KR20060041163A

KR20060041163A - 코로나바이러스에 의한 감염을 치료, 조절 및 예방하기위한 항바이러스 제제들

Info

Publication number: KR20060041163A
Application number: KR1020057020588A
Authority: KR
Inventors: 아베라르도 실바; 존 더블유 에릭슨
Original assignee: 세쿠오이아 파마큐티컬스 인코오퍼레이티드
Priority date: 2003-04-28
Filing date: 2004-04-28
Publication date: 2006-05-11
Also published as: EP1620061B1; ATE458750T1; WO2005032453A2; CA2524209A1; DE602004025689D1; JP2007526213A; US7151163B2; EP1620061A2; EP1620061A4; US20070185027A1; WO2005032453A3; US20060258577A1; AU2004277370A1

Abstract

본 발명에서는 환자에서 코로나바이러스 감염을 예방 및 치료하는데 유용한 조성물 및 방법을 제공한다. 보다 상세하게는, 본 발명에서는 표적 세포에 SARS 바이러스와 같은 코로나바이러스의 융합을 차단하는 펩타이드들 및 컨쥬게이트들, 및 펩타이드와 컨쥬게이트들을 포함하는 약제학적 조성물을 제공한다. 상기 차단 메카니즘은 인간 환자와 같은 환자에서 SARS 감염과 같은 코로나바이러스 감염을 예방 또는 치료한다.

코로나바이러스, SARS 바이러스, 펩타이드, 컨쥬게이트, 약제학적 조성물

Description

코로나바이러스에 의한 감염을 치료, 조절 및 예방하기 위한 항바이러스 제제들{Antiviral agents for the treatment, control and prevention of infections by coronaviruses}

본 출원은 2003년 4월 28일자로 출원된 미국 가출원번호 제60/465,782호 및 2003년 4월 30일자로 출원된 미국 가출원번호 60/466,432호의 우선권 효력을 청구하며, 이들 전체 내용을 본 명세서에서 참고자료로 통합 수록하였다.

중증 급성 호흡기 증후군(Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS)은 인간을 감염시키는 신규 코로나바이러스에 의해 유발되어 출현한 신규 감염성 질병이다. Ksiazek et al ., New Engl . J. Med . (http://content.nejm.org/cgi/reprint/ NEJMoa030781v2.pdf, 2003년 4월 10일 공개) 참조. SARS는 지금까지 보고된 사례의 약 4-10%가 치명적이다. 2003년 2월 중순에 비전형성 폐렴(atypical pneumonia)으로 중국의 구앙동 지방에서 처음으로 발견되었고, 2003년 3월 중순까지 세계보건기구(WHO)는 알려지지 않은 발생 또는 원인의 150 이상의 새롭게 의심되는 사례에 관한 보고를 받았다. 2003년 4월 중순까지 SARS의 증상을 가지는 것으로 진단된 환자 263명의 죽음과 함께 4400 사례 이상이 캐나다, 중국, 홍콩, 인도네시아, 필리핀, 싱가폴, 태국, 베트남 및 미국을 포함하는 다른 나라들로부터 보고되었다. 짧은 시간 동안에 여러 나라에서 SARS의 급속한 보급 사실에서, 세계보건기구는 전세계에 경계 경보를 발령하였고 여행자 및 항공기에 긴급 안내를 제공하였다. 감염 후 몇 개월만에 처음 인지되고, SARS는 세계 건강 및 세계 경제를 세계적으로 위협하게 되었다. 현재 SARS에 대하여 효과가 있는 치료법을 알지 못하며 백신을 사용할 수도 없다. 따라서, 감염된 개체에서 SARS를 조절 또는 예방할 수 있고 보급으로부터 SARS를 예방할 수 있는 항바이러스 제제들이 시급히 필요하다.

일반적으로, SARS는 100.4°F[>38.0℃] 이상의 높은 발열로 시작된다. 다른 증상들은 두통, 전체적으로 불안한 느낌 및 몸살을 포함할 수 있다. 또한 일부 사람들은 가벼운 호흡기 증후군을 경험한다. 2-7일 후 SARS 환자들은 마른 기침을 하게 되고 호흡 곤란으로 발전한다.

SARS가 보급되는 일차 경로는 인접한 사람대 사람 접촉에 의한 것이다. SARS의 대부분의 사례들은 SARS를 앓는 사람을 돌보았거나 같이 살았거나, 혹은 SARS를 앓는 사람으로부터 감염성 물질(예를 들면, 호흡기 분비물)과 직접 접촉한 사람들을 포함한다. SARS가 보급될 수 있는 잠재적 경로들은 눈, 코 또는 입의 접촉에 의해 감염성 작은 방울로 오염된 다른 사람들 또는 개체들의 피부에 접촉하는 것을 포함한다. SARS를 앓고 있는 사람이 그들 자신들, 다른 사람들 또는 인접한 표면에서 기침하거나 재채기하는 경우 발생할 수 있다. 또한 SARS는 공기 또는 근래에 알려지지 않은 다른 경로들을 통하여 보다 폭넓게 보급될 수 있다.

미국 질병 대책 센터(Centers for Disease Control and Prevention; CDC) 및 전세계의 다른 연구소들에서 과학자들은 SARS를 앓고 있는 환자들에서 예전에 인지되지 않았던 코로나바이러스를 검출하였다. 코로나바이러스에 대한 증거는 유전자 핑거프린트(genetic fingerprint) 및 전자 현미경의 초미세구조 연구를 기초로 하고 대중적인 간행물에서 광범위하게 보고되었다. CDC, WHO 및 다수의 대학 연구소들에서 바이러스 학자들은 모두 SARS의 원인에 대한 주된 가설이 코로나바이러스임을 보고하였다.

최근 CDC는 SARS를 초래할 수 있다고 간주되는 신규 인간 코로나바이러스 균주인 SARS-CoV(Urbani strain)의 게놈 서열화를 보고하였다. 서열 데이타는 SARS 바이러스가 예전에 인지되지 않았던 코로나바이러스임을 증명하였다. 이 바이러스는 SARS 환자들로부터 목 배양조직(throat culture)을 습득하여 세포를 배양하였고 질병유발 코로나바이러스의 리보핵산(RNA)을 복제하기 위하여 베로(Vero) 세포(아프리카 녹색 원숭이의 신장 세포)에서 생장시켰다. 새로운 서열은 코로나바이러스에 대한 전형적인 RNA 경계들 안에 잘 배치하는 29,727 뉴클레오타이드를 가진다. 이 바이러스 집단의 일원들은 29,000에서 31,000 사이의 뉴클레오타이드를 가지는 경향이 있다. Lai et al ., Adv . Virus Res . 48:1 (1997) 참조. 또한 SARS 바이러스의 게놈 조직은 다른 코로나바이러스와 유사하다.

SARS-CoV(Urbani strain)의 게놈 서열은 미국국립의학도서관(NLM) 산하 NCBI(National Center for Biotechnology Information)의 웹 사이트 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/의 GenBank에서 이용할 수 있다. SARS-CoV(Urbani strain) 서열에 대한 승인번호는 ay278741이다. 본 발명자들은 SARS를 치료하고 유행성이 증대되는 흐름을 저지하는데 사용될 수 있는 안전하고 효과적인 신규 항바이러스 치료법들을 설계하는데 사용할 수 있는 분자 표적들을 동정하는데 이들 서열 데이타를 사용하였다.

본 발명의 요약

본 발명의 첫 번째 관점에 의하면, 7에서 50 사이의 아미노산들을 가지는 항바이러스 펩타이드를 제공하며, 상기 펩타이드는 코로나바이러스에 대항하는 항바이러스 활성을 가지고, 하기와 같은 서열 중 하나로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산들을 포함하는 서열을 포함한다:

본 발명의 다른 두 번째 관점에 의하면, 7에서 50 사이의 아미노산들을 가지는 항바이러스 펩타이드를 제공하며, 상기 펩타이드는 코로나바이러스에 대항하는 항바이러스 활성을 가지고, 하기와 같은 서열로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산들을 포함하는 서열을 포함한다:

상기에서, 굵은 알파벳 위치의 아미노산들은 I, L, V, W, Y, F, N, Q, S, T, D, E, G, H 및 M으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산과 치환될 수 있고, 상기 굵지않은 알파벳 위치의 아미노산들은 프롤린을 제외한 어떠한 아미노산도 될 수 있다.

상기 펩타이드들은 하기와 같은 군에서 선택된 서열을 포함할 수 있다:

펩타이드는 하기 서열 중 하나로부터 10, 15, 20, 25, 30, 35 또는 40개 이상의 연속하는 아미노산들을 포함할 수 있다:

예를 들어, 상기 펩타이드 중 어느 하나는 인간 혈청 알부민과 같은 담체 단백질과 결합될 수 있다.

본 발명의 다른 세 번째 관점에 의하면, 7에서 50 사이의 아미노산들을 가지는 펩타이드 X를 포함하는 항바이러스 조성물을 제공하며, 상기 펩타이드는 코로나바이러스에 대항하는 항바이러스 활성을 가지고, 상기 조성물은 하기와 같은 구조를 가진다:

B-X-Z,

상기 B는 약 43개 이하의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열이거나, B는 아미노기, 아세틸기, 9-플루오레닐메톡시-카르보닐기, 소수성기 또는 거대분자 담체기이거나, 또는 B는 담체 단백질이며, 이 경우 B는 8개 이상의 아미노산을 포함할 수 있고 또한 담체 단백질에 대한 항바이러스 서열을 연결하는 링커 펩타이드 서열을 포함할 수 있으며; Z는 43개 이하의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열이거나, Z는 카르복시기, 아미도기(amido group), 소수성기 또는 거대분자 담체기를 포함하거나, 또는 Z는 HSA와 같은 담체 단백질이며, 이 경우 Z는 8개 이상의 아미노산들을 포함할 수 있고 또한 담체 단백질에 대한 항바이러스 서열을 연결하는 링커 펩타이드 서열을 포함할 수 있으며; B와 Z가 함께 고려될 때 B와 Z기 사이에 8개 이상의 아미노산을 포함해야 하고; 여기에서 X는 하기와 같은 서열 중 하나로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산을 포함하는 펩타이드 서열이다:

예를 들면, X는 하기 서열 중 하나로부터 10, 15, 20, 25, 30, 35 또는 40개 이상의 연속하는 아미노산을 포함할 수 있다:

본 발명의 다른 네 번째 관점에 의하면, 7에서 50 사이의 아미노산들을 가지는 항바이러스 펩타이드를 제공하며, 상기 펩타이드는 코로나바이러스에 대항하는 항바이러스 활성을 가지고, 연속하는 헵타펩타이드(heptapeptide)의 일곱 개 위치 중 둘 이상에서 상동성을 보이는 서열을 포함하며, 상기 헵타펩타이드는 하기와 같은 서열 중 하나로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산을 포함한다:

예를 들어, 상기 서열 상동성은 연속하는 헵타펩타이드들에서 ith 및 i+4th 위치에 존재할 수 있다.

본 발명의 다른 관점에 의하면, 상기에 기재된 펩타이드 또는 조성물 및 약제학적으로 허용가능한 희석제, 조절제 및/또는 부형제를 포함하는 약제학적 조성물을 제공한다.

본 발명의 또 다른 관점에 의하면, 상기에 기재된 펩타이드 또는 조성물의 유효량을 감염된 것으로 의심되는 환자에게 투여하는 단계를 포함하여 환자에서 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다. 상기 환자는 인간, 젖소, 돼지 또는 닭이 될 수 있다.

본 발명의 다른 목적, 특징 및 이점들은 이어지는 상세한 설명에서 명백해 질 것이다. 그러나, 상세한 설명 및 특정 실시예들에 서술된 설명은 발명의 바람직한 구현예들을 나타내고 설명하기 위한 방법으로 주어진 것일 뿐이며, 이 상세한 설명으로부터 본 발명의 의도 및 범주 안에서 다양한 변화 및 변형이 당업자에게 자명할 것이다.

본 발명에서는 환자에서 코로나바이러스 감염을 예방 또는 치료하는데 유용한 조성물 및 방법을 제공한다. 보다 상세하게는, 본 발명에서는 표적 세포에 SARS 바이러스와 같은 코로나바이러스의 융합을 차단하는 펩타이드들 및 컨쥬게이트들, 및 펩타이드와 컨쥬게이트들을 포함하는 약제학적 조성물을 제공한다. 상기 차단 메카니즘은 인간 환자와 같은 환자에서 SARS 감염과 같은 코로나바이러스 감염을 예방 또는 치료한다.

SARS - CoV 는 신규 코로나바이러스이다.

SARS-CoV의 게놈 서열은 CDC 웹 사이트로부터 다운로드 받을 수 있고 10개의 추정 오픈 리딩 프레임(ORFs)으로 번역되었다. 10개의 ORFs에 의해 인코드되는 추정 단백질과 일치하는 아미노산 서열은 단백질 데이타베이스 조사 프로그램인 BLAST를 사용하여 프로테옴(proteome)에 존재하는 단백질을 상동 분석하였다. Altschul et al ., Nucleic Acids Res . 25: 3389(1997) 참조. 다수의 오픈 리딩 프레임들은 알려진 코로나바이러스로부터 단백질에 상당한 서열 상동을 가지는 단백질을 인코드하는 것을 발견하였다. 예를 들면, ORF1은 코로나바이러스 중합효소 단백질(polymerase 1a, 1b)과 일치하고 ORF3는 코로나바이러스 스파이크 단백질(S)과 일치한다. 게놈의 상동관계 및 조직은 SARS 바이러스가 코로나바이러스라고 납득시키는 부가적 증거를 제공한다.

이전의 코로나바이러스들은 유전자 데이타에 의해 백업된 항체들의 교차-반응성에 기초하는 세 가지 카테고리로 분류되었다. 이전에 분리된 두 개의 인간 코로나바이러스들은 두 개의 다른 그룹에 속한다. 이들 그룹 중 하나는 위장염을 유발하는 다수의 장 코로나바이러스를 포함한다. 다른 것은 다양한 종에서 호흡기 또는 신경 질병을 유발하는 코로나바이러스를 포함한다. 세 번째 그룹은 조류 종에서 분리된 코로나바이러스를 포함한다.

SARS-CoV 유래 S 단백질의 서열은 그것의 1260 전체 또는 인간, 젖소, 돼지, 쥐 및 닭에서 유래하는 코로나바이러스를 포함하는 코로나바이러스의 세 그룹 모두에서 유래한 S 단백질을 가지는 아미노산 길이에 약 30-35% 상동성을 공유한다. 서열 상동 분석에 기초하여, SARS 코로나바이러스는 지금까지 처음으로 신규 네 번째 코로나바이러스 그룹의 일원으로 나타났다.

스파이크 단백질들은 바이러스 진입을 위하여 요구된다.

다수의 연구들은 숙주 세포로 외피를 가지는 바이러스가 진입하는데 바이러스와 숙주 세포 사이에 막 융합이 요구된다는 것을 보여준다. 대부분의 동물 바이러스에 있어서 이들 융합 기능은 비리온 표면의 단일 외피 당단백질에 의해 중재되었다. S 단백질은 코로나바이러스에 의한 세포 진입을 중재하는 융합 단백질이 된다. Spaan et al., J. Gen . Virol . 69: 2939(1988) 참조.

S 단백질은 전자현미경 사진(electron micrograph)에서 보여지는 것과 같이 비리온 표면에 돌출한 페플로머 돌출부(peplomer projection)를 생성한다. 페플로머는 세 개의 올리고머화된 S 단백질 분자들로 이루어진 생각된다. Delmas et al ., J. Virol . 64: 5367 (1990) 참조. S 단백질은 바이러스가 두 개의 유사한 크기의 서브유닛들인 S1과 S2에 조합되는 동안에 숙주의 프로테아제에 의해 분해된다. S1 서브유닛이 S 단백질의 수용체 결합 활성을 포함하는 반면에, N-말단 S1과 비공유적으로 결합하는 C-말단 S2 서브유닛은 막횡단 도메인을 통과하여 S 단백질을 고정시킨다.

S2 서브유닛에서 나선의 7개 반복은 융합을 위하여 요구된다.

바이러스 진입 및 발병학에서 코로나바이러스 스파이크 단백질의 역할에 대한 보고는 Gallagher et al ., Virology 279: 371 (2001) 및 Lue et al ., J. Virol . 73: 8152 (1999)에서 찾을 수 있다. 여러 가지 연구들이 S2 서브유닛이 바이러스 융합에 요구된다고 제안한다. 기능성 돌연변이반응 연구들은 융합을 위한 결정적인 잔기들이 7개 반복 영역과 일치하는 S2에서 두 개의 영역 내에 위치한다고 말한다. 7개 반복 영역은 인플루엔자와 같은 파라믹소바이러스, HIV와 같은 레트로바이러스, 에볼라(Ebola) 바이러스와 같은 필로바이러스(filoviruses)를 포함하는 다른 외피 바이러스 유래의 융합 단백질에서 발견되었다. 코로나바이러스의 S2 서브유닛에서 비-나선 스페이서(spacer)에 의해 분리된 두 개의 7개 반복인 HR1과 HR2의 존재는 예를 들면 HIV, 인플루엔자 바이러스 및 에볼라 바이러스의 융합 당단백질에서 나선의 7개 반복에 의해 생성된다고 여겨지는 융해 구조(fusogenic structure)와 유사한 코일된-코일(coiled-coil) 또는 "헤어핀의 트라이머(trimer of hairpins)" 융해 복합체 생성을 제안하고 있다.

HIV의 경우, HR1 또는 HR2를 모방하는 펩타이드 서열은 HIV 융합을 방해하고 바이러스 복제를 차단한다. HIV 당단백질의 HR2 서열에 기초하는 38개 잔기 펩타이드인 엔푸르비티드(Enfurvitide)는 HIV/AIDS 치료에 임상적으로 사용된다. 본 발명자들은 생산적 융해 복합체의 생성을 차단하고 바이러스 진입을 막도록 코로나바이러스의 코일된-코일 중간물질에 결합할 수 있는 펩타이드를 추론하였다(도 1).

SARS - CoV 는 나선이 되는 것으로 예상되는 코로나바이러스의 HR1 및 HR2 를 가지는 높은 상동 영역을 포함한다.

SARS-CoV와 다른 코로나바이러스의 S 단백질 사이에서 아미노산 서열 상동관계는 그것의 길이를 통하여 평가되었다. 이 영역에서 가장 높은 상동 잔기들은 알려진 코로나바이러스에서 HR1과 HR2 7개 반복과 겹쳐진다. 이차 구조 예상법(예를 들면, CUBIST 단백질 예상 서버 @http://cubic.bioc.columbia.edu 에서 실행하는 프로그램 PROF 참조)을 이용하는 S 단백질의 분석은 HR1과 HR2 영역이 나선이 되는 것으로 강하게 예상되는 것을 밝혔다(도 2). HR1과 HR2 영역은 나선이 될 것으로 가장 강하게 예상되는 5개의 연속하는 아미노산 절편으로 나뉘었다. HIV gp41과 동일한 융합에서 7개-포함 서열들은 HR2 나선에 결합하는 HR1 절편으로부터 유도되었다. 유사하게, 7개-포함 서열들은 HR1 나선에 결합하는 HR2 절편으로부터 유도되었다. HR1과 HR2에 결합하는 나선들은 융해 복합체의 생성을 붕괴시켜 바이러스 진입을 방해한다. 이러한 펩타이드 및 이들 펩타이드를 포함하는 조성물은 코로나바이러스에 대한 예방제로서 코로나바이러스에 의해 발생하는 감염을 치료하는데 유용하다. 이들 펩타이드는 특히 SARS 감염을 예방 및 치료하는데 유용하다.

N 펩타이드들은 HIV gp41의 HR1과 유사한 3중 대칭(3-fold symmetry)을 가지는 트라이머의 코일된-코일을 생성하는 것으로 예상된다. C 펩타이드들은 HIV gp41의 HR2와 유사하게 코일된 코일 내에서 인접한 N-나선들에 의해 생성되는 그루브에 결합하는 나선을 생성하는 것으로 예상된다. 이들 펩타이드 서열은 올리고머 생성에 중요한 또는 결정적인 ith 및 i+4th 잔기들에서 연속하거나 또는 밀접하게 연속하는 나선의 7개 반복 시리즈를 구성하는 연속적인 알파 나선을 생성하는 것으로 예상된다.

S 단백질에 포함되는 펩타이드들은 하기 서열을 가진다(가장 강하게 예상되는 나선 서열들은 굵게 보여진다):

C-말단, HR2 펩타이드 1

N-말단, HR1 펩타이드 2

N-말단, HR1 펩타이드 3

N-말단, HR1 펩타이드 4

N-말단, HR1 펩타이드 5

N-말단, HR1 펩타이드 6

이들 서열들은 약 15에서 50 사이의 아미노산을 가지는, 바람직하게는 15-50 아미노산을 가지고 상기에서 보여지는 서열 중 하나로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산을 포함하는 펩타이드 억제제를 설계하는데 사용되었다. 따라서, 예를 들면 상기 펩타이드는 하기의 7개 아미노산 서열 중 하나를 포함할 수 있다:

C-말단, HR2 펩타이드 1를 위한 펩타이드는 하기 서열 중 하나를 포함할 수 있다:

N-말단, HR1 펩타이드 2를 위한 펩타이드는 하기 서열 중 하나를 포함할 수 있다:

N-말단, HR1 펩타이드 3을 위한 펩타이드는 하기 서열 중 하나를 포함할 수 있다:

N-말단, HR1 펩타이드 4를 위한 펩타이드는 하기 서열 중 하나를 포함할 수 있다:

N-말단, HR1 펩타이드 5를 위한 펩타이드는 하기 서열 중 하나를 포함할 수 있다:

더욱이, 펩타이드의 특정 아미노산이 코일된 코일에서 인접한 N-나선들에 의해 생성되는 그루브(grooves)에 접촉하기 때문에 비-그루브 결합 위치들에서 아미노산들은 "돌연변이된" 펩타이드 억제제들을 제조하는 다른 아미노산과 본질적으로 교체될 수 있다. 게다가, 그루브 접촉을 형성하는 위치에서 아미노산들은 특정 바람직한 아미노산들과 교체될 수 있다. 따라서, 펩타이드 내에서

굵은 알파벳 위치의 아미노산들은 I, L, V, W, Y, F, N, Q, S, T, D, E, G, H 및 M으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산과 치환될 수 있다. 이들 아미노산들 중에서 I, L, V, W 및 Y가 가장 바람직하고, F, N, Q, S 및 T가 그 다음으로 바람직하며, D, E, G, H 및 M도 사용될 수 있다. 상기 굵지않은 알파벳 위치의 아미노산들은 나선 구조를 깨뜨리고 그루브 결합을 방해하는 것으로 예상되는 프롤린을 제외한 어떠한 아미노산이 될 수 있다. 상기 펩타이드를 가짐으로써, 이러한 돌연변이된 펩타이드의 7개 연속하는 잔기들을 포함하는 펩타이드가 사용될 수 있다.

이들 펩타이드 서열은 적어도 15개 이상에서 50개까지의 아미노산을 포함하는 긴 펩타이드 서열 내에 포함된다. 부가적 아미노산들은 보여지는 서열의 N 및/또는 C 말단이 될 수 있다.

또한 펩타이드 억제제는 상기에서 보여지는 서열 중 하나로부터 10, 15, 20, 25, 30, 35 또는 40개 이상의 연속하는 아미노산을 포함하지만, 상기에 기재된 길이 제한이 잔류한다. 또한 펩타이드는 하기에서 보다 상세히 기재한 담체 단백질과 같은 담체에 결합될 수 있으며, 순수 분자의 경우 50개 아미노산 이상을 포함하지만, 세포 결합을 초래하는 분자의 부분은 여전히 50개 이하의 아미노산을 포함할 것이다.

본 발명의 펩타이드는 하기의 일반 구조를 가질 수 있다:

B-X-Z,

상기 B는 약 43개 이하의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열이거나, B는 아미노기, 아세틸기, 9-플루오레닐메톡시-카르보닐기, 소수성기 또는 거대분자 담체기이다. 또한 B는 HSA와 같은 담체 단백질이며, 이 경우 B는 8개 이상의 아미노산을 포함할 수 있고 또한 담체 단백질에 대한 항바이러스 서열을 연결하는 링커 펩타이드 서열을 포함할 수 있다.

Z는 43개 이하의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열이거나, Z는 카르복시기, 아미도기(amido group), 소수성기 또는 거대분자 담체기를 포함한다. 또한 Z는 HSA와 같은 담체 단백질이며, 이 경우 Z는 8개 이상의 아미노산들을 포함할 수 있고 또한 담체 단백질에 대한 항바이러스 서열을 연결하는 링커 펩타이드 서열을 포함할 수 있다. 또한 상기 펩타이드 및 담체는 예를 들면, Pierce(Rockford, IL)에 개시된 것과 같은 통상적으로 이용가능한 형태 유형의 말레이미드 링커와 같은 링커를 통하여 화학 컨쥬게이트로서 결합될 수 있다.

B와 Z가 함께 고려되는 경우 B 및 Z 그룹 사이에 8개 이상의 아미노산을 포함하여야 한다. 일반적으로 B와 Z 중 하나만이 거대분자 또는 담체 단백질이다.

X는 상기에서 동정된 C 또는 N 펩타이드 유래의 7, 10, 15, 20, 25, 30, 35 또는 40개의 연속하는 아미노산이다.

또 본 발명의 펩타이드들은 상기에서 보여준 서열 중 하나로부터 7, 10, 15, 20, 25, 30, 35 또는 40개 이상의 연속하는 아미노산과 70% 또는 그 이상의 서열 상동성을 보이는 펩타이드 서열을 포함할 수 있는 반면, 상기에 기재된 길이 제한에 잔류한다.

또한 본 발명은 상기에 기재된 연속하는 헵타펩타이드 펩타이드의 7개의 위치 중 두 군데에서 상동성을 보이는 펩타이드 서열을 포함할 수 있는 반면, 상기에 기재된 길이 제한이 잔류한다. 이 서열 상동성은 상기에 기재된 연속하는 헵타펩타이드 펩타이드 내에 ith 및 i+4th에 유리하게 위치할 수 있다.

생체 밖에서 HSA와 같은 거대분자에 대한 본 발명의 부위 컨쥬게이션은 엄격하게 조절된 복용량으로 정제되고 투여될 수 있는 높은 가용성 컨쥬게이트를 생산한다. 은폐된 컨쥬게이트는 컨쥬게이트로서의 생물학적 활성이 있다. 즉, 컨쥬게이트로부터 펩타이드 부위를 방출하는 프로드럭으로 작용하지 않고 컨쥬게이트의 분열이 생물학적 활성에서 요구되지 않는다. 더욱이, 환자에게 한번 투여된 컨쥬게이트는 생체 내에서 놀랍도록 긴 반감기를 가지고, 탁월한 조직 분포를 가지며 컨쥬게이트의 생물학적 활성 부위의 활성과 일치하는 지속되는 활성을 생산한다.

유리하게, 펩타이드 및 담체 단백질 및 거대분자는 생물학적 활성 부위의 "부착소화(heptenization)" 및 컨쥬게이트에 대한 면역 반응의 생성을 피하기 위하여 약 1:1 비율로 결합된다. 더욱이, 펩타이드는 거대분자에서 단일 부위에 유리하게 첨부된다. 예를 들면, HSA의 비정상적으로 반응하는 시스테인 34(C34)에 대한 선택적 결합이 사용될 수 있다. 말레이미드 함유 링커 등을 이용하는 C34에 선택적 결합 방법은 당업계에 잘 알려져 있다.

펩타이드의 하나 이상의 분자가 거대분자에 결합되는 경우, 거대분자의 단일 점에 부착하는 "다가(multivalent)" 링커를 통하여 유리하게 완성된다. 예를 들면, 링커는 링커에 다수의 펩타이드들의 부착을 허용하는 HSA의 C34에 첨부될 수 있다. 다가 링커는 당업계에 잘 알려져 있으며, HSA의 C34와 반응하는 티오필릭기(thiophilic group), 및 링커에 대한 다수의 펩타이드들의 부착을 허용하는 다중의 친핵성 기(NH 또는 OH) 또는 친전자성 기(활성화된 에스테르)를 포함할 수 있다.

본 발명의 펩타이드 제조

본 발명의 펩타이드는 당업계에 잘 알려진 기술에 의해 합성 또는 제조될 수 있다. 펩타이드 합성기들은 상업적으로 이용가능한 형태, 예를 들면, Applied Biosystems 또는 Milligen/Biosearch 등을 사용한다. 또 예를 들면, Creighton, 1983, Proteins: Structures and Molecular Principles, W.H. Freeman and Co., N.Y., 참조, 본 명세서에서 전체를 참고자료로 통합 수록하였다. 짧은 펩타이드들은 고상 지지체 또는 용액으로 합성될 수 있다. 긴 펩타이드 또는 인간 혈청 알부민과 같은 담체 단백질과 긴 펩타이드의 융합은 재조합 DNA 기술을 사용하여 제조할 수 있다. 상기 펩타이드를 포함하는 원하는 펩타이드 또는 융합 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열은 당업계에 통상적으로 잘 알려진 기술에 의하여 합성되고 및/또는 클론되고 발현될 수 있다. 예를 들면, Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Vols. 1-3, Cold Spring Harbor Press, N.Y. 참조.

또한 상기 펩타이드는 펩타이드의 아미노산 잔기를 결합하는 하나 또는 그 이상의 결합이 비-펩타이드 결합이 되도록 합성될 수 있다. 양자택일적인 비-펩타이드 결합은 당업계에 잘 알려진 반응에 의해 생성될 수 있으며, 이미노, 에스테르, 히드라지드, 세미카르바지드(semicarbazide) 및 아조(azo) 결합을 포함하지만 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 다른 구현예에서, 상기에 기재된 서열을 포함하는 펩타이드는 펩타이드의 안정성, 생체이용가능성 및/또는 억제 활성이 증강된 이들의 아미노 및/또는 카르복시 말단에서 부가적 화학기들로 합성될 수 있다. 예를 들면, 카르보벤즈옥실(carbobenzoxyl), 단실(dansyl) 또는 t-부틸옥시카르보닐기와 같은 소수성기는 펩타이드의 아미노 말단에 첨가될 수 있다. 마찬가지로 아세틸기 또는 9-플로오레닐메톡시-카르보닐기(9-fluorenylmethoxy-carbonyl group)는 펩타이드의 아미노 말단과 교체될 수 있다. 부가적으로, 소수성기, t-부틸옥시카르보닐 또는 아미노기는 펩타이드의 카르복시 말단에 첨가될 수 있다. 또한 비-자연적으로 발생하는 아미노산들은 펩타이드의 안정성, 생체이용가능성 또는 결합/억제 특성을 개선하기 위하여 첨가될 수 있다. 예를 들면, 메티오닌(methionine)은 노르류신(norleucine)과 교체될 수 있다. 다른 비-자연적으로 발생하는 아미노산 잔기들이 잘 알려져 있다.

또한 본 발명의 펩타이드들은 보존된 또는 비-보존된 특성이 될 수 있는 아미노산 치환을 포함할 수 있다. 보존된 아미노산 치환은 예를 들어 글루탐산(E)에서 아스파르트산(D)으로의 아미노산 치환과 같이 유사한 전하량, 크기 및/또는 소수성의 아미노산 펩타이드 서열에서 하나 또는 그 이상의 아미노산이 교체되어 이루어진다. 보존된 치환으로만 만들어지는 경우, 생성된 펩타이드는 비치환된 펩타이드의 기능성이 잔류한다. 비-보존된 아미노산 치환은 예를 들어 글루탐산(E)에서 발린(V)으로의 아미노산 치환과 같이 다른 전하량, 크기 및/또는 소수성을 가지는 아미노산과 펩타이드 서열에서 하나 또는 그 이상의 아미노산이 교체되어 이루어진다. 본 발명의 펩타이드는 보존된 특성의 아미노산 치환을 유리하게 포함한다.

본 발명의 펩타이드 안정성은 혈액 성분과 같은 담체 단백질에 대한 생체 내 또는 생체 밖 결합에 의하여 증가될 수 있다. 본 발명에서 사용하는 적절한 혈액 성분은 당업계에 잘 알려져 있다. 인간 혈청 알부민("HSA")은 인간 혈액의 주요 성분이며 특히 본 발명에서 사용하기에 적절하다. 특히 HSA는 단백질에 대한 펩타이드 화합물의 공유 결합을 위한 반응 티올 부위를 제공하는 노출된 표면 시스테인 잔기를 가진다. 티올에 결합하기에 적절한 활성화된 링커는 말레이미드와 같은 불포화 사이클릭 이미드, α-요오드- 및 α-브로모 아세테이트와 같은 α-할로 에스테르 및 비닐 피리딘 유도체를 포함한다. 이러한 링커들은 합성하는 동안에 펩타이에 첨가될 수 있고 N 및/또는 C 말단을 유리하게 사용한다 하더라도 서열에서 어떤 포인트에서 첨가될 수 있다. 적절한 활성화된 링커들은 Pierce Chemical(Rockford, IL)과 같이 상업적으로 이용가능한 형태이다. HSA에 결합하기 위한 적절한 활성화된 화합물의 제조방법은 당업계에 잘 알려져 있다. 미국특허 제5,612,034호 참조, 본 명세서에서 전체를 통합 수록하였다.

더욱이 HSA의 유전자는 펩타이드 및 HSA의 융합 단백질의 준비 제조를 허용하여 클론된다. 융합 단백질의 제조방법은 당업계에 잘 알려져 있다. 예를 들면, 국제공개특허공보 제WO01/79271호 및 제WO01/79258호 참조, 본 명세서에서 이들의 전체를 참고자료로 통합 수록하였다. 융합 단백질의 제조는 현재 항-바이러스 펩타이드의 지속적인 유도체들을 제조하는데 유용하다.

항-바이러스 화합물에 결합하기에 적절한 다른 혈액 성분은 면역글로불린("Ig") 분자이다. Igs은 혈액에서 상대적으로 높은 농도로 지속되고 존재한다. 시험실에서의 커플링을 위하여, Igs은 안정하고 쉽게 분리되는 이점을 가지고 Ig 컨쥬게이트를 제조하는 방법은 당업계에 잘 알려져 있다. 더욱이, Ig 유전자들은 쉽게 클론되고 재조합 Ig 및 Ig 융합 단백질이 제조된다. 온전한 인간 Ig을 획득하는 방법은 당업계에 잘 알려져 있다. 예를 들면, 미국특허 제5,969,108호 및 제6,300,064호 참조, 본 명세서에서 전체를 참고자료로 통합 수록하였다. 또한, HSA에 결합하기 위하여 요구되는 결합 활성을 가지는 Igs을 선택하는 파지 전시법은 당업계에 잘 알려져 있다. 미국특허 제5,885,793호, 제5,969,108호 및 제6,300,064호 참조. 본 발명의 배경에서, Ig는 전체 IgG, IgM, Fab 단편, F(ab')₂ 단편 및 단일쇄 Fv 단편을 포함하는 당업계에 잘 알려진 적절한 면역글로불린 또는 면역글로불린 유도체를 말한다.

본 발명에서 사용하기에 적절한 다른 혈액 성분들은 트랜스페린(transferrin), 페리틴(ferritin), 스테로이드 결합 단백질, 티록신(thyroxin) 결합 단백질 및 α-2-매크로글로불린을 포함한다.

또한 펩타이드에서, 활성화된 링커들은 리신 측쇄와 같은 측쇄 잔기와 반응하여 커플될 수 있다. 예를 들면, 활성 에스테르 부위 및 말레이미드 부위를 포함하는 결합기는 펩타이드의 리신 측쇄 또는 N-말단을 통해 활성 에스테르(N-히드록시숙신이미딜 에스테르)에서 선택적으로 반응될 수 있다.

천연 및 재조합 HSA 및 인간 Igs 모두 상업적으로 이용가능하며 본 발명에서 사용하기에 적절하다.

또한 펩타이드는 이들의 아미노 및/또는 카르복시 말단에 공유적으로 결합하는 비-펩타이드 거대분자 담체기를 가질 수 있다. 이러한 거대분자 담체기는 지질-지방산 컨쥬게이트, 폴리에틸렌 글리콜 또는 탄수화물을 포함할 수 있다.

펩타이드의 용도

본 발명의 펩타이드들은 SARS 바이러스와 같은 코로나바이러스에 대하여 잠재적 항바이러스 활성을 보인다. 이와 같이, 상기 펩타이드들은 인간 및 비-인간 코로나바이러스, 특히 SARS의 비감염된 세포로의 전이 억제제로서 사용될 수 있다. SARS 바이러스 및 뮤린 헤파티티스 바이러스(MHV)의 S2 단백질의 C-말단 HR2 도메인 유래의 다양한 펩타이드들은 세포 배양 분석에서 이들 바이러스들에 대한 항바이러스 활성을 보였다(Liu et al ., Lancet 363: 938 (2004); 및 Bosch et al ., J. Virol. 77: 8801 (2003) 참조). 본 발명의 펩타이드에 의해 전이가 억제될 수 있는 인간 SARS 바이러스는 SARS 바이러스의 모든 균주를 포함하지만 이에만 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 펩타이드에 의해 전이가 억제될 수 있는 비인간 레트로바이러스는 온전한 가정 동물 및 가축을 감염시키는 젖소, 돼지, 쥐 및 닭 유래의 코로나바이러스를 포함하지만 이에만 한정되는 것은 아니다. 그러나, 코로나바이러스를 예방하는데 사용되는 펩타이드가 감염 바이러스 균주의 특이 서열을 사용하여 유도되는 경우 대부분 효과적일 것이라는 사실은 당업자에게 자명할 것이다.

인간에서 SARS와 관련하여, 본 발명의 펩타이드들은 SARS 감염을 치료하는데 치료제로서 사용될 수 있다. 본 발명의 펩타이드들은 당업계에 잘 알려진 기술을 이용하여 투여될 수 있다. 바람직하게는, 제제들은 시스템적으로 제형화되고 투여된다. 제형 및 투여에 관한 기술은 "Remington's Pharmaceutical Sciences" 18th ed., 1990 Mack Publishing Co., Easton, Pa에서 발견할 수 있다. 적절한 경로를 일부만 들어보면, 경구, 직장, 경점막(transmucosal) 또는 장내 투여; 근육내, 피하의, 골수내 주사뿐만 아니라 수막강내(intrathecal), 직접 심실내(intraventricular), 정맥내, 복강내, 비강내 또는 수정체내 주사를 포함하는 비경구 운반을 포함할 수 있다. 가장 바람직하게는, 정맥내 투여가 좋다. 주사를 위하여, 본 발명의 제제들은 수용액으로 제형화될 수 있고, 바람직하게는 행크스(Hanks') 용액, 링거스(Ringer's) 용액 또는 생리 식염수 완충액과 같이 생리학적으로 적절한 완충액이 좋다. 경점막 투여를 위해서는 투과되는 경계에 적절한 침윤제가 제형내에 사용된다. 이러한 침윤제는 당업계에 일반적으로 알려져 있다. 다른 희석제, 조절제 및 부형제는 당업계에 알려져 있다.

또한 펩타이드들은 SARS 바이러스에 심각한 노출 후에 이전의 비감염된 개체들에서 예방 수단으로 사용될 수 있다. 펩타이드의 이러한 예방 용도의 예로는 SARS 전이 가능성이 병원 및 항공기 및 기차역과 같은 운송 터미널에 존재하도록 세팅하는 것을 포함하지만, 이에만 한정되는 것은 아니다. 이러한 경우에서 본 발명의 펩타이드들은 예방 백신의 역할을 제공할 수 있으며, 숙주는 본 발명의 펩타이드에 대한 항체를 생성하고 SARS 감염을 억제하여 SARS 바이러스를 상쇄시킨다. 따라서, 예방 백신으로서 본 발명의 펩타이드 투여는 감염 세포에서 SARS 활성을 억제하여 SARS 또는 관련된 코로나바이러스를 상쇄하는데 충분한 면역 반응을 초래하는데 효과적인 펩타이드의 농도를 숙주에 투여하는 단계를 포함할 수 있다. 정확한 농도는 투여되는 특이 펩타이드에 의존하지만, 당업계의 통상적인 기술을 가진 자에게 잘 알려진 면역 반응의 발전을 정량하는 표준 기술을 사용하여 측정될 수 있다. 백신으로 사용되는 펩타이드들은 일반적으로 근육내로 투여된다.

펩타이드는 면역 반응을 증강시키기 위한 적절한 보조제와 함께 제형화될 수 있다. 이러한 보조제들은 수산화 알루미늄과 같은 미네랄 겔; 리소레시틴(lysolecithin), 플루로닉(pluronic) 폴리올, 다가음이온(polyanions)과 같은 표면 활성 기질; 다른 펩타이드; 오일 에멀젼; 및 BCG 및 코리네박테리움 파르붐(Corynebacterium parvum)과 같이 잠재적으로 유용한 인간 보조제를 포함할 수 있다. 많은 방법들이 본 명세서에 기재된 백신 제형에 도입되어 사용될 수 있다. 이들 방법들은 경구, 내피, 근육내, 복강내, 정맥내, 피하 및 비강내 경로를 포함하지만, 이에만 한정되는 것은 아니다.

선택적으로, 본 발명의 펩타이드에 대항하여 생산되는 다클론 또는 단클론 항체의 효과적인 농도는 비감염된 세포가 SARS 바이러스 또는 다른 코로나바이러스에 의해 감염되지 않도록 숙주에 투여될 수 있다. 이러한 항체들의 정확한 농도는 각각의 특이 항체 조제에 따라 변화하지만, 당업계의 통상적인 기술을 가진 자에게 잘 알려진 표준 기술을 사용하여 결정될 수 있다. 항체의 투여는 다양한 기술을 사용하여 수행하는 것을 포함하지만, 이 부분에서 기재된 것에만 한정되는 것은 아니다.

투여되는 본 발명에 의한 펩타이드의 효과적인 복용량은 생물학적 반감기, 생체이용가능성 및 독성 등의 매개변수를 설명하는 당업계에 잘 알려진 과정을 통하여 결정될 수 있다.

본 발명에 의한 펩타이드의 항바이러스 활성은 진술된 유형 및 아형 특이성, 즉, 특이적 코로나바이러스만의 활성 억제에서 효과적인 특이 펩타이드를 보인다. 본 발명의 이 특성에는 많은 이점이 존재한다. 예를 들면, 진단 분야에서 하나의 이점은 바이러스 분리물의 상동성을 확인하는데 본 발명의 펩타이드의 항바이러스 특이성을 이용할 수 있다는 것이다. 코로나바이러스와 관련하여, 보다 가벼운 감기류 증상을 유발하는 SARS 또는 바이러스를 발생시키는 코로나바이러스로 이루어진 바이러스 분리물인지를 쉽게 결정할 수 있다. 예를 들면, 비감염된 세포들은 SARS 바이러스를 포함하는 것으로 확인된 코로나바이러스 분리물과 공동-감염(co-infected)될 수 있다. 세포 상청액의 레트로바이러스 활성을 알려진 방법을 이용하여 정량한 후에 SARS 바이러스에 대하여 작용하는 것으로 알려진 본 발명의 펩타이드를 첨가할 수 있다. 바이러스 활성이 완전히 또는 거의 완전히 억제된 이들 분리물들은 SARS 바이러스를 포함한다. 바이러스 활성이 변화되거나 또는 적은 양에 의하여서만 감소되는 이들 분리물들은 SARS 바이러스를 포함하지 않은 것으로 간주될 수 있다. 이러한 분비물은 하나 또는 그 이상의 본 발명의 다른 펩타이드와 함께 처리된 다음, 계속해서 바이러스 분비물의 상동성을 결정하기 위하여 이들의 바이러스 활성을 검사한다.

도 1은 숙주 세포와 융합하는 SARS-CoV 모델 및 SARS-CoV과 숙주 세포막 사이에 융합을 차단하는 억제제 모델을 보여준다. SARS-CoV는 S1과 S2 도메인을 구성하는 표면 스파이크(spike) 단백질을 포함한다. SARS-CoV는 S1 도메인과 숙주 세포 수용체인 ACE2 사이의 상호작용을 통하여 숙주 세포에 결합한다. S2 단백질의 HR2 나선들은 HR1 나선들에 포개져 상호작용하고 융합을 위하여 바이러스와 숙주 세포 막을 함께 끌어들이는 "헤어핀-류" 구조를 생성한다. 억제제는 HR1 트라이머(trimer)에 결합하고 HR1과 HR2의 결합을 차단하여 숙주 세포와 SARS-CoV 융합을 억제하며 아랫 부분에서 보여진다. Shibo Jiang 박사에 의한 www.nybloodcenter.org/pdf/Anti-SARS%20Peptide%20Model.pdf에 의한 모델이다.

도 2는 SARS 코로나바이러스 유래의 펩타이드에서 E2 당단백질 전구체인 Tor2를 분리하는 이차 구조 예상 및 상동 분석 결과의 대표적인 예 중 일부를 보여준다. 대부분 높게 예상된 나선 영역의 아미노산들은 굵게 나타내었다. E, H 및 L 설계는 이차 구조 예상 알고리듬에서 유래하고 각각 연장된 또는 코일(coil), 나선 및 루프 영역을 말한다. 숫자들은 0에서 9까지 예상의 확실한 정확도를 말한다. 마지막 줄은 테스트한 코로나바이러스의 다양한 S2 단백질들 사이에서 퍼센트 아미노산 서열 상동관계를 가리킨다. 잔기들은 모든 S2 코로나 바이러스 단백질에서 70% 이상 보존된다; 일치하는 것과 동일한 SARS S2 단백질에서 잔기들은 굵게 강조하였다.

SEQUENCE LISTING <110> SEQUOIA PHARMACEUTICALS, INC. <120> ANTIVIRAL AGENTS FOR THE TREATMENT, CONTROL AND PREVENTION OF INFECTIONS BY CORONAVIRUSES <130> 38911-0009WO <140> PCT/US04/012962 <141> 2004-04-28 <150> 60/465,782 <151> 2003-04-28 <150> 60/466,432 <151> 2003-04-30 <160> 197 <170> PatentIn version 3.3 <210> 1 <211> 49 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 1 Asp Val Asp Leu Gly Asp Ile Ser Gly Ile Asn Ala Ser Val Val Asn 1 5 10 15 Ile Gln Lys Glu Ile Asp Arg Leu Asn Glu Val Ala Lys Asn Leu Asn 20 25 30 Glu Ser Leu Ile Asp Leu Gln Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile 35 40 45 Lys <210> 2 <211> 45 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 2 Gln Ile Pro Phe Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe Asn Gly Ile Gly 1 5 10 15 Val Thr Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Gln Ile Ala Asn Gln 20 25 30 Phe Asn Lys Ala Ile Ser Gln Ile Gln Glu Ser Leu Thr 35 40 45 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Claims

7에서 50개 사이의 아미노산을 가지는 항바이러스 펩타이드로서, 상기 펩타이드는 코로나바이러스에 대한 항바이러스 활성을 보이고, 상기 펩타이드는 하기 서열 중 하나로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산을 포함하는 서열을 포함하는 항바이러스 펩타이드:
제 1항에 있어서, 상기 펩타이드는 하기와 같이 이루어진 군으로부터 선택된 서열을 포함하는 것임을 특징으로 하는 펩타이드:
제 1항에 있어서, 상기 펩타이드는 하기 서열 중 하나로부터 10, 15, 20, 25, 30, 35 또는 40개 이상의 연속하는 아미노산을 포함하는 것임을 특징으로 하는 펩타이드:
선행하는 청구항들에 있어서, 상기 펩타이드는 담체 단백질에 결합됨을 특징으로 하는 펩타이드.
선행하는 청구항들에 있어서, 상기 펩타이드는 인간 혈청 알부민에 결합하는 것임을 특징으로 하는 펩타이드.
7에서 50개 사이의 아미노산을 가지는 항바이러스 펩타이드로서, 상기 펩타이드는 코로나바이러스에 대한 항바이러스 활성을 보이고, 상기 펩타이드는 하기 구조를 가지는 항바이러스 펩타이드:

B-X-Z,

상기 B는 약 43개 이하의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열이거나, B는 아미노기, 아세틸기, 9-플루오레닐메톡시-카르보닐기, 소수성기 또는 거대분자 담체기이거나, 또는 B는 담체 단백질이며, 이 경우 B는 8개 이상의 아미노산을 포함할 수 있고 또한 담체 단백질에 대한 항바이러스 서열을 연결하는 링커 펩타이드 서열 을 포함할 수 있으며;

Z는 43개 이하의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열이거나, Z는 카르복시기, 아미도기(amido group), 소수성기 또는 거대분자 담체기를 포함하거나, 또는 Z는 HSA와 같은 담체 단백질이며, 이 경우 Z는 8개 이상의 아미노산들을 포함할 수 있고 또한 담체 단백질에 대한 항바이러스 서열을 연결하는 링커 펩타이드 서열을 포함할 수 있으며;

B와 Z가 함께 고려될 때 B와 Z기 사이에 8개 이상의 아미노산을 포함하여야 하고;

여기에서 X는 하기와 같은 서열 중 하나로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산을 포함하는 펩타이드 서열임:
제 6항에 있어서, 하기 서열 중 하나로부터 10, 15, 20, 25, 30, 35 또는 40개 이상의 연속하는 아미노산을 포함하는 펩타이드:
7에서 50개 사이의 아미노산을 가지는 항바이러스 펩타이드로서, 상기 펩타이드는 코로나바이러스에 대한 항바이러스 활성을 보이고, 상기 펩타이드는 연속하는 헵타펩타이드(heptapeptide)의 7개 위치 중 두 군데에서 상동성을 보이며,

상기 연속하는 헵타펩타이드는 하기 서열 중 하나로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산을 포함하는 서열을 포함하는 것임을 특징으로 하는 항바이러스 펩타이드:
제 8항에 있어서, 상기 서열 상동성은 상기 연속하는 헵타펩타이드에서 ith 및 i=4th 부위에 위치함을 특징으로 하는 펩타이드.
선행하는 청구항에 따른 펩타이드, 약제학적으로 허용가능한 희석제, 보조제 및/또는 부형제를 포함하는 약제학적 조성물.
선행하는 청구항에 따른 펩타이드 또는 조성물의 유효량을 감염된 것으로 의심되는 환자에게 투여하는 단계를 포함하여, 환자에서 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법.
제 11항에 있어서, 상기 환자는 인간임을 특징으로 하는 방법.
제 11항에 있어서, 상기 환자는 젖소, 돼지 또는 닭임을 특징으로 하는 방법.
7에서 50개 사이의 아미노산들을 가지는 항바이러스 펩타이드로서, 상기 펩타이드는 코로나바이러스에 대항하는 항바이러스 활성을 가지고, 하기와 같은 서열로부터 7개 이상의 연속하는 아미노산들을 포함하는 서열을 포함하는 펩타이드:

상기에서, 굵은 알파벳 위치의 아미노산들은 I, L, V, W, Y, F, N, Q, S, T, D, E, G, H 및 M으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산과 치환될 수 있고, 상기 굵지않은 알파벳 위치의 아미노산들은 프롤린을 제외한 어떠한 아미노산도 될 수 있음.
담체 단백질에 공유 결합되는 제 14항에 의한 펩타이드를 포함하는 화합물.
제 14항에 있어서, 굵은 알파벳 위치의 8개 이상의 아미노산들은 I, L, V, W 및 Y로 이루어진 군에서 선택된 것임을 특징으로 하는 펩타이드.
제 15항에 있어서, 상기 화합물은 융합 단백질임을 특징으로 하는 화합물.
제 15항에 있어서, 상기 펩타이드는 비-펩타이드 링커에 의해 상기 담체 단백질에 결합됨을 특징으로 하는 화합물.
제 14항에 의한 펩타이드 및 약제학적으로 허용가능한 부형제, 희석제 또는 보조제를 포함하는 약제학적 조성물.
제 19항에 의한 약제학적 조성물을 환자에게 투여하는 단계를 포함하여, 환자에서 코로나바이러스 감염을 예방 또는 치료하는 방법.