KR20230043151A - 증강된 바이러스-유사 입자 및 세포에의 전달을 위한 그의 사용 방법 - Google Patents
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Abstract
증강된 바이러스-유사 입자 (eVLP)로서, 외부 측 상에 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질을 보유하는 인지질 이중층을 포함하는 막; 및 막 내측 상의 eVLP 코어에 배치되는 카고를 포함하며, 여기서 eVLP는 외인성 gag/pol 단백질을 포함하지 않는 것인 eVLP, 및 세포에의 카고의 전달을 위한 그의 사용 방법.
Description
우선권 주장
본 출원은 2020년 7월 24일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 63/056,125의 이익을 주장한다. 상기의 전체 내용은 참조로 포함된다.
연방 후원 연구 또는 개발
본 발명은 국립 보건원(National Institutes of Health)에 의해 교부되는 교부금 번호 GM118158 하의 정부 지원으로 이루어졌다. 정부는 본 발명에 있어서 소정의 권리를 가진다.
기술 분야
본원에서 기술되는 것은 증강된 바이러스-유사 입자 (eVLP)로서, 외부 측 상에 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질을 보유하는 인지질 이중층을 포함하는 막; 및 막 내측 상의 eVLP 코어에 배치되는 카고를 포함하며, 여기서 eVLP는 임의의 인간 내인성 또는 외인성 바이러스 gag 또는 pol로부터의 단백질을 포함하지 않는 것인 eVLP, 및 세포에의 카고의 전달을 위한 그의 사용 방법이다.
살아있는 세포의 시토졸에의 단백질, 핵산 및/또는 화학물질과 같은 카고의 전달은 생물학적 치료제의 개발에 있어서 상당한 장애가 되고 있다.
본원에서 기술되는 것은 매우 다양한 페이로드, 예를 들어, 핵산 (DNA, RNA) 또는 단백질을 포함한 생체분자, 소형 분자를 포함한 화학적 화합물, 및/또는 다른 분자, 및 이들의 임의의 조합을 패키징하여 진핵 세포로 전달할 수 있는 증강된 바이러스-유사 입자 (eVLP)이다. 본원에서 기술되는 비-바이러스 eVLP 시스템은 통상적인 인공-유래 지질/금 나노입자 및 바이러스 입자-기반 전달 시스템에 비해 더 단순하며, 더 효율적이고, 더 안전할 가능성을 가지고 있는데, 적어도 그 이유는 eVLP는 ENV 이외에는 바이러스-유래 구성요소를 갖고 있지 않으며, eVLP는 화학물질-기반 이량체화제를 이용할 수는 있으나 그를 필요로 하지는 않고, eVLP는 특수 단일 및/또는 이중-가닥 DNA 분자 (예를 들어 플라스미드, 미니 서클, 폐쇄형-말단 선형 DNA, AAV DNA, 에피솜, 박테리오파지 DNA, 상동성 유도 복구 주형 등), 단일 및/또는 이중-가닥 RNA 분자 (예를 들어 단일 가이드 RNA, 프라임 편집 가이드 RNA, 메신저 RNA, 전달 RNA, 긴 비-코딩 RNA, 원형 RNA, RNA 레플리콘, 원형 또는 선형 스플라이싱 RNA, 마이크로 RNA, 소형 간섭 RNA, 짧은 헤어핀 RNA, piwi-상호작용 RNA, 토홀드 스위치 RNA, RNA 결합 단백질에 의해 결합될 수 있는 RNA, 박테리오파지 RNA, 내부 리보솜 진입 부위 함유 RNA 등), 단백질, 화학적 화합물 및/또는 분자, 및 상기 열거된 카고 (예를 들어 AAV 입자)의 조합을 패키징하여 전달할 능력을 가지고 있기 때문이다. 막 배열구조, 신규한 혁신적인 로딩 전략에 의해 가능한 막대한 가능 카고의 다양성, 제한적인 DNA/RNA 길이 제약의 부재, 임의의 바이러스 gag 또는 pol로부터 유래하는 단백질의 부재, 및 세포 진입 메커니즘으로 인하여, 본원에서 기술되는 eVLP는 통상적인 레트로바이러스 입자, 바이러스-유사 입자 (VLP), 엑소솜, 및 카고가 로딩될 수 있는 다른 지금까지 기술된 세포외 소포와는 상이하다.
본원에서 기술되는 것은 많은 질환 치료법에 적용가능한 게놈 편집, 에피게놈 조정, 전사체 편집 및 단백질체 조정 시약을 포함한 다양한 일련의 단백질 및 핵산 분자와 함께 사용될 수 있는 카고 전달을 위한 조성물 및 방법이다.
이에 따라, 본원에서 제공되는 것은 외부 측 상에 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질 (예를 들어 표 1에 제시된 바와 같은 것)을 보유하는 인지질 이중층을 포함하는 막; 및 임의적으로 막 내측 상의 eVLP 코어에 배치되는 카고를 포함하며, 여기서 eVLP는 임의의 gag 및/또는 pol 단백질을 포함하지 않는 것인 eVLP이다.
또한 본원에서 제공되는 것은 표적 세포, 예를 들어, 생체내 또는 시험관내 세포로 카고를 전달하는 방법이다. 상기 방법은 카고로서 생체분자 및/또는 화학물질을 포함하는 본원에서 기술되는 바와 같은 eVLP와 세포를 접촉시키는 것을 포함한다.
본원에서 추가적으로 제공되는 것은, 예를 들어, 생체분자 카고를 포함하는 eVLP를 생산하는 방법이다. 상기 방법은 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질 (ENV) (예를 들어 표 1에 제시된 바와 같은 것), 및 카고 생체분자 및/또는 화학물질을 발현하는 세포로서, 외인성 gag 및/또는 pol 단백질을 발현하지 않는 세포를 제공하는 것; 및 세포가 eVLP를 생산하도록 하는 조건 하에서 세포를 유지하는 것을 포함한다.
일부 실시양태에서, 상기 방법은 생산된 eVLP를 수확하고, 임의적으로 정제하고/거나 농축시키는 것을 포함한다.
일부 실시양태에서, 상기 방법은 ENV (예를 들어 표 1에 제시된 바와 같은 것) 이외의 임의의 외인성 단백질, 및, 원하는 경우에, 원형질 막 동원 도메인 (예를 들어 표 6에 제시된 바와 같은 것)을 발현하도록 조작되어 있거나 조작되어 있지 않은 세포를 사용하는 것을 포함한다. 이와 같은 실시양태에서, 생산되는 "빈" 입자에는 뉴클레오펙션, 지질, 중합체 또는 CaCl2 형질감염, 초음파처리, 냉동 해동, 및/또는 카고와 혼합된 정제된 입자의 열 충격을 이용하는 것에 의해 카고가 로딩될 수 있다. 모든 실시양태에서, 생산자 세포는 임의의 바이러스 gag 단백질을 발현하지 않는다. 이와 같은 유형의 로딩은 카고가 원형질 막 동원 도메인에의 융합에 의해 변형되지 않는 것을 가능하게 함으로써, 이전 VLP 기술로부터의 상당한 진전을 나타낸다.
본원에서 또한 제공되는 것은 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질 (예를 들어 표 1에 제시된 바와 같은 것), 및 카고를 발현하는 세포로서, 외인성 gag 단백질을 발현하지 않는 세포이다. 일부 실시양태에서, 상기 세포는 1차 또는 안정한 인간 세포주, 예를 들어, 인간 배아 신장 (HEK) 293 세포 또는 HEK293 T 세포이다.
일부 실시양태에서, 입자의 외부 표면은 scFv, 나노바디, darpin, 및/또는 세포-특이적 진입을 가능하게 하는 다른 표적화 펩티드를 함유할 수 있다.
일부 실시양태에서, 생체분자 카고는 치료용 또는 진단용 단백질, 또는 치료용 또는 진단용 단백질을 코딩하는 핵산이다.
일부 실시양태에서, 카고는 화학적 화합물 또는 분자이다.
일부 실시양태에서, 화학적 분자는 A/C 이종이량체화제 또는 라파마이신과 같은 다량체화 중 단백질-단백질 이량체화를 위한 촉발제이다.
일부 실시양태에서, 화학적 화합물은 상동성 유도 복구 유전자 편집을 강력하게 증강시키는 M3814, NU7026 또는 NU7441와 같은 DNA PK 억제제이다.
일부 실시양태에서, 카고는 유전자 편집 시약이다.
일부 실시양태에서, 유전자 편집 시약은 아연 핑거 (ZF), 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE) 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질; 아연 핑거 (ZF), 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE) 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 코딩하는 핵산; 또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 포함하는 리보핵단백질 복합체 (RNP)를 포함한다.
일부 실시양태에서, 유전자 편집 시약은 표 2, 3, 4 & 5에 열거되어 있는 단백질로부터 선택된다.
일부 실시양태에서, 유전자 편집 시약은 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 포함하고, eVLP는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질에 결합하여 그를 표적 서열로 안내하는 1종 이상의 가이드 RNA를 추가로 포함한다.
일부 실시양태에서, 카고는, 바람직하게는 표 6에 제시된 바와 같은 원형질 막 동원 도메인에의 공유 또는 비-공유 연결을 포함한다. 예를 들어, 공유 연결은 단일 판독 프레임, 펩티드 결합을 형성할 수 있는 인테인, R-기에서 공유 연결을 형성할 수 있는 다른 단백질 및/또는 RNA 스플라이싱으로부터 생성되는 직접적인 단백질-단백질 융합을 포함할 수 있다. 예를 들어, 비-공유 연결은 DNA/DNA, DNA/RNA 및/또는 RNA/RNA 혼성체 (수소-결합 상호작용을 통하여 다른 핵산에 염기 쌍을 형성하는 핵산), 화학적 화합물/분자에 대한 필요성이 있거나 없이 이량체화 또는 다량체화하여 단백질-단백질 결합을 유도하는 단백질 도메인, 단일 사슬 가변 단편, 나노바디, 아피바디, DNA 및/또는 RNA에 결합하는 단백질, 사차 구조적 상호작용을 가지는 단백질, 특정 광 파장의 존재 하에서 이량체화 또는 다량체화할 수 있는 광유전학적 단백질 도메인, 및/또는 자연적으로 재구성하는 스플릿 단백질을 포함할 수 있다.
일부 실시양태에서, 카고는 이량체화 또는 단백질-단백질 결합을 촉발하는 분자를 필요로 할 수 있거나 필요로 하지 않을 수 있는 이량체화 도메인 또는 단백질-단백질 결합 도메인에의 융합체를 포함한다.
일부 실시양태에서, 생산자 세포는 FDA-승인 세포주, 동종이형 세포, 및/또는 공여자로로부터 유래하는 자가 세포이다.
일부 실시양태에서, 면역원성을 감소시키기 위하여, eVLP 표면에 인간 CD47의 완전 또는 활성 펩티드 도메인이 도입될 수 있다.
본원에서 포함되는 AAV 단백질의 예는 AAV REP 52, REP 78 및 VP1-3이다. 단백질이 삽입될 수 있는 캡시드 부위는 VP1 아미노산 계수로부터 시작하여 T138이다. 이량체화 도메인은 예를 들어 캡시드의 이와 같은 부위에 삽입될 수 있다.
소형 분자 유도인자를 필요로 할 수 있거나 필요로 하지 않을 수 있는 본원에서 포함되는 이량체화 도메인의 예는 dDZF1, dDZF2, DmrA, DmrB, DmrC, FKBP, FRB, GCN4 scFv, 10x/24x GCN4, GFP 나노바디 및 GFP이다.
본원에서 포함되는 스플릿 인테인의 예는 Npu DnaE, Cfa, Vma 및 Ssp DnaE이다.
함께 공유 결합을 형성하는 본원에서 포함되는 다른 스플릿 단백질의 예는 스파이 태그(Spy Tag) 및 스파이 캣처(Spy Catcher)이다.
본원에서 포함되는 RNA 결합 단백질의 예는 MS2, Com 및 PP7이다.
본원에서 포함되는 합성 DNA-결합 아연 핑거의 예는 ZF6/10, ZF8/7, ZF9, MK10, 아연 핑거 268 및 아연 핑거 268/NRE이다.
본원에서 포함되는 사차 구조의 결과로서 다량체화되는 단백질의 예는 이. 콜리(E. coli) 페리틴, 및 페리틴의 다른 키메라 형태이다.
본원에서 포함되는 광유전학적 "광-유도성 단백질"의 예는 Cry2, CIBN 및 Lov2-Ja이다.
본원에서 포함되는 형질도입을 증강시키는 펩티드의 예는 L17E, 벡토푸신, KALA, 및 다양한 형태의 니신이다.
달리 정의되지 않는 한, 본원에서 사용되는 모든 기술 및 과학 용어는 본 발명이 속하는 관련 기술분야 통상의 기술자에 의해 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 가진다. 본 발명에서 사용하기 위한 방법 및 재료가 본원에서 기술되는 바; 관련 기술분야에 알려져 있는 다른 적합한 방법 및 재료가 또한 사용될 수 있다. 재료, 방법 및 예는 오로지 예시적인 것으로서, 제한하고자 하는 것이 아니다. 본원에서 언급되는 모든 공개물, 특허 출원, 특허, 서열, 데이터베이스 엔트리, 및 다른 참고문헌은 그 전체가 참조로 포함된다. 상충의 경우, 정의를 포함한 본 명세서가 우선할 것이다.
본 발명의 다른 특색 및 이점은 하기의 상세한 설명 및 도면, 및 청구범위로부터 명백해질 것이다.
도 1: 예시적인 T2eVLP/T4eVLP 생산 및 RNP/단백질 전달을 위한 형질도입의 도시. 모든 eVLP 발현 구축물은 생산자 세포의 게놈에 안정하게 통합된다. 구축물 1-1은 인지질 이중층 동원 도메인에 해당한다. 1-2는 카고에 해당한다. 2는 임의적인 가이드 RNA에 해당한다. 1-1 및 1-2는 시토졸에서 번역되며, 여기서 그것이 가이드 RNA와 복합체화된 후, 그것이 인지질 이중층으로 동원된다. 3은 바이러스-유래 당단백질 (VSVG)에 해당한다. 바이러스-유래 당단백질은 원형질 막 상의 막횡단 단백질로 발현되어, 원형질 막으로부터 세포외 공간으로의 카고-함유 eVLP의 출아를 구동하는 것을 돕는다. 이들 입자는 정제된 후 표적 세포와 융합되어 표적 세포 표면의 표면 수용체와 상호작용하는 것에 의해 카고를 전달할 수 있다.
도 2: 정제된 eVLP가 표적 세포에 진입하여 시토졸에 카고를 전달하는 것의 도시. 중요하게는, 인지질 이중층 동원 도메인은 카고가 핵 국재화 서열을 보유하는 한 카고가 표적 세포 핵에 진입하는 것을 가능하게 한다는 것이다.
도 3: Cas9 RNP를 hPLCδ1 또는 hAKT1으로부터의 PH 도메인이 있거나 없이 VSVG-위형화 T2eVLP 중으로 전달하였다. 10개 아미노산 글리신/세린 폴리펩티드 링커를 통하여 Cas9의 N-말단에 PH 도메인을 융합시켰다. HepG2, U2OS, HEK293T, CFPAC1, BeWo, Jurkat, K562 및 1차 T 세포를 정제되어 100x 농축된 T2eVLP로 72시간 동안 처리하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 VEGF 부위 #3의 퍼센트 표적화 유전자 변형을 측정하였다. x-축 표지는 각 T2eVLP 조제물의 함량에 해당한다. Cas9 (융합 없음)에는 PH 도메인 융합이 결여되어 있다. 벤조나제 (Benz)를 사용하여 VLP 외부의 RNA 및 DNA를 분해하였으며, 벤조나제 처리된 샘플을 대조군으로서 포함시켰다.
도 4: T1eVLP/T3eVLP 생산의 도시. 형질감염에 수반된 플라스미드 DNA 구축물은 카고, 임의적인 가이드 RNA 및 바이러스-유래 당단백질 (VSVG)을 코딩한다. 플라스미드 또는 다른 유형의 DNA 분자는 생산 세포 전체에 걸쳐 분포하게 되며, 그에 따라 핵에 배치되는 구축물은 eVLP 구성요소 및 카고를 발현할 것이고, 원형질 막 또는 엔도솜 부근에 배치되는 구축물은 출아하는 eVLP 내에 캡슐화될 것이다.
도 5A-B: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. A) spCas9 및 sgRNA에 융합된 라우스(Rous) 육종 바이러스 gag를 포함하는 VLP, spCas9 및 sgRNA에 융합된 PLC 플렉스트린 상동성 (PH)을 포함하는 T1eVLP, 또는 SV40 핵 국재화 서열 (NLS) 및 sgRNA에 융합된 라우스 육종 바이러스 gag를 포함하는 VLP에 의해 형질도입되는 U2OS eGFP 및 HEK293 eGFP 세포주. sgRNA는 GFP를 표적으로 한다. 형질도입 72시간 후, 유동 세포측정법 또는 T7E1이 수행된다. 라우스 육종 바이러스 gag VLP는 대조군으로서 사용된다. B) 도 5A 실험으로부터의 U2OS 또는 293 세포 하위군집의 T7E1 분석. eVLP 및 VLP는 VSVG에 의해 위형화된다.
도 6: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. HEK 부위 #3 또는 VEGF 부위 #2에 대하여 표적화된 spCas9에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 U2OS 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 7: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. VEGF 부위 #3에 대하여 표적화된 spCas9에 융합된 PLC PH 또는 hAkt PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 U2OS 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 8: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 염기 편집. VEGF 부위 #2에 대하여 표적화된 sgRNA를 동반하여 spCas9 BE3 또는 Gam-BE4에 융합된 라우스 육종 바이러스 gag를 포함하는 VLP, 또는 VEGF 부위 #2에 대하여 표적화된 sgRNA를 동반하여 spCas9 BE3 또는 Gam-BE4에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293T 세포. eVLP 및 VLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다. 라우스 육종 바이러스 gag VLP는 양성 대조군으로서 사용된다.
도 9: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 염기 편집. HEK 부위 #3에 대하여 표적화된 코돈 최적화 spCas9 BE4에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293T 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 10: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 염기 편집. VEGF 부위 #3에 대하여 표적화된 코돈 최적화 spCas9 ABE에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293T 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 11: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 염기 편집. HEK 부위 #3에 대하여 표적화된 코돈 최적화 spCas9 ABE에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293T 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 12: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 asCas12a 게놈 편집. 라우스 육종 바이러스 gag를 포함하는 VLP, 또는 asCas12a에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293 세포. VLP 및 eVLP는 crRNA에 의해 FANCF 부위 #1에 대하여 표적화된다. T7E1에 의해 유전자 변형이 측정된다. 라우스 육종 바이러스 gag VLP는 양성 대조군으로서 사용된다.
도 13: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. RNA 결합 단백질 MS2에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293 세포. MS2는 Cas9와 복합체화되는 sgRNA 중 MS2 스템 루프에 결합하며, MS2는 효율적인 eVLP 로딩을 위하여 PH 도메인에 융합된다. eVLP는 sgRNA에 의해 GFP 부위 #1에 대하여 표적화된다. T7E1에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 14: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. 이량체화 도메인 (DmrC)에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293 세포. A/C 이종이량체화제 분자의 존재 하에서, DmrC는 Cas9에 직접적으로 융합되는 DmrA에 결합한다. eVLP는 sgRNA에 의해 GFP 부위 #1에 대하여 표적화된다. T7E1에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 15: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 asCas9 게놈 편집. GNC4 단백질 도메인 반복부에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293 세포. scFv는 GCN4 반복부에 결합하며, scFv는 Cas9에 직접적으로 융합된다. eVLP는 sgRNA에 의해 GFP 부위 #1에 대하여 표적화된다. T7E1에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 16-40: 다양한 예시적인 eVLP 배열구조 및 가능한 카고의 개략적 예시.
도 2: 정제된 eVLP가 표적 세포에 진입하여 시토졸에 카고를 전달하는 것의 도시. 중요하게는, 인지질 이중층 동원 도메인은 카고가 핵 국재화 서열을 보유하는 한 카고가 표적 세포 핵에 진입하는 것을 가능하게 한다는 것이다.
도 3: Cas9 RNP를 hPLCδ1 또는 hAKT1으로부터의 PH 도메인이 있거나 없이 VSVG-위형화 T2eVLP 중으로 전달하였다. 10개 아미노산 글리신/세린 폴리펩티드 링커를 통하여 Cas9의 N-말단에 PH 도메인을 융합시켰다. HepG2, U2OS, HEK293T, CFPAC1, BeWo, Jurkat, K562 및 1차 T 세포를 정제되어 100x 농축된 T2eVLP로 72시간 동안 처리하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 VEGF 부위 #3의 퍼센트 표적화 유전자 변형을 측정하였다. x-축 표지는 각 T2eVLP 조제물의 함량에 해당한다. Cas9 (융합 없음)에는 PH 도메인 융합이 결여되어 있다. 벤조나제 (Benz)를 사용하여 VLP 외부의 RNA 및 DNA를 분해하였으며, 벤조나제 처리된 샘플을 대조군으로서 포함시켰다.
도 4: T1eVLP/T3eVLP 생산의 도시. 형질감염에 수반된 플라스미드 DNA 구축물은 카고, 임의적인 가이드 RNA 및 바이러스-유래 당단백질 (VSVG)을 코딩한다. 플라스미드 또는 다른 유형의 DNA 분자는 생산 세포 전체에 걸쳐 분포하게 되며, 그에 따라 핵에 배치되는 구축물은 eVLP 구성요소 및 카고를 발현할 것이고, 원형질 막 또는 엔도솜 부근에 배치되는 구축물은 출아하는 eVLP 내에 캡슐화될 것이다.
도 5A-B: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. A) spCas9 및 sgRNA에 융합된 라우스(Rous) 육종 바이러스 gag를 포함하는 VLP, spCas9 및 sgRNA에 융합된 PLC 플렉스트린 상동성 (PH)을 포함하는 T1eVLP, 또는 SV40 핵 국재화 서열 (NLS) 및 sgRNA에 융합된 라우스 육종 바이러스 gag를 포함하는 VLP에 의해 형질도입되는 U2OS eGFP 및 HEK293 eGFP 세포주. sgRNA는 GFP를 표적으로 한다. 형질도입 72시간 후, 유동 세포측정법 또는 T7E1이 수행된다. 라우스 육종 바이러스 gag VLP는 대조군으로서 사용된다. B) 도 5A 실험으로부터의 U2OS 또는 293 세포 하위군집의 T7E1 분석. eVLP 및 VLP는 VSVG에 의해 위형화된다.
도 6: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. HEK 부위 #3 또는 VEGF 부위 #2에 대하여 표적화된 spCas9에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 U2OS 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 7: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. VEGF 부위 #3에 대하여 표적화된 spCas9에 융합된 PLC PH 또는 hAkt PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 U2OS 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 8: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 염기 편집. VEGF 부위 #2에 대하여 표적화된 sgRNA를 동반하여 spCas9 BE3 또는 Gam-BE4에 융합된 라우스 육종 바이러스 gag를 포함하는 VLP, 또는 VEGF 부위 #2에 대하여 표적화된 sgRNA를 동반하여 spCas9 BE3 또는 Gam-BE4에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293T 세포. eVLP 및 VLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다. 라우스 육종 바이러스 gag VLP는 양성 대조군으로서 사용된다.
도 9: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 염기 편집. HEK 부위 #3에 대하여 표적화된 코돈 최적화 spCas9 BE4에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293T 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 10: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 염기 편집. VEGF 부위 #3에 대하여 표적화된 코돈 최적화 spCas9 ABE에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293T 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 11: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 염기 편집. HEK 부위 #3에 대하여 표적화된 코돈 최적화 spCas9 ABE에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293T 세포. eVLP는 VSVG에 의해 위형화된다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 12: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 asCas12a 게놈 편집. 라우스 육종 바이러스 gag를 포함하는 VLP, 또는 asCas12a에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293 세포. VLP 및 eVLP는 crRNA에 의해 FANCF 부위 #1에 대하여 표적화된다. T7E1에 의해 유전자 변형이 측정된다. 라우스 육종 바이러스 gag VLP는 양성 대조군으로서 사용된다.
도 13: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. RNA 결합 단백질 MS2에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293 세포. MS2는 Cas9와 복합체화되는 sgRNA 중 MS2 스템 루프에 결합하며, MS2는 효율적인 eVLP 로딩을 위하여 PH 도메인에 융합된다. eVLP는 sgRNA에 의해 GFP 부위 #1에 대하여 표적화된다. T7E1에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 14: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 spCas9 게놈 편집. 이량체화 도메인 (DmrC)에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293 세포. A/C 이종이량체화제 분자의 존재 하에서, DmrC는 Cas9에 직접적으로 융합되는 DmrA에 결합한다. eVLP는 sgRNA에 의해 GFP 부위 #1에 대하여 표적화된다. T7E1에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 15: 시험관 내에서의 예시적인 T1eVLP-전달 asCas9 게놈 편집. GNC4 단백질 도메인 반복부에 융합된 PLC PH를 포함하는 T1eVLP에 의해 형질도입된 HEK293 세포. scFv는 GCN4 반복부에 결합하며, scFv는 Cas9에 직접적으로 융합된다. eVLP는 sgRNA에 의해 GFP 부위 #1에 대하여 표적화된다. T7E1에 의해 유전자 변형이 측정된다.
도 16-40: 다양한 예시적인 eVLP 배열구조 및 가능한 카고의 개략적 예시.
치료용 단백질 및 핵산은 커다란 가능성을 가지고 있지만, 이들 중 많은 것에서 세포에의 대형 생체분자 전달이 임상 개발에 있어서 장애가 되고 있다. 게놈 편집 시약 예컨대 아연 핑거 뉴클레아제 (ZFN) 또는 RNA-가이드된, 효소 활성/불활성 DNA 결합 단백질 예컨대 Cas9가 실행될 수 있는 특이성 및 편집 유형 면에서 빠른 진전을 이루었지만, 생체내 전달에 있어서의 안전성 문제는 여전히 효능있는 유전자 편집 치료법을 방해하고 있다. 본원에서 기술되는 것은 증강된 바이러스-유사 입자 (eVLP)의 다양한 실시양태는 물론, 게놈 편집 시약의 전달을 위한 신규한 최적 플랫폼을 제공하며 eVLP를 정규 전달 양식과 대조하는 다양한 eVLP 실시양태의 특징이다.
렌티바이러스와 같은 레트로바이러스 입자가 게놈 DNA로 통합될 수 있거나 통합되지 않을 수 있는 DNA로 역전사되는 RNA를 전달하도록 개발되어 있다. 자가-조립되는 그의 능력에 있어서 바이러스 입자를 모방하나 코어 바이러스 유전자 중 일부가 거기에 결여되어 있기 때문에 감염성은 아닌 VLP가 개발되어 있다. 렌티바이러스 및 VLP 벡터 둘 다는 통상적으로 렌티바이러스 입자 또는 VLP를 생산하는데 필요한 모든 구성요소를 코딩하는 플라스미드를 사용하여 생산자 세포주를 일시적으로 형질감염시키는 것에 의해 생산된다. 이와 같은 통상적인 일시적 형질감염 방법에 의해 생산되는 렌티바이러스 입자 및 VSVG-기반 VLP와 관련하여 본 발명자들이 발견한 한 가지 결함은 이들 입자가 그의 통상적인 카고 이외에 최초 일시적 감염에 사용되었던 플라스미드 DNA도 패키징하여 전달한다는 것이다. 이와 같은 의도치 않은 플라스미드 DNA 전달은 면역원성이 되어 플라스미드 DNA가 게놈 DNA에 통합되는 것과 같은 원치 않는 효과를 야기할 수 있다. 입자 내로 전달될 수 있는 생체분자/화학물질의 유형을 명확히 하는 것이 중요하기 때문에, 이와 같은 적절한 능력을 보유하도록 eVLP를 설계하였다.
본원에서 기술되는 eVLP는 DNA 단독, DNA+RNA+단백질 또는 RNA+단백질을 포함한 매우 다양한 카고를 전달할 수 있다. 중요하게는, eVLP가 카고 (DNA, 단백질 및/또는 RNA)의 형태를 제어할 수 있는 첫 번째 VSVG-기반 VLP 전달 양식이라는 것이다. 지금까지 기술된 VSVG-기반 소포 및 바이러스 입자는 예정된 단백질 및/또는 RNA 카고(들) 이외에 일시적인 형질감염을 통하여 입자 생산자 세포에 도입되는 원치 않는 플라스미드 DNA (또는 다른 유형의 DNA-기반 유전자 발현 구축물)도 패키징하여 전달한다.
eVLP의 또 다른 측면은 eVLP 표면 상의 ENV 단백질이다. 이론에 얽매이고자 하는 것은 아니나, ENV 단백질은 단독으로 eVLP 입자 생성 및 카고를 효율적으로 세포에 전달하는 eVLP의 능력을 담당한다. 렌티바이러스 및 VLP는 통상적으로 세포 배양 배지로의 생산자 세포 원형질 막의 출아 분리를 통한 입자 형성을 구동하는데 GAG 및 ENV 단백질을 필요로 한다. 추가적으로, 대부분의 레트로바이러스 ENV 단백질은 ENV 단백질의 융합원성을 활성화하기 위하여 ENV 단백질 세포내 도메인 (ICD)의 단백질분해 절단 형태의 번역-후 변형을 필요로 하는데; 이는 바이러스 감염성에 필수적이다. 표 1에 기술되어 있는 외피 단백질은 모두 바이러스로부터 유래한다. 그러나, 이들 eVLP ENV 단백질은 입자 형성에 외인성 GAG를 필요로 하지 않으며, 융합원성을 위한 ICD 절단을 필요로 하지 않는다.1-3 ENV는 eVLP의 유일한 바이러스-유래 구성요소이며, eVLP 외부 표면 상의 이러한 ENV 당단백질은 표적 세포에의 eVLP의 융합/진입을 촉진하는데 사용되는데, 이들이 자연적으로 융합성인 것으로 알려져 있기 때문이다. 추가적으로, eVLP는 지금까지 기술된 바이러스 입자, VLP 및 세포외 소포와는 상이한데, eVLP가, 원하는 경우에, 정제에 의해 분리될 수 있는 엑토솜과 엑소솜의 혼합물로 구성되기 때문이다. 상기 언급된 설계상의 단순성 및 최적성으로 인하여, eVLP는 DNA, RNA, 단백질, 또는 생체분자 및/또는 화학물질의 조합, 예를 들어 DNA-코딩되거나 RNP-기반인 게놈 편집 시약을 포함한 카고의 전달에 특히 적합하다.
게놈 편집 시약, 특히 CRISPR-CAS, 아연 핑거 및 TAL-뉴클레아제-기반 시약과 같은 단백질 및 단백질 복합체를 포함한 대형 생체분자는 유전 질환을 포함한 수많은 질환의 치료를 위한 생체내 치료제가 될 가능성을 가지고 있으나, 이들 시약을 세포로 전달하기 위한 기술은 심각하게 제한되고 있거나, 환자에게 안전하지 않다. 통상적인 치료용 모노클로날 항체 전달은 직접적인 단백질 주사 이용 시에 성공적이다. 불행히도, Cas9와 같은 유전자 편집 단백질의 직접 주사 전략은 면역원성, 분해, 비효과적인 세포 특이성, 및 원형질 막을 가로지르거나 엔도솜/리소솜을 탈출하는 능력의 부재에 의해 방해를 받고 있다.4-10 단백질 치료법 및 유전자 편집의 더 광범위한 적용은 치료용 단백질 카고를 세포의 내부로 전달하는 것에 의해 달성될 수 있다. 예를 들어, Cas9는 인지질 이중층을 효율적으로 가로질러 세포에 진입할 수 없으며, 선천성 및 적응성 면역원성 가능성을 가지고 있는 것으로 제시된 바 있다.4-8 따라서, 직접 주사에 의해, 또는 세포독성 및 면역원성 특성을 가지고 있으며 종종 낮은 수준의 원하는 유전자 변형을 산출하는 지질, 단백질 또는 금속-기재 나노입자에 대한 외부/내부 접합체로서 Cas9를 전달하는 것은 실용적이거나 바람직하지 않다.9-20
카고를 캡슐화하는 나노입자는 DNA, 단백질, RNA 및 RNP를 세포에 전달하는데 사용될 수 있는 또 다른 전달 전략이다.9-18 나노입자는 세포 특이성에 있어서 조작될 수 있으며, 세포내이입 및 이후의 엔도솜 용해를 촉발할 수 있다. 그러나, 나노입자는 인공-유래 비히클 쉘로 인하여, 가변적인 수준의 면역원성을 가질 수 있다.9-20 많은 나노입자가 입자 구조적 완전성을 유지하는데 있어서 강한 반대 전하 분포에 의존하는데, 많은 생체내 치료 시나리오에서 정전기가 그를 독성이 되고 부적합하게 되도록 할 수 있다.9 RNA를 전달하는 나노입자가 최근의 임상 시험에서 성공을 거둔 바 있으나, 대부분은 siRNA 또는 shRNA를 전달하는데에만 사용되고 있다. 그와 같은 나노입자로부터의 독성은 여전히 주요 우려사항이다.9 게놈 편집 RNP를 코딩하는 mRNA를 전달하는 나노입자가 또한 최근 성공을 거둔 바 있으나, 그것은 단백질 전달에 비해 더 많은 수의 표적-이탈 효과를 생성시키며, RNA 안정성이 단백질에 것에 비해 더 낮다.17 상동성 유도 복구 (HDR) 및 비-상동성 말단 연결 (NHEJ) 둘 다를 그것이 제고할 수 있기 때문에, 게놈 편집 RNP 및 DNA를 전달하는 나노입자가 중요한 돌파구가 되기는 하였지만, 시험관내 및 생체내에서 엄청나게 낮은 유전자 변형 빈도를 나타내며, 그에 따라 현재 유전자 편집 치료제로서는 생체내에서 제한된 적용을 가진다.15
현재, 게놈 편집 치료제를 전달하기 위한 임상 표준 비히클은 아데노-연관 바이러스 (AAV)이다. AAV 벡터가 진핵 세포에 성공적으로 DNA를 전달할 수 있는 유망한 전달 양식이기는 하지만, AAV는 4.5 kb보다 더 큰 DNA 구축물을 효율적으로 패키징하여 전달할 수 없는데, 이는 더 큰 DNA 발현 구축물을 필요로 하는 많은 CRISPR-기반 유전자 편집 시약의 전달을 방해한다. CRISPR-기반 유전자 편집 시약이 다수의 상이한 AAV 입자로 스플릿될 수 있기는 하지만, 이와 같은 전략은 전달 및 편집 효율을 급격하게 감소시킨다. 필요한 투여량에 따라, AAV 및 아데노바이러스 벡터는 가변적인 수준의 면역원성을 가질 수 있다. 추가적으로, AAV DNA 구축물의 역전-말단 반복부 (ITR)는 게놈 편집 시약의 연장된 발현 및 증가된 표적-이탈 효과로 이어지는 자발적 에피솜 형성을 촉진할 수 있다. ITR은 또한 게놈 DNA에의 AAV DNA의 원치 않는 통합을 촉진할 수 있다.21-24
최근, VLP가 세포의 시토졸에 mRNA 및 단백질 카고를 전달하는데 이용되고 있다.2,3,25-30 VLP는 레트로바이러스 입자의 대체 전달 양식으로서 부상하였다. VLP는 레트로바이러스 DNA를 통합하고 단백질/RNP/DNA를 패키징하여 전달하는 능력이 결여되도록 설계될 수 있다. 그러나, 오늘날까지 알려진 게놈 편집 시약을 전달하는 최근 고안된 VLP를 포함하여 대부분의 VLP는 레트로바이러스-유사 입자를 생성시키는데 HIV 또는 다른 바이러스-유래 gag- pol 단백질 융합체 및 바이러스 프로테아제를 이용한다.25-27,29,30 두 번째로, RGN을 포함하는 일부 VLP는 렌티바이러스 DNA 전사체로부터의 가이드 RNA를 패키징하고 발현해야 하기도 한다.27 세 번째로, 일부 VLP는 기능성 입자를 형성시키고 게놈 편집 카고를 방출하기 위하여 바이러스 프로테아제를 필요로 한다.25-27,29 이와 같은 바이러스 프로테아제는 다수의 아미노산 모티프를 인식하여 절단하기 때문에, 그것이 단백질 카고의 손상을 야기할 수 있는데, 이는 치료 적용분야에는 위험할 수 있다. 네 번째로, 오늘날까지 게놈 편집 단백질을 전달하는 대부분의 공개된 VLP 양식은 낮은 패키징 및 형질도입 효율로 인하여 낮은 시험관내 및 생체내 유전자 변형 효율을 나타낸다.25-27 다섯 번째로, 이러한 VLP 구성요소에 이용되는 복합 바이러스 게놈은 다수의 리딩 프레임을 보유하며, 의사 융합 단백질 산물이 전달되는 것으로 이어질 수 있는 RNA 스플라이싱을 사용한다.25-27,29,30 여섯 번째로, 이러한 VLP에서의 리버스 트랜스크립타제, 인테그라제, 캡시드 및 바이러스-유래 외피 단백질의 존재는 면역원성 및 표적 이탈 편집 우려로 인하여 대부분의 치료 적용분야에서 이상적이지 않다. 마지막으로, 렌티바이러스 입자와 같은 대부분의 레트로바이러스 입자는 VSVG를 사용하여 위형화되며, 지금까지의 게놈 편집 시약을 전달하는 거의 모든 기술된 VLP는 VSVG 를 보유하고 거기에 의존한다.2,3,25-30 본 발명자들은 생산자 세포를 일시적으로 형질감염시키는 것에 의해 형성되는 VSVG-기반 입자가 형질감염되었던 DNA를 패키징하여 전달한다는 것을 발견하였다. VSVG-기반 VLP의 현재 버전은 이와 같은 부주의한 DNA 전달을 방지할 수 없으며, 이는 최소한의 면역원성 및 표적 이탈 효과를 필요로 하는 시나리오에서의 VLP의 사용을 방해한다.
세포외 소포는 엑소솜 및 엑토솜 내의 카고를 패키징하여 전달할 수 있는 또 다른 전달 양식이다.31,32 VLP와 유사하게, 세포외 소포는 포유동물 세포로부터의 인지질 이중층으로 구성된다. VLP와 달리, 세포외 소포에는 바이러스 구성요소가 결여되어 있으며, 그에 따라 제한된 면역원성을 가진다. 외부 융합성 당단백질 (VSVG)로 인하여 VLP가 커다란 세포 진입 능력을 가지는 반면, 세포외 소포는 주로 미세음세포작용을 통한 세포 흡수에 의존하는데, 이는 세포외 소포의 전달 효율을 제한한다.
eVLP는 - 특히 게놈 편집 시약의 전달에 있어서 - 지금까지 기술된 VLP, 세포외 소포, AAV 및 나노입자에 비해 더 안전하고 더 효과적인 대안인데, eVLP가 HIV-1 gag 백신 (VSVG)의 임상 시험에서 인간에서 안전한 것으로 입증된 바이러스-유래 당단백질 이외에는 모두 인간 구성요소로 구성되며,33 eVLP에는 안전한 당단백질 이외에는 모든 다른 레트로바이러스 구성요소가 결여되어 있고, 다른 지금까지 기술된 VLP가 일시적 형질감염 DNA가 본의 아니게 패키징 및 전달되는 것을 방지할 수 없는 반면 eVLP는 DNA+RNP 또는 RNP 단독을 전달할 능력을 가지고 있으며, eVLP는 특수 DNA 분자를 전달할 수 있는 반면 지금까지 기술된 VLP, 나노입자 및 AAV는 그럴 수 없거나 그렇게 하지 않고, 부정적인 면역 반응의 위험성을 더 감소시키기 위하여 eVLP가 환자로부터 유래하는 세포 (자가 eVLP) 및 다른 FDA-승인 세포주 (동종이계 eVLP)를 사용하여 생산될 수 있기 때문이다. 본원에서, 본 발명자들은 예를 들어 게놈 편집, 에피게놈 조정, 전사체 편집 및 단백질체 조정의 시험관내 및 생체내 적용을 위하여 eVLP를 생산하고, 정제하고, 투여하기 위한 방법 및 조성물을 기술한다. 원하는 편집 결과는 치료 맥락에 따라 달라지며, 상이한 유전자 편집 시약을 필요로 하게 된다. 스트렙토코쿠스 피오게네스(Streptococcus pyogenes) Cas9 (spCas9) 및 아시다미노코쿠스(acidaminococcus) 종 Cas12a (기능성화)는 삽입을 야기하기 위한 정지 코돈 또는 결실, 또는 HDR을 도입하기 위하여 NHEJ를 제고하는 편집에 있어서 가장 인기있는 RNA-가이드된 효소 2종이다.34-36 염기 편집자로도 알려져 있는 Cas9-데아미나제 융합체는 이중 가닥 DNA 절단이 없는 단일 뉴클레오티드 정밀 편집의 현재 표준이다.37,38 중요하게는, 이러한 방법이 VLP에서의 부주의한 DNA 전달 현상을 해결하고, 먼저 전달될 생체분자의 유형 (DNA, RNA 및/또는 단백질)을 제어함으로써, 있을 수 있는 생체내 게놈 변형에서의 치료제의 유형을 증가시키고, 유해한 표적 이탈 효과를 최소화한다는 것이다.
섹션 1: DNA, 단백질 및 RNA의
eVLP
-매개 전달
단백질-기반 카고를 캡슐화하여 전달하도록 조작되는 통상적인 VLP는 통상적으로 INT 또는 GAG 폴리단백질에 카고를 융합시킨다.25-27,29,30,39,40 생산 플라스미드 DNA 구축물의 일시적 형질감염 후, 이러한 단백질 융합체는 통상적인 VLP 생산 세포주의 시토졸에서 번역되고, gag 매트릭스가 아세틸화되어 세포 막으로 동원된 후, VLP가 막으로부터 세포외 공간으로 출아 분리될 때 gag 융합체가 VLP 내에 캡슐화된다 (일시적 형질감염 DNA가 또한 의도치 않게 캡슐화됨).
반면, 일부 실시양태에서, 본원에서 기술되는 eVLP는 모든 생산 DNA를 생산 세포주의 게놈 DNA에 통합하는 것에 의해 단백질-기반 카고를 패키징할 수 있다. 일단 세포주가 생성되고 나면, 단백질 전달 eVLP는 구성적 또는 유도성 방식으로 생산될 수 있다. 단백질은 선택된 인간-유래 인지질 이중층 동원 도메인을 단백질-기반 카고 (예를 들어 표 6에 제시된 바와 같은 것)에 융합시키는 것에 의해 eVLP로 패키징된다. 이와 같은 목적으로 사용되는 한 가지 그와 같은 인간-유래 인지질 이중층 동원 도메인은 인간 플렉스트린 상동성 (PH) 도메인이다. PH 도메인은 PIP2, PIP3, GPCR의 βγ-서브유닛, 및 PKC와 같은 생물학적 막 내 포스파티딜이노시톨 지질 및 단백질과 상호작용한다.41,42 대안적으로, 인간 Arc 단백질이 단백질-기반 카고에 융합되어 카고를 인지질 이중층의 시토졸 측으로 동원할 수 있다.43 이러한 인간-유래 인지질 이중층 동원 도메인은 카고 내 1종 이상의 핵 국재화 서열(들) (NLS)의 위치 또는 위치들에 관계없이 가변적인 길이의 폴리펩티드 링커를 통하여 단백질-기반 카고의 N-말단 또는 C-말단에 융합될 수 있다. 바람직하게는, 단백질-기반 카고와 인지질 이중층 동원 도메인 사이의 상기 링커는 주로 글리신 및 세린으로 구성되는 길이 5-20, 예를 들어 8-12, 예를 들어 10개 아미노산의 폴리펩티드 링커이다. 인간-유래 인지질 이중층 동원 도메인은 인지질 이중층에 카고를 배치하며, 이와 같은 단백질 카고는 생산자 세포로부터 세포외 공간으로의 입자의 출아 분리를 촉발하는데 당단백질을 이용하는 eVLP 내에 패키징된다 (도 1). 이러한 인간-유래 도메인 및 단백질은 eVLP 생산 세포 내 원형질 막의 시토졸 면에의 카고의 국재화를 촉진할 수 있으며, 또한, 외인성 레트로바이러스 gag/pol 또는 화학물질 및/또는 광-기반 이량체화 시스템의 이용 없이 eVLP-형질도입된 세포의 핵에 카고가 배치되는 것을 그것이 가능하게 한다 (도 2). 예를 들어, Cas9의 전달은 원형질 막 동원 도메인이 없는 것에 비해 원형질 막 동원 도메인에의 융합에 의해 상당히 더 효율적이 된다 (도 3).
일부 실시양태에서, eVLP가 생산 세포주의 일시적인 형질감염을 통하여 생산되는 경우, eVLP는 DNA와 RNA의 조합도 패키징하여 전달할 수 있다. 세포에 형질감염되는 DNA가 크기-의존성 이동성을 보유하게 됨으로써, 형질감염된 DNA의 한 분획은 시토졸에 남게 되는 반면, 형질감염된 DNA의 또 다른 분획은 핵에 배치되게 된다.44-46 핵 중 형질감염 DNA의 하나의 분획은 eVLP를 생성시키는데 필요한 구성요소를 발현하게 되는 반면, 시토졸/원형질 막 부근의 다른 분획은 eVLP 내에 캡슐화되어 전달되게 된다 (도 4).
eVLP "카고"는 전달될 수 있는 임의의 페이로드를 지칭하는 것으로서, 예를 들어, 치료용 또는 진단용 용도, 또는 게놈 편집, 에피게놈 조정 및/또는 전사체 조정의 적용을 위한 화학물질, 예를 들어, 소형 분자 화합물, 및 DNA, RNA, RNP, 단백질, 및 DNA와 RNP의 조합, RNP, DNA와 단백질의 조합을 포함한 상기의 조합, 또는 단백질은 물론, 바이러스 및 그의 일부를 포함한 생체분자를 포함한다. 이러한 구별을 단순화하기 위하여, DNA와 RNP의 조합은 본원에서 유형 1 카고 (T1eVLP)로 지칭될 것이며, RNP는 본원에서 유형 2 카고 (T2eVLP)로 지칭될 것이고, DNA와 단백질의 조합은 본원에서 유형 3 카고 (T3eVLP)로 지칭될 것이며, 단백질은 본원에서 유형 4 카고 (T4eVLP)로 지칭될 것이다. 이와 같은 맥락에서, RNA에는 예를 들어 단일 가이드 RNA (sgRNA), 클러스터링된 규칙적 간격의 짧은 회문식 반복부 (CRISPR) RNA (crRNA), 및/또는 카고를 코딩하는 mRNA가 포함된다.
본원에서 사용될 때, "소형 분자"는 약 3,000 달톤 미만의 분자량의 소형 유기 또는 무기 분자를 지칭한다. 일반적으로, 본 발명에 유용한 소형 분자는 3,000 달톤 (Da) 미만의 분자량을 가진다. 소형 분자는, 예를 들어, 적어도 약 100 Da 내지 약 3,000 Da (예를 들어 약 100 내지 약 3,000 Da, 약 100 내지 약 2500 Da, 약 100 내지 약 2,000 Da, 약 100 내지 약 1,750 Da, 약 100 내지 약 1,500 Da, 약 100 내지 약 1,250 Da, 약 100 내지 약 1,000 Da, 약 100 내지 약 750 Da, 약 100 내지 약 500 Da, 약 200 내지 약 1500, 약 500 내지 약 1000, 약 300 내지 약 1000 Da, 또는 약 100 내지 약 250 Da)의 것일 수 있다.
카고는, 예를 들어, 일부 실시양태에서 30 nm 내지 500 nm의 범위인 입자의 직경에 의해 제한된다.
게놈 편집의 적용분야용으로 개발된 카고에는 뉴클레아제 및 염기 편집자가 또한 포함된다. 뉴클레아제에는 FokI 및 AcuI ZFNs 및 전사 활성화인자-유사 이펙터 뉴클레아제 (TALEN) 및 CRISPR 기반 뉴클레아제 또는 이들의 기능성 유도체 (예를 들어 표 2에 제시된 바와 같은 것)가 포함된다 (ZFN에 대해서는, 예를 들어, 미국 특허 공개 20030232410; 20050208489; 20050026157; 20050064474; 20060188987; 20060063231; 및 국제 공개 WO 07/014275에 기술되어 있음) (TALEN에 대해서는, 예를 들어, 미국 특허 공개 US9393257B2; 및 국제 공개 WO2014134412A1에 기술되어 있음) (CRISPR 기반 뉴클레아제에 대해서는, 예를 들어, 미국 특허 공개 US8697359B1; US20180208976A1; 및 국제 공개 WO2014093661A2; WO2017184786A8에 기술되어 있음).34-36 이와 같은 저작물들이 기술하고 있는 염기 편집자에는 가변적인 길이의 폴리펩티드 링커를 사용하여 1종의 또는 다수의 우라실 글리코실라제 억제제 (UGI)에 대한 C-말단에서의 융합이 있거나 없이 N-말단에서 데아미나제 또는 그의 기능성 유도체 (예를 들어 표 3에 제시된 바와 같은 것)에 융합된, 예를 들어 표 2에 제시된 바와 같은 임의의 CRISPR 기반 뉴클레아제 오르토로그 (wt, 니카제 또는 촉매적 불활성 (CI))가 포함된다 (염기 편집자에 대해서는, 예를 들어, 미국 특허 공개 US20150166982A1; US20180312825A1; US10113163B2; 및 국제 공개 WO2015089406A1; WO2018218188A2; WO2017070632A2; WO2018027078A8; WO2018165629A1에 기술되어 있음).37,38 추가적으로, 프라임 편집자가 또한 eVLP 전달 양식과 상용성이다 (프라임 편집자에 대해서는, 예를 들어, PMID: 31634902에 기술되어 있음).
sgRNA는 패키징 프로세스 동안 게놈 편집 시약과 복합체화되어 eVLP 내로 공동-전달된다. 오늘날까지, 이와 같은 개념은 외인성 및 내인성 부위의 부위 특이적 편집 목적의 단백질로서 데아미나제 및 UGI (염기 편집자)에 융합된 RGN 및 CI RGN의 T1eVLP 또는 T2eVLP 전달을 입증하는 실험에 의해 시험관 내에서 검증되어 왔다 (도 3, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 & 12). 예를 들어, T1eVLP는 외인성 GFP, 및 내인성 HEK 부위 #3 및 VEGF 부위 #2 & #3을 편집할 목적으로 U2OS 및 HEK293 세포에 Cas9 RNP를 전달하는데 사용되어 왔다 (도 4, 5, 6 & 7). 추가적으로, T1eVLP는 내인성 VEGF 부위 #2 & #3 및 HEK 부위 #3을 염기 편집할 목적으로 HEK293T 세포에 BE3 및 BE4 RNP를 전달하는데 사용되어 왔다 (도 8, 9, 10 & 11). T1eVLP는 또한 내인성 FANCF 부위 #1을 편집할 목적으로 HEK293 세포에 Cas12a RNP를 전달하는데 사용되어 왔다 (도 12).
에피게놈 조정 목적으로 설계되는 카고에는 1종 이상의 가변 길이 폴리펩티드 링커에 의해 함께 연결된, 에피게놈 조정인자 또는 에피게놈 조정인자들의 조합 또는 이들의 기능성 유도체에 융합된 CI CRISPR 기반 뉴클레아제, 아연 핑거 (ZF) 및 TALE가 포함된다 (표 2 & 4). 전사체 편집 목적으로 설계되는 T1-T4 카고에는 1종 이상의 가변 길이 폴리펩티드 링커에 의해 표 3의 데아미나제에 융합된 표 5의 CRISPR 기반 뉴클레아제 또는 그의 임의의 기능성 유도체, 또는 표 5의 CI CRISPR 기반 뉴클레아제 또는 그의 임의의 기능성 유도체가 포함된다.
카고에는 또한 임의의 치료적으로 또는 진단적으로 유용한 단백질, DNA, RNP, 또는 DNA, 단백질 및/또는 RNP의 조합이 포함될 수 있다. 예를 들어, WO2014005219; US10137206; US20180339166; US5892020A; EP2134841B1; WO2007020965A1을 참조한다. 예를 들어, 뉴클레아제 또는 염기 편집자 단백질 또는 RNP 또는 이들의 유도체를 코딩하거나 그것으로 구성되는 카고가 레베르 선천성 흑암시 유형 10을 담당하는 스플라이스 부위 결함을 보정할 목적으로 망막 세포에 전달될 수 있다. 포유동물 내이에서, β-카테닌을 더 우수하게 안정화하기 위한 β-카테닌 (Tyr, Pro 또는 Cys로 편집된 β-카테닌 Ser 33) 편집 목적의 와우 지지 세포 및 털 세포와 같은 감각 세포에의 염기 편집 시약 또는 HDR 촉진 카고의 eVLP 전달은 청력 상실을 반전시키는 것을 도울 수 있다.
또 다른 적용분야에서, RNA 편집 시약 또는 단백질체 교란 시약의 eVLP 전달은 (잠재적으로 전신 농도, 특정 기관 또는 특정 세포 하위세트, 예를 들어 종양에서) 1종 이상의 특정 해당 단백질의 일시적인 세포 농도 감소를 야기할 수 있으며, 이차 약물(들)이 투여될 수 있는 경우 (이와 같은 이차 약물은 해당 단백질의 부재 시에, 또는 더 낮은 농도의 해당 단백질의 존재 시에 더 효과적임), 이는 치료적으로 작용가능한 범위를 생성시킬 수 있다. 예를 들어, RNA 편집 시약 또는 단백질체 교란 시약의 eVLP 전달은 베무라페닙/다브라페닙-내성 BRAF-구동된 종양 세포에서 MAPK 및 PI3K/AKT 단백질 및 관련 mRNA의 표적화된 분해를 촉발할 수 있으며, 이는 베무라페닙/다브라페닙의 투여를 위한 범위를 개방할 수 있는데, BRAF 억제제 내성이 일시적으로 무산되기 때문이다 (eVLP 카고에 의해 MAPK/PI3K/AKT 경로를 기반으로 하는 내성 메커니즘이 일시적으로 하향조절됨). 이와 같은 예는 특히 항원 유도성이며 그에 따라 종양 세포에 특이적인 eVLP와 조합되는 경우에 타당하다.
일부 실시양태에서, eVLP는 유도된 만능 줄기 세포를 생성시키기 위하여 인간 또는 마우스 섬유모세포와 같은 세포에, 예를 들어, 야마나카(Yamanaka) 인자 Oct3/4, Sox2, Klf4 및 c-Myc를 포함한 인자를 전달하는데 사용될 수 있다.
일부 실시양태에서, eVLP는 치료 효과를 도출하기 위하여 우성-음성 형태의 단백질을 전달할 수 있다.
항원-특이적 (즉 종양-항원 특이적) eVLP는 암 세포의 아폽토시스를 촉발하기 위한 아폽토시스유발 단백질 BIM, BID, PUMA, NOXA, BAD, BIK, BAX, BAK 및/또는 HRK을 전달하기 위하여 암 세포에 표적화될 수 있다. 종양 항원에 대해서는 관련 기술분야에 알려져 있으며, 절제불가능 질환을 동반하여 존재하는 췌장암 환자 중 90%가 포함된다. 절제불가능 췌장 종양이 있는 환자 중 대략 30%는 국소적인 질환 진행으로 사망하게 되며, 그에 따라 절제 방사선을 사용하여 국소적으로 진행된 췌장 종양을 치료하는 것이 바람직하나, 장관로는 종양 절제를 야기하는데 필요한 고도 선량의 방사선을 견딜 수 없다. 장관로의 선택적 방사선보호는 주변 위장관로에 가해지는 손상을 최소화하면서 췌장 종양의 절제 방사선 치료법을 가능하게 한다. 이를 위하여, eVLP에는 전사 억제인자 KRAB 및 EGLN을 표적화하는 가이드 RNA에 융합된 dCas9가 로딩될 수 있다. EGLN 억제는 절제 방사선 치료로부터의 위장관 독성을 상당히 감소시키는 것으로 제시된 바 있는데, 그것이 위장관로의 선택적인 방사선보호를 야기하나 췌장 종양은 그렇지 않기 때문이다.47 본원에서는 그와 같은 융합 단백질, eVLP, 및 이들의 제조 및 사용 방법이 제공된다.
시토졸에는 비결합 스테로이드 수용체가 존재한다. 리간드에의 결합 후, 이러한 수용체는 핵으로 전위하여 반응 유전자의 전사를 개시하게 된다. eVLP는 세포의 시토졸에 단일 사슬 가변 단편 (scFv) 항체를 전달할 수 있는데, 그것은 시토졸 스테로이드 수용체에 결합하여 그를 붕괴시킨다. 예를 들어, scFv는 글루코코르티코이드 수용체에 결합하여 그것이 덱사메타손에 결합하는 것을 방지할 수 있는데, 이는 종양 생성과 연결되어 있는 메탈로티오네인 1E와 같은 반응 유전자의 전사를 방지하게 된다.48
eVLP는 표적화된 단백질 붕괴를 수반하는 치료용으로 지시될 수 있다. 예를 들어, eVLP는 세포의 시토졸에 항체/scFv를 전달하는 것에 의해 세포의 시토졸 중 단백질을 표적화하고 붕괴시키는데 이용될 수 있다. 전통적으로, 세포 시토졸으로의 원형질 막을 통한 항체의 전달은 악명높게 어렵고 비효율적이었다. 이와 같은 단백질 억제 방식은 표적화된 소형 분자가 시토졸 중 단백질에 결합하여 그를 붕괴시키는 방법과 유사하며, 다양한 일련의 질환들의 치료에 유용할 수 있다.49-51 그와 같은 융합 단백질, eVLP, 및 그의 제조 및 사용 방법이 존재한다.
추가적으로, 표적화되는 소형 분자의 표적화는 촉매적 기능 또는 단백질-단백질 상호작용에 관련있는 결합 포켓을 포함하는 특정 크기의 단백질로 제한된다. scFv는 이러한 제한에 의해 방해를 받지 않는데, 촉매작용 및 다른 단백질과의 상호작용을 붕괴시키기 위하여 단백질의 많은 상이한 모이어티에 결합하는 scFv가 생성될 수 있기 때문이다. 예를 들어, RAS 종양단백질은 다수의 암 아형에 걸쳐 연관되어 있으며, RAS는 암에서 가장 빈번하게 관찰되는 종양유전자 중 하나이다. 예를 들어, 국제 암 게놈 협회는 KRAS가 그의 췌장 선암종 샘플 중 95%에서 돌연변이된다고 밝히고 있다. RAS 이소형은 PI3K 및 MAPK 경로와 같이 인간 암에서 조절장애가 있는 다양한 경로를 활성화하는 것으로 알려져 있다. RAS가 암에서 하는 이상한 역할에도 불구하고, RAS의 효능있는 약학적 직접 또는 간접 소형 분자 억제제는 개발되어 임상 용도로 승인되지 못하고 있다. RAS를 표적화하는 한 가지 전략은 다수의 RAS 이소형에 결합하여 그의 기능을 붕괴시키는 scFv를 암 세포에 특이적으로 전달할 수 있는 eVLP가 될 수 있다.49-51
섹션 2:
eVLP
조성물, 생산, 정제 및 적용분야
eVLP는 적어도 1종의 플라스미드 또는 생산자 세포주 게놈 DNA에 통합된 안정하게 발현하는 구축물 중 어느 하나에 의해 일시적으로 형질감염된 생산자 세포주로부터 생산될 수 있다. T1 및 T3eVLP의 일부 실시양태에서, 형질감염에 단일 플라스미드가 사용되는 경우, 그것은 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질 (예를 들어 표 1에 제시된 바와 같은 것)을 코딩하는 서열, 원형질 막 동원 도메인 (예를 들어 표 6에 제시된 바와 같은 것)에의 융합이 있거나 없는 카고 (예를 들어 치료용 단백질 또는 유전자 편집 시약 예컨대 아연 핑거, 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE), 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집/조정 단백질 및/또는 RNP 예컨대 표 2, 3, 4 & 5에 나와 있는 것들), 및 필요할 경우 가이드 RNA를 포함해야 한다. 바람직하게는, 2 내지 3종의 플라스미드가 형질감염에 사용된다. 이러한 2 내지 3종의 플라스미드에는 하기의 것이 포함될 수 있다 (임의의 2종 이상이 단일 플라스미드에 조합될 수 있음):
1. 원형질 막 동원 도메인에의 융합이 있거나 없는, 치료용 단백질 또는 게놈 편집 시약을 코딩하는 서열을 포함하는 플라스미드.
2. 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질 (예를 들어 표 1에 제시된 바와 같은 것)을 포함하는 플라스미드.
3. 플라스미드 1로부터의 게놈 편집 시약이 1종 이상의 가이드 RNA를 필요로 하는 경우, 플라스미드 1의 게놈 편집 시약에 부합하는 1종 이상의 가이드 RNA를 포함하는 플라스미드.
플라스미드(들)가 아닌 다른 유형의 DNA 분자를 전달할 것이 요구되는 경우, 상기 언급된 형질감염은 이중-가닥 폐쇄형-말단 선형 DNA, 에피솜, 미니서클, 이중-가닥 올리고뉴클레오티드 및/또는 다른 특수 DNA 분자를 사용하여 수행될 수 있다. 대안적으로, T2 및 T4eVLP의 경우에는, 상기 형질감염에서 기술된 구축물 (1 내지 3)을 안정하게 발현하도록 생산자 세포주가 구성될 수 있다.
초반에 언급된 바와 같이, 일부 실시양태에서, 상기 방법은 바이러스 외피를 제외한 임의의 외인성 단백질 (예를 들어 표 1에 제시된 바와 같은 것), 및, 원하는 경우에, 원형질 막 동원 도메인 (예를 들어 표 6에 제시된 바와 같은 것)을 발현하도록 조작되어 있거나 조작되어 있지 않은 세포를 사용하는 것을 포함한다. 이와 같은 실시양태에서, 생산되는 "빈" 입자에는 뉴클레오펙션, 지질, 중합체 또는 CaCl2 형질감염, 초음파처리, 냉동 해동, 및/또는 카고와 혼합된 정제된 입자의 열 충격을 이용하는 것에 의해 카고가 로딩될 수 있다. 모든 실시양태에서, 생산자 세포는 임의의 gag 단백질을 발현하지 않는다. 이와 같은 유형의 로딩은 카고가 원형질 막 동원 도메인에의 융합에 의해 변형되지 않는 것을 가능하게 하는 것으로서, 지금까지의 VLP 기술로부터 상당한 진전을 나타내는 것이다.
관련 기술분야에 알려져 있거나 상기한 플라스미드 또는 다른 유형의 특수 DNA 분자에는 바람직하게는 코딩된 서열의 발현 또는 번역을 구동하는 다른 요소, 예를 들어 프로모터 서열; 인핸서 서열, 예를 들어 5' 비번역 영역 (UTR) 또는 3' UTR; 폴리아데닐화 부위; 인슐레이터 서열; 또는 발현을 증가시키거나 제어하는 또 다른 서열 (예를 들어, 유도성 프로모터 요소)이 또한 포함될 수 있다.
바람직하게는, 적절한 생산자 세포주는 형질감염 시약의 효과 및 바이러스-유래 당단백질로 인한 융합성 효과에 대하여 불응성인 1차 또는 안정한 인간 세포주이다. 적절한 세포주의 예에는 인간 배아 신장 (HEK) 293 세포, HEK293 T/17 SF 세포 신장-유래 피닉스(Phoenix)-AMPHO 세포 및 태반-유래 BeWo 세포가 포함된다. 예를 들어, 이와 같은 세포는 부착성 세포 또는 현탁 세포로서 성장하는 그의 능력을 기준으로 선택될 수 있다. 일부 실시양태에서, 생산자 세포는 혈청 조건, 무-혈청 조건, 또는 무-엑소솜 혈청 조건 하에 전통적인 DMEM 중에서 배양될 수 있다. eVLP, 예를 들어 T1 및 T3eVLP는 해당 세포가 관련 기술분야에 알려져 있는 다양한 기술에 의해 상기 언급된 eVLP 생산 구성요소를 코딩하는 DNA 구축물을 사용하여 형질감염될 수 있는 한, 환자로부터 유래하는 세포 (자가 eVLP) 및 다른 FDA-승인 세포주 (동종이계 eVLP)로부터 생산될 수 있다.
추가적으로, 바람직할 경우, 1종 초과의 게놈 편집 시약이 형질감염에 포함될 수 있다. 상기 DNA 구축물은 생산자 세포주에서 단백질을 과발현하도록 설계될 수 있다. 예를 들어, 형질감염에 사용되는 플라스미드 백본은 RNA 폴리머라제 II 전사체용의 CMV 프로모터 또는 RNA 폴리머라제 III 전사체용의 U6 프로모터를 사용하는 pCDNA3 백본과 같이 관련 기술분야 통상의 기술자에게 익숙한 것일 수 있다. 관련 기술분야에 알려져 있는 다양한 기술이 생산자 세포에 핵산 분자를 도입하는데 사용될 수 있다. 그와 같은 기술에는 칼슘 포스페이트와 같은 화합물을 사용하는 화학물질-촉진 형질감염, 양이온성 지질, 양이온성 중합체, 리포솜-매개 형질감염, 예를 들어 리포펙타민(LIPOFECTAMINE) (리포펙타민 2000 또는 3000 및 트랜스IT-X2(TransIT-X2))과 같은 양이온성 리포솜, 폴리에틸렌이민, 비-화학적 방법 예컨대 전기천공, 입자 충격 또는 미세주사가 포함된다.
구성적 및/또는 유도성 방식으로 필요한 eVLP 구성요소를 안정하게 발현하는 인간 생산자 세포주가 T2 및 T4eVLP의 생산에 사용될 수 있다. 해당 세포가 상기 언급된 eVLP 구성요소를 발현하는 안정한 세포주로 전환되어 있는 경우, T2 및 T4eVLP는 환자로부터 유래하는 세포 (자가 eVLP) 및 다른 FDA-승인 세포주 (동종이계 eVLP)로부터 생산될 수 있다.
본원에서 또한 제공되는 것은 생산자 세포 자체이다.
카고-로딩된
eVLP
및 조성물의 생산
바람직하게는, eVLP는 형질감염 36-48시간 후, 또는 eVLP가 생산자 세포 배지 중 최대 농도로 존재할 때 (생산자 세포는 배지 중으로 입자를 배출하는데, 소정의 시점에 배지 중 입자 농도는 입자를 수확하기에 최적이 될 것임), 세포 배양 배지 상청액으로부터 수확된다. 상청액은 원심분리, 초원심분리, 침전, 한외여과 및/또는 크로마토그래피와 같은 업계에 알려져 있는 어떠한 방법에 의해서도 정제될 수 있다. 일부 실시양태에서, 상청액은 먼저, 예를 들어, 1 μm보다 더 큰 입자를 제거하기 위하여 예를 들어 0.45 세공 크기의 폴리비닐리덴 플루오라이드 친수성 막 (밀리포어 밀렉스(Millipore Millex)-HV), 또는 0.8 μm 세공 크기의 혼합 셀룰로스 에스테르 친수성 막 (밀리포어 밀렉스-AA)을 통하여 여과된다. 여과 후, 상청액은, 예를 들어, 1℃ 내지 5℃의 온도에서 1 내지 2시간 동안의 80,000 내지 100,000xg의 속도, 또는 1℃ 내지 5℃의 온도에서 10 내지 16시간 동안의 8,000 내지 15,000 g의 속도인 초원심분리를 사용하여 추가로 정제 및 농축될 수 있다. 이와 같은 원심분리 단계 후, eVLP는 원심분리물 (펠릿)의 형태로 농축되는데, 그것은 원하는 농도로 재현탁되거나, 형질도입-증강 시약과 혼합되거나, 완충제 교환에 적용되거나, 또는 그대로 사용될 수 있다. 일부 실시양태에서, eVLP-함유 상청액은 여과되어, 침전되고, 원심분리된 후, 농축 용액으로 재현탁될 수 있다. 입자를 침전시키는데, 예를 들어, 폴리에틸렌 글리콜 (PEG), 예를 들어, PEG 8000, 또는 eVLP 표면 단백질 또는 막 구성요소에 결합하는 항체-비드 접합체가 사용될 수 있다. 정제된 입자는 안정해서, 4℃에서 1주까지 동안, 또는 -80℃에서 수년 동안 상당한 활성의 상실 없이 저장될 수 있다.
바람직하게는, eVLP는 적절한 캐리어 중에 입자가 현탁되도록 재현탁되거나 완충제 교환에 적용된다. 일부 실시양태에서, 완충제 교환은 한외여과 (사르토리우스 비바스핀(Sartorius Vivaspin) 500 MWCO 100,000)에 의해 수행될 수 있다. 시험관내 적용에 사용될 예시적인 적절한 eVLP용 캐리어는 바람직하게는 eVLP에 의해 형질도입될 세포에 적합한 세포 배양 배지일 것이다. 시험관내 적용을 위하여 정제 및 농축된 eVLP 용액에 혼합될 수 있는 형질도입-증강 시약에는 관련 기술분야 통상의 기술자에게 알려져 있는 시약 (밀테니이 바이오텍 벡토푸신(Miltenyi Biotec Vectofusin)-1, 밀리포어 폴리브렌(Millipore Polybrene), 타카라 레트로넥틴(Takara Retronectin), 시그마 프로타민 술페이트(Sigma Protamine Sulfate) 등)이 포함된다. 적절한 캐리어 중 eVLP가 형질도입될 세포에 적용된 후에는, 원심분리에 의해 형질도입 효율이 추가로 증가될 수 있다. 바람직하게는, 세포에 적용되는 eVLP를 함유하는 플레이트는 실온에서 30분 동안 1,150 g의 속도로 원심분리될 수 있다. 원심분리 후, 세포는 적절한 세포 배양 인큐베이터 (5% CO2를 포함하는 37℃의 가습 인큐베이터)로 복귀된다.
포유동물, 특히 인간에게 투여될 적절한 eVLP용 캐리어는 바람직하게는 제약상 허용되는 조성물일 것이다. "제약상 허용되는 조성물"은 비-독성의 반고체, 액체이거나 에어로졸화된 임의의 유형의 충전제, 희석제, 캡슐화 재료, 콜로이드 현탁액 또는 제제화 보조제를 지칭한다. 바람직하게는, 이와 같은 조성물은 주사용으로 적합하다. 이들은 특히 등장성의 멸균 식염수 용액 (모노나트륨 또는 디나트륨 포스페이트, 나트륨, 칼륨, 칼슘 또는 마그네슘 클로라이드 및 유사 용액 또는 이와 같은 염의 혼합물), 또는 경우에 따라 멸균수 또는 생리 식염수의 첨가 시 주사가능 용액의 구성을 가능하게 하는 건조, 특히 냉동-건조 조성물일 수 있다. 또 다른 적절한 제약용 형태는 비내 흡입 또는 기관내 삽관에 의한 투여를 위한 에어로졸화된 입자일 수 있다.
주사가능 용도로 적합한 제약 형태에는 멸균된 수성 용액 또는 현탁액이 포함된다. 상기 용액 또는 현탁액은 eVLP와 상용성이며 표적 세포에의 eVLP 진입을 방해하지 않는 첨가제를 포함할 수 있다. 모든 경우에서, 형태는 멸균성이어야 하며, 시린지를 사용하여 형태가 투여될 수 있는 정도까지 유동성이어야 한다. 그것은 제조 및 저장 조건 하에서 안정해야 하며, 세균 및 진균과 같은 미생물의 오염 작용에 대항하여 보존되어야 한다. 적절한 용액의 예는 포스페이트 완충 식염수와 같은 완충제이다.
적합한 제약 조성물의 제제화 방법에 대해서는 관련 기술분야에 알려져 있으며, 예를 들어, 문헌 [Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21st ed., 2005; and the books in the series Drugs and the Pharmaceutical Sciences: a Series of Textbooks and Monographs (Dekker, NY)]을 참조한다. 예를 들어, 비경구, 피내 또는 피하 적용에 사용되는 용액 또는 현탁액은 하기의 구성요소를 포함할 수 있다: 멸균된 희석제 예컨대 주사용수, 식염수 용액, 고정 오일, 폴리에틸렌 글리콜, 글리세린, 프로필렌 글리콜 또는 다른 합성 용매; 항세균제 예컨대 벤질 알콜 또는 메틸 파라벤; 항산화제 예컨대 아스코르브산 또는 나트륨 비술파이트; 킬레이팅제 예를 들어 에틸렌디아민테트라아세트산; 완충제 예컨대 아세테이트, 시트레이트 또는 포스페이트, 및 장성 조정을 위한 작용제 예컨대 나트륨 클로라이드 또는 덱스트로스. pH는 염산 또는 나트륨 히드록시드와 같은 산 또는 염기를 사용하여 조정될 수 있다. 비경구 조제물은 유리 또는 플라스틱으로 제조된 앰풀, 일회용 시린지 또는 다중 투여 바이알 내에 봉입될 수 있다.
주사가능 용도로 적합한 제약 조성물에는 멸균 주사가능 용액 또는 분산액의 즉석 조제를 위한 멸균 수성 용액 (수용성인 경우) 또는 분산액 및 멸균 분말이 포함될 수 있다. 정맥내 투여의 경우, 적합한 캐리어에는 생리 식염수, 정균수, 크레모포어(Cremophor) EL™ (바스프(BASF), 뉴저지주 파르시파니 소재) 또는 포스페이트 완충 식염수 (PBS)가 포함된다. 모든 경우에서, 조성물은 멸균성이어야 하며, 용이한 시린지성이 존재하는 정도까지 유동성이어야 한다. 그것은 제조 및 저장 조건 하에서 안정해야 하며, 세균 및 진균과 같은 미생물의 오염 작용에 대항하여 보존되어야 한다. 캐리어는, 예를 들어, 물, 에탄올, 폴리올 (예를 들어 글리세롤, 프로필렌 글리콜 및 액체 폴리에틸렌 글리콜 등) 및 이들의 적합한 혼합물을 함유하는 용매 또는 분산 매체일 수 있다. 적정한 유동성은, 예를 들어, 레시틴과 같은 코팅의 사용에 의해, 분산액의 경우 필요한 입자 크기의 유지에 의해, 그리고 계면활성제의 사용에 의해 유지될 수 있다. 미생물 작용의 방지는 다양한 항세균제 및 항진균제, 예를 들어, 파라벤, 클로로부탄올, 페놀, 아스코르브산, 티메로살 등에 의해 달성될 수 있다. 많은 경우에서, 등장화제, 예를 들어, 당, 폴리알콜 예를 들어 만니톨, 소르비톨, 나트륨 클로라이드를 조성물에 포함시키는 것이 바람직하게 된다. 주사가능 조성물의 연장된 흡수는 흡수를 지연하는 작용제, 예를 들어, 알루미늄 모노스테아레이트 및 젤라틴을 조성물에 포함시키는 것에 의해 초래될 수 있다.
멸균 주사가능 용액은 필요에 따라 상기에서 열거된 1종 이상의 성분 조합과 함께 적절한 용매 중에 필요한 양의 활성 화합물을 혼입한 후, 여과 멸균하는 것에 의해 제조될 수 있다. 일반적으로, 분산액은 기본 분산 매체 및 상기에서 열거된 것들 중 필요한 다른 성분을 함유하는 멸균 비히클에 활성 화합물을 혼입하는 것에 의해 제조된다. 멸균 주사가능 용액의 제조를 위한 멸균 분말의 경우, 바람직한 제조 방법은 진공 건조 및 냉동-건조이며, 이는 미리 멸균-여과된 해당 용액으로부터 활성 성분 플러스 임의의 추가적인 원하는 성분의 분말을 산출한다.
카고-로딩된 eVLP를 포함하는 조성물은 투여 지침과 함께 용기, 팩 또는 분배기 내에 포함될 수 있다.
실시예
본 발명은 하기의 실시예에서 추가로 기술되며, 이는 청구범위에서 기술되는 본 발명의 범주를 제한하는 것은 아니다.
방법
하기 실시예에서는, 하기의 방법을 사용하였다. 폴리에틸렌이민 (PEI) 기반 플라스미드 형질감염을 사용하여 HEK293T 세포에 의해 eVLP 입자를 생산하였다. PEI는 선형 폴리에틸렌이민 25kD (폴리사이언시즈(Polysciences) #23966-2)이다. 스톡 'PEI MAX' 용액을 제조하기 위하여, 1 g의 PEI를 미리 ~80℃로 가열된 1 L의 무-내독소 dH2O에 첨가한 후, 실온으로 냉각하였다. 이와 같은 혼합물을 10 N NaOH의 첨가에 의해 pH 7.1로 중화하고, 0.22 μm 폴리에테르술폰 (PES)를 사용하여 여과 멸균하였다. PEI MAX는 -20℃에서 저장한다.
HEK293T 세포를 형질감염 시점에 70%-90%의 전면생장률에 도달하도록 스플릿하고, 10% FBS DMEM 배지에서 배양하였다. 코돈 최적화된 Cas9에의 hPLCδ1 PH 융합체의 CMV 프로모터 구동 발현을 코딩하는 것과 같은 카고 벡터를 U6 프로모터-sgRNA 코딩 플라스미드 및 VSV-G 외피 플라스미드 pMD2.G (애드진(Addgene) #12259)와 함께 공동-형질감염시켰다. 형질감염 반응액은 환원된 혈청 배지 (Opti-MEM; 기브코(GIBCO) #31985-070) 중에 구성하였다. 10 cm 플레이트에서의 eVLP 입자 생산을 위하여, 7.5 μg의 PH-Cas9 발현 플라스미드, 7.5 μg의 sgRNA-발현 플라스미드 및 5 μg의 pMD2.G를 1 mL Opti-MEM 중에서 혼합한 후, 27.5 μl의 PEI MAX를 첨가하였다. 실온에서 20-30분 인큐베이션 후, 형질감염 반응액을 HEK293T 세포 상에 적가 분산시켰다.
형질감염 48-72시간 후, eVLP를 수확하였다. 0.45 μm 셀룰로스 아세테이트 또는 0.8 μm PES 막 필터를 사용하여 eVLP 상청액을 여과한 후, SW28 로터와 함께 사용되는 폴리프로필렌 베크만(Beckman) 초원심분리기 튜브 (베크만 쿨터(Beckman Coulter) #326823)로 전달하였다. 각 초원심분리기 튜브에 대략 35-37.5 ml의 최종 부피에 부피에 도달하도록 3개의 10 cm 플레이트로부터 eVLP-함유 상청액을 충전하였다. 4℃에서 2시간 동안 대략 100,000xg 또는 25,000 rpm으로, eVLP 상청액을 초원심분리에 적용하였다. 초원심분리 후, 상청액을 경사분리하고, eVLP 펠릿을 DMEM 10% FBS 배지 중에 재현탁함으로써, 그것이 이제는 초원심분리 이전의 그것에 비해 대략 1,000배 더 농축되도록 하였다. 형질도입 24시간 전에 24-웰 플레이트에 시딩되었던 세포에 eVLP를 적가하였다. 필요할 경우, 형질도입 효율을 증강시키기 위하여, 폴리브렌 (세포 배양 배지 중 5-10 μg/mL; 시그마-알드리치(Sigma-Aldrich) #TR-1003-G)을 보충하였다. 필요할 경우, 형질도입 효율을 증강시키기 위하여, 벡토푸신(Vectofusin)-1 (세포 배양 배지 중 10 μg/mL, 밀테니이 바이오텍 #130-111-163)을 보충하였다. eVLP의 첨가 직후, 필요할 경우, 형질도입 효율을 증강시키기 위하여, 실온에서 30분 동안 1,150xg로 24-웰 플레이트를 원심분리하였다.
실시예
1.
PH 도메인에의 융합이 있거나 없는 VSVG-위형화 VLP 중으로 Cas9 RNP를 전달하였다. PH 융합이 있거나 없는 Cas9 및 VEGF-표적화 sgRNA를 포함하는 T2eVLP를 48시간 동안 HepG2, U2OS, HEK293T, CFPAC1, BeWo, Jurkat, K562 및 1차 T 세포에 적용하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 VEGF 내 표적 부위의 유전자 변형 빈도를 수득하였다. 도 3은 hPLCδ1 또는 hAKT1으로부터의 PH 도메인에의 융합이 T2eVLP 중 Cas9의 전달/편집 효율을 상당히 증강시켰음을 입증한다.
GFP를 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 Cas9에의 Gag 융합체 및 Cas9에의 PH 융합체를 각각 VLP 또는 T1eVLP 중에 패키징하였다. VSVG, Cas9 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, GFP의 단일 복제본을 안정하게 발현하는 U2OS 또는 HEK293 세포주를 처리하였다. PVDF 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. T7E1 및 유동 세포측정법에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다. 결과는 도 5A-B에 제시되어 있다.
도 6에서는, HEK 부위 #3 또는 VEGF 부위 #2를 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 코돈 최적화된 Cas9에의 hPLCδ1 PH 융합체를 T1eVLP에 패키징하였다. VSVG, Cas9 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM, 10% FBS)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, U2OS 세포를 처리하였다. 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 7에서는, VEGF 부위 #3을 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 코돈 최적화된 Cas9에의 hPLCδ1 (좌측 그래프) 또는 hAkt PH (우측 그래프) 융합체를 T1eVLP에 패키징하였다. VSVG, Cas9 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM, 10% FBS)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, U2OS 세포를 처리하였다. 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 8에서는, VEGF 부위 #2를 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 Cas9-기반 염기 편집자 (BE3 및 BE4) N 또는 C 말단에의 gag 융합체 또는 BE3 및 BE4 N 또는 C 말단에의 PH 융합체를 각각 VLP 및 eVLP에 패키징하였다. VSVG, 염기 편집자 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, HEK293T 세포를 처리하였다. 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 9에서는, HEK 부위 #3를 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 Cas9-기반 염기 편집자 (코돈 최적화된 BE4) N 말단에의 hPLCδ1 융합체를 eVLP에 패키징하였다. VSVG, 염기 편집자 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, HEK293T 세포를 처리하였다. 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 10에서는, VEGF 부위 #3를 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 Cas9-기반 염기 편집자 (코돈 최적화된 ABE) N 말단에의 hPLCδ1 융합체를 eVLP에 패키징하였다. VSVG, 염기 편집자 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, HEK293T 세포를 처리하였다. 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 11에서는, HEK 부위 #3를 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 Cas9-기반 염기 편집자 (코돈 최적화된 ABE) N 말단에의 hPLCδ1 융합체를 eVLP에 패키징하였다. VSVG, 염기 편집자 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, HEK293T 세포를 처리하였다. 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. 앰플리콘 서열분석에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 12에서는, FANCF 부위 #1을 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 Cas12a에의 gag 융합체 또는 Cas12a에의 hPLCδ1 PH 융합체를 각각 VLP 및 eVLP에 패키징하였다. VSVG, Cas12a 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, HEK293 세포를 처리하였다. PVDF 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. T7E1에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 13에서는, GFP 부위 #1을 표적화하는 MS2-스템 루프 가이드 RNA를 동반하는 MS2에의 hPLCδ1 PH 융합체를 Cas9를 동반하는 eVLP에 패키징하였다. VSVG, Cas9, PH-MS2 융합체 및 MS2 스템 루프 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, HEK293 세포를 처리하였다. PVDF 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. T7E1에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 14에서는, GFP 부위 #1 및 DmrA 반복부에 융합된 Cas9를 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 DmrC에의 hPLCδ1 PH 융합체를 eVLP에 패키징하였다. VSVG, DmrA-Cas9, PH-DmrC 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, HEK293 세포를 처리하였다. PVDF 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. T7E1에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 15에서는, GFP 부위 #1 및 scFv에 융합된 Cas9를 표적화하는 가이드 RNA를 동반하는 GCN4 반복부에의 hPLCδ1 PH 융합체를 eVLP에 패키징하였다. VSVG, scFv-Cas9, PH-GCN4 융합체 및 가이드 RNA 발현 플라스미드의 형질감염 48시간 후 HEK293T 세포 배양 배지 (DMEM)로부터 미리 정제된 이들 입자를 사용하여, HEK293 세포를 처리하였다. PVDF 여과 및 100,000xg에서 2시간 동안의 초원심분리에 의해 입자 정제 및 농축을 수행하였다. T7E1에 의해 유전자 변형 빈도를 측정하였다.
도 16-40은 eVLP 배열구조 및 가능한 카고의 다양한 비-제한적 예를 제시한다.
표 1 | 예시적인 바이러스-유래 당단백질
표 2 | 예시적인 잠재적 Cas9 및 Cas12a 오르토로그
표 3 | 예시적인 데아미나제 도메인 및 그의 기질 서열 선호도.
표 4 | 예시적인 후성적 조정인자 도메인.
표 5 | 예시적인 CRISPR 기반 RNA-가이드된 RNA 결합 효소
표 6 | 예시적인 원형질 막 동원 도메인
예시적인 관련 단백질 서열:
인용 문헌
다른 실시양태
본 발명이 그의 상세한 설명과 연계해서 기술되기는 하였지만, 전술한 상세한 설명은 첨부된 청구범위의 범주에 의해 정의되는 본 발명의 범주를 예시하고자 하는 것이지, 제한하고자 하는 것이 아님을 이해해야 한다. 다른 측면, 이점 및 변형은 하기 청구범위의 범주에 속한다.
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<213> Homo sapiens
<400> 1
Met Gln Thr Gly Arg Thr Glu Asp Asp Leu Val Pro Thr Ala Pro Ser
1 5 10 15
Leu Gly Thr Lys Glu Gly Tyr Leu Thr Lys Gln Gly Gly Leu Val Lys
20 25 30
Thr Trp Lys Thr Arg Trp Phe Thr Leu His Arg Asn Glu Leu Lys Tyr
35 40 45
Phe Lys Asp Gln Met Ser Pro Glu Pro Ile Arg Ile Leu Asp Leu Thr
50 55 60
Glu Cys Ser Ala Val Gln Phe Asp Tyr Ser Gln Glu Arg Val Asn Cys
65 70 75 80
Phe Cys Leu Val Phe Pro Phe Arg Thr Phe Tyr Leu Cys Ala Lys Thr
85 90 95
Gly Val Glu Ala Asp Glu Trp Ile Lys Ile Leu Arg Trp Lys Leu Ser
100 105 110
Gln Ile Arg Lys Gln Leu Asn Gln Gly Glu Gly Thr Ile Arg
115 120 125
<210> 2
<211> 153
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 2
Pro Phe Lys Ile Pro Glu Asp Asp Gly Asn Asp Leu Thr His Thr Phe
1 5 10 15
Phe Asn Pro Asp Arg Glu Gly Trp Leu Leu Lys Leu Gly Gly Arg Val
20 25 30
Lys Thr Trp Lys Arg Arg Trp Phe Ile Leu Thr Asp Asn Cys Leu Tyr
35 40 45
Tyr Phe Glu Tyr Thr Thr Asp Lys Glu Pro Arg Gly Ile Ile Pro Leu
50 55 60
Glu Asn Leu Ser Ile Arg Glu Val Glu Asp Pro Arg Lys Pro Asn Cys
65 70 75 80
Phe Glu Leu Tyr Asn Pro Ser His Lys Gly Gln Val Ile Lys Ala Cys
85 90 95
Lys Thr Glu Ala Asp Gly Arg Val Val Glu Gly Asn His Val Val Tyr
100 105 110
Arg Ile Ser Ala Pro Ser Pro Glu Glu Lys Glu Glu Trp Met Lys Ser
115 120 125
Ile Lys Ala Ser Ile Ser Arg Asp Pro Phe Tyr Asp Met Leu Ala Thr
130 135 140
Arg Lys Arg Arg Ile Ala Asn Lys Lys
145 150
<210> 3
<211> 118
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 3
Asn Pro Asp Arg Glu Gly Trp Leu Leu Lys Leu Gly Gly Gly Arg Val
1 5 10 15
Lys Thr Trp Lys Arg Arg Trp Phe Ile Leu Thr Asp Asn Cys Leu Tyr
20 25 30
Tyr Phe Glu Tyr Thr Thr Asp Lys Glu Pro Arg Gly Ile Ile Pro Leu
35 40 45
Glu Asn Leu Ser Ile Arg Glu Val Glu Asp Pro Arg Lys Pro Asn Cys
50 55 60
Phe Glu Leu Tyr Asn Pro Ser His Lys Gly Gln Val Ile Lys Ala Cys
65 70 75 80
Lys Thr Glu Ala Asp Gly Arg Val Val Glu Gly Asn His Val Val Tyr
85 90 95
Arg Ile Ser Ala Pro Ser Pro Glu Glu Lys Glu Glu Trp Met Lys Ser
100 105 110
Ile Lys Ala Ser Ile Ser
115
<210> 4
<211> 99
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 4
Ser Gly Ser Ala Arg Glu Gly Trp Leu Phe Lys Trp Thr Asn Tyr Ile
1 5 10 15
Lys Gly Tyr Gln Arg Arg Trp Phe Val Leu Ser Asn Gly Leu Leu Ser
20 25 30
Tyr Tyr Arg Ser Lys Ala Glu Met Arg His Thr Cys Arg Gly Thr Ile
35 40 45
Asn Leu Ala Thr Ala Asn Ile Thr Val Glu Asp Ser Cys Asn Phe Ile
50 55 60
Ile Ser Asn Gly Gly Ala Gln Thr Tyr His Leu Lys Ala Ser Ser Glu
65 70 75 80
Val Glu Arg Gln Arg Trp Val Thr Ala Leu Glu Leu Ala Lys Ala Lys
85 90 95
Ala Val Lys
<210> 5
<211> 177
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 5
Met Ala Ala Val Ile Leu Glu Ser Ile Phe Leu Lys Arg Ser Gln Gln
1 5 10 15
Lys Lys Lys Thr Ser Pro Leu Asn Phe Lys Lys Arg Leu Phe Leu Leu
20 25 30
Thr Val His Lys Leu Ser Tyr Tyr Glu Tyr Asp Phe Glu Arg Gly Arg
35 40 45
Arg Gly Ser Lys Lys Gly Ser Ile Asp Val Glu Lys Ile Thr Cys Val
50 55 60
Glu Thr Val Val Pro Glu Lys Asn Pro Pro Pro Glu Arg Gln Ile Pro
65 70 75 80
Arg Arg Gly Glu Glu Ser Ser Glu Met Glu Gln Ile Ser Ile Ile Glu
85 90 95
Arg Phe Pro Tyr Pro Phe Gln Val Val Tyr Asp Glu Gly Pro Leu Tyr
100 105 110
Val Phe Ser Pro Thr Glu Glu Leu Arg Lys Arg Trp Ile His Gln Leu
115 120 125
Lys Asn Val Ile Arg Tyr Asn Ser Asp Leu Val Gln Lys Tyr His Pro
130 135 140
Cys Phe Trp Ile Asp Gly Gln Tyr Leu Cys Cys Ser Gln Thr Ala Lys
145 150 155 160
Asn Ala Met Gly Cys Gln Ile Leu Glu Asn Arg Asn Gly Ser Leu Lys
165 170 175
Pro
<210> 6
<211> 98
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 6
Met Glu Gly Val Leu Tyr Lys Trp Thr Asn Tyr Leu Thr Gly Trp Gln
1 5 10 15
Pro Arg Trp Phe Val Leu Asp Asn Gly Ile Leu Ser Tyr Tyr Asp Ser
20 25 30
Gln Asp Asp Val Cys Lys Gly Ser Lys Gly Ser Ile Lys Met Ala Val
35 40 45
Cys Glu Ile Lys Val His Ser Ala Asp Asn Thr Arg Met Glu Leu Ile
50 55 60
Ile Pro Gly Glu Gln His Phe Tyr Met Lys Ala Val Asn Ala Ala Glu
65 70 75 80
Arg Gln Arg Trp Leu Val Ala Leu Gly Ser Ser Lys Ala Cys Leu Thr
85 90 95
Asp Thr
<210> 7
<211> 122
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 7
Met Ser Asp Asn Gln Ser Trp Asn Ser Ser Gly Ser Glu Glu Asp Pro
1 5 10 15
Glu Thr Glu Ser Gly Pro Pro Val Glu Arg Cys Gly Val Leu Ser Lys
20 25 30
Trp Thr Asn Tyr Ile His Gly Trp Gln Asp Arg Trp Val Val Leu Lys
35 40 45
Asn Asn Ala Leu Ser Tyr Tyr Lys Ser Glu Asp Glu Thr Glu Tyr Gly
50 55 60
Cys Arg Gly Ser Ile Cys Leu Ser Lys Ala Val Ile Thr Pro His Asp
65 70 75 80
Phe Asp Glu Cys Arg Phe Asp Ile Ser Val Asn Asp Ser Val Trp Tyr
85 90 95
Leu Arg Ala Gln Asp Pro Asp His Arg Gln Gln Trp Ile Asp Ala Ile
100 105 110
Glu Gln His Lys Thr Glu Ser Gly Tyr Gly
115 120
<210> 8
<211> 120
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 8
Thr Val Met Lys Glu Gly Trp Met Val His Tyr Thr Ser Lys Asp Thr
1 5 10 15
Leu Arg Lys Arg His Tyr Trp Arg Leu Asp Ser Lys Cys Ile Thr Leu
20 25 30
Phe Gln Asn Asp Thr Gly Ser Arg Tyr Tyr Lys Glu Ile Pro Leu Ser
35 40 45
Glu Ile Leu Ser Leu Glu Pro Val Lys Thr Ser Ala Leu Ile Pro Asn
50 55 60
Gly Ala Asn Pro His Cys Phe Glu Ile Thr Thr Ala Asn Val Val Tyr
65 70 75 80
Tyr Val Gly Glu Asn Val Val Asn Pro Ser Ser Pro Ser Pro Asn Asn
85 90 95
Ser Val Leu Thr Ser Gly Val Gly Ala Asp Val Ala Arg Met Trp Glu
100 105 110
Ile Ala Ile Gln His Ala Leu Met
115 120
<210> 9
<211> 101
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 9
Arg Ile Gln Leu Ser Gly Met Tyr Asn Val Arg Lys Gly Lys Met Gln
1 5 10 15
Leu Pro Val Asn Arg Trp Thr Arg Arg Gln Val Ile Leu Cys Gly Thr
20 25 30
Cys Leu Ile Val Ser Ser Val Lys Asp Ser Leu Thr Gly Lys Met His
35 40 45
Val Leu Pro Leu Ile Gly Gly Lys Val Glu Glu Val Lys Lys His Gln
50 55 60
His Cys Leu Ala Phe Ser Ser Ser Gly Pro Gln Ser Gln Thr Tyr Tyr
65 70 75 80
Ile Cys Phe Asp Thr Phe Thr Glu Tyr Leu Arg Trp Leu Arg Gln Val
85 90 95
Ser Lys Val Ala Ser
100
<210> 10
<211> 97
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 10
Asp Val Leu Lys Gln Gly Tyr Met Met Lys Lys Gly His Arg Arg Lys
1 5 10 15
Asn Trp Thr Glu Arg Trp Phe Val Leu Lys Pro Asn Ile Ile Ser Tyr
20 25 30
Tyr Val Ser Glu Asp Leu Lys Asp Lys Lys Gly Asp Ile Leu Leu Asp
35 40 45
Glu Asn Cys Cys Val Glu Ser Leu Pro Asp Lys Asp Gly Lys Lys Cys
50 55 60
Leu Phe Leu Val Lys Cys Phe Asp Lys Thr Phe Glu Ile Ser Ala Ser
65 70 75 80
Asp Lys Lys Lys Lys Gln Glu Trp Ile Gln Ala Ile His Ser Thr Ile
85 90 95
His
<210> 11
<211> 113
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 11
Asp Met Leu Ser Ser His His Tyr Lys Ser Phe Lys Val Ser Met Ile
1 5 10 15
His Arg Leu Arg Phe Thr Thr Asp Val Gln Leu Gly Ile Ser Gly Asp
20 25 30
Lys Val Glu Ile Asp Pro Val Thr Asn Gln Lys Ala Ser Thr Lys Phe
35 40 45
Trp Ile Lys Gln Lys Pro Ile Ser Ile Asp Ser Asp Leu Leu Cys Ala
50 55 60
Cys Asp Leu Ala Glu Glu Lys Ser Pro Ser His Ala Ile Phe Lys Leu
65 70 75 80
Thr Tyr Leu Ser Asn His Asp Tyr Lys His Leu Tyr Phe Glu Ser Asp
85 90 95
Ala Ala Thr Val Asn Glu Ile Val Leu Lys Val Asn Tyr Ile Leu Glu
100 105 110
Ser
<210> 12
<211> 562
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Description of Unknown:
Baboon endogenous virus sequence
<400> 12
Met Gly Phe Thr Thr Lys Ile Ile Phe Leu Tyr Asn Leu Val Leu Val
1 5 10 15
Tyr Ala Gly Phe Asp Asp Pro Arg Lys Ala Ile Glu Leu Val Gln Lys
20 25 30
Arg Tyr Gly Arg Pro Cys Asp Cys Ser Gly Gly Gln Val Ser Glu Pro
35 40 45
Pro Ser Asp Arg Val Ser Gln Val Thr Cys Ser Gly Lys Thr Ala Tyr
50 55 60
Leu Met Pro Asp Gln Arg Trp Lys Cys Lys Ser Ile Pro Lys Asp Thr
65 70 75 80
Ser Pro Ser Gly Pro Leu Gln Glu Cys Pro Cys Asn Ser Tyr Gln Ser
85 90 95
Ser Val His Ser Ser Cys Tyr Thr Ser Tyr Gln Gln Cys Arg Ser Gly
100 105 110
Asn Lys Thr Tyr Tyr Thr Ala Thr Leu Leu Lys Thr Gln Thr Gly Gly
115 120 125
Thr Ser Asp Val Gln Val Leu Gly Ser Thr Asn Lys Leu Ile Gln Ser
130 135 140
Pro Cys Asn Gly Ile Lys Gly Gln Ser Ile Cys Trp Ser Thr Thr Ala
145 150 155 160
Pro Ile His Val Ser Asp Gly Gly Gly Pro Leu Asp Thr Thr Arg Ile
165 170 175
Lys Ser Val Gln Arg Lys Leu Glu Glu Ile His Lys Ala Leu Tyr Pro
180 185 190
Glu Leu Gln Tyr His Pro Leu Ala Ile Pro Lys Val Arg Asp Asn Leu
195 200 205
Met Val Asp Ala Gln Thr Leu Asn Ile Leu Asn Ala Thr Tyr Asn Leu
210 215 220
Leu Leu Met Ser Asn Thr Ser Leu Val Asp Asp Cys Trp Leu Cys Leu
225 230 235 240
Lys Leu Gly Pro Pro Thr Pro Leu Ala Ile Pro Asn Phe Leu Leu Ser
245 250 255
Tyr Val Thr Arg Ser Ser Asp Asn Ile Ser Cys Leu Ile Ile Pro Pro
260 265 270
Leu Leu Val Gln Pro Met Gln Phe Ser Asn Ser Ser Cys Leu Phe Ser
275 280 285
Pro Ser Tyr Asn Ser Thr Glu Glu Ile Asp Leu Gly His Val Ala Phe
290 295 300
Ser Asn Cys Thr Ser Ile Thr Asn Val Thr Gly Pro Ile Cys Ala Val
305 310 315 320
Asn Gly Ser Val Phe Leu Cys Gly Asn Asn Met Ala Tyr Thr Tyr Leu
325 330 335
Pro Thr Asn Trp Thr Gly Leu Cys Val Leu Ala Thr Leu Leu Pro Asp
340 345 350
Ile Asp Ile Ile Pro Gly Asp Glu Pro Val Pro Ile Pro Ala Ile Asp
355 360 365
His Phe Ile Tyr Arg Pro Lys Arg Ala Ile Gln Phe Ile Pro Leu Leu
370 375 380
Ala Gly Leu Gly Ile Thr Ala Ala Phe Thr Thr Gly Ala Thr Gly Leu
385 390 395 400
Gly Val Ser Val Thr Gln Tyr Thr Lys Leu Ser Asn Gln Leu Ile Ser
405 410 415
Asp Val Gln Ile Leu Ser Ser Thr Ile Gln Asp Leu Gln Asp Gln Val
420 425 430
Asp Ser Leu Ala Glu Val Val Leu Gln Asn Arg Arg Gly Leu Asp Leu
435 440 445
Leu Thr Ala Glu Gln Gly Gly Ile Cys Leu Ala Leu Gln Glu Lys Cys
450 455 460
Cys Phe Tyr Val Asn Lys Ser Gly Ile Val Arg Asp Lys Ile Lys Thr
465 470 475 480
Leu Gln Glu Glu Leu Glu Arg Arg Arg Lys Asp Leu Ala Ser Asn Pro
485 490 495
Leu Trp Thr Gly Leu Gln Gly Leu Leu Pro Tyr Leu Leu Pro Phe Leu
500 505 510
Gly Pro Leu Leu Thr Leu Leu Leu Leu Leu Thr Ile Gly Pro Cys Ile
515 520 525
Phe Asn Arg Leu Val Gln Phe Val Lys Asp Arg Ile Ser Val Val Gln
530 535 540
Ala Leu Val Leu Thr Gln Gln Tyr His Gln Leu Lys Pro Leu Glu Tyr
545 550 555 560
Glu Pro
<210> 13
<211> 546
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 13
Met Gly Phe Thr Thr Lys Ile Ile Phe Leu Tyr Asn Leu Val Leu Val
1 5 10 15
Tyr Ala Gly Phe Asp Asp Pro Arg Lys Ala Ile Glu Leu Val Gln Lys
20 25 30
Arg Tyr Gly Arg Pro Cys Asp Cys Ser Gly Gly Gln Val Ser Glu Pro
35 40 45
Pro Ser Asp Arg Val Ser Gln Val Thr Cys Ser Gly Lys Thr Ala Tyr
50 55 60
Leu Met Pro Asp Gln Arg Trp Lys Cys Lys Ser Ile Pro Lys Asp Thr
65 70 75 80
Ser Pro Ser Gly Pro Leu Gln Glu Cys Pro Cys Asn Ser Tyr Gln Ser
85 90 95
Ser Val His Ser Ser Cys Tyr Thr Ser Tyr Gln Gln Cys Arg Ser Gly
100 105 110
Asn Lys Thr Tyr Tyr Thr Ala Thr Leu Leu Lys Thr Gln Thr Gly Gly
115 120 125
Thr Ser Asp Val Gln Val Leu Gly Ser Thr Asn Lys Leu Ile Gln Ser
130 135 140
Pro Cys Asn Gly Ile Lys Gly Gln Ser Ile Cys Trp Ser Thr Thr Ala
145 150 155 160
Pro Ile His Val Ser Asp Gly Gly Gly Pro Leu Asp Thr Thr Arg Ile
165 170 175
Lys Ser Val Gln Arg Lys Leu Glu Glu Ile His Lys Ala Leu Tyr Pro
180 185 190
Glu Leu Gln Tyr His Pro Leu Ala Ile Pro Lys Val Arg Asp Asn Leu
195 200 205
Met Val Asp Ala Gln Thr Leu Asn Ile Leu Asn Ala Thr Tyr Asn Leu
210 215 220
Leu Leu Met Ser Asn Thr Ser Leu Val Asp Asp Cys Trp Leu Cys Leu
225 230 235 240
Lys Leu Gly Pro Pro Thr Pro Leu Ala Ile Pro Asn Phe Leu Leu Ser
245 250 255
Tyr Val Thr Arg Ser Ser Asp Asn Ile Ser Cys Leu Ile Ile Pro Pro
260 265 270
Leu Leu Val Gln Pro Met Gln Phe Ser Asn Ser Ser Cys Leu Phe Ser
275 280 285
Pro Ser Tyr Asn Ser Thr Glu Glu Ile Asp Leu Gly His Val Ala Phe
290 295 300
Ser Asn Cys Thr Ser Ile Thr Asn Val Thr Gly Pro Ile Cys Ala Val
305 310 315 320
Asn Gly Ser Val Phe Leu Cys Gly Asn Asn Met Ala Tyr Thr Tyr Leu
325 330 335
Pro Thr Asn Trp Thr Gly Leu Cys Val Leu Ala Thr Leu Leu Pro Asp
340 345 350
Ile Asp Ile Ile Pro Gly Asp Glu Pro Val Pro Ile Pro Ala Ile Asp
355 360 365
His Phe Ile Tyr Arg Pro Lys Arg Ala Ile Gln Phe Ile Pro Leu Leu
370 375 380
Ala Gly Leu Gly Ile Thr Ala Ala Phe Thr Thr Gly Ala Thr Gly Leu
385 390 395 400
Gly Val Ser Val Thr Gln Tyr Thr Lys Leu Ser Asn Gln Leu Ile Ser
405 410 415
Asp Val Gln Ile Leu Ser Ser Thr Ile Gln Asp Leu Gln Asp Gln Val
420 425 430
Asp Ser Leu Ala Glu Val Val Leu Gln Asn Arg Arg Gly Leu Asp Leu
435 440 445
Leu Thr Ala Glu Gln Gly Gly Ile Cys Leu Ala Leu Gln Glu Lys Cys
450 455 460
Cys Phe Tyr Val Asn Lys Ser Gly Ile Val Arg Asp Lys Ile Lys Thr
465 470 475 480
Leu Gln Glu Glu Leu Glu Arg Arg Arg Lys Asp Leu Ala Ser Asn Pro
485 490 495
Leu Trp Thr Gly Leu Gln Gly Leu Leu Pro Tyr Leu Leu Pro Phe Leu
500 505 510
Gly Pro Leu Leu Thr Leu Leu Leu Leu Leu Thr Ile Gly Pro Cys Ile
515 520 525
Phe Asn Arg Leu Thr Ala Phe Ile Asn Asp Lys Leu Asn Ile Ile His
530 535 540
Ala Met
545
<210> 14
<211> 504
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 14
Met Val Pro Gln Val Leu Leu Phe Val Leu Leu Leu Gly Phe Ser Leu
1 5 10 15
Cys Phe Gly Lys Phe Pro Ile Tyr Thr Ile Pro Asp Glu Leu Gly Pro
20 25 30
Trp Ser Pro Ile Asp Ile His His Leu Ser Cys Pro Asn Asn Leu Val
35 40 45
Val Glu Asp Glu Gly Cys Thr Asn Leu Ser Glu Phe Ser Tyr Met Glu
50 55 60
Leu Lys Val Gly Tyr Ile Ser Ala Ile Lys Val Asn Gly Phe Thr Cys
65 70 75 80
Thr Gly Val Val Thr Glu Ala Glu Thr Tyr Thr Asn Phe Val Gly Tyr
85 90 95
Val Thr Thr Thr Phe Lys Arg Lys His Phe Arg Pro Thr Pro Asp Ala
100 105 110
Cys Arg Ala Ala Tyr Asn Trp Lys Met Ala Gly Asp Pro Arg Tyr Glu
115 120 125
Glu Ser Leu His Asn Pro Tyr Pro Asp Tyr His Trp Leu Arg Thr Val
130 135 140
Arg Thr Thr Lys Glu Ser Leu Ile Ile Ile Ser Pro Ser Val Thr Asp
145 150 155 160
Leu Asp Pro Tyr Asp Lys Ser Leu His Ser Arg Val Phe Pro Gly Gly
165 170 175
Lys Cys Ser Gly Ile Thr Val Ser Ser Thr Tyr Cys Ser Thr Asn His
180 185 190
Asp Tyr Thr Ile Trp Met Pro Glu Asn Pro Arg Pro Arg Thr Pro Cys
195 200 205
Asp Ile Phe Thr Asn Ser Arg Gly Lys Arg Ala Ser Asn Gly Asn Lys
210 215 220
Thr Cys Gly Phe Val Asp Glu Arg Gly Leu Tyr Lys Ser Leu Lys Gly
225 230 235 240
Ala Cys Arg Leu Lys Leu Cys Gly Val Leu Gly Leu Arg Leu Met Asp
245 250 255
Gly Thr Trp Val Ala Met Gln Thr Ser Asp Glu Thr Lys Trp Cys Pro
260 265 270
Pro Asp Gln Leu Val Asn Leu His Asp Phe Arg Ser Asp Glu Ile Glu
275 280 285
His Leu Val Val Glu Glu Leu Val Lys Lys Arg Glu Glu Cys Leu Asp
290 295 300
Ala Leu Glu Ser Ile Met Thr Thr Lys Ser Val Ser Phe Arg Arg Leu
305 310 315 320
Ser His Leu Arg Lys Leu Val Pro Gly Phe Gly Lys Ala Tyr Thr Ile
325 330 335
Phe Asn Lys Thr Leu Met Glu Ala Asp Ala His Tyr Lys Ser Val Arg
340 345 350
Thr Trp Asn Glu Ile Ile Pro Ser Lys Gly Cys Leu Lys Val Gly Gly
355 360 365
Arg Cys His Pro His Val Asn Gly Val Phe Phe Asn Gly Ile Ile Leu
370 375 380
Gly Pro Asp Asp His Val Leu Ile Pro Glu Met Gln Ser Ser Leu Leu
385 390 395 400
Gln Gln His Met Glu Leu Leu Glu Ser Ser Val Ile Pro Leu Met His
405 410 415
Pro Leu Ala Asp Pro Ser Thr Val Phe Lys Glu Gly Asp Glu Ala Glu
420 425 430
Asp Phe Val Glu Val His Leu Pro Lys Asn Pro Ile Glu Leu Val Glu
435 440 445
Gly Trp Phe Ser Ser Trp Lys Ser Ser Ile Ala Ser Phe Phe Phe Ile
450 455 460
Ile Gly Leu Ile Ile Gly Leu Phe Leu Val Leu Arg Val Gly Ile His
465 470 475 480
Leu Cys Ile Lys Leu Lys His Thr Lys Lys Arg Gln Ile Tyr Thr Asp
485 490 495
Ile Glu Met Asn Arg Leu Gly Lys
500
<210> 15
<211> 504
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 15
Met Val Pro Gln Val Leu Leu Phe Val Leu Leu Leu Gly Phe Ser Leu
1 5 10 15
Cys Phe Gly Lys Phe Pro Ile Tyr Thr Ile Pro Asp Glu Leu Gly Pro
20 25 30
Trp Ser Pro Ile Asp Ile His His Leu Ser Cys Pro Asn Asn Leu Val
35 40 45
Val Glu Asp Glu Gly Cys Thr Asn Leu Ser Glu Phe Ser Tyr Met Glu
50 55 60
Leu Lys Val Gly Tyr Ile Ser Ala Ile Lys Val Asn Gly Phe Thr Cys
65 70 75 80
Thr Gly Val Val Thr Glu Ala Glu Thr Tyr Thr Asn Phe Val Gly Tyr
85 90 95
Val Thr Thr Thr Phe Lys Arg Lys His Phe Arg Pro Thr Pro Asp Ala
100 105 110
Cys Arg Ala Ala Tyr Asn Trp Lys Met Ala Gly Asp Pro Arg Tyr Glu
115 120 125
Glu Ser Leu His Asn Pro Tyr Pro Asp Tyr His Trp Leu Arg Thr Val
130 135 140
Arg Thr Thr Lys Glu Ser Leu Ile Ile Ile Ser Pro Ser Val Thr Asp
145 150 155 160
Leu Asp Pro Tyr Asp Lys Ser Leu His Ser Arg Val Phe Pro Gly Gly
165 170 175
Lys Cys Ser Gly Ile Thr Val Ser Ser Thr Tyr Cys Ser Thr Asn His
180 185 190
Asp Tyr Thr Ile Trp Met Pro Glu Asn Pro Arg Pro Arg Thr Pro Cys
195 200 205
Asp Ile Phe Thr Asn Ser Arg Gly Lys Arg Ala Ser Asn Gly Asn Lys
210 215 220
Thr Cys Gly Phe Val Asp Glu Arg Gly Leu Tyr Lys Ser Leu Lys Gly
225 230 235 240
Ala Cys Arg Leu Lys Leu Cys Gly Val Leu Gly Leu Arg Leu Met Asp
245 250 255
Gly Thr Trp Val Ala Met Gln Thr Ser Asp Glu Thr Lys Trp Cys Pro
260 265 270
Pro Asp Gln Leu Val Asn Leu His Asp Phe Arg Ser Asp Glu Ile Glu
275 280 285
His Leu Val Val Glu Glu Leu Val Lys Lys Arg Glu Glu Cys Leu Asp
290 295 300
Ala Leu Glu Ser Ile Met Thr Thr Lys Ser Val Ser Phe Arg Arg Leu
305 310 315 320
Ser His Leu Arg Lys Leu Val Pro Gly Phe Gly Lys Ala Tyr Thr Ile
325 330 335
Phe Asn Lys Thr Leu Met Glu Ala Asp Ala His Tyr Lys Ser Val Arg
340 345 350
Thr Trp Asn Glu Ile Ile Pro Ser Lys Gly Cys Leu Lys Val Gly Gly
355 360 365
Arg Cys His Pro His Val Asn Gly Val Phe Phe Asn Gly Ile Ile Leu
370 375 380
Gly Pro Asp Asp His Val Leu Ile Pro Glu Met Gln Ser Ser Leu Leu
385 390 395 400
Gln Gln His Met Glu Leu Leu Glu Ser Ser Val Ile Pro Leu Met His
405 410 415
Pro Leu Ala Asp Pro Ser Thr Val Phe Lys Glu Gly Asp Glu Ala Glu
420 425 430
Asp Phe Val Glu Val His Leu Glu Lys Asn Pro Ile Glu Leu Val Glu
435 440 445
Gly Trp Phe Ser Ser Trp Lys Ser Ser Ile Ala Ser Phe Phe Phe Ile
450 455 460
Ile Gly Leu Ile Ile Gly Leu Phe Leu Val Leu Arg Val Gly Ile His
465 470 475 480
Leu Cys Ile Lys Leu Lys His Thr Lys Lys Arg Gln Ile Tyr Thr Asp
485 490 495
Ile Glu Met Asn Arg Leu Gly Lys
500
<210> 16
<211> 654
<212> PRT
<213> Murine leukemia virus
<400> 16
Met Ala Arg Ser Thr Leu Ser Lys Pro Pro Gln Asp Lys Ile Asn Pro
1 5 10 15
Trp Lys Pro Leu Ile Val Met Gly Val Leu Leu Gly Val Gly Met Ala
20 25 30
Glu Ser Pro His Gln Val Phe Asn Val Thr Trp Arg Val Thr Asn Leu
35 40 45
Met Thr Gly Arg Thr Ala Asn Ala Thr Ser Leu Leu Gly Thr Val Gln
50 55 60
Asp Ala Phe Pro Lys Leu Tyr Phe Asp Leu Cys Asp Leu Val Gly Glu
65 70 75 80
Glu Trp Asp Pro Ser Asp Gln Glu Pro Tyr Val Gly Tyr Gly Cys Lys
85 90 95
Tyr Pro Ala Gly Arg Gln Arg Thr Arg Thr Phe Asp Phe Tyr Val Cys
100 105 110
Pro Gly His Thr Val Lys Ser Gly Cys Gly Gly Pro Gly Glu Gly Tyr
115 120 125
Cys Gly Lys Trp Gly Cys Glu Thr Thr Gly Gln Ala Tyr Trp Lys Pro
130 135 140
Thr Ser Ser Trp Asp Leu Ile Ser Leu Lys Arg Gly Asn Thr Pro Trp
145 150 155 160
Asp Thr Gly Cys Ser Lys Val Ala Cys Gly Pro Cys Tyr Asp Leu Ser
165 170 175
Lys Val Ser Asn Ser Phe Gln Gly Ala Thr Arg Gly Gly Arg Cys Asn
180 185 190
Pro Leu Val Leu Glu Phe Thr Asp Ala Gly Lys Lys Ala Asn Trp Asp
195 200 205
Gly Pro Lys Ser Trp Gly Leu Arg Leu Tyr Arg Thr Gly Thr Asp Pro
210 215 220
Ile Thr Met Phe Ser Leu Thr Arg Gln Val Leu Asn Val Gly Pro Arg
225 230 235 240
Val Pro Ile Gly Pro Asn Pro Val Leu Pro Asp Gln Arg Leu Pro Ser
245 250 255
Ser Pro Ile Glu Ile Val Pro Ala Pro Gln Pro Pro Ser Pro Leu Asn
260 265 270
Thr Ser Tyr Pro Pro Ser Thr Thr Ser Thr Pro Ser Thr Ser Pro Thr
275 280 285
Ser Pro Ser Val Pro Gln Pro Pro Pro Gly Thr Gly Asp Arg Leu Leu
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Ala Asn Cys Thr Ala Thr Ser Gln His Lys Leu Thr Leu Ser Glu Val
355 360 365
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370 375 380
Leu Cys Asn Thr Thr Gln Ser Ala Gly Ser Gly Ser Tyr Tyr Leu Ala
385 390 395 400
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Leu Ser Thr Thr Val Leu Asn Leu Thr Thr Asp Tyr Cys Val Leu Val
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Glu Leu Trp Pro Arg Val Ile Tyr His Ser Pro Asp Tyr Met Tyr Gly
435 440 445
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<210> 17
<211> 665
<212> PRT
<213> Murine leukemia virus
<400> 17
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660 665
<210> 18
<211> 645
<212> PRT
<213> Murine leukemia virus
<400> 18
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Val Ser Gly Pro Pro Tyr Tyr Glu Gly Val Ala Val Val Gly Thr Tyr
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<210> 19
<211> 1710
<212> PRT
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<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
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<400> 19
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Ala Leu Ala His Met Ile Lys Phe Arg Gly His Phe Leu Ile Glu Gly
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435 440 445
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450 455 460
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<210> 20
<211> 198
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<400> 20
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195
<210> 21
<211> 191
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 21
Leu Met Asp Pro His Ile Phe Thr Ser Asn Phe Asn Asn Gly Ile Gly
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<211> 175
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 22
Met Asp Pro His Ile Phe Thr Ser Asn Phe Asn Asn Gly Ile Gly Arg
1 5 10 15
His Lys Thr Tyr Leu Cys Tyr Glu Val Glu Arg Leu Asp Ser Ala Thr
20 25 30
Ser Phe Ser Leu Asp Phe Gly Tyr Leu Arg Asn Lys Asn Gly Cys His
35 40 45
Val Glu Leu Leu Phe Leu Arg Tyr Ile Ser Asp Trp Asp Leu Asp Pro
50 55 60
Gly Arg Cys Tyr Arg Val Thr Trp Phe Thr Ser Trp Ser Pro Cys Tyr
65 70 75 80
Asp Cys Ala Arg His Val Ala Asp Phe Leu Arg Gly Asn Pro Asn Leu
85 90 95
Ser Leu Arg Ile Phe Thr Ala Arg Leu Tyr Phe Cys Glu Asp Arg Lys
100 105 110
Ala Glu Pro Glu Gly Leu Arg Arg Leu His Arg Ala Gly Val Gln Ile
115 120 125
Ala Ile Met Thr Phe Lys Asp Tyr Phe Tyr Cys Trp Asn Thr Phe Val
130 135 140
Glu Asn His Glu Arg Thr Phe Lys Ala Trp Glu Gly Leu His Glu Asn
145 150 155 160
Ser Val Arg Leu Ser Arg Gln Leu Arg Arg Ile Leu Leu Pro Leu
165 170 175
<210> 23
<211> 229
<212> PRT
<213> Rattus norvegicus
<400> 23
Met Ser Ser Glu Thr Gly Pro Val Ala Val Asp Pro Thr Leu Arg Arg
1 5 10 15
Arg Ile Glu Pro His Glu Phe Glu Val Phe Phe Asp Pro Arg Glu Leu
20 25 30
Arg Lys Glu Thr Cys Leu Leu Tyr Glu Ile Asn Trp Gly Gly Arg His
35 40 45
Ser Ile Trp Arg His Thr Ser Gln Asn Thr Asn Lys His Val Glu Val
50 55 60
Asn Phe Ile Glu Lys Phe Thr Thr Glu Arg Tyr Phe Cys Pro Asn Thr
65 70 75 80
Arg Cys Ser Ile Thr Trp Phe Leu Ser Trp Ser Pro Cys Gly Glu Cys
85 90 95
Ser Arg Ala Ile Thr Glu Phe Leu Ser Arg Tyr Pro His Val Thr Leu
100 105 110
Phe Ile Tyr Ile Ala Arg Leu Tyr His His Ala Asp Pro Arg Asn Arg
115 120 125
Gln Gly Leu Arg Asp Leu Ile Ser Ser Gly Val Thr Ile Gln Ile Met
130 135 140
Thr Glu Gln Glu Ser Gly Tyr Cys Trp Arg Asn Phe Val Asn Tyr Ser
145 150 155 160
Pro Ser Asn Glu Ala His Trp Pro Arg Tyr Pro His Leu Trp Val Arg
165 170 175
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180 185 190
Leu Asn Ile Leu Arg Arg Lys Gln Pro Gln Leu Thr Phe Phe Thr Ile
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210 215 220
Ala Thr Gly Leu Lys
225
<210> 24
<211> 397
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 24
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1 5 10 15
Ile Arg Asn Leu Ile Ser Gln Glu Thr Phe Lys Phe His Phe Lys Asn
20 25 30
Leu Gly Tyr Ala Lys Gly Arg Lys Asp Thr Phe Leu Cys Tyr Glu Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
His Asp Lys Val Leu Lys Val Leu Ser Pro Arg Glu Glu Phe Lys Ile
85 90 95
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100 105 110
Val Arg Phe Leu Ala Thr His His Asn Leu Ser Leu Asp Ile Phe Ser
115 120 125
Ser Arg Leu Tyr Asn Val Gln Asp Pro Glu Thr Gln Gln Asn Leu Cys
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260 265 270
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275 280 285
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Leu Cys Ser Leu Trp Gln Ser Gly Ile Leu Val Asp Val Met Asp Leu
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Arg Leu Arg Arg Ile Lys Glu Ser Trp Gly Leu Gln Asp Leu Val Asn
370 375 380
Asp Phe Gly Asn Leu Gln Leu Gly Pro Pro Met Ser Asn
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<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 25
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Leu Gly Tyr Ala Lys Gly Arg Lys Asp Thr Phe Leu Cys Tyr Glu Val
35 40 45
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Arg Pro Trp Lys Arg Leu Leu Thr Asn Phe Arg Tyr Gln Asp Ser Lys
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Leu Gln Glu Ile Leu Arg Arg
195
<210> 26
<211> 199
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 26
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Ser Leu Gln Leu Asp Pro Ala Gln Ile Tyr Arg Val Thr Trp Phe Ile
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 27
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130 135 140
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245 250 255
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275 280 285
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305 310 315 320
Cys Gln Glu Gly Leu Arg Thr Leu Ala Glu Ala Gly Ala Lys Ile Ser
325 330 335
Ile Met Thr Tyr Ser Glu Phe Lys His Cys Trp Asp Thr Phe Val Asp
340 345 350
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Gln Asp Leu Ser Gly Arg Leu Arg Ala Ile Leu Gln Asn Gln Glu Asn
370 375 380
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 28
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1 5 10 15
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20 25 30
Thr Trp Val Leu Leu Asn Gln Arg Arg Gly Phe Leu Cys Asn Gln Ala
35 40 45
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120 125
Thr Leu Ala Glu Ala Gly Ala Lys Ile Ser Ile Met Thr Tyr Ser Glu
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165 170 175
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<211> 200
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 29
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1 5 10 15
Arg Arg Leu Arg Arg Pro Tyr Tyr Pro Arg Lys Ala Leu Leu Cys Tyr
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65 70 75 80
Thr Trp Ser Pro Cys Ser Ser Cys Ala Trp Glu Leu Val Asp Phe Ile
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115 120 125
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130 135 140
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Lys Met Leu Glu Glu Leu Asp Lys Asn Ser Arg Ala Ile Lys Arg Arg
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Leu Glu Arg Ile Lys Ile Pro Gly Val Arg Ala Gln Gly Arg Tyr Met
180 185 190
Asp Ile Leu Cys Asp Ala Glu Val
195 200
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<211> 373
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 30
Met Lys Pro His Phe Arg Asn Thr Val Glu Arg Met Tyr Arg Asp Thr
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65 70 75 80
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100 105 110
Val Thr Leu Thr Ile Ser Ala Ala Arg Leu Tyr Tyr Tyr Trp Glu Arg
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Asp Tyr Arg Arg Ala Leu Cys Arg Leu Ser Gln Ala Gly Ala Arg Val
130 135 140
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210 215 220
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225 230 235 240
Gln Val Asp Pro Glu Thr His Cys His Ala Glu Arg Cys Phe Leu Ser
245 250 255
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260 265 270
Trp Tyr Thr Ser Trp Ser Pro Cys Pro Glu Cys Ala Gly Glu Val Ala
275 280 285
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290 295 300
Arg Leu Tyr Tyr Phe Trp Asp Thr Asp Tyr Gln Glu Gly Leu Arg Ser
305 310 315 320
Leu Ser Gln Glu Gly Ala Ser Val Glu Ile Met Gly Tyr Lys Asp Phe
325 330 335
Lys Tyr Cys Trp Glu Asn Phe Val Tyr Asn Asp Asp Glu Pro Phe Lys
340 345 350
Pro Trp Lys Gly Leu Lys Tyr Asn Phe Leu Phe Leu Asp Ser Lys Leu
355 360 365
Gln Glu Ile Leu Glu
370
<210> 31
<211> 189
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 31
Lys Glu Ile Leu Arg Asn Pro Met Glu Ala Met Tyr Pro His Ile Phe
1 5 10 15
Tyr Phe His Phe Lys Asn Leu Arg Lys Ala Tyr Gly Arg Asn Glu Ser
20 25 30
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Trp Lys Arg Gly Val Phe Arg Asn Gln Val Asp Pro Glu Thr His Cys
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Tyr Asn Asp Asp Glu Pro Phe Lys Pro Trp Lys Gly Leu Lys Tyr Asn
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<210> 32
<211> 383
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 32
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1 5 10 15
Arg Lys Val Ser Glu Val Glu Phe Ser His Glu Tyr Trp Met Arg His
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Ala Leu Thr Leu Ala Lys Arg Ala Trp Asp Glu Arg Glu Val Pro Val
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130 135 140
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Ala Leu Leu Ser Asp Phe Phe Arg Met Arg Arg Gln Glu Ile Lys Ala
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Ser Ser Gly Gly Ser Ser Gly Gly Ser Ser Glu Val Glu Phe Ser His
210 215 220
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225 230 235 240
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275 280 285
Tyr Arg Leu Ile Asp Ala Thr Leu Tyr Val Thr Phe Glu Pro Cys Val
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305 310 315 320
Gly Val Arg Asn Ala Lys Thr Gly Ala Ala Gly Ser Leu Met Asp Val
325 330 335
Leu His Tyr Pro Gly Met Asn His Arg Val Glu Ile Thr Glu Gly Ile
340 345 350
Leu Ala Asp Glu Cys Ala Ala Leu Leu Cys Tyr Phe Phe Arg Met Pro
355 360 365
Arg Gln Val Phe Asn Ala Gln Lys Lys Ala Gln Ser Ser Thr Asp
370 375 380
<210> 33
<211> 1226
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 33
Met Asn Pro Arg Gln Gly Tyr Ser Leu Ser Gly Tyr Tyr Thr His Pro
1 5 10 15
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Gly Ser Ser Pro Ser Ser Phe Leu Leu Lys Gln Ile Glu Phe Leu Lys
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Gly Gln Leu Pro Glu Ala Pro Val Ile Gly Lys Gln Thr Pro Ser Leu
50 55 60
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100 105 110
Pro Arg Gly Arg Ser Leu Pro Gln Arg Gly Val Asp Cys Leu Ser Ser
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His Phe Gln Glu Leu Ser Ile Tyr Gln Asp Gln Glu Gln Arg Ile Leu
130 135 140
Lys Phe Leu Glu Glu Leu Gly Glu Gly Lys Ala Thr Thr Ala His Asp
145 150 155 160
Leu Ser Gly Lys Leu Gly Thr Pro Lys Lys Glu Ile Asn Arg Val Leu
165 170 175
Tyr Ser Leu Ala Lys Lys Gly Lys Leu Gln Lys Glu Ala Gly Thr Pro
180 185 190
Pro Leu Trp Lys Ile Ala Val Ser Thr Gln Ala Trp Asn Gln His Ser
195 200 205
Gly Val Val Arg Pro Asp Gly His Ser Gln Gly Ala Pro Asn Ser Asp
210 215 220
Pro Ser Leu Glu Pro Glu Asp Arg Asn Ser Thr Ser Val Ser Glu Asp
225 230 235 240
Leu Leu Glu Pro Phe Ile Ala Val Ser Ala Gln Ala Trp Asn Gln His
245 250 255
Ser Gly Val Val Arg Pro Asp Ser His Ser Gln Gly Ser Pro Asn Ser
260 265 270
Asp Pro Gly Leu Glu Pro Glu Asp Ser Asn Ser Thr Ser Ala Leu Glu
275 280 285
Asp Pro Leu Glu Phe Leu Asp Met Ala Glu Ile Lys Glu Lys Ile Cys
290 295 300
Asp Tyr Leu Phe Asn Val Ser Asp Ser Ser Ala Leu Asn Leu Ala Lys
305 310 315 320
Asn Ile Gly Leu Thr Lys Ala Arg Asp Ile Asn Ala Val Leu Ile Asp
325 330 335
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340 345 350
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355 360 365
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370 375 380
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385 390 395 400
Asn Asn Met Val Thr Thr Glu Lys Val Glu Asn Gly Gln Glu Pro Val
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Ile Lys Leu Glu Asn Arg Gln Glu Ala Arg Pro Glu Pro Ala Arg Leu
420 425 430
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435 440 445
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450 455 460
Ser Ile Arg Ala Ala Pro Gly Glu Phe Arg Ala Ile Met Glu Met Pro
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Ser Phe Tyr Ser His Gly Leu Pro Arg Cys Ser Pro Tyr Lys Lys Leu
485 490 495
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Pro Pro His Glu Pro Arg Phe Lys Phe Gln Val Val Ile Asn Gly Arg
530 535 540
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545 550 555 560
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595 600 605
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645 650 655
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660 665 670
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Lys Tyr Asn Ser Gln Thr Ala Lys Asp Ser Ile Phe Glu Pro Ala Lys
930 935 940
Gly Gly Glu Lys Leu Gln Ile Lys Lys Thr Val Ser Phe His Leu Tyr
945 950 955 960
Ile Ser Thr Ala Pro Cys Gly Asp Gly Ala Leu Phe Asp Lys Ser Cys
965 970 975
Ser Asp Arg Ala Met Glu Ser Thr Glu Ser Arg His Tyr Pro Val Phe
980 985 990
Glu Asn Pro Lys Gln Gly Lys Leu Arg Thr Lys Val Glu Asn Gly Glu
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Gly Ile Arg Leu Gly Glu Arg Leu Arg Thr Met Ser Cys Ser Asp
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Lys Ile Leu Arg Trp Asn Val Leu Gly Leu Gln Gly Ala Leu Leu
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<210> 34
<211> 1419
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<213> Streptococcus pyogenes
<400> 34
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1 5 10 15
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115 120 125
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Met Ile Lys Phe Arg Gly His Phe Leu Ile Glu Gly Asp Leu Asn Pro
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<213> Staphylococcus aureus
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Pro Glu Phe Thr Asn Leu Lys Val Tyr His Asp Ile Lys Asp Ile Thr
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Ile Val Asn Asn Leu Asn Gly Leu Tyr Asp Lys Asp Asn Asp Lys Leu
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Leu Thr Lys Tyr Ser Lys Lys Asp Asn Gly Pro Val Ile Lys Lys Ile
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Lys Tyr Tyr Gly Asn Lys Leu Asn Ala His Leu Asp Ile Thr Asp Asp
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Tyr Glu Val Lys Ser Lys Lys His Pro Gln Ile Ile Lys Lys Gly
1040 1045 1050
<210> 36
<211> 984
<212> PRT
<213> Campylobacter jejuni
<400> 36
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Leu Ser Lys Leu Glu Phe Lys Asp His Leu Asn Ile Ser Phe Lys Ala
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Arg Gln Arg Glu Asp Phe Lys Lys
980
<210> 37
<211> 1082
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 37
Met Ala Ala Phe Lys Pro Asn Ser Ile Asn Tyr Ile Leu Gly Leu Asp
1 5 10 15
Ile Gly Ile Ala Ser Val Gly Trp Ala Met Val Glu Ile Asp Glu Glu
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Ala Val Leu Leu His Leu Ile Lys His Arg Gly Tyr Leu Ser Gln Arg
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Gly Val Ala Gly Asn Ala His Ala Leu Gln Thr Gly Asp Phe Arg Thr
165 170 175
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180 185 190
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Pro His Val Ser Gly Gly Leu Lys Glu Gly Ile Glu Thr Leu Leu Met
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Thr Gln Arg Pro Ala Leu Ser Gly Asp Ala Val Gln Lys Met Leu Gly
245 250 255
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260 265 270
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275 280 285
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325 330 335
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340 345 350
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355 360 365
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370 375 380
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435 440 445
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450 455 460
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465 470 475 480
Leu Ser Gln Ala Arg Lys Val Ile Asn Gly Val Val Arg Arg Tyr Gly
485 490 495
Ser Pro Ala Arg Ile His Ile Glu Thr Ala Arg Glu Val Gly Lys Ser
500 505 510
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515 520 525
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565 570 575
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595 600 605
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660 665 670
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675 680 685
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690 695 700
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705 710 715 720
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725 730 735
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740 745 750
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755 760 765
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<212> PRT
<213> Acidaminococcus sp.
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<211> 1228
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Description of Unknown:
Lachnospiraceae bacterium sequence
<400> 39
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1 5 10 15
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Asn Lys Arg Leu Leu Val Glu Asp Glu Lys Arg Ala Glu Asp Tyr Lys
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195 200 205
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Ile Gly Gly Phe Val Thr Glu Ser Gly Glu Lys Ile Lys Gly Leu Asn
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260 265 270
Phe Lys Pro Leu Tyr Lys Gln Val Leu Ser Asp Arg Glu Ser Leu Ser
275 280 285
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325 330 335
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340 345 350
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355 360 365
Ile His Leu Lys Lys Lys Ala Val Val Thr Glu Lys Tyr Glu Asp Asp
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385 390 395 400
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740 745 750
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755 760 765
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785 790 795 800
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945 950 955 960
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965 970 975
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980 985 990
Ile Phe Tyr Ile Pro Ala Trp Leu Thr Ser Lys Ile Asp Pro Ser Thr
995 1000 1005
Gly Phe Val Asn Leu Leu Lys Thr Lys Tyr Thr Ser Ile Ala Asp
1010 1015 1020
Ser Lys Lys Phe Ile Ser Ser Phe Asp Arg Ile Met Tyr Val Pro
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1040 1045 1050
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1070 1075 1080
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1190 1195 1200
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1220 1225
<210> 40
<211> 1389
<212> PRT
<213> Leptotrichia shahii
<400> 40
Met Gly Asn Leu Phe Gly His Lys Arg Trp Tyr Glu Val Arg Asp Lys
1 5 10 15
Lys Asp Phe Lys Ile Lys Arg Lys Val Lys Val Lys Arg Asn Tyr Asp
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225 230 235 240
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290 295 300
Trp Asn Ile Thr Lys Arg Ile Glu Lys Val Lys Lys Val Asn Asn Glu
305 310 315 320
Phe Leu Glu Lys Arg Arg Asn Arg Thr Tyr Ile Lys Ser Tyr Val Leu
325 330 335
Leu Asp Lys His Glu Lys Phe Lys Ile Glu Arg Glu Asn Lys Lys Asp
340 345 350
Lys Ile Val Lys Phe Phe Val Glu Asn Ile Lys Asn Asn Ser Ile Lys
355 360 365
Glu Lys Ile Glu Lys Ile Leu Ala Glu Phe Lys Ile Asp Glu Leu Ile
370 375 380
Lys Lys Leu Glu Lys Glu Leu Lys Lys Gly Asn Cys Asp Thr Glu Ile
385 390 395 400
Phe Gly Ile Phe Lys Lys His Tyr Lys Val Asn Phe Asp Ser Lys Lys
405 410 415
Phe Ser Lys Lys Ser Asp Glu Glu Lys Glu Leu Tyr Lys Ile Ile Tyr
420 425 430
Arg Tyr Leu Lys Gly Arg Ile Glu Lys Ile Leu Val Asn Glu Gln Lys
435 440 445
Val Arg Leu Lys Lys Met Glu Lys Ile Glu Ile Glu Lys Ile Leu Asn
450 455 460
Glu Ser Ile Leu Ser Glu Lys Ile Leu Lys Arg Val Lys Gln Tyr Thr
465 470 475 480
Leu Glu His Ile Met Tyr Leu Gly Lys Leu Arg His Asn Asp Ile Asp
485 490 495
Met Thr Thr Val Asn Thr Asp Asp Phe Ser Arg Leu His Ala Lys Glu
500 505 510
Glu Leu Asp Leu Glu Leu Ile Thr Phe Phe Ala Ser Thr Asn Met Glu
515 520 525
Leu Asn Lys Ile Phe Ser Arg Glu Asn Ile Asn Asn Asp Glu Asn Ile
530 535 540
Asp Phe Phe Gly Gly Asp Arg Glu Lys Asn Tyr Val Leu Asp Lys Lys
545 550 555 560
Ile Leu Asn Ser Lys Ile Lys Ile Ile Arg Asp Leu Asp Phe Ile Asp
565 570 575
Asn Lys Asn Asn Ile Thr Asn Asn Phe Ile Arg Lys Phe Thr Lys Ile
580 585 590
Gly Thr Asn Glu Arg Asn Arg Ile Leu His Ala Ile Ser Lys Glu Arg
595 600 605
Asp Leu Gln Gly Thr Gln Asp Asp Tyr Asn Lys Val Ile Asn Ile Ile
610 615 620
Gln Asn Leu Lys Ile Ser Asp Glu Glu Val Ser Lys Ala Leu Asn Leu
625 630 635 640
Asp Val Val Phe Lys Asp Lys Lys Asn Ile Ile Thr Lys Ile Asn Asp
645 650 655
Ile Lys Ile Ser Glu Glu Asn Asn Asn Asp Ile Lys Tyr Leu Pro Ser
660 665 670
Phe Ser Lys Val Leu Pro Glu Ile Leu Asn Leu Tyr Arg Asn Asn Pro
675 680 685
Lys Asn Glu Pro Phe Asp Thr Ile Glu Thr Glu Lys Ile Val Leu Asn
690 695 700
Ala Leu Ile Tyr Val Asn Lys Glu Leu Tyr Lys Lys Leu Ile Leu Glu
705 710 715 720
Asp Asp Leu Glu Glu Asn Glu Ser Lys Asn Ile Phe Leu Gln Glu Leu
725 730 735
Lys Lys Thr Leu Gly Asn Ile Asp Glu Ile Asp Glu Asn Ile Ile Glu
740 745 750
Asn Tyr Tyr Lys Asn Ala Gln Ile Ser Ala Ser Lys Gly Asn Asn Lys
755 760 765
Ala Ile Lys Lys Tyr Gln Lys Lys Val Ile Glu Cys Tyr Ile Gly Tyr
770 775 780
Leu Arg Lys Asn Tyr Glu Glu Leu Phe Asp Phe Ser Asp Phe Lys Met
785 790 795 800
Asn Ile Gln Glu Ile Lys Lys Gln Ile Lys Asp Ile Asn Asp Asn Lys
805 810 815
Thr Tyr Glu Arg Ile Thr Val Lys Thr Ser Asp Lys Thr Ile Val Ile
820 825 830
Asn Asp Asp Phe Glu Tyr Ile Ile Ser Ile Phe Ala Leu Leu Asn Ser
835 840 845
Asn Ala Val Ile Asn Lys Ile Arg Asn Arg Phe Phe Ala Thr Ser Val
850 855 860
Trp Leu Asn Thr Ser Glu Tyr Gln Asn Ile Ile Asp Ile Leu Asp Glu
865 870 875 880
Ile Met Gln Leu Asn Thr Leu Arg Asn Glu Cys Ile Thr Glu Asn Trp
885 890 895
Asn Leu Asn Leu Glu Glu Phe Ile Gln Lys Met Lys Glu Ile Glu Lys
900 905 910
Asp Phe Asp Asp Phe Lys Ile Gln Thr Lys Lys Glu Ile Phe Asn Asn
915 920 925
Tyr Tyr Glu Asp Ile Lys Asn Asn Ile Leu Thr Glu Phe Lys Asp Asp
930 935 940
Ile Asn Gly Cys Asp Val Leu Glu Lys Lys Leu Glu Lys Ile Val Ile
945 950 955 960
Phe Asp Asp Glu Thr Lys Phe Glu Ile Asp Lys Lys Ser Asn Ile Leu
965 970 975
Gln Asp Glu Gln Arg Lys Leu Ser Asn Ile Asn Lys Lys Asp Leu Lys
980 985 990
Lys Lys Val Asp Gln Tyr Ile Lys Asp Lys Asp Gln Glu Ile Lys Ser
995 1000 1005
Lys Ile Leu Cys Arg Ile Ile Phe Asn Ser Asp Phe Leu Lys Lys
1010 1015 1020
Tyr Lys Lys Glu Ile Asp Asn Leu Ile Glu Asp Met Glu Ser Glu
1025 1030 1035
Asn Glu Asn Lys Phe Gln Glu Ile Tyr Tyr Pro Lys Glu Arg Lys
1040 1045 1050
Asn Glu Leu Tyr Ile Tyr Lys Lys Asn Leu Phe Leu Asn Ile Gly
1055 1060 1065
Asn Pro Asn Phe Asp Lys Ile Tyr Gly Leu Ile Ser Asn Asp Ile
1070 1075 1080
Lys Met Ala Asp Ala Lys Phe Leu Phe Asn Ile Asp Gly Lys Asn
1085 1090 1095
Ile Arg Lys Asn Lys Ile Ser Glu Ile Asp Ala Ile Leu Lys Asn
1100 1105 1110
Leu Asn Asp Lys Leu Asn Gly Tyr Ser Lys Glu Tyr Lys Glu Lys
1115 1120 1125
Tyr Ile Lys Lys Leu Lys Glu Asn Asp Asp Phe Phe Ala Lys Asn
1130 1135 1140
Ile Gln Asn Lys Asn Tyr Lys Ser Phe Glu Lys Asp Tyr Asn Arg
1145 1150 1155
Val Ser Glu Tyr Lys Lys Ile Arg Asp Leu Val Glu Phe Asn Tyr
1160 1165 1170
Leu Asn Lys Ile Glu Ser Tyr Leu Ile Asp Ile Asn Trp Lys Leu
1175 1180 1185
Ala Ile Gln Met Ala Arg Phe Glu Arg Asp Met His Tyr Ile Val
1190 1195 1200
Asn Gly Leu Arg Glu Leu Gly Ile Ile Lys Leu Ser Gly Tyr Asn
1205 1210 1215
Thr Gly Ile Ser Arg Ala Tyr Pro Lys Arg Asn Gly Ser Asp Gly
1220 1225 1230
Phe Tyr Thr Thr Thr Ala Tyr Tyr Lys Phe Phe Asp Glu Glu Ser
1235 1240 1245
Tyr Lys Lys Phe Glu Lys Ile Cys Tyr Gly Phe Gly Ile Asp Leu
1250 1255 1260
Ser Glu Asn Ser Glu Ile Asn Lys Pro Glu Asn Glu Ser Ile Arg
1265 1270 1275
Asn Tyr Ile Ser His Phe Tyr Ile Val Arg Asn Pro Phe Ala Asp
1280 1285 1290
Tyr Ser Ile Ala Glu Gln Ile Asp Arg Val Ser Asn Leu Leu Ser
1295 1300 1305
Tyr Ser Thr Arg Tyr Asn Asn Ser Thr Tyr Ala Ser Val Phe Glu
1310 1315 1320
Val Phe Lys Lys Asp Val Asn Leu Asp Tyr Asp Glu Leu Lys Lys
1325 1330 1335
Lys Phe Lys Leu Ile Gly Asn Asn Asp Ile Leu Glu Arg Leu Met
1340 1345 1350
Lys Pro Lys Lys Val Ser Val Leu Glu Leu Glu Ser Tyr Asn Ser
1355 1360 1365
Asp Tyr Ile Lys Asn Leu Ile Ile Glu Leu Leu Thr Lys Ile Glu
1370 1375 1380
Asn Thr Asn Asp Thr Leu
1385
<210> 41
<211> 1152
<212> PRT
<213> Leptotrichia wadei
<400> 41
Met Lys Val Thr Lys Val Asp Gly Ile Ser His Lys Lys Tyr Ile Glu
1 5 10 15
Glu Gly Lys Leu Val Lys Ser Thr Ser Glu Glu Asn Arg Thr Ser Glu
20 25 30
Arg Leu Ser Glu Leu Leu Ser Ile Arg Leu Asp Ile Tyr Ile Lys Asn
35 40 45
Pro Asp Asn Ala Ser Glu Glu Glu Asn Arg Ile Arg Arg Glu Asn Leu
50 55 60
Lys Lys Phe Phe Ser Asn Lys Val Leu His Leu Lys Asp Ser Val Leu
65 70 75 80
Tyr Leu Lys Asn Arg Lys Glu Lys Asn Ala Val Gln Asp Lys Asn Tyr
85 90 95
Ser Glu Glu Asp Ile Ser Glu Tyr Asp Leu Lys Asn Lys Asn Ser Phe
100 105 110
Ser Val Leu Lys Lys Ile Leu Leu Asn Glu Asp Val Asn Ser Glu Glu
115 120 125
Leu Glu Ile Phe Arg Lys Asp Val Glu Ala Lys Leu Asn Lys Ile Asn
130 135 140
Ser Leu Lys Tyr Ser Phe Glu Glu Asn Lys Ala Asn Tyr Gln Lys Ile
145 150 155 160
Asn Glu Asn Asn Val Glu Lys Val Gly Gly Lys Ser Lys Arg Asn Ile
165 170 175
Ile Tyr Asp Tyr Tyr Arg Glu Ser Ala Lys Arg Asn Asp Tyr Ile Asn
180 185 190
Asn Val Gln Glu Ala Phe Asp Lys Leu Tyr Lys Lys Glu Asp Ile Glu
195 200 205
Lys Leu Phe Phe Leu Ile Glu Asn Ser Lys Lys His Glu Lys Tyr Lys
210 215 220
Ile Arg Glu Tyr Tyr His Lys Ile Ile Gly Arg Lys Asn Asp Lys Glu
225 230 235 240
Asn Phe Ala Lys Ile Ile Tyr Glu Glu Ile Gln Asn Val Asn Asn Ile
245 250 255
Lys Glu Leu Ile Glu Lys Ile Pro Asp Met Ser Glu Leu Lys Lys Ser
260 265 270
Gln Val Phe Tyr Lys Tyr Tyr Leu Asp Lys Glu Glu Leu Asn Asp Lys
275 280 285
Asn Ile Lys Tyr Ala Phe Cys His Phe Val Glu Ile Glu Met Ser Gln
290 295 300
Leu Leu Lys Asn Tyr Val Tyr Lys Arg Leu Ser Asn Ile Ser Asn Asp
305 310 315 320
Lys Ile Lys Arg Ile Phe Glu Tyr Gln Asn Leu Lys Lys Leu Ile Glu
325 330 335
Asn Lys Leu Leu Asn Lys Leu Asp Thr Tyr Val Arg Asn Cys Gly Lys
340 345 350
Tyr Asn Tyr Tyr Leu Gln Val Gly Glu Ile Ala Thr Ser Asp Phe Ile
355 360 365
Ala Arg Asn Arg Gln Asn Glu Ala Phe Leu Arg Asn Ile Ile Gly Val
370 375 380
Ser Ser Val Ala Tyr Phe Ser Leu Arg Asn Ile Leu Glu Thr Glu Asn
385 390 395 400
Glu Asn Gly Ile Thr Gly Arg Met Arg Gly Lys Thr Val Lys Asn Asn
405 410 415
Lys Gly Glu Glu Lys Tyr Val Ser Gly Glu Val Asp Lys Ile Tyr Asn
420 425 430
Glu Asn Lys Gln Asn Glu Val Lys Glu Asn Leu Lys Met Phe Tyr Ser
435 440 445
Tyr Asp Phe Asn Met Asp Asn Lys Asn Glu Ile Glu Asp Phe Phe Ala
450 455 460
Asn Ile Asp Glu Ala Ile Ser Ser Ile Ala His Gly Ile Val His Phe
465 470 475 480
Asn Leu Glu Leu Glu Gly Lys Asp Ile Phe Ala Phe Lys Asn Ile Ala
485 490 495
Pro Ser Glu Ile Ser Lys Lys Met Phe Gln Asn Glu Ile Asn Glu Lys
500 505 510
Lys Leu Lys Leu Lys Ile Phe Lys Gln Leu Asn Ser Ala Asn Val Phe
515 520 525
Asn Tyr Tyr Glu Lys Asp Val Ile Ile Lys Tyr Leu Lys Asn Thr Lys
530 535 540
Phe Asn Phe Val Asn Lys Asn Ile Pro Phe Val Pro Ser Phe Thr Lys
545 550 555 560
Leu Tyr Asn Lys Ile Glu Asp Leu Arg Asn Thr Leu Lys Phe Phe Trp
565 570 575
Ser Val Pro Lys Asp Lys Glu Glu Lys Asp Ala Gln Ile Tyr Leu Leu
580 585 590
Lys Asn Ile Tyr Tyr Gly Glu Phe Leu Asn Lys Phe Val Lys Asn Ser
595 600 605
Lys Val Phe Phe Lys Ile Thr Asn Glu Val Ile Lys Ile Asn Lys Gln
610 615 620
Arg Asn Gln Lys Thr Gly His Tyr Lys Tyr Gln Lys Phe Glu Asn Ile
625 630 635 640
Glu Lys Thr Val Pro Val Glu Tyr Leu Ala Ile Ile Gln Ser Arg Glu
645 650 655
Met Ile Asn Asn Gln Asp Lys Glu Glu Lys Asn Thr Tyr Ile Asp Phe
660 665 670
Ile Gln Gln Ile Phe Leu Lys Gly Phe Ile Asp Tyr Leu Asn Lys Asn
675 680 685
Asn Leu Lys Tyr Ile Glu Ser Asn Asn Asn Asn Asp Asn Asn Asp Ile
690 695 700
Phe Ser Lys Ile Lys Ile Lys Lys Asp Asn Lys Glu Lys Tyr Asp Lys
705 710 715 720
Ile Leu Lys Asn Tyr Glu Lys His Asn Arg Asn Lys Glu Ile Pro His
725 730 735
Glu Ile Asn Glu Phe Val Arg Glu Ile Lys Leu Gly Lys Ile Leu Lys
740 745 750
Tyr Thr Glu Asn Leu Asn Met Phe Tyr Leu Ile Leu Lys Leu Leu Asn
755 760 765
His Lys Glu Leu Thr Asn Leu Lys Gly Ser Leu Glu Lys Tyr Gln Ser
770 775 780
Ala Asn Lys Glu Glu Thr Phe Ser Asp Glu Leu Glu Leu Ile Asn Leu
785 790 795 800
Leu Asn Leu Asp Asn Asn Arg Val Thr Glu Asp Phe Glu Leu Glu Ala
805 810 815
Asn Glu Ile Gly Lys Phe Leu Asp Phe Asn Glu Asn Lys Ile Lys Asp
820 825 830
Arg Lys Glu Leu Lys Lys Phe Asp Thr Asn Lys Ile Tyr Phe Asp Gly
835 840 845
Glu Asn Ile Ile Lys His Arg Ala Phe Tyr Asn Ile Lys Lys Tyr Gly
850 855 860
Met Leu Asn Leu Leu Glu Lys Ile Ala Asp Lys Ala Lys Tyr Lys Ile
865 870 875 880
Ser Leu Lys Glu Leu Lys Glu Tyr Ser Asn Lys Lys Asn Glu Ile Glu
885 890 895
Lys Asn Tyr Thr Met Gln Gln Asn Leu His Arg Lys Tyr Ala Arg Pro
900 905 910
Lys Lys Asp Glu Lys Phe Asn Asp Glu Asp Tyr Lys Glu Tyr Glu Lys
915 920 925
Ala Ile Gly Asn Ile Gln Lys Tyr Thr His Leu Lys Asn Lys Val Glu
930 935 940
Phe Asn Glu Leu Asn Leu Leu Gln Gly Leu Leu Leu Lys Ile Leu His
945 950 955 960
Arg Leu Val Gly Tyr Thr Ser Ile Trp Glu Arg Asp Leu Arg Phe Arg
965 970 975
Leu Lys Gly Glu Phe Pro Glu Asn His Tyr Ile Glu Glu Ile Phe Asn
980 985 990
Phe Asp Asn Ser Lys Asn Val Lys Tyr Lys Ser Gly Gln Ile Val Glu
995 1000 1005
Lys Tyr Ile Asn Phe Tyr Lys Glu Leu Tyr Lys Asp Asn Val Glu
1010 1015 1020
Lys Arg Ser Ile Tyr Ser Asp Lys Lys Val Lys Lys Leu Lys Gln
1025 1030 1035
Glu Lys Lys Asp Leu Tyr Ile Ala Asn Tyr Ile Ala His Phe Asn
1040 1045 1050
Tyr Ile Pro His Ala Glu Ile Ser Leu Leu Glu Val Leu Glu Asn
1055 1060 1065
Leu Arg Lys Leu Leu Ser Tyr Asp Arg Lys Leu Lys Asn Ala Ile
1070 1075 1080
Met Lys Ser Ile Val Asp Ile Leu Lys Glu Tyr Gly Phe Val Ala
1085 1090 1095
Thr Phe Lys Ile Gly Ala Asp Lys Lys Ile Glu Ile Gln Thr Leu
1100 1105 1110
Glu Ser Glu Lys Ile Val His Leu Lys Asn Leu Lys Lys Lys Lys
1115 1120 1125
Leu Met Thr Asp Arg Asn Ser Glu Glu Leu Cys Glu Leu Val Lys
1130 1135 1140
Val Met Phe Glu Tyr Lys Ala Leu Glu
1145 1150
<210> 42
<211> 175
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 42
Met Asp Ser Gly Arg Asp Phe Leu Thr Leu His Gly Leu Gln Asp Asp
1 5 10 15
Glu Asp Leu Gln Ala Leu Leu Lys Gly Ser Gln Leu Leu Lys Val Lys
20 25 30
Ser Ser Ser Trp Arg Arg Glu Arg Phe Tyr Lys Leu Gln Glu Asp Cys
35 40 45
Lys Thr Ile Trp Gln Glu Ser Arg Lys Val Met Arg Thr Pro Glu Ser
50 55 60
Gln Leu Phe Ser Ile Glu Asp Ile Gln Glu Val Arg Met Gly His Arg
65 70 75 80
Thr Glu Gly Leu Glu Lys Phe Ala Arg Asp Val Pro Glu Asp Arg Cys
85 90 95
Phe Ser Ile Val Phe Lys Asp Gln Arg Asn Thr Leu Asp Leu Ile Ala
100 105 110
Pro Ser Pro Ala Asp Ala Gln His Trp Val Leu Gly Leu His Lys Ile
115 120 125
Ile His His Ser Gly Ser Met Asp Gln Arg Gln Lys Leu Gln His Trp
130 135 140
Ile His Ser Cys Leu Arg Lys Ala Asp Lys Asn Lys Asp Asn Lys Met
145 150 155 160
Ser Phe Lys Glu Leu Gln Asn Phe Leu Lys Glu Leu Asn Ile Gln
165 170 175
<210> 43
<211> 168
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 43
Met Ser Asp Val Ala Ile Val Lys Glu Gly Trp Leu His Lys Arg Gly
1 5 10 15
Glu Tyr Ile Lys Thr Trp Arg Pro Arg Tyr Phe Leu Leu Lys Asn Asp
20 25 30
Gly Thr Phe Ile Gly Tyr Lys Glu Arg Pro Gln Asp Val Asp Gln Arg
35 40 45
Glu Ala Pro Leu Asn Asn Phe Ser Val Ala Gln Cys Gln Leu Met Lys
50 55 60
Thr Glu Arg Pro Arg Pro Asn Thr Phe Ile Ile Arg Cys Leu Gln Trp
65 70 75 80
Thr Thr Val Ile Glu Arg Thr Phe His Val Glu Thr Pro Glu Glu Arg
85 90 95
Glu Glu Trp Thr Thr Ala Ile Gln Thr Val Ala Asp Gly Leu Lys Lys
100 105 110
Gln Glu Glu Glu Glu Met Asp Phe Arg Ser Gly Ser Pro Ser Asp Asn
115 120 125
Ser Gly Ala Glu Glu Met Glu Val Ser Leu Ala Lys Pro Lys His Arg
130 135 140
Val Thr Met Asn Glu Phe Glu Tyr Leu Lys Leu Leu Gly Lys Gly Thr
145 150 155 160
Phe Gly Lys Val Asp Pro Pro Val
165
<210> 44
<211> 92
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 44
Lys Met Gly Pro Val Asp Lys Arg Lys Gly Leu Phe Ala Arg Arg Arg
1 5 10 15
Gln Leu Leu Leu Thr Glu Gly Pro His Leu Tyr Tyr Val Asp Pro Val
20 25 30
Asn Lys Val Leu Lys Gly Glu Ile Pro Trp Ser Gln Glu Leu Arg Pro
35 40 45
Glu Ala Lys Asn Phe Lys Thr Phe Phe Val His Thr Pro Asn Arg Thr
50 55 60
Tyr Tyr Leu Met Asp Pro Ser Gly Asn Ala His Lys Trp Cys Arg Lys
65 70 75 80
Ile Gln Glu Val Trp Arg Gln Arg Tyr Gln Ser His
85 90
<210> 45
<211> 38
<212> PRT
<213> Human alphaherpesvirus 1
<400> 45
Pro Thr Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Pro Ala Asp
1 5 10 15
Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Pro Ala Asp Ala Leu Asp
20 25 30
Asp Phe Asp Leu Asp Met
35
<210> 46
<211> 53
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 46
Gly Arg Ala Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser
1 5 10 15
Asp Ala Leu Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu
20 25 30
Asp Asp Phe Asp Leu Asp Met Leu Gly Ser Asp Ala Leu Asp Asp Phe
35 40 45
Asp Leu Asp Met Leu
50
<210> 47
<211> 261
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 47
Ser Gln Tyr Leu Pro Asp Thr Asp Asp Arg His Arg Ile Glu Glu Lys
1 5 10 15
Arg Lys Arg Thr Tyr Glu Thr Phe Lys Ser Ile Met Lys Lys Ser Pro
20 25 30
Phe Ser Gly Pro Thr Asp Pro Arg Pro Pro Pro Arg Arg Ile Ala Val
35 40 45
Pro Ser Arg Ser Ser Ala Ser Val Pro Lys Pro Ala Pro Gln Pro Tyr
50 55 60
Pro Phe Thr Ser Ser Leu Ser Thr Ile Asn Tyr Asp Glu Phe Pro Thr
65 70 75 80
Met Val Phe Pro Ser Gly Gln Ile Ser Gln Ala Ser Ala Leu Ala Pro
85 90 95
Ala Pro Pro Gln Val Leu Pro Gln Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro
100 105 110
Ala Met Val Ser Ala Leu Ala Gln Ala Pro Ala Pro Val Pro Val Leu
115 120 125
Ala Pro Gly Pro Pro Gln Ala Val Ala Pro Pro Ala Pro Lys Pro Thr
130 135 140
Gln Ala Gly Glu Gly Thr Leu Ser Glu Ala Leu Leu Gln Leu Gln Phe
145 150 155 160
Asp Asp Glu Asp Leu Gly Ala Leu Leu Gly Asn Ser Thr Asp Pro Ala
165 170 175
Val Phe Thr Asp Leu Ala Ser Val Asp Asn Ser Glu Phe Gln Gln Leu
180 185 190
Leu Asn Gln Gly Ile Pro Val Ala Pro His Thr Thr Glu Pro Met Leu
195 200 205
Met Glu Tyr Pro Glu Ala Ile Thr Arg Leu Val Thr Gly Ala Gln Arg
210 215 220
Pro Pro Asp Pro Ala Pro Ala Pro Leu Gly Ala Pro Gly Leu Pro Asn
225 230 235 240
Gly Leu Leu Ser Gly Asp Glu Asp Phe Ser Ser Ile Ala Asp Met Asp
245 250 255
Phe Ser Ala Leu Leu
260
<210> 48
<211> 190
<212> PRT
<213> Human gammaherpesvirus 8
<400> 48
Arg Asp Ser Arg Glu Gly Met Phe Leu Pro Lys Pro Glu Ala Gly Ser
1 5 10 15
Ala Ile Ser Asp Val Phe Glu Gly Arg Glu Val Cys Gln Pro Lys Arg
20 25 30
Ile Arg Pro Phe His Pro Pro Gly Ser Pro Trp Ala Asn Arg Pro Leu
35 40 45
Pro Ala Ser Leu Ala Pro Thr Pro Thr Gly Pro Val His Glu Pro Val
50 55 60
Gly Ser Leu Thr Pro Ala Pro Val Pro Gln Pro Leu Asp Pro Ala Pro
65 70 75 80
Ala Val Thr Pro Glu Ala Ser His Leu Leu Glu Asp Pro Asp Glu Glu
85 90 95
Thr Ser Gln Ala Val Lys Ala Leu Arg Glu Met Ala Asp Thr Val Ile
100 105 110
Pro Gln Lys Glu Glu Ala Ala Ile Cys Gly Gln Met Asp Leu Ser His
115 120 125
Pro Pro Pro Arg Gly His Leu Asp Glu Leu Thr Thr Thr Leu Glu Ser
130 135 140
Met Thr Glu Asp Leu Asn Leu Asp Ser Pro Leu Thr Pro Glu Leu Asn
145 150 155 160
Glu Ile Leu Asp Thr Phe Leu Asn Asp Glu Cys Leu Leu His Ala Met
165 170 175
His Ile Ser Thr Gly Leu Ser Ile Phe Asp Thr Ser Leu Phe
180 185 190
<210> 49
<211> 72
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 49
Met Asp Ala Lys Ser Leu Thr Ala Trp Ser Arg Thr Leu Val Thr Phe
1 5 10 15
Lys Asp Val Phe Val Asp Phe Thr Arg Glu Glu Trp Lys Leu Leu Asp
20 25 30
Thr Ala Gln Gln Ile Val Tyr Arg Asn Val Met Leu Glu Asn Tyr Lys
35 40 45
Asn Leu Val Ser Leu Gly Tyr Gln Leu Thr Lys Pro Asp Val Ile Leu
50 55 60
Arg Leu Glu Lys Gly Glu Glu Pro
65 70
<210> 50
<211> 289
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 50
Glu Ala Ser Val Gln Val Lys Arg Val Leu Glu Lys Ser Pro Gly Lys
1 5 10 15
Leu Leu Val Lys Met Pro Phe Gln Ala Ser Pro Gly Gly Lys Gly Glu
20 25 30
Gly Gly Gly Ala Thr Thr Ser Ala Gln Val Met Val Ile Lys Arg Pro
35 40 45
Gly Arg Lys Arg Lys Ala Glu Ala Asp Pro Gln Ala Ile Pro Lys Lys
50 55 60
Arg Gly Arg Lys Pro Gly Ser Val Val Ala Ala Ala Ala Ala Glu Ala
65 70 75 80
Lys Lys Lys Ala Val Lys Glu Ser Ser Ile Arg Ser Val Gln Glu Thr
85 90 95
Val Leu Pro Ile Lys Lys Arg Lys Thr Arg Glu Thr Val Ser Ile Glu
100 105 110
Val Lys Glu Val Val Lys Pro Leu Leu Val Ser Thr Leu Gly Glu Lys
115 120 125
Ser Gly Lys Gly Leu Lys Thr Cys Lys Ser Pro Gly Arg Lys Ser Lys
130 135 140
Glu Ser Ser Pro Lys Gly Arg Ser Ser Ser Ala Ser Ser Pro Pro Lys
145 150 155 160
Lys Glu His His His His His His His Ala Glu Ser Pro Lys Ala Pro
165 170 175
Met Pro Leu Leu Pro Pro Pro Pro Pro Pro Glu Pro Gln Ser Ser Glu
180 185 190
Asp Pro Ile Ser Pro Pro Glu Pro Gln Asp Leu Ser Ser Ser Ile Cys
195 200 205
Lys Glu Glu Lys Met Pro Arg Ala Gly Ser Leu Glu Ser Asp Gly Cys
210 215 220
Pro Lys Glu Pro Ala Lys Thr Gln Pro Met Val Ala Ala Ala Ala Thr
225 230 235 240
Thr Thr Thr Thr Thr Thr Thr Thr Val Ala Glu Lys Tyr Lys His Arg
245 250 255
Gly Glu Gly Glu Arg Lys Asp Ile Val Ser Ser Ser Met Pro Arg Pro
260 265 270
Asn Arg Glu Glu Pro Val Asp Ser Arg Thr Pro Val Thr Glu Arg Val
275 280 285
Ser
<210> 51
<211> 718
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 51
Leu Pro Thr Cys Ser Cys Leu Asp Arg Val Ile Gln Lys Asp Lys Gly
1 5 10 15
Pro Tyr Tyr Thr His Leu Gly Ala Gly Pro Ser Val Ala Ala Val Arg
20 25 30
Glu Ile Met Glu Asn Arg Tyr Gly Gln Lys Gly Asn Ala Ile Arg Ile
35 40 45
Glu Ile Val Val Tyr Thr Gly Lys Glu Gly Lys Ser Ser His Gly Cys
50 55 60
Pro Ile Ala Lys Trp Val Leu Arg Arg Ser Ser Asp Glu Glu Lys Val
65 70 75 80
Leu Cys Leu Val Arg Gln Arg Thr Gly His His Cys Pro Thr Ala Val
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Met Val Val Leu Ile Met Val Trp Asp Gly Ile Pro Leu Pro Met Ala
100 105 110
Asp Arg Leu Tyr Thr Glu Leu Thr Glu Asn Leu Lys Ser Tyr Asn Gly
115 120 125
His Pro Thr Asp Arg Arg Cys Thr Leu Asn Glu Asn Arg Thr Cys Thr
130 135 140
Cys Gln Gly Ile Asp Pro Glu Thr Cys Gly Ala Ser Phe Ser Phe Gly
145 150 155 160
Cys Ser Trp Ser Met Tyr Phe Asn Gly Cys Lys Phe Gly Arg Ser Pro
165 170 175
Ser Pro Arg Arg Phe Arg Ile Asp Pro Ser Ser Pro Leu His Glu Lys
180 185 190
Asn Leu Glu Asp Asn Leu Gln Ser Leu Ala Thr Arg Leu Ala Pro Ile
195 200 205
Tyr Lys Gln Tyr Ala Pro Val Ala Tyr Gln Asn Gln Val Glu Tyr Glu
210 215 220
Asn Val Ala Arg Glu Cys Arg Leu Gly Ser Lys Glu Gly Arg Pro Phe
225 230 235 240
Ser Gly Val Thr Ala Cys Leu Asp Phe Cys Ala His Pro His Arg Asp
245 250 255
Ile His Asn Met Asn Asn Gly Ser Thr Val Val Cys Thr Leu Thr Arg
260 265 270
Glu Asp Asn Arg Ser Leu Gly Val Ile Pro Gln Asp Glu Gln Leu His
275 280 285
Val Leu Pro Leu Tyr Lys Leu Ser Asp Thr Asp Glu Phe Gly Ser Lys
290 295 300
Glu Gly Met Glu Ala Lys Ile Lys Ser Gly Ala Ile Glu Val Leu Ala
305 310 315 320
Pro Arg Arg Lys Lys Arg Thr Cys Phe Thr Gln Pro Val Pro Arg Ser
325 330 335
Gly Lys Lys Arg Ala Ala Met Met Thr Glu Val Leu Ala His Lys Ile
340 345 350
Arg Ala Val Glu Lys Lys Pro Ile Pro Arg Ile Lys Arg Lys Asn Asn
355 360 365
Ser Thr Thr Thr Asn Asn Ser Lys Pro Ser Ser Leu Pro Thr Leu Gly
370 375 380
Ser Asn Thr Glu Thr Val Gln Pro Glu Val Lys Ser Glu Thr Glu Pro
385 390 395 400
His Phe Ile Leu Lys Ser Ser Asp Asn Thr Lys Thr Tyr Ser Leu Met
405 410 415
Pro Ser Ala Pro His Pro Val Lys Glu Ala Ser Pro Gly Phe Ser Trp
420 425 430
Ser Pro Lys Thr Ala Ser Ala Thr Pro Ala Pro Leu Lys Asn Asp Ala
435 440 445
Thr Ala Ser Cys Gly Phe Ser Glu Arg Ser Ser Thr Pro His Cys Thr
450 455 460
Met Pro Ser Gly Arg Leu Ser Gly Ala Asn Ala Ala Ala Ala Asp Gly
465 470 475 480
Pro Gly Ile Ser Gln Leu Gly Glu Val Ala Pro Leu Pro Thr Leu Ser
485 490 495
Ala Pro Val Met Glu Pro Leu Ile Asn Ser Glu Pro Ser Thr Gly Val
500 505 510
Thr Glu Pro Leu Thr Pro His Gln Pro Asn His Gln Pro Ser Phe Leu
515 520 525
Thr Ser Pro Gln Asp Leu Ala Ser Ser Pro Met Glu Glu Asp Glu Gln
530 535 540
His Ser Glu Ala Asp Glu Pro Pro Ser Asp Glu Pro Leu Ser Asp Asp
545 550 555 560
Pro Leu Ser Pro Ala Glu Glu Lys Leu Pro His Ile Asp Glu Tyr Trp
565 570 575
Ser Asp Ser Glu His Ile Phe Leu Asp Ala Asn Ile Gly Gly Val Ala
580 585 590
Ile Ala Pro Ala His Gly Ser Val Leu Ile Glu Cys Ala Arg Arg Glu
595 600 605
Leu His Ala Thr Thr Pro Val Glu His Pro Asn Arg Asn His Pro Thr
610 615 620
Arg Leu Ser Leu Val Phe Tyr Gln His Lys Asn Leu Asn Lys Pro Gln
625 630 635 640
His Gly Phe Glu Leu Asn Lys Ile Lys Phe Glu Ala Lys Glu Ala Lys
645 650 655
Asn Lys Lys Met Lys Ala Ser Glu Gln Lys Asp Gln Ala Ala Asn Glu
660 665 670
Gly Pro Glu Gln Ser Ser Glu Val Asn Glu Leu Asn Gln Ile Pro Ser
675 680 685
His Lys Ala Leu Thr Leu Thr His Asp Asn Val Val Thr Val Ser Pro
690 695 700
Tyr Ala Leu Thr His Val Ala Gly Pro Tyr Asn His Trp Val
705 710 715
<210> 52
<211> 912
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 52
Met Pro Ala Met Pro Ser Ser Gly Pro Gly Asp Thr Ser Ser Ser Ala
1 5 10 15
Ala Glu Arg Glu Glu Asp Arg Lys Asp Gly Glu Glu Gln Glu Glu Pro
20 25 30
Arg Gly Lys Glu Glu Arg Gln Glu Pro Ser Thr Thr Ala Arg Lys Val
35 40 45
Gly Arg Pro Gly Arg Lys Arg Lys His Pro Pro Val Glu Ser Gly Asp
50 55 60
Thr Pro Lys Asp Pro Ala Val Ile Ser Lys Ser Pro Ser Met Ala Gln
65 70 75 80
Asp Ser Gly Ala Ser Glu Leu Leu Pro Asn Gly Asp Leu Glu Lys Arg
85 90 95
Ser Glu Pro Gln Pro Glu Glu Gly Ser Pro Ala Gly Gly Gln Lys Gly
100 105 110
Gly Ala Pro Ala Glu Gly Glu Gly Ala Ala Glu Thr Leu Pro Glu Ala
115 120 125
Ser Arg Ala Val Glu Asn Gly Cys Cys Thr Pro Lys Glu Gly Arg Gly
130 135 140
Ala Pro Ala Glu Ala Gly Lys Glu Gln Lys Glu Thr Asn Ile Glu Ser
145 150 155 160
Met Lys Met Glu Gly Ser Arg Gly Arg Leu Arg Gly Gly Leu Gly Trp
165 170 175
Glu Ser Ser Leu Arg Gln Arg Pro Met Pro Arg Leu Thr Phe Gln Ala
180 185 190
Gly Asp Pro Tyr Tyr Ile Ser Lys Arg Lys Arg Asp Glu Trp Leu Ala
195 200 205
Arg Trp Lys Arg Glu Ala Glu Lys Lys Ala Lys Val Ile Ala Gly Met
210 215 220
Asn Ala Val Glu Glu Asn Gln Gly Pro Gly Glu Ser Gln Lys Val Glu
225 230 235 240
Glu Ala Ser Pro Pro Ala Val Gln Gln Pro Thr Asp Pro Ala Ser Pro
245 250 255
Thr Val Ala Thr Thr Pro Glu Pro Val Gly Ser Asp Ala Gly Asp Lys
260 265 270
Asn Ala Thr Lys Ala Gly Asp Asp Glu Pro Glu Tyr Glu Asp Gly Arg
275 280 285
Gly Phe Gly Ile Gly Glu Leu Val Trp Gly Lys Leu Arg Gly Phe Ser
290 295 300
Trp Trp Pro Gly Arg Ile Val Ser Trp Trp Met Thr Gly Arg Ser Arg
305 310 315 320
Ala Ala Glu Gly Thr Arg Trp Val Met Trp Phe Gly Asp Gly Lys Phe
325 330 335
Ser Val Val Cys Val Glu Lys Leu Met Pro Leu Ser Ser Phe Cys Ser
340 345 350
Ala Phe His Gln Ala Thr Tyr Asn Lys Gln Pro Met Tyr Arg Lys Ala
355 360 365
Ile Tyr Glu Val Leu Gln Val Ala Ser Ser Arg Ala Gly Lys Leu Phe
370 375 380
Pro Val Cys His Asp Ser Asp Glu Ser Asp Thr Ala Lys Ala Val Glu
385 390 395 400
Val Gln Asn Lys Pro Met Ile Glu Trp Ala Leu Gly Gly Phe Gln Pro
405 410 415
Ser Gly Pro Lys Gly Leu Glu Pro Pro Glu Glu Glu Lys Asn Pro Tyr
420 425 430
Lys Glu Val Tyr Thr Asp Met Trp Val Glu Pro Glu Ala Ala Ala Tyr
435 440 445
Ala Pro Pro Pro Pro Ala Lys Lys Pro Arg Lys Ser Thr Ala Glu Lys
450 455 460
Pro Lys Val Lys Glu Ile Ile Asp Glu Arg Thr Arg Glu Arg Leu Val
465 470 475 480
Tyr Glu Val Arg Gln Lys Cys Arg Asn Ile Glu Asp Ile Cys Ile Ser
485 490 495
Cys Gly Ser Leu Asn Val Thr Leu Glu His Pro Leu Phe Val Gly Gly
500 505 510
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515 520 525
Asp Asp Asp Gly Tyr Gln Ser Tyr Cys Thr Ile Cys Cys Gly Gly Arg
530 535 540
Glu Val Leu Met Cys Gly Asn Asn Asn Cys Cys Arg Cys Phe Cys Val
545 550 555 560
Glu Cys Val Asp Leu Leu Val Gly Pro Gly Ala Ala Gln Ala Ala Ile
565 570 575
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580 585 590
Gly Leu Leu Arg Arg Arg Glu Asp Trp Pro Ser Arg Leu Gln Met Phe
595 600 605
Phe Ala Asn Asn His Asp Gln Glu Phe Asp Pro Pro Lys Val Tyr Pro
610 615 620
Pro Val Pro Ala Glu Lys Arg Lys Pro Ile Arg Val Leu Ser Leu Phe
625 630 635 640
Asp Gly Ile Ala Thr Gly Leu Leu Val Leu Lys Asp Leu Gly Ile Gln
645 650 655
Val Asp Arg Tyr Ile Ala Ser Glu Val Cys Glu Asp Ser Ile Thr Val
660 665 670
Gly Met Val Arg His Gln Gly Lys Ile Met Tyr Val Gly Asp Val Arg
675 680 685
Ser Val Thr Gln Lys His Ile Gln Glu Trp Gly Pro Phe Asp Leu Val
690 695 700
Ile Gly Gly Ser Pro Cys Asn Asp Leu Ser Ile Val Asn Pro Ala Arg
705 710 715 720
Lys Gly Leu Tyr Glu Gly Thr Gly Arg Leu Phe Phe Glu Phe Tyr Arg
725 730 735
Leu Leu His Asp Ala Arg Pro Lys Glu Gly Asp Asp Arg Pro Phe Phe
740 745 750
Trp Leu Phe Glu Asn Val Val Ala Met Gly Val Ser Asp Lys Arg Asp
755 760 765
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770 775 780
Val Ser Ala Ala His Arg Ala Arg Tyr Phe Trp Gly Asn Leu Pro Gly
785 790 795 800
Met Asn Arg Pro Leu Ala Ser Thr Val Asn Asp Lys Leu Glu Leu Gln
805 810 815
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820 825 830
Ile Thr Thr Arg Ser Asn Ser Ile Lys Gln Gly Lys Asp Gln His Phe
835 840 845
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850 855 860
Glu Arg Val Phe Gly Phe Pro Val His Tyr Thr Asp Val Ser Asn Met
865 870 875 880
Ser Arg Leu Ala Arg Gln Arg Leu Leu Gly Arg Ser Trp Ser Val Pro
885 890 895
Val Ile Arg His Leu Phe Ala Pro Leu Lys Glu Tyr Phe Ala Cys Val
900 905 910
<210> 53
<211> 511
<212> PRT
<213> Indiana vesiculovirus
<400> 53
Met Lys Cys Leu Leu Tyr Leu Ala Phe Leu Phe Ile Gly Val Asn Cys
1 5 10 15
Lys Phe Thr Ile Val Phe Pro His Asn Gln Lys Gly Asn Trp Lys Asn
20 25 30
Val Pro Ser Asn Tyr His Tyr Cys Pro Ser Ser Ser Asp Leu Asn Trp
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Val Thr Thr Cys Asp Phe Arg Trp Tyr Gly Pro Lys Tyr Ile Thr His
85 90 95
Ser Ile Arg Ser Phe Thr Pro Ser Val Glu Gln Cys Lys Glu Ser Ile
100 105 110
Glu Gln Thr Lys Gln Gly Thr Trp Leu Asn Pro Gly Phe Pro Pro Gln
115 120 125
Ser Cys Gly Tyr Ala Thr Val Thr Asp Ala Glu Ala Val Ile Val Gln
130 135 140
Val Thr Pro His His Val Leu Val Asp Glu Tyr Thr Gly Glu Trp Val
145 150 155 160
Asp Ser Gln Phe Ile Asn Gly Lys Cys Ser Asn Tyr Ile Cys Pro Thr
165 170 175
Val His Asn Ser Thr Thr Trp His Ser Asp Tyr Lys Val Lys Gly Leu
180 185 190
Cys Asp Ser Asn Leu Ile Ser Met Asp Ile Thr Phe Phe Ser Glu Asp
195 200 205
Gly Glu Leu Ser Ser Leu Gly Lys Glu Gly Thr Gly Phe Arg Ser Asn
210 215 220
Tyr Phe Ala Tyr Glu Thr Gly Gly Lys Ala Cys Lys Met Gln Tyr Cys
225 230 235 240
Lys His Trp Gly Val Arg Leu Pro Ser Gly Val Trp Phe Glu Met Ala
245 250 255
Asp Lys Asp Leu Phe Ala Ala Ala Arg Phe Pro Glu Cys Pro Glu Gly
260 265 270
Ser Ser Ile Ser Ala Pro Ser Gln Thr Ser Val Asp Val Ser Leu Ile
275 280 285
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290 295 300
Ser Lys Ile Arg Ala Gly Leu Pro Ile Ser Pro Val Asp Leu Ser Tyr
305 310 315 320
Leu Ala Pro Lys Asn Pro Gly Thr Gly Pro Ala Phe Thr Ile Ile Asn
325 330 335
Gly Thr Leu Lys Tyr Phe Glu Thr Arg Tyr Ile Arg Val Asp Ile Ala
340 345 350
Ala Pro Ile Leu Ser Arg Met Val Gly Met Ile Ser Gly Thr Thr Thr
355 360 365
Glu Arg Glu Leu Trp Asp Asp Trp Ala Pro Tyr Glu Asp Val Glu Ile
370 375 380
Gly Pro Asn Gly Val Leu Arg Thr Ser Ser Gly Tyr Lys Phe Pro Leu
385 390 395 400
Tyr Met Ile Gly His Gly Met Leu Asp Ser Asp Leu His Leu Ser Ser
405 410 415
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420 425 430
Leu Pro Asp Asp Glu Ser Leu Phe Phe Gly Asp Thr Gly Leu Ser Lys
435 440 445
Asn Pro Ile Glu Leu Val Glu Gly Trp Phe Ser Ser Trp Lys Ser Ser
450 455 460
Ile Ala Ser Phe Phe Phe Ile Ile Gly Leu Ile Ile Gly Leu Phe Leu
465 470 475 480
Val Leu Arg Val Gly Ile His Leu Cys Ile Lys Leu Lys His Thr Lys
485 490 495
Lys Arg Gln Ile Tyr Thr Asp Ile Glu Met Asn Arg Leu Gly Lys
500 505 510
<210> 54
<211> 512
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Description of Unknown:
Baculovirus envelope glycoprotein GP64 sequence
<400> 54
Met Val Ser Ala Ile Val Leu Tyr Val Leu Leu Ala Ala Ala Ala His
1 5 10 15
Ser Ala Phe Ala Ala Glu His Cys Asn Ala Gln Met Lys Thr Gly Pro
20 25 30
Tyr Lys Ile Lys Asn Leu Asp Ile Thr Pro Pro Lys Glu Thr Leu Gln
35 40 45
Lys Asp Val Glu Ile Thr Ile Val Glu Thr Asp Tyr Asn Glu Asn Val
50 55 60
Ile Ile Gly Tyr Lys Gly Tyr Tyr Gln Ala Tyr Ala Tyr Asn Gly Gly
65 70 75 80
Ser Leu Asp Pro Asn Thr Arg Val Glu Glu Thr Met Lys Thr Leu Asn
85 90 95
Val Gly Lys Glu Asp Leu Leu Met Trp Ser Ile Arg Gln Gln Cys Glu
100 105 110
Val Gly Glu Glu Leu Ile Asp Arg Trp Gly Ser Asp Ser Asp Asp Cys
115 120 125
Phe Arg Asp Asn Glu Gly Arg Gly Gln Trp Val Lys Gly Lys Glu Leu
130 135 140
Val Lys Arg Gln Asn Asn Asn His Phe Ala His His Thr Cys Asn Lys
145 150 155 160
Ser Trp Arg Cys Gly Ile Ser Thr Ser Lys Met Tyr Ser Arg Leu Glu
165 170 175
Cys Gln Asp Asp Thr Asp Glu Cys Gln Val Tyr Ile Leu Asp Ala Glu
180 185 190
Gly Asn Pro Ile Asn Val Thr Val Asp Thr Val Leu His Arg Asp Gly
195 200 205
Val Ser Met Ile Leu Lys Gln Lys Ser Thr Phe Thr Thr Arg Gln Ile
210 215 220
Lys Ala Ala Cys Leu Leu Ile Lys Asp Asp Lys Asn Asn Pro Glu Ser
225 230 235 240
Val Thr Arg Glu His Cys Leu Ile Asp Asn Asp Ile Tyr Asp Leu Ser
245 250 255
Lys Asn Thr Trp Asn Cys Lys Phe Asn Arg Cys Ile Lys Arg Lys Val
260 265 270
Glu His Arg Val Lys Lys Arg Pro Pro Thr Trp Arg His Asn Val Arg
275 280 285
Ala Lys Tyr Thr Glu Gly Asp Thr Ala Thr Lys Gly Asp Leu Met His
290 295 300
Ile Gln Glu Glu Leu Met Tyr Glu Asn Asp Leu Leu Lys Met Asn Ile
305 310 315 320
Glu Leu Met His Ala His Ile Asn Lys Leu Asn Asn Met Leu His Asp
325 330 335
Leu Ile Val Ser Val Ala Lys Val Asp Glu Arg Leu Ile Gly Asn Leu
340 345 350
Met Asn Asn Ser Val Ser Ser Thr Phe Leu Ser Asp Asp Thr Phe Leu
355 360 365
Leu Met Pro Cys Thr Asn Pro Pro Ala His Thr Ser Asn Cys Tyr Asn
370 375 380
Asn Ser Ile Tyr Lys Glu Gly Arg Trp Val Ala Asn Thr Asp Ser Ser
385 390 395 400
Gln Cys Ile Asp Phe Ser Asn Tyr Lys Glu Leu Ala Ile Asp Asp Asp
405 410 415
Val Glu Phe Trp Ile Pro Thr Ile Gly Asn Thr Thr Tyr His Asp Ser
420 425 430
Trp Lys Asp Ala Ser Gly Trp Ser Phe Ile Ala Gln Gln Lys Ser Asn
435 440 445
Leu Ile Thr Thr Met Glu Asn Thr Lys Phe Gly Gly Val Gly Thr Ser
450 455 460
Leu Ser Asp Ile Thr Ser Met Ala Glu Gly Glu Leu Ala Ala Lys Leu
465 470 475 480
Thr Ser Phe Met Phe Gly His Val Val Asn Phe Val Ile Ile Leu Ile
485 490 495
Val Ile Leu Phe Leu Tyr Cys Met Ile Arg Asn Arg Asn Arg Gln Tyr
500 505 510
<210> 55
<211> 856
<212> PRT
<213> Human immunodeficiency virus 1
<400> 55
Met Arg Val Lys Glu Lys Tyr Gln His Leu Trp Arg Trp Gly Trp Arg
1 5 10 15
Trp Gly Thr Met Leu Leu Gly Met Leu Met Ile Cys Ser Ala Thr Glu
20 25 30
Lys Leu Trp Val Thr Val Tyr Tyr Gly Val Pro Val Trp Lys Glu Ala
35 40 45
Thr Thr Thr Leu Phe Cys Ala Ser Asp Ala Lys Ala Tyr Asp Thr Glu
50 55 60
Val His Asn Val Trp Ala Thr His Ala Cys Val Pro Thr Asp Pro Asn
65 70 75 80
Pro Gln Glu Val Val Leu Val Asn Val Thr Glu Asn Phe Asn Met Trp
85 90 95
Lys Asn Asp Met Val Glu Gln Met His Glu Asp Ile Ile Ser Leu Trp
100 105 110
Asp Gln Ser Leu Lys Pro Cys Val Lys Leu Thr Pro Leu Cys Val Ser
115 120 125
Leu Lys Cys Thr Asp Leu Lys Asn Asp Thr Asn Thr Asn Ser Ser Ser
130 135 140
Gly Arg Met Ile Met Glu Lys Gly Glu Ile Lys Asn Cys Ser Phe Asn
145 150 155 160
Ile Ser Thr Ser Ile Arg Gly Lys Val Gln Lys Glu Tyr Ala Phe Phe
165 170 175
Tyr Lys Leu Asp Ile Ile Pro Ile Asp Asn Asp Thr Thr Ser Tyr Lys
180 185 190
Leu Thr Ser Cys Asn Thr Ser Val Ile Thr Gln Ala Cys Pro Lys Val
195 200 205
Ser Phe Glu Pro Ile Pro Ile His Tyr Cys Ala Pro Ala Gly Phe Ala
210 215 220
Ile Leu Lys Cys Asn Asn Lys Thr Phe Asn Gly Thr Gly Pro Cys Thr
225 230 235 240
Asn Val Ser Thr Val Gln Cys Thr His Gly Ile Arg Pro Val Val Ser
245 250 255
Thr Gln Leu Leu Leu Asn Gly Ser Leu Ala Glu Glu Glu Val Val Ile
260 265 270
Arg Ser Val Asn Phe Thr Asp Asn Ala Lys Thr Ile Ile Val Gln Leu
275 280 285
Asn Thr Ser Val Glu Ile Asn Cys Thr Arg Pro Asn Asn Asn Thr Arg
290 295 300
Lys Arg Ile Arg Ile Gln Arg Gly Pro Gly Arg Ala Phe Val Thr Ile
305 310 315 320
Gly Lys Ile Gly Asn Met Arg Gln Ala His Cys Asn Ile Ser Arg Ala
325 330 335
Lys Trp Asn Asn Thr Leu Lys Gln Ile Ala Ser Lys Leu Arg Glu Gln
340 345 350
Phe Gly Asn Asn Lys Thr Ile Ile Phe Lys Gln Ser Ser Gly Gly Asp
355 360 365
Pro Glu Ile Val Thr His Ser Phe Asn Cys Gly Gly Glu Phe Phe Tyr
370 375 380
Cys Asn Ser Thr Gln Leu Phe Asn Ser Thr Trp Phe Asn Ser Thr Trp
385 390 395 400
Ser Thr Glu Gly Ser Asn Asn Thr Glu Gly Ser Asp Thr Ile Thr Leu
405 410 415
Pro Cys Arg Ile Lys Gln Ile Ile Asn Met Trp Gln Lys Val Gly Lys
420 425 430
Ala Met Tyr Ala Pro Pro Ile Ser Gly Gln Ile Arg Cys Ser Ser Asn
435 440 445
Ile Thr Gly Leu Leu Leu Thr Arg Asp Gly Gly Asn Ser Asn Asn Glu
450 455 460
Ser Glu Ile Phe Arg Pro Gly Gly Gly Asp Met Arg Asp Asn Trp Arg
465 470 475 480
Ser Glu Leu Tyr Lys Tyr Lys Val Val Lys Ile Glu Pro Leu Gly Val
485 490 495
Ala Pro Thr Lys Ala Lys Arg Arg Val Val Gln Arg Glu Lys Arg Ala
500 505 510
Val Gly Ile Gly Ala Leu Phe Leu Gly Phe Leu Gly Ala Ala Gly Ser
515 520 525
Thr Met Gly Ala Ala Ser Met Thr Leu Thr Val Gln Ala Arg Gln Leu
530 535 540
Leu Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu Leu Arg Ala Ile Glu
545 550 555 560
Ala Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp Gly Ile Lys Gln Leu
565 570 575
Gln Ala Arg Ile Leu Ala Val Glu Arg Tyr Leu Lys Asp Gln Gln Leu
580 585 590
Leu Gly Ile Trp Gly Cys Ser Gly Lys Leu Ile Cys Thr Thr Ala Val
595 600 605
Pro Trp Asn Ala Ser Trp Ser Asn Lys Ser Leu Glu Gln Ile Trp Asn
610 615 620
His Thr Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr Ser
625 630 635 640
Leu Ile His Ser Leu Ile Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys Asn
645 650 655
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660 665 670
Phe Asn Ile Thr Asn Trp Leu Trp Tyr Ile Lys Leu Phe Ile Met Ile
675 680 685
Val Gly Gly Leu Val Gly Leu Arg Ile Val Phe Ala Val Leu Ser Ile
690 695 700
Val Asn Arg Val Arg Gln Gly Tyr Ser Pro Leu Ser Phe Gln Thr His
705 710 715 720
Leu Pro Thr Pro Arg Gly Pro Asp Arg Pro Glu Gly Ile Glu Glu Glu
725 730 735
Gly Gly Glu Arg Asp Arg Asp Arg Ser Ile Arg Leu Val Asn Gly Ser
740 745 750
Leu Ala Leu Ile Trp Asp Asp Leu Arg Ser Leu Cys Leu Phe Ser Tyr
755 760 765
His Arg Leu Arg Asp Leu Leu Leu Ile Val Thr Arg Ile Val Glu Leu
770 775 780
Leu Gly Arg Arg Gly Trp Glu Ala Leu Lys Tyr Trp Trp Asn Leu Leu
785 790 795 800
Gln Tyr Trp Ser Gln Glu Leu Lys Asn Ser Ala Val Ser Leu Leu Asn
805 810 815
Ala Thr Ala Ile Ala Val Ala Glu Gly Thr Asp Arg Val Ile Glu Val
820 825 830
Val Gln Gly Ala Cys Arg Ala Ile Arg His Ile Pro Arg Arg Ile Arg
835 840 845
Gln Gly Leu Glu Arg Ile Leu Leu
850 855
<210> 56
<211> 564
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Description of Unknown:
Endogenous feline virus sequence
<400> 56
Met Lys Leu Pro Thr Gly Met Val Ile Leu Cys Ser Leu Ile Ile Val
1 5 10 15
Arg Ala Gly Phe Asp Asp Pro Arg Lys Ala Ile Ala Leu Val Gln Lys
20 25 30
Gln His Gly Lys Pro Cys Glu Cys Ser Gly Gly Gln Val Ser Glu Ala
35 40 45
Pro Pro Asn Ser Ile Gln Gln Val Thr Cys Pro Gly Lys Thr Ala Tyr
50 55 60
Leu Met Thr Asn Gln Lys Trp Lys Cys Arg Val Thr Pro Lys Ile Ser
65 70 75 80
Pro Ser Gly Gly Glu Leu Gln Asn Cys Pro Cys Asn Thr Phe Gln Asp
85 90 95
Ser Met His Ser Ser Cys Tyr Thr Glu Tyr Arg Gln Cys Arg Arg Ile
100 105 110
Asn Lys Thr Tyr Tyr Thr Ala Thr Leu Leu Lys Ile Arg Ser Gly Ser
115 120 125
Leu Asn Glu Val Gln Ile Leu Gln Asn Pro Asn Gln Leu Leu Gln Ser
130 135 140
Pro Cys Arg Gly Ser Ile Asn Gln Pro Val Cys Trp Ser Ala Thr Ala
145 150 155 160
Pro Ile His Ile Ser Asp Gly Gly Gly Pro Leu Asp Thr Lys Arg Val
165 170 175
Trp Thr Val Gln Lys Arg Leu Glu Gln Ile His Lys Ala Met Thr Pro
180 185 190
Glu Leu Gln Tyr His Pro Leu Ala Leu Pro Lys Val Arg Asp Asp Leu
195 200 205
Ser Leu Asp Ala Arg Thr Phe Asp Ile Leu Asn Thr Thr Phe Arg Leu
210 215 220
Leu Gln Met Ser Asn Phe Ser Leu Ala Gln Asp Cys Trp Leu Cys Leu
225 230 235 240
Lys Leu Gly Thr Pro Thr Pro Leu Ala Ile Pro Thr Pro Ser Leu Thr
245 250 255
Tyr Ser Leu Ala Asp Ser Leu Ala Asn Ala Ser Cys Gln Ile Ile Pro
260 265 270
Pro Leu Leu Val Gln Pro Met Gln Phe Ser Asn Ser Ser Cys Leu Ser
275 280 285
Ser Pro Phe Ile Asn Asp Thr Glu Gln Ile Asp Leu Gly Ala Val Thr
290 295 300
Phe Thr Asn Cys Thr Ser Val Ala Asn Val Ser Ser Pro Leu Cys Ala
305 310 315 320
Leu Asn Gly Ser Val Phe Leu Cys Gly Asn Asn Met Ala Tyr Thr Tyr
325 330 335
Leu Pro Gln Asn Trp Thr Arg Leu Cys Val Gln Ala Ser Leu Leu Pro
340 345 350
Asp Ile Asp Ile Asn Pro Gly Asp Glu Pro Val Pro Ile Pro Ala Ile
355 360 365
Asp His Tyr Ile His Arg Pro Lys Arg Ala Val Gln Phe Ile Pro Leu
370 375 380
Leu Ala Gly Leu Gly Ile Thr Ala Ala Phe Thr Thr Gly Ala Thr Gly
385 390 395 400
Leu Gly Val Ser Val Thr Gln Tyr Thr Lys Leu Ser His Gln Leu Ile
405 410 415
Ser Asp Val Gln Val Leu Ser Gly Thr Ile Gln Asp Leu Gln Asp Gln
420 425 430
Val Asp Ser Leu Ala Glu Val Val Leu Gln Asn Arg Arg Gly Leu Asp
435 440 445
Leu Leu Thr Ala Glu Gln Gly Gly Ile Cys Leu Ala Leu Gln Glu Lys
450 455 460
Cys Cys Phe Tyr Ala Asn Lys Ser Gly Ile Val Arg Asn Lys Ile Arg
465 470 475 480
Thr Leu Gln Glu Glu Leu Gln Lys Arg Arg Glu Ser Leu Ala Thr Asn
485 490 495
Pro Leu Trp Thr Gly Leu Gln Gly Phe Leu Pro Tyr Leu Leu Pro Leu
500 505 510
Leu Gly Pro Leu Leu Thr Leu Leu Leu Ile Leu Thr Ile Gly Pro Cys
515 520 525
Val Phe Ser Arg Leu Met Ala Phe Ile Asn Asp Arg Leu Asn Val Val
530 535 540
His Ala Met Val Leu Ala Gln Gln Tyr Gln Ala Leu Lys Ala Glu Glu
545 550 555 560
Glu Ala Gln Asp
<210> 57
<211> 229
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 57
Met Ser Pro Val Lys Gly Gly Thr Lys Cys Ile Lys Tyr Leu Leu Phe
1 5 10 15
Gly Phe Asn Phe Ile Phe Trp Leu Ala Gly Ile Ala Val Leu Ala Ile
20 25 30
Gly Leu Trp Leu Arg Phe Asp Ser Gln Thr Lys Ser Ile Phe Glu Gln
35 40 45
Glu Thr Asn Asn Asn Asn Ser Ser Phe Tyr Thr Gly Val Tyr Ile Leu
50 55 60
Ile Gly Ala Gly Ala Leu Met Met Leu Val Gly Phe Leu Gly Cys Cys
65 70 75 80
Gly Ala Val Gln Glu Ser Gln Cys Met Leu Gly Leu Phe Phe Gly Phe
85 90 95
Leu Leu Val Ile Phe Ala Ile Glu Ile Ala Ala Ala Ile Trp Gly Tyr
100 105 110
Ser His Lys Asp Glu Val Ile Lys Glu Val Gln Glu Phe Tyr Lys Asp
115 120 125
Thr Tyr Asn Lys Leu Lys Thr Lys Asp Glu Pro Gln Arg Glu Thr Leu
130 135 140
Lys Ala Ile His Tyr Ala Leu Asn Cys Cys Gly Leu Ala Gly Gly Val
145 150 155 160
Glu Gln Phe Ile Ser Asp Ile Cys Pro Lys Lys Asp Val Leu Glu Thr
165 170 175
Phe Thr Val Lys Ser Cys Pro Asp Ala Ile Lys Glu Val Phe Asp Asn
180 185 190
Lys Phe His Ile Ile Gly Ala Val Gly Ile Gly Ile Ala Val Val Met
195 200 205
Ile Phe Gly Met Ile Phe Ser Met Ile Leu Cys Cys Ala Ile Arg Arg
210 215 220
Asn Arg Glu Met Val
225
<210> 58
<211> 238
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 58
Met Ala Val Glu Gly Gly Met Lys Cys Val Lys Phe Leu Leu Tyr Val
1 5 10 15
Leu Leu Leu Ala Phe Cys Ala Cys Ala Val Gly Leu Ile Ala Val Gly
20 25 30
Val Gly Ala Gln Leu Val Leu Ser Gln Thr Ile Ile Gln Gly Ala Thr
35 40 45
Pro Gly Ser Leu Leu Pro Val Val Ile Ile Ala Val Gly Val Phe Leu
50 55 60
Phe Leu Val Ala Phe Val Gly Cys Cys Gly Ala Cys Lys Glu Asn Tyr
65 70 75 80
Cys Leu Met Ile Thr Phe Ala Ile Phe Leu Ser Leu Ile Met Leu Val
85 90 95
Glu Val Ala Ala Ala Ile Ala Gly Tyr Val Phe Arg Asp Lys Val Met
100 105 110
Ser Glu Phe Asn Asn Asn Phe Arg Gln Gln Met Glu Asn Tyr Pro Lys
115 120 125
Asn Asn His Thr Ala Ser Ile Leu Asp Arg Met Gln Ala Asp Phe Lys
130 135 140
Cys Cys Gly Ala Ala Asn Tyr Thr Asp Trp Glu Lys Ile Pro Ser Met
145 150 155 160
Ser Lys Asn Arg Val Pro Asp Ser Cys Cys Ile Asn Val Thr Val Gly
165 170 175
Cys Gly Ile Asn Phe Asn Glu Lys Ala Ile His Lys Glu Gly Cys Val
180 185 190
Glu Lys Ile Gly Gly Trp Leu Arg Lys Asn Val Leu Val Val Ala Ala
195 200 205
Ala Ala Leu Gly Ile Ala Phe Val Glu Val Leu Gly Ile Val Phe Ala
210 215 220
Cys Cys Leu Val Lys Ser Ile Arg Ser Gly Tyr Glu Val Met
225 230 235
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 59
Met Gly Val Glu Gly Cys Thr Lys Cys Ile Lys Tyr Leu Leu Phe Val
1 5 10 15
Phe Asn Phe Val Phe Trp Leu Ala Gly Gly Val Ile Leu Gly Val Ala
20 25 30
Leu Trp Leu Arg His Asp Pro Gln Thr Thr Asn Leu Leu Tyr Leu Glu
35 40 45
Leu Gly Asp Lys Pro Ala Pro Asn Thr Phe Tyr Val Gly Ile Tyr Ile
50 55 60
Leu Ile Ala Val Gly Ala Val Met Met Phe Val Gly Phe Leu Gly Cys
65 70 75 80
Tyr Gly Ala Ile Gln Glu Ser Gln Cys Leu Leu Gly Thr Phe Phe Thr
85 90 95
Cys Leu Val Ile Leu Phe Ala Cys Glu Val Ala Ala Gly Ile Trp Gly
100 105 110
Phe Val Asn Lys Asp Gln Ile Ala Lys Asp Val Lys Gln Phe Tyr Asp
115 120 125
Gln Ala Leu Gln Gln Ala Val Val Asp Asp Asp Ala Asn Asn Ala Lys
130 135 140
Ala Val Val Lys Thr Phe His Glu Thr Leu Asp Cys Cys Gly Ser Ser
145 150 155 160
Thr Leu Thr Ala Leu Thr Thr Ser Val Leu Lys Asn Asn Leu Cys Pro
165 170 175
Ser Gly Ser Asn Ile Ile Ser Asn Leu Phe Lys Glu Asp Cys His Gln
180 185 190
Lys Ile Asp Asp Leu Phe Ser Gly Lys Leu Tyr Leu Ile Gly Ile Ala
195 200 205
Ala Ile Val Val Ala Val Ile Met Ile Phe Glu Met Ile Leu Ser Met
210 215 220
Val Leu Cys Cys Gly Ile Arg Asn Ser Ser Val Tyr
225 230 235
<210> 60
<211> 10
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 60
Glu Val Thr Glu Leu Thr Arg Glu Gly Glu
1 5 10
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<211> 21
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 61
Gly Asn Tyr Thr Cys Glu Val Thr Glu Leu Thr Arg Glu Gly Glu Thr
1 5 10 15
Ile Ile Glu Leu Lys
20
<210> 62
<211> 293
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 62
Met Trp Pro Leu Val Ala Ala Leu Leu Leu Gly Ser Ala Cys Cys Gly
1 5 10 15
Ser Ala Gln Leu Leu Phe Asn Lys Thr Lys Ser Val Glu Phe Thr Phe
20 25 30
Cys Asn Asp Thr Val Val Ile Pro Cys Phe Val Thr Asn Met Glu Ala
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50 55 60
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65 70 75 80
Phe Ser Ser Ala Lys Ile Glu Val Ser Gln Leu Leu Lys Gly Asp Ala
85 90 95
Ser Leu Lys Met Asp Lys Ser Asp Ala Val Ser His Thr Gly Asn Tyr
100 105 110
Thr Cys Glu Val Thr Glu Leu Thr Arg Glu Gly Glu Thr Ile Ile Glu
115 120 125
Leu Lys Tyr Arg Val Val Ser Trp Phe Ser Pro Asn Glu Asn Ile Leu
130 135 140
Ile Val Ile Phe Pro Ile Phe Ala Ile Leu Leu Phe Trp Gly Gln Phe
145 150 155 160
Gly Ile Lys Thr Leu Lys Tyr Arg Ser Gly Gly Met Asp Glu Lys Thr
165 170 175
Ile Ala Leu Leu Val Ala Gly Leu Val Ile Thr Val Ile Val Ile Val
180 185 190
Gly Ala Ile Leu Phe Val Pro Gly Glu Tyr Ser Leu Lys Asn Ala Thr
195 200 205
Gly Leu Gly Leu Ile Val Thr Ser Thr Gly Ile Leu Ile Leu Leu His
210 215 220
Tyr Tyr Val Phe Ser Thr Ala Ile Gly Leu Thr Ser Phe Val Ile Ala
225 230 235 240
Ile Leu Val Ile Gln Val Ile Ala Tyr Ile Leu Ala Val Val Gly Leu
245 250 255
Ser Leu Cys Ile Ala Ala Cys Ile Pro Met His Gly Pro Leu Leu Ile
260 265 270
Ser Gly Leu Ser Ile Leu Ala Leu Ala Gln Leu Leu Gly Leu Val Tyr
275 280 285
Met Lys Phe Val Glu
290
<210> 63
<211> 397
<212> PRT
<213> Adeno-associated virus 2
<400> 63
Met Glu Leu Val Gly Trp Leu Val Asp Lys Gly Ile Thr Ser Glu Lys
1 5 10 15
Gln Trp Ile Gln Glu Asp Gln Ala Ser Tyr Ile Ser Phe Asn Ala Ala
20 25 30
Ser Asn Ser Arg Ser Gln Ile Lys Ala Ala Leu Asp Asn Ala Gly Lys
35 40 45
Ile Met Ser Leu Thr Lys Thr Ala Pro Asp Tyr Leu Val Gly Gln Gln
50 55 60
Pro Val Glu Asp Ile Ser Ser Asn Arg Ile Tyr Lys Ile Leu Glu Leu
65 70 75 80
Asn Gly Tyr Asp Pro Gln Tyr Ala Ala Ser Val Phe Leu Gly Trp Ala
85 90 95
Thr Lys Lys Phe Gly Lys Arg Asn Thr Ile Trp Leu Phe Gly Pro Ala
100 105 110
Thr Thr Gly Lys Thr Asn Ile Ala Glu Ala Ile Ala His Thr Val Pro
115 120 125
Phe Tyr Gly Cys Val Asn Trp Thr Asn Glu Asn Phe Pro Phe Asn Asp
130 135 140
Cys Val Asp Lys Met Val Ile Trp Trp Glu Glu Gly Lys Met Thr Ala
145 150 155 160
Lys Val Val Glu Ser Ala Lys Ala Ile Leu Gly Gly Ser Lys Val Arg
165 170 175
Val Asp Gln Lys Cys Lys Ser Ser Ala Gln Ile Asp Pro Thr Pro Val
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Ile Val Thr Ser Asn Thr Asn Met Cys Ala Val Ile Asp Gly Asn Ser
195 200 205
Thr Thr Phe Glu His Gln Gln Pro Leu Gln Asp Arg Met Phe Lys Phe
210 215 220
Glu Leu Thr Arg Arg Leu Asp His Asp Phe Gly Lys Val Thr Lys Gln
225 230 235 240
Glu Val Lys Asp Phe Phe Arg Trp Ala Lys Asp His Val Val Glu Val
245 250 255
Glu His Glu Phe Tyr Val Lys Lys Gly Gly Ala Lys Lys Arg Pro Ala
260 265 270
Pro Ser Asp Ala Asp Ile Ser Glu Pro Lys Arg Val Arg Glu Ser Val
275 280 285
Ala Gln Pro Ser Thr Ser Asp Ala Glu Ala Ser Ile Asn Tyr Ala Asp
290 295 300
Arg Tyr Gln Asn Lys Cys Ser Arg His Val Gly Met Asn Leu Met Leu
305 310 315 320
Phe Pro Cys Arg Gln Cys Glu Arg Met Asn Gln Asn Ser Asn Ile Cys
325 330 335
Phe Thr His Gly Gln Lys Asp Cys Leu Glu Cys Phe Pro Val Ser Glu
340 345 350
Ser Gln Pro Val Ser Val Val Lys Lys Ala Tyr Gln Lys Leu Cys Tyr
355 360 365
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370 375 380
Leu Val Asn Val Asp Leu Asp Asp Cys Ile Phe Glu Gln
385 390 395
<210> 64
<211> 621
<212> PRT
<213> Adeno-associated virus 2
<400> 64
Met Pro Gly Phe Tyr Glu Ile Val Ile Lys Val Pro Ser Asp Leu Asp
1 5 10 15
Glu His Leu Pro Gly Ile Ser Asp Ser Phe Val Asn Trp Val Ala Glu
20 25 30
Lys Glu Trp Glu Leu Pro Pro Asp Ser Asp Met Asp Leu Asn Leu Ile
35 40 45
Glu Gln Ala Pro Leu Thr Val Ala Glu Lys Leu Gln Arg Asp Phe Leu
50 55 60
Thr Glu Trp Arg Arg Val Ser Lys Ala Pro Glu Ala Leu Phe Phe Val
65 70 75 80
Gln Phe Glu Lys Gly Glu Ser Tyr Phe His Met His Val Leu Val Glu
85 90 95
Thr Thr Gly Val Lys Ser Met Val Leu Gly Arg Phe Leu Ser Gln Ile
100 105 110
Arg Glu Lys Leu Ile Gln Arg Ile Tyr Arg Gly Ile Glu Pro Thr Leu
115 120 125
Pro Asn Trp Phe Ala Val Thr Lys Thr Arg Asn Gly Ala Gly Gly Gly
130 135 140
Asn Lys Val Val Asp Glu Cys Tyr Ile Pro Asn Tyr Leu Leu Pro Lys
145 150 155 160
Thr Gln Pro Glu Leu Gln Trp Ala Trp Thr Asn Met Glu Gln Tyr Leu
165 170 175
Ser Ala Cys Leu Asn Leu Thr Glu Arg Lys Arg Leu Val Ala Gln His
180 185 190
Leu Thr His Val Ser Gln Thr Gln Glu Gln Asn Lys Glu Asn Gln Asn
195 200 205
Pro Asn Ser Asp Ala Pro Val Ile Arg Ser Lys Thr Ser Ala Arg Tyr
210 215 220
Met Glu Leu Val Gly Trp Leu Val Asp Lys Gly Ile Thr Ser Glu Lys
225 230 235 240
Gln Trp Ile Gln Glu Asp Gln Ala Ser Tyr Ile Ser Phe Asn Ala Ala
245 250 255
Ser Asn Ser Arg Ser Gln Ile Lys Ala Ala Leu Asp Asn Ala Gly Lys
260 265 270
Ile Met Ser Leu Thr Lys Thr Ala Pro Asp Tyr Leu Val Gly Gln Gln
275 280 285
Pro Val Glu Asp Ile Ser Ser Asn Arg Ile Tyr Lys Ile Leu Glu Leu
290 295 300
Asn Gly Tyr Asp Pro Gln Tyr Ala Ala Ser Val Phe Leu Gly Trp Ala
305 310 315 320
Thr Lys Lys Phe Gly Lys Arg Asn Thr Ile Trp Leu Phe Gly Pro Ala
325 330 335
Thr Thr Gly Lys Thr Asn Ile Ala Glu Ala Ile Ala His Thr Val Pro
340 345 350
Phe Tyr Gly Cys Val Asn Trp Thr Asn Glu Asn Phe Pro Phe Asn Asp
355 360 365
Cys Val Asp Lys Met Val Ile Trp Trp Glu Glu Gly Lys Met Thr Ala
370 375 380
Lys Val Val Glu Ser Ala Lys Ala Ile Leu Gly Gly Ser Lys Val Arg
385 390 395 400
Val Asp Gln Lys Cys Lys Ser Ser Ala Gln Ile Asp Pro Thr Pro Val
405 410 415
Ile Val Thr Ser Asn Thr Asn Met Cys Ala Val Ile Asp Gly Asn Ser
420 425 430
Thr Thr Phe Glu His Gln Gln Pro Leu Gln Asp Arg Met Phe Lys Phe
435 440 445
Glu Leu Thr Arg Arg Leu Asp His Asp Phe Gly Lys Val Thr Lys Gln
450 455 460
Glu Val Lys Asp Phe Phe Arg Trp Ala Lys Asp His Val Val Glu Val
465 470 475 480
Glu His Glu Phe Tyr Val Lys Lys Gly Gly Ala Lys Lys Arg Pro Ala
485 490 495
Pro Ser Asp Ala Asp Ile Ser Glu Pro Lys Arg Val Arg Glu Ser Val
500 505 510
Ala Gln Pro Ser Thr Ser Asp Ala Glu Ala Ser Ile Asn Tyr Ala Asp
515 520 525
Arg Tyr Gln Asn Lys Cys Ser Arg His Val Gly Met Asn Leu Met Leu
530 535 540
Phe Pro Cys Arg Gln Cys Glu Arg Met Asn Gln Asn Ser Asn Ile Cys
545 550 555 560
Phe Thr His Gly Gln Lys Asp Cys Leu Glu Cys Phe Pro Val Ser Glu
565 570 575
Ser Gln Pro Val Ser Val Val Lys Lys Ala Tyr Gln Lys Leu Cys Tyr
580 585 590
Ile His His Ile Met Gly Lys Val Pro Asp Ala Cys Thr Ala Cys Asp
595 600 605
Leu Val Asn Val Asp Leu Asp Asp Cys Ile Phe Glu Gln
610 615 620
<210> 65
<211> 735
<212> PRT
<213> Adeno-associated virus 2
<400> 65
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Thr Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Gln Trp Trp Lys Leu Lys Pro Gly Pro Pro Pro Pro
20 25 30
Lys Pro Ala Glu Arg His Lys Asp Asp Ser Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Phe Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Glu Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Arg Gln Leu Asp Ser Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Lys Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Lys Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Val Leu Glu Pro
115 120 125
Leu Gly Leu Val Glu Glu Pro Val Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
130 135 140
Pro Val Glu His Ser Pro Val Glu Pro Asp Ser Ser Ser Gly Thr Gly
145 150 155 160
Lys Ala Gly Gln Gln Pro Ala Arg Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln Thr
165 170 175
Gly Asp Ala Asp Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Leu Gly Gln Pro Pro
180 185 190
Ala Ala Pro Ser Gly Leu Gly Thr Asn Thr Met Ala Thr Gly Ser Gly
195 200 205
Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala Asp Gly Val Gly Asn Ser
210 215 220
Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp Met Gly Asp Arg Val Ile
225 230 235 240
Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His Leu
245 250 255
Tyr Lys Gln Ile Ser Ser Gln Ser Gly Ala Ser Asn Asp Asn His Tyr
260 265 270
Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe Asp Phe Asn Arg Phe His
275 280 285
Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg Leu Ile Asn Asn Asn Trp
290 295 300
Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys Leu Phe Asn Ile Gln Val
305 310 315 320
Lys Glu Val Thr Gln Asn Asp Gly Thr Thr Thr Ile Ala Asn Asn Leu
325 330 335
Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Thr Asp Ser Glu Tyr Gln Leu Pro Tyr
340 345 350
Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro Ala Asp
355 360 365
Val Phe Met Val Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn Asn Gly Ser
370 375 380
Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe Pro Ser
385 390 395 400
Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Thr Phe Ser Tyr Thr Phe Glu
405 410 415
Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu Asp Arg
420 425 430
Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr
435 440 445
Asn Thr Pro Ser Gly Thr Thr Thr Gln Ser Arg Leu Gln Phe Ser Gln
450 455 460
Ala Gly Ala Ser Asp Ile Arg Asp Gln Ser Arg Asn Trp Leu Pro Gly
465 470 475 480
Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys Thr Ser Ala Asp Asn Asn
485 490 495
Asn Ser Glu Tyr Ser Trp Thr Gly Ala Thr Lys Tyr His Leu Asn Gly
500 505 510
Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Pro Ala Met Ala Ser His Lys Asp
515 520 525
Asp Glu Glu Lys Phe Phe Pro Gln Ser Gly Val Leu Ile Phe Gly Lys
530 535 540
Gln Gly Ser Glu Lys Thr Asn Val Asp Ile Glu Lys Val Met Ile Thr
545 550 555 560
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565 570 575
Gly Ser Val Ser Thr Asn Leu Gln Arg Gly Asn Arg Gln Ala Ala Thr
580 585 590
Ala Asp Val Asn Thr Gln Gly Val Leu Pro Gly Met Val Trp Gln Asp
595 600 605
Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro His Thr
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Asp Gly His Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe Gly Leu Lys
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Pro Ser Thr Thr Phe Ser Ala Ala Lys Phe Ala Ser Phe Ile Thr Gln
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Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln Lys
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Asn Lys Ser Val Asn Val Asp Phe Thr Val Asp Thr Asn Gly Val Tyr
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Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
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<210> 66
<211> 597
<212> PRT
<213> Adeno-associated virus 2
<400> 66
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Ser Ser Ser Gly Thr Gly Lys Ala Gly Gln Gln Pro Ala Arg Lys Arg
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Thr Tyr Asn Asn His Leu Tyr Lys Gln Ile Ser Ser Gln Ser Gly Ala
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Leu Ile Asn Asn Asn Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys
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Thr Ile Ala Asn Asn Leu Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Thr Asp Ser
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275 280 285
Ser Gln Ser Leu Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu
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Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr Asn Thr Pro Ser Gly Thr Thr Thr Gln Ser
305 310 315 320
Arg Leu Gln Phe Ser Gln Ala Gly Ala Ser Asp Ile Arg Asp Gln Ser
325 330 335
Arg Asn Trp Leu Pro Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys
340 345 350
Thr Ser Ala Asp Asn Asn Asn Ser Glu Tyr Ser Trp Thr Gly Ala Thr
355 360 365
Lys Tyr His Leu Asn Gly Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Pro Ala
370 375 380
Met Ala Ser His Lys Asp Asp Glu Glu Lys Phe Phe Pro Gln Ser Gly
385 390 395 400
Val Leu Ile Phe Gly Lys Gln Gly Ser Glu Lys Thr Asn Val Asp Ile
405 410 415
Glu Lys Val Met Ile Thr Asp Glu Glu Glu Ile Arg Thr Thr Asn Pro
420 425 430
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435 440 445
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Gly Met Val Trp Gln Asp Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp
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515 520 525
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595
<210> 67
<211> 533
<212> PRT
<213> Adeno-associated virus 2
<400> 67
Met Ala Thr Gly Ser Gly Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala
1 5 10 15
Asp Gly Val Gly Asn Ser Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp
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65 70 75 80
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100 105 110
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130 135 140
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145 150 155 160
Pro Pro Phe Pro Ala Asp Val Phe Met Val Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu
165 170 175
Thr Leu Asn Asn Gly Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys
180 185 190
Leu Glu Tyr Phe Pro Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Thr
195 200 205
Phe Ser Tyr Thr Phe Glu Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His
210 215 220
Ser Gln Ser Leu Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu
225 230 235 240
Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr Asn Thr Pro Ser Gly Thr Thr Thr Gln Ser
245 250 255
Arg Leu Gln Phe Ser Gln Ala Gly Ala Ser Asp Ile Arg Asp Gln Ser
260 265 270
Arg Asn Trp Leu Pro Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys
275 280 285
Thr Ser Ala Asp Asn Asn Asn Ser Glu Tyr Ser Trp Thr Gly Ala Thr
290 295 300
Lys Tyr His Leu Asn Gly Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Pro Ala
305 310 315 320
Met Ala Ser His Lys Asp Asp Glu Glu Lys Phe Phe Pro Gln Ser Gly
325 330 335
Val Leu Ile Phe Gly Lys Gln Gly Ser Glu Lys Thr Asn Val Asp Ile
340 345 350
Glu Lys Val Met Ile Thr Asp Glu Glu Glu Ile Arg Thr Thr Asn Pro
355 360 365
Val Ala Thr Glu Gln Tyr Gly Ser Val Ser Thr Asn Leu Gln Arg Gly
370 375 380
Asn Arg Gln Ala Ala Thr Ala Asp Val Asn Thr Gln Gly Val Leu Pro
385 390 395 400
Gly Met Val Trp Gln Asp Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp
405 410 415
Ala Lys Ile Pro His Thr Asp Gly His Phe His Pro Ser Pro Leu Met
420 425 430
Gly Gly Phe Gly Leu Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn
435 440 445
Thr Pro Val Pro Ala Asn Pro Ser Thr Thr Phe Ser Ala Ala Lys Phe
450 455 460
Ala Ser Phe Ile Thr Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile
465 470 475 480
Glu Trp Glu Leu Gln Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile
485 490 495
Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr Asn Lys Ser Val Asn Val Asp Phe Thr Val
500 505 510
Asp Thr Asn Gly Val Tyr Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr
515 520 525
Leu Thr Arg Asn Leu
530
<210> 68
<211> 252
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 68
Glu Gln Lys Leu Ile Ser Glu Glu Asp Leu Asp Ile Gln Met Thr Gln
1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser
20 25 30
Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln
35 40 45
Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu
50 55 60
His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
65 70 75 80
Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr
85 90 95
Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr
100 105 110
Lys Leu Glu Ile Thr Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
115 120 125
Gly Gly Gly Ser Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val
130 135 140
Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser
145 150 155 160
Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly
165 170 175
Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn
180 185 190
Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser
195 200 205
Gln Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile
210 215 220
Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp
225 230 235 240
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
245 250
<210> 69
<211> 110
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 69
Phe Lys Cys Glu His Cys Arg Ile Leu Phe Leu Asp His Val Met Phe
1 5 10 15
Thr Ile His Met Gly Cys His Gly Phe Arg Asp Pro Phe Lys Cys Asn
20 25 30
Met Cys Gly Glu Lys Cys Asp Gly Pro Val Gly Leu Phe Val His Met
35 40 45
Ala Arg Asn Ala His Gly Glu Lys Pro Phe Tyr Cys Glu His Cys Glu
50 55 60
Ile Thr Phe Arg Asp Val Val Met Tyr Ser Leu His Lys Gly Tyr His
65 70 75 80
Gly Phe Arg Asp Pro Phe Glu Cys Asn Ile Cys Gly Tyr His Ser Gln
85 90 95
Asp Arg Tyr Glu Phe Ser Ser His Ile Val Arg Gly Glu His
100 105 110
<210> 70
<211> 110
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 70
His His Cys Gln His Cys Asp Met Tyr Phe Ala Asp Asn Ile Leu Tyr
1 5 10 15
Thr Ile His Met Gly Cys His Ser Cys Asp Asp Val Phe Lys Cys Asn
20 25 30
Met Cys Gly Glu Lys Cys Asp Gly Pro Val Gly Leu Phe Val His Met
35 40 45
Ala Arg Asn Ala His Gly Glu Lys Pro Thr Lys Cys Val His Cys Gly
50 55 60
Ile Val Phe Leu Asp Glu Val Met Tyr Ala Leu His Met Ser Cys His
65 70 75 80
Gly Phe Arg Asp Pro Phe Glu Cys Asn Ile Cys Gly Tyr His Ser Gln
85 90 95
Asp Arg Tyr Glu Phe Ser Ser His Ile Val Arg Gly Glu His
100 105 110
<210> 71
<211> 110
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 71
Met Gly Arg Gly Val Gln Val Glu Thr Ile Ser Pro Gly Asp Gly Arg
1 5 10 15
Thr Phe Pro Lys Arg Gly Gln Thr Cys Val Val His Tyr Thr Gly Met
20 25 30
Leu Glu Asp Gly Lys Lys Phe Asp Ser Ser Arg Asp Arg Asn Lys Pro
35 40 45
Phe Lys Phe Met Leu Gly Lys Gln Glu Val Ile Arg Gly Trp Glu Glu
50 55 60
Gly Val Ala Gln Met Ser Val Gly Gln Arg Ala Lys Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Pro Asp Tyr Ala Tyr Gly Ala Thr Gly His Pro Gly Ile Ile Pro Pro
85 90 95
His Ala Thr Leu Val Phe Asp Val Glu Leu Leu Lys Leu Glu
100 105 110
<210> 72
<211> 111
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 72
Met Ala Ser Arg Gly Val Gln Val Glu Thr Ile Ser Pro Gly Asp Gly
1 5 10 15
Arg Thr Phe Pro Lys Arg Gly Gln Thr Cys Val Val His Tyr Thr Gly
20 25 30
Met Leu Glu Asp Gly Lys Lys Val Asp Ser Ser Arg Asp Arg Asn Lys
35 40 45
Pro Phe Lys Phe Met Leu Gly Lys Gln Glu Val Ile Arg Gly Trp Glu
50 55 60
Glu Gly Val Ala Gln Met Ser Val Gly Gln Arg Ala Lys Leu Thr Ile
65 70 75 80
Ser Pro Asp Tyr Ala Tyr Gly Ala Thr Gly His Pro Gly Ile Ile Pro
85 90 95
Pro His Ala Thr Leu Val Phe Asp Val Glu Leu Leu Lys Leu Glu
100 105 110
<210> 73
<211> 97
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 73
Met Gly Ser Arg Ile Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Glu
1 5 10 15
Glu Ala Ser Arg Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe
20 25 30
Glu Val Leu Glu Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr
35 40 45
Leu Lys Glu Thr Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu
50 55 60
Ala Gln Glu Trp Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp
65 70 75 80
Leu Leu Gln Ala Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser
85 90 95
Lys
<210> 74
<211> 108
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 74
Met Gly Val Gln Val Glu Thr Ile Ser Pro Gly Asp Gly Arg Thr Phe
1 5 10 15
Pro Lys Arg Gly Gln Thr Cys Val Val His Tyr Thr Gly Met Leu Glu
20 25 30
Asp Gly Lys Lys Phe Asp Ser Ser Arg Asp Arg Asn Lys Pro Phe Lys
35 40 45
Phe Met Leu Gly Lys Gln Glu Val Ile Arg Gly Trp Glu Glu Gly Val
50 55 60
Ala Gln Met Ser Val Gly Gln Arg Ala Lys Leu Thr Ile Ser Pro Asp
65 70 75 80
Tyr Ala Tyr Gly Ala Thr Gly His Pro Gly Ile Ile Pro Pro His Ala
85 90 95
Thr Leu Val Phe Asp Val Glu Leu Leu Lys Leu Glu
100 105
<210> 75
<211> 93
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 75
Gln Gly Met Leu Glu Met Trp His Glu Gly Leu Glu Glu Ala Ser Arg
1 5 10 15
Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu Glu
20 25 30
Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu Thr
35 40 45
Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu Trp
50 55 60
Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Leu Gln Ala
65 70 75 80
Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys
85 90
<210> 76
<211> 277
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 76
Met Gly Pro Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala
1 5 10 15
Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala
20 25 30
Val Thr Thr Ser Asn Tyr Ala Ser Trp Val Gln Glu Lys Pro Gly Lys
35 40 45
Leu Phe Lys Gly Leu Ile Gly Gly Thr Asn Asn Arg Ala Pro Gly Val
50 55 60
Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Leu Ile Gly Asp Lys Ala Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Leu
85 90 95
Trp Tyr Ser Asn His Trp Val Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Leu
100 105 110
Lys Arg Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
115 120 125
Ser Ser Gly Gly Gly Ser Glu Val Lys Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly
130 135 140
Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly
145 150 155 160
Phe Ser Leu Thr Asp Tyr Gly Val Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly
165 170 175
Arg Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Asp Gly Ile Thr Asp
180 185 190
Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Asp Arg Phe Ile Ile Ser Lys Asp Asn Gly
195 200 205
Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gln Met Ser Lys Val Arg Ser Asp Asp Thr
210 215 220
Ala Leu Tyr Tyr Cys Val Thr Gly Leu Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
225 230 235 240
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala
245 250 255
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
260 265 270
Gly Gly Gly Gly Ser
275
<210> 77
<211> 237
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 77
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
1 5 10 15
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
20 25 30
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
50 55 60
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
65 70 75 80
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
85 90 95
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
100 105 110
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
115 120 125
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
130 135 140
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
145 150 155 160
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
165 170 175
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
180 185 190
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
195 200 205
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
210 215 220
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser
225 230 235
<210> 78
<211> 573
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 78
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
1 5 10 15
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
20 25 30
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
50 55 60
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
65 70 75 80
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
85 90 95
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
100 105 110
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
115 120 125
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
130 135 140
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
145 150 155 160
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
165 170 175
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
180 185 190
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
195 200 205
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
210 215 220
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
225 230 235 240
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
245 250 255
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
260 265 270
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
275 280 285
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
290 295 300
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
305 310 315 320
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
325 330 335
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
340 345 350
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
355 360 365
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
370 375 380
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
385 390 395 400
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
405 410 415
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
420 425 430
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
435 440 445
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
450 455 460
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
465 470 475 480
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
485 490 495
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
500 505 510
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly
515 520 525
Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asp Tyr His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg
530 535 540
Leu Lys Lys Gly Ser Gly Ser Gly Glu Glu Leu Leu Ser Lys Asn Tyr
545 550 555 560
His Leu Glu Asn Glu Val Ala Arg Leu Lys Lys Gly Ser
565 570
<210> 79
<211> 114
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 79
Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Ala Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser
1 5 10 15
Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Pro Val Asn Arg Tyr Ser
20 25 30
Met Arg Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Trp Val Ala
35 40 45
Gly Met Ser Ser Ala Gly Asp Arg Ser Ser Tyr Glu Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ala Arg Asn Thr Val Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Ser Asn
85 90 95
Val Asn Val Gly Phe Glu Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val
100 105 110
Ser Ser
<210> 80
<211> 102
<212> PRT
<213> Nostoc commune
<400> 80
Cys Leu Ser Tyr Glu Thr Glu Ile Leu Thr Val Glu Tyr Gly Leu Leu
1 5 10 15
Pro Ile Gly Lys Ile Val Glu Lys Arg Ile Glu Cys Thr Val Tyr Ser
20 25 30
Val Asp Asn Asn Gly Asn Ile Tyr Thr Gln Pro Val Ala Gln Trp His
35 40 45
Asp Arg Gly Glu Gln Glu Val Phe Glu Tyr Cys Leu Glu Asp Gly Ser
50 55 60
Leu Ile Arg Ala Thr Lys Asp His Lys Phe Met Thr Val Asp Gly Gln
65 70 75 80
Met Leu Pro Ile Asp Glu Ile Phe Glu Arg Glu Leu Asp Leu Met Arg
85 90 95
Val Asp Asn Leu Pro Asn
100
<210> 81
<211> 39
<212> PRT
<213> Nostoc commune
<400> 81
Met Ile Lys Ile Ala Thr Arg Lys Tyr Leu Gly Lys Gln Asn Val Tyr
1 5 10 15
Asp Ile Gly Val Glu Arg Asp His Asn Phe Ala Leu Lys Asn Gly Phe
20 25 30
Ile Ala Ser Asn Cys Phe Asn
35
<210> 82
<211> 101
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 82
Cys Leu Ser Tyr Asp Thr Glu Ile Leu Thr Val Glu Tyr Gly Phe Leu
1 5 10 15
Pro Ile Gly Lys Ile Val Glu Glu Arg Ile Glu Cys Thr Val Tyr Thr
20 25 30
Val Asp Lys Asn Gly Phe Val Tyr Thr Gln Pro Ile Ala Gln Trp His
35 40 45
Asn Arg Gly Glu Gln Glu Val Phe Glu Tyr Cys Leu Glu Asp Gly Ser
50 55 60
Ile Ile Arg Ala Thr Lys Asp His Lys Phe Met Thr Thr Asp Gly Gln
65 70 75 80
Met Leu Pro Ile Asp Glu Ile Phe Glu Arg Gly Leu Asp Leu Lys Gln
85 90 95
Val Asp Gly Leu Pro
100
<210> 83
<211> 36
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 83
Met Val Lys Ile Ile Ser Arg Lys Ser Leu Gly Thr Gln Asn Val Tyr
1 5 10 15
Asp Ile Gly Val Glu Lys Asp His Asn Phe Leu Leu Lys Asn Gly Leu
20 25 30
Val Ala Ser Asn
35
<210> 84
<211> 184
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 84
Cys Phe Ala Lys Gly Thr Asn Val Leu Met Ala Asp Gly Ser Ile Glu
1 5 10 15
Cys Ile Glu Asn Ile Glu Val Gly Asn Lys Val Met Gly Lys Asp Gly
20 25 30
Arg Pro Arg Glu Val Ile Lys Leu Pro Arg Gly Arg Glu Thr Met Tyr
35 40 45
Ser Val Val Gln Lys Ser Gln His Arg Ala His Lys Ser Asp Ser Ser
50 55 60
Arg Glu Val Pro Glu Leu Leu Lys Phe Thr Cys Asn Ala Thr His Glu
65 70 75 80
Leu Val Val Arg Thr Pro Arg Ser Val Arg Arg Leu Ser Arg Thr Ile
85 90 95
Lys Gly Val Glu Tyr Phe Glu Val Ile Thr Phe Glu Met Gly Gln Lys
100 105 110
Lys Ala Pro Asp Gly Arg Ile Val Glu Leu Val Lys Glu Val Ser Lys
115 120 125
Ser Tyr Pro Ile Ser Glu Gly Pro Glu Arg Ala Asn Glu Leu Val Glu
130 135 140
Ser Tyr Arg Lys Ala Ser Asn Lys Ala Tyr Phe Glu Trp Thr Ile Glu
145 150 155 160
Ala Arg Asp Leu Ser Leu Leu Gly Ser His Val Arg Lys Ala Thr Tyr
165 170 175
Gln Thr Tyr Ala Pro Ile Leu Tyr
180
<210> 85
<211> 65
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 85
Val Leu Leu Asn Val Leu Ser Lys Cys Ala Gly Ser Lys Lys Phe Arg
1 5 10 15
Pro Ala Pro Ala Ala Ala Phe Ala Arg Glu Cys Arg Gly Phe Tyr Phe
20 25 30
Glu Leu Gln Glu Leu Lys Glu Asp Asp Tyr Tyr Gly Ile Thr Leu Ser
35 40 45
Asp Asp Ser Asp His Gln Phe Leu Leu Ala Asn Gln Val Val Val His
50 55 60
Asn
65
<210> 86
<211> 123
<212> PRT
<213> Synechocystis sp.
<400> 86
Cys Leu Ser Phe Gly Thr Glu Ile Leu Thr Val Glu Tyr Gly Pro Leu
1 5 10 15
Pro Ile Gly Lys Ile Val Ser Glu Glu Ile Asn Cys Ser Val Tyr Ser
20 25 30
Val Asp Pro Glu Gly Arg Val Tyr Thr Gln Ala Ile Ala Gln Trp His
35 40 45
Asp Arg Gly Glu Gln Glu Val Leu Glu Tyr Glu Leu Glu Asp Gly Ser
50 55 60
Val Ile Arg Ala Thr Ser Asp His Arg Phe Leu Thr Thr Asp Tyr Gln
65 70 75 80
Leu Leu Ala Ile Glu Glu Ile Phe Ala Arg Gln Leu Asp Leu Leu Thr
85 90 95
Leu Glu Asn Ile Lys Gln Thr Glu Glu Ala Leu Asp Asn His Arg Leu
100 105 110
Pro Phe Pro Leu Leu Asp Ala Gly Thr Ile Lys
115 120
<210> 87
<211> 36
<212> PRT
<213> Synechocystis sp.
<400> 87
Met Val Lys Val Ile Gly Arg Arg Ser Leu Gly Val Gln Arg Ile Phe
1 5 10 15
Asp Ile Gly Leu Pro Gln Asp His Asn Phe Leu Leu Ala Asn Gly Ala
20 25 30
Ile Ala Ala Asn
35
<210> 88
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide
<400> 88
Val Pro Thr Ile Val Met Val Asp Ala Tyr Lys Arg Tyr Lys
1 5 10
<210> 89
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 89
Met Val Thr Thr Leu Ser Gly Leu Ser Gly Glu Gln Gly Pro Ser Gly
1 5 10 15
Asp Met Thr Thr Glu Glu Asp Ser Ala Thr His Ile Lys Phe Ser Lys
20 25 30
Arg Asp Glu Asp Gly Arg Glu Leu Ala Gly Ala Thr Met Glu Leu Arg
35 40 45
Asp Ser Ser Gly Lys Thr Ile Ser Thr Trp Ile Ser Asp Gly His Val
50 55 60
Lys Asp Phe Tyr Leu Tyr Pro Gly Lys Tyr Thr Phe Val Glu Thr Ala
65 70 75 80
Ala Pro Asp Gly Tyr Glu Val Ala Thr Ala Ile Thr Phe Thr Val Asn
85 90 95
Glu Gln Gly Gln Val Thr Val Asn Gly Glu Ala Thr Lys Gly Asp Ala
100 105 110
His Thr Gly Ser Ser Gly Ser
115
<210> 90
<211> 130
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Description of Unknown:
Enterobacteria phage MS2 sequence
<400> 90
Met Ala Ser Asn Phe Thr Gln Phe Val Leu Val Asp Asn Gly Gly Thr
1 5 10 15
Gly Asp Val Thr Val Ala Pro Ser Asn Phe Ala Asn Gly Val Ala Glu
20 25 30
Trp Ile Ser Ser Asn Ser Arg Ser Gln Ala Tyr Lys Val Thr Cys Ser
35 40 45
Val Arg Gln Ser Ser Ala Gln Asn Arg Lys Tyr Thr Ile Lys Val Glu
50 55 60
Val Pro Lys Val Ala Thr Gln Thr Val Gly Gly Val Glu Leu Pro Val
65 70 75 80
Ala Ala Trp Arg Ser Tyr Leu Asn Met Glu Leu Thr Ile Pro Ile Phe
85 90 95
Ala Thr Asn Ser Asp Cys Glu Leu Ile Val Lys Ala Met Gln Gly Leu
100 105 110
Leu Lys Asp Gly Asn Pro Ile Pro Ser Ala Ile Ala Ala Asn Ser Gly
115 120 125
Ile Tyr
130
<210> 91
<211> 130
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Description of Unknown:
Enterobacteria phage MS2 sequence
<400> 91
Met Ala Ser Asn Phe Thr Gln Phe Val Leu Val Asp Asn Gly Gly Thr
1 5 10 15
Gly Asp Val Thr Val Ala Pro Ser Asn Phe Ala Asn Gly Val Ala Glu
20 25 30
Trp Ile Ser Ser Asn Ser Arg Ser Gln Ala Tyr Lys Val Thr Cys Ser
35 40 45
Val Arg Gln Ser Ser Ala Gln Lys Arg Lys Tyr Thr Ile Lys Val Glu
50 55 60
Val Pro Lys Val Ala Thr Gln Thr Val Gly Gly Val Glu Leu Pro Val
65 70 75 80
Ala Ala Trp Arg Ser Tyr Leu Asn Met Glu Leu Thr Ile Pro Ile Phe
85 90 95
Ala Thr Asn Ser Asp Cys Glu Leu Ile Val Lys Ala Met Gln Gly Leu
100 105 110
Leu Lys Asp Gly Asn Pro Ile Pro Ser Ala Ile Ala Ala Asn Ser Gly
115 120 125
Ile Tyr
130
<210> 92
<211> 130
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Description of Unknown:
Enterobacteria phage MS2 sequence
<400> 92
Met Ala Ser Asn Phe Thr Gln Phe Val Leu Val Asp Asn Gly Gly Thr
1 5 10 15
Gly Asp Val Thr Val Ala Pro Ser Asn Phe Ala Asn Gly Ile Ala Glu
20 25 30
Trp Ile Ser Ser Asn Ser Arg Ser Gln Ala Tyr Lys Val Thr Cys Ser
35 40 45
Val Arg Gln Ser Ser Ala Gln Lys Arg Lys Tyr Thr Ile Lys Val Glu
50 55 60
Val Pro Lys Val Ala Thr Gln Thr Val Gly Gly Val Glu Leu Pro Val
65 70 75 80
Ala Ala Trp Arg Ser Tyr Leu Asn Met Glu Leu Thr Ile Pro Ile Phe
85 90 95
Ala Thr Asn Ser Asp Cys Glu Leu Ile Val Lys Ala Met Gln Gly Leu
100 105 110
Leu Lys Asp Gly Asn Pro Ile Pro Ser Ala Ile Ala Ala Asn Ser Gly
115 120 125
Ile Tyr
130
<210> 93
<211> 121
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Description of Unknown:
Pseudomonas phage PP7 sequence
<400> 93
Lys Thr Ile Val Leu Ser Val Gly Glu Ala Thr Arg Thr Leu Thr Glu
1 5 10 15
Ile Gln Ser Thr Ala Asp Arg Gln Ile Phe Glu Glu Lys Val Gly Pro
20 25 30
Leu Val Gly Arg Leu Arg Leu Thr Ala Ser Leu Arg Gln Asn Gly Ala
35 40 45
Lys Thr Ala Tyr Arg Val Asn Leu Lys Leu Asp Gln Ala Asp Val Val
50 55 60
Asp Ser Gly Leu Pro Lys Val Arg Tyr Thr Gln Val Trp Ser His Asp
65 70 75 80
Val Thr Ile Val Ala Asn Ser Thr Glu Ala Ser Arg Lys Ser Leu Tyr
85 90 95
Asp Leu Thr Lys Ser Leu Val Ala Thr Ser Gln Val Glu Asp Leu Val
100 105 110
Val Asn Leu Val Pro Leu Gly Arg Ser
115 120
<210> 94
<211> 62
<212> PRT
<213> Escherichia virus Mu
<400> 94
Met Lys Ser Ile Arg Cys Lys Asn Cys Asn Lys Leu Leu Phe Lys Ala
1 5 10 15
Asp Ser Phe Asp His Ile Glu Ile Arg Cys Pro Arg Cys Lys Arg His
20 25 30
Ile Ile Met Leu Asn Ala Cys Glu His Pro Thr Glu Lys His Cys Gly
35 40 45
Lys Arg Glu Lys Ile Thr His Ser Asp Glu Thr Val Arg Tyr
50 55 60
<210> 95
<211> 179
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 95
Ser Thr Arg Pro Gly Glu Arg Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg
1 5 10 15
Asn Phe Ser Ile Pro Asn His Leu Ala Arg His Thr Arg Thr His Thr
20 25 30
Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Gln
35 40 45
Ser Ala His Leu Lys Arg His Leu Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro
50 55 60
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Gln Asp Val Ser Leu
65 70 75 80
Val Arg His Leu Lys Thr His Leu Arg Gln Lys Asp Gly Glu Arg Pro
85 90 95
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Ser Ala Gln Ala Leu
100 105 110
Ala Arg His Thr Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg
115 120 125
Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Gln Gly Gly Asn Leu Thr Arg His Leu
130 135 140
Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg
145 150 155 160
Asn Phe Ser Gln His Pro Asn Leu Thr Arg His Leu Lys Thr His Leu
165 170 175
Arg Gly Ser
<210> 96
<211> 178
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 96
Ser Arg Pro Gly Glu Arg Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn
1 5 10 15
Phe Ser Thr Met Ala Val Leu Arg Arg His Thr Arg Thr His Thr Gly
20 25 30
Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Arg
35 40 45
Glu Val Leu Glu Asn His Leu Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe
50 55 60
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Gln Thr Val Asn Leu Asp
65 70 75 80
Arg His Leu Lys Thr His Leu Arg Gln Lys Asp Gly Glu Arg Pro Phe
85 90 95
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Lys Lys Asp His Leu His
100 105 110
Arg His Thr Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile
115 120 125
Cys Met Arg Asn Phe Ser Gln Arg Pro His Leu Thr Asn His Leu Arg
130 135 140
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn
145 150 155 160
Phe Ser Val Gly Ala Ser Leu Lys Arg His Leu Lys Thr His Leu Arg
165 170 175
Gly Ser
<210> 97
<211> 90
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 97
Ser Arg Pro Gly Glu Arg Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn
1 5 10 15
Phe Ser Asp Lys Thr Lys Leu Arg Val His Thr Arg Thr His Thr Gly
20 25 30
Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Val Arg
35 40 45
His Asn Leu Thr Arg His Leu Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe
50 55 60
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Gln Ser Thr Ser Leu Gln
65 70 75 80
Arg His Leu Lys Thr His Leu Arg Gly Phe
85 90
<210> 98
<211> 176
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 98
Ser Arg Pro Gly Glu Arg Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn
1 5 10 15
Phe Ser Arg Arg His Gly Leu Asp Arg His Thr Arg Thr His Thr Gly
20 25 30
Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Asp His
35 40 45
Ser Ser Leu Lys Arg His Leu Arg Thr His Thr Gly Ser Gln Lys Pro
50 55 60
Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Val Arg His Asn Leu
65 70 75 80
Thr Arg His Leu Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg
85 90 95
Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Asp His Ser Asn Leu Ser Arg His Leu
100 105 110
Lys Thr His Thr Gly Ser Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met
115 120 125
Arg Asn Phe Ser Gln Arg Ser Ser Leu Val Arg His Leu Arg Thr His
130 135 140
Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser
145 150 155 160
Glu Ser Gly His Leu Lys Arg His Leu Arg Thr His Leu Arg Gly Ser
165 170 175
<210> 99
<211> 86
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 99
Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp
1 5 10 15
Glu Leu Thr Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln
20 25 30
Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp His Leu Thr Thr
35 40 45
His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys
50 55 60
Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His Thr Lys Ile
65 70 75 80
His Leu Arg Gln Lys Asp
85
<210> 100
<211> 86
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 100
Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Gln Ser His
1 5 10 15
Asp Leu Thr Lys His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln
20 25 30
Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Asp Ser Ser Lys Leu Ser Arg
35 40 45
His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys
50 55 60
Gly Arg Lys Phe Ala Arg Leu Asp Asn Arg Thr Ala His Thr Lys Ile
65 70 75 80
His Leu Arg Gln Lys Asp
85
<210> 101
<211> 176
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 101
Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp
1 5 10 15
Glu Leu Thr Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln
20 25 30
Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp His Leu Thr Thr
35 40 45
His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys
50 55 60
Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His Thr Lys Ile
65 70 75 80
His Leu Arg Gln Lys Asp Gly Glu Arg Pro Tyr Ala Cys Pro Val Glu
85 90 95
Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Gln Ser His Asp Leu Thr Lys His Ile
100 105 110
Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg
115 120 125
Asn Phe Ser Asp Ser Ser Lys Leu Ser Arg His Ile Arg Thr His Thr
130 135 140
Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Arg
145 150 155 160
Leu Asp Asn Arg Thr Ala His Thr Lys Ile His Leu Arg Gln Lys Asp
165 170 175
<210> 102
<211> 179
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 102
Tyr Ala Cys Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Arg Ser Asp
1 5 10 15
Glu Leu Thr Arg His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln
20 25 30
Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp His Leu Thr Thr
35 40 45
His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys
50 55 60
Gly Arg Lys Phe Ala Arg Ser Asp Glu Arg Lys Arg His Thr Lys Ile
65 70 75 80
His Leu Arg Gln Lys Asp Gly Gly Gly Ser Glu Arg Pro Tyr Ala Cys
85 90 95
Pro Val Glu Ser Cys Asp Arg Arg Phe Ser Gln Ser His Asp Leu Thr
100 105 110
Lys His Ile Arg Ile His Thr Gly Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile
115 120 125
Cys Met Arg Asn Phe Ser Asp Ser Ser Lys Leu Ser Arg His Ile Arg
130 135 140
Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys
145 150 155 160
Phe Ala Arg Leu Asp Asn Arg Thr Ala His Thr Lys Ile His Leu Arg
165 170 175
Gln Lys Asp
<210> 103
<211> 286
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 103
Ser Arg Pro Gly Glu Arg Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn
1 5 10 15
Phe Ser Thr Arg Gln Asn Leu Asp Thr His Thr Arg Thr His Thr Gly
20 25 30
Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Arg
35 40 45
Asp Thr Leu Glu Arg His Leu Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe
50 55 60
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Pro Asp Ala Leu Pro
65 70 75 80
Arg His Leu Lys Thr His Leu Arg Gly Ser Gln Leu Val Lys Ser Glu
85 90 95
Leu Glu Glu Lys Lys Ser Glu Leu Arg His Lys Leu Lys Tyr Val Pro
100 105 110
His Glu Tyr Ile Glu Leu Ile Glu Ile Ala Arg Asn Ser Thr Gln Asp
115 120 125
Arg Ile Leu Glu Met Lys Val Met Glu Phe Phe Met Lys Val Tyr Gly
130 135 140
Tyr Arg Gly Lys His Leu Gly Gly Ser Arg Lys Pro Asp Gly Ala Ile
145 150 155 160
Tyr Thr Val Gly Ser Pro Ile Asp Tyr Gly Val Ile Val Asp Thr Lys
165 170 175
Ala Tyr Ser Gly Gly Tyr Asn Leu Pro Ile Gly Gln Ala Asp Glu Met
180 185 190
Gln Arg Tyr Val Glu Glu Asn Gln Thr Arg Asn Lys His Ile Asn Pro
195 200 205
Asn Glu Trp Trp Lys Val Tyr Pro Ser Ser Val Thr Glu Phe Lys Phe
210 215 220
Leu Phe Val Ser Gly His Phe Lys Gly Asn Tyr Lys Ala Gln Leu Thr
225 230 235 240
Arg Leu Asn His Ile Thr Asn Cys Asn Gly Ala Val Leu Ser Val Glu
245 250 255
Glu Leu Leu Ile Gly Gly Glu Met Ile Lys Ala Gly Thr Leu Thr Leu
260 265 270
Glu Glu Val Arg Arg Lys Phe Asn Asn Gly Glu Ile Asn Phe
275 280 285
<210> 104
<211> 286
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 104
Ser Arg Pro Gly Glu Arg Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn
1 5 10 15
Phe Ser Ser Pro Ser Lys Leu Ile Arg His Thr Arg Thr His Thr Gly
20 25 30
Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Asp Gly
35 40 45
Ser Asn Leu Ala Arg His Leu Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe
50 55 60
Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Val Asp Asn Leu Pro
65 70 75 80
Arg His Leu Lys Thr His Leu Arg Gly Ser Gln Leu Val Lys Ser Glu
85 90 95
Leu Glu Glu Lys Lys Ser Glu Leu Arg His Lys Leu Lys Tyr Val Pro
100 105 110
His Glu Tyr Ile Glu Leu Ile Glu Ile Ala Arg Asn Ser Thr Gln Asp
115 120 125
Arg Ile Leu Glu Met Lys Val Met Glu Phe Phe Met Lys Val Tyr Gly
130 135 140
Tyr Arg Gly Lys His Leu Gly Gly Ser Arg Lys Pro Asp Gly Ala Ile
145 150 155 160
Tyr Thr Val Gly Ser Pro Ile Asp Tyr Gly Val Ile Val Asp Thr Lys
165 170 175
Ala Tyr Ser Gly Gly Tyr Asn Leu Pro Ile Gly Gln Ala Asp Glu Met
180 185 190
Gln Arg Tyr Val Glu Glu Asn Gln Thr Arg Asn Lys His Ile Asn Pro
195 200 205
Asn Glu Trp Trp Lys Val Tyr Pro Ser Ser Val Thr Glu Phe Lys Phe
210 215 220
Leu Phe Val Ser Gly His Phe Lys Gly Asn Tyr Lys Ala Gln Leu Thr
225 230 235 240
Arg Leu Asn His Ile Thr Asn Cys Asn Gly Ala Val Leu Ser Val Glu
245 250 255
Glu Leu Leu Ile Gly Gly Glu Met Ile Lys Ala Gly Thr Leu Thr Leu
260 265 270
Glu Glu Val Arg Arg Lys Phe Asn Asn Gly Glu Ile Asn Phe
275 280 285
<210> 105
<211> 353
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 105
Met Asp Tyr Lys Asp His Asp Gly Asp Tyr Lys Asp His Asp Ile Asp
1 5 10 15
Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val
20 25 30
Gly Ile His Gly Val Pro Ala Ala Met Ala Glu Arg Pro Phe Gln Cys
35 40 45
Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Asp Arg Ser Asn Leu Ser Arg His
50 55 60
Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly
65 70 75 80
Arg Lys Phe Ala Ile Ser Ser Asn Leu Asn Ser His Thr Lys Ile His
85 90 95
Thr Gly Ser Gln Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe
100 105 110
Ser Arg Ser Asp Asn Leu Ala Arg His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu
115 120 125
Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Thr Ser Gly
130 135 140
Asn Leu Thr Arg His Thr Lys Ile His Leu Arg Gly Ser Gln Leu Val
145 150 155 160
Lys Ser Glu Leu Glu Glu Lys Lys Ser Glu Leu Arg His Lys Leu Lys
165 170 175
Tyr Val Pro His Glu Tyr Ile Glu Leu Ile Glu Ile Ala Arg Asn Ser
180 185 190
Thr Gln Asp Arg Ile Leu Glu Met Lys Val Met Glu Phe Phe Met Lys
195 200 205
Val Tyr Gly Tyr Arg Gly Lys His Leu Gly Gly Ser Arg Lys Pro Asp
210 215 220
Gly Ala Ile Tyr Thr Val Gly Ser Pro Ile Asp Tyr Gly Val Ile Val
225 230 235 240
Asp Thr Lys Ala Tyr Ser Gly Gly Tyr Asn Leu Pro Ile Gly Gln Ala
245 250 255
Asp Glu Met Gln Arg Tyr Val Glu Glu Asn Gln Thr Arg Asn Lys His
260 265 270
Ile Asn Pro Asn Glu Trp Trp Lys Val Tyr Pro Ser Ser Val Thr Glu
275 280 285
Phe Lys Phe Leu Phe Val Ser Gly His Phe Lys Gly Asn Tyr Lys Ala
290 295 300
Gln Leu Thr Arg Leu Asn His Ile Thr Asn Cys Asn Gly Ala Val Leu
305 310 315 320
Ser Val Glu Glu Leu Leu Ile Gly Gly Glu Met Ile Lys Ala Gly Thr
325 330 335
Leu Thr Leu Glu Glu Val Arg Arg Lys Phe Asn Asn Gly Glu Ile Asn
340 345 350
Phe
<210> 106
<211> 352
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 106
Met Asp Tyr Lys Asp His Asp Gly Asp Tyr Lys Asp His Asp Ile Asp
1 5 10 15
Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys Met Ala Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val
20 25 30
Gly Ile His Gly Val Pro Ala Ala Met Ala Glu Arg Pro Phe Gln Cys
35 40 45
Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser Arg Ser Asp Asn Leu Ser Val His
50 55 60
Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly
65 70 75 80
Arg Lys Phe Ala Gln Lys Ile Asn Leu Gln Val His Thr Lys Ile His
85 90 95
Thr Gly Glu Lys Pro Phe Gln Cys Arg Ile Cys Met Arg Asn Phe Ser
100 105 110
Arg Ser Asp Val Leu Ser Glu His Ile Arg Thr His Thr Gly Glu Lys
115 120 125
Pro Phe Ala Cys Asp Ile Cys Gly Arg Lys Phe Ala Gln Arg Asn His
130 135 140
Arg Thr Thr His Thr Lys Ile His Leu Arg Gly Ser Gln Leu Val Lys
145 150 155 160
Ser Glu Leu Glu Glu Lys Lys Ser Glu Leu Arg His Lys Leu Lys Tyr
165 170 175
Val Pro His Glu Tyr Ile Glu Leu Ile Glu Ile Ala Arg Asn Ser Thr
180 185 190
Gln Asp Arg Ile Leu Glu Met Lys Val Met Glu Phe Phe Met Lys Val
195 200 205
Tyr Gly Tyr Arg Gly Lys His Leu Gly Gly Ser Arg Lys Pro Asp Gly
210 215 220
Ala Ile Tyr Thr Val Gly Ser Pro Ile Asp Tyr Gly Val Ile Val Asp
225 230 235 240
Thr Lys Ala Tyr Ser Gly Gly Tyr Asn Leu Pro Ile Gly Gln Ala Asp
245 250 255
Glu Met Gln Arg Tyr Val Glu Glu Asn Gln Thr Arg Asn Lys His Ile
260 265 270
Asn Pro Asn Glu Trp Trp Lys Val Tyr Pro Ser Ser Val Thr Glu Phe
275 280 285
Lys Phe Leu Phe Val Ser Gly His Phe Lys Gly Asn Tyr Lys Ala Gln
290 295 300
Leu Thr Arg Leu Asn His Ile Thr Asn Cys Asn Gly Ala Val Leu Ser
305 310 315 320
Val Glu Glu Leu Leu Ile Gly Gly Glu Met Ile Lys Ala Gly Thr Leu
325 330 335
Thr Leu Glu Glu Val Arg Arg Lys Phe Asn Asn Gly Glu Ile Asn Phe
340 345 350
<210> 107
<211> 196
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 107
Gln Leu Val Lys Ser Glu Leu Glu Glu Lys Lys Ser Glu Leu Arg His
1 5 10 15
Lys Leu Lys Tyr Val Pro His Glu Tyr Ile Glu Leu Ile Glu Ile Ala
20 25 30
Arg Asn Ser Thr Gln Asp Arg Ile Leu Glu Met Lys Val Met Glu Phe
35 40 45
Phe Met Lys Val Tyr Gly Tyr Arg Gly Lys His Leu Gly Gly Ser Arg
50 55 60
Lys Pro Asp Gly Ala Ile Tyr Thr Val Gly Ser Pro Ile Asp Tyr Gly
65 70 75 80
Val Ile Val Asp Thr Lys Ala Tyr Ser Gly Gly Tyr Asn Leu Pro Ile
85 90 95
Gly Gln Ala Asp Glu Met Gln Arg Tyr Val Glu Glu Asn Gln Thr Arg
100 105 110
Asn Lys His Ile Asn Pro Asn Glu Trp Trp Lys Val Tyr Pro Ser Ser
115 120 125
Val Thr Glu Phe Lys Phe Leu Phe Val Ser Gly His Phe Lys Gly Asn
130 135 140
Tyr Lys Ala Gln Leu Thr Arg Leu Asn His Ile Thr Asn Cys Asn Gly
145 150 155 160
Ala Val Leu Ser Val Glu Glu Leu Leu Ile Gly Gly Glu Met Ile Lys
165 170 175
Ala Gly Thr Leu Thr Leu Glu Glu Val Arg Arg Lys Phe Asn Asn Gly
180 185 190
Glu Ile Asn Phe
195
<210> 108
<211> 199
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 108
Val His Asp His Lys Leu Glu Leu Ala Lys Leu Ile Arg Asn Tyr Glu
1 5 10 15
Thr Asn Arg Lys Glu Cys Leu Asn Ser Arg Tyr Asn Glu Thr Leu Leu
20 25 30
Arg Ser Asp Tyr Leu Asp Pro Phe Phe Glu Leu Leu Gly Trp Asp Ile
35 40 45
Lys Asn Lys Ala Gly Lys Pro Thr Asn Glu Arg Glu Val Val Leu Glu
50 55 60
Glu Ala Leu Lys Ala Ser Ala Ser Glu His Ser Lys Lys Pro Asp Tyr
65 70 75 80
Thr Phe Arg Leu Phe Ser Glu Arg Lys Phe Phe Leu Glu Ala Lys Lys
85 90 95
Pro Ser Val His Ile Glu Ser Asp Asn Glu Thr Ala Lys Gln Val Arg
100 105 110
Arg Tyr Gly Phe Thr Ala Lys Leu Lys Ile Ser Val Leu Ser Asn Phe
115 120 125
Glu Tyr Leu Val Ile Tyr Asp Thr Ser Val Lys Val Asp Gly Asp Asp
130 135 140
Thr Phe Asn Lys Ala Arg Ile Lys Lys Tyr His Tyr Thr Glu Tyr Glu
145 150 155 160
Thr His Phe Asp Glu Ile Cys Asp Leu Leu Gly Arg Glu Ser Val Tyr
165 170 175
Ser Gly Asn Phe Asp Lys Glu Trp Leu Ser Ile Glu Asn Lys Ile Asn
180 185 190
His Phe Ser Val Asp Thr Leu
195
<210> 109
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 109
Tyr Asn Glu Thr Leu Leu Arg Ser Asp Tyr Leu Asp Pro Phe Phe Glu
1 5 10 15
Leu Leu Gly Trp Asp Ile Lys Asn Lys Ala Gly Lys Pro Thr Asn Glu
20 25 30
Arg Glu Val Val Leu Glu Glu Ala Leu Lys Ala Ser Ala Ser Glu His
35 40 45
Ser Lys Lys Pro Asp Tyr Thr Phe Arg Leu Phe Ser Glu Arg Lys Phe
50 55 60
Phe Leu Glu Ala Lys Lys Pro Ser Val His Ile Glu Ser Asp Asn Glu
65 70 75 80
Thr Ala Lys Gln Val Arg Arg Tyr Gly Phe Thr Ala Lys Leu Lys Ile
85 90 95
Ser Val Leu Ser Asn Phe Glu Tyr Leu Val Ile Tyr Asp Thr Ser Val
100 105 110
Lys Val Asp Gly Asp Asp Thr
115
<210> 110
<211> 165
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 110
Met Leu Lys Pro Glu Met Ile Glu Lys Leu Asn Glu Gln Met Asn Leu
1 5 10 15
Glu Leu Tyr Ser Ser Leu Leu Tyr Gln Gln Met Ser Ala Trp Cys Ser
20 25 30
Tyr His Thr Phe Glu Gly Ala Ala Ala Phe Leu Arg Arg His Ala Gln
35 40 45
Glu Glu Met Thr His Met Gln Arg Leu Phe Asp Tyr Leu Thr Asp Thr
50 55 60
Gly Asn Leu Pro Arg Ile Asn Thr Val Glu Ser Pro Phe Ala Glu Tyr
65 70 75 80
Ser Ser Leu Asp Glu Leu Phe Gln Glu Thr Tyr Lys His Glu Gln Leu
85 90 95
Ile Thr Gln Lys Ile Asn Glu Leu Ala His Ala Ala Met Thr Asn Gln
100 105 110
Asp Tyr Pro Thr Phe Asn Phe Leu Gln Trp Tyr Val Ser Glu Gln His
115 120 125
Glu Glu Glu Lys Leu Phe Lys Ser Ile Ile Asp Lys Leu Ser Leu Ala
130 135 140
Gly Lys Ser Gly Glu Gly Leu Tyr Phe Ile Asp Lys Glu Leu Ser Thr
145 150 155 160
Leu Asp Thr Gln Asn
165
<210> 111
<211> 165
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 111
Met Leu Lys Pro Glu Met Ile Glu Lys Leu Asn Glu Gln Met Asn Leu
1 5 10 15
Glu Leu Tyr Ser Ser Leu Leu Tyr Gln Gln Met Ser Ala Trp Cys Ser
20 25 30
Tyr Leu Thr Phe Glu Gly Ala Ala Ala Phe Leu Arg Arg His Ala Gln
35 40 45
Glu Glu Met Thr His Met Gln Arg Leu Phe Asp Tyr Leu Thr Asp Ile
50 55 60
Gly Asn Leu Pro Arg Ile Asn Thr Val Glu Ser Pro Phe Ala Glu Tyr
65 70 75 80
Ser Ser Leu Asp Glu Leu Phe Gln Glu Thr Tyr Lys His Glu Gln Leu
85 90 95
Ile Thr Gln Lys Ile Asn Glu Leu Ala His Ala Ala Met Thr Asn Gln
100 105 110
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115 120 125
Glu Glu Glu Lys Leu Phe Lys Ser Ile Ile Asp Lys Leu Ser Leu Ala
130 135 140
Gly Lys Ser Gly Glu Gly Leu Tyr Phe Ile Asp Lys Glu Leu Ser Thr
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Leu Asp Thr Gln Asn
165
<210> 112
<211> 389
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 112
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1 5 10 15
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20 25 30
Ser Leu Gly Phe Phe Phe Asp Arg Asp Asp Val Ala Leu Glu Gly Val
35 40 45
Gly His Phe Phe Arg Glu Leu Ala Glu Glu Lys Arg Glu Gly Ala Glu
50 55 60
Arg Leu Leu Glu Phe Gln Asn Asp Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Gln
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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260 265 270
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370 375 380
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<211> 378
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 113
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1 5 10 15
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165 170 175
Gly Gly Gly Ser Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys Gly Gly Gly Gly
180 185 190
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195 200 205
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210 215 220
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245 250 255
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<211> 612
<212> PRT
<213> Arabidopsis thaliana
<400> 114
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1 5 10 15
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35 40 45
Gly Arg Ala Ser Arg Trp Trp Met Lys Gln Ser Leu Ala His Leu Ser
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195 200 205
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225 230 235 240
Gly Asn Ser Thr Ser Leu Leu Ser Pro Tyr Leu His Phe Gly Glu Ile
245 250 255
Ser Val Arg His Val Phe Gln Cys Ala Arg Met Lys Gln Ile Ile Trp
260 265 270
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275 280 285
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290 295 300
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305 310 315 320
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325 330 335
Gly Tyr Pro Leu Val Asp Ala Gly Met Arg Glu Leu Trp Ala Thr Gly
340 345 350
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Leu Leu Asp Ala Asp Leu Glu Cys Asp Ile Leu Gly Trp Gln Tyr Ile
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Leu Ala Lys Ala Ile Ser Arg Thr Arg Glu Ala Gln Ile Met Ile Gly
485 490 495
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595 600 605
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610
<210> 115
<211> 170
<212> PRT
<213> Arabidopsis thaliana
<400> 115
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Ser Val Leu Glu Arg Gln Arg Ala His Leu Lys Tyr Leu Asn Pro Thr
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<210> 116
<211> 144
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 116
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35 40 45
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115 120 125
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130 135 140
<210> 117
<211> 740
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 117
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1 5 10 15
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Asn Thr Asp Phe Thr Ser Asp Gln Ala Asp Phe Pro Asp Thr Leu Phe
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Asn Gly Phe Glu Thr Pro Asp Lys Ala Glu Pro Pro Phe Tyr Val Gly
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Glu Leu Arg Pro Gly Leu Lys Tyr Asp Phe Leu Ser Glu Ser Gly Glu
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Phe Glu Gly Ser Gly Arg Asn Lys Lys Leu Ala Lys Ala Arg Ala Ala
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405 410 415
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420 425 430
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435 440 445
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Leu Pro Pro Leu Tyr Thr Leu Asn Lys Pro Leu Leu Ser Gly Ile Ser
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<211> 740
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 118
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1 5 10 15
Glu Asn Arg Asn Leu Asp Asn Val Ser Pro Lys Asp Gly Ser Thr Pro
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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275 280 285
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385 390 395 400
Ser Leu Leu Arg Phe Leu Tyr Thr Gln Leu Glu Leu Tyr Leu Asn Asn
405 410 415
Lys Asp Asp Gln Lys Arg Ser Ile Phe Gln Lys Ser Glu Arg Gly Gly
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Phe Arg Leu Lys Glu Asn Val Gln Phe His Leu Tyr Ile Ser Thr Ser
435 440 445
Pro Cys Gly Asp Ala Arg Ile Phe Ser Pro His Glu Pro Ile Leu Glu
450 455 460
Gly Ser Arg Ser Tyr Thr Gln Ala Gly Val Gln Trp Cys Asn His Gly
465 470 475 480
Ser Leu Gln Pro Arg Pro Pro Gly Leu Leu Ser Asp Pro Ser Thr Ser
485 490 495
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530 535 540
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545 550 555 560
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565 570 575
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580 585 590
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 119
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165 170 175
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195 200 205
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210 215 220
Leu Gln Gly Glu Arg Leu Leu Thr Met Ser Cys Ser Asp Lys Ile Ala
225 230 235 240
Arg Trp Asn Val Val Gly Ile Gln Gly Ser Leu Leu Ser Ile Phe Val
245 250 255
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420
<210> 120
<211> 420
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 120
Val Leu Ala Asp Ala Val Ser Arg Leu Val Leu Gly Lys Phe Gly Asp
1 5 10 15
Leu Thr Asp Asn Phe Ser Ser Pro His Ala Arg Arg Lys Val Leu Ala
20 25 30
Gly Val Val Met Thr Thr Gly Thr Asp Val Lys Asp Ala Lys Val Ile
35 40 45
Ser Val Ser Thr Gly Thr Lys Cys Ile Asn Gly Glu Tyr Met Ser Asp
50 55 60
Arg Gly Leu Ala Leu Asn Asp Cys His Ala Glu Ile Ile Ser Arg Arg
65 70 75 80
Ser Leu Leu Arg Phe Leu Tyr Thr Gln Leu Glu Leu Tyr Leu Asn Asn
85 90 95
Lys Asp Asp Gln Lys Arg Ser Ile Phe Gln Lys Ser Glu Arg Gly Gly
100 105 110
Phe Arg Leu Lys Glu Asn Val Gln Phe His Leu Tyr Ile Ser Thr Ser
115 120 125
Pro Cys Gly Asp Ala Arg Ile Phe Ser Pro His Glu Pro Ile Leu Glu
130 135 140
Gly Ser Arg Ser Tyr Thr Gln Ala Gly Val Gln Trp Cys Asn His Gly
145 150 155 160
Ser Leu Gln Pro Arg Pro Pro Gly Leu Leu Ser Asp Pro Ser Thr Ser
165 170 175
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180 185 190
Arg Lys Ala Arg Gly Gln Leu Arg Thr Lys Ile Glu Ser Gly Gln Gly
195 200 205
Thr Ile Pro Val Arg Ser Asn Ala Ser Ile Gln Thr Trp Asp Gly Val
210 215 220
Leu Gln Gly Glu Arg Leu Leu Thr Met Ser Cys Ser Asp Lys Ile Ala
225 230 235 240
Arg Trp Asn Val Val Gly Ile Gln Gly Ser Leu Leu Ser Ile Phe Val
245 250 255
Glu Pro Ile Tyr Phe Ser Ser Ile Ile Leu Gly Ser Leu Tyr His Gly
260 265 270
Asp His Leu Ser Arg Ala Met Tyr Gln Arg Ile Ser Asn Ile Glu Asp
275 280 285
Leu Pro Pro Leu Tyr Thr Leu Asn Lys Pro Leu Leu Ser Gly Ile Ser
290 295 300
Asn Ala Glu Ala Arg Gln Pro Gly Lys Ala Pro Asn Phe Ser Val Asn
305 310 315 320
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325 330 335
Lys Asp Glu Leu Gly Arg Ala Ser Arg Leu Cys Lys His Ala Leu Tyr
340 345 350
Cys Arg Trp Met Arg Val His Gly Lys Val Pro Ser His Leu Leu Arg
355 360 365
Ser Lys Ile Thr Lys Pro Asn Val Tyr His Glu Ser Lys Leu Ala Ala
370 375 380
Lys Glu Tyr Gln Ala Ala Lys Ala Arg Leu Phe Thr Ala Phe Ile Lys
385 390 395 400
Ala Gly Leu Gly Ala Trp Val Glu Lys Pro Thr Glu Gln Asp Gln Phe
405 410 415
Ser Leu Thr Pro
420
<210> 121
<211> 584
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 121
Met Ala Ser Asn Phe Thr Gln Phe Val Leu Val Asp Asn Gly Gly Thr
1 5 10 15
Gly Asp Val Thr Val Ala Pro Ser Asn Phe Ala Asn Gly Ile Ala Glu
20 25 30
Trp Ile Ser Ser Asn Ser Arg Ser Gln Ala Tyr Lys Val Thr Cys Ser
35 40 45
Val Arg Gln Ser Ser Ala Gln Asn Arg Lys Tyr Thr Ile Lys Val Glu
50 55 60
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65 70 75 80
Pro Ile Phe Ala Thr Asn Ser Asp Cys Glu Leu Ile Val Lys Ala Met
85 90 95
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100 105 110
Asn Ser Gly Ile Tyr Gly Gly Ser Gly Ser Gly Ala Gly Ser Gly Ser
115 120 125
Pro Ala Gly Gly Gly Ala Pro Gly Ser Gly Gly Gly Ser Lys Ala Glu
130 135 140
Arg Met Gly Phe Thr Glu Val Thr Pro Val Thr Gly Ala Ser Leu Arg
145 150 155 160
Arg Thr Met Leu Leu Leu Ser Arg Ser Pro Glu Ala Gln Pro Lys Thr
165 170 175
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180 185 190
His Arg Cys Phe Asn Thr Leu Thr Asn Ser Phe Gln Pro Ser Leu Leu
195 200 205
Gly Arg Lys Ile Leu Ala Ala Ile Ile Met Lys Lys Asp Ser Glu Asp
210 215 220
Met Gly Val Val Val Ser Leu Gly Thr Gly Asn Arg Cys Val Lys Gly
225 230 235 240
Asp Ser Leu Ser Leu Lys Gly Glu Thr Val Asn Asp Cys His Ala Glu
245 250 255
Ile Ile Ser Arg Arg Gly Phe Ile Arg Phe Leu Tyr Ser Glu Leu Met
260 265 270
Lys Tyr Asn Ser Gln Thr Ala Lys Asp Ser Ile Phe Glu Pro Ala Lys
275 280 285
Gly Gly Glu Lys Leu Gln Ile Lys Lys Thr Val Ser Phe His Leu Tyr
290 295 300
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305 310 315 320
Ser Asp Arg Ala Met Glu Ser Thr Glu Ser Arg His Tyr Pro Val Phe
325 330 335
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340 345 350
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355 360 365
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370 375 380
Leu Arg Trp Asn Val Leu Gly Leu Gln Gly Ala Leu Leu Thr His Phe
385 390 395 400
Leu Gln Pro Ile Tyr Leu Lys Ser Val Thr Leu Gly Tyr Leu Phe Ser
405 410 415
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435 440 445
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450 455 460
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465 470 475 480
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Glu Glu Lys Asn Phe Tyr Leu Cys Pro Val Gly Ser Gly Ser Gly Ser
565 570 575
Leu Pro Pro Leu Glu Arg Leu Thr
580
<210> 122
<211> 585
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 122
Met Ala Ser Asn Phe Thr Gln Phe Val Leu Val Asp Asn Gly Gly Thr
1 5 10 15
Gly Asp Val Thr Val Ala Pro Ser Asn Phe Ala Asn Gly Ile Ala Glu
20 25 30
Trp Ile Ser Ser Asn Ser Arg Ser Gln Ala Tyr Lys Val Thr Cys Ser
35 40 45
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Pro Ile Phe Ala Thr Asn Ser Asp Cys Glu Leu Ile Val Lys Ala Met
85 90 95
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100 105 110
Asn Ser Gly Ile Tyr Gly Gly Ser Gly Ser Gly Ala Gly Ser Gly Ser
115 120 125
Pro Ala Gly Gly Gly Ala Pro Gly Ser Gly Gly Gly Ser Lys Ala Glu
130 135 140
Arg Met Gly Phe Thr Glu Val Thr Pro Val Thr Gly Ala Ser Leu Arg
145 150 155 160
Arg Thr Met Leu Leu Leu Ser Arg Ser Pro Glu Ala Gln Pro Lys Thr
165 170 175
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Gly Arg Lys Ile Leu Ala Ala Ile Ile Met Lys Lys Asp Ser Glu Asp
210 215 220
Met Gly Val Val Val Ser Leu Gly Thr Gly Asn Arg Cys Val Lys Gly
225 230 235 240
Asp Ser Leu Ser Leu Lys Gly Glu Thr Val Asn Asp Cys His Ala Glu
245 250 255
Ile Ile Ser Arg Arg Gly Phe Ile Arg Phe Leu Tyr Ser Glu Leu Met
260 265 270
Lys Tyr Asn Ser Gln Thr Ala Lys Asp Ser Ile Phe Glu Pro Ala Lys
275 280 285
Gly Gly Glu Lys Leu Gln Ile Lys Lys Thr Val Ser Phe His Leu Tyr
290 295 300
Ile Ser Thr Ala Pro Cys Gly Asp Gly Ala Leu Phe Asp Lys Ser Cys
305 310 315 320
Ser Asp Arg Ala Met Glu Ser Thr Glu Ser Arg His Tyr Pro Val Phe
325 330 335
Glu Asn Pro Lys Gln Gly Lys Leu Arg Thr Lys Val Glu Asn Gly Gln
340 345 350
Gly Thr Ile Pro Val Glu Ser Ser Asp Ile Val Pro Thr Trp Asp Gly
355 360 365
Ile Arg Leu Gly Glu Arg Leu Arg Thr Met Ser Cys Ser Asp Lys Ile
370 375 380
Leu Arg Trp Asn Val Leu Gly Leu Gln Gly Ala Leu Leu Thr His Phe
385 390 395 400
Leu Gln Pro Ile Tyr Leu Lys Ser Val Thr Leu Gly Tyr Leu Phe Ser
405 410 415
Gln Gly His Leu Thr Arg Ala Ile Cys Cys Arg Val Thr Arg Asp Gly
420 425 430
Ser Ala Phe Glu Asp Gly Leu Arg His Pro Phe Ile Val Asn His Pro
435 440 445
Lys Val Gly Arg Val Ser Ile Tyr Asp Ser Lys Arg Gln Ser Gly Lys
450 455 460
Thr Lys Glu Thr Ser Val Asn Trp Cys Leu Ala Asp Gly Tyr Asp Leu
465 470 475 480
Glu Ile Leu Asp Gly Thr Arg Gly Thr Val Asp Gly Pro Arg Asn Glu
485 490 495
Leu Ser Arg Val Ser Lys Lys Asn Ile Phe Leu Leu Phe Lys Lys Leu
500 505 510
Cys Ser Phe Arg Tyr Arg Arg Asp Leu Leu Arg Leu Ser Tyr Gly Glu
515 520 525
Ala Lys Lys Ala Ala Arg Asp Tyr Glu Thr Ala Lys Asn Tyr Phe Lys
530 535 540
Lys Gly Leu Lys Asp Met Gly Tyr Gly Asn Trp Ile Ser Lys Pro Gln
545 550 555 560
Glu Glu Lys Asn Phe Tyr Leu Cys Pro Val Gly Ser Gly Ser Gly Ser
565 570 575
Leu Pro Pro Leu Glu Arg Leu Thr Leu
580 585
<210> 123
<211> 972
<212> PRT
<213> Ruminococcus flavefaciens
<400> 123
Glu Ala Ser Ile Glu Lys Lys Lys Ser Phe Ala Lys Gly Met Gly Val
1 5 10 15
Lys Ser Thr Leu Val Ser Gly Ser Lys Val Tyr Met Thr Thr Phe Ala
20 25 30
Glu Gly Ser Asp Ala Arg Leu Glu Lys Ile Val Glu Gly Asp Ser Ile
35 40 45
Arg Ser Val Asn Glu Gly Glu Ala Phe Ser Ala Glu Met Ala Asp Lys
50 55 60
Asn Ala Gly Tyr Lys Ile Gly Asn Ala Lys Phe Ser His Pro Lys Gly
65 70 75 80
Tyr Ala Val Val Ala Asn Asn Pro Leu Tyr Thr Gly Pro Val Gln Gln
85 90 95
Asp Met Leu Gly Leu Lys Glu Thr Leu Glu Lys Arg Tyr Phe Gly Glu
100 105 110
Ser Ala Asp Gly Asn Asp Asn Ile Cys Ile Gln Val Ile His Asn Ile
115 120 125
Leu Asp Ile Glu Lys Ile Leu Ala Glu Tyr Ile Thr Asn Ala Ala Tyr
130 135 140
Ala Val Asn Asn Ile Ser Gly Leu Asp Lys Asp Ile Ile Gly Phe Gly
145 150 155 160
Lys Phe Ser Thr Val Tyr Thr Tyr Asp Glu Phe Lys Asp Pro Glu His
165 170 175
His Arg Ala Ala Phe Asn Asn Asn Asp Lys Leu Ile Asn Ala Ile Lys
180 185 190
Ala Gln Tyr Asp Glu Phe Asp Asn Phe Leu Asp Asn Pro Arg Leu Gly
195 200 205
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210 215 220
Asn Tyr Gly Asn Glu Cys Tyr Asp Ile Leu Ala Leu Leu Ser Gly Leu
225 230 235 240
Arg His Trp Val Val His Asn Asn Glu Glu Glu Ser Arg Ile Ser Arg
245 250 255
Thr Trp Leu Tyr Asn Leu Asp Lys Asn Leu Asp Asn Glu Tyr Ile Ser
260 265 270
Thr Leu Asn Tyr Leu Tyr Asp Arg Ile Thr Asn Glu Leu Thr Asn Ser
275 280 285
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290 295 300
Gly Ile Asn Pro Ala Glu Phe Ala Glu Gln Tyr Phe Arg Phe Ser Ile
305 310 315 320
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325 330 335
Val Met Leu Asp Arg Lys Asp Met Ser Glu Ile Arg Lys Asn His Lys
340 345 350
Val Phe Asp Ser Ile Arg Thr Lys Val Tyr Thr Met Met Asp Phe Val
355 360 365
Ile Tyr Arg Tyr Tyr Ile Glu Glu Asp Ala Lys Val Ala Ala Ala Asn
370 375 380
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385 390 395 400
Val Ile Asn Leu Arg Gly Ser Phe Asn Asp Asp Gln Lys Asp Ala Leu
405 410 415
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420 425 430
His Asn Ile Lys Glu Phe Arg Gly Asn Lys Thr Arg Glu Tyr Lys Lys
435 440 445
Lys Asp Ala Pro Arg Leu Pro Arg Ile Leu Pro Ala Gly Arg Asp Val
450 455 460
Ser Ala Phe Ser Lys Leu Met Tyr Ala Leu Thr Met Phe Leu Asp Gly
465 470 475 480
Lys Glu Ile Asn Asp Leu Leu Thr Thr Leu Ile Asn Lys Phe Asp Asn
485 490 495
Ile Gln Ser Phe Leu Lys Val Met Pro Leu Ile Gly Val Asn Ala Lys
500 505 510
Phe Val Glu Glu Tyr Ala Phe Phe Lys Asp Ser Ala Lys Ile Ala Asp
515 520 525
Glu Leu Arg Leu Ile Lys Ser Phe Ala Arg Met Gly Glu Pro Ile Ala
530 535 540
Asp Ala Arg Arg Ala Met Tyr Ile Asp Ala Ile Arg Ile Leu Gly Thr
545 550 555 560
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565 570 575
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580 585 590
Phe Ile Ile Asn Asn Val Ile Ser Asn Lys Arg Phe His Tyr Leu Ile
595 600 605
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610 615 620
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625 630 635 640
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645 650 655
Gly Lys Asp Lys Gly Lys Ser Val Ser Glu Lys Val Asp Ala Leu Thr
660 665 670
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675 680 685
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690 695 700
Lys Ile Ile Ser Leu Tyr Leu Thr Val Ile Tyr His Ile Leu Lys Asn
705 710 715 720
Ile Val Asn Ile Asn Ala Arg Tyr Val Ile Gly Phe His Cys Val Glu
725 730 735
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740 745 750
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755 760 765
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770 775 780
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820 825 830
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835 840 845
Leu Arg Ile Asp Asn Lys Thr Cys Thr Leu Phe Arg Asn Lys Ala Val
850 855 860
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865 870 875 880
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885 890 895
Ile Met Asn Glu Arg Tyr Glu Lys Ser Ser Gly Lys Val Ser Glu Tyr
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915 920 925
Leu Leu Cys Val Pro Phe Gly Tyr Cys Ile Pro Arg Phe Lys Asn Leu
930 935 940
Ser Ile Glu Ala Leu Phe Asp Arg Asn Glu Ala Ala Lys Phe Asp Lys
945 950 955 960
Glu Lys Lys Lys Val Ser Gly Asn Ser Gly Ser Gly
965 970
<210> 124
<211> 991
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 124
Glu Ala Ser Ile Glu Lys Lys Lys Ser Phe Ala Lys Gly Met Gly Val
1 5 10 15
Lys Ser Thr Leu Val Ser Gly Ser Lys Val Tyr Met Thr Thr Phe Ala
20 25 30
Glu Gly Ser Asp Ala Arg Leu Glu Lys Ile Val Glu Gly Asp Ser Ile
35 40 45
Arg Ser Val Asn Glu Gly Glu Ala Phe Ser Ala Glu Met Ala Asp Lys
50 55 60
Asn Ala Gly Tyr Lys Ile Gly Asn Ala Lys Phe Ser His Pro Lys Gly
65 70 75 80
Tyr Ala Val Val Ala Asn Asn Pro Leu Tyr Thr Gly Pro Val Gln Gln
85 90 95
Asp Met Leu Gly Leu Lys Glu Thr Leu Glu Lys Arg Tyr Phe Gly Glu
100 105 110
Ser Ala Asp Gly Asn Asp Asn Ile Cys Ile Gln Val Ile His Asn Ile
115 120 125
Leu Asp Ile Glu Lys Ile Leu Ala Glu Tyr Ile Thr Asn Ala Ala Tyr
130 135 140
Ala Val Asn Asn Ile Ser Gly Leu Asp Lys Asp Ile Ile Gly Phe Gly
145 150 155 160
Lys Phe Ser Thr Val Tyr Thr Tyr Asp Glu Phe Lys Asp Pro Glu His
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195 200 205
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225 230 235 240
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275 280 285
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Met Lys Glu Gln Lys Asn Leu Gly Phe Asn Ile Thr Lys Leu Arg Glu
325 330 335
Val Met Leu Asp Arg Lys Asp Met Ser Glu Ile Arg Lys Asn His Lys
340 345 350
Val Phe Asp Ser Ile Arg Thr Lys Val Tyr Thr Met Met Asp Phe Val
355 360 365
Ile Tyr Arg Tyr Tyr Ile Glu Glu Asp Ala Lys Val Ala Ala Ala Asn
370 375 380
Lys Ser Leu Pro Asp Asn Glu Lys Ser Leu Ser Glu Lys Asp Ile Phe
385 390 395 400
Val Ile Asn Leu Arg Gly Ser Phe Asn Asp Asp Gln Lys Asp Ala Leu
405 410 415
Tyr Tyr Asp Glu Ala Asn Arg Ile Trp Arg Lys Leu Glu Asn Ile Met
420 425 430
His Asn Ile Lys Glu Phe Arg Gly Asn Lys Thr Arg Glu Tyr Lys Lys
435 440 445
Lys Asp Ala Pro Arg Leu Pro Arg Ile Leu Pro Ala Gly Arg Asp Val
450 455 460
Ser Ala Phe Ser Lys Leu Met Tyr Ala Leu Thr Met Phe Leu Asp Gly
465 470 475 480
Lys Glu Ile Asn Asp Leu Leu Thr Thr Leu Ile Asn Lys Phe Asp Asn
485 490 495
Ile Gln Ser Phe Leu Lys Val Met Pro Leu Ile Gly Val Asn Ala Lys
500 505 510
Phe Val Glu Glu Tyr Ala Phe Phe Lys Asp Ser Ala Lys Ile Ala Asp
515 520 525
Glu Leu Arg Leu Ile Lys Ser Phe Ala Arg Met Gly Glu Pro Ile Ala
530 535 540
Asp Ala Arg Arg Ala Met Tyr Ile Asp Ala Ile Arg Ile Leu Gly Thr
545 550 555 560
Asn Leu Ser Tyr Asp Glu Leu Lys Ala Leu Ala Asp Thr Phe Ser Leu
565 570 575
Asp Glu Asn Gly Asn Lys Leu Lys Lys Gly Lys His Gly Met Arg Asn
580 585 590
Phe Ile Ile Asn Asn Val Ile Ser Asn Lys Arg Phe His Tyr Leu Ile
595 600 605
Arg Tyr Gly Asp Pro Ala His Leu His Glu Ile Ala Lys Asn Glu Ala
610 615 620
Val Val Lys Phe Val Leu Gly Arg Ile Ala Asp Ile Gln Lys Lys Gln
625 630 635 640
Gly Gln Asn Gly Lys Asn Gln Ile Asp Arg Tyr Tyr Glu Thr Cys Ile
645 650 655
Gly Lys Asp Lys Gly Lys Ser Val Ser Glu Lys Val Asp Ala Leu Thr
660 665 670
Lys Ile Ile Thr Gly Met Asn Tyr Asp Gln Phe Asp Lys Lys Arg Ser
675 680 685
Val Ile Glu Asp Thr Gly Arg Glu Asn Ala Glu Arg Glu Lys Phe Lys
690 695 700
Lys Ile Ile Ser Leu Tyr Leu Thr Val Ile Tyr His Ile Leu Lys Asn
705 710 715 720
Ile Val Asn Ile Asn Ala Arg Tyr Val Ile Gly Phe His Cys Val Glu
725 730 735
Arg Asp Ala Gln Leu Tyr Lys Glu Lys Gly Tyr Asp Ile Asn Leu Lys
740 745 750
Lys Leu Glu Glu Lys Gly Phe Ser Ser Val Thr Lys Leu Cys Ala Gly
755 760 765
Ile Asp Glu Thr Ala Pro Asp Lys Arg Lys Asp Val Glu Lys Glu Met
770 775 780
Ala Glu Arg Ala Lys Glu Ser Ile Asp Ser Leu Glu Ser Ala Asn Pro
785 790 795 800
Lys Leu Tyr Ala Asn Tyr Ile Lys Tyr Ser Asp Glu Lys Lys Ala Glu
805 810 815
Glu Phe Thr Arg Gln Ile Asn Arg Glu Lys Ala Lys Thr Ala Leu Asn
820 825 830
Ala Tyr Leu Arg Asn Thr Lys Trp Asn Val Ile Ile Arg Glu Asp Leu
835 840 845
Leu Arg Ile Asp Asn Lys Thr Cys Thr Leu Phe Ala Asn Lys Ala Val
850 855 860
Ala Leu Glu Val Ala Arg Tyr Val His Ala Tyr Ile Asn Asp Ile Ala
865 870 875 880
Glu Val Asn Ser Tyr Phe Gln Leu Tyr His Tyr Ile Met Gln Arg Ile
885 890 895
Ile Met Asn Glu Arg Tyr Glu Lys Ser Ser Gly Lys Val Ser Glu Tyr
900 905 910
Phe Asp Ala Val Asn Asp Glu Lys Lys Tyr Asn Asp Arg Leu Leu Lys
915 920 925
Leu Leu Cys Val Pro Phe Gly Tyr Cys Ile Pro Arg Phe Lys Asn Leu
930 935 940
Ser Ile Glu Ala Leu Phe Asp Arg Asn Glu Ala Ala Lys Phe Asp Lys
945 950 955 960
Glu Lys Lys Lys Val Ser Gly Asn Ser Gly Ser Gly Pro Lys Lys Lys
965 970 975
Arg Lys Val Ala Ala Ala Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala
980 985 990
<210> 125
<211> 1094
<212> PRT
<213> Prevotella sp.
<400> 125
Met Asn Ile Pro Ala Leu Val Glu Asn Gln Lys Lys Tyr Phe Gly Thr
1 5 10 15
Tyr Ser Val Met Ala Met Leu Asn Ala Gln Thr Val Leu Asp His Ile
20 25 30
Gln Lys Val Ala Asp Ile Glu Gly Glu Gln Asn Glu Asn Asn Glu Asn
35 40 45
Leu Trp Phe His Pro Val Met Ser His Leu Tyr Asn Ala Lys Asn Gly
50 55 60
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65 70 75 80
Ser Tyr Phe Pro Phe Leu Lys Ile Met Ala Glu Asn Gln Arg Glu Tyr
85 90 95
Ser Asn Gly Lys Tyr Lys Gln Asn Arg Val Glu Val Asn Ser Asn Asp
100 105 110
Ile Phe Glu Val Leu Lys Arg Ala Phe Gly Val Leu Lys Met Tyr Arg
115 120 125
Asp Leu Thr Asn His Tyr Lys Thr Tyr Glu Glu Lys Leu Asn Asp Gly
130 135 140
Cys Glu Phe Leu Thr Ser Thr Glu Gln Pro Leu Ser Gly Met Ile Asn
145 150 155 160
Asn Tyr Tyr Thr Val Ala Leu Arg Asn Met Asn Glu Arg Tyr Gly Tyr
165 170 175
Lys Thr Glu Asp Leu Ala Phe Ile Gln Asp Lys Arg Phe Lys Phe Val
180 185 190
Lys Asp Ala Tyr Gly Lys Lys Lys Ser Gln Val Asn Thr Gly Phe Phe
195 200 205
Leu Ser Leu Gln Asp Tyr Asn Gly Asp Thr Gln Lys Lys Leu His Leu
210 215 220
Ser Gly Val Gly Ile Ala Leu Leu Ile Cys Leu Phe Leu Asp Lys Gln
225 230 235 240
Tyr Ile Asn Ile Phe Leu Ser Arg Leu Pro Ile Phe Ser Ser Tyr Asn
245 250 255
Ala Gln Ser Glu Glu Arg Arg Ile Ile Ile Arg Ser Phe Gly Ile Asn
260 265 270
Ser Ile Lys Leu Pro Lys Asp Arg Ile His Ser Glu Lys Ser Asn Lys
275 280 285
Ser Val Ala Met Asp Met Leu Asn Glu Val Lys Arg Cys Pro Asp Glu
290 295 300
Leu Phe Thr Thr Leu Ser Ala Glu Lys Gln Ser Arg Phe Arg Ile Ile
305 310 315 320
Ser Asp Asp His Asn Glu Val Leu Met Lys Arg Ser Ser Asp Arg Phe
325 330 335
Val Pro Leu Leu Leu Gln Tyr Ile Asp Tyr Gly Lys Leu Phe Asp His
340 345 350
Ile Arg Phe His Val Asn Met Gly Lys Leu Arg Tyr Leu Leu Lys Ala
355 360 365
Asp Lys Thr Cys Ile Asp Gly Gln Thr Arg Val Arg Val Ile Glu Gln
370 375 380
Pro Leu Asn Gly Phe Gly Arg Leu Glu Glu Ala Glu Thr Met Arg Lys
385 390 395 400
Gln Glu Asn Gly Thr Phe Gly Asn Ser Gly Ile Arg Ile Arg Asp Phe
405 410 415
Glu Asn Met Lys Arg Asp Asp Ala Asn Pro Ala Asn Tyr Pro Tyr Ile
420 425 430
Val Asp Thr Tyr Thr His Tyr Ile Leu Glu Asn Asn Lys Val Glu Met
435 440 445
Phe Ile Asn Asp Lys Glu Asp Ser Ala Pro Leu Leu Pro Val Ile Glu
450 455 460
Asp Asp Arg Tyr Val Val Lys Thr Ile Pro Ser Cys Arg Met Ser Thr
465 470 475 480
Leu Glu Ile Pro Ala Met Ala Phe His Met Phe Leu Phe Gly Ser Lys
485 490 495
Lys Thr Glu Lys Leu Ile Val Asp Val His Asn Arg Tyr Lys Arg Leu
500 505 510
Phe Gln Ala Met Gln Lys Glu Glu Val Thr Ala Glu Asn Ile Ala Ser
515 520 525
Phe Gly Ile Ala Glu Ser Asp Leu Pro Gln Lys Ile Leu Asp Leu Ile
530 535 540
Ser Gly Asn Ala His Gly Lys Asp Val Asp Ala Phe Ile Arg Leu Thr
545 550 555 560
Val Asp Asp Met Leu Thr Asp Thr Glu Arg Arg Ile Lys Arg Phe Lys
565 570 575
Asp Asp Arg Lys Ser Ile Arg Ser Ala Asp Asn Lys Met Gly Lys Arg
580 585 590
Gly Phe Lys Gln Ile Ser Thr Gly Lys Leu Ala Asp Phe Leu Ala Lys
595 600 605
Asp Ile Val Leu Phe Gln Pro Ser Val Asn Asp Gly Glu Asn Lys Ile
610 615 620
Thr Gly Leu Asn Tyr Arg Ile Met Gln Ser Ala Ile Ala Val Tyr Asp
625 630 635 640
Ser Gly Asp Asp Tyr Glu Ala Lys Gln Gln Phe Lys Leu Met Phe Glu
645 650 655
Lys Ala Arg Leu Ile Gly Lys Gly Thr Thr Glu Pro His Pro Phe Leu
660 665 670
Tyr Lys Val Phe Ala Arg Ser Ile Pro Ala Asn Ala Val Glu Phe Tyr
675 680 685
Glu Arg Tyr Leu Ile Glu Arg Lys Phe Tyr Leu Thr Gly Leu Ser Asn
690 695 700
Glu Ile Lys Lys Gly Asn Arg Val Asp Val Pro Phe Ile Arg Arg Asp
705 710 715 720
Gln Asn Lys Trp Lys Thr Pro Ala Met Lys Thr Leu Gly Arg Ile Tyr
725 730 735
Ser Glu Asp Leu Pro Val Glu Leu Pro Arg Gln Met Phe Asp Asn Glu
740 745 750
Ile Lys Ser His Leu Lys Ser Leu Pro Gln Met Glu Gly Ile Asp Phe
755 760 765
Asn Asn Ala Asn Val Thr Tyr Leu Ile Ala Glu Tyr Met Lys Arg Val
770 775 780
Leu Asp Asp Asp Phe Gln Thr Phe Tyr Gln Trp Asn Arg Asn Tyr Arg
785 790 795 800
Tyr Met Asp Met Leu Lys Gly Glu Tyr Asp Arg Lys Gly Ser Leu Gln
805 810 815
His Cys Phe Thr Ser Val Glu Glu Arg Glu Gly Leu Trp Lys Glu Arg
820 825 830
Ala Ser Arg Thr Glu Arg Tyr Arg Lys Gln Ala Ser Asn Lys Ile Arg
835 840 845
Ser Asn Arg Gln Met Arg Asn Ala Ser Ser Glu Glu Ile Glu Thr Ile
850 855 860
Leu Asp Lys Arg Leu Ser Asn Ser Arg Asn Glu Tyr Gln Lys Ser Glu
865 870 875 880
Lys Val Ile Arg Arg Tyr Arg Val Gln Asp Ala Leu Leu Phe Leu Leu
885 890 895
Ala Lys Lys Thr Leu Thr Glu Leu Ala Asp Phe Asp Gly Glu Arg Phe
900 905 910
Lys Leu Lys Glu Ile Met Pro Asp Ala Glu Lys Gly Ile Leu Ser Glu
915 920 925
Ile Met Pro Met Ser Phe Thr Phe Glu Lys Gly Gly Lys Lys Tyr Thr
930 935 940
Ile Thr Ser Glu Gly Met Lys Leu Lys Asn Tyr Gly Asp Phe Phe Val
945 950 955 960
Leu Ala Ser Asp Lys Arg Ile Gly Asn Leu Leu Glu Leu Val Gly Ser
965 970 975
Asp Ile Val Ser Lys Glu Asp Ile Met Glu Glu Phe Asn Lys Tyr Asp
980 985 990
Gln Cys Arg Pro Glu Ile Ser Ser Ile Val Phe Asn Leu Glu Lys Trp
995 1000 1005
Ala Phe Asp Thr Tyr Pro Glu Leu Ser Ala Arg Val Asp Arg Glu
1010 1015 1020
Glu Lys Val Asp Phe Lys Ser Ile Leu Lys Ile Leu Leu Asn Asn
1025 1030 1035
Lys Asn Ile Asn Lys Glu Gln Ser Asp Ile Leu Arg Lys Ile Arg
1040 1045 1050
Asn Ala Phe Asp His Asn Asn Tyr Pro Asp Lys Gly Val Val Glu
1055 1060 1065
Ile Lys Ala Leu Pro Glu Ile Ala Met Ser Ile Lys Lys Ala Phe
1070 1075 1080
Gly Glu Tyr Ala Ile Met Lys Gly Ser Leu Gln
1085 1090
<210> 126
<211> 25
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide
<400> 126
Ile Trp Leu Thr Ala Leu Lys Phe Leu Gly Lys His Ala Ala Lys His
1 5 10 15
Glu Ala Lys Gln Gln Leu Ser Lys Leu
20 25
<210> 127
<211> 75
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 127
Ile Trp Leu Thr Ala Leu Lys Phe Leu Gly Lys His Ala Ala Lys His
1 5 10 15
Glu Ala Lys Gln Gln Leu Ser Lys Leu Asn Ala Val Gly Gln Asp Thr
20 25 30
Gln Glu Val Ile Val Val Pro His Ser Leu Pro Phe Lys Val Val Val
35 40 45
Ile Ser Ala Ile Leu Ala Leu Val Val Leu Thr Ile Ile Ser Leu Ile
50 55 60
Ile Leu Ile Met Leu Trp Gln Lys Lys Pro Arg
65 70 75
<210> 128
<211> 30
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 128
Trp Glu Ala Lys Leu Ala Lys Ala Leu Ala Lys Ala Leu Ala Lys His
1 5 10 15
Leu Ala Lys Ala Leu Ala Lys Ala Leu Lys Ala Cys Glu Ala
20 25 30
<210> 129
<211> 80
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 129
Trp Glu Ala Lys Leu Ala Lys Ala Leu Ala Lys Ala Leu Ala Lys His
1 5 10 15
Leu Ala Lys Ala Leu Ala Lys Ala Leu Lys Ala Cys Glu Ala Asn Ala
20 25 30
Val Gly Gln Asp Thr Gln Glu Val Ile Val Val Pro His Ser Leu Pro
35 40 45
Phe Lys Val Val Val Ile Ser Ala Ile Leu Ala Leu Val Val Leu Thr
50 55 60
Ile Ile Ser Leu Ile Ile Leu Ile Met Leu Trp Gln Lys Lys Pro Arg
65 70 75 80
<210> 130
<211> 26
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide
<400> 130
Lys Lys Ala Leu Leu His Ala Ala Leu Ala His Leu Leu Ala Leu Ala
1 5 10 15
His His Leu Leu Ala Leu Leu Lys Lys Ala
20 25
<210> 131
<211> 76
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 131
Lys Lys Ala Leu Leu His Ala Ala Leu Ala His Leu Leu Ala Leu Ala
1 5 10 15
His His Leu Leu Ala Leu Leu Lys Lys Ala Asn Ala Val Gly Gln Asp
20 25 30
Thr Gln Glu Val Ile Val Val Pro His Ser Leu Pro Phe Lys Val Val
35 40 45
Val Ile Ser Ala Ile Leu Ala Leu Val Val Leu Thr Ile Ile Ser Leu
50 55 60
Ile Ile Leu Ile Met Leu Trp Gln Lys Lys Pro Arg
65 70 75
<210> 132
<211> 50
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide
<400> 132
Asn Ala Val Gly Gln Asp Thr Gln Glu Val Ile Val Val Pro His Ser
1 5 10 15
Leu Pro Phe Lys Val Val Val Ile Ser Ala Ile Leu Ala Leu Val Val
20 25 30
Leu Thr Ile Ile Ser Leu Ile Ile Leu Ile Met Leu Trp Gln Lys Lys
35 40 45
Pro Arg
50
<210> 133
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 133
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 134
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 134
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr Cys Asn Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 135
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 135
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr Cys Asn Cys Ser Val His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 136
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 136
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Val Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Leu Lys Thr Ala Thr Cys Asn Cys Ser Val His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 137
<211> 34
<212> PRT
<213> Streptococcus hyointestinalis
<400> 137
Phe Thr Ser Ile Ser Met Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Thr Cys Asn Tyr Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Ser Ile Lys Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 138
<211> 31
<212> PRT
<213> Streptococcus uberis
<400> 138
Ile Thr Ser Lys Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ile Leu
1 5 10 15
Met Thr Cys Pro Leu Lys Thr Ala Thr Cys Gly Cys His Phe Gly
20 25 30
<210> 139
<211> 31
<212> PRT
<213> Streptococcus uberis
<400> 139
Val Thr Ser Lys Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ile Leu
1 5 10 15
Met Thr Cys Pro Leu Lys Thr Ala Thr Cys Gly Cys His Phe Gly
20 25 30
<210> 140
<211> 31
<212> PRT
<213> Streptococcus gallolyticus
<400> 140
Val Thr Ser Lys Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ile Leu
1 5 10 15
Met Thr Cys Ala Ile Lys Thr Ala Thr Cys Gly Cys His Phe Gly
20 25 30
<210> 141
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 141
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Ala Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 142
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 142
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Asp Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 143
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 143
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Glu Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 144
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 144
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Gly Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 145
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 145
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Thr Thr Ala Thr Cys His Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 146
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 146
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Pro Met Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 147
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 147
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Val Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 148
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 148
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Ser Thr Ala Thr Cys His Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 149
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 149
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Lys Met Lys Thr Ala Thr Cys Asn Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 150
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 150
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Lys Lys Thr Ala Thr Cys Asn Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 151
<211> 143
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 151
guuuuagagc uaggccaaca ugaggaucac ccaugucugc agggccuagc aaguuaaaau 60
aaggcuaguc cguuaucaac uuggccaaca ugaggaucac ccaugucugc agggccaagu 120
ggcaccgagu cggugcuuuu uuu 143
<210> 152
<211> 199
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 152
guuuuagagc uaggccaaca ugaggaucac ccaugucugc agggccuagc aaguuaaaau 60
aaggcuaguc cguuaucaac uuggccaaca ugaggaucac ccaugucugc agggccaagu 120
ggcaccgagu cggugcggga gcacaugagg aucacccaug ugcgacuccc acagucacug 180
gggagucuuc ccuuuuuuu 199
<210> 153
<211> 149
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 153
guuuaagagc uaugcuggaa acagcauagc aaguuuaaau aaggcuaguc cguuaucaac 60
uugaaaaagu ggcaccgagu cggugcggga gcacaugagg aucacccaug ugcgacuccc 120
acagucacug gggagucuuc ccuuuuuuu 149
<210> 154
<211> 186
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 154
uucuagauca ucgaaacaug aggaucaccc auaucugcag ucgacaucga aacaugagga 60
ucacccaugu cugcagucga caucgaaaca ugaggaucac ccaugucugc agucgacauc 120
gaaacaugag gaucacccau gucugcaguc gacaucgaaa ucgauaagcu ucagaucaga 180
uccuag 186
<210> 155
<211> 19
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 155
acaugaggau cacccaugu 19
<210> 156
<211> 19
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 156
acaugaggau cacccauau 19
<210> 157
<211> 14
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 157
ccacagucac uggg 14
<210> 158
<211> 89
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 158
acaugaggau cacccauguc ugcagggccu agcaaguuaa aauaaggcua guccguuauc 60
aacuuggcca acaugaggau cacccaugu 89
<210> 159
<211> 141
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 159
guuuuagagc uaggccggag cagacgauau ggcgucgcuc cggccuagca aguuaaaaua 60
aggcuagucc guuaucaacu uggccggagc agacgauaug gcgucgcucc ggccaagugg 120
caccgagucg gugcuuuuuu u 141
<210> 160
<211> 32
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 160
gccggagcag acgauauggc gucgcuccgg cc 32
<210> 161
<211> 112
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 161
guuuaagagc uaugcuggaa acagcauagc aaguuuaaau aaggcuaguc cguuaucaac 60
uugaaaaagu ggcaccgagu cggugccuga augccugcga gcaucuuuuu uu 112
<210> 162
<211> 19
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 162
cugaaugccu gcgagcauc 19
<210> 163
<211> 448
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 163
agugacagug gagauuguac aguuuuuucc ucgauuuguc aggauuuuuu uuuuuugacg 60
gaguuuaacu ucuugucucc cagguaggaa gugcaguggc guaaucucgg cucacuacaa 120
ccuccaccuc cuggguucaa gcguuucucc ugccucagcu uuccgaguag cugggauuac 180
aggcgccugc caccaugccc ugcugacuuu uguauuuuua guagagacgg gguuucacca 240
uguuggccag gcuggucuug aacuccugac cgcaggcgau uggccugccu cggccuccca 300
aagugcugag auuacaggcg ugagccacca cccccggccu caggagcguu cugauagugc 360
cucgaugugc ugccuccuau aaaguguuag cagcacagau cacuuuuugu aaagguacgu 420
acuaaugacu uuuuuuuuau acuucagg 448
<210> 164
<211> 796
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 164
uaagaagcaa gguuucauuu aggggaaggg aaaugauuca ggacgagagu cuuugugcug 60
cugagugccu gugaugaaga agcauguuag uccugggcaa cguagcgaga ccccaucucu 120
acaaaaaaua gaaaaauuag ccagguauag uggcgcacac cugugauucc agcuacgcag 180
gaggcugagg ugggaggauu gcuugagccc aggagguuga ggcugcagug agcuguaauc 240
augccacuac uccaaccugg gcaacacagc aaggacccug ucucaaaagc uacuuacaga 300
aaagaauuag gcucggcacg guagcucaca ccuguaaucc cagcacuuug ggaggcugag 360
gcgggcagau cacuugaggu caggaguuug agaccagccu ggccaacaug gugaaaccuu 420
gucucuacua aaaauaugaa aauuagccag gcaugguggc acauuccugu aaucccagcu 480
acucgggagg cugaggcagg agaaucacuu gaacccagga gguggagguu gcaguaagcc 540
gagaucguac cacugugcuc uagccuuggu gacagagcga gacugucuua aaaaaaaaaa 600
aaaaaaaaaa agaauuaauu aaaaauuuaa aaaaaaauga aaaaaagcug caugcuuguu 660
uuuuguuuuu aguuauucua cauuguuguc auuauuacca aauauugggg aaaauacaac 720
uuacagacca aucucaggag uuaaauguua cuacgaaggc aaaugaacua ugcguaauga 780
accugguagg cauuag 796
<210> 165
<211> 133
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 165
guaaguauca agguuacaag acagguuuaa ggagaccaau agaaacuggg cuugucgaga 60
cagagaagac ucuugcguuu cugauaggca ccuauugguc uuacugacau ccacuuugcc 120
uuucucucca cag 133
<210> 166
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 166
gaagaagctg caggaggt 18
<210> 167
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 167
gctggagggg aagtggtc 18
<210> 168
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 168
gaagaagctg caggaggtgc tggaggggaa gtggtc 36
<210> 169
<211> 346
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 169
tgaagaagct gcaggaggtg ctggagggga agtggtccgg atcttgaaga agctgcagga 60
ggtgctggag gggaagtggt ccggatcttg aagaagctgc aggaggtgct ggaggggaag 120
tggtccggat cttgaagaag ctgcaggagg tgctggaggg gaagtggtcc ggatcttgaa 180
gaagctgcag gaggtgctgg aggggaagtg gtccggatct tgaagaagct gcaggaggtg 240
ctggagggga agtggtccgg atcttgaaga agctgcagga ggtgctggag gggaagtggt 300
ccggatcttg aagaagctgc aggaggtgct ggaggggaag tggtcc 346
<210> 170
<211> 9
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 170
gtagatgga 9
<210> 171
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 171
cggcgtagcc gatgtcgcgc 20
<210> 172
<211> 9
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 172
aagggttca 9
<210> 173
<211> 9
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 173
gcgtgggcg 9
<210> 174
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 174
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<210> 175
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 175
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<210> 176
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 176
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<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
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<211> 4215
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 178
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gtggaaaaca cccagctgca gaacgagaag ctgtacctgt actacctgca gaatgggcgg 2460
gatatgtacg tggaccagga actggacatc aaccggctgt ccgactacga tgtggaccat 2520
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tattctgtgc tggtggtggc caaagtggaa aagggcaagt ccaagaaact gaagagtgtg 3480
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tactccctgt tcgagctgga aaacggccgg aagagaatgc tggcctctgc cggcgaactg 3660
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cactatgaga agctgaaggg ctcccccgag gataatgagc agaaacagct gtttgtggaa 3780
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<210> 179
<211> 4260
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 179
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gccgacgcta atctggacaa agtgctgtcc gcctacaaca agcaccggga taagcccatc 4740
agagagcagg ccgagaatat catccacctg tttaccctga ccaatctggg agcccctgcc 4800
gccttcaagt actttgacac caccatcgac cggaagaggt acaccagcac caaagaggtg 4860
ctggacgcca ccctgatcca ccagagcatc accggcctgt acgagacacg gatcgacctg 4920
tctcagctgg gaggtgacag cggcgggagc ggcgggagcg gggggagcac taatctgagc 4980
gacatcattg agaaggagac tgggaaacag ctggtcattc aggagtccat cctgatgctg 5040
cctgaggagg tggaggaagt gatcggcaac aagccagagt ctgacatcct ggtgcacacc 5100
gcctacgacg agtccacaga tgagaatgtg atgctgctga cctctgacgc ccccgagtat 5160
aagccttggg ccctggtcat ccaggattct aacggcgaga ataagatcaa gatgctgagc 5220
ggaggatccg gaggatctgg aggcagcacc aacctgtctg acatcatcga gaaggagaca 5280
ggcaagcagc tggtcatcca ggagagcatc ctgatgctgc ccgaagaagt cgaagaagtg 5340
atcggaaaca agcctgagag cgatatcctg gtccataccg cctacgacga gagtaccgac 5400
gaaaatgtga tgctgctgac atccgacgcc ccagagtata agccctgggc tctggtcatc 5460
caggattcca acggagagaa caaaatcaaa atgctgtctg gcggctcaaa aagaaccgcc 5520
gacggcagcg aattcgagcc caagaagaag aggaaagtct aa 5562
<210> 181
<211> 5412
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 181
atgaaacgga cagccgacgg aagcgagttc gagtcaccaa agaagaagcg gaaagtctct 60
gaagtcgagt ttagccacga gtattggatg aggcacgcac tgaccctggc aaagcgagca 120
tgggatgaaa gagaagtccc cgtgggcgcc gtgctggtgc acaacaatag agtgatcgga 180
gagggatgga acaggccaat cggccgccac gaccctaccg cacacgcaga gatcatggca 240
ctgaggcagg gaggcctggt catgcagaat taccgcctga tcgatgccac cctgtatgtg 300
acactggagc catgcgtgat gtgcgcagga gcaatgatcc acagcaggat cggaagagtg 360
gtgttcggag cacgggacgc caagaccggc gcagcaggct ccctgatgga tgtgctgcac 420
caccccggca tgaaccaccg ggtggagatc acagagggaa tcctggcaga cgagtgcgcc 480
gccctgctga gcgatttctt tagaatgcgg agacaggaga tcaaggccca gaagaaggca 540
cagagctcca ccgactctgg aggatctagc ggaggatcct ctggaagcga gacaccaggc 600
acaagcgagt ccgccacacc agagagctcc ggcggctcct ccggaggatc ctctgaggtg 660
gagttttccc acgagtactg gatgagacat gccctgaccc tggccaagag ggcacgcgat 720
gagagggagg tgcctgtggg agccgtgctg gtgctgaaca atagagtgat cggcgagggc 780
tggaacagag ccatcggcct gcacgaccca acagcccatg ccgaaattat ggccctgaga 840
cagggcggcc tggtcatgca gaactacaga ctgattgacg ccaccctgta cgtgacattc 900
gagccttgcg tgatgtgcgc cggcgccatg atccactcta ggatcggccg cgtggtgttt 960
ggcgtgagga acgcaaaaac cggcgccgca ggctccctga tggacgtgct gcactacccc 1020
ggcatgaatc accgcgtcga aattaccgag ggaatcctgg cagatgaatg tgccgccctg 1080
ctgtgctatt tctttcggat gcctagacag gtgttcaatg ctcagaagaa ggcccagagc 1140
tccaccgact ccggaggatc tagcggaggc tcctctggct ctgagacacc tggcacaagc 1200
gagagcgcaa cacctgaaag cagcgggggc agcagcgggg ggtcagacaa gaagtacagc 1260
atcggcctgg ccatcggcac caactctgtg ggctgggccg tgatcaccga cgagtacaag 1320
gtgcccagca agaaattcaa ggtgctgggc aacaccgacc ggcacagcat caagaagaac 1380
ctgatcggag ccctgctgtt cgacagcggc gaaacagccg aggccacccg gctgaagaga 1440
accgccagaa gaagatacac cagacggaag aaccggatct gctatctgca agagatcttc 1500
agcaacgaga tggccaaggt ggacgacagc ttcttccaca gactggaaga gtccttcctg 1560
gtggaagagg ataagaagca cgagcggcac cccatcttcg gcaacatcgt ggacgaggtg 1620
gcctaccacg agaagtaccc caccatctac cacctgagaa agaaactggt ggacagcacc 1680
gacaaggccg acctgcggct gatctatctg gccctggccc acatgatcaa gttccggggc 1740
cacttcctga tcgagggcga cctgaacccc gacaacagcg acgtggacaa gctgttcatc 1800
cagctggtgc agacctacaa ccagctgttc gaggaaaacc ccatcaacgc cagcggcgtg 1860
gacgccaagg ccatcctgtc tgccagactg agcaagagca gacggctgga aaatctgatc 1920
gcccagctgc ccggcgagaa gaagaatggc ctgttcggaa acctgattgc cctgagcctg 1980
ggcctgaccc ccaacttcaa gagcaacttc gacctggccg aggatgccaa actgcagctg 2040
agcaaggaca cctacgacga cgacctggac aacctgctgg cccagatcgg cgaccagtac 2100
gccgacctgt ttctggccgc caagaacctg tccgacgcca tcctgctgag cgacatcctg 2160
agagtgaaca ccgagatcac caaggccccc ctgagcgcct ctatgatcaa gagatacgac 2220
gagcaccacc aggacctgac cctgctgaaa gctctcgtgc ggcagcagct gcctgagaag 2280
tacaaagaga ttttcttcga ccagagcaag aacggctacg ccggctacat tgacggcgga 2340
gccagccagg aagagttcta caagttcatc aagcccatcc tggaaaagat ggacggcacc 2400
gaggaactgc tcgtgaagct gaacagagag gacctgctgc ggaagcagcg gaccttcgac 2460
aacggcagca tcccccacca gatccacctg ggagagctgc acgccattct gcggcggcag 2520
gaagattttt acccattcct gaaggacaac cgggaaaaga tcgagaagat cctgaccttc 2580
cgcatcccct actacgtggg ccctctggcc aggggaaaca gcagattcgc ctggatgacc 2640
agaaagagcg aggaaaccat caccccctgg aacttcgagg aagtggtgga caagggcgct 2700
tccgcccaga gcttcatcga gcggatgacc aacttcgata agaacctgcc caacgagaag 2760
gtgctgccca agcacagcct gctgtacgag tacttcaccg tgtataacga gctgaccaaa 2820
gtgaaatacg tgaccgaggg aatgagaaag cccgccttcc tgagcggcga gcagaaaaag 2880
gccatcgtgg acctgctgtt caagaccaac cggaaagtga ccgtgaagca gctgaaagag 2940
gactacttca agaaaatcga gtgcttcgac tccgtggaaa tctccggcgt ggaagatcgg 3000
ttcaacgcct ccctgggcac ataccacgat ctgctgaaaa ttatcaagga caaggacttc 3060
ctggacaatg aggaaaacga ggacattctg gaagatatcg tgctgaccct gacactgttt 3120
gaggacagag agatgatcga ggaacggctg aaaacctatg cccacctgtt cgacgacaaa 3180
gtgatgaagc agctgaagcg gcggagatac accggctggg gcaggctgag ccggaagctg 3240
atcaacggca tccgggacaa gcagtccggc aagacaatcc tggatttcct gaagtccgac 3300
ggcttcgcca acagaaactt catgcagctg atccacgacg acagcctgac ctttaaagag 3360
gacatccaga aagcccaggt gtccggccag ggcgatagcc tgcacgagca cattgccaat 3420
ctggccggca gccccgccat taagaagggc atcctgcaga cagtgaaggt ggtggacgag 3480
ctcgtgaaag tgatgggccg gcacaagccc gagaacatcg tgatcgaaat ggccagagag 3540
aaccagacca cccagaaggg acagaagaac agccgcgaga gaatgaagcg gatcgaagag 3600
ggcatcaaag agctgggcag ccagatcctg aaagaacacc ccgtggaaaa cacccagctg 3660
cagaacgaga agctgtacct gtactacctg cagaatgggc gggatatgta cgtggaccag 3720
gaactggaca tcaaccggct gtccgactac gatgtggacc atatcgtgcc tcagagcttt 3780
ctgaaggacg actccatcga caacaaggtg ctgaccagaa gcgacaagaa ccggggcaag 3840
agcgacaacg tgccctccga agaggtcgtg aagaagatga agaactactg gcggcagctg 3900
ctgaacgcca agctgattac ccagagaaag ttcgacaatc tgaccaaggc cgagagaggc 3960
ggcctgagcg aactggataa ggccggcttc atcaagagac agctggtgga aacccggcag 4020
atcacaaagc acgtggcaca gatcctggac tcccggatga acactaagta cgacgagaat 4080
gacaagctga tccgggaagt gaaagtgatc accctgaagt ccaagctggt gtccgatttc 4140
cggaaggatt tccagtttta caaagtgcgc gagatcaaca actaccacca cgcccacgac 4200
gcctacctga acgccgtcgt gggaaccgcc ctgatcaaaa agtaccctaa gctggaaagc 4260
gagttcgtgt acggcgacta caaggtgtac gacgtgcgga agatgatcgc caagagcgag 4320
caggaaatcg gcaaggctac cgccaagtac ttcttctaca gcaacatcat gaactttttc 4380
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ggcgaaaccg gggagatcgt gtgggataag ggccgggatt ttgccaccgt gcggaaagtg 4500
ctgagcatgc cccaagtgaa tatcgtgaaa aagaccgagg tgcagacagg cggcttcagc 4560
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gaccctaaga agtacggcgg cttcgacagc cccaccgtgg cctattctgt gctggtggtg 4680
gccaaagtgg aaaagggcaa gtccaagaaa ctgaagagtg tgaaagagct gctggggatc 4740
accatcatgg aaagaagcag cttcgagaag aatcccatcg actttctgga agccaagggc 4800
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gaaaacggcc ggaagagaat gctggcctct gccggcgaac tgcagaaggg aaacgaactg 4920
gccctgccct ccaaatatgt gaacttcctg tacctggcca gccactatga gaagctgaag 4980
ggctcccccg aggataatga gcagaaacag ctgtttgtgg aacagcacaa gcactacctg 5040
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ctggacaaag tgctgtccgc ctacaacaag caccgggata agcccatcag agagcaggcc 5160
gagaatatca tccacctgtt taccctgacc aatctgggag cccctgccgc cttcaagtac 5220
tttgacacca ccatcgaccg gaagaggtac accagcacca aagaggtgct ggacgccacc 5280
ctgatccacc agagcatcac cggcctgtac gagacacgga tcgacctgtc tcagctggga 5340
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<210> 182
<211> 1536
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
<400> 182
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cctagctcta gcgaccttaa ttggcataac gacctgatcg gcacagccct gcaggtgaag 180
atgcctaaga gccacaaggc catccaggcc gacggatgga tgtgccacgc cagcaagtgg 240
gtcacaacct gtgacttcag atggtacggc cctaaataca ttacccactc tatcagaagc 300
ttcacccctt ctgtggaaca atgtaaagag tccattgagc agacaaagca gggcacctgg 360
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ttcgccgctg ccagattccc agagtgccct gagggcagct ccatcagcgc cccttcccag 840
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<210> 183
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 183
tggggcccag actgagcacg tga 23
<210> 184
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 184
tgtctgtgtg ggtgagtgag tgtgtgcgtg 30
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<211> 30
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<213> Artificial Sequence
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<400> 185
caatccttgg ggcccagact gagcacgtga 30
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<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 186
gaccccctcc accccgcctc 20
Claims (25)
- 하기를 포함하는, 증강된 바이러스-유사 입자 (eVLP)로서:
외부 측 상에 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질, 임의적으로 표 1에 제시된 바와 같은 당단백질을 보유하는 인지질 이중층을 포함하는 막; 및
막 내측 상의 eVLP 코어에 배치되는 카고,
여기서 eVLP는 외인성 gag 및/또는 pol 단백질을 포함하지 않는 것인
eVLP. - 제1항에 있어서, 카고가 치료용 또는 진단용 단백질, 또는 치료용 또는 진단용 단백질을 코딩하는 핵산, 또는 화학물질, 임의적으로 소형 분자 치료제 또는 진단제인 eVLP.
- 제1항에 있어서, 카고가 유전자 편집 시약인 eVLP.
- 제1항에 있어서, 유전자 편집 시약이 아연 핑거 (ZF), 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE) 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질; 아연 핑거 (ZF), 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE) 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 코딩하는 핵산; 또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 포함하는 리보핵단백질 복합체 (RNP)를 포함하는 것인 eVLP.
- 제4항에 있어서, 유전자 편집 시약이 표 2, 3, 4 & 5에 열거되어 있는 단백질로부터 선택되는 것인 eVLP.
- 제4항에 있어서, 유전자 편집 시약이 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 포함하고, eVLP가 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질에 결합하여 그를 표적 서열로 안내하는 1종 이상의 가이드 RNA를 추가로 포함하는 것인 eVLP.
- 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 카고가, 바람직하게는 표 6에 제시된 바와 같은 원형질 막 동원 도메인에의 융합체를 포함하는 것인 eVLP.
- 표적 세포, 임의적으로 생체내 또는 시험관내 세포로 카고를 전달하는 방법으로서, 카고를 포함하는 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 따른 eVLP와 세포를 접촉시키는 것을 포함하는 방법.
- 카고를 포함하는 eVLP를 생산하는 방법으로서:
1종 이상의 바이러스-유래 당단백질 (임의적으로 표 1에 제시된 바와 같은 것) 및 카고를 발현하는 세포로서, 외인성 gag 및/또는 pol 단백질을 발현하지 않는 세포를 제공하는 것; 및
세포가 eVLP를 생산하도록 하는 조건 하에서 세포를 유지하는 것
을 포함하는 방법. - 제9항에 있어서, 생산된 eVLP를 수확하고, 임의적으로 정제하고/거나 농축시키는 것을 추가로 포함하는 방법.
- 제9항에 있어서, 카고가 치료용 또는 진단용 단백질, 또는 치료용 또는 진단용 단백질을 코딩하는 핵산, 또는 소형 분자, 임의적으로 치료용 또는 진단용 소형 분자인 방법.
- 제9항에 있어서, 카고가 유전자 편집 시약인 방법.
- 제9항에 있어서, 유전자 편집 시약이 아연 핑거 (ZF), 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE) 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질; 아연 핑거 (ZF), 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE) 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 코딩하는 핵산; 또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 포함하는 리보핵단백질 복합체 (RNP)를 포함하는 것인 방법.
- 제13항에 있어서, 유전자 편집 시약이 표 2, 3, 4 & 5에 열거되어 있는 단백질로부터 선택되는 것인 방법.
- 제13항에 있어서, 유전자 편집 시약이 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 포함하고, eVLP가 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질에 결합하여 그를 표적 서열로 안내하는 1종 이상의 가이드 RNA를 추가로 포함하는 것인 방법.
- 제9항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 카고가, 바람직하게는 표 6에 제시된 바와 같은 원형질 막 동원 도메인에의 융합체를 포함하는 것인 방법.
- 1종 이상의 바이러스-유래 당단백질 (임의적으로 표 1에 제시된 바와 같은 것) 및 카고를 발현하는 세포로서, 외인성 gag 단백질을 발현하지 않는 세포.
- 제17항에 있어서, 카고가 치료용 또는 진단용 단백질, 또는 치료용 또는 진단용 단백질을 코딩하는 핵산, 또는 소형 분자, 임의적으로 치료용 또는 진단용 소형 분자인 세포.
- 제17항에 있어서, 카고가 유전자 편집 시약인 세포.
- 제17항에 있어서, 유전자 편집 시약이 아연 핑거 (ZF), 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE) 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질; 아연 핑거 (ZF), 전사 활성화인자-유사 이펙터 (TALE) 및/또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 코딩하는 핵산; 또는 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 포함하는 리보핵단백질 복합체 (RNP)를 포함하는 것인 세포.
- 제20항에 있어서, 유전자 편집 시약이 표 2, 3, 4 & 5에 열거되어 있는 단백질로부터 선택되는 것인 세포.
- 제20항에 있어서, 유전자 편집 시약이 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질을 포함하고, eVLP가 CRISPR-기반 게놈 편집 또는 조정 단백질에 결합하여 그를 표적 서열로 안내하는 1종 이상의 가이드 RNA를 추가로 포함하는 것인 세포.
- 제17항 내지 제22항 중 어느 한 항에 있어서, 카고가, 바람직하게는 표 6에 제시된 바와 같은 원형질 막 동원 도메인에의 융합체를 포함하는 것인 세포.
- 제17항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 세포가 1차 또는 안정한 인간 세포주인 세포.
- 제24항에 있어서, 인간 배아 신장 (HEK) 293 세포 또는 HEK293 T 세포인 세포.
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