KR20110121852A - Method for producing antimicrobial peptide and use of the same - Google Patents

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Abstract

PURPOSE: A method for preparing peptides having antibacterial activity is provided to produce a large amount of beta-defensin. CONSTITUTION: A method for in vitro expression of pig beta-defensin comprises: a step of performing PCR using pig tissue-derived cDNA as a template and primer for amplifying beta-defensin; a step of treating restriction enzyme to the PCR product; a step of performing ligation of the PCR product; and a step of transforming an expression vector to a host cell. The primer has a base sequence of sequence number 1 or 2. The host cell is yeast. An antibacterial composition against pathogenic microorganism contains beta-defensin. The pathogenic microorganism is gram-positive such as Bacillus cereus or Bacillus cereus or gram-negative bacteria such as E.coli or Salmonella enteritidis.

Description

항생 펩타이드의 제조방법 및 그 펩타이드의 응용{Method for producing antimicrobial peptide and use of the same}Method for producing antibiotic peptide and application of the peptide {Method for producing antimicrobial peptide and use of the same}

본 발명은 항균 활성을 갖는 펩타이드의 제조방법 및 그 제조방법을 통해서 생성된 펩타이드의 용도에 관한 것이다.The present invention relates to a method for producing a peptide having antimicrobial activity and to the use of a peptide produced through the method.

종래의 항생제에 내성을 갖는 세균성 균주의 출현은 동물 기원의 항균성 펩타이드를 포함하여, 새로운 치료제의 연구를 촉진하였다. 항균성 펩타이드는 식물, 곤충, 양서류 및 포유동물의 유기체를 포함하여 대부분의 살아있는 유기체의 고유의 숙주 방어 메카니즘에서 중요한 역할을 한다는 것이 인식되어 있고, 세균, 균류 및 특정 바이러스에 대한 잠재적인 항균 활성을 소유한다고 알려져 있다.The emergence of bacterial strains resistant to conventional antibiotics has prompted the study of new therapeutic agents, including antimicrobial peptides of animal origin. Antimicrobial peptides are recognized to play an important role in the inherent host defense mechanisms of most living organisms, including plants, insects, amphibians and mammalian organisms, and possess potential antimicrobial activity against bacteria, fungi and certain viruses. It is known.

항균성 펩타이드는 넓은-스펙트럼 활성을 소유하고 미생물 감염에 대한 숙주 방어의 중요한 일부를 구성하는 5 킬로달톤 미만의 저분자량 분자로서, 이들은 저 분자 중량 항균성 화합물을 고안하기 위한 출발점을 제공한다.Antimicrobial peptides are low molecular weight molecules of less than 5 kilodaltons that possess broad-spectrum activity and constitute an important part of host defense against microbial infection, providing a starting point for designing low molecular weight antimicrobial compounds.

대부분의 항균성 펩타이드는 병원체의 특이 분자 수용체를 표적으로 하지 않고 오히려 영향을 미치고 미생물 막을 투과한다. 이들은 그들의 맴브라놀리틱 활성에 기여하는 특성인 소수성과 하전 영역의 클러스터를 갖는 양쪽 친매성 구조로 접힐 수 있는 경향을 갖는다고 알려진다. 항균성 펩타이드는 막 완전성을 타협하기 위해 지질에 병합하는 펩타이드의 95% 초과를 인지질 이중층으로 쉽게 구분한다.Most antimicrobial peptides do not target specific molecular receptors of the pathogen but rather affect and penetrate the microbial membrane. They are known to have a tendency to fold into both hydrophilic structures with clusters of hydrophobic and charged regions, which are properties contributing to their membrane activity. Antimicrobial peptides easily distinguish more than 95% of peptides incorporated into lipids to compromise membrane integrity into phospholipid bilayers.

세균에서, 항균성 펩타이드는 평면 지질 이중층에서 작은 임시의 전도성 증가를 가져올 수 있고, 그것에 의해 부분적으로 세포질 막 포텐셜 구배의 극성을 없앤다. 세균이 항생제 내성을 크게 개발함에 따라, 항생제 내성의 문제를 극복할 수 있는 신규한 치료제로서, 항균성 펩타이드의 개발에 대한 가능성이 명백해진다.In bacteria, antimicrobial peptides can lead to a small temporary increase in conductivity in planar lipid bilayers, thereby partially canceling out the polarity of the cellular membrane potential gradient. As bacteria greatly develop antibiotic resistance, the potential for the development of antimicrobial peptides becomes clear as novel therapeutics that can overcome the problem of antibiotic resistance.

고유의 숙주 방어 메카니즘에서 항균성 펩타이드의 보호 기능은 Drosophilia에서 증명되어 왔고, 여기서 이와 같은 펩타이드의 감소된 발현은 미생물 공격 후 생존률을 극적으로 감소시켰다. 포유동물에서, 유사한 기능은 낭포성 섬유증 환자의 폐와 작은 마이스에서 불완전한 세균 사살에 의한 것으로 제안된다.The protective function of antimicrobial peptides in their own host defense mechanisms has been demonstrated in Drosophilia, where reduced expression of these peptides dramatically reduced survival after microbial attack. In mammals, a similar function is suggested due to incomplete bacterial killing in the lungs and small mice in patients with cystic fibrosis.

현재, 수백 개의 항균성 펩타이드의 특성이 기술되었다. 일반적으로, 천연적으로 유래된 항균성 펩타이드는 12~50 아미노산 길이이고 α-나선, β-시트, 연장된 펩타이드 및 루프된 펩타이드를 포함하여 여러 구조적 군으로 나뉜다.Currently, the properties of hundreds of antimicrobial peptides have been described. Generally, naturally occurring antimicrobial peptides are 12-50 amino acids in length and are divided into several structural groups, including α-helix, β-sheets, extended peptides and looped peptides.

비록 이들 펩타이드는 현저한 다양성을 나타내지만, 이들은 2가지 일반적이고 기능적으로 중요한 요건을 갖는다:음으로 하전된 미생물 표면과 상호작용을 용이하게 하는 순 양이온성, 및 미생물 막으로의 병합을 허용하는 양쪽친매성 구조를 가정할 수 있는 능력.Although these peptides exhibit significant diversity, they have two general and functionally important requirements: pure cationic, which facilitates interaction with the negatively charged microbial surface, and an amphiphilic that allows integration into the microbial membrane. The ability to assume a fascination structure.

포유동물에서 발견되는 항균성 펩타이드는 시스테인-풍부 디펜신(defensin)(α- 및 β-디펜신) 및 카세리시딘(cathelicidin) 류로 분류된다. Antimicrobial peptides found in mammals are classified into cysteine-defensin (α- and β-defensins) and cathelicidins.

또한 소, 돼지, 닭 등을 사육하면서 사료에 동물용 항생제를 섞어 먹이는데 이 때문에 동물 내에 항생제 내성균이 생기고, 이 내성균은 축산물을 먹는 사람에게 옮기게 된다. 2005년 4월부터 7개월간 식품의약품안전청이 조사한 '식품 중 식중독 균 항생제 내성 모니터링'결과에 따르면, 육류에서 검출된 대장균이 항생제에 92.5%의 내성률을 보이는 등 먹을 거리의 항생제 내성균 역시 우려할 만한 수준인 것으로 나타났다. 현재 항생제 대체제에 대한 개발이 진행되고 있으나 이와는 별도로 생체 내에서 자연적으로 생성되는 세균방어 물질들을 활용한 기술의 개발이 필요하다. In addition, while breeding cattle, pigs, chickens, etc., antibiotics for animals are mixed and fed into the feed, which causes antibiotic-resistant bacteria in the animals, which are transferred to people who eat livestock. According to the Food and Drug Administration's Monitoring of Antibiotic Resistance of Food Poisoning Bacteria for 7 months from April 2005, food-resistant antibiotic-resistant bacteria are also of concern, as E. coli detected in meat has a 92.5% resistance to antibiotics. Appeared to be. Currently, the development of antibiotic substitutes is in progress, but apart from this, there is a need for the development of a technology using bacterial defense materials naturally generated in vivo.

항생제를 양돈 사료에 첨가하여서 유해미생물의 증식 억제, 영양소의 이용률과 흡수율 증가를 통한 성장률과 사료효율을 개선할 수 있고, 장내 대사과정에 관여하여 면역증가, 치료효과를 증진시켜 질병을 예방할 수 있다. 그러나 항생제를 남용함으로써 항생제 내성균의 유발로 동물 치료의 어려움이 있고, 축산물에 잔류된 내성균이 사람에게 전이되어 쇼크 내성균 유발, 신체발육 이상 등의 문제를 야기 시킬 수 있다. 그리하여 오늘날 WHO 등 국제 기구에서 항생물질 규제를 시작했다. 기존에 개발된 대체 항생물질 (난황황체, 생균제, 유기산, Mannanoligosaccharide, Fructooligosaccharide, 키토산 등) 대부분의 항균 효과는 in-vitro 수준에서 증명되었고, 점막면역 시스템과의 관계 증명이 미흡한 실정이다. 또한, 동물 실험 결과 항균 효과가 모호하며 생산비용의 증가로 인한 무제한 사용이 어려운 실정이다.Antibiotics can be added to pig feed to improve the growth rate and feed efficiency by inhibiting the growth of harmful microorganisms, increasing the utilization and absorption rate of nutrients, and preventing diseases by increasing immunity and therapeutic effects by participating in intestinal metabolism. . However, by abuse of antibiotics, there is a difficulty in treating animals due to the induction of antibiotic resistant bacteria, and the resistant bacteria remaining in the livestock products can be transferred to humans, causing shock resistant bacteria, physical development abnormalities, and the like. Thus, international organizations such as the World Health Organization (WHO) have begun to regulate antibiotics. Most of the antimicrobial effects developed previously (eg yolk sulphate, probiotics, organic acids, Mannanoligosaccharides, Fructooligosaccharides, chitosan, etc.) have been demonstrated at the in-vitro level, and the relationship with the mucosal immune system is insufficient. In addition, as a result of animal experiments, the antimicrobial effect is ambiguous and unlimited use due to the increase in production cost is difficult.

그러나 항균펩타이드 (antimicrobial peptides)라 불리는 생체 내 분자들로 선천면역 (innate immunity) 반응 물 중 하나인 천연 항생제 디펜신 (defensin)은 미생물의 종류에 크게 상관없이 작용하며, 즉각적 혹은 몇 시간 내에 작용할 수 있다. 기존의 항생제의 문제점인 내성균의 문제가 없으며, 후천면역에 대한 부작용이나 거부반응 문제가 없다. 또한, 디펜신의 발현이나 조절기작에 문제가 생기면 각종 감염 질환이 야기되며, 세균 군마다 서로 다른 디펜신이 더 잘 작용한다고 예측되고 있다. 따라서 디펜신 연구는 산업적으로 매우 중요하다. 디펜신은 선천 면역뿐만 아니라 선천면역-후천면역 사이의 교량 역할을 하며, 인간 디펜신의 경우 항균력뿐 만 아니라 에이즈 억제 능력 등 항바이러스 효과가 증명되었다. 디펜신은 lysozyme의 항균력 보다 수 백배 강력한 효능을 가지며, 인간 디펜신은 병원균에 특이적으로 작용할 뿐만 아니라 조합 사용 시 상승작용으로 치료의 범위가 다양하다. 유도발현 등을 통한 새로운 감염치료 방법 수립의 가능성이 존재하고 유전자 조작에 의한 대량 생산으로 사료 첨가제로 산업화의 가능성이 있다. However, one of the innate immunity reactants, which are in vivo molecules called antimicrobial peptides, the natural antibiotic defensin, regardless of the type of microorganism, can act immediately or within hours. have. There is no problem of resistant bacteria, a problem of conventional antibiotics, and there are no side effects or rejection problems for acquired immunity. In addition, when a problem occurs in the expression or regulation mechanism of defensin, various infectious diseases are caused, and it is predicted that different defensins work better in different bacterial groups. Thus, defensin research is of great industrial importance. Defensins serve as a bridge between innate immunity and acquired immunity as well as innate immunity, and human defensins have been shown to have antiviral effects such as antimicrobial activity and AIDS suppression ability. Defensins have several hundred times stronger potency than the antimicrobial activity of lysozyme, and human defensins not only act specifically on pathogens, but also vary in the range of treatment due to their synergism. There is a possibility of establishing a new infection treatment method through induction expression, and there is a possibility of industrialization as a feed additive by mass production by genetic manipulation.

본 발명은 상기의 필요성에 의하여 안출된 것으로서 본 발명의 목적은 디펜신의 체외발현시스템을 제공하는 것이다.The present invention has been made in view of the above necessity, and an object of the present invention is to provide an in vitro expression system of defensin.

본 발명의 다른 목적은 상기 체외발현시스템으로부터 얻은 디펜신을 포함하는 약학 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition comprising defensin obtained from the in vitro expression system.

본 발명의 또 다른 목적은 상기 체외발현시스템으로부터 얻은 디펜신을 포함하는 사료조성물을 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide a feed composition containing defensin obtained from the in vitro expression system.

상기의 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 a) 돼지 조직으로부터 유래한 cDNA를 주형으로 하여서 베타-디페신을 증폭하기 위한 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계; b) 상기 PCR 산물을 제한 효소 처리하는 단계;c) 상기 제한 효소 처리된 PCR 산물을 도 2의 발현벡터에 라이게이션하는 단계; 및 d) 상기 발현벡터를 숙주세포에 형질전환하는 단계를 포함하는 돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법를 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention comprises the steps of: a) performing PCR using primers for amplifying beta-diffsin using cDNA derived from porcine tissue as a template; b) subjecting the PCR product to restriction enzymes; c) ligating the restriction enzyme-treated PCR product to the expression vector of FIG. 2; And d) provides a method for in vitro expression of porcine beta defensin comprising the step of transforming the expression vector into a host cell.

본 발명의 일 구체예에 있어서, 상기 프라이머는 서열번호 1 및 2로 이루어진 군으로부터 선택된 염기서열을 가지는 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In one embodiment of the invention, the primer preferably has a base sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1 and 2, but is not limited thereto.

본 발명의 일 구체예에 있어서 상기 베타-디펜신은 서열번호 5의 아미노산 서열을 가지는 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In one embodiment of the present invention, the beta-defensin preferably has an amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, but is not limited thereto.

또한 본 발명은 a) 돼지 조직으로부터 유래한 cDNA를 주형으로 하여서 베타-디페신을 증폭하기 위한 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계; b) 상기 PCR 산물을 제한 효소 처리하는 단계;c) 상기 제한 효소 처리된 PCR 산물을 발현벡터에 라이게이션하여서 도 6의 발현벡터를 구축하는 단계; 및 d) 상기 발현벡터를 숙주세포에 형질전환하는 단계를 포함하는 돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법을 제공한다.In addition, the present invention comprises the steps of a) PCR using a primer for amplifying beta-diffsin using a cDNA derived from pig tissue as a template; b) subjecting the PCR product to restriction enzymes; c) constructing the expression vector of FIG. 6 by ligating the restriction enzyme-treated PCR product to an expression vector; And d) provides a method for in vitro expression of porcine beta defensin comprising the step of transforming the expression vector into a host cell.

본 발명의 일 구체예에 있어서, 상기 프라이머는 서열번호 3 및 4로 이루어진 군으로부터 선택된 염기서열을 가지는 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In one embodiment of the present invention, the primer preferably has a base sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 3 and 4, but is not limited thereto.

본 발명의 다른 일 구체예에 있어서, 상기 숙주세포는 효모인 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In another embodiment of the present invention, the host cell is preferably yeast, but is not limited thereto.

또한 본 발명은 상기 본 발명의 발현방법에 의하여 제조된 베타-디펜신을 포함하는 병원성 미생물에 대한 항균용 조성물을 제공한다.In another aspect, the present invention provides a composition for antimicrobial against pathogenic microorganisms, including beta-defensin prepared by the expression method of the present invention.

본 발명의 일 구체예에 있어서 상기 병원성 미생물은 그람 양성 또는 그람 음성균인 것이 바람직하고, 상기 그람 양성균은 바실러스 세레우스 또는 스타필로코커스 아우레우스이고, 상기 그람 양성균은 대장균 또는 살모넬라 엔터라이티디스인 것이 더욱 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In one embodiment of the present invention, the pathogenic microorganism is preferably Gram-positive or Gram-negative bacteria, and the Gram-positive bacteria is Bacillus cereus or Staphylococcus aureus, and the Gram-positive bacteria is Escherichia coli or Salmonella enteritidis. More preferably, but is not limited thereto.

본 발명은 돼지 beta defensin의 효모(yeast) 세포질내 발현을 통해 그 발현산물(lysate 또는 isolation 또는 purified products)에 대한 항균 효능을 검정하기 위해 효모 균주 발현벡터(도 6)를 구축하여, 효모 균주 내로 도입하며 도입된 효모 균주의 배양을 통해 최종 산물의 항균 기능을 확인한다(pGAL-10 벡터는 yeast에서 특이적으로 발현되는 백터). The present invention is to build a yeast strain expression vector (Fig. 6) to test the antimicrobial efficacy of the expression product (lysate or isolation or purified products) through yeast cytoplasmic expression of porcine beta defensin, into the yeast strain Introducing and confirming the antimicrobial function of the final product through the culture of the introduced yeast strain (pGAL-10 vector is a vector specifically expressed in yeast).

돼지 beta defensin 1,2,3 발현 산물의 항균 효능을 검정하기 위하여, 각각의 돼지 beta defensin에서 mature peptide sequence만을 이용하여 효모(yeast) 세포질내의 발현을 유도하기로 한다. 이에 따라 각각의 mature peptide 구조를 확인한 후, 효모 발현 벡터에 삽입하고 효모 내로 도입하여 발현을 유도한다. 효모 내의 발현을 위한 각각의 mature peptide를 확인하기 위해 NCBI 유전자 은행의 정보를 확인하고 이에 대한 각각의 mRNA에서 cDNA 및 염기서열을 확인한다. 그러나 동물세포내 발현이 아닌 대장균이나 효모의 발현을 위해서 합성신호(transcript factor)를 제외한 최종 발현산물(mature peptide)의 크기를 확인이 필요하다. 특히 돼지와 사람의 beta defensin 유전자 구조를 비교함으로서 필요한 mature peptide sequence를 확인한다.In order to test the antimicrobial efficacy of pig beta defensin 1,2,3 expression products, the expression of yeast cytoplasm is induced using only the mature peptide sequence in each beta defensin. Accordingly, after confirming each mature peptide structure, it is inserted into the yeast expression vector and introduced into the yeast to induce expression. To identify each mature peptide for expression in yeast, check the information of the NCBI gene bank and identify cDNA and sequence in each mRNA for it. However, for the expression of E. coli or yeast, not the expression of animal cells, it is necessary to confirm the size of the final peptide except for the transcript factor. In particular, the mature peptide sequence is identified by comparing the beta defensin gene structure of pigs and humans.

본 발명을 더 상세히 논의하기 전에 하기 용어 및 규정들을 먼저 정의한다.Before discussing the present invention in more detail, the following terms and conventions are first defined.

본원에서 용어 "항균 활성"은 미생물 세포를 죽이거나 그 성장을 억제할 수 있는 활성으로서 정의된다. 본 발명의 문맥에서, 용어 "항균"은 살균 및/또는 정균 및/또는 살진균 및/또는 정진균 효과 및/또는 바이러스 살균 효과가 있다는 의미이며,여기서 용어 "살균"은 박테리아 세포를 죽일 수 있다는 것으로서 이해되어야 한다. 용어 "정균"은 박테리아 성장 억제, 즉 박테리아 세포의 성장을 억제할 수 있다는 것으로서 이해되어야 한다. 용어 "살진균"은 진균 세포를 죽일 수 있다는 것으로서 이해되어야 한다. 용어 "정진균"은 진균 성장 억제, 즉 진균 세포의 성장을 억제할 수 있다는 것으로서 이해되어야 한다.The term "antibacterial activity" is defined herein as an activity capable of killing or inhibiting the growth of microbial cells. In the context of the present invention, the term "antibacterial" means bactericidal and / or bacteriostatic and / or fungicidal and / or bacteriostatic effect and / or viral bactericidal effect, wherein the term "sterilization" is intended to kill bacterial cells. It must be understood. The term "bacterial" should be understood as being able to inhibit bacterial growth, ie, inhibit the growth of bacterial cells. The term "fungicidal" should be understood as capable of killing fungal cells. The term “fungal fungus” should be understood as being able to inhibit fungal growth, ie, inhibit the growth of fungal cells.

용어 "바이러스 살균"은 바이러스를 비활성화할 수 있다는 것으로서 이해되어야 한다. 용어 "미생물 세포"는 박테리아 또는 진균 세포(효모를 포함하는)를 나타낸다.The term "virus sterilization" should be understood as being able to inactivate viruses. The term "microbial cell" refers to a bacterial or fungal cell (including yeast).

본 발명의 목적을 위해, 항균 활성은 Lehrer 등의 Journal of Immunological Methods(137(2) 권 pp. 167-174 (1991))에설명된 과정에 따라서 결정될 수 있다.For the purposes of the present invention, the antimicrobial activity can be determined according to the procedure described in the Journal of Immunological Methods (137 (2), pp. 167-174 (1991)) by Lehrer et al.

본 문맥에서 사용되었을 때, 용어 "cDNA"는 진핵세포로부터 유래된 성숙한 스플라이스된 mRNA(mature spliced mRNA)분자로부터 역전사에 의해 제조될 수 있는 DNA 분자를 포함한다. cDNA는 상응하는 게놈 DNA에 통상 존재하는 인트론 서열을 결여하고 있다. 초기 1차 RNA 전사체는 mRNA의 전구체이며, 그것은 성숙한 스플라이스된 mRNA로서 나타나기 전에 일련의 프로세싱 사건들을 겪는다. 이들 사건은 스플라이싱(splicing)으로 명명된 과정에 의한 인트론 서열의 제거를 포함한다. 그러므로, cDNA가 mRNA로부터 유래된 때는 인트론 서열이 결여된다.As used in this context, the term “cDNA” includes DNA molecules that can be prepared by reverse transcription from mature spliced mRNA molecules derived from eukaryotic cells. cDNA lacks the intron sequence normally present in the corresponding genomic DNA. Early primary RNA transcripts are precursors of mRNA, which undergo a series of processing events before appearing as mature spliced mRNA. These events include the removal of intron sequences by a process named splicing. Therefore, when cDNA is derived from mRNA, it lacks the intron sequence.

본원에서 사용되었을 때, 용어 "핵산 구성물"은 자연발생한 유전자로부터 분리되거나 또는 자연에서 존재하는 않는 방식으로 핵산의 세그먼트들을 함유하도록 변형된, 단일- 또는 이중-가닥의 핵산 분자를 의미한다. 핵산 구성물이 본 발명의 코딩 서열의 발현에 필요한 제어 서열을 함유할 때, 용어 "핵산 구성물"은 용어 "발현 카세트"와 같은 의미이다.As used herein, the term “nucleic acid construct” refers to a single- or double-stranded nucleic acid molecule that has been isolated from a naturally occurring gene or modified to contain segments of nucleic acid in a manner that does not exist in nature. When the nucleic acid construct contains a control sequence necessary for the expression of the coding sequence of the present invention, the term "nucleic acid construct" is synonymous with the term "expression cassette".

본원에서 용어 "제어 서열"은 본 발명의 폴리펩타이드의 발현에 필요하거나 유리한 모든 성분들을 포함하도록 정의된다. 각 제어 서열은 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열에 자생적이거나 외래적일 수 있다. 그러한 제어 서열은, 제한은 없지만, 리더, 폴리아데닐화 서열, 프로펩타이드 서열, 프로모터, 신호 펩타이드 서열, 및 전사 터미네이터를 포함한다. 최소한 제어 서열은 프로모터, 그리고 전사 및 번역 중단 신호를 포함한다. 제어 서열은 제어 서열과 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오티드서 서열의 코딩 영역의 리게이션(ligation)을 용이하게 하는 특이적 제한 부위를 도입할 목적으로 링커와 함께 제공될 수 있다.The term "control sequence" is defined herein to include all components necessary or advantageous for expression of a polypeptide of the invention. Each control sequence may be native or foreign to the nucleotide sequence encoding the polypeptide. Such control sequences include, but are not limited to, leader, polyadenylation sequence, propeptide sequence, promoter, signal peptide sequence, and transcription terminator. At least the control sequence includes a promoter and a transcriptional and translational disruption signal. Control sequences may be provided with a linker for the purpose of introducing specific restriction sites that facilitate the ligation of the coding region of the control sequence and the nucleotide sequence encoding the polypeptide.

본원에서 용어 "작동가능하게 연결된"은 제어 서열이 DNA 서열의 코딩 서열에 관련된 위치에 적합하게 배치되어, 이 제어서열이 폴리펩타이드의 발현을 지시하도록 하는 입체배치로서 정의된다.The term “operably linked” is defined herein as a conformation such that the control sequence is appropriately positioned at a position relative to the coding sequence of the DNA sequence such that the control sequence directs the expression of the polypeptide.

본원에서 사용되었을 때, 용어 "코딩 서열"은 그 단백질 산물의 아미노산 서열을 직접 특정하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 코딩 서열의 경계는 일반적으로 통상 ATG 시작 코돈으로 시작하는 오픈 리딩 프레임에 의해 결정된다. 코딩 서열은 전형적으로 DNA, cDNA, 및 재조합 뉴클레오티드 서열을 포함한다.As used herein, the term “coding sequence” includes nucleotide sequences that directly specify the amino acid sequence of the protein product. The boundaries of the coding sequences are usually determined by an open reading frame that usually begins with an ATG start codon. Coding sequences typically include DNA, cDNA, and recombinant nucleotide sequences.

본 문맥에서, 용어 "발현"은, 제한은 없지만, 전사, 전사-후 변형, 번역, 번역-후 변형, 및 분비를 포함하는, 펩타이드의 생산에 연루된 어떤 단계를 포함한다.In this context, the term “expression” includes any step involved in the production of a peptide, including but not limited to transcription, post-transcriptional modification, translation, post-translational modification, and secretion.

본 문맥에서, 용어 "발현 벡터"는 본 발명의 펩타이드를 암호화하는 세그먼트를 포함하며 그것의 전사를 제공하는 추가 세그먼트에 작동가능하게 연결된 선형 또는 환상의 DNA 분자를 포함한다.In this context, the term “expression vector” includes a linear or cyclic DNA molecule comprising a segment encoding a peptide of the invention and operably linked to additional segments that provide for its transcription.

본원에 사용된 용어 "숙주 세포"는 핵산 구성물을 사용한 형질전환을 받아들이는 어떤 세포 종류를 포함한다.The term "host cell" as used herein includes any cell type that accepts transformation with nucleic acid constructs.

이하 본 발명을 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described.

본 발명은 제어 서열과 양립가능한 조건하에서 적합한 숙주 세포에서의 코딩 서열의 발현을 지시하는 하나 이상의 제어 서열에 작동가능하게 연결된 본 발명의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 베타 디펜신을 생산하는 핵산 구성물에 관한 것이다.The present invention relates to nucleic acid constructs that produce beta defensin comprising a nucleotide sequence of the invention operably linked to one or more control sequences that direct expression of a coding sequence in a suitable host cell under conditions compatible with the control sequence.

본 발명의 펩타이드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열은 펩타이드의 발현을 제공하도록 다양한 방식으로 조작될 수 있다. 발현 벡터에 따라서는 벡터에 삽입하기 전의 뉴클레오티드 서열 조작이 바람직하거나 또는 필수적일 수 있다. 재조합 DNA 방법을 이용해서 뉴클레오티드 서열을 변형하는 기술이 본 분야에 잘 공지되어 있다.Nucleotide sequences encoding peptides of the invention can be engineered in a variety of ways to provide expression of the peptides. Depending on the expression vector, nucleotide sequence manipulation prior to insertion into the vector may be desirable or necessary. Techniques for modifying nucleotide sequences using recombinant DNA methods are well known in the art.

제어 서열은 그 뉴클레오티드 서열의 발현을 위해 숙주 세포에 의해 인식되는 뉴클레오티드 서열인 적합한 프로모터 서열일 수 있다. 프로모터 서열은 펩타이드의 발현을 매개하는 전사 제어 서열을 함유한다. 프로모터는 돌연변이 프로모터,절형 프로모터(truncated promoter), 및 혼성체 프로모터를 포함하는 선택된 숙주 세포에서 전사 활성을 나타내는 어떤 뉴클레오티드 서열일 수 있으며, 숙주 세포에 상동성이거나 이종성인 세포외 또는 세포내 펩타이드를 암호화하는 유전자로부터 얻어질 수 있다.The control sequence may be a suitable promoter sequence which is a nucleotide sequence recognized by the host cell for expression of that nucleotide sequence. The promoter sequence contains a transcriptional control sequence that mediates the expression of the peptide. The promoter may be any nucleotide sequence that exhibits transcriptional activity in selected host cells, including mutated promoters, truncated promoters, and hybrid promoters, and encodes extracellular or intracellular peptides that are homologous or heterologous to the host cell Can be obtained from a gene.

특히 박테리아 숙주 세포에서 본 발명의 핵산 구성물의 전사를 지시하는데 적합한 프로모터의 예들은, 대장균 lac 오페론,Streptomyces coelicolor 아가라제 유전자(dagA), Bacillus subtilis 레반수크라제 유전자(sacB), Bacillus licheniformis 알파-아밀라제 유전자(amyL), Bacillus stearothermophilus 말토겐 아밀라제 유전자(amyM), Bacillus amyloliquefaciens 알파-아밀라제 유전자(amyQ), Baci-llus licheniformis 페니실리나제 유전자(penP), Bacillus subtilis xylA 및 xylB 유전자, 및 원핵 베타-락타마제 유전자로부터 얻어진 프로모터(Villa-Kamaroff 등, 1978,Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75:3727-3731), 뿐만 아니라 tac 프로모터(DeBoer 등,1983, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 80:21-25)이다. 더 이상의 프로모터들이 "재조합 박테리아로부터의 유용한 단백질": Scientific American(1980, 242:74-94); 및 Sambrook 등, 1989(상동)에 설명된다.Examples of promoters that are particularly suitable for directing transcription of the nucleic acid constructs of the present invention in bacterial host cells include Escherichia coli lac operon, Streptomyces coelicolor agarase gene (dagA), Bacillus subtilis Levansukraase gene (sacB), Bacillus licheniformis alpha- Amylase gene (amyL), Bacillus stearothermophilus maltogen amylase gene (amyM), Bacillus amyloliquefaciens alpha-amylase gene (amyQ), Baci-llus licheniformis penicillinase gene (penP), Bacillus subtilis xylA and xylB genes, and prokaryotic beta-lacta Promoters obtained from the horseshoe gene (Villa-Kamaroff et al., 1978, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75: 3727-3731), as well as tac promoters (DeBoer et al., 1983, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 80: 21- 25). Further promoters are “useful proteins from recombinant bacteria”: Scientific American (1980, 242: 74-94); And Sambrook et al., 1989 (homologous).

효모 숙주에서 유용한 프로모터는 Saccharomyces cerevisiae 에놀라제(ENO-1), Saccharomyces cerevisiae 갈락토키나제(GAL1), Saccharomyces cerevisiae 알콜 탈수소효소/글리세르알데히드-3-포스페이트 탈수소효소((ADH2/GAP),및 Saccha-romyces cerevisiae 3-포스포글리세레이트 키나제의 유전자로부터 얻어진다. 다른 유용한 효모 숙주 세포의 프로모터가 Romanos 등, 1992, Yeast 8:423-488에 설명된다.Useful promoters in yeast hosts include Saccharomyces cerevisiae enolase (ENO-1), Saccharomyces cerevisiae galactokinase (GAL1), Saccharomyces cerevisiae alcohol dehydrogenase / glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (ADH2 / GAP), and Saccha Obtained from the gene of -romyces cerevisiae 3-phosphoglycerate kinase Another useful yeast host cell promoter is described in Romanos et al., 1992, Yeast 8: 423-488.

또한, 제어 서열은 숙주 세포에 의해 인식되어 전사를 종결하는 서열인 적합한 전사 터미테이터 서열일 수 있다. 터미네이터 서열은 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열의 3' 말단에서 작동가능하게 연결된다. 선택된 숙주 세포에서 기능하는 어느 터미네터도 본 발명에서 사용될 수 있다.The control sequence can also be a suitable transcription terminator sequence that is a sequence recognized by the host cell to terminate transcription. Terminator sequences are operably linked at the 3 'end of the nucleotide sequence encoding the polypeptide. Any terminator that functions in the selected host cell can be used in the present invention.

효모 숙주 세포에 바람직한 터미네이터는 Saccharomyces cerevisiae 에놀라제, Saccharomyces cerevisiae 시토크롬C(CYC1), 및 Saccharomyces cerevisiae 글리세르알데히드-3-포스페이트 탈수소효소의 유전자로부터 얻어진다. 다른 유용한 효모 숙주 세포의 터미테이터가 Romanos 등, 1992(상동)에 설명된다.Preferred terminators for yeast host cells are obtained from the genes of Saccharomyces cerevisiae enolase, Saccharomyces cerevisiae cytochrome C (CYC1), and Saccharomyces cerevisiae glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. Terminators of other useful yeast host cells are described in Romanos et al., 1992 (homologous).

또한, 제어 서열은 숙주 세포에 의한 번역에 중요한 mRNA의 미번역 영역인 적합한 리더 서열일 수 있다. 리더 서열은 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열의 5' 말단에서 작동가능하게 연결된다. 선택된 숙주 세포에서 기능하는 어느리더 서열도 본 발명에서 사용될 수 있다.The control sequence can also be a suitable leader sequence that is an untranslated region of mRNA important for translation by the host cell. The leader sequence is operably linked at the 5 'end of the nucleotide sequence encoding the polypeptide. Any leader sequence that functions in the selected host cell can be used in the present invention.

효모 숙주 세포에 적합한 리더는 Saccharomyces cerevisiae 에놀라제(ENO-1), Saccharomyces cerevisiae 3-포스포글리세레이트 키나제, Saccharomyces cere-visiae 알파-인자, 및 Saccharomyces cerevisiae 알콜 탈수소효소/글리세르알데히드-3-포스페이트 탈수소효소(ADH2/GAP)의 유전자로부터 얻어진다.Suitable leaders for yeast host cells are Saccharomyces cerevisiae enolase (ENO-1), Saccharomyces cerevisiae 3-phosphoglycerate kinase, Saccharomyces cere-visiae alpha-factor, and Saccharomyces cerevisiae alcohol dehydrogenase / glyceraldehyde-3-phosphate It is obtained from the gene of dehydrogenase (ADH2 / GAP).

또한, 제어 서열은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단에 작동가능하게 연결된 서열로서, 전사되었을 때 신호로서 숙주 세포에 의해 인식되어 전사된 mRNA에 폴리아데노신 잔기를 부가하는 서열인 폴리아데닐화 서열일 수 있다. 선택된 숙주 세포에서 기능하는 어느 폴리아데닐화 서열도 본 발명에서 사용될 수 있다.The control sequence can also be a polyadenylation sequence, a sequence operably linked to the 3 'end of the nucleotide sequence, which is a sequence that, when transcribed, adds a polyadenosine residue to the transcribed mRNA that is recognized by the host cell as a signal. Any polyadenylation sequence that functions in the selected host cell can be used in the present invention.

효모 숙주 세포에 유용한 폴리아데닐화 서열은 Guo 및 Sherman, 1995, Mole-cular Cellular Biology 15:5983-5990에 설명된다.Polyadenylation sequences useful for yeast host cells are described in Guo and Sherman, 1995, Mole-cular Cellular Biology 15: 5983-5990.

또한, 제어 서열은, 폴리펩타이드의 아미노 말단에 연결된 아미노산 서열을 코딩하고, 이 암호화된 폴리펩타이드를 세포의 분비 경로로 보내는, 신호 펩타이드 코딩 영역일 수 있다. 원래 뉴클레오티드 서열의 코딩 서열의 5' 단부는 분비된 폴리펩타이드를 암호화하는 코딩 영역의 세그먼트로 번역 리딩 프레임에 본래 연결된 신호 펩타이드 코딩 영역을 함유한다. 또는 달리, 코딩 서열의 5' 단부는 코딩 서열에 외래적인 신호 펩타이드 코딩 영역을 함유할 수 있다. 외래 신호 펩타이드 코딩 영역은 코딩 서열이 신호 펩타이드 코딩 영역을 본래 함유하지 않는 경우 필요할 수 있다. 또는 달리, 외래 신호 펩타이드 코딩 영역은 본래의 신호 펩타이드 코딩 영역을 단순히 대체하여 폴리펩타이드의 분비를 증진시킨다. 그러나, 발현된 폴리펩타이드를 선택된 숙주 세포의 분비 경로로 보내는 어떤 신호 펩타이드 코딩 영역도 본 발명에서 사용될 수 있다.The control sequence may also be a signal peptide coding region, encoding an amino acid sequence linked to the amino terminus of the polypeptide and directing the encoded polypeptide to the cell's secretory pathway. The 5 'end of the coding sequence of the original nucleotide sequence contains a signal peptide coding region originally linked to the translation leading frame into a segment of the coding region encoding the secreted polypeptide. Alternatively, the 5 'end of the coding sequence may contain a signal peptide coding region that is foreign to the coding sequence. A foreign signal peptide coding region may be necessary if the coding sequence does not originally contain the signal peptide coding region. Alternatively, the foreign signal peptide coding region simply replaces the original signal peptide coding region to enhance secretion of the polypeptide. However, any signal peptide coding region that directs the expressed polypeptide to the secretory pathway of the selected host cell can be used in the present invention.

박테리아 숙주 세포에 효과적인 신호 펩타이드 코딩 영역은 Bacillus NCIB 11837 말토겐 아밀라제, Bacillus stearothermophilus 알파-아밀라제, Bacillus licheniformis 섭틸리신, Bacillus licheniformis 베타-락타마제, Bacillus stear-othermophilus 중성 프로테아제(nprT, nprS, nprM), 및 Bacillus subtilis prsA의 유전자로부터 얻어진 신호 펩티드 코딩 영역이다.Effective signal peptide coding regions for bacterial host cells include Bacillus NCIB 11837 maltogen amylase, Bacillus stearothermophilus alpha-amylase, Bacillus licheniformis subtilisin, Bacillus licheniformis beta-lactamase, Bacillus stear-othermophilus neutral protease (nprT, nprT), nprS, And a signal peptide coding region obtained from the gene of Bacillus subtilis prsA.

효모 숙주 세포에 유용한 신호 펩타이드는 Saccharomyces cerevisiae 알파-인자 및 Saccharomyces cerevisiae 인베르타제의 유전자로부터 얻어진다. 다른 유용한 신호 펩타이드 코딩 영역이 Romanos 등, 1992(상동)에 설명된다.Useful signal peptides for yeast host cells are obtained from genes of Saccharomyces cerevisiae alpha-factor and Saccharomyces cerevisiae invertase. Another useful signal peptide coding region is described in Romanos et al., 1992 (homologous).

또한, 본 발명은 본 발명의 핵산 구성물을 포함하는 베타 디펜신 생산용 재조합 발현 벡터에 관한 것이다. 상기 설명된 여러 뉴클레오티드 및 제어 서열들이 함께 결합되어 재조합 발현 벡터를 생산할 수 있으며, 이 벡터는 하나 이상의 편리한 제한 부위를 포함함으로써 그러한 부위에서 펩타이드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열의 삽입 또는 치환을 허용할 수 있다. 또는 달리, 본 발명의 뉴클레오티드 서열은, 뉴클레오티드 서열이나 이 서열을 포함하는 핵산 구성물을 발현에 적합한 벡터에 삽입함으로써 발현될 수 있다. 발현 벡터를 만드는데 있어서, 코딩 서열은 이 코딩 서열이 발현에 적합한 제어 서열과 작동가능하게 연결되도록 벡터에 위치된다.The invention also relates to recombinant expression vectors for the production of beta defensin comprising the nucleic acid constructs of the invention. The various nucleotides and control sequences described above may be joined together to produce a recombinant expression vector, which may include one or more convenient restriction sites to allow insertion or substitution of nucleotide sequences encoding peptides at those sites. Alternatively, the nucleotide sequence of the present invention can be expressed by inserting a nucleotide sequence or a nucleic acid construct comprising the sequence into a vector suitable for expression. In making an expression vector, a coding sequence is positioned in the vector such that the coding sequence is operably linked with a control sequence suitable for expression.

재조합 발현 벡터는 재조합 DNA 과정을 편리하게 행할 수 있으며, 뉴클레오티드 서열의 발현을 야기할 수 있는 어떤 벡터(예를 들어, 플라스미드 또는 바이러스)일 수 있다. 벡터의 선택은 전형적으로 벡터와 이 벡터가 도입될 숙주 세포의 양립성에 의존할 것이다. 벡터는 선형이거나 폐쇄된 환상 프라스미드일 수 있다.Recombinant expression vectors can conveniently carry out recombinant DNA processes and can be any vector (eg, plasmid or virus) that can result in expression of a nucleotide sequence. The choice of vector will typically depend on the compatibility of the vector and the host cell into which it will be introduced. The vector may be linear or closed cyclic prasmid.

벡터는 자율 복제 벡터, 즉 염색체외 존재로서 존재하는 벡터일 수 있으며, 이것의 복제는 염색체 복제에 독립적이고, 예를들어 플라스미드, 염색체외 요소, 소형염색체(minichromosome), 또는 인공 염색체이다.The vector may be an autonomous replication vector, ie, a vector that exists as an extrachromosomal being, the replication of which is independent of chromosomal replication, for example a plasmid, extrachromosomal element, minichromosome, or artificial chromosome.

벡터는 자가-복제를 보장하기 위한 어떤 수단을 함유할 수 있다. 또는, 벡터는 숙주 세포에 도입되었을 때, 게놈으로 통합되고 통합된 염색체(들)과 함께 복제되는 것일 수 있다. 더욱이, 단일 벡터나 플라스미드 또는 숙주 세포의 게놈에 도입될 총 DNA를 함께 함유하는 2개 이상의 벡터나 플라스미드, 또는 트랜스포존이 사용될 수 있다.The vector may contain any means for ensuring self-replication. Or, when introduced into a host cell, the vector may be one that is integrated into the genome and replicates with the integrated chromosome (s). Moreover, two or more vectors or plasmids or transposons together containing a single vector or plasmid or total DNA to be introduced into the genome of the host cell can be used.

본 발명의 벡터는 바람직하게 형질전환된 세포의 용이한 선택을 허락하는 하나 이상의 선택성 마커를 함유한다. 선택성 마커는 유전자이며, 이것의 산물은 살생물제 또는 바이러스 저항성, 중금속에 대한 저항성, 영양요구주에 대한 원영양성 등을 제공한다.Vectors of the invention preferably contain one or more selectable markers that allow for easy selection of transformed cells. Selective markers are genes, the products of which provide biocides or virus resistance, resistance to heavy metals, protrophicity to nutritional supporters, and the like.

박테리아 선택성 마커의 예들은 Bacillus subtilis 또는 Bacillus lichenif-ormis로부터의 dal 유전자, 또는 암피실린, 카나마이신, 클로르암페니콜 또는 테트라시클린 저항성과 같은 항생물질 저항성을 부여하는 마커이다. 효모 숙주 세포에 적합한 마커는 ADE2, HIS3, LEU2, LYS2, MET3, TRP1, 및 URA3이다. Examples of bacterial selectable markers are dal genes from Bacillus subtilis or Bacillus lichenif-ormis, or markers confer antibiotic resistance such as ampicillin, kanamycin, chloramphenicol or tetracycline resistance. Suitable markers for yeast host cells are ADE2, HIS3, LEU2, LYS2, MET3, TRP1, and URA3.

본 발명의 벡터는 바람직하게 숙주 세포의 게놈으로 벡터가 안정하게 통합되는 것이나 게놈과 독립적으로 세포에서 벡터가 자율 복제하는 것을 허가하는 요소(들)을 함유한다.The vectors of the invention preferably contain element (s) that allow for the stable integration of the vector into the genome of the host cell but permit the vector to autonomously replicate in the cell independently of the genome.

숙주 세포 게놈으로의 통합에 대해서, 벡터는 상동성 또는 비-상동성 재조합에 의한 벡터의 게놈으로의 안정한 통합을 위해 펩타이드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열이나 또는 벡터의 어떤 다른 요소에 의존할 수 있다. 또는 달리, 벡터는 상동성 재조합에 의한 숙주 세포 게놈으로의 통합을 지시하는 추가의 뉴클레오티드 서열을 함유할 수 있다. 추가의 뉴클레오티드 서열은 벡터가 염색체(들)내의 정확한 장소(들)에서 숙주 세포 게놈으로 통합되는 것을 가능하게 한다. 정확한 장소에서 통합될 가능성을 증가시키기 위해서, 통합 요소는 바람직하게, 상응하는 표적 서열과 고도로 상동성인 충분한 수의 뉴클레오티드, 예를 들어 100-1,500염기쌍, 바람직하게는 400-1,500염기쌍, 그리고 가장 바람직하게는 800-1,500염기 쌍을 함유해야 하며 이로써 상동성 재조합의 가능성이 증진된다. 통합 요소는 숙주 세포 게놈내의 표적 서열과 상동성인 어떤 서열일 수 있다. 더욱이, 통합 요소는 비-암호화 또는 암호화 뉴클레오티드 서열일 수 있다. 한편, 벡터는 비-상동성 재조합에 의해 숙주 세포의 게놈으로 통합될 수 있다.For integration into the host cell genome, the vector may depend on the nucleotide sequence encoding the peptide or any other element of the vector for stable integration of the vector into the genome by homologous or non-homologous recombination. Alternatively, the vector may contain additional nucleotide sequences that direct integration into the host cell genome by homologous recombination. Additional nucleotide sequences enable the vector to integrate into the host cell genome at the correct place (s) in the chromosome (s). In order to increase the likelihood of incorporation in the right place, the integrating element is preferably a sufficient number of nucleotides, for example 100-1,500 base pairs, preferably 400-1,500 base pairs, and most preferably highly homologous to the corresponding target sequence. Should contain 800-1,500 base pairs, thereby enhancing the possibility of homologous recombination. The integration element can be any sequence that is homologous with the target sequence in the host cell genome. Moreover, the integrating element can be a non-coding or coding nucleotide sequence. On the other hand, the vector can be integrated into the genome of the host cell by non-homologous recombination.

자율 복제에 대해서, 벡터는 문제의 숙주 세포에서 벡터가 자율적으로 복제할 수 있도록 하는 복제의 기원을 더 포함할 수 있다. 복제의 박테리아 기원의 예들은 대장균에서 복제를 허가하는 플라스미드 pBR322, pUC19, pACYC177, 및 pACYC- 184, Bacillus에서 복제를 허가하는 pUB110, pE194, pTA1060, 및 pAMf31의 복제 기원이다. 효모 숙주 세포에서 사용되는 복제 기원의 예들은 복제의 2 미크론 기원, ARS1, ARS4, ARS1와 CEN3의 조합, 및 ARS4와 CEN6의 조합이다. 복제의 기원은 숙주 세포에서 그 기능을 온도-감응성으로 만드는 돌연변이를 갖는 것일 수 있다(예를 들어, Ehrlich, 1978, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75:1433 참조).For autonomous replication, the vector may further comprise an origin of replication that allows the vector to autonomously replicate in the host cell in question. Examples of bacterial origin of replication are the origins of replication of plasmids pBR322, pUC19, pACYC177, and pACYC177, and pACYC-184, pUB110, pE194, pTA1060, and pAMf31 that allow replication in Bacillus. Examples of replication origin used in yeast host cells are the 2 micron origin of replication, ARS1, ARS4, a combination of ARS1 and CEN3, and a combination of ARS4 and CEN6. The origin of replication may be with a mutation that makes its function temperature-sensitive in the host cell (see, eg, Ehrlich, 1978, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75: 1433).

유전자 산물의 생산을 증가시키기 위해 본 발명의 뉴클레오티드 서열의 1개 이상의 카피가 숙주 세포에 삽입될 수 있다.One or more copies of the nucleotide sequences of the invention can be inserted into a host cell to increase the production of the gene product.

뉴클레오티드 서열의 카피 수의 증가는, 적어도 하나의 추가 서열 카피를 숙주 세포 게놈에 통합하거나, 또는 뉴클레오티드 서열을 갖는 증폭가능한 선택성 마커 유전자를 포함시킴으로써 얻어질 수 있으며, 이 경우 선택성 마커 유전자의 증폭된 카피를 함유하는 세포와, 이로 인한 추가 뉴클레오티드 서열 카피가 적합한 선택성 제제의 존재하에 이 세포를 배양함으로써 선택될 수 있다.An increase in the number of copies of a nucleotide sequence can be obtained by incorporating at least one additional sequence copy into the host cell genome or by including an amplifiable selectable marker gene having a nucleotide sequence, in which case an amplified copy of the selectable marker gene Cells containing and additional copies of nucleotide sequences thereby can be selected by culturing the cells in the presence of a suitable selective agent.

상기 설명된 요소들을 리게이션하여 본 발명의 재조합 발현 벡터를 구성하는데 사용되는 과정들은 본 분야에 잘 공지되어있다(예를 들어, Sambrook 등, 1989, 상동 참조).The procedures used to construct the recombinant expression vectors of the invention by ligation of the elements described above are well known in the art (see, eg, Sambrook et al., 1989, homology).

본 발명은 베타 디펜신의 재조합 생산에서 유리하게 사용되는 본 발명의 핵산 구성물을 포함하는 재조합 숙주 세포에 관한 것이다. 본 발명의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 벡터가 숙주 세포로 도입되며, 이로써 벡터는 이미 설명된 것처럼 염색체 통합체로서 또는 자가-복제하는 염색체외 벡터로서 유지되게 된다.The present invention relates to a recombinant host cell comprising the nucleic acid construct of the invention which is advantageously used in the recombinant production of beta defensin. A vector comprising the nucleotide sequence of the invention is introduced into a host cell, such that the vector is maintained as an chromosomal integration or self-replicating extrachromosomal vector as previously described.

숙주 세포는 단세포 미생물, 예를 들어 원핵생물이나, 비-단세포 미생물, 예를 들어 진핵생물일 수 있다.The host cell may be a single cell microorganism, for example a prokaryote, or a non- single cell microorganism, for example a eukaryote.

유용한 단세포 세포들은 박테리아 세포, 예를 들어 그램 양성 박테리아이며, 제한은 없지만, Bacillus 세포, 예를 들어 Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus clausii, Bacillus coagulans, Bacillus lautus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Baci-llus megaterium, Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis, 및 Bacillus thuringiensis; 또는 Streptomyces 세포, 예를 들어 Streptomyces lividans 또는 Streptomyces murinus, 또는 그램 음성 박테리아, 예를 들어 대장균 및 Pseudomonas 종을 포함한다. Useful single cell cells are bacterial cells, for example gram positive bacteria, without limitation, Bacillus cells, for example Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus clausii, Bacillus coagulans, Bacillus lautus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Baci-llus megaterium, Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis, and Bacillus thuringiensis; Or Streptomyces cells, for example Streptomyces lividans or Streptomyces murinus, or Gram-negative bacteria, for example E. coli and Pseudomonas species.

박테리아 숙주 세포로 벡터를 도입하는 것은, 예를 들어 적격세포(competent cell)(예를 들어, Young 및 Spizizin, 1961,Journal of Bacteriology 81:823-829, 또는 Dubnau 및 Davidoff-Abelson, 1971, Journal of Molecular Biology 56:209-221 참조), 전기천공(예를 들어, Shigekawa 및 Dower, 1988, Biotechniques 6:742-751 참조), 또는 콘쥬게이션(예를 들어, Koehler 및 Thorne, 1987, Journal of Bacteriology 169:5771-5278 참조)을 이용한 원형질체 형질전환에 의해 달성될 수 있다.Introduction of the vector into bacterial host cells can be accomplished by, for example, competent cells (e.g., Young and Spizizin, 1961, Journal of Bacteriology 81: 823-829, or Dubnau and Davidoff-Abelson, 1971, Journal of Molecular Biology 56: 209-221), electroporation (see, eg, Shigekawa and Dower, 1988, Biotechniques 6: 742-751), or conjugation (eg, Koehler and Thorne, 1987, Journal of Bacteriology 169 (5771-5278).

숙주 세포는 진핵생물, 예를 들어 포유동물, 곤충, 식물, 또는 진균 세포일 수 있다.The host cell can be a eukaryote, for example a mammalian, insect, plant, or fungal cell.

바람직한 구체예에서, 숙주 세포는 진균 세포이다. 본원에 사용된 "진균"은 자낭균문, 담자균문, 호상균문, 및 접합균문(Hawksworth 등, Ainsworth andBisby's Dictionary of The Fungi(8판, 1995, CAB International, University Press,영국 캠브리지)에서 정의된 것과 같다) 뿐만 아니라 난균류(Hawksworth 등(1995, 상동, 171페이지에서 인용) 및 모든 mitosporic 진균(Hawksworth 등, 상동)을 포함한다.In a preferred embodiment, the host cell is a fungal cell. As used herein, “fungus” is defined as that defined in the bacterium, basidiomycetes, staphylococcus, and junctures (Hawksworth et al., Ainsworth and Bisby's Dictionary of The Fungi (8th edition, 1995, CAB International, University Press, Cambridge, UK). As well as fungi (Hawksworth et al. (1995, homologous, cited on page 171)) and all mitosporic fungi (Hwksworth et al., Homologous).

더 바람직한 구체예에서, 진균 숙주 세포는 효모 세포이다. 본원에 사용된 "효모"는 자낭포자형성 효모(자낭균 효모), 담자포자형성 효모, 및 불완전 균류에 속하는 효모(Blastomycetes)를 포함한다. 효모의 분류가 앞으로 변화할 수 있으므로, 본 발명의 목적을 위해, 효모는 Biology and Activities of Yeast(Skinner, F. A., Passmore, S. M., 및 Davenport, R. R. 편저, Soc. App. Bacteriol. Symposium Series No. 9, 1980)에 설명된 대로 정의하기로 한다.In a more preferred embodiment, the fungal host cell is a yeast cell. As used herein, “yeast” includes vesicular spore forming yeast (capsulocytic yeast), vesicular spore forming yeast, and yeast (Blastomycetes) belonging to incomplete fungi. As the classification of yeast may change in the future, for the purposes of the present invention, yeast is known as Biology and Activities of Yeast (Skinner, FA, Passmore, SM, and Davenport, RR, Soc. App. Bacteriol. Symposium Series No. 9). , 1980).

더욱 바람직한 구체예에서, 효모 숙주 세포는 Candida, Hansenula, Kluyver-omyces, Pichia, Saccharomyces,Schizosaccharomyces, 또는 Yarrowia 세포이다.In a more preferred embodiment, the yeast host cell is a Candida, Hansenula, Kluyver-omyces, Pichia, Saccharomyces, Schizosaccharomyces, or Yarrowia cells.

가장 바람직한 구체예로, 효모 숙주 세포는 Saccharomyces cerevisiae 세포이다.In the most preferred embodiment, the yeast host cell is a Saccharomyces cerevisiae cell.

진균 세포는 원래 공지된 방식으로 원형질체 형성, 이 원형질체의 형질전환, 및 세포벽의 재생을 포함하는 과정에 의해 형질전환될 수 있다. Fungal cells can be transformed in a manner known in the art by processes involving protoplast formation, transformation of these protoplasts, and regeneration of the cell wall.

효모는 Becker 및 Guarente, Abelson, J. N. 및 Simon, M. I. 편집자, Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology, Methods in Enzymology, Volume 194, pp182-187, Academic Press, Inc., 뉴욕; Ito 등, 1983, Journal of Bacteriology 153:163; 및 Hinnen 등, 1978,Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75:1920에 설명된 과정들을 사용하여 형질전환될 수 있다.Yeast is Becker and Guarente, Abelson, J. N. and Simon, M. I. Editor, Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology, Methods in Enzymology, Volume 194, pp182-187, Academic Press, Inc., New York; Ito et al., 1983, Journal of Bacteriology 153: 163; And Hinnen et al., 1978, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 75: 1920.

또한, 본 발명은 (a) 본 발명의 항생 펩타이드를 생산할 수 있는 균주를 배양하는 단계; 및 (b) 상기 펩타이드를 회수하는 단계를 포함하는, 본 발명의 펩타이드를 생산하는 방법에 관한 것이다. In addition, the present invention comprises the steps of (a) culturing a strain capable of producing the antibiotic peptide of the present invention; And (b) relates to a method for producing a peptide of the present invention, comprising recovering the peptide.

또한, 본 발명은 (a) 본 발명의 펩타이드의 생산에 도움이 되는 조건하에서 숙주 세포를 배양하는 단계; 및 (b) 상기 펩타이드를 회수하는 단계를 포함하는, 본 발명의 항생 펩타이드를 생산하는 방법에 관한 것이다.In addition, the present invention comprises the steps of (a) culturing a host cell under conditions conducive to the production of a peptide of the invention; And (b) relates to a method for producing an antibiotic peptide of the present invention, comprising recovering the peptide.

본 발명의 생산 방법에서, 세포는 본 분야에 공지된 방법을 사용하여 펩타이드를 생산하는데 적합한 영양배지에서 배양된다. 예를 들어, 세포는 적합한 배지와 펩타이드가 발효 및/또는 분리되는 것을 허용하는 조건하에서 수행되는, 실험실 또는 산업용 발효기에서 쉐이크 플라스크 배양, 소규모 혹은 대규모 발효(연속, 뱃치, 유가(fed-batch) 또는 고체상태 발효)에 의해 배양될 수 있다. 배양은 탄소 및 질소 공급원과 무기염을 포함하는 적합한 영양배지에서 본 분야에 공지된 과정을 사용하여 일어난다. 적합한 배지는 상업적 공급자로부터 입수하거나 공개된 조성(예를 들어, American Type Culture Collection의 카달록에)에 따라 제조될 수 있다. 만일 펩타이드가 영양배지로 분비된다면, 이 펩타이드는 배지로부터 직접 회수될 수 있다. 만일 펩타이드가 분비되지 않는다면, 그것은 세포 용해액으로부터 회수될 수 있다.In the production method of the present invention, the cells are cultured in a nutrient medium suitable for producing peptides using methods known in the art. For example, cells may be shake flask culture, small or large scale fermentation (continuous, batch, fed-batch) or in laboratory or industrial fermentors, performed under conditions that allow the fermentation and / or separation of suitable media and peptides. Solid state fermentation). Cultivation takes place using procedures known in the art in suitable nutrient media including carbon and nitrogen sources and inorganic salts. Suitable media can be obtained from commercial suppliers or prepared according to published compositions (eg, catalogues of the American Type Culture Collection). If the peptide is secreted into nutrient medium, the peptide can be recovered directly from the medium. If the peptide is not secreted, it can be recovered from the cell lysate.

본 발명의 펩타이드는 본 분야에 공지된 방법에 의해 회수될 수 있다. 예를 들어, 펩타이드는 제한은 없지만, 원심분리,여과, 추출, 분무건조, 증발, 또는 침전을 포함하는 종래의 과정들에 의해 영양배지로부터 회수될 수 있다.Peptides of the invention can be recovered by methods known in the art. For example, the peptide can be recovered from the nutrient medium by conventional procedures including, but not limited to, centrifugation, filtration, extraction, spray drying, evaporation, or precipitation.

본 발명의 펩타이드는 제한은 없지만, 크로마토그래피(예를 들어, 이온교환, 친화성, 소수성, 크로마토포커싱, 및 크기배제), 전기영동 과정(예를 들어, 예비 등전 포커싱), 차별 용해도(예를 들어, 황산암모늄 침전), SDS-PAGE, 또는 추출을 포함하는 본 분야에 공지된 여러 가지의 과정들에 의해 정제될 수 있다(예를 들어, Protein Purification, J. C. Janson 및 Lars Ryden, 편집자, VCH Publishers, 뉴욕, 1989 참조).Peptides of the invention include, but are not limited to, chromatography (eg, ion exchange, affinity, hydrophobicity, chromatofocusing, and size exclusion), electrophoresis processes (eg, pre-isoelectric focusing), differential solubility (eg, For example, it can be purified by various procedures known in the art, including ammonium sulfate precipitation, SDS-PAGE, or extraction (eg, Protein Purification, JC Janson and Lars Ryden, Editor, VCH Publishers). , New York, 1989).

또한 본 발명은 본 발명의 항균 펩타이드를 포함하는 제약 조성물과 같은 조성물에 관한 것이다.The invention also relates to compositions such as pharmaceutical compositions comprising the antimicrobial peptides of the invention.

본 발명의 조성물은 본 발명의 펩타이드를 포함한다. The composition of the present invention comprises a peptide of the present invention.

본 조성물은 다른 제약학적 활성 제제, 예를 들어 추가의 살균제, 예를 들어 상기 정의된 항균 활성을 나타내는 다른 항균 폴리펩타이드를 더 포함할 수 있다.The composition may further comprise other pharmaceutically active agents, for example additional fungicides, for example other antimicrobial polypeptides exhibiting the antimicrobial activity as defined above.

살균제는 본 분야에 공지된 항생물질일 수 있다. 항생물질의 부류는 페니실린, 예를 들어 페니실린 G, 페니실린 V, 메티실린, 옥사실린, 카르베니실린, 나프실린, 암피실린 등; 베타-락타마제 억제제인 세팔로스포린, 예를 들어 세파크롤, 세파졸린, 세푸록심, 목살락탐 등과 조합된 페니실린; 카르바페넴; 모노박탐; 아미노글리코시드;테트라시클린; 마크롤리드; 린코마이신; 폴리믹신; 술포아미드; 퀴놀론; 클로르암페니콜; 메트로니다졸; 스펙티노마이신;트리메토프림; 반코마이신; 등을 포함한다. 살균제는 또 항-진균제일 수 있으며, 폴리렌, 예를 들어 암포테리신 B, 니스타틴; 5-플루코신; 및 아졸레스, 예를 들어 미코나졸, 케토코나졸, 이트라코나졸 및 플루코나졸을 포함한다.Fungicides can be antibiotics known in the art. Classes of antibiotics include penicillins such as penicillin G, penicillin V, methicillin, oxacillin, carbenicillin, naphcillin, ampicillin and the like; Cephalosporins that are beta-lactamase inhibitors, for example penicillin in combination with cepacrol, cefazoline, cepuroxime, oxalactam and the like; Carbapenem; Monobactam; Aminoglycosides; tetracycline; Macrolides; Lincomycin; Polymyxin; Sulfoamides; Quinolone; Chloramphenicol; Metronidazole; Spectinomycin; trimethoprim; Vancomycin; And the like. Fungicides may also be anti-fungal agents and include polyenes such as amphotericin B, nistatin; 5-flucosine; And azoles such as myconazole, ketoconazole, itraconazole and fluconazole.

한 구체예에서, 살균제는 비-효소적 화학 제제이다. 다른 구체예에서, 살균제는 비-폴리펩타이드 화학 제제이다.In one embodiment, the fungicide is a non-enzymatic chemical agent. In another embodiment, the fungicide is a non-polypeptide chemical agent.

본 발명의 조성물의 본 발명 항균 펩타이드와 살균제는 상승작용적 항균 효과가 얻어지도록 선택될 수 있다. 조성물의 항균 펩타이드와 살균제는, 50%w/w(바람직하게 25%w/w, 더 바람직하게 10%w/w, 가장 바람직하게 5%w/w)의 살균제와 0.5ppm(바람직하게 0.1ppm)의 항균 펩타이드를 함유하는 수용액에서 살균제 및 항균 펩타이드를 단독으로 사용하여 별도로 인큐베이션한 결과들을 더하여 얻어진 것에 비하여, 즉 단순한 부가적 효과에 비하여, 적어도 5%(바람직하게 적어도 10%) 이상 항균 활성이 나타나도록 선택될 수 있다.Inventive antimicrobial peptides and fungicides of the compositions of the invention may be selected so that a synergistic antimicrobial effect is obtained. The antimicrobial peptides and fungicides of the composition are 50% w / w (preferably 25% w / w, more preferably 10% w / w, most preferably 5% w / w) and 0.5 ppm (preferably 0.1 ppm) Antimicrobial activity of at least 5% (preferably at least 10%) is higher than that obtained by adding the results of incubation separately using a fungicide and an antimicrobial peptide alone in an aqueous solution containing Can be selected to appear.

본 발명의 조성물은 적합한 담체 물질을 포함할 수 있다. 조성물은 의약으로 사용된 때, 본 발명의 항균 펩타이드를 원하는 장소로 송달할 수 있는 적합한 송달 부형제를 포함할 수 있다.The composition of the present invention may comprise a suitable carrier material. The composition may comprise a suitable delivery excipient which, when used in medicine, can deliver the antimicrobial peptides of the invention to a desired location.

조성물은 본 분야에 공지된 방법에 따라서 제조될 수 있으며, 액상 또는 건성 조성물의 형태일 수 있다. 예를 들어, 펩티드 조성물은 과립 또는 미세과립의 형태일 수 있다. 조성물에 포함되는 펩타이드는 본 분야에 공지된 방법에 따라서 안정화될 수 있다.The composition may be prepared according to methods known in the art and may be in the form of a liquid or dry composition. For example, the peptide composition may be in the form of granules or microgranules. Peptides included in the composition can be stabilized according to methods known in the art.

본 발명의 펩타이드 조성물의 바람직한 사용의 예들이 하기 주어진다. 본 발명의 펩타이드 조성물의 용량 및 조성물이 사용되는 다른 조건들은 본 분야에 공지된 방법을 기초로 하여 결정될 수 있다.Examples of preferred uses of the peptide composition of the present invention are given below. The dose of the peptide composition of the present invention and other conditions under which the composition is used may be determined based on methods known in the art.

또한, 본 발명은 항균 펩타이드의 다양한 사용을 포함한다. 항균 펩타이드는 전형적으로 박테리아, 진균, 효모 또는 조류에 의해 오염된 어떤 장소에 유용하다. 전형적으로, 장소들은 냉각수 시스템 등의 수성 시스템, 세탁장 헹굼물, 커팅오일등의 오일 시스템, 윤활제, 유전 등이며, 미생물을 죽이거나 그들의 성장을 억제할 필요가 있는 장소이다. The present invention also encompasses the various uses of antimicrobial peptides. Antimicrobial peptides are typically useful at any place contaminated by bacteria, fungi, yeast or algae. Typically, places are aqueous systems such as cooling water systems, laundry rinsing water, oil systems such as cutting oils, lubricants, oil fields and the like, and are places that need to kill microorganisms or inhibit their growth.

다른 용도는 음식, 음료수, 화장품, 예를 들어 로숀, 크림, 젤, 연고, 비누, 샴푸, 컨디셔너, 제한제, 방취제, 양치질약, 콘텍트렌즈 제품, 효소 조제물, 또는 음식 원료의 보존을 포함한다.Other uses include preservation of food, beverages, cosmetics such as lotions, creams, gels, ointments, soaps, shampoos, conditioners, limiting agents, deodorants, gargles, contact lens products, enzyme preparations, or food ingredients. .

따라서, 본 발명의 항균 폴리펩타이드는 소독제로서, 예를 들어 여드름, 눈이나 입의 감염, 피부 감염의 치료에서; 제한제 또는 방취제에서; 족욕용 염들에서; 콘텍트렌즈, 단단한 표면, 치아(구강관리), 상처, 멍 등의 세척과 소독에서 유용하다.Thus, the antimicrobial polypeptides of the present invention are antiseptics, for example in the treatment of acne, eye or mouth infections, skin infections; In limiting or deodorizing agents; In salts for foot baths; It is useful for cleaning and disinfecting contact lenses, hard surfaces, teeth (oral care), wounds and bruises.

또한, 본 발명은 본 발명의 항균 펩타이드 또는 조성물의 의약으로서의 사용에 관한 것이다. 더 나아가, 본 발명의 항균 펩타이드 또는 조성물은 또한 진균 유기체 또는 박테리아, 바람직하게는 그램 양성 또는 음성 박테리아 같은 미생물을 제어하거나 살균하기 위한 의약의 제조에 사용될 수 있다.The present invention also relates to the use of the antimicrobial peptide or composition of the present invention as a medicament. Furthermore, the antimicrobial peptides or compositions of the present invention can also be used in the manufacture of a medicament for controlling or killing fungal organisms or microorganisms, such as gram positive or negative bacteria.

본 발명의 조성물 및 항균 펩타이드는 수의사나 사람의 치료적 또는 예방적 항균제로서 사용될 수 있다. 따라서, 본 발명의 조성물 및 항균 펩타이드는, 박테리아 또는 진균 감염, 바람직하게는 그램 양성 또는 음성 박테리아 감염과 같은 미생물 감염의 치료를 위한 수의사나 사람의 치료제 또는 예방제의 제조에서 사용될 수 있다. 특히, 미생물 감염은, 제한은 없지만, 식중독 등에 관련될 수 있다.Compositions and antimicrobial peptides of the invention can be used as therapeutic or prophylactic antimicrobial agents of veterinarians or humans. Thus, the compositions and antimicrobial peptides of the present invention can be used in the manufacture of a veterinary or human therapeutic or prophylactic for the treatment of microbial infections, such as bacterial or fungal infections, preferably gram positive or negative bacterial infections. In particular, microbial infections may be associated with, but not limited to, food poisoning and the like.

본 발명의 조성물은 본 발명의 항균 펩타이드의 효과적인 양을 포함한다.The composition of the present invention comprises an effective amount of the antimicrobial peptide of the present invention.

본원에서 사용되었을 때, 용어 "효과적인 양"은 본 발명의 항균 펩타이드 또는 그것의 단편이나 변이체의 양이 문제의 미생물의 성장을 억제하는데 충분하다는 의미이다.As used herein, the term "effective amount" means that the amount of the antimicrobial peptide of the present invention or fragment or variant thereof is sufficient to inhibit the growth of the microorganism in question.

본 발명의 항균 펩타이드는 본 분야에 공지된 종래의 방법을 사용하여 시험관내 합성에 의해 제조될 수 있다. 다양한 상업적 합성 장치들을 이용할 수 있으며, 예를 들어 Applied Biosystems Inc., Beckman 등에 의한 자동합성기가 있다. 합성기를 사용하여, 자연발생 아미노산이 비자연적 아미노산, 특히 D-이성질체(또는 D-형), 예를 들어 D-알라닌 및 D-이소로이신,부분입체이성질체, 상이한 길이 및 작용기들을 갖는 측쇄 등으로 치환될 수 있다. 특정 서열과 그 제조 방식은 편리성, 경제성, 필요한 순도 등에 의해 결정될 것이다.Antimicrobial peptides of the invention can be prepared by in vitro synthesis using conventional methods known in the art. Various commercial synthesis apparatuses are available, for example an autosynthesizer by Applied Biosystems Inc., Beckman et al. Using synthetic groups, naturally occurring amino acids are substituted with unnatural amino acids, in particular D-isomers (or D-forms) such as D-alanine and D-isoleucine, diastereomers, side chains with different lengths and functional groups, and the like. Can be. The particular sequence and its mode of manufacture will be determined by convenience, economy, purity required, and the like.

아미드 또는 치환 아미드 형성에 아미드기, 예를 들어 환원 아미드화, 티오에테르 또는 이황화물 형성에 티올기, 아미드 형성에 카르복실기와 같이, 결합하는데 편리한 작용기들을 포함하는 다양한 펩타이드 또는 단백질에 화학적 연결이 제공될 수 있다.Chemical linkages may be provided to various peptides or proteins, including functional groups that are convenient for binding, such as amide groups for the formation of amides or substituted amides, such as thiol groups for reducing amidation, thioethers or disulfide formation, and carboxyl groups for amide formation. Can be.

원한다면 다른 분자나 표면과의 연결을 허용하는 다양한 기들이 합성이나 발현 동안 펩타이드에 도입될 수 있다. 따라서, 시스테인은 티오에테르를 만드는데 사용될 수 있으며, 히스티딘은 금속이온 착물과 연결되는데, 카르복실기는 아미드나 에스테르를 형성하는데, 아미노기는 아미드를 형성하는데 사용될 수 있다.If desired, various groups can be introduced into the peptide during synthesis or expression that allow for linkage with other molecules or surfaces. Thus, cysteine can be used to make thioethers and histidines are linked to metal ion complexes, where carboxyl groups form amides or esters, and amino groups can be used to form amides.

또한, 펩타이드는 재조합 합성에 대한 종래 방법에 따라서 분리 및 정제될 수 있다. 용해물이 발현 숙주로부터 제조될 수 있으며, 용해물은 HPLC, 배제 크로마토그래피, 겔 전기영동, 친화성 크로마토그래피, 또는 다른 정제 기술을 사용하여 정제된다. 대체로, 사용되는 조성물은 산물의 제조 방법 및 그것의 정제에 관련된 오염물질에 관하여, 원하는 산물을 적어도 20중량%, 더 통상적으로 적어도 약 75중량%, 바람직하게 적어도 약 95중량% 포함할 것이며, 치료적 목적을 위해서는, 통상 적어도 약 99.5중량% 포함할 것이다. 통상, 백분율은 총 단백질을 기준으로 할 것이다.In addition, peptides can be isolated and purified according to conventional methods for recombinant synthesis. Lysates can be prepared from expression hosts, and the lysates are purified using HPLC, exclusion chromatography, gel electrophoresis, affinity chromatography, or other purification techniques. In general, the composition used will comprise at least 20%, more typically at least about 75%, preferably at least about 95%, by weight, of the desired product, relative to the method of making the product and the contaminants associated with its purification, For professional purposes it will usually comprise at least about 99.5% by weight. Typically, percentages will be based on total protein.

또한, 본 발명은 항균 활성을 갖는 펩타이드를 동물 사료에 사용하는 방법에 관한 것이며, 본 발명의 항균 펩타이드를 포함하는 사료 조성물 및 사료 첨가제에 관한 것이다.The present invention also relates to a method of using a peptide having an antimicrobial activity in an animal feed, and to a feed composition and a feed additive comprising the antimicrobial peptide of the present invention.

용어 "동물"은 사람을 포함한 모든 동물을 포함한다. 동물의 예들은 비-반추동물과 반추동물, 예를 들어 돼지, 소, 양 및 말이다.The term "animal" includes all animals, including humans. Examples of animals are non-ruminants and ruminants such as pigs, cattle, sheep and horses.

특정한 구체예에서, 동물은 비-반추동물이다. 비-반추동물은 단일 위 동물, 예를 들어 돼지(제한은 없지만, 새끼돼지, 성장중인 돼지, 및 암퇘지를 포함함); 가금, 예를 들어 칠면조 및 닭(제한은 없지만, 불고기용 영계, 알 낳는 닭을 포함함); 어린 송아지; 및 어류(제한은 없지만, 연어를 포함함)를 포함한다.In certain embodiments, the animal is a non-ruminant animal. Non-ruminant animals include, but are not limited to, single gastric animals such as pigs (including but not limited to piglets, growing pigs, and sows); Poultry such as turkeys and chickens (including but not limited to broiler chickens, egg laying chickens); Young calf; And fish (including but not limited to salmon).

용어 "사료 또는 사료 조성물"은 동물에 의한 섭취에 적합한 또는 동물에 의한 섭취를 의도한 어떤 화합물, 제조물, 혼합물,또는 조성물을 의미한다.The term "feed or feed composition" means any compound, preparation, mixture, or composition suitable for or intended for ingestion by an animal.

본 발명에 따르는 사용에서, 항균 펩타이드는 식이요법 전, 후, 또는 동시에 동물에 공급될 수 있다.In use according to the invention, the antimicrobial peptides can be supplied to the animals before, after, or simultaneously with the diet.

특정한 구체예에서, 사료에 첨가되는 형태의 또는 사료 첨가제에 포함되었을 때의 항균 펩타이드가 잘 규정되어 있다. In certain embodiments, the antimicrobial peptides in the form added to the feed or when included in the feed additive are well defined.

"잘 규정된"의 의미는 항균 펩타이드 제조물이 크기배제 크로마토그래피에 의해 결정된 것으로서 적어도 50% 순수하다는 것이다(WO 01/58275의 실시예 12 참조). 다른 특정한 구체예에서, 항균 폴리펩타이드 제조물은 이런 방법에 의해 결정된 것으로서 적어도 60, 70, 80, 85, 88, 90, 92, 94, 또는 적어도 95% 순수하다."Well defined" means that the antimicrobial peptide preparation is at least 50% pure as determined by size exclusion chromatography (see Example 12 of WO 01/58275). In another specific embodiment, the antimicrobial polypeptide preparation is at least 60, 70, 80, 85, 88, 90, 92, 94, or at least 95% pure as determined by this method.

그러나, 동물 사료에서의 사용을 위해서는 항균 펩타이드가 순수할 필요가 없고, 예를 들어 다른 효소를 포함할 수 있으며, 이 경우에는 항균 펩타이드 조제물로 명명될 수 있다.However, for use in animal feed, the antimicrobial peptide does not need to be pure, for example it may comprise other enzymes, in which case it may be termed an antimicrobial peptide preparation.

본 발명의 항균 펩타이드 제조물은 (a) 사료에 직접 첨가될 수 있거나(또는 식물성 단백질의 처리 과정에서 직접 사용된다), 또는 (b) 그것은 사료 첨가제나 프리믹스와 같은, 사료에 후속하여 첨가되는 하나 이상의 중간 조성물의 생산에서 사용될 수 있다(또는 처리 과정에서 사용된다). 상기 설명된 순도는 상기 (a)나 (b)의 어느 것에 따라서 사용되든지 간에 원래 항균 펩타이드 제조물의 순도로 간주한다.The antimicrobial peptide preparation of the present invention may be (a) added directly to the feed (or used directly in the processing of the vegetable protein), or (b) it is one or more added following the feed, such as feed additives or premixes. It may be used in the production of intermediate compositions (or used in the course of processing). The purity described above is considered to be the purity of the original antimicrobial peptide preparation, whether used according to any of (a) or (b) above.

그러한 항균 펩타이드 제조물은 물론 다른 효소와 혼합될 수 있다.Such antimicrobial peptide preparations can of course be mixed with other enzymes.

항균 펩타이드는 어떤 형태로도 사료에 첨가될 수 있으며, 비교적 순수한 항균 펩타이드로서, 또는 동물 사료에 첨가되는 다른 성분들과의 혼합물로 즉 동물 사료 첨가제의 형태로, 예를 들어 소위 프리믹스라고 하는 형태로 첨가된다.The antimicrobial peptides can be added to the feed in any form, either as relatively pure antibacterial peptides or in admixture with other ingredients added to the animal feed, ie in the form of animal feed additives, for example in the form of so-called premixes. Is added.

더 이상의 양태로서, 본 발명은 동물 사료에 사용되는 조성물, 예를 들어 동물 사료, 및 동물 사료 첨가제, 예를 들어 프리믹스에 관한 것이다.In a further aspect, the present invention relates to compositions for use in animal feed, such as animal feed, and animal feed additives such as premixes.

본 발명의 항균 펩타이드와는 별도로 본 발명의 동물 사료 첨가제는 적어도 하나의 지용성 비타민, 및/또는 적어도 하나의 수용성 비타민, 및/또는 적어도 하나의 미량 미네랄, 및/또는 적어도 하나의 다량 미네랄을 함유한다.Apart from the antimicrobial peptides of the invention, the animal feed additives of the invention contain at least one fat soluble vitamin, and / or at least one water soluble vitamin, and / or at least one trace mineral, and / or at least one macro mineral. .

더 나아가, 선택적 사료 첨가제 성분은 착색제, 방향 화합물, 안정제, 및/또는 피타제 EC 3.1.3.8 또는 3.1.3.26; 크실라나제 EC 3.2.1.8; 갈락타나제 EC 3.2.1.89; 및/또는 베타-글루카나제 EC 3.2.1.4 중에서 선택된 적어도 하나의 다른 효소이다.Furthermore, optional feed additive ingredients include colorants, fragrance compounds, stabilizers, and / or phytase EC 3.1.3.8 or 3.1.3.26; Xylanase EC 3.2.1.8; Galactanase EC 3.2.1.89; And / or at least one other enzyme selected from beta-glucanase EC 3.2.1.4.

통상적으로, 지용성 및 수용성 비타민, 그리고 미량 미네랄이 사료에 첨가되는 소위 프리믹스라의 일부를 형성하지만, 반면에 다량 미네랄은 통상 사료에 따로 첨가된다. Typically, fat-soluble and water-soluble vitamins, and trace minerals form part of the so-called premix, which is added to the feed, while large minerals are usually added separately to the feed.

특정한 구체예에서, 본 발명의 동물 사료 첨가제는 0.01 내지 10.0%; 더 바람직하게 0.05 내지 5.0%; 또는 0.2 내지 1.0%(%는 사료 100g 당의 첨가제 g을 의미한다)의 수준으로 동물 규정식이나 사료에 포함되도록 의도된다(또는 첨가되도록 처방된다). 이것은 특히 프리믹스에 대해 그렇다.In certain embodiments, the animal feed additive of the present invention is 0.01 to 10.0%; More preferably 0.05 to 5.0%; Or 0.2-1.0% (% means additive g per 100 g of feed), which is intended to be included (or prescribed for addition) in an animal diet or feed. This is especially true for premixes.

다음에 이들 성분의 예들을 제한되지 아니하게 열거한다.Examples of these components are listed below without limitation.

지용성 비타민의 예들은 비타민 A, 비타민 D3, 비타민 E, 및 비타민 K, 예를 들어 비타민 K3이다.수용성 비타민의 예들은 비타민 B12, 비오틴과 콜린, 비타민 B1, 비타민 B2, 비타민 B6, 니아신, 폴산 및 판토테네이트,예를 들어 Ca-D-판토테네이트이다.미량 미네랄의 예들은 망간, 아연, 철, 구리, 요오드, 셀레늄, 및 코발트이다.다량 미네랄의 예들은 칼슘, 인 및 나트륨이다.Examples of fat soluble vitamins are vitamin A, vitamin D3, vitamin E, and vitamin K, such as vitamin K3. Examples of water soluble vitamins are vitamin B12, biotin and choline, vitamin B1, vitamin B2, vitamin B6, niacin, folic acid and Pantothenates, for example Ca-D-pantothenate. Examples of trace minerals are manganese, zinc, iron, copper, iodine, selenium, and cobalt. Examples of large minerals are calcium, phosphorus and sodium.

이들 성분의 영양요구성(가금 및 새끼돼지/돼지로 예시된다)이 WO 01/58275의 표 A에 기재된다. 영양요구성은 이들 성분이 나타낸 농도로 규정식에 제공되어야 한다는 의미이다.Nutritional components of these components (exemplified by poultry and piglets / pigs) are described in Table A of WO 01/58275. Nutritional composition means that these ingredients must be provided in the diet at the concentrations indicated.

대안으로, 본 발명이 동물 사료 첨가제는 WO 01/58275의 표 A에 명시된 개별 성분들 중 적어도 하나를 포함한다. 더 구체적으로, 이 적어도 하나의 개별 성분은, 표 A의 4째 열, 또는 5째 열, 또는 6째 열에 나타낸 범위내의 사료 중 농도를 제공할 수 있는 양으로 본 발명의 첨가제에 포함된다.Alternatively, the animal feed additive of the present invention comprises at least one of the individual components specified in Table A of WO 01/58275. More specifically, this at least one individual component is included in the additive of the present invention in an amount capable of providing a concentration in the feed within the range shown in column 4, 5, or 6 of Table A.

또, 본 발명은 동물 사료 조성물에 관한 것이다. 동물 사료 조성물 또는 규정식은 비교적 높은 함량의 단백질을 가진다. 가금 및 돼지 규정식은 WO 01/58275의 표 B의 2-3째 열에 나타낸 것을 특징으로 한다. 어류의 규정식은 이 표 B의 4째 열에 나타낸 것을 특징으로 한다. 더욱이, 그러한 어류의 규정식은 통상 200-310g/kg의 조지방 함량을 가진다.The present invention also relates to an animal feed composition. Animal feed compositions or diets have a relatively high content of protein. The poultry and pig diets are characterized by the columns 2-3 of Table B of WO 01/58275. The diet of fish is characterized by the fourth column in Table B. Moreover, diets of such fishes usually have a crude fat content of 200-310 g / kg.

본 발명에 따르는 동물 사료 조성물은 50-800g/kg의 조단백질 함량을 가지며, 더욱이 본원에서 청구된 적어도 하나의 항균 펩타이드를 포함한다.Animal feed compositions according to the invention have a crude protein content of 50-800 g / kg and further comprise at least one antimicrobial peptide claimed herein.

특정한 구체예에서, 본 발명의 동물 사료 조성물은 적어도 하나의 식물성 단백질 또는 그 공급원을 함유한다.In certain embodiments, the animal feed composition of the present invention contains at least one vegetable protein or source thereof.

다른 특정한 구체예에서, 본 발명의 동물 사료 조성물은 0-80% 옥수수; 및/또는 0-80% 사탕수수; 및/또는 0-70% 밀; 및/또는 0-70% 보리; 및/또는 0-30% 귀리; 및/또는 0-40% 대두 가루; 및/또는 0-10% 생선 가루; 및/또는 0-20% 유장을 함유한다. 동물 규정식은, 예를 들어 매시 사료(비펠릿형) 또는 펠릿형 사료로서 제조될 수 있다. 전형적으로, 제분된 사료-원료들이 혼합되고, 충분한 양의 필수 비타민과 미네랄이 해당 종들에 대한 명세사항에 따라서 첨가된다. 효소가 고상 또는 액상 효소 조제물로서 첨가될 수 있다. 예를 들어, 고상 효소 조제물은 전형적으로 혼합 단계 전이나 혼합 단계 동안 첨가되고, 액상 효소 제조물은 전형적으로 펠릿형성 단계 후에 첨가된다. 효소는 또한 사료 첨가제 또는 프리믹스에 혼합될 수 있다.In another specific embodiment, the animal feed composition of the present invention comprises 0-80% corn; And / or 0-80% sugarcane; And / or 0-70% wheat; And / or 0-70% barley; And / or 0-30% oats; And / or 0-40% soy flour; And / or 0-10% fish flour; And / or 0-20% whey. Animal diets can be prepared, for example, as mash feed (non-pellet) or pellet feed. Typically, milled feed-raw materials are mixed and sufficient amounts of essential vitamins and minerals are added according to the specifications for the species. The enzyme may be added as a solid or liquid enzyme preparation. For example, the solid enzyme preparation is typically added before or during the mixing step, and the liquid enzyme preparation is typically added after the pelleting step. The enzyme may also be mixed in feed additives or premixes.

규정식에서 최종 효소 농도는 규정식 kg 당 효소 단백질 0.01-200mg의 범위내이며, 예를 들어 동물 규정식 kg 당 효소 단백질 5-30mg의 범위이다.The final enzyme concentration in the diet is in the range of 0.01-200 mg of enzyme protein per kg of diet, for example in the range of 5-30 mg of enzyme protein per kg of animal diet.

본 발명의 항균 펩타이드는 다음 양들(용량 범위들) 중 하나 이상으로 투여될 수 있다: 0.01-200; 또는 0.01-100; 또는 0.05-100;또는 0.05-50; 또는 0.10-10. 이들 범위는 모두 사료 kg 당 항균 펩타이드 단백질 mg이다(ppm).Antimicrobial peptides of the invention may be administered in one or more of the following amounts (dose ranges): 0.01-200; Or 0.01-100; Alternatively 0.05-100; or 0.05-50; Or 0.10-10. All of these ranges are in mg of antimicrobial peptide protein per kilogram of feed.

사료 kg 당 항균 펩타이드 단백질 mg을 결정하기 위해서, 항균 폴리펩타이드가 사료 조성물로부터 정제되고, 정제된 항균 펩타이드의 특이적 활성이 관련 분석법을 사용하여 결정된다(항균 활성, 기질, 및 분석법의 항목 참조).To determine the mg of antimicrobial peptide protein per kg of feed, the antimicrobial polypeptide is purified from the feed composition and the specific activity of the purified antimicrobial peptide is determined using the relevant assay (see the section on Antimicrobial Activity, Substrate, and Assay). .

사료 조성물의 항균 활성이 또한 동일한 분석법을 사용하여 결정되며, 이들 두 가지 측정을 기초로, 사료 kg 당 항균 펩타이드 단백질 mg으로 용량이 계산된다.The antimicrobial activity of the feed composition is also determined using the same assay, and based on these two measurements, the dose is calculated in mg antimicrobial peptide protein per kg feed.

동일한 원리가 사료 첨가제에서 항균 펩타이드 단백질 mg을 결정하는데 적용된다. 물론 만일 샘플이 사료 첨가제나 사료를 제조하는데 사용된 항균 펩타이드를 이용할 수 있다면, 특이적 활성은 이 샘플로부터 결정된다(사료 조성물이나 첨가제로부터 항균 펩타이드를 정제할 필요가 없다).The same principle applies to determining the antimicrobial peptide protein mg in feed additives. Of course, if the sample can utilize feed additives or the antimicrobial peptides used to make the feed, the specific activity is determined from this sample (no need to purify the antimicrobial peptides from the feed composition or additives).

본 발명을 통하여 알 수 있는 바와 같이 본 발명의 제조방법을 통하여 베타 디펜신을 대량으로 생산할 수 있었으며, 대량 생산된 디펜신을 통한 항균활성을 확인하여 이를 통하여 제약 및 사료 산업 등에 이용할 수 있는 효과가 있다.As can be seen through the present invention it was possible to produce a large amount of beta defensin through the production method of the present invention, there is an effect that can be used in the pharmaceutical and feed industry through this by confirming the antibacterial activity through the mass produced defensin.

도 1은 beta defensin 2에 대하여 NCBI 유전자은행 데이테베이스 검색을 통하여 cDNA 서열 확인 및 mature peptide의 아미노산 서열을 확인한 그림.
도 2는 돼지 beta defensin mature peptide 염기서열 증폭 및 construct 구축용 벡터.
도 3은 도 2의 돼지 항균펩타이드인 디펜신을 포함하는 벡터를 293T cell에 transfection 하여 배양 후, cell을 수거하여 lysate를 만들어서 Salmonella Enteritidis 균을 접종한 후 4℃ 와 37℃에서 배양하여 24시간 후에 균수를 측정한 그림.
도 4는 도 2의 돼지 항균펩타이드인 디펜신을 포함하는 벡터를 293T cell에 transfection 하여 배양 후, cell을 수거하여 lysate를 만들어서 E.coli 0157:H7 (1000CFU)균을 접종한 후 4℃ 와 37℃에서 배양하여 24시간 후에 균수를 측정한 그림.
도 5는 각각의 mature peptide 절편을 추출하기 위해 제작된 construct를 template로 이용하여 PCR 증폭산물을 확보하고, 도입 과정을 나타내는 개략도.
도 6은 각각의 mature peptide 절편을 추출하기 위해 제작된 construct 발현벡터.
도 7은 박테리아에서 PBD1, 2, 3 항생물질 자극 반응을 보기 위해 디스크 확산법을 수행한 사진.사진에서 좌측의 L1은 pGAL10-PBD1 / L3262를, L2는 pGAL10-PBD2 / L3262, L3는 pGAL10-PBD3 / L3262 을 나타내며, 우측의 L1은 pGAL10-PBD1 / Y2805ㅿgal1, L2는 pGAL10-PBD2 / Y2805ㅿgal1, L3는 pGAL10-PBD3 / Y2805ㅿgal1를 나타내며, y: Yeast / D.W. (-) control 그리고 Am: Ampicillin (+) control을 나타낸다.
1 is a diagram showing the cDNA sequence confirmation and the amino acid sequence of the mature peptide through the NCBI gene bank database search for beta defensin 2.
Figure 2 is a beta defensin mature peptide nucleotide sequence amplification and construct vector.
Figure 3 is a bacterial count after the culture by transfection of vectors containing put in dependency pig antimicrobial peptide of 2 to 293T cell, and then creating a lysate collected by cell inoculation with Salmonella Enteritidis bacteria were cultured at 4 ℃ and 37 ℃ after 24 hours Figure measured.
4 is transfected with a vector containing the pig antimicrobial peptide defensin of FIG. Figure 24 shows the bacterial counts after incubation at.
Figure 5 is a schematic diagram showing the introduction process, to secure the PCR amplification product using a construct prepared to extract each mature peptide fragment as a template.
Figure 6 is a construct expression vector prepared for extracting each mature peptide fragment.
Figure 7 is a picture of the disk diffusion to perform the PBD1, 2, 3 antibiotic stimulation response in bacteria. / L3262, L1 on the right represents pGAL10-PBD1 / Y2805 ㅿ gal1, L2 represents pGAL10-PBD2 / Y2805 ㅿ gal1, L3 indicates pGAL10-PBD3 / Y2805 ㅿ gal1, y: Yeast / DW (-) control and Am Ampicillin (+) control.

이하 비한정적인 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세하게 설명한다. 단 하기 실시예는 본 발명을 설명하기 위한 목적으로 기재된 것으로서 본 발명의 범위는 하기 실시예에 의하여 제한되는 것으로 해석되지 아니한다.The present invention will now be described in more detail by way of non-limiting examples. However, the following examples are described for the purpose of illustrating the present invention and the scope of the present invention is not to be construed as limited by the following examples.

실시예 1:돼지 beta defensin 유전자 발현 시스템 구축Example 1 Construction of Pig Beta Defensin Gene Expression System

1) 돼지 beta defensin 정보1) pig beta defensin information

돼지 베타 디펜신 정보는 표 1과 같다.Pig beta defensin information is shown in Table 1.

Figure pat00001
Figure pat00001

① 돼지 beta defensin 2 (PBD2)① Pig Beta Defensin 2 (PBD2)

효모를 발현체로 활용하기 위하여 각각의 beta defensin에 대하여 NCBI 유전자은행 데이테베이스 검색을 통하여 cDNA 서열 확인 및 mature peptide의 아미노산 서열을 확인하였다. 특히 돼지와 사람의 beta defensin 유전자 구조를 비교하여서 construct 구축에 필요한 mature peptide sequence 를 재확인하였다(도 1).In order to utilize yeast as an expression, the beta defensin was identified by cDNA sequence and amino acid sequence of mature peptide through NCBI gene bank database search. In particular, by comparing the beta defensin gene structure of pigs and humans, the mature peptide sequence required for construct construction was reconfirmed (Fig. 1).

도 1에서 알 수 있는 바와 같이, 돼지와 사람의 beta defensin 2는 유사한 구조를 가지고 있다. Mature peptide 구성은 다소 차이가 있으나, 항균 기능으로서의 역할을 담당할 것으로 예상되는 disulfide bond의 위치는 동일한 것으로 나타났다. As can be seen in Figure 1, beta defensin 2 in pigs and humans has a similar structure. Although the mature peptide composition was somewhat different, disulfide bonds expected to play a role as antimicrobial function were found to be identical.

2) 돼지 beta defensin 발현을 위한 발현벡터 구축: beta-actin promoter를 사용한 조직 비특이적 발현벡터(도 2)2) Expression vector construction for swine beta defensin expression: Tissue nonspecific expression vector using beta-actin promoter (FIG. 2)

beta-actin promoter(전체 조직에서 발현되는 promoter)가 삽입되어 있는 pCAGGS 벡터는 포유동물세포(mammalian cell)에서 발현되는 벡터로써, 293T cell에 transfection하여 얻은 cell lysate가 균에 대한 항균효과 유무를 알아보기 위해 본 벡터를 사용하였다. 본 벡터는 addgene(USA)으로부터 구입하여서 프로모터 부분을 새롭게 가공한 벡터이다.pCAGGS vector with beta-actin promoter (promoters expressed in whole tissues) is expressed in mammalian cells, and cell lysate obtained by transfection of 293T cells to antibacterial activity This vector was used for this purpose. This vector is a vector obtained by newly processing the promoter portion purchased from addgene (USA).

3) 돼지 beta defensin mature peptide 염기서열 증폭 및 construct 제작3) Amplification of pig beta defensin mature peptide sequence and construction of construct

각각의 mature peptide 증폭에 필요한 PCR primer를 설계하여 증폭을 실시하였다. 증폭에 필요한 primer 설계서열은 다음과 같다(표 2). 본 발명의 프라이머는 대한민국 바이오니아(주)에 제조의뢰하여서 사용하였다.PCR primers for each mature peptide amplification were designed and amplified. Primer design sequences required for amplification are as follows (Table 2). The primer of the present invention was used by the manufacturer of Bioneer Korea.

Figure pat00002
Figure pat00002

돼지 폐의 cDNA는 다음과 같은 방법으로 제조되었다.Porcine lung cDNA was prepared by the following method.

Total RNA는 돼지의 폐 0.3g에서 TRIzol (Invitrogen, USA)을 이용하여 추출하였다. 3㎍의 Total RNA와 oligo-(dT)15 Primer (Promega, USA), 10mM dNTP Mix (TAKARA, Japan)를 혼합하여, 65℃에서 5분간 변성시키고, 얼음에서 5분간 냉각시킨 후, 변성된 RNA를 5X First-strand buffer, 0.1M DTT, Superscript ⅢTM reverse transcriptase (Invitrogen, USA)와 혼합하여 50℃ 53분, 72℃ 15분, 4℃에서 4분 과정을 거쳐 cDNA를 얻는다.Total RNA was extracted using TRIzol (Invitrogen, USA) from 0.3 g of pig lung. 3 μg of total RNA, oligo- (dT) 15 Primer (Promega, USA), 10 mM dNTP Mix (TAKARA, Japan) were mixed, denatured at 65 ° C. for 5 minutes, cooled on ice for 5 minutes, and then denatured RNA. The mixture was mixed with 5X First-strand buffer, 0.1M DTT, Superscript III TM reverse transcriptase (Invitrogen, USA), and obtained cDNA after 4 minutes at 50 ° C 53 minutes, 72 ° C 15 minutes, and 4 ° C.

PCR 증폭을 위해 반응액은 돼지 폐의 cDNA와 10mM MgCl2를 가지는 10X 반응버퍼, 10 pmol 각 프라이머, 25mM dNTP, 1.25U 의 Pyrobest Taq polymerase (TAKARA, JAPAN)를 함유하였으며, 전체 부피25㎕에서 수행하였다. 각 프라이머를 이용한 증폭은 94℃에서 3분간 가열하여 변성을 유도하고, 94℃ 에서 30초 변성, 58℃ 또는 55℃에서 30초의 프라이머 어닐링, 72℃에서 1분 총 3단계를 35번 반복한 후에 72℃에서 4분간 익스텐젼 하였다. PCR 증폭산물은 1.5% 아가로스 젤 상에서 1X TAE 런닝 버퍼, 100V 조건하에서 40분간 젤 전기영동 후 365nm UV램프에서 특정 DNA 밴드를 절취하여 Gel Extraction kit (Qiagen, USA)을 이용하여 정제하였다. 정제된 DNA 는 20 U XbaⅠ, XhoⅠ (TAKARA, JAPAN) 제한효소를 이용해 37℃에서 2시간 처리하였고, pCAGGS 벡터(도 2)에 도입시키기 위해 벡터 역시 XbaⅠ, XhoⅠ 제한효소로 절단하였다. 제한효소로 절단된 DNA와 pCAGGS 벡터를 T4 DNA ligase 350 U (TAKARA, JAPAN)을 이용하여 16℃에서 약 16시간 라이게이션 하였다. 라이게이션이 끝난 DNA는 전기 천공법을 이용하여 대장균 DH10B 세포(Invitrogen, USA)내로 형질전환 하였다. 37℃ 진탕배양기에서 1시간 배양 후 엠피실린 (50㎍/㎖)이 첨가된 LB플레이트에 접종, 37℃ 배양기에서 약 16시간 배양하였다. 16시간 후 플레이트에 형성된 단일 콜로니로 부터 DNA를 추출하였다 (GeneAll, Korea). 추출된 DNA는 ABI Prism BigDye Terminator 사이클 시퀀싱 레디 반응 키트 (Applied Biosystems, USA)로 ABI 3730 DNA 분석기 (Applied Bissystems, USA)상에서 양 방향으로 시퀀싱 하였다. 시퀀싱 결과들을 NCBI 에서 분석하였다.For PCR amplification, the reaction solution contained 10X reaction buffer containing cDNA and 10 mM MgCl 2 in pig lung, 10 pmol of each primer, 25 mM dNTP, and 1.25U of Pyrobest Taq polymerase (TAKARA, JAPAN). It was. The amplification using each primer was heated for 3 minutes at 94 ° C to induce denaturation, followed by 35 steps of 30 seconds denaturation at 94 ° C, 30 seconds of primer annealing at 58 ° C or 55 ° C, and 3 steps of 1 minute at 72 ° C. Extension was performed at 72 ° C. for 4 minutes. PCR amplification products were purified using Gel Extraction kit (Qiagen, USA) by cutting specific DNA bands from 365nm UV lamp after gel electrophoresis for 40 minutes under 1X TAE running buffer, 100V on 1.5% agarose gel. Purified DNA was treated for 2 hours at 37 ° C. using 20 U Xba I, Xho I (TAKARA, JAPAN) restriction enzyme, and the vector was also digested with Xba I, Xho I restriction enzyme for introduction into pCAGGS vector (FIG. 2). DNA digested with restriction enzyme and pCAGGS vector were ligated at 16 ° C. for 16 hours using T4 DNA ligase 350 U (TAKARA, JAPAN). The ligated DNA was transformed into E. coli DH10B cells (Invitrogen, USA) using electroporation. After 1 hour of incubation in a 37 ° C. shaker incubator, the cells were inoculated into LB plates to which empicillin (50 μg / ml) was added and incubated for about 16 hours in a 37 ° C. incubator. After 16 hours DNA was extracted from a single colony formed on the plate (GeneAll, Korea). The extracted DNA was sequenced in both directions on an ABI 3730 DNA analyzer (Applied Bissystems, USA) with the ABI Prism BigDye Terminator cycle sequencing ready reaction kit (Applied Biosystems, USA). Sequencing results were analyzed in NCBI.

4) 살모넬라 및 대장균에 대한 돼지 디펜신의 효과 검정4) Effect of swine defensin on Salmonella and Escherichia coli

Salmonella Enteritidis (SE) 항균효과 실험: 돼지 항균펩타이드인 디펜신을 293T cell(Invitrogen, USA)에 transfection 하여 배양 후, cell을 수거하여 lysate를 만들었고 Salmonella Enteritidis 와 E.coli 0157:H7 (1000CFU)에 대한 항균효과를 알아보았다. 준비된 lysate에 균을 접종한 후 4℃ 와 37℃에서 배양하여 24시간 후에 균수를 측정하였다. Salmonella Enteritidis (SE) Antimicrobial Effect Experiment: After transfection of pig antimicrobial peptide defensin into 293T cells (Invitrogen, USA), the cells were harvested to make lysate and antibacterial against Salmonella Enteritidis and E.coli 0157: H7 (1000CFU). The effect was found. After inoculating the prepared lysate and incubated at 4 ℃ and 37 ℃ to determine the number of bacteria after 24 hours.

24시간 후에 4℃에서 배양 한 lysate에 Salmonella Enteritidis 균 수를 측정한 결과 컨트롤 보다 PBD 1, 2, 3 모두 Salmonella Enteritidis균 수를 줄이는 것으로 나타났다. 37℃에서 배양한 것의 균 수 역시 컨트롤 보다 감소하였다. 돼지 항균펩타이드인 디펜신이 항균 효과가 있음을 보여준다(도 3).
24 hours later 4 ℃ a lysate to be a result of Salmonella Enteritidis PBD 1, 2 more control measures the bacteria cultured in 3 both showed that reducing the number of bacteria Salmonella Enteritidis. The number of bacteria incubated at 37 ° C was also lower than in the control. Porcine antibacterial peptide defensin shows an antimicrobial effect (Fig. 3).

24시간 후에 4℃에서 배양 한 lysate에 Ecoli O157:H7 균 수를 측정한 결과 컨트롤 보다 디펜신 1, 2, 3 모두 Ecoli O157:H7 균 수를 줄어는 것으로 나타났다. 37℃에서 배양한 것의 균 수 역시 컨트롤 보다 감소하였다(도 4).After 24 hours, the number of Ecoli O157: H7 bacteria was decreased in the lysate cultured at 4 ° C. The bacterial counts of those cultured at 37 ° C. were also lower than controls (FIG. 4).

실시예 2: 효모 (yeast)를 이용한 돼지 beta defensin 발현 산물의 항균 효능 검정Example 2: Antimicrobial Activity Assay of Porcine Beta Defensin Expression Product Using Yeast

돼지 beta defensin의 효모 세포질 내 발현을 통해 발현산물 (lysate)에 대한 항균 효능을 검정하기 위해 효모 균주 발현벡터를 구축, 효모 균주 내로 도입하며 도입된 효모 균주의 배양 및 lysate 추출을 통해 최종 산물의 향균 기능을 확인하였다.To test the antimicrobial efficacy of lysate through expression in the yeast cytoplasm of pig beta defensin, yeast strain expression vectors were constructed, introduced into yeast strains, and the final product was cultivated by culturing the introduced yeast strains and extracting lysate. The function was confirmed.

1) 돼지 beta defensin mature peptide 염기서열 증폭 및 발현 균주 내 벡터의 도입1) Amplification of pig beta defensin mature peptide sequence and introduction of the vector in the expression strain

각각의 mature peptide 증폭에 필요한 PCR primer를 설계하여 증폭을 실시한다. 증폭에 필요한 각각의 primer 설계 서열을 다음과 같다(표 3).Design PCR primers for each mature peptide amplification and amplify them. Each primer design sequence required for amplification is as follows (Table 3).

Figure pat00003
Figure pat00003

각각의 mature peptide 절편을 추출하기 위해 제작된 construct를 template로 이용하여 PCR 증폭산물을 확보하였으며, 도입 과정과 박현 벡터의 내용은 다음과 같다(도 5 및 6). 위의 Primer를 이용해 새로운 발현 벡터에 클로닝하여 확인하고, 효모 균주 내로 도입하였다.PCR amplification products were obtained by using the constructed construct as a template to extract each mature peptide fragment, the introduction process and the contents of the Park Hyun vector are as follows (Figs. 5 and 6). Cloning to a new expression vector using the above Primer was confirmed, and introduced into the yeast strain.

2) 효모 균주 내 형질전환2) Transformation in Yeast Strains

S. cerevisiae Y2805ㅿgal1, L3262 균주(에프디생명과학, 대한민국) 내로 pGAL10-PBD1을 형질전환 하였다. 5~10ng의 pGAL10-PBD1과 100㎍ denatured sheared salmon sperm DNA, PEG/LiAC solution (40% PEG-3350, 1X TE, 1X LiAC)를 첨가하여 30℃ 진탕배양기에서 30분 배양하였다. 30분 후 DMSO 첨가하고 42℃에서 7분 동안 열 충격을 가한다. 2500 rpm에서 약 10초 동안 원심분리 후에 상청액을 버리고 1X TE에 펠렛을 녹인다. 녹인 펠렛은 YNBCAD (0.67% YNB, 2% glucose, 0.5% casamino acids, 2% Agar) 플레이트에 접종하고, 30℃ 배양기에서 3~4일 배양하였다.PGAL10-PBD1 was transformed into S. cerevisiae Y2805 ㅿ gal1 and L3262 strains (F.D. Life Science, Korea). 5 ~ 10ng of pGAL10-PBD1 and 100㎍ denatured sheared salmon sperm DNA, PEG / LiAC solution (40% PEG-3350, 1X TE, 1X LiAC) was added and incubated for 30 minutes in a shaker at 30 ℃. After 30 minutes DMSO is added and heat shock is applied at 42 ° C. for 7 minutes. After centrifugation at 2500 rpm for about 10 seconds, the supernatant is discarded and the pellet is dissolved in 1X TE. Dissolved pellets were inoculated in YNBCAD (0.67% YNB, 2% glucose, 0.5% casamino acids, 2% Agar) plate and incubated for 3-4 days in a 30 ℃ incubator.

3) 디스크 확산법 (disk diffusion test)3) disk diffusion test

박테리아에서 PBD1 항생물질 자극 반응을 보기 위해 디스크 확산법을 하였다.Disc diffusion was performed to view PBD1 antibiotic stimulation in bacteria.

YPDG (1% Yeast extract, 2% peptone, 1% glucose, 1% galactose) 배양액에 각각의 pGAL10-PBD1이 형질전환 된 S. cerevisiae Y2805ㅿgal1, L3262의 단일 콜로니를 접종시키고, 30℃ 진탕 배양기에서 약 16~24시간 배양하였다. 배양액을 1500 g에서 5분간 원심분리 한 후에 Y-per Yeast protein extraction reagent (Thermo, USA)에 녹인 후, 다시 원심분리 한다. 상청액을 제거하고 Y-per Yeast protein extraction reagent로 펠렛을 녹여 혼탁정도 (OD600>50-100)를 확인한 후에 동량의 glass beads (acid-washed)를 첨가하였다. YPDG (1% Yeast extract, 2% peptone, 1% glucose, 1% galactose) cultures were inoculated with a single colony of S. cerevisiae Y2805 ㅿ gal1, L3262 transformed with each pGAL10-PBD1, and in a 30 ° C shaking incubator. Incubated for about 16-24 hours. Centrifuge the culture at 1500 g for 5 minutes, dissolve in Y-per Yeast protein extraction reagent (Thermo, USA) and centrifuge again. The supernatant was removed, and the pellet was dissolved with Y-per Yeast protein extraction reagent to confirm the turbidity (OD600> 50-100). Then, the same amount of glass beads (acid-washed) was added.

<110> Konkuk University Industrial Cooperation Corp. <120> Method for producing antimicrobial peptide and use of the same <160> 6 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> mPBD-2F <400> 1 tctagagcca gaggatggac cactac 26 <210> 2 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PBD-2R <400> 2 ctcgaggtgg cttctggctc a 21 <210> 3 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> N-PBD2 <400> 3 accctcgacg aattcatggg tcttggccag aggtccgacc ac 42 <210> 4 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> C-PBD2 <400> 4 atacgctccg tcgactcagc ggatgcagca cttggc 36 <210> 5 <211> 43 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> peptide <400> 5 Gly Leu Gly Gln Arg Ser Asp His Tyr Ile Cys Ala Lys Lys Gly Gly 1 5 10 15 Thr Cys Asn Phe Ser Pro Cys Pro Leu Phe Asn Arg Ile Glu Gly Thr 20 25 30 Cys Tyr Ser Gly Lys Ala Lys Cys Cys Ile Arg 35 40 <210> 6 <211> 349 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PBD2 <400> 6 cctctgagag cctctccttc cctgggcatc cggccaccac ctgccgccgc catgagggcc 60 ctctgcttgc tgctgctgac tgtctgcctc ctctcttccc agctggctgc aggtattaac 120 ctgcttacgg gtcttggcca gaggtccgac cactacatat gtgccaagaa aggggggacc 180 tgcaacttct ccccctgccc gctcttcaac aggattgaag ggacctgtta cagtggcaag 240 gccaagtgct gcatccgctg accctgagcc agaagccaca gcagagggga cacacaggcc 300 aagtgaagta tttgcaactg ttgttttaat aaaagaagtt tttttttga 349 <110> Konkuk University Industrial Cooperation Corp. <120> Method for producing antimicrobial peptide and use of the same <160> 6 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> mPBD-2F <400> 1 tctagagcca gaggatggac cactac 26 <210> 2 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PBD-2R <400> 2 ctcgaggtgg cttctggctc a 21 <210> 3 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> N-PBD2 <400> 3 accctcgacg aattcatggg tcttggccag aggtccgacc ac 42 <210> 4 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> C-PBD2 <400> 4 atacgctccg tcgactcagc ggatgcagca cttggc 36 <210> 5 <211> 43 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> peptide <400> 5 Gly Leu Gly Gln Arg Ser Asp His Tyr Ile Cys Ala Lys Lys Gly Gly   1 5 10 15 Thr Cys Asn Phe Ser Pro Cys Pro Leu Phe Asn Arg Ile Glu Gly Thr              20 25 30 Cys Tyr Ser Gly Lys Ala Lys Cys Cys Ile Arg          35 40 <210> 6 <211> 349 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PBD2 <400> 6 cctctgagag cctctccttc cctgggcatc cggccaccac ctgccgccgc catgagggcc 60 ctctgcttgc tgctgctgac tgtctgcctc ctctcttccc agctggctgc aggtattaac 120 ctgcttacgg gtcttggcca gaggtccgac cactacatat gtgccaagaa aggggggacc 180 tgcaacttct ccccctgccc gctcttcaac aggattgaag ggacctgtta cagtggcaag 240 gccaagtgct gcatccgctg accctgagcc agaagccaca gcagagggga cacacaggcc 300 aagtgaagta tttgcaactg ttgttttaat aaaagaagtt tttttttga 349

Claims (10)

a) 돼지 조직으로부터 유래한 cDNA를 주형으로 하여서 베타-디페신을 증폭하기 위한 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계;
b) 상기 PCR 산물을 제한 효소 처리하는 단계;
c) 상기 제한 효소 처리된 PCR 산물을 도 2의 발현벡터에 라이게이션하는 단계; 및
d) 상기 발현벡터를 숙주세포에 형질전환하는 단계를 포함하는
돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법.
a) performing PCR using a primer for amplifying beta-diffsin using cDNA derived from porcine tissue as a template;
b) restriction enzyme treatment of said PCR product;
c) ligation of the restriction enzyme treated PCR product into the expression vector of FIG. 2; And
d) transforming the expression vector into a host cell.
In Vitro Expression of Porcine Beta Defensin.
제 1항에 있어서, 상기 프라이머는 서열번호 1 및 2로 이루어진 군으로부터 선택된 염기서열을 가지는 것을 특징으로 하는 돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법.The method of claim 1, wherein the primer has a nucleotide sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 1 and 2. In vitro expression method of porcine beta defensin. 제 1항에 있어서 상기 베타-디펜신은 서열번호 5의 아미노산 서열을 가지는 것을 특징으로 하는 돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법.The method of claim 1, wherein the beta-defensin has an amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 in vitro expression method of pig beta defensin. a) 돼지 조직으로부터 유래한 cDNA를 주형으로 하여서 베타-디페신을 증폭하기 위한 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계;
b) 상기 PCR 산물을 제한 효소 처리하는 단계;
c) 상기 제한 효소 처리된 PCR 산물을 발현벡터에 라이게이션하여서 도 6의 발현벡터를 구축하는 단계; 및
d) 상기 발현벡터를 숙주세포에 형질전환하는 단계를 포함하는
돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법.
a) performing PCR using a primer for amplifying beta-diffsin using cDNA derived from porcine tissue as a template;
b) restriction enzyme treatment of said PCR product;
c) constructing the expression vector of FIG. 6 by ligating the restriction product treated PCR product to an expression vector; And
d) transforming the expression vector into a host cell.
In Vitro Expression of Porcine Beta Defensin.
제 4항에 있어서, 상기 프라이머는 서열번호 3 및 4로 이루어진 군으로부터 선택된 염기서열을 가지는 것을 특징으로 하는 돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법.The method of claim 4, wherein the primer has a nucleotide sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 3 and 4. 제 4 항에 있어서 상기 베타-디펜신은 서열번호 5의 아미노산 서열을 가지는 것을 특징으로 하는 돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법.The method of claim 4 wherein the beta-defensin has an amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 in vitro expression method of porcine beta defensin. 제 4항에 있어서, 상기 숙주세포는 효모인 것을 특징으로 하는 돼지 베타 디펜신의 체외발현 방법.According to claim 4, wherein said host cell is an in vitro expression method of porcine beta defensin, characterized in that the yeast. 제 1항 내지 제 7항 중 어느 한 항의 발현방법에 의하여 제조된 베타-디펜신을 포함하는 병원성 미생물에 대한 항균용 조성물.An antimicrobial composition against pathogenic microorganisms comprising beta-defensin prepared by the expression method of any one of claims 1 to 7. 제 8항에 있어서 상기 병원성 미생물은 그람 양성 또는 그람 음성균인 것을 특징으로 하는 병원성 미생물에 대한 항균용 조성물.The antimicrobial composition of claim 8, wherein the pathogenic microorganism is Gram-positive or Gram-negative bacteria. 제 9항에 있어서, 상기 그람 양성균은 바실러스 세레우스 또는 스타필로코커스 아우레우스이고, 상기 그람 양성균은 대장균 또는 살모넬라 엔터라이티디스인 병원성 미생물에 대한 항균용 조성물. The antimicrobial composition of claim 9, wherein the Gram-positive bacteria is Bacillus cereus or Staphylococcus aureus, and the Gram-positive bacteria is Escherichia coli or Salmonella enteritidis.
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