KR20160149625A - 대규모 생물학적 네트워크를 자동적으로 시각화하는 방법 및 장치 - Google Patents
대규모 생물학적 네트워크를 자동적으로 시각화하는 방법 및 장치 Download PDFInfo
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Abstract
Description
도 2는 본 발명에 의한 노드 위치를 결정하고 시각화한 예시를 나타낸 그래프이다.
도 3은 본 발명에 의한 노드의 중요도를 정하여 계층적으로 시각화하는 방법을 나타내는 순서도이다.
도 4는 본 발명에 의한 노드의 중요도를 정하여 계층적으로 시각화하는 방법을 나타내는 도면이다.
도 5는 본 발명에 의한 노드 위치를 자동적으로 결정하여 시각화하는 방법을 나타내는 순서도이다.
도 6은 본 발명에 의한 노드의 중요도를 정하여 계층적으로 시각화하는 방법을 나타내는 순서도이다.
도 7은 본 발명에 의한 노드 위치를 자동적으로 결정하여 시각화하는 장치를 나타내는 구성도이다.
도 8은 본 발명에 의한 노드의 중요도를 정하여 계층적으로 시각화하는 장치를 나타내는 구성도이다.
300 : 제 3산출부 400 : 제 4산출부
410 : 제 4-1산출부 420 : 제 4-2산출부
500 : 출력부 600 : 제 5산출부
700 : 제 6산출부 800 : 제 7산출부
900 : 제 2출력부
Claims (8)
- 복수 개의 노드 및 각 노드를 연결하는 복수 개의 에지를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 방법에 있어서,
사용자가 입력한 에지 목록 정보에 기초하여 상기 노드의 연결 상태를 파악하는 단계(S100);
사용자가 입력한 노드 목록 정보에 기초하여 상기 노드의 생물학적 특성을 파악하는 단계(S200);
상기 노드의 생물학적 특성에 기초하여 상기 노드 간의 생물학적 유사성을 계산하는 단계(S300);
상기 노드의 연결 상태 및 상기 노드 간의 생물학적 유사성에 기초하여 상기 노드의 좌표 정보를 산출하는 단계(S400); 및
상기 좌표 정보에 기초하여 생물학적 네트워크를 시각화하는 단계(S500);
를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 방법.
- 제 1항에 있어서,
상기 노드의 좌표 정보를 산출하는 단계(S400)는
상기 복수 개의 노드 간의 상대적인 거리를 산출하는 단계(S410); 및
상기 거리에 기초하여 Multi-Dimensional Scaling 알고리즘을 통하여 좌표값을 계산하는 단계(S420);
를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 방법.
- 제 2항에 있어서,
상기 복수 개의 노드 간의 상대적인 거리를 산출하는 단계는,
상기 노드 간의 생물학적 유사성 정보 및 상기 노드 간의 연결 상태 정보를 바탕으로 한 계산 알고리즘을 통하여 산출하는 생물학적 네트워크의 시각화 방법.
- 복수 개의 노드 및 각 노드를 연결하는 복수 개의 에지를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 방법에 있어서,
사용자가 입력한 에지 목록 정보에 기초하여 상기 노드의 연결 상태를 파악하는 단계(S100);
사용자가 입력한 노드 목록 정보에 기초하여 상기 노드의 생물학적 특성을 파악하는 단계(S200);
상기 노드의 연결 상태에 기초하여 노드의 중심성을 계산하는 단계(S600);
상기 노드의 생물학적 특성과 상기 노드의 중심성에 기초하여 노드의 중요도를 계산하는 단계(S700);
상기 중요도에 기초하여 상기 노드들을 계층화하는 단계(S800); 및
상기 계층화에 기초하여 상기 노드들을 우선순위를 정하여 순차적으로 시각화하는 단계(S900);
를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 방법.
- 복수 개의 노드 및 각 노드를 연결하는 복수 개의 에지를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 장치에 있어서,
사용자가 입력한 에지 목록 정보에 기초하여 상기 노드의 연결 상태를 파악하는 제 1산출부(100);
사용자가 입력한 노드 목록 정보에 기초하여 상기 노드의 생물학적 특성을 파악하는 제 2산출부(200);
상기 노드의 생물학적 특성에 기초하여 상기 노드 간의 생물학적 유사성을 계산하는 제 3산출부(300);
상기 노드의 연결 상태 및 상기 노드 간의 생물학적 유사성에 기초하여 상기 노드의 좌표 정보를 산출하는 제 4산출부(400); 및
상기 좌표 정보에 기초하여 생물학적 네트워크를 시각화하는 제 1출력부(500);
를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 장치.
- 제 5항에 있어서,
상기 노드의 좌표 정보를 산출하는 제 4산출부(400)는,
상기 복수 개의 노드 간의 상대적인 거리를 산출하는 제 4-1산출부(410); 및
상기 거리에 기초하여 Multi-Dimensional Scaling 알고리즘을 통하여 좌표값을 계산하는 제 4-2산출부(420);
를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 장치.
- 제 6항에 있어서,
상기 복수 개의 노드 간의 상대적인 거리를 산출하는 제 4-1산출부(410)는,
상기 노드 간의 생물학적 유사성 정보 및 상기 노드 간의 연결 상태 정보를 바탕으로 한 계산 알고리즘을 통하여 산출하는 생물학적 네트워크의 시각화 장치.
- 복수 개의 노드 및 각 노드를 연결하는 복수 개의 에지를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 장치에 있어서,
사용자가 입력한 에지 목록 정보에 기초하여 상기 노드의 연결 상태를 파악하는 제 1산출부(100);
사용자가 입력한 노드 목록 정보에 기초하여 상기 노드의 생물학적 특성을 파악하는 제 2산출부(200);
상기 노드의 연결 상태에 기초하여 노드의 중심성을 계산하는 제 5산출부(600);
상기 노드의 생물학적 특성과 상기 노드의 중심성에 기초하여 노드의 중요도를 계산하는 제 6산출부(700);
상기 중요도에 기초하여 상기 노드들을 계층화하는 제 7산출부(800); 및
상기 계층화에 기초하여 상기 노드들을 우선순위를 정하여 순차적으로 시각화하는 제 2출력부(900);
를 포함하는 생물학적 네트워크의 시각화 장치.
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Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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KR102392131B1 (ko) * | 2021-10-14 | 2022-04-28 | 고려대학교 산학협력단 | 먹이그물 네트워크 분석을 통한 생태계 예측 평가 시스템 및 이의 동작 방법 |
KR20230135354A (ko) | 2022-03-16 | 2023-09-25 | 경상국립대학교산학협력단 | 생물학적 네트워크 조절을 통한 암세포 특이적 치료제 분석 시스템 및 이를 이용한 암세포 특이적 치료제 분석 방법 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20040102887A (ko) | 2003-05-30 | 2004-12-08 | 학교법인 인하학원 | 단백질 상호작용 네트워크의 시각화방법 |
-
2015
- 2015-06-18 KR KR1020150086904A patent/KR101842681B1/ko not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (1)
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---|---|---|---|---|
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KR20230135354A (ko) | 2022-03-16 | 2023-09-25 | 경상국립대학교산학협력단 | 생물학적 네트워크 조절을 통한 암세포 특이적 치료제 분석 시스템 및 이를 이용한 암세포 특이적 치료제 분석 방법 |
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