KR20230074664A - 코로나19 변이&전사 방지 말단결합 헤어핀 상보적 dna 염기조성물 - Google Patents

코로나19 변이&전사 방지 말단결합 헤어핀 상보적 dna 염기조성물 Download PDF

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Abstract

코로나19 혹은 신종코로나바이러스감염증, COVID-19 의 경우 새로운 문화를 창조할 정도로 이 바이러스는 전 인류적인 문제를 일으켰으며, 이로 인해 골머리를 앓는 지도자들과 과학자들이 많았다. 비대면 문화를 생성시켜서 수많은 일을 디지털화 하는데 일조하기도 했지만, 2023년 기준 최소 600만명의 소중한 생명을 앗아간 치명적인 바이러스다. 코로나19 변이 중에는 alpha 변이, beta 변이, gamma 변이, delta 변이, mu 변이부터 오미크론 및 하위, 변종 변이까지 끊임없는 변이종이 나오는 + sense RNA 바이러스이다. 본 발명으로 해결하려는 과제는 코로나19용 전사 방지 및 자동 소멸 촉진을 위한 플랫폼이다. 이 COVID는 굵고 길게 간다. SARS 보다 GC content 가 5% 낮고, RNA DNA 바이러스 통틀어 최하위를 기록한다. 유전체가 너무 길어 잘게 쪼개서 2차구조를 보고 있는데, 10동강을 내야 하고, 정확한 자유에너지 분석이 안된다. 이를 대응하기 위한 조성물 발명이다.

Description

코로나19 변이&전사 방지 말단결합 헤어핀 상보적 DNA 염기조성물{COVID-19 mutation and translation blocker complementary DNA hairpin folder}
본 발명은 코로나19의 변이 진화 과정을 방지하기 위한 생화학적 결합 앱타머 기술이다.
코로나19는 현대의 페스트라 불리울 정도로 수많은 목숨을 앗아갔다. 전파력은 강한데 상대적으로 작은 치명률로 안전 불감증을 일으키기에 충분하며, 이로 인해 많은 사람들이 안도하는 지경에 이르러 갑자기 사이토카인 스톰으로 죽는 경우가 많다. 코로나19 변이 중에는 alpha 변이, beta 변이, gamma 변이, delta 변이, mu 변이부터 오미크론 변이까지 끊임없는 변이종이 나오는 + sense RNA 바이러스이다.
새로운 문화를 창조할 정도로 이 바이러스는 전 인류적인 문제를 일으켰으며, 이로 인해 골머리를 앓는 지도자들과 과학자들이 많았다. 비대면 문화를 생성시켜서 수많은 일을 디지털화 하는데 일조하기도 했지만, 2023년 기준 최소 600만명의 소중한 생명을 앗아간 치명적인 바이러스다. 관련 백신은 스푸트니크V를 비롯하여 모더나, 화이자, 아스트라제네카, 얀센 그리고 치료제인 머크와 화이자 먹는 치료제 등이 출시되었다.
[특허문헌1] KR20200032050A [특허문헌2] RU2720614C1 [특허문헌3] WO2021226019A3 [특허문헌4] CN113444830A
[실시예 1] Convergent evolution of SARS-CoV-2 spike mutations, L452R, E484Q and P681R, in the second wave of COVID-19 in Maharashtra, India. https://www.biorxiv.org/content../2021.04.22.440932v2
본 발명으로 해결하려는 과제는 코로나19용 전사 방지 및 자동 소멸 촉진을 위한 플랫폼이다.
코로나 바이러스에 감염된 사람이 코로 분비물을 흡입하면 되는 구조이다. 적절한 임상시험이 필요하며 긴급사용승인이 가능하다.
코로나19 변이의 억제효과(시험관 내)
[도 1] 폴드 접합체의 구조
[도 2] 코로나 바이러스의 변이 조사 보고서 및 특징 정리
[도 3] 코로나19 관련 대처 방법의 업데이트된 고안
계절성 인플루엔자처럼 갈 가능성은 높아보인다. 하지만 보통 가늘고 길게 혹은 굵고 짧게 바이러스가 가는게 대부분인데, 이 COVID는 굵고 길게 간다. SARS 보다 GC content 가 5% 낮고, RNA DNA 바이러스 통틀어 최하위를 기록한다. 유전체가 너무 길어 잘게 쪼개서 2차구조를 보고 있는데, 10동강을 내야 하고, 정확한 자유에너지 분석이 안된다. 헤어핀 분석도 마찬가지.
다만 굵고 길게 가는데에는 수세미처럼 웅크리는 유전체와 그러면서 낮은 GC content 로 숙주 세포질에서 번식하고 호텔처럼 머물다 증식하고 나간다는 점이다. 그래서 나도 이를 인지하고, 변이가 나올때마다 원천 차단하기 위해 리포솜 약물전달 분무형 단일가닥 DNA를 제안한 것이다.
프라이머 제작소에 오더해서 대량생산 하면, 이들을 히스톤 분산에 쓴것 처럼, PCR 검사 순비용 + 바이알 비용 + 리포좀비용 + 기타 인건비가 원자재 단가가 된다. 치료제를 처음부터 고집했던 이유가, 그렇게 해야 어떤 방식의 치료제든 격멸이, 종식이 가능하다. 그 외 심리학적 설문도 가능하다 (준 의료행위일 경우 특허 대상은 아니고, 설명에 불과함).
1. 코로나19 이후 예민해지고 불안한 경우 어떻게 해야 하면 완화 할 수 있는가?
정신분석적 방법으로 종이에 불안한 혹은 예민한 내용을 쓰는 것이 도움이 된다고 판단하고 있음. 그래서 일기장 방법 등 추천됨 .
2. 불안과 우울 공포증은 무엇이 다른가?
우울정신에너지가 떨어진 상태고, 불안미래에 대한 정신적 취약이다. 그 요소가 해결되면 되는게불안에 가깝다고 볼 수 있음. 공포도 이미 있는 것에 대한 것으로 무지(예시: 어둠에 대한 두려움)에의해생긴다는 점에서 좀 다르다. (출처: DSM-V, ICD-11).
3. 코로나 치료 후 몸이 많이 약해졌는데 어떻게 하면 좋을지?
멀티비타민등 균형적 영양 보충이 필요. 몸이 에너지를 많이 썼기 때문. 그래서 멀티비타민을 초기완치 후 요법으로 추천. 어떤 영양소부터 부족해졌는지 알지 못하기 때문 .
4. 그 밖에 유의사항은 없는지?
마스크 착용시, 자가호흡으로 이산화 탄소 누적으로 졸음이 올 수 있습니다. 뇌 연수 조절 중추가 이를 감지한다. 운송수단 밀폐된 공간으로 어쩔 수 없이 장기간 착용시, 산소 공급 등 환기할 방법을 반드시 찾는 것이 중요. 졸음이 위험요소가 되는 여건 등.
델타가 B.1.617. 로 불리우는 변이이다. 2021년에 창궐한 변이로 인도발 변이이기도 하다. 수많은 사상자를 내어 안전불감증의 조사대상이 되는 변이다.
The World Health Organization - introduced a new naming system, based on the Greek alphabet, for coronavirus variants in the spring 2021. )
인도발 변이 관련 논문: Convergent evolution of SARS-CoV-2 spike mutations, L452R, E484Q and P681R, in the second wave of COVID-19 in Maharashtra, India. https://www.biorxiv.org/content../2021.04.22.440932v2(링크 내 이미지와 논문내용의 저작권은 CC-BY-NC-ND 4.0 International license에 따른 위 논문의 저자들에 있음)
이 논문은 한마디로 아미노산 중에
452번째 류신(L)<->아르기닌(R)
484번째 글루탐산(E) <-> 글루타민(Q)
681번째 프롤린(P) <->아르기닌(R)
변화가 주로 나타났다고 보고하고 있음.
본 논문에서는, 자세하게 어떤 부분 ACE2(안지오텐신 변환효소2 - 혈압조절관련성 있는 효소) 관련 결합부분이 변이가 생겼는지 Figure/ Supp. Figure 그리고 3D Stereotype 이미지와 함께 60쪽 가량으로 보고를 배포하고 있음.
개인적 발명 예시의 시뮬레이션은은, 세개의 치환 모두 아미노산 성질을 보면,
소수성 <->전하성
전하성<-> 비전하극성
특이 아미노산 <-> 전하성
등의 변화가 일어났으며, 전하성이 3차원적으로 확연히 발현되어, 엄청난 3차구조 변화를 일으킬 수 있는 치환이다. 특히 세번째 치환 특이아미노산 프롤린은 단백질이 접히는 부위가 있는 곳에 존재하는 것으로, 이것이 전하성으로 치환되면 스파이크 단백질의 구조 자체가 달라질 수도 있다. 이에대한 서열의 업데이트가 필요하므로 서열목록을 첨부하지 않는다.

Claims (5)

  1. alpha 변이, beta 변이, gamma 변이, delta 변이, mu 변이부터 오미크론 및 하위, 변종 변이까지 끊임없는 변이종이 나오는 + sense RNA 바이러스에 있어서 양 끝에 50-100 nt의 single strand 상보적 DNA를 설계된 조성물로 [도1]을 참조하여 그 결합 길이가 각각 10-20 nt 에 해당 하는 조성물
  2. 제 1항에 있어서 변이가 펙토리얼 변이 기법으로 [도2]와 같이 변이가 증가하는 바이러스에 시뮬레이션 하는 것으로 하는 조성물로, 섭씨 35-38도에서 작용하는 조성물
  3. COVID-19 델타 변이와 같이 세개의 치환 모두 아미노산 성질을 보면,
    소수성 <->전하성
    전하성<-> 비전하극성
    특이 아미노산 <-> 전하성
    등의 변화가 일어났으며, 전하성이 3차원적으로 확연히 발현되어, 엄청난 3차구조 변화를 일으킬 수 있는 치환, 특히 세번째 치환 특이아미노산 프롤린은 단백질이 접히는 부위가 있는 곳에 존재하는 것으로, 이것이 전하성으로 치환되면 스파이크 단백질의 구조 자체가 달라질 수도 있는 것을 50-100 nt의 single strand 상보적 DNA를 설계된 조성물로 [도1]을 참조하여 그 결합 길이가 각각 10-20 nt 에 해당 하는 조성물
  4. 제 3항에 있어서 그 DNA 절편을 리포좀으로 수송하는 방법으로 상온인 25도 섭씨와 40도 섭씨를 온도 범위로 하는 것
  5. 제 3항에 있어서 자유에너지를 가우시안 함수 통계 분석 및 Chi square test 로 분석하는 방법
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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KR20200032050A (ko) 2020-03-05 2020-03-25 김승찬 COVID-19 바이러스 맞춤형 삼중 knockout DNA 치료제
RU2720614C1 (ru) 2020-04-23 2020-05-12 федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации Иммунобиологическое средство и способ его использования для индукции специфического иммунитета против вируса тяжелого острого респираторного синдрома SARS-CoV-2 (варианты)
CN113444830A (zh) 2020-03-27 2021-09-28 中国科学院合肥物质科学研究院 用于检测SARS-CoV-2冠状病毒的试剂盒及其专用引物和探针
WO2021226019A2 (en) 2020-05-04 2021-11-11 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for treating viral infections

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20200032050A (ko) 2020-03-05 2020-03-25 김승찬 COVID-19 바이러스 맞춤형 삼중 knockout DNA 치료제
CN113444830A (zh) 2020-03-27 2021-09-28 中国科学院合肥物质科学研究院 用于检测SARS-CoV-2冠状病毒的试剂盒及其专用引物和探针
RU2720614C1 (ru) 2020-04-23 2020-05-12 федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации Иммунобиологическое средство и способ его использования для индукции специфического иммунитета против вируса тяжелого острого респираторного синдрома SARS-CoV-2 (варианты)
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