KR20000022489A - Method for producing recombinant adenovirus - Google Patents

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Abstract

PURPOSE: Provided is a novel method for producing recombinant Adenovirus. And purified virus preparations produced by processes of the method is also provided. CONSTITUTION: Provided is a method for producing recombinant Adenovirus by which viral DNA is introduced in a packaging cell culture and the viruses produced are harvested after by ultrafiltration, gel permeation chromatography or ion exchange chromatography, after liberation of at least 50% of virus in the supernatant. The viruses produced and their use are also provided.

Description

재조합 아데노바이러스의 제조방법Method for producing recombinant adenovirus

아데노바이러스는 유전자 요법에 있어 유전자 전달용 벡터로서 사용하기에 특히 유리한 특성을 보인다. 특히, 이들은 상당히 광범위한 숙주 스펙트럼을 보유하고, 휴지기 세포를 감염시킬 수 있으며, 감염 세포의 게놈에 통합되지 않으며, 현재까지로는 인간에 있어 주요 병리와 연관되어 있지 않다. 아데노바이러스는 따라서 해당 유전자를 근육[참조문헌: Ragot et al. m Nature 361 (1993) 647], 간[참조문헌: Jaffe et al., Nature genetics 1 (1992) 372], 신경계[참조문헌: Akli et al., Nature genetics 3 (1993) 224] 등으로의 전달에 사용되어 왔다.Adenoviruses show particularly advantageous properties for use as gene delivery vectors in gene therapy. In particular, they have a fairly broad host spectrum, can infect resting cells, do not integrate into the genome of infected cells, and to date have not been associated with major pathologies in humans. Adenoviruses are therefore responsible for the use of these genes in muscle [Ragot et al. m Nature 361 (1993) 647], liver [Jaffe et al., Nature genetics 1 (1992) 372], nervous system (Akli et al., Nature genetics 3 (1993) 224) and the like. Has been used in.

아데노바이러스는 약 36(킬로 베이스) kb 크기의 선형 이본쇄 DNA이다. 이들의 게놈은 특히 각각의 말단에 역 반복서열(ITR), 캡시드화 서열(Psi), 초기 유전자 및 후기 유전자를 포함한다. 주된 초기 유전자는 E1, E2, E3 및 E4 영역에 들어있다. 이들 가운데서, 특히 E1 영역에 들어있는 유전자는 바이러스 증식에 필수이다. 주된 후기 유전자는 L1 내지 L5 영역에 들어있다. Ad5 아데노바이러스의 게놈은 완전히 서열분석되었으며 데이터베이스상에서 접근가능하다(특히 Genebank M73260). 이와 마찬가지로, 다른 아데노바이러스(Ad2, Ad7, Ad12 등) 게놈의 일부 또는 심지어는 전부도 서열분석되었다.Adenovirus is a linear double stranded DNA of about 36 (kilobase) kb in size. Their genomes, in particular, include reverse repeats (ITR), capsidized sequences (Psi), early genes and late genes at each end. The main early genes are in the E1, E2, E3 and E4 regions. Among these, genes particularly in the E1 region are essential for virus propagation. The major late genes are in the L1 to L5 regions. The genome of the Ad5 adenovirus is fully sequenced and accessible on the database (especially Genebank M73260). Similarly, some or even all of the other adenovirus (Ad2, Ad7, Ad12, etc.) genomes were sequenced.

이들을 유전자 요법에 사용하기 위해, 각종 치료 유전자가 이입되어 있는 아데노바이러스로부터 유도된 각종 벡터가 제조되었다. 이러한 작제물 각각에 있어서, 아데노바이러스는 감염세포에서 복제할 수 없게 되도록 변형된다. 따라서, 선행기술에 기술된 작제물은 바이러스 복제에 필수인 E1 영역이 결실되고 이의 수준에서 이종 DNA 서열이 삽입되는 아데노바이러스이다[참조문헌: Levrero et al., Gene 101 (1991) 195; Gosh-Choudhury et al., Gene 50 (1986) 161] 더욱이, 벡터의 특성을 증진시키기 위하여, 아데노바이러스 게놈에 다른 결실이나 변형을 생성시키는 것이 제안되었다. 따라서, 열-민감성 돌연변이가 ts125 돌연변이체에 도입되었으며, 이렇게 하여 72 kDa DNA 결합 단백질(DBP)을 불활성화시킬 수 있게된다[참조문헌: Van der Vlist et al., 1975]. 다른 벡터는 바이러스 복제 및/또는 증식에 필수인 다른 영역, E4 영역의 결실을 포함한다. E4 영역은 사실 후기 유전자의 발현 조절, 후기 핵 RNA의 안정성, 숙주 세포 단백질의 발현 폐지 및 바이러스 DNA 복제의 효능에 관여된다. 따라서, E1 및 E4 영역이 결실되어 있는 아데노바이러스 벡터는 전사 백그라운드 노이즈 및 매우 감소된 바이러스 유전자의 발현을 보유한다. 이러한 벡터는 예를 들면, 출원 WO 94/28152, WO 95/02697, PCT/FR96/00088에 기술되어 있다. 또한, IVa2 유전자 수준에서 변형을 운반하는 벡터 또한 기술되어 있다(WO 96/10088).In order to use them in gene therapy, various vectors derived from adenoviruses into which various therapeutic genes have been introduced have been produced. In each of these constructs, the adenovirus is modified so that it cannot replicate in infected cells. Thus, the constructs described in the prior art are adenoviruses which delete the E1 region essential for viral replication and insert heterologous DNA sequences at this level (Levrero et al., Gene 101 (1991) 195; Gosh-Choudhury et al., Gene 50 (1986) 161] Moreover, in order to enhance the properties of the vector, it has been proposed to create other deletions or modifications in the adenovirus genome. Thus, heat-sensitive mutations have been introduced into the ts125 mutant, which makes it possible to inactivate 72 kDa DNA binding protein (DBP) (Van der Vlist et al., 1975). Other vectors include deletion of other regions, E4 regions, which are essential for viral replication and / or propagation. The E4 region is actually involved in regulating expression of late genes, stability of late nuclear RNA, abolition of expression of host cell proteins and the efficacy of viral DNA replication. Thus, adenovirus vectors that have deleted the E1 and E4 regions retain transcriptional background noise and very reduced expression of viral genes. Such vectors are described, for example, in applications WO 94/28152, WO 95/02697, PCT / FR96 / 00088. In addition, vectors carrying modifications at the IVa2 gene level have also been described (WO 96/10088).

문헌에 기술되어 있는 재조합 아데노바이러스는 상이한 아데노바이러스 혈청형으로부터 생성된다. 사실상, 구조와 특성이 다소 다양한 각종 아데노바이러스 혈청형이 존재하지만, 이들은 필적할 만한 유전자 구성을 보인다. 더욱 구체적으로 말하면, 재조합 아데노바이러스는 인간 또는 동물 기원일 수 있다. 인간 기원의 아데노바이러스와 관련하여, 바람직하게는 C 그룹으로 분류된 것들, 특히 유형 2(Ad2), 5(Ad5), 7(Ad7) 또는 12(Ad12)의 아데노바이러스를 들 수 있다. 동물기원의 각종 아데노바이러스 가운데는, 바람직하게는 개 기원 및 특히 CAV2 아데노바이러스의 모든 균주를 들 수 있다(예를 들면, 맨해튼 균주 또는 A26/61 (ATCC VR-800). 동물기원의 기타 아데노바이러스는 본원에서 참조로 인용되는 출원 WO 94/26914에 실려있다.Recombinant adenoviruses described in the literature are generated from different adenovirus serotypes. In fact, there are a variety of adenovirus serotypes that vary somewhat in structure and character, but they show comparable genetic makeup. More specifically, the recombinant adenovirus may be of human or animal origin. With respect to adenoviruses of human origin, there are preferably those classified into the C group, in particular those of type 2 (Ad2), 5 (Ad5), 7 (Ad7) or 12 (Ad12). Among the various adenoviruses of animal origin, preferably all strains of dog origin and in particular of CAV2 adenoviruses (for example, Manhattan strain or A26 / 61 (ATCC VR-800). Other adenoviruses of animal origin Is described in application WO 94/26914, which is incorporated herein by reference.

본 발명의 바람직한 양태로서, 재조합 아데노바이러스는 C 그룹 인간 아데노바이러스이다. 더욱 바람직하게는, Ad2 또는 Ad5 아데노바이러스이다.In a preferred embodiment of the invention, the recombinant adenovirus is a C group human adenovirus. More preferably, it is Ad2 or Ad5 adenovirus.

재조합 아데노바이러스는 캡시드화주, 즉 재조합 아데노바이러스 게놈에 결힙된 하나 이상의 기능을 트랜스로 보완할 수 있는 세포주에서 생성된다. 이러한 세포주 중 하나는 예를 들면, 아데노바이러스 게놈의 일부가 통합되어 있는 세포주 293이다. 더욱 정확하게 말하면, 세포주 293은 좌측 ITR, 캡시드화 영역, E1a 및 E1b 영역을 포함한 E1 영역, pIX 단백질을 암호화하는 영역 및 pIVa2 단백질을 암호화하는 영역의 일부를 포함하는 혈청형 5 아데노바이러스(Ad5) 게놈의 좌측 말단(약 11 내지 12 %)을 함유하는 인간 배아 신장 세포주이다. 이 세포주는 E1 영역이 결손된, 즉 E1 영역의 전부 또는 일부가 결힙된 재조합 아데노바이러스를 트랜스 상보화할 수 있고, 고역가의 바이러스 스톡을 생성할 수 있다. 이 세포주는 또한 허용되는 온도(32℃)에서, 추가로 열-민감성 E2 돌연변이를 포함하는 바이러스 스톡을 생성할 수 있다. E1 영역을 상보화할 수 있는 기타 세포주가 특히 인간 폐암 세포 A549(WO 94/28152) 또는 인간 망막아세포[참조문헌: Hum. Gen. Ther. (1996) 215]를 토대로 기술되었다. 더욱이, 아데노바이러스의 수종의 기능을 상보화할 수 있는 세포주도 기술되었다. 특히, E1 및 E4 영역을 상보화할 수 있는 세포주[참조문헌: Yeh et al., J. Virol. 70 (1996) 559; Cancer Gen. Ther. 2 (1995) 322; Krougliak et al., Hum. Gen. Ther. 6 (1995) 1575] 및 E1 및 E2 영역을 상보화할 수 있는 세포주(WO 94/28152, WO 95/02697, wO/27071)를 들 수 있다.Recombinant adenoviruses are produced in capsidated lines, ie cell lines that can complement trans with one or more functions missing in the recombinant adenovirus genome. One such cell line is cell line 293, for example, in which a portion of the adenovirus genome is integrated. More precisely, cell line 293 is a serotype 5 adenovirus (Ad5) genome comprising a left ITR, a capsidized region, an E1 region including E1a and E1b regions, a region encoding a pIX protein and a region encoding a pIVa2 protein. Human embryonic kidney cell line containing the left end of the (about 11 to 12%). This cell line can trans-complement recombinant adenoviruses lacking the El region, ie, all or part of the El region, and can produce high titers of viral stock. This cell line can also produce virus stocks that further include heat-sensitive E2 mutations at acceptable temperatures (32 ° C.). Other cell lines capable of complementing the El region are in particular human lung cancer cells A549 (WO 94/28152) or human retinal blasts [Hum. Gen. Ther. (1996) 215). Moreover, cell lines have been described that can complement the functions of several species of adenoviruses. In particular, cell lines capable of complementing the E1 and E4 regions are described in Yeh et al., J. Virol. 70 (1996) 559; Cancer Gen. Ther. 2 (1995) 322; Krougliak et al., Hum. Gen. Ther. 6 (1995) 1575] and cell lines capable of complementing the El and E2 regions (WO 94/28152, WO 95/02697, wO / 27071).

재조합 아데노바이러스는 바이러스 DNA를 캡시드화주로 도입한 다음, 약 2일 또는 3일 후에 세포를 용해시킴으로써 생성된다(아데노바이러스 사이클의 동역학은 24 내지 36 시간이다). 세포 용해후, 재조합 바이러스 입자는 세슘 클로라이드 구배 원심분리로 분리해낸다.Recombinant adenoviruses are produced by introducing viral DNA into the capsid, followed by lysis of cells about 2 or 3 days (kinetics of the adenovirus cycle is 24 to 36 hours). After cell lysis, the recombinant virus particles are separated by cesium chloride gradient centrifugation.

이러한 공정을 수행하기 위해, 도입된 바이러스 DNA는 임의로 세균(WO 96/25506) 또는 효모(WO 95/03400)에서 작제한, 세포 중으로 형질감염된 완전한 재조합 바이러스 게놈일 수 있다. 바이러스 DNA는 또한, 각각이 재조합 바이러스 게놈의 일부 및 캡시드화 세포 중으로의 도입 후, 바이러스 게놈을 다양한 단편 간의 상동성 재조합에 의해 재구성되도록 허용하는 상동지역을 운반하는 단편 형태로 도입될 수 있다. 따라서 아데노바이러스의 생산을 위한 통상적인 방법은 다음과 같은 단계를 포함한다: 세포(예를 들면, 세포 293)를 배양 접시에서 세포당 3 내지 5 개의 바이러스 입자의 양으로 바이러스 프리스톡으로 감염시키거나(감염 중복도(MOI) = 3 내지 5), 바이러스 DNA로 감염시킨다. 이어서 배양을 40 내지 72 시간 지속한다. 이어서, 바이러스를 일반적으로 수차례의 연속적인 해동 사이클에 의한 세포 용해에 의해 핵으로부터 방출시킨다. 이어서 수득된 세포 용해물을 저속(2000 내지 4000 rpm)으로 원심분리하고 상등액(투명해진 세포 용해물)을 세슘 클로라이드의 존재하에 두 단계로 원심분리한다:To carry out this process, the introduced viral DNA may be a complete recombinant viral genome transfected into cells, optionally constructed in bacteria (WO 96/25506) or yeast (WO 95/03400). Viral DNA may also be introduced in the form of fragments, each carrying a homology region that allows the viral genome to be reconstructed by homologous recombination between the various fragments, after each introduction into a portion of the recombinant viral genome and into the capsidized cells. Thus, conventional methods for the production of adenoviruses include the following steps: infecting cells (eg, cells 293) with virus prestock in an amount of 3 to 5 virus particles per cell in a culture dish, or (Infection redundancy (MOI) = 3-5), infected with viral DNA. The incubation is then continued for 40 to 72 hours. The virus is then released from the nucleus by cell lysis, usually by several successive thawing cycles. The obtained cell lysate is then centrifuged at low speed (2000-4000 rpm) and the supernatant (cleared cell lysate) is centrifuged in two steps in the presence of cesium chloride:

- 배지내 단백질로부터 바이러스를 분리하기 위해 바이러스 밀도(1.34)를 플랭킹하는 밀도 1.25 내지 1.40의 두 세슘 클로라이드 층에서 1.5 시간 동안 제 1 고속 원심분리;First high speed centrifugation for 1.5 h in two cesium chloride layers of density 1.25 to 1.40 flanking virus density (1.34) to separate viruses from proteins in medium;

- 실질적이고 단독의 바이러스 정제 단계를 구성하는 제 2 장기 구배 원심분리(사용된 회전자에 따라 10 내지 40 시간).A second long-term gradient centrifugation (10 to 40 hours depending on the rotor used), which constitutes a substantially single virus purification step.

일반적으로, 제 2 원심분리 단계 후, 바이러스 밴드가 우세하다. 그럼에도 불구하고, 전자 현미경에 의한 검사로 이들이 더 조밀한 밴드의 경우 속이 비거나 파괴된 바이러스 입자이고, 덜 조밀한 밴드의 경우 바이러스 아단위(펩톤, 헥손)인 것으로 나타난 두 미세하고 덜 조밀한 밴드가 관찰된다. 이 단계 후, 바이러스는 니들을 사용하여 투공에 의해 원심분리관에서 수거하고 투석이나 탈염에 의해 세슘을 제거한다.Generally, after the second centrifugation step, the viral band is dominant. Nevertheless, two microscopic and less dense bands showed by electron microscopy that they were hollow or destroyed virus particles for denser bands and viral subunits (peptone, hexone) for less dense bands. Is observed. After this step, the virus is collected in a centrifuge tube by perforation using a needle and the cesium is removed by dialysis or desalting.

수득된 순도수준이 만족스럽지만, 이러한 유형의 고정은 그럼에도 불구하고 특정한 단점이 있다. 특히, 이러한 공정은 인간에 있어 치료용도와 부합하지 않는 반응성인 세슘 클로라이드의 사용에 기초한다. 이러한 이유로 해서, 정제 말미에 세슘 클로라이드를 제거하는 것이 불가피하다. 이러한 공정은 또한 뒤에 언급되는 다른 단점을 지니고 있어 산업적 규모로의 사용이 제한된다.Although the level of purity obtained is satisfactory, this type of fixation nevertheless has certain disadvantages. In particular, this process is based on the use of cesium chloride which is reactive in humans that is incompatible with therapeutic uses. For this reason, it is inevitable to remove cesium chloride at the end of the purification. This process also has other disadvantages, which are mentioned later, which limit its use on an industrial scale.

이러한 문제점을 극복하기 위해, 용해 후, 세슘 클로라이드 구배를 이용하지 않고, 크로마토그래피를 이용하여 바이러스를 정제하는 것이 제안되어 왔다. 따라서, Huyghe 등에 의한 논문[참조: Hum. Gen. Ther. 6 (1996) 1403]은 재조합 아데노바이러스의 정제에 도입된 크로마토그래피의 상이한 유형의 연구에 대하여 기술하고 있다. 이 논문은 특히, 약 음이온-교환 크로마토그래피(DEAE)를 이용한 재조합 아데노바이러스의 정제 연구에 대하여 기술하고 있다. 이전의 연구는 이미 이러한 목적에 이러한 유형의 크로마토그래피의 사용에 대하여 기술하고 있다[참조문헌:Klemperer et al., Virology 9 (1959) 536; Philipson L., Virology 10 (1960) 459: Haruna et al., Virology 13 (1961) 264]. Huyghe 등에 의한 논문에 제시된 결과는 권장된 이온 교환 크로마토그래피 절차의 매우 평범한 효능을 보여준다. 따라서, 수득된 분석력은 평균적이며, 저자들은 바이러스 입자가 여러개의 크로마토그래피 피크에 존재하고; 수율이 낮으며(바이러스 입자 수율: 67%; 감염입자 수율: 49%); 및 이러한 크로마토그래피 단계를 따라 수행된 바이러스 제제가 순수하지 않음을 시사하고 있다. 추가로, 다양한 효소/단백질로 바이러스를 예비처리하는 것이 필수이다. 이 동일 논문은 또한, 매우 불량한 분석 및 매우 낮은 수율(15 내지 20%)을 실증하는 겔 투과 크로마토그래피이 사용에 대한 연구도 기술하고 있다.In order to overcome this problem, it has been proposed to purify the virus using chromatography after dissolution without using cesium chloride gradient. Thus, a paper by Huyghe et al. [Hum. Gen. Ther. 6 (1996) 1403 describe different types of studies of chromatography introduced in the purification of recombinant adenoviruses. This paper describes, in particular, the purification of recombinant adenoviruses using weak anion-exchange chromatography (DEAE). Previous studies have already described the use of this type of chromatography for this purpose (Klemperer et al., Virology 9 (1959) 536; Philipson L., Virology 10 (1960) 459: Haruna et al., Virology 13 (1961) 264]. The results presented in the paper by Huyghe et al. Demonstrate the very mediocre efficacy of the recommended ion exchange chromatography procedure. Thus, the analytical power obtained is average and the authors believe that viral particles are present in several chromatographic peaks; Low yield (viral particle yield: 67%; infected particle yield: 49%); And suggest that the viral preparation performed following this chromatography step is not pure. In addition, it is necessary to pretreat the virus with various enzymes / proteins. This same paper also describes a study on the use of gel permeation chromatography demonstrating very poor analysis and very low yields (15-20%).

본 발명은 재조합 아데노바이러스의 신규 제조방법에 관한 것이다. 본 바명은 또한, 본 공정에 따라 생성된 정제 바이러스 제제에 관한 것이다.The present invention relates to a novel method for producing a recombinant adenovirus. The present invention also relates to purified virus preparations produced according to the present process.

도 1: 실시예 4에 따라서 정제된 아데노바이러스의 안정성 연구.1: Study of stability of adenovirus purified according to Example 4. FIG.

도 2: 실시예 4에 따라서 정제된 아데노바이러스의 HPLC (역상) 분석. 실시예 3의 아데노바이러스와 비교.2: HPLC (reverse phase) analysis of adenovirus purified according to Example 4. FIG. Comparison with the adenovirus of Example 3.

도 3: 반정량적 PCR 및 플라크 분석에 의해서 측정된 세포 293 상등액내 아데노바이러스 Ad-βGal의 방출 카이네틱스.3: Release kinetics of adenovirus Ad-βGal in cell 293 supernatant measured by semiquantitative PCR and plaque assay.

도 4: 한외여과된 아데노바이러스 상등액의 Source Q15에 대한 용출 프로필 (실시예 5.1).4: Elution profile for Source Q15 of ultrafiltered adenovirus supernatant (Example 5.1).

도 5: 한외여과된 아데노바이러스 상등액의 Source Q15 수지에 대한 크로마토그래피에 의해서 수득된 바이러스 피크의 Ressource Q HPLC 분석 (실시예 5.1).Figure 5: Ressource Q HPLC analysis of virus peaks obtained by chromatography on Source Q15 resin of ultrafiltered adenovirus supernatant (Example 5.1).

도 6: (A) 한외여과된 Ad-APOA1 아데노바이러스 상등액의 Source Q15 수지에 대한 용출 프로필 (실시예 5.3); 및 (B) 수득된 바이러스 피크의 HPLC (Resource Q) 분석.Figure 6: (A) Elution profile for Source Q15 resin of ultrafiltered Ad-APOA1 adenovirus supernatant (Example 5.3); And (B) HPLC (Resource Q) analysis of the virus peak obtained.

도 7: (A) 한외여과된 Ad-TK 아데노바이러스 상등액의 Source Q15에 대한 용출 프로필 (실시예 5.3). 수득된 다양한 바이러스 분획(피크의 시작 및 끝)의 HPLC (Resource Q) 분석: (B) 분획 F2, 피크의 중간; (C) 분획 F3, 피크의 한계; (D) 분획 F4, 피크의 끝.Figure 7: (A) Elution profile for Source Q15 of ultrafiltered Ad-TK adenovirus supernatant (Example 5.3). HPLC (Resource Q) analysis of the various virus fractions obtained (start and end of peak): (B) Fraction F2, middle of peak; (C) fraction F3, limit of peaks; (D) Fraction F4, end of peak.

도 8: 아데노바이러스 생성 세포 배양액의 농축된 상등액의 Mono Q 수지에 대한 용출 프로필 (실시예 5.4). BG25F1: 세슘에서 농축되고 정제된 바이러스 상등액. BG25C: 농축 감염된 상등액.8: Elution profile for Mono Q resin of concentrated supernatant of adenovirus producing cell culture (Example 5.4). BG25F1: Virus supernatant concentrated and purified in cesium. BG25C: concentrated infected supernatant.

도 9: 아데노바이러스 생성 세포 배양액의 농축된 상등액의 POROS HQ 겔에 대한 용출 프로필 (실시예 5.4). BG25F1: 세슘에서 농축되고 정제된 바이러스 상등액. BG25C: 농축 감염된 상등액.9: Elution profile for POROS HQ gel of concentrated supernatant of adenovirus producing cell culture (Example 5.4). BG25F1: Virus supernatant concentrated and purified in cesium. BG25C: concentrated infected supernatant.

도 10A 및 B: 한외여과된 아데노바이러스 상등액의 S1000HR/Superdex 200HR에 대한 겔 투과 정제 프로필 (실시예 6).10A and B: Gel Permeation Tablet Profile for S1000HR / Superdex 200HR of Ultrafiltered Adenovirus Supernatant (Example 6).

도 11: 본 발명에 따라서 정제된 아데노바이러스 스톡의 전자 현미경에 의한 분석.11: Analysis by electron microscopy of adenovirus stocks purified according to the invention.

도 12: 밀도 1.27 바이러스 밴드의 전자 현미경에 의한 분석.12: Analysis by electron microscopy of density 1.27 virus bands.

일반적인 분자 생물학 기술Common molecular biology techniques

통상적으로 분자 생물학에 사용되는 방법, 예를 들면, 플라스미드 DNA의 예비 추출, 세슘 클로라이드 구배에서 플라스미드 DNA의 원심분리, 아가로스 또는 아크릴아미드 겔 전기영동, 전기용출에 의한 DNA 단편의 정제, 단백질의 페놀 또는 페놀-클로로포름 추출, 염수 매질에서 DNA의 에탄올 또는 이소프로판올 침전, 에세리히아 콜라이에서의 형질전환 등이 당해분야 기술자들에게 익히 공지되어 있고 문헌[참조: Maniatis T. et al., "Molecular Cloning, a Laboratory Manual", Cold Spring Haebor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 1982; Ausubel F.M. et al., (eds), "Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley & Sons, New York, 1987]에 광범위하게 기재되어 있다.Methods commonly used in molecular biology, such as preliminary extraction of plasmid DNA, centrifugation of plasmid DNA in a cesium chloride gradient, electrophoresis of agarose or acrylamide gels, purification of DNA fragments by electrolysis, phenols of proteins Or phenol-chloroform extraction, ethanol or isopropanol precipitation of DNA in saline media, transformation in Escherichia coli and the like are well known to those skilled in the art and described in Maniatis T. et al., “Molecular Cloning, a Laboratory Manual ", Cold Spring Haebor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, 1982; Ausubel F.M. et al., (eds), "Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley & Sons, New York, 1987.

pBR322 및 PUC 유형 플라스미드 및 M13 시리즈의 파지가 시판 기원의 것이다 (Bethesda Research Laboratories). 라이게이션을 위해서, DNA 단편을 아가로스 또는 아크릴아미드 겔 전기영동에 의해서 크기에 따라 분리하고 페놀 또는 페놀/클로로포름 혼합물로 추출하며, 에탄올로 침전시킨 다음 공급자의 권장에 따라 파지 T4 DNA 리가제 (Biolabs)의 존재하에 공급자의 사양서에 따라서 배양한다. 뻗어 나오는 5' 말단을 채움은 공급자의 사양서에 따라서 이. 콜라이 DNA 폴리머라제 I(Biolabs)의 클레노브 단편으로 수행할 수 있다. 뻗어 나오는 3' 말단의 파괴는 제조자의 권고에 따라서 사용된 파지 T4 DNA 폴리머라제(Biolabs)의 존재하에 수행된다. 뻗어 나오는 5' 말단의 파괴는 S1 뉴클레아제로의 통제된 처리에 의해서 수행된다.Phages of pBR322 and PUC type plasmids and the M13 series are of commercial origin (Bethesda Research Laboratories). For ligation, DNA fragments are separated by size by agarose or acrylamide gel electrophoresis, extracted with a phenol or phenol / chloroform mixture, precipitated with ethanol and phage T4 DNA ligase (Biolabs as recommended by the supplier). Culture in accordance with the supplier's specifications in the presence of Filling out the 5 'end extends in accordance with the supplier's specifications. It can be performed with Klenob fragment of E. coli DNA polymerase I (Biolabs). Breakage of the extending 3 'end is carried out in the presence of phage T4 DNA polymerase (Biolabs) used according to the manufacturer's recommendations. Destruction of the extending 5 'end is carried out by controlled treatment with S1 nucleases.

합성 올리고디옥시뉴클레오티드에 의한 시험관내 부위-인도 돌연변이현상이 Taylor 등 [참조문헌: Nucleic Acids Res. 13 (1985) 8749-8764]에 의해서 기재된 방법에 따라서 Amersham에 의해서 기여된 키트를 사용하여 수행될 수 있다. 소위 PCR 기술[참조문헌: Polymerase-catalyzed Chain Reaction, Saiki R.K. et al., Science 230 (1985) 1350-1354; Mullis K.B. and Faloona F.A. Meth. Enzym. 155 (1987) 335-350]에 의한 DNA 단편의 효소 증폭이 제조자의 사양서에 따라서 DNA 열 순환기(Perkin Elmer)를 사용하여 수행될 수 있다. 뉴클레오티드 서열의 다양화는 Sanger 등[참조문헌: Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74 (1977) 5463-5467]에 의해서 개발된 방법에 의해서 Amersham에 의해 기여된 키트를 사용하여 수행될 수 있다.In vitro site-induced mutagenesis by synthetic oligodioxynucleotides is described by Taylor et al. Nucleic Acids Res. 13 (1985) 8749-8764 can be performed using a kit contributed by Amersham. So-called PCR techniques [Ref. Polymerase-catalyzed Chain Reaction, Saiki R.K. et al., Science 230 (1985) 1350-1354; Mullis K.B. and Faloona F.A. Meth. Enzym. 155 (1987) 335-350 can be carried out using a DNA thermal cycler (Perkin Elmer) according to the manufacturer's specifications. Diversification of nucleotide sequences is described by Sanger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74 (1977) 5463-5467, by a kit contributed by Amersham.

실시예Example

실시예 1: 세포주의 캡시드화Example 1: Capsidation of Cell Lines

본 발명의 프레임워크 내에서 사용되는 캡시드화 세포는 아데노바이러스에 의해서 감염될 수 있고 치료 목적 용도와 양립할 수 있는 세포주로부터 수득될 수 있다. 이들은 좀더 바람직하게는 하기의 세포주 중에서 선택된다:Capsidated cells used within the framework of the present invention can be obtained from cell lines that can be infected by adenoviruses and are compatible with therapeutic purposes. These are more preferably selected from the following cell lines:

- 293 세포주:293 cell lines:

293 세포주는 좌측 ITR, 캡시드화 영역, E1a와 E1b를 포함하는 E1 영역, pIX 단백질을 암호화하는 영역 및 pIVa2 단백질을 암호화하는 영역을 포함하는 혈청형 5 아데노바이러스 (Ad5) 게놈의 좌측 말단 (약 11 내지 12 %)를 함유하는 인간 배아 신장 세포주이다 [참조문헌: J. Gen. Virol. 36 (1977) 59)]. 이러한 세포주는 E1 영역에 대해 결손이 있는 즉, E1 영역 모두 또는 일부가 부족한 재조합 아데노바이러스를 트랜스상보화할 수 있고, 고 역가의 바이러스 스톡을 생성할 수 있다.The 293 cell line has the left end of the serotype 5 adenovirus (Ad5) genome, including the left ITR, the encapsidation region, the E1 region comprising E1a and E1b, the region encoding the pIX protein and the region encoding the pIVa2 protein (about 11 To 12%) in human embryonic kidney cell lines. J. Gen. Virol. 36 (1977) 59). Such cell lines can trans complement the recombinant adenovirus that is defective for the El region, ie lacks all or part of the El region, and can produce high titers of viral stock.

- A459 세포주A459 cell line

아데노바이러스 E1 영역을 보완하는 세포가 A549 세포로부터 작제된다 (Imler et al., Gene Ther. (1996) 75). 이들 세포는 좌측 ITR이 부족하고 유도성 프로모터의 조절하에 배치된 E1 영역의 제한된 단편을 함유한다.Cells complementing the adenovirus El region are constructed from A549 cells (Imler et al., Gene Ther. (1996) 75). These cells lack the left ITR and contain a limited fragment of the El region located under the control of an inducible promoter.

- HER 세포주HER cell line

인간 배 망막 (HER) 세포를 아데노바이러스로 감염시킨다 (참조문헌: Byrd et al., Oncogene 2 (1998) 477). 이러한 세포로부터 제조된 아데노바이러스 캡슐화 세포가 예를 들면, 출원 WO 94/28152 또는 Fallaux 등에 의한 논문(Hum. Gene Ther. (1996) 215)에 기재되었다. 좀더 상세하게는 Ad5 아데노바이러스 게놈의 E1 영역을 포함하는 세포주 911, HER 세포의 게놈으로 통합된 뉴클레오티드 79에서 뉴클레오티드 5789를 언급할 수 있다. 이러한 세포주는 E1 영역에 대해 결합성인 바이러스 생성을 허용한다.Human embryonic retinal (HER) cells are infected with adenovirus (Byrd et al., Oncogene 2 (1998) 477). Adenovirus encapsulated cells prepared from such cells are described, for example, in the application WO 94/28152 or in Fallaux et al. (Hum. Gene Ther. (1996) 215). More specifically, reference may be made to cell line 911 comprising the El region of the Ad5 adenovirus genome, nucleotide 5789 at nucleotide 79 integrated into the genome of HER cells. This cell line allows for virus production that is binding to the El region.

- IGRP2 세포IGRP2 cells

IGRP2 세포는 세포 293으로부터 E4 영역의 작용성 단위의 통합에 의해서 유도성 프로모터의 조절하에 수득된 세포이다. 이러한 세포는 E1 및 E4 영역에 대해 결손이 있는 바이러스의 생성을 허용한다 (Yeh et al., J. Virol (1996) 70).IGRP2 cells are cells obtained under the control of an inducible promoter by incorporation of functional units of the E4 region from cell 293. Such cells allow the production of viruses that are missing for the El and E4 regions (Yeh et al., J. Virol (1996) 70).

- VK 세포-VK cells

VK 세포 (VK2-20 및 VK10-9)는 세포 293으로부터 유도성 프로모터의 조절하에 전체 E4 영역 및 pIX 단백질을 암호화하는 영역의 통합에 의해서 수득되는 세포이다. 이러한 세포는 E1 및 E4 영역에 대해 결손이 있는 바이러스의 생성을 허용한다 (Krougliak et al., Hum. Gene Ther. 6 (1995) 1575).VK cells (VK2-20 and VK10-9) are cells obtained by integration of the entire E4 region and the region encoding the pIX protein under the control of an inducible promoter from cell 293. Such cells allow the generation of viruses that are missing for the El and E4 regions (Krougliak et al., Hum. Gene Ther. 6 (1995) 1575).

- 293E4 세포293E4 cells

293E4 세포는 세포 293으로부터 전체 E4 영역의 통합에 의해서 수득된 세포이다. 이러한 세포는 E1 및 E4 영역에 대해 결손이 있는 바이러스의 생성을 허용한다 (WO 95/02597; Cancer Gene Ther. (1995) 322).293E4 cells are cells obtained by integration of the entire E4 region from cell 293. Such cells allow the generation of viruses that are missing for the El and E4 regions (WO 95/02597; Cancer Gene Ther. (1995) 322).

실시예 2: 사용된 바이러스Example 2: Viruses Used

하기의 실시예 상황에서 생성되는 바이러스는 이. 콜라이 LacZ 마커 유전자 (Ad-βGal), 허프스 바이러스 티미딘 키나제 (Ad-TK)를 암호화하는 유전자를 함유하는 아데노바이러스, 인간 p53 종양 억제제 단백질을 암호화하는 유전자를 함유하는 아데노바이러스 및 아포리포프로테인 A1을 암호화하는 바이러스 (Ad-apoAI)이다. 이러한 바이러스는 Ad5 혈청형으로부터 유도되고 하기의 구조를 지닌다:Viruses produced in the following example situations are described in E. Adenoviral containing gene encoding E. coli LacZ marker gene (Ad-βGal), Huffs virus thymidine kinase (Ad-TK), adenovirus and apolipoprotein A1 containing gene encoding human p53 tumor suppressor protein It is a virus that encrypts (Ad-apoAI). Such viruses are derived from the Ad5 serotype and have the following structure:

- 예를 들면, 뉴클레오티드 382 (HinfI 부위)에서 3446 (Sau3a 부위)를 포함하는 E1 영역에서의 결실.A deletion in the El region comprising, for example, 3446 (Sau3a region) at nucleotide 382 (HinfI site).

- 결실의 수준으로 삽입된, RSV 또는 CMV 프로모터의 조절하에서의 유전자 발현을 위한 카세트.Cassette for gene expression under the control of the RSV or CMV promoter, inserted at the level of deletion.

- E3 영역에서의 결실.Deletion in the E3 region.

이러한 바이러스의 작제가 참조문헌 (WO 94/25073, WO 95/14102, FR 95/01632, Stratford-Perricaudet et al., J. Clin. Invest (1992) p626)에 기재되어 있다. 기타 작제물, 특히 기타 이종 유전자 및/또는 기타 결실 (예를 들면, E1/E4 또는 E1/E2)을 운반하는 바이러스가 본 발명의 방법에 따라서 생성될 수 있음이 이해된다.The construction of such viruses is described in WO 94/25073, WO 95/14102, FR 95/01632, Stratford-Perricaudet et al., J. Clin. Invest (1992) p626. It is understood that viruses carrying other constructs, particularly other heterologous genes and / or other deletions (eg, E1 / E4 or E1 / E2), can be produced according to the methods of the present invention.

실시예 3: 세포 용해에 의한 바이러스의 생성Example 3: Generation of Virus by Cell Lysis

본 실시예는 생성된 바이러스를 회수하기 위해서 캡시드화 세포를 용해함에 있어서 바이러스 생성을 위한 이전의 기술을 재생한다.This example regenerates previous techniques for virus production in lysing capsidated cells to recover the virus produced.

세포 293을 세포당 3 내지 5 바이러스의 양으로 (감염의 중복도 MOI = 3 내지 5) Ad-βGal 또는 Ad-TK 바이러스 (실시예 2)의 프리스톡을 갖는 배양 디쉬에서 80 내지 90 % 합류로 감염시킨다. 배양을 40 내지 72 시간 동안 지속하고, 수득 시기를 현미경 하에서 둥글게 되고, 좀더 굴절성이고 배양 지지체에 점점 더 약하게 접착하는 세포를 관찰함으로써 결정한다. 문헌에서, 바이러스 사이클의 동력학은 24 내지 36 시간 동안 지속한다.Cells 293 with 80 to 90% confluence in culture dishes with prestock of Ad-βGal or Ad-TK virus (Example 2) at an amount of 3 to 5 viruses per cell (duplication of infection MOI = 3 to 5) Infect. Incubation is continued for 40 to 72 hours, and the timing of obtaining is determined by observing cells that are rounded under the microscope and are more refractive and adhere to the culture support more and more weakly. In the literature, the kinetics of virus cycles last for 24 to 36 hours.

실험실 생산의 수준에서, 세포를 손실하지 않으면서 수득 시기에 감염 배지를 제거한 다음 이들을 최소 용적으로(농도 인자는 배양물 크기에 따라 약 10 내지 100 배) 수득하기 위해서 분리하기 전에 세포를 수득함이 중요하다.At the level of laboratory production, the cells are harvested prior to separation to remove the infection medium at the time of harvest without losing the cells and then to obtain them in a minimum volume (concentration factor is about 10 to 100 times depending on the culture size). It is important.

이어서 바이러스를 3 내지 6 연속 해동 사이클(-70 ℃에서 에탄올-건조, 37 ℃에서 수조)에 의해서 핵으로부터 방출시킨다.Virus is then released from the nucleus by 3 to 6 consecutive thaw cycles (ethanol-dried at −70 ° C., water bath at 37 ° C.).

이어서 수득된 세포 용해물을 저속(2000 내지 4000 rpm)에서 원심분리한 다음 상등액(맑아진 세포 용해물)을 하기의 두 단계로 세슘 클로라이드 구배 상에서 한외여과에 의해서 정제한다:The cell lysate obtained is then centrifuged at low speed (2000-4000 rpm) and then the supernatant (clear cell lysate) is purified by ultrafiltration on a cesium chloride gradient in two steps:

- 바이러스를 배지 중의 단백질로부터 제거하기 위해서 바이러스 밀도 (1.34)를 플랭킹하는 두 세슘 층 1.25 및 1.40에서 1.5 시간, 35000 rpm, 로터 sw 41의 제 1 신속 한외여과; 로터는 처리될 용적에 따라서 "스윙잉" 로터 (Sw28, Sw41 Beckman)이거나 고정각 로터 (Ti 45, Ti70, Ti 70.1 Beckman)일 수 있다.First rapid ultrafiltration of two cesium layers 1.25 and 1.40 for 1.5 hours, 35000 rpm, rotor sw 41 to flank the virus density (1.34) to remove the virus from the protein in the medium; The rotor may be a "swinging" rotor (Sw28, Sw41 Beckman) or a fixed angle rotor (Ti 45, Ti70, Ti 70.1 Beckman) depending on the volume to be treated.

- 제 2의 더욱 장시간의 구배 한외여과 (사용되는 로터에 따라 10 내지 40 시간), 예를 들면, 실질적인 단독의 바이러스 정제를 구성하는 sw 41 로터에서 35000 rpm으로 18 시간 동안. 바이러스는 1.34의 밀도에서 평형으로 선형 구배로 존재한다.A second, longer gradient gradient ultrafiltration (10 to 40 hours depending on the rotor used), for example 18 hours at 35000 rpm in a sw 41 rotor constituting substantially alone virus purification. Viruses exist in a linear gradient in equilibrium at a density of 1.34.

일반적으로 이 단계에서, 바이러스 밴드가 우세하다. 그럼에도 불구하고, 두 개의 미세하고 덜 짙은 밴드가 종종 관찰되고 전자 현미경에 의한 검사는 이것이 비어 있거나 부서진 바이러스이고 가장 덜 짙은 밴드에 대해서는 바이러스 서브단위(펜톤, 헥손)임을 예시하였다. 이러한 단계 후, 바이러스는 바늘로 관통함으로써 수득되고 세슘은 G25 상의 투석 또는 탈염에 의해서 제거된다.Generally at this stage, viral bands prevail. Nevertheless, two fine and darker bands are often observed and examination by electron microscopy has demonstrated that this is an empty or broken virus and the virus subunits (Fenton, Hexon) for the least dark bands. After this step, the virus is obtained by penetrating with a needle and cesium is removed by dialysis or desalting on G25.

실시예 4: 상등액에서 바이러스의 생성Example 4: Generation of Virus in Supernatant

본 실시예는 하기 자연 방출물의 회수에 의한 바이러스 생성 실험에 관해 기술하고 있다. 한외여과로 바이러스를 수거한 다음 세슘 클로라이드로 정제한다.This example describes a virus production experiment by recovery of the following natural releases. The virus is collected by ultrafiltration and purified by cesium chloride.

4.1. 과정4.1. process

본 방법에서는, 실시예 3과는 달리, 감염 후 40 내지 72시간 만에 세포가 수거되지 않지만, 동결-해동 사이클을 수행할 필요없이 8 내지 12일간 배양되어 전체 세포 용해물을 얻게 된다. 바이러스는 상등액에 존재한다.In the present method, unlike Example 3, cells are not collected only after 40 to 72 hours after infection, but are cultured for 8 to 12 days without performing a freeze-thaw cycle to obtain whole cell lysate. The virus is present in the supernatant.

점감 다공성(10 ㎛/1.0 ㎛/0.8-0.2㎛)의 깊이 필터상에서의 여과를 통해 상등액을 정화시킨다.The supernatant is clarified through filtration on a depth filter of tapered porosity (10 μm / 1.0 μm / 0.8-0.2 μm).

바이러스는 0.1 ㎛의 크기를 가지며 이 단계에서, 최하 다공성(0.22 ㎛)에서 필터상의 보유력에 의한 바이러스의 손실은 관찰되지 않는다.The virus has a size of 0.1 μm and at this stage no loss of virus due to retention on the filter at the lowest porosity (0.22 μm) is observed.

일단 정화되면, 상등액을 300 kDa의 절단부를 지닌 밀리포어 나선막상의 접선 한외여과를 통해 농축한다.Once clarified, the supernatant is concentrated via tangential ultrafiltration on a Millipore spiral membrane with a cut of 300 kDa.

본 발명에서 보고된 실험에서, 농축 인자는 100 ㎖인 시스템의 경계 부피로 표시된다. 이 시스템을 이용하여 4 내지 20 리터의 상등액 부피를 농축하여, 어려움없이 20 내지 100배의 농축 인자에 상응하는 100 ㎖ 내지 200㎖의 농축물 부피를 얻을 수 있다.In the experiments reported herein, the concentration factor is expressed as the boundary volume of the system which is 100 ml. This system can be used to concentrate the supernatant volume of 4 to 20 liters to obtain a concentrate volume of 100 ml to 200 ml, corresponding to a concentration factor of 20 to 100 times without difficulty.

농축물을 0.22 ㎛상에서 여과한 다음 실시예 3에 기재된 세슘 클로라이드상의 원심분리에 의해 정제하고, 이후 투석 단계를 진행한다.The concentrate is filtered over 0.22 μm and then purified by centrifugation on cesium chloride as described in Example 3, followed by the dialysis step.

4.2. 결과4.2. result

순도water

세포내 바이러스 튜브(실시예 3)가 때때로 바이러스 밴드를 띤 응괴(지질, 단백질)와 함께 흐린 형태를 갖지만, 본 발명 공정에 의해 세슘 클로라이드상의 제 1 원심분리 단계 이후 수득된 바이러스 제조물은 상층상을 지속시키는 매질 중의 불순물로부터 이미 잘 분리된 바이러스 밴드를 지닌다. Resource Q 칼럼상의 고-해상 액체 크로마토그래피 분석(비교 실시예 5)은 또한 감염된 상등액의 한외 여과에 의해 수득된 개시 물질의 순도에서 핵산 불순물(1.8보다 크거나 동일한 OD 260/280비) 및 단백질 불순물(1보다 작은 OD 260/280비)이 감소되는 이러한 결과를 보여준다.Although intracellular viral tubes (Example 3) sometimes have a cloudy form with viral banded clots (lipids, proteins), virus preparations obtained after the first centrifugation step on cesium chloride by the process of the present invention are supernatant. It has a virus band already well separated from impurities in the sustaining medium. High-resolution liquid chromatography analysis on a Resource Q column (Comparative Example 5) also shows nucleic acid impurities (OD 260/280 ratio greater than or equal to 1.8) and protein impurities in the purity of the starting material obtained by ultrafiltration of the infected supernatant. (OD 260/280 ratio less than 1) shows this result.

37℃의 상등액에서 바이러스의 안정성Virus Stability in Supernatant at 37 ° C

플라크 분석법에 의해, 37℃에서 감염 후 다양한 배양 시간때에 수집된 감염성 배양 상등액의 분취량을 적정하여 바이러스의 안정성을 관찰한다. 하기에 나타나 있다:By plaque assay, aliquots of infectious culture supernatants collected at various incubation times after infection at 37 ° C. are titrated to observe the stability of the virus. It is shown below:

Ad-TK 바이러스:Ad-TK Virus:

· 감염 10일 후 적정량 = 3.5 x 108pfu/㎖Titration after 10 days of infection = 3.5 × 10 8 pfu / ml

· 감염 20일 후 적정량 = 3.3 x 108pfu/㎖ Ad-βGal 바이러스Proper dose 20 days after infection = 3.3 x 10 8 pfu / ml Ad-βGal virus

· 감염 8일 후 적정량 = 5.8 x 108pfu/㎖Titration 8 days post infection = 5.8 x 10 8 pfu / ml

· 감염 9일 후 적정량 = 3.6 x 108pfu/㎖Titration 9 days after infection = 3.6 x 10 8 pfu / ml

· 감염 10일 후 적정량 = 3.5 x 108pfu/㎖Titration after 10 days of infection = 3.5 × 10 8 pfu / ml

· 감염 13일 후 적정량 = 4.1 x 108pfu/㎖Titration 13 days after infection = 4.1 x 10 8 pfu / ml

· 감염 16일 후 적정량 = 5.5 x 108pfu/㎖Titer 16 days after infection = 5.5 x 10 8 pfu / ml

얻어진 결과는 감염 후 적어도 20일 이하에서, 상등액의 적정량이 분석의 정밀도의 범위내에서 안정함을 보여준다. 또한, 도 1은 용출 완충액에서, 바이러스가 -80℃ 및 -20℃에서 적어도 8개월간 안정함을 보여준다.The results obtained show that, at least 20 days after infection, the appropriate amount of supernatant is stable within the range of precision of the assay. 1 also shows that in elution buffer, the virus is stable for at least 8 months at −80 ° C. and −20 ° C. FIG.

제조물의 특정 감염성Specific infectivity of the preparation

HPLC로 측정된 바이러스 입자수 : pfu수의 비에 상응하는 이러한 파라미터는 바이러스 제조물의 감염성에 관한 정보를 제공한다. FDA의 추천에 따르면, 이는 100 이하여야 한다. 이러한 파라미터는 하기와 같이 측정된다: 세포 293을 함유한 두가지 부류의 배양 플라스크를 동일한 조건하에 동일한 바이러스 사전 저장물과 동시에 나란히 감염시킨다. 재조합 Ad-βgal 아데노바이러스에 대해 본 실험을 수행한 다음, Ad-TK 아데노바이러스에 대해 이 실험을 반복한다. 각 아데노바이러스의 경우, 일련의 플라스크는 감염 후 48시간만에 수거되고 이는 동결-해동 후 세슘 구배상에서 정제된 세포내 바이러스의 생성으로 간주된다. 나머지 플라스크를 감염 후 10일간 배양하고 상등액에서 바이러스를 수거한다. 수득된 정제 제조물을 플라크 분석으로 적정하고 6.4 M 구아니딘에서 샘플을 변성시킨 후 C4 Vydac 4.6 x 50 ㎜ 칼럼상의 역상 HPLC에 의해 PVII 단백질의 농도를 측정함으로써 바이러스 입자 총 수의 정량을 측정한다. PVII 단백질의 양은 720 PVII 사본/바이러스를 고려하면 바이러스 입자 수와 상관 관계가 있다(Horwitz, Virology, second edition (1990)). 흡광도의 특정 사멸 계수 1.0 유닛이 1.1 x 1012입자/㎖임을 고려할 때, 본 방법은 260 ㎚에서 농도계법에 의해 정제된 제조물상의 바이러스 입자의 측정값과 상관 관계가 있다.These parameters corresponding to the ratio of virus particle number to pfu number measured by HPLC provide information regarding the infectivity of the virus preparation. According to FDA's recommendation, this should be less than 100. These parameters are measured as follows: Two classes of culture flasks containing cells 293 are simultaneously infected side by side with the same virus prestore under the same conditions. This experiment is performed for recombinant Ad-βgal adenovirus and then this experiment is repeated for Ad-TK adenovirus. For each adenovirus, a series of flasks were collected 48 hours after infection and this is considered the production of purified intracellular virus on cesium gradient after freeze-thaw. The remaining flasks are incubated for 10 days after infection and the virus is harvested from the supernatant. The resulting tablet preparation is titrated by plaque assay and the sample is denatured in 6.4 M guanidine and the quantification of the total number of virus particles is determined by measuring the concentration of PVII protein by reverse phase HPLC on a C4 Vydac 4.6 x 50 mm column. The amount of PVII protein correlates with the number of virus particles when considering 720 PVII copies / viruses (Horwitz, Virology, second edition (1990)). Considering that the specific killing factor 1.0 unit of absorbance is 1.1 x 10 12 particles / ml, the method correlates with the measurement of viral particles on the preparation purified by densitometry at 260 nm.

얻어진 결과는 Ad-βgal 바이러스의 경우, 이 비율이 상등액 바이러스의 경우 16이고 세포내 바이러스의 경우 45임을 보여준다. Ad-TK 바이러스의 경우, 이 비율은 상등액법에서 바이러스 수거의 경우 78이고 세포내법에 의해 수거된 바이러스의 경우 80이다.The results obtained show that for Ad-βgal virus this ratio is 16 for supernatant virus and 45 for intracellular virus. For Ad-TK viruses, this ratio is 78 for virus harvest in the supernatant method and 80 for virus harvested by the intracellular method.

전자 현미경에 의한 분석:Analysis by electron microscope:

본 방법은 빈 입자의 존재 또는 함께 정제된 바이러스 서브유닛의 부재를 검출하고, 정제된 바이러스 제조물의 단백질 오염 또는 바이러스 입자의 비-분리성 집합체의 존재를 평가할 수 있다.The method can detect the presence of empty particles or the absence of purified virus subunits together and assess the protein contamination of purified virus preparations or the presence of non-separable aggregates of viral particles.

과정: 20 ㎕의 샘플을 탄소 그리드상에 침착시킨 다음 실험을 위해 1.5%의 우라닐 아세테이트를 이용한 음성 염색으로 처리한다. 실험을 위해, 50 kV 내지 100 kV Jeol 1010 전자 현미경을 사용한다.Procedure: 20 μl of sample is deposited on a carbon grid and then subjected to negative staining with 1.5% uranil acetate for experiments. For the experiment, a 50 kV to 100 kV Jeol 1010 electron microscope is used.

결과: 상등액에서 수거된 바이러스상에서 수행된 분석은 불순물, 집합체 및 빈 바이러스 입자없이, 맑은 제조물을 보여준다. 이는 또한 바이러스 섬유 및 일정한 기하 구조와 구별될 수 있다. 이러한 결과는 본 발명에 따라 수득된 양질의 바이러스 입자를 확인시킨다.Results: Analysis performed on the virus collected from the supernatant shows clear preparations, without impurities, aggregates and empty virus particles. It can also be distinguished from viral fibers and certain geometries. These results confirm the high quality viral particles obtained according to the present invention.

단백질 프로필의 HPLC 및 SDS-PAGE 분석HPLC and SDS-PAGE Analysis of Protein Profiles

SDS-PAGE 분석:SDS-PAGE Analysis:

20 ㎕의 샘플을 Laemmli 완충액(Nature 227 (1970) 680-685)에서 희석하고, 95℃에서 5분간 분해시킨 다음 Novex 겔 1 ㎜ x 10 웰 구배 4 내지 20%상으로 로딩한다. 이동 후, 겔을 쿠마시 블루로 염색하고, Pharmacia VDS Image Master상에서 분석한다. 분석은 문헌 자료(Lennart Philipson, 1984 H.S. Ginsberg editors, Plenum press, 310-338)에 따라 상등액에서 수거된 바이러스에 대한 전기 영동 프로필을 보여준다.20 μl of the sample is diluted in Laemmli buffer (Nature 227 (1970) 680-685), digested at 95 ° C. for 5 min and loaded onto a Novex gel 1 mm × 10 well gradient 4-20%. After migration, the gels are stained with Coomassie Blue and analyzed on Pharmacia VDS Image Master. The analysis shows the electrophoretic profile for the virus collected from the supernatant according to literature data (Lennart Philipson, 1984 H.S. Ginsberg editors, Plenum press, 310-338).

역상 HPLC 분석:Reverse Phase HPLC Analysis:

도 2는 세포내적으로 수거된 두가지 바이러스 샘플과 상등액법으로 정제된 바이러스 샘플로부터 수득된 3 크로마토그램의 겹침을 보여준다. 실험 조건은 하기와 같다: Vydac 칼럼 참조 번호 254 Tp 5405, RPC4 4.6 x 50 ㎜, 용매\A: H20+TFA 0.07%; 용매 B: CH3CN+TFA 0.07%, 직선 구배: T = 0분 %B=25; T-50분 %B=50%; 유동율 = 1 ㎖/분, 검출기=215 ㎚. 크로마토그램은 각 피크의 상대적인 강도에서 차이없이, 샘플간의 완벽한 확인을 보여준다. 각 피크의 성질은 서열에 의해 결정되고 단백질 존재가 모든 바이러스 기원임을 보여준다(하기 표 참조).Figure 2 shows an overlap of three chromatograms obtained from two viral samples collected intracellularly and virus samples purified by supernatant method. Experimental conditions are as follows: Vydac column reference no. 254 Tp 5405, RPC4 4.6 x 50 mm, solvent \ A: H20 + TFA 0.07%; Solvent B: CH 3 CN + TFA 0.07%, linear gradient: T = 0 min% B = 25; T-50 min% B = 50%; Flow rate = 1 ml / min, detector = 215 nm. The chromatogram shows complete confirmation between the samples, with no difference in the relative intensity of each peak. The nature of each peak is determined by the sequence and shows that the protein presence is of all viral origin (see table below).

피크 (Min)Peak (Min) 동정Sympathy 19-2019-20 전구체 PVIIPrecursor PVII 21-2221-22 전구체 PVII; 전구체 PX 1-12Precursor PVII; Precursor PX 1-12 27-2827-28 전구체 PVI; 전구체 PXPrecursor PVI; Precursor PX 32-3332-33 전구체 PXPrecursor PX 3434 35-3635-36 성숙 PVIIMature PVII 3737 성숙 PVII; PVIII 전구체Mature PVII; PVIII precursor 39-4139-41 성숙 PVIMature PVI 4545 pXpX 4646 pIXpIX

시험관 내에서 형질도입 및 세포독성의 효율 분석Efficiency analysis of transduction and cytotoxicity in vitro

MOI를 증가시키기 위해 24-웰 플레이트에 HCT116 세포를 감염시키고 크리스탈 바이올렛 염색 기법을 이용하여, 감염 후 2 및 5일만에, 비-감염된 대조군과 비교하여 생존 세포의 퍼센티지를 측정함으로써 독성 분석을 행한다.Toxicity assays are performed by infecting HCT116 cells in 24-well plates to increase MOI and using crystal violet staining techniques, two and five days after infection, measuring the percentage of viable cells compared to non-infected controls.

결과는 하기 표에 나타나 있다:The results are shown in the table below:

아데노바이러스Adenovirus MOI=3.0MOI = 3.0 MOI=10.0MOI = 10.0 MOI=30.0MOI = 30.0 MOI=100.0MOI = 100.0 상등액, 2일Supernatant, 2 days 91%91% 96%96% 87%87% 89%89% 상등액, 5일Supernatant, 5 days 97%97% 90%90% 10%10% <5%<5%

형질 도입 효율의 분석Analysis of Transduction Efficiency

AD-βGal 아데노바이러스의 경우, 바이러스 입자의 농도를 증가시킴에 따라, 24-웰 플레이트에서 배양된 복제 비-허용성 W162 세포를 감염시켜 제조물의 형질 도입 효율을 측정한다. 침착된 동량의 바이러스 입자의 경우, X-gal을 기질로 배양한 후 감염 48시간만에 베타-갈락토시다제 활성을 발현시키는 세포를 헤아린다. 각 청색 세포를 하나의 형질 도입 단위(TDU)로 계산하고, 여기서 나온 결과에 샘플의 형질도입 단위로서의 농도를 얻기위해 샘플의 희석배수를 곱한다. 바이러스 입자의 농도 : TDU 농도비를 계산하여 형질 도입 효율로 표현한다. 얻어진 결과는 정제된 바이러스가 시험관 내에서 우수한 형질도입 효율을 가짐을 보여준다.For AD-βGal adenovirus, as the concentration of viral particles increases, replication non-perceptible W162 cells cultured in 24-well plates are infected to determine the transduction efficiency of the preparation. For the same amount of viral particles deposited, cells that express beta-galactosidase activity are counted 48 hours after infection with X-gal incubated with the substrate. Each blue cell is counted as one transduction unit (TDU), and the result is multiplied by the dilution factor of the sample to obtain the concentration as the transduction unit of the sample. The concentration of virus particles: TDU concentration ratio is calculated and expressed as transduction efficiency. The results obtained show that the purified virus has good transduction efficiency in vitro.

생체 내에서 뇌내 발현의 분석Analysis of Intracranial Expression in Vivo

생체내에서 유전자 전달 및 발현을 위한 본 발명에 따른 아데노바이러스의 효율을 평가하기 위해, 아데노바이러스를 정위 경로를 통해 OF1 면역컴피턴트 마우스의 스트리애텀에 주입한다. 이를 위해, 107pfu의 바이러스 중 부피 1 ㎕를 하기의 정위 참조 지점(0 ㎜에서 절개선의 경우)에 주입한다: 전후 방향: +0.5; 메디오래터럴: 2; 깊이: -3.5.To assess the efficiency of adenoviruses according to the invention for gene delivery and expression in vivo, adenoviruses are injected into the striatum of OF1 immunocompetent mice via a stereotactic route. To this end, 1 μl of the volume of 10 7 pfu of virus is injected into the following stereotactic reference point (for incision at 0 mm): fore and aft direction: +0.5; Medial lateral: 2; Depth: -3.5.

주입 후 7일만에 뇌를 분석한다. 얻어진 결과는 형질도입 효율이 높음을 보여준다: 수천개의 형질도입 세포, 핵에서의 매우 강한 발현 및 원형질에서의 빈번한 강한 분산.Brain is analyzed 7 days after infusion. The results obtained show high transduction efficiency: thousands of transduced cells, very strong expression in the nucleus and frequent strong dispersion in the plasma.

4.3. 바이러스 방출의 동역학4.3. Dynamics of Virus Release

본 실시예는 캡시드화 세포 배양 상등액에서 아데노바이러스 방출의 동역학에 관한 연구를 기술하고 있다.This example describes a study on the kinetics of adenovirus release in capsidated cell culture supernatants.

본 연구는 아데노바이러스 게놈 영역에 상보적인 올리고뉴클레오티드에 의한 반정량적 PCR에 의해 수행된다. 이러한 효과를 위해, dXTP(2 ㎕, 10 mM), 한쌍의 특정 올리고뉴클레오티드 및 10배 PCR 완충액에서 Taq 폴리머라제(Cetus)의 존재하에 선형 바이러스 DNA(1-10 ng)를 배양하고, 하기 조건하에 30회 증폭을 행한다: 91℃에서 2분, 30회(91℃에서 1분, 어닐링 온도에서 2분, 72℃에서 3분), 72℃에서 5분에 이어, 4℃에서 행함. 하기 서열의 올리고뉴클레오티드 쌍을 이용하여 PCR 실험을 수행한다:This study is performed by semiquantitative PCR with oligonucleotides complementary to the adenovirus genomic region. For this effect, linear viral DNA (1-10 ng) was incubated in the presence of Taq polymerase (Cetus) in dXTP (2 μl, 10 mM), a pair of specific oligonucleotides and 10-fold PCR buffer and under the following conditions: 30 times amplification was performed: 2 minutes at 91 ° C, 30 times (1 minute at 91 ° C, 2 minutes at annealing temperature, 3 minutes at 72 ° C), 5 minutes at 72 ° C, and then 4 ° C. PCR experiments are performed using oligonucleotide pairs of the following sequence:

- 쌍 1:Pair 1:

TAATTACCTGGGCGGCGAGCACGAT(6368) - 서열번호 1TAATTACCTGGGCGGCGAGCACGAT (6368)-SEQ ID NO: 1

ACCTTGGATGGGACCGCTGGGAACA(6369) - 서열번호 2ACCTTGGATGGGACCGCTGGGAACA (6369)-SEQ ID NO: 2

- 쌍 2:Pair 2:

TTTTTGATGCGTTTCTTACCTCTGG (6362) - 서열번호 3TTTTTGATGCGTTTCTTACCTCTGG (6362)-SEQ ID NO: 3

CAGACAGCGATGCGGAAGAGAGTGA (6363) - 서열번호 4CAGACAGCGATGCGGAAGAGAGTGA (6363)-SEQ ID NO: 4

- 쌍 3:Pair 3:

TGTTCCCAGCGGTCCCATCCAAGGT (6364) - 서열번호 5TGTTCCCAGCGGTCCCATCCAAGGT (6364)-SEQ ID NO: 5

AAGGACAAGCAGCCGAAGTAGAAGA (6365) - 서열번호 6AAGGACAAGCAGCCGAAGTAGAAGA (6365)-SEQ ID NO: 6

- 쌍 4:Pair 4:

GGATGATATGGTTGGACGCTGGAAG (6366) - 서열번호 7GGATGATATGGTTGGACGCTGGAAG (6366)-SEQ ID NO: 7

AGGGCGGATGCGACGACACTGACTT (6367) - 서열번호 8AGGGCGGATGCGACGACACTGACTT (6367)-SEQ ID NO: 8

감염 후 다양한 시간 때에, Ad-βGal로 감염된 세포 293의 상등액상에서 상등액 중의 유리 아데노바이러스의 양을 측정한다. 얻어진 결과는 도 3에 나타나 있다. 이는 세포 방출이 감염 후 5 또는 6일부터 시작됨을 보여준다.At various times after infection, the amount of free adenovirus in the supernatant is measured in the supernatant of cells 293 infected with Ad-βGal. The obtained result is shown in FIG. This shows that cell release begins from 5 or 6 days after infection.

기타 바이러스 측정 기법은 기타 캡시드화 주상에서, 동일한 목적, 및 아데노바이러스 유형에 이용될 수 있음이 이해된다.It is understood that other virus measurement techniques can be used on other capsidizing columns, for the same purpose, and for adenovirus types.

실시예 5: 한외여과 및 이온 교환에 의한 바이러스의 정제Example 5: Purification of Viruses by Ultrafiltration and Ion Exchange

본 실시예는 농축물에 함유된 아데노바이러스가 직접 및 단일 이온-교환 크로마토크래피 단계에서 매우 높은 수율로 정제될 수 있는 방법에 관해 기술하고 있다.This example describes how adenoviruses contained in the concentrate can be purified in very high yields in direct and single ion-exchange chromatography steps.

5.1. 과정5.1. process

본 실험에서, 개시 물질은 따라서 실시예 4에서 기술된 농축물(또는 한외여과 리텐테이트)로 구성된다. 이 리텐테이트는 PBS 완충액(10 mM 포스페이트, 150 mM NaCl을 함유한 pH 7.2)에서 5 내지 50 ㎎/㎖, 바람직하게는 10 내지 30 ㎎/㎖의 총 단백질 함량을 가진다.In this experiment, the starting material thus consisted of the concentrate (or ultrafiltration retentate) described in Example 4. This retentate has a total protein content of 5-50 mg / ml, preferably 10-30 mg / ml in PBS buffer (pH 7.2 containing 10 mM phosphate, 150 mM NaCl).

바이러스 제조물로부터 수득된 한외여과 상등액을 250 mM NaCl, 1.0 mM MgCl2및 10% 글리세롤(완충액 A)을 함유한 50 mM Tris-HCl 완충액 pH 8.0에서 평형이 이루어진 Source Q 15(Pharmacia)를 함유한 칼럼중에 주입한다. 완충액 A의 10 칼럼 부피로 세정한 후, 흡착된 부류를 25 칼럼 부피상에서 직선 NaCl 구배(250 mM - 1 M)를 이용하여, 60 내지 300 ㎝/시간, 바람직하게는 12 ㎝/시간의 직선 유동율로 용출시킨다. 260 ㎚에서 수득된 전형적인 용출 프로필은 도 4에 나타나 있다. 바이러스 입자를 함유한 분획을 수집한다. 이는 보유 시간이 초원심분리에 의해 정제된 바이러스 입자의 제조물을 이용하여 수득된 보유 시간과 일치하는 미세한 대칭 피크에 상응한다. 상술된 조건하에, 바이러스 입자 피크의 우수한 해상도를 보유하면서 Source Q 15 1 ㎖당 최소 30 ㎎의 총 단백질을 주입할 수 있다.The ultrafiltration supernatant obtained from the virus preparation was columned with Source Q 15 (Pharmacia) equilibrated in 50 mM Tris-HCl buffer pH 8.0 containing 250 mM NaCl, 1.0 mM MgCl 2 and 10% glycerol (buffer A). Inject during. After washing with 10 column volumes of Buffer A, the adsorbed class was subjected to a linear flow rate of 60 to 300 cm / hour, preferably 12 cm / hour, using a straight NaCl gradient (250 mM-1 M) on 25 column volumes. Elute. Typical elution profiles obtained at 260 nm are shown in FIG. 4. Collect fractions containing viral particles. This corresponds to a fine symmetrical peak whose retention time is consistent with the retention time obtained using the preparation of virus particles purified by ultracentrifugation. Under the conditions described above, at least 30 mg of total protein per ml of Source Q 15 can be injected while retaining good resolution of the viral particle peak.

β-gal 아데노바이러스 제조물을 이용하여 수행된 대표적인 실험(실시예 2)에서, 총 12.6 ㎎의 단백질을 Source Q 칼럼(1 ㎖), 즉 5 x 1010PFU 및 1.6 x 1010TDU 중에 주입한다. 크로마토크래피(3.2 ㎖; 도 5) 후 수집된 바이러스 입자 피크는 173 ㎍의 단백질 및 3.2 x 1010PFU 및 2.3 x 1010TDU를 함유한다. 따라서 바이러스 입자를 70배(단백질의 양) 정제하면 정제 수율은 PFU가 64%이고 TDU가 142%(하기 표 참조)이다.In a representative experiment performed with β-gal adenovirus preparation (Example 2), a total of 12.6 mg of protein was injected into a Source Q column (1 mL), ie 5 × 10 10 PFU and 1.6 × 10 10 TDU. Viral particle peaks collected after chromatography (3.2 mL; FIG. 5) contain 173 μg of protein and 3.2 × 10 10 PFU and 2.3 × 10 10 TDU. Thus, when the virus particles were purified 70 times (amount of protein), the purification yield was 64% PFU and 142% TDU (see table below).

단계step 농도 샘플Concentration sample 침착 부피Deposition volume 수거 부피Collection volume 수율yield 정제 인자Refinement factor 상등액Supernatant 5000 ㎖5000 ml 5000 ㎖5000 ml 100%100% -- 한외여과300 kdUltrafiltration300 kd 단백질:6.3 ㎎/㎖PFU:2.5x1010/㎖TDU:8.1x109/㎖입자 3.8x1011/㎖파트/pfu비:16.0파트/tdu비:47.0Protein: 6.3 mg / ml PFU: 2.5 x 10 10 / ml TDU: 8.1 x 10 9 / ml Particles 3.8 x 10 11 / ml Part / pfu ratio: 16.0 parts / tdu ratio: 47.0 5000 ㎖5000 ml 200 ㎖200 ml 100%100% 55 이온-교환 정제(1 단계)Ion-Exchange Purification (Step 1) PFU:1.0x1010/㎖TDU:7.2x109/㎖입자:2.0x1011/㎖파트/pfu비=20파트/tdu비=27PFU: 1.0x10 10 /㎖TDU:7.2x10 9 / ㎖ particles: 2.0x10 11 / ㎖ Part / pfu ratio = 20 Part / tdu ratio = 27 농축물의 2.0 ㎖2.0 ml of concentrate 용출의3.0 ㎖3.0 ml of elution 단백질=85%PFU=64%TDU=140%입자=84%HPLC순도=98.4%Protein = 85% PFU = 64% TDU = 140% Particle = 84% HPLC Purity = 98.4% 7070 CsCl 구배CsCl gradient PFU:1.0x1011/㎖TDU:7.5x1010/㎖입자:2.2x1012/㎖파트/pfu비=22파트/tdu비=29PFU: 1.0x10 11 /㎖TDU:7.5x10 10 / ㎖ particles: 2.2x10 12 / ㎖ Part / pfu ratio = 22 Part / tdu ratio = 29 농축물의 28.3 ㎖28.3 ml of concentrate QSP28.3 ㎖QSP28.3 ml PFU=66%TDU=130%입자=84%HPLC순도=98.4%PFU = 66% TDU = 130% Particles = 84% HPLC Purity = 98.4% 7070

5.2. 순도5.2. water

정제 단계 후, 수집된 분획은 하기 크로마토그래피 시스템에서 Source Q 칼럼(1 ㎖)상에서 고-해상 액체 크로마토그래피(HPLC)에 의해 분석할 경우, 순도≥98% 바이러스 입자(260 ㎚에서 UV 검출)를 가진다: (실시예 5.1에 기재된 크로마토그래피에 의해 정제된 10 ㎕ 분획을 50 mM Tris/HCl 완충액 pH 8.0(완충액 B)에서 평형이 이루어진 Source Q15 칼럼(겔 1 ㎖; Pharmacia) 중에 주입함). 5 ㎖의 완충액 B로 세정한 후, 흡착된 부류를 B 완충액에서 30 ㎖의 NaCl(0 - 1 M)의 직선 구배를 이용하여 1 ㎖/분의 유동율로 용출시킨다. 용출된 부류는 260 ㎚에서 검출된다. 이 HPLC 분석(도 5)은 또한, 한외여과 리텐테이트에 존재하는 잔류 소 혈청 알부민이 예비 크로마토그래핑 동안 완전히 제거됨을 보여준다. 정제된 분획내의 함량은 0.1%보다 작을 것으로 추정된다. 항-BSA 폴리클로날 항체를 이용한 웨스턴 블랏 분석(ECL 노출; Amersham)은 크로마토그래피 제조물에서 BSA의 함량이 바이러스 1 ㎎당 100 ng 이하임을 나타낸다.After the purification step, the collected fractions were purified by high-resolution liquid chromatography (HPLC) on a Source Q column (1 mL) in the following chromatography system to obtain purity ≧ 98% virus particles (UV detection at 260 nm). (10 mL fraction purified by chromatography described in Example 5.1 is injected into a Source Q15 column (gel 1 ml; Pharmacia) equilibrated in 50 mM Tris / HCl buffer pH 8.0 (buffer B)). After washing with 5 ml Buffer B, the adsorbed class is eluted in B buffer at a flow rate of 1 ml / min using a straight gradient of 30 ml NaCl (0-1 M). The eluted class is detected at 260 nm. This HPLC analysis (FIG. 5) also shows that the residual bovine serum albumin present in the ultrafiltration retentate is completely removed during preliminary chromatography. The content in the purified fraction is estimated to be less than 0.1%. Western blot analysis (ECL exposure; Amersham) using anti-BSA polyclonal antibodies indicates that the content of BSA in the chromatographic preparation is 100 ng or less per mg of virus.

크로마토그래피에 의해 정제된 아데노바이러스 분획의 전기영동 분석은 변성(SDS) 조건하에 폴리아크릴아미드 겔(4-20%)상에서 수행된다. 단백질 밴드는 은 나이트레이트에 의해 나타난다. 이러한 분석은 크로마토그래피에 의해 수득된 아데노바이러스 제조물이 기존의 초원심분리에 의해 수득된 제조물의 것과 적어도 동일한 순도 수준을 가짐을 보여주는데 이는 비-아데노바이러스 단백질에 의한 제조물의 오염원을 나타내는 추가 단백질 밴드를 가지지 않기 때문이다.Electrophoretic analysis of adenovirus fractions purified by chromatography is carried out on polyacrylamide gels (4-20%) under denaturing (SDS) conditions. Protein bands are represented by silver nitrate. This analysis shows that the adenovirus preparations obtained by chromatography have at least the same purity level as the ones obtained by conventional ultracentrifugation, which reveals additional protein bands that represent contaminants of the preparations by non-adenovirus proteins. Because it does not have.

크로마토그래피에 의해 수득된 아데노바이러스 제조물은 1.30±0.05에 일치하는 흡광비 A260㎚/A280㎚를 가진다. 초원심분리에 의해 수득된 최상의 제조물의 경우에 얻어진 것과 일치하는 이 값은 제조물이 단백질을 오염시키거나 핵산을 오염시키지 않음을 나타낸다.The adenovirus preparation obtained by chromatography has an absorbance ratio A 260 nm / A 280 nm , which corresponds to 1.30 ± 0.05. This value, consistent with that obtained for the best preparations obtained by ultracentrifugation, indicates that the preparations do not contaminate proteins or nucleic acids.

크로마토그래피-정제 Ad-βgal 바이러스상에서 실시예 4.2에 기재된 조건하에 수행된 전자 현미경에 의한 분석은 오염원, 집합체 및 빈 바이러스 입자가 없는(도 11) 맑은 제조물을 보여준다. 또한, 본 제조물의 세슘 클로라이드 구배 원심분리는 밀도 1.30의 단일 밴드를 보이는데, 이는 잠재적인 빈 입자 또는 캡시드 분획에 의한 크로마토그래피 제조물 오염원의 부재를 확인시킨다. 정제 동안, 바이러스에 대한 크로마토그래피 피크 다음에 맨 뒷부분에 쇼울더(또는 제 2 피크)가 있는데, 이는 주된 피크와 함께 수집되지는 않는다. 이러한 분획의 세슘 클로라이드 구배 초원심분리는 밀도 1.27의 밴드를 나타내고, 이러한 분획 조성물의 분석은 이것이 핵산을 함유하지 않음을 보여준다. 전자 현미경에 의한 분석은 이러한 분획이 표면에 구멍을 나타내는 비균일 형상의 입자를 함유함을 보여준다(도 12). 따라서 이는 속이 빈(DNA 결여) 불완전한 입자이다. 이는 따라서 크로마토그래피에 의한 아데노바이러스의 정제가 정제 이전에 소량의 제조물에 존재하는 빈 입자를 제거하였음을 입증한다.Analysis by electron microscopy performed on the chromatography-purified Ad-βgal virus under the conditions described in Example 4.2 shows clear preparations free of contaminants, aggregates and empty virus particles (FIG. 11). In addition, cesium chloride gradient centrifugation of the present product shows a single band of density 1.30, which confirms the absence of chromatographic product contaminants by potential empty particles or capsid fractions. During purification, there is a shoulder (or second peak) at the end after the chromatographic peak for the virus, which is not collected with the main peak. Cesium chloride gradient ultracentrifugation of this fraction shows a band of density 1.27, and analysis of this fraction composition shows that it contains no nucleic acid. Analysis by electron microscopy shows that this fraction contains particles of non-uniform shape showing pores on the surface (FIG. 12). It is therefore a hollow (lacking DNA) incomplete particle. This thus demonstrates that purification of adenovirus by chromatography removed empty particles present in a small amount of preparation prior to purification.

5.3. ApoA1 또는 티미딘 키나제 단백질을 암호화하는 유전자와 같은 치료 유전자를 포함하는 아데노바이러스의 정제5.3. Purification of adenoviruses containing therapeutic genes, such as genes encoding ApoA1 or thymidine kinase protein

본 실시예는 게놈 중에, 치료 단백질을 암호화하는 이종 핵산 서열을 포함하는 아데노바이러스가 직접 및 단일 이온-교환 크로마토그래피 단계에서 정제되는 방법에 관해 기재하고 있다. 이는 또한 아데노바이러스의 크로마토그래피 행위가 다양한 이종 핵산 서열을 운반하는 상이한 아데노바이러스의 경우에 동일한 정제 공정이 이용될 수 있도록, 이것이 운반하는 이종 핵산 서열과 일치함을 보여준다.This example describes how in the genome, adenoviruses comprising heterologous nucleic acid sequences encoding therapeutic proteins are purified in direct and single ion-exchange chromatography steps. It also shows that the chromatographic behavior of adenoviruses is consistent with the heterologous nucleic acid sequences they carry, so that the same purification process can be used for different adenoviruses carrying various heterologous nucleic acid sequences.

전형적인 정제 실험에서, 게놈 중에, ApoA1 단백질을 암호화하는 이종 핵산 서열(실시예 2, WO 94/25073)은 실시예 5.1에 기재된 시스템에서 감염 10일 후 수거된 세포 배양의 농축된 상등액 18 ㎖(단백질 72 ㎎; 1.08 x 1013입자)를 크로마토그래핑시켜 정제된다(도 6A). 크로마토그래피 후 수집된 바이러스 입자 피크(14 ㎖; 단배질 1.4 ㎎)는 92%의 입자 수율 및 51의 정제 인자를 나타내는 9.98 x 1012입자를 함유한다. 이러한 정제 단계 후, 수집된 분획은 5.2에 기재된 조건하에 크로마토그래피 분석 동안 바이러스 입자의 경우 98%보다 높은 순도(도 6B)를 가진다. 실시예 5.2에 기재된 조건하에 수행된 크로마토그래피에 의해 정제된 아데노바이러스 분획의 전기 영동 분석은 이러한 제조물이 기존의 초원심분리에 의해 수득된 제조물의 것과 적어도 일치하는 순도 수준을 가지고, 단백질을 오염시키거나 핵산을 오염시키지 않음을 보여준다.In a typical purification experiment, in the genome, a heterologous nucleic acid sequence encoding the ApoA1 protein (Example 2, WO 94/25073) was obtained with 18 ml of concentrated supernatant of the cell culture harvested 10 days after infection in the system described in Example 5.1. 72 mg; 1.08 × 10 13 particles) was purified by chromatography (FIG. 6A). The viral particle peak collected after chromatography (14 ml; protein 1.4 mg) contains 9.98 × 10 12 particles, showing a particle yield of 92% and a purification factor of 51. After this purification step, the collected fractions have a purity higher than 98% (FIG. 6B) for viral particles during chromatographic analysis under the conditions described in 5.2. Electrophoretic analysis of adenovirus fractions purified by chromatography performed under the conditions described in Example 5.2 showed that these preparations had a purity level at least consistent with that of the preparations obtained by conventional ultracentrifugation and contaminating the protein. Or do not contaminate the nucleic acid.

또다른 전형적인 정제 실험에서, 게놈 중에, 유형 1의 허프스 심플렉스 티미딘 키나제 단백질(실시예 2, WO 95/14102)을 암호화하는 이종 핵산 서열을 포함하는 아데노바이러스가 실시예 5.1에 기재된 시스템에서, 세포 배양의 농축된 상등액 36 ㎖(단백질 180 ㎎; 4.69 x 1013입자)을 크로마토그래핑시켜 정제된다(도 7A). 크로마토그래피 후 수집된 바이러스 입자 피크(20 ㎖; 단백질 5.6 ㎎)는 91%의 입자 수율 및 32의 정제 인자를 나타내는 4.28 x 1013입자를 함유한다. 이러한 정제 단계 후, 수집된 분획은 실시예 5.2에 기재된 조건 및 1.29의 흡광비하에 크로마토그래피 분석 동안 바이러스 입자의 경우 99%보다 큰 순도를 가진다(도 7B-D). 실시예 5.2에 기재된 조건하에 수행된 크로마토그래피에 의해 정제된 아데노바이러스 분획의 전기 영동 분석은 이러한 제조물이 기존의 초원심분리에 의해 수득된 제조물의 것과 적어도 일치하는 순도 수준을 가지고, 단백질을 오염시키거나 핵산을 오염시키지 않음을 보여준다.In another typical purification experiment, an adenovirus comprising a heterologous nucleic acid sequence encoding a type 1 Huff's simplex thymidine kinase protein (Example 2, WO 95/14102) in the genome is disclosed in the system described in Example 5.1. 36 ml (180 mg protein; 4.69 × 10 13 particles) of the concentrated supernatant of the cell culture were purified by chromatography (FIG. 7A). The viral particle peak collected after chromatography (20 ml; protein 5.6 mg) contains 4.28 x 10 13 particles, which exhibits 91% particle yield and 32 purification factors. After this purification step, the collected fractions have a purity greater than 99% for viral particles during the chromatographic analysis under the conditions described in Example 5.2 and the absorbance ratio of 1.29 (FIGS. 7B-D). Electrophoretic analysis of adenovirus fractions purified by chromatography performed under the conditions described in Example 5.2 showed that these preparations had a purity level at least consistent with that of the preparations obtained by conventional ultracentrifugation and contaminating the protein. Or do not contaminate the nucleic acid.

5.4. 강 음이온 교환에 의한 세포내 아데노바이러스의 정제5.4. Purification of Intracellular Adenovirus by Strong Anion Exchange

본 실시예는 게놈 중에 단일 이온-교환 크로마토그래피 단계에서 직접 정제될 수 있는 이종 핵산 서열을 포함하는 아데노바이러스가 바이러스를 생성하는 캡시드화 세포의 용해액으로부터 가지는 방법에 관해 기술하고 있다.This example describes a method in which adenoviruses comprising heterologous nucleic acid sequences that can be directly purified in a single ion-exchange chromatography step in the genome have from lysates of capsidated cells that produce viruses.

전형적인 정제 실험에서, 게놈중에 β-gal 단백질을 암호화하는 이종 핵산 서열을 포함하는 아데노바이러스는 실시예 5.1에 기재된 시스템(FineLine Pilot 35 칼럼, Pharmacia, Source 15Q 수지 100 ㎖)에서 화학적 용해(1% Tween-20)에 의해 감염 후 3일만에 수거된 세포 배양의 농축 용해물 450 ㎖(즉 2.5 x 1014입자)를 크로마토그래핑시켜 정제된다. 크로마토그래피 후 수집된 바이러스 입자 피크(110 ㎖)는 86%의 수율을 나타내는 2.15 x 1014입자를 함유한다. 이러한 정제 단계 후, 수집된 분획은 5.2에 기재된 조건하에 크로마토그래피 분석 동안 98%보다 큰 바이러스 입자 순도를 가진다. 실시예 5.2에 기재된 조건하에 수행된 크로마토그래피에 의해 정제된 아데노바이러스 분획의 전기 영동 분석은 이러한 제조물이 기존의 초원심분리에 의해 수득된 제조물의 것과 적어도 일치하는 순도 수준을 가지고, 단백질을 오염시키거나 핵산을 오염시키지 않음을 보여준다.In a typical purification experiment, adenoviruses comprising heterologous nucleic acid sequences encoding β-gal proteins in the genome were chemically lysed (1% Tween in a system described in Example 5.1 (FineLine Pilot 35 column, Pharmacia, Source 15Q resin 100 ml)). -20) is purified by chromatographing 450 ml of concentrated lysate (ie 2.5 x 10 14 particles) of cell culture harvested only 3 days after infection. The virus particle peak (110 mL) collected after chromatography contains 2.15 × 10 14 particles, showing a yield of 86%. After this purification step, the collected fractions have a viral particle purity greater than 98% during chromatographic analysis under the conditions described in 5.2. Electrophoretic analysis of adenovirus fractions purified by chromatography performed under the conditions described in Example 5.2 showed that these preparations had a purity level at least consistent with that of the preparations obtained by conventional ultracentrifugation and contaminating the protein. Or do not contaminate the nucleic acid.

5.5. 다양한 칼럼상에서 한외여과 및 이온-교환 크로마토그래피에 의한 바이러스의 정제5.5. Purification of virus by ultrafiltration and ion-exchange chromatography on various columns

본 실시예는 동일한 분리 원리, 매트릭스의 4급 아민 그룹과 상호작용에 의한 음이온 교환으로 작업하는 동안, Source 15Q 지지체와 상이한 겔을 이용한 단일 이온-교환 크로마토그래피 단계에서 농축물에 함유된 아데노바이러스가 직접 정제될 수 있는 방법에 관해 기술하고 있다.This example demonstrates that the adenovirus contained in the concentrate in a single ion-exchange chromatography step with a different gel from the Source 15Q support, while working on the same separation principle, anion exchange by interacting with the quaternary amine groups of the matrix, A method that can be purified directly is described.

아데노바이러스의 정제를 위한 전형적인 실험에서, 다양한 재조합 아데노바이러스(βGal, 아포리포단백질 AI 및 TK 암호)는 Source Q30 겔 칼럼상의 크로마토그래피에 이어 실시예 5.1에 기재된 프로토콜에 의해 정제된다. 얻어진 결과는 Source Q30 겔이 70 내지 100%의 수율과 함께, 85% 순도의 바이러스 제조물을 수득할 수 있게끔 해줌을 보여준다. 또한, 얻어진 결과는 Q30이 아데노바이러스 정제의 경우, 1000의 효율(이론상 플레이트 수로 표현됨) 및 0.5 내지 1 x 1012vp/㎖(피크의 변형없이 크로마토그래핑이 가능한 바이러스의 최대량)를 보유하고 있음을 보여준다. 이러한 결과는 Source Q30 겔이 재조합 아데노바이러스의 정제에 적당할 수 있지만, 이의 특성은 Source Q15의 것(99%의 순도, 8000의 효율 및 2.5 내지 5 x 1012vp/㎖의 수용능력)보다 우수하지 못함을 보여준다.In a typical experiment for purification of adenoviruses, various recombinant adenoviruses (βGal, Apolipoprotein AI and TK code) are purified by chromatography on a Source Q30 gel column followed by the protocol described in Example 5.1. The results obtained show that the Source Q30 gel allows to obtain a virus preparation of 85% purity, with a yield of 70 to 100%. In addition, the results obtained indicate that Q30 has an efficiency of 1000 (expressed in the number of plates theoretically) and 0.5 to 1 x 10 12 vp / ml (maximum amount of virus that can be chromatographed without peak modification) for adenovirus purification. Shows. These results suggest that Source Q30 gel may be suitable for purification of recombinant adenovirus, but its properties are superior to that of Source Q15 (99% purity, 8000 efficiency and 2.5 to 5 x 10 12 vp / ml capacity). Show that you can't.

또다른 전형적인 아데노바이러스 정제 실험에서, β-Gal 아데노바이러스는 실시예 5.1에 기술된 과정을 이용하여 MonoQ HR 5/5 칼럼상에서의 크로마토그래피에 의해 정제된다. 이렇게 수득된 한외여과 리텐테이트 및 정제된 바이러스 제조물에 상응하는 크로마토그래피 상은 도 8에 기술되어 있다.In another typical adenovirus purification experiment, β-Gal adenovirus is purified by chromatography on a MonoQ HR 5/5 column using the procedure described in Example 5.1. The chromatographic phases corresponding to the ultrafiltration retentate and purified virus preparation thus obtained are described in FIG. 8.

또다른 전형적인 아데노바이러스 정제 실험에서, β-Gal 아데노바이러스는 실시예 5.1에 기술된 과정을 이용하여 poros HQ/M 칼럼상에서의 크로마토그래피에 의해 정제된다. 이렇게 수득된 한외여과 리텐테이트 및 정제된 바이러스 제조물에 상응하는 크로마토그래피 상은 도 9에 기술되어 있다.In another typical adenovirus purification experiment, β-Gal adenovirus is purified by chromatography on a poros HQ / M column using the procedure described in Example 5.1. The chromatographic phases corresponding to the ultrafiltration retentate and purified virus preparation thus obtained are described in FIG. 9.

실시예 6: 한외여과 및 겔 투과에 의한 바이러스의 정제Example 6: Purification of Virus by Ultrafiltration and Gel Permeation

본 실시예는 농축물(한외여과 리텐테이트)에 함유된 아데노바이러스가 매우 높은 수율로, 겔 투과 크로마토그래피에 의해 직접 정제될 수 있는 방법에 관해 기술하고 있다.This example describes how adenoviruses contained in the concentrate (ultrafiltration retentate) can be purified directly by gel permeation chromatography in very high yields.

6.1. 과정6.1. process

실시예 4에서 수득된 한외여과 리텐테이트 200 ㎕(즉 단백질 1.3 ㎎)를 예를 들면 150 mM NaCl을 함유한 pH 7.2의 PBS 완충액(완충액 C)에서 평형화된 Sephacryl S-1000SF(Pharmacia)로 충진된 HR 10/30 칼럼(Pharmacia) 중으로 주입한다. 부류를 분획화하고 0.5 ㎖/분의 유동율로 완충액 C를 이용하여 용출시킨 다음 260 ㎚에서 UV에 의한 칼럼의 아울렛에서 검출된다. 다르게는, 동일한 작업 조건하에, 100 ㎚ 내지 1000㎚의 입자에 대한 칼럼 Sephacryl S-1000HR보다 우수한 해상도를 나타내는 Sephacryl S-2000으로 충진된 칼럼을 이용할 수 있다.200 μl of ultrafiltration retentate (ie 1.3 mg of protein) obtained in Example 4 was filled with Sephacryl S-1000SF (Pharmacia) equilibrated in PBS buffer (buffer C), for example pH 7.2 containing 150 mM NaCl. Inject into HR 10/30 column (Pharmacia). The class is fractionated and eluted with Buffer C at a flow rate of 0.5 ml / min and then detected at the outlet of the column by UV at 260 nm. Alternatively, a column filled with Sephacryl S-2000 can be used that exhibits better resolution than column Sephacryl S-1000HR for particles of 100 nm to 1000 nm under the same operating conditions.

상술된 두가지 겔 투과 크로마토그래피 시스템의 해상도는 완충액 C로 평형화된 부류(Sephacryl S-1000HR 또는 S-2000 칼럼에 이은 Superdex 200 HR 칼럼)로 커플링된 2 HR 10/30 칼럼(Pharmacia) 시스템상에서 한외여과 상등액(200 ㎕)을 크로마토그래핑시켜 유리하게 증진될 수 있다. 본 부류는 완충액 C를 이용하여 0.5 ㎖/분의 유동율로 용출되고 260 ㎚에서 UV로 검출된다. 이 시스템에서, 바이러스 입자 피크는 Sephacryl S-1000 HR 또는 Sephacryl S-2000 칼럼만으로 구성된 시스템에서보다 낮은-분자량 부류로부터 매우 명확하게 잘 분리된다.The resolution of the two gel permeation chromatography systems described above was ultra-high on a 2 HR 10/30 column (Pharmacia) system coupled to a class equilibrated with buffer C (Sephacryl S-1000HR or S-2000 column followed by Superdex 200 HR column). It can be advantageously enhanced by chromatographic filtering supernatant (200 μl). This class is eluted with a buffer C at a flow rate of 0.5 ml / min and detected by UV at 260 nm. In this system, viral particle peaks are very well separated from the lower-molecular weight classes than in systems consisting only of Sephacryl S-1000 HR or Sephacryl S-2000 columns.

대표적인 실험에서, 한외여과 리텐테이트(200 ㎕, 단백질 1.3 ㎎)는 2 Sephacryl S-1000HR-Superdex 200 HR 10/30 칼럼 시스템상에서 크로마토그래핑된다(도 10). 바이러스 입자를 함유한 크로마토그래피 피크가 수집된다. 유지 시간은 초원심분리에 의해 정제된 바이러스 입자 제조물의 경우 얻어진 보유 시간과 일치한다. 크로마토그래피 후 수집된 바이러스 입자 피크(7 ㎖)는 28 ㎍의 단백질과 3.5 x 109PFU를 함유한다. 실시예 5.2에 기재된 조건하에 분석용 이온-교환 크로마토그래피에 의한 분석은 분석용 칼럼상에 좀더 강하게 남아있는 오염화 피크의 존재를 보여주고, 이의 표면적은 바이러스 피크 표면적의 약 25%를 나타낸다. 1.86 값을 가진 260 ㎚/280 ㎚ 흡광도 비는 이러한 오염화 피크가 핵산에 상응함을 나타낸다. 따라서 바이러스 입자는 약 50배(단백질 량)로 정제되고 정제 수율은 PFU의 경우 85%이다.In a representative experiment, ultrafiltration retentate (200 μl, protein 1.3 mg) was chromatographed on a 2 Sephacryl S-1000HR-Superdex 200 HR 10/30 column system (FIG. 10). Chromatographic peaks containing viral particles are collected. The retention time is consistent with the retention time obtained for virus particle preparations purified by ultracentrifugation. Viral particle peak (7 mL) collected after chromatography contains 28 μg of protein and 3.5 × 10 9 PFU. Analysis by analytical ion-exchange chromatography under the conditions described in Example 5.2 shows the presence of contaminating peaks remaining stronger on the analytical column, the surface area of which represents about 25% of the viral peak surface area. The 260 nm / 280 nm absorbance ratio with a value of 1.86 indicates that this fouling peak corresponds to the nucleic acid. Thus, virus particles are purified about 50 times (protein amount) and the purification yield is 85% for PFU.

다르게는, 완충액 C로 평형화된 TSK G6000 PW 칼럼(7.5 x 300 ㎜; TosoHaas)상에서 바이러스 입자의 제조물(음이온-교환 크로마토그래피의 아울렛에서의 한외여과물 또는 분획)을 크로마토그래핑할 수 있다. 부류는 완충액 C를 이용하여 0.5 ㎖/분의 유동율로 용출되고 260 ㎚에서 UV로 검출된다. 또한, 완충액 C로 평형화된 부류[TSK G6000 PW 칼럼(7.5 x 300 mm)에 이은 Superdex 200 HR 칼럼]로 커플링된 2 칼럼 시스템상에서 한외여과 상등액(50 내지 200 ㎕)을 크로마토그래핑시켜, 크로마토그래피 시스템의 해상도, 특히 저-분자량의 부류로부터 바이러스 입자 피크의 분리를 증가시키는 것이 유리할 수 있다. 이 부류는 완충액 C를 이용하여 0.5 ㎖/분의 유동율로 용출되고 260 ㎚에서 UV로 검출된다.Alternatively, the preparation of the virus particles (ultrafiltration or fraction in the outlet of anion-exchange chromatography) can be chromatographed on a TSK G6000 PW column (7.5 x 300 mm; TosoHaas) equilibrated with Buffer C. The class is eluted with a buffer C at a flow rate of 0.5 ml / min and detected with UV at 260 nm. In addition, the ultrafiltration supernatant (50-200 μl) was chromatographed on a two-column system coupled with a class equilibrated with Buffer C [TSK G6000 PW column (7.5 × 300 mm) followed by Superdex 200 HR column] It may be advantageous to increase the resolution of the imaging system, especially the separation of viral particle peaks from the low-molecular weight class. This class is eluted with a buffer C at a flow rate of 0.5 ml / min and detected by UV at 260 nm.

실시예 7: 한외여과, 이온 교환 및 겔 투과에 의한 바이러스의 정제Example 7: Purification of Viruses by Ultrafiltration, Ion Exchange and Gel Permeation

음이온-교환 크로마토그래피로부터 유도된 바이러스 입자 분획(실시예 5)을 예를 들면 바이러스 입자의 순도 수준을 추가로 개선시킴과 동시에, 주로 바이러스 제조물과 친화적이거나 이의 차후 용도(주입, 등)에 적합한 배지에 바이러스 입자를 패킹시키기 위해 상술된 겔 투과 크로마토그래피 시스템 중 하나에서 유리하게 크로마토그래핑될 수 있다.The viral particle fraction derived from anion-exchange chromatography (Example 5) further improves the purity level of, for example, viral particles, while at the same time a medium that is primarily compatible with the virus preparation or suitable for its subsequent use (injection, etc.). It may advantageously be chromatographed in one of the gel permeation chromatography systems described above for packing virus particles into.

서열 목록Sequence list

(1) 일반 정보:(1) General Information:

(i) 출원인:(i) Applicant:

(A) 성명: 롱프랑 로라 소시에테 아노님(A) Name: Longfran Laura Societe Annoim

(B) 거리: 아브뉴 레이몽 아롱 20(B) Street: Avenue Lamont Along 20

(C) 시: 앙토니(C) poetry: Anthony

(E) 국가: 프랑스(E) Country: France

(F) 우편 번호: 920165(F) Zip code: 920165

(ii) 발명의 명칭: 재조합 아데노바이러스의 제조방법(ii) Name of the Invention: Method for producing recombinant adenovirus

(iii) 서열 수: 8(iii) SEQ ID NO: 8

(iv) 컴퓨터 판독형:(iv) computer readable:

(A) 매체형: 플로피 디스크(A) Medium type: floppy disk

(B) 컴퓨터: IBM PC 호환기종(B) Computer: IBM PC compatible model

(C) 운영 체계: PC-DOS/MS-DOS(C) operating system: PC-DOS / MS-DOS

(D) 소프트웨어: PatentIn Release #1.0, 버젼 #1.30 (EPO)(D) Software: PatentIn Release # 1.0, version # 1.30 (EPO)

(2) 서열 번호: 1의 정보:(2) Information of SEQ ID NO:

(i) 서열 특성:(i) sequence properties:

(A) 길이: 25 염기쌍(A) Length: 25 base pairs

(B) 유형: 뉴클레오티드(B) Type: Nucleotide

(C) 본쇄형: 일본쇄(C) main chain type: Japanese chain

(D) 형태: 선형(D) mode: linear

(ii) 분자 유형: DNA(ii) Molecular Type: DNA

(xi) 서열 번호: 1의 서열 배열:(xi) the sequence sequence of SEQ ID NO:

TAATTACCTG GGCGGCGAGC ACGAT 25TAATTACCTG GGCGGCGAGC ACGAT 25

(2) 서열 번호: 2의 정보:(2) Information of SEQ ID NO: 2:

(i) 서열 특성:(i) sequence properties:

(A) 길이: 25 염기쌍(A) Length: 25 base pairs

(B) 유형: 뉴클레오티드(B) Type: Nucleotide

(C) 본쇄형: 일본쇄(C) main chain type: Japanese chain

(D) 형태: 선형(D) mode: linear

(ii) 분자 유형: DNA(ii) Molecular Type: DNA

(xi) 서열 번호: 2의 서열 배열:(xi) the sequence sequence of SEQ ID NO: 2:

ACCTTGGATG GGACCGCTGG GAACA 25ACCTTGGATG GGACCGCTGG GAACA 25

(2) 서열 번호: 3의 정보:(2) Information of SEQ ID NO: 3:

(i) 서열 특성:(i) sequence properties:

(A) 길이: 25 염기쌍(A) Length: 25 base pairs

(B) 유형: 뉴클레오티드(B) Type: Nucleotide

(C) 본쇄형: 일본쇄(C) main chain type: Japanese chain

(D) 형태: 선형(D) mode: linear

(ii) 분자 유형: DNA(ii) Molecular Type: DNA

(xi) 서열 번호: 3의 서열 배열:(xi) the sequence sequence of SEQ ID NO: 3:

TTTTTGATGC GTTTCTTACC TCTGG 25TTTTTGATGC GTTTCTTACC TCTGG 25

(2) 서열 번호: 4의 정보:(2) Information of SEQ ID NO: 4:

(i) 서열 특성:(i) sequence properties:

(A) 길이: 25 염기쌍(A) Length: 25 base pairs

(B) 유형: 뉴클레오티드(B) Type: Nucleotide

(C) 본쇄형: 일본쇄(C) main chain type: Japanese chain

(D) 형태: 선형(D) mode: linear

(ii) 분자 유형: DNA(ii) Molecular Type: DNA

(xi) 서열 번호: 4의 서열 배열:(xi) the sequence sequence of SEQ ID NO: 4:

CAGACAGCGA TGCGGAAGAGAGTGA 25CAGACAGCGA TGCGGAAGAGAGTGA 25

(2) 서열 번호: 5의 정보:(2) Information of SEQ ID NO: 5:

(i) 서열 특성:(i) sequence properties:

(A) 길이: 25 염기쌍(A) Length: 25 base pairs

(B) 유형: 뉴클레오티드(B) Type: Nucleotide

(C) 본쇄형: 일본쇄(C) main chain type: Japanese chain

(D) 형태: 선형(D) mode: linear

(ii) 분자 유형: DNA(ii) Molecular Type: DNA

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TGTTCCCAGC GGTCCCATCC AAGGT 25TGTTCCCAGC GGTCCCATCC AAGGT 25

(2) 서열 번호: 6의 정보:(2) Information of SEQ ID NO: 6:

(i) 서열 특성:(i) sequence properties:

(A) 길이: 25 염기쌍(A) Length: 25 base pairs

(B) 유형: 뉴클레오티드(B) Type: Nucleotide

(C) 본쇄형: 일본쇄(C) main chain type: Japanese chain

(D) 형태: 선형(D) mode: linear

(ii) 분자 유형: DNA(ii) Molecular Type: DNA

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AAGGACAAGC AGCCGAAGTA GAAGA 25AAGGACAAGC AGCCGAAGTA GAAGA 25

(2) 서열 번호: 7의 정보:(2) Information of SEQ ID NO: 7:

(i) 서열 특성:(i) sequence properties:

(A) 길이: 25 염기쌍(A) Length: 25 base pairs

(B) 유형: 뉴클레오티드(B) Type: Nucleotide

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(D) 형태: 선형(D) mode: linear

(ii) 분자 유형: DNA(ii) Molecular Type: DNA

(xi) 서열 번호: 7의 서열 배열:(xi) the sequence sequence of SEQ ID NO: 7:

GGATGATATG GTTGGACGCT GGAAG 25GGATGATATG GTTGGACGCT GGAAG 25

(2) 서열 번호: 8의 정보:(2) Information of SEQ ID NO: 8:

(i) 서열 특성:(i) sequence properties:

(A) 길이: 25 염기쌍(A) Length: 25 base pairs

(B) 유형: 뉴클레오티드(B) Type: Nucleotide

(C) 본쇄형: 일본쇄(C) main chain type: Japanese chain

(D) 형태: 선형(D) mode: linear

(ii) 분자 유형: DNA(ii) Molecular Type: DNA

(xi) 서열 번호: 8의 서열 배열:(xi) the sequence sequence of SEQ ID NO: 8:

AGGGCGGATG CGACGACACT GACTT 25AGGGCGGATG CGACGACACT GACTT 25

본 발명은 재조합 아데노바이러스의 새로운 생산방법에 대하여 설명한다. 본 발명에 따른 공정은 생산 단계 수준 및/또는 정제 단계 수준에서 기존 공정의 변형에서 유도된다. 본 발명에 따른 공정은 매우 높은 양과 품질의 바이러스 스톡을 매우 신속하고 공업화 가능한 방식으로 수득할 수 있게 해준다.The present invention describes a new method for producing recombinant adenoviruses. The process according to the invention is derived from the modification of existing processes at the production stage level and / or at the purification stage level. The process according to the invention makes it possible to obtain very high quantities and quality of virus stocks in a very rapid and industrializable manner.

본 발명의 제 1 면 중 하나는 특히, 바이러스가 배양 상등액으로부터 수거되는 재조합 아데노바이러스의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명의 다른 일면은 한외여과 단계를 포함하는 아데노바이러스 제조방법에 관한 것이다. 다른 일면에 따라, 본 발명은 또한, 음이온 교환 크로마토그래피 단계를 포함하는 재조합 아데노바이러스의 정제 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한, 임의로 음이온 교환 크로마토그래피와 커플링된 겔 투과 크로마토그래피를 이용하는 개선된 정제방법에 대해서도 설명한다. 본 발명에 따른 공정은 순도, 안정성, 형태 및 감염력에 있어서, 매우 높은 수율로 공업적 요구조건 및 치료 분자의 생산에 관련된 법제와 완전히 부합될 수 있는 생산조건하에 고 품질의 바이러스를 수득가능하게 해준다.One of the first aspects of the invention relates, in particular, to a method for producing a recombinant adenovirus in which the virus is harvested from the culture supernatant. Another aspect of the invention relates to a method for producing adenovirus comprising an ultrafiltration step. According to another aspect, the present invention also relates to a method for purifying recombinant adenovirus comprising an anion exchange chromatography step. The present invention also describes an improved purification method using gel permeation chromatography, optionally coupled with anion exchange chromatography. The process according to the invention makes it possible to obtain a high quality virus under production conditions which, in terms of purity, stability, morphology and infectivity, can be fully matched with industrial requirements and legislation involved in the production of therapeutic molecules in very high yields. .

특히, 산업화면에서, 본 발명의 공정은 마이크로 여과 또는 깊이 여과, 및 접선 한외여과와 같은, 재조합 단백질에 대해 대규모상에서 입증된 배양 상등액의 처리방법을 이용한다. 더욱이, 37℃에서 바이러스의 안정성으로 해서, 본 공정은 내세포법과는 대조적으로, 수거 시간이 반나절내에서는 정확해야 할 필요가 없기 때문에 공업적 단계의 더 양호한 구성을 허용한다. 더욱이 몇몇 영역이 결손된 바이러스의 경우 특히 중요한 바이러스의 최대 수확을 보장한다. 또한, 본 발명의 공정은 예비처리 없이 상등액의 균질 샘플에서 직접, 생산 동역학의 더욱 용이하고 더욱 정확한 모니터링을 허용하며, 이에 따라 생산의 재현성이 더 양호해진다. 본 발명에 따른 공정은 또한 세포 용해 단계로 분해하는 것을 가능케 해준다. 따라서, 공업적 수준에서 동결-해동 사이클에 의한 세포 파괴를 구상하는 것이 곤란해질 수도 있다. 더욱이, 대안의 용해방법(Dounce, X-프레스, 음파처리, 기계적 전단 등)은 단점을 안고 있으며; 이들은 L2 또는 L3 바이러스를 속박하기 곤란한 에어로졸의 잠정적인 생성자이며(병원성 또는 전파 양식에 따라 바이러스의 속박 수준), 이들 바이러스는 또한, 공기를 통한 경로에 의해 감염되는 경향이 있으며; 이들은 통제하기가 어렵고 제제의 활성을 감소시키는 전단력 및/또는 열 방출을 생성한다. 세포 용해를 위한 세제 사용 용액은 유효하기 위해 요구될 것이며 또한 세제 제거의 유효함을 요할 것이다. 최종적으로, 세포 용해는 정제를 더 복잡하게 만드는 수많은 세포 파편을 배지에 존재하게 한다. 바이러스 품질면에서, 본 발명의 공정은 잠정적으로 바이러스의 더 양호한 성숙을 허용하여 더 균질한 집단을 이끈다. 특히, 바이러스 DNA의 패키징이 바이러스 사이클의 최종단계이므로, 세포의 때이른 용해는 비록 비-복제성이지만, 감염성이고 바이러스에 특이적인 독성 효과에 참여할 수 있고 수득된 제제의 특정 활성비를 증가시킬 수 있는 속이 빈 입자를 잠정적으로 방출한다. 제제의 특정 감염력 비는 생화학적 방법(OD260nm, CLHP, PCR, 면역효소법 등)으로 측정한 바이러스 입자의 총수 : 생물학적 효과(고체 배지내 배양시 세포상 용해 파지의 형성, 세포의 형질도입)를 생성하는 바이러스 입자의 수의 비로서 정의된다. 실질적으로, 정제된 제제의 경우, 이러한 비는 260nm에서 OD에 의해 측정된 입자의 농도 : 제제의 플라크 형성 단위의 농도 비를 게산해냄으로써 측정된다. 이러한 비는 100 이하이다.In particular, in the industrial context, the process of the present invention utilizes a method of treating culture supernatants that has been demonstrated on a large scale for recombinant proteins, such as microfiltration or depth filtration, and tangential ultrafiltration. Moreover, due to the stability of the virus at 37 ° C., the process allows for better construction of the industrial stage since the collection time does not have to be accurate in half a day, in contrast to the intracellular method. Moreover, in the case of viruses with several missing regions, this ensures a maximum harvest of particularly important viruses. In addition, the process of the present invention allows easier and more accurate monitoring of production kinetics directly on homogeneous samples of the supernatant without pretreatment, which results in better reproducibility of production. The process according to the invention also makes it possible to degrade into cell lysis steps. Thus, it may be difficult to envision cell disruption by freeze-thaw cycles at the industrial level. Moreover, alternative dissolution methods (Dounce, X-press, sonication, mechanical shear, etc.) have drawbacks; These are potential producers of aerosols that are difficult to confine L2 or L3 viruses (binding levels of viruses depending on pathogenic or propagation form), and these viruses also tend to be infected by routes through the air; They produce shear forces and / or heat release that are difficult to control and reduce the activity of the formulation. Detergent use solutions for cell lysis will be required to be effective and will also require the effectiveness of detergent removal. Finally, cell lysis results in the presence of numerous cell debris in the medium making the purification more complex. In terms of virus quality, the process of the present invention potentially allows for better maturation of the virus, leading to a more homogeneous population. In particular, since the packaging of viral DNA is the final stage of the virus cycle, the premature lysis of cells, although non-replicating, can be infectious and participate in viral specific toxic effects and increase the specific activity ratio of the resulting agent. Provisionally releases hollow particles. The specific infectivity ratio of the preparation produces the total number of virus particles as measured by biochemical methods (OD260nm, CLHP, PCR, immunoenzyme method, etc.): biological effects (formation of cytolytic phage, cell transduction in culture in solid medium). It is defined as the ratio of the number of viral particles. Practically, for purified formulations, this ratio is determined by calculating the concentration ratio of the particles measured by OD at 260 nm: the concentration of plaque forming units of the formulation. This ratio is 100 or less.

수득 결과는 본 발명의 과정이 농축 바이러스 상등액을 출발물질로 하여, 선행 처리 없이 일단계로, 세슘 클로라이드 구배 농도에 의해 정제된 상동체와 적어도 동등한 순도의 바이러스를 수득가능하게 해줌을 보여준다.The results show that the process of the present invention makes it possible to obtain viruses of at least equivalent purity to homologs purified by the cesium chloride gradient concentration, in one step, without prior treatment, using the concentrated virus supernatant as the starting material.

따라서 본 발명의 제 1 목적은 바이러스 DNA를 캡시드화 세포 배양액 중으로 도입하고, 생성된 바이러스를 배양 상등액 중으로의 방출 뒤에 수거함을 특징으로 하는 재조합 아데노바이러스 제조방법에 관한 것이다. 바이러스가 기계적으로 또는 화학적으로 수행된 때이른 세포 용해 뒤에 수거되는 선행기술 방법과는 대조적으로, 본 발명의 방법에 있어서, 세포는 외부요인에 의해 용해되지 않는다. 배양을 더 긴 기간 동안 지속하고, 캡시드화 세포에 의한 동시 방출 후에 바이러스를 상등액에서 직접 수거한다. 본 발명에 따른 바이러스는 따라서 세포 상등액에서 회수되는 반면에, 선행기술 방법의 경우, 이는 내세포성, 특히 핵간 바이러스이다.Therefore, a first object of the present invention relates to a method for producing a recombinant adenovirus, characterized in that viral DNA is introduced into a capsidated cell culture and the resulting virus is collected after release into the culture supernatant. In contrast to the prior art methods in which viruses are harvested after premature cell lysis performed mechanically or chemically, in the method of the invention, the cells are not lysed by external factors. The culture is continued for a longer period of time and the virus is harvested directly from the supernatant after simultaneous release by the encapsidated cells. The virus according to the invention is thus recovered in the cell supernatant, whereas for the prior art methods it is endogenous, in particular internuclear virus.

본 출원인은, 배양 지속기간의 연장 및 대 용적 사용에도 불구하고, 본 발명에 따른 방법이 다량으로 더 우수한 품질로 바이러스 입자를 생성가능하게 해줌을 밝혀내었다. 또한, 전술한 바와 같이, 이러한 공정은 산업수준에서 번거럽고 다수의 불순물을 생성하는 용해 단계를 피할 수 있게 해준다.Applicants have found that, despite the prolonged incubation duration and the use of large volumes, the method according to the invention makes it possible to produce viral particles in a much better quality. In addition, as described above, this process makes it possible to avoid dissolution steps that are cumbersome at the industrial level and produce a large number of impurities.

방법의 원리는 따라서, 상등액 중으로 방출된 바이러스의 수거에 기초한다. 이러한 방법은 세포 용해에 기초한 선행기술에 대한 것보다 더 긴 배양시간을 수반할 수 있다. 전술한 바와 같이, 수거 시간은 반나절내에서 정확하여야 할 필요는 없다. 이는 본질적으로 세포 상등액 중으로의 바이러스 방출 동역학에 의해 결정된다.The principle of the method is thus based on the collection of the virus released into the supernatant. This method may involve longer incubation times than for the prior art based on cell lysis. As mentioned above, the collection time need not be accurate within half a day. This is essentially determined by the virus release kinetics into the cell supernatant.

바이러스 방출의 동역학은 다양한 방법으로 모니터링될 수 있다. 특히, RP-HPLC, IE-HPLC, 반정량적 PCR(실시예4.3), 트립판 블루에 의한 사멸세포의 염색, LDH형 내세포 효소의 방출 측정, 쿨터형 장치 또는 광산란에 의한 상등액내 입자의 측정, 면역학적 방법(ELISA, RIA 등) 또는 현탁액내 세균 계량법, 항체 존재하 응집에 의한 적정과 같은 분석방법을 이용하는 것이 가능하다.The kinetics of virus release can be monitored in a variety of ways. In particular, RP-HPLC, IE-HPLC, semi-quantitative PCR (Example 4.3), staining of dead cells by trypan blue, measurement of release of LDH-type endothelial enzymes, measurement of particles in supernatant by coulter type device or light scattering It is also possible to use analytical methods such as immunological methods (ELISA, RIA, etc.) or bacterial assays in suspension, titration by aggregation in the presence of antibodies.

바람직하게는, 수거는 바이러스의 적어도 50%가 상등액 중으로 방출될 때 수행된다. 바이러스의 50%가 방출될 때의 시간은 전술한 방법에 따른 동역학을 도출하여 용이하게 측정할 수 있다. 더욱 바람직하게는, 수거는 바이러스의 적어도 70%가 상등액 중으로 방출될 때 수행된다. 바이러스의 적어도 90%가 상등액 중으로 방출될 때, 즉 동역학이 안정수준기에 도달할 때 수거를 수행하는 것이 특히 바람직하다. 바이러스 방출의 동역학은 본질적으로 아데노바이러스 복제 사이클에 기초하며 특정 요인에 의해 영향받을 수 있다. 특히, 사용된 바이러스 유형, 및 특히 재조합 바이러스 게놈에 생긴 결실 유형에 따라 변할 수 있다. 특히, E3 영역의 결실은 바이러스의 방출을 지연시키는 것으로 보인다. 따라서, E3 영역의 존재하에, 바이러스는 24 내지 48 시간 후-감염으로부터 수거될 수 있다. 이와는 대조적으로, E3 영역의 부재하에, 더 긴 배양시간이 필요한 것으로 보인다. 이와 관련하여, 본 출원인은 세포 상등액내 E1 및 E3 영역이 결핍된 아데노바이러스의 방출 동역학에 대해 실험을 수행하였으며, 방출이 감염 약 4 내지 5일 후 개시되어 대략 14일째까지 지속함을 알아내었다. 방출은 일반적으로 8일째 내지 14일째 사이에 안정상태에 도달하고, 역가는 적어도 20일 후-감염 동안 안정하게 남는다.Preferably, harvesting is performed when at least 50% of the virus is released into the supernatant. The time when 50% of the virus is released can be easily determined by deriving the kinetics according to the method described above. More preferably, harvesting is performed when at least 70% of the virus is released into the supernatant. Particular preference is given to performing collection when at least 90% of the virus is released into the supernatant, ie when the kinetics reach a stable level. The kinetics of virus release is essentially based on the adenovirus replication cycle and can be influenced by certain factors. In particular, it can vary depending on the type of virus used, and in particular the type of deletion occurring in the recombinant viral genome. In particular, deletion of the E3 region appears to delay the release of the virus. Thus, in the presence of the E3 region, the virus can be harvested from 24 to 48 hours post-infection. In contrast, in the absence of the E3 region, longer incubation times appear to be necessary. In this regard, we conducted experiments on the release kinetics of adenoviruses deficient in the E1 and E3 regions in the cell supernatant and found that release began about 4-5 days after infection and continued until approximately 14 days. Release generally reaches a steady state between days 8 and 14, and the titer remains stable for at least 20 days post-infection.

바람직하게는, 본 발명의 공정에서, 세포는 2 내지 14일간 동안 배양된다. 더욱이, 바이러스의 방출은 캡시드화 세포에서, 바이러스의 방출에 연루된, 단백질, 예를 들면, 바이러스 단백질의 발현에 의해 유도될 수 있다. 따라서, 아데노바이러스의 경우, 방출은 임의로 유도성 프로모터의 조절하에 발현된, 아데노바이러스의 E3 영역에 의해 암호화된 사멸 단백질(단백질 E3-11.6K)의 발현에 의해 조정될 수 있다. 이러한 이유로 해서, 바이러스 방출 시간을 조절하고 배양 상등액에서 24 내지 48 시간 감염후 바이러스의 50% 이상을 수거할 수 있다.Preferably, in the process of the invention, the cells are incubated for 2 to 14 days. Moreover, release of the virus can be induced by expression of a protein, eg, viral protein, involved in the release of the virus in capsidated cells. Thus, for adenoviruses, release can be modulated by the expression of a killing protein (protein E3-11.6K) encoded by the E3 region of adenovirus, optionally expressed under the control of an inducible promoter. For this reason, more than 50% of the virus can be harvested after 24 to 48 hours infection in the culture supernatant by controlling the virus release time.

바이러스 입자를 회수하기 위하여, 배양 상등액을 유리하게는 사전에 여과한다. 약 0.1 ㎛(120 nm) 크기의 아데노바이러스에서, 여과는 바이러스를 통과시키기에 충분히 크지만, 오염물을 보유시키기에는 충분히 미세한 다공성을 갖는 막에 의해 수행한다. 바람직하게는, 여과는 0.2㎛ 이상의 다공성을 갖는 막에 의해 수행된다. 특히 유리한 양태에 따라, 여과는 감소하는 다공성 막에서 연속적인 여과에 의해 수행한다. 특히 우수한 결과는 감소하는 다공성 10㎛, 1.0㎛ 및 0.8 내지 0.2㎛의 깊이 필터상에서 여과를 수행함으로써 수득된다. 바람직한 별법에 따라, 여과는 편평막 또는 중공 섬유상에서의 접선 미세여과에 의해 수행된다. 특히 다공성이 0.2 내지 0.6 ㎛인 편평한 밀리포어 막 또는 중공 섬유를 사용하는 것이 가능하다. 실시예에 제시된 결과는 이러한 여과 단계로 100% 수율(최저 다공성을 갖는 필터상에 보유시킴으로써 바이러스의 어떠한 손실도 관찰되지 않았다)이 달성됨을 보여준다.In order to recover the virus particles, the culture supernatant is advantageously filtered beforehand. In adenoviruses of about 0.1 μm (120 nm) in size, filtration is performed by membranes that are large enough to pass the virus but have a fine porosity sufficient to retain contaminants. Preferably, the filtration is carried out by a membrane having a porosity of at least 0.2 μm. According to a particularly advantageous embodiment, the filtration is carried out by continuous filtration in a decreasing porous membrane. Particularly good results are obtained by performing filtration on decreasing porosity 10 μm, 1.0 μm and depth filters of 0.8 to 0.2 μm. According to a preferred alternative, the filtration is carried out by tangential microfiltration on flat membranes or hollow fibers. It is possible in particular to use flat millipore membranes or hollow fibers with a porosity of 0.2 to 0.6 μm. The results presented in the Examples show that this filtration step achieves 100% yield (no loss of virus was observed by retaining on the filter with the lowest porosity).

본 발명의 다른 일면에 따라, 본 출원인은 상등액으로부터 바이러스의 수거와 정제를 가능케 해주는 방법을 개발하였다. 이런 취지로, 여과된(또는 청징화된) 상등액을 한외여과시킨다. 이러한 한외여과는 상등액 농축(수반된 용적이 커짐)(i), 바이러스의 1차 정제(ii) 및 제조 완충제의 후속 제조단계에 조정을 가능하게 해준다. 바람직한 양태에 따라, 상등액은 접선 한외여과에 투입된다. 접선 한외여과는 측정된 컷-오프를 갖는 막에 의해 분리된 두 구획, 보유물과 여액 간의 용액 농축 및 분획화, 장치의 보유물 구획내 유동 생성 및 이러한 구획과 여액 구획 간의 수송막 압력을 적용함에 있다. 유동은 일반적으로 장치의 보유물 구획내 펌프에 의해 생성되고 수송막 압력은 보유물 회로의 액체 스트림에 대한 밸브 또는 여액 회로의 액체 스트림에 대한 가변용량 펌프에 의해 조절될 수 있다. 유속과 수송막 압력은 막의 차단을 피하면서, 낮은 전단력(5000 sec-1, 바람직하게는 3000 sec-1이하의 레이놀즈 수, 1.0 바 이하의 압력)을 발생시키도록 선택된다. 예를 들면, 나선형 막 (Millipore, Amicon), 편평막 또는 중공 섬유(Amicon, Millipore, Sartorius, Pall, GF, Sepracor)과 같은 다양한 시스템이 한외여과 수행에 사용될 수 있다. 약 1000 kDa 질량을 갖는 아데노바이러스, 컷-오프가 1000, 바람직하게는 100 kDa 내지 1000 kDa인 막이 본 발명의 프레임워크내에서 유리하게 사용된다. 컷-오프가 1000 kDa 이상인 막의 사용으로 본 단계에서 바이러스의 상당한 소실이 초래된다. 바람직하게는, 컷-오프가 200 내지 600 kDa, 더욱 바람직하게는 300 내지 500 kDa인 막이 사용된다. 실시예에 제시된 실험은 컷-오프가 300 kDa인 막의 사용이 배지로부터 오염물(DNA, 배지내 단백질, 세포 단백질 등)을 제거하면서 바이러스 입자의 90% 이상 보유를 허용함을 보여준다. 500 kDa의 컷-오프 사용은 동일 이점을 제공한다.In accordance with another aspect of the present invention, Applicants have developed a method that enables the collection and purification of viruses from the supernatant. To this end, the filtered (or clarified) supernatant is ultrafiltered. This ultrafiltration allows adjustment to supernatant concentration (large volume involved) (i), primary purification of virus (ii) and subsequent preparation of the preparation buffer. According to a preferred embodiment, the supernatant is added to tangential ultrafiltration. Tangential ultrafiltration applies two compartments separated by a membrane with a measured cut-off, solution concentration and fractionation between retentate and filtrate, generation of flow in the retentate compartment of the apparatus and transport membrane pressure between these compartments and filtrate compartments. It is in a ship. The flow is generally produced by a pump in the retentate compartment of the device and the transport membrane pressure can be regulated by a valve for the liquid stream of the retentate circuit or a variable displacement pump for the liquid stream of the filtrate circuit. The flow rate and transport membrane pressure are selected to generate a low shear force (5000 sec −1 , preferably Reynolds number below 3000 sec −1 , pressure below 1.0 bar) while avoiding blocking of the membrane. For example, various systems such as spiral membranes (Millipore, Amicon), flat membranes or hollow fibers (Amicon, Millipore, Sartorius, Pall, GF, Sepracor) can be used for ultrafiltration. Adenoviruses having a mass of about 1000 kDa, membranes with a cut-off of 1000, preferably 100 kDa to 1000 kDa, are advantageously used within the framework of the present invention. The use of a membrane with a cut-off greater than 1000 kDa results in significant loss of the virus at this stage. Preferably, a film is used having a cut-off of from 200 to 600 kDa, more preferably from 300 to 500 kDa. The experiments presented in the Examples show that the use of a membrane with a cut-off of 300 kDa allows retention of at least 90% of viral particles while removing contaminants (DNA, proteins in the medium, cellular proteins, etc.) from the medium. The cut-off use of 500 kDa provides the same advantages.

실시예에 제시된 결과는 이러한 단계가 바이러스의 손실없이(90%의 수율) 상등액의 대 용적을 농축시킬 수 있게 해주고, 더 양호한 품질의 바이러스를 생성함을 보여준다.The results presented in the Examples show that this step allows to concentrate the large volume of the supernatant without loss of virus (90% yield) and to produce virus of better quality.

따라서, 이러한 한외여과는 컷-오프(300 또는 500 kDa)보다 작은 질량을 갖는 오염물이 적어도 부분적으로 제거되므로 통상적인 전략에 비해 추가적인 정제를 구성한다. 바이러스 제제 품질의 증진은 분리 양태가 두 공정에 따른 제 1 한외여과 단계 후에 비교하였을 때 명백하다. 용해를 수반하는 통상적인 공정에 있어서, 바이러스 제제의 튜브는 종종 바이러스 밴드를 터치하는 코애귤럼(지질, 단백질)과의 흐릿한 외관을 보이는 반면에, 본 발명의 공정에 있어서, 방출 및 한외여과 후 제제는 상부상에 지속되는 배지내 오염물로부터 이미 잘 분석되는 밴드를 갖는다. 품질의 증진은 또한, 본 발명에 설명된 바와 같이 한외여과에 의해 수득된 바이러스에 대해 세포 용해에 의해 수득한 바이러스의 이온 교환 크로마토그래피 프로필을 비교하였을 때 입증된다. 더욱이, 농축물의 투석여과에 의한 한외여과를 수행함으로써 품질을 더욱 증진시킬 수 있다. 이러한 투석여과는 접선 한외여과에서와 동일 원리로 수행되고, 정제 완충제에서 농축물을 평형시키면서, 막 컷-오프 이상인 크기의 오염물을 완전히 제거하는 것이 가능하다.Thus, such ultrafiltration constitutes further purification compared to conventional strategies since at least partly the contaminants having a mass less than cut-off (300 or 500 kDa) are removed. Enhancement of viral product quality is evident when the separation mode is compared after the first ultrafiltration step following the two processes. In conventional processes involving dissolution, the tubes of viral preparation often exhibit a blurred appearance with coagulum (lipids, proteins) that touch the viral band, whereas in the process of the present invention, preparations after release and ultrafiltration Has a band that is already well analyzed from contaminants in the medium that persist on the top. Enhancement of quality is also demonstrated when comparing the ion exchange chromatography profile of the virus obtained by cell lysis against the virus obtained by ultrafiltration as described herein. Moreover, quality can be further enhanced by performing ultrafiltration by diafiltration of the concentrate. This diafiltration is carried out on the same principle as in tangential ultrafiltration and it is possible to completely remove contaminants of size beyond the membrane cut-off while equilibrating the concentrate in the purification buffer.

더욱이, 본 출원인은 또한, 이러한 한외여과가 이온 교환 칼럼상에서의 크로마토그래피에 의해 또는 겔 투과 크로마토그래피에 의해 직접 바이러스를 정제가능케 해주고, 이에 따라 크로마토그래피에 앞서 제제를 처리할 필요없이 바이러스 입자 피크의 탁월한 분해를 수득할 수 있게 됨을 알아내었다. 이는 특별히 예상되지 않고 유리하다. 사실상, 상기에서 인용된 Hyughe 등에 의한 문헌에 나타난 바와 같이 바이러스 제제의 크로마토그래피 정제가 평범한 결과를 부여하고 추가로 벤조나제 및 사이클로덱스트린으로 바이러스 현탁액을 예비처리하는 것을 요한다.Furthermore, Applicants also found that such ultrafiltration allows for direct purification of the virus by chromatography on an ion exchange column or by gel permeation chromatography, thus eliminating the need for treatment of the agent prior to chromatography. It has been found that excellent degradation can be obtained. This is not particularly expected and advantageous. In fact, chromatographic purification of viral preparations, as indicated in the literature by Hyughe et al., Cited above, impart mediocre results and further require pretreatment of the virus suspension with benzonase and cyclodextrin.

구체적으로 말해서, 본 발명에 따른 공정은 따라서 바이러스가 한외여과에 의해 수거됨을 특징으로 한다.Specifically, the process according to the invention is characterized in that the virus is thus collected by ultrafiltration.

전술한 바와 같이, 생성되는 농축물은 바이러스 정제에 직접 사용될 수 있다. 이러한 정제과정은 크기, 밀도 또는 침강계수에 따라 입자가 분리되도록 허용하는 세슘 클로라이드 또는 다른 한외여과 매질상에서의 원심분리와 같은 기존의 기술에 의해 수행될 수 있다. 실시예 4에 제시된 결과는 사실, 수득된 바이러스가 현저한 특성을 지니고 있음을 보여준다. 특히, 본 발명에 따라, 세슘 클로라이드를 아이오딕사놀, 5,5′-[(2-하이드록시-1,3-프로판디일)비스(아세틸이미노)]-비스[N,N′-비스(2,3-디하이드록시프로필)-2,4-트리아이오도-1,3-벤젠디카복사미드]의 용액으로 대치가능하고, 이 용액에서 바이러스는 1.16 내지 1.24의 상대밀도에서 평형상태에서 침강한다. 이러한 용액의 사용은 세슘 클로라이드와는 달리 무독하기 때문에 유리하다. 더욱이, 출원인은 또한, 유리하게는 수득된 농축물이 또한 이온 교환 메커니즘에 의해 또는 겔 투과에 의해 직접 바이러스를 정제하고, 예비처리의 필요없이 바이러스 입자 크로마토그래피 피크의 탁월한 분해를 수득할 수 있게 해준다.As mentioned above, the resulting concentrate can be used directly for virus purification. This purification can be accomplished by conventional techniques such as centrifugation on cesium chloride or other ultrafiltration media that allow particles to separate according to size, density or sedimentation coefficient. The results presented in Example 4 show, in fact, that the virus obtained has significant properties. In particular, according to the present invention, cesium chloride is selected from iodixanol, 5,5 '-[(2-hydroxy-1,3-propanediyl) bis (acetylimino)]-bis [N, N'-bis ( 2,3-dihydroxypropyl) -2,4-triiodo-1,3-benzenedicarboxamide], in which the virus settles in equilibrium at a relative density of 1.16 to 1.24 do. The use of such solutions is advantageous because, unlike cesium chloride, they are nontoxic. Moreover, Applicants also advantageously allow the obtained concentrate to also purify the virus directly by ion exchange mechanism or by gel permeation and to obtain excellent degradation of viral particle chromatography peaks without the need for pretreatment. .

바람직한 양태에 따라, 바이러스는 따라서 음이온 교환 크로마토그래피에 의해 수거되고 정제된다.According to a preferred embodiment, the virus is thus collected and purified by anion exchange chromatography.

음이온 교환 크로마토그래피의 경우, 셀룰로스, 아가로스(세파로스 겔), 덱스트란(세파덱스 겔), 아크릴아미드(세파크릴 겔, 트리스아크릴 겔), 실리카(TSK 겔-SW 겔), 폴리(스티렌-디비닐벤젠](Source 또는 Poros 겔), 에틸렌글리콜-메타크릴레이트 공중합체(Toyopearl HW 겔 및 TSK 겔- PW 겔), 또는 혼합물(아가로스-덱스트란: 슈퍼덱스 겔)과 같은 다양한 유형의 지지체가 사용될 수 있다. 더욱이, 크로마토그래피 해상력을 증진시키기 위해, 본 발명의 프레임워크내에서, 다음과 같은 특징을 지닌 비드 형태의 지지체를 사용하는 것이 바람직하다:For anion exchange chromatography, cellulose, agarose (sepharose gel), dextran (sephadex gel), acrylamide (cepacryl gel, trisacryl gel), silica (TSK gel-SW gel), poly (styrene- Various types of supports such as divinylbenzene] (Source or Poros gel), ethylene glycol-methacrylate copolymers (Toyopearl HW gel and TSK gel-PW gel), or mixtures (agarose-dextran: superdex gel) Furthermore, in order to enhance the chromatographic resolution, within the framework of the present invention, it is preferable to use a bead-shaped support having the following characteristics:

-가능한 한 구형,-Spherical as possible,

-보정된 직경(모두 동일하거나 가능한 한 균질인 비드), 결함이나 파괴 없음,-Calibrated diameter (beads that are all the same or as homogeneous as possible), no defects or breakage,

-최소 가능 직경: 10 ㎛의 비드가 기술됨(예를 들면, Pharmacia로부터의 MonoBeads 또는 OosoHaas로부터의 TSK). 이러한 값은 또한 물체가 비드 내측에 크로마토그래피되도록 하기 위해 다공성이 매우 높아야하는 비드의 직경에 대한 하한선을 구성하는 것으로 보인다),-Minimum possible diameter: beads of 10 μm are described (eg MonoBeads from Pharmacia or TSK from OosoHaas). These values also appear to constitute a lower limit for the diameter of the beads, which must be very high in porosity for the object to be chromatographed inside the beads),

-압력에 견디기 위해 경질성 유지.-Stay rigid to withstand pressure.

더욱이, 초대형 크기(직경 100 nm 이상)의 물체를 구성하는 아데노바이러스를 크로마토그래피하기 위해서는, 바이러스 입자의 접근이 관심의 대상이 되는 작용 그룹에 허용되도록, 다공성의 높은 상한선을 갖는, 또는 심지어 가능한 한 다공성이 높은 겔을 사용하는 것이 중요하다.Moreover, in order to chromatograph adenoviruses that make up objects of extra-large size (100 nm or more in diameter), having a high upper limit of porosity, or even as much as possible, allows the access of viral particles to the functional groups of interest. It is important to use a gel with a high porosity.

유리하게도, 지지체를 아가로스, 덱스트란, 아크릴아미드, 실리카, 폴리[스티렌-디비닐벤젠], 에틸렌글리콜-메타크릴레이트 공중합체 중에서 단독으로 또는 혼합체로서 선택한다.Advantageously, the support is chosen alone or as a mixture from agarose, dextran, acrylamide, silica, poly [styrene-divinylbenzene], ethylene glycol-methacrylate copolymers.

음이온 교환 크로마토그래피를 위해서, 사용된 지지체는 음이온성 분자와 상호작용할 수 있는 그룹을 이식함으로써 작용화되어야 한다. 좀더 일반적으로, 그룹은 3급 또는 4급일 수 있는 아민으로 이루어진다. 예를 들면, DEAE와 같은 3급 아민을 사용함으로써, 약 음이온성 교환제가 수득된다. 4급 아민을 사용함으로써 강 음이온 교환제가 수득된다.For anion exchange chromatography, the support used must be functionalized by implanting groups that can interact with the anionic molecules. More generally, the group consists of amines which may be tertiary or quaternary. For example, by using a tertiary amine such as DEAE, a weak anionic exchanger is obtained. Strong anion exchangers are obtained by using quaternary amines.

본 발명의 프레임워크 내에서, 강 음이온성 교환제를 사용함이 특히 유리하다. 따라서, 상기에 지적된 바와 같은 4급 아민에 의해서 작용화된 크로마토그래피 지지체는 바람직하게 본 발명에 따라서 사용된다. 4급 아민에 의해서 작용화된 지지체 중에서, 예로서 수지 Source Q, Mono Q, Q Sepharose, Poros HQ 및 Poros QE, Fractogel TMAE 유형의 수지 및 Toyopearl Super Q 수지가 언급될 수 있다.Within the framework of the present invention, it is particularly advantageous to use strong anionic exchangers. Thus, chromatographic supports functionalized with quaternary amines as indicated above are preferably used according to the invention. Among the supports functionalized with quaternary amines, mention may be made of resins Source Q, Mono Q, Q Sepharose, Poros HQ and Poros QE, resins of the Fractogel TMAE type and Toyopearl Super Q resins as examples.

본 발명의 프레임워크 내에서 사용될 수 있는 수지의 바람직한 예는 Source, 특히 Source Q, 예를 들면, 15 Q (Pharmacia), MonoBeads, 예를 들면, Q (Pharmacia), Poros HQ 및 Poros OE 유형 수지이다. MonoBeads 지지체 (비드 직경 10 ± 0.5 ㎛)가 10 년 이상, Source (15 ㎛) 또는 Poros (10 ㎛ 또는 20 ㎛) 유형의 수지가 약 5 년 동안 시판되어 왔다. Source 또는 Poros 지지체는 매우 광범위한 내부 포어 분포 (이들은 20 nm 내지 1 ㎛ 범위임)를 갖는 장점을 나타내고, 이렇게 하여 비드를 통한 매우 큰 물체의 통과를 허용한다. 또한, 이들은 순환에 대한 매우 적은 내성 또는 겔을 통한 액체(그러므로 매우 적은 압력)를 제공하고 매우 경질이다. 그러므로, 상호작용할 작용 그룹을 향한 용질의 수송은 매우 신속하다. 본 출원인은 분산이 그 크기로 인하여 느린 아데노바이러스의 경우에 특히 중요하다.Preferred examples of resins that can be used within the framework of the invention are Source, in particular Source Q, for example 15 Q (Pharmacia), MonoBeads, for example Q (Pharmacia), Poros HQ and Poros OE type resins. . MonoBeads supports (bead diameter 10 ± 0.5 μm) have been commercially available for more than 10 years, and Source (15 μm) or Poros (10 μm or 20 μm) resins for about 5 years. Source or Poros supports exhibit the advantage of having a very wide internal pore distribution (they range from 20 nm to 1 μm), thus allowing the passage of very large objects through the beads. In addition, they provide very little resistance to circulation or liquid through the gel (and therefore very little pressure) and are very hard. Therefore, the transport of solutes to the functional groups to interact is very rapid. Applicants are particularly important for adenoviruses where dispersion is slow due to their size.

실시예에 제시된 결과는 아데노바이러스가 정제 수율이 우수하고(tdu의 경지에서, Huyghes 등에 의해 보고된 49 %의 값과 비교하여) 해상력이 우수한 단일 음이온-교환 크로마토그래피 단계에서 농도물로부터 정제될 수 있다. 또한, 제시된 결과는 수득된 아데노바이러스가 높은 감염성을 지니고, 따라서 치료 용도를 위해서 요구되는 특성을 지님을 예시한다. 특히 유리한 결과가 강 음이온 교환제로 수득되고, 즉, 특히 수지 Source Q로 4급 아민에 의해서 작용화된다. 수지 Source Q15가 특히 바람직하다.The results presented in the Examples show that adenoviruses can be purified from concentrations in a single anion-exchange chromatography step with good purification yields (compared to the value of 49% reported by Huyghes et al. At tdu). have. In addition, the results presented exemplify that the adenoviruses obtained have high infectivity and therefore have the required properties for therapeutic use. Particularly advantageous results are obtained with strong anion exchangers, ie functionalized with quaternary amines, in particular with resin Source Q. Resin Source Q15 is particularly preferred.

이에 관하여, 본 발명의 다른 주제는 강 음이온-교환 크로마토그래피에 의한 정제단계를 포함함을 특징으로 하는 생물학적 배지로부터의 재조합 아데노바이러스의 정제방법에 관한 것이다.In this regard, another subject of the present invention relates to a method for purifying recombinant adenovirus from a biological medium, comprising the step of purifying by strong anion-exchange chromatography.

이러한 변형에 있어서, 생물학적 배지는 바이러스를 생성하는 캡시드화 세포의 현탁액, 바이러스를 생성하는 캡시드화 세포의 용해물 또는 바이러스 정제 용액일 수 있다.In such a modification, the biological medium may be a suspension of virus producing capsidated cells, a lysate of virus producing capsidated cells or a virus purification solution.

바람직하게는, 크로마토그래피는 4급 아민으로 작용화된 지지체에서 수행된다. 또한 바람직한 양식에 있어서, 지지체가 아가로스, 덱스트란, 아크릴아미드, 실리카, 폴리[스티렌-디비닐벤젠], 에틸렌글리콜-메타크릴레이트 공중합체 중에서 단독 또는 혼합물로서 선택된다.Preferably, chromatography is performed on a support functionalized with quaternary amines. Also in a preferred mode, the support is selected alone or as a mixture from agarose, dextran, acrylamide, silica, poly [styrene-divinylbenzene], ethylene glycol-methacrylate copolymer.

특히 유리한 양태는 크로마토그래피가 Source Q 수지, 바람직하게는 Q15에서 수행됨을 특징으로 한다.A particularly advantageous embodiment is characterized in that the chromatography is carried out in a Source Q resin, preferably Q15.

또한, 상술된 방법은 유리하게는 생성 세포의 현택액을 사용하여 수행되고 예비 한외여과 단계를 포함한다. 이 단계는 유리하게는 상술된 조건 하에서 수행되고 특히 이것은 300 내지 500 kDa의 절단을 지닌 막에서의 접선식 한외여과이다.In addition, the method described above is advantageously carried out using a suspension of producing cells and comprises a preliminary ultrafiltration step. This step is advantageously carried out under the conditions described above and in particular it is tangential ultrafiltration in a membrane with a cut of 300 to 500 kDa.

본 발명 방법의 다른 양태에 있어서, 바이러스가 수득되고 겔 투과 크로마토그래피에 의해서 정제된다.In another embodiment of the method of the invention, the virus is obtained and purified by gel permeation chromatography.

겔 투과는 상등액, 농축물, 또는 음이온-교환 크로마토그래피로부터 유도된 바이러스 상에서 직접 실행될 수 있다. 음이온-교환 크로마토그래피에 대해서 언급된 지지체가 작용화되지 않으면서 이 단계에서 사용될 수 있다.Gel permeation can be performed directly on supernatants, concentrates, or viruses derived from anion-exchange chromatography. The support mentioned for anion-exchange chromatography can be used in this step without being functionalized.

이에 관하여, 바람직한 지지체는 아가로스 (Sepharose 겔), 덱스트란 (Sephadex 겔), 아크릴아미드 (Sephacryl 겔, Trisacryl 겔), 실리카 (TSK 겔-SW 겔), 에틸렌글리콜-메타크릴레이트 공중합체 (Toyopearl HW 겔 및 TSK 겔-PW 겔), 또는 혼합물 (아가로스-덱스트란: Superdex 겔)이다. 특히 바람직한 지지체는In this regard, preferred supports are agarose (Sepharose gel), dextran (Sephadex gel), acrylamide (Sephacryl gel, Trisacryl gel), silica (TSK gel-SW gel), ethylene glycol-methacrylate copolymer (Toyopearl HW) Gel and TSK gel-PW gel), or a mixture (agarose-dextran: Superdex gel). Particularly preferred supports are

- Superdex 200HR (Pharmacia)-Superdex 200HR (Pharmacia)

- Sephacryl S-500HR, S-1000HR 또는 S-2000 (Pharmacia)Sephacryl S-500HR, S-1000HR or S-2000 (Pharmacia)

- TSK G6000 PW (TosoHaas)이다.-TSK G6000 PW (TosoHaas).

그러므로, 본 발명에 따른 바람직한 방법은 한외여과에 이은 음이온-교환 크로마토그래피를 포함한다.Therefore, the preferred method according to the invention comprises ultrafiltration followed by anion-exchange chromatography.

바람직한 방법은 한외여과에 이은 음이온-크로마토그래피, 이어서 겔 투과 크로마토그래피를 포함한다.Preferred methods include ultrafiltration followed by anion-chromatography followed by gel permeation chromatography.

본 발명의 변형은 제 1 단계의 한외여과, 제 2 단계의 희석 또는 투석 및 제 3 단계의 음이온-교환 크로마토그래피를 포함하는 생물학적 배지로부터 아데노바이러스 정제방법에 관한 것이다. 바람직하게는, 이러한 변형에 있어서, 제 1 단계는 세슘 클로라이드 구배의 신속한 한외여과에 의해서 수행된다. 용어 신속한이란 약 0.5 내지 4 시간 범위의 한외여과를 의미한다. 제 2 단계 동안, 크로마토그래피 겔에의 주입 및 한외여과 매질의 제거를 촉진하기 위해서 바이러스를 희석하거나 완충제에 대해서 투석한다. 제 3 단계를 상술된 바와 같이, 음이온, 바람직하게는 강 음이온-교환 크로마토그래피를 사용하여 수행한다. 전형적인 실험에서, 상등액(또는 임의로 세포내)에서 수득된 바이러스로 시작하여, 제 1 한외여과를 세슘 클로라이드로 실행한다 (실시예 3에서와 같이). 다음, 샘플의 단순 희석(예를 들면, 완충제 10 용적으로) 후 또는 완충제내 단순 희석 후, 샘플을 이온-교환 크로마토그래피에 투입한다 (실시예 5.1에서와 같이). 본 발명 방법의 이러한 변형의 장점은 총 2가지의 상이한 바이러스 분리 양식 (밀도 및 표면 전하)를 사용한다는 사실로부터 유래하고, 이는 아마도 바이러스를 2가지 방법의 성능을 결합시키는 질의 수준으로 인도할 수 있다. 또한, 크로마토그래피 단계는 한외여과(예를 들면, 세슘 클로라이드 또는 상술된 바와 같은 다른 동등한 매질)에 사용되는 매질을 동시에 제거함을 가능하게 한다.A modification of the invention relates to a method for purifying adenovirus from a biological medium comprising a first step of ultrafiltration, a second step of dilution or dialysis and a third step of anion-exchange chromatography. Preferably, in this variant, the first step is carried out by rapid ultrafiltration of cesium chloride gradient. The term rapid means ultrafiltration in the range of about 0.5 to 4 hours. During the second step, the virus is diluted or dialyzed against the buffer to facilitate injection into the chromatography gel and removal of the ultrafiltration medium. The third step is carried out using anions, preferably strong anion-exchange chromatography, as described above. In a typical experiment, starting with the virus obtained in the supernatant (or optionally intracellularly), the first ultrafiltration is run with cesium chloride (as in Example 3). Next, after a simple dilution of the sample (eg, with 10 volumes of buffer) or after a simple dilution in buffer, the sample is subjected to ion-exchange chromatography (as in Example 5.1). The advantage of this variant of the method of the present invention stems from the fact that it uses a total of two different virus isolation modalities (density and surface charge), which can possibly lead the virus to a level of query that combines the performance of the two methods. . The chromatographic step also makes it possible to simultaneously remove the medium used for ultrafiltration (eg cesium chloride or other equivalent medium as described above).

본 발명의 다른 주제는 아데노바이러스 정제를 위한 아이오딕사놀, 5,5'-[2-하이드록시-1,3-프로판디일)비스(아세틸이미노)]비스[N,N'-비스(2,3-디하이드록시프로필)-2,4,6-트리아이오도-1,3-벤젠디카복사미드]의 사용에 관한 것이다.Another subject of the invention is iodixanol, 5,5 '-[2-hydroxy-1,3-propanediyl) bis (acetylimino)] bis [N, N'-bis (2) for adenovirus purification , 3-dihydroxypropyl) -2,4,6-triiodo-1,3-benzenedicarboxamide].

본 발명 방법을 수행하기 위해서, 다양한 아데노바이러스 캡시드화 세포가 사용될 수 있다. 특히, 캡시드화 세포는 다양한 약학적으로 유용한 세포, 즉, 산업적으로 허용되는 조건 하에서 배양할 수 있지만 인식되는 병리학적 특성을 지니지 않는 것으로부터 제조될 수 있다. 이들은 세포주 또는 제 1 배양물 및 특히 인간 망막아종, 인간 폐암 세포, 또는 배아 신장세포를 성립할 수 있다. 이들은 유리하게는 아데노바이러스에 의해서 감염될 수 있는 인간 기원의 세포일 수 있다. 이에 관하여, KB, Hela, 293, Vero, gmDBP6, HER, A549, HER 세포 등이 언급될 수 있다.In order to carry out the methods of the invention, various adenovirus capsidated cells can be used. In particular, the encapsidated cells can be prepared from a variety of pharmaceutically useful cells, ie those that can be cultured under industrially acceptable conditions but do not have recognized pathological properties. They can establish cell lines or first cultures and in particular human retinoblastoma, human lung cancer cells, or embryonic kidney cells. They can advantageously be cells of human origin that can be infected by adenoviruses. In this regard, KB, Hela, 293, Vero, gmDBP6, HER, A549, HER cells and the like can be mentioned.

KB의 세포주는 인간 상피 암종으로부터 유도된다. 이것은 ATCC (ref. CCL17) 및 이의 배양을 허용하는 조건에서 접근하기 쉽다. 인간 세포주 Hela는 인간 상피 암종으로부터 유도된다. 이것은 또한 ATCC (ref. CCL2) 및 이의 배양을 허용하는 조건에서 접근하기 쉽다. 세포주 293은 인간 배아 신장세포이다 [참조문헌: Graham et al., J. Gen. Virol. 36 (1977) 59]. 이러한 세포주는 특히 이의 게놈에 통합된 인간 아데노바이러스 Ad5 (12%) 게놈의 좌측부를 함유한다. 세포주 gm DBP6 [참조문헌: Brough et a., Virology 190 (1992) 624]는 MMTV LTR의 조절 하에서 아데노바이러스 E2 유전자를 운반하는 Hela 세포로 이루어진다.KB's cell line is derived from human epithelial carcinoma. It is easy to access under conditions that allow ATCC (ref. CCL17) and its culture. Human cell line Hela is derived from human epithelial carcinoma. It is also easy to access under conditions that allow ATCC (ref. CCL2) and its culture. Cell line 293 is human embryonic kidney cells. See, eg, Graham et al., J. Gen. Virol. 36 (1977) 59]. This cell line contains in particular the left part of the human adenovirus Ad5 (12%) genome integrated in its genome. The cell line gm DBP6 (Brough et a., Virology 190 (1992) 624) consists of Hela cells carrying adenovirus E2 gene under the control of MMTV LTR.

이들은 또한 개 기원 (BHK, MDCK 등)의 세포일 수 있다. 이에 관하여, 고양이의 MDCK 세포주가 바람직하다. MDCK 배양을 위한 조건은 특히 문헌[참조: Macatney et al., Science 44 (1988) 9.]에 기재되어 있다.They may also be cells of dog origin (BHK, MDCK, etc.). In this regard, the MDCK cell line of cats is preferred. Conditions for culturing MDCK are described in particular in Macatney et al., Science 44 (1988) 9.

다양한 캡시드화 세포주가 문헌에 기재되어 있고 실시예에 언급되어 있다. 이들은 유리하게는 아데노바이러스 E1 기능을 트랜스상보화하는 세포이다. 좀더 바람직하게는, 이들은 아데노바이러스 E1 및 E4 또는 E1 및 E2a 기능을 트랜스상보화하는 세포이다. 이러한 세포는 바람직하게는 신장 또는 망막 세포, 또는 인간 폐 암종으로부터 유도된다.Various capsidated cell lines are described in the literature and are mentioned in the Examples. These are advantageously cells which trans complement the adenovirus E1 function. More preferably, they are cells that trans-complement adenovirus El and E4 or El and E2a functions. Such cells are preferably derived from renal or retinal cells, or human lung carcinoma.

따라서, 본 발명은 특히 유리한 재조합 아데노바이러스의 생성방법을 제공한다. 이러한 방법은 하나 이상의 영역에 결손이 있는 재조합 바이러스, 특히 E1 영역에 대해 또는 E1 및 E4 영역에 대해 결손이 있는 바이러스의 생성에 적합하다. 또한, 상기에 지적된 바와 같이 이것을 다양한 혈청형의 아데노바이러스 생성에 적용할 수 있다.Accordingly, the present invention provides a method of producing a particularly advantageous recombinant adenovirus. This method is suitable for the production of recombinant viruses which are defective in one or more regions, in particular viruses which are defective for the El region or for the El and E4 regions. In addition, as noted above, this can be applied to the production of adenoviruses of various serotypes.

특히 유리한 양식에 따라서, 본 발명의 방법은 E1 영역이 Ad5 아데노바이러스 서열에서 뉴클레오티드 454에서 뉴클레오티드 3328을 스트렛칭하는 PvuII-BglII 단편의 결실에 의해서 불활성화되는 재조합 아데노바이러스의 생성에 사용된다. 이러한 서열은 문헌 및 데이터베이스에서 접근하기 쉽다 (특히 Genebank 제 M73260 참조). 다른 바람직한 양태에서, E1 영역은 뉴클레오티드 382에서 뉴클레오티드 3446을 스트렛칭하는 HindfII-Sau3A 단편의 결실에 의해서 불활성화된다. 특정 양식에서, 방법은 E4 영역 전체의 결실을 포함하는 벡터의 생성을 허용한다. 이것은 뉴클레오티드 35935에서 32720에 상응하는 MaeII-MscI 단편의 절제에 의해서 수행될 수 있다. 다른 양식에서, E4의 작용부만이 결실된다. 이러한 부분은 적어도 ORF3 및 ORF6 프레임을 포함한다. 실시예에 의해서, 이러한 판독 프레임이 뉴클레오티드 34801에서 34329 및 34115에서 33126 각각에 상응하는 pvuII-AluI 및 BglII-PvuII 단편 각각의 형태로 게놈으로부터 결실될 수 있다. 바이러스 Ad2 dl808 또는 바이러스 Ad5 dl1004, Ad5 dl1007, Ad5 dl1011 또는 Ad5 dl1014의 E4 영역의 결실이 또한 본 발명 프레임워크 내에 사용될 수 있다. 이에 관하여, 본 발명의 세포는 불활성 E1 영역과 Ad5 dl1014의 게놈에 존재하는 유형의 E4 영역에 결실을 포함하는 바이러스, 즉, 판독 프레임 ORF4를 전환하는 E4-바이러스 생성에 특히 유리하다.According to a particularly advantageous mode, the method of the present invention is used for the production of recombinant adenovirus in which the El region is inactivated by deletion of the PvuII-BglII fragment stretching nucleotide 3328 to nucleotide 3328 in the Ad5 adenovirus sequence. Such sequences are easy to access in literature and databases (see in particular Genebank No. M73260). In another preferred embodiment, the El region is inactivated by the deletion of a HindfII-Sau3A fragment that stretches nucleotide 3446 at nucleotide 382. In certain modalities, the method allows for the generation of a vector comprising deletions throughout the E4 region. This can be done by excision of the MaeII-MscI fragment corresponding to 32720 at nucleotides 35935. In another form, only the functional site of E4 is deleted. This portion includes at least ORF3 and ORF6 frames. By way of example, such a reading frame may be deleted from the genome in the form of pvuII-AluI and BglII-PvuII fragments, respectively, corresponding to nucleotides 34801 at 34329 and 34115 at 33126, respectively. Deletion of the E4 region of virus Ad2 dl808 or virus Ad5 dl1004, Ad5 dl1007, Ad5 dl1011 or Ad5 dl1014 can also be used within the framework of the invention. In this regard, the cells of the present invention are particularly advantageous for the production of viruses comprising deletions in the inactive El region and in the E4 region of the type present in the genome of Ad5 dl1014, ie E4 - viruses which convert the reading frame ORF4.

상기에 지적된 바와 같이, E1 영역의 결실은 유리하게는 모두 또는 일부의 E1A 및 E1B 영역을 포함한다. 이러한 결실은 세포내 자발적인 복제가 불가능한 바이러스가 되도록 하기에 충분해야 한다. 본 발명에 따른 아데노바이러스에서 결실된 일부의 E1 영역은 유리하게는 뉴클레오티드 454에서 3328 또는 382에서 3446을 포함한다.As pointed out above, deletion of the El region advantageously includes all or a portion of the El and El regions. This deletion should be sufficient to make the virus impossible for spontaneous replication within the cell. Some of the El regions deleted in the adenovirus according to the invention advantageously comprise nucleotides 454 at 3328 or 382 at 3446.

상기에 해당하는 위치는 데이터베이스 상에서 공개되고 접근이 가능한 야생형 Ad5 아데노바이러스 서열을 의미한다. 소수 변형이 다양한 아데노바이러스 혈청형 사이에 존재할 수 있지만, 이러한 위치는 일반적으로 혈청형으로부터 본 발명에 따른 재조합 아데노바이러스, 및 특히 아데노바이러스 Ad2 및 Ad7의 작제에 적용할 수 있다.The corresponding positions refer to wild type Ad5 adenovirus sequences that are published and accessible on a database. Although minor modifications may exist between the various adenovirus serotypes, this position is generally applicable to the construction of recombinant adenoviruses according to the invention from the serotypes, and in particular adenoviruses Ad2 and Ad7.

또한, 생성된 아데노바이러스는 이러한 게놈에 기타 변형을 지닐 수 있다. 특히, 기타 영역이 바이러스의 능력을 증가시키고 바이러스 유전자의 발현에 연결된 부작용을 감소시키기 위해서 결실될 수 있다. 따라서, 모든 또는 일부의 E3 또는 Iva2 영역이 특히 결실될 수 있다. 그러나, E3 영역에 관하여, gp19K 단백질을 암호화하는 부분을 전환함이 특히 유리할 수 있다. 사실상 이러한 단백질은 아데노바이러스 벡터가 (i) 이의 작용을 제한하고 (ii) 바람직하지 못한 부작용을 지닐 수 있는 면역 반응의 주제가 되지 못하게 함을 가능하게 한다. 특정 양식에 따라서, E3 영역이 결실되고 gp19K 단백질을 암호화하는 서열이 이종 프로모터의 조절 하에서 재도입된다.In addition, the resulting adenovirus may have other modifications to this genome. In particular, other regions may be deleted to increase the ability of the virus and to reduce the side effects linked to the expression of viral genes. Thus, all or part of the E3 or Iva2 region may be particularly deleted. However, with respect to the E3 region, it may be particularly advantageous to switch the portion encoding the gp19K protein. Indeed such proteins make it possible for adenovirus vectors to (i) limit their action and (ii) not be the subject of an immune response that may have undesirable side effects. According to certain modalities, the E3 region is deleted and the sequence encoding the gp19K protein is reintroduced under the control of a heterologous promoter.

상기에 지적된 바와 같이, 아데노바이러스는 유전자 및 세포 치료 적용에 매우 효율적인 유전자 전달용 벡터를 구성한다. 이를 위해서, 세포, 기관 또는 유기체로의 전달 및/또는 발현이 목적인 이종 핵산이 이의 게놈으로 삽입될 수 있다. 이러한 서열은 하나 이상의 치료 유전자, 예를 들면, 표적 세포에서의 전사 및 가능한 해독이 치료 효과를 갖는 산물을 생성하는 하나 이상의 치료 유전자를 함유할 수 있다. 치료 산물 중에서, 좀더 상세하게 효소, 혈액 유도체, 호르몬, 림포카인: 인터류킨, 인터페론, TNF 등 (FR 9203120), 생장 인자, 신경전달물질 또는 이의 전구체 또는 합성 효소, 영양 인자: BDNF, CNTF, NGF, IGF, GMF, aFGF, bFGF, NT3, NT5 등; 아포리포프로테인: ApoAI, ApoAIV, ApoE 등 (WO 94/25073), 디스트로핀 또는 미니디스트로핀 (WO 93/06223), 종양 억제 유전자: p53, Rb, Rap1A, DCC, k-rev 등 (WO 94/24297), 응고에 수반되는 유전자 암호화 인자: 인자 VII, VIII, IX등, 자살 유전자: 티미딘 키나제, 시오신 디아미나제 등, 또는 모든 또는 일부의 천연 또는 인공 이뮤노글로불린(Fab, ScFv 등, WO94/29446) 등이 언급될 수 있다. 치료 유전자는 또한 표적 세포에서의 발현이 유전자 발현 또는 세포 mRNA 전사의 조절을 가능하게 하는 안티센스 유전자 또는 서열일 수 있다. 이러한 서열은 예를 들면, 표적 세포에서 세포 mRNA에 상보적인 RNA로 전사될 수 있고, 따라서 특허 EP 140 308에 기재된 기술에 따라서 단백질로의 해독을 억제할 수 있다. 치료 유전자는 또한 백신 생성을 위해 인간에게 면역 반응을 생성할 수 있는 항원 펩티드를 암호화하는 유전자일 수 있다. 이들은 특히 Epstein-Barr 바이러스, HIV 바이러스, 헤파티티스 B 바이러스 (EP 185 573), 슈도-라비즈 바이러스에 특이하거나 종양 (EP 259 212)에 특이한 항원 펩티드일 수 있다.As noted above, adenoviruses constitute vectors for gene delivery that are highly efficient for gene and cell therapeutic applications. To this end, heterologous nucleic acids intended for delivery and / or expression to a cell, organ or organism can be inserted into its genome. Such sequences may contain one or more therapeutic genes, eg, one or more therapeutic genes whose transcription and possible translation in a target cell produces a product having a therapeutic effect. Among the therapeutic products, enzymes, blood derivatives, hormones, lymphokines: interleukin, interferon, TNF, etc. (FR 9203120), growth factors, neurotransmitters or precursors or synthetases thereof, nutritional factors: BDNF, CNTF, NGF , IGF, GMF, aFGF, bFGF, NT3, NT5 and the like; Apolipoproteins: ApoAI, ApoAIV, ApoE, etc. (WO 94/25073), dystrophin or minidystrophin (WO 93/06223), tumor suppressor genes: p53, Rb, Rap1A, DCC, k-rev, etc. (WO 94/24297) , Gene coding factors involved in coagulation: Factors VII, VIII, IX, etc. Suicide genes: thymidine kinase, Shiosin deaminase, etc., or all or part of natural or artificial immunoglobulins (Fab, ScFv et al., WO94 / 29446) may be mentioned. The therapeutic gene may also be an antisense gene or sequence whose expression in the target cell allows for regulation of gene expression or cellular mRNA transcription. Such sequences can, for example, be transcribed into RNA complementary to cellular mRNA in the target cell and thus inhibit translation into proteins according to the techniques described in patent EP 140 308. The therapeutic gene may also be a gene encoding an antigenic peptide capable of generating an immune response in humans for vaccine production. These may be antigen peptides specific for the Epstein-Barr virus, HIV virus, Hepatitis B virus (EP 185 573), Pseudo-Raviz virus or for tumors (EP 259 212).

일반적으로, 이종 핵산 서열은 또한 감염된 세포 및 해당 유전자 3'에 위치하는 영역에 작용성이고 전사 말단 시그널 및 폴리아데닐화 부위를 특화하는 전사 프로모터 영역을 포함한다. 이들 요소 모두가 발현 카세트를 구성한다. 프로모터 영역에 관하여, 이것은 프로모터가 감염된 세포에서 작용화할 수 있는 경우 고려되는 유전자의 발현을 자연적으로 책임지는 프로모터 영역일 수 있다. 이것은 또한 (기타 단밸질의 발현을 책임지는, 또는 심지어 합성인) 상이한 기원의 영역일 수 있다. 특히, 이들은 특정한 방식으로 또는 이와 달리 또는 유도성 방식으로 또는 이와 달리 유전자의 전사를 자극하거나 억제하는 진핵 또는 바이러스 유전자의 프로모터 서열 또는 유도된 프로모터 서열일 수 있다. 예로서, 감염시키기를 원하는 세포의 게놈 또는 바이러스의 게놈으로부터 유도된 프로모터 서열, 특히 아데노바이러스 MLP, E1A 유전자, RSV-LTR, CMV 프로모터 등일 수 있다. 진핵세포 프로모터 중에서, 편재성 프로모터 (HPRT, 비멘틴, α-액틴, 튜불린 등), 중간체 필라멘트의 프로모터(데스민, 뉴로필라멘트, 케라틴, GFAP 등), 치료 유전자의 프로모터 (MDR, CFTR, 인자 VIII 유형 등), 조직-특이 프로모터 (피루베이트 키나제, 빌린, 내장 지방산-결합 단백질을 위한 프로모터, 평활근 세포의 α-액틴을 위한 프로모터, 간에 대해 특이한 프로모터; Apo AI, Apo AII, 인간 알부민 등) 또는 이와 달리 자극에 반응하는 프로모터 (스테로이드 호르몬 수용체, 레티노산 수용체 등)가 또한 언급될 수 있다. 또한 이러한 발현 서열은 활성화 또는 조절 서열 또는 조직-특이적이거나 우세한 발현을 허용하는 서열의 첨가에 의해서 변형될 수 있다. 또한, 삽입된 핵산이 발현 서열을 함유하지 않을 경우, 이것은 이러한 서열의 결손 바이러스 하류의 게놈으로 삽입될 수 있다.In general, the heterologous nucleic acid sequence also includes a transcriptional promoter region that is functional in the infected cell and the region located in the gene 3 ′ and which specializes in transcriptional end signals and polyadenylation sites. All of these elements constitute an expression cassette. With regard to the promoter region, this may be a promoter region which is naturally responsible for the expression of the gene under consideration if the promoter can be functionalized in infected cells. It may also be a region of different origin (which is responsible for the expression of other proteins, or even synthetic). In particular, they may be promoter sequences or elicited promoter sequences of eukaryotic or viral genes that stimulate or inhibit transcription of the gene in a particular way or otherwise or in an inducible way or otherwise. By way of example, it may be a promoter sequence derived from the genome of the cell or virus genome desired to be infected, in particular adenovirus MLP, E1A gene, RSV-LTR, CMV promoter and the like. Among eukaryotic promoters, ubiquitous promoters (HPRT, bimentin, α-actin, tubulin, etc.), promoters of intermediate filaments (desmin, neurofilament, keratin, GFAP, etc.), promoters of therapeutic genes (MDR, CFTR, factor VIII) Types, etc.), tissue-specific promoters (pyruvate kinases, borrowers, promoters for visceral fatty acid-binding proteins, promoters for α-actin of smooth muscle cells, promoters specific for the liver; Apo AI, Apo AII, human albumin, etc.) or Alternatively, promoters that respond to stimulation (steroid hormone receptors, retinoic acid receptors, etc.) may also be mentioned. Such expression sequences can also be modified by addition of activation or regulatory sequences or sequences that allow tissue-specific or predominant expression. In addition, if the inserted nucleic acid does not contain an expression sequence, it may be inserted into the genome downstream of the viral deletion of this sequence.

또한, 이종 핵산 서열이 특히 치료 유전자의 상류에 표적 세포의 분비 경로에 합성된 치료 산물을 인도하는 시그널 서열을 함유할 수 있다. 이러한 시그널 서열은 치료 산물을 위한 천연 시그널 서열일 수 있지만, 이것은 또한 기타 작용성 시그널 서열 또는 인공적인 시그널 서열일 수 있다.In addition, the heterologous nucleic acid sequence may contain a signal sequence that, in particular, upstream of the therapeutic gene, directs the therapeutic product synthesized in the secretory pathway of the target cell. Such signal sequences may be natural signal sequences for therapeutic products, but they may also be other functional signal sequences or artificial signal sequences.

치료 유전자를 위한 발현 카세트는 선행 기술에 기재된 기술에 따라서, 재조합 아데노바이러스 게놈의 다양한 부위로 삽입될 수 있다. 이것은 무엇보다도 E1 결실의 수준에서 삽입될 수 있다. 이것은 또한 서열의 첨가 또는 치환으로서 E3 영역의 수준에서 삽입될 수 있다. 이것은 또한 결실된 E4 영역의 수준에서 위치될 수 있다.Expression cassettes for therapeutic genes can be inserted into various sites of the recombinant adenovirus genome, according to techniques described in the prior art. This can be inserted above all at the level of E1 deletion. It can also be inserted at the level of the E3 region as addition or substitution of sequences. It can also be located at the level of the deleted E4 region.

본 발명은 또한 본 발명 방법에 따라 수득된 정제된 바이러스 제조 및 본 발명에 따라서 제조된 하나 이상의 결손 재조합 아데노바이러스를 포함하는 약학 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 약학 조성물은 국부, 경구, 비경구, 비내, 전맥내, 근육내, 피하, 안내 또는 경피 투여 등을 위해 제형될 수 있다.The invention also relates to the preparation of the purified virus obtained according to the method of the invention and to a pharmaceutical composition comprising at least one defective recombinant adenovirus produced according to the invention. The pharmaceutical compositions of the present invention may be formulated for topical, oral, parenteral, nasal, intravenous, intramuscular, subcutaneous, intraocular or transdermal administration and the like.

바람직하게는, 약학 조성물은 주사 제형을 위해 약학적으로 허용되는 비히클을 함유한다. 이들은 특히 염수 (일나트륨 또는 이나트륨 포스페이트, 나트륨, 칼륨, 칼슘 또는 마그네슘 클로라이드 등, 또는 이러한 염의 혼합물), 멸균 또는 등장 용액, 또는 멸균수 또는 생리학적 식염수를 경우에 따라 첨가시, 주사액의 구성을 허용하는 건조, 특히 동결-건조 조성물일 수 있다. 예를 들면, 하이드로겔과 같은 기타 부형제가 사용될 수 있다. 이러한 하이드로겔이 생물호환성 및 비세포독성 중합체로부터 제조될 수 있다 (호모 또는 헤테로). 이러한 중합체가 예를 들면, WO 93/08845에 기재되어 있다. 이들 중에서 일부, 예를 들면, 특히 에틸렌 및/또는 프로필렌 옥사이드로부터 수득된 것들이 시판된다. 주사용으로 사용되는 바이러스 용량은 다양한 파라미터, 특히 사용되는 투여 양식, 관련 경로, 발현될 유전자 또는 바람직한 처리 기간에 따라서 조정될 수 있다. 일반적으로, 본 발명에 따른 재조합 아데노바이러스가 제형되고 104내지 1014pfu, 바람직하게는 106내지 1010pfu의 용량 형태로 투여된다. 용어 pfu (플라크 형성 단위)는 아데노바이러스 용액의 감염도에 상응하고, 적합한 세포 배양물을 감염시키고, 일반적으로 15 일 후 감염된 세포 플라크 수를 측정함으로써 측정된다. 바이러스 용액의 pfu 적정 측정기술이 문헌에 잘 기재되어 있다.Preferably, the pharmaceutical composition contains a pharmaceutically acceptable vehicle for injectable formulation. They are particularly suited to the composition of the injectable solution upon addition of saline (mono- or disodium phosphate, sodium, potassium, calcium or magnesium chloride, or mixtures of these salts), sterile or isotonic solutions, or sterile water or physiological saline, if desired. Acceptable drying, in particular freeze-drying compositions. For example, other excipients such as hydrogels can be used. Such hydrogels can be prepared from biocompatible and noncytotoxic polymers (homo or hetero). Such polymers are described, for example, in WO 93/08845. Some of these are commercially available, for example those obtained from ethylene and / or propylene oxide in particular. The viral dose used for injection can be adjusted according to various parameters, in particular the dosage form used, the relevant route, the gene to be expressed or the desired duration of treatment. In general, the recombinant adenovirus according to the invention is formulated and administered in a dosage form of 10 4 to 10 14 pfu, preferably 10 6 to 10 10 pfu. The term pfu (plaque forming unit) corresponds to the degree of infection of an adenovirus solution and is measured by infecting a suitable cell culture and generally measuring the number of infected cell plaques after 15 days. Techniques for measuring pfu titration of viral solutions are well described in the literature.

치료 유전자에 따라서, 이렇게 하여 생성된 바이러스가 유전적 질병(영양실조, 담낭 섬유증 등), 신경 퇴행성 질병(알츠하이머, 파킨슨, ALS 등), 암, 혈액응고 장애 또는 리포프로테인 장해에 연관된 병, 바이러스 감염 (헤파티티스, AIDS 등)에 연관된 병 등을 포함하여 다수의 병의 치료 또는 예방을 위해서 사용될 수 있다.Depending on the therapeutic gene, the virus produced in this way may be a genetic disease (malnutrition, gallbladder fibrosis, etc.), neurodegenerative diseases (Alzheimer's, Parkinson's, ALS, etc.), cancers, diseases associated with coagulation disorders or lipoprotein disorders, viral infections It can be used for the treatment or prophylaxis of many diseases, including diseases associated with (hepatitis, AIDS, etc.).

본 발명은 설명적이고 제한적이지 않은 것으로서 고려되어야 하는 하기의 실시예의 도움으로 좀더 완전히 기재될 것이다.The invention will be described more fully with the aid of the following examples which should be considered as illustrative and not restrictive.

Claims (32)

바이러스 DNA가 캡시드화 세포 배양액 중으로 도입되고 생성된 바이러스가 상등액 중으로의 방출 뒤에 수거됨을 특징으로 하는 재조합 아데노바이러스의 제조방법.A method for producing a recombinant adenovirus, characterized in that viral DNA is introduced into a capsidated cell culture and the resulting virus is collected after release into the supernatant. 제 1 항에 있어서, 수거가 바이러스의 적어도 50%가 상등액 중으로 방출되었을 때 수행됨을 특징으로 하는 방법.The method of claim 1, wherein the harvesting is performed when at least 50% of the virus is released into the supernatant. 제 1 항에 있어서, 수거가 바이러스의 적어도 70%가 상등액 중으로 방출되었을 때 수행됨을 특징으로 하는 방법.The method of claim 1, wherein the harvesting is performed when at least 70% of the virus is released into the supernatant. 제 1 항에 있어서, 수거가 바이러스의 적어도 90%가 상등액 중으로 방출되었을 때 수행됨을 특징으로 하는 방법.The method of claim 1, wherein the harvesting is performed when at least 90% of the virus is released into the supernatant. 제 1 항에 있어서, 바이러스가 한외여과에 의해 수거됨을 특징으로 하는 방법.The method of claim 1, wherein the virus is harvested by ultrafiltration. 제 5 항에 있어서, 한외여과가 접선 한외여과임을 특징으로 하는 방법.6. The method of claim 5 wherein the ultrafiltration is tangential ultrafiltration. 제 5 항 또는 6 항에 있어서, 한외여과가 1000 kDa 이하의 컷 오프를 갖는 막에서 수행됨을 특징으로 하는 방법.7. Method according to claim 5 or 6, characterized in that ultrafiltration is carried out on the membrane with a cut off of 1000 kDa or less. 제 1 항에 있어서, 바이러스가 음이온 교환 크로마토그래피로 수거됨을 특징으로 하는 방법.The method of claim 1 wherein the virus is harvested by anion exchange chromatography. 제 8 항에 있어서, 음이온 교환 크로마토그래피가 강 음이온 교환 크로마토그래피임을 특징으로 하는 방법.9. The method of claim 8, wherein the anion exchange chromatography is strong anion exchange chromatography. 제 9 항에 있어서, 강 음이온 교환 크로마토그래피가 수지 Source Q, Mono Q, Q 세파로스, Poros HQ 및 Poros QE, Fractogel TMAE 유형의 수지 및 Toyopearl 슈퍼 Q 중에서 선택된 지지체상에서 수행됨을 특징으로 하는 방법.10. The method of claim 9, wherein the strong anion exchange chromatography is performed on a support selected from resins Source Q, Mono Q, Q Sepharose, Poros HQ and Poros QE, resins of the Fractogel TMAE type and Toyopearl Super Q. 제 1 항에 있어서, 바이러스가 겔 투과 크로마토그래피에 의해 수거됨을 특징으로 하는 방법.The method of claim 1, wherein the virus is harvested by gel permeation chromatography. 겔 투과 크로마토그래피가 겔 세파크릴 S-500 HR, 세파크릴 S-1000 SF, 세파크릴 S-1000 HR, 세파크릴 S-2000, 슈퍼덱스 200 HR, 세파로스 2B, 4B 또는 6B 및 TSK G6000 PW 중에서 선택된 지지체상에서 수행됨을 특징으로 하는 방법.Gel permeation chromatography was performed on gel Sephacryl S-500 HR, Sephacryl S-1000 SF, Sephacryl S-1000 HR, Sephacryl S-2000, Superdex 200 HR, Sepharose 2B, 4B or 6B and TSK G6000 PW. Characterized in that it is carried out on a selected support. 제 1 항에 있어서, 바이러스가 한외여과를 하여 수거한 뒤에 음이온 교환 크로마토그래피를 수행함을 특징으로 하는 방법.2. The method of claim 1, wherein the virus is harvested by ultrafiltration followed by anion exchange chromatography. 제 13 항에 있어서, 바이러스가 한외여과를 하여 수거한 뒤에 음이온 교환 크로마토그래피를 수행한 다음 겔 투과 크로마토그래피를 수행함을 특징으로 하는 방법.The method according to claim 13, wherein the virus is collected by ultrafiltration followed by anion exchange chromatography followed by gel permeation chromatography. 제 1 항 내지 14 항 중 어느 한 항에 있어서, 캡시드화 세포가 아데노바이러스 E1 기능을 트랜스상보화하는 세포임을 특징으로 하는 방법.The method according to any one of claims 1 to 14, wherein the capsidated cells are cells that trans complement the adenovirus E1 function. 제 15 항에 있어서, 캡시드화 세포가 아데노바이러스 E1 및 E4 기능을 트랜스상보화함을 특징으로 하는 방법.The method of claim 15, wherein the capsidated cells trans complement complement adenovirus E1 and E4 functions. 제 15 항에 있어서, 캡시드화 세포가 아데노바이러스 E1 및 E2a 기능을 트랜스상보화함을 특징으로 하는 방법.16. The method of claim 15, wherein the capsidated cells trans complement complement adenovirus E1 and E2a functions. 제 15 항 내지 제 17 항 중 어느 한 항에 있어서, 세포가 배아 인간 신장 세포, 인간 망막아세포 또는 인간 암종으로부터의 세포임을 특징으로 하는 방법.18. The method of any one of claims 15 to 17, wherein the cells are cells from embryonic human kidney cells, human retinal cells or human carcinoma. 강 음이온 교환 크로마토그래피에 의한 정제단계를 포함함을 특징으로 하는, 생물학적 배지로부터 재조합 아데노바이러스의 정제방법.A method for purifying recombinant adenovirus from a biological medium, comprising the step of purifying by strong anion exchange chromatography. 제 19 항에 있어서, 생물학적 배지가 바이러스를 생성하는 캡시드화 세포의 상등액임을 특징으로 하는 방법.20. The method of claim 19, wherein the biological medium is a supernatant of capsidated cells producing a virus. 제 19 항에 있어서, 생물학적 배지가 바이러스를 생성하는 캡시드화 세포의 용해물임을 특징으로 하는 방법.20. The method of claim 19, wherein the biological medium is a lysate of capsidated cells that produce a virus. 제 19 항에 있어서, 생물학적 배지가 바이러스의 예비정제 용액임을 특징으로 하는 방법.20. The method of claim 19, wherein the biological medium is a prepurification solution of the virus. 제 19 항에 있어서, 크로마토그래피가 4급 아민으로 작용화된 지지체에서 수행됨을 특징으로 하는 방법.20. The method of claim 19, wherein the chromatography is performed on a support functionalized with a quaternary amine. 제 23 항에 있어서, 지지체가 아가로스, 덱스트란, 아크릴아미드, 실리카, 폴리[스티렌-디비닐벤젠], 에틸렌글리콜-메타크릴레이트 공중합체 중에서 선택되어 단독으로 또는 이들의 혼합물로 사용됨을 특징으로 하는 방법.24. The method of claim 23, wherein the support is selected from agarose, dextran, acrylamide, silica, poly [styrene-divinylbenzene], ethylene glycol-methacrylate copolymer and used alone or in a mixture thereof. How to. 제 24 항에 있어서, 크로마토그래피가 수지 Source Q, Mono Q, Q 세파로스, Poros HQ, Poros QE, Fractogel TMAE 및 Toyopearl 슈퍼 Q 중에서 선택된 지지체상에서 수행됨을 특징으로 하는 방법.25. The method of claim 24, wherein the chromatography is performed on a support selected from Resin Source Q, Mono Q, Q Sepharose, Poros HQ, Poros QE, Fractogel TMAE, and Toyopearl Super Q. 제 25 항에 있어서, 크로마토그래피가 Source Q 수지, 바람직하게는 Q15상에서 수행됨을 특징으로 하는 방법.The process according to claim 25, wherein the chromatography is carried out on a Source Q resin, preferably Q15. 제 19 항에 있어서, 예비 한외여과 단계를 포함함을 특징으로 하는 방법.20. The method of claim 19, comprising a preliminary ultrafiltration step. 제 27 항에 있어서, 한외여과가 300 내지 500 kDa의 컷 오프를 갖는 막에서의 접선 한외여과임을 특징으로 하는 방법.28. The method of claim 27, wherein the ultrafiltration is tangential ultrafiltration in a membrane having a cut off of 300 to 500 kDa. 제 1 항 또는 19 항의 방법에 따라 수득된 정제된 바이러스 제제.Purified virus preparation obtained according to the method of claim 1. 제 29 항에 따른 바이러스 제제 및 약학적으로 허용되는 비히클을 함유하는 약학 조성물.A pharmaceutical composition comprising the viral preparation according to claim 29 and a pharmaceutically acceptable vehicle. 아이오딕사놀, 5,5′-[(2-하이드록시-1,3-프로판디일)비스(아세틸이미노)]비스[N,N′-비스(2,3-디하이드록시프로필)-2,4,6-트리아이오도-1,3-벤젠카복사미드]의 아데노바이러스 정제를 위한 용도.Iodixanol, 5,5 '-[(2-hydroxy-1,3-propanediyl) bis (acetylimino)] bis [N, N'-bis (2,3-dihydroxypropyl) -2 , 4,6-triiodo-1,3-benzenecarboxamide] for adenovirus purification. 초원심분리의 제 1 단계, 희석 또는 투석의 제 2 단계, 및 음이온 교환 크로마토그래피의 제 3 단계를 포함하는, 생물학적 배지로부터 아데노바이러스의 정제방법.A method for purifying adenovirus from biological media, comprising a first step of ultracentrifugation, a second step of dilution or dialysis, and a third step of anion exchange chromatography.
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