KR20200027243A - Biomarker for diagnosing radiation exposure and method using thereof - Google Patents

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Abstract

The present invention relates to a biomarker for diagnosing radiation exposure and a method using the same. According to a composition and a kit for diagnosing radiation exposure, and a method for diagnosing radiation exposure using the same in one aspect, radiation exposure time or exposure dose can be easily diagnosed and a radiation treatment effect can be predicted. The composition comprises a formulation for measuring an expression level of a G-patch domain and KOW motifs protein or a fragment thereof.

Description

방사선 피폭 진단용 바이오마커 및 이를 이용한 방법{Biomarker for diagnosing radiation exposure and method using thereof} Biomarker for diagnosing radiation exposure and method using thereof

방사선 피폭 진단용 바이오마커 및 이를 이용한 방법에 관한 것이다.It relates to a biomarker for the diagnosis of radiation exposure and a method using the same.

방사선 피폭은 심장질환이나 암 발생의 위험을 증가시킨다. 방사선 피폭에 의한 인체 손상 정도를 측정하기 위해 세포학적, 유전학적인 측정법들이 지난 수십 년간 사용되어 왔다. 하지만 이러한 측정법들은 방사선에 대한 인체의 유전자 또는 세포의 손상 여부를 확인해 줄 수 있을 뿐, 방사선에 대한 인체 반응의 분자적 기작에 대한 정보는 제공하지는 않는다. 따라서, 방사선 피폭을 편리하고 정확하게 진단할 수 있도록 하는 마커를 찾기 위해 지금도 많은 노력이 경주되고 있다.Radiation exposure increases the risk of developing heart disease or cancer. Cytologic and genetic measurements have been used for decades to measure the extent of human damage caused by radiation exposure. However, these methods can only confirm whether the human gene or cell is damaged by radiation, but do not provide information on the molecular mechanism of the human response to radiation. Therefore, much effort is still being made to find markers that can conveniently and accurately diagnose radiation exposure.

지난 수십 년간 방사선 피폭 마커에 대한 연구는 주로 암에 집중되어 왔지만 최근 들어 방사선에 노출된 정상 조직이나 시료에서 발견될 수 있는 피폭 마커를 찾는 연구로 더욱 확대되었다. 지금까지 방사선 피폭 마커로 연구되어 온 단백질 마커들이 일부 존재하나, 방사선 피폭 정도를 정량적으로 예측하기는 어려웠다.Although research on radiation exposure markers has been mainly focused on cancer for the past several decades, it has recently been expanded to research on exposure markers that can be found in normal tissue or samples exposed to radiation. Although some protein markers have been studied as radiation exposure markers so far, it has been difficult to quantitatively predict the degree of radiation exposure.

일반적으로, 방사선 종사자들이 작업 시 사용하는 TLD(ThermoLuminescence Dosimeter, 열형광 선량계 배지(badge)로 선량계의 방사선 노출 정도를 계산하는 방법과 피폭 상황을 재구성하여 방사선 선량을 수학적으로 계산하는 방법이 사용되지만, 배지 패용에 대한 간접 측정 또는 이론적 측정으로 인해 개별 인체에 미치는 선량도 측정의 신뢰도가 떨어지는 한계가 있다. 또한, 소핵 형성도 측정, 적혈구의 글리코포린 A(glycophorin A)의 돌연변이 측정, DNA절단 정도, 및 치아의 에나멜(enamel)을 이용한 ESR(Electron Spin Resonance: 전자 스핀 공명)등의 방법들이 시도되었지만 개인차에 따라 지표들의 오차 범위가 매우 커서 방사선 선량측정이 거의 불가능하였다. 방사선 피폭 개체의 피폭 선량을 측정하기 위해, 염색체 이상(conventional chromosome aberration) 측정법으로 피폭환자의 말초혈액을 채취하여 림프구를 배양하고 림프구내에 형성된 염색체 이상인 이동원체(dicentrics)와 환(ring)의 발생빈도를 광학현미경 및 미세구조 관찰장비를 통해 판별할 수 있는 최적 표준(gold standard) 방법이 연구되었으나, 많은 시간 및 비용이 들며, 소수 전문가들만이 진단할 수 있는 한계로 거의 활용되지 못하고 있는 실정이다.In general, a method of calculating the radiation exposure level of a dosimeter using a thermoluminum dosimeter (TLD) used by radiation workers during work and a method of mathematically calculating the radiation dose by reconstructing the exposure situation are used. Due to the indirect or theoretical measurement of the culture of the medium, there is a limitation that the reliability of the measurement of the dose to the individual human body is poor.In addition, the measurement of micronuclei formation, the measurement of the mutation of glycophorin A in red blood cells, the degree of DNA cleavage, And methods such as ESR (Electron Spin Resonance) using tooth enamel have been tried, but due to individual differences, the error range of the indicators is very large and radiation dose measurement is almost impossible. For the measurement, the patient was exposed by the chromosome aberration method. Research on an optimal gold standard method for collecting lymphocytes and culturing lymphocytes and determining the frequency of occurrence of dicentrics and rings over the chromosomes formed in the lymphocytes through optical microscope and microstructure observation equipment However, it takes a lot of time and money, and it is rarely used as a limitation that only a small number of experts can diagnose.

따라서, 채취가 간편한 액체 시료에서 방사선 피폭 선량에 정량적으로 반응하여 방사선 피폭을 정확하고 빠르게 진단할 수 있는 바이오마커에 대한 연구가 필요한 실정이다.Therefore, there is a need for research on biomarkers capable of accurately and rapidly diagnosing radiation exposure by quantitatively responding to radiation exposure dose in a liquid sample that is easy to collect.

방사선에 노출시 발현이 정량적으로 변화하므로, 방사선 피폭 선량을 예측할 수 있고 방사선 치료 효과를 진단할 수 있는 바이오마커 조성물에 관한 것으로, GPKOW(G-patch domain and KOW motifs, G-패치 도메인 및 KOW 모티프) 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 방사선 피폭 진단용 조성물, 키트 및 상기 단백질을 이용한 방사선 피폭을 진단하는 방법을 제공한다.Since the expression is quantitatively changed upon exposure to radiation, the present invention relates to a biomarker composition capable of predicting radiation exposure dose and diagnosing a radiation treatment effect, and is a GPKOW (G-patch domain and KOW motifs, G-patch domain and KOW motif) ) Provides a composition, kit for diagnosing radiation exposure, and a method for diagnosing radiation exposure using the protein, including a preparation for measuring the expression level of a protein or fragment thereof.

본 발명은 방사선 피폭에 대한 단백질 마커를 발견하기 위해 예의 연구한 결과, 방사선에 피폭 시 특정 단백질, 즉 GPKOW와 그 mRNA 발현량이 혈액 세포에서 특이적으로 증가한다는 것을 발견하고 GPKOW의 방사선 피폭 마커로서의 용도를 발명하였다. The present invention has been studied extensively to find protein markers for radiation exposure, and as a result of exposure to radiation, the specific protein, that is, the expression of GPKOW and its mRNA is specifically increased in blood cells, and the use of GPKOW as a radiation exposure marker Invented.

일 양상은 GPKOW(G-patch domain and KOW motifs) 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 방사선 피폭 진단용 조성물을 제공한다. One aspect provides a composition for diagnosing radiation exposure comprising an agent that measures the expression level of a G-patch domain and KOW motifs (GPKOW) protein or fragment thereof.

본 명세서에서 용어 "진단"은 병태 생리의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미하는 것이다. 본 발명에서의 진단은 방사선 피폭 여부 및/또는 그 정도를 확인하는 것이다. The term "diagnosis" in this specification is meant to identify the presence or characteristics of the pathophysiology. The diagnosis in the present invention is to confirm whether and / or the degree of radiation exposure.

방사선 피폭시, 체세포가 손상되어 조혈조직 손상, 소화기계통 손상, 중추신경계 손상, 또는 피부 손상과 같은 급성 부작용이나 백내장, 종양, 생식력 저하와 같은 만성 부작용이 나타날 수 있다. 또한, 염색체 이상으로 발생되는 생식 세포 손상의 원인이 되기도 한다. 따라서, 방사선 피폭을 정량적으로 진단할 수 있는 마커가 필요하다.When exposed to radiation, somatic cells may be damaged, resulting in acute side effects such as damage to hematopoietic tissue, damage to the digestive system, damage to the central nervous system, or skin, or chronic side effects such as cataracts, tumors, and decreased fertility. In addition, it may cause damage to germ cells caused by chromosomal abnormalities. Therefore, there is a need for a marker capable of quantitatively diagnosing radiation exposure.

또한, 방사선 치료는 항암 치료에 있어 매우 중요한 역할을 하지만, 방사선 치료시 방사선 피폭에 의해 불가항력적으로 종양 주변의 정상 조직에 손상이 발생한다. 이러한 종양 주변 정상 조직의 손상은 방사선 치료를 향상시키는 데 걸림돌이 된다. 또한, 방사선 치료로 인해 정상 장기에 한계선량 이상의 방사선이 조사되면 장기 고유의 기능을 부분적으로 상실하거나 영구적으로 기능 손상이 유발되어 만성적 부작용을 초래하기도 한다. 따라서, 방사선 노출에 반응하는 정상 조직 및 암 조직의 손상을 모니터링할 수 있는 마커가 필요하고, 이러한 마커를 통해 환자 맞춤형 치료가 가능하다.In addition, radiation therapy plays a very important role in the treatment of anti-cancer, but radiation treatment irresistibly causes damage to normal tissues around the tumor by radiation exposure. Damage to normal tissue around these tumors is a barrier to improving radiation therapy. In addition, when radiation above the threshold dose is irradiated to normal organs due to radiation treatment, the organ's intrinsic function may be partially lost or permanently impaired, leading to chronic side effects. Therefore, markers capable of monitoring damage to normal and cancerous tissues responsive to radiation exposure are needed, and such markers allow patient-specific treatment.

본 명세서에서 용어 "마커(marker)"란 정상군 개체와 방사선 피폭된 개체를 구분하여 진단할 수 있는 물질로, 정상군 개체에 비해 방사선에 피폭된 군에서 증가 또는 감소를 보이는 폴리펩티드, 단백질 또는 핵산, 유전자, 지질, 당지질, 당단백질 또는 당 등과 같은 유기 생체 분자들을 포함한다. 본 발명에서의 방사선 피폭을 진단하기 위한 마커는 정상 대조군의 시료에 비하여, 방사선 피폭군의 시료에서 특이적으로 낮은 수준의 발현을 보이는 GPKOW 유전자 및 이에 의해 코딩되는 단백질이다. As used herein, the term "marker (marker)" is a substance that can be diagnosed by distinguishing between a normal group of individuals and a radiation-exposed individual, a polypeptide, protein, or nucleic acid showing an increase or decrease in a group exposed to radiation compared to a normal group , Organic biomolecules such as genes, lipids, glycolipids, glycoproteins or sugars. The marker for diagnosing radiation exposure in the present invention is a GPKOW gene and a protein encoded by the GPKOW gene that exhibits a specifically low level of expression in a sample of the radiation exposure group as compared to a sample of the normal control group.

상기 GPKOW(G-patch domain and KOW motifs) 단백질은 세포의 생존 항상성을 유지하기 위해 지속적으로 전사되는 유전자들의 pre-mRNA 스플라이싱을 담당하는 스플라이소좀(spliceosome)을 구성하는 단백질체이다. GPKOW 단백질은 주요 혈액 세포에서 발현되나, 방사선 피폭과의 연관성 또는 방사선 피폭에 의한 영향에 대해서는 전혀 알려져 있지 않다. GPKOW 단백질은 주로 미토콘드리아 (mitochondria), 세포질(cytosol), 세포골격 (cytoskeleton)에서 발현하므로 GPKOW의 발현이나 기능 모니터링을 위해 세포 내 기관의 분리나 분해 과정이 필요 없다는 장점이 있다.The GPKOW (G-patch domain and KOW motifs) protein is a protein body constituting a spliceosome responsible for pre-mRNA splicing of genes that are continuously transcribed to maintain cell homeostasis. The GPKOW protein is expressed in major blood cells, but the association with radiation exposure or the effect of radiation exposure is unknown. GPKOW protein is mainly expressed in the mitochondria (mitochondria), cytosol (cytosol), cytoskeleton (cytoskeleton), there is an advantage that does not require the separation or decomposition of organs in the cell to monitor the expression or function of GPKOW.

상기 GPKOW 단백질은 T54, Spp2, GPATC5, GPATCH5로도 표시될 수 있으며, 인간에서 Genebank Accession No. NM_015698.5, BC003148.1, BC000397.2, AB209806.1, XM_017029415.2 NCBI Reference Sequence: NG_021310.2의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산으로부터 암호화된 단백질일 수 있다. 상기 GPKOW 단백질은 GPKOW 동형 단백질이나 이들의 전구체일 수 있다. 용어 "동형(isoform)"은 동일한 단백질의 다른 형태를 말한다. 상기 GPKOW 단백질은 예를 들어, 인간에서 GenBank Accession No. XP_016884904.1, NP_056513.2, Q92917.2, EAW50694.1, AAH03148.1, AAH00397.1 또는 UniprotKB Accession No. Q92917의 아미노산 서열을 포함하는 단백질일 수 있다. The GPKOW protein may also be expressed as T54, Spp2, GPATC5, GPATCH5, and Genebank Accession No. NM_015698.5, BC003148.1, BC000397.2, AB209806.1, XM_017029415.2 NCBI Reference Sequence: may be a protein encoded from a nucleic acid comprising the nucleotide sequence of NG_021310.2. The GPKOW protein may be a GPKOW isoform protein or a precursor thereof. The term "isoform" refers to different forms of the same protein. The GPKOW protein is, for example, GenBank Accession No. XP_016884904.1, NP_056513.2, Q92917.2, EAW50694.1, AAH03148.1, AAH00397.1 or UniprotKB Accession No. It may be a protein comprising the amino acid sequence of Q92917.

상기 GPKOW 단백질은 서열번호 1 또는 2의 아미노산 서열을 포함하는 단백질일 수 있다. The GPKOW protein may be a protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 2.

상기 GPKOW 단백질의 단편은 면역원성 단편일 수 있다. 상기 GPKOW 단백질에 대한 항체에 의해 인식될 수 있는 하나 이상의 에피토프(epitope)를 가지고 있는 단편일 수 있다. The fragment of the GPKOW protein may be an immunogenic fragment. It may be a fragment having one or more epitopes that can be recognized by an antibody against the GPKOW protein.

상기 GPKOW 단백질의 발현 수준 측정은 GPKOW 단백질의 발현 수준 또는 GPKOW 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오티드, 예를 들어 mRNA 발현 수준을 측정함으로써 수행할 수 있다.Measurement of the expression level of the GPKOW protein can be performed by measuring the expression level of the GPKOW protein or the polynucleotide encoding the GPKOW protein, for example, mRNA expression level.

본 명세서에서 용어 "발현 수준 측정"이란 방사선 피폭을 진단하기 위하여 생물학적 시료에서의 방사선 피폭 진단 유전자에서 발현된 단백질의 발현량을 확인하는 과정으로, 본 발명의 일 구현예에 따르면 상기 단백질에 대해 특이적으로 결합하는 항체 또는 항원 결합 단편을 이용하여 단백질을 확인할 수 있다. 이를 위한 분석방법으로는 웨스턴 블랏팅(western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbent assay: 효소결합 면역흡착 분석), 방사선 면역분석(RIA: Radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트(rocket) 면역전기영동, 조직면역 염색, 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법(Complement Fixation Assay), FACS(Fluorescence Activated Cell Sorter, 형광 활성화 세포 분류기), 단백질 칩(protein chip) 등이 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present specification, the term "measurement of expression level" is a process of confirming the expression level of a protein expressed in a radiation exposure diagnostic gene in a biological sample in order to diagnose radiation exposure, and according to one embodiment of the present invention, specific for the protein Proteins can be identified using antibodies or antigen-binding fragments that bind antigenically. As an analysis method for this, western blotting, ELISA (enzyme linked immunosorbent assay), radioimmunoassay (RIA), radioimmunodiffusion, radioimmunodiffusion, Ouchterlony ) Immuno-diffusion method, rocket immunoelectrophoresis, tissue immunostaining, immunoprecipitation assay, complement fixation assay, FACS (Fluorescence Activated Cell Sorter), fluorescence activated cell sorter (FACS), protein chip (protein) chip) and the like, but is not limited thereto.

본 명세서에서 용어 "항체"란 당해 기술분야에 공지된 용어로서 항원성 부위에 대하여 지시되는 특이적인 면역 글로불린을 의미한다. 본 발명에서의 항체는 본 발명의 방사선 피폭 마커인 GPKOW에 대해 특이적으로 결합하는 항체를 의미하며, GPKOW 유전자를 발현벡터에 클로닝하여 GPKOW 유전자에 의해 코딩되는 GPKOW 단백질을 얻고, 얻어진 GPKOW 단백질로부터 당해 기술분야의 통상적인 방법에 따라 항체를 제조할 수 있다. 상기 항체의 형태는 폴리클론 항체 또는 모노클론 항체를 포함하며, 모든 면역글로불린 항체가 포함된다. 상기 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2 개의 전체 길이의 중쇄를 갖는 완전한 형태를 의미한다. 또한, 상기 항체는 인간화 항체 등의 특수 항체도 포함된다.The term "antibody" as used herein refers to a specific immunoglobulin directed against an antigenic site as a term known in the art. The antibody in the present invention refers to an antibody that specifically binds to the radiation exposure marker GPKOW of the present invention, and the GPKOW gene is cloned into an expression vector to obtain a GPKOW protein encoded by the GPKOW gene, and is obtained from the obtained GPKOW protein. Antibodies can be prepared according to conventional methods in the art. The form of the antibody includes a polyclonal antibody or a monoclonal antibody, and all immunoglobulin antibodies are included. The antibody refers to a complete form with two full-length light chains and two full-length heavy chains. In addition, the antibody also includes special antibodies such as humanized antibodies.

상기 GPKOW 단백질을 암호화하는 mRNA 발현량을 측정하는 제제는 일 구현에에 따르면 유전자의 mRNA에 대해 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브, 또는 안티센스 뉴클레오티드이며, GPKOW 유전자의 핵산 서열이 알려져 있으므로, 당업자는 상기 서열을 바탕으로 이들 유전자의 mRANA에 대해 특이적으로 결합하는 프라미어 또는 프로브를 디자인할 수 있다.According to one embodiment, the agent for measuring the mRNA expression level encoding the GPKOW protein is a primer, probe, or antisense nucleotide that specifically binds to the mRNA of the gene, and the nucleic acid sequence of the GPKOW gene is known. Based on the sequence, a primer or probe that specifically binds to mRANA of these genes can be designed.

본 명세서에서 용어 "mRNA 발현 수준 측정"이란 방사선 피폭을 진단하기 위하여 생물학적 시료에서 방사선 피폭 마커 유전자의 mRNA 발현정도를 확인하는 과정으로, 본 발명의 일 구현예에 따르면 mRNA에 대한 프라이머 또는 프로브를 이용하여 측정할 수 있다. 이를 위한 분석방법으로는 RT-PCR(Reverse Transctiption-Polymerase Chain Reaction, 역전사-중합효소 연쇄 반응), 경쟁적 RT-PCR(competitive RT-PCR), 실시간 RTPCR(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA: RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting), 또는 DNA 칩 등이 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.The term "measurement of mRNA expression level" in the present specification is a process of determining the mRNA expression level of a radiation exposure marker gene in a biological sample to diagnose radiation exposure, according to an embodiment of the present invention, using a primer or probe for mRNA Can be measured. As an analysis method for this, RT-PCR (Reverse Transctiption-Polymerase Chain Reaction), competitive RT-PCR (competitive RT-PCR), real-time RTPCR (Real-time RT-PCR), RNase protection assay (RPA: RNase protection assay), Northern blotting, or DNA chip, but is not limited thereto.

본 명세서에서 용어 "프라이머"는 짧은 자유 3-말단 수산화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 핵산 서열로 상보적인 템플레이트(template)와 염기쌍을 형성할 수 있고 템플레이트 가닥 복사을 위한 시작 지점으로서 작용하는 짧은 핵산 서열을 말한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응을 위한 시약(즉, DNA 폴리머라제 또는 역전사효소) 및 상이한 4 가지의 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재 하에서 DNA 합성을 개시할 수 있다. 본 발명의 일 구현예에 따르면 GPKOW 유전자의 mRNA의 센스 및 안티센스 프라이머를 이용하여 PCR 증폭을 실시하여 원하는 생성물의 생성량의 측정을 통해 방사선 피폭을 진단할 수 있다. PCR 조건, 센스 및 안티센스 프라이머의 길이는 당업계에 공지된 기술에 따라 적절히 선택될 수 있다.The term “primer” herein is a short nucleic acid that can form a complementary template and base pair with a nucleic acid sequence having a short free 3- 'hydroxyl group and acts as a starting point for template strand copying. Refers to the sequence. The primer can initiate DNA synthesis in the presence of four different nucleoside triphosphates and reagents for polymerization (ie, DNA polymerase or reverse transcriptase) at appropriate buffers and temperatures. According to an embodiment of the present invention, PCR amplification may be performed using the sense and antisense primers of the mRNA of the GPKOW gene to diagnose radiation exposure through measurement of a desired product production amount. PCR conditions, sense and antisense primer length can be appropriately selected according to techniques known in the art.

본 명세서에서 용어 "프로브"란 mRNA외 특이적으로 결합을 이룰 수 있는 짧게는 수 염기 내지 길게는 수백 염기에 해당하는 RNA 또는 DNA 등의 핵산 단편을 의미하며 라벨링되어 있어서 특정 mRNA의 존재 유무, 발현량을 확인할 수 있다.The term "probe" as used herein refers to a nucleic acid fragment such as RNA or DNA corresponding to short to several bases to hundreds of bases that can specifically bind other than mRNA, and is labeled to indicate the presence or absence of specific mRNA. You can check the amount.

프로브는 올리고뉴클레오타이드(oligonucleotide) 프로브, 단쇄 DNA(single strand DNA) 프로브, 이중쇄DNA(double strand DNA)프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있다. 본 발명의 일 구현예에 따르면 GPKOW 폴리뉴클레오티드의 mRNA와 상보적인 프로브를 이용하여 혼성화를 실시하여, 혼성화 정도를 통해 mRNA의 발현량을 측정함으로써 방사선 피폭 여부 및 정도를 측정할 수 있다. 적절한 프로브의 선택 및 혼성화 조건은 당해 기술 분야에 공지된 기술에 따라 적절히 선택할 수 있다.The probe may be produced in the form of an oligonucleotide probe, a single strand DNA probe, a double strand DNA probe, or an RNA probe. According to one embodiment of the present invention, hybridization is performed using a probe complementary to the mRNA of the GPKOW polynucleotide, and the expression and expression level of the mRNA can be measured through the degree of hybridization to measure whether and how much radiation is exposed. The appropriate probe selection and hybridization conditions may be appropriately selected according to techniques known in the art.

본 발명의 프라이머 또는 프로브는 포스포아미다이트(phosphoramidite) 고체 지지체 합성법이나 기타 널리 공지된 방법을 이용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이러한 핵산 서열은 또한 당해 기술분야에 공지된 다양한 방법을 통해 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 예로는 메틸화, 캡화, 천연 뉴클레오티드 하나 이상의 동족체로의 치환, 및 뉴클레오티드 간의 변형, 예를 들면 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)로의 변형이 있다.The primer or probe of the present invention can be chemically synthesized using a phosphoramidite solid support synthesis method or other well-known methods. Such nucleic acid sequences can also be modified through a variety of methods known in the art. Examples of such modifications are methylation, encapsulation, substitution with one or more homologs of natural nucleotides, and modifications between nucleotides, such as uncharged linkages (eg methyl phosphonate, phosphotriester, phosphoroamidate, carbamate Or the like) or a modified linker (eg, phosphorothioate, phosphorodithioate, etc.).

상기 GPKOW 단백질 및 그 유전자의 mRNA 발현 수준은 방사선 피폭시 혈액 세포 특이적으로 증가하므로, 상기 본 발명에 따른 방사선 피폭을 진단하기 위한 마커 검출용 조성물은 방사선 피폭이 의심되는 개체 중에서 특히 얻기 쉬운 혈액세포나 혈액으로부터 얻어진 시료에서의 단백질 발현 수준을 측정하는데 이용될 수 있다. Since the mRNA expression level of the GPKOW protein and its gene increases specifically during blood exposure, the composition for detecting markers for diagnosing radiation exposure according to the present invention is particularly easy to obtain blood cells among individuals suspected of radiation exposure. It can be used to measure the level of protein expression in samples obtained from blood.

상기 조성물은 방사선 피폭 진단에 필요한 시료를 더 포함할 수 있다. The composition may further include a sample necessary for diagnosis of radiation exposure.

다른 양상은 GPKOW 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 방사선 피폭 진단용 키트를 제공한다. Another aspect provides a kit for diagnosing radiation exposure comprising an agent that measures the expression level of a GPKOW protein or fragment thereof.

GPKOW 단백질, GPKOW 단백질의 단편, 발현 수준, 및 발현 수준의 측정은 전술한 바와 같다. Measurements of GPKOW protein, fragments of GPKOW protein, expression level, and expression level are as described above.

상기 키트는 방사선 피폭 진단에 필요한 시료를 더 포함할 수 있다. 상기 키트는 항체, 항체의 면역학적 검출을 위하여 기질, 적합한 완충용액, 발색 효소 또는 형광물질로 표지된 2차 항체, 또는 발색 기질을 포함할 수 있다. The kit may further include a sample necessary for diagnosis of radiation exposure. The kit may include an antibody, a substrate for immunological detection of the antibody, a suitable buffer solution, a secondary antibody labeled with a chromogenic enzyme or fluorescent substance, or a chromogenic substrate.

다른 구체예에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트, DNA 칩 키트, ELISA 키트, 단백질 칩 키트, 래피드(rapid) 키트 또는 MRM(Multiple reaction monitoring, 다중 반응 탐색) 키트일 수 있다.In other embodiments, the kit may be an RT-PCR kit, a DNA chip kit, an ELISA kit, a protein chip kit, a rapid kit, or a multiple reaction monitoring (MRM) kit.

다른 양상은 (a) 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 GPKOW 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 상기 측정된 발현 수준을 정상 대조군의 단백질 발현 수준과 비교하는 단계를 포함하는 방사선 피폭 진단에 필요한 정보를 제공하는 방법을 제공한다. Another aspect includes the steps of (a) measuring the expression level of a GPKOW protein or fragment thereof in a biological sample isolated from an individual; And (b) comparing the measured expression level with the protein expression level of a normal control.

GPKOW 단백질, GPKOW 단백질의 단편, 발현 수준, 및 발현 수준의 측정은 전술한 바와 같다. Measurements of GPKOW protein, fragments of GPKOW protein, expression level, and expression level are as described above.

상기 방법은 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 GPKOW 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함한다. The method includes measuring the expression level of a GPKOW protein or fragment thereof in a biological sample isolated from an individual.

상기 (a) 단계는 상기 생물학적 시료와 상기 GPKOW 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 항체를 인큐베이션(incubation)시키는 단계를 포함할 수 있다. 상기 인큐베이션은 인 비트로(in vitro)에서 수행될 수 있다. The step (a) may include the step of incubating the antibody specifically binding to the biological sample and the GPKOW protein or a fragment thereof. The incubation can be performed in vitro.

상기 단계 (a)는 상기 GPKOW 단백질에서 유래한 펩타이드를 측정함으로써, 상기 생물학적 시료의 질량 분석을 수행하는 단계를 포함하는 포함할 수 있다.The step (a) may include the step of performing mass spectrometry of the biological sample by measuring the peptide derived from the GPKOW protein.

상기 단계 (a)는 GPKOW 폴리뉴클레오티드의 mRNA와 상보적인 프로브를 이용하여 혼성화(hybridization)를 수행하고, 혼성화 정도를 통해 상기 GPKOW 폴리뉴클레오티드의 mRNA 발현량을 측정하는 단계를 포함할 수 있다.The step (a) may include the step of performing hybridization using a probe complementary to the mRNA of the GPKOW polynucleotide, and measuring the mRNA expression level of the GPKOW polynucleotide through the degree of hybridization.

상기 개체는 방사선 피폭이 의심되는 개체일 수 있고, 인간을 포함한 포유동물일 수 있다. The subject may be an individual suspected of radiation exposure, or may be a mammal, including a human.

용어 "생물학적 시료"는 생물로부터 수득된 시료를 말한다. 상기 생물학적 시료는 혈액, 혈장, 혈소판, 혈청, 복수액, 골수액, 림프액, 타액, 누액, 점막액, 양수, 또는 이들의 조합일 수 있다. 상기 생물학적 시료가 혈액 또는 혈장일 경우, 채취가 용이한 혈액, 혈장을 검체로 사용하기 때문에 개체의 장기 조직을 적출하지 않기 때문에 개체에게 부담을 주지 않으면서도 간편하게 분석할 수 있다. 또한, 혈액은 인체를 빠른 속도로 순환하기 때문에 방사선 노출에 의해 민감하게 반응할 수 있으므로 진단의 정확도 및 민감도가 높아 방사선 피폭 진단에 유용하게 사용될 수 있다. The term "biological sample" refers to a sample obtained from an organism. The biological sample may be blood, plasma, platelets, serum, ascites fluid, bone marrow fluid, lymph fluid, saliva, tear fluid, mucosal fluid, amniotic fluid, or a combination thereof. When the biological sample is blood or plasma, since blood or plasma that is easily collected is used as a sample, the organ tissues of the individual are not extracted, so it can be easily analyzed without burdening the individual. In addition, since blood circulates through the human body at a high speed, it can react sensitively by exposure to radiation, and thus, the accuracy and sensitivity of diagnosis is high, and thus it can be usefully used for diagnosis of radiation exposure.

상기 생물학적 시료는 온전한(intact) 단백질을 포함할 수 있다. 온전한 단백질은 별도의 단백질의 변형 없이 생물학적 시료로부터 분리된 단백질일 수 있다. 온전한 단백질은, 예를 들어 단백질 분해 효소에 의한 단백질 분해 없이, 생물학적 시료로부터 분리된 단백질일 수 있다. The biological sample may include an intact protein. The intact protein may be a protein isolated from a biological sample without modification of a separate protein. The intact protein can be a protein isolated from a biological sample without proteolysis, for example, by proteolytic enzymes.

상기 측정 방법은 예를 들어, 웨스턴블랏팅, ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선 면역분석(RIA:The measurement method is, for example, Western blotting, ELISA (enzyme linked immunosorbent assay), radioimmunoassay (RIA:

Radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트(rocket) 면역전기영동, 조직면역 염색, 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법Radioimmunoassay, radioimmunodiffusion, Ouchterlony immunodiffusion, rocket immunoelectrophoresis, tissue immunostaining, immunoprecipitation assay, complement fixation assay

(Complement Fixation Assay), FACS, 단백질 칩(protein chip) 등을 포함할 수 있다.(Complement Fixation Assay), FACS, protein chips, and the like.

상기 방법은 상기 측정된 발현 수준을 정상 대조군의 GPKOW 단백질 발현 수준과 비교하는 단계를 포함한다. The method includes comparing the measured expression level with the GPKOW protein expression level of a normal control.

상기 정상 대조군은 방사선에 노출되지 않은 개체, 또는 방사선에 노출되기 전에 동일 개체로부터 분리된 생물학적 시료일 수 있다. The normal control may be an individual who has not been exposed to radiation, or a biological sample isolated from the same individual before being exposed to radiation.

상기 측정된 단백질의 발현 수준은 방사선에 노출된 시간 및/또는 선량에 비례하여 정상 대조군에 비해 증가하기 때문에, GPKOW 단백질의 발현 수준을 정상 대조군의 GPKOW 단백질 발현 수준과 비교함으로써, GPKOW 단백질의 발현 수준이 증가하는 정도에 따라 방사선 피폭 여부 및/또는 그 정도, 예를 들어, 방사선 피폭 선량을 예측하거나, 방사선 치료에 대한 효과를 예측하거나, 방사선 치료시 방사선 조사에 의한 치료 대상 이외의 정상 장기의 손상 정도를 진단, 예측할 수 있다.Since the expression level of the measured protein increases in proportion to the time and / or dose exposed to radiation, the expression level of the GPKOW protein is compared to the expression level of the GPKOW protein in the normal control group, thereby increasing the expression level of the GPKOW protein. Depending on the extent of this increase, and / or the extent of radiation exposure, for example, the radiation exposure dose is predicted, the effect on radiation therapy is predicted, and the damage to normal organs other than the object to be treated by irradiation during radiation therapy The degree can be diagnosed and predicted.

일 양상에 따른 방사선 피폭 진단용 조성물, 키트, 및 이를 이용한 방사선 피폭 진단 방법에 따르면, 방사선 피폭 시간이나 피폭 선량을 간편하게 진단할 수 있고, 방사선 치료 효과를 예측할 수 있다.According to a composition, kit for diagnosing radiation exposure according to an aspect, and a method for diagnosing radiation exposure using the same, it is possible to easily diagnose a radiation exposure time or a radiation dose, and predict a radiation treatment effect.

도 1은 방사선 조사시 혈액 세포에서 단백질 발현 패턴 변화를 비표지 정량법으로 단백질체를 정량하고, 정량값에 따라 단백질들을 분류한 결과이다.
도 2는 혈액세포주 GM10832 및 GM10860에 x선을 2Gy 조사하고 0, 4, 9시간 후의 GPKOW mRNA 발현을 RT-PCR로 확인한 결과이다.
도 3은 혈액세포주 GM010833, GM10834, 및 GM10860에 x선을 0, 0.25, 0.5, 1, 2, 4 Gy 선량으로 조사하고 9시간 후의 GPKOW mRNA 발현을 RT-PCR로 확인한 결과이다.
도 4는 방사선 조사 시간에 따른 GPKOW 단백질 발현 정량값의 변화를 나타낸 그래프이다.
1 is a result of quantifying a protein body in a non-labeled quantitative method for protein expression pattern changes in blood cells upon irradiation, and classifying proteins according to the quantitative value.
2 is a result of 2Gy irradiation of x-rays to blood cell lines GM10832 and GM10860 and confirmation of GPKOW mRNA expression after 0, 4, and 9 hours by RT-PCR.
Figure 3 is a blood cell line GM010833, GM10834, and GM10860 x-ray irradiation at 0, 0.25, 0.5, 1, 2, 4 Gy dose, and after 9 hours GPKOW mRNA expression is the result confirmed by RT-PCR.
Figure 4 is a graph showing the change in the expression value of GPKOW protein according to the irradiation time.

이하 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 하나 이상의 구체예를 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다. It will be described in more detail through the following examples. However, these examples are intended to illustrate one or more embodiments by way of example, and the scope of the present invention is not limited to these examples.

실시예 1. 방사선 피폭 바이오마커의 선별Example 1. Screening of radiation exposure biomarkers

혈액 세포에 방사선을 조사한 후, 각 시료를 질량분석기술 기반의 프로테옴 프로파일링 방법과 비표지 정량법(Label-Free Quantification, LFQ)으로 바이오마커 후보를 선별하였다. 구체적으로, 혈액세포주에 2Gy의 방사선을 조사하고, 0, 1, 5, 24시간 후 단백질 발현 패턴의 변화를 비표지 정량법을 통해서 단백질을 정량하고, 시료 간의 패턴 변화에 따라 단백질들의 그룹을 6개의 클러스터(cluster)로 분류하였다. 분류 결과를 도 1에 나타내었다. 6개의 클러스터 중 시간이 지남에 따라 발현량이 일관적으로 증가하는 클러스터 3을 선택하였다. After irradiating blood cells, biomarker candidates were selected for each sample using mass spectrometry-based proteome profiling and label-free quantification (LFQ). Specifically, 2Gy radiation was irradiated to the blood cell line, and protein changes in protein expression patterns after 0, 1, 5, and 24 hours were quantified through non-labeled quantitation, and groups of proteins were grouped according to pattern changes between samples. It was classified as a cluster. The classification results are shown in FIG. 1. Among the 6 clusters, cluster 3 was selected in which the expression level was consistently increased over time.

클러스터 3에 속하는 123개의 단백질 중 방사선 피폭 후 24시간이 지난 후에도 발현량이 지속적으로 증가하는 단백질인 GPKOW를 바이오마커로 선택하였다. Among the 123 proteins belonging to cluster 3, GPKOW, a protein whose expression level is continuously increased even after 24 hours after radiation exposure, was selected as a biomarker.

실시예 2. 방사선 피폭에 따른 GPKOW mRNA의 발현 변화 평가Example 2. Evaluation of expression change of GPKOW mRNA according to radiation exposure

실시예 1에서 선택한 GPKOW가 방사선 피폭의 바이오마커로 기능하는지 여부를 평가하기 위해서, 혈액세포주에 방사선을 조사한 후 GPKOW mRNA의 발현 변화를 RT-PCR을 통해 확인하였다.In order to evaluate whether the GPKOW selected in Example 1 functions as a biomarker of radiation exposure, a change in expression of GPKOW mRNA was confirmed through RT-PCR after irradiation with blood cell lines.

구체적으로, 림프아구성 세포주(lymphoblastoid cell line)는 GM10832, GM10833, GM10834, 및 GM10860 세포주를 Coriell Cell Repositories (NJ, USA)에서 분양 받았다. 분양 받은 세포주를 2mM L-글루타민과 15% 열처리되지 않은 FBS(fetal bovine serum, 우태아혈청)가 함유된 RPMI 1640 배지에서 부유시켜 T75 플라스크에서 부유된 상태로 배양하였다.Specifically, the lymphoblastoid cell line (lymphoblastoid cell line) was distributed from GM10832, GM10833, GM10834, and GM10860 cell lines from Coriell Cell Repositories (NJ, USA). The pre-distributed cell line was suspended in RPMI 1640 medium containing 2 mM L-glutamine and 15% untreated fetal bovine serum (FBS) and cultured in a suspended state in a T75 flask.

상기 림프아구성 세포주에 X-RAD 320 Biological X-Ray Irradiator (Precision X-Ray, Inc., CT, USA)로 2Gy선량으로 x선을 조사한 후 0, 4, 9시간 후에 샘플링을 하였다. 또한, 림프아구성 세포주에 0, 0.25, 0.5, 1, 2, 4, 8 Gy 선량으로 x선을 조사하고 9시간 후에 샘플링을 하였다.The lymphoblastic cell lines were irradiated with X-RAD 320 Biological X-Ray Irradiator (Precision X-Ray, Inc., CT, USA) at 2 Gy dose, and then sampled after 0, 4, and 9 hours. In addition, the lymphoblastic cell lines were irradiated with x-rays at doses of 0, 0.25, 0.5, 1, 2, 4, and 8 Gy and sampled 9 hours later.

상기 샘플링한 세포주에 대하여, 0.01% Triton X-100, 완전 프로테아제 저해제 칵테일 용액(complete protease inhibitor cocktail solution)과 1% PMSF(phenylmethylsulfonyl fluoride, 페닐메틸설포닐 플루오라이드)가 포함된 PBS(Phosphate Buffer Solution, 인산 완충액)을 사용하여 세포 용해물(cell lysate)에 5초 3회 20% 프로브 타입 음파처리(probe type sonication) 과정을 통해 단백질체 분석을 위한 단백질 균질액을 얻었다. For the sampled cell line, PBS (Phosphate Buffer Solution, PBS containing 0.01% Triton X-100, complete protease inhibitor cocktail solution) and 1% PMSF (phenylmethylsulfonyl fluoride) Phosphate buffer) was used to obtain a protein homogenate for proteomic analysis through a 20% probe type sonication process 3 times for 5 seconds in cell lysate.

상기 단백질 균질액에서 당업계에서 사용되는 공지된 방법을 통해 총 RNA를 추출하였다. 추출된 총 RNA는 260/280 nm에서 1.95이상, 260/230nm에서 1.2이상의 순도로 정제하였다. 정제한 mRNA 1μg으로부터 cDNA를 합성하기 위해, 정제한 mRNA 1μg으로부터 High Capacity RNA-to-cDNA Kit (Applied Biosystems, USA)에 기술된 방법을 이용하여 20μl의 cDNA를 합성하였다. 키트 사용법은 10μl의 2X RT 버퍼, 1μl의 20X Enzyme mix, 1μg total RNA를 9 μl까지 혼합하여 반응물 조성을 구성하고 최종 부피가 20μl가 되도록 nuclease-free H2O로 맞추었다. 37℃에서 60분간 효소반응 후 95℃에서 5분간 반응정지와 동시에 4℃에서 합성된 cDNA합성을 종료하였다. 각 유전자 발현을 위해 PCR을 수행하기 전까지 완성된 cDNA는 -15 내지 -25℃ 구간의 냉동고에 저장하여 사용하였다. Total RNA was extracted from the protein homogenate through a known method used in the art. The extracted total RNA was purified to a purity of 1.95 or higher at 260/280 nm and 1.2 or higher at 260/230 nm. To synthesize cDNA from 1 μg of purified mRNA, 20 μl of cDNA was synthesized from 1 μg of purified mRNA using the method described in High Capacity RNA-to-cDNA Kit (Applied Biosystems, USA). Using the kit, 10 μl of 2X RT buffer, 1 μl of 20X Enzyme mix, and 1 μg total RNA were mixed up to 9 μl to construct a reaction composition and adjusted with nuclease-free H 2 O so that the final volume was 20 μl. After the enzyme reaction at 37 ° C for 60 minutes, the reaction was stopped at 95 ° C for 5 minutes, and cDNA synthesis synthesized at 4 ° C was terminated. Completed cDNA until PCR was performed for the expression of each gene was stored and used in a freezer at -15 to -25 ° C.

cDNA 합성 후, GPKOW(NM_015698.5)의 프라이머 쌍(정방향: 5'-accagatgaggagcaagaga-3', 역방향: 5'-ctgctttctcactcttggct-3'; 377bp)을 사용하여 94℃ 4분 1 사이클, 94℃ 30초와 57℃ 50초와 72℃ 1분 27사이클, 72℃ 10분 1사이클로 PCR을 수행하였다. PCR을 통해 얻어진 PCR 산물을 2% 아가로오스 겔에서 전기영동하여 mRNA의 발현을 확인하였다. After cDNA synthesis, a primer pair of GPKOW (NM_015698.5) (forward: 5'-accagatgaggagcaagaga-3 ', reverse: 5'-ctgctttctcactcttggct-3'; 377bp) was used, 94 ° C 4 minutes 1 cycle, 94 ° C 30 seconds PCR was performed at 57 ° C for 50 seconds, 72 ° C for 1 minute and 27 cycles, and 72 ° C for 10 minutes and 1 cycle. The PCR product obtained through PCR was electrophoresed on a 2% agarose gel to confirm mRNA expression.

도 2는 혈액세포주 GM10832 및 GM10860에 x선을 2Gy 조사하고 0, 4, 9시간 후의 GPKOW mRNA 발현을 RT-PCR로 확인한 결과이다.2 is a result of confirming the expression of GPKOW mRNA after 0, 4, and 9 hours by x-ray irradiation on blood cell lines GM10832 and GM10860 by RT-PCR.

도 2에 나타낸 바와 같이, 두 종류의 혈액 세포에서 x선 조사 후 시간이 지남에 따라 GPKOW mRNA의 발현량이 정량적으로 증가하였고, 9시간이 지난 후에도 계속하여 증가하는 것을 확인하였다.As shown in FIG. 2, it was confirmed that the expression level of GPKOW mRNA increased quantitatively over time after x-ray irradiation in two types of blood cells, and continued to increase even after 9 hours.

도 3은 혈액세포주 GM010833, GM10834, 및 GM10860에 x선을 0, 0.25, 0.5, 1, 2, 4 Gy 선량으로 조사하고 9시간 후의 GPKOW mRNA 발현을 RT-PCR로 확인한 결과이다.3 is a blood cell line GM010833, GM10834, and GM10860 x-ray irradiation at 0, 0.25, 0.5, 1, 2, 4 Gy dose, and after 9 hours GPKOW mRNA expression is the result confirmed by RT-PCR.

도 3에 나타낸 바와 같이, 세 종류의 혈액 세포에서 x선을 조사한 선량에 비례하여 GPKOW mRNA의 발현량이 정량적으로 증가하는 것을 확인하였다.As shown in FIG. 3, it was confirmed that the expression level of GPKOW mRNA increased quantitatively in proportion to the dose irradiated with x-rays in three types of blood cells.

따라서, GPKOW mRNA는 방사선 조사 선량 및 조사 시간에 비례하여 발현량이 정량적으로 증가하는 것을 알 수 있다.Therefore, it can be seen that the expression level of GPKOW mRNA increases quantitatively in proportion to the radiation dose and irradiation time.

실시예 3.Example 3. 방사선 피폭에 따른 GPKOW 단백질의 발현 변화 평가Evaluation of GPKOW protein expression change according to radiation exposure

GPKOW 단백질의 방사선 피폭에 따른 변화를 평가하기 위해서, 고분해능 질량분석기를 이용하여 펩타이드들의 스펙트럼 강도를 통계적으로 분석하는 비표지 정량법을 통해 정량을 수행하였다. 구체적으로는, 프로테아제/포르파타제 저해제 칵테일이 추가된 8M 우레아 100μl를 이용하여 1x106의 세포를 용해시킨 후 50mM 디티오트레이톨(dithiothreitol)로 37℃에서 이황화 결합을 환원시켰다. 이후 55mM 요오드아세트아미드(iodoacetamide)로 빛이 없는 조건에서 알킬화(alkylation)를 수행한 후 55mM 디티오트레이톨로 급냉(quenching)을 수행하였다. 50mM 탄산수소 암모늄(ammonium bicarbonate)을 800 ml까지 추가하여 단백질:프로테아제 = 25:1의 비율로 처리하고 37℃에서 O/N으로 분해를 수행하였다. 분해된 후 10% 포름산을 이용하여 반응을 중지시키고 C18 역상 탈염 카트리지(reverse phase desalting cartridge)를 이용하여 탈염을 수행하였다. 탈염된 펩타이드는 진공 건조기(Speed Vac)를 이용하여 건조한 후 0.1% 포름산으로 녹여LC-MS 분석을 수행하였다. MS장비는 Q-Exactive Plus BioPharm version (Thermo, USA)을, LC는 UltiMate™ 3000 RSLCnano System (Thermo, USA)를 사용하였으며 펩타이드 시료는 4μl씩 주입하여 300 μl/min의 유속으로 NanoLC와 연동된 이온 트랩 질량 분석기(Ion trap mass spectrometer)로 분석을 수행하였다. LC는 Solution A (5% 아세토니트릴, 0.1% 포름산)와 solution B (95% 아세토니트릴, 0.1% 포름산)의 농도 구배 120분을 포함하여 총 150분 동안 분리하며 사용하는 분석 컬럼은 AQUA C18 (5μm, 125A)을 충진한 내직경 75μm, 외직경 360μm, 길이 50cm 용융 실리카 모세관 칼럼(fused silica capillary column)을 사용하여 펩타이드 혼합체를 분리하였다. 분리된 펩타이드는 2000V의 전자분무 이온화 전압(Electrospray ionization voltage)을 이용하여 이온 분사하며 이온 방출기는 내직경 20 μm 트랩 이온 스프레이 방출기(tappered ion spray emitter)를 통해 질량분석기로 주입하여 스펙트럼 데이터를 획득하였다. 오비트랩(Orbitrap) MS 분석은 400~2000 m/z 범위에 대해 이온 트랩 MS로 1번의 서베이 스캔(survey scan) (resolution 30,000)후에 고에너지 충돌유도 해리(Higher energy collision-induced dissociation, HCD, 25% energy level) 방식을 이용하여 오비트랩 MS를 이용, 8번의 MS/MS (resolution 60,000) 분석을 수행하였다. 5분의 dynamic exclusion option을 통해 중복된 펩타이드 이온 검출을 최소화하였다. 이온 트랩의 Auto gain control target setting은 Full MS에 대해서는 3E04를, FT MS/MS에 대해서는 2E5을 사용하였다. 획득한 RAW 파일을 Sequest 알고리즘 기반의 데이터 베이스 분석 소프트웨어인 프로테옴 디스커버러(Proteome Discoverer) (Thermo, USA, version 2.2)를 이용하여 정성 분석 및 비표지 정량 분석을 수행하였다. 시스테인에는 시스테인 카르바이도메틸화(cystein carbamidomethylation)을 고정값(fixed modification)으로 처리하고, 메티오닌(methionine)에는 산화(oxidation)를 변수 수정(variable modification)으로 수행하였다. 트립신 미절단(Trypsin missed cleavage)은 “1”값을 이용하며 서열 데이터베이스(sequence database)는 최신 swissprot sequence DB를 사용하며 비표지 정량을 위해서 펩타이드 이온 강도를 이용한 정량분석을 수행하였다. 동정된 단백체들을 Uniprot accession number를 쿼리(query)로 사용하여 Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) v6.7 (http://david.abcc.ncifcrf.gov)을 이용, gene ontology (GO)를 세포 성분(cellular component), 분자 기능 및 생물학적 공정의 세 분야를 대상으로 분석하였으며 Perseus(http://www.perseus-framework.org)를 이용하여 히트 맵(heat map) 및 클러스터링 분석과 Volcano plot 분석을 수행하였다. In order to evaluate the change according to the radiation exposure of the GPKOW protein, quantification was performed through a non-labeled quantitative method that statistically analyzes the spectral intensity of peptides using a high-resolution mass spectrometer. Specifically, 1 × 10 6 cells were lysed using 100 μl of 8M urea to which a protease / portatase inhibitor cocktail was added, and then disulfide bonds were reduced at 37 ° C. with 50 mM dithiothreitol. Subsequently, alkylation was performed in a light-free condition with 55 mM iodoacetamide, followed by quenching with 55 mM dithiothreitol. 50 mM ammonium bicarbonate was added up to 800 ml, treated at a ratio of protein: protease = 25: 1, and digested with O / N at 37 ° C. After decomposition, the reaction was stopped using 10% formic acid, and desalting was performed using a C18 reverse phase desalting cartridge. The desalted peptide was dried using a vacuum dryer (Speed Vac) and then dissolved in 0.1% formic acid to perform LC-MS analysis. Q-Exactive Plus BioPharm version (Thermo, USA) was used for MS equipment, UltiMate ™ 3000 RSLCnano System (Thermo, USA) was used for LC, and peptide samples were injected in 4 μl increments, and ions linked to NanoLC at a flow rate of 300 μl / min Analysis was carried out with a trap mass spectrometer. The LC is separated for a total of 150 minutes including the concentration gradient of Solution A (5% acetonitrile, 0.1% formic acid) and solution B (95% acetonitrile, 0.1% formic acid) for a total of 150 minutes.The analysis column used is AQUA C18 (5 μm , 125A), the peptide mixture was separated using a fused silica capillary column with an inner diameter of 75 μm, an outer diameter of 360 μm, and a length of 50 cm. The separated peptides were ion-sprayed using an electrospray ionization voltage of 2000 V, and the ion emitter was injected into a mass spectrometer through a 20 μm inner diameter trapped ion spray emitter to obtain spectral data. . Orbitrap MS analysis is a high energy collision-induced dissociation (HCD, 25) after one survey scan (resolution 30,000) with an ion trap MS for a range of 400 to 2000 m / z. % energy level) was used to perform 8 MS / MS (resolution 60,000) analysis using Orbit Lab MS. Duplicate peptide ion detection was minimized through a 5-minute dynamic exclusion option. The ion trap's Auto gain control target setting was 3E04 for Full MS and 2E5 for FT MS / MS. Qualitative analysis and unlabeled quantitative analysis were performed on the obtained RAW file using Proquestome Discoverer (Thermo, USA, version 2.2), a database analysis software based on Sequest algorithm. Cysteine carbamidomethylation was treated as a fixed modification to cysteine, and oxidation was performed as a variable modification to methionine. Trypsin missed cleavage uses a value of “1”, the sequence database uses the latest swissprot sequence DB, and quantitative analysis using peptide ion intensity is performed for unlabeled quantification. Using the identified proteins as the query for the Uniprot accession number, Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) v6.7 (http://david.abcc.ncifcrf.gov), gene ontology (GO) Was analyzed for three areas of cellular component, molecular function and biological process. Heat map and clustering analysis and Volcano plot using Perseus (http://www.perseus-framework.org) Analysis was performed.

실험 결과, 하기 표 1에 방사선 피폭 후 시간 경과에 따른 GPKOW의 단백질 발현 정량값을 나타내었다. GPKOW 발현 정량값은 3회 분석하여 얻은 값의 평균이다.As a result of the experiment, Table 1 below shows the quantitative values of protein expression of GPKOW over time after radiation exposure. The quantitative value of GPKOW expression is an average of the values obtained by analyzing three times.

2Gy후 시간Time after 2Gy 0시간0 hours 1시간1 hours 5시간5 hours 24시간24 hours GPKOW 단백질
발현 정량값
GPKOW protein
Quantitative expression value
9.29.2 27.427.4 41.141.1 322.3322.3

표 1에 나타낸 바와 같이, 방사선 피폭 후 GPKOW 단백질의 발현량이 시간에 비례하여 증가하는 것을 확인하였다. 도 4는 방사선 조사 시간에 따른 GPKOW 단백질 발현 정량값의 변화를 나타낸 그래프이다.As shown in Table 1, it was confirmed that the expression level of GPKOW protein increased in proportion to time after radiation exposure. 4 is a graph showing the change in the expression value of GPKOW protein according to the irradiation time.

도 4에 나타낸 바와 같이, x축을 시간으로, y축을 GPKOW 단백질의 발현 정량값으로 하여 그래프를 그린 결과, 그래프가 선형을 나타내어 GPKOW 단백질이 방사선 조사 후 시간에 비례하여 발현이 증가하는 것을 확인하였다.As shown in FIG. 4, as a result of plotting the graph with the x-axis as the time and the y-axis as the quantitative expression value of the GPKOW protein, it was confirmed that the graph shows linearity and that the GPKOW protein increases in proportion to the time after irradiation.

<110> University of Ulsan Foundation For Industry Cooperation THE ASAN FOUNDATION <120> Biomarker for diagnosing radiation exposure and method using thereof <130> PN123358 <160> 2 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 491 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 1 Met Glu Leu Gln Gln Ala Ala Arg Arg Pro Gly Lys Arg Ser Lys Met 1 5 10 15 Ala Asp Ser Lys Glu Gly Val Leu Pro Leu Thr Ala Ala Ser Thr Ala 20 25 30 Pro Ile Ser Phe Gly Phe Thr Arg Thr Ser Ala Arg Arg Arg Leu Ala 35 40 45 Asp Ser Gly Asp Gly Ala Gly Pro Ser Pro Glu Glu Lys Asp Phe Leu 50 55 60 Lys Thr Val Glu Gly Arg Glu Leu Gln Ser Val Lys Pro Gln Glu Ala 65 70 75 80 Pro Lys Glu Leu Val Ile Pro Leu Ile Gln Asn Gly His Arg Arg Gln 85 90 95 Pro Pro Ala Arg Pro Pro Gly Pro Ser Thr Asp Thr Gly Ala Leu Ala 100 105 110 Asp Gly Val Val Ser Gln Ala Val Lys Glu Leu Ile Ala Glu Ser Lys 115 120 125 Lys Ser Leu Glu Glu Arg Glu Asn Ala Gly Val Asp Pro Thr Leu Ala 130 135 140 Ile Pro Met Ile Gln Lys Gly Cys Thr Pro Ser Gly Glu Gly Ala Asp 145 150 155 160 Ser Glu Pro Arg Ala Glu Thr Val Pro Glu Glu Ala Asn Tyr Glu Ala 165 170 175 Val Pro Val Glu Ala Tyr Gly Leu Ala Met Leu Arg Gly Met Gly Trp 180 185 190 Lys Pro Gly Glu Gly Ile Gly Arg Thr Phe Asn Gln Val Val Lys Pro 195 200 205 Arg Val Asn Ser Leu Arg Pro Lys Gly Leu Gly Leu Gly Ala Asn Leu 210 215 220 Thr Glu Ala Gln Ala Leu Thr Pro Thr Gly Pro Ser Arg Met Pro Arg 225 230 235 240 Pro Asp Glu Glu Gln Glu Lys Asp Lys Glu Asp Gln Pro Gln Gly Leu 245 250 255 Val Pro Gly Gly Ala Val Val Val Leu Ser Gly Pro His Arg Gly Leu 260 265 270 Tyr Gly Lys Val Glu Gly Leu Asp Pro Asp Asn Val Arg Ala Met Val 275 280 285 Arg Leu Ala Val Gly Ser Arg Val Val Thr Val Ser Glu Tyr Tyr Leu 290 295 300 Arg Pro Val Ser Gln Gln Glu Phe Asp Lys Asn Thr Leu Asp Leu Arg 305 310 315 320 Gln Gln Asn Gly Thr Ala Ser Ser Arg Lys Thr Leu Trp Asn Gln Glu 325 330 335 Leu Tyr Ile Gln Gln Asp Asn Ser Glu Arg Lys Arg Lys His Leu Pro 340 345 350 Asp Arg Gln Asp Gly Pro Ala Ala Lys Ser Glu Lys Ala Ala Pro Arg 355 360 365 Ser Gln His Trp Leu His Arg Asp Leu Arg Val Arg Phe Val Asp Asn 370 375 380 Met Tyr Lys Gly Gly Gln Tyr Tyr Asn Thr Lys Met Ile Ile Glu Asp 385 390 395 400 Val Leu Ser Pro Asp Thr Cys Val Cys Arg Thr Asp Glu Gly Arg Val 405 410 415 Leu Glu Gly Leu Arg Glu Asp Met Leu Glu Thr Leu Val Pro Lys Ala 420 425 430 Glu Gly Asp Arg Val Met Val Val Leu Gly Pro Gln Thr Gly Arg Val 435 440 445 Gly His Leu Leu Ser Arg Asp Arg Ala Arg Ser Arg Ala Leu Val Gln 450 455 460 Leu Pro Arg Glu Asn Gln Val Val Glu Leu His Tyr Asp Ala Ile Cys 465 470 475 480 Gln Tyr Met Gly Pro Ser Asp Thr Asp Asp Asp 485 490 <210> 2 <211> 476 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 2 Met Ala Asp Ser Lys Glu Gly Val Leu Pro Leu Thr Ala Ala Ser Thr 1 5 10 15 Ala Pro Ile Ser Phe Gly Phe Thr Arg Thr Ser Ala Arg Arg Arg Leu 20 25 30 Ala Asp Ser Gly Asp Gly Ala Gly Pro Ser Pro Glu Glu Lys Asp Phe 35 40 45 Leu Lys Thr Val Glu Gly Arg Glu Leu Gln Ser Val Lys Pro Gln Glu 50 55 60 Ala Pro Lys Glu Leu Val Ile Pro Leu Ile Gln Asn Gly His Arg Arg 65 70 75 80 Gln Pro Pro Ala Arg Pro Pro Gly Pro Ser Thr Asp Thr Gly Ala Leu 85 90 95 Ala Asp Gly Val Val Ser Gln Ala Val Lys Glu Leu Ile Ala Glu Ser 100 105 110 Lys Lys Ser Leu Glu Glu Arg Glu Asn Ala Gly Val Asp Pro Thr Leu 115 120 125 Ala Ile Pro Met Ile Gln Lys Gly Cys Thr Pro Ser Gly Glu Gly Ala 130 135 140 Asp Ser Glu Pro Arg Ala Glu Thr Val Pro Glu Glu Ala Asn Tyr Glu 145 150 155 160 Ala Val Pro Val Glu Ala Tyr Gly Leu Ala Met Leu Arg Gly Met Gly 165 170 175 Trp Lys Pro Gly Glu Gly Ile Gly Arg Thr Phe Asn Gln Val Val Lys 180 185 190 Pro Arg Val Asn Ser Leu Arg Pro Lys Gly Leu Gly Leu Gly Ala Asn 195 200 205 Leu Thr Glu Ala Gln Ala Leu Thr Pro Thr Gly Pro Ser Arg Met Pro 210 215 220 Arg Pro Asp Glu Glu Gln Glu Lys Asp Lys Glu Asp Gln Pro Gln Gly 225 230 235 240 Leu Val Pro Gly Gly Ala Val Val Val Leu Ser Gly Pro His Arg Gly 245 250 255 Leu Tyr Gly Lys Val Glu Gly Leu Asp Pro Asp Asn Val Arg Ala Met 260 265 270 Val Arg Leu Ala Val Gly Ser Arg Val Val Thr Val Ser Glu Tyr Tyr 275 280 285 Leu Arg Pro Val Ser Gln Gln Glu Phe Asp Lys Asn Thr Leu Asp Leu 290 295 300 Arg Gln Gln Asn Gly Thr Ala Ser Ser Arg Lys Thr Leu Trp Asn Gln 305 310 315 320 Glu Leu Tyr Ile Gln Gln Asp Asn Ser Glu Arg Lys Arg Lys His Leu 325 330 335 Pro Asp Arg Gln Asp Gly Pro Ala Ala Lys Ser Glu Lys Ala Ala Pro 340 345 350 Arg Ser Gln His Trp Leu His Arg Asp Leu Arg Val Arg Phe Val Asp 355 360 365 Asn Met Tyr Lys Gly Gly Gln Tyr Tyr Asn Thr Lys Met Ile Ile Glu 370 375 380 Asp Val Leu Ser Pro Asp Thr Cys Val Cys Arg Thr Asp Glu Gly Arg 385 390 395 400 Val Leu Glu Gly Leu Arg Glu Asp Met Leu Glu Thr Leu Val Pro Lys 405 410 415 Ala Glu Gly Asp Arg Val Met Val Val Leu Gly Pro Gln Thr Gly Arg 420 425 430 Val Gly His Leu Leu Ser Arg Asp Arg Ala Arg Ser Arg Ala Leu Val 435 440 445 Gln Leu Pro Arg Glu Asn Gln Val Val Glu Leu His Tyr Asp Ala Ile 450 455 460 Cys Gln Tyr Met Gly Pro Ser Asp Thr Asp Asp Asp 465 470 475 <110> University of Ulsan Foundation For Industry Cooperation          THE ASAN FOUNDATION <120> Biomarker for diagnosing radiation exposure and method using          about <130> PN123358 <160> 2 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 491 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 1 Met Glu Leu Gln Gln Ala Ala Arg Arg Pro Gly Lys Arg Ser Lys Met   1 5 10 15 Ala Asp Ser Lys Glu Gly Val Leu Pro Leu Thr Ala Ala Ser Thr Ala              20 25 30 Pro Ile Ser Phe Gly Phe Thr Arg Thr Ser Ala Arg Arg Arg Leu Ala          35 40 45 Asp Ser Gly Asp Gly Ala Gly Pro Ser Pro Glu Glu Lys Asp Phe Leu      50 55 60 Lys Thr Val Glu Gly Arg Glu Leu Gln Ser Val Lys Pro Gln Glu Ala  65 70 75 80 Pro Lys Glu Leu Val Ile Pro Leu Ile Gln Asn Gly His Arg Arg Gln                  85 90 95 Pro Pro Ala Arg Pro Pro Gly Pro Ser Thr Asp Thr Gly Ala Leu Ala             100 105 110 Asp Gly Val Val Ser Gln Ala Val Lys Glu Leu Ile Ala Glu Ser Lys         115 120 125 Lys Ser Leu Glu Glu Arg Glu Asn Ala Gly Val Asp Pro Thr Leu Ala     130 135 140 Ile Pro Met Ile Gln Lys Gly Cys Thr Pro Ser Gly Glu Gly Ala Asp 145 150 155 160 Ser Glu Pro Arg Ala Glu Thr Val Pro Glu Glu Ala Asn Tyr Glu Ala                 165 170 175 Val Pro Val Glu Ala Tyr Gly Leu Ala Met Leu Arg Gly Met Gly Trp             180 185 190 Lys Pro Gly Glu Gly Ile Gly Arg Thr Phe Asn Gln Val Val Lys Pro         195 200 205 Arg Val Asn Ser Leu Arg Pro Lys Gly Leu Gly Leu Gly Ala Asn Leu     210 215 220 Thr Glu Ala Gln Ala Leu Thr Pro Thr Gly Pro Ser Arg Met Pro Arg 225 230 235 240 Pro Asp Glu Glu Gln Glu Lys Asp Lys Glu Asp Gln Pro Gln Gly Leu                 245 250 255 Val Pro Gly Gly Ala Val Val Val Leu Ser Gly Pro His Arg Gly Leu             260 265 270 Tyr Gly Lys Val Glu Gly Leu Asp Pro Asp Asn Val Arg Ala Met Val         275 280 285 Arg Leu Ala Val Gly Ser Arg Val Val Thr Val Ser Glu Tyr Tyr Leu     290 295 300 Arg Pro Val Ser Gln Gln Glu Phe Asp Lys Asn Thr Leu Asp Leu Arg 305 310 315 320 Gln Gln Asn Gly Thr Ala Ser Ser Arg Lys Thr Leu Trp Asn Gln Glu                 325 330 335 Leu Tyr Ile Gln Gln Asp Asn Ser Glu Arg Lys Arg Lys His Leu Pro             340 345 350 Asp Arg Gln Asp Gly Pro Ala Ala Lys Ser Glu Lys Ala Ala Pro Arg         355 360 365 Ser Gln His Trp Leu His Arg Asp Leu Arg Val Arg Phe Val Asp Asn     370 375 380 Met Tyr Lys Gly Gly Gln Tyr Tyr Asn Thr Lys Met Ile Ile Glu Asp 385 390 395 400 Val Leu Ser Pro Asp Thr Cys Val Cys Arg Thr Asp Glu Gly Arg Val                 405 410 415 Leu Glu Gly Leu Arg Glu Asp Met Leu Glu Thr Leu Val Pro Lys Ala             420 425 430 Glu Gly Asp Arg Val Met Val Val Leu Gly Pro Gln Thr Gly Arg Val         435 440 445 Gly His Leu Leu Ser Arg Asp Arg Ala Arg Ser Arg Ala Leu Val Gln     450 455 460 Leu Pro Arg Glu Asn Gln Val Val Glu Leu His Tyr Asp Ala Ile Cys 465 470 475 480 Gln Tyr Met Gly Pro Ser Asp Thr Asp Asp Asp                 485 490 <210> 2 <211> 476 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 2 Met Ala Asp Ser Lys Glu Gly Val Leu Pro Leu Thr Ala Ala Ser Thr   1 5 10 15 Ala Pro Ile Ser Phe Gly Phe Thr Arg Thr Ser Ala Arg Arg Arg Leu              20 25 30 Ala Asp Ser Gly Asp Gly Ala Gly Pro Ser Pro Glu Glu Lys Asp Phe          35 40 45 Leu Lys Thr Val Glu Gly Arg Glu Leu Gln Ser Val Lys Pro Gln Glu      50 55 60 Ala Pro Lys Glu Leu Val Ile Pro Leu Ile Gln Asn Gly His Arg Arg  65 70 75 80 Gln Pro Pro Ala Arg Pro Pro Gly Pro Ser Thr Asp Thr Gly Ala Leu                  85 90 95 Ala Asp Gly Val Val Ser Gln Ala Val Lys Glu Leu Ile Ala Glu Ser             100 105 110 Lys Lys Ser Leu Glu Glu Arg Glu Asn Ala Gly Val Asp Pro Thr Leu         115 120 125 Ala Ile Pro Met Ile Gln Lys Gly Cys Thr Pro Ser Gly Glu Gly Ala     130 135 140 Asp Ser Glu Pro Arg Ala Glu Thr Val Pro Glu Glu Ala Asn Tyr Glu 145 150 155 160 Ala Val Pro Val Glu Ala Tyr Gly Leu Ala Met Leu Arg Gly Met Gly                 165 170 175 Trp Lys Pro Gly Glu Gly Ile Gly Arg Thr Phe Asn Gln Val Val Lys             180 185 190 Pro Arg Val Asn Ser Leu Arg Pro Lys Gly Leu Gly Leu Gly Ala Asn         195 200 205 Leu Thr Glu Ala Gln Ala Leu Thr Pro Thr Gly Pro Ser Arg Met Pro     210 215 220 Arg Pro Asp Glu Glu Gln Glu Lys Asp Lys Glu Asp Gln Pro Gln Gly 225 230 235 240 Leu Val Pro Gly Gly Ala Val Val Val Leu Ser Gly Pro His Arg Gly                 245 250 255 Leu Tyr Gly Lys Val Glu Gly Leu Asp Pro Asp Asn Val Arg Ala Met             260 265 270 Val Arg Leu Ala Val Gly Ser Arg Val Val Thr Val Ser Glu Tyr Tyr         275 280 285 Leu Arg Pro Val Ser Gln Gln Glu Phe Asp Lys Asn Thr Leu Asp Leu     290 295 300 Arg Gln Gln Asn Gly Thr Ala Ser Ser Arg Lys Thr Leu Trp Asn Gln 305 310 315 320 Glu Leu Tyr Ile Gln Gln Asp Asn Ser Glu Arg Lys Arg Lys His Leu                 325 330 335 Pro Asp Arg Gln Asp Gly Pro Ala Ala Lys Ser Glu Lys Ala Ala Pro             340 345 350 Arg Ser Gln His Trp Leu His Arg Asp Leu Arg Val Arg Phe Val Asp         355 360 365 Asn Met Tyr Lys Gly Gly Gln Tyr Tyr Asn Thr Lys Met Ile Ile Glu     370 375 380 Asp Val Leu Ser Pro Asp Thr Cys Val Cys Arg Thr Asp Glu Gly Arg 385 390 395 400 Val Leu Glu Gly Leu Arg Glu Asp Met Leu Glu Thr Leu Val Pro Lys                 405 410 415 Ala Glu Gly Asp Arg Val Met Val Val Leu Gly Pro Gln Thr Gly Arg             420 425 430 Val Gly His Leu Leu Ser Arg Asp Arg Ala Arg Ser Arg Ala Leu Val         435 440 445 Gln Leu Pro Arg Glu Asn Gln Val Val Glu Leu His Tyr Asp Ala Ile     450 455 460 Cys Gln Tyr Met Gly Pro Ser Asp Thr Asp Asp Asp 465 470 475

Claims (11)

GPKOW(G-patch domain and KOW motifs) 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 방사선 피폭 진단용 조성물.GPKOW (G-patch domain and KOW motifs) composition for diagnosing radiation exposure comprising an agent for measuring the expression level of a protein or fragment thereof. 청구항 1에 있어서, 상기 GPKOW 단백질은 서열번호 1 또는 2의 아미노산 서열을 포함하는 것인 방사선 피폭 진단용 조성물. The method according to claim 1, wherein the GPKOW protein is a composition for diagnosing radiation exposure comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 2. 청구항 1에 있어서, 상기 제제는 GPKOW 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편인 것인 방사선 피폭 진단용 조성물. The method according to claim 1, wherein the agent is a composition for diagnosing radiation exposure, which is an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds GPKOW protein or a fragment thereof. 청구항 3에 있어서, 상기 항체는 폴리클론 항체 또는 모노클론 항체인 것인 방사선 피폭 진단용 조성물. The method according to claim 3, wherein the antibody is a polyclonal antibody or monoclonal antibody composition for diagnosing radiation exposure. 청구항 1에 있어서, 상기 제제는 GPKOW 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오티드에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 또는 안티센스 뉴클레오티드인 것인 방사선 피폭 진단용 조성물.The method according to claim 1, wherein the agent is a composition for diagnosing radiation exposure, which is a primer, probe, or antisense nucleotide that specifically binds to a polynucleotide encoding a GPKOW protein. 청구항 1 내지 5 중 어느 하나의 항에 따른 조성물을 포함하는 방사선 피폭 진단용 키트. A kit for diagnosing radiation exposure comprising the composition according to claim 1. (a) 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 GPKOW 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준 또는 GPKOW 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오티드의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 상기 측정된 발현 수준을 정상 대조군의 단백질 발현 수준과 비교하는 단계를 포함하는 방사선 피폭 진단에 필요한 정보를 제공하는 방법.
(a) measuring the expression level of a GPKOW protein or fragment thereof in a biological sample isolated from an individual or the expression level of a polynucleotide encoding a GPKOW protein; And
(B) a method for providing information necessary for the diagnosis of radiation exposure, comprising comparing the measured expression level with the protein expression level of a normal control.
청구항 7에 있어서, 상기 생물학적 시료는 혈액, 혈장, 혈소판, 혈청, 복수액, 골수액, 림프액, 타액, 누액, 점막액, 양수, 또는 이들의 조합인 것인 방법. The method of claim 7, wherein the biological sample is blood, plasma, platelets, serum, ascites fluid, bone marrow fluid, lymph fluid, saliva, tear fluid, mucous fluid, amniotic fluid, or a combination thereof. 청구항 7에 있어서, 상기 단계 (a)는 상기 생물학적 시료와 상기 GPKOW 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 항체를 인큐베이션(incubation)시키는 단계를 포함하는 것인 방법. The method of claim 7, wherein the step (a) comprises incubating an antibody specifically binding to the biological sample and the GPKOW protein or a fragment thereof. 청구항 7에 있어서, 상기 단계 (a)는 상기 GPKOW 단백질에서 유래한 펩타이드를 측정함으로써, 상기 생물학적 시료의 질량 분석을 수행하는 단계를 포함하는 것인 방법. The method of claim 7, wherein step (a) comprises measuring the peptide derived from the GPKOW protein, thereby performing mass spectrometry of the biological sample. 청구항 7에 있어서, 상기 단계 (a)는 GPKOW 폴리뉴클레오티드의 mRNA와 상보적인 프로브를 이용하여 혼성화(hybridization)를 수행하고, 혼성화 정도를 통해 상기 GPKOW 폴리뉴클레오티드의 mRNA 발현량을 측정하는 단계를 포함하는 것인 방법.The method according to claim 7, wherein step (a) comprises a hybridization (hybridization) using a probe complementary to the mRNA of the GPKOW polynucleotide, and measuring the mRNA expression level of the GPKOW polynucleotide through the degree of hybridization How would that be.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20130237454A1 (en) * 2010-05-12 2013-09-12 Steven E. Schutzer Diagnostic markers for neuropsychiatric disease

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Medical Hypotheses, 2008, Vol 71, pp 537-541. *
NCBI Reference Sequence: XP_016884904.1 *

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