KR20220166744A - Biomarkers for predicting prostatic carcinoma prognosis and uses thereof - Google Patents
Biomarkers for predicting prostatic carcinoma prognosis and uses thereof Download PDFInfo
- Publication number
- KR20220166744A KR20220166744A KR1020220070875A KR20220070875A KR20220166744A KR 20220166744 A KR20220166744 A KR 20220166744A KR 1020220070875 A KR1020220070875 A KR 1020220070875A KR 20220070875 A KR20220070875 A KR 20220070875A KR 20220166744 A KR20220166744 A KR 20220166744A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- mir
- prostate cancer
- prognosis
- predicting
- present
- Prior art date
Links
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 94
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 title claims abstract description 48
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 title claims abstract description 25
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims abstract description 92
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 claims abstract description 58
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 claims abstract description 56
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 50
- 108091062762 miR-21 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 39
- 108091041631 miR-21-1 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 39
- 108091044442 miR-21-2 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 39
- 108091091900 miR-636 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 39
- 108091079658 miR-142-1 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 36
- 108091071830 miR-142-2 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 36
- 108091027943 miR-16 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 36
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 29
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 claims abstract description 24
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 claims abstract description 24
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims abstract description 22
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims abstract description 17
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 33
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 claims description 15
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 13
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 12
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 12
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims description 7
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 7
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 abstract description 8
- -1 miR-451 Proteins 0.000 abstract description 8
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 31
- 102000007066 Prostate-Specific Antigen Human genes 0.000 description 30
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 description 30
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 15
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 14
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 13
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 12
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 11
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 11
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 10
- 230000008859 change Effects 0.000 description 9
- 210000001808 exosome Anatomy 0.000 description 9
- 238000003762 quantitative reverse transcription PCR Methods 0.000 description 9
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 8
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 7
- 108091026822 U6 spliceosomal RNA Proteins 0.000 description 6
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 6
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 5
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 5
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 5
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 5
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 4
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000007477 logistic regression Methods 0.000 description 4
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 4
- 108091060382 miR-140 stem-loop Proteins 0.000 description 4
- 108091030617 miR-140-1 stem-loop Proteins 0.000 description 4
- 108091023370 miR-140-2 stem-loop Proteins 0.000 description 4
- 238000013058 risk prediction model Methods 0.000 description 4
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 4
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 4
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 3
- 108091068993 Homo sapiens miR-142 stem-loop Proteins 0.000 description 3
- 108091070493 Homo sapiens miR-21 stem-loop Proteins 0.000 description 3
- 108091008065 MIR21 Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 230000000951 immunodiffusion Effects 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 3
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 108091069017 Homo sapiens miR-140 stem-loop Proteins 0.000 description 2
- 108091061623 Homo sapiens miR-636 stem-loop Proteins 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 2
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 238000002790 cross-validation Methods 0.000 description 2
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 238000003317 immunochromatography Methods 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 108091041042 miR-18 stem-loop Proteins 0.000 description 2
- 108091062221 miR-18a stem-loop Proteins 0.000 description 2
- 108091007432 miR-29b Proteins 0.000 description 2
- 108091023968 miR-330 stem-loop Proteins 0.000 description 2
- 108091039521 miR-363 stem-loop Proteins 0.000 description 2
- 108091056495 miR-363-1 stem-loop Proteins 0.000 description 2
- 108091025820 miR-363-2 stem-loop Proteins 0.000 description 2
- 108091080309 miR-483 stem-loop Proteins 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- 210000005267 prostate cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000011472 radical prostatectomy Methods 0.000 description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 2
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 2
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- CVOFKRWYWCSDMA-UHFFFAOYSA-N 2-chloro-n-(2,6-diethylphenyl)-n-(methoxymethyl)acetamide;2,6-dinitro-n,n-dipropyl-4-(trifluoromethyl)aniline Chemical compound CCC1=CC=CC(CC)=C1N(COC)C(=O)CCl.CCCN(CCC)C1=C([N+]([O-])=O)C=C(C(F)(F)F)C=C1[N+]([O-])=O CVOFKRWYWCSDMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 102100025222 CD63 antigen Human genes 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 208000017667 Chronic Disease Diseases 0.000 description 1
- 208000032544 Cicatrix Diseases 0.000 description 1
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 description 1
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000934368 Homo sapiens CD63 antigen Proteins 0.000 description 1
- 108091070491 Homo sapiens miR-16-1 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091068927 Homo sapiens miR-16-2 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091032683 Homo sapiens miR-451a stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 108091028108 MiR-212 Proteins 0.000 description 1
- 108091030146 MiRBase Proteins 0.000 description 1
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 1
- 108091028066 Mir-126 Proteins 0.000 description 1
- 108091062140 Mir-223 Proteins 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 1
- 108020004518 RNA Probes Proteins 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 239000003391 RNA probe Substances 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 208000009956 adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 239000003596 drug target Substances 0.000 description 1
- 238000001839 endoscopy Methods 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000762 glandular Effects 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 1
- 238000011532 immunohistochemical staining Methods 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 210000003041 ligament Anatomy 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 208000010658 metastatic prostate carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108091048308 miR-210 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091053935 miR-212 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091028397 miR-212-1 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091028945 miR-212-2 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091069917 miR-491 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 238000003253 miRNA assay Methods 0.000 description 1
- 108091007420 miR‐142 Proteins 0.000 description 1
- 244000309715 mini pig Species 0.000 description 1
- 238000010606 normalization Methods 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 1
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 1
- 239000000092 prognostic biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 description 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 210000000664 rectum Anatomy 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 1
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003161 ribonuclease inhibitor Substances 0.000 description 1
- 231100000241 scar Toxicity 0.000 description 1
- 230000037387 scars Effects 0.000 description 1
- 210000000582 semen Anatomy 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 1
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 238000013517 stratification Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- 210000003708 urethra Anatomy 0.000 description 1
- 230000002485 urinary effect Effects 0.000 description 1
- 210000001635 urinary tract Anatomy 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/118—Prognosis of disease development
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA
Abstract
Description
본 발명은 전립선 암 예후 예측용 바이오마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 더욱 구체적으로는 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및/또는 miR-636으로 이루어진 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 바이오마커를 제공하고, 상기 miRNA의 발현량을 측정할 수 있는 제제를 포함하는 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 조성물을 제공하여, 전립선암 전이 여부 등의 정보를 제공할 수 있다.The present invention relates to a biomarker for predicting prognosis of prostate cancer and its use, and more specifically, to diagnosis of prostate cancer consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and/or miR-636. Alternatively, a biomarker for predicting prognosis and a composition for diagnosing or predicting prognosis of prostate cancer including an agent capable of measuring the expression level of the miRNA may be provided, thereby providing information such as metastasis of prostate cancer.
전립선암은 남성의 전립선에 발생하는 악성종양이며, 발병률이 높은 고위험군의 병으로 알려져 있다. 특히 전립선암은 미국에서 두 번째로 흔한 암 사망 원인으로 알려져 있을 뿐만 아니라 2016년 국가 암 등록 통계에 따르면 2016년에 새로 발생한 암 환자의 수는 2015년 21만 2542명에 비해 22만 9180명(남 12만 68명, 여 10만 9112명)으로 1만 2638명(5.8%)가 증가한 것으로 보도되었고, 이 중 전립선암은 2015년과 비교 하였을 때, 간암을 제치고 4번째로 많이 발생하는 암으로 보고되었다.Prostate cancer is a malignant tumor that occurs in the male prostate and is known as a high-risk disease with a high incidence rate. In particular, prostate cancer is not only known as the second most common cause of cancer death in the United States, but according to the 2016 National Cancer Registry statistics, the number of newly diagnosed cancer patients in 2016 was 229,180 (men) compared to 212,542 in 2015. 120,068 cases, 109,112 females), an increase of 12,638 (5.8%) was reported, of which prostate cancer was reported as the 4th most common cancer, surpassing liver cancer, compared to 2015. It became.
최근 우리나라도 고령화 사회로 진입하면서 전립선암의 유병률이 증가한 것으로 보이는데, 그 이유는 전립선암의 가장 중요한 위험 인자가 나이로 주로 60대 이후 노인에게 전립선암이 많이 발생하기 때문이다. 하지만 50대 이하의 남성에게서도 많이 발병하고 있는 실정이다. 따라서, 전립선암은 꾸준한 관리가 필요한 만성 질환으로 자리 잡고 있으며, 이에 대한 전립선암의 정확한 진단이 필요한 시점이다. 또한, 전립선암은 예측하기 어려운 병의 진행 형태를 보이기 때문에 예후를 통해 사전에 예측하는 것이 필요하다.Recently, the prevalence of prostate cancer seems to have increased as Korea entered an aging society, because the most important risk factor for prostate cancer is age, and prostate cancer occurs mostly in the elderly after 60 years of age. However, it is also common in men under the age of 50. Therefore, prostate cancer is positioned as a chronic disease that requires steady management, and it is time to accurately diagnose prostate cancer. In addition, since prostate cancer shows an unpredictable disease progression, it is necessary to predict in advance through prognosis.
한편, 현재까지 암 진단 방법은 조직 샘플의 채취 및 내시경 검사와 같은 침습적인 방법으로 이루어지고 있다. 특히, 조직검사는 질병이 의심되는 부위의 일부를 적출해 현미경으로 관찰하는 방식으로 이루어지고 있다. 따라서, 조직 샘플을 채취하기 위해 침이나 펀치, 내시경 또는 복강경을 이용하기 위해서는, 인체를 절개하여야 하므로, 환자가 느끼는 불편함이 적지 않을 뿐 아니라 흉터가 남고 회복하는데 오랜 시간이 걸린다.Meanwhile, until now, cancer diagnosis methods have been performed using invasive methods such as tissue sample collection and endoscopy. In particular, a biopsy is performed by removing a part of a suspected disease area and observing it under a microscope. Therefore, in order to use a needle, punch, endoscope, or laparoscope to collect a tissue sample, the human body must be incised, causing not only a lot of discomfort to the patient, but also leaving scars and taking a long time to recover.
전립선암 진단을 위한 종래기술로는 PSA(Prostate Specific Antigen) 측정 및 생검(biopsy)이 있다. PSA 측정은 전립선암 진단에서 가장 많이 쓰이는 방법으로, 전립선 세포에서 만들어지는 특이 항원 수치를 측정해 전립선암 위험도를 결정짓는 방법이다. 악성 전립선암 일수록 PSA 수치는 높으며, 전립선암이 없는 대부분의 남성들은 4ng/mL 미만의 수치를 가지고 있다. 하지만 측정한 PSA 수치가 전립선암의 부재에도 불구하고 굉장히 높거나 혹은 PSA gray zone(PSA 4ng/mL 이상 10ng/mL 이하)구간에 들어설 경우 생검(biopsy)을 요하게 된다. 생검(biopsy)은 암이 의심되는 장기 부분의 조직을 바늘로 취해 병리조직학적 검사를 통해 환자의 해당 장기에 암, 육종 등의 악성종양 유무를 진단하는 방법이다. 이러한 생검(biopsy) 검사는 환자들로 하여금 굉장히 고통스러우며, 특히 PSA gray zone에서의 전립선암 진단의 정확률은 채 30% 가 되질 않는다. 즉 다시 말해 약 70%의 환자들이 PSA의 한계로 인해 비용이 들고 고통스러운 재생검(rebiopsy)를 겪게 된다는 단점이 있다.Conventional techniques for diagnosing prostate cancer include PSA (Prostate Specific Antigen) measurement and biopsy. PSA measurement is the most commonly used method in prostate cancer diagnosis, and it is a method of determining the risk of prostate cancer by measuring the level of specific antigens produced by prostate cells. PSA levels are higher in malignant prostate cancer, and most men without prostate cancer have levels less than 4 ng/mL. However, if the measured PSA level is very high despite the absence of prostate cancer or if it is in the PSA gray zone (PSA 4ng/mL or more and 10ng/mL or less), a biopsy is required. Biopsy is a method of diagnosing the presence or absence of a malignant tumor such as cancer or sarcoma in a patient's organ by taking tissue from an organ suspected of having cancer with a needle and performing a histopathological examination. This biopsy test is very painful for patients, and the accuracy rate of prostate cancer diagnosis in the PSA gray zone, in particular, is less than 30%. In other words, there is a disadvantage that about 70% of patients undergo costly and painful rebiopsy due to limitations of PSA.
결국, 이와 같은 임상적 특성을 가진 전립선암의 진단 또는 예후 예측을 위해서는 생검(biopsy)이 요구되는 데, 현재 임상에서 점차 증가되고 있는 전립선암 환자들을 모두 조직검사를 하는 것은 한계가 있어, 전립선암을 비침습적으로 진단할 수 있는 도구 혹은 방법의 개발이 시급한 실정이다.After all, a biopsy is required for the diagnosis or prognosis of prostate cancer with such clinical characteristics, but there is a limit to biopsy of all prostate cancer patients, which are gradually increasing in clinical practice. There is an urgent need to develop tools or methods that can non-invasively diagnose .
본 발명의 목적은, 특정 바이오마커 miRNA의 함량을 측정 및 비교함으로써 전립선암을 진단하고, 예후를 예측하는 방법을 제공하는 것이다. 특히, 본원 발명의 목적은 전립선암의 전이여부를 진단하기위한 바이오 마커를 제공하기 위함이다.An object of the present invention is to provide a method for diagnosing prostate cancer and predicting prognosis by measuring and comparing the content of a specific biomarker miRNA. In particular, an object of the present invention is to provide a biomarker for diagnosing metastasis of prostate cancer.
본 발명의 다른 목적은, 특정 바이오마커의 함량을 측정 및 비교함으로써 전립선암의 발병 여부 또는 전이여부를 진단하는 방법을 제공하는 것이다. Another object of the present invention is to provide a method for diagnosing the onset or metastasis of prostate cancer by measuring and comparing the content of a specific biomarker.
본 발명의 또 다른 목적은, 특정 바이오마커의 함량을 측정하는 제제를 포함하는 전립선암의 진단, 예후 예측용 조성물을 제공하는 것이다. Another object of the present invention is to provide a composition for diagnosis and prognosis of prostate cancer, including an agent for measuring the content of a specific biomarker.
본 발명의 또 다른 목적은, 특정 바이오마커의 함량을 측정하는 제제 또는 장치를 이용한 전립선암 진단, 예후 예측용 키트를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a kit for diagnosing and predicting prognosis of prostate cancer using an agent or device for measuring the content of a specific biomarker.
상술한 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA를 포함하는, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 바이오마커를 제공한다.In order to solve the above problems, the present invention is a diagnosis of prostate cancer, including at least one miRNA selected from the group consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and miR-636. or providing a biomarker for predicting prognosis.
본 발명의 일 실시예에 따르면, 상기 바이오마커는 대상체로부터 분리된 생물학적 시료에서 검출되는 것이 바람직하며, 대상 시료는 비침습적 시료일 수 있으며, 상기 비침습적 시료는 혈액, 혈청, 소변, 또는 타액일 수 있고, 가장 바람직하게는 소변일 수 있다.According to one embodiment of the present invention, the biomarker is preferably detected in a biological sample separated from the subject, the subject sample may be a non-invasive sample, and the non-invasive sample may be blood, serum, urine, or saliva. It may be, most preferably urine.
본 발명에서 상기 전립선 암의 예후 예측은 전립선암의 전이 여부를 진단하는 것을 포함한다.In the present invention, prognosis of prostate cancer includes diagnosing metastasis of prostate cancer.
본 발명은 또한, miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA의 발현 수준을 측정할 수 있는 제제를 포함하는, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 조성물을 제공한다.The present invention also relates to a prostate, including an agent capable of measuring the expression level of at least one miRNA selected from the group consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and miR-636. A composition for diagnosing or predicting the prognosis of cancer is provided.
본 발명의 일 실시예에 따르면, 상기 제제는 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함한다.According to one embodiment of the present invention, the agent is a nucleic acid capable of specifically binding to at least one miRNA selected from the group consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and miR-636. includes
본 발명은 또한, 상기의 조성물을 포함하는 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 키트를 제공한다.The present invention also provides a kit for diagnosing or predicting prognosis of prostate cancer comprising the above composition.
본 발명은 (a) 피검자로부터 취득한 샘플 중에 포함된 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636의 발현양을 정상군 샘플 중에 포함된 miRNA의 발현양과 비교하는 단계를 포함하는 전립선암의 진단 또는 예후 예측을 위한 정보를 제공하는 방법을 제공한다.The present invention (a) compares the expression level of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 or miR-636 contained in samples obtained from subjects with the expression level of miRNA contained in normal group samples It provides a method for providing information for diagnosis or prognosis of prostate cancer comprising the step.
본 발명의 일 실시예에 따르면, 상기 방법은 하기의 (b)단계를 추가적으로 포함할 수 있다: (b) 상기 피검자의 샘플 중에 포함된 상기 miR-21, miR-16, miR-142-3p 또는 miR-451의 발현양이 정상군 샘플 중에 포함된 miRNA의 발현양 보다 증가된 경우, 전립선암이 발병한 것으로 판별하거나 전이 위험을 높은 수준으로 예측하는 단계 또는 (b) 상기 피검자의 샘플 중에 포함된 상기 miR-636의 발현양이 정상군 샘플 중에 포함된 miRNA의 발현양 보다 감소된 경우, 전립선암이 발병한 것으로 판별하거나 전이 위험을 높은 수준으로 예측하는 단계.According to one embodiment of the present invention, the method may further include the following step (b): (b) the miR-21, miR-16, miR-142-3p or If the expression level of miR-451 is higher than that of the miRNA contained in the sample of the normal group, determining that prostate cancer has occurred or predicting a high level of metastasis risk or (b) If the expression level of miR-636 is lower than the expression level of miRNA contained in the normal group sample, determining that prostate cancer has occurred or predicting a high level of metastasis risk.
본 발명의 일 실시예에 따르면, 상기 피검자로부터 취득한 샘플은 피검자의 혈액 또는 소변인 것이 바람직하다.According to one embodiment of the present invention, the sample obtained from the subject is preferably the subject's blood or urine.
본 발명의 바이오마커 유전자의 발현 수준을 측정함으로써 전립선암의 발병 여부 및 전립선암의 전이 여부를 빠르고 용이하지만 정확하게 진단할 수 있고, 이를 통하여 전립선암의 발병에 따라 유발될 수 있는 질환을 조기에 진단하거나, 상기 질환의 경과, 예후 또는 치료 효과에 대하여도 추적이 가능하다.By measuring the expression level of the biomarker gene of the present invention, it is possible to quickly, easily, but accurately diagnose the onset of prostate cancer and metastasis of prostate cancer, thereby diagnosing diseases that may be caused by the onset of prostate cancer at an early stage. Alternatively, it is possible to track the progress, prognosis, or treatment effect of the disease.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 위험 예측 모델 실험 결과이다. 도 1의 A는 전립선 암에 대한 수신자 작동 특성(ROC, receiver operating characteristic) 분석 결과이다. 도 1의 A를 참조하면, 전립선암의 수술 전 PSA(Prostate-specific antigen) 수준에 대한 민감도(sensitivity)와 특이도(specificity)는 3개의 miRNA(miR-636, miR-21 및 miR-451)로 구성된 위험 예측 모델(PCa-MRS)의 ROC 곡선에서 가장 계층화되는 것을 확인할 수 있다. 특히, 상기 3개의 miRNA(miR-636, miR-21 및 miR-451)로 구성된 위험 예측 모델(PCa-MRS)의 ROC 곡선은, 다른 miRNA(녹색), 수술 전 PSA 수준(회색) 또는 임상 Gleason 점수(보라색)로만 구성된 다른 모델에 비해 우수한 계층화 능력(AUC = 0.925)을 보여준다.
도 1의 B는 본 발명의 일 실시예에 따른 각 샘플 세트의 PCa MRS에 대한 ROC 곡선이다. 도 1의 B에서 민감도와 특이도는 Youden 지수의 PCa-MRS 모델에서 -0.82의 컷오프 값을 기반으로 계산되었다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에 따른 위험 점수별 BCR-free 및 전체 생존에 대한 Kaplan-Meier 곡선을 나타낸다. PCa-MRS 점수가 높은 환자(녹색)는 점수가 낮은 환자(파란색)보다 BCR 없는 생존율(도 2의 a)과 전체 생존율(도 2의 b)이 유의하게 더 낮게 나타났다. 도 2에서 괄호 안 생존율은 (생존/케이스 수)를 나타낸다. 본 실시예에서는, 외부 모델 검증 세트의 149개 결합 데이터 중에서 BCR-free 생존을 위해 근치전립선 절제술(RP, radical prostatectomy)을 받은 136명의 환자와 전체 생존을 위해 149명의 환자를 조사했다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에서 수행된 전이성 전립선암의 특징인 miRNA 마커를 확인하기 위한 실험의 진행 단계를 나타낸다. 본 실시예에서 실험은 두 단계로 진행되었다. 도 3을 참조하면, 본 실험은 (I) TaqMan 저밀도 miRNA 어레이(TLDA) 및 정량적 역전사 PCR(qRT-PCR) 실험에 의해 차등적으로 발현된 miRNA의 발견 및 독립적 검증 단계(Phase 1); (II) 5중 교차 검증 및 모델의 외부 검증과 함께 Lasso 로지스틱 회귀를 사용한 모델을 구성하는 단계(Phase 2)로 구성된다. 상기 (II)에서는, 결합된 세트로 전이에 대한 후보 miRNA의 예측 능력을 평가하기 위해 위험 점수 분석 및 ROC 곡선을 사용한 로지스틱 회귀 모델을 포함하는 통계 분석을 수행했다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른 Taqman 저밀도 miRNA 분석에 의한 발견 단계에서 차등적으로 발현된 miRNA의 상대적 발현을 확인한 결과이다. 데이터는 U6 snRNA로 정규화된 중앙값(및 범위) 상대 발현을 상자 도표(box plots)로 표시하였다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따라, 100가지 위험 예측 모델의 성능을 확인한 그래프이다. 본 실시예에서 5중 교차 검증의 100회 반복에서 중앙값 AUC는 0.917(범위 0.909-0.925)으로 나타났다.
도 6은 본 발명의 일 실시예에 따라 소변 엑소좀을 확인한 결과이다. 웨스턴 블롯을 사용하여 소변 엑소좀에서 엑소좀 마커(CD63 및 CD9)를 확인하였다.1 is a risk prediction model test result according to an embodiment of the present invention. 1A is a receiver operating characteristic (ROC) analysis result for prostate cancer. Referring to Figure 1A, the sensitivity and specificity for the level of prostate-specific antigen (PSA) before surgery for prostate cancer are three miRNAs (miR-636, miR-21 and miR-451) It can be seen that it is most stratified in the ROC curve of the risk prediction model (PCa-MRS) composed of . In particular, the ROC curve of the risk prediction model (PCa-MRS) composed of the three miRNAs (miR-636, miR-21 and miR-451) is different from other miRNAs (green), preoperative PSA levels (grey) or clinical Gleason It shows superior stratification ability (AUC = 0.925) compared to other models consisting only of scores (purple).
1B is an ROC curve for PCa MRS of each sample set according to an embodiment of the present invention. In Fig. 1B, sensitivity and specificity were calculated based on a cutoff value of -0.82 in the PCa-MRS model of Youden index.
2 shows Kaplan-Meier curves for BCR-free and overall survival by risk score according to an embodiment of the present invention. Patients with high PCa-MRS scores (green) showed significantly lower BCR-free survival rates (Fig. 2 a) and overall survival rates (Fig. 2 b) than patients with low scores (blue). In Figure 2, the survival rate in parentheses represents (survival / number of cases). In this example, 136 patients who underwent radical prostatectomy (RP) for BCR-free survival and 149 patients for overall survival were investigated among 149 combined data from the external model validation set.
Figure 3 shows the progress of the experiment for identifying miRNA markers characteristic of metastatic prostate cancer performed in one embodiment of the present invention. In this example, the experiment was conducted in two stages. Referring to FIG. 3, this experiment includes (I) discovery and independent verification of differentially expressed miRNAs by TaqMan low-density miRNA array (TLDA) and quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) experiments (Phase 1); (II) It consists of constructing a model using Lasso logistic regression with 5-fold cross-validation and external validation of the model (Phase 2). In (II) above, statistical analysis including risk score analysis and logistic regression model using ROC curves was performed to evaluate the predictive ability of candidate miRNAs for metastasis in the combined set.
4 is a result of confirming the relative expression of differentially expressed miRNAs in the discovery step by Taqman low-density miRNA analysis according to an embodiment of the present invention. Data were presented as box plots with median (and range) relative expression normalized to U6 snRNA.
5 is a graph confirming the performance of 100 risk prediction models according to an embodiment of the present invention. In this example, the median AUC was found to be 0.917 (range 0.909-0.925) in 100 repetitions of 5-fold cross-validation.
6 is a result of confirming urine exosomes according to an embodiment of the present invention. Exosome markers (CD63 and CD9) were identified in urine exosomes using Western blot.
이하, 발명의 이해를 돕기 위해 다양한 실시예를 제시한다. 하기 실시예는 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐 발명의 보호범위가 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, various embodiments are presented to aid understanding of the invention. The following examples are provided to more easily understand the invention, but the protection scope of the invention is not limited to the following examples.
본 발명의 일 실시예에 따르면, 본 발명은 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA를 포함하는, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 바이오마커(또는 바이오마커 조성물)를 제공한다.According to one embodiment of the present invention, the present invention is a treatment for prostate cancer, including at least one miRNA selected from the group consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and miR-636. A biomarker (or biomarker composition) for diagnosis or prognosis is provided.
상기 바이오마커는 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 구성된 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA의 발현 수준을 검출 또는 측정함으로서 특정 개체의 전립선암을 진단하거나 및/또는 예후를 예측할 수 있다.The biomarker diagnoses prostate cancer of a specific subject by detecting or measuring the expression level of at least one miRNA selected from the group consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and miR-636. and/or predict prognosis.
본 명세서에서의 용어 "진단"은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 본 발명의 목적상, 진단이란 전립선암의 발병 여부를 판별하는 것을 의미하는 것일 수 있다.As used herein, the term “diagnosis” means confirming the presence or character of a pathological condition. For the purposes of the present invention, diagnosis may mean determining whether or not prostate cancer has occurred.
본 명세서에서의 용어 "예후"는 병세의 진행, 회복에 관한 예측을 의미하는 것으로, 전망 내지는 예비적 평가를 말한다. 본 발명의 목적상, 예후란 전립선암의 치료 후 해당 개체에서 치료 성공 여부, 생존, 재발, 전이, 약물 반응성, 내성 등과 같은 여부를 판단하는 것을 의미한다. 즉, 의학적 귀추(예컨대, 장기 생존 가능성, 무병생존율 등)에 대한 예상을 의미하며, 양성적 예후(긍정적 예후) 또는 음성적 예후(부정적 예후)를 포함하며, 상기 음성적 예후는 재발, 종양 성장, 전이, 약 저항성 등의 병의 진행 또는 치명성(mortality)을 포함하고, 양성적 예후는 질병이 없는 상태 등의 질병의 차도, 종양 퇴행 등의 질병의 개선 또는 안정화(stabilization)를 포함한다.As used herein, the term "prognosis" refers to a prediction of disease progression and recovery, and refers to a prospective or preliminary evaluation. For the purpose of the present invention, prognosis means determining whether or not treatment success, survival, recurrence, metastasis, drug response, resistance, etc. in a subject after treatment of prostate cancer. That is, it means prediction of medical outcome (eg, long-term viability, disease-free survival rate, etc.), and includes positive prognosis (positive prognosis) or negative prognosis (negative prognosis), wherein the negative prognosis is recurrence, tumor growth, metastasis A positive prognosis includes remission of the disease, such as no disease, and improvement or stabilization of the disease, such as tumor regression.
본 명세서에서의 용어 "예측"은 의학적 귀추에 대하여 미리 헤아려 짐작하는 것을 의미하며, 본 발명의 목적상 전립선암으로 진단받은 환자의 병의 경과(병의 진행, 개선, 암의 재발, 종양 성장, 약 저항성)를 미리 짐작하는 것을 의미하는 것일 수 있다.The term "prediction" in the present specification means to guess in advance about medical consequences, and for the purpose of the present invention, the course of a patient diagnosed with prostate cancer (disease progression, improvement, cancer recurrence, tumor growth, drug resistance) may be meant to predict in advance.
본 명세서에서의 용어 "전립선암 (prostate cancer, PCa)"은 전립선에서 발생하는 암을 의미한다. 전립선(prostate)은 방광 바로 밑, 직장 앞쪽에 있는 밤톨만 한 크기의 남성 생식기관으로, 정액의 일부를 만들어내고 저장하는 역할을 한다. 위로는 방광경부, 즉 방광에서 요도로 이행하는 부위와 인접해 앞쪽의 치골전립 선인대에 고정되어 있고, 아래로는 비뇨생식격막에 의해 고정되어 있다. 전립선에서 발생하는 암의 대부분은 전립선 세포에서 발생하는 선암(샘세포의 암)이며, 종양 조직의 분화 정도와 세포의 특성 등에 따라 유형을 구분할 수 있다.The term "prostate cancer (PCa)" as used herein refers to cancer arising from the prostate. The prostate is a walnut-sized male reproductive organ located just below the bladder and in front of the rectum. It produces and stores some of the semen. Above is the bladder neck, that is, adjacent to the transition from the bladder to the urethra, and is fixed to the anterior pubic anterior ligament, and below is fixed by the urogenital diaphragm. Most of the cancers arising from the prostate are adenocarcinomas (cancers of glandular cells) arising from prostate cells, and types can be classified according to the degree of differentiation of tumor tissues and cell characteristics.
본 명세서에서의 용어 "바이오마커(biomarker)"는 일반적으로 단백질, 핵산(DNA 및 mRNA 등), 대사물질(지질, 당지질, 당단백질 및 당 등) 등의 유기생체분자를 이용해 몸 안의 변화를 알아 낼 수 있는 지표를 의미하는 것으로서, 구체적으로 특정 질병이나 또는 암의 경우에서 정상이나 병적인 상태를 구분할 수 있거나 치료 반응을 예측할 수 있고 객관적으로 측정할 수 있는 표지자를 의미한다. 바이오마커는 그 활용에 따라, 약물 타겟의 존 재를 확인하는 타겟마커, 병의 유무를 진단하는 진단마커, 특정 약물에 대한 반응군과 비반응군을 구별할 수 있는 예상마커, 약물 치료효과를 모니터링할 수 있는 대리표지자마커, 질병의 예후를 알려주는 예후 바이오마커 등이 있다.The term "biomarker" in this specification generally refers to changes in the body using organic biomolecules such as proteins, nucleic acids (DNA and mRNA, etc.), metabolites (lipids, glycolipids, glycoproteins and sugars, etc.). It means an index that can be produced, and specifically means a marker that can distinguish a normal or pathological state in the case of a specific disease or cancer, or can predict a treatment response and can be measured objectively. Depending on their use, biomarkers include target markers that confirm the existence of drug targets, diagnostic markers that diagnose the presence or absence of disease, predictive markers that can distinguish between responders and non-responders to a specific drug, and drug treatment effects. There are surrogate markers that can be monitored and prognostic biomarkers that inform the prognosis of diseases.
본 발명은 또한, miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA의 발현 수준을 측정할 수 있는 제제를 포함하는, 전립선암의 진단, 예후 예측용 조성물을 제공한다. 상기에서 설명한 내용과 동일한 부분은 상기 조성물에도 공히 적용된다.The present invention also relates to a prostate, including an agent capable of measuring the expression level of at least one miRNA selected from the group consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and miR-636. A composition for diagnosis and prognosis of cancer is provided. The same parts as described above also apply to the composition.
본 명세서에서의 용어 "발현 수준의 측정"은 특정 유전자, 특정 단백질(펩타이드) 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 존재 여부, 발현 여부 또는 발현 정도를 측정하는 것으로서, 구체적으로 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA의 발현 수준을 측정하는 것일 수 있다.As used herein, the term "measurement of expression level" refers to measuring the presence, expression, or expression level of a specific gene, a specific protein (peptide), or a gene encoding the protein, specifically miR-21, miR-16 It may be to measure the expression level of at least one miRNA selected from the group consisting of miR-142-3p, miR-451 and miR-636.
상기 miRNA 또는 유전자의 발현 수준을 측정하는 방법은 역전사효소 중합반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사효소 중합 효소반응(competitive RT-PCR), 실시간 역전사 효소 중합효소반응(real time quantitative RT-PCR), 정량적 중합효소반응(quantitative RT-PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection method), 노던 블랏팅(Nothern blotting), DNA 칩 방법(DNA chip technology) 또는 바이오센서(biosensor)인 것일 수 있다.The method of measuring the expression level of the miRNA or gene is reverse transcriptase polymerization (RT-PCR), competitive reverse transcriptase polymerase reaction (competitive RT-PCR), real-time reverse transcriptase polymerase reaction (real time quantitative RT-PCR), It may be quantitative polymerase reaction (quantitative RT-PCR), RNase protection method, Northern blotting, DNA chip technology, or biosensor.
상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 방법은 웨스턴 블랏팅(Western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선면역분석(RIA: radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radical immunodiffusion), 오우크테로니면역 확산법(Ouchterlony immunodiffusion), 로케트 면역전기영동(rocket immunoeletrophoresis), 면역조직화학염색법(immunohistochemical staining), 면역침전분석법(immunoprecipitation assay), 보체 고정 분석법(complenent Fixation Assay), 면역형광법(immunofluorescence), 면역크로마토그래피법 (immunochromatography), FACS 분석법(fluorescenceactivated cell sorter analysis), 단백질 칩 방법(protein chip technology) 또는 바이오센서(biosensor)인 것일 수 있다.Methods for measuring the expression level of the protein include Western blotting, enzyme linked immunosorbent assay (ELISA), radioimmunoassay (RIA), radical immunodiffusion, and Okteroni immunodiffusion method ( Ouchterlony immunodiffusion), rocket immunoeletrophoresis, immunohistochemical staining, immunoprecipitation assay, complement fixation assay, immunofluorescence, immunochromatography ( It may be immunochromatography, fluorescence activated cell sorter analysis (FACS), protein chip technology, or biosensor.
본 명세서에서의 용어 "발현 수준을 측정할 수 있는 제제"는 특정 유전자의 발현 수준을 확인하기 위하여 사용될 수 있는 분자를 의미하며, 구체적으로 상기 유전자를 검출 및/또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.As used herein, the term "agent capable of measuring the expression level" refers to a molecule that can be used to determine the expression level of a specific gene, and specifically includes an agent capable of detecting and/or amplifying the gene. It may be, but is not limited thereto.
상기 "특정 유전자(또는 특정 단백질)를 검출할 수 있는 제제"는 상기 특정 유전자 또는 단백질에 특이적으로 결합하여 인식할 수 있도록 하거나, 검출하여 증폭시킬 수 있는 제제를 의미하고, "특정 유전자 또는 단백질을 증폭할 수 있는 제제"는 상기 특정 유전자 또는 단백질의 복제를 반복하여 그 수를 증가시킬 수 있는 제제를 의미하며, 예를 들어 상기 유전자를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머 또는 특이적으로 결합할 수 있는 프로브를 의미하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.The "agent capable of detecting a specific gene (or specific protein)" refers to an agent capable of specifically binding to and recognizing the specific gene or protein, or detecting and amplifying the specific gene or protein. "Agent capable of amplifying" refers to an agent capable of increasing the number by repeating the replication of the specific gene or protein, for example, a primer capable of specifically amplifying a polynucleotide containing the gene or It may mean a probe capable of specifically binding, but is not limited thereto.
본 발명은 또한, 상기 조성물을 포함하는 전립선암 진단 또는 예후 예측용 키트를 제공한다. 상기에서 설명한 내용과 동일한 부분은 상기 키트에도 공히 적용된다.The present invention also provides a kit for diagnosing or predicting prognosis of prostate cancer comprising the composition. The same parts as described above also apply to the kit.
본 발명의 전립선암 진단 또는 예후 예측용 키트는 생물학적 시료로부터 (엑소좀 유래의) miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636를 발현 수준을 측정할 수 있는 제제를 포함할 수 있으며, 상기 제제란 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636의 발현 수준을 확인함으로써 마커의 검출에 사용될 수 있는 분자를 의미한다. 본 발명에서 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636 발현 수준 측정 제제로서 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머, 프로브, 및/또는 항체를 사용할 수 있으며, 유전자 발현 정도를 측정하는데 이용되는 공지의 방법, 예를 들면 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하거나, 프로브를 이용한 혼성화 반응을 통하여 실시하여 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636의 발현 수준을 측정할 수 있다. 또한, 상기 키트에는 상기 측정 제제 이에외도 검출을 용이하게 하는 당업계에 공지된 여러 도구, 시약, 예를 들어 적합한 담체, 검출 가능한 신호를 생성할 수 있는 표지 물질, 안정화제 등이 포함될 수 있다.The kit for diagnosing or predicting prognosis of prostate cancer of the present invention can measure the expression level of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 or miR-636 (derived from exosomes) from a biological sample. It may include an agent, and the agent means a molecule that can be used for detecting a marker by checking the expression level of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 or miR-636. In the present invention, miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 or miR-636 expression levels are measured as miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 or miR-636 Antisense oligonucleotides, primers, probes, and / or antibodies that specifically bind to may be used, and a known method used to measure the level of gene expression, for example, PCR using a primer or using a probe The expression level of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 or miR-636 can be measured by hybridization. In addition to the measurement agent, the kit may include various tools and reagents known in the art for facilitating detection, for example, a suitable carrier, a label material capable of generating a detectable signal, and a stabilizer.
본 발명에서 생물학적 시료는 비침습적 시료일 수 있으며, 상기 비침습적 시료는 혈액, 혈청, 소변, 또는 타액일 수 있고, 바람직하게는 혈액 또는 혈청일 수 있고, 더욱 바람직하게는 소변일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the biological sample may be a non-invasive sample, and the non-invasive sample may be blood, serum, urine, or saliva, preferably blood or serum, and more preferably urine. It is not limited.
본 발명에서 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636는 이를 구성하는 올리고뉴클레오티드의 작용성 등가물, 예를 들어, miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636 올리고뉴클레오티드의 일부 염기서열이 결실(deletion), 치환(substitution) 또는 삽입(insertion)에 의해 변형되었지만, miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636 핵산분자와 기능적으로 동일한 작용을 할 수 있는 변이체(variants) 및 모방체(mimic)를 포함하는 개념이다.In the present invention, miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 or miR-636 are functional equivalents of the oligonucleotides constituting them, e.g., miR-21, miR-16, miR-142 Although some base sequences of -3p, miR-451 or miR-636 oligonucleotides were modified by deletion, substitution or insertion, miR-21, miR-16, miR-142-3p, It is a concept including variants and mimics that can functionally have the same action as miR-451 or miR-636 nucleic acid molecules.
본 발명에서 "안티센스 올리고뉴클레오티드"는 상기 miRNA에 상보적으로 결합하여 발현을 억제하는 염기서열로서, 이에 제한되지는 않으나 antisenseRNA, antagonist mRNA를 포함한다.In the present invention, "antisense oligonucleotide" is a nucleotide sequence that binds complementary to the miRNA and suppresses its expression, and includes, but is not limited to, antisenseRNA and antagonist mRNA.
본 발명에서 “프라이머”는 짧은 자유 수산화기를 가지는 핵산서열로서 상보적인 템플레이트와 염기쌍을 형성할 수 있고 템플레이트 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능하는 짧은 핵산서열을 말한다. 본 발명의 프라이머는 예를 들면, 포스포르아미다이트 고체 지지체 방법과 같은 당 분야에 공지된 방법을 이용하여 화학적으로 합성할 수 있다.In the present invention, a "primer" refers to a short nucleic acid sequence having a short free hydroxyl group that can form base pairing with a complementary template and serves as a starting point for copying a template strand. The primers of the present invention can be chemically synthesized using methods known in the art, such as, for example, the phosphoramidite solid support method.
본 발명에서 “프로브”는 mRNA와 특이적으로 결합할 수 있는 수개 내지 수백개의 염기로 이루어진 RNA 또는 DNA 등의 핵산 단편을 의미하며 라벨링되어 있어 특정 mRNA의 존재유무를 확인할 수 있다. 프로브는 올리고뉴클레오타이드 프로브, 단쇄 DNA 프로브, 이중쇄 DNA 프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있고 비오틴, FITC, 로다민, DIG 등으로 표지되거나 방사선 동위 원소 등으로 표지될 수 있다.In the present invention, "probe" refers to a nucleic acid fragment such as RNA or DNA consisting of several to hundreds of bases that can specifically bind to mRNA, and is labeled so that the presence or absence of a specific mRNA can be confirmed. The probe may be prepared in the form of an oligonucleotide probe, a single-stranded DNA probe, a double-stranded DNA probe, an RNA probe, and the like, and may be labeled with biotin, FITC, rhodamine, DIG, or the like, or labeled with a radioactive isotope.
본 발명에서 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 일 예로서 RT-PCR 키트의 경우, 마커 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 데옥시뉴클레오티드(dNTPs), Taq-중합효소 및 역전사효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-물(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다.In the present invention, the kit may be a kit including essential elements required to perform RT-PCR, but is not limited thereto. In the case of an RT-PCR kit as an example, in addition to each primer pair specific for a marker gene, a test tube or other suitable container, reaction buffer, deoxynucleotides (dNTPs), Taq-polymerase and reverse transcriptase, DNase, RNase inhibitors , DEPC-water, sterile water, and the like.
본 발명은 또한, 개체로부터 분리된 생물학적 시료로부터, miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및/또는 miR-636의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 전립선암 진단 또는 예후 예측을 위한 정보제공 방법을 제공하는 것이다. 상기에서 설명한 내용과 동일한 부분은 상기 방법에도 공히 적용된다.The present invention also provides diagnosis of prostate cancer, comprising measuring the expression level of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and/or miR-636 in a biological sample isolated from the subject. Or to provide a method of providing information for prognosis prediction. The same parts as described above are also applied to the method.
본 명세서에서의 용어 "개체"는 전립선암이 발병되거나 발병될 가능성이 있는 모든 생물체를 의미하며, 구체적인 예로, 개, 고양이, 마우스, 래트, 원숭이, 소, 돼지, 미니돼지, 가축, 인간 등을 포함하는 포유동물, 양식어류 등을 포함할 수 있으며, 이에 제한되는 것은 아니다.As used herein, the term "subject" refers to all organisms that have or are likely to develop prostate cancer, and specific examples include dogs, cats, mice, rats, monkeys, cows, pigs, mini-pigs, livestock, humans, and the like. It may include mammals, farmed fish, etc., including, but is not limited thereto.
본 명세서에서의 용어 "시료"는 상기 개체로부터 유래한 물질을 의미하며, 구체적으로 조직, 세포, 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 객담, 뇌척수액, 소변 등을 포함할 수 있으며, 이에 제한되는 것은 아니다. 또한, 이들 시료로부터 유전자 및/또는 단백질 시료를 얻을 수 있으며, 유전자 시료는 핵산, 예를 들어, DNA, mRNA, 또는 mRNA로부터 합성되는 cDNA 등을 포함할 수 있으며, 이로부터 특정 유전자/단백질의 발현 수준을 확인할 수 있는 한, 그 종류는 이에 제한되는 것은 아니다.The term "sample" in the present specification means a material derived from the subject, and may specifically include tissue, cells, whole blood, serum, plasma, saliva, sputum, cerebrospinal fluid, urine, etc., but is not limited thereto . In addition, gene and/or protein samples may be obtained from these samples, and the genetic samples may include nucleic acids, for example, DNA, mRNA, or cDNA synthesized from mRNA, from which expression of specific genes/proteins may be obtained. As long as the level can be confirmed, the type is not limited thereto.
상기 시료는 소변 또는 소변으로부터 유래된 시료일 수 있다. 또한, 상기 시료는 직장 수지 검사 (digital rectal examination, DRE) 시행 전 또는 시행 후 개체로부터 분리된 것일 수 있으며, 구체적으로 DRE 시행 후 개체로부터 분리된 것일 수 있다.The sample may be urine or a sample derived from urine. In addition, the sample may be isolated from an individual before or after performing digital rectal examination (DRE), and specifically may be isolated from an individual after performing DRE.
상기 방법은 대조군으로부터 분리된 생물학적 시료로부터, miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및/또는 miR-636의 발현 수준을 측정하는 단계; 및 상기 개체 및 상기 대조군의 발현 수준을 비교하는 단계를 추가로 포함하는 것일 수 있다. The method includes measuring the expression level of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and/or miR-636 in a biological sample isolated from a control group; And it may be to further include the step of comparing the expression level of the individual and the control group.
본 명세서에서의 용어 "대조군"은 전립선암이 발병되지 않은 일반 개체, 비-전립선암 환자군, 비환자군 등을 의미하는 것일 수 있다. As used herein, the term "control group" may mean a general individual without prostate cancer, a non-prostate cancer patient group, a non-patient group, and the like.
본 발명은 다양한 변환을 가할 수 있고 여러 가지 실시예를 가질 수 있는 바, 이하 특정 실시예들을 도면에 예 시하고 상세한 설명에 상세하게 설명하고자 한다. 그러나, 이는 본 발명을 특정한 실시 형태에 대해 한정하려는 것이 아니며, 본 발명의 사상 및 기술 범위에 포함되는 모든 변환, 균등물 내지 대체물을 포함하는 것으로 이해되어야 한다. 본 발명을 설명함에 있어서 관련된 공지 기술에 대한 구체적인 설명이 본 발명의 요지를 흐릴 수 있다고 판단되는 경우 그 상세한 설명을 생략한다.The present invention can apply various transformations and can have various embodiments. Hereinafter, specific embodiments will be illustrated in the drawings and described in detail in the detailed description. However, it should be understood that this is not intended to limit the present invention to specific embodiments, and includes all transformations, equivalents, and substitutes included in the spirit and scope of the present invention. In describing the present invention, if it is determined that a detailed description of related known technologies may obscure the gist of the present invention, the detailed description will be omitted.
엑소좀 준비 및 RNA 추출Exosome preparation and RNA extraction
ExoQuick-TC (System bioscience, CA, USA) 키트를 이용하여 5mL의 소변으로부터 엑소좀을 추출하였다. 엑소좀의 추출은 제조사에서 제시한 실험방법대로 진행하며, 대략적으로는 소변 시료를 3,000g에서 15분간 원심분리 후 얻은 상층액에 엑소좀 침전 용액을 넣고 4℃에서 overnight동안 보관하였다. 이 후 4℃, 1,500g로 30분 간 원심분리 후 상층액을 제거하고, 5분 간 1,500g에서 원심분리하여 남은 미량의 액체 성분을 제거하였다.Exosomes were extracted from 5 mL of urine using the ExoQuick-TC (System bioscience, CA, USA) kit. Extraction of exosomes proceeded according to the experimental method suggested by the manufacturer. Roughly, exosome precipitation solution was added to the supernatant obtained after centrifugation of the urine sample at 3,000g for 15 minutes and stored at 4 ° C. overnight. Thereafter, the supernatant was removed after centrifugation at 4° C. and 1,500 g for 30 minutes, and centrifugation was performed at 1,500 g for 5 minutes to remove remaining trace liquid components.
이렇게 얻은 엑소좀 펠렛은 TRIzol (Thermo Fisher Sicentific, MA, USA) 용액을 이용하여 total RNA를 추출하였다.Total RNA was extracted from the exosome pellet thus obtained using TRIzol (Thermo Fisher Sicentific, MA, USA) solution.
TLDA 실험 및 데이터 분석TLDA experiments and data analysis
Megaplex PreAmp Primers Human Pool A 및 TaqMan PreAmp Master Mix(Thermo Fisher Scientific)를 사용하여 Megaplex 역전사 반응 및 사전 증폭 반응을 수행한다. MiRNA 발현은 TLDA 패널 A v2.0(Thermo Fisher Scientific)을 통해 평가하였고, TLDA 실험은 제조사에서 제시한 실험방법에 따라 진행하였다. QuantStudio Real-Time PCR 소프트웨어(Thermo Fisher Scientific)를 사용하여 원시 데이터를 처리하여 각 miRNA에 대한 주기 임계값(Ct) 값을 결정하였다.Megaplex reverse transcription and pre-amplification reactions were performed using Megaplex PreAmp Primers Human Pool A and TaqMan PreAmp Master Mix (Thermo Fisher Scientific). MiRNA expression was evaluated through TLDA panel A v2.0 (Thermo Fisher Scientific), and TLDA experiments were conducted according to the experimental method suggested by the manufacturer. The raw data were processed using QuantStudio Real-Time PCR software (Thermo Fisher Scientific) to determine cycle threshold (Ct) values for each miRNA.
TLDA 데이터 분석을 위해 인간 소변에서 가장 안정적으로 발현되는 엑소좀 miRNA 중 하나인 U6 snRNA를 정규화를 위한 내부 대조군으로 선택하였다. ΔCt 값은 Bioconductor의 HTqPCR R 패키지 (https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/HTqPCR.html)를 사용하여 모든 TLDA 데이터에 걸쳐 정규화하였다. 분석 과정에서 안정적으로 정량화되지 않았거나 30% 미만으로 발현된 miRNA를 제외하고, 배수 변화(전이성/국소화된 PCa)가 ±2 이상인 MiRNA는 두 그룹 간에 차등적으로 발현되는 것으로 간주하였다. For TLDA data analysis, U6 snRNA, one of the most stably expressed exosomal miRNAs in human urine, was selected as an internal control for normalization. ΔCt values were normalized across all TLDA data using Bioconductor's HTqPCR R package (https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/HTqPCR.html). MiRNAs with a fold change (metastatic/localized PCa) of ±2 or more were considered differentially expressed between the two groups, except for miRNAs that were not reliably quantified during the analysis or were expressed at less than 30%.
miRNA 특이적 정량적 역전사 PCRmiRNA-specific quantitative reverse transcription PCR
후보 miRNA의 발현은 TaqMan microRNA Assay (miR-636-002088, miR-21-5p-000397, miR-16-5p-000391, miR-142-3p-000464 및 miR-451a-001141) 를 이용하여 확인하고, U6 snRNA (U6 snRNA-001973) 를 내인성 대조군으로 사용하였다. TaqMan MicroRNA Reverse Transcription Kit(Thermo Fisher Scientific)를 사용하여 5μl의 RNA를 miRNA 특이적 프라이머로 첫 번째 가닥 cDNA로 전환한 다음, TaqMan 프로브를 사용하여 실시간 PCR을 수행하였다. 각 경우에 개별 miRNA의 상대적 발현은 2-ΔCt로 정의한다. 모든 qRT-PCR 반응은 삼중으로 수행되었고 U6 snRNA의 Ct>35인 샘플은 제외하였다.Expression of candidate miRNAs was confirmed using TaqMan microRNA Assay (miR-636-002088, miR-21-5p-000397, miR-16-5p-000391, miR-142-3p-000464 and miR-451a-001141) , U6 snRNA (U6 snRNA-001973) was used as an endogenous control. 5 μl of RNA was converted to first-strand cDNA with miRNA-specific primers using the TaqMan MicroRNA Reverse Transcription Kit (Thermo Fisher Scientific), followed by real-time PCR using TaqMan probes. The relative expression of individual miRNAs in each case is defined as 2-ΔCt. All qRT-PCR reactions were performed in triplicate and samples with Ct>35 of U6 snRNA were excluded.
PCa 전이와 관련된 요로 엑소좀 miRNA 분석에 이용된 시료의 환자 정보Patient information of samples used for urinary tract exosomal miRNA analysis related to PCa metastasis
본 발명의 실시예 각 단계 (Discovery set, Validation set, External model validation set 등) 에서 이용된 대상 시료의 환자 정보는 하기 표 1과 같다.The patient information of the target sample used in each step (discovery set, validation set, external model validation set, etc.) of the embodiment of the present invention is shown in Table 1 below.
(Preoperative PSA, ng/mL)PSA before surgery
(Preoperative PSA, ng/mL)
(Prostate volume, mL)prostate volume
(Prostate volume, mL)
(PSA density, ng/mL)PSA density
(PSA density, ng/mL)
(Clinical Gleason score)Clinical Gleason Score
(Clinical Gleason score)
(Preoperative PSA, ng/mL)PSA before surgery
(Preoperative PSA, ng/mL)
(Prostate volume, mL)prostate volume
(Prostate volume, mL)
(PSA density, ng/mL)PSA density
(PSA density, ng/mL)
(Clinical Gleason score)Clinical Gleason Score
(Clinical Gleason score)
(Preoperative PSA, ng/mL)PSA before surgery
(Preoperative PSA, ng/mL)
(Prostate volume, mL)prostate volume
(Prostate volume, mL)
(PSA density, ng/mL)PSA density
(PSA density, ng/mL)
(Clinical Gleason score)Clinical Gleason Score
(Clinical Gleason score)
후보 miRNA의 검증Validation of candidate miRNAs
본 발명에 따라 전립선 암의 발병, 특히 전립선 암의 전이와 관련된 miRNA를 선별하기 위하여, 시료에서 miRNA의 발현량을 정량분석하였다. 하기 표 2는 본 실시예에 따라 국소의 전립선 암 환자의 시료 대비 전립선 암의 전이가 일어난 환자에서의 miRNA 변화량을 나타냈다.In order to select miRNAs associated with the onset of prostate cancer, in particular, metastasis of prostate cancer according to the present invention, the expression level of miRNAs in samples was quantitatively analyzed. Table 2 below shows the amount of change in miRNA in a patient with metastasis of prostate cancer compared to a sample of a local prostate cancer patient according to the present example.
하기 표 2를 참조하면, miR-636, miR-483-5p, miR-330, miR-29b, miR-18a, miR-363은, 정상대조군 대비 발현량이 감소하였으며, miR-142-3p, miR-451, miR-21, miR-16 등에서는 miRNA의 발현량이 증가하였음을 알 수 있다.Referring to Table 2 below, the expression levels of miR-636, miR-483-5p, miR-330, miR-29b, miR-18a, and miR-363 were decreased compared to the normal control group, and miR-142-3p, miR-
(Down-regulated miRNAs)Downregulated miRNAs
(Down-regulated miRNAs)
(Up-regulated miRNAs)Upregulated miRNAs
(Up-regulated miRNAs)
특히, 상기 표 2에서 miR-636, miR-142-3p, miR-451, miR-21, miR-16는 P 값(P-value) 가 0.05이하로 나타나, 전립선 암 전이를 판단하기 위한 대상으로 적합함을 확인하고, 이를 대상으로 하여 qRT-PCR를 진행하였다. 해당 결과는 하기 표 3과 같다.In particular, in Table 2, miR-636, miR-142-3p, miR-451, miR-21, and miR-16 had a P-value of 0.05 or less, making them suitable for determining metastasis of prostate cancer. After confirming suitability, qRT-PCR was performed on this target. The results are shown in Table 3 below.
(Discovery set)discovery set
(Discovery set)
(Validation set)
(qRT-PCR)validation set
(Validation set)
(qRT-PCR)
(Combined:
Model construction set)
(qRT-PCR)combined set
(Combined:
Model construction set)
(qRT-PCR)
(TLDA)Discovery
(TLDA)
(qRT-PCR)Technical validation
(qRT-PCR)
(p-value)p-value
(p-value)
(p-value)p-value
(p-value)
(p-value)p-value
(p-value)
(p-value)p-value
(p-value)
표 3은 각 miR-636, miR-142-3p, miR-451, miR-21, miR-16의 Discovery set, Validation set, Combined(Model construction) set에서의 qRT-PCR 분석 결과 국소의 전립선 암 환자의 시료 대비 전립선 암의 전이가 일어난 환자에서의 miRNA 변화량을 나타낸다. 표 3을 참조하면, 모든 집합의 값에서 miR-636는 발현이 감소, miR-142-3p, miR-451, miR-21, miR-16의 발현은 증가하였다 (도 4 참조).Table 3 shows the results of qRT-PCR analysis in each miR-636, miR-142-3p, miR-451, miR-21, and miR-16 Discovery set, Validation set, and Combined (Model construction) set of local prostate cancer patients Represents the amount of change in miRNA in a patient with metastasis of prostate cancer compared to a sample of . Referring to Table 3, the expression of miR-636 decreased, and the expression of miR-142-3p, miR-451, miR-21, and miR-16 increased in all values of the set (see FIG. 4).
즉, miR-636는 발현이 감소하는 경우 또는 miR-142-3p, miR-451, miR-21, miR-16의 발현이 증가하는 경우 전립선암이 전이되었다고 판단할 수 있음을 알 수 있다.That is, it can be seen that if the expression of miR-636 decreases or if the expression of miR-142-3p, miR-451, miR-21, or miR-16 increases, it can be determined that prostate cancer has metastasized.
통계분석statistical analysis
6-1. PCa 전이에 대한 위험 점수 모델 개발6-1. Development of a risk scoring model for PCa metastasis
본 발명의 실시예에서 도출한 값의 통계 값의 정확도를 분석하기 위해, 하기 표 4 내지 5와 같이 로지스틱 회귀 분석 및 PCa-MRS 점수에 따른 민감도, 특이도 및 정확도를 분석하였다.In order to analyze the accuracy of the statistical values of the values derived in the examples of the present invention, logistic regression analysis and sensitivity, specificity and accuracy according to PCa-MRS scores were analyzed as shown in Tables 4 and 5 below.
(OR (95% CI))oddsby
(OR (95% CI))
(P-value)P-value
(P-value)
(aOR (95% CI))corrected odds ratio
(aOR (95% CI))
(P-value)P-value
(P-value)
표 4 및 표 5를 참조하면, 본 발명에 따라 도출된 결과들은 신뢰성 있는 데이터임을 알 수 있다.Referring to Tables 4 and 5, it can be seen that the results derived according to the present invention are reliable data.
6-2. PCa-MRS 점수와 생화학적 재발(BCR) 없는 생존과의 상관관계6-2. Correlation between PCa-MRS score and biochemical recurrence (BCR)-free survival
본 발명에서 이용된 환자의 시료 내 전립선 암의 생화학적 재발과의 상관관계는 하기 표 6과 같이 분석되었다. Correlation with biochemical recurrence of prostate cancer in the patient samples used in the present invention was analyzed as shown in Table 6 below.
(P-value)P-value
(P-value)
(P-value)P-value
(P-value)
(high vs low score)highs vs lows
(high vs low score)
표 6 및 도 2의 내용을 참조하면, PCa-MRS 점수가 낮을수록 생화학적 재발(biochemical recurrence, BCR)없는 생존 및 전체 생존률이 더 높다는 것을 알 수 있다. 따라서, 본 발명의 바이오마커는 전립선 암의 전이 여부 등을 진단하여 전립선 암의 예후예측이 가능함을 알 수 있다.Referring to Table 6 and FIG. 2, it can be seen that the lower the PCa-MRS score, the higher the biochemical recurrence (BCR)-free survival and overall survival rate. Therefore, it can be seen that the biomarker of the present invention can predict the prognosis of prostate cancer by diagnosing metastasis of prostate cancer.
본 발명에 이용된 각 miRNA probe의 타겟은 하기 표 7과 같으며, 표 7에서 U6는 내인성 대조군에 대한 miRNA 정보이다.The targets of each miRNA probe used in the present invention are shown in Table 7 below, and U6 in Table 7 is miRNA information for the endogenous control group.
(LT†AssayName) LT† Analytical Name
(LT†AssayName)
UGGAACGATACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCC
CUGCGCAAGGAUGACACGCAAAUUCGUGAAG
CGUUCCAUAUUUUGUGCUCGCUUCGGCAGCACAUAUACUAAAAU
UGGAACGATACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCC
CUGCGCAAGGAUGACACGCAAAUUCGUGAAG
CGUUCCAUAUUUU
표 7에 나타난 바와 같이, 본 발명의 miR-636는 서열번호 1의 유전자서열을, miR-140-3p는 서열번호 2의 유전자 서열을, miR-21는 서열번호 3의 유전자 서열을, miR-16는 서열번호 4의 유전자 서열을, miR-142-3p는 서열번호 5의 유전자 서열을, miR-451는 서열번호 6의 유전자 서열을 포함할 수 있다.As shown in Table 7, miR-636 of the present invention has the gene sequence of SEQ ID NO: 1, miR-140-3p has the gene sequence of SEQ ID NO: 2, miR-21 has the gene sequence of SEQ ID NO: 3, and miR-140-3p has the gene sequence of SEQ ID NO: 3. 16 may include the gene sequence of SEQ ID NO: 4, miR-142-3p may include the gene sequence of SEQ ID NO: 5, and miR-451 may include the gene sequence of SEQ ID NO: 6.
이제까지 본 발명에 대하여 그 바람직한 실시예들을 중심으로 살펴보았다. 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 본 발명이 본 발명의 본질적인 특성에서 벗어나지 않는 범위에서 변형된 형태로 구현될 수 있음을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 개시된 실시예들은 한정적인 관점이 아니라 설명적인 관점에서 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 설명이 아니라 특허청구범위에 나타나 있으며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 차이점은 본 발명에 포함된 것으로 해석되어야 할 것이다.So far, the present invention has been looked at with respect to its preferred embodiments. Those skilled in the art to which the present invention pertains will be able to understand that the present invention can be implemented in a modified form without departing from the essential characteristics of the present invention. Therefore, the disclosed embodiments should be considered from an illustrative rather than a limiting point of view. The scope of the present invention is shown in the claims rather than the foregoing description, and all differences within the equivalent scope will be construed as being included in the present invention.
<110> THE CATHOLIC UNIVERSITY OF KOREA INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION <120> BIOMARKERS FOR PREDICTING PROSTATIC CARCINOMA PROGNOSIS AND USES THEREOF <130> 1071242 <150> KR 10-2021-0075498 <151> 2021-06-10 <160> 7 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 23 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> hsa-miR-636 <400> 1 ugugcuugcu cgucccgccc gca 23 <210> 2 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> hsa-miR-140-3p <400> 2 uaccacaggg uagaaccacg g 21 <210> 3 <211> 22 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> hsa-miR-21 <400> 3 uagcuuauca gacugauguu ga 22 <210> 4 <211> 22 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> hsa-miR-16 <400> 4 uagcagcacg uaaauauugg cg 22 <210> 5 <211> 23 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> hsa-miR-142-3p <400> 5 uguaguguuu ccuacuuuau gga 23 <210> 6 <211> 22 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> mmu-miR-451 <400> 6 aaaccguuac cauuacugag uu 22 <210> 7 <211> 106 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> U6 snRNA <400> 7 gugcucgcuu cggcagcaca uauacuaaaa uuggaacgat acagagaaga uuagcauggc 60 cccugcgcaa ggaugacacg caaauucgug aagcguucca uauuuu 106 <110> THE CATHOLIC UNIVERSITY OF KOREA INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION <120> BIOMARKERS FOR PREDICTING PROSTATIC CARCINOMA PROGNOSIS AND USES THEREOF <130> 1071242 <150> KR 10-2021-0075498 <151> 2021-06-10 <160> 7 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 23 <212> RNA <213> artificial sequence <220> <223> hsa-miR-636 <400> 1 uggcuugcu cgucccgccc gca 23 <210> 2 <211> 21 <212> RNA <213> artificial sequence <220> <223> hsa-miR-140-3p <400> 2 uaccacaggg uagaaccacg g 21 <210> 3 <211> 22 <212> RNA <213> artificial sequence <220> <223> hsa-miR-21 <400> 3 uagcuuauca gacugauguu ga 22 <210> 4 <211> 22 <212> RNA <213> artificial sequence <220> <223> hsa-miR-16 <400> 4 uagcagcacg uaaauauugg cg 22 <210> 5 <211> 23 <212> RNA <213> artificial sequence <220> <223> hsa-miR-142-3p <400> 5 uguaguguuu ccuacuuuau gga 23 <210> 6 <211> 22 <212> RNA <213> artificial sequence <220> <223> mmu-miR-451 <400> 6 aaaccguuac cauuacugag uu 22 <210> 7 <211> 106 <212> RNA <213> artificial sequence <220> <223> U6 snRNA <400> 7 gugcucgcuu cggcagcaca uauacuaaaa uuggaacgat acagagaaga uuagcauggc 60 cccugcgcaa ggaugacacg caaauucgug aagcguucca uauuuu 106
Claims (13)
상기 바이오마커는 대상체로부터 분리된 생물학적 시료에서 검출되는 것인, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 바이오마커.According to claim 1,
Wherein the biomarker is detected in a biological sample isolated from a subject, a biomarker for diagnosis or prognosis of prostate cancer.
상기 생물학적 시료는 소변인, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 바이오마커.According to claim 2,
The biological sample is urine, a biomarker for diagnosis or prognosis of prostate cancer.
상기 예후 예측은 전립선암의 전이 여부를 진단하는 것인, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 바이오마커.According to claim 1,
The prognostic prediction is a biomarker for diagnosing or predicting prognosis of prostate cancer, which is to diagnose metastasis of prostate cancer.
상기 제제는 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 포함하는, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 조성물.According to claim 5,
The preparation includes a nucleic acid capable of specifically binding to at least one miRNA selected from the group consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and miR-636, diagnosis of prostate cancer or A composition for predicting prognosis.
상기 예후 예측은 전립선암의 전이 여부를 진단하는 것인, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 조성물.According to claim 6,
Wherein the prognosis is to diagnose metastasis of prostate cancer, a composition for diagnosing or predicting prognosis of prostate cancer.
상기 키트는 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 및 miR-636으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 miRNA와 특이적으로 결합 가능한 핵산을 추가적으로 포함하는 것을 특징으로 하는, 전립선암의 진단 또는 예후 예측용 키트.According to claim 8,
The kit further comprises a nucleic acid capable of specifically binding to at least one miRNA selected from the group consisting of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 and miR-636, A kit for diagnosing or predicting the prognosis of prostate cancer.
(a) 피검자로부터 취득한 샘플 중에 포함된 miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 또는 miR-636의 발현양을 정상군 샘플 중에 포함된 miRNA의 발현양과 비교하는 단계.A method for providing information for diagnosis or prognosis of prostate cancer comprising the following steps:
(a) comparing the expression level of miR-21, miR-16, miR-142-3p, miR-451 or miR-636 in the sample obtained from the subject with the expression level of miRNA included in the sample of the normal group.
(b) 상기 피검자의 샘플 중에 포함된 상기 miR-21, miR-16, miR-142-3p 또는miR-451의 발현양이 정상군 샘플 중에 포함된 miRNA의 발현양 보다 증가된 경우, 전립선암이 발병한 것으로 판별하거나 전이 위험을 높은 수준으로 예측하는 단계.11. The method of claim 10, wherein the method further comprises the following steps:
(b) When the expression level of miR-21, miR-16, miR-142-3p or miR-451 included in the sample of the subject is higher than the expression level of miRNA included in the sample of the normal group, prostate cancer The stage at which the disease is identified or the risk of metastasis is predicted at a high level.
(b) 상기 피검자의 샘플 중에 포함된 상기 miR-636의 발현양이 정상군 샘플 중에 포함된 miRNA의 발현양 보다 감소된 경우, 전립선암이 발병한 것으로 판별하거나 전이 위험을 높은 수준으로 예측하는 단계.11. The method of claim 10, wherein the method further comprises the following steps:
(b) determining that prostate cancer has occurred or predicting a high level of metastasis risk when the expression level of miR-636 included in the sample of the subject is lower than the expression level of miRNA included in the sample of the normal group .
상기 피검자로부터 취득한 샘플은 피검자의 소변인, 전립선암의 진단 또는 예후 예측을 위한 정보를 제공하는 방법.According to claim 10,
A method for providing information for diagnosis or prognosis of prostate cancer, wherein the sample obtained from the subject is urine of the subject.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR20210075498 | 2021-06-10 | ||
KR1020210075498 | 2021-06-10 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20220166744A true KR20220166744A (en) | 2022-12-19 |
Family
ID=84535518
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020220070875A KR20220166744A (en) | 2021-06-10 | 2022-06-10 | Biomarkers for predicting prostatic carcinoma prognosis and uses thereof |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR20220166744A (en) |
-
2022
- 2022-06-10 KR KR1020220070875A patent/KR20220166744A/en unknown
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6203209B2 (en) | Plasma microRNA for detection of early colorectal cancer | |
CN111961725B (en) | Kit or device for detecting pancreatic cancer and detection method | |
US9920375B2 (en) | Biomarkers in peripheral blood mononuclear cells for diagnosing or detecting lung cancers | |
US20210130905A1 (en) | Micro-rna biomarkers and methods of using same | |
JP6408380B2 (en) | Method and kit for diagnosing a subject at risk of having cancer | |
ES2608322T3 (en) | Procedure to predict the response to chemotherapy in a patient who suffers or is at risk of developing recurrent breast cancer | |
JP2016514966A (en) | Composition for prognosis detection and determination of prostate cancer and method for detection and determination | |
KR20190089552A (en) | Biomarkers for diagnosis of Non-muscle invasive bladder cancer and uses thereof | |
WO2017223216A1 (en) | Compositions and methods for diagnosing lung cancers using gene expression profiles | |
US10704106B2 (en) | Methods and kits for assessing the risk of developing or diagnosing endometrial cancer | |
EP3122905B1 (en) | Circulating micrornas as biomarkers for endometriosis | |
US11243206B2 (en) | Gender-specific markers for diagnosing prognosis and determining treatment strategy for renal cancer patients | |
CN108949969B (en) | Application of long-chain non-coding RNA in colorectal cancer | |
CN110229899B (en) | Plasma marker combinations for early diagnosis or prognosis prediction of colorectal cancer | |
KR20220166744A (en) | Biomarkers for predicting prostatic carcinoma prognosis and uses thereof | |
WO2021191485A1 (en) | Biomarkers for predicting a patient's response to bcg therapy, methods and uses based thereon | |
KR20220131083A (en) | MicroRNA Biomarker for Diagnosis of Thyroid Cancer and Use Thereof | |
US20150087549A1 (en) | Methods of using tissue biomarkers for indication of progression from barretts esophagus to esophageal adenocarcinoma | |
US20210147944A1 (en) | Methods for monitoring and treating prostate cancer | |
CN113862367A (en) | MiRNA-based prediction of sensitivity of lung adenocarcinoma patient to platinum-containing dual-drug chemotherapy | |
CN113981089A (en) | Method for predicting sensitivity of lung adenocarcinoma to platinum-containing dual-drug chemotherapy | |
KR20220151482A (en) | Biomarker for diagnosis of prostate cancer | |
CN114015776A (en) | Application of miRNA in predicting sensitivity of lung adenocarcinoma to platinum-containing dual-drug chemotherapy | |
CN113981088A (en) | Application of miRNA marker and related product thereof in predicting sensitivity of lung adenocarcinoma to chemotherapy | |
RU2618409C1 (en) | Method for prostate cancer differential diagnosis based on plasma micrornas analysis |