KR20030077790A - Pcr primers for amplifying the gene of pathogenic microorganism, and method and test kit for detecting pathogenic microorganism by using the same - Google Patents

Pcr primers for amplifying the gene of pathogenic microorganism, and method and test kit for detecting pathogenic microorganism by using the same Download PDF

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Abstract

PURPOSE: Provided is a primer set for amplifying the gene of pathogenic microorganism which is used in making the polymerase chain reaction (PCR) to rapidly and correctly detect maximally nine kinds of pathogenic microorganism causing bacterial foodborne intoxication. CONSTITUTION: The primer set for amplifying the gene of pathogenic microorganism comprises a pair of primer for amplifying the gene of Campylobacter jejuni having the base sequence of SEQ ID NO 1 and 2, that of E. coli 0157:H7 having the base sequences of SEQ ID NO 3 and 4, that of Bacillus cereus having the base sequences of SEQ ID NO 5 and 6, that of Listeria monocytogenes having the base sequences of SEQ ID NO 7 and 8, that of Yersinia enterocolitica having the base sequences of SEQ ID NO 9 and 10, that of Salmonella sp. having the base sequences of SEQ ID NO 11 and 12, that of Staphylococcus aureus having the base sequences of SEQ ID NO 13 and 14, that of Shigella spp. having the base sequences of SEQ ID NO 15 and 16, and that of Vibrio parahaemolyticus having the base sequences of SEQ ID NO 17 and 18.

Description

병원성 미생물의 유전자 증폭용 프라이머, 이를 이용한 병원성 미생물의 검출방법, 및 검출키트{PCR PRIMERS FOR AMPLIFYING THE GENE OF PATHOGENIC MICROORGANISM, AND METHOD AND TEST KIT FOR DETECTING PATHOGENIC MICROORGANISM BY USING THE SAME}Primer for gene amplification of pathogenic microorganism, method for detecting pathogenic microorganism using same, and detection kit {PCR PRIMERS FOR AMPLIFYING THE GENE OF PATHOGENIC MICROORGANISM, AND METHOD AND TEST KIT FOR DETECTING PATHOGENIC MICROORGANISM BY USING THE SAME}

본 발명은 9종의 병원성 미생물의 특정 유전자를 증폭가능한 PCR 프라이머쌍, 이를 사용하여 다중 중합효소연쇄반응(Multiplex-Polymerase Chain Reaction; M-PCR)을 수행하여 식중독의 원인이 되는 병원성 미생물을 신속 정확하게 검출해 내는 병원성 미생물 검출방법, 및 검출키트에 관한 것이다.According to the present invention, PCR primer pairs capable of amplifying specific genes of nine pathogenic microorganisms, and using the same, perform a multiplex-polymerase chain reaction (M-PCR) to quickly and accurately identify pathogenic microorganisms causing food poisoning. The present invention relates to a pathogenic microorganism detection method and a detection kit.

과학기술의 발달에도 불구하고 식중독을 완전히 예방하는 것은 여전히 어려운 일이다. 식중독은 그 원인에 기초하여 자연독(복어독, 버섯독 등)에 의한 식중독; 음식물의 부패에 의한 식중독; 및 음식물 중 세균의 혼입 내지는 번식에 의한 식중독으로 크게 나눌 수 있다. 이들 식중독 중 자연독에 의한 식중독은 원인이 되는 음식물의 섭취를 피함으로써 쉽게 예방할 수 있고, 음식물의 부패는 음식물의 외관, 냄새 등의 변화에 의해 용이하게 검출되므로 음식물의 부패에 의한 식중독을 피하는 것도 비교적 용이하다. 그러나, 이에 비해 세균에 의한 식중독, 즉 세균성 식중독의 경우는 세균의 음식물에의 혼입 내지는 번식이 일반적으로 육안으로 관찰되지 않고 전문적인 방법에 의하지 않고는 검출이 매우 곤란하기 때문에 가장 예방이 어려운 식중독이라고 할 수 있다.Despite the development of science and technology, it is still difficult to completely prevent food poisoning. Food poisoning is food poisoning caused by natural poisoning (blowfish poison, mushroom poison, etc.) based on the cause; Food poisoning due to food decay; And food poisoning by incorporation or reproduction of bacteria in food. Among these food poisonings, food poisoning caused by natural poisoning can be easily prevented by avoiding the ingestion of foods that cause the food poisoning. Relatively easy. However, in the case of food poisoning caused by bacteria, that is, bacterial food poisoning, food poisoning is most difficult to prevent because it is generally not observed by the naked eye and is difficult to detect by professional methods. can do.

최근 식당, 주문 배달업, 급식 센터, 패스트푸드점 등 대량으로 음식물을 공급하는 시설과 이를 이용하는 소비자가 많아짐에 따라 이러한 시설에서 세균성 식중독이 발생할 경우 단시간내 많은 사람들이 식중독에 걸릴 위험이 있다. 그리고 세균성 식중독은 심한 구토, 설사, 복통, 고열 등과 같이 그 증상이 심각하기 때문에 집단 식중독의 발생은 식품공급업체와 소비자 모두에게 중대한 문제가 된다. 또한 이러한 식중독 원인균은 감염된 사람의 체내에서 내독소 등의 독성물질을 생성하기 때문에 감염후에 치료를 수행해야 하고, 치료가 어려운 경우도 많이 있으며, 특히 병원성 대장균 O157:H7 과 같이 출혈성 장염 등의 매우 심각한 증상을 나타내고 심한 경우 사망으로 이어지는 경우도 있다. 따라서, 이러한 병원성 식중독의 원인균을 조기에 발견하여 예방하는 것이 절실히 필요하다고 할 수 있다.Recently, as food facilities, such as restaurants, order delivery, food centers, and fast food restaurants, are being used in large quantities, and many consumers use them, there is a risk that many people will get food poisoning in a short time when bacterial food poisoning occurs in these facilities. And because bacterial food poisoning is severe, such as severe vomiting, diarrhea, abdominal pain, and high fever, the occurrence of group food poisoning is a significant problem for both food suppliers and consumers. In addition, these food poisoning causative bacteria produce toxic substances such as endotoxins in the body of infected people, so the treatment should be performed after infection, and in many cases, the treatment is difficult. Especially, very serious such as hemorrhagic enteritis such as pathogenic E. coli O157: H7 Symptoms may be severe and lead to death in severe cases. Therefore, it can be said that there is an urgent need for early detection and prevention of the causative agent of pathogenic food poisoning.

세균성 식중독의 원인균을 검출·확인하는 방법으로는, 채취한 검체를 선택배지를 이용하여 배양하고, 배지에 형성된 콜로니를 육안으로 관찰하거나, 기타 탐지확인 수단을 이용하여 확인하는 방법 등이 있으며, 최근에는 중합효소연쇄반응(PCR)을 이용한 검사법이 개발 및 사용되고 있다.As a method of detecting and confirming the causative agent of bacterial food poisoning, the collected sample is cultured using a selective medium, the colonies formed on the medium are visually observed, or other detection and confirmation means are used. In the test method using a polymerase chain reaction (PCR) has been developed and used.

중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction : PCR)은 아주 적은 양의 DNA만을 갖고서도 특정 부위의 DNA서열을 기하급수적으로 증폭할 수 있는 간단하고 편리한 방법으로, 증폭하고자 하는 DNA에 특이적으로 결합하는 서로 반대 방향의 두 종류의 프라이머와, 고온에서도 기능적으로 안정한 Taq DNA 중합효소(polymerase)를 사용하여 서로 다른 세 가지 온도의 순환과정인 변성(Denaturation step), 결합(Annealing step), 연장(Extension step)을 반복적으로 실행함으로써 특정 DNA를 증폭하게 된다. PCR을 이용한 병원성 미생물의 검출방법은, 검출하고자 하는 미생물의 특이 유전자를 인식하는 프라이머를 이용하여 PCR 반응으로 이를 증폭하고 전기영동등의 방법으로 이를 확인하게 되는데, 검출효율이 높아 검체 중에 미량으로 존재하는 병원성 미생물도 검출할 수 있다.Polymerase Chain Reaction (PCR) is a simple and convenient way to exponentially amplify DNA sequences of specific regions with very small amounts of DNA. Two different primers in the opposite direction and Taq DNA polymerase, which are functionally stable at high temperatures, are used in three different temperature cycles: denaturation step, annealing step, and extension step. Repeatedly amplify specific DNA. The detection method of pathogenic microorganisms using PCR is amplified by PCR reaction using primers that recognize specific genes of microorganisms to be detected and confirmed by electrophoresis, etc. Pathogenic microorganisms can also be detected.

PCR을 이용한 병원성 미생물 검출방법과 관련된 선행기술로는, 특허공개 제1999-65107호는 중합효소연쇄반응법을 이용하여 병원성 대장균(O157:H7)이 가지고 있는 특이 유전자 4종(베로톡신 2종, 장벽 부착 병원인자 및 효소 특이 유전자)을 검출할 수 있는 다종 유전자 동시 검출방법(multiplex-PCR)을 기술하고 있다. 또한, 특허공개 제1999-88425호는 EHEC 또는 VTEC의 베로독소 유전자 또는 병원성 대장균 O157의 O 항원 합성영역 유전자와 선택적으로 혼성화하는 올리고뉴클레오티드를 제조하여 이 올리고뉴클레오티드를 프라이머로 사용하여 PCR을 수행함으로써O157을 생산하는 균 및 베로독소를 생산할 수 있는 대장균을 선택적으로 검출하는 방법에 관해 기술하고 있다.As a prior art related to a pathogenic microorganism detection method using PCR, Patent Publication No. 1999-65107 discloses four specific genes (2 verotoxins) possessed by Escherichia coli (O157: H7) using a polymerase chain reaction method. A method for simultaneously detecting multiple genes (multiplex-PCR) capable of detecting barrier-associated pathogens and enzyme specific genes) is described. In addition, Japanese Patent Laid-Open No. 1999-88425 discloses oligonucleotides that selectively hybridize with the Verotoxin gene of EHEC or VTEC or the O antigen synthesis region gene of Escherichia coli O157, and perform PCR using this oligonucleotide as a primer. It describes a method for selectively detecting the bacteria producing E. coli and E. coli capable of producing vero toxin.

본 발명의 목적은 사람에게 식중독을 일으키는 병원성 미생물의 특이 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 제공함에 있다.An object of the present invention is to provide a primer capable of amplifying a specific gene of a pathogenic microorganism causing food poisoning in humans.

본 발명의 또다른 목적은 사람에게 식중독을 일으키는 병원성 미생물의 특이 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 이용한 중합효소연쇄반응으로 병원성 미생물을 검출할 수 있으며 식중독균의 진단 시간을 종래의 4일∼7일에서 하루로 단축할 수 있는 신속하고 정확한 병원성 미생물의 검출 방법을 제공함에 있다.Still another object of the present invention is to detect pathogenic microorganisms by polymerase chain reaction using primers that can amplify specific genes of pathogenic microorganisms causing food poisoning in humans. It is to provide a fast and accurate method for detecting pathogenic microorganisms that can be shortened to one day.

본 발명의 또다른 목적은 사람에게 식중독을 일으키는 병원성 미생물의 특이 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 이용한 중합효소연쇄반응으로 단시간내에 신속하고 정확하게 병원성 미생물을 검출할 수 있는 병원성 미생물의 검출키트를 제공함에 있다.It is another object of the present invention to provide a detection kit for pathogenic microorganisms that can detect pathogenic microorganisms quickly and accurately in a short time by polymerase chain reaction using a primer that can amplify specific genes of pathogenic microorganisms causing food poisoning in humans. have.

도 1a, 1b, 및 1c는 병원성 미생물을 혼합 배양한 후 추출한 게놈 DNA를 주형으로 하여 다중 중합효소연쇄반응(Multiplex-PCR)을 수행한 후 전기영동한 결과를 나타낸 것이다.Figures 1a, 1b, and 1c shows the results of electrophoresis after performing multiplex polymerase chain reaction (Multiplex-PCR) using the genomic DNA extracted after the mixed culture of the pathogenic microorganism as a template.

도 2a 내지 2i는 9종의 병원성 미생물을 각각 배양한 후 추출한 게놈 DNA를 주형으로 하여 중합효소연쇄반응을 수행한 후 전기영동한 결과를 나타낸 것이다.Figures 2a to 2i shows the results of electrophoresis after polymerase chain reaction using the genomic DNA extracted after culturing each of the nine pathogenic microorganisms as a template.

상기와 같은 목적을 달성하기 위해서, 본 발명은In order to achieve the above object, the present invention

서열번호 1 및 2에 나타난 염기서열을 갖는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 3 및 4에 나타난 염기서열을 갖는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 5 및 6에 나타난 염기서열을 갖는 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 7 및 8에 나타난 염기서열을 갖는단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 9 및 10에 나타난 염기서열을 갖는 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 11 및 12에 나타난 염기서열을 갖는 살모넬라(Salmonella sp.)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 13 및 14에 나타난 염기서열을 갖는 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 15 및 16에 나타난 염기서열을 갖는 쉬겔라(Shigella spp.)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 및 서열번호 17 및 18에 나타난 염기서열을 갖는 장염 비브리오(Vibrio parahaemolyticus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 프라이머쌍을 포함하는 병원성 미생물의 특이 유전자 증폭용 프라이머 세트를 제공한다.Primer for amplification of Campylobacter jejuni having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 1 and 2, E. coli O157: H7 ( E.coli O157: H7 ) having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 3 and 4 Primer pair for gene amplification of Bacillus cereus having a base sequence shown in SEQ ID NOs: 5 and 6, a pair of primers for amplification of gene of Bacillus cereus , Listeria monocytogenes having a base sequence shown in SEQ ID NOs: 7 and 8 Primer pair for amplification of genes of the genome of Yersinia enterocolitica having a base sequence shown in SEQ ID NOs: 9 and 10, Salmonella sp having a base sequence shown in SEQ ID NOs: 11 and 12 . a pair of primers for amplification of the gene), SEQ ID NO: 13 and having the nucleotide sequence shown in 14 Staphylococcus gene increased the mouse fluorescein (Staphylococcus aureus) For a pair of primers, SEQ ID NO: 15 and a pair of primers for gene amplification of the Sh Gela (Shigella spp.) Having the nucleotide sequence shown in 16, and SEQ ID NO: 17 and Vibrio parahaemolyticus having a base sequence shown in the 18 gene amplification (Vibrio parahaemolyticus) Provided is a primer set for specific gene amplification of a pathogenic microorganism comprising one or more primer pairs selected from the group consisting of primer pairs.

또한, 본 발명은 중합효소연쇄반응(PCR)을 이용한 병원성 미생물의 검출방법에 있어서, 상기 프라이머 세트를 이용한 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction)으로 식중독의 원인이 되는 병원성 미생물을 탐지하는 것을 특징으로 하는 병원성 미생물의 검출방법에 관한 것이다. 바람직하게는, 2종 이상의 다른 병원성 미생물의 유전자 증폭용 프라이머쌍을 포함하는 프라이머 세트를 이용한 다중 중합효소연쇄반응(Multiplex-Polymerase chain reaction)으로 식중독의 원인이 되는 9종의 병원성 미생물을 탐지하는 것을 특징으로 하는 2종 이상의 병원성 미생물의 검출방법을 제공하고자 한다.In addition, the present invention is a method for detecting pathogenic microorganisms using a polymerase chain reaction (PCR), characterized in that detecting the pathogenic microorganisms that cause food poisoning by polymerase chain reaction (Polymerase Chain Reaction) using the primer set It relates to a method for detecting pathogenic microorganisms. Preferably, the detection of nine pathogenic microorganisms causing food poisoning by a multiplex-polymerase chain reaction using a primer set comprising primer pairs for gene amplification of two or more different pathogenic microorganisms. It is intended to provide a method for detecting two or more pathogenic microorganisms.

또한, 본 발명은 중합효소연쇄반응(PCR)을 이용하여 병원성 미생물을 검출하도록 PCR 프라이머, 반응완충액, Taq DNA 중합효소을 포함하는 병원성 미생물의 검출키트에 있어서, 상기 PCR 프라이머는 서열번호 1 및 2에 나타난 염기서열을 갖는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 3 및 4에 나타난 염기서열을 갖는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 5 및 6에 나타난 염기서열을 갖는 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 7 및 8에 나타난 염기서열을 갖는 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 9 및 10에 나타난 염기서열을 갖는 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 11 및 12에 나타난 염기서열을 갖는 살모넬라(Salmonella sp.)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 13 및 14에 나타난 염기서열을 갖는 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 15 및 16에 나타난 염기서열을 갖는 쉬겔라(Shigella spp.)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 및 서열번호 17 및 18에 나타난 염기서열을 갖는 장염 비브리오(Vibrio parahaemolyticus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 프라이머쌍을 포함하는 병원성 미생물의 특이 유전자 증폭용 프라이머 세트인 것을 특징으로 하는 병원성 미생물 검출키트에 관한 것이다.In addition, the present invention is a kit for detecting pathogenic microorganisms, including PCR primers, reaction buffer, Taq DNA polymerase to detect pathogenic microorganisms using a PCR polymerase chain reaction (PCR), the PCR primers in SEQ ID NO: 1 and 2 A primer pair for amplification of the gene of Campylobacter jejuni having the nucleotide sequence shown, and a pair of primers for the gene amplification of E. coli O157: H7 ( E. coli O157: H7 ) having the nucleotide sequence shown in SEQ ID NOs: 3 and 4. Primer pairs for gene amplification of Bacillus cereus having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 5 and 6, primer pairs for gene amplification of Listeria monocytogenes having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 7 and 8 , SEQ ID NO: 9, and example 10 having the nucleotide sequence shown in reusi California Enterococcus coli urticae a pair of primers for amplification of the gene (Yersinia enterocolitica), SEQ ID No. 11 and salmonella having the nucleotide sequence shown in 12, a pair of primers for gene amplification of the (Salmonella sp.), SEQ ID NO: 13 and having the nucleotide sequence shown in 14 Staphylococcus fluorescein-house primer pairs for gene amplification (Staphylococcus aureus), Primer pairs for gene amplification of Shigella spp. Having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 15 and 16, and primer pairs for gene amplification of Vibrio parahaemolyticus having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 17 and 18. The present invention relates to a pathogenic microorganism detection kit comprising a primer set for amplifying a specific gene of a pathogenic microorganism comprising at least one primer pair selected from the group consisting of:

본 발명은 병원성 미생물의 특정 유전자를 증폭가능한 PCR 프라이머쌍, 이를 사용하여 다중 중합효소연쇄반응(Multiplex-Polymerase Chain Reaction; M-PCR)을 수행하여 식중독의 원인이 되는 병원성 미생물을 신속 정확하게 검출해 내는 병원성 미생물 검출방법 및 검출키트에 관한 것으로, 본 발명에 따른 병원성 미생물 및검출 키트를 사용함으로써 진단 시간을 종래의 4일∼7일에서 하루로 단축할 수 있는 신속하고 정확하게 병원성 미생물을 검출할 수 있다.According to the present invention, a PCR primer pair capable of amplifying a specific gene of a pathogenic microorganism, using the same, performs a Multiplex-Polymerase Chain Reaction (M-PCR) to quickly and accurately detect a pathogenic microorganism that causes food poisoning. The present invention relates to a pathogenic microorganism detection method and a detection kit. By using the pathogenic microorganism and the detection kit according to the present invention, pathogenic microorganisms can be detected quickly and accurately, which can shorten the diagnosis time from 4 days to 7 days. .

이하, 본 발명을 보다 구체적으로 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.

본 발명에서는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni), 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7), 바실러스 세레우스(Bacillus cereus), 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes), 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica) , 살모넬라(Salmonella sp.), 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus), 쉬겔라(Shigella spp.), 및 장염 비브리오(Vibrio parahaemolyticus)의 병원성 미생물의 특이 유전자를 탐지할 수 있도록 상기 특이 유전자의 증폭용 프라이머쌍을 제공한다. 바람직하게는, 본 발명은 상기 9쌍의 병원성 미생물의 프라이머쌍으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 프라이머쌍을 포함하는 프라이머 세트를 제공할 수 있다.In the present invention, Campylobacter jejuni , Escherichia coli O157: H7 ( E. coli O157: H7 ), Bacillus cereus, Bacillus cereus , Listeria monocytogenes , Yersinia enterocholicica ( Yersinia) the specific gene to detect specific genes of pathogenic microorganisms of enterocolitica ), Salmonella sp. , Staphylococcus aureus , Staglococcus aureus , Shigella spp. , and Vibrio parahaemolyticus A primer pair for amplification of is provided. Preferably, the present invention may provide a primer set including one or more primer pairs selected from the group consisting of the primer pairs of the nine pairs of pathogenic microorganisms.

상기 9종의 병원성 미생물의 특이 유전자를 서로 크기가 다르게 동시에 탐지할 수 있도록 9개의 PCR 프라이머쌍을 설계하고 합성한다.Nine PCR primer pairs are designed and synthesized so that specific genes of the nine pathogenic microorganisms can be detected simultaneously with different sizes.

첫 번째 PCR 프라이머쌍 P1/P2는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni)를 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭 산물의 크기는 127 bp이다. 본 PCR 프라이머의 염기서열은 다음과 같다.The first PCR primer pair P1 / P2 was designed to specifically detect Campylobacter jejuni , and the size of the amplification product was 127 bp. The base sequence of this PCR primer is as follows.

PCR 프라이머 P1 : 5'-attttcgctgattttgattttagg-3'(서열번호 1)PCR primer P1: 5'-attttcgctgattttgattttagg-3 '(SEQ ID NO: 1)

PCR 프라이머 P2 : 5'-tattgatatctttggtggaggcga-3'(서열번호 2)PCR primer P2: 5'-tattgatatctttggtggaggcga-3 '(SEQ ID NO: 2)

두 번째 PCR 프라이머쌍 P3/P4는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7)을 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭 산물의 크기는 208 bp이다. 염기서열은 다음과 같다.The second PCR primer pair P3 / P4 was designed to specifically detect E. coli O157: H7 ( E. coli O157: H7 ), and the size of the amplification product was 208 bp. The nucleotide sequence is as follows.

PCR 프라이머 P3 : 5'-gacagcagttataccactctgcaa-3'(서열번호 3)PCR primer P3: 5'-gacagcagttataccactctgcaa-3 '(SEQ ID NO: 3)

PCR 프라이머 P4 : 5'-gacgaaattctctctgtatctgcc-3'(서열번호 4)PCR primer P4: 5'-gacgaaattctctctgtatctgcc-3 '(SEQ ID NO: 4)

세 번째 PCR 프라이머쌍 P5/P6는 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)를 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭 산물의 크기는 305 bp이다. 염기 서열은 다음과 같다.The third PCR primer pair P5 / P6 was designed to specifically detect Bacillus cereus , and the size of the amplification product was 305 bp. The base sequence is as follows.

PCR 프라이머 P5 : 5'-gactacattcacgattacgcagaa-3'(서열번호 5)PCR primer P5: 5'-gactacattcacgattacgcagaa-3 '(SEQ ID NO: 5)

PCR 프라이머 P6 : 5'-ctatgctgacgagctacatccata-3'(서열번호 6)PCR primer P6: 5'-ctatgctgacgagctacatccata-3 '(SEQ ID NO: 6)

네 번째 PCR 프라이머쌍 P7/P8은 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes)를 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭 산물의 크기는 454 bp이다. 염기 서열은 다음과 같다.The fourth PCR primer pair P7 / P8 was designed to specifically detect Listeria monocytogenes , and the size of the amplification product was 454 bp. The base sequence is as follows.

PCR 프라이머 P7 : 5'-ctggcacaaaattacttacaacga-3'(서열번호 7)PCR primer P7: 5'-ctggcacaaaattacttacaacga-3 '(SEQ ID NO: 7)

PCR 프라이머 P8 : 5'-aactactggagctgcttgtttttc-3'(서열번호 8)PCR primer P8: 5'-aactactggagctgcttgtttttc-3 '(SEQ ID NO: 8)

다섯 번째 PCR 프라이머쌍 P9/P10은 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica)를 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭 산물의 크기는 551 bp이다.The fifth PCR primer pair P9 / P10 was designed to specifically detect Yersinia enterocolitica , and the size of the amplification product was 551 bp.

PCR 프라이머 P9 : 5'-cctgtttatcaattgcgtctgtta-3'(서열번호 9)PCR primer P9: 5'-cctgtttatcaattgcgtctgtta-3 '(SEQ ID NO: 9)

PCR 프라이머 P10 : 5'-ataaatggggttcacttcactcag-3'(서열번호 10)PCR primer P10: 5'-ataaatggggttcacttcactcag-3 '(SEQ ID NO: 10)

여섯 번째 PCR 프라이머쌍 P11/P12는 살모넬라(Salmonella sp.)을 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭산물의 크기는 678 bp이다.The sixth PCR primer pair P11 / P12 was designed to specifically detect Salmonella sp. , And the size of the amplification product was 678 bp.

PCR 프라이머 P11 : 5'-gaatcctcagtttttcaacgtttc-3'(서열번호 11)PCR primer P11: 5'-gaatcctcagtttttcaacgtttc-3 '(SEQ ID NO: 11)

PCR 프라이머 P12 : 5'-tagccgtaacaaccaatacaaatg-3'(서열번호 12)PCR primer P12: 5'-tagccgtaacaaccaatacaaatg-3 '(SEQ ID NO: 12)

일곱 번째 PCR 프라이머쌍 P13/P14는 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus)을 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭산물의 크기는 264 bp이다.The seventh PCR primer pair P13 / P14 was designed to specifically detect Staphylococcus aureus , and the size of the amplification product was 264 bp.

PCR 프라이머 P13 : 5'-aatttaacagctaaagagtttggt-3'(서열번호 13)PCR primer P13: 5'-aatttaacagctaaagagtttggt-3 '(SEQ ID NO: 13)

PCR 프라이머 P14 : 5'-ttcattaaagaaaaagtgtacgag-3'(서열번호 14)PCR primer P14: 5'-ttcattaaagaaaaagtgtacgag-3 '(SEQ ID NO: 14)

여덟 번째 PCR 프라이머쌍 P15/P16는 쉬겔라(Shigella spp.)을 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭산물의 크기는 959 bp이다.The eighth PCR primer pair P15 / P16 was designed to specifically detect Shigella spp. And the size of the amplification product was 959 bp.

PCR 프라이머 P15 : 5'-gacttgttaagtataaaggaaggc-3'(서열번호 15)PCR primer P15: 5'-gacttgttaagtataaaggaaggc-3 '(SEQ ID NO: 15)

PCR 프라이머 P16 : 5'-aagatttttattatctgaattggg-3'(서열번호 16)PCR primer P16: 5'-aagatttttattatctgaattggg-3 '(SEQ ID NO: 16)

아홉 번째 PCR 프라이머쌍 P17/P18는 장염 비브리오(Vibrio parahaemolyticus)을 특이적으로 탐지 할 수 있도록 설계하였고, 증폭산물의 크기는 375 bp이다.The ninth PCR primer pair P17 / P18 was designed to specifically detect Vibrio parahaemolyticus , and the size of the amplification product was 375 bp.

PCR 프라이머 P17 : 5'-ctcatttgtactgttgaacgccta-3'(서열번호 17)PCR primer P17: 5'-ctcatttgtactgttgaacgccta-3 '(SEQ ID NO: 17)

PCR 프라이머 P18 : 5'-aatagaaggcaaccagttgttgat-3'(서열번호 18)PCR primer P18: 5'-aatagaaggcaaccagttgttgat-3 '(SEQ ID NO: 18)

또한, 본 발명은 상기 병원성 미생물의 특이 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머쌍을 이용한 다중 중합효소연쇄반응으로 병원성 미생물을 검출하는 방법에 관한 것이다.The present invention also relates to a method for detecting a pathogenic microorganism by a multiplex polymerase chain reaction using a primer pair capable of amplifying a specific gene of the pathogenic microorganism.

본 발명에서는 상기 9쌍의 프라이머쌍으로 구성되는 군에서 선택된 1종 이상의 프라이머쌍을 포함하는 프라이머 세트를 이용한 중합효소연쇄반응으로 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni), 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7), 바실러스 세레우스(Bacillus cereus), 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes), 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica), 살모넬라(Salmonella sp.), 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus), 쉬겔라(Shigella spp.), 및 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus)을하나 이상의 병원성 미생물을 검출할 수 있다. 바람직하게는 상기 프라이머쌍중에서 2종 이상을 포함하는 프라이머 세트를 이용하여 다중 중합효소연쇄반응으로 2종 이상의 병원성 미생물을 검출할 수 있으며 최대 9종의 미생물을 동시에 검출할 수 있다.In the present invention, Campylobacter jejuni , Escherichia coli O157: H7 ( E.coli ) by polymerase chain reaction using a primer set comprising at least one primer pair selected from the group consisting of the nine pairs of primer pairs. O157: H7 ), Bacillus cereus , Listeria monocytogenes , Yersinia enterocolitica , Salmonella sp. , Staphylococcus aureus , Staphylococcus aureus , Shigella spp. , And Vibrio parahaemolyticus can detect one or more pathogenic microorganisms. Preferably, two or more pathogenic microorganisms can be detected by multiplex polymerase chain reaction using a primer set including two or more of the primer pairs, and up to nine microorganisms can be detected simultaneously.

본 발명의 일례에 따르며, 검출방법은 먼저 병원성 미생물에 오염이 되었으리라고 의심되는 식품을 채취,배양하고, 배양된 미생물로부터 DNA를 열 추출한 후, 이를 주형 DNA로 하여 상기 멀티플렉스 프라이머 혼합액을 이용한 다중 중합효소연쇄반응(M-PCR)을 수행한다. M-PCR 반응이 끝나면 증폭된 유전자 산물을 아가로스 겔상으로 전기영동하여 특이 유전자 증폭 유무에 따라 식품에 어떠한 병원성 미생물이 오염되었는지를 확인 판정한다.According to an example of the present invention, the detection method first collects and cultures food suspected of being contaminated with pathogenic microorganisms, heat-extracts DNA from the cultured microorganisms, and then uses the multiplex primer mixture as the template DNA. Perform polymerase chain reaction (M-PCR). After the M-PCR reaction, the amplified gene product is electrophoresed on agarose gel to determine which pathogenic microorganisms are contaminated in the food depending on the presence or absence of specific gene amplification.

도 1a, 1b, 및 1c는 병원성 미생물을 혼합 배양한 후 추출한 게놈 DNA를 주형으로 하여 M-PCR를 수행한 결과를 나타낸 것이다. 도 1a에서 각 레인은 다음과 같다.Figures 1a, 1b, and 1c shows the results of M-PCR performed with the genomic DNA extracted after the mixed culture of the pathogenic microorganism as a template. In FIG. 1A, each lane is as follows.

레인 M: 사이즈 마커(size marker),Lane M: size marker,

레인 1는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni),Lane 1 is Campylobacter jejuni ,

레인 2는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7),Lane 2 is E. coli 0157: H7 ( E. coli 0157: H7 ),

레인 3은 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus),Lane 3 is Staphylococcus aureus ,

레인 4은 바실러스 세레우스(Bacillus cereus),Lane 4 is Bacillus cereus ,

레인 5는 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus),Lane 5 is Vibrio parahaemolyticus ,

레인 6은 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes),Lane 6 is Listeria monocytogenes ,

레인 7은 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica),Lane 7 is Yersinia enterocolitica ,

레인 8은 살모넬라(Salmonella sp.), 및Lane 8 is Salmonella sp. , And

레인 9는 쉬겔라(Shigella spp.).Lane 9 is Shigella spp .

도 1에서 레인 1은 상기 9종의 병원성 미생물을 혼합하여 배양한 후, 여기에서 추출한 게놈(genomic) DNA를 주형으로 하여 멀티플렉스 PCR 프라이머로 중합효소연쇄반응을 수행한 결과이다.In FIG. 1, lane 1 is a result of performing a polymerase chain reaction with multiplex PCR primers by culturing the above 9 pathogenic microorganisms and culturing the extracted genomic DNA as a template.

도 1b 및 1c에서 레인 2 내지 10은 다음과 같다.Lanes 2 to 10 in FIGS. 1B and 1C are as follows.

레인 M: 사이즈 마커(size marker),Lane M: size marker,

레인 2는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni),Lane 2 is Campylobacter jejuni ,

레인 3는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7),Lane 3 is E. coli 0157: H7 ( E. coli 0157: H7 ),

레인 4은 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus),Lane 4 is Staphylococcus aureus ,

레인 5은 바실러스 세레우스(Bacillus cereus),Lane 5 is Bacillus cereus ,

레인 6는 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus),Lane 6 is Vibrio parahaemolyticus ,

레인 7은 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes),Lane 7 is Listeria monocytogenes ,

레인 8은 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica),Lane 8 is Yersinia enterocolitica ,

레인 9은 살모넬라(Salmonella sp.), 및Lane 9 is Salmonella sp. , And

레인 10는 쉬겔라(Shigella spp.).Lane 10 is Shigella spp .

도 1c의 레인 1-1은 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni), 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus), 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes), 및 살모넬라(Salmonella sp.)를 혼합하여 배양한 후에 여기서 추출한 게놈 DNA를 주형으로 하여 다중 중합효소연쇄반응을 한 결과를 나타낸다. 도 1c의 레인 1-2는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7), 바실러스 세레우스(Bacillus cereus), 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus), 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica), 및 쉬겔라(Shigella spp.)을 혼합하여 배양한 후에 여기서 추출한 게놈 DNA를 주형으로 하여 다중 중합효소연쇄반응을 한 결과를 나타낸다.Lane 1-1 of FIG. 1C shows a culture after mixing Campylobacter jejuni , Staphylococcus aureus , Listeria monocytogenes , and Salmonella sp. The result of multiple polymerase chain reaction using genomic DNA extracted here as a template is shown. Lanes 1-2 of FIG. 1C show E. coli O157: H7 , Bacillus cereus , Vibrio parahaemolyticus , Yersinia enterocolitica , And Shigella spp. Were mixed and cultured, followed by multiple polymerase chain reaction using genomic DNA extracted as a template.

본 발명의 검출방법은, 상기 1종의 PCR 프라이머를 이용하여 각각의 병원성 미생물을 검출할 수 있을 뿐만 아니라, 상기 2이상의 PCR 프라이머가 포함된 프라이머 세트를 이용하여 다중 중합효소연쇄반응(M-PCR)을 수행함으로써 상기 9종의 병원성 미생물을 한번에 신속 정확하게 검출할 수 있다.The detection method of the present invention can not only detect each pathogenic microorganism by using the one PCR primer, but also use a polymerase chain reaction (M-PCR) using a primer set including two or more PCR primers. ), The nine pathogenic microorganisms can be detected quickly and accurately at one time.

또한, 본 발명에서는 상기 9쌍의 PCR 프라이머중에서 선택된 1 종이상의 프라이머쌍을 함유하는 프라이머 세트를 포함하는 병원성 미생물 검출키트가 제공된다. 검출키트는 상기 9쌍의 프라이머(서열번호 1∼18)와 PCR을 이용한 미생물 검출키트의 일반적인 구성성분(반응완충액, Taq DNA 중합효소 등)을 포함한다. 본 발명의 바람직한 일 실시예에서 검출키트는 다음과 같이 구성된다.In addition, the present invention provides a pathogenic microorganism detection kit comprising a primer set containing one pair of primer pairs selected from the nine pairs of PCR primers. The detection kit includes the nine pairs of primers (SEQ ID NOs: 1 to 18) and general components of the microbial detection kit using PCR (reaction buffer, Taq DNA polymerase, etc.). In a preferred embodiment of the present invention, the detection kit is configured as follows.

(1) 서열번호 1∼18의 상기 PCR 프라이머쌍 P1/P2; P3/P4; P5/P6; P7/P8; P9/P10, P11/P12, P13/P14, P15/P16, 및 P17/P18중에서 선택된 1종 이상의 프라이머쌍을 함유하는 프라이머 세트(1) the PCR primer pair P1 / P2 of SEQ ID NOs: 1-18; P3 / P4; P5 / P6; P7 / P8; Primer set containing one or more primer pairs selected from P9 / P10, P11 / P12, P13 / P14, P15 / P16, and P17 / P18

(2) 반응완충액(Reaction Buffer)(2) Reaction Buffer

(3) Taq DNA 중합효소(Taq DNA polymerase)(3) Taq DNA polymerase

이하, 실시예에 의해 본 발명을 보다 상세히 설명한다. 그러나 다음의 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것으로, 실시예에 의해 본 발명의 범위가 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. However, the following examples are only for illustrating the present invention, and the scope of the present invention is not limited by the examples.

실시예 1Example 1

9종의 병원성 미생물의 특이 유전자 증폭용 프라이머의 설계 및 합성Design and Synthesis of Primer for Amplifying Specific Genes of 9 Pathogenic Microorganisms

캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni), 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7), 바실러스 세레우스(Bacillus cereus), 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes), 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica), 살모넬라(Salmonella sp.), 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus), 쉬겔라(Shigella spp.), 및 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus)의 9종의 병원성 미생물을 동시에 탐지할 수 있도록 녹는점을 유사하게 하여 다음의 표 1과 같이 병원성 미생물 검출용 PCR 프라이머를 설계, 합성하였다. Campylobacter jejuni , Escherichia coli O157: H7 ( E.coli O157: H7 ), Bacillus cereus , Listeria monocytogenes , Yersinia enterocolitica , Soluble to simultaneously detect nine pathogenic microorganisms: Salmonella sp. , Staphylococcus aureus , Shigella spp. , And Vibrio parahaemolyticus . Similarly, PCR primers for detecting pathogenic microorganisms were designed and synthesized as shown in Table 1 below.

프라이머primer 검출 미생물Microbe detection 염기서열(서열번호)Sequence (SEQ ID NO) 서열order P1P1 Campylobacter jejuniCampylobacter jejuni 5'-attttcgctgattttgattttagg-3'5'-attttcgctgattttgattttagg-3 ' 1One P2P2 Campylobacter jejuniCampylobacter jejuni 5'-tattgatatctttggtggaggcga-3'5'-tattgatatctttggtggaggcga-3 ' 22 P3P3 E.coli O157:H7E.coli O157: H7 5'-gacagcagttataccactctgcaa-3'5'-gacagcagttataccactctgcaa-3 ' 33 P4P4 E.coli O157:H7E.coli O157: H7 5'-gacgaaattctctctgtatctgcc-3'5'-gacgaaattctctctgtatctgcc-3 ' 44 P5P5 Bacillus cereusBacillus cereus 5'-gactacattcacgattacgcagaa-3'5'-gactacattcacgattacgcagaa-3 ' 55 P6P6 Bacillus cereusBacillus cereus 5'-ctatgctgacgagctacatccata-3'5'-ctatgctgacgagctacatccata-3 ' 66 P7P7 Listeria monocytogenesListeria monocytogenes 5'-ctggcacaaaattacttacaacga-3'5'-ctggcacaaaattacttacaacga-3 ' 77 P8P8 Listeria monocytogenesListeria monocytogenes 5'-aactactggagctgcttgtttttc-3'5'-aactactggagctgcttgtttttc-3 ' 88 P9P9 Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica 5'-cctgtttatcaattgcgtctgtta-3'5'-cctgtttatcaattgcgtctgtta-3 ' 99 P10P10 Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica 5'-ataaatggggttcacttcactcag-3'5'-ataaatggggttcacttcactcag-3 ' 1010 P11P11 Salmonell sp.Salmonell sp. 5'-gaatcctcagtttttcaacgtttc-3'5'-gaatcctcagtttttcaacgtttc-3 ' 1111 P12P12 Salmonell sp.Salmonell sp. 5'-tagccgtaacaaccaatacaaatg-3'5'-tagccgtaacaaccaatacaaatg-3 ' 1212 P13P13 Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus 5'-aatttaacagctaaagagtttggt-3'5'-aatttaacagctaaagagtttggt-3 ' 1313 P14P14 Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus 5'-ttcattaaagaaaaagtgtacgag-3'5'-ttcattaaagaaaaagtgtacgag-3 ' 1414 P15P15 Shigella sp.Shigella sp. 5'-gacttgttaagtataaaggaaggc-3'5'-gacttgttaagtataaaggaaggc-3 ' 1515 P16P16 Shigella sp.Shigella sp. 5'-aagatttttattatctgaattggg-3'5'-aagatttttattatctgaattggg-3 ' 1616 P17P17 Vibrio parahaemolyticusVibrio parahaemolyticus 5'-ctcatttgtactgttgaacgccta-3'5'-ctcatttgtactgttgaacgccta-3 ' 1717 P18P18 Vibrio parahaemolyticusVibrio parahaemolyticus 5'-aatagaaggcaaccagttgttgat-3'5'-aatagaaggcaaccagttgttgat-3 ' 1818

실시예 2: 병원성 미생물 검출키트의 구성Example 2: Construction of a Pathogenic Microorganism Detection Kit

실시예 1에서 합성한 9쌍의 PCR 프라이머(서열번호 1 내지 18)를 포함하는 멀티플렉스 프라이머 혼합액을 만들어 다음과 같이 검출키트를 구성하였다.A multiplex primer mixture was prepared containing 9 pairs of PCR primers (SEQ ID NOS: 1 to 18) synthesized in Example 1 to construct a detection kit as follows.

(키트 구성성분)(Kit component)

5 × Reaction buffer5 × Reaction buffer

멀티플렉스 프라이머 혼합액(서열번호 1∼18)Multiplex Primer Mixture (SEQ ID NOS: 1-18)

Taq DNA 중합효소(1U/㎕)Taq DNA Polymerase (1U / μl)

실시예 3: 다중 중합효소연쇄반응을 이용한 병원성 미생물의 탐지Example 3: Detection of Pathogenic Microorganisms Using Multiple Polymerase Chain Reaction

병원성 미생물에 오염된 식품의 배양액으로부터 추출한 DNA를 주형으로 하여, 실시예 2에서 제조한 멀티플렉스 프라이머 혼합액으로 PCR 반응시켜 미생물의 특이 유전자를 증폭하였다. 증폭된 유전자 산물을 아가로스 젤상에서 전기영동한후 특이 유전자의 증폭유무에 따라 병원성 미생물의 오염 여부를 판정하였다(도 2a∼2i 참조). 구체적인 실험방법은 다음과 같다.DNA extracted from the culture solution of the food contaminated with the pathogenic microorganism as a template, PCR reaction with the multiplex primer mixture prepared in Example 2 to amplify the specific gene of the microorganism. The amplified gene product was electrophoresed on agarose gel, and then the pathogenic microorganisms were determined according to the presence or absence of amplification of specific genes (see FIGS. 2A to 2I). The specific experimental method is as follows.

1) 균체 열추출 시료의 조제1) Preparation of cell heat extraction sample

병원성 미생물에 오염이 되었으리라고 의심되는 식품 25g을 정량한 후, 이것을 225 ㎖의 종균 배양액에 첨가하여 37℃에서 18∼24시간 진탕 배양하였다. 종균 배양액 1 ㎖를 1.5 ㎖ 원심 분리용 튜브에 옮겨서 12,000 rpm의 속도로 5분간 원심분리한 후 상청액을 제거하고, 모아진 균체를 200 ㎕의 멸균 증류수에 현탁한 후 100℃에서 5분간 가열 처리하였다. 가열 처리 후 12,000 rpm에서 10분간 원심 분리한 다음 상청액을 회수하여 이를 열 추출 시료로 하였다.After 25g of food suspected of being contaminated with pathogenic microorganisms was quantified, it was added to 225 ml of the seed culture and shaken at 37 ° C for 18 to 24 hours. 1 ml of the spawn culture was transferred to a 1.5 ml centrifuge tube, centrifuged at 12,000 rpm for 5 minutes, the supernatant was removed, and the collected cells were suspended in 200 µl of sterile distilled water and heated at 100 ° C. for 5 minutes. After the heat treatment, the mixture was centrifuged at 12,000 rpm for 10 minutes, and then the supernatant was collected as a heat extract sample.

2) PCR 반응액(전체 반응액 50 ㎕)2) PCR reaction solution (50 μl total reaction solution)

열 추출 시료 10 ㎕10 μl heat extract sample

5 × Reaction buffer 10 ㎕5 × Reaction buffer 10 μl

멀티플렉스 프라이머 혼합액 5 ㎕5 μl multiplex primer mixture

Taq DNA 중합효소 (1U/㎕) 1 ㎕1 μl of Taq DNA polymerase (1U / μl)

멸균 증류수 잔부(전체 50 ㎕)Residual sterile distilled water (50 μl total)

3) PCR 조건3) PCR condition

다중 중합효소연쇄반응은 초기 변성(initial denaturation)을 94℃에서 2분간 수행 한 후, 변성(denaturation, 94℃에서 30초), 결합(annealing, 60℃에서 30초), 연장(extension, 72℃에서 30초)을 총 40회 실시하였다.Multiple polymerase chain reaction is performed after initial denaturation at 94 ° C. for 2 minutes, followed by denaturation (30 seconds at 94 ° C.), annealing (30 seconds at 60 ° C.), and extension (72 ° C.). 30 seconds) was performed a total of 40 times.

4) 식품의 병원성 미생물 오염여부 판정4) Determination of food pathogenic microbial contamination

반응이 끝난 PCR 산물을 2% 아가로스 겔상에서 전기 영동으로 전개하여 균주 특이적 유전자 증폭 산물의 형성 유무로 병원성 미생물의 오염 여부를 확인하였다. 각각의 병원성 미생물에 오염된 식품의 검사결과를 도 2a∼2i에 나타내었다.After completion of the reaction, the PCR product was developed by electrophoresis on a 2% agarose gel to confirm the contamination of the pathogenic microorganisms with or without the formation of strain-specific gene amplification products. Test results of the food contaminated with each pathogenic microorganism are shown in Figures 2a to 2i.

레인 1: 음성 대조구Lane 1: negative control

레인 2는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni),Lane 2 is Campylobacter jejuni ,

레인 3는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7),Lane 3 is E. coli 0157: H7 ( E. coli 0157: H7 ),

레인 4은 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus),Lane 4 is Staphylococcus aureus ,

레인 5은 바실러스 세레우스(Bacillus cereus),Lane 5 is Bacillus cereus ,

레인 6는 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus),Lane 6 is Vibrio parahaemolyticus ,

레인 7은 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes),Lane 7 is Listeria monocytogenes ,

레인 8은 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica),Lane 8 is Yersinia enterocolitica ,

레인 9은 살모넬라(Salmonella sp.), 및Lane 9 is Salmonella sp. , And

레인 10은 쉬겔라(Shigella spp.).Lane 10 is Shigella spp .

도 2a는 검사식품이 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni)에 오염된 경우로 127 bp의 유전자 증폭 산물이 확인되었으며, 도 2b는 식품이 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7)에 오염된 경우로 208 bp의 유전자 증폭 산물이 확인되었다. 도 2c는 식품에서 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus)가 검출된 경우, 도 2d는 식품에서 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)가 검출된 경우로 각각 264 bp, 305 bp의 유전자 증폭 산물이 확인되었다. 또한, 도 2e는 식품에서 장염 비브리오(Vibrio parahaemolyticus)가 검출된 경우, 도 2f는 식품에서 단구증리스테리아(Listeria monocytogenes)가 검출된 경우로 각각 375 bp, 454 bp의 유전자 증폭 산물이 확인되었다. 도 2g는 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica)가 검출된 경우, 도 2h는 식품에서 살모넬라(Salmonella sp.)가 검출된 경우로 각각 551 bp, 678bp의 유전자 증폭 산물이 확인되었다. 도 2i는 식품에서 쉬겔라(Shigella spp.)가 검출된 경우로 959 bp의 유전자 증폭산물이 확인되었다.Figure 2a is a test food was contaminated with Campylobacter jejuni (127 bp gene amplification product was confirmed, contaminated with E. coli O157: H7 ( E. coli O157: H7 ) was confirmed that the food amplification product In this case, a gene amplification product of 208 bp was identified. FIG. 2c shows a case where Staphylococcus aureus is detected in food, and FIG. 2d shows a case where Bacillus cereus is detected in food, and 264 bp and 305 bp gene amplification products were identified, respectively. . In addition, Figure 2e is when Vibrio parahaemolyticus is detected in the food, Figure 2f is a case of detecting the listeria monocytogenes ( Listeria monocytogenes ) in the food was confirmed that the gene amplification products of 375 bp, 454 bp, respectively. Figure 2g is Yersinia enterocolitica ( Yersinia enterocolitica ) is detected, Figure 2h is Salmonella ( Salmonella sp. ) Was detected in the food when the gene amplification products of 551 bp, 678bp, respectively. FIG. 2i shows a case where Shigella spp. Was detected in food and a gene amplification product of 959 bp was identified.

본 발명에 따라 식중독의 원인이 되는 주요 병원성 미생물의 오염 여부를 신속하고 정확하게 판정할 수 있으므로 세균성 식중독의 예방에 효과적으로 활용될 수 있으며, 특히 종래에 통상 4일 내지 7일이 소요되던 식중독 균 진단 시간을 하루만에 진단 할 수 있도록 단축하여 시간과 경비를 현저하게 절감할 수 있는 장점을 가지고 있다.According to the present invention, it is possible to quickly and accurately determine whether the major pathogenic microorganisms causing food poisoning can be effectively used for the prevention of bacterial food poisoning, and in particular, the conventional food poisoning bacteria diagnosis time, which usually takes 4 to 7 days By shortening the diagnosis in a day, it has the advantage of significantly reducing time and expense.

Claims (4)

서열번호 1 및 2에 나타난 염기서열을 갖는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 3 및 4에 나타난 염기서열을 갖는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 5 및 6에 나타난 염기서열을 갖는 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 7 및 8에 나타난 염기서열을 갖는 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 9 및 10에 나타난 염기서열을 갖는 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 11 및 12에 나타난 염기서열을 갖는 살모넬라(Salmonella sp.)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 13 및 14에 나타난 염기서열을 갖는 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 15 및 16에 나타난 염기서열을 갖는 쉬겔라 (Shigella spp.)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 및 서열번호 17 및 18에 나타난 염기서열을 갖는 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 프라이머쌍을 포함하는 병원성 미생물의 특이 유전자 증폭용 프라이머 세트.Primer for amplification of Campylobacter jejuni having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 1 and 2, E. coli O157: H7 ( E.coli O157: H7 ) having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 3 and 4 Primer pair for gene amplification of Bacillus cereus having a base sequence shown in SEQ ID NO: 5 and 6, primer pair for amplification of gene of Bacillus cereus , Listeria monocytogenes having a base sequence shown in SEQ ID NO: 7 and 8 Primer pair for amplification of genes of the genome of Yersinia enterocolitica having a base sequence shown in SEQ ID NOs: 9 and 10, Salmonella sp having a base sequence shown in SEQ ID NOs: 11 and 12 . a pair of primers for amplification of the gene), SEQ ID NO: 13 and having the nucleotide sequence shown in 14 Staphylococcus gene increased the mouse fluorescein (Staphylococcus aureus) For a pair of primers, SEQ ID NO: 15 and to Vibrio para having the nucleotide sequence shown in the DNA amplification primers, and SEQ ID NO: 17 and 18 for the rest Gela (Shigella spp.) Having the nucleotide sequence shown in 16 Molly tea kusu (Vibrio parahaemolyticus A primer set for specific gene amplification of a pathogenic microorganism comprising one or more primer pairs selected from the group consisting of primer pairs for gene amplification. 중합효소연쇄반응(PCR)을 이용한 병원성 미생물의 검출방법에 있어서,In the method for detecting pathogenic microorganisms using polymerase chain reaction (PCR), 제 1항에 따른 프라이머 세트를 이용한 중합효소연쇄반응(Polymerase ChainReaction)으로 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni), 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7), 바실러스 세레우스(Bacillus cereus), 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes), 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica), 살모넬라(Salmonella sp.), 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus), 쉬겔라 (Shigella spp.) 및 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 병원성 미생물을 탐지하는 것을 특징으로 하는 병원성 미생물의 검출방법.Campylobacter jejuni (Polymerase Chain Reaction) using a primer set according to claim 1Campylobacter jejuni), Escherichia coli O157: H7 (E.coli O157: H7), Bacillus cereus (Bacillus cereus), Monocytic listeria (Listeria monocytogenes), Yersinia Enterocholicica (Yersinia enterocolitica), SalmonellaSalmonella sp.), Staphylococcus oreus (Staphylococcus aureus), Shigella (Shigella spp.) And Vibrio parahamoliticus (Vibrio parahaemolyticusThe detection method of the pathogenic microorganism, characterized in that for detecting one or more pathogenic microorganisms selected from the group consisting of. 제 2 항에 있어서, 2종 이상의 다른 병원성 미생물의 유전자 증폭용 프라이머쌍을 포함하는 프라이머 세트를 이용한 다중 중합효소연쇄반응(Multiplex-Polymerase chain reaction)으로 식중독의 원인이 되는 2종 이상의 병원성 미생물을 동시에 탐지하는 것을 특징으로 하는 병원성 미생물의 검출방법.The method of claim 2, wherein two or more pathogenic microorganisms causing food poisoning by a multiplex-polymerase chain reaction using a primer set including primer pairs for gene amplification of two or more different pathogenic microorganisms are simultaneously used. A method for detecting pathogenic microorganisms, characterized in that the detection. 제 3 항에 있어서, 중합효소연쇄반응(PCR)을 이용하여 병원성 미생물을 검출하도록 PCR 프라이머, 반응완충액, Taq DNA 중합효소을 포함하는 병원성 미생물의 검출키트에 있어서,4. The detection kit of pathogenic microorganisms according to claim 3, comprising PCR primers, reaction buffers, and Taq DNA polymerases to detect pathogenic microorganisms using polymerase chain reaction (PCR). 상기 PCR 프라이머는 서열번호 1 및 2에 나타난 염기서열을 갖는 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 3 및 4에 나타난 염기서열을 갖는 대장균 O157:H7(E.coli O157:H7)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 5 및 6에 나타난 염기서열을 갖는 바실러스 세레우스(Bacilluscereus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 7 및 8에 나타난 염기서열을 갖는 단구증 리스테리아(Listeria monocytogenes)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 9 및 10에 나타난 염기서열을 갖는 예르시니아 엔테로콜리티카(Yersinia enterocolitica)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 11 및 12에 나타난 염기서열을 갖는 살모넬라(Salmonella sp.)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 13 및 14에 나타난 염기서열을 갖는 스타필로코쿠스 오레우스(Staphylococcus aureus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 서열번호 15 및 16에 나타난 염기서열을 갖는 쉬겔라 (Shigella spp.)의 유전자 증폭용 프라이머쌍, 및 서열번호 17 및 18에 나타난 염기서열을 갖는 비브리오 파라해몰리티쿠스(Vibrio parahaemolyticus)의 유전자 증폭용 프라이머쌍으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 프라이머쌍을 포함하는 병원성 미생물의 특이 유전자 증폭용 프라이머 세트인 것을 특징으로 하는 병원성 미생물 검출키트.The PCR primer is a primer pair for amplification of Campylobacter jejuni having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 1 and 2, E. coli O157: H7 ( E. coli) having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 3 and 4 O157: single vera L. having a base sequence shown in the gene amplification primer pairs for SEQ ID NO: Bacillus cereus (Bacilluscereus) a pair of primers for gene amplification having the base sequence shown in the 5 and 6, SEQ ID NO: 7 and 8, H7) ( Listeria monocytogenes ), amplification primer pair of genes of Yersinia enterocolitica ( Yersinia enterocolitica ) having a base sequence shown in SEQ ID NO: 9 and 10, Salmonella having a base sequence shown in SEQ ID NO: 11 and 12 (Salmonella sp.) Staphylococcus fluorescein mouse having the nucleotide sequence shown in the primer pair SEQ ID NO: 13 and 14 for amplification of the gene (Staphylococcus aureus ) gene amplification primer pair, Shigella spp. having a nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 15 and 16, amplification primer pair of Shigella spp. , and Vibrio parahamole with a nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 17 and 18 Pathogenic microorganism detection kit, characterized in that the specific gene amplification primer set of the pathogenic microorganism comprising at least one primer pair selected from the group consisting of a primer pair for gene amplification of Vibrio parahaemolyticus .
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