATCGTAACGAGCCTCACTGGCAGGGACACCAATGAGAATTGTGGCGAAGTGCAGGTCTTATCCACCGCTACGCAGTCCTTCCTGGGTACTGCGGTTAACGGCGTGATGTGGACCGTCTACCACGGGGCGGGTGCCAAGACCATCAGCGGCCCGAAGGGACCTGTCAATCAAATGTACACTAATGTTGACCAAGACTTGGTGGGGTGGCCAGCACCCCCCGGAGTCAGATCTCTTGCTCCGTGCACCTGCGGCTCGGCAGACTTGTATCTAGTCACCAGGCACGCGGATGTAATACCCGTGCGCAGGAGAGGAGACACCAGAGGAGCTCTCTTGAGCCCTAGACCAATATCCATTCTTAAGGGATCTTCCGGAGGTCCGCTGCTGTGCCCCATGGGACACCGCGCCGGCATATTCCGTGCGGCGGTGTGTACTCGGGGGGTAGCCAAGGCGGTAGACTTCGTCCCGGTTGAATCTCTTGAGACTACCATGAGATCACCAGTGTTCACTGACAACTCAACACCCCCAGCAGTGCCCCAGACCTACCAGGTCGCGCACCTACACGCACCAACAGGAAGTGGCAAGAGCACTAAGGTCCCGGCGGCGCATGCTGCCCAAGGCTATAAAGTGCTAGTGCTCAATCCTTCGGTTGCGGCCACACTGGGTTTTGGGGTATACATGTCCAAGGCATATGGCATCGACCCGAACATCCGGTCGGGAGTCAGGACCATCACCACGGGTGCGCCAATCACGTACTCAACGTATGGTAAGTTCCTGGCTGATGGAGGTTGCAGCGGAGGGGCATACGACATAATCATCTGTGACGAGTGCTATTCCACTGACTCCACAACGATCCTTGGCATAGGCACAGTCCTGGACCAAGCGGAGACCGCTGGAGTGCGCCTCACCGTGCTCGCGACTGCTACTCCGCCAGGGTCAGTGACTACACCTCATTCCAACATAGAGGAGGTCGCCCTGCCAACAACGGGGGAAATACCCTTTTACGGCAAGGCGATCCCTCTGGAGCTGATCAAGGGGGGCAGACATCTCATCTTCTGCCATTCAAAGAAAAAGTGCGATGAACTGGCCAGACAACTGACATCTCTTGGTCTGAATGCCGTAGCCTACTACAGAGGCTTAGACGTTTCGGTGATTCCCACGTCTGGGGACGTCGTGGTATGCGCCACGGACGCCCTCATGACGGGTTTCACCGGCGACTTTGACTCAGTGATAGACTGCAATACATCTGTGATACAGACTGTTGACTTCAGCTTGGACCCCACCTTCTCCATAGAGATTACAACCGTTCCCCAGGACGCGGTATCCCGCAGCCAGCGGAGAGGCCGCACTGGTAGGGGGAGGTTGGGCACATACCGGTATGTCACCCCGGGAGAGAGACCATCAGGCATGTTTGACACTGCAGAGCTTTGCGAGTGCTACGATGCCGGGTGCGCCTGGTACGAGCTGACACCTGCTGAAACCACAACAAGGCTGAAAGCTTACTTCGACACACCAGGCCTTCCTGTGTGCCAAGACCATCTGGAATTCTGGGAGAGCGTCTTTACAGGGTTAACCCACATAGACGGTCATTTCCTATCCCAGACCAAGCAATCGGGTGAGAATTTCCCGTATCTTGTTGCTTACCAAGCGACGGTGTCGGCCAAGGTCTGGCTCGCTCCACCAAGCTGGGACACCATGTGGAAGTGCCTAATTCGCCTTAAGCCCACCCTGCACGGGCCCACGCCCCTCCTCTACAGACTGGGGTCTGTGCAGAATGAAGTGGTGCTCACCCATCCCATCACCAAATACATCATGGCTTGCATGTCAGCTGATCTCGAGGTAGTGACA [서열번호 208]
따라서, 바람직하게는 상기 C형 간염 NS3/4A 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 208에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 C형 간염 NS3/4A 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 209로 제공된다:
GCCCCTATCACAGCCTACGCTCAGCAGACCAGAGGCCTGTTCAGCACCATCGTGACAAGCCTGACCGGCAGAGACACCAACGAGAATTGTGGCGAGGTGCAGGTCCTGTCTACAGCTACCCAGAGCTTTCTGGGCACCGCCGTGAATGGCGTGATGTGGACAGTGTATCATGGCGCTGGCGCCAAGACAATCTCTGGCCCTAAGGGCCCCGTGAACCAGATGTACACCAACGTGGACCAGGACCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCCTGGTGTTAGAAGCCTGGCTCCTTGTACATGCGGCAGCGCCGATCTGTACCTGGTCACAAGACACGCCGACGTGATCCCCGTCAGAAGAAGAGGCGATACAAGAGGCGCCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCTCTATCCTGAAGGGCAGCTCTGGCGGCCCTCTGCTTTGTCCTATGGGACACAGAGCCGGCATCTTCAGAGCCGCCGTGTGTACTAGAGGCGTGGCCAAGGCTGTGGACTTCGTGCCTGTGGAAAGCCTGGAAACCACCATGAGAAGCCCCGTGTTCACCGACAACAGCACCCCTCCAGCTGTGCCTCAGACATACCAGGTGGCCCATCTGCATGCCCCTACAGGCTCTGGCAAGAGCACAAAAGTGCCTGCCGCTCATGCTGCCCAGGGCTATAAGGTGCTGGTGCTCAATCCTAGCGTGGCCGCCACACTCGGCTTTGGCGTGTACATGTCTAAGGCCTACGGCATCGACCCCAACATCAGATCTGGCGTGCGGACCATCACAACAGGCGCCCCAATCACCTACTCTACCTACGGCAAGTTCCTGGCCGATGGCGGATGTTCTGGCGGAGCCTACGACATCATCATCTGCGACGAGTGCTACAGCACCGACAGCACCACAATCCTCGGCATCGGCACAGTGCTGGATCAGGCTGAAACAGCCGGCGTCAGACTGACTGTGCTGGCCACAGCTACACCTCCAGGCAGCGTGACAACCCCTCACAGCAACATCGAGGAAGTGGCCCTGCCTACAACCGGCGAGATCCCATTCTATGGCAAGGCCATTCCTCTCGAGCTGATCAAAGGCGGCAGACACCTGATCTTTTGCCACAGCAAGAAGAAGTGCGACGAGCTGGCCAGACAGCTGACATCCCTGGGACTGAATGCCGTGGCCTACTACAGAGGACTGGACGTGTCCGTGATTCCCACATCTGGCGACGTGGTCGTGTGTGCCACAGATGCCCTGATGACCGGCTTCACCGGCGACTTCGATAGCGTGATCGACTGCAACACCAGCGTGATCCAGACCGTGGACTTCTCTCTGGACCCCACCTTCAGCATCGAGATCACCACCGTTCCTCAGGACGCCGTGTCTCGGTCACAGAGAAGAGGCAGAACAGGCAGAGGCCGGCTGGGCACATACAGATATGTGACACCCGGCGAAAGACCCAGCGGCATGTTTGATACAGCCGAGCTGTGCGAGTGTTACGACGCCGGATGTGCTTGGTACGAGCTGACACCAGCCGAGACAACCACCAGACTGAAGGCCTACTTCGACACCCCTGGCCTGCCTGTGTGTCAGGACCACCTGGAATTTTGGGAGAGCGTGTTCACAGGACTGACCCACATCGACGGCCACTTTCTGAGCCAGACCAAGCAGAGCGGCGAGAACTTCCCTTACCTGGTGGCCTATCAGGCTACCGTGTCCGCCAAAGTTTGGCTGGCTCCTCCTAGCTGGGACACCATGTGGAAGTGCCTGATCCGGCTGAAGCCTACACTGCACGGACCTACACCTCTGCTGTACAGACTGGGCAGCGTGCAGAATGAGGTGGTGCTGACCCATCCTATCACCAAGTACATCATGGCCTGCATGAGCGCCGACCTGGAAGTGGTTACA [서열번호 209]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 209에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 209의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 210으로 제공된다:
GCCCCUAUCACAGCCUACGCUCAGCAGACCAGAGGCCUGUUCAGCACCAUCGUGACAAGCCUGACCGGCAGAGACACCAACGAGAAUUGUGGCGAGGUGCAGGUCCUGUCUACAGCUACCCAGAGCUUUCUGGGCACCGCCGUGAAUGGCGUGAUGUGGACAGUGUAUCAUGGCGCUGGCGCCAAGACAAUCUCUGGCCCUAAGGGCCCCGUGAACCAGAUGUACACCAACGUGGACCAGGACCUCGUUGGCUGGCCUGCUCCUCCUGGUGUUAGAAGCCUGGCUCCUUGUACAUGCGGCAGCGCCGAUCUGUACCUGGUCACAAGACACGCCGACGUGAUCCCCGUCAGAAGAAGAGGCGAUACAAGAGGCGCCCUGCUGAGCCCUAGACCUAUCUCUAUCCUGAAGGGCAGCUCUGGCGGCCCUCUGCUUUGUCCUAUGGGACACAGAGCCGGCAUCUUCAGAGCCGCCGUGUGUACUAGAGGCGUGGCCAAGGCUGUGGACUUCGUGCCUGUGGAAAGCCUGGAAACCACCAUGAGAAGCCCCGUGUUCACCGACAACAGCACCCCUCCAGCUGUGCCUCAGACAUACCAGGUGGCCCAUCUGCAUGCCCCUACAGGCUCUGGCAAGAGCACAAAAGUGCCUGCCGCUCAUGCUGCCCAGGGCUAUAAGGUGCUGGUGCUCAAUCCUAGCGUGGCCGCCACACUCGGCUUUGGCGUGUACAUGUCUAAGGCCUACGGCAUCGACCCCAACAUCAGAUCUGGCGUGCGGACCAUCACAACAGGCGCCCCAAUCACCUACUCUACCUACGGCAAGUUCCUGGCCGAUGGCGGAUGUUCUGGCGGAGCCUACGACAUCAUCAUCUGCGACGAGUGCUACAGCACCGACAGCACCACAAUCCUCGGCAUCGGCACAGUGCUGGAUCAGGCUGAAACAGCCGGCGUCAGACUGACUGUGCUGGCCACAGCUACACCUCCAGGCAGCGUGACAACCCCUCACAGCAACAUCGAGGAAGUGGCCCUGCCUACAACCGGCGAGAUCCCAUUCUAUGGCAAGGCCAUUCCUCUCGAGCUGAUCAAAGGCGGCAGACACCUGAUCUUUUGCCACAGCAAGAAGAAGUGCGACGAGCUGGCCAGACAGCUGACAUCCCUGGGACUGAAUGCCGUGGCCUACUACAGAGGACUGGACGUGUCCGUGAUUCCCACAUCUGGCGACGUGGUCGUGUGUGCCACAGAUGCCCUGAUGACCGGCUUCACCGGCGACUUCGAUAGCGUGAUCGACUGCAACACCAGCGUGAUCCAGACCGUGGACUUCUCUCUGGACCCCACCUUCAGCAUCGAGAUCACCACCGUUCCUCAGGACGCCGUGUCUCGGUCACAGAGAAGAGGCAGAACAGGCAGAGGCCGGCUGGGCACAUACAGAUAUGUGACACCCGGCGAAAGACCCAGCGGCAUGUUUGAUACAGCCGAGCUGUGCGAGUGUUACGACGCCGGAUGUGCUUGGUACGAGCUGACACCAGCCGAGACAACCACCAGACUGAAGGCCUACUUCGACACCCCUGGCCUGCCUGUGUGUCAGGACCACCUGGAAUUUUGGGAGAGCGUGUUCACAGGACUGACCCACAUCGACGGCCACUUUCUGAGCCAGACCAAGCAGAGCGGCGAGAACUUCCCUUACCUGGUGGCCUAUCAGGCUACCGUGUCCGCCAAAGUUUGGCUGGCUCCUCCUAGCUGGGACACCAUGUGGAAGUGCCUGAUCCGGCUGAAGCCUACACUGCACGGACCUACACCUCUGCUGUACAGACUGGGCAGCGUGCAGAAUGAGGUGGUGCUGACCCAUCCUAUCACCAAGUACAUCAUGGCCUGCAUGAGCGCCGACCUGGAAGUGGUUACA [서열번호 210]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 210에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DENV NS3 단백질(P17763; 게놈 폴리단백질 뎅기(Dengue) 바이러스 타입 1(나우루(Nauru)/West Pac/1974 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. DENV NS3 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 211로 나타낸다:
SGVLWDTPSPPEVERAVLDDGIYRILQRGLLGRSQVGVGVFQEGVFHTMWHVTRGAVLMYQGKRLEPSWASVKKDLISYGGGWRFQGSWNAGEEVQVIAVEPGKNPKNVQTAPGTFKTPEGEVGAIALDFKPGTSGSPIVNREGKIVGLYGNGVVTTSGTYVSAIAQAKASQEGPLPEIEDEVFRKRNLTIMDLHPGSGKTRRYLPAIVREAIRRNVRTLVLAPTRVVASEMAEALKGMPIRYQTTAVKSEHTGKEIVDLMCHATFTMRLLSPVRVPNYNMIIMDEAHFTDPASIAARGYISTRVGMGEAAAIFMTATPPGSVEAFPQSNAVIQDEERDIPERSWNSGYDWITDFPGKTVWFVPSIKSGNDIANCLRKNGKRVVQLSRKTFDTEYQKTKNNDWDYVVTTDISEMGANFRADRVIDPRRCLKPVILKDGPERVILAGPMPVTVASAAQRRGRIGRNQNKEGDQYIYMGQPLNNDEDHAHWTEAKMLLDNINTPEGIIPALFEPEREKSAAIDGEYRLRGEARKTFVELMRRGDLPVWLSYKVASEGFQYSDRRWCFDGERNNQVLEENMDVEIWTKEGERKKLRPRWLDARTYSDPLALREFKEFAAGRR [서열번호 211]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 211에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DENV NS3 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 212의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
TCAGGAGTGCTATGGGACACACCCAGCCCTCCAGAAGTGGAAAGAGCAGTCCTTGATGATGGCATTTATAGAATTCTCCAAAGAGGATTGTTGGGCAGGTCTCAAGTAGGAGTAGGAGTTTTTCAAGAAGGCGTGTTCCACACAATGTGGCACGTCACCAGGGGAGCTGTCCTCATGTACCAAGGGAAGAGACTGGAACCAAGTTGGGCCAGTGTCAAAAAAGACTTGATCTCATATGGAGGAGGTTGGAGGTTTCAAGGATCCTGGAACGCGGGAGAAGAAGTGCAGGTGATTGCTGTTGAACCGGGGAAGAACCCCAAAAATGTACAGACAGCGCCGGGTACCTTCAAGACCCCTGAAGGCGAAGTTGGAGCCATAGCTCTAGACTTTAAACCCGGCACATCTGGATCTCCTATCGTGAACAGAGAGGGAAAAATAGTAGGTCTTTATGGAAATGGAGTGGTGACAACAAGTGGTACCTACGTCAGCGCCATAGCTCAAGCTAAAGCATCACAAGAAGGGCCTCTACCAGAGATTGAGGACGAGGTGTTTAGGAAAAGAAACTTAACAATAATGGACCTACATCCAGGATCGGGGAAAACAAGAAGATATCTTCCAGCCATAGTCCGTGAGGCCATAAGAAGGAACGTGCGCACGCTAGTCTTAGCTCCCACAAGAGTTGTCGCTTCTGAAATGGCAGAGGCGCTCAAGGGAATGCCAATAAGGTATCAGACAACAGCAGTGAAGAGTGAACACACAGGAAAAGAGATAGTTGACCTTATGTGTCACGCCACTTTCACTATGCGTCTCCTGTCTCCTGTGAGAGTTCCCAATTATAATATGATTATCATGGATGAAGCACATTTTACCGATCCAGCCAGCATAGCAGCCAGAGGGTATATCTCAACCCGAGTGGGTATGGGTGAAGCAGCTGCGATTTTCATGACAGCCACTCCCCCCGGATCGGTGGAGGCCTTTCCACAGAGCAATGCAGTTATCCAAGATGAGGAAAGAGACATTCCTGAAAGATCATGGAACTCAGGCTATGACTGGATCACTGATTTCCCAGGTAAAACAGTCTGGTTTGTTCCAAGCATCAAATCAGGAAATGACATTGCCAACTGTTTAAGAAAGAATGGGAAACGGGTGGTCCAATTGAGCAGAAAAACTTTTGACACTGAGTACCAGAAAACAAAAAATAACGACTGGGACTATGTTGTCACAACAGACATATCCGAAATGGGAGCAAACTTCCGAGCCGACAGGGTAATAGACCCGAGGCGGTGCCTGAAACCGGTAATACTAAAAGATGGCCCAGAGCGTGTCATTCTAGCCGGACCGATGCCAGTGACTGTGGCTAGCGCCGCCCAGAGGAGAGGAAGAATTGGAAGGAACCAAAATAAGGAAGGCGATCAGTATATTTACATGGGACAGCCTCTAAACAATGATGAGGACCACGCCCATTGGACAGAAGCAAAAATGCTCCTTGACAACATAAACACACCAGAAGGGATTATCCCAGCCCTCTTTGAGCCGGAGAGAGAAAAGAGTGCAGCAATAGACGGGGAATACAGACTACGGGGTGAAGCGAGGAAAACGTTCGTGGAGCTCATGAGAAGAGGAGATCTACCTGTCTGGCTATCCTACAAAGTTGCCTCAGAAGGCTTCCAGTACTCCGACAGAAGGTGGTGCTTTGATGGGGAAAGGAACAACCAGGTGTTGGAGGAGAACATGGACGTGGAGATCTGGACAAAAGAAGGAGAAAGAAAGAAACTACGACCCCGCTGGCTGGATGCCAGAACATACTCTGACCCACTGGCTCTGCGCGAATTCAAAGAGTTCGCAGCAGGAAGAAGA [서열번호 212]
따라서, 바람직하게는 상기 DENV NS3 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 212에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DENV NS3 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 213으로 제공된다:
TCTGGCGTGCTGTGGGATACACCTTCTCCACCAGAGGTGGAAAGAGCCGTGCTGGACGACGGCATCTACCGGATTCTGCAGAGAGGACTGCTGGGCAGATCTCAAGTTGGCGTGGGCGTGTTCCAAGAAGGGGTGTTCCACACCATGTGGCACGTGACAAGAGGCGCCGTGCTGATGTACCAGGGCAAGAGACTGGAACCTAGCTGGGCCAGCGTGAAGAAGGACCTGATCTCTTACGGCGGAGGCTGGCGGTTTCAAGGCTCTTGGAATGCCGGCGAAGAGGTGCAAGTGATCGCCGTGGAACCCGGCAAGAACCCCAAGAACGTTCAGACAGCCCCTGGCACCTTCAAGACCCCTGAAGGCGAAGTGGGAGCTATCGCCCTGGATTTCAAGCCTGGCACAAGCGGCAGCCCCATCGTGAACAGAGAAGGCAAGATCGTGGGCCTGTACGGCAATGGCGTGGTCACCACATCTGGCACCTACGTGTCAGCCATTGCTCAGGCCAAGGCCTCTCAAGAGGGACCCCTGCCTGAGATCGAGGACGAGGTGTTCCGGAAGCGGAACCTGACCATCATGGATCTGCACCCTGGCAGCGGCAAGACCAGAAGATATCTGCCCGCCATTGTGCGCGAGGCCATCCGAAGAAATGTGCGGACACTGGTGCTGGCCCCTACAAGAGTGGTGGCCTCTGAAATGGCCGAGGCTCTGAAGGGCATGCCTATCAGATACCAGACCACCGCCGTGAAGTCTGAGCACACCGGCAAAGAAATCGTGGACCTGATGTGCCACGCCACCTTCACCATGAGACTGCTGAGCCCTGTGCGGGTGCCCAACTACAACATGATCATCATGGACGAGGCCCACTTCACAGACCCCGCCTCTATTGCCGCCAGAGGCTACATCTCTACCAGAGTCGGCATGGGAGAAGCCGCCGCTATCTTCATGACAGCCACACCTCCAGGCAGCGTGGAAGCCTTTCCTCAGTCCAATGCCGTGATCCAGGACGAAGAGAGAGACATCCCCGAGCGGAGCTGGAACAGCGGCTACGACTGGATCACCGACTTTCCAGGCAAGACCGTTTGGTTCGTGCCCAGCATCAAGAGCGGCAACGATATCGCCAACTGCCTGCGGAAGAACGGCAAGAGAGTGGTGCAGCTGAGCAGAAAGACCTTCGACACCGAGTACCAAAAGACCAAGAACAACGACTGGGACTACGTCGTGACCACCGACATCTCTGAGATGGGCGCCAACTTCAGGGCCGACAGAGTGATCGACCCTCGGAGATGTCTGAAGCCCGTGATCCTGAAGGACGGCCCTGAGAGAGTGATTCTGGCCGGACCTATGCCTGTGACAGTGGCTTCTGCCGCTCAGAGAAGAGGCCGGATCGGCCGGAATCAGAACAAAGAGGGCGACCAGTACATCTACATGGGCCAGCCTCTGAACAACGATGAGGATCACGCCCACTGGACCGAGGCCAAGATGCTGCTGGACAACATCAACACCCCTGAGGGCATCATCCCCGCTCTGTTCGAGCCCGAGAGAGAGAAGTCTGCCGCAATCGACGGCGAGTACAGACTGAGAGGCGAGGCCAGAAAGACATTTGTGGAACTGATGCGGAGAGGCGACCTGCCTGTGTGGCTGAGTTACAAGGTGGCCAGCGAGGGCTTCCAGTACAGCGATAGAAGATGGTGCTTCGATGGCGAGCGGAACAACCAGGTGCTGGAAGAGAACATGGACGTGGAAATCTGGACCAAAGAAGGCGAGCGCAAGAAACTGCGGCCCAGATGGCTGGATGCCCGGACATATTCTGACCCTCTGGCTCTGCGCGAGTTCAAAGAGTTTGCCGCCGGAAGAAGA [서열번호 213]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 213에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 213의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 214로 제공된다:
UCUGGCGUGCUGUGGGAUACACCUUCUCCACCAGAGGUGGAAAGAGCCGUGCUGGACGACGGCAUCUACCGGAUUCUGCAGAGAGGACUGCUGGGCAGAUCUCAAGUUGGCGUGGGCGUGUUCCAAGAAGGGGUGUUCCACACCAUGUGGCACGUGACAAGAGGCGCCGUGCUGAUGUACCAGGGCAAGAGACUGGAACCUAGCUGGGCCAGCGUGAAGAAGGACCUGAUCUCUUACGGCGGAGGCUGGCGGUUUCAAGGCUCUUGGAAUGCCGGCGAAGAGGUGCAAGUGAUCGCCGUGGAACCCGGCAAGAACCCCAAGAACGUUCAGACAGCCCCUGGCACCUUCAAGACCCCUGAAGGCGAAGUGGGAGCUAUCGCCCUGGAUUUCAAGCCUGGCACAAGCGGCAGCCCCAUCGUGAACAGAGAAGGCAAGAUCGUGGGCCUGUACGGCAAUGGCGUGGUCACCACAUCUGGCACCUACGUGUCAGCCAUUGCUCAGGCCAAGGCCUCUCAAGAGGGACCCCUGCCUGAGAUCGAGGACGAGGUGUUCCGGAAGCGGAACCUGACCAUCAUGGAUCUGCACCCUGGCAGCGGCAAGACCAGAAGAUAUCUGCCCGCCAUUGUGCGCGAGGCCAUCCGAAGAAAUGUGCGGACACUGGUGCUGGCCCCUACAAGAGUGGUGGCCUCUGAAAUGGCCGAGGCUCUGAAGGGCAUGCCUAUCAGAUACCAGACCACCGCCGUGAAGUCUGAGCACACCGGCAAAGAAAUCGUGGACCUGAUGUGCCACGCCACCUUCACCAUGAGACUGCUGAGCCCUGUGCGGGUGCCCAACUACAACAUGAUCAUCAUGGACGAGGCCCACUUCACAGACCCCGCCUCUAUUGCCGCCAGAGGCUACAUCUCUACCAGAGUCGGCAUGGGAGAAGCCGCCGCUAUCUUCAUGACAGCCACACCUCCAGGCAGCGUGGAAGCCUUUCCUCAGUCCAAUGCCGUGAUCCAGGACGAAGAGAGAGACAUCCCCGAGCGGAGCUGGAACAGCGGCUACGACUGGAUCACCGACUUUCCAGGCAAGACCGUUUGGUUCGUGCCCAGCAUCAAGAGCGGCAACGAUAUCGCCAACUGCCUGCGGAAGAACGGCAAGAGAGUGGUGCAGCUGAGCAGAAAGACCUUCGACACCGAGUACCAAAAGACCAAGAACAACGACUGGGACUACGUCGUGACCACCGACAUCUCUGAGAUGGGCGCCAACUUCAGGGCCGACAGAGUGAUCGACCCUCGGAGAUGUCUGAAGCCCGUGAUCCUGAAGGACGGCCCUGAGAGAGUGAUUCUGGCCGGACCUAUGCCUGUGACAGUGGCUUCUGCCGCUCAGAGAAGAGGCCGGAUCGGCCGGAAUCAGAACAAAGAGGGCGACCAGUACAUCUACAUGGGCCAGCCUCUGAACAACGAUGAGGAUCACGCCCACUGGACCGAGGCCAAGAUGCUGCUGGACAACAUCAACACCCCUGAGGGCAUCAUCCCCGCUCUGUUCGAGCCCGAGAGAGAGAAGUCUGCCGCAAUCGACGGCGAGUACAGACUGAGAGGCGAGGCCAGAAAGACAUUUGUGGAACUGAUGCGGAGAGGCGACCUGCCUGUGUGGCUGAGUUACAAGGUGGCCAGCGAGGGCUUCCAGUACAGCGAUAGAAGAUGGUGCUUCGAUGGCGAGCGGAACAACCAGGUGCUGGAAGAGAACAUGGACGUGGAAAUCUGGACCAAAGAAGGCGAGCGCAAGAAACUGCGGCCCAGAUGGCUGGAUGCCCGGACAUAUUCUGACCCUCUGGCUCUGCGCGAGUUCAAAGAGUUUGCCGCCGGAAGAAGA [서열번호 214]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 214에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 EV71 3Cpro(B9VUU3; 게놈 폴리단백질 인간 엔테로바이러스 71), 또는 그의 동원체이다. [Lei X, Xiao X, Xue Q, Jin Q, He B, Wang JJ. (2013) Cleavage of interferon regulatory factor 7 by enterovirus 71 3C suppresses cellular responses. J Virol, 87, 3, 1690-1698. doi: 10.1128/JVI.01855-12. Epub 2012 Nov 21]. 상기 IIP는 IRF7을 절단하는 것으로 여겨진다. EV71 3Cpro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 215로 나타낸다:
GPSLDFALSLLRRNVRQVQTDQGHFTMLGVRDRLAVLPRHSQPGKTIWIEHKLVNVLDAVELVDEQGVNLELTLITLDTNEKFRDITKFIPENISTASDATLVINTEHMPSMFVPVGDVVQYGFLNLSGKPTHRTMMYNFPTKAGQCGGVVTSVGKVIGIHIGGNGRQGFCAGLKRSYFASEQ [서열번호 215]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 215에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 EV71 3Cpro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 216의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGCCCGAGCCTTGATTTTGCTCTCTCCCTACTGAGGAGGAACGTCAGGCAAGTCCAAACAGACCAGGGGCATTTCACCATGTTGGGTGTTAGGGATCGCTTAGCAGTCCTCCCACGCCACTCACAACCCGGCAAAACTATTTGGATTGAGCACAAACTCGTGAACGTCCTTGATGCAGTTGAATTGGTGGATGAGCAAGGAGTCAACCTGGAATTAACCCTCATCACTCTTGATACCAACGAGAAGTTTAGGGATATCACCAAATTCATCCCGGAAAATATTAGCACTGCTAGTGATGCCACCCTAGTGATCAACACGGAGCACATGCCCTCGATGTTTGTCCCGGTGGGTGACGTTGTGCAGTATGGTTTCCTGAATCTCAGTGGTAAGCCTACTCATCGCACCATGATGTACAACTTTCCTACTAAGGCAGGGCAATGTGGAGGGGTGGTGACATCAGTTGGAAAAGTCATCGGTATACACATAGGTGGCAACGGTAGACAAGGATTTTGTGCAGGTCTTAAGAGAAGCTACTTTGCCAGCGAGCAA [서열번호 216]
따라서, 바람직하게는 상기 EV71 3Cpro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 216에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 EV71 3Cpro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 217로 제공된다:
GGCCCTTCTCTGGATTTTGCCCTGAGCCTGCTGCGGAGAAATGTGCGCCAGGTGCAGACAGATCAGGGCCACTTTACAATGCTGGGCGTCAGAGACAGACTGGCCGTGCTGCCTAGACACTCTCAGCCTGGCAAGACCATCTGGATCGAGCACAAGCTGGTCAACGTGCTGGACGCCGTGGAACTGGTTGATGAGCAGGGCGTGAACCTGGAACTGACCCTGATCACCCTGGACACCAACGAGAAGTTCCGGGACATCACCAAGTTCATCCCCGAGAACATCAGCACCGCCAGCGACGCCACACTGGTCATCAATACCGAGCACATGCCCAGCATGTTCGTGCCTGTGGGAGATGTGGTGCAGTACGGCTTCCTGAACCTGAGCGGCAAGCCCACACACCGGACCATGATGTACAACTTCCCTACCAAGGCCGGCCAGTGCGGCGGAGTGGTTACATCTGTGGGCAAAGTGATCGGCATCCACATCGGCGGCAATGGCAGACAGGGATTTTGTGCCGGCCTGAAGAGAAGCTACTTCGCCTCTGAACAG [서열번호 217]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 217에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 217의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 218로 제공된다:
GGCCCUUCUCUGGAUUUUGCCCUGAGCCUGCUGCGGAGAAAUGUGCGCCAGGUGCAGACAGAUCAGGGCCACUUUACAAUGCUGGGCGUCAGAGACAGACUGGCCGUGCUGCCUAGACACUCUCAGCCUGGCAAGACCAUCUGGAUCGAGCACAAGCUGGUCAACGUGCUGGACGCCGUGGAACUGGUUGAUGAGCAGGGCGUGAACCUGGAACUGACCCUGAUCACCCUGGACACCAACGAGAAGUUCCGGGACAUCACCAAGUUCAUCCCCGAGAACAUCAGCACCGCCAGCGACGCCACACUGGUCAUCAAUACCGAGCACAUGCCCAGCAUGUUCGUGCCUGUGGGAGAUGUGGUGCAGUACGGCUUCCUGAACCUGAGCGGCAAGCCCACACACCGGACCAUGAUGUACAACUUCCCUACCAAGGCCGGCCAGUGCGGCGGAGUGGUUACAUCUGUGGGCAAAGUGAUCGGCAUCCACAUCGGCGGCAAUGGCAGACAGGGAUUUUGUGCCGGCCUGAAGAGAAGCUACUUCGCCUCUGAACAG [서열번호 218]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 218에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 FMDV Lpro(P03307; 리더(Leader) 프로테아제 게놈 폴리단백질 구제역 바이러스(단리물-/독일/A5 베스터발트(Westerwald)/1951 혈청형 A)), 또는 그의 동원체이다. FMDV Lpro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 219로 나타낸다:
MHTTDCFIALVHAIREIRALFLPRTTGKMELTLHNGEKKTFYSRPNNHDNCWLNTILQLFRYVDEPFFDWVYNSPENLTLEAINQLEELTGLELHEGGPPALVIWNIKHLLHTGIGTASRPSEVCMVDGTDMCLADFHAGIFLKGQEHAVFACVTSNGWYAIDDEEFYPWTPDPSDVLVFVPYDQEPLNGDWKAMVQRKLK [서열번호 219]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 219에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 FMDV Lpro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 220의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGCATACAACTGACTGTTTTATCGCTTTGGTGCACGCTATCAGAGAGATCAGAGCACTTTTTCTACCACGAACCACAGGAAAGATGGAACTCACCCTGCACAACGGCGAGAAAAAGACTTTTTACTCTAGACCCAACAACCACGACAACTGCTGGTTGAACACCATCCTTCAGTTGTTCAGGTATGTCGATGAACCCTTCTTCGACTGGGTCTACAACTCGCCCGAGAACCTCACGCTTGAAGCCATCAACCAATTGGAGGAACTCACAGGACTTGAGTTGCACGAGGGCGGACCGCCTGCCCTTGTGATCTGGAACATCAAACACTTGCTCCACACCGGCATCGGCACCGCCTCACGACCCAGTGAGGTGTGTATGGTGGACGGCACGGACATGTGTCTTGCTGACTTCCACGCAGGCATTTTCCTGAAGGGACAGGAACACGCAGTCTTTGCGTGTGTCACCTCCAACGGGTGGTACGCGATTGACGACGAGGAATTTTACCCCTGGACGCCTGACCCGTCAGACGTCCTGGTGTTTGTCCCGTACGATCAAGAACCACTCAACGGGGACTGGAAAGCGATGGTTCAGAGGAAGCTTAAG [서열번호 220]
따라서, 바람직하게는 상기 FMDV Lpro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 220에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 FMDV Lpro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 221로 제공된다:
ATGCACACCACCGACTGCTTTATCGCCCTGGTGCACGCCATCAGAGAGATCAGAGCCCTGTTCCTGCCTCGGACCACCGGCAAGATGGAACTGACACTGCACAACGGCGAGAAGAAAACCTTCTACAGCAGACCCAACAACCACGACAACTGCTGGCTGAACACCATCCTGCAGCTGTTCAGATACGTGGACGAGCCCTTCTTCGACTGGGTGTACAACAGCCCCGAGAATCTGACCCTGGAAGCCATCAACCAGCTGGAAGAACTGACCGGCCTGGAACTGCATGAAGGCGGACCTCCAGCTCTGGTCATCTGGAACATCAAACATCTGCTGCACACCGGCATCGGCACCGCCTCTAGACCATCTGAAGTGTGCATGGTGGACGGCACCGATATGTGCCTGGCCGATTTTCACGCCGGCATCTTTCTGAAGGGCCAAGAGCATGCCGTGTTCGCCTGCGTGACAAGCAATGGATGGTACGCCATCGACGACGAGGAATTCTACCCCTGGACACCCGATCCTAGCGACGTGCTGGTGTTCGTGCCCTACGATCAAGAGCCCCTGAACGGCGATTGGAAGGCCATGGTGCAGCGGAAGCTGAAG [서열번호 221]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 221에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 221의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 222로 제공된다:
AUGCACACCACCGACUGCUUUAUCGCCCUGGUGCACGCCAUCAGAGAGAUCAGAGCCCUGUUCCUGCCUCGGACCACCGGCAAGAUGGAACUGACACUGCACAACGGCGAGAAGAAAACCUUCUACAGCAGACCCAACAACCACGACAACUGCUGGCUGAACACCAUCCUGCAGCUGUUCAGAUACGUGGACGAGCCCUUCUUCGACUGGGUGUACAACAGCCCCGAGAAUCUGACCCUGGAAGCCAUCAACCAGCUGGAAGAACUGACCGGCCUGGAACUGCAUGAAGGCGGACCUCCAGCUCUGGUCAUCUGGAACAUCAAACAUCUGCUGCACACCGGCAUCGGCACCGCCUCUAGACCAUCUGAAGUGUGCAUGGUGGACGGCACCGAUAUGUGCCUGGCCGAUUUUCACGCCGGCAUCUUUCUGAAGGGCCAAGAGCAUGCCGUGUUCGCCUGCGUGACAAGCAAUGGAUGGUACGCCAUCGACGACGAGGAAUUCUACCCCUGGACACCCGAUCCUAGCGACGUGCUGGUGUUCGUGCCCUACGAUCAAGAGCCCCUGAACGGCGAUUGGAAGGCCAUGGUGCAGCGGAAGCUGAAG [서열번호 222]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 222에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 FMDV 3Cpro(P03307; 프로테아제 3C 게놈 폴리단백질 구제역 바이러스(단리물-/독일/A5 베스터발트/1951 혈청형 A), 또는 그의 동원체이다. [Ekanayaka P, Shin SH, Weeratunga P, Lee H, Kim T-H, Chathuranga K, Subasinghe A, Park J-H, Lee J-S (2021) Foot and mouth disease virus 3C protease antagonises interferon signaling and C142T substitution attenuates the FMD virus. Front Microbiol., 21, 737031. doi: 10.3389/fmicb.2021.737031].
FMDV 3Cpro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 223으로 나타낸다:
SGAPPTDLQKMVMGNTKPVELILDGKTVAICCATGVFGTAYLVPRHLFAEKYDKIMLDGRAMTDSDYRVFEFEIKVKGQDMLSDAALMVLHRGNRVRDITKHFRDTARMKKGTPVVGVINNADVGRLIFSGEALTYKDIVVCMDGDTMPGLFAYRAATKAGYCGGAVLAKDGADTFIVGTHSAGGNGVGYCSCVSRSMLLKMKAHIDPEPHHE [서열번호 223]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 223에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 FMDV 3Cpro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 224의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
AGTGGTGCCCCCCCGACCGACTTGCAAAAGATGGTCATGGGCAACACAAAGCCTGTTGAGCTCATCCTCGACGGGAAGACAGTAGCCATCTGCTGTGCTACTGGAGTGTTTGGCACTGCCTACCTCGTGCCTCGTCATCTTTTCGCTGAGAAGTATGACAAGATCATGTTGGACGGCAGAGCCATGACAGACAGTGACTACAGAGTGTTTGAGTTCGAGATCAAAGTAAAAGGACAGGACATGCTCTCAGACGCCGCACTCATGGTGCTCCACCGTGGGAACCGCGTGAGAGACATCACGAAGCACTTTCGTGACACAGCAAGAATGAAGAAAGGCACCCCCGTTGTCGGCGTGATCAACAATGCCGATGTCGGGAGACTGATTTTCTCTGGCGAAGCCCTTACCTACAAAGACATTGTAGTGTGCATGGACGGAGACACCATGCCCGGGCTTTTTGCCTACAGAGCCGCCACTAAGGCAGGCTACTGCGGGGGAGCCGTTCTCGCTAAGGACGGGGCTGACACTTTCATCGTTGGCACTCACTCTGCAGGAGGTAATGGAGTTGGATACTGCTCATGCGTTTCCAGGTCCATGCTTCTCAAGATGAAGGCACACATTGACCCTGAGCCGCACCACGAG [서열번호 224]
따라서, 바람직하게는 상기 FMDV 3Cpro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 224에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 FMDV 3Cpro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 225로 제공된다:
TCTGGTGCCCCTCCTACCGACCTGCAGAAAATGGTCATGGGCAACACCAAGCCTGTGGAACTGATCCTGGACGGCAAGACCGTGGCCATCTGTTGTGCAACAGGCGTGTTCGGCACCGCCTACCTGGTTCCTAGACACCTGTTCGCCGAGAAGTACGACAAGATCATGCTGGATGGCAGAGCCATGACCGACAGCGACTACCGGGTGTTCGAGTTCGAGATCAAAGTGAAAGGCCAGGACATGCTGAGCGACGCCGCTCTGATGGTTCTGCACAGAGGCAACAGAGTGCGGGACATCACCAAGCACTTCCGGGACACCGCCAGAATGAAGAAAGGCACACCTGTCGTGGGCGTGATCAACAACGCTGACGTGGGCAGACTGATCTTCTCTGGCGAGGCCCTGACCTACAAGGACATCGTCGTGTGCATGGACGGCGACACAATGCCTGGCCTGTTTGCCTATAGAGCCGCCACAAAGGCCGGCTACTGTGGCGGAGCTGTGCTGGCTAAAGATGGCGCCGATACCTTCATCGTGGGCACACATTCTGCCGGCGGAAATGGCGTGGGCTACTGCTCTTGTGTGTCCAGATCCATGCTGCTGAAGATGAAGGCCCACATCGACCCCGAGCCTCACCATGAA [서열번호 225]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 225에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 225의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 226으로 제공된다:
UCUGGUGCCCCUCCUACCGACCUGCAGAAAAUGGUCAUGGGCAACACCAAGCCUGUGGAACUGAUCCUGGACGGCAAGACCGUGGCCAUCUGUUGUGCAACAGGCGUGUUCGGCACCGCCUACCUGGUUCCUAGACACCUGUUCGCCGAGAAGUACGACAAGAUCAUGCUGGAUGGCAGAGCCAUGACCGACAGCGACUACCGGGUGUUCGAGUUCGAGAUCAAAGUGAAAGGCCAGGACAUGCUGAGCGACGCCGCUCUGAUGGUUCUGCACAGAGGCAACAGAGUGCGGGACAUCACCAAGCACUUCCGGGACACCGCCAGAAUGAAGAAAGGCACACCUGUCGUGGGCGUGAUCAACAACGCUGACGUGGGCAGACUGAUCUUCUCUGGCGAGGCCCUGACCUACAAGGACAUCGUCGUGUGCAUGGACGGCGACACAAUGCCUGGCCUGUUUGCCUAUAGAGCCGCCACAAAGGCCGGCUACUGUGGCGGAGCUGUGCUGGCUAAAGAUGGCGCCGAUACCUUCAUCGUGGGCACACAUUCUGCCGGCGGAAAUGGCGUGGGCUACUGCUCUUGUGUGUCCAGAUCCAUGCUGCUGAAGAUGAAGGCCCACAUCGACCCCGAGCCUCACCAUGAA [서열번호 226]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 226에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 토스카나 바이러스 NSS 단백질(RIG 1 분해)(P21699; 비-구조 단백질 NS-S 토스카나 바이러스), 또는 그의 동원체이다. 토스카나 바이러스 NSS 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 227로 나타낸다:
MQSRAVILKYRSGSGHKRSLPRFYIDCDLDTFDFEKDCSLIENEFPIYINNYKVVYKSKPTLSHFLIEKEFPAVLGPGMISAVRTRLYEPTMRELYQESIHQLKRSNKKYLLSALRWPTGIPTLEFIDYYFEELLFLSEFDPGSIQRYLKLLVKASGLYNSTNEEQIVEIHRRVLIEGKKHGLTAFDLPGNDILGDICVVQAARVTRLVAKTFSKMTRDTHLMIYFSISPVELVLSKLDKKGDKRAKAKGLMSMSAARSYDYFMRTDLGFRETALSTFWAKDWPTPQETILSDKRCLKEDMRVTKWLPSPPHYPPL [서열번호 227]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 227에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 토스카나 바이러스 NSS 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 228의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGCAATCCAGAGCTGTCATCTTGAAGTATAGATCTGGTTCAGGCCACAAGAGGTCTTTGCCCAGGTTCTACATAGACTGTGATTTGGACACCTTTGATTTTGAGAAGGATTGCTCTCTGATTGAGAATGAGTTCCCCATTTACATAAACAATTATAAGGTGGTCTATAAGTCAAAGCCAACTCTCTCACATTTCCTCATTGAGAAGGAGTTTCCTGCTGTGCTGGGGCCTGGTATGATCAGTGCAGTTCGAACCAGACTTTACGAGCCAACTATGAGAGAGCTCTACCAGGAATCGATTCACCAACTAAAGAGGAGCAACAAGAAATACCTTTTGTCTGCTCTCAGGTGGCCCACAGGGATTCCTACTCTAGAGTTTATAGACTATTACTTCGAGGAGCTCCTGTTCTTGTCAGAGTTTGACCCGGGGTCTATCCAGAGATACCTGAAATTACTGGTTAAGGCCTCTGGGCTTTACAACTCCACTAATGAGGAGCAGATAGTGGAGATTCACAGACGAGTGCTCATAGAAGGCAAAAAGCACGGATTGACTGCTTTTGATCTCCCAGGAAATGACATCCTTGGAGACATCTGTGTGGTCCAAGCAGCACGGGTGACAAGACTGGTTGCTAAGACATTCTCTAAGATGACCAGAGACACCCATCTGATGATATACTTCTCGATAAGCCCAGTTGAGTTGGTTTTGAGTAAACTTGATAAGAAAGGGGACAAGAGGGCTAAAGCAAAAGGGTTGATGTCTATGAGTGCCGCTAGGTCTTATGACTATTTTATGAGAACTGACTTGGGATTCAGAGAGACTGCTCTTTCCACCTTTTGGGCTAAGGACTGGCCTACCCCACAAGAGACCATTCTATCTGACAAACGATGCCTTAAAGAAGACATGAGAGTGACAAAGTGGCTGCCTAGTCCCCCCCACTACCCACCCTTA [서열번호 228]
따라서, 바람직하게는 상기 토스카나 바이러스 NSS 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 228에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 토스카나 바이러스 NSS 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 229로 제공된다:
ATGCAGAGCAGAGCCGTGATCCTGAAGTACAGAAGCGGCAGCGGCCACAAGAGAAGCCTGCCTAGATTCTACATCGACTGCGACCTGGACACCTTCGACTTCGAGAAGGACTGCAGCCTGATCGAGAACGAGTTCCCCATCTACATCAACAACTACAAGGTGGTGTACAAGAGCAAGCCAACTCTGAGCCACTTCCTCATCGAGAAAGAATTCCCTGCCGTGCTCGGCCCTGGCATGATCTCTGCCGTTAGAACCAGACTGTACGAGCCCACCATGAGAGAGCTGTACCAAGAGAGCATCCACCAGCTGAAGCGGAGCAACAAGAAGTACCTGCTGAGCGCCCTGAGATGGCCCACAGGCATTCCCACACTGGAATTCATCGACTACTACTTCGAGGAACTGCTGTTCCTGAGCGAGTTCGACCCTGGCAGCATCCAGAGATACCTGAAGCTGCTGGTCAAGGCCAGCGGCCTGTACAACAGCACCAACGAGGAACAGATCGTGGAAATCCACCGGCGGGTGCTGATCGAGGGAAAGAAGCACGGACTGACCGCCTTCGACCTGCCTGGCAATGATATCCTGGGCGACATCTGCGTGGTGCAGGCCGCTAGAGTGACAAGACTGGTGGCCAAGACCTTCAGCAAGATGACCAGAGACACCCACCTGATGATCTACTTCAGCATCAGCCCCGTGGAACTGGTGCTGAGCAAGCTGGACAAGAAGGGCGACAAGAGAGCCAAGGCCAAGGGCCTGATGAGCATGTCTGCCGCCAGATCCTACGACTACTTCATGAGAACCGACCTGGGCTTCAGAGAGACAGCCCTGAGCACCTTCTGGGCCAAAGACTGGCCCACACCTCAAGAGACAATCCTGTCCGACAAGCGGTGCCTGAAAGAAGATATGCGGGTCACCAAGTGGCTGCCCTCTCCACCTCATTACCCTCCACTT [서열번호 229]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 229에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 229의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 230으로 제공된다:
AUGCAGAGCAGAGCCGUGAUCCUGAAGUACAGAAGCGGCAGCGGCCACAAGAGAAGCCUGCCUAGAUUCUACAUCGACUGCGACCUGGACACCUUCGACUUCGAGAAGGACUGCAGCCUGAUCGAGAACGAGUUCCCCAUCUACAUCAACAACUACAAGGUGGUGUACAAGAGCAAGCCAACUCUGAGCCACUUCCUCAUCGAGAAAGAAUUCCCUGCCGUGCUCGGCCCUGGCAUGAUCUCUGCCGUUAGAACCAGACUGUACGAGCCCACCAUGAGAGAGCUGUACCAAGAGAGCAUCCACCAGCUGAAGCGGAGCAACAAGAAGUACCUGCUGAGCGCCCUGAGAUGGCCCACAGGCAUUCCCACACUGGAAUUCAUCGACUACUACUUCGAGGAACUGCUGUUCCUGAGCGAGUUCGACCCUGGCAGCAUCCAGAGAUACCUGAAGCUGCUGGUCAAGGCCAGCGGCCUGUACAACAGCACCAACGAGGAACAGAUCGUGGAAAUCCACCGGCGGGUGCUGAUCGAGGGAAAGAAGCACGGACUGACCGCCUUCGACCUGCCUGGCAAUGAUAUCCUGGGCGACAUCUGCGUGGUGCAGGCCGCUAGAGUGACAAGACUGGUGGCCAAGACCUUCAGCAAGAUGACCAGAGACACCCACCUGAUGAUCUACUUCAGCAUCAGCCCCGUGGAACUGGUGCUGAGCAAGCUGGACAAGAAGGGCGACAAGAGAGCCAAGGCCAAGGGCCUGAUGAGCAUGUCUGCCGCCAGAUCCUACGACUACUUCAUGAGAACCGACCUGGGCUUCAGAGAGACAGCCCUGAGCACCUUCUGGGCCAAAGACUGGCCCACACCUCAAGAGACAAUCCUGUCCGACAAGCGGUGCCUGAAAGAAGAUAUGCGGGUCACCAAGUGGCUGCCCUCUCCACCUCAUUACCCUCCACUU [서열번호 230]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 230에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 비-구조 단백질 1 인플루엔자 A 바이러스(바이러스주 A/푸에르토리코/8/1934 H1N1)(P03496; 인플루엔자 A/PR/8/34 NS1), 또는 그의 동원체이다. 인플루엔자 A 바이러스 비-구조 단백질 1의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 231로 나타낸다:
MDPNTVSSFQVDCFLWHVRKRVADQELGDAPFLDRLRRDQKSLRGRGSTLGLDIETATRAGKQIVERILKEESDEALKMTMASVPASRYLTDMTLEEMSREWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEWNDNTVRVSETLQRFAWRSSNENGRPPLTPKQKREMAGTIRSEV [서열번호 231]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 231에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 비-구조 단백질 1 인플루엔자 A 바이러스 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 232의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGATCCAAACACTGTGTCAAGCTTTCAGGTAGATTGCTTTCTTTGGCATGTCCGCAAACGAGTTGCAGACCAAGAACTAGGTGATGCCCCATTCCTTGATCGGCTTCGCCGAGATCAGAAATCCCTAAGAGGAAGGGGCAGCACTCTTGGTCTGGACATCGAGACAGCCACACGTGCTGGAAAGCAGATAGTGGAGCGGATTCTGAAAGAAGAATCCGATGAGGCACTTAAAATGACCATGGCCTCTGTACCTGCGTCGCGTTACCTAACCGACATGACTCTTGAGGAAATGTCAAGGGAATGGTCCATGCTCATACCCAAGCAGAAAGTGGCAGGCCCTCTTTGTATCAGAATGGACCAGGCGATCATGGATAAAAACATCATACTGAAAGCGAACTTCAGTGTGATTTTTGACCGGCTGGAGACTCTAATATTGCTAAGGGCTTTCACCGAAGAGGGAGCAATTGTTGGCGAAATTTCACCATTGCCTTCTCTTCCAGGACATACTGCTGAGGATGTCAAAAATGCAGTTGGAGTCCTCATCGGAGGACTTGAATGGAATGATAACACAGTTCGAGTCTCTGAAACTCTACAGAGATTCGCTTGGAGAAGCAGTAATGAGAATGGGAGACCTCCACTCACTCCAAAACAGAAACGAGAAATGGCGGGAACAATTAGGTCAGAAGTTTGA [서열번호 232]
따라서, 바람직하게는 상기 비-구조 단백질 1 인플루엔자 A 바이러스 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 232에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 비-구조 단백질 1 인플루엔자 A 바이러스 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 233으로 제공된다:
ATGGACCCCAATACCGTCAGCAGCTTCCAGGTGGACTGCTTCCTGTGGCACGTGCGGAAAAGAGTGGCCGATCAAGAACTGGGCGACGCCCCATTCCTGGACAGACTGAGAAGAGATCAGAAGTCCCTGAGAGGCAGAGGCAGCACACTGGGCCTCGACATTGAGACAGCCACAAGAGCCGGCAAGCAGATCGTGGAACGGATCCTGAAAGAGGAAAGCGACGAGGCCCTGAAGATGACCATGGCCTCTGTGCCTGCCAGCAGATACCTGACCGACATGACCCTGGAAGAGATGAGCCGCGAGTGGTCCATGCTGATCCCCAAGCAGAAAGTGGCCGGACCTCTGTGCATCAGAATGGATCAGGCCATCATGGACAAGAACATCATCCTGAAGGCCAACTTCAGCGTGATCTTCGACCGGCTGGAAACCCTGATCCTGCTGAGAGCCTTTACCGAAGAGGGCGCCATCGTGGGAGAGATCAGTCCTCTGCCTTCTCTGCCTGGACACACCGCCGAGGATGTGAAGAATGCTGTGGGCGTGCTGATCGGCGGCCTGGAATGGAACGATAACACCGTCAGAGTGTCCGAGACACTGCAGAGATTTGCCTGGCGGAGCAGCAACGAGAACGGCAGACCTCCTCTGACACCTAAGCAGAAAAGAGAGATGGCCGGCACCATCCGCAGCGAAGTGTAA [서열번호 233]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 233에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 233의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 234로 제공된다:
AUGGACCCCAAUACCGUCAGCAGCUUCCAGGUGGACUGCUUCCUGUGGCACGUGCGGAAAAGAGUGGCCGAUCAAGAACUGGGCGACGCCCCAUUCCUGGACAGACUGAGAAGAGAUCAGAAGUCCCUGAGAGGCAGAGGCAGCACACUGGGCCUCGACAUUGAGACAGCCACAAGAGCCGGCAAGCAGAUCGUGGAACGGAUCCUGAAAGAGGAAAGCGACGAGGCCCUGAAGAUGACCAUGGCCUCUGUGCCUGCCAGCAGAUACCUGACCGACAUGACCCUGGAAGAGAUGAGCCGCGAGUGGUCCAUGCUGAUCCCCAAGCAGAAAGUGGCCGGACCUCUGUGCAUCAGAAUGGAUCAGGCCAUCAUGGACAAGAACAUCAUCCUGAAGGCCAACUUCAGCGUGAUCUUCGACCGGCUGGAAACCCUGAUCCUGCUGAGAGCCUUUACCGAAGAGGGCGCCAUCGUGGGAGAGAUCAGUCCUCUGCCUUCUCUGCCUGGACACACCGCCGAGGAUGUGAAGAAUGCUGUGGGCGUGCUGAUCGGCGGCCUGGAAUGGAACGAUAACACCGUCAGAGUGUCCGAGACACUGCAGAGAUUUGCCUGGCGGAGCAGCAACGAGAACGGCAGACCUCCUCUGACACCUAAGCAGAAAAGAGAGAUGGCCGGCACCAUCCGCAGCGAAGUGUAA [서열번호 234]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 234에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 SARS CoV N 단백질(P59595; 핵단백질 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스), 또는 그의 동원체이다. SARS CoV N 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 235로 나타낸다:
MSDNGPQSNQRSAPRITFGGPTDSTDNNQNGGRNGARPKQRRPQGLPNNTASWFTALTQHGKEELRFPRGQGVPINTNSGPDDQIGYYRRATRRVRGGDGKMKELSPRWYFYYLGTGPEASLPYGANKEGIVWVATEGALNTPKDHIGTRNPNNNAATVLQLPQGTTLPKGFYAEGSRGGSQASSRSSSRSRGNSRNSTPGSSRGNSPARMASGGGETALALLLLDRLNQLESKVSGKGQQQQGQTVTKKSAAEASKKPRQKRTATKQYNVTQAFGRRGPEQTQGNFGDQDLIRQGTDYKHWPQIAQFAPSASAFFGMSRIGMEVTPSGTWLTYHGAIKLDDKDPQFKDNVILLNKHIDAYKTFPPTEPKKDKKKKTDEAQPLPQRQKKQPTVTLLPAADMDDFSRQLQNSMSGASADSTQA [서열번호 235]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 235에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SARS CoV N 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 236의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGTCTGATAATGGACCCCAATCAAACCAACGTAGTGCCCCCCGCATTACATTTGGTGGACCCACAGATTCAACTGACAATAACCAGAATGGAGGACGCAATGGGGCAAGGCCAAAACAGCGCCGACCCCAAGGTTTACCCAATAATACTGCGTCTTGGTTCACAGCTCTCACTCAGCATGGCAAGGAGGAACTTAGATTCCCTCGAGGCCAGGGCGTTCCAATCAACACCAATAGTGGTCCAGATGACCAAATTGGCTACTACCGAAGAGCTACCCGACGAGTTCGTGGTGGTGACGGCAAAATGAAAGAGCTCAGCCCCAGATGGTACTTCTATTACCTAGGAACTGGCCCAGAAGCTTCACTTCCCTACGGCGCTAACAAAGAAGGCATCGTATGGGTTGCAACTGAGGGAGCCTTGAATACACCCAAAGACCACATTGGCACCCGCAATCCTAATAACAATGCTGCCACCGTGCTACAACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAGGGAAGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGCTCCTCATCACGTAGTCGCGGTAATTCAAGAAATTCAACTCCTGGCAGCAGTAGGGGAAATTCTCCTGCTCGAATGGCTAGCGGAGGTGGTGAAACTGCCCTCGCGCTATTGCTGCTAGACAGATTGAACCAGCTTGAGAGCAAAGTTTCTGGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAAACTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCATCTAAAAAGCCTCGCCAAAAACGTACTGCCACAAAACAGTACAACGTCACTCAAGCATTTGGGAGACGTGGTCCAGAACAAACCCAAGGAAATTTCGGGGACCAAGACCTAATCAGACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCTCCAAGTGCCTCTGCATTCTTTGGAATGTCACGCATTGGCATGGAAGTCACACCTTCGGGAACATGGCTGACTTATCATGGAGCCATTAAATTGGATGACAAAGATCCACAATTCAAAGACAACGTCATACTGCTGAACAAGCACATTGACGCATACAAAACATTCCCACCAACAGAGCCTAAAAAGGACAAAAAGAAAAAGACTGATGAAGCTCAGCCTTTGCCGCAGAGACAAAAGAAGCAGCCCACTGTGACTCTTCTTCCTGCGGCTGACATGGATGATTTCTCCAGACAACTTCAAAATTCCATGAGTGGAGCTTCTGCTGATTCAACTCAGGCA [서열번호 236]
따라서, 바람직하게는 상기 SARS CoV N 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 236에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 SARS CoV N 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 237로 제공된다:
ATGAGCGACAATGGCCCTCAGAGCAACCAGAGAAGCGCCCCTAGAATCACCTTTGGCGGCCCTACCGACAGCACCGACAACAACCAGAACGGCGGCAGAAATGGCGCCAGACCTAAGCAGAGAAGGCCTCAGGGCCTGCCTAACAATACCGCCAGCTGGTTCACAGCCCTGACACAGCACGGCAAAGAGGAACTGAGATTCCCCAGAGGACAGGGCGTGCCCATCAACACAAATAGCGGCCCTGACGACCAGATCGGCTACTACAGACGGGCCACCAGAAGAGTTAGAGGCGGCGACGGCAAGATGAAGGAACTGTCCCCTCGGTGGTACTTCTACTACCTCGGCACAGGACCCGAAGCCAGCCTTCCTTATGGCGCCAACAAAGAGGGCATCGTCTGGGTTGCAACAGAAGGCGCCCTGAACACCCCTAAGGACCACATCGGCACCAGAAATCCCAACAACAACGCCGCCACAGTGCTGCAGTTGCCACAGGGAACAACACTGCCCAAGGGCTTCTACGCCGAGGGATCTAGAGGCGGATCTCAGGCCAGCAGCAGAAGCAGCTCTAGAAGCAGAGGCAACAGCCGGAATAGCACCCCTGGCAGCTCCAGAGGCAATTCCCCTGCCAGAATGGCTTCTGGCGGCGGAGAAACAGCTCTGGCACTGCTGCTGCTCGACCGGCTGAATCAGCTGGAATCTAAGGTGTCCGGCAAGGGCCAGCAACAGCAGGGACAGACCGTGACCAAGAAGTCTGCCGCTGAGGCCAGCAAGAAGCCCAGACAGAAGAGAACCGCCACCAAGCAGTACAACGTGACCCAGGCCTTTGGCAGAAGAGGCCCAGAACAGACCCAGGGCAATTTCGGCGACCAGGACCTGATCAGACAGGGCACCGATTACAAGCACTGGCCCCAGATCGCCCAGTTTGCCCCTTCTGCCTCTGCCTTTTTCGGCATGAGCCGGATCGGCATGGAAGTGACACCTAGCGGCACCTGGCTGACATATCACGGCGCCATCAAGCTGGACGACAAGGACCCTCAGTTCAAGGACAACGTGATCCTGCTGAACAAGCACATCGACGCCTACAAGACATTCCCTCCAACCGAGCCTAAGAAGGACAAGAAGAAGAAAACCGACGAGGCCCAGCCTCTGCCACAGAGACAGAAAAAGCAGCCCACCGTGACACTGCTGCCTGCCGCCGATATGGACGACTTCTCTAGACAGCTGCAGAACAGCATGAGCGGCGCCAGCGCTGATTCTACACAAGCT [서열번호 237]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 237에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 237의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 238로 제공된다:
AUGAGCGACAAUGGCCCUCAGAGCAACCAGAGAAGCGCCCCUAGAAUCACCUUUGGCGGCCCUACCGACAGCACCGACAACAACCAGAACGGCGGCAGAAAUGGCGCCAGACCUAAGCAGAGAAGGCCUCAGGGCCUGCCUAACAAUACCGCCAGCUGGUUCACAGCCCUGACACAGCACGGCAAAGAGGAACUGAGAUUCCCCAGAGGACAGGGCGUGCCCAUCAACACAAAUAGCGGCCCUGACGACCAGAUCGGCUACUACAGACGGGCCACCAGAAGAGUUAGAGGCGGCGACGGCAAGAUGAAGGAACUGUCCCCUCGGUGGUACUUCUACUACCUCGGCACAGGACCCGAAGCCAGCCUUCCUUAUGGCGCCAACAAAGAGGGCAUCGUCUGGGUUGCAACAGAAGGCGCCCUGAACACCCCUAAGGACCACAUCGGCACCAGAAAUCCCAACAACAACGCCGCCACAGUGCUGCAGUUGCCACAGGGAACAACACUGCCCAAGGGCUUCUACGCCGAGGGAUCUAGAGGCGGAUCUCAGGCCAGCAGCAGAAGCAGCUCUAGAAGCAGAGGCAACAGCCGGAAUAGCACCCCUGGCAGCUCCAGAGGCAAUUCCCCUGCCAGAAUGGCUUCUGGCGGCGGAGAAACAGCUCUGGCACUGCUGCUGCUCGACCGGCUGAAUCAGCUGGAAUCUAAGGUGUCCGGCAAGGGCCAGCAACAGCAGGGACAGACCGUGACCAAGAAGUCUGCCGCUGAGGCCAGCAAGAAGCCCAGACAGAAGAGAACCGCCACCAAGCAGUACAACGUGACCCAGGCCUUUGGCAGAAGAGGCCCAGAACAGACCCAGGGCAAUUUCGGCGACCAGGACCUGAUCAGACAGGGCACCGAUUACAAGCACUGGCCCCAGAUCGCCCAGUUUGCCCCUUCUGCCUCUGCCUUUUUCGGCAUGAGCCGGAUCGGCAUGGAAGUGACACCUAGCGGCACCUGGCUGACAUAUCACGGCGCCAUCAAGCUGGACGACAAGGACCCUCAGUUCAAGGACAACGUGAUCCUGCUGAACAAGCACAUCGACGCCUACAAGACAUUCCCUCCAACCGAGCCUAAGAAGGACAAGAAGAAGAAAACCGACGAGGCCCAGCCUCUGCCACAGAGACAGAAAAAGCAGCCCACCGUGACACUGCUGCCUGCCGCCGAUAUGGACGACUUCUCUAGACAGCUGCAGAACAGCAUGAGCGGCGCCAGCGCUGAUUCUACACAAGCU [서열번호 238]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 238에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 MHV N 단백질(P03416; 핵단백질 뮤린 코로나바이러스(A59 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. MHV N 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 239로 나타낸다:
MSFVPGQENAGGRSSSVNRAGNGILKKTTWADQTERGPNNQNRGRRNQPKQTATTQPNSGSVVPHYSWFSGITQFQKGKEFQFAEGQGVPIANGIPASEQKGYWYRHNRRSFKTPDGQQKQLLPRWYFYYLGTGPHAGASYGDSIEGVFWVANSQADTNTRSDIVERDPSSHEAIPTRFAPGTVLPQGFYVEGSGRSAPASRSGSRSQSRGPNNRARSSSNQRQPASTVKPDMAEEIAALVLAKLGKDAGQPKQVTKQSAKEVRQKILNKPRQKRTPNKQCPVQQCFGKRGPNQNFGGSEMLKLGTSDPQFPILAELAPTVGAFFFGSKLELVKKNSGGADEPTKDVYELQYSGAVRFDSTLPGFETIMKVLNENLNAYQKDGGADVVSPKPQRKGRRQAQEKKDEVDNVSVAKPKSSVQRNVSRELTPEDRSLLAQILDDGVVPDGLEDDSNV [서열번호 239]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 239에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 MHV N 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 240의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGTCTTTTGTTCCTGGGCAAGAAAATGCCGGTGGCAGAAGCTCCTCTGTAAACCGCGCTGGTAATGGAATCCTCAAGAAGACCACTTGGGCTGACCAAACCGAGCGTGGACCAAATAATCAAAATAGAGGCAGAAGGAATCAGCCAAAGCAGACTGCAACTACTCAACCCAACTCCGGGAGTGTGGTTCCCCATTACTCCTGGTTTTCTGGCATTACCCAGTTCCAAAAGGGAAAGGAGTTTCAGTTTGCAGAAGGACAAGGAGTGCCTATTGCCAATGGAATCCCCGCTTCAGAGCAAAAGGGATATTGGTATAGACACAACCGCCGTTCTTTTAAAACACCTGATGGGCAGCAGAAGCAATTACTGCCCAGATGGTATTTTTACTATCTTGGCACAGGGCCCCATGCTGGAGCCAGTTATGGAGACAGCATTGAAGGTGTCTTCTGGGTTGCAAACAGCCAAGCGGACACCAATACCCGCTCTGATATTGTCGAAAGGGACCCAAGCAGTCATGAGGCTATTCCTACTAGGTTTGCGCCCGGCACGGTATTGCCTCAGGGCTTTTATGTTGAAGGCTCTGGAAGGTCTGCACCTGCTAGCCGATCTGGTTCGCGGTCACAATCCCGTGGGCCAAATAATCGCGCTAGAAGCAGTTCCAACCAGCGCCAGCCTGCCTCTACTGTAAAACCTGATATGGCCGAAGAAATTGCTGCTCTTGTTTTGGCTAAGCTCGGTAAAGATGCCGGCCAGCCCAAGCAAGTAACGAAGCAAAGTGCCAAAGAAGTCAGGCAGAAAATTTTAAACAAGCCTCGCCAAAAGAGGACTCCAAACAAGCAGTGCCCAGTGCAGCAGTGTTTTGGAAAGAGAGGCCCCAATCAGAATTTTGGAGGCTCTGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGATCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAGTTGGCTCCAACAGTTGGTGCCTTCTTCTTTGGATCTAAATTAGAATTGGTCAAAAAGAATTCTGGTGGTGCTGATGAACCCACCAAAGATGTGTATGAGCTGCAATATTCAGGTGCAGTTAGATTTGATAGTACTCTACCTGGTTTTGAGACTATCATGAAAGTGTTGAATGAGAATTTGAATGCCTACCAGAAGGATGGTGGTGCAGATGTGGTGAGCCCAAAGCCCCAAAGAAAAGGGCGTAGACAGGCTCAGGAAAAGAAAGATGAAGTAGATAATGTAAGCGTTGCAAAGCCCAAAAGCTCTGTGCAGCGAAATGTAAGTAGAGAATTAACCCCAGAGGATAGAAGTCTGTTGGCTCAGATCCTTGATGATGGCGTAGTGCCAGATGGGTTAGAAGATGACTCTAATGTG [서열번호 240]
따라서, 바람직하게는 상기 MHV N 폴리펩티드 실질적으로 서열번호 240에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 MHV N 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 241로 제공된다:
ATGAGCTTCGTGCCCGGCCAAGAAAATGCCGGCGGAAGATCTAGCAGCGTGAACAGAGCCGGCAACGGCATCCTGAAGAAAACCACCTGGGCCGACCAGACCGAGAGAGGCCCCAACAACCAGAACCGGGGCAGAAGAAACCAGCCTAAGCAGACCGCCACCACACAGCCTAATAGCGGCTCTGTGGTGCCCCACTACAGCTGGTTTAGCGGCATCACCCAGTTCCAGAAGGGCAAAGAGTTCCAGTTCGCCGAAGGACAGGGCGTGCCAATCGCCAATGGAATCCCTGCCTCTGAGCAGAAAGGCTACTGGTACAGACACAACCGGCGGAGCTTCAAGACCCCTGATGGACAGCAGAAACAGCTGCTGCCCAGATGGTACTTCTACTACCTCGGCACAGGACCTCACGCAGGCGCCTCTTATGGCGATTCTATCGAGGGCGTGTTCTGGGTCGCCAACAGCCAGGCCGATACCAACACCAGATCCGACATCGTGGAACGGGACCCTAGCAGCCACGAGGCCATTCCTACAAGATTTGCCCCTGGCACCGTGCTGCCTCAGGGCTTTTATGTGGAAGGCAGCGGAAGAAGCGCCCCTGCCAGTAGATCTGGCAGCAGATCTCAGAGCAGGGGCCCTAACAACAGAGCCAGAAGCAGCAGCAACCAGAGACAGCCTGCCAGCACCGTGAAGCCCGATATGGCCGAAGAAATCGCCGCTCTGGTGCTGGCCAAGCTGGGAAAAGATGCCGGCCAGCCAAAGCAAGTGACCAAGCAGAGCGCCAAAGAAGTGCGGCAGAAGATCCTGAACAAGCCCCGGCAGAAGCGGACCCCTAACAAGCAGTGTCCTGTGCAGCAGTGCTTCGGCAAGAGGGGCCCCAATCAGAATTTTGGCGGCAGCGAGATGCTGAAGCTGGGCACAAGCGATCCTCAGTTCCCTATCCTGGCCGAGCTGGCTCCTACAGTGGGCGCATTTTTCTTTGGCTCCAAACTCGAGCTGGTCAAGAAGAACAGCGGCGGAGCCGATGAGCCCACCAAGGATGTGTACGAGCTGCAGTACTCTGGCGCCGTCAGATTCGATAGCACCCTGCCTGGCTTCGAGACAATCATGAAGGTGCTGAACGAGAACCTGAACGCCTACCAGAAGGATGGCGGCGCTGACGTGGTGTCTCCTAAGCCTCAGAGAAAAGGCAGACGGCAGGCCCAAGAGAAGAAAGACGAGGTGGACAACGTGTCCGTGGCCAAGCCTAAGAGCAGCGTGCAGAGAAACGTGTCCAGAGAGCTGACCCCAGAGGACAGATCTCTGCTGGCTCAGATCCTGGACGATGGCGTGGTGCCAGATGGCCTGGAAGATGACAGCAACGTG [서열번호 241]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 241에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 241의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 242로 제공된다:
AUGAGCUUCGUGCCCGGCCAAGAAAAUGCCGGCGGAAGAUCUAGCAGCGUGAACAGAGCCGGCAACGGCAUCCUGAAGAAAACCACCUGGGCCGACCAGACCGAGAGAGGCCCCAACAACCAGAACCGGGGCAGAAGAAACCAGCCUAAGCAGACCGCCACCACACAGCCUAAUAGCGGCUCUGUGGUGCCCCACUACAGCUGGUUUAGCGGCAUCACCCAGUUCCAGAAGGGCAAAGAGUUCCAGUUCGCCGAAGGACAGGGCGUGCCAAUCGCCAAUGGAAUCCCUGCCUCUGAGCAGAAAGGCUACUGGUACAGACACAACCGGCGGAGCUUCAAGACCCCUGAUGGACAGCAGAAACAGCUGCUGCCCAGAUGGUACUUCUACUACCUCGGCACAGGACCUCACGCAGGCGCCUCUUAUGGCGAUUCUAUCGAGGGCGUGUUCUGGGUCGCCAACAGCCAGGCCGAUACCAACACCAGAUCCGACAUCGUGGAACGGGACCCUAGCAGCCACGAGGCCAUUCCUACAAGAUUUGCCCCUGGCACCGUGCUGCCUCAGGGCUUUUAUGUGGAAGGCAGCGGAAGAAGCGCCCCUGCCAGUAGAUCUGGCAGCAGAUCUCAGAGCAGGGGCCCUAACAACAGAGCCAGAAGCAGCAGCAACCAGAGACAGCCUGCCAGCACCGUGAAGCCCGAUAUGGCCGAAGAAAUCGCCGCUCUGGUGCUGGCCAAGCUGGGAAAAGAUGCCGGCCAGCCAAAGCAAGUGACCAAGCAGAGCGCCAAAGAAGUGCGGCAGAAGAUCCUGAACAAGCCCCGGCAGAAGCGGACCCCUAACAAGCAGUGUCCUGUGCAGCAGUGCUUCGGCAAGAGGGGCCCCAAUCAGAAUUUUGGCGGCAGCGAGAUGCUGAAGCUGGGCACAAGCGAUCCUCAGUUCCCUAUCCUGGCCGAGCUGGCUCCUACAGUGGGCGCAUUUUUCUUUGGCUCCAAACUCGAGCUGGUCAAGAAGAACAGCGGCGGAGCCGAUGAGCCCACCAAGGAUGUGUACGAGCUGCAGUACUCUGGCGCCGUCAGAUUCGAUAGCACCCUGCCUGGCUUCGAGACAAUCAUGAAGGUGCUGAACGAGAACCUGAACGCCUACCAGAAGGAUGGCGGCGCUGACGUGGUGUCUCCUAAGCCUCAGAGAAAAGGCAGACGGCAGGCCCAAGAGAAGAAAGACGAGGUGGACAACGUGUCCGUGGCCAAGCCUAAGAGCAGCGUGCAGAGAAACGUGUCCAGAGAGCUGACCCCAGAGGACAGAUCUCUGCUGGCUCAGAUCCUGGACGAUGGCGUGGUGCCAGAUGGCCUGGAAGAUGACAGCAACGUG [서열번호 242]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 242에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 FMDV 2B 단백질(P03307; 프로테아제 3C 게놈 폴리단백질 구제역 바이러스(단리물-/독일/A5 베스터발트/1951 혈청형 A), 또는 그의 동원체이다. FMDV 2B 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 243으로 제공된다:
PFFFSDVRSNFSKLVETINQMQEDMSTKHGPDFNRLVSAFEELAAGVKAIRTGLDEAKPWYKLIKLLSRLSCMAAVAARSKDPVLVAIMLADTGLEILDSTFVVKKISDSLSSLFHVPAPVFSFGAPILLAGLVKVASSFFRSTPEDLERAEKQ [서열번호 243]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 243에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 FMDV 2B 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 244의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
CCCTTCTTCTTCTCTGACGTTAGGTCAAACTTTTCTAAGCTGGTGGAAACCATCAACCAGATGCAGGAAGACATGTCAACAAAACACGGGCCCGACTTTAACCGGTTGGTGTCCGCCTTTGAGGAACTGGCCGCTGGAGTAAAAGCCATCAGGACCGGCCTCGACGAGGCCAAACCCTGGTACAAGCTTATCAAACTCCTAAGCCGCCTGTCGTGCATGGCCGCTGTGGCAGCACGGTCCAAGGACCCAGTCCTTGTGGCCATCATGCTGGCCGACACCGGTCTCGAGATTCTGGACAGCACTTTCGTCGTGAAGAAGATCTCCGACTCGCTCTCCAGTCTCTTCCACGTGCCGGCCCCCGTCTTCAGTTTCGGAGCCCCGATTCTGCTAGCCGGGCTGGTCAAGGTCGCCTCGAGTTTCTTCCGGTCCACGCCCGAAGACCTTGAGAGAGCAGAGAAACAG [서열번호 244]
따라서, 바람직하게는 상기 FMDV 2B 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 244에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 FMDV 2B 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 245로 제공된다:
CCGTTCTTCTTTAGCGACGTGCGGAGCAACTTCAGCAAGCTGGTGGAAACCATCAACCAGATGCAAGAGGACATGAGCACCAAGCACGGCCCCGACTTCAACAGACTGGTGTCCGCCTTTGAGGAACTGGCCGCTGGCGTGAAGGCCATCAGAACAGGACTGGATGAGGCCAAGCCTTGGTACAAGCTGATCAAGCTGCTGAGCCGGCTGAGCTGTATGGCTGCTGTGGCCGCCAGATCCAAGGATCCTGTGCTGGTGGCCATCATGCTGGCCGATACAGGCCTGGAAATCCTGGACAGCACCTTCGTGGTCAAGAAGATCAGCGACAGCCTGAGCAGCCTGTTCCACGTGCCAGCTCCAGTGTTCTCTTTTGGCGCCCCTATTCTGCTGGCCGGCCTGGTCAAAGTGGCCAGCAGCTTCTTTAGAAGCACCCCTGAGGACCTGGAACGGGCCGAAAAACAA [서열번호 245]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 245에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 245의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 246으로 제공된다:
CCGUUCUUCUUUAGCGACGUGCGGAGCAACUUCAGCAAGCUGGUGGAAACCAUCAACCAGAUGCAAGAGGACAUGAGCACCAAGCACGGCCCCGACUUCAACAGACUGGUGUCCGCCUUUGAGGAACUGGCCGCUGGCGUGAAGGCCAUCAGAACAGGACUGGAUGAGGCCAAGCCUUGGUACAAGCUGAUCAAGCUGCUGAGCCGGCUGAGCUGUAUGGCUGCUGUGGCCGCCAGAUCCAAGGAUCCUGUGCUGGUGGCCAUCAUGCUGGCCGAUACAGGCCUGGAAAUCCUGGACAGCACCUUCGUGGUCAAGAAGAUCAGCGACAGCCUGAGCAGCCUGUUCCACGUGCCAGCUCCAGUGUUCUCUUUUGGCGCCCCUAUUCUGCUGGCCGGCCUGGUCAAAGUGGCCAGCAGCUUCUUUAGAAGCACCCCUGAGGACCUGGAACGGGCCGAAAAACAA [서열번호 246]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 246에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 인플루엔자 바이러스 A PB1-F2(B4URE5; 단백질 PB1-F2 인플루엔자 A 바이러스(바이러스주 A/러시아:상트 페테르부르크/8/2006 H1N1 바이러스주), 또는 그의 동원체이다. 인플루엔자 바이러스 A PB1-F2의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 247로 나타낸다:
MGQEQDTPWILSTGHISTQKREDGQQTPKLEHRNSTRLMGHFQKTMNQVVMPKQIVYWRRWLSLRNPILVFLKTRVLKRWRLFSKHE [서열번호 247]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 247에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 인플루엔자 바이러스 A PB1-F2 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 248의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGACAGGAACAGGATACACCATGGATACTGTCAACAGGACACATCAGTACTCAGAAAAGGGAAGATGGACAACAAACACCGAAACTGGAGCACCGCAACTCAACCCGATTGATGGGCCACTTCCAGAAGACAATGAACCAAGTGGTTATGCCCAAACAGATTGTGTATTGGAGGCGATGGCTTTCCTTGAGGAATCCCATCCTGGTATTTTTGAAAACTCGTGTATTGAAACGATGGAGGTTGTTCAGCAAACACGAG [서열번호 248]
따라서, 바람직하게는 상기 인플루엔자 바이러스 A PB1-F2 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 248에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 인플루엔자 바이러스 A PB1-F2 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 249로 제공된다:
ATGGGCCAAGAGCAGGACACACCTTGGATCCTGAGCACCGGCCACATCAGCACCCAGAAGAGAGAGGACGGACAGCAGACCCCTAAGCTGGAACACCGGAACAGCACCAGACTGATGGGCCACTTCCAGAAAACCATGAACCAGGTGGTCATGCCCAAGCAGATCGTGTACTGGCGGAGATGGCTGAGCCTGCGGAATCCTATCCTGGTGTTCCTGAAAACCCGGGTGCTGAAGAGATGGCGGCTGTTCTCTAAGCACGAG [서열번호 249]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 249에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 249의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 250으로 제공된다:
AUGGGCCAAGAGCAGGACACACCUUGGAUCCUGAGCACCGGCCACAUCAGCACCCAGAAGAGAGAGGACGGACAGCAGACCCCUAAGCUGGAACACCGGAACAGCACCAGACUGAUGGGCCACUUCCAGAAAACCAUGAACCAGGUGGUCAUGCCCAAGCAGAUCGUGUACUGGCGGAGAUGGCUGAGCCUGCGGAAUCCUAUCCUGGUGUUCCUGAAAACCCGGGUGCUGAAGAGAUGGCGGCUGUUCUCUAAGCACGAG [서열번호 250]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 250에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 A형 간염 단백질 3ABC(Q05794; 게놈 폴리단백질 인간 A형 간염 바이러스 유전자형 IA(HAS-15 단리물)), 또는 그의 동원체이다. A형 간염 단백질 3ABC의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 251로 나타낸다:
GISDDDSAVAEFFQSFPSGEPSNSKLSSFFQSVTNHKWVAVGAAVGILGLLVGGWFVYKHFSRKEEEPIPAEGVYHGVTKPKQVIKLDADPVESQSTLEIAGLVRKNLVQFGVGEKNGCVRWVMNALGVKDDWLLVPSHAYKFEKDYEMMEFYFNRGGTYYSISAGNVVIQSLDVGFQDVVLMKVPTIPKFRDITQHFIKKGDVPRALNRLATLVTTVNGTPMLISEGPLKMEEKATYVHKKNDGTTVDLTVDQAWRGKGEGLPGMCGGALVSSNQSIQNAILGIHVAGGNSILVAKLITQEMFQNIDKKIESQ [서열번호 251]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 251에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 A형 간염 단백질 3ABC 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 252의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGAATTTCAGATGATGACAGTGCAGTAGCTGAGTTTTTCCAGTCTTTTCCATCTGGTGAACCATCAAATTCCAAGTTATCTAGTTTTTTCCAATCTGTCACTAATCACAAGTGGGTTGCTGTGGGAGCTGCAGTTGGTATTCTTGGATTGCTAGTGGGAGGATGGTTTGTGTATAAGCATTTTTCCCGCAAAGAGGAAGAACCAATTCCAGCTGAAGGGGTTTATCATGGAGTGACTAAGCCCAAACAAGTGATTAAATTGGATGCAGATCCAGTAGAGTCCCAGTCAACTCTAGAAATAGCAGGATTAGTTAGGAAAAATTTGGTTCAGTTTGGAGTTGGTGAGAAAAATGGATGTGTGAGATGGGTCATGAATGCCTTAGGAGTGAAGGATGATTGGTTGTTAGTACCTTCTCATGCTTATAAATTTGAAAAGGATTATGAAATGATGGAGTTTTATTTCAATAGAGGTGGAACTTACTATTCAATTTCAGCTGGTAATGTTGTTATTCAATCTTTAGATGTGGGATTCCAAGATGTTGTTCTAATGAAGGTTCCTACAATTCCCAAGTTTAGAGATATTACTCAACATTTTATTAAGAAAGGAGATGTGCCTAGAGCCTTGAATCGCTTGGCAACATTAGTGACAACCGTTAATGGAACTCCTATGTTAATTTCTGAGGGACCTTTAAAAATGGAAGAAAAAGCCACTTATGTTCATAAGAAGAACGATGGTACTACGGTTGATTTGACTGTAGATCAGGCATGGAGAGGAAAAGGTGAAGGTCTTCCTGGAATGTGTGGTGGGGCCCTAGTGTCATCAAATCAGTCCATACAAAATGCAATTTTGGGTATTCATGTTGCTGGAGGAAATTCAATTCTTGTGGCAAAGTTGATTACTCAAGAAATGTTTCAAAACATTGATAAGAAAATTGAAAGTCAG [서열번호 252]
따라서, 바람직하게는 상기 A형 간염 단백질 3ABC 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 252에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 A형 간염 단백질 3ABC 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 253으로 제공된다:
GGCATCAGCGACGATGATTCTGCCGTGGCCGAGTTCTTCCAGAGCTTTCCTAGCGGCGAGCCCAGCAACAGCAAGCTGAGCAGCTTCTTCCAGTCCGTGACCAACCACAAATGGGTCGCCGTGGGAGCCGCTGTGGGAATTCTGGGACTTCTCGTTGGCGGATGGTTCGTGTACAAGCACTTCAGCCGGAAAGAGGAAGAACCCATTCCTGCCGAGGGCGTGTACCACGGCGTGACCAAACCTAAGCAAGTGATCAAGCTGGACGCCGATCCTGTGGAAAGCCAGAGCACACTGGAAATCGCCGGACTCGTGCGGAAGAACCTGGTGCAGTTTGGCGTGGGCGAGAAGAACGGCTGTGTCAGATGGGTCATGAACGCCCTGGGCGTGAAGGACGATTGGCTGCTGGTTCCTAGCCACGCCTACAAGTTCGAGAAGGACTACGAGATGATGGAATTCTACTTCAACAGAGGCGGCACCTACTACAGCATCAGCGCCGGCAATGTGGTCATCCAGTCTCTGGATGTGGGCTTCCAGGACGTGGTGCTGATGAAGGTGCCAACAATCCCCAAGTTCCGGGACATCACCCAGCACTTCATCAAGAAAGGCGACGTGCCCAGGGCTCTGAACAGACTGGCTACCCTGGTCACCACCGTGAACGGCACACCCATGCTGATCTCTGAGGGCCCACTGAAGATGGAAGAGAAGGCCACCTACGTGCACAAGAAGAACGACGGCACCACAGTGGACCTGACCGTGGATCAAGCTTGGAGAGGCAAAGGCGAGGGCCTGCCTGGAATGTGTGGCGGAGCACTGGTGTCCAGCAACCAGAGCATCCAGAATGCCATCCTGGGCATCCATGTGGCTGGCGGCAATTCTATCCTGGTGGCCAAGCTGATCACCCAAGAGATGTTCCAGAACATCGACAAGAAGATCGAGAGCCAG [서열번호 253]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 253에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 253의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 254로 제공된다:
GGCAUCAGCGACGAUGAUUCUGCCGUGGCCGAGUUCUUCCAGAGCUUUCCUAGCGGCGAGCCCAGCAACAGCAAGCUGAGCAGCUUCUUCCAGUCCGUGACCAACCACAAAUGGGUCGCCGUGGGAGCCGCUGUGGGAAUUCUGGGACUUCUCGUUGGCGGAUGGUUCGUGUACAAGCACUUCAGCCGGAAAGAGGAAGAACCCAUUCCUGCCGAGGGCGUGUACCACGGCGUGACCAAACCUAAGCAAGUGAUCAAGCUGGACGCCGAUCCUGUGGAAAGCCAGAGCACACUGGAAAUCGCCGGACUCGUGCGGAAGAACCUGGUGCAGUUUGGCGUGGGCGAGAAGAACGGCUGUGUCAGAUGGGUCAUGAACGCCCUGGGCGUGAAGGACGAUUGGCUGCUGGUUCCUAGCCACGCCUACAAGUUCGAGAAGGACUACGAGAUGAUGGAAUUCUACUUCAACAGAGGCGGCACCUACUACAGCAUCAGCGCCGGCAAUGUGGUCAUCCAGUCUCUGGAUGUGGGCUUCCAGGACGUGGUGCUGAUGAAGGUGCCAACAAUCCCCAAGUUCCGGGACAUCACCCAGCACUUCAUCAAGAAAGGCGACGUGCCCAGGGCUCUGAACAGACUGGCUACCCUGGUCACCACCGUGAACGGCACACCCAUGCUGAUCUCUGAGGGCCCACUGAAGAUGGAAGAGAAGGCCACCUACGUGCACAAGAAGAACGACGGCACCACAGUGGACCUGACCGUGGAUCAAGCUUGGAGAGGCAAAGGCGAGGGCCUGCCUGGAAUGUGUGGCGGAGCACUGGUGUCCAGCAACCAGAGCAUCCAGAAUGCCAUCCUGGGCAUCCAUGUGGCUGGCGGCAAUUCUAUCCUGGUGGCCAAGCUGAUCACCCAAGAGAUGUUCCAGAACAUCGACAAGAAGAUCGAGAGCCAG [서열번호 254]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 254에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 B형 간염 X 단백질(P03165; 단백질 X B형 간염 바이러스 유전자형 D), 또는 그의 동원체이다. B형 간염 X 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 255로 나타낸다:
MAARLCCQLDPARDVLCLRPVGAESRGRPFSGSLGTLSSPSPSAVSTDHGAHLSLRGLPVCAFSSAGPCALRFTSARRMETTVKAQPFLPKVLHKRTLGLSVMSTTDLEAYFKDCLFKDWEELGEEIRLKVFVLGGCRHKLVCAPAPCNFFTSA [서열번호 255]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 255에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 B형 간염 X 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 256의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCTGCTAGGCTGTGCTGCCAACTGGATCCTGCGCGGGACGTCCTTTGTTTACGTCCCGTCGGCGCTGAATCCCGCGGACGACCCTTCTCGGGGTCGCTTGGGACTCTCTCGTCCCCTTCTCCGTCTGCCGTTTCGACCGACCACGGGGCGCACCTCTCTTTACGCGGACTCCCCGTCTGTGCCTTCTCATCTGCCGGACCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGCACGTCGCATGGAGACCACCGTGAAAGCCCAACCATTCTTGCCCAAGGTCTTACATAAGAGGACTCTTGGACTCTCTGTAATGTCAACGACCGACCTTGAGGCATACTTCAAAGACTGTTTGTTTAAAGACTGGGAGGAGTTGGGGGAGGAGATTAGATTAAAGGTCTTTGTATTAGGAGGCTGTAGGCATAAATTGGTCTGCGCACCAGCACCATGCAACTTTTTCACCTCTGCC [서열번호 256]
따라서, 바람직하게는 상기 B형 간염 X 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 256에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 B형 간염 X 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 257로 제공된다:
ATGGCCGCCAGACTGTGCTGTCAACTGGACCCTGCTAGGGACGTGCTGTGTCTCAGACCTGTGGGAGCCGAGTCTAGAGGCAGACCTTTTTCTGGCTCTCTGGGCACCCTGAGCAGCCCATCTCCATCTGCCGTGTCTACAGATCACGGCGCCCACCTGTCTCTGAGAGGACTGCCTGTGTGTGCCTTTAGCAGCGCCGGACCTTGCGCTCTGAGATTCACATCTGCCAGACGGATGGAAACCACCGTGAAGGCCCAGCCTTTCCTGCCTAAGGTGCTGCACAAGAGAACCCTGGGCCTGAGCGTGATGAGCACCACAGATCTGGAAGCCTACTTCAAGGATTGCCTGTTCAAGGACTGGGAAGAACTGGGCGAAGAGATCCGGCTGAAGGTGTTCGTGCTCGGCGGATGCAGACACAAGCTCGTGTGTGCTCCCGCTCCTTGCAACTTCTTTACCAGCGCT [서열번호 257]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 257에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 257의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 258로 제공된다:
AUGGCCGCCAGACUGUGCUGUCAACUGGACCCUGCUAGGGACGUGCUGUGUCUCAGACCUGUGGGAGCCGAGUCUAGAGGCAGACCUUUUUCUGGCUCUCUGGGCACCCUGAGCAGCCCAUCUCCAUCUGCCGUGUCUACAGAUCACGGCGCCCACCUGUCUCUGAGAGGACUGCCUGUGUGUGCCUUUAGCAGCGCCGGACCUUGCGCUCUGAGAUUCACAUCUGCCAGACGGAUGGAAACCACCGUGAAGGCCCAGCCUUUCCUGCCUAAGGUGCUGCACAAGAGAACCCUGGGCCUGAGCGUGAUGAGCACCACAGAUCUGGAAGCCUACUUCAAGGAUUGCCUGUUCAAGGACUGGGAAGAACUGGGCGAAGAGAUCCGGCUGAAGGUGUUCGUGCUCGGCGGAUGCAGACACAAGCUCGUGUGUGCUCCCGCUCCUUGCAACUUCUUUACCAGCGCU [서열번호 258]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 258에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 SARS-CoV NSP15(P0C6X7; 레플리카아제(replicase) 폴리단백질 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스), 또는 그의 동원체이다. SARS-CoV NSP15의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 259로 나타낸다:
SLENVAYNVVNKGHFDGHAGEAPVSIINNAVYTKVDGIDVEIFENKTTLPVNVAFELWAKRNIKPVPEIKILNNLGVDIAANTVIWDYKREAPAHVSTIGVCTMTDIAKKPTESACSSLTVLFDGRVEGQVDLFRNARNGVLITEGSVKGLTPSKGPAQASVNGVTLIGESVKTQFNYFKKVDGIIQQLPETYFTQSRDLEDFKPRSQMETDFLELAMDEFIQRYKLEGYAFEHIVYGDFSHGQLGGLHLMIGLAKRSQDSPLKLEDFIPMDSTVKNYFITDAQTGSSKCVCSVIDLLLDDFVEIIKSQDLSVISKVVKVTIDYAEISFMLWCKDGHVETFYPKLQ [서열번호 259]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 259에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SARS-CoV NSP15 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 260의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
AGTTTAGAAAATGTGGCTTATAATGTTGTTAATAAAGGACACTTTGATGGACACGCCGGCGAAGCACCTGTTTCCATCATTAATAATGCTGTTTACACAAAGGTAGATGGTATTGATGTGGAGATCTTTGAAAATAAGACAACACTTCCTGTTAATGTTGCATTTGAGCTTTGGGCTAAGCGTAACATTAAACCAGTGCCAGAGATTAAGATACTCAATAATTTGGGTGTTGATATCGCTGCTAATACTGTAATCTGGGACTACAAAAGAGAAGCCCCAGCACATGTATCTACAATAGGTGTCTGCACAATGACTGACATTGCCAAGAAACCTACTGAGAGTGCTTGTTCTTCACTTACTGTCTTGTTTGATGGTAGAGTGGAAGGACAGGTAGACCTTTTTAGAAACGCCCGTAATGGTGTTTTAATAACAGAAGGTTCAGTCAAAGGTCTAACACCTTCAAAGGGACCAGCACAAGCTAGCGTCAATGGAGTCACATTAATTGGAGAATCAGTAAAAACACAGTTTAACTACTTTAAGAAAGTAGACGGCATTATTCAACAGTTGCCTGAAACCTACTTTACTCAGAGCAGAGACTTAGAGGATTTTAAGCCCAGATCACAAATGGAAACTGACTTTCTCGAGCTCGCTATGGATGAATTCATACAGCGATATAAGCTCGAGGGCTATGCCTTCGAACACATCGTTTATGGAGATTTCAGTCATGGACAACTTGGCGGTCTTCATTTAATGATAGGCTTAGCCAAGCGCTCACAAGATTCACCACTTAAATTAGAGGATTTTATCCCTATGGACAGCACAGTGAAAAATTACTTCATAACAGATGCGCAAACAGGTTCATCAAAATGTGTGTGTTCTGTGATTGATCTTTTACTTGATGACTTTGTCGAGATAATAAAGTCACAAGATTTGTCAGTGATTTCAAAAGTGGTCAAGGTTACAATTGACTATGCTGAAATTTCATTCATGCTTTGGTGTAAGGATGGACATGTTGAAACCTTCTACCCAAAACTACAA [서열번호 260]
따라서, 바람직하게는 상기 SARS-CoV NSP15 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 260에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 SARS-CoV NSP15 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 261로 제공된다:
AGCCTGGAAAACGTGGCCTACAACGTGGTCAACAAGGGCCACTTTGATGGCCACGCTGGCGAAGCCCCTGTGTCCATCATTAACAACGCCGTGTACACCAAGGTGGACGGCATCGACGTGGAAATCTTCGAGAACAAGACCACACTGCCCGTGAATGTGGCCTTCGAGCTGTGGGCCAAGCGGAACATTAAGCCCGTGCCTGAGATCAAGATCCTGAACAACCTGGGCGTCGACATTGCCGCCAACACCGTGATCTGGGACTACAAGAGAGAAGCCCCAGCTCACGTGTCCACCATCGGCGTGTGTACCATGACCGATATCGCCAAGAAGCCCACCGAGAGCGCCTGTAGCTCTCTGACCGTGCTGTTCGACGGCAGAGTGGAAGGCCAGGTGGACCTGTTCAGAAACGCCAGAAACGGCGTGCTGATCACCGAGGGCTCTGTGAAGGGACTGACCCCTTCTAAGGGACCTGCTCAGGCCTCTGTGAATGGCGTGACACTGATCGGCGAGAGCGTGAAAACCCAGTTCAACTACTTCAAGAAGGTCGACGGGATCATCCAGCAGCTGCCCGAGACATACTTCACCCAGAGCCGCGACCTGGAAGATTTCAAGCCTCGGAGCCAGATGGAAACCGACTTCCTGGAACTGGCCATGGACGAGTTCATCCAGCGGTACAAGCTGGAAGGCTACGCCTTTGAGCACATCGTGTACGGCGATTTCAGCCACGGACAGCTCGGAGGACTGCACCTGATGATTGGCCTGGCCAAGAGAAGCCAGGACAGCCCTCTGAAGCTCGAGGACTTCATCCCCATGGACAGCACCGTGAAGAATTACTTCATCACAGACGCCCAGACCGGCAGCTCTAAGTGCGTGTGTAGCGTGATCGACCTGCTGCTGGACGACTTTGTGGAAATCATCAAGAGCCAGGACCTGAGCGTGATCTCCAAGGTGGTCAAAGTGACCATCGACTACGCCGAGATCAGCTTCATGCTGTGGTGCAAGGACGGCCACGTGGAAACATTCTACCCCAAGCTGCAG [서열번호 261]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 261에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 261의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 262로 제공된다:
AGCCUGGAAAACGUGGCCUACAACGUGGUCAACAAGGGCCACUUUGAUGGCCACGCUGGCGAAGCCCCUGUGUCCAUCAUUAACAACGCCGUGUACACCAAGGUGGACGGCAUCGACGUGGAAAUCUUCGAGAACAAGACCACACUGCCCGUGAAUGUGGCCUUCGAGCUGUGGGCCAAGCGGAACAUUAAGCCCGUGCCUGAGAUCAAGAUCCUGAACAACCUGGGCGUCGACAUUGCCGCCAACACCGUGAUCUGGGACUACAAGAGAGAAGCCCCAGCUCACGUGUCCACCAUCGGCGUGUGUACCAUGACCGAUAUCGCCAAGAAGCCCACCGAGAGCGCCUGUAGCUCUCUGACCGUGCUGUUCGACGGCAGAGUGGAAGGCCAGGUGGACCUGUUCAGAAACGCCAGAAACGGCGUGCUGAUCACCGAGGGCUCUGUGAAGGGACUGACCCCUUCUAAGGGACCUGCUCAGGCCUCUGUGAAUGGCGUGACACUGAUCGGCGAGAGCGUGAAAACCCAGUUCAACUACUUCAAGAAGGUCGACGGGAUCAUCCAGCAGCUGCCCGAGACAUACUUCACCCAGAGCCGCGACCUGGAAGAUUUCAAGCCUCGGAGCCAGAUGGAAACCGACUUCCUGGAACUGGCCAUGGACGAGUUCAUCCAGCGGUACAAGCUGGAAGGCUACGCCUUUGAGCACAUCGUGUACGGCGAUUUCAGCCACGGACAGCUCGGAGGACUGCACCUGAUGAUUGGCCUGGCCAAGAGAAGCCAGGACAGCCCUCUGAAGCUCGAGGACUUCAUCCCCAUGGACAGCACCGUGAAGAAUUACUUCAUCACAGACGCCCAGACCGGCAGCUCUAAGUGCGUGUGUAGCGUGAUCGACCUGCUGCUGGACGACUUUGUGGAAAUCAUCAAGAGCCAGGACCUGAGCGUGAUCUCCAAGGUGGUCAAAGUGACCAUCGACUACGCCGAGAUCAGCUUCAUGCUGUGGUGCAAGGACGGCCACGUGGAAACAUUCUACCCCAAGCUGCAG [서열번호 262]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 262에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 SARS CoV Orf9b(P59636; SARS ORF9b 단백질 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스), 또는 그의 동원체이다. SARS CoV Orf9b의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 263으로 나타낸다:
MDPNQTNVVPPALHLVDPQIQLTITRMEDAMGQGQNSADPKVYPIILRLGSQLSLSMARRNLDSLEARAFQSTPIVVQMTKLATTEELPDEFVVVTAK [서열번호 263]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 263에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 SARS CoV Orf9b 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 264의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGACCCCAATCAAACCAACGTAGTGCCCCCCGCATTACATTTGGTGGACCCACAGATTCAACTGACAATAACCAGAATGGAGGACGCAATGGGGCAAGGCCAAAACAGCGCCGACCCCAAGGTTTACCCAATAATACTGCGTCTTGGTTCACAGCTCTCACTCAGCATGGCAAGGAGGAACTTAGATTCCCTCGAGGCCAGGGCGTTCCAATCAACACCAATAGTGGTCCAGATGACCAAATTGGCTACTACCGAAGAGCTACCCGACGAGTTCGTGGTGGTGACGGCAAAA [서열번호 264]
따라서, 바람직하게는 상기 SARS CoV Orf9b 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 264에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 SARS CoV Orf9b 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 265로 제공된다:
ATGGACCCCAACCAGACCAATGTGGTGCCTCCTGCTCTGCACCTGGTGGACCCTCAGATCCAGCTGACCATCACCAGAATGGAAGATGCCATGGGCCAGGGCCAGAACAGCGCCGATCCTAAGGTGTACCCCATCATCCTGAGACTGGGCAGCCAGCTGAGCCTGAGCATGGCCAGAAGAAACCTGGACAGCCTGGAAGCCAGAGCCTTCCAGAGCACACCTATCGTGGTGCAGATGACCAAGCTGGCCACCACCGAGGAACTGCCCGATGAGTTTGTGGTGGTCACCGCCAAA [서열번호 265]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 265에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 265의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 266으로 제공된다:
AUGGACCCCAACCAGACCAAUGUGGUGCCUCCUGCUCUGCACCUGGUGGACCCUCAGAUCCAGCUGACCAUCACCAGAAUGGAAGAUGCCAUGGGCCAGGGCCAGAACAGCGCCGAUCCUAAGGUGUACCCCAUCAUCCUGAGACUGGGCAGCCAGCUGAGCCUGAGCAUGGCCAGAAGAAACCUGGACAGCCUGGAAGCCAGAGCCUUCCAGAGCACACCUAUCGUGGUGCAGAUGACCAAGCUGGCCACCACCGAGGAACUGCCCGAUGAGUUUGUGGUGGUCACCGCCAAA [서열번호 266]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 266에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 리노바이러스 2Apro(P23008; 게놈 폴리단백질 인간 리노바이러스 1A), 또는 그의 동원체이다. 리노바이러스 2Apro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 267로 나타낸다:
GPSDLYVHVGNLIYRNLHLFNSEMHDSILISYSSDLIIYRTNTIGDDYIPNCNCTEATYYCRHKNRYYPIKVTPHDWYEIQESEYYPKHIQYNLLIGEGPCEPGDCGGKLLCRHGVIGIITAGGEGHVAFIDLRQFHCAEEQ [서열번호 267]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 267에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 리노바이러스 2Apro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 268의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGGCCCAGTGATCTATATGTGCATGTAGGTAACTTAATATATAGAAACTTACATCTGTTCAATTCTGAAATGCATGATTCAATTTTGATTTCATACTCTTCTGATTTAATCATATACCGCACAAACACTATAGGTGATGATTATATTCCCAATTGTAACTGCACTGAGGCTACTTATTATTGTAGACACAAAAATAGGTATTACCCAATAAAAGTTACTCCACATGATTGGTATGAAATACAAGAGAGTGAATATTACCCCAAACACATCCAATACAACCTATTAATTGGTGAAGGACCATGTGAACCTGGTGATTGTGGTGGAAAACTTCTTTGTAGACATGGTGTCATTGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAAGGTCATGTAGCATTTATAGATCTTAGACAATTTCACTGTGCTGAGGAACAA [서열번호 268]
따라서, 바람직하게는 상기 리노바이러스 2Apro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 268에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 리노바이러스 2Apro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 269로 제공된다:
GGCCCTAGCGATCTGTATGTGCACGTGGGCAACCTGATCTACCGGAACCTGCACCTGTTCAACAGCGAGATGCACGACAGCATCCTGATCAGCTACAGCAGCGACCTGATCATCTATCGGACCAACACCATCGGCGACGACTACATCCCCAACTGCAACTGTACCGAGGCCACCTACTACTGCCGGCACAAGAACCGGTACTACCCCATCAAAGTGACCCCTCACGATTGGTACGAGATCCAAGAGAGCGAGTACTACCCTAAGCACATCCAGTACAACCTGCTGATCGGCGAGGGACCTTGCGAGCCTGGCGATTGTGGTGGAAAGCTGCTGTGTAGACACGGCGTGATCGGCATCATTACAGCCGGCGGAGAAGGACACGTGGCCTTTATCGACCTGCGGCAGTTTCACTGCGCCGAGGAACAG [서열번호 269]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 269에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 269의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 270으로 제공된다:
GGCCCUAGCGAUCUGUAUGUGCACGUGGGCAACCUGAUCUACCGGAACCUGCACCUGUUCAACAGCGAGAUGCACGACAGCAUCCUGAUCAGCUACAGCAGCGACCUGAUCAUCUAUCGGACCAACACCAUCGGCGACGACUACAUCCCCAACUGCAACUGUACCGAGGCCACCUACUACUGCCGGCACAAGAACCGGUACUACCCCAUCAAAGUGACCCCUCACGAUUGGUACGAGAUCCAAGAGAGCGAGUACUACCCUAAGCACAUCCAGUACAACCUGCUGAUCGGCGAGGGACCUUGCGAGCCUGGCGAUUGUGGUGGAAAGCUGCUGUGUAGACACGGCGUGAUCGGCAUCAUUACAGCCGGCGGAGAAGGACACGUGGCCUUUAUCGACCUGCGGCAGUUUCACUGCGCCGAGGAACAG [서열번호 270]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 270에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 리노바이러스 3Cpro(P23008; 게놈 폴리단백질 인간 리노바이러스 1A), 또는 그의 동원체이다. 리노바이러스 3Cpro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 271로 나타낸다:
GPEEEFGRSILKNNTCVITTGNGKFTGLGIHDRILIIPTHADPGREVQVNGVHTKVLDSYDLYNRDGVKLEITVIQLDRNEKFRDIRKYIPETEDDYPECNLALSANQDEPTIIKVGDVVSYGNILLSGNQTARMLKYNYPTKSGYCGGVLYKIGQILGIHVGGNGRDGFSAMLLRSYFTDTQ [서열번호 271]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 271에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 리노바이러스 3Cpro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 272의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGTCCAGAAGAAGAATTTGGAAGGTCAATTCTCAAAAACAATACTTGTGTGATTACTACAGGTAATGGAAAATTTACAGGTCTTGGTATACATGACAGAATTCTAATCATCCCAACACATGCTGATCCAGGTAGAGAGGTCCAAGTTAATGGTGTCCACACTAAGGTTCTAGACTCATATGATCTTTATAATAGAGATGGAGTTAAACTTGAAATAACGGTCATACAATTAGATAGAAATGAAAAATTTAGGGACATTAGAAAGTATATACCTGAAACAGAAGACGATTATCCAGAATGCAATTTGGCACTTTCAGCTAATCAAGATGAACCAACTATAATTAAAGTAGGAGATGTAGTGTCCTATGGCAATATTTTGCTTAGTGGAAATCAAACAGCCAGAATGCTTAAATATAATTACCCCACAAAATCAGGGTATTGTGGAGGGGTACTATATAAAATTGGTCAAATTCTAGGTATTCATGTGGGTGGAAATGGAAGGGATGGTTTTTCAGCTATGTTACTTAGATCATACTTTACAGATACTCAG [서열번호 272]
따라서, 바람직하게는 상기 리노바이러스 3Cpro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 272에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 리노바이러스 3Cpro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 273으로 제공된다:
GGACCTGAGGAAGAGTTCGGCAGATCCATCCTGAAGAACAATACCTGCGTGATCACCACCGGCAACGGCAAGTTTACAGGCCTGGGCATCCACGACCGGATCCTGATCATTCCCACACACGCCGATCCTGGCCGGGAAGTGCAAGTGAATGGCGTGCACACCAAGGTGCTGGACAGCTACGACCTGTACAACCGCGACGGCGTGAAGCTGGAAATCACCGTGATTCAGCTGGACCGGAACGAGAAGTTCCGGGACATCCGGAAGTACATCCCCGAGACAGAGGACGACTACCCCGAGTGTAATCTGGCCCTGAGCGCCAACCAGGACGAGCCCACAATTATCAAAGTGGGCGACGTGGTGTCCTACGGCAACATCCTGCTGTCCGGCAATCAGACCGCCAGAATGCTGAAGTACAACTACCCCACCAAGAGCGGCTACTGTGGCGGCGTGCTGTATAAGATCGGCCAGATCCTGGGAATTCACGTCGGCGGCAATGGCAGAGATGGCTTCTCTGCTATGCTGCTGCGGAGCTACTTCACCGACACACAG [서열번호 273]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 273에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 273의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 274로 제공된다:
GGACCUGAGGAAGAGUUCGGCAGAUCCAUCCUGAAGAACAAUACCUGCGUGAUCACCACCGGCAACGGCAAGUUUACAGGCCUGGGCAUCCACGACCGGAUCCUGAUCAUUCCCACACACGCCGAUCCUGGCCGGGAAGUGCAAGUGAAUGGCGUGCACACCAAGGUGCUGGACAGCUACGACCUGUACAACCGCGACGGCGUGAAGCUGGAAAUCACCGUGAUUCAGCUGGACCGGAACGAGAAGUUCCGGGACAUCCGGAAGUACAUCCCCGAGACAGAGGACGACUACCCCGAGUGUAAUCUGGCCCUGAGCGCCAACCAGGACGAGCCCACAAUUAUCAAAGUGGGCGACGUGGUGUCCUACGGCAACAUCCUGCUGUCCGGCAAUCAGACCGCCAGAAUGCUGAAGUACAACUACCCCACCAAGAGCGGCUACUGUGGCGGCGUGCUGUAUAAGAUCGGCCAGAUCCUGGGAAUUCACGUCGGCGGCAAUGGCAGAGAUGGCUUCUCUGCUAUGCUGCUGCGGAGCUACUUCACCGACACACAG [서열번호 274]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 274에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 로타바이러스 VP3(A2T3S5; 단백질 VP3 로타바이러스 A(RVA/원숭이/남아프리카/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 단리물)), 또는 그의 동원체이다. 로타바이러스 VP3의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 275로 나타낸다:
MKVLALRHSVAQVYADTQVYVHDDTKDSYENAFLISNLTTHNILYLNYSIKTLEILNKSGIAAIALQSLEELFTLIRCNFTYDYELDIIYLHDYSYYTNNEIRTDQHWITKTNIEEYLLPGWKLTYVGYNGSETRGHYNFSFKCQNAATDDDLIIEYIYSEALDFQNFMLKKIKERMTTSLPIARLSNRVFRDKLFPSLLKEHKNVVNVGPRNESMFTFLNYPTIKQFSNGAYLVKDTIKLKQERWLGKRISQFDIGQYKNMLNVLTAIYYYYNLYKSKPIIYMIGSAPSYWIYDVRHYSDFFFETWDPLDTPYSSIHHKELFFINDVKKLKDNSILYIDIRTDRGNADWKKWRKTVEEQTINNLDIAYEYLRTGKAKVCCVKMTAMDLELPISAKLLHHPTTEIRSEFYLLLDTWDLTNIRRFIPKGVLYSFINNIITENVFIQQPFKVKVLNDSYIVALYALSNDFNNRSEVIKLINNQKQSLITVRINNTFKDEPKVGFKNIYDWTFLPTDFDTKEAIITSYDGCLGLFGLSISLASKPTGNNHLFILSGTDKYYKLDQFANHTSISRRSHQIRFSESATSYSGYIFRDLSNNNFNLIGTNIENSVSGHVYNALIYYRYNYSFDLKRWIYLHSIDKVDIEGGKYYELAPIELIYACRSAKEFATLQDDLTVLRYSNEIENYINTVYSITYADDPNYFIGIQFRNIPYKYDVKIPHLTFGVLHISDNMVPDVIDILKIMKNELFKMDITTSYTYMLSDGIYVANVSGVLSTYFKIYNVFYKNQITFGQSRMFIPHITLSFNNMRTVRIETTKLQIKSIYLRKIKGDTVFDMVE [서열번호 275]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 275에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 로타바이러스 VP3 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 276의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGAAAGTACTAGCTTTAAGACACAGTGTGGCTCAAGTGTATGCAGACACTCAAGTCTACGTTCATGATGATACAAAAGATAGTTATGAAAACGCTTTTTTAATCTCTAATCTTACGACCCATAATATTTTATACTTAAATTATAGCATTAAAACATTAGAAATATTAAATAAGTCAGGAATAGCTGCAATTGCTTTACAATCACTTGAAGAATTATTCACATTAATAAGGTGTAATTTCACTTATGATTATGAACTTGATATAATATATTTACATGATTATTCATATTATACCAATAATGAAATTAGAACAGACCAACATTGGATAACAAAAACAAATATTGAAGAATATTTACTACCTGGATGGAAATTAACATATGTTGGTTATAATGGAAGTGAAACTAGAGGACATTATAACTTTTCATTTAAATGTCAAAACGCTGCAACAGATGATGATCTAATAATTGAATACATTTATTCAGAAGCGTTGGACTTCCAAAATTTTATGTTAAAAAAGATAAAGGAAAGAATGACTACATCGTTGCCTATAGCTAGATTATCTAACAGAGTATTTAGGGATAAGTTATTCCCATCATTATTGAAAGAACATAAGAATGTAGTGAACGTTGGTCCGCGTAATGAATCTATGTTTACATTTTTAAATTATCCAACTATAAAACAATTTTCAAATGGTGCGTATTTAGTAAAAGATACTATAAAATTAAAACAAGAACGATGGTTAGGTAAAAGGATATCTCAGTTTGATATTGGTCAGTATAAAAATATGCTGAATGTTCTTACAGCAATTTATTATTACTATAATTTATATAAAAGTAAACCAATTATATATATGATCGGATCTGCTCCATCTTATTGGATATATGACGTTAGGCATTATTCCGATTTTTTCTTTGAAACTTGGGATCCATTGGACACACCATATTCATCAATCCATCACAAAGAATTATTTTTTATAAATGATGTGAAGAAACTGAAGGATAACTCAATATTGTATATTGATATAAGAACCGATAGGGGCAATGCTGATTGGAAAAAATGGAGAAAGACAGTAGAAGAACAAACTATTAATAATTTGGACATAGCTTATGAATATTTACGAACGGGTAAAGCGAAGGTGTGTTGTGTTAAGATGACAGCTATGGATTTGGAACTGCCAATTTCAGCTAAATTACTGCACCACCCAACTACGGAAATAAGATCAGAATTTTATTTATTACTAGATACTTGGGATTTAACTAACATTAGGAGGTTCATTCCTAAAGGCGTGTTATATTCATTTATAAACAATATAATAACTGAAAATGTGTTTATTCAACAACCATTTAAAGTAAAAGTACTGAATGATAGTTATATTGTAGCGTTATATGCATTATCAAATGATTTTAATAATAGATCAGAAGTAATTAAATTAATTAATAATCAGAAACAATCTCTAATAACTGTTAGAATAAATAATACGTTTAAGGATGAACCAAAAGTTGGGTTCAAAAATATCTATGATTGGACCTTTCTTCCAACCGACTTTGATACCAAAGAAGCTATAATTACTTCATACGACGGTTGTTTAGGACTCTTTGGTTTGTCTATATCGTTAGCATCAAAACCAACAGGGAATAATCATTTATTCATTTTAAGTGGTACAGATAAGTATTATAAATTGGATCAATTTGCTAATCACACCAGTATATCGAGAAGATCACACCAAATTAGGTTTTCGGAATCTGCTACTTCATATTCAGGTTATATATTTAGAGATTTGTCCAATAATAATTTTAATCTAATTGGTACTAATATAGAGAATTCAGTATCAGGTCATGTATATAATGCTTTAATTTATTATAGATATAATTATTCATTTGATCTTAAACGCTGGATTTATTTACATTCTATAGATAAAGTTGATATAGAAGGAGGAAAGTATTATGAACTCGCACCAATAGAATTAATTTATGCATGTAGATCAGCAAAAGAATTTGCTACATTGCAGGATGACTTAACTGTATTGAGATATTCAAACGAAATAGAGAATTATATTAATACAGTATATAGTATAACATACGCTGATGATCCGAATTACTTTATCGGAATACAATTTAGAAATATACCATATAAATATGATGTTAAAATACCGCATTTAACCTTCGGAGTATTACATATTTCTGATAACATGGTGCCAGACGTGATTGACATACTAAAGATAATGAAGAATGAATTATTTAAAATGGATATTACGACCAGTTATACATATATGTTATCAGATGGAATCTACGTAGCAAATGTTAGTGGAGTATTATCTACATACTTTAAAATCTATAACGTATTTTATAAAAATCAAATAACTTTTGGCCAATCCAGAATGTTTATTCCGCACATAACATTAAGCTTCAATAACATGAGAACAGTAAGGATAGAGACTACTAAATTACAAATTAAATCCATTTATTTAAGAAAGATTAAGGGTGATACAGTGTTTGATATGGTTGAG [서열번호 276]
따라서, 바람직하게는 상기 로타바이러스 VP3 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 276에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 로타바이러스 VP3 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 277로 제공된다:
ATGAAGGTGCTGGCCCTGAGACATTCTGTGGCCCAGGTGTACGCCGACACACAGGTCTACGTGCACGACGACACCAAGGACAGCTACGAGAACGCCTTCCTGATCAGCAACCTGACCACACACAACATCCTGTACCTGAACTACAGCATCAAGACCCTCGAGATCCTGAACAAGAGCGGAATCGCCGCTATCGCCCTGCAGAGCCTGGAAGAACTGTTCACCCTGATCCGGTGCAACTTCACCTACGACTACGAGCTGGACATCATCTACCTGCACGATTACAGCTACTACACCAACAACGAGATCCGGACCGACCAGCACTGGATCACCAAGACCAACATCGAGGAATACCTGCTGCCTGGCTGGAAGCTGACCTACGTGGGCTACAATGGCAGCGAGACACGGGGCCACTACAACTTCAGCTTCAAGTGCCAGAACGCCGCCACCGACGACGACCTGATCATCGAGTACATCTACAGCGAGGCCCTGGACTTCCAGAACTTCATGCTGAAGAAAATCAAAGAACGGATGACCACCAGCCTGCCTATCGCCAGACTGAGCAACCGGGTGTTCCGGGACAAGCTGTTTCCCAGCCTGCTGAAAGAACACAAGAACGTGGTCAACGTGGGCCCCAGAAACGAGAGCATGTTCACCTTTCTGAACTACCCCACCATCAAGCAGTTCAGCAACGGCGCCTACCTGGTCAAGGACACAATCAAGCTGAAGCAAGAGAGATGGCTGGGCAAGAGAATCAGCCAGTTCGACATCGGCCAGTACAAGAACATGCTGAACGTGCTGACCGCCATCTACTACTACTATAACCTGTACAAGAGCAAGCCGATCATCTACATGATTGGCAGCGCCCCTAGCTACTGGATCTACGACGTGCGGCACTACAGCGACTTTTTCTTCGAAACCTGGGATCCCCTGGACACCCCTTACAGCAGCATCCACCACAAAGAGCTGTTCTTCATCAACGACGTGAAGAAGCTCAAGGACAACAGCATCCTCTACATCGACATCAGAACCGACCGGGGCAACGCCGACTGGAAGAAATGGCGGAAAACCGTGGAAGAACAGACCATCAACAACCTGGATATCGCCTACGAGTACCTGCGGACCGGCAAGGCCAAAGTGTGCTGCGTGAAGATGACAGCCATGGACCTGGAACTGCCCATCAGCGCCAAACTGCTGCACCATCCTACCACCGAGATCAGAAGCGAGTTCTATCTGCTGCTGGACACCTGGGACCTGACCAATATCAGACGGTTCATCCCCAAGGGCGTGCTGTACTCCTTTATCAACAACATCATCACCGAGAACGTGTTCATCCAGCAGCCGTTCAAAGTGAAAGTGCTGAACGACAGCTACATCGTGGCCCTGTACGCCCTGAGCAACGACTTCAACAATCGGAGCGAAGTGATCAAACTGATCAACAATCAGAAGCAGTCCCTGATCACCGTGCGCATCAACAATACCTTCAAGGACGAGCCCAAAGTGGGCTTCAAGAATATCTACGACTGGACCTTCCTGCCTACCGACTTCGACACCAAAGAGGCCATCATCACAAGCTACGACGGCTGCCTGGGCCTGTTTGGCCTGTCTATTAGCCTGGCCAGCAAGCCCACCGGCAACAACCACCTGTTTATCCTGAGCGGCACCGACAAGTACTACAAGCTGGATCAGTTCGCCAACCACACCAGCATCAGCAGAAGAAGCCACCAGATCCGGTTCAGCGAGAGCGCCACAAGCTATAGCGGCTACATCTTCCGGGACCTGTCCAACAACAACTTCAACCTGATCGGCACGAACATCGAGAACAGCGTGTCCGGCCACGTGTACAACGCCCTGATCTACTACCGGTACAACTACTCCTTCGACCTGAAGCGGTGGATCTATCTGCACAGCATCGACAAGGTGGACATCGAAGGCGGCAAGTACTATGAGCTGGCCCCTATCGAGCTGATCTACGCCTGCAGAAGCGCCAAAGAGTTCGCCACACTGCAGGACGATCTGACCGTGCTGAGATACAGCAATGAGATCGAGAACTACATCAACACCGTGTACTCCATCACCTACGCCGACGATCCCAACTACTTCATCGGAATCCAGTTCCGCAACATCCCCTATAAGTACGACGTCAAGATCCCTCACCTGACCTTCGGCGTGCTGCACATCAGCGACAACATGGTGCCCGACGTGATCGACATCCTGAAGATCATGAAGAATGAGCTGTTCAAGATGGACATCACCACCAGCTACACCTACATGCTGAGCGACGGCATCTACGTGGCCAATGTGTCTGGCGTGCTGAGCACCTACTTCAAGATCTACAACGTGTTCTACAAGAACCAGATCACCTTCGGCCAGAGCCGGATGTTCATCCCTCACATCACCCTGAGCTTTAACAACATGCGGACCGTGCGGATCGAAACCACCAAGCTGCAGATCAAGAGCATCTACCTCCGGAAGATCAAGGGCGACACCGTGTTCGACATGGTGGAA [서열번호 277]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 277에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 277의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 278로 제공된다:
AUGAAGGUGCUGGCCCUGAGACAUUCUGUGGCCCAGGUGUACGCCGACACACAGGUCUACGUGCACGACGACACCAAGGACAGCUACGAGAACGCCUUCCUGAUCAGCAACCUGACCACACACAACAUCCUGUACCUGAACUACAGCAUCAAGACCCUCGAGAUCCUGAACAAGAGCGGAAUCGCCGCUAUCGCCCUGCAGAGCCUGGAAGAACUGUUCACCCUGAUCCGGUGCAACUUCACCUACGACUACGAGCUGGACAUCAUCUACCUGCACGAUUACAGCUACUACACCAACAACGAGAUCCGGACCGACCAGCACUGGAUCACCAAGACCAACAUCGAGGAAUACCUGCUGCCUGGCUGGAAGCUGACCUACGUGGGCUACAAUGGCAGCGAGACACGGGGCCACUACAACUUCAGCUUCAAGUGCCAGAACGCCGCCACCGACGACGACCUGAUCAUCGAGUACAUCUACAGCGAGGCCCUGGACUUCCAGAACUUCAUGCUGAAGAAAAUCAAAGAACGGAUGACCACCAGCCUGCCUAUCGCCAGACUGAGCAACCGGGUGUUCCGGGACAAGCUGUUUCCCAGCCUGCUGAAAGAACACAAGAACGUGGUCAACGUGGGCCCCAGAAACGAGAGCAUGUUCACCUUUCUGAACUACCCCACCAUCAAGCAGUUCAGCAACGGCGCCUACCUGGUCAAGGACACAAUCAAGCUGAAGCAAGAGAGAUGGCUGGGCAAGAGAAUCAGCCAGUUCGACAUCGGCCAGUACAAGAACAUGCUGAACGUGCUGACCGCCAUCUACUACUACUAUAACCUGUACAAGAGCAAGCCGAUCAUCUACAUGAUUGGCAGCGCCCCUAGCUACUGGAUCUACGACGUGCGGCACUACAGCGACUUUUUCUUCGAAACCUGGGAUCCCCUGGACACCCCUUACAGCAGCAUCCACCACAAAGAGCUGUUCUUCAUCAACGACGUGAAGAAGCUCAAGGACAACAGCAUCCUCUACAUCGACAUCAGAACCGACCGGGGCAACGCCGACUGGAAGAAAUGGCGGAAAACCGUGGAAGAACAGACCAUCAACAACCUGGAUAUCGCCUACGAGUACCUGCGGACCGGCAAGGCCAAAGUGUGCUGCGUGAAGAUGACAGCCAUGGACCUGGAACUGCCCAUCAGCGCCAAACUGCUGCACCAUCCUACCACCGAGAUCAGAAGCGAGUUCUAUCUGCUGCUGGACACCUGGGACCUGACCAAUAUCAGACGGUUCAUCCCCAAGGGCGUGCUGUACUCCUUUAUCAACAACAUCAUCACCGAGAACGUGUUCAUCCAGCAGCCGUUCAAAGUGAAAGUGCUGAACGACAGCUACAUCGUGGCCCUGUACGCCCUGAGCAACGACUUCAACAAUCGGAGCGAAGUGAUCAAACUGAUCAACAAUCAGAAGCAGUCCCUGAUCACCGUGCGCAUCAACAAUACCUUCAAGGACGAGCCCAAAGUGGGCUUCAAGAAUAUCUACGACUGGACCUUCCUGCCUACCGACUUCGACACCAAAGAGGCCAUCAUCACAAGCUACGACGGCUGCCUGGGCCUGUUUGGCCUGUCUAUUAGCCUGGCCAGCAAGCCCACCGGCAACAACCACCUGUUUAUCCUGAGCGGCACCGACAAGUACUACAAGCUGGAUCAGUUCGCCAACCACACCAGCAUCAGCAGAAGAAGCCACCAGAUCCGGUUCAGCGAGAGCGCCACAAGCUAUAGCGGCUACAUCUUCCGGGACCUGUCCAACAACAACUUCAACCUGAUCGGCACGAACAUCGAGAACAGCGUGUCCGGCCACGUGUACAACGCCCUGAUCUACUACCGGUACAACUACUCCUUCGACCUGAAGCGGUGGAUCUAUCUGCACAGCAUCGACAAGGUGGACAUCGAAGGCGGCAAGUACUAUGAGCUGGCCCCUAUCGAGCUGAUCUACGCCUGCAGAAGCGCCAAAGAGUUCGCCACACUGCAGGACGAUCUGACCGUGCUGAGAUACAGCAAUGAGAUCGAGAACUACAUCAACACCGUGUACUCCAUCACCUACGCCGACGAUCCCAACUACUUCAUCGGAAUCCAGUUCCGCAACAUCCCCUAUAAGUACGACGUCAAGAUCCCUCACCUGACCUUCGGCGUGCUGCACAUCAGCGACAACAUGGUGCCCGACGUGAUCGACAUCCUGAAGAUCAUGAAGAAUGAGCUGUUCAAGAUGGACAUCACCACCAGCUACACCUACAUGCUGAGCGACGGCAUCUACGUGGCCAAUGUGUCUGGCGUGCUGAGCACCUACUUCAAGAUCUACAACGUGUUCUACAAGAACCAGAUCACCUUCGGCCAGAGCCGGAUGUUCAUCCCUCACAUCACCCUGAGCUUUAACAACAUGCGGACCGUGCGGAUCGAAACCACCAAGCUGCAGAUCAAGAGCAUCUACCUCCGGAAGAUCAAGGGCGACACCGUGUUCGACAUGGUGGAA [서열번호 278]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 278에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 GB 바이러스 B NS3/4A(Q69422; 게놈 폴리단백질 간염 GB 바이러스 B), 또는 그의 동원체이다. GB 바이러스 B NS3/4A의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 279로 나타낸다:
APFTLQCLSERGTLSAMAVVMTGIDPRTWTGTIFRLGSLATSYMGFVCDNVLYTAHHGSKGRRLAHPTGSIHPITVDAANDQDIYQPPCGAGSLTRCSCGETKGYLVTRLGSLVEVNKSDDPYWCVCGALPMAVAKGSSGAPILCSSGHVIGMFTAARNSGGSVSQIRVRPLVCAGYHPQYTAHATLDTKPTVPNEYSVQILIAPTGSGKSTKLPLSYMQEKYEVLVLNPSVATTASMPKYMHATYGVNPNCYFNGKCTNTGASLTYSTYGMYLTGACSRNYDVIICDECHATDATTVLGIGKVLTEAPSKNVRLVVLATATPPGVIPTPHANITEIQLTDEGTIPFHGKKIKEENLKKGRHLIFEATKKHCDELANELARKGITAVSYYRGCDISKIPEGDCVVVATDALCTGYTGDFDSVYDCSLMVEGTCHVDLDPTFTMGVRVCGVSAIVKGQRRGRTGRGRAGIYYYVDGSCTPSGMVPECNIVEAFDAAKAWYGLSSTEAQTILDTYRTQPGLPAIGANLDEWADLFSMVNPEPSFVNTAKRTADNYVLLTAAQLQLCHQYGYAAPNDAPRWQGARLGKKPCGVLWRLDGADACPGPEPSEVTRYQMCFTEVNTSGTAALAVGVGVAMAYLAIDTFGATCVRRCWSITSVPTGATVAPVVDEEEIVEEC [서열번호 279]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 279에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 GB 바이러스 B NS3/4A 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 280의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GCACCTTTTACGCTGCAGTGTCTCTCTGAACGTGGCACGCTGTCAGCGATGGCAGTGGTCATGACTGGTATAGACCCCCGAACTTGGACTGGAACTATCTTCAGATTAGGATCTCTGGCCACTAGCTACATGGGATTTGTTTGTGACAACGTGTTGTATACTGCTCACCATGGCAGCAAGGGGCGCCGGTTGGCTCATCCCACAGGCTCCATACACCCAATAACCGTTGACGCGGCTAATGACCAGGACATCTATCAACCACCATGTGGAGCTGGGTCCCTTACTCGGTGCTCTTGCGGGGAGACCAAGGGGTATCTGGTAACACGACTGGGGTCATTGGTTGAGGTCAACAAATCCGATGACCCTTATTGGTGTGTGTGCGGGGCCCTTCCCATGGCTGTTGCCAAGGGTTCTTCAGGTGCCCCGATTCTGTGCTCCTCCGGGCATGTTATTGGGATGTTCACCGCTGCTAGAAATTCTGGCGGTTCAGTCAGCCAGATTAGGGTTAGGCCGTTGGTGTGTGCTGGATACCATCCCCAGTACACAGCACATGCCACTCTTGATACAAAACCTACTGTGCCTAACGAGTATTCAGTGCAAATTTTAATTGCCCCCACTGGCAGCGGCAAGTCAACCAAATTACCACTTTCTTACATGCAGGAGAAGTATGAGGTCTTGGTCCTAAATCCCAGTGTGGCTACAACAGCATCAATGCCAAAGTACATGCACGCGACGTACGGCGTGAATCCAAATTGCTATTTTAATGGCAAATGTACCAACACAGGGGCTTCACTTACGTACAGCACATATGGCATGTACCTGACCGGAGCATGTTCCCGGAACTATGACGTCATCATTTGTGACGAATGCCATGCTACCGATGCAACCACCGTGTTGGGCATTGGAAAGGTTCTAACCGAAGCTCCATCCAAAAATGTTAGGCTAGTGGTTCTTGCCACGGCTACCCCCCCTGGAGTAATCCCTACACCACATGCCAACATAACTGAGATTCAATTAACCGATGAAGGCACTATCCCCTTTCATGGAAAAAAGATTAAGGAGGAAAATCTGAAGAAAGGGAGACACCTTATCTTTGAGGCTACCAAAAAACACTGTGATGAGCTTGCTAACGAGTTAGCTCGAAAGGGAATAACAGCTGTCTCTTACTATAGGGGATGTGACATCTCAAAAATCCCTGAGGGCGACTGTGTAGTAGTTGCCACTGATGCCTTGTGTACAGGGTACACTGGTGACTTTGATTCCGTGTATGACTGCAGCCTCATGGTAGAAGGCACATGCCATGTTGACCTTGACCCTACTTTCACCATGGGTGTTCGTGTGTGCGGGGTCTCAGCAATAGTTAAAGGCCAGCGTAGGGGCCGCACAGGCCGTGGGAGAGCTGGCATATACTACTATGTAGACGGGAGTTGTACCCCTTCGGGTATGGTTCCTGAATGCAACATTGTTGAAGCCTTCGACGCAGCCAAGGCATGGTATGGTTTGTCATCAACAGAAGCTCAAACTATTCTGGACACCTATCGCACCCAACCTGGGTTACCTGCGATAGGAGCAAATTTGGACGAGTGGGCTGATCTCTTTTCTATGGTCAACCCCGAACCTTCATTTGTCAATACTGCAAAAAGAACTGCTGACAATTATGTTTTGTTGACTGCAGCCCAACTACAACTGTGTCATCAGTATGGCTATGCTGCTCCCAATGACGCACCACGGTGGCAGGGAGCCCGGCTTGGGAAAAAACCTTGTGGGGTTCTGTGGCGCTTGGACGGCGCTGACGCCTGTCCTGGCCCAGAGCCCAGCGAGGTGACCAGATACCAAATGTGCTTCACTGAAGTCAATACTTCTGGGACAGCCGCACTCGCTGTTGGCGTTGGAGTGGCTATGGCTTATCTAGCCATTGACACTTTTGGCGCCACTTGTGTGCGGCGTTGCTGGTCTATTACATCAGTCCCTACCGGTGCTACTGTCGCCCCAGTGGTTGACGAAGAAGAAATCGTGGAGGAGTGT [서열번호 280]
따라서, 바람직하게는 상기 GB 바이러스 B NS3/4A 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 280에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 GB 바이러스 B NS3/4A 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 281로 제공된다:
GCCCCTTTCACACTGCAATGCCTGAGCGAGAGAGGCACCCTGTCTGCCATGGCCGTGGTTATGACAGGCATCGACCCTAGAACCTGGACCGGCACCATCTTCAGACTGGGAAGCCTGGCCACAAGCTACATGGGCTTCGTGTGCGACAACGTGCTGTACACAGCCCACCACGGCAGCAAAGGCAGAAGGCTGGCTCACCCTACAGGCAGCATTCACCCCATCACAGTGGACGCCGCCAACGACCAGGATATCTACCAACCTCCTTGCGGCGCTGGCAGCCTGACCAGATGTTCTTGTGGCGAGACAAAGGGCTACCTGGTCACCAGGCTGGGATCCCTGGTGGAAGTGAACAAGAGCGACGACCCCTATTGGTGCGTGTGTGGCGCACTGCCTATGGCTGTGGCCAAAGGATCTTCTGGCGCCCCTATCCTGTGTAGCTCTGGCCACGTGATCGGCATGTTTACCGCCGCCAGAAATAGCGGCGGCAGCGTGTCACAGATTAGAGTGCGGCCTCTTGTGTGCGCCGGCTATCACCCTCAGTATACAGCCCACGCCACACTGGACACCAAGCCTACCGTGCCTAACGAGTACAGCGTGCAGATCCTGATCGCCCCAACAGGCAGCGGCAAGAGCACAAAACTGCCCCTGAGCTACATGCAAGAGAAGTACGAGGTGCTGGTGCTGAACCCTAGCGTGGCCACAACAGCCAGCATGCCCAAGTACATGCACGCCACCTATGGCGTGAACCCCAACTGCTACTTCAACGGCAAGTGCACCAATACCGGCGCCAGCCTGACATACAGCACCTACGGCATGTATCTGACCGGCGCCTGCAGCAGAAACTACGACGTGATCATCTGCGACGAGTGCCACGCCACCGATGCCACAACTGTGCTCGGAATCGGCAAGGTGCTGACAGAGGCCCCTAGCAAGAATGTGCGACTGGTGGTGCTGGCCACTGCTACACCACCTGGCGTTATCCCTACACCTCACGCCAACATCACCGAGATCCAGCTGACCGACGAGGGCACAATCCCATTCCACGGCAAGAAGATCAAAGAGGAAAACCTGAAGAAGGGCCGCCACCTGATCTTCGAGGCCACCAAGAAACACTGTGACGAGCTGGCCAACGAACTGGCCAGAAAGGGCATCACCGCCGTGTCCTACTACAGAGGCTGCGACATCAGCAAGATCCCCGAGGGCGATTGTGTGGTGGTGGCTACAGATGCCCTGTGTACCGGCTACACCGGCGACTTCGATAGCGTGTACGACTGCAGCCTGATGGTGGAAGGCACCTGTCATGTGGATCTGGACCCCACCTTTACCATGGGCGTCAGAGTGTGCGGAGTGTCCGCCATCGTGAAGGGCCAGAGAAGAGGCAGAACTGGCAGAGGCAGAGCCGGCATCTACTACTATGTGGACGGCAGCTGTACCCCTAGCGGCATGGTGCCTGAGTGCAACATCGTGGAAGCCTTCGATGCCGCCAAGGCTTGGTACGGCCTGTCTAGCACAGAGGCTCAGACCATCCTGGACACCTACAGAACCCAGCCAGGACTGCCTGCCATCGGCGCCAATCTTGATGAATGGGCCGACCTGTTCAGCATGGTCAACCCCGAGCCTAGCTTCGTGAACACCGCCAAGAGAACCGCCGACAACTACGTGCTGCTGACAGCCGCTCAGCTCCAGCTGTGTCACCAGTACGGATACGCCGCTCCTAACGACGCCCCTAGATGGCAAGGCGCTAGACTGGGCAAGAAACCATGTGGCGTTCTGTGGCGACTGGATGGCGCTGATGCTTGTCCTGGACCTGAGCCTAGCGAAGTGACCAGATACCAGATGTGCTTCACCGAAGTGAATACCAGCGGCACAGCTGCCCTGGCCGTTGGTGTTGGAGTGGCCATGGCTTACCTGGCCATCGATACCTTTGGCGCCACATGCGTGCGGAGATGCTGGTCTATCACCAGCGTTCCAACAGGCGCTACAGTGGCCCCTGTGGTGGATGAGGAAGAGATTGTGGAAGAGTGC [서열번호 281]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 281에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 281의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 282로 제공된다:
GCCCCUUUCACACUGCAAUGCCUGAGCGAGAGAGGCACCCUGUCUGCCAUGGCCGUGGUUAUGACAGGCAUCGACCCUAGAACCUGGACCGGCACCAUCUUCAGACUGGGAAGCCUGGCCACAAGCUACAUGGGCUUCGUGUGCGACAACGUGCUGUACACAGCCCACCACGGCAGCAAAGGCAGAAGGCUGGCUCACCCUACAGGCAGCAUUCACCCCAUCACAGUGGACGCCGCCAACGACCAGGAUAUCUACCAACCUCCUUGCGGCGCUGGCAGCCUGACCAGAUGUUCUUGUGGCGAGACAAAGGGCUACCUGGUCACCAGGCUGGGAUCCCUGGUGGAAGUGAACAAGAGCGACGACCCCUAUUGGUGCGUGUGUGGCGCACUGCCUAUGGCUGUGGCCAAAGGAUCUUCUGGCGCCCCUAUCCUGUGUAGCUCUGGCCACGUGAUCGGCAUGUUUACCGCCGCCAGAAAUAGCGGCGGCAGCGUGUCACAGAUUAGAGUGCGGCCUCUUGUGUGCGCCGGCUAUCACCCUCAGUAUACAGCCCACGCCACACUGGACACCAAGCCUACCGUGCCUAACGAGUACAGCGUGCAGAUCCUGAUCGCCCCAACAGGCAGCGGCAAGAGCACAAAACUGCCCCUGAGCUACAUGCAAGAGAAGUACGAGGUGCUGGUGCUGAACCCUAGCGUGGCCACAACAGCCAGCAUGCCCAAGUACAUGCACGCCACCUAUGGCGUGAACCCCAACUGCUACUUCAACGGCAAGUGCACCAAUACCGGCGCCAGCCUGACAUACAGCACCUACGGCAUGUAUCUGACCGGCGCCUGCAGCAGAAACUACGACGUGAUCAUCUGCGACGAGUGCCACGCCACCGAUGCCACAACUGUGCUCGGAAUCGGCAAGGUGCUGACAGAGGCCCCUAGCAAGAAUGUGCGACUGGUGGUGCUGGCCACUGCUACACCACCUGGCGUUAUCCCUACACCUCACGCCAACAUCACCGAGAUCCAGCUGACCGACGAGGGCACAAUCCCAUUCCACGGCAAGAAGAUCAAAGAGGAAAACCUGAAGAAGGGCCGCCACCUGAUCUUCGAGGCCACCAAGAAACACUGUGACGAGCUGGCCAACGAACUGGCCAGAAAGGGCAUCACCGCCGUGUCCUACUACAGAGGCUGCGACAUCAGCAAGAUCCCCGAGGGCGAUUGUGUGGUGGUGGCUACAGAUGCCCUGUGUACCGGCUACACCGGCGACUUCGAUAGCGUGUACGACUGCAGCCUGAUGGUGGAAGGCACCUGUCAUGUGGAUCUGGACCCCACCUUUACCAUGGGCGUCAGAGUGUGCGGAGUGUCCGCCAUCGUGAAGGGCCAGAGAAGAGGCAGAACUGGCAGAGGCAGAGCCGGCAUCUACUACUAUGUGGACGGCAGCUGUACCCCUAGCGGCAUGGUGCCUGAGUGCAACAUCGUGGAAGCCUUCGAUGCCGCCAAGGCUUGGUACGGCCUGUCUAGCACAGAGGCUCAGACCAUCCUGGACACCUACAGAACCCAGCCAGGACUGCCUGCCAUCGGCGCCAAUCUUGAUGAAUGGGCCGACCUGUUCAGCAUGGUCAACCCCGAGCCUAGCUUCGUGAACACCGCCAAGAGAACCGCCGACAACUACGUGCUGCUGACAGCCGCUCAGCUCCAGCUGUGUCACCAGUACGGAUACGCCGCUCCUAACGACGCCCCUAGAUGGCAAGGCGCUAGACUGGGCAAGAAACCAUGUGGCGUUCUGUGGCGACUGGAUGGCGCUGAUGCUUGUCCUGGACCUGAGCCUAGCGAAGUGACCAGAUACCAGAUGUGCUUCACCGAAGUGAAUACCAGCGGCACAGCUGCCCUGGCCGUUGGUGUUGGAGUGGCCAUGGCUUACCUGGCCAUCGAUACCUUUGGCGCCACAUGCGUGCGGAGAUGCUGGUCUAUCACCAGCGUUCCAACAGGCGCUACAGUGGCCCCUGUGGUGGAUGAGGAAGAGAUUGUGGAAGAGUGC [서열번호 282]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 282에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HAV 3Cpro(P08617; 게놈 폴리단백질 인간 A형 간염 바이러스 유전자형 IB(HM175 단리물)), 또는 그의 동원체이다. HAV 3Cpro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 283으로 나타낸다:
STLEIAGLVRKNLVQFGVGEKNGCVRWVMNALGVKDDWLLVPSHAYKFEKDYEMMEFYFNRGGTYYSISAGNVVIQSLDVGFQDVVLMKVPTIPKFRDITQHFIKKGDVPRALNRLATLVTTVNGTPMLISEGPLKMEEKATYVHKKNDGTTVDLTVDQAWRGKGEGLPGMCGGALVSSNQSIQNAILGIHVAGGNSILVAKLVTQEMFQNIDKKIESQ [서열번호 283]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 283에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HAV 3Cpro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 284의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
TCAACTTTGGAAATAGCAGGACTGGTTAGGAAGAACTTGGTTCAGTTTGGAGTTGGAGAGAAGAATGGATGTGTGAGATGGGTTATGAATGCCTTGGGAGTGAAAGATGATTGGCTGCTTGTGCCTTCCCATGCTTATAAATTTGAGAAAGATTATGAAATGATGGAGTTTTATTTTAATAGAGGTGGAACTTACTATTCAATTTCAGCTGGTAATGTTGTTATTCAATCTTTGGATGTGGGATTCCAGGATGTTGTTCTGATGAAGGTTCCTACAATTCCTAAGTTTAGAGATATTACTCAGCATTTTATTAAGAAAGGGGATGTGCCTAGAGCTTTGAATCGCCTGGCAACATTAGTGACAACTGTAAATGGAACCCCTATGTTAATTTCTGAGGGCCCACTAAAGATGGAAGAGAAAGCTACTTATGTTCATAAGAAAAATGATGGTACAACAGTTGATTTAACTGTGGATCAGGCATGGAGAGGAAAAGGCGAAGGTCTTCCTGGAATGTGTGGTGGGGCCTTGGTTTCATCGAATCAATCTATACAGAATGCAATCTTGGGCATCCATGTTGCTGGAGGAAATTCAATTCTTGTTGCAAAATTGGTTACTCAAGAAATGTTCCAAAATATTGATAAGAAAATTGAAAGTCAG [서열번호 284]
따라서, 바람직하게는 상기 HAV 3Cpro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 284에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 HAV 3Cpro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 285로 제공된다:
AGCACACTGGAAATCGCCGGACTCGTGCGGAAGAACCTGGTGCAGTTTGGCGTGGGCGAGAAGAACGGCTGTGTCAGATGGGTCATGAACGCCCTGGGCGTGAAGGACGATTGGCTGCTGGTTCCTAGCCACGCCTACAAGTTCGAGAAGGACTACGAGATGATGGAATTCTACTTCAACAGAGGCGGCACCTACTACAGCATCAGCGCCGGCAATGTGGTCATCCAGTCTCTGGATGTGGGCTTCCAGGACGTGGTGCTGATGAAGGTGCCAACAATCCCCAAGTTCCGGGACATCACCCAGCACTTCATCAAGAAAGGCGACGTGCCCAGGGCTCTGAACAGACTGGCTACCCTGGTCACCACCGTGAACGGCACACCCATGCTGATCTCTGAGGGCCCACTGAAGATGGAAGAGAAGGCCACCTACGTGCACAAGAAGAACGACGGCACCACAGTGGACCTGACCGTGGATCAAGCTTGGAGAGGCAAAGGCGAGGGCCTGCCTGGAATGTGTGGCGGAGCACTGGTGTCCAGCAACCAGAGCATCCAGAATGCCATCCTGGGCATCCATGTGGCTGGCGGCAATTCTATCCTGGTGGCCAAGCTGGTCACCCAAGAGATGTTCCAGAACATCGACAAGAAGATCGAGAGCCAG [서열번호 285]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 285에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 285의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 286으로 제공된다:
AGCACACUGGAAAUCGCCGGACUCGUGCGGAAGAACCUGGUGCAGUUUGGCGUGGGCGAGAAGAACGGCUGUGUCAGAUGGGUCAUGAACGCCCUGGGCGUGAAGGACGAUUGGCUGCUGGUUCCUAGCCACGCCUACAAGUUCGAGAAGGACUACGAGAUGAUGGAAUUCUACUUCAACAGAGGCGGCACCUACUACAGCAUCAGCGCCGGCAAUGUGGUCAUCCAGUCUCUGGAUGUGGGCUUCCAGGACGUGGUGCUGAUGAAGGUGCCAACAAUCCCCAAGUUCCGGGACAUCACCCAGCACUUCAUCAAGAAAGGCGACGUGCCCAGGGCUCUGAACAGACUGGCUACCCUGGUCACCACCGUGAACGGCACACCCAUGCUGAUCUCUGAGGGCCCACUGAAGAUGGAAGAGAAGGCCACCUACGUGCACAAGAAGAACGACGGCACCACAGUGGACCUGACCGUGGAUCAAGCUUGGAGAGGCAAAGGCGAGGGCCUGCCUGGAAUGUGUGGCGGAGCACUGGUGUCCAGCAACCAGAGCAUCCAGAAUGCCAUCCUGGGCAUCCAUGUGGCUGGCGGCAAUUCUAUCCUGGUGGCCAAGCUGGUCACCCAAGAGAUGUUCCAGAACAUCGACAAGAAGAUCGAGAGCCAG [서열번호 286]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 286에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 인간 메타뉴모바이러스 M2-2(Q6WB96; 단백질 M2-2 인간 메타뉴모바이러스(CAN97-83 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. 인간 메타뉴모바이러스 M2-2의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 287로 나타낸다:
MTLHMPCKTVKALIKCSEHGPVFITIEVDEMIWTQKELKEALSDGIVKSHTNIYNCYLENIEIIYVKAYLS [서열번호 287]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 287에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 인간 메타뉴모바이러스 M2-2 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 288의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGACTCTTCATATGCCCTGCAAGACAGTGAAAGCATTAATCAAGTGCAGTGAGCATGGTCCTGTTTTCATTACTATAGAGGTTGATGAAATGATATGGACTCAAAAAGAATTAAAAGAAGCTTTGTCCGATGGGATAGTGAAGTCTCACACCAACATTTACAATTGTTATTTAGAAAACATAGAAATTATATATGTCAAGGCTTACTTAAGT [서열번호 288]
따라서, 바람직하게는 상기 인간 메타뉴모바이러스 M2-2 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 288에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 인간 메타뉴모바이러스 M2-2 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 289로 제공된다:
ATGACCCTGCACATGCCCTGCAAGACAGTGAAGGCCCTGATCAAGTGTAGCGAGCACGGCCCCGTGTTCATCACCATTGAGGTGGACGAGATGATCTGGACCCAGAAAGAGCTGAAAGAGGCCCTGAGCGACGGCATCGTGAAGTCCCACACCAACATCTACAACTGCTACCTCGAGAACATCGAGATCATCTACGTGAAGGCCTACCTGAGC [서열번호 289]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 289에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 289의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 290으로 제공된다:
AUGACCCUGCACAUGCCCUGCAAGACAGUGAAGGCCCUGAUCAAGUGUAGCGAGCACGGCCCCGUGUUCAUCACCAUUGAGGUGGACGAGAUGAUCUGGACCCAGAAAGAGCUGAAAGAGGCCCUGAGCGACGGCAUCGUGAAGUCCCACACCAACAUCUACAACUGCUACCUCGAGAACAUCGAGAUCAUCUACGUGAAGGCCUACCUGAGC [서열번호 290]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 290에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 E형 간염 메틸트랜스퍼라아제(Q9WC28; 비-구조 폴리단백질 pORF1 메틸트랜스퍼라아제 E형 간염 바이러스 유전자형 1), 또는 그의 동원체이다. E형 간염 메틸트랜스퍼라아제의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 291로 나타낸다:
EVFWNQPIQRVIHNELELYCRARSGRCLEIGAHPRSINDNPNVVHRCFLRPVGRDVQRWYTAPTRGPAANCRRSALRGLPAADRTYCFDGFSGCSCPAETGIALYSLHDMSPSDVAEAMFRHGMTRLYAALHLPPEVLLPPGTYRTASYLLIHDGRRVVVTYEGDTSAGYNHDVSNLRSWI [서열번호 291]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 291에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 E형 간염 메틸트랜스퍼라아제 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 292의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GAGGTTTTCTGGAATCAACCCATCCAGCGTGTCATTCATAACGAGCTGGAGCTTTACTGCCGCGCTCGCTCCGGCCGCTGTCTTGAAATTGGCGCCCATCCCCGCTCAATAAATGATAATCCTAATGTGGTCCACCGCTGCTTCCTCCGCCCTGTTGGGCGTGATGTTCAGCGCTGGTATACTGCTCCCACTCGCGGGCCGGCTGCTAATTGCCGCCGTTCCGCGTTGCGTGGGCTTCCCGCTGCTGACCGCACATACTGCTTCGACGGGTTTTCTGGCTGTAGCTGCCCCGCCGAGACGGGTATCGCCCTTTACTCCCTCCATGATATGTCACCATCTGATGTTGCCGAGGCCATGTTCCGCCATGGTATGACGCGGCTTTATGCTGCCCTCCATCTTCCGCCTGAGGTCTTGCTGCCCCCTGGCACATATCGCACCGCATCGTATTTGCTGATTCATGACGGCAGGCGCGTTGTGGTGACGTATGAGGGTGATACTAGTGCTGGTTACAACCACGATGTCTCCAACTTGCGCTCCTGGATT [서열번호 292]
따라서, 바람직하게는 상기 E형 간염 메틸트랜스퍼라아제 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 292에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 E형 간염 메틸트랜스퍼라아제 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 293으로 제공된다:
GAGGTGTTCTGGAACCAGCCTATCCAGAGAGTGATCCACAACGAGCTGGAACTGTACTGCAGAGCCAGATCCGGCCGGTGTCTGGAAATTGGAGCCCATCCTCGGAGCATCAACGACAACCCCAACGTGGTGCACAGATGCTTTCTGAGGCCCGTGGGCAGAGATGTGCAGCGGTGGTATACAGCCCCTACAAGAGGACCTGCCGCCAACTGTAGAAGAAGCGCCCTGAGAGGACTGCCTGCCGCCGATAGAACCTACTGCTTCGATGGCTTCAGCGGCTGCAGCTGTCCTGCCGAAACTGGAATCGCCCTGTACAGCCTGCACGACATGAGCCCATCTGATGTGGCCGAGGCCATGTTCAGACACGGCATGACCAGACTGTACGCCGCTCTGCATCTGCCTCCAGAAGTTCTGCTGCCTCCTGGCACCTACAGAACCGCCAGCTATCTGCTGATCCACGATGGGAGAAGAGTGGTGGTCACCTACGAGGGCGATACAAGCGCCGGCTACAACCACGACGTGTCCAACCTGAGAAGCTGGATC [서열번호 293]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 293에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 293의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 294로 제공된다:
GAGGUGUUCUGGAACCAGCCUAUCCAGAGAGUGAUCCACAACGAGCUGGAACUGUACUGCAGAGCCAGAUCCGGCCGGUGUCUGGAAAUUGGAGCCCAUCCUCGGAGCAUCAACGACAACCCCAACGUGGUGCACAGAUGCUUUCUGAGGCCCGUGGGCAGAGAUGUGCAGCGGUGGUAUACAGCCCCUACAAGAGGACCUGCCGCCAACUGUAGAAGAAGCGCCCUGAGAGGACUGCCUGCCGCCGAUAGAACCUACUGCUUCGAUGGCUUCAGCGGCUGCAGCUGUCCUGCCGAAACUGGAAUCGCCCUGUACAGCCUGCACGACAUGAGCCCAUCUGAUGUGGCCGAGGCCAUGUUCAGACACGGCAUGACCAGACUGUACGCCGCUCUGCAUCUGCCUCCAGAAGUUCUGCUGCCUCCUGGCACCUACAGAACCGCCAGCUAUCUGCUGAUCCACGAUGGGAGAAGAGUGGUGGUCACCUACGAGGGCGAUACAAGCGCCGGCUACAACCACGACGUGUCCAACCUGAGAAGCUGGAUC [서열번호 294]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 294에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 PRRV Npro(P24381; 세린/트레오닌-단백질 키나아제(kinase) US3 동족체(homolog) 수이드(Suid) 헤르페스바이러스 2(NIA-3 바이러스주) 가성광견병(Pseudorabies) 바이러스), 또는 그의 동원체이다. PRRV Npro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 295로 나타낸다:
MLAMWRWVTKRSRLRRGHAHLGGNKGVRGICSLYLAGLSRGLSRVHAQRSHAATMADAGIPDEILYSDISDDEIIIDGDGDGDSSGDEDDDDGGLTRQAASRIATDLGFEVLQPLQSGSEGRVFVARRPGEADTVVLKVGQKPSTLMEGMLLKRLAHDNVMSLKQMLARGPVTCLVLPHFRCDLYSYLTMRDGPLDMRDAGRVIRSVLRGLAYLHGMRIMHRDVKAENIFLEDVDTVCLGDLGAARCNVAAPNFYGLAGTIETNAPEVLARDRYDTKVDVWGAGVVLFETLAYPKTIAGGDEPAINGEMHLIDLIRALGVHPEEFPPDTRLRSEFVRYAGTHRQPYTQYARVARLGLPETGAFLIYKMLTFDPVRRPSADEILNFGMWTV [서열번호 295]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 295에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 PRRV Npro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 296의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGCTGGCGATGTGGAGATGGGTCACCAAGAGGTCGCGGCTCCGCCGAGGCCACGCCCATCTTGGGGGAAATAAAGGAGTCCGGGGAATTTGTTCCTTATACCTTGCCGGGCTCAGCAGGGGGTTGTCGCGCGTCCACGCCCAGCGCTCGCACGCAGCAACAATGGCCGACGCCGGAATCCCCGACGAGATCCTGTACTCGGACATCAGCGACGACGAGATCATCATCGACGGCGACGGCGACGGCGACAGCAGCGGGGACGAGGACGACGATGACGGGGGGCTGACGCGGCAGGCCGCGTCGCGCATCGCCACGGACCTGGGCTTCGAGGTGCTGCAGCCCCTGCAGTCGGGCTCGGAGGGCCGCGTCTTCGTGGCCCGCCGGCCCGGCGAGGCGGACACGGTGGTGCTGAAGGTGGGCCAGAAGCCCTCGACGCTGATGGAGGGCATGCTGCTGAAGCGCCTGGCCCACGATAACGTCATGAGCCTGAAGCAGATGCTCGCCCGGGGCCCGGTGACGTGCCTGGTCCTGCCGCACTTTCGGTGCGATCTGTACAGCTACCTGACCATGCGGGACGGGCCGCTGGACATGCGCGACGCCGGGCGCGTGATCCGGTCCGTGCTCCGCGGGCTCGCCTACCTGCACGGGATGCGCATCATGCACCGCGACGTCAAGGCGGAGAACATCTTCCTCGAGGACGTGGACACGGTGTGCCTGGGGGACCTCGGGGCCGCGCGCTGCAACGTGGCGGCGCCCAACTTTTACGGGCTCGCCGGGACCATCGAGACCAACGCCCCCGAGGTGCTCGCGCGCGACCGCTACGACACCAAGGTCGACGTCTGGGGCGCGGGGGTGGTGCTCTTCGAGACGCTGGCCTACCCCAAGACGATCGCCGGCGGGGACGAGCCCGCGATCAACGGGGAGATGCACCTGATCGACCTCATCCGCGCCCTCGGGGTGCACCCCGAGGAGTTCCCGCCCGACACGCGCCTCCGGAGCGAGTTCGTCCGGTACGCCGGGACCCACCGCCAGCCGTACACGCAGTACGCGCGCGTGGCTCGCCTCGGGCTGCCCGAGACGGGGGCTTTCCTGATTTACAAGATGTTGACGTTTGATCCCGTCCGCCGCCCTTCCGCTGATGAGATACTCAACTTTGGAATGTGGACCGTA [서열번호 296]
따라서, 바람직하게는 상기 PRRV Npro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 296에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 PRRV Npro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 297로 제공된다:
ATGCTGGCCATGTGGCGCTGGGTCACCAAGAGAAGCAGACTGAGAAGAGGACACGCCCACCTCGGCGGAAACAAGGGCGTTAGAGGCATCTGCAGCCTGTATCTGGCCGGCCTGTCTAGAGGACTGAGCAGAGTGCATGCCCAGAGATCTCACGCCGCCACAATGGCCGATGCTGGCATCCCTGATGAGATCCTGTACAGCGACATCAGCGACGACGAGATCATCATCGATGGCGACGGCGACGGGGATAGCAGCGGAGATGAGGATGACGATGATGGCGGCCTGACAAGACAGGCTGCCAGCAGAATTGCCACCGACCTGGGATTTGAGGTGCTGCAGCCTCTGCAGTCTGGCTCTGAGGGCAGAGTGTTCGTGGCTAGAAGGCCTGGCGAAGCCGATACCGTGGTGCTGAAAGTGGGCCAGAAACCTAGCACACTGATGGAAGGCATGCTGCTGAAGAGACTGGCCCACGACAACGTGATGAGCCTGAAGCAGATGCTGGCTAGAGGCCCTGTGACCTGTCTGGTGCTGCCTCACTTCAGATGCGACCTGTACTCCTACCTGACCATGAGAGATGGCCCTCTGGATATGCGCGACGCCGGCAGAGTGATCAGATCTGTGCTGAGAGGCCTGGCCTACCTGCACGGCATGAGAATCATGCACAGGGACGTGAAGGCCGAGAACATCTTTCTGGAAGATGTGGACACCGTGTGCCTGGGCGATCTGGGAGCCGCTAGATGTAATGTGGCCGCTCCTAACTTCTACGGCCTGGCCGGAACCATCGAGACAAATGCCCCTGAAGTGCTGGCCCGGGACAGATACGATACCAAGGTGGACGTTTGGGGAGCCGGCGTGGTCCTGTTTGAGACACTGGCTTACCCCAAGACAATCGCTGGCGGCGACGAGCCTGCTATCAATGGCGAGATGCACCTGATCGACCTGATCAGAGCCCTGGGCGTGCACCCTGAGGAATTCCCTCCAGACACACGGCTGCGGAGCGAGTTCGTTAGATACGCCGGAACACACAGACAGCCCTACACACAGTATGCCAGAGTGGCCAGACTGGGCCTGCCTGAAACAGGCGCCTTCCTGATCTACAAGATGCTGACCTTCGATCCCGTGCGGAGGCCTTCTGCCGATGAGATTCTGAACTTCGGCATGTGGACCGTG [서열번호 297]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 297에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 297의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 298로 제공된다:
AUGCUGGCCAUGUGGCGCUGGGUCACCAAGAGAAGCAGACUGAGAAGAGGACACGCCCACCUCGGCGGAAACAAGGGCGUUAGAGGCAUCUGCAGCCUGUAUCUGGCCGGCCUGUCUAGAGGACUGAGCAGAGUGCAUGCCCAGAGAUCUCACGCCGCCACAAUGGCCGAUGCUGGCAUCCCUGAUGAGAUCCUGUACAGCGACAUCAGCGACGACGAGAUCAUCAUCGAUGGCGACGGCGACGGGGAUAGCAGCGGAGAUGAGGAUGACGAUGAUGGCGGCCUGACAAGACAGGCUGCCAGCAGAAUUGCCACCGACCUGGGAUUUGAGGUGCUGCAGCCUCUGCAGUCUGGCUCUGAGGGCAGAGUGUUCGUGGCUAGAAGGCCUGGCGAAGCCGAUACCGUGGUGCUGAAAGUGGGCCAGAAACCUAGCACACUGAUGGAAGGCAUGCUGCUGAAGAGACUGGCCCACGACAACGUGAUGAGCCUGAAGCAGAUGCUGGCUAGAGGCCCUGUGACCUGUCUGGUGCUGCCUCACUUCAGAUGCGACCUGUACUCCUACCUGACCAUGAGAGAUGGCCCUCUGGAUAUGCGCGACGCCGGCAGAGUGAUCAGAUCUGUGCUGAGAGGCCUGGCCUACCUGCACGGCAUGAGAAUCAUGCACAGGGACGUGAAGGCCGAGAACAUCUUUCUGGAAGAUGUGGACACCGUGUGCCUGGGCGAUCUGGGAGCCGCUAGAUGUAAUGUGGCCGCUCCUAACUUCUACGGCCUGGCCGGAACCAUCGAGACAAAUGCCCCUGAAGUGCUGGCCCGGGACAGAUACGAUACCAAGGUGGACGUUUGGGGAGCCGGCGUGGUCCUGUUUGAGACACUGGCUUACCCCAAGACAAUCGCUGGCGGCGACGAGCCUGCUAUCAAUGGCGAGAUGCACCUGAUCGACCUGAUCAGAGCCCUGGGCGUGCACCCUGAGGAAUUCCCUCCAGACACACGGCUGCGGAGCGAGUUCGUUAGAUACGCCGGAACACACAGACAGCCCUACACACAGUAUGCCAGAGUGGCCAGACUGGGCCUGCCUGAAACAGGCGCCUUCCUGAUCUACAAGAUGCUGACCUUCGAUCCCGUGCGGAGGCCUUCUGCCGAUGAGAUUCUGAACUUCGGCAUGUGGACCGUG [서열번호 298]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 298에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HSV1 US3(P04413; 세린/트레오닌-단백질 키나아제 US3 인간 헤르페스바이러스 1(17 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. HSV1 US3의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 299로 나타낸다:
MACRKFCRVYGGQGRRKEEAVPPETKPSRVFPHGPFYTPAEDACLDSPPPETPKPSHTTPPSEAERLCHLQEILAQMYGNQDYPIEDDPSADAADDVDEDAPDDVAYPEEYAEELFLPGDATGPLIGANDHIPPPCGASPPGIRRRSRDEIGATGFTAEELDAMDREAARAISRGGKPPSTMAKLVTGMGFTIHGALTPGSEGCVFDSSHPDYPQRVIVKAGWYTSTSHEARLLRRLDHPAILPLLDLHVVSGVTCLVLPKYQADLYTYLSRRLNPLGRPQIAAVSRQLLSAVDYIHRQGIIHRDIKTENIFINTPEDICLGDFGAACFVQGSRSSPFPYGIAGTIDTNAPEVLAGDPYTTTVDIWSAGLVIFETAVHNASLFSAPRGPKRGPCDSQITRIIRQAQVHVDEFSPHPESRLTSRYRSRAAGNNRPPYTRPAWTRYYKMDIDVEYLVCKALTFDGALRPSAAELLCLPLFQQK [서열번호 299]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 299에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HSV1 US3 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 300의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCCTGTCGTAAGTTTTGTCGCGTTTACGGGGGACAGGGCAGGAGGAAGGAGGAGGCCGTCCCGCCGGAGACAAAGCCGTCCCGGGTGTTTCCTCATGGCCCCTTTTATACCCCAGCCGAGGACGCGTGCCTGGACTCCCCGCCCCCGGAGACCCCCAAACCTTCCCACACCACACCACCCAGCGAGGCCGAGCGCCTGTGTCATCTGCAGGAGATCCTTGCCCAGATGTACGGAAACCAGGACTACCCCATAGAGGACGACCCCAGCGCGGATGCCGCGGACGATGTCGACGAGGACGCCCCGGACGACGTGGCCTATCCGGAGGAATACGCAGAGGAGCTTTTTCTGCCCGGGGACGCGACCGGTCCCCTTATCGGGGCCAACGACCACATCCCTCCCCCGTGTGGCGCATCTCCCCCCGGTATACGACGACGCAGCCGGGATGAGATTGGGGCCACGGGATTTACCGCGGAAGAGCTGGACGCCATGGACAGGGAGGCGGCTCGAGCCATCAGCCGCGGCGGCAAGCCCCCCTCGACCATGGCCAAGCTGGTGACTGGCATGGGCTTTACGATCCACGGAGCGCTCACCCCAGGATCGGAGGGGTGTGTCTTTGACAGCAGCCATCCAGATTACCCCCAACGGGTAATCGTGAAGGCGGGGTGGTACACGAGCACGAGCCACGAGGCGCGACTGCTGAGGCGACTGGACCACCCGGCGATCCTGCCCCTCCTGGACCTGCATGTCGTCTCCGGGGTCACGTGTCTGGTCCTCCCCAAGTACCAGGCCGACCTGTATACCTATCTGAGTAGGCGCCTGAACCCACTGGGACGCCCGCAGATCGCAGCGGTCTCCCGGCAGCTCCTAAGCGCCGTTGACTACATTCACCGCCAGGGCATTATCCACCGCGACATTAAGACCGAAAATATTTTTATTAACACCCCCGAGGACATTTGCCTGGGGGACTTTGGCGCCGCGTGCTTCGTGCAGGGTTCCCGATCAAGCCCCTTCCCCTACGGAATCGCCGGAACCATCGACACCAACGCCCCCGAGGTCCTGGCCGGGGATCCGTATACCACGACCGTCGACATTTGGAGCGCCGGTCTGGTGATCTTCGAGACTGCCGTCCACAACGCGTCCTTGTTCTCGGCCCCCCGCGGCCCCAAAAGGGGCCCGTGCGACAGTCAGATCACCCGCATCATCCGACAGGCCCAGGTCCACGTTGACGAGTTTTCCCCGCATCCAGAATCGCGCCTCACCTCGCGCTACCGCTCCCGCGCGGCCGGGAACAATCGCCCGCCGTACACCCGACCGGCCTGGACCCGCTACTACAAGATGGACATAGACGTCGAATATCTGGTTTGCAAAGCCCTCACCTTCGACGGCGCGCTTCGCCCCAGCGCCGCAGAGCTGCTTTGTTTGCCGCTGTTTCAACAGAAA [서열번호 300]
따라서, 바람직하게는 상기 HSV1 US3 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 300에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 HSV1 US3 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 301로 제공된다:
ATGGCCTGCCGGAAGTTCTGTAGAGTGTACGGCGGACAGGGGCGCAGAAAAGAGGAAGCCGTTCCTCCTGAGACAAAGCCCAGCAGAGTGTTCCCTCACGGCCCCTTTTACACCCCTGCCGAAGATGCCTGTCTGGACAGCCCTCCTCCAGAAACACCTAAGCCTAGCCACACCACACCTCCAAGCGAGGCCGAAAGACTGTGCCATCTGCAAGAGATTCTGGCCCAGATGTACGGCAACCAGGACTACCCCATCGAGGACGATCCATCTGCCGATGCCGCCGACGATGTGGATGAAGATGCCCCTGATGACGTGGCCTATCCTGAGGAATACGCCGAGGAACTGTTCCTGCCTGGCGACGCTACAGGACCTCTGATCGGAGCCAACGATCACATCCCTCCACCTTGTGGCGCTAGCCCTCCTGGCATCAGAAGAAGAAGCAGGGACGAGATCGGCGCCACCGGCTTTACAGCCGAAGAACTGGACGCCATGGACAGAGAAGCCGCCAGAGCCATTTCTAGAGGCGGCAAGCCTCCTAGCACCATGGCCAAACTGGTTACCGGCATGGGCTTCACCATTCACGGCGCTCTGACACCTGGCTCTGAGGGCTGTGTGTTCGACAGCTCTCACCCCGACTATCCCCAGCGCGTGATCGTGAAAGCCGGCTGGTACACAAGCACAAGCCACGAGGCCAGACTGCTGCGGAGACTGGATCATCCTGCCATCCTGCCTCTGCTGGATCTGCATGTGGTGTCCGGCGTGACATGTCTGGTGCTGCCTAAGTACCAGGCCGACCTGTACACCTACCTGAGCAGAAGGCTGAACCCTCTGGGCAGACCTCAGATTGCCGCTGTGTCAAGACAGCTGCTGAGCGCTGTGGACTACATCCACAGACAGGGCATCATCCACCGGGACATCAAGACCGAGAATATCTTCATCAACACGCCCGAGGACATCTGCCTGGGCGATTTTGGCGCCGCTTGCTTCGTGCAAGGCAGCAGAAGCAGCCCCTTTCCTTATGGAATCGCCGGCACCATCGACACAAACGCCCCTGAAGTTCTGGCCGGCGATCCTTACACCACCACCGTGGATATTTGGAGCGCCGGACTGGTCATCTTCGAGACAGCCGTGCATAACGCCAGCCTGTTCTCTGCCCCTAGAGGCCCTAAAAGAGGCCCCTGCGATAGCCAGATCACCCGGATCATTAGACAGGCCCAGGTGCACGTGGACGAGTTCTCTCCACATCCTGAGAGCCGGCTGACCAGCCGGTACAGATCTAGAGCCGCCGGAAACAACCGGCCTCCATACACAAGACCTGCCTGGACACGGTACTACAAGATGGACATCGACGTGGAATACCTCGTGTGCAAGGCCCTGACCTTCGATGGCGCCCTTAGACCTTCTGCCGCCGAACTGCTTTGCCTGCCACTGTTCCAGCAGAAG [서열번호 301]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 301에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 301의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 302로 제공된다:
AUGGCCUGCCGGAAGUUCUGUAGAGUGUACGGCGGACAGGGGCGCAGAAAAGAGGAAGCCGUUCCUCCUGAGACAAAGCCCAGCAGAGUGUUCCCUCACGGCCCCUUUUACACCCCUGCCGAAGAUGCCUGUCUGGACAGCCCUCCUCCAGAAACACCUAAGCCUAGCCACACCACACCUCCAAGCGAGGCCGAAAGACUGUGCCAUCUGCAAGAGAUUCUGGCCCAGAUGUACGGCAACCAGGACUACCCCAUCGAGGACGAUCCAUCUGCCGAUGCCGCCGACGAUGUGGAUGAAGAUGCCCCUGAUGACGUGGCCUAUCCUGAGGAAUACGCCGAGGAACUGUUCCUGCCUGGCGACGCUACAGGACCUCUGAUCGGAGCCAACGAUCACAUCCCUCCACCUUGUGGCGCUAGCCCUCCUGGCAUCAGAAGAAGAAGCAGGGACGAGAUCGGCGCCACCGGCUUUACAGCCGAAGAACUGGACGCCAUGGACAGAGAAGCCGCCAGAGCCAUUUCUAGAGGCGGCAAGCCUCCUAGCACCAUGGCCAAACUGGUUACCGGCAUGGGCUUCACCAUUCACGGCGCUCUGACACCUGGCUCUGAGGGCUGUGUGUUCGACAGCUCUCACCCCGACUAUCCCCAGCGCGUGAUCGUGAAAGCCGGCUGGUACACAAGCACAAGCCACGAGGCCAGACUGCUGCGGAGACUGGAUCAUCCUGCCAUCCUGCCUCUGCUGGAUCUGCAUGUGGUGUCCGGCGUGACAUGUCUGGUGCUGCCUAAGUACCAGGCCGACCUGUACACCUACCUGAGCAGAAGGCUGAACCCUCUGGGCAGACCUCAGAUUGCCGCUGUGUCAAGACAGCUGCUGAGCGCUGUGGACUACAUCCACAGACAGGGCAUCAUCCACCGGGACAUCAAGACCGAGAAUAUCUUCAUCAACACGCCCGAGGACAUCUGCCUGGGCGAUUUUGGCGCCGCUUGCUUCGUGCAAGGCAGCAGAAGCAGCCCCUUUCCUUAUGGAAUCGCCGGCACCAUCGACACAAACGCCCCUGAAGUUCUGGCCGGCGAUCCUUACACCACCACCGUGGAUAUUUGGAGCGCCGGACUGGUCAUCUUCGAGACAGCCGUGCAUAACGCCAGCCUGUUCUCUGCCCCUAGAGGCCCUAAAAGAGGCCCCUGCGAUAGCCAGAUCACCCGGAUCAUUAGACAGGCCCAGGUGCACGUGGACGAGUUCUCUCCACAUCCUGAGAGCCGGCUGACCAGCCGGUACAGAUCUAGAGCCGCCGGAAACAACCGGCCUCCAUACACAAGACCUGCCUGGACACGGUACUACAAGAUGGACAUCGACGUGGAAUACCUCGUGUGCAAGGCCCUGACCUUCGAUGGCGCCCUUAGACCUUCUGCCGCCGAACUGCUUUGCCUGCCACUGUUCCAGCAGAAG [서열번호 302]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 302에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HSV2 US1(A0A290Y3Z3; A0A290Y3Z3_HHV2 US1 인간 헤르페스바이러스 2), 또는 그의 동원체이다. HSV2 US1의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 303으로 나타낸다:
MADIPPDPPALNTTPVNHAPPSPPPGSRKRRRPVLPSSSESEGKPDTESESSSTESSEDEAGDLRGGRRRSPRELGGRYFLDLSAESTTGTESEGTGPSDDDDDDASDGWLVDTPPRKSKRPRINLRLTSSPDRRAGVVFPEVWRNDRPIRAAQPQAPAQSSGDRAAAPRRSARQAQMRSGAAWTLDLHYIRQCVNQLFRILRAAPNPPGSANRLRHLVRDCYLMGYCRTRLGPRTWGRLLQISGGTWDVRLRNAIREVEARFEPAAEPVCELPCLNARRYGPECDVGNLETNGGSTSDDEISDATDSDDTLASHSDTEGGPSPAGRENPESASGGAIAARLECEFGTFDWTSEEGSQPWLSAVVADTSSAERSGLPAPGACRATEAPEREDGCRKMRFPAACPYPCGHTFLRP [서열번호 303]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 303에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HSV2 US1 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 304의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCAGACATCCCCCCGGACCCGCCCGCGCTCAACACGACGCCTGTGAATCATGCTCCCCCATCCCCGCCCCCGGGTTCACGGAAGCGCAGACGCCCCGTCCTCCCCAGCTCGTCGGAATCTGAGGGTAAGCCCGACACAGAATCGGAATCCTCCTCGACCGAGTCGTCCGAGGATGAGGCGGGAGACCTACGCGGCGGGCGCCGTCGCTCCCCGCGGGAGCTCGGGGGGAGGTATTTTTTGGATCTGTCGGCAGAATCGACCACGGGGACGGAATCGGAGGGAACGGGGCCGTCGGACGACGATGATGATGATGCGTCAGACGGCTGGTTGGTTGACACCCCCCCCCGTAAATCCAAGCGACCCCGAATCAACCTGCGATTAACGAGCTCCCCCGACCGGCGCGCGGGTGTGGTTTTCCCCGAGGTGTGGAGAAACGACAGACCTATCCGCGCGGCGCAACCCCAGGCCCCGGCCCAGTCTTCCGGGGATCGCGCAGCCGCACCGCGGCGCTCTGCTCGCCAGGCCCAGATGCGGAGCGGAGCCGCCTGGACGCTTGATCTGCATTACATACGCCAGTGCGTCAACCAGCTCTTTCGGATCCTGCGTGCCGCCCCGAACCCGCCCGGCAGCGCCAACCGCCTGCGCCACCTGGTGCGAGACTGCTACCTCATGGGCTACTGCCGGACCCGCCTGGGGCCGCGCACGTGGGGCCGCCTGCTGCAGATCTCGGGCGGAACCTGGGACGTGCGCCTGCGAAACGCAATCCGGGAGGTCGAGGCGCGTTTTGAACCCGCCGCCGAGCCCGTGTGCGAGCTGCCCTGTCTGAACGCCAGGCGTTACGGCCCCGAGTGTGATGTTGGCAATCTCGAGACCAACGGCGGCTCGACGAGCGATGATGAGATATCGGATGCGACGGACTCGGACGATACCCTCGCGTCCCATTCCGACACGGAGGGGGGGCCCTCCCCGGCCGGCCGGGAGAACCCGGAATCCGCGTCCGGCGGGGCTATCGCGGCTCGGCTGGAGTGTGAGTTTGGGACGTTTGACTGGACGTCCGAGGAGGGCTCCCAGCCCTGGCTGTCCGCGGTGGTCGCCGATACCAGCTCCGCCGAACGCTCTGGCCTACCCGCCCCGGGCGCGTGTCGCGCAACGGAAGCCCCAGAACGCGAGGACGGGTGCCGAAAAATGCGCTTCCCCGCCGCCTGCCCCTATCCCTGCGGCCACACATTTCTCCGGCCA [서열번호 304]
따라서, 바람직하게는 상기 HSV2 US1 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 304에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 HSV2 US1 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 305로 제공된다:
ATGGCCGACATTCCTCCTGATCCTCCAGCTCTGAACACCACACCTGTGAATCACGCCCCTCCATCTCCACCACCTGGCAGCAGAAAGAGAAGAAGGCCTGTCCTGCCTAGCAGCAGCGAGTCTGAGGGCAAGCCTGATACAGAGAGCGAGAGCAGCAGCACAGAGAGCAGCGAGGACGAAGCTGGCGATCTTAGAGGCGGCAGAAGAAGAAGCCCCAGAGAACTCGGCGGCAGATACTTCCTGGATCTGAGCGCCGAGAGCACCACCGGCACTGAATCTGAAGGCACAGGCCCCAGCGACGACGATGACGATGATGCCTCTGATGGCTGGCTGGTGGACACCCCTCCTAGAAAGTCCAAGCGGCCCAGAATCAACCTGCGGCTGACAAGCTCTCCTGATCGCAGAGCTGGCGTGGTGTTCCCCGAAGTGTGGCGGAACGACAGACCTATCAGAGCCGCTCAGCCTCAGGCTCCTGCTCAGTCTAGCGGAGATAGAGCTGCCGCTCCTAGAAGATCTGCCAGACAGGCCCAGATGAGAAGCGGAGCTGCTTGGACACTGGACCTGCACTACATCCGGCAGTGCGTGAACCAGCTGTTCCGGATCCTTCGGGCTGCCCCTAATCCACCTGGCTCCGCCAATAGACTGAGACACCTTGTGCGGGACTGCTACCTGATGGGCTACTGCAGAACAAGACTGGGCCCCAGAACATGGGGCAGACTGCTGCAAATCTCTGGCGGCACATGGGACGTGCGGCTGAGAAACGCCATTAGAGAGGTGGAAGCCAGATTCGAGCCAGCCGCTGAGCCTGTGTGTGAACTGCCTTGTCTGAACGCTCGGAGATACGGCCCCGAGTGTGATGTGGGCAACCTGGAAACAAATGGCGGCAGCACCTCCGACGACGAGATCTCTGATGCCACCGACAGCGACGATACACTGGCCAGCCACAGCGATACAGAAGGCGGACCATCTCCTGCCGGAAGAGAGAATCCTGAGTCTGCCTCTGGCGGAGCTATCGCCGCAAGACTGGAATGCGAGTTCGGCACCTTCGACTGGACAAGCGAGGAAGGCTCTCAGCCTTGGCTGTCTGCTGTGGTGGCCGATACCTCTAGCGCCGAAAGATCTGGACTTCCTGCTCCTGGCGCCTGCAGAGCTACAGAAGCTCCTGAAAGAGAGGACGGCTGCAGAAAGATGCGGTTCCCTGCCGCCTGTCCTTATCCTTGCGGCCACACATTTCTGCGGCCT [서열번호 305]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 305에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 305의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 306으로 제공된다:
AUGGCCGACAUUCCUCCUGAUCCUCCAGCUCUGAACACCACACCUGUGAAUCACGCCCCUCCAUCUCCACCACCUGGCAGCAGAAAGAGAAGAAGGCCUGUCCUGCCUAGCAGCAGCGAGUCUGAGGGCAAGCCUGAUACAGAGAGCGAGAGCAGCAGCACAGAGAGCAGCGAGGACGAAGCUGGCGAUCUUAGAGGCGGCAGAAGAAGAAGCCCCAGAGAACUCGGCGGCAGAUACUUCCUGGAUCUGAGCGCCGAGAGCACCACCGGCACUGAAUCUGAAGGCACAGGCCCCAGCGACGACGAUGACGAUGAUGCCUCUGAUGGCUGGCUGGUGGACACCCCUCCUAGAAAGUCCAAGCGGCCCAGAAUCAACCUGCGGCUGACAAGCUCUCCUGAUCGCAGAGCUGGCGUGGUGUUCCCCGAAGUGUGGCGGAACGACAGACCUAUCAGAGCCGCUCAGCCUCAGGCUCCUGCUCAGUCUAGCGGAGAUAGAGCUGCCGCUCCUAGAAGAUCUGCCAGACAGGCCCAGAUGAGAAGCGGAGCUGCUUGGACACUGGACCUGCACUACAUCCGGCAGUGCGUGAACCAGCUGUUCCGGAUCCUUCGGGCUGCCCCUAAUCCACCUGGCUCCGCCAAUAGACUGAGACACCUUGUGCGGGACUGCUACCUGAUGGGCUACUGCAGAACAAGACUGGGCCCCAGAACAUGGGGCAGACUGCUGCAAAUCUCUGGCGGCACAUGGGACGUGCGGCUGAGAAACGCCAUUAGAGAGGUGGAAGCCAGAUUCGAGCCAGCCGCUGAGCCUGUGUGUGAACUGCCUUGUCUGAACGCUCGGAGAUACGGCCCCGAGUGUGAUGUGGGCAACCUGGAAACAAAUGGCGGCAGCACCUCCGACGACGAGAUCUCUGAUGCCACCGACAGCGACGAUACACUGGCCAGCCACAGCGAUACAGAAGGCGGACCAUCUCCUGCCGGAAGAGAGAAUCCUGAGUCUGCCUCUGGCGGAGCUAUCGCCGCAAGACUGGAAUGCGAGUUCGGCACCUUCGACUGGACAAGCGAGGAAGGCUCUCAGCCUUGGCUGUCUGCUGUGGUGGCCGAUACCUCUAGCGCCGAAAGAUCUGGACUUCCUGCUCCUGGCGCCUGCAGAGCUACAGAAGCUCCUGAAAGAGAGGACGGCUGCAGAAAGAUGCGGUUCCCUGCCGCCUGUCCUUAUCCUUGCGGCCACACAUUUCUGCGGCCU [서열번호 306]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 306에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 CSFV NPro(P19712; 게놈 폴리단백질 고전적 돼지 열병 바이러스(알포트(Alfort) 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. CSFV NPro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 307로 나타낸다:
MELNHFELLYKTSKQKPVGVEEPVYDTAGRPLFGNPSEVHPQSTLKLPHDRGRGDIRTTLRDLPRKGDCRSGNHLGPVSGIYIKPGPVYYQDYTGPVYHRAPLEFFDEAQFCEVTKRIGRVTGSDGKLYHIYVCVDGCILLKLAKRGTPRTLKWIRNFTNCPLWVTSC [서열번호 307]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 307에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 CSFV NPro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 308의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGAGTTGAATCATTTTGAATTATTATACAAAACAAGCAAACAAAAACCAGTGGGAGTGGAGGAACCGGTGTATGACACCGCGGGGAGACCACTATTTGGGAACCCAAGTGAGGTACACCCACAATCAACGCTGAAGCTGCCACACGACAGGGGGAGAGGAGATATCAGAACAACACTGAGGGACCTACCCAGGAAAGGTGACTGTAGGAGTGGCAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACATAAAGCCCGGCCCTGTCTACTATCAGGACTACACGGGCCCAGTCTATCACAGAGCTCCTTTAGAGTTCTTTGATGAGGCCCAGTTCTGCGAGGTGACTAAGAGAATAGGCAGGGTCACGGGTAGTGATGGTAAGCTTTACCACATATATGTGTGCGTCGATGGTTGCATACTGCTGAAATTAGCCAAAAGGGGCACACCCAGAACCCTAAAGTGGATTAGGAACTTCACCAACTGTCCATTATGGGTAACCAGTTGC [서열번호 308]
따라서, 바람직하게는 상기 CSFV NPro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 308에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 CSFV NPro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 309로 제공된다:
ATGGAACTGAACCACTTCGAGCTGCTGTACAAGACCAGCAAGCAGAAACCCGTGGGCGTCGAGGAACCCGTGTATGATACAGCTGGCAGACCCCTGTTCGGCAACCCCTCTGAAGTGCACCCTCAGAGCACACTGAAGCTGCCCCACGATAGAGGCAGAGGCGACATCAGAACCACACTGCGGGACCTGCCTAGAAAGGGCGATTGCAGAAGCGGCAATCATCTGGGCCCTGTGTCCGGCATCTACATCAAGCCTGGACCAGTGTACTACCAGGACTACACAGGCCCCGTGTACCACAGAGCCCCTCTGGAATTCTTCGACGAGGCCCAGTTCTGCGAAGTGACCAAGAGAATCGGCAGAGTGACCGGCTCCGACGGCAAGCTGTACCACATCTACGTGTGCGTGGACGGCTGCATCCTGCTGAAGCTGGCCAAGAGAGGCACCCCTAGAACACTGAAGTGGATCCGGAACTTCACCAACTGTCCTCTGTGGGTCACCAGCTGC [서열번호 309]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 309에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 309의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 310으로 제공된다:
AUGGAACUGAACCACUUCGAGCUGCUGUACAAGACCAGCAAGCAGAAACCCGUGGGCGUCGAGGAACCCGUGUAUGAUACAGCUGGCAGACCCCUGUUCGGCAACCCCUCUGAAGUGCACCCUCAGAGCACACUGAAGCUGCCCCACGAUAGAGGCAGAGGCGACAUCAGAACCACACUGCGGGACCUGCCUAGAAAGGGCGAUUGCAGAAGCGGCAAUCAUCUGGGCCCUGUGUCCGGCAUCUACAUCAAGCCUGGACCAGUGUACUACCAGGACUACACAGGCCCCGUGUACCACAGAGCCCCUCUGGAAUUCUUCGACGAGGCCCAGUUCUGCGAAGUGACCAAGAGAAUCGGCAGAGUGACCGGCUCCGACGGCAAGCUGUACCACAUCUACGUGUGCGUGGACGGCUGCAUCCUGCUGAAGCUGGCCAAGAGAGGCACCCCUAGAACACUGAAGUGGAUCCGGAACUUCACCAACUGUCCUCUGUGGGUCACCAGCUGC [서열번호 310]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 310에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 BDV Npro(A0A290YXI0; 오토프로테아제(Autoprotease) p20 보더 질환(Border disease) 바이러스), 또는 그의 동원체이다. BDV Npro의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 311로 나타낸다:
MELNKFELLYKTSKQRPVGAVEPVYDSAGNPLYGERTTVHPQATLKLPHHRGVAEVITTLKDLPRKGDCRSGNHRGPVSGIYIKPGPVIYQDYKRPVYHRAPLEQFTKVQICEATKRVGRVTGSDGKLYHLYVCMDGCILLKLASRTVNAVLKWTHNTLDCPLWVTSC [서열번호 311]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 311에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 BDV Npro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 312의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGAGTTGAATAAGTTTGAACTTTTATACAAAACAAGTAAACAAAGACCAGTAGGGGCTGTTGAACCAGTTTATGACTCAGCGGGTAACCCCCTATATGGTGAAAGAACAACAGTACACCCGCAAGCCACTCTGAAACTACCACATCACAGGGGAGTAGCCGAGGTGATAACAACCCTGAAGGATTTGCCCAGGAAAGGAGACTGCAGGAGTGGAAACCATCGAGGCCCAGTGAGTGGTATATACATCAAGCCAGGTCCAGTCATATACCAGGATTACAAGAGACCGGTGTACCACAGGGCTCCTCTGGAGCAGTTCACGAAGGTACAAATCTGTGAGGCTACGAAAAGGGTGGGGAGAGTCACTGGCAGCGATGGCAAATTGTACCACCTATACGTTTGCATGGATGGTTGCATATTGCTGAAACTGGCAAGCAGGACCGTGAATGCAGTGCTAAAATGGACACATAACACTCTGGACTGTCCACTTTGGGTTACAAGCTGC [서열번호 312]
따라서, 바람직하게는 상기 BDV Npro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 312에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 BDV Npro 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 313으로 제공된다:
ATGGAACTGAACAAGTTCGAGCTGCTGTACAAGACCAGCAAGCAGAGGCCTGTGGGAGCCGTGGAACCTGTGTATGATAGCGCCGGCAATCCCCTGTACGGCGAGAGAACAACAGTGCACCCTCAGGCCACACTGAAGCTGCCTCATCATAGAGGCGTGGCCGAAGTGATCACAACCCTGAAGGACCTGCCTCGGAAGGGCGATTGCAGAAGCGGCAATCACAGAGGCCCTGTGTCCGGCATCTACATCAAGCCCGGACCTGTGATCTACCAGGACTACAAGCGGCCCGTGTACCACAGAGCACCCCTGGAACAGTTCACCAAGGTGCAGATTTGCGAGGCCACCAAGCGCGTGGGAAGAGTGACAGGCTCTGACGGCAAGCTGTACCACCTGTACGTGTGCATGGACGGCTGCATCCTGCTGAAACTGGCCAGCAGAACCGTGAACGCCGTGCTGAAGTGGACCCACAACACCCTGGATTGCCCTCTGTGGGTCACCAGCTGT [서열번호 313]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 313에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 313의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 314로 제공된다:
AUGGAACUGAACAAGUUCGAGCUGCUGUACAAGACCAGCAAGCAGAGGCCUGUGGGAGCCGUGGAACCUGUGUAUGAUAGCGCCGGCAAUCCCCUGUACGGCGAGAGAACAACAGUGCACCCUCAGGCCACACUGAAGCUGCCUCAUCAUAGAGGCGUGGCCGAAGUGAUCACAACCCUGAAGGACCUGCCUCGGAAGGGCGAUUGCAGAAGCGGCAAUCACAGAGGCCCUGUGUCCGGCAUCUACAUCAAGCCCGGACCUGUGAUCUACCAGGACUACAAGCGGCCCGUGUACCACAGAGCACCCCUGGAACAGUUCACCAAGGUGCAGAUUUGCGAGGCCACCAAGCGCGUGGGAAGAGUGACAGGCUCUGACGGCAAGCUGUACCACCUGUACGUGUGCAUGGACGGCUGCAUCCUGCUGAAACUGGCCAGCAGAACCGUGAACGCCGUGCUGAAGUGGACCCACAACACCCUGGAUUGCCCUCUGUGGGUCACCAGCUGU [서열번호 314]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 314에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 소 RV NS1(Q8JZ13; 비-구조 단백질 1 소 로타바이러스 A), 또는 그의 동원체이다. 소 RV NS1의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 315로 나타낸다:
MATFKDACYHYKKLNKLNSLVLKLGANDEWRPAPVTKYKGWCLDCCQYTNLTYCRGCALYHVCQWCSQYNRCFLDEEPHLLRMRTFKDVVTKEDIEGLLTMYETLFPINEKLVNKFINSVKQRKCRNEYLLEWYNHLLMPITLQALTINLEDNVYYMFGYYDCMEHENQTPFQFVNLLEKYDKLLLDDRNFHRMSHLPVILQQEYALRYFSKSRFLSKGKKRLSRSDFSDNLMEDRHSPTSLMQVVRNCISIHIDDCEWNKACTLIVDARNYISIMNSSYTEHYSVSQRCKLFTKYKFGIVSKLVKPNYIFSSHESCALNVHNCKWCQINNHYKVWEDFRLRKIYNNVMDFIRALVKSNVNVGHCSSQESVYKYVPDLFLICKTEKWSEAVEMLFNYLEPVNVNGTEYVLLDYEVNWEVRGLVMQNMDGKVPRILNMNDTKKILSAMIFDWFDTRYMRETPMTTSTTNQLRTLNKRNELIDEYDLELSDVE [서열번호 315]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 315에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하느 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 소 RV NS1 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 316의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCGACTTTTAAGGACGCTTGTTATCATTATAAAAAGTTGAATAAATTAAATAGTTTAGTGCTCAAACTAGGAGCAAATGATGAATGGAGGCCAGCACCAGTGACAAAATATAAAGGATGGTGTTTAGATTGTTGTCAATATACAAATTTGACATATTGCAGAGGGTGCGCTCTATACCATGTATGTCAGTGGTGCAGTCAGTATAACAGGTGTTTCTTAGATGAAGAACCCCATTTGCTGAGAATGCGAACATTTAAAGATGTAGTAACAAAAGAAGATATAGAAGGACTGCTAACCATGTATGAAACGTTGTTTCCAATAAATGAAAAGTTAGTGAATAAATTCATAAACTCTGTGAAGCAGCGTAAGTGTAGGAATGAGTATTTGTTAGAATGGTATAACCACTTACTAATGCCAATAACATTGCAAGCATTGACTATAAATCTTGAGGATAATGTATATTATATGTTTGGATACTATGATTGCATGGAGCATGAAAACCAAACACCATTCCAATTTGTTAACCTACTAGAAAAATATGATAAATTGCTACTAGATGATAGAAATTTCCATAGAATGTCACACTTACCAGTAATATTGCAACAAGAGTATGCGTTGAGATATTTTTCAAAATCAAGATTTTTAAGTAAAGGGAAGAAAAGATTGAGTAGGAGTGATTTCTCAGATAATCTTATGGAAGATAGACATAGTCCAACATCATTAATGCAAGTGGTACGTAACTGCATCAGTATACACATAGATGATTGTGAATGGAATAAAGCGTGTACGCTTATAGTTGATGCTAGAAATTATATTAGTATTATGAATTCATCGTATACTGAGCATTACAGTGTGTCACAAAGATGTAAACTGTTCACTAAGTATAAATTTGGGATTGTATCAAAATTGGTGAAACCGAATTACATTTTTTCTAGCCATGAATCATGCGCATTAAACGTACACAATTGTAAATGGTGTCAGATCAATAACCATTACAAAGTGTGGGAAGATTTTAGACTTAGGAAAATATACAATAATGTAATGGATTTTATCAGGGCACTTGTGAAATCGAATGTAAACGTTGGACATTGTTCATCACAGGAATCAGTGTATAAGTATGTACCGGATTTATTTTTAATTTGTAAAACGGAAAAATGGAGCGAAGCTGTCGAAATGTTATTTAATTATCTAGAACCAGTGAACGTAAATGGAACGGAGTATGTATTATTAGACTATGAAGTGAACTGGGAAGTGAGGGGACTAGTCATGCAAAACATGGACGGGAAAGTACCAAGAATTTTGAATATGAATGATACAAAGAAGATACTGAGTGCAATGATATTTGACTGGTTTGACACAAGATATATGAGAGAAACACCAATGACGACGTCAACAACAAACCAACTTCGAACACTGAACAAAAGGAATGAGCTCATAGATGAGTACGATTTAGAACTTTCAGATGTTGAA [서열번호 316]
따라서, 바람직하게는 상기 소 RV NS1 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 316에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 소 RV NS1 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 317로 제공된다:
ATGGCCACCTTCAAGGACGCCTGCTACCACTACAAGAAGCTGAACAAGCTGAATAGCCTGGTGCTGAAGCTGGGCGCCAATGATGAATGGCGACCTGCTCCTGTGACCAAGTACAAAGGCTGGTGCCTGGACTGCTGCCAGTACACCAATCTGACCTACTGCAGAGGCTGCGCCCTGTACCACGTCTGTCAGTGGTGCAGCCAGTACAACCGGTGCTTCCTGGACGAGGAACCCCATCTGCTGCGGATGCGGACCTTTAAGGACGTGGTCACCAAAGAGGACATCGAGGGCCTGCTGACTATGTACGAGACACTGTTCCCCATCAACGAGAAGCTGGTCAACAAGTTCATCAACAGCGTGAAGCAGCGGAAGTGCCGGAACGAGTACCTGCTGGAATGGTACAATCATCTGCTGATGCCCATCACACTGCAGGCCCTGACCATCAACCTGGAAGATAACGTGTACTACATGTTCGGCTACTACGACTGCATGGAACACGAGAATCAGACCCCTTTCCAGTTCGTGAACCTGCTCGAGAAGTACGACAAGCTGCTGCTGGACGACCGGAACTTCCACCGGATGTCTCATCTGCCCGTGATCCTGCAGCAAGAGTACGCCCTGCGGTACTTCAGCAAGAGCCGGTTTCTGAGCAAGGGCAAGAAGCGGCTGAGCAGAAGCGACTTCAGCGACAACCTGATGGAAGATCGGCACAGCCCCACCAGCCTGATGCAGGTCGTCAGAAACTGCATCAGCATCCACATCGACGACTGTGAATGGAACAAGGCCTGCACACTGATCGTGGACGCCCGCAACTACATCTCCATCATGAACAGCAGCTACACCGAGCACTACAGCGTGTCCCAGCGGTGCAAGCTGTTCACAAAGTACAAGTTCGGCATCGTGTCCAAGCTCGTGAAGCCCAATTACATCTTCAGCAGCCACGAGAGCTGTGCCCTGAACGTGCACAACTGCAAGTGGTGCCAGATCAACAATCACTACAAAGTGTGGGAAGATTTCCGGCTGCGGAAGATCTACAACAACGTGATGGACTTCATCCGCGCTCTGGTCAAGAGCAACGTGAACGTGGGCCACTGCAGCAGCCAAGAGTCCGTGTACAAATACGTGCCCGACCTGTTCCTGATCTGCAAGACCGAGAAGTGGAGCGAGGCCGTGGAAATGCTGTTCAACTACCTGGAACCTGTGAACGTCAACGGCACCGAGTACGTCCTGCTGGACTACGAAGTGAACTGGGAAGTGCGGGGCCTCGTGATGCAGAACATGGATGGCAAGGTGCCCCGGATCCTGAACATGAACGACACCAAGAAAATCCTGAGCGCCATGATCTTCGATTGGTTCGACACCCGGTACATGCGCGAGACACCTATGACCACCAGCACCACCAACCAGCTGCGGACCCTGAACAAGAGAAACGAGCTGATCGACGAGTACGACCTGGAACTGAGCGACGTGGAA [서열번호 317]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 317에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 317의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 318로 제공된다:
AUGGCCACCUUCAAGGACGCCUGCUACCACUACAAGAAGCUGAACAAGCUGAAUAGCCUGGUGCUGAAGCUGGGCGCCAAUGAUGAAUGGCGACCUGCUCCUGUGACCAAGUACAAAGGCUGGUGCCUGGACUGCUGCCAGUACACCAAUCUGACCUACUGCAGAGGCUGCGCCCUGUACCACGUCUGUCAGUGGUGCAGCCAGUACAACCGGUGCUUCCUGGACGAGGAACCCCAUCUGCUGCGGAUGCGGACCUUUAAGGACGUGGUCACCAAAGAGGACAUCGAGGGCCUGCUGACUAUGUACGAGACACUGUUCCCCAUCAACGAGAAGCUGGUCAACAAGUUCAUCAACAGCGUGAAGCAGCGGAAGUGCCGGAACGAGUACCUGCUGGAAUGGUACAAUCAUCUGCUGAUGCCCAUCACACUGCAGGCCCUGACCAUCAACCUGGAAGAUAACGUGUACUACAUGUUCGGCUACUACGACUGCAUGGAACACGAGAAUCAGACCCCUUUCCAGUUCGUGAACCUGCUCGAGAAGUACGACAAGCUGCUGCUGGACGACCGGAACUUCCACCGGAUGUCUCAUCUGCCCGUGAUCCUGCAGCAAGAGUACGCCCUGCGGUACUUCAGCAAGAGCCGGUUUCUGAGCAAGGGCAAGAAGCGGCUGAGCAGAAGCGACUUCAGCGACAACCUGAUGGAAGAUCGGCACAGCCCCACCAGCCUGAUGCAGGUCGUCAGAAACUGCAUCAGCAUCCACAUCGACGACUGUGAAUGGAACAAGGCCUGCACACUGAUCGUGGACGCCCGCAACUACAUCUCCAUCAUGAACAGCAGCUACACCGAGCACUACAGCGUGUCCCAGCGGUGCAAGCUGUUCACAAAGUACAAGUUCGGCAUCGUGUCCAAGCUCGUGAAGCCCAAUUACAUCUUCAGCAGCCACGAGAGCUGUGCCCUGAACGUGCACAACUGCAAGUGGUGCCAGAUCAACAAUCACUACAAAGUGUGGGAAGAUUUCCGGCUGCGGAAGAUCUACAACAACGUGAUGGACUUCAUCCGCGCUCUGGUCAAGAGCAACGUGAACGUGGGCCACUGCAGCAGCCAAGAGUCCGUGUACAAAUACGUGCCCGACCUGUUCCUGAUCUGCAAGACCGAGAAGUGGAGCGAGGCCGUGGAAAUGCUGUUCAACUACCUGGAACCUGUGAACGUCAACGGCACCGAGUACGUCCUGCUGGACUACGAAGUGAACUGGGAAGUGCGGGGCCUCGUGAUGCAGAACAUGGAUGGCAAGGUGCCCCGGAUCCUGAACAUGAACGACACCAAGAAAAUCCUGAGCGCCAUGAUCUUCGAUUGGUUCGACACCCGGUACAUGCGCGAGACACCUAUGACCACCAGCACCACCAACCAGCUGCGGACCCUGAACAAGAGAAACGAGCUGAUCGACGAGUACGACCUGGAACUGAGCGACGUGGAA [서열번호 318]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 318에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 소 RV NS2(Q86505; 비-구조 단백질 2 소 로타바이러스 A), 또는 그의 동원체이다. 소 RV NS2의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 319로 나타낸다:
MAELACFCYPHLESDTYRFIPFNSLAIKCMLTAKVDKKDQDKFYNSIIYGIAPPPQFKKRYNTNDNSRGMNYETPMFNKVAVLICEALNSIKVTQSDVASVLSKVISVRHLENLVLRRENHQDVLFHSKELLLRSVLIAIGHSKEIETTATAEGGEVVFQNAAFTMWKLTYLEHRLMPILDQNFIEYKITVNEDKPISESHVRELIAELRWQYNKFAVITHGKGHYRVVKYSSVANHADRVYATFKSNNKNGNVIEFNLLDQRIIWQNWYAFTSSMKQGNTLEICKKLLFQKMKRESNPFKGLSTDRKMDEVSQIGI [서열번호 319]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 319에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 소 RV NS2 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 320의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCTGAGCTAGCTTGCTTTTGTTATCCCCATTTGGAGAGCGATACGTATAGATTCATTCCATTTAACAGTTTAGCTATAAAATGTATGTTGACAGCAAAAGTGGACAAAAAAGATCAGGATAAGTTTTACAATTCAATAATTTATGGCATTGCACCACCGCCACAGTTCAAAAAACGTTATAACACAAATGATAATTCGAGAGGAATGAATTATGAAACTCCAATGTTTAATAAAGTGGCGGTATTAATTTGTGAAGCGTTGAATTCAATTAAAGTTACTCAATCTGATGTTGCGAGTGTACTTTCAAAAGTAATTTCTGTAAGACATTTAGAGAATTTGGTACTGAGAAGAGAGAACCATCAGGACGTGCTTTTCCATTCAAAAGAGTTGTTGCTGAGATCAGTACTAATAGCTATTGGTCACTCAAAAGAAATTGAAACAACTGCCACTGCTGAAGGAGGGGAAGTAGTTTTTCAAAATGCAGCTTTTACAATGTGGAAACTGACATACCTGGAGCATAGACTAATGCCAATTTTGGATCAAAATTTTATCGAATATAAAATAACAGTGAATGAAGATAAACCAATTTCAGAATCACATGTAAGAGAACTCATTGCTGAATTGCGGTGGCAATACAACAAATTTGCAGTAATTACACATGGTAAAGGTCACTACAGAGTTGTAAAATATTCATCAGTTGCGAATCATGCAGATAGAGTTTACGCTACTTTCAAGAGCAATAATAAGAATGGGAATGTGATAGAGTTTAATCTACTTGATCAAAGAATAATATGGCAGAACTGGTATGCGTTTACATCCTCAATGAAACAAGGCAACACTCTTGAAATATGCAAGAAACTACTGTTCCAAAAGATGAAGCGAGAAAGTAATCCGTTTAAGGGACTGTCAACTGATAGAAAGATGGATGAGGTCTCTCAAATAGGAATT [서열번호 320]
따라서, 바람직하게는 상기 소 RV NS2 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 320에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 소 RV NS2 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 321로 제공된다:
ATGGCCGAGCTGGCCTGCTTTTGTTACCCTCACCTGGAAAGCGATACCTACCGGTTCATCCCCTTCAACAGCCTGGCCATCAAGTGCATGCTGACCGCCAAGGTGGACAAGAAGGACCAGGACAAGTTCTACAACAGCATCATCTACGGAATCGCCCCTCCACCTCAGTTCAAGAAGCGGTACAACACCAACGACAACAGCCGGGGCATGAACTACGAGACACCCATGTTCAACAAGGTGGCCGTGCTGATCTGCGAGGCCCTGAACTCCATCAAAGTGACCCAGTCCGATGTGGCCAGCGTGCTGAGCAAAGTGATCTCTGTGCGGCACCTCGAGAACCTGGTGCTGCGGAGAGAAAACCACCAGGACGTGCTGTTCCACAGCAAAGAGCTGCTGCTGAGATCTGTGCTGATCGCCATCGGCCACTCCAAAGAGATCGAGACAACCGCCACAGCCGAAGGCGGAGAGGTGGTGTTTCAGAATGCCGCCTTCACCATGTGGAAGCTGACCTACCTGGAACACCGGCTGATGCCCATCCTGGACCAGAACTTCATCGAGTACAAGATCACCGTGAACGAGGACAAGCCCATCAGCGAGTCTCACGTGCGGGAACTGATTGCCGAGCTGCGGTGGCAGTACAACAAGTTCGCCGTGATCACACACGGCAAGGGCCACTACAGAGTGGTCAAGTACAGCAGCGTGGCCAACCACGCCGATAGAGTGTACGCCACCTTCAAGAGCAACAACAAGAACGGCAACGTGATCGAGTTCAACCTGCTGGACCAGCGGATCATCTGGCAGAATTGGTACGCCTTTACCAGCAGCATGAAGCAGGGCAACACCCTGGAAATCTGCAAGAAGCTCCTGTTCCAGAAGATGAAGAGAGAGAGCAACCCCTTCAAGGGCCTGAGCACCGACCGGAAGATGGATGAGGTGTCCCAGATCGGCATC [서열번호 321]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 321에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 321의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 322로 제공된다:
AUGGCCGAGCUGGCCUGCUUUUGUUACCCUCACCUGGAAAGCGAUACCUACCGGUUCAUCCCCUUCAACAGCCUGGCCAUCAAGUGCAUGCUGACCGCCAAGGUGGACAAGAAGGACCAGGACAAGUUCUACAACAGCAUCAUCUACGGAAUCGCCCCUCCACCUCAGUUCAAGAAGCGGUACAACACCAACGACAACAGCCGGGGCAUGAACUACGAGACACCCAUGUUCAACAAGGUGGCCGUGCUGAUCUGCGAGGCCCUGAACUCCAUCAAAGUGACCCAGUCCGAUGUGGCCAGCGUGCUGAGCAAAGUGAUCUCUGUGCGGCACCUCGAGAACCUGGUGCUGCGGAGAGAAAACCACCAGGACGUGCUGUUCCACAGCAAAGAGCUGCUGCUGAGAUCUGUGCUGAUCGCCAUCGGCCACUCCAAAGAGAUCGAGACAACCGCCACAGCCGAAGGCGGAGAGGUGGUGUUUCAGAAUGCCGCCUUCACCAUGUGGAAGCUGACCUACCUGGAACACCGGCUGAUGCCCAUCCUGGACCAGAACUUCAUCGAGUACAAGAUCACCGUGAACGAGGACAAGCCCAUCAGCGAGUCUCACGUGCGGGAACUGAUUGCCGAGCUGCGGUGGCAGUACAACAAGUUCGCCGUGAUCACACACGGCAAGGGCCACUACAGAGUGGUCAAGUACAGCAGCGUGGCCAACCACGCCGAUAGAGUGUACGCCACCUUCAAGAGCAACAACAAGAACGGCAACGUGAUCGAGUUCAACCUGCUGGACCAGCGGAUCAUCUGGCAGAAUUGGUACGCCUUUACCAGCAGCAUGAAGCAGGGCAACACCCUGGAAAUCUGCAAGAAGCUCCUGUUCCAGAAGAUGAAGAGAGAGAGCAACCCCUUCAAGGGCCUGAGCACCGACCGGAAGAUGGAUGAGGUGUCCCAGAUCGGCAUC [서열번호 322]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 322에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 PBoV NP1(D7RF52; 비-구조 단백질 NP-1 돼지 보카바이러스(bocavirus) 1), 또는 그의 동원체이다. PBoV NP1의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 323으로 나타낸다:
MSSARSDTDTGRRGKRSRSRSRSRDRDQAPGLPPKKRDYRRRSGERGSESSPDRSTRGSPSCSTASRTSRVTSATWRRPNDSRDGGKIWGNKNKKNKTNPYEVFSQHMARFKPDKSYCGFYWHSCRMARKGTDYIFTEGMRDFQKRCKDNKCEWKDVREIMFGLKKVLDQGYRNMMYHFRHTQCEKCNYWDEVYKMHLANVSPSETEPQELTDEEILAAAMEVDGTHE [서열번호 323]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 323에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 PBoV NP1 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 324의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGAGCTCAGCGAGATCCGACACAGACACAGGCAGGAGAGGGAAGCGGTCGAGGAGCCGGTCGAGGAGCCGCGACCGGGACCAAGCACCGGGGCTGCCTCCGAAAAAAAGGGACTATCGCCGTCGGAGTGGGGAGAGAGGCTCGGAGTCCTCACCAGATCGCTCGACGAGGGGGAGCCCATCGTGCTCCACTGCTTCGAGAACATCCCGAGTGACTTCAGCGACATGGAGGAGACCGAATGACTCTCGGGACGGGGGGAAAATATGGGGAAATAAAAATAAAAAGAATAAAACAAACCCTTACGAGGTATTCAGCCAGCACATGGCCAGGTTCAAGCCAGATAAAAGCTATTGTGGCTTCTACTGGCACAGCTGCCGGATGGCTCGTAAGGGCACAGATTATATCTTTACCGAGGGAATGAGGGATTTCCAAAAACGCTGTAAAGACAATAAATGTGAGTGGAAAGATGTCAGGGAGATCATGTTCGGCCTCAAAAAGGTCTTAGATCAGGGATATAGAAATATGATGTATCACTTTAGACATACCCAGTGTGAGAAATGTAACTACTGGGATGAAGTGTATAAAATGCACCTGGCTAACGTGTCTCCTTCTGAAACAGAACCGCAGGAACTGACAGACGAGGAGATATTAGCCGCGGCCATGGAGGTCGATGGCACCCACGAA [서열번호 324]
따라서, 바람직하게는 상기 PBoV NP1 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 324에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 PBoV NP1 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 325로 제공된다:
ATGAGCAGCGCCAGAAGCGATACCGACACAGGCAGACGGGGCAAGAGAAGCAGAAGCCGGTCCAGAAGCAGAGACAGAGATCAGGCTCCTGGCCTGCCTCCTAAGAAGCGGGACTACAGAAGAAGATCCGGCGAGAGAGGCAGCGAGAGCAGCCCTGATAGAAGCACAAGAGGCAGCCCTAGCTGTAGCACCGCCAGCAGAACAAGCAGAGTGACCTCTGCCACTTGGCGGAGGCCCAACGATTCTAGAGATGGCGGCAAGATCTGGGGCAACAAGAACAAGAAGAACAAAACGAACCCCTACGAGGTGTTCAGCCAGCACATGGCCAGATTCAAGCCCGACAAGAGCTACTGCGGCTTCTACTGGCACAGCTGCCGGATGGCCAGAAAGGGCACCGACTACATCTTCACCGAGGGCATGAGAGACTTCCAGAAGCGGTGCAAGGACAACAAGTGCGAGTGGAAGGACGTGCGCGAGATCATGTTCGGCCTGAAGAAGGTGCTGGACCAGGGCTACAGAAACATGATGTACCACTTCCGGCACACCCAGTGCGAGAAGTGCAACTACTGGGACGAAGTGTACAAGATGCACCTGGCCAACGTGTCCCCATCCGAGACAGAGCCTCAAGAGCTGACCGACGAGGAAATTCTGGCCGCTGCCATGGAAGTGGATGGCACACATGAA [서열번호 325]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 325에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 325의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 326으로 제공된다:
AUGAGCAGCGCCAGAAGCGAUACCGACACAGGCAGACGGGGCAAGAGAAGCAGAAGCCGGUCCAGAAGCAGAGACAGAGAUCAGGCUCCUGGCCUGCCUCCUAAGAAGCGGGACUACAGAAGAAGAUCCGGCGAGAGAGGCAGCGAGAGCAGCCCUGAUAGAAGCACAAGAGGCAGCCCUAGCUGUAGCACCGCCAGCAGAACAAGCAGAGUGACCUCUGCCACUUGGCGGAGGCCCAACGAUUCUAGAGAUGGCGGCAAGAUCUGGGGCAACAAGAACAAGAAGAACAAAACGAACCCCUACGAGGUGUUCAGCCAGCACAUGGCCAGAUUCAAGCCCGACAAGAGCUACUGCGGCUUCUACUGGCACAGCUGCCGGAUGGCCAGAAAGGGCACCGACUACAUCUUCACCGAGGGCAUGAGAGACUUCCAGAAGCGGUGCAAGGACAACAAGUGCGAGUGGAAGGACGUGCGCGAGAUCAUGUUCGGCCUGAAGAAGGUGCUGGACCAGGGCUACAGAAACAUGAUGUACCACUUCCGGCACACCCAGUGCGAGAAGUGCAACUACUGGGACGAAGUGUACAAGAUGCACCUGGCCAACGUGUCCCCAUCCGAGACAGAGCCUCAAGAGCUGACCGACGAGGAAAUUCUGGCCGCUGCCAUGGAAGUGGAUGGCACACAUGAA [서열번호 326]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 326에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 E형 간염 Orf3(P69616; 단백질 ORF3 E형 간염 바이러스 유전자형 1), 또는 그의 동원체이다. E형 간염 Orf3의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 327로 나타낸다:
MGSRPCALGLFCCCSSCFCLCCPRHRPVSRLAAVVGGAAAVPAVVSGVTGLILSPSQSPIFIQPTPSPPMSPLRPGLDLVFANPPDHSAPLGVTRPSAPPLPHVVDLPQLGPRR [서열번호 327]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 327에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 E형 간염 Orf3 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 328의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGGTTCGCGACCATGCGCCCTCGGCCTATTTTGTTGCTGCTCCTCATGTTTTTGCCTATGCTGCCCGCGCCACCGCCCGGTCAGCCGTCTGGCCGCCGTCGTGGGCGGCGCAGCGGCGGTTCCGGCGGTGGTTTCTGGGGTGACCGGGTTGATTCTCAGCCCTTCGCAATCCCCTATATTCATCCAACCAACCCCTTCGCCCCCGATGTCACCGCTGCGGCCGGGGCTGGACCTCGTGTTCGCCAACCCGCCCGACCACTCGGCTCCGCTTGGCGTGACCAGGCCCAGCGCCCCGCCGTTGCCTCACGTCGTAGACCTACCACAGCTGGGGCCGCGCCGC [서열번호 328]
따라서, 바람직하게는 상기 E형 간염 Orf3 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 328에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 E형 간염 Orf3 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 329로 제공된다:
ATGGGCAGCAGACCTTGTGCTCTGGGCCTGTTCTGCTGCTGCAGCTCCTGCTTCTGCCTGTGCTGCCCTAGACACAGACCCGTGTCTAGACTGGCCGCTGTTGTTGGCGGAGCTGCTGCTGTTCCAGCTGTGGTGTCTGGCGTGACAGGCCTGATTCTGAGCCCTTCTCAGAGCCCCATCTTCATCCAGCCTACACCTAGTCCTCCAATGAGCCCTCTGAGGCCTGGACTGGATCTGGTGTTCGCCAATCCTCCTGATCACTCTGCCCCTCTGGGCGTGACAAGACCTTCTGCTCCTCCTCTGCCACACGTGGTGGATCTGCCTCAACTGGGCCCTAGAAGA [서열번호 329]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 329에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 329의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 330으로 제공된다:
AUGGGCAGCAGACCUUGUGCUCUGGGCCUGUUCUGCUGCUGCAGCUCCUGCUUCUGCCUGUGCUGCCCUAGACACAGACCCGUGUCUAGACUGGCCGCUGUUGUUGGCGGAGCUGCUGCUGUUCCAGCUGUGGUGUCUGGCGUGACAGGCCUGAUUCUGAGCCCUUCUCAGAGCCCCAUCUUCAUCCAGCCUACACCUAGUCCUCCAAUGAGCCCUCUGAGGCCUGGACUGGAUCUGGUGUUCGCCAAUCCUCCUGAUCACUCUGCCCCUCUGGGCGUGACAAGACCUUCUGCUCCUCCUCUGCCACACGUGGUGGAUCUGCCUCAACUGGGCCCUAGAAGA [서열번호 330]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 330에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 로타바이러스 NSP1(Q99FX5; 비-구조 단백질 1 로타바이러스 A(RVA/SA11-4F/G3P6[1]) 바이러스주), 또는 그의 동원체이다. [Barro M, Patton JT (2007) Rotavirus NSP1 inhibits expression of type 1 interferon by antagonising the function of interferon regulatory factors IRF3, IRF5 and IRF7. J Virol, 81, 9, 4473-4481]. 상기 IIP는 IRF7의 분해를 유도하는 것으로 여겨진다. 로타바이러스 NSP1의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 331로 나타낸다:
MATFKDACFHYRRLTALNRRLCNIGANSICMPVPDAKIKGWCLECCQIADLTHCYGCSLPHVCKWCVQNRRCFLDNEPHLLKLRTVKHPITKDKLQCIIDLYNIIFPINDKVIRKFERMIKQRKCRNQYKIEWYNHLLLPITLNAAAFKFDENNLYYVFGLYEKSVSDIYAPYRIVNFINEFDKLLLDDINFTRMSNLPIELRNHYAKKYFQLSRLPSSKLKQIYFSDFTKETVIFNTYTKTPGRSIYRNVTEFNWRDELELYSDLKNDKNKLIAAMMTSKYTRFYAHDNNFGRLKMTIFELGHHCQPNYVASNHPGNASDIQYCKWCNIKYFLSKIDWRIRDMYNLLMEFIKDCYKSNVNVGHCSSVENIYPLIKRLIWSLFTNHMDQTIEEVFNHMSPVSVEGTNVIMLILGLNISLYNEIKRTLNVDSIPMVLNLNEFSSIVKSISSKWYNVDELDKLPMSIKSTEELIEMKNSGTLTEEFELLISNSEDDNE [서열번호 331]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 331에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 로타바이러스 NSP1 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 332의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCTACTTTTAAAGATGCATGCTTTCATTATCGTAGATTAACTGCTTTAAATCGGAGATTATGCAACATTGGTGCAAATTCTATTTGCATGCCAGTTCCTGATGCGAAGATTAAGGGGTGGTGTTTAGAATGTTGTCAAATAGCTGATTTAACCCATTGTTATGGTTGCTCATTGCCGCATGTTTGCAAATGGTGTGTTCAGAACAGAAGATGCTTCCTTGACAATGAACCTCATTTGCTTAAGCTTAGAACTGTGAAACATCCAATTACCAAAGACAAATTACAGTGTATCATAGACTTGTACAATATAATATTTCCAATTAATGATAAAGTAATTAGAAAATTTGAAAGAATGATAAAGCAAAGAAAATGTAGGAATCAATATAAAATTGAATGGTATAATCATTTGCTGCTCCCAATTACATTAAATGCTGCTGCATTTAAGTTTGATGAAAATAATCTTTATTATGTTTTTGGGTTATATGAGAAATCAGTCAGTGATATATATGCTCCATATAGAATTGTTAACTTTATAAATGAATTTGATAAATTATTGCTTGATGATATTAACTTTACAAGAATGTCCAATCTACCAATAGAGTTGAGAAACCATTATGCAAAGAAATACTTCCAATTATCAAGACTGCCATCATCAAAACTAAAGCAAATTTACTTTTCAGATTTTACTAAAGAAACTGTGATTTTTAATACTTATACAAAAACGCCAGGAAGATCAATATACAGAAATGTAACTGAATTTAATTGGAGAGATGAATTGGAGCTTTATTCTGATTTAAAAAATGATAAGAATAAATTAATTGCTGCAATGATGACGAGTAAGTATACTCGGTTCTATGCTCATGATAATAATTTTGGAAGGTTGAAAATGACAATATTTGAGTTGGGACATCATTGTCAGCCTAACTACGTGGCATCTAATCACCCAGGCAATGCTTCCGATATCCAGTACTGTAAATGGTGTAATATAAAATATTTTCTTAGTAAAATTGATTGGCGGATTCGTGATATGTATAATTTATTGATGGAATTTATTAAGGATTGTTATAAAAGTAATGTTAACGTTGGACATTGTAGTTCTGTTGAAAACATATATCCTTTAATTAAAAGATTAATTTGGAGTTTGTTTACTAATCACATGGATCAAACAATTGAAGAAGTGTTTAATCACATGTCGCCAGTGTCAGTTGAAGGTACGAATGTCATCATGTTGATTCTTGGATTGAATATTAGTTTGTATAATGAAATTAAGCGCACTTTGAATGTAGATAGCATACCAATGGTACTTAATTTAAATGAATTCAGTAGTATAGTTAAATCAATTAGCAGTAAATGGTATAATGTTGATGAATTGGATAAATTGCCAATGTCAATAAAATCAACGGAGGAACTGATTGAAATGAAGAATTCTGGAACTTTAACTGAAGAATTTGAGCTACTGATCTCCAACTCAGAAGATGACAATGAG [서열번호 332]
따라서, 바람직하게는 상기 로타바이러스 NSP1 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 332에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 로타바이러스 NSP1 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 333으로 제공된다:
ATGGCCACCTTCAAGGACGCCTGCTTCCACTACAGACGGCTGACAGCCCTGAATCGGCGGCTGTGTAATATCGGCGCCAACAGCATCTGCATGCCCGTGCCTGACGCCAAGATCAAAGGCTGGTGCCTGGAATGCTGCCAGATCGCCGATCTCACCCACTGCTACGGCTGTTCTCTGCCCCATGTGTGCAAGTGGTGCGTGCAGAACAGACGGTGCTTCCTGGACAACGAGCCCCATCTGCTGAAGCTGAGAACCGTGAAGCACCCCATCACCAAGGACAAGCTGCAGTGCATCATCGACCTGTACAACATCATCTTCCCCATCAACGACAAAGTGATCCGGAAGTTCGAGCGGATGATCAAGCAGCGGAAGTGCCGGAACCAGTACAAGATCGAGTGGTACAATCATCTGCTGCTGCCCATCACACTGAACGCCGCTGCCTTCAAGTTCGACGAGAACAACCTGTACTACGTGTTCGGCCTGTACGAGAAGTCCGTGTCCGACATCTACGCCCCTTACCGGATCGTGAACTTCATCAACGAGTTCGATAAGCTGCTGCTGGACGACATCAACTTCACCCGGATGAGCAACCTGCCTATCGAGCTGAGAAACCACTACGCCAAGAAGTACTTTCAGCTGAGCAGACTGCCCAGCAGCAAGCTGAAGCAGATCTACTTCTCCGACTTCACCAAAGAAACCGTGATCTTCAACACCTACACCAAGACACCCGGCAGATCCATCTACCGGAACGTGACCGAGTTCAACTGGCGGGACGAGCTGGAACTGTACAGCGACCTGAAGAACGACAAGAACAAGCTGATCGCCGCCATGATGACCAGCAAGTACACCCGGTTCTACGCCCACGACAACAATTTCGGCCGGCTGAAGATGACCATCTTCGAGCTGGGCCACCACTGCCAGCCTAATTACGTGGCCTCTAATCACCCCGGCAACGCCAGCGATATCCAGTACTGCAAATGGTGCAATATCAAGTACTTCCTGAGCAAGATCGACTGGCGGATCCGGGACATGTACAACCTGCTGATGGAATTCATCAAGGACTGCTACAAGAGCAACGTGAACGTGGGCCACTGCAGCAGCGTCGAGAACATCTACCCTCTGATCAAGCGGCTGATCTGGTCCCTGTTCACCAACCACATGGACCAGACCATCGAAGAGGTGTTCAATCACATGAGCCCCGTGTCCGTGGAAGGCACCAACGTGATCATGCTGATCCTGGGCCTGAACATCAGCCTGTACAATGAGATCAAGCGCACCCTGAACGTGGACAGCATCCCCATGGTGCTGAACCTGAACGAGTTCAGCAGCATCGTGAAGTCCATCTCCAGCAAGTGGTATAACGTGGACGAACTGGACAAACTGCCCATGAGCATCAAGTCCACCGAGGAACTGATCGAGATGAAGAACAGCGGCACCCTGACCGAGGAATTCGAGCTGCTGATCTCCAACAGCGAGGACGACAACGAG [서열번호 333]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 333에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 333의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 334로 제공된다:
AUGGCCACCUUCAAGGACGCCUGCUUCCACUACAGACGGCUGACAGCCCUGAAUCGGCGGCUGUGUAAUAUCGGCGCCAACAGCAUCUGCAUGCCCGUGCCUGACGCCAAGAUCAAAGGCUGGUGCCUGGAAUGCUGCCAGAUCGCCGAUCUCACCCACUGCUACGGCUGUUCUCUGCCCCAUGUGUGCAAGUGGUGCGUGCAGAACAGACGGUGCUUCCUGGACAACGAGCCCCAUCUGCUGAAGCUGAGAACCGUGAAGCACCCCAUCACCAAGGACAAGCUGCAGUGCAUCAUCGACCUGUACAACAUCAUCUUCCCCAUCAACGACAAAGUGAUCCGGAAGUUCGAGCGGAUGAUCAAGCAGCGGAAGUGCCGGAACCAGUACAAGAUCGAGUGGUACAAUCAUCUGCUGCUGCCCAUCACACUGAACGCCGCUGCCUUCAAGUUCGACGAGAACAACCUGUACUACGUGUUCGGCCUGUACGAGAAGUCCGUGUCCGACAUCUACGCCCCUUACCGGAUCGUGAACUUCAUCAACGAGUUCGAUAAGCUGCUGCUGGACGACAUCAACUUCACCCGGAUGAGCAACCUGCCUAUCGAGCUGAGAAACCACUACGCCAAGAAGUACUUUCAGCUGAGCAGACUGCCCAGCAGCAAGCUGAAGCAGAUCUACUUCUCCGACUUCACCAAAGAAACCGUGAUCUUCAACACCUACACCAAGACACCCGGCAGAUCCAUCUACCGGAACGUGACCGAGUUCAACUGGCGGGACGAGCUGGAACUGUACAGCGACCUGAAGAACGACAAGAACAAGCUGAUCGCCGCCAUGAUGACCAGCAAGUACACCCGGUUCUACGCCCACGACAACAAUUUCGGCCGGCUGAAGAUGACCAUCUUCGAGCUGGGCCACCACUGCCAGCCUAAUUACGUGGCCUCUAAUCACCCCGGCAACGCCAGCGAUAUCCAGUACUGCAAAUGGUGCAAUAUCAAGUACUUCCUGAGCAAGAUCGACUGGCGGAUCCGGGACAUGUACAACCUGCUGAUGGAAUUCAUCAAGGACUGCUACAAGAGCAACGUGAACGUGGGCCACUGCAGCAGCGUCGAGAACAUCUACCCUCUGAUCAAGCGGCUGAUCUGGUCCCUGUUCACCAACCACAUGGACCAGACCAUCGAAGAGGUGUUCAAUCACAUGAGCCCCGUGUCCGUGGAAGGCACCAACGUGAUCAUGCUGAUCCUGGGCCUGAACAUCAGCCUGUACAAUGAGAUCAAGCGCACCCUGAACGUGGACAGCAUCCCCAUGGUGCUGAACCUGAACGAGUUCAGCAGCAUCGUGAAGUCCAUCUCCAGCAAGUGGUAUAACGUGGACGAACUGGACAAACUGCCCAUGAGCAUCAAGUCCACCGAGGAACUGAUCGAGAUGAAGAACAGCGGCACCCUGACCGAGGAAUUCGAGCUGCUGAUCUCCAACAGCGAGGACGACAACGAG [서열번호 334]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 334에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 KSHV ORF45(Q77UV9; HHV8 ORF 45 인간 헤르페스바이러스 8 OX), 또는 그의 동원체이다. KSHV ORF45의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 335로 나타낸다:
MAMFVRTSSSTHDEERMLPIEGAPRRRPPVKFIFPPPPLSSLPGFGRPRGYAGPTVIDMSAPDDVFAEDTPSPPATPLDLQISPDQSSGESEYDEDEEDEDEEENDDVQEEDEPEGYPADFFQPLSHLRPRPLARRAHTPKPVAVVAGRVRSSTDTAESEASMGWVSQDDGFSPAGLSPSDDEGVAILEPMAAYTGTGAYGLSPASRNSVPGTQSSPYSDPDEGPSWRPLRAAPTAIVDLTSDSDSDDSSNSPDVNNEAAFTDARHFSHQPPSSEEDGEDQGEVLSQRIGLMDVGQKRKRQSTASSGSEDVVRCQRQPNLSRKAVASVIIISSGSDTDEEPSSAVSVIVSPSSTKGHLPTQSPSTSAHSISSGSTTTAGSRCSDPTRILASTPPLCGNGAYNWPWLD [서열번호 335]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 335에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 KSHV ORF45 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 336의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCGATGTTTGTGAGGACCTCGTCTAGCACACACGATGAAGAGAGAATGCTTCCAATTGAAGGAGCGCCTCGCAGACGACCCCCCGTGAAGTTCATATTCCCACCTCCACCTCTTTCATCACTTCCAGGATTTGGCAGGCCGCGCGGCTATGCTGGACCCACGGTGATAGATATGTCTGCCCCAGACGACGTCTTCGCCGAGGACACGCCATCGCCGCCAGCAACCCCTCTGGATCTACAGATATCCCCGGATCAGTCGAGCGGCGAATCTGAATATGACGAGGATGAGGAAGATGAAGATGAAGAAGAAAATGACGATGTTCAGGAGGAAGACGAGCCAGAGGGGTACCCTGCAGACTTTTTTCAACCTTTATCTCACTTGCGCCCGAGGCCTCTGGCCAGACGGGCCCATACGCCCAAACCGGTAGCAGTGGTAGCGGGCCGCGTGCGCAGTTCAACGGACACGGCGGAGTCCGAGGCGTCCATGGGATGGGTTAGTCAGGATGACGGATTTTCCCCTGCTGGGCTCTCACCTTCAGACGACGAGGGGGTTGCTATCCTGGAACCGATGGCGGCATACACTGGGACCGGGGCATACGGACTTTCACCTGCTTCCAGAAATAGTGTACCTGGAACACAAAGTTCACCATACAGCGACCCTGATGAAGGGCCCTCGTGGCGCCCCCTGCGCGCCGCACCCACCGCGATCGTCGACCTGACATCGGACTCTGATAGCGATGACAGTTCCAACTCTCCGGACGTGAACAATGAGGCCGCGTTTACCGACGCGCGCCATTTTTCCCACCAGCCACCCTCGTCCGAGGAGGACGGAGAAGACCAAGGGGAAGTATTGAGTCAGAGAATCGGGCTCATGGACGTGGGCCAGAAGCGCAAAAGGCAGTCTACCGCCTCCTCTGGTAGCGAGGATGTGGTGCGCTGCCAGAGACAACCAAACTTAAGCCGCAAAGCAGTGGCGTCTGTGATAATTATATCCTCGGGGAGTGACACAGACGAGGAGCCCTCGTCCGCCGTGAGCGTGATCGTGTCTCCGTCGAGCACAAAGGGTCACCTCCCAACCCAATCTCCCAGTACTTCCGCCCACTCGATTTCATCAGGAAGCACAACTACCGCGGGGTCCAGGTGCAGCGACCCAACCCGCATCCTGGCCTCCACGCCACCCCTGTGTGGAAACGGTGCATATAACTGGCCGTGGCTGGAC [서열번호 336]
따라서, 바람직하게는 상기 KSHV ORF45 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 336에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 KSHV ORF45 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 337로 제공된다:
ATGGCCATGTTTGTGCGGACCAGCAGCAGCACCCACGACGAGGAAAGAATGCTGCCTATCGAGGGCGCTCCTCGGAGAAGGCCTCCTGTGAAGTTCATCTTCCCACCTCCACCACTGAGCAGCCTGCCTGGATTTGGCAGACCTAGAGGCTACGCCGGACCTACCGTGATCGATATGAGCGCCCCTGACGATGTGTTCGCCGAGGATACACCTTCTCCACCAGCCACACCTCTGGACCTGCAGATCAGCCCTGATCAGTCTAGCGGCGAGAGCGAGTACGATGAGGACGAAGAGGACGAGGATGAGGAAGAGAACGACGACGTCCAAGAGGAAGATGAGCCCGAGGGCTACCCCGCCGATTTCTTTCAGCCTCTGTCTCACCTGAGGCCTCGGCCTCTTGCTAGAAGGGCCCACACACCTAAACCTGTGGCTGTGGTGGCCGGAAGAGTGCGGTCTAGCACAGATACAGCCGAGTCCGAAGCCAGCATGGGATGGGTGTCACAGGACGATGGATTCAGCCCTGCCGGACTGAGCCCTTCCGATGATGAAGGCGTGGCCATCCTGGAACCTATGGCCGCCTATACTGGCACAGGCGCCTATGGACTGTCTCCCGCCAGCAGAAATAGCGTGCCAGGCACACAGAGCAGCCCCTACTCTGATCCTGATGAGGGCCCATCTTGGAGGCCCCTTAGAGCTGCTCCTACCGCCATCGTGGATCTGACCAGCGACAGCGATAGCGACGACAGCAGCAATAGCCCCGACGTGAACAATGAGGCCGCCTTCACAGACGCCCGGCACTTTTCTCATCAGCCTCCAAGCAGCGAAGAGGATGGCGAGGATCAGGGCGAAGTGCTGTCTCAGAGAATCGGCCTGATGGACGTGGGCCAGAAGCGGAAGAGACAGAGCACAGCCAGCAGCGGCTCTGAGGATGTCGTCAGATGCCAGAGACAGCCCAACCTGAGCAGAAAGGCCGTGGCCAGCGTGATCATCATCAGCTCTGGCAGCGACACCGATGAGGAACCTAGCTCTGCCGTGTCCGTGATCGTGTCTCCTAGCAGCACCAAGGGCCATCTGCCTACACAGAGCCCTAGCACAAGCGCCCACTCTATCTCTAGCGGCAGCACAACAACAGCCGGCAGCAGATGCAGCGACCCCACAAGAATTCTGGCCAGCACACCTCCTCTGTGCGGCAACGGCGCTTACAATTGGCCTTGGCTGGAT [서열번호 337]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 337에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 337의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 338로 제공된다:
AUGGCCAUGUUUGUGCGGACCAGCAGCAGCACCCACGACGAGGAAAGAAUGCUGCCUAUCGAGGGCGCUCCUCGGAGAAGGCCUCCUGUGAAGUUCAUCUUCCCACCUCCACCACUGAGCAGCCUGCCUGGAUUUGGCAGACCUAGAGGCUACGCCGGACCUACCGUGAUCGAUAUGAGCGCCCCUGACGAUGUGUUCGCCGAGGAUACACCUUCUCCACCAGCCACACCUCUGGACCUGCAGAUCAGCCCUGAUCAGUCUAGCGGCGAGAGCGAGUACGAUGAGGACGAAGAGGACGAGGAUGAGGAAGAGAACGACGACGUCCAAGAGGAAGAUGAGCCCGAGGGCUACCCCGCCGAUUUCUUUCAGCCUCUGUCUCACCUGAGGCCUCGGCCUCUUGCUAGAAGGGCCCACACACCUAAACCUGUGGCUGUGGUGGCCGGAAGAGUGCGGUCUAGCACAGAUACAGCCGAGUCCGAAGCCAGCAUGGGAUGGGUGUCACAGGACGAUGGAUUCAGCCCUGCCGGACUGAGCCCUUCCGAUGAUGAAGGCGUGGCCAUCCUGGAACCUAUGGCCGCCUAUACUGGCACAGGCGCCUAUGGACUGUCUCCCGCCAGCAGAAAUAGCGUGCCAGGCACACAGAGCAGCCCCUACUCUGAUCCUGAUGAGGGCCCAUCUUGGAGGCCCCUUAGAGCUGCUCCUACCGCCAUCGUGGAUCUGACCAGCGACAGCGAUAGCGACGACAGCAGCAAUAGCCCCGACGUGAACAAUGAGGCCGCCUUCACAGACGCCCGGCACUUUUCUCAUCAGCCUCCAAGCAGCGAAGAGGAUGGCGAGGAUCAGGGCGAAGUGCUGUCUCAGAGAAUCGGCCUGAUGGACGUGGGCCAGAAGCGGAAGAGACAGAGCACAGCCAGCAGCGGCUCUGAGGAUGUCGUCAGAUGCCAGAGACAGCCCAACCUGAGCAGAAAGGCCGUGGCCAGCGUGAUCAUCAUCAGCUCUGGCAGCGACACCGAUGAGGAACCUAGCUCUGCCGUGUCCGUGAUCGUGUCUCCUAGCAGCACCAAGGGCCAUCUGCCUACACAGAGCCCUAGCACAAGCGCCCACUCUAUCUCUAGCGGCAGCACAACAACAGCCGGCAGCAGAUGCAGCGACCCCACAAGAAUUCUGGCCAGCACACCUCCUCUGUGCGGCAACGGCGCUUACAAUUGGCCUUGGCUGGAU [서열번호 338]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 338에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 EBV BZLF-1(P03206; 트랜스-활성화제(Trans-activator) 단백질 BZLF1 엡스타인-바 바이러스(Epstein-Barr virus)(B95-8 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. [Hahn AM, Huye LE, Ning S, Webster-Cyriaque JM Pagano JS (2005) Interferon Regulatory Factor 7 Is Negatively Regulated by the Epstein-Barr Virus Immediate-Early Gene, J Virol, 79, 15, 10040-10052 doi:10.1128/JVI.79.15.10040-10052.2005]. EBV BZLF-1의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 339로 나타낸다:
MMDPNSTSEDVKFTPDPYQVPFVQAFDQATRVYQDLGGPSQAPLPCVLWPVLPEPLPQGQLTAYHVSTAPTGSWFSAPQPAPENAYQAYAAPQLFPVSDITQNQQTNQAGGEAPQPGDNSTVQTAAAVVFACPGANQGQQLADIGVPQPAPVAAPARRTRKPQQPESLEECDSELEIKRYKNRVASRKCRAKFKQLLQHYREVAAAKSSENDRLRLLLKQMCPSLDVDSIIPRTPDVLHEDLLNF [서열번호 339]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 339에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 EBV BZLF-1 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 340의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGATGGACCCAAACTCGACTTCTGAAGATGTAAAATTTACACCTGACCCATACCAGGTGCCTTTTGTACAAGCTTTTGACCAAGCTACCAGAGTCTATCAGGACCTGGGAGGGCCATCGCAAGCTCCTTTGCCTTGTGTGCTGTGGCCGGTGCTGCCAGAGCCTCTGCCACAAGGCCAGCTAACTGCCTATCATGTTTCAACCGCTCCGACTGGGTCGTGGTTTTCTGCCCCTCAGCCTGCTCCTGAGAATGCTTATCAAGCTTATGCAGCACCTCAGCTGTTCCCAGTCTCCGACATAACCCAGAATCAACAGACTAACCAAGCCGGGGGAGAAGCACCTCAACCTGGAGACAATTCTACTGTTCAAACAGCAGCAGCAGTGGTGTTTGCTTGCCCCGGGGCTAACCAAGGACAACAGCTAGCAGACATTGGTGTTCCACAGCCTGCACCAGTGGCTGCCCCGGCACGACGCACACGGAAACCACAACAGCCAGAATCGCTGGAGGAATGCGATTCTGAACTAGAAATAAAGCGATACAAGAATCGGGTGGCTTCCAGAAAATGCCGGGCCAAGTTTAAGCAACTGCTGCAGCACTACCGTGAGGTCGCTGCTGCCAAATCATCTGAAAATGACAGGCTGCGCCTCCTGTTGAAGCAGATGTGCCCAAGCCTGGATGTTGACTCCATTATCCCCCGGACACCAGATGTTTTACACGAGGATCTCTTAAATTTC [서열번호 340]
따라서, 바람직하게는 상기 EBV BZLF-1 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 340에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 EBV BZLF-1 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 341로 제공된다:
ATGATGGACCCCAACAGCACCAGCGAGGACGTGAAGTTCACCCCTGATCCTTACCAGGTGCCATTCGTGCAGGCCTTCGATCAGGCCACCAGAGTGTACCAGGATCTCGGCGGACCTTCTCAGGCTCCTCTGCCTTGTGTTCTGTGGCCTGTGCTGCCTGAACCTCTGCCTCAGGGACAGCTGACAGCCTACCATGTGTCTACAGCCCCTACCGGCAGCTGGTTTTCTGCTCCTCAACCTGCTCCTGAGAACGCCTACCAGGCCTATGCTGCCCCTCAGCTGTTTCCCGTGTCCGACATCACCCAGAACCAGCAGACAAATCAGGCTGGCGGAGAAGCTCCTCAGCCTGGCGATAATAGCACCGTGCAGACAGCTGCCGCCGTGGTGTTTGCTTGTCCTGGCGCTAATCAGGGCCAGCAGCTGGCTGATATTGGCGTGCCACAACCAGCTCCAGTGGCCGCTCCTGCCAGAAGAACAAGAAAGCCTCAGCAGCCCGAGAGCCTGGAAGAGTGCGATAGCGAGCTGGAAATCAAGCGGTACAAGAACAGAGTGGCCAGCCGGAAGTGCCGGGCCAAGTTTAAACAGCTGCTCCAGCACTACAGAGAGGTGGCCGCTGCCAAGAGCAGCGAGAACGATAGACTGCGGCTGCTGCTGAAGCAGATGTGCCCTAGCCTGGACGTGGACAGCATCATCCCCAGAACACCCGATGTGCTGCACGAGGACCTGCTGAACTTT [서열번호 341]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 341에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 341의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 342로 제공된다:
AUGAUGGACCCCAACAGCACCAGCGAGGACGUGAAGUUCACCCCUGAUCCUUACCAGGUGCCAUUCGUGCAGGCCUUCGAUCAGGCCACCAGAGUGUACCAGGAUCUCGGCGGACCUUCUCAGGCUCCUCUGCCUUGUGUUCUGUGGCCUGUGCUGCCUGAACCUCUGCCUCAGGGACAGCUGACAGCCUACCAUGUGUCUACAGCCCCUACCGGCAGCUGGUUUUCUGCUCCUCAACCUGCUCCUGAGAACGCCUACCAGGCCUAUGCUGCCCCUCAGCUGUUUCCCGUGUCCGACAUCACCCAGAACCAGCAGACAAAUCAGGCUGGCGGAGAAGCUCCUCAGCCUGGCGAUAAUAGCACCGUGCAGACAGCUGCCGCCGUGGUGUUUGCUUGUCCUGGCGCUAAUCAGGGCCAGCAGCUGGCUGAUAUUGGCGUGCCACAACCAGCUCCAGUGGCCGCUCCUGCCAGAAGAACAAGAAAGCCUCAGCAGCCCGAGAGCCUGGAAGAGUGCGAUAGCGAGCUGGAAAUCAAGCGGUACAAGAACAGAGUGGCCAGCCGGAAGUGCCGGGCCAAGUUUAAACAGCUGCUCCAGCACUACAGAGAGGUGGCCGCUGCCAAGAGCAGCGAGAACGAUAGACUGCGGCUGCUGCUGAAGCAGAUGUGCCCUAGCCUGGACGUGGACAGCAUCAUCCCCAGAACACCCGAUGUGCUGCACGAGGACCUGCUGAACUUU [서열번호 342]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 342에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 MuHV Orf73(O41974; MHV68 ORF73 단백질 뮤린 헤르페스바이러스 4), 또는 그의 동원체이다. MuHV Orf73의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 343으로 나타낸다:
MPTSPPTTRNTTSGKTRSGCKRRCFNKPAAMPPKRRRAPKRPAPPPPPGCQGDEESSQGTQTPNPPSPPVPPSSPTLPSSPVPPSSPVHEPPSPSPPPAPPSPDVDVEGLDVGETDDPGPPPPKRYSRYQKPHNPSDPLPKKYQGMRRHLQVTAPRLFDPEGHPPTHFKSAVMFSSTHPYTLNKLHKCIQSKHVLSTPVSCLPLVPGTTQQCVTYYLLSFVEDKKQAKKLKRVVLAYCEKYHSSVEGTIVKAKPYFPLPEPPTEPPTDPEQPSTSTQASGTQHGPTASLDAGAEQGATGSPGSSPGQQGQGSQT [서열번호 343]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 343에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 MuHV Orf73 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 344의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGCCCACATCCCCACCGACTACACGCAACACAACCTCAGGCAAAACCAGATCAGGGTGCAAACGTAGGTGCTTCAACAAACCAGCAGCCATGCCTCCTAAAAGACGCCGCGCTCCAAAAAGACCAGCCCCTCCTCCACCACCGGGATGCCAAGGTGATGAGGAGTCCAGCCAGGGAACTCAAACGCCAAACCCCCCATCACCACCAGTGCCCCCTTCATCACCAACACTTCCCTCATCCCCCGTCCCTCCTTCATCACCAGTACATGAGCCACCATCTCCTTCCCCCCCACCAGCCCCACCATCACCAGATGTTGATGTTGAAGGTTTAGATGTAGGAGAGACAGACGATCCCGGTCCCCCTCCACCAAAAAGATACTCCAGGTATCAAAAACCGCATAATCCATCTGATCCATTGCCTAAAAAATATCAGGGAATGCGAAGACACCTGCAGGTGACAGCACCCAGGTTATTTGATCCCGAGGGTCACCCCCCAACACATTTTAAGTCAGCTGTTATGTTTAGTAGCACACATCCCTACACTTTGAATAAACTTCACAAGTGTATCCAAAGCAAACATGTACTCTCAACACCAGTTAGCTGTTTACCCTTGGTACCAGGCACAACACAACAGTGTGTAACATACTATTTACTTTCATTTGTTGAAGACAAGAAACAGGCCAAAAAACTAAAAAGGGTTGTCTTGGCCTACTGTGAAAAATACCACAGCAGCGTAGAAGGTACTATAGTCAAGGCAAAGCCTTATTTTCCCTTACCAGAGCCCCCTACAGAGCCCCCTACAGACCCCGAGCAGCCATCCACAAGTACACAAGCTTCTGGCACACAACATGGTCCCACAGCATCTCTGGATGCCGGTGCAGAGCAAGGTGCCACAGGATCACCTGGATCTAGTCCAGGACAACAGGGACAAGGGTCTCAGACA [서열번호 344]
따라서, 바람직하게는 상기 MuHV Orf73 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 344에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 MuHV Orf73 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 345로 제공된다:
ATGCCTACAAGCCCTCCTACCACCAGAAACACCACCAGCGGCAAGACAAGAAGCGGCTGCAAGCGGCGGTGCTTCAACAAACCTGCTGCCATGCCTCCTAAGCGGCGGAGAGCACCTAAAAGACCTGCTCCTCCTCCACCTCCTGGTTGCCAAGGCGACGAGGAATCTTCTCAGGGCACCCAGACACCTAATCCTCCATCTCCACCTGTGCCTCCAAGCAGCCCTACACTGCCATCTTCTCCAGTGCCACCTAGCAGCCCAGTGCACGAACCACCTAGTCCAAGTCCTCCACCAGCTCCACCTTCTCCAGACGTGGACGTGGAAGGACTGGATGTGGGCGAGACAGACGATCCTGGACCTCCACCACCTAAGCGGTACAGCAGATACCAGAAGCCTCACAACCCCAGCGATCCTCTGCCTAAGAAATACCAGGGCATGCGCCGGCATCTGCAAGTGACAGCCCCTAGACTGTTCGACCCTGAGGGACACCCTCCTACACACTTCAAGAGCGCCGTGATGTTCAGCAGCACACACCCCTACACTCTGAACAAGCTGCACAAGTGCATCCAGAGCAAACACGTGCTGAGCACCCCTGTGTCCTGTCTGCCTCTGGTGCCTGGAACCACACAGCAGTGCGTGACCTACTACCTGCTGAGCTTCGTGGAAGATAAGAAGCAGGCCAAGAAACTGAAGAGAGTGGTGCTGGCCTACTGCGAGAAGTACCACAGCAGCGTGGAAGGCACCATCGTGAAGGCCAAGCCTTACTTCCCACTGCCTGAGCCTCCAACCGAGCCACCTACAGATCCTGAGCAGCCTAGCACAAGCACACAGGCCTCTGGAACACAGCACGGACCTACAGCTAGTCTGGATGCTGGTGCTGAACAGGGCGCCACAGGATCACCTGGAAGTAGCCCTGGACAGCAAGGCCAGGGATCTCAGACA [서열번호 345]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 345에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 345의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 346으로 제공된다:
AUGCCUACAAGCCCUCCUACCACCAGAAACACCACCAGCGGCAAGACAAGAAGCGGCUGCAAGCGGCGGUGCUUCAACAAACCUGCUGCCAUGCCUCCUAAGCGGCGGAGAGCACCUAAAAGACCUGCUCCUCCUCCACCUCCUGGUUGCCAAGGCGACGAGGAAUCUUCUCAGGGCACCCAGACACCUAAUCCUCCAUCUCCACCUGUGCCUCCAAGCAGCCCUACACUGCCAUCUUCUCCAGUGCCACCUAGCAGCCCAGUGCACGAACCACCUAGUCCAAGUCCUCCACCAGCUCCACCUUCUCCAGACGUGGACGUGGAAGGACUGGAUGUGGGCGAGACAGACGAUCCUGGACCUCCACCACCUAAGCGGUACAGCAGAUACCAGAAGCCUCACAACCCCAGCGAUCCUCUGCCUAAGAAAUACCAGGGCAUGCGCCGGCAUCUGCAAGUGACAGCCCCUAGACUGUUCGACCCUGAGGGACACCCUCCUACACACUUCAAGAGCGCCGUGAUGUUCAGCAGCACACACCCCUACACUCUGAACAAGCUGCACAAGUGCAUCCAGAGCAAACACGUGCUGAGCACCCCUGUGUCCUGUCUGCCUCUGGUGCCUGGAACCACACAGCAGUGCGUGACCUACUACCUGCUGAGCUUCGUGGAAGAUAAGAAGCAGGCCAAGAAACUGAAGAGAGUGGUGCUGGCCUACUGCGAGAAGUACCACAGCAGCGUGGAAGGCACCAUCGUGAAGGCCAAGCCUUACUUCCCACUGCCUGAGCCUCCAACCGAGCCACCUACAGAUCCUGAGCAGCCUAGCACAAGCACACAGGCCUCUGGAACACAGCACGGACCUACAGCUAGUCUGGAUGCUGGUGCUGAACAGGGCGCCACAGGAUCACCUGGAAGUAGCCCUGGACAGCAAGGCCAGGGAUCUCAGACA [서열번호 346]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 346에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 토크 테노 바이러스 Orf2(A7XCD9; ORF2 단백질 토크 테노 바이러스(인간/핀란드/Hel32/2002 단리물)), 또는 그의 동원체이다. [Zheng H, Ye L, Fang X, Li B, Wang Y, Xiang X, Kong L, Wang W et al. (2007) Torque teno virus (SANBAN isolate) ORF2 protein suppresses NF-kB pathways via interaction with IkappaB kinases. J Virol, 81, 21, 11917-11924]. 상기 IIP는 정규적 및 비-정규적 Nf-KB 경로를 저해하는 것으로 여겨진다. 토크 테노 바이러스 Orf2의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 347로 나타낸다:
MWQPPTQNGTQLERHWFESVWRSHAAFCSCGDCIGHLQHLATNLGRPPAPQPPRDQHPPHIRGLPALPAPPSNRNSWPGTGGDAAGGEAGGSRGAGDGGDGELADEDLLDAIALAAE [서열번호 347]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 347에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 토크 테노 바이러스 Orf2 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 348의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGTGGCAGCCACCTACCCAGAATGGAACCCAACTCGAACGGCACTGGTTCGAGTCCGTTTGGCGTTCGCATGCTGCCTTTTGTAGCTGTGGCGACTGTATTGGCCATCTTCAGCATCTGGCTACTAACCTGGGTCGACCACCTGCTCCACAACCGCCGCGAGACCAACACCCACCGCACATAAGAGGGCTCCCGGCACTCCCGGCACCTCCCAGTAACAGAAACTCATGGCCTGGTACTGGTGGAGACGCCGCCGGAGGAGAGGCTGGTGGAAGCCGAGGCGCAGGAGATGGAGGAGACGGAGAGCTCGCAGACGAGGACCTGCTAGACGCCATCGCGCTCGCCGCAGAG [서열번호 348]
따라서, 바람직하게는 상기 토크 테노 바이러스 Orf2 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 348에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 토크 테노 바이러스 Orf2 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 349로 제공된다:
ATGTGGCAGCCTCCTACACAGAATGGCACCCAGCTGGAACGGCATTGGTTCGAGAGCGTTTGGAGAAGCCACGCCGCTTTCTGCAGCTGCGGAGATTGCATCGGACATCTGCAGCACCTGGCCACCAATCTGGGTAGACCTCCAGCTCCTCAGCCTCCTCGAGATCAGCACCCTCCTCACATCAGAGGACTGCCTGCACTTCCTGCTCCTCCAAGCAACAGAAACAGCTGGCCTGGCACAGGCGGAGATGCTGCTGGCGGAGAAGCTGGTGGATCTAGAGGTGCCGGCGACGGTGGCGACGGCGAACTTGCTGATGAAGATCTGCTGGACGCTATCGCCCTGGCCGCTGAA [서열번호 349]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 349에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 349의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 350으로 제공된다:
AUGUGGCAGCCUCCUACACAGAAUGGCACCCAGCUGGAACGGCAUUGGUUCGAGAGCGUUUGGAGAAGCCACGCCGCUUUCUGCAGCUGCGGAGAUUGCAUCGGACAUCUGCAGCACCUGGCCACCAAUCUGGGUAGACCUCCAGCUCCUCAGCCUCCUCGAGAUCAGCACCCUCCUCACAUCAGAGGACUGCCUGCACUUCCUGCUCCUCCAAGCAACAGAAACAGCUGGCCUGGCACAGGCGGAGAUGCUGCUGGCGGAGAAGCUGGUGGAUCUAGAGGUGCCGGCGACGGUGGCGACGGCGAACUUGCUGAUGAAGAUCUGCUGGACGCUAUCGCCCUGGCCGCUGAA [서열번호 350]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 350에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 EBV EBNA1(P03211; 엡스타인-바 핵 항원 1 엡스타인-바 바이러스(B95-8 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. EBV EBNA1의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 351로 나타낸다:
MSDEGPGTGPGNGLGEKGDTSGPEGSGGSGPQRRGGDNHGRGRGRGRGRGGGRPGAPGGSGSGPRHRDGVRRPQKRPSCIGCKGTHGGTGAGAGAGGAGAGGAGAGGGAGAGGGAGGAGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGAGAGGGAGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGAGAGGGAGGAGGAGAGGGAGAGGAGGAGGAGAGGAGAGGGAGGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGGAGAGGAGGAGAGGAGGAGAGGGAGGAGAGGGAGGAGAGGAGGAGAGGAGGAGAGGAGGAGAGGGAGAGGAGAGGGGRGRGGSGGRGRGGSGGRGRGGSGGRRGRGRERARGGSRERARGRGRGRGEKRPRSPSSQSSSSGSPPRRPPPGRRPFFHPVGEADYFEYHQEGGPDGEPDVPPGAIEQGPADDPGEGPSTGPRGQGDGGRRKKGGWFGKHRGQGGSNPKFENIAEGLRALLARSHVERTTDEGTWVAGVFVYGGSKTSLYNLRRGTALAIPQCRLTPLSRLPFGMAPGPGPQPGPLRESIVCYFMVFLQTHIFAEVLKDAIKDLVMTKPAPTCNIRVTVCSFDDGVDLPPWFPPMVEGAAAEGDDGDDGDEGGDGDEGEEGQE [서열번호 351]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 351에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 EBV EBNA1 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 352의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGTCTGACGAGGGGCCAGGTACAGGACCTGGAAATGGCCTAGGAGAGAAGGGAGACACATCTGGACCAGAAGGCTCCGGCGGCAGTGGACCTCAAAGAAGAGGGGGTGATAACCATGGACGAGGACGGGGAAGAGGACGAGGACGAGGAGGCGGAAGACCAGGAGCCCCGGGCGGCTCAGGATCAGGGCCAAGACATAGAGATGGTGTCCGGAGACCCCAAAAACGTCCAAGTTGCATTGGCTGCAAAGGGACCCACGGTGGAACAGGAGCAGGAGCAGGAGCGGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGGGCAGGAGCAGGAGGTGGAGGCCGGGGTCGAGGAGGCAGTGGAGGCCGGGGTCGAGGAGGTAGTGGAGGCCGGGGTCGAGGAGGTAGTGGAGGCCGCCGGGGTAGAGGACGTGAAAGAGCCAGGGGGGGAAGTCGTGAAAGAGCCAGGGGGAGAGGTCGTGGACGTGGAGAAAAGAGGCCCAGGAGTCCCAGTAGTCAGTCATCATCATCCGGGTCTCCACCGCGCAGGCCCCCTCCAGGTAGAAGGCCATTTTTCCACCCTGTAGGGGAAGCCGATTATTTTGAATACCACCAAGAAGGTGGCCCAGATGGTGAGCCTGACGTGCCCCCGGGAGCGATAGAGCAGGGCCCCGCAGATGACCCAGGAGAAGGCCCAAGCACTGGACCCCGGGGTCAGGGTGATGGAGGCAGGCGCAAAAAAGGAGGGTGGTTTGGAAAGCATCGTGGTCAAGGAGGTTCCAACCCGAAATTTGAGAACATTGCAGAAGGTTTAAGAGCTCTCCTGGCTAGGAGTCACGTAGAAAGGACTACCGACGAAGGAACTTGGGTCGCCGGTGTGTTCGTATATGGAGGTAGTAAGACCTCCCTTTACAACCTAAGGCGAGGAACTGCCCTTGCTATTCCACAATGTCGTCTTACACCATTGAGTCGTCTCCCCTTTGGAATGGCCCCTGGACCCGGCCCACAACCTGGCCCGCTAAGGGAGTCCATTGTCTGTTATTTCATGGTCTTTTTACAAACTCATATATTTGCTGAGGTTTTGAAGGATGCGATTAAGGACCTTGTTATGACAAAGCCCGCTCCTACCTGCAATATCAGGGTGACTGTGTGCAGCTTTGACGATGGAGTAGATTTGCCTCCCTGGTTTCCACCTATGGTGGAAGGGGCTGCCGCGGAGGGTGATGACGGAGATGACGGAGATGAAGGAGGTGATGGAGATGAGGGTGAGGAAGGGCAGGAGTGA [서열번호 352]
따라서, 바람직하게는 상기 EBV EBNA1 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 352에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 EBV EBNA1 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 353으로 제공된다:
ATGTCCGATGAAGGCCCTGGAACAGGCCCTGGCAATGGACTGGGAGAGAAGGGCGATACAAGCGGCCCTGAAGGTTCTGGCGGATCTGGCCCTCAAAGAAGAGGCGGCGATAATCACGGCAGAGGACGCGGAAGAGGTAGAGGCAGAGGCGGAGGTAGACCTGGTGCTCCTGGTGGTTCTGGCTCTGGCCCTAGACATAGAGATGGCGTCAGACGGCCTCAGAAGAGGCCTTCTTGTATCGGCTGCAAGGGCACACATGGCGGAACAGGTGCTGGTGCTGGCGCAGGCGGAGCAGGCGCTGGTGGTGCAGGCGCTGGCGGCGGTGCCGGTGCAGGCGGCGGAGCTGGTGGCGCTGGCGGTGCTGGCGGAGCTGGTGCAGGCGGAGGTGCCGGCGCTGGTGGCGGAGCAGGCGGAGCTGGCGGAGCCGGCGCTGGCGGTGGCGCTGGTGCCGGCGGAGGCGCAGGCGGCGCTGGTGCTGGTGGTGGTGCTGGCGGCGCAGGCGGTGCAGGCGCAGGCGGAGGCGCTGGCGCTGGCGGTGGTGCAGGCGGTGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGGCGGAGCCGGTGGTGCTGGTGCTGGTGGCGGAGCTGGCGCTGGCGGAGCTGGCGGTGCAGGCGGCGCAGGCGCTGGTGGCGCTGGCGCAGGCGGTGGCGCTGGCGGAGCAGGCGGAGCTGGCGCTGGCGGCGCAGGCGCAGGCGGAGCCGGTGCTGGCGGAGCTGGTGCTGGTGGTGCAGGCGGAGCTGGTGCCGGTGGCGCTGGTGGTGCCGGTGCCGGTGGTGCCGGCGGAGCCGGCGCAGGCGGCGGTGCAGGCGGAGCAGGCGCAGGCGGCGGAGCTGGTGGTGCCGGCGCAGGCGGCGCTGGTGGTGCTGGTGCCGGCGGAGCTGGTGGCGCAGGCGCTGGCGGTGCAGGCGGTGCCGGTGCCGGTGGTGGTGCAGGCGCAGGCGGTGCTGGTGCCGGCGGTGGCGGAAGAGGAAGAGGTGGTAGCGGAGGCCGAGGACGAGGCGGAAGTGGTGGTCGTGGTAGAGGCGGCAGCGGAGGAAGAAGAGGACGGGGTAGAGAACGAGCTAGAGGCGGATCTAGAGAGAGAGCCCGAGGCAGAGGAAGAGGCCGCGGAGAGAAAAGACCTAGAAGCCCTAGCAGCCAGAGCAGCTCTAGCGGATCTCCACCTAGAAGGCCACCTCCAGGCAGACGGCCATTCTTTCACCCTGTGGGCGAAGCCGACTACTTCGAGTACCACCAAGAAGGCGGACCTGACGGCGAACCTGATGTTCCTCCTGGCGCCATTGAACAGGGCCCAGCTGATGATCCTGGCGAGGGACCTTCTACAGGCCCTAGAGGACAAGGCGACGGCGGCAGACGAAAGAAAGGCGGATGGTTCGGCAAGCACAGAGGCCAAGGTGGCAGCAACCCCAAGTTCGAGAATATCGCCGAGGGCCTGAGAGCCCTGCTGGCCAGATCTCACGTGGAAAGAACCACCGACGAAGGCACATGGGTGGCAGGCGTGTTCGTTTACGGCGGCTCTAAGACCAGCCTGTACAACCTGAGAAGAGGCACAGCCCTGGCCATTCCTCAGTGCAGACTGACCCCTCTGAGCAGACTGCCTTTTGGCATGGCTCCTGGACCTGGACCTCAACCTGGACCACTGAGAGAATCCATCGTGTGCTACTTCATGGTGTTTCTGCAGACCCACATCTTCGCCGAGGTGCTGAAGGACGCCATCAAGGACCTGGTCATGACAAAGCCCGCTCCTACCTGCAACATCAGAGTGACCGTGTGCAGCTTCGACGACGGCGTTGACCTGCCTCCTTGGTTTCCTCCAATGGTGGAAGGCGCTGCTGCCGAAGGCGACGATGGCGACGACGGCGACGAAGGTGGCGACGGCGACGAGGGCGAAGAAGGACAAGAGTAA [서열번호 353]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 353에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 353의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 354로 제공된다:
AUGUCCGAUGAAGGCCCUGGAACAGGCCCUGGCAAUGGACUGGGAGAGAAGGGCGAUACAAGCGGCCCUGAAGGUUCUGGCGGAUCUGGCCCUCAAAGAAGAGGCGGCGAUAAUCACGGCAGAGGACGCGGAAGAGGUAGAGGCAGAGGCGGAGGUAGACCUGGUGCUCCUGGUGGUUCUGGCUCUGGCCCUAGACAUAGAGAUGGCGUCAGACGGCCUCAGAAGAGGCCUUCUUGUAUCGGCUGCAAGGGCACACAUGGCGGAACAGGUGCUGGUGCUGGCGCAGGCGGAGCAGGCGCUGGUGGUGCAGGCGCUGGCGGCGGUGCCGGUGCAGGCGGCGGAGCUGGUGGCGCUGGCGGUGCUGGCGGAGCUGGUGCAGGCGGAGGUGCCGGCGCUGGUGGCGGAGCAGGCGGAGCUGGCGGAGCCGGCGCUGGCGGUGGCGCUGGUGCCGGCGGAGGCGCAGGCGGCGCUGGUGCUGGUGGUGGUGCUGGCGGCGCAGGCGGUGCAGGCGCAGGCGGAGGCGCUGGCGCUGGCGGUGGUGCAGGCGGUGCUGGCGCUGGCGGCGGUGCUGGCGGAGCCGGUGGUGCUGGUGCUGGUGGCGGAGCUGGCGCUGGCGGAGCUGGCGGUGCAGGCGGCGCAGGCGCUGGUGGCGCUGGCGCAGGCGGUGGCGCUGGCGGAGCAGGCGGAGCUGGCGCUGGCGGCGCAGGCGCAGGCGGAGCCGGUGCUGGCGGAGCUGGUGCUGGUGGUGCAGGCGGAGCUGGUGCCGGUGGCGCUGGUGGUGCCGGUGCCGGUGGUGCCGGCGGAGCCGGCGCAGGCGGCGGUGCAGGCGGAGCAGGCGCAGGCGGCGGAGCUGGUGGUGCCGGCGCAGGCGGCGCUGGUGGUGCUGGUGCCGGCGGAGCUGGUGGCGCAGGCGCUGGCGGUGCAGGCGGUGCCGGUGCCGGUGGUGGUGCAGGCGCAGGCGGUGCUGGUGCCGGCGGUGGCGGAAGAGGAAGAGGUGGUAGCGGAGGCCGAGGACGAGGCGGAAGUGGUGGUCGUGGUAGAGGCGGCAGCGGAGGAAGAAGAGGACGGGGUAGAGAACGAGCUAGAGGCGGAUCUAGAGAGAGAGCCCGAGGCAGAGGAAGAGGCCGCGGAGAGAAAAGACCUAGAAGCCCUAGCAGCCAGAGCAGCUCUAGCGGAUCUCCACCUAGAAGGCCACCUCCAGGCAGACGGCCAUUCUUUCACCCUGUGGGCGAAGCCGACUACUUCGAGUACCACCAAGAAGGCGGACCUGACGGCGAACCUGAUGUUCCUCCUGGCGCCAUUGAACAGGGCCCAGCUGAUGAUCCUGGCGAGGGACCUUCUACAGGCCCUAGAGGACAAGGCGACGGCGGCAGACGAAAGAAAGGCGGAUGGUUCGGCAAGCACAGAGGCCAAGGUGGCAGCAACCCCAAGUUCGAGAAUAUCGCCGAGGGCCUGAGAGCCCUGCUGGCCAGAUCUCACGUGGAAAGAACCACCGACGAAGGCACAUGGGUGGCAGGCGUGUUCGUUUACGGCGGCUCUAAGACCAGCCUGUACAACCUGAGAAGAGGCACAGCCCUGGCCAUUCCUCAGUGCAGACUGACCCCUCUGAGCAGACUGCCUUUUGGCAUGGCUCCUGGACCUGGACCUCAACCUGGACCACUGAGAGAAUCCAUCGUGUGCUACUUCAUGGUGUUUCUGCAGACCCACAUCUUCGCCGAGGUGCUGAAGGACGCCAUCAAGGACCUGGUCAUGACAAAGCCCGCUCCUACCUGCAACAUCAGAGUGACCGUGUGCAGCUUCGACGACGGCGUUGACCUGCCUCCUUGGUUUCCUCCAAUGGUGGAAGGCGCUGCUGCCGAAGGCGACGAUGGCGACGACGGCGACGAAGGUGGCGACGGCGACGAGGGCGAAGAAGGACAAGAGUAA [서열번호 354]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 354에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 BDV P 단백질(P0C799; 인단백질 보르나 질환 바이러스(Borna disease virus)(V 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. 상기 IIP는 TBK에 의한 인산화를 위한 유인 단백질로 작용하여서, IRF3 및 7의 TBK 활성 및 활성화를 감소시키는 효과를 갖는 것으로 여겨진다. BDV P 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 355로 나타낸다:
MATRPSSLVDSLEDEEDPQTLRRERPGSPRPRKVPRNALTQPVDQLLKDLRKNPSMISDPDQRTGREQLSNDELIKKLVTELAENSMIEAEEVRGTLGDISARIEAGFESLSALQVETIQTAQRCDHSDSIRILGENIKILDRSMKTMMETMKLMMEKVDLLYASTAVGTSAPMLPSHPAPPRIYPQLPSAPTTDEWDIIP [서열번호 355]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 355에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 BDV P 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 356의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCAACGCGACCATCGAGTCTGGTCGACTCCCTGGAGGACGAAGAAGATCCCCAGACACTACGACGGGAACGACCGGGGTCACCAAGACCACGGAAGGTCCCAAGGAATGCATTGACCCAACCAGTAGACCAGCTCCTGAAGGACCTCAGGAAGAACCCCTCCATGATCTCAGACCCAGACCAGCGAACCGGAAGGGAGCAGCTGTCGAATGATGAGCTAATCAAGAAGTTAGTGACGGAGCTGGCCGAGAATAGCATGATCGAGGCTGAGGAGGTGCGGGGCACTCTTGGAGACATCTCGGCTCGTATCGAGGCAGGGTTTGAGTCCCTGTCCGCCCTCCAAGTGGAAACCATCCAGACAGCTCAGCGGTGCGATCACTCCGACAGCATCAGGATCCTCGGCGAGAACATCAAGATACTAGATCGCTCCATGAAGACAATGATGGAGACAATGAAGCTCATGATGGAGAAGGTGGATCTCCTCTACGCATCAACCGCCGTTGGGACCTCTGCACCCATGTTGCCCTCCCATCCTGCACCTCCGCGCATTTATCCCCAGCTCCCAAGTGCCCCGACAACGGATGAATGGGACATCATACCA [서열번호 356]
따라서, 바람직하게는 상기 BDV P 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 356에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 BDV P 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 357로 제공된다:
ATGGCCACAAGACCTAGCAGCCTGGTGGACAGCCTGGAAGATGAGGAAGATCCCCAGACACTGCGGAGAGAGAGGCCTGGATCTCCCAGACCTAGAAAGGTGCCCAGAAACGCCCTGACACAGCCCGTTGATCAGCTGCTGAAGGACCTGAGAAAGAACCCCAGCATGATCAGCGACCCCGACCAGAGAACCGGAAGAGAGCAGCTGTCTAACGACGAGCTGATTAAGAAGCTGGTCACCGAGCTGGCCGAGAACTCCATGATTGAGGCCGAAGAAGTGCGGGGCACCCTGGGCGATATCTCTGCCAGAATCGAGGCCGGCTTTGAGTCTCTGAGCGCCCTGCAGGTTGAGACAATCCAGACAGCCCAGAGATGCGACCACAGCGACAGCATCAGAATCCTGGGCGAGAACATCAAGATCCTGGATCGGAGCATGAAGACCATGATGGAAACCATGAAGCTGATGATGGAAAAGGTGGACCTGCTGTACGCCAGCACAGCCGTGGGAACATCTGCTCCCATGCTGCCTTCTCACCCCGCTCCTCCAAGAATCTACCCTCAGCTGCCTAGCGCTCCCACCACCGATGAGTGGGATATCATCCCT [서열번호 357]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 357에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 357의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 358로 제공된다:
AUGGCCACAAGACCUAGCAGCCUGGUGGACAGCCUGGAAGAUGAGGAAGAUCCCCAGACACUGCGGAGAGAGAGGCCUGGAUCUCCCAGACCUAGAAAGGUGCCCAGAAACGCCCUGACACAGCCCGUUGAUCAGCUGCUGAAGGACCUGAGAAAGAACCCCAGCAUGAUCAGCGACCCCGACCAGAGAACCGGAAGAGAGCAGCUGUCUAACGACGAGCUGAUUAAGAAGCUGGUCACCGAGCUGGCCGAGAACUCCAUGAUUGAGGCCGAAGAAGUGCGGGGCACCCUGGGCGAUAUCUCUGCCAGAAUCGAGGCCGGCUUUGAGUCUCUGAGCGCCCUGCAGGUUGAGACAAUCCAGACAGCCCAGAGAUGCGACCACAGCGACAGCAUCAGAAUCCUGGGCGAGAACAUCAAGAUCCUGGAUCGGAGCAUGAAGACCAUGAUGGAAACCAUGAAGCUGAUGAUGGAAAAGGUGGACCUGCUGUACGCCAGCACAGCCGUGGGAACAUCUGCUCCCAUGCUGCCUUCUCACCCCGCUCCUCCAAGAAUCUACCCUCAGCUGCCUAGCGCUCCCACCACCGAUGAGUGGGAUAUCAUCCCU [서열번호 358]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 358에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HPV E7(P03129; 단백질 E7 인간 파필로마바이러스 타입 16), 또는 그의 동원체이다. HPV E7의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 359로 나타낸다:
MHGDTPTLHEYMLDLQPETTDLYCYEQLNDSSEEEDEIDGPAGQAEPDRAHYNIVTFCCKCDSTLRLCVQSTHVDIRTLEDLLMGTLGIVCPICSQKP [서열번호 359]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 359에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HPV E7 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 360의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGCATGGAGATACACCTACATTGCATGAATATATGTTAGATTTGCAACCAGAGACAACTGATCTCTACTGTTATGAGCAATTAAATGACAGCTCAGAGGAGGAGGATGAAATAGATGGTCCAGCTGGACAAGCAGAACCGGACAGAGCCCATTACAATATTGTAACCTTTTGTTGCAAGTGTGACTCTACGCTTCGGTTGTGCGTACAAAGCACACACGTAGACATTCGTACTTTGGAAGACCTGTTAATGGGCACACTAGGAATTGTGTGCCCCATCTGTTCTCAGAAACCA [서열번호 360]
따라서, 바람직하게는 상기 HPV E7 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 360에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 HPV E7 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 361로 제공된다:
ATGCACGGCGATACCCCTACACTGCACGAGTACATGCTGGACCTGCAGCCTGAGACAACCGACCTGTACTGCTACGAGCAGCTGAACGACAGCAGCGAGGAAGAGGACGAGATTGACGGACCTGCCGGACAGGCCGAACCTGATAGAGCCCACTACAATATCGTGACCTTCTGCTGCAAGTGCGACAGCACCCTGAGACTGTGTGTGCAGAGCACCCACGTGGACATCAGAACCCTGGAAGATCTGCTGATGGGCACCCTGGGCATCGTGTGCCCTATCTGTTCTCAGAAGCCC [서열번호 361]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 361에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 361의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 362로 제공된다:
AUGCACGGCGAUACCCCUACACUGCACGAGUACAUGCUGGACCUGCAGCCUGAGACAACCGACCUGUACUGCUACGAGCAGCUGAACGACAGCAGCGAGGAAGAGGACGAGAUUGACGGACCUGCCGGACAGGCCGAACCUGAUAGAGCCCACUACAAUAUCGUGACCUUCUGCUGCAAGUGCGACAGCACCCUGAGACUGUGUGUGCAGAGCACCCACGUGGACAUCAGAACCCUGGAAGAUCUGCUGAUGGGCACCCUGGGCAUCGUGUGCCCUAUCUGUUCUCAGAAGCCC [서열번호 362]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 362에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 아레나바이러스 NP1 단백질(A0A2H4RDN2; 핵단백질 아레나바이러스 속(sp.)), 또는 그의 동원체이다. 아레나바이러스 NP1 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 363으로 나타낸다:
MSNSKEVKSFLWTQALRRELSPYCTSVKLQVIKDAQSLLHSLDFSEVSNVQRLMRKDKRDDGDLKRLRDLNQAVNNLVELKSQQQKNVLSVGQLSSDDLLVLAADIDRLKAKITRTERPQSNGVYMGNLTAQQLEQRKKLLELVGMTRPNLRAGSDGVVRVWDVKNPDLLNNQFGTMPSLTIACMTKQGQSDINDVVQALTDLGLIYTAKYPNSSDLDQLVKTHPVLGIIDTEKSAINVSGYNFSLSAAVKAGACMLDGGNMLETIKVTPQNIDPILKKTLAVKKSVGMFVSDTPGDRNPYENLLYKICLSGNGWPYIASRTSILGRAWDNTVVDLGSSNPITKPLNQQARDKVPGLQQTVGLTYSQIMCLKDIMTGMDPTSKTWIDIEGRAEDPVEIAIYQPAGGQYIHFYREPTDAKQFKQDSKYSHGIDIVDLFRVQPGLTSAVIESLPKGMVLTCQGSEDIRKLLDSQGRRDIKLIDVMMSKIDARKFENEVWDDLKTLCNMHTGVVHEKKKRGGKQEITPHCALLDCIMYEAATQGSYKTPKLTPLLPTDLVFRAGAPKVTL [서열번호 363]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 363에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 아레나바이러스 NP1 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 364의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGAGCAACTCCAAGGAGGTGAAGTCCTTTCTTTGGACTCAAGCCCTTAGGAGGGAATTATCACCATACTGCACAAGTGTCAAACTTCAAGTTATCAAGGATGCTCAGAGTCTCCTTCACAGCTTGGATTTCTCAGAAGTGAGTAATGTACAACGCTTGATGAGGAAGGACAAAAGGGATGACGGTGACTTGAAGAGGCTGAGAGATTTAAATCAGGCAGTCAACAATCTTGTTGAACTAAAATCTCAACAGCAGAAAAATGTCTTAAGTGTGGGGCAGCTGTCATCTGATGACCTTTTAGTCCTCGCTGCTGACATTGACAGGCTGAAAGCAAAGATAACCAGGACAGAGAGGCCCCAATCTAATGGGGTCTACATGGGGAACCTCACAGCTCAGCAACTTGAACAACGAAAGAAGCTCCTAGAGTTGGTGGGGATGACCAGACCAAACTTAAGAGCTGGTTCTGATGGTGTTGTCAGGGTGTGGGACGTGAAGAATCCTGATCTCTTGAATAACCAATTTGGCACAATGCCCAGTCTAACGATTGCCTGCATGACAAAACAAGGACAATCAGACATAAATGATGTTGTTCAGGCATTAACTGACTTGGGGCTAATTTATACAGCTAAGTACCCAAATTCATCAGATCTTGATCAACTTGTCAAAACCCATCCAGTTTTGGGCATCATAGACACAGAAAAATCTGCCATCAATGTTTCAGGTTACAACTTCAGCCTGTCAGCTGCAGTTAAGGCAGGTGCATGTATGCTAGATGGGGGTAACATGCTCGAGACCATAAAGGTAACACCTCAGAATATTGATCCAATTCTGAAGAAGACTCTGGCAGTTAAAAAGTCTGTTGGCATGTTTGTCTCAGACACACCAGGTGACAGAAACCCATATGAAAACTTACTATACAAGATCTGCCTCTCAGGCAATGGATGGCCCTACATTGCTAGCAGAACTTCAATTCTCGGGAGGGCCTGGGACAACACAGTTGTGGACTTGGGCAGCAGTAACCCAATCACAAAGCCCCTCAATCAGCAAGCTAGAGACAAAGTTCCTGGTTTGCAGCAAACAGTTGGACTCACATACTCACAAATCATGTGTCTCAAAGACATAATGACCGGTATGGACCCGACAAGTAAGACTTGGATTGACATTGAGGGCAGGGCTGAGGACCCAGTGGAGATTGCCATCTACCAGCCAGCTGGTGGGCAATATATTCATTTCTACAGAGAACCAACAGATGCCAAGCAATTTAAGCAGGATTCTAAGTACTCACATGGCATTGACATTGTTGACCTGTTTAGGGTGCAACCAGGCCTTACAAGTGCTGTGATAGAGAGTCTACCGAAAGGGATGGTCTTAACTTGTCAGGGATCTGAGGACATAAGAAAGCTGTTAGATAGTCAGGGGCGCCGAGACATCAAGTTAATTGATGTGATGATGAGCAAGATTGATGCACGGAAGTTTGAAAATGAGGTCTGGGATGATCTTAAAACACTGTGCAACATGCACACTGGGGTGGTCCATGAGAAGAAGAAGAGAGGTGGTAAACAAGAAATAACACCTCACTGTGCACTTCTAGACTGCATTATGTATGAGGCAGCCACCCAGGGGTCATACAAGACCCCCAAATTAACACCTCTGCTACCAACTGACTTGGTGTTTAGAGCAGGAGCACCCAAAGTCACTCTG [서열번호 364]
따라서, 바람직하게는 상기 아레나바이러스 NP1 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 364에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 아레나바이러스 NP1 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 365로 제공된다:
ATGAGCAACAGCAAAGAAGTCAAGAGCTTCCTCTGGACACAGGCCCTGAGAAGAGAGCTGAGCCCTTACTGCACCAGCGTGAAGCTGCAAGTGATCAAGGACGCCCAGAGCCTGCTGCACAGCCTGGATTTTTCCGAGGTGTCCAACGTGCAGCGGCTGATGCGGAAGGACAAGAGAGATGACGGCGACCTGAAGCGGCTGAGGGATCTGAATCAGGCCGTGAACAACCTGGTGGAACTGAAGTCCCAGCAGCAGAAAAACGTGCTGAGCGTGGGCCAGCTGAGCAGCGACGATCTGCTTGTTCTGGCCGCCGACATCGACAGACTGAAGGCCAAGATCACCAGAACCGAGCGGCCTCAGAGCAACGGCGTGTACATGGGAAATCTGACAGCCCAGCAGCTGGAACAGCGGAAGAAACTGCTGGAACTCGTGGGCATGACCCGGCCTAATCTGAGAGCTGGCTCTGATGGCGTCGTCAGAGTGTGGGACGTGAAGAACCCCGACCTGCTGAACAACCAGTTCGGCACCATGCCTAGCCTGACAATCGCCTGCATGACCAAGCAGGGCCAGAGCGACATCAACGATGTGGTGCAGGCACTGACCGACCTGGGCCTGATCTACACCGCCAAGTATCCCAACAGCAGCGACCTGGATCAGCTGGTCAAGACACACCCTGTGCTGGGCATCATCGACACCGAGAAGTCCGCCATCAACGTGTCCGGCTACAACTTCTCTCTGTCTGCCGCCGTGAAAGCCGGCGCTTGTATGCTGGATGGCGGCAACATGCTGGAAACCATCAAAGTGACCCCTCAGAACATCGACCCCATCCTGAAGAAAACCCTGGCCGTGAAGAAAAGCGTGGGGATGTTCGTGTCTGACACCCCTGGCGACAGAAACCCCTACGAGAACCTGCTGTACAAGATCTGCCTGAGCGGCAACGGCTGGCCCTATATCGCCAGCAGAACCAGCATTCTGGGCAGAGCCTGGGACAACACCGTGGTGGATCTGGGCAGCAGCAACCCCATCACCAAGCCTCTGAACCAGCAGGCCAGAGATAAGGTGCCAGGCCTGCAGCAGACAGTGGGCCTGACATACAGCCAGATCATGTGCCTGAAGGACATCATGACCGGCATGGACCCCACCAGCAAGACATGGATCGACATCGAGGGCAGAGCTGAGGACCCTGTGGAAATCGCCATCTACCAACCTGCCGGCGGACAGTACATCCACTTCTACAGAGAGCCCACCGACGCCAAGCAGTTCAAGCAGGACAGCAAGTACAGCCACGGCATCGATATCGTGGACCTGTTCAGAGTGCAGCCCGGACTGACATCTGCCGTGATCGAGTCTCTGCCCAAAGGCATGGTCCTGACCTGTCAGGGCAGCGAGGACATCAGAAAGCTGCTCGACAGCCAGGGCAGAAGAGACATCAAGCTGATCGACGTGATGATGAGCAAGATCGACGCCCGGAAGTTCGAGAACGAAGTGTGGGATGACCTGAAAACCCTCTGCAACATGCACACCGGCGTGGTGCACGAGAAGAAGAAGAGAGGCGGCAAGCAAGAGATCACCCCTCACTGTGCTCTGCTGGACTGCATTATGTACGAGGCCGCCACACAGGGCAGCTACAAGACCCCTAAACTGACCCCTCTGCTGCCTACCGATCTGGTGTTTAGAGCCGGCGCACCCAAAGTGACACTG [서열번호 365]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 365에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 365의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 366으로 제공된다:
AUGAGCAACAGCAAAGAAGUCAAGAGCUUCCUCUGGACACAGGCCCUGAGAAGAGAGCUGAGCCCUUACUGCACCAGCGUGAAGCUGCAAGUGAUCAAGGACGCCCAGAGCCUGCUGCACAGCCUGGAUUUUUCCGAGGUGUCCAACGUGCAGCGGCUGAUGCGGAAGGACAAGAGAGAUGACGGCGACCUGAAGCGGCUGAGGGAUCUGAAUCAGGCCGUGAACAACCUGGUGGAACUGAAGUCCCAGCAGCAGAAAAACGUGCUGAGCGUGGGCCAGCUGAGCAGCGACGAUCUGCUUGUUCUGGCCGCCGACAUCGACAGACUGAAGGCCAAGAUCACCAGAACCGAGCGGCCUCAGAGCAACGGCGUGUACAUGGGAAAUCUGACAGCCCAGCAGCUGGAACAGCGGAAGAAACUGCUGGAACUCGUGGGCAUGACCCGGCCUAAUCUGAGAGCUGGCUCUGAUGGCGUCGUCAGAGUGUGGGACGUGAAGAACCCCGACCUGCUGAACAACCAGUUCGGCACCAUGCCUAGCCUGACAAUCGCCUGCAUGACCAAGCAGGGCCAGAGCGACAUCAACGAUGUGGUGCAGGCACUGACCGACCUGGGCCUGAUCUACACCGCCAAGUAUCCCAACAGCAGCGACCUGGAUCAGCUGGUCAAGACACACCCUGUGCUGGGCAUCAUCGACACCGAGAAGUCCGCCAUCAACGUGUCCGGCUACAACUUCUCUCUGUCUGCCGCCGUGAAAGCCGGCGCUUGUAUGCUGGAUGGCGGCAACAUGCUGGAAACCAUCAAAGUGACCCCUCAGAACAUCGACCCCAUCCUGAAGAAAACCCUGGCCGUGAAGAAAAGCGUGGGGAUGUUCGUGUCUGACACCCCUGGCGACAGAAACCCCUACGAGAACCUGCUGUACAAGAUCUGCCUGAGCGGCAACGGCUGGCCCUAUAUCGCCAGCAGAACCAGCAUUCUGGGCAGAGCCUGGGACAACACCGUGGUGGAUCUGGGCAGCAGCAACCCCAUCACCAAGCCUCUGAACCAGCAGGCCAGAGAUAAGGUGCCAGGCCUGCAGCAGACAGUGGGCCUGACAUACAGCCAGAUCAUGUGCCUGAAGGACAUCAUGACCGGCAUGGACCCCACCAGCAAGACAUGGAUCGACAUCGAGGGCAGAGCUGAGGACCCUGUGGAAAUCGCCAUCUACCAACCUGCCGGCGGACAGUACAUCCACUUCUACAGAGAGCCCACCGACGCCAAGCAGUUCAAGCAGGACAGCAAGUACAGCCACGGCAUCGAUAUCGUGGACCUGUUCAGAGUGCAGCCCGGACUGACAUCUGCCGUGAUCGAGUCUCUGCCCAAAGGCAUGGUCCUGACCUGUCAGGGCAGCGAGGACAUCAGAAAGCUGCUCGACAGCCAGGGCAGAAGAGACAUCAAGCUGAUCGACGUGAUGAUGAGCAAGAUCGACGCCCGGAAGUUCGAGAACGAAGUGUGGGAUGACCUGAAAACCCUCUGCAACAUGCACACCGGCGUGGUGCACGAGAAGAAGAAGAGAGGCGGCAAGCAAGAGAUCACCCCUCACUGUGCUCUGCUGGACUGCAUUAUGUACGAGGCCGCCACACAGGGCAGCUACAAGACCCCUAAACUGACCCCUCUGCUGCCUACCGAUCUGGUGUUUAGAGCCGGCGCACCCAAAGUGACACUG [서열번호 366]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 366에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HCV NS3 단백질(P27958; 게놈 폴리단백질 C형 간염 바이러스 유전자형 1a(H77 단리물)), 또는 그의 동원체이다. HCV NS3 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 367로 나타낸다:
APITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWTVYHGAGTRTIASPKGPVIQTYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPTGHAVGLFRAAVCTRGVAKAVDFIPVENLETTMRSPVFTDNSSPPAVPQSFQVAHLHAPTGSGKSTKVPAAYAAKGYKVLVLNPSVAATLGFGAYMSKAHGVDPNIRTGVRTITTGSPITYSTYGKFLADAGCSGGAYDIIICDECHSTDATSISGIGTVLDQAETAGARLVVLATATPPGSVTVSHPNIEEVALSTTGEIPFYGKAIPLEVIKGGRHLIFCHSKKKCDELAAKLVALGINAVAYYRGLDVSVIPTSGDVVVVSTDALMTGFTGDFDSVIDCNTCVTQTVDFSLDPTFTIETTTLPQDAVSRTQRRGRTGRGKPGIYRFVAPGERPSGMFDSSVLCECYDAGCAWYELTPAETTVRLRAYMNTPGLPVCQDHLGFWEGVFTGLTHIDAHFLSQTKQSGENFPYLVAYQATVCARAQAPPPSWDQMRKCLIRLKPTLHGPTPLLYRLGAVQNEVTLTHPITKYIMTCMSADLEVVT [서열번호 367]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 367에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HCV NS3 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 368의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GCGCCCATCACGGCGTACGCCCAGCAGACGAGAGGCCTCCTAGGGTGTATAATCACCAGCCTGACTGGCCGGGACAAAAACCAAGTGGAGGGTGAGGTCCAGATCGTGTCAACTGCTACCCAGACCTTCCTGGCAACGTGCATCAATGGGGTATGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGAACGAGGACCATCGCATCACCCAAGGGTCCTGTCATCCAGACGTATACCAATGTGGATCAAGACCTCGTGGGCTGGCCCGCTCCTCAAGGTTCCCGCTCATTGACACCCTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTTTACCTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGAGGTGATAGCAGGGGTAGCCTGCTTTCGCCCCGGCCCATTTCCTACTTGAAAGGCTCCTCGGGGGGTCCGCTGTTGTGCCCCACGGGACACGCCGTGGGCCTATTCAGGGCCGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCTGTGGAGAACCTAGAGACAACCATGAGATCCCCGGTGTTCACGGACAACTCCTCTCCACCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACCTGCATGCTCCCACCGGCAGCGGTAAGAGCACCAAGGTCCCGGCTGCGTACGCAGCCAAGGGCTACAAGGTGTTGGTGCTCAACCCCTCTGTTGCTGCAACACTGGGCTTTGGTGCTTACATGTCCAAGGCCCATGGGGTTGATCCTAATATCAGGACCGGGGTGAGAACAATTACCACTGGCAGCCCCATCACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCCGACGCCGGGTGCTCAGGAGGTGCTTATGACATAATAATTTGTGACGAGTGCCACTCCACGGATGCCACATCCATCTCGGGCATCGGCACTGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCGAGACTGGTTGTGCTCGCCACTGCTACCCCTCCGGGCTCCGTCACTGTGTCCCATCCTAACATCGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGAGAGATCCCCTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTCGAGGTGATCAAGGGGGGAAGACATCTCATCTTCTGCCACTCAAAGAAGAAGTGCGACGAGCTCGCCGCGAAGCTGGTCGCATTGGGCATCAATGCCGTGGCCTACTACCGCGGTCTTGACGTGTCTGTCATCCCGACCAGCGGCGATGTTGTCGTCGTGTCGACCGATGCTCTCATGACTGGCTTTACCGGCGACTTCGACTCTGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACTCAGACAGTCGATTTTAGCCTTGACCCTACCTTTACCATTGAGACAACCACGCTCCCCCAGGATGCTGTCTCCAGGACTCAACGCCGGGGCAGGACTGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTATAGATTTGTGGCACCGGGGGAGCGCCCCTCCGGCATGTTCGACTCGTCCGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGTGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACTACAGTTAGGCTACGAGCGTACATGAACACCCCGGGGCTTCCCGTGTGCCAGGACCATCTTGGATTTTGGGAGGGCGTCTTTACGGGCCTCACTCATATAGATGCCCACTTTCTATCCCAGACAAAGCAGAGTGGGGAGAACTTTCCTTACCTGGTAGCGTACCAAGCCACCGTGTGCGCTAGGGCTCAAGCCCCTCCCCCATCGTGGGACCAGATGCGGAAGTGTTTGATCCGCCTTAAACCCACCCTCCATGGGCCAACACCCCTGCTATACAGACTGGGCGCTGTTCAGAATGAAGTCACCCTGACGCACCCAATCACCAAATACATCATGACATGCATGTCGGCCGACCTGGAGGTCGTCACG [서열번호 368]
따라서, 바람직하게는 상기 HCV NS3 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 368에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 HCV NS3 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 369로 제공된다:
GCCCCTATCACAGCCTACGCTCAGCAGACAAGAGGCCTGCTGGGCTGCATCATCACAAGCCTGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGTGGAAGGCGAGGTGCAGATCGTGTCTACAGCTACCCAGACCTTCCTGGCCACCTGTATCAATGGCGTGTGCTGGACCGTGTATCACGGCGCTGGCACCAGAACAATCGCCTCTCCAAAGGGCCCTGTGATCCAGACCTACACCAACGTGGACCAGGATCTCGTTGGCTGGCCTGCTCCTCAGGGCAGCAGATCTCTGACCCCTTGTACATGCGGCAGCAGCGACCTGTACCTGGTCACAAGACACGCCGACGTGATCCCCGTCAGAAGAAGAGGCGATAGCAGAGGCAGCCTGCTGAGCCCTAGACCTATCAGCTACCTGAAGGGCAGCTCTGGCGGACCTCTGCTGTGTCCAACAGGACATGCCGTGGGCCTGTTTAGAGCCGCCGTGTGTACAAGAGGCGTGGCCAAAGCCGTGGACTTCATCCCCGTGGAAAACCTGGAAACCACCATGCGGAGCCCCGTGTTCACCGACAATTCTAGCCCTCCAGCCGTGCCTCAGAGCTTCCAAGTGGCTCATCTGCATGCCCCTACAGGCAGCGGCAAGAGCACAAAAGTGCCTGCCGCCTATGCCGCCAAGGGCTATAAGGTGCTGGTGCTGAATCCCAGCGTGGCCGCCACACTTGGCTTTGGCGCCTATATGTCTAAAGCCCACGGCGTGGACCCCAACATCAGAACCGGCGTGCGGACAATCACAACAGGCAGCCCTATCACCTACTCTACCTACGGCAAGTTCCTGGCCGATGCCGGATGTTCTGGCGGAGCCTACGACATCATCATCTGCGACGAGTGCCACAGCACCGACGCCACATCTATCTCTGGCATCGGCACCGTGCTGGATCAGGCCGAAACAGCTGGTGCTAGACTGGTGGTGCTGGCCACAGCTACACCTCCAGGCTCTGTGACAGTGTCTCACCCCAATATCGAGGAAGTGGCCCTGTCTACAACCGGCGAGATCCCATTCTATGGCAAGGCCATTCCTCTGGAAGTGATCAAAGGCGGCAGACACCTGATCTTTTGCCACTCCAAGAAGAAGTGCGACGAGCTGGCCGCCAAACTGGTGGCCCTTGGAATCAATGCCGTGGCCTACTACAGAGGACTGGACGTGTCCGTGATTCCCACATCTGGCGACGTGGTGGTGGTGTCCACTGATGCCCTGATGACCGGCTTCACCGGCGACTTCGATAGCGTGATCGACTGCAATACCTGCGTGACCCAGACCGTGGATTTCTCTCTGGACCCCACCTTCACCATCGAGACAACCACACTGCCTCAGGACGCCGTGTCTCGGACACAGAGAAGAGGCAGAACCGGAAGAGGCAAGCCCGGCATCTACAGATTTGTGGCCCCTGGCGAAAGACCCAGCGGCATGTTTGATAGCAGCGTGCTGTGCGAGTGCTACGATGCTGGCTGTGCTTGGTACGAGCTGACCCCTGCCGAGACTACCGTTAGACTGCGGGCCTACATGAACACCCCTGGCCTGCCTGTGTGTCAGGACCACCTCGGATTTTGGGAGGGCGTGTTCACAGGACTGACCCACATCGACGCCCACTTTCTGAGCCAGACAAAGCAGAGCGGCGAGAACTTCCCTTACCTGGTGGCTTACCAGGCCACCGTGTGTGCTAGAGCACAAGCCCCTCCACCTAGCTGGGACCAGATGAGGAAGTGCCTGATCCGGCTGAAGCCTACACTGCACGGACCAACACCACTGCTGTATAGACTGGGCGCCGTGCAGAACGAAGTGACCCTGACACATCCCATCACCAAGTACATCATGACCTGCATGAGCGCCGACCTGGAAGTGGTCACA [서열번호 369]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 369에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 369의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 370으로 제공된다:
GCCCCUAUCACAGCCUACGCUCAGCAGACAAGAGGCCUGCUGGGCUGCAUCAUCACAAGCCUGACCGGCAGAGACAAGAACCAGGUGGAAGGCGAGGUGCAGAUCGUGUCUACAGCUACCCAGACCUUCCUGGCCACCUGUAUCAAUGGCGUGUGCUGGACCGUGUAUCACGGCGCUGGCACCAGAACAAUCGCCUCUCCAAAGGGCCCUGUGAUCCAGACCUACACCAACGUGGACCAGGAUCUCGUUGGCUGGCCUGCUCCUCAGGGCAGCAGAUCUCUGACCCCUUGUACAUGCGGCAGCAGCGACCUGUACCUGGUCACAAGACACGCCGACGUGAUCCCCGUCAGAAGAAGAGGCGAUAGCAGAGGCAGCCUGCUGAGCCCUAGACCUAUCAGCUACCUGAAGGGCAGCUCUGGCGGACCUCUGCUGUGUCCAACAGGACAUGCCGUGGGCCUGUUUAGAGCCGCCGUGUGUACAAGAGGCGUGGCCAAAGCCGUGGACUUCAUCCCCGUGGAAAACCUGGAAACCACCAUGCGGAGCCCCGUGUUCACCGACAAUUCUAGCCCUCCAGCCGUGCCUCAGAGCUUCCAAGUGGCUCAUCUGCAUGCCCCUACAGGCAGCGGCAAGAGCACAAAAGUGCCUGCCGCCUAUGCCGCCAAGGGCUAUAAGGUGCUGGUGCUGAAUCCCAGCGUGGCCGCCACACUUGGCUUUGGCGCCUAUAUGUCUAAAGCCCACGGCGUGGACCCCAACAUCAGAACCGGCGUGCGGACAAUCACAACAGGCAGCCCUAUCACCUACUCUACCUACGGCAAGUUCCUGGCCGAUGCCGGAUGUUCUGGCGGAGCCUACGACAUCAUCAUCUGCGACGAGUGCCACAGCACCGACGCCACAUCUAUCUCUGGCAUCGGCACCGUGCUGGAUCAGGCCGAAACAGCUGGUGCUAGACUGGUGGUGCUGGCCACAGCUACACCUCCAGGCUCUGUGACAGUGUCUCACCCCAAUAUCGAGGAAGUGGCCCUGUCUACAACCGGCGAGAUCCCAUUCUAUGGCAAGGCCAUUCCUCUGGAAGUGAUCAAAGGCGGCAGACACCUGAUCUUUUGCCACUCCAAGAAGAAGUGCGACGAGCUGGCCGCCAAACUGGUGGCCCUUGGAAUCAAUGCCGUGGCCUACUACAGAGGACUGGACGUGUCCGUGAUUCCCACAUCUGGCGACGUGGUGGUGGUGUCCACUGAUGCCCUGAUGACCGGCUUCACCGGCGACUUCGAUAGCGUGAUCGACUGCAAUACCUGCGUGACCCAGACCGUGGAUUUCUCUCUGGACCCCACCUUCACCAUCGAGACAACCACACUGCCUCAGGACGCCGUGUCUCGGACACAGAGAAGAGGCAGAACCGGAAGAGGCAAGCCCGGCAUCUACAGAUUUGUGGCCCCUGGCGAAAGACCCAGCGGCAUGUUUGAUAGCAGCGUGCUGUGCGAGUGCUACGAUGCUGGCUGUGCUUGGUACGAGCUGACCCCUGCCGAGACUACCGUUAGACUGCGGGCCUACAUGAACACCCCUGGCCUGCCUGUGUGUCAGGACCACCUCGGAUUUUGGGAGGGCGUGUUCACAGGACUGACCCACAUCGACGCCCACUUUCUGAGCCAGACAAAGCAGAGCGGCGAGAACUUCCCUUACCUGGUGGCUUACCAGGCCACCGUGUGUGCUAGAGCACAAGCCCCUCCACCUAGCUGGGACCAGAUGAGGAAGUGCCUGAUCCGGCUGAAGCCUACACUGCACGGACCAACACCACUGCUGUAUAGACUGGGCGCCGUGCAGAACGAAGUGACCCUGACACAUCCCAUCACCAAGUACAUCAUGACCUGCAUGAGCGCCGACCUGGAAGUGGUCACA [서열번호 370]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 370에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DENV 1 NS4A 단백질(P17763; 게놈 폴리단백질 뎅기 바이러스 타입 1(나우루/West Pac/1974 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. DENV 1 NS4A 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 371로 나타낸다:
SVSGDLILEIGKLPQHLTQRAQNALDNLVMLHNSEQGGKAYRHAMEELPDTIETLMLLALIAVLTGGVTLFFLSGRGLGKTSIGLLCVIASSALLWMASVEPHWIAASIILEFFLMVLLIPEPDRQR [서열번호 371]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 371에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DENV 1 NS4A 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 372의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
AGCGTCTCAGGTGACCTAATATTAGAAATAGGGAAACTTCCACAACATTTAACGCAAAGGGCCCAGAACGCCTTGGACAATCTGGTTATGTTGCACAACTCTGAACAAGGAGGAAAAGCCTATAGACACGCCATGGAAGAACTACCAGACACCATAGAAACGTTAATGCTCCTAGCTTTGATAGCTGTGCTGACTGGTGGAGTGACGTTGTTCTTCCTATCAGGAAGGGGTCTAGGAAAAACATCCATTGGCCTACTCTGCGTGATTGCCTCAAGCGCACTGCTATGGATGGCCAGTGTGGAACCCCATTGGATAGCGGCCTCTATCATACTGGAGTTCTTTCTGATGGTGTTGCTTATTCCAGAGCCGGACAGACAGCGC [서열번호 372]
따라서, 바람직하게는 상기 DENV 1 NS4A 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 372에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DENV 1 NS4A 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 373으로 제공된다:
TCCGTTAGCGGCGACCTGATCCTGGAAATCGGCAAGCTGCCTCAGCACCTGACACAGAGAGCACAGAACGCCCTGGACAACCTGGTCATGCTGCACAACTCTGAGCAAGGCGGCAAGGCCTACAGACACGCCATGGAAGAACTGCCCGACACCATCGAGACACTGATGCTGCTGGCCCTGATCGCTGTTCTGACAGGCGGAGTGACCCTGTTCTTCCTGTCTGGCAGAGGCCTGGGCAAGACCTCTATCGGACTGCTGTGTGTGATCGCCAGCTCTGCCCTGCTGTGGATGGCTTCTGTGGAACCTCATTGGATCGCCGCCTCTATTATCCTGGAATTCTTCCTGATGGTGCTGCTGATCCCCGAGCCTGACAGACAGAGA [서열번호 373]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 373에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 373의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 374로 제공된다:
UCCGUUAGCGGCGACCUGAUCCUGGAAAUCGGCAAGCUGCCUCAGCACCUGACACAGAGAGCACAGAACGCCCUGGACAACCUGGUCAUGCUGCACAACUCUGAGCAAGGCGGCAAGGCCUACAGACACGCCAUGGAAGAACUGCCCGACACCAUCGAGACACUGAUGCUGCUGGCCCUGAUCGCUGUUCUGACAGGCGGAGUGACCCUGUUCUUCCUGUCUGGCAGAGGCCUGGGCAAGACCUCUAUCGGACUGCUGUGUGUGAUCGCCAGCUCUGCCCUGCUGUGGAUGGCUUCUGUGGAACCUCAUUGGAUCGCCGCCUCUAUUAUCCUGGAAUUCUUCCUGAUGGUGCUGCUGAUCCCCGAGCCUGACAGACAGAGA [서열번호 374]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 374에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DENV 1 NS2A(P17763; 게놈 폴리단백질 뎅기 바이러스 타입 1(나우루/West Pac/1974 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. DENV 1 NS2A의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 375로 나타낸다:
GSGEVDSFSLGLLCISIMIEEVMRSRWSRKMLMTGTLAVFLLLTMGQLTWNDLIRLCIMVGANASDKMGMGTTYLALMATFRMRPMFAVGLLFRRLTSREVLLLTVGLSLVASVELPNSLEELGDGLAMGIMMLKLLTDFQSHQLWATLLSLTFVKTTFSLHYAWKTMAMILSIVSLFPLCLSTTSQKTTWLPVLLGSLGCKPLTMFLITENKIWGRK [서열번호 375]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 375에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DENV 1 NS2A 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 376의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGGTCAGGAGAAGTGGACAGTTTTTCACTAGGACTGCTATGCATATCAATAATGATCGAAGAGGTAATGAGATCCAGATGGAGCAGAAAAATGCTGATGACTGGAACATTGGCTGTGTTCCTCCTTCTCACAATGGGACAATTGACATGGAATGATCTGATCAGGCTATGTATCATGGTTGGAGCCAACGCTTCAGACAAGATGGGGATGGGAACAACGTACCTAGCTTTGATGGCCACTTTCAGAATGAGACCAATGTTCGCAGTCGGGCTACTGTTTCGCAGATTAACATCTAGAGAAGTTCTTCTTCTTACAGTTGGATTGAGTCTGGTGGCATCTGTAGAACTACCAAATTCCTTAGAGGAGCTAGGGGATGGACTTGCAATGGGCATCATGATGTTGAAATTACTGACTGATTTTCAGTCACATCAGCTATGGGCTACCTTGCTGTCTTTAACATTTGTCAAAACAACTTTTTCATTGCACTATGCATGGAAGACAATGGCTATGATACTGTCAATTGTATCTCTCTTCCCTTTATGCCTGTCCACGACTTCTCAAAAAACAACATGGCTTCCGGTGTTGCTGGGATCTCTTGGATGCAAACCACTAACCATGTTTCTTATAACAGAAAACAAAATCTGGGGAAGGAAA [서열번호 376]
따라서, 바람직하게는 상기 DENV 1 NS2A 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 376에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DENV 1 NS2A 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 377로 제공된다:
GGATCTGGCGAGGTGGACTCTTTTTCTCTGGGCCTGCTGTGCATCAGCATCATGATCGAGGAAGTGATGCGGAGCCGCTGGTCCCGGAAAATGCTGATGACTGGAACCCTGGCCGTGTTCCTGCTGCTGACAATGGGACAGCTGACCTGGAACGACCTGATCCGGCTGTGTATCATGGTCGGAGCCAACGCCAGCGACAAGATGGGCATGGGCACAACCTATCTGGCCCTGATGGCCACCTTCCGGATGAGGCCTATGTTTGCCGTGGGACTGCTGTTCAGAAGGCTGACCTCTAGAGAGGTGCTGCTGCTCACAGTGGGCCTGTCTCTGGTGGCTTCTGTGGAACTGCCCAACAGCCTGGAAGAACTCGGAGATGGACTGGCCATGGGCATTATGATGCTCAAGCTGCTGACCGACTTCCAGAGCCACCAGCTGTGGGCTACACTGCTGAGCCTGACCTTCGTGAAAACCACCTTCAGCCTGCACTACGCCTGGAAAACAATGGCCATGATCCTGAGCATCGTGTCTCTGTTCCCTCTGTGCCTGAGCACCACCAGCCAGAAAACCACATGGCTGCCTGTGCTGCTGGGCTCTCTGGGCTGTAAACCCCTGACCATGTTCCTGATCACCGAGAACAAGATCTGGGGCAGAAAG [서열번호 377]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 377에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 377의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 378로 제공된다:
GGAUCUGGCGAGGUGGACUCUUUUUCUCUGGGCCUGCUGUGCAUCAGCAUCAUGAUCGAGGAAGUGAUGCGGAGCCGCUGGUCCCGGAAAAUGCUGAUGACUGGAACCCUGGCCGUGUUCCUGCUGCUGACAAUGGGACAGCUGACCUGGAACGACCUGAUCCGGCUGUGUAUCAUGGUCGGAGCCAACGCCAGCGACAAGAUGGGCAUGGGCACAACCUAUCUGGCCCUGAUGGCCACCUUCCGGAUGAGGCCUAUGUUUGCCGUGGGACUGCUGUUCAGAAGGCUGACCUCUAGAGAGGUGCUGCUGCUCACAGUGGGCCUGUCUCUGGUGGCUUCUGUGGAACUGCCCAACAGCCUGGAAGAACUCGGAGAUGGACUGGCCAUGGGCAUUAUGAUGCUCAAGCUGCUGACCGACUUCCAGAGCCACCAGCUGUGGGCUACACUGCUGAGCCUGACCUUCGUGAAAACCACCUUCAGCCUGCACUACGCCUGGAAAACAAUGGCCAUGAUCCUGAGCAUCGUGUCUCUGUUCCCUCUGUGCCUGAGCACCACCAGCCAGAAAACCACAUGGCUGCCUGUGCUGCUGGGCUCUCUGGGCUGUAAACCCCUGACCAUGUUCCUGAUCACCGAGAACAAGAUCUGGGGCAGAAAG [서열번호 378]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 378에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DENV 2 NS2A(P29990; 게놈 폴리단백질 뎅기 바이러스 타입 2(태국/16681/1984 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. DENV 2 NS2A의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 379로 나타낸다:
GHGQVDNFSLGVLGMALFLEEMLRTRVGTKHAILLVAVSFVTLIIGNMSFRDLGRVMVMVGATMTDDIGMGVTYLALLAAFKVRPTFAAGLLLRKLTSKALMMTTIGIVLSSQSTTPETILELTDALALGMMVLKMVRNMEKYQLAVTIMAILCVPNAVILQNAWKVSCTILAVVSVSPLFLTSSQQKTDWIPLALTIKGLNPTAIFLTTLSRTSKKR [서열번호 379]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 379에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DENV 2 NS2A 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 380의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGACATGGGCAGGTCGACAACTTTTCACTAGGAGTCTTGGGAATGGCATTGTTCCTGGAGGAAATGCTTAGGACCCGAGTAGGAACGAAACATGCAATACTACTAGTTGCAGTTTCTTTTGTGACATTGATCATAGGGAACATGTCCTTTAGAGACCTGGGAAGAGTAATGGTTATGGTAGGCGCCACTATGACGGATGACATAGGTATGGGCGTGACTTATCTTGCCCTACTAGCAGCCTTCAAAGTCAGACCAACTTTTGCAGCTGGACTACTCTTGAGAAAGCTGACCTCCAAGGCATTGATGATGACTACTATAGGAATTGTACTCTCCTCCCAGAGCACTACACCAGAGACCATTCTTGAGTTGACTGATGCGTTAGCCTTAGGCATGATGGTCCTCAAAATGGTGAGAAATATGGAAAAGTATCAATTGGCAGTGACTATCATGGCTATCTTGTGCGTCCCAAACGCAGTGATATTACAAAACGCATGGAAAGTGAGTTGCACGATATTGGCAGTGGTGTCCGTTTCCCCACTGTTCTTAACATCCTCACAGCAAAAAACGGATTGGATACCATTAGCGTTGACGATCAAAGGTCTCAATCCAACAGCTATTTTTCTAACAACCCTCTCAAGAACCAGCAAGAAAAGG [서열번호 380]
따라서, 바람직하게는 상기 DENV 2 NS2A 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 380에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DENV 2 NS2A 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 381로 제공된다:
GGACACGGACAGGTGGACAATTTTTCCCTGGGCGTGCTCGGCATGGCCCTGTTTCTGGAAGAGATGCTGAGAACCAGAGTGGGCACCAAGCACGCCATTCTGCTGGTGGCCGTGTCCTTCGTGACACTGATCATCGGCAACATGAGCTTCCGCGACCTGGGCAGAGTGATGGTCATGGTCGGAGCCACCATGACCGACGATATCGGCATGGGCGTGACCTATCTGGCTCTGCTGGCCGCTTTTAAAGTGCGGCCTACATTTGCCGCCGGACTGCTGCTGAGAAAGCTGACATCTAAGGCCCTGATGATGACCACCATCGGCATCGTGCTGAGCAGCCAGAGCACCACACCTGAGACAATCCTGGAACTGACCGACGCTCTGGCCCTGGGAATGATGGTGCTGAAGATGGTCCGAAACATGGAAAAGTACCAGCTGGCCGTGACCATCATGGCCATCCTGTGTGTGCCCAACGCCGTGATCCTGCAGAACGCCTGGAAGGTGTCCTGTACCATCCTGGCCGTGGTGTCTGTGTCCCCTCTGTTTCTGACCAGCAGCCAGCAGAAAACCGACTGGATCCCACTGGCTCTGACCATCAAGGGCCTGAATCCTACCGCCATCTTCCTGACCACACTGAGCCGGACCAGCAAGAAGAGA [서열번호 381]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 381에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 381의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 382로 제공된다:
GGACACGGACAGGUGGACAAUUUUUCCCUGGGCGUGCUCGGCAUGGCCCUGUUUCUGGAAGAGAUGCUGAGAACCAGAGUGGGCACCAAGCACGCCAUUCUGCUGGUGGCCGUGUCCUUCGUGACACUGAUCAUCGGCAACAUGAGCUUCCGCGACCUGGGCAGAGUGAUGGUCAUGGUCGGAGCCACCAUGACCGACGAUAUCGGCAUGGGCGUGACCUAUCUGGCUCUGCUGGCCGCUUUUAAAGUGCGGCCUACAUUUGCCGCCGGACUGCUGCUGAGAAAGCUGACAUCUAAGGCCCUGAUGAUGACCACCAUCGGCAUCGUGCUGAGCAGCCAGAGCACCACACCUGAGACAAUCCUGGAACUGACCGACGCUCUGGCCCUGGGAAUGAUGGUGCUGAAGAUGGUCCGAAACAUGGAAAAGUACCAGCUGGCCGUGACCAUCAUGGCCAUCCUGUGUGUGCCCAACGCCGUGAUCCUGCAGAACGCCUGGAAGGUGUCCUGUACCAUCCUGGCCGUGGUGUCUGUGUCCCCUCUGUUUCUGACCAGCAGCCAGCAGAAAACCGACUGGAUCCCACUGGCUCUGACCAUCAAGGGCCUGAAUCCUACCGCCAUCUUCCUGACCACACUGAGCCGGACCAGCAAGAAGAGA [서열번호 382]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 382에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DENV 4 NS2A(P09866; 게놈 폴리단백질 뎅기 바이러스 타입 4(도미니카/814669/1981 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. DENV 4 NS2A의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 383으로 나타낸다:
GQGTSETFSMGLLCLTLFVEECLRRRVTRKHMILVVVITLCAIILGGLTWMDLLRALIMLGDTMSGRIGGQIHLAIMAVFKMSPGYVLGVFLRKLTSRETALMVIGMAMTTVLSIPHDLMELIDGISLGLILLKIVTQFDNTQVGTLALSLTFIRSTMPLVMAWRTIMAVLFVVTLIPLCRTSCLQKQSHWVEITALILGAQALPVYLMTLMKGASRR [서열번호 383]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 383에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DENV 4 NS2A 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 384의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGACAGGGCACATCAGAAACTTTTTCTATGGGTCTGTTGTGCCTGACCTTGTTTGTGGAAGAATGCTTGAGGAGAAGAGTCACTAGGAAACACATGATATTAGTTGTGGTGATCACTCTTTGTGCTATCATCCTGGGAGGCCTCACATGGATGGACTTACTACGAGCCCTCATCATGTTGGGGGACACTATGTCTGGTAGAATAGGAGGACAGATCCACCTAGCCATCATGGCAGTGTTCAAGATGTCACCAGGATACGTGCTGGGTGTGTTTTTAAGGAAACTCACTTCAAGAGAGACAGCACTAATGGTAATAGGAATGGCCATGACAACGGTGCTTTCAATTCCACATGACCTTATGGAACTCATTGATGGAATATCACTGGGACTAATTTTGCTAAAAATAGTAACACAGTTTGACAACACCCAAGTGGGAACCTTAGCTCTTTCCTTGACTTTCATAAGATCAACAATGCCATTGGTCATGGCTTGGAGGACCATTATGGCTGTGTTGTTTGTGGTCACACTCATTCCTTTGTGCAGGACAAGCTGTCTTCAAAAACAGTCTCATTGGGTAGAAATAACAGCACTCATCCTAGGAGCCCAAGCTCTGCCAGTGTACCTAATGACTCTTATGAAAGGAGCCTCAAGAAGA [서열번호 384]
따라서, 바람직하게는 상기 DENV 4 NS2A 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 384에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DENV 4 NS2A 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 385로 제공된다:
GGCCAGGGAACAAGCGAGACATTTTCCATGGGCCTGCTGTGTCTGACCCTGTTCGTGGAAGAGTGCCTGCGGAGAAGAGTGACCCGGAAGCACATGATCCTGGTGGTGGTCATCACCCTGTGCGCCATCATTCTCGGCGGCCTGACATGGATGGATCTGCTGAGAGCCCTGATCATGCTGGGCGATACCATGAGCGGCAGAATCGGCGGACAGATCCACCTGGCCATCATGGCCGTGTTCAAGATGAGCCCTGGCTACGTGCTGGGCGTGTTCCTGAGAAAGCTGACCAGCAGAGAAACAGCCCTGATGGTCATCGGAATGGCCATGACCACCGTGCTGAGCATCCCTCACGACCTGATGGAACTGATCGACGGCATCAGCCTGGGCCTGATCCTGCTGAAGATCGTGACCCAGTTCGACAACACCCAAGTGGGCACACTGGCCCTGAGCCTGACCTTCATCAGATCCACAATGCCCCTCGTGATGGCCTGGCGGACAATTATGGCCGTGCTGTTCGTCGTGACACTGATCCCTCTGTGCAGAACCAGCTGCCTGCAGAAACAGAGCCACTGGGTCGAGATCACCGCTCTGATTCTGGGAGCACAGGCCCTGCCTGTGTACCTGATGACACTTATGAAGGGCGCCAGCAGACGG [서열번호 385]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 385에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 385의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 386으로 제공된다:
GGCCAGGGAACAAGCGAGACAUUUUCCAUGGGCCUGCUGUGUCUGACCCUGUUCGUGGAAGAGUGCCUGCGGAGAAGAGUGACCCGGAAGCACAUGAUCCUGGUGGUGGUCAUCACCCUGUGCGCCAUCAUUCUCGGCGGCCUGACAUGGAUGGAUCUGCUGAGAGCCCUGAUCAUGCUGGGCGAUACCAUGAGCGGCAGAAUCGGCGGACAGAUCCACCUGGCCAUCAUGGCCGUGUUCAAGAUGAGCCCUGGCUACGUGCUGGGCGUGUUCCUGAGAAAGCUGACCAGCAGAGAAACAGCCCUGAUGGUCAUCGGAAUGGCCAUGACCACCGUGCUGAGCAUCCCUCACGACCUGAUGGAACUGAUCGACGGCAUCAGCCUGGGCCUGAUCCUGCUGAAGAUCGUGACCCAGUUCGACAACACCCAAGUGGGCACACUGGCCCUGAGCCUGACCUUCAUCAGAUCCACAAUGCCCCUCGUGAUGGCCUGGCGGACAAUUAUGGCCGUGCUGUUCGUCGUGACACUGAUCCCUCUGUGCAGAACCAGCUGCCUGCAGAAACAGAGCCACUGGGUCGAGAUCACCGCUCUGAUUCUGGGAGCACAGGCCCUGCCUGUGUACCUGAUGACACUUAUGAAGGGCGCCAGCAGACGG [서열번호 386]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 386에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DENV 1 NS2B(P17763; 게놈 폴리단백질 뎅기 바이러스 타입 1(나우루/West Pac/1974 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. DENV 1 NS2B의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 387로 나타낸다:
SWPLNEGIMAVGIVSILLSSLLKNDVPLAGPLIAGGMLIACYVISGSSADLSLEKAAEVSWEEEAEHSGASHNILVEVQDDGTMKIKDEERDDTLTILLKATLLAISGVYPMSIPATLFVWYFWQKKKQR [서열번호 387]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 387에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DENV 1 NS2B 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 388의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
AGCTGGCCTCTCAATGAAGGAATTATGGCTGTTGGAATAGTTAGCATTCTTCTAAGTTCACTTCTCAAGAATGATGTGCCACTAGCTGGCCCACTAATAGCTGGAGGCATGCTAATAGCATGTTATGTCATATCTGGAAGCTCGGCCGATTTATCACTGGAGAAAGCGGCTGAGGTCTCCTGGGAAGAAGAAGCAGAACACTCTGGTGCCTCACACAACATACTAGTGGAGGTCCAAGATGATGGAACCATGAAGATAAAGGATGAAGAGAGAGATGACACACTCACCATTCTCCTCAAAGCAACTCTGCTAGCAATCTCAGGGGTATACCCAATGTCAATACCGGCGACCCTCTTTGTGTGGTATTTTTGGCAGAAAAAGAAACAGAGA [서열번호 388]
따라서, 바람직하게는 상기 DENV 1 NS2B 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 388에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DENV 1 NS2B 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 389로 제공된다:
AGCTGGCCTCTGAACGAGGGAATTATGGCCGTGGGCATCGTGTCCATCCTGCTGTCTAGCCTGCTGAAGAACGACGTGCCACTGGCCGGACCTCTTATTGCTGGCGGAATGCTGATCGCCTGCTACGTGATCAGCGGCAGCTCTGCCGATCTGAGCCTGGAAAAAGCCGCCGAGGTGTCCTGGGAAGAAGAGGCCGAACATTCTGGCGCCTCTCACAACATCCTGGTGGAAGTGCAGGACGACGGCACCATGAAGATCAAGGACGAGGAACGGGACGACACCCTGACCATTCTGCTGAAGGCTACCCTGCTGGCCATCAGCGGAGTGTACCCTATGAGCATCCCCGCCACTCTGTTCGTGTGGTACTTCTGGCAGAAGAAGAAGCAGCGG [서열번호 389]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 389에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 389의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 390으로 제공된다:
AGCUGGCCUCUGAACGAGGGAAUUAUGGCCGUGGGCAUCGUGUCCAUCCUGCUGUCUAGCCUGCUGAAGAACGACGUGCCACUGGCCGGACCUCUUAUUGCUGGCGGAAUGCUGAUCGCCUGCUACGUGAUCAGCGGCAGCUCUGCCGAUCUGAGCCUGGAAAAAGCCGCCGAGGUGUCCUGGGAAGAAGAGGCCGAACAUUCUGGCGCCUCUCACAACAUCCUGGUGGAAGUGCAGGACGACGGCACCAUGAAGAUCAAGGACGAGGAACGGGACGACACCCUGACCAUUCUGCUGAAGGCUACCCUGCUGGCCAUCAGCGGAGUGUACCCUAUGAGCAUCCCCGCCACUCUGUUCGUGUGGUACUUCUGGCAGAAGAAGAAGCAGCGG [서열번호 390]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 390에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DENV 2 NS2B(P29990; 게놈 폴리단백질 뎅기 바이러스 타입 2(태국/16681/1984 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. DENV 2 NS2B의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 391로 나타낸다:
SWPLNEAIMAVGMVSILASSLLKNDIPMTGPLVAGGPLTVCYVLTGRSADLELERAADVKWEDQAEISGSSPILSITISEDGSMSIKNEEEEQTLTILIRTGLLVISGLFPVSIPITAAAWYLWEVKKQR [서열번호 391]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 391에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DENV 2 NS2B 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 392의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
AGCTGGCCATTAAATGAGGCTATCATGGCAGTCGGGATGGTGAGCATTTTAGCCAGTTCTCTCCTAAAAAATGATATTCCCATGACAGGACCATTAGTGGCTGGAGGGCCCCTCACTGTGTGCTACGTGCTCACTGGACGATCGGCCGATTTGGAACTGGAGAGAGCAGCCGATGTCAAATGGGAAGACCAGGCAGAGATATCAGGAAGCAGCCCAATCCTGTCAATAACAATATCAGAAGATGGTAGCATGTCGATAAAAAATGAAGAGGAAGAACAAACACTGACCATACTCATTAGAACAGGATTGCTGGTGATCTCAGGACTTTTTCCTGTATCAATACCAATCACGGCAGCAGCATGGTACCTGTGGGAAGTGAAGAAACAACGG [서열번호 392]
따라서, 바람직하게는 상기 DENV 2 NS2B 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 392에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DENV 2 NS2B 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 393으로 제공된다:
AGCTGGCCTCTGAACGAGGCCATTATGGCCGTCGGCATGGTGTCTATCCTGGCCAGCAGCCTGCTGAAGAACGACATCCCTATGACAGGCCCTCTGGTGGCTGGTGGACCTCTGACAGTGTGTTACGTGCTGACAGGCAGAAGCGCCGACCTGGAACTTGAAAGGGCCGCTGATGTGAAGTGGGAAGATCAGGCCGAGATCAGCGGCAGCAGCCCTATCCTGAGCATCACCATCAGCGAGGACGGCAGCATGAGCATCAAGAACGAGGAAGAGGAACAGACCCTGACCATCCTGATCAGAACCGGCCTGCTGGTCATCAGCGGACTGTTCCCTGTGTCAATCCCCATCACAGCCGCCGCTTGGTATCTGTGGGAAGTGAAGAAGCAGCGG [서열번호 393]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 393에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 393의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 394로 제공된다:
AGCUGGCCUCUGAACGAGGCCAUUAUGGCCGUCGGCAUGGUGUCUAUCCUGGCCAGCAGCCUGCUGAAGAACGACAUCCCUAUGACAGGCCCUCUGGUGGCUGGUGGACCUCUGACAGUGUGUUACGUGCUGACAGGCAGAAGCGCCGACCUGGAACUUGAAAGGGCCGCUGAUGUGAAGUGGGAAGAUCAGGCCGAGAUCAGCGGCAGCAGCCCUAUCCUGAGCAUCACCAUCAGCGAGGACGGCAGCAUGAGCAUCAAGAACGAGGAAGAGGAACAGACCCUGACCAUCCUGAUCAGAACCGGCCUGCUGGUCAUCAGCGGACUGUUCCCUGUGUCAAUCCCCAUCACAGCCGCCGCUUGGUAUCUGUGGGAAGUGAAGAAGCAGCGG [서열번호 394]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 394에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 DENV 4 NS2B(P09866; 게놈 폴리단백질 바이러스 타입 4(도미니카/814669/1981 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. DENV 4 NS2B의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 395로 나타낸다:
SWPLNEGIMAVGLVSLLGSALLKNDVPLAGPMVAGGLLLAAYVMSGSSADLSLEKAANVQWDEMADITGSSPIIEVKQDEDGSFSIRDVEETNMITLLVKLALITVSGLYPLAIPVTMTLWYMWQVKTQR [서열번호 395]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 395에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 DENV 4 NS2B 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 396의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
TCTTGGCCTCTTAACGAGGGCATAATGGCTGTGGGTTTGGTTAGTCTCTTAGGAAGCGCTCTTTTAAAGAATGATGTCCCTTTAGCTGGCCCAATGGTGGCAGGAGGCTTACTTCTGGCGGCTTACGTGATGAGTGGTAGCTCAGCAGATCTGTCACTAGAGAAGGCCGCCAACGTGCAGTGGGATGAAATGGCAGACATAACAGGCTCAAGCCCAATCATAGAAGTGAAGCAGGATGAAGATGGCTCTTTCTCCATACGGGACGTCGAGGAAACCAATATGATAACCCTTTTGGTGAAACTGGCACTGATAACAGTGTCAGGTCTCTACCCCTTGGCAATTCCAGTCACAATGACCTTATGGTACATGTGGCAAGTGAAAACACAAAGA [서열번호 396]
따라서, 바람직하게는 상기 DENV 4 NS2B 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 396에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 DENV 4 NS2B 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 397로 제공된다:
AGCTGGCCTCTGAACGAGGGAATCATGGCCGTTGGCCTGGTGTCTCTGCTGGGATCTGCCCTGCTGAAGAACGATGTGCCTCTGGCCGGACCTATGGTTGCTGGTGGACTGCTGCTGGCCGCCTATGTGATGTCTGGAAGCAGCGCCGATCTGAGCCTGGAAAAGGCCGCTAACGTGCAGTGGGACGAGATGGCCGATATCACAGGCAGCAGCCCCATCATCGAAGTGAAGCAGGATGAGGACGGCAGCTTCAGCATCCGCGACGTGGAAGAGACAAACATGATCACCCTGCTGGTCAAGCTGGCCCTGATCACCGTGTCTGGCCTGTATCCTCTGGCTATCCCCGTGACCATGACACTGTGGTACATGTGGCAAGTGAAAACCCAGCGG [서열번호 397]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 397에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 397의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 398로 제공된다:
AGCUGGCCUCUGAACGAGGGAAUCAUGGCCGUUGGCCUGGUGUCUCUGCUGGGAUCUGCCCUGCUGAAGAACGAUGUGCCUCUGGCCGGACCUAUGGUUGCUGGUGGACUGCUGCUGGCCGCCUAUGUGAUGUCUGGAAGCAGCGCCGAUCUGAGCCUGGAAAAGGCCGCUAACGUGCAGUGGGACGAGAUGGCCGAUAUCACAGGCAGCAGCCCCAUCAUCGAAGUGAAGCAGGAUGAGGACGGCAGCUUCAGCAUCCGCGACGUGGAAGAGACAAACAUGAUCACCCUGCUGGUCAAGCUGGCCCUGAUCACCGUGUCUGGCCUGUAUCCUCUGGCUAUCCCCGUGACCAUGACACUGUGGUACAUGUGGCAAGUGAAAACCCAGCGG [서열번호 398]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 398에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 WNV NS4A(P06935; 게놈 폴리단백질 웨스트 나일 바이러스(West Nile virus) NS4A), 또는 그의 동원체이다. WNV NS4A의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 399로 나타낸다:
SQIGLVEVLGRMPEHFMVKTWEALDTMYVVATAEKGGRAHRMALEELPDALQTIVLIALLSVMSLGVFFLLMQRKGIGKIGLGGVILGAATFFCWMAEVPGTKIAGMLLLSLLLMIVLIPEPEKQR [서열번호 399]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 399에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 WNV NS4A 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 400의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
TCACAAATCGGGCTCGTTGAGGTGCTCGGGAGAATGCCTGAACACTTCATGGTGAAAACTTGGGAGGCATTGGACACGATGTATGTGGTGGCGACCGCTGAAAAAGGAGGCCGAGCTCACAGGATGGCTCTTGAGGAGCTACCGGACGCCCTTCAGACAATAGTTTTGATTGCACTATTGAGTGTGATGTCCTTAGGTGTGTTTTTTCTACTCATGCAAAGGAAGGGCATTGGTAAGATTGGCTTGGGAGGAGTAATCTTAGGAGCTGCCACATTCTTCTGCTGGATGGCTGAAGTCCCAGGAACGAAAATAGCAGGCATGCTCCTGCTTTCCCTGCTGCTCATGATTGTTTTGATTCCGGAGCCGGAAAAGCAGCGC [서열번호 400]
따라서, 바람직하게는 상기 WNV NS4A 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 400에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 WNV NS4A 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 401로 제공된다:
TCTCAGATCGGCCTGGTGGAAGTGCTGGGCAGAATGCCTGAGCACTTCATGGTCAAGACCTGGGAAGCCCTGGACACTATGTACGTGGTGGCCACAGCCGAGAAAGGCGGCAGAGCACATAGAATGGCCCTGGAAGAACTGCCCGACGCTCTGCAGACAATCGTGCTGATTGCCCTGCTGAGCGTGATGAGCCTGGGCGTGTTCTTCCTGCTGATGCAGAGAAAAGGCATCGGCAAGATCGGACTCGGCGGCGTTATACTGGGAGCCGCCACCTTCTTTTGCTGGATGGCTGAAGTGCCCGGCACCAAGATTGCCGGAATGCTGCTGCTGTCCCTGCTGCTGATGATTGTGCTGATCCCCGAGCCTGAGAAGCAGAGA [서열번호 401]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 401에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 401의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 402로 제공된다:
UCUCAGAUCGGCCUGGUGGAAGUGCUGGGCAGAAUGCCUGAGCACUUCAUGGUCAAGACCUGGGAAGCCCUGGACACUAUGUACGUGGUGGCCACAGCCGAGAAAGGCGGCAGAGCACAUAGAAUGGCCCUGGAAGAACUGCCCGACGCUCUGCAGACAAUCGUGCUGAUUGCCCUGCUGAGCGUGAUGAGCCUGGGCGUGUUCUUCCUGCUGAUGCAGAGAAAAGGCAUCGGCAAGAUCGGACUCGGCGGCGUUAUACUGGGAGCCGCCACCUUCUUUUGCUGGAUGGCUGAAGUGCCCGGCACCAAGAUUGCCGGAAUGCUGCUGCUGUCCCUGCUGCUGAUGAUUGUGCUGAUCCCCGAGCCUGAGAAGCAGAGA [서열번호 402]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 402에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 WNV NS4B(P06935; 게놈 폴리단백질 웨스트 나일 바이러스 NS4A), 또는 그의 동원체이다. WNV NS4B의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 403으로 나타낸다:
NEMGWLDKTKNDIGSLLGHRPEARETTLGVESFLLDLRPATAWSLYAVTTAVLTPLLKHLITSDYINTSLTSINVQASALFTLARGFPFVDVGVSALLLAVGCWGQVTLTVTVTAAALLFCHYAYMVPGWQAEAMRSAQRRTAAGIMKNVVVDGIVATDVPELERTTPVMQKKVGQIILILVSMAAVVVNPSVRTVREAGILTTAAAVTLWENGASSVWNATTAIGLCHIMRGGWLSCLSIMWTLIKNMEKPGLKR [서열번호 403]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 403에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 WNV NS4B 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 404의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
AATGAAATGGGCTGGCTGGACAAGACCAAGAATGACATTGGCAGCCTGTTGGGGCACAGGCCAGAAGCTAGAGAGACGACCCTGGGAGTTGAGAGCTTCTTACTTGATCTGCGGCCGGCCACGGCATGGTCGCTCTATGCCGTAACGACAGCCGTTCTCACCCCTTTGCTGAAGCATCTAATCACGTCAGACTACATCAACACTTCGTTGACCTCAATAAACGTCCAAGCCAGCGCGTTGTTCACTTTGGCCAGAGGCTTCCCTTTTGTGGACGTTGGTGTGTCAGCTCTCTTGCTGGCGGTCGGGTGCTGGGGTCAGGTGACTCTGACTGTGACTGTGACTGCAGCTGCTCTGCTCTTTTGCCACTATGCTTACATGGTGCCAGGCTGGCAAGCGGAAGCCATGCGATCTGCCCAGCGGCGGACAGCTGCTGGCATCATGAAAAATGTAGTGGTGGATGGGATCGTGGCCACTGATGTACCTGAACTTGAACGAACAACTCCAGTCATGCAGAAAAAAGTTGGACAGATCATATTGATCTTGGTATCAATGGCCGCGGTGGTCGTCAATCCATCAGTGAGAACCGTCAGAGAGGCCGGAATTCTGACTACAGCAGCAGCAGTCACCCTATGGGAGAATGGTGCTAGTTCAGTGTGGAATGCAACGACAGCTATTGGCCTTTGTCACATCATGCGAGGAGGATGGCTCTCGTGTCTCTCCATCATGTGGACTCTCATCAAAAACATGGAGAAACCAGGCCTCAAGAGG [서열번호 404]
따라서, 바람직하게는 상기 WNV NS4B 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 404에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 WNV NS4B 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 405로 제공된다:
AACGAGATGGGCTGGCTGGACAAGACCAAGAACGACATCGGAAGCCTGCTGGGCCACAGACCTGAGGCCAGAGAAACAACCCTGGGCGTCGAGAGCTTCCTGCTGGATCTTAGACCTGCCACCGCTTGGAGCCTGTACGCCGTTACAACAGCCGTGCTGACCCCTCTGCTGAAGCACCTGATCACCAGCGACTACATCAACACCAGCCTGACCAGCATCAACGTGCAGGCCAGCGCTCTGTTTACCCTGGCCAGAGGCTTCCCCTTTGTGGACGTGGGAGTTTCTGCTCTGCTGCTGGCCGTTGGCTGTTGGGGACAAGTGACCCTGACCGTGACAGTGACTGCTGCCGCTCTGCTGTTCTGCCACTACGCCTATATGGTGCCTGGATGGCAGGCCGAGGCCATGAGATCTGCCCAGAGAAGAACAGCCGCCGGAATCATGAAGAACGTGGTGGTGGATGGCATCGTGGCCACCGACGTTCCAGAGCTGGAAAGAACCACACCTGTGATGCAGAAGAAAGTCGGCCAGATCATCCTGATCCTGGTGTCCATGGCCGCCGTGGTGGTCAATCCTAGCGTGCGGACAGTTAGAGAGGCCGGCATCCTGACAACAGCTGCCGCTGTTACCCTGTGGGAGAATGGCGCTAGCAGCGTGTGGAATGCCACCACAGCCATCGGCCTGTGCCACATCATGAGAGGCGGCTGGCTGAGCTGCCTGAGCATCATGTGGACCCTGATCAAGAACATGGAAAAGCCCGGCCTGAAGCGG [서열번호 405]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 405에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 405의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 406으로 제공된다:
AACGAGAUGGGCUGGCUGGACAAGACCAAGAACGACAUCGGAAGCCUGCUGGGCCACAGACCUGAGGCCAGAGAAACAACCCUGGGCGUCGAGAGCUUCCUGCUGGAUCUUAGACCUGCCACCGCUUGGAGCCUGUACGCCGUUACAACAGCCGUGCUGACCCCUCUGCUGAAGCACCUGAUCACCAGCGACUACAUCAACACCAGCCUGACCAGCAUCAACGUGCAGGCCAGCGCUCUGUUUACCCUGGCCAGAGGCUUCCCCUUUGUGGACGUGGGAGUUUCUGCUCUGCUGCUGGCCGUUGGCUGUUGGGGACAAGUGACCCUGACCGUGACAGUGACUGCUGCCGCUCUGCUGUUCUGCCACUACGCCUAUAUGGUGCCUGGAUGGCAGGCCGAGGCCAUGAGAUCUGCCCAGAGAAGAACAGCCGCCGGAAUCAUGAAGAACGUGGUGGUGGAUGGCAUCGUGGCCACCGACGUUCCAGAGCUGGAAAGAACCACACCUGUGAUGCAGAAGAAAGUCGGCCAGAUCAUCCUGAUCCUGGUGUCCAUGGCCGCCGUGGUGGUCAAUCCUAGCGUGCGGACAGUUAGAGAGGCCGGCAUCCUGACAACAGCUGCCGCUGUUACCCUGUGGGAGAAUGGCGCUAGCAGCGUGUGGAAUGCCACCACAGCCAUCGGCCUGUGCCACAUCAUGAGAGGCGGCUGGCUGAGCUGCCUGAGCAUCAUGUGGACCCUGAUCAAGAACAUGGAAAAGCCCGGCCUGAAGCGG [서열번호 406]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 406에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 광견병 바이러스 PP(P69479; 인단백질 광견병 바이러스(ERA 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. 광견병 바이러스 PP의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 407로 나타낸다:
MSKIFVNPSAIRAGLADLEMAEETVDLINRNIEDNQAHLQGEPIEVDNLPEDMGRLHLDDGKSPNPGEMAKVGEGKYREDFQMDEGEDPSFLFQSYLENVGVQIVRQMRSGERFLKIWSQTVEEIISYVAVNFPNPPGKSSEDKSTQTTGRELKKETTPTPSQRESQSSKARMAAQTASGPPALEWSATNEKDDLSVEAEIAHQIAESFSKKYKFPSRSSGILLYNFEQLKMNLDDIVKEAKNVPGVTRLAHDGSKLPLRCVLGWVALANSKKFQLLVESDKLSKIMQDDLNRYTSC [서열번호 407]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 407에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 광견병 바이러스 PP 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 408의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCTAGTGCTATTAGAGCCGGTCTGGCCGATCTTGAGATGGCTGAAGAAACTGTTGATCTGATCAATAGAAATATCGAAGACAATCAGGCTCATCTCCAAGGGGAACCCATAGAAGTGGACAATCTCCCTGAGGATATGGGGCGACTTCACCTGGATGATGGAAAATCGCCCAACCCTGGTGAGATGGCCAAGGTGGGAGAAGGCAAGTATCGAGAGGACTTTCAGATGGATGAAGGAGAGGATCCTAGCTTCCTGTTCCAGTCATACCTGGAAAATGTTGGAGTCCAAATAGTCAGACAAATGAGGTCAGGAGAGAGATTTCTCAAGATATGGTCACAGACCGTAGAAGAGATTATATCCTATGTCGCGGTCAACTTTCCCAACCCTCCAGGAAAGTCTTCAGAGGATAAATCAACCCAGACTACTGGCCGAGAGCTCAAGAAGGAGACAACACCCACTCCTTCTCAGAGAGAAAGCCAATCATCGAAAGCCAGGATGGCGGCTCAAACTGCTTCTGGCCCTCCAGCCCTTGAATGGTCGGCCACCAATGAAAAGGATGATCTATCAGTGGAGGCTGAGATCGCTCACCAGATTGCAGAAAGTTTCTCCAAAAAATATAAGTTTCCCTCTCGATCCTCAGGGATACTCTTGTATAATTTTGAGCAATTGAAAATGAACCTTGATGATATAGTTAAAGAGGCAAAAAATGTACCAGGTGTGACCCGTTTAGCCCATGACGGGTCCAAACTCCCCCTAAGATGTGTACTGGGATGGGTCGCTTTGGCCAACTCTAAGAAATTCCAGTTGTTAGTCGAATCCGACAAGCTGAGTAAAATCATGCAAGATGACTTGAATCGCTATACATCTTGC [서열번호 408]
따라서, 바람직하게는 상기 광견병 바이러스 PP 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 408에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 광견병 바이러스 PP 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 409로 제공된다:
ATGAGCAAGATCTTCGTGAACCCCAGCGCCATCAGAGCCGGACTGGCTGATCTGGAAATGGCCGAGGAAACCGTGGACCTGATCAACCGGAACATCGAGGACAATCAGGCCCATCTGCAGGGCGAGCCTATCGAGGTTGACAACCTGCCTGAGGACATGGGCAGACTGCACCTGGATGATGGCAAGAGCCCTAATCCTGGCGAGATGGCCAAAGTCGGCGAGGGCAAGTACCGCGAGGACTTCCAAATGGACGAGGGCGAAGATCCCAGCTTCCTGTTCCAGTCCTACCTGGAAAACGTGGGCGTGCAGATCGTGCGGCAGATGAGAAGCGGCGAGCGGTTCCTGAAGATCTGGTCCCAGACCGTGGAAGAGATCATCAGCTACGTGGCCGTGAACTTCCCCAATCCTCCAGGCAAGAGCAGCGAGGACAAGAGCACACAGACCACCGGCAGAGAGCTGAAGAAAGAGACAACCCCTACACCTAGCCAGAGAGAGAGCCAGAGCAGCAAGGCCAGAATGGCCGCTCAGACAGCTTCTGGACCTCCTGCACTTGAGTGGAGCGCCACCAACGAGAAGGACGACCTGTCTGTGGAAGCCGAGATCGCCCACCAGATCGCCGAGAGCTTCAGCAAGAAGTACAAGTTCCCCAGCAGAAGCAGCGGCATCCTGCTGTACAACTTCGAGCAGCTGAAGATGAACCTGGACGACATCGTGAAAGAGGCCAAGAACGTCCCCGGCGTGACAAGACTGGCCCACGATGGATCTAAGCTGCCCCTGAGATGTGTGCTCGGATGGGTTGCCCTGGCCAACAGCAAGAAATTCCAGCTGCTGGTGGAAAGCGACAAGCTGTCCAAGATCATGCAGGACGATCTGAACCGGTACACCAGCTGC [서열번호 409]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 409에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 409의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 410으로 제공된다:
AUGAGCAAGAUCUUCGUGAACCCCAGCGCCAUCAGAGCCGGACUGGCUGAUCUGGAAAUGGCCGAGGAAACCGUGGACCUGAUCAACCGGAACAUCGAGGACAAUCAGGCCCAUCUGCAGGGCGAGCCUAUCGAGGUUGACAACCUGCCUGAGGACAUGGGCAGACUGCACCUGGAUGAUGGCAAGAGCCCUAAUCCUGGCGAGAUGGCCAAAGUCGGCGAGGGCAAGUACCGCGAGGACUUCCAAAUGGACGAGGGCGAAGAUCCCAGCUUCCUGUUCCAGUCCUACCUGGAAAACGUGGGCGUGCAGAUCGUGCGGCAGAUGAGAAGCGGCGAGCGGUUCCUGAAGAUCUGGUCCCAGACCGUGGAAGAGAUCAUCAGCUACGUGGCCGUGAACUUCCCCAAUCCUCCAGGCAAGAGCAGCGAGGACAAGAGCACACAGACCACCGGCAGAGAGCUGAAGAAAGAGACAACCCCUACACCUAGCCAGAGAGAGAGCCAGAGCAGCAAGGCCAGAAUGGCCGCUCAGACAGCUUCUGGACCUCCUGCACUUGAGUGGAGCGCCACCAACGAGAAGGACGACCUGUCUGUGGAAGCCGAGAUCGCCCACCAGAUCGCCGAGAGCUUCAGCAAGAAGUACAAGUUCCCCAGCAGAAGCAGCGGCAUCCUGCUGUACAACUUCGAGCAGCUGAAGAUGAACCUGGACGACAUCGUGAAAGAGGCCAAGAACGUCCCCGGCGUGACAAGACUGGCCCACGAUGGAUCUAAGCUGCCCCUGAGAUGUGUGCUCGGAUGGGUUGCCCUGGCCAACAGCAAGAAAUUCCAGCUGCUGGUGGAAAGCGACAAGCUGUCCAAGAUCAUGCAGGACGAUCUGAACCGGUACACCAGCUGC [서열번호 410]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 410에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 PEDV N 단백질(Q07499; 핵단백질 돼지 유행성 설사 바이러스(CV777 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. PEDV N 단백질의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 411로 나타낸다:
MASVSFQDRGRKRVPLSLYAPLRVTNDKPLSKVLANNAVPTNKGNKDQQIGYWNEQIRWRMRRGERIEQPSNWHFYYLGTGPHGDLRYRTRTEGVFWVAKEGAKTEPTNLGVRKASEKPIIPKFSQQLPSVVEIVEPNTPPASRANSRSRSRGNGNNRSRSPSNNRGNNQSRGNSQNRGNNQGRGASQNRGGNNNNNNKSRNQSNNRNQSNDRGGVTSRDDLVAAVKDALKSLGIGENPDRHKQQQKPKQEKSDNSGKNTPKKNKSRATSKERDLKDIPEWRRIPKGENSVAACFGPRGGFKNFGDAEFVEKGVDASGYAQIASLAPNVAALLFGGNVAVRELADSYEITYNYKMTVPKSDPNVELLVSQVDAFKTGNAKLQRKKEKKNKRETTLQQHEEAIYDDVGAPSDVTHANLEWDTAVDGGDTAVEIINEIFDTGN [서열번호 411]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 411에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 PEDV N 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 412의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCTTCTGTCAGCTTTCAGGATCGTGGCCGCAAACGGGTGCCATTATCTCTCTATGCCCCTCTTAGGGTTACTAATGACAAGCCCCTTTCTAAGGTACTTGCAAACAACGCTGTACCCACTAACAAGGGGAATAAGGACCAGCAAATTGGGTACTGGAATGAGCAAATTCGCTGGCGCATGCGCCGTGGTGAGCGAATTGAACAACCTTCCAATTGGCATTTCTACTACCTCGGAACAGGACCTCACGGCGACCTCCGTTATAGGACTCGTACTGAGGGTGTTTTCTGGGTTGCTAAAGAAGGCGCAAAGACTGAACCCACTAATTTGGGTGTCAGAAAGGCGTCTGAAAAGCCAATCATTCCAAAATTCTCTCAACAGCTCCCCAGTGTAGTTGAGATTGTTGAACCTAACACACCTCCTGCTTCACGTGCAAATTCGCGTAGCAGGAGTCGTGGCAATGGCAACAATAGGTCTAGATCTCCAAGTAACAACAGAGGCAATAACCAGTCCCGTGGTAATTCACAGAATCGTGGAAATAACCAGGGTCGTGGAGCTTCTCAGAACAGAGGAGGCAATAATAATAACAATAACAAGTCTCGTAACCAGTCCAATAACAGGAACCAGTCAAATGACCGTGGTGGTGTAACATCACGCGATGATCTGGTGGCTGCTGTCAAGGATGCACTTAAATCTTTGGGTATTGGAGAAAATCCTGACAGGCATAAGCAACAGCAGAAGCCTAAGCAGGAAAAGTCTGACAACAGCGGCAAAAATACACCTAAGAAGAACAAATCCAGGGCCACTTCGAAGGAACGTGACCTCAAAGACATCCCAGAGTGGAGGAGAATTCCCAAGGGCGAAAATAGCGTAGCAGCTTGCTTCGGACCCAGAGGGGGCTTCAAAAACTTTGGAGATGCGGAATTTGTCGAAAAAGGTGTTGATGCGTCAGGCTATGCTCAGATCGCCAGTTTAGCACCAAATGTTGCAGCATTGCTCTTTGGTGGTAATGTGGCTGTTCGTGAGCTAGCGGACTCTTACGAGATTACATACAACTATAAAATGACTGTGCCAAAGTCAGATCCAAATGTTGAGCTTCTTGTTTCACAGGTGGATGCATTTAAAACTGGGAATGCAAAACTCCAGAGAAAGAAGGAAAAGAAGAACAAGCGTGAAACCACGCTGCAGCAGCATGAAGAGGCCATCTACGATGATGTGGGTGCGCCATCTGATGTGACCCATGCCAATCTGGAATGGGACACAGCTGTTGATGGTGGTGATACGGCCGTTGAAATTATCAACGAGATCTTCGATACAGGAAAT [서열번호 412]
따라서, 바람직하게는 상기 PEDV N 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 412에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 PEDV N 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 413으로 제공된다:
ATGGCCAGCGTCAGCTTTCAGGACCGGGGCAGAAAAAGAGTGCCCCTGTCTCTGTACGCCCCTCTGAGAGTGACCAACGACAAGCCCCTGAGCAAGGTGCTGGCCAACAATGCCGTGCCTACCAACAAGGGCAACAAGGACCAGCAGATCGGCTACTGGAACGAGCAGATCCGGTGGCGGATGAGAAGAGGCGAGAGAATCGAGCAGCCCAGCAACTGGCACTTCTACTACCTCGGCACAGGCCCTCACGGCGACCTGAGATACAGAACCAGAACCGAGGGCGTGTTCTGGGTCGCCAAAGAGGGCGCCAAGACCGAGCCTACAAATCTCGGCGTCAGAAAGGCCAGCGAGAAGCCTATCATCCCCAAGTTCAGCCAGCAGCTGCCCAGCGTGGTGGAAATCGTGGAACCCAATACTCCTCCTGCCAGCCGGGCCAACAGCAGAAGCAGATCTAGAGGCAACGGCAACAATCGGAGCAGAAGCCCCAGCAACAACCGGGGCAACAACCAGTCCAGAGGCAACAGCCAGAACCGCGGAAACAATCAAGGCAGAGGCGCTAGCCAGAACAGAGGCGGCAACAACAACAATAACAACAAGAGCCGGAACCAGTCTAACAACCGCAACCAGAGCAACGATAGAGGCGGCGTGACCAGCAGGGATGATCTGGTGGCTGCCGTGAAGGATGCCCTGAAGTCTCTCGGCATCGGCGAGAACCCCGACAGACACAAGCAGCAGCAGAAACCCAAGCAAGAGAAGTCCGACAACAGCGGCAAGAACACCCCTAAGAAGAACAAGAGCAGGGCCACCAGCAAAGAGCGGGACCTGAAGGATATTCCCGAGTGGCGGAGAATCCCCAAGGGCGAGAATTCTGTGGCCGCCTGCTTTGGACCAAGAGGCGGCTTCAAGAATTTCGGCGACGCCGAGTTCGTGGAAAAAGGCGTGGACGCCTCTGGCTATGCCCAGATTGCATCTCTGGCCCCTAATGTGGCTGCCCTGCTGTTTGGCGGAAACGTGGCCGTTAGAGAGCTGGCCGATAGCTACGAGATCACCTACAACTACAAGATGACCGTGCCTAAGAGCGACCCCAACGTGGAACTGCTGGTGTCTCAGGTGGACGCATTCAAGACCGGCAACGCCAAGCTGCAGCGCAAGAAAGAGAAGAAAAACAAGCGCGAGACAACCCTGCAGCAGCACGAGGAAGCTATCTACGACGACGTGGGAGCCCCTTCCGATGTGACACACGCCAACCTGGAATGGGACACAGCAGTGGATGGCGGCGATACCGCCGTGGAAATCATCAACGAGATCTTCGACACCGGCAAC [서열번호 413]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 413에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 413의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 414로 제공된다:
AUGGCCAGCGUCAGCUUUCAGGACCGGGGCAGAAAAAGAGUGCCCCUGUCUCUGUACGCCCCUCUGAGAGUGACCAACGACAAGCCCCUGAGCAAGGUGCUGGCCAACAAUGCCGUGCCUACCAACAAGGGCAACAAGGACCAGCAGAUCGGCUACUGGAACGAGCAGAUCCGGUGGCGGAUGAGAAGAGGCGAGAGAAUCGAGCAGCCCAGCAACUGGCACUUCUACUACCUCGGCACAGGCCCUCACGGCGACCUGAGAUACAGAACCAGAACCGAGGGCGUGUUCUGGGUCGCCAAAGAGGGCGCCAAGACCGAGCCUACAAAUCUCGGCGUCAGAAAGGCCAGCGAGAAGCCUAUCAUCCCCAAGUUCAGCCAGCAGCUGCCCAGCGUGGUGGAAAUCGUGGAACCCAAUACUCCUCCUGCCAGCCGGGCCAACAGCAGAAGCAGAUCUAGAGGCAACGGCAACAAUCGGAGCAGAAGCCCCAGCAACAACCGGGGCAACAACCAGUCCAGAGGCAACAGCCAGAACCGCGGAAACAAUCAAGGCAGAGGCGCUAGCCAGAACAGAGGCGGCAACAACAACAAUAACAACAAGAGCCGGAACCAGUCUAACAACCGCAACCAGAGCAACGAUAGAGGCGGCGUGACCAGCAGGGAUGAUCUGGUGGCUGCCGUGAAGGAUGCCCUGAAGUCUCUCGGCAUCGGCGAGAACCCCGACAGACACAAGCAGCAGCAGAAACCCAAGCAAGAGAAGUCCGACAACAGCGGCAAGAACACCCCUAAGAAGAACAAGAGCAGGGCCACCAGCAAAGAGCGGGACCUGAAGGAUAUUCCCGAGUGGCGGAGAAUCCCCAAGGGCGAGAAUUCUGUGGCCGCCUGCUUUGGACCAAGAGGCGGCUUCAAGAAUUUCGGCGACGCCGAGUUCGUGGAAAAAGGCGUGGACGCCUCUGGCUAUGCCCAGAUUGCAUCUCUGGCCCCUAAUGUGGCUGCCCUGCUGUUUGGCGGAAACGUGGCCGUUAGAGAGCUGGCCGAUAGCUACGAGAUCACCUACAACUACAAGAUGACCGUGCCUAAGAGCGACCCCAACGUGGAACUGCUGGUGUCUCAGGUGGACGCAUUCAAGACCGGCAACGCCAAGCUGCAGCGCAAGAAAGAGAAGAAAAACAAGCGCGAGACAACCCUGCAGCAGCACGAGGAAGCUAUCUACGACGACGUGGGAGCCCCUUCCGAUGUGACACACGCCAACCUGGAAUGGGACACAGCAGUGGAUGGCGGCGAUACCGCCGUGGAAAUCAUCAACGAGAUCUUCGACACCGGCAAC [서열번호 414]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 414에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HSV1 ICP27(P10238; ICP27 mRNA 내보냄(export) 인자 인간 헤르페스바이러스 1(17 바이러스주)), 또는 그의 동원체이다. HSV1 ICP27의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 415로 나타낸다:
MATDIDMLIDLGLDLSDSDLDEDPPEPAESRRDDLESDSSGECSSSDEDMEDPHGEDGPEPILDAARPAVRPSRPEDPGVPSTQTPRPTERQGPNDPQPAPHSVWSRLGARRPSCSPEQHGGKVARLQPPPTKAQPARGGRRGRRRGRGRGGPGAADGLSDPRRRAPRTNRNPGGPRPGAGWTDGPGAPHGEAWRGSEQPDPPGGQRTRGVRQAPPPLMTLAIAPPPADPRAPAPERKAPAADTIDATTRLVLRSISERAAVDRISESFGRSAQVMHDPFGGQPFPAANSPWAPVLAGQGGPFDAETRRVSWETLVAHGPSLYRTFAGNPRAASTAKAMRDCVLRQENFIEALASADETLAWCKMCIHHNLPLRPQDPIIGTTAAVLDNLATRLRPFLQCYLKARGLCGLDELCSRRRLADIKDIASFVFVILARLANRVERGVAEIDYATLGVGVGEKMHFYLPGACMAGLIEILDTHRQECSSRVCELTASHIVAPPYVHGKYFYCNSLF [서열번호 415]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 415에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HSV1 ICP27 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 416의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCGACTGACATTGATATGCTAATTGACCTCGGCCTGGACCTCTCCGACAGCGATCTGGACGAGGACCCCCCCGAGCCGGCGGAGAGCCGCCGCGACGACCTGGAATCGGACAGCAGCGGGGAGTGTTCCTCGTCGGACGAGGACATGGAAGACCCCCACGGAGAGGACGGACCGGAGCCGATACTCGACGCCGCTCGCCCGGCGGTCCGCCCGTCTCGTCCAGAAGACCCCGGCGTACCCAGCACCCAGACGCCTCGTCCGACGGAGCGGCAGGGCCCCAACGATCCTCAACCAGCGCCCCACAGTGTGTGGTCGCGCCTCGGGGCCCGGCGACCGTCTTGCTCCCCCGAGCAGCACGGGGGCAAGGTGGCCCGCCTCCAACCCCCACCGACCAAAGCCCAGCCTGCCCGCGGCGGACGCCGTGGGCGTCGCAGGGGTCGGGGTCGCGGTGGTCCCGGGGCTGCCGATGGTTTGTCGGACCCCCGCCGGCGTGCCCCCAGAACCAATCGCAACCCTGGGGGACCCCGCCCCGGGGCGGGGTGGACGGACGGCCCCGGCGCCCCCCATGGCGAGGCGTGGCGCGGCAGTGAGCAGCCCGACCCACCCGGAGGCCAGCGGACACGGGGCGTGCGCCAAGCACCCCCCCCGCTAATGACGCTGGCGATTGCCCCCCCGCCCGCGGACCCCCGCGCCCCGGCCCCGGAGCGAAAGGCGCCCGCCGCCGACACCATCGACGCCACCACGCGGTTGGTCCTGCGCTCCATCTCCGAGCGCGCGGCGGTCGACCGCATCAGCGAGAGCTTTGGCCGCAGCGCACAGGTCATGCACGACCCCTTTGGGGGGCAGCCGTTTCCCGCCGCGAATAGCCCCTGGGCCCCGGTGCTGGCGGGCCAAGGAGGGCCCTTTGACGCCGAGACCAGACGGGTCTCCTGGGAAACCTTGGTCGCCCACGGCCCGAGCCTCTATCGCACTTTTGCCGGCAATCCTCGGGCCGCATCGACCGCCAAGGCCATGCGCGACTGCGTGCTGCGCCAAGAAAATTTCATCGAGGCGCTGGCCTCCGCCGACGAGACGCTGGCGTGGTGCAAGATGTGCATCCACCACAACCTGCCGCTGCGCCCCCAGGACCCCATTATCGGGACGACCGCGGCTGTGCTGGATAACCTCGCCACGCGCCTGCGGCCCTTTCTCCAGTGCTACCTGAAGGCGCGAGGCCTGTGCGGCCTGGACGAACTGTGTTCGCGGCGGCGTCTGGCGGACATTAAGGACATTGCATCCTTCGTGTTTGTCATTCTGGCCAGGCTCGCCAACCGCGTCGAGCGTGGCGTCGCGGAGATCGACTACGCGACCCTTGGTGTCGGGGTCGGAGAGAAGATGCATTTCTACCTCCCCGGGGCCTGCATGGCGGGCCTGATCGAAATCCTAGACACGCACCGCCAGGAGTGTTCGAGTCGTGTCTGCGAGTTGACGGCCAGTCACATCGTCGCCCCCCCGTACGTGCACGGCAAATATTTTTATTGCAACTCCCTGTTT [서열번호 416]
따라서, 바람직하게는 상기 HSV1 ICP27 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 416에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 HSV1 ICP27 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 417로 제공된다:
ATGGCCACCGACATCGACATGCTGATCGACCTGGGCCTCGACCTGAGCGACTCTGACCTGGATGAAGATCCTCCTGAGCCTGCCGAGAGCAGAAGGGACGATCTGGAAAGCGATAGCAGCGGCGAGTGTAGCAGCAGCGACGAGGACATGGAAGATCCCCACGGCGAGGATGGACCTGAGCCTATTCTGGATGCCGCCAGACCTGCCGTCAGACCTTCTAGACCTGAAGATCCAGGCGTGCCCAGCACACAGACCCCTAGACCTACAGAGAGACAGGGCCCCAACGATCCTCAGCCTGCTCCTCATAGCGTGTGGTCTAGACTGGGAGCCAGAAGGCCTAGCTGTAGCCCTGAACAGCACGGCGGAAAAGTGGCCAGACTGCAGCCTCCTCCAACAAAGGCTCAACCTGCTAGAGGCGGCAGACGGGGCAGAAGAAGAGGTAGAGGAAGAGGTGGACCTGGCGCCGCTGATGGACTGTCTGATCCTAGAAGAAGGGCCCCTCGGACCAACAGAAATCCTGGCGGACCTAGACCAGGCGCCGGATGGACAGATGGACCAGGTGCTCCACATGGCGAGGCTTGGAGAGGATCTGAGCAGCCTGATCCTCCAGGCGGCCAAAGAACAAGAGGCGTTAGACAGGCTCCTCCTCCTCTGATGACCCTGGCTATTGCTCCTCCACCAGCCGATCCTAGAGCACCCGCTCCAGAAAGAAAAGCCCCTGCCGCCGATACCATCGACGCCACAACAAGACTGGTGCTGCGGAGCATCTCTGAGAGGGCCGCTGTGGATAGAATCAGCGAGAGCTTTGGGAGAAGCGCCCAAGTGATGCACGACCCTTTTGGCGGCCAGCCTTTTCCTGCCGCCAATTCTCCTTGGGCTCCTGTGCTTGCTGGACAAGGCGGCCCTTTTGACGCCGAGACAAGAAGAGTGTCCTGGGAGACACTGGTGGCCCACGGACCTAGCCTGTACAGAACATTCGCCGGCAATCCAAGAGCCGCCAGCACAGCCAAAGCCATGAGAGACTGCGTGCTGAGACAAGAGAACTTCATCGAGGCCCTGGCCAGCGCCGATGAGACACTTGCTTGGTGCAAGATGTGCATCCACCACAACCTGCCTCTGAGGCCACAGGACCCTATCATCGGAACAACAGCTGCCGTGCTGGATAACCTGGCTACCAGACTGAGGCCCTTCCTGCAGTGCTACCTGAAGGCCAGAGGACTGTGTGGCCTGGATGAGCTGTGCTCCAGAAGAAGGCTGGCTGACATCAAGGATATCGCCAGCTTCGTGTTCGTGATTCTGGCCCGGCTGGCCAACAGAGTGGAAAGAGGCGTGGCCGAGATCGACTATGCCACACTCGGAGTTGGCGTGGGCGAGAAGATGCACTTTTATCTGCCTGGCGCCTGCATGGCCGGCCTGATCGAAATTCTGGACACCCACAGACAAGAGTGCAGCTCCAGAGTGTGCGAGCTGACAGCCTCTCACATTGTGGCCCCTCCATACGTGCACGGCAAGTACTTCTACTGCAACAGCCTGTTC [서열번호 417]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 417에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 417의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 418로 제공된다:
AUGGCCACCGACAUCGACAUGCUGAUCGACCUGGGCCUCGACCUGAGCGACUCUGACCUGGAUGAAGAUCCUCCUGAGCCUGCCGAGAGCAGAAGGGACGAUCUGGAAAGCGAUAGCAGCGGCGAGUGUAGCAGCAGCGACGAGGACAUGGAAGAUCCCCACGGCGAGGAUGGACCUGAGCCUAUUCUGGAUGCCGCCAGACCUGCCGUCAGACCUUCUAGACCUGAAGAUCCAGGCGUGCCCAGCACACAGACCCCUAGACCUACAGAGAGACAGGGCCCCAACGAUCCUCAGCCUGCUCCUCAUAGCGUGUGGUCUAGACUGGGAGCCAGAAGGCCUAGCUGUAGCCCUGAACAGCACGGCGGAAAAGUGGCCAGACUGCAGCCUCCUCCAACAAAGGCUCAACCUGCUAGAGGCGGCAGACGGGGCAGAAGAAGAGGUAGAGGAAGAGGUGGACCUGGCGCCGCUGAUGGACUGUCUGAUCCUAGAAGAAGGGCCCCUCGGACCAACAGAAAUCCUGGCGGACCUAGACCAGGCGCCGGAUGGACAGAUGGACCAGGUGCUCCACAUGGCGAGGCUUGGAGAGGAUCUGAGCAGCCUGAUCCUCCAGGCGGCCAAAGAACAAGAGGCGUUAGACAGGCUCCUCCUCCUCUGAUGACCCUGGCUAUUGCUCCUCCACCAGCCGAUCCUAGAGCACCCGCUCCAGAAAGAAAAGCCCCUGCCGCCGAUACCAUCGACGCCACAACAAGACUGGUGCUGCGGAGCAUCUCUGAGAGGGCCGCUGUGGAUAGAAUCAGCGAGAGCUUUGGGAGAAGCGCCCAAGUGAUGCACGACCCUUUUGGCGGCCAGCCUUUUCCUGCCGCCAAUUCUCCUUGGGCUCCUGUGCUUGCUGGACAAGGCGGCCCUUUUGACGCCGAGACAAGAAGAGUGUCCUGGGAGACACUGGUGGCCCACGGACCUAGCCUGUACAGAACAUUCGCCGGCAAUCCAAGAGCCGCCAGCACAGCCAAAGCCAUGAGAGACUGCGUGCUGAGACAAGAGAACUUCAUCGAGGCCCUGGCCAGCGCCGAUGAGACACUUGCUUGGUGCAAGAUGUGCAUCCACCACAACCUGCCUCUGAGGCCACAGGACCCUAUCAUCGGAACAACAGCUGCCGUGCUGGAUAACCUGGCUACCAGACUGAGGCCCUUCCUGCAGUGCUACCUGAAGGCCAGAGGACUGUGUGGCCUGGAUGAGCUGUGCUCCAGAAGAAGGCUGGCUGACAUCAAGGAUAUCGCCAGCUUCGUGUUCGUGAUUCUGGCCCGGCUGGCCAACAGAGUGGAAAGAGGCGUGGCCGAGAUCGACUAUGCCACACUCGGAGUUGGCGUGGGCGAGAAGAUGCACUUUUAUCUGCCUGGCGCCUGCAUGGCCGGCCUGAUCGAAAUUCUGGACACCCACAGACAAGAGUGCAGCUCCAGAGUGUGCGAGCUGACAGCCUCUCACAUUGUGGCCCCUCCAUACGUGCACGGCAAGUACUUCUACUGCAACAGCCUGUUC [서열번호 418]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 418에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 HSV1 VP24(F8RDC3; UL26 인간 헤르페스바이러스 1의 캡시드 스캐폴딩(scaffolding) 단백질 VP24 절단 생성물), 또는 그의 동원체이다. HSV1 VP24의 폴리펩티드 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 419로 나타낸다:
MAADAPGDRMEEPLPDRAVPIYVAGFLALYDSGDSGELALDPDTVRAALPPDNPLPINVDHRAGCEVGRVLAVVDDPRGPFFVGLIACVQLERVLETAASAAIFERRGPPLSREERLLYLITNYLPSVSLATKRLGGEAHPDRTLFAHVALCAIGRRLGTIVTYDTGLDAAIAPFRHLSPASREGARRLAAEAELALSGRTWAPGVEALTHTLLSTAVNNMMLRDRWSLVAERRRQAGIAGHTYLQA [서열번호 419]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 419에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HSV1 VP24 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 420의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGCAGCCGATGCCCCGGGAGACAGGATGGAGGAGCCCCTGCCAGACAGGGCCGTGCCCATTTACGTGGCTGGGTTTTTGGCCCTGTATGACAGCGGGGACTCGGGCGAGTTGGCATTGGATCCGGATACGGTGCGGGCGGCCCTGCCTCCGGATAACCCACTCCCGATTAACGTGGACCACCGCGCTGGCTGCGAGGTGGGGCGGGTGCTGGCCGTGGTCGACGACCCCCGCGGGCCGTTTTTTGTGGGGCTGATCGCCTGCGTGCAGCTGGAGCGCGTCCTCGAGACGGCCGCCAGCGCTGCGATTTTCGAGCGCCGCGGGCCGCCGCTCTCCCGGGAGGAGCGCCTGTTGTACCTGATCACCAACTACCTGCCCTCGGTCTCCCTGGCCACAAAACGCCTGGGGGGCGAGGCGCACCCCGATCGCACGCTGTTCGCGCACGTCGCGCTGTGCGCGATCGGGAGGCGCCTCGGCACTATCGTCACCTACGACACCGGTCTCGACGCCGCCATCGCGCCCTTTCGCCACCTGTCGCCGGCGTCTCGCGAGGGGGCGCGGCGACTGGCCGCCGAGGCCGAGCTCGCGCTGTCCGGACGCACCTGGGCGCCCGGCGTGGAGGCGCTGACCCACACGCTGCTTTCCACCGCCGTTAACAACATGATGCTGCGGGACCGCTGGAGCCTGGTGGCCGAGCGGCGGCGGCAGGCCGGGATTGCCGGACACACCTACCTCCAGGCG [서열번호 420]
따라서, 바람직하게는 상기 HSV1 VP24 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 420에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 HSV1 VP24 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 421로 제공된다:
ATGGCTGCTGATGCCCCTGGCGACAGAATGGAAGAACCCCTGCCTGATAGAGCCGTGCCTATCTACGTGGCCGGATTTCTGGCCCTGTACGACTCTGGCGATTCTGGCGAACTGGCCCTGGATCCTGATACAGTCAGAGCCGCTCTGCCTCCTGACAACCCTCTGCCAATCAACGTGGACCACAGAGCCGGCTGTGAAGTGGGAAGAGTGCTGGCCGTGGTGGACGATCCTAGAGGCCCTTTCTTTGTGGGCCTGATCGCCTGCGTGCAGCTGGAAAGAGTTCTGGAAACAGCCGCCAGCGCCGCCATCTTCGAAAGAAGAGGACCTCCTCTGAGCCGGGAAGAGAGACTGCTGTACCTGATCACCAACTACCTGCCTAGCGTGTCCCTGGCCACAAAGAGACTTGGCGGAGAGGCCCATCCTGACAGAACCCTGTTTGCCCATGTGGCCCTGTGTGCCATTGGTAGAAGGCTGGGCACCATCGTGACCTACGATACAGGACTGGACGCCGCTATCGCCCCATTCAGACATCTGAGCCCTGCCAGCAGAGAAGGCGCCAGAAGGCTTGCTGCTGAAGCCGAACTGGCTCTGAGCGGCAGAACATGGGCTCCAGGTGTTGAAGCCCTGACACACACCCTGCTGAGCACCGCCGTGAACAACATGATGCTGCGGGACAGATGGTCCCTGGTGGCCGAGAGAAGAAGGCAGGCTGGAATTGCCGGCCACACATATCTGCAGGCT [서열번호 421]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 421에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 421의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 422로 제공된다:
AUGGCUGCUGAUGCCCCUGGCGACAGAAUGGAAGAACCCCUGCCUGAUAGAGCCGUGCCUAUCUACGUGGCCGGAUUUCUGGCCCUGUACGACUCUGGCGAUUCUGGCGAACUGGCCCUGGAUCCUGAUACAGUCAGAGCCGCUCUGCCUCCUGACAACCCUCUGCCAAUCAACGUGGACCACAGAGCCGGCUGUGAAGUGGGAAGAGUGCUGGCCGUGGUGGACGAUCCUAGAGGCCCUUUCUUUGUGGGCCUGAUCGCCUGCGUGCAGCUGGAAAGAGUUCUGGAAACAGCCGCCAGCGCCGCCAUCUUCGAAAGAAGAGGACCUCCUCUGAGCCGGGAAGAGAGACUGCUGUACCUGAUCACCAACUACCUGCCUAGCGUGUCCCUGGCCACAAAGAGACUUGGCGGAGAGGCCCAUCCUGACAGAACCCUGUUUGCCCAUGUGGCCCUGUGUGCCAUUGGUAGAAGGCUGGGCACCAUCGUGACCUACGAUACAGGACUGGACGCCGCUAUCGCCCCAUUCAGACAUCUGAGCCCUGCCAGCAGAGAAGGCGCCAGAAGGCUUGCUGCUGAAGCCGAACUGGCUCUGAGCGGCAGAACAUGGGCUCCAGGUGUUGAAGCCCUGACACACACCCUGCUGAGCACCGCCGUGAACAACAUGAUGCUGCGGGACAGAUGGUCCCUGGUGGCCGAGAGAAGAAGGCAGGCUGGAAUUGCCGGCCACACAUAUCUGCAGGCU [서열번호 422]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 422에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 IIP는 뮤린 CTMV M45(Q06A28; 리보뉴클레오시드-디포스페이트 리덕타아제(reductase) 큰 서브유닛-유사 단백질 뮤린 헤르페스바이러스 1(스미스 바이러스주) 뮤린 사이토메갈로바이러스(Cytomegalovirus) M45 단백질), 또는 그의 동원체이다. [Fliss P, Pechenick Jowers T et al (2012) Viral Mediated Redirection of NEMO/IKKγ to Autophagosomes Curtails the Inflammatory Cascade. PLoS Pathogens 8, 2]. M45는 NEMO의 프로테아좀(proteasome)-독립적 분해를 유도하는 것으로 여겨진다. 뮤린 CTMV M45의 폴리펩티드 서열의 한 구현예 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 423으로 나타낸다:
MDRQPKVYSDPDNGFFFLDVPMPDDGQGGQQTATTAAGGAFGVGGGHSVPYVRIMNGVSGIQIGNHNAMSIASCWSPSYTDRRRRSYPKTATNAAADRVAAAVSAANAAVNAAAAAAAAGGGGGANLLAAAVTCANQRGCCGGNGGHSLPPTRMPKTNATAAAAPAVAGASNAKSDNNHANATSGAGSAAATPAATTPAATAVENRRPSPSPSTASTAPCDEGSSPRHHRPSHVSVGTQATPSTPIPIPAPRCSTGQQQQQPQAKKLKPAKADPLLYAATMPPPASVTTAAAAAVAPESESSPAASAPPAAAAMATGGDDEDQSSFSFVSDDVLGEFEDLRIAGLPVRDEMRPPTPTMTVIPVSRPFRAGRDSGRDALFDDAVESVRCYCHGILGNSRFCALVNEKCSEPAKERMARIRRYAADVTRCGPLALYTAIVSSANRLIQTDPSCDLDLAECYVETASKRNAVPLSAFYRDCDRLRDAVAAFFKTYGMVVDAMAQRITERVGPALGRGLYSTVVMMDRCGNSFQGREETPISVFARVAAALAVECEVDGGVSYKILSSKPVDAAQAFDAFLSALCSFAIIPSPRVLAYAGFGGSNPIFDAVSYRAQFYSAESTINGTLHDICDMVTNGLSVSVSAADLGGDIVASLHILGQQCKALRPYARFKTVLRIYFDIWSVDALKIFSFILDVGREYEGLMAFAVNTPRIFWDRYLDSSGDKMWLMFARREAAALCGLDLKSFRNVYEKMERDGRSAITVSPWWAVCQLDACVARGNTAVVFPHNVKSMIPENIGRPAVCGPGVSVVSGGFVGCTPIHELCINLENCVLEGAAVESSVDVVLGLGCRFSFKALESLVRDAVVLGNLLIDMTVRTNAYGAGKLLTLYRDLHIGVVGFHAVMNRLGQKFADMESYDLNQRIAEFIYYTAVRASVDLCMAGADPFPKFPKSLYAAGRFYPDLFDDDERGPRRMTKEFLEKLREDVVKHGIRNASFITGCSADEAANLAGTTPGFWPRRDNVFLEQTPLMMTPTKDQMLDECVRSVKIEPHRLHEEDLSCLGENRPVELPVLNSRLRQISKESATVAVRRGRSAPFYDDSDDEDEVACSETGWTVSTDAVIKMCVDRQPFVDHAQSLPVAIGFGGSSVELARHLRRGNALGLSVGVYKCSMPPSVNYR [서열번호 423]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 423에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 뮤린 CTMV M45 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 424의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGATCGCCAGCCCAAAGTCTACTCCGACCCGGACAACGGATTCTTCTTTTTGGATGTCCCCATGCCTGACGACGGGCAGGGAGGCCAGCAGACCGCCACCACCGCTGCCGGGGGAGCCTTCGGGGTGGGTGGGGGGCACAGCGTGCCCTACGTCAGGATCATGAATGGAGTCTCTGGAATACAGATCGGAAACCATAATGCTATGAGCATCGCCTCTTGCTGGAGTCCCTCCTACACTGACCGACGCCGCAGGAGCTACCCCAAGACCGCGACCAACGCGGCGGCAGACAGGGTCGCCGCTGCCGTCTCCGCCGCCAATGCTGCTGTCAATGCTGCTGCCGCGGCTGCTGCCGCCGGCGGGGGCGGCGGCGCTAACCTACTGGCTGCTGCTGTCACTTGTGCAAATCAGCGAGGTTGCTGCGGAGGAAATGGGGGGCATTCCCTCCCTCCCACCCGAATGCCGAAGACCAACGCTACCGCCGCGGCCGCTCCTGCCGTCGCCGGTGCTTCCAACGCCAAGAGTGACAACAATCACGCTAACGCCACCTCTGGTGCTGGATCCGCGGCCGCCACCCCCGCCGCCACCACCCCCGCCGCCACCGCCGTCGAAAACCGACGACCCAGCCCGAGCCCCTCTACAGCCTCGACTGCGCCCTGTGACGAGGGATCTTCTCCTCGCCACCATCGTCCTAGTCACGTTAGTGTCGGCACTCAGGCGACTCCGTCGACTCCTATCCCGATTCCCGCTCCCCGGTGCAGCACAGGCCAACAACAACAGCAACCTCAAGCCAAGAAGCTTAAGCCCGCTAAAGCTGATCCCCTCCTGTACGCGGCGACGATGCCGCCTCCCGCGAGCGTAACGACCGCCGCTGCCGCTGCCGTCGCCCCTGAATCCGAATCCTCACCTGCCGCTTCGGCACCACCAGCAGCAGCAGCGATGGCGACCGGGGGAGACGACGAAGATCAGTCGTCTTTCTCGTTCGTGAGCGACGACGTCCTCGGAGAATTCGAAGATCTGCGCATCGCCGGGCTCCCCGTCAGGGACGAGATGCGCCCCCCGACCCCGACGATGACGGTCATTCCCGTCAGCAGGCCCTTCCGCGCGGGGCGCGACAGCGGGCGCGACGCCTTGTTTGACGACGCCGTCGAGTCCGTGCGCTGCTACTGCCACGGCATCCTCGGCAACAGCCGATTCTGCGCCCTCGTCAACGAGAAGTGCTCCGAACCCGCCAAGGAGCGCATGGCTCGCATCCGCCGCTACGCCGCGGACGTGACGCGCTGCGGACCCCTCGCGCTCTACACCGCCATCGTCTCCAGCGCCAACCGTCTCATCCAGACCGACCCGTCGTGCGACCTGGATCTCGCCGAATGTTACGTCGAGACGGCGTCCAAGAGGAACGCCGTCCCCCTCTCGGCCTTCTACCGCGACTGCGATCGCCTGCGGGATGCTGTCGCCGCGTTCTTCAAGACCTACGGCATGGTGGTGGACGCCATGGCGCAGCGCATCACGGAGCGGGTCGGGCCGGCCCTGGGTAGGGGCCTCTACTCGACCGTCGTCATGATGGATCGCTGCGGAAACAGCTTCCAGGGACGCGAGGAGACCCCCATCTCCGTCTTCGCCCGGGTCGCCGCGGCTCTCGCCGTCGAGTGCGAGGTCGACGGGGGCGTCTCGTACAAGATCCTCAGCTCCAAGCCCGTCGACGCCGCGCAGGCCTTCGACGCCTTCCTCTCCGCCCTCTGCTCCTTCGCCATCATCCCCTCGCCGCGGGTCCTGGCCTACGCCGGGTTCGGCGGTTCCAACCCGATCTTCGACGCCGTTTCTTACCGCGCTCAGTTCTACTCGGCCGAGAGCACGATCAACGGCACCCTGCACGACATCTGCGACATGGTGACCAACGGCCTCTCGGTGTCCGTCAGCGCGGCGGACCTCGGAGGCGACATCGTGGCCTCTCTGCACATCCTCGGACAGCAGTGCAAGGCGCTGCGGCCGTACGCGCGATTCAAGACCGTCTTGAGGATCTACTTCGACATCTGGTCCGTCGACGCTCTCAAGATCTTCTCTTTCATCCTCGACGTCGGGCGGGAATACGAGGGCCTGATGGCCTTCGCGGTCAACACGCCGAGGATCTTCTGGGATCGCTACCTAGACAGCTCCGGCGACAAGATGTGGCTCATGTTCGCGAGGCGGGAGGCCGCGGCCCTGTGCGGCCTCGACCTCAAGTCCTTCCGTAACGTCTACGAGAAGATGGAGCGTGACGGGCGCAGCGCCATCACCGTCTCGCCCTGGTGGGCCGTCTGTCAGCTCGACGCGTGCGTGGCGCGGGGCAACACGGCCGTGGTCTTCCCTCACAACGTCAAGAGTATGATCCCCGAGAACATCGGGCGCCCCGCCGTGTGCGGACCCGGCGTCTCCGTCGTCTCCGGCGGCTTCGTCGGCTGTACCCCCATCCACGAGCTGTGCATCAACCTGGAGAACTGCGTCCTGGAGGGCGCGGCAGTCGAGAGCTCCGTCGACGTGGTCCTCGGTCTCGGTTGCCGCTTCAGCTTCAAGGCCCTGGAGTCCCTGGTCCGCGACGCGGTGGTGCTGGGTAACCTGCTCATCGACATGACCGTGCGCACCAACGCGTACGGCGCCGGCAAGCTCCTGACGCTCTATCGCGACCTGCACATCGGGGTCGTCGGCTTCCACGCTGTGATGAATCGCCTCGGGCAGAAGTTCGCCGACATGGAGTCTTACGACCTCAACCAGCGTATCGCGGAGTTTATCTACTACACCGCCGTGCGGGCCAGCGTCGACCTGTGCATGGCGGGCGCCGATCCGTTCCCCAAGTTCCCTAAGAGCCTGTACGCGGCCGGCCGCTTCTACCCCGACCTCTTCGACGACGACGAGCGCGGCCCGCGTCGCATGACCAAGGAGTTCCTCGAGAAACTACGTGAAGACGTGGTGAAACACGGCATCAGGAACGCCTCCTTCATCACCGGCTGCTCGGCCGACGAAGCCGCCAACCTGGCGGGCACCACTCCGGGCTTCTGGCCGCGCCGCGACAACGTCTTTCTCGAGCAGACGCCGCTCATGATGACCCCGACGAAGGATCAGATGCTCGATGAGTGCGTGCGCTCCGTCAAGATCGAGCCCCATCGCCTGCACGAGGAGGATCTCTCCTGTCTCGGCGAGAACCGGCCCGTCGAGCTGCCCGTGCTCAACAGCCGCCTCAGGCAGATCTCGAAAGAGTCCGCGACGGTCGCCGTGCGCCGCGGCCGCTCGGCGCCCTTCTACGACGACTCGGACGACGAGGACGAGGTGGCGTGCTCCGAGACCGGCTGGACCGTGTCGACCGACGCGGTCATCAAGATGTGCGTCGACAGACAGCCGTTCGTCGACCATGCGCAGTCGCTGCCCGTCGCCATCGGCTTCGGGGGGTCTTCGGTGGAATTGGCGCGTCATCTGAGACGAGGGAACGCTCTGGGACTGTCCGTCGGAGTATATAAATGTAGTATGCCCCCTTCCGTGAATTATCGC [서열번호 424]
따라서, 바람직하게는 상기 뮤린 CTMV M45 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 424에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
상기 뮤린 CTMV M45 폴리펩티드를 암호화하는 코돈 최적화된 핵산(DNA)의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 425로 제공된다:
ATGGACAGACAGCCCAAGGTGTACAGCGACCCCGACAACGGCTTCTTCTTCCTGGATGTGCCCATGCCTGACGATGGCCAAGGCGGACAGCAGACAGCTACAACAGCTGCCGGCGGAGCCTTTGGAGTTGGCGGAGGACATTCTGTGCCCTACGTGCGGATCATGAATGGCGTGTCCGGCATCCAGATCGGCAACCACAACGCCATGTCTATCGCCAGCTGTTGGAGCCCCAGCTACACCGATCGGCGGAGAAGAAGCTACCCTAAGACCGCCACAAACGCCGCTGCCGATAGAGTGGCTGCTGCTGTGTCTGCCGCTAACGCTGCTGTGAATGCTGCTGCCGCTGCTGCAGCCGCAGGCGGCGGAGGCGGAGCTAATCTTCTTGCAGCAGCCGTGACCTGCGCCAACCAGAGAGGATGTTGCGGAGGAAATGGCGGCCACAGCCTGCCTCCAACCAGAATGCCTAAGACCAATGCCACAGCCGCTGCAGCTCCAGCAGTTGCCGGTGCCTCTAATGCCAAGAGCGACAACAACCACGCCAACGCCACATCTGGCGCTGGATCTGCTGCTGCTACACCAGCCGCTACAACACCAGCTGCCACCGCCGTTGAGAACAGAAGGCCATCTCCAAGTCCTAGCACCGCCAGCACAGCCCCTTGTGATGAGGGAAGCAGCCCCAGACACCACAGACCTAGCCATGTGTCTGTGGGCACACAGGCCACACCTAGCACACCAATTCCTATTCCAGCTCCTCGGTGCTCCACAGGCCAGCAGCAACAACAGCCTCAGGCCAAGAAGCTGAAGCCCGCCAAAGCTGACCCTCTGCTGTATGCCGCAACCATGCCTCCTCCAGCCTCTGTGACTACTGCCGCAGCAGCTGCAGTGGCCCCTGAGTCTGAATCTTCTCCTGCCGCTTCTGCCCCTCCAGCAGCCGCCGCTATGGCTACAGGCGGAGATGATGAGGACCAGAGCAGCTTCTCCTTCGTGTCCGATGATGTGCTGGGCGAGTTCGAGGACCTGAGAATTGCTGGACTGCCCGTGCGGGATGAGATGAGGCCTCCTACACCTACCATGACAGTGATCCCCGTGTCTCGGCCTTTCAGAGCCGGCAGAGATTCTGGCAGAGATGCCCTGTTCGACGACGCCGTGGAAAGCGTGCGGTGTTACTGTCACGGCATCCTGGGCAACAGCAGATTCTGCGCCCTGGTCAACGAGAAGTGTAGCGAGCCTGCCAAAGAACGGATGGCCCGGATTAGAAGATACGCCGCCGACGTGACAAGATGCGGACCTCTGGCTCTGTACACCGCCATTGTGTCTAGCGCCAACCGGCTGATCCAGACAGACCCTAGCTGTGACCTGGATCTGGCCGAGTGCTACGTGGAAACCGCCTCCAAGAGAAACGCCGTGCCTCTGAGCGCCTTCTACAGAGACTGCGACAGACTGAGAGATGCCGTGGCCGCCTTCTTCAAGACCTACGGCATGGTGGTGGACGCCATGGCTCAGAGAATCACCGAGAGAGTGGGACCCGCTCTCGGCAGAGGACTGTATTCTACCGTGGTCATGATGGACAGATGCGGCAACAGCTTCCAGGGCAGAGAAGAGACACCCATCAGCGTGTTCGCCAGAGTGGCTGCTGCTCTGGCCGTGGAATGTGAAGTGGATGGCGGCGTGTCCTACAAGATCCTGAGCAGCAAGCCTGTGGATGCCGCTCAGGCCTTCGATGCCTTTCTGAGCGCCCTGTGCAGCTTCGCCATCATTCCATCTCCAAGAGTGCTGGCCTACGCCGGCTTTGGCGGCAGCAATCCTATCTTTGACGCCGTGTCTTACAGGGCCCAGTTCTACAGCGCCGAGAGCACCATCAATGGCACCCTGCACGACATCTGCGACATGGTCACAAACGGCCTGTCCGTGTCTGTGTCTGCCGCTGATCTCGGCGGAGATATCGTGGCCTCTCTGCACATTCTGGGCCAGCAGTGCAAAGCCCTGAGGCCTTACGCCAGATTCAAGACCGTGCTGCGGATCTACTTCGACATTTGGAGCGTGGACGCCCTGAAGATCTTTAGCTTCATCCTGGACGTGGGGCGCGAGTACGAAGGACTGATGGCCTTTGCCGTGAATACCCCTCGGATCTTCTGGGACAGATACCTGGACAGCAGCGGCGACAAGATGTGGCTGATGTTTGCCAGAAGAGAAGCCGCCGCTCTGTGCGGCCTGGATCTGAAGTCCTTCCGGAACGTGTACGAGAAGATGGAACGCGACGGCCGCTCTGCCATCACAGTTAGTCCTTGGTGGGCCGTGTGTCAGCTGGATGCCTGTGTGGCCAGAGGCAATACCGCCGTGGTGTTCCCTCACAACGTGAAGTCTATGATCCCCGAGAACATCGGCAGGCCAGCCGTGTGTGGACCTGGCGTTAGTGTTGTGTCTGGCGGCTTCGTGGGCTGCACACCTATTCACGAGCTGTGCATCAACCTGGAAAACTGCGTGCTGGAAGGCGCCGCTGTGGAATCCTCTGTGGATGTGGTGCTCGGCCTGGGCTGCAGATTCAGCTTTAAGGCCCTGGAAAGCCTCGTGCGGGATGCTGTGGTTCTGGGCAACCTGCTGATCGACATGACCGTGCGGACCAATGCCTATGGCGCTGGCAAACTGCTGACCCTGTACCGGGATCTGCACATCGGCGTTGTGGGATTCCACGCCGTGATGAACAGACTGGGCCAGAAATTCGCCGACATGGAAAGCTACGACCTGAACCAGCGGATCGCCGAGTTCATCTACTACACAGCCGTCAGAGCCAGCGTGGACCTGTGTATGGCTGGCGCCGATCCATTTCCTAAGTTCCCCAAGAGCCTGTACGCCGCTGGCAGATTCTACCCCGACCTGTTCGACGACGATGAGAGGGGCCCTAGACGGATGACCAAAGAGTTCCTGGAAAAGCTGAGGGAAGATGTGGTCAAGCACGGCATCCGGAACGCCAGCTTTATCACAGGCTGTAGCGCCGACGAGGCCGCCAATCTTGCTGGAACAACACCCGGCTTTTGGCCCAGACGGGACAATGTGTTTCTGGAACAGACCCCTCTGATGATGACCCCTACCAAGGACCAGATGCTGGACGAGTGCGTGCGGAGCGTGAAGATCGAACCTCACAGACTGCACGAAGAGGACCTGAGCTGCCTGGGCGAGAACAGACCTGTGGAACTGCCCGTGCTGAACAGCAGACTGCGGCAGATCAGCAAAGAAAGCGCCACCGTGGCCGTGCGGAGAGGAAGAAGTGCTCCATTCTACGACGACAGCGACGACGAGGATGAAGTGGCCTGTTCTGAGACAGGCTGGACCGTGTCTACCGATGCCGTGATCAAGATGTGCGTGGACAGACAGCCCTTCGTGGATCACGCTCAGTCTCTGCCTGTGGCCATCGGCTTTGGAGGCTCTAGCGTGGAACTGGCCAGACACCTGAGAAGAGGCAATGCCCTGGGACTGTCTGTGGGCGTGTACAAGTGTAGCATGCCTCCTAGCGTGAACTACCGG [서열번호 425]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 425에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 서열번호 425의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 426으로 제공된다:
AUGGACAGACAGCCCAAGGUGUACAGCGACCCCGACAACGGCUUCUUCUUCCUGGAUGUGCCCAUGCCUGACGAUGGCCAAGGCGGACAGCAGACAGCUACAACAGCUGCCGGCGGAGCCUUUGGAGUUGGCGGAGGACAUUCUGUGCCCUACGUGCGGAUCAUGAAUGGCGUGUCCGGCAUCCAGAUCGGCAACCACAACGCCAUGUCUAUCGCCAGCUGUUGGAGCCCCAGCUACACCGAUCGGCGGAGAAGAAGCUACCCUAAGACCGCCACAAACGCCGCUGCCGAUAGAGUGGCUGCUGCUGUGUCUGCCGCUAACGCUGCUGUGAAUGCUGCUGCCGCUGCUGCAGCCGCAGGCGGCGGAGGCGGAGCUAAUCUUCUUGCAGCAGCCGUGACCUGCGCCAACCAGAGAGGAUGUUGCGGAGGAAAUGGCGGCCACAGCCUGCCUCCAACCAGAAUGCCUAAGACCAAUGCCACAGCCGCUGCAGCUCCAGCAGUUGCCGGUGCCUCUAAUGCCAAGAGCGACAACAACCACGCCAACGCCACAUCUGGCGCUGGAUCUGCUGCUGCUACACCAGCCGCUACAACACCAGCUGCCACCGCCGUUGAGAACAGAAGGCCAUCUCCAAGUCCUAGCACCGCCAGCACAGCCCCUUGUGAUGAGGGAAGCAGCCCCAGACACCACAGACCUAGCCAUGUGUCUGUGGGCACACAGGCCACACCUAGCACACCAAUUCCUAUUCCAGCUCCUCGGUGCUCCACAGGCCAGCAGCAACAACAGCCUCAGGCCAAGAAGCUGAAGCCCGCCAAAGCUGACCCUCUGCUGUAUGCCGCAACCAUGCCUCCUCCAGCCUCUGUGACUACUGCCGCAGCAGCUGCAGUGGCCCCUGAGUCUGAAUCUUCUCCUGCCGCUUCUGCCCCUCCAGCAGCCGCCGCUAUGGCUACAGGCGGAGAUGAUGAGGACCAGAGCAGCUUCUCCUUCGUGUCCGAUGAUGUGCUGGGCGAGUUCGAGGACCUGAGAAUUGCUGGACUGCCCGUGCGGGAUGAGAUGAGGCCUCCUACACCUACCAUGACAGUGAUCCCCGUGUCUCGGCCUUUCAGAGCCGGCAGAGAUUCUGGCAGAGAUGCCCUGUUCGACGACGCCGUGGAAAGCGUGCGGUGUUACUGUCACGGCAUCCUGGGCAACAGCAGAUUCUGCGCCCUGGUCAACGAGAAGUGUAGCGAGCCUGCCAAAGAACGGAUGGCCCGGAUUAGAAGAUACGCCGCCGACGUGACAAGAUGCGGACCUCUGGCUCUGUACACCGCCAUUGUGUCUAGCGCCAACCGGCUGAUCCAGACAGACCCUAGCUGUGACCUGGAUCUGGCCGAGUGCUACGUGGAAACCGCCUCCAAGAGAAACGCCGUGCCUCUGAGCGCCUUCUACAGAGACUGCGACAGACUGAGAGAUGCCGUGGCCGCCUUCUUCAAGACCUACGGCAUGGUGGUGGACGCCAUGGCUCAGAGAAUCACCGAGAGAGUGGGACCCGCUCUCGGCAGAGGACUGUAUUCUACCGUGGUCAUGAUGGACAGAUGCGGCAACAGCUUCCAGGGCAGAGAAGAGACACCCAUCAGCGUGUUCGCCAGAGUGGCUGCUGCUCUGGCCGUGGAAUGUGAAGUGGAUGGCGGCGUGUCCUACAAGAUCCUGAGCAGCAAGCCUGUGGAUGCCGCUCAGGCCUUCGAUGCCUUUCUGAGCGCCCUGUGCAGCUUCGCCAUCAUUCCAUCUCCAAGAGUGCUGGCCUACGCCGGCUUUGGCGGCAGCAAUCCUAUCUUUGACGCCGUGUCUUACAGGGCCCAGUUCUACAGCGCCGAGAGCACCAUCAAUGGCACCCUGCACGACAUCUGCGACAUGGUCACAAACGGCCUGUCCGUGUCUGUGUCUGCCGCUGAUCUCGGCGGAGAUAUCGUGGCCUCUCUGCACAUUCUGGGCCAGCAGUGCAAAGCCCUGAGGCCUUACGCCAGAUUCAAGACCGUGCUGCGGAUCUACUUCGACAUUUGGAGCGUGGACGCCCUGAAGAUCUUUAGCUUCAUCCUGGACGUGGGGCGCGAGUACGAAGGACUGAUGGCCUUUGCCGUGAAUACCCCUCGGAUCUUCUGGGACAGAUACCUGGACAGCAGCGGCGACAAGAUGUGGCUGAUGUUUGCCAGAAGAGAAGCCGCCGCUCUGUGCGGCCUGGAUCUGAAGUCCUUCCGGAACGUGUACGAGAAGAUGGAACGCGACGGCCGCUCUGCCAUCACAGUUAGUCCUUGGUGGGCCGUGUGUCAGCUGGAUGCCUGUGUGGCCAGAGGCAAUACCGCCGUGGUGUUCCCUCACAACGUGAAGUCUAUGAUCCCCGAGAACAUCGGCAGGCCAGCCGUGUGUGGACCUGGCGUUAGUGUUGUGUCUGGCGGCUUCGUGGGCUGCACACCUAUUCACGAGCUGUGCAUCAACCUGGAAAACUGCGUGCUGGAAGGCGCCGCUGUGGAAUCCUCUGUGGAUGUGGUGCUCGGCCUGGGCUGCAGAUUCAGCUUUAAGGCCCUGGAAAGCCUCGUGCGGGAUGCUGUGGUUCUGGGCAACCUGCUGAUCGACAUGACCGUGCGGACCAAUGCCUAUGGCGCUGGCAAACUGCUGACCCUGUACCGGGAUCUGCACAUCGGCGUUGUGGGAUUCCACGCCGUGAUGAACAGACUGGGCCAGAAAUUCGCCGACAUGGAAAGCUACGACCUGAACCAGCGGAUCGCCGAGUUCAUCUACUACACAGCCGUCAGAGCCAGCGUGGACCUGUGUAUGGCUGGCGCCGAUCCAUUUCCUAAGUUCCCCAAGAGCCUGUACGCCGCUGGCAGAUUCUACCCCGACCUGUUCGACGACGAUGAGAGGGGCCCUAGACGGAUGACCAAAGAGUUCCUGGAAAAGCUGAGGGAAGAUGUGGUCAAGCACGGCAUCCGGAACGCCAGCUUUAUCACAGGCUGUAGCGCCGACGAGGCCGCCAAUCUUGCUGGAACAACACCCGGCUUUUGGCCCAGACGGGACAAUGUGUUUCUGGAACAGACCCCUCUGAUGAUGACCCCUACCAAGGACCAGAUGCUGGACGAGUGCGUGCGGAGCGUGAAGAUCGAACCUCACAGACUGCACGAAGAGGACCUGAGCUGCCUGGGCGAGAACAGACCUGUGGAACUGCCCGUGCUGAACAGCAGACUGCGGCAGAUCAGCAAAGAAAGCGCCACCGUGGCCGUGCGGAGAGGAAGAAGUGCUCCAUUCUACGACGACAGCGACGACGAGGAUGAAGUGGCCUGUUCUGAGACAGGCUGGACCGUGUCUACCGAUGCCGUGAUCAAGAUGUGCGUGGACAGACAGCCCUUCGUGGAUCACGCUCAGUCUCUGCCUGUGGCCAUCGGCUUUGGAGGCUCUAGCGUGGAACUGGCCAGACACCUGAGAAGAGGCAAUGCCCUGGGACUGUCUGUGGGCGUGUACAAGUGUAGCAUGCCUCCUAGCGUGAACUACCGG [서열번호 426]
다른 구현예에서, 선천적 신호전달 경로의 억제제는 천산갑(Pangolin) CoV-2 ORF3b*57 변이체 단백질(즉, 미성숙 종결 코돈이 AA 글루타민으로 변경된 천산갑 CoV-2 ORF3b 단백질의 돌연변이 형태(NCBI 참조 서열: QIG55946.1; UniProtKB - A0A6M3G7Q4(A0A6M3G7Q4_9BETC)), 또는 그의 동원체이다. [Konno Y, Kimura I, Uriu K, Fukushi M, Irie T, Koyanagi Y, Sauter D, Gifford R, USFQ-COVID19 Consortium, Nakagawa S and Sato K. 2020. SARS-CoV-2 ORF3b is a potent interferon antagonist whose activity is increased by a naturally occurring elongation variant. Cell Reports 32: Issue 12. doi.org/10.1016/j.celrep.2020.108185]. 상기 천산갑 CoV-2 ORF3b*57의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 427로 나타낸다:
MMLTTSCVGILIVTTIVFHTIVQLLQLSLPPVMAQQIPLQNMTTKLVVILRNGNLE [서열번호 427]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 427에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 천산갑 CoV-2 ORF3b*57 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 428의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGATGCTAACTACTTCCTGTGTTGGCATACTAATTGTTACGACTATTGTATTCCATACAATAGTGCAACTTCTTCAATTGTCATTACCTCCGGTGATGGCACAACAAATCCCATTACAGAACATGACTACCAAATTGGTGGTTATTTTGAGAAATGGGAATCTGGAG [서열번호 428]
따라서, 바람직하게는 상기 천산갑 CoV-2 ORF3b*57 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 428에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 429의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGAUGCUAACUACUUCCUGUGUUGGCAUACUAAUUGUUACGACUAUUGUAUUCCAUACAAUAGUGCAACUUCUUCAAUUGUCAUUACCUCCGGUGAUGGCACAACAAAUCCCAUUACAGAACAUGACUACCAAAUUGGUGGUUAUUUUGAGAAAUGGGAAUCUGGAG [서열번호 429]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 429에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 442의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 430으로 제공된다:
ATGATGCTGACCACCAGCTGTGTGGGCATCCTGATCGTGACCACCATCGTGTTCCACACAATCGTGCAGCTGCTGCAGCTCAGCCTGCCTCCTGTTATGGCCCAGCAGATCCCTCTGCAGAACATGACCACAAAGCTGGTCGTGATCCTGCGGAACGGCAACCTGGAATGA [서열번호 430]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 430에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 430의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 431로 제공된다:
AUGAUGCUGACCACCAGCUGUGUGGGCAUCCUGAUCGUGACCACCAUCGUGUUCCACACAAUCGUGCAGCUGCUGCAGCUCAGCCUGCCUCCUGUUAUGGCCCAGCAGAUCCCUCUGCAGAACAUGACCACAAAGCUGGUCGUGAUCCUGCGGAACGGCAACCUGGAAUGA [서열번호 431]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 431에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 선천적 신호전달 경로의 억제제는 천산갑 CoV-2 ORF3b*79 변이체 단백질(즉, 미성숙 종결 코돈이 AA 글루타민으로 변경된 천산갑 CoV-2 ORF3b 단백질의 돌연변이 형태(NCBI 참조 서열: QIG55946.1; UniProtKB - A0A6M3G7Q4(A0A6M3G7Q4_9BETC)), 또는 그의 동원체이다. [Konno Y, Kimura I, Uriu K, Fukushi M, Irie T, Koyanagi Y, Sauter D, Gifford R, USFQ-COVID19 Consortium, Nakagawa S and Sato K. 2020. SARS-CoV-2 ORF3b is a potent interferon antagonist whose activity is increased by a naturally occurring elongation variant. Cell Reports 32: Issue 12. doi.org/10.1016/j.celrep.2020.108185]. 상기 천산갑 CoV-2 ORF3b*79의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 432로 나타낸다:
MMLTTSCVGILIVTTIVFHTIVQLLQLSLPPVMAQQIPLQNMTTKLVVILRNGNLELKTVLYYTATSLQITTSCTQLN [서열번호 432]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 432에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 천산갑 CoV-2 ORF3b*79 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 433의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGATGCTAACTACTTCCTGTGTTGGCATACTAATTGTTACGACTATTGTATTCCATACAATAGTGCAACTTCTTCAATTGTCATTACCTCCGGTGATGGCACAACAAATCCCATTACAGAACATGACTACCAAATTGGTGGTTATTTTGAGAAATGGGAATCTGGAGCTGAAGACTGTGTTGTATTACACAGCTACTTCACTTCAGATTACTACCAGCTGTACTCAACTCAAT [서열번호 433]
따라서, 바람직하게는 상기 천산갑 CoV-2 ORF3b*79 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 433에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 434의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGAUGCUAACUACUUCCUGUGUUGGCAUACUAAUUGUUACGACUAUUGUAUUCCAUACAAUAGUGCAACUUCUUCAAUUGUCAUUACCUCCGGUGAUGGCACAACAAAUCCCAUUACAGAACAUGACUACCAAAUUGGUGGUUAUUUUGAGAAAUGGGAAUCUGGAGCUGAAGACUGUGUUGUAUUACACAGCUACUUCACUUCAGAUUACUACCAGCUGUACUCAACUCAAU [서열번호 434]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 434에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 432의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 435로 제공된다:
ATGATGCTGACCACCAGCTGTGTGGGCATCCTGATCGTGACCACCATCGTGTTCCACACAATCGTGCAGCTGCTGCAGCTCAGCCTGCCTCCTGTTATGGCCCAGCAGATCCCTCTGCAGAACATGACCACAAAGCTGGTCGTGATCCTGCGGAACGGCAACCTGGAACTGAAAACCGTGCTGTACTACACCGCCACCAGCCTGCAGATCACCACAAGCTGCACCCAGCTGAACTGA [서열번호 435]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 435에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 435의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 436으로 제공된다:
AUGAUGCUGACCACCAGCUGUGUGGGCAUCCUGAUCGUGACCACCAUCGUGUUCCACACAAUCGUGCAGCUGCUGCAGCUCAGCCUGCCUCCUGUUAUGGCCCAGCAGAUCCCUCUGCAGAACAUGACCACAAAGCUGGUCGUGAUCCUGCGGAACGGCAACCUGGAACUGAAAACCGUGCUGUACUACACCGCCACCAGCCUGCAGAUCACCACAAGCUGCACCCAGCUGAACUGA [서열번호 436]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 436에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 선천적 신호전달 경로의 억제제는 MERS-ORF4a 단백질(NCBI 참조 서열: AGV08457.1; UniProtKB - T2BBG6(T2BBG6_MERS)), 또는 그의 동원체이다. 상기 MERS-ORF4a의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 437로 나타낸다:
MDYVSLLNQIWQKYLNSPYTTCLYIPKPTAKYTPLVGTSLHPVLWNCQLSFAGYTESAVNSTKALAKQDAAQRIAWLLHKDGGIPDGCSLYLRHSSLFAQSEEEESFSN [서열번호 437]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 437에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 MERS-ORF4a 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 438의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGACTACGTGTCCCTGCTGAACCAGATTTGGCAGAAGTACCTGAACAGCCCCTACACCACCTGTCTGTACATCCCCAAGCCTACCGCCAAGTACACACCTCTCGTGGGCACATCTCTGCACCCCGTGCTGTGGAATTGCCAGCTGAGCTTTGCCGGCTACACCGAGTCTGCCGTGAACAGCACAAAGGCCCTGGCCAAACAGGACGCCGCTCAGAGAATTGCCTGGCTGCTGCACAAGGATGGCGGCATCCCTGATGGCTGTAGCCTGTACCTGAGACACAGCAGCCTGTTCGCCCAGAGCGAGGAAGAGGAATCCTTCAGCAAC [서열번호 438]
따라서, 바람직하게는 상기 MERS-ORF4a 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 438에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 439의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGGACUACGUGUCCCUGCUGAACCAGAUUUGGCAGAAGUACCUGAACAGCCCCUACACCACCUGUCUGUACAUCCCCAAGCCUACCGCCAAGUACACACCUCUCGUGGGCACAUCUCUGCACCCCGUGCUGUGGAAUUGCCAGCUGAGCUUUGCCGGCUACACCGAGUCUGCCGUGAACAGCACAAAGGCCCUGGCCAAACAGGACGCCGCUCAGAGAAUUGCCUGGCUGCUGCACAAGGAUGGCGGCAUCCCUGAUGGCUGUAGCCUGUACCUGAGACACAGCAGCCUGUUCGCCCAGAGCGAGGAAGAGGAAUCCUUCAGCAAC [서열번호 439]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 439에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 437의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 440으로 제공된다:
ATGGACTACGTGTCCCTGCTGAATCAGATCTGGCAGAAGTACCTGAACAGCCCCTACACCACCTGTCTGTACATCCCCAAGCCTACCGCCAAGTACACACCTCTCGTGGGCACATCTCTGCACCCCGTGCTGTGGAATTGCCAGCTGAGCTTTGCCGGCTACACCGAGAGCGCCGTGAATAGCACAAAGGCCCTGGCCAAACAGGACGCCGCTCAGAGAATTGCCTGGCTGCTGCACAAGGATGGCGGCATCCCTGATGGCTGTAGCCTGTACCTGAGACACAGCAGCCTGTTCGCCCAGAGCGAGGAAGAGGAATCCTTCAGCAACTGA [서열번호 440]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 440에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 440의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 441로 제공된다:
AUGGACUACGUGUCCCUGCUGAAUCAGAUCUGGCAGAAGUACCUGAACAGCCCCUACACCACCUGUCUGUACAUCCCCAAGCCUACCGCCAAGUACACACCUCUCGUGGGCACAUCUCUGCACCCCGUGCUGUGGAAUUGCCAGCUGAGCUUUGCCGGCUACACCGAGAGCGCCGUGAAUAGCACAAAGGCCCUGGCCAAACAGGACGCCGCUCAGAGAAUUGCCUGGCUGCUGCACAAGGAUGGCGGCAUCCCUGAUGGCUGUAGCCUGUACCUGAGACACAGCAGCCUGUUCGCCCAGAGCGAGGAAGAGGAAUCCUUCAGCAACUGA [서열번호 441]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 441에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 선천적 신호전달 경로의 억제제는 BVDV nPro 단백질(NCBI 참조 서열: AAA42854.1; UniProtKB - P19711(POLG_BVDVN)), 또는 그의 동원체이다. 상기 BVDV nPro의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 442로 나타낸다:
MELITNELLYKTYKQKPVGVEEPVYDQAGDPLFGERGAVHPQSTLKLPHKRGERDVPTNLASLPKRGDCRTGNSRGPVSGIYLKPGPLFYQDYKGPVYHRAPLELFEEGSMCETTKRIGRVTGSDGKLYHIYVCIDGCIIIKSATRSYQRVFRWVHNRLDCPLWVTSC [서열번호 442]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 442에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 BVDV nPro 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 443의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCGTCGGGGTGGAGGAACCTGTTTATGATCAGGCAGGTGATCCCTTATTTGGTGAAAGGGGAGCAGTCCACCCTCAATCGACGCTAAAGCTCCCACACAAGAGAGGGGAACGCGATGTTCCAACCAACTTGGCATCCTTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGGACGGGTAATAGCAGAGGACCTGTGAGCGGGATCTACCTGAAGCCAGGGCCACTATTTTACCAGGACTATAAAGGTCCCGTCTATCACAGGGCCCCGCTGGAGCTCTTTGAGGAGGGATCCATGTGTGAAACGACTAAACGGATAGGGAGAGTAACTGGAAGTGACGGAAAGCTGTACCACATTTATGTGTGTATAGATGGATGTATAATAATAAAAAGTGCCACGAGAAGTTACCAAAGGGTGTTCAGGTGGGTCCATAATAGGCTTGACTGCCCTCTATGGGTCACAAGTTGC [서열번호 443]
따라서, 바람직하게는 상기 BVDV nPro 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 443에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 444의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGGAGUUGAUCACAAAUGAACUUUUAUACAAAACAUACAAACAAAAACCCGUCGGGGUGGAGGAACCUGUUUAUGAUCAGGCAGGUGAUCCCUUAUUUGGUGAAAGGGGAGCAGUCCACCCUCAAUCGACGCUAAAGCUCCCACACAAGAGAGGGGAACGCGAUGUUCCAACCAACUUGGCAUCCUUACCAAAAAGAGGUGACUGCAGGACGGGUAAUAGCAGAGGACCUGUGAGCGGGAUCUACCUGAAGCCAGGGCCACUAUUUUACCAGGACUAUAAAGGUCCCGUCUAUCACAGGGCCCCGCUGGAGCUCUUUGAGGAGGGAUCCAUGUGUGAAACGACUAAACGGAUAGGGAGAGUAACUGGAAGUGACGGAAAGCUGUACCACAUUUAUGUGUGUAUAGAUGGAUGUAUAAUAAUAAAAAGUGCCACGAGAAGUUACCAAAGGGUGUUCAGGUGGGUCCAUAAUAGGCUUGACUGCCCUCUAUGGGUCACAAGUUGC [서열번호 444]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 444에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 442의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 445로 제공된다:
ATGGAACTGATCACCAACGAGCTGCTGTACAAGACCTACAAGCAGAAACCCGTGGGCGTCGAGGAACCCGTGTATGATCAAGCTGGCGACCCTCTGTTTGGCGAGAGAGGCGCTGTTCACCCTCAGAGCACACTGAAGCTGCCCCACAAGCGGGGCGAAAGAGATGTGCCTACCAACCTGGCCAGCCTGCCTAAGAGAGGCGATTGCAGAACCGGCAATAGCAGAGGCCCTGTGTCCGGCATCTACCTGAAACCTGGACCACTGTTCTACCAGGACTACAAGGGCCCCGTGTACCACAGAGCACCCCTGGAACTTTTCGAAGAGGGCAGCATGTGCGAAACCACCAAGCGGATCGGAAGAGTGACCGGCTCTGACGGCAAGCTGTACCACATCTACGTGTGCATCGACGGCTGCATCATCATCAAGAGCGCCACCAGATCCTACCAGCGGGTGTTCAGATGGGTGCACAACAGACTGGACTGCCCTCTGTGGGTCACCAGCTGCTGA [서열번호 445]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 445에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 445의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 446으로 제공된다:
AUGGAACUGAUCACCAACGAGCUGCUGUACAAGACCUACAAGCAGAAACCCGUGGGCGUCGAGGAACCCGUGUAUGAUCAAGCUGGCGACCCUCUGUUUGGCGAGAGAGGCGCUGUUCACCCUCAGAGCACACUGAAGCUGCCCCACAAGCGGGGCGAAAGAGAUGUGCCUACCAACCUGGCCAGCCUGCCUAAGAGAGGCGAUUGCAGAACCGGCAAUAGCAGAGGCCCUGUGUCCGGCAUCUACCUGAAACCUGGACCACUGUUCUACCAGGACUACAAGGGCCCCGUGUACCACAGAGCACCCCUGGAACUUUUCGAAGAGGGCAGCAUGUGCGAAACCACCAAGCGGAUCGGAAGAGUGACCGGCUCUGACGGCAAGCUGUACCACAUCUACGUGUGCAUCGACGGCUGCAUCAUCAUCAAGAGCGCCACCAGAUCCUACCAGCGGGUGUUCAGAUGGGUGCACAACAGACUGGACUGCCCUCUGUGGGUCACCAGCUGCUGA [서열번호 446]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 446에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 선천적 신호전달 경로의 억제제는 HSV US1 단백질(NCBI 참조 서열: CAB06708.1; UniProtKB - P89474(ICP22_HHV2H)), 또는 그의 동원체이다. 상기 HSV US1의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 447로 나타낸다:
MVRDCYLMGYCRTRLGPRTWGRLLQISGGTWDVRLRNAIREVEAHFEPAAEPVCELPCLNARRYGPECDVGNLETNGGSTSDDEISDATDSDDTLASHSDTEGGPSPAGRENPESASGGAIAARLECEFGTFDWTSEEGSQPWLSAVVADTSSAERSGLPAPGACRATEAPEREDGCRKMRFPAACPYPCGHTFLRP [서열번호 447]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 447에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 HSV US1폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 448의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGTGCGAGACTGCTACCTCATGGGCTACTGCCGGACCCGCCTGGGGCCGCGCACGTGGGGCCGCCTGCTGCAGATCTCGGGCGGAACCTGGGACGTGCGCCTGCGAAACGCAATCCGGGAGGTCGAGGCGCATTTTGAACCCGCCGCCGAGCCCGTGTGCGAGCTGCCCTGTCTGAACGCCAGGCGTTACGGCCCCGAGTGTGATGTTGGCAATCTCGAGACCAACGGCGGCTCGACGAGCGATGATGAGATATCGGATGCGACGGACTCGGACGATACCCTCGCGTCCCATTCCGACACGGAGGGGGGGCCCTCCCCGGCCGGCCGGGAGAACCCGGAATCCGCGTCCGGCGGGGCTATCGCGGCTCGGCTGGAGTGTGAGTTTGGGACGTTTGACTGGACGTCCGAGGAGGGCTCCCAGCCCTGGCTGTCCGCGGTGGTCGCCGATACCAGCTCCGCCGAACGCTCTGGCCTACCCGCCCCGGGCGCGTGTCGCGCAACGGAAGCCCCAGAACGCGAGGACGGGTGCCGAAAAATGCGCTTCCCCGCCGCCTGCCCCTATCCCTGCGGCCACACATTTCTCCGGCCA [서열번호 448]
따라서, 바람직하게는 상기 HSV US1 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 448에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 449의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGGUGCGAGACUGCUACCUCAUGGGCUACUGCCGGACCCGCCUGGGGCCGCGCACGUGGGGCCGCCUGCUGCAGAUCUCGGGCGGAACCUGGGACGUGCGCCUGCGAAACGCAAUCCGGGAGGUCGAGGCGCAUUUUGAACCCGCCGCCGAGCCCGUGUGCGAGCUGCCCUGUCUGAACGCCAGGCGUUACGGCCCCGAGUGUGAUGUUGGCAAUCUCGAGACCAACGGCGGCUCGACGAGCGAUGAUGAGAUAUCGGAUGCGACGGACUCGGACGAUACCCUCGCGUCCCAUUCCGACACGGAGGGGGGGCCCUCCCCGGCCGGCCGGGAGAACCCGGAAUCCGCGUCCGGCGGGGCUAUCGCGGCUCGGCUGGAGUGUGAGUUUGGGACGUUUGACUGGACGUCCGAGGAGGGCUCCCAGCCCUGGCUGUCCGCGGUGGUCGCCGAUACCAGCUCCGCCGAACGCUCUGGCCUACCCGCCCCGGGCGCGUGUCGCGCAACGGAAGCCCCAGAACGCGAGGACGGGUGCCGAAAAAUGCGCUUCCCCGCCGCCUGCCCCUAUCCCUGCGGCCACACAUUUCUCCGGCCA [서열번호 449]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 449에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 447의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 450으로 제공된다:
ATGGTCCGAGACTGCTACCTGATGGGCTACTGCAGAACCAGACTGGGCCCTAGAACATGGGGCAGACTGCTGCAGATCTCTGGCGGCACATGGGATGTGCGGCTGAGAAACGCCATCAGAGAGGTGGAAGCCCACTTCGAGCCTGCCGCTGAACCTGTGTGTGAACTGCCCTGTCTGAACGCTAGAAGATACGGCCCTGAGTGCGACGTGGGCAACCTGGAAACAAATGGCGGCAGCACCAGCGACGACGAGATCTCTGATGCCACCGACAGCGACGATACACTGGCCAGCCACAGCGATACAGAAGGCGGACCATCTCCTGCCGGAAGAGAGAATCCTGAGTCTGCCTCTGGCGGAGCTATCGCCGCTAGACTGGAATGCGAGTTCGGCACCTTCGACTGGACAAGCGAGGAAGGCTCTCAGCCTTGGCTGTCTGCTGTGGTGGCCGATACAAGCAGCGCCGAAAGATCTGGACTTCCTGCTCCTGGCGCCTGCAGAGCTACAGAAGCTCCTGAAAGAGAGGACGGCTGCAGAAAGATGCGGTTCCCTGCCGCCTGTCCTTATCCTTGCGGCCACACATTTCTGCGGCCCTGA [서열번호 450]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 450에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 450의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 451로 제공된다:
AUGGUCCGAGACUGCUACCUGAUGGGCUACUGCAGAACCAGACUGGGCCCUAGAACAUGGGGCAGACUGCUGCAGAUCUCUGGCGGCACAUGGGAUGUGCGGCUGAGAAACGCCAUCAGAGAGGUGGAAGCCCACUUCGAGCCUGCCGCUGAACCUGUGUGUGAACUGCCCUGUCUGAACGCUAGAAGAUACGGCCCUGAGUGCGACGUGGGCAACCUGGAAACAAAUGGCGGCAGCACCAGCGACGACGAGAUCUCUGAUGCCACCGACAGCGACGAUACACUGGCCAGCCACAGCGAUACAGAAGGCGGACCAUCUCCUGCCGGAAGAGAGAAUCCUGAGUCUGCCUCUGGCGGAGCUAUCGCCGCUAGACUGGAAUGCGAGUUCGGCACCUUCGACUGGACAAGCGAGGAAGGCUCUCAGCCUUGGCUGUCUGCUGUGGUGGCCGAUACAAGCAGCGCCGAAAGAUCUGGACUUCCUGCUCCUGGCGCCUGCAGAGCUACAGAAGCUCCUGAAAGAGAGGACGGCUGCAGAAAGAUGCGGUUCCCUGCCGCCUGUCCUUAUCCUUGCGGCCACACAUUUCUGCGGCCCUGA [서열번호 451]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 452에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
다른 구현예에서, 선천적 신호전달 경로의 억제제는 MERS CoV M 단백질(NCBI 참조 서열: AGV08396.1; UniProtKB - T2BB40(T2BB40_MERS)), 또는 그의 동원체이다. 상기 MERS CoV M의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 452로 나타낸다:
MSNMTQLTEAQIIAIIKDWNFAWSLIFLLITIVLQYGYPSRSMTVYVFKMFVLWLLWPSSMALSIFSAIYPIDLASQIISGIVAAVSAMMWISYFVQSIRLFMRTGSWWSFNPETNCLLNVPFGGTTVVRPLVEDSTSVTAVVTNGHLKMAGMHFGACDYDRLPNEVTVAKPNVLIALKMVKRQSYGTNSGVAIYHRYKAGNYRSPPITADIELALLR [서열번호 452]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 452에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
한 구현예에서, 상기 MERS CoV M 폴리펩티드는 다음과 같은 서열번호 453의 DNA 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGTCTAATATGACGCAACTCACTGAGGCGCAGATTATTGCCATTATTAAAGACTGGAACTTTGCATGGTCCCTGATCTTTCTCTTAATTACTATCGTACTACAGTATGGATACCCATCCCGTAGTATGACTGTCTATGTCTTTAAAATGTTTGTTTTATGGCTCCTATGGCCATCTTCCATGGCGCTATCAATATTTAGCGCCATTTATCCAATTGATCTAGCTTCCCAGATAATCTCTGGCATTGTAGCAGCTGTTTCAGCTATGATGTGGATTTCCTACTTTGTGCAGAGTATCCGGCTGTTTATGAGAACTGGATCATGGTGGTCATTCAATCCTGAGACTAATTGCCTTTTGAACGTTCCATTTGGTGGTACAACTGTCGTACGTCCACTCGTAGAGGACTCCACCAGTGTAACTGCTGTTGTAACCAATGGCCACCTCAAAATGGCTGGCATGCATTTCGGTGCTTGTGACTACGACAGACTTCCTAATGAAGTCACCGTGGCCAAACCCAATGTGCTGATTGCTTTAAAAATGGTGAAGCGGCAAAGCTACGGAACTAATTCCGGCGTTGCCATTTACCATAGATATAAGGCAGGTAATTACAGGAGTCCGCCTATTACGGCGGATATTGAACTTGCATTGCTTCGA [서열번호 453]
따라서, 바람직하게는 상기 MERS CoV M 폴리펩티드는 실질적으로 서열번호 453에 나타낸 것과 같은 DNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 454의 RNA 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다:
AUGUCUAAUAUGACGCAACUCACUGAGGCGCAGAUUAUUGCCAUUAUUAAAGACUGGAACUUUGCAUGGUCCCUGAUCUUUCUCUUAAUUACUAUCGUACUACAGUAUGGAUACCCAUCCCGUAGUAUGACUGUCUAUGUCUUUAAAAUGUUUGUUUUAUGGCUCCUAUGGCCAUCUUCCAUGGCGCUAUCAAUAUUUAGCGCCAUUUAUCCAAUUGAUCUAGCUUCCCAGAUAAUCUCUGGCAUUGUAGCAGCUGUUUCAGCUAUGAUGUGGAUUUCCUACUUUGUGCAGAGUAUCCGGCUGUUUAUGAGAACUGGAUCAUGGUGGUCAUUCAAUCCUGAGACUAAUUGCCUUUUGAACGUUCCAUUUGGUGGUACAACUGUCGUACGUCCACUCGUAGAGGACUCCACCAGUGUAACUGCUGUUGUAACCAAUGGCCACCUCAAAAUGGCUGGCAUGCAUUUCGGUGCUUGUGACUACGACAGACUUCCUAAUGAAGUCACCGUGGCCAAACCCAAUGUGCUGAUUGCUUUAAAAAUGGUGAAGCGGCAAAGCUACGGAACUAAUUCCGGCGUUGCCAUUUACCAUAGAUAUAAGGCAGGUAAUUACAGGAGUCCGCCUAUUACGGCGGAUAUUGAACUUGCAUUGCUUCGA [서열번호 454]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 454에 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명자들은 서열번호 452의 단백질 서열에 인간 발현을 위한 코돈 최적화를 하였고, 개시(ATG) 및 종결(TGA) 코돈을 포함하는 코돈 최적화된 핵산(DNA) 서열의 한 구현예는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 455로 제공된다:
ATGAGCAACATGACCCAGCTGACAGAGGCCCAGATCATTGCCATCATCAAGGACTGGAACTTCGCTTGGAGCCTGATCTTCCTGCTGATCACCATCGTGCTGCAGTACGGCTACCCCAGCAGATCCATGACCGTGTACGTGTTCAAGATGTTCGTCCTGTGGCTGCTGTGGCCCAGCTCTATGGCCCTGAGCATCTTCAGCGCCATCTATCCCATCGACCTGGCCAGCCAGATCATCTCTGGAATCGTGGCCGCCGTGTCCGCCATGATGTGGATCAGCTACTTCGTGCAGAGCATCCGGCTGTTCATGAGAACCGGCAGCTGGTGGTCCTTCAATCCCGAGACAAACTGCCTGCTGAACGTGCCCTTTGGCGGCACTACAGTCGTCAGACCCCTGGTGGAAGATAGCACCTCTGTGACCGCCGTGGTCACCAATGGCCACCTGAAAATGGCCGGCATGCACTTCGGCGCCTGCGACTATGACAGACTGCCCAACGAAGTGACCGTGGCCAAGCCTAATGTGCTGATCGCCCTGAAGATGGTCAAGCGGCAGAGCTACGGCACCAATTCTGGCGTGGCCATCTACCACAGATACAAGGCCGGCAACTACAGAAGCCCTCCTATCACCGCCGACATCGAGCTGGCTCTGCTGAGATGA [서열번호 455]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 455에 나타낸 것과 같은 DNA 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체에 의해 암호화된다.
구현예에서, 개시(AUG) 및 종결(UGA) 코돈을 포함하는 서열번호 455의 코돈 최적화된 DNA 서열에 대응하는 RNA 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 456으로 제공된다:
AUGAGCAACAUGACCCAGCUGACAGAGGCCCAGAUCAUUGCCAUCAUCAAGGACUGGAACUUCGCUUGGAGCCUGAUCUUCCUGCUGAUCACCAUCGUGCUGCAGUACGGCUACCCCAGCAGAUCCAUGACCGUGUACGUGUUCAAGAUGUUCGUCCUGUGGCUGCUGUGGCCCAGCUCUAUGGCCCUGAGCAUCUUCAGCGCCAUCUAUCCCAUCGACCUGGCCAGCCAGAUCAUCUCUGGAAUCGUGGCCGCCGUGUCCGCCAUGAUGUGGAUCAGCUACUUCGUGCAGAGCAUCCGGCUGUUCAUGAGAACCGGCAGCUGGUGGUCCUUCAAUCCCGAGACAAACUGCCUGCUGAACGUGCCCUUUGGCGGCACUACAGUCGUCAGACCCCUGGUGGAAGAUAGCACCUCUGUGACCGCCGUGGUCACCAAUGGCCACCUGAAAAUGGCCGGCAUGCACUUCGGCGCCUGCGACUAUGACAGACUGCCCAACGAAGUGACCGUGGCCAAGCCUAAUGUGCUGAUCGCCCUGAAGAUGGUCAAGCGGCAGAGCUACGGCACCAAUUCUGGCGUGGCCAUCUACCACAGAUACAAGGCCGGCAACUACAGAAGCCCUCCUAUCACCGCCGACAUCGAGCUGGCUCUGCUGAGAUGA [서열번호 456]
그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 456에 나타낸 것과 같은 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 임의의 코로나바이러스의 ORF4a(NS4a), 임의의 코로나바이러스의 ORF3b, 또는 마우스 간염 바이러스 및 SARS(코로나바이러스)의 뉴클레오캡시드 단백질; 및 그의 동원체로 이루어진 IIP의 군으로부터 선택되지 않을 수 있다.
상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 HSV-2 Us1; HSV-1 Us1; HSV-1Us11; ORF V20.0L; BVDV Npro; Langat NS5; 인플루엔자 NS1; PIV-5 V; SARS-CoV-2 ORF3b; 및 MERS-CoV ORF4a;로 이루어진 IIP의 군으로부터 선택되지 않을 수 있다.
상기 RNA 구조체는 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 이것은 도 1에서 관심있는 유전자(GOI)로 나타낸다.
상기 적어도 하나의 치료 생체분자는 치료 단백질을 포함할 수 있다. 숙련된 기술자는 치료 단백질이 바람직하게는 인간에서 치료 적용분야를 갖는 임의의 단백질에 관한 것임을 이해할 것이다. 상기 RNA 분자에 의해 암호화될 수 있는 예시적인 치료 생체분자는 박테리아, 바이러스, 진균, 원생동물/또는 기생충과 같은 병원체로부터 유래되는 단백질 또는 펩티드를 포함한다. 상기 단백질 또는 펩티드는 항원, 즉 숙주에서 면역 반응을 자극 또는 촉발할 수 있는 항원일 수 있다. 그러므로, 상기 적어도 하나의 치료 생체분자가 항원인 구현예에서, 제1 측면의 RNA 구조체는 백신으로 간주될 수 있다.
바이러스로부터 유래되는 단백질 또는 펩티드는 바이러스 항원일 수 있다. 상기 바이러스 항원은 오르토믹소바이러스(Orthomyxovirus); 파라믹소비리대(Paramyxoviridae) 바이러스; 메타뉴모바이러스 및 모르빌리바이러스(Morbillivirus); 뉴모바이러스; 파라믹소바이러스(Paramyxovirus); 폭스비리대(Poxviridae); 메타뉴모바이러스; 모르빌리바이러스; 피코르나바이러스; 엔테로바이러스; 분야바이러스(Bunyavirus); 플레보바이러스(Phlebovirus); 나이로바이러스(Nairovirus); 헤파르나바이러스(Heparnavirus); 토가바이러스(Togavirus); 알파바이러스; 아르테리바이러스(Arterivirus); 플라비바이러스; 페스티바이러스; 헤파드나바이러스(Hepadnavirus); 라브도바이러스(Rhabdovirus); 칼리시비리대(Caliciviridae); 코로나바이러스; 레트로바이러스(Retroviruses); 레오바이러스(Reovirus); 파르보바이러스(Parvovirus); 델타 간염 바이러스(HDV); E형 간염 바이러스(HEV); 인간 헤르페스바이러스 및 파포바바이러스(Papovavirus);로 이루어진 군으로부터 선택되는 바이러스로부터 유래될 수 있다.
상기 오르토믹소바이러스는 인플루엔자(인플루엔자) A, B 및 C일 수 있다. 상기 파라믹소비리대 바이러스는 뉴모바이러스(RSV), 파라믹소바이러스(PIV)일 수 있다. 상기 메타뉴모바이러스는 모르빌리바이러스(예컨대, 홍역)일 수 있다. 상기 뉴모바이러스는 호흡기 세포융합 바이러스(RSV), 소 호흡기 세포융합 바이러스, 마우스의 폐렴 바이러스, 또는 터키 비기관염(rhinotracheitis) 바이러스일 수 있다. 상기 파라믹소바이러스는 파라인쿠엔자(Parainfluenza) 바이러스 타입 1 - 4(PIV), 볼거리, 센다이 바이러스, 원숭이 바이러스 5, 소 파라인플루엔자 바이러스, 니파바이러스, 헤니파바이러스(Henipavirus) 또는 뉴캐슬(Newcastle) 질환 바이러스일 수 있다. 상기 폭스비리대는 바리올라 베라(Variola vera), 예를 들면 바리올라 메이저(major) 및 바리올라 마이너(minor)일 수 있다. 상기 메타뉴모바이러스는 인간 메타뉴모바이러스(hMPV) 또는 조류 메타뉴모바이러스(aMPV)일 수 있다. 상기 모르빌리바이러스는 홍역일 수 있다. 상기 피코르나바이러스는 엔테로바이러스, 리노바이러스, 헤파르나바이러스, 파레코바이러스(Parechovirus), 카디오바이러스(Cardiovirus) 및 아프토바이러스(Aphthovirus)일 수 있다. 상기 엔테로바이러스는 폴리오바이러스 타입 1, 2 또는 3, 콕사키 A 바이러스 타입 1 내지 22 및 24, 콕사키 B 바이러스 타입 1 내지 6, 에코바이러스(Echovirus)(ECHO) 바이러스) 타입 1 내지 9, 11 내지 27 및 29 내지 34 또는 엔테로바이러스 68 내지 71일 수 있다. 상기 분야바이러스는 캘리포니아 뇌염 바이러스일 수 있다. 상기 플레보바이러스는 리프트 계곡열 바이러스일 수 있다. 상기 나이로바이러스는 크림-콩고(Crimean-Congo) 출혈열 바이러스일 수 있다. 상기 헤파르나바이러스는 A형 간염 바이러스(HAV)일 수 있다. 상기 토가바이러스는 루비바이러스일 수 있다. 상기 플라비바이러스는 진드기-매개 뇌염(TBE) 바이러스, 뎅기(타입 1, 2, 3 또는 4) 바이러스, 황열 바이러스, 일본 뇌염 바이러스, 키아사누 삼림 바이러스(Kyasanur Forest Virus), 웨스트 나일 뇌염 바이러스, 세인트 루이스 뇌염 바이러스, 러시아 봄-여름 뇌염 바이러스 또는 포와산(Powassan) 뇌염 바이러스일 수 있다. 상기 페스티바이러스는 소 바이러스 설사(BVDV), 고전적 돼지 열병(CSFV) 또는 보더 질환(BDV)일 수 있다. 상기 헤파드나바이러스는 B형 간염 바이러스 또는 C형 간염 바이러스일 수 있다. 상기 라브도바이러스는 리사바이러스(Lyssavirus)(광견병 바이러스) 또는 수포성바이러스(Vesiculovirus)(VSV)일 수 있다. 상기 칼리시비리대는 노워크(Norwalk) 바이러스, 또는 노워크-유사 바이러스, 예컨대 하와이 바이러스 및 스노우 마운틴 바이러스(Snow Mountain Virus)일 수 있다. 상기 코로나바이러스는 SARS CoV-1, SARS-CoV-2, MERS, 인간 호흡기 코로나바이러스, 조류 전염성 기관지염(IBV), 마우스 간염 바이러스(MHV), 또는 돼지 전염성 위장염 바이러스(TGEV)일 수 있다. 상기 레트로바이러스는 온코바이러스(Oncovirus), 렌티바이러스(Lentivirus) 또는 스푸마바이러스(Spumavirus)일 수 있다. 상기 레오바이러스는 오르토레오(Orthoreo) 바이러스, 로타바이러스, 오르비바이러스(Orbivirus), 또는 콜티바이러스(Coltivirus)일 수 있다. 상기 파르보바이러스는 파르보바이러스 B 19일 수 있다. 상기 인간 헤르페스바이러스는 헤르페스 심플렉스 바이러스(HSV), 바리셀라-조스터(Varicella-zoster) 바이러스(VZV), 엡스테인-바 바이러스(EBV), 사이토메갈로바이러스(CMV), 인간 헤르페스바이러스 6(HHV6), 인간 헤르페스바이러스 7(HHV7), 또는 인간 헤르페스바이러스 8(HHV8)일 수 있다. 상기 파포바바이러스는 유두종 바이러스, 폴리오마바이러스(Polyomavirus), 아데노바이러스(Adenovirus) 또는 아레나바이러스일 수 있다.
박테리아로부터 유래되는 단백질 또는 펩티드는 박테리아 항원일 수 있다.
상기 박테리아 항원은 나이세리아 메닝기티데스(Neisseria meningitides), 스트렙토코커스 뉴모니애(Streptococcus pneumoniae), 스트렙토코커스 피로게네스(Streptococcus pyogenes), 모락셀라 카타랄리스(Moraxella catarrhalis), 보르데텔라 페르투시스(Bordetella pertussis), 부르크홀데리아 속(Burkholderia sp.)(예컨대, 부르크홀데리아 말레이, 부르크홀데리아 슈도말레이 및 부르크홀데리아 세파시아), 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococcus aureus), 해모필러스 인쿠엔자에(Haemophilus influenzae), 클로스트리디움 테타니(Clostridium tetani)(파상풍), 클로스트리디움 퍼프린젠스(Clostridium perfringens), 클로스트리디움 보툴리눔스(Clostridium botulinums), 코리네박테리움 디프테리애(Cornynebacterium diphtheriae)(디프테리아), 슈도모나스 애루기노사(Pseudomonas aeruginosa), 레지오넬라 뉴모필라(Legionella pneumophila), 콕시엘라 부르네티이(Coxiella burnetii), 브루셀라 속(Brucella sp.)(예컨대, B. 아보르투스, B. 카니스, B. 멜리텐시스, B. 네오토마에, B. 오비스, B. 수이스 및 B. 피니페디애), 프란시셀라 속(Francisella sp.)(예컨대, F. 노비시다, F. 필로미라지아 및 F. 툴라렌시스), 스트렙토코커스 아갈락티애(Streptococcus agalactiae), 나이세리아 고노레애(Neiserria gonorrhoeae), 클라미디아 트라코마티스(Chlamydia trachomatis), 트레포네마 팔리둠(Treponema pallidum)(매독), 해모필러스 두크레이이(Haemophilus ducreyi), 엔테로코커스 패칼리스(Enterococcus faecalis), 엔테로코커스 패시움(Enterococcus faecium), 헬리코박터 파일로리(Helicobacter pylori), 스타필로코커스 사프로피티쿠스(Staphylococcus saprophyticus), 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica), 대장균(E. coli), 바실러스 안트라시스(Bacillus anthracis)(탄저병), 예르시니아 페스티스(Yersinia pestis)(페스트), 미코박테리움 투베르쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis), 리케챠(Rickettsia), 리스테리아(Listeria), 클라미디아 뉴모니애(Chlamydia pneumoniae), 비브리오 콜레라에(Vibrio cholerae), 살모넬라 타이피(Salmonella typhi)(장티푸스), 보렐리아 부르그도르퍼(Borrelia burgdorfer), 포르필라모나스 속(Porphyromonas sp.) 및 클레브시엘라 속(Klebsiella sp.)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 박테리아로부터 유래될 수 있다.
진균으로부터 유래되는 단백질 또는 펩티드는 진균 항원일 수 있다.
상기 진균 항원은 에피더모피톤 코쿠숨(Epidermophyton koccusum), 마이크로스포룸 아우도우이니(Microsporum audouini), 마이크로스로품 카니스(Microsporum canis), 마이크로스포룸 디스토르툼(Microsporum distortum), 마이크로스포룸 에퀴눔(Microsporum equinum), 마이크로스포룸 기프숨(Microsporum gypsum), 마이크로스포룸 나눔(Microsporum nanum), 트리코피톤 콘센트리쿰(Trichophyton concentricum), 트리코피톤 에퀴눔(Trichophyton equinum), 트리코피톤 갈리나에(Trichophyton gallinae), 트리코피톤 기프세움(Trichophyton gypseum), 트리코피톤 메그니니(Trichophyton megnini), 트리코피톤 멘타그로피테스(Trichophyton mentagrophytes), 트리코피톤 퀸케아눔(Trichophyton quinckeanum), 트리코피톤루브룸(Trichophyton rubrum), 트리코피톤 쇼엔레이니(Trichophyton schoenleini), 트리코피톤 톤수란스(Trichophyton tonsurans), 트리코피톤 베루코숨(Trichophyton verrucosum), T 베루코숨 var. album, var. 디스코이데스, var. 오크라세움, 트리코피톤 비올라세움(Trichophyton violaceum), 및/또는 트리코피톤 파비포르메(Trichophyton faviforme)을 포함하는 피부사상균(Dermatophytres); 또는 아스페르길루스 푸미가투스(Aspergillus fumigatus), 아스페르길루스 카부스(Aspergillus kavus), 아스페르길루스 나이거(Aspergillus niger), 아스페르길루스 니둘란스(Aspergillus nidulans), 아스페르길루스 테레우스(Aspergillus terreus), 아스페르길루스 시도위(Aspergillus sydowi), 아스페르길루스 카바투스(Aspergillus kavatus), 아스페르길루스 글라우쿠스(Aspergillus glaucus), 블라스토키조마이세스 카피타투스(Blastoschizomyces capitatus), 칸디다 알비칸스(Candida albicans), 칸디다 에놀라세(Candida enolase), 칸디다 트로피칼리스(Candida tropicalis), 칸디다 글라브라타(Candida glabrata), 칸디다 크루세이(Candida krusei), 칸디다 파라프실로시스(Candida parapsilosis), 칸디다 스텔라토이데아(Candida stellatoidea), 칸디다 쿠세이(Candida kusei), 칸디다 파라쿠세이(Candida parakwsei), 칸디다 루시타니애(Candida lusitaniae), 칸디다 슈도트로피칼리스(Candida pseudotropicalis), 칸디다 구일리에르몬디(Candida guilliermondi), 클라도스포리움 카리오니이(Cladosporium carrionii), 코시디오이데스 이미티스(Coccidioides immitis), 블라스토마이세스 더마티디스(Blastomyces dermatidis), 크립토코커스 네오포르만스(Cryptococcus neoformans), 게오트리쿰 클라바툼(Geotrichum clavatum), 히스토플라스마 카프술라툼(Histoplasma capsulatum), 클레브시엘라 뉴모니애(Klebsiella pneumoniae), 마이크로스포리디아(Microsporidia), 엔세팔리토준 속(Encephalitozoon spp.), 세프타타 인테스티날리스(Septata intestinalis) 및 엔테로시토준 비에네우시(Enterocytozoon bieneusi); 브라키올라 속(Brachiola spp.), 마이크로스포룸 속(Microsporidium spp.), 노세마 속(Nosema spp.), 플레이스토포라 속(Pleistophora spp.), 트라키플레이스토포라 속(Trachipleistophora spp.), 비타포르마 속(Vittaforma spp.), 파라코시디오이데스 브라실리엔시스(Paracoccidioides 브라질iensis), 뉴모시스티스 카리니이(Pneumocystis carinii), 피티움 인시디오숨(Pythiumn insidiosum), 피티로스포룸 오발레(Pityrosporum ovale), 사카로마이세스 세레비지애(Sacharomyces cerevisiae), 사카로마이세스 보울라르디이(Saccharomyces boulardii), 사카로마이세스 폼베(Saccharomyces pombe), 세도스포리움 아디오스페룸(Scedosporium apiosperum), 스포로트릭스 센키이(Sporothrix schenckii), 트리코스포론 베이겔리이(Trichosporon beigelii), 톡소플라스마 곤디이(Toxoplasma gondii), 페니실리움 마르네페이(Penicillium marneffei), 말라세지아 속(Malassezia spp.), 폰세카애 속(Fonsecaea spp.), 완지엘라 속(Wangiella spp.), 스포로트릭스 속(Sporothrix spp.), 바시디오볼루스 속(Basidiobolus spp.), 코니디오볼루스 속(Conidiobolus spp.), 리조푸스 속(Rhizopus spp.), 무코르 속(Mucor spp.), 아브시디아 속(Absidia spp.), 모르티에렐라 속(Mortierella spp.), 쿠닝가멜라 속(Cunninghamella spp.), 사크세나애 속(Saksenaea spp.), 알테르나리아 속(Alternaria spp.), 쿠르불라리아 속(Curvularia spp.), 헬민토스포리움 속(Helminthosporium spp.), 푸사리움 속(Fusarium spp.), 아스페르길루스 속(Aspergillus spp.), 페니실리움 속(Penicillium spp.), 모놀리니아 속(Monolinia spp.), 리조크토니아 속(Rhizoctonia spp.), 패실로마이세스 속(Paecilomyces spp.), 피토마이세스 속(Pithomyces spp.), 및 클라도스포리움 속(Cladosporium spp.)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 진균으로부터 유래될 수 있다.
원생동물로부터 유래되는 단백질 또는 펩티드는 원생동물 항원일 수 있다.
상기 원생동물 항원은 엔타모에바 히스톨리티카(Entamoeba histolytica), 지아르디아 람블리(Giardia lambli), 크립토스포리디움 파르붐(Cryptosporidium parvum), 시클로스포라 카야타넨시스(Cyclospora cayatanensis) 및 톡소플라스마(Toxoplasma)로 이루어진 군으로부터 선택되는 원생동물로부터 유래될 수 있다.
상기 치료 생체분자는 식물로부터 유래되는 단백질 또는 펩티드일 수 있다. 바람직하게는, 상기 단백질 또는 펩티드는 식물 항원이다. 예를 들면, 상기 식물 항원은 리시누스 코무니스(Ricinus communis)로부터 유래될 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 치료 생체분자는 면역원 또는 항원일 수 있다. 바람직하게는, 상기 면역원 또는 항원은 종양 면역원 또는 항원, 또는 암 면역원 또는 항원이다. 상기 종양 면역원 및 항원은 펩티드-함유 종양 항원, 예컨대 폴리펩티드 종양 항원 또는 당단백질 종양 항원일 수 있다.
상기 종양 항원은 (a) 암 세포와 연관된 전장(full length) 분자, (b) 결실, 부가 및/또는 치환된 부분을 갖는 분자를 포함하는 상동체(homolog) 및 그의 변형된 형태, 및 (c) 그의 단편일 수 있다.
적합한 종양 면역원은 CD8+ 림프구에 의해 인식되는 클래스(class) I-제한(restricted) 항원 또는 CD4+ 림프구에 의해 인식되는 클래스 II-제한 항원을 포함한다.
상기 종양 항원은 고환암, 흑색종, 폐암, 두경부암, NSCLC, 유방암, 위장암, 방광암, 결장직장암, 췌장암, 림프종, 백혈병, 신장암, 간암, 난소암, 위암 및 전립선암으로 이루어진 군으로부터 선택되는 암과 연관된 항원일 수 있다.
상기 종양 항원은 다음으로부터 선택될 수 있다:
(a) 암-고환 항원, 예컨대 NY-ESO-I, SSX2, SCP-1뿐만 아니라 RAGE, BAGE, GAGE 및 MAGE 패밀리 폴리펩티드, 예를 들면, (예를 들면, 흑색종, 폐, 두경부, NSCLC, 유방, 위장, 및 방광 종양을 다루기 위해 사용될 수 있는) GAGE-I, GAGE-2, MAGE-I, MAGE-2, MAGE-3, MAGE-4, MAGE-5, MAGE-6, 및 MAGE-12;
(b) 돌연변이된 항원, 예를 들면, (다양한 고형 종양, 예컨대, 결장직장암, 폐암, 두경부암과 연관되는) p53, (예컨대, 흑색종, 췌장암 및 결장직장암과 연관되는) p21/Ras, (예컨대, 흑색종과 연관되는) CDK4, (예컨대, 흑색종과 연관되는) MUM-1, (예컨대, 두경부암과 연관되는) 카스파아제(caspase)-8, (예컨대, 방광암과 연관되는) CIA 0205, HLA-A2-R1701, (예컨대, 흑색종과 연관되는) 베타 카테닌, (예컨대, T-세포 비-호지킨 림프종과 연관되는) TCR, (예컨대, 만성 골수성 백혈병과 연관되는) BCR-abl, 트리오스포스페이트 아이소머라아제(triosephosphate isomerase), KIA 0205, CDC-27, 및 LDLR-FUT;
(c) 과발현된 항원, 예를 들면, (예컨대, 결장직장암과 연관되는) 갈렉틴(Galectin) 4, (예컨대, 호지킨 질환과 연관되는) 갈렉틴 9, (예컨대, 만성 골수성 백혈병과 연관되는) 프로티나아제 3, (예컨대, 다양한 백혈병과 연관되는) WT 1, (예컨대, 신장암과 연관되는) 탄산 탈수효소(carbonic anhydrase), (예컨대, 폐암과 연관되는) 알돌라아제(aldolase) A, (예컨대, 흑색종과 연관되는) PRAME, (예컨대, 유방암, 결장암, 폐암 및 난소암과 연관되는) HER-2/neu, (예컨대, 간암과 연관되는) 알파-페토단백질, (예컨대, 결장직장암과 연관되는) KSA, (예컨대, 췌장암 및 위암과 연관되는) 가스트린(gastrin), 텔로머라아제 촉매화 단백질, (예컨대, 유방암 및 난소암과 연관되는) MUC-I, (예컨대, 신장 세포 암종과 연관되는) G-250, (예컨대, 유방암, 결장암과 연관되는) p53, 및 (예컨대, 유방암, 폐암, 및 결장직장암과 같은 위장관의 암과 연관되는) 암태아성 항원;
(d) 공유된 항원, 예를 들면, (예컨대, 흑색종과 연관되는) 흑색종-멜라닌세포 분화 항원, 예컨대 MART-1/멜란(Melan) A, gp100, MClR, 멜라닌세포-자극 호르몬 수용체, 티로시나아제, 티로시나아제 관련 단백질-1/TRPl 및 티로시나아제 관련 단백질-2/TRP2;
(e) 예컨대, 전립선 암과 연관되는 전립선-연관 항원, 예컨대 PAP, PSA, PSMA, PSH-Pl, PSM-Pl, PSM-P2; 및/또는
(f) (예를 들면, 골수종 및 B 세포 림프종과 연관되는) 면역글로불린 이디오타입(idiotype).
상기 치료 생체분자는 진핵생물 단백질 또는 펩티드일 수 있다. 한 구현예에서, 상기 진핵생물 단백질 또는 펩티드는 포유동물 단백질 또는 펩티드이다. 상기 포유동물 단백질 또는 펩티드는 효소; 효소 억제제; 호르몬; 면역 시스템 단백질; 수용체; 결합 단백질; 전사 인자; 번역 인자; 종양 성장 저해 단백질; 구조 단백질 및 혈액 단백질;로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
상기 면역 시스템 단백질은 항체 또는 그의 항원 결합 단편일 수 있다. 따라서, 상기 치료 생체분자는 항체 또는 그의 항원 결합 단편일 수 있다. 상기 항원 결합 단편은 개별 중쇄 또는 경쇄, 또는 그의 단편, 예컨대 VL, VH 및 Fd; 1가(monovalent) 단편, 예컨대 Fv, Fab, 및 Fab'; 2가(bivalent) 단편, 예컨대 F(ab')2; 단일쇄 Fv(scFv); 하나 이상의 상보성 결정 영역(CDR); 또는 Fc 단편;을 포함할 수 있다.
상기 효소는 키모신; 위 리파아제; 조직 플라스미노겐 활성화제; 스트렙토키나아제; 콜레스테롤 생합성 또는 분해성 스테로이드생성 효소; 키나아제; 포스포디에스테라아제; 메틸라아제; 탈-메틸라아제; 탈수소효소; 셀룰라아제; 프로테아제; 리파아제; 포스포리파아제; 아로마타아제; 시토크롬; 아데닐레이트 또는 구아닐레이트 시클라아제 및 뉴라미다아제;로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
상기 효소 억제제는 메탈로프로티나아제(TIMP)의 조직 억제제일 수 있다. 상기 호르몬 성장 호르몬일 수 있다.
상기 면역 시스템 단백질은 사이토카인; 케모카인; 림포카인; 에리트로포이에틴; 인테그린; 아드레신; 셀렉틴; 귀소(homing) 수용체; T 세포 수용체 및 면역글로불린;으로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
상기 사이토카인은 인터루킨, 예를 들면 IL-2, IL-4 및/또는 IL-6, 콜로니 자극 인자(CSF), 과립구 콜로니 자극 인자(G-CSF), 과립구-대식세포 콜로니 자극 인자(GM-CSF) 또는 종양 괴사 인자(TNF)일 수 있다.
상기 케모카인은 대식세포 염증성 단백질-2 및/또는 플라스미노겐 활성화제일 수 있다.
상기 림포카인은 인터페론일 수 있다.
상기 면역글로불린은 자연형, 변형된 또는 키메라 면역글로불린 또는 그의 단편일 수 있다. 바람직하게는, 상기 면역글로불린은 이중 활성을 갖는 키메라 면역글로불린, 예컨대 항체 효소 또는 항체-독소 키메라이다.
상기 호르몬은 인슐린, 갑상선 호르몬, 카테콜아민, 고나도트로핀, 자극 호르몬, 프로락틴, 옥시토신, 도파민, 소 소마토트로핀, 렙틴; 성장 호르몬(예컨대, 인간 성장 호르몬), 성장 인자(예컨대, 표피 성장 인자, 신경 성장 인자, 인슐린-유사 성장 인자 등);로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
상기 수용체는 스테로이드 호르몬 수용체 또는 펩티드 수용체일 수 있다. 바람직하게는, 상기 수용체는 성장 인자 수용체이다.
상기 결합 단백질은 성장 인자 결합 단백질일 수 있다.
상기 종양 성장 저해 단백질은 혈관형성을 억제하는 단백질일 수 있다.
상기 구조 단백질은 콜라겐; 피브로인; 피브리노겐; 엘라스틴; 튜불린; 액틴; 및 미오신;으로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
상기 혈액 단백질은 트롬빈; 혈청 알부민; 인자 VII; 인자 VIII; 인슐린; 인자 IX; 인자 X; 조직 플라스미노겐 활성화제; 단백질 C; 본 빌레브란트 인자; 항-트롬빈 III; 글루코세레브로시다아제; 에리트로포이에틴 과립구 콜로니 자극 인자(GCSF) 또는 변형된 인자 VIII; 및 항응고제;로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
한 바람직한 구현예에서, 상기 치료 생체분자는 림프 항상성을 조절할 수 있는 사이토카인, 바람직하게는 T 세포의 발생, 프라이밍, 확장, 분화 및/또는 생존에 수반되고, 바람직하게는 이를 유도 또는 향상시키는 사이토카인이다. 따라서, 바람직하게는 상기 사이토카인은 인터루킨이다. 가장 바람직하게는, IL-2, IL-7, IL-12, IL-15, 또는 IL-21이다.
상기 치료 생체분자는 줄기 세포 특징을 갖는 세포로 체세포의 재프로그래밍(reprogramming)을 향상시킬 수 있는 단백질일 수 있다. 줄기 세포 특징을 갖는 세포로 체세포의 재프로그래밍을 향상시킬 수 있는 단백질은 OCT4, SOX2, NANOG, LIN28, p53, ART-4, BAGE, ss-카테닌/m, Bcr-abL CAMEL, CAP-1, CASP-8, CDC27/m, CD 4/m, CEA, CLAUDIN-12, c-MYC, CT, Cyp-B, DAM, ELF2M, ETV6-AML1, G250, GAGE, GnT-V, Gap100, HAGE, HER-2/neu, HPV-E7, HPV-E6, HAST-2, hTERT(또는 hTRT), LAGE, LDLR/FUT, MAGE-A, MAGE-B, MAGE-C, MART-1/멜란-A, MC1R, 마이오신/m, MUC1, MUM-1, -2, -3, NA88-A, NF1, NY-ESO-1, NY-BR-1, pl90 마이너 BCR-abL, Plac-1, Pml/RARa, PRAME, 프로티나아제 3, PSA, PSM, RAGE, RU1 또는 RU2, SAGE, SART-1 또는 SART-3, SCGB3A2, SCP1, SCP2, SCP3, SSX, SURVIVIN, TEL/AML1, TPI/m, TRP-1, TRP-2, TRP-2/INT2, TPTE 및 WT로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있고, 바람직하게는 WT-1이다.
바람직하게는, MAGE-A는 MAGE-A1, MAGE-A2, MAGE-A3, MAGE-A4, MAGE-A5, MAGE-A6, MAGE-A7, MAGE-A8, MAGE-A9, MAGE-A10, MAGE-A11, 또는 MAGE-A12로 이루어진 군으로부터 선택된다.
바람직하게는, 줄기 세포 특징을 갖는 세포로 체세포의 재프로그래밍을 향상시킬 수 있는 단백질은 OCT4, SOX2, LF4; c-MYC; NANOG; LIN28;이다.
상기 치료 생체분자는 세포-치료법 적응증을 위해 생체외(ex vivo)에서 세포를 변형하기 위해 이용될 수 있는 생체분자일 수 있다. 따라서, 바람직하게는 상기 치료 생체분자는 면역글로불린, T-세포 수용체 및 NK 수용체로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
상기 치료 생체분자는 내인성(endogenous) 숙주 유전자의 발현을 조절할 수 있는 RNA 분자, 예를 들면 간섭 RNA, 예컨대 작은 RNA, siRNA 또는 microRNA일 수 있다.
상기 적어도 하나의 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP)을 암호화하는 서열은 제1 측면의 RNA 구조체 내의 임의의 곳에 배치될 수 있으며, 예컨대 상기 치료 생체분자(즉, 도 1에서의 GOI)를 암호화하는 서열은 상기 적어도 하나의 IIP를 암호화하는 서열의 5' 또는 3'에 배치될 수 있다.
예를 들면, 한 구현예에서, 상기 치료 생체분자를 암호화하는 서열은 바람직하게는 상기 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열의 5'에 배치된다. 예를 들면, 도 1에 나타낸 saRNA 구현예 2a, 3a, 4a, 및 mRNA 구현예 6a 및 7a 참조.
그러나, 다른 구현예에서, 상기 치료 생체분자를 암호화하는 서열은 바람직하게는 상기 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열의 3'에 배치된다. 예를 들면, 도 1에 나타낸 saRNA 구현예 2b, 3b, 4b, 및 mRNA 구현예 6b 및 7b 참조.
바람직하게는, 제1 측면에 따른 RNA 구조체는 게놈성 또는 서브게놈성일 수 있는 적어도 하나의 프로모터(promoter)를 포함한다. 그러나, 바람직하게는 상기 프로모터는 도 1(구현예 1-4b)에 나타낸 것과 같이 서브게놈성 프로모터이다. 따라서, 바람직하게는 본 발명의 saRNA 구조체는 프로모터를 포함한다. 숙련된 기술자는 상기 서브게놈성 프로모터가 적어도 하나의 치료 생체분자 및 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질을 암호화하는 서열에 작동가능하게 연결되어서, 상기 치료 생체분자 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 전사할 수 있는 프로모터에 관한 것임을 이해할 것이다.
바람직하게는, 상기 서브게놈성 프로모터는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 67로 제공되는 26S이다:
GGGCCCCTATAACTCTCTACGGCTAACCTGAATGGACTACGACAT [서열번호 67]
따라서, 바람직하게는 (바람직하게는, 서브게놈성 프로모터일 수 있는) 상기 프로모터는 실질적으로 서열번호 67에 나타낸 것, 또는 그의 변이체 또는 단편이다.
한 구현예에서, 동일한 프로모터가 관심있는 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열에 작동가능하게 연결된다.
상기 치료 생체분자(즉, GOI) 및 IIP가 모두 RNA의 단일 가닥에 의해 암호화되는 본 발명자들의 디자인은 유리하게는 훨씬 적은 용량의 RNA를 사용하는 것을 가능하게 하는데, 그 이유는 단백질이 상기 RNA에 의해 감지되는 동일한 세포에서 발현되고, 또한 복제될 수 있으며, 이에 따라 선천적 조절 성분이 발현 및 증폭되는 부가적인 측면을 갖기 때문이다.
따라서, 상기 RNA 구조체의 한 구현예에서, 상기 프로모터는 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열 및 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질을 암호화하는 서열의 5'에 배치되어서, 상기 프로모터는 양쪽 서열 모두에 작동가능하게 연결되고, 이로 인해 양쪽 모두의 발현을 구동한다.
그러나, 다른 구현예에서, 제1 프로모터는 관심있는 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열에 작동가능하게 연결되고, 제2 프로모터는 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질을 암호화하는 서열에 작동가능하게 연결된다. 이것은 2중 게놈 구조체로 나타낸다. 바람직하게는, 상기 제1 및/또는 제2 프로모터는 게놈성 또는 서브게놈성이다. 바람직하게는, 양쪽 프로모터는 모두 서브게놈성 프로모터, 예컨대 26S이다.
상기 RNA 구조체는 적어도 2개, 3개, 4개 또는 5개 IIP를 암호화할 수 있다. 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열이 1개 이상인 구현예에서, 단일 프로모터는 선천적 조절 단백질을 암호화하는 모든 서열에 작동가능하게 연결될 수 있다. 대안적으로, 프로모터는 선천적 조절 단백질을 암호화하는 각각의 서열에 연결되어서, 각각의 선천적 조절 단백질이 별도의 프로모터에 작동가능하게 연결될 수 있다. 상기 구현예에서, 별도의 프로모터는 동일한 프로모터 서열 또는 상이한 프로모터 서열을 포함할 수 있다. 다른 구현예에서, 상이한 프로모터는 선천적 조절 단백질을 암호화하는 각각의 서열에 작동가능하게 연결된다.
상기 RNA 구조체는 관심있는 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열 사이에 배치된 링커(linker) 서열을 추가로 포함할 수 있다. 상기 링커 서열은 단일 프로모터로부터 IIP의 생산 및 치료 분자의 생산을 가능하게 한다. 한 구현예에서, 상기 링커 서열은 번역 후에 소화되거나 절단됨으로써 숙주 세포에서 적어도 하나의 치료 생체분자 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 분리하도록 구성되는 펩티드 링커를 암호화한다. 이와 같이, 상기 링커 서열은 바람직하게는 절단 부위를 형성할 수 있는 절단가능한 펩티드, 예를 들면 2A 펩티드이다. [Furler S, Paterna J-C, Weibel M and Bueler H Recombinant AAV vectors containing the foot and mouth disease virus 2A sequence confer efficient bicistronic gene expression in cultured cells and rat substantia nigra neurons Gene Ther. 2001, vol. 8, PP: 864-873].
바람직하게는, 상기 2A 펩티드 서열을 암호화하는 링커 서열은 2개의 코딩 서열을 함께 연결한다. 이것은 상기 RNA 구조체가 다양한 벡터에서의 발현시에 일어날 수 있는 크기 제한을 극복할 수 있게 하고, 제1 측면의 RNA 구조체에 의해 암호화되는 모든 펩티드의 발현 및 번역이 단일 프로모터의 제어 하에 단일 단백질로서 일어날 수 있게 한다. 따라서, 상기 IIP, 2A 펩티드, 및 치료 생체분자의 서열을 포함하는 단일 단백질의 번역 이후에, 말단 글리신-프롤린 연결부에서 바이러스 2A 펩티드 서열의 절단이 일어나고, 이로 인해 2개의 폴리펩티드가 자유롭게 된다.
상기 2A 스페이서(spacer) 서열은 [Wang Y et al. Scientific Reports 2015, 5]에 개시된 것과 같이 E2A, F2A, P2A 및 T2A로 나타내는 서열을 포함하는 임의의 공지된 변이체일 수 있으며, 즉 적합한 2A 펩티드는 돼지 테스코바이러스(teschovirus)-1 2A(P2A) - ATNFSLLKQAGDVEENPGP(서열번호 68), 토세아 아시그나(thosea asigna) 바이러스 2A(T2A) - QCTNYALLKLAGDVESNPGP(서열번호 69), 말 비염 A 바이러스 2A(E2A), 및 구제역 바이러스 2A(F2A) - VKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP(서열번호 70)를 포함한다. 바람직하게는, 상기 2A 펩티드는 토세아 아시그나 바이러스 2A(T2A)이다.
다른 구현예에서, 상기 절단가능한 펩티드는 자가-절단 펩티드이다. 구현예에서, 상기 링커는 바이러스 2A 펩티드 스페이서를 포함하고, 푸린(furin) 절단 부위를 추가로 포함한다. 바람직하게는, 상기 자가-절단 펩티드는 푸린/2A 펩티드이다. 상류에 푸린 절단 부위를 삽입하면, 그렇지 않을 경우 상류 단백질에 부착되어 남아있게 되는 2A 잔기의 제거를 가능하게 한다.
상기 푸린 서열은 상기 2A 서열의 3' 또는 5'에 배치될 수 있다. 그러나, 바람직하게는 상기 푸린 서열은 상기 2A 서열의 5'에 배치되고, 바람직하게는 GSG 스페이서가 상기 푸린 및 2A 서열 사이에 배치된다.
숙련된 기술자는 푸린이 특이적 인식 서열(정규적으로 R-X-R/K/X-R(서열번호 71))에서 전구체 단백질을 절단하고, 최종 R 후에 전구단백질을 절단하는 (주로 골지 및 트랜스-골지 네트워크 내의) 분비 경로에 위치하는 편재성(ubiquitous) 칼슘-의존형 전구단백질 컨버타아제(convertase)임을 인식할 것이다. 따라서, 한 구현예에서, 상기 푸린 서열은 R-X-R/K/X-R이다. 그러나, 바람직하게는 상기 푸린 서열은 최적화된 서열 RRRRRR(서열번호 72) GSG 서열이다. 바람직하게는, 상기 GSG 상기 푸린 서열의 3' 및 상기 2A 서열의 5'에 배치된다.
따라서, 바람직하게는 상기 스페이서 서열은 NCBI 참조 서열: 진뱅크: AAC97195.1에 의해 제공되고, 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 73으로 제공되는 푸린/T2A이다:
RRRRRRGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP [서열번호 73]
그러므로, 바람직하게는 상기 스페이서 서열은 서열번호 73에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
도 1은 상기 GOI 및 IIP가 푸린-T2a 절단 부위를 암호화하는 뉴클레오티드 서열에 의해 연결되는 구현예 2a, 2b 및 6a, 6b를 보여준다. 한 구현예에서, 도 1에서 2a 또는 6a로 나타낸 것과 같이, 상기 F-T2a 절단 부위는 5' GOI 및 3' IIP를 분리시킨다. 한 구현예에서, 도 1에서 2b 또는 6b로 나타낸 것과 같이, 상기 F-T2a 절단 부위는 3' GOI 및 5' IIP를 분리시킨다.
RNA 구조체 또는 레플리콘이 선천적 조절 단백질을 암호화하는 하나 이상의 서열을 포함하는 구현예에서, 상기 구조체는 선천적 조절 단백질을 암호화하는 각각의 서열 사이, 또는 일부 IIP 사이에만 배치되는 링커 서열을 포함할 수 있다.
한 구현예에서, 상기 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열은, 그 서열이 무엇이든 간에(즉, 도 1에서 구현예 3a, 3b, 7a 또는 7b에 나타낸 것과 같은 GOI 또는 IIP), 종결 코돈에 의해 분리되고, 이어서 하류 서열의 번역을 시작할 수 있는 내부 리보솜 도입 부위(IRES) 서열이 뒤따를 수 있으며, 그 서열은 어느 것이나 될 수 있다. 따라서, 바람직하게는 상기 IRES 서열은 상기 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열 및 상기 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열 사이에 배치된다. 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열이 다수 사용된다면, 링커 서열은 공지된 절단 서열 및/또는 IRES 서열의 조합을 포함할 수 있다. 한 구현예에서, 도 1에서 3a 또는 7a로 나타낸 것과 같이, 상기 IRES 분위는 5' GOI 및 3' IIP를 분리한다. 한 구현예에서, 도 1에서 3b 또는 7b로 나타낸 것과 같이, 상기 IRES 부위는 3' GOI 및 5' IIP를 분리한다.
구현예에서, 상기 IRES는 피코르나바이러스 IRES이다. 다른 전형적인 IRES 서열은 뇌심근염 바이러스(EMCV) 또는 혈관 내피 성장 인자 및 타입 1 콜라겐-유도성 단백질(VCIP)의 IRES 서열과 같은 것을 포함하며, 본 기술분야의 기술자에게 알려져 있다.
다른 구현예에서, 상기 IRES는 리노바이러스 IRES, A형 간염 바이러스 IRES, C형 간염 바이러스 IRES, 폴리오바이러스 IRES, 엔테로바이러스 IRES, 카디오바이러스(cardiovirus) IRES, 아프토바이러스(aphthovirus) IRES, 플라비바이러스 IRES, 페스티바이러스 IRES, 크리파바이러스(cripavirus) IRES, 로팔로시품 파디 바이러스(rhopalosiphum padi virus) IRES, 또는 임의의 적합한 IRES로부터 선택될 수 있다. 특히, 상기 IRES는 실험적으로 검증된 IRES 구조의 데이터베이스를 제공하는 "IRESite"(http://www.iresite.org/)에 의해 기술되거나, "New Messenger RNA Research Communications" (ISBN: 1-60021-488-6)에 개시된 것과 같은 임의의 IRES일 수 있다.
바람직한 구현예에서, 상기 IRES는 다음과 같은 서열번호 74에 나타낸 것과 같을 수 있는 구제역 바이러스(FMDV) IRES, 또는 그의 단편 또는 변이체이다:
AGCAGGTTTCCCCAACTGACACAAAACGTGCAACTTGAAACTCCGCCTGGTCTTTCCAGGTCTAGAGGGGTAACACTTTGTACTGCGTTTGGCTCCACGCTCGATCCACTGGCGAGTGTTAGTAACAGCACTGTTGCTTCGTAGCGGAGCATGACGGCCGTGGGAACTCCTCCTTGGTAACAAGGACCCACGGGGCCAAAAGCCACGCCCACACGGGCCCGTCATGTGTGCAACCCCAGCACGGCGACTTTACTGCGAAACCCACTTTAAAGTGACATTGAAACTGGTACCCACACACTGGTGACAGGCTAAGGATGCCCTTCAGGTACCCCGAGGTAACACGCGACACTCGGGATCTGAGAAGGGGACTGGGGCTTCTATAAAAGCGCTCGGTTTAAAAAGCTTCTATGCCTGAATAGGTGACCGGAGGTCGGCACCTTTCCTTTGCAATTACTGACCAC [서열번호 74]
다른 바람직한 구현예에서, 상기 IRES는 뇌심근염 바이러스(EMCV) IRES이다. 상기 EMCV IRES는 다음과 같은 서열번호 75에 나타낸 것, 또는 그의 단편 또는 변이체일 수 있다:
cgttactggccgaagccgcttggaataaggccggtgtgcgtttgtctatatgttattttccaccatattgccgtcttttggcaatgtgagggcccggaaacctggccctgtcttcttgacgagcattcctaggggtctttcccctctcgccaaaggaatgcaaggtctgttgaatgtcgtgaaggaagcagttcctctggaagcttcttgaagacaaacaacgtctgtagcgaccctttgcaggcagcggaaccccccacctggcgacaggtgcctctgcggccaaaagccacgtgtataagatacacctgcaaaggcggcacaaccccagtgccacgttgtgagttggatagttgtggaaagagtcaaatggctcccctcaagcgtattcaacaaggggctgaaggatgcccagaaggtaccccattgtatgggatctgatctggggcctcggtgcacatgcttttcatgtgtttagtcgaggttaaaaaacgtctaggccccccgaaccacggggacgtggttttcctttgaaaaacacgatgataata [서열번호 75]
따라서, 바람직하게는 상기 IRES는 실질적으로 서열번호 74 또는 75에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
대안적으로, IRES 또는 2A 링커 대신에, 상기 링커 서열은 상기 치료 생체분자 및 IIP 모두를 단일 폴리펩티드 사슬로서 발현하게 하는 유연성 링커를 암호화하는 서열을 포함할 수 있지만, 상기 치료 생체분자 및 IIP는 독립적인 단백질로서 작용한다. 그러므로, 상기 단백질들은 이들이 개별적으로 발현된 것과 동일한 방식으로 그 효과를 발휘한다.
상기 유연성 링커 서열은 WO 2013/061076 A1(Oxford Biomedica)에 개시된 것과 같을 수 있다. 상기 유연성 링커 서열은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 76, 또는 그의 단편 또는 변이체로 나타낼 수 있다:
ggaggtggcgggtccgggggcgggggtagcggtggcgggggctcc [서열번호 76]
바람직하게는, 따라서, 상기 유연성 링커 서열은 실질적으로 서열번호 76에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
한 바람직한 구현예에서, 상기 유연성 링커 서열은 본 명세서에서 아래에 나타낸 것과 같은 서열번호 77로 나타낸 아미노산 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다:
GGGGSGGGGSGGGGS [서열번호 77]
따라서, 바람직하게는 상기 유연성 링커 서열은 실질적으로 서열번호 77에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 암호화한다.
또 다른 구현예에서, 상기 적어도 하나의 치료 생체분자 및 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질을 암호화하는 서열은 종결 코돈에 의해 분리되고, 이어서 하류 서열의 전사를 시작할 수 있는 제2 서브게놈성 프로모터 서열이 뒤따를 수 있다. 상기 구현예의 예는 도 1, 구현예 4a 및 4b에서 실증된다.
(바람직하게는 saRNA 구조체일 때) 상기 RNA 구조체는 적어도 하나의 치료 생체분자 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열의 5' 또는 3'에 배치된 적어도 하나의 비-구조 단백질(NSP)을 암호화할 수 있다. 바람직하게는, 상기 적어도 하나의 NSP를 암호화하는 서열은 치료 생체분자 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열의 5'에 배치된다. 따라서, 바람직하게는 상기 적어도 하나의 NSP를 암호화하는 서열은 상기 RNA 구조체의 5' 말단에 배치된다.
상기 RNA 구조체에 의해 암호화되는 적어도 하나의 비-구조 단백질은 RNA 폴리머라아제 NSP4일 수 있다. 상기 하나 이상의 비-구조 단백질은 바람직하게는 레플리카아제르 암호화한다. 바람직하게는, 상기 구조체는 NSP1, NSP2, NSP3 및 NSP4를 암호화한다. 숙련된 기술자는 NSP1은 바이러스 캡핑 효소 및 복제 복합체(RC)의 막 앵커(anchor)이지만, NSP2는 ns 폴리단백질 처리를 담당하는 RNA 헬리카아제 및 프로테아제임을 이해할 것이다. NSP3은 몇 가지 숙주 단백질과 상호작용하고, 단백질 폴리- 및 모노-ADP-리보실화를 조정할 수 있으며, NSP4는 코어 바이러스 RNA-의존형 RNA 폴리머라아제이다.
한 구현예에서, NSP1은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 78로 제공된다:
MEKVHVDIEEDSPFLRALQRSFPQFEVEAKQVTDNDHANARAFSHLASKLIETEVDPSDTILDIGSAPARRMYSKHKYHCICPMRCAEDPDRLYKYATKLKKNCKEITDKELDKKMKELAAVMSDPDLETETMCLHDDESCRYEGQVAVYQDVYAVDGPTSLYHQANKGVRVAYWIGFDTTPFMFKNLAGAYPSYSTNWADETVLTARNIGLCSSDVMERSRRGMSILRKKYLKPSNNVLFSVGSTIYHEKRDLLRSWHLPSVFHLRGKQNYTCRCETIVSCDGYVVKRIAISPGLYGKPSGYAATMHREGFLCCKVTDTLNGERVSFPVCTYVPATLCDQMTGILATDVSADDAQKLLVGLNQRIVVNGRTQRNTNTMKNYLLPVVAQAFARWAKEYKEDQEDERPLGLRDRQLVMGCCWAFRRHKITSIYKRPDTQTIIKVNSDFHSFVLPRIGSNTLEIGLRTRIRKMLEEHKEPSPLITAEDVQEAKCAADEAKEVREAEELRAALPPLAADVEEPTLEADVDLMLQEAGA [서열번호 78]
따라서, NSP1은 바람직하게는 실질적으로 서열번호 78에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 생물학적 활성 변이체 또는 단편을 포함한다.
한 구현예에서, NSP1은 다음과 같은 서열번호 79에 정의된 것과 같은 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
ATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCATTCCTCAGAGCTTTGCAGCGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACTGATAATGACCATGCTAATGCCAGAGCGTTTTCGCATCTGGCTTCAAAACTGATCGAAACGGAGGTGGACCCATCCGACACGATCCTTGACATTGGAAGTGCGCCCGCCCGCAGAATGTATTCTAAGCACAAGTATCATTGTATCTGTCCGATGAGATGTGCGGAAGATCCGGACAGATTGTATAAGTATGCAACTAAGCTGAAGAAAAACTGTAAGGAAATAACTGATAAGGAATTGGACAAGAAAATGAAGGAGCTGGCCGCCGTCATGAGCGACCCTGACCTGGAAACTGAGACTATGTGCCTCCACGACGACGAGTCGTGTCGCTACGAAGGGCAAGTCGCTGTTTACCAGGATGTATACGCGGTTGACGGACCGACAAGTCTCTATCACCAAGCCAATAAGGGAGTTAGAGTCGCCTACTGGATAGGCTTTGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACTTGGCTGGAGCATATCCATCATACTCTACCAACTGGGCCGACGAAACCGTGTTAACGGCTCGTAACATAGGCCTATGCAGCTCTGACGTTATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATTCTTAGAAAGAAGTATTTGAAACCATCCAACAATGTTCTATTCTCTGTTGGCTCGACCATCTACCACGAGAAGAGGGACTTACTGAGGAGCTGGCACCTGCCGTCTGTATTTCACTTACGTGGCAAGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATAGCTATCAGTCCAGGCCTGTATGGGAAGCCTTCAGGCTATGCTGCTACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAAGTGACAGACACATTGAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCCGTGTGCACGTATGTGCCAGCTACATTGTGTGACCAAATGACTGGCATACTGGCAACAGATGTCAGTGCGGACGACGCGCAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGTATAGTCGTCAACGGTCGCACCCAGAGAAACACCAATACCATGAAAAATTACCTTTTGCCCGTAGTGGCCCAGGCATTTGCTAGGTGGGCAAAGGAATATAAGGAAGATCAAGAAGATGAAAGGCCACTAGGACTACGAGATAGACAGTTAGTCATGGGGTGTTGTTGGGCTTTTAGAAGGCACAAGATAACATCTATTTATAAGCGCCCGGATACCCAAACCATCATCAAAGTGAACAGCGATTTCCACTCATTCGTGCTGCCCAGGATAGGCAGTAACACATTGGAGATCGGGCTGAGAACAAGAATCAGGAAAATGTTAGAGGAGCACAAGGAGCCGTCACCTCTCATTACCGCCGAGGACGTACAAGAAGCTAAGTGCGCAGCCGATGAGGCTAAGGAGGTGCGTGAAGCCGAGGAGTTGCGCGCAGCTCTACCACCTTTGGCAGCTGATGTTGAGGAGCCCACTCTGGAAGCCGATGTCGACTTGATGTTACAAGAGGCTGGGGCC [서열번호 79]
따라서, NSP1은 바람직하게는 실질적으로 서열번호 79에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 80으로 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
AUGGAGAAAGUUCACGUUGACAUCGAGGAAGACAGCCCAUUCCUCAGAGCUUUGCAGCGGAGCUUCCCGCAGUUUGAGGUAGAAGCCAAGCAGGUCACUGAUAAUGACCAUGCUAAUGCCAGAGCGUUUUCGCAUCUGGCUUCAAAACUGAUCGAAACGGAGGUGGACCCAUCCGACACGAUCCUUGACAUUGGAAGUGCGCCCGCCCGCAGAAUGUAUUCUAAGCACAAGUAUCAUUGUAUCUGUCCGAUGAGAUGUGCGGAAGAUCCGGACAGAUUGUAUAAGUAUGCAACUAAGCUGAAGAAAAACUGUAAGGAAAUAACUGAUAAGGAAUUGGACAAGAAAAUGAAGGAGCUGGCCGCCGUCAUGAGCGACCCUGACCUGGAAACUGAGACUAUGUGCCUCCACGACGACGAGUCGUGUCGCUACGAAGGGCAAGUCGCUGUUUACCAGGAUGUAUACGCGGUUGACGGACCGACAAGUCUCUAUCACCAAGCCAAUAAGGGAGUUAGAGUCGCCUACUGGAUAGGCUUUGACACCACCCCUUUUAUGUUUAAGAACUUGGCUGGAGCAUAUCCAUCAUACUCUACCAACUGGGCCGACGAAACCGUGUUAACGGCUCGUAACAUAGGCCUAUGCAGCUCUGACGUUAUGGAGCGGUCACGUAGAGGGAUGUCCAUUCUUAGAAAGAAGUAUUUGAAACCAUCCAACAAUGUUCUAUUCUCUGUUGGCUCGACCAUCUACCACGAGAAGAGGGACUUACUGAGGAGCUGGCACCUGCCGUCUGUAUUUCACUUACGUGGCAAGCAAAAUUACACAUGUCGGUGUGAGACUAUAGUUAGUUGCGACGGGUACGUCGUUAAAAGAAUAGCUAUCAGUCCAGGCCUGUAUGGGAAGCCUUCAGGCUAUGCUGCUACGAUGCACCGCGAGGGAUUCUUGUGCUGCAAAGUGACAGACACAUUGAACGGGGAGAGGGUCUCUUUUCCCGUGUGCACGUAUGUGCCAGCUACAUUGUGUGACCAAAUGACUGGCAUACUGGCAACAGAUGUCAGUGCGGACGACGCGCAAAAACUGCUGGUUGGGCUCAACCAGCGUAUAGUCGUCAACGGUCGCACCCAGAGAAACACCAAUACCAUGAAAAAUUACCUUUUGCCCGUAGUGGCCCAGGCAUUUGCUAGGUGGGCAAAGGAAUAUAAGGAAGAUCAAGAAGAUGAAAGGCCACUAGGACUACGAGAUAGACAGUUAGUCAUGGGGUGUUGUUGGGCUUUUAGAAGGCACAAGAUAACAUCUAUUUAUAAGCGCCCGGAUACCCAAACCAUCAUCAAAGUGAACAGCGAUUUCCACUCAUUCGUGCUGCCCAGGAUAGGCAGUAACACAUUGGAGAUCGGGCUGAGAACAAGAAUCAGGAAAAUGUUAGAGGAGCACAAGGAGCCGUCACCUCUCAUUACCGCCGAGGACGUACAAGAAGCUAAGUGCGCAGCCGAUGAGGCUAAGGAGGUGCGUGAAGCCGAGGAGUUGCGCGCAGCUCUACCACCUUUGGCAGCUGAUGUUGAGGAGCCCACUCUGGAAGCCGAUGUCGACUUGAUGUUACAAGAGGCUGGGGCC [서열번호 80]
한 구현예에서, NSP2는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 81로 제공된다:
GSVETPRGLIKVTSYDGEDKIGSYAVLSPQAVLKSEKLSCIHPLAEQVIVITHSGRKGRYAVEPYHGKVVVPEGHAIPVQDFQALSESATIVYNEREFVNRYLHHIATHGGALNTDEEYYKTVKPSEHDGEYLYDIDRKQCVKKELVTGLGLTGELVDPPFHEFAYESLRTRPAAPYQVPTIGVYGVPGSGKSGIIKSAVTKKDLVVSAKKENCAEIIRDVKKMKGLDVNARTVDSVLLNGCKHPVETLYIDEAFACHAGTLRALIAIIRPKKAVLCGDPKQCGFFNMMCLKVHFNHEICTQVFHKSISRRCTKSVTSVVSTLFYDKKMRTTNPKETKIVIDTTGSTKPKQDDLILTCFRGWVKQLQIDYKGNEIMTAAASQGLTRKGVYAVRYKVNENPLYAPTSEHVNVLLTRTEDRIVWKTLAGDPWIKTLTAKYPGNFTATIEEWQAEHDAIMRHILERPDPTDVFQNKANVCWAKALVPVLKTAGIDMTTEQWNTVDYFETDKAHSAEIVLNQLCVRFFGLDLDSGLFSAPTVPLSIRNNHWDNSPSPNMYGLNKEVVRQLSRRYPQLPRAVATGRVYDMNTGTLRNYDPRINLVPVNRRLPHALVLHHNEHPQSDFSSFVSKLKGRTVLVVGEKLSVPGKMVDWLSDRPEATFRARLDLGIPGDVPKYDIIFVNVRTPYKYHHYQQCEDHAIKLSMLTKKACLHLNPGGTCVSIGYGYADRASESIIGAIARQFKFSRVCKPKSSLEETEVLFVFIGYDRKARTHNSYKLSSTLTNIYTGSRLHEAGC [서열번호 81]
따라서, NSP2는 바람직하게는 실질적으로 서열번호 81에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 생물학적 활성 변이체 또는 단편을 포함한다.
한 구현예에서, NSP2는 다음과 같은 서열번호 82에 정의된 것과 같은 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GGCTCAGTGGAGACACCTCGTGGCTTGATAAAGGTTACCAGCTACGATGGCGAGGACAAGATCGGCTCTTACGCTGTGCTTTCTCCGCAGGCTGTACTCAAGAGTGAAAAATTATCTTGCATCCACCCTCTCGCTGAACAAGTCATAGTGATAACACACTCTGGCCGAAAAGGGCGTTATGCCGTGGAACCATACCATGGTAAAGTAGTGGTGCCAGAGGGACATGCAATACCCGTCCAGGACTTTCAAGCTCTGAGTGAAAGTGCCACCATTGTGTACAACGAACGTGAGTTCGTAAACAGGTACCTGCACCATATTGCCACACATGGAGGAGCGCTGAACACTGATGAAGAATATTACAAAACTGTCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAATACCTGTACGACATCGACAGGAAACAGTGCGTCAAGAAAGAACTAGTCACTGGGCTAGGGCTCACAGGCGAGCTGGTGGATCCTCCCTTCCATGAATTCGCCTACGAGAGTCTGAGAACACGACCAGCCGCTCCTTACCAAGTACCAACCATAGGGGTGTATGGCGTGCCAGGATCAGGCAAGTCTGGCATCATTAAAAGCGCAGTCACCAAAAAAGATCTAGTGGTGAGCGCCAAGAAAGAAAACTGTGCAGAAATTATAAGGGACGTCAAGAAAATGAAAGGGCTGGACGTCAATGCCAGAACTGTGGACTCAGTGCTCTTGAATGGATGCAAACACCCCGTAGAGACCCTGTATATTGACGAAGCTTTTGCTTGTCATGCAGGTACTCTCAGAGCGCTCATAGCCATTATAAGACCTAAAAAGGCAGTGCTCTGCGGGGATCCCAAACAGTGCGGTTTTTTTAACATGATGTGCCTGAAAGTGCATTTTAACCACGAGATTTGCACACAAGTCTTCCACAAAAGCATCTCTCGCCGTTGCACTAAATCTGTGACTTCGGTCGTCTCAACCTTGTTTTACGACAAAAAAATGAGAACGACGAATCCGAAAGAGACTAAGATTGTGATTGACACTACCGGCAGTACCAAACCTAAGCAGGACGATCTCATTCTCACTTGTTTCAGAGGGTGGGTGAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAAGGCAACGAAATAATGACGGCAGCTGCCTCTCAAGGGCTGACCCGTAAAGGTGTGTATGCCGTTCGGTACAAGGTGAATGAAAATCCTCTGTACGCACCCACCTCAGAACATGTGAACGTCCTACTGACCCGCACGGAGGACCGCATCGTGTGGAAAACACTAGCCGGCGACCCATGGATAAAAACACTGACTGCCAAGTACCCTGGGAATTTCACTGCCACGATAGAGGAGTGGCAAGCAGAGCATGATGCCATCATGAGGCACATCTTGGAGAGACCGGACCCTACCGACGTCTTCCAGAATAAGGCAAACGTGTGTTGGGCCAAGGCTTTAGTGCCGGTGCTGAAGACCGCTGGCATAGACATGACCACTGAACAATGGAACACTGTGGATTATTTTGAAACGGACAAAGCTCACTCAGCAGAGATAGTATTGAACCAACTATGCGTGAGGTTCTTTGGACTCGATCTGGACTCCGGTCTATTTTCTGCACCCACTGTTCCGTTATCCATTAGGAATAATCACTGGGATAACTCCCCGTCGCCTAACATGTACGGGCTGAATAAAGAAGTGGTCCGTCAGCTCTCTCGCAGGTACCCACAACTGCCTCGGGCAGTTGCCACTGGAAGAGTCTATGACATGAACACTGGTACACTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAACCTAGTACCTGTAAACAGAAGACTGCCTCATGCTTTAGTCCTCCACCATAATGAACACCCACAGAGTGACTTTTCTTCATTCGTCAGCAAATTGAAGGGCAGAACTGTCCTGGTGGTCGGGGAAAAGTTGTCCGTCCCAGGCAAAATGGTTGACTGGTTGTCAGACCGGCCTGAGGCTACCTTCAGAGCTCGGCTGGATTTAGGCATCCCAGGTGATGTGCCCAAATATGACATAATATTTGTTAATGTGAGGACCCCATATAAATACCATCACTATCAGCAGTGTGAAGACCATGCCATTAAGCTTAGCATGTTGACCAAGAAAGCTTGTCTGCATCTGAATCCCGGCGGAACCTGTGTCAGCATAGGTTATGGTTACGCTGACAGGGCCAGCGAAAGCATCATTGGTGCTATAGCGCGGCAGTTCAAGTTTTCCCGGGTATGCAAACCGAAATCCTCACTTGAAGAGACGGAAGTTCTGTTTGTATTCATTGGGTACGATCGCAAGGCCCGTACGCACAATTCTTACAAGCTTTCATCAACCTTGACCAACATTTATACAGGTTCCAGACTCCACGAAGCCGGATGT [서열번호 82]
따라서, 바람직하게는 NSP2는 실질적으로 서열번호 82에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 83을 포함할 수 있다:
GGCUCAGUGGAGACACCUCGUGGCUUGAUAAAGGUUACCAGCUACGAUGGCGAGGACAAGAUCGGCUCUUACGCUGUGCUUUCUCCGCAGGCUGUACUCAAGAGUGAAAAAUUAUCUUGCAUCCACCCUCUCGCUGAACAAGUCAUAGUGAUAACACACUCUGGCCGAAAAGGGCGUUAUGCCGUGGAACCAUACCAUGGUAAAGUAGUGGUGCCAGAGGGACAUGCAAUACCCGUCCAGGACUUUCAAGCUCUGAGUGAAAGUGCCACCAUUGUGUACAACGAACGUGAGUUCGUAAACAGGUACCUGCACCAUAUUGCCACACAUGGAGGAGCGCUGAACACUGAUGAAGAAUAUUACAAAACUGUCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAAUACCUGUACGACAUCGACAGGAAACAGUGCGUCAAGAAAGAACUAGUCACUGGGCUAGGGCUCACAGGCGAGCUGGUGGAUCCUCCCUUCCAUGAAUUCGCCUACGAGAGUCUGAGAACACGACCAGCCGCUCCUUACCAAGUACCAACCAUAGGGGUGUAUGGCGUGCCAGGAUCAGGCAAGUCUGGCAUCAUUAAAAGCGCAGUCACCAAAAAAGAUCUAGUGGUGAGCGCCAAGAAAGAAAACUGUGCAGAAAUUAUAAGGGACGUCAAGAAAAUGAAAGGGCUGGACGUCAAUGCCAGAACUGUGGACUCAGUGCUCUUGAAUGGAUGCAAACACCCCGUAGAGACCCUGUAUAUUGACGAAGCUUUUGCUUGUCAUGCAGGUACUCUCAGAGCGCUCAUAGCCAUUAUAAGACCUAAAAAGGCAGUGCUCUGCGGGGAUCCCAAACAGUGCGGUUUUUUUAACAUGAUGUGCCUGAAAGUGCAUUUUAACCACGAGAUUUGCACACAAGUCUUCCACAAAAGCAUCUCUCGCCGUUGCACUAAAUCUGUGACUUCGGUCGUCUCAACCUUGUUUUACGACAAAAAAAUGAGAACGACGAAUCCGAAAGAGACUAAGAUUGUGAUUGACACUACCGGCAGUACCAAACCUAAGCAGGACGAUCUCAUUCUCACUUGUUUCAGAGGGUGGGUGAAGCAGUUGCAAAUAGAUUACAAAGGCAACGAAAUAAUGACGGCAGCUGCCUCUCAAGGGCUGACCCGUAAAGGUGUGUAUGCCGUUCGGUACAAGGUGAAUGAAAAUCCUCUGUACGCACCCACCUCAGAACAUGUGAACGUCCUACUGACCCGCACGGAGGACCGCAUCGUGUGGAAAACACUAGCCGGCGACCCAUGGAUAAAAACACUGACUGCCAAGUACCCUGGGAAUUUCACUGCCACGAUAGAGGAGUGGCAAGCAGAGCAUGAUGCCAUCAUGAGGCACAUCUUGGAGAGACCGGACCCUACCGACGUCUUCCAGAAUAAGGCAAACGUGUGUUGGGCCAAGGCUUUAGUGCCGGUGCUGAAGACCGCUGGCAUAGACAUGACCACUGAACAAUGGAACACUGUGGAUUAUUUUGAAACGGACAAAGCUCACUCAGCAGAGAUAGUAUUGAACCAACUAUGCGUGAGGUUCUUUGGACUCGAUCUGGACUCCGGUCUAUUUUCUGCACCCACUGUUCCGUUAUCCAUUAGGAAUAAUCACUGGGAUAACUCCCCGUCGCCUAACAUGUACGGGCUGAAUAAAGAAGUGGUCCGUCAGCUCUCUCGCAGGUACCCACAACUGCCUCGGGCAGUUGCCACUGGAAGAGUCUAUGACAUGAACACUGGUACACUGCGCAAUUAUGAUCCGCGCAUAAACCUAGUACCUGUAAACAGAAGACUGCCUCAUGCUUUAGUCCUCCACCAUAAUGAACACCCACAGAGUGACUUUUCUUCAUUCGUCAGCAAAUUGAAGGGCAGAACUGUCCUGGUGGUCGGGGAAAAGUUGUCCGUCCCAGGCAAAAUGGUUGACUGGUUGUCAGACCGGCCUGAGGCUACCUUCAGAGCUCGGCUGGAUUUAGGCAUCCCAGGUGAUGUGCCCAAAUAUGACAUAAUAUUUGUUAAUGUGAGGACCCCAUAUAAAUACCAUCACUAUCAGCAGUGUGAAGACCAUGCCAUUAAGCUUAGCAUGUUGACCAAGAAAGCUUGUCUGCAUCUGAAUCCCGGCGGAACCUGUGUCAGCAUAGGUUAUGGUUACGCUGACAGGGCCAGCGAAAGCAUCAUUGGUGCUAUAGCGCGGCAGUUCAAGUUUUCCCGGGUAUGCAAACCGAAAUCCUCACUUGAAGAGACGGAAGUUCUGUUUGUAUUCAUUGGGUACGAUCGCAAGGCCCGUACGCACAAUUCUUACAAGCUUUCAUCAACCUUGACCAACAUUUAUACAGGUUCCAGACUCCACGAAGCCGGAUGU [서열번호 83]
따라서, 그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 83으로 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
한 구현예에서, NSP3은 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 84로 제공된다:
APSYHVVRGDIATATEGVIINAANSKGQPGGGVCGALYKKFPESFDLQPIEVGKARLVKGAAKHIIHAVGPNFNKVSEVEGDKQLAEAYESIAKIVNDNNYKSVAIPLLSTGIFSGNKDRLTQSLNHLLTALDTTDADVAIYCRDKKWEMTLKEAVARREAVEEICISDDSSVTEPDAELVRVHPKSSLAGRKGYSTSDGKTFSYLEGTKFHQAAKDIAEINAMWPVATEANEQVCMYILGESMSSIRSKCPVEESEASTPPSTLPCLCIHAMTPERVQRLKASRPEQITVCSSFPLPKYRITGVQKIQCSQPILFSPKVPAYIHPRKYLVETPPVDETPEPSAENQSTEGTPEQPPLITEDETRTRTPEPIIIEEEEEDSISLLSDGPTHQVLQVEADIHGPPSVSSSSWSIPHASDFDVDSLSILDTLEGASVTSGATSAETNSYFAKSMEFLARPVPAPRTVFRNPPHPAPRTRTPSLAPSRACSRTSLVSTPPGVNRVITREELEALTPSRTPSRSVSRTSLVSNPPGVNRVITREEFEAFVAQQQRFDAGA [서열번호 84]
따라서, 바람직하게는 NSP3은 실질적으로 서열번호 84에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 생물학적 활성 변이체 또는 단편을 포함한다.
한 구현예에서, NSP3은 다음과 같은 서열번호 85에 정의된 것과 같은 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
GCACCCTCATATCATGTGGTGCGAGGGGATATTGCCACGGCCACCGAAGGAGTGATTATAAATGCTGCTAACAGCAAAGGACAACCTGGCGGAGGGGTGTGCGGAGCGCTGTATAAGAAATTCCCGGAAAGCTTCGATTTACAGCCGATCGAAGTAGGAAAAGCGCGACTGGTCAAAGGTGCAGCTAAACATATCATTCATGCCGTAGGACCAAACTTCAACAAAGTTTCGGAGGTTGAAGGTGACAAACAGTTGGCAGAGGCTTATGAGTCCATCGCTAAGATTGTCAACGATAACAATTACAAGTCAGTAGCGATTCCACTGTTGTCCACCGGCATCTTTTCCGGGAACAAAGATCGACTAACCCAATCATTGAACCATTTGCTGACAGCTTTAGACACCACTGATGCAGATGTAGCCATATACTGCAGGGACAAGAAATGGGAAATGACTCTCAAGGAAGCAGTGGCTAGGAGAGAAGCAGTGGAGGAGATATGCATATCCGACGACTCTTCAGTGACAGAACCTGATGCAGAGCTGGTGAGGGTGCATCCGAAGAGTTCTTTGGCTGGAAGGAAGGGCTACAGCACAAGCGATGGCAAAACTTTCTCATATTTGGAAGGGACCAAGTTTCACCAGGCGGCCAAGGATATAGCAGAAATTAATGCCATGTGGCCCGTTGCAACGGAGGCCAATGAGCAGGTATGCATGTATATCCTCGGAGAAAGCATGAGCAGTATTAGGTCGAAATGCCCCGTCGAAGAGTCGGAAGCCTCCACACCACCTAGCACGCTGCCTTGCTTGTGCATCCATGCCATGACTCCAGAAAGAGTACAGCGCCTAAAAGCCTCACGTCCAGAACAAATTACTGTGTGCTCATCCTTTCCATTGCCGAAGTATAGAATCACTGGTGTGCAGAAGATCCAATGCTCCCAGCCTATATTGTTCTCACCGAAAGTGCCTGCGTATATTCATCCAAGGAAGTATCTCGTGGAAACACCACCGGTAGACGAGACTCCGGAGCCATCGGCAGAGAACCAATCCACAGAGGGGACACCTGAACAACCACCACTTATAACCGAGGATGAGACCAGGACTAGAACGCCTGAGCCGATCATCATCGAAGAGGAAGAAGAGGATAGCATAAGTTTGCTGTCAGATGGCCCGACCCACCAGGTGCTGCAAGTCGAGGCAGACATTCACGGGCCGCCCTCTGTATCTAGCTCATCCTGGTCCATTCCTCATGCATCCGACTTTGATGTGGACAGTTTATCCATACTTGACACCCTGGAGGGAGCTAGCGTGACCAGCGGGGCAACGTCAGCCGAGACTAACTCTTACTTCGCAAAGAGTATGGAGTTTCTGGCGCGACCGGTGCCTGCGCCTCGAACAGTATTCAGGAACCCTCCACATCCCGCTCCGCGCACAAGAACACCGTCACTTGCACCCAGCAGGGCCTGCTCGAGAACCAGCCTAGTTTCCACCCCGCCAGGCGTGAATAGGGTGATCACTAGAGAGGAGCTCGAGGCGCTTACCCCGTCACGCACTCCTAGCAGGTCGGTCTCGAGAACCAGCCTGGTCTCCAACCCGCCAGGCGTAAATAGGGTGATTACAAGAGAGGAGTTTGAGGCGTTCGTAGCACAACAACAATGACGGTTTGATGCGGGTGCA [서열번호 85]
따라서, 바람직하게는 NSP3은 실질적으로 서열번호 85에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 86을 포함할 수 있다:
GCACCCUCAUAUCAUGUGGUGCGAGGGGAUAUUGCCACGGCCACCGAAGGAGUGAUUAUAAAUGCUGCUAACAGCAAAGGACAACCUGGCGGAGGGGUGUGCGGAGCGCUGUAUAAGAAAUUCCCGGAAAGCUUCGAUUUACAGCCGAUCGAAGUAGGAAAAGCGCGACUGGUCAAAGGUGCAGCUAAACAUAUCAUUCAUGCCGUAGGACCAAACUUCAACAAAGUUUCGGAGGUUGAAGGUGACAAACAGUUGGCAGAGGCUUAUGAGUCCAUCGCUAAGAUUGUCAACGAUAACAAUUACAAGUCAGUAGCGAUUCCACUGUUGUCCACCGGCAUCUUUUCCGGGAACAAAGAUCGACUAACCCAAUCAUUGAACCAUUUGCUGACAGCUUUAGACACCACUGAUGCAGAUGUAGCCAUAUACUGCAGGGACAAGAAAUGGGAAAUGACUCUCAAGGAAGCAGUGGCUAGGAGAGAAGCAGUGGAGGAGAUAUGCAUAUCCGACGACUCUUCAGUGACAGAACCUGAUGCAGAGCUGGUGAGGGUGCAUCCGAAGAGUUCUUUGGCUGGAAGGAAGGGCUACAGCACAAGCGAUGGCAAAACUUUCUCAUAUUUGGAAGGGACCAAGUUUCACCAGGCGGCCAAGGAUAUAGCAGAAAUUAAUGCCAUGUGGCCCGUUGCAACGGAGGCCAAUGAGCAGGUAUGCAUGUAUAUCCUCGGAGAAAGCAUGAGCAGUAUUAGGUCGAAAUGCCCCGUCGAAGAGUCGGAAGCCUCCACACCACCUAGCACGCUGCCUUGCUUGUGCAUCCAUGCCAUGACUCCAGAAAGAGUACAGCGCCUAAAAGCCUCACGUCCAGAACAAAUUACUGUGUGCUCAUCCUUUCCAUUGCCGAAGUAUAGAAUCACUGGUGUGCAGAAGAUCCAAUGCUCCCAGCCUAUAUUGUUCUCACCGAAAGUGCCUGCGUAUAUUCAUCCAAGGAAGUAUCUCGUGGAAACACCACCGGUAGACGAGACUCCGGAGCCAUCGGCAGAGAACCAAUCCACAGAGGGGACACCUGAACAACCACCACUUAUAACCGAGGAUGAGACCAGGACUAGAACGCCUGAGCCGAUCAUCAUCGAAGAGGAAGAAGAGGAUAGCAUAAGUUUGCUGUCAGAUGGCCCGACCCACCAGGUGCUGCAAGUCGAGGCAGACAUUCACGGGCCGCCCUCUGUAUCUAGCUCAUCCUGGUCCAUUCCUCAUGCAUCCGACUUUGAUGUGGACAGUUUAUCCAUACUUGACACCCUGGAGGGAGCUAGCGUGACCAGCGGGGCAACGUCAGCCGAGACUAACUCUUACUUCGCAAAGAGUAUGGAGUUUCUGGCGCGACCGGUGCCUGCGCCUCGAACAGUAUUCAGGAACCCUCCACAUCCCGCUCCGCGCACAAGAACACCGUCACUUGCACCCAGCAGGGCCUGCUCGAGAACCAGCCUAGUUUCCACCCCGCCAGGCGUGAAUAGGGUGAUCACUAGAGAGGAGCUCGAGGCGCUUACCCCGUCACGCACUCCUAGCAGGUCGGUCUCGAGAACCAGCCUGGUCUCCAACCCGCCAGGCGUAAAUAGGGUGAUUACAAGAGAGGAGUUUGAGGCGUUCGUAGCACAACAACAAUGACGGUUUGAUGCGGGUGCA [서열번호 86]
따라서, 그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 86으로 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
한 구현예에서, NSP4는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 87로 제공된다:
YIFSSDTGQGHLQQKSVRQTVLSEVVLERTELEISYAPRLDQEKEELLRKKLQLNPTPANRSRYQSRKVENMKAITARRILQGLGHYLKAEGKVECYRTLHPVPLYSSSVNRAFSSPKVAVEACNAMLKENFPTVASYCIIPEYDAYLDMVDGASCCLDTASFCPAKLRSFPKKHSYLEPTIRSAVPSAIQNTLQNVLAAATKRNCNVTQMRELPVLDSAAFNVECFKKYACNNEYWETFKENPIRLTEENVVNYITKLKGPKAAALFAKTHNLNMLQDIPMDRFVMDLKRDVKVTPGTKHTEERPKVQVIQAADPLATAYLCGIHRELVRRLNAVLLPNIHTLFDMSAEDFDAIIAEHFQPGDCVLETDIASFDKSEDDAMALTALMILEDLGVDAELLTLIEAAFGEISSIHLPTKTKFKFGAMMKSGMFLTLFVNTVINIVIASRVLRERLTGSPCAAFIGDDNIVKGVKSDKLMADRCATWLNMEVKIIDAVVGEKAPYFCGGFILCDSVTGTACRVADPLKRLFKLGKPLAADDEHDDDRRRALHEESTRWNRVGILSELCKAVESRYETVGTSIIVMAMTTLASSVKSFSYLRGAPITLYG [서열번호 87]
따라서, 바람직하게는 NSP4는 실질적으로 서열번호 87에 나타낸 것과 같은 아미노산 서열, 또는 그의 생물학적 활성 변이체 또는 단편을 포함한다.
한 구현예에서, NSP4는 다음과 같은 서열번호 88에 정의된 것과 같은 뉴클레오티드 서열에 의해 암호화된다:
TACATCTTTTCCTCCGACACCGGTCAAGGGCATTTACAACAAAAATCAGTAAGGCAAACGGTGCTATCCGAAGTGGTGTTGGAGAGGACCGAATTGGAGATTTCGTATGCCCCGCGCCTCGACCAAGAAAAAGAAGAATTACTACGCAAGAAATTACAGTTAAATCCCACACCTGCTAACAGAAGCAGATACCAGTCCAGGAAGGTGGAGAACATGAAAGCCATAACAGCTAGACGTATTCTGCAAGGCCTAGGGCATTATTTGAAGGCAGAAGGAAAAGTGGAGTGCTACCGAACCCTGCATCCTGTTCCTTTGTATTCATCTAGTGTGAACCGTGCCTTTTCAAGCCCCAAGGTCGCAGTGGAAGCCTGTAACGCCATGTTGAAAGAGAACTTTCCGACTGTGGCTTCTTACTGTATTATTCCAGAGTACGATGCCTATTTGGACATGGTTGACGGAGCTTCATGCTGCTTAGACACTGCCAGTTTTTGCCCTGCAAAGCTGCGCAGCTTTCCAAAGAAACACTCCTATTTGGAACCCACAATACGATCGGCAGTGCCTTCAGCGATCCAGAACACGCTCCAGAACGTCCTGGCAGCTGCCACAAAAAGAAATTGCAATGTCACGCAAATGAGAGAATTGCCCGTATTGGATTCGGCGGCCTTTAATGTGGAATGCTTCAAGAAATATGCGTGTAATAATGAATATTGGGAAACGTTTAAAGAAAACCCCATCAGGCTTACTGAAGAAAACGTGGTAAATTACATTACCAAATTAAAAGGACCAAAAGCTGCTGCTCTTTTTGCGAAGACACATAATTTGAATATGTTGCAGGACATACCAATGGACAGGTTTGTAATGGACTTAAAGAGAGACGTGAAAGTGACTCCAGGAACAAAACATACTGAAGAACGGCCCAAGGTACAGGTGATCCAGGCTGCCGATCCGCTAGCAACAGCGTATCTGTGCGGAATCCACCGAGAGCTGGTTAGGAGATTAAATGCGGTCCTGCTTCCGAACATTCATACACTGTTTGATATGTCGGCTGAAGACTTTGACGCTATTATAGCCGAGCACTTCCAGCCTGGGGATTGTGTTCTGGAAACTGACATCGCGTCGTTTGATAAAAGTGAGGACGACGCCATGGCTCTGACCGCGTTAATGATTCTGGAAGACTTAGGTGTGGACGCAGAGCTGTTGACGCTGATTGAGGCGGCTTTCGGCGAAATTTCATCAATACATTTGCCCACTAAAACTAAATTTAAATTCGGAGCCATGATGAAATCTGGAATGTTCCTCACACTGTTTGTGAACACAGTCATTAACATTGTAATCGCAAGCAGAGTGTTGAGAGAACGGCTAACCGGATCACCATGTGCAGCATTCATTGGAGATGACAATATCGTGAAAGGAGTCAAATCGGACAAATTAATGGCAGACAGGTGCGCCACCTGGTTGAATATGGAAGTCAAGATTATAGATGCTGTGGTGGGCGAGAAAGCGCCTTATTTCTGTGGAGGGTTTATTTTGTGTGACTCCGTGACCGGCACAGCGTGCCGTGTGGCAGACCCCCTAAAAAGGCTGTTTAAGCTTGGCAAACCTCTGGCAGCAGACGATGAACATGATGATGACAGGAGAAGGGCATTGCATGAAGAGTCAACACGCTGGAACCGAGTGGGTATTCTTTCAGAGCTGTGCAAGGCAGTAGAATCAAGGTATGAAACCGTAGGAACTTCCATCATAGTTATGGCCATGACTACTCTAGCTAGCAGTGTTAAATCATTCAGCTACCTGAGAGGGGCCCCTATAACTCTCTACGGC [서열번호 88]
따라서, 바람직하게는 NSP4는 실질적으로 서열번호 88에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편에 의해 암호화된다.
따라서, 상기 RNA 구조체는 다음과 같은 서열번호 89를 포함할 수 있다:
UACAUCUUUUCCUCCGACACCGGUCAAGGGCAUUUACAACAAAAAUCAGUAAGGCAAACGGUGCUAUCCGAAGUGGUGUUGGAGAGGACCGAAUUGGAGAUUUCGUAUGCCCCGCGCCUCGACCAAGAAAAAGAAGAAUUACUACGCAAGAAAUUACAGUUAAAUCCCACACCUGCUAACAGAAGCAGAUACCAGUCCAGGAAGGUGGAGAACAUGAAAGCCAUAACAGCUAGACGUAUUCUGCAAGGCCUAGGGCAUUAUUUGAAGGCAGAAGGAAAAGUGGAGUGCUACCGAACCCUGCAUCCUGUUCCUUUGUAUUCAUCUAGUGUGAACCGUGCCUUUUCAAGCCCCAAGGUCGCAGUGGAAGCCUGUAACGCCAUGUUGAAAGAGAACUUUCCGACUGUGGCUUCUUACUGUAUUAUUCCAGAGUACGAUGCCUAUUUGGACAUGGUUGACGGAGCUUCAUGCUGCUUAGACACUGCCAGUUUUUGCCCUGCAAAGCUGCGCAGCUUUCCAAAGAAACACUCCUAUUUGGAACCCACAAUACGAUCGGCAGUGCCUUCAGCGAUCCAGAACACGCUCCAGAACGUCCUGGCAGCUGCCACAAAAAGAAAUUGCAAUGUCACGCAAAUGAGAGAAUUGCCCGUAUUGGAUUCGGCGGCCUUUAAUGUGGAAUGCUUCAAGAAAUAUGCGUGUAAUAAUGAAUAUUGGGAAACGUUUAAAGAAAACCCCAUCAGGCUUACUGAAGAAAACGUGGUAAAUUACAUUACCAAAUUAAAAGGACCAAAAGCUGCUGCUCUUUUUGCGAAGACACAUAAUUUGAAUAUGUUGCAGGACAUACCAAUGGACAGGUUUGUAAUGGACUUAAAGAGAGACGUGAAAGUGACUCCAGGAACAAAACAUACUGAAGAACGGCCCAAGGUACAGGUGAUCCAGGCUGCCGAUCCGCUAGCAACAGCGUAUCUGUGCGGAAUCCACCGAGAGCUGGUUAGGAGAUUAAAUGCGGUCCUGCUUCCGAACAUUCAUACACUGUUUGAUAUGUCGGCUGAAGACUUUGACGCUAUUAUAGCCGAGCACUUCCAGCCUGGGGAUUGUGUUCUGGAAACUGACAUCGCGUCGUUUGAUAAAAGUGAGGACGACGCCAUGGCUCUGACCGCGUUAAUGAUUCUGGAAGACUUAGGUGUGGACGCAGAGCUGUUGACGCUGAUUGAGGCGGCUUUCGGCGAAAUUUCAUCAAUACAUUUGCCCACUAAAACUAAAUUUAAAUUCGGAGCCAUGAUGAAAUCUGGAAUGUUCCUCACACUGUUUGUGAACACAGUCAUUAACAUUGUAAUCGCAAGCAGAGUGUUGAGAGAACGGCUAACCGGAUCACCAUGUGCAGCAUUCAUUGGAGAUGACAAUAUCGUGAAAGGAGUCAAAUCGGACAAAUUAAUGGCAGACAGGUGCGCCACCUGGUUGAAUAUGGAAGUCAAGAUUAUAGAUGCUGUGGUGGGCGAGAAAGCGCCUUAUUUCUGUGGAGGGUUUAUUUUGUGUGACUCCGUGACCGGCACAGCGUGCCGUGUGGCAGACCCCCUAAAAAGGCUGUUUAAGCUUGGCAAACCUCUGGCAGCAGACGAUGAACAUGAUGAUGACAGGAGAAGGGCAUUGCAUGAAGAGUCAACACGCUGGAACCGAGUGGGUAUUCUUUCAGAGCUGUGCAAGGCAGUAGAAUCAAGGUAUGAAACCGUAGGAACUUCCAUCAUAGUUAUGGCCAUGACUACUCUAGCUAGCAGUGUUAAAUCAUUCAGCUACCUGAGAGGGGCCCCUAUAACUCUCUACGGC [서열번호 89]
따라서, 그러므로, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 89로 나타낸 것과 같은 RNA 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
바람직하게는, 숙주 세포에 존재하는 단백질과 함께, 본 발명의 RNA 구조체에 의해 암호화되는 비-구조 단백질은 적어도 하나의 치료 생체분자 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 서열의 게놈 복제 및 전사를 위해 필요한 효소 복합체(즉, 레플리카아제)를 형성한다. 예를 들면, 상기 하나 이상의 비-구조 단백질은 상기 구조체가 관심있는 적어도 하나의 펩티드 또는 단백질(즉, 치료 생체분자) 및 적어도 하나의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 증폭하게 할 수 있는 폴리머라아제를 암호화할 수 있다.
상기 숙주 세포는 진핵생물 또는 원핵생물 숙주 세포일 수 있다. 바람직하게는, 상기 숙주 세포는 진핵생물 숙주 세포이다. 보다 바람직하게는, 상기 숙주 세포는 포유동물 숙주 세포이다.
상기 RNA 구조체는 적어도 하나의 비-구조 단백질의 5'에 배치된 프로모터를 추가로 포함할 수 있으며, 상기 프로모터는 적어도 하나의 비-구조 단백질을 암호화하는 서열에 작동가능하게 연결되고, 숙주 세포에서 적어도 하나의 비-구조 단백질을 발현할 수 있다.
바람직하게는, 상기 RNA 구조체는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 90으로 나타낼 수 있는 5' UTR 보존된 서열 요소를 포함한다:
AUGGGCGGCGCAUGAGAGAAGCCCAGACCAAUUACCUACCCAAA [서열번호 90]
따라서, 바람직하게는 상기 UTR은 적어도 하나의 비-구조 단백질의 5'에 배치되고, 실질적으로 서열번호 90에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
바람직하게는, 상기 RNA 구조체는 본 명세서에서 다음과 같은 서열번호 91로 나타낼 수 있는 3' UTR 보존된 서열 요소를 포함한다:
AAUUGGCAAGCUGCUUACAUAGAACUCGCGGCGAUUGGCAUGCCGCCUUAAAAUUUUUAUUUUAUUUUUCUUUUCUUUUCCGAAUCGGAUUUUGUUUUUAAUAUUUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA [서열번호 91]
따라서, 바람직하게는 상기 3' UTR은 상기 적어도 하나의 비-구조 단백질의 3'에 배치되고, 실질적으로 서열번호 91에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
바람직하게는, 상기 RNA 구조체는 폴리A 꼬리(polyA tail)를 포함한다. 바람직하게는, 상기 폴리A 꼬리는 상기 구조체의 3' 말단에 배치된다. 상기 폴리A 꼬리는 적어도 35개 nt, 또는 적어도 40개 nt, 또는 적어도 45개 nt, 또는 적어도 50개 nt를 포함할 수 있으며, 여기서 각각의 nt는 아데닌이다. 다른 구현예에서, 상기 폴리A 꼬리는 적어도 55개 nt 또는 적어도 60개 nt를 포함할 수 있으며, 여기서 각각의 nt는 아데닌이다. 또 다른 구현예에서, 상기 폴리A 꼬리는 적어도 60개 아데닌과, 이어서 하나 이상의 비-아데닌 뉴클레오티드(즉, G, C 또는 T, 바람직하게는 구아닌), 이후 다른 적어도 35개 nt, 또는 적어도 40개 nt, 또는 적어도 45개 nt, 또는 적어도 50개 nt, 또는 적어도 55개 nt, 또는 적어도 60개 nt를 포함할 수 있으며, 여기서 각각의 nt는 아데닌이다.
상기 RNA 구조체는 5' 캡을 추가로 포함할 수 있다. 본 발명의 문맥에서, 용어 "5'-캡"은 RNA 캡 구조를 닮은 5'-캡 유사체를 포함하며, 바람직하게는 생체내 및/또는 세포에서 여기에 부착될 경우 RNA를 안정화하거나, 및/또는 RNA의 번역을 향상시키는 능력을 갖도록 변형된다.
5'-캡을 갖는 RNA는 상기 5'-캡의 존재시에 DNA 주형의 시험관내 전사에 의해 달성될 수 있으며, 여기서 상기 5'-캡은 생성된 RNA 가닥 내로 공동-전사적으로 통합되거나, 상기 RNA는, 예를 들면, 시험관내 전사에 의해 생성될 수 있고, 상기 5' -캡은 캡핑 효소, 예를 들면, 백시니아 바이러스의 캡핑 효소를 이용하여 사후-전사적으로 RNA에 부착될 수 있다. 캡핑된 RNA에서, (캡핑된) RNA 분자의 제1 염기의 3' 위치는 포스포디에스테르 결합을 통해 RNA 분자의 후속 염기("제2 염기")의 5' 위치에 연결된다.
한 구현예에서, 상기 RNA 구조체는, 바람직하게는 5'에서 3'으로, 프로모터, 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열, 링커 서열, 및 IIP를 암호화하는 적어도 하나의 서열을 포함한다. 한 구현예에서, 상기 RNA 구조체는, 바람직하게는 5'에서 3'으로, 프로모터, 적어도 하나의 IIP를 암호화하는 서열, 링커 서열, 및 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열을 포함한다. 양쪽 구현예에서, 상기 링커는 F-T2a 또는 IRES일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 RNA 구조체는, 바람직하게는 5'에서 3'으로, 프로모터, 적어도 하나의 비-구조 단백질을 암호화하는 서열, 서브게놈성 프로모터, 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열, 링커 서열, 및 적어도 하나의 바이러스 IIP를 암호화하는 서열을 포함한다. 다른 구현예에서, 상기 RNA 구조체는, 바람직하게는 5'에서 3'으로, 프로모터, 적어도 하나의 비-구조 단백질을 암호화하는 서열, 서브게놈성 프로모터, 적어도 하나의 바이러스 IIP를 암호화하는 서열, 링커 서열, 및 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열을 포함한다. 양쪽 구현예에서, 상기 링커는 F-T2a 또는 IRES일 수 있다.
또 다른 구현예에서, 상기 RNA 구조체는, 바람직하게는 5'에서 3'으로, 프로모터, 적어도 하나의 비-구조 단백질을 암호화하는 서열, 서브게놈성 프로모터, 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열, 링커 서열, 및 적어도 하나의 바이러스 IIP를 암호화하는 서열, 및 폴리A 꼬리를 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 RNA 구조체는, 바람직하게는 5'에서 3'으로, 프로모터, 적어도 하나의 비-구조 단백질을 암호화하는 서열, 서브게놈성 프로모터, 적어도 하나의 바이러스 IIP를 암호화하는 서열, 링커 서열, 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열, 및 폴리A 꼬리를 포함한다. 양쪽 구현예에서, 상기 링커는 F-T2a 또는 IRES일 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 RNA 구조체는, 바람직하게는 5'에서 3'으로, 프로모터, 적어도 하나의 비-구조 단백질을 암호화하는 서열, 제1 서브게놈성 프로모터, 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열, 제2 서브게놈성 프로모터, 적어도 하나의 바이러스 IIP를 암호화하는 서열, 및 폴리A 꼬리를 포함한다. 다른 구현예에서, 상기 RNA 구조체는, 바람직하게는 5'에서 3'으로, 프로모터, 적어도 하나의 비-구조 단백질을 암호화하는 서열, 제1 서브게놈성 프로모터, 적어도 하나의 바이러스 IIP를 암호화하는 서열, 제2 서브게놈성 프로모터, 적어도 하나의 치료 생체분자를 암호화하는 서열, 및 폴리A 꼬리를 포함한다.
가장 바람직하게는, 상기 RNA 구조체는, 5'에서 3'으로, 5' 캡, 프로모터, nsP1, nsP2, nsP3, nsP4, 서브게놈성 프로모터 26S, 치료 생체분자를 암호화하는 서열, 링커 서열, 바이러스 IIP를 암호화하는 서열, 및 폴리A 꼬리를 포함한다. 가장 바람직하게는, 상기 RNA 구조체는, 5'에서 3'으로, 5' 캡, 프로모터, nsP1, nsP2, nsP3v, nsP4, 서브게놈성 프로모터 26S, 바이러스 IIP를 암호화하는 서열, 링커 서열, 치료 생체분자를 암호화하는 서열; 및 폴리A 꼬리를 포함한다.
따라서, 한 구현예에서, 상기 RNA 구조체는 GOI - 푸린 T2A - HCV E6을 암호화하거나 이를 포함할 수 있다(이것은 본 명세서에서 인용된 첫번째 바이러스 IIP이지만, 본 명세서에 개시된 임의의 IIP 또는 링커가 사용될 수 있음이 인식될 것이다). 그러므로, 상기 RNA 구조체는 단일 RNA 구조체 내에 서열번호 92를 포함하거나 이로 이루어지는 단일 RNA 구조체, GOI, 및 서열번호 457을 포함하거나 이로 이루어질 수 있다. 서열번호 92 및 서열번호 457는 다음과 같다:
AUGGGCGGCGCAUGAGAGAAGCCCAGACCAAUUACCUACCCAAAAUGGAGAAAGUUCACGUUGACAUCGAGGAAGACAGCCCAUUCCUCAGAGCUUUGCAGCGGAGCUUCCCGCAGUUUGAGGUAGAAGCCAAGCAGGUCACUGAUAAUGACCAUGCUAAUGCCAGAGCGUUUUCGCAUCUGGCUUCAAAACUGAUCGAAACGGAGGUGGACCCAUCCGACACGAUCCUUGACAUUGGAAGUGCGCCCGCCCGCAGAAUGUAUUCUAAGCACAAGUAUCAUUGUAUCUGUCCGAUGAGAUGUGCGGAAGAUCCGGACAGAUUGUAUAAGUAUGCAACUAAGCUGAAGAAAAACUGUAAGGAAAUAACUGAUAAGGAAUUGGACAAGAAAAUGAAGGAGCUGGCCGCCGUCAUGAGCGACCCUGACCUGGAAACUGAGACUAUGUGCCUCCACGACGACGAGUCGUGUCGCUACGAAGGGCAAGUCGCUGUUUACCAGGAUGUAUACGCGGUUGACGGACCGACAAGUCUCUAUCACCAAGCCAAUAAGGGAGUUAGAGUCGCCUACUGGAUAGGCUUUGACACCACCCCUUUUAUGUUUAAGAACUUGGCUGGAGCAUAUCCAUCAUACUCUACCAACUGGGCCGACGAAACCGUGUUAACGGCUCGUAACAUAGGCCUAUGCAGCUCUGACGUUAUGGAGCGGUCACGUAGAGGGAUGUCCAUUCUUAGAAAGAAGUAUUUGAAACCAUCCAACAAUGUUCUAUUCUCUGUUGGCUCGACCAUCUACCACGAGAAGAGGGACUUACUGAGGAGCUGGCACCUGCCGUCUGUAUUUCACUUACGUGGCAAGCAAAAUUACACAUGUCGGUGUGAGACUAUAGUUAGUUGCGACGGGUACGUCGUUAAAAGAAUAGCUAUCAGUCCAGGCCUGUAUGGGAAGCCUUCAGGCUAUGCUGCUACGAUGCACCGCGAGGGAUUCUUGUGCUGCAAAGUGACAGACACAUUGAACGGGGAGAGGGUCUCUUUUCCCGUGUGCACGUAUGUGCCAGCUACAUUGUGUGACCAAAUGACUGGCAUACUGGCAACAGAUGUCAGUGCGGACGACGCGCAAAAACUGCUGGUUGGGCUCAACCAGCGUAUAGUCGUCAACGGUCGCACCCAGAGAAACACCAAUACCAUGAAAAAUUACCUUUUGCCCGUAGUGGCCCAGGCAUUUGCUAGGUGGGCAAAGGAAUAUAAGGAAGAUCAAGAAGAUGAAAGGCCACUAGGACUACGAGAUAGACAGUUAGUCAUGGGGUGUUGUUGGGCUUUUAGAAGGCACAAGAUAACAUCUAUUUAUAAGCGCCCGGAUACCCAAACCAUCAUCAAAGUGAACAGCGAUUUCCACUCAUUCGUGCUGCCCAGGAUAGGCAGUAACACAUUGGAGAUCGGGCUGAGAACAAGAAUCAGGAAAAUGUUAGAGGAGCACAAGGAGCCGUCACCUCUCAUUACCGCCGAGGACGUACAAGAAGCUAAGUGCGCAGCCGAUGAGGCUAAGGAGGUGCGUGAAGCCGAGGAGUUGCGCGCAGCUCUACCACCUUUGGCAGCUGAUGUUGAGGAGCCCACUCUGGAAGCCGAUGUCGACUUGAUGUUACAAGAGGCUGGGGCCGGCUCAGUGGAGACACCUCGUGGCUUGAUAAAGGUUACCAGCUACGAUGGCGAGGACAAGAUCGGCUCUUACGCUGUGCUUUCUCCGCAGGCUGUACUCAAGAGUGAAAAAUUAUCUUGCAUCCACCCUCUCGCUGAACAAGUCAUAGUGAUAACACACUCUGGCCGAAAAGGGCGUUAUGCCGUGGAACCAUACCAUGGUAAAGUAGUGGUGCCAGAGGGACAUGCAAUACCCGUCCAGGACUUUCAAGCUCUGAGUGAAAGUGCCACCAUUGUGUACAACGAACGUGAGUUCGUAAACAGGUACCUGCACCAUAUUGCCACACAUGGAGGAGCGCUGAACACUGAUGAAGAAUAUUACAAAACUGUCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAAUACCUGUACGACAUCGACAGGAAACAGUGCGUCAAGAAAGAACUAGUCACUGGGCUAGGGCUCACAGGCGAGCUGGUGGAUCCUCCCUUCCAUGAAUUCGCCUACGAGAGUCUGAGAACACGACCAGCCGCUCCUUACCAAGUACCAACCAUAGGGGUGUAUGGCGUGCCAGGAUCAGGCAAGUCUGGCAUCAUUAAAAGCGCAGUCACCAAAAAAGAUCUAGUGGUGAGCGCCAAGAAAGAAAACUGUGCAGAAAUUAUAAGGGACGUCAAGAAAAUGAAAGGGCUGGACGUCAAUGCCAGAACUGUGGACUCAGUGCUCUUGAAUGGAUGCAAACACCCCGUAGAGACCCUGUAUAUUGACGAAGCUUUUGCUUGUCAUGCAGGUACUCUCAGAGCGCUCAUAGCCAUUAUAAGACCUAAAAAGGCAGUGCUCUGCGGGGAUCCCAAACAGUGCGGUUUUUUUAACAUGAUGUGCCUGAAAGUGCAUUUUAACCACGAGAUUUGCACACAAGUCUUCCACAAAAGCAUCUCUCGCCGUUGCACUAAAUCUGUGACUUCGGUCGUCUCAACCUUGUUUUACGACAAAAAAAUGAGAACGACGAAUCCGAAAGAGACUAAGAUUGUGAUUGACACUACCGGCAGUACCAAACCUAAGCAGGACGAUCUCAUUCUCACUUGUUUCAGAGGGUGGGUGAAGCAGUUGCAAAUAGAUUACAAAGGCAACGAAAUAAUGACGGCAGCUGCCUCUCAAGGGCUGACCCGUAAAGGUGUGUAUGCCGUUCGGUACAAGGUGAAUGAAAAUCCUCUGUACGCACCCACCUCAGAACAUGUGAACGUCCUACUGACCCGCACGGAGGACCGCAUCGUGUGGAAAACACUAGCCGGCGACCCAUGGAUAAAAACACUGACUGCCAAGUACCCUGGGAAUUUCACUGCCACGAUAGAGGAGUGGCAAGCAGAGCAUGAUGCCAUCAUGAGGCACAUCUUGGAGAGACCGGACCCUACCGACGUCUUCCAGAAUAAGGCAAACGUGUGUUGGGCCAAGGCUUUAGUGCCGGUGCUGAAGACCGCUGGCAUAGACAUGACCACUGAACAAUGGAACACUGUGGAUUAUUUUGAAACGGACAAAGCUCACUCAGCAGAGAUAGUAUUGAACCAACUAUGCGUGAGGUUCUUUGGACUCGAUCUGGACUCCGGUCUAUUUUCUGCACCCACUGUUCCGUUAUCCAUUAGGAAUAAUCACUGGGAUAACUCCCCGUCGCCUAACAUGUACGGGCUGAAUAAAGAAGUGGUCCGUCAGCUCUCUCGCAGGUACCCACAACUGCCUCGGGCAGUUGCCACUGGAAGAGUCUAUGACAUGAACACUGGUACACUGCGCAAUUAUGAUCCGCGCAUAAACCUAGUACCUGUAAACAGAAGACUGCCUCAUGCUUUAGUCCUCCACCAUAAUGAACACCCACAGAGUGACUUUUCUUCAUUCGUCAGCAAAUUGAAGGGCAGAACUGUCCUGGUGGUCGGGGAAAAGUUGUCCGUCCCAGGCAAAAUGGUUGACUGGUUGUCAGACCGGCCUGAGGCUACCUUCAGAGCUCGGCUGGAUUUAGGCAUCCCAGGUGAUGUGCCCAAAUAUGACAUAAUAUUUGUUAAUGUGAGGACCCCAUAUAAAUACCAUCACUAUCAGCAGUGUGAAGACCAUGCCAUUAAGCUUAGCAUGUUGACCAAGAAAGCUUGUCUGCAUCUGAAUCCCGGCGGAACCUGUGUCAGCAUAGGUUAUGGUUACGCUGACAGGGCCAGCGAAAGCAUCAUUGGUGCUAUAGCGCGGCAGUUCAAGUUUUCCCGGGUAUGCAAACCGAAAUCCUCACUUGAAGAGACGGAAGUUCUGUUUGUAUUCAUUGGGUACGAUCGCAAGGCCCGUACGCACAAUUCUUACAAGCUUUCAUCAACCUUGACCAACAUUUAUACAGGUUCCAGACUCCACGAAGCCGGAUGUGCACCCUCAUAUCAUGUGGUGCGAGGGGAUAUUGCCACGGCCACCGAAGGAGUGAUUAUAAAUGCUGCUAACAGCAAAGGACAACCUGGCGGAGGGGUGUGCGGAGCGCUGUAUAAGAAAUUCCCGGAAAGCUUCGAUUUACAGCCGAUCGAAGUAGGAAAAGCGCGACUGGUCAAAGGUGCAGCUAAACAUAUCAUUCAUGCCGUAGGACCAAACUUCAACAAAGUUUCGGAGGUUGAAGGUGACAAACAGUUGGCAGAGGCUUAUGAGUCCAUCGCUAAGAUUGUCAACGAUAACAAUUACAAGUCAGUAGCGAUUCCACUGUUGUCCACCGGCAUCUUUUCCGGGAACAAAGAUCGACUAACCCAAUCAUUGAACCAUUUGCUGACAGCUUUAGACACCACUGAUGCAGAUGUAGCCAUAUACUGCAGGGACAAGAAAUGGGAAAUGACUCUCAAGGAAGCAGUGGCUAGGAGAGAAGCAGUGGAGGAGAUAUGCAUAUCCGACGACUCUUCAGUGACAGAACCUGAUGCAGAGCUGGUGAGGGUGCAUCCGAAGAGUUCUUUGGCUGGAAGGAAGGGCUACAGCACAAGCGAUGGCAAAACUUUCUCAUAUUUGGAAGGGACCAAGUUUCACCAGGCGGCCAAGGAUAUAGCAGAAAUUAAUGCCAUGUGGCCCGUUGCAACGGAGGCCAAUGAGCAGGUAUGCAUGUAUAUCCUCGGAGAAAGCAUGAGCAGUAUUAGGUCGAAAUGCCCCGUCGAAGAGUCGGAAGCCUCCACACCACCUAGCACGCUGCCUUGCUUGUGCAUCCAUGCCAUGACUCCAGAAAGAGUACAGCGCCUAAAAGCCUCACGUCCAGAACAAAUUACUGUGUGCUCAUCCUUUCCAUUGCCGAAGUAUAGAAUCACUGGUGUGCAGAAGAUCCAAUGCUCCCAGCCUAUAUUGUUCUCACCGAAAGUGCCUGCGUAUAUUCAUCCAAGGAAGUAUCUCGUGGAAACACCACCGGUAGACGAGACUCCGGAGCCAUCGGCAGAGAACCAAUCCACAGAGGGGACACCUGAACAACCACCACUUAUAACCGAGGAUGAGACCAGGACUAGAACGCCUGAGCCGAUCAUCAUCGAAGAGGAAGAAGAGGAUAGCAUAAGUUUGCUGUCAGAUGGCCCGACCCACCAGGUGCUGCAAGUCGAGGCAGACAUUCACGGGCCGCCCUCUGUAUCUAGCUCAUCCUGGUCCAUUCCUCAUGCAUCCGACUUUGAUGUGGACAGUUUAUCCAUACUUGACACCCUGGAGGGAGCUAGCGUGACCAGCGGGGCAACGUCAGCCGAGACUAACUCUUACUUCGCAAAGAGUAUGGAGUUUCUGGCGCGACCGGUGCCUGCGCCUCGAACAGUAUUCAGGAACCCUCCACAUCCCGCUCCGCGCACAAGAACACCGUCACUUGCACCCAGCAGGGCCUGCUCGAGAACCAGCCUAGUUUCCACCCCGCCAGGCGUGAAUAGGGUGAUCACUAGAGAGGAGCUCGAGGCGCUUACCCCGUCACGCACUCCUAGCAGGUCGGUCUCGAGAACCAGCCUGGUCUCCAACCCGCCAGGCGUAAAUAGGGUGAUUACAAGAGAGGAGUUUGAGGCGUUCGUAGCACAACAACAAUGACGGUUUGAUGCGGGUGCAUACAUCUUUUCCUCCGACACCGGUCAAGGGCAUUUACAACAAAAAUCAGUAAGGCAAACGGUGCUAUCCGAAGUGGUGUUGGAGAGGACCGAAUUGGAGAUUUCGUAUGCCCCGCGCCUCGACCAAGAAAAAGAAGAAUUACUACGCAAGAAAUUACAGUUAAAUCCCACACCUGCUAACAGAAGCAGAUACCAGUCCAGGAAGGUGGAGAACAUGAAAGCCAUAACAGCUAGACGUAUUCUGCAAGGCCUAGGGCAUUAUUUGAAGGCAGAAGGAAAAGUGGAGUGCUACCGAACCCUGCAUCCUGUUCCUUUGUAUUCAUCUAGUGUGAACCGUGCCUUUUCAAGCCCCAAGGUCGCAGUGGAAGCCUGUAACGCCAUGUUGAAAGAGAACUUUCCGACUGUGGCUUCUUACUGUAUUAUUCCAGAGUACGAUGCCUAUUUGGACAUGGUUGACGGAGCUUCAUGCUGCUUAGACACUGCCAGUUUUUGCCCUGCAAAGCUGCGCAGCUUUCCAAAGAAACACUCCUAUUUGGAACCCACAAUACGAUCGGCAGUGCCUUCAGCGAUCCAGAACACGCUCCAGAACGUCCUGGCAGCUGCCACAAAAAGAAAUUGCAAUGUCACGCAAAUGAGAGAAUUGCCCGUAUUGGAUUCGGCGGCCUUUAAUGUGGAAUGCUUCAAGAAAUAUGCGUGUAAUAAUGAAUAUUGGGAAACGUUUAAAGAAAACCCCAUCAGGCUUACUGAAGAAAACGUGGUAAAUUACAUUACCAAAUUAAAAGGACCAAAAGCUGCUGCUCUUUUUGCGAAGACACAUAAUUUGAAUAUGUUGCAGGACAUACCAAUGGACAGGUUUGUAAUGGACUUAAAGAGAGACGUGAAAGUGACUCCAGGAACAAAACAUACUGAAGAACGGCCCAAGGUACAGGUGAUCCAGGCUGCCGAUCCGCUAGCAACAGCGUAUCUGUGCGGAAUCCACCGAGAGCUGGUUAGGAGAUUAAAUGCGGUCCUGCUUCCGAACAUUCAUACACUGUUUGAUAUGUCGGCUGAAGACUUUGACGCUAUUAUAGCCGAGCACUUCCAGCCUGGGGAUUGUGUUCUGGAAACUGACAUCGCGUCGUUUGAUAAAAGUGAGGACGACGCCAUGGCUCUGACCGCGUUAAUGAUUCUGGAAGACUUAGGUGUGGACGCAGAGCUGUUGACGCUGAUUGAGGCGGCUUUCGGCGAAAUUUCAUCAAUACAUUUGCCCACUAAAACUAAAUUUAAAUUCGGAGCCAUGAUGAAAUCUGGAAUGUUCCUCACACUGUUUGUGAACACAGUCAUUAACAUUGUAAUCGCAAGCAGAGUGUUGAGAGAACGGCUAACCGGAUCACCAUGUGCAGCAUUCAUUGGAGAUGACAAUAUCGUGAAAGGAGUCAAAUCGGACAAAUUAAUGGCAGACAGGUGCGCCACCUGGUUGAAUAUGGAAGUCAAGAUUAUAGAUGCUGUGGUGGGCGAGAAAGCGCCUUAUUUCUGUGGAGGGUUUAUUUUGUGUGACUCCGUGACCGGCACAGCGUGCCGUGUGGCAGACCCCCUAAAAAGGCUGUUUAAGCUUGGCAAACCUCUGGCAGCAGACGAUGAACAUGAUGAUGACAGGAGAAGGGCAUUGCAUGAAGAGUCAACACGCUGGAACCGAGUGGGUAUUCUUUCAGAGCUGUGCAAGGCAGUAGAAUCAAGGUAUGAAACCGUAGGAACUUCCAUCAUAGUUAUGGCCAUGACUACUCUAGCUAGCAGUGUUAAAUCAUUCAGCUACCUGAGAGGGGCCCCUAUAACUCUCUACGGCUAACCUGAAUGGACUACGACAUAGUCUAGUCCGCCAAGUCUAGCAUAUGGCCACC [서열번호 92]----------------GOI---------------------CGGAGACGGCGCAGAAGAAGAGGAUCUGGCGAAGGCAGAGGCAGCCUGCUUACAUGUGGCGACGUGGAAGAGAACCCCGGACCUAUGCACCAGAAACGGACCGCCAUGUUCCAGGAUCCUCAAGAGAGGCCCAGAAAGCUGCCUCAGCUGUGUACCGAGCUGCAGACCACCAUCCACGACAUCAUCCUGGAAUGCGUGUACUGCAAGCAGCAGCUCCUGCGGAGAGAGGUGUACGAUUUCGCCUUCCGGGACCUGUGCAUCGUGUACAGAGAUGGCAACCCCUACGCCGUGUGCGACAAGUGCCUGAAGUUCUACAGCAAGAUCAGCGAGUACCGGCACUACUGCUACAGCCUGUACGGCACCACACUGGAACAGCAGUACAACAAGCCCCUGUGCGACCUGCUGAUCCGGUGCAUCAACUGCCAGAAACCUCUGUGCCCCGAGGAAAAGCAGCGGCACCUGGACAAGAAGCAGCGGUUCCACAACAUCAGAGGCCGGUGGACCGGCAGAUGCAUGAGCUGUUGUCGGAGCAGCAGAACCAGACGGGAAACCCAGCUGUGAGCGGCCGCGAAUUGGCAAGCUGCUUACAUAGAACUCGCGGCGAUUGGCAUGCCGCCUUAAAAUUUUUAUUUUAUUUUUCUUUUCUUUUCCGAAUCGGAUUUUGUUUUUAAUAUUUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA [서열번호 457]
따라서, 바람직하게는 상기 RNA 구조체는 실질적으로 서열번호 92, GOI, 및 서열번호 457, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함하거나 이로 이루어지는 상기에 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
본 발명의 제2 측면에서, 제1 측면의 RNA 구조체를 암호화하는 핵산 서열이 제공된다.
한 구현예에서, 상기 핵산 서열은 GOI - 푸린 T2A - HCV E6을 암호화할 수 있다(이것은 본 명세서에서 인용된 첫번째 바이러스 IIP이지만, 본 명세서에 개시된 임의의 IIP 또는 링커가 사용될 수 있음이 인식될 것이다). 따라서, 상기 핵산 서열은 서열번호 93, GOI, 및 서열번호 458을 포함하거나 이로 이루어질 수 있다. 서열번호 93 및 서열번호 458은 다음과 같다:
ATGGGCGGCGCATGAGAGAAGCCCAGACCAATTACCTACCCAAAATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCATTCCTCAGAGCTTTGCAGCGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACTGATAATGACCATGCTAATGCCAGAGCGTTTTCGCATCTGGCTTCAAAACTGATCGAAACGGAGGTGGACCCATCCGACACGATCCTTGACATTGGAAGTGCGCCCGCCCGCAGAATGTATTCTAAGCACAAGTATCATTGTATCTGTCCGATGAGATGTGCGGAAGATCCGGACAGATTGTATAAGTATGCAACTAAGCTGAAGAAAAACTGTAAGGAAATAACTGATAAGGAATTGGACAAGAAAATGAAGGAGCTGGCCGCCGTCATGAGCGACCCTGACCTGGAAACTGAGACTATGTGCCTCCACGACGACGAGTCGTGTCGCTACGAAGGGCAAGTCGCTGTTTACCAGGATGTATACGCGGTTGACGGACCGACAAGTCTCTATCACCAAGCCAATAAGGGAGTTAGAGTCGCCTACTGGATAGGCTTTGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACTTGGCTGGAGCATATCCATCATACTCTACCAACTGGGCCGACGAAACCGTGTTAACGGCTCGTAACATAGGCCTATGCAGCTCTGACGTTATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATTCTTAGAAAGAAGTATTTGAAACCATCCAACAATGTTCTATTCTCTGTTGGCTCGACCATCTACCACGAGAAGAGGGACTTACTGAGGAGCTGGCACCTGCCGTCTGTATTTCACTTACGTGGCAAGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATAGCTATCAGTCCAGGCCTGTATGGGAAGCCTTCAGGCTATGCTGCTACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAAGTGACAGACACATTGAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCCGTGTGCACGTATGTGCCAGCTACATTGTGTGACCAAATGACTGGCATACTGGCAACAGATGTCAGTGCGGACGACGCGCAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGTATAGTCGTCAACGGTCGCACCCAGAGAAACACCAATACCATGAAAAATTACCTTTTGCCCGTAGTGGCCCAGGCATTTGCTAGGTGGGCAAAGGAATATAAGGAAGATCAAGAAGATGAAAGGCCACTAGGACTACGAGATAGACAGTTAGTCATGGGGTGTTGTTGGGCTTTTAGAAGGCACAAGATAACATCTATTTATAAGCGCCCGGATACCCAAACCATCATCAAAGTGAACAGCGATTTCCACTCATTCGTGCTGCCCAGGATAGGCAGTAACACATTGGAGATCGGGCTGAGAACAAGAATCAGGAAAATGTTAGAGGAGCACAAGGAGCCGTCACCTCTCATTACCGCCGAGGACGTACAAGAAGCTAAGTGCGCAGCCGATGAGGCTAAGGAGGTGCGTGAAGCCGAGGAGTTGCGCGCAGCTCTACCACCTTTGGCAGCTGATGTTGAGGAGCCCACTCTGGAAGCCGATGTCGACTTGATGTTACAAGAGGCTGGGGCCGGCTCAGTGGAGACACCTCGTGGCTTGATAAAGGTTACCAGCTACGATGGCGAGGACAAGATCGGCTCTTACGCTGTGCTTTCTCCGCAGGCTGTACTCAAGAGTGAAAAATTATCTTGCATCCACCCTCTCGCTGAACAAGTCATAGTGATAACACACTCTGGCCGAAAAGGGCGTTATGCCGTGGAACCATACCATGGTAAAGTAGTGGTGCCAGAGGGACATGCAATACCCGTCCAGGACTTTCAAGCTCTGAGTGAAAGTGCCACCATTGTGTACAACGAACGTGAGTTCGTAAACAGGTACCTGCACCATATTGCCACACATGGAGGAGCGCTGAACACTGATGAAGAATATTACAAAACTGTCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAATACCTGTACGACATCGACAGGAAACAGTGCGTCAAGAAAGAACTAGTCACTGGGCTAGGGCTCACAGGCGAGCTGGTGGATCCTCCCTTCCATGAATTCGCCTACGAGAGTCTGAGAACACGACCAGCCGCTCCTTACCAAGTACCAACCATAGGGGTGTATGGCGTGCCAGGATCAGGCAAGTCTGGCATCATTAAAAGCGCAGTCACCAAAAAAGATCTAGTGGTGAGCGCCAAGAAAGAAAACTGTGCAGAAATTATAAGGGACGTCAAGAAAATGAAAGGGCTGGACGTCAATGCCAGAACTGTGGACTCAGTGCTCTTGAATGGATGCAAACACCCCGTAGAGACCCTGTATATTGACGAAGCTTTTGCTTGTCATGCAGGTACTCTCAGAGCGCTCATAGCCATTATAAGACCTAAAAAGGCAGTGCTCTGCGGGGATCCCAAACAGTGCGGTTTTTTTAACATGATGTGCCTGAAAGTGCATTTTAACCACGAGATTTGCACACAAGTCTTCCACAAAAGCATCTCTCGCCGTTGCACTAAATCTGTGACTTCGGTCGTCTCAACCTTGTTTTACGACAAAAAAATGAGAACGACGAATCCGAAAGAGACTAAGATTGTGATTGACACTACCGGCAGTACCAAACCTAAGCAGGACGATCTCATTCTCACTTGTTTCAGAGGGTGGGTGAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAAGGCAACGAAATAATGACGGCAGCTGCCTCTCAAGGGCTGACCCGTAAAGGTGTGTATGCCGTTCGGTACAAGGTGAATGAAAATCCTCTGTACGCACCCACCTCAGAACATGTGAACGTCCTACTGACCCGCACGGAGGACCGCATCGTGTGGAAAACACTAGCCGGCGACCCATGGATAAAAACACTGACTGCCAAGTACCCTGGGAATTTCACTGCCACGATAGAGGAGTGGCAAGCAGAGCATGATGCCATCATGAGGCACATCTTGGAGAGACCGGACCCTACCGACGTCTTCCAGAATAAGGCAAACGTGTGTTGGGCCAAGGCTTTAGTGCCGGTGCTGAAGACCGCTGGCATAGACATGACCACTGAACAATGGAACACTGTGGATTATTTTGAAACGGACAAAGCTCACTCAGCAGAGATAGTATTGAACCAACTATGCGTGAGGTTCTTTGGACTCGATCTGGACTCCGGTCTATTTTCTGCACCCACTGTTCCGTTATCCATTAGGAATAATCACTGGGATAACTCCCCGTCGCCTAACATGTACGGGCTGAATAAAGAAGTGGTCCGTCAGCTCTCTCGCAGGTACCCACAACTGCCTCGGGCAGTTGCCACTGGAAGAGTCTATGACATGAACACTGGTACACTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAACCTAGTACCTGTAAACAGAAGACTGCCTCATGCTTTAGTCCTCCACCATAATGAACACCCACAGAGTGACTTTTCTTCATTCGTCAGCAAATTGAAGGGCAGAACTGTCCTGGTGGTCGGGGAAAAGTTGTCCGTCCCAGGCAAAATGGTTGACTGGTTGTCAGACCGGCCTGAGGCTACCTTCAGAGCTCGGCTGGATTTAGGCATCCCAGGTGATGTGCCCAAATATGACATAATATTTGTTAATGTGAGGACCCCATATAAATACCATCACTATCAGCAGTGTGAAGACCATGCCATTAAGCTTAGCATGTTGACCAAGAAAGCTTGTCTGCATCTGAATCCCGGCGGAACCTGTGTCAGCATAGGTTATGGTTACGCTGACAGGGCCAGCGAAAGCATCATTGGTGCTATAGCGCGGCAGTTCAAGTTTTCCCGGGTATGCAAACCGAAATCCTCACTTGAAGAGACGGAAGTTCTGTTTGTATTCATTGGGTACGATCGCAAGGCCCGTACGCACAATTCTTACAAGCTTTCATCAACCTTGACCAACATTTATACAGGTTCCAGACTCCACGAAGCCGGATGTGCACCCTCATATCATGTGGTGCGAGGGGATATTGCCACGGCCACCGAAGGAGTGATTATAAATGCTGCTAACAGCAAAGGACAACCTGGCGGAGGGGTGTGCGGAGCGCTGTATAAGAAATTCCCGGAAAGCTTCGATTTACAGCCGATCGAAGTAGGAAAAGCGCGACTGGTCAAAGGTGCAGCTAAACATATCATTCATGCCGTAGGACCAAACTTCAACAAAGTTTCGGAGGTTGAAGGTGACAAACAGTTGGCAGAGGCTTATGAGTCCATCGCTAAGATTGTCAACGATAACAATTACAAGTCAGTAGCGATTCCACTGTTGTCCACCGGCATCTTTTCCGGGAACAAAGATCGACTAACCCAATCATTGAACCATTTGCTGACAGCTTTAGACACCACTGATGCAGATGTAGCCATATACTGCAGGGACAAGAAATGGGAAATGACTCTCAAGGAAGCAGTGGCTAGGAGAGAAGCAGTGGAGGAGATATGCATATCCGACGACTCTTCAGTGACAGAACCTGATGCAGAGCTGGTGAGGGTGCATCCGAAGAGTTCTTTGGCTGGAAGGAAGGGCTACAGCACAAGCGATGGCAAAACTTTCTCATATTTGGAAGGGACCAAGTTTCACCAGGCGGCCAAGGATATAGCAGAAATTAATGCCATGTGGCCCGTTGCAACGGAGGCCAATGAGCAGGTATGCATGTATATCCTCGGAGAAAGCATGAGCAGTATTAGGTCGAAATGCCCCGTCGAAGAGTCGGAAGCCTCCACACCACCTAGCACGCTGCCTTGCTTGTGCATCCATGCCATGACTCCAGAAAGAGTACAGCGCCTAAAAGCCTCACGTCCAGAACAAATTACTGTGTGCTCATCCTTTCCATTGCCGAAGTATAGAATCACTGGTGTGCAGAAGATCCAATGCTCCCAGCCTATATTGTTCTCACCGAAAGTGCCTGCGTAT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[서열번호 93]----------------GOI---------------------CGGAGACGGCGCAGAAGAAGAGGATCTGGCGAAGGCAGAGGCAGCCTGCTTACATGTGGCGACGTGGAAGAGAACCCCGGACCTATGCACCAGAAACGGACCGCCATGTTCCAGGATCCTCAAGAGAGGCCCAGAAAGCTGCCTCAGCTGTGTACCGAGCTGCAGACCACCATCCACGACATCATCCTGGAATGCGTGTACTGCAAGCAGCAGCTCCTGCGGAGAGAGGTGTACGATTTCGCCTTCCGGGACCTGTGCATCGTGTACAGAGATGGCAACCCCTACGCCGTGTGCGACAAGTGCCTGAAGTTCTACAGCAAGATCAGCGAGTACCGGCACTACTGCTACAGCCTGTACGGCACCACACTGGAACAGCAGTACAACAAGCCCCTGTGCGACCTGCTGATCCGGTGCATCAACTGCCAGAAACCTCTGTGCCCCGAGGAAAAGCAGCGGCACCTGGACAAGAAGCAGCGGTTCCACAACATCAGAGGCCGGTGGACCGGCAGATGCATGAGCTGTTGTCGGAGCAGCAGAACCAGACGGGAAACCCAGCTGTGAGCGGCCGCGAATTGGCAAGCTGCTTACATAGAACTCGCGGCGATTGGCATGCCGCCTTAAAATTTTTATTTTATTTTTCTTTTCTTTTCCGAATCGGATTTTGTTTTTAATATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA [서열번호 458]
따라서, 바람직하게는 상기 핵산 서열은 실질적으로 서열번호 93을 포함하거나 이로 이루어지는 상기 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, GOI, 및 서열번호 458, 또는 그의 단편 또는 변이체를 포함한다.
제3 측면에서, 제2 측면에 따른 핵산 서열을 포함하는 발현 카세트(cassette)가 제공된다.
본 발명의 핵산 서열은 바람직하게는 재조합 벡터, 예를 들면 상기 RNA 구조체를 생산할 수 있도록 관심있는 숙주 세포 내로 운반하기 위한 재조합 벡터 내에 포함된다.
본 발명의 핵산 서열은 바람직하게는 재조합 벡터, 예를 들면 상기 RNA 구조체를 생산할 수 있도록 관심있는 숙주 세포 내로 운반하기 위한 재조합 벡터 내에 포함된다.
따라서, 제4 측면에서, 제3 측면에 따른 발현 카세트를 포함하는 재조합 벡터가 제공된다.
한 구현예에서, 상기 벡터는 GOI - 푸린 T2A - HCV E6를 갖고 있는 saRNA 플라스미드 구조체를 암호화하거나 이를 포함하는 DNA 서열을 포함할 수 있다(이것은 본 명세서에서 인용된 첫번째 바이러스 IIP이지만, 본 명세서에 개시된 임의의 IIP 또는 링커가 사용될 수 있음이 인식될 것이다). 따라서, 상기 벡터는 단일 벡터 내에 서열번호 94의 핵산 서열, GOI, 및 서열번호 459의 핵산 서열을 포함할 수 있다. 서열번호 94 및 서열번호 459는 다음과 같으며, 여기서 "GOI"는 치료 생체분자를 암호화하는 서열의 위치를 나타낸다:
TAATACGACTCACTATAGATGGGCGGCGCATGAGAGAAGCCCAGACCAATTACCTACCCAAAATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCATTCCTCAGAGCTTTGCAGCGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACTGATAATGACCATGCTAATGCCAGAGCGTTTTCGCATCTGGCTTCAAAACTGATCGAAACGGAGGTGGACCCATCCGACACGATCCTTGACATTGGAAGTGCGCCCGCCCGCAGAATGTATTCTAAGCACAAGTATCATTGTATCTGTCCGATGAGATGTGCGGAAGATCCGGACAGATTGTATAAGTATGCAACTAAGCTGAAGAAAAACTGTAAGGAAATAACTGATAAGGAATTGGACAAGAAAATGAAGGAGCTGGCCGCCGTCATGAGCGACCCTGACCTGGAAACTGAGACTATGTGCCTCCACGACGACGAGTCGTGTCGCTACGAAGGGCAAGTCGCTGTTTACCAGGATGTATACGCGGTTGACGGACCGACAAGTCTCTATCACCAAGCCAATAAGGGAGTTAGAGTCGCCTACTGGATAGGCTTTGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACTTGGCTGGAGCATATCCATCATACTCTACCAACTGGGCCGACGAAACCGTGTTAACGGCTCGTAACATAGGCCTATGCAGCTCTGACGTTATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATTCTTAGAAAGAAGTATTTGAAACCATCCAACAATGTTCTATTCTCTGTTGGCTCGACCATCTACCACGAGAAGAGGGACTTACTGAGGAGCTGGCACCTGCCGTCTGTATTTCACTTACGTGGCAAGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATAGCTATCAGTCCAGGCCTGTATGGGAAGCCTTCAGGCTATGCTGCTACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAAGTGACAGACACATTGAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCCGTGTGCACGTATGTGCCAGCTACATTGTGTGACCAAATGACTGGCATACTGGCAACAGATGTCAGTGCGGACGACGCGCAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGTATAGTCGTCAACGGTCGCACCCAGAGAAACACCAATACCATGAAAAATTACCTTTTGCCCGTAGTGGCCCAGGCATTTGCTAGGTGGGCAAAGGAATATAAGGAAGATCAAGAAGATGAAAGGCCACTAGGACTACGAGATAGACAGTTAGTCATGGGGTGTTGTTGGGCTTTTAGAAGGCACAAGATAACATCTATTTATAAGCGCCCGGATACCCAAACCATCATCAAAGTGAACAGCGATTTCCACTCATTCGTGCTGCCCAGGATAGGCAGTAACACATTGGAGATCGGGCTGAGAACAAGAATCAGGAAAATGTTAGAGGAGCACAAGGAGCCGTCACCTCTCATTACCGCCGAGGACGTACAAGAAGCTAAGTGCGCAGCCGATGAGGCTAAGGAGGTGCGTGAAGCCGAGGAGTTGCGCGCAGCTCTACCACCTTTGGCAGCTGATGTTGAGGAGCCCACTCTGGAAGCCGATGTCGACTTGATGTTACAAGAGGCTGGGGCCGGCTCAGTGGAGACACCTCGTGGCTTGATAAAGGTTACCAGCTACGATGGCGAGGACAAGATCGGCTCTTACGCTGTGCTTTCTCCGCAGGCTGTACTCAAGAGTGAAAAATTATCTTGCATCCACCCTCTCGCTGAACAAGTCATAGTGATAACACACTCTGGCCGAAAAGGGCGTTATGCCGTGGAACCATACCATGGTAAAGTAGTGGTGCCAGAGGGACATGCAATACCCGTCCAGGACTTTCAAGCTCTGAGTGAAAGTGCCACCATTGTGTACAACGAACGTGAGTTCGTAAACAGGTACCTGCACCATATTGCCACACATGGAGGAGCGCTGAACACTGATGAAGAATATTACAAAACTGTCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAATACCTGTACGACATCGACAGGAAACAGTGCGTCAAGAAAGAACTAGTCACTGGGCTAGGGCTCACAGGCGAGCTGGTGGATCCTCCCTTCCATGAATTCGCCTACGAGAGTCTGAGAACACGACCAGCCGCTCCTTACCAAGTACCAACCATAGGGGTGTATGGCGTGCCAGGATCAGGCAAGTCTGGCATCATTAAAAGCGCAGTCACCAAAAAAGATCTAGTGGTGAGCGCCAAGAAAGAAAACTGTGCAGAAATTATAAGGGACGTCAAGAAAATGAAAGGGCTGGACGTCAATGCCAGAACTGTGGACTCAGTGCTCTTGAATGGATGCAAACACCCCGTAGAGACCCTGTATATTGACGAAGCTTTTGCTTGTCATGCAGGTACTCTCAGAGCGCTCATAGCCATTATAAGACCTAAAAAGGCAGTGCTCTGCGGGGATCCCAAACAGTGCGGTTTTTTTAACATGATGTGCCTGAAAGTGCATTTTAACCACGAGATTTGCACACAAGTCTTCCACAAAAGCATCTCTCGCCGTTGCACTAAATCTGTGACTTCGGTCGTCTCAACCTTGTTTTACGACAAAAAAATGAGAACGACGAATCCGAAAGAGACTAAGATTGTGATTGACACTACCGGCAGTACCAAACCTAAGCAGGACGATCTCATTCTCACTTGTTTCAGAGGGTGGGTGAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAAGGCAACGAAATAATGACGGCAGCTGCCTCTCAAGGGCTGACCCGTAAAGGTGTGTATGCCGTTCGGTACAAGGTGAATGAAAATCCTCTGTACGCACCCACCTCAGAACATGTGAACGTCCTACTGACCCGCACGGAGGACCGCATCGTGTGGAAAACACTAGCCGGCGACCCATGGATAAAAACACTGACTGCCAAGTACCCTGGGAATTTCACTGCCACGATAGAGGAGTGGCAAGCAGAGCATGATGCCATCATGAGGCACATCTTGGAGAGACCGGACCCTACCGACGTCTTCCAGAATAAGGCAAACGTGTGTTGGGCCAAGGCTTTAGTGCCGGTGCTGAAGACCGCTGGCATAGACATGACCACTGAACAATGGAACACTGTGGATTATTTTGAAACGGACAAAGCTCACTCAGCAGAGATAGTATTGAACCAACTATGCGTGAGGTTCTTTGGACTCGATCTGGACTCCGGTCTATTTTCTGCACCCACTGTTCCGTTATCCATTAGGAATAATCACTGGGATAACTCCCCGTCGCCTAACATGTACGGGCTGAATAAAGAAGTGGTCCGTCAGCTCTCTCGCAGGTACCCACAACTGCCTCGGGCAGTTGCCACTGGAAGAGTCTATGACATGAACACTGGTACACTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAACCTAGTACCTGTAAACAGAAGACTGCCTCATGCTTTAGTCCTCCACCATAATGAACACCCACAGAGTGACTTTTCTTCATTCGTCAGCAAATTGAAGGGCAGAACTGTCCTGGTGGTCGGGGAAAAGTTGTCCGTCCCAGGCAAAATGGTTGACTGGTTGTCAGACCGGCCTGAGGCTACCTTCAGAGCTCGGCTGGATTTAGGCATCCCAGGTGATGTGCCCAAATATGACATAATATTTGTTAATGTGAGGACCCCATATAAATACCATCACTATCAGCAGTGTGAAGACCATGCCATTAAGCTTAGCATGTTGACCAAGAAAGCTTGTCTGCATCTGAATCCCGGCGGAACCTGTGTCAGCATAGGTTATGGTTACGCTGACAGGGCCAGCGAAAGCATCATTGGTGCTATAGCGCGGCAGTTCAAGTTTTCCCGGGTATGCAAACCGAAATCCTCACTTGAAGAGACGGAAGTTCTGTTTGTATTCATTGGGTACGATCGCAAGGCCCGTACGCACAATTCTTACAAGCTTTCATCAACCTTGACCAACATTTATACAGGTTCCAGACTCCACGAAGCCGGATGTGCACCCTCATATCATGTGGTGCGAGGGGATATTGCCACGGCCACCGAAGGAGTGATTATAAATGCTGCTAACAGCAAAGGACAACCTGGCGGAGGGGTGTGCGGAGCGCTGTATAAGAAATTCCCGGAAAGCTTCGATTTACAGCCGATCGAAGTAGGAAAAGCGCGACTGGTCAAAGGTGCAGCTAAACATATCATTCATGCCGTAGGACCAAACTTCAACAAAGTTTCGGAGGTTGAAGGTGACAAACAGTTGGCAGAGGCTTATGAGTCCATCGCTAAGATTGTCAACGATAACAATTACAAGTCAGTAGCGATTCCACTGTTGTCCACCGGCATCTTTTCCGGGAACAAAGATCGACTAACCCAATCATTGAACCATTTGCTGACAGCTTTAGACACCACTGATGCAGATGTAGCCATATACTGCAGGGACAAGAAATGGGAAATGACTCTCAAGGAAGCAGTGGCTAGGAGAGAAGCAGTGGAGGAGATATGCATATCCGACGACTCTTCAGTGACAGAACCTGATGCAGAGCTGGTGAGGGTGCATCCGAAGAGTTCTTTGGCTGGAAGGAAGGGCTACAGCACAAGCGATGGCAAAACTTTCTCATATTTGGAAGGGACCAAGTTTCACCAGGCGGCCAAGGATATAGCAGAAATTAATGCCATGTGGCCCGTTGCAACGGAGGCCAATGAGCAGGTATGCATGTATATCCTCGGAGAAAGCATGAGCAGTATTAGGTCGAAATGCCCCGTCGAAGAGTCGGAAGCCTCCACACCACCTAGCACGCTGCCTTGCTTGTGCATCCATGCCATGACTCCAGAAAGAGTACAGCGCCTAAAAGCCTCACGTCCAGAACAAATTACTGTGTGCTCATCCTTTCCATTGCCGAAGTATAGAATCACTGGTGTGCAGAAGATCCAATGCTCCCAGCCTATATTGTTCTCACCGAAAGTGCCTGCGTATATTCATCCAAGGAAGTATCTCGTGGAAACACCACCGGTAGACGAGACTCCGGAGCCATCGGCAGAGAACCAATCCACAGAGGGGACACCTGAACAACCACCACTTATAACCGAGGATGAGACCAGGACTAGAACGCCTGAGCCGATCATCATCGAAGAGGAAGAAGAGGATAGCATAAGTTTGCTGTCAGATGGCCCGACCCACCAGGTGCTGCAAGTCGAGGCAGACATTCACGGGCCGCCCTCTGTATCTAGCTCATCCTGGTCCATTCCTCATGCATCCGACTTTGATGTGGACAGTTTATCCATACTTGACACCCTGGAGGGAGCTAGCGTGACCAGCGGGGCAACGTCAGCCGAGACTAACTCTTACTTCGCAAAGAGTATGGAGTTTCTGGCGCGACCGGTGCCTGCGCCTCGAACAGTATTCAGGAACCCTCCACATCCCGCTCCGCGCACAAGAACACCGTCACTTGCACCCAGCAGGGCCTGCTCGAGAACCAGCCTAGTTTCCACCCCGCCAGGCGTGAATAGGGTGATCACTAGAGAGGAGCTCGAGGCGCTTACCCCGTCACGCACTCCTAGCAGGTCGGTCTCGAGAACCAGCCTGGTCTCCAACCCGCCAGGCGTAAATAGGGTGATTACAAGAGAGGAGTTTGAGGCGTTCGTAGCACAACAACAATGACGGTTTGATGCGGGTGCATACATCTTTTCCTCCGACACCGGTCAAGGGCATTTACAACAAAAATCAGTAAGGCAAACGGTGCTATCCGAAGTGGTGTTGGAGAGGACCGAATTGGAGATTTCGTATGCCCCGCGCCTCGACCAAGAAAAAGAAGAATTACTACGCAAGAAATTACAGTTAAATCCCACACCTGCTAACAGAAGCAGATACCAGTCCAGGAAGGTGGAGAACATGAAAGCCATAACAGCTAGACGTATTCTGCAAGGCCTAGGGCATTATTTGAAGGCAGAAGGAAAAGTGGAGTGCTACCGAACCCTGCATCCTGTTCCTTTGTATTCATCTAGTGTGAACCGTGCCTTTTCAAGCCCCAAGGTCGCAGTGGAAGCCTGTAACGCCATGTTGAAAGAGAACTTTCCGACTGTGGCTTCTTACTGTATTATTCCAGAGTACGATGCCTATTTGGACATGGTTGACGGAGCTTCATGCTGCTTAGACACTGCCAGTTTTTGCCCTGCAAAGCTGCGCAGCTTTCCAAAGAAACACTCCTATTTGGAACCCACAATACGATCGGCAGTGCCTTCAGCGATCCAGAACACGCTCCAGAACGTCCTGGCAGCTGCCACAAAAAGAAATTGCAATGTCACGCAAATGAGAGAATTGCCCGTATTGGATTCGGCGGCCTTTAATGTGGAATGCTTCAAGAAATATGCGTGTAATAATGAATATTGGGAAACGTTTAAAGAAAACCCCATCAGGCTTACTGAAGAAAACGTGGTAAATTACATTACCAAATTAAAAGGACCAAAAGCTGCTGCTCTTTTTGCGAAGACACATAATTTGAATATGTTGCAGGACATACCAATGGACAGGTTTGTAATGGACTTAAAGAGAGACGTGAAAGTGACTCCAGGAACAAAACATACTGAAGAACGGCCCAAGGTACAGGTGATCCAGGCTGCCGATCCGCTAGCAACAGCGTATCTGTGCGGAATCCACCGAGAGCTGGTTAGGAGATTAAATGCGGTCCTGCTTCCGAACATTCATACACTGTTTGATATGTCGGCTGAAGACTTTGACGCTATTATAGCCGAGCACTTCCAGCCTGGGGATTGTGTTCTGGAAACTGACATCGCGTCGTTTGATAAAAGTGAGGACGACGCCATGGCTCTGACCGCGTTAATGATTCTGGAAGACTTAGGTGTGGACGCAGAGCTGTTGACGCTGATTGAGGCGGCTTTCGGCGAAATTTCATCAATACATTTGCCCACTAAAACTAAATTTAAATTCGGAGCCATGATGAAATCTGGAATGTTCCTCACACTGTTTGTGAACACAGTCATTAACATTGTAATCGCAAGCAGAGTGTTGAGAGAACGGCTAACCGGATCACCATGTGCAGCATTCATTGGAGATGACAATATCGTGAAAGGAGTCAAATCGGACAAATTAATGGCAGACAGGTGCGCCACCTGGTTGAATATGGAAGTCAAGATTATAGATGCTGTGGTGGGCGAGAAAGCGCCTTATTTCTGTGGAGGGTTTATTTTGTGTGACTCCGTGACCGGCACAGCGTGCCGTGTGGCAGACCCCCTAAAAAGGCTGTTTAAGCTTGGCAAACCTCTGGCAGCAGACGATGAACATGATGATGACAGGAGAAGGGCATTGCATGAAGAGTCAACACGCTGGAACCGAGTGGGTATTCTTTCAGAGCTGTGCAAGGCAGTAGAATCAAGGTATGAAACCGTAGGAACTTCCATCATAGTTATGGCCATGACTACTCTAGCTAGCAGTGTTAAATCATTCAGCTACCTGAGAGGGGCCCCTATAACTCTCTACGGCTAACCTGAATGGACTACGACATAGTCTAGTCCGCCAAGTCTAGCATATGGCCACC [서열번호 94]----------GOI----------CGGAGACGGCGCAGAAGAAGAGGATCTGGCGAAGGCAGAGGCAGCCTGCTTACATGTGGCGACGTGGAAGAGAACCCCGGACCTATGCACCAGAAACGGACCGCCATGTTCCAGGATCCTCAAGAGAGGCCCAGAAAGCTGCCTCAGCTGTGTACCGAGCTGCAGACCACCATCCACGACATCATCCTGGAATGCGTGTACTGCAAGCAGCAGCTCCTGCGGAGAGAGGTGTACGATTTCGCCTTCCGGGACCTGTGCATCGTGTACAGAGATGGCAACCCCTACGCCGTGTGCGACAAGTGCCTGAAGTTCTACAGCAAGATCAGCGAGTACCGGCACTACTGCTACAGCCTGTACGGCACCACACTGGAACAGCAGTACAACAAGCCCCTGTGCGACCTGCTGATCCGGTGCATCAACTGCCAGAAACCTCTGTGCCCCGAGGAAAAGCAGCGGCACCTGGACAAGAAGCAGCGGTTCCACAACATCAGAGGCCGGTGGACCGGCAGATGCATGAGCTGTTGTCGGAGCAGCAGAACCAGACGGGAAACCCAGCTGTGAGCGGCCGCGAATTGGCAAGCTGCTTACATAGAACTCGCGGCGATTGGCATGCCGCCTTAAAATTTTTATTTTATTTTTCTTTTCTTTTCCGAATCGGATTTTGTTTTTAATATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCGTCGAGGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATATTGAAAAAGGAAGAGTATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCCCTTATTCCCTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTGCTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACTGGATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTGTTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTCAGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGCAGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCTAACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCATACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAACTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCGCTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGGTCTCGCGGTATCATTGCAGCACTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGATGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAACTGTCAGACCAAGTTTACTCATATATACTTTAGATTGATTTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTCCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCATTGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGAGCTC [서열번호 459]
따라서, 바람직하게는 상기 벡터는 실질적으로 서열번호 94, GOI, 및 서열번호 459를 포함하거나 이로 이루어지는 상기 나타낸 것과 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 포함한다.
본 발명의 saRNA 구조체는 주형으로서 DNA 플라스미드를 이용해 만들어질 수 있다. 이후, RNA 사본(copy)은 폴리머라아제, 예컨대 T7 폴리머라아제를 이용한 시험관내 전사에 의해 만들어질 수 있고, 상기 T7 프로모터는 saRNA의 상류일 수 있다. 그러므로, 본 발명의 saRNA 구조체는 주형으로서 실질적으로 서열번호 94, GOI, 및 서열번호 459를 포함하거나 이로 이루어지는 상기 나타낸 것과 같은 핵산 서열, 또는 그의 변이체 또는 단편을 갖는 DNA 플라스미드를 이용해 만들어질 수 있다. 물론, 다른 RNA 폴리머라아제, 예를 들면 SP6 또는 T3 폴리머라아제가 T7 폴리머라아제 대신에 사용될 수 있음이 인식될 것이며, 이 경우 상기 saRNA 구조체는 대신에 SP6 또는 T3 프로모터를 포함할 수 있다.
제1 측면의 RNA 구조체를 암호화하는 제4 측면의 벡터는 예를 들면 플라스미드, 코스미드(cosmid) 또는 파지(phage)이거나, 및/또는 바이러스 벡터일 수 있다. 이러한 재조합 벡터는 세포를 뉴클레오티드 서열로 형질전환하기 위한 본 발명의 운반 시스템에서 매우 유용하다. 상기 뉴클레오티드 서열은 바람직하게는 DNA 서열일 수 있고, 상기 DNA 서열이 제1 측면의 RNA 구조체를 형성하는 RNA 서열을 암호화한다.
제1 측면의 RNA 구조체를 암호화하는 재조합 벡터는 또한 다른 기능적 요소를 포함할 수 있다. 예를 들면, 재조합 벡터는 숙주 세포에서 벡터의 도입시 전이유전자 발현을 시작하기 위한 적합한 프로모터를 포함하는 다양한 다른 기능적 요소를 추가로 포함할 수 있다. 예를 들어, 상기 벡터는 바람직하게는 숙주 세포, 예컨대 박테리아 세포의 핵에서 자발적으로 복제할 수 있다. 이 경우, DNA 복제를 유도 또는 조절하는 요소가 상기 재조합 벡터에 필요할 수 있다. 대안적으로, 상기 재조합 벡터는 숙주 세포의 게놈 내로 통합되도록 디자인될 수 있다. 이 경우, (예컨대 상동성 재조합에 의한) 표적화된 통합에 유리한 DNA 서열이 예측된다. 적합한 프로모터는 예로서 SV40 프로모터, CMV, EF1a, PGK, 바이러스 긴 말단 반복뿐만 아니라 유도가능한 프로모터, 예컨대 테트라사이클린 유도가능한 시스템을 포함할 수 있다. 상기 카세트 또는 벡터는 또한 종결자(terminator), 예컨대 베타 글로빈, SV40 폴리아데닐화 서열 또는 합성 폴리아데닐화 서열을 포함할 수 있다. 상기 재조합 벡터는 또한 필요시 핵산의 발현을 제어하기 위한 프로모터 또는 조절자 또는 인핸서(enhancer)를 포함할 수 있다.
상기 벡터는 또한 형질감염(transfection) 또는 형질전환(transformation)된 세포의 선택을 가능하게 하고, 이종성 DNA가 통합된 벡터를 갖고 있는 세포의 선택을 가능하게 하는 클로닝 공정에서 선택가능한 마커로서 사용될 수 있는 유전자를 코딩하는 DNA를 포함할 수 있다. 예를 들면, 암피실린, 네오마이신, 푸로마이신 또는 클로람페니콜 저항성이 예측된다. 대안적으로, 상기 선택가능한 마커 유전자는 전이유전자(들)를 함유하는 벡터와 동시에 사용될 수 있는 상이한 벡터에 있을 수 있다. 상기 카세트 또는 벡터는 또한 뉴클레오티드 서열의 발현을 조절하거나, 발현된 폴리펩티드를 숙주 세포의 소정 부분으로 표적화하는데 관여되는 DNA를 포함할 수 있다.
정제된 벡터는 적합한 수단, 예컨대 직접 식작용 섭취(endocytotic uptake)에 의해 숙주 세포 내로 직접적으로 삽입될 수 있다. 상기 벡터는 형질감염, 감염, 전기천공, 미세주사, 세포 융합, 원형질체 융합 또는 탄도적 충격(ballistic bombardment)에 의해 숙주 세포(예컨대, 진핵생물 또는 원핵생물 세포) 내로 직접 도입될 수 있다. 대안적으로, 본 발명의 벡터는 입자 총을 이용해 숙주 세포 내로 직접 도입될 수 있다.
상기 핵산 분자는 (필수적인 것은 아니지만) 숙주 세포의 DNA에 통합되게 되는 것일 수 있다. 미분화된 세포는 인정적으로 형질전환되어 유전적으로 변형된 딸세포의 생산을 유도할 수 있다(이 경우, 예컨대 특정 전사 인자 또는 유전자 활성화제를 이용한 대상체에서의 발현의 조절이 필요할 수 있다). 대안적으로, 상기 운반 시스템은 분화된 세포의 불안정하거나 일시적인 형질전환을 선호하도록 디자인될 수 있다. 이 경우일 때는 발현의 조절이 덜 중요할 수 있는데, 그 이유는 형질전환된 세포가 죽거나 단백질의 발현을 중단할 때 상기 DNA 분자의 발현이 중단될 것이기 때문이다.
대안적으로, 상기 운반 시스템은 벡터에 통합되지 않고 숙주 세포에 핵산 분자를 제공할 수 있다. 예를 들어, 상기 핵산 분자는 리포좀 또는 바이러스 입자 내에 통합될 수 있다. 대안적으로, "네이키드(naked)" 핵산 분자가 적합한 수단, 예컨대 직접 식작용 섭취에 의해 숙주 세포 내로 삽입될 수 있다.
제5 측면에서, 제1 측면의 RNA 구조체, 제2 측면의 핵산 서열, 제3 측면의 발현 카세트 또는 제4 측면의 벡터, 및 약학적으로 허용가능한 비히클(vehicle)을 포함하는 약학적 조성물이 제공된다.
제6 측면에서, 제5 측면에 따른 약학적 조성물을 제조하기 위한 공정이 제공되며, 상기 방법은 제1 측면의 RNA 구조체, 제2 측면의 핵산 서열, 제3 측면의 발현 카세트 또는 제4 측면의 벡터를 약학적으로 허용가능한 비히클과 접촉시키는 단계를 포함한다.
제7 측면에서, 제1 측면의 RNA 구조체의 제조 방법이 제공되며, 상기 방법은
a) ⅰ) 숙주 세포 내로 제4 측면의 벡터를 도입하는 단계; 및
ⅱ) 제1 측면의 RNA 구조체의 생산을 야기하기 위한 조건 하에 상기 숙주 세포를 배양하는 단계를 포함하거나; 또는
b) 제4 측면에 따른 벡터로부터 RNA 구조체를 전사하는 단계를 포함한다.
단계 a)의 숙주 세포는 진핵생물 또는 원핵생물 숙주 세포일 수 있다. 바람직하게는, 상기 숙주 세포는 진핵생물 숙주 세포이다. 보다 바람직하게는, 상기 숙주 세포는 포유동물 숙주 세포, 예컨대 인간 배아 신장 293 세포 또는 중국 햄스터 난소(CHO) 세포이다. 단계 (b)는 시험관내 또는 생체내에서, 바람직하게는 시험관내에서 수행될 수 있다.
시험관내 전사의 적합한 방법은 본 기술분야에 잘 알려져 있으며, 본 기술분야의 기술자에게 알려져 있을 것이다. 예를 들면, [Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd edition. (1989) editor C Nolan, Cold Spring Harbor Laboratory Press]에 기술되어 있다.
제1 측면의 RNA 레플리콘은 치료법용으로 특히 적합하다.
본 발명자들은 제1 측면의 RNA 구조체가 치료법에서 생체내에서 사용하기 위해 시험관내 전사에 의해 생성될 것으로 예측했지만, 본 기술분야의 숙련자는 상기 RNA 구조체는 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터를 대상체에게 생체내 운반함으로써 치료법을 위해 대상체에서 생체내에서 생성될 수 있음을 인식할 것이다.
그러므로, 제8 측면에 따르면, 약제로서 또는 치료법에서 사용하기 위한 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물이 제공된다.
본 발명의 제9 측면에서, 원생동물, 진균, 박테리아 또는 바이러스 감염의 예방, 개선 또는 치료에 사용하기 위한 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물이 제공된다.
상기 원생동물, 진균, 박테리아 또는 바이러스 감염은 제1 측면에서 정의된 것과 같은 원생동물, 진균, 박테리아 또는 바이러스의 감염일 수 있다.
본 발명의 제10 측면에서, 암의 예방, 개선 또는 치료에 사용하기 위한 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물이 제공된다.
상기 암은 제1 측면에서 정의된 것일 수 있다.
본 발명의 제11 측면에서, 원생동물, 진균, 박테리아 또는 바이러스 감염을 치료하기 위한 방법이 제공되며, 상기 방법은 이를 필요로 하는 대상체에게, 치료적 유효량의 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
치료되어야 하는 원생동물, 진균, 박테리아 또는 바이러스 감염은 제1 측면에서 정의된 것과 같은 원생동물, 진균, 박테리아 또는 바이러스의 감염일 수 있다.
본 발명의 제12 측면에서, 암을 치료하기 위한 방법이 제공되며, 상기 방법은 이를 필요로 하는 대상체에게 치료적 유효량의 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
치료되어야 하는 암은 제1 측면에서 정의된 것일 수 있다.
본 명세서에 기술된 RNA 구조체는 (예컨대, 바이러스, 박테리아 또는 진균 감염에 대해) 대상체 및 암을 백신화하는 효과적인 수단을 제공한다.
따라서, 본 발명의 제13 측면에서, 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물를 포함하는 백신이 제공된다.
운반 제형 내로 통합된 어주번트(adjuvant)는 박테리아 지질펩티드, 지질단백질 및 리포테이코산; 마이코박테리아 지질글리칸; 효모 자이모산, 포린, 지질폴리사카라이드, 지질 A, 모노포스포릴 지질 A(MPL), 플라젤린, CpG DNA, 헤모조인, 토마틴, ISCOM, ISCOMATRIXTM, 스쿠알렌계 에멀전, 폴리머, 예컨대 PEI, 카르보폴, 지질 나노입자 및 박테리아 독소(CT, LT)로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다. 운반 제형 내로 통합된 어주번트의 다른 예는 알루미늄 염, 합성 형태의 DNA, 탄수화물, 정제 결합제, 이온 교환 수지, 보존제, 폴리머, 에멀전 및/또는 지질을 포함할 수 있다. 어주번트의 예는 일나트륨 글루타메이트, 수크로오스, 덱스트로오스, 알루미늄 소, 인간 혈청 알부민, 시토신 포스포구아닌, 인산칼륨, 플라스돈 C, 무수 락토오스, 셀룰로오스, 폴라크릴린 칼륨, 글리세린, 아스파라긴, 시트르산, 인산칼륨 황산마그네슘, 철 암모늄 시트레이트, 2-페녹시에탄올, 알루미늄, 베타-프로피오락톤, 소 추출물, DOPC, EDTA, 포름알데히드, 티메로살, 페놀, 칼륨 알루미늄 설페이트, 글루탐산칼륨, 붕산나트륨, 나트륨 메타비설파이트, 우레아, PLGA, PVA, PLA, PVP, 시클로덱스트린계 안정화제, 수중유(oil in water) 에멀전 어주번트 및/또는 지질계 어주번트를 포함할 수 있다.
본 발명의 제14 측면에서, 대상체에서 면역 반응을 자극하는데 사용하기 위한 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물이 제공된다.
상기 면역 반응은 제1 측면에서 정의된 항원에 다른 원생동물, 박테리아, 바이러스, 진균 또는 암에 대해 자극될 수 있다.
다른 측면에서, 대상체를 백신화하는 방법이 제공되며, 상기 방법은 이를 필요로 하는 대상체에게 치료적 유효량의 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물을 투여하거나, 투여한 단계를 포함한다.
제15 측면에 따르면, 줄기 세포 치료법에서 사용하기 위한 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물이 제공된다.
줄기 세포 치료법은 체세포를 줄기 세포 특징을 갖는 세포로 재프로그래밍하는 것에 관한 것일 수 있다.
체세포는 제1 측면에서 정의된 것과 같은 줄기 세포 특징을 갖는 세포로 체세포를 재프로그래밍 하는 것을 향상시킬 수 있는 하나 이상의 단백질을 운반함으로써 재프로그래밍될 수 있다.
제16 측면에 따르면, 제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물을 세포로 운반하는 단계를 포함하는 생체외 또는 시험관내에서 세포를 변형시키는 방법이 제공된다.
바람직하게는, 상기 방법은 생체외에서 수행된다.
상기 세포는 진핵생물 또는 원핵생물 세포일 수 있다. 바람직하게는, 상기 세포는 진핵생물 세포이다. 보다 바람직하게는, 상기 세포는 포유동물 숙주 세포이다. 가장 바람직하게는, 상기 세포는 인간 세포이다.
바람직하게는, 상기 변형된 세포는 세포-치료법 적응증을 위해 적합하다.
제17 측면에서, 제16 측면의 방법으로부터 수득되거나 이것에 의해 수득가능한 변형된 세포가 제공된다.
제18 측면에서, 치료법, 선택적으로 세포 치료법에서 사용하기 위한 제17 측면의 변형된 세포가 제공된다.
제1 측면에 따른 RNA 구조체, 제2 측면에 따른 핵산, 제3 측면에 따른 발현 카세트, 제4 측면에 따른 벡터 또는 제5 측면에 따른 약학적 조성물(본 명세서에서 활성제로 알려짐)이 질환을 치료, 개선, 또는 예방하거나 백신화하기 위한 단일치료법(즉, 상기 활성제의 사용)으로서 사용될 수 있는 약제에서 사용될 수 있음이 인식될 것이다. 대안적으로, 본 발명에 따른 활성제는 질환의 치료, 개선, 또는 예방을 위해 알려진 치료법에 부가하여, 또는 이와 조합하여 사용될 수 있다.
본 발명의 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 특히 조성물이 사용되어야 하는 방식에 따라 다수의 상이한 형태를 갖는 조성물에 조합될 수 있다. 따라서, 예를 들면, 상기 조성물은 분말, 정제, 캡슐, 액체, 연고, 크림, 겔, 히드로겔, 에어로졸, 스프레이, 미셀 용액, 경피 패치, 리포좀 현탁액, 폴리플렉스, 에멀전, (표면에 RNA를 갖거나 캡슐화된) 지질 나노입자의 형태 또는 치료 또는 백신화를 필요로 하는 인간 또는 동물에게 투여될 수 있는 임의의 다른 적합한 형태일 수 있다. 본 발명에 따른 약제의 비히클은 이것이 제공되는 대상체에 의해 잘-용인되는 것이어야 함이 인식될 것이다.
본 발명의 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 또한 느린-또는 지연된-방출 장치 내에 통합될 수 있다. 이러한 장치는, 예를 들면, 피부 위 또는 아래에 삽입될 수 있고, 상기 약제는 수 주 또는 심지어 수 개월에 걸쳐 방출될 수 있다. 상기 장치는 치료 부위와 적어도 인접하게 위치될 수 있다. 이러한 장치는 상기 RNA 구조체 또는 재조합 벡터를 이용한 장기간의 치료가 필요하고 정상적으로 빈번한 투여(예컨대, 적어도 매일 주사)가 필요할 때 특히 유리할 수 있다.
그러나, 바람직한 구현예에서, 본 발명에 따른 약제는 혈류, 근육, 피부 내로, 또는 치료를 필요로 하는 부위 내로 직접 주사함으로써 대상체에게 투여될 수 있다. 가장 바람직하게는, 상기 RNA 구조체를 포함하는 약제는 근육 내로 주사된다. 주사는 정맥내(볼루스 또는 수액) 또는 피하(볼루스 또는 수액), 또는 진피내(볼루스 또는 수액), 또는 근육내(볼루스 또는 수액)일 수 있다.
필요한 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물의 양은 그 생물학적 활성 및 생체이용성에 의해 결정되고, 차례로 상기 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물의 투여 방식, 물리화학적 특성 및 단일치료법 또는 조합 치료법으로 사용되는지 여부에 의존할 것임이 인식될 것이다. 투여의 빈도는 또한 치료되는 대상체 내에서 상기 활성제의 반감기에 의해 영향을 받을 것이다. 투여되어야 하는 최적의 복용량은 본 기술분야의 기술자에 의해 결정될 수 있고, 사용되는 특정 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물, 약학적 조성물의 강도, 투여 방식, 및 바이러스 감염의 타입 및 진행에 따라 변할 것이다. 대상체의 연령, 중량, 성별, 식이, 및 투여 시간을 포함하는 치료되는 특정 대상체에 의존하는 부가적인 인자는 복용량을 조정할 필요성을 야기할 것이다.
일반적으로, 0.001 ㎍/㎏의 체중 내지 10 ㎎/㎏의 체중, 또는 0.01 ㎍/㎏의 체중 내지 1 ㎎/㎏의 체중의 본 발명의 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물의 일일 용량이 사용되는 활성제에 따라 질환을 치료, 개선, 또는 예방하기 위해 사용될 수 있다.
일일 용량은 단일 투여(예컨대 단일 일일 주사 또는 코 스프레이의 흡입)로서 제공될 수 있다. 대안적으로, 상기 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 하루 동안에 2회 이상의 투여가 필요할 수 있다. 예로서, 상기 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 0.07 ㎍ 내지 700 ㎎(즉, 70 ㎏의 체중으로 추정함)의 2회(또는 치료되는 질환의 증세에 따라 그 이상)의 일일 용량으로 투여될 수 있다. 치료를 받는 환자는 기상시 제1 용량을, 이후 저녁(2회 용량 요법이라면)에 또는 이후에 3 또는 4시간 간격으로 제2 용량을 취할 수 있다. 대안적으로, 느린 방출 장치는 본 발명에 따른 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물을 반복된 용량을 투여할 필요 없이 환자에게 최적의 용량을 제공하기 위해 사용될 수 있다.
그러나, 바람직하게는 본 발명에 따른 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 매주 용량, 보다 바람직하게는 격주 용량으로 제공될 수 있다.
제약 산업에 의해 종래 도입되는 것들과 같은 공지된 절차(예컨대 생체내 실험, 임상 시험, 등)는 본 발명에 따른 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트 또는 벡터의 구체적인 제형 및 정확한 치료 요법(예컨대, 제제의 일일 용량 및 투여 빈도)을 형성하기 위해 사용될 수 있다.
"대상체"는 척추동물, 포유동물, 또는 가축일 수 있다. 따라서, 본 발명에 따른 조성물 및 약제는 임의의 포유동물, 예를 들면 가축(예컨대, 말), 애완동물을 치료하기 dnlgo 사용될 수 있거나, 다른 수의과 적용분야에 사용될 수 있다. 그러나, 가장 바람직하게는, 상기 대상체는 인간이다.
상기 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물의 "치료적 유효량"은 대상체에게 투여될 때 임의의 해당 질환을 개선, 예방 또는 치료하기 위해 필요한 전술한 양인 임의의 양이다.
예를 들면, 본 발명의 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 약 0.0001 ㎎ 내지 약 800 ㎎, 바람직하게는 약 0.001 ㎎ 내지 약 500 ㎎으로 사용될 수 있다. 상기 레플리콘, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물의 양은 약 0.01 ㎎ 내지 약 250 ㎎, 가장 바람직하게는 약 0.01 ㎎ 내지 약 1 ㎎의 양인 것이 바람직하다. 바람직하게는, 본 발명에 따른 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 1-200 ㎍의 용량으로 투여된다.
본 명세서에서 나타낼 때, "약학적으로 허용가능한 비히클"은 약학적 조성물을 제형화하는데 유용하다고 본 기술분야의 기술자에게 알려진 임의의 공지된 화합물 또는 공지된 화합물들의 조합이다.
한 구현예에서, 상기 약학적으로 허용가능한 비히클은 고체일 수 있고, 상기 조성물은 분말 또는 정제의 형태일 수 있다. 고체인 약학적으로 허용가능한 비히클은 향미제, 윤활제, 가용화제, 현탁화제, 염료, 충진제, 활택제, 압착 보조제, 불활성 결합제, 감미제, 보존제, 염료, 코팅물, 또는 정제-붕괴제로서도 작용할 수 있는 하나 이상의 물질을 포함할 수 있다. 상기 비히클은 또한 캡슐화 물질일 수 있다. 분말에서, 상기 비히클은 본 발명에 따른 세분된 활성제와 혼합되는 세분된 고체이다. 정제에서, 상기 활성제(예컨대, 본 발명에 따른 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물)는 필요한 압착 특성을 갖는 비히클과 적합한 비율로 혼합되고 원하는 형태 및 크기로 압착될 수 있다. 상기 분말 및 정제는 바람직하게는 상기 활성제를 최대 99%까지 함유한다. 적합한 고체 비히클은, 예를 들면 인산칼슘, 스테아르산마그네슘, 탈크, 당, 락토오스, 덱스트린, 전분, 젤라틴, 셀룰로오스, 폴리비닐피롤리돈, 저융점 왁스 및 이온 교환 수지를 포함한다. 다른 구현예에서, 상기 약학적 비히클은 겔일 수 있고, 상기 조성물은 크림 등의 형태일 수 있다.
그러나, 상기 약학적 비히클은 액체일 수 있고, 상기 약학적 조성물은 용액의 형태이다. 액체 비히클은 용액, 현탁액, 에멀전, 시럽, 엘릭시르 및 가압 조성물의 제조에 사용된다. 본 발명에 따른 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 약학적으로 허용가능한 액체 비히클, 예컨대 물, 유기 용매, 이들의 혼합물 또는 약학적으로 허용가능한 오일 또는 지방에 용해 또는 현탁될 수 있다. 상기 액체 비히클은 다른 적합한 약학적 첨가제, 예컨대 가용화제, 에멀전화제, 버퍼, 보존제, 감미제, 향미제, 현탁화제, 증점제, 착색제, 점도 조절제, 안정화제 또는 삼투-조절제를 함유할 수 있다. 경구 및 비경구 투여를 위한 액체 비히클의 적합한 예는 (상기와 같은 첨가제, 예컨대 셀룰로오스 유도체, 바람직하게는 나트륨 카르복시메틸 셀룰로오스 용액을 부분적으로 함유하는) 물, (1가 알코올 및 다가 알코올, 예컨대 글리콜을 포함하는) 알코올 및 그의 유도체, 및 오일(예컨대 분획화된 코코넛 오일 및 아라키스 오일)을 포함한다. 비경구 투여의 경우, 상기 비히클은 또한 오일성 에스테르, 예컨대 에틸 올레에이트 및 이소프로필 미리스테이트일 수 있다. 멸균 액체 비히클은 비경구 투여용 멸균 액체 형태 조성물에서 유용하다. 가압 조성물을 위한 액체 비히클은 할로겐화 탄화수소 또는 다른 약학적으로 허용가능한 추진제(propellant)일 수 있다.
멸균 용액 또는 현탁액인 액체 약학적 조성물은, 예를 들면, 피하, 진피내, 척추강내, 경막외, 복강내, 정맥내, 특히 근육내 주사에 의해 이용될 수 있다. 본 발명의 핵산 서열, 또는 발현 카세트는 멸균수, 식염수, 또는 다른 적절한 멸균 주사가능한 매체를 이용하여 투여 시점에 용해 또는 현탁될 수 있는 멸균 고체 조성물로서 제조될 수 있다.
본 발명의 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 다른 용질 또는 현탁화제(예를 들면, 용액이 등장이 되게 하기에 충분한 식염수 또는 글루코오스), 담즙 염, 아카시아, 젤라틴, 소르비탄 모노올레이이트, 폴리소르베이트 80(소르비톨의 올레에이트 에스테르 및 에틸렌 옥사이드로 공중합된 그의 무수물) 등을 함유하는 멸균 용액 또는 현탁액의 형태로 경구 투여될 수 있다. 본 발명에 따른 RNA 구조체, 핵산 서열, 발현 카세트, 벡터 또는 약학적 조성물은 또한 액체 또는 고체 조성물 형태로 경구 투여될 수 있다. 경구 투여용으로 적합한 조성물은 알약, 캡슐, 과립, 정제, 및 분말과 같은 고체 형태, 및 용액, 시럽, 엘릭시르, 및 현탁액과 같은 액체 형태를 포함한다. 비경구 투여를 위해 유용한 형태는 멸균 용액, 에멀전, 및 현탁액을 포함한다.
본 발명은 그의 변이체 또는 단편을 포함하여 실질적으로 본 명세서에 나타낸 임의의 서열의 아미노산 또는 핵산 서열을 포함하는 임의의 핵산 또는 펩티드 또는 그의 변이체, 유도체 또는 유사체로 확장됨이 인식될 것이다. 용어 "실질적으로 아미노산/뉴클레오티드/펩티드 서열", "변이체" 및 "단편"은 본 명세서에 나타낸 어느 한 서열의 아미노산/뉴클레오티드/펩티드 서열과 적어도 40% 서열 동일성(identity), 예를 들면 본명세서에서 확인된 임의의 서열과 40% 동일성을 갖는 서열일 수 있다.
나타낸 임의의 서열과 65% 이상, 보다 바람직하게는 70% 이상, 보다 더 바람직하게는 75% 이상의 서열 동일성, 보다 더 바람직하게는 80% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열이 또한 예측된다. 바람직하게는, 상기 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열은 나타낸 임의의 서열과 적어도 85% 동일성, 보다 바람직하게는 적어도 90% 동일성, 보다 더 바람직하게는 적어도 92% 동일성, 보다 더 바람직하게는 적어도 95% 동일성, 보다 더 바람직하게는 적어도 97% 동일성, 보다 더 바람직하게는 적어도 98% 동일성, 가장 바람직하게는 본 명세서에 나타낸 임의의 서열과 적어도 99% 동일성을 갖는다.
숙련된 기술자는 2개의 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열 사이에 동일성 백분율을 계산하는 방법을 인식할 것이다. 2개의 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열 사이의 동일성 백분율을 계산하기 위하여, 상기 2개의 서열의 정렬이 먼저 준비되어야 하고, 이어서 서열 동일성 값을 계산한다. 2개의 서열에 대한 동일성 백분율은 다음에 따라 상이한 값을 취할 수 있다: (ⅰ) 서열을 정렬하기 위해 사용된 방법, 예를 들면, ClustalW, BLAST, FASTA, 스미스-워터맨(상이한 프로그램에서 실행됨), 또는 3D 비교로부터의 구조적 정렬; 및 (ⅱ) 정렬 방법에 의해 사용된 파라미터, 예를 들면, 국소 대 전체 정렬, 사용된 쌍별-점수 매트릭스(예컨대 BLOSUM62, PAM250, Gonnet 등), 및 갭-페널티, 예컨대 기능적 형태 및 상수.
정렬을 만든 후, 2개의 서열 사이에 동일성 백분율을 계산하는 많은 다양한 방식이 있다. 예를 들면, 동일성의 수를 다음에 의해 나눌 수 있다: (ⅰ) 가장 짧은 서열의 길이; (ⅱ) 정렬의 길이; (ⅲ) 서열의 평균 길이; (ⅳ) 비-갭 위치의 수; 또는 (ⅴ) 돌출부(overhang)를 배제한 등가물 위치의 수. 아울러, 동일성 백분율은 또한 매우 길이 의존성임이 인식될 것이다. 따라서, 서열의 쌍이 짧을수록 더 높은 서열 동일성이 우연히 일어날 것으로 예상할 수 있다.
그러므로, 단백질 또는 DNA 서열의 정확한 정렬은 복잡한 공정임이 인식될 것이다. 대중적인 다중 정렬 프로그램 ClustalW(Thompson et al., 1994, Nucleic Acids Research, 22, 4673-4680; Thompson et al., 1997, Nucleic Acids Research, 24, 4876-4882)는 본 발명에 따른 단백질 또는 DNA의 다중 정렬을 생성하기 위한 바람직한 방법이다. ClustalW에 대한 적합한 파라미터는 다음과 같을 수 있다: DNA 정렬의 경우: 갭 개방 페널티 = 15.0, 갭 연장 패널티 = 6.66, 및 매트릭스 = 동일성. 단백질 정렬의 경우: 갭 개방 페널티 = 10.0, 갭 연장 페널티 = 0.2, 및 매트릭스 = Gonnet. DNA 및 단백질 정렬의 경우: ENDGAP = -1, 및 GAPDIST = 4. 본 기술분야의 기술자는 최적의 서열 정렬을 위해서는 상기 및 다른 파라미터들을 변화시킬 필요가 있을 수 있음을 인식할 것이다.
바람직하게는, 2개의 아미노산/폴리뉴클레오티드/폴리펩티드 서열 사이의 동일성 백분율의 계산은 이후 이러한 정렬로부터 (N/T)×100으로서 계산될 수 있으며, 여기서 N은 서열이 동일한 잔기를 공유하는 위치의 수이고, T는 갭을 포함하고 돌출부를 포함하거나 배제한 비교된 위치의 총 수이다. 바람직하게는, 돌출부는 상기 계산에 포함된다. 따라서, 2개의 서열 사이의 동일성 백분율을 계산하기 위한 가장 바람직한 방법은 (ⅰ) 예를 들면, 상기에 나타낸 것과 같은 적합한 세트의 파라미터를 이용하여 ClustalW 프로그램을 이용하여 서열 정렬을 준비하는 단계; 및 (ⅱ) N 및 T의 값을 다음의 식: 서열 동일성 = (N/T)×100 내로 삽입하는 단계를 포함한다.
유사한 서열을 확인하기 위한 대안적인 방법은 본 기술분야의 기술자에게 알려질 것이다. 예를 들면, 실질적으로 유사한 뉴클레오티드 서열은 엄격한 조건 하에서 DNA 서열 또는 그의 상보체(complement)와 교잡하는 서열에 의해 암호화될 것이다. 엄격한 조건이란 것은, 본 발명자들은 뉴클레오티드가 대략 45℃에서 3× 염화나트륨/시트르산나트륨(SSC)과, 이어서 대략 20-65℃에서 0.2× SSC/0.1% SDS에서 적어도 1회의 세척 후 필터-결합된 DNA 또는 RNA에 혼성화하는 것을 의미한다. 대안적으로, 실질적으로 유사한 폴리펩티드는 본 명세서에 기술된 임의의 서열과 적어도 1개이지만, 5, 10, 20, 50 또는 100개 미만의 아미노산이 상이할 수 있다.
유전자 코드의 축퇴(degeneracy)로 인하여, 본 명세서에 기술된 임의의 핵산 서열은 이것에 의해 암호화된 단백질의 서열에 실질적으로 영향을 미치지 않으면서 다양해지거나 변화되어 그의 기능적 변이체를 제공할 수 있음이 명확하다. 적합한 뉴클레오티드 변이체는 서열 내에서 동일한 아미노산을 암호화하여 침묵적(동의적) 변화를 생산하는 상이한 코돈의 치환에 의해 변경된 서열을 갖는 것들이다. 다른 적합한 변이체는 상동성 뉴클레오티드 서열을 갖지만 치환되는 아미노산과 유사한 생물물리학적 특성의 측쇄를 갖는 아미노산을 암호화하는 상이한 코돈의 치환에 의해 변경되어 보존된 변화를 생산하는 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 것들이다. 예를 들면, 작은 비극성의 소수성 아미노산은 글리신, 알라닌, 루이신, 이소루이신, 발린, 프롤린, 및 메티오닝을 포함한다. 큰 비극성의 소수성 아미노산은 페닐알라닌, 트립토판 및 티로신을 포함한다. 극성의 중성 아미노산은 세린, 트레오닌, 시스테인, 아스파라긴 및 글루타민을 포함한다. 양을 대전된(염기성) 아미노산은 리신, 아르기닌 및 히스티딘을 포함한다. 음으로 대전된(산성) 아미노산은 아스파르트산 및 글루탐산을 포함한다. 따라서, 어느 아미노산이 유사한 생물물리학적 특성을 갖는 아미노산으로 교체될 수 있음이 인식될 것이고, 숙련된 기술자는 상기 아미노산을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 알 것이다.
(임의의 부속 청구항, 요약 및 도면을 포함하는) 본 명세서에 기술된 모든 특성들 및/또는 여기에 개시된 임의의 방법 또는 공정의 모든 단계들은, 이러한 특성 및/또는 단계의 적어도 일부가 상호 배타적인 조합을 제외하고는, 임의의 조합으로 임의의 상기 측면들과 조합될 수 있다.
본 발명을 보다 잘 이해하고, 본 발명의 구현예가 효과를 내기 위해 수행될 수 있는 방식을 보이기 위하여, 이제 실시예로서 부속하는 도면에 대한 참조가 행해질 것이다:
도 1은 본 발명의 RNA 구조체의 다양한 구현예(1-7로 나타냄)의 개략도를 보여준다(예컨대, 왼쪽의 saRNA 레플리콘, 또는 mRNA 구조체). 상기 saRNA 레플리콘(1-4)은 알파 바이러스 백본에 기반하고 있다. 상기 소위 '스틸티콘' 벡터는 5' UTR과, 이어지는 알파바이러스, 예컨대 VEEV로부터의 비-구조 단백질(NSP1-4)을 암호화하는 핵산, 서브게놈성 프로모터(SGP), GOI(관심있는 유전자), 예컨대 바이러스, 박테리아, 진균 또는 포유동물 단백질 또는 항원, 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP), 3' UTR 및 폴리A 꼬리를 포함한다. 상기 mRNA 구조체(5-7)는 5' UTR, GOI(관심있는 유전자), 예컨대 바이러스, 박테리아, 진균 또는 포유동물 단백질 또는 항원, 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP), 3' UTR 및 3' 폴리A 꼬리를 포함한다. 상기 IIP 및 GOI의 순서는 상이한 실증적 구현예에 나타낸 것과 같이 saRNA 및 mRNA 모두에 대해 다양할 수 있다;
도 2는 메신저 RNA(mRNA) 백신으로 백신화된 대상체(최초 프라이머(primer) 예방접종(jab)과, 이어지는 후속 부스트(boost) 예방접종)에서의 면역 반응을 실증한다;
도 3은 표준 자가-증폭형 (saRNA) 백신으로 백신화된 대상체(최초 프라이머 예방접종과, 이어지는 부스트 예방접종)에서의 면역 반응을 실증한다;
도 4는 본 발명의 RNA 구조체의 한 구현예, 예를 들면 도 1에 나타낸 스틸티콘 벡터로 백신화된 대상체(최초 프라이머 예방접종과, 이어지는 부스트 예방접종)에서의 면역 반응을 실증한다;
도 5는 본 발명의 RNA 구조체의 한 구현예, 즉 도 1에 나타낸 스틸티콘 벡터로 백신화된 대상체(최초 프라이머 예방접종과, 이어지는 부스트 예방접종)에서의 항원 발현 레벨을 실증한다;
도 6은 F-T2A 형상(configuration)에서 선택된 IIP를 함유하는 VEEV 레플리콘으로 형질감염된 이후 HeLa 세포에서의 f-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. HEK293T/17 및 HeLa 세포는 리포터 단백질로서 루시퍼라아제를 함유하는 saRNA(100 ng)로 형질감염되었고, 24시간 후 단백질 발현에 대해 평가하였다;
도 7은 F-T2A 형상에서 선택된 IIP를 함유하는 VEEV 레플리콘으로 형질감염된 이후 HeLa 세포에서의 f-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. HEK293T/17 및 HeLa 세포는 리포터 단백질로서 루시퍼라아제를 함유하는 saRNA(100 ng)로 형질감염되었고, 24시간 후 단백질 발현에 대해 평가하였다;
도 8은 F-T2A 형상에서 IIP를 함유하는 선택된 VEEV 레플리콘으로 형질감염된 이후 HeLa 세포에서의 f-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. HEK293T/17 및 HeLa 세포는 리포터 단백질로서 루시퍼라아제를 함유하는 saRNA(100 ng)로 형질감염되었고, 24시간 후 단백질 발현에 대해 평가하였다;
도 9는 이중 서브게놈성 프로모터(DSGP) 형상에서 IIP를 함유하는 VEEV 레플리콘으로 형질감염된 이후 HeLa 세포에서의 f-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. HEK293T/17 및 HeLa 세포는 리포터 단백질로서 루시퍼라아제를 함유하는 saRNA(100 ng)로 형질감염되었고, 24시간 후 단백질 발현에 대해 평가하였다;
도 10은 F-T2A 형상에서 IIP가 없는 saRNA와 비교하여 IIP HSV ICP34.5를 함유하는 saRNA로 형질감염된 이후 HeLa 세포에서 VEGF-A 발현에서의 증가를 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. HEK293T/17 및 HeLa 세포는 분비된 리포터 단백질로서 VEGF-A를 함유하는 saRNA(100 ng)로 형질감염되었고, 48시간 후 ELISA에 의해 배양 배지에서 단백질 발현에 대해 평가하였다;
도 11은 도 1에 나타낸 F-T2A 형상(구조체 2a 및 2b), IRES 형상(구조체 3b) 및 DSGP 형상(구조체 4a 및 4b)에서 GOI(구조체 1)로서 f-Luc를 함유하는 saRNA 및 IIP MERS ORF4a로 형질감염된 이후 HeLa 세포에서의 f-Luc 발현을 비교한다. HeLa 세포는 리포터 단백질로서 루시퍼라아제를 함유하는 RNA(100 ng)로 형질감염되었고, 24시간 후 단백질 발현에 대해 평가하였다; 및
도 12는 F-T2A 형상에서 IIP를 함유하는 mRNA로 형질감염된 이후 HeLa 세포에서의 n-Luc 발현 및 f-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. HEK293T/17 및 HeLa 세포는 리포터 단백질로서 루시퍼라아제를 함유하는 RNA(100 ng)로 형질감염되었고, 24시간 후 단백질 발현에 대해 평가하였다.
실시예
본 발명자들은 saRNA 또는 mRNA의 선천적 인식을 억제하는 것으로 알려져 있는 비-바이러스 공급원, 예컨대 인간 및 다른 포유동물 유래의 시스 암호화 단백질이 숙주 세포에서 선천적 감지를 약화시키고 RNA 백신의 단백질 발현 및 면역원성 모두를 향상시킬 것임을 가정하였다. 따라서, 본 발명자들은 바이러스 선천적 면역 억제제 단백질(IIP) 및 관심있는 유전자(GOI)를 함유하는 다양한 RNA 구조체(saRNA 및 mRNA)를 디자인 및 테스트한 후, 상기 구조체가 (관심있는 유전자에 의해 암호화된) 세포내 및 분비된 단백질 발현 모두를 향상시키는지 여부를 특징분석하였다.
재료 및 방법
IIP를 함유하는 saRNA 레플리콘 플라스미드의 클로닝
반딧불이 루시퍼라아제(fLuc) 및 베네주엘라 말 뇌염 바이러스(VEEV)로부터 유래되는 레플리카아제를 암호화하는 saRNA를 종래 기술된 것과 같이 플라스미드 벡터 내로 클로닝하였다(1). IIP(반딧불이 루시퍼라아제 f-Luc; Uniprot: Q27758)에 이어서 리포터 유전자를 함유하는 레플리콘 플라스미드를 푸린-T2A 또는 이중 서브게놈성 프로모터를 이용해 생성하였다. 이중 서브게놈성(DSG) 구조체는 상기 fLuc 및 IIP를 암호화하는 별도의 RNA 분자의 전사를 시작하도록 디자인하였고, Gibson 조립체 및 뉴클레오티드 염기 중첩부를 이용해 기본 이중 서브게놈성 벡터 내로 클로닝함으로써 생산하였다. 간략하게, 플라스미드 DNA를 37℃에서 2시간 동안 제한 소화시켰고, 제조사의 프로토콜(New England BioLabs, UK)에 따라 GeneArt(Regensburg, Germany) 또는 Integrated DNA Technologies(IDT)(Iowa, USA)에 의해 합성된 유전자 단편 스트링(string)을 이용한 NEB Builder HiFi DNA 조립 반응물에 사용하였다. fLuc 번역을 위하여 종결 코돈 없이 VEEV 일차적(primary) 서브게놈성 프로모터로부터 단일 RNA 전사체를 생성하기 위해 디자인된 푸린-T2A(F-T2A) 구조체는 F-T2A 서열을 갖는 IIP를 대응하는 DSG 플라스미드 벡터의 제한 효소 부위 내로 클로닝함으로써 생산하였다. 50℃에서 30분 동안 인큐베이션한 후, 2 ㎕의 NEB Builder HiFi 조립 반응물을 사용하여 NEB 10-알파 박테리아를 형질전환시켰고, 상기 형질전환체를 LB 아가 플레이트에 플레이팅한 후, 밤새 인큐베이션하였다. 콜로니(colony)를 선택하였고, 밤새 확장시켰고, 퀴아젠 플라스미드 미니프렙 키트(Qiagen, UK)를 이용해 재조합 플라스미드를 정제하였다. 정제된 클론성 플라스미드를 진단적 제한 효소 소화를 이용해 분석하였고, 올바른 소화 패턴을 나타내는 것을 완전히 시퀀싱하여 뉴클레오티드 동일성을 확인하였다(Eurofins, Germany).
IIP에 이어서 F-T2A 또는 DSG 형태로 리포터 유전자를 가질 뿐만 아니라, ECMV IRES 내부 리보솜 도입 서열(메신저 RNA 전사체 내부 부위의 IRES 요소로부터 단백질 번역을 시작함; Bochkov and Palmenburg, Biotechniques 41(3):283-4, 2006)을 이용하는 구조체를 갖는 플라스미드를 표준 분자 기술을 이용하여 벡터빌더(VectorBuilder, Germany)에 의해 생성하였다.
통합된 인터페론 억제 단백질(IIP)은 다음의 데이터베이스 식별자/접근 번호를 이용해 발견될 수 있다:
EBOV VP35(에볼라 바이러스 VP35; NP_066244.1; 접근 번호 - NCBI 참조 서열: NC_002549.1; UniProtKB - Q05127(VP35_EBOZM); EV71- 2Apro(엔테로바이러스 71 2A pro; 접근 번호 - 진뱅크 KC875402.1 및 AGO28195.1; UniProtKB - Q66478(POLG_HE71B); HCV E2(C형 간염 바이러스 E2; 폴리단백질 AAA45534.1로부터의 NS1 단백질; 접근 번호 - 게놈 RNA 번역 AAA45534.1; UniProtKB - P27958(384-746)(POLG_HCV77)); HCV NS5a(C형 간염 바이러스 NS5a; 단리물 H - 게놈 RNA 번역: AAA45534.1; UniProtKB - P27958(POLG_HCV77)); HPV E6(인간 파필로마바이러스 E6; NP_041325.1; 접근 번호 - NCBI 참조 서열: NC_001526.4; UniProtKB - P03126(VE6_HPV16)); HSV ICP34.5(헤르페스 심플렉스 바이러스 ICP34.5; YP_009137073.1; 접근 번호 - NCBI 참조 서열: NC_001806.2; UniProtKB - P36313(ICP34_HHV11)); KSHV ORF52(카포시 육종-연관 헤르페스바이러스 ORF52; 접근 번호 - 게놈 DNA 번역: ACY00451.1; UniProtKB - F5HBL8(F5HBL8_HHV8)); MERS ORF8b(중동 호흡기 증후군 바이러스 ORF8b; 접근 번호 - 게놈 RNA 번역 ANF29170.1; UniProtKB - A0A1W5LGP6(A0A1W5LGP6_MERS)); VACV C6 백시니아 C6(백시니아 바이러스 C6; 접근 번호 - 게놈 DNA 번역: AAA69602.1; UniProtKB - P17362(C6_VACCW)); VACV K3L(백시니아 바이러스 K3L; 접근 번호 - 게놈 DNA 번역: AAA48009.1; UniProtKB - P20639(K3_VACCC)); PIV 5 V(파라인플루엔자 바이러스 5 V; ENA 단백질 ID: AAA47882.1; 진뱅크 접근 번호 J03142.1; UniProtKB - P11207; V_PIV5)); SARS ORF3b*57 변이체(중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(2019-nCoV)(SARS-CoV-2) ORF3b 단백질 - AA 23에서 돌연변이된 종결 코돈; 게놈 RNA 번역 QTT40181.1; UniProtKB - P0DTF1(ORF3B_SARS2)); SARS ORF3b*79 변이체(중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(2019-nCoV)(SARS-CoV-2) ORF3b 단백질 - AA 23 및 AA 57에서 돌연변이된 종결 코돈; 게놈 RNA 번역 QTT40181.1; UniProtKB - P0DTF1(ORF3B_SARS2)); SARS ORF3b*57 에콰도르 변이체(중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(2019-nCoV)(SARS-CoV-2) ORF3b 단백질 - AA 23에서 돌연변이된 종결 코돈; AA 24에서 에콰도르 돌연변이(L24M); 게놈 RNA 번역 QTT40181.1; UniProtKB - P0DTF1(ORF3B_SARS2)); 천산갑 ORF3b *57(천산갑 코로나바이러스 - 게놈 RNA 번역: QIG55946.1; ORF3b 단백질 - AA 23에서 돌연변이된 종결 코돈; UniProtKB - A0A6M3G7Q4(A0A6M3G7Q4_9BETC)); 천산갑 ORF3b *79(천산갑 코로나바이러스 - 게놈 RNA 번역: QIG55946.1; ORF3b 단백질 - AA 23 및 AA 57에서 돌연변이된 종결 코돈; UniProtKB - A0A6M3G7Q4(A0A6M3G7Q4_9BETC)); MERS ORF4a(중동 호흡기 증후군-연관 코로나바이러스(MERS-CoV) NS4A 단백질 - 게놈 RNA 번역: AGV08457.1; UniProtKB: T2BBG6(T2BBG6_MERS)); BVDV nPro(소 바이러스성 설사 바이러스(BVDV)(점막 질환 바이러스) N-말단 프로테아제(aa 1-168) - 게놈 RNA 번역: AAA42854.1; UniProtKB: P19711(POLG_BVDVN)); HSV US1(인간 헤르페스바이러스 2(HG52 바이러스주)(HHV-2)(인간 헤르페스 심플렉스 바이러스 2) E3 유비퀴틴 리가아제(ubiquitin ligase) ICP22 US1 - 게놈 DNA 번역: CAB06708.1; UniProtKB: P89474(ICP22_HHV2H)); MERS CoV M(중동 호흡기 증후군-연관 코로나바이러스(MERS-CoV) 막 단백질(M) - 게놈 RNA 번역: AGV08396.1; UniProtKB: T2BB40(T2BB40_MERS)).
(1) A. K. Blakney, P. F. McKay, R. J. Shattock, Structural Components for Amplification of Positive and Negative Strand VEEV Splitzicons. Frontiers in Molecular Biosciences 5, 71 (2018).
RNA 전사를 위한 IIP를 함유하는 플라스미드의 클로닝
제한 소화와, 이어서 뉴클레오티드 염기 중첩부 영역을 갖고 F-T2A 서열을 포함하는 Gibson 조립체를 이용함으로써 IIP를 n-Luc과, 이어서 IIP의 단일 전사체 발현을 가능하게 하는 기본 플라스미드 내로 삽입하였다. 상기 기본 플라스미드는 T7 프로모터, 알파-글로빈 5' UTR 및 베타-글로빈 3' UTR을 갖는 발광성 새우 나노루시퍼라아제(n-Luc) 발현 카세트를 암호화하는 mRNA로 이루어졌다. 간략하게, 상기 n-Luc 플라스미드 구조체를 제한 효소를 이용해 37℃에서 2시간 동안 선형화한 후, NEB Builder HiFi 조립체 프로토콜(New England BioLabs, UK)에 본질적으로 기술된 것과 같은 NEB Builder HiFi DNA 조립 반응물에서 사용하였다. 50℃에서 30분 동안 인큐베이션한 후, 2 ㎕의 조립 반응물을 사용하여 프로토콜에 따라 NEB 10-알파 박테리아를 형질전환시켰고, 상기 형질전환체를 LB 아가 플레이트에 플레이팅하였고, 콜로니 성장을 위해 밤새 인큐베이션하였다. 콜로니를 선택하였고, 밤새 확장하였고, 재조합 플라스미드를 퀴아젠 플라스미드 미니프렙 키트(Qiagen, UK)를 이용해 박테리아로부터 정제하였고, 정제된 클론성 플라스미드를 처음에 진단적 제한 효소 소화물을 이용해 분석하였고, 올바른 소화 패턴을 나타내는 것을 완전히 시퀀싱하여 뉴클레오티드 동일성을 확인하였다(Eurofins, Germany).
saRNA 레플리콘 및 mRNA 전사를 위해 사용된 플라스미드 모두에 대하여 IIP에 이어서 F-T2A 또는 DSG 형태로 n-Luc를 가질 뿐만 아니라, ECMV IRES 내부 리보솜 도입 서열(메신저 RNA 전사체 내부 부위의 IRES 요소로부터 단백질 번역을 시작함; Bochkov and Palmenburg, Biotechniques 41(3):283-4, 2006)을 이용하는 구조체를 갖는 플라스미드를 표준 분자 기술을 이용하여 벡터빌더(VectorBuilder, Germany)에 의해 생성하였다.
saRNA의 시험관내 전사
플라스미드 DNA(pDNA)를 대장균(E. coli)(New England BioLabs, UK) 내로 형질전환시켰고, 100 ㎍/㎖의 카르베니실린(Sigma Aldrich, UK)을 갖는 100 ㎖의 Luria Broth(LB)에서 배양하였다. pDNA를 플라스미드 플러스 맥시프렙 키트(QIAGEN, UK)를 이용해 단리하였고, 최종 농도를 NanoDrop One(ThermoFisher, UK)에서 측정하였다. CleanCap Reagent AG(Tebu-bio, France)를 이용해 pDNA 주형으로부터 saRNA를 전사하여 자연 발생형 Cap 1 구조를 갖는 RNA 전사체를 생산하였다. 간략하게, 상기 pDNA 주형을 37℃에서 3시간 동안 선형화시킨 후, 1 ㎍의 선형화된 pDNA 주형을 제조사의 프로토콜에 따라 표준 CleanCap 전사 프로토콜(Tebu-bio, France)에 사용하였다. -20℃에서 적어도 30분 동안 LiCl 침전함으로써 전사체를 정제하였고, 20,000 g로 4℃에서 20분 동안 원심분리하여 RNA를 펠렛화하였고, 70% EtOH로 1회 세정하였고, 다시 20,000 g로 4℃에서 5분 동안 원심분리하였고, UltraPure H2O(Ambion, UK)에 재부유시켰고, 이후 사용할 때까지 -80℃에 보관하였다.
RNA의 시험관내 전사
pDNA를 대장균(New England BioLabs, UK) 내로 형질전환시켰고, 100 ㎍/㎖의 카르베니실린(Sigma Aldrich, UK)을 갖는 100 ㎖의 Luria Broth(LB)에서 배양하였다. 플라스미드 플러스 맥시프렙 키트(QIAGEN, UK)를 이용해 플라스미드를 정제하였고, 농도 및 순도를 NanoDrop One(ThermoFisher, UK)으로 측정하였다. MEGAscript™ T7 전사 프로토콜(ThermoFisher, UK)을 이용하고, 이어서 ScriptCap™ m7G 캡핑 시스템 포스트 번역(Cambio, UK)에 의해 상기 플라스미드 DNA 주형으로부터 RNA를 전사하였다. 간략하게, pDNA를 37℃에서 3시간 동안 선형화하였고, 1 ㎍의 선형화된 pDNA 주형을 표준 반응 프로토콜에 사용하였다. MEGAscript™ T7 전사 후, 상기 전사체를 -20℃에서 적어도 30분 동안 LiCl 침전에 의해 정제한 후, 20,000 g로 4℃에서 20분 동안 원심분리하여 RNA를 펠렛화하였고, 70% EtOH로 1회 세정하였고, 다시 20,000 g로 4℃에서 5분 동안 원심분리하였고, UltraPure H2O(Ambion, UK)에 재부유시켰다. 이후, 상기 전사체를 ScriptCap™ m7G 캡핑 시스템 표준 프로토콜을 이용해 전사-후 캡핑시켰고, 마지막으로 상기 기술된 것과 같이 LiCl 침전시켰다. 이후, 정제되고 Cap 1 캡핑된 RNA를 UltraPure H2O(Ambion, UK)에 재부유시켰고, 이후 사용할 때까지 -80℃에 보관하였다.
IIP 활성의 측정
바이러스 IIP를 함유하는 saRNA가 IIP가 없는 saRNA에 대비하여 saRNA f-luc 발현을 증가시키는 능력; IIP를 함유하는 mRNA가 IIP가 없는 mRNA에 대비하여 mRNA n-luc 발현을 증가시키는 능력, 및 IIP를 함유하는 mRNA가 IIP가 없는 saRNA로부터 f-luc 발현을 증가시키는 능력을 확립하기 위하여, 구조체를 인터페론 적격(competent) HeLa 세포에서 테스트하였고, 기능적 항-바이러스 신호전달 경로를 갖지 않는 HEK293T/17 세포에서 얻어진 경우와 그 발현을 비교하였다. 양쪽 세포주 모두 10%(v/v) 소 태아 혈청(FBS), 5 ㎎/㎖ L-글루타민(Gibco, ThermoFisher, UK) 및 5 ㎎/㎖ 페니실린/스트렙토마이신(Sigma-Aldrich, Merck, UK)을 함유하는 높은 글루코오스의 둘베코 변형 이글 배지(cDMEM)(Sigma-Aldrich, Merck, UK)에서 배양하였다.
saRNA 반딧불이 루시퍼라아제(f-Luc) 발현에 대한 IIP의 평가
평평한 투명 바닥 96-웰 플레이트(Corning Costar) 내로 HEK293T/17 세포를 웰 당 25,000 세포의 밀도로, 그리고 HeLa 세포를 웰 당 10,000 세포의 밀도로 플레이팅한 후, 24시간 동안 인큐베이션하였다. 0.15 ㎕의 리포펙타민(lipofectamine) MessengerMAX(ThermoFisher, UK) 및 100 ng의 saRNA IIP 구조체 또는 saRNA 대조군(IIP 없음)을 함유하는 10 ㎕의 OptiMEM(ThermoFisher, UK)을 웰에 삼중으로 첨가하였고, 추가로 24시간 후, 플레이트를 630 g로 실온에서 5분 동안 원심분리하였고, 50 ㎕의 배지를 각각의 웰로부터 제거하였고, 50 ㎕의 ONE-Glo™ Ex Reagent D-루시페린 시약(Promega, UK)을 첨가하였고, 피펫팅(pipetting)에 의해 혼합하였다. 이후, 각각의 웰로부터의 총 부피를 평평 바닥 불투명 백색 96-웰 플레이트(Corning Costar)로 전달하였고, 10분 이내에 FLUOstar OMEGA 플레이트 판독기(BMG LABTECH, UK)에서 형광을 측정하였다. saRNA를 함유하지 않은 대조군 웰로부터의 배경 형광을 saRNA를 함유하는 각각의 웰에 대한 신호로부터 뺐다. 이후, HeLa 세포에서 IIP를 함유하는 saRNA에 대해 수득된 신호를 대조군 saRNA를 이용해 수득된 신호 및 HEK293T/17 세포에서 수득된 신호로부터의 배수 변화로 표현하였다.
saRNA VEGF-A 발현에 대한 IIP의 평가
HEK293T/17 또는 Hela 세포를 f-Luc를 발현하는 구조체의 테스트에 대해 기술된 것과 동일한 방법을 이용하여 VEGF-A 유전자를 함유하는 100 ng의 saRNA로 형질감염시켰다. 48시간 후, 세포 배양 배지 내의 VEGF-A를 인간 VEGF-A ELISA 키트(Invitrogen, UK)를 이용해 측정하였다. 간략하게, 분석 플레이트 웰을 400 ㎕의 세척 버퍼로 2회 세척한 후, 테스트 샘플 또는 VEGF-A 표준물(15.6 pg/㎖ 내지 1,000 pg/㎖)을 첨가하였다. 이후, 플레이트를 마이크로플레이트 교반기(300 rpm; Jencons Scientific Ltd, UK)에서 실온에서 2시간 동안 인큐베이션한 후, 400 ㎕의 세척 버퍼로 6회 세척하였고, 100 ㎕의 바이오틴-접합체 검출 항체(1:100 희석)를 각각의 웰에 첨가하였고, 플레이트를 마이크로플레이트 교반기(실온에서 1시간, 300 rpm)에서 인큐베이션하였다. 400 ㎕의 세척 버퍼로 6회 세척한 후, 스트렙트아비딘-HRP(1:100 희석) 제2 층 접합체(100 ㎕)를 첨가하였고, 이후 1시간 추가로 인큐베이션하였고, 6회 추가로 세척하였고, 100 ㎕의 TMB 기질을 각각의 웰에 첨가하였다. 암소에서 실온에서 30분 동안 인큐베이션한 후, 100 ㎕의 중단 용액을 첨가하였고, 각각의 웰의 흡광도를 VersaMax 마이크로플레이트 분광광도계(Molecular Devices, UK)로 450 nm에서 판독하였다. 표준 곡선에 내삽(interpolation)함으로써 샘플 내의 VEGF-A 레벨을 결정하였다.
RNA 나노-루시퍼라아제(n-luc) 발현에 대한 IIP의 평가
평평한 투명 바닥 96-웰 플레이트(Corning Costar) 내로 HEK293T/17 세포를 웰 당 25,000 세포의 밀도로, 그리고 HeLa 세포를 웰 당 10,000 세포의 밀도로 플레이팅한 후, 24시간 동안 인큐베이션하였다. 0.15 ㎕의 리포펙타민 MessengerMAX(ThermoFisher, UK) 및 100 ng의 saRNA IIP 구조체 또는 saRNA 대조군(IIP 없음)을 함유하는 10 ㎕의 OptiMEM(ThermoFisher, UK)을 웰에 삼중으로 첨가하였고, 추가로 24시간 후, 플레이트를 630 g로 실온에서 5분 동안 원심분리하였고, 50 ㎕의 배지를 각각의 웰로부터 제거하였고, 50 ㎕의 NanoDLR™ Stop & Glo® 시약(Promega, UK)을 첨가하였고, 피펫팅에 의해 혼합하였다. 이후, 각각의 웰로부터의 총 부피를 평평 바닥 불투명 백색 96-웰 플레이트(Corning Costar)로 전달하였고, 10분 이내에 FLUOstar OMEGA 플레이트 판독기(BMG LABTECH, UK)에서 형광을 측정하였다. RNA를 함유하지 않은 대조군 웰로부터의 배경 형광을 RNA를 함유하는 각각의 웰에 대한 신호로부터 뺐다. 이후, HeLa 세포에서 IIP를 함유하는 RNA에 대해 수득된 신호를 대조군 RNA를 이용해 수득된 신호 및 HEK293T/17 세포에서 수득된 신호로부터의 배수 변화로 표현하였다.
실시예 1 - 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP) 구조체의 구조 디자인
바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP)은 자가-증폭형 RNA(saRNA) 또는 메신저 RNA(mRNA)일 수 있는 본 발명의 RNA 구조체 내로 통합되어서, 단백질 발현 및 번역, 즉 임의의 치료 생체분자일 수 있는 관심있는 유전자(GOI)에 의해 암호화되는 단백질을 변형 또는 감소시킬 수 있는 선천적 인식 및 반응을 감소 또는 제거할 수 있다.
본 발명의 RNA 구조체에 대한 디자인 형상의 다양한 구현예는 도 1에 나타나 있다. saRNA 발현 구조체는 알파바이러스 백본을 기반으로 하며, 여기서 비-구조 단백질은 유지되지만, 관심있는 유전자(GOI)는 서브게놈성 프로모터(SGP)의 하류에 삽입되어 바이러스의 구조 유전자를 교체한다(도 1에서 구현예 "1" 참조). 상기 GOI는 임의의 단백질일 수 있으며, 바이러스, 박테리아, 진균 또는 포유동물 단백질, 즉 생물치료제 단백질일 수 있다. 그러나, 본 발명자들은 본 발명의 RNA 구조체가 백신 공간에서 현저한 유용성을 실증할 것으로 예측하며, 따라서 상기 GOI는 백신 항원, 예컨대 바이러스, 박테리아 또는 진균 단백질, 예컨대 코트 단백질을 암호화할 것이다.
saRNA 구조체(도 1의 좌측)
임의의 IIP가 다음의 디자인 접근법을 이용하여 saRNA 내에 암호화될 수 있다:
- 도 1에서 구현예 "2a"는 펩티드 절단 모티프(motif)(예컨대, 푸린-T2A)를 포함하는 융합 단백질을 암호화하는 saRNA 구조체를 보여주며, GOI(예컨대, 관심있는 항원) 및 IIP에 의해 암호화되는 단백질은 숙주 세포에서 번역시 별개의 단백질로 절단된다;
- 도 1의 구현예 "2b"에서, GOI 및 IIP의 순서가 반대이며, IIP는 GOI의 5'에 있고, 다시 상기 IIP와 GOI 사이에 펩티드 절단 모티프가 있어서, saRNA 구조체가 번역된 후 숙주 세포에서 2개의 별개의 단백질이 생산된다;
- 구현예 "3a"에서, IIP는 GOI 종결 코돈의 하류에 삽입된다. 서브게놈성 프로모터는 GOI의 번역을 구동하고, IIP의 발현/번역은 내부 리보솜 도입 부위(IRES)를 포함시킴으로써 구동된다;
- 구현예 "3b"에서, GOI 및 IIP의 순서가 반대이며, IIP의 번역은 서브게놈성 프로모터에 의해, 그리고 GOI는 IRES에 의해 촉진된다;
- 구현예 "4a"에서, IIP는 GOI 종결 코돈의 하류에 삽입된다. GOI의 번역은 제1 서브게놈성 프로모터에 의해 촉진되고, IIP의 번역은 제2 서브게놈성 프로모터를 포함시킴으로써 구동된다;
- 구현예 "4b"에서, IIP 및 GOI의 위치가 바뀌었으며, 즉 IIP가 GOI의 앞에 있다.
mRNA 구조체(도 1의 오른쪽)
도 1을 참조하면, 임의의 IIP가 다음의 디자인 접근법을 이용하여 mRNA 내에 암호화될 수 있다(구현예 "5" 참조):
- 구현예 "6a"에서, mRNA 구조체는 펩티드 절단 모티프(예컨대, F-T2a)를 포함하는 융합 단백질을 암호화하며, GOI 및 IIP는 번역시 별개의 단백질로 절단된다;
- 구현예 "6b"에서, GOI 및 IIP의 순서가 반대이며, IIP는 GOI의 5'에 있다;
- 구현예 "7a"에서, IIP는 GOI 종결 코돈의 하류에 삽입되며, 여기서 번역은 내부 리보솜 도입 부위(IRES)를 포함시킴으로써 구동된다;
- 구현예 "7b"에서, GOI 및 IIP의 순서가 반대이며, 번역은 서브게놈성 프로모터에 의해, 그리고 GOI는 IRES에 의해 촉진된다.
본 발명자들은 도 1에 실증된 RNA 구조체의 다양한 구현예에서 많은 수의 바이러스 IIP를 테스트하였으며, 이들이 각각 saRNA 및 RNA에 대한 발현 및 반응을 변형할 잠재력을 갖는 것으로 여긴다.
실시예 2 - 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP)을 포함하는 saRNA 구조체의 구축 및 테스트
본 발명자들은 리포터 유전자, f-Luc 또는 VEGF-A의 발현시 상이한 레플리콘 형상에서 일련의 다양한 바이러스 IIP를 디자인하고, 구축하고, 이후 테스트하였으며, 발현 연구의 결과는 도 6 내지 도 11에 나타나 있다.
도 6을 참조하면, F-T2A 형상에서 HPV E6, HSV ICP34.5, HCV E2, VACV E3L, MERS ORF8b 또는 VACV K3L을 함유하는 VEEV 레플리콘으로 형질감염된 후 HeLa 세포에서 f-Luc 발현에서의 배수 증가를 보여준다. HEK293T/17 및 HeLa 세포는 리포터 단백질로서 루시퍼라아제를 함유하는 saRNA(100 ng)로 형질감염되었고, 24시간 후 단백질 발현에 대해 평가하였다. HeLa 세포는 HEK293T/17와 비교하여 보다 온전한 IFN 발현 경로를 갖는 것으로 알려져 있고, 따라서 대조군(리포터 단백질로서 루시퍼라아제를 함유하고 IIP는 없는 saRNA)과 대비하여 증가된 발현(배수 증가)은 상기 IIP가 saRNA 발현을 증가시키는 것을 시사한다. 상기 IIP 중에서, HSV ICP34.5는 f-Luc 발현에서 가장 큰 증가를 생성하였다. 나타낸 데이터는 HeLa 세포에서의 루시퍼라아제 발현이 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 ∼2배 이상 증가를 제공하는 구조체이며, 3개의 별개의 saRNA의 배치를 이용하여 3번의 독립적 실험에서 수득된 데이터의 평균±SEM이다.
도 7을 참조하면, F-T2A 형상에서 KHSV ORF52, EBOV VP35, SARS ORF3b* 57 변이체, SARS ORF3b*79 변이체, SARS ORF3b*57 에콰도르 변이체 또는 천산갑 ORF3b* 57을 함유하는 VEEV 레플리콘으로 형질감염된 후 HeLa 세포에서의 f-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. 실험 방법의 상세 내용은 도 6에 제공된다. 이들 중에서, EBOV VP35 및 SARS ORF3b*79 변이체는 f-Luc 발현에서 가장 큰 증가를 생성하였다. 나타낸 데이터는 HeLa 세포에서의 루시퍼라아제 발현이 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 ∼2배 이상 증가를 제공하는 구조체이며, 3개의 별개의 saRNA의 배치를 이용하여 3번의 독립적 실험에서 수득된 데이터의 평균±SEM이다.
도 8을 참조하면, F-T2A 형상에서 IIP를 함유하는 선택된 VEEV 레플리콘으로 형질감염된 후 HeLa 세포에서의 f-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. 실험 방법의 상세 내용은 도 6에 제공된다. PIV V5 및 MERS ORF4a는 f-Luc 발현에서 가장 큰 증가를 생성하였다. 나타낸 데이터는 HeLa 세포에서의 루시퍼라아제 발현이 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 ∼2배 이상 증가를 제공하는 구조체이며, 3개의 별개의 saRNA의 배치를 이용하여 3번의 독립적 실험에서 수득된 데이터의 평균±SEM이다.
도 9를 참조하면, 이중 서브게놈성 프로모터(DSGP) 형상에서 IIP를 함유하는 VEEV 레플리콘으로 형질감염된 후 HeLa 세포에서의 f-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. 실험 방법의 상세 내용은 도 6에 제공된다. HCV E2, VACV E3L 및 PIV 5V는 f-Luc 발현에서 유사한 증가를 생성하였다. 나타낸 데이터는 HeLa 세포에서의 루시퍼라아제 발현이 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 ∼2배 이상 증가를 제공하는 구조체이며, 3개의 별개의 saRNA의 배치를 이용하여 3번의 독립적 실험에서 수득된 데이터의 평균±SEM이다.
도 10을 참조하면, IIP가 없는 saRNA와 비교하고 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 F-T2A 형상에서 IIP HSV ICP34.5를 함유하는 saRNA로 형질감염된 후 HeLa 세포로부터 VEGF-A 분비에서의 증가를 보여준다. HEK293T/17 및 HeLa 세포는 리포터 단백질로서 VEGF-A를 함유하는 RNA(100 ng)로 형질감염되었고, 48시간 후 배양 배지 내로 단백질 발현 및 분비를 ELISA에 의해 평가하였다. HeLa 세포는 HEK293T/17과 비교하여 보다 온전한 IFN 발현 경로를 갖는 것으로 알려져 있으며, 따라서 대조군(GOI로서 VEGF-A를 함유하고 IIP는 없는 RNA)과 대비하여 증가된 발현은 HSV ICP34.5가 saRNA GOI 발현을 증가시켰음을 시사한다. 데이터는 1회 실험으로부터 유래되며, 3번의 반복 측정의 평균±SEM을 나타낸다.
도 11을 참조하면, 도 1에 나타낸 F-T2A 형상(구조체 2a 및 2b), IRES 형상(구조체 3b) 및 DSGP 형상(구조체 4a 및 4b)에서 GOI로서 f-Luc(구조체 1) 및 IIP MERS ORF4a를 함유하는 saRNA로 형질감염된 후 HeLa 세포에서 f-Luc 발현을 보여준다. 실험 방법의 상세 내용은 도 6에 제공된다. 데이터는 3개의 별개의 saRNA의 배치를 이용하여 3번의 독립적 실험에서 수득된 데이터의 평균±SEM이다. P<0.05는 IIP가 없는 구조체와 비교하여 ANOVA 측정에서 유의함을 나타낸다.
실시예 3 - 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP)을 포함하는 RNA 구조체의 구축 및 테스트
본 발명자들은 일련의 다양한 바이러스 IIP를 디자인하고, 구축하고, 이후 테스트하였으며, 발현 연구의 결과는 도 12에 나타나 있다.
도 12를 참조하면, F-T2A 형상에서 IIP를 함유하는 RNA로 형질감염된 후 HeLa 세포에서의 n-Luc 발현을 HEK293T/17 세포에서의 발현과 대비하여 보여준다. 실험 방법의 상세 내용은 도 6에 제공된다. 나타낸 데이터는 루시퍼라아제 발현이 ∼2배 이상 증가를 제공하는 구조체이며, 3개의 별개의 RNA의 배치를 이용하여 3번의 독립적 실험에서 수득된 데이터의 평균±SEM이다.
결론
본 발명자들은 본 명세서에 기술된 구조체가 다음을 포함하여 종래 기술에 기술된 것들보다 많은 이점을 나타낸다고 여긴다:
ⅰ) RNA 구조체, 예컨대 mRNA 또는 saRNA 내로 직접 임의의 선천적 조절 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 삽입하고, IIP 단백질 및 관심있는 유전자에 의해 암호화되는 생물치료제 분자의 이중 단백질 발현을 가능하게 한다;
ⅱ) 하나는 관심있는 유전자(GOI), 즉 치료 생체분자를 암호화하고 하나는 IIP를 암호화하는 2개의 상이한 별개 가닥의 RNA를 운반하는 것과 대조적으로, 단일 가닥의 운반만이 필요하다;
ⅲ) IIP는 RNA의 선천적 감지를 억제하고, 이에 따라 더 높은 단백질 발현을 가능하게 한다;
ⅳ) RNA 구조체가 saRNA일 때, IIP 발현 자체는 서브게놈성 가닥에서 GOI와 공동 발현됨으로 인해 자가-증폭된다; 및/또는
ⅴ) 종래의 VEEV RNA 레플리콘 구조체와 비교하여 단백질 발현의 규모 및 기간 모두 증가된다.
번호가 매겨진 문단
다음의 문단은 청구항이 아니라 발명의 설명의 일부를 형성한다:
1. (ⅰ) 적어도 하나의 치료 생체분자; 및 (ⅱ) 적어도 하나의 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP);을 암호화하는 RNA 구조체.
2. 상기 구조체가 mRNA, saRNA 또는 트랜스-레플리콘 시스템이고, 가장 바람직하게는 saRNA인, 문단 1에 따른 RNA 구조체.
3. 상기 구조체가 알파바이러스; 피코르나바이러스; 플라비바이러스; 루비바이러스; 페스티바이러스; 헤파시바이러스; 칼리시바이러스 및 코로나바이러스;로 이루어진 속의 군으로부터 선택되양성 가닥 RNA 바이러스, 바람직하게는 알파바이러스, 임의적으로는 VEEV를 포함하거나 이로부터 유래되는, 문단 1 또는 문단 2에 따른 RNA 구조체.
4. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 HPV E6 또는 HSV ICP34.5, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
5. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 HCV E2 또는 HCV NS5a, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
6. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 VACV E3L 또는 VACV K3L, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
7. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 MERS ORF8B, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
8. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 KSHV ORF52, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
9. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 에볼라 VP35, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
10. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 백시니아 C6, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
11. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*57 변이체, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
12. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*79 변이체, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
13. 상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)이 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*57 에콰도르 변이체, 또는 그의 동원체인, 문단 1 내지 문단 3 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체.
14. 상기 치료 생체분자가 치료 단백질을 포함하고, 바람직하게는 상기 단백질 또는 펩티드가 항원, 보다 바람직하게는 바이러스 항원인, 임의의 선행한 문단에 따른 RNA 구조체.
15. 임의의 선행한 문단에 따른 RNA 구조체를 암호화하는 핵산 서열.
16. 문단 15에 따른 핵산 서열을 포함하는 발현 카세트.
17. 문단 16에 따른 발현 카세트를 포함하는 재조합 벡터.
18. 문단 1 내지 문단 14 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체, 문단 15에 따른 핵산 서열, 문단 16에 따른 발현 카세트 또는 문단 17에 따른 벡터, 및 약학적으로 허용가능한 비히클을 포함하는 약학적 조성물.
19. 문단 1 내지 문단 14 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체의 제조 방법으로서, 상기 방법은
a) ⅰ) 숙주 세포 내로 문단 17에 따른 벡터를 도입하는 단계; 및
ⅱ) 상기 숙주 세포를 문단 1 내지 문단 14 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체의 생산을 야기하는 조건 하에 배양하는 단계; 또는
b) 문단 17에 따른 벡터로부터 RNA 구조체를 전사하는 단계;를 포함하는 방법.
20. 약제로서 또는 치료법에 사용하기 위한 문단 1 내지 문단 14 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체, 문단 15에 따른 핵산 서열, 문단 16에 따른 발현 카세트 또는 문단 17에 따른 벡터 또는 문단 18에 따른 약학적 조성물.
21. 원생동물, 진균, 박테리아 또는 바이러스 감염의 예방, 개선 또는 치료에 사용하기 위한 문단 1 내지 문단 14 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체, 문단 15에 따른 핵산 서열, 문단 16에 따른 발현 카세트 또는 문단 17에 따른 벡터 또는 문단 18에 따른 약학적 조성물.
22. 암의 예방, 개선 또는 치료에 사용하기 위한 문단 1 내지 문단 14 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체, 문단 15에 따른 핵산 서열, 문단 16에 따른 발현 카세트, 문단 17에 따른 벡터 또는 문단 18에 따른 약학적 조성물.
23. 문단 1 내지 문단 14 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체, 문단 15에 따른 핵산 서열, 문단 16에 따른 발현 카세트, 문단 17에 따른 벡터 또는 문단 18에 따른 약학적 조성물을 포함하는 백신.
24. 대상체에서 면역 반응의 자극에 사용하기 위한 문단 1 내지 문단 14 중 어느 하나에 따른 RNA 구조체, 문단 15에 따른 핵산 서열, 문단 16에 따른 발현 카세트, 문단 17에 따른 벡터 또는 문단 18에 따른 약학적 조성물.
<110> IMPERIAL COLLEGE INNOVATIONS LIMITED VaxEquity LtdVaxEquity Ltd <120> RNA construct <130> 2023-FPA-2153 <150> 2020061.4 <151> 2020-12-17 <160> 459 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 158 <212> PRT <213> Human papillomavirus type 16 <400> 1 Met His Gln Lys Arg Thr Ala Met Phe Gln Asp Pro Gln Glu Arg Pro 1 5 10 15 Arg Lys Leu Pro Gln Leu Cys Thr Glu Leu Gln Thr Thr Ile His Asp 20 25 30 Ile Ile Leu Glu Cys Val Tyr Cys Lys Gln Gln Leu Leu Arg Arg Glu 35 40 45 Val Tyr Asp Phe Ala Phe Arg Asp Leu Cys Ile Val Tyr Arg Asp Gly 50 55 60 Asn Pro Tyr Ala Val Cys Asp Lys Cys Leu Lys Phe Tyr Ser Lys Ile 65 70 75 80 Ser Glu Tyr Arg His Tyr Cys Tyr Ser Leu Tyr Gly Thr Thr Leu Glu 85 90 95 Gln Gln Tyr Asn Lys Pro Leu Cys Asp Leu Leu Ile Arg Cys Ile Asn 100 105 110 Cys Gln Lys Pro Leu Cys Pro Glu Glu Lys Gln Arg His Leu Asp Lys 115 120 125 Lys Gln Arg Phe His Asn Ile Arg Gly Arg Trp Thr Gly Arg Cys Met 130 135 140 Ser Cys Cys Arg Ser Ser Arg Thr Arg Arg Glu Thr Gln Leu 145 150 155 <210> 2 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virus <400> 21 Met Ser Lys Ile Tyr Ile Asp Glu Arg Ser Asp Ala Glu Ile Val Cys 1 5 10 15 Ala Ala Ile Lys Asn Ile Gly Ile Glu Gly Ala Thr Ala Ala Gln Leu 20 25 30 Thr Arg Gln Leu Asn Met Glu Lys Arg Glu Val Asn Lys Ala Leu Tyr 35 40 45 Asp Leu Gln Arg Ser Ala Met Val Tyr Ser Ser Asp Asp Ile Pro Pro 50 55 60 Arg Trp Phe Met Thr Thr Glu Ala Asp Lys Pro Asp Ala Asp Ala Met 65 70 75 80 Ala Asp Val Ile Ile Asp Asp Val Ser Arg Glu Lys Ser Met Arg Glu 85 90 95 Asp His Lys Ser Phe Asp Asp Val Ile Pro Ala Lys Lys Ile Ile Asp 100 105 110 Trp Lys Asp Ala Asn Pro Val Thr Ile Ile Asn Glu Tyr Cys Gln Ile 115 120 125 Thr Lys Arg Asp Trp Ser Phe Arg Ile Glu Ser Val Gly Pro Ser Asn 130 135 140 Ser Pro Thr Phe Tyr Ala Cys Val Asp Ile Asp Gly Arg Val Phe Asp 145 150 155 160 Lys Ala Asp Gly Lys Ser Lys Arg Asp Ala Lys Asn Asn Ala Ala Lys 165 170 175 Leu Ala Val Asp Lys Leu Leu Gly Tyr Val Ile Ile Arg Phe 180 185 190 <210> 22 <211> 570 <212> DNA <213> Vaccinia virus <400> 22 atgtctaaga tctatatcga cgagcgttct gacgcagaga ttgtgtgtgc ggctattaaa 60 aacattggaa tcgaaggagc tactgctgca caactaacta gacaacttaa tatggagaag 120 cgagaagtta ataaagctct gtacgatctt caacgtagtg ctatggtgta cagctccgac 180 gatattcctc ctcgttggtt tatgacaacg gaggcggata agccggatgc tgatgctatg 240 gctgacgtca taatagatga tgtatcccgc gaaaaatcaa tgagagagga tcataagtct 300 tttgatgatg ttattccggc taaaaaaatt attgattgga aagatgctaa ccctgtcacc 360 attattaatg agtactgcca aataactaag agagattggt cttttcgtat tgaatcagtt 420 gggcctagta actctcctac attttatgcc tgtgtagata tcgacggaag agtattcgat 480 aaggccgatg gaaaatctaa acgagatgct aaaaataatg cagctaaatt ggctgtagat 540 aaacttcttg ggtacgtcat cattagattc 570 <210> 23 <211> 570 <212> RNA <213> Vaccinia virus <400> 23 augucuaaga ucuauaucga cgagcguucu gacgcagaga uugugugugc ggcuauuaaa 60 aacauuggaa ucgaaggagc uacugcugca caacuaacua gacaacuuaa uauggagaag 120 cgagaaguua auaaagcucu guacgaucuu caacguagug cuauggugua cagcuccgac 180 gauauuccuc cucguugguu uaugacaacg gaggcggaua agccggaugc ugaugcuaug 240 gcugacguca uaauagauga uguaucccgc gaaaaaucaa ugagagagga ucauaagucu 300 uuugaugaug uuauuccggc uaaaaaaauu auugauugga aagaugcuaa cccugucacc 360 auuauuaaug aguacugcca aauaacuaag agagauuggu cuuuucguau ugaaucaguu 420 gggccuagua acucuccuac auuuuaugcc uguguagaua ucgacggaag aguauucgau 480 aaggccgaug gaaaaucuaa acgagaugcu aaaaauaaug cagcuaaauu ggcuguagau 540 aaacuucuug gguacgucau cauuagauuc 570 <210> 24 <211> 573 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding VACV E3L protein <400> 24 atgagcaaga tctacatcga cgagcggagc gacgccgaga ttgtgtgtgc cgccatcaag 60 aacatcggca tcgaaggcgc tacagccgct cagctgacca gacagctgaa catggaaaag 120 cgggaagtga acaaggccct gtacgacctg cagagaagcg ccatggtgta cagcagcgac 180 gacatccctc ctcggtggtt tatgaccaca gaggccgaca agcccgacgc cgatgctatg 240 gccgatgtga tcatcgacga cgtgtcccgc gagaagtcca tgagagagga ccacaagagc 300 ttcgatgacg tgatccccgc caagaagatc atcgattgga aggacgccaa tcctgtgacc 360 atcatcaacg agtactgcca gatcaccaag cgcgactggt ccttcagaat cgagagcgtg 420 ggccccagca acagccctac 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<400> 26 Met Leu Ala Phe Cys Tyr Ser Leu Pro Asn Ala Gly Asp Val Ile Lys 1 5 10 15 Gly Arg Val Tyr Glu Lys Asp Tyr Ala Leu Tyr Ile Tyr Leu Phe Asp 20 25 30 Tyr Pro His Ser Glu Ala Ile Leu Ala Glu Ser Val Lys Met His Met 35 40 45 Asp Arg Tyr Val Glu Tyr Arg Asp Lys Leu Val Gly Lys Thr Val Lys 50 55 60 Val Lys Val Ile Arg Val Asp Tyr Thr Lys Gly Tyr Ile Asp Val Asn 65 70 75 80 Tyr Lys Arg Met Cys Arg His Gln 85 <210> 27 <211> 264 <212> DNA <213> Vaccinia virus <400> 27 atgcttgcat tttgttattc gttgcccaat gcgggcgatg taataaaggg cagagtatac 60 gagaaggatt atgctctata catttatctt tttgactatc ctcactctga agctatcttg 120 gcagagagtg ttaagatgca tatggataga tatgttgaat atagggataa actggtaggg 180 aaaactgtaa aagttaaagt gattagagtt gattatacaa aaggatatat agatgtcaat 240 tacaaaagga tgtgtagaca tcaa 264 <210> 28 <211> 264 <212> RNA <213> Vaccinia virus <400> 28 augcuugcau uuuguuauuc guugcccaau gcgggcgaug uaauaaaggg cagaguauac 60 gagaaggauu augcucuaua cauuuaucuu uuugacuauc cucacucuga agcuaucuug 120 gcagagagug 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uacaagcgga ugugcaggca ccaguga 267 <210> 31 <211> 151 <212> PRT <213> Vaccinia virus <400> 31 Met Asn Ala Tyr Asn Lys Ala Asp Ser Phe Ser Leu Glu Ser Asp Ser 1 5 10 15 Ile Lys Asp Val Ile His Asp Tyr Ile Cys Trp Leu Ser Met Thr Asp 20 25 30 Glu Met Arg Pro Ser Ile Gly Asn Val Phe Lys Ala Met Glu Thr Phe 35 40 45 Lys Ile Asp Ala Val Arg Tyr Tyr Asp Gly Asn Ile Tyr Glu Leu Ala 50 55 60 Lys Asp Ile Asn Ala Met Ser Phe Asp Gly Phe Ile Arg Ser Leu Gln 65 70 75 80 Thr Ile Ala Ser Lys Lys Asp Lys Leu Thr Val Tyr Gly Thr Met Gly 85 90 95 Leu Leu Ser Ile Val Val Asp Ile Asn Lys Gly Cys Asp Ile Ser Asn 100 105 110 Ile Lys Phe Ala Ala Gly Ile Ile Ile Leu Met Glu Tyr Ile Phe Asp 115 120 125 Asp Thr Asp Met Ser His Leu Lys Val Ala Leu Tyr Arg Arg Ile Gln 130 135 140 Arg Arg Asp Asp Val Asp Arg 145 150 <210> 32 <211> 453 <212> DNA <213> Vaccinia virus <400> 32 atgaatgcgt ataataaagc cgattcgttt tctttagagt ctgattctat caaagatgtt 60 atacacgatt atatttgttg gctcagtatg actgatgaaa tgagaccatc tatcggaaac 120 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caacgccaug agcuucgacg gcuucaucag aagccugcag 240 acaaucgcca gcaagaaaga caagcugacc guguacggca ccaugggccu gcugucuauc 300 gugguggaua ucaacaaggg cugcgacauc agcaacauca aguucgccgc uggcaucauc 360 auccugaugg aguacaucuu cgacgacacc gacaugagcc accugaaggu ggcccuguac 420 agaagaaucc agcggaggga cgacguggac agauga 456 <210> 36 <211> 143 <212> PRT <213> Middle East Respiratory Syndrome virus <400> 36 Met Pro Ile Pro Pro Leu Arg Lys Met Leu Gly Ile Gly Gly Asp Arg 1 5 10 15 Thr Glu Lys Leu Ile Pro Gly Met Glu Leu Ser Asn Trp Leu Pro Gly 20 25 30 Gly Thr Ser Thr Thr Leu Glu Leu Asp Pro Lys Gln His Ser His Ser 35 40 45 Gly Leu Leu Arg Met Ala Ser Phe Gly Ser Met Lys Met Ala Pro Leu 50 55 60 Met Leu Leu Gln Leu Leu Gly Arg Gly Thr Leu Thr Met Ile Gln Leu 65 70 75 80 Leu Leu His Asn Ser Arg Pro Val Leu Ser Phe Leu Lys Thr Ser Thr 85 90 95 Leu Arg Gly Leu Glu Ala Ile Val Asn His Leu Gln Glu Pro Leu Ala 100 105 110 Gln Ala Glu Thr Leu Pro Asp Leu Val His Lys Val Gln Asp Gln Glu 115 120 125 Thr Leu Pro Ala Ala 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uuguuacaca auucgcgccc gguacuaagc uuccuaaaaa cuuccacauu gaggggacug 300 gaggcaauag ucaaucaucu ucaagagccu cuagcgcaag cagaaacucu uccagaucua 360 guucacaagg uucaagauca ggaaacucua cccgcggcac uucuccaggu ccaucuggaa 420 ucggagcag 429 <210> 39 <211> 432 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding MERS ORF8b protein <400> 39 atgcccattc ctccactgag aaagatgctc ggcatcggcg gcgacagaac cgagaagctg 60 atccctggca tggaactgag caactggctg cctggcggca ccagcacaac actggaactg 120 gatcctaagc agcacagcca cagcggcctg ctgagaatgg ccagctttgg cagcatgaag 180 atggcccctc tgatgctgct gcagctgctc ggaagaggca ccctgacaat gatccagctg 240 ctgctccaca acagcagacc cgtgctgagc ttcctgaaaa ccagcacact gagaggcctg 300 gaagccatcg tgaaccatct gcaagagccc ctggctcagg ccgagacact gcctgatctg 360 gtgcacaagg tgcaggacca agaaaccctg cctgccgctc tgctgcaggt ccacctggaa 420 tctgagcagt ga 432 <210> 40 <211> 432 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding MERS ORF8b protein <400> 40 augcccauuc cuccacugag 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gttttggaac tgctttccac 720 caattagtac aagtgatttg taaattggga aaagatagca actcattgga catcattcat 780 gctgagttcc aggccagcct ggctgaagga gactctcctc aatgtgccct aattcaaatt 840 acaaaaagag ttccaatctt ccaagatgct gctccacctg tcatccacat ccgctctcga 900 ggtgacattc cccgagcttg ccagaaaagc ttgcgtccag tcccaccatc gcccaagatt 960 gatcgaggtt gggtatgtgt ttttcagctt caagatggta aaacacttgg actcaaaatt 1020 1020 <210> 48 <211> 1020 <212> RNA <213> Ebola virus <400> 48 augacaacua gaacaaaggg caggggccau acugcggcca cgacucaaaa cgacagaaug 60 ccaggcccug agcuuucggg cuggaucucu gagcagcuaa ugaccggaag aauuccugua 120 agcgacaucu ucugugauau ugagaacaau ccaggauuau gcuacgcauc ccaaaugcaa 180 caaacgaagc caaacccgaa gacgcgcaac agucaaaccc aaacggaccc aauuugcaau 240 cauaguuuug aggagguagu acaaacauug gcuucauugg cuacuguugu gcaacaacaa 300 accaucgcau cagaaucauu agaacaacgc auuacgaguc uugagaaugg ucuaaagcca 360 guuuaugaua uggcaaaaac aaucuccuca uugaacaggg uuugugcuga gaugguugca 420 aaauaugauc uucuggugau gacaaccggu cgggcaacag caaccgcugc ggcaacugag 480 gcuuauuggg ccgaacaugg ucaaccacca ccuggaccau cacuuuauga agaaagugcg 540 auucggggua agauugaauc uagagaugag accgucccuc aaaguguuag ggaggcauuc 600 aacaaucuaa acaguaccac uucacuaacu gaggaaaauu uugggaaacc ugacauuucg 660 gcaaaggauu ugagaaacau uauguaugau cacuugccug guuuuggaac ugcuuuccac 720 caauuaguac aagugauuug uaaauuggga aaagauagca acucauugga caucauucau 780 gcugaguucc aggccagccu ggcugaagga gacucuccuc aaugugcccu aauucaaauu 840 acaaaaagag uuccaaucuu ccaagaugcu gcuccaccug ucauccacau ccgcucucga 900 ggugacauuc cccgagcuug ccagaaaagc uugcguccag ucccaccauc gcccaagauu 960 gaucgagguu ggguaugugu uuuucagcuu caagauggua aaacacuugg acucaaaauu 1020 1020 <210> 49 <211> 1023 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding Ebola VP35 protein <400> 49 atgaccacca ggaccaaagg cagaggacac accgccgcca ccacacagaa cgacagaatg 60 cctggacctg agctgagcgg ctggatctct gagcagctga tgacaggcag aatccccgtg 120 tccgacatct tctgcgacat cgagaacaac cccggcctgt gttacgccag ccagatgcag 180 cagaccaagc ctaatcctaa gacacggaac agccagacac agacagaccc catctgcaac 240 cacagcttcg aggaagtggt gcagacactg gccagcctgg ctacagttgt gcagcagcag 300 acaatcgcca gcgagagcct ggaacagaga atcaccagcc tggaaaacgg cctgaagcct 360 gtgtacgaca tggccaagac catcagctcc ctgaacagag tgtgcgccga gatggtggcc 420 aaatacgacc tgctcgtgat gaccaccggc agagccacag ctacagccgc tgccacagaa 480 gcctattggg ccgaacatgg acagcctcca cctggaccta gcctgtacga ggaatctgcc 540 atccggggca agatcgagag cagggatgag acagtgcccc agtctgtgcg cgaggccttc 600 aacaacctga acagcaccac aagcctgacc gaggaaaact tcggcaagcc cgacatcagc 660 gccaaggacc tgcggaacat tatgtacgac catctgcctg gcttcggcac cgccttccat 720 cagctggtgc aagtgatctg caagctgggc aaagacagca acagcctgga catcatccac 780 gccgagtttc aggcctctct ggccgaaggc gattctcctc agtgtgccct gatccagatc 840 accaagcggg tgcccatctt ccaggatgct gcccctcctg tgatccacat cagaagcaga 900 ggcgacatcc ccagagcctg ccagaaatct ctcagacccg tgcctccatc tcctaagatc 960 gacagaggct gggtctgcgt gttccagctg caagatggca agaccctggg cctgaagatc 1020 tga 1023 <210> 50 <211> 1023 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding Ebola VP35 protein <400> 50 augaccacca ggaccaaagg cagaggacac accgccgcca ccacacagaa cgacagaaug 60 ccuggaccug agcugagcgg cuggaucucu gagcagcuga ugacaggcag aauccccgug 120 uccgacaucu ucugcgacau cgagaacaac cccggccugu guuacgccag ccagaugcag 180 cagaccaagc cuaauccuaa gacacggaac agccagacac agacagaccc caucugcaac 240 cacagcuucg aggaaguggu gcagacacug gccagccugg cuacaguugu gcagcagcag 300 acaaucgcca gcgagagccu ggaacagaga aucaccagcc uggaaaacgg ccugaagccu 360 guguacgaca uggccaagac caucagcucc cugaacagag ugugcgccga gaugguggcc 420 aaauacgacc ugcucgugau gaccaccggc agagccacag cuacagccgc ugccacagaa 480 gccuauuggg ccgaacaugg acagccucca ccuggaccua gccuguacga ggaaucugcc 540 auccggggca agaucgagag cagggaugag acagugcccc agucugugcg cgaggccuuc 600 aacaaccuga acagcaccac aagccugacc gaggaaaacu ucggcaagcc cgacaucagc 660 gccaaggacc ugcggaacau uauguacgac caucugccug gcuucggcac cgccuuccau 720 cagcuggugc aagugaucug caagcugggc aaagacagca acagccugga caucauccac 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aacatgacta ccagattggt ggttatactg aaaaatggga atctggag 168 <210> 54 <211> 168 <212> RNA <213> Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 <400> 54 augaugccaa cuauuuucuu ugcuggcaua cuaauuguua cgacuauugu auaccuuaca 60 auagugcaac uucuucaauu gucauuacuu caggugaugg cacaacaagu ccuauuucug 120 aacaugacua ccagauuggu gguuauacug aaaaauggga aucuggag 168 <210> 55 <211> 171 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding SARS-CoV-2 ORF3b*57 protein <400> 55 atgatgccga ccatcttctt cgccggcatc ctgatcgtga ccaccatcgt gtacctgacc 60 atcgtgcagc tgctgcagct cagcctgctg caagtgatgg ctcagcaggt cctgttcctg 120 aatatgacca ccagactggt cgtgatcctg aagaacggca acctggaatg a 171 <210> 56 <211> 171 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding SARS-CoV-2 ORF3b*57 protein <400> 56 augaugccga ccaucuucuu cgccggcauc cugaucguga ccaccaucgu guaccugacc 60 aucgugcagc ugcugcagcu cagccugcug caagugaugg cucagcaggu ccuguuccug 120 aauaugacca ccagacuggu cgugauccug aagaacggca 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auagugcaac uucuucaauu gucauuacuu caggugaugg cacaacaagu ccuauuucug 120 aacaugacua ccagauuggu gguuauacug aaaaauggga aucuggaguu aaagacugug 180 uuguauuaca caguuacuuc acuucagacu auuaccagcu guacucaacu caau 234 <210> 60 <211> 237 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding SARS-Cov-2 ORF3b*79 protein <400> 60 atgatgccga ccatcttctt cgccggcatc ctgatcgtga ccaccatcgt gtacctgacc 60 atcgtgcagc tgctgcagct cagcctgctg caagtgatgg ctcagcaggt cctgttcctg 120 aatatgacca ccagactggt cgtgatcctg aagaacggca acctggaact gaaaaccgtg 180 ctgtactaca ccgtgaccag cctgcagacc atcaccagct gcacccagct gaactga 237 <210> 61 <211> 237 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding SARS-CoV-2 ORF3b*79 protein <400> 61 augaugccga ccaucuucuu cgccggcauc cugaucguga ccaccaucgu guaccugacc 60 aucgugcagc ugcugcagcu cagccugcug caagugaugg cucagcaggu ccuguuccug 120 aauaugacca ccagacuggu cgugauccug aagaacggca accuggaacu gaaaaccgug 180 cuguacuaca ccgugaccag ccugcagacc aucaccagcu 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Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding SARS-CoV-2 ORF3b*57 protein <400> 65 atgatgccga ccatcttctt cgccggcatc ctgatcgtga ccaccatcgt gtacctgacc 60 atcgtgcaga tgctgcagct gagcctgctg caagtgatgg cccagcaggt cctgttcctg 120 aatatgacca ccagactggt cgtgatcctg aagaacggca acctggaatg a 171 <210> 66 <211> 171 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding SARS-CoV-2 ORF3b*57 protein <400> 66 augaugccga ccaucuucuu cgccggcauc cugaucguga ccaccaucgu guaccugacc 60 aucgugcaga ugcugcagcu gagccugcug caagugaugg cccagcaggu ccuguuccug 120 aauaugacca ccagacuggu cgugauccug aagaacggca accuggaaug a 171 <210> 67 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 26S promoter <400> 67 gggcccctat aactctctac ggctaacctg aatggactac gacat 45 <210> 68 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> P2A spacer sequence <400> 68 Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn 1 5 10 15 Pro Gly Pro <210> 69 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial 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ugcccaaaua ugacauaaua uuuguuaaug ugaggacccc auauaaauac caucacuauc 3720 agcaguguga agaccaugcc auuaagcuua gcauguugac caagaaagcu ugucugcauc 3780 ugaaucccgg cggaaccugu gucagcauag guuaugguua cgcugacagg gccagcgaaa 3840 gcaucauugg ugcuauagcg cggcaguuca aguuuucccg gguaugcaaa ccgaaauccu 3900 cacuugaaga gacggaaguu cuguuuguau ucauugggua cgaucgcaag gcccguacgc 3960 acaauucuua caagcuuuca ucaaccuuga ccaacauuua uacagguucc agacuccacg 4020 aagccggaug ugcacccuca uaucaugugg ugcgagggga uauugccacg gccaccgaag 4080 gagugauuau aaaugcugcu aacagcaaag gacaaccugg cggaggggug ugcggagcgc 4140 uguauaagaa auucccggaa agcuucgauu uacagccgau cgaaguagga aaagcgcgac 4200 uggucaaagg ugcagcuaaa cauaucauuc augccguagg accaaacuuc aacaaaguuu 4260 cggagguuga aggugacaaa caguuggcag aggcuuauga guccaucgcu aagauuguca 4320 acgauaacaa uuacaaguca guagcgauuc cacuguuguc caccggcauc uuuuccggga 4380 acaaagaucg acuaacccaa ucauugaacc auuugcugac agcuuuagac accacugaug 4440 cagauguagc cauauacugc agggacaaga aaugggaaau gacucucaag gaagcagugg 4500 cuaggagaga agcaguggag gagauaugca uauccgacga cucuucagug acagaaccug 4560 augcagagcu ggugagggug cauccgaaga guucuuuggc uggaaggaag ggcuacagca 4620 caagcgaugg caaaacuuuc ucauauuugg aagggaccaa guuucaccag gcggccaagg 4680 auauagcaga aauuaaugcc auguggcccg uugcaacgga ggccaaugag cagguaugca 4740 uguauauccu cggagaaagc augagcagua uuaggucgaa augccccguc gaagagucgg 4800 aagccuccac accaccuagc acgcugccuu gcuugugcau ccaugccaug acuccagaaa 4860 gaguacagcg ccuaaaagcc ucacguccag aacaaauuac ugugugcuca uccuuuccau 4920 ugccgaagua uagaaucacu ggugugcaga agauccaaug cucccagccu auauuguucu 4980 caccgaaagu gccugcguau auucauccaa ggaaguaucu cguggaaaca ccaccgguag 5040 acgagacucc ggagccaucg gcagagaacc aauccacaga ggggacaccu gaacaaccac 5100 cacuuauaac cgaggaugag accaggacua gaacgccuga gccgaucauc aucgaagagg 5160 aagaagagga uagcauaagu uugcugucag auggcccgac ccaccaggug cugcaagucg 5220 aggcagacau ucacgggccg cccucuguau cuagcucauc cugguccauu ccucaugcau 5280 ccgacuuuga uguggacagu uuauccauac uugacacccu ggagggagcu agcgugacca 5340 gcggggcaac gucagccgag acuaacucuu acuucgcaaa gaguauggag uuucuggcgc 5400 gaccggugcc ugcgccucga acaguauuca ggaacccucc acaucccgcu ccgcgcacaa 5460 gaacaccguc acuugcaccc agcagggccu gcucgagaac cagccuaguu uccaccccgc 5520 caggcgugaa uagggugauc acuagagagg agcucgaggc gcuuaccccg ucacgcacuc 5580 cuagcagguc ggucucgaga accagccugg ucuccaaccc gccaggcgua aauaggguga 5640 uuacaagaga ggaguuugag gcguucguag cacaacaaca augacgguuu gaugcgggug 5700 cauacaucuu uuccuccgac accggucaag ggcauuuaca acaaaaauca guaaggcaaa 5760 cggugcuauc cgaaguggug uuggagagga ccgaauugga gauuucguau gccccgcgcc 5820 ucgaccaaga aaaagaagaa uuacuacgca agaaauuaca guuaaauccc acaccugcua 5880 acagaagcag auaccagucc aggaaggugg agaacaugaa agccauaaca gcuagacgua 5940 uucugcaagg ccuagggcau uauuugaagg cagaaggaaa aguggagugc uaccgaaccc 6000 ugcauccugu uccuuuguau ucaucuagug ugaaccgugc cuuuucaagc cccaaggucg 6060 caguggaagc cuguaacgcc auguugaaag agaacuuucc gacuguggcu ucuuacugua 6120 uuauuccaga guacgaugcc uauuuggaca ugguugacgg agcuucaugc ugcuuagaca 6180 cugccaguuu uugcccugca aagcugcgca gcuuuccaaa gaaacacucc uauuuggaac 6240 ccacaauacg aucggcagug ccuucagcga uccagaacac gcuccagaac guccuggcag 6300 cugccacaaa aagaaauugc aaugucacgc aaaugagaga auugcccgua uuggauucgg 6360 cggccuuuaa uguggaaugc uucaagaaau augcguguaa uaaugaauau ugggaaacgu 6420 uuaaagaaaa ccccaucagg cuuacugaag aaaacguggu aaauuacauu accaaauuaa 6480 aaggaccaaa agcugcugcu cuuuuugcga agacacauaa uuugaauaug uugcaggaca 6540 uaccaaugga cagguuugua auggacuuaa agagagacgu gaaagugacu ccaggaacaa 6600 aacauacuga agaacggccc aagguacagg ugauccaggc ugccgauccg cuagcaacag 6660 cguaucugug cggaauccac cgagagcugg uuaggagauu aaaugcgguc cugcuuccga 6720 acauucauac acuguuugau augucggcug aagacuuuga cgcuauuaua gccgagcacu 6780 uccagccugg ggauuguguu cuggaaacug acaucgcguc guuugauaaa agugaggacg 6840 acgccauggc ucugaccgcg uuaaugauuc uggaagacuu agguguggac gcagagcugu 6900 ugacgcugau ugaggcggcu uucggcgaaa uuucaucaau acauuugccc acuaaaacua 6960 aauuuaaauu cggagccaug augaaaucug gaauguuccu cacacuguuu gugaacacag 7020 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cattctcact tgtttcagag ggtgggtgaa gcagttgcaa atagattaca 2760 aaggcaacga aataatgacg gcagctgcct ctcaagggct gacccgtaaa ggtgtgtatg 2820 ccgttcggta caaggtgaat gaaaatcctc tgtacgcacc cacctcagaa catgtgaacg 2880 tcctactgac ccgcacggag gaccgcatcg tgtggaaaac actagccggc gacccatgga 2940 taaaaacact gactgccaag taccctggga atttcactgc cacgatagag gagtggcaag 3000 cagagcatga tgccatcatg aggcacatct tggagagacc ggaccctacc gacgtcttcc 3060 agaataaggc aaacgtgtgt tgggccaagg ctttagtgcc ggtgctgaag accgctggca 3120 tagacatgac cactgaacaa tggaacactg tggattattt tgaaacggac aaagctcact 3180 cagcagagat agtattgaac caactatgcg tgaggttctt tggactcgat ctggactccg 3240 gtctattttc tgcacccact gttccgttat ccattaggaa taatcactgg gataactccc 3300 cgtcgcctaa catgtacggg ctgaataaag aagtggtccg tcagctctct cgcaggtacc 3360 cacaactgcc tcgggcagtt gccactggaa gagtctatga catgaacact ggtacactgc 3420 gcaattatga tccgcgcata aacctagtac ctgtaaacag aagactgcct catgctttag 3480 tcctccacca taatgaacac ccacagagtg acttttcttc attcgtcagc aaattgaagg 3540 gcagaactgt 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tcacgggccg ccctctgtat ctagctcatc ctggtccatt cctcatgcat 5280 ccgactttga tgtggacagt ttatccatac ttgacaccct ggagggagct agcgtgacca 5340 gcggggcaac gtcagccgag actaactctt acttcgcaaa gagtatggag tttctggcgc 5400 gaccggtgcc tgcgcctcga acagtattca ggaaccctcc acatcccgct ccgcgcacaa 5460 gaacaccgtc acttgcaccc agcagggcct gctcgagaac cagcctagtt tccaccccgc 5520 caggcgtgaa tagggtgatc actagagagg agctcgaggc gcttaccccg tcacgcactc 5580 ctagcaggtc ggtctcgaga accagcctgg tctccaaccc gccaggcgta aatagggtga 5640 ttacaagaga ggagtttgag gcgttcgtag cacaacaaca atgacggttt gatgcgggtg 5700 catacatctt ttcctccgac accggtcaag ggcatttaca acaaaaatca gtaaggcaaa 5760 cggtgctatc cgaagtggtg ttggagagga ccgaattgga gatttcgtat gccccgcgcc 5820 tcgaccaaga aaaagaagaa ttactacgca agaaattaca gttaaatccc acacctgcta 5880 acagaagcag ataccagtcc aggaaggtgg agaacatgaa agccataaca gctagacgta 5940 ttctgcaagg cctagggcat tatttgaagg cagaaggaaa agtggagtgc taccgaaccc 6000 tgcatcctgt tcctttgtat tcatctagtg tgaaccgtgc cttttcaagc cccaaggtcg 6060 cagtggaagc 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aagacagccc attcctcaga gctttgcagc 120 ggagcttccc gcagtttgag gtagaagcca agcaggtcac tgataatgac catgctaatg 180 ccagagcgtt ttcgcatctg gcttcaaaac tgatcgaaac ggaggtggac ccatccgaca 240 cgatccttga cattggaagt gcgcccgccc gcagaatgta ttctaagcac aagtatcatt 300 gtatctgtcc gatgagatgt gcggaagatc cggacagatt gtataagtat gcaactaagc 360 tgaagaaaaa ctgtaaggaa ataactgata aggaattgga caagaaaatg aaggagctgg 420 ccgccgtcat gagcgaccct gacctggaaa ctgagactat gtgcctccac gacgacgagt 480 cgtgtcgcta cgaagggcaa gtcgctgttt accaggatgt atacgcggtt gacggaccga 540 caagtctcta tcaccaagcc aataagggag ttagagtcgc ctactggata ggctttgaca 600 ccaccccttt tatgtttaag aacttggctg gagcatatcc atcatactct accaactggg 660 ccgacgaaac cgtgttaacg gctcgtaaca taggcctatg cagctctgac gttatggagc 720 ggtcacgtag agggatgtcc attcttagaa agaagtattt gaaaccatcc aacaatgttc 780 tattctctgt tggctcgacc atctaccacg agaagaggga cttactgagg agctggcacc 840 tgccgtctgt atttcactta cgtggcaagc aaaattacac atgtcggtgt gagactatag 900 ttagttgcga cgggtacgtc gttaaaagaa tagctatcag 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atcttgcatc caccctctcg 1800 ctgaacaagt catagtgata acacactctg gccgaaaagg gcgttatgcc gtggaaccat 1860 accatggtaa agtagtggtg ccagagggac atgcaatacc cgtccaggac tttcaagctc 1920 tgagtgaaag tgccaccatt gtgtacaacg aacgtgagtt cgtaaacagg tacctgcacc 1980 atattgccac acatggagga gcgctgaaca ctgatgaaga atattacaaa actgtcaagc 2040 ccagcgagca cgacggcgaa tacctgtacg acatcgacag gaaacagtgc gtcaagaaag 2100 aactagtcac tgggctaggg ctcacaggcg agctggtgga tcctcccttc catgaattcg 2160 cctacgagag tctgagaaca cgaccagccg ctccttacca agtaccaacc ataggggtgt 2220 atggcgtgcc aggatcaggc aagtctggca tcattaaaag cgcagtcacc aaaaaagatc 2280 tagtggtgag cgccaagaaa gaaaactgtg cagaaattat aagggacgtc aagaaaatga 2340 aagggctgga cgtcaatgcc agaactgtgg actcagtgct cttgaatgga tgcaaacacc 2400 ccgtagagac cctgtatatt gacgaagctt ttgcttgtca tgcaggtact ctcagagcgc 2460 tcatagccat tataagacct aaaaaggcag tgctctgcgg ggatcccaaa cagtgcggtt 2520 tttttaacat gatgtgcctg aaagtgcatt ttaaccacga gatttgcaca caagtcttcc 2580 acaaaagcat ctctcgccgt tgcactaaat ctgtgacttc 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gacccgtgaa gcccagacgg aagaaagtga tcagcaacac cacaccttac 240 acgatcgccg acaacatccc tcctgagaag ctgcccatca acacccctat tcctaatcct 300 ctgctgcccc tggccagacc tcacggcaag atgaccgaca tcgatatcgt gaccggcaac 360 atcaccgagg gcagctacaa aggcgtggaa ctggccaagc tgggcaagca gacactgctg 420 accagattca ccagcaacga gcctgtgtct agcgccggct ctgcccagga tcctaacttc 480 aaaagaggcg gagccaacag agagagagcc agaggcaacc atcggagaga gtggtctatt 540 gcctgggtcg gagatcaagt gaaggtgttc gagtggtgca accccagatg tgcccctgtg 600 acagccagcg ccagaaagtt cacctgtacc tgcggcagct gtcccagcat ttgcggagag 660 tgtgaaggcg accat 675 <210> 102 <211> 675 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding PIV2 Non-structural protein V <400> 102 auggccgagg aaccuaccua caccaccgaa cagguggacg agcugauuca cgccggacug 60 ggaaccgugg acuucuuucu gucccggccu aucgaugccc agagcagccu cggcaaggga 120 ucuauuccuc cuggcgugac agccgugcug acaucugccg ccgaggccaa gucuaaaccu 180 guggcugcug gacccgugaa gcccagacgg aagaaaguga ucagcaacac cacaccuuac 240 acgaucgccg acaacauccc uccugagaag cugcccauca acaccccuau uccuaauccu 300 cugcugcccc uggccagacc ucacggcaag augaccgaca ucgauaucgu gaccggcaac 360 aucaccgagg gcagcuacaa aggcguggaa cuggccaagc ugggcaagca gacacugcug 420 accagauuca ccagcaacga gccugugucu agcgccggcu cugcccagga uccuaacuuc 480 aaaagaggcg gagccaacag agagagagcc agaggcaacc aucggagaga guggucuauu 540 gccugggucg gagaucaagu gaagguguuc gaguggugca accccagaug ugccccugug 600 acagccagcg ccagaaaguu caccuguacc ugcggcagcu gucccagcau uugcggagag 660 ugugaaggcg accau 675 <210> 103 <211> 224 <212> PRT <213> Mumps virus <400> 103 Met Asp Gln Phe Ile Lys Gln Asp Glu Thr Gly Asp Leu Ile Glu Thr 1 5 10 15 Gly Met Asn Val Ala Asn His Phe Leu Ser Ala Pro Ile Gln Gly Thr 20 25 30 Asn Ser Leu Ser Lys Ala Thr Ile Ile Pro Gly Val Ala Pro Val Leu 35 40 45 Ile Gly Asn Pro Glu Gln Lys Asn Ile Gln Tyr Pro Thr Thr Ser His 50 55 60 Gln Gly Ser Lys Ser Lys Gly Arg Gly Ser Gly Ala Arg Pro Ile Ile 65 70 75 80 Val Ser Ser Ser Glu Gly Gly Thr Gly Gly Thr Gln Val Pro Glu Pro 85 90 95 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gcctaccggc 360 agctacagaa gcgtggaact ggccaagatc ggcaaagaac ggatgatcaa ccgcttcgtg 420 gaaaagccca gaaccagcac acccgtgacc gagttcaaaa gaggcgccgg aagcggctgc 480 agcagacccg ataatcctag aggcggccat cggagagagt ggtccctgtc ttgggttcag 540 ggcgaagtgc gggtgttcga gtggtgcaat cctatctgca gccccatcac agccgccgct 600 agattccaca gctgcaagtg cggaaactgc cccgccaagt gtgaccagtg cgagagagat 660 tacggccctc ct 672 <210> 106 <211> 672 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding Mumps V protein <400> 106 auggaccagu ucaucaagca ggacgagaca ggcgaccuga ucgaaaccgg caugaacgug 60 gccaaccacu uccugucugc cccuauccag ggcaccaaca gccugagcaa ggccacaauu 120 aucccuggcg uggccccugu gcugaucggc aauccugagc agaagaacau ucaguacccc 180 accaccagcc accagggcag caagucuaaa ggcagaggcu cuggcgcucg gcccaucauc 240 guuucuagua gcgaaggcgg caccggcgga acacagguuc cagaaccucu guuugcccag 300 acaggccaag gcggcaucgu gaccacagug uaccaggauc cuaccaucca gccuaccggc 360 agcuacagaa gcguggaacu ggccaagauc ggcaaagaac ggaugaucaa ccgcuucgug 420 gaaaagccca gaaccagcac acccgugacc gaguucaaaa gaggcgccgg aagcggcugc 480 agcagacccg auaauccuag aggcggccau cggagagagu ggucccuguc uuggguucag 540 ggcgaagugc ggguguucga guggugcaau ccuaucugca gccccaucac agccgccgcu 600 agauuccaca gcugcaagug cggaaacugc cccgccaagu gugaccagug cgagagagau 660 uacggcccuc cu 672 <210> 107 <211> 384 <212> PRT <213> Sendai virus <400> 107 Met Asp Gln Asp Ala Phe Ile Leu Lys Glu Asp Ser Glu Val Glu Arg 1 5 10 15 Glu Ala Pro Gly Gly Arg Glu Ser Leu Ser Asp Val Ile Gly Phe Leu 20 25 30 Asp Ala Val Leu Ser Ser Glu Pro Thr Asp Ile Gly Gly Asp Arg Ser 35 40 45 Trp Leu His Asn Thr Ile Asn Thr Pro Gln Gly Pro Gly Ser Ala His 50 55 60 Arg Ala Lys Ser Glu Gly Glu Gly Glu Val Ser Thr Pro Ser Thr Gln 65 70 75 80 Asp Asn Arg Ser Gly Glu Glu Ser Arg Val Ser Gly Arg Thr Ser Lys 85 90 95 Pro Glu Ala Glu Ala His Ala Gly Asn Leu Asp Lys Gln Asn Ile His 100 105 110 Arg Ala Phe Gly Gly Arg Thr Gly Thr Asn Ser Val Ser Gln Asp Leu 115 120 125 Gly Asp Gly Gly Asp Ser Gly Ile Leu Glu Asn Pro 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ctaaggatga tggagatgtt gaaagaagaa acttggagga tctatccagt 240 acttctccca cagatggaac tattggaaag agagtgtcga acacccgtga ctgggcagaa 300 ggttcagatg acatacaact ggacccagtg gttacagacg ttgtatacca tgatcatgga 360 ggagaatgta ccggatatgg atttacttca agccctgaga gagggtggag tgattacaca 420 tcaggagcaa acaatgggaa tgtatgtctt gtatctgatg caaagatgct gtcctatgct 480 cccgaaattg cagtttctaa agaagatcgg gaaactgatc tagttcatct tgagaataaa 540 ctatctacta caggactgaa tcccacagca gtaccgttca ctctgagaaa cctgtctgat 600 cctgcaaaag actctcctgt gattgctgaa cactactacg gactaggagt taaagagcaa 660 aacgttggcc ctcagactag cagaaatgtc aatttggaca gcatcaaatt gtacacatca 720 gatgacgaag aggcagatca gcttgaattc gaagatgagt ttgcaggaag ctcaagtgaa 780 gtgatagtcg gcatttctcc tgaagatgaa gagccttcaa gtgttggcgg aaaacccaat 840 gaatccattg gacgtacaat cgaaggccaa tcaatccgag acaaccttca agccaaggac 900 aacaaatcaa cagatgtacc aggagcagga ccgaaagatt cagcagtgaa ggaagaacca 960 ccccagaaga ggctacctat gttagctgaa gaatttgagt gctctggatc ggaagaccca 1020 atcattcggg agctgctgaa ggagaactca ctcataaatt gtcagcaagg gaaagatgct 1080 cagcctccat atcattggag catcgagagg tcaataagcc cggataaaac tgagatcgtc 1140 aacggtgctg tgcaaactgc tgacaggcaa agaccaggaa ctccgatgcc aaagtcccga 1200 ggtattccca ttaaaaaggg gcacagacgc gaaatatcca tctgctggga cggaaaacgt 1260 gcctgggtcg aagagtggtg caacccggca tgttcgagga tcacccccct accaagaagg 1320 caagagtgtc aatgcggaga atgtccaact gaatgcttcc actgcggt 1368 <210> 117 <211> 1368 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding NiV V protein <400> 117 atggacaagc tggaactggt caacgacggc ctgaacatca tcgacttcat ccagaagaac 60 cagaaagaga tccagaaaac ctacggccgg tccagcatcc agcagcctag catcaaggat 120 cagaccaagg cctgggaaga tttcctgcag tgtaccagcg gcgagagcga acaggttgaa 180 ggcggcatga gcaaggacga cggcgacgtg gaaagacgga acctggaaga tctgagcagc 240 acaagcccta ccgatggcac catcggcaag cgggtgtcca acacaagaga ttgggccgag 300 ggcagcgacg acattcagct ggatcctgtg gtcaccgatg tggtgtacca cgatcacggc 360 ggcgagtgta caggctacgg ctttacaagc agccccgaga gaggctggag cgattataca 420 agcggcgcca acaacggcaa cgtgtgcctg gtgtctgacg ccaagatgct gagctacgcc 480 cctgagatcg ccgtgtccaa agaggacaga gaaaccgacc tggtgcacct ggaaaacaag 540 ctgagcacca ccggactgaa ccctaccgcc gtgcctttca cactgagaaa cctgagcgac 600 cccgccaagg actctcctgt gattgccgag cactactacg gcctgggcgt gaaagaacag 660 aacgtgggcc ctcagaccag ccggaacgtg aacctggatt ccatcaagct gtacacctcc 720 gacgacgagg aagccgacca gctggaattc gaggatgagt ttgccggcag cagcagcgaa 780 gtgattgtgg gcatcagccc tgaggacgag gaacctagct ctgttggcgg caagcccaat 840 gagagcatcg gcagaacaat cgagggccag agcatccggg ataacctgca ggccaaggac 900 aacaagagca ccgatgttcc aggcgctggc cctaaggata gcgccgtgaa agaggaacca 960 cctcagaaac ggctgcccat gctggccgag gaatttgagt gtagcggcag cgaggacccc 1020 atcatcagag agctgctgaa agagaacagc ctgatcaact gccagcaggg caaagacgcc 1080 cagcctcctt accactggtc catcgagaga tctatcagcc ccgacaagac cgagatcgtg 1140 aatggcgctg tgcagaccgc cgatagacag aggcctggaa ctcccatgcc taagagcaga 1200 ggcatcccca tcaagaaggg ccacagaaga gagatcagca tctgctggga cggcaagcgc 1260 gcctgggttg 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gaaagaacag 660 aacgugggcc cucagaccag ccggaacgug aaccuggauu ccaucaagcu guacaccucc 720 gacgacgagg aagccgacca gcuggaauuc gaggaugagu uugccggcag cagcagcgaa 780 gugauugugg gcaucagccc ugaggacgag gaaccuagcu cuguuggcgg caagcccaau 840 gagagcaucg gcagaacaau cgagggccag agcauccggg auaaccugca ggccaaggac 900 aacaagagca ccgauguucc aggcgcuggc ccuaaggaua gcgccgugaa agaggaacca 960 ccucagaaac ggcugcccau gcuggccgag gaauuugagu guagcggcag cgaggacccc 1020 aucaucagag agcugcugaa agagaacagc cugaucaacu gccagcaggg caaagacgcc 1080 cagccuccuu accacugguc caucgagaga ucuaucagcc ccgacaagac cgagaucgug 1140 aauggcgcug ugcagaccgc cgauagacag aggccuggaa cucccaugcc uaagagcaga 1200 ggcaucccca ucaagaaggg ccacagaaga gagaucagca ucugcuggga cggcaagcgc 1260 gccuggguug aagaguggug uaaucccgcc ugcagccgga ucacaccucu gccuagaagg 1320 caagagugcc aguguggcga gugucccacc gaguguuuuc acugugga 1368 <210> 119 <211> 318 <212> PRT <213> Encephalomyocarditis virus <400> 119 Leu Lys Ala Arg Asp Ile Asn Asp Ile Phe Ala Ile Leu Lys Asn Gly 1 5 10 15 Glu 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coronavirus <400> 128 atgtgcaact gccatctgca gctgcgagat ttatatagat tgtgcaataa gctgcacatc 60 agaagagacg atgttcctga gcttattgac cctctcgtta aaactcgctg ttttgcttac 120 agtctcgtgg ttcttgctaa tgctaatcca attgcattta gcatactacc tcggaaaatt 180 cttatcaatg gtgagccttt actgcttgaa tatggtagca tatatggtaa agactttatc 240 attagaccat cgctccaagt cattcttgaa gatgaattaa at 282 <210> 129 <211> 285 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding Porcine delta coronavirus NS6 protein <400> 129 atgtgcaact gccatctgca gctgcgggac ctgtaccggc tgtgtaacaa gctgcacatc 60 agacgggacg acgtgcccga gctgatcgat cctctggtca agaccagatg cttcgcctac 120 agcctggtgg tgctggccaa cgccaatcct atcgccttca gcatcctgcc tcggaagatc 180 ctgatcaacg gcgagcctct gctgctggaa tacggcagca tctacggcaa ggacttcatc 240 atcagaccca gcctgcaagt gatcctggaa gatgagctga actga 285 <210> 130 <211> 285 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA sequence encoding Porcine delta coronavirus NS6 protein <400> 130 augugcaacu 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Junin virus <400> 159 Met Gly Asn Cys Asn Gly Ala Ser Lys Ser Asn Gln Pro Asp Ser Ser 1 5 10 15 Arg Val Thr Gln Pro Ala Ala Glu Phe Arg Arg Val Ala His Ser Ser 20 25 30 Leu Tyr Gly Arg Tyr Asn Cys Lys Cys Cys Trp Phe Ala Asp Thr Asn 35 40 45 Leu Ile Thr Cys Asn Asp His Tyr Leu Cys Leu Arg Cys His Gln Val 50 55 60 Met Leu Arg Asn Ser Asp Leu Cys Asn Ile Cys Trp Lys Pro Leu Pro 65 70 75 80 Thr Thr Ile Thr Val Pro Val Glu Pro Thr Ala Pro Pro Pro 85 90 <210> 160 <211> 282 <212> DNA <213> Junin virus <400> 160 atgggcaact gcaacggggc atccaagtca aaccagccag actcttcaag ggtcacacag 60 ccagccgcag aattcaggag ggtggctcac agcagtctat atggtagata caactgcaag 120 tgctgctggt ttgctgacac caatctgata acctgcaatg atcactacct ttgtttaagg 180 tgccatcagg ttatgttaag gaattcggac ctctgcaata tctgttggaa gcccctacct 240 accacaatca cagtgccggt ggagccaaca gcaccaccac ca 282 <210> 161 <211> 282 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon otpimised DNA encoding JUNV Z protein <400> 161 atgggcaatt gcaacggcgc cagcaagagc 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gggacaucag accucacauc cccacacaga ucaccgagac aaacgacggc 300 gugcugaucg ugaauaccag caaguacccc aauauguacg ugcccguggg cgccgugaca 360 gagcagggau aucugaaucu cggcggcaga cagaccgcca gaacacugau guacaacuuc 420 cccaccagag ccggccagug cggcggagug auuacaugua ccggcaaagu gaucggcaug 480 cacgucggcg gcaauggcuc ucacggauuu gcugccgcuc ugaagagaag cuacuucacc 540 cagagccag 549 <210> 187 <211> 149 <212> PRT <213> Poliovirus <400> 187 Gly Phe Gly His Gln Asn Lys Ala Val Tyr Thr Ala Gly Tyr Lys Ile 1 5 10 15 Cys Asn Tyr His Leu Ala Thr Gln Asp Asp Leu Gln Asn Ala Val Asn 20 25 30 Val Met Trp Ser Arg Asp Leu Leu Val Thr Glu Ser Arg Ala Gln Gly 35 40 45 Thr Asp Ser Ile Ala Arg Cys Asn Cys Asn Ala Gly Val Tyr Tyr Cys 50 55 60 Glu Ser Arg Arg Lys Tyr Tyr Pro Val Ser Phe Val Gly Pro Thr Phe 65 70 75 80 Gln Tyr Met Glu Ala Asn Asn Tyr Tyr Pro Ala Arg Tyr Gln Ser His 85 90 95 Met Leu Ile Gly His Gly Phe Ala Ser Pro Gly Asp Cys Gly Gly Ile 100 105 110 Leu Arg Cys His His Gly Val Ile Gly Ile Ile Thr Ala Gly Gly Glu 115 120 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acatggatgt gatattatag ccagatgtca gtgcacaacg 180 ggagtgtact tttgtgcgtc caaaaacaag cactacccaa tttcgtttga aggaccaggt 240 ctagtagagg tccaagagag tgaatactac cccaggagat accaatccca tgtgctttta 300 gcagctggat tttccgaacc aggtgactgt ggcggtatcc taaggtgtga gcatggtgtc 360 attggcattg tgaccatggg gggtgaaggc gtggtcggct ttgcagacat ccgtgatctc 420 ctgtggctgg aagatgatgc aatggaacag 450 <210> 193 <211> 450 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding CVB3 2A protease <400> 193 ggagcttttg gacagcagtc tggcgccgtg tacgtgggca attaccgggt cgtgaataga 60 cacctggcca cctctgccga ctggcagaat tgtgtgtggg agagctacaa ccgggacctg 120 ctggtgtcta ccacaacagc ccacggctgc gacatcattg ccagatgcca gtgtacaacc 180 ggcgtgtact tctgcgccag caagaacaag cactacccca tcagcttcga aggccctggc 240 ctggtggaag tgcaagagag cgagtactac cctcggagat accagagcca cgtgctgctg 300 gccgctggct tttctgaacc tggcgattgt ggcggcatcc tgagatgtga acacggcgtg 360 atcggcatcg tgaccatggg cggagaaggc gttgtgggct tcgccgacat tagagatctg 420 ctgtggctgg aagatgacgc 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uugccagacc 180 ggcguguacu acugcaacag cagacggaag cacuaccccg uguccuucag caagcccagc 240 cugaucuaug uggaagccag cgaguacuac cccgccagau accagucuca ccugaugcug 300 gcccagggcc auucugagcc aggcgauugu ggcggaaucc ugagaugcca gcauggcguc 360 gugggcauug ugucuaccgg cggaaauggc cucgugggau uugccgaugu ucgcgaccug 420 cuguggcugg acgaagaggc uauggaacag 450 <210> 199 <211> 219 <212> PRT <213> Human metapneumovirus <400> 199 Met Glu Val Lys Val Glu Asn Ile Arg Ala Ile Asp Met Leu Lys Ala 1 5 10 15 Arg Val Lys Asn Arg Val Ala Arg Ser Lys Cys Phe Lys Asn Ala Ser 20 25 30 Leu Ile Leu Ile Gly Ile Thr Thr Leu Ser Ile Ala Leu Asn Ile Tyr 35 40 45 Leu Ile Ile Asn Tyr Thr Ile Gln Lys Thr Ser Ser Glu Ser Glu His 50 55 60 His Thr Ser Ser Pro Pro Thr Glu Ser Asn Lys Glu Ala Ser Thr Ile 65 70 75 80 Ser Thr Asp Asn Pro Asp Ile Asn Pro Asn Ser Gln His Pro Thr Gln 85 90 95 Gln Ser Thr Glu Asn Pro Thr Leu Asn Pro Ala Ala Ser Val Ser Pro 100 105 110 Ser Glu Thr Glu Pro Ala Ser Thr Pro Asp Thr Thr Asn Arg Leu Ser 115 120 125 Ser 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caaaaccgac agtccacaca agaaacaacc caagcacagc ttccagtaca 480 caatccccac cacgggcaac aacgaaggca atccgcagag ccaccacttt ccgcatgagc 540 agcacaggaa aaagaccaac cacaacatca gtccagtccg acagcagcac cacaacccaa 600 aatcatgaag aaacaggttc agcgaaccca caggcatctg taagcacaat gcaaaac 657 <210> 201 <211> 657 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding hMPV G protein <400> 201 atggaagtga aggtcgagaa catccgggcc atcgacatgc tgaaggccag agtgaagaac 60 agagtggccc ggtccaagtg cttcaagaac gccagcctga tcctgatcgg catcaccaca 120 ctgtctatcg ccctgaacat ctacctgatc atcaactaca ccatccagaa aaccagcagc 180 gagagcgagc accacacaag ctctccacct accgagagca acaaagaggc cagcaccatc 240 agcaccgaca atcccgacat caaccccaac tctcagcacc ccacacagca gtccaccgag 300 aatcccacac tgaaccctgc cgcctctgtg tccccatctg agacagaacc tgccagcaca 360 cccgacacca ccaacagact gtctagcgtg gacagaagca cagcccagcc tagcgagagc 420 cggaccaaga caaaacctac cgtgcacacc cggaacaacc ctagcacagc cagctctaca 480 cagagccctc caagagccac caccaaggcc attagaaggg ccaccacctt ccggatgagc 540 agcaccggca aaagacctac caccaccagc gtgcagagcg acagcagcac aaccacacag 600 aaccacgagg aaaccggcag cgccaatcct caggctagcg tgtccaccat gcagaac 657 <210> 202 <211> 657 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding hMPV G protein <400> 202 auggaaguga aggucgagaa cauccgggcc aucgacaugc ugaaggccag agugaagaac 60 agaguggccc gguccaagug cuucaagaac gccagccuga uccugaucgg caucaccaca 120 cugucuaucg cccugaacau cuaccugauc aucaacuaca ccauccagaa aaccagcagc 180 gagagcgagc accacacaag cucuccaccu accgagagca acaaagaggc cagcaccauc 240 agcaccgaca aucccgacau caaccccaac ucucagcacc ccacacagca guccaccgag 300 aaucccacac ugaacccugc cgccucugug uccccaucug agacagaacc ugccagcaca 360 cccgacacca ccaacagacu gucuagcgug gacagaagca cagcccagcc uagcgagagc 420 cggaccaaga caaaaccuac cgugcacacc cggaacaacc cuagcacagc cagcucuaca 480 cagagcccuc caagagccac caccaaggcc auuagaaggg ccaccaccuu ccggaugagc 540 agcaccggca aaagaccuac caccaccagc gugcagagcg acagcagcac aaccacacag 600 aaccacgagg 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ggacgccaaa 180 gaactggtgg acaaggacgg caccaacctg gaactgaccc tgctgaagct gaaccggaac 240 gagaagttcc gggatatcag aggcttcctg gccaaagaag aggtggaagt caacgaagcc 300 gtgctggcca tcaacaccag caagttcccc aacatgtaca tccccgtggg ccaagtgaca 360 gagtacggct tcctgaatct cggcggcacc cctaccaagc ggatgctgat gtacaacttc 420 cccaccagag ccggccagtg tggcggagtt cttatgtcta ccggcaaggt gctgggaatc 480 cacgttggcg gaaatggcca ccagggcttt tctgccgctc tgctgaaaca ctacttcaac 540 gacgagcag 549 <210> 206 <211> 549 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding CVB3 3C protease <400> 206 ggaccugccu uugaauucgc cguggccaug augaagcgga acagcagcac cgugaaaacc 60 gaguacggcg aguucaccau gcugggcauc uacgacagau gggccgugcu gccuagacac 120 gccaaaccug gaccuaccau ccugaugaac gaccaagaag ugggcguucu ggacgccaaa 180 gaacuggugg acaaggacgg caccaaccug gaacugaccc ugcugaagcu gaaccggaac 240 gagaaguucc gggauaucag aggcuuccug gccaaagaag agguggaagu caacgaagcc 300 gugcuggcca ucaacaccag caaguucccc aacauguaca uccccguggg ccaagugaca 360 gaguacggcu uccugaaucu cggcggcacc ccuaccaagc ggaugcugau guacaacuuc 420 cccaccagag ccggccagug uggcggaguu cuuaugucua ccggcaaggu gcugggaauc 480 cacguuggcg gaaauggcca ccagggcuuu ucugccgcuc ugcugaaaca cuacuucaac 540 gacgagcag 549 <210> 207 <211> 631 <212> PRT <213> Hepatitis C virus <400> 207 Ala Pro Ile Thr Ala Tyr Ala Gln Gln Thr Arg Gly Leu Phe Ser Thr 1 5 10 15 Ile Val Thr Ser Leu Thr Gly Arg Asp Thr Asn Glu Asn Cys Gly Glu 20 25 30 Val Gln Val Leu Ser Thr Ala Thr Gln Ser Phe Leu Gly Thr Ala Val 35 40 45 Asn Gly Val Met Trp Thr Val Tyr His Gly Ala Gly Ala Lys Thr Ile 50 55 60 Ser Gly Pro Lys Gly Pro Val Asn Gln Met Tyr Thr Asn Val Asp Gln 65 70 75 80 Asp Leu Val Gly Trp Pro Ala Pro Pro Gly Val Arg Ser Leu Ala Pro 85 90 95 Cys Thr Cys Gly Ser Ala Asp Leu Tyr Leu Val Thr Arg His Ala Asp 100 105 110 Val Ile Pro Val Arg Arg Arg Gly Asp Thr Arg Gly Ala Leu Leu Ser 115 120 125 Pro Arg Pro Ile Ser Ile Leu Lys Gly Ser Ser Gly Gly Pro Leu Leu 130 135 140 Cys Pro Met Gly His Arg Ala Gly Ile Phe 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encoding DENV NS3 protein <400> 214 ucuggcgugc ugugggauac accuucucca ccagaggugg aaagagccgu gcuggacgac 60 ggcaucuacc ggauucugca gagaggacug cugggcagau cucaaguugg cgugggcgug 120 uuccaagaag ggguguucca caccaugugg cacgugacaa gaggcgccgu gcugauguac 180 cagggcaaga gacuggaacc uagcugggcc agcgugaaga aggaccugau cucuuacggc 240 ggaggcuggc gguuucaagg cucuuggaau gccggcgaag aggugcaagu gaucgccgug 300 gaacccggca agaaccccaa gaacguucag acagccccug gcaccuucaa gaccccugaa 360 ggcgaagugg gagcuaucgc ccuggauuuc aagccuggca caagcggcag ccccaucgug 420 aacagagaag gcaagaucgu gggccuguac ggcaauggcg uggucaccac aucuggcacc 480 uacgugucag ccauugcuca ggccaaggcc ucucaagagg gaccccugcc ugagaucgag 540 gacgaggugu uccggaagcg gaaccugacc aucauggauc ugcacccugg cagcggcaag 600 accagaagau aucugcccgc cauugugcgc gaggccaucc gaagaaaugu gcggacacug 660 gugcuggccc cuacaagagu gguggccucu gaaauggccg aggcucugaa gggcaugccu 720 aucagauacc agaccaccgc cgugaagucu gagcacaccg gcaaagaaau cguggaccug 780 augugccacg ccaccuucac caugagacug cugagcccug ugcgggugcc 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ttgatgtcta tgagtgccgc taggtcttat 780 gactatttta tgagaactga cttgggattc agagagactg ctctttccac cttttgggct 840 aaggactggc ctaccccaca agagaccatt ctatctgaca aacgatgcct taaagaagac 900 atgagagtga caaagtggct gcctagtccc ccccactacc caccctta 948 <210> 229 <211> 948 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding Toscana virus NSS protein <400> 229 atgcagagca gagccgtgat cctgaagtac agaagcggca gcggccacaa gagaagcctg 60 cctagattct acatcgactg cgacctggac accttcgact tcgagaagga ctgcagcctg 120 atcgagaacg agttccccat ctacatcaac aactacaagg tggtgtacaa gagcaagcca 180 actctgagcc acttcctcat cgagaaagaa ttccctgccg tgctcggccc tggcatgatc 240 tctgccgtta gaaccagact gtacgagccc accatgagag agctgtacca agagagcatc 300 caccagctga agcggagcaa caagaagtac ctgctgagcg ccctgagatg gcccacaggc 360 attcccacac tggaattcat cgactactac ttcgaggaac tgctgttcct gagcgagttc 420 gaccctggca gcatccagag atacctgaag ctgctggtca aggccagcgg cctgtacaac 480 agcaccaacg aggaacagat cgtggaaatc caccggcggg tgctgatcga gggaaagaag 540 cacggactga ccgccttcga cctgcctggc aatgatatcc tgggcgacat ctgcgtggtg 600 caggccgcta gagtgacaag actggtggcc aagaccttca gcaagatgac cagagacacc 660 cacctgatga tctacttcag catcagcccc gtggaactgg tgctgagcaa gctggacaag 720 aagggcgaca agagagccaa ggccaagggc ctgatgagca tgtctgccgc cagatcctac 780 gactacttca tgagaaccga cctgggcttc agagagacag ccctgagcac cttctgggcc 840 aaagactggc ccacacctca agagacaatc ctgtccgaca agcggtgcct gaaagaagat 900 atgcgggtca ccaagtggct gccctctcca cctcattacc ctccactt 948 <210> 230 <211> 948 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding Toscana virus NSS protein <400> 230 augcagagca gagccgugau ccugaaguac agaagcggca gcggccacaa gagaagccug 60 ccuagauucu acaucgacug cgaccuggac accuucgacu ucgagaagga cugcagccug 120 aucgagaacg aguuccccau cuacaucaac aacuacaagg ugguguacaa gagcaagcca 180 acucugagcc acuuccucau cgagaaagaa uucccugccg ugcucggccc uggcaugauc 240 ucugccguua gaaccagacu guacgagccc accaugagag agcuguacca agagagcauc 300 caccagcuga agcggagcaa caagaaguac cugcugagcg cccugagaug gcccacaggc 360 auucccacac uggaauucau cgacuacuac uucgaggaac ugcuguuccu gagcgaguuc 420 gacccuggca gcauccagag auaccugaag cugcugguca aggccagcgg ccuguacaac 480 agcaccaacg aggaacagau cguggaaauc caccggcggg ugcugaucga gggaaagaag 540 cacggacuga ccgccuucga ccugccuggc aaugauaucc ugggcgacau cugcguggug 600 caggccgcua gagugacaag acugguggcc aagaccuuca gcaagaugac cagagacacc 660 caccugauga ucuacuucag caucagcccc guggaacugg ugcugagcaa gcuggacaag 720 aagggcgaca agagagccaa ggccaagggc cugaugagca ugucugccgc cagauccuac 780 gacuacuuca ugagaaccga ccugggcuuc agagagacag cccugagcac cuucugggcc 840 aaagacuggc ccacaccuca agagacaauc cuguccgaca agcggugccu gaaagaagau 900 augcggguca ccaaguggcu gcccucucca ccucauuacc cuccacuu 948 <210> 231 <211> 230 <212> PRT <213> Influenza A virus <400> 231 Met Asp Pro Asn Thr Val Ser Ser Phe Gln Val Asp Cys Phe Leu Trp 1 5 10 15 His Val Arg Lys Arg Val Ala Asp Gln Glu Leu Gly Asp Ala Pro Phe 20 25 30 Leu Asp Arg Leu Arg Arg Asp Gln Lys Ser Leu Arg Gly Arg Gly Ser 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Foot-and-mouth disease virus <400> 243 Pro Phe Phe Phe Ser Asp Val Arg Ser Asn Phe Ser Lys Leu Val Glu 1 5 10 15 Thr Ile Asn Gln Met Gln Glu Asp Met Ser Thr Lys His Gly Pro Asp 20 25 30 Phe Asn Arg Leu Val Ser Ala Phe Glu Glu Leu Ala Ala Gly Val Lys 35 40 45 Ala Ile Arg Thr Gly Leu Asp Glu Ala Lys Pro Trp Tyr Lys Leu Ile 50 55 60 Lys Leu Leu Ser Arg Leu Ser Cys Met Ala Ala Val Ala Ala Arg Ser 65 70 75 80 Lys Asp Pro Val Leu Val Ala Ile Met Leu Ala Asp Thr Gly Leu Glu 85 90 95 Ile Leu Asp Ser Thr Phe Val Val Lys Lys Ile Ser Asp Ser Leu Ser 100 105 110 Ser Leu Phe His Val Pro Ala Pro Val Phe Ser Phe Gly Ala Pro Ile 115 120 125 Leu Leu Ala Gly Leu Val Lys Val Ala Ser Ser Phe Phe Arg Ser Thr 130 135 140 Pro Glu Asp Leu Glu Arg Ala Glu Lys Gln 145 150 <210> 244 <211> 462 <212> DNA <213> Foot-and-mouth disease virus <400> 244 cccttcttct tctctgacgt taggtcaaac ttttctaagc tggtggaaac catcaaccag 60 atgcaggaag acatgtcaac aaaacacggg cccgacttta accggttggt gtccgccttt 120 gaggaactgg ccgctggagt 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ctggcggcac atgggacgtg cggctgagaa acgccattag agaggtggaa 780 gccagattcg agccagccgc tgagcctgtg tgtgaactgc cttgtctgaa cgctcggaga 840 tacggccccg agtgtgatgt gggcaacctg gaaacaaatg gcggcagcac ctccgacgac 900 gagatctctg atgccaccga cagcgacgat acactggcca gccacagcga tacagaaggc 960 ggaccatctc ctgccggaag agagaatcct gagtctgcct ctggcggagc tatcgccgca 1020 agactggaat gcgagttcgg caccttcgac tggacaagcg aggaaggctc tcagccttgg 1080 ctgtctgctg tggtggccga tacctctagc gccgaaagat ctggacttcc tgctcctggc 1140 gcctgcagag ctacagaagc tcctgaaaga gaggacggct gcagaaagat gcggttccct 1200 gccgcctgtc cttatccttg cggccacaca tttctgcggc ct 1242 <210> 306 <211> 1242 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding HSV2 US1 protein <400> 306 auggccgaca uuccuccuga uccuccagcu cugaacacca caccugugaa ucacgccccu 60 ccaucuccac caccuggcag cagaaagaga agaaggccug uccugccuag cagcagcgag 120 ucugagggca agccugauac agagagcgag agcagcagca cagagagcag cgaggacgaa 180 gcuggcgauc uuagaggcgg cagaagaaga agccccagag aacucggcgg cagauacuuc 240 cuggaucuga gcgccgagag caccaccggc acugaaucug aaggcacagg ccccagcgac 300 gacgaugacg augaugccuc ugauggcugg cugguggaca ccccuccuag aaaguccaag 360 cggcccagaa ucaaccugcg gcugacaagc ucuccugauc gcagagcugg cgugguguuc 420 cccgaagugu ggcggaacga cagaccuauc agagccgcuc agccucaggc uccugcucag 480 ucuagcggag auagagcugc cgcuccuaga agaucugcca gacaggccca gaugagaagc 540 ggagcugcuu ggacacugga ccugcacuac auccggcagu gcgugaacca gcuguuccgg 600 auccuucggg cugccccuaa uccaccuggc uccgccaaua gacugagaca ccuugugcgg 660 gacugcuacc ugaugggcua cugcagaaca agacugggcc ccagaacaug gggcagacug 720 cugcaaaucu cuggcggcac augggacgug cggcugagaa acgccauuag agagguggaa 780 gccagauucg agccagccgc ugagccugug ugugaacugc cuugucugaa cgcucggaga 840 uacggccccg agugugaugu gggcaaccug gaaacaaaug gcggcagcac cuccgacgac 900 gagaucucug augccaccga cagcgacgau acacuggcca gccacagcga uacagaaggc 960 ggaccaucuc cugccggaag agagaauccu gagucugccu cuggcggagc uaucgccgca 1020 agacuggaau gcgaguucgg caccuucgac uggacaagcg aggaaggcuc ucagccuugg 1080 cugucugcug ugguggccga uaccucuagc gccgaaagau cuggacuucc ugcuccuggc 1140 gccugcagag cuacagaagc uccugaaaga gaggacggcu gcagaaagau gcgguucccu 1200 gccgccuguc cuuauccuug cggccacaca uuucugcggc cu 1242 <210> 307 <211> 168 <212> PRT <213> Classical swine fever virus <400> 307 Met Glu Leu Asn His Phe Glu Leu Leu Tyr Lys Thr Ser Lys Gln Lys 1 5 10 15 Pro Val Gly Val Glu Glu Pro Val Tyr Asp Thr Ala Gly Arg Pro Leu 20 25 30 Phe Gly Asn Pro Ser Glu Val His Pro Gln Ser Thr Leu Lys Leu Pro 35 40 45 His Asp Arg Gly Arg Gly Asp Ile Arg Thr Thr Leu Arg Asp Leu Pro 50 55 60 Arg Lys Gly Asp Cys Arg Ser Gly Asn His Leu Gly Pro Val Ser Gly 65 70 75 80 Ile Tyr Ile Lys Pro Gly Pro Val Tyr Tyr Gln Asp Tyr Thr Gly Pro 85 90 95 Val Tyr His Arg Ala Pro Leu Glu Phe Phe Asp Glu Ala Gln Phe Cys 100 105 110 Glu Val Thr Lys Arg Ile Gly Arg Val Thr Gly Ser Asp Gly Lys Leu 115 120 125 Tyr His Ile Tyr Val Cys Val Asp Gly Cys Ile Leu Leu Lys Leu Ala 130 135 140 Lys Arg Gly Thr Pro Arg Thr Leu Lys Trp Ile Arg Asn Phe Thr 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tgagcgccat gatcttcgat tggttcgaca cccggtacat gcgcgagaca 1380 cctatgacca ccagcaccac caaccagctg cggaccctga acaagagaaa cgagctgatc 1440 gacgagtacg acctggaact gagcgacgtg gaa 1473 <210> 318 <211> 1473 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding Bovine RV NS1 protein <400> 318 auggccaccu ucaaggacgc cugcuaccac uacaagaagc ugaacaagcu gaauagccug 60 gugcugaagc ugggcgccaa ugaugaaugg cgaccugcuc cugugaccaa guacaaaggc 120 uggugccugg acugcugcca guacaccaau cugaccuacu gcagaggcug cgcccuguac 180 cacgucuguc aguggugcag ccaguacaac cggugcuucc uggacgagga accccaucug 240 cugcggaugc ggaccuuuaa ggacgugguc accaaagagg acaucgaggg ccugcugacu 300 auguacgaga cacuguuccc caucaacgag aagcugguca acaaguucau caacagcgug 360 aagcagcgga agugccggaa cgaguaccug cuggaauggu acaaucaucu gcugaugccc 420 aucacacugc aggcccugac caucaaccug gaagauaacg uguacuacau guucggcuac 480 uacgacugca uggaacacga gaaucagacc ccuuuccagu ucgugaaccu gcucgagaag 540 uacgacaagc ugcugcugga cgaccggaac uuccaccgga ugucucaucu gcccgugauc 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ctcaatctga tgttgcgagt 300 gtactttcaa aagtaatttc tgtaagacat ttagagaatt tggtactgag aagagagaac 360 catcaggacg tgcttttcca ttcaaaagag ttgttgctga gatcagtact aatagctatt 420 ggtcactcaa aagaaattga aacaactgcc actgctgaag gaggggaagt agtttttcaa 480 aatgcagctt ttacaatgtg gaaactgaca tacctggagc atagactaat gccaattttg 540 gatcaaaatt ttatcgaata taaaataaca gtgaatgaag ataaaccaat ttcagaatca 600 catgtaagag aactcattgc tgaattgcgg tggcaataca acaaatttgc agtaattaca 660 catggtaaag gtcactacag agttgtaaaa tattcatcag ttgcgaatca tgcagataga 720 gtttacgcta ctttcaagag caataataag aatgggaatg tgatagagtt taatctactt 780 gatcaaagaa taatatggca gaactggtat gcgtttacat cctcaatgaa acaaggcaac 840 actcttgaaa tatgcaagaa actactgttc caaaagatga agcgagaaag taatccgttt 900 aagggactgt caactgatag aaagatggat gaggtctctc aaataggaat t 951 <210> 321 <211> 951 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding Bovine RV NS2 protein <400> 321 atggccgagc tggcctgctt ttgttaccct cacctggaaa gcgataccta ccggttcatc 60 cccttcaaca 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gaagatggat gaggtgtccc agatcggcat c 951 <210> 322 <211> 951 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding Bovine RV NS2 protein <400> 322 auggccgagc uggccugcuu uuguuacccu caccuggaaa gcgauaccua ccgguucauc 60 cccuucaaca gccuggccau caagugcaug cugaccgcca agguggacaa gaaggaccag 120 gacaaguucu acaacagcau caucuacgga aucgccccuc caccucaguu caagaagcgg 180 uacaacacca acgacaacag ccggggcaug aacuacgaga cacccauguu caacaaggug 240 gccgugcuga ucugcgaggc ccugaacucc aucaaaguga cccaguccga uguggccagc 300 gugcugagca aagugaucuc ugugcggcac cucgagaacc uggugcugcg gagagaaaac 360 caccaggacg ugcuguucca cagcaaagag cugcugcuga gaucugugcu gaucgccauc 420 ggccacucca aagagaucga gacaaccgcc acagccgaag gcggagaggu gguguuucag 480 aaugccgccu ucaccaugug gaagcugacc uaccuggaac accggcugau gcccauccug 540 gaccagaacu ucaucgagua caagaucacc gugaacgagg acaagcccau cagcgagucu 600 cacgugcggg aacugauugc cgagcugcgg uggcaguaca acaaguucgc cgugaucaca 660 cacggcaagg gccacuacag aguggucaag uacagcagcg uggccaacca cgccgauaga 720 guguacgcca ccuucaagag caacaacaag aacggcaacg ugaucgaguu caaccugcug 780 gaccagcgga ucaucuggca gaauugguac gccuuuacca gcagcaugaa gcagggcaac 840 acccuggaaa ucugcaagaa gcuccuguuc cagaagauga agagagagag caaccccuuc 900 aagggccuga gcaccgaccg gaagauggau gagguguccc agaucggcau c 951 <210> 323 <211> 228 <212> PRT <213> Porcine bocavirus 1 <400> 323 Met Ser Ser Ala Arg Ser Asp Thr Asp Thr Gly Arg Arg Gly Lys Arg 1 5 10 15 Ser Arg Ser Arg Ser Arg Ser Arg Asp Arg Asp Gln Ala Pro Gly Leu 20 25 30 Pro Pro Lys Lys Arg Asp Tyr Arg Arg Arg Ser Gly Glu Arg Gly Ser 35 40 45 Glu Ser Ser Pro Asp Arg Ser Thr Arg Gly Ser Pro Ser Cys Ser Thr 50 55 60 Ala Ser Arg Thr Ser Arg Val Thr Ser Ala Thr Trp Arg Arg Pro Asn 65 70 75 80 Asp Ser Arg Asp Gly Gly Lys Ile Trp Gly Asn Lys Asn Lys Lys Asn 85 90 95 Lys Thr Asn Pro Tyr Glu Val Phe Ser Gln His Met Ala Arg Phe Lys 100 105 110 Pro Asp Lys Ser Tyr Cys Gly Phe Tyr Trp His Ser Cys Arg Met Ala 115 120 125 Arg Lys Gly Thr Asp Tyr Ile Phe Thr Glu Gly Met Arg 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caacuacugg gacgaagugu acaagaugca ccuggccaac 600 guguccccau ccgagacaga gccucaagag cugaccgacg aggaaauucu ggccgcugcc 660 auggaagugg auggcacaca ugaa 684 <210> 327 <211> 114 <212> PRT <213> Hepatitis E virus <400> 327 Met Gly Ser Arg Pro Cys Ala Leu Gly Leu Phe Cys Cys Cys Ser Ser 1 5 10 15 Cys Phe Cys Leu Cys Cys Pro Arg His Arg Pro Val Ser Arg Leu Ala 20 25 30 Ala Val Val Gly Gly Ala Ala Ala Val Pro Ala Val Val Ser Gly Val 35 40 45 Thr Gly Leu Ile Leu Ser Pro Ser Gln Ser Pro Ile Phe Ile Gln Pro 50 55 60 Thr Pro Ser Pro Pro Met Ser Pro Leu Arg Pro Gly Leu Asp Leu Val 65 70 75 80 Phe Ala Asn Pro Pro Asp His Ser Ala Pro Leu Gly Val Thr Arg Pro 85 90 95 Ser Ala Pro Pro Leu Pro His Val Val Asp Leu Pro Gln Leu Gly Pro 100 105 110 Arg Arg <210> 328 <211> 342 <212> DNA <213> Hepatitis E virus <400> 328 atgggttcgc gaccatgcgc cctcggccta ttttgttgct gctcctcatg tttttgccta 60 tgctgcccgc gccaccgccc ggtcagccgt ctggccgccg tcgtgggcgg cgcagcggcg 120 gttccggcgg tggtttctgg ggtgaccggg ttgattctca gcccttcgca atcccctata 180 ttcatccaac caaccccttc gcccccgatg tcaccgctgc ggccggggct ggacctcgtg 240 ttcgccaacc cgcccgacca ctcggctccg cttggcgtga ccaggcccag cgccccgccg 300 ttgcctcacg tcgtagacct accacagctg gggccgcgcc gc 342 <210> 329 <211> 342 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding Hepatitis E Orf3 protein <400> 329 atgggcagca gaccttgtgc tctgggcctg ttctgctgct gcagctcctg cttctgcctg 60 tgctgcccta gacacagacc cgtgtctaga ctggccgctg ttgttggcgg agctgctgct 120 gttccagctg tggtgtctgg cgtgacaggc ctgattctga gcccttctca gagccccatc 180 ttcatccagc ctacacctag tcctccaatg agccctctga ggcctggact ggatctggtg 240 ttcgccaatc ctcctgatca ctctgcccct ctgggcgtga caagaccttc tgctcctcct 300 ctgccacacg tggtggatct gcctcaactg ggccctagaa ga 342 <210> 330 <211> 342 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding Hepatitis E Orf3 polypeptide <400> 330 augggcagca gaccuugugc ucugggccug uucugcugcu gcagcuccug cuucugccug 60 ugcugcccua gacacagacc cgugucuaga cuggccgcug uuguuggcgg agcugcugcu 120 guuccagcug uggugucugg cgugacaggc cugauucuga gcccuucuca gagccccauc 180 uucauccagc cuacaccuag uccuccaaug agcccucuga ggccuggacu ggaucuggug 240 uucgccaauc cuccugauca cucugccccu cugggcguga caagaccuuc ugcuccuccu 300 cugccacacg ugguggaucu gccucaacug ggcccuagaa ga 342 <210> 331 <211> 496 <212> PRT <213> Rotavirus A <400> 331 Met Ala Thr Phe Lys Asp Ala Cys Phe His Tyr Arg Arg Leu Thr Ala 1 5 10 15 Leu Asn Arg Arg Leu Cys Asn Ile Gly Ala Asn Ser Ile Cys Met Pro 20 25 30 Val Pro Asp Ala Lys Ile Lys Gly Trp Cys Leu Glu Cys Cys Gln Ile 35 40 45 Ala Asp Leu Thr His Cys Tyr Gly Cys Ser Leu Pro His Val Cys Lys 50 55 60 Trp Cys Val Gln Asn Arg Arg Cys Phe Leu Asp Asn Glu Pro His Leu 65 70 75 80 Leu Lys Leu Arg Thr Val Lys His Pro Ile Thr Lys Asp Lys Leu Gln 85 90 95 Cys Ile Ile Asp Leu Tyr Asn Ile Ile Phe Pro Ile Asn Asp Lys Val 100 105 110 Ile Arg Lys Phe Glu Arg Met Ile Lys Gln Arg Lys Cys Arg Asn Gln 115 120 125 Tyr Lys Ile Glu Trp Tyr Asn His Leu Leu Leu Pro Ile Thr Leu Asn 130 135 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1500 tggtatgagc tcacgcccgc cgagactaca gttaggctac gagcgtacat gaacaccccg 1560 gggcttcccg tgtgccagga ccatcttgga ttttgggagg gcgtctttac gggcctcact 1620 catatagatg cccactttct atcccagaca aagcagagtg gggagaactt tccttacctg 1680 gtagcgtacc aagccaccgt gtgcgctagg gctcaagccc ctcccccatc gtgggaccag 1740 atgcggaagt gtttgatccg ccttaaaccc accctccatg ggccaacacc cctgctatac 1800 agactgggcg ctgttcagaa tgaagtcacc ctgacgcacc caatcaccaa atacatcatg 1860 acatgcatgt cggccgacct ggaggtcgtc acg 1893 <210> 369 <211> 1893 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding HCV NS3 protein <400> 369 gcccctatca cagcctacgc tcagcagaca agaggcctgc tgggctgcat catcacaagc 60 ctgaccggca gagacaagaa ccaggtggaa ggcgaggtgc agatcgtgtc tacagctacc 120 cagaccttcc tggccacctg tatcaatggc gtgtgctgga ccgtgtatca cggcgctggc 180 accagaacaa tcgcctctcc aaagggccct gtgatccaga cctacaccaa cgtggaccag 240 gatctcgttg gctggcctgc tcctcagggc agcagatctc tgaccccttg tacatgcggc 300 agcagcgacc tgtacctggt cacaagacac gccgacgtga tccccgtcag 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augaggaagu gccugauccg gcugaagccu acacugcacg gaccaacacc acugcuguau 1800 agacugggcg ccgugcagaa cgaagugacc cugacacauc ccaucaccaa guacaucaug 1860 accugcauga gcgccgaccu ggaagugguc aca 1893 <210> 371 <211> 127 <212> PRT <213> Dengue virus type 1 <400> 371 Ser Val Ser Gly Asp Leu Ile Leu Glu Ile Gly Lys Leu Pro Gln His 1 5 10 15 Leu Thr Gln Arg Ala Gln Asn Ala Leu Asp Asn Leu Val Met Leu His 20 25 30 Asn Ser Glu Gln Gly Gly Lys Ala Tyr Arg His Ala Met Glu Glu Leu 35 40 45 Pro Asp Thr Ile Glu Thr Leu Met Leu Leu Ala Leu Ile Ala Val Leu 50 55 60 Thr Gly Gly Val Thr Leu Phe Phe Leu Ser Gly Arg Gly Leu Gly Lys 65 70 75 80 Thr Ser Ile Gly Leu Leu Cys Val Ile Ala Ser Ser Ala Leu Leu Trp 85 90 95 Met Ala Ser Val Glu Pro His Trp Ile Ala Ala Ser Ile Ile Leu Glu 100 105 110 Phe Phe Leu Met Val Leu Leu Ile Pro Glu Pro Asp Arg Gln Arg 115 120 125 <210> 372 <211> 381 <212> DNA <213> Dengue virus type 1 <400> 372 agcgtctcag gtgacctaat attagaaata gggaaacttc cacaacattt aacgcaaagg 60 gcccagaacg ccttggacaa 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auggaucugc ugagagcccu gaucaugcug 180 ggcgauacca ugagcggcag aaucggcgga cagauccacc uggccaucau ggccguguuc 240 aagaugagcc cuggcuacgu gcugggcgug uuccugagaa agcugaccag cagagaaaca 300 gcccugaugg ucaucggaau ggccaugacc accgugcuga gcaucccuca cgaccugaug 360 gaacugaucg acggcaucag ccugggccug auccugcuga agaucgugac ccaguucgac 420 aacacccaag ugggcacacu ggcccugagc cugaccuuca ucagauccac aaugccccuc 480 gugauggccu ggcggacaau uauggccgug cuguucgucg ugacacugau cccucugugc 540 agaaccagcu gccugcagaa acagagccac ugggucgaga ucaccgcucu gauucuggga 600 gcacaggccc ugccugugua ccugaugaca cuuaugaagg gcgccagcag acgg 654 <210> 387 <211> 130 <212> PRT <213> Dengue virus type 1 <400> 387 Ser Trp Pro Leu Asn Glu Gly Ile Met Ala Val Gly Ile Val Ser Ile 1 5 10 15 Leu Leu Ser Ser Leu Leu Lys Asn Asp Val Pro Leu Ala Gly Pro Leu 20 25 30 Ile Ala Gly Gly Met Leu Ile Ala Cys Tyr Val Ile Ser Gly Ser Ser 35 40 45 Ala Asp Leu Ser Leu Glu Lys Ala Ala Glu Val Ser Trp Glu Glu Glu 50 55 60 Ala Glu His Ser Gly Ala Ser His Asn Ile Leu Val 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Dengue virus type 2 <400> 391 Ser Trp Pro Leu Asn Glu Ala Ile Met Ala Val Gly Met Val Ser Ile 1 5 10 15 Leu Ala Ser Ser Leu Leu Lys Asn Asp Ile Pro Met Thr Gly Pro Leu 20 25 30 Val Ala Gly Gly Pro Leu Thr Val Cys Tyr Val Leu Thr Gly Arg Ser 35 40 45 Ala Asp Leu Glu Leu Glu Arg Ala Ala Asp Val Lys Trp Glu Asp Gln 50 55 60 Ala Glu Ile Ser Gly Ser Ser Pro Ile Leu Ser Ile Thr Ile Ser Glu 65 70 75 80 Asp Gly Ser Met Ser Ile Lys Asn Glu Glu Glu Glu Gln Thr Leu Thr 85 90 95 Ile Leu Ile Arg Thr Gly Leu Leu Val Ile Ser Gly Leu Phe Pro Val 100 105 110 Ser Ile Pro Ile Thr Ala Ala Ala Trp Tyr Leu Trp Glu Val Lys Lys 115 120 125 Gln Arg 130 <210> 392 <211> 390 <212> DNA <213> Dengue virus type 2 <400> 392 agctggccat taaatgaggc tatcatggca gtcgggatgg tgagcatttt agccagttct 60 ctcctaaaaa atgatattcc catgacagga ccattagtgg ctggagggcc cctcactgtg 120 tgctacgtgc tcactggacg atcggccgat ttggaactgg agagagcagc cgatgtcaaa 180 tgggaagacc aggcagagat atcaggaagc agcccaatcc tgtcaataac aatatcagaa 240 gatggtagca 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coronavirus 2 <400> 429 augaugcuaa cuacuuccug uguuggcaua cuaauuguua cgacuauugu auuccauaca 60 auagugcaac uucuucaauu gucauuaccu ccggugaugg cacaacaaau cccauuacag 120 aacaugacua ccaaauuggu gguuauuuug agaaauggga aucuggag 168 <210> 430 <211> 171 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding Pangolin CoV-2 ORF3b*57 <400> 430 atgatgctga ccaccagctg tgtgggcatc ctgatcgtga ccaccatcgt gttccacaca 60 atcgtgcagc tgctgcagct cagcctgcct cctgttatgg cccagcagat ccctctgcag 120 aacatgacca caaagctggt cgtgatcctg cggaacggca acctggaatg a 171 <210> 431 <211> 171 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding Pangolin CoV-2 ORF3b*57 <400> 431 augaugcuga ccaccagcug ugugggcauc cugaucguga ccaccaucgu guuccacaca 60 aucgugcagc ugcugcagcu cagccugccu ccuguuaugg cccagcagau cccucugcag 120 aacaugacca caaagcuggu cgugauccug cggaacggca accuggaaug a 171 <210> 432 <211> 78 <212> PRT <213> Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 <400> 432 Met Met Leu Thr Thr Ser 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Syndrome virus <400> 439 auggacuacg ugucccugcu gaaccagauu uggcagaagu accugaacag ccccuacacc 60 accugucugu acauccccaa gccuaccgcc aaguacacac cucucguggg cacaucucug 120 caccccgugc uguggaauug ccagcugagc uuugccggcu acaccgaguc ugccgugaac 180 agcacaaagg cccuggccaa acaggacgcc gcucagagaa uugccuggcu gcugcacaag 240 gauggcggca ucccugaugg cuguagccug uaccugagac acagcagccu guucgcccag 300 agcgaggaag aggaauccuu cagcaac 327 <210> 440 <211> 330 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding MERS-ORF4a <400> 440 atggactacg tgtccctgct gaatcagatc tggcagaagt acctgaacag cccctacacc 60 acctgtctgt acatccccaa gcctaccgcc aagtacacac ctctcgtggg cacatctctg 120 caccccgtgc tgtggaattg ccagctgagc tttgccggct acaccgagag cgccgtgaat 180 agcacaaagg ccctggccaa acaggacgcc gctcagagaa ttgcctggct gctgcacaag 240 gatggcggca tccctgatgg ctgtagcctg tacctgagac acagcagcct gttcgcccag 300 agcgaggaag aggaatcctt cagcaactga 330 <210> 441 <211> 330 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised RNA encoding MERS-ORF4a <400> 441 auggacuacg ugucccugcu gaaucagauc uggcagaagu accugaacag ccccuacacc 60 accugucugu acauccccaa gccuaccgcc aaguacacac cucucguggg cacaucucug 120 caccccgugc uguggaauug ccagcugagc uuugccggcu acaccgagag cgccgugaau 180 agcacaaagg cccuggccaa acaggacgcc gcucagagaa uugccuggcu gcugcacaag 240 gauggcggca ucccugaugg cuguagccug uaccugagac acagcagccu guucgcccag 300 agcgaggaag aggaauccuu cagcaacuga 330 <210> 442 <211> 168 <212> PRT <213> Bovine viral diarrhea virus <400> 442 Met Glu Leu Ile Thr Asn Glu Leu Leu Tyr Lys Thr Tyr Lys Gln Lys 1 5 10 15 Pro Val Gly Val Glu Glu Pro Val Tyr Asp Gln Ala Gly Asp Pro Leu 20 25 30 Phe Gly Glu Arg Gly Ala Val His Pro Gln Ser Thr Leu Lys Leu Pro 35 40 45 His Lys Arg Gly Glu Arg Asp Val Pro Thr Asn Leu Ala Ser Leu Pro 50 55 60 Lys Arg Gly Asp Cys Arg Thr Gly Asn Ser Arg Gly Pro Val Ser Gly 65 70 75 80 Ile Tyr Leu Lys Pro Gly Pro Leu Phe Tyr Gln Asp Tyr Lys Gly Pro 85 90 95 Val Tyr His Arg Ala Pro Leu Glu Leu Phe Glu Glu Gly Ser Met Cys 100 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virus <400> 444 auggaguuga ucacaaauga acuuuuauac aaaacauaca aacaaaaacc cgucggggug 60 gaggaaccug uuuaugauca ggcaggugau cccuuauuug gugaaagggg agcaguccac 120 ccucaaucga cgcuaaagcu cccacacaag agaggggaac gcgauguucc aaccaacuug 180 gcauccuuac caaaaagagg ugacugcagg acggguaaua gcagaggacc ugugagcggg 240 aucuaccuga agccagggcc acuauuuuac caggacuaua aaggucccgu cuaucacagg 300 gccccgcugg agcucuuuga ggagggaucc augugugaaa cgacuaaacg gauagggaga 360 guaacuggaa gugacggaaa gcuguaccac auuuaugugu guauagaugg auguauaaua 420 auaaaaagug ccacgagaag uuaccaaagg guguucaggu ggguccauaa uaggcuugac 480 ugcccucuau gggucacaag uugc 504 <210> 445 <211> 507 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Codon optimised DNA encoding BVDV nPro <400> 445 atggaactga tcaccaacga gctgctgtac aagacctaca agcagaaacc cgtgggcgtc 60 gaggaacccg tgtatgatca agctggcgac cctctgtttg gcgagagagg cgctgttcac 120 cctcagagca cactgaagct gccccacaag cggggcgaaa gagatgtgcc taccaacctg 180 gccagcctgc ctaagagagg cgattgcaga accggcaata gcagaggccc tgtgtccggc 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180 atcatcctgg aatgcgtgta ctgcaagcag cagctcctgc ggagagaggt gtacgatttc 240 gccttccggg acctgtgcat cgtgtacaga gatggcaacc cctacgccgt gtgcgacaag 300 tgcctgaagt tctacagcaa gatcagcgag taccggcact actgctacag cctgtacggc 360 accacactgg aacagcagta caacaagccc ctgtgcgacc tgctgatccg gtgcatcaac 420 tgccagaaac ctctgtgccc cgaggaaaag cagcggcacc tggacaagaa gcagcggttc 480 cacaacatca gaggccggtg gaccggcaga tgcatgagct gttgtcggag cagcagaacc 540 agacgggaaa cccagctgtg agcggccgcg aattggcaag ctgcttacat agaactcgcg 600 gcgattggca tgccgcctta aaatttttat tttatttttc ttttcttttc cgaatcggat 660 tttgttttta atatttcaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aa 712 <210> 459 <211> 2520 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Recombinant vector <400> 459 cggagacggc gcagaagaag aggatctggc gaaggcagag gcagcctgct tacatgtggc 60 gacgtggaag agaaccccgg acctatgcac cagaaacgga ccgccatgtt ccaggatcct 120 caagagaggc ccagaaagct gcctcagctg tgtaccgagc tgcagaccac catccacgac 180 atcatcctgg aatgcgtgta ctgcaagcag cagctcctgc ggagagaggt gtacgatttc 240 gccttccggg acctgtgcat cgtgtacaga gatggcaacc cctacgccgt gtgcgacaag 300 tgcctgaagt tctacagcaa gatcagcgag taccggcact actgctacag cctgtacggc 360 accacactgg aacagcagta caacaagccc ctgtgcgacc tgctgatccg gtgcatcaac 420 tgccagaaac ctctgtgccc cgaggaaaag cagcggcacc tggacaagaa gcagcggttc 480 cacaacatca gaggccggtg gaccggcaga tgcatgagct gttgtcggag cagcagaacc 540 agacgggaaa cccagctgtg agcggccgcg aattggcaag ctgcttacat agaactcgcg 600 gcgattggca tgccgcctta aaatttttat tttatttttc ttttcttttc cgaatcggat 660 tttgttttta atatttcaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aacgcgtcga 720 ggggaattaa ttcttgaaga cgaaagggcc aggtggcact tttcggggaa atgtgcgcgg 780 aacccctatt tgtttatttt tctaaataca ttcaaatatg tatccgctca tgagacaata 840 accctgataa atgcttcaat aatattgaaa aaggaagagt atgagtattc aacatttccg 900 tgtcgccctt attccctttt ttgcggcatt ttgccttcct gtttttgctc acccagaaac 960 gctggtgaaa gtaaaagatg ctgaagatca gttgggtgca cgagtgggtt acatcgaact 1020 ggatctcaac agcggtaaga tccttgagag ttttcgcccc gaagaacgtt ttccaatgat 1080 gagcactttt aaagttctgc tatgtggcgc ggtattatcc cgtgttgacg ccgggcaaga 1140 gcaactcggt cgccgcatac actattctca gaatgacttg gttgagtact caccagtcac 1200 agaaaagcat cttacggatg gcatgacagt aagagaatta tgcagtgctg ccataaccat 1260 gagtgataac actgcggcca acttacttct gacaacgatc ggaggaccga aggagctaac 1320 cgcttttttg cacaacatgg gggatcatgt aactcgcctt gatcgttggg aaccggagct 1380 gaatgaagcc ataccaaacg acgagcgtga caccacgatg cctgtagcaa tggcaacaac 1440 gttgcgcaaa ctattaactg gcgaactact tactctagct tcccggcaac aattaataga 1500 ctggatggag gcggataaag ttgcaggacc acttctgcgc tcggcccttc cggctggctg 1560 gtttattgct gataaatctg gagccggtga gcgtgggtct cgcggtatca ttgcagcact 1620 ggggccagat ggtaagccct cccgtatcgt agttatctac acgacgggga gtcaggcaac 1680 tatggatgaa cgaaatagac agatcgctga gataggtgcc tcactgatta agcattggta 1740 actgtcagac caagtttact catatatact ttagattgat ttaaaacttc atttttaatt 1800 taaaaggatc taggtgaaga tcctttttga taatctcatg accaaaatcc cttaacgtga 1860 gttttcgttc cactgagcgt cagaccccgt agaaaagatc aaaggatctt cttgagatcc 1920 tttttttctg cgcgtaatct gctgcttgca aacaaaaaaa ccaccgctac cagcggtggt 1980 ttgtttgccg gatcaagagc taccaactct ttttccgaag gtaactggct tcagcagagc 2040 gcagatacca aatactgtcc ttctagtgta gccgtagtta ggccaccact tcaagaactc 2100 tgtagcaccg cctacatacc tcgctctgct aatcctgtta ccagtggctg ctgccagtgg 2160 cgataagtcg tgtcttaccg ggttggactc aagacgatag ttaccggata aggcgcagcg 2220 gtcgggctga acggggggtt cgtgcacaca gcccagcttg gagcgaacga cctacaccga 2280 actgagatac ctacagcgtg agcattgaga aagcgccacg cttcccgaag ggagaaaggc 2340 ggacaggtat ccggtaagcg gcagggtcgg aacaggagag cgcacgaggg agcttccagg 2400 gggaaacgcc tggtatcttt atagtcctgt cgggtttcgc cacctctgac ttgagcgtcg 2460 atttttgtga tgctcgtcag gggggcggag cctatggaaa aacgccagca acgcgagctc 2520 2520

Claims (24)

  1. (ⅰ) 적어도 하나의 치료 생체분자; 및 (ⅱ) 적어도 하나의 바이러스 선천적 억제제 단백질(IIP);을 암호화하는 RNA 구조체.
  2. 청구항 1에 있어서,
    상기 구조체는 mRNA 분자인 RNA 구조체.
  3. 청구항 1에 있어서,
    상기 구조체는 saRNA 분자인 RNA 구조체.
  4. 청구항 1 내지 청구항 3 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 구조체는 알파바이러스; 피코르나바이러스; 플라비바이러스; 루비바이러스; 페스티바이러스; 헤파시바이러스; 칼리시바이러스 및 코로나바이러스;로 이루어진 속의 군으로부터 선택되는 양성 가닥 RNA 바이러스, 바람직하게는 알파바이러스, 임의적으로는 VEEV를 포함하거나 이로부터 유래되는 RNA 구조체.
  5. 청구항 1 내지 청구항 4 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은
    (ⅰ) HPV16 E6, 또는 그의 동원체;
    (ⅱ) HSV ICP34.5, 또는 그의 동원체;
    (ⅲ) HCV E2, 또는 그의 동원체;
    (ⅳ) HCV NS5a, 또는 그의 동원체;
    (ⅴ) VACV E3L, 또는 그의 동원체;
    (ⅵ) VACV K3L, 또는 그의 동원체;
    (ⅶ) MERS ORF8B, 또는 그의 동원체;
    (ⅷ) KSHV ORF52, 또는 그의 동원체; 및/또는
    (ⅸ) 에볼라 VP35, 또는 그의 동원체;인 RNA 구조체.
  6. 청구항 1 내지 청구항 5 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 백시니아 C6, 또는 그의 동원체인 RNA 구조체.
  7. 청구항 1 내지 청구항 6 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 EV71-2Apro, 또는 그의 동원체인 RNA 구조체.
  8. 청구항 1 내지 청구항 7 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 BVDV nPro, 또는 그의 동원체인 RNA 구조체.
  9. 청구항 1 내지 청구항 8 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 HSV Us1, 또는 그의 동원체인 RNA 구조체.
  10. 청구항 1 내지 청구항 9 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 원숭이 바이러스 5(PIV5 비-구조 단백질 V), 또는 그의 동원체인 RNA 구조체.
  11. 청구항 1 내지 청구항 10 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 (i) 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*57 변이체, 또는 그의 동원체, 또는 (ii) 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*57 에콰도르 변이체, 또는 그의 동원체인 RNA 구조체.
  12. 청구항 1 내지 청구항 11 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 (i) 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*57 천산갑 변이체, 또는 그의 동원체, 또는 (ii) 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*79 변이체, 또는 그의 동원체인 RNA 구조체.
  13. 청구항 1 내지 청구항 12 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 적어도 하나의 선천적 억제제 단백질(IIP)은 야생형 SARS-CoV-2 ORF3b의 ORF3b*79 천산갑 변이체, 또는 그의 동원체인 RNA 구조체.
  14. 청구항 1 내지 청구항 13 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 치료 생체분자는 치료 단백질을 포함하고, 바람직하게는 상기 단백질 또는 펩티드는 항원, 보다 바람직하게는 바이러스 항원인 RNA 구조체.
  15. 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체를 암호화하는 핵산 서열.
  16. 청구항 15에 따른 핵산 서열을 포함하는 발현 카세트.
  17. 청구항 16에 따른 발현 카세트를 포함하는 재조합 벡터.
  18. 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체, 청구항 15에 따른 핵산 서열, 청구항 16에 따른 발현 카세트 또는 청구항 17에 따른 벡터, 및 약학적으로 허용가능한 비히클을 포함하는 약학적 조성물.
  19. 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체의 제조 방법으로서,
    상기 방법은
    a) ⅰ) 숙주 세포 내로 청구항 17에 따른 벡터를 도입하는 단계; 및
    ⅱ) 상기 숙주 세포를 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체의 생산을 야기하는 조건 하에 배양하는 단계; 또는
    b) 청구항 17에 따른 벡터로부터 RNA 구조체를 전사하는 단계;를 포함하는 방법.
  20. 약제로서 또는 치료법에 사용하기 위한 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체, 청구항 15에 따른 핵산 서열, 청구항 16에 따른 발현 카세트 또는 청구항 17에 따른 벡터 또는 청구항 18에 따른 약학적 조성물.
  21. 원생동물, 진균, 박테리아 또는 바이러스 감염의 예방, 개선 또는 치료에 사용하기 위한 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체, 청구항 15에 따른 핵산 서열, 청구항 16에 따른 발현 카세트 또는 청구항 17에 따른 벡터 또는 청구항 18에 따른 약학적 조성물.
  22. 암의 예방, 개선 또는 치료에 사용하기 위한 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체, 청구항 15에 따른 핵산 서열, 청구항 16에 따른 발현 카세트, 청구항 17에 따른 벡터 또는 청구항 18에 따른 약학적 조성물.
  23. 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체, 청구항 15에 따른 핵산 서열, 청구항 16에 따른 발현 카세트, 청구항 17에 따른 벡터 또는 청구항 18에 따른 약학적 조성물을 포함하는 백신.
  24. 대상체에서 면역 반응의 자극에 사용하기 위한 것이고, 임의적으로 상기 면역 반응은 원생동물, 박테리아, 바이러스, 진균 또는 암에 대해 자극되는 것인 청구항 1 내지 청구항 14 중 어느 한 항에 따른 RNA 구조체, 청구항 15에 따른 핵산 서열, 청구항 16에 따른 발현 카세트, 청구항 17에 따른 벡터 또는 청구항 18에 따른 약학적 조성물.
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