KR20030000010A - 추가적인 ｐｒｏ 폴리펩티드 및 그의 서열 - Google Patents

Abstract

본 발명은 폴리펩티드 및 이들 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 분자에 관한 것이다. 본원에서는 상기 핵산 서열을 포함하는 벡터 및 숙주 세포, 본 발명의 폴리펩티드를 이종 폴리펩티드 서열에 융합시킨 키메라 폴리펩티드 분자, 본 발명의 폴리펩티드에 결합하는 항체, 및 본 발명의 폴리펩티드를 제조하는 방법도 제공된다.

Description

추가적인 ＰＲＯ 폴리펩티드 및 그의 서열 {Further PRO Polypeptides And Sequences Thereof}

세포외 단백질은 무엇보다도 다세포 생물의 형성, 분화 및 유지에 중요한 역할을 담당한다. 많은 개별 세포의 운명, 예를 들어 증식, 이동, 분화 또는 다른 세포와의 상호작용은 다른 세포 및(또는) 인접 환경으로부터 받은 정보에 의해 지배당하는 것이 일반적이다. 이런 정보는 종종 분비된 폴리펩티드 (예를 들면 유사분열 촉진인자, 생존 인자, 세포독성 인자, 분화 인자, 신경 펩티드 및 호르몬)에 의해 전달되어, 결국엔 다양한 세포 수용체들이나 막결합 단백질들에 의해 수용되고 해독된다. 이들 분비 폴리펩티드 또는 신호전달 분자는 대개 세포 분비 경로를 통해 세포외 환경의 자신의 작용 장소에 도달하게 된다.

분비 단백질은 제약, 진단, 바이오센서, 생물반응기 등과 같은 다양한 산업적 용도를 갖고 있다. 사실상 혈전용해제, 인터페론, 인터루킨, 에리트로포이에틴, 콜로니 자극 인자 및 다양한 다른 사이토킨 등 현재 이용되는 대부분의 단백질 의약은 분비 단백질이다. 이들의 수용체인 막결합 단백질도 치료제나 진단제로서가능성이 있다. 새로운 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력 가운데 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규한 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 스크리닝 방법 및 기술의 예는 문헌 (Klein et al.,Proc. Natl. Acad. Sci., 93:7108-7113 (1996); 미국특허 제5,536,637호)에 기재되어 있다.

막결합 단백질 및 수용체는 무엇보다도 다세포 생물의 형성, 분화 및 유지에서 중요한 역할을 담당할 수 있다. 많은 개별 세포의 운명, 예를 들어 증식, 이동, 분화 또는 다른 세포와의 상호작용은 다른 세포 및(또는) 인접 환경으로부터 받은 정보에 의해 지배당하는 것이 일반적이다. 이런 정보는 종종 분비된 폴리펩티드 (예를 들면 유사분열 촉진인자, 생존 인자, 세포독성 인자, 분화 인자, 신경 펩티드 및 호르몬)에 의해 전달되어, 결국엔 다양한 세포 수용체들이나 막결합 단백질들에 의해 수용되고 해독된다. 이러한 막결합 단백질과 세포 수용체로는 사이토킨 수용체, 수용체 키나제, 수용체 포스파타제, 세포-세포 상호작용에 관여하는 수용체, 셀렉틴 및 인테그린과 같은 세포 어드헤신 (adhesin) 분자 등을 들 수 있으나 이것으로 국한되는 것은 아니다. 예를 들어, 세포 증식 및 분화를 조절하는 신호전달은 부분적으로 여러 세포 단백질의 인산화를 통해 조절된다. 이 과정을 촉매하는 효소인 단백질 티로신 키나제는 증식인자 수용체로도 작용할 수 있다. 그 예로는 섬유아세포 증식인자 수용체 및 신경 증식인자 수용체 등을 들 수 있다.

막결합 단백질 및 수용체 분자는 제약 및 진단제를 비롯한 다양한 산업적 용도를 갖는다. 예를 들면 수용체 이뮤노어드헤신 (immunoadhesin)은 수용체-리간드상호작용을 차단하는 치료제로 사용될 수 있다. 막결합 단백질은 또한 관련 수용체/리간드 상호작용을 억제할 수 있는 펩티드 또는 소분자 억제제를 스크리닝하는 데 사용될 수도 있다.

신규한 천연 수용체 또는 막결합 단백질을 찾아내려는 학계 및 산업계의 노력이 진행되고 있다. 이런 노력 가운데 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규한 수용체 또는 막결합 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다.

1.PRO1560

테트라스판족 (tetraspan family) 단백질은 초파리를 비롯한 다양한 종으로부터 유래한 대략 20종의 공지된 유전자를 포함한다. 테트라스판은 막횡단 4 (TM4) 거대족으로도 알려져 있으며 세포막에서 조직화 기능을 하는 것으로 보고되어 있다. 다른 분자와 상호작용하고, 세포 부착, 활성화 및 분화와 같은 다양한 활동에 관여하는 상기 테트라스판의 능력은 궁극적으로 거대한 분자 복합체를 결집시키는 역할에 촛점이 맞추어져 있다 (Skubitz, et al., J. Immunology, 15: 3617-3626 (1996)). 테트라스판 그룹은 문헌 (Schwann cell biology)에서 기능이 우수한 단백질 세트로도 개시되어 있다 (Mirsky 및 Jessen,Curr. Opin. Neurobiol., 6(1): 89-96 (1996)). 테트라스판 (종종 테트라스파닌으로도 불림)은 문헌 (Maecker, et al.,FASEB, 11: 428-442 (1997))에 더 기재되어 있다. 따라서, 테트라스판족의 구성원은 관심을 끈다.

2.PRO444

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막결합 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO444로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

3.PRO1018

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1018로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

4.PRO1773

레틴산 생합성의 주된 단계겸 속도 제한 단계는 레티놀이 레티날로 전환되는 것을 필요로 한다. 레티놀 디히드로게나제 단백질은 완전-세포성 레티놀-결합 단백질을 기질로 인식하여 그의 기질로부터의 레틴산 생합성의 첫 단계를 촉매하는 작용을 하는 효소이다. 다양한 레티놀 디히드로게나제 유전자가 클로닝되어 있고 그 특징이 규명되어 있는데, 이들 유전자의 산물은 색소성 망막염, 건선, 여드름 및 다양한 암의 치료에 유용할 수 있는 것으로 기재되어 있다 (Chai et al.,J. Bio. Chem. 270: 28408-28412 (1995) 및 Chai et al.,Gene169: 219-222 (1996)). 레티놀 디히드로게나제 효소의 중요성이 분명하게 밝혀져 있어 레티놀 디히드로게나제와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1773 폴리펩티드로 지칭하며 레티놀 디히드로게나제 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

5.PRO1477

글리코실화는 단계 특이적 방식 및 조직 특이적 방식으로 단백질의 생리화학적 및 생물학적 성질을 조절하는 중요한 기작이다. 사카로마이세스 세레비지애 (Saccharomyces cerevisiae)에서 글리코실화에 관여하는 중요한 효소 중의 하나로 알파 1,2-만노시다제가 있으며, 이 효소는 N-연결 올리고당류의 형성 과정에서 Man9GlcNAc2를 Man8GlcNAc2로 전환시킨다. 사카로마이세스 세레비지애의 알파 1,2-만노시다제 효소는 효모에서부터 포유동물까지 보존된 클래스 I 알파 1,2-만노시다제에 속하는 것이다. 글리코실화에서 알파 1,2-만노시다제 및 만노시다제가 수행하는 기능의 중요성과 글리코실화에 의해 조절되는 생리화학적 활성의 중요성 때문에 하나 이상의 만노시다제와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 찾아내는 데 상당한 관심이 존재한다. 본 발명자들은 알파 1,2-만노시다제 단백질과 상동성이 있으며 본원에서 PRO1447 폴리펩티드로 지칭하는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술한다.

6.PRO1478

최근에, 타입 II 막횡단 단백질을 코딩하는 갈락토실트랜스퍼라제 유전자의 신규 하위족이 마우스 게놈 라이브러리로부터 확인되었다 (Hennet et al., (1998) J. Biol. Chem.273(1): 58-65). 일반적으로, 갈락토실트랜스퍼라제는 모두 관심을 끈다. 베타 1,4-갈락토실트랜스퍼라제는 두 개의 세포 하위 구역에서 발견되며, 이들 구역에서 베타 1,4-갈락토실트랜스퍼라제는 두 가지 다른 기능을 수행하는 것으로 여겨진다 (Evans, et al.,Joessays17(3): 261-268 (1995)). 베타 1,4-갈락토실트랜스퍼라제는 문헌 (Dubois 및 Shur, Adv. Exp. Med. Biol., 376: 105-114 (1995))에 가능성 있는 신호전달 수용체로 기재되어 있고, 문헌 (Shur,Glycobiology, 1(6): 563-575 (1991))에 더 잘 기재되어 있다. 세포 표면 갈락토실트랜스퍼라제의 발현 및 기능에 대해서는 문헌 (Shur,Biochim. Biophys. Acta., 988(3): 389-409 (1989))에 보고되어 있다. 게다가, 포유동물 수정 과정에서 갈락토실트랜스퍼라제의 수용체 기능은 문헌 (Shur,Adv. Exp. Biol., 207: 79-93 (1986))에 기재되어 있고, 세포 상호작용 과정에서 수용체 기능은 문헌 (Shur,Mol. Cell Biochem., 61(2): 143-158 (1984))에 기재되어 있다. 따라서, 갈락토실트랜스퍼라제 및 그의 관련 단백질은 관심을 끈다.

7.PRO831

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO831로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

8.PRO1113

단백질-단백질 상호작용은 수용체와 항원의 복합체 및 신호전달 기작을 포함한다. 단백질-단백질 상호작용의 기초가 되는 구조적 및 기능적 기작에 대해 잘 알려진 바와 같이 단백질-단백질 상호작용은 쉽게 조작하여 그 특정 결과를 조절할 수 있다. 따라서 단백질-단백질 상호작용의 기초 기작은 과학계 및 의학계에 관심의 대상이 되고 있다.

루이신 풍부 반복부를 포함하는 모든 단백질은 단백질-단백질 상호작용에 관여하는 것으로 생각된다. 루이신 풍부 반복부는 기능과 세포내 위치가 상이한 많은 단백질에 존재하는 짧은 서열 모티프이다. 리보뉴클레아제 억제제 단백질의 결정 구조를 통해 밝혀진 바로는 루이신 풍부 반복부는 베타-알파 구조 단위와 일치한다. 이들 단위는 한쪽 면이 용매에 노출된 평행한 베타 시트를 형성되므로, 이 단백질은 독특한 비(非)구형을 취하게 된다. 위와 같은 두 가지 특징은 루이신 풍부 반복부를 포함하는 단백질의 단백질-결합 기능의 원인이 되는 것으로 밝혀졌다. 이와 관련해서는 문헌 (Kobe and Deisenhofer,Trends Biochem. Sci., 19(10):415-421 (Oct. 1994))을 참조할 수 있다.

한 연구 보고서에 따르면, 루이신 풍부 프로테오글리칸은 개체 발생시 콜라겐 섬유를 배향하고 정돈하는 조직 형성체로서 기능하며, 창상 치유, 조직 수복 및 종양 지질 (支質) 형성 등의 병리적 과정에 관여한다 (Iozzo, R. V.,Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., 32(2):141-174 (1997)). 루이신 풍부 단백질이 창상 치유 및 조직 복구에 연루되어 있다는 다른 연구 결과도 있다. 출혈 장애 버나드-소울리어 증후군과 관련된 복합체 중의 루이신 풍부 모티프가 돌연변이되었음을 보고한 문헌 (De La Salle, C., et al.,Vouv. Rev. Fr. Hematol. (Germany), 37(4):215-222 (1995), 혈소판이 루이신 풍부 반복부를 갖는다고 보고한 문헌 (Chlemetson, K.J., Thromb. Haemost. (Germany), 74(1):111-116 (July 1995)), 및 형질전환 성장인자 β에 결합하는 데코린이 암 치료, 창상 치유 및 흉터 형성에 관여하는 것으로 보고한 라졸라 암연구재단 (La Jolla Cancer Research Foundation)의 (Ruoslahti, E. I. et al. WO9110727A)이 그것이다. 인슐린 유사 성장인자 (IGF)가 결합 조직, 피부 및 뼈 등의 조직 재성장과 관련된 창상 치유 및 관련 치료법에 유용하고 인간 및 동물에게서 신체 성장을 촉진하는 데 유용하며, 기타 성장 관련 과정을 자극하는 데 유용하다는 측면에서 IGF는 이런 단백질군과 기능상 관련되어 있다. IGF의 산 불안정성 서브유닛 (ALS)도 이것이 IGF의 반감기를 증가시키고 생체내에서 IGF 복합체의 일부라는 점 때문에 흥미가 있다.

루이신 풍부 반복부를 갖는 것으로 보고된 또다른 단백질은 SLIT 단백질로서, 이 단백질은 알쯔하이머병 등의 신경 퇴행성 질환 및 파킨슨병 등에서의 신경 손상을 치료하는 데, 그리고 암의 진단에서 유용한 것으로 보고된 바 있다 (Artavanistsakonas, S. and Rothberg, J. M., WO9210518-A1, 예일대학). 또한 생쥐 뇌의 신경교 세포에서 특이적으로 발현되는 막 당단백질인 LIG-1도 루이신 풍부 반복부 및 이뮤노글로불린 유사 도메인을 갖고 있어 흥미롭다 (Suzuki et al.,J. Biol. Chem.(US) 271 (32): 22522 (1996)). 루이신 풍부 반복부를 갖는 단백질의 생체 기능에 관한 다른 연구 보고서로는 (Tayar, N., et al.,Mol. Cell Endocrinol., (Ireland), 125(1-2):65-70 (Dec. 1996)) (고나도트로핀 수용체 관련), (Miura, Y., et al.,Nippon Rinsho(Japan), 54(7):1784-1789 (July 1996))(아폽토시스 관련), (Harris, P. C., et al.,J. Am. Soc. Nephrol., 6(4):1125-1133 (Oct. 1995)) (신장병 관련) 등이 있다.

9.PRO1194

핵 유전자 PET117 및 PET119는 사카로마이세스 세레비지애에서 활성 사이토크롬 c 옥시다제의 어셈블리에 필요하므로 관심을 끈다. 이들 유전자와 서열 동일성이 있는 핵산도 흥미롭다. PET 유전자는 문헌 (McEwen, et al.,Curr. Genet., 23(1): 9-14 (1993))에 더 기재되어 있다.

10.PRO1110

골수는 포유동물에서 많은 중요한 역할을 담당하고 있다. 이들 역할 중 하나는 혈액과 면역계의 중요 세포 및 다른 성분으로 분화하는 다양한 전구세포원을 제공하는 것이다. 따라서, 골수계의 기능은 매우 많은 관심을 끈다.

본 발명자들은 본원에서 PRO1110 폴리펩티드로 지칭하며 골수 상향조절 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

11.PRO1378

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1378로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

12.PRO1481

신규 천연 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1481로 지칭하는 신규 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

13.PRO1189

증식 또는 분화를 일으키는 데 관여할 수 있는 간세포 (stem cell) 및 전구세포 상의 수용체 단백질의 확인에 많은 관심이 기울여져 왔다. 타입 II 막횡단 단백질은 생후 하악 관절융기 증식의 외부 연골막하 테두리에서 증식하는 전구세포에서 확인되었다. 연구자들은 E25가 연골형성 분화에 대한 유용한 마커일 수 있다는 결론을 내렸다 (Deleersnijder,et al.,J. Biol. Chem. 271(32): 19475-19482 (1996)).

14.PRO1415

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1415로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

15.PRO1411

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1411로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

16.PRO1295

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1295로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

17.PRO1359

하이알루로니다제, 시알릴트랜스퍼라제, 유로키나제-타입 플라스미노겐 활성화제, 플라스민, 매트릭스 메탈로프로테이나제 등과 같은 효소는 세포외 매트릭스 분자의 이화에서 중추적인 역할을 한다. 따라서, 이들 효소 및 그의 억제제는 전이성 암 및 그의 치료에 작용할 수 있다 (Van Aswegen 및 du Plessis,Med. Hypotheses, 48(5): 443-447 (1997)). 상기 이유로, 이들의 다양한 기질 특이성 뿐만 아니라 예를 들어, 시알릴트랜스퍼라제도 특히 흥미롭다. 예를 들어, 관심을 받고 있는 펩티드는 문헌 (Kurosawa, et al.,J. Biol. Chem., 269(2): 1402-1409 (1994))에 기재되어 있는 GalNAc 알파 2,6-시알릴트랜스퍼라제이다. 이 펩티드는 분비되도록 구성되어 있는데, 그의 촉매 활성은 보유되었다. 발현된 효소는 아시알로뮤신 및 아시알로페튜인에 대한 활성은 나타내지만 시험된 다른 당단백질에 대한 활성은 나타내지 않는다. 시알릴화는 중요한 기능이므로, 이러한 기능을 하는 시알릴트랜스퍼라제, 및 서열 동일성에 의해 관련된 펩티드는 흥미를 끈다. 시알릴트랜스퍼라제는 문헌 (예를 들어, Sjoberg, et al.,J. Biol. Chem., 271(13): 7450-7459 (1996), Tsuji,J. Biochem., 120(1): 1-13 (1996) 및 Harduin-Lepers, et al.,Glycobiology, 5(8): 741-758 (1995) 참조)에 더 기재되어 있다.

18.PRO1190

문헌 (Kang et al., J. Cell Biol. (1997) 138(1): 203-213)은 Ig 거대족의 신규 세포 표면 당단백질의 확인에 관해 보고하였다. Ig 거대족의 세포 부착 분자는 세포 이동, 증식 조절 및 종양발생을 비롯한 매우 다양한 생물학적 과정과 관련되어 있다. 상기 문헌의 연구결과는 CDO 기능의 상실이 종양을 발생시킬 수 있다고 제시하고 있다. 따라서, 추가적인 CDO-유사 분자, 및 보다 일반적으로 Ig 거대족의 세포 부착 분자를 확인하는 것은 관심을 끈다.

19.PRO1772

펩티다제는 특이적 또는 비특이적 방식으로 펩티드 기질을 절단하는 기능을 하는 효소 단백질이다. 펩티다제는 일반적으로 포유동물 및 비포유동물 생물체에서 매우 중요한 다수의 생물학적 과정에 관여한다. 여러 가지 다양한 포유동물 및 비포유동물 생물체로부터 유래한 수많은 다양한 펩티다제 효소가 확인되었고 그 특징이 규명되었다. 포유동물 펩티다제 효소는 예를 들어, 단백질 소화, 펩티드 호르몬 활성의 활성화, 비활성화 또는 조절, 및 단백질과 효소의 물리적 특징의 변경을 비롯한 여러 가지 많은 생물학적 과정에서 중요한 역할을 한다.

펩티다제 효소의 중요한 생리학적 역할의 견지에서, 신규 천연 펩티다제 상동체를 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 현재 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 스크리닝 방법 및 기술의 예는 문헌 (예를 들어, Klein et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 93: 7108-7113 (1996); 미국 특허 제5,536,637호 참조)에 기재되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1772 폴리펩티드로 지칭하며 다양한 펩티다제 효소와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인에 관해 기술하고 있다.

20.PRO1248

추정 단백질-2 (PUT-2)는 인간 질병 유전자 L1CAM, G6PD 및 P55의 상동체이다 (Riboldi Tumnicliffe et al.,Genome Analysis, 제출됨). 따라서, PUT-2 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드 및 코딩 DNA를 확인하는 것은 관심을 끈다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1248 폴리펩티드로 지칭하며 PUT-2 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

21.PRO1316

딕코프 (Dkk)는 시스테인이 풍부한 도메인에서 높은 상동성 (즉, 80-90%)가 있는 분비 단백질족이다. 이 족에 속하는 것으로 처음 발견된 단백질인 Dkk-1은 스페만 형성체에 대해 강력한 머리-유도 활성을 나타낸다 (Glinka et al., Nature 391 (6665): 357-362 (1988)). 양서류 배 (胚)의 스페만 형성체는 두 가지 다른 활성, 즉 몸통 형성체 및 머리 형성체로 나누어질 수 있다. Dkk-1은 제노퍼스(Xenopus) 배 (胚)에서 머리 형성을 유도하는 데 충분하고 필요한 것으로 밝혀졌으며, Wnt 신호전달의 강력한 길항제이기도 하는데, 이는 Dkk 유전자가 전체 Wnt 억제제족을 코딩한다는 것을 의미한다.

Wnt 유전자족의 구성원은 정상적인 발달 및 분화 뿐만 아니라 종양발생에서도 작용한다. Wnt는 환상 벌레, 곤충, 연골성 물고기 및 척추동물에서 발견된 거대한 유전자족에 의해 코딩된다 (Holland et al., Dev. Suppl., 125-133 (1994)). Wnt 유전자는 세포 운명을 제어하는 분비 당단백질족을 코딩하고 수용체-매개 신호전달 경로의 활성화를 통해 배 (胚)에서 작용한다.

Wnt 유전자의 돌연변이에 대한 연구는 성장 조절 및 조직 패턴닝에서 Wnt의 역할을 보여준다. 초파리에서, 윙글리스 (wg)는 Wnt-관련 유전자 (Rijsewik et al., Cell, 50: 649-657 (1987))를 코딩하고 wg 돌연변이는 배자외배엽, 신경발생 및 영상 원판 증식의 양상을 변화시킨다 (Morata 및 Lawerence, Dev. Biol., 56: 227-240 (1977); Baker, Dev. Biol., 125: 96-108 (1998); Klingensmith 및 Nusse, Dev. Biol., 166: 396-414 (1994)). 캐노하브디티스 엘레강스 (Caenorhabditis elegans)에서, lin-44는 비대칭 세포 분열에 필요한 Wnt 상동체를 코딩한다 (Herman 및 Horvitz,Development, 120: 1035-1047 (1994)). 마우스에서 넉아웃 돌연변이는 Wnt가 뇌 발달 (McMahon 및 Bradley,Cell, 62: 1073-1085 (1990); Thomas 및 Cappechi,Nature, 346: 847-850 (1990)), 및 신장 (Stark et al.,Nature, 372: 679-683 (1994), 꼬리 (Takada et al., Genes Dev., 8: 174-189 (1994)) 및 팔다리 (Parr 및 McMahon, Nature, 374: 350-353 (1995))에 대한 배원기의 성장에 필수적이라는 것을 보여준다. 유선에서 Wnt의 과다발현은 유방 과다증식 및 종양 (상기 McMahon (1992); Nusse 및 Varmus, H. E.,Cell69: 1073-1087 (1992))과 조발성 폐포 발달 (Bradbury et al.,Dev. Biol., 170: 553-563 (1995))을 초래할 수 있다. 게다가, 이식된 유방 상피세포의 동정 숙주에서 Wnt-4의 구성성 발현 (constitutive expression)은 임신-유사 증식 양상과 유사한 매우 분지된 조직을 초래하였다 (Bradury et al.,Dev. Biol., 170: 553-563 (1995)).

Wnt/Wg 신호전달 경로는 생물체의 생물학적인 발달에서 중요한 역할을 하고 여러 가지 인간 암에 관련되어 있다. 이 경로에는 종양 억제 유전자인 APC도 포함된다. APC 유전자의 돌연변이는 산발적 및 유전적 형태의 인간 결장직장암의 발달과 관련이 있다. 예를 들어, Wnt-2의 농도 상승이 결장직장암에서 관찰된 바 있다 (Vider, B-Z. et al.,Oncogene12: 153-158 (1996)).

22.PRO1197

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1197로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

23.PRO1293

이뮤노글로불린은 B-세포막에 있는 항체에 대한 수용체 및 플라스마 세포의 분비 물질로 작용하는 항체 분자이다. 모든 항체 분자처럼, 이뮤노글로불린은 두가지 주요 기능을 수행한다: 이뮤노글로불린은 항체에 특이적으로 결합하고 제한된 수의 생물학적 이펙터 (effector) 기능에 참여한다. 그러므로, Ig 거대족의 신규 구성원 및 그의 단편은 항상 관심을 끈다. 다양한 바이러스에 의해 수용체로 작용하는 분자 및 면역 기능을 조절하는 분자는 특히 관심을 끈다. 특히, 바이러스 수용체로 작용하거나 면역 기능을 조절하는, Ig족의 공지된 구성원과 상동성이 있는 분자도 관심을 끈다. 따라서, Ig 거대족의 구성원과 상동성이 있는 분자 및 그의 단편 (즉, 중쇄 및 경쇄 단편)은 특히 관심을 끈다.

본 발명자들은 본원에서 PRO1293 폴리펩티드로 지칭하며 이뮤노글로불린 중쇄 가변 영역 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

24.PRO1380

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1380으로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

25.PRO1265

생리학적 및 대사적 경로에 관여하는 신규 분비 단백질의 확인은 제약 제제로 이용 가능하기 때문에 관심을 끈다. 면역 반응 및 염증 기작에 관여할 가능성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인은 특히 관심을 끈다. IL-4에 반응하여 마우스 B세포에서 발현되는 신규 폴리펩티드가 최근에 확인되었다. 이 폴리펩티드를 코딩하는 유전자를 인터루킨-4로부터 유래한 유전자 1 또는 "Fig 1"이라 부른다 (Chu et al., Proc. Natl. Acad. Sci (1997) 94(6): 2507-2512).

26.PRO1250

장쇄 지방산 CoA 리가제는 장쇄 지방산을 결합시키는 작용을 하는 효소 단백질로서, 상기 기능은 다양한 생리학적 과정에서 중요한 역할을 한다. 이 효소 단백질의 중요성 때문에, 신규 장쇄 지방산 CoA 리가제 상동체를 찾아내려는 노력이 현재 이루어지고 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1250 폴리펩티드로 지칭하며 장쇄 지방산 CoA 리가제와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

27.PRO1475

N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 단백질은 포유동물 생물체에서 다양한 중요 생물학적 기능을 제공하는 효소족을 포함한다. 예를 들면, UDP-N-아세틸글루코스아민: 알파-3-D-만노시드 비트-1,2-N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 I은 만노스가 많은 N-글리칸이 하이브리드 및 복합 N-글리칸으로 전환되는 데 필수적인 첫 단계를 촉매하는 효소 단백질이다 (Sarker et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88: 234-238 (1991)). N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 효소의 중요성이 명백하므로, N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명은 상당한 관심을 끈다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1475 폴리펩티드로 지칭하며 N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

28.PRO1377

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1377로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

29.PRO1326

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1326으로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

30.PRO1249

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1249로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

31.PRO1315

많은 중요 사이토킨 단백질은 확인되어 그 특징이 규명되어 있고 특정 세포 표면 수용체 복합체를 통해 신호를 전달하는 것으로 보여진다. 예를 들면, 클래스 II 사이토킨 수용체족 (CRF2)에는 인터페론 수용체, 인터루킨-10 수용체 및 조직 인자 CRFB4가 포함된다 (Spencer et al., J. Exp. Med. 187: 571-578 (1998) 및 Kotenko et al., EMBO J. 16: 5894-5903 (1997)). 따라서, 다양한 사이토킨 단백질에 의해 나타나는 많은 생물학적 활성은 표적 세포의 표면에 있는 사이토킨 수용체 단백질의 존재에 절대적으로 달려있다. 그러므로, 1종 이상의 사이토킨 수용체족과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 확인하고 그 특징을 규명하는 데 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1315 폴리펩티드로 지칭하며 사이토킨 수용체족-4 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

32.PRO1599

그란자임 M은 천연 킬러 세포의 세린 프로테아제이다. 다른 세린 프로테아제와 동일한 엑손-인트론 구조를 갖는 인간 유전자는 7.5 킬로베이스이고 염색체 19p13.3에 있는 세린 프로테아제 유전자 군집에 매우 가깝게 위치한다 (Pilat et al., Genomics, 24: 445-450 (1994)). 그란자임 M은 2종의 인간 천연 살해 백혈구 세포주, 즉 무자극된 인간 말초혈 단핵구 및 비처리 정제된 CD3-CD56+ 거대 과립 림프구에서 발견되었다 (Smyth et al., J. Immunol., 151: 6195-6205 (1993)).

33.PRO1430

리덕타제는 다양한 포유동물 조직에서 발견된 효소 단백질의 거대한 클래스를 형성하고 이들 조직이 적당히 작용하는 데 많은 중요 역할을 한다. 리덕타제는 반응성 산소종이 물로 전환되는 것을 촉매하는 항산화 효소이다. 리덕타제가 비정상적인 농도로 존재하거나 비정상적으로 작용하는 것은 졸중, 심장발작, 산성화 스트레스, 고혈압, 및 양성과 악성 종양의 발달을 비롯한 여러 가지 질환 및 질병에 관여한다. 예를 들어, 악성 전립선 상피에는 상기 항산화 효소의 발현이 저하되어 있을 수 있다 (Baker et al., Prostate 32(4): 229-233 (1997)). 국제 특허 출원 제WO9622360-A1에는 전립선암을 진단 및 치료하고 신규 길항제를 스크리닝하는 데 유용한 전립선 특이적 리덕타제가 기재되어 있다. 알파-리덕타제의 억제제는 양성 전립선 증식증을 치료하는 데 이용되어 왔다 (Anderson, Drugs Aging (1996) 6(5): 388-396). 이런 이유로, 암과 다른 질환 및 질병을 치료하고 진단하기 위해 리덕타제족의 신규 구성원을 확인하는 것은 관심을 받아 왔다.

34.PRO1374

프롤릴 4-히드록실라제 (P4HA)는 콜라겐에서 4-히드록시프롤린의 형성을 촉매한다 (Annunen, et al., J. Biol. Chem., 272(28): 17342-17348 (1997); Helaakoski, et al., PNAS USA, 92(10): 4427-4431 (1995); 및 Hopkinson, et al., Gene, 149(2): 391-392 (1994)). 이 효소 및 그와 관련된 분자는 관심을 끈다.

35.PRO1311

"막횡단 4 (TM4) 거대족"으로도 불리는 테트라스판족 단백질은 세포막에서 조직화 기능을 하는 것으로 알려져 있다. 상기 테트라스판족 단백질은 거대한 분자 복합체와 상호작용하고 세포 부착, 활성화 및 분화와 같은 다양한 활성에 작용하는 것으로 믿어지고 있다 (Maecker, et al.,FASEB, 11: 428-442 (1997)). 따라서, 테트라스판족 단백질의 신규 구성원을 확인하는 것은 관심을 끈다. 신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 수용체 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다.

36.PRO1357

에브네린은 포유동물에서 본 에브너선과 관련된 세포 표면 단백질이다. 신규 천연 단백질, 및 구체적으로는 에브네린 또는 다른 침샘-관련 단백질과 같은 세포 표면 단백질과 상동성이 있는 서열을 갖는 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 수용체 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1357 폴리펩티드로 지칭하며 본 에브너 소침샘-관련 단백질과 상당한 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인에 관해 기술하고 있다.

37.PRO1244

주목받는 한 가지 유형의 막횡단 단백질은 착상-관련 자궁 단백질이다. 이 단백질이 결핍되었거나 비정상적 양으로 존재하면 유산의 원인이 될 수 있다. 그러므로, 착상-관련 단백질의 확인 및 특징규명은 관심을 끈다.

38.PRO1246

골-관련 술파타제는 골조직에서 프로테오글리칸 당쇄의 술페이트 기를 분해하는 것으로 보여지는 효소 단백질이다 (호주 특허 공개 제AU 93/44921-A호, 1994년 3월 3일). 상기 골-관련 술파타제의 특이적 술파타제 활성 때문에, 골-관련 술파타제는 골 대사 질환의 치료에 이용될 수 있다고 제안되어 왔다. 따라서, 골-관련 술파타제와 유사한 서열을 갖는 신규 폴리펩티드를 확인하고 그 특징을 규명하는 데 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1246 폴리펩티드로 지칭하며 골-관련 술파타제와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

39.PRO1356

클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 (Clostridium perfringensenterotoxin, CPE)는 클로스트리듐 퍼프링겐스 타입 A 식중독 증상을 일으키는 데 원인이 되는 발병인자로 여겨지고 있고, 다른 인간 및 수의 질환에 관여할 수도 있다 (McClane, Toxicon. 34: 1355-1343 (1996)). CPE는 클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 수용체 (CPE-R)로 지칭하는 약 50 kD의 세포 표면 수용체 단백질에 결합하여 세포 표면에서 약 90,000 kD의 복합체를 형성함으로써 세포에서 유해한 기능을 수행한다. CPE-R 단백질을 코딩하는 cDNA는 인간 및 마우스에서 확인되어 그 특징이 규명되었다 (Katahira et al., J. Cell Biol. 136: 1239-1247 (1997) 및 Katahira et al., J. Biol. Chem. 272: 26652-26658 (1997)). CPE 독소는 포유동물 숙주에서 다양한 질병을 일으키는 것으로 보고되어 왔으며, 상기 질병은 CPE-R에 CPE 독소가 결합하여 개시되기 때문에, 신규 CPE-R 상동체를 확인하는 데 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1356 폴리펩티드로 지칭하며 CPE-R과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

40.PRO1275

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1275로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

41.PRO1274

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1274로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

42.PRO1412

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1412로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

43.PRO1557

신경 발달에서 작용하는 분비성 단백질의 확인은 관심을 끈다. 이러한 단백질은 신경 질환 및 신경 질병을 이해하고 치료하는 데 이용될 수 있다. 제노퍼스로부터 단리된 코딘 (Chordin) 단백질은 제노퍼스 머리, 몸통 및 꼬리 발달의 형성 중심부에서 세포-세포 상호작용을 조절하는 강력한 배 (胚)형성 인자이다 (Sasai et al., (1994) Cell 79(5): 779-790; Mullins, (1998) Trends Genet. 14(4): 127-129; 및 Kessel et al., (1998) Trends Genet. 14(5): 169-171). 상기 코딘 단백질은 신경 및 근육 세포를 배양하기 위한 배양 배지의 성분으로 이용될 수 있고, 신경퇴행성 질환 및 신경손상의 치료에 이용될 수 있다 (미국 특허 제5,679,783호).

44.PRO1286

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1286으로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

45.PRO1294

후각 신경상피의 세포외 점액성 기질은 후각 신호도입 기구가 위치한 화학감지 섬모와 친밀하게 접해있는 매우 조직적인 구조이다. 이 세포외 기질의 주요 단백질 성분은 올팍토메딘으로서, 올팍토메딘은 후각 신경상피에서 발현되고 분자간 이황화결합을 통해 중합체를 형성하는 당단백질이다 (Yokoe et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA90:4655-4659 (1993), Bal et al.,Biochemistry32:1047-1053(1993) and Snyder et al.,Biochemistry30:9143-9153 (1991)). 올팍토메딘이 후각 뉴런의 수상돌기 첨단에 존재하는 화학감지 섬모의 유지, 성장 또는 분화에 영향을 끼칠 수 있음이 제기되었다. 이러한 중요한 역할 때문에, 올팍토메딘과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 찾아내고 그 특징을 규명하는 데 상당한 관심이 존재한다.

본 발명자들은 올팍토메딘 단백질과 상동성이 있으며 본원에서 PRO1294 폴리펩티드로 명명된 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

46.PRO1347

부티로필린은 포유동물 젖에서 지방 소구막과 결합된 전체 단백질 중 40 % 이상을 차지하는 젖 당단백질이다. 부티로필린 mRNA의 발현은 임신 말기쪽으로 갈수록 젖 지방 생산이 개시되는 것과 상관관계가 있는 것으로 밝혀졌으며, 수유기간 내내 유지된다. 부티로필린은 소, 뮤린, 및 인간에게서 확인되었으며 (Taylor et al.,Biochim. Biophys. Acta1306:1-4 (1996), Ishii et al.,Biochim. Biophys. Acta1245:285-292 (1995), Mather et al.,J. Dairy Sci.76:3832-3850 (1993), Banghart et al.,J. Biol. Chem.273:4171-4179 (1998)), 지방 소구막에 박혀있는 타입 I 막횡단 단백질이다. 부티로필린은 수유기간 중에 선단 표면으로부터 젖-지방 소구의 버딩 및 방출에 기능하는 다른 단백질과 크산틴 디히드로게나제/옥시다제와의 복합체가 형성되는 데 주골격으로 기능할 수 있다고 제시되었다 (Banghart et al., 앞의 책).

부티로필린이 포유동물 젖 생산에서 분명히 중요한 역할을 담당하므로, 신규부티로필린 상동체를 밝혀내는 데 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 부티로필린과 상동성이 있으며 본원에서 PRO1347 폴리펩티드로 명명된 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

47.PRO1305

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1305로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

48.PRO1273

리포칼린 단백질족은 세포외 소단백질로 이루어진 거대한 그룹다. 상기 족은 서열 수준에서 높은 다양성을 나타내지만, 대부분의 리포칼린은 특징적인 보존 서열 모티프를 공유한다. 리포칼린은 레티놀 전달, 무척추동물의 음와성 착색, 후각 및 페로몬 전달, 및 프로스타글란딘 합성에 관여하는 것으로 알려져 있다. 리포칼린은 세포 항산성의 조절 및 면역 반응의 제어에도 관여하며, 담체 단백질로서 일반적으로 내독성 및 외독성 화합물을 제거하는 데 작용한다 (Flower, Biochem. J., 318(Pt 1): 1-14 (1996); Flower, FEBS Lett., 354(1): 7-11 (1994)). 따라서, 리포칼린 단백질족의 신규 구성원은 관심을 끈다.

49.PRO1302

CD33은 시알산 타입, 및 이 타입과 하위말단 당과의 결합에 대한 특이성이다른 시알산 의존성 결합을 매개할 수 있는 시알로어드헤신족 단백질의 구성원인 세포-표면 단백질이다. CD33은 초기 골수 및 몇몇 단핵구 세포 계열에서 특이적으로 발현되고 예를 들어, 급성 비림프구성 백혈병 (ANLL)을 비롯한 다양한 골수성 종양과 밀접하게 관련되어 있는 것으로 보여진다. 따라서, CD33은 단백질의 높은 발현도와 관련된 암을 치료하기 위한 가능성 있는 표적으로 제시되어 왔다. 한 가지 CD33 상동체 (CD33L로 지칭함)가 문헌 (Takei et al., Cytogenet. Cell Genet. 78: 295-300 (1997))에 기재되어 있다. 또다른 연구는 급성 골수성 백혈병의 골수 이식에서 CD33 단일클론 항체의 이용에 대해 기술하고 있다 (Robertson, et al., Prog. Clin. Biol. Res., 389: 47-63 (1994)).

게다가, 시알로어드헤신족의 구성원이 정상적인 상태 하에서 뿐만 아니라 염증 반응 과정에서 대식세포 기능의 범위에 기여한다는 연구도 보고되어 있다 (Crocker, et al., Glycoconj. J., 14(5): 601-609 (1997)). 또한, 이들 단백질은 다양한 생물학적 과정, 즉 조혈, 신경 발달 및 면역과 관련되어 있다 (Kelm et al., Glycoconj. J., 13(6): 913-926 (1996)). 따라서, 서열 동일성에 의해 CD33과 관련된 신규 폴리펩티드는 관심을 끈다.

50.PRO1283

후각 수용은 비강 상피에 위치해 있는 후각 수용체 세포의 화학감지 섬모와 방향제의 상호작용을 통해 일어난다. 비강 상피-관련 방향제 결합 단백질의 다양성을 기초로, 포유동물 후각계는 다양한 다수의 방향제 분자를 인식하고 구별화할 수 있다. 이러한 면에서, 많은 상이한 방향제 결합 단백질 및 그들의 코딩 DNA가최근에 확인되어 그 특징이 규명되었다 (Dear et al., Biochemistry 30: 10376-10382 (1991), Pevsner et al., Science 241: 336-339 (1998), Buck et al., Cell 65: 175-187 (1991) 및 Breer et al., J. Recept. Res. 13: 527-540 (1993)). 포유동물 후각계에 의한 방향제 검출 기작에 대한 연구는 관심의 대상이기 때문에, 신규 방향제 결합 단백질을 확인하는 데 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1283 폴리펩티드로 지칭하며 방향제 결합 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

51.PRO1279

프로테아제는 포유동물 및 비포유동물의 매우 중요한 많은 생물학적 과정에 관여하는 단백질 효소이다. 여러 세린-함유 단백질에 대해 특이적 활성을 갖는 세린 프로테아제를 비롯하여, 여러 다양한 포유동물 및 비포유동물체로부터 수많은 상이한 프로테아제 효소가 확인되고 특징이 규명되었다. 포유동물 프로테아제 효소는 단백질 소화, 활성화, 불활성화, 펩티드 호르몬 활성 변조, 및 단백질과 효소의 물리적 성질 변경을 비롯한 많은 다양한 생물학적 과정에서 중요한 역할을 담당한다.

뉴롭신은 mRNA가 중추 신경계에서 발현되는 신규 세린 프로테아제이다. 생쥐 뉴롭신이 클로닝되었으며, 연구 결과 이것이 해마 점성에 관여하는 것으로 밝혀졌다. 뉴롭신은 세포외 기질 수식 및 세포 이동과 관련된 것으로 나타났다 (Chen, et al.,Neurosci., 7(2):5088-5097 (1995) 및 Chen, et al.,J. Histochem. Cytochem., 46:313-320 (1998)).

본 발명자들은 본원에서 PRO1279 폴리펩티드로 지칭하며 뉴롭신 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

52.PRO1304

이뮤노필린은 시클로스포린 A, FK506 및 라파마이신과 같은 면역억제 약물에 대한 수용체로 작용하는 단백질족이다. 이뮤노필린은 두 가지 클래스, (1) FK506 및 라파마이신에 결합하는 FK506-결합 단백질 (FKBP)과, (2) 시클로스포린 A에 결합하는 시클로필린으로 분리된다. FK506-결합 단백질을 살펴보면, FK506/FKBP 복합체는 세린/트레오닌 단백질 포스파타제 2B (칼시뉴린)의 활성을 억제하는 작용을 하여 면역억제 활성을 제공하는 것으로 보고되어 있다 (Gold, Mol. Neurobiol. 15: 285-306 (1997)). 또한, FKBP 이뮤노필린은 포유동물 신경계에서 발견되며, 면역억제가 이루어지는 과정에 의존하지 않는 기작을 통해 중추 신경계의 축삭 재생에 관여할 수 있다 (상기 Gold). 따라서, FKBP 이뮤노필린과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 확인하는 데 실질적인 관심이 있다.

본 발명자들은 본원에서 PRO1304 폴리펩티드로 지칭하며 FK506 결합 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

53.PRO1317

백혈구 집단의 자극시 발현이 증가되는 분자의 확인에 상당한 관심이 기울여지고 있는데, 이는 이들 분자의 구조 및 기능을 이해하는 것이 활성화를 수반하는 세포내 및 세포간 이벤트를 더 이해하게 할 수 있기 때문이다. 이러한 분자의 하나인 CD97은 림프구가 활성화될 때 빠르게 상향조절되는 세포 표면 항체로서 최근에 여러 논문의 주제가 되고 있다 (Eichler et al., Tissue Antigens (1997) 50(5): 429-438; Aust et al., Cancer Res. (1997) 57(9): 1798-1806 참조). CD97에 대한 강력한 양성반응을 나타내는 백혈구는 정상 림프조직에서 CD97 발현과 관련한 염증이 일어나는 부위에 농축되어 있다. CD97의 가용성 서브유닛인 CD97알파는 염증 조직의 체액에서 발견되었다 (Gray et al., J. Immunol. (1996) 157(12): 5438-5447).

54.PRO1303

프로테아제는 포유동물 및 비포유동물의 매우 중요한 많은 생물학적 과정에 관여하는 단백질 효소이다. 여러 세린-함유 단백질에 대해 특이적 활성을 갖는 세린 프로테아제를 비롯하여, 여러 다양한 포유동물 및 비포유동물체로부터 수많은 상이한 프로테아제 효소가 확인되고 특징이 규명되었다. 포유동물 프로테아제 효소는 단백질 소화, 활성화, 불활성화, 펩티드 호르몬 활성 변조, 및 단백질과 효소의 물리적 성질 변경을 비롯한 많은 다양한 생물학적 과정에서 중요한 역할을 담당한다.

뉴롭신은 mRNA가 중추 신경계에서 발현되는 신규 세린 프로테아제이다. 생쥐 뉴롭신이 클로닝되었으며, 연구 결과 이것이 해마 점성에 관여하는 것으로 밝혀졌다. 뉴롭신은 세포외 기질 수식 및 세포 이동과 관련된 것으로 나타났다 (Chen, et al.,Neurosci., 7(2):5088-5097 (1995) 및 Chen, et al.,J. Histochem. Cytochem., 46:313-320 (1998)). 뉴롭신은 세포외 매트릭스 수식 및 세포 이동과 관련되어 있는 것으로도 기재되어 있다 (일반적으로, Chen, et al., Neurosci.,7(2): 5088-5097 (1995) 및 Chen, et al., J. Histochem. Cytochem., 46: 313-320 (1998) 참조). 흥분이 마우스 뇌에서 뉴롭신 mRNA를 유도한다는 다른 연구도 보고되어 있다 (Okabe, et al., Brain Res., 728(1): 116-120(1996)). 추가적으로, 연구 결과 반응성 산소종의 생성이 회피학습 장애와 관련될 수 있는 변연영역 (limbric area)의 뉴롭신 전사체에서 중요한 역할을 하는 것으로 밝혀져 있다 (Akita, et al., Brain Res., 769(1): 86-96 (1997)). 따라서, 뉴롭신, 및 아고니스트와 길항제를 비롯한 관련 단백질 및 물질은 관심을 끈다.

55.PRO1306

새로운 치료 방법에 이르게 할 수 있는, 포유동물 질환 및 질병에 작용하는 단백질의 확인에 많은 관심이 기울여지고 있다. 대식세포 폴리펩티드인 다인타인 (daintain)/동종이식 염증 인자 I (다인타인/AIF1)은 당뇨병 전의 래트의 췌장에서 발견되었고, 인슐린 분비에 직접적으로 영향을 주는 것으로 확인되었다. 다인타인/AIF1이 저용량으로 마우스에 정맥내 투여되면, 포도당 제거의 손상과 동시에 포도당-자극 인슐린 분비가 억제된다. 보다 높은 용량에서 다인타인/AIF1은 포도당-자극 인슐린 분비를 상승시키고 포도당 제거를 향상시켰다. 따라서, 다인타인/AIF1이 인슐린-의존성 당뇨병의 발병기작과 관련되는 작용을 할 수 있다는 것이 제시되었다 (Chen et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (1997) 94(25): 13879-13884). AIF-1은 래트 및 인간 동종 심장이식 거부에도 관여하고 있고, 대식세포 활성화 및 기능에 작용할 수 있다 (Utans et al., J. Clin. Invest. (1995) 95(6): 2954-2962).

56.PRO1336

단백질-단백질 상호작용은 수용체와 항원의 복합체 및 신호전달 기작을 포함한다. 단백질-단백질 상호작용의 기초가 되는 구조적 및 기능적 기작에 대해 잘 알려진 바와 같이 단백질-단백질 상호작용은 쉽게 조작하여 그 특정 결과를 조절할 수 있다. 따라서 단백질-단백질 상호작용의 기초 기작은 과학계 및 의학계에 관심의 대상이 되고 있다.

루이신이 풍부한 단백질은 단백질-단백질 상호작용과 관련되어 있는 것으로 알려져 있다. 한 연구 보고서에 따르면, 루이신 풍부 프로테오글리칸은 개체 발생시 콜라겐 섬유를 배향하고 정돈하는 조직 형성체로서 기능하며, 창상 치유, 조직 수복 및 종양 지질 (支質) 형성 등의 병리적 과정에 관여한다 (Iozzo, R. V.,Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., 32(2):141-174 (1997)). 루이신 풍부 단백질이 창상 치유 및 조직 복구에 연루되어 있다는 다른 연구 결과도 있다. 출혈 장애 버나드-소울리어 증후군과 관련된 복합체 중의 루이신 풍부 모티프가 돌연변이되었음을 보고한 문헌 (De La Salle, C., et al.,Vouv. Rev. Fr. Hematol. (Germany), 37(4):215-222 (1995), 혈소판이 루이신 풍부 반복부를 갖는다고 보고한 문헌 (Chlemetson, K.J., Thromb. Haemost. (Germany), 74(1):111-116 (July 1995))이 그것이다.

루이신 풍부 반복부를 갖는 것으로 보고된 또다른 단백질은 SLIT 단백질로서, 이 단백질은 알쯔하이머병 등의 신경 퇴행성 질환 및 파킨슨병 등에서의 신경 손상을 치료하는 데, 그리고 암의 진단에서 유용한 것으로 보고된 바 있다(Artavanistsakonas, S. and Rothberg, J. M., WO9210518-A1, 예일대학). SLIT 단백질은 그 특징이 규명되었고 신경교세포에 의해 분비되며, 초파리에서 축삭 경로의 형성 뿐만 아니라 세포외 단백질 상호작용의 매개에 관여하는 것으로 보고되어 있다 (Wharton 및 Crews, Mech. Dev., 40(3): 141-154 (1993); Rothberg 및 Artavanis-Tsakonas, J. Mol. Biol., 227(2): 367-370 (1992); Rothberg, et al., Genes Dev., 4(12A): 2169-2187 (1990); 및 Rothberg, et al., Cell, 55(6): 1047-1059 (1998)).

57.PRO1278

라이소자임은 일부 미생물의 뮤코펩티드 세포벽 구조에서 일어나는, N-아세틸뮤람산과 N-아세틸글루코스아민 사이의 [베타]-1,4 글루코시드 결합을 우선적으로 가수분해하는 분비 효소이다. 라이소자임은 동물 및 식물에 넓게 분포해 있다. 타액, 눈물, 젖, 경관점액, 백혈구, 신장 등을 비롯한 포유동물 분비물 및 조직에서 발견되었다. 대사 기능 및 기능저하에서 라이소자임이 하는 다양한 역할 때문에, 라이소자임족 단백질의 신규 구성원을 확인하는 것은 관심을 끈다. 라이소자임의 비정상적인 양은 다양한 질환 상태와 관련되어 있다. 라이소자임에는 항균효과, 진통효과 및 항통각 효과가 있는 것으로 보고되어 있다. 라이소자임의 추가적인 특징 및 가능성 있는 용도는 미국 특허 제5,618,712호에 기재되어 있다.

58.PRO1298

글리코실화는 단백질의 운명 예를 들어, 단백질이 분비되는지 분비되지 않는지를 결정할 수 있다. 또한, 당단백질은 특히 세포막의 일부로서 구조적 및 기능적 역할을 한다. 따라서, 글리코실화는 관심을 끈다. 효모에서 초기 N-글리코실화 유전자의 성장-관련 조절에 대한 연구가 보고되어 있다 (Kukuruzinska 및 Lennon, Glycobiology, 4(4): 437-443 (1994)). 게다가, 단백질 글리코실화와 당단백질의 지방 아실화 사이의 관계는 야생형 효모 및 아스파라진-결합 글리코실화-결핍 돌연변이체 효모에서 연구되었다 (Appukuttan, FEBS Lett., 255(1): 139-142 (1989)). 효모에서 아스파라진-결합 올리고당의 생합성도 돌연변이체를 이용하여 연구되었다 (Jackson, et al., Glycobiology, 3(4): 357-364 (1993)). 단백질 글리코실화가 결핍된 효모 돌연변이체도 문헌 (Huffacker 및 Robbins, PNAS, 80(24): 7466-7470 (1983))에 보고되어 있다.

59.PRO1301

사이토크롬 P450 단백질은 히드록실화에 관여하는 모노옥시게나제 효소로 이루어진 거대한 클래스를 형성한다. 히드록실화 반응은 콜레스테롤 및 스테로이드 호르몬의 합성에 중요하다. 사이토크롬 P450족의 효소는 아라키돈산과 같은 대사 내인성 화합물에서 중요한 역할을 한다. 이들 효소는 체내에서 약물을 제거하는 것과 같은 외부 물질의 대사에서도 중요하다 [예를 들어, Peterson, Aliment. Pharmacol. Ther., 9: 1-9 (1995) 참조]. 또한, 사이토크롬 P450 경로를 통해 생긴 대사물은 암발생, 혈압 조절 및 신장 기능에 작용할 수 있다 [예를 들어, Rahman et al., Am. J. Hypertens., 10: 356-365 (1997) 참조].

60.PRO1268

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1268로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

61.PRO1269

가장 흔한 형태의 백혈구 세포인 과립구는 종양 세포 및 미생물에 대한 면역 세포독성을 매개할 수 있다. 따라서, 이들 세포에 의해 생산되는 다양한 인자를 확인하는 데 관심이 기울여지고 있는데, 이는 제약 제제로서 상기 인자의 잠재적인 용도 때문이다. 특허 공개 제WO9729765-A1호에는 소 및 뮤린 과립구로부터 단리된 과립구 펩티드 A의 확인이 기재되어 있다. 치료 용도, 농약으로서의 용도, 음식 방부제로서의 용도, 및 물 치료 제제로서의 용도를 비롯한, 상기 펩티드의 여러 가지 용도가 확인되었다.

62.PRO1327

뉴렉소필린 (Neurexophilin)은 알파-라트로독소가 부착되어 있는 친화 크로마토그래피 과정에서 뉴렉신 I 알파와 함께 정제된 신경 당단백질로 발견된 단백질이다 (Missler et al., J. Neurosci. 18: 3630-3638 (1998)). 최근 데이타는 포유동물 뇌에 그 생성물이 5 개의 도메인으로 구성된 공통 구조 [(1) N-말단 신호 펩티드, (2) 가변 N-말단 도메인, (3) N-글리코실화되며 고도로 보존된 중심 도메인, (4) 짧은 결합 영역 및 (5) 시스테인이 풍부한 보존된 C-말단 도메인]를 공유하는 뉴렉소필린 생성물에 대한 4 가지 유전자가 함유되어 있음을 보였다 (상기 Missleret al.). 또한, 이들 데이타는 뉴렉소필린이 합성 후에 프로테아제에 의해 프로세싱되어 알파-뉴렉신에 결합한다는 것을 입증한다. 뉴렉소필린의 구조 및 특징은 뉴렉소필린이 알파-뉴렉신을 통해 신호를 보낼 수 있는 뉴로펩티드로서 작용할 수 있음을 나타낸다. 그러므로, 뉴렉소필린과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 확인하고 그 특징을 규명하는 데 상당한 관심이 기울여져 있다.

본 발명자들은 본원에서 PRO1327 폴리펩티드로 지칭하며 뉴렉소필린 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

63.PRO1382

세레벨린 (cerebellin)은 뇌 전체에서 발견되는 분비성 시냅스후 신경단백질이다. 이 단백질의 가장 높은 농도는 소뇌에서 발견되었다. 또한, 뇌하수체, 척수 및 부신에서도 검출된 바 있다 (Satoh et al., J. Endocrinol. (1997) 154(1): 27-34). 소뇌의 조롱박 세포 (purkinje cell)의 성숙을 조사하고 신경발달을 해도하기 위한 양적화 가능한 마커로 소뇌의 이용 가능성이 보고되어 있다 (Slemmon et al., Proc. Natl. Acad. Sci (1985) 82(20): 7145-7148 참조). 척수소뇌 퇴화증, 올리브교소뇌 위축증 (OPCAQ) 및 샤이-드래거 증후군 (Shy-Drager Syndrome)을 앓는 환자의 부검 연구에서 얻은 인간 뇌에서 세레벨린의 농도가 상당히 감소되어 있는 것으로 확인되었는데, 이는 세레벨린이 이들 소뇌 질환에서 중요한 병리학적 역할을 한다는 것을 제시하고 있다 (Mizuno et al., Brain Res. (1995) 686(1): 115-118; Mizuno et al., No To Shinkei (1995) 47(11): 1069-1074). 신경발단과 신경질환 및 신경질병에서 세레벨린은 중요하므로, 이 단백질족의 구성원을 확인하고그 특징을 규명하는 것에 관심이 기울어져 있다 (Yiangou et al., J. Neurochem. (1989) 53(3): 886-889 및 Mugnaini et al., Synapse (1988) 2(2): 125-138 참조).

64.PRO1328

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1328로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

65.PRO1325

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1325로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

66.PRO1340

캐드헤린 (Cadherin)은 동형 세포성 인식의 주요 매개자로 알려져 있고 조직 발달의 형태발생 방향에서 입증된 역할을 수행한다. 캐드헤린은 신경 조직을 비롯한 다양한 조직에서 확인된 여러 단백질족이다 (Suzuki et al., Cell Regul., 2: 261-270 (1991)). Ksp-캐드헤린은 캐드헤린 다중유전자족의 신장-특이적 구성원이다 (Thomson et al., Biol. Chem, 270: 17594-17601 (1995)). 캐드헤린은 인간 암에서 중요한 역할을 하는 것으로 생각된다 (Yap, Cancer Invest., 16: 252-261 (1998)).

67.PRO1339

카르복시펩티다제는 관심을 끈다. 카르복시펩티다제 E는 넓은 범위의 펩티드 호르몬의 생합성에 관여하는 듯하다 (Fricker, Annu. Rev. Physiol., 50: 309-321 (1988)). 이 카르복시펩티다제는 비만과 관련되어 있다 (Leiter, J. Endocrinol., 155(2): 211-214 (1997)). 카르복시펩티다제 M은 대식세포 성숙의 마커인 것으로 보고되어 있다 (Krause, et al., Immunol. Rev., 161: 119-127 (1998)). 인간 비만세포의 카르복시펩티다제는 알러지와 관련되어 있는 것으로 보고되어 있다 (Goldstein, et al., Monogr. Allergy, 27: 132-145 (1990)). 카르복시펩티다제 A2에 대해서도 보고되어 있다 (Faming, et al., J. Biol. Chem., 266(36): 24606-24612 (1991)). 당분야에 알려진 특히 관심을 받는 다른 카르복시펩티다제에는 인간 췌장 카르복시펩티다제 2, 카르복시펩티다제 a1 및 카르복시펩티다제 B가 포함된다. 그러므로, 카르복시펩티다제족의 신규 구성원은 관심을 끈다.

68.PRO1337

가능성 있는 치료 용도를 가질 수 있거나 혈액-관련 질병의 진단에 유용할 수 있는 혈액-관련 단백질의 확인은 특히 관심을 받는다. 티록신-결합 글로불린 (TBG)은 간에 의해 합성되고 혈류로 분비된다. 티록신-결합 글로불린은 인간 혈청의 주요 갑상선 호르몬 전달 단백질이다 (Refetoff et al., Horm. Res. (1996)45(3-5): 128-138). TBG의 높은 혈청 농도는 과티록신혈증을 초래하는 것으로 확인되었다 (Leahy et al., Postgrad Med. J. (1984) 60(703): 324-327). 따라서, 비정상적인 TBG 단백질의 확인 (Refetoff, Endocr. Rev. (1989) 10(3): 275-293 참조)을 비롯한, TBG 단백질의 확인 및 특징규명은 관심을 받고 있다 (Flink et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 미국 (1986) 83(20): 7708-7712; Bartalena et al., Acta Med. Austriaca, (1988) 15 Suppl 1:12-15 참조). 많은 노력이 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 스크리닝 방법 및 기술의 예는 문헌 [예를 들어, Klein et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 93: 7108-7113 (1996); 미국 특허 제5,536,637호 참조]에 기재되어 있다.

69.PRO1342

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1342로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

70.PRO1343

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1343으로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

71.PRO1480

세마포린 (Semaphorin)은 막횡단 및 분비 단백질로 이루어진 거대한 족으로서, 세마포린의 상당수가 신경계에서 발현된다. 세마포린족의 구성원에는 리간드 및 수용체가 포함된다 (Eckhardt et al., Mol. Cell. Neurosci., 9: 409-419 (1997)). 배 (胚) 운동 및 중추 신경계 축삭 유도 (guidance) 및 시냅스 형성에서 세마포린의 역할을 보여주는 연구가 있다 (Catalano et al., Mol. Cell. Neurosci., 11: 173-182 (1988); Kitsukawa et al., Neuron, 19: 995-1005 (1997); Yu et al., Neuron, 20: 207-220 (1998)). 세마포린은 신경세포의 증식 추체허탈 (cone collapse)을 유도하고 생체내에서 그들의 경로를 바꾸는 것으로 보여졌다 (Shoji et al., Development, 125: 1275-1283 (1998)). 인간 단핵구에서 사이토킨 생성을 유도하는 세마포린 구성원은 면역학적으로 활성인 것으로 보여진다 (Comeau et al., Immunity, 8: 473-482 (1998)). 세마포린은 암에서도 작용할 수 있다. 마우스 세마포린 유전자의 발현은 마우스 종양 세포주의 전이능력과 연관되어 있는 것으로 알려져 있다 (Christensen et al., Cancer Res., 58:1238-1244 (1998)).

72.PRO1487

프린지 (Fringe)는 초파리 날개 영상원판의 배 (dosal) 구역에서 노취의 세레이트-매개 활성화를 특이적으로 막는 단백질이다 (Fleming et al., Development, 124(15): 2973-81 (1997); Wu et al., Science (1996) 273(5273): 355-358 참조).또한, 프린지 단백질은 지아 성장에 필수적인 꼭대기 외배엽 능선의 농화 (thickening)가 라디칼 프린지를 발현하는 배 세포와 발현하지 않는 배 세포 사이의 상호작용을 수반하는 척추동물 발달에 관여한다 (Wolpert, L. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci (1998) 353(1370): 871-875; Kengaku et al., Science (1998) 280(5367): 1274-1277; Cohen et al., Nat. Genet. (1997) 16(3): 283-288; Johnston et al., Development (1997) 124(11): 2245-2254; Laufer et al., Nature (1997) 386(6623): 366-373; Rodriguez-Esteban et al., Nature (1997) 386(6623): 360-366). 그러므로, 프린지 단백질은 발달에서 그의 역할 뿐만 아니라 세레이트를 조절하는 능력, 특히 세레이트가 신호를 보내는 능력 때문에 관심을 끈다. 발달 및/또는 세레이트-유사 분자의 조절에서 작용할 수 있는 신규 폴리펩티드도 관심을 끈다. 특히, 프린지 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드가 관심을 끈다.

73.PRO1418

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1418로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

74.PRO1472

부티로필린은 포유동물 젖에서 지방 소구막과 결합된 전체 단백질 중 40 %이상을 차지하는 젖 당단백질이다. 부티로필린 mRNA의 발현은 임신 말기쪽으로 갈수록 젖 지방 생산이 개시되는 것과 상관관계가 있는 것으로 밝혀졌으며, 수유기간 내내 유지된다. 부티로필린은 소, 뮤린, 및 인간에게서 확인되었으며 (Taylor et al.,Biochim. Biophys. Acta1306:1-4 (1996), Ishii et al.,Biochim. Biophys. Acta1245:285-292 (1995), Mather et al.,J. Dairy Sci.76:3832-3850 (1993), Banghart et al.,J. Biol. Chem.273:4171-4179 (1998)), 지방 소구막에 박혀있는 타입 I 막횡단 단백질이다. 부티로필린은 수유기간 중에 선단 표면으로부터 젖-지방 소구의 버딩 및 방출에 기능하는 다른 단백질과 크산틴 디히드로게나제/옥시다제와의 복합체가 형성되는 데 주골격으로 기능할 수 있다고 제시되었다 (상기 Banghart et al.). 부티로필린이 포유동물의 젖 생산에 작용하므로, 신규 부틸로필린 상동체를 확인하는 데 실질적인 관심이 있다. 부티로필린족의 구성원은 문헌 (TaziAhnini, et al., Immunogenetics, 47(1): 55-63(1997); Davey, et al., Gene, 199(1-2): 57-62 (1997); 및 Mather 및 Jack, J. Dairy Sci., 76(12):3832-3850 (1993))에 추가로 기재되어 있다.

75.PRO1461

프로테아제는 소화, 단백질 활성화 및 비활성화, 펩티드 호르몬 활성의 조절, 및 단백질과 효소의 물리적 특성의 변경을 비롯한, 포유동물 및 비포유동물 생물체의 많은 생물학적 과정에 관여하는 효소 단백질이다. 세린 프로테아제는 다양한 세린-함유 단백질에 대한 특이적 활성을 나타내는 거대한 효소 클래스를 포함한다. 췌장에 의해 합성되고 소장으로 분비되는 트립신은 소화된 단백질의 펩티드결합을 가수분해하는, 그 특징이 잘 규명되어 있는 세린 프로테아제이다. 세포 표면 단백질인 트립신-유사 프로테아제의 특징이 규명된 바 있다 (Farley et al., Biochim Biophys Acta (1993) 1173(3): 350-352; 및 Leytus et al. Biochemistry (1998) 27(3): 1067-1074 참조). 이들 트립신-유사 단백질 중 몇몇은 가용성, 활성 프로테아제로 성숙하는 막결합 전구체로 합성될 수 있다 (Yamaoka et al., J. Biol. Chem (1998) 273(19): 11895-11901).

대사 및 다른 효소적 과정에서 세린-유사 프로테아제는 중요하므로, 신규 천연 세린-유사 프로테아제를 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에 의해 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 수용체 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다.

76.PRO1410

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1410으로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

77.PRO1568

테트라스파닌 (또는 테트라스판)족 단백질은 다양한 종에서 발견된 약 20종의 공지된 유전자를 포함한다. 테트라스판은 예를 들어, CD81. CD82, CD9, CD63, CD37 및 CD53을 포함하는 4 가지 막횡단 도메인 막결합 분자이다. 이들 단백질의상당수는 계통-특이적 단백질, 인테그린 및 다른 트랜스파닌을 비롯한 다른 분자와 혼잡하게 관련되어 있는 경향이 있다. 기능의 관점에서, 상기 단백질은 세포 활성화 및 증식, 부착 및 운동, 분화 및 암과 같은 다양한 과정에 관여한다. 한 연구는 이들 기능이 특이적 세포-표면 단백질을 분류하여 기능성 신호전달 복합체의 형성 및 안정성을 증기시키는 "분자 촉진자"로 작용하는 그들의 능력과 모두 관련되어 있을 수 있다고 제시하고 있다 (Maecker, et al., FASEB, 11(6): 428-42 (1997)). 다른 연구는 상기 단백질이 세포 형태발생, 세포-ECM 부착 및 세포-신호전달을 변화시키는 원인이라는 결론을 내린 바 있다 (Skubitz, et al., J. Immunology, 157: 3617-3626 (1996)). 따라서, 이러한 족의 신규 구성원은 관심을 끈다.

78.PRO1570

프로테아제는 소화, 단백질 활성화 및 비활성화, 펩티드 호르몬 활성의 조절, 및 단백질과 효소의 물리적 특성의 변경을 비롯한, 포유동물 및 비포유동물 생물체의 많은 생물학적 과정에 관여하는 효소 단백질이다. 세린 프로테아제는 다양한 세린-함유 단백질에 대한 특이적 활성을 나타내는 거대한 효소 클래스를 포함한다. 췌장에 의해 합성되고 소장으로 분비되는 트립신은 소화된 단백질의 펩티드 결합을 가수분해하는, 그 특징이 잘 규명되어 있는 세린 프로테아제이다. 세포 표면 단백질인 트립신-유사 프로테아제의 특징이 규명된 바 있다 (Farley et al., Biochim Biophys Acta (1993) 1173(3): 350-352; 및 Leytus et al. Biochemistry (1998) 27(3): 1067-1074 참조). 이들 트립신-유사 단백질 중 몇몇은 가용성, 활성 프로테아제로 성숙하는 막결합 전구체로 합성될 수 있다 (Yamaoka et al., J. Biol. Chem (1998) 273(19): 11895-11901).

세린 프로테아제와 관련된 질환 상태 및 질병의 치료에 사용하기 위한 특이적 억제제 또는 조절제를 스크리닝하는 데 유용할 수 있는, 인간 결장암으로부터 유래한 세린 프로테아제 SP59, SP60 및 SP67은 특히 관심을 끈다. 일본 특허 제JO9149790-A호에는 접수 번호가 P_W2298660호이고 아미노산이 233개인 SP60이 확인된 것으로 보고되어 있다.

79.PRO1317

세마포린족 당단백질의 구성원은 신경계 발달, 및 보다 구체적으로는 측삭 유도에서 중요한 역할을 한다. 세마포린은 인간 면역계에서 확인되었는데, 이들은 인간 면역계에서 B-세포 신호전달을 비롯한 기능을 수행하는 것으로 믿어진다 (Hall et al., Proc. Natl. Acad. Sci (1996) 93(21): 11780-50). 신경계 면역 질환의 진단에 유용한 인간 세마포린 유전자는 1998년 6월 16일 공개된 일본 특허 제J10155490-A호에 기재되어 있다. 세마포린족의 구성원을 추가로 확인하는 것은 관심을 끈다.

80.PRO1780

대사 질환 또는 질병에 연루되어 있을 수 있는 효소 단백질은 특히 관심을 끈다. 효소를 이용하여 당을 지방-가용성 화합물에 첨가하는 것은 지방 가용성 화합물이 배출될 때 물 및 보조제에서 이들의 용해성을 증가시키는 중요한 과정이다. 포유동물에서, 글루큐론산은 대사의 폐기물 및 지방-가용성 화합물이 체내에서 독성을 나타내는 농도에 도달하는 것을 막는 데 이용되는 주요 당이다. 이 반응을 수행하는 UDP-글루큐로노실트랜스퍼라제는 동물, 식물 및 박테리아에서 발견된 UDP 글리코실트랜스퍼라제 거대족의 일부이다. 간에서, UDP-글루큐로노실트랜스퍼라제는 빌리루빈과 결합한다. 비결합성 과빌리루빈혈증을 일으키는 UDP-글루큐로노실트랜스퍼라제 활성에 영향을 미치는 상태가 많다. 이들 상태에는 크리글러-나야 증후군 (Crigler-Najjar syndrome) (Jurgen et al., Biochem. J. (1996) 314: 477-483 참조) 및 길버트 증후군과 같은 유전적 질환 뿐만 아니라, 루세이-드리스콜 증후군 (Lucey-Driscoll syndrome)과 같은 후천적 질환이 포함된다. 따라서, 글루큐로노실트랜스퍼라제족의 신규 구성원의 확인은 관심을 받고 있다 (Tukey et al., J. Biol. Chem. (1993) 268(20): 15260-6; 및 WO9212987-A 참조).

81.PRO1486

소뇌에는 세레벨린이라고 불리는 헥사데카펩티드가 있는데, 이것은 인간부터 닭까지 그 서열에서 보존되어 있다. 세레벨린 서열을 코딩하는 3개의 독립된 오버랩핑 cDNA 클론이 인간 소뇌 cDNA로부터 단리되었다. 193개의 아미노산으로 이루어진 단백질을 코딩하는 가장 긴 클론을 일반적으로 프리세레벨린 또는 세레벨린 전구체라 부른다. 이 단백질은 인간 보체 성분 C1q의 B 사슬의 소구 영역과 상당히 유사하다. 연관성이 있는 영역은 두 단백질의 카르복시 말단에 위치한 약 145 개 이상의 아미노산에 걸쳐 있다. C1q B 사슬과는 달리, 콜라겐-유사 모티프는 프리세레벨린의 아미노 말단 영역에 존재한다. 많은 신경펩티드 전구체에서 보여지며 프로테아제가 이염기성 아미노산 절단하는 고전적인 기작으로 프리세레벨린으로부터 세레벨린을 유리하지 못하는 것으로 믿어지고 있다. 세레벨린 전구체는 시냅스 생리학과 관련되어 있다 (Urade, et al., PNAS, 미국, 88: 1069-1073 (1991)). 그러므로, 세레벨린, 그의 전구체 및 관련 분자, 특히 세레벨린과 서열 동일성이 있는 분자는 관심을 끈다.

82.PRO1433

신규 천연 막횡단 및 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1433으로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

83.PRO1490

효소 단백질은 음식물의 소화, 거대분자의 생합성, 화학에너지의 조절된 분비 및 이용, 그외 생명을 유지하는 데 필요한 그밖의 과정에 관여하는 화학 반응에서 중요한 역할을 담당한다. 아실트랜스퍼라제는 잔기를 아실화하는 효소이다. 예를 들어, 아실-글리세롤-포스페이트 아실트랜스퍼라제는 리소포스패티드산 기질에 작용한다. 이 리소포스패티드산은 포스패티드산으로 전환되어 막에서 발견되는 포스파티딜에탄올아민을 형성하는 데 작용한다 (Brown, et al.,Plant Mol. Biol., 26(1):211-223 (1994)). 게다가, 1-아실-sn-글리세롤-3-포스페이트 아실트랜스퍼라제 (LPAAT)는 중쇄 길이의 지방산 아실 조효소 A 기질을 선호하는 효소 단백질이다 (Knutson, et al., Plant Physiol. 109: 999-1006 (1995) 참조). 따라서, 아실트랜스퍼라제는 아실화가 필요한 분자 생합성에서 중요한 역할을 한다.

본 발명자들은 본원에서 PRO1490 폴리펩티드로 지칭하며 1-아실-sn-글리세롤-3-포스패이트 아실트랜스퍼라제 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

84.PRO1482

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1482로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

85.PRO1446

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1446으로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

86.PRO1558

메틸트랜스퍼라제 효소는 공여 분자로부터 수용 분자로의 메틸기 전달을 촉매한다. 메틸트랜스퍼라제 효소는 예컨데 원핵세포의 세포막 및 진핵세포의 미토콘드리아 내막에서 전자 전달 사슬을 비롯한 여러 다양한 생물학적 과정에서 매우중요한 기능을 한다 (예를 들어, Barkovich et al.,J. Biol. Chem.272:9182-9188 (1997), Dibrov et al.,J. Biol. Chem.272:9175-9181 (1997), Lee et al.,J. Bacteriol.. 179:1748-1754 (1997) 및 Marbois et al.,Arch. Biochem. Biophys.313:83-88 (1994) 참조). 메틸트랜스퍼라제 효소는 유비퀴논 (조효소 Q) 및 메나퀴논 (비타민 K2)의 생합성에 필수적인 것으로 밝혀졌는데, 상기 유비퀴논 및 메나퀴논은 호흡 전자 전자 사슬에 필수적인 이소프레노이드 퀴논 성분이다. 메틸트랜스퍼라제 효소의 중요함이 명백하므로, 메틸트랜스퍼라제의 신규 폴리펩티드 상동체를 찾아내는 데 실질적인 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1558 폴리펩티드로 지칭하며 메틸트랜스퍼라제 효소와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

87.PRO1604

성장 인자는 정상 상태 및 비정상 상태에서 세포 성장, 증식 및 분화를 유도하는 데 작용하기 때문에, 신규 성장 인자의 확인은 특히 관심을 끈다. 비정상적 조직 (예를 들어, 종양)에서 과발현 또는 저발현되는 성장 인자의 확인은 진단 방법 및 치료제를 발달시킬 수 있다. 성장 인자는 간암세포로부터 유래한 세포주로부터 단리되었다. 간암세포로부터 유래한 성장 인자는 마우스 (1997년 12월 9일 공개된 일본 특허 제JO9313185-A호) 및 인간 (1994년 12월 20일 공개된 일본 특허 제JO6343470-A호) 조직으로부터 단리된 바 있다. 인간 간암세포로부터 유래한 세포주로부터 단리된 간암세포-유래 성장 인자는 여러 가지 종양세포-유래 세포주 뿐만 아니라 정상 조직에서 편재적으로 발현되는 것으로 확인되었다 (Nakamura etal., J. Biol. Chem. (1994) 269(40): 25143-9). 성장 인자는 섬유아세포를 분열촉진하는 신규 헤파린-결합 단백질로 확인되었다.

88.PRO1491

신경세포체는 다른 세포처럼 대개 둥글다. 그러나, 이들 세포에는 이들로부터 성장하여 시냅스 연결부를 형성하는, "돌기"라고 불리기도 하는 구조가 있다. 이들 돌기 중 일부는 세포체로부터 정보를 나르는데, 종종 매우 긴 길이를 걸쳐 정보를 나른다. 길고 얇은 이들 돌기는 축삭이다. 이 축삭은 움직임이 없는 얇은 관이다. 다른 돌기는 세포체를 향해서만 정보를 나르거나, 세포체를 향해서 뿐만 아니라 세포체로부터 밖으로로도 정보를 나른다. 보다 짧고 대개 보다 두터운 이들 돌기를 수상돌기라고 부른다. 축삭 및 수상돌기는 신경돌기라고 불린다.

신경의 발달 및 성장 단계 동안, 신경돌기는 성장원뿔에 의해 형성된다. 성장원뿔은 신경돌기의 성장첨이다. 성장원뿔은 평평하고 매우 유동적이며, 새로운 재료가 첨가되고 축삭이 더욱 확장되는 곳이다. 성장원뿔이 뻗어나가는 곳을 조절하면 축삭이 만들어져서 존재하게 되는 곳을 조절하게 된다.

성장원뿔에는 여러 가지 정의가능한 부분이 있다. 선도연으로부터 나와 수축하는, 얇고 평평한 장막과 유사한 돌기를 라멜리포디아라고 부른다. 선도연으로부터 나와 수축하는, 바늘과 유사한 돌기를 마이크로스피크 또는 필로포디아라고 부른다. 이들은 성장원뿔이 향하는 선도연을 미는 데 관여하는 구조이다.

적당한 표적에 성장원뿔이 정확히 가기 위해서는, 성장원뿔이 그들의 주위 환경에 있는, 표적을 찾는 신호를 인식하고 반응해야 한다. 이들 신호 중 몇몇은성장원뿔이 일정한 면적으로 확장되게 하는 반면, 다른 일부는 성장원뿔이 일정한 면적으로 확장되지 못하게 한다. 시험관내에서 신경돌기의 성장을 촉진하며, 그 특징이 잘 규명되어 있는 분자에는 세포외 매트릭스 분자 라미닌 및 신경세포 표면 분자 L1/G4/8D9가 포함된다. 신경돌기 확장을 촉진하는 이들 분자는 일반적으로 체내 전체에 넓게 분포한다. 라미닌 면역반응성은 중추 및 말초 신경계에 넓게 분포하는 것이 이상적이다. 유사하게, L1/G4/8D9는 발달하는 중추 신경계, 특히 길게 뻗은 축삭에서 매우 다양한 신경돌기 위에 존재한다. 그러므로, 성장원뿔이 가능한 경로를 결정할 때 하는 자가-특이적 선택에서 공지된 성장 촉진 분자가 중요한 역할을 하는지는 불분명하다. 대신에, 성장원뿔이 확장되어 표적을 찾는 보다 특정한 신호에 반응하는 일반적으로 허용가능한 환경을 제공하는 것이 성장 촉진 분자의 기능이라고 믿어지고 있다.

보다 특정한 이들 신호 중에는 구체적인 성장원뿔의 운동성을 저해하는 분자가 있다. 성장원뿔은 그들의 운동성 형태를 잃고 여러 가지 형태의 다른 신경돌기와 접촉한 상태에서 전진 (붕괴)을 중단하는 것으로 관찰되었다. 시험관내의 영역 형성은 생체내에서 선택적인 섬유속성 연축을 발생시키는 과정의 징후를 의미한다. 일부 성장원뿔은 발달하고 있는 배 (胚)에서 특정한 축삭 경로, 또는 축삭 경로의 상동 순서를 따라 서행하는 것으로 관찰되었다. 특이적인 운동성 저해 효과는 성장원뿔이 여러 가지 대체 경로 중 어떤 경로 위에서 확장할 것인지를 결정할 수 있었다. 성장원뿔은 그들이 붕괴되도록 유도하는 축삭을 피하면서 그들의 붕괴를 유도하지 않는 축삭 위에서 성장하는 것을 선호할 것 같다.

예를 들어, 교감 성장원뿔은 망막 신경돌기와 접촉할 때 저해되거나 붕괴될 것으로 관찰되었다. 마찬가지로, 망막 신경돌기의 성장원뿔은 교감 신경돌기와 접촉할 때 붕괴될 것이다. 성장과 관련된 특정 신호를 전달하는 분자에 의해 특정한 성장 저해 신호에 특이적으로 반응하는 수용체의 존재를 통해 상기 세포 활성이 이루어진다고 믿고 있다. 신호는 세포 표면, 구체적으로 축삭 표면 위에 존재하는 것으로 믿어진다.

신경 손상이 일어날 때, 손상된 축삭 또는 신경돌기가 손상되지 않은 신경돌기로 교체되지 못하기 때문에 회복이 저해되거나 회복될 수 없다. 존재하는 신경돌기가 손상되거나, 엄격해지거나, 또는 파괴되면, 새로운 신경돌기가 세포체로부터 성장하여 기존 신경돌기를 대체할 수 없다. 신경돌기의 성장을 저해하는 분자의 존재는 신경돌기가 재생하기 어려운 이유라로 믿어지고 있다. 콜랩신은 성장원뿔의 확장을 조절하는 분자의 활성을 제어하는 기능을 하는 단백질이다.

본 발명자들은 본원에서 PRO1491 폴리펩티드로 지칭하며 콜랩신 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

89.PRO1431

세포내 신호전달은 분화, 운동 및 분열과 같은 세포 활동에 중요하다. 이러한 신호전달은 단백질 사이의 복합체 상호작용 형태로 세포 전체에서 일어나는 것으로 생각된다. 이러한 단백질-단백질 상호작용은 종종 신호전달 단백질 내의 조절 도메인에 의해 매개된다. 결과적으로, 현재 신호전달은 분자가 조합하여 작용해서 신호를 결정하는 계 및 상기 조합의 조성물로 모형화된다.

Src와 상동성이 있는 도메인 (예를 들어, SH2 및 SH3)은 신호전달에 관여하는 단백질 사이에 서열이 유사한 영역에서 발견된 두 개의 도메인이다. 종양을 발생시킬 수 있는 티로신 키나제 Src에 대한 초기 연구는 SH2 도메인을 확인하였다. 그 이후, SH2 및 SH3 도메인이 다양한 다수의 단백질에서 발견되었기 때문에, 이들 도메인은 가장 흔한 타입의 구조적 모티프가 되었다. SH2 및 SH3 도메인이 그들을 포함하는 단백질과는 독립적으로 폴딩하고 그들의 2차 구조가 N- 및 C-말단을 공간적으로 서로서로 가깝게 하며, 한 단백질에서 다음 단백질까지 가변 위치 (N- 내지 C-말단)에서 나타난다는 점에서 상기 SH2 및 SH3 도메인은 조절자이다 (Cohen et al., Cell 80: 237-348, 1995).

SH2 또는 SH3 도메인을 돌연변이시킨 초기 연구는 기능에 중요하다는 것을 보였지만, RAS-GAP 및 Crk 종양발생 유전자와 같이 관련성이 없는 신호전달 단백질족이 클로닝될 때까지 이들 도메인의 조절 성질은 드러나지 않았다. 이들 후자 실험은 리간드 자극시 RAS-GAP 및 Crk가 수용체 티로신 키나제에 강하게 결합되어 있다는 것을 입증하였다. 그 다음 연구는 상기 결합 기작이 SH2 도메인을 통해 일어나고 수용체의 자가인산화가 필요하다는 것을 입증하였다. 이러한 발견은 수용체 티로신 키나제의 활성화가 세포내 도메인의 결합 양상을 변화시키는 수단으로 보일 수 있고, 수용체-SH2 함유 단백질 상호작용이 신호전달 캐스케이드를 개시할 것을 의미하였다.

SH3 도메인은 SH2보다 더 많은 일반적 기능을 가진다. SH3 결합 단백질은 박테리오파지 발현 라이브러리를 표지된 SH3 도메인으로 스크리닝하여 단리하였다.이 실험 결과는 SH3 도메인이 짧은 프롤린-풍부 펩티드, 특히 모티프 PxxP에 결합할 것을 보여주었다. 본 특허 출원을 준비하는 시기의 지식 수준을 기초로, 확인된 모든 SH3 결합 부위에는 프롤린이 풍부하다는 특성이 있다. SH3 도메인의 결합은 SH2 도메인에 일어나는 인산화와 같은, 결합 부위의 공유결합성 수식에 의존하지 않는다. 결과적으로, 비록 예외는 있지만, SH3-리간드 상호작용은 대개 구성성이지 유발성이 아니다. 일반적으로, SH3 도메인은 친화도가 중간 정도인 상호작용을 통해 단백질 복합체를 형성하는 수단보다 "스위치" 신호로 작용할 가능성이 더 작다. 친화도가 중간 정도인 이러한 상호작용은 SH3-매개 상호작용이 상대적으로 짧게 지속될 것이고 결합 파트너의 농도 변화에 반응하여 재모형화될 것임을 의미하기도 한다.

SH2 및 SH3 도메인의 결합 특징의 해석은 신호전달을 막는 화합물을 제안하였다. SH2 및 SH3 도메인에 대한 표적 단백질의 서열을 기초로 하는, 펩티드와 유사한 리간드는 항상 활성화되어 있는 티로신 키나제 (예를 들어, 만성 골수성 및 급성 림프구성 백혈병의 BCR/ARL 또는 유방암 및 난소암의 HER-2/Neu)에 의한 증식 관련 질병을 치료하기 위한 신규 선도 화합물을 나타낼 수 있다.

90.PRO1563

세포성 디스인테그린 및 메탈로프로테이나제 (ADAM)는 뱀독 메탈로프로테이나제 및 디스인테그린의 서열과 유사한 서열이 있는 유전자족이다. ADAMTS-1 유전자는 트롬보스판딘 (TSP) 타입 I 모티프를 갖는다는 면에서 새로운 형태의 ADAM 단백질을 코딩하는데, 이 유전자의 발현은 염증 과정과 관련되어 있다 (Kuno et al.,J. Biol. Chem. 273: 13912-13917 (1998), Kuno et al., Genomics 46: 466-471 (1997) 및 Kuno et al., J. Biol. Chem. 272: 556-562 (1997)). ADAMTS-1 유전자의 발현은 리포폴리사카라이드의 생체내 투여에 의해 신장 및 심장에서 유도되는데, 이는 염증 반응에 작용할 가능성이 있다는 것을 제시하고 있다. 이러한 면에서, ADAMTS-1 단백질은 다양한 염증 과정 뿐만 아니라 암 악액질의 발달에 작용가능한 것으로 제시되어 왔다 (상기 Kuno et al.). 본 발명자들은 본원에서 PRO1563 폴리펩티드로 지칭하며 ADAMTS-1 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

91.PRO1565

콘드로모듈린 단백질은 연골세포의 성장 및 분화를 상승적으로 자극하는 연골-생성 매트릭스 성분이다 (Suzuki, Connect. Tissue Res. 35: 303-307 (1996)). 보다 구체적으로, 콘드로모듈린-I은 혈관 내피세포의 증식 및 관형성을 저해하는 작용을 함으로써 초기 단계에서 연골 성장을 자극하는 기능을 하고 연골이 골로 대체되는 것을 저해한다. 콘드로모듈린-II는 콘드로모듈린-I처럼 혈관신생을 저해할 수 없지만 파골세포의 분화 및 연골의 성장을 자극하는 기능을 한다. 따라서, 이들 두 가지 폴리펩티드는 연골 및 연골내 골 구조의 형성을 조절하는 데 필수적이다. 콘드로모듈린 단백질이 매우 중요한 생리학적 역할을 수행하므로, 이들 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 확인하고 그 특징을 규명하는 것은 상당한 관심을 끈다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1565 폴리펩티드로 지칭하며 콘드로모듈린-I 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

92.PRO1571

클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 (Clostridium perfringensenterotoxin, CPE)는 클로스트리듐 퍼프링겐스 타입 A 식중독 증상을 일으키는 데 원인이 되는 발병인자로 여겨지고 있고, 다른 인간 및 수의 질환에 관여할 수도 있다 (McClane, Toxicon. 34: 1355-1343 (1996)). CPE는 클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 수용체 (CPE-R)로 지칭하는 약 50 kD의 세포 표면 수용체 단백질에 결합하여 세포 표면에서 약 90,000 kD의 복합체를 형성함으로써 세포에서 유해한 기능을 수행한다. CPE-R 단백질을 코딩하는 cDNA는 인간 및 마우스에서 확인되어 그 특징이 규명되었다 (Katahira et al., J. Cell Biol. 136: 1239-1247 (1997) 및 Katahira et al., J. Biol. Chem. 272: 26652-26658 (1997)). CPE 독소는 포유동물 숙주에서 다양한 질병을 일으키는 것으로 보고되어 왔으며, 상기 질병은 CPE-R에 CPE 독소가 결합하여 개시되기 때문에, 신규 CPE-R 상동체를 확인하는 데 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1571 폴리펩티드로 지칭하며 CPE-R과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

93.PRO1572

클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소는 생체내에서 기능성 수용체로서 구조적으로 관련되어 있는 두 가지 막 단백질을 이용한다. 클로스트리듐 장독소 수용체 (CPE-R) 유전자와 상동성을 나타내는 인간 및 마우스 cDNA는 문헌 (Katahira, et al., J. Biol. Chem., 272(42): 26652-8 (1997))에 기재된 바와 같이 이미 클로닝되었다. 상기 cDNA는 두 개의 군, 즉 베로 (Vero) 세포 CPE 수용체 상동체 및 래트 안드로겐 중지 아폽토시스 단백질 (RVP1)로 분류된다. 따라서, 이들 수용체는 관련되어 있는 분자로서 관심을 끈다. 이들 수용체 및 관련 분자를 상기 수용체의 조절자를 확인하는 데 이용하는 것은 특히 관심을 끈다.

또한, 클로우딘족의 구성원 및 그와 관련된 분자도 관심을 끈다. 클로우딘은 오클루딘과 서열 유사성이 없는, 폐쇄막에 위치하는 구성 막 단백질이다 (Furuse, et al., J. Cell Biol., 141(7): 1539-50 (1998)).

94.PRO1573

클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소는 생체내에서 기능성 수용체로서 구조적으로 관련되어 있는 두 가지 막 단백질을 이용한다. 클로스트리듐 장독소 수용체 (CPE-R) 유전자와 상동성을 나타내는 인간 및 마우스 cDNA는 문헌 (Katahira, et al., J. Biol. Chem., 272(42): 26652-8 (1997))에 기재된 바와 같이 이미 클로닝되었다. 상기 cDNA는 두 개의 군, 즉 베로 (Vero) 세포 CPE 수용체 상동체 및 래트 안드로겐 중지 아폽토시스 단백질 (RVP1)로 분류된다. 따라서, 이들 수용체는 관련되어 있는 분자로서 관심을 끈다. 이들 수용체 및 관련 분자를 상기 수용체의 조절자를 확인하는 데 이용하는 것은 특히 관심을 끈다.

또한, 거세 후 퇴화하는 래트 전립선에서 전사가 유도되는 배쪽 전립선.1 단백질 (RVP.1)도 관심을 끈다. 이 단백질은 문헌 (Peacock, et al., Genomics, 46(3): 443-9 (1997))에 더 기재되어 있다.

95.PRO488

클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소는 생체내에서 기능성 수용체로서 구조적으로 관련되어 있는 두 가지 막 단백질을 이용한다. 클로스트리듐 장독소 수용체 (CPE-R) 유전자와 상동성을 나타내는 인간 및 마우스 cDNA는 문헌 (Katahira, et al., J. Biol. Chem., 272(42): 26652-8 (1997), 및 Katahira, et al., J. Cell. Biol., 136(6): 1239-1247 (1997))에 기재된 바와 같이 이미 클로닝되었다. 상기 cDNA는 두 개의 군, 즉 베로 (Vero) 세포 CPE 수용체 상동체 및 래트 안드로겐 중지 아폽토시스 단백질 (RVP1)로 분류된다. 따라서, 이들 수용체는 관련되어 있는 분자로서 관심을 끈다. 이들 수용체 및 관련 분자를 상기 수용체의 조절자를 확인하는 데 이용하는 것은 특히 관심을 끈다.

신규 천연 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 수용체 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다.

96.PRO1489

클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 (Clostridium perfringensenterotoxin, CPE)는 클로스트리듐 퍼프링겐스 타입 A 식중독 증상을 일으키는 데 원인이 되는 발병인자로 여겨지고 있고, 다른 인간 및 수의 질환에 관여할 수도 있다 (McClane, Toxicon. 34: 1355-1343 (1996)). CPE는 클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 수용체 (CPE-R)로 지칭하는 약 50 kD의 세포 표면 수용체 단백질에 결합하여 세포 표면에서 약 90,000 kD의 복합체를 형성함으로써 세포에서 유해한 기능을 수행한다. CPE-R 단백질을 코딩하는 cDNA는 인간 및 마우스에서 확인되어 그 특징이 규명되었다 (Katahira et al., J. Cell Biol. 136: 1239-1247 (1997) 및 Katahira et al., J. Biol. Chem. 272: 26652-26658 (1997)). CPE 독소는 포유동물 숙주에서 다양한 질병을 일으키는 것으로 보고되어 왔으며, 상기 질병은 CPE-R에 CPE 독소가 결합하여 개시되기 때문에, 신규 CPE-R 상동체를 확인하는 데 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1489 폴리펩티드로 지칭하며 CPE-R과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

97.PRO1474

조류 수정란 흰자는 모두 4가지 기작 클래스에 속하는 프로테이나제의 풍부한 단백질 억제제원이다. 오보뮤코이드 및 오보억제제는 세린 프로테이나제에 대한 실질적 또는 가능한 반응 부위를 함유하는 각 도메인이 있는 다중도메인 카잘 (Kazal)-타입 억제제이다. 오보스타틴은 4 가지 기작 클래스 모두의 프로테이나제를 억제하지만 시스타틴은 시스테인 프로테이나제 억제제이다. 이들 억제제에 대해 보다 자세한 정보를 얻고자 하면 문헌 (Saxena 및 Tayyab, Cell Mol. Life Sci., 53(1): 13-23 (1997))을 참고하면 된다. 프로테이나제의 단백질 억제제의 신규 구성원, 특히 오보뮤코이드와 같은 공지된 억제제와 서열 동일성이 있는 것은 관심을 끈다.

일반적인 세린 프로테아제 억제제는 관심을 끈다. 뉴롭신과 같은 세린 프로테아제는 세포외 매트릭스 수식 및 세포 이동과 관련되어 있는 것으로 나타났다 (일반적으로 Chen, et al., Neurosci., 7(2): 5088-5097 (1995) 및 Chen, et al., J. Histochem. Cytochem., 46: 313-320 (1998) 참조). 또다른 세린 프로테아제인에나멜 매트릭스 세린 프로테아제는 치아에서 유기 매트릭스의 분해와 관련되어 있다 (Simmer, et al., J. Dent. Res., 77(2): 377-386 (1998), Overall 및 Limeback, Biochem J., 256(3): 965-972 (1998), 및 Moradian-Oldak, Connect. Tissue Res., 35(1-4): 231-238 (1996)). 따라서, 이들 프로테아제의 억제제는 이들 기작이 조절을 필요로 할 경우에 관심을 받는다.

98.PRO1508

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1508로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

99.PRO1555

신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1555로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

100.PRO1485

라이소자임은 일부 미생물의 뮤코펩티드 세포벽 구조에서 일어나는, N-아세틸뮤람산과 N-아세틸글루코스아민 사이의 [베타]-1,4 글루코시드 결합을 우선적으로 가수분해하는 분비 효소이다. 라이소자임은 동물 및 식물에 넓게 분포해 있다. 타액, 눈물, 젖, 경관점액, 백혈구, 신장 등을 비롯한 포유동물 분비물 및 조직에서 발견되었다. 대사 기능 및 기능저하에서 라이소자임이 하는 다양한 역할 때문에, 라이소자임족 단백질의 신규 구성원을 확인하는 것에 관심이 있다. 비정상적인 양의 라이소자임은 다양한 질환 상태와 연관되어 있다. 라이소자임에는 항균효과, 진통효과 및 항통각 효과가 있는 것으로 보고되어 있다. 라이소자임의 추가적인 특징 및 가능성 있는 용도는 미국 특허 제5,618,712호에 기재되어 있다.

발효된 식품의 미생물로부터 영양분을 회수할 필요가 있는 생물의 위에 있는 소화 효소로 동원되는 라이소자임 C는 특히 관심을 받는다. 라이소자임 C 및 관련 단백질의 역사는 문헌 (Qasba 및 Kumar, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., 32(4): 255-306 (1997); Irwin, EXS, 75: 347--361 (1996))에 더 기재되어 있다.

101.PRO1564

글리코실화는 번역 (translation)후 단백질 수식의 통상적인 복합체 형태이다. 다수의 독특한 구조가 존재하는 것으로 알려져 있을지라도, 대부분은 일련의 공통적인 합성 중간체로부터 생겨나고 그들의 주변부 글리코실트랜스퍼라제에서 다른데, 상기 글리코실트랜스퍼라제는 올리고당 수용체와 근원적인 단백질의 특징을 인식한다. UDP-N-아세틸-알파-D-갈락토스아민:폴리펩티드 N-아세틸갈락토스아미닐트랜스퍼라제는 세린 및 트레오닌 아미노산의 히드록시 기에 N-아세틸갈락토스아민을 첨가함으로써 단백질에서 특정 세린 및 트레오닌 아미노산의 O-글리코실화를 개시하는 효소 단백질이다. 다수의 중요 생물학적 및 생리학적 이벤트가 단백질 글리코실화에 의해 조절되기 때문에, 공지된 글리코실화 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 확인하고 그 특징을 규명하는 데 상당한 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1564 폴리펩티드로 지칭하며 N-아세틸갈락토스아미닐트랜스퍼라제 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

102.PRO1755

신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1755로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

103.PRO1757

신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1757로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

104.PRO1758

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1758로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

105.PRO1575

단백질 디설파이드 이소머라제 (PDI)는 인간 혈청 알부민 (HSA)에서 디설파이드 결합의 형성을 촉진한다. 결과적으로, PDI는 인간 혈청 알부민의 전체 구조의 형성에서 보조적 역할을 수행한다. PDI와 인간 혈청 알부민을 함께 발현시키면 세포에 존재하는 프로테아제에 의한 HSA의 구조적 불안정성 및 파괴가 일어날 수 있는 가능성이 감소하여 HSA의 분비가 증가한다. PDI 및 HSA의 공동 발현은 진핵 세포의 소포체에서 위치 결정을 향상시킨다 (Hayano et al., EP-50941-A (1992)). PDI 및 인간 프롤릴 4-히드록실라제의 베타 서브유닛은 동일한 유전자의 산물로 보여진다 (Pihlajaniemi et al., EMBO J., 6: 643-49 (1987)). 또한, PDI의 CGHC-함유 활성 부위 서열의 카피는 풍부한 관강내 소포체 단백질인 Erp72에서 발견되었다 (Mazzarella et al., J. Biol. Chem., 2: 1094-1101 (1990)).

신규 천연 수용체 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 수용체 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다.

106.PRO1787

다중 신규 MPZ (PO) 점 돌연변이는 산발성 데저린-소타스병 (Dejerine-Sottas, DDS)의 경우에서 확인되었다 (Warner, et al., Hum. Mutat., 10(1): 21-4(1997)). DDS는 유아기에 발병하는 심각한 탈수초성 말초 신경병증이고, PMP22 또는 MPZ의 돌연변이와 관련되어 있다. 게다가, 샤르코-마리-투스병과 압박마비에 걸리기 쉬운 유전성 신경병증을 앓는 스페인 계통의 환자에서 MPZ, PMP22 및 Cx32 유전자의 돌연변이 분석에 대해 보고된 바 있다 (Bort, et al., Hum. Genet., 99(6): 746-54 (1997)). 미엘린 당단백질 PO에 대해서도 다른 다수의 연구에서 보고되어 있다 (Blanquet-Grossard, et al., Clin. Genet., 48(6): 281-3 (1995), Hayasaka, et al., Nat. Genet., 5(1): 31-4 (1993) 및 Saavedra, et al., J. Mol. Evol., 29(2): 149-56 (1989)). 따라서, 미엘린 PO족에 속할 수 있는 단백질은 관심을 끈다.

107.PRO1781

신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1781로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

108.PRO1556

신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1556으로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

109.PRO1759

신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1759로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

110.PRO1760

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1760으로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

111.PRO1561

포스포리파제 A2 (PLA2)는 인지질의 2-아실 에스테르 결합을 가수분해하는 단백질이며, 그의 예로는 서로 명백히 분별될 수 있는 세포질 PLA2 및 분비성 PLA2가 있다. 세포질 PLA2 (cPLA2)는 2-위치가 에스테르화된 아라키돈산을 함유하는 인지질을 선택적으로 가수분해하는 것으로 알려져 있다. 이들의 중요 생물학적 활성 때문에, 포스포리파제 A2 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 확인하고 그 특징을 규명하는 것은 관심을 끈다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1561 폴리펩티드로 지칭하며 인간 포스포리파제 A2 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

112.PRO1567

결장 특이적 유전자 (CSG) 및 그의 발현 산물은 공개된 국제 출원 WO9639419에 기재되어 있다. 상기 유전자는 결장암 및 결장암 전이에 대한 유용한 진단 마커이고, 가능성 있는 제약 및 진단 제제를 스크리닝하는 데 이용될 수도 있다. CGS족의 신규 구성원을 확인하는 것은 관심을 끈다.

113.PRO1693

인슐린-유사 성장 인자에는 성장 촉진 및 인슐린-유사 활성이 있다. 인간에는 특징이 잘 규명되어 있는 2종의 혈장 IGF-결합 단백질이 있다. 보다 큰 단백질은 IGF-I 또는 IGF-II, 결합 단백질 자체 및 분자량이 약 100K kD인 산-불안정성 비-IGF-결합 단백질로 구성되어 있는 것으로 생각되는 125 내지 150 kD의 복합체로 대개 순환하는 53K의 산-불안정성 단백질이다. 보다 작은 단백질은 비환원 형태에서 28K의 겉보기 분자량, 그리고 환원되었을 때 34K의 겉보기 분자량을 갖는다. 이들 IGF-결합 단백질은 인슐린-유사 성장 인자 단백질이 수행하는 생리학적인 활성에서 중요한 기능을 하는 것으로 보여진다. 따라서, 인슐린-유사 성장 인자 결합 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 확인하고 특징규명하는 데 실질적인 관심이 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1693 폴리펩티드로 지칭하며 인슐린-유사 성장 인자 결합 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

114.PRO1784

신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1784로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

115.PRO1605

N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 단백질은 포유동물 생물체에서 다양한 중요 생물학적 기능을 제공하는 효소족을 포함한다. 예를 들면, UDP-N-아세틸글루코스아민: 알파-3-D-만노시드 비트-1,2-N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 I은 만노스가 많은 N-글리칸이 하이브리드 및 복합 N-글리칸으로 전환되는 필수적인 첫 단계를 촉매하는 효소 단백질이다 (Sarker et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88: 234-238 (1991)). N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 효소의 중요성이 명백하므로, N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명은 상당한 관심을 끈다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1605 폴리펩티드로 지칭하며 N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 단백질과 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

116.PRO1788

단백질-단백질 상호작용은 수용체와 항원의 복합체 및 신호전달 기작을 포함한다. 단백질-단백질 상호작용의 기초가 되는 구조적 및 기능적 기작에 대해 잘알려진 바와 같이 단백질-단백질 상호작용은 쉽게 조작하여 그 특정 결과를 조절할 수 있다. 따라서 단백질-단백질 상호작용의 기초 기작은 과학계 및 의학계에 관심의 대상이 되고 있다.

루이신 풍부 반복부를 포함하는 모든 단백질은 단백질-단백질 상호작용에 관여하는 것으로 생각된다. 루이신 풍부 반복부는 기능과 세포내 위치가 상이한 많은 단백질에 존재하는 짧은 서열 모티프이다. 리보뉴클레아제 억제제 단백질의 결정 구조를 통해 밝혀진 바로는 루이신 풍부 반복부는 베타-알파 구조 단위와 일치한다. 이들 단위는 한쪽 면이 용매에 노출된 평행한 베타 시트를 형성되므로, 이 단백질은 독특한 비(非)구형을 취하게 된다. 위와 같은 두 가지 특징은 루이신 풍부 반복부를 포함하는 단백질의 단백질-결합 기능의 원인이 되는 것으로 밝혀졌다. 이와 관련해서는 문헌 (Kobe and Deisenhofer,Trends Biochem. Sci., 19(10):415-421 (Oct. 1994))을 참조할 수 있다.

한 연구 보고서에 따르면, 루이신 풍부 프로테오글리칸은 개체 발생시 콜라겐 섬유를 배향하고 정돈하는 조직 형성체로서 기능하며, 창상 치유, 조직 수복 및 종양 지질 (支質) 형성 등의 병리적 과정에 관여한다 (Iozzo, R. V.,Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., 32(2):141-174 (1997)). 루이신 풍부 단백질이 창상 치유 및 조직 복구에 연루되어 있다는 다른 연구 결과도 있다. 출혈 장애 버나드-소울리어 증후군과 관련된 복합체 중의 루이신 풍부 모티프가 돌연변이되었음을 보고한 문헌 (De La Salle, C., et al.,Vouv. Rev. Fr. Hematol. (Germany), 37(4):215-222 (1995), 혈소판이 루이신 풍부 반복부를 갖는다고 보고한 문헌 (Chlemetson,K.J., Thromb. Haemost. (Germany), 74(1):111-116 (July 1995)), 및 형질전환 성장인자 β에 결합하는 데코린이 암 치료, 창상 치유 및 흉터 형성에 관여하는 것으로 보고한 라졸라 암연구재단 (La Jolla Cancer Research Foundation)의 (Ruoslahti, E. I. et al. WO9110727A)이 그것이다. 인슐린 유사 성장인자 (IGF)가 결합 조직, 피부 및 뼈 등의 조직 재성장과 관련된 창상 치유 및 관련 치료법에 유용하고 인간 및 동물에게서 신체 성장을 촉진하는 데 유용하며, 기타 성장 관련 과정을 자극하는 데 유용하다는 측면에서 IGF는 이런 단백질군과 기능상 관련되어 있다. IGF의 산 불안정성 서브유닛 (ALS)도 이것이 IGF의 반감기를 증가시키고 생체내에서 IGF 복합체의 일부라는 점 때문에 흥미가 있다.

루이신 풍부 반복부를 갖는 것으로 보고된 또다른 단백질은 SLIT 단백질로서, 이 단백질은 알쯔하이머병 등의 신경 퇴행성 질환 및 파킨슨병 등에서의 신경 손상을 치료하는 데, 그리고 암의 진단에서 유용한 것으로 보고된 바 있다 (Artavanistsakonas, S. and Rothberg, J. M., WO9210518-A1, 예일대학). 또한 생쥐 뇌의 신경교 세포에서 특이적으로 발현되는 막 당단백질인 LIG-1도 루이신 풍부 반복부 및 이뮤노글로불린 유사 도메인을 갖고 있어 흥미롭다 (Suzuki et al.,J. Biol. Chem.(US) 271 (32): 22522 (1996)). 루이신 풍부 반복부를 갖는 단백질의 생체 기능에 관한 다른 연구 보고서로는 (Tayar, N., et al.,Mol. Cell Endocrinol., (Ireland), 125(1-2):65-70 (Dec. 1996)) (고나도트로핀 수용체 관련), (Miura, Y., et al.,Nippon Rinsho(Japan), 54(7):1784-1789 (July 1996)) (아폽토시스 관련), (Harris, P. C., et al.,J. Am. Soc. Nephrol., 6(4):1125-1133 (Oct. 1995)) (신장병 관련) 및 (Almeida, A., et al., Oncogene 16(23): 2997-3002 (1998년 6월)) (악성 신경교종 관련)이 있다.

117.PRO1801

인터루킨-10 (IL-10)은 골수 세포 및 림프절 세포 기능의 중요한 조절자로 관여하는 다면발현성 면역억제 사이토킨이다. IL-10은 예를 들어, IL-1, IL-6, IFN-γ및 TNF-α를 비롯한 다양한 염증성 사이토킨 합성의 활성화에 대한 강력한 억제제로 작용한다는 것이 입증되어 있다 (Gesser et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 미국 94: 14620-14625 (1997)). 게다가, IL-10은 대식세포의 여러 가지 부차적 활성을 강력하게 저해함으로써 대식세포, T-세포 및 NK 세포의 이펙터 기능에 대한 강력한 억제제로 작용한다는 것이 입증되었다 (Kuhn et al., Cell 75: 263-274 (1993)). 또한, IL-10은 B-세포, 비만세포 및 흉선세포 분화의 조절에 밀접하게 관여한다.

IL-10은 실험의 두 가지 분리된 계열에서 독립적으로 확인되었다. 첫째, 뮤린 IL-10을 코딩하는 cDNA 클론은 사이토킨 합성을 억제하는 인자의 발현을 기초로 하여 확인되었는데 (Moore et al., Science 248: 1230-1234 (1990), 인간 IL-10에 대응하는 cDNA는 뮤린 IL-10 cDNA와의 교차-혼성화에 의해 나중에 확인되었다 (Viera et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 미국 88: 1172-1176 (1991)). 추가적으로, IL-10은 활성 흉선세포를 보조 자극하는 기능을 하는 B-세포-유래 매개자로 독립적으로 확인되었다 (Suda et al., Cell Immunol. 129: 228 (1990)).

최근에, IL-10-관련 사이토킨족에 속하는 신규 사이토킨 폴리펩티드가 확인되었고 그 특징이 규명되었다. IL-19로 지칭하는 이 신규 분비 사이토킨은 분자량이 약 20.4 kD인 177개의 아미노산 폴리펩티드이다 (1998년 5월 5일 공개된 WO98/08870 참조). IL-19는 활성화된 단핵구에 의해 특이적으로 발현되는 것으로 보고되어 있는데, 증가 및/또는 감소된 IL-19 농도는 증가 또는 감소된 사이토킨 생성 농도와 관련되어 있는 1 가지 이상의 생리학적 질병과 연관되어 있을 수 있다 (WO 98/08870 참조). 구체적으로, IL-19는 면역계의 세포에 의한 염증성 사이토킨의 합성을 저해할 수 있는 것으로 제시되어 있다.

다양한 사이토킨 폴리펩티드 및, 보다 구체적으로는 IL-10 및 IL-19 (가능성 있음)와 같은 면역억제 사이토킨의 중요성이 명백하므로, IL-10 및/또는 IL-19와 상동성이 있는 신규 사이토킨 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 상당한 관심이 기울여져 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1801 폴리펩티드로 지칭하며 IL-19와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

118.UCP4

대사 과정에서 작용하는 것으로 믿어지고 있는 비커플링 단백질 또는 "UCP"는 문헌에 보고되어 있다. UCP는 곰과 같은 동면동물의 갈색 지방 세포에서 처음 발견되어 기재되었다. UCP는 이러한 동면동물 및 추운 날씨에 적응된 다른 동물이 그들 신체의 휴면 대사 속도를 상승시켜 추운 날씨에 코어 체온을 유지하도록 돕는 것으로 믿어졌다. 인간은 상대적으로 적은 양의 갈색 지방조직을 갖고 있기 때문에, UCP는 본래 인간 대사에서 하는 기능이 적은 것으로 여겨졌다.

여러 가지 다양한 인간 비커플링 단백질이 현재 기재되어 있다 (일반적으로Gura, Science, 280: 1369-1370 (1998) 참조). UCP1로 불리는 인간 비커플링 단백질은 Nicholls 등에 의해 확인되었다. Nicholls 등은 갈색 지방 세포의 미토콘드리아 내막이 단백질에 대한 투과성이 높음을 보였고, 연구자들은 미토콘드리아 막에서 UCP1이라 불리는 단백질에 대해 관찰된 투과성을 추적하였다. Nicholls 등은 UCP1이 이러한 투과성을 야기하여 식품원으로부터 만들어질 수 있는 ATP의 수를 감소시키고, 결국 신체 대사 속도를 상승시켜 열을 발생시킨다고 보고하였다 (Nicholls et al., Physiol. Rev., 64, 1-64 (1984)).

UCP1이 실제로 갈색 지방조직에서만 발현되는 것은 나중에 확인되었다 (Bouillaud et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 82: 445-448 (1985); Jacobsson et al., J. Biol. Chem., 260: 16250-16254 (1985)). 유전자 맴핑 연구는 인간 UCP1 유전자가 4번 염색체 위에 위치하고 있다는 것을 보여준 바 있다 (Cassard et al., J. Cell. Biochem., 43: 255-264 (1990)).

UCPH 또는 UCP2라고 불리는 또다른 인간 UCP도 기재되어 있다 (Gimeno et al., Diabetes, 46: 900-906 (1997); Fleury et al., Nat. Genet., 15: 269-272 (1997); Boss et al., FEBS Letters, 408: 39-42 (1997); Wolf, Nutr. Rev., 55: 178-179 (1997)도 참조). Fleury 등은 UCP2 단백질이 UCP1과 59% 아미노산 동일성을 갖으며, UCP2가 고인슐린혈증 및 비만과 관련되어 있는 11번 염색체의 영역에 위치하고 있다고 보고하였다 (상기 Fleury et al.). 또한, UCP2는 뇌 및 근육과 지방 세포와 같은 다양한 성인 조직에서 발현된다고 보고되어 있다 (상기 Gimeno et al., 및 상기 Fleury et al.)

세번째 인간 UCP인 UCP3은 최근에 문헌 (상기 Boss et al., Vidal-Puig et al., Biochem. Biophys. Res. Comm., 235: 79-82 (1997); Solanes et al., J. Biol. Chem., 272: 25433-25436 (1997); 및 Gong et al., J. Biol. Chem., 272: 24129-24132 (1997), 또한 영국 특허 제9716886호 참조). Solanes 등은 UCP1 및 UCP2와는 달리 UCP3이 인간 골근육에서 우선적으로 발현되며, UCP2 유전자와 인접한 UCP3 유전자가 11번 인간 염색체에 위치해 있다고 보고하고 있다 (상기 Solanes et al.). Gong 등은 UCP3 발현이 갑상선 호르몬, 베타3-아드레날린성 아고니스트 및 렙틴과 같은 공지된 발열 자극에 의해 조절될 수 있다고 기술하고 있다 (상기 Gong et al.).

119.PRO193

신규 천연 막횡단 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 막횡단 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO193으로 지칭하는 신규 막횡단 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

120.PRO1130

인간 2-19 단백질과 같은 폴리펩티드는 사이토킨으로 작용할 수 있다. 사이토킨은 면역세포의 분화, 증식 및 기능을 자극하거나 저해하는 저분자량의 단백질이다. 사이토킨 단백질은 종종 세포간 메신저로 작용하고 생리학적인 다중 효과를 나타낸다. 생체내 면역대사는 생리학적으로 중요하므로, 면역계에 영향을 주는 데관여하는 신규 천연 단백질을 확인하는 데 현재 노력하고 있다. 본 발명자들은 본원에서 인간 2-19 단백질과 서열 유사성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인에 관해 기술하고 있다.

121.PRO1335

탄소 안히드라제는 이산화탄소의 전달을 보조하며 이산화탄소 및 물로부터 탄산의 합성 (및 탈수)을 촉매하여 포유동물 혈액계에 유리되어 있는 효소 단백질이다. 따라서, 탄소 안히드라제의 작용은 포유동물에서 다양한 중요 생리학적 반응에 필수적이다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1335 폴리펩티드로 지칭하며 탄소 안히드라제와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

122.PRO1329

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1329로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

123.PRO1550

신규 천연 분비 단백질을 찾아내려는 노력이 산업계와 학계에서 이루어지고 있다. 이런 노력의 상당수는 포유동물 재조합 DNA 라이브러리를 스크리닝해서 신규 분비 단백질의 코딩 서열을 확인하는 데 집중되어 있다. 본 발명자들은 본원에서 PRO1550으로 지칭하는 신규 분비 단백질의 확인 및 특징규명에 관해 기술하고 있다.

<발명의 요약>

1.PRO1560

본 발명자들은 테트라스판족의 신규 구성원으로 믿어지며 본원에서 "PRO1560"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA19902-1669)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1560 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 2 (서열 4)의 아미노산 잔기 1 또는 약 43 내지 약 245의 서열을 갖는 PRO1560 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 1 (서열 3)의 잔기 약 167과 약 775 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1560 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203454호 (DNA19902-1669)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203454호 (DNA19902-1669)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 2 (서열 4)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 245의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 2 (서열 4)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 245의 서열을 갖는 PRO1560 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1560 폴리펩티드, 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 2 (서열 4)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 42까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1560 아미노산 서열 (도 2, 서열 4)에서 아미노산 위치 약 19-42, 61-83, 92-114 및 209-230에서 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 2 (서열 4)의 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 245의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1560 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1560 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 2 (서열 4)의 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 245를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열PRO1560 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 2 (서열 4)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 245의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1560 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 2 (서열 4)의 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 245의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1560 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 2 (서열 4)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 245의 서열을 포함하는 단리된 PRO1560 폴리펩티드, 또는 항-PRO1560 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1560 단편은 천연 PRO1560 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 2 (서열 4)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 245의 서열을 갖는 PRO1560 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1560 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1560 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1560 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1560 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1560 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

2.PRO444

본 발명자들은 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하며 본원에서 "PRO444"로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA26846-1397)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO444 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 4 (서열 6)의 아미노산 잔기 1 또는약 17 내지 약 117의 서열을 갖는 PRO444 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 3 (서열 5)의 잔기 약 656과 약 958 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO444 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203406호 (DNA26846-1397)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203406호 (DNA26846-1397)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 4 (서열 6)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 117의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 4 (서열 6)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 117의 서열을 갖는 PRO444 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 10개 이상의 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20개 이상의 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 40개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO444 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 4 (서열 6)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 16까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 4 (서열 6)의 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 117의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO444 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO444 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 4 (서열 6)의 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 117을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO444 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 4 (서열 6)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 117의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO444 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 4 (서열 6)의 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 117의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO444 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 4 (서열 6)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 117의 서열을 포함하는 단리된 PRO444 폴리펩티드, 또는 항-PRO444 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO444 단편은 천연 PRO444 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 4 (서열 6)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 117의 서열을 갖는 PRO444 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

3.PRO1018

본 발명자들은 본원에서 "PRO1018"으로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA56107-1415)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1018 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 6 (서열 8)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 25 내지 약 189의 서열을 갖는 PRO1018 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및(b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 5 (서열 7)의 뉴클레오티드 약 129 또는 약 201과 약 695 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1018 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203405호 (DNA56107-1415)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203405호 (DNA56107-1415)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 6 (서열 8)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 189의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 6 (서열 8)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 189의 서열을 갖는 PRO1018 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 10개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1018 폴리펩티드, 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 6 (서열 8)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 24까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1018 아미노산 서열 (도 6, 서열 8)에서 아미노산 위치 약 86부터 103까지, 및 아미노산 위치 약 60부터 75까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 6 (서열 8)의 잔기 1 또는 약 25 내지 약 189의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1018 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 5 (서열 7)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1018 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 6 (서열 8)의 잔기 1 또는 약 25 내지 약 189를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1018 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 6 (서열 8)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 189의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1018 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 6 (서열 8)의 잔기 1 또는 약 25 내지 약 189의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1018 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 6 (서열 8)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 189의 서열을 포함하는 단리된 PRO1018 폴리펩티드, 또는 항-PRO1018 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1018 단편은 천연 PRO1018 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 6 (서열 8)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 25 내지 약 189의 서열을 갖는 PRO1018 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

4.PRO1773

본 발명자들은 레티놀 디히드로게나제 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며 본원에서 "PRO1773"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA56406-1704)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1773 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 8 (서열 10)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 18 내지 약 319의 서열을 갖는 PRO1773 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 7 (서열 9)의 뉴클레오티드 약 111 또는 약 162와 약 1067 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1773 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203478호 (DNA56406-1704)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203478호 (DNA56406-1704)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 8 (서열 10)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 319의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 8 (서열 10)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 319의 서열을 갖는 PRO1773 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 525개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1773 폴리펩티드, 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 8 (서열 10)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 17까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1773 아미노산 서열 (도 8, 서열 10)에서 아미노산 위치 약 136부터 아미노산 위치 약 152까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 8 (서열 10)의 잔기 1 또는 약 18 내지 약 319의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1773 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 7 (서열 9)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1773 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 8 (서열 10)의 잔기 1 또는 약 18 내지 약 319를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1773 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 8 (서열 10)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 319의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1773 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 8 (서열 10)의 잔기 1 또는 약 18 내지 약 319의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1773 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 8 (서열 10)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 319의 서열을 포함하는 단리된 PRO1773 폴리펩티드, 또는 항-PRO1773 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1773 단편은 천연 PRO1773 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 8 (서열 10)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 18 내지 약 319의 서열을 갖는 PRO1773 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1773 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1773 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1773 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1773 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1773 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

5.PRO1477

본 발명자들은 만노시다제 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며 본원에서 "PRO1477"로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA56529-1647)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1477 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 10 (서열 12)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 699의 서열을 갖는 PRO1477 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 9 (서열 11)의 뉴클레오티드 약 23과 약 2119 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1477 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203293호 (DNA56529-1647)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203293호 (DNA56529-1647)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 10 (서열 12)의 아미노산 잔기 1 내지 약 699의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 10 (서열 12)의 아미노산 잔기 1 내지 약 699의 서열을 갖는 PRO1477 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 540개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1477 폴리펩티드, 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1477 아미노산 서열 (도 10, 서열 12)에서 아미노산 위치 약 21부터 아미노산 위치 약 40까지, 그리고 아미노산 위치 약 84부터 아미노산 위치 약 105까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 10 (서열 12)의 잔기 1 내지 약 699의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1477 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 9 (서열 11)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1477 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 10 (서열 12)의 잔기 1 내지 약 699를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1477 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 10 (서열 12)의 아미노산 잔기 1 내지 약 699의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1477 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 10 (서열 12)의 잔기 1 내지 약 699의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1477 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 10 (서열 12)의 아미노산 잔기 1 내지 약 699의 서열을 포함하는 단리된 PRO1477 폴리펩티드, 또는 항-PRO1477 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1477 단편은 천연 PRO1477 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 10 (서열 12)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 699의 서열을 갖는 PRO1477 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1477 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1477 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1477 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1477 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1477 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

6.PRO1478

본 발명자들은 갈락토실트랜스퍼라제와 서열 동일성이 있으며 본원에서 "PRO1478"로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA56531-1648)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1478 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 12 (서열 17)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 327의 서열을 갖는 PRO1478 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 11 (서열 16)의 잔기 약 77과 약 1057 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1478 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203286호 (DNA56531-1648)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203286호 (DNA56531-1648)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 12 (서열 17)의 아미노산 잔기 1 내지 약 327의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 12 (서열 17)의 아미노산잔기 1 내지 약 327의 서열을 갖는 PRO1478 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 가용성 형태의 PRO1478 폴리펩티드, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인 (타입 II)은 PRO1478 아미노산 서열 (도 12, 서열 17)에서 아미노산 위치 약 29부터 아미노산 위치 약 49까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 그러므로, 아미노산 1-28이 있거나 없는, 아미노산 50-327을 포함하는 펩티드 뿐만 아니라 이러한 펩티드를 코딩하는 핵산은 본원에서 구체적으로 구현된다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 12 (서열 17)의 잔기 1 내지 약 327의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1478 폴리펩티드코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1478 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 12 (서열 17)의 잔기 1 내지 약 327을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1478 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 12 (서열 17)의 아미노산 잔기 1 내지 약 327의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1478 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 12 (서열 17)의 잔기 1 내지 약 327의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1478 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 12 (서열 17)의 아미노산 잔기 1 내지 약 327의 서열을 포함하는 단리된 PRO1478 폴리펩티드, 또는 항-PRO1478 항체에 대한결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1478 단편은 천연 PRO1478 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 12 (서열 17)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 327의 서열을 갖는 PRO1478 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1478 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1478 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1478 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1478 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1478 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

7.PRO831

본 발명자들은 본원에서 "PRO831"로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA56862-1343)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO831 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 14 (서열 22)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 16 내지 약 73의 서열을 갖는 PRO831 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 13 (서열 21)의 뉴클레오티드 약 40 또는 약 85와 약 258 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO831 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203174호 (DNA56862-1343)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203174호 (DNA56862-1343)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 14 (서열 22)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 73의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 14 (서열 22)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 73의 서열을 갖는 PRO831 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 470개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO831 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 14 (서열 22)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 15까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 14 (서열 22)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 73의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO831 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 13 (서열 21)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO831 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 14 (서열 22)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 73을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO831 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 14 (서열 22)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 73의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO831 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 14 (서열 22)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 73의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO831 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 14 (서열 22)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 73의 서열을 포함하는 단리된 PRO831 폴리펩티드, 또는 항-PRO831 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO831 단편은 천연 PRO831 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 14 (서열 22)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 16 내지 약 73의 서열을 갖는 PRO831 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

8.PRO1113

본 발명자들은 루이신이 풍부한 반복부을 포함하는 단백질과 서열 동일성이 있으며 본원에서 "PRO1113"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA57254-1477)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1113 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 16 (서열 24)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 616의 서열을 갖는 PRO1113 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 15 (서열 23)의 잔기 약 214와 약 2061 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1113 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203289호 (DNA57254-1477)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203289호 (DNA57254-1477)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 16 (서열 24)의 아미노산 잔기 1 내지 약616의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 16 (서열 24)의 아미노산 잔기 1 내지 약 616의 서열을 갖는 PRO1113 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 및 가용성 PRO1113 폴리펩티드, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1113 아미노산 서열 (도 16, 서열 24)에서 아미노산 위치 약 13부터 아미노산 위치 약 40까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 따라서, 서열 24의 아미노산 41-616 및 경우에 따라 1-12를 포함하는 펩티드, 및 동일한 것을 코딩하는 핵산도 본원에서 제공된다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 16 (서열 24)의 잔기 1 내지 약 616의아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1113 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1113 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 16 (서열 24)의 잔기 1 내지 약 616을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1113 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 16 (서열 24)의 아미노산 잔기 1 내지 약 616의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1113 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 16 (서열 24)의 잔기 1 내지 약 616의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1113 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 16 (서열 24)의 아미노산 잔기 1 내지 약 616의 서열을 포함하는 단리된 PRO1113 폴리펩티드, 또는 항-PRO1113 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1113 단편은 천연 PRO1113 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 16 (서열 24)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 616의 서열을 갖는 PRO1113 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1113 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1113 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1113 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연PRO1113 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1113 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

9.PRO1194

본 발명자들은 본원에서 "PRO1194"로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA57841-1522)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1194 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 18 (서열 29)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 22 내지 약 81의 서열을 갖는 PRO1194 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 17 (서열 28)의 잔기 약 72와 약 251 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1194 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203458호 (DNA57841-1522)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203458호 (DNA57841-1522)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 18 (서열 29)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 81의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 18 (서열 29)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 81의 서열을 갖는 PRO1194 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 18 (서열 29)의 잔기 약 22 내지 약 81의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1194 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1194 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 18 (서열 29)의 잔기 약 22 내지 약 81을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1194 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 18 (서열 29)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 81의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1194 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 18 (서열 29)의 잔기 약 22 내지 약 81의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1194 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 18 (서열 29)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 81의 서열을 포함하는 단리된 PRO1194 폴리펩티드, 또는 항-PRO1194 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1194 단편은 천연 PRO1194 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 18 (서열 29)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 81의 서열을 갖는 PRO1194 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1194 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1194 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1194 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연PRO1194 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1194 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

10.PRO1110

본 발명자들은 골수의 양을 상승조절하는 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며 본원에서 "PRO1110"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA58727-1474)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1110 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 20 (서열 31)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 322의 서열을 갖는 PRO1110 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 19 (서열 30)의 뉴클레오티드 약 131과 약 1096 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1110 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203171호 (DNA58727-1474)의인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203171호 (DNA58727-1474)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 20 (서열 31)의 아미노산 잔기 1 내지 약 322의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 20 (서열 31)의 아미노산 잔기 1 내지 약 322의 서열을 갖는 PRO1110 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 10개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1110 폴리펩티드, 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1110 아미노산 서열 (도 20, 서열 31)에서 아미노산 위치 약 41부터 아미노산 위치 약 60까지, 아미노산 위치 약 66부터 아미노산 위치 약 85까지, 아미노산 위치 약 101부터 아미노산 위치 120까지, 아미노산 위치 약 137부터 아미노산 위치 약 153까지, 아미노산 위치 약 171부터 아미노산 위치 약 192까지, 아미노산 위치 약 205부터 아미노산 위치 약 226까지, 아미노산 위치 약 235부터 아미노산 위치 약 255까지, 및 아미노산 위치 약 294부터 아미노산 위치 약 312까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 20 (서열 31)의 잔기 1 내지 약 322의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1110 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 19 (서열 30)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에의해 코딩되는 단리된 PRO1110 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 20 (서열 31)의 잔기 1 내지 약 322를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1110 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 20 (서열 31)의 아미노산 잔기 1 내지 약 322의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1110 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 20 (서열 31)의 잔기 1 내지 약 322의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1110 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 20 (서열 31)의 아미노산 잔기 1 내지 약 322의 서열을 포함하는 단리된 PRO1110 폴리펩티드, 또는 항-PRO1110 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1110 단편은 천연 PRO1110 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 20 (서열 31)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 322의 서열을 갖는 PRO1110 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1110 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1110 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1110 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1110 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1110 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

11.PRO1378

본 발명자들은 본원에서 "PRO1378"로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA58730-1607)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1378 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 22 (서열 33)의 아미노산 잔기 약 1또는 약 16 내지 약 335의 서열을 갖는 PRO1378 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 21 (서열 32)의 잔기 약 1365와 약 2369 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1378 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203221호 (DNA58730-1607)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203221호 (DNA58730-1607)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 22 (서열 33)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 335의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 22 (서열 33)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 335의 서열을 갖는 PRO1378 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 20개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열이 있거나 없는 PRO1378 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 22 (서열 33)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 15까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 22 (서열 33)의 잔기 약 16 내지 약 335의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1378 폴리펩티드코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1378 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 22 (서열 33)의 잔기 약 16 내지 약 335를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1378 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 22 (서열 33)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 335의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1378 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 22 (서열 33)의 잔기 약 16 내지 약 335의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1378 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 22 (서열 33)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 335의 서열을 포함하는 단리된 PRO1378 폴리펩티드, 또는 항-PRO1378 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1378 단편은 천연 PRO1378 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 22 (서열 33)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 335의 서열을 갖는 PRO1378 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

12.PRO1481

본 발명자들은 본원에서 "PRO1481"로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA58732-1650)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1481 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 24 (서열 41)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 24 내지 약 334의 서열을 갖는 PRO1481 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 23 (서열 40)의 잔기 약 88과 약 1321 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1481 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203290호 (DNA58732-1650)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203290호 (DNA58732-1650)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 24 (서열 41)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 334의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 24 (서열 41)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 334의 서열을 갖는 PRO1481 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1481 폴리펩티드, 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 24 (서열 41)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 23까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1481 아미노산 서열 (도 24, 서열 41)에서 아미노산 위치 약 235부터 아미노산 위치 약 262까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 24 (서열 41)의 잔기 약 24 내지 약 334의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1481 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1481 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 24 (서열 41)의 잔기 약 24 내지 약 334를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1481 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 24 (서열 41)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 334의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1481 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 24 (서열 41)의 잔기 약 24 내지 약 334의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1481 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 24 (서열 41)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 334의 서열을 포함하는 단리된 PRO1481 폴리펩티드, 또는 항-PRO1481 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이PRO1481 단편은 천연 PRO1481 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 24 (서열 41)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 334의 서열을 갖는 PRO1481 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1481 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1481 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1481 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1481 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1481 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

13.PRO1189

본 발명자들은 E25와 상동성이 있으며 본원에서 "PRO1189"로 지칭하는 신규폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA58828-1519)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1189 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 26 (서열 43)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 263의 서열을 갖는 PRO1189 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 25 (서열 42)의 잔기 약 79와 약 867 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1189 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203172호 (DNA58828-1519)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203172호 (DNA58828-1519)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 26 (서열 43)의 아미노산 잔기 1 내지 약 263의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 26 (서열 43)의 아미노산 잔기 1 내지 약 263의 서열을 갖는 PRO1189 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개의 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 그의 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 PRO1189 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1189 아미노산 서열 (도 26, 서열 43)에서 아미노산 위치 약 53부터 아미노산 위치 약 75까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 26 (서열 43)의 잔기 1 내지 약 263의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1189 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1189 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 26 (서열 43)의 잔기 1 내지 약 263을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1189 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 26 (서열 43)의 아미노산 잔기 1 내지 약 263의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1189 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 26 (서열 43)의 잔기 1 내지 약 263의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1189 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 26 (서열 43)의 아미노산 잔기 1 내지 약 263의 서열을 포함하는 단리된 PRO1189 폴리펩티드, 또는 항-PRO1189 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1189 단편은 천연 PRO1189 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 26 (서열 43)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 263의 서열을 갖는 PRO1189 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1189 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1189 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1189 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1189 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1189 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

14.PRO1415

본 발명자들은 본원에서 "PRO1415"로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA58852-1637)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1415 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 28 (서열 50)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 26 내지 약 283의 서열을 갖는 PRO1415 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 27 (서열 49)의 뉴클레오티드 약 148 또는 약 223과 약 996 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1415 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203271호 (DNA58852-1637)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203271호 (DNA58852-1637)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 28 (서열 50)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 283의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 28 (서열 50)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 283의 서열을 갖는 PRO1415 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1415 폴리펩티드, 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 28 (서열 50)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 25까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1415 아미노산 서열 (도 28, 서열 50)에서 아미노산 위치 약 94부터 아미노산 위치 약 118까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 28 (서열 50)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 283의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1415 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 27 (서열 49)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1415 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 28 (서열 50)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 283를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1415 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 28 (서열 50)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 283의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1415 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 28 (서열 50)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 283의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1415 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 28 (서열 50)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 283의 서열을 포함하는 단리된 PRO1415 폴리펩티드, 또는 항-PRO1415 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1415 단편은 천연 PRO1415 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 28 (서열 50)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 26 내지 약 283의 서열을 갖는 PRO1415 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1415 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1415 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1415 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1415 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1415 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

15.PRO1411

본 발명자들은 본원에서 "PRO1441"로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA59212-1627)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1441 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 30 (서열 52)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 22 내지 약 440의 서열을 갖는 PRO1441 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 29 (서열 51)의 잔기 약 247과 약 1503 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1441 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203245호 (DNA59212-1627)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203245호 (DNA59212-1627)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 30 (서열 52)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 440의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 30 (서열 52)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 440의 서열을 갖는 PRO1441 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 30 (서열 52)의 잔기 약 22 내지 약 440의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1441 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1441 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 30 (서열 52)의 잔기 약 22 내지 약 440을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1441 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 30 (서열 52)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 440의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1441 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 30 (서열 52)의 잔기 약 22 내지 약 440의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1441 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 30 (서열 52)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 440의 서열을 포함하는 단리된 PRO1441 폴리펩티드, 또는 항-PRO1441 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1441 단편은 천연 PRO1441 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 30 (서열 52)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 440의 서열을 갖는 PRO1441 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85%이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1441 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1441 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1441 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1441 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1441 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

16.PRO1295

본 발명자들은 본원에서 "PRO1295"로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA59218-1559)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1295 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 32 (서열 54)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 19 내지 약 280의 서열을 갖는 PRO1295 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 31 (서열 53)의 잔기 약 261과 약 1046 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1295 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203287호 (DNA59218-1559)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203287호 (DNA59218-1559)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 32 (서열 54)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 280의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 32 (서열 54)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 280의 서열을 갖는 PRO1295 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 32 (서열 54)의 잔기 약 19 내지 약 280의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1295 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1295 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 32 (서열 54)의 잔기 약 19 내지 약 280을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1295 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 32 (서열 54)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 280의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1295 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 32 (서열 54)의 잔기 약 19 내지 약 280의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1295 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 32 (서열 54)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 280의 서열을 포함하는 단리된 PRO1295 폴리펩티드, 또는 항-PRO1295 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1295 단편은 천연 PRO1295 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 32 (서열 54)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 280의 서열을 갖는 PRO1295 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85%이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1295 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1295 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1295 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1295 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1295 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

17.PRO1359

본 발명자들은 시알릴트랜스퍼라제와 서열 동일성이 있으며 본원에서 "PRO1359" 폴리펩티드로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA59219-1613)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1359 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 34 (서열 56)의 아미노산 잔기 약 1또는 약 32 내지 약 299의 서열을 갖는 PRO1359 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 33 (서열 55)의 잔기 약 277과 약 1080 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1359 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203220호 (DNA59219-1613)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203220호 (DNA59219-1613)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 34 (서열 56)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 299의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 34 (서열 56)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 299의 서열을 갖는 PRO1359 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 가용성 PRO1359 폴리펩티드, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인 (타입 II)은 PRO1359 아미노산 서열 (도 34, 서열 56)에서 아미노산 위치 약 9부터 아미노산 위치 약 31까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 34 (서열 56)의 잔기 32 내지 약 299의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1359 폴리펩티드코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1359 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 34 (서열 56)의 잔기 약 32 내지 약 299를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1359 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 34 (서열 56)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 299의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1359 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 34 (서열 56)의 잔기 약 32 내지 약 299의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1359 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 34 (서열 56)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 299의 서열을 포함하는 단리된 PRO1359 폴리펩티드, 또는 항-PRO1359 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1359 단편은 천연 PRO1359 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 34 (서열 56)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 299의 서열을 갖는 PRO1359 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1359 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1359 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1359 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1359 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1359 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

18.PRO1190

본 발명자들은 CDO 단백질과 상동성이 있으며 본원에서 "PRO1190"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA59586-1520)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1190 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 36 (서열 58)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 1115의 서열을 갖는 PRO1190 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 35 (서열 58)의 잔기 약 340과 약 3684 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1190 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203288호 (DNA59586-1520)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203288호 (DNA59586-1520)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 36 (서열 58)의 아미노산 잔기 1 내지 약 1115의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 36 (서열 58)의 아미노산 잔기 1 내지 약 1115의 서열을 갖는 PRO1190 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 개 이상의 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체와 함께 PRO1190 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인은 도 36 (서열 58)에 나타낸 PRO1190 아미노산 서열에서 아미노산 위치 약 16부터 아미노산 위치 약 30까지, 그리고 아미노산 위치 약 854부터 아미노산 위치 약 879까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 36 (서열 58)의 잔기 1 내지 약 1115의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1190 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1190 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 36 (서열 58)의 잔기 1 내지 약 1115를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1190 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 36 (서열 58)의 아미노산 잔기 1 내지 약 1115의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1190 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 36 (서열 58)의 잔기 1 내지 약 1115의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1190 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 36 (서열 58)의 아미노산 잔기 1 내지 약 1115의 서열을 포함하는 단리된 PRO1190 폴리펩티드, 또는 항-PRO1190 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1190 단편은 천연 PRO1190 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 36 (서열 58)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 1115의 서열을 갖는 PRO1190 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1190 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1190 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1190 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1190 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1190 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

19.PRO1772

본 발명자들은 펩티다제 효소를 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며 본원에서 "PRO1772"로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA59817-1703)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1772 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 38 (서열 63)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 37 내지 약 487의 서열을 갖는 PRO1772 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 37 (서열 62)의 뉴클레오티드 약 93 또는 약 201과 약 1553 사이의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1772 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203470호 (DNA59817-1703)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203470호 (DNA59817-1703)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 38 (서열 63)의 아미노산 잔기 1 또는 약 37 내지 약 487의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 38 (서열 63)의 아미노산 잔기 1 또는 약 37 내지 약 487의 서열을 갖는 PRO1772 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 415개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1772 폴리펩티드, 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 38 (서열 63)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 36까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1772 아미노산 서열 (도 38, 서열 63)에서 아미노산 위치 약 313부터 아미노산 위치 약 331까지 걸쳐 있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 38 (서열 63)의 잔기 1 또는 약 37 내지 약 487의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1772 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 37 (서열 62)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1772 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 38 (서열 63)의 잔기 1 또는 약 37 내지 약 487을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1772 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 38 (서열 63)의 아미노산 잔기 1 또는 약 37 내지 약 487의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1772 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 38 (서열 63)의 잔기 1 또는 약 37 내지 약 487의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1772 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 38 (서열 63)의 아미노산 잔기 1 또는 약 37 내지 약 487의 서열을 포함하는 단리된 PRO1772 폴리펩티드, 또는 항-PRO1772 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1772 단편은 천연 PRO1772 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 38 (서열 63)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 37 내지 약 487의 서열을 갖는 PRO1772 폴리펩티드를 코딩하는DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1772 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1772 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1772 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1772 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1772 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

20. PRO1248

본원에서 PUT-2를 코딩하는 핵산에 상동성이 있으며 "PRO1248"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA60278-1530)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1248 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산 분자는 (a) 도 40 (서열 68)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 21 내지 약 183의 서열을 갖는 PRO1248 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 39 (서열 67)의 뉴클레오티드 약 122 또는 약 182 내지 약 670 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1248 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203170호 (DNA60278-1530)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 핵산 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203170호 (DNA60278-1530)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 40 (서열 68)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 183의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 10개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 40 (서열 68)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 183의 서열을 갖는 PRO1248 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1248 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 40 (서열 68)의 서열에서 약 아미노산 1번 내지 약 20번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1248 아미노산 서열 (도 40, 서열 68)에서 약 아미노산 90번 내지 약 112번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 40 (서열 68)의 잔기 1 또는 약 21 내지 약 183의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용한, PRO1248 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 39 (서열 67)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1248 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 40 (서열 68)의 잔기 1 또는 약 21 내지 약 183을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1248 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 40 (서열 68)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 183의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1248 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 40 (서열 68)의 잔기 1 또는 약 21 내지 약 183의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1248 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 40 (서열 68)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 183의 서열을 포함하는 단리된 PRO1248 폴리펩티드, 또는 항-PRO1248 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 40 (서열 68)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 21 내지 약 183의 서열을 갖는 PRO1248 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1248 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1248 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1248 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO1248 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1248 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트나 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

21. PRO1316

본원에서 딕코프 (Dickkopf)에 상동성이 있으며 "PRO1316"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA60608-1577)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1316 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산 분자는 (a) 도 42 (서열 70)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 259의 서열을 갖는 PRO1316 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 41 (서열 69)의 잔기 약 281 내지 약 987 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1316 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203126호 (DNA60608-1577)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203126호 (DNA60608-1577)의 인간 단백질 cDNA에의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 42 (서열 70)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 259의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 15개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 41 (서열 69)의 잔기 1-454 또는 잔기 1095-3130에 걸쳐있는 영역과 동일성이 있는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 혼성화시키는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 이와는 달리, 본 발명은 15개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 41 (서열 69)의 잔기 1-454 또는 잔기 1095-3130에 걸쳐있는 영역과 동일성이 있는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1316 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 42 (서열 70)의 서열에서 약 아미노산 1번 내지 약 25번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. N-글리코실화 부위는 52번에서 확인되었으며, 진균 Zn(2)-Cys(6) 2핵 클러스터는 99번에서 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 42 (서열 70)의 잔기 26 내지 약 259의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1316 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 42 (서열 70)의 잔기 26 내지 259를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1316 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 42 (서열 70)의 아미노산 잔기 26 내지 약 259의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1316 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 42 (서열 70)의 잔기 26 내지 약 259의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1316 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 42 (서열 70)의 아미노산 잔기 26 내지 약259의 서열을 포함하는 단리된 PRO1316 폴리펩티드, 또는 항-PRO1316 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1316 단편은 천연 PRO1316 폴리펩티드의 정량적 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 42 (서열 70)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 259의 서열을 갖는 PRO1316 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1316 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1316 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1316 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO1316 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1316 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트나 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

22. PRO1197

본원에서 "PRO1197"로 지칭되는 신규 분비된 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA60611-1524)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1197 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산 분자는 (a) 도 44 (서열 72)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 363의 서열을 갖는 PRO1197 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 43 (서열 71)의 잔기 약 383 내지 약 1399 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1197 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203175호 (DNA60611-1524)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203175호 (DNA60611-1524)의 인간 단백질 cDNA에의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 44 (서열 72)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 363의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 44 (서열 72)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 363의 서열을 갖는 PRO1197 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 만일 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 44 (서열 72)의 잔기 약 25 내지 약 363의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용한, PRO1197 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1197 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 44 (서열 72)의 잔기 25 내지 363을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1197 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 44 (서열 72)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 363의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1197 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 44 (서열 72)의 잔기 25 내지 363의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1197 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 44 (서열 72)의 아미노산 잔기 25 내지 363의 서열을 포함하는 단리된 PRO1197 폴리펩티드, 또는 항-PRO1197 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1197 단편은 천연 PRO1197 폴리펩티드의 정량적 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 44 (서열 72)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 363의 서열을 갖는 PRO1197 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1197 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1197 항체이다.

23. PRO1293

본원에서 이뮤노글로불린 중쇄 가변 영역 단백질을 코딩하는 핵산에 상동성이 있으며 "PRO1293"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA60618-1557)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1293 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산 분자는 (a) 도 46 (서열 77)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 20 내지 약 341의 서열을 갖는 PRO1293 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 45 (서열 76)의 뉴클레오티드 약 37 또는 약 94 내지 약 1059 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1293 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203292호 (DNA60618-1557)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 핵산 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203292호 (DNA60618-1557)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 46 (서열 77)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 341의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 46 (서열 77)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 341의 서열을 갖는PRO1293 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 만일 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1293 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 46 (서열 77)의 서열에서 약 아미노산 1번 내지 약 19번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1293 아미노산 서열 (도 46, 서열 77)에서 약 아미노산 237번 내지 약 262번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 46 (서열 77)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약 341의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용한, PRO1293 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 45 (서열 76)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1293 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 46 (서열 77)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약 341을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1293 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 46 (서열 77)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 341의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1293 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 46 (서열 77)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약 341의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1293 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 46 (서열 77)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 341의 서열을 포함하는 단리된 PRO1293 폴리펩티드, 또는 항-PRO1293 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1293 단편은 천연 PRO1293 폴리펩티드의 정량적 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 46 (서열 77)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 20 내지 약 341의 서열을 갖는 PRO1293 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1293 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1293 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1293 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO1293 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1293 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트나 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

24. PRO1380

본원에서 "PRO1380"으로 지칭되는 신규 다중 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA60740-1615)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1380 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산 분자는 (a) 도 48 (서열 79)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 470의 서열을 갖는 PRO1380 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 47 (서열 78)의 잔기 약 36 내지 약 1460 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1380 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203456호 (DNA60740-1615)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203456호 (DNA60740-1615)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 48 (서열 79)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 470의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상,더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 48 (서열 79)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 470의 서열을 갖는 PRO1380 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 만일 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 PRO1380 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 막횡단 도메인은 PRO1380 아미노산 서열 (도 48, 서열 79)에서 약 아미노산 50-74, 105-127, 135-153, 163-183, 228-252, 305-330 및 448-472번에서 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 48 (서열 79)의 잔기 1 내지 약 470의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용한, PRO1380 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1380 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 48 (서열 79)의 잔기 1 내지 470을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1380 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 48 (서열 79)의 아미노산 잔기 1 내지 약 470의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1380 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 48 (서열 79)의 잔기 1 내지 470의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1380 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 48 (서열 79)의 아미노산 잔기 1 내지 약 470의 서열을 포함하는 단리된 PRO1380 폴리펩티드, 또는 항-PRO1380 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1380 단편은 천연 PRO1380 폴리펩티드의 정량적 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 48 (서열 79)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 470의 서열을 갖는 PRO1380 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

25. PRO1265

본원에서 도 1 폴리펩티드에 상동성이 있으며 "PRO1265"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA60764-1533)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1265 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산 분자는 (a) 도 50 (서열 84)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 567의 서열을 갖는 PRO1265 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 49 (서열 83)의 잔기 약 142 내지 약 1779 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1265 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203452호 (DNA60764-1533)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203452호 (DNA60764-1533)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 50 (서열 84)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 567의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 50 (서열 84)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 567의 서열을 갖는 PRO1265 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고,만일 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1265 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 50 (서열 84)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 21번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 50 (서열 84)의 잔기 22 내지 약 567의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용한, PRO1265 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1265 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 50 (서열 84)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 567을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1265 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 50 (서열 84)의 아미노산 잔기 22 내지 약 567의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1265 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 50 (서열 84)의 잔기 22 내지 약 567의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1265 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 50 (서열 84)의 아미노산 잔기 22 내지 약 567의 서열을 포함하는 단리된 PRO1265 폴리펩티드, 또는 항-PRO1265 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1265 단편은 천연 PRO1265 폴리펩티드의 정량적 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 50 (서열 84)의 아미노산 잔기 약 22 내지 약 567의 서열을 갖는 PRO1265 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면,(ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

26. PRO1250

본원에서 장쇄 지방산 CoA 리가제를 코딩하는 핵산에 상동성이 있으며 "PRO1250"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA60775-1532)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1250 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산 분자는 (a) 도 52 (서열 86)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 739의 서열을 갖는 PRO1250 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 51 (서열 85)의 뉴클레오티드 약 74 내지 약 2290 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1250 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203173호 (DNA60775-1532)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는DNA 분자 또는 (b) 핵산 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203173호 (DNA60775-1532)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 52 (서열 86)의 아미노산 잔기 1 내지 약 739의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 10개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 52 (서열 86)의 아미노산 잔기 1 내지 약 739의 서열을 갖는 PRO1250 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 만일 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1250 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 타입 II 막횡단 도메인은 PRO1250 아미노산 서열 (도 52, 서열 86)에서 약 아미노산 61번 내지 약 80번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 52 (서열 86)의 잔기 1 내지 약 739의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용한, PRO1250 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 51 (서열 85)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1250 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 52 (서열 86)의 잔기 1 내지 약 739를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1250 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 52 (서열 86)의 아미노산 잔기 1 내지 약 739의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1250 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 52 (서열 86)의 잔기 1 내지 약 739의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1250 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 52 (서열 86)의 아미노산 잔기 1 내지 약 739의 서열을 포함하는 단리된 PRO1250 폴리펩티드, 또는 항-PRO1250 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1250 단편은 천연 PRO1250 폴리펩티드의 정량적 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 52 (서열 86)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 739의 서열을 갖는 PRO1250 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1250 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1250항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1250 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO1250 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1250 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트나 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

27. PRO1475

본원에서 N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼라제를 코딩하는 핵산에 상동성이 있으며 "PRO1475"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA61185-1646)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1475 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 54 (서열 88)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 660의 서열을 갖는 PRO1475 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 53 (서열 87)의 뉴클레오티드 약 130 내지 약 2109 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1475 폴리펩티드를코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203464호 (DNA61185-1646)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 핵산 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203464호 (DNA61185-1646)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 54 (서열 88)의 아미노산 잔기 1 내지 약 660의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 180개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 54 (서열 88)의 아미노산 잔기 1 내지 약 660의 서열을 갖는 PRO1475 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 만일 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1475 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 막횡단 도메인은 PRO1475 아미노산 서열 (도 54, 서열 88)에서 약 아미노산 38번 내지 약 55번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 54 (서열 88)의 잔기 1 내지 약 660의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용한, PRO1475 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 53 (서열 87)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1475 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 54 (서열 88)의 잔기 1내지 약 660을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1475 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 54 (서열 88)의 아미노산 잔기 1 내지 약 660의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1475 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 54 (서열 88)의 잔기 1 내지 약 660의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1475 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 54 (서열 88)의 아미노산 잔기 1 내지 약 660의 서열을 포함하는 단리된 PRO1475 폴리펩티드, 또는 항-PRO1475 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1475 단편은 천연 PRO1475 폴리펩티드의 정량적 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 54 (서열 88)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 660의 서열을 갖는 PRO1475 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1475 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1475 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1475 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO1475 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1475 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트나 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

28. PRO1377

본원에서 "PRO1377"로 지칭되는 신규 다중 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA61608-1606)을 찾아냈다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1377 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산 분자는 (a) 도 56 (서열 95)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 307의 서열을 갖는 PRO1377 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 55 (서열 94)의 잔기 약 203 내지 약 1069 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1377 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203239호 (DNA61608-1606)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203239호 (DNA61608-1606)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 56 (서열 95)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 307의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 56 (서열 95)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 307의 서열을 갖는 PRO1377 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는(b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 만일 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1377 폴리펩티드 및 하나 이상의 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 56 (서열 95)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 18번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1377 아미노산 서열 (도 56, 서열 95)에서 약 아미노산 37-56, 106-122, 211-20, 240-260 및 288-304번에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 56 (서열 95)의 잔기 19 내지 약 307의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용한, PRO1377 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1377 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 56 (서열 95)의 잔기 19 내지 307을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1377 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 56 (서열 95)의 아미노산 잔기 19 내지 약 307의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1377 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 56 (서열 95)의 잔기 19 내지 307의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1377 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 56 (서열 95)의 아미노산 잔기 19 내지 약 307의 서열을 포함하는 단리된 PRO1377 폴리펩티드, 또는 항-PRO1377 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1377 단편은 천연 PRO1377 폴리펩티드의 정량적 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 56 (서열 95)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 307의 서열을 갖는 PRO1377 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

29.PRO1326

본 발명자들은 본원에서 "PRO1326"으로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA62808-1582)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1326 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 58 (서열 100)의 아미노산 잔기 1 또는 약 30 내지 약 401의 서열을 갖는 PRO1326 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 57 (서열 99)의 핵산 잔기 약 199에서 약 1314까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1326 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203358호 (DNA62808-1582)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203358호 (DNA62808-1582)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 58 (서열 100)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 401의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 58 (서열 100)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 401의 서열을 갖는 PRO1326 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1326 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 58 (서열 100)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 29까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 58 (서열 100)의 잔기 30 내지 약 401의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1326 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1326 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 58 (서열 100)의 잔기 30 또는 401을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1326 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 58 (서열 100)의 아미노산 잔기 30 내지 약 401의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1326 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 58 (서열 100)의 잔기 30 내지 401의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1326 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 58 (서열 100)의 아미노산 잔기 30 내지 약 401의 서열을 포함하는 단리된 PRO1326 폴리펩티드, 또는 항-PRO1326 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1326 단편은 천연 PRO1326 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 58 (서열 100)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 401의 서열을 갖는 PRO1326 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85%이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

30.PRO1249

본 발명자들은 본원에서 "PRO1249"으로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA62809-1531)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1249 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 60 (서열 102)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 1089의 서열을 갖는 PRO1249 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 59 (서열 101)의 뉴클레오티드 약 3 또는 약 51에서 약 3269까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1249 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203237호 (DNA62809-1531)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203237호 (DNA62809-1531)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 60 (서열 102)의 아미노산 잔기 1 또는 약 17 내지 약 1089의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 60 (서열 102)의 아미노산 잔기 1 또는 약 17 내지 약 1089의 서열을 갖는 PRO1249 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 10개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1249 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 것)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 60 (서열 102)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 16까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1249 아미노산 서열 (도 60, 서열 102)에서 아미노산 위치 약 317부터 아미노산 위치 약 341, 아미노산 위치 약 451부터 아미노산 위치 약 470, 아미노산 위치 약 481부터 아미노산 위치 약 500, 아미노산 위치 약 510부터 아미노산 위치 약 527, 아미노산 위치 약 538부터 아미노산 위치 약 555, 아미노산 위치 약 831부터 아미노산 위치 약 850, 아미노산 위치 약 1016터 아미노산 위치 약 1034, 아미노산 위치 약 1052부터 아미노산 위치 약 1070까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 60 (서열 102)의 잔기 1 또는 약 17 내지 약 1089의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1249 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 59(서열 101)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1249 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 60 (서열 102)의 잔기 1 또는 약 17 내지 약 1089을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1249 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 60 (서열 102)의 아미노산 잔기 1 또는 약 17 내지 약 1089의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1249 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 60 (서열 102)의 잔기 1 또는 약 17 내지 약 1089의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1249 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 60 (서열 102)의 아미노산 잔기 1 또는 약 17 내지 약 1089의 서열을 포함하는 단리된 PRO1249 폴리펩티드, 또는 항-PRO1249 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1249 단편은 천연 PRO1249 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 60 (서열 102)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 17 내지 약 1089의 서열을 갖는 PRO1249 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

31.PRO1315

본 발명자들은 사이토킨 수용체 족-4 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성을 나타내며, 본원에서 "PRO1315"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA62815-1576)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1315 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 62 (서열 104)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 29 내지 약 442의 서열을 갖는 PRO1315 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 61 (서열 103)의 뉴클레오티드 약 121 또는 약 205에서 약 1446까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1315 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203247호 (DNA62815-1576)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203247호 (DNA62815-1576)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 62 (서열 104)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 442의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 62 (서열 104)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 442의 서열을 갖는 PRO1315 폴리펩티드를 코딩하는DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 500개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1315 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 것)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 62 (서열 104)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 28까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1315 아미노산 서열 (도 62, 서열 104)에서 아미노산 위치 약 140부터 아미노산 위치 약 163까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 62 (서열 104)의 잔기 1 또는 약 29 내지 약 442의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1315 폴리펩티드코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 61 (서열 103)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1315 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 62 (서열 104)의 잔기 1 또는 약 29 내지 약 442을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1315 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 62 (서열 104)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 442의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1315 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 62 (서열 104)의 잔기 1 또는 약 29 내지 약 442의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1315 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 62 (서열 104)의 아미노산 잔기 1 또는 약29 내지 약 442의 서열을 포함하는 단리된 PRO1315 폴리펩티드, 또는 항-PRO1315 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1315 단편은 천연 PRO1315 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 62 (서열 104)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 29 내지 약 442의 서열을 갖는 PRO1315 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1315 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1383 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1383 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1315 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1315 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

32. PRO1599

본 발명자들은 그란자임 M과 상동성을 나타내며, 본원에서 "PRO1599"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA62845-1684)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1599 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 64 (서열 111)의 아미노산 잔기 1 또는 약 31 내지 약 283의 서열을 갖는 PRO1599 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 63 (서열 110)의 핵산 잔기 약 159에서 약 917까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1599 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203361호 (DNA62845-1684)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203361호 (DNA62845-1684)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 64 (서열 111)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 283의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 64 (서열 111)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 283의 서열을 갖는 PRO1599 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1599 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 64 (서열 111)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 30까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 64 (서열 111)의 잔기 31 내지 약 283의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1599 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1599 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 64 (서열 111)의 잔기 31 내지 283을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1599 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 64 (서열 111)의 아미노산 잔기 31 내지 약 283의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1599 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 64 (서열 111)의 잔기 31 내지 283의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1599 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 64 (서열 111)의 아미노산 잔기 31 내지 약 283의 서열을 포함하는 단리된 PRO1599 폴리펩티드, 또는 항-PRO1599 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1599 단편은 천연 PRO1599 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 64 (서열 111)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 283의 서열을 갖는 PRO1599 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1599 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1599 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1599 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1599 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1599 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

33. PRO1430

본 발명자들은 리덕타제 단백질과 상동성을 나타내며, 본원에서 "PRO1430"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64842-1632)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1430 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 66 (서열 116)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 331의 서열을 갖는 PRO1430 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 65 (서열 115)의 핵산 잔기 약 33에서 약 1074까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1430 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203278호 (DNA64842-1632)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203278호 (DNA64842-1632)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 66 (서열 116)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 331의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 66 (서열 116)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 331의 서열을 갖는 PRO1430 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열이 있거나 없는 PRO1430 폴리펩티드를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 66 (서열 116)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 17까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 66 (서열 116)의 잔기 18 내지 약 331의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1430 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1430 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 66 (서열 116)의 잔기 18 내지 331을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1430 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 66 (서열 116)의 아미노산 잔기 18 내지 약 331의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1430 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 66 (서열 116)의 잔기 18 내지 331의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1430 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 66 (서열 116)의 아미노산 잔기 18 내지 약 331의 서열을 포함하는 단리된 PRO1430 폴리펩티드, 또는 항-PRO1430 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1430 단편은 천연 PRO1430 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 66 (서열 116)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 331의 서열을 갖는 PRO1430 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1430 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1430 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1430 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1430 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1430 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

34. PRO1374

본 발명자들은 P4HA와 서열 상동성을 나타내며, 본원에서 "PRO1374"로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64849-1604)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1374 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 68 (서열 118)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 544의 서열을 갖는 PRO1374 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 67 (서열 117)의 핵산 잔기 약 78에서 약 1652까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1374 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203468호 (DNA64849-1604)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203468호 (DNA64849-1604)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 68 (서열 118)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 544의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 68 (서열 118)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 544의 서열을 갖는 PRO1374 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 68 (서열 118)의 잔기 20 내지 약 544의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1374 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1374 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 68 (서열 118)의 잔기 20 내지 544을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1374 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 68 (서열 118)의 아미노산 잔기 20 내지 약 544의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1374 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 68 (서열 118)의 잔기 20 내지 544의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1374 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 68 (서열 118)의 아미노산 잔기 20 내지 약 544의 서열을 포함하는 단리된 PRO1374 폴리펩티드, 또는 항-PRO1374 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1374 단편은 천연 PRO1374 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 68 (서열 118)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 544의 서열을 갖는 PRO1374 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1374 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1374 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1374 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1374 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1374 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

35. PRO1311

본 발명자들은 본원에서 "PRO1311"으로 지칭하는 신규 테트라스판 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64863-1573)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1311 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 70 (서열 123)의 아미노산 잔기 1또는 약 45 내지 약 294의 서열을 갖는 PRO1311 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 69 (서열 122)의 핵산 잔기 약 327에서 약 1076까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1311 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203251호 (DNA64863-1573)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203251호 (DNA64863-1573)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 70 (서열 123)의 아미노산 잔기 약 45 내지 약 294의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 70 (서열 123)의 아미노산 잔기 약 45 내지 약 294의 서열을 갖는 PRO1311 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1311 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 것)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 70 (서열 123)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 44까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다. 4개의 막횡단 도메인은 PRO1311 아미노산 서열 (도 70, 서열 123)에서 아미노산 위치 약 22부터 아미노산 위치 약 42, 아미노산 위치 약 57부터 아미노산 위치 약 85,아미노산 위치 약 94부터 아미노산 위치 약 116, 및 아미노산 위치 약 230부터 아미노산 위치 약 257까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 70 (서열 123)의 잔기 45 내지 약 294의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1311 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1311 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 70 (서열 123)의 잔기 45 내지 294을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1311 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 70 (서열 123)의 아미노산 잔기 45 내지 약 294의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1311 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 70 (서열 123)의 잔기 45 내지 294의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1311 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 70 (서열 123)의 아미노산 잔기 45 내지 약294의 서열을 포함하는 단리된 PRO1311 폴리펩티드, 또는 항-PRO1311 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1311 단편은 천연 PRO1311 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 70 (서열 123)의 아미노산 잔기 약 45 내지 약 294의 서열을 갖는 PRO1311 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

36. PRO1357

본 발명자들은 본 에브너 소 침샘 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성을 나타내며, 본원에서 "PRO1357"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64881-1602)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1357 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 72 (서열 128)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 22 내지 약 484의 서열을 갖는 PRO1357 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 71 (서열 127)의 뉴클레오티드 약 74 또는 약 137에서 약 1525까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1357 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203240호 (DNA64881-1602)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203240호 (DNA64881-1602)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 72 (서열 128)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 484와의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 72 (서열 128)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 484의의 서열을 갖는 PRO1357 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 40개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1357 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 72 (서열 128)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 21까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 72 (서열 128)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 484의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1357 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 71 (서열 127)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1357 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 72 (서열 128)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 484를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1357 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 72 (서열 128)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 484의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1357 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 72 (서열 128)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 484의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1357 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 72 (서열 128)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 484의 서열을 포함하는 단리된 PRO1357 폴리펩티드, 또는 항-PRO1357 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1357 단편은 천연 PRO1357 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 72 (서열 128)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 22 내지 약 484의 서열을 갖는 PRO1357 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1357 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1357 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1357 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1357 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1357 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

37. PRO1244

본 발명자들은 이식 관련 단백질과 상동성을 나타내며 본 원에서 "PRO1244"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64883-1526)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1244 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 74 (서열 130)의 아미노산 잔기 1 또는 약 30 내지 약 335의 서열을 갖는 PRO1244 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 73 (서열 129)의 핵산 잔기 약 96에서 약 1013까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1244 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203253호 (DNA64883-1526)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203253호 (DNA64883-1526)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 74 (서열 130)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 335의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 74 (서열 130)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 335의 서열을 갖는 PRO1244 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1244 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 것)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 74 (서열 130)의 서열에서아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 29까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1244 아미노산 서열에서 아미노산 위치 약 183부터 아미노산 위치 약 205까지,아미노산 위치 약 217부터 아미노산 위치 약 237까지,아미노산 위치 약 271부터 아미노산 위치 약 287까지, 및 아미노산 위치 약 301부터 아미노산 위치 약 321까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 74 (서열 130)의 잔기 30 내지 약 335의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1244 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1244 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 74 (서열 130)의 잔기 30 내지 335를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1244 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 74 (서열 130)의 아미노산 잔기 30 내지 약 335의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1244 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 74 (서열 130)의 잔기 30 내지 335의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1244 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 74 (서열 130)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 335의 서열을 갖는 PRO1244 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1244 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1244 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1244 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1244 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1244 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

38. PRO1246

본 발명자들은 골 관련 술파타제를 코딩하는 핵산과 상동성을 나타내며, 본원에서 "PRO1246"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64885-1529)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1246 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 76 (서열 132)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 16 내지 약 536의 서열을 갖는 PRO1246 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 75 (서열 131)의 뉴클레오티드 약 119 또는 약 164에서 약 1726까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1246 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203457호 (DNA64885-1529)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203457호 (DNA64885-1529)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 76 (서열 132)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 536의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 76 (서열 132)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 536의 서열을 갖는 PRO1246 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1246 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 76 (서열 132)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 16까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 76 (서열 132)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 536의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1246 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 75 (서열 131)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1246 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 76 (서열 132)의 잔기 1또는 약 16 내지 약 536을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1246 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 76 (서열 132)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 536의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1246 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 76 (서열 132)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 536의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1246 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 76 (서열 132)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 536의 서열을 포함하는 단리된 PRO1246 폴리펩티드, 또는 항-PRO1246 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1246 단편은 천연 PRO1246 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 76 (서열 132)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 16 내지 약 536의 서열을 갖는 PRO1246 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1246 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1246 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1246 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1246 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1246 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

39. PRO1356

본 발명자들은 클로스트리듐 퍼프링겐 엔테로톡신 수용체를 코딩하는 핵산과 상동성을 나타내며, 본원에서 "PRO1356"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64886-1601)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1356 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 78 (서열 134)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 25 내지 약 230의 서열을 갖는 PRO1356 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 77 (서열 133)의 뉴클레오티드 약 122 또는 약 194에서 약 811까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1356 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203241호 (DNA64886-1601)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203241호 (DNA64886-1601)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 78 (서열 134)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 230의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 78 (서열 134)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 230의 서열을 갖는 PRO1356 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 20개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1356 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 것)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 78 (서열 134)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 24까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1356 아미노산 서열 (도 78, 서열 134)에서 아미노산 위치 약 82부터 아미노산 위치 약 102까지,아미노산 위치 약 117부터 아미노산 위치 약 140까지,아미노산 위치 약 163부터 아미노산 위치 약 182까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 78 (서열 134)의 잔기 1 또는 약 25 내지 약 230의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1356 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고 도 77 (서열 133)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1356 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 78 (서열 134)의 잔기 1 또는 약 25 내지 약 230을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1356 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 78 (서열 134)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 230의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1356 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 78 (서열 134)의 잔기 1 또는 약 25 내지 약 230의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1356 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 78 (서열 134)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 230의 서열을 포함하는 단리된 PRO1356 폴리펩티드, 또는 항-PRO1356 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1356 단편은 천연 PRO1356 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 78 (서열 134)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 25 내지 약 230의 서열을 갖는 PRO1356 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1356 폴리펩티드의 아고니스트 및길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1383 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1356 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1383 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1356폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

40. PRO1275

본 발명자들은 원에서 "PRO1275"로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64888-1542)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1275 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 80 (서열 136)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 119의 서열을 갖는 PRO1275 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 79 (서열 135)의 핵산 잔기 약 112에서 약 393까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1275 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203249호 (DNA64888-1542)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203249호 (DNA64888-1542)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 80 (서열 136)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 119의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 80 (서열 136)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 119의 서열을 갖는 PRO1275 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 80 (서열 136)의 잔기 26 내지 약 119의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1275 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1275 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 80 (서열 136)의 잔기 26 내지 119을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1275 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 80 (서열 136)의 아미노산 잔기 26 내지 약 119의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1275 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 80 (서열 136)의 잔기 26 내지 약 119의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1275 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 80 (서열 136)의 아미노산 잔기 26 내지 약 119의 서열을 포함하는 단리된 PRO1275 폴리펩티드, 또는 항-PRO1275 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1275 단편은 천연 PRO1275 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 80 (서열 136)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 119의 서열을 갖는 PRO1275 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1275 폴리펩티드의 아고니스트 및길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1275 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1275 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1275 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1275 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

41. PRO1274

본 발명자들은 본원에서 "PRO1274"로 지칭하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64889-1541)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1274 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 82 (서열 138)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 110의 서열을 갖는 PRO1274 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 81 (서열 137)의 핵산 잔기 약 96에서 약 353까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1274 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203250호 (DNA64889-1541)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203250호 (DNA64889-1541)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 82 (서열 138)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 110의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 82 (서열 138)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 110의 서열을 갖는 PRO1274 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 82 (서열 138)의 잔기 25 내지 약 110의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1274 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1274 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 82 (서열 138)의 잔기 25 내지 110을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1274 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 82 (서열 138)의 아미노산 잔기 25 내지 약 110의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1274 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 82 (서열 138)의 잔기 25 내지 110의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1274 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 82 (서열 138)의 아미노산 잔기 25 내지 약 110의 서열을 포함하는 단리된 PRO1274 폴리펩티드, 또는 항-PRO1274 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1274 단편은 천연 PRO1274 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 82 (서열 138)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 110의 서열을 갖는 PRO1274 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1274 폴리펩티드의 아고니스트 및길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1274 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1274 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1274 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1274 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

42. PRO1412

본 발명자들은 본원에서 "PRO1412"로 지칭하는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64897-1628)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1412 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 84 (서열 140)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 311의 서열을 갖는 PRO1412 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 83 (서열 139)의 핵산 잔기 약 226에서 약 1074까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1412 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203216호 (DNA64897-1628)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203216호 (DNA64897-1628)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 84 (서열 140)의 아미노산 잔기 약 29 내지 약 311의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 84 (서열 140)의 아미노산 잔기 약 29 내지 약 311의 서열을 갖는 PRO1412 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1412 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 것)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 84 (서열 140)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 28까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1412 아미노산 서열 (도 84, 서열 140)에서 아미노산 위치 약 190부터 아미노산 위치 약 216까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 84 (서열 140)의 잔기 29 내지 약 311의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1412 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1412 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 84 (서열 140)의 잔기 29 내지 311을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1412 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 84 (서열 140)의 아미노산 잔기 29 내지 약 311의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1412 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 84 (서열 140)의 잔기 29 내지 311의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1412 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 84 (서열 140)의 아미노산 잔기 29 내지 약 311의 서열을 포함하는 단리된 PRO1412 폴리펩티드, 또는 항-PRO1412 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1412 단편은 천연 PRO1412 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 84 (서열 140)의 아미노산잔기 약 29 내지 약 311의 서열을 갖는 PRO1412 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

43. PRO1557

본 발명자들은 코르딘과 상동성을 나타내며, 본원에서 "PRO1557"으로 지칭하는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64902-1667)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1557 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 86 (서열 142)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 451의 서열을 갖는 PRO1557 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 85 (서열 141)의 핵산 잔기 약 362에서 약 1639까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1557 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203317호 (DNA64902-1667)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 및 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체 중 하나와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203317호 (DNA64902-1667)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 86 (서열 142)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 451의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 86 (서열 142)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 451의 서열을 갖는 PRO1557 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1557 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자에 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 서열은 도 86 (서열 142)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 25까지 걸쳐있는 서열로서 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 86 (서열 142)의 잔기 26 내지 약 451의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1557 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1557 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 86 (서열 142)의 잔기 26내지 451을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1557 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 86 (서열 142)의 아미노산 잔기 26 내지 약 451의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1557 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 86 (서열 142)의 잔기 26 내지 451의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1557 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 86 (서열 142)의 아미노산 잔기 26 내지 약 451의 서열을 포함하는 단리된 PRO1557 폴리펩티드, 또는 항-PRO1557 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1557 단편은 천연 PRO1557 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 86 (서열 142)의 아미노산 잔기 약 26 내지 약 451의 서열을 갖는 PRO1557 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1557 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1557 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1557 폴리펩티드를 후보 물질과 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1557 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1557 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

44. PRO1286

본원에서 "PRO1286"으로 지칭되는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64903-1553)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1286 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 88 (서열 144)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 93의 서열을 갖는 PRO1286 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 87 (서열 143)의 잔기 약 147과 약 371 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1286 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203223 (DNA64903-1553)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203223 (DNA64903-1553)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 88 (서열 144)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 93의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하기로는 약 100 개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 88 (서열 144)의 아미노산 잔기 약 19 내지약 93의 서열을 갖는 PRO1286 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1286 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 88 (서열 144)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 18번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 88 (서열 144)의 잔기 19 내지 약 93의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1286 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1286 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 88 (서열 144)의 잔기 19 내지 93의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1286 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 88 (서열 144)의 아미노산 잔기 19 내지 약 93의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1286 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 88 (서열 144)의 아미노산 잔기 19 내지 약 93의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1286 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 88 (서열 144)의 아미노산 잔기 19 내지 약 93의 서열을 포함하는 단리된 PRO1286 폴리펩티드, 또는 항-PRO1286 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1286 단편은 천연 PRO1286 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 88 (서열 144)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 93의 서열을 갖는 PRO1286 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a)또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

45. PRO1294

올팍토메딘을 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1294"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64905-1558)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1294 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 90 (서열 145)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 22 내지 약 406의 서열을 갖는 PRO1294 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 89 (서열 145)의 뉴클레오티드 110 또는 약 173과 약 1327 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1294 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203233 (DNA64905-1558)의인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 핵산 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203233 (DNA64903-1558)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 90 (서열 146)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 406의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 10개 이상 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 90 (서열 146)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 406의 서열을 갖는 PRO1294 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1294 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 90 (서열 146)의 서열에서 아미노산 약 1번 내지 약 21번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 90 (서열 146)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 406의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1294 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 89 (서열 145)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1294 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 90 (서열 146)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 406의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1294 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 90 (서열 146)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 406의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1294 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 90 (서열 146)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 406의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1294 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 90 (서열 146)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 406의 서열을 포함하는 단리된 PRO1294 폴리펩티드, 또는 항-PRO1294 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1294 단편은 천연 PRO1294 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 90 (서열 146)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 22 내지 약 406의 서열을 갖는 PRO1294 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1294 폴리펩티드의 아고니스트 및길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1294 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1294 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO1294 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1294 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다

46. PRO1347

본원에서 부티로필린과 상동성이 있으며, "PRO1347"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64950-1590)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1347 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 92 (서열 148)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 500의 서열을 갖는 PRO1347 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 91 (서열 147)의 뉴클레오티드 약 234 내지 약 1682 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1347 폴리펩티드를코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203224 (DNA64950-1590)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203224 (DNA64950-1590)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 92 (서열 148)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 500의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 92 (서열 148)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 500의 서열을 갖는 PRO1347 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1347 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실(또는 말단이 잘림)되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 92 (서열 148)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 17번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1347 아미노산 서열 (도 92, 서열 148)에서 아미노산 약 239번 내지 약 255번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 92 (서열 148)의 잔기 18 내지 약 500의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1347 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1347 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 92 (서열 148)의 잔기 18 내지 500의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1347 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 92 (서열 148)의 아미노산 잔기 18 내지 약 500의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1347 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 92 (서열 148)의 아미노산 잔기 18 내지 500의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1347 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 92 (서열 148)의 아미노산 잔기 18 내지 약 500의 서열을 포함하는 단리된 PRO1347 폴리펩티드, 또는 항-PRO1286 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1286 단편은 천연 PRO1347 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 92 (서열 148)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 500의 서열을 갖는 PRO1347 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가(a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1347 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1347 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1347 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1347 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1347 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

47. PRO1305

본원에서 "PRO1305"로 지칭되는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA64952-1568)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1305 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 94 (서열 153)의 아미노산 잔기 약 1또는 약 26 내지 약 258의 서열을 갖는 PRO1305 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 93 (서열 152)의 뉴클레오티드 약 126 또는 약 201과 약 899 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1305 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203222 (DNA64952-1568)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203222 (DNA64952-1568)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 94 (서열 15 3)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 258의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 10개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 94 (서열 153)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 258의 서열을 갖는 PRO1305 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1305 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 94 (서열 153)의 서열에서 아미노산 약 1번 내지 약 25번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 94 (서열 153)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 258의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1305 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 93 (서열 152)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1305 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 94 (서열 153)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 258의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1305 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 94 (서열 153)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 258의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1305 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 94 (서열 153)의 아미노산 잔기 1 내지 약 26 내지 약 258의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1305 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 94 (서열 153)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 258의 서열을 포함하는 단리된 PRO1305 폴리펩티드, 또는 항-PRO1305 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1305 단편은 천연 PRO1305 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 94 (서열 153)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 26 내지 약 259의 서열을 갖는 PRO1305 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

48. PRO1273

리포칼린과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1273"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65402-1540)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1273 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 96 (서열 158)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 163의 서열을 갖는 PRO1273 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 95 (서열 157)의 뉴클레오티드 약 86 내지 약 514 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1273 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203252 (DNA65402-1540)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203252 (DNA65402-1540)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 96 (서열 158)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 163의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 96 (서열 158)의 아미노산 잔기 약 21 또는 약 163의 서열을 갖는 PRO1273 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 96 (서열 158)의 잔기 21 내지 약 163의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1273 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1273 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 96 (서열 158)의 잔기 21 내지 163의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1273 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 96 (서열 158)의 아미노산 잔기 21 내지 약 163의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1273 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 96 (서열 158)의 아미노산 잔기 1 내지 163의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1273 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 96 (서열 158)의 아미노산 잔기 21 내지 약 163의 서열을 포함하는 단리된 PRO1273 폴리펩티드, 또는 항-PRO1273 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1273 단편은 천연 PRO1273 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 96 (서열 158)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 163의 서열을 갖는 PRO1273 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1273 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1273 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1273 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1273 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1273 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

49. PRO1302

CD33과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1302"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65403-1565)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1302 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 98 (서열 160)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 463의 서열을 갖는 PRO1302 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 97 (서열 159)의 잔기 약 88 내지 약 1431 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1302 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203230 (DNA65403-1565)의인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203230 (DNA65403-1565)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 98 (서열 160)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 463의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 98 (서열 160)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 463의 서열을 갖는 PRO1302 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1302 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단도메인이 결실(또는 말단이 잘린 형태)되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자,또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 98 (서열 160)의 서열에서 아미노산 1번 내지 15번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1302 아미노산 서열 (도 98, 서열 160)에서 아미노산 약 351번 내지 약 370번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 98 (서열 160)의 잔기 16 내지 약 463의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1302 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1302 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 98 (서열 160)의 잔기 16 내지 463의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1302 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 98 (서열 160)의 아미노산 잔기 16 내지 약 463의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1302 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 98 (서열 160)의 아미노산 잔기 16 내지 463의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1302 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 98 (서열 160)의 아미노산 잔기 16 내지 약 463의 서열을 포함하는 단리된 PRO1302 폴리펩티드, 또는 항-PRO1302 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1302 단편은 천연 PRO1302 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 98 (서열 160)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 463의 서열을 갖는 PRO1302 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1302 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1302 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1302 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1302 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1302 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

50. PRO1283

오도란트 결합 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1283"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65404-1551)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1283 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 100 (서열 162)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 18 내지 약 170의 서열을 갖는 PRO1283 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 99 (서열 161)의 뉴클레오티드 약 45 또는 약 96과 554 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1283 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203244 (DNA65404-1551)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203244 (DNA65404-1551)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 100 (서열 162)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 170의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 10개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 100 (서열 162)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 170의 서열을 갖는PRO1273 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1283 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 100 (서열 162)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 17번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 100 (서열 162)의 잔기 1 또는 약 18 내지 약 170의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1283 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1283 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 100 (서열 162)의 잔기 1 또는 약 18 내지 약 170의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1283 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 100 (서열 162)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 170의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1283 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 100 (서열 162)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 170의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1283 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 100 (서열 162)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 170의 서열을 포함하는 단리된 PRO1283 폴리펩티드, 또는 항-PRO1273 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1283 단편은 천연 PRO1283 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 100 (서열 162)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 18 내지 약 170의 서열을 갖는 PRO1283 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고,시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1283 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1283 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1283 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1283 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1283 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

51. PRO1279

뉴로스핀을 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1279"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65405-1547)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1279 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 102 (서열 170)의 아미노산 잔기 약1 또는 약 19 내지 약 250의 서열을 갖는 PRO1279 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 101 (서열 169)의 뉴클레오티드 약 106 또는 약 160과 약 855 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1279 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203476 (DNA65405-1547)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203476 (DNA65405-1547)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 102 (서열 167)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 250의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 100개 이상이 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 102 (서열 170)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 250의 서열을 갖는 PRO1279 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1279 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 102 (서열 170)의 서열에서 아미노산 약 1번 내지 약 18번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 102 (서열 170)의 잔기 1 또는 약 19 내지 약 250의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1279 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 101 (서열 169)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1279 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 102 (서열 170)의 잔기 1 또는 약 19 내지 약 250의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1279 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 102 (서열 170)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 250의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1279 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 102 (서열 170)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 250의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1279 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 102 (서열 170)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 250의 서열을 포함하는 단리된 PRO1279 폴리펩티드, 또는 항-PRO1279 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1279 단편은 천연 PRO1279 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 102 (서열 170)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 19 내지 약 250의 서열을 갖는 PRO1279 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1279 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1279 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1279 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1279 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1279 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

52. PRO1304

FK506 결합 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1304"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65406-1567)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1304 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 104 (서열 180)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 222의 서열을 갖는 PRO1304 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 103 (서열 179)의 뉴클레오티드 약 23과 약 688 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1304 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203219 (DNA65406-1567)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203219 (DNA65406-1567)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 104 (서열 180)의 아미노산 잔기 1 내지 약 222의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 10개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 104 (서열 180)의 아미노산 잔기 1 또는 약 222의 서열을 갖는 PRO1304 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1304 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 104 (서열 180)의 잔기 1 내지 약 222의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1304 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 103 (서열 179)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다..

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO104 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 104 (서열 180)의 잔기 1 내지 약 222의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1304 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 104 (서열 180)의 아미노산 잔기 1 내지 약 222의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1304 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 104 (서열 180)의 아미노산 잔기 1 내지 약 222의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1304 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 104 (서열 180)의 아미노산 잔기 1 내지 약 222의 서열을 포함하는 단리된 PRO1304 폴리펩티드, 또는 항-PRO1304 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1304 단편은 천연 PRO1304 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 104 (서열 180)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 222의 서열을 갖는 PRO1304 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1304 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1304 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1304 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1304 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1304 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

53. PRO1317

인간 CD97과 상동성을 공유하는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65408-1578)을 확인하였다. 이 신규 폴리펩티드는 본원에서 "PRO1317"로 지칭하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 106 (서열 189)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 74의 서열을 갖는 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 105 (서열 188)의 뉴클레오티드 약 60과 약 227 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203217 (DNA65408-1578)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203217 (DNA65408-1578)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 104 (서열 180)의 아미노산 잔기 약 19내지 약 74의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 106 (서열 189)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 74의 서열을 갖는 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1317 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 106 (서열 189)의 서열에서 아미노산 약 1번 내지 약 18번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 106 (서열 189)의 잔기 19 내지 약 74의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1317 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1317 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 106 (서열 189)의 잔기 19 내지 74의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1317 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 106 (서열 189)의 아미노산 잔기 19 내지 약 74의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1317 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 106 (서열 189)의 아미노산 잔기 19 내지 74의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1317 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 106 (서열 189)의 아미노산 잔기 19 내지 약 74의 서열을 포함하는 단리된 PRO1317 폴리펩티드, 또는 항-PRO1317 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1317 단편은 천연 PRO1317 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 106 (서열 189)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 74의 서열을 갖는 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

54. PRO1303

뉴롭신을 비롯한 프로테아제와 서열 동일성이 있으며, 본원에서 "PRO1303"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65409-1566)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1303 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 108 (서열 194)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 248의 서열을 갖는 PRO1303 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 107 (서열 193)의 잔기 약 172과 약 864 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1303 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203232 (DNA65409-1566)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203232 (DNA65409-1566)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 108 (서열 194)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 248의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 108 (서열 194)의 아미노산 잔기 약 18 또는약 248의 서열을 갖는 PRO1303 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 108 (서열 194)의 잔기 18 내지 약 248의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1303 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1303 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 108 (서열 194)의 잔기 18 내지 248의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1303 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 108 (서열 194)의 아미노산 잔기 18 내지 약 248의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1303 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 108 (서열 194)의 아미노산 잔기 18 내지 약 248의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1303 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 108 (서열 194)의 아미노산 잔기 18 내지 약 248의 서열을 포함하는 단리된 PRO1303 폴리펩티드, 또는 항-PRO1303 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1303 단편은 천연 PRO1303 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 108 (서열 194)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 248의 서열을 갖는 PRO1303 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1303 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1303 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1303 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1303 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1303 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

55. PRO1306

본원에서 AIF/다인타인과 상동성이 있으며, "PRO1306"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65410-1569)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1306 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 110 (서열 196)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 150의 서열을 갖는 PRO1306 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 109 (서열 195)의 잔기 약 106과 약 555 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1306 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203231 (DNA65410-1569)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203231 (DNA65410-1569)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 110 (서열 196)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 150의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 110 (서열 196)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 150의 서열을 갖는 PRO1306 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a)또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 110 (서열 196)의 잔기 1 내지 약 150의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1306 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1306 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 110 (서열 196)의 잔기 1 내지 150의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1306 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 110 (서열 196)의 아미노산 잔기 1 내지 약 150의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1306 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 110 (서열 196)의 아미노산 잔기 약 1 내지 150의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1306 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 110 (서열 196)의 아미노산 잔기 1 내지 약 150의 서열을 포함하는 단리된 PRO1306 폴리펩티드, 또는 항-PRO1306 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1306 단편은 천연 PRO1306 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 110 (서열 196)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 150의 서열을 갖는 PRO1306 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1306 폴리펩티드의 아고니스트 및길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1306 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1306 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1306 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1306 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

56. PRO1336

슬릿트와 서열 동일성이 있으며, 본원에서 "PRO1336"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA65423-1595)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1336 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 112 (서열 198)의 아미노산 잔기 1 내지 약 28 내지 약 1523의 서열을 갖는 PRO1336 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 111A-B (서열 197)의 잔기 약 164과 약 4651 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1336 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203227 (DNA65423-1595)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203227 (DNA65423-1595)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 112 (서열 198)의 아미노산 잔기 약 28 내지 약 1523의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 112 (서열 198)의 아미노산 잔기 약 28 내지 약 1523의 서열을 갖는 PRO1336 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 112 (서열 198)의 잔기 28 내지 약 1523의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1336 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1336 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 112 (서열 198)의 잔기 28 내지 1523의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1336 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 112 (서열 198)의 아미노산 잔기 28 내지 약 1523의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1336 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 112 (서열 198)의 아미노산 잔기 28 내지 1523의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1336 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 112 (서열 198)의 아미노산 잔기 28 내지 약 1523의 서열을 포함하는 단리된 PRO1336 폴리펩티드, 또는 항-PRO1336 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1336 단편은 천연 PRO1336 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 112 (서열 198)의 아미노산 잔기 약 28 내지 약 1523의 서열을 갖는 PRO1336 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1336 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1336 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1336 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1336 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1336 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

57. PRO1278

라이소자임 C와 서열 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1278"로 지칭되는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66304-1546)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1278 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 114 (서열 203)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1278 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 113 (서열 202)의 잔기 198과 584 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1278 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203321 (DNA66304-1546)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203321 (DNA66304-1546)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 114 (서열 203)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 148의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 114 (서열 203)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1278 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을포함하거나 포함하지 않는 PRO1278 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 114 (서열 203)의 서열에서 아미노산 약 1번 내지 약 19번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 114 (서열 203)의 잔기 20 내지 약 148의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1278 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1278 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 114 (서열 203)의 잔기 20 내지 148의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1278 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 114 (서열 203)의 아미노산 잔기 20 내지 약 148의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1278 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 114 (서열 203)의 아미노산 잔기 20 내지 148의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1278 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 114 (서열 203)의 아미노산 잔기 20 내지 약 148의 서열을 포함하는 단리된 PRO1278 폴리펩티드, 또는 항-PRO1278 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1278 단편은 천연 PRO1278 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 114 (서열 203)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1278 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1278 폴리펩티드의 아고니스트 및길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1278 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1278 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1278 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1278 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

58. PRO1298

글리코실트랜스퍼라제와 서열 동일성이 있으며, 본원에서 "PRO1298"로 지칭되는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66511-1563)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1298 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 116 (서열 210)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 323의 서열을 갖는 PRO1298 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 115 (서열 209)의 뉴클레오티드 약 139와 약 1062 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1298 폴리펩티드를코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203228 (DNA66511-1563)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203228 (DNA66511-1563)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 1164 (서열 210)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 323의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 116 (서열 210)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 323의 서열을 갖는 PRO1298 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 116 (서열 210)의 잔기 16 내지 약 323의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1298 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1298 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 116 (서열 210)의 잔기 16 내지 323의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1298 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 116 (서열 210)의 아미노산 잔기 16 내지 약 323의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1298 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 116 (서열 210)의 아미노산 잔기 16 내지 323의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1298 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 116 (서열 210)의 아미노산 잔기 16 내지 약 323의 서열을 포함하는 단리된 PRO1298 폴리펩티드, 또는 항-PRO1298 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게, PRO1298 단편은 천연 PRO1298 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 116 (서열 210)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 323의 서열을 갖는 PRO1298 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1298 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1298 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1298 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1298 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1298 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

59. PRO1301

시토크롬 P450과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1301"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66512-1564)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1301 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 118 (서열 212)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 462의 서열을 갖는 PRO1301 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 117 (서열 211)의 잔기 97과 약 1428 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1301 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203218 (DNA66512-1564)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203218 (DNA66512-1564)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 118 (서열 212)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 462의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 118 (서열 212)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 462의 서열을 갖는 PRO1301 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을포함하거나 포함하지 않는 PRO1301 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 118 (서열 212)의 서열에서 아미노산 약 271번 내지 약 290번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 118 (서열 212)의 잔기 19 내지 약 462의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1301 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1301 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 118 (서열 212)의 잔기 19 내지 462의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1301 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 118 (서열 212)의 아미노산 잔기 19 내지 약 462의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1301 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 118 (서열 212)의 아미노산 잔기 19 내지 462의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1301 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 118 (서열 212)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 462의 서열을 포함하는 단리된 PRO1301 폴리펩티드, 또는 항-PRO1301 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1301 단편은 천연 PRO1301 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 118 (서열 212)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 462의 서열을 갖는 PRO1301 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기폴리펩티드를 제공한다.

60. PRO1268

본원에서 "PRO1268"로 지칭되는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66519-1535)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1268 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 120 (서열 214)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 140의 서열을 갖는 PRO1268 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 119 (서열 213)의 잔기 89와 약 508 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1268 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203236 (DNA66519-1535)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서,이 핵산은 ATCC 기탁번호 203236 (DNA66519-1535)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 120 (서열 214)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 140의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 120 (서열 214)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 140의 서열을 갖는 PRO1268 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 결실되거나 불활성화된 1종 이상의 가용성 핵산을 갖는 PRO1268 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 그러한 코딩화 핵산 분자에 상보적인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다. 막횡단 도메인은 PRO1268 아미노산 서열(도 120, 서열 214)에서 아미노산 약 12 내지 28(타입 Ⅱ), 51 내지 66 및 107 내지 124에서 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 120 (서열 214)의 잔기 1 내지 약 140의아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1268 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1268 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 120 (서열 214)의 잔기 1 내지 140의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1268 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 120 (서열 214)의 아미노산 잔기 1 내지 약 140의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1268 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 120 (서열 214)의 아미노산 잔기 1 내지 약 140의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1268 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 120 (서열 214)의 아미노산 잔기 1 내지 약 140 서열을 포함하는 단리된 PRO1268 폴리펩티드, 또는 항-PRO1268 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1268 단편은 천연 PRO1268 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 120 (서열 214)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 140의 서열을 갖는 PRO1268 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

61. PRO1269

그래뉼로사이트 펩티드 A와 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1269"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66520-1536)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1269 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 122 (서열 216)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 196의 서열을 갖는 PRO1269 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 121 (서열 215)의 잔기 약 86과 약 613 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1269 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203226 (DNA66520-1536)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203226 (DNA66520-1536)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 122 (서열 216)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 196의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 122 (서열 216)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 196의 서열을 갖는 PRO1269 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1269 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 122 (서열 216)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 20번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 122 (서열 216)의 잔기 21 내지 약 196의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1269 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1269 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 122 (서열 216)의 잔기 21 내지 196의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1269 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 122 (서열 216)의 아미노산 잔기 21 내지 약 196의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1269 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 122 (서열 216)의 아미노산 잔기 21 내지 196의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1269 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 122 (서열 216)의 아미노산 잔기 21 내지 약 196의 서열을 포함하는 단리된 PRO842 폴리펩티드, 또는 항-PRO842 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게, PRO1269 단편은 천연 PRO1269 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 122 (서열 216)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 196의 서열을 갖는 PRO1269 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상이라면, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1269 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1269 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1269 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1269 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1269 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

62. PRO1327

뉴렉소필린을 코딩하는 핵산과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1327"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66521-1583)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1327 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 124 (서열 218)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 15 내지 약 252의 서열을 갖는 PRO1327 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 123 (서열 217)의 뉴클레오티드 약 55 또는 약 97과 약 810 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1327 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203225 (DNA66521-1583)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203225 (DNA66521-1583)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 124 (서열 218)의 아미노산 잔기 1 또는 약 15와 약 252 사이의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 260개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 124 (서열 218)의 아미노산 잔기 1 또는 약 15 내지 약 252의 서열을 갖는 PRO1327 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1327 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 124 (서열 218)의 서열에서 아미노산 약 1번 내지 약 14번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 124 (서열 218)의 잔기 1 또는 약 15 내지 약 252의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1327 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 123 (서열 217)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1327 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 124 (서열 218)의 잔기 1 또는 약 15 내지 약 252의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1327 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 124 (서열 218)의 아미노산 잔기 1 또는 약 15 내지 약 252의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1327 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 124 (서열 218)의 아미노산 잔기 1 또는 약 15 내지 약 252의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1327 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 124 (서열 218)의 아미노산 잔기 1 또는 약 15 내지 약 252 서열을 포함하는 단리된 PRO1327 폴리펩티드, 또는 항-PRO1327 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1237 단편은 천연 PRO1327 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 124 (서열 218)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 15 내지 약 252의 서열을 갖는 PRO1327 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1327 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1327 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1327 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1327 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1327 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

63. PRO1382

세레벨렌과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1382"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66526-1616)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1382 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 126 (서열 220)의 아미노산 잔기 1 또는 약 28 내지 약 201의 서열을 갖는 PRO1382 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 125 (서열 219)의 잔기 약 418과 약 939 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1382 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203246 (DNA66526-1616)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서,이 핵산은 ATCC 기탁번호 203246 (DNA66526-1616)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 126 (서열 220)의 아미노산 잔기 약 28 내지 약 201의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 126 (서열 220)의 아미노산 잔기 약 28 내지 약 201의 서열을 갖는 PRO1382 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1382 폴리펩티드 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 126 (서열 220)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 27번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 126 (서열 220)의 잔기 28 내지 약 201의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1382 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1382 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 126 (서열 220)의 잔기 28 내지 201의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1382 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 126 (서열 220)의 아미노산 잔기 28 내지 약 201의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1382 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 126 (서열 220)의 아미노산 잔기 28 내지 201의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 %이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1382 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 도 126 (서열 220)의 아미노산 잔기 28 내지 약 201의 서열을 포함하는 단리된 PRO1382 폴리펩티드, 또는 항-PRO1382 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1382 단편은 천연 PRO1382 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 126 (서열 220)의 아미노산 잔기 약 28 내지 약 201의 서열을 갖는 PRO1382 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1382 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1382 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1382 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1382 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1382 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

64. PRO1328

본원에서 "PRO1328"로 지칭되는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66658-1584)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1328 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 128 (서열 225)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 20 내지 약 257의 서열을 갖는 PRO1328 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 127 (서열 224)의 뉴클레오티드 9 또는 약 66 과 약 779 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1328 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203229 (DNA66658-1584)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203229 (DNA66658-1584)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 128 (서열 225)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 257의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 475개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 128 (서열 2254)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 257의 서열을 갖는 PRO1328 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1328 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 128 (서열 225)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 19번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1328 아미노산 서열 (도 128, 서열 225)에서 아미노산 약 32번 내지 약 51번, 아미노산 약 119번 내지 약 138번, 아미노산 약 152번 내지 약 169번, 아미노산 약 216번 내지 약 235번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 128 (서열 225)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약 257의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1328 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 127 (서열 224)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1328 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 128 (서열 225)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약 257의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1328 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 128 (서열 225)의 아미노산 잔기 1 내지 약 20 내지 약 257의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1328 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 128 (서열 225)의 아미노산 잔기 1 내지 약 20 내지 약 257의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1328 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 128 (서열 225)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 257 서열을 포함하는 단리된 PRO1328 폴리펩티드, 또는 항-PRO1328 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1328 단편은 천연 PRO1328 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 128 (서열 225)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 20 내지 약 257의 서열을 갖는 PRO1328 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

65. PRO1325

본원에서 "PRO1325"로 지칭되는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66659-1593)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1325 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 130 (서열 227)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 19 내지 약 832의 서열을 갖는 PRO1325 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 129 (서열 226)의 뉴클레오티드 51 또는 약 105과 약 2546 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1325 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203269 (DNA66659-1593)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서,이 핵산은 ATCC 기탁번호 203269 (DNA66659-1593)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 130 (서열 227)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 832의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 130 (서열 227)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 832의 서열을 갖는 PRO1325 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1325 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 130 (서열 227)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 18번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1325 아미노산 서열 (도 130, 서열 227)에서아미노산 약 292번 내지 약 317번, 아미노산 약 451번 내지 약 470번, 아미노산 약 501번 내지 약 520번, 아미노산 약 607번 내지 약 627번 및 약 751번 내지 약 770번 까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 130 (서열 227)의 잔기 1 또는 약 19 내지 약 832의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1325 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 129 (서열 226)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1325 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 130 (서열 227)의 잔기 1 또는 약 19 내지 832의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1325 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 130 (서열 227)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 832의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상,더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1325 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 130 (서열 227)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 832의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1325 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 130 (서열 227)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 832 서열을 포함하는 단리된 PRO1325 폴리펩티드, 또는 항-PRO1325 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1325 단편은 천연 PRO1325 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 130 (서열 227)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 19 내지 약 832의 서열을 갖는 PRO1325 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

66. PRO1340

Ksp-카드헤린과 상동성이 있으며, 본원에서 "PRO1340"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66663-1598)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1340 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 132 (서열 229)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 807의 서열을 갖는 PRO1340 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 131 (서열 228)의 잔기 약 182 내지 약 2548의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1340 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203268 (DNA66663-1598)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203268 (DNA66663-1598)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 132 (서열 229)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 807의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 132 (서열 229)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 807의 서열을 갖는 PRO1340 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 포함하거나 포함하지 않는 PRO1340 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 132 (서열 229)의 서열에서 아미노산 1번 내지 약 18번까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1340 아미노산 서열 (도 132, 서열 229)에서 아미노산 약 762번 내지 약 784번 까지에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 132 (서열 229)의 잔기 19 내지 약 807의아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1340 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1340 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 132 (서열 229)의 잔기 19 내지 807의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1340 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 132 (서열 229)의 아미노산 잔기 19 내지 약 807의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1340 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 132 (서열 229)의 아미노산 잔기 19 내지 807의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1340 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 132 (서열 229)의 아미노산 잔기 19 내지 약 807의 서열을 포함하는 단리된 PRO1340 폴리펩티드, 또는 항-PRO1340 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1340 단편은 천연 PRO1340 폴리펩티드의 정성의 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 132 (서열 229)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 807의 서열을 갖는 PRO1340 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1340 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1340 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1340 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO1340 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1340 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

67. PRO1339

카르복시펩시다제와 서열 동일성이 있으며, 본원에서 "PRO1339"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66669-1597)을 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1339 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 134 (서열 234)의 아미노산 잔기 1 또는 약 17 내지 약 421의 서열을 갖는 PRO1339 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 133 (서열 233)의 잔기 58과 약 127 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는, PRO1339 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건 및 세척 조건에서 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 203272 (DNA66669-1597)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 203272 (DNA66669-1597)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 134 (서열 234)의 아미노산 잔기 약 17 내지 약 421의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상의 뉴클레오티드로 이루어지고, (a) 도 134 (서열 234)의 아미노산 잔기 약 17 내지 약 421의 서열을 갖는 PRO1339 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건하에서 시험 DNA 분자를 혼성화시키고, 상기 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우에 시험 DNA 분자의 단리에 의해 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 134 (서열 234)의 잔기 17 내지 약 421의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA, 또는 (b) DNA (a)의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 유용할 수 있는, PRO1339 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드이고, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 본원의 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1339 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 134 (서열 234)의 잔기 17 내지 421의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1339 폴리펩티드를 제공한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 134 (서열 234)의 아미노산 잔기 17 내지 약 421의 서열과의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1339 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 134 (서열 234)의 아미노산 잔기 17 내지 421의 아미노산 서열과 비교할 때, 약 80 % 이상의 양성, 바람직하게는 약 85 % 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1339 폴리펩티드에관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 134 (서열 234)의 아미노산 잔기 17 내지 약 421의 서열을 포함하는 단리된 PRO1339 폴리펩티드, 또는 항-PRO839 항체에 대한 결합 부위를 충분히 제공하는 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게, PRO1339 단편은 천연 PRO1339 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA를 (a) 도 134 (서열 234)의 아미노산 잔기 약 17 내지 약 421의 서열을 갖는 PRO1339 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) DNA 분자 (a)의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 시험 DNA가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 85 % 이상, 더욱 바람직하게는 약 90 % 이상, 가장 바람직하게는 약 95 % 이상인 경우, (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 상기 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1339 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1339 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1339 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰하는, 천연 PRO 1339 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1339 폴리펩티드, 또는 앞서 정의된 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약상 허용가능한 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

68.PRO1337

본 발명자들은 본원에서 "PRO1337"로 지칭되는 신규 인간 티록신 결합 글로불린에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66672-1586)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1337 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 136 (서열 236)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 417의 서열을 갖는 PRO1337 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 135 (서열 235)의 잔기 약 120 내지 약 1310의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1337 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203265호 (DNA66672-66672)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203265호 (DNA66672-66672)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 136 (서열 236)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 417의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 136 (서열 236)의 아미노산 잔기 21 내지 약 417의 서열을 갖는 PRO1337 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 136 (서열 236)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 20까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 136 (서열 236)의 잔기 21 내지 약 417의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1337 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1337 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 136 (서열 236)의 잔기 21 내지 417을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1337 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 136 (서열 236)의 아미노산 잔기 21 내지 약 417의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1337 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 136 (서열 236)의 잔기 21 내지 417의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1337 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 136 (서열 236)의 아미노산 잔기 21 내지 약 417의 서열을 포함하는 단리된 PRO1337 폴리펩티드, 또는 항-PRO1337 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1337 단편은 천연 PRO1337 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 136 (서열 236)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 417의 서열을 갖는 PRO1337 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1337 폴리펩티드의 아고니스트 및길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1337 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1337 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1487 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1337 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

69.PRO1342

본 발명자들은 본원에서 "PRO1342"로 지칭되는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66672-1586)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1342 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 138 (서열 243)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 596의 서열을 갖는 PRO1342 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 137 (서열 242)의 잔기 약 299 내지 약 2026의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1342 폴리펩티드를 코딩하는단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203281호 (DNA66674-1599)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203281호 (DNA66674-1599)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 138 (서열 243)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 596의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 138 (서열 243)의 아미노산 잔기 21 내지 약 596의 서열을 갖는 PRO1342 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1342 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화됨)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 138 (서열 243)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 20까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1342 아미노산 서열 (도 138, 서열 243)에서 아미노산 위치 약 510부터 아미노산 위치 약 532까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 138 (서열 243)의 잔기 21 내지 약 596의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1342 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1342 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 138 (서열 243)의 잔기 21 내지 596을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1342 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 138 (서열 243)의 아미노산 잔기 21 내지 약 596의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1342 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 138 (서열 243)의 잔기 21 내지 596의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1342 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 138 (서열 243)의 아미노산 잔기 21 내지 약 596의 서열을 포함하는 단리된 PRO1342 폴리펩티드, 또는 항-PRO1342 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1342 단편은 천연 PRO1342 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 138 (서열 243)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 596의 서열을 갖는 PRO1342 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

70.PRO1343

본 발명자들은 본원에서 "PRO1343"으로 지칭되는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66675-1587)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1343 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 140 (서열 248)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 26 내지 약 247의 서열을 갖는 PRO1343 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 139 (서열 247)의 잔기 약 71 또는 약 146 내지 약 811의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1343 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203282호 (DNA66675-1587)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203282호 (DNA66675-1587)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 140 (서열 248)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 247의 서열 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 140 (서열 248)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 247의 서열을 갖는 PRO1343 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1343 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 140 (서열 248)에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 25까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 140 (서열 248)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 247의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1343 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며 도 139 (서열 247)에서 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1343 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 140 (서열 248)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 247을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1343 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 140 (서열 248)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 247의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1343 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 140 (서열 248)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 247의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1343 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 140 (서열 248)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 247의 서열을 포함하는 단리된 PRO1343 폴리펩티드, 또는 항-PRO1343 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1343 단편은 천연 PRO1343 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 140 (서열 248)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 247의 서열을 갖는 PRO1343 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

71.PRO1480

본 발명자들은 본원에서 "PRO1480"으로 지칭되는 신규 세마포린 C에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA67962-1649)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1480 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 142 (서열 253)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 837의 서열을 갖는 PRO1480 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 141 (서열 252)의 잔기 약 241 내지 약 2751의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1480 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203291호 (DNA67962-1649)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203291호 (DNA67962-1649)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 142 (서열 253)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 837의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 142 (서열 253)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 837의 서열을 갖는 PRO1480 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화됨)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 막횡단 도메인은 PRO1480 아미노산 서열(도 142, 서열 253)에서 아미노산 위치 약 23부터 아미노산 위치 약 46 (타입 II)까지 및 아미노산 위치 약 718부터 아미노산 위치 약 738까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 142 (서열 253)의 잔기 1 내지 약 837의 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1480 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1480 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 142 (서열 253)의 잔기 1 내지 837을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1480 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 142 (서열 253)의 아미노산 잔기 1 내지 약 837의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1480 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 142 (서열 253)의 잔기 1 내지 약 837의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1480 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 142 (서열 253)의 아미노산 잔기 1 내지 약 837의 서열을 포함하는 단리된 PRO1480 폴리펩티드, 또는 항-PRO1480 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1480 단편은 천연 PRO1480 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 142 (서열 253)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 837의 서열을 갖는 PRO1480 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1480 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1480 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1480 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1480 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1480 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

72.PRO1487

본 발명자들은 본원에서 "PRO1487"로 지칭되는 신규 인간 티록신 결합 글로불린에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA68836-1656)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 144 (서열 260)의 아미노산 잔기 1 또는 약 24 내지 약 802의 서열을 갖는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 143A-B (서열 259)의 잔기 약 558 내지 약 2894의 서열의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203455호 (DNA68836-1656)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203455호 (DNA68836-1656)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 144 (서열 260)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 802의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 144 (서열 260)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 802의 서열을 갖는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 144 (서열 260)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 23까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 144 (서열 260)의 잔기 24 내지 약 802의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1487 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1487 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 144 (서열 260)의 잔기 24 내지 802을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1487 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 144 (서열 260)의 아미노산 잔기 24 내지 802의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1487 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 144 (서열 260)의 잔기 24 내지 약 802의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1487 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 144 (서열 260)의 아미노산 잔기 24 내지 약 802의 서열을 포함하는 단리된 PRO1487 폴리펩티드, 또는 항-PRO1487 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1487 단편은 천연 PRO1487 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 144 (서열 260)의 아미노산잔기 약 24 내지 약 802의 서열을 갖는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1487 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1487 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1487 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1487 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1487 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

73.PRO1418

본 발명자들은 본원에서 "PRO1418"로 지칭되는 신규 분비 펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA68864-1629)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1418 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 146 (서열 265)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 350의 서열을 갖는 PRO1418 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 145 (서열 264)의 잔기 약 195 내지 약 1187의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1418 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203276호 (DNA68864-1629)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203276호 (DNA68864-1629)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 146 (서열 265)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 350의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 146 (서열 265)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 350의 서열을 갖는 PRO1418 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 146 (서열 265)의 잔기 20 내지 약 350의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1418 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1418 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 146 (서열 265)의 잔기 20 내지 350을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1418 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 146 (서열 265)의 아미노산 잔기 20 내지 약 350의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1418 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 146 (서열 265)의 잔기 20 내지 350의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1418 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 146 (서열 265)의 아미노산 잔기 20 내지 약 350의 서열을 포함하는 단리된 PRO1418 폴리펩티드, 또는 항-PRO1418 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1418 단편은 천연 PRO1418 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 146 (서열 265)의 아미노산잔기 약 20 내지 약 350의 서열을 갖는 PRO1418 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1418 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1418 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1418 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1487 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1418 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

74.PRO1472

본 발명자들은 본원에서 "PRO1472"로 지칭되는 신규 부티로필린에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA68866-1644)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1472 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 148 (서열 267)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 466의 서열을 갖는 PRO1472 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 147 (서열 266)의 잔기 약 185 내지 약 1531의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1472 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203283호 (DNA68866-1644)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203283호 (DNA68866-1644)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 148 (서열 267)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 466의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 148 (서열 267)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 466의 서열을 갖는 PRO1472 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드 및 그의 가용성 즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 148 (서열 267)에서 아미노산 위치 약 1 부터 아미노산 위치 약 17까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막 횡단 도메인은 도 148 (서열 267)에서 아미노산 위치 약 131부터 아미노산 위치 약 150까지, 및 아미노산 위치 약 235부터 아미노산 위치 약 259까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. PRO1472는 본원의 정보가 주어지는 경우 특정 영역만을 함유하도록, 예를 들어 세포외 또는 세포질 영역만을 함유하거나 제2 막횡단도메인이 결실되는 경우 절단된 카르복실 말단을 함유하도록 조작될 수 있는 것으로 이해된다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 148 (서열 267)의 잔기 18 내지 약 466의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1472 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1472 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 148 (서열 267)의 잔기 약 18 내지 약 466을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1472 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 148 (서열 267)의 아미노산 잔기 18 내지 약 466의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1472 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 148 (서열 267)의 잔기 18 내지 466의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1472 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 148 (서열 267)의 아미노산 잔기 18 내지 약 466의 서열을 포함하는 단리된 PRO1472 폴리펩티드, 또는 항-PRO1472 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1472 단편은 천연 PRO1472 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 148 (서열 267)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 466의 서열을 갖는 PRO1472 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1472 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1472 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1472 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1487 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1472 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

75. PRO1461

본 발명자들은 본원에서 "PRO1461"로 지칭되는 신규 세린 프로테아제에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA68871-1638)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1461 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 150 (서열 269)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 423의 서열을 갖는 PRO1461 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 149 (서열 268)의 잔기 약 32 내지 약 1300의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1461 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203280호 (DNA68871-68871)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203280호 (DNA68871-68871)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 150 (서열 269)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 423의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 150 (서열 269)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 423의 서열을 갖는 PRO1461 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된,약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화됨)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 150 (서열 269)에서 아미노산 위치 약 21부터 아미노산 위치 약 40까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 150 (서열 269)의 잔기 1 내지 약 423의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1461 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1461 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 150 (서열 269)의 잔기 약 1 내지 423을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1461 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 150 (서열 269)의 아미노산 잔기 1 내지 약 423의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1461 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 150 (서열 269)의 잔기 1 내지 423의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1461 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 150 (서열 269)의 아미노산 잔기 1 내지 약 423의 서열을 포함하는 단리된 PRO1461 폴리펩티드, 또는 항-PRO1461 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1461 단편은 천연 PRO1461 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 150 (서열 269)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 423의 서열을 갖는 PRO1461 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1461 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1461 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1461 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1487 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1461 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

76. PRO1410

본 발명자들은 본원에서 "PRO1410"으로 지칭되는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66672-1586)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1410 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 152 (서열 271)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 21 내지 약 238의 서열을 갖는 PRO1410 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 151 (서열 270)의 잔기 약 152 또는 약 212 내지 약 865의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1410 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203277호 (DNA68874-1622)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203277호 (DNA68874-1622)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 152 (서열 271)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 238의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 152 (서열 271)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 238의 서열을 갖는 PRO1410 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 152 (서열 271)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 20까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 도 152 (서열 271)에서 아미노산 위치 약 194부터 아미노산 위치 약 220까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 152 (서열 271)의 잔기 1 또는 약 21 내지 약 238의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1410 폴리펩티드코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 151 (서열 270)의 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1410 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 152 (서열 271)의 잔기 1 또는 약 21 내지 약 238을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1410 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 152 (서열 271)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 238의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1410 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 152 (서열 271)의 잔기 1 또는 약 21 내지 약 238의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1410 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 152 (서열 271)의 아미노산 잔기 1 또는 약21 내지 약 238의 서열을 포함하는 단리된 PRO1410 폴리펩티드, 또는 항-PRO1410 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1410 단편은 천연 PRO1410 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 152 (서열 271)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 21 내지 약 238의 서열을 갖는 PRO1410 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1410 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1410 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1410 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1410 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1410 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

77. PRO1568

본 발명자들은 본원에서 "PRO1568"로 지칭되는 신규 테트라스파닌에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA68880-1676)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1568 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 154 (서열 273)의 아미노산 잔기 1 또는 약 34 내지 약 305의 서열을 갖는 PRO1568 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 153 (서열 272)의 잔기 약 307 내지 약 1122의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1568 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203319호 (DNA68880-1676)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성,가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203319호 (DNA68880-1676)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 154 (서열 273)의 아미노산 잔기 약 34 내지 약 305의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a) DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 154 (서열 273)의 아미노산 잔기 약 34 내지 약 305의 서열을 갖는 PRO1568 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1568 폴리펩티드 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 154 (서열 273)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 33까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 도 154 (서열 273)에서 아미노산 위치 약 12부터 아미노산 위치 약 35까지, 아미노산 위치 약 57부터 아미노산 위치 약 86까지, 아미노산 위치 약 94부터 아미노산 위치 약 114 까지 및 아미노산 위치 약 226부터 아미노산 위치 약 248까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 154 (서열 273)의 잔기 34 내지 약 305의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1568 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1568 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 154 (서열 273)의 잔기 34 내지 305를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1568 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 154 (서열 273)의 아미노산 잔기 34 내지 약 305의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1568 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 154 (서열 273)의 잔기 34 내지 약 305의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1568 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 154 (서열 273)의 아미노산 잔기 34 내지 약 305의 서열을 포함하는 단리된 PRO1568 폴리펩티드, 또는 항-PRO1568 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1568 단편은 천연 PRO1568 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 154 (서열 273)의 아미노산 잔기 약 34 내지 약 305의 서열을 갖는 PRO1568 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1568 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1568 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1568 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1568 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1568 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

78. PRO1570

본 발명자들은 본원에서 "PRO1570"으로 지칭되는 신규 SP6에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA68885-1678)을 확인하였다. 특히, 본 출원인들은 SP6로 이미 확인된 단백질의 아미노 말단에 추가된 199개의 아미노산을 최초로 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1570 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 156 (서열 275)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 432의 서열을 갖는 PRO1570 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b)상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 155 (서열 274)의 잔기 약 210 내지 약 1505의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1570 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203311호 (DNA68885-1678)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203311호 (DNA68885-1678)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 156 (서열 275)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 432의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 156 (서열 275)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 432의 서열을 갖는 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 본원에 제공된 프로브는 서열 275의 아미노산 1 내지 199로 정의된, 도 1에서 확인된 펩티드의 아미노 말단부터이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 분비되는 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실, 절단 또는 불활성화된 변이체의 형태의 PRO1570 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 156 (서열 275)의 잔기 1 내지 약 432의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (a) DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1570 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1570 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 156 (서열 275)의 잔기 1 내지 432를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1570 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 156 (서열 275)의 아미노산 잔기 1 내지 약 432의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1570 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 156 (서열 275)의 잔기 1 내지 432의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1570 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 156 (서열 275)의 아미노산 잔기 1 내지 약 432의 서열을 포함하는 단리된 PRO1570 폴리펩티드, 또는 항-PRO1570 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이PRO1570 단편은 천연 PRO1570 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 156 (서열 275)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 423의 서열을 갖는 PRO1570 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1570 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1570 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1570 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1570 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1570 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

79. PRO1317

본 발명자들은 본원에서 "PRO1317"로 지칭되는 신규 세마포린 B에 상동성을갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71166-1685)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 158 (서열 277)의 아미노산 잔기 1 또는 약 31 내지 약 761의 서열을 갖는 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 157 (서열 276)의 잔기 약 195 내지 약 2387의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203355호 (DNA71166-1685)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203355호 (DNA71166-1685)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 158 (서열 277)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 761의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 158 (서열 277)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 761의 서열을 갖는 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 및 그의 가용성 변이체(막횡단 도메인이 결실 또는 불활성화됨), 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 158 (서열 277)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 30까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 도 158 (서열 277)에서 아미노산 위치 약 13부터 아미노산 위치 약 31까지, 아미노산 위치 약 136부터 아미노산 위치 약 156까지, 아미노산 위치 약 222부터 아미노산 위치 약 247까지, 아미노산 위치 약 474부터 아미노산 위치 약 490까지 및 아미노산 위치 약 685부터 아미노산 위치 약 704까지까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 158 (서열 277)의 잔기 31 내지 약 761의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1317 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1317 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 158 (서열 277)의 잔기 31 내지 761을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1317 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 158 (서열 277)의 아미노산 잔기 31 내지 761의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1317 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 158 (서열 277)의 잔기 31 내지 761의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1317 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 158 (서열 277)의 아미노산 잔기 31 내지 약 761의 서열을 포함하는 단리된 PRO1317 폴리펩티드, 또는 항-PRO1317 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1317 단편은 천연 PRO1317 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 158 (서열 277)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 761의 서열을 갖는 PRO1317 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1317 폴리펩티드의 아고니스트 및길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1317 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1317 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1317 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1317 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

80. PRO1780

본 발명자들은 본원에서 "PRO1780"으로 지칭되는 신규 글루크로니실 트랜스퍼라제에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71169-1709)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1780 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 160 (서열 282)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 523의 서열을 갖는 PRO1780 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 159 (서열 281)의 잔기 약 125 내지 약 1636의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1780 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203467호 (DNA71169-1709)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203467호 (DNA71169-17092)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 160 (서열 282)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 523의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 160 (서열 282)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 523의 서열을 갖는 PRO1780 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 및 그의 가용성 변이체 (막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화됨)를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 160 (서열 282)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 19까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 도 160 (서열 282)에서 아미노산 위치 약 483부터 아미노산 위치 약 504까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 160 (서열 282)의 잔기 20 내지 약 523의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1780 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1780 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 160 (서열 282)의 잔기 20 내지 523을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1780 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 160 (서열 282)의 아미노산 잔기 20 내지 약 523의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1780 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 160 (서열 282)의 잔기 20 내지 523의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1780 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 160 (서열 523)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 523의 서열을 포함하는 단리된 PRO1780 폴리펩티드, 또는 항-PRO1780 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1780 단편은 천연 PRO1780 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 160 (서열 282)의 아미노산잔기 약 21 내지 약 417의 서열을 갖는 PRO1780 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1780 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1780 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1780 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1780 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1780 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

81. PRO1486

본 발명자들은 본원에서 "PRO1486"으로 지칭되는 신규 세레벨린에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71180-1655)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1486 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 162 (서열 287)의 아미노산 잔기 1 또는 약 33 내지 약 205의 서열을 갖는 PRO1486 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 161 (서열 286)의 잔기 약 568 내지 약 1086의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1486 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203403호 (DNA71180-1655)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203403호 (DNA71180-1655)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 162 (서열 287)의 아미노산 잔기 약 33 내지 약 205의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 162 (서열 287)의 아미노산 잔기 약 33 내지 약 205의 서열을 갖는 PRO1486 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 162 (서열 287)의 잔기 33 내지 약 205의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1486 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1486 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 162 (서열 287)의 잔기 33 내지 205를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1486 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 162 (서열 287)의 아미노산 잔기 33 내지 205의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1486 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 162 (서열 287)의 잔기 33 내지 205의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1486 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 162 (서열 287)의 아미노산 잔기 33 내지 약 205의 서열을 포함하는 단리된 PRO1486 폴리펩티드, 또는 항-PRO1486 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1486 단편은 천연 PRO1486 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 162 (서열 287)의 아미노산잔기 약 33 내지 약 205의 서열을 갖는 PRO1486 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1486 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1486 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1486 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1487 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1486 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

82. PRO1433

본 발명자들은 본원에서 "PRO1433"으로 지칭되는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71184-1634)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1433 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 164 (서열 292)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 388의 서열을 갖는 PRO1433 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 163 (서열 291)의 잔기 약 185 내지 약 1348의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1433 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203266호 (DNA71184-1634)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203266호 (DNA71184-1634)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 164 (서열 292)의 아미노산 잔기 1 내지 약 388의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 164 (서열 292)의 아미노산 잔기 1 내지 약 388의 서열을 갖는 PRO1433 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 250개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 및 그의 가용성, 즉 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성된 변이체를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 막횡단 도메인은 도 164 (서열 292)에서 아미노산 위치 약 76부터 아미노산 위치 약 97까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 164 (서열 292)의 잔기 1 내지 약 388의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1433 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 163 (서열 291)의 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1433 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 164 (서열 292)의 잔기 1 내지 약 388을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1433 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 164 (서열 292)의 아미노산 잔기 1 내지 약 388의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1433 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 164 (서열 292)의 잔기 1 내지 약 388의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1433 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 164 (서열 292)의 아미노산 잔기 1 내지 약388의 서열을 포함하는 단리된 PRO1433 폴리펩티드, 또는 항-PRO1433 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1433 단편은 천연 PRO1433 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 164 (서열 292)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 388의 서열을 갖는 PRO1433 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1433 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1433 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1433 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1433 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1433 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

83. PRO1490

본 발명자들은 본원에서 "PRO1490"으로 지칭되는 신규 1-아실-Sn-글리세롤-3-포스페이트-아실트랜스퍼라제 단백질 코딩 핵산에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71213-1659)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1490 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 165 (서열 296)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 26 내지 약 368의 서열을 갖는 PRO1490 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 165 (서열 296)의 잔기 약 272 또는 약 347 내지 약 1375의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1490 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203401호 (DNA71213-1659)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203401호 (DNA71213-1659)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 166 (서열 297)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 368의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 166 (서열 297)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 368의 서열을 갖는 PRO1490 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 285개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드 및 그의 가용성 즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 166 (서열 297)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 25까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1490의 아미노산 서열(도 166, 서열 297)에서 아미노산 위치 약 307부터 아미노산 위치 약 323까지, 아미노산 위치 약 335부터 아미노산 위치 약 352까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 166 (서열 297)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 368의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1490 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 165 (서열 296)의 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1490 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 166 (서열 297)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 368을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1490 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 166 (서열 297)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 368의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1490 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 166 (서열 297)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 368의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1490 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 166 (서열 297)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 368의 서열을 포함하는 단리된 PRO1490 폴리펩티드, 또는 항-PRO1490 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1490 단편은 천연 PRO1490 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 166 (서열 297)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 26 내지 약 368의 서열을 갖는 PRO1490 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고,iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1490 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1490 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1490 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1490 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1490 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

84. PRO1482

본 발명자들은 본원에서 "PRO1482"로 지칭되는 신규 인간 티록신 결합 글로불린에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71234-1615)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1482 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 168 (서열 302)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 29 내지 약 143의 서열을 갖는 PRO1482 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 167 (서열 301)의 잔기 약 117 내지 약 461의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1482 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203402호 (DNA71234-1651)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203402호 (DNA71234-1651)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 168 (서열 302)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 143의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 168 (서열 302)의 아미노산 잔기 1 또는 29 내지 약 143의 서열을 갖는 PRO1482 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 260개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 168 (서열 302)에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 28까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 168 (서열 302)의 잔기 1 또는 약 29 내지 약 143의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1482 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 167 (서열 301)의 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1482 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 168 (서열 302)의 잔기 1 또는 29 내지 약 143을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1482 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 168 (서열 302)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 143의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1482 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 168 (서열 302)의 잔기 1 또는 약 29 내지 약 143의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1482 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 168 (서열 302)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 417의 서열을 포함하는 단리된 PRO1482 폴리펩티드, 또는 항-PRO1482 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1482 단편은 천연 PRO1482 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 168 (서열 302)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 29 내지 약 143의 서열을 갖는 PRO1482 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1482 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1482 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1482 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1482 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1482 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

85. PRO1446

본 발명자들은 본원에서 "PRO1446"으로 지칭되는 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71277-1636)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1446 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 170 (서열 304)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 109의 서열을 갖는 PRO1446 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 169 (서열 303)의 잔기 약 197 내지 약 478의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1446 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203285호 (DNA71277-1636)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203285호 (DNA71277-1636)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 170 (서열 304)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 109의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 170 (서열 304)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 109의 서열을 갖는 PRO1446 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 170 (서열 304)의 잔기 16 내지 약 109의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1446 폴리펩티드코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1446 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 170 (서열 304)의 잔기 16 내지 109을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1446 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 170 (서열 304)의 아미노산 잔기 16 내지 약 109의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1446 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 170 (서열 304)의 잔기 16 내지 109의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1446 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 170 (서열 304)의 아미노산 잔기 16 내지 약 109의 서열을 포함하는 단리된 PRO1446 폴리펩티드, 또는 항-PRO1446 항체에 대한결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1446 단편은 천연 PRO1446 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 170 (서열 304)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 109의 서열을 갖는 PRO1446 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1446 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1446 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1446 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1446 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1446 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

86. PRO1558

본 발명자들은 본원에서 "PRO1558"로 지칭되는 신규 인간 티록신 결합 글로불린에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71282-1668)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1558 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 172 (서열 306)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 26 내지 약 262의 서열을 갖는 PRO1558 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 171 (서열 305)의 잔기 약 84 또는 약 159 내지 약 869의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1558 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203312호 (DNA71282-1668)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203312호(DNA71282-1660)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 172 (서열 306)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 262의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 172 (서열 306)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 262의 서열을 갖는 PRO1558 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드 및 그의 가용성 즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 172 (서열 306)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 25까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 도 172 (서열 306)에서 아미노산 위치 약 8부터 아미노산 위치 약30까지 및 아미노산 위치 약 130까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 172 (서열 306)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 262의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1558 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1558 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 172 (서열 306)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 262을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1558 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 172 (서열 306)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 262의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1558 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 172 (서열 306)의 잔기 1 또는 약 26 내지 약 262의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1558 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 172 (서열 306)의 아미노산 잔기 1 또는 약 26 내지 약 262의 서열을 포함하는 단리된 PRO1558 폴리펩티드, 또는 항-PRO1558 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1558 단편은 천연 PRO1558 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 172 (서열 306)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 26 내지 약 262의 서열을 갖는 PRO1558 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1558 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1558 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1558 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1558 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1558 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

87. PRO1604

본 발명자들은 본원에서 "PRO1604"로 지칭되는 신규 간암 유도된 성장 인자 (HDGF)에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71286-1687)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1604 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 174 (서열 308)의 아미노산 잔기 1 또는 약 14 내지 약 671의 서열을 갖는 PRO1604 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 173 (서열 307)의 잔기 약 104 내지 약 2077의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1604 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203357호 (DNA71286-1687)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203357호 (DNA71286-1687)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 174 (서열 308)의 아미노산 잔기 약 14 내지 약 671의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 174 (서열 308)의 아미노산 잔기 약 14 내지 약 671의 서열을 갖는 PRO1604 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1604 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 174 (서열 308)에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 13까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 174 (서열 308)의 잔기 14 내지 약 671의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1604 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1604 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 174 (서열 308)의 잔기 약 14 내지 671을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1604 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 174 (서열 308)의 아미노산 잔기 21 내지 약 417의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1604 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 174 (서열 308)의 잔기 14 내지 671의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1604 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 174 (서열 308)의 아미노산 잔기 14 내지 약 671의 서열을 포함하는 단리된 PRO1604 폴리펩티드, 또는 항-PRO1604 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1604 단편은 천연 PRO1604 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 174 (서열 308)의 아미노산 잔기 약 14 내지 약 671의 서열을 갖는 PRO1604 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1604 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1604 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1604 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1604 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1604 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

88. PRO1491

본 발명자들은 본원에서 "PRO1491"로 지칭되는 신규 콜랍신 단백질을 코딩하는 핵산에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71883-1660)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1491 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 176 (서열 310)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 37 내지 약 777의 서열을 갖는 PRO1491 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 175 (서열 309)의 잔기 약 107 또는 약 215 내지 약 2437의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1491 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203475호 (DNA71883-1660)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203475호 (DNA71883-1660)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 176 (서열 310)의 아미노산 잔기 1 또는 약 37 내지 약 777의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 176 (서열 310)의 아미노산 잔기 1 또는 약 37 내지 약 777의 서열을 갖는 PRO1491 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 1670개 이상의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1487 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 176 (서열 310)에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 36까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 176 (서열 310)의 잔기 약 1 또는 약 37 내지 약 777의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는, PRO1491 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 및 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이며, 도 175 (서열 309)의 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1491 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 176 (서열 310)의 잔기 1 또는 약 37 내지 약 777을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1491 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 176 (서열 310)의 아미노산 잔기 1 또는 약 37 내지 약 777의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1491 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 176 (서열 310)의 잔기 1 또는 약 37 내지 약 777의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1491 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 176 (서열 310)의 아미노산 잔기 1 또는 약 37 내지 약 777의 서열을 포함하는 단리된 PRO1491 폴리펩티드, 또는 항-PRO1491 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1491 단편은 천연 PRO1491 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 176 (서열 310)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 37 내지 약 777의 서열을 갖는 PRO1491 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1491 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1491 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1491 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1491 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1491 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

89. PRO1431

본 발명자들은 본원에서 "PRO1431"로 지칭되는 신규 SH3에 상동성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA73401-1633)을 확인하였다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1431 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 178 (서열 315)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 370의 서열을 갖는 PRO1431 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 177 (서열 314)의 잔기 1 내지 약 1335 및 약 1560 내지 약 3934의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1431 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203273호 (DNA73401-1633)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203273호 (DNA73401-1633)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 178 (서열 315)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 370의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA를 (a) 도 178 (서열 315)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 370의 서열을 갖는 PRO1431 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 15개의 뉴클레오티드를 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 178 (서열 315)의 잔기 1 내지 약 370의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1431 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 일부 실시양태에서 도 178 (서열 315)의 잔기 1 내지 370을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1431 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 178 (서열 315)의 아미노산 잔기 1 내지 약 370의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1431 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 178 (서열 315)의 잔기 1 내지 370의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1431 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 178 (서열 315)의 아미노산 잔기 1 내지 약 370의 서열을 포함하는 단리된 PRO1431 폴리펩티드, 또는 항-PRO1431 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이 PRO1337 단편은 천연 PRO1337 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA를 (a) 도 178 (서열 315)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 370의 서열을 갖는 PRO1431 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1431 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1431 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1431 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1431 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1431 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

90.PRO1563

본원에서 "PRO1563"으로 지칭하는, 신규 폴리펩티드를 코딩하는, ADAMTS-1을 코딩하는 핵산과 상동성이 있는 cDNA 클론(DNA73492-1671)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1563 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 180 (서열 317)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 49 내지 약 837의 서열을 갖는 PRO1563 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 179A-B (서열 316)의 뉴클레오티드 419 또는 약 563에서 약 2929까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1563 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203324호 (DNA73492-1671)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203324호 (DNA73492-1671)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 180 (서열 317)의 아미노산 잔기 1 또는약 49 내지 약 837의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 180 (서열 317)의 아미노산 잔기 1 또는 약 49 내지 약 837의 서열을 갖는 PRO1563 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1563 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 180 (서열 317)의 서열에서 아미노산 위치 약 1에서 아미노산 위치 약 48에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 180 (서열 317)의 잔기 1 또는 약 49 내지 약 837의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1563 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고, 도 179A-B (서열 316)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1563 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 180 (서열 317)의 잔기 1 또는 약 49 내지 약 837을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1563 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 180 (서열 317)의 아미노산 잔기 1 또는 약 49 내지 약 837의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1563 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 180 (서열 317)의 잔기 1 또는 약 49 내지 약 837의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1563 폴리펩티드에 관한것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 180 (서열 317)의 잔기 1 또는 약 49 내지 약 837의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1563 폴리펩티드, 또는 항-PRO1563 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1563 단편은 천연 PRO1563 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 180 (서열 317)의 아미노산 잔기 1 또는 약 49 내지 약 837의 서열을 갖는 PRO1563 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1563 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1563 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1563 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연PRO1563 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1563 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

91.PRO1565

본원에서 "PRO1565"로 지칭하는, 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 콘드로모듈린 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성이 있는 cDNA 클론(DNA73727-1673)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1565 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 182 (서열 322)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 41 내지 약 317의 서열을 갖는 PRO1565 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 181 (서열 321)의 뉴클레오티드 약 59 또는 약 179에서 약 1009까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1565 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203459호 (DNA73727-1673)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203459호 (DNA73727-1673)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 182 (서열 322)의 아미노산 잔기 1 또는 약 41 내지 약 317의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 182 (서열 322)의 아미노산 잔기 1 또는 약 41 내지 약 317의 서열을 갖는 PRO1565 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 410 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1565 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 182 (서열 322)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 40까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1565 아미노산 서열 (도 182, 서열 322)에서 아미노산 위치 약 25부터 아미노산 위치 약 47까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 182 (서열 322)의 잔기 1 또는 약 41 내지 약 317의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1565 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고, 도 181 (서열 321)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1565 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 182 (서열 322)의 잔기 1 또는 약 41 내지 약 317을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1565 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 182 (서열 322)의 아미노산 잔기 1 또는 약 41 내지 약 317의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1565 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 182 (서열 322)의 잔기 1 또는 약 41 내지 약 317의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1565 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 182 (서열 322)의 잔기 1 또는 약 41 내지 약 317의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1565 폴리펩티드, 또는 항-PRO1565 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1565 단편은 천연 PRO1565 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 182 (서열 322)의 아미노산 잔기 1 또는 약 41 내지 약 317의 서열을 갖는 PRO1565 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1565 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1565 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1565 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1565 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1565 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

92.PRO1571

본원에서 "PRO1571"로 지칭하는, 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 수용체(CPE-R)를 코딩하는 핵산과 상동성이 있는 cDNA 클론(DNA73730-1679)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1571 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 184 (서열 324)의 아미노산 잔기 약1 또는 약 22 내지 약 239의 서열을 갖는 PRO1571 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 183 (서열 323)의 뉴클레오티드 약 90 또는 약 153에서 약 806까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1571 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203320호 (DNA73730-1679)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203320호 (DNA73730-1679)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 184 (서열 324)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 239의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 184 (서열 324)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 239의 서열을 갖는 PRO1571 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 910 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1571 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 184 (서열 324)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 21까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1571 아미노산 서열 (도 184, 서열 324)에서 아미노산 위치 약 82부터 아미노산 위치 약 103까지, 아미노산 위치 약 115부터 아미노산 위치 약 141까지 및 아미노산 위치 약 160부터 아미노산 위치 약 182까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 184 (서열 324)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 239의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1571 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고, 도 183 (서열 323)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1571 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 184 (서열 324)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 239를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1571 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 184 (서열 324)의 아미노산 잔기 1 또는 약 22 내지 약 239의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1571 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 184 (서열 324)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 239의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1571 폴리펩티드에 관한것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 184 (서열 324)의 잔기 1 또는 약 22 내지 약 239의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1571 폴리펩티드, 또는 항-PRO1571 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1571 단편은 천연 PRO1571 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 184 (서열 324)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 22 내지 약 239의 서열을 갖는 PRO1571 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1571 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1571 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1571 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연PRO1571 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1571 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

93.PRO1572

본원에서 "PRO1572"로 지칭하는, CPE-R과 서열 동일성을 갖는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA73734-1680)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1572 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 186 (서열 326)의 아미노산 잔기 1 또는 약 24 내지 약 261의 서열을 갖는 PRO1572 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 185 (서열 325)의 잔기 약 159에서 약 872까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1572 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203363호 (DNA73734-1680)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203363호 (DNA73734-1680)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 186 (서열 326)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 261의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 186 (서열 326)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 261의 서열을 갖는 PRO1572 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1572 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 186 (서열 326)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 23까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1572 아미노산 서열 (도 186, 서열 326)에서 대략적으로 약 81 내지 100, 121 내지 141 및 173 내지 194에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 186 (서열 326)의 잔기 24 내지 약 261의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1572 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1572 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 186 (서열 326)의 잔기 24 내지 약 261을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1572 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 186 (서열 326)의 아미노산 잔기 24 내지 약 261의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1572 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 186 (서열 326)의 잔기 24 내지 261의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1572 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 186 (서열 326)의 잔기 24 내지 약 261의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1572 폴리펩티드, 또는 항-PRO1572 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1572 단편은 천연 PRO1572 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 186 (서열 326)의 아미노산 잔기 약 24 내지 약 261의 서열을 갖는 PRO1572 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1572 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1572 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1572 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1572 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1572 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

94.PRO1573

본원에서 "PRO1573"으로 지칭하는, CPE-R과 서열 동일성을 갖는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA73735-1681)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1573 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 188 (서열 328)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 225의 서열을 갖는 PRO1573 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 187 (서열 327)의 잔기 약 148에서 약 771까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1573 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203356호 (DNA73735-1681)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203356호 (DNA73735-1681)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 188 (서열 328)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 225의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 188 (서열 328)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 225의 서열을 갖는 PRO1573 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1573 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 188 (서열 328)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 17까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1573 아미노산 서열 (도 188, 서열 328)에서 대략적으로 약 82 내지 101, 118 내지 145 및 164 내지 188에 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 188 (서열 328)의 잔기 18 내지 약 225의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1573 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1573 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 188 (서열 328)의 잔기 18 내지 약 225를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1573 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 188 (서열 328)의 아미노산 잔기 18 내지 약 225의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1573 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 188 (서열 328)의 잔기 18 내지 약 225의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1573 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 188 (서열 328)의 잔기 18 내지 약 225의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1573 폴리펩티드, 또는 항-PRO1573 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1573 단편은 천연 PRO1573 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 188 (서열 328)의 아미노산 잔기 약 18 내지 약 225의 서열을 갖는 PRO1573 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1573 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1573 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1573 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1573 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1573 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

95.PRO1488

본원에서 "PRO1488"로 지칭하는, 클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 수용체 (CPE-R)와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA73736-1657)을찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1488 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 190 (서열 330)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 220의 서열을 갖는 PRO1488 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 189 (서열 329)의 잔기 약 6에서 약 665까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1488 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203466호 (DNA73736-1657)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203466호 (DNA73736-1657)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 190 (서열 330)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 220의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 190 (서열 330)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 220의 서열을 갖는 PRO1488 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1488 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1488 아미노산 서열 (도 190, 서열 330)에서 아미노산 위치 약 8 내지 30, 82 내지 102, 121 내지 140 및 166 내지 186에 위치하는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 190 (서열 330)의 잔기 1 내지 약 220의아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1488 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1488 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 190 (서열 330)의 잔기 1 내지 220을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1488 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 190 (서열 330)의 아미노산 잔기 1 내지 약 220의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1488 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 190 (서열 330)의 잔기 1 내지 220의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1488 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 190 (서열 330)의 잔기 1 내지 약 220의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1488 폴리펩티드, 또는 항-PRO1488 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1488 단편은 천연 PRO1488 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 190 (서열 330)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 220의 서열을 갖는 PRO1488 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1488 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1488 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1488 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1488 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1488 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

96.PRO1489

본원에서 "PRO1489"로 지칭하는, 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 클로스트리듐 퍼프링겐스 장독소 수용체(CPE-R)를 코딩하는 핵산과 상동성이 있는 cDNA 클론(DNA73737-1658)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1489 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 192 (서열 332)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 173의 서열을 갖는 PRO1489 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 191 (서열 331)의 뉴클레오티드 약 264에서 약 782까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1489 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203412호 (DNA73737-1658)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203412호 (DNA73737-1658)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 192 (서열 332)의 아미노산 잔기 1 내지 약 173의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 192 (서열 332)의 아미노산 잔기 1 내지 약 173의 서열을 갖는 PRO1489 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 25 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1489 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1489 아미노산 서열 (도 192, 서열 332)에서 아미노산 위치 약 31에서 아미노산 위치 약 51까지, 아미노산 위치 약 71에서 아미노산 위치 약 90까지 및 아미노산 위치 약 112에서 아미노산 위치 약 133까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 192 (서열 332)의 잔기 1 내지 약 173의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1489 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고, 도 191 (서열 331)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1489 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 192 (서열 332)의 잔기 1 내지 약 173을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1489 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 192 (서열 332)의 아미노산 잔기 1 내지 약 173의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1489 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 192 (서열 332)의 잔기 1 내지 약 173의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1489 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 192 (서열 332)의 잔기 1 내지 약 173의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1489 폴리펩티드, 또는 항-PRO1489 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1489 단편은 천연 PRO1489 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 192 (서열 332)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 173의 서열을 갖는 PRO1489 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1489 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1489 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1489 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1489 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1489 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

97.PRO1474

본원에서 "PRO1474"로 지칭하는, 오보뮤코이드와 서열 동일성이 있는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA73739-1645)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1474 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 194 (서열 334)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 82의 서열을 갖는 PRO1474 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 193 (서열 333)의 잔기 약 102에서 약 299까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1474 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203270호 (DNA73739-1645)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203270호 (DNA73739-1645)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 194 (서열 334)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 85의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 194 (서열 334)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 85의 서열을 갖는 PRO1474 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 194 (서열 334)의 잔기 20 내지 약 85의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1474 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1474 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 194 (서열 334)의 잔기 20 내지 85를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1474 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 194 (서열 334)의 아미노산 잔기 20 내지 약85의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1474 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 194 (서열 334)의 잔기 20 내지 85의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1474 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 194 (서열 334)의 잔기 20 내지 약 85의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1474 폴리펩티드, 또는 항-PRO1474 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1474 단편은 천연 PRO1474 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 194 (서열 334)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 85의 서열을 갖는 PRO1474 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1474 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1474 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1474 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1474 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1474 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

98.PRO1508

본원에서 "PRO1508"로 지칭하는, 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA73742-1662)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1508 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 196 (서열 336)의 아미노산 잔기 1 또는 약 31 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1508 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 195 (서열 335)의 잔기 약 160에서 약 513까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1508 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203316호 (DNA73742-1662)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203316호 (DNA73742-1662)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 196 (서열 336)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 148의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 196 (서열 336)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1508 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1508 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 196 (서열 336)의 서열에서 아미노산 위치 1에서 아미노산 위치 약 30까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 196 (서열 336)의 잔기 31 내지 약 148의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1508 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1508 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 196 (서열 336)의 잔기 31 내지 148을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1508 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 196 (서열 336)의 아미노산 잔기 31 내지 약 148의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1508 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 196 (서열 336)의 잔기 31 내지 148의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1508 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 196 (서열 336)의 잔기 31 내지 약 148의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1508 폴리펩티드, 또는 항-PRO1508 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1508 단편은 천연 PRO1508 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 196 (서열 336)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1508 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

99.PRO1555

본원에서 "PRO1555"로 지칭하는, 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA73744-1665)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1555 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 198 (서열 338)의 아미노산 잔기 1 또는 약 32 내지 약 246의 서열을 갖는 PRO1555 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 197 (서열 337)의 잔기 약 83에서 약 827까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1555 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203322호 (DNA73744-1665)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203322호 (DNA73744-1665)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 198 (서열 338)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 246의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 198 (서열 338)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 246의 서열을 갖는 PRO1555 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1555 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 상기 신호 펩티드는 도 198 (서열 338)의 서열에서 아미노산 위치 1에서 아미노산 위치 약 31까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1555 아미노산 서열 (도 198, 서열 338)에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 32까지, 및 아미노산 위치 약 195부터 아미노산 위치 약 217까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 198 (서열 338)의 잔기 32 내지 약 246의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1555 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 32 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1555 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 198 (서열 338)의 잔기 32 내지 246을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1555 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 198 (서열 338)의 아미노산 잔기 32 내지 약 246의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1555 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 198 (서열 338)의 잔기 32 내지 246의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1555 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 198 (서열 338)의 잔기 32 내지 약 246의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1555 폴리펩티드, 또는 항-PRO1555 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1555 단편은 천연 PRO1555 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 198 (서열 338)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 246의 서열을 갖는 PRO1555 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

100.PRO1485

본원에서 "PRO1485"로 지칭하는, 라이소자임, 보다 구체적으로는 라이소자임 C 전구체와 서열 동일성을 갖는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA73746-1654)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1485 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 200 (서열 340)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1485 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 199 (서열 339)의 잔기 약 205에서 약 594까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1485 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203411호 (DNA73746-1654)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203411호 (DNA73746-1654)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 200 (서열 340)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 148의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 200 (서열 340)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1485 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 200 (서열 340)의 잔기 19 내지 약 148의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1485 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1485 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 200 (서열 340)의 잔기 19 내지 148을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1485 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 200 (서열 340)의 아미노산 잔기 19 내지 약 148의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1485 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 200 (서열 340)의 잔기 19 내지 148의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1485 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 200 (서열 340)의 잔기 19 내지 약 148의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1485 폴리펩티드, 또는 항-PRO1485 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1485 단편은 천연 PRO1485 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 200 (서열 340)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 148의 서열을 갖는 PRO1485 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1485 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1485 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1485 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1485 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1485 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

101.PRO1564

본원에서 "PRO1564"로 지칭하는, 신규 폴리펩티드를 코딩하는, N-아세틸갈락토스아미닐트랜스퍼라제를 코딩하는 핵산과 상동성이 있는 cDNA 클론(DNA73760-1672)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1564 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 202 (서열 347)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 29 내지 약 639의 서열을 갖는 PRO1564 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 201 (서열 346)의 뉴클레오티드 약 462 또는 약 546에서 약 2378까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1564 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203314호 (DNA73760-1672)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호제203314호 (DNA73760-1672)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 202 (서열 347)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 639의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 202 (서열 347)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 639의 서열을 갖는 PRO1564 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1564 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 202 (서열 347)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 28까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1564 아미노산 서열 (도 202, 서열 347)에서 아미노산 위치 약 11부터 아미노산 위치 약 36까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 202 (서열 347)의 잔기 1 또는 약 29 내지 약 639의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1564 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고, 도 201 (서열 346)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1564 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 202 (서열 347)의 잔기 1 또는 약 29 내지 약 639를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1564 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 202 (서열 347)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 639의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1564 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 202 (서열 347)의 잔기 1 또는 약 29 내지 639의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1564 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 202 (서열 347)의 잔기 1 또는 약 29 내지 약 639의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1564 폴리펩티드, 또는 항-PRO1564 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1564 단편은 천연 PRO1564 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 202 (서열 347)의 아미노산 잔기 1 또는 약 29 내지 약 639의 서열을 갖는 PRO1564 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1564 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1564 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1564 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1564 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1564 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

102.PRO1755

본원에서 "PRO1755"로 지칭하는, 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76396-1698)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1755 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 204 (서열 352)의 아미노산 잔기 1 또는 약 32 내지 약 276의 서열을 갖는 PRO1755 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 203 (서열 351)의 잔기 약 151에서 약 885까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1755 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203471호 (DNA76396-1698)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203471호 (DNA76396-1698)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 204 (서열 352)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 276의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 204 (서열 352)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 276의 서열을 갖는 PRO1755 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1755 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 204 (서열 352)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 31까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1755 아미노산 서열 (도 204, 서열 352)에서 아미노산 위치 약 178부터 아미노산 위치 약 198까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 204 (서열 352)의 잔기 32 내지 약 276의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1755 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1755 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 204 (서열 352)의 잔기 32 내지 276을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1755 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 204 (서열 352)의 아미노산 잔기 32 내지 약 276의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1755 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 204 (서열 352)의 잔기 32 내지 276의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1755 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 204 (서열 352)의 잔기 32 내지 약 276의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1755 폴리펩티드, 또는 항-PRO1755 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1755 단편은 천연 PRO1755 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 204 (서열 352)의 아미노산 잔기 약 32 내지 약 276의 서열을 갖는 PRO1755 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1755 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1755 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1755 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1755 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1755 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

103.PRO1757

본원에서 "PRO1757"로 지칭하는, 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76398-1699)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1757 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 206 (서열 354)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 20 내지 약 121의 서열을 갖는 PRO1757 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 205 (서열 353)의 뉴클레오티드 약 59 또는 약 116에서 약 121까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1757 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203474호 (DNA76398-1699)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203474호 (DNA76398-1699)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 206 (서열 354)의 아미노산 잔기 1 또는약 20 내지 약 121의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 206 (서열 354)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 121의 서열을 갖는 PRO1757 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 125 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1757 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 206 (서열 354)의 서열에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 19까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1757 아미노산 서열 (도 206, 서열 354)에서 아미노산 위치 약 91부터 아미노산 위치 약 110까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 206 (서열 354)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약 121의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1757 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고, 도 205 (서열 353)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1757 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 206 (서열 354)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약 121을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1757 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 206 (서열 354)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 121의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1757 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 206 (서열 354)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약121의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1757 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 206 (서열 354)의 잔기 1 또는 약 20 내지 약 121의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1757 폴리펩티드, 또는 항-PRO1757 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1757 단편은 천연 PRO1757 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 206 (서열 354)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 121의 서열을 갖는 PRO1757 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1757 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1757 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1757 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1757 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1757 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

104.PRO1758

본원에서 "PRO1758"로 지칭하는, 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76399-1700)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1758 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 208 (서열 356)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 157의 서열을 갖는 PRO1758 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 207 (서열 355)의 잔기 약 123에서 약 548까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1758 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203472호 (DNA76399-1700)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203472호 (DNA76399-1700)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 208 (서열 356)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 157의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 208 (서열 356)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 157의 서열을 갖는 PRO1758 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 20 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열이 있거나 없는 PRO1758 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 208 (서열 356)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 15까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 208 (서열 356)의 잔기 16 내지 약 157의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1758 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1758 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 208 (서열 356)의 잔기 16 내지 157을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1758 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 208 (서열 356)의 아미노산 잔기 16 내지 약157의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1758 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 208 (서열 356)의 잔기 16 내지 157의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1758 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 208 (서열 356)의 잔기 16 내지 약 157의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1758 폴리펩티드, 또는 항-PRO1758 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1758 단편은 천연 PRO1758 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 208 (서열 356)의 아미노산 잔기 약 16 내지 약 157의 서열을 갖는 PRO1758 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

105.PRO1575

본원에서 "PRO1575"로 지칭하는, 단백질 이황화물 이소머라제와 상동성이 있는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76401-1683)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1575 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 210 (서열 358)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 273의 서열을 갖는 PRO1575 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 209 (서열 357)의 잔기 약 82에서 약 840까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1575 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203360호 (DNA76401-1683)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호제203360호 (DNA76401-1683)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 210 (서열 358)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 273의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 210 (서열 358)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 273의 서열을 갖는 PRO1575 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 PRO1575 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 210 (서열 358)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 20까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1575 아미노산 서열 (도210, 서열 358)에서 아미노산 위치 약 143부터 아미노산 위치 약 162까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 210 (서열 358)의 잔기 21 내지 약 273의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1575 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1575 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 210 (서열 358)의 잔기 21 내지 273을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1575 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 210 (서열 358)의 아미노산 잔기 21 내지 약 273의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1575 폴리펩티드에관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 210 (서열 358)의 잔기 21 내지 273의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1575 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 210 (서열 358)의 잔기 21 내지 약 273의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1575 폴리펩티드, 또는 항-PRO1575 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1575 단편은 천연 PRO1575 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 210 (서열 358)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 273의 서열을 갖는 PRO1575 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1575 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1575 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1575 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1575 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1575 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

106.PRO1787

본원에서 "PRO1787"로 지칭하는, 마이엘린 p0과 서열 동일성이 있는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76510-2504)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1787 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 212 (서열 364)의 아미노산 잔기 1 또는 약 38 내지 약 269의 서열을 갖는 PRO1787 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 211 (서열 363)의 잔기 약 274에서 약 969까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1787 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203477호 (DNA76510-2504)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203477호 (DNA76510-2504)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 212 (서열 364)의 아미노산 잔기 약 38 내지 약 269의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 212 (서열 364)의 아미노산 잔기 약 38 내지 약 269의 서열을 갖는 PRO1787 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1787 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 212 (서열 364)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 37까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1787 아미노산 서열 (도 212, 서열 364)에서 아미노산 위치 약 161부터 아미노산 위치 약 183까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 212 (서열 364)의 잔기 38 내지 약 269의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1787 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1787 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 212 (서열 364)의 잔기 38 내지 269를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1787 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 212 (서열 364)의 아미노산 잔기 38 내지 약 269의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1787 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 212 (서열 364)의 잔기 38 내지 269의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1787 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 212 (서열 364)의 잔기 38 내지 약 269의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1787 폴리펩티드, 또는 항-PRO1787 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1787 단편은 천연 PRO1787 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 212 (서열 364)의 아미노산 잔기 약 38 내지 약 269의 서열을 갖는 PRO1787 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1787 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1787 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1787 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1787 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1787 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

107.PRO1781

본원에서 "PRO1781"로 지칭하는, 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76522-2500)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1781 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 214 (서열 366)의 아미노산 잔기 1 또는 약 20 내지 약 373의 서열을 갖는 PRO1781 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 213 (서열 365)의 잔기 약 78에서 약 1139까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1781 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203469호 (DNA76522-2500)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203469호 (DNA76522-2500)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 214 (서열 366)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 373의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 214 (서열 366)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 373의 서열을 갖는 PRO1781 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1781 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 214 (서열 366)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 19까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1781 아미노산 서열 (도 214, 서열 366)에서 아미노산 위치 약 39부터 아미노산 위치 약 60까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 214 (서열 366)의 잔기 20 내지 약 373의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1781 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1781 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 214 (서열 366)의 잔기 20 내지 373을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1781 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 214 (서열 366)의 아미노산 잔기 20 내지 약 373의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1781 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 214 (서열 366)의 잔기 20 내지 373의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1781 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 214 (서열 366)의 잔기 20 내지 약 373의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1781 폴리펩티드, 또는 항-PRO1781 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1781 단편은 천연 PRO1781 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 214 (서열 366)의 아미노산 잔기 약 20 내지 약 373의 서열을 갖는 PRO1781 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

108.PRO1556

본원에서 "PRO1556"으로 지칭하는, 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76529-1666)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1556 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 216 (서열 372)의 아미노산 잔기 1 또는 약 25 내지 약 269의 서열을 갖는 PRO1556 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 215 (서열 371)의 잔기 약 160에서 약 891까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1556 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203315호 (DNA76529-1666)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203315호 (DNA76529-1666)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 216 (서열 372)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 269의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 216 (서열 372)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 269의 서열을 갖는 PRO1556 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1556 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 216 (서열 372)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 24까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1556 아미노산 서열 (도 216, 서열 372)에서 아미노산 위치 약 11부터 아미노산 위치 약 25까지 및 약 226부터 아미노산 위치 약 243까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 216 (서열 372)의 잔기 25 내지 약 269의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1556 폴리펩티드코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1556 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 216 (서열 372)의 잔기 25 내지 269를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1556 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 216 (서열 372)의 아미노산 잔기 25 내지 약 269의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1556 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 216 (서열 372)의 잔기 25 내지 269의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1556 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 216 (서열 372)의 잔기 25 내지 약 269의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1556 폴리펩티드, 또는 항-PRO1556 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1556단편은 천연 PRO1556 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 216 (서열 372)의 아미노산 잔기 약 25 내지 약 269의 서열을 갖는 PRO1556 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1556 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1556 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1556 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1556 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1556 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

109.PRO1759

본원에서 "PRO1759"로 지칭하는, 다중 막횡단 도메인을 갖는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76531-1701)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1759 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 218 (서열 374)의 아미노산 잔기 1 또는 약 19 내지 약 450의 서열을 갖는 PRO1759 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 217 (서열 373)의 잔기 약 179에서 약 1474까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1759 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203465호 (DNA76531-1701)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203465호 (DNA76531-1701)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 218 (서열 374)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 450의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 218 (서열 374)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 450의 서열을 갖는 PRO1759 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1759 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 218 (서열 374)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 18까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1759 아미노산 서열 (도 218, 서열 374)에서 아미노산 약 1 내지 19 (가능하게는 신호 펩티드), 41 내지 55, 75 내지 94, 127 내지143, 191 내지 213, 249 내지 270, 278 내지 299, 314 내지 330, 343 내지 359, 379 내지 394 및 410 내지 430까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 218 (서열 374)의 잔기 19 내지 약 450의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1759 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1759 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 218 (서열 374)의 잔기 19 내지 450을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1759 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 218 (서열 374)의 아미노산 잔기 19 내지 약 450의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1759 폴리펩티드에관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 218 (서열 374)의 잔기 19 내지 450의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1759 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 218 (서열 374)의 잔기 19 내지 약 450의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1759 폴리펩티드, 또는 항-PRO1759 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1759 단편은 천연 PRO1759 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 218 (서열 374)의 아미노산 잔기 약 19 내지 약 450의 서열을 갖는 PRO1759 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1759 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1759 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1759 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1759 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1759 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

110.PRO1760

본원에서 "PRO1760"으로 지칭하는, 신규 분비 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA76532-1702)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1760 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 220 (서열 376)의 아미노산 잔기 1 또는 약 21 내지 약 188의 서열을 갖는 PRO1760 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 219 (서열 375)의 잔기 약 120에서 약 623까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1760 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203473호 (DNA76532-1702)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203473호 (DNA76532-1702)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 220 (서열 376)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 188의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 220 (서열 376)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 188의 서열을 갖는 PRO1760 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 50 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산분자에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 220 (서열 376)의 잔기 21 내지 약 188의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1760 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1760 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 220 (서열 376)의 잔기 21 내지 188을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1760 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 220 (서열 376)의 아미노산 잔기 21 내지 약 188의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1760 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 220 (서열 376)의 잔기 21 내지 188의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1760 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 220 (서열 376)의 잔기 21 내지 약 188의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1760 폴리펩티드, 또는 항-PRO1760 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1760 단편은 천연 PRO1760 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 220 (서열 376)의 아미노산 잔기 약 21 내지 약 188의 서열을 갖는 PRO1760 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1760 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1760 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1760 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1760 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1760 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

111.PRO1561

본원에서 "PRO1561"로 지칭하는, 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 인간 포스포리파제 A2 단백질을 코딩하는 핵산과 상동성이 있는 cDNA 클론(DNA76538-1670)을 찾아냈다.

한 실시양태에서 본 발명은 PRO1561 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 222 (서열 378)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 18 내지 약 116의 서열을 갖는 PRO1561 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 221 (서열 377)의 뉴클레오티드 약 29 또는 약 80에서 약 376까지의 핵산의 상보체와 혼성화하는 DNA를 포함하는, PRO1561 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는 혼성화는 엄격한 혼성화 및 세척 조건 하에 일어난다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203313호 (DNA76538-1670)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203313호 (DNA76538-1670)의 인간 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

추가 측면에서, 본 발명은 (a) 도 222 (서열 378)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 116의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 (a) 도 222 (서열 378)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 116의 서열을 갖는 PRO1561 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조된, 약 100 뉴클레오티드 이상을 갖는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

특정한 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및/또는 개시 메티오닌이 있거나 없는 PRO1561 폴리펩티드 및 그의 가용성 변이체 (즉, 막횡단 도메인 결실 또는 불활성화 변이체)를 코딩하는 DNA를 포함하거나, 이 코딩 핵산 분자와 상보적인 단리된 핵산 분자를 제공한다. 신호 펩티드는 도 222 (서열 378)의 서열에서 아미노산 위치 1부터 아미노산 위치 약 17까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 상기 막횡단 도메인은 PRO1561 아미노산 서열 (도 222, 서열 378)에서 아미노산 위치 약 1부터 아미노산 위치 약 24까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

또다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 222 (서열 378)의 잔기 1 또는 약 18 내지 약 116의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

또다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있는 PRO1561 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이 핵산 단편의 길이는 약 20 내지 약 80 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 20 내지 약 60 뉴클레오티드, 보다 바람직하게는 약 20 내지 약 50 뉴클레오티드, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40 뉴클레오티드이고, 도 221 (서열 377)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로부터 유도될 수 있다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 상기에서 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1561 폴리펩티드를 제공한다.

특정한 측면에서, 본 발명은 한 실시양태에서 도 222 (서열 378)의 잔기 1 또는 약 18 내지 116을 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 천연 서열 PRO1561 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 222 (서열 378)의 아미노산 잔기 1 또는 약 18 내지 약 116의 서열과 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1561 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가 측면에서, 본 발명은 도 222 (서열 378)의 잔기 1 또는 약 18 내지 약 116의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1561 폴리펩티드에 관한 것이다.

또다른 측면에서, 본 발명은 도 222 (서열 378)의 잔기 1 또는 약 18 내지 약 116의 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO1561 폴리펩티드, 또는 항-PRO1561 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1561 단편은 천연 PRO1561 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

추가 측면에서, 본 발명은 i) 시험 DNA 분자를 (a) 도 222 (서열 378)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 18 내지 약 116의 서열을 갖는 PRO1561 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 엄격한 조건에서 혼성화시키고, 만일 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와 약 80% 이상의 서열 동일성, 바람직하게는 약 85% 이상의 서열 동일성, 보다 바람직하게는 약 90% 이상의 서열 동일성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는다면, ii) 시험 DNA 분자를 함유하는 숙주 세포를 상기 폴리펩티드를 발현시키기에 적합한 조건에서 배양하고, iii) 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또다른 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1561 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 한 가지 구체적인 실시양태에서 상기 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1561 항체이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 천연 PRO1561 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시키고 상기 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 관찰함으로써 천연 PRO1561 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법에 관한 것이다.

추가 실시양태에서 본 발명은 제약상 허용가능한 담체와 함께 PRO1561 폴리펩티드, 또는 상기에서 정의된 아고니스트 또는 길항제를 포함하는 조성물에 관한 것이다.

112.PRO1567

결장 특이적 유전자인 CSG6의 발현 산물에 상동성을 갖고 본원에서 "PRO1567"로 지칭하는 신규한 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA76541-1675)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1567 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 224 (서열 383)의 아미노산 잔기 1 또는 약 23 내지 약 178의 서열을 갖는 PRO1567 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 223 (서열 382)의 잔기 약 175 내지 약 642의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1567 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203409호 (DNA76541-1675)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203409호 (DNA76541-1675)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 224 (서열 383)의 아미노산 잔기 약 23 내지 약 178의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85%이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 224 (서열 383)의 아미노산 잔기 약 23 내지 약 178의 서열을 갖는 PRO1567 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열을 갖거나 갖지 않는 PRO1567 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 224 (서열 383)의 서열에서 아미노산 1위에서 약 22위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 224 (서열 383)의 잔기 23 내지 약 178의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1567 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1567 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1567 폴리펩티드를 제공하며, 이는 한 실시양태에서 도 224 (서열 383)의 잔기 23 내지 178의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 224 (서열 383)의 아미노산 잔기 23 내지 약 178의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1567 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 224 (서열 383)의 잔기 23 내지 178의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1567 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 224 (서열 383)의 아미노산 잔기 23 내지 약 178의 서열을 포함하는 단리된 PRO1567 폴리펩티드, 또는 항-PRO1567 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1567 단편은 천연 PRO1567 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 224 (서열 383)의 아미노산 잔기 약 23 내지 약 178의 서열을 갖는 PRO1567 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1567 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1567 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1567 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO1567 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1567 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

113.PRO1693

본원에서 "PRO1693"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 인슐린형 성장 인자 결합 단백질을 코딩하는 핵산에 상동성을 갖는 cDNA 클론 (DNA77301-1708)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1693 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 226 (서열 385)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 34 내지 약 513의 서열을 갖는 PRO1693 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 225 (서열 384)의 뉴클레오티드 약 508 또는 약 607 내지 약 2046 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1693 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203407호 (DNA77301-1708)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203407호 (DNA77301-1708)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 226 (서열 385)의 아미노산 잔기 1또는 약 34 내지 약 513의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 175개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 226 (서열 385)의 아미노산 잔기 1 또는 약 34 내지 약 513의 서열을 갖는 PRO1693 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는 PRO1693 폴리펩티드 및 그의 가용성, 즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 226 (서열 385)의 서열에서 아미노산 약 1위에서 약 33위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1693 아미노산 서열 (도 226, 서열 385)에서 아미노산 약 420위에서 약 442위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 226 (서열 385)의 잔기 1 또는 약 34 내지 약 513의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1693 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이며, 도 225 (서열 384)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1693 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1693 폴리펩티드를 제공하며, 이는 특정 실시양태에서 도 226 (서열 385)의 잔기 1 또는 약 34 내지 약 513의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 226 (서열 385)의 아미노산 잔기 1 또는 약 34 내지 약 513의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1693 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 226 (서열 385)의 잔기 1 또는 약 34 내지 약 513의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1693 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 226 (서열 385)의 아미노산 잔기 1 또는 약 34 내지 약 513의 서열을 포함하는 단리된 PRO1693 폴리펩티드, 또는 항-PRO1693 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1693 단편은 천연 PRO1693 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 226 (서열 385)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 34 내지 약 513의 서열을 갖는 PRO1693 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1693 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1693 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1693 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO1693폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1693 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

114.PRO1784

본원에서 "PRO1784"로 지칭되는 신규 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA77303-2502)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1784 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 228 (서열 390)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 30 내지 약 146의 서열을 갖는 PRO1784 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 227 (서열 389)의 잔기 약 155 내지 약 505 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1784 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203479호 (DNA77303-2502)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203479호 (DNA77303-2502)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 228 (서열 390)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 146의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 228 (서열 390)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 146의 서열을 갖는 PRO1784 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는 PRO1784 폴리펩티드 및 그의 가용성, 즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 228 (서열 390)의 서열에서 아미노산 1위에서 약 29위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1784 아미노산 서열 (도 228, 서열 390)에서 아미노산 약 52위에서 약 70위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 228 (서열 390)의 잔기 30 내지 약 146의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1784 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1784 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1784 폴리펩티드를 제공하며, 이는 한 실시양태에서 도 228 (서열 390)의 잔기 30에서 146까지의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 228 (서열 390)의 아미노산 잔기 30 내지 약 146의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1784 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 228 (서열 390)의 잔기 30 내지 146의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1784 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 228 (서열 390)의 아미노산 잔기 30 내지 약 146의 서열을 포함하는 단리된 PRO1784 폴리펩티드, 또는 항-PRO1784 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1784 단편은 천연 PRO1784 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 228 (서열 390)의 아미노산 잔기 약 30 내지 약 146의 서열을 갖는 PRO1784 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1784 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1784 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1784 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO1784 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1784 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

115.PRO1605

본원에서 "PRO1605"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 글리코실트랜스퍼라제 단백질을 코딩하는 핵산에 상동성을 갖는 cDNA 클론 (DNA77648-1688)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1605 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 230 (서열 395)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 27 내지 약 140의 서열을 갖는 PRO1605 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 229 (서열 394)의 뉴클레오티드 약 425 또는 약 503 내지 약 844 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1605폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203408호 (DNA77648-1688)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203408호 (DNA77648-1688)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 230 (서열 395)의 아미노산 잔기 1 또는 약 27 내지 약 140의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 380개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 230 (서열 395)의 아미노산 잔기 1 또는 약 27 내지 약 140의 서열을 갖는 PRO1605 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는, PRO1605 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 230 (서열 395)의 서열에서 아미노산 1위에서 약 26위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 230 (서열 395)의 잔기 1 또는 약 27 내지 약 140의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1605 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이고, 도 229 (서열 394)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1605 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1605 폴리펩티드를 제공하며, 이는 특정 실시양태에서 도 230 (서열 395)의 잔기 1 또는 약 27 내지 약140의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 230 (서열 395)의 아미노산 잔기 1 또는 약 27 내지 약 140의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1605 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 230 (서열 395)의 잔기 1 또는 약 27 내지 약 140의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1605 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 230 (서열 395)의 아미노산 잔기 1 또는 약 27 내지 약 140의 서열을 포함하는 단리된 PRO1605 폴리펩티드, 또는 항-PRO1605 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1605 단편은 천연 PRO1605 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 230 (서열 395)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 27 내지 약 140의 서열을 갖는 PRO1605 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1605 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1605 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1605 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO1605 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1605 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

116.PRO1788

류신 풍부 반복부 단백질에 상동성을 갖고 본원에서 "PRO1788"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA77652-2505)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1788 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 232 (서열 397)의 아미노산 잔기 1 또는 약 17 내지 약 353의 서열을 갖는 PRO1788 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 231 (서열 396)의 잔기 약 112 내지 약 1122 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1788 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203480호 (DNA77652-2505)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203480호 (DNA77652-2505)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 232 (서열 397)의 아미노산 잔기 약 17 내지 약 353의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 232 (서열 397)의아미노산 잔기 약 17 내지 약 353의 서열을 갖는 PRO1788 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는 PRO1788 폴리펩티드 및 그의 가용성, 즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 232 (서열 397)의 서열에서 아미노산 1위에서 약 16위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1788 아미노산 서열 (도 232, 서열 397)에서 아미노산 약 215위에서 약 232위와 아미노산 약 287위에서 약 304위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 232 (서열 397)의 잔기 17 내지 약 353의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1788 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1788 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1788 폴리펩티드를 제공하며, 이는 한 실시양태에서 도 232 (서열 397)의 잔기 17 내지 353의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 232 (서열 397)의 아미노산 잔기 17 내지 약 353의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1788 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 232 (서열 397)의 잔기 17 내지 353의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1788 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 232 (서열 397)의 아미노산 잔기 17 내지 약 353의 서열을 포함하는 단리된 PRO1788 폴리펩티드, 또는 항-PRO1788 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1788 단편은 천연 PRO1788 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에(a) 도 232 (서열 397)의 아미노산 잔기 약 17 내지 약 353의 서열을 갖는 PRO1788 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1788 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1788 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1788 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO1788 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1788 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

117.PRO1801

본원에서 "PRO1801"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는, IL-19 폴리펩티드를 코딩하는 핵산에 상동성을 갖는 cDNA 클론 (DNA83500-2506)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1801 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 234 (서열 402)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 261의 서열을 갖는 PRO1801 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 233 (서열 401)의 뉴클레오티드 약 109 또는 약 235 내지 약 891 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1801 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203391호 (DNA83500-2506)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203391호 (DNA83500-2506)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 234 (서열 402)의 아미노산 잔기 1 또는 약 43 내지 약 261의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 30개 이상, 일반적으로 약 50개 이상, 더 일반적으로 약 100개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 234 (서열 402)의 아미노산 잔기 1 또는 약 43 내지 약 261의 서열을 갖는 PRO1801 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는, PRO1801 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 234 (서열 402)의 서열에서 아미노산 약 1위에서 약 42위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 234 (서열 402)의 잔기 1 또는 약 43 내지 약 261의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1801 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이고, 도 233 (서열 401)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1801 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1801 폴리펩티드를 제공하며, 이는 특정 실시양태에서 도 234 (서열 402)의 잔기 1 또는 약 43 내지 약 261의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 234 (서열 402)의 아미노산 잔기 1 또는 약 43 내지 약 261의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1801 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 234 (서열 402)의 잔기 1 또는 약 43 내지 약 261의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1801 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 234 (서열 402)의 아미노산 잔기 1 또는 약43 내지 약 261의 서열을 포함하는 단리된 PRO1801 폴리펩티드, 또는 항-PRO1801 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1801 단편은 천연 PRO1801 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 234 (서열 402)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 43 내지 약 261의 서열을 갖는 PRO1801 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1801 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1801 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1801 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO1801 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1801 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

본 발명의 다른 실시양태는 염증성 사이토킨을 생산할 수 있는 세포를 PRO1801 폴리펩티드와 접촉시켜 염증성 사이토킨의 생산을 억제시키는 단계를 포함하는, 염증성 사이토킨을 생산할 수 있는 세포에 의한 염증성 사이토킨의 생산을 억제시키는 방법에 관한 것이다. 세포는 예를 들어 T-세포, NK 세포 또는 마크로파지일 수 있으며, 생산을 억제시킬 수 있는 염증성 사이토킨은 예를 들어 IL-1, IL-6, IFN-γ 또는 TNF-α일 수 있다.

본 발명의 추가의 실시양태는 면역억제를 요하는 개인에게 PRO181 폴리펩티드 면역억제량을 투여하는 단계를 포함하는, 면역억제를 요하는 개인의 치료 방법에 관한 것이다. 면역억제를 요하는 개인은 류마티스성 관절염, 근무력증(myasthenia gravis), 인슐린 의존성 당뇨병, 전신성 루푸스성 홍반증, 갑상선염 또는 대장염과 같은 자가면역 질환, 또는 패혈성 쇼크, 내독성 쇼크 또는 면역억제가 요망되는 임의의 다른 유형의 장애에 걸려있을 수 있다. 개인은 또한 조직 이식을 받았거나 받을 예정일 수 있으며, 이 경우 본 방법은 조직 이식의 거부 반응을 억제한다.

다른 실시양태들은 본 명세서를 읽어보면 명백해 질 것이다.

118.UCP4

본원에서 "UCP4"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 몇몇 공지의 인간 언커플링 단백질에 어떤 상동성을 갖는 cDNA 클론 (DNA77568-1626)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 UCP4 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 236 (서열 406)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 323의 서열을 갖는 UCP4 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 235 (서열 405)의 뉴클레오티드 약 40 내지 약 1011 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 UCP4 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203134호의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203134호의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 236 (서열 406)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 323의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 236 (서열 406)의 잔기 1 내지 약 323의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

본 발명의 다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용하기에 충분한 길이의, UCP4 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, 이러한 단편은 도 235 (서열 405)의 서열에 포함된 약 20개 이상 내지 약 80개의 연속 염기를 함유한다. 임의로, 이러한 단편은 도 236 (서열 406)의 서열의 N-말단 또는 C-말단을 포함한다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 UCP4 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 UCP4 폴리펩티드를 제공하며, 이는 한 실시양태에서 도 236 (서열 406)의 잔기 1 내지 323의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 236 (서열 406)의 아미노산 잔기 1 내지 약 323의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 UCP4 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 236 (서열 406)의 잔기 1 내지 323의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 UCP4 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 236 (서열 406)의 아미노산 잔기 1 내지 약 323의 서열을 포함하는 단리된 UCP4 폴리펩티드, 또는 예를 들어 항-UCP4 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, UCP4 단편은 천연 UCP4 폴리펩티드의 적어도 하나의 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 236 (서열 406)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 323의 서열을 갖는 UCP4 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 UCP4 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-UCP4 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 UCP4 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 원하는 활성을 모니터하는, 천연 UCP4 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한 UCP4를 이용하는 치료 방법 및 진단 방법을 제공한다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 UCP4 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

119.PRO193

본원에서 "PRO193"으로 지칭되는 신규 다중-막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA23322-1393)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO193 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 238 (서열 410)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 158의 서열을 갖는 PRO193 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 237 (서열 409)의 잔기 약 138 내지 약 611 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO193 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203400호 (DNA23322-1393)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203400호 (DNA23322-1393)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 238 (서열 410)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 158의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 238 (서열 410)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 158의 서열을 갖는 PRO193 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 가용성 형태, 즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체인 PRO193 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 막횡단 도메인은PRO193 아미노산 서열 (도 238, 서열 410)에서 아미노산 약 23-42위, 60-80위, 97-117위 및 128-148위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 238 (서열 410)의 잔기 1 내지 약 158의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO193 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO193 폴리펩티드를 제공하며, 이는 한 실시양태에서 도 238 (서열 410)의 잔기 1 내지 158의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 238 (서열 410)의 아미노산 잔기 1 내지 약 158의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO193 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 238 (서열 410)의 잔기 1 내지 158의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO193 폴리펩티드에 관한 것이다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 238 (서열 410)의 아미노산 잔기 약 1 내지 약 158의 서열을 갖는 PRO193 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO193 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO193 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO193 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO193 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO193 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

120.PRO1130

본원에서 "PRO1130"으로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 사람 2-19 단백질을 코딩하는 핵산에 상동성을 갖는 cDNA 클론 (DNA59814-1486)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1130 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 240 (서열 415)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 16 내지 약 224의 서열을 갖는 PRO1130 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 239 (서열 414)의 뉴클레오티드 약 312 또는 약 357 내지 약 983 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1130 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203359호 (DNA59814-1486)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203359호 (DNA59814-1486)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 240 (서열 415)의 아미노산 잔기 1또는 약 16 내지 약 224의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 10개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 240 (서열 415)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 224의 서열을 갖는 PRO1130 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는, PRO1130 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 240 (서열 415)의 서열에서 아미노산 약 1위에서 약 15위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 240 (서열 415)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 224의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1130 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이고, 도 239 (서열 414)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1130 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1130 폴리펩티드를 제공하며, 이는 특정 실시양태에서 도 240 (서열 415)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 224의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 240 (서열 415)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 224의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1130 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 240 (서열 415)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 224의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1130 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 240 (서열 415)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 224의 서열을 포함하는 단리된 PRO1130 폴리펩티드, 또는 항-PRO1130 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1130 단편은 천연 PRO1130 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 240 (서열 415)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 16 내지 약 224의 서열을 갖는 PRO1130 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1130 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1130 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1130 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO1130 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1130 폴리펩티드 또는 상기 정의한바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

121.PRO1335

본원에서 "PRO1335"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는, 카르본산 안하이드라제를 코딩하는 핵산에 상동성을 갖는 cDNA 클론 (DNA62812-1594)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1335 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 242 (서열 423)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 16 내지 약 337의 서열을 갖는 PRO1335 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 241 (서열 422)의 뉴클레오티드 약 271 또는 약 316 내지 약 1281 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1335 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203248호 (DNA62812-1594)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203248호 (DNA62812-1594)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 242 (서열 423)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 337의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 180개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 242 (서열 423)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 337의 서열을 갖는 PRO1335 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는 PRO1335 폴리펩티드 및 그의 가용성, 즉, 막횡단 도메인이 결실되거나 불활성화된 변이체를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 242 (서열 423)의서열에서 아미노산 약 1위에서 약 15위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다. 막횡단 도메인은 PRO1335 아미노산 서열 (도 242, 서열 423)에서 아미노산 약 291위에서 약 310위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 242 (서열 423)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 337의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1335 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이고, 도 241 (서열 422)에 기재된 뉴클레오티드 서열로부터 유래할 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1335 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1335 폴리펩티드를 제공하며, 이는 특정 실시양태에서 도 242 (서열 423)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 337의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 242 (서열 423)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 337의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상,더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1335 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 242 (서열 423)의 잔기 1 또는 약 16 내지 약 337의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1335 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 242 (서열 423)의 아미노산 잔기 1 또는 약 16 내지 약 337의 서열을 포함하는 단리된 PRO1335 폴리펩티드, 또는 항-PRO1335 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1335 단편은 천연 PRO1335 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 242 (서열 423)의 아미노산 잔기 약 1 또는 약 16 내지 약 337의 서열을 갖는 PRO1335 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1335 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO1335 항체이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 천연 PRO1335 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는, 천연 PRO1335 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO1335 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 아고니스트 또는 길항제를 제약학상 허용되는 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다.

122.PRO1329

본원에서 "PRO1329"로 지칭되는 신규 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA66660-1585)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1329 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 244 (서열 429)의 아미노산 잔기 1 또는 약 17 내지 약 209의 서열을 갖는 PRO1329 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 243 (서열 428)의 잔기 약 138 내지 약 716 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1329 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203279호 (DNA66660-1585)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203279호 (DNA66660-1585)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 244 (서열 429)의 아미노산 잔기 약 17 내지 약 209의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 244 (서열 429)의 아미노산 잔기 약 17 내지 약 209의 서열을 갖는 PRO1329 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는, PRO1329 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 244 (서열 429)의 서열에서 아미노산 1위에서 약 16위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 244 (서열 429)의 잔기 17 내지 약 209의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1329 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1329 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1329 폴리펩티드를 제공하며, 이는 한 실시양태에서 도 244 (서열 429)의 잔기 17 내지 209의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 244 (서열 429)의 아미노산 잔기 17 내지 약 209의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1329 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 244 (서열 429)의 잔기 17 내지 209의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1329 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 244 (서열 429)의 아미노산 잔기 17 내지 약 209의 서열을 포함하는 단리된 PRO1329 폴리펩티드, 또는 항-PRO1329 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1329 단편은 천연 PRO1329 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 244 (서열 429)의 아미노산 잔기 약 17 내지 약 209의 서열을 갖는 PRO1329 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

123.PRO1550

본원에서 "PRO1550"으로 지칭되는 신규 분비형 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA76393-1664)를 확인하였다.

한 실시양태에서, 본 발명은 PRO1550 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 이 단리된 핵산은 (a) 도 246 (서열 431)의 아미노산 잔기 1 또는 약 31 내지 약 243의 서열을 갖는 PRO1550 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 245 (서열 430)의 잔기 약 228 내지 약 866 사이의 핵산의 상보체에 혼성화되는 DNA를 포함하는 PRO1550 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 혼성화 조건과 세척 조건 하에 일어난다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) ATCC 기탁번호 제203323호 (DNA76393-1664)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 핵산 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다. 바람직한 실시양태에서, 이 핵산은 ATCC 기탁번호 제203323호 (DNA76393-1664)의 사람 단백질 cDNA에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 도 246 (서열 431)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 243의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 뉴클레오티드 약 50개 이상, 바람직하게는 약 100개 이상을 갖고, 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 246 (서열 431)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 243의 서열을 갖는 PRO1550 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 시험 DNA 분자를 단리함으로써 제조되는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 N-말단 신호 서열 및(또는) 개시 메티오닌을 갖거나 갖지 않는, PRO1550 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 단리된 핵산 분자, 또는 이러한 코딩 핵산 분자의 상보체를 제공한다. 신호 펩티드는 도 246 (서열 431)의 서열에서 아미노산 1위에서 약 30위까지 걸쳐있는 것으로 잠정적으로 확인되었다.

다른 측면에서, 본 발명은 (a) 도 246 (서열 431)의 잔기 31 내지 약 243의아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 또는 (b) 상기 (a)의 DNA의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 실시양태는 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO1550 폴리펩티드 코딩 서열의 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 길이가 뉴클레오티드 약 20 내지 약 80개, 바람직하게는 약 20 내지 약 60개, 더욱 바람직하게는 약 20 내지 약 50개, 가장 바람직하게는 약 20 내지 약 40개이다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 확인된 임의의 단리된 핵산 서열에 의해 코딩되는 단리된 PRO1550 폴리펩티드를 제공한다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 단리된 천연 서열 PRO1550 폴리펩티드를 제공하며, 이는 한 실시양태에서 도 246 (서열 431)의 잔기 31 내지 243의 아미노산 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 본 발명은 도 246 (서열 431)의 아미노산 잔기 31 내지 약 243의 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1550 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 도 246 (서열 431)의 잔기 31 내지 243의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 가장 바람직하게는 약 95% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 PRO1550 폴리펩티드에 관한 것이다.

또 다른 측면에서, 본 발명은 도 246 (서열 431)의 아미노산 잔기 31 내지 약 243의 서열을 포함하는 단리된 PRO1550 폴리펩티드, 또는 항-PRO1550 항체에 대한 결합 부위를 제공하기에 충분한 그의 단편에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO1550 단편은 천연 PRO1550 폴리펩티드의 정성적인 생물학적 활성을 보유한다.

또한 추가의 측면에서, 본 발명은 (i) 시험 DNA 분자를 엄격한 조건 하에 (a) 도 246 (서열 431)의 아미노산 잔기 약 31 내지 약 243의 서열을 갖는 PRO1550 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와 혼성화시키고, 만일 이 시험 DNA 분자가 (a) 또는 (b)와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 가장 바람직하게는 약 95% 이상인 경우에 (ii) 이 시험 DNA 분자를 포함하는 숙주 세포를 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, (iii) 이 세포 배양물로부터 상기 폴리펩티드를 회수함으로써 제조된 폴리펩티드를 제공한다.

124.추가의 실시양태

본 발명의 다른 실시양태에서, 본 발명은 본원에서 상기한 폴리펩티드 중 임의의 것을 코딩하는 DNA를 함유하는 벡터를 제공한다. 또한 이러한 임의의 벡터를 포함하는 숙주 세포를 제공한다. 예로서, 숙주 세포는 CHO 세포, 대장균(E. coli) 또는 효모일 수 있다. 본원에 기재한 임의의 폴리펩티드를 생산하는 방법을 또한 제공하며, 이 방법은 숙주 세포를 원하는 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고 이 세포 배양물로부터 원하는 폴리펩티드를 회수하는 것을 포함한다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 이종 폴리펩티드 또는 아미노산 서열에 융합된 본원에 기재한 임의의 폴리펩티드를 포함하는 키메라 분자를 제공한다. 이러한 키메라 분자의 예로는 면역글로불린의 Fc 영역 또는 에피토프 태그 서열에 융합된 본원에 기재한 임의의 폴리펩티드를 포함한다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 또한 상기하거나 하기하는 폴리펩티드 중 임의의 것에 특이적으로 결합하는 항체를 제공한다. 임의로, 항체는 모노클로날 항체, 인간화 항체, 항체 단편 또는 단쇄 항체이다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 게놈 및 cDNA의 뉴클레오티드 서열을 단리하기에 유용한 올리고뉴클레오티드 프로브를 제공하며, 여기서 상기 프로브는 상기하거나 하기하는 뉴클레오티드 서열 중 임의의 것으로부터 유래될 수 있다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공한다.

한 측면에서, 상기 단리된 핵산 분자는 (a) 본원에 개시된 바와 같은 전장 아미노산 서열, 본원에 개시된 바와 같은 신호 펩티드가 결여된 아미노산 서열, 또는 본원에 개시된 바와 같은 신호 펩티드를 갖거나 갖지 않는 막횡단 단백질의 세포외 도메인을 갖는 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 81% 이상, 더욱 바람직하게는 약 82% 이상, 더욱 바람직하게는 약 83% 이상, 더욱 바람직하게는 약 84% 이상, 더욱 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 86% 이상, 더욱 바람직하게는 약 87% 이상, 더욱 바람직하게는 약 88% 이상, 더욱 바람직하게는 약89% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 더욱 바람직하게는 약 91% 이상, 더욱 바람직하게는 약 92% 이상, 더욱 바람직하게는 약 93% 이상, 더욱 바람직하게는 약 94% 이상, 더욱 바람직하게는 약 95% 이상, 더욱 바람직하게는 약 96% 이상, 더욱 바람직하게는 약 97% 이상, 더욱 바람직하게는 약 98% 이상, 더욱 바람직하게는 약 99% 이상인 뉴클레오티드 서열을 포함한다.

다른 측면에서, 상기 단리된 핵산 분자는 (a) 본원에 개시된 바와 같은 전장 PRO 폴리펩티드 cDNA의 코딩 서열, 본원에 개시된 바와 같은 신호 펩티드가 결여된 PRO 폴리펩티드의 코딩 서열, 또는 본원에 개시된 바와 같은 신호 펩티드를 갖거나 갖지 않는 막횡단 PRO 폴리펩티드의 세포외 도메인의 코딩 서열을 포함하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 81% 이상, 더욱 바람직하게는 약 82% 이상, 더욱 바람직하게는 약 83% 이상, 더욱 바람직하게는 약 84% 이상, 더욱 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 86% 이상, 더욱 바람직하게는 약 87% 이상, 더욱 바람직하게는 약 88% 이상, 더욱 바람직하게는 약 89% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 더욱 바람직하게는 약 91% 이상, 더욱 바람직하게는 약 92% 이상, 더욱 바람직하게는 약 93% 이상, 더욱 바람직하게는 약 94% 이상, 더욱 바람직하게는 약 95% 이상, 더욱 바람직하게는 약 96% 이상, 더욱 바람직하게는 약 97% 이상, 더욱 바람직하게는 약 98% 이상, 더욱 바람직하게는 약 99% 이상인 뉴클레오티드 서열을 포함한다.

추가의 측면에서, 본 발명은 (a) 본원에 개시된 바와 같은 ATCC에 기탁된 사람 단백질 cDNA 중 임의의 것에 의해 코딩되는 것과 동일한 성숙 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 분자 또는 (b) 상기 (a)의 DNA 분자의 상보체와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 81% 이상, 더욱 바람직하게는 약 82% 이상, 더욱 바람직하게는 약 83% 이상, 더욱 바람직하게는 약 84% 이상, 더욱 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 86% 이상, 더욱 바람직하게는 약 87% 이상, 더욱 바람직하게는 약 88% 이상, 더욱 바람직하게는 약 89% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 더욱 바람직하게는 약 91% 이상, 더욱 바람직하게는 약 92% 이상, 더욱 바람직하게는 약 93% 이상, 더욱 바람직하게는 약 94% 이상, 더욱 바람직하게는 약 95% 이상, 더욱 바람직하게는 약 96% 이상, 더욱 바람직하게는 약 97% 이상, 더욱 바람직하게는 약 98% 이상, 더욱 바람직하게는 약 99% 이상인 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 핵산 분자에 관한 것이다.

다른 측면에서 본 발명은 막횡단 도메인이 결실되거나 막횡단 도메인이 불활성화된 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열, 또는 이러한 코딩 뉴클레오티드 서열의 상보체를 포함하는 단리된 핵산 분자를 제공하며, 그러한 폴리펩티드의 막횡단 도메인(들)을 본원에 개시한다. 따라서, 본원에 기재된 PRO 폴리펩티드들의 가용성 세포외 도메인이 고려된다.

다른 실시양태는 예를 들어 혼성화 프로브로서 이용할 수 있는 PRO 폴리펩티드 코딩 서열의 단편, 또는 항-PRO 항체에 대한 결합 부위를 포함하는 폴리펩티드를 임의로 코딩할 수 있는 PRO 폴리펩티드의 코딩 단편에 관한 것이다. 이러한 핵산 단편은 일반적으로 길이가 뉴클레오티드 약 20개 이상, 바람직하게는 약 30개 이상, 더 바람직하게는 약 40개 이상, 더 바람직하게는 약 50개 이상, 더 바람직하게는 약 60개 이상, 더 바람직하게는 약 70개 이상, 더 바람직하게는 약 80개 이상, 더 바람직하게는 약 90개 이상, 더 바람직하게는 약 100개 이상, 더 바람직하게는 약 110개 이상, 더 바람직하게는 약 120개 이상, 더 바람직하게는 약 130개 이상, 더 바람직하게는 약 140개 이상, 더 바람직하게는 약 150개 이상, 더 바람직하게는 약 160개 이상, 더 바람직하게는 약 170개 이상, 더 바람직하게는 약 180개 이상, 더 바람직하게는 약 190개 이상, 더 바람직하게는 약 200개 이상, 더 바람직하게는 약 250개 이상, 더 바람직하게는 약 300개 이상, 더 바람직하게는 약 350개 이상, 더 바람직하게는 약 400개 이상, 더 바람직하게는 약 450개 이상, 더 바람직하게는 약 500개 이상, 더 바람직하게는 약 600개 이상, 더 바람직하게는 약 700개 이상, 더 바람직하게는 약 800개 이상, 더 바람직하게는 약 900개 이상, 더 바람직하게는 약 1000개 이상이며, 이 때 본 문맥에서 용어 "약"은 언급한 뉴클레오티드 서열 길이±이 길이의 10%를 의미한다. PRO 폴리펩티드 코딩 뉴클레오티드 서열의 신규 단편은, PRO 폴리펩티드 코딩 뉴클레오티드 서열을 다른 공지의 뉴클레오티드 서열을 사용하여 많은 잘 알려진 서열 정렬 프로그램 중 임의의 것을 이용하여 정렬시키고, PRO 폴리펩티드 코딩 뉴클레오티드 서열 단편(들)이 신규한 것인지를 결정함으로써 일상적인 방식으로 결정할 수 있음을 알아야 한다. 이러한 PRO 폴리펩티드 코딩 뉴클레오티드 서열 모두가 본원에서 고려된다. 또한 이들 뉴클레오티드 분자 단편에 의해 코딩되는 PRO 폴리펩티드 단편, 바람직하게는 항-PRO 항체에 대한 결합 부위를 포함하는 PRO 폴리펩티드 단편들도 고려된다.

다른 실시양태에서, 본 발명은 상기에서 확인된 단리된 핵산 서열들 중 임의의 것에 의해 코딩되는 단리된 PRO 폴리펩티드를 제공한다.

특정 측면에서, 본 발명은 본원에 개시된 바와 같은 전장 아미노산 서열, 본원에 개시된 바와 같은 신호 펩티드가 결여된 아미노산 서열, 또는 본원에 개시된 바와 같은 신호 펩티드를 갖거나 갖지 않는 막횡단 단백질의 세포외 도메인을 갖는 PRO 폴리펩티드와의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 81% 이상, 더욱 바람직하게는 약 82% 이상, 더욱 바람직하게는 약 83% 이상, 더욱 바람직하게는 약 84% 이상, 더욱 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 86% 이상, 더욱 바람직하게는 약 87% 이상, 더욱 바람직하게는 약 88% 이상, 더욱 바람직하게는 약 89% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 더욱 바람직하게는 약 91% 이상, 더욱 바람직하게는 92% 이상, 더욱 바람직하게는 약 93% 이상, 더욱 바람직하게는 약 94% 이상, 더욱 바람직하게는 약 95% 이상, 더욱 바람직하게는 약 96% 이상, 더욱 바람직하게는 약 97% 이상, 더욱 바람직하게는 약 98% 이상, 더욱 바람직하게는 약 99% 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 본원에 개시된 바와 같은 ATCC에 기탁된 사람 단백질 cDNA들 중 임의의 것에 의해 코딩되는 아미노산 서열과의 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 81% 이상, 더욱 바람직하게는 약 82% 이상, 더욱 바람직하게는 약 83% 이상, 더욱 바람직하게는 약 84% 이상, 더욱 바람직하게는 약 85% 이상, 더욱 바람직하게는 약 86% 이상, 더욱 바람직하게는 약 87% 이상, 더욱 바람직하게는 약 88% 이상, 더욱 바람직하게는 약 89% 이상, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상, 더욱 바람직하게는 약 91% 이상, 더욱 바람직하게는 92% 이상, 더욱 바람직하게는 약 93% 이상, 더욱 바람직하게는 약 94% 이상, 더욱 바람직하게는 약 95% 이상, 더욱 바람직하게는 약 96% 이상, 더욱 바람직하게는 약 97% 이상, 더욱 바람직하게는 약 98% 이상, 더욱 바람직하게는 약 99% 이상인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO 폴리펩티드에 관한 것이다.

추가의 측면에서, 본 발명은 본원에 개시된 바와 같은 전장 아미노산 서열, 본원에 개시된 바와 같은 신호 펩티드가 결여된 아미노산 서열, 또는 본원에 개시된 바와 같은 신호 펩티드를 갖거나 갖지 않는 막횡단 단백질의 세포외 도메인을 갖는 PRO 폴리펩티드의 아미노산 서열과 비교할 때 약 80% 이상의 양성, 바람직하게는 약 81% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 82% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 83% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 84% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 85% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 86% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 87% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 88% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 89% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 90% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 91% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 92% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 93% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 94% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 95% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 96% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 97% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 98% 이상의 양성, 더욱 바람직하게는 약 99% 이상의 양성을 기록하는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 PRO 폴리펩티드에 관한 것이다.

구체적인 측면에서, 본 발명은 상기한 바와 같은 아미노산 서열을 코딩하는뉴클레오티드 서열에 의해 코딩되며, N-말단 신호 펩티드 및(또는) 개시 메티오닌을 갖지 않는 단리된 PRO 폴리펩티드를 제공한다. 또한 상기한 단리된 PRO 폴리펩티드의 제조 방법도 본원에 기재하며, 이들 방법은 적절한 코딩 핵산 분자를 함유하는 벡터를 포함하는 숙수 세포를 PRO 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, 이 세포 배양물로부터 PRO 폴리펩티드를 회수하는 것을 포함한다.

다른 측면에서 본 발명은 막횡단 도메인이 결실되거나 막횡단 도메인이 불활성화된 단리된 PRO 폴리펩티드를 제공한다. 또한 상기한 단리된 PRO 폴리펩티드의 제조 방법도 본원에 기재하며, 이들 방법은 적절한 코딩 핵산 분자를 함유하는 벡터를 포함하는 숙수 세포를 PRO 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건 하에 배양하고, 이 세포 배양물로부터 PRO 폴리펩티드를 회수하는 것을 포함한다.

또 다른 실시양태에서, 본 발명은 상기 정의한 바와 같은 천연 PRO 폴리펩티드의 아고니스트 및 길항제에 관한 것이다. 특정한 실시양태에서, 아고니스트 또는 길항제는 항-PRO 항체 또는 소분자이다.

추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO 폴리펩티드를 후보 분자와 접촉시켜 이 PRO 폴리펩티드에 의해 매개되는 생물학적 활성을 모니터하는 것을 포함하는 PRO 폴리펩티드에 대한 아고니스트 또는 길항제의 확인 방법에 관한 것이다. 바람직하게는, PRO 폴리펩티드는 천연 PRO 폴리펩티드이다.

또한 추가의 실시양태에서, 본 발명은 PRO 폴리펩티드 또는 상기 정의한 바와 같은 PRO 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 담체와 함께 포함하는 조성물에 관한 것이다. 임의로, 상기 담체는 제약학상 허용되는 담체이다.

본 발명의 다른 실시양태는 PRO 폴리펩티드, 또는 상기한 바와 같은 그의 아고니스트 또는 길항제, 또는 항-PRO 항체의, PRO 폴리펩티드, 그의 아고니스트 또는 길항제 또는 항-PRO 항체에 반응성인 질환 치료용 의약의 제조에 있어서의 용도에 관한 것이다.

본 발명은 일반적으로 신규 DNA의 확인 (identification) 및 분리와 신규 폴리펩티드의 재조합 생산에 관한 것이다.

도 1은 천연 서열 PRO1560 (UNQ767) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 3)을 도시하며, 여기서 서열 3은 본원에서 "DNA19902-1669"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 2는 도 1에 나타낸 서열 3의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 4)이다.

도 3은 천연 서열 PRO444 (UNQ328) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 5)을 도시하며, 여기서 서열 5는 본원에서 "DNA26846-1397"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 4는 도 3에 나타낸 서열 5의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 6)이다.

도 5는 천연 서열 PRO1018 (UNQ501) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 7)을 도시하며, 여기서 서열 7은 본원에서 "DNA56107-1415"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 6은 도 5에 나타낸 서열 7의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 8)이다.

도 7은 천연 서열 PRO1773 (UNQ835) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 9)을 도시하며, 여기서 서열 9는 본원에서 "DNA56406-1704"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 8은 도 7에 나타낸 서열 9의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 10)이다.

도 9는 천연 서열 PRO1477 (UNQ747) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 11)을 도시하며, 여기서 서열 11은 본원에서 "DNA56529-1647"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 10은 도 9에 나타낸 서열 11의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 12)이다.

도 11은 천연 서열 PRO1478 (UNQ748) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 16)을 도시하며, 여기서 서열 16은 본원에서 "DNA56531-1648"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 12는 도 11에 나타낸 서열 16의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 17)이다.

도 13은 천연 서열 PRO831 (UNQ471) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 21)을 도시하며, 여기서 서열 21은 본원에서 "DNA56862-1343"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 14는 도 13에 나타낸 서열 21의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 22)이다.

도 15는 천연 서열 PRO1113 (UNQ556) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 23)을 도시하며, 여기서 서열 23은 본원에서 "DNA57254-1477"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 16은 도 15에 나타낸 서열 23의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 24)이다.

도 17은 천연 서열 PRO1194 (UNQ607) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 28)을 도시하며, 여기서 서열 28은 본원에서 "DNA57841-1522"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 18은 도 17에 나타낸 서열 28의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 29)이다.

도 19는 천연 서열 PRO1110 (UNQ553) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 30)을 도시하며, 여기서 서열 30은 본원에서 "DNA58727-1474"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 20은 도 19에 나타낸 서열 30의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 31)이다.

도 21은 천연 서열 PRO1378 (UNQ715) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 32)을 도시하며, 여기서 서열 32은 본원에서 "DNA58730-1607"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 22는 도 21에 나타낸 서열 32의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 33)이다.

도 23은 천연 서열 PRO1481 (UNQ750) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 40)을 도시하며, 여기서 서열 40은 본원에서 "DNA58732-1650"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 24는 도 23에 나타낸 서열 40의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 41)이다.

도 25는 천연 서열 PRO1189 (UNQ603) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 42)을 도시하며, 여기서 서열 42은 본원에서 "DNA58828-1519"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 26은 도 25에 나타낸 서열 42의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 43)이다.

도 27은 천연 서열 PRO1415 (UNQ731) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 49)을 도시하며, 여기서 서열 49는 본원에서 "DNA58852-1637"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 28은 도 27에 나타낸 서열 49의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 50)이다.

도 29는 천연 서열 PRO1411 (UNQ729) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 51)을 도시하며, 여기서 서열 51은 본원에서 "DNA59212-1627"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 30은 도 29에 나타낸 서열 51의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 52)이다.

도 31은 천연 서열 PRO1295 (UNQ664) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 53)을 도시하며, 여기서 서열 53은 본원에서 "DNA59218-1559"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 32는 도 31에 나타낸 서열 53의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 54)이다.

도 33은 천연 서열 PRO1359 (UNQ708) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 55)을 도시하며, 여기서 서열 55는 본원에서 "DNA59219-1613"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 34는 도 33에 나타낸 서열 55의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 56)이다.

도 35는 천연 서열 PRO1190 (UNQ604) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 57)을 도시하며, 여기서 서열 57은 본원에서 "DNA59586-1520"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 36은 도 35에 나타낸 서열 57의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 58)이다.

도 37은 천연 서열 PRO1772 (UNQ834) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 62)을 도시하며, 여기서 서열 62는 본원에서 "DNA59817-1703"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 38은 도 37에 나타낸 서열 62의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 63)이다.

도 39는 천연 서열 PRO1248 (UNQ631) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 67)을 도시하며, 여기서 서열 67은 본원에서 "DNA60278-1530"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 40은 도 39에 나타낸 서열 67의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 68)이다.

도 41은 천연 서열 PRO1316 (UNQ682) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 69)을 도시하며, 여기서 서열 69는 본원에서 "DNA60608-1577"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 42는 도 41에 나타낸 서열 69의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 70)이다.

도 43은 천연 서열 PRO1197 (UNQ610) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 71)을 도시하며, 여기서 서열 71은 본원에서 "DNA60611-1524"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 44는 도 43에 나타낸 서열 71의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 72)이다.

도 45는 천연 서열 PRO1293 (UNQ662) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 76)을 도시하며, 여기서 서열 76은 본원에서 "DNA60618-1557"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 46은 도 45에 나타낸 서열 76의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 77)이다.

도 47은 천연 서열 PRO1380 (UNQ717) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 78)을 도시하며, 여기서 서열 78은 본원에서 "DNA60740-1615"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 48은 도 47에 나타낸 서열 78의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 79)이다.

도 49는 천연 서열 PRO1265 (UNQ636) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 83)을 도시하며, 여기서 서열 83은 본원에서 "DNA60764-1533"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 50은 도 49에 나타낸 서열 83의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 84)이다.

도 51은 천연 서열 PRO1250 (UNQ633) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 85)을 도시하며, 여기서 서열 85는 본원에서 "DNA60775-1532"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 52는 도 51에 나타낸 서열 85의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 86)이다.

도 53은 천연 서열 PRO1475 (UNQ746) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 87)을 도시하며, 여기서 서열 87은 본원에서 "DNA61185-1646"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 54는 도 53에 나타낸 서열 87의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 88)이다.

도 55는 천연 서열 PRO1377 (UNQ714) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 94)을 도시하며, 여기서 서열 94는 본원에서 "DNA61608-1606"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 56은 도 55에 나타낸 서열 94의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 95)이다.

도 57은 천연 서열 PRO1326 (UNQ686) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 99)을 도시하며, 여기서 서열 99는 본원에서 "DNA62808-1582"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 58은 도 57에 나타낸 서열 99의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 100)이다.

도 59는 천연 서열 PRO1249 (UNQ632) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 101)을 도시하며, 여기서 서열 101은 본원에서 "DNA62809-1531"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 60은 도 59에 나타낸 서열 101의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 102)이다.

도 61은 천연 서열 PRO1315 (UNQ681) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 103)을 도시하며, 여기서 서열 103은 본원에서 "DNA62815-1578"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 62는 도 61에 나타낸 서열 103의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 104)이다.

도 63은 천연 서열 PRO1549 (UNQ782) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 110)을 도시하며, 여기서 서열 110은 본원에서 "DNA62845-1684"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 64는 도 63에 나타낸 서열 110의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 111)이다.

도 65는 천연 서열 PRO1430 (UNQ736) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 115)을 도시하며, 여기서 서열 115는 본원에서 "DNA64842-1632"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 66은 도 65에 나타낸 서열 115의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 116)이다.

도 67은 천연 서열 PRO1374 (UNQ711) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 117)을 도시하며, 여기서 서열 117은 본원에서 "DNA64849-1604"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 68은 도 67에 나타낸 서열 117의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 118)이다.

도 69는 천연 서열 PRO1311 (UNQ677) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 122)을 도시하며, 여기서 서열 122는 본원에서 "DNA64863-1573"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 70은 도 69에 나타낸 서열 122의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 123)이다.

도 71은 천연 서열 PRO1357 (UNQ706) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 127)을 도시하며, 여기서 서열 127은 본원에서 "DNA64881-1602"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 72는 도 71에 나타낸 서열 127의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 128)이다.

도 73은 천연 서열 PRO1244 (UNQ628) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 129)을 도시하며, 여기서 서열 129는 본원에서 "DNA64883-1526"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 74는 도 73에 나타낸 서열 129의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 130)이다.

도 75는 천연 서열 PRO1246 (UNQ630) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 131)을 도시하며, 여기서 서열 131은 본원에서 "DNA64885-1529"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 76은 도 75에 나타낸 서열 131의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 132)이다.

도 77은 천연 서열 PRO1356 (UNQ705) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 133)을 도시하며, 여기서 서열 133은 본원에서 "DNA64886-1601"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 78은 도 77에 나타낸 서열 133의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 134)이다.

도 79는 천연 서열 PRO1275 (UNQ645) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 135)을 도시하며, 여기서 서열 135는 본원에서 "DNA64888-1542"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 80은 도 79에 나타낸 서열 135의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 136)이다.

도 81은 천연 서열 PRO1274 (UNQ644) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 137)을 도시하며, 여기서 서열 137은 본원에서 "DNA64889-1542"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 82는 도 81에 나타낸 서열 137의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 138)이다.

도 83은 천연 서열 PRO1412 (UNQ730) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 139)을 도시하며, 여기서 서열 139는 본원에서 "DNA64897-1628"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 84는 도 83에 나타낸 서열 139의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 140)이다.

도 85는 천연 서열 PRO1557 (UNQ765) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 141)을 도시하며, 여기서 서열 141은 본원에서 "DNA64902-1667"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 86은 도 85에 나타낸 서열 141의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 142)이다.

도 87은 천연 서열 PRO1286 (UNQ655) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 143)을 도시하며, 여기서 서열 143은 본원에서 "DNA64903-1553"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 88은 도 87에 나타낸 서열 143의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 144)이다.

도 89는 천연 서열 PRO1294 (UNQ663) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 145)을 도시하며, 여기서 서열 145는 본원에서 "DNA64905-1558"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 90은 도 89에 나타낸 서열 145의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 146)이다.

도 91은 천연 서열 PRO1347 (UNQ702) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 147)을 도시하며, 여기서 서열 147은 본원에서 "DNA64950-1590"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 92는 도 91에 나타낸 서열 147의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 148)이다.

도 93은 천연 서열 PRO1305 (UNQ671) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 152)을 도시하며, 여기서 서열 152는 본원에서 "DNA64952-1568"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 94는 도 93에 나타낸 서열 152의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 153)이다.

도 95는 천연 서열 PRO1273 (UNQ643) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 157)을 도시하며, 여기서 서열 157은 본원에서 "DNA65402-1540"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 96은 도 95에 나타낸 서열 157의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 158)이다.

도 97은 천연 서열 PRO1302 (UNQ668) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 159)을 도시하며, 여기서 서열 159는 본원에서 "DNA65403-1565"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 98은 도 97에 나타낸 서열 159의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 160)이다.

도 99는 천연 서열 PRO1283 (UNQ653) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 161)을 도시하며, 여기서 서열 161은 본원에서 "DNA65404-1551"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 100은 도 99에 나타낸 서열 161의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 162)이다.

도 101은 천연 서열 PRO1279 (UNQ649) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 169)을 도시하며, 여기서 서열 169는 본원에서 "DNA65405-1547"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 102는 도 101에 나타낸 서열 169의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 170)이다.

도 103은 천연 서열 PRO1304 (UNQ670) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 179)을 도시하며, 여기서 서열 179는 본원에서 "DNA65406-1567"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 104는 도 103에 나타낸 서열 179의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 180)이다.

도 105는 천연 서열 PRO1317 (UNQ683) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 188)을 도시하며, 여기서 서열 188은 본원에서 "DNA65408-1578"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 106은 도 105에 나타낸 서열 188의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 189)이다.

도 107은 천연 서열 PRO1303 (UNQ669) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 193)을 도시하며, 여기서 서열 193은 본원에서 "DNA65409-1566"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 108은 도 107에 나타낸 서열 193의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 194)이다.

도 109는 천연 서열 PRO1306 (UNQ672) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 195)을 도시하며, 여기서 서열 195는 본원에서 "DNA65410-1569"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 110은 도 109에 나타낸 서열 195의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 196)이다.

도 111A-B는 천연 서열 PRO1336 (UNQ691) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 197)을 도시하며, 여기서 서열 197은 본원에서 "DNA65423-1595"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 112는 도 111A-B에 나타낸 서열 197의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 198)이다.

도 113은 천연 서열 PRO1278 (UNQ648) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 202)을 도시하며, 여기서 서열 202는 본원에서 "DNA66304-1546"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 114는 도 113에 나타낸 서열 202의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 203)이다.

도 115는 천연 서열 PRO1298 (UNQ666) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 209)을 도시하며, 여기서 서열 209는 본원에서 "DNA66511-1563"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 116은 도 115에 나타낸 서열 209의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 210)이다.

도 117은 천연 서열 PRO1301 (UNQ667) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 211)을 도시하며, 여기서 서열 211은 본원에서 "DNA66512-1564"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 118은 도 117에 나타낸 서열 211의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 212)이다.

도 119는 천연 서열 PRO1268 (UNQ638) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 213)을 도시하며, 여기서 서열 213은 본원에서 "DNA66519-1535"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 120은 도 119에 나타낸 서열 213의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 214)이다.

도 121은 천연 서열 PRO1269 (UNQ639) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 215)을 도시하며, 여기서 서열 215는 본원에서 "DNA66520-1536"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 122는 도 121에 나타낸 서열 215의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 216)이다.

도 123은 천연 서열 PRO1327 (UNQ687) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 217)을 도시하며, 여기서 서열 217은 본원에서 "DNA66521-1583"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 124는 도 123에 나타낸 서열 217의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 218)이다.

도 125는 천연 서열 PRO1382 (UNQ718) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 219)을 도시하며, 여기서 서열 219는 본원에서 "DNA66526-1616"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 126은 도 125에 나타낸 서열 219의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 220)이다.

도 127은 천연 서열 PRO1328 (UNQ688) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 224)을 도시하며, 여기서 서열 224은 본원에서 "DNA66658-1584"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 128은 도 127에 나타낸 서열 224의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 225)이다.

도 129는 천연 서열 PRO1325 (UNQ685) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 226)을 도시하며, 여기서 서열 226은 본원에서 "DNA66659-1593"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 130은 도 129에 나타낸 서열 226의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 227)이다.

도 131은 천연 서열 PRO1340 (UNQ695) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 228)을 도시하며, 여기서 서열 228은 본원에서 "DNA66663-1598"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 132는 도 131에 나타낸 서열 228의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 229)이다.

도 133은 천연 서열 PRO1339 (UNQ694) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 233)을 도시하며, 여기서 서열 233은 본원에서 "DNA66669-1597"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 134는 도 133에 나타낸 서열 233의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 234)이다.

도 135는 천연 서열 PRO1337 (UNQ692) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 235)을 도시하며, 여기서 서열 235는 본원에서 "DNA66672-1586"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 136은 도 135에 나타낸 서열 235의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 236)이다.

도 137은 천연 서열 PRO1342 (UNQ697) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 242)을 도시하며, 여기서 서열 242는 본원에서 "DNA66674-1599"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 138은 도 137에 나타낸 서열 242의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 243)이다.

도 139는 천연 서열 PRO1343 (UNQ698) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 247)을 도시하며, 여기서 서열 247은 본원에서 "DNA66675-1587"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 140은 도 139에 나타낸 서열 247의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 248)이다.

도 141은 천연 서열 PRO1480 (UNQ749) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 252)을 도시하며, 여기서 서열 252는 본원에서 "DNA67962-1649"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 142는 도 141에 나타낸 서열 252의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 253)이다.

도 143A-B는 천연 서열 PRO1487 (UNQ756) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 259)을 도시하며, 여기서 서열 259는 본원에서 "DNA68836-1656"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 144는 도 143A-B에 나타낸 서열 259의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 260)이다.

도 145는 천연 서열 PRO1418 (UNQ732) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 264)을 도시하며, 여기서 서열 264는 본원에서 "DNA68864-1629"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 146은 도 145에 나타낸 서열 264의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 265)이다.

도 147은 천연 서열 PRO1472 (UNQ744) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 266)을 도시하며, 여기서 서열 266은 본원에서 "DNA68866-1644"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 148은 도 147에 나타낸 서열 266의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 267)이다.

도 149는 천연 서열 PRO1461 (UNQ742) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 268)을 도시하며, 여기서 서열 268은 본원에서 "DNA68871-1638"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 150은 도 149에 나타낸 서열 268의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 269)이다.

도 151은 천연 서열 PRO1410 (UNQ728) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 270)을 도시하며, 여기서 서열 270은 본원에서 "DNA68874-1622"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 152는 도 151에 나타낸 서열 270의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 271)이다.

도 153은 천연 서열 PRO1568 (UNQ774) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 272)을 도시하며, 여기서 서열 272는 본원에서 "DNA68880-1676"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 154는 도 153에 나타낸 서열 272의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 273)이다.

도 155는 천연 서열 PRO1570 (UNQ776) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 274)을 도시하며, 여기서 서열 274는 본원에서 "DNA68885-1678"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 156은 도 155에 나타낸 서열 274의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 275)이다.

도 157은 천연 서열 PRO1317 (UNQ783) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 276)을 도시하며, 여기서 서열 276은 본원에서 "DNA71166-1685"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 158은 도 157에 나타낸 서열 276의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 277)이다.

도 159는 천연 서열 PRO1780 (UNQ842) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 281)을 도시하며, 여기서 서열 281은 본원에서 "DNA71169-1709"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 160은 도 159에 나타낸 서열 281의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 282)이다.

도 161은 천연 서열 PRO1486 (UNQ755) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 286)을 도시하며, 여기서 서열 286은 본원에서 "DNA71180-1655"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 162는 도 161에 나타낸 서열 286의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 287)이다.

도 163은 천연 서열 PRO1433 (UNQ738) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 291)을 도시하며, 여기서 서열 291은 본원에서 "DNA71184-1634"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 164는 도 163에 나타낸 서열 291의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 292)이다.

도 165는 천연 서열 PRO1490 (UNQ759) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 296)을 도시하며, 여기서 서열 296은 본원에서 "DNA71213-1659"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 166은 도 165에 나타낸 서열 296의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 297)이다.

도 167은 천연 서열 PRO1482 (UNQ751) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 301)을 도시하며, 여기서 서열 301은 본원에서 "DNA71234-1651"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 168은 도 167에 나타낸 서열 301의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 302)이다.

도 169는 천연 서열 PRO1446 (UNQ740) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 303)을 도시하며, 여기서 서열 303은 본원에서 "DNA71277-1636"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 170은 도 169에 나타낸 서열 303의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 304)이다.

도 171은 천연 서열 PRO1558 (UNQ766) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 305)을 도시하며, 여기서 서열 305는 본원에서 "DNA71282-1668"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 172는 도 171에 나타낸 서열 305의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 306)이다.

도 173은 천연 서열 PRO1604 (UNQ785) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 307)을 도시하며, 여기서 서열 307은 본원에서 "DNA71286-1687"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 174는 도 173에 나타낸 서열 307의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 308)이다.

도 175는 천연 서열 PRO1491 (UNQ760) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 309)을 도시하며, 여기서 서열 309는 본원에서 "DNA71883-1660"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 176은 도 175에 나타낸 서열 309의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 310)이다.

도 177은 천연 서열 PRO1431 (UNQ737) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 314)을 도시하며, 여기서 서열 314는 본원에서 "DNA73401-1633"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 178은 도 177에 나타낸 서열 314의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 315)이다.

도 179A-B는 천연 서열 PRO1563 (UNQ769) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 316)을 도시하며, 여기서 서열 316은 본원에서 "DNA73492-1671"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 180은 도 179A-B에 나타낸 서열 316의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 317)이다.

도 181은 천연 서열 PRO1565 (UNQ771) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 321)을 도시하며, 여기서 서열 321은 본원에서 "DNA73727-1673"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 182는 도 181에 나타낸 서열 321의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 322)이다.

도 183은 천연 서열 PRO1571 (UNQ777) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 323)을 도시하며, 여기서 서열 323은 본원에서 "DNA73730-1679"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 184는 도 183에 나타낸 서열 323의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 324)이다.

도 185는 천연 서열 PRO1572 (UNQ778) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 325)을 도시하며, 여기서 서열 325는 본원에서 "DNA73734-1680"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 186은 도 185에 나타낸 서열 325의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 326)이다.

도 187은 천연 서열 PRO1573 (UNQ779) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 327)을 도시하며, 여기서 서열 327은 본원에서 "DNA73735-1681"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 188은 도 187에 나타낸 서열 327의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 328)이다.

도 189는 천연 서열 PRO1488 (UNQ757) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 329)을 도시하며, 여기서 서열 329는 본원에서 "DNA73736-1657"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 190은 도 189에 나타낸 서열 329의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 330)이다.

도 191은 천연 서열 PRO1489 (UNQ758) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 331)을 도시하며, 여기서 서열 331은 본원에서 "DNA73737-1658"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 192는 도 191에 나타낸 서열 331의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 332)이다.

도 193은 천연 서열 PRO1474 (UNQ745) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 333)을 도시하며, 여기서 서열 333은 본원에서 "DNA73739-1645"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 194는 도 193에 나타낸 서열 333의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 334)이다.

도 195는 천연 서열 PRO1508 (UNQ761) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 335)을 도시하며, 여기서 서열 335는 본원에서 "DNA73742-1662"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 196은 도 195에 나타낸 서열 335의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 336)이다.

도 197은 천연 서열 PRO1555 (UNQ763) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 337)을 도시하며, 여기서 서열 337은 본원에서 "DNA73744-1665"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 198은 도 197에 나타낸 서열 337의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 338)이다.

도 199는 천연 서열 PRO1485 (UNQ754) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 339)을 도시하며, 여기서 서열 339는 본원에서 "DNA73746-1654"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 200은 도 199에 나타낸 서열 339의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 340)이다.

도 201은 천연 서열 PRO1564 (UNQ770) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 346)을 도시하며, 여기서 서열 346은 본원에서 "DNA73760-1672"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 202는 도 201에 나타낸 서열 346의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 347)이다.

도 203은 천연 서열 PRO1755 (UNQ828) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 351)을 도시하며, 여기서 서열 351은 본원에서 "DNA76396-1698"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 204는 도 203에 나타낸 서열 351의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 352)이다.

도 205는 천연 서열 PRO1757 (UNQ830) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 353)을 도시하며, 여기서 서열 353은 본원에서 "DNA76398-1699"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 206은 도 205에 나타낸 서열 353의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 354)이다.

도 207은 천연 서열 PRO1758 (UNQ831) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 355)을 도시하며, 여기서 서열 355는 본원에서 "DNA76399-1700"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 208은 도 207에 나타낸 서열 355의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 356)이다.

도 209는 천연 서열 PRO1575 (UNQ781) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 357)을 도시하며, 여기서 서열 357은 본원에서 "DNA76401-1683"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 210은 도 209에 나타낸 서열 357의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 358)이다.

도 211은 천연 서열 PRO1787 (UNQ849) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 363)을 도시하며, 여기서 서열 363은 본원에서 "DNA76510-2504"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 212는 도 211에 나타낸 서열 363의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 364)이다.

도 213은 천연 서열 PRO1781 (UNQ843) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 365)을 도시하며, 여기서 서열 365는 본원에서 "DNA76522-2500"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 214는 도 213에 나타낸 서열 365의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 366)이다.

도 215는 천연 서열 PRO1556 (UNQ764) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 371)을 도시하며, 여기서 서열 371은 본원에서 "DNA76529-1666"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 216은 도 215에 나타낸 서열 371의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 372)이다.

도 217은 천연 서열 PRO1759 (UNQ832) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 373)을 도시하며, 여기서 서열 373은 본원에서 "DNA76531-1701"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 218은 도 217에 나타낸 서열 373의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 374)이다.

도 219는 천연 서열 PRO1760 (UNQ833) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 375)을 도시하며, 여기서 서열 375는 본원에서 "DNA76532-1702"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 220은 도 219에 나타낸 서열 375의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 376)이다.

도 221은 천연 서열 PRO1561 (UNQ768) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 377)을 도시하며, 여기서 서열 377은 본원에서 "DNA76538-1670"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 222는 도 221에 나타낸 서열 377의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 378)이다.

도 223은 천연 서열 PRO1567 (UNQ773) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 382)을 도시하며, 여기서 서열 382는 본원에서 "DNA76541-1675"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 224는 도 223에 나타낸 서열 382의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 383)이다.

도 225는 천연 서열 PRO1693 (UNQ803) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 384)을 도시하며, 여기서 서열 384는 본원에서 "DNA77301-1693"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 226은 도 225에 나타낸 서열 384의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 385)이다.

도 227은 천연 서열 PRO1784 (UNQ846) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 389)을 도시하며, 여기서 서열 389는 본원에서 "DNA77303-2502"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 228은 도 227에 나타낸 서열 389의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 390)이다.

도 229는 천연 서열 PRO1605 (UNQ786) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 394)을 도시하며, 여기서 서열 394는 본원에서 "DNA77648-1688"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 230은 도 229에 나타낸 서열 394의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 395)이다.

도 231은 천연 서열 PRO1788 (UNQ850) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 396)을 도시하며, 여기서 서열 396은 본원에서 "DNA77652-2505"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 232는 도 231에 나타낸 서열 396의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 397)이다.

도 233은 천연 서열 PRO1801 (UNQ852) cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 401)을 도시하며, 여기서 서열 401은 본원에서 "DNA83500-2506"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 234는 도 233에 나타낸 서열 401의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 402)이다.

도 235는 천연 서열 UCP4 cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 405)을 도시하며, 여기서 서열 405는 본원에서 "DNA77568-1626"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 236은 도 235에 나타낸 서열 405의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 406)이다.

도 237은 천연 서열 PRO193 cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 409)을 도시하며, 여기서 서열 409는 본원에서 "DNA23322-1393"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 238은 도 237에 나타낸 서열 409의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 410)이다.

도 239는 천연 서열 PRO1130 cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 414)을 도시하며, 여기서 서열 414는 본원에서 "DNA59814-1486"으로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 240은 도 239에 나타낸 서열 414의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 415)이다.

도 241은 천연 서열 PRO1335 cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 422)을 도시하며, 여기서 서열 422는 본원에서 "DNA62812-1594"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 242는 도 241에 나타낸 서열 422의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 423)이다.

도 243은 천연 서열 PRO1329 cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 428)을 도시하며, 여기서 서열 428은 본원에서 "DNA66660-1585"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 244는 도 243에 나타낸 서열 428의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 429)이다.

도 245는 천연 서열 PRO1550 cDNA의 뉴클레오티드 서열 (서열 430)을 도시하며, 여기서 서열 430은 본원에서 "DNA76393-1664"로 지칭되는 클론이다. 개시 코돈과 정지 코돈은 굵고 밑줄친 활자로 나타냈다.

도 246은 도 245에 나타낸 서열 430의 코딩 서열로부터 유래된 아미노산 서열 (서열 431)이다.

도 247A-D는 ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램을 이용하여 아미노산 서열 동일성% (도 247A-B)과 핵산 서열 동일성% (도 247C-D)를 측정하는 하기한 방법을 이용하기 위한 가설적인 예를 도시하며, 여기서, "PRO"는 관심있는 가정의 PEACH 폴리펩티드의 아미노산 서열을 나타내고, "비교 단백질"은 관심있는 "PRO" 폴리펩티드를 비교할 폴리펩티드의 아미노산 서열을 나타내며, "PRO-DNA"는 관심있는 가정의 PEACH-코딩 핵산 서열을 나타내며, "비교 DNA"는 관심있는 "PRO-DNA" 핵산 분자를 비교할 핵산 분자의 뉴클레오티드 서열을 나타내며, "X", "Y" 및 "Z"는 각각 상이한 가정의 아미노산 잔기를 나타내며, "N", "L" 및 "V"는 각각 상이한 가정의 뉴클레오티드를 나타낸다.

도 248A-Q는 ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램에 대한 완전한 소스 코드를 제공한다. 이 소스 코드는 ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램을 제공하기 위해 UNIX 운영 시스템 상에서의 사용에 일상적으로 적용할 수 있다.

Ⅰ.정의

"PRO 폴리펩티드" 및 "PRO" 또는 "UCP"란 본 명세서에 사용된 바와 같이 바로 뒤에 숫자가 붙어서 다양한 폴리펩티드를 의미하는데, 완전한 명칭(즉, PRO/숫자)은 본 명세서에 기재된 특정 폴리펩티드를 의미하는 용어이다. 본 명세서에 사용된 "PRO/숫자 폴리펩티드" 및 "PRO/숫자" (여기서 숫자 부분은 실제 수로 나타냄)는 천연 서열 폴리펩티드 및 폴리펩티드 변이체 (본 명세서에 추가로 정의됨)를 포함하는 용어이다. 본 명세서에 기재된 PRO 폴리펩티드는 인간 조직 또는 다른출처와 같은 다양한 출처로부터 단리될 수 있거나 재조합 또는 합성에 의해 제조될 수 있다.

"천연 서열 PRO 폴리펩티드" 또는 "UCP"는 자연으로부터 유도된 대응하는 PRO 폴리펩티드와 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 천연 서열 PRO 폴리펩티드는 자연으로부터 단리할 수 있거나 재조합 또는 합성 방법으로 제조할 수 있다. 용어 "천연 서열 PRO 폴리펩티드"는 구체적으로는 특정 PRO 폴리펩티드의 자연발생 말단 절단 (truncated) 또는 분비된 형태 (예를 들어 세포외 도메인 서열), 이러한 폴리펩티드의 자연발생 변이체 (달리 스프라이싱된 형태) 및 자연발생 대립 변이체를 포함한다. 본 발명의 여러 실시양태에서, 천연 서열 PRO 폴리펩티드는 수반하는 도면에 나타낸 전장 아미노산 서열을 포함하는 성숙 또는 전장 천연 서열 폴리펩티드이다. 개시 및 중지 코돈은 도면에서 굵은 글씨 및 밑줄로 표시된다. 그러나, 본원에서 수반하는 도면에 개시된 PRO 폴리펩티드는 도면에서 아미노산 위치 1로 지칭하는 메티오닌 잔기로 시작하는 것으로 나타나 있지만, 도면에서 아미노산 위치 1로부터 위쪽 또는 아래쪽 부분에 위치한 다른 메티오닌 잔기가 PRO 폴리펩티드에 대한 출발 아미노산 잔기로 이용될 수 있다.

PRO 폴리펩티드 "세포외 도메인" 또는 "ECD"란 본질적으로 막횡단 또는 세포질 도메인이 없는 PRO 폴리펩티드의 형태를 의미한다. PRO 폴리펩티드 ECD는 통상 막횡단 및(또는) 세포질 도메인을 1% 미만으로 포함하며, 바람직하게는 상기 도메인들을 0.5% 미만으로 포함한다. 본 발명의 PRO 폴리펩티드에서 확인된 모든 막횡단 도메인은 당업계에서 소수성 도메인 유형을 밝히는 데 통상적으로 사용되는 기준에 준거하여 확인된 것임을 이해해야 할 것이다. 막횡단 도메인의 정확한 경계선은 다를 수 있지만, 대부분은 본원에서 처음 확인된 도메인의 말단에서 5개 아미노산 범위 내에 존재한다. 따라서, PRO 폴리펩티드의 세포외 도메인은 경우에 따라 실시예 및 상세한 설명에서 확인된 막횡단 도메인/세포외 도메인의 각 경계면에서 약 5개 이하의 아미노산을 포함할 수 있고, 관련 신호 펩티드가 있거나 없는 이러한 폴리펩티드, 및 이들을 코딩하는 핵산은 본 발명에 포함된다.

본원에 개시된 다양한 PRO 폴리펩티드의 "신호 펩티드"의 대략적인 위치는 수반하는 도면에 나타나 있다. 그러나, 신호 펩티드의 C-말단 경계는 다양할 수 있지만, 대부분은 본원에서 처음 확인된 신호 펩티드 C-말단의 각 경계면에서 아미노산은 약 5개 이하일 것을 알아야 하는데, 여기서 신호 펩티드의 C-말단 경계는 당업계에서 아미노산 서열 요소의 타입을 확인하는 데 통상적으로 이용되는 기준에 따라 확인될 수 있다 (예를 들어, Nielsen et al., Prot. Eng. 10: 1-6 (1997) 및 von Heinje et al., Nucl. Acids. Res. 14: 4683-4690 (1986)). 게다가, 일부 경우에는 분비 폴리펩티드의 신호 서열의 절단이 전체적으로 동일하지 않아 1종 이상의 분비 폴리펩티드를 생성시킨다는 것을 인지해야 한다. 본원에서 확인된 신호 펩티드의 C-말단의 각 경계면에 있는 약 5개 이하의 아미노산 범위 내에서 신호 펩티드가 절단된 이들 성숙 폴리펩티드, 및 이들을 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 본 발명에 포함된다.

"PRO 폴리펩티드 변이체"는 본원에 개시된 전장 천연 서열 PRO 폴리펩티드 서열, 본원에 개시된 바와 같이 신호 펩티드가 없는 전장 천연 서열 PRO 폴리펩티드, 본원에 개시된 바와 같이 신호 펩티드가 있거나 없는 PRO 폴리펩티드의 세포외 도메인, 또는 본원에 개시된 전장 PRO 폴리펩티드 서열의 임의의 다른 단편과 약 80% 이상의 아미노산 서열 동일성을 갖는, 앞서 또는 뒤에 정의된 활성 PRO 폴리펩티드을 의미한다. 이러한 PRO 폴리펩티드 변이체로는 예를 들어 전장 천연 아미노산 서열의 N 말단 또는 C 말단에 하나 이상의 아미노산 잔기가 부가되거나 결실된 PRO 폴리펩티드 등이 있다. 통상, PRO 폴리펩티드 변이체는 본원에서 개시된 전장 천연 서열 PRO 폴리펩티드 서열, 본원에 개시된 바와 같이 신호 펩티드가 없는 전장 천연 서열 PRO 폴리펩티드, 본원에 개시된 바와 같이 신호 펩티드가 있거나 없는 PRO 폴리펩티드의 세포외 도메인, 또는 본원에 개시된 전장 PRO 폴리펩티드 서열의 임의의 다른 단편과의 아미노산 서열 동일성이 약 80% 이상, 바람직하게는 약 81 % 이상, 더 바람직하게는 약 82 % 이상, 더 바람직하게는 약 83 % 이상, 더 바람직하게는 약 84 % 이상, 더 바람직하게는 약 85 % 이상, 더 바람직하게는 약 86 % 이상, 더 바람직하게는 약 87 % 이상, 더 바람직하게는 약 88 % 이상, 더 바람직하게는 약 89 % 이상, 더 바람직하게는 약 90% 이상, 더 바람직하게는 약 91 % 이상, 더 바람직하게는 92 % 이상, 더 바람직하게는 약 93 % 이상, 더 바람직하게는 약 94 % 이상, 더 바람직하게는 약 95% 이상, 더 바람직하게는 약 96 % 이상, 더 바람직하게는 약 97 % 이상, 더 바람직하게는 약 98 % 이상, 가장 바람직하게는 약 99 % 이상이다. 통상적으로, PRO 변이체 폴리펩티드는 그 길이가 약 10개 이상의 아미노산, 흔히 약 20개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 30개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 40개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 50개 이상의 아미노산, 더 흔히는약 60개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 70 개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 80 개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 90 개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 100 개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 150 개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 200 개 이상의 아미노산, 더 흔히는 약 300 개 이상의 아미노산 또는 그 이상이다.

본원에서 밝혀진 PRO 폴리펩티드 서열에 대한 "아미노산 서열 동일성 (%)"은 특정 PRO 폴리펩티드 서열과 후보 서열을 정렬하고, 필요한 경우 서열 동일성 퍼센트의 최대치를 얻기 위해 갭을 도입한 후 어떠한 보존적 치환도 서열 동일성의 일부로서 간주하지 않은 상태에서 특정 PRO 폴리펩티드 서열의 아미노산 잔기와 동일한, 후보 서열의 아미노산 잔기의 비율로서 정의된다. 아미노산 서열 동일성 (%)을 측정하기 위한 정렬은 당업계에 공지된 다양한 방법, 예를 들어 BLAST, BLAST-2, ALIGN 또는 Megalign (DNASTAR) 소프트웨어와 같은 쉽게 구할 수 있는 컴퓨터 소프트웨어를 사용하여 달성할 수 있다. 당업계의 숙련가는 비교되는 서열들의 전체 길이에 걸쳐 최대로 정렬시키기 위해 필요한 임의의 알고리즘을 비롯하여 정렬을 측정하기에 적합한 파라미터를 정할 수 있다. 그러나, 본원의 목적상 아미노산 서열 동일성 값(%)은 WU-BLAST-2 컴퓨터 프로그램 (Altschul et al., Methods in Enzymology 266: 460-80 (1996))를 이용하여 얻는다. WU-BLAST-2 검색 파라미터 대부분은 디폴트값으로 설정된다. 디폴트값으로 설정하지 않은 것들 즉, 조정가능한 파라미터는 다음 값으로 설정된다: 오버랩 스팬 = 1, 오버랩 분획 = 0.125, 워드 한계 (T) = 11, 및 점수 매트릭스 = BLOSUM62. 본원의 목적을 달성하기 위해 아미노산 서열 동일성 값(%)은, 천연 PRO 폴리펩티드로부터 유도된 서열을 갖는 당해 PRO 폴리펩티드의 아미노산 서열과 비교되는 당해 아미노산 서열 (즉, 당해 PRO 폴리펩티드와 비교되는 서열로서 PRO 변이체 폴리펩티드일 수 있음)과의 사이에 매치되는 동일한 아미노산 잔기의 수를 WU-BLAST-2로 결정하여 얻고, 이를 당해 PRO 폴리펩티드의 아미노산 총 잔기수로 나누어 결정한다.

예를 들어, 아미노산 서열 B와 80% 이상의 아미노산 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열 A를 포함하는 폴리펩티드"라는 말에서, 아미노산 서열 A는 비교하는 당해 아미노산 서열이고 아미노산 서열 B는 당해 PRO 폴리펩티드의 아미노산 서열이다.

달리 구체적으로 언급하지 않는 한, 본원에 이용된 모든 아미노산 서열 동일성 값 (%)은 바로 앞선 단락에 기재된 바와 같이 WU-BLAST-2 컴퓨터 프로그램을 이용하여 얻는다. 그러나, 아미노산 서열 동일성 값 (%)은 하기에 기재된 바와 같이 서열 비교 컴퓨터 프로그램 ALIGN-2를 이용하여 얻을 수도 있는데, 상기 ALIGN-2 프로그램에 대한 완전한 원시 코드는 도 248A-Q에 기재되어 있다. ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램은 제넨텍, 인크사가 개발하였으며, 도 248A-Q에 나타낸 원시 코드는 미국 저작권청 (20559 워싱톤 D.C.에 소재)의 사용자 문서로 보관되어 있는데, 상기 코드는 미국 저작권 등록 제TXU510087호 하에 등록되어 있다. ALIGN-2 프로그램은 제넨텍, 인크사 (캘리포니아주 사우스 샌 프란시스코 소재)를 통해 쉽게 구할 수 있거나, 도 248A-Q에 기재된 원시 코드로부터 편집될 수 있다. ALIGN-2 프로그램은 UNIX 작동계, 바람직하게는 디지탈 UNIX V4.0D에서 편집되어 이용될 수 있다. 모든 서열 비교 파라미터는 ALIGN-2 프로그램으로 설정하고 다양하지 않다.

ALIGN-2가 아미노산 서열 비교를 위해 사용되는 경우, 주어진 아미노산 서열 B에, B와, 또는 B에 대한 주어진 아미노산 서열 A의 아미노산 서열 동일성 (%)(주어진 아미노산 서열 B에, B와, 또는 B에 대한 일정한 아미노산 서열 동일성 (%)을 갖거나 포함하는 주어진 아미노산 서열 A로 달리 표현할 수 있음)은 하기와 같이 계산한다:

X/Y ×100

여기서, X는 A와 B의 프로그램 정렬에서 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2에 의해 동일하게 매치되는 것으로 기록되는 아미노산 잔기의 수이고, Y는 B에서 아미노산 잔기의 총 수이다. 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 같지 않는 경우, B에 대한 A의 아미노산 서열 동일성 (%)은 A에 대한 B의 아미노산 서열 동일성 (%)과 같지 않음을 인지해야 할 것이다. 이 방법을 이용한 아미노산 서열 동일성 계산의 예로서, 도 247A-B는 "PRO"로 지칭하는 아미노산 서열에 대한 "비교 단백질"로 지칭하는 아미노산 서열의 아미노산 서열 동일성 (%)을 계산하는 방법을 나타낸다.

아미노산 서열 동일성 (%)은 서열 비교 프로그램 NCBI-BLAST2를 이용하여 계산할 수도 있다 (Altschul et al., Nucleic Acids Res. 25: 3389-3402 (1997)). 상기 NCBI-BLAST2 서열 비교 프로그램은 웹 사이트 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov.)로부터 다운로드 받을 수 있다. NCBI-BLAST2는 여러 가지 검색 파라미터를 이용하는데, 이러한 모든 검색 파라미터는 예를 들어, 언마스크 = 예, 가닥 = 모두, 기대 발생 = 10, 최소 저복합성 길이 = 15/5, 다중-통과 e-값 = 0.01, 다중-통과에 대한 상수 = 25, 최종 갭 정렬에 대한 드롭오프 = 25 및 점수 매트릭스 = BLOSUM62를 포함하는 디폴트값으로 설정된다.

NCBI-BLAST2가 아미노산 서열 비교에 사용되는 경우, 주어진 아미노산 서열 B에, B와, 또는 B에 대한 주어진 아미노산 서열 A의 아미노산 서열 동일성 (%)(주어진 아미노산 서열 B에, B와, 또는 B에 대한 일정한 아미노산 서열 동일성 (%)을 갖거나 포함하는 주어진 아미노산 서열 A로 달리 표현할 수 있음)은 하기와 같이 계산한다:

X/Y ×100

여기서, X는 NCBI-BLAST2 프로그램 정렬에서 서열 정렬 프로그램 NCBI-BLAST2에 의해 동일하게 매치되는 것으로 기록되는 아미노산 잔기의 수이고, Y는 B에서 아미노산 잔기의 총 수이다. 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 같지 않는 경우, B에 대한 A의 아미노산 서열 동일성 (%)은 A에 대한 B의 아미노산 서열 동일성 (%)과 같지 않음을 인지해야 할 것이다.

"PRO 변이체 폴리뉴클레오티드" 또는 "PRO 변이체 핵산 서열"은 아래 정의된 바와 같은 활성 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 분자로서, 본원에 개시된 전장 천연 서열 PRO 폴리펩티드 서열, 본원에 개시된 바와 같이 신호 펩티드가 없는 전장 천연 서열 PRO 폴리핍티드 서열, 본원에 개시된 PRO 폴리펩티드의 세포외 도메인, 또는 본원에 개시된 전장 PRO 폴리펩티드 서열의 여타의 다른 단편 중 어느 하나를 코딩하는 핵산 서열과의 핵산 서열 동일성이 약 80 % 이상인 핵산 분자이다. 보통PRO 변이체 폴리뉴클레오티드는 본원에 개시된 전장 천연 서열 PRO 폴리펩티드 서열, 본원에 개시된 바와 같이 신호 펩티드가 없는 전장 천연 서열 PRO 폴리핍티드 서열, 본원에 개시된 PRO 폴리펩티드의 세포외 도메인, 또는 본원에 개시된 전장 PRO 폴리펩티드 서열의 여타의 다른 단편 중 어느 하나를 코딩하는 핵산 서열과의 핵산 서열 동일성이 약 80 % 이상, 바람직하게는 약 81 % 이상, 더 바람직하게는 약 82 % 이상, 더 바람직하게는 약 83 % 이상, 더 바람직하게는 약 84 % 이상, 더 바람직하게는 약 85 % 이상, 더 바람직하게는 약 86 % 이상, 더 바람직하게는 약 87 % 이상, 더 바람직하게는 약 88 % 이상, 더 바람직하게는 약 89 % 이상, 더 바람직하게는 약 90 % 이상, 더 바람직하게는 약 91 % 이상, 더 바람직하게는 약 92 % 이상, 더 바람직하게는 약 93 % 이상, 더 바람직하게는 약 94 % 이상, 더 바람직하게는 약 95 % 이상, 더 바람직하게는 약 96 % 이상, 더 바람직하게는 약 97 % 이상, 더 바람직하게는 약 98 % 이상, 가장 바람직하게는 약 99 % 이상일 것이다. 변이체들은 천연 뉴클레오티드 서열 전체를 포괄하지는 않는다.

보통 PRO 변이체 폴리뉴클레오티드는 그 길이가 약 30개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 60 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 90 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 120 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 150 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 180 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 210 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 240 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 270 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 300 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 450 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 600 개 이상의 뉴클레오티드, 더 흔히는 약 900 개 이상의 뉴클레오티드 또는 그 이상이다.

본원에서 확인된 PRO 코딩 핵산 서열과 관련하여 "핵산 서열 동일성 (%)"은 특정 PRO 핵산 서열과 후보 서열을 정렬시키고, 필요한 경우 서열 동일성의 최대치를 얻기 위해 갭을 도입한 후 특정 PRO 핵산 서열의 뉴클레오티드와 동일한, 후보 서열의 뉴클레오티드의 비율로서 정의된다. 핵산 서열 동일성 (%)을 측정하기 위한 정렬은 당업계에 공지된 다양한 방법, 예를 들어 BLAST, BLAST-2, ALIGN 또는 Megalign (DNASTAR) 소프트웨어와 같은 쉽게 구할 수 있는 컴퓨터 소프트웨어를 사용하여 달성할 수 있다. 그러나, 본원의 목적을 달성하기 위해, 핵산 서열 동일성 값(%)은 WU-BLAST-2 컴퓨터 프로그램 (Altschul et al., Methods in Enzymology 266: 460-80 (1996))을 이용하여 얻는다. WU-BLAST-2 검색 파라미터 대부분은 디폴트값으로 설정한다. 디폴트값으로 설정되지 않은, 즉 조정가능한 파라미터는 다음 값으로 설정되었다: 오버랩 스팬 = 1, 오버랩 분획 = 0.125, 워드 한계 (T) = 11, 및 점수 매트릭스 = BLOSUM62. 본원의 목적을 달성하기 위해, 핵산 서열 동일성 값(%)은 (a) 천연 PRO 폴리펩티드-코딩 핵산으로부터 유도된 서열을 갖는 당해 PRO 폴리펩티드 코딩 핵산 분자의 핵산 서열과 비교되는 핵산 분자 (즉, 당해 PRO 폴리펩티드 코딩 핵산 분자와 비교되는 서열로서 PRO 변이체 폴리뉴클레오티드일 수 있음)과의 사이에 매치되는 동일한 뉴클레오티드의 수를 WU-BLAST-2로 얻은 후 이를 (b) 당해 PRO 폴리펩티드 코딩 핵산 분자의 총 뉴클레오티드수로 나누어 얻는다. 예를 들어, 핵산 서열 B와 80% 이상의 핵산 서열 동일성을 갖는 핵산 서열 A를 포함하는 단리된 핵산 분자"라는 말에서, 핵산 서열 A는 비교하는 당해 핵산 분자의 서열이고 핵산 서열 B는 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 당해 핵산 분자의 핵산 서열이다.

달리 구체적으로 언급하지 않는 한, 본원에 이용된 모든 핵산 서열 동일성 값 (%)은 바로 앞선 단락에 기재된 바와 같이 WU-BLAST-2 컴퓨터 프로그램을 이용하여 얻는다. 그러나, 핵산 서열 동일성 값 (%)은 하기에 기재된 바와 같이 서열 비교 컴퓨터 프로그램 ALIGN-2를 이용하여 얻을 수도 있는데, 상기 ALIGN-2 프로그램에 대한 완전한 원시 코드는 도 248A-Q에 기재되어 있다. ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램은 제넨텍, 인크사가 개발하였으며, 도 248A-Q에 나타낸 원시 코드는 미국 저작권청 (20559 워싱톤 D.C.에 소재)의 사용자 문서로 보관되어 있는데, 상기 코드는 미국 저작권 등록 제TXU510087호 하에 등록되어 있다. ALIGN-2 프로그램은 제넨텍, 인크사 (캘리포니아주 사우스 샌 프란시스코 소재)를 통해 쉽게 구할 수 있거나, 도 248A-Q에 기재된 원시 코드로부터 편집될 수 있다. ALIGN-2 프로그램은 UNIX 작동계, 바람직하게는 디지탈 UNIX V4.0D에서 편집되어 이용될 수 있다. 모든 서열 비교 파라미터는 ALIGN-2 프로그램으로 설정하고 다양하지 않다.

ALIGN-2가 핵산 서열 비교를 위해 사용되는 경우, 주어진 핵산 서열 D에, D와, 또는 D에 대한 주어진 핵산 서열 C의 핵산 서열 동일성 (%)(주어진 핵산 서열 D에, D와, 또는 D에 대한 일정한 핵산 서열 동일성 (%)을 갖거나 포함하는 주어진 핵산 서열 C로 달리 표현할 수 있음)은 하기와 같이 계산한다:

W/Z ×100

여기서, W는 C와 D의 프로그램 정렬에서 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2에 의해동일하게 매치되는 것으로 기록되는 뉴클레오티드의 수이고, Z는 D에서 뉴클레오티드의 총 수이다. 핵산 서열 C의 길이가 핵산 서열 D의 길이와 같지 않는 경우, D에 대한 C의 핵산 서열 동일성 (%)은 C에 대한 D의 핵산 서열 동일성 (%)과 같지 않음을 인지해야 할 것이다. 핵산 서열 동일성 계산의 예로서, 도 247C-D는 "PRO-DNA"로 지칭하는 핵산 서열에 대한 "비교 DNA"로 지칭하는 핵산 서열의 핵산 서열 동일성 (%)을 계산하는 방법을 나타낸다.

핵산 서열 동일성 (%)은 서열 비교 프로그램 NCBI-BLAST2를 이용하여 계산할 수도 있다 (Altschul et al., Nucleic Acids Res. 25: 3389-3402 (1997)). 상기 NCBI-BLAST2 서열 비교 프로그램은 웹 사이트 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov.)로부터 다운로드 받을 수 있다. NCBI-BLAST2는 여러 가지 검색 파라미터를 이용하는데, 이러한 모든 검색 파라미터는 예를 들어, 언마스크 = 예, 가닥 = 모두, 기대 발생 = 10, 최소 저복합성 길이 = 15/5, 다중-통과 e-값 = 0.01, 다중-통과에 대한 상수 = 25, 최종 갭 정렬에 대한 드롭오프 = 25 및 점수 매트릭스 = BLOSUM62를 포함하는 디폴트값으로 설정된다.

NCBI-BLAST2가 핵산 서열 비교에 사용되는 경우, 주어진 핵산 서열 D에, D와, 또는 D에 대한 주어진 핵산 서열 C의 핵산 서열 동일성 (%)(주어진 핵산 서열 D에, D와, 또는 D에 대한 일정한 핵산 서열 동일성 (%)을 갖거나 포함하는 주어진 핵산 서열 C로 달리 표현할 수 있음)은 하기와 같이 계산한다:

W/Z ×100

여기서, W는 프로그램 정렬에서 서열 정렬 프로그램 NCBI-BLAST2에 의해 동일하게 매치되는 것으로 기록되는 뉴클레오티드의 수이고, Z는 D에서 뉴클레오티드의 총 수이다. 핵산 서열 C의 길이가 핵산 서열 D의 길이와 같지 않는 경우, D에 대한 C의 핵산 서열 동일성 (%)은 C에 대한 D의 핵산 서열 동일성 (%)과 같지 않음을 인지해야 할 것이다.

다른 실시양태에서 PRO 변이체 폴리뉴클레오티드는 본원에 개시된 전장 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열에 혼성화할 수 있는 (바람직하게는 엄격한 혼성화 및 세척 조건에서) 활성 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 분자이다. PRO 변이체 폴리펩티드는 PRO 변이체 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩되는 것일 수 있다.

상기한 바와 같이 수행되는 서열 비교와 관련하여 "양성"이란 용어는 동일하지는 않으나 성질이 유사한 비교되는 서열의 잔기를 의미한다 (예를 들면 보존적 치환의 결과로, 표 1 참조). 본원의 목적을 달성하기 위해, 양성 값(%)은, 우선 천연 PRO 폴리펩티드 서열로부터 유도된 서열을 갖는 당해 PRO 폴리펩티드 아미노산 서열과 비교되는 아미노산 서열 (즉, PRO 폴리펩티드 서열이 비교되는 아미노산 서열)과의 사이에서 양성 값을 기록한 아미노산 잔기의 수를 WU-BLAST-2의 BLOSUM 62 매트릭스에서 결정한 후, 이를 당해 PRO 폴리펩티드의 아미노산 잔기의 총 수로 나누어 결정한다.

달리 구체적으로 언급하지 않는 한, 양성값 (%)은 바로 앞선 단락에 기재된 바와 같이 계산한다. 그러나, 상기 ALIGN-2 및 NCBI-BLAST2에 대해 기재한 바와 같이 수행되는 아미노산 서열 동일성 비교는 동일하지는 않으나 성질이 유사한 비교되는 서열의 아미노산 잔기를 포함한다. 당해 아미노산 잔기에 대해 양성값을 기록하는 아미노산 잔기는 당해 아미노산 잔기와 동일한 것이거나 당해 아미노산 잔기의 바람직한 치환 (하기 표 1에 기재되어 있음)이다.

ALIGN-2 또는 NCBI-BLAST2를 이용한 아미노산 서열 비교를 위해서는, 주어진 아미노산 서열 B에, B와, 또는 B에 대한 주어진 아미노산 서열 A의 양성값 (%)(주어진 아미노산 서열 B에, B와, 또는 B에 대한 일정한 양성값 (%)을 갖거나 포함하는 주어진 아미노산 서열 A로 달리 표현할 수 있음)은 하기와 같이 계산한다:

X/Y ×100

여기서, X는 A와 B의 프로그램 정렬에서 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2 또는 NCBI-BLAST2에 의해 상기에서 정의된 양성값을 기록하는 아미노산 잔기의 수이고, Y는 B에서 아미노산 잔기의 총 수이다. 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 같지 않는 경우, B에 대한 A의 양성값 (%)은 A에 대한 B의 양성값 (%)과 같지 않음을 인지해야 할 것이다.

본원에 개시된 다양한 폴리펩티드를 기술하기 위해 사용된 "단리된"은 폴리펩티드가 확인되고, 그 자연 환경 요소로부터 분리 및(또는) 회수되었음을 의미한다. 폴리펩티드의 자연 환경의 오염 요소는 이 폴리펩티드의 진단 또는 치료적 사용을 일반적으로 방해하는 물질로서, 효소, 호르몬 및 다른 단백질성 또는 비단백질성 용질 등이 있을 수 있다. 바람직한 실시양태에서, 폴리펩티드는 (1) 스피닝컵 서열분석기를 사용하여 N 말단 또는 내부 아미노산 서열의 15개 이상의 잔기를 얻기에 충분한 정도로 정제되거나, 또는 (2) 쿠마시 블루 또는 바람직하게는 은 염색을 사용하여 비환원 또는 환원 조건 하에 SDS-PAGE에서 하나의 밴드만 나타날 정도로 정제될 수 있다. PRO 폴리펩티드 자연 환경의 요소가 하나 이상 존재하지 않을 것이기 때문에 단리된 폴리펩티드는 재조합 세포 내에 존재하는 폴리펩티드를 포함한다. 그러나, 통상 단리된 폴리펩티드는 하나 이상의 정제 단계에 의해 얻어질 것이다.

"단리된" PRO 폴리펩티드 코딩 핵산이란 PRO 폴리펩티드 핵산의 천연 출처에서 통상적으로 결합되는 하나 이상의 오염 핵산 분자로부터 확인 및 분리된 핵산 분자라는 의미이다. 단리된 PRO 폴리펩티드 핵산 분자는 자연에서 발견되는 형태 또는 상태와 다르게 존재한다. 따라서, 단리된 PRO 폴리펩티드 핵산 분자는 천연 세포에 존재하는 특정 PRO 폴리펩티드 핵산 분자와 구별된다. 그러나, 예를 들어, 천연 세포와 상이한 염색체 위치에 존재하며 통상적으로 PRO 폴리펩티드를 발현하는 세포에 함유된 폴리펩티드 핵산 분자는 단리된 PRO 폴리펩티드 핵산 분자에 포함된다.

용어 "조절 서열"이란 특정 숙주 유기체에서 작동가능하게 연결된 코딩 서열의 발현에 필요한 DNA 서열이다. 원핵생물에 적절한 조절 서열로는 예컨데 프로모터, 경우에 따라 오퍼레이터 서열, 및 리보솜 결합 부위를 들 수 있다. 진핵세포는 프로모터, 폴리아데닐화 신호 및 인핸서를 이용하는 것으로 알려져 있다.

핵산은 다른 핵산 서열과 기능적 관계로 배치될 때 "작동가능하게 연결"된다. 예를 들면, 전서열 또는 분비 리더 (leader)의 DNA는 해당 폴리펩티드가 분비되기 전의 형태인 전단백질로서 발현되는 경우 그 폴리펩티드의 DNA에 작동가능하게 연결되고, 프로모터 또는 인핸서는 폴리펩티드 서열의 전사에 영향을 끼치는 경우 코딩 서열에 작동가능하게 연결되며, 리보솜 결합 부위는 번역을 촉진하도록 배치될 때 코딩 서열에 작동가능하게 연결된다. 일반적으로 "작동가능하게 연결된"은 연결될 DNA 서열들이 인접하여 위치함을 의미하며, 분비 리더의 경우 인접하여 위치할 뿐만 아니라 동일한 리딩 프레임 내에 존재하는 것을 의미한다. 그러나 인핸서는 인접하여 위치할 필요가 없다. 연결은 편리한 제한 효소 부위에서 라이게이션에 의해 달성된다. 이러한 부위가 존재하지 않는 경우, 합성 올리고뉴클레오티드 어댑터 또는 링커를 통상적인 관행에 따라 사용한다.

용어 "항체"는 가장 넓은 의미로 사용되며, 구체적으로는 하나의 항-PRO 폴리펩티드 모노클로날 항체 (아고니스트, 길항제 및 중화 항체 등), 폴리에피토프 특이성이 있는 항-PRO 항체 조성물, 단쇄 항-PRO 항체 및 항-PRO 항체의 단편 (하기 참조) 등을 통칭한다. 본원에서 사용되는 용어 "모노클로날 항체"는 실질적으로 동종 항체들의 집단으로부터 얻은 항체, 즉, 소량으로 존재할 수 있는 가능한 자연발생적 돌연변이를 제외한, 한 집단을 이루는 동일한 개별 항체를 의미한다.

혼성화 반응의 "엄격도"는 당업자가 용이하게 결정할 수 있으며, 일반적으로 프로브 길이, 세척 온도, 염 농도에 따라 달라지는 실험적 계산값이다. 일반적으로 보다 긴 프로브일수록 적절한 어닐링에 보다 높은 온도를 필요로하며, 보다 짧은 프로브일수록 보다 낮은 온도를 필요로 한다. 혼성화는 일반적으로 상보적 가닥이 자신들의 용융 온도보다 낮은 환경에 존재할 때 재어닐링되는 변성된 DNA의 능력에 따라 달라진다. 프로브와 혼성화가능한 서열 사이의 원하는 상동성의 정도가 높을수록, 사용할 수 있는 상대적인 온도가 높아진다. 따라서, 상대적 온도보다 높아질수록 반응 조건은 더욱 엄격해지는 반면, 상대적 온도가 낮을수록 반응조건은 덜 엄격해진다. 혼성화 반응의 엄격도와 관련한 더 자세한 정보 및 설명은 문헌 (Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, Wiley Interscience Publishers (1995))을 참조한다.

본원에서 정의되는 "엄격 조건" 또는 "엄격도가 높은 조건"이란 (1) 세척시 이온 세기가 낮고 온도가 높은 조건, 예를 들면 50 ℃에서 0.015 M 염화나트륨/0.0015 M 시트르산나트륨/0.1 % 소듐 도데실 술페이트를 사용하는 조건, 또는 (2) 혼성화시에 포름아미드, 예를 들어 42 ℃, 750 mM 염화나트륨, 75 mM 시트르산나트륨이 함유된 50 mM 인산나트륨 완충액 (pH 6.5)/0.1 % 소혈청 알부민/0.1 % 피콜/0.1 % 폴리비닐피롤리돈으로 제조한 50 % (부피/부피) 포름아미드와 같은 변성제를 사용하는 조건, (3) 50 % 포름아미드, 5 x SSC (0.75 M NaCl, 0.075 M 시트르산나트륨), 50 mM 인산나트륨 (pH 6.8), 0.1 % 피로인산 나트륨, 5 x Denhardt's 용액, 초음파처리된 연어 정자 DNA (50 ㎍/ml), 0.1 % SDS, 및 10 % 덱스트란 술페이트를 42 ℃에서 사용하고, 42 ℃에서 0.2 x SSC (염화나트륨/시트르산나트륨), 그리고 55 ℃에서 50 % 포름아미드로 세척하며, 55 ℃에서 EDTA가 함유된 0.1 x SSC를 이용한 고엄격 세척을 수행하는 것이다.

"중간정도의 엄격 조건"이란 문헌 (Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, New York: Cold Spring Harbor Press 1989)에 기재된 바와 같고, 상기한 것보다 엄격성이 낮은 혼성화 조건 (예를 들어 온도, 이온 세기 및%SDS)의 이용을 말한다. 중간정도의 엄격 조건의 예는 20% 포름아미드, 5 x SSC (150 mM 염화나트륨, 15 mM 시트르산삼나트륨), 50 mM 인산나트륨 (pH 7.6), 5 x Denhardt 용액, 10% 덱스트란 술페이트 및 20 mg/ml의 잘린 연어 정액 변성 DNA를 포함하는 용액 중에서 37℃로 밤새 인큐베이션한 후 필터를 약 37 내지 50℃에서 1 x SSC로 세척하는 조건이다. 당업계의 숙련가는 프로브 길이 등과 같은 인자에 맞추기 위해 필요한 온도, 이온 세기 등을 조절하는 방법을 잘 알 것이다.

본원에 사용된 "에피토프 태그를 붙인"란 용어는 "태그 폴리펩티드"에 융합된 PRO 폴리펩티드를 포함하는 키메라 폴리펩티드를 지칭한다. "태그 폴리펩티드"가 만들어질 수 있을 정도의 에피토프를 제공하기에 충분한 잔기를 갖지만 융합되는 PRO 폴리펩티드의 활성을 방해하지 않을 정도로 충분히 짧다. 태그 폴리펩티드는 아주 독특해서 자신에 대한 항체가 다른 에피토프와는 실질적으로 가교반응하지 않는 것이 바람직하다. 적절한 태그 폴리펩티드는 일반적으로 6개 이상의 아미노산 잔기를 가지며, 통상 약 8 내지 50개의 아미노산 잔기를 갖는다 (바람직하게는 약 10 내지 20개의 잔기).

본원에 사용된 용어 "이뮤노어드헤신"은 이뮤노글로불린 불변 도메인의 이펙터 기능과 이종 단백질 (어드헤신)의 결합 특이성을 겸비한 항체 유사 분자를 지칭한다. 구조적으로 보면 이뮤노어드헤신은 항체의 항원 인식 및 결합 부위가 아닌, 원하는 결합 특이성을 갖는 아미노산 서열과 이뮤노글로불린 불변 도메인 서열의 융합체를 포함한다. 이뮤노어드헤신 분자의 어드헤신 부분은 전형적으로 적어도 수용체 또는 리간드의 결합 부위를 포함하는 인접 아미노산 서열이다. 이뮤노어드헤신 중 이뮤노글로불린 불변 도메인 서열은 IgG-1, IgG-2, IgG-3, IgG-4 서브타입, IgA (IgA-1 및 IgA-2 포함), IgE, IgD 또는 IgM과 같은 임의의 이뮤노글로불린으로부터 얻을 수 있다.

본원에서 사용된 "활성의" 또는 "활성"은 천연 또는 자연발생 PRO 폴리펩티드의 생물학적 및(또는) 면역학적 활성을 보유하는 PRO 폴리펩티드의 형태(들)을 말하는데, 여기서 "생물학적" 활성이란 천연 또는 자연발생 PRO에 있는 항원성 에피토프에 대한 항체 생성을 유도하는 능력이 아니라, 천연 또는 자연발생 PRO에 의한 생물학적 기능 (억제 또는 촉진능)을 말하며, "면역학적" 활성이란 천연 또는 자연발생 PRO에 있는 항원성 에피토프에 대한 항체 생성을 유도하는 능력을 말한다.

용어 "길항제"는 가장 넓은 의미로 사용되며, 본원에 개시된 천연 PRO 폴리펩티드의 생물학적 활성을 부분적으로 또는 완전히 차단, 억제 또는 중화시키는 모든 분자를 통칭한다. 이와 비슷하게 용어 "아고니스트"도 가장 넓은 의미로 사용되며, 본원에 개시된 천연 PRO 폴리펩티드의 생물학적 활성을 흉내내는 모든 분자를 통칭한다. 적절한 아고니스트 또는 길항제 분자로는 구체적으로 아고니스트 또는 길항제의 항체 또는 항체의 단편, 천연 PRO 폴리펩티드의 단편 또는 아미노산 서열 변이체, 펩티드, 안티센스 올리고뉴클레오티드, 작은 유기분자 등을 들 수 있다. PRO 폴리펩티드의 아고니스트 또는 길항제를 확인하는 방법은 PRO 폴리펩티드를 후보 아고니스트 분자나 후보 길항제 분자와 접촉시키고, PRO 폴리펩티드와 정상적으로 관련된 하나 이상의 생물학적 활성에서 검출가능한 변화를 측정하는 것을포함할 수 있다.

"치료"는 표적 병태나 질병을 예방하거나 늦추기 (완화하기) 위한 목적으로 수행되는 치료와 예방 또는 방지 조치를 나타낸다. 치료를 요하는 대상은 이미 질병을 앓고 있는 대상 뿐만 아니라 질병에 걸리기 쉬운 대상 또는 질병을 예방하고자 하는 대상을 포함한다.

"만성" 투여란 급성 방식과 반대로 연속 방식으로 작용제(들)를 투여하여, 초기 치료 효과 (활성)를 장기간 동안 유지하는 것을 말한다. "간헐적" 투여는 중단없이 계속해서 행하는 것이 아니라 성질상 주기적으로 이루어지는 처치를 의미한다.

치료에 맞는 "포유동물"은 인간, 가축과 사육 동물, 및 동물원용, 경기용 또는 애완용 동물, 예를 들면, 개, 고양이, 소, 말, 양, 돼지, 염소, 토끼 등을 포함하는 포유동물로서 분류되는 모든 동물을 말한다. 바람직한 포유동물은 인간이다.

하나 이상의 다른 치료제와 "병행하여" 투여된다는 것은 동시에 (동시다발적으로) 투여하거나 어떤 순서로든 연속하여 투여하는 것을 포괄한다.

본원에서 사용되는 "담체"는 사용되는 투여량 및 농도에 노출되는 세포 또는 포유동물에 무독성인 제약상 허용되는 담체, 부형제, 또는 안정화제를 포함한다. 생리학상 허용되는 담체는 pH 완충 수용액이다. 생리학상 허용되는 담체의 예는 포스페이트, 시트레이트 및 다른 유기산과 같은 완충액; 아스코르브산을 포함한 항산화제; 저분자량 (약 10 잔기 미만) 폴리펩티드; 단백질, 예를 들어 혈청 알부민, 젤라틴 또는 이뮤노글로불린; 친수성 중합체, 예를 들어 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예를 들어 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 아르기닌 또는 라이신; 단당류, 이당류 및 글루코스, 만노스 또는 덱스트린을 비롯한 기타 탄수화물; 킬레이팅제, 예를 들어 EDTA; 당 알콜, 예를 들어 만니톨 또는 소르비톨; 염 형성 카운터 이온, 예를 들어 나트륨; 및(또는) 비이온계 계면활성제, 예를 들어 TWEEN, 폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 및 PLURONICS를 포함한다.

"항체 단편"은 온전한 항체의 일부, 바람직하게는 온전한 항체의 항원 결합 영역 또는 가변 영역을 포함한다. 항체 단편의 예로는 Fab, Fab', F(ab')₂및 Fv 단편; 디아바디; 선형 항체 (Zapata et al., Protein Eng. 8 (10):1057-1062 (1995); 단쇄 항체 분자; 및 항체 단편으로부터 형성된 다중특이성 항체 등이 있다.

항체를 파파인 (Papain) 분해하면 2개의 동일한 항원 결합 단편, 즉 단일 항원 결합 부위가 있는 각 "Fab" 단편, 및 쉽게 결정화되는 능력을 반영하여 이름 붙여진 나머지 "Fc" 단편이 생성된다. 펩신을 처리하면, 2개의 항원 결합 부위가 있으며 여전히 항원에 교차결합할 수 있는 F(ab')₂단편이 생성된다.

"Fv"는 완전한 항원 인식 및 항원 결합 부위를 포함하는 최소 항체 단편이다. 이 영역은 단단하게 비공유결합된 하나의 중쇄 가변 도메인과 하나의 경쇄 가변 도메인으로 이루어진 이량체로 구성된다. 이 구조에서는 각 가변 도메인의 CDR 3개가 상호작용하여 V_H-V_L이량체의 표면에 항원 결합 부위를 형성한다. 결론적으로 보면, 6개의 CDR이 항체에 항원 결합 특이성을 부여한다. 그러나, 단일 가변도메인 (또는 항원에 특이적인 단지 3개의 CDR만을 포함하는 Fv의 절반) 조차도 전체 결합 부위보다 친화성은 낮지만 항원을 인식하여 항원에 결합하는 능력을 갖는다.

또한, 경쇄의 불변 도메인 및 중쇄의 제1 불변 도메인(CH1)을 함유한다. Fab 단편은 항체 힌지 (Hinge) 영역으로부터 유래한 하나 이상의 시스테인을 포함하는 중쇄 CH1 도메인의 카르복시 말단에 몇 개의 잔기가 첨가되었다는 점에서 Fab 단편은 Fab' 단편과 상이하다. 본원에서 Fab'-SH는 불변 도메인의 시스테인 잔기(들)이 유리 티올기를 보유하는 Fab'를 지칭한다. F(ab')₂항체 단편은 본래 그들 사이에 힌지 시스테인이 있는 몇쌍의 Fab' 단편으로 생성되었다. 항체 단편의 다른 화학적 커플링도 공지되었다.

임의의 척추동물종으로부터 유래한 항체(이뮤노글로불린)의 "경쇄"는 그의 불변 도메인의 아미노산 서열을 기초로 하여 카파(κ) 및 람다(λ)로 불리는 2개의 명백하게 상이한 타입 중의 하나로 분류될 수 있다.

이뮤노글로불린은 그의 중쇄의 불변 도메인의 아미노산 서열에 따라 상이한 클래스로 분류될 수 있다. 이뮤노글로불린에는 IgA, IgD, IgE, IgG 및 IgM의 5개 주요 클래스가 있고, 이들 중 몇 개는 서브클래스(이소타입), 예를 들어 IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA 및 IgA2로 더 분류될 수 있다.

"단일쇄 Fv" 또는 "sFv" 항체 단편은 단일 폴리펩티드 사슬에 존재하는 항체의 V_H및 V_L도메인을 포함한다. 바람직하게는, Fv 폴리펩티드는 sFv가 항원 결합에 필요한 구조를 형성하도록 하는 V_H및 V_L도메인 사이의 폴리펩티드 링커도 포함한다(sFv에 관해서는 문헌 (Pluckthan in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg 및 Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)) 참조).

용어 "디아바디 (diabody)"는 동일한 폴리펩티드 사슬 (V_H-V_L) 내에 경쇄 가변 도메인(V_L)에 연결된 중쇄 가변 도메인 (V_H)을 포함하는, 2개의 항원 결합 부위가 있는 작은 항체 단편을 말한다. 동일한 사슬에 있는 2개의 도메인을 페어링시키기에는 너무 짧은 링커를 사용함으로써, 도메인을 다른 사슬의 상보성 도메인과 강제로 페어링시켜 2개의 항원 결합 부위를 생성시킨다. 디아바디는 예를 들어 EP 404,097, WO93/11611 및 Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)에 보다 상세하게 기재되어 있다.

"단리된" 항체란 자신의 천연 환경의 요소로부터 확인 및 분리 및(또는) 회수된 항체이다. 그의 천연 환경의 오염 요소는 항체의 진단 또는 치료적 사용을 방해하는 물질로서, 효소, 호르몬 및 다른 단백성 또는 비단백성 용질을 포함할 수 있다. 바람직한 실시양태에서, 항체는 (1) 로우리(Lowry) 방법에 의해 측정시 95 중량% 초과, 가장 바람직하게는 99 중량% 초과의 항체로, 또는 (2) 스피닝 컵(spinning cup) 서열분석기를 사용하여 N 말단 또는 내부 아미노산의 잔기 15개 이상을 수득하기에 충분한 정도로, 또는 (3) 쿠마시 블루, 또는 바람직하게는 은 염색을 사용하여 환원 또는 비환원 조건 하에 SDS-PAGE에 의해 하나의 밴드로 정제될 것이다. 단리된 항체는 그 항체의 천연 환경의 하나 이상의 성분이 존재하지 않을 것이기 때문에, 재조합 세포 내의 원위치에서의 항체를 포함한다. 그러나, 단리된 항체는 일반적으로 하나 이상의 정제 단계에 의해 정제될 것이다.

"표지 (label)"는 이 명세서에 사용될 때, 항체에 직간접적으로 접합되어 "표지된" 항체를 생성시키는 검출가능한 화합물 또는 조성물을 말한다. 표지는 그 자체로 (방사성동위원소 표지 또는 형광 표지) 검출될 수 있거나, 효소 표지인 경우에는 검출가능한 기질 화합물 또는 조성물의 화학적 변경을 촉매할 수 있다.

"고상 (solid phase)"은 본 발명의 항체가 부착될 수 있는 비수성 매트릭스를 의미한다. 고상의 예는 부분적으로 또는 완전하게 형성된 유리 (예를 들어 세공 조절된 유리), 폴리사카라이드 (예를 들어 아가로스), 폴리아크릴아미드, 폴리스티렌, 폴리비닐 알콜 및 실리콘 등이 있다. 특정 실시양태에서, 내용에 따라 고상은 분석 플레이트의 웰을 포함할 수 있으며, 다른 실시양태에서 고상은 정제 컬럼 (예를 들어 친화 크로마토그래피 컬럼)이다. 이 용어는 또한 미국 특허 제4,275,149호에 기재된 것과 같은 별개 입자의 비연속적 고상도 포함한다.

"리포좀"은 약물 (예를 들어 PRO 폴리펩티드 또는 이에 대한 항체)을 포유동물에게 전달하는 데 유용한 여러 형태의 지질, 인지질 및(또는) 계면활성제로 이루어진 작은 베지클 (vesicle)이다. 리포좀의 성분들은 통상적으로 생체막의 지질 정렬과 유사하게 이중층 형태로 정렬된다.

"소분자 (작은 분자)"는 본원에서 분자량이 약 500 달톤 이하인 것으로 정의된다.

II. 본 발명의 조성물 및 방법

본 발명은 본원에서 PRO 폴리펩티드로 언급된 폴리펩티드를 코딩하는 새로이 확인되고 단리된 뉴클레오티드 서열에 관한 것이다. 특히, 하기 실시예에 보다 상세히 기재된 바와 같이, 각종 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA를 확인하고 단리하였다. 별도의 발현 라운드에서 생산된 단백질의 PRO 숫자는 다를 수 있지만 UNQ 수는 임의 주어진 DNA 및 코딩된 단백질 특유의 것이며, 변하지 않을 것이다. 그러나, 본원에서는 간단하게, 본원에 개시된 전장의 천연 핵산 분자에 의해 코딩된 단백질, 및 상기 정의에 포함된 PRO의 다른 천연 상동체 및 변이체를 이들의 출처 및 제조 방식과 상관없이 "PRO/숫자"로 언급할 것이다.

하기 실시예에 기재된 바와 같이, 여러가지 cDNA 클론을 ATCC에 기탁하였다. 당업자라면 당업계의 일반적인 방법을 이용하여 기탁된 클론의 서열을 분석함으로써 상기 클론의 실제 뉴클레오티드 서열을 쉽게 결정할 수 있다. 일반적인 기술을 사용하여 뉴클레오티드 서열로부터 예상된 아미노산 서열을 결정할 수 있다. 본원에 기재된 PRO 폴리펩티드 및 이를 코딩하는 핵산의 경우, 본 발명자들은 당시 이용할 수 있었던 서열 정보를 사용하여 가장 잘 확인할 수 있는 리딩 프레임으로 여겨지는 것을 확인하였다.

A. 전장 PRO 폴리펩티드

1. PRO1560

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용하여, 전장 천연 서열 PRO1560(도 2 및 서열 4에 나타냄)이 본 발명의 발견 후에 확인된 Tspan-6과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1560은 테트라스판 족의 새로이 확인된 일원인 것으로 현재 생각된다.

2. PRO444

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 태아 폐 라이브러리로부터 DNA26846-1397 클론을 단리하였다. 따라서, DNA26846-1397 클론은 분비 인자를 코딩한다. 알려진 바로는, DNA26846-1397 서열은 본원에서 PRO444로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 상당한 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

3. PRO1018

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 난소 종양 조직 라이브러리로부터 DNA56107-1415 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA56107-1415 서열은 본원에서 PRO1018로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 상당한 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

4. PRO1773

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1773(도 8 및 서열 10에 나타냄)의 일부가 라투스 노르베기쿠스(rattus norvegicus)의 레티놀 디히드로게나제 타입 II 단백질(ROH2_RAT)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1773은 레티놀 디히드로게나제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

5. PRO1447

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1447(도 10 및 서열 12에 나타냄)이 만노실-올리고사카라이드 1,2-알파-만노시다제 단백질(A54408)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1477은 만노시다제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 만노시다제 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

6. PRO1478

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1478(도 12 및 서열 17에 나타냄)이 갈락토실트랜스퍼라제와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1478은 갈락토실트랜스퍼라제 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 다른 요소와 하나 이상의 공유 메카니즘을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

7. PRO831

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 자궁 라이브러리로부터 DNA56862-1343 클론을 단리하였다. 따라서, DNA56862-1343 클론은 분비 인자를 코딩한다. 알려진 바로는, DNA56862-1343 서열은 본원에서 PRO831로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

8. PRO1113

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1113(도 16 및 서열 24에 나타냄)이 LIG-1 및 SLIT와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1113은 루이신 풍부 반복부 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 단백질-단백질 상호작용 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

9. PRO1194

알려진 바로는, DNA57841-1522 서열은 본원에서 PRO1194로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 한정된 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

10. PRO1110

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1110(도 20 및 서열 31에 나타냄)이 쥐의 골수양성 상향조절(myeloid upregulated) 단백질과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1110은 이 골수양성 상향조절 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

11. PRO1378

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 골수 라이브러리로부터 DNA58730-1607 클론을 단리하였다. 따라서,DNA58730-1607 클론은 분비 인자를 코딩한다. 알려진 바로는, DNA58730-1607 서열은 본원에서 PRO1378로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, PRO1378의 아미노산 서열과 공지 단백질 사이의 다소의 서열 동일성을 밝혀내었다. 그러나, 서열 동일성이 크지는 않았다.

12. PRO1481

알려진 바로는, DNA58732-1650 서열은 본원에서 PRO1481로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 단지 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

13. PRO1189

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1189(도 26 및 서열 43에 나타냄)가 데이호프(Dayhoff) 데이타베이스에서 "MUSE25A_1"로 지칭되는 E25 단백질의 아미노산 서열과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1189는 E25 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 활성 또는 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

14. PRO1415

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 질환에 걸린 인간의 전립선 조직 라이브러리로부터 DNA58852-1637 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA58852-1637 서열은 본원에서 PRO1415로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 상당한 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

15. PRO1411

알려진 바로는, DNA59212-1627 서열은 본원에서 PRO1411로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. 그러나, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

16. PRO1295

알려진 바로는, DNA59218-1559 서열은 본원에서 PRO1295로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 단지 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

17. PRO1359

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1359(도 34 및 서열 56에 나타냄)가 N-아세틸갈락토사민 알파-2,6-시알릴트랜스퍼라제와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1359는 시알릴트랜스퍼라제 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 트랜스퍼라제 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

18. PRO1190

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1190(도 36 및 서열 58에 나타냄)이 랫트 및 인간 CDO 모두와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1190은 CDO 족의 새로이 확인된 일원이며 CDO 족의 전형적인 세포 부착 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

19. PRO1772

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1772(도 38 및 서열 63에 나타냄)가 인간 마이크로솜 디펩티다제 단백질(P_R13857)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1772는 이 펩티다제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

20. PRO1248

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1248(도 40 및 서열 68에 나타냄)이 PUT-2 단백질(AF026198_5)과 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1248은 새로운 PUT-2 동족체이며 PUT-2 단백질의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

21. PRO1316

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1316(도 42 및 서열 70에 나타냄)이 쥐의 디크코프(dickkopf)와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1316은 이 디크코프 족의 새로이 확인된 일원이며 스페만 형성체(Spemann organizer) 및(또는) Wnt 길항작용으로부터 헤드(head) 유도를 일으키는 능력을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

22. PRO1197

알려진 바로는, DNA60611-1524 서열은 본원에서 PRO1197로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 실시예에 추가로 기재되어 있는 바와 같이 공지 단백질과 단지 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

23. PRO1293

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1293(도 46 및 서열 77에 나타냄)이 인간 Ig 중쇄 V 영역 단백질(HSVCD54_1)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1293은 Ig 단백질 및 그의 단편의 거대족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

24. PRO1380

DNA60740-1615 클론을 인간 망막 라이브러리로부터 단리하였다. 알려진 바로는, DNA60740-1615 서열은 본원에서 PRO1380으로 지칭되는 새로운 다중 막횡단 폴리펩티드를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

25. PRO1265

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1265(도 50 및 서열 84에 나타냄)가 데이호프 데이타베이스(버전 35.45 SwissProt 35)에서 "MMU70429_1"로 지칭되는 Fig1 폴리펩티드와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1265는 FIG1족의 새로이 확인된 일원이며, 인터루킨-4에 의한 활성화를 포함하는 FIG1 폴리펩티드의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

26. PRO1250

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1250(도 52 및 서열 86에 나타냄)이 인간의 장쇄 지방산 CoA 리가제 단백질(LCFB_HUMAN)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1250은 새로이 확인된 장쇄 지방산 CoA 리가제 동족체이며 장쇄 지방산 CoA 리가제의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

27. PRO1475

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1475(도 54 및 서열 88에 나타냄)가 마우스 알파-3-D-만노시드 비트-1,2-N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼라제 I 단백질의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1475는 N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼라제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

28. PRO1377

본원에 기술된 바와 같이, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용하여 PRO1377 아미노산 서열과 공지 단백질의 아미노산 서열과의 서열 동일성을 결정하였다. 다소의 서열 동일성이 밝혀졌지만, 서열 동일성이 크지는 않았다. 따라서,알려진 바로는, DNA61608 서열은 본원에서 PRO1377로 지칭되는 새로운 막횡단 단백질을 코딩한다.

29. PRO1326

DNA62808-1582 클론은 분비 인자를 코딩하는 것으로 생각된다. 알려진 바로는, DNA62808-1582 서열은 본원에서 PRO1326으로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 서열 동일성이 밝혀졌으나 크지는 않았다.

30. PRO1249

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 결장 종양 조직으로부터 DNA62809-1531 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA62809-1531 서열은 본원에서 PRO1249로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

31. PRO1315

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1315(도 62 및 서열 104에 나타냄)가 무스 무스쿨루스(mus musculus)의 클래스 II 사이토카인 수용체 4 단백질(MMU53696_1)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1315는 사이토카인 수용체 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

32. PRO1599

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1599(도 64 및 서열 111에 나타냄)가 데이호프 서열 "CFAD_PIG"와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1599는 그랜자임(Granzyme) M 족의 새로이 확인된 일원이며 그랜자임 M 족의 전형적인 활성 및 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

33. PRO1430

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1430(도 66 및 서열 116에 나타냄)이 전립선 특이적 리덕타제(데이호프 데이타베이스에서 "P_WO3198"로 지칭됨)와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1430은 이 리덕타제 족의 새로이 확인된 일원이며 이 리덕타제 족의 요소의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

34. PRO1374

알려진 바로는, DNA64849-1604 서열은 본원에서 PRO1374로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 인간 P4HA의 알파 유닛과 같은 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 밝혀졌다. 따라서, PRO1374는 P4HA와 관련이 있으며 한가지 이상의 메카니즘을 공유할 수 있는 것으로 생각된다.

35. PRO1311

DNA64863-1573 클론은 인간의 대동맥 내피 세포로부터 단리하였으며 본원에서 PRO1311로 지칭되는 새로운 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 것으로 생각된다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 밝혀졌으나 크지는 않았다.

36. PRO1357

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1357(도 72 및 서열 128에 나타냄)이 무스 무스쿨루스의 폰 에브너(von Ebner) 작은 침샘 단백질(MMU46068_1)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1357은 새로이 확인된 폰 에브너 작은 침샘 단백질의 동족체인 것으로 현재 생각된다.

37. PRO1244

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1244(도 74 및 서열 130에 나타냄)가 데이호프 데이타베이스(버전 35.45 SwissProt 35)에서 "AF008554_1"로 지칭되는 공지된 착상-관련 단백질과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1244는 착상-관련 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 부착 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

38. PRO1246

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1246(도 76 및 서열 132에 나타냄)이 쥐의 뼈-관련 술파타제-유사 전구체 단백질(P_R51355)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1246은 새로이 확인된 뼈-관련 술파타제 동족체이며 뼈-관련 술파타제의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

39. PRO1356

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1356(도 78 및 서열 134에 나타냄)이 무스 무스쿨루스의 CPE-수용체 단백질(AB000713_1)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1356은 CPE 수용체 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

40. PRO1275

알려진 바로는, DNA64888-1542 서열은 본원에서 PRO1275로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

41. PRO1274

알려진 바로는, DNA64889-1541 서열은 본원에서 PRO1274로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

42. PRO1412

DNA64897-1628 클론은 분비 인자인 것으로 생각된다. 알려진 바로는, DNA64897-1628 서열은 본원에서 PRO1412로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 서열 동일성이 있으나 크지는 않았다.

43. PRO1557

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1557(도 86, 서열 142에 나타냄)이 데이호프 데이타베이스에서 AF034606_1로 지칭되는 코딘(chordin) 단백질과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1557은 코딘 족의 새로이 확인된 일원이며 코딘 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

44. PRO1286

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 기술을 사용하여 DNA64903-1553 클론을 확인하였다. 알려진 바로는, DNA64903 서열은 본원에서 PRO1286으로 지칭되는 새로운 분비 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었으나, 서열 동일성은 크지 않았다.

45. PRO1294

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1294(도 90 및 서열 146에 나타냄)가 랫트 뉴론의 올팍토메딘-관련 ER 국소화 단백질(I73636)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1294는 새로이 확인된 올팍토메딘 동족체이며 이 단백질의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

46. PRO1347

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1347(도 92 및 서열 148에 나타냄)이 부티로필린과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 또한, 부티로필린에 있어서 전형적인 것으로 대략 서열의 중간 부위에 막횡단 도메인이 있다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1347은 부티로필린 족의 새로이 확인된 일원이며 수유 동안 유지방 소구를 버딩 및 방출시키는 역할을 하는 것으로 현재 생각된다.

47. PRO1305

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 태아 신장 라이브러리로부터 DNA64952-1568 클론을 단리하였다. 따라서, DNA64952-1568 클론은 분비 인자를 코딩한다. 알려진 바로는, DNA64952-1568 서열은 본원에서 PRO1305로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

48. PRO1273

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1273(도 96 및 서열 158에 나타냄)이 리포칼린 전구체와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 또한, 도 96은 PRO1273이 리포칼린에서 보존된 모티프를 가짐을 보여준다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1273은 리포칼린 족의 새로이 확인된 일원이며 리포칼린과 하나 이상의 메카니즘을 공유하는 것으로 현재생각된다.

49. PRO1302

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1302(도 98 및 서열 160에 나타냄)가 CD33L1 및 CD33L2와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1302는 시알로어드헤신 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 특성을 가지는 것으로 현재 생각된다. 특히, PRO1302는 암, 염증, 조혈, 신경 발달 및(또는) 면역에 관련될 수 있다.

50. PRO1283

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1283(도 100 및 서열 162에 나타냄)이 랫트의 취기제 결합 단백질 동족체 OBP-II 전구체(A40464)와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1283은 새로운 취기제 결합 단백질이며 이 취기제 결합 단백질의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

51. PRO1279

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1279(도 102 및 서열 170에 나타냄)가 마우스 뉴롭신 단백질(I56559)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1279는 새로이 확인된 뉴롭신 동족체이며 뉴롭신 단백질의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

52. PRO1304

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1304(도 104 및 서열 180에 나타냄)가 무스 무스쿨루스의 FK-506 결합 단백질(AFO40252_1)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1304는 FK506 결합 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

53. PRO1317

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1317(도 106 및 서열 189에 나타냄)이 인간 CD97 단백질과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1317은 백혈구 항원이며 백혈구 활성화와 관련될 수 있는 것으로 현재 생각된다.

54. PRO1303

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1303(도 108 및 서열 194에 나타냄)이 뉴롭신과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1303은 세린 프로테아제 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 이화작용 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

55. PRO1306

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1306(도 110 및 서열 196에 나타냄)이 데이호프 서열번호 AIF1_HUMAN과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1306은 AIF1/다인타인 족의 새로이 확인된 일원이며 AIF1/다인타인의 전형적인 활성 및 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

56. PRO1336

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1336(도 112 및 서열 198에 나타냄)이 슬릿과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1336은 EGF-반복 족의 새로이 확인된 일원이며 단백질 상호작용 매개 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

57. PRO1278

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1278(도 114 및 서열 203에 나타냄)이 데이호프 데이타베이스에서 "LYC1_ANAPL"로 지칭되는 리소자임 c-1 전구체와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1278은 리소자임 족의 새로이 확인된 일원이며 리소자임 족의 전형적인 가수분해 및 다른 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

58. PRO1298

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1298(도 116 및 서열 210에 나타냄)이 글리코실트랜스퍼라제 alg2와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1298은글리코실트랜스퍼라제 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 요소와 하나 이상의 메카니즘을 공유할 수 있는 것으로 현재 생각된다.

59. PRO1301

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1301(도 118 및 서열 212에 나타냄)이 시토크롬 P450 단백질과 일치하는 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1301은 시토크롬 P450 족의 새로이 확인된 일원이며 시토크롬 P450 족의 전형적인 모노옥시게나제 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

60. PRO1268

알려진 바로는, DNA66519-1535 서열은 본원에서 PRO1268로 지칭되는 새로운 막횡단 폴리펩티드 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 서열 동일성이 있음을 밝혀내었으나 크지는 않았다.

61. PRO1269

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1269(도 122 및 서열 216에 나타냄)가 데이호프 데이타베이스(버전 35.45 SwissProt 35)에서 "P_W23722"로 지칭되는 소의 과립세포 펩티드 A 전구체와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1269는 과립세포 A 펩티드 족의 새로이 확인된 일원이며 이 펩티드 족의 전형적인 미생물 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

62. PRO1327

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1327(도 124 및 서열 218에 나타냄)이 랫트의 뉴렉소필린-1 단백질(NPH1_RAT)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1327은 뉴렉소필린 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

63. PRO1382

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1382(도 126 및 서열 220에 나타냄)가 데이호프 데이타베이스에서 "CERL_RAT"로 지칭되는 공지된 세레벨린-유사 당단백질의 아미노산 서열과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1382는 뉴로펩티드의 세레벨린 족의 새로이 확인된 일원이며 세레벨린의 전형적인 활성 및 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

64. PRO1328

단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 질환에 걸린 인간의 전립선 조직으로부터 DNA66658-1584 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA66658-1584 서열은 본원에서 PRO1328로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 상당한 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

65. PRO1325

단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여인간 흉선 조직 라이브러리로부터 DNA66659-1593 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA66659-1593 서열은 본원에서 PRO1325로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

66. PRO1340

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1340(도 132 및 서열 229에 나타냄)이 데이호프 서열번호 I46536과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1340은 카드헤린 족의 새로이 확인된 일원이며 카드헤린 족의 전형적인 활성 및 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

67. PRO1339

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1339(도 134 및 서열 234에 나타냄)가 인간 췌장 카르복시펩티다제 및 카르복시펩티다제 a1과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1339는 카르복시펩티다제 족의 새로이 확인된 일원이며 카르복시펩티다제 활성을 갖는 것으로 현재 생각된다.

68. PRO1337

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1337(도 136 및 서열 236에 나타냄)이 데이호프 데이타베이스에서 "THBG_HUMAN"으로 확인된 인간 TBG와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.따라서, 본원에서 개시된 PRO1337은 TBG 족의 새로이 확인된 일원이며 갑상선 호르몬 운반능 및 다른 능력을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

69. PRO1342

DNA66674-1599 클론을 인간 식도 조직으로부터 단리하였다. 하기에 보다 상세히 기술된 바와 같이, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. DNA66674-1599 클론은 새로운 막횡단 폴리펩티드를 코딩하는 것으로 보인다.

70. PRO1343

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 평활근 세포 조직 라이브러리로부터 DNA66675-1587 클론을 단리하였다. 따라서, DNA66675-1587 클론은 분비 인자를 코딩한다. 알려진 바로는, DNA66675-1587 서열은 본원에서 PRO1343으로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 상당한 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

71. PRO1480

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1480(도 142 및 서열 253에 나타냄)이 데이호프 서열번호 I48746과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1480은 세마포린(Semaphorin) C 족의 새로이 확인된 일원인 것으로 현재 생각된다.

72. PRO1487

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1487(도 144 및 서열 260에 나타냄)이 데이호프 데이타베이스에서 GGU82088_1로 지칭되는 라디칼 가장자리 단백질과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1487은 가장자리 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 가장자리 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

73. PRO1418

알려진 바로는, DNA68864-1629 서열은 본원에서 PRO1418으로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 서열 동일성은 극히 적었다.

74. PRO1472

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1472(도 148 및 서열 267에 나타냄)가 부티로필린과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1472는 부티로필린 족의 새로이 확인된 일원이며 수유와 관련될 수 있는 것으로 현재 생각된다.

75. PRO1461

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1461(도 150 및 서열 269에 나타냄)이 데이호프 데이타베이스에서 "P_R89435"로 확인된 트립신-유사 효소와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1461은 세린 프로테아제 족의 새로이 확인된 일원이며세린 프로테아제 활성, 보다 구체적으로는 다른 트립신-유사 효소의 전형적인 효소 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다. 또한, 상동성은 PRO1461 아미노산 서열과 데이호프 데이타베이스에서의 다른 트립신-유사 효소 및 세린 프로테아제 사이에 존재하는 것으로 밝혀졌다.

76. PRO1410

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 뇌 수막종 조직 라이브러리로부터 DNA68874-1622 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA68874-1622 서열은 본원에서 PRO1410으로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

77. PRO1568

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1568(도 154 및 서열 273에 나타냄)이 테트라스판 5 및 테트라스판 4와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1568은 테트라스파닌 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 분자 촉진 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

78. PRO1570

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1570(도 156 및 서열 275에 나타냄)이 SP60과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었지만, 본원에서는 처음으로 이 단백질의 앞의 아미노산 199개를확인 및 제공하였다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1570은 세린 프로테아제 족의 새로이 확인된 일원이며 암과 관련되는 것으로 현재 생각된다.

79. PRO1317

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1317(도 158 및 서열 277에 나타냄)이 데이호프 데이타베이스에서 "I48745"로 지칭되는 공지 세마포린 B 단백질과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1317은 세마포린 당단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 세마포린의 전형적인 활성 또는 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

80. PRO1780

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1780(도 160 및 서열 282에 나타냄)이 데이호프 데이타베이스에서 "UDA2_RABIT"로 지칭되는 공지 글루쿠로노실트랜스퍼라제와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1780은 글루쿠로노실트랜스퍼라제 족의 새로이 확인된 일원이며 글루쿠로노실트랜스퍼라제 족의 전형적인 효소 활성 및 다른 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

81. PRO1486

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1486(도 162 및 서열 287에 나타냄)이 세레벨린 1 전구체와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1486은 세레벨린족의 새로이 확인된 일원이며 세레벨린과 하나 이상의 메카니즘을 공유하는 것으로 현재 생각된다.

82. PRO1433

단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 부신 조직 라이브러리로부터 DNA71184-1634 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA71184-1634 서열은 본원에서 PRO1433으로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

83. PRO1490

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1490(도 166 및 서열 297에 나타냄)의 일부가 1-아실-sn-글리세롤-3-포스페이트 아실트랜스퍼라제 단백질(S60478)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1490은 아실트랜스퍼라제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 1-아실-sn-글리세롤-3-포스페이트 아실트랜스퍼라제 단백질의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

84. PRO1482

분비 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 부신 라이브러리로부터 DNA71234-1651 클론을 단리하였다. 따라서, DNA71234-1651 클론은 분비 인자를 코딩한다. 알려진 바로는, DNA71234-1651 서열은 본원에서 PRO1482로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

85. PRO1446

알려진 바로는, DNA71277-1636 서열은 본원에서 PRO1446으로 지칭되는 새로운 인자를 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 서열 동일성은 극히 적었다.

86. PRO1558

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1558(도 172 및 서열 306에 나타냄)이 메틸트랜스퍼라제 단백질(CAMT_EUCGU)과 상당한 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1558은 메틸트랜스퍼라제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

87. PRO1604

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1604(도 174 및 서열 308에 나타냄)가 데이호프 데이타베이스에서 P_W37483으로 지칭되는 마우스 간암-발원 세포 증식 인자와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1604는 HDGF 족의 새로이 확인된 일원이며 다른 HDGF의 전형적인 증식 인자 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

88. PRO1491

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1491(도 176 및 서열 310에 나타냄)이 닭(Gallus gallus)의 콜랩신-2 단백질(GGU28240_1)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1491은 콜랩신 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

89. PRO1431

전장 천연 서열 PRO1431[도 178(서열 315)에 나타냄]이 SH3 도메인 함유 단백질인 SH17_HUMAN과 상당한 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1431은 SH3 도메인 함유 단백질의 새로이 확인된 일원이며 신호 전달 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

90. PRO1563

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1563(도 180 및 서열 317에 나타냄)이 마우스 ADAMTS-1 단백질(AB001735_1)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1563은 ADAM 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

91. PRO1565

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1565(도 182 및 서열 322에 나타냄)의 일부가 라투스 노르베기쿠스(rattus norvegicus)의 콘드로모둘린-I 단백질(AF051425_1)의 일부와 어느 정도 아미노산서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1565는 콘드로모둘린 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

92. PRO1571

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1571(도 184 및 서열 324에 나타냄)이 인간 클로스트리듐 페르프링겐스(clostridium perfringens) 엔테로톡신 수용체 단백질(AB000712_1)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1571은 새로이 확인된 CPE-R 동족체이며 CPE-R 단백질의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

93. PRO1572

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1572(도 186 및 서열 326에 나타냄)가 CPE-R과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1572는 CPE-R과 관련이 있으며 하나 이상의 공유 메카니즘을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

94. PRO1573

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1573(도 188 및 서열 328에 나타냄)이 CPE-R과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1573은 CPE-R과 관련이 있으며 하나 이상의 공유 메카니즘을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

95. PRO1488

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1488(도 190 및 서열 330)이 데이호프 데이타베이스에서 "AB000712_1"로 지칭되는 공지 CPE-R과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1488은 CPE-R 족의 새로이 확인된 일원이며 CPE-R 족의 전형적인 결합 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

96. PRO1489

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1489(도 192 및 서열 332에 나타냄)가 세르코피테쿠스 아에티옵스(Cercopithecus aethiops)의 클로스트리듐 페르프링겐스 엔테로톡신 수용체(D88492_1)와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1489는 새로이 확인된 클로스트리듐 페르프링겐스 엔테로톡신 수용체 동족체이며 클로스트리듐 페르프링겐스 엔테로톡신 수용체 단백질의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

97. PRO1474

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1474(도 194 및 서열 334)가 오보뮤코이드와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1474는 카잘 세린 프로테아제 저해제 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 세린 프로테아제 저해 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

98. PRO1508

DNA73742-1508 클론을 질환에 걸린 인간의 연골 조직 라이브러리로부터 단리하였다. 알려진 바로는, DNA73742-1508 서열은 본원에서 PRO1508로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하지만, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

99. PRO1555

DNA73744-1665 클론을 인간의 조직 라이브러리로부터 단리하였다. 알려진 바로는, DNA73744 서열은 본원에서 PRO1555로 지칭되는 새로운 막횡단 단백질을 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

100. PRO1485

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1485(도 200 및 서열 340에 나타냄)가 리소자임 C 전구체 펩티드와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1485는 리소자임 족의 새로이 확인된 일원이며 하나 이상의 유사 메카니즘을 공유하는 것으로 현재 생각된다.

101. PRO1564

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1564(도 202 및 서열 347에 나타냄)의 일부가 마우스 폴리펩티드 GalNAc 트랜스퍼라제 T4 단백질(MMU73819_1)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1564는 N-아세틸갈락토사미닐트랜스퍼라제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

102. PRO1755

알려진 바로는, DNA76396-1698 서열은 본원에서 PRO1755로 지칭되는 새로운 막횡단 단백질을 코딩한다. 그렇지만, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

103. PRO1757

단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 선별하는 트랩핑 기술을 사용하여 인간 고환 조직 라이브러리로부터 DNA76398-1699 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA76398-1699 서열은 본원에서 PRO1757로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 어떠한 공지 단백질과도 상당한 서열 동일성이 없음을 밝혀내었다.

104. PRO1758

임신 17주째에 무뇌체증으로 사망한 태아로부터 얻은 인간 흉선 조직으로부터 유도된 라이브러리로부터 DNA76399-1700 클론을 단리하였다. DNA76399-1700 클론은 본원에서 PRO1758로 지칭되는 새로운 분비 인자를 코딩하는 것으로 생각된다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, PRO1758의 아미노산 서열과 데이호프 서열번호 AC005328_2 사이에는 상당한 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

105. PRO1575

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1575(도 210 및 서열 358에 나타냄)가 데이호프 서열 번호 A12005_1과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1575는 단백질 디술피드 이소머라제 족의 새로이 확인된 일원이며 디술피드 이소머라제 족의 전형적인 활성 및 특성을 가질 수 있는 것으로 생각된다.

106. PRO1787

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1787(도 212 및 서열 364)이 다양한 종류의 미엘린 pO와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1787은 미엘린 pO 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 하나 이상의 유사한 메카니즘을 공유할 수 있는 것으로 현재 생각된다. PRO1787의 조절자를 사용하여 신경병, 유전성 치아 질환 등과 같은 미엘린 pO 관련 질환을 치료할 수 있는 것으로 현재 생각된다.

107. PRO1781

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, PRO1781 아미노산 서열(서열 366)과 공지 단백질의 아미노산 서열 사이에 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었으나 크지는 않았다. 따라서, 알려진 바로는, DNA76522-2500 서열은 새로운 단백질을 코딩한다.

108. PRO1556

DNA76529-1666 클론을 인간 유방암 조직 라이브러리로부터 단리하였다. 알려진 바로는, DNA76529-1666 서열은 본원에서 PRO1556으로 지칭되는 새로운 막횡단단백질을 코딩한다. WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

109. PRO1759

알려진 바로는, DNA76531-1701 서열은 본원에서 PRO1759로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 한정된 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

110. PRO1760

알려진 바로는, DNA76532-1702 서열은 본원에서 PRO1760으로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 한정된 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

111. PRO1561

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1561(도 222 및 서열 378에 나타냄)의 일부가 인간 포스포리파제 A2 단백질(P_R63053)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1561은 포스포리파제 A2 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

112. PRO1567

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1567(도 224 및 서열 383)이 데이호프 데이타베이스에서 P_W06549로 확인된 인간 결장 특이적 유전자 CSG6 폴리펩티드와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1567은 새로이 확인된 CSG 발현 산물이며 이 단백질의 전형적인 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

113. PRO1693

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1693(도 226 및 서열 385에 나타냄)의 일부가 마우스 인슐린-유사 증식 인자 결합 단백질(ALS_MOUSE)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1693은 인슐린-유사 증식 인자 결합 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

114. PRO1784

알려진 바로는, DNA77303-2502 서열은 본원에서 PRO1784로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 다소의 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다.

115. PRO1605

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1605(도 230 및 서열 395에 나타냄)의 일부가 인간 알파-1,3-만노실당단백질 베타-1,6-n-아세틸트랜스퍼라제 단백질(GNT5_HUMAN)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1605는 글리코실트랜스퍼라제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

116. PRO1788

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1788(도 232 및 서열 397에 나타냄)이 11q14 염색체 영역에 배치된 유전자에 의해 코딩된 루이신-풍부 반복부-함유 단백질인 데이호프 서열 "GARP_HUMAN"과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1788은 루이신-풍부 반복부-함유 족의 새로이 확인된 일원이며 루이신-풍부 반복부-함유 족의 전형적인 활성 또는 특성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

117. PRO1801

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1801(도 234 및 서열 402에 나타냄)의 일부가 IL-19 단백질(P_W37935)의 일부와 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1801은 IL-10-관련 사이토카인 족의 새로이 확인된 일원이며 이 사이토카인 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

118. UCP4

메갈린(Megalign) DNASTAR 컴퓨터 프로그램(및 제작자에 의해 설정된 이 소프트웨어의 알고리즘 및 파라메타)(Oxford Molecular Group, Inc.)을 사용한 결과, 전장 천연 서열 UCP4(도 236 및 서열 406에 나타냄)가 UCP3, UCP2 및 UCP1과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 UCP4는 인간의 언커플링 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 단백질 족의 전형적인 활성 및(또는) 특성, 예를 들어 미토콘드리아 막전위에 영향을 줌으로써 대사 속도를 높이거나 또는 늦추는 능력을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

119. PRO193

본 발명은 본원에서 PRO193으로 언급되는 폴리펩티드를 코딩하는 새로이 확인 및 단리된 뉴클레오티드 서열을 제공한다. 특히, 본 발명자들은 하기 실시예에 보다 상세히 기재된 바와 같이 PRO193 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA를 확인 및 단리하였다. PRO193-코딩 클론은 인간 망막 라이브러리로부터 단리하였다.

120. PRO1130

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1130(도 240 및 서열 415에 나타냄)이 인간 2-19 단백질과 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1130은 새로이 확인된 2-19 단백질 동족체인 것으로 현재 생각된다.

121. PRO1335

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 전장 천연 서열 PRO1335(도 242 및 서열 423에 나타냄)가 인간의 카르보닉 안히드라제 전구체 단백질(AF037335_1)과 어느 정도 아미노산 서열 동일성이 있음을 밝혀내었다. 따라서, 본원에서 개시된 PRO1335는 카르보닉 안히드라제 단백질 족의 새로이 확인된 일원이며 이 족의 전형적인 활성을 가질 수 있는 것으로 현재 생각된다.

122. PRO1329

DNA66660-1585 클론은 분비 인자를 코딩하는 것으로 생각된다. 알려진 바로는, DNA66660-1585 서열은 본원에서 PRO1329로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며,WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 서열 동일성이 있음을 밝혀내었으나 서열 동일성이 크지는 않았다.

123. PRO1550

추출된 인간 유방암 조직 라이브러리로부터 DNA76393-1664 클론을 단리하였다. 알려진 바로는, DNA76393-1664 서열은 본원에서 PRO1550으로 지칭되는 새로운 인자를 코딩하며, WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램을 사용한 결과, 공지 단백질과 서열 동일성이 있음을 밝혀내었으나 서열 동일성이 크지는 않았다.

B. PRO 변이체

본원에서 설명되는 전장 천연 서열 PRO 폴리펩티드 외에, PRO 변이체를 제조할 수 있는 것으로 생각된다. PRO 변이체는 적합한 뉴클레오티드 변화를 PRO DNA에 도입하고(하거나) 목적 PRO 폴리펩티드를 합성하여 제조할 수 있다. 당업자라면 글리코실화 부위의 수 또는 위치의 변경 또는 멤브레인 앵커링 특성의 변화와 같은 아미노산 변화가 RPO의 번역후 프로세싱을 변경시킬 수 있다는 것을 이해할 것이다.

본원에서 설명되는 전장 천연 서열 PRO 또는 PRO의 여러 도메인에서의 변이는 예를 들어 미국 특허 제5,364,934호에 개시된 보존적 및 비보존적 돌연변이 기술 및 지침을 사용하여 제조할 수 있다. 변이는 천연 서열 PRO와 비교되는 것으로 PRO의 아미노산 서열이 변화된 PRO를 코딩하는 하나 이상의 코돈의 치환, 결실 또는 삽입일 수 있다. 임의로, 변이는 하나 이상의 PRO 도메인에서 하나 이상의 아미노산을 임의 다른 아미노산으로 치환함으로써 생성된다. 목적 활성에 유해한 효과를 주지 않으면서 삽입, 치환 또는 결실될 수 있는 아미노산 잔기는 PRO의 서열을 공지의 상동 단백질 분자의 서열과 비교하고 상동성이 높은 영역에서 생성된 아미노산 서열 변화의 수를 최소화함으로써 결정할 수 있다. 아미노산 치환은 하나의 아미노산을 유사한 구조 및(또는) 화학적 특성을 갖는 다른 아미노산으로 치환, 예를 들어 루이신의 세린으로의 치환, 즉 아미노산의 보존적 치환의 결과일 수 있다. 삽입 또는 결실은 임의로 약 1 내지 5개의 아미노산에서 발생할 수 있다. 허용되는 변이는 서열 내에 아미노산을 체계적으로 삽입, 결실 또는 치환시키고, 전장 또는 성숙 천연 서열에 의해 나타나는 생성된 변이체의 활성을 시험함으로써 정할 수 있다.

본원은 PRO 폴리펩티드 단편들을 제공한다. 예를 들어 전장 천연 단백질과 비교하는 경우, 이 단편들은 N-말단 또는 C-말단이 잘릴 수 있으며 내부 잔기가 결손될 수 있다. 몇몇 단편은 본 발명의 PRO 폴리펩티드의 목적 생물학적 활성에 필수적이지 않은 아미노산 잔기가 결손되어 있다.

PRO 단편은 많은 통상의 기술 중 임의 기술에 의해 제조할 수 있다. 목적 펩티드 단편은 화학적으로 합성할 수 있다. 다른 방법은 효소적 분해 방법, 예를 들어 이 단백질을 특정 아미노산 잔기에 의해 정해진 부위에서 단백질을 자르는 것으로 알려진 효소로 처리하거나 또는 이 DNA를 적합한 제한 효소로 잘라냄으로써 PRO 단편을 생성하고 이 목적 단편을 단리하는 것을 포함한다. 그러나, 또다른 적합한 기술은 중합효소 연쇄 반응(PCR)에 의해 목적 폴리펩티드 단편을 코딩하는 DNA 단편을 단리하고 증폭하는 것을 포함한다. DNA 단편의 목적 말단부를 정하는올리고뉴클레오티드는 PCR에서 5' 및 3' 프라이머로 사용된다. 바람직하게는, PRO 폴리펩티드 단편은 본원에서 개시된 천연 PRO 폴리펩티드와 한가지 이상의 생물학적 및(또는) 면역학적 활성을 공유한다.

구체적인 실시태양에서, 목적물의 보존적 치환은 바람직한 치환이라는 표제로 표 1에 나타내었다. 이러한 치환에 의해 생물학적 활성이 변화하는 경우, 하기 표 1에서 치환예로서 명명되거나 아미노산 종류에 대해서 하기에서 보다 상세하게 설명된 보다 실질적인 변화를 도입하고 생성물을 스크리닝하였다.

<표 1>

PRO 폴리펩티드의 기능 또는 면역학적 동일성의 실질적인 변형은 (a) 치환 영역에서의 폴리펩티드 백본의 구조를, 예를 들어 시트 또는 나선 형태로서 유지하거나, (b) 표적 부위에서의 분자의 하전 또는 소수성을 유지하거나, 또는 (c) 대부분의 측쇄를 유지하는 그의 효과를 상당히 변경시키는 치환을 선택함으로써 수행된다. 자연 발생 잔기는 공통적인 측쇄 특성에 따라 다음과 같은 군으로 구분된다:

(1) 소수성: norleucine, met, ala, val, leu, ile;

(2) 중성 친수성: cys, ser, thr;

(3) 산성: asp, glu;

(4) 염기성: asn, gln, his, lys, arg;

(5) 사슬 배향에 영향을 미치는 잔기: gly, pro; 및

(6) 방향족; trp, tyr, phe.

비보존적 치환은 상기 한 종류의 구성 성분을 다른 종류의 것으로 교환시킬 것이다. 또한, 이렇게 치환되는 잔기는 보존적 치환 부위에 도입될 수 있거나 또는 보다 바람직하게는 나머지 (비보존) 부위에 도입될 수 있다.

변이는 올리고뉴클레오티드 매개 (위치 지정) 돌연변이 유발법, 알라닌 스캐닝법 및 PCR 돌연변이 유발법과 같은 당업계에 공지된 방법을 사용하여 제조할 수있다. 위치 지정 돌연변이 유발법 [Carter et al.,Nucl. Acids Res.,13:4331 (1986); Zoller et al.,Nucl. Acids Res.,10:6487 (1987)], 카세트 돌연변이 유발법 [Wells et al.,Gene,34:315 (1985)], 제한 선택 돌연변이 유발법 [Wells et al.,Philos. Trans. R. Soc. London SerA,317:415 (1986)] 또는 다른 공지의 기술을 클로닝된 DNA에 실시하여 본 발명의 PRO 폴리펩티드 변이체 DNA를 제조할 수 있다.

또한, 스캐닝 아미노산 분석법을 사용하여 인접 서열을 따라 하나 이상의 아미노산을 확인할 수 있다. 바람직한 스캐닝 아미노산은 비교적 작은 중성 아미노산이다. 이러한 아미노산은 알라닌, 글리신, 세린 및 시스테인을 포함한다. 통상적으로, 알라닌은 베타-탄소 밖의 측쇄를 제거하고 변이체의 주쇄 배열을 변경시킬 가능성이 적기 때문에 바람직한 스캐닝 아미노산이다[Cunningham and Wells,Science,244: 1081-1085 (1989)]. 또한, 알라닌은 통상적으로 가장 흔한 아미노산이기 때문에 바람직하다. 또한, 알라닌은 파묻힌 위치 및 노출된 위치 모두에서 빈번하게 발견된다 [Creighton,The Proteins, (W.H. Freeman & Co., N.Y.); Chothia,J. Mol. Biol.,150:1 (1976)]. 알라닌 치환이 적당한 양의 변이체를 생성시키지 않으면, 동배체(isoteric) 아미노산을 사용할 수 있다.

C. PRO의 변형

PRO의 공유결합 변형은 본 발명의 범위에 포함된다. 공유결합 변형의 한 형태는 PRO의 선택된 측쇄 또는 N 말단 또는 C 말단 잔기와 반응할 수 있는 유기 유도체화제와 PRO 폴리펩티드의 표적 아미노산 잔기를 반응시키는 것을 포함한다. 이관능성 작용제를 사용한 유도체화는 예를 들어 항-PRO 폴리펩티드 항체 정제 방법에 사용하기 위한 수불용성 지지체 매트릭스 또는 표면에 PRO를 가교결합시키거나 그 반대로 가교결합시키는데 유용하다. 통상 사용되는 가교결합제는 예를 들어 1,1-비스(디아조아세틸)-2-페닐에탄, 글루타르알데히드, N-히드록시숙신이미드 에스테르, 예를 들어 4-아지도살리실산과의 에스테르, 3,3'-디티오비스(숙신이미딜프로피오네이트)와 같은 디숙신이미딜 에스테르를 포함하는 동종이관능성 이미도에스테르, 비스-N-말레이미도-1,8-옥탄과 같은 이관능성 말레이미드 및 메틸-3-[(p-아지도페닐)디티오]프로피오이미데이트와 같은 물질을 포함한다.

다른 변형은 글루타미닐 및 아스파라기닐 잔기의 각각 대응하는 글루타밀 및 아스파르틸 잔기로의 탈아미드화, 프롤린 및 리신의 히드록실화, 세릴 또는 트레오닐 잔기의 히드록실기의 인산화, 리신, 아르기닌 및 히스티딘 측쇄의 알파-아미노기의 메틸화[T.E. Creighton,Proteins: Structure and Molecular Properties, W.H. Freeman & Co., San Francisco, pp. 79-86(1983)], N-말단 아민의 아세틸화 및 C-말단 카르복실기의 아미드화를 포함한다.

본 발명의 범위 내에 포함되는 PRO 폴리펩티드의 공유결합 변형의 다른 유형은 폴리펩티드의 천연 글리코실화 패턴의 변화를 포함한다. 본원에서 "천연 글리코실화 패턴의 변화"는 천연 서열 PRO에서 발견되는 하나 이상의 탄수화물 잔기의 결실(잠재적인 글리코실화 부위를 제거하거나 화학적 및(또는) 효소적 방법에 의해 글리코실화를 결실시킴으로써) 및(또는) 천연 서열 PRO에 존재하지 않는 하나 이상의 글리코실화 부위의 부가를 의미한다. 또한, 이 용어는 존재하는 다양한 탄수화물 잔기의 특성 및 비율의 변화를 비롯한 천연 단백질의 글리코실화에 있어 질적 변화를 포함한다.

PRO 폴리펩티드에 대한 글리코실화 부위의 부가는 아미노산 서열의 변화에 의해 달성될 수 있다. 변화는 예를 들어 천연 서열 PRO에 하나 이상의 세린 또는 트레오닌 잔기의 부가 또는 치환에 의해 이루어질 수 있다 (O-연결 글리코실화 부위의 경우). PRO 아미노산 서열은 특히 목적 아미노산으로 번역되는 코돈을 생성시키도록 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 미리 선택된 염기에서 돌연변이시킴으로써 DNA 수준에서의 변화를 통하여 임의로 변화시킬 수 있다.

PRO 폴리펩티드 상의 탄수화물 잔기의 수를 증가시키는 다른 수단은 글리코시드를 폴리펩티드에 화학적으로 또는 효소에 의해 커플링시키는 것이다. 이러한 방법은 예를 들어 1987년 9월 11일 공개된 WO 87/05330 및 문헌 [Aplin and Wriston,CRC Crit. Rev. Biochem., pp. 259-306 (1981)]에 기재되어 있다.

PRO 폴리펩티드에 존재하는 탄수화물 잔기의 제거는 화학적으로 또는 효소에 의해 또는 글리코실화 표적으로 기능하는 아미노산 잔기를 코딩하는 코돈의 돌연변이에 의한 치환에 의해 달성될 수 있다. 화학적 탈글리코실화 기술은 당업계에 공지되어 있고, 예를 들어 문헌 [Hakimuddin, et al.,Arch. Biochem. Biophys.,259:52(1987) 및 Edge et al.,Anal. Biochem.,118:131(1981)]에 기재되어 있다. 폴리펩티드 상의 탄수화물 잔기의 효소에 의한 절단은 다양한 엔도글리코시다제 및 엑소글리코시다제를 사용하여 달성할 수 있다 [Thotakura et al.,Meth. Enzymol.,138:350(1987)].

PRO의 공유결합 변형의 다른 종류는 미국 특허 제4,640,835호, 동 제4,496,689호, 동 제4,301,144호, 동 제4,670,417호, 동 제4,791,192호 또는 동 제4,179,337호에 기재된 방식으로 다양한 비단백질성 중합체, 예를 들어 폴리에틸렌 글리콜(PEG), 폴리프로필렌 글리콜 또는 폴리옥시알킬렌 중의 하나에 PRO 폴리펩티드를 연결시키는 것을 포함한다.

또한, 본 발명의 PRO는 다른 이종 폴리펩티드 또는 아미노산 서열에 융합된 PRO를 포함하는 키메라 분자를 형성하는 방식으로 변형될 수 있다.

본 발명의 한 실시태양에서, 이러한 키메라 분자는 항-태그 항체가 선택적으로 결합할 수 있는 에피토프를 제공하는 태그 폴리펩티드와 PRO의 융합체를 포함한다. 에피토프 태그는 일반적으로 PRO의 아미노 또는 카르복실 말단에 위치한다. 상기 에피토프 태그를 갖는 형태의 PRO의 존재는 태그 폴리펩티드에 대한 항체를 사용하여 검출할 수 있다. 또한, 에피토프 태그를 도입하면 항-태그 항체 또는 에피토프 태그에 결합하는 다른 종류의 친화성 매트릭스를 사용한 친화성 정제에 의해 PRO를 용이하게 정제할 수 있다. 다양한 태그 폴리펩티드 및 이들 각각의 항체는 당업계에 공지되어 있다. 그 예로는 폴리-히스티딘(poly-his) 또는 폴리-히스티딘-글리신 (poly-his-gly) 태그, flu HA 태그 폴리펩티드 및 그의 항체 12CA5 [Field et al.,Mol. Cell. Biol.,8:2159-2165 (1988)], c-myc 태그 및 이에 대한 8F9, 3C7, 6E10, G4, B7 및 9E10 항체 [Evan et al.,Molecular and Cellular Biology,5:3610-3636 (1985)], 및 단순포진 바이러스 당단백질 D (gD) 태그 및 그의 항체 [Paborsky et al.,Protein Engineering,3(6):547-553 (1990)]를 들 수 있다. 다른 태그 폴리펩티드는 Flag-펩티드 [Hopp et al.,BioTechnology,6:1204-1210 (1988)], KT3 에피토프 펩티드 [Martin et al.,Science,255:192-194 (1992)], 알파-튜불린 에피토프 펩티드 [Skinner et al.,J. Biol. Chem.,266:15163-15166 (1991)] 및 T7 유전자 10 단백질 태그 [Lutz-Freyermuth et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA,87:6393-6397 (1990)]를 포함한다.

다른 한 실시태양에서, 키메라 분자는 PRO와 이뮤노글로불린 또는 이뮤노글로불린의 특정 영역의 융합체를 포함할 수 있다. 키메라 분자의 2가 형태("면역어드헤신"으로 언급하기도 함)의 경우, 융합체는 IgG 분자의 Fc 영역일 수 있다. 이 Ig 융합체는 바람직하게는 Ig 분자내 1개 이상의 가변성 영역의 부위를 PRO 폴리펩티드의 가용성(결실 또는 실활화된 막횡단 도메인) 형태로 치환한 것을 포함한다. 특히 바람직한 한 실시태양에서, 이뮤노글로불린 융합체는 IgG1 분자의 힌지, CH2 및 CH3, 또는 힌지, CH1, CH2 및 CH3 영역을 포함한다. 이뮤노글로불린 융합체를 생산하는 방법으로는, 1995년 6월 27일 간행된 미국 특허 제5,428,130호를 참조한다.

D. PRO의 제조

이하에 설명되는 내용은 주로 PRO 핵산을 함유하는 벡터로 형질전환 또는 형질감염된 세포를 배양함으로써 PRO를 제조하는 방법에 관한 것이다. 물론, 당업계에 공지된 다른 방법을 사용하여 PRO를 제조할 수 있다. 예를 들어, PRO 서열 또는 그의 단편은 고상 기술을 사용하는 직접 펩티드 합성법에 의해 제조할 수 있다 [문헌 (Stewart et al.,Solid -Phase Peptide Synthesis, W.H. Freeman Co., San Francisco, CA (1969); Merrifield,J. Am. Chem. Soc.,85:2149-2154 (1963))을 참조한다]. 시험관 내 단백질 합성은 수동 방법 또는 자동 방법에 의해 수행될 수 있다. 자동 합성법은 예를 들어 어플라이드 바이오시스템즈 펩티드 합성기( Applied Biosystems Peptide Synthesizer)(미국 캘리포니아주 포스터시티 소재)를 제조사의 지시에 따라 사용하여 수행할 수 있다. PRO의 상이한 단편을 별도로 화학적으로 합성하고 화학적 또는 효소적 방법을 사용하여 조합함으로써 전장 PRO를 제조할 수 있다.

1. PRO를 코딩하는 DNA의 단리

PRO를 코딩하는 DNA는 PRO mRNA를 보유하여 그를 검출가능한 수준으로 발현할 것으로 생각되는 조직으로부터 제조한 cDNA 라이브러리로부터 수득할 수 있다. 따라서, 인간 PRO DNA는 실시예에서 설명되는 바와 같이 인체 조직으로부터 제조된 cDNA 라이브러리로부터 편리하게 수득할 수 있다. PRO 코딩 유전자는 또한 게놈 라이브러리로부터 수득하거나 또는 공지된 합성 방법(예를 들어, 자동 핵산 합성 방법)에 의해 수득할 수 있다.

라이브러리는 목적 유전자 또는 이 유전자에 의해 코딩되는 단백질을 확인하기 위해 고안된 프로브 (예를 들어, 목적하는 PRO에 대한 항체 또는 약 20 내지 80개 이상의 염기로 구성된 올리고뉴클레오티드)를 사용하여 스크리닝할 수 있다. 선택된 프로브를 사용한 cDNA 또는 게놈 라이브러리의 스크리닝은 예를 들어 문헌 [Sambrook et al.,Molecular Cloning: A Laboratory Manual(New York: Cold Spring Haror Laboratory Press, 1989)]에 기재된 바와 같은 표준 방법을 사용하여 수행할 수 있다. PRO를 코딩하는 유전자를 단리하는 다른 수단은 PCR 방법을 사용하는 것이다 [Sambrook et al.,상기 문헌; Dieffenbach et al.,PCR Primer: A Laboratory Manual(Cold Spring Haror Laboratory Press, 1995)].

하기 실시예는 cDNA 라이브러리를 스크리닝하는 기술을 설명한다. 프로브로서 선택된 올리고뉴클레오티드 서열은 가양성 결과를 최소화하기 위해서 충분한 길이를 갖고 충분히 분명한 서열이어야 한다. 올리고뉴클레오티드는 스크리닝되는 라이브러리에서 DNA에 혼성화시에 검출될 수 있도록 표지되는 것이 바람직하다.표지 방법은 당업계에 공지되어 있고,³²P-표지된 ATP와 같은 방사성 표지, 비오티닐화 또는 효소 표지의 사용을 포함한다. 중간정도 엄격성 및 높은 엄격성을 포함하는 혼성화 조건은 문헌 (Sambrook et al.,상기 문헌)에서 제공된다.

상기 라이브러리 스크리닝 방법에서 확인된 서열은 GenBank와 같은 공용 데이타베이스 또는 다른 독점 서열 데이타베이스에 기탁되고 입수될 수 있는 다른 공지의 서열과 비교하여 정렬시킬 수 있다. 분자의 한정된 영역 내 또는 전장 서열에 걸친 서열 동일성 (아미노산 또는 뉴클레오티드 수준에서)은 선행 기술 공지된 방법 및 본원에서 설명된 방법을 이용하여 결정할 수 있다.

단백질 코딩 서열을 갖는 핵산은 먼저 본원에서 개시된 추정 아미노산 서열을 사용하고 필요하다면 전구체를 검출하기 위해 문헌 (Sambrook et al.,상기 문헌)에 기재된 통상의 프라이머 신장 방법을 사용하여, 선택된 cDNA 또는 게놈 라이브러리를 스크리닝하고, cDNA로 역전사되지 않은 mRNA의 중간체를 프로세싱함으로써 수득할 수 있다.

2. 숙주 세포의 선택 및 형질전환

숙주 세포는 PRO 생산을 위해 본원에서 설명한 발현 또는 클로닝 벡터로 형질감염 또는 형질전환되고 프로모터 유도, 형질전환체 선택 또는 목적 서열을 코딩하는 유전자 증폭에 적합하게끔 개질된 통상의 영양 배지 중에서 배양된다. 당업자라면 불필요한 실험을 수행하지 않고서도 배지, 온도, pH 등과 같은 배양 조건을 선택할 수 있다. 일반적으로, 세포 배양물의 생산성을 최대화하기 위한 원칙, 프로토콜 및 실시되는 기술은 문헌 [Mammalian Cell Biotechnology: a Practical Approach, M. Butler, ed. (IRL Press, 1991) 및 Sambrook et al.,상기 문헌]에서 찾을 수 있다.

진핵세포 형질감염 방법 및 원핵세포 형질전환 방법, 예를 들어 CaCl₂, CaPO₄, 리포솜-매개 방법 및 일렉트로포레이션은 당업계의 숙련가에게 공지되어 있다. 사용되는 숙주 세포에 따라, 형질전환은 상기 세포에 적합한 표준 기술을 사용하여 수행된다. 문헌 (Sambrook et al.,상기 문헌)에 기재된 염화칼슘법을 이용하는 칼슘 처리, 또는 일렉트로포레이션은 일반적으로 원핵세포에 대해 사용된다. 아그로박테리움 투메파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)를 사용한 감염은 문헌 [Shaw et al.,Gene,23:315(1983) 및 1989년 6월 29일 공개된 WO 89/05859]에 기재된 바와 같이 특정 식물 세포의 형질전환에 사용된다. 상기 세포벽이 없는 포유동물 세포의 경우, 문헌 [Graham and van der Eb,Virology,52:456-457 (1978)]의 인산칼슘 침전법을 사용할 수 있다. 포유동물 세포 숙주 시스템 형질감염의 일반적인 특징은 미국 특허 제4,399,216호에 기재되어 있다. 효모 내로의 형질전환은 일반적으로 문헌 [Van Solingen et al.,J. Bact.,130:949(1977) 및 Hsiao et al.,Proc. Natl. Acad. Sci.(USA),76:3829(1979)]의 방법에 따라 수행된다. 그러나, 세포 내로 DNA를 도입하는 다른 방법, 예를 들어 핵내 미세주입, 일렉트로포레이션, 원형 세포와 세균 원형질체 융합, 또는 다원양이온(polycation), 예를 들어 폴리브렌, 폴리오르니틴도 사용할 수 있다.포유동물 세포의 형질전환을 위한 여러 기술에 대해서는 문헌 [Keown et al.,Methods in Enzymology, 185:527-537 (1990) 및 Mansour et al.,Nature, 336:348-352 (1988)]을 참조한다.

본원에서 벡터 내의 DNA를 클로닝 또는 발현하기에 적합한 숙주 세포에는 원핵세포, 효모 또는 고등 진핵세포가 포함된다. 적합한 원핵세포는 진정세균, 예를 들어 그람 음성 또는 그람 양성 생물, 예를 들어 엔테로박테리아세애(Enterobacteriaceae), 예를 들어 이. 콜라이를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 다양한 이. 콜라이 균주, 예를 들어 이. 콜라이 K12 균주 MM294 (ATCC 31,446), 이. 콜라이 X1776 (ATCC 31,537), 이. 콜라이 균주 W3110 (ATCC 27,325) 및 K5 772 (ATCC 53,635)는 용이하게 입수할 수 있다. 다른 적합한 원핵생물 숙주 세포는 에셔리키아(Eshcerichia), 예를 들어 이. 콜라이, 엔테로박터 (Enterobacter), 에르위니아 (Erwinia), 클렙시엘라 (Klebsiella), 프로테우스 (Proteus), 살모넬라 (Salmonella), 예를 들어 살모넬라 티피무리움 (typhimurium), 세라티아 (Serratia), 예를 들어 세라티아 마르세스칸스 (marcescans) 및 시겔라 (Shigella)와 같은 장내세균과(Enterobacteriaceae), 및 바실러스 (Bacillus), 예를 들어 비. 서브틸리스 (subtilis) 및 비. 리체니포르미스 (licheniformis) (예를 들어, 1989년 4월 12일자로 공고된 DD 266,710호에 기재된 비. 리체니포르미스 41P), 슈도모나스 (Pseudomonas), 예를 들어 피. 아에루기노사 (aeruginosa) 및 스트렙토마이세스 (Streptomyces)를 포함한다. 이러한 예는 단지 예시적인 것으로서 이에 제한되는 것은 아니다. 균주 W3110은 재조합 DNA 산물 발효에 공통적인 숙주 균주이기 때문에 특히 바람직한 숙주 또는 모 숙주이다. 바람직하게는, 숙주 세포는 최소량의 단백질 분해 효소를 분비한다. 예를 들어, 균주 W3110은 숙주의 내생 단백질을 코딩하는 유전자의 돌연변이를 초래하도록 변형될 수 있고, 이러한 숙주의 예는 완전한 유전자형 tonA를 갖는 이. 콜라이 W3110 균주 1A2, 완전한 유전자형 tonA ptr3을 갖는 이. 콜라이 W3110 균주 9E4, 완전한 유전자형 tonA ptr3 phoA E15 (argF-lac)169 degP ompT kan^r를 갖는 이. 콜라이 W3110 균주 27C7 (ATCC 55,244), 완전한 유전자형 tonA ptr3 phoA E15 (argF-lac)169 degP ompT rbs7 ilvG kan^r를 갖는 이. 콜라이 W3110 균주 37D6, 비-카나마이신 내성 degP 결실 돌연변이를 갖는 균주 37D6인 이. 콜라이 W3110 균주 40B4 및 1990년 8월 7일 공포된 미국 특허 제4,946,783호에 개시된 페리플라즘 프로테아제 변이체를 갖는 이. 콜라이 균주를 포함한다. 별법으로, 시험관내 클로닝 방법, 예를 들어 PCR 또는 다른 핵산 폴리머라제 반응이 적합하다.

원핵세포 외에, 섬유상 진균 또는 효모와 같은 진핵 미생물이 PRO-코딩 벡터의 클로닝 또는 발현 숙주로서 적합하다. 사카로마이세스 세레비지애 (Saccharomyces cerevisiae)가 일반적으로 사용되는 하등 진핵 숙주 미생물이다. 다른 미생물에는 시조사카로마이세스 폼베 (Schizosaccharomyces pombe) (Beach and Nurse,Nature, 290: 140 [1981]; 1985년 5월 2일 공고된 EP 139,383); 클루이베로마이세스(Kluyveromyces) 숙주 (미국 특허 제4,943,529호; Fleer et al.,Bio/Technology, 9:968-975 (1991)), 예를 들어 케이. 락티스 (lactis) (MW98-8C,CBS683, CBS4574; Louvencourt et al.,J. Bacteriol., 737 [1983]), 케이. 프라길리스 (fragilis) (ATCC 12,424), 케이. 불가리쿠스(bulgaricus) (ATCC 16,045), 케이. 위케라미 (wickeramii) (ATCC 24,178), 케이. 왈티이 (waltii) (ATCC 56,500), 케이. 드로소필라룸 (drosophilarum) (ATCC 36,906; Van den Berg et al.,Bio/Technology, 8:135(1990)), 케이. 테르모톨레란스 (thermotolerans) 및 케이. 막시아누스 (marxianus); 야로위아 (yarrowia) (EP 402,226); 피치아 파스토리스 (Pichia pastoris) (EP 183,070; Sreekrishna et al.,J. Basic Microbiol., 28:265-278 [1988]); 칸디다 (Candida); 트리코데르마 레에시아(Trichoderma reesia)(EP 244,234); 뉴로스포라 크라사 (Neurospora crassa; Case et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 76:5259-5263 [1979]); 시와니오마이세스 (Schwanniomyces), 예를 들어 시와니오마이세스 옥시덴탈리스 (occidentalis) (1990년 10월 31일 공고된 EP 394,538); 및 섬유상 진균, 예를 들어 뉴로스포라, 페니실리움 (Penicillium), 톨리포클라디움 (Tolypocladium) (1991년 1월 10일 공고된 WO 91/00357) 및 아스퍼길러스 (Aspergillus) 숙주, 예를 들어 에이. 니둘란스 (nidulans) (Ballance et al,,Biochem. Biophys. Res. Commun., 112:284-289 [1983]; Tilburn et al.,Gene, 26:205-221 [1983]; Yelton et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 1470-1474 [1984]) 및 에이. 니게르 (niger) (Kelly and Hynes,EMBO J., 4: 475-479 [1985])가 포함된다. 메틸 영양 요구성 효모가 적합하고, 한세눌라 (Hansenula), 칸디다 (Candida), 클로엑케라 (Kloeckera), 피치아, 사카로마이세스, 토룰롭시스(Torulopsis) 및 로도토룰라(Rhodotorula)로 이루어지는 속으로부터 선택된, 메탄올 상에서 성장할 수 있는 효모를 포함하나 이에 한정되지 않는다. 이들 종류의 효모의 예인 구체적인 종의 목록은 문헌 [C. Anthony,The Biochemistry of Methylotrophs, 269 (1982)]에 기재되어 있다.

글리코실화 PRO의 발현에 적합한 숙주 세포는 다세포 생물로부터 유래한다. 무척추동물 세포의 예에는 드로소필라 S2 및 스포도프테라 Sf9와 같은 곤충 세포 및 식물 세포가 포함된다. 유용한 포유동물 숙주 세포주의 예에는 차이니즈 햄스터 난소 (CHO) 세포 및 COS 세포가 포함된다. 보다 구체적인 예에는 SV40에 의해 형질전환된 원숭이 신장 CV1 라인 (COS-7, ATCC CRL 1651), 인간 배아 신장 라인 (293 세포 또는 현탁 배양액 중의 성장을 위해 서브클로닝된 293 세포, Graham et al.,J. Gen Virol., 36:59(1997)), 차이니즈 햄스터 난소 세포/-DHFR (CHO, Urlaub and Chasin,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77:4216 (1980)), 마우스 세르톨리 세포 (TM4, Mather,Biol. Reprod., 23:243-251 (1980)), 인간 폐 세포 (W138, ATCC CCL 75), 인간 간세포 (Hep G2, HB 8065) 및 마우스 유방 종양 (MMT 060562, ATCC CCL51)이 포함된다. 당업계의 숙련가라면 적합한 숙주 세포를 선택할 수 있다.

3. 복제가능 벡터의 선택 및 사용

PRO를 코딩하는 핵산 (예를 들어, cDNA 또는 게놈 DNA)은 클로닝 (DNA의 증폭) 또는 발현을 위한 복제가능 벡터에 삽입할 수 있다. 다양한 벡터를 용이하게 구할 수 있다. 예를 들어, 벡터는 플라스미드, 코스미드, 바이러스 입자 또는 파지의 형태일 수 있다. 적합한 핵산 서열은 다양한 방법에 의해 벡터 내에 삽입될수 있다. 일반적으로, 당업계에 공지된 기술을 사용하여 DNA를 적합한 제한 엔도뉴클레아제 부위(들) 내에 삽입한다. 벡터 성분은 일반적으로 신호 서열, 복제 기점, 하나 이상의 마커 유전자, 인핸서 성분, 프로모터 및 전사 종결 서열을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 상기 성분을 하나 이상 포함하는 적합한 벡터의 제조는 당업계의 숙련가에게 공지된 표준 라이게이션 기술을 사용한다.

PRO는 직접 재조합 방법에 의해 생산될 수 있을 뿐만 아니라 성숙 단백질 또는 폴리펩티드의 N-말단에서 특이적 절단 부위를 갖는 다른 폴리펩티드 또는 신호 서열일 수 있는 이종 폴리펩티드와의 융합 폴리펩티드로서 생산될 수 있다. 일반적으로, 신호 서열은 벡터의 성분일 수 있거나 또는 벡터 내로 삽입된 PRO-코딩 DNA의 일부일 수 있다. 신호 서열은 예를 들어 알칼리 포스파타제, 페니실리나제, lpp 또는 열안정성 엔테로톡신 II 리더의 군으로부터 선택된 원핵생물 신호 서열일 수 있다. 효모 분비를 위해, 신호 서열은 예를 들어 효모 인버타제 리더, α 인자 리더 (사카로마이세스 및 클루이베로마이세스 α-인자 리더 (미국 특허 제5,010,182호)를 포함함) 또는 산 포스파타제 리더, 씨. 알비칸스 (C. albicans) 글루코아밀라제 리더 (1990년 4월 4일 공고된 EP 362,179) 또는 1990년 11월 15일 공개된 WO 90/13646에 기재된 신호 서열일 수 있다. 포유동물 세포 발현에서, 포유동물 신호 서열, 예를 들어 동일하거나 관련된 종의 분비 폴리펩티드로부터의 신호 서열 및 바이러스 분비 리더를 사용하여 단백질의 분비를 지시할 수 있다.

발현 및 클로닝 벡터 모두는 벡터가 선택된 1종 이상의 숙주 세포에서 복제할 수 있도록 만드는 핵산 서열을 함유한다. 이러한 서열은 다양한 세균, 효모 및바이러스에 대해 공지되어 있다. 플라스미드 pBR322로부터의 복제 기점은 대부분의 그람 음성 세균에 적합하고, 2μ 플라스미드 기점은 효모에 적합하고, 다양한 바이러스 기점 (SV40, 폴리오마, 아데노바이러스, VSV 또는 BPV)은 포유동물 세포에서 벡터를 클로닝하는데 유용하다.

발현 및 클로닝 벡터는 통상적으로 선택가능한 마커로도 불리우는 선택 유전자를 함유할 것이다. 대표적인 선택 유전자, 예를 들어 바실러스 (Bacillus)의 경우 D-알라닌 라세마제를 코딩하는 유전자는 (a) 항생제 또는 다른 독소, 예를 들어 암피실린, 네오마이신, 메토트렉세이트 또는 테트라싸이클린에 내성을 부여하는 단백질, (b) 영양요구성 결함을 보완하는 단백질 또는 (c) 복합 배지로부터 이용할 수 없는 중요한 영양물질을 공급하는 단백질을 코딩한다.

포유동물 세포에 적합한 선택가능한 마커의 예는 PRO 코딩 핵산을 수용할 수 있는 세포의 동정을 가능하게 하는 것, 예를 들어 DHFR 또는 티미딘 키나제이다. 야생형 DHFR이 이용될 경우, 적합한 숙주 세포는 DHFR 활성이 결여된 CHO 세포주이고, 문헌 [Urlaub et al,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77:4216 (1980)]에 기재된 바와 같이 제조 및 증식된다. 효모에 사용하는데 적합한 선택 유전자는 효모 플라스미드 YRp7에 존재하는 trp1 유전자이다 [Stinchcomb et al.,Nature, 282:39 (1979); Kingsman et al.,Gene, 7:141 (1979); Tschemper et al.,Gene, 10:157 (1980)]. trp1 유전자는 트립토판으로의 성장능이 결여된 효모의 변이주 (예를 들어, ATCC 44076 또는 PEP4-1)에 대한 선택 마커를 제공한다 [Jones,Genetics, 85: 12 (1977)].

발현 및 클로닝 벡터는 일반적으로 mRNA 합성을 지시하는 PRO 코딩 핵산 서열에 작동가능하게 연결된 프로모터를 함유한다. 다양한 잠재적인 숙주 세포에 의해 인식되는 프로모터는 공지되어 있다. 원핵생물 숙주에 사용하기에 적합한 프로모터에는 β-락타마제 및 락토스 프로모터 시스템 [Chang et al.,Nature, 275:615 (1978); Goeddel et al.,Nature, 281:544 (1979)], 알칼리 포스파타제, 트립토판 (trp) 프로모터 시스템 [Goeddel,Nucleic acid Res., 8:4057 (1980); EP 36,776], 및 하이브리드 프로모터, 예를 들어 tac 프로모터 [deBoer et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 80:21-25 (1983)]를 포함한다. 또한, 세균계에서 사용되는 프로모터는 PRO를 코딩하는 DNA에 작동가능하게 연결된 샤인-달가노 (S.D.) 서열을 함유할 것이다.

효모 숙주에 사용하기 적합한 프로모터 서열의 예는 3-포스포글리세레이트 키나제 [Hitzeman et al.,J. Biol. Chem., 255:2073 (1980)] 또는 다른 당분해 효소 [Hess et al.,J. Adv. Enzyme Reg., 7:149 (1968); Holland,Biochemistry, 17:4900 (1978)], 예를 들어 에놀라제, 글리세르알데히드-3-포스페이트 디히드로게나제, 헥소키나제, 피루베이트 디카르복실라제, 포스포프룩토키나제, 글루코스-6-포스페이트 이소머라제, 3-포스포글리세레이트 뮤타제, 피루베이트 키나제, 트리오스포스페이트 이소머라제, 포스포글루코스 이소머라제 및 글루코키나제에 대한 프로모터를 포함한다.

성장 조건에 의해 조절되는 전사의 추가의 이점을 갖는 유도가능한 프로모터인 다른 효모 프로모터는 알코올 디히드로게나제 2, 이소시토크롬 C, 산 포스파타제, 질소 대사에 관련된 분해 효소, 메탈로티오네인, 글리세르알데히드-3-포스페이트 디히드로게나제, 및 말토스 및 갈락토스 이용에 작용하는 효소에 대한 프로모터 영역이다. 효모 발현에 사용하기에 적합한 벡터 및 프로모터는 추가로 EP 제73,657호에 기재되어 있다.

포유동물 숙주 세포내의 벡터로부터의 PRO 전사는 바이러스, 예를 들어 폴리오마 바이러스, 계두 바이러스 (1989년 7월 5일 공고된 UK 2,211,504호), 아데노바이러스 (예를 들어, 아데노바이러스 2), 소 유두종 바이러스, 조류 육종 바이러스, 사이토메갈로바이러스, 레트로바이러스, B형 간염 바이러스 및 원숭이 바이러스 40 (SV40)의 게놈으로부터 얻어진 프로모터, 이종 포유동물 프로모터, 예를 들어 액틴 프로모터 또는 이뮤노글로불린 프로모터 및 열-충격 프로모터로부터 얻어진, 숙주 세포계에 적합성인 프로모터에 의해 조절된다.

고등 진핵세포에 의한 PRO를 코딩하는 DNA의 전사는 인핸서 서열을 벡터에 삽입함으로써 증가될 수 있다. 인핸서는 일반적으로 전사를 증가시키기 위해 프로모터에 대해 작용하는, 약 10 내지 300 bp의 DNA의 시스-액팅 성분이다. 많은 인핸서 서열은 포유동물 유전자 (글로빈, 엘라스타제, 알부민, α-페토단백질 및 인슐린)로부터 유래하는 것으로 알려져 있다. 그러나, 통상적으로 진핵세포 바이러스로부터 유래한 인핸서를 사용할 것이다. 그 예는 복제 기점의 뒷부분 상의 SV40 인핸서 (bp 100-270), 사이토메갈로바이러스 초기 프로모터 인핸서, 복제 기점의 뒷부분 상의 폴리오마 인핸서, 및 아데노바이러스 인핸서를 포함한다. 인핸서는 PRO 코딩 서열에 5' 또는 3' 위치에서 벡터에 스플라이싱될 수 있지만, 프로모터로부터 5' 부위에 위치하는 것이 바람직하다.

또한, 진핵생물 숙주 세포 (효모, 진균, 곤충, 식물, 동물, 인간 또는 다른 다세포 생물로부터 유래한 다핵 세포)에 사용되는 발현 벡터는 전사 종결 및 mRNA 안정화에 필요한 서열을 포함할 수 있을 것이다. 그러한 서열은 통상적으로 진핵세포 또는 바이러스 DNA 또는 cDNA의 5' 및 때로는 3' 비번역 영역으로부터 확보된다. 이들 영역은 PRO를 코딩하는 mRNA의 비번역 부분에서 폴리아데닐화 단편으로서 전사되는 뉴클레오티드 단편을 포함한다.

재조합 척추동물 세포 배양에서 PRO의 합성에 적용하는데 적합한 다른 방법, 벡터 및 숙주 세포는 문헌 [Gething et al.,Nature, 293:620-625 (1981); Mantei et al.,Nature, 281:40-46 (1979); EP 117,060 및 EP 117,058]에 기재되어 있다.

4. 유전자 증폭/발현의 검출

유전자 증폭 및(또는) 발현은 예를 들어 통상의 서던 블로팅, mRNA의 전사를 정량하기 위한 노던 블로팅 [Thomas,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77:5201-5205 (1980)], 도트 블로팅 (DNA 분석) 또는 본원에서 제공된 서열을 기초로 하여 적절하게 표지된 프로브를 사용한 in situ 혼성화에 의해 시료에서 직접 측정할 수 있다. 별법으로, DNA 이중쇄, RNA 이중쇄 및 DNA-RNA 혼성 이중쇄 또는 DNA-단백질 이중쇄를 비롯한 특정 이중쇄를 인식할 수 있는 항체를 사용할 수 있다. 바꾸어 말하면, 항체를 표지하고, 상기 이중쇄를 표면에 결합시켜, 표면 상에 이중쇄가 형성될 때 이중쇄에 결합한 항체의 존재를 검출할 수 있는 분석을 수행할 수 있다.

별법으로, 유전자 발현은 세포 또는 조직 절편의 면역조직화학적 염색과 같은 면역학적 방법 및 유전자 산물의 발현을 직접 정량하기 위한 세포 배양액 또는 체액의 분석에 의해 측정할 수 있다. 면역조직화학적 염색 및(또는) 시료 유체의 분석에 유용한 항체는 모노클로날 또는 폴리클로날 항체일 수 있고, 임의 포유동물에서 제조할 수 있다. 편리하게는, 천연 PRO 폴리펩티드 또는 본원에서 제공되는 DNA 서열을 기초로 한 합성 펩티드 또는 PRO DNA에 융합되고 특정 항체 에피토프를 코딩하는 외인성 서열에 대한 항체를 제조할 수 있다.

5. 폴리펩티드의 정제

PRO의 형태는 배양 배지 또는 숙주 세포 용균액으로부터 회수될 수 있다. 멤브레인에 결합하는 경우, 적합한 세제 용액 (예를 들어 Triton-X 100)을 사용하거나 효소의 절단에 의해 멤브레인으로부터 방출될 수 있다. PRO의 발현에 사용된 세포는 동결-해동 싸이클, 초음파 처리, 기계적 분쇄 또는 세포 용균제와 같은 다양한 물리적 또는 화학적 수단에 의해 분쇄시킬 수 있다.

재조합 세포 단백질 또는 폴리펩티드로부터 PRO를 정제하는 것이 바람직할 수 있다. 적합한 정제 방법의 예는 이온 교환 컬럼 상에서의 분획화, 에탄올 침전, 역상 HPLC, 실리카 또는 양이온 교환 수지, 예를 들어 DEAE 상에서의 크로마토그래피, 크로마토포커싱, SDS-PAGE, 황산암모늄 침전, 예를 들어 Sephadex G-75를 사용한 겔 여과, IgG와 같은 오염물질을 제거하기 위한 단백질 A 세파로스 컬럼 및 PRO의 에피토프 태그 형태를 결합시키기 위한 금속 킬레이팅 컬럼이다. 다양한 단백질 정제 방법을 사용할 수 있으며, 이러한 방법은 당업계에 공지되어 있으며, 예를 들어 문헌 [Deutscher,Methods in Enzymology, 182 (1990); Scopes,ProteinPurification: Principles and Practice, Springer-Verlag, New York (1982)]에 기재되어 있다. 선택되는 정제 단계(들)은 예를 들어 사용되는 생산 방법 및 생산되는 특정 PRO의 특성에 따라 결정될 것이다.

E. PRO의 용도

PRO를 코딩하는 뉴클레오티드 서열 (또는 그의 상보체)는 혼성화 프로브로서의 용도를 비롯한 분자생물학 분야, 염색체 및 유전자 맵핑 및 안티센스 RNA 및 DNA의 제조에서 다양한 용도를 갖는다. 또한, PRO 코딩 핵산은 본원에서 설명되는 재조합 기술에 의한 PRO 폴리펩티드의 제조에도 유용할 것이다.

전장 천연 서열 PRO 유전자 또는 그의 단편은 본원에서 개시된 천연 PRO 서열과 목적하는 서열 동일성을 갖는 전장 PRO cDNA 또는 다른 cDNA (예를 들어 PRO의 자연 발생 변이체 또는 다른 종으로부터의 PRO를 코딩하는 유전자)를 단리하기 위한 cDNA 라이브러리에 대한 혼성화 프로브로서 사용할 수 있다. 임의로, 프로브의 길이는 약 20 내지 약 50개의 염기일 것이다. 혼성화 프로브는 전장 천연 뉴클레오티드 서열의 새로운 영역(여기서, 이 영역은 불필요한 실험 없이도 결정할 수 있음)의 적어도 일부 또는 천연 서열 PRO의 프로모터, 인핸서 성분 및 인트론을 포함하는 게놈 서열로부터 유도될 수 있다. 예를 들면, 스크리닝 방법은 약 40 염기의 선택된 프로브를 합성하기 위해서 공지의 DNA 서열을 사용하여 PRO 유전자의 코딩 영역을 단리하는 것을 포함할 것이다. 혼성화 프로브는³²P 또는³⁵S와 같은 방사성 뉴클레오티드 또는 아비딘/비오틴 커플링 시스템을 통하여 프로브에 커플링된알칼리 포스파타제와 같은 효소 표지를 비롯한 다양한 표지에 의해 표지할 수 있다. 본 발명의 PRO 유전자와 상보적인 서열을 갖는 표지된 프로브를 사용하여 인간 cDNA, 게놈 DNA 또는 mRNA의 라이브러리를 스크리닝함으로써 프로브가 혼성화하는 상기 라이브러리의 구성원을 결정할 수 있다. 혼성화 기술은 하기 실시예에서 보다 상세하게 설명된다.

본원에 개시된 임의 EST 서열은 본원에서 설명된 방법을 사용하여 프로브로서 유사하게 사용될 수 있다.

다른 유용한 PRO 핵산의 단편에는 표적 PRO mRNA(센스) 또는 PRO DNA(안티센스) 서열과 결합할 수 있는 단일-가닥 핵산 서열(RNA 또는 DNA)을 포함하는 안티센스 또는 센스 올리고뉴클레오티드가 포함된다. 본 발명에 따른 안티센스 또는 센스 올리고뉴클레오티드는 PRO DNA의 코딩 영역의 단편을 포함한다. 이 단편은 일반적으로 약 14개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 약 14개 내지 30개의 뉴클레오티드를 포함한다. 주어진 단백질을 코딩하는 cDNA 서열을 토대로 한 안티센스 또는 센스 올리고뉴클레오티드를 유도하는 능력은 예를 들어 문헌 [Stein and Cohen(Cancer Res.48:2659, 1988) 및 van der Krol et al. (BioTechniques6:958, 1988)]에 기재되어 있다.

안티센스 또는 센스 올리고뉴클레오티드와 표적 핵산 서열의 결합은 이중쇄의 강화된 분해, 전사 또는 번역의 조기 종결을 비롯한 여러 방법 또는 다른 방법 중 하나에 의해 표적 서열의 전사 또는 번역을 차단하는 이중쇄를 형성시킨다. 따라서, 안티센스 올리고뉴클레오티드를 사용하여 PRO 단백질의 발현을 차단할 수 있다. 또한, 안티센스 또는 센스 올리고뉴클레오티드는 변형된 당-포스포디에스테르 백본 (또는 다른 당 연쇄, 예를 들어 WO 91/06629에 개시된 당 연쇄)을 갖는 올리고뉴클레오티드를 포함하며, 여기서 이러한 당 연쇄는 내부 뉴클레아제에 대한 내성이 있다. 내성이 있는 당 연쇄를 갖는 이러한 올리고뉴클레오티드는 생체내에서 안정(즉, 효소 분해에 대해 내성이 있음)하지만, 표적 뉴클레오티드 서열과 결합할 수 있는 서열 특이성을 보유한다.

센스 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드의 다른 예에는 유기 잔기, 예를 들어 WO 90/10048에 개시된 잔기 및 표적 핵산 서열에 대한 올리고뉴클레오티드의 친화성을 증가시키는 다른 잔기, 예를 들어 폴리-(L-라이신)과 공유적으로 연결되는 올리고뉴클레오티드가 포함된다. 또한, 엘립티신과 같은 인터칼레이트제, 및 알킬화제 또는 금속 복합체를 센스 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드에 연결하여 표적 뉴클레오티드 서열에 대한 안티센스 또는 센스 올리고뉴클레오티드의 결합 특이성을 변화시킬 수 있다.

예를 들어, CaPO₄-매개 DNA 형질감염법, 엘렉트로포레이션을 비롯한 임의 유전자 전달 방법에 의하거나 엡스타인-바(Epstein-Barr) 바이러스와 같은 유전자 전달 벡터를 사용함으로써 표적 핵산 서열을 포함하는 세포에 안티센스 또는 센스 올리고뉴클레오티드를 도입할 수 있다. 바람직한 한 방법으로는, 안티센스 또는 센스 올리고뉴클레오티드를 적합한 레트로바이러스 벡터에 삽입한다. 표적 핵산 서열을 포함하는 세포는 생체내 또는 생체외에서 재조합 레트로바이러스 벡터와 접촉한다. 적합한 레트로바이러스 벡터에는 쥐과 레트로바이러스 M-MuLV, N2(M-MuLV로부터 유도된 레트로바이러스), 또는 DCT5A, DCT5B 및 DCT5C(WO 90/13641을 참조한다)로 지칭되는 이중 카피 벡터로부터 유도된 벡터가 포함되나 이에 한정되지 않는다.

또한, WO 91/04753에 개시된 바와 같이, 리간드 결합 분자와 복합체를 형성함으로써 표적 뉴클레오티드 서열을 포함하는 세포에 센스 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드를 도입할 수 있다. 적합한 리간드 결합 분자에는 세포 표면 수용체, 증식 인자, 다른 시토킨, 또는 세포 표면 수용체와 결합하는 다른 리간드가 포함되나 이에 한정되지 않는다. 바람직하게는, 리간드 결합 분자의 연결은, 리간드 결합 분자가 그의 상응하는 분자 또는 수용체와 결합하는 능력을 실제적으로 방해하지 않거나, 센스 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드 또는 그의 복합체 형태의 세포내 진입을 차단하지 않는다.

별법으로, WO 90/10448에 개시된 바와 같이, 올리고뉴클레오티드-지질 복합체를 형성함으로써 표적 핵산 서열을 포함하는 세포내에 센스 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드를 도입할 수 있다. 이러한 센스 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드-지질 복합체는 바람직하게는 세포내에서 내부 리파제에 의해 분리된다.

또한, 상기 프로브를 PCR 기술에서 사용하여 밀접하게 관련된 PRO 코딩 서열의 확인을 위한 일군의 서열을 생성시킬 수 있다.

또한, PRO를 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 사용하여 PRO를 코딩하는 유전자의 맵핑 및 유전 질환이 있는 개체의 유전자 분석을 위한 혼성화 프로브를 제조할수 있다. 본원에서 제공되는 뉴클레오티드 서열은 in situ 혼성화, 공지의 염색체 마커에 대한 연결 분석 및 라이브러리를 사용한 혼성화 스크리닝과 같은 공지의 기술을 사용하여 염색체 및 염색체의 특정 영역에 맵핑시킬 수 있다.

PRO에 관한 코딩 서열이 다른 단백질(예를 들어, 여기서 PRO는 수용체임)과 결합하는 단백질을 코딩하는 경우, PRO는 이러한 결합 상호작용에 관여하는 다른 단백질 또는 분자를 확인하기 위한 분석에 사용될 수 있다. 이 방법에 의해, 수용체/리간드 결합 상호작용의 저해제도 확인할 수 있다. 또한, 상기 결합 상호작용에 관여하는 단백질을 사용하여 펩티드 또는 결합 상호작용의 작은 분자 저해제 또는 아고니스트를 스크리닝할 수 있다. 또한, 수용체 PRO를 사용하여 유사한 리간드를 단리할 수 있다. 스크리닝 분석을 설계하여 천연 PRO 또는 PRO에 대한 수용체의 생물학적 활성을 모방하는 리드 화합물을 발견할 수 있다. 이러한 스크리닝 분석은 화학 물질 라이브러리에 대한 고처리 스크리닝 분석을 포함하며, 특히 작은 분자의 약물 후보물질을 확인하는데 적합할 것이다. 고려되는 작은 분자는 합성 유기 또는 무기 화합물을 포함한다. 분석은 당업계에 특성화된 단백질-단백질 결합 분석, 생화학적 스크리닝 분석, 면역분석 및 세포 기재 분석을 비롯한 다양한 포맷으로 수행될 수 있다.

또한, PRO 또는 그의 변이체를 코딩하는 핵산을 사용하여 유용한 치료제의 개발 및 스크리닝에 유용한 트랜스제닉 동물 또는 "녹 아웃(knock out)" 동물을 생성시킬 수 있다. 트랜스제닉(transgenic) 동물 (예를 들어, 생쥐 또는 쥐)은 형질도입유전자(transgene)를 포함하는 세포를 갖는 동물인데, 형질도입유전자는 태아기 예를 들어 배 단계에서 동물 또는 그 동물의 조상에 도입된다. 형질도입유전자는 세포의 게놈내에 통합되는 DNA이며, 이 세포로부터 트랜스제닉 동물이 발달한다. 한 실시태양에서, PRO를 코딩하는 cDNA를 사용하여 확립된 기술에 따라 PRO를 코딩하는 게놈 DNA를 클로닝할 수 있고, 이 게놈 서열을 사용하여 PRO를 코딩하는 DNA를 발현하는 세포를 포함하는 트랜스제닉 동물을 생성시킬 수 있다. 특히, 생쥐 또는 쥐와 같은 트랜스제닉 동물을 생성시키는 방법은 당업계에서 통상적인 방법이며, 예를 들어 미국 특허 제4,736,866호 및 동 제4,870,009호에 기재되어 있다. 통상적으로, 조직 특이적 인핸서를 갖춘 PRO 형질도입유전자의 도입에는 특정 세포가 표적이 된다. 배 단계에서 동물의 생식 라인에 도입된 PRO를 코딩하는 한 카피의 형질도입유전자를 포함하는 트랜스제닉 동물을 사용하여 PRO를 코딩하는 DNA의 발현 증가 효과를 조사할 수 있다. 이러한 동물은 예를 들어 PRO 폴리펩티드의 과다발현과 관련된 병리학적 증상으로부터 보호할 것으로 생각되는 시약에 대한 시험 동물로서 사용할 수 있다. 본 발명의 이러한 측면에 따라, 상기 시약으로 동물을 처리하면, 형질도입유전자를 보유하는 미처리 동물에 비해 병리학적 증상의 발생은 저하되며, 이는 상기 병리학적 증상에 대한 잠재적인 치료적 개입을 나타낸다.

별법으로, PRO의 비인간 동족체를 사용하여 PRO를 코딩하는 내인성 유전자와 이 동물의 배간세포에 도입된 PRO를 코딩하는 변형된 게놈 DNA 사이의 상동 재조합의 결과로서 PRO를 코딩하는 결함 또는 변형 유전자를 갖는 PRO "녹 아웃" 동물을 만드는데 사용할 수 있다. 예를 들어, PRO를 코딩하는 cDNA를 사용하여 확립된 기술에 따라 PRO를 코딩하는 게놈 DNA를 클로닝할 수 있다. PRO를 코딩하는 게놈 DNA의 일부는 결실되거나, 통합을 모니터하기 위해 사용될 수 있는 선택적 마커를 코딩하는 유전자와 같은 다른 유전자로 치환될 수 있다. 일반적으로, 수천개의 염기의 비변형된 플랭킹 DNA (5' 및 3' 말단 모두에서)가 벡터내에 포함된다 (예를 들어, 상동성 재조합 벡터에 대해서는 문헌 (Thomas and Capecchi,Cell, 51:503 (1987))을 참조한다). 이 벡터는 (예를 들어, 일렉트로포레이션에 의해) 배간세포주에 도입되고, 도입된 DNA와 내인성 DNA가 상동 재조합된 세포가 선택된다 (예를 들어, 문헌 (Li et al.,Cell, 69:915 (1992))을 참조한다). 선택된 세포는 이어서 동물 (예를 들어, 생쥐 또는 쥐)의 배반포에 주입되어 응집 키메라를 형성한다 (예를 들어, 문헌(Bradley, Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells: A Practical Approach, E.J. Robertson, ed. (IRL, Oxford, 1987), pp. 113-152)을 참조한다). 이어서, 키메라 배를 적합한 가임신 대리모 동물에 이식하여 "녹 아웃" 동물을 생성시켰다. 생식 세포 내에 상동 재조합 DNA를 보유하는 자손체를 표준 기술로 확인하고 그를 사용하여 동물의 모든 세포가 상동성 재조합 DNA를 함유하는 동물을 육종할 수 있다. 녹 아웃 동물은 예를 들어 특정 병리학적 증상에 대한 방어 능력 및 PRO 폴리펩티드의 부재로 인한 병리학적 증상의 발생을 특징으로 한다.

폴리펩티드를 코딩하는 핵산은 유전자 치료법에도 사용될 수 있다. 유전자 치료법에 사용될 경우, 유전자는 치료상 유효한 유전자 산물의 생체내 합성을 달성하기 위해, 예를 들면 결함있는 유전자를 대체하기 위해 세포내로 도입된다. "유전자 치료법"은 단일 처치에 의해 지속 효과가 달성되는 전통적인 유전자 치료법 및 치료상 유효한 DNA 또는 mRNA의 일회 또는 반복 투여를 포함하는 유전자 치료제의 투여를 모두 포함한다. 안티센스 RNA 및 DNA는 생체내에서 특정 유전자의 발현을 차단하기 위한 치료제로서 사용될 수 있다. 세포막을 통한 짧은 안티센스 올리고뉴클레오티드의 흡수가 제한적이어서 이런 올리고뉴클레오티드의 세포내 농도가 낮음에도 불구하고, 이들이 세포내로 도입되면 저해제로 작용할 수 있음이 이미 밝혀져 있다 (Zamecnik et al.,Proc. Natl. Acad., Sci. USA83, 4143-4146 (1986)). 이러한 올리고뉴클레오티드는 변형, 예를 들어 이들의 음으로 대전된 포스포디에스테르기를 비대전 기로 치환함으로써 올리고뉴클레오티드의 흡수를 증대시킬 수 있다.

핵산을 살아있는 세포로 도입하는 데 사용될 수 있는 다양한 기술이 있다. 이 기술은 핵산이 시험관내에서 배양된 세포로 전달되는가 또는 생체내에서 목적하는 숙주의 세포로 전달되는가에 따라 달라진다. 시험관내 포유동물 세포로 핵산을 전달하는데 적합한 기술은 리포솜, 엘렉트로포레이션, 미세주입, 세포 융합, DEAE-덱스트란, 인산칼슘 침전법 등을 포함한다. 생체내 유전자 전이 기술로 현재 바람직한 것으로는 바이러스 (통상적으로, 레트로바이러스) 벡터를 사용한 형질감염 및 바이러스 코트 단백질-리포솜 매개 형질감염 등이 있다 (Dzau et al.,Trends in Biotechnology11, 205-210 (1993)). 어떤 경우에는, 표적 세포를 표적화하는 작용제, 예컨대 세포 표면 막 단백질 또는 표적 세포에 특이적인 항체, 표적 세포 상의 수용체에 대한 리간드 등을 핵산 공급원에 제공하는 것이 바람직하다. 리포솜이 사용되는 경우에는, 엔도사이토시스에 관련된 세포 표면 막 단백질과 결합하는 단백질을 표적화에 사용하고(하거나) 흡수를 촉진시킬 수 있는데, 그러한 단백질의 예로는, 특정 세포 유형에 향성(向性)이 있는 캡시드 단백질 또는 그의 단편, 순환시 내부화를 경험하는 단백질에 대한 항체, 세포내 위치를 표적화하고 세포내 반감기를 증대시키는 단백질 등이 있다. 수용체 매개 엔도사이토시스 기술은 예를 들면 문헌 (Wu et al.,J. Biol. Chem.262, 4429-4432 (1987), 및 Wagner et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA87, 3410-3414 (1990))에 기재되어 있다. 유전자 마킹 및 유전자 치료법 프로토콜의 검토를 위해서는, 문헌 (Anderson et al.,Science256, 808-813 (1992))을 참조한다.

본원에 개시된 PRO 폴리펩티드는 단백질 전기영동을 위한 분자량 마커로 사용할 수도 있으며, 단리된 핵산 서열은 이러한 마커를 재조합 발현하는데 사용할 수 있다.

본원에 개시된 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 분자 또는 그의 단편은 염색체의 확인에 유용하다. 이 점에 대해서, 새로운 염색체 마커를 확인할 계속적인 필요가 있는데, 이는 실제 서열 데이타를 토대로 한 이용가능한 염색체 마킹 시약이 현재로서는 비교적 적기 때문이다. 본 발명의 PRO 핵산 분자 각각은 염색체 마커로 사용할 수 있다.

본 발명의 PRO 폴리펩티드 및 핵산 분자는 조직 유형화(tissue typing)에 사용할 수도 있으며, 여기서 본 발명의 PRO 폴리펩티드는 다른 조직에 비해 한 조직에서 차별적으로 발현될 수 있다. PRO 핵산 분자는 PCR, 노던 분석, 서던 분석 및웨스턴 분석용 프로브를 생성하는데 사용될 것이다.

본원에 개시된 PRO 폴리펩티드를 치료제로 사용할 수도 있다. 공지된 방법에 따라 본 발명의 PRO 폴리펩티드를 제제화하여 제약상 유용한 조성물을 제조할 수 있는데, 여기서 이 PRO 생성물은 제약상 허용되는 담체 비이클과 배합된다. 치료 제형은 바람직한 순도를 갖는 활성 성분을 임의 생리적으로 허용가능한 담체, 부형제 또는 안정화제와 혼합함으로써 동결건조 제형 또는 수용액 형태의 보관용으로 제조된다 (Remington's Pharmaceutical Sciences16th edition, Osol, A. Ed. (1980)). 허용되는 담체, 부형제 또는 안정화제는 사용되는 투여량과 농도에서 환자에게 무독성이며, 인산염, 시트르산염 및 다른 유기산, 아스코르브산 등의 항산화제, 저분자량 (약 10 개 잔기 미만의) 폴리펩티드, 혈청 알부민, 젤라틴 또는 이뮤노글로불린 등의 단백질, 폴리비닐피롤리돈 등의 친수성 중합체, 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 아르기닌 또는 라이신 등의 아미노산, 단당류, 이당류, 및 그밖에 글루코스, 만노스, 또는 덱스트린을 포함하는 탄수화물, EDTA 등의 킬레이트제, 만니톨 또는 소르비톨 등의 당 알콜, 나트륨 등의 염-형성 카운터이온, 및(또는) 트윈 (Tween, 등록상표), 플루로닉스 (Pluronics, 등록상표) 또는 PEG 등의 비이온성 계면활성제 등이 있다.

생체내 투여에 사용되는 제제는 멸균처리되어야 한다. 이는 동결건조 및 재용해 (reconstitution) 전 또는 후에 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 용이하게 달성된다.

본원의 치료 조성물은 일반적으로 멸균 접근 출입구가 있는 용기, 예를 들면정맥내 용액제 백 또는 피하 주사 바늘에 의해 뚫을 수 있는 마개가 있는 바이알에 담을 수 있다.

투여 경로는 공지된 방법, 예를 들면 정맥내, 복강내, 뇌내, 근육내, 안내, 동맥내 또는 병소내 경로에 의한 주사 또는 주입, 국소 투여, 또는 서방계에 의한 방법이 있다.

본 발명의 제약 조성물의 투여량 및 목적하는 약물 농도는 계획된 특정 용도에 따라 변할 수 있다. 적합한 투여량 또는 투여 경로의 결정은 당업자라면 잘 아는 것이다. 동물 실험 결과는 인간 치료에 효과적인 투여량을 결정하는데 믿을만한 지침을 제공한다. 종간의 효과적인 투여량의 척도화는 문헌 (Mordenti, J. and Chappell, W. "The use of interspecies scaling in toxicokinetics" In Toxicokinetics and New Drug Development, Yacobi et al., Eds., Pergamon Press, New York 1989, pp. 42-96)의 원리에 따라 수행될 수 있다.

PRO 폴리펩티드 또는 아고니스트 또는 그의 길항제가 생체내에서 사용되는 경우, 일반적인 투여량은 투여 경로에 따라 좌우되며, 포유동물의 체중 1 kg당 약 10 ng 내지 100 mg, 또는 일당으로는 바람직하게는 약 1 ㎍/kg 내지 10 mg/kg일 수 있다. 특정 투여량 및 전달 방법에 대한 지침은 문헌, 예를 들어 미국 특허 제4,657,760호, 동 제5,206,344호 또는 동 제5,225,212호에 제시되어 있다. 다른 치료 화합물 및 다른 질환에 대해서는 다른 제제가 효과적일 수 있으며, 한가지 기관 또는 조직을 표적으로 하는 투여는 예를 들어 또다른 기관 또는 조직에 대한 투여와는 다른 방식으로의 전달을 필요로할 것으로 예상된다.

PRO 폴리펩티드의 서방성 투여가 PRO 폴리펩티드의 투여를 필요로 하는 특정 질병 또는 질환의 치료에 적합한 방출 특성을 갖는 제제에 요구되는 경우, PRO 폴리펩티드의 마이크로캡슐화가 고려된다. 지연 방출을 위한 재조합 단백질의 마이크로캡슐화는 인간 성장 호르몬 (rhGH), 인터페론 (rhIFN), 인터루킨-2 및 MN rgp120을 사용하여 성공적으로 수행되었다 (Johnson et al.,Nat. Med., 2:795-799 (1996); Yasuda,Biomed. Ther., 27:1221-1223(1993); Hora et al.,Bio/Technology, 8:755-758(1990); Cleland, "Design and Production of Single Immunization Vaccines Using Polyactide Polyglycolide Microsphere Systems," inVaccine Design: The Subunit and Adjuvant Approach, Powell and Newman, eds, (Plenum Press: New York, 1995), pp. 439-462: WO 97/03692, WO 96/40072, WO 96/07399 및 미국 특허 제5,654,010호).

상기 단백질의 서방성 제제는 그의 생체적합성 및 광범위한 생분해성 특성으로 인해, 폴리-락트산-co-글리콜산 (PLGA) 중합체를 사용하여 개발되었다. PLGA의 분해 산물인 락트산 및 글리콜산은 인체내에서 신속하게 소실될 수 있다. 또한, 상기 중합체의 분해능은 그의 분자량 및 조성에 따라 수개월 내지 몇년으로 조정될 수 있다 (Lewis, "Controlled release of bioactive agents from lactide/glycolide polymer," in: M. Chasin and R. Langer (Eds.),Biodegradable Polymers as Drug Delivery Systems(Marcel Dekker: New York, 1990), pp. 1-41).

본 발명은 PRO 폴리펩티드를 모방한 화합물(아고니스트)을 확인하고 PRO 폴리펩티드의 영향을 방지하기 위한 화합물(길항제)을 스크리닝하는 방법을 포함한다. 길항제 약물 후보에 관한 스크리닝 분석법을 설계하여 본원에서 확인된 유전자에 의해 코딩된 PRO 폴리펩티드와 결합하거나 복합체를 이루거나, 또는 코딩된 폴리펩티드와 다른 세포내 단백질의 상호작용을 방해하는 화합물을 확인하였다. 이러한 스크리닝 분석법은 화학 물질 라이브러리에 대해 고처리 스크리닝할 수 있는 분석법을 포함하며, 이는 작은 분자 약물 후보를 확인하는데 특히 적합할 것이다.

상기 분석법은 당업계에서 특성화된 단백질-단백질 결합 분석법, 생화학적 스크리닝 분석법, 면역분석법 및 세포계 분석법을 비롯한 다양한 포맷으로 수행할 수 있다.

길항제에 관한 모든 분석법의 공통점은 상호작용하기에 충분한 조건 및 시간 동안 약물 후보와 본원에서 확인된 핵산에 의해 코딩된 PRO 폴리펩티드의 접촉을 요구하는 점이다.

결합 분석법에서, 상호작용은 결합하는 것이며, 형성된 복합체는 단리하거나 반응 혼합물에서 검출할 수 있다. 특정 실시태양에서, 본원에서 확인된 유전자에 의해 코딩된 PRO 폴리펩티드 또는 약물 후보는 공유적 부착 또는 비공유적 부착에 의해 고체상, 예를 들어 마이크로타이터 플레이트에 고정된다. 비공유적 부착은 일반적으로 고체 표면을 PRO 폴리펩티드 용액으로 코팅하고 건조함으로써 달성된다. 별법으로, 고정화 항체, 예를 들어 고정된 PRO 폴리펩티드에 특이적인 모노클로날 항체를 사용하여 그를 고체 표면에 앵커링할 수 있다. 이 분석은 검출가능한 표지로 표지될 수 있는 비고정 성분을 고정 성분, 예를 들어 앵커링된 성분을 포함하는 코딩 표면에 부가함으로써 수행된다. 반응이 종결되었을 때, 반응하지 않은 성분은 예를 들어 세척에 의해 제거되며, 고체 표면에 앵커링된 복합체는 검출된다. 본래 고정되지 않은 성분이 검출가능한 표지를 운반하는 경우, 표면에 고정된 표지의 검출은 복합화 반응이 일어났음을 나타낸다. 본래 고정되지 않은 성분이 표지를 운반하지 않는 경우, 예를 들어 고정된 복합체와 특이적으로 결합하는 표지된 항체를 사용하여 복합화 반응을 검출할 수 있다.

후보 화합물이 본원에서 확인된 유전자에 의해 코딩된 특정 PRO 폴리펩티드와 상호작용하지만 결합하지 않는 경우, 후보 화합물과 이 폴리펩티드의 상호작용은 단백질-단백질 상호작용을 검출하는 잘 알려진 방법에 의해 분석할 수 있다. 이러한 분석법에는 통상의 방법, 예를 들어 가교형성법, 공동면역침전법, 및 구배 또는 크로마토그래피 컬럼을 통한 공동정제법이 포함된다. 또한, 단백질-단백질 상호작용은 문헌 [Fields and co-workers(Fields and Song,Nature(London), 340:245-246 (1989); Chien et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88:9578-9582 (1991)) as disclosed by Chevray and Nathans,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:5789-5793 (1991)]에 기재된 효모계 유전자 시스템을 사용하여 모니터링할 수 있다. 많은 전사 활성자, 예를 들어 효모 GAL4는 물리적으로 구별되는 2개의 모듈형 도메인으로 이루어져 있는데, 한 도메인은 DNA-결합 도메인으로 작용하고, 나머지 한 도메인은 전사-활성 도메인으로 작용한다. 상기 간행물에 기재된 효모 발현계(일반적으로, "2-하이브리드계"로 언급됨)는 이러한 특성을 이용하며, 2-하이브리드 단백질을 사용하는데, 이 중 하나는 표적 단백질이 GAL4의 DNA-결합 도메인과융합된 것이며, 다른 하나는 후보 활성 단백질이 활성 도메인과 융합된 것이다. GAL4-활성 프로모터의 조절하에 GAL1-lacZ 리포터 유전자의 발현은 단백질-단백질 상호작용을 통한 GAL4 활성의 재구성에 따라 좌우된다. 상호작용 폴리펩티드를 포함하는 콜로니는 β-갈락토시다제에 대한 색소생산성 기질을 사용하여 검출한다. 2-하이브리드 기술을 사용하여 2종의 특이적인 단백질사이의 단백질-단백질 상호작용을 확인하는 완성형 킷트(MATCHMAKER, 등록상표)는 클론테크사에서 구입할 수 있다. 또한, 이 시스템을 확장하여 특이적 단백질 상호작용에 관여하는 단백질 도메인을 매핑할 수 있을뿐 아니라, 이러한 상호작용에 결정적인 아미노산 잔기의 위치를 정확하게 나타낼 수 있다.

하기의 방법으로, 본원에서 확인된 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 유전자와 다른 세포내 또는 세포외 성분의 상호작용을 방해하는 화합물을 시험할 수 있다. PRO 폴리펩티드를 코딩하는 유전자의 산물과 세포내 또는 세포외 성분을 포함하는 반응 혼합물을 두 생성물의 상호작용 및 결합을 허용하는 조건 및 시간하에 제조하였다. 결합을 저해하는 후보 화합물의 능력을 시험하기 위해, 시험 화합물의 존재 및 부재하에 반응을 수행하였다. 또한, 양성 대조군 역할을 하는 제3의 반응 혼합물에 위약을 첨가할 수 있다. 혼합물에 존재하는 시험 화합물과 세포내 또는 세포외 성분사이의 결합(복합체 형성)을 상기 기재된 바와 같이 모니터링하였다. 대조 반응물에서는 복합체가 형성되었으나 시험 화합물을 포함하는 반응 혼합물에서 복합체가 형성되지 않은 것은 시험 화합물이 시험 화합물과 그의 반응 대응물의 상호작용을 방해한다는 사실을 나타낸다.

길항제를 분석하기 위해, PRO 폴리펩티드를 화합물과 함께 세포에 첨가하여 특정 활성을 스크리닝할 수 있었으며, PRO 폴리펩티드의 존재하에 목적 활성을 저해하는 화합물의 능력은 이 화합물이 PRO 폴리펩티드에 대한 길항제임을 나타내었다. 별법으로, 경쟁적 저해 분석을 위해 적절한 조건하에 PRO 폴리펩티드 및 잠재적인 길항제를 막-결합 PRO 폴리펩티드 수용체 또는 재조합 수용체와 함께 결합시킴으로써 길항제를 검출할 수 있었다. PRO 폴리펩티드를 예를 들어 방사 활성 동위원소로 표지하여, 수용체와 결합하는 PRO 폴리펩티드 분자의 수를 이용하여 잠재적인 길항제의 효과를 결정할 수 있었다. 당업자에게 공지된 여러 방법, 예를 들어 리간드 패닝법 및 FACS 분류법 (Coligan et al.,Current Protocols in Immun., 1(2): Chapter 5 (1991))에 의해 수용체를 코딩하는 유전자를 확인할 수 있었다. 바람직하게는, 발현 클로닝법이 사용되는데, 여기서 폴리아데닐화 RNA는 PRO 폴리펩티드에 대해 반응성인 세포로부터 제조되며, 이 RNA로부터 생성된 cDNA 라이브러리는 푸울로 분류되어 PRO 폴리펩티드에 대해 비반응성인 COS 세포 또는 다른 세포를 형질감염시키는데 사용된다. 글래스 슬라이드에서 증식하는 형질감염된 세포는 표지된 PRO 폴리펩티드에 노출된다. 부위-특이적 단백질 키나제에 관한 인식 부위의 요오드화 또는 봉입화를 비롯한 여러 방법에 의해 PRO 폴리펩티드를 표지할 수 있었다. 고정화하고 인큐베이션한 다음, 슬라이드를 오토라디오그래피법으로 분석하였다. 양성 푸울을 동정하여 서브-푸울을 제조하고, 상호작용 서브-푸울링 및 재스크리닝 방법을 이용하여 재형질감염시킴으로써, 결국 추정의 수용체를 코딩하는 단일 클론을 산출하였다.

수용체를 확인하는 다른 방법으로, 표지된 PRO 폴리펩티드를 세포막 또는 수용체 분자를 발현시키는 추출물 시료와 함께 광친화성-연결할 수 있었다. PAGE에 의해 가교 물질을 분석하고 엑스선 필름에 노출시켰다. 수용체를 포함하는 표지 복합체를 자르고 펩티드 단편으로 분해하여 단백질 마이크로-시퀀싱처리할 수 있었다. 마이크로-시퀀싱으로부터 얻어진 아미노산 서열을 사용하여 축퇴 올리고뉴클레오티드 프로브 한 세트를 설계함으로써 cDNA 라이브러리를 스크리닝하고 추정의 수용체를 코딩하는 유전자를 확인할 수 있었다.

다른 길항제 분석 방법으로, 후보 화합물의 존재하에 수용체를 발현하는 포유류 세포 또는 막 시료를 표지된 PRO 폴리펩티드와 함께 인큐베이션하였다. 그 후에, 상기 상호작용을 강화 또는 차단하는 화합물의 능력을 측정할 수 있었다.

잠재적인 길항제의 보다 구체적인 예에는 이뮤노글로불린과 PRO 폴리펩티드의 융합체와 결합하는 올리고뉴클레오티드, 및 특히 폴리- 및 모노클로날 항체, 및 항체 단편, 측쇄 항체, 항-유전자형 항체, 및 이러한 항체 또는 그의 단편의 키메라 형태 또는 인간화 형태, 및 인간 항체 및 항체 단편을 비롯한 항체가 포함되나 이에 한정되지 않는다. 또는, 잠재적인 길항제는 밀접하게 관련된 단백질, 예를 들어 수용체를 인식하지만 영향을 주지는 않으며, 따라서 PRO 폴리펩티드의 작용을 경쟁적으로 저해하는 PRO 폴리펩티드의 변이된 형태일 수 있다.

또다른 잠재적인 PRO 폴리펩티드 길항제는 안티센스 기술을 사용하여 제조한 안티센스 RNA 또는 DNA 작제물인데, 여기서 안티센스 RNA 또는 DNA 분자는 표적 mRNA와 혼성화하여 단백질 번역을 방지함으로써 mRNA의 번역을 직접 차단하는 작용을 한다. 안티센스 기술을 사용하여 삼중나선 형성 또는 안티센스 DNA 또는 RNA를 통한 유전자 발현을 조절할 수 있는데, 이 방법들은 모두 폴리뉴클레오티드와 DNA 또는 RNA의 결합을 토대로 한다. 예를 들어, 본원에서 성숙 PRO 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열의 5'코딩 부분을 사용하여 염기쌍 약 10 내지 40개 길이의 안티센스 RNA 올리고뉴클레오티드를 설계한다. DNA 올리고뉴클레오티드는 전사에 관여하는 유전자 영역에 대해 상보적이게끔 설계하여(삼중나선-문헌(Lee et al.,Nucl. Acids Res., 6:3073 (1979); Cooney et al,,Science, 241:456 (1988); Dervan et al.,Science, 251:1360 (1991))을 참조한다) 전사 및 PRO 폴리펩티드의 생산을 방지하였다. 안티센스 RNA 올리고뉴클레오티드는 생체내에서 그의 mRNA와 혼성화하여 mRNA 분자의 PRO 폴리펩티드로의 번역을 차단하였다(antisense - Okano,Neurochem., 56:560 (1991);Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of Gene Expression(CRC Press: Boca Raton, FL, 1988)). 또한, 상기 기재된 올리고뉴클레오티드를 세포에 전달하여 안티센스 RNA 또는 DNA를 생체내에서 발현시킴으로써 PRO 폴리펩티드의 생산을 억제할 수 있었다. 안티센스 DNA가 사용되는 경우, 전사-개시 부위, 예를 들어 표적 유전자 뉴클레오티드 서열의 약 -10 내지 +10 위치 사이로부터 유도된 올리고데옥시리보뉴클레오티드가 바람직하였다.

잠재적인 길항제에는 활성 부위, 수용체 결합 부위, 또는 PRO 폴리펩티드의 증식 인자 또는 다른 관련 결합 부위와 결합하여 PRO 폴리펩티드의 정상적인 생물학적 활성을 차단하는 작은 분자가 포함된다. 작은 분자의 예에는 작은 펩티드 또는 펩티드-유사 분자, 바람직하게는 가용성 펩티드, 및 합성 비펩티딜 유기 또는 무기 화합물이 포함되나 이에 한정되지 않는다.

리보자임은 RNA의 특이적인 절단을 촉매할 수 있는 효소 RNA 분자이다. 리보자임은 그와 상보적인 표적 RNA와 서열-특이적 혼성화한 다음, 엔도누클레아제에 의해 절단됨으로써 작용한다. 공지된 기술로 잠재적인 RNA 표적내의 특이적인 리보자임 절단 부위를 확인할 수 있었다. 보다 자세한 사항은 예를 들어 문헌 (Rossi,Current Biology, 4:469-471 (1994) 및 PCT publication No. WO 97/33551(published September 18, 1997))을 참조한다.

전사를 억제하는데 사용되는 삼중나선 형태의 핵산 분자는 단일-가닥이어야하며, 데옥시뉴클레오티드로 이루어져야 한다. 이러한 올리고뉴클레오티드의 염기 조성은 그가 Hoogsteen 염기쌍 규칙을 통해 삼중나선 형성을 촉진하게끔 설계되어 있는데, 삼중나선 형성에는 일반적으로 이중쇄 중 한 쇄에 상당한 크기의 퓨린 또는 피리미딘 스트레치가 있어야 한다. 보다 자세한 사항은 예를 들어 문헌 (PCT publication No. WO 97/33551, supra.)을 참조한다.

상기 작은 분자들은 상기 기재된 임의 한가지 이상의 스크리닝 분석법 및(또는) 당업자에게 잘 알려진 임의 다른 스크리닝 기술에 의해 확인할 수 있다.

F. 항-PRO 항체

본 발명은 추가로 항-PRO 항체를 제공한다. 항체의 예는 폴리클로날, 모노클로날, 인간화, 이중특이적 및 이종접합(heteroconjugate) 항체를 포함한다.

1. 폴리클로날 항체

항-PRO 항체는 폴리클로날 항체를 포함할 수 있다. 폴리클로날 항체의 제조 방법은 당업자에게 공지되어 있다. 폴리클로날 항체는 예를 들어 면역화제 및 필요한 경우 보조제를 1회 이상 주사함으로써 포유동물에서 생성시킬 수 있다. 일반적으로, 면역화제 및(또는) 보조제는 피하 또는 복강내 수회 주사하는 방법으로 포유동물에 주사될 것이다. 면역화제는 PRO 폴리펩티드 또는 그의 융합 단백질을 포함할 수 있다. 면역처리되는 포유동물에서 면역원성인 것으로 알려진 단백질에 면역화제를 접합시키는 것이 유용할 수 있다. 상기 면역원성 단백질의 예에는 키홀 림펫 헤모시아닌, 혈청 알부민, 소 티로글로불린 및 대두 트립신 저해제가 포함되나 이에 한정되지 않는다. 사용될 수 있는 보조제의 예는 프로이드 완전 보조제 및 MPL-TDM 보조제 (모노포스포릴 지질 A, 합성 트레할로스 디코리노미콜레이트)를 포함한다. 면역처리 방법은 불필요한 실험 없이도 당업계의 숙련가에 의해 선택될 수 있다.

2. 모노클로날 항체

항-PRO 항체는 별법으로 모노클로날 항체일 수 있다. 모노클로날 항체는 문헌 [Kohler and Milstein,Nature,256:495 (1975)]에 기재되 바와 같은 하이브리도마 방법을 사용하여 제조할 수 있다. 하이브리도마 방법에서, 생쥐, 햄스터 또는 다른 적절한 숙주 동물을 통상적으로 면역화제로 면역처리하여 면역화제에 특이적으로 결합하는 항체를 생산하거나 생산할 수 있는 임파구를 유도한다. 별법으로, 임파구는 시험관 내에서 면역처리할 수 있다.

면역화제는 일반적으로 PRO 폴리펩티드 또는 그의 융합 단백질을 포함할 것이다. 일반적으로, 인체 기원의 세포를 원하는 경우 말초 혈액 임파구 ("PBL")가 사용되나, 인간 이외의 포유동물 공급원을 원하는 경우에는 비장 세포 또는 임프절 세포가 사용된다. 이어서, 폴리에틸렌 글리콜과 같은 적합한 융합제를 사용하여 임파구와 불멸화된 세포주를 융합시켜 하이브리도마 세포를 형성시킨다 [Goding,Monoclonal Antibodies: Principle and Practice, Academic Press, (1986) pp. 59-103]. 불멸화된 세포주는 대체로 형질전환된 포유동물 세포, 특히 설치류, 소 및 인체 기원의 골수종 세포이다. 일반적으로, 쥐 또는 생쥐 골수종 세포주가 사용된다. 하이브리도마 세포는 바람직하게는 비융합된 불멸화된 세포의 증식 또는 생존을 억제하는 1종 이상의 물질을 함유하는 적합한 배양 배지에서 배양시킬 수 있다. 예를 들면, 모세포가 하이포잔틴 구아닌 포스포리보실 트랜스퍼라제 (HGPRT 또는 HPRT) 효소가 결핍된 경우, 하이브리도마용 배양 배지 ("HAT 배지")는 전형적으로 하이포잔틴, 아미노프테린 및 티미딘을 포함할 것이며, 이들 물질은 HGPRT-결핍 세포의 증식을 억제시킨다.

바람직한 불멸화된 세포주는 효율적으로 융합하고, 선택된 항체-생산 세포에 의한 항체의 생산을 높은 수준으로 안정하게 유지하며, HAT 배지와 같은 배지에 감수성이 있는 것이다. 보다 바람직한 불멸화된 세포주는 예를 들어 솔크 인스티튜트 셀 디스트리뷰션 센터 (Salk Institute Cell Distribution Center, 미국 캘리포니아주 샌디에고) 및 아메리칸 타입 컬쳐 컬렉션 (American Type Culture Collection, 미국 버지니아주 마나사스)으로부터 입수가능한 쥐과 골수종 세포주이다. 또한, 인간 골수종 세포주 및 생쥐-인간 헤테로골수종 세포주가 인간 모노클로날 항체의 생산에 대해 기술되었다 [Kozbor,J. Immunol., 133: 3001 (1984); Brodeur et al.,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, Marcel Dekker, Inc., New York, (1987) pp. 51-63].

하이브리도마 세포가 배양되는 배양 배지를 PRO에 대해 지시된 모노클로날 항체의 존재에 대해 분석할 수 있다. 바람직하게는, 하이브리도마 세포에 의해 생산된 모노클로날 항체의 결합 특이성을 면역침전법에 의해, 또는 방사성면역분석법 (RIA) 또는 효소-결합 면역흡수 분석법 (ELISA)과 같은 시험관내 결합 분석에 의해 측정하였다. 이러한 기술 및 분석은 당업계에 공지되어 있다. 모노클로날 항체의 결합 친화도는 예를 들어 스카트카르트(Scatchard) 분석 (Munson and Pollard,Anal. Biochem.,107:220 (1980))에 의해 측정할 수 있다.

원하는 하이브리도마 세포를 확인한 후, 제한 희석 절차에 의해 클론을 서브클로닝시키고 표준 방법 [Goding,상기문헌]에 의해 배양시켰다. 이러한 목적에 적합한 배양 배지에는 예를 들면, 둘베코스 변형 이글 배지 (Dulbecco's Modified Eagle's Medium) 또는 RPMI-1640 배지가 포함된다. 또는, 하이브리도마 세포는 포유류에서 복수종양으로서 생체내 배양시킬 수 있다.

서브클론에 의해 분비된 모노클로날 항체는 예를 들면, 단백질 A-세파로스, 히드록실아파티트 크로마토그래피, 겔 전기영동, 투석 또는 친화성 크로마토그래피와 같은 통상의 이뮤노글로불린 정제 절차에 의해 배양 배지 또는 복수액으로부터 단리 및 정제시킬 수 있다.

또한, 모노클로날 항체는 미국 특허 제4,816,567호에 기재된 것과 같은 재조합 DNA 방법에 의해 제조할 수 있다. 본 발명의 모노클로날 항체를 코딩하는 DNA는 통상의 방법을 이용하여 (예를 들면, 쥐과 동물 항체의 중쇄 및 경쇄를 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오티드 프로브를 이용함으로써) 쉽게 단리하여 시퀀싱할 수 있다. 본 발명의 하이브리도마 세포는 그러한 DNA의 바람직한 공급원으로서의 역할을 한다. 일단 단리되면, DNA는 발현 백터 내로 넣은 다음, 원숭이 COS 세포, 차이니즈 햄스터 난소(CHO) 세포 또는 다른 방법으로는 이뮤노글로불린 단백질을 생산하지 않는 골수종 세포와 같은 숙주 세포 내로 발현 벡터를 형질감염시켜 재조합 숙주 세포에서 모노클로날 항체를 합성시킬 수 있다. 또한, DNA는 예를 들어 상동성의 쥐과 동물 서열 부위를 인간 중쇄 및 경쇄 불변 도메인에 대한 코딩 서열로 치환하거나 (미국 특허 제4,816,567호; Morrison et al.,상기 문헌), 또는 비-이뮤노글로불린 폴리펩티드에 대한 코딩 서열의 전체 또는 일부를 이뮤노글로불린 코딩 서열에 공유 결합시킴으로써 변형시킬 수 있다. 그러한 비-이뮤노글로불린 폴리펩티드로 본 발명의 항체의 불변 도메인을 치환하거나, 본 발명의 항체의 한 항체-결합 부위의 가변 도메인을 치환하여 키메라 2가 항체를 생성시킬 수 있다.

항체는 1가 항체일 수 있다. 1가 항체를 제조하는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 예를 들어 한 방법은 이뮤노글로불린 경쇄 및 변형 중쇄의 재조합 발현을 포함한다. 중쇄 가교결합을 방지하기 위해서 중쇄는 일반적으로 Fc 영역의 임의의 지점에서 말단이 절단된다. 또는, 관련 시스테인 잔기는 가교결합을 방지하기 위해서 다른 아미노산 잔기로 치환되거나 결실된다.

또한, 시험관내 방법도 1가 항체의 제조에 적합하다. 항체 단편, 특히 Fab 단편을 제조하기 위한 항체의 분해는 당업계에 통상적으로 알려진 기술을 사용하여 수행할 수 있다.

3. 인간 항체 및 인간화 항체

또한, 본 발명의 항-PRO 항체는 인간화 항체 또는 인간 항체를 포함할 수 있다. 비-인간(예를 들어, 쥐과 동물) 항체의 인간화 형태는 키메라 이뮤노글로불린, 비-인간 이뮤노글로불린으로부터 유도된 최소 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 사슬 또는 그의 단편 (예를 들어, Fv, Fab, Fab', F(ab')₂또는 항체의 다른 항원 결합 작은 서열)이다. 인간화 항체는, 수용체의 상보성 결정 영역 (CDR)의 잔기를 원하는 특이성, 친화도 및 능력을 갖는 생쥐, 쥐 또는 토끼와 같은 인간 이외의 종 (공여 항체)의 CDR로부터의 잔기로 치환시킨 인간 이뮤노글로불린 (수용 항체)을 포함한다. 몇몇 경우에, 인간 이뮤노글로불린의 Fv 프레임워크 잔기는 대응하는 비-인간 잔기에 의해 치환된다. 또한, 인간화 항체는 수용 항체에서도 또는 도입되는 CDR 또는 프레임워크 서열에서도 발견되지 않는 잔기를 포함할 수 있다. 일반적으로, 인간화 항체는 하나 이상, 일반적으로 둘 이상의 가변 도메인을 실질적으로 모두 포함할 것이며, 여기서 모든 또는 실질적으로 모든 CDR 영역은 비-인간 이뮤노글로불린의 영역에 대응하며, 모든 또는 실질적으로 모든 FR 영역은 인간 이뮤노글로불린 컨센서스 서열의 영역에 해당한다. 또한, 인간화 항체는 이뮤노글로불린 불변 영역 (Fc)의 적어도 일부, 일반적으로 인간 이뮤노글로불린 영역의 적어도 일부를 포함할 것이다 [Jones et al.,Nature,321: 522-525 (1986); Riechmann et al.,Nature,332: 323-329 (1988); 및 Presta,Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992)].

비인간 항체를 인간화하는 방법은 당업계에 잘 알려져 있다. 일반적으로, 인간화 항체는 비-인간 공급원으로부터의 그에 도입된 하나 이상의 아미노산 잔기를 갖는다. 이들 비-인간 아미노산 잔기는 흔히 "임포트(import)" 잔기로 언급되며, 통상적으로 "임포트" 가변 도메인으로부터 얻어진다. 인간화는 인간 항체의 상응하는 서열을 설치류 CDR 또는 CDR 서열로 치환함으로써 본질적으로 윈터 (Winter) 등의 방법 [Jones et al.,Nature,321: 522-525 (1986); Riechmann et al.,Nature,332: 323-327 (1988); Verhoeyen et al.,Science,239: 1534-1536 (1988)]에 따라 수행할 수 있다. 따라서, 그러한 "인간화" 항체는 실질적으로 보다 적은 무손상 인간 가변 도메인이 비-인간 종 유래의 상응하는 서열에 의해 치환된 키메라 항체 (미국 특허 제4,816,567호)이다. 실제로, 인간화 항체는 통상적으로 일부 CDR 잔기 및 가능하게는 일부 FR 잔기를 설치류 항체에서 유사한 부위로부터의 잔기로 치환시킨 인간 항체이다.

인간 항체는 파지 디스플레이 라이브러리를 비롯한 당업계에 공지된 여러 기술을 사용하여 제조할 수도 있다 [Hoogenboom and Winter.,J. Mol. Biol.,227: 381 (1991); Marks et al.,J. Mol. Bio.,222: 581 (1991)]. 또한, 코울 등 및 보에르너 등의 기술도 인간 모노클로날 항체의 제조에 사용할 수 있다 (Cole et al.,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985) andBoerner et al.,J. Immunol.,147(1):86-95 (1991)]. 마찬가지로, 유전자도입 동물, 예를 들어 생쥐에 인간 이뮤노글로불린 유전자좌를 도입함으로써 인간 항체를 제조할 수 있는데, 여기서 내부 이뮤노글로불린 유전자는 부분적으로 또는 완전히 실활화된다. 항원투여 후에, 인간 항체 생산이 관찰되었는데, 이는 유전자 재배열, 어셈블리 및 항체 목록을 비롯한 모든 점에서 인간에서 관찰되는 항체와 매우 유사하였다. 상기 사항은 예를 들어 문헌 (미국 특허 제5,545,807호, 동 제5,545,806호, 동 제5,569,825호, 동 제5,625,126호, 동 제5,633,425호, 동 5,661,016호) 및 과학 간행물 (Marks et al.,Bio/Technology 10, 779-783 (1992); Lonberg et al.,Nature 368, 856-859 (1994), Morrison,Nature 368, 812-13 (1994); Fishwild et al.,Nature Biotechnology 14, 845-51 (1996); Neuberger,Nature Biotechnology 14, 826 (1996); Lonberg and Huszar,Intern. Rev. Immunol. 1365-93 (1995))에 기재되어 있다.

4. 이중특이적 항체

이중특이적 항체는 2종 이상의 상이한 항원에 대해 결합 특이성을 갖는 모노클로날, 바람직하게는 인간 또는 인간화 항체이다. 이 경우에, 결합 특이성 중의 하나는 PRO에 대한 것이고, 다른 하나는 임의 다른 항원, 바람직하게는 세포 표면 단백질 또는 수용체 또는 수용체 서브유닛에 대한 것이다.

이중특이적 항체를 제조하는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 통상적으로, 이중 특이적 항체의 재조합 생산은 2개의 이뮤노글로불린 중쇄-경쇄/경쇄-중쇄 쌍의 동시발현에 기초하며, 여기에서, 2개의 중쇄는 상이한 특이성을 갖는다[Millstein and Cuello,Nature,305: 537-539 (1983)]. 이뮤노글로불린 중쇄 및 경쇄의 무작위 분류로 인해, 이들 하이브리도마 (쿼드로마)는 10가지 상이한 항체 분자의 가능한 혼합물을 생산하며, 이중 하나만이 정확한 이중특이적 구조를 갖는다. 정확한 분자의 정제는 일반적으로 친화성 크로마토그래피 단계에 의해 수행된다. 유사한 방법이 WO 제93/08829호(1993년 5월 13일에 공개됨) 및 문헌[Traunecker et al.,EMBO J., 10: 3655-3659 (1991)]에 기재되어 있다.

원하는 결합 특이성을 갖는 항체의 가변 도메인(항체-항원 결합 부위)을 이뮤노글로불린 불변 도메인 서열에 융합시킬 수 있다. 이 융합은 힌지의 적어도 일부, CH2 및 CH3 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 중쇄 불변 도메인과의 융합이 바람직하다. 경쇄 결합을 위해 필요한 부위를 포함하는 제1 중쇄 불변 영역 (CH1)이 융합체의 적어도 하나에 존재하는 것이 바람직하다. 이뮤노글로불린 중쇄 융합체, 및 원한다면 이뮤노글로불린 경쇄를 코딩하는 DNA를 별도의 발현 벡터에 삽입하고, 적합한 숙주 유기체에 공동 형질감염시킨다. 이중특이적 항체를 생산하기 위한 보다 상세한 내용은 예를 들면, 문헌[Suresh et al.,Methods in Enzymmology,121: 210(1986)]을 참조한다.

WO 96/27011에 개시된 다른 방법에 따르면, 한쌍의 항체 분자사이의 인터페이스를 조작하여 재조합 세포 배양으로부터 회수되는 헤테로다이머의 백분율을 최대화할 수 있다. 바람직한 인터페이스는 항체 불변 도메인의 CH3 영역의 적어도 일부를 포함한다. 이 방법에서, 제1 항체 분자의 인터페이스로부터 1개 이상의 작은 아미노산 측쇄를 보다 큰 측쇄(예를 들어, 티로신 또는 트립토판)로 대체하였다. 큰 아미노산 측쇄를 작은 아미노산 측쇄(예를 들어, 알라닌 또는 트레오닌)로 대체함으로써 큰 측쇄에 대해 동일하거나 유사한 크기의 보충의 "공동(cavity)"을 제2 항체 분자의 인터페이스에 생성시켰다. 이는 헤테로다이머의 수율을 호모다이머와 같은 다른 원치 않는 최종-생성물의 수율 이상으로 증가시키는 메카니즘을 제공한다.

이중특이적 항체는 전장 항체 또는 항체 단편(예를 들어, F(ab')₂이중특이적 항체)으로 제조할 수 있다. 항체 단편으로부터 이중특이적 항체를 생성하는 기술은 문헌에 기재되어 있다. 예를 들어, 화학적 연결을 이용하여 이중특이적 항체를 제조할 수 있다. 문헌 (Brennan et al.,Science229:81 (1985))에는 무손상 항체를 단백질 가수분해로 잘라서 F(ab')₂단편을 생성하는 방법이 기재되어 있다. 이러한 단편은 디티올 복합 물질인 소듐 아르세니트의 존재하에 환원되어 근처 디티올을 안정화하고 분재내 디술피드 형성을 방지한다. 그 후에, 생성된 Fab' 단편을 티오니트로벤조에이트(TNB) 유도체로 전환시켰다. 그 후에, Fab'-TNB 유도체 중 하나를 머캅토에틸아민을 사용하여 환원시킴으로써 Fab'-티올로 재전환시키고 등몰량의 다른 Fab'-TNB 유도체와 혼합하여 이중특이적 항체를 형성시켰다. 생성된 이중특이적 항체는 효소의 선택적 고정화를 위한 물질로 사용할 수 있다.

이. 콜라이로부터 Fab' 단편을 직접 회수하여 화학적으로 연결시킴으로써 이중특이적 항체를 형성시켰다. 문헌 (Shalaby et al.,J. Exp. Med.175:217-225 (1992))에는 완전한 인간화 이중특이적 항체 F(ab')₂분자가 개시되어 있다. 각각의 Fab' 단편은 이 콜라이로부터 별도로 분비되었으며 지시된 시험관내의 화학적 방법으로 연결하여 이중특이적 항체를 형성시켰다. 이와 같이 형성된 이중특이적 항체는 ErbB2 수용체를 과다발현시키는 세포 및 정상적인 인간 T 세포와 결합할 수 있을뿐 아니라, 인간 유방암 표적에 대한 인간 세포독성 림프구의 용해 활성을 개시할 수 있었다.

또한, 재조합 세포 배양으로부터 직접 이중특이적 항체 단편을 만들고 단리하는 여러 기술이 개시되어 있다. 예를 들어, 루신 지퍼를 사용하여 이중 특이적 항체를 제조하였다(Kostelny et al.,J. Immunol. 148(5):1547-1553 (1992)). 유전자 융합에 의해, Fos 및 Jun 단백질로부터의 루신 지퍼 펩티드를 2종의 상이한 항체의 Fab' 부분에 연결하였다. 항체 호모다이머의 힌지 영역을 환원시켜 단량체를 형성한 다음, 재산화시켜 항체 헤테로다이머를 형성시켰다. 또한, 이 방법은 항체 호모다이머를 생산하기 위한 방법으로 이용할 수도 있다. 문헌 (Hollinger et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA90:6444-6448 (1993))에 기재된 "디아바디(diabody)" 기술은 이중특이적 항체 단편을 만드는 다른 메카니즘을 제공한다. 이 단편은 링커에 의해 경쇄 가변 도메인(V_L)에 연결된 중쇄 가변 도메인(V_H)을 포함하는데, 이 링커는 너무 짧아서 상기 두 도메인을 동일 쇄로 짝지을 수 없다. 따라서, 한 단편의 V_H및 V_L도메인은 다른 단편의 상보적인 V_H및 V_L도메인과 쌍을 이루게 되며, 2개의 항원 결합 부위를 형성한다. 단쇄 Fv(sFv) 이량체를 사용하여 이중특이적 항체 단편을 만드는 또다른 전략이 보고되었다(문헌(Gruber et al.,J. Immunol.152:5368 (1994))을 참조한다). 2가 이상의 결합가를 갖는 항체도 고려 대상이다. 예를 들어, 삼중특이적 항체를 만들 수 있다(Tutt et al.,J. Immunol.147:60 (1991)).

전형적인 이중특이적 항체는 본원에서 제공된 PRO 폴리펩티드의 2종의 상이한 에피톱과 결합할 수 있다. 또는, 특정 PRO 폴리펩티드를 발현시키는 세포에 대한 세포내 방어 메카니즘에 초점을 맞추기 위해, 항-PRO 폴리펩티드 팔을 백혈구 상 개시 분자, 예를 들어 T-세포 수용체 분자(예를 들어, CD2, CD3, CD28 또는 B7), 또는 IgG의 Fc 수용체(FcγR), 예를 들어 FcγRI(CD64), FcγRII(CD32) 및 FcγRIII(CD16)와 결합하는 팔과 연결할 수 있다. 또한, 이중특이적 항체를 사용하여 특정 PRO 폴리펩티드를 발현시키는 세포에 세포독성 물질을 국소화할 수 있다. 이러한 항체는 PRO-결합 팔과 세포독성 물질 또는 방사성핵종 킬레이트제, 예를 들어 EOTUBE, DPTA, DOTA 또는 TETA와 결합하는 팔을 가지고 있다. 목적하는 또다른 이중특이적 항체는 PRO 폴리펩티드와 결합하며 추가로 조직 인자(TF)와 결합한다.

5. 이종접합 항체

이종접합 항체도 본 발명의 범위에 포함된다. 이종접합 항체는 2개의 공유결합된 항체로 구성된다. 이러한 항체는 예를 들어 면역계 세포를 원하지 않는 세포에 표적화시키기 위해 (미국 특허 제4,676,980호), 및 HIV 감염의 치료를 위해 (WO 제91/00360호, 동 제92/200373호, 및 EP 제03089호) 제안되었다. 이종접합 항체는 가교결합제를 사용하는 방법을 포함하여 합성 단백질 화학에 공지된 방법을 이용하여 시험관내에서 제조할 수 있는 것으로 생각된다. 예를 들어, 면역독소는디술피드 교환 반응 또는 티오에테르 결합을 형성함으로써 제조할 수 있다. 상기 목적에 적합한 시약은 이미노티올레이트 및 메틸-4-메르캅토부티르이미데이트 및 미국 특허 제4,676,980호에 개시된 시약을 포함한다.

6. 효과기 기능 조작

효과기 기능에 대해 본 발명의 항체를 변형하여 예를 들어 암치료에 있어 항체의 효과를 증대하는 것이 바람직할 수 있다. 예를 들어, 시스테인 잔기를 Fc 영역에 도입하여 이 영역내 쇄간 디술피드 결합을 형성시킬 수 있다. 이와 같이 생성된 호모다이머 항체는 내부화 능력을 향상시키고(시키거나) 보체-매개 세포 사멸 및 항체-의존성 세포내 세포독성(ADCC)을 증대시킨다 (문헌 (Caron et al.,J. Exp Med., 176:1191-1195 (1992) 및 Shopes,J. Immunol., 148:2918-2922 (1992))을 참조한다). 또한, 문헌 (Wolff et al.Cancer Research,53: 2560-2565 (1993))에 기재된 헤테로이관능성 가교를 사용하여 증대된 항-종양 활성을 지닌 호모다이머 항체를 제조할 수 있다. 또는, 이중의 Fc 영역을 갖는 항체를 조작하여 보체 용균성 및 ADCC 능력을 증대시킬 수 있다 (문헌 (Stevenson et al.,Anti-Cancer Drug Design, 3:219-230 (1989))을 참조한다).

7. 면역복합체

또한, 본 발명은 세포독성 물질, 예를 들어 화학치료제, 독소(예를 들어, 효소적으로 활성인 박테리아, 진균, 식물 또는 동물성 독소, 또는 그의 단편) 또는 방사활성 동위원소(즉, 방사성복합체)와 결합된 항체를 포함하는 면역복합체에 관한 것이다.

상기 면역복합체의 생성에 유용한 화학치료제는 상기에 기재되어 있다. 사용될 수 있는 효소적으로 활성인 독소 및 그의 단편에는 디프테리아 A 쇄, 디프테리아 독소의 비결합 활성 단편, 외독소 A 쇄(슈도모나스 애루기노사(Pseudomonas aeruginosa) 유래), 리신 A 쇄, 아브린 A 쇄, 모데신 A 쇄, 알파-사르신, 알레우리테스 포르디(Aleurites fordii) 단백질, 디안틴 단백질, 피톨라카 아메리카나(Phytolaca americana) 단백질(PAPI, PAPII 및 PAP-S), 쓴 멜론(momordica charantia) 저해제, 쿠르신, 크로틴, 사파오나리아 오피시날리스(sapaonaria officinalis) 억제제, 겔로닌, 미토겔린, 레스트릭토신, 페노마이신, 에노마이신, 및 트리코테세네스가 포함된다. 여러 방사성핵종을 방사복합체 항체의 제조에 이용할 수 있다. 예에는²¹²Bi,¹³¹I,¹³¹In,⁹⁰Y 및¹⁸⁶Re가 포함된다. 다양한 이관능성 단백질-연결 물질, 예를 들어 N-숙신이미딜-3-(2-피리딜디티올)프로피오네이트(SPDP), 이미노티올란(IT), 이미도에스테르의 이관능성 유도체(예를 들어, 디메틸 아디프이미데이트 HCL), 활성 에스테르(예를 들어, 디숙신이미딜 수베레이트), 알데히드(예를 들어, 글루타르알데히드), 비스-아지도 화합물(예를 들어, 비스(p-아지도벤조일)헥산디아민), 비스-디아조늄 유도체(예를 들어, 비스-(p-디아조늄벤조일)-에틸렌디아민), 디이소시아네이트(예를 들어, 톨리엔 2,6-디이소시아네이트), 및 비스-활성 플루오르 화합물(예를 들어, 1,5-디플루오로-2,4-디니트로벤젠)을 사용하여 항체와 세포독성 물질의 복합체를 만들 수 있다. 예를 들어, 문헌 (Vitetta et al.,Science,238:1098 (1987))에기재된 바와 같이 리신 면역독소를 제조할 수 있다. 탄소-14-표지된 1-이소티오시아네이토벤질-3-메틸디에틸렌 트리아민펜타아세트산(MX-DTPA)은 방사성뉴클레오디드와 항체를 연결하는 전형적인 킬레이트제이다(WO 94/11026을 참조한다).

또다른 실시태양으로, 항체와 종양 예비표적화에 이용되는 "수용체"(예를 들어, 스트렙타비딘)를 연결할 수 있는데, 여기서 항체-수용체 복합체를 투여 대상에게 투여한 다음, 킬레이트제를 사용하여 순환으로부터 결합하지 않은 복합체를 제거하고 세포독성 물질(예를 들어, 방사성뉴클레오티드)에 연결된 "리간드"(예를 들어, 아비딘)를 투여한다.

8. 면역리포좀

본원에서 개시된 항체를 면역리포좀으로 제제화할 수도 있다. 이 항체를 포함하는 리포좀은 당업계에 공지된 방법, 예를 들어 문헌 (Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82:3688 (1985); Hwang et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA, 77:4030 (1980); 및 미국 특허 제4,485,045호 및 동 제4,544,545호)에 기재된 방법으로 제조할 수 있다. 순환 시간이 증대된 리포좀은 문헌 (미국 특허 제5,013,556호)에 개시되어 있다.

특히 유용한 리포좀은 포스파티딜콜린, 콜레스테롤 및 PEG-유도체화 포스파티딜에탄올아민(PEG-PE)을 함유하는 지질 조성물을 사용하여 역상 증발법에 의해 생성할 수 있다. 정해진 공극 크기의 필터를 통해 리포좀을 밀어내어 소정의 직경을 갖는 리포좀을 수득하였다. 문헌 (Martin et al.,J. Biol. Chem.,257:286-288 (1982))에 기재된 바와 같이 디술피드-상호교환 반응을 통해 본 발명의 항체의Fab' 단편을 리포좀에 연결할 수 있다. 화학요법제(예를 들어, 독소루비신(Doxorubicin))은 임의로 리포좀내에 포함된다(문헌 (Gabizon et al.,J. National Cancer Inst.,81(19):1484 (1989))을 참조한다).

9. 항체 제약 조성물

각종 질환을 치료하기 위해, 본원에서 확인된 PRO 폴리펩티드와 특이적으로 결합하는 항체 및 상기 기재된 스크리닝 분석에 의해 확인된 다른 분자를 제약 조성물 형태로 투여할 수 있다.

PRO 폴리펩티드가 세포내에 있고 항체 전부가 저해제로 사용되는 경우, 내부화 항체가 바람직하다. 그러나, 또한 리포펙션 또는 리포좀을 사용하여 항체 또는 항체 단편을 세포내에 전달할 수 있다. 항체 단편이 사용되는 경우, 표적 단백질의 결합 도메인에 특이적으로 결합하는 최소 저해성 단편이 바람직하다. 예를 들어, 항체의 가변-영역 서열을 토대로, 표적 단백질 서열과 결합하는 능력을 지닌 펩티드 분자를 설계할 수 있다. 이러한 펩티드는 화학적으로 합성하고(하거나) 재조합 DNA 기술에 의해 제조할 수 있다(예를 들어, 문헌 (Marasco et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:7889-7893 (1993))을 참조한다). 또한, 본원의 제형은 치료할 특정 증상에 있어 필요에 따라 1종 이상의 활성 화합물, 바람직하게는 서로 악영향을 주지 않는 상보적인 활성을 지닌 화합물을 포함할 수 있다. 별법으로, 또는 추가로, 이 조성물은 그의 기능을 증대시키는 물질, 예를 들어 세포독성 물질, 시토킨, 화학요법제, 또는 증식-억제제를 포함할 수 있다. 이러한 분자는 적합하게는 의도된 목적에 효과적인 양으로 배합된다.

활성 성분은 예를 들어 각각 콜로이드성 약물 전달 시스템 (예를 들어 리포솜, 알부민 마이크로스피어, 마이크로에멀젼, 나노입자 및 나노캡슐) 또는 마크로에멀젼 중에서 예를 들어 코아세르베이션(coacervation) 기술 또는 계면 중합, 예를 들어 히드록시메틸셀룰로스 또는 젤라틴-마이크로캡슐 및 폴리-(메틸메타크릴레이트) 마이크로캡슐에 의해 제조된 마이크로캡슐에 봉입될 수 있다. 상기 기술은 문헌 (Remington'sPharmaceutical Sciences, 상기 문헌)에 개시되어 있다.

체내 투여에 사용되는 제제는 멸균처리되어야 한다. 이것은 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 용이하게 수행된다.

서방성 제제도 제조될 수 있다. 서방성 제제의 적합한 예는 항체를 함유하는 고체 소수성 중합체의 성형품, 예를 들어 필름 또는 마이크로캡슐 형태의 반투과성 매트릭스를 포함한다. 서방성 매트릭스의 예는 폴리에스테르, 히드로겔(예를 들어, 폴리(2-히드록시에틸-메타크릴레이트) 또는 폴리(비닐알콜)), 폴리락티드 (미국 특허 제3,773,919호), L-글루탐산과 γ 에틸-L-글루타메이트의 공중합체, 비분해성 에틸렌-비닐 아세테이트, 분해성 락트산-글리콜산 공중합체, 예를 들어 LUPRON DEPOT(등록상표)(락트산-글리콜산 공중합체 및 루프롤라이드 아세테이트로 이루어진 주입가능한 마이크로스피어), 및 폴리-D-(-)-3-히드록시부티르산이 있다. 에틸렌-비닐 아세테이트 및 락트산-글리콜산과 같은 중합체는 100일 이상 동안 분자를 방출시키지만, 어떤 히드로겔은 보다 짧은 기간 동안 단백질을 방출시킨다. 캡슐화된 항체가 오랫 동안 체내에 남아있는 경우, 그는 37 ℃에서 습기에 노출된 결과, 변성 또는 응집되어 생물 활성을 감소시키고 면역원성을 변화시킬 수 있다.안정화를 위해 관련된 메카니즘에 따라 합리적인 전략을 설계할 수 있다. 예를 들어, 응집 메카니즘이 티오-디술피드 상호교환을 통한 분재내 S-S 결합 형성인 것으로 밝혀진 다면, 술프히드릴 잔기의 변형, 산성 용액으로부터의 동결건조, 수분 함량 조절, 적절한 첨가제 사용 및 특이적인 중합체 매트릭스 조성물의 개발에 의해 안정화를 달성할 수 있다.

G. 항-PRO 항체의 용도

본 발명의 항-PRO 항체는 다양한 유용성을 갖는다. 예를 들어, 항-PRO 항체는 PRO에 대한 진단 분석, 예를 들어 특정 세포, 조직 또는 혈청에서의 그의 발현의 검출에 사용될 수 있다. 당업계에 공지된 다양한 진단 분석 기술, 예를 들어 이종상 또는 동종상에서 수행되는 경쟁 결합 분석, 직접 또는 간접 샌드위치 분석 및 면역침전 분석[Zola,Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, CRC Press, Inc. (1987) pp. 147-158]을 사용할 수 있다. 진단 분석에 사용되는 항체는 검출가능한 잔기로 표지될 수 있다. 검출가능한 잔기는 직접 또는 간접적으로 검출가능한 신호를 생성시킬 수 있어야 한다. 예를 들어, 검출가능한 잔기는 방사성 동위 원소, 예를 들어³H,¹⁴C,³²P,³⁵S 또는¹²⁵I, 형광 또는 화학발광 화합물, 예를 들어 플루오레세인 이소티오시아네이트, 로다민 또는 루시페린, 또는 효소, 예를 들어 알칼리 포스파타제, 베타-갈락토시다제 또는 양고추냉이 페록시다제일 수 있다. 문헌 [Hunter et al,Nature,144:945(1962); David et al.,Biochemistry,13:1014 (1974); Pain et al.,J. Immunol. Meth.,40:219 (1981);및 Nygren,J. Histochem. and Cytochem.,30:407 (1982)]에 기재된 방법을 비롯하여 항체를 검출가능한 잔기에 결합시키기 위한 당업계에 공지된 임의 방법을 사용할 수 있다.

또한, 항-PRO 항체는 재조합 세포 배양액 또는 천연 공급원으로부터 PRO의 친화성 정제에도 유용하다. 이 과정에서, PRO에 대한 항체는 당업계에 공지된 방법을 사용하여 세파덱스 수지 또는 여과지에 적합한 지지체에 고정된다. 그 후에, 고정된 항체는 정제될 PRO를 함유하는 시료와 접촉시킨 후, 고정된 항체에 결합한 PRO 폴리펩티드를 제외하고 시료 내의 모든 물질을 실질적으로 제거하기 위해 적합한 용매로 세척한다. 최종적으로, 지지체는 다른 적합한 용매로 세척하여 항체로부터 PRO 폴리펩티드를 방출시킨다.

다음의 실시예는 단지 예시를 목적으로 제공될 뿐이며, 어떤 식으로든 본 발명의 범위를 한정하려는 것이 아니다.

이 명세서에 인용된 모든 특허와 문헌은 그를 거명함으로써 그 전체가 본원에 도입된다.

실시예에서 언급한 시판 시약들은 달리 지시하지 않는 한 제조업자의 지시에 따라 사용하였다. 하기 실시예와 명세서 전반에서 ATCC 기탁 번호로 확인되는 세포들의 입수원은 아메리칸 타입 컬쳐 콜렉션(American Type Culture Collection, 버지니아주 마나사스)이다.

실시예 1: 신규 폴리펩티드 및 이를 코딩하는 cDNA를 확인하기 위한 세포외 도메인상동성 스크리닝

스위스-프롯(Swiss-Prot) 공용 데이타베이스로부터 약 950개의 공지된 분비형 단백질로부터의 세포외 도메인 (ECD) 서열 (존재하는 경우 분비 신호 서열 포함)을 사용하여 EST 데이타베이스를 조사하였다. EST 데이타베이스는 공용 데이타베이스 (예를 들면, 데이호프(Dayhoff), 젠뱅크(GenBank))와 독점 데이타베이스 (예를 들면, LIFESEQ™ (인사이트 파마슈티칼스(Incyte Pharmaceuticals, 캘리포니아주 팔로 알토))를 포함한다. 조사는 EST 서열의 6개 프레임 번역에 대한 ECD 단백질 서열의 비교로서 컴퓨터 프로그램 WU-BLAST-2 [Altschul et al.,Methods in Enzymology266: 460-480 (1996)]를 이용하여 수행하였다. 공지된 단백질을 코딩하지 않는 70 (또는 몇몇 경우 90) 이상의 블라스트(Blast) 스코어를 갖는 비교물을 클러스터시키고, 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington 워싱턴주 시애틀)을 사용하여 컨센서스 DNA 서열로 조립하였다.

본 세포외 도메인 상동성 스크린을 이용하여, 컨센서스 DNA 서열을 phrap을 사용하여 확인된 다른 EST 서열에 대해 조립하였다. 또한, 수득한 컨센서스 DNA 서열을 종종 (항상은 아니지만) 가능한 한 상기 논의한 EST 서열원을 사용하여 컨센서스 서열을 신장시키기 위해 WU-BLAST-2와 phrap의 반복 사이클을 이용하여 신장시켰다.

이어서, 상기한 바와 같이 수득한 컨센서스 서열에 기준하여 올리고뉴클레오티드를 합성하여, PCR에 의해 관심있는 서열을 포함하는 cDNA 라이브러리를 확인하기 위해 사용하고 PRO 폴리펩티드에 대한 전장 코딩 서열의 클론을 단리시키기 위한 프로브로서 사용하였다. 전방향 및 역방향 PCR 프라이머는 일반적으로 20 내지 30개 뉴클레오티드 범위이고, 종종 약 100 내지 1000 bp 길이의 PCR 산물을 제공하기 위해 고안된다. 프로브 서열은 대개 40 내지 55 bp 길이이다. 몇몇 경우, 컨센서스 서열이 약 1 내지 1.5 kbp보다 큰 경우 추가의 올리고뉴클레오티드가 합성된다. 전장 클론을 위한 몇몇 라이브러리를 스크리닝하기 위해, 이들 라이브러리로부터의 DNA를 PCR 프라이머 쌍을 사용하여 문헌 (Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology)에 따라 PCR 증폭에 의해 스크리닝하였다. 이어서, 양성 라이브러리를 사용함으로써 프로브 올리고뉴클레오티드 및 프라이머 쌍들 중 하나를 이용하여 관심있는 유전자를 코딩하는 클론을 단리시켰다.

cDNA 클론을 단리시키기 위해 사용되는 cDNA 라이브러리는 인비트로젠(Invitrogen, 캘리포니아주 샌디에고)으로부터의 시약들과 같은 시판 시약을 사용하여 표준 방법으로 제작하였다. cDNA를 NotI 부위를 갖는 올리고 dT로 프라이밍시키고, SalI 헤미키나제화 어댑터에 평활 말단으로 연결시키고, NotI로 절단하고, 겔 전기영동에 의해 적절한 크기로 분류하고, 적당한 클로닝 벡터 (예를 들면, pRKB 또는 pRKD; pRK5B는 SfiI 부위를 포함하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌 [Holmes et al.,Science,253: 1278-1280 (1991)]을 참조한다)내의 유일한 XhoI 및 NotI 부위에 정해진 방향으로 클로닝하였다.

실시예 2: 아밀라제 스크리닝에 의한 cDNA 클론의 단리

1. 올리고 dT 프라이밍된 cDNA 라이브러리의 제조

인비트로젠 (캘리포니아주, 샌디에고)사의 시약 및 프로토콜 (Fast Track 2)을 사용하여 인간 조직으로부터 mRNA를 단리하였다. 미국 메릴랜드주 게터스버그 소재의 Life Technologies사의 시약 및 프로토콜 (Super Script Plasmid System)을 이용하여, 상기 RNA를 사용하여 벡터 pRK5D에 올리고 dT 프라이밍된 cDNA 라이브러리를 생성시켰다. 이 과정에서, 이중 가닥 cDNA의 크기를 1000 bp보다 크도록 선택하고, SalI/NotI 링커 부착 cDNA를 XhoI/NotI 절단 벡터에 클로닝하였다. pRK5D는 sp6 전사 개시 부위, SfiI 제한 효소 부위, XhoI/NotI cDNA 클로닝 부위를 순서대로 포함하는 클로닝 벡터이다.

2. 랜덤 프라이밍된 cDNA 라이브러리의 제조

1차 cDNA 클론의 5' 말단을 우선적으로 제공하기 위해 2차 cDNA 라이브러리를 생성시켰다. 1차 라이브러리 (상기한 바와 같음)로부터 sp6 RNA를 생성시키고, Life Technologies사의 시약 및 프로토콜 (Super Script Plasmid System, 상기한 바와 같음)을 이용하여 상기 RNA를 사용하여 랜덤 프라이밍된 cDNA 라이브러리를 생성시켰다. 이 과정에서, 이중가닥 cDNA를 500 내지 1000 bp의 크기로 만들고, NotI 어댑터에 평활한 상태로 연결시키고, SfiI로 절단하여 SfiI/NotI 절단 벡터에 클로닝하였다. pSST-AMY.0은 cDNA 클로닝 부위 및 생쥐 아밀라제 서열 (성숙 서열, 분비 신호 없음) 앞에 효모 알콜 탈수소효소 프로모터를 갖고 클로닝 부위 뒤에 효모 알콜 디히드로게나제 터미네이터를 갖는 클로닝 벡터이다. 따라서, 프레임내에 아밀라제 서열과 융합된, 상기 벡터 내에 클로닝된 cDNA는 적절하게 형질감염된 효모 콜로니로부터 아밀라제를 분비시킬 수 있다.

3. 형질전환 및 검출

상기 단락 2에 기재된 라이브러리로부터의 DNA를 빙상에서 냉각시켜 전기수용성(electorcompetent) DH10B 세균 (Life Technologies) 20 ml을 첨가하였다. 세균 및 벡터 혼합물을 이어서 제조자의 권고대로 일렉트로포레이션시켰다. 이어서, SOC 배지 (Life Technologies) 1 ml을 첨가하고 혼합물을 30분 동안 37℃에서 인큐베이션하였다. 그 후에, 형질전환체를 암피실린 함유 표준 150 mm LB 플레이트 20개에 플레이팅하고 16시간 동안 (37℃)에서 인큐베이션하였다. 양성 콜로니를 플레이트로부터 분리하여 표준 프로토콜, 예를 들어 CsCL-구배법을 사용하여 DNA를 세균 펠렛으로부터 단리하였다. 정제된 DNA를 사용하여 다음과 같은 효모 프로토콜을 수행하였다.

효모 방법은 다음 세개의 카테고리로 분류된다: 1) 플라스미드/cDNA 조합 벡터를 사용한 효모의 형질전환, 2) 아밀라제를 분비하는 효모 클론의 검출 및 단리 및 3) 효모 콜로니로부터 삽입체의 직접 PCR 증폭 및 서열분석 및 추가의 분석을 위한 DNA의 정제.

사용된 효모는 HD56-5A (ATCC-90785)이었다. 이 균주는 MAT 알파, ura3-52, leu2-3, leu2-112, his3-11, his3-15, MAL⁺, SUC⁺, GAL⁺의 인자형을 갖는다. 바람직하게는, 번역 후 경로가 결여된 효모 변이체를 사용할 수 있다. 이러한 변이체는 sec71, sec72, sec62, 바람직하게는 말단이 잘린 sec71에서 전좌(translocation)로 인한 결핍 대립유전자를 가질 수 있다. 별법으로, 상기 유전자의 정상적인 작동을 방해하거나 상기 번역 후 경로에 관련된 다른 단백질 (예를 들어 SEC61p, SEC72p,SEC62p, SEC63p, TDJ1p 또는 SSA1p-4p) 또는 이들 단백질의 복합체 형성을 방해하는 길항제 (안티센스 뉴클레오티드 및(또는) 리간드 포함)를 사용하는 것이 바람직할 수 있다.

형질전환은 문헌 [Gietz et al.,Nucl. Acid. Res., 20:1425 (1992)]에 개관된 프로토콜에 기초하여 수행하였다. 이어서, 형질전환된 세포를 아가로부터 YEPD 복합 배지 브로쓰 100 ml에 접종하고 30℃에서 철야 성장시켰다. YEPD 브로쓰를 문헌 [Kaiser et al.,Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY, p. 207 (1994)]에 기재된 바와 같이 제조하였다. 철야 배양액을 신선 YEPD 브로쓰 500 ml로 약 2 x 10⁶세포/ml (약 OD₆₀₀= 0.1)로 희석하여 약 1 x 10⁷세포/ml (약 OD₆₀₀= 0.4 - 0.5)로 재성장시켰다.

세포를 회수한 다음, 형질전환을 준비하였는데, Sorval GS3 로터의 GS3 로터 바틀로 옮겨서 5,000 rpm에서 5분 동안 원심분리하고, 상등액을 버리고, 멸균수로 재현탁시켜 Beckman GS-6KR 원심분리기에서 3,500 rpm으로 50 ml 팔콘 튜브에서 다시 원심분리하여였다. 상등액을 버리고, 세포를 LiAc/TE (10 ml, 10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA pH7.5, 100 mM Li₂OOCCH₃)로 세척하여 LiAc/TE (2.5 ml)에 재현탁시켰다.

마이크로 원심분리 튜브에서, 준비한 세포 100 ㎕를 신선한 변성 단일 가닥 연어 고환 DNA (미국 메릴랜드주 게이터스버그 소재 Lofstrand Lab)와 형질전환 DNA 1 ㎍ (부피 < 10 ㎕)와 혼합하여 형질전환을 수행하였다. 혼합물을 볼텍싱에의해 잠깐 혼합한 후, 40% PEG/TE 600 ㎕ (40% 폴리에틸렌 글리콜-4000, 10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA, 100 mM Li₂OOCCH₃, pH 7.5)를 첨가하였다. 상기 혼합물을 부드럽게 혼합하고 30분 동안 교반하면서 30℃에서 인큐베이션하였다. 세포를 이어서 42℃에서 15분 동안 열 쇼크를 가하고, 반응 용기를 마이크로원심분리기에서 12,000 rpm에서 5 내지 10초 동안 원심분리하여 상등액을 버리고 TE 500 ㎕ (10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA pH7.5)에 재현탁시킨 후 재원심분리하였다. 세포를 TE 1 ml로 희석하고 분취액 200 ㎕를 150 mm 성장 플레이트 (VWR)에서 미리 제조한 선택 배지 상에 도말하였다.

별법으로, 작은 다수회의 반응 대신에, 시약량을 증가시키면서 1회의 대규모의 반응을 이용하여 형질전환을 수행하였다.

사용된 선택 배지는 문헌 [Kaiser et al.,Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY, p. 208-210 (1994)]에 기재된 바와 같이 제조된 우라실 결여된 합성 완전 덱스트로스 아가 (SCD-Ura)이었다. 형질전환체를 30℃에서 2 내지 3일 동안 성장시켰다.

아밀라제를 분비하는 콜로니의 검출은 선택 성장 배지 중에 적색 전분을 포함시켜 수행하였다. 문헌 [Biely et al.,Anal. Biochem.,172:176-179 (1988)]에 기재된 바와 같은 방법에 따라 전분을 적색 염료 (반응성 Red-120, Sigma)와 결합시켰다. 결합된 전분을 최종 농도 0.15% (w/v)로 SCD-Ura 아가 플레이트에 첨가하고, 인산칼륨을 사용하여 pH 7.0으로 완충시켰다 (최종 농도 50 내지 100 mM).

양성 콜로니를 선택하여 새로운 선택 배지 (150 mm 플레이트 상의)에 스트리킹하여 잘 단리되며 동정가능한 단일 콜로리를 수득하였다. 적색 전분을 완충된 SCD-Ura 아가에 직접 첨가하여 아밀라제 분비에 대해 양성인 잘 단리된 단일 콜로니를 검출하였다. 전분을 분해하여 직접 시각으로 확인할 수 있는 양성 콜로니 주위에 투명 원광(halo)을 생성시키는 능력에 의해 양성 콜로니를 결정하였다.

4. PCR 증폭에 의한 DNA의 단리

양성 콜로니를 단리할 때, 그 일부를 이쑤시개로 떠내어 96웰 플레이트 내의 멸균수 30 ㎕ 중에 희석하였다. 이때, 양성 콜로니를 동결시켜 후속 분석을 위해 보관하거나 즉시 증폭하였다. 0.5 ㎕ Klentaq (미국 캘리포니아주 팔로 알토 소재의 Clontech), 10 mM dNTP 4.0 ㎕ (Perkin Elmer-Cetus), Kentaq 완충액 (Clontech) 2.5 ㎕, 전방향 올리고뉴클레오티드 1 0.25 ㎕, 역방향 올리고뉴클레오티드 2 0.25 ㎕, 증류수 12.5 ㎕를 포함하는 25 ㎕ 부피의 PCR 반응의 주형으로서 세포의 분취액 5 ㎕를 사용하였다. 전방향 올리고뉴클레오티드 1의 서열은 다음과 같다:

5'-tgtaaaacgacggccagttaaatagacctgcaattattaatct-3' (서열 1)

역방향 올리고뉴클레오티드 2의 서열은 다음과 같다:

5'-caggaaacagctatgaccacctgcacacctgcaaatccatt-3' (서열 2)

이어서, PCR을 다음과 같이 수행하였다.

a. 92℃에서 5분 동안 변성시킴,

b. 92℃에서 30초 동안 변성, 59℃에서 30초 동안 어닐링, 72℃에서 60초간신장시키는 과정을 3회 실시,

c. 92℃에서 30초 동안 변성, 57℃에서 30초 동안 어닐링, 72℃에서 60초간 신장시키는 과정을 3회 실시,

d. 92℃에서 30초 동안 변성, 55℃에서 30초 동안 어닐링, 72℃에서 60초간 신장시키는 과정을 25회 실시,

e. 4℃에서 유지시킴.

올리고뉴클레오티드의 밑줄친 영역은 ADH 프로모터 영역 및 아밀라제 영역에 각각 어닐링되고, 삽입체가 존재하지 않을 경우 벡터 pSST-AMY.O으로부터 307 bp 영역을 증폭하였다. 통상적으로, 상기 올리고뉴클레오티드의 5' 말단의 처음 18개의 뉴클레오티드는 서열 분석 프라이머의 어닐링 부위를 포함하였다. 따라서, 공(empty) 벡터로부터 PCR 반응의 총 생성물은 343 bp이었다. 그러나, 신호 서열이 융합된 cDNA는 상당히 긴 뉴클레오티드 서열을 생성시켰다.

PCR 후에, 반응액의 분취액 5 ㎕를 문헌 [Sambrook et al.,상기 문헌]에 기재된 Tris-Borate-EDTA (TBE) 완충 시스템을 사용하여 1% 아가로스 겔에서의 아가로스 겔 전기영동에 의해 조사하였다. 400 bp보다 큰 강력한 하나의 PCR 생성물을 생성시키는 클론을 96 Qiaquick PCR clean-up 컬럼 (미국 캘리포니아주 채스워쓰 소재의 Qiagen Inc.)로 정제한 후 DNA 서열 분석에 의해 추가로 분석하였다.

실시예 3: 신호 알고리즘 분석을 이용한 cDNA 클론의 단리

제넨테크, 인크(Genentech, Inc., South San Franscisco, CA)사에서 개발한 독점적인 신호 서열 검색 알고리즘을 사용하여, 공용(예를 들어, Genbank) 및(또는) 독점(LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Inc., Palo Alto, CA) 데이타베이스로부터의 EST 및 밀집되고 조립된 EST 단편에서 다양한 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 서열을 확인하였다. 신호 서열 알고리즘은 고려 대상의 서열 또는 서열 단편의 5'-말단에서 첫번째 및 임의로 두번재 메티오닌 코돈(ATG) 주변의 DNA 뉴클레오티드의 특성을 토대로 분비 신호 점수를 계산하였다. 첫번째 ATG 다음의 뉴클레오티드는 임의 정지 코돈 없이 35개 이상의 분명한 아미노산을 코딩해야 한다. 첫번째 ATG는 소정의 아미노산을 갖는 경우, 두번째 ATG는 조사하지 않았다. 이 요건을 충족시키지 못하는 경우, 후보 서열의 점수는 계산하지 않았다. EST 서열이 분명한 신호 서열을 포함하는지를 결정하기 위해, 분비 신호와 관련된 것으로 알려진 7개의 센서(평가 파라메타) 한 세트를 사용하여 이 DNA 및 ATG 코돈 주변의 아미노산 서열의 점수를 매겼다. 이 알고리즘을 사용하여 많은 폴리펩티드-코딩 핵산 서열을 확인하였다.

실시예 4: 인간 PRO1560을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기술된 바와 같이 phrap을 사용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조립하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA17409로 지칭된다. DNA17409 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1560의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 DNA19902-1669에 대한 전장 DNA 서열(도 1, 서열 3) 및 PRO1560에 대한 유도된 단백질 서열을 제공하였다.

DNA19902-1669의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 1 (서열 3)에 나타나 있다. 클론 DNA19902-1669는 뉴클레오티드 위치 41 내지 43의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 776 내지 778의 분명한 정지 코돈을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 245개 길이이다. 또한, 신호 펩티드, 막횡단 도메인, N-글리코실화 부위, N-미리스토일화 부위, 티로신 키나제 인산화 부위 및 막 리포단백질 지질 부착 부위의 대략적인 위치는 도 2에 나타나 있다. 클론 DNA19902-1669를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203454를 배정받았다. 전장 PRO1560 단백질은 도 2에 나타나 있으며 추정 분자량은 약 27,563 달톤이고 추정 pI는 약 8.36이다.

도 2(서열 4)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1560 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF053453_1, AF053454_1, A15_HUMAN, AF054840_1, CD63_HUMAN, AF065389_1, AF054838_1, AF089749_1, P_R27525 및 P_R86834 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 5: 인간 PRO444를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 2에 기술된 아밀라제 스크리닝에서 단리된 cDNA 서열은 DNA13121로 지칭된다. 이 서열을 기초로, 프로브를 생성하고 사용하여 상기 실시예 2의 단락 1에서 기술된 바와 같이 준비된 인간 태아 폐 라이브러리(LIB25)를 스크리닝하였다. 클로닝 벡터는 pRK5B(pRK5B는 SfiI 부위를 포함하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌 (Holmes et al.,Science,253:1278-1280 (1991))을 참조한다)이었으며 절단된 cDNA 크기는 2800 bp미만이었다.

전장 클론은 뉴클레오티드 위치 608 내지 610의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 959 내지 961에서 발견되는 정지 코돈으로 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임(도 3, 서열 5)을 포함하는 것으로 확인되었다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 117개 길이이고 이론치 분자량은 약 12,692 달톤이며 추정 pI는 약 7.50이다. 도 4(서열 6)에 나타낸 전장 PRO444 서열의 분석 결과는 아미노산 1 내지 약 아미노산 16의 신호 펩티드의 존재를 입증하였다. 데이호프 데이타베이스(버전 35.45 SwissProt 35)의 분석 결과는 PRO444 아미노산 서열과 데이호프 서열 CEF44D12_8, P_R88452, YNE1_CAEEL, A47312, AF009957_1 및 A06133_1 사이의 상동성을 입증하였다. 클론 DNA26846-1397을 1998년 10월 27일자로 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203406을 배정받았다.

실시예 6: 인간 PRO1018을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

천연 인간 PRO1018 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA56107-1415)을 효모 스크리닝에 의해 주요 cDNA 클론의 5' 말단을 선택적으로 나타내는 인간 난소 종양 cDNA 라이브러리에서 확인하였다. 사용된 효모 스크리닝에 의해 본원에서 DNA41000으로 지칭되는 단일 EST 클론을 확인하였다. 그 후에, 상동 EST 서열을 확인하기 위해 DNA41000 서열을 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 비롯한 여러 EST 데이타베이스와 비교하였다. 비교는 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2 (Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460-480(1996))를 사용하여 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 본원에서는 이 컨센서스 서열을 DNA44449로 지칭하였다. 그 후에, DNA44449 서열을 토대로 한 올리고뉴클레오티드 프라이머를 합성하여 사용함으로써 인간 난소 종양 cDNA 라이브러리를 스크리닝하여 도 5에 나타낸 DNA56107-1415 클론을 확인하였다.

전장 DNA56107-1415 클론은 뉴클레오티드 위치 129 내지 131의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 696 내지 698의 정지 코돈에서 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 11, 서열 19)을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 189개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 6). 도 6 (서열 8)에 나타낸 전장 PRO1018 서열의 분석 결과는 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 24의 신호 펩티드, 약 아미노산 86 내지 약 아미노산 103 및 약 아미노산 60 내지 약 아미노산 75의 막횡단 도메인, 및 약 아미노산 44 내지 약 아미노산 84의 G-단백질 연결된 수용체 단백질과 상동성을 지닌 아미노산 서열 블록의 존재를 입증한다. 클론 DNA56107-1415를 1998년 10월 27일자로 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203405를 배정받았다.

도 6(서열 8)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST-2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석 결과는 PRO1018 아미노산 서열과 데이호프 서열 CEB0399_4, S59764, YHDT_HAEIN 및 AE000675_3 사이의 상당한 상동성을 입증하였다.

실시예 7: 인간 PRO1773을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기술된 바와 같이 phrap을 사용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조립하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA49797로 지칭된다. DNA49797 컨센서스 서열과 Incyte EST 클론 번호 509434내에 포함된 EST 서열 사이에서 관찰된 상동성을 기초로 하여, Incyte EST 클론 번호 509434를 입수하고 그의 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 서열은 본원에서 도 7에 나타나 있고 DNA56406-1704로 지칭된다.

DNA56406-1704의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 7 (서열 9)에 나타나 있다. 클론 DNA56406-1704는 뉴클레오티드 위치 111 내지 113의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1068 내지 1070의 분명한 정지 코돈으로 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 7)을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 319개 길이이다 (도 8). 도 8에 나타낸 전장 PRO1773 단백질의 추정 분자량은 약 35,227 달톤이고 추정 pI는 약 8.97이다. 도 8(서열 10)에 나타낸 전장 PRO1773 서열의 분석 결과는 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 17의 신호 펩티드, 약 아미노산 136 내지 약 아미노산 152의 막횡단 도메인, 약 아미노산 161 내지 약 아미노산 164, 약 아미노산 187 내지 약 아미노산 190, 및 약 아미노산 253 내지 약 아미노산 256의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 39 내지 약 아미노산 42의 글리코사미노글리칸 부착 부위, 및 약 아미노산 36 내지 약 아미노산 41, 약 아미노산 42 내지 약 아미노산 47, 약 아미노산 108 내지 약 아미노산 113, 약 아미노산 166 내지 약 아미노산 171, 약 아미노산 198 내지 약 아미노산 203, 및 약 아미노산 207 내지 약 아미노산 212의 잠재적인 N-미리스톨화 부위의 존재를 입증한다. 클론 DNA56406-1704를 1998년 11월 17일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203478을 배정받았다.

도 8(서열 10)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석 결과는 PRO1773 아미노산 서열과 데이호프 서열 ROH2_RAT, ROH3_RAT, AF030513_1, ROH1_RAT, AF056194_1, AF057034_1, P_W18337, P_W18328, BDH_HUMAN 및 BDH_RAT 사이의 상당한 상동성을 입증하였다.

실시예 8: 인간 PRO1477을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기술된 바와 같이 phrap을 사용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조립하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA52641로 지칭된다. DNA52641 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO240의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

하기 PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머5'-cgccagaagg gcgtgattga cgtc-3' (서열 13) 및

역방향 PCR 프라이머5'-ccatccttct tcccagacag gccg-3' (서열 14)

추가로, 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 컨센서스 DNA52641 서열로부터 작제하였다.

혼성화 프로브

5'-gaagcctgtg tccaggtcct tcagtgagtg gtttggcctc ggtc-3' (서열 15)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO240 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다.

상기 기술된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 본원에서 DNA56529-1647로 지칭되는 PRO1477에 대한 전장 DNA 서열(도 9, 서열 11) 및 이로부터 유도된 PRO1477에 대한 단백질 서열을 제공하였다.

DNA56529-1647의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 9 (서열 11)에 나타나 있다. 클론 DNA56529-1647은 뉴클레오티드 위치 23 내지 25의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 2120 내지 2122의 종결 코돈으로 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 9)을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 699개 길이를 갖는다 (도 10). 도 10에 나타낸 전장 PRO240 단백질의 추정 분자량은 약 79,553 달톤이고 추정 pI는 약 7.83이다. 도 10 (서열 12)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석 결과는 약 아미노산 21 내지 약 아미노산 40, 및 약 아미노산 84 내지 약 아미노산 105의 막횡단 도메인의 존재를 입증한다. 클론 DNA56529-1647을 1998년 9월 29일자로 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203293을 배정받았다.

도 10 (서열 12)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석 결과는 PRO1477 아미노산 서열과 데이호프 서열 CELT03G11_1, CEZC410_4, A54408, SSMAN9MAN_1, GEN12643, GEN12642, AF027156_1, P_W46900, SPAC23A_1 및 DMC86E4_5 사이의 상당한 상동성을 입증하였다.

실시예 9: 인간 PRO1478을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기술된 바와 같이 phrap을 사용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조립하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA52719로 지칭된다. DNA52719 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1478의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

하기 PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머5'-gcgaacgctt cgaggagtcc tgg-3' (서열 18) 및

역방향 PCR 프라이머5'-gcagtgcggg aagccacatg gtac-3' (서열 19)

추가로, 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 컨센서스 DNA52719 서열로부터 작제하였다.

혼성화 프로브

5'-cttcctgagc aggaagaaga tccggcacca catctacgtg ctcaac-3' (서열 20)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1478 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다.

상기 기술된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1478에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1478에 대한 단백질 서열을 제공하였다.

PRO1478의 전체 코딩 서열은 도 11 (서열 16)에 나타나 있다. 클론 DNA56531-1648은 서열 16의 뉴클레오티드 위치 77 내지 79의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1058 내지 1060의 종결 코돈으로 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 327개 길이를 갖는다. 타입 II 막횡단 서열은 서열 17의 약 아미노산 29 내지 49에 있는 것으로 생각되고 N-글리코실화 부위는 서열 17의 약 아미노산 154 내지 157에 있는 것으로 생각된다. 클론 DNA56531-1648을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203286을 배정받았다. 도 12에 나타낸 전장 PRO1478 단백질의 추정 분자량은 약 37,406 달톤이고 추정 pI는 약 9.3이다.

도 12 (서열 17)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석 결과는 PRO1478 아미노산 서열과 데이호프 서열 YNJ4_CAEEL, P_R55706, A38781_1, NALS_MOUSE, HUMHGT_1, AF048687_1, CEW02B12_11, Y09F_MYCTU, FOJO_DROME, 및 G01936 사이의 서열 동일성을 입증하였다.

실시예 10: 인간 PRO831을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기술된 독점 신호 서열 발견 알고리즘을 사용하여 DNA56862-1343을 확인하였다. 상기 기술된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 Incyte 클러스트 서열번호 25507로 지칭되는, Incyte 데이타베이스로부터의 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2 (Altshul et al.,Methods in Enzymology266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 정리하여 컨센서스 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA55714로 명명하였다.

DNA55714 서열과 Merck EST 클론 AA099445 내에 포함된 EST 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, Merck EST 클론 AA099445를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 13에 나타나 있고 본원에서 DNA56862-1343으로 지칭된다.

클론 DNA56862-1343은 뉴클레오티드 위치 40 내지 42의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 259 내지 261의 종결 코돈으로 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 13)을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 73개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 14). 도 14에 나타낸 전장 PRO831 단백질의 추정 분자량은 약 7,879 달톤이고 추정 pI는 약 7.21이다. 도 14 (서열 22)에 나타낸 전장 PRO831의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 15의 신호 펩티드, 및 증식인자 및 사이토카인 수용체 족 단백질과 상동성을 갖는 약 아미노산 3 내지 약 아미노산 18의 아미노산 서열 블록의 존재를 입증한다. 클론 DNA56862-1343을 1998년 9월 1일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203174를 배정받았다.

도 14 (서열 22)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST-2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO831 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_W30724, HUMPPA_1, AF022238_1, 4HHB_C, P_R39727, P_R39728, TRYT_MERUN, GPR5_HUMAN, AB010266_3 및 HSBCL3S2_1 사이의 상당한 상동성을 입증하였다.

실시예 11: 인간 PRO1113을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기술된 바와 같이 phrap을 사용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조립하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA34025로 지칭된다. DNA34025 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1113의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

하기 PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머5'-gaggactcac caatctggtt cggc-3' (서열 25) 및

역방향 PCR 프라이머5'-aactggaaag gaaggctgtc tccc-3' (서열 26)

추가로, 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 컨센서스 DNA34025 서열로부터 작제하였다.

혼성화 프로브

5'-gtaaaggaga agaacatcac ggtacgggat accaggtgtg tttatcctaa-3' (서열 27)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1113 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리의 작제를 위한 RNA는 인간 태아 신장으로부터 단리하였다.

상기 기술된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 본원에서 DNA57254-1477로 지칭되는 PRO1113에 대한 전장 DNA 서열(도 15, 서열 23) 및 이로부터 유도된 PRO1113에 대한 단백질 서열을 제공하였다.

PRO1113의 전체 코딩 서열은 도 15 (서열 23)에 나타나 있다. 클론 DNA57254-1477은 서열 23의 뉴클레오티드 위치 214 내지 216의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2062 내지 2064의 분명한 종결 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 616개 길이를 갖는다. 막횡단 도메인(타입 II)은 서열 24의 약 아미노산 13 내지 40에 있는 것으로 생각된다. N-글리코실화 부위 및 N-미리스토일화 부위는 도 16에 나타나 있다. 클론 DNA57254-1477을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203289를 배정받았다. 도 16에 나타낸 전장 PRO1113 단백질의 추정 분자량은 약 68,243 달톤이고 추정 pI는 약 8.66이다.

도 16 (서열 24)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석 결과는 PRO1113 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 포함된 데이타) D86983_1, A58532, SLIT_DROME, AB007865_1, AC004142_1, CELT21D12_8, AB003184_1, DMU42767_1, MUSLRRP_1 및 GPCR_LYMST 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 12: 인간 PRO1194를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 13에 기술된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 인간 송과선(pineal gland) 라이브러리로부터 1종 이상의 EST를 유도하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2 (Altshul et al.,Methods in Enzymology266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열은 본원에서 DNA56511로 지칭된다.

DNA56511 서열과 Merck EST AA069568 내에 포함된 EST 사이의 서열 상동성을 고려하여, 이 EST를 포함하는 클론 382736을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 17에 나타나 있고 본원에서 DNA57841-1522로 지칭된다.

도 17에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 9 내지 11의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 252 내지 254의 종결 코돈으로 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 17, 서열 28)을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체 (도 18, 서열 29)는 81개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 29의 약 아미노산 1 내지 21에 있다. PRO1194의 이론치 분자량은 약 9,223 달톤이고 추정 pI는 약 10.47이다. 클론 DNA57841-1522를 1998년 11월 3일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203458을 배정받았다.

도 18 (서열 29)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1194 아미노산 서열과 데이호프 서열 PT17_YEAST, RR2_CHLVU, CEK12F2_1, S22452, S76705, AF031898_7, A4_DROME, AF038931_1, E49905 및 GSPL_AERHY 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 13: 인간 PRO1110을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

천연 인간 PRO1110 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론(DNA58727-1474)을 효모 스크리닝에 의해 주요 cDNA 클론의 5' 말단을 선택적으로 나타내는 인간 태아 신장 cDNA 라이브러리에서 확인하였다. 사용된 효모 스크리닝에 의해 본원에서 DNA45566으로 지칭되는 단일 EST 클론을 확인하였다. 그 후에, 상동 EST 서열을 확인하기 위해, DNA45566 서열을 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 비롯한 여러 EST 데이타베이스와 비교하였다. 비교는 컴퓨터 프로그램BLAST 또는 BLAST2 (Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460-480 (1996))를 사용하여 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 본원에서는 이 컨센서스 서열을 DNA46965로 지칭하였다. 그 후에, DNA46965 서열을 기초로, 올리고뉴클레오티드 프라이머를 합성하여 사용함으로써 인간 SK-Lu-1 선암종(adenocarcinoma) cDNA 라이브러리 (LIB247)를 스크리닝하여 도 19에 나타낸 DNA58727-1474 클론을 확인하였다.

도 19에 나타낸 전장 DNA58727-1474 클론은 뉴클레오티드 위치 131 내지 133의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1097 내지 1099의 종결 코돈에서 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 19)을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 322개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 20). 도 20에 나타낸 전장 PRO1110 서열의 분석 결과는 약 아미노산 41 내지 약 아미노산 60, 약 아미노산 66 내지 약 아미노산 85, 약 아미노산 101 내지 약 아미노산 120, 약 아미노산 137 내지 약 아미노산 153, 약 아미노산 171 내지 약 아미노산 192, 약 아미노산 205 내지 약 아미노산 226, 약 아미노산 235 내지 약 아미노산 255, 및 약 아미노산 294 내지 약 아미노산 312의 막횡단 도메인, 약 아미노산 6 내지 약 아미노산 69의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 18 내지 약 아미노산 21의 글리코사미노글리칸 부착 부위의 존재를 입증한다. 클론 DNA58727-1474를 1998년 9월 1일자로 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203171을 배정받았다.

도 20 (서열 31)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1110 아미노산 서열과 데이호프 서열 MMMYELUPR_1, P_R99799, MAL_HUMAN, P_P80929, RNMALGENE_1, S68406, PLLP_RAT, MMMALPROT_1, I38891 및 S55622 사이의 상당한 상동성을 입증하였다.

실시예 14: 인간 PRO13787을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

효모 스크리닝을 사용하여 주요 cDNA 클론의 5' 말단을 선택적으로 나타내는 인간 골수 cDNA 라이브러리에서 본원에서 DNA51941로 언급되는 처음의 DNA 서열을 확인하였다. DNA51941 서열을 기초로 하여, 골수 cDNA 라이브러리로부터 PRO1377에 대한 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로 사용되는 하기 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

tgtcctttgt cccagacttc tgtcc (서열 34),

ctggatgcta atgtgtccag taaatgatcc ccttatcccg tcgcgatgct (서열 35),

ttccactcaa tgaggtgagc cactc (서열 36),

ggcgagccct aactatccag gag (서열 37),

ggagatcgct gcgctggcca ggtcctccct gcatggtat (서열 38) 및

ctgctgcaaa gcgagcctct tg (서열 39)

도 21에 나타낸 전장 DNA58730-1607 클론은 뉴클레오티드 위치 1365 내지 1367의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 2370 내지 2372의 종결 코돈에서 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 21, 서열 32)을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체 (도 22, 서열 33)는 335개의 아미노산으로 이루어진 길이를 가지며, 약 아미노산 1 내지 15의 신호 펩티드를 갖는다. PRO1378의 이론치 분자량은 약 36,108 달톤이고 추정 pI는 약 4.51이다.

도 22 (서열 33)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1378 아미노산 서열과 데이호프 서열 ICAL_RABIT, SP2_HUMAN, SHPSPRBB_1, SP23_HUMAN, P_W08158 및 P_W08150 사이의 다소의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA58730-1607을 1998년 9월 15일자로 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203221을 배정받았다.

실시예 15: 인간 PRO1481을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

효모 스크리닝을 사용하여 주요 cDNA 클론의 5' 말단을 선택적으로 나타내는 인간 태아 신장 cDNA 라이브러리에서 본원에서 DNA53254로 언급되는 처음의 DNA 서열을 확인하였다. DNA53254 서열을 기초로 하여, 인간 태아 신장 cDNA 라이브러리로부터 PRO1481에 대한 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브 (또는 프라이머)로 사용되는 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

도 23에 나타낸 전장 DNA58732-1650 클론은 뉴클레오티드 위치 320 내지 322의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1322 내지 1324의 종결 코돈에서 끝나는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 23, 서열 40)을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체 (도 24, 서열 41)는 334개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 약 아미노산 1 내지 23에 있으며 막횡단 도메인은 서열 41의 약 아미노산 235 내지 약 아미노산 262에 있다. N-글리코실화 부위는 도 24에 나타나 있다. PRO1481의 이론치 분자량은 약 36,294 달톤이고 추정 pI는 약 4.98이다. 클론 DNA58732-1650을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203290을 배정받았다.

도 24 (서열 41)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1481 아미노산 서열과 데이호프 서열 YN23_YEAST, S67770, H36857, YLU2_PICAN, GEN12881, CVY15035_28, YM96_YEAST, ESC1_SCHPO, CELZK783_1 및 S59310 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 16: 인간 PRO1189를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 2에 기술된 아밀라제 스크리닝에서 단리된 cDNA 서열은 본원에서 DNA41784로 지칭된다. 그 후에, 상동 EST 서열을 확인하기 위해, DNA41784 서열을 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA; and Genentech, South San Francisco, CA)를 포함하는 여러가지 발현된 서열 태그 (EST) 데이타베이스와 비교하였다. 상동성 조사는 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2 (Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460-480 (1996))를 사용하여 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이렇게 얻어진 컨센서스 서열은 본원에서 DNA45499로 지칭된다.

DNA45499 서열을 기초로 하여, 올리고뉴클레오티드를 생성하여 사용함으로써 상기 실시예 2의 단락 1에 기술된 바와 같이 준비한 인간 골수 라이브러리를 스크리닝하였다. 클로닝 벡터는 pRK5B (pRK5B는 SfiI 부위를 포함하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌 (Holmes et al.,Science,253:1278-1280 (1991))을 참조한다)이었고 절단된 cDNA 크기는 2800 bp 미만이었다.

하기 PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머(45499.f1)5'-gaaagacacg acacagcagc ttgc-3' (서열 44),

전방향 PCR 프라이머(45499.f2)5'-gggaactgct atctgatgcc-3' (서열 45),

전방향 PCR 프라이머(45499.f3)5'-caggatctcc tcttgcagtc tgcagc-3' (서열 46),

역방향 PCR 프라이머(45499.r1)5'-cttctcgaac cacataagtt tgaggcag-3' (서열 47)

및

역방향 PCR 프라이머(45499.r2)5'-cacgattccc tccacagcaa ctggg-3' (서열 48)

추가로, 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 DNA45499 서열로부터 작제하였다.

혼성화 프로브(45499.p1)

5'-cgccttaccg cgcagcccga agattcacta tggtgaaaat cgccttcaat-3' (서열 49)

전장 클론의 공급원에 대한 몇몇 라이브러리를 스크리닝하기 위해, 상기 확인된 PCR 프라이머 쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 이어서, 양성 라이브러리를 사용함으로써 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머들 중 하나를 이용하여 PRO1189 유전자를 코딩하는 클론을 단리하였다.

뉴클레오티드 위치 79 내지 81의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 868 내지 870의 종결 신호를 갖는 단일 오픈 리딩 프레임 (도 25, 서열 42)을 포함하는 전장 클론을 확인하였다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 263개의 아미노산으로 이루어진 길이를 가지며 이론치 분자량은 약 29,741 달톤이고 추정 pI는 약 5.74이다. 추가적인 특징으로는 약 아미노산 53 내지 75의 타입 II 막횡단 도메인 및 아미노산 166 내지 169의 잠재적인 N-글리코실화 부위가 포함된다.

도 26 (서열 43)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1189 아미노산 서열과 데이호프 서열 MUSE25A_1 및 HS696H22_1 사이의 상당한 상동성을 입증하였다. 또한, PRO1189 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF017985_1, CBRG01D9_2, I79662, 및 CHPDRBAG_1 사이의 다소의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA58828-1519를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203172를 배정받았다.

실시예 17: 인간 PRO1415를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 서열 제150918호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA55720이라 지칭하였다.

DNA55720 서열과 Incyte EST 클론 제4081476호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, Incyte EST 클론 제4081476호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 27에 나타내었고 본원에서 DNA58852-1637이라 지칭하였다.

클론 DNA58852-1637은 뉴클레오티드 위치 148 내지 150의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 997 내지 999의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 27). 예상된 폴리펩티드 전구체는 283개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 28). 도 28에 나타낸 전장 PRO1415 단백질의 추정 분자량은 약 29,191 달톤이고 pI는 약 4.52이다. 도 28 (서열 50)에 나타낸 전장 PRO1415 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 25의 신호 펩티드, 약 아미노산 94 내지 약 아미노산 118의 막횡단 도메인, 및 약 아미노산 18 내지 약 아미노산 23, 약 아미노산 40 내지 약 아미노산 45, 약 아미노산 46 내지 약 아미노산 51, 약 아미노산 145 내지 약 아미노산 150, 약 아미노산 192 내지 약 아미노산 197, 약 아미노산 193 내지 약 아미노산 198, 약 아미노산 211 내지 약 아미노산216, 약 아미노산 238 내지 약 아미노산 243 및 약 아미노산 242 내지 약 아미노산 247의 잠재적인 N-미리스토일화 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA58852-1637을 1998년 9월 22일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203271호를 배정받았다.

도 28 (서열 50)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1415 아미노산 서열과 데이호프 서열 HSU66616, P_W24017, A38219, CD30_HUMAN, HSU78971_1, P_W22214, NFM_HUMAN, ADH1_ASPFL, PAU93274_5 및 CENB_MOUSE 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 18: 인간 PRO1411을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 1종 이상의 EST가 갑상선 조직 라이브러리로부터 유도되었다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서DNA56013이라 지칭하였다.

DNA56013 서열과 Incyte EST 1444225 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST를 포함하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 29에 나타내었고 본원에서 DNA59212-1627이라 지칭하였다.

도 29에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 184 내지 186의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1504 내지 1506의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 29, 서열 51). 예상된 폴리펩티드 전구체는 440개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 30, 서열 52). 신호 펩티드는 서열 52의 약 아미노산 1 내지 21에 있고, 세포 부착 부위는 서열 52의 약 아미노산 301 내지 303에 있다. PRO1411의 계산된 분자량은 약 42,208 달톤이고 추정 pI는 약 6.36이다. 클론 DNA59212-1627을 1998년 9월 9일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203245호를 배정받았다.

도 30 (서열 52)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1411 아미노산 서열과 데이호프 서열 MTV023_19, P_R05307, P_W26348, P_P82962, AF000949_1, EBN1_EBV, P_R95107, GRP2_PHAVU, P_R91318 및 S74439_1 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 19: 인간 PRO1295를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 1종 이상의 EST가 흉선 조직 라이브러리로부터 유도되었다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56262라 지칭하였다.

DNA56262 서열과 Incyte EST 3743334 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST를 포함하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 31에 나타내었고 본원에서 DNA59218-1559라 지칭하였다.

도 31에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 207 내지 209의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1407 내지 1409의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 31, 서열 53). 예상된 폴리펩티드 전구체는 280개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 32, 서열 54). 신호 펩티드는 서열 54의 약 아미노산 1 내지 18에 있다. 또한, 표적화 신호 및 N-글리코실화 부위도 서열54에 나타난다. PRO1295의 계산된 분자량은 약 30,163 달톤이고 추정 pI는 약 6.87이다. 클론 DNA59218-1559를 1998년 9월 29일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203287호를 배정받았다.

도 32 (서열 54)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1295 아미노산 서열과 데이호프 서열 AB011099_1, ILVE_MYCTU, ATTERC_2, AF010496_27, P_R15346, S37191, PER_DROMS, L2MU_ADECC 및 P_W34238 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 20: 인간 PRO1359를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 1종 이상의 EST가 S상 결장 조직 라이브러리로부터 유도되었다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56263이라 지칭하였다.

DNA56263 서열과 Incyte EST 1931418 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST를 포함하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 33에 나타내었고 본원에서 DNA59219-1613라 지칭하였다.

도 33에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 184 내지 186의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1081 내지 1083의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 33, 서열 55). 예상된 폴리펩티드 전구체는 299개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 34, 서열 56). 막횡단 도메인은 서열 56의 약 아미노산 9 내지 31에 있다. N-글리코실화 부위는 서열 54의 약 아미노산 64 내지 67 및 115 내지 118에 있다. PRO1359의 계산된 분자량은 약 34,219 달톤이고 추정 pI는 약 9.87이다. 클론 DNA59219-1613을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203220호를 배정받았다.

도 34 (서열 56)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1359 아미노산 서열과 데이호프 서열 GEM14384, P_R78622, A23699_1, P_R65244, A54898, AF059321_1, RNU55938_1, P_R75199 및 P_W63216 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 21: 인간 PRO1190을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 방법을 이용하여 본원에서 "DNA53943"이라 지칭되는, 머크/워싱턴대(Merck/Washington University) EST 서열인 EST 제AA339802호를 확인할 수 있었다. DNA53943 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1190 코딩 서열의 전장 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: (53943.f1) GGGAAACACAGCAGTCATTGCCTGC (서열 59)

역방향 PCR 프라이머: (53943.r1) GCACACGTAGCCTGTCGCTGGAGC (서열 60)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA53943 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: (53943.p1) CACCCCAAAGCCCAGGTCCTTTACAGCGTCAAACAAGAGTGG (서열 61)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1190 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 골수로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1190의 DNA 서열 (본원에서 DNA59586-1520 [도 35, 서열 57]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1190의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1190의 전체 코딩 서열은 도 35 (서열 57)에 나타내었다. 클론 DNA59586-1520은 뉴클레오티드 위치 340 내지 342의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 3685 내지 3687의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 1115개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 36에 나타낸 PRO1190 단백질의 추정 분자량은 약 121,188 달톤이고 pI는 약 7.07이다. PRO1190의 다른 특징으로는 아미노산 16 내지 30 및 854 내지 879의 막횡단 도메인 2개, 아미노산 1051 내지 1060의 시토크롬 P450 시스테인 헴-철 리간드 신호, 아미노산 1045 내지 1051의 N-6 아데닌-특이적 DNA 메틸라제 신호, 및 아미노산 65 내지 68, 76 내지 79, 98 내지 101, 189 내지 192, 275 내지 278, 518 내지 521, 726 내지 729 및 760 내지 763의 잠재적인 N-글리코실화 부위가 있다. 클론 DNA59586-1520을 1998년 9월 29일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203288호를 배정받았다.

도 36 (서열 58)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1190 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF004840_1, AF004841_1, AF026465_1, HSU72391_1, P_R13144, AXO1_HUMAN, GEN13349, I58164, D87212, A53449 및 D86983, 및 KIAA0230 사이의 상동성을 보여주었다.

실시예 22: 인간 PRO1772를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA45120이라 지칭되어 있다. DNA45120 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1772의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (45120.f1)5'-CCTTCACCTGCAGTACACCATGGGC-3' (서열 64)

역방향 PCR 프라이머 (45120.r1)5'-GTCACACACAGCTCTGGCAGCTGAG-3' (서열 65)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA45120 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (45120.p1)

5'-CCAAGTTCAGACACCACATGTACACCAACGTCAGCGGATTGACAAGC-3' (서열 66)

cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 골수 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1772의 DNA 서열 (본원에서 DNA59817-1703 [도 37, 서열 62]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1772의 단백질 서열을 수득하였다.

DNA59817-1703의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 37 (서열 62)에 나타내었다. 클론 DNA59817-1703은 뉴클레오티드 위치 93 내지 95의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1554 내지 1556의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 37). 예상된 폴리펩티드 전구체는 487개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 38). 도 38에 나타낸 PRO1772 단백질의 추정 분자량은 약 53,569 달톤이고 pI는 약 7.68이다. 도 38 (서열 63)에 나타낸 전장 PRO1772 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 36의 신호 펩티드, 약 아미노산 313 내지 약 아미노산 331의 막횡단 도메인, 약 아미노산 119 내지 약 아미노산 122, 약 아미노산 184 내지 약 아미노산 187, 약 아미노산 243 내지 약 아미노산 246 및 약아미노산 333 내지 약 아미노산 336의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 41 내지 약 아미노산 46, 약 아미노산 59 내지 약 아미노산 64, 약 아미노산 73 내지 약 아미노산 78, 약 아미노산 133 및 약 아미노산 138, 약 아미노산 182 내지 약 아미노산 187, 약 아미노산 194 내지 약 아미노산 199, 약 아미노산 324 내지 약 아미노산 329, 약 아미노산 354 내지 약 아미노산 359, 약 아미노산 357 내지 약 아미노산 362, 약 아미노산 394 내지 약 아미노산 399, 약 아미노산 427 내지 약 아미노산 432 및 약 아미노산 472 내지 약 아미노산 477의 잠재적인 N-미리스토일화 부위, 및 약 아미노산 136 내지 약 아미노산 146의 원핵세포막 지단백질 지질 부착 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA59817-1703을 1998년 11월 17일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203470호를 배정받았다.

도 38 (서열 63)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1772 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_R30823, MDP1_PIG, MDP1_HUMAN, P_R13857, P_R53920, MDP1_MOUSE, P_R30822, JC4222, CELF52C6_2 및 MYV027_13 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 23: 인간 PRO1248을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 서열 제7494호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스(LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56056이라 지칭하였다.

DNA56056 서열과 머크 EST 클론 제AA404441호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 머크 EST 클론 제AA404441호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 39에 나타내었고 본원에서 DNA60278-1530이라 지칭하였다.

클론 DNA60278-1530은 뉴클레오티드 위치 122 내지 124의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 671 내지 673의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 39). 예상된 폴리펩티드 전구체는 183개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 40). 도 40에 나타낸 전장 PRO1248 단백질의 추정 분자량은 약 20,574 달톤이고 pI는 약 6.60이다. 도 40 (서열 68)에 나타낸 전장 PRO1248 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 20의 신호 펩티드, 약 아미노산 90 내지 약 아미노산 112의 막횡단 도메인, 및 약 아미노산 21 내지 약 아미노산 24, 약 아미노산 38 내지 약 아미노산 41 및 약 아미노산 47 내지 약 아미노산 50의 잠재적인 N-글리코실화 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA60278-1530을 1998년 9월 1일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203170호를 배정받았다.

도 40 (서열 68)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1248 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF026198_5, CELR12C12_5, PN0563, S64541_1, PN0564, P_R44881 및 XLU78189_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 24: 인간 PRO1316을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

특정 분비 서열을 함유하는 것으로 공지된 공용 데이타베이스의 신호 서열 을 포함하는 세포외 도메인 (ECD)을 이용하여 다양한 공용 EST 데이타베이스 (젠뱅크, 머크/워싱턴대)를 검색하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 EST 서열의 6 프레임 번역물에 대해 ECD 단백질 서열의 비교물로서 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, WA)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다.

상기 검색 결과, 분비 단백질 Dkk-1과 상동성이 있는, W55979로 지칭되는 EST를 확인하였다. EST W55979 (클론 NbHH19W)에 상응하는 클론을 머크/워싱턴대로부터 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 그 전체를 서열 분석하였다.

구입한 클론에 의해 코딩되는 전장의 PRO1316 (DNA60608-1577이라 지칭)에 상응하는 핵산 서열은 도 41 (서열 69)에 나타내었다. 클론 DNA60608-1577은 뉴클레오티드 위치 211 내지 213의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 988 내지 990의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 42, 서열 70). 예상된 폴리펩티드 전구체는 259개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 상당히 흥미있는 부가의 영역에는 신호 펩티드 (211-283)를 코딩하는 뉴클레오티드 잔기, N-글리코실화 부위 (364-366) 및 Zn(2)-Cys(6) 2핵 클러스터 도메인 (505-655)이 있다. 클론 DNA60608-1577을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203126호를 배정받았다. 도 42에 나타낸 전장 PRO1316 단백질의 추정 분자량은 약 28,447 달톤이고 pI는 약 9.48이다.

전장 서열의 BLAST 및 FastA 서열 정렬 분석 (ALIGN 컴퓨터 프로그램 이용)을 기초로, PRO1316은 딕코프 (dickkopf) 족 단백질과 상당한 아미노산 서열 동일성을 나타내었다. 추가로, DNA60608은 AF030433_1, LFE4_CHICK, COL_RABIT, YQI6_CAEEL, ITB6_HUMAN, CONO_LYMST, S41033, D63483_1, D86864_1 및 AB001978_1과 상동성이 있었다.

실시예 25: 인간 PRO1197을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

효모 스크린을 사용하여, 주로 1차 cDNA 클론의 5' 말단을 나타내는 인간 SK-Lu-1 선암종 cDNA 라이브러리에서 본원에서 DNA56267로 언급되는 최초의 DNA 서열을 확인하였다. 인간 유방암 cDNA 라이브러리로부터 전장의 PRO1197 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해, DNA56267을 이용하여 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

서열 73: 5'AATTCATGGCAAATATTTCCCTTCCC3' (전방향),

서열 74: 5'TGGTAAACTGGCCCAAACTCGG3' (역방향), 및

서열 75: 5'TTAAAGTCATCCGTCCTTGGCTCAGGATTTGGAGAGCTTGCACCACCAAA3' (프로브).

도 43에 나타낸 전장의 DNA60611-1524는 뉴클레오티드 위치 311 내지 313의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1400 내지 1402의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 43, 서열 71). 예상된 폴리펩티드 전구체는 363개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 44, 서열 72). 신호 펩티드는 서열 72의 약 아미노산 1 내지 24에 있다. PRO1197의 계산된 분자량은 약 38,825 달톤이고 추정 pI는 약 9.88이다. 클론 DNA60611-1524를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203175호를 배정받았다.

도 44 (서열 72)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1197 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타베이스로부터의 정보) Y144_HUMAN, I47141 (위의 뮤신, 뮤신은 문헌 (Ann. NY Acad. Sci. 140(2):804-834)에 기재됨), AMYH_YEAST, CELK06A9_3, CELZK783_1, HKR1_YEAST, AB003521_1, D87895_1, S61993 및 YM96_YEAST 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 26: 인간 PRO1293을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 서열 제115204호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56522라 지칭하였다.

DNA56522 서열과 Incyte EST 클론 제2966119호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, Incyte EST 클론 제2966119호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 45에 나타내었고 본원에서 DNA60618-1557이라 지칭하였다.

클론 DNA60618-1557은 뉴클레오티드 위치 37 내지 39의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1060 내지 1062의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 45). 예상된 폴리펩티드 전구체는 341개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 46). 도 46에 나타낸 전장 PRO1293 단백질의 추정 분자량은 약 38,070 달톤이고 pI는 약 6.88이다. 도 46 (서열 77)에 나타낸 전장 PRO1293 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 19의 신호 펩티드, 약 아미노산 237 내지 약 아미노산 262의 막횡단 도메인, 약 아미노산 205 내지 약 아미노산 208의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 151 내지 약 아미노산 152의 세포 부착 서열, 및 약 아미노산 115 내지 약 아미노산 140의 코프로포르피리노겐 Ⅲ 옥사다제 상동성 아미노산 서열 블록의 존재를 보여준다. 클론 DNA60618-1557을 1998년 9월 29일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203292호를 배정받았다.

도 46 (서열 77)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1293 아미노산 서열과 데이호프 서열 HSVCD54_1, A33_HUMAN, AF009220_1, HSU82279_1, AF004230_1, P_R13272, AF004231_1, AF043644_1, S44125 및 HSIGGHC85_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 27: 인간 PRO1380을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 2에 기재된 아밀라제 스크린에서 단리된 cDNA 서열을 본원에서 DNA45776이라 지칭하였다. DNA45776 서열을 기초로 하여 올리고뉴클레오티드 프로브를 제조하고, 상기 실시예 2의 첫번째 단락에 기재된 바와 같이 제조된 인간 망막 라이브러리를 스크린하기 위해 사용하였다. 클로닝 벡터는 pRK5B (pRK5B는 SfiⅠ 부위를 함유하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌 (Holmes et al., Science, 253:1278-1280 (1991)) 참조)였으며, 절단된 cDNA의 크기는 2800bp 미만이었다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (45776.f1)5'-TTTTGCGGTCACCATTGTCTGC-3' (서열 80) 및

역방향 PCR 프라이머 (45776.r1)5'-CGTAGGTGACACAGAAGCCCAGG-3' (서열 81).

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA45776 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (45776.p1)

5'-TACGGCATGACCGGCTCCTTTCCTATGAGGAACTCCCAGGCACTGATAT-3' (서열 82)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1380 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다.

뉴클레오티드 위치 36 내지 38의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1461 내지 1463의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함하는 전장의 클론을 확인하였다 (도 47, 서열 78). 예상된 폴리펩티드 전구체는 470개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖으며, 계산된 분자량은 약 51,715 달톤이고 추정 pI는 약 7.86이다. 다른 특징으로는 약 아미노산 50 내지 74, 105 내지 127, 135 내지 153, 163 내지 183, 228 내지 252, 305 내지 330 및 448 내지 472의 막횡단 도메인, 약 아미노산 14 내지 17 및 84 내지 87의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 60 내지 68의 디히드로폴레이트 리덕타제 신호가 있다.

도 48 (서열 79)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1380 아미노산 서열과 데이호프 서열 HSU81375_1, CEZK809_6, CEK02E11_1, AF034102_1, JC4196, CEF36H2_2, P_R92315, YAC2_YEAST, F1707_13 및 CEF44D12_3 사이의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA60740-1615를 1998년 11월 3일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203456호를 배정받았다.

실시예 28: 인간 PRO1265를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 EST 클러스터 제86995호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 때 사용된 1종 이상의 EST가 염증을 일으킨 인간 선양 조직에서 단리된 RNA를 이용하여 제조한 cDNA 라이브러리로부터 유도되었다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA55717이라 지칭하였다.

DNA55717 서열과 EST 클론 제20965호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 제20965호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 49에 나타내었고 본원에서 DNA60764라 지칭하였다.

도 49에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 79 내지 81의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1780 내지 1782의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 49, 서열 83). 예상된 폴리펩티드 전구체는 567개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 50, 서열 84). PRO1265의 계산된 분자량은 약 62,881 달톤이고 추정 pI는 약 8.97이다. 다른 특징으로는 약 아미노산 1 내지 21의 신호 펩티드 서열, 약 아미노산 54 내지 57, 134 내지 137, 220 내지 223 및 559 내지 562의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 61 내지 80의 D-아미노산 옥시다제 단백질 상동성 영역이 있다.

도 50 (서열 84)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1265 아미노산 서열과 데이호프 서열 제MMU70429_1호 사이의 상당한 서열 동일성을 보여주었다. 또한 도 50 (서열 84)에 나타낸 전장 서열과 추가의 데이호프 서열 BC542A_1, E69899, S76290, MTV014_14, AOFB_HUMAN, ZMJ002204_1, S45812_1, DBRNAPD_1 및 CRT_SOYBN 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

클론 DNA60764-1533을 1998년 11월 10일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203452호를 배정받았다.

실시예 29: 인간 PRO1250을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 제56523호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을,공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56103라 지칭하였다.

DNA56103 서열과 EST 클론 제3371784호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 제3371784호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 51에 나타내었고 본원에서 DNA60775-1532라 지칭하였다.

클론 DNA60775-1532는 뉴클레오티드 위치 74 내지 76의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2291 내지 2293의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 51). 예상된 폴리펩티드 전구체는 739개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 52). 도 52에 나타낸 전장 PRO1250 단백질의 추정 분자량은 약 82,263 달톤이고 pI는 약 7.55이다. 도 52 (서열 86)에 나타낸 전장 PRO1250 서열의 분석은 약 아미노산 61 내지 약 아미노산 80의 Ⅱ형 막횡단 도메인, 약 아미노산 314 내지 약 아미노산 325의 추정 AMP-결합 도메인 신호 서열, 및약 아미노산 102 내지 약 아미노산 105 약 아미노산 588 내지 약 아미노산 591 및 약 아미노산 619 내지 약 아미노산 622의 잠재적인 N-글리코실화 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA60775-1532를 1998년 9월 1일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203173호를 배정받았다.

도 52 (서열 86)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1250 아미노산 서열과 데이호프 서열 LCFB_HUMAN, S56508_1, BNAMPBP2_1, BNACS7_1, CELT08B1_6, CELC46F4_2, AF008206_6, CELR07C3_11, LMU70253_2 및 AF008206_7 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 30: 인간 PRO1475를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA45639라 지칭되어 있다. DNA45639 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1475의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (45639.f1)5'-GATGGCAAAACGTGTGTTTGACACG-3' (서열 89)

전방향 PCR 프라이머 (45639.f2)5'-CCTCAACCAGGCCACGGGCCAC-3' (서열 90)

역방향 PCR 프라이머 (45639.r1)5'-CCCAGGCAGAGATGCAGTACAGGC-3' (서열 91)

역방향 PCR 프라이머 (45639.r2)5'-CCTCCAGTAGGTGGATGGATTGGCTC-3' (서열 92)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA45639 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (45639.p1)

5'-CTCACCTCATGAGGATGAGGCCATGGTGCTATTCCTCAACATGGTAG-3' (서열 93)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1475 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 뇌조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1475의 DNA 서열 (본원에서 DNA61185-1646 [도 53, 서열 87]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1475의 단백질 서열을 수득하였다.

DNA61185-1646의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 53 (서열 87)에 나타내었다. 클론 DNA61185-1646은 뉴클레오티드 위치 130 내지 132의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2110 내지 2112의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 53). 예상된 폴리펩티드 전구체는 660개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 54). 도 54에 나타낸 전장 PRO1475 단백질의 추정 분자량은 약 75,220 달톤이고 pI는 약 6.76이다. 도 54 (서열 88)에 나타낸 전장 PRO1475 서열의 분석은 약 아미노산 38 내지 약 아미노산 55의 막횡단 도메인 및 약 아미노산 229 내지 약 아미노산 660의 생쥐 GNT1 상동성 영역의 존재를 보여준다. 클론DNA61185-1646을 1998년 11월 17일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203464호를 배정받았다.

도 54 (서열 88)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1475 아미노산 서열과 데이호프 서열 GNT1_MOUSE, CGU65792_1, CGU65791_1, P_R24781, CELF48E3_1, G786_HUMAN, P_W06547, GNT1_CAEEL, 219_HUMAN 및 EF07_MOUSE 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 31: 인간 PRO1377을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

효모 스크린을 사용하여, 주로 1차 cDNA 클론의 5' 말단을 나타내는 인간 탯줄 정맥 내피 세포 cDNA 라이브러리에서 본원에서 DNA46892로 언급되는 최초의 DNA 서열을 확인하였다. 인간 태아 신장 cDNA 라이브러리로부터 전장의 PRO1377 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해, DNA46892를 기초로 올리고뉴클레오티드를 합성하였다: GTTGTGGGTGAATAAAGGAGGGCAG (서열 96), GTGTGCTCATGTTCATGGACAACTG (서열 97), 및 GGATGATTTCATCTCCATTAGCCTGCTGTCTCTGGCTATGTTGGTGGGAT (서열 98).

도 55에 나타낸 전장의 DNA61608-1606은 뉴클레오티드 위치 149 내지 151의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1070 내지 1072의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 55, 서열 94). 예상된 폴리펩티드 전구체는 307개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 56, 서열 95). PRO1377의 계산된 분자량은 약 32,251 달톤이고 추정 pI는 약 6.62이다. 부가의 특징에는 약아미노산 1 내지 18의 신호 펩티드, 약 아미노산 29 내지 32 및 241-244의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 37 내지 56, 106 내지 122, 211 내지 230, 240 내지 260 및 288 내지 304의 막횡단 도메인이 있다.

도 56 (서열 95)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1377 아미노산 서열과 데이호프 서열 CET01D3_6, CET28F3_4, CEF26D10_3, S66962, ATX2_YEAST, CEH13N06_8, S49959, YIC3_YEAST, G01173 및 P_W35557 사이에 약간의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA61608-1606을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203239호를 배정받았다.

실시예 32: 인간 PRO1326을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 제59366호라 지칭되며, 또한 본원에서 "DNA10295"라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 때 사용된 1종 이상의 EST가 편평세포 암종이 있는 남성 성기로부터 분리한 종양 조직에서 단리된 RNA를 이용하여 제조한 cDNA 라이브러리로부터 유도되었다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56257이라 지칭하였다.

DNA56257 서열과 Incyte EST 클론 제1450878호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 1450878을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 57에 나타내었고 본원에서 "DNA62808-1582"라 지칭하였다.

도 57에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 112 내지 114의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1315 내지 1317의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 57, 서열 99). 예상된 폴리펩티드 전구체는 401개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 58, 서열 100). PRO1326 단백질의 다른 특징으로는 약 아미노산 1 내지 29의 신호 서열, 약 아미노산 129 내지 166의 리보솜 단백질 S2Ae 상동성 영역, 및 약 아미노산 109 내지 112, 144 내지 147 및 398 내지 401의 잠재적인 N-글리코실화 부위가 있다. PRO1326의 계산된 분자량은 약 45,333 달톤이고 추정 pI는 약 4.95이다. 클론 DNA62808-1582를 1998년 10월 20일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203358호를 배정받았다.

도 58 (서열 100)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1326 아미노산 서열과 데이호프 서열 AC004013_1, HROMHCEMB_1, CEF47A4_2, A45592, MYSP_HUMAN, NFU43192_1, ONGMBWMZ_1, CELC25A11_2, CELC25A11_1 및 A42184 사이에 약간의 상동성을 보여주었다.

실시예 33: 인간 PRO1249를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 제122605호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56060이라 지칭하였다.

DNA56060 서열과 Incyte EST 클론 제2630770호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, Incyte EST 클론 제2630770호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 59에 나타내었고 본원에서 DNA62809-1531이라 지칭하였다.

클론 DNA62809-1531은 뉴클레오티드 위치 3 내지 5의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 3270 내지 3272의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 59). 예상된 폴리펩티드 전구체는 1089개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 60). 도 60에 나타낸 전장 PRO1249 단백질의 추정 분자량은 약 118,699 달톤이고 pI는 약 8.49이다. 도 60 (서열 102)에 나타낸 전장 PRO1249 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 16의 신호 펩티드, 약 아미노산 317 내지 약 아미노산 341, 약 아미노산 451 내지 약 아미노산 470, 약 아미노산 481 내지 약 아미노산 500, 약 아미노산 510 내지 약 아미노산 527, 약 아미노산 538 내지 약 아미노산 555, 약 아미노산 831 내지 약 아미노산 850, 약 아미노산 1016 내지 약 아미노산 1034 및 약 아미노산 1052 내지 약 아미노산 1070의 막횡단 도메인, 약 아미노산 843 내지 약 아미노산 864의 루이신 지퍼 패턴 서열, 및 약 아미노산 37 내지 약 아미노산 40 및 약 아미노산 268 내지 약 아미노산 271의 잠재적인 N-글리코실화 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA62809-1531을 1998년 9월 9일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203271호를 배정받았다.

도 60 (서열 102)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1249 아미노산 서열과 데이호프 서열 AC004472_3, AB004539_7, S64782, S62432, YJG2_YEAST, CELC27A12_8, YKQ5_YEAST, AB009505_3, SPBC24E9_8 및 AF060218_4 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 34: 인간 PRO1315를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA35925라 지칭되어 있다. DNA35925 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1315의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (35925.f1)5'-CGCTGCTGCTGTTGCTCCTGG-3' (서열 105)

전방향 PCR 프라이머 (35925.f2)5'-CAGTGTGCCAGGACTTTG-3' (서열 106)

전방향 PCR 프라이머 (35925.f3)5'-AGTCGCAGGCAGCGTTGG-3' (서열 107)

역방향 PCR 프라이머 (35925.r1)5'-CTCCTCCGAGTCTGTGTGCTCCTGC-3' (서열 108)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA35925 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (35925.p1)

5'-GGACGGGCAGTTCCCTGTGTCTCTGGTGGTTTGCCTAAACCTGCAAACATC-3' (서열 109)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1315 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 망막 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1315의 DNA 서열 (본원에서 DNA62815-1576 [도 61, 서열 103]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1315의 단백질 서열을 수득하였다.

DNA62815-1576의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 61 (서열 103)에 나타내었다. 클론 DNA62815-1576은 뉴클레오티드 위치 121 내지 123의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1447 내지 1449의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 61). 예상된 폴리펩티드 전구체는 442개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 62). 도 62에 나타낸 전장 PRO1315 단백질의 추정 분자량은 약 49,932 달톤이고 pI는 약 4.55이다. 도 62 (서열 104)에 나타낸 전장 PRO1315 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 28의 신호 펩티드, 약 아미노산 140 내지 약 아미노산 163의 막횡단 도메인 및 약 아미노산 71 내지 약 아미노산 74, 약 아미노산 80 내지 약 아미노산 83, 약 아미노산 89 내지 약 아미노산 92, 약 아미노산 204 내지 약 아미노산 207 및 약 아미노산 423 내지 약 아미노산 426의 잠재적인 N-글리코실화 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA62815-1576을 1998년 9월 9일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203247호를 배정받았다.

도 62 (서열 104)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1315 아미노산 서열과 데이호프 서열 MMU53696_1, NVY08571_2, B64560, STMSLPE_1, P_R80508, P_W19258, A55817, GEN14043, AE000768_7 및 RNMUCASGP5_1pSMC 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 35: 인간 PRO1599를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 기술을 이용하여, 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상인 Incyte EST 제1491360호를 목적 서열로서 찾아내었다. EST 제1491360호의 뉴클레오티드 서열 및 그의 상보체 서열은 본원에서 "DNA37192"라 지칭되어 있다. DNA37192 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1599의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: GACGTCTGCAACAGCTCCTGGAAG (37192.f1, 서열 112)

역방향 PCR 프라이머: CGAGAAGGAAACGAGGCCGTGAG (37192.r1, 서열 113)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA37192 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: TGACACTTACCATGCTCTGCACCCGCAGTGGGGACAGCCACAGA (서열 114)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1599 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 간 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1599의 DNA 서열 (본원에서 DNA62845-1684 [도 63, 서열 110]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1599의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1599의 전체 코딩 서열은 도 63 (서열 110)에 나타내었다. 클론 DNA62845-1684는 뉴클레오티드 위치 69 내지 71의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 918 내지 920의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 283개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 64에 나타낸 전장 PRO1599 단백질의 추정 분자량은 약 30,350 달톤이고 pI는 약 9.66이다. PRO1599의 부가의 특징에는 약 아미노산 1 내지 30의 신호 펩티드, 약 아미노산 129 내지 132 및 189 내지 192의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 263 내지 266의 잠재적인 cAMP 및 cGMP-의존성 단백질 키나아제 인산화 부위, 약 아미노산 28 내지 33, 55 내지 60, 174 내지 179 및 236 내지 241의 잠재적인 N-미리스토일화 부위, 약 아미노산 144 내지 147의 잠재적인 아미드화 부위, 및 약 아미노산 70 내지 75의 세린 프로테아제, 트립신족, 히스티딘 활성 부위가 있다.

도 64 (서열 111)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1599 아미노산 서열과 데이호프 서열 CFAD_PIG 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1599 아미노산 서열과 부가의 데이호프 서열 CFAD_HUMAN, P_R05421, P_R55757, P_R05772, GRAM_HUMAN, MUSLMET_1, P_P80335, P_R55758, A42048_1 및 P_W05383 사이에 상동성이 있었다.

클론 DNA62845-1684를 1998년 10월 20일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203361호를 배정받았다.

실시예 36: 인간 PRO1430을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이, 본원에서 DNA49433이라 지칭되는 DNA 서열을 수득하였다. 조합된 서열로부터 목적 EST로 확인된 머크 EST 제T49469호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 그 전체를 서열 분석하였다.

상기한 바와 같은 클론의 DNA 서열 분석을 통하여, 본원에서 "DNA64842-1632" (서열 115)라 지칭되는 PRO1430의 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1430의 단백질 서열 (서열 116)을 수득하였다. 클론 DNA64842-1632는 뉴클레오티드 위치 82 내지 84의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1075 내지 1077의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 도 66에 나타낸 전장의 PRO1430 단백질의 추정 분자량은 약 35,932 달톤이고 pI는 약 8.45이다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 331개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 부가의 특징에는 약 아미노산 1 내지 17의 신호 펩티드, 약 아미노산 171 내지 171의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 29 내지 51, 116 내지 126, 180 내지 217 및 222 내지 230의 단쇄 알코올 데히드로게나제 족 단백질 상동성 영역이 있다.

도 66 (서열 116)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1430 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_W03198 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1430 아미노산 서열과 부가의 데이호프 서열 MTV030_10, MTV037_2, A40116_1, S42651, CEC15H11_6, SPCC736_13, SCU43704_1, S19842, OXIR_STRAT 및 OXIR_STRLI 사이에 상동성이 있었다.

클론 DNA64842-1632를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203278호를 배정받았다.

실시예 37: 인간 PRO1374를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA47357"이라 지칭되어 있다. DNA47357 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1374의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: 5'CGGGACAGGAGACCCAGAAAGGG3' (서열 119) 및

역방향 PCR 프라이머: 5'GGCCAAGTGATCCAAGGCATCTTC3' (서열 120)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA47357 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: 5'CTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCTTTGCATGGGG 3' (서열 121)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1374 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 선암종 세포주로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1374의 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1374의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1374의 전체 코딩 서열은 도 67 (서열 117)에 나타내었다. 클론 DNA64849-1604는 서열 117의 뉴클레오티드 위치 20 내지 22의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1653 내지 1655의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 544개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드, N-글리코실화 부위, 루이신 지퍼 패턴 및 리보뉴클레오티드 리덕타제의 작은 서브유닛 신호의 개략적인 위치는 도 68에 나타나 있다. 클론 DNA64849-1604를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203468호를 배정받았다. 도 68에 나타낸 전장 PRO1374 단백질의 추정 분자량은 약 61,126 달톤이고 pI는 약 6.4이다.

도 68 (서열 118)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1374 아미노산 서열과 데이호프 서열 CEF35G2_4, P_W37046, S44204, CET28D6_1, CET20B3_6, CELC14E2_3, CUAL_CHICK, ATM7J2_3, S74997 및 HIVH5994R8_1 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 38: 인간 PRO1311을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 2에 기재된 아밀라제 스크린에서 단리된 cDNA 서열을 본원에서 DNA37721이라 지칭하였다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA48616이라 지칭하였다. DNA48616 서열을 기초로 하여 올리고뉴클레오티드 프로브를 제조하고, 상기 실시예 2의 첫번째 단락에 기재된 바와 같이 제조된 인간 대동맥 내피 세포 라이브러리를 스크린하기 위해 사용하였다. 클로닝 벡터는 pRK5B (pRK5B는 SfiⅠ 부위를 함유하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌 (Holmes et al., Science, 253:1278-1280 (1991)) 참조)였으며, 절단된 cDNA의 크기는 2800bp 미만이었다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (48616.f1)5'-ATCATCTATTCCACCGTGTTCTGGC-3' (서열 124) 및

역방향 PCR 프라이머 (48616.r1)5'-GACAGAGTGCTCCATGATGATGTCC-3' (서열 125).

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA48616 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (48616.p1)

5'-CCTGTCTGTGGGCATCTATGCAGAGGTTGAGCGGCAGAAATATAAAACCC-3' (서열 126)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1311 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다.

뉴클레오티드 위치 195 내지 197의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1077 내지 1079의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함하는 전장의 클론을 확인하였다 (도 69, 서열 122). 예상된 폴리펩티드 전구체는 294개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖으며, 계산된 분자량은 약 33,211 달톤이고 추정 pI는 약 5.35이다. 부가의 특징에는 약 아미노산 1 내지 44의 신호 서열, 약 아미노산 22 내지 42, 57 내지 85, 94 내지 116 및 230 내지 257의 가능한 막횡단 도메인, 약 아미노산 118 내지 121, 1899 내지 192 및 230 내지 233의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 3 내지 11 및 129 내지 136의 잠재적인 티로신 키나아제 인산화 부위, 약 아미노산 80 내지 85, 109 내지 114, 180 내지 185, 218 내지 223, 248 내지 253, 276 내지 281, 285 내지 290 및 287 내지 292의 잠재적인 N-미리스토일화 부위, 및 약 아미노산 3 내지 5의 세포 부착 서열이 있다.

도 70 (서열 123)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1311 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF065389_1, AF053455_1, CD63_HUMAN, A15_HUMAN, AF043906_1, C151_HUMAN, AF053453_1, AF054838_1, P_R91446 및 CD82_HUMAN 사이에 약간의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA64863-1573을 1998년 9월 9일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호제203251호를 배정받았다.

실시예 39: 인간 PRO1357을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열 제69537호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56034라 지칭하였다.

DNA56034 서열과 Incyte EST 클론 제936239호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, Incyte EST 클론 제936239호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 27에 나타내었고 본원에서 DNA64881-1602라 지칭하였다.

클론 DNA64881-1602는 뉴클레오티드 위치 74 내지 76의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1526 내지 1528의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 71). 예상된 폴리펩티드 전구체는 484개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 72). 도 72에 나타낸 전장 PRO1357 단백질의 추정 분자량은 약 52,468 달톤이고 pI는 약 7.14이다. 도 72 (서열 128)에 나타낸 전장 PRO1357 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 21의 신호 펩티드, 약 아미노산 48 내지 약 아미노산 51, 약 아미노산 264 내지 약 아미노산 267 및 약 아미노산 401 내지 약 아미노산 404의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 412 내지 약 아미노산 415의 글리코사미노글리칸 부착 부위, 및 LBP/BPI/CETP 족 단백질에 상동성이 있는 약 아미노산 407 내지 약 아미노산 457의 아미노산 서열 블록의 존재를 보여준다. 클론 DNA64881-1602를 1998년 9월 9일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제2032140호를 배정받았다.

도 72 (서열 128)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1357 아미노산 서열과 데이호프 서열 MMU46068_1, S17447, MMU1_1, BPI_RABIT, P_W16808, P_R21844, PSP_MOUSE, HSLBPEX1_1 및 BTU79413_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 40: 인간 PRO1244를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 클러스터 제7874호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 1종 이상의 EST가 해면체(corpus cavernosum)의 조직에서 제조된 라이브러리로부터 유도되었다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA56011"이라 지칭하였다.

DNA56011 서열과 Incyte EST 클론 제3202349호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST 클론 제3202349호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 73 (서열 129)에 나타내었고 본원에서 "DNA64883-1526"이라 지칭하였다.

전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 9 내지 11의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1014 내지 1016의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 73, 서열 129). 예상된 폴리펩티드 전구체는 335개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 74, 서열 130). PRO1244의 계산된 분자량은 약 38,037 달톤이고 추정 pI는 약 9.87이다. 다른 특징에는 약 아미노산 1 내지 29의 신호 펩티드, 약 아미노산 183 내지 205, 217 내지 237, 271 내지 287 및 301 내지 321의 막횡단 도메인, 약 아미노산 71 내지 74 및 215 내지 218의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 150 내지 152의 세포 부착 서열이 있다.

도 74 (서열 130)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1244 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF008554_1, P_485334, G02297, HUMN33S11_1, HUMN33S10_1, YO13_CAEEL, GEN13255, S49758, E70107 및 ERP5_MEDSA 사이의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA64883-1526을 1998년 9월 9일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제2032253호를 배정받았다.

실시예 41: 인간 PRO1246을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열 제56853호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56021이라 지칭하였다.

DNA56021 서열과 Incyte EST 클론 제2481345호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, Incyte EST 클론 제2481345호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 75에 나타내었고 본원에서 DNA64885-1529라 지칭하였다.

클론 DNA64885-1529는 뉴클레오티드 위치 119 내지 121의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1727 내지 1729의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 75). 예상된 폴리펩티드 전구체는 536개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 76). 도 76에 나타낸 전장 PRO1246 단백질의 추정 분자량은 약 61,450 달톤이고 pI는 약 9.17이다. 도 76 (서열 132)에 나타낸 전장 PRO1246 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 15의 신호 펩티드, 약 아미노산 108 내지 약 아미노산 111, 약 아미노산 166 내지 약 아미노산 169, 약 아미노산 193 내지 약 아미노산 196, 약 아미노산 262 내지 약 아미노산 265, 약 아미노산 375 내지 약 아미노산 378, 약 아미노산 413 내지 약 아미노산 416 및 약 아미노산 498 내지 약 아미노산 501의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 286 내지 약 아미노산 315, 약 아미노산 359 내지 약 아미노산 369 및 약 아미노산 78 내지 약 아미노산 97의 술파타제 상동성 아미노산 서열 블록의 존재를 보여준다. 클론 DNA64885-1529를 1998년 11월 3일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203457호를 배정받았다.

도 76 (서열 132)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1246 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_R51355, CELK09C4_1, BCU44852_1, IDS_HUMAN, G65169, E64903, ARSA_HUMAN, GL6S_HUMAN, HSARSF_1 및 GEN12648 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 42: 인간 PRO1356을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열 제44725호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56023이라 지칭하였다.

DNA56023 서열과 Incyte EST 클론 제4071746호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, Incyte EST 클론 제4071746호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 77에 나타내었고 본원에서 DNA64886-1601이라 지칭하였다.

클론 DNA64886-1601은 뉴클레오티드 위치 122 내지 124의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 812 내지 814의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 77). 예상된 폴리펩티드 전구체는 230개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 78). 도 78에 나타낸 전장 PRO1356 단백질의 추정 분자량은 약 24,549 달톤이고 pI는 약 8.56이다. 도 78 (서열 134)에 나타낸 전장 PRO1356 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 24의 신호 펩티드, 약 아미노산 82 내지 약 아미노산 102, 약 아미노산 117 내지 약 아미노산 140 및 약 아미노산 163 내지 약 아미노산 182의 막횡단 도메인, 약 아미노산 190 내지 약 아미노산 193의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 PMP-22/EMP/MP20 족 단백질에 상동성이 있는 약 아미노산 46 내지 약 아미노산 59의 아미노산 서열 블록의 존재를 보여준다. 클론 DNA64886-1601을 1998년 9월 9일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203241호를 배정받았다.

도 78 (서열 134)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1356 아미노산 서열과 데이호프 서열 AB00014_1, AB000712_1, A39484, AF000959_1, AF035814_1, HSU89916_1, MMU19582_1, P_R30059, HUAC004125_1 및 PM22_RAT 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 43: 인간 PRO1275를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

본원에서 DNA57700이라 지칭되는 신규 분비 분자를 사용하여 Incyte의 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA) 독점 데이타베이스및 젠뱅크의 공용 데이타베이스에 대해 분석하였다. 양성 클론을 확인하고, 이를 이용하여 seqext 프로그램에 의해 조합체 화일 (assembly file)을 생성하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 EST 서열의 6 프레임 번역물에 대한 ECD 단백질 서열의 비교물로서 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다.

BLAST와 phrap을 반복 사용하여 다른 EST 서열에 대해 컨센서스 DNA 서열을 조합하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA59572"라 지칭되어 있다.

DNA59572 컨센서스 서열 및 조합시 확인된 서열들과의 관계를 기초로 하여, 조합시 이용된 서열들 중 하나를 포함하는 한 클론 (Incyte 클론 2026581)을 구입하여 서열 분석하였다. Incyte 클론 2026581은 상피성 유방 각질 세포로부터의 RNA로 제작된 라이브러리에서 유도되었다.

PRO1275의 전체 코딩 서열은 도 79 (서열 135)에 나타나 있다. 클론 DNA64888-1542는 서열 135에서 뉴클레오티드 위치 37 내지 39의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 394 내지 396의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 119개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 136의 약 아미노산 1 내지 15에 있다. 클론 DNA64888-1542를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203249호를 배정받았다. 도 79에 나타낸 전장 PRO1275 단백질의 추정 분자량은 약 13,248 달톤이고 pI는 약 7.78이다.

도 80 (서열 136)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1275 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타베이스로부터의 정보) B48151 (Mst98Cb), D86424_1 (황 함량이 높은 케라틴 단백질), P_R79964 (연결 조직 생장 인자), CHRD_RAT (코르딘), MT_DREPO (메탈로티오네인), PL05_PLETR (플렉톡신), P_R25156 (Ig 항원), S73732_1 (VLDP), AF025440_1 (OIP4) 및 P_R32757 (IGF-II) 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 44: 인간 PRO1274를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

본원에서 DNA57700이라 지칭되는 신규 분비 분자를 사용하여 Incyte의 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA) 독점 데이타베이스 및 젠뱅크의 공용 데이타베이스에 대해 분석하였다. 양성 클론을 확인하고, 이를 이용하여 seqext 프로그램에 의해 조합체 화일을 생성하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 EST 서열의 6 프레임 번역물에 대한 ECD 단백질 서열의 비교물로서 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다.

BLAST와 phrap을 반복 사용하여 다른 EST 서열에 대해 컨센서스 DNA 서열을조합하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA59573"이라 지칭되어 있다.

DNA59573 컨센서스 서열 및 조합시 확인된 서열들과의 관계를 기초로 하여, 조합시 이용된 서열들 중 하나를 포함하는 한 클론 (Incyte 클론 2623992)을 구입하여 서열 분석하였다. Incyte 클론 2623992는 상피성 유방 각질 세포로부터의 RNA로 제작된 라이브러리에서 유도되었다.

PRO1274의 전체 코딩 서열은 도 81 (서열 137)에 나타나 있다. 클론 DNA64889-1541은 서열 137에서 뉴클레오티드 위치 24 내지 26의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 354 내지 356의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 110개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 138의 약 아미노산 1 내지 24에 있다. 인슐린 족 단백질 및 N-글리코실화 부위의 보존된 영역은 도 82에 표시되어 있다. 클론 DNA64889-1541을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203250호를 배정받았다. 도 82에 나타낸 전장 PRO1274 단백질의 추정 분자량은 약 12,363 달톤이고 pI는 약 8.31이다.

도 82 (서열 138)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1274 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타베이스로부터의 정보) CEW05B2_9, AF016922_1 (인슐린-유사 생장 인자 1), B48151, A53640, BTIGF2REC_1 (인슐린-유사 생장 인자 2), HSNF1GEN12_1, TXA3_RADMA (뉴로톡신 3), CXM1_CONGE, P_P61301, TXA4_RADMA (뉴로톡신 4) 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 45: 인간 PRO1412를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 Incyte 클러스터 제101368호라 지칭되며 본원에서 "DNA10643"이라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 때 사용된 1종 이상의 EST가 남자 태아에서 분리된 전립선 스트로마의 섬유아세포로부터 단리된 RNA로부터 유도되었다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA58754"라 지칭하였다.

DNA58754 서열과 EST 클론 제3597385호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 제3597385호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 그 전체를 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 83에 나타내었고 본원에서 "DNA64897-1628"이라 지칭하였다.

도 83에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 142 내지 144의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1075 내지 1077의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 83, 서열 139). 예상된 폴리펩티드 전구체는 311개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 84, 서열 140). PRO1412 단백질의 다른 특징으로는 약 아미노산 1 내지 28의 신호 서열, 약 아미노산 190 내지 216의 막횡단 도메인, 약 아미노산 49 내지 52, 91 내지 94, 108 내지 111, 128 내지 131, 135 내지 138 및 190 내지 193의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 62 내지 69의 티로신 키나아제 인산화 부위, 및 약 아미노산 183 내지 224의 리소좀-결합 막 당단백질 복제 도메인이 있다. PRO1412의 계산된 분자량은 약 33,908 달톤이고 추정 pI는 약 6.87이다. 클론 DNA64897-1628을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203216호를 배정받았다.

도 84 (서열 140)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1412 아미노산 서열과 데이호프 서열 I50116, AF035963_1, NCA2_RAT, I61783, P_W07682, MMHC135G15_3, S21461, MMIGL2_1, ONHIGMV9A_1 및 MMU70448_1 사이에 약간의 상동성을 보여주었다.

실시예 46: 인간 PRO1557을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 제넨테크 데이타베이스로부터 "DNA58763"이라 지칭되는 EST 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을 상기 기재된 EST 데이타베이스를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA58763"이라 지칭하였다.

DNA58763 서열과 EST 클론 제2267403호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 제2267403호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 85에 나타내었고 본원에서 DNA64902-1667이라 지칭하였다.

도 85에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 287 내지 289의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1640 내지 1642의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 85, 서열 141). 예상된 폴리펩티드 전구체는 451개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 86, 서열 142). PRO1557의 계산된 분자량은 약 49,675 달톤이고 추정 pI는 약 7.15이다. 부가의 특징으로는 약 아미노산 1 내지 25의 신호 서열, 약 아미노산 114 내지 117의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 388 내지 41의 cAMP 및 cGMP-의존성 단백질 키나아제 인산화 부위, 약 아미노산 54 내지 69, 66 내지 71, 146 내지 151 및 367 내지 372의 잠재적인 N-미리스토일화 부위, 약 아미노산 36 내지 39 및 205 내지 208의 잠재적인 아미드화 부위, 및 약 아미노산 151 내지 258의 ATP/GTP-결합 부위 모티프 A(P-루프)가 있다.

도 86 (서열 142)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1557 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF034606_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1557 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_W31559, AF031230_1, SOG_DROME, CA11_MOUSE, P_R41320, CHRD_RAT, P_W40288, NEL_CHICK 및 HSMUC5B_1 사이의 상동성이 발견되었다.

클론 DNA64902-1667을 1998년 10월 6일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203317호를 배정받았다.

실시예 47: 인간 PRO1286을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 EST 클러스터 제86809호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 조합에 사용된 EST는 종양, 세포주 또는 질환 조직으로부터 확인된 것들을 포함하였다. 1종 이상의 EST가 질병에 걸린 직장 조직으로부터 단리된 RNA로 제조된 cDNA 라이브러리에서 얻어졌다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA58822라 지칭하였다.

DNA58822 서열과 EST 클론 제1695434호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 제1695434호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 87에 나타내었고 본원에서 DNA64903-1553 (서열 143)이라 지칭하였다.

도 87에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 93 내지 95의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 372 내지 374의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 87, 서열 143). 예상된 폴리펩티드 전구체는 약 아미노산 1 내지 18의 신호 서열을 갖는, 93개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 88, 서열 144). PRO1286의 계산된 분자량은 약 10,111 달톤이고 추정 pI는 약 9.70이다.

도 88 (서열 144)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1286 아미노산 서열과 데이호프 서열 SR5C_ARATH, CELC17H12_11, MCPD_ENTAE, JQ2283, INVO_LEMCA, P_R07309, ADEVBCAGN_4, AF020947_1, CELT23H2_1 및 MDH_STRAR 사이에 약간의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA64903-1553을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호제203223호를 배정받았다.

실시예 48: 인간 PRO1294를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 제10559호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA57203이라 지칭하였다.

DNA57203 서열과 Incyte EST 클론 제3037763호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 제3037763호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 89에 나타내었고 본원에서 DNA64905-1558이라 지칭하였다.

클론 DNA64905-1558은 뉴클레오티드 위치 110 내지 112의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1328 내지 1330의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 89). 예상된 폴리펩티드 전구체는 406개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 90). 도 90에 나타낸 전장 PRO1294의 추정 분자량은 약 46,038 달톤이고 pI는 약 6.50이다. 도 90 (서열 146)에 나타낸 전장 PRO1294 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 21의 신호 펩티드, 및 약 아미노산 177 내지 약 아미노산 180 및 약 아미노산 248 내지 약 아미노산 251의 잠재적인 N-글리코실화 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA64905-1558을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203233호를 배정받았다.

도 90 (서열 146)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1294 아미노산 서열과 데이호프 서열 I73636, AF028740_1, AB006686S3_1, P_R98225, RNU78105_1, CELC48E7_4, CEF11C3_3, SCP1_MESAU, TPM3_HUMAN 및 CELK05B2_3 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 49: 인간 PRO1347을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조합하였다. 본원에서 이 컨센서스 서열은 "DNA47373"이라 지칭되어 있다. DNA47373 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1347 코딩 서열의 전장 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: 5'GCGTGGTCCACCTCTACAGGGACG3' (서열 149) 및

역방향 PCR 프라이머: 5'GGAACTGACCCAGTGCTGACACC3' (서열 150).

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA47373 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: 5'GCAGATGCCACAGTATCAAGGCAGGACAAAACTGGTGAAGGATTC3' (서열 151).

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1347 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 소장으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1347의 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1347의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1347의 전체 코딩 서열은 도 91 (서열 147)에 나타내었다. 클론 DNA64950-1590은 뉴클레오티드 위치 183 내지 185의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1683 내지 1685의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 500개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 148에서 약 아미노산 1 내지 17에 있고, 막횡단 도메인은 약 239 내지 255에 있다. 클론 DNA64950-1590을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203224호를 배정받았다. 도 92에 나타낸 전장 PRO1347 단백질의 추정 분자량은 약 56,748 달톤이고 pI는 약 8.5이다.

도 92 (서열 148)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1347 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) BUTY_HUMAN, AF033107_1, HSU90142_1, HSU90144_1, HSB73_1, HS111M5_2, RO52_HUMAN, AF018080_1, HSAJ03147_4 및 MOG_MOUSE 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 50: 인간 PRO1305를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을을 이용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조합하였다. 본원에서 이 컨센서스 서열은 DNA38103이라 지칭되어 있다. DNA38103 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1305 코딩 서열의 전장 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머(38103.f1)5'-AACTGCTCTGTGGTTGGAAGCCTG-3' (서열 154) 및

역방향 PCR 프라이머(38103.r1)5'-CAGTCACATGGCTGACAGACCCAC-3' (서열 155).

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA38103 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브(38103.p1)

5'-AGGTTATCAGGGGCTTCACTGTGAAACCTGCAAAGAGG-3' (서열 156).

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1305유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 신장 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1305의 전장 DNA 서열 (본원에서 DNA46952-1568[도 93, 서열 152]이라 지칭됨) 및 이로부터 유도된 PRO1305의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1305의 전체 코딩 서열은 도 93 (서열 152)에 나타내었다. 클론 DNA64952-1568은 뉴클레오티드 위치 126 내지 128의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 900 내지 902의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 93). 예상된 폴리펩티드 전구체는 258개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 94). 도 94에 나타낸 전장 PRO1305 단백질의 추정 분자량은 약 25,716 달톤이고 pI는 약 8.13이다. 도 94 (서열 153)에 나타낸 전장 PRO1305 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 25의 신호 펩티드, 약 아미노산 30 내지 약 아미노산 33, 약 아미노산 172 내지 약 아미노산 175, 약 아미노산 195 내지 약 아미노산 198, 약 아미노산 208 내지 약 아미노산 211 및 약 아미노산 235 내지 약 아미노산 238의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 214 내지 약 아미노산 225의 EGF-유사 도메인 시스테인 패턴 신호 서열의 존재를 보여준다. 클론 DNA64952-1568을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203222호를 배정받았다.

도 94 (서열 153)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1305 아미노산 서열과 데이호프 서열 CET22A3_7, LMA2_MOUSE, AF055580_1, AF016903_1, LMB2_MOUSE, P_R71730, LMB3_MOUSE, LMG1_HUMAN, LMG1_DROME 및 LMA5_MOUSE 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 이와 마찬가지로, PRO1305 폴리펩티드는 라민에 상동성을 나타냈으며, 라민 동족체일 수 있다.

실시예 51: 인간 PRO1273을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

발현된 서열 태그 (EST) DNA 데이타베이스(LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 검색하여 EST를 찾아내었다. 이 서열을 공용 데이타베이스 및 Incyte 데이타베이스에 대해 분석하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여, EST 서열의 6 프레임 번역에 대한 세포외 도메인 (ECD)의 비교물로서 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA60747이라 지칭하였다.

BLAST와 phrap을 반복 사용하여 다른 EST 서열에 대해 컨센서스 DNA 서열을 조합하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA60747"이라 지칭되어 있다. DNA60747 컨센서스 서열 및 정렬된 서열 조합체 내의 서열에 대한 관계를 기초로 하여, Incyte 클론 3541105를 구입하여 전체를 서열 분석하였다. 이 Incyte 클론은 정낭 조직으로부터 단리된 RNA로 제조된 라이브러리에서 유도되었다.

PRO1273의 전체 코딩 서열은 도 95 (서열 157)에 나타내었다. 클론DNA65402-1540은 서열 157에서 뉴클레오티드 위치 26 내지 28의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 515 내지 517의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 163개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 158에서 약 아미노산 1 내지 20에 있고, 리포칼린의 보존된 영역은 약 아미노산 25 내지 36에 있다. 클론 DNA65402-1540을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203252호를 배정받았다. 도 96에 나타낸 전장 PRO1273 단백질의 추정 분자량은 약 18,045 달톤이고 pI는 약 4.87이다.

도 96 (서열 158)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1273 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타베이스로부터의 정보) PGHD_FELCA (프로스타글란딘-h2 d-이소머라제 전구체), S57748 (프로스타글란딘 D 합성효소 전구체), LIPO_BUFMA (리포칼린 전구체), S52354, QSP_CHICK, ECP19_1, LACB_CAPHI, OLFA_RANPI, D87752_1 및 LACB_BOVIN 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 52: 인간 PRO1302를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

phrap을 반복 사용하여 PRO1302를 코딩하는 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조합하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA28742"라 지칭되어 있다. DNA28742 컨센서스 서열, 이 컨센서스 서열이 유도된 조합체, 및 본원에 제공된 정보 및 발견을 기초로 하여, Incyte 클론 3344926 (병에 걸린 비장 조직 라이브러리로부터 얻음)을 구입하여 그 전체를 서열 분석하였다. 서열 분석을 통하여PRO1302에 대한 전장의 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1302의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1302의 전체 코딩 서열은 도 97 (서열 159)에 나타내었다. 클론 DNA65403-1565는 서열 159에서 뉴클레오티드 위치 43 내지 45의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1432 내지 1435의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 463개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 160에서 약 아미노산 1 내지 15에 있고, 막횡단 서열은 약 아미노산 351 내지 357에 있다. 클론 DNA65403-1565를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203230호를 배정받았다. 도 98에 나타낸 전장 PRO1302 단백질의 추정 분자량은 약 50,082 달톤이고 pI는 약 7.3이다.

도 98 (서열 160)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1302 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) D86358_1, D86359_1, S71403_1, MAG_HUMAN, JH0593, MMSIAL2_1, C22A_HUMAN, PGBM_HUMAN, PGBM_HUMAN, LACH_DROME 및 KMLS_HUMAN 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 53: 인간 PRO1283을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA28753이라 지칭되어 있다. DNA28753 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1283의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (28753.f1)5'-GGAGATGAAGACCCTGTTCCTG-3' (서열 163)

전방향 PCR 프라이머 (28753.f11)5'-GGAGATGAAGACCCTGTTCCTGGGTG-3' (서열 164)

역방향 PCR 프라이머 (28753.r1)5'-GTCCTCCGGAAAGTCCTTATC-3' (서열 165)

역방향 PCR 프라이머 (28753.r11)5'-GCCTAGTGTTCGGGAACGCAGCTTC-3' (서열 166)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA28753 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (28753.p1)

5'-CAGGGACCTGGTACGTGAAGGCCATGGTGGTCGATAAGGACTTTCCGGAG-3' (서열 167)

혼성화 프로브 (28753.p11)

5'-CTGTCCTTCACCCTGGAGGAGGAGGATATCACAGGGACCTGGTAC-3' (서열 168)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1283 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 유방암 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1283의 DNA 서열 (본원에서 DNA65404-1551 [도 99, 서열 161]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1283의 단백질 서열을 수득하였다.

DNA65404-1551의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 99 (서열 161)에 나타내었다. 클론 DNA65404-1551은 뉴클레오티드 위치 45 내지 47의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 555 내지 557의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 99). 예상된 폴리펩티드 전구체는 170개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 100). 도 100에 나타낸 전장 PRO1283 단백질의 추정 분자량은 약 19,457 달톤이고 pI는 약 9.10이다. 도 100 (서열 162)에 나타낸 전장 PRO1283 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 17의 신호 펩티드의 존재를 보여준다. 클론 DNA65404-1551을 1998년 9월 9일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203464호를 배정받았다.

도 100 (서열 162)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1283 아미노산 서열과 데이호프 서열 A40464, VEGP_HUMAN, ALL1_CANFA, LALP_TRIVU, S51803, XELPDS_1, LIPO_BUFMA, S52354, QSP_CHICK 및 ERBP_RAT 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 54: 인간 PRO1279를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA30856이라 지칭되어 있다. DNA30856 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1279의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (30856.f1)5'-GGCTGCGGGACTGGAAGTCATCGGG-3' (서열 171)

전방향 PCR 프라이머 (30856.f11)5'-CTCCAGGCCATGAGGATTCTGCAG-3' (서열 172)

전방향 PCR 프라이머 (30856.f12)5'-CCTCTGGTCTGTAACCAG-3' (서열 173)

역방향 PCR 프라이머 (30856.r1)5'-TCTGTGATGTTGCCGGGGTAGGCG-3' (서열 174)

역방향 PCR 프라이머 (30856.r11)5'-CGTGTAGACACCAGGCTTTCGGGTG-3' (서열 175)

역방향 PCR 프라이머 (30856.r12)5'-CCCTTGATGATCCTGGTC-3' (서열 176)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA30856 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (30856.p1)

5'-AGGCCATGAGGATTCTGCAGTTAATCCTGCTTGCTCTGGCAACAGGGCTT-3' (서열 177)

혼성화 프로브 (30856.p11)

5'-GAGAGACCAGGATCATCAAGGGGTTCGAGTGCAAGCCTCACTC-3' (서열 178)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1279 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 폐암 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1279의 DNA 서열 (본원에서 DNA65405-1547 [도 101, 서열 169]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된PRO1279의 단백질 서열을 수득하였다.

DNA65405-1547의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 101 (서열 169)에 나타내었다. 클론 DNA65405-1547은 뉴클레오티드 위치 106 내지 108의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 856 내지 858의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 101). 예상된 폴리펩티드 전구체는 250개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 102). 도 102에 나타낸 전장 PRO1279 단백질의 추정 분자량은 약 27,446 달톤이고 pI는 약 8.87이다. 도 102 (서열 170)에 나타낸 전장 PRO1279 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 18의 신호 펩티드, 약 아미노산 58 내지 약 아미노산 63의 세린 프로테아제, 트립신족 히스티딘 활성 부위, 약 아미노산 99 내지 약 아미노산 102, 약 아미노산 165 내지 약 아미노산 168, 약 아미노산 181 내지 약 아미노산 184 및 약 아미노산 210 내지 약 아미노산 213의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 145 내지 약 아미노산 148의 글리코사미노글리칸 부착 부위, 약 아미노산 197 내지 약 아미노산 209 및 약 아미노산 47 내지 약 아미노산 64의 크링글(kirngle) 도메인 단백질에 존재하는 아미노산 서열 블록, 세린 프로테아제, 트립신족, 히스티딘 단백질에 상동성이 있는 약 아미노산 199 내지 약 아미노산 209, 약 아미노산 47 내지 약 아미노산 63 및 약 아미노산 220 내지 약 아미노산 243의 아미노산 서열 블록, 및 애플(apple) 도메인 단백질에 상동성이 있는 약 아미노산 222 내지 약 아미노산 249 및 약 아미노산 189 내지 약 아미노산 222의 아미노산 서열 블록의 존재를 보여준다. 클론 DNA65405-1547을 1998년 11월 17일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203476호를 배정받았다.

도 102 (서열 170)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1279 아미노산 서열과 데이호프 서열 I56559, S55066, KLK7_RAT, KLK1_RAT, KLKB_RAT, KLK3_MOUSE, KLK8_RAT, AF013988_1, D78203_1 및 HSU62801_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

또한, DNA65405-1547은 Incyte EST 클론 제2723646호를 구입하고 이 클론의 삽입체를 서열 분석함으로써, 도 101 (서열 169)에 나타낸 DNA65405-1547을 수득하였다.

실시예 55: 인간 PRO1304를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA35745라 지칭되어 있다. DNA35745 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1304의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (35745.f1)5'-GTGTTCTGCTGGAGCCGATGCC-3' (서열 181)

전방향 PCR 프라이머 (35745.f2)5'-GACATGGACAATGACAGG-3' (서열 182)

전방향 PCR 프라이머 (35745.f3)5'-CCTTTCAGGATGTAGGAG-3' (서열 183)

전방향 PCR 프라이머 (35745.f4)5'-GATGTCTGCCACCCCAAG-3' (서열 184)

역방향 PCR 프라이머 (35745.r1)5'-GCATCCTGATATGACTTGTCACGTGGC-3' (서열 185)

역방향 PCR 프라이머 (35745.r2)5'-TACAAGAGGGAAGAGGAGTTGCAC-3' (서열 186)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA35745 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (35745.p1)

5'-GCCCATTATGACGGCTACCTGGCTAAAGACGGCTCGAAATTCTACTGCAGCC-3' (서열 187)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1304 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 난소 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1304의 DNA 서열 (본원에서 DNA65406-1567 [도 103, 서열 179]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1304의 단백질 서열을 수득하였다.

DNA65406-1567의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 103 (서열 179)에 나타내었다. 클론 DNA65406-1567은 뉴클레오티드 위치 23 내지 25의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 689 내지 691의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 103). 예상된 폴리펩티드 전구체는 222개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다 (도 104). 도 104에 나타낸 전장 PRO1304 단백질의 추정 분자량은 약 25,794 달톤이고 pI는 약 6.24이다. 도 104 (서열 180)에 나타낸 전장 PRO1304 서열의 분석은 약 아미노산 219 내지 약 아미노산 222의 소포체 표적 서열, 약 아미노산 55 내지 약 아미노산 48의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 87 내지 약 아미노산 123 및 약 아미노산 129 내지 약 아미노산 142의 FKBP-형 펩티딜-프롤릴 시스-트랜스 이소머라제 상동성 블록, 및 약 아미노산 202 내지 약 아미노산 214 및 약 아미노산 195 내지 약 아미노산 214의 EF-핸드(EF-hand) 칼슘 결합 도메인 단백질 상동성 블록의 존재를 보여준다. 클론 DNA65406-1567을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203219호를 배정받았다.

도 104 (서열 180)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1304 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF040252_1, P_R28980, S71238, CELC05C8_1, VFU52045_1, S75144, FKB3_BOVIN, CELC50F2_6, CELB0511_12 및 P_R41781 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

또한, DNA65406-1567은 Incyte EST 클론 제2813577호의 삽입체를 단리 및 서열 분석하여 수득하였다.

실시예 56: 인간 PRO1317을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 기술을 이용하여, 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상인 Incyte EST 제33598호를 목적 서열로서 찾아내었다. EST 제33598호의 서열은 본원에서 "DNA36958"이라 지칭되어 있다. DNA36958 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1317의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: AGGGACCATTGCTTCTTCCAGGCC (36958.f1, 서열 190)

역방향 PCR 프라이머: CGTTACATGTCTCCAAGGGGAATG (36958.r1, 서열 191)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA36958 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: CCTGTGCTAAGTGCCCCCCAAATGCTTCCTGTGTCAATAACACTCACTGC (36958.p1, 서열 192)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1317 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 말초혈, 특히 백혈구 수치가 높은 (예를 들면, 과호산구증가증) 환자의 혈액과 같이 목적 서열을 함유하는 조직으로부터 단리하였다.

본원에서 DNA65408-1578 (도 105, 서열 188)이라 지칭되는 PRO1317의 전장 DNA 서열은, Incyte EST 제335958호를 구입하고 cDNA 삽입체를 수득하여 그 전체를 서열 분석함으로써 수득하였다. Incyte 클론 제335958 호는 과호산구증가증을 앓고 있는 남성 환자에서 채집한 말초혈 세포에서 단리된 RNA를 사용하여 제조한 라이브러리로부터 유도되었다.

PRO1317의 전체 코딩 서열은 도 105 (서열 188)에 나타내었다. 클론 DNA65408-1578은 뉴클레오티드 위치 6 내지 8의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 228 내지 230의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 74개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 106에 나타낸 전장 PRO1317 단백질의 추정 분자량은 약 7,831 달톤이고 pI는 약 9.08이다. 부가의 특징에는 약 아미노산 1 내지 18의 신호 펩티드, 약 아미노산 34 내지 37 및 39 내지 42의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 72 내지 74의 미소체 C-말단 표적 신호가 있다.

도 106 (서열 189)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1317 아미노산 서열과 데이호프 서열 CD97_HUMAN 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1317 아미노산 서열과 부가의 데이호프 서열 GEN12618, CELZK783_1, G156_PARPR, GIAVSPE_1, AF040387_1, S78059, I50617, XLSEK1_1 및 NEL2_RAT 사이에 약간의 상동성이 있었다.

클론 DNA65408-1578을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203217호를 배정받았다.

실시예 57: 인간 PRO1303을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 phrap을 이용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조합하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA47347"이라 지칭되어 있다. DNA47347 컨센서스 서열 및 이 DNA47347이 유도된 조합체 내의 Incyte EST의 동족체를 기초로 하여, Incyte 클론 1430305 (회장 조직 라이브러리에서 유도)를 구입하여 그 전체를 서열 분석하였다. 이로써 PRO1303을 코딩하는 서열을 찾아내었다.

PRO1303의 전체 코딩 서열은 도 107 (서열 193)에 나타내었다. 클론 DNA65409-1566은 뉴클레오티드 위치 121 내지 123의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 865 내지 867의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 248개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 194의 약 아미노산 1 내지 17에 있다. N-글리코실화 부위, 활성 및 보존된 영역 및 도메인의 위치는 도 194에 추가로 나타내었다. 클론 DNA65409-1566을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203232호를 배정받았다. 도 108에 나타낸 전장 PRO1303 단백질의 추정 분자량은 약 26,734 달톤이고 pI는 약 7.9이다.

도 108 (서열 194)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1303 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) AB009849_1, P_W08475, AF024605_1, A42048_1, TRY3_RAT, MMAE00066414, TRY1_RAT, MMAE000663_4, MMAE000665_2 및 MMAE00066412 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 58: 인간 PRO1306을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 방법을 이용하여, 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상인 Incyte EST 제2449282 호(본원에서 DNA5918이라 지칭됨)를 목적 서열로서 찾아내었다. DNA5918 서열로부터, BLAST 및 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)을 이용하여 컨센서스 서열을 조합하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA47399"라 지칭되어 있다. DNA47399 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1306 코딩 서열의 전장 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성할 수 있다.

도 109 (서열 195)에 나타낸 PRO1306의 전체 코딩 서열은 Incyte EST 제2449282호를 구입하고 cDNA 삽입체를 수득하여 그 전체를 서열 분석함으로써 수득하였다. 클론 DNA65410-1569는 뉴클레오티드 위치 106 내지 108의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 556 내지 558의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 150개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 110에 나타낸 전장 PRO1306 단백질의 추정 분자량은 약 17,068 달톤이고 pI는 약 7.29이며, 약 아미노산 131 내지 134에 잠재적인 N-글리코실화 부위가 있다.

도 110 (서열 196)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1306 아미노산 서열과 데이호프 서열 AIF1_HUMAN 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1306 아미노산 서열과 데이호프 서열 JC4902, BAR1_RAT, AF020281_1, HSU95213_1, TCH3_ARATH, LEY14765_1, CATR_NAEGR, S35185 및 AF065247_1 사이에 상동성이 있었다.

클론 DNA65410-1569를 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203231호를 배정받았다.

실시예 59: 인간 PRO1336을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

EST 서열 하나를 찾아내어 독점 Genentech 데이타베이스에 넣었다. 이 EST를 다양한 EST 데이타베이스에 대해 분석하였다. 이 EST 데이타베이스에는 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크), 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA) 및 Genentech의 독점 데이타베이스가 포함된다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 EST 서열의 6 프레임 번역물에 대해 ECD 단백질 서열의 비교물로서 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, WA)으로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다.

PRO1336을 코딩하는 컨센서스 DNA 서열을 phrap을 이용하여 정렬된 다른 EST 서열(조합체를 형성)에 대해 조합하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA43319"라 지칭되어 있다.

DNA43319 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1336 코딩 서열의 전장 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머5'ATGGAGATTCCTGCCAACTTGCCG3' (서열 199) 및

역방향 PCR 프라이머5'TTGTTGGCATTGAGGAGGAGCAGC3' (서열 200)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA43319 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브5'GAGGGCATCGTCGAAATACGCCTAGAACAGAACTCCATCAAAGCCATCCC3' (서열 201)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1336 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 폐 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1336의 DNA 서열 (본원에서 DNA65423-1595 [도 111 A-B, 서열 198]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1336의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1336의 전체 코딩 서열은 도 111 A-B (서열 198)에 나타내었다. 클론 DNA65423-1595는 서열 198에서 뉴클레오티드 위치 83 내지 85의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 4652 내지 4654의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 1523개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호펩티드(아미노산 1 내지 27), 아스파라긴산 및 아스파라긴 히드록실화 부위, EGF-유사 도메인 시스테인 패턴 신호 영역, 루이신 지퍼 패턴 영역, 이뮤노글로불린 및 주요 조직 적합성 복합체, 및 N-글리코실화 부위의 개략적인 위치가 도 112에 표시되어 있다. 클론 DNA65423-1595를 ATCC에 기탁하여ATCC 기탁번호 제203227호를 배정받았다. 도 112에 나타낸 전장의 PRO1336 단백질의 추정 분자량은 약 167,715 달톤이고 pI는 약 8.06이다.

도 112 (서열 198)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1336 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) SLIT_DROME, CEF40E10_1, LCU58977_1, AF029779_1, FBP1_STRPU, NOTC_XENLA, AC004663_1, XELXDEL_1, P_W05835 및 HSU77720_1 사이의 상동성을 보여주었다.

실시예 60: 인간 PRO1278을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "Consen5230"이라 지칭되어 있다. 또한, BLAST 및 phrap을 반복 사용하여, Consen5230 컨센서스 서열을 상기 논의된 EST 서열의 공급원을 이용해 가능한 긴 길이로 확장시켰다. 확장된 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA44801"이라 지칭하였다. DNA44801 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1278의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머GCAGGCTTTGAGGATGAAGGCTGC (44801.f1, 서열 204) 및 CTCATTGGCTGCCTGGTCACAGGC (44801.f2, 서열 205)

역방향 PCR 프라이머CCAGTCGGACAGGTCTCTCCCCTC (44801.r1, 서열 206) 및TCAGTGACCAAGGCTGAGCAGGCG (44801.r2, 서열 207)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA44801 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브CTACACTCGTTGCAAACTGGCAAAAATATTCTCGAGGGCTGGCCTGG (44801.p1, 서열 208)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1278 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 정소로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1278의 DNA 서열 (본원에서 DNA66304-1546 [도 113, 서열 202]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1278의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1278의 전체 코딩 서열은 도 113 (서열 202)에 나타내었다. 클론 DNA66304-1546은 뉴클레오티드 위치 141 내지 143의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 585 내지 587의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 148개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 114에 나타낸 전장 PRO1278 단백질의 추정 분자량은 약 16,623 달톤이고 pI는 약 8.47이다. 부가의 특징으로는 약 아미노산 1 내지 19의 신호 펩티드, 약 아미노산 58 내지 61의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 94 내지 112의알파-락트알부민/리소자임 C 신호, 및 약 아미노산 35 내지 59, 67 내지 59 및 112 내지 133의 알파-락트알부민/리소자임 C 동족체가 있다.

도 114 (서열 203)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1278 아미노산 서열과 데이호프 서열 LYC1_ANAPL, LYC3_ANAPL 및 LYC_HUMAN 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

클론 DNA66304-1546을 1998년 10월 6일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203321호를 배정받았다.

실시예 61: 인간 PRO1298을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 1종 이상의 EST가 질병에 걸린 전립선 조직 라이브러리로부터 유도되었다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56389라 지칭하였다.

DNA56389 서열과 이 컨센서스 서열이 유도된 조합체 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, Incyte EST 클론 제3355717호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 115에 나타내었고 본원에서 DNA66511-1563이라 지칭하였다.

도 115에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 94 내지 96의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1063 내지 1065의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 115, 서열 209). 예상된 폴리펩티드 전구체는 323개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 116, 서열 210). 신호 펩티드는 서열 210의 약 아미노산 1 내지 15에 있다. PRO1298의 계산된 분자량은 약 37,017 달톤이고 추정 pI는 약 8.83이다. 클론 DNA66511-1563을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203228호를 배정받았다.

도 116 (서열 210)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1298 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) ALG2_YEAST, CAPM_STAAU, C69098, C69255, SUS2_MAIZE, A69143, S74778, AB009527_13, AF050103_2 및 BBA224769_1 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 62: 인간 PRO1301을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 제93492호라 지칭되며, 또한 본원에서"DNA10591"이라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 1종 이상의 EST가 선암종이 있는 남성으로부터 분리한 폐 조직에서 단리된 RNA를 이용하여 제조한 cDNA 라이브러리로부터 유도되었다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA57725"라 지칭하였다.

DNA57725 서열과 EST 제3395984호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST 클론 3395984를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 그 전체를 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 117에 나타내었고 본원에서 "DNA66512-1564"라 지칭하였다.

도 117에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 43 내지 45의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1429 내지 1431의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 117, 서열 211). 예상된 폴리펩티드 전구체는 462개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 118, 서열 212). PRO1301 단백질의다른 특징으로는 약 아미노산 1 내지 18의 신호 서열, 약 아미노산 271 내지 290의 막횡단 도메인, 약 아미노산 134 내지 462의 시토크롬 P450 상동성 영역, 및 약 아미노산 94 내지 97, 217 내지 220 및 246 내지 249의 잠재적인 N-글리코실화 부위가 있다. PRO1301의 계산된 분자량은 약 52,432 달톤이고 추정 pI는 약 6.14이다. 클론 DNA66512-1564를 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203218호를 배정받았다.

도 118 (서열 212)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1301 아미노산 서열과 데이호프 서열 PSU29243_1, A69975, ATAC00448418, D78607_1, CEB0331_1, HUMCYTIIIA_1, AF014800_1, CELT13C5_4, CELC45H4_14 및 CEC54E10_1 사이에 약간의 상동성을 보여주었다.

실시예 63: 인간 PRO1268을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 EST 클러스터 제8879호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 1종 이상의 EST가 손상된 뇌막에서 채취한 인간 뇌 종양 조직에서 제조한 cDNA 라이브러리로부터 유도되었다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56258라 지칭하였다.

DNA56258 서열과 EST 클론 제2944541호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST 클론 제2944541호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 119에 나타내었고 본원에서 "DNA66519-1535"라 지칭하였다.

도 119에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 89 내지 91의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 509 내지 511의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 119, 서열 213). 예상된 폴리펩티드 전구체는 140개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 120, 서열 214). PRO1268의 계산된 분자량은 약 15,503 달톤이고 추정 pI는 약 6.64이다. 다른 특징으로는 약 아미노산 12 내지 28의 Ⅱ형 막횡단 도메인, 약 아미노산 51 내지 66 및 약 아미노산 107 내지 124의 Ⅰ형 막횡단 도메인, 약 아미노산 79 내지 82의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 수용체와 결합된 G-단백질과 상동성이 있는 약 아미노산 59 내지 99의 영역이 있다.

도 120 (서열 214)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1268 아미노산서열과 데이호프 서열 CEF39B2_9 사이에 약간의 상동성을 보여주었다. 그러나, 서열 상동성 퍼센트는 높지 않은 것으로 결정되었다.

클론 DNA66519-1535를 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203236호를 배정받았다.

실시예 64: 인간 PRO1269를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 EST 클러스터 제101920호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56509라 지칭하였다.

DNA56509 서열과 EST 클론 제103157호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST 클론 제103157호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 121에 나타내었고 본원에서DNA66520-1536이라 지칭하였다.

도 121에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 26 내지 29의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 614 내지 616의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 121, 서열 215). 예상된 폴리펩티드 전구체는 약 아미노산 1 내지 20에 잠재적인 N-글리코실화 부위가 있는 196개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 122, 서열 216). 약 아미노산 112 내지 115에 잠재적인 N-글리코실화 부위가 았다. PRO1269의 계산된 분자량은 약 21,731 달톤이고 추정 pI는 약 8.97이다.

도 122 (서열 216)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1269 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_W23722 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1269 아미노산 서열과 데이호프 서열 MMTAG7_1, MTV026_16, NAAA_BPT3, S75616_1 및 NCP_PIG 사이의 상동성도 나타났다.

클론 DNA66520-1536을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203226호를 배정받았다.

실시예 65: 인간 PRO1327을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 제173410호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56520이라 지칭하였다.

DNA56520 서열과 EST 클론 제3451760호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST 클론 제3451760호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 123에 나타내었고 본원에서 DNA66521-1583이라 지칭하였다.

클론 DNA66521-1583은 뉴클레오티드 위치 55 내지 57의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 811 내지 813의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 123). 예상된 폴리펩티드 전구체는 252개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 124). PRO1327 단백질의 추정 분자량은 약 28,127 달톤이고 pI는 약 8.91이다. 도 124 (서열 218)에 나타낸 전장 PRO1327 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 14의 신호 펩티드, 약 아미노산 62 내지 약 아미노산 65, 약 아미노산 127 내지 약 아미노산 130, 약 아미노산 137 내지 약 아미노산 140 및 약 아미노산 143 내지 약 아미노산 146의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및약 아미노산 61 내지 약 아미노산 71의 2-옥소 산 데히드로게나제 아실트랜스퍼라제 상동성 블록의 존재를 보여준다. 클론 DNA66521-1583을 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203225호를 배정받았다.

도 124 (서열 218)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1327 아미노산 서열과 데이호프 서열 NPH1_RAT, NPH2_MOU SE, OTU_DROME, D40750, BB61_RABIT, P_R23873, P_W09643, CAGHMGPA_1, HUMPRP11_1 및 S670958_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 66: 인간 PRO1382를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 방법을 이용하여, 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상인 Incyte EST 제2719호를 목적 서열로서 찾아내었다. EST 제2719호의 뉴클레오티드 서열은 본원에서 "DNA42842"라 지칭되어 있다. DNA42842 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1382의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: ACGGCTCACCATGGGCTCCG (42842.f1, 서열 221)

역방향 PCR 프라이머: AGGAAGAGGAGCCCTTGGAGTCCG (42842.r1, 서열 222)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA42842 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: CGTGCTGGAGGGCAAGTGTCTGGTGGTGTGCGACTCGAAC (42842.p1, 서열 223)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1382 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 유방암 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1382의 DNA 서열 (본원에서 DNA66526-1616 [도 125, 서열 219]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1382의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1382의 전체 코딩 서열은 도 125 (서열 219)에 나타내었다. 클론 DNA66526-1616은 뉴클레오티드 위치 337 내지 339의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 940 내지 942의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 201개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 126에 나타낸 전장 PRO1382 단백질의 추정 분자량은 약 21,808 달톤이고 pI는 약 9.04이다. 부가의 특징에는 약 아미노산 1 내지 27의 신호 펩티드, 약 아미노산 29 내지 32 및 88 내지 91의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 92 내지 126, 159 내지 178 및 191 내지 200의 C1q 단백질 상동성 영역이 있다.

도 126 (서열 220)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1382 아미노산 서열과 데이호프 서열 CERL_RAT 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한,PRO1382 아미노산 서열과 데이호프 서열 CERB_HUMAN, S76975_1, A41752, HUMC1QB2_1, A57131, CA1A_HUMAN, ACR3_MOUSE 및 COLE_LEPMA 사이에 상동성이 있었다.

클론 DNA66526-1616을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203246호를 배정받았다.

실시예 67: 인간 PRO1328을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 제40671호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56749라 지칭하였다.

DNA56749 서열과 EST 클론 제4111192호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST 클론 제4111192호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 127에 나타내었고 본원에서 DNA66658-1584라 지칭하였다.

클론 DNA66658-1584는 뉴클레오티드 위치 9 내지 11의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 780 내지 782의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 127). 예상된 폴리펩티드 전구체는 257개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 128). 도 128에 나타낸 전장 PRO1328 단백질의 추정 분자량은 약 28,472 달톤이고 pI는 약 9.33이다. 도 128 (서열 225)에 나타낸 전장 PRO1328 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 19의 신호 펩티드, 약 아미노산 32 내지 약 아미노산 51, 약 아미노산 119 내지 약 아미노산 138, 약 아미노산 152 내지 약 아미노산 169 및 약 아미노산 216 내지 약 아미노산 235의 막횡단 도메인, 약 아미노산 120 내지 약 아미노산 123의 글리코사미노글리칸 부착 부위, 및 약 아미노산 31 내지 약 아미노산 65의 나트륨/신경전달물질 공동 수송 족 단백질 상동성 블록의 존재를 보여준다. 클론 DNA66658-1584를 1998년 9월 15일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203229호를 배정받았다.

도 128 (서열 225)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1328 아미노산 서열과 데이호프 서열 CEVF36H2L_2, TIP2_TOBAC, AB009466_16, ATU39485_1, P_R60153, P_R77082, S73351, C69392, LEU95008_1 및 E64667 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 68: 인간 PRO1325를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 제139524호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56115라 지칭하였다.

DNA56115 서열과 EST 클론 제3744079호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST 클론 제3744079호를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 129에 나타내었고 본원에서 DNA66659-1593이라 지칭하였다.

클론 DNA66659-1593은 뉴클레오티드 위치 51 내지 53의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2547 내지 2549의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 129). 예상된 폴리펩티드 전구체는 832개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 130). 도 130에 나타낸 전장 PRO1325 단백질의 추정 분자량은 약 94,454 달톤이고 pI는 약 6.94이다. 도 130 (서열 227)에 나타낸 전장 PRO1325 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 18의 신호 펩티드, 약 아미노산 292 내지 약 아미노산 317, 약 아미노산 451 내지 약 아미노산 470, 약 아미노산 501 내지 약 아미노산 520, 약 아미노산 607 내지 약 아미노산 627 및 약 아미노산 751 내지 약 아미노산 770의 막횡단 도메인, 약 아미노산 497 내지 약 아미노산 518의 루이신 지퍼 패턴 서열, 및 약 아미노산 27 내지 약 아미노산 30, 약 아미노산 54 내지 약 아미노산 57, 약 아미노산 60 내지 약 아미노산 63, 약 아미노산 123 내지 약 아미노산 126, 약 아미노산 141 내지 약 아미노산 144, 약 아미노산 165 내지 약 아미노산 168, 약 아미노산 364 내지 약 아미노산 367, 약 아미노산 476 내지 약 아미노산 479, 약 아미노산 496 내지 약 아미노산 499, 약 아미노산 572 내지 약 아미노산 575, 약 아미노산 603 내지 약 아미노산 606 및 약 아미노산 699 내지 약 아미노산 702의 잠재적인 N-글리코실화 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA66659-1593을 1998년 9월 22일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203269호를 배정받았다.

도 130 (서열 227)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1325 아미노산 서열과 데이호프 서열 CELR04E5_1, CELZK721_5, CELC30E1_5, CELC30E1_6, CELC30E1_2, CEY37H2C_1, CELC30E1_7, CELT07H8_7 및 E64006 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 69: 인간 PRO1340을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 방법을 이용하여, 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상인 Incyte EST 제878906호를 목적 서열로서 찾아내었다. EST 제878906호의 뉴클레오티드 서열은 본원에서 "DNA42809"라 지칭되어 있다. DNA42809 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1340의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: TCCAGGTGGACCCCACTTCAGG (42809.f1, 서열 270)

역방향 PCR 프라이머: GGGAGGCTTATAGGCCCAATCTGG (42809.r1, 서열 271)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA42809 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: GGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGA (42809.p1, 서열 272)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1340 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 신장 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1340의 DNA 서열 (본원에서 DNA66663-1598 [도 131, 서열 228]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된PRO1340의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1340의 전체 코딩 서열은 도 131 (서열 228)에 나타내었다. 클론 DNA66663-1598은 뉴클레오티드 위치 128 내지 130의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2549 내지 2551의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 807개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 132에 나타낸 전장 PRO1340 단백질의 추정 분자량은 약 87,614 달톤이고 pI는 약 4.83이다. 부가의 특징에는 약 아미노산 1 내지 18의 신호 펩티드, 약 아미노산 762 내지 784의 막횡단 도메인, 약 아미노산 492 내지 494의 세포 부착 서열, 약 아미노산 517 내지 520, 602 내지 605 및 700 내지 703의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 307 내지 351, 324 내지 348, 67 내지 103, 97 내지 141 및 114 내지 138의 카드헤린(cadherin) 세포외 반복 도메인이 있다.

도 132 (서열 229)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1340 아미노산 서열과 데이호프 서열 I46536 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1340 아미노산 서열과 데이호프 서열 S55396, RATPDRPT_1, CADD_CHICK, CAD1_CHICK, CADB_CHICK, I50180, CAD4_CHICK, G02878 및 DSC1_MOUSE 사이에 상동성이 있었다.

클론 DNA66663-1598을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203268호를 배정받았다.

실시예 70: 인간 PRO1339를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 phrap을 이용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조합하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA40652"라 지칭되어 있다. 컨센서스 서열 내에서, 조합체는 Incyte EST 2479394였다. 컨센서스 서열 및 본원에 제공된 발견과 정보를 기초로 하여, Incyte EST 2479394를 포함하는 클론을 구입하여 그 전체를 서열 분석하였다. 서열 분석을 통하여 PRO1339를 코딩하는 서열을 포함하는, 도 133에 나타낸 핵산 서열을 수득하였다.

클론 DNA66669-1597은 서열 233에서 뉴클레오티드 위치 9 내지 11의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1272 내지 1274의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 421개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 234의 약 아미노산 1 내지 16에 있다. 아연 카르복시펩티다아제 및 N-글리코실화 부위의 보존된 영역은 도 134에 추가로 나타내었다. 클론 DNA66669-1597을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203272호를 배정받았다. 전장 PRO1339 단백질의 추정 분자량은 약 47,351 달톤이고 pI는 약 6.61이다.

도 134 (서열 234)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1339 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) P_W01505, CBP1_HUMAN, HSA224866_1, P_R90293, YHT2_YEAST, CEF02D8_4, CEW01A8_6, P_W36815, HSU83411_1 및 CBPN_HUMAN 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 71: 인간 PRO1337을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 방법을 이용하여, 단일 Incyte EST 클론 (EST제1747546 호)을 찾아내었고, 이를 본원에서 "DNA4417"이라 지칭하였다. 컨센서스 서열을 조합하기 위해, BLAST와 phrap을 반복 사용하여 DNA4417을 상기 논의된 EST 서열의 공급원을 이용해 가능한 긴 길이로 확장시켰다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA45569"라 지칭하였다. DNA45569 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1337의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: CAACCATGCAAGGACAGGGCAGG (45569.f1, 서열 237) 및 CTTTGCTGTTGGCCTCTGTGCTCCCAACCATGCAAGGACAGGGCAGG (45569.f2, 서열 238)

역방향 PCR 프라이머: TGACTCGGGGTCTCCAAAACCAGC (45569.r1, 서열 239) 및 GGTATAGGCGGAAGGCAAAGTCGG (45569.r2, 서열 235)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA45569 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: GGCATCTTACCTTTATGGAGTACTCTTTGCTGTTGGCCTCTGTGCTCC (45569.p1, 서열 241)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1337 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1337의 DNA 서열 (본원에서 DNA66672-1586 [도 135, 서열 235]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1337의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1337의 전체 코딩 서열은 도 135 (서열 235)에 나타내었다. 클론 DNA66672-1586은 뉴클레오티드 위치 60 내지 62의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1311 내지 1313의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 417개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 136에 나타낸 전장 PRO1337 단백질의 추정 분자량은 약 46,493 달톤이고 pI는 약 7.97이다.

도 136 (서열 236)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1337 아미노산 서열과 데이호프 서열 THBG_HUMAN 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1337 아미노산 서열과 데이호프 서열 KAIN_HUMAN, HSACT1_1, IPSP_HUMAN, G02081, HAMHPP_1, CPI6_RAT, S31507, AB000547_1 및 KBP_MOUSE 사이에 상동성이 있었다.

클론 DNA66672-1586을 1998년 9월 22일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203265호를 배정받았다.

실시예 72: 인간 PRO1342를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 2에 기재된 아밀라제 스크린에서 단리된 cDNA 서열을 본원에서DNA43203이라 지칭하였다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA48360"이라 지칭하였다.

이 DNA48360 서열을 기초로 하여 올리고뉴클레오티드 프로브를 제조하고, 상기 실시예 2의 첫번째 단락에 기재된 바와 같이 제조된 인간 식도 라이브러리를 스크린하기 위해 사용하였다. 클로닝 벡터는 pRK5B (pRK5B는 SfiⅠ 부위를 함유하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌 (Holmes et al., Science, 253:1278-1280 (1991)) 참조)였으며, 절단된 cDNA의 크기는 2800bp 미만이었다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: 5'-GAAGCACCAGCCTTTATCTCTTCACC-3' (48360.f1, 서열 244) 및

역방향 PCR 프라이머: 5'-GTCAGAGTTGGTGGCTGTGCTAGC-3' (48360.r1, 서열 245).

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA48360 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브

5'GGACCCAGGCATCTTGCTTTCCAGCCACAAAGAGACAGATGAAGATGC-3' (48360.p1, 서열 246)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1342 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다.

뉴클레오티드 위치 239 내지 241의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2027 내지 2029의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함하는 전장의 클론을 확인하였다 (도 137, 서열 242). 예상된 폴리펩티드 전구체는 596개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖으며, 계산된 분자량은 약 5,173 달톤이고 추정 pI는 약 4.82이다. 부가의 특징으로는 약 아미노산 1 내지 20의 신호 서열, 약 아미노산 510 내지 532의 막횡단 도메인, 약 아미노산 25 내지 28의 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 325 내지 328의 글리코사미노글리칸 부착 부위, 및 약 아미노산 284 내지 337, 404 내지 457, 254 내지 307, 359 내지 412, 194 내지 247, 239 내지 292, 299 내지 352, 134 내지 187, 314 내지 367 및 164 내지 217의 박테리아 빙핵 형성(ice-nucleation) 단백질 8량체 반복 서열이 있다.

도 138 (서열 243)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1342 아미노산 서열과 데이호프 서열 CELZC178_2, LMSAP2GN_1, D88734_, AMYH_YEAST, MMDSPPG_1, VGLX_HSVEB, S52714, CELF59A6_5, CELK06A9_3 및 YM96_YEAST 사이에 약간의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA66674-1599를 1998년 9월 22일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203281호를 배정받았다.

실시예 73: 인간 PRO1343을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

WU-BLAST2 서열 정렬 컴퓨터 프로그램에 의해 상기 실시예 2에 기재된 아밀라제 스크린에서 단리된 cDNA 서열이 임의의 공지된 인간 코딩 핵산과 상동성을 갖는다는 것을 발견하였다. 이 cDNA 서열을 본원에서 DNA48921이라 지칭하였다. DNA48921 서열을 기초로 하여 올리고뉴클레오티드 프로브를 제조하고, 상기 첫번째 단락에 기재된 바와 같이 제조된 인간 평활근 세포 조직 라이브러리를 스크린하기 위해 사용하였다. 클로닝 벡터는 pRK5B (pRK5B는 SfiⅠ 부위를 함유하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌 (Holmes et al., Science, 253:1278-1280 (1991)) 참조)였으며, 절단된 cDNA의 크기는 2800bp 미만이었다.

사용된 올리고뉴클레오티드 프로브는 하기와 같다.

전방향 PCR 프라이머(48921.f1) 5'-CAATATGCATCTTGCACGTCTGG-3' (서열 249)

역방향 PCR 프라이머(48921.r1) 5'-AAGCTTCTCTGCTTCCTTTCCTGC-3' (서열 250)

혼성화 프로브(48921.p1)

5'-TGACCCCATTGAGAAGGTCATTGAAGGGATCAACCGAGGGCTG-3' (서열 251)

뉴클레오티드 위치 71 내지 73의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 812 내지 814의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함하는 전장의 클론을 확인하였다 (도 139, 서열 247). 예상된 폴리펩티드 전구체는 247개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖으며, 계산된 분자량은 약 25,335 달톤이고 추정 pI는 약 7.0이다. 도 140 (서열 248)에 나타낸 전장 PRO1343의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 25의 신호 펩티드, 및 약 아미노산 35 내지 약 아미노산 225의 서컴스포로조이트(circumsporozoite) 반복 서열 상동성 영역의 존재를 보여주었다. 클론 DNA66675-1587을 1998년 9월 22일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203282호를 배정받았다.

도 140 (서열 248)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1343 아미노산 서열과 데이호프 서열 CSP_PLACC, CEF25H8_2, U88974_40, BNAMRNAA_1, BOBOPC3_1, S58135, AF061832_1, BHU52040_1, HUMPROFILE_1 및 MTV023_14 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

또한, DNA48921 서열에 상동성이 있는 Incyte EST 클론 (Incyte EST 클론 제4701148 호)을 수득하여 그 삽입체를 서열 분석함으로써, 도 139에 나타낸 DNA66675-1587 서열을 얻었다.

실시예 74: 인간 PRO1480을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 기술을 이용하여, 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상인 Incyte EST 제1628847호를 목적 서열로서 찾아내었다. 프로그램 "phrap"(Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)을 이용하여 이 서열들을 컨센서스 서열로 조합하였다. 이 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA1395"라 지칭하였다. 또한, BLAST 및 phrap을 반복 사용하여, "DNA1395" 컨센서스 서열을 상기 논의된 EST 서열의 공급원을 이용해 가능한 긴 길이로 확장시켰다. 확장된 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA40642"라 지칭하였다. DNA40642 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1480의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: AGCCCGTGCAGAATCTGCTCCTGG (40642.f1, 서열 254)

역방향 PCR 프라이머: TGAAGCCAGGGCAGCGTCCTCTGG (40642.r1, 서열 255), GTACAGGCTGCAGTTGGC (40642.r2, 서열 256)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA40642 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: AGAAGCCATGTGAGCAAGTCCAGTTCCAGCCCAACACAGTG (40642.p1, 서열 257), GAGCTGCAGATCTTCTCATCGGGACAGCCCGTGCAGAATCTGCTC (40642.p2, 서열 258)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1480 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 신장 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1480의 DNA 서열 (본원에서 DNA67962-1649 [도 141, 서열 252]라 지칭함) 및 이로부터 유도된PRO1480의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1480의 전체 코딩 서열은 도 141 (서열 252)에 나타내었다. 클론 DNA67962-1649는 뉴클레오티드 위치 241 내지 243의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2752 내지 2754의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 837개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 142에 나타낸 전장 PRO1480 단백질의 추정 분자량은 약 92,750 달톤이고 pI는 약 7.04이다. PRO1480의 부가의 특징에는 약 아미노산 23 내지 46(Ⅱ형) 및 718 내지 738의 막횡단 도메인, 약 아미노산 69 내지 72, 96 내지 99, 165 내지 168, 410 내지 413, 525 내지 528 및 630 내지 633의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 12 내지 33의 루이신 지퍼 패턴이 있다.

도 142 (서열 253)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1480 아미노산 서열과 데이호프 서열 I48746 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1480 아미노산 서열과 데이호프 서열 S66498, P_W17658, MMU69535_1, HSU60800_1, I48745, A49069, I48747, GG U28240_1 및 AF022946_1 사이에 상동성이 있었다.

클론 DNA67962-1649를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203291호를 배정받았다.

실시예 75: 인간 PRO1487을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 기술을 이용하여, 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상인 단일 머크 EST, HSC2ID011 (본원에서 "DNA8208"이라 지칭됨)을 목적 EST로서 찾아내었다. BLAST 및 "phrap"(Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)을 반복 사용하여, DNA8208 서열을 상기 논의된 EST 서열의 공급원을 이용해 가능한 긴 길이로 확장시켰다. 결과의 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA68836"이라 지칭하였다. DNA68836 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1487의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: GTGCCACTACGGGGTGTGGACGAC (54209.f1, 서열 261) 및

역방향 PCR 프라이머: TCCCATTTCTTCCGTGGTGCCCAG (54209.r1, 서열 262)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA68836 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브: CCAGAAGAAGTCCTTCATGATGCTCAAGTACATGCACGACCACTAC (54209.p1, 서열 263)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1487 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 신장 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1487의 전장DNA 서열 (본원에서 DNA68836-1656 [도 143 A-B, 서열 259]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1487의 단백질 서열 (도 144, 서열 260)을 수득하였다.

PRO1487의 전체 코딩 서열은 도 143 A-B (서열 259)에 나타내었다. 클론 DNA68836-1656은 뉴클레오티드 위치 489 내지 491의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2895 내지 2897의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 802개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 144에 나타낸 전장 PRO1487 단백질의 추정 분자량은 약 91,812 달톤이고 pI는 약 9.52이다. 부가의 특징에는 약 아미노산 1 내지 23의 신호 펩티드, 약 아미노산 189 내지 192, 623 내지 626 및 796 내지 799의 잠재적인 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 62 내지 64의 세포 부착 서열이 있다.

도 144 (서열 260)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1487 아미노산 서열과 데이호프 서열 CET24D1_1, S44860, CELC02H6_1, CEC38H2_3, CELC17A2_5, CET09E11_10, CEE03H4_3, CELT22B11_3, GGU82088_1 및 CEF56H6_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

클론 DNA68836-1656을 1998년 11월 3일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203455호를 배정받았다.

실시예 76: 인간 PRO1418을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 1종 이상의 EST가 태반 조직 라이브러리로부터 유도되었다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA58845라 지칭하였다.

DNA58845 서열과 Incyte EST 클론 1306026 내에 포함된 EST 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 145에 나타내었고 본원에서 DNA68864-1629라 지칭하였다.

도 145에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 138 내지 140의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1188 내지 1190의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 145, 서열 264). 예상된 폴리펩티드 전구체는 서열 265의 약 아미노산 1 내지 19에 신호 펩티드가 있는 350개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 146, 서열 265). 전장 PRO1418 단백질의 추정 분자량은 약 39,003 달톤이고 pI는 약 5.59이다. 클론 DNA68864-1629를 1998년 9월 22일에ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203276호를 배정받았다.

도 146 (서열 265)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1418 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) AGA1_HAEIN (이뮤노글로불린 a1 프로테아제 전구체), P_W03740, CELT23E7_1, SSN6_YEAST, MMPININ_1, AB00993_1, P_R52601, S22624, A10377_1 및 MUA1_XENLA 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 77: 인간 PRO1472를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

Incyte EST 클론을 찾아내어 데이타베이스의 다른 단백질에 상동성이 있는지 조사하기 위해 컴퓨터에 입력하였다. 이 EST 데이타베이스는 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함한다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 EST 서열의 6 프레임 번역물에 대해 ECD 단백질 서열의 비교물로서 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다.

phrap을 반복 사용하여 다른 EST 서열에 대해 PRO1472를 코딩하는 컨센서스 DNA 서열을 조합하였다. 이 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA62824"라 지칭하였다. DNA62824 컨센서스 서열 및 본원에 제공된 다른 발견과 정보를 기초로 하여, 조합체에서 발견된 EST 1579843 (십이지장 조직 라이브러리로부터)을 포함하는 Incyte클론을 구입하여 그 전체를 서열 분석하였다.

서열 분석을 통하여 도 147 (서열 266)에 나타낸 바와 같은 전체 PRO1472 코딩 서열을 수득하였다. 클론 DNA68866-1644는 서열 266에서 뉴클레오티드 위치 134 내지 136의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1532 내지 1534의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 466개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 148에 나타낸 바와 같이, 신호 펩티드는 서열 267에서 약 아미노산 1 내지 17에 있고, 막횡단 도메인은 약 아미노산 131 내지 150 및 235 내지 259에 있다. 클론 DNA68866-1644를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203283호를 배정받았다. 도 148에 나타낸 전장 PRO1472 단백질의 추정 분자량은 약 52,279 달톤이고 pI는 약 6.16이다.

도 148 (서열 267)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1472 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) BUTY_HUMAN, HS45P21_1, HS45P21_3, HS45P21_5, HS45P21_4, HSU90142_1, HSU90546_1, AF033107_1, MMHC135G15_7 및 HSB73_1 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 78: 인간 PRO1461을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 제159103호라 지칭되며, 본원에서 "DNA10747"이라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, DNA10747 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 때 사용된 1종 이상의 EST가 췌장암 조직으로부터 제조된 라이브러리에서 유도되었다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA59553"이라 지칭하였다.

DNA59553 서열과 Incyte EST 클론 제2944541호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, 이 EST 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 149에 나타내었고 본원에서 DNA68871-1638이라 지칭하였다.

도 149에 나타낸 전장의 클론은 뉴클레오티드 위치 32 내지 34의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1301 내지 1303의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 149, 서열 268). 예상된 폴리펩티드 전구체는 423개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 150, 서열 269). PRO1461의 계산된 분자량은 약 47,696 달톤이고 추정 pI는 약 8.96이다. 부가의 특징으로는 약 아미노산 21 내지 40의 Ⅱ형 막횡단 도메인, 약 아미노산 359 내지 366의 ATP/GTP-결합 부위 모티프(P-루프), 약 아미노산 228 내지 약 아미노산 233의 트립신족 히스티딘활성 부위, 약 아미노산 179 내지 184, 213 내지 218, 317 내지 322 및 360 내지 365의 잠재적인 N-미리스토일화 부위, 및 약 아미노산 75 내지 78, 166 내지 169 및 223 내지 226의 잠재적인 N-글리코실화 부위가 있다.

도 150 (서열 269)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1461 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_R89435 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1461 아미노산 서열과 데이호프 서열 AB002134_1, P_R89430, P_W22987, HEPS_MOUSE, ENTK_HUMAN, P_W22986, KAL_MOUSE, ACRO_PIG, p_R57283 및 TRY7_ANOGA 사이에 상동성이 발견되었다.

클론 DNA68871-1638을 1998년 9월 22일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203280호를 배정받았다.

실시예 79: 인간 PRO1410을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 이용하여 Incyte 데이타베이스로부터 Incyte EST 클러스터 서열 제98502호라 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al., Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 검색을 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 조합하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56451이라 지칭하였다.

DNA56451 서열과 Incyte EST 클론 제1257046호 내에 포함된 EST 서열 사이에 관찰된 서열 상동성을 고려하여, Incyte EST 클론 1257046을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 151에 나타내었고 본원에서 DNA68874-1622라 지칭하였다.

클론 DNA68874-1622는 뉴클레오티드 위치 152 내지 154의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 866 내지 868의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 151). 예상된 폴리펩티드 전구체는 238개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다(도 152). 도 152에 나타낸 전장 PRO1410 단백질의 추정 분자량은 약 25,262 달톤이고 pI는 약 6.44이다. 도 152 (서열 271)에 나타낸 전장 PRO1410 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 20의 신호 펩티드, 약 아미노산 194 내지 약 아미노산 220의 막횡단 도메인, 및 약 아미노산 132 내지 약 아미노산 135의 잠재적인 N-글리코실화 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA68874-1622를 1998년 9월 22일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203277호를 배정받았다.

도 152 (서열 271)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1410 아미노산서열과 데이호프 서열 I48652, P_R76466, HSMHC3W36A_2, EPB4_HUMAN, P_R14256, EPA8_MOUSE, P_R77285, P_W13569, AF000560_1 및 ASF1_HELAN 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 80: 인간 PRO1568을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조합하였다. 본원에서 이 컨센서스 서열은 "DNA54208"이라 지칭되어 있다. DNA54208 컨센서스 서열, 조합체, 및 본원에 제공된 정보 및 발견을 기초로 하여, 조합체 내의 EST를 포함하는 클론을 주문하여 서열 분석하였다. 전체 서열 분석을 통하여 도 153에 나타낸 서열을 수득하였다.

PRO1568의 전체 코딩 서열은 도 153 (서열 272)에 나타내었다. 클론 DNA68880-1676은 서열 272에서 뉴클레오티드 위치 208 내지 210의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1123 내지 1125의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 305개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 또한, 신호 펩티드, 막횡단 영역, N-미리스토일화 부위 및 아미드화 부위가 도 154에 표시되어 있다. 클론 DNA68880-1676을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203319호를 배정받았다. 도 154에 나타낸 전장 PRO1568 단백질의 추정 분자량은 약 35,383 달톤이고 pI는 약 5.99이다.

도 154 (서열 273)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1568 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재된 데이타) AF089749_1, AF054841_1,NAG2_HUMAN, CD63_HUMAN, CD82_HUMAN, P_W05732, P_R86834, A15_HUMAN, P_W27333 및 CD37_HUMAN 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 81: 인간 PRO1570을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조합하였다. 본원에서 이 컨센서스 서열은 "DNA65415"라 지칭되어 있다. DNA65415 컨센서스 서열 및 본원에 제공된 정보와 발견을 기초로 하여, Incyte EST 3232285 (자궁/직장암 조직 라이브러리로부터)를 포함하는 클론을 구입하여 그 전체를 서열 분석함으로써 서열 274를 수득하였다.

PRO1570의 전체 코딩 서열은 도 153 (서열 274)에 나타내었다. 클론 DNA68885-1678은 서열 274에서 뉴클레오티드 위치 210 내지 212의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1506 내지 1508의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 432개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 275는 모티프의 수를 나타낸다. 클론 DNA68885-1678을 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203311호를 배정받았다. 도 156에 나타낸 전장 PRO1570 단백질의 추정 분자량은 약 47,644 달톤이고 pI는 약 5.18이다.

도 156 (서열 275)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1570 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에 기재됨) P_W22986, TMS2_HUMAN, HEPS_HUMAN, P_R89435, AB002134_1, KAL_MOUSE, ACRO_HUMAN, GEN12917, AF045649_1 및 P_W34285 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 82: 인간 PRO1317을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 phrap을 이용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "Consen8865"라 지칭되어 있다. 또한, BLAST 및 phrap을 반복 사용하여, Consen8865 컨센서스 서열을 상기 논의된 EST 서열의 공급원을 이용해 가능한 긴 길이로 확장시켰다. 확장된 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA63334"라 지칭하였다. DNA63334 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1317의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머CTGCTGGTGAAATCTGGCGTGGAG (63334.f1, 서열 278) 및

역방향 PCR 프라이머GTCTGGTCCTGGCTGTCCACCCAG (63334.r1, 서열 279)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA63334 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브CATCTTGTCATGTACCTGGGAACCACCACAGGGTCGCTCCACAAG (63334.p1, 서열 280)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1317 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 해마상 융기 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1317의 DNA 서열 (본원에서 DNA71166-1685 [도 157, 서열 276]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1317의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1317의 전체 코딩 서열은 도 157 (서열 276)에 나타내었다. 클론 DNA71166-1685는 뉴클레오티드 위치 105 내지 107의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2388 내지 2390의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 761개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖으며, 추정 분자량은 약 83,574 달톤이고 pI는 약 6.78이다.

도 158 (서열 277)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1317 아미노산 서열과 데이호프 서열 I48745 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한, PRO1317 아미노산 서열과 데이호프 서열 I48746, GEN13418, P_W58540, P_217657, MUSC1_1, P_471380, U73167_5, HSU33920_1 및 GG828240_1 사이에 상동성이 있었다.

클론 DNA71166-1685를 1998년 10월 20일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203355호를 배정받았다.

실시예 83: 인간 PRO1780을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 DNA63837.init 서열을 수득하고, BLAST 및 프로그램 "phrap" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)을 반복 사용하여, 이 서열을 상기 논의된 EST 서열의 공급원을 이용해가능한 긴 길이로 확장시켰다. 확장된 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA63837"이라 지칭하였다. DNA63837 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1780의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머TGCCTTTGCTCACCTACCCCAAGG (63837.f1, 서열 283)

역방향 PCR 프라이머TCAGGCTGGTCTCCAAAGAGAGGG (63837.r1, 서열 284)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA63837 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브CCCAAAGATGTCCACCTGGCTGCAAATGTGAAAATTGTGGACTGG (63837.p1, 서열 285)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍으로의 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1780 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 신장으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1780의 DNA 서열 (본원에서 DNA71169-1709 [도 159, 서열 281]이라 지칭함) 및 이로부터 유도된 PRO1780의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1780의 전체 코딩 서열은 도 159 (서열 281)에 나타내었다. 클론DNA71169-1709는 뉴클레오티드 위치 68 내지 70의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1637 내지 1639의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 523개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. 도 160에 나타낸 전장 PRO1780 단백질의 추정 분자량은 약 59,581 달톤이고 pI는 약 8.68이다. 부가의 특징에는 약 아미노산 1 내지 19의 신호 펩티드 서열, 약 아민노산 483 내지 504의 막횡단 도메인, 약 아미노산 68 내지 74 및 425 내지 433의 티로신 인산화 부위, 약 아미노산 16 내지 21, 301 내지 206, 370 내지 375 및 494 내지 499의 N-미리스토일화 부위, 및 약 아미노산 493 내지 514의 루이신 지퍼 패턴이 있다.

도 160 (서열 282)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타 베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1780 아미노산 서열과 데이호프 서열 UDA2_RABIT, CGT_HUMAN, UD11_HUMAN, P_R26153, UDB1_RAT, HSU59209_1, AB010872_1, UDB5_MOUSE, UDB8_HUMAN 및 UD14_HUMAN 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

클론 DNA71169-1709를 1998년 11월 17일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 제203467호를 배정받았다.

실시예 84: 인간 PRO1486을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프(phrap)를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA48897"로 지칭되어 있다. DNA48897 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1486의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머5'-AGGCAGCCACCAGCTCTGTGCTAC-3' (서열 288) 및

역방향 PCR 프라이머5'-CAGAGAGGGAAGATGAGGAAGCCAGAG-3' (서열 289)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA48897 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브

5'-CTGTGCTACTGCCCTTGGACCCTGGGGACCGAGTGTCTCTGC-3' (서열 290)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1486 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1486에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1486의 단백질 서열을 제공하였다.

PRO1486의 전체 코딩 서열은 도 161 (서열 286)에 나타나 있다. 클론 DNA71180-1655는 서열 286의 뉴클레오티드 위치 472 내지 474의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1087 내지 1089의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 205개 길이이다. 신호 펩티드는 서열 287의 약 아미노산 1 내지 32이다. C1q 및 N-글리코실라티오니 부위의 것들과 유사한 영역이 도 162에 지시된 바와 같이 위치한다. 클론 DNA71180-1655는 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203403을 배정받았다. 도 162에 나타낸 전장 PRO1486 단백질의 추정 분자량은 약 21,521 달톤이고 pI는 약 7.07이다.

도 162(서열 287)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1486 아미노산 서열과 데이호프 서열 CERB_HUMAN, CERL_RAT, GEN11893, P_R22263, CA18_HUMAN, C1QC_HUMAN, AF054891_1, A57131, HUMC1Qb_2, ACR3_MOUSE 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 85: 인간 PRO1433을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA45230으로 지칭되어 있다. DNA45230 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1433의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머 (45230.f1)5'-GCTGACCTGGTTCCCATCTACTCC-3' (서열 293) 및

역방향 PCR 프라이머 (45230.r1)5'-CCCACAGACACCCATGACACTTCC-3' (서열 294)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA45230 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브(45230.p1)

5'-AAGAATGAATTGTACAAAGCAGGTGATCTTCGAGGAGGGCTCCTGGGGCC-3' (서열 295)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1433 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간의 부신조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1433 (본원에서, DNA71184-1634라 지칭) [도 163, 서열 291]에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1433의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA71184-1634의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 163 (서열 291)에 나타나 있다. 클론 DNA71184-1634는 뉴클레오티드 위치 185 내지 187의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1349 내지 1351의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 163). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 388개 길이이다 (도 164). 도 164에 나타낸 전장 PRO1433 단백질의 추정 분자량은 약 43,831 달톤이고 pI는 약 9.64이다. 도 164에 나타낸 전장 PRO1433 서열 (서열 292)의 분석은 하기의 존재를 증명한다: 약 아미노산 76 내지 약 아미노산 97의 막횡단 도메인, 약 아미노산 60 내지 약 아미노산 63, 약 아미노산 173 내지 약 아미노산 176 및 약 아미노산 228 내지 약 아미노산 231의 가능한 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 10 내지 약 아미노산 15, 약 아미노산 41 내지 약 아미노산 46, 약 아미노산 84 내지 약 아미노산 89, 약 아미노산 120 내지 약 아미노산 125, 약 아미노산 169 내지 약 아미노산 174, 약 아미노산 229 내지 약 아미노산 234, 약 아미노산 240 내지 약 아미노산 245, 약 아미노산 318 내지 약 아미노산 323 및 약 아미노산 378 내지 약 아미노산 383의 가능한 N-미리스톨화 부위. 클론 DNA71184-1634를 1998년 9월 22일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203266을 배정받았다.

도 164(서열 292)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1433 아미노산 서열과 데이호프 서열 CELW01A11_4, CEF59A1_4, S67138, MTV050_3, S75135 및 S12411 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 86: 인간 PRO1490을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA67006으로 지칭되어 있다. DNA67006 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1490의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머(67006.f1)5'-CTTCCTCTGTGGGTGGACCATGTG-3' (서열 298) 및

역방향 PCR 프라이머(67006.r1)5'-GCCACCTCCATGCTAACGCGG-3' (서열 299)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA67006 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브(67006.p1)

5'-CCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTACGTGCCCCTCATCG-3' (서열 300)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1490 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간 부신피질 조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1490 (본원에서 DNA71213-1659라 지칭) [도 165, 서열 296]에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1490의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA71213-1659의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 165 (서열 296)에 나타나 있다. 클론 DNA71213-1659는 뉴클레오티드 위치 272 내지 274의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1376 내지 1378의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 165). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 368개 길이이다 (도 166). 도 166에 나타낸 전장 PRO1490 단백질의 추정 분자량은 약 42,550 달톤이고 pI는 약 9.11이다. 도 166에 나타낸 전장 PRO1490 서열 (서열 297)의 분석은 하기의 존재를 증명한다: 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 25의 신호 펩티드, 약 아미노산 307 내지 약 아미노산 323 및 약 아미노산 335 내지 약 아미노산 352의 막횡단 도메인, 약 아미노산 160 내지 약 아미노산 168 및 약 아미노산 161 내지 약 아미노산 168의 티로신 키나제 포스포릴화 부위. 클론 DNA71213-1659는 1998년 10월 27일자로 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203401을 배정받았다.

도 166(서열 297)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1490 아미노산 서열과 데이호프 서열 A52744_1, S60478, P_R59712, YBP2_YEAST, S54641, CELT05H4_15, CELF28B3_1, CELZK40_1 및 YIHG_ECOLI 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 87: 인간 PRO1482를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

효모 스크린에 의해, 주로 최초 cDNA 클론의 5' 말단을 나타내는 인간 부신 cDNA 라이브러리에서 네이티브 인간 PRO1482 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA71234-1651)을 확인하였다.

도 167에 나타낸 전장 DNA71234-1651 클론은 뉴클레오티드 위치 33 내지 35의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 462 내지 464의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 167). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 143개 길이이다 (도 168). 도 168에 나타낸 전장 PRO1482 단백질의 추정 분자량은 약 15,624 달톤이고 pI는 약 9.58이다. 도 168에 나타낸 전장 PRO1482 서열 (서열 302)의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 28의 신호 펩티드의 존재를 증명한다. 클론 DNA71234-1651은 1998년 10월 27일자로 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203402를 배정받았다.

도 168(서열 302)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1482 아미노산 서열과 데이호프 서열 A18267_3 의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 88: 인간 PRO1446을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 인사이트 데이타베이스 유래의 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56514로 지칭하였다.

DNA56514 컨센서스 서열과 인사이트 EST238044 내에 함유된 EST 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, EST를 포함하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 169에 나타내었고 본원에서 DNA71277-1636으로 지칭하였다.

도 169에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 152 내지 154의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 479 내지 481에서 발견되는 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 169; 서열 303). 예상된 폴리펩티드 전구체 (도 170, 서열 304)는 서열 304의 약 아미노산 1 내지 15에서 신호 펩티드를 갖는 109개의 아미노산으로 이루어진 길이를 갖는다. PRO1446의 추정 분자량은 약 11,822 달톤이고 pI는 약 8.63이다. 클론 DNA71277-1636은 1998년 9월 22일 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203285를 배정받았다.

도 170 (서열 304)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1446 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에서 인용된 데이타) P53_CANFA, P53_FELCA, LRP1_HSV1F, OSU57338_1, S75842, P_P93722, AF002189_1, B70408, S54309 및 S53365 사이의 서열 동일성을 보여주었다. 상기 목록에서 처음은 또한 문헌 (Kraegel, et al.,Cancer Lett., 92(2):181-186 (1995))에 기재되어 있다.

실시예 89: 인간 PRO1558을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 인사이트 EST 클러스터 서열 86390으로 지칭되는 인사이트 데이타베이스 유래의 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA58842로 지칭하였다.

DNA58842 서열과 인사이트 EST 클론 3746964 내에 함유된 EST 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, 인사이트 EST 3746964를 포함하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 171에 나타내었고 본원에서 DNA71282-1668로 지칭하였다.

클론 DNA71282-1668은 뉴클레오티드 위치 84 내지 86의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 870 내지 872에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 171). 예상된 폴리펩티드 전구체는 262개의 아미노산 길이를 갖는다. 도 172에 나타낸 전장 PRO1558 단백질의 추정 분자량은 약 28,809 달톤이고 pI는 약 8.80이다. 도 172에 나타낸 전장 PRO1558 서열 (서열 306)의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 25의 신호 펩티드, 약 아미노산 8 내지 약 아미노산 30 및 약 아미노산 109 내지 약 아미노산 130의 막횡단 도메인, 약 아미노산 190 내지 약 아미노산 193의 가능한 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 238 내지 약 아미노산 246의 티로신 키나제 포스포릴화 부위, 약 아미노산 22 내지 약 아미노산 27, 약 아미노산 28 내지 약 아미노산 33, 약 아미노산 110내지 약 아미노산 115, 약 아미노산 205 내지 약 아미노산 210 및 약 아미노산 255 내지 약 아미노산 260의 가능한 N-미리스톨화 부위, 및 약 아미노산 31 내지 약 아미노산 34 및 약 아미노산 39 내지 약 아미노산 42의 아미드화 부위의 존재를 증명한다. 클론 DNA71282-1668은 1998년 10월 6일 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203312를 배정받았다.

도 172 (서열 306)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1558 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF075724_2, MXU24657_3, CAMT_EUCGU, MSU20736_1, P_R29515, B70431, JC4004, CEY32B12A_3, CELF53B3_2 및 P_R13543 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 90: 인간 PRO1604를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

발현 서열 태그 (EST) DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 조사하였다. 인사이트 EST 3550440을 HDGF와 상동성을 갖는 것으로 확인하였다. 이어서, 상동성이 있는 EST 서열을 확인하기 위해, 이 EST 3550440을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스를 포함하는 다양한 EST 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 정리하여 컨센서스 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA67237"로 지칭하였다.

DNA67237 서열과 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스의 EST 3367060 서열 간의 서열 상동성을 고려하여, 인사이트 EST 3367060을 포함하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하여, 도 173에 나타낸 전체 코딩 서열 PRO1604 (서열 307)을 수득하였다.

클론 DNA71286-1687은 뉴클레오티드 위치 65 내지 67의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 2078 내지 2080의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 함유한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 671개의 아미노산 길이를 갖는다. 도 174에 나타낸 전장 PRO1604 단백질의 추정 분자량은 약 74,137 달톤이고 pI는 약 7.62이다. 또한 약 아미노산 1 내지 13의 신호 펩티드; 약 아미노산 156 내지 159, 171 내지 174 및 451 내지 454의 가능한 cAMP- 및 cGMP-의존 단백질 키나제 포스포릴화 부위; 약 아미노산 46 내지 51, 365 내지 370 및 367 내지 372의 가능한 N-미리스토일화 부위; 및 약 아미노산 661 내지 663의 세포 부착 서열을 포함하는 특징이 있다.

도 174 (서열 308)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1604 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_W37483 사이의 상동성을 보여주었다. 또한 PRO1604 아미노산 서열과 AF063020_1, P_R66727, P_W37482, JC5661, CEC25A1_11, CEU33058_1, I38073, MST2_DROHY 및 HSATRX36_1 사이의 상동성을 보여주었다.

클론 DNA71286-1687은 1998년 10월 20일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203357을 배정받았다.

실시예 91: 인간 PRO1491을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA67202로 지칭되어 있다. DNA67202 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1491의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머 (67202.f1)5'-CAACGCAGCCGTGATAAACAAGTGG-3' (서열 311)

역방향 PCR 프라이머 (67202.r1)5'-GCTTGGACATGTACCAGGCCGTGG-3' (서열 312)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA67202 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브 (67202.p1)

5'-GGCCAGACTGATTTGCTCAATTCCTGGAAGTGATGGGGCAGATAC-3' (서열 313)

cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간 낭형 내피 세포 조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1491(이하, DNA71883-1660이라 지칭) [도 175, 서열 309]에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1491의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA71883-1660의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 175 (서열 309)에 나타나 있다. 클론 DNA71883-1660은 뉴클레오티드 위치 107 내지 109의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 2438 내지 2440의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 175). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 777개 길이이다 (도 176). 도 176에 나타낸 전장 PRO1491 단백질의 추정 분자량은 약 89,651 달톤이고 pI는 약 7.97이다. 도 176에 나타낸 전장 PRO1491 서열 (서열 310)의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 36의 신호 펩티드, 약 아미노산 139 내지 약 아미노산 142, 약 아미노산 607 내지 약 아미노산 610 및 약 아미노산 724 내지 약 아미노산 727의 가능한 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 571 내지 약 아미노산 576의 티로신 키나제 포스포릴화 부위, 및 약 아미노산 32 내지 약 아미노산 37의 그램 양성 구균 표면 단백실 앵커 헥사펩티드 서열의 존재를 증명한다. 클론 DNA71883-1660은 1998년 11월 17일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203475를 배정받았다.

도 176(서열 310)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1491 아미노산 서열과 데이호프 서열 GGU28240_1, MUSC1_1, D49423, MMSEMH_1, AB002329_1, AF022947_1, HSU33920_1, HUMLUCA19_1, G01856 및 AF022946_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 92: 인간 PRO1431을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

발현 서열 태그(EST) DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), IncytePharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 조사하고, SH3과 상동성을 나타내는 EST (성인 뇌간 조직으로부터 단리)를 확인하였다 (1370141, DNA66505). cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간 척수로부터 단리하였다. 단리된 EST에 상응하는 전장 cDNA를 pRK5에서 생체 내 클로닝 기법(DNA73401-1633)을 사용하여 단리하였다.

인간 PRO1431을 코딩하는 cDNA 클론을 단리하기 위해 사용된 cDNA 라이브러리는 시판 시약, 예를 들어 인비트로젠(Invitrogen, San Diego, CA)사에서 구입한 시약을 사용한 표준 방법에 의해 제조하였다. NotI 부위를 포함하는 올리고 dT를 사용하여 cDNA를 프라이밍하고, 블런트로 SalI 헤미키나제화 어댑터와 연결하고, NotI으로 절단하여 겔 전기영동에 의해 적절한 크기로 분류하고 정해진 방향으로 적합한 클로닝 벡터 (예를 들어, pRKB 또는 pRKD; pRK5B는 SfiI 부위를 포함하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌 (Holmes et al.,Science,253:1278-1280 (1991))을 참조)내의 유일한 XhoI 및 NotI 부위에 클로닝하였다.

cDNA 클론을 전체적으로 서열 분석하였다. DNA73401-1633의 전체 뉴클레오티드 서열 (서열 314)은 도 177에 나타낸다. 클론 DNA73401-1633은 약 뉴클레오티드 위치 630 내지 632의 분명한 번역 개시 부위 및 약 뉴클레오티드 위치 1740 내지 1742의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. DNA73401-1633으로 코딩되는 예상 폴리펩티드 전구체는 370개의 아미노산 길이이다. 클론 DNA73401 (DNA73402-1633으로 지칭)은 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203273을 배정받았다.

(ALIGN 컴퓨터 프로그램을 사용한) 전장 서열의 서열 정렬 분석에 따르면,PRO1431은 SH17_HUMAN, SH3P17로서 공지된 단백질을 함유하는 SH3과 상당한 아미노산 서열 동일성을 나타내었다. 또한 D89164_1, AF0432118_1, EXLP_TOBAC, YHR4_YEAST, S46992, RATP130CAS_2, AF03259_1, RATP130CAS_1 및 MYSC_ACACA과의 상당한 동일성 스코어가 관찰되었다.

실시예 93: 인간 PRO1563을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA67191로 지칭되어 있다. DNA67191 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1563의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머 (67191.f1)5'-CCCTGAAGCTGCCAGATGGCTCC-3' (서열 318)

역방향 PCR 프라이머 (67191.r1)5'-CTGTGCTCTTCGGTGCAGCCAGTC-3' (서열 319)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA67191 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브 (67191.p1)

5'-CCACAGATGTGGTACTGCCTGGGGCAGTCAGCTTGCGCTACAG-3' (서열 320)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1563 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간 골수 조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1563 (본원에서 DNA73492-1671라 지칭)[도 179A-B, 서열 316]에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1563의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA73492-1671의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 179A-B (서열 316)에 나타나 있다. 클론 DNA73492-1671은 뉴클레오티드 위치 419 내지 421의 분명한 번역 개시 부위를 갖고, 뉴클레오티드 위치 2930 내지 2932의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 179A-B). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 837개 길이이다 (도 180). 도 180에 나타낸 전장 PRO1563 단백질의 추정 분자량은 약 90,167 달톤이고 pI는 약 8.39이다. 도 180에 나타낸 전장 PRO1563 서열 (서열 317)의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 48의 신호 펩티드, 약 아미노산 68 내지 약 아미노산 71의 가능한 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 188 내지 약 아미노산 191 및 약 아미노산 772 내지 약 아미노산 775의 글리코스아미노글리칸 부착 부위, 약 아미노산 182 내지 약 아미노산 185의 cAMP- 및 cGMP-의존 단백질 키나제 포스포릴화 부위, 약 아미노산 730 내지 약 아미노산 736의 티로신 키나제 포스포릴화 부위, 약 아미노산 5 내지 약 아미노산 10, 약 아미노산 19 내지 약 아미노산 24, 약 아미노산 121 내지 약 아미노산 126, 약 아미노산 125 내지 약 아미노산 130, 약 아미노산 130 내지 약 아미노산 135, 약 아미노산 147 내지 약 아미노산 152, 약 아미노산 167 내지 약 아미노산 172, 약 아미노산 168 내지 약 아미노산173, 약 아미노산 174 내지 약 아미노산 179, 약 아미노산 323 내지 약 아미노산 328, 약 아미노산 352 내지 약 아미노산 357, 약 아미노산 539 내지 약 아미노산 544, 약 아미노산 555 내지 약 아미노산 560, 약 아미노산 577 내지 약 아미노산 582, 약 아미노산 679 내지 약 아미노산 684, 약 아미노산 682 내지 약 아미노산 687 및 약 아미노산 763 내지 약 아미노산 768의 가능한 N-미리스톨화 부위, 약 아미노산 560 내지 약 아미노산 563 및 약 아미노산 834 내지 약 아미노산 837의 아미드화 부위, 약 아미노산 17 내지 약 아미노산 38 및 약 아미노산 24 내지 약 아미노산 45의 로이신 지퍼 패턴 서열, 및 약 아미노산 358 내지 약 아미노산 367의 중성 아연 메탈로펩티다제, 아연 결합 영역 서명 서열의 존재를 증명한다. 클론 DNA73492-1671은 1998년 10월 6일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203324를 배정받았다.

도 180(서열 317)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1563 아미노산 서열과 데이호프 서열 AB014588_1, D67076_1, AB001735_1, P_W47028, AB002364_1, P_W47029, GEN13695, P_R40823, AF005665_1 및 DISA_TRIGA 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 94: 인간 PRO1565를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA67183으로 지칭되어 있다. DNA67183 컨센서스 서열 및 인사이트 EST 클론 2510320 내에 함유된EST 서열 간에 관찰된 상동성을 기초로, 인사이트 EST 클론 2510320을 구입하고, 그 삽입물을 관찰하고 서열 분석하였다. 상기 삽입 서열을 도 181에 나타내고, 본원에서 DNA73727-1673 (서열 321)이라 지칭한다.

DNA73727-1673의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 181 (서열 321)에 나타나 있다. 클론 DNA73727-1673는 뉴클레오티드 위치 56 내지 61의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1010 내지 1012의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 181). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 317개 길이이다 (도 182). 도 182에 나타낸 전장 PRO1565 단백질의 추정 분자량은 약 37,130 달톤이고 pI는 약 5.18이다. 도 182에 나타낸 전장 PRO1565 서열 (서열 322)의 분석은 하기의 존재를 증명한다: 약 1 아미노산 내지 약 40 아미노산의 신호 펩티드, 약 아미노산 25 내지 약 아미노산 47의 가능한 Ⅱ 막횡단 도메인, 약 아미노산 94 내지 약 아미노산 97 및 약 아미노산 180 내지 약 아미노산 183의 가능한 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 92 내지 약 아미노산 95, 약 아미노산 70 내지 약 아미노산 73, 약 아미노산 85 내지 약 아미노산 88, 약 아미노산 133 내지 약 아미노산 136, 약 아미노산 148 내지 약 아미노산 151, 약 아미노산 192 내지 약 아미노산 195 및 약 아미노산 239 내지 약 아미노산 242의 글리코스아미노글리칸 부착 부위, 약 아미노산 33 내지 약 아미노산 38, 약 아미노산 95 내지 약 아미노산 100, 약 아미노산 116 내지 약 아미노산 121, 약 아미노산 215 내지 약 아미노산 220 및 약 아미노산 272 내지 약 아미노산 277의 가능한 N-미리스톨화 부위, 약 아미노산 315 내지 약 아미노산 317의 미생물 C-말단 목적 신호 서열, 및 약 아미노산 9 내지 약 아미노산 14의 사이토크롬 C족 헤미-결합 부위 서명 서열. 클론 DNA73727-1673을 1998년 11월 3일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203459를 배정받았다.

도 182(서열 322)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1565 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF051425_1, P_R65490, P_R65488, GRPE_STAAU, RNU31330_1, ACCD_BRANA, D50558_1, HUMAMYAB3_1, P_W34452 및 P_P50629 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 95: 인간 PRO1571을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA69559로 지칭되어 있다. DNA69559 컨센서스 서열 및 인사이트 EST 클론 3140760 내에 함유된 EST 서열 간에 관찰된 상동성을 기초로, 인사이트 EST 클론 3140760을 구입하고, cDNA 삽입체를 관찰하고 서열 분석하였다. 상기 cDNA 삽입 서열을 도 183에 나타내고, 본원에서 DNA73730-1679라 지칭한다.

클론 DNA73730-1679는 뉴클레오티드 위치 90 내지 92의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 807 내지 809의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 183). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 239개 길이이다 (도 184). 도 184에 나타낸 전장 PRO1571 단백질의 추정 분자량은 약 25,699 달톤이고 pI는 약 8.99이다. 도 184에 나타낸 전장 PRO1571 서열 (서열324)의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 21의 신호 펩티드, 및 약 아미노산 82 내지 약 아미노산 103, 약 아미노산 115 내지 약 아미노산 141 및 약 아미노산 160 내지 약 아미노산 182의 막횡단 도메인의 존재를 입증한다. 클론 DNA73730-1679를 1998년 10월 6일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203320을 배정받았다.

도 184(서열 324)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1571 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF072128_1, AB000712_1, AB000714_1, AF007189_1, AF000959_1, AF068863_1, P_W15288, PM22_HUMAN, P_R30056 및 LSU46824_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 96: 인간 PRO1572를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 컨센서스 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA69560"이라 지칭한다. DNA69560 컨센서스 서열 및 본원에서 제공된 기타 정보를 기초로, 제조된 다른 EST를 함유하는 클론 (인사이트 DNA3051424)를 구입하고 서열 분석하였다.

PRO1573의 전체 코딩 서열은 도 185 (서열 325)에 포함된다. 클론 DNA73734-1680은 뉴클레오티드 위치 90 내지 92의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 873 내지 875의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 261개 길이이다. 신호 펩티드는 서열 326의 약 아미노산 1 내지 23이며, 막횡단 도메인은 약 아미노산 81 내지 100, 121 내지 141 및 173 내지 194이다. 하나 이상의 막횡단 도메인이 삭제 또는불활성화될 수 있다. N-글리코실화 부위, N-미리스토일화 부위, 티로신 키나제 포스포릴화 부위 및 원핵막 리포단백질 지질 부착 부위의 위치를 도 186에 나타낸다. 클론 DNA73734-1680은 ATCC에 기탁되었으며 ATCC 기탁 번호 203363을 배정받았다. 도 186에 나타낸 전장 PRO1572 단백질의 추정 분자량은 약 27,856 달톤이고 pI는 약 8.5이다.

도 186(서열 326)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1572 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에서 인용된) AF072127_1, HSU89916_1, AB0000713_1, AB000714_1, AB000712_1, AF00059_1, AF072128_1, AF068863_1, P_W29881 및 P_W58869 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 97: 인간 PRO1573을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

EST 3628990을 인사이트 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)에서 확인하고, 데이타베이스에서 기타 서열과 비교하여 어셈블리를 형성하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 EST 서열의 6 프레임 번역에 대한 ECD 단백질 서열의 비교로서 정렬 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA69561"로 지칭하였다.

DNA69561 컨센서스 서열과 본원에서 제공된 기타 정보를 고려하여, 어셈블리로부터 다른 EST를 포함하는 클론 (인사이트 DNA3752657)을 포함하는 클론을 구입하고, 서열 분석하였다. 이 클론은 유방종양 조직 라이브러리로부터 유래하였다.

PRO1573의 전체 코딩 서열은 도 187 (서열 327)에 포함된다. 클론 DNA73735-1681은 뉴클레오티드 위치 97 내지 99의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 772 내지 774의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 225개의 아미노산 길이를 갖는다. 신호 펩티드는 서열 328의 약 아미노산 1 내지 17이며, 막횡단 도메인은 약 아미노산 82 내지 101, 118 내지 145 및 164 내지 188이다. 하나 이상의 박횡단 도메인이 삭제 또는 불활성화될 수 있다. 포스포릴화 부위, 아미드화 부위 및 N-미리스토일화 부위는 도 188에 나타낸다. 클론 DNA73735-1681은 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203356을 배정받았다. 도 188에 나타낸 전장 PRO1573 단백질의 추정 분자량은 약 24,845 달톤이며, pI는 약 9.07이다.

도 188 (서열 328)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1573 아미노산 서열과 데이호프 서열 (본원에서 인용된) AF007189_1, AB000714_1, AB000713_1, AB000712_1, A39484, AF000959_1, AF072127_, AF072128_1, AF068863_1 및 AF077739_1 사이에 서열 동일성을 나타냈다.

실시예 98: 인간 PRO1488을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

발현 서열 태그 (EST) DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), IncytePharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 조사하고, EST 3639112H1 을 CPE-R과 상동성을 갖는 것으로 확인하였다. EST 3699112H1을 본원에서 "DNA69562"라 지칭한다. 파타우 증후로 사망한 20-주 태아의 폐 조직 라이브러리로부터 유도된 EST 클론 3639112H1을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하고 전체적으로 서열 분석하였다. PRO1488의 전체 뉴클레오티드 서열을 도 189에 나타내며 (서열 329), 본원에서 DNA73736-1657로 지칭한다. DNA73736-1657은 뉴클레오티드 위치 6 내지 8의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 666 내지 668의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 함유한다 (도 189; 서열 329). 예상 폴리펩티드 전구체는 220개의 아미노산 길이를 갖는다.

도 190에 나타낸 전장 PRO1488 단백질의 추정 분자량은 약 23,292 달톤이며 pI는 약 8.43이다. 4개의 막횡단 도메인이 약 아미노산 위치 8 내지 30, 82 내지 102, 121 내지 140 및 166 내지 186에서 확인되었다.

도 190 (서열 330)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1488 아미노산 서열과 데이호프 서열 AB000712_1 사이에 상당한 상동성을 나타냈다. 또한, 데이호프 서열 AB000714_1, AF007189_1, AF000959_1, P_W63697, MMU82758_1, AF072127_1, AF072128_1, HSU89916_1, AF068863_1, CEAF000418_1 및 AF077739_1 과 PRO1488 아미노산 서열 사이에서도 상동성이 또한 발견되었다.

클론 DNA73736-1657은 1998년 11월 17일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203466을 배정받았다.

실시예 99: 인간 PRO1489를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA69563으로 지칭한다. DNA69563 컨센서스 서열 및 인사이트 EST 클론 3376608 내에 함유된 EST 서열 간에 관측된 서열 유사성을 기초로 하여, 인사이트 EST 클론 3376608을 구입하고, 그 삽입체를 수득하고 서열 분석하였다. 삽입체를 본원에서 DNA73737-1658이라 지칭한다.

DNA73737-1658의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 191 (서열 331)에 나타낸다. 클론 DNA73737-1658은 뉴클레오티드 위치 264 내지 266의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 783 내지 785의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 함유한다 (도 191). 예상 폴리펩티드 전구체는 173개의 아미노산 길이를 갖는다 (도 192). 도 192에 나타낸 전장 PRO1489 단백질의 추정 분자량은 약 18,938 달톤이며, pI는 약 9.99이다. 도 192에 나타낸 전장 PRO1489 서열 (서열 332)는 약 아미노산 31 내지 51, 약 아미노산 71 내지 90 및 약 아미노산 112 내지 133의 막횡단 도메인, 및 약 아미노산 161 내지 약 아미노산 164의 가능한 N-글리코실화 부위의 존재를 증명한다. 클론 DNA73737-1658은 1998년 10월 27일 ATCC에 기탁하였으며 ATCC 기탁 번호 203412를 배정받았다.

도 192 (서열 332)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1489 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF007189_1, AB000712_1, AF000959_1, MMU82758_1,AF035814_1, AF072127_1, AF072128_1, HSU89916_1, AF068863_1 및 PPU50051_1 사이에 상당한 상동성을 입증하였다.

실시예 100: 인간 PRO1474를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

발현 서열 태그 (EST) DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 조사하고, EST를 확인하였다. 이 EST는 췌장분비 트립신 억제제와 상동성을 나타냈다.

이 EST를 포함하는 클론을 인사이트로부터 구입하고 (자궁목 조직 라이브러리 유래) PRO1474를 코딩하는 서열 333의 핵산을 나타내도록 전체적으로 서열 분석하였다.

PRO1474의 전체 뉴클레오티드 서열 (서열 333)을 도 193에 나타낸다. 클론 DNA73739-1645는 뉴클레오티드 위치 45 내지 47의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 300 내지 302의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 함유한다 (도 193; 서열 333). 예상 폴리펩티드 전구체는 85개의 아미노산 길이를 갖는다. 도 194에서 나타내는 바와 같이, 카잘(Kazal) 세린 프로타제 억제제 족 서명은 서열 334의 약 아미노산 45에서 시작한다. 또한 도 194에서 나타내는 바와 같이 (서열 334의 약 아미노산 32에서 시작하는) 인테그린 α-쇄에 보존된 영역이다. 클론 DNA73739-1645는 ATCC에 기탁하였으며 ATCC 기탁 번호 203270을 배정받았다. 도 194에 나타낸 전장 PRO1474 단백질의 추정 분자량은 약 9,232 달톤이며 pI는 약 7.94이다.

도 194 (서열 334)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1474 아미노산 서열과 데이호프 서열 (모든 오보뮤코이드, 본원에서 인용된 데이타) IOVO_FRAER, IOVO_FRAAF, IOVO_FRACO, IOVO_CYRMO, IOVO_STRCA, H61492, C61589, IOVO_POLPL, D61589 및 IOVO_TURME 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 101: 인간 PRO1508을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 인사이트 클러스터 34523으로 지칭되며, 본원에서 "DNA10047"이라고도 하는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 및 독점 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA55723"로 지칭하였다.

DNA55723 컨센서스 서열과 인사이트 EST2989064 내에 함유된 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 2989064를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 전체적으로 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 195에 나타내었고 본원에서 "DNA73742-1662"로 지칭하였다.

도 195에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 70 내지 72의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 514 내지 516에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 195; 서열 335). 예상된 폴리펩티드 전구체 (도 196, 서열 335)는 148개의 아미노산 길이를 갖는다. PRO1508 단백질의 또다른 특징에는 약 아미노산 1 내지 30의 신호 서열; 약 아미노산 96 내지 103의 티로신 키나제 포스포릴화 모티브; 및 약 아미노산 27 내지 32, 28 내지 33 및 140 내지 145의 N-미리스톨화 모티브가 있다. PRO1508의 추정 분자량은 약 17,183 달톤이고 추정 pI는 약 8.77이다. 클론 DNA73742-1662는 1998년 10월 6일 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203316을 배정받았다.

도 196 (서열 336)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1508 아미노산 서열과 데이호프 서열 HSAJ3728_1; P_R74962; P_R74941; AF053074_1; F69515; S20706; RPB1_PLAFD; A20587_1; A51861_1; 및 S75947 사이의 일부 상동성을 보여주었다.

실시예 102: 인간 PRO1555를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 (LIFESEQ(등록상표) 로부터 EST 클러스터 521로 지칭되며, 본원에서 "DNA10316"이라고도 하는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA56374"로 지칭하였다.

DNA56374 컨센서스 서열과 인사이트 EST 2855769 내에 함유된 EST 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, EST 2855769를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. EST 2855769는 여성 유방 지방 조직으로부터 제조된 라이브러리로부터 유래하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 197에 나타내었고 본원에서 DNA73744-1665로 지칭하였다.

도 197에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 90 내지 92의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 828 내지 830에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 197, 서열 337). 예상된 폴리펩티드 전구체 (도 198, 서열 338)는 246개의 아미노산 길이를 갖는다. PRO1555의 추정 분자량은 약 26,261 달톤이고 추정 pI는 약 5.65이다. 또다른 특징에는 약 아미노산 1 내지 31의 신호 펩티드, 약 아미노산 11 내지 31 및 195 내지 217의 막횡단 도메인; 약 아미노산 111 내지 114의 가능한 N-글리코실화 부위; 약 아미노산 2 내지 5, 98 내지 101 및 191 내지 194의 가능한 카제인 키나제 Ⅱ 포스포릴화 부위; 및 약 아미노산 146 내지 151 및 192 내지 197의 가능한 N-미리스토일화 부위가 있다.

도 198 (서열 338)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1555 아미노산 서열과 데이호프 서열 YKA4_CAEEL, AB014541_1, HVSX99518_2, SSU63019_1, GEN14286, MMU68267_1, XP2_XENLA, ICP4_HSV11, P_W40200 및 AE001360 사이의 일부 상동성을 보여주었다.

클론 DNA73744-1665는 1998년 10월 6일 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203322를 배정받았다.

실시예 103: 인간 PRO1485를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA44791"로 지칭되어 있다. DNA44791 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1485의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (2개 전방향 및 2개 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머 15'-CCCTCCAAGGATGACAAAGGCGC-3' (서열 341)

전방향 PCR 프라이머 25'-GGTCAGCAGCTTTCTTGCCCTAAATCAGG-3' (서열 342)

역방향 PCR 프라이머 15'-ATCTCAGGCGGCATCCTGTCAGCC-3' (서열 343) 및

역방향 PCR 프라이머 25'-GTGGATGCCTGCAAGAAGGTTGGG-3' (서열 344)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA44791 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브

5'-AGCTTTCTTGCCCTAAATCAGGCCAGCCTCATCAGTCGCTGTGAC-3' (서열 345)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1485 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제작용 RNA를 인간 고환으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1485에 대한 전장 DNA 서열 (본원에서, DNA73746-1654라 지칭) [도 199, 서열 339] 및 이로부터 유도된 PRO1485의 단백질 서열을 제공하였다.

PRO1485의 전체 코딩 서열은 도 199 (서열 339)에 나타나 있다. 클론 DNA73746-1654는 서열 339의 뉴클레오티드 위치 151 내지 153의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 595 내지 597의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 148개 길이이다. 신호 펩티드는 서열 340의 약 1 내지 18의 아미노산이다. 리소자임 C 서명인 CAAX box 및 N-글리코실화 부위는 도 200에 나타나 있다. 클론 DNA73746-1654는 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203411을 배정받았다. 도 200에 나타낸 전장 PRO1485 단백질의 추정 분자량은 약 16,896 달톤이고 추정 pI는 약 6.05이다.

도 200(서열 340)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1485 아미노산 서열과 데이호프 서열 LYC_PHACO, P_R76684, 2HFL_Y, JC2144, JC5544, JC5555, JC5369, LYC2_PIG, P_R12113 및 JC5380 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 104: 인간 PRO1564를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA67213으로 지칭되어 있다. DNA67213 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1564의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머 (67213.f1)5'-GGAGAGGTGGTGGCCATGGACAG-3' (서열 348) 및

역방향 PCR 프라이머 (67213.r1)5'-CTGTCACTGCAAGGAGCCAACACC-3' (서열 349)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA67213 서열로부터 제조하였다

혼성화 프로브(67213.p1)

5'-TATGTCGCTGCGAGGTGAAAACCTCGAACTGTCTTTCAAGGC-3' (서열 350)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1564 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간의 유방암 조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1564 (본원에서, DNA73760-1672라 지칭) [도 201, 서열 346]에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1564의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA73760-1672의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 201 (서열 346)에 나타나 있다. 클론 DNA73760-1672는 뉴클레오티드 위치 462 내지 464의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 2379 내지 2381의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 201). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 639개 길이이다 (도 202). 도 202에 나타낸 전장 PRO1564 단백질의 추정 분자량은 약 73,063 달톤이고 pI는 약 6.84이다. 도 202에 나타낸 전장 PRO1564 서열 (서열 347)의 분석은 하기의 존재를 증명한다: 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 28의 신호 펩티드, 약 아미노산 11 내지 약 아미노산 36의 막횡단 도메인, 약 아미노산 107 내지 약 아미노산 110 및 약 아미노산 574 내지 약 아미노산 577의 가능한 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 50 내지 약 아미노산 57의 티로신 키나제 포스포릴화 부위, 약 아미노산 158 내지 약 아미노산 163, 약 아미노산 236 내지 약 아미노산 241, 약 아미노산 262 내지 약 아미노산 267, 약 아미노산 270 내지 약 아미노산 275, 약 아미노산 380 내지 약 아미노산 385 및 약 아미노산 513 내지 약 아미노산 518의 가능한 N-미리스톨화 부위, 약 아미노산 110 내지 약 아미노산 113의 아미드화 부위, 및 약 아미노산 15 내지 약 아미노산 25의 원핵막 리포단백질 지질 부착 부위. 클론 DNA73760-1672를 1998년 10월 6일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203314를 배정받았다.

도 202(서열 347)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1564 아미노산 서열과 데이호프 서열 MMU73819_1, HSY08564_1, P_W34470, P_R66402, PAGT_HUMAN, CEGLY5B_1, CEGLY6A_1, CEGLY6B_1, AP000006_308 및 E69322 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 105: 인간 PRO1755를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 본원에서 DNA141872라고 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 상기한 데이타베이스로부터의 각종 EST 와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)으로 정리하여 컨센서스 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 DNA 서열을 본원에서 "DNA55731"로 지칭하였다.

DNA55731 서열과 인사이트 EST 257323 내에 함유된 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, EST 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 인사이트 클론 257323은 hNT2 세포주 (Stratagene 라이브러리 STR9372310)로부터 분리된 RNA를 사용하여 제조된 라이브러리로부터 유도되며, 초기 전개 단계에서 위임된 신경원 전구체의 특성을 나타내는 인간 기형암으로부터 유도된다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 203에 나타내었고 본원에서 "DNA76396-1698"로 지칭하였다. 또다른 방법으로, DNA76396-1698 서열은 올리고뉴클레오티드 프로브 및 프라이머를 제조하고, 적절한 라이브러리 (예, STR9372310)로부터 서열을 단리함으로써 수득할 수 있다.

도 203에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 58 내지 60의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 886 내지 888에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 203; 서열 351). 예상된 폴리펩티드 전구체 (도 204, 서열 352)는 276개의 아미노산 길이를 갖는다. PRO1577의 추정 분자량은 약 29,426 달톤이며, 추정 pI는 약 9.40이다. 또다른 특징에는 약 아미노산 1 내지 31의 신호 펩티드 서열; 약 아미노산 178 내지 198의 막횡단 도메인; 악 아미노산 210 내지 213의 cAMP 및 cGMP-의존 단백질 키나제 포스포릴화 부위; 약 아미노산 117 내지 122, 154 내지 149 및 214 내지 219의 가능한 N-미리스토일화 부위; 및 약 아미노산 149 내지 151의 세포 부착 서열이 있다.

도 204 (서열 352)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1755 아미노산 서열과 데이호프 서열 APG-BRANA, P_R37743, NAU88587_1, YHL1_EBV, P_W31855, CET10B10_4, AF39404_1, PRP1_HUMAN, AF038575_1 및 AF053091_1 사이의 일부 상동성을 보여주었다.

클론 DNA76396-1698은 1998년 11월 17일 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203471을 배정받았다.

실시예 106: 인간 PRO1757을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 인사이트 데이타베이스로부터 본원에서 인사이트 EST 클론 2007947, 2014962 및 1912034로 지칭되는 3개의 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 이들 EST 서열을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 여기서 수득된 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56054로 지칭한다.

DNA56054 컨센서스 서열과 인사이트 EST 클론 2007947 내에 함유된 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, 인사이트 EST 클론 2007947을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 205에 나타내었고 본원에서 DNA76398-1699로 지칭하였다.

클론 DNA76398-1699는 뉴클레오티드 위치 59 내지 61의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 422 내지 424에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 205). 예상된 폴리펩티드 전구체는 121개의 아미노산 길이를 갖는다 (도 206). 도 206에 나타낸 PRO1757의 추정 분자량은 약 12,073이고, pI는 약 4.11이다. 도 206에 나타낸 전장 PRO1757 서열 (서열 354)의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 19의 신호 펩티드, 약 아미노산 91 내지 약 아미노산 110의 막횡단 도메인, 약 아미노산 44 내지 약 아미노산 47의 글리코스아미노글리칸 부착 부위, 약 아미노산 116 내지 약 아미노산 119의 cAMP- 및 cGMP-의존 단백질 키나제 포스포릴화 부위, 및 약 아미노산 91 내지 약 아미노산 96의 가능한 N-미리스톨화 부위의 존재를 증명한다. 클론 DNA76398-1699는 1998년 11월 17일 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203474를 배정받았다.

도 206 (서열 354)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1757 아미노산 서열과 데이호프 서열 JQ0964, COLL_HSVS7, HSU70136_1, AF003473_1, D89728_1, MTF1_MOUSE, AF029777_1, HSU88153_1 및 P_W05321 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 107: 인간 PRO1758을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 인사이트 클러스터 20926으로 지칭되는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을 상기한 데이타베이스로부터의 다양한 발현된 서열 태그(EST)와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56260으로 지칭하였다.

DNA56260 서열과 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스 유래의 EST 2936330 내에 함유된 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, 아니세팔루스(anecephalus)로 사망한 태아의 흉선 조직으로부터 제조된 라이브러리 기원의 EST 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 207에 나타내었고 본원에서 DNA76399-1700으로 지칭하였다.

도 207에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 78 내지 80의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 549 내지 551에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 207; 서열 355). 예상된 폴리펩티드 전구체 (도 208, 서열 356)는 157개의 아미노산 길이를 갖는다. PRO1578의 추정 분자량은 약 17,681 달톤이며, 추정 pI는 약 7.65이다. 또다른 특징에는 약 아미노산 1 내지 15의 신호 펩티드; 약 아미노산 24 내지 27의 가능한 N-글리코실화 부위; 약 아미노산 27 내지 30의 cAMP- 및 cGMP-의존 단백질 키나제 포스포릴화 부위; 약 아미노산 60 내지 63의 카제인 키나제 Ⅱ 포스포릴화 부위; 약 아미노산 17 내지 22, 50 내지 55, 129 내지 134 및 133 내지 138의 가능한 N-미리스토일화 부위; 약 아미노산 153 내지 155의 세포 부착 서열; 및 약 아미노산 18 내지 23의 사이토크롬 c족 헤미 결합 부위 서명이 있다.

도 208 (서열 356)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1758 아미노산 서열과 데이호프 서열 AC005328_2 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한 PRO1758 아미노산 서열과 데이호프 서열 CELC46F2_1에서도 상동성이 발견되었다.

클론 DNA76399-1700은 1998년 11월 17일 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203472를 배정받았다.

실시예 108: 인간 PRO1575를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA35699"로 지칭되어 있다. DNA35699 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1575의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머CCAGCAGTGCCCATACTCCATAGC (35699.f1; 서열 359); TGACGAGTGGGATACACTGC (35699.f2; 서열 360)

역방향 PCR 프라이머GCTCTACGGAAACTTCTGCTGTGG (35699.r1; 서열 361)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA35699 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브

ATTCCCAGGCGTGTCATTTGGGATCAGCACTGATTCTGAGGTTCTGACAC (35699.p1; 서열 362)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1575 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 제작용 RNA를 인간 췌장 조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1575에 대한 전장 DNA 서열 (본원에서, DNA76041-1683이라 지칭) [도 209, 서열 357] 및 이로부터 유도된 PRO1575의 단백질 서열을 제공하였다.

PRO1575의 전체 코딩 서열은 도 209 (서열 357)에 나타나 있다. 클론 DNA76401-1683은 뉴클레오티드 위치 22 내지 24의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 841 내지 843의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 273개 길이이다. 도 210에 나타낸 전장 PRO1575 단백질의 추정 분자량은 약 30,480 달톤이며, pI는 약 4.60이다. 또한 약 아미노산 1 내지 20의 신호 펩티드; 약 아미노산 143 내지 162의 막횡단 도메인; 약 아미노산 100 내지 103의 가능한 N-글리코실화 부위; 및 약 아미노산 84 내지 89, 103 내지 108, 154 내지 159 및 201 내지 206의 가능한 N-미리스토일화 부위의 특징을 갖는다.

도 210(서열 358)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1575 아미노산 서열과 데이호프 서열 A12005_1 사이의 상당한 상동성을 나타내었다. 또한 PRO1575 아미노산 서열과 추가의 데이호프 서열 P_P80615; P_R25297; P_R51696; A47300; PDI_DROME; P_R49829; P_R63807; DMALPADAP_1 및 DRZNF6_1 사이에도 상동성이 나타났다.

클론 DNA76401-1683은 1998년 10월 20일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호203360을 배정받았다.

실시예 109: 인간 PRO1787을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 "DNA45213"으로 지칭되어 있다. DNA45213 컨센서스 및 어셈블리 내에서 확인된 인사이트 EST 3618549 의 상동성, 및 본원에서 제공된 기타 발견 및 정보를 기초로, 이 EST를 함유하는 클론을 구입하고, 서열 분석하였다. 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1787에 대한 전장 DNA 서열 및 PRO1787에 대해 유도된 단백질 서열을 제공하였다.

PRO1787의 전체 코딩 서열은 도 211 (서열 363)에 나타나 있다. 클론 DNA76510-2504는 서열 363의 뉴클레오티드 위치 163 내지 165의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 970 내지 972의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 신호 펩티드, 막횡단 도메인, N-글리코실화 부위, N-미리스토일화 부위 및 키나제 포스포릴화 부위는 도 212에 나타나 있다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 269개 길이이다. 클론 DNA76510-2504는 ATCC에 기탁하였으며 ATCC 기탁 번호 203477을 배정받았다. 도 212에 나타낸 전장 PRO1787 단백질의 추정 분자량은 약 29,082 달톤이고 pI는 약 9.02이다.

도 212(서열 364)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1787 아미노산 서열과 데이호프 서열 MYP0_RAT, MYP0_HUMAN, MUP0_BOVIN, GEN12838, HSSCN2B2_1, AF007783_1, HSU90716_1, P_W42015, XLU43330_1 및 AF060231_1 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 110: 인간 PRO1781을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

효모 스크리닝을 사용하여 초기 cDNA 클론의 5' 말단을 우세하게 나타내는 인간 SK-Lu-1 선암종 세포주 cDNA 라이브러리에서, 본원에서 DNA58070 및 DNA56340으로 지칭되는 초기 DNA 서열을 확인하였다. 이들 서열을 수집하고 컴퓨터 프로그램 "프라프" (Phill Green, University of Washington, 워싱톤주 시애틀)을 사용하여 컨센서스 DNA 서열을 제조하였다. 이 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA59575"라 지칭한다.

DNA59575 컨센서스 서열에 기초하여, 인간 태아 폐 cDNA 라이브러리로부터 PRO1781에 대한 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 하기 올리고뉴클레오티드를 합성하였다: TGGAAAAGAAGTCTGGTCAGAAGGTTTAGG (서열 367), CATTTGGCTTCATTCTCCTGCTCTG (서열 368), AAAACCTCAGAACAACTCATTTTGCACC (서열 369) 및 GTCTCACCATGGTTGCTCTTGCCAAATTGTGGGAAGCAGGG (서열 370).

도 213에 나타낸 전장 DNA76522-2500 클론은 뉴클레오티드 위치 21 내지 23의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1141 내지 1143의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 213; 서열 365). 예상된 폴리펩티드 전구체는 373개의 아미노산 길이를 갖는다 (도 214; 서열 366). PRO1781의 추정 분자량은 약 41,221 달톤이고 추정 pI는 약 8.54이다. 또한 약 아미노산 1 내지 19의 가능한 신호 펩티드, 약 아미노산 39 내지 60의 막횡단 도메인; 약 아미노산 228 내지 236의 티로신 포스포릴화 부위; 약 아미노산 16 내지 21, 17 내지22, 43 내지 48, 45 내지 50, 47 내지 52, 49 내지 54, 53 내지 58, 58 내지 63, 59 내지 64, 62 내지 67, 126 내지 131 및 142 내지 147의 가능한 N-미리스토일화 부위; 약 아미노산 22 내지 25 및 280 내지 283의 아미드화 부위; 및 약 아미노산 12 내지 22의 원핵막 리포단백질 지질 부착 부위의 특징을 갖는다.

도 214에 나타낸 전장 서열 (서열 366)의 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)를 사용한 서열 분석은 PRO1781 아미노산 서열과 데이호프 서열 CEY4510D_5, AP000001_146, P_R10676, DAC_STRSQ, CEC40H5_5, P_R35204, KPU58495_1, KPN16781_1, AF010403_1 및 AF056116_14 사이의 일부 상동성을 보여주었다.

클론 DNA76522-2500은 1998년 11월 17일 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203469를 배정받았다.

실시예 111: 인간 PRO1556을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여, LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 본원에서 EST 클러스터 103158로 지칭되며, 또한 "DNA10398"이라고도 하는 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 및 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA56417로 지칭하였다.

DNA56417 서열과 인사이트 EST 959332 내에 함유된 서열의 서열 상동성을 고려하여, EST 959332를 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 215에 나타내었고 본원에서 DNA76529-1666으로 지칭하였다.

도 215에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 85 내지 87의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 892 내지 894에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 215; 서열 371). 예상된 폴리펩티드 전구체는 269개의 아미노산 길이를 갖는다(도 216; 서열 372). PRO1556의 추정 분자량은 약 28,004 달톤이고 추정 pI는 약 5.80이다. 또한, 약 아미노산 1 내지 24의 신호 펩티드 서열; 약 아미노산 11 내지 25 및 226 내지 243의 막횡단 도메인; 약 아미노산 182 내지 185의 가능한 N-글리코실화 부위; 약 아미노산 70 내지 73의 가능한 cAMP- 및 cGMP-의존 단백질 키나제 포스포릴화 부위; 및 약 아미노산 29 내지 34, 35 내지 39, 117 내지 122, 121 내지 126, 125 내지 130, 154 내지 159, 166 내지 171, 241 내지 246, 246 내지 251, 247 내지 252, 249 내지 254, 250 내지 255, 251 내지 256, 252 내지 257, 253 내지 258, 254 내지 259, 255 내지 260, 256 내지 261, 257 내지 262 및 259 내지 264의 가능한 N-미리스토일화 부위의 특징을 갖는다.

도 216 (서열 372)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1556 아미노산 서열과 데이호프 서열 T8F5_4, R23B_MOUSE, CANS_HUMAN, P_W41640, DSU51091_1, TP2B_CHICK, DVU20660_1, S43296, P_R23962 및 BRN1_HUMAN 사이의 일부 상동성을 보여주었다.

클론 DNA76529-1666은 1998년 10월 6일 ATCC에 기탁하여, ATCC 기탁 번호 203315를 배정받았다.

실시예 112: 인간 PRO1759를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 본원에서 DNA10571로 지칭된, 인사이트 데이타베이스 유래의 EST 클러스터 서열을 확인할 수 있었다. 그 후에, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 이 EST 클러스터 서열을, 공용 EST 데이타베이스 (예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 다양한 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA57313으로 지칭하였다.

DNA57313 컨센서스 서열과 인사이트 EST 2434255 사이의 서열 상동성을 고려하여, 이 EST를 포함하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 217에 나타내었고 본원에서 DNA76531-1701로 지칭하였다.

도 217에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 125 내지 127의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1475 내지 1477에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 217; 서열 373). 신호 펩티드 및 막횡단 도메인의 대략적인 위치는 도 218에 나타내는 한편, N-미리스토일화 부위, 지질 부착 부위, 아미드화 부위 및 키나제 포스포릴화 부위의 위치는 도 218에 나타나 있다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 450개의 아미노산 길이를 갖는다(도 218, 서열 374). PRO1759의 추정 분자량은 약 49,765 달톤이고 추정 pI는 약 8.14이다. 클론 DNA76531-1701을 1998년 11월 17일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203465를 배정받았다.

도 218 (서열 374)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1759 아미노산 서열과 데이호프 서열 OPDE_PSEAE, TH11_TRYBB, S67684, RGT2_YEAST, S68362, ATSUGTRPR_1, P_W17836 (특허출원 WO9715668-A2호), F69587, A48076 및 A45611 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 113: 인간 PRO1760을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 3에 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 인사이트 데이타베이스로부터 인사이트 EST 서열을 확인할 수 있었다. 이어서, 존재하는 상동성을 확인하기 위하여, 이 EST 클러스터 서열을 공용 EST 데이타베이스 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 발현 서열 태그 (EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 DNA58798로 지칭하였다.

DNA58798 서열과 인사이트 EST 3358745 사이의 서열 상동성을 고려하여, 이 EST를 포함하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 219에 나타내었고, DNA76532-1702로 지칭한다.

도 219에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 60 내지 62의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 624 내지 626에서 발견된 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 219, 서열 375). 예상된 폴리펩티드 전구체는 188개의 아미노산 길이를 갖는다(도 220, 서열 376). 모티브는 추가로 도 220에 나타낸다. PRO1760의 추정 분자량은 약 21,042 달톤이고 추정 pI는 약 5.36이다. 클론 DNA76532-1702는 1998년 11월 17일자로 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203473을 배정받았다.

도 220에 나타낸 전장 서열 (서열 376)의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35) 분석은 PRO1760 아미노산 서열과 데이호프 서열 CELT07F12_2, T22J18_16, ATF1C12_3, APE3_YEAST, P_W22471, SAU56098_1, SCPA_STRPY, ATAC00423817, SAPURCLUS_2 및 AF041468_9 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 114: 인간 PRO1561을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대해, 컨센서스 DNA 서열을 수득하고, 상기 실시예 1에 논의된 EST 서열을 사용하여 가능한 한 멀리 걸쳐있는 프라프 및 BLAST 주기를 반복하였다. 이 컨센서스 서열을 본원에서는 DNA40630이라 지칭한다. 이 DNA40630 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1561의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (40630.f1): 5'-CTGCCTCCACTGCTCTGTGCTGGG-3' (서열 379)

역방향 PCR 프라이머 (40630.r1): 5'-CAGAGCAGTGGATGTTCCCCTGGG-3' (서열 380)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 컨센서스 DNA40630 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (40630.p1)

5'-CTGAACAAGATGGTCAAGCAAGTGACTGGGAAAATGGCCCATCCTC-3' (서열 381)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1561 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간 유방 종양 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1561의 전장 DNA 서열(본원에서 DNA76538-1670로 지칭함) [도 221, 서열 377] 및 이로부터 유도된 PRO1561의 단백질 서열을 수득하였다.

DNA76538-1670의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 221 (서열 377)에 도시하였다. 클론 DNA76538-1670은 뉴클레오티드 위치 29 내지 31의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 377 내지 379의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 221). 예상된 폴리펩티드 전구체는 116개의 아미노산 길이를 갖는다 (도 222). 도 222에 나타낸 전장 PRO1561 단백질의 추정 분자량은 약 12,910 달톤이고 pI는 약 6.41이다. 도 222 (서열 378)에 나타낸 전장 PRO1561 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 17의 신호 펩티드, 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 24의 막횡단 도메인, 약 아미노산 86 내지 약 아미노산 89의 가능한 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 20 내지 약 아미노산 25 및 약 아미노산 45 내지 약 아미노산 50의 가능한 N-미리스톨화 부위, 및 약 아미노산 63 내지 약 아미노산 70의 포스포리파제 A2 히스티딘 활성 부위의 존재를 보여준다. 클론 DNA76538-1670을 1998년 10월 6일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203313을 배정받았다.

도 222(서열 378)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1561 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_R63053, P_R25416, P_R63055, P_P93363, P_R63046, PA2A_VIPAA, P_W58476, GEN13747, PA2X_HUMAN 및 PA2A_CRODU 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

상기 외에, 서열 상동성 조사는 DNA40630 컨센서스 서열 및 인사이트 EST 클론 1921092 사이에 상당한 상동성을 입증하였다. 이에 따라, 인사이트 EST 클론 1921092를 구입하고, 삽입체를 수득하고 서열 분석함으로써 도 221에 나타낸 DNA76538-1670 서열 (서열 377)을 수득하였다.

실시예 115: 인간 PRO1567을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

실시예 2에 기재된 아밀라제 스크리닝으로 분리된 cDNA 서열을 본원에서 DNA47580이라 지칭한다. DNA47580 서열은 이어서, 존재하는 상동성을 확인하기 위해, 공용 EST 데이타베이스(에컨대, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하는 발현 서열 태그 (EST) 데이타베이스와 비교하였다. 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 상동성 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상 (일부 경우에 90)인 비교물을 수집하여 프로그램 "프라프" (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)로 정리하여 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이와 같이 얻어진 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA57246"으로 지칭하였다.

DNA57246 서열과 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스 유래의 EST 1793996 사이의 서열 상동성을 고려하여, 전립선종 조직으로부터 제조된 라이브러리 기원의 EST 1793996을 함유하는 클론을 구입하고, cDNA 삽입체를 수득하여 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 223 (서열 382)에 나타내었고, 본원에서 DNA76541-1675로 지칭한다.

전장 클론은 뉴클레오티드 위치 109 내지 111의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 643 내지 645의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 223, 서열 382). 예상된 폴리펩티드 전구체는 178개의 아미노산 길이를 가지며, 추정 분자량은 약 19,600 달톤이고 추정 pI는 약 5.89이다. 또다른 특징은 약 아미노산 1 내지 22의 신호 펩티드; 약 아미노산 167 내지 170의 가능한 N-글리코실화 부위; 약 아미노산 107 내지 약 아미노산 109의 단백질 키나제 C 포스포릴화 부위; 및 약 아미노산 46 내지 51, 72 내지 77 및 120 내지 125의 가능한 N-미리스토일화 부위에 있다.

데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)를 사용한, 도 224에 나타낸 전장 서열 (서열 383)의 분석은 PRO1567 아미노산 서열과 데이호프 서열 "P_W06549"로 지칭된 인간 장 특이 유전자 CSG6 폴리펩티드 사이의 상당한 상동성을 보여주었다. 또한 PRO1567 아미노산 서열과 추가의 데이호프 서열 HUAC002301_1, P_246880, A49685, SPBP_RAT, S42924, SPBP_MOUSE, I52115, MMU03711_1 및 AF041468_31 사이에도 상동성이 발견되었다.

클론 DNA76541-1675는 1998년 10월 27일자로 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203409를 배정받았다.

실시예 116: 인간 PRO1693을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA38251로 지칭되어 있다. DNA38251 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1693의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머 (38251.f1)5'-CTGGGATCTGAACAGTTTCGGGGC-3' (서열 386) 및

역방향 PCR 프라이머 (38251.r1)5'-GGTCCCCAGGACATGGTCTGTCCC-3' (서열 387)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA38251 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브 (38251.p1)

5'-GCTGAGTTTACAGGTCTAACTCCCTGAGAACCATCCCTGTGCG-3' (서열 388)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1693 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조를 위한 RNA를 인간 태아 신장 조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1693에 대한 전장DNA 서열 (본원에서 DNA77301-1708이라 지칭)[도 225, 서열 384] 및 이로부터 유도된 PRO1693의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA77301-1708의 전체 코딩 서열은 도 225 (서열 384)에 나타나 있다. 클론 DNA77301-1708은 뉴클레오티드 위치 508 내지 510의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 2047 내지 2049의 분명한 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 225). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 513개 길이이다 (도 226). 도 226에 나타낸 전장 PRO1693 단백질의 추정 분자량은 약 58,266 달톤이고 pI는 약 9.84이다. 도 226에 나타낸 전장 PRO1693 서열 (서열 385)은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 33의 신호 펩티드, 약 아미노산 420 내지 약 아미노산 442의 막횡단 도메인, 약 아미노산 126 내지 약 아미노산 129, 약 아미노산 357 내지 약 아미노산 360, 약 아미노산 496 내지 약 아미노산 499 및 약 아미노산 504 내지 약 아미노산 507의 가능한 N-글리코실화 부위, 약 아미노산 465 내지 약 아미노산 468의 cAMP- 및 cGMP-의존 단백질 키나제 포스포릴화 부위, 약 아미노산 136 내지 약 아미노산 142의 티로신 키나제 포스포릴화 부위, 및 약 아미노산 11 내지 약 아미노산 16, 약 아미노산 33 내지 약 아미노산 38, 약 아미노산 245 내지 약 아미노산 250, 약 아미노산 332 내지 약 아미노산 337, 약 아미노산 497 내지 약 아미노산 502 및 약 아미노산 507 내지 약 아미노산 512의 가능한 N-미리스톨화 부위의 존재를 증명한다. 클론 DNA77301-1708은 1998년 10월 27일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁번호 203407을 배정받았다.

도 226(서열 385)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1693 아미노산 서열과 데이호프 서열 AB007876_1, ALS_MOUSE, HSCHON03_1, P_R85889, AF062006_1, AB014462_1, A58532, MUSLRRPA_1, AB007865_1 및 AF030435_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 117: 인간 PRO1784를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 2에 기재된 아밀라제 스크리닝으로 단리된 cDNA 서열을 본원에서 DNA43862라 지칭한다. DNA43862 서열을 기초로 하여, 올리고뉴클레오티드 프로브를 생성하고, 상기 단락 1에서 기재된 바와 같이 제조된 인간 태아 신장 라이브러리를 스크리닝하는데 사용하였다. 클론 벡터는 pRK5B (pRK5는 SfiI 부위를 함유하지 않는 pRK5D의 전구체이다; Holmes et al.,Science,253: 1278-1280 (1991) 참고)였으며, cDNA 크기를 2800 bp 미만으로 절단하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머 (f1): 5'-CTTTTCAGTGTCACCTCAGCGATCTC-3' (서열 391) 및

역방향 PCR 프라이머 (r1): 5'-CCAAAACATGGAGCAGGAACAGG-3' (서열 392)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 DNA43862 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브 (p1)

5'-CCAGTTGGTGCTCTCGGACCTACCATGCGAAGATGAAATGTGTG-3' (서열 393)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1784 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다.

전장 클론은 뉴클레오티드 위치 68 내지 70의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 506 내지 508의 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 227, 서열 389). 예상된 폴리펩티드 전구체는 146개의 아미노산 길이를 가지며, 추정 분자량은 약 16,116 달톤이며 추정 pI는 약 4.99이다. 신호 펩티드, 막횡단 도메인 및 N-미리스토일화 부위의 대략적인 위치는 도 228에 나타나 있다. 클론 DNA77303-2502를 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203479를 배정받았다.

도 228(서열 390)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1784 아미노산 서열과 데이호프 서열 RNU87224_1, RNAF000114_1, P_W31947, S18038, AE001300_8, AF039833_1, P_W39833_1, P_W39788, HSU87223_1, NTU06712_1 및 P_W31946 사이의 서열 동일성을 보여주었다.

실시예 118: 인간 PRO1605를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

최초 cDNA 클론의 5' 말단을 우세하게 나타내는 인간 태아 신장 cDNA 라이브러리에서 효모 스크리닝에 의해 천연 인간 PRO1605 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 클론 (DNA77648-1688)을 확인하였다.

도 229에 나타낸 전장 DNA77648-1688 클론은 뉴클레오티드 위치 425 내지 427의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 845 내지 847의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 229). 예상된 폴리펩티드 전구체는 140개의 아미노산 길이를 갖는다 (도 230). 도 230에 나타낸 전장 PRO1605 단백질의 추정 분자량은 약 15,668 달톤이고 pI는 약 10.14이다. 도 230 (서열 395)에 나타낸 전장 PRO1605 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 26의 신호 펩티드의 존재를 보여주었다. 클론 DNA77648-1688을 1998년 10월 27일에 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203408을 배정받았다.

도 230에 나타낸 전장 서열 (서열 395)의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1605 아미노산 서열과 데이호프 서열 GNT5_HUMAN, P_R48975, P_W22519, MM26SPROT_1, HSU86782_1, CH60_LEPIN, HMCT_HELPY, F65126, HIU08875_1 및 P_R41724 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 119: 인간 PRO1788을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

Swiss Prot 공용 데이타베이스로부터 약 950개의 공지된 분비 단백질로부터 (분비 신호 서열 존재시, 이를 포함하는) 세포외 도메인 (ECD) 서열을 EST 데이타베이스 조사에 사용하였다. 이 EST 데이타베이스는 공용 EST 데이타베이스(예를 들어, 젠뱅크) 및 독점 EST DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 포함하였다. EST 서열의 6 프레임 번역과 ECD 단백질 서열의 비교로서 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))를 사용하여 조사를 수행하였다. 공지의 단백질을 코딩하지 않는, BLAST 스코어가 70 이상인 목적 서열로서 인사이트 클론 2968304를 확인하였다. 인사이트 클론 2968304의 뉴클레오티드 서열을 본원에서 "DNA6612"라 지칭한다.

또한, DNA6612 서열은 BLAST의 반복 주기 및 프라프 (Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington)를 사용하여, 상기 논의된 EST 서열 공급원을 사용할 수 있는 한 신장시켰다. 신장된 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA49648"이라 지칭한다. DNA49648 컨센서스 서열을 기초로, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1788의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: CCCTGCCAGCCGAGAGCTTCACC (49648.f1; 서열 398)

역방향 PCR 프라이머: GGTTGGTGCCCGAAAGGTCCAGC (49648.r1; 서열 399)

추가로, 다음 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 컨센서스 DNA49648 서열로부터 제조하였다.

혼성화 프로브

CAACCCCAAGCTTAACTGGGCAGGAGCTGAGGTGTTTTCAGGCC (49648.p1; 서열 400)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1788 유전자를 코딩하는 클론을 단리하기 위해 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA는 인간 태아 신장 조직으로부터 단리하였다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1788의 전장 DNA 서열 (본원에서 DNA77652-2505로 지칭) [도 231, 서열 396] 및 이로부터 유도된 PRO1788의 단백질 서열을 수득하였다.

PRO1788의 전체 코딩 서열은 도 231 (서열 396)에 도시하였다. 클론 DNA77652-2505는 뉴클레오티드 위치 64 내지 66의 분명한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 1123 내지 1125의 분명한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 353개의 아미노산 길이를 갖는다. 도 232에 나타낸 전장 PRO1788 단백질의 추정 분자량은 약 37,847 달톤이며, pI는 약 6.80이다. PRO1788은 또한, 약 아미노산 1 내지 16의 신호 펩티드; 약 아미노산 215 내지 232 및 287 내지 304의 막횡단 도메인; 약 아미노산 74 내지 77 및 137 내지 140의 가능한 N-글리코실화 부위; 약 아미노산 45 내지 48의 글리코스아미노글리칸 부착 부위; 약 아미노산 318 내지 325의 티로신 키나제 포스포릴화 부위; 약 아미노산 13 내지 18, 32 내지 37, 88 내지 93, 214 내지 219 및 223 내지 228의 N-미리스토일화 부위; 및 약 아미노산 284 내지 305의 로이신 지퍼 패턴의 특징을 갖는다.

도 232(서열 397)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1788 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF030435_1; AF062006_1; DMTARTAN_1; GARP_HUMAN; S42799; P_R71294; HSU88879_1; DROWHEELER_1; A58532; 및 AF068920_1 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

클론 DNA77652-2505를 1998년 11월 17일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203480을 배정받았다.

실시예 120: 인간 PRO1801을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

독점 발현 서열 태그 (EST) DNA 데이타베이스 (LIFESEQ(등록상표), Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)를 조사하여, EST가 IL-19 단백질과 상동성을 나타냄을 확인하였다. 이 EST 서열은 인사이트 EST 클론 819592이며, 본원에서 DNA79293으로 지칭된다. 이 DNA79293 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1801의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머: 5'-CTCCTGTGGTCTCCAGATTTCAGGCCTA-3' (서열 403),

역방향 PCR 프라이머: 5'-AGTCCTCCTTAAGATTCTGATGTCAA-3' (서열 404).

cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간 태아 신장 조직으로부터 단리하였다. cDNA 클론을 단리시키기 위해 사용된 cDNA 라이브러리는 인비트로젠(Invitrogen, 캘리포니아주 샌디에고)으로부터의 시약들과 같은 시판 시약을 사용하여 표준 방법으로 제작하였다. cDNA를 NotI 부위를 갖는 올리고 dT로 프라이밍시키고, SalI 헤미키나제화 어댑터에 평활 말단으로 연결시키고, NotI로 절단하고, 겔 전기영동에 의해 적절하게 크기 분류하고, 적당한 클로닝 벡터 (예를 들면, pRKB 또는 pRKD; pRK5B는 SfiI 부위를 포함하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌[Holmes et al.,Science,253: 1278-1280 (1991)] 참조)에 유일한 XhoI 및 NotI 부위에서 정해진방향으로 클로닝시켰다.

상기한 바와 같이 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 PRO1801의 전장 DNA 서열 (본원에서 DNA83500-1506으로 지칭함)[도 233, 서열 401] 및 이로부터 유도된 PRO1801의 단백질 서열을 수득하였다.

DNA83500-2506의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 233 (서열 401)에 도시하였다. 클론 DNA83500-2506은 뉴클레오티드 위치 109 내지 111의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 892 내지 894의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 예상된 폴리펩티드 전구체는 261개의 아미노산 길이를 갖는다 (도 234). 도 234에 나타낸 전장 PRO1801 단백질의 추정 분자량은 약 29,667 달톤이며 pI는 약 8.76이다. 도 234에 나타낸 전장 PRO1801 서열 (서열 402)의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 42의 신호 펩티드, 약 아미노산 192 내지 약 아미노산 195 및 약 아미노산 225 내지 약 아미노산 228의 cAMP- 및 cGMP-의존 단백질 키나제 포스포릴화 부위, 및 약 아미노산 42 내지 약 아미노산 47, 약 아미노산 46 내지 약 아미노산 51 및 약 아미노산 136 내지 약 아미노산 141의 가능한 N-미리스톨화 부위의 존재를 보여주었다. 클론 DNA83500-2506은 1998년 10월 29일 ATCC에 기탁하여 ATCC 기탁 번호 203391을 배정받았다.

도 234 (서열 402)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35) 분석은 PRO1801 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_W37935, HGS_B477, P_R32277, IL10_MACFA, P_W46585, P_R39714, P_R71471, P_R10159, IL10_RAT 및 P_W57201 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 121:인간 UCP4를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

공용 EST 데이타베이스 (예, 젠뱅크) 및 독점 EST 데이타베이스 (LIFESEQ™ (Incyte Pharmaceuticals, 캘리포니아주 팔로 알토))를 포함하는 EST 데이타베이스를 인간 UCP3에 대해 상동성을 갖는 서열에 대해 조사하였다. EST 서열의 6 프레임 번역에 대한 UCP3 단백질 서열의 비교로서 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2 [Altschul et al.,Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)]를 이용하여 수행하였다. 공지된 단백질을 코딩하지 않는 70 (또는 일부 경우 90) 이상의 블라스트(Blast) 스코어를 갖는 비교물을 클러스터시키고, 프로그램 AssemblLIGN 및 MacVector (Oxford Molecular Group, Inc.)를 사용하여 컨센서스 DNA 서열로 조립하였다.

AssemblLIGN 소프트웨어를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 DNA 서열 ("기원DNA")를 제조하였다. 또한, 상기 논의된 EST 서열의 공급원을 사용할 수 있는 한 멀리 서열을 신장시키기 위해 BLAST 및 AssemblLIGN의 반복 주기를 사용하여 기원DNA 서열을 신장시켰다. 이 DNA 서열을 기초로, 올리고뉴클레오티드를 합성하여 PCR에 의한 UCP4에 대한 전장 코딩 서열의 클론을 단리하였다. 전방향 및 역방향 PCR 프라이머는 일반적으로 20 내지 30의 뉴클레오티드 범위이며, 약 100 내지 1000 bp 길이의 PCR 생성물을 수득하도록 종종 고안된다. 프로브 서열은 전형적으로 40 내지 55 bp 길이이다. 일부 경우에, 컨센서스 서열이 약 1 내지 1.5 kbp보다 크면 추가 올리고뉴클레오티드가 합성된다.

PCR 프라이머(전방향 및 역방향)를 합성하였다.

전방향 PCR 프라이머CGCGGATCCCGTTATCGTCTTGCGCTACTGC (서열 407)

역방향 PCR 프라이머GCGGAATTCTTAAAATGGACTGACTCCACTCATC (서열 408)

cDNA 라이브러리 제작을 위한 RNA를 인간 뇌 조직으로부터 단리하였다. cDNA 클론을 단리시키기 위한 cDNA 라이브러리는 인비트로겐 (Invitrogen, 캘리포니아주 샌디에고)으로부터의 시약들과 같은 시판 시약을 사용하여 표준 방법으로 제작하였다. cDNA를 NotI 부위를 갖는 올리고 dT로 프라이밍시키고, SalI 헤미키나징된(hemikinased) 어댑터(adaptor)에 평활 말단으로 연결시키고, NotI로 절단하고, 겔 전기영동에 의해 적절하게 크기 분류하고, 적당한 클로닝 벡터 (예를 들면, pRKB 또는 pRKD; pRK5B는 SfiI 부위를 포함하지 않는 pRK5D의 전구체임; 문헌[홀름스(Holmes) 등,Science,253: 1278-1280 (1991) 참조] 내로 특이 XhoI 및 NotI 부위에서 규정 방향으로 클로닝시켰다.

상기한 바와 같이 PCR에 대해 단리한 클론의 DNA 서열 분석을 통하여 UCP4 [DNA77568-1626으로 지칭] (도 235; 서열 405)의 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 UCP4에 대한 단백질 서열을 수득하였다.

UCP4의 전체 코딩 서열을 도 235 (서열 405)에 도시하였다. 클론 DNA77568-1626은 뉴클레오티드 위치 27 내지 29의 명백한 번역 개시 부위 및 뉴클레오티드 위치 996 내지 998의 명백한 정지 코돈을 갖는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 235; 서열 405). 예상된 폴리펩티드 전구체는 323개의 아미노산 길이를 갖는다. UCP4는 막-결합 단백질이며, 6 이상의 막횡단 영역을 갖는 것으로 최근 믿어진다. UCP4 아미노산 서열 내의 이들 추정 막횡단 영역은 도 236에 예시한다. pcDNA3 벡터 (인비트로겐) 내에 함유된 클론 DNA77568-1626을 ATCC에 가탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203134를 배정받았다. UCP4 폴리펩티드는 기탁된 ATCC 203134 벡터의 cDNA 삽입체에 의해 코딩된 분자를 발현함으로써 수득되거나 수득가능하다. BamHI 및 EcoRI 제한 효소를 갖는 벡터의 분해는 약 972 외에 34bp 삽입체를 수득한다. 도 236에 나타낸 전장 UCP4 단백질의 추정 분자량은 약 36,061 달톤이며, pI는 약 9.28이다.

실시예 122: 인간 PRO193을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO193의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

한 쌍의 PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머5'-GTTTGAGGAAGCTGGGATAC-3' (서열 411) 및

역방향 PCR 프라이머5'-CCAAACTCGAGCACCTGTTC-3' (서열 412)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브

5'-ATGGCAGGCTTCCTAGATAATTTTCGTTGGCCAGAATGTG-3' (서열 413)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO193 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간의 부신조직 (LIB94)으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO193 (본원에서, DNA23322-1393이라 지칭) (서열 409)에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO193의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA23322-1393의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 237에 나타나 있다 (서열 409). 클론 DNA23322-1393은 뉴클레오티드 위치 138 내지 140의 분명한 번역 개시 부위를 갖고, 뉴클레오티드 위치 612 내지 614의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 함유한다 (도 237). 예상된 폴리펩티드 전구체는 158 아미노산 길이를 갖는다 (도 238). 도 238에 나타낸 전장 PRO193 단백질의 추정 분자량은 약 17,936 달톤이며, pI는 약 5.32이다. 클론 DNA23322-1393은 ATCC에 기탁하였다. 서열에 있어서 기탁된 클론은 올바른 서열을 함유하며, 본원에서 제공된 서열은 공지된 서열 분석 기법에 기초함이 이해되어야 한다.

또한, 서열 410의 아미노산 서열 분석 결과, 서열 410의 약 아미노산 23 내지 42, 60 내지 80, 97 내지 117 및 128 내지 148에 막횡단 도메인이 위치한다. 세포 부착 서열은 서열 410의 약 아미노산 81 내지 83에 있다. 퍼록시다제 프록시말 헤미-리간드 도메인은 서열 410의 약 아미노산 81 내지 83에 있다. 상응하는뉴클레오티드는 본원에서 제공된 서열을 일상적으로 결정할 수 있다.

실시예 123: 인간 PRO1130을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 프라프를 사용하여 다른 EST 서열에 대한 컨센서스 DNA 서열을 수득하였다. 이 컨센서스 서열은 본원에서 DNA34360으로 지칭되어 있다. DNA34360 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1130의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머(34360.f1)5'-GCCATAGTCACGACATGGATG-3' (서열 416)

전방향 PCR 프라이머(34360.f2)5'-GGATGGCCAGAGCTGCTG-3' (서열 417)

전방향 PCR 프라이머(34360.f3)5'-AAAGTACAAGTGTGGCCTCATCAAGC-3' (서열 418)

역방향 PCR 프라이머(34360.r1)5'-TCTGACTCCTAAGTCAGGCAGGAG-3' (서열 419)

역방향 PCR 프라이머(34360.r2)5'-ATTCTCTCCACAGACAGCTGGTTC-3' (서열 420)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA34360 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브(34360.p1)

5'-GTACAAGTGTGGCCTCATCAAGCCCTGCCCAGCCAACTACTTTGCG-3' (서열 421)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1130 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간 낭형 내피세포 조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1130 (본원에서 DNA59814-1486라 지칭) [도 239, 서열 414]에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1130의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA59814-1486의 전체 뉴클레오티드 서열은 도 239 (서열 414)에 나타나 있다. 클론 DNA59814-1486은 뉴클레오티드 위치 312 내지 314의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 984 내지 986의 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 239). 예상된 폴리펩티드 전구체는 아미노산 224개 길이이다 (도 240). 도 240에 나타낸 전장 PRO1130 단백질의 추정 분자량은 약 24,963 달톤이고 pI는 약 9.64이다. 도 240에 나타낸 전장 PRO1130 서열 (서열 415)의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 15의 신호 펩티드, 약 아미노산 184 내지 약 아미노산 191의 ATP/GTP-결합 부위 모티브 A, 약 아미노산 107 내지 약 아미노산 110의 가능한 N-글리코실화 부위의 존재를 증명한다. 클론 DNA59814-1486은 1998년 10월 20일자로 ATCC에 기탁하였으며, ATCC 기탁 번호 203359를 배정받았다.

도 240(서열 415)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1130 아미노산 서열과 데이호프 서열 P_W06547, 216_HUMAN, D87120_1, MMU72677_1, LAU04889_1 및 D69319 사이의 상당한 상동성을 보여주었다.

실시예 124:인간 PRO1335를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 1에서 기재된 프라프를 이용하여 컨센서스 DNA 서열을 다른 EST 서열에 대해 조립하였다. 이 컨센서스 서열을 본원에서 DNA35727로 지칭하였다. DNA35727 컨센서스 서열을 기초로 하여, 1) 목적 서열을 함유하는 cDNA 라이브러리를 PCR에 의해 확인하고 2) PRO1335의 전장 코딩 서열의 클론을 단리하기 위한 프로브로서 사용하기 위해 올리고뉴클레오티드를 합성하였다.

PCR 프라이머 (전방향 및 역방향)를 합성하였다:

전방향 PCR 프라이머(35727.f1)5'-GTAAAGTCGCTGGCCAGC-3' (서열 424)

전방향 PCR 프라이머(35727.f2)5'-CCCGATCTGCCTGCTGTA-3' (서열 425)

역방향 PCR 프라이머(35727.r1)5'-CTGCACTGTATGGCCATTATTGTG-3' (서열 426)

추가로, 하기 뉴클레오티드 서열을 갖는 합성 올리고뉴클레오티드 혼성화 프로브를 콘센서스 DNA35727 서열로부터 제조하였다:

혼성화 프로브(35727.p1)

5'-CAGAAACCCATGATACCCTACTGAACACCGAATCCCCTGGAAGCC-3' (서열 427)

전장 클론의 공급원에 대해 몇개의 라이브러리를 스크리닝하기 위해 상기 확인한 PCR 프라이머쌍을 사용한 PCR 증폭에 의해 라이브러리로부터 DNA를 스크리닝하였다. 그 후에, 프로브 올리고뉴클레오티드 및 PCR 프라이머 중의 하나를 사용하여 PRO1335 유전자를 코딩하는 클론을 단리하는데 양성 라이브러리를 이용하였다. cDNA 라이브러리 제조용 RNA를 인간 부신피질 조직으로부터 단리하였다.

상기 기재된 바와 같이 단리된 클론의 DNA 서열 분석은 PRO1335 (본원에서DNA62812-1594라 지칭) [도 241, 서열 422]에 대한 전장 DNA 서열 및 이로부터 유도된 PRO1335의 단백질 서열을 제공하였다.

DNA62812-1594의 전체 뉴클레오티드 서열을 도 241 (서열 422)에 도시하였다. 클론 DNA62812-1594는 뉴클레오티드 위치 271 내지 273의 명백한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 1282 내지 1284의 정지 코돈에서 종결되는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 241). 예상된 폴리펩티드 전구체는 337개의 아미노산 길이를 갖는다 (도 242). 도 242에 도시된 전장 PRO1335 단백질의 추정 분자량은 약 37,668 달톤이고 추정 pI는 약 6.27이다. 도 242 (서열 423)에 나타낸 전장 PRO1335 서열의 분석은 약 아미노산 1 내지 약 아미노산 15의 신호 펩티드, 약 아미노산 291 내지 약 아미노산 310의 막횡단 도메인, 약 아미노산 214 내지 약 아미노산 216의 가능한 N-글리코실화 부위, 및 약 아미노산 197 내지 약 아미노산 245, 약 아미노산 104 내지 약 아미노산 140 및 약 아미노산 22 내지 약 아미노산 69의 원핵형 탄산 안히드라제에 상동성을 갖는 아미노산 서열 블록의 존재를 입증한다. 클론 DNA62812-1594는 ATCC 기탁 번호 203248로서 1998년 9월 9일자로 ATCC에 기탁되었다.

도 242 (서열 423)에 나타낸 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 사용한 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1335 아미노산 서열과 데이호프 서열 AF037335_1, I38013, PTPG_MOUSE, CAH2_HUMAN, 1CAC, CAH7_HUMAN, CAH3_HUMAN, CAH1_HUMAN, CAH5_HUMAN 및 P_R41746 사이의 상당한 상동성을 입증한다.

실시예 125:인간 PRO1329를 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에서 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 LIFESEQ(등록상표) 데이타베이스로부터 인사이트 클러스터 167544라고 지칭되며, 또한 본원에서 "DNA10680"이라고도 하는 EST 클러스터 서열을 확인하였다. 이어서, 이 EST 클러스터 서열을 공용 EST 데이타베이스 (예, 젠뱅크(GenBank))와 독점 EST 데이타베이스 (예, LIFESEQ™ (Incyte Pharmaceuticals, 캘리포니아주 팔로 알토))를 포함하는 여러 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하여 존재하는 상동성을 확인하였다. 상동성 조사는 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2 [Altshul et al.,Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)]를 이용하여 수행하였다. 공지된 단백질을 코딩하지 않는 70 (또는 몇몇 경우 90) 이상의 블라스트(Blast) 스코어를 갖는 비교물을 클러스터시키고, 프로그램 "프라프" (필 그린(Phil Green), University of Washington (워싱턴주 시애틀))를 사용하여 컨센서스 DNA 서열로 조립하였다. 하나 이상의 EST가 류마티스성 관절염을 갖는 여성의 팔꿈치에서 제거된 윤활막으로부터 단리된 RNA 유래의 cDNA 라이브러리로부터 유도되었다. 이로부터 수득된 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA58836"으로 지칭하였다.

DNA58836 서열과 인사이트 EST 클론 368774 내에 포함된 서열 사이의 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 368774를 구입하여 cDNA 삽입체를 얻어 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체를 도 243에 나타내고, 본원에서 DNA66660-1585라 지칭한다.

도 243에 도시된 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 90 내지 92의 분명한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 717 내지 719에서 발견되는 정지 코돈에서 종결하는 단일 오픈 리딩 프레임을 갖는다 (도 243; 서열 428). 예상 폴리펩티드 전구체 (도 244, 서열 429)는 209개의 아미노산 길이이며, 약 아미노산 1 내지 16의 신호 서열을 갖는다. PRO1329의 추정 분자량은 약 21,588 달톤이고 추정 pI는 약 5.50이다. 클론 DNA66660-1585는 1998년 ATCC 기탁 번호 203279로서 1998년 9월 22일자로 ATCC에 기탁되었다.

도 244 (서열 429)에 도시된 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용하는 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1329 아미노산 서열 및 데이호프 서열 CELK06A9_3, PROA_XANCP, CXU21300_4, MTV037_17, SYN1_RAT, I56542, S60743, BNOLE3_1, AB001573_1 및 P_P80671 사이의 일부 상동성을 보여주었다.

실시예 126:인간 PRO1550을 코딩하는 cDNA 클론의 단리

상기 실시예 3에서 기재된 신호 서열 알고리즘을 사용하여 머크 데이타베이스로부터 CELT15B7_12라고 지칭되며 본원에서 "DNA10022"라고도 하는 EST 클러스터 서열을 확인하였다. 이어서, 이 EST 클러스터 서열을 공용 및 독점 EST 데이타베이스 (예, 젠뱅크(GenBank)와 LIFESEQ™)를 포함하는 여러 발현된 서열 태그(EST) 데이타베이스와 비교하여 존재하는 상동성을 확인하였다. 상동성 조사는 컴퓨터 프로그램 BLAST 또는 BLAST2 [Altschul et al.,Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)]를 이용하여 수행하였다. 공지된 단백질을 코딩하지 않는 70 (또는 몇몇 경우 90) 이상의 블라스트(Blast) 스코어를 갖는 비교물을 클러스터시키고, 프로그램 "프라프" (필 그린(Phil Green), University of Washington (워싱턴주 시애틀))를 사용하여 컨센서스 DNA 서열로 조립하였다. 이로부터 수득된 컨센서스 서열을 본원에서 "DNA55708"로 지칭하였다.

DNA55708 컨센서스 서열과 인사이트 EST 클론 3411659 내에 포함된 서열 사이의 확인된 서열 상동성을 고려하여, EST 클론 3411659를 구입하여 cDNA 삽입체를 얻어 전체적으로 서열 분석하였다. 이 cDNA 삽입체의 서열은 도 245에 도시하였으며, 본원에서 "DNA76393-1664"로 지칭하였다.

도 245에 나타낸 전장 클론은 뉴클레오티드 위치 138 내지 140의 명백한 번역 개시 부위를 갖고 뉴클레오티드 위치 867 내지 869의 정지 코돈에서 종결되는 단일 오픈 리딩 프레임을 포함한다 (도 245, 서열 430). 예상된 폴리펩티드 전구체는 243개의 아미노산 길이를 갖는다 (도 246, 서열 431). PRO1550의 또다른 특징은 약 아미노산 1 내지 30의 신호 서열; 약 아미노산 195 내지 217의 소수성 도메인; 및 약 아미노산 186 내지 189의 가능한 N-글리코실화 부위를 포함한다. PRO1550의 추정 분자량은 약 26,266 달톤이고 추정 pI는 약 8.43이다. 클론 DNA76393-1664는 ATCC 기탁 번호 203323으로서 1998년 10월 6일자로 ATCC에 기탁되었다.

도 246 (서열 431)에 도시된 전장 서열의 WU-BLAST2 서열 정렬 분석을 이용하는 데이호프 데이타베이스 (버전 35.45 SwissProt 35)의 분석은 PRO1550 아미노산 서열과 데이호프 서열 CELF59E12_11, CA24_ASCSU; AF018082_1; CA13_BOVIN; CA54_HUMAN, CA34_HUMAN; HUMCOL7A1X_1; P_W09643; AF053538_1 및 HSEMCXIV2_1 사이의 일부 상동성을 보여주었다.

실시예 127:혼성화 프로브로서 PRO의 용도

다음 방법은 PRO를 코딩하는 뉴클레오티드 서열의 혼성화 프로브로서의 용도를 기술한다.

본원에 기술한 바와 같이 전장 또는 성숙 PRO의 코딩 서열을 포함하는 DNA를 이용할 수 있거나, 인간 조직 cDNA 라이브러리 또는 인간 조직 게놈 라이브러리에서 상동성 DNA (예를 들면, PRO의 천연 변종을 코딩하는 것)를 스크리닝하는 데 프로브로서 사용하였다.

이들 라이브러리 DNA를 포함하는 필터의 혼성화 및 세척을 다음 고엄격 조건 하에 수행하였다. 방사선 표지된 PRO 유도 프로브를 50% 포름아미드, 5×SSC, 0.1% SDS, 0.1% 피로인산나트륨, 50 mM 인산나트륨, pH 6.8, 2×덴하르트(Denhardt's) 용액 및 10% 덱스트란 황산염의 용액 중에서 42℃에서 20시간 동안 혼성화를 수행하였다. 필터를 0.1×SSC 및 0.1% SDS의 수용액 중에서 42℃에서 세척하였다.

이어서, 전장 천연 서열 PRO를 코딩하는 DNA와 원하는 서열 동일성을 갖는 DNA를 당업계에 공지된 표준 방법으로 확인하였다.

실시예 128:이. 콜라이에서 PRO의 발현

본 실시예는 이. 콜라이 내의 재조합 발현으로 PRO 폴리펩티드의 비글리코실화된 형태를 제조하는 방법을 나타낸다.

처음에 원하는 PRO를 코딩하는 DNA 서열을 선택된 PCR 프라이머를 이용하여 증폭하였다. 프라이머는 선택된 발현 벡터 상의 제한 효소 부위에 해당하는 제한효소 부위를 포함해야만 한다. 여러 발현 벡터가 사용될 수 있다. 적합한 벡터의 예로는 앰피실린 및 테트라사이클린 내성 유전자를 포함하는 pBR322[이. 콜라이에서 유래; Bolivar et al.,Gene2:95(1977)]가 있다. 벡터를 제한 효소로 절단하고 탈인산화시켰다. 이어서, PCR 증폭된 서열을 벡터에 라이게이션하였다. 벡터는 바람직하게는 항생제 내성 유전자, trp 프로모터, 폴리his 리더(처음 6개의 STII 코돈, 폴리his 서열 및 엔테로키나제 절단 부위를 포함), PRO 코딩 부위, 람다 전사 터미네이터 및 argU 유전자를 코딩하는 서열을 포함할 것이다.

이어서, 라이게이션 혼합물을 Sambrook 등(상기 문헌)이 기재한 방법을 이용하여 선택된 이. 콜라이 균주를 형질전환시키는데 사용하였다. LB 배지에서 성장할 수 있는 형질전환체를 확인하고 항생제 내성을 갖는 콜로니를 선택하였다. 플라스미드 DNA를 제한 분석법 및 DNA 서열 분석을 이용하여 단리, 확인하였다.

선택된 클론을 항생제가 보충된 LB 브로스와 같은 액체 배양 배지에서 밤새 배양하였다. 이 배양액을 더 큰 규묘의 배양 접종에 사용하였다. 이어서, 세포를 발현 프로모터가 작동되는 동안 원하는 광학 밀도까지 배양시켰다.

수시간 이상 동안 세포를 배양한 후에 원심분리로 세포를 회수할 수 있다. 원심분리로 얻어진 세포 펠렛을 당업계에 공지된 여러가지 시약을 이용하여 용해시키고, 단백질이 강하게 결합하는 조건 하에서 금속 킬레이팅 칼럼을 이용하여 용해된 PRO 단백질을 정제하였다.

PRO는 다음 과정을 이용하여 이. 콜라이에서 폴리-His 태그가 부가된 형태로 발현될 수 있다. PRO를 코딩하는 DNA는 선택된 PCR 프라이머를 이용하여 초기에증폭된다. 프라이머는 선택된 발현 벡터 상의 제한효소 부위에 해당하는 제한 효소 부위 및 효율적이고 신뢰할 만한 번역 개시, 금속 킬레이트 칼럼에서 빠른 정제, 엔테로키나제를 사용한 단백질 분해 제거를 제공하는 다른 유용한 서열을 포함하였다. 이어서 PCR 증폭된, 폴리-His 태그가 부가된 서열을 발현 벡터에 라이게이션시켜 이. 콜라이 숙주[균주 52(W3110fuhA(tonA) lon galE rpoHts(htpRts) clpP (lacIq)]를 형질전환 시키는 데 사용하였다. 우선 형질전환체를 50 ㎎/㎖의 카르베니실린 (carbenicillin)을 포함하는 LB 배지에서 O.D.600이 3 내지 5에 도달할 때까지 30℃에서 진탕 배양하였다. 이어서, 배양액을 CRAP 배지(물 500 ㎖ 내의 3.57 g (NH₄)₂SO₄, 0.71 g 시트르산나트륨·2H₂O, 1.07 g KCl, 5.36 g Difco 효모 추출물, 5.36 g Sheffield hycase SF, 또한 110 mM MPOS, pH 7.3, 0.55% (w/v) 글루코스 및 7 mM MgSO₄를 혼합하여 준비)로 50 내지 100배로 희석하고 약 20 내지 30시간 동안 30℃에서 진탕 배양시켰다. 시료를 취해 SDS-PAGE 분석법으로 발현을 확인하고 대량 배양액을 원심분리하여 세포를 펠렛으로 만들었다. 세포 펠렛을 정제와 리폴딩시킬 때까지 냉동시켰다.

0.5 내지 1L 발효액으로부터 얻은 이. 콜라이 페이스트 (6 내지 10 g 펠렛)를 10배 부피(w/v)의 7 M 구아니딘, 20 mM Tris, pH 8 완충액에 재현탁시켰다. 고체 아황산나트륨 및 사티온산나트륨을 각각 최종 농도 0.1 M과 0.02 M이 되도록 첨가하고 용액을 4℃에서 밤새 교반하였다. 이 단계에서 아황산염화에 의해 모든 시스테인 잔기가 차단된 변성 단백질이 생성되었다. 이 용액을 Beckman 초원심 분리기에서 40,000 rpm에서 30분간 원심분리하였다. 상등액을 3 내지 5 배 부피의 금속 킬레이트 칼럼 완충액(6 M 구아니딘, 20 mM Tris, pH 7.4)으로 희석하고 0.22 마이크론 필터로 여과시켜 정화하였다. 정화된 추출물을 금속 킬레이트 칼럼 완충액으로 평형화된 5 ㎖ Qiagen Ni-NTA 금속 킬레이트 칼럼에 로딩하였다. 칼럼을 50 mM 이미다졸(Calbiochem, Utrol grade)을 포함하는 추가의 완충액(pH 7.4)으로 세척하였다. 단백질을 250 mM 이미다졸을 포함하는 완충액으로 용출시키고, 목적하는 단백질을 포함하는 분획을 모아 4℃에 보관하였다. 아미노산 서열에 따라 계산된 흡광 계수를 이용하여 280 nm 흡광도로 단백질 농도를 측정하였다.

시료를 20 mM Tris, pH 8.6, 0.3 M NaCl, 2.5 M 우레아, 5 mM 시스테인, 20 mM 글리신 및 1 mM EDTA로 구성된 새롭게 준비한 리폴딩 완충액으로 천천히 희석하여 단백질을 리폴딩시켰다. 리폴딩 부피는 최종 단백질 농도가 50 내지 100 ㎍/㎖가 되도록 정하였다. 리폴딩 용액을 4℃에서 12 내지 36시간 가량 서서히 교반하였다. 최종농도가 0.4% (약 pH 3)가 되도록 TFA를 첨가하여 리폴딩 반응을 정지시켰다. 추가로 단백질을 정제하기 전에, 용액을 0.22 마이크론 필터로 여과시키고 아세토니트릴을 최종 농도 2 내지 10%가 되도록 첨가하였다. 리폴딩된 단백질을 10 내지 80%의 아세토니트릴 농도 구배로 용출시키면서 0.1% TFA의 이동 완충액을 이용하는 Poros R1/H 역상 칼럼 크로마토그래피시켰다. A280 흡광도를 보이는 분획의 분액을 SDS 폴리아크릴아미드 겔에서 분석하여 균질하게 리폴딩된 단백질을 포함하는 분획을 회수하였다. 일반적으로, 리폴딩된 단백질은 역상 수지와의 상호작용으로부터 보호되는 소수성의 내부 부분과 가장 밀착되기 때문에, 대부분의 단백질에서 적절하게 리폴딩된 단백질 형태는 아세토니트릴의 가장 낮은 농도에서 용출된다. 응집된 단백질은 대개 높은 아세토니트릴 농도에서 용출된다. 역상 단계는 바람직한 형태의 단백질로부터 잘못 폴딩된 형태의 단백질을 분리할 뿐 아니라, 시료로부터 내독소를 제거한다.

폴딩된 PRO 폴리펩티드를 포함하는 분획을 회수하여 용액에 대해 질소 기류를 부드럽게 적용하여 아세토니트릴을 제거하였다. 투석법 또는 제제화 완충액으로 평형화되고 멸균 여과된 G25 Superfine(Pharmacia) 수지를 이용한 겔 여과법으로 0.14 M 염화나트륨 및 4% 만니톨을 포함하는 20 mM Hepes, pH 6.8으로 단백질을 제제화하였다.

본원에서 개시된 많은 PRO 폴리펩티드가 상기에 기재된 바와 같이 성공적으로 발현되었다.

실시예 129:포유동물 세포에서의 PRO의 발현

본 실시예는 포유동물 세포내의 재조합 발현으로 PRO 폴리펩티드의 가능한 글리코실화된 형태를 제조하는 방법을 예시한다.

벡터 pRK5(1989. 3.15 공개된 EP 307,247 참조)를 발현 벡터로 사용하였다. 임의로, Sambrook 등(상기 문헌)이 기재한 라이게이션 방법을 이용하여 PRO DNA를 선택된 제한 효소를 사용하여 pRK5에 라이게이션시켜, PRO DNA를 삽입하였다. 생성 벡터를 pRK5-PRO 폴리펩티드로 지칭하였다.

한 실시 태양에서, 숙주 세포로서 293 세포를 선택할 수 있다. 인간 293 세포(ATCC CCL 1573)를 태아 송아지 혈청 및 임의로 영양소 및(또는) 항생제가 보충된 DMEM와 같은 배지에서 조직 배양 플레이트에 융합(confluent)되도록 배양하였다. 약 10 ㎍ pRK5-PRO DNA를 VA RNA 유전자를 코딩하는 DNA[Thimmappaya et al.,Cell,31: 543(1982)] 약 1 ㎍과 혼합하여, 500 ㎕의 1 mM Tris-HCl, 0.1 mM EDTA 및 0.227 M CaCl₂에 용해시켰다. 이 혼합물에 500 ㎕의 50 mM HEPES(pH 7.35), 280 mM NaCl, 1.5 mM NaPO₄를 적가하여 25℃에서 10분간 침전물을 형성시켰다. 침전물을 현탁시키고 293 세포에 첨가하여 37℃에서 4시간 가량을 정치시켰다. 배지를 흡인 제거하고 PBS 내의 20% 글리세롤 2 ㎖를 30초 동안 첨가하였다. 이어서, 293세포를 혈청 무첨가 배지로 세척하고 새로운 배지를 첨가하고 5일간 세포를 배양하였다.

형질감염 약 24시간 후에 배양 배지를 제거하고 배지(만으로) 또는 200 μCi/㎖³⁵S-시스테인 및 200 μCi/㎖³⁵S-메티오닌을 포함하는 배지로 교체하였다. 12시간 배양 후, 조건화된 배지를 회수하고 회전 필터에서 농축시켜 15% SDS 겔에 로딩하였다. 처리된 겔을 건조시키고 일정 기간동안 필름에 노출시켜 PRO 폴리펩티드의 존재를 확인하였다. 형질감염된 세포를 포함하는 배양액을 추가로 배양시키고(혈청 무첨가 배지에서), 배지를 선택된 생물분석법으로 시험하였다.

별법으로, 문헌[Somparyrac et al.,Proc. Natl. Acad. Sci.,12:7575(1981)]이 기재한 덱스트란 술페이트 방법을 이용하여 PRO를 293 세포에 일시적으로 도입시킬 수 있었다. 293 세포는 회전 플라스크에서 최고 밀도가 되도록 배양하고 700 ㎍ pRK5-PRO DNA를 첨가하였다. 세포를 우선 원심분리하여 회전 플라스크로부터 농축하고 PBS로 세척하였다. DNA-덱스트란 침전물을 4시간 동안 세포 펠렛 상에서 인큐베이션하였다. 세포를 20% 글리세롤로 90초간 처리하고 조직 배양 배지로 세척한 후 다시 조직 배양 배지, 5 ㎍/㎖ 소의 인슐린 및 0.1 ㎍/㎖ 소의 트랜스페린을 포함하는 회전 플라스크에 넣었다. 약 4일 후에 조건화된 배지를 원심분리하고 여과시켜 세포와 파쇄물을 제거하였다. 발현된 PRO를 포함하는 시료를 농축시키고 선택된 방법, 예를 들어 투석 및(또는) 칼럼 크로마토그래피로 정제하였다.

다른 실시 태양으로, PRO를 CHO 세포에 발현시킬 수 있다. pRK5-PRO를 공지된 시약, 예를 들어 CaPO₄또는 DEAE 덱스트란을 이용하여 CHO 세포에 형질감염시킬 수 있다. 상기에서 언급한 것과 같이, 세포를 배양하고, 배지만으로 또는³⁵S-메티오닌과 같은 방사선 표지를 포함하는 배지로 배양액을 교체할 수 있다. 발현된 폴리펩티드의 존재를 확인하고 나서, 배양 배지를 혈청 무첨가 배지로 교체한다. 바람직하게는, 약 6일 가량 배양물을 인큐베이션 하고 조건화된 배지를 회수한다. 발현된 PRO를 포함하는 배지를 농축하여 선택된 방법으로 정제할 수 있다.

또한, 에피토프 태그가 부가된 PRO는 CHO 숙주세포에서 발현될 수 있다. PRO는 pRK5 벡터로부터 서브클로닝될 수 있다. 서브클론의 삽입은 PCR을 통해 폴리-his 태그와 같은 선택된 에피토프 태그를 갖는 형태로 바큘로바이러스 발현 벡터에 융합될 수 있다. 폴리-his 태그가 부가된 PRO 삽입체는 안정한 클론을 선택하기 위해 DHFR과 같은 선택 마커를 포함하는 SV40 유도 벡터로 서브클로닝될 수있다. 최종적으로, CHO 세포는 (상기에서와 같이) SV40 유도 벡터로 형질감염될 수 있다. 발현을 확인하기 위해서 상기와 같은 방법으로 표지될 수 있다. 이어서, 발현된 폴리-His 태그된 PRO를 포함하는 배양 배지를 농축하여 Ni²⁺-킬레이트 친화도 크로마토그래피와 같이 선택된 방법으로 정제할 수 있다.

PRO는 또한 일시적인 발현 과정에 의해 CHO 및(또는) COS 세포에서 또는 다른 안정된 발현 방법에 의해서 CHO 세포 내에서 발현될 수 있다.

다음 실험 방법을 이용하여 CHO 세포 내에서 안정하게 발현되었다. 단백질은 각 단백질의 가용성 형태의 코딩 서열(예, 세포의 도메인)이 힌지, CH2 및 CH2 도메인을 포함하는 IgG1 불변 영역 서열에 융합된 IgG 구조체 (이뮤노어드헤신)로서 발현 및(또는) 폴리-His 태그가 부가된 형태로 발현되었다.

PCR 증폭에 이어 문헌 [Ausubel et al.,Current Protocols of Molecular Biology, Unit 3.16, Johnn Wiley and Sons(1997)]에 의해 기재된 표준 방법을 이용하여 각 DNA를 CHO 발현 벡터에 서브클로닝 하였다. CHO 발현 벡터는 목적하는 DNA의 5' 및 3'에 적합한 제한 부위를 갖도록 제조되어 cDNA의 제한 위치가 편리하게 셔틀링될 수 있게 된다. CHO 세포에서 발현에 사용되는 벡터는 문헌[Lucas et al.,Nucl. Acids Res.24:9(1774-1779(1996)]에 의해 기재된 바와 같으며, 목적하는 cDNA와 디히드로폴레이트 리덕타제(DHFR)를 발현시키기 위해 SV40 초기 프로모터/인핸서를 사용하였다. DHFR 발현으로 형질감염된 플라스미드의 안정적 유지를 선별할 수 있다.

원하는 플라스미드 DNA 12 ㎍을 시판되는 형질감염 시약 Superfect(등록상표) (Qiagen), Dosper(등록상표) 또는 Fugene(등록상표)(Boehringer Mannheim)을 이용하여 약 1000만개의 CHO 세포에 도입하였다. 상기의 문헌(Lucas et al.)의 기재 방법에 따라 세포를 배양하였다. 추후에 세포를 배양 및 생산하기 위해 약 3 x 10^-7세포를 하기에 기재된 방법에 따라 앰플에 동결시켰다.

플라스미드 DNA를 포함하는 앰플을 수조에 넣어 녹인 후 볼텍싱하여 혼합하였다. 내용물을 배지 10 ㎖를 포함하는 원심분리 튜브에 피펫으로 넣고 1000 rpm에서 5분간 원심분리하였다. 상등액을 흡입해 내고 세포를 10 ㎖ 선택 배지(0.2 ㎛ 투석 여과된 5% 소 태아 혈청을 포함하는 0.2 ㎛ 여과된 PS20)에 재현탁시켰다. 세포를 90 ㎖ 선택 배지를 포함하는 100 ㎖ 스피너에 분주하였다. 1 내지 2일 후 세포를 150 ㎖ 선택 배지로 채워진 250 ㎖ 스피너로 옮겨 37℃에서 배양하였다. 2 내지 3일 후에 250 ㎖, 500 ㎖ 및 2000 ㎖ 스피너에 3 x 10⁵세포/㎖를 접종하였다. 세포 배양액을 원심 분리하여 신선한 배지로 교환하고 생산 배지에 재현탁하였다. 임의의 적합한 CHO 배지를 이용할 수 있으나, 공개 미국 특허 제5,122,469호 (1992. 6. 16)에 기재된 생산 배지를 실제로 이용하였다. 3 ℓ 생산 스피너에 1.2 x 10⁶세포/㎖가 되도록 접종하였다. 제0일에 세포 수와 pH를 측정하였다. 제1일에 스피너에서 시료를 취해 여과된 공기의 살포를 개시하였다. 제2일에 스피너에서 시료를 취해 온도를 33℃로 바꾸고 500 g/L-글루코스 30 ㎖ 및 10% 소포제 0.6 ㎖(예, 35% 폴리디메틸 실록산 유액, Dow Corning 365 의약 등급 유액)를 첨가하였다. 전체 생산기 동안, pH를 약 7.2에서 유지시켜야만 한다. 10일 후 또는 생존률이 70% 미만으로 떨어질 즈음 세포 배양액을 원심분리로 회수하고 0.22 ㎛ 필터에 여과시켰다. 여과액을 정제 칼럼에 로딩하기 전까지 4℃에 보관하였다.

폴리-his 태그된 구조물의 경우, Ni-NTA 칼럼(Qiagen)을 이용하여 단백질을 정제하였다. 정제하기 전에 이미다졸을 5 mM 농도로 조건화된 배지에 첨가하였다. 조건화된 배지를 0.3 M NaCl 및 5 mM 이미다졸을 포함하는 20 mM Hepes, pH 7.4 완충액으로 평형화된 6 ㎖ Ni-NTA 칼럼에 4℃에서 4 내지 5 ㎖/분의 유속으로 주입하였다. 로딩 후에 칼럼을 추가의 평형 완충액으로 세척하고 단백질을 0.25 M 이미다졸을 포함하는 평형 완충액으로 용출하였다. 이어서 정제된 단백질을 25 ㎖의 G25 수퍼파인 (Pharmacia) 칼럼으로 10 mM Hepes, 0.14 M NaCl 및 4% 만니톨을 함유하는 저장 완충액(pH 6.8)에서 염을 제거하고 -80℃에서 보관하였다.

이뮤노어드헤신(Fc 포함) 구조물은 조건화된 배지로부터 다음과 같이 정제되었다. 조건화된 배지를 20 mM 인산 나트륨 완충액(pH 6.8)으로 평형화된 5 ㎖ 단백질 A 칼럼(Pharmacia)에 주입하였다. 로딩후, 칼럼을 평형화 완충용액으로 세척하고 100 mM 시트르산(pH 3.5)으로 용출하였다. 용출된 단백질을 275 ㎕의 1 M Tris 완충액(pH 9)을 포함하는 튜브에 1 ㎖ 분획으로 회수하여 즉시 중화시켰다. 이어서 고도로 정제된 단백질을 폴리-His 태그된 단백질의 경우에 상기에 기재된 방법으로 저장 완충액으로 염을 제거하였다. 상동성을 SDS-폴리아크릴 아미드 겔 및 에드만 분해법으로 수행되는 N-말단 아미노산 서열 분석으로 확인하였다.

본원에서 개시된 많은 PRO 폴리펩티드가 상기에 기재된 바와 같이 성공적으로 발현되었다.

실시예 130:PRO 폴리펩티드의 효모에서의 발현

다음 방법은 효모에서 원하는 PRO의 재조합 발현을 기재하고 있다.

우선, ADH2/GAPDH 프로모터로부터 PRO의 세포내 생산 또는 분비를 위한 효모 발현 벡터를 제조하였다. PRO 및 프로모터를 코딩하는 DNA를 PRO 폴리펩티드의 세포내 발현을 위해 선택된 플라스미드의 적합한 제한 효소 부위에 삽입하였다. 분비의 경우, PRO 발현을 위해 PRO를 코딩하는 DNA를 ADH2/GAPDH 프로모터, 천연 PRO 신호 펩티드 또는 다른 포유동물의 신호 펩티드, 예를 들어 효모 알파-인자 또는 인버타제 분비 신호/리더 서열 및 링커 서열(필요한 경우)을 코딩하는 DNA와 함께 선택된 플라스미드에 클로닝할 수 있다.

이어서, 효모 세포, 예를 들어 효모 균주 AB110을 상기에서 기재된 발현 플라스미드로 형질전환시키고 선택된 발효 배지에서 배양할 수 있다. 형질 전환된 효모 상등액을 10% 트리클로로아세트산으로 침전시키고 SDS-PAGE로 분리한 후 겔을 쿠마시 블루로 염색하여 분석할 수 있다.

계속해서, 원심분리에 의해 발효 배지로부터 효모 세포를 제거하고 선택된 카트리지 필터를 이용하여 배지를 농축시켜 재조합 PRO를 단리하고 정제할 수 있다. PRO를 함유하는 농축액을 선택된 칼럼 크로마토그래피 수지를 이용하여 추가로 정제할 수 있다.

본원에서 개시된 많은 PRO 폴리펩티드가 상기에 기재된 바와 같이 성공적으로 발현되었다.

실시예 131:바큘로바이러스 감염 곤충 세포 내에서 PRO의 발현

다음 방법은 바큘로바이러스 감염 곤충 세포 내에서 PRO의 재조합 발현에 대하여 기재하고 있다.

PRO를 코딩하는 서열을 바큘로바이러스 발현 벡터에 포함된 에피토프 태그의 상류에 융합시켰다. 상기의 에피토프 태그는 폴리-his 태그 및 면역글로블린 태그(IgG의 Fc 영역과 같이)를 포함하고 있다. 시판되는 플라스미드, 예를 들어 pVL1393(Novagen)에서 유도된 플라스미드를 포함하여 여러 플라스미드를 사용할 수 있다. 간략하게, PRO 또는 PRO의 코딩 서열의 원하는 부분, 예를 들어 막횡단 단백질의 세포외 도메인을 코딩하는 서열 또는 성숙 단백질 코딩하는 서열을 5' 및 3' 영역에 상보적인 프라이머를 이용하여 PCR로 증폭하였다. 5' 프라이머는 인접한 (선택된) 제한 효소 부위를 포함할 수 있다. 이어서 생산물을 선택된 제한 효소로 절단하여 발현 벡터에 서브클로닝하였다.

재조합 바큘로바이러스는 리포펙틴(GIBCO-BRL로부터 구입)을 이용하여 상기의 플라스미드 및 BaculoGold(등록상표) 바이러스 DNA (Pharmingen)를 스포돕테라 프루기페르다 ("Sf9") 세포 (ATCC CRL 1711)에 동시에 형질감염시켜 생성되었다. 28℃에서 4 내지 5일 배양 후에, 방출된 바이러스를 회수하여 이후의 증폭에 사용한다. 바이러스 감염 및 단백질 발현은 문헌[O'Reilley et al.,Baculovirus Expression vectors:A laboratory Manual, Oxford: Oxford University Press (1994)]에 따라 수행하였다.

이어서, 발현된 폴리-his 태그된 PRO는 예를 들어 Ni²⁺-킬레이트 친화도 크로마토그래피로 다음과 같이 정제될 수 있다. 추출액을 문헌[Rupert et al.,Nature,362: 175-179(1993)]에 따라 재조합 바이러스-감염된 Sf9 세포로부터 제조한다. 간략하게, Sf9 세포를 세척하여 초음파 처리 완충액 (25 ㎖ Hepes, pH 7.9; 12.5 mM MgCl₂; 0.1 mM EDTA; 10% 글리세롤; 0.1% NP-40; 0.4 M KCl)에 재현탁시키고 빙상에서 20초간 두차례 초음파 처리하였다. 초음파 처리물을 원심분리로 제거하고 상등액을 로딩 완충액(50 mM 인산, 300 mM NaCl, 10% 글리세롤, pH 7.8)에 50배 희석하여 0.45 ㎛ 필터로 여과시켰다. Ni²⁺-NTA 아가로즈 칼럼(Quiagen으로부터 구입)을 5 ㎖ 충진 부피로 준비하여 물 25 ㎖로 세척하고 로딩 완충액 25 ㎖로 평형화시켰다. 여과시킨 세포 추출물을 분당 0.5 ㎖로 칼럼에 로딩하였다. 점 분획 회수를 개시할 때 칼럼을 로딩 완충액으로 A₂₈₀기준선까지 세척하였다. 다음으로, 2차 세척 완충액(50 mM 인산; 300 mM NaCl, 10% 글리세롤, pH 6.0)으로 칼럼을 세척하여 비특이적으로 결합된 단백질을 용출시켰다. A₂₈₀이 기준선에 다시 도달하면, 칼럼을 2차 세척 완충액에 0 내지 500 mM 이미다졸로 구배로 전개시켰다. 1 ㎖ 분획을 회수하여 SDS-PAGE 및 은 염색 또는 알카리 포스파타제에 결합된 Ni²⁺-NTA(Qiagen)로 웨스턴 블롯팅하여 분석하였다. 용출된 His₁₀태그된 PRO를 포함하는 분획을 모아 로딩 완충액에 대해 투석하였다.

별법으로, IgG 태그된 (또는 Fc 태그된) PRO의 정제는 공지된 크로마토그래피 기술, 예를 들어 단백질 A 또는 단백질 G 칼럼 크로마토그래피를 이용하여 수행하였다.

본원에서 개시된 많은 PRO 폴리펩티드가 상기에 기재된 바와 같이 성공적으로 발현되었다.

실시예 132:PRO에 결합하는 항체의 제조

본 실시예는 PRO에 특이적으로 결합할 수 있는 단클론 항체를 제조하는 방법이다.

모노클로날 항체를 생산하는 기술은 당업계에 공지되어 있으며 예를 들어 상기의 문헌(Goding)에 기재되어 있다. 이용될 수 있는 면역원에는 본 발명의 정제된 PRO, PRO를 포함하는 융합 단백질 및 세포 표면에 재조합 PRO를 발현하는 세포를 포함한다. 숙련자는 불필요한 실험없이도 면역원을 선택할 수 있다.

생쥐, 예를 들어 Balb/c를 프로인드 완전 보조액에 유화된 PRO 면역원 1 내지 100 ㎍을 피하 또는 복강내 주사하여 면역시켰다. 별법으로, 면역원을 MPL-TDM 보조액(Ribi Immunochemical Research, Hamilton, MT)에 유화시켜 동물의 뒷발바닥에 주사하여 면역화하였다. 이어서 면역된 생쥐를 10 내지 12 일 후에 선택된 보조제 내에 유화된 추가의 면역원으로 부스팅하였다. 그 이후, 수주 동안 생쥐를 추가 면역 주사로 부스팅할 수 있다. 역회전 출혈법으로 생쥐로부터 혈청 시료를 주기적으로 채취하여, ELISA 분석법을 시험하여 항-PRO 폴리펩티드 항체를 검출하였다.

적합한 항체 역가가 검출되면, 항체에 대해 "양성"인 동물에게 PRO를 최종정맥주사하였다. 3 내지 4일 후에 생쥐를 희생시켜 비장 세포를 회수한다. 이어서, 비장 세포를 선택된 쥐의 골수종 세포주, 예를 들어 ATCC 번호 CRL 1597로부터 이용 가능한 P3X63AgU.1와 융합시켰다 (35% 폴리에틸렌 글리콜 이용). 융합체는 비 융합 세포, 골수종 하이브리드 및 비장세포 하이브리드의 증식을 억제하는 HAT(하이포잔틴, 아미노프테린 및 티미딘) 배지를 포함하는 96 웰 조직 배양 플레이트에 플레이팅될 수 있는 하이브리도마 세포를 생성하였다.

하이브리도마 세포를 PRO에 대한 반응성을 위한 ELISA로 스크리닝할 수 있다. PRO 폴리펩티드에 대한 목적하는 단클론 항체를 분비하는 "양성" 하이브리도마 세포를 결정하는 방법은 당업계의 숙련자에게 잘 알려져 있다.

양성 하이브리도마 세포는 동계의 Balb/c 생쥐가 항-PRO 단클론 항체를 포함하는 복수를 생산하도록 복강 내에 주사될 수 있다. 별법으로, 하이브리도마 세포는 조직 배양 플라스크 또는 롤러병에서 배양될 수 있다. 복수 내에서 생성된 단클론 항체는 황산암모늄 침전, 이어서 겔 배제 크로마토그래피를 이용하여 정제될 수 있다. 별법으로, 항체의 단백질 A 또는 단백질 G 결합을 기초로 하는 친화도 크로마토그래피를 이용할 수도 있다.

실시예 133:특이 항체를 사용한 PRO 폴리펩티드의 정제

천연 또는 재조합 PRO 폴리펩티드를 단백질 정제 분야의 다양한 표준 기법으로 정제할 수 있다. 예를 들면, 프로(pro)-PRO 폴리펩티드, 성숙 PRO 폴리펩티드 또는 프리(pre)-PRO 폴리펩티드를 목적 PRO 폴리펩티드에 특이적인 항체를 이용하는 면역친화성 크로마토그래피로 정제한다. 일반적으로, 면역친화성 칼럼은 항-PRO폴리펩티드 항체를 활성화된 크로마토그래피 수지에 공유 결합적으로 커플링시킴으로써 제작된다.

폴리클론 이뮤노글로불린은 면역 혈청으로부터 황산암모늄으로 침전시키거나, 고정화 Protein A (Pharmacia LKB Biotechnology (뉴저지주 피츠카타웨이)) 상에서 정제하여 제조하였다. 유사하게, 단클론 항체는 생쥐 복수액으로부터 황산암모늄 침전법 또는 고정화 Protein A 상의 크로마토그래피에 의해 제조하였다. 부분적으로 정제된 이뮤노글로불린을 CnBr-활성화 SEPHAROSE™ (Pharmacia LKB Biotechnology)와 같은 크로마토그래피 수지에 공유적으로 부착시켰다. 항체를 수지에 커플링시키고, 수지를 블록킹시키고, 유도된 수지를 제조업자의 지시에 따라 세척하였다.

이러한 면역친화성 칼럼은 PRO 폴리펩티드를 가용성 형태로 포함하는 세포로부터 분획을 제조함으로써 PRO 폴리펩티드의 정제에 이용된다. 이 제제는 세제 첨가에 의해 또는 당업계에 잘 알려져 있는 다른 방법에 의한 전세포의 가용화 또는 차등 원심분리를 통해 수득한 세포하 분획의 가용화에 의해 유도된다. 별법으로, 신호 서열을 포함하는 가용형 PRO 폴리펩티드는 세포가 성장하는 배지 내로 유용한 양으로 분비될 수 있다.

가용형 PRO 폴리펩티드 함유 제제를 면역친화성 칼럼 상으로 통과시키고, 칼럼을 PRO 폴리펩티드의 차별적인 흡광도를 허용하는 조건 (예를 들면, 세제의 존재 하에 고이온 강도 완충액) 하에 세척하였다. 이어서, 칼럼을 항체/PRO 폴리펩티드 결합을 파괴시키는 조건 (예를 들면, 약 pH 2 내지 3과 같은 저 pH 완충액 또는 고농도의, 요소 또는 티오시아네이트 이온과 같은 카오트로프(chaotrope)) 하에 용출시키고, PRO 폴리펩티드를 회수하였다.

실시예 134:약물 스크리닝

본 발명은 PRO 폴리펩티드 또는 그의 결합 단편을 사용하여 임의의 다양한 약물 스크리닝 기법으로 화합물을 스크리닝하기 위해 특히 유용하다. 이러한 시험에 사용된 PRO 폴리펩티드 또는 단편은 용액 중에 유리되어 있거나, 고상 지지체에 고착되거나, 세포 표면에서 유지되거나, 세포 내에 위치할 수 있다. 약물 스크리닝의 한 방법에서는 PRO 폴리펩티드 또는 단편을 발현하는 재조합 핵산을 사용하여 안정하게 형질전환된 진핵 또는 원핵 숙주 세포를 이용한다. 약물을 경쟁적 결합 분석으로 상기 형질전환된 세포에 대해 스크리닝하였다. 생존형 또는 고정형의 상기 세포는 표준 결합 분석을 위해 사용할 수 있다. 예를 들면, PRO 폴리펩티드 또는 단편과 시험되는 활성제 사이의 복합체 형성을 측정할 수 있다. 별법으로, 시험되는 활성제의 의해 유발된 PRO 폴리펩티드와 그의 표적 세포 또는 표적 수용체 사이의 복합체 형성의 감소를 검사할 수 있다.

따라서, 본 발명은 PRO 폴리펩티드-관련 질환 또는 장애에 영향을 끼칠 수 있는 약물 또는 임의의 다른 활성제를 스크리닝하기 위한 방법을 제공한다. 이들 방법은 그러한 활성제를 PRO 폴리펩티드 또는 그의 단편과 접촉시키고, 당업계에 잘 알려진 방법으로 (i) 활성제와 PRO 폴리펩티드 또는 단편 사이의 복합체의 존재 또는 (ii) PRO 폴리펩티드 또는 단편과 세포 사이의 복합체의 존재에 대해 분석하는 것을 포함한다. 이러한 경쟁적 결합 분석에서, PRO 폴리펩티드 또는 단편은 대개 표지화시킨다. 적합한 인큐베이션 후, 유리 PRO 폴리펩티드 또는 단편을 결합형으로 존재하는 것으로부터 분리시키며, 유리 또는 비복합된 표지의 양은 특정 활성제의 PRO 폴리펩티드에 결합하는 능력 또는 PRO 폴리펩티드/세포 복합체를 저해하는 능력의 척도이다.

또다른 약물 스크리닝 기법은 폴리펩티드에 적합한 결합 친화도를 갖는 화합물에 대한 고처리량 스크리닝을 제공하고, WO84/03564 (1984. 9. 13일자 공개)에 상세히 기재되어 있다. 간단히 서술하면, 다수의 상이한 작은 펩티드 시험 화합물을 플라스틱 핀 또는 몇몇 다른 표면과 같은 고상 기질 상에 합성한다. PRO 폴리펩티드에 적용시켜, 펩티드 시험 화합물을 PRO 폴리펩티드와 반응시키고 세척한다. 결합된 PRO 폴리펩티드는 당업계에 잘 공지된 방법으로 검출한다. 정제된 PRO 폴리펩티드는 또한 상기 언급한 약물 스크리닝 기법에 사용하기 위해 평판 상에 직접 코팅될 수 있다. 또한, 비중화 항체를 사용하여 펩티드를 포획하여 이를 고상 지지체 상에 고정시킬 수 있다.

본 발명은 또한 PRO 폴리펩티드에 결합할 수 있는 중화 항체가 PRO 폴리펩티드 또는 그의 단편에 결합하는데 있어서 시험 화합물과 특이적으로 경쟁하는 경쟁적 약물 스크리닝 분석의 이용을 고려한다. 이러한 방식으로, 항체를 PRO 폴리펩티드와 하나 이상의 항원 결정자를 공유하는 임의의 펩티드의 존재를 검출하기 위해 사용할 수 있다.

실시예 135:합리적인(Rational) 약물 디자인

합리적 약물 디자인의 목표는 관심있는 생물 활성 폴리펩티드 (즉, PRO 폴리펩티드) 또는 이들이 상호작용하는 작은 분자, 예를 들면, 아고니스트, 길항제 또는 억제제의 구조적 동족체를 생산하는 것이다. 이들 예 중 임의의 것들을 PRO 폴리펩티드의 보다 활성적이거나 보다 안정한 형태인 약물, 또는 생체 내 PRO 폴리펩티드의 기능을 강화하거나 저해하는 약물을 형성하기 위해 이용할 수 있다 (문헌[호지슨 (Hodgson),Bio/Technology,9: 19-21 (1991)] 참조).

한 연구에서, PRO 폴리펩티드 또는 PRO 폴리펩티드-억제제 복합체의 3차원 구조를 x-선 결정법, 컴퓨터 모델링 또는 가장 전형적으로 상기 두 방법의 조합에 의해 결정한다. 분자의 구조를 밝히고 활성 부위(들)을 결정하기 위해 PRO 폴리펩티드의 형태와 전하 모두를 확인해야 한다. 더 적은 빈도이지만, PRO 폴리펩티드의 구조에 관한 유용한 정보는 상동성 단백질의 구조를 기준으로 모델링함으로써 얻을 수 있다. 두 경우 모두, 관련 구조 정보를 동족 PRO 폴리펩티드 유사 분자를 디자인하거나 유효한 억제제를 확인하기 위해 사용한다. 합리적 약물 디자인의 유용한 예는 문헌[브락스톤(Braxton) 및 웰스(Wells),Biochemistry, 31:7796-7801 (1992)]에 나타낸 바와 같이 활성 또는 안정성을 증진시킨 분자, 또는 문헌[아타우다 (Athauda) 등,J. Biochem.,113:742-746 (1993)]에 나타낸 바와 같이 천연 펩티드의 억제제, 아고니스트 또는 길항제로서 작용하는 분자를 포함할 수 있다.

기능 분석에 의해 선택된 표적-특이적 항체를 상기한 바와 같이 단리한 후 그의 결정 구조를 해석하는 것도 가능하다. 이 방법은 원칙적으로 후속적인 약물 디자인이 기준이 될 수 있는 파마코어(pharmacore)를 제공한다. 기능성 약리 활성 항체에 대한 항-유전형 항체 (항-id)를 생산함으로써 단백질 결정법을 생략하는 것도 가능하다. 거울상의 거울상으로서, 항-id의 결합 부위는 원래 수용체의 동족체일 것으로 기대될 것이다. 이어서, 항-id를 사용하여 화학적 또는 생물학적으로 생산된 펩티드 뱅크로부터 펩티드를 확인하고 단리시킬 수 있을 것이다. 이어서, 단리된 펩티드는 파마코어로서 작용할 것이다.

본 발명에 의해, x-선 결정법과 같은 분석적 연구를 수행하기 위해 충분한 양의 PRO 폴리펩티드를 이용가능하게 할 수 있다. 또한, 본원에 제공된 PRO 폴리펩티드 아미노산 서열 정보는 x-선 결정법 대신 또는 그에 덧붙여 컴퓨터 모델링 기법을 이용하는데 지침을 제공할 것이다.

물질의 기탁

다음 물질들은 미국 버지니아주 20110-2209 마나사스 유니버시티 불바드 10801에 소재하는 아메리칸 타입 컬쳐 콜렉션(ATCC)에 기탁되었다.

<표 2>

물질 ATCC 기탁번호 기탁일

DNA19902-16692034541998년 11월 3일

DNA26846-13972034061998년 10월 27일

DNA56107-14152034051998년 10월 27일

DNA56406-17042034781998년 11월 17일

DNA56529-16472032931998년 9월 29일

DNA56531-16482032861998년 9월 29일

DNA56862-13432031741998년 9월 1일

DNA57254-14772032891998년 9월 29일

DNA57841-15222034581998년 11월 3일

DNA58727-14742031711998년 9월 1일

DNA58730-16072032211998년 9월 15일

DNA58732-16502032901998년 9월 29일

DNA58828-15192031721998년 9월 1일

DNA58852-16372032711998년 9월 22일

DNA59212-16272032451998년 9월 9일

DNA59218-15592032871998년 9월 29일

DNA59219-16132032201998년 9월 15일

DNA59586-15202032881998년 9월 29일

DNA59817-17032034701998년 11월 17일

DNA60278-15302031701998년 9월 1일

DNA60608-15772031261998년 8월 18일

DNA606l1-15242031751998년 9월 1일

DNA60618-15572032921998년 9월 29일

DNA60740-16152034561998년 11월 3일

DNA60764-15332034521998년 11월 10일

DNA60775-15322031731998년 9월 1일

DNA61185-16462034641998년 11월 17일

DNA61608-16062032391998년 9월 9일

DNA62808-13262033581998년 10월 20일

DNA62809-15312032371998년 9월 9일

DNA62815-15782032471998년 9월 9일

DNA62845-16842033611998년 10월 20일

DNA64842-16322032781998년 9월 22일

DNA64849-16042034681998년 11월 17일

DNA64863-15732032511998년 9월 9일

DNA64881-16022032401998년 9월 9일

DNA64883-15262032531998년 9월 9일

DNA64885-15292034571998년 11월 3일

DNA64886-16012032411998년 9월 9일

DNA64888-15422032491998년 9월 9일

DNA64889-15412032501998년 9월 9일

DNA64897-16282032161998년 9월 15일

DNA64902-16672033171998년 10월 6일

DNA64903-15532032231998년 9월 15일

DNA64905-15582032331998년 9월 15일

DNA64950-15902032241998년 9월 15일

DNA64952-15682032221998년 9월 15일

DNA65402-15402032521998년 9월 9일

DNA65403-15652032301998년 9월 15일

DNA65404-15512032441998년 9월 9일

DNA65405-l5472034761998년 11월 17일

DNA65406-15672032191998년 9월 15일

DNA65408-15782032171998년 9월 15일

DNA65409-15662032321998년 9월 15일

DNA65410-15692032311998년 9월 15일

DNA65423-15952032271998년 9월 15일

DNA66304-15462033211998년 10월 6일

DNA66511-14112032281998년 9월 15일

DNA66512-15642032181998년 9월 15일

DNA66519-15352032361998년 9월 15일

DNA66520-15362032261998년 9월 15일

DNA66521-15832032251998년 9월 15일

DNA66526-16162032461998년 9월 9일

DNA66658-15842032291998년 9월 15일

DNA66659-15932032691998년 9월 22일

DNA66663-15982032681998년 9월 22일

DNA66669-15972032721998년 9월 22일

DNA66672-15862032651998년 9월 22일

DNA66674-15992032811998년 9월 22일

DNA66675-15872032821998년 9월 22일

DNA67962-16492032911998년 9월 29일

DNA68836-16562034551998년 11월 3일

DNA68864-16292032761998년 9월 22일

DNA68866-16442032831998년 9월 22일

DNA68871-16382032801998년 9월 22일

DNA68874-16222032771998년 9월 22일

DNA68880-16762033191998년 10월 6일

DNA68885-15702033111998년 10월 6일

DNA71166-16852033551998년 10월 20일

DNA71169-17092034671998년 11월 17일

DNA71180-16552034031998년 10월 27일

DNA71184-16342032661998년 9월 22일

DNA71213-16592034011998년 10월 27일

DNA71234-16512034021998년 10월 27일

DNA71277-16362032851998년 9월 22일

DNA71282-16682033121998년 10월 6일

DNA71286-16042033571998년 10월 20일

DNA71883-16602034751998년 11월 17일

DNA73401-16332032731998년 9월 22일

DNA73492-16712033241998년 10월 6일

DNA73727-16732034591998년 11월 3일

DNA73730-16792033201998년 10월 6일

DNA73734-16802033631998년 10월 20일

DNA73735-16812033561998년 10월 20일

DNA73736-16572034661998년 11월 17일

DNA73737-16582034121998년 10월 27일

DNA73739-16452032701998년 9월 22일

DNA73742-16622033161998년 10월 6일

DNA73744-16652033221998년 10월 6일

DNA73746-16542034111998년 10월 27일

DNA73760-16722033141998년 10월 6일

DNA76396-16982034711998년 11월 17일

DNA76398-16992034741998년 11월 17일

DNA76399-17002034721998년 11월 17일

DNA76401-16832033601998년 10월 20일

DNA76510-25042034771998년 11월 17일

DNA76522-25002034691998년 11월 17일

DNA76529-16662033151998년 10월 6일

DNA76531-17012034651998년 11월 17일

DNA76532-17022034731998년 11월 17일

DNA76538-16702033131998년 10월 6일

DNA76541-16752034091998년 10월 27일

DNA77301-17082034071998년 10월 27일

DNA77303-25022034791998년 11월 17일

DNA77648-16882034081998년 10월 27일

DNA77652-25052034801998년 11월 17일

DNA83500-25062033911998년 10월 29일

DNA77568-16262031341998년 8월 18일

DNA23322-13932034001998년 10월 27일

DNA59814-14862033591998년 10월 20일

DNA62812-15942032481998년 9월 9일

DNA66660-15852032791998년 9월 22일

DNA76393-16642033231998년 10월 6일

이들 기탁은 특허 절차상 미생물 기탁의 국제적 승인에 관한 부다페스트 조약 및 그의 규칙 (부다페스트 조약 (Budapest Treaty))의 규정 하에 이루어졌다. 이는 기탁일로부터 30년 동안 기탁물의 생존 배양물의 유지를 보장한다. 기탁물은 부다페스트 조약의 협약 하에 ATCC로부터 제넨테크 인크와 ATCC 사이 협정에 따라분양될 것이며, 이는 관련 미국 특허의 허여시 또는 미국 또는 외국 특허 출원의 공개시 (이 중 먼저인 때) 공공에 대한 기탁물의 배양 프로제니의 영구적이고 비제한적인 분양을 보장하고, 미국 특허 및 상표청장에 의해 35 USC §122 및 그에 따른 미국 특허 및 상표청장의 규칙 (37 CFR §1.14 포함, 특히 886 OG 638 참조)에 따라 권리가 있는 것으로 결정한 이에게 프로제니의 분양을 보장한다.

본 출원의 양수인은 적합한 조건 하에 배양할 때 기탁 물질의 배양물이 사멸하거나 손실되거나 파손된 경우, 그 통지시 물질을 다른 동일한 물질로 즉시 교체할 것임을 동의하였다. 기탁 물질의 분양은 각국 정부의 권한으로 그 특허법에 따라 승인된 권리에 위배하여 본 발명을 실시하도록 허가하는 것으로서 해석되어서는 안된다.

앞서 기술한 명세서는 당업계의 숙련인이 본 발명을 실시할 수 있도록 하기에 충분한 것으로 생각된다. 본 발명은 기탁된 실시태양은 본 발명의 특정 측면의 한 예시로서 의도되는 것이므로 기탁된 구조물의 범위에 제한되지 않고, 기능적으로 동등한 임의의 구조물은 본 발명의 범위 내에 있다. 본원에서 물질의 기탁은 본원에 포함된 기재 내용이 본 발명의 최선의 양식을 포함한 임의의 측면을 실시하기에 부적절하다는 것을 의미하지는 않으며, 특허 청구 범위의 범위를 명세서에서 나타내는 구체적인 설명에 제한하려는 것으로 해석되어서는 안된다. 실제로, 앞서의 상세한 설명으로부터 본원에 나타내고 기술된 것 이외에 본 발명의 다양한 변형이 당업계의 숙련인에게는 명백하고, 이는 첨부된 특허 청구의 범위 내에 있을 것이다.

Claims (27)

1. 도 2 (서열 4), 도 4 (서열 6), 도 6 (서열 8), 도 8 (서열 10), 도 10 (서열 12), 도 12 (서열 17), 도 14 (서열 22), 도 16 (서열 24), 도 18 (서열 29), 도 20 (서열 31), 도 22 (서열 33), 도 24 (서열 41), 도 26 (서열 43), 도 28 (서열 50), 도 30 (서열 52), 도 32 (서열 54), 도 34 (서열 56), 도 36 (서열 58), 도 38 (서열 63), 도 40 (서열 68), 도 42 (서열 70), 도 44 (서열 72), 도 46 (서열 77), 도 48 (서열 79), 도 50 (서열 84), 도 52 (서열 86), 도 54 (서열 88), 도 56 (서열 95), 도 58 (서열 100), 도 60 (서열 102), 도 62 (서열 104), 도 64 (서열 111), 도 66 (서열 116), 도 68 (서열 118), 도 70 (서열 123), 도 72 (서열 128), 도 74 (서열 130), 도 76 (서열 132), 도 78 (서열 134), 도 80 (서열 136), 도 82 (서열 138), 도 84 (서열 140), 도 86 (서열 142), 도 88 (서열 144), 도 90 (서열 146), 도 92 (서열 148), 도 94 (서열 153), 도 96 (서열 158), 도 98 (서열 160), 도 100 (서열 162), 도 102 (서열 170), 도 104 (서열 180), 도 106 (서열 189), 도 108 (서열 194), 도 110 (서열 196), 도 112 (서열 198), 도 114 (서열 203), 도 116 (서열 210), 도 118 (서열 212), 도 120 (서열 214), 도 122 (서열 216), 도 124 (서열 218), 도 126 (서열 220), 도 128 (서열 225), 도 130 (서열 227), 도 132 (서열 229), 도 134 (서열 234), 도 136 (서열 236), 도 138 (서열 243), 도 140 (서열 248), 도 142 (서열 253), 도 144 (서열 260), 도 146 (서열 265), 도 148 (서열 267), 도 150 (서열 269), 도 152 (서열 271), 도 154 (서열273), 도 156 (서열 275), 도 158 (서열 277), 도 160 (서열 282), 도 162 (서열 287), 도 164 (서열 292), 도 166 (서열 297), 도 168 (서열 302), 도 170 (서열 304), 도 172 (서열 306), 도 174 (서열 308), 도 176 (서열 310), 도 178 (서열 315), 도 180 (서열 317), 도 182 (서열 322), 도 184 (서열 324), 도 186 (서열 326), 도 188 (서열 328), 도 190 (서열 330), 도 192 (서열 332), 도 194 (서열 334), 도 196 (서열 336), 도 198 (서열 338), 도 200 (서열 340), 도 202 (서열 347), 도 204 (서열 352), 도 206 (서열 354), 도 208 (서열 356), 도 210 (서열 358), 도 212 (서열 364), 도 214 (서열 366), 도 216 (서열 372), 도 218 (서열 374), 도 220 (서열 376), 도 222 (서열 378), 도 224 (서열 383), 도 226 (서열 385), 도 228 (서열 390), 도 230 (서열 395), 도 232 (서열 397), 도 234 (서열 402), 도 236 (서열 406), 도 238 (서열 410), 도 240 (서열 415), 도 242 (서열 423), 도 244 (서열 429), 도 246 (서열 431)에 나타낸 아미노산 서열로 구성된 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열과의 서열 동일성이 80 % 이상인 단리된 핵산.
2. 제1항에 있어서, 상기 뉴클레오티드 서열은

   도 1 (서열 3), 도 3 (서열 5), 도 5 (서열 7), 도 7 (서열 9), 도 9 (서열 11), 도 11 (서열 16), 도 13 (서열 21), 도 15 (서열 23), 도 17 (서열 28), 도 19 (서열 30), 도 21 (서열 32), 도 23 (서열 40), 도 25 (서열 42), 도 27 (서열 49), 도 29 (서열 51), 도 31 (서열 53), 도 33 (서열 55), 도 35 (서열 57), 도 37 (서열 62), 도 39 (서열 67), 도 41 (서열 69), 도 43 (서열 71), 도 45 (서열 76), 도 47 (서열 78), 도 49 (서열 83), 도 51 (서열 85), 도 53 (서열 87), 도 55 (서열 94), 도 57 (서열 99), 도 59 (서열 101), 도 61 (서열 103), 도 63 (서열 110), 도 65 (서열 115), 도 67 (서열 117), 도 69 (서열 122), 도 71 (서열 127), 도 73 (서열 129), 도 75 (서열 131), 도 77 (서열 133), 도 79 (서열 135), 도 81 (서열 137), 도 83 (서열 139), 도 85 (서열 141), 도 87 (서열 143), 도 89 (서열 145), 도 91 (서열 147), 도 93 (서열 152), 도 95 (서열 157), 도 97 (서열 159), 도 99 (서열 161), 도 101 (서열 169), 도 103 (서열 179), 도 105 (서열 188), 도 107 (서열 193), 도 109 (서열 195), 도 111 (서열 197), 도 113 (서열 202), 도 115 (서열 209), 도 117 (서열 211), 도 119 (서열 213), 도 121 (서열 215), 도 123 (서열 217), 도 125 (서열 219), 도 127 (서열 224), 도 129 (서열 226), 도 131 (서열 228), 도 133 (서열 233), 도 135 (서열 235), 도 137 (서열 242), 도 139 (서열 247), 도 141 (서열 252), 도 143 (서열 259), 도 145 (서열 264), 도 147 (서열 266), 도 149 (서열 268), 도 151 (서열 270), 도 153 (서열 272), 도 155 (서열 274), 도 157 (서열 276), 도 159 (서열 281), 도 161 (서열 286), 도 163 (서열 291), 도 165 (서열 296), 도 167 (서열 301), 도 169 (서열 303), 도 171 (서열 305), 도 173 (서열 307), 도 175 (서열 309), 도 177 (서열 314), 도 179 (서열 316), 도 181 (서열 321), 도 183 (서열 323), 도 185 (서열 325), 도 187 (서열 327), 도 189 (서열 329), 도 191 (서열 331), 도 193 (서열 333), 도 195 (서열 335), 도 197 (서열 337), 도 199 (서열 339), 도 201 (서열 346), 도203 (서열 351), 도 205 (서열 353), 도 207 (서열 355), 도 209 (서열 357), 도 211 (서열 363), 도 213 (서열 365), 도 215 (서열 371), 도 217 (서열 373), 도 219 (서열 375), 도 221 (서열 377), 도 223 (서열 382), 도 225 (서열 384), 도 227 (서열 389), 도 229 (서열 394), 도 231 (서열 396), 도 233 (서열 401), 도 235 (서열 405), 도 237 (서열 409), 도 239 (서열 414), 도 241 (서열 422), 도 242 (서열 428), 도 245 (서열 430)에 나타낸 서열로 구성된 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 핵산.
3. 제1항에 있어서, 상기 뉴클레오티드 서열은

   도 1 (서열 3), 도 3 (서열 5), 도 5 (서열 7), 도 7 (서열 9), 도 9 (서열 11), 도 11 (서열 16), 도 13 (서열 21), 도 15 (서열 23), 도 17 (서열 28), 도 19 (서열 30), 도 21 (서열 32), 도 23 (서열 40), 도 25 (서열 42), 도 27 (서열 49), 도 29 (서열 51), 도 31 (서열 53), 도 33 (서열 55), 도 35 (서열 57), 도 37 (서열 62), 도 39 (서열 67), 도 41 (서열 69), 도 43 (서열 71), 도 45 (서열 76), 도 47 (서열 78), 도 49 (서열 83), 도 51 (서열 85), 도 53 (서열 87), 도 55 (서열 94), 도 57 (서열 99), 도 59 (서열 101), 도 61 (서열 103), 도 63 (서열 110), 도 65 (서열 115), 도 67 (서열 117), 도 69 (서열 122), 도 71 (서열 127), 도 73 (서열 129), 도 75 (서열 131), 도 77 (서열 133), 도 79 (서열 135), 도 81 (서열 137), 도 83 (서열 139), 도 85 (서열 141), 도 87 (서열 143), 도 89 (서열 145), 도 91 (서열 147), 도 93 (서열 152), 도 95 (서열 157), 도 97 (서열 159),도 99 (서열 161), 도 101 (서열 169), 도 103 (서열 179), 도 105 (서열 188), 도 107 (서열 193), 도 109 (서열 195), 도 111 (서열 197), 도 113 (서열 202), 도 115 (서열 209), 도 117 (서열 211), 도 119 (서열 213), 도 121 (서열 215), 도 123 (서열 217), 도 125 (서열 219), 도 127 (서열 224), 도 129 (서열 226), 도 131 (서열 228), 도 133 (서열 233), 도 135 (서열 235), 도 137 (서열 242), 도 139 (서열 247), 도 141 (서열 252), 도 143 (서열 259), 도 145 (서열 264), 도 147 (서열 266), 도 149 (서열 268), 도 151 (서열 270), 도 153 (서열 272), 도 155 (서열 274), 도 157 (서열 276), 도 159 (서열 281), 도 161 (서열 286), 도 163 (서열 291), 도 165 (서열 296), 도 167 (서열 301), 도 169 (서열 303), 도 171 (서열 305), 도 173 (서열 307), 도 175 (서열 309), 도 177 (서열 314), 도 179 (서열 316), 도 181 (서열 321), 도 183 (서열 323), 도 185 (서열 325), 도 187 (서열 327), 도 189 (서열 329), 도 191 (서열 331), 도 193 (서열 333), 도 195 (서열 335), 도 197 (서열 337), 도 199 (서열 339), 도 201 (서열 346), 도 203 (서열 351), 도 205 (서열 353), 도 207 (서열 355), 도 209 (서열 357), 도 211 (서열 363), 도 213 (서열 365), 도 215 (서열 371), 도 217 (서열 373), 도 219 (서열 375), 도 221 (서열 377), 도 223 (서열 382), 도 225 (서열 384), 도 227 (서열 389), 도 229 (서열 394), 도 231 (서열 396), 도 233 (서열 401), 도 235 (서열 405), 도 237 (서열 409), 도 239 (서열 414), 도 241 (서열 422), 도 242 (서열 428), 도 245 (서열 430)에 나타낸 서열의 전장 코딩 서열로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 핵산.
4. 명세서 중 표 2에 나타낸 ATCC 기탁번호 중 어느 하나로 기탁된 DNA의 전장 코딩 서열을 포함하는 단리된 핵산.
5. 제1항에 따른 핵산을 포함하는 벡터.
6. 제5항에 있어서, 상기 벡터로 형질전환된 숙주 세포에 의해 인식되는 조절 서열에 작동가능하게 연결된 벡터.
7. 제5항의 벡터를 포함하는 숙주 세포.
8. 제7항에 있어서, CHO 세포인 숙주 세포.
9. 제7항에 있어서, 대장균(E. coli.)인 숙주 세포.
10. 제7항에 있어서, 효모 세포인 숙주 세포.
11. 제7항의 숙주 세포를 PRO 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건에서 배양하고 이 세포 배양물로부터 PRO 폴리펩티드를 회수하는 것을 포함하는 PRO 폴리펩티드의 제조 방법.
12. 도 2 (서열 4), 도 4 (서열 6), 도 6 (서열 8), 도 8 (서열 10), 도 10 (서열 12), 도 12 (서열 17), 도 14 (서열 22), 도 16 (서열 24), 도 18 (서열 29), 도 20 (서열 31), 도 22 (서열 33), 도 24 (서열 41), 도 26 (서열 43), 도 28 (서열 50), 도 30 (서열 52), 도 32 (서열 54), 도 34 (서열 56), 도 36 (서열 58), 도 38 (서열 63), 도 40 (서열 68), 도 42 (서열 70), 도 44 (서열 72), 도 46 (서열 77), 도 48 (서열 79), 도 50 (서열 84), 도 52 (서열 86), 도 54 (서열 88), 도 56 (서열 95), 도 58 (서열 100), 도 60 (서열 102), 도 62 (서열 104), 도 64 (서열 111), 도 66 (서열 116), 도 68 (서열 118), 도 70 (서열 123), 도 72 (서열 128), 도 74 (서열 130), 도 76 (서열 132), 도 78 (서열 134), 도 80 (서열 136), 도 82 (서열 138), 도 84 (서열 140), 도 86 (서열 142), 도 88 (서열 144), 도 90 (서열 146), 도 92 (서열 148), 도 94 (서열 153), 도 96 (서열 158), 도 98 (서열 160), 도 100 (서열 162), 도 102 (서열 170), 도 104 (서열 180), 도 106 (서열 189), 도 108 (서열 194), 도 110 (서열 196), 도 112 (서열 198), 도 114 (서열 203), 도 116 (서열 210), 도 118 (서열 212), 도 120 (서열 214), 도 122 (서열 216), 도 124 (서열 218), 도 126 (서열 220), 도 128 (서열 225), 도 130 (서열 227), 도 132 (서열 229), 도 134 (서열 234), 도 136 (서열 236), 도 138 (서열 243), 도 140 (서열 248), 도 142 (서열 253), 도 144 (서열 260), 도 146 (서열 265), 도 148 (서열 267), 도 150 (서열 269), 도 152 (서열 271), 도 154 (서열 273), 도 156 (서열 275), 도 158 (서열 277), 도 160 (서열 282), 도 162 (서열287), 도 164 (서열 292), 도 166 (서열 297), 도 168 (서열 302), 도 170 (서열 304), 도 172 (서열 306), 도 174 (서열 308), 도 176 (서열 310), 도 178 (서열 315), 도 180 (서열 317), 도 182 (서열 322), 도 184 (서열 324), 도 186 (서열 326), 도 188 (서열 328), 도 190 (서열 330), 도 192 (서열 332), 도 194 (서열 334), 도 196 (서열 336), 도 198 (서열 338), 도 200 (서열 340), 도 202 (서열 347), 도 204 (서열 352), 도 206 (서열 354), 도 208 (서열 356), 도 210 (서열 358), 도 212 (서열 364), 도 214 (서열 366), 도 216 (서열 372), 도 218 (서열 374), 도 220 (서열 376), 도 222 (서열 378), 도 224 (서열 383), 도 226 (서열 385), 도 228 (서열 390), 도 230 (서열 395), 도 232 (서열 397), 도 234 (서열 402), 도 236 (서열 406), 도 238 (서열 410), 도 240 (서열 415), 도 242 (서열 423), 도 244 (서열 429), 도 246 (서열 431)에 나타낸 아미노산 서열로 구성된 군에서 선택된 아미노산 서열과의 서열 동일성이 80 % 이상인 단리된 PRO 폴리펩티드.
13. 명세서 중 표 2에 나타낸 ATCC 기탁번호 중 어느 하나로 기탁된 핵산 분자에 의해 코딩되는 아미노산 서열과의 서열 동일성이 80 % 이상인 단리된 PRO 폴리펩티드.
14. 이종 아미노산 서열에 융합된 제12항에 따른 폴리펩티드를 포함하는 키메라 분자.
15. 제14항에 있어서, 상기 이종 아미노산 서열은 에피토프 태그(tag) 서열인 키메라 분자.
16. 제14항에 있어서, 상기 이종 아미노산 서열은 이뮤노글로불린의 Fc 영역인 키메라 분자.
17. 제12항에 따른 PRO 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 항체.
18. 제17항에 있어서, 모노클로날인 항체.
19. 제17항에 있어서, 인간화 항체인 항체.
20. 제17항에 있어서, 상기 항체가 항체 단편인 항체.
21. 도 1 (서열 3), 도 3 (서열 5), 도 5 (서열 7), 도 7 (서열 9), 도 9 (서열 11), 도 11 (서열 16), 도 13 (서열 21), 도 15 (서열 23), 도 17 (서열 28), 도 19 (서열 30), 도 21 (서열 32), 도 23 (서열 40), 도 25 (서열 42), 도 27 (서열 49), 도 29 (서열 51), 도 31 (서열 53), 도 33 (서열 55), 도 35 (서열 57), 도 37 (서열 62), 도 39 (서열 67), 도 41 (서열 69), 도 43 (서열 71), 도 45 (서열76), 도 47 (서열 78), 도 49 (서열 83), 도 51 (서열 85), 도 53 (서열 87), 도 55 (서열 94), 도 57 (서열 99), 도 59 (서열 101), 도 61 (서열 103), 도 63 (서열 110), 도 65 (서열 115), 도 67 (서열 117), 도 69 (서열 122), 도 71 (서열 127), 도 73 (서열 129), 도 75 (서열 131), 도 77 (서열 133), 도 79 (서열 135), 도 81 (서열 137), 도 83 (서열 139), 도 85 (서열 141), 도 87 (서열 143), 도 89 (서열 145), 도 91 (서열 147), 도 93 (서열 152), 도 95 (서열 157), 도 97 (서열 159), 도 99 (서열 161), 도 101 (서열 169), 도 103 (서열 179), 도 105 (서열 188), 도 107 (서열 193), 도 109 (서열 195), 도 111 (서열 197), 도 113 (서열 202), 도 115 (서열 209), 도 117 (서열 211), 도 119 (서열 213), 도 121 (서열 215), 도 123 (서열 217), 도 125 (서열 219), 도 127 (서열 224), 도 129 (서열 226), 도 131 (서열 228), 도 133 (서열 233), 도 135 (서열 235), 도 137 (서열 242), 도 139 (서열 247), 도 141 (서열 252), 도 143 (서열 259), 도 145 (서열 264), 도 147 (서열 266), 도 149 (서열 268), 도 151 (서열 270), 도 153 (서열 272), 도 155 (서열 274), 도 157 (서열 276), 도 159 (서열 281), 도 161 (서열 286), 도 163 (서열 291), 도 165 (서열 296), 도 167 (서열 301), 도 169 (서열 303), 도 171 (서열 305), 도 173 (서열 307), 도 175 (서열 309), 도 177 (서열 314), 도 179 (서열 316), 도 181 (서열 321), 도 183 (서열 323), 도 185 (서열 325), 도 187 (서열 327), 도 189 (서열 329), 도 191 (서열 331), 도 193 (서열 333), 도 195 (서열 335), 도 197 (서열 337), 도 199 (서열 339), 도 201 (서열 346), 도 203 (서열 351), 도 205 (서열 353), 도 207 (서열 355), 도 209 (서열357), 도 211 (서열 363), 도 213 (서열 365), 도 215 (서열 371), 도 217 (서열 373), 도 219 (서열 375), 도 221 (서열 377), 도 223 (서열 382), 도 225 (서열 384), 도 227 (서열 389), 도 229 (서열 394), 도 231 (서열 396), 도 233 (서열 401), 도 235 (서열 405), 도 237 (서열 409), 도 239 (서열 414), 도 241 (서열 422), 도 242 (서열 428), 도 245 (서열 430)에 나타낸 핵산 서열로 구성된 군에서 선택된 핵산과의 서열 동일성이 80 % 이상인 단리된 핵산.
22. 도 1 (서열 3), 도 3 (서열 5), 도 5 (서열 7), 도 7 (서열 9), 도 9 (서열 11), 도 11 (서열 16), 도 13 (서열 21), 도 15 (서열 23), 도 17 (서열 28), 도 19 (서열 30), 도 21 (서열 32), 도 23 (서열 40), 도 25 (서열 42), 도 27 (서열 49), 도 29 (서열 51), 도 31 (서열 53), 도 33 (서열 55), 도 35 (서열 57), 도 37 (서열 62), 도 39 (서열 67), 도 41 (서열 69), 도 43 (서열 71), 도 45 (서열 76), 도 47 (서열 78), 도 49 (서열 83), 도 51 (서열 85), 도 53 (서열 87), 도 55 (서열 94), 도 57 (서열 99), 도 59 (서열 101), 도 61 (서열 103), 도 63 (서열 110), 도 65 (서열 115), 도 67 (서열 117), 도 69 (서열 122), 도 71 (서열 127), 도 73 (서열 129), 도 75 (서열 131), 도 77 (서열 133), 도 79 (서열 135), 도 81 (서열 137), 도 83 (서열 139), 도 85 (서열 141), 도 87 (서열 143), 도 89 (서열 145), 도 91 (서열 147), 도 93 (서열 152), 도 95 (서열 157), 도 97 (서열 159), 도 99 (서열 161), 도 101 (서열 169), 도 103 (서열 179), 도 105 (서열 188), 도 107 (서열 193), 도 109 (서열 195), 도 111 (서열 197), 도 113 (서열202), 도 115 (서열 209), 도 117 (서열 211), 도 119 (서열 213), 도 121 (서열 215), 도 123 (서열 217), 도 125 (서열 219), 도 127 (서열 224), 도 129 (서열 226), 도 131 (서열 228), 도 133 (서열 233), 도 135 (서열 235), 도 137 (서열 242), 도 139 (서열 247), 도 141 (서열 252), 도 143 (서열 259), 도 145 (서열 264), 도 147 (서열 266), 도 149 (서열 268), 도 151 (서열 270), 도 153 (서열 272), 도 155 (서열 274), 도 157 (서열 276), 도 159 (서열 281), 도 161 (서열 286), 도 163 (서열 291), 도 165 (서열 296), 도 167 (서열 301), 도 169 (서열 303), 도 171 (서열 305), 도 173 (서열 307), 도 175 (서열 309), 도 177 (서열 314), 도 179 (서열 316), 도 181 (서열 321), 도 183 (서열 323), 도 185 (서열 325), 도 187 (서열 327), 도 189 (서열 329), 도 191 (서열 331), 도 193 (서열 333), 도 195 (서열 335), 도 197 (서열 337), 도 199 (서열 339), 도 201 (서열 346), 도 203 (서열 351), 도 205 (서열 353), 도 207 (서열 355), 도 209 (서열 357), 도 211 (서열 363), 도 213 (서열 365), 도 215 (서열 371), 도 217 (서열 373), 도 219 (서열 375), 도 221 (서열 377), 도 223 (서열 382), 도 225 (서열 384), 도 227 (서열 389), 도 229 (서열 394), 도 231 (서열 396), 도 233 (서열 401), 도 235 (서열 405), 도 237 (서열 409), 도 239 (서열 414), 도 241 (서열 422), 도 242 (서열 428), 도 245 (서열 430)에 나타낸 뉴클레오티드 서열로 구성된 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열의 전장 코딩 서열과의 서열 동일성이 80 % 이상인 단리된 핵산.
23. PRO 폴리펩티드의 단리된 세포외 도메인.
24. 수반하는 신호 펩티드가 없는 단리된 PRO 폴리펩티드.
25. PRO 폴리펩티드의 세포외 도메인과의 아미노산 서열 동일성이 약 80 % 이상인 단리된 폴리펩티드.
26. 수반하는 신호 펩티드가 없는 PRO 폴리펩티드와의 아미노산 서열 동일성이 약 80 % 이상인 단리된 폴리펩티드.
27. 제23항 내지 제26항 중 어느 한 항의 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산.