KR20000014502A - Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase promoter gene derived from pichia ciferrii and a process for manufacturing taps using thereof - Google Patents

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Abstract

PURPOSE: Glyceraldehyde-3-phsphate dehydrogenase (GAPDH) promoter gene isolated from GAPDH gene coding glyceraldehyde-3-phsphate dehydrogenase derived from pichia ciferrii is able to increase yield of tetraacetyl phytosphingosine(TAPS) by amplifying LCB2 gene. CONSTITUTION: Tetraacetyl phytosphingosine(TAPS) is produced by cultivating transformant pichia ciferrii transformed with plasmid containing ribosome DNA derived from pichia ciferrii, CYH gene with resistance to antibiotic cycloheximide, glyceraldehyde-3-phsphate dehydrogenase(GAPDH) promoter gene, LCB2 gene coding serine palmitoyl transferase derived from pichia ciferrii and by extracting tetraacetyl phytosphingosine from culture media.

Description

피치아 시페리 유래의 글리세르알데히드-3-인산 탈수소효소 프로모터 유전자 및 이를 이용한 TAPS 생산방법Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase promoter gene derived from peach ciferi and method for producing TAPS using the same

본 발명은 피치아 시페리(Pichia ciferrii) ATCC 14091 유래의 글리세르알데히드-3-인산 탈수소효소(GAPDH : glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase) 프로모터 유전자, 이 프로모터 유전자를 포함하는 플라스미드 prACGL2(KCTC-0498BP)와 prHECGL2(KCTC-0511BP), 이에 의해 형질전환된 피치아 시페리 형질전환체 및 이를 배양하여 세라미드의 원료인 테트라아세틸 피토스핑고신(TAPS : tetraacetyl phytosphingosine)을 대량 생산하는 방법에 관한 것이다.The present invention is a glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) promoter gene derived from Pichia ciferrii ATCC 14091, plasmid prACGL2 (KCTC-0498BP) comprising the promoter gene. And prHECGL2 (KCTC-0511BP), and transformed by the chia ciferi transformant and a method for producing a large amount of tetraacetyl phytosphingosine (TAPS: tetraacetyl phytosphingosine) by culturing it.

세라미드(ceramides)는 피부 표층(stratum corneum)에서 이중사슬 라멜라 구조에 의해 피부 표면에 결합되어 매끄럽고 탄력성 있는 피부를 유지시켜 주며, 피부를 보호하고 피부건조를 방지하는 효능을 갖고 있어 기능성 화장품에 사용되어 왔다. 그 구조를 보면 수산화된 2차 아민(hydroxylated secondary amine)에 고급 지방산이 아미드 결합으로 연결되어 있으며, 이러한 화합물질들을 통칭하여 세라미드라 하며, 스핑고지질(sphingolipids)에 속한다{유럽특허-B-097,059호}.Ceramides are bonded to the surface of the skin by the double-chain lamellar structure in the stratum corneum to keep the skin smooth and elastic, and it is used in functional cosmetics as it protects the skin and prevents skin drying. come. Its structure is linked to hydroxylated secondary amines with higher fatty acids linked by amide bonds, and these compounds are collectively called ceramides and belong to sphingolipids. {European Patent-B-097,059 number}.

세라미드를 포함하는 스핑고지질은 유핵세포의 원형질막에 존재하며, 동물의 경우에는 세포-세포의 인식, 세포의 성장이나 분화를 조절하는 기능을 갖고 있다. 스핑고지질의 분해물인 스핑고신, 스핑고신-1-인산, 리소스핑고지질, 세라미드 등은 신호전이체계에서 2차 메신저 역할을 한다{Nagiec et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91, 7899, 1994}.Sphingolipids, including ceramides, are present in the plasma membrane of nucleated cells, and in animals, have functions to regulate cell-cell recognition, cell growth or differentiation. Sphingosine, sphingosine-1-phosphate, lysphingolipids, and ceramides, which are decomposed products of sphingolipids, act as secondary messengers in the signal transduction system {Nagiec et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91, 7899, 1994}.

상술한 바와 같이, 세라미드는 다양한 생리활성을 갖고 있음에도 불구하고, 천연 동식물 및 미생물에 극미량으로 존재하여, 이를 추출법에 의해 공급하는 경우 경제적 부담이 매우 크다.As described above, although ceramides have various physiological activities, they are present in extremely small amounts in natural plants and animals and microorganisms, and when they are supplied by extraction, the economic burden is very high.

반면, TAPS를 포함한 피토스핑고신(phytosphingosine)은 세라미드와 마찬가지로 피부 보호, 피부건조 방지 등의 유효 효능을 나타낼 뿐만 아니라, 다양한 미생물에 의해 생산되어 천연원료 확보가 용이하다. 또한, N-아실화반응에 의해 세라미드로 용이하게 전환되기 때문에 세라미드의 원료로서도 유용하다.On the other hand, phytosphingosine, including TAPS, not only shows effective effects such as skin protection and skin drying prevention, like ceramides, but is also produced by various microorganisms to facilitate natural raw materials. It is also useful as a raw material of ceramide because it is easily converted to ceramide by N-acylation.

특히, 피치아 시페리는 피토스핑고신류인 TAPS를 생산하여 세포 밖으로 분비하는 특징을 갖고 있어, 그 이용성이 높다{Barenholz et al., Biochem. Biophys. Acta, 248, 458, 1971; ibid, 306, 341, 1973}. 그러나, 야생종인 피치아 시페리 ATCC 14091 및 F-60-10(NRRL 1301) 균주의 TAPS 생산량은 미량이어서{Wickerham & Burton, J. Bacteriol., 80, 484, 1960}, 이들 균주의 TAPS 생산량을 증가시키기 위한 변이주 개발이 활발히 진행되고 있다{미국특허 5,618,706호}. 본 발명자들도 TAPS 생산량이 증가되고 발효기간도 단축되어 생산성이 크게 향상된 변이주(KFCC-10937)를 개발하여 특허출원한 바 있다{한국특허출원 96-67997호}.In particular, peach ciferi produces TAPS, which is a phytosphingosine, and has a characteristic of being secreted out of cells, and thus its availability is high {Barenholz et al., Biochem. Biophys. Acta, 248, 458, 1971; ibid, 306, 341, 1973}. However, the TAPS production of wild strains of Peachia ciperi ATCC 14091 and F-60-10 (NRRL 1301) was very low (Wickerham & Burton, J. Bacteriol., 80, 484, 1960), which produced The development of mutant strains to increase the number is active {US 5,618,706}. The present inventors have also applied for a patent application by developing a mutant strain (KFCC-10937) having a significantly improved productivity due to an increase in TAPS production and a shortened fermentation period (Korean Patent Application No. 96-67997).

계속해서 본 발명자들은 개발된 피치아 시페리 KFCC-10937의 TAPS 생산성을 더욱 증가시키기 위하여 유전공학적으로 접근하게 되었고, 그 결과 야생균주인 피치아 시페리 ATCC 14091로부터 TAPS를 포함한 피토스핑고신의 생합성에 관여하는 세린 팔미토일 트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자 LCB2를 클로닝하고(서열 1), 이 유전자를 변이주 KFCC-10937에 형질전환하여, 형질전환체의 증가된 TAPS 생산성(모균주 KFCC-10937에 비하여 최소 1.3배의 TAPS 생산능)을 확인하고, 「피치아 시페리 유래의 세린 팔미토일 트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자 LCB2를 포함하는 플라스미드 prACL2(KCTC-0468BP) 및 이에 의해 형질전환되어 향상된 TAPS 생산능을 갖는 형질전환체」에 관하여 특허출원한 바 있다{한국특허출원 98-16309호}.Subsequently, the present inventors have approached genetic engineering to further increase the TAPS productivity of the developed Pchia ciferi KFCC-10937. As a result, the biosynthesis of phytosphingosine including TAPS from wild strain Pchia ciferi ATCC 14091. Cloning the gene LCB2 encoding the serine palmitoyl transferase involved in (SEQ ID NO: 1) and transforming the gene into variant KFCC-10937, resulting in increased TAPS productivity of the transformants (minimum compared to parent strain KFCC-10937). 1.3 times the TAPS production capacity) and confirmed that the plasmid prACL2 (KCTC-0468BP) comprising the gene LCB2 encoding serine palmitoyl transferase derived from Pichia ciferi and thereby transformed with improved TAPS production capacity Transformant "has been applied for a patent {Korean Patent Application No. 98-16309).

나아가, 본 발명자들은 TAPS 생산능이 더욱 향상된 피치아 시페리를 제공하기 위하여 계속적으로 연구하던 중, 피치아 시페리의 GAPDH 프로모터 유전자를 클로닝하게 되었으며, 이를 이용하는 경우 LCB2 유전자의 발현을 증폭시켜 TAPS의 생산량을 증가시킬 수 있을 것으로 기대되어 본 발명을 완성하게 되었다.Furthermore, the inventors of the present invention, while continuing to study to provide a more improved Peachia Cipari TAPS production capacity, cloned the GAPDH promoter gene of Peachia Ciperi, when using this amplified the expression of the LCB2 gene yield of TAPS It is expected that this can be increased to complete the present invention.

따라서, 본 발명의 목적은 피치아 시페리 유래의 글리세르알데히드-3-인산 탈수소효소(GAPDH) 및 GAPDH 프로모터에 대한 유전정보를 제공하는 것이다.Accordingly, it is an object of the present invention to provide genetic information for glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) and GAPDH promoters derived from pichia ciferi.

본 발명의 다른 목적은 피치아 시페리 유래의 GAPDH 프로모터 유전자와, 피치아 시페리 유래의 세린 팔미토일 트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자를 포함하는 플라스미드 prACGL2와 prHECGL2 및 이에 의해 형질전환되어 향상된 TAPS 생산능을 갖는 형질전환체를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is a plasmid prACGL2 and prHECGL2 comprising a GAPDH promoter gene derived from pichia ciferi, and a gene encoding serine palmitoyl transferase derived from pichia ciferi, and thereby transformed to improve TAPS production ability. It is to provide a transformant having.

또한, 본 발명의 또다른 목적은 상기한 형질전환된 피치아 시페리로부터 TAPS를 대량 생산하는 방법을 제공하는 것이다.It is still another object of the present invention to provide a method for mass production of TAPS from the transformed pichia ciferi.

도 1은 피치아 시페리 유래의 GAPDH 유전자의 제한효소지도이며, 화살표의 방향과 길이는 염기서열 결정방향 및 염기서열 결정정도를 나타낸다.Figure 1 is a restriction map of the GAPDH gene derived from chia ciferi, the direction and length of the arrow indicates the direction of nucleotide sequence determination and the degree of nucleotide sequence determination.

도 2는 플라스미드 prACGL2의 제작방법 및 제한효소 지도이다.2 is a method for constructing plasmid prACGL2 and a restriction map.

도 3은 플라스미드 prHECGL2의 제작방법 및 제한효소 지도이다.3 is a method for constructing plasmid prHECGL2 and a restriction map.

도 4는 형질전환체에서 삽입된 LCB2 유전자의 카피수를 확인하기 위한 서던블럿 결과이다.4 is a Southern blot result for confirming the copy number of the LCB2 gene inserted in the transformant.

상기한 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 야생균주인 피치아 시페리 ATCC 14091로부터 글리세르알데히드-3-인산 탈수소효소(GAPDH)를 코딩하는 전체 유전자의 염기서열을 결정하고, 600bp 크기의 GAPDH 프로모터 유전자를 분리하였다.In order to achieve the above object, the present invention is to determine the nucleotide sequence of the entire gene encoding glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) from the wild strain Pchia siferi ATCC 14091, GAPDH promoter of 600bp size Gene was isolated.

1. 글리세르알데히드-3-인산 탈수소효소(GAPDH)를 코딩하는 유전자의 분리 :1. Isolation of the gene encoding glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH):

글리세르알데히드-3-인산 탈수소효소(GAPDH : glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)는 해당과정(glycolysis)에 관여하는 필수 효소로서, 글리세르알데히드-3-인산을 1,3-비스-포스포글리세린산(1,3-bis-phosphoglycerate)으로 전환시키며, 생체내에서 항상 발현된 상태로 있다. GAPDH 프로모터는 여러 가지 탄소원에 의해 발현유도과정이 영향을 받지 않기 때문에, 이러한 특성을 활용하기 위하여 유전자재조합 분야에서 활발히 연구가 진행되고 있다{Kniskern et al., Gene, 46, 135, 1986; Travis et al., J. Biol. Chem., 260, 4384, 1985; Hallewell et al., Biotechnol., 5, 363, 1987; Rosenberg et al., Method Enzymol., 185, 341, 1990; Waterham et al., Gene, 16, 37, 1997}.Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) is an essential enzyme involved in glycolysis. It is converted into (1,3-bis-phosphoglycerate) and is always expressed in vivo. Since the GAPDH promoter is not affected by the expression induction process by various carbon sources, active research is being conducted in the field of genetic recombination in order to utilize these characteristics {Kniskern et al., Gene, 46, 135, 1986; Travis et al., J. Biol. Chem., 260, 4384, 1985; Hallewell et al., Biotechnol., 5, 363, 1987; Rosenberg et al., Method Enzymol., 185, 341, 1990; Waterham et al., Gene, 16, 37, 1997}.

본 발명자들도 이러한 연구들을 기초로 하여 피치아 시페리의 GAPDH 프로모터 유전자를 클로닝하였으며, 이 GAPDH 프로모터에 의해 피치아 시페리의 TAPS를 포함한 피토스핑고신의 생합성에 관여하는 세린 팔미토일 트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자 LCB2의 발현이 증폭되는지를 확인하였다.Based on these studies, the present inventors also cloned the GAPDH promoter gene of pichia ciferi, and the serine palmitoyl transferase involved in the biosynthesis of phytosphingosine including TAPS of pichia ciferri by this GAPDH promoter. It was confirmed whether the expression of the encoding gene LCB2 was amplified.

본 발명자들은 사카로마이세스 세레비지아에(Saccharomyces cerevisiae) 2805 유래의 GAPDH 유전자를 사용하여 피치아 시페리 ATCC 14091의 게놈 DNA로부터 GAPDH 유전자를 클로닝하여 플라스미드 pGH2.2를 제작하였다. 피치아 시페리 ATCC 14091 유래의 GAPDH 유전자의 염기서열을 결정하였으며, 그 결과는 서열 2에 나타내었다. DNA 염기서열은 1998년 3월 7일자로 GenBank에 AF053300으로 등록하였다.The present inventors cloned the GAPDH gene from the genomic DNA of Peachia ciperi ATCC 14091 using GAPDH gene from Saccharomyces cerevisiae 2805 to produce plasmid pGH2.2. The base sequence of the GAPDH gene from Peachia ciperie ATCC 14091 was determined, and the result is shown in SEQ ID NO: 2. The DNA sequence was registered on GenBank as March 05, 1998 as AF053300.

염기서열을 비교하면, 피치아 시페리 ATCC 14091의 GAPDH 유전자는 1004bp 크기로 인트론은 없으며, 사카로마이세스 세레비시아에의 염기서열과는 69.3%가 일치하였고, 염기서열을 바탕으로 유추한 아미노산 서열도 사카로마이세스 세레비시아에의 아미노산 서열과 76.2%가 일치하였다. 이로써 피치아 시페리 ATCC 14091의 GAPDH 유전자 염기서열은 신규임을 알 수 있다.Comparing the nucleotide sequences, the GAPDH gene of Peachia ciperi ATCC 14091 was 1004 bp in size, without introns, and 69.3% identical to the nucleotide sequence of Saccharomyces cerevisiae. The sequence was also 76.2% identical to the amino acid sequence of Saccharomyces cerevisiae. It can be seen that the GAPDH gene sequence of the chia ciferi ATCC 14091 is novel.

2. GAPDH 프로모터 유전자의 분리 :2. Isolation of the GAPDH Promoter Gene:

플라스미드 pGH2.2와, 프라이머 :With plasmid pGH2.2, primers:

제한효소 EcoRⅤ 인식부위를 포함하는 프라이머 3Primer 3 containing restriction enzyme EcoRV recognition site 5'-GAT ATC TAC ATA CAA TTG ACC CAT AG-3'5'-GAT ATC TAC ATA CAA TTG ACC CAT AG-3 ' 제한효소 BamHⅠ 인식부위를 포함하는 프라이머 4Primer 4 containing restriction enzyme BamHI recognition site 5'-GGA TCC TTA ATT ATT TGT TTG TTT-3'5'-GGA TCC TTA ATT ATT TGT TTG TTT-3 '

를 PCR 반응시켜 600bp 크기의 피치아 시페리의 GAPDH 프로모터 유전자를 분리하였으며, pT7-Blue T-vector의 EcoRⅤ 위치에 삽입하여 플라스미드 pT7GH를 제작하였다.The PCR reaction was carried out to isolate the GAPDH promoter gene of 600 bp pitchia ciferi, was inserted into the EcoRV position of pT7-Blue T-vector to prepare a plasmid pT7GH.

3. 자체 프로모터를 제거한 LCB2 유전자의 분리 :3. Isolation of LCB2 gene from which its own promoter was removed:

플라스미드 pL2SA{한국특허출원 98-16309호}로부터 2.3kb 크기의 프로모터를 포함하지 않는 LCB2 유전자를 분리하여 플라스미드 pT7GH의 BamHⅠ 위치에 삽입하여 플라스미드 pGAL2를 제작하였다.The plasmid pGAL2 was prepared by separating the LCB2 gene from the plasmid pL2SA {Korean Patent Application No. 98-16309) without the 2.3 kb promoter and inserting it into the BamHI position of the plasmid pT7GH.

4. 발현벡터의 제작 :4. Construction of Expression Vectors:

플라스미드 pGAL2로부터 2.9kb 크기의 LCB2 유전자를 분리하여, 플라스미드 prHEC1.9F{한국특허출원 98-16309호}에 삽입하여 플라스미드 prACGL2를 제작하였다. 이 플라스미드는 피치아 시페리 유래의 리보좀 DNA, 항생제 시클로헥시미드(cycloheximide)에 대해 저항성을 갖는 CYHr유전자(L41), GAPDH 프로모터 유전자 및 LCB2 유전자의 순서로 연결된 형태를 이루고 있으며, 도 2에 기재된 제한효소지도를 갖는다. 이 플라스미드는 한국과학기술연구원 생명공학연구소내 유전자은행에 부다페스트 조약하의 규정에 따라 1998년 6월 25일자로 국제기탁하여 수탁번호 KCTC-0498BP호를 부여받았다.A 2.9 kb LCB2 gene was isolated from plasmid pGAL2 and inserted into plasmid prHEC1.9F (Korean Patent Application No. 98-16309) to prepare plasmid prACGL2. This plasmid is linked to the order of ribosome DNA derived from piacyferi, CYH r gene (L41), GAPDH promoter gene and LCB2 gene, which are resistant to the antibiotic cycloheximide. Has a restriction map as described. This plasmid was deposited internationally on June 25, 1998 to the Gene Bank of the Korea Institute of Science and Technology, under the provisions of the Budapest Treaty, and was assigned accession number KCTC-0498BP.

한편, 플라스미드 prACGL2를 사용하여 형질전환하는 경우, 리보좀 DNA 중의 한 곳을 절단하도록 제한효소를 처리하여 개환한 후 형질전환시키기 때문에, 형질전환체는 피치아 시페리 유래의 유전자 뿐만 아니라 대장균용 벡터가 함께 삽입되어 외래 유전자의 삽입을 배제할 수가 없다. 이에 플라스미드 prACGL2의 LCB2 유전자 뒤에 800bp의 리보좀 DNA 단편을 더 포함하는 형태로 플라스미드 prHECGL2를 제작하였다. 플라스미드 prHECGL2는 피치아 시페리 유래의 리보좀 DNA, 항생제 시클로헥시미드에 대해 저항성을 갖는 CYHr유전자(L41), GAPDH 프로모터 유전자, LCB2 유전자 및 피치아 시페리 유래의 리보좀 DNA의 순서로 연결된 형태를 이루고 있으며, 도 3에 기재된 제한효소지도를 갖는다. 이 플라스미드는 한국과학기술연구원 생명공학연구소내 유전자은행에 부다페스트 조약하의 규정에 따라 1998년 8월 10일자로 국제기탁하여 수탁번호 KCTC-0511BP호를 부여받았다. 플라스미드 prHECGL2를 사용하여 형질전환하는 경우, 양쪽의 리보좀 DNA 각각의 한 곳을 절단하도록 제한효소를 처리함으로써 형질전환체의 염색체에 외래 유전자가 삽입되는 것을 배제할 수 있다.On the other hand, when transforming using the plasmid prACGL2, the transformant is transformed by processing a ring enzyme by cleaving one of ribosomal DNA and then transforming the transformant. Inserted together, the insertion of foreign genes cannot be ruled out. The plasmid prHECGL2 was prepared in the form of further comprising an 800 bp ribosomal DNA fragment after the LCB2 gene of plasmid prACGL2. Plasmid prHECGL2 is linked to the sequence of ribosomal DNA derived from pichia ciferi, CYH r gene (L41), GAPDH promoter gene, LCB2 gene, and ribosomal DNA derived from pichia ciferi, which are resistant to antibiotic cycloheximide. And the restriction enzyme map shown in FIG. 3. The plasmid was deposited internationally on August 10, 1998 to the Gene Bank of the Korea Institute of Science and Technology, under the provisions of the Budapest Treaty, and was assigned accession number KCTC-0511BP. When transforming with the plasmid prHECGL2, foreign genes can be prevented from being inserted into the chromosome of the transformant by treating restriction enzymes to cut one of each of both ribosome DNAs.

5. 형질전환 :5. Transformation:

플라스미드 prACGL2와 prHECGL2를, 전압 500V, 정전용량 50㎌, 저항 800Ω의 조건에서 전기자극(electroporation)을 가하여, 생산균주인 피치아 시페리 KFCC-10937에 형질전환시켜, 플라스미드 prACL2(KCTC-0468BP){한국특허출원 98-16309호}를 대조군으로 하여 형질전환체를 선발하였다.Plasmids prACGL2 and prHECGL2 were subjected to electroporation under the conditions of a voltage of 500 mA, a capacitance of 50 mA, and a resistance of 800 mA, and transformed into the production strain Pchia ciferi KFCC-10937, and the plasmid prACL2 (KCTC-0468BP) { Transformant was selected using Korean Patent Application No. 98-16309} as a control.

6. 형질전환체의 발효에 의한 TAPS의 생산 :6. Production of TAPS by Fermentation of Transformants:

형질전환체를 YGM 최적배지 {글리세롤 100g/ℓ, 효모 추출물 2g/ℓ, KNO33g/ℓ, (NH4)2SO40.5g/ℓ, MgSO4·7H2O 0.3g/ℓ, NaCl 0.5g/ℓ, CSL 3g/ℓ, LS-300 1g/ℓ)에서 발효시켜 TAPS를 생산한다.The transformant was optimized for YGM medium {glycerol 100g / l, yeast extract 2g / l, KNO 3 3g / l, (NH 4 ) 2 SO 4 0.5g / l, MgSO 4 7H 2 O 0.3g / l, NaCl 0.5 g / L, CSL 3g / L, LS-300 1g / L) to produce TAPS.

본 발명에 의해 제공되는 플라스미드 prACGL2(KCTC-0498BP) 및 prHECGL2(KCTC-0511BP) 각각에 의해 형질전환된 형질전환체들은 모균주 KFCC-10937에 비하여 적어도 2.1배, 대조군인 플라스미드 prACL2(KCTC-0468BP)에 의해 형질전환된 형질전환체에 비하여 적어도 1.5배의 TAPS 생산능을 갖고 있다.Transformants transformed by the plasmids prACGL2 (KCTC-0498BP) and prHECGL2 (KCTC-0511BP) provided by the present invention are at least 2.1 times the control strain plasmid prACL2 (KCTC-0468BP) compared to the parent strain KFCC-10937. It has a TAPS production capacity of at least 1.5 times as compared to the transformant transformed by.

이하, 실시예를 참조하여 본 발명의 구성 및 작용효과를 보다 구체적으로 설명한다.Hereinafter, with reference to the embodiment will be described in more detail the configuration and effect of the present invention.

<실시예 1> GAPDH 유전자 클로닝을 위한 프로브의 제작 :Example 1 Preparation of a Probe for Cloning GAPDH Gene

프라이머 1 : 5'-ATG GTT AGA GTT GCT ATT AAC G-3'Primer 1: 5'-ATG GTT AGA GTT GCT ATT AAC G-3 '

프라이머 2 : 5'-AAG CCT TGG CAA TGT GTT CAA-3'를 합성하고 PCR을 수행하여 사카로마이세스 세레비지아에 2805(NIH R.B.Wickner로부터 분양받음)로부터 1kb 크기의 GAPDH 유전자를 분리하였고, 플라스미드 pT7-Blue T-vector(Novagen사 제품)의 EcoRⅤ 위치에 삽입하여 플라스미드 pT7-SGH를 제작하였다.Primer 2: 5'-AAG CCT TGG CAA TGT GTT CAA-3 'was synthesized and PCR was performed to isolate a 1kb size GAPDH gene from 2805 (available from NIH RBWickner) in Saccharomyces cerevisiae, The plasmid pT7-SGH was prepared by inserting at the EcoRV position of the plasmid pT7-Blue T-vector (manufactured by Novagen).

플라스미드 pT7-SGH를 제한효소 XbaⅠ과 SalⅠ으로 절단하여 0.9kb 크기의 유전자 단편을 DIG-라벨링 검출 킷트(labeling and detection kit, Boehringer Mannheim사 제품)를 사용하여 제품 매뉴얼에 따라 라벨링하여 프로브를 제작하였다.The plasmid pT7-SGH was digested with restriction enzymes Xba I and Sal I and the 0.9 kb gene fragment was labeled according to the product manual using a DIG-labeling detection kit (boehringer Mannheim) to produce a probe.

<실시예 2> 피치아 시페리 ATCC 14091의 게놈 DNA의 추출 :Example 2 Extraction of Genomic DNA of Peachia Peri ATCC 14091:

존스톤의 방법{Yeast Genetics, molecular aspects, pp. 107-123, IRL Press, 1988}에 따라 YEPD 배지(펩톤 2%, 효모 추출물 1%, 글루코스 2%)에서 배양한 피치아 시페리 ATCC 14091로부터 게놈 DNA를 추출하였다.Johnston's method {Yeast Genetics, molecular aspects, pp. 107-123, IRL Press, 1988}, genomic DNA was extracted from Peachia Peri ATCC 14091 incubated in YEPD medium (2% peptone, 1% yeast extract, 2% glucose).

<실시예 3> 피치아 시페리의 GAPDH 유전자의 분리 :Example 3 Isolation of GAPDH Gene of Pichia Ciferi

실시예 2의 DNA를 제한효소 BamHⅠ, EcoRⅠ, EcoRⅤ, HindⅢ, PstⅠ, SalⅠ으로 각각 처리하고, 0.9%의 아가로스 겔에서 전기영동한 다음, 나이트란 멤브레인(Nytran membrane, Schleicher & Schuell사 제품)으로 옮겨, 실시예 1에서 제작한 프로브와 서던블럿하였다.The DNA of Example 2 was treated with restriction enzymes BamHI, EcoRI, EcoRV, HindIII, PstI, SalI, respectively, and electrophoresed on 0.9% agarose gel, followed by a Nytran membrane (manufactured by Nytran membrane, Schleicher & Schuell). Then, the probe produced in Example 1 and Southern blot were carried out.

서던블럿 조건은 하이브리드액(5× SSC, 0.1%의 N-라우릴사르코신, 0.02%의 SDS, 2%의 블로킹제(blocking agent), 30%의 포름아미드)을 사용하여 42℃에서 6시간 반응시키는 것으로, Boehringer Mannheim사의 제품 매뉴얼에 따라 처리하였다.Southern blot conditions were 6 hours at 42 ° C. using a hybrid solution (5 × SSC, 0.1% N-laurylsarcosine, 0.02% SDS, 2% blocking agent, 30% formamide). The reaction was carried out according to the product manual of Boehringer Mannheim.

알칼리성 인산효소(alkaline phosphatase)가 결합된 항체를 투여한 후, BCIP와 X-포스페이트(X-phosphate)를 첨가하여 보라색으로 염색된 밴드를 관찰하였다. HindⅢ/EcoRⅠ으로 처리한 약 6kb 크기의 DNA 밴드에서 양성반응을 나타냈다.After administration of the antibody bound to alkaline phosphatase, alkaline bands were observed by adding BCIP and X-phosphate. The DNA band of about 6 kb treated with HindIII / EcoR I showed positive reaction.

밴드가 나타난 위치의 DNA를 추출하여 플라스미드 pBluescript KS+에 연결시킨 다음, 대장균 DH5α에 형질전환하여 라이브러리를 제작한 후, 이 라이브러리를 대상으로 서던블럿을 반복하여 6.0kb 크기의 플라스미드 pGH6.0을 선발하였고, 다시 2.2kb 크기의 AflⅢ/HindⅢ 단편으로 축소하여 플라스미드 pGH2.2를 제작하였다.DNA was extracted from the band and linked to plasmid pBluescript KS +, and transformed into E. coli DH5α to prepare a library. Repeated Southern blot was used to select 6.0kb plasmid pGH6.0. In addition, the plasmid pGH2.2 was prepared by reducing the size of the AflIII / HindIII fragment to 2.2 kb.

GAPDH 유전자의 제한효소 지도와 염기서열 결정방법은 도 1에 나타내었고, 그 결과를 서열 2에 나타내었다. 피치아 시페리의 GAPDH 유전자의 염기서열은 GenBank에 AF053300(98.3.7)으로 등록하였다.Restriction map and nucleotide sequence determination method of the GAPDH gene is shown in Figure 1, the results are shown in SEQ ID NO: 2. The nucleotide sequence of GAPDH gene of peach ciferi was registered in GenBank as AF053300 (98.3.7).

피치아 시페리 ATCC 14091의 GAPDH 유전자는 인트론이 없는 1004bp 크기로 사카로마이세스 세레비시아에의 염기서열과는 69.3%가 일치하였고, 아미노산 서열에서도 사카로마이세스 세레비시아에의 아미노산 서열과 76.2%가 일치하였다.GAPDH gene of Peachia ciperi ATCC 14091 is 1004bp without intron and is 69.3% identical to that of Saccharomyces cerevisiae, and the amino acid sequence of Saccharomyces cerevisiae 76.2% were in agreement.

<실시예 4> 피치아 시페리의 GAPDH 프로모터 유전자의 분리 :Example 4 Isolation of GAPDH Promoter Gene of Pichia Ciferi:

프라이머 3 : 5'-GAT ATC TAC ATA CAA TTG ACC CAT AG-3',Primer 3: 5'-GAT ATC TAC ATA CAA TTG ACC CAT AG-3 ',

프라이머 4 : 5'-GGA TCC TTA ATT ATT TGT TTG TTT-3'를 합성하고, 실시예 3에서 제작한 플라스미드 pGH2.2와 PCR 반응시켜 600bp 크기의 피치아 시페리의 GAPDH 프로모터 유전자를 분리하였으며, pT7-Blue T-vector의 EcoRⅤ 위치에 삽입하여 플라스미드 pT7GH를 제작하였다.Primer 4: 5'-GGA TCC TTA ATT ATT TGT TTG TTT-3 'was synthesized and subjected to PCR reaction with the plasmid pGH2.2 prepared in Example 3 to isolate the GAPDH promoter gene of 600 bp pichia ciferi, The plasmid pT7GH was constructed by inserting into the EcoRV position of pT7-Blue T-vector.

<실시예 5> 자체 프로모터가 제거된 LCB2 유전자의 분리 :<Example 5> Isolation of LCB2 gene from which its own promoter was removed:

프라이머 L2f : 5'-ATG AGT ACT CCT GCA AAC TA-3',Primer L2f: 5'-ATG AGT ACT CCT GCA AAC TA-3 ',

프라이머 L2r : 5'-TAA CAA AAT ACT TGT CGT CC-3'를 합성하고 PCR을 수행하여 1680bp의 사카로마이세스 세레비지아에 LCB2 유전자를 분리하였다. 913bp의 제한효소 SalⅠ 단편을 DIG-라벨링 검출 킷트(labeling and detection kit, Boehringer Mannheim사 제품)를 사용하여 제품 매뉴얼에 따라 라벨링하여 프로브를 제작하였다.Primer L2r: 5'-TAA CAA AAT ACT TGT CGT CC-3 'was synthesized and PCR was performed to isolate the LCB2 gene in 1680 bp Saccharomyces cerevisiae. A 913 bp restriction enzyme Sal I fragment was labeled according to the product manual using a DIG-labeling detection kit (product of Boehringer Mannheim) to prepare a probe.

실시예 2의 DNA를 제한효소 BamHⅠ, EcoRⅠ, EcoRⅤ, HindⅢ, PstⅠ, SalⅠ으로 각각 처리하고, 0.9%의 아가로스 겔에서 전기영동한 다음, 나이트란 멤브레인(Nytran membrane, Schleicher & Schuell사 제품)으로 옮겨, 위에서 제작한 프로브와 서던블럿하였다. 서던블럿 조건은 하이브리드액(5X SSC, 0.1%의 N-라우릴사르코신, 0.02%의 SDS, 2%의 블로킹제(blocking agent), 30%의 포름아미드)을 사용하여 42℃에서 6시간 반응시키는 것으로, Boehringer Mannheim사의 제품 매뉴얼에 따라 처리하였다. 알칼리성 인산효소(alkaline phosphatase)가 결합된 항체를 투여한 후, BCIP와 X-포스페이트(X-phosphate)를 첨가하여 보라색으로 염색된 밴드를 관찰하였다. HindⅢ로 처리한 12kb 크기의 DNA에서 양성반응을 나타냈다.The DNA of Example 2 was treated with restriction enzymes BamHI, EcoRI, EcoRV, HindIII, PstI, SalI, respectively, and electrophoresed on 0.9% agarose gel, followed by a Nytran membrane (manufactured by Nytran membrane, Schleicher & Schuell). It moved and Southern blot with the probe produced above. Southern blot conditions were reacted at 42 ° C. for 6 hours using a hybrid solution (5X SSC, 0.1% N-laurylsarcosine, 0.02% SDS, 2% blocking agent, 30% formamide). The treatment was carried out according to the product manual of Boehringer Mannheim. After administration of the antibody bound to alkaline phosphatase, alkaline bands were observed by adding BCIP and X-phosphate. Positive reaction was observed in 12 kb sized DNA treated with HindIII.

밴드가 나타난 위치의 DNA를 추출하여 플라스미드 pBluescript KS+에 연결시킨 다음, 대장균 DH5α에 형질전환하여 라이브러리를 제작한 후, 이 라이브러리를 대상으로 서던블럿을 반복하여 3.0kb 크기의 ScaⅠ/ AflⅢ 단편으로 축소하여 플라스미드 pL2SA을 제작하였다.DNA was extracted from the band and linked to the plasmid pBluescript KS +, transformed into E. coli DH5α to prepare a library, and the Southern blot was repeated for the library to be reduced to a 3.0kb ScaⅠ / AflIII fragment. Plasmid pL2SA was constructed.

플라스미드 pL2SA를 제한효소 AflⅢ로 처리하여 2.3kb 크기의 프로모터를 포함하지 않는 LCB2 유전자를 분리하였고, Klenow로 처리한 다음, BamHⅠ/Klenow로 처리한 플라스미드 pBluesript KS+에 옮겨 플라스미드 pL2B2.3을 제작하였다.Plasmid pL2SA was treated with restriction enzyme AflIII to isolate the LCB2 gene without the promoter of 2.3 kb size, treated with Klenow, and then transferred to plasmid pBluesript KS + treated with BamHI / Klenow to prepare plasmid pL2B2.3.

플라스미드 pL2B2.3을 다시 BamHⅠ으로 처리하여 2.3kb 크기의 LCB2 유전자를 분리하였고, 실시예 4의 플라스미드 pT7GH의 BamHⅠ 위치에 삽입하여 플라스미드 pGAL2를 제작하였다.Plasmid pL2B2.3 was again treated with BamHI to isolate an LCB2 gene of 2.3 kb in size, and was inserted at the BamHI position of plasmid pT7GH of Example 4 to prepare plasmid pGAL2.

<실시예 6> 발현벡터의 제작 :Example 6 Preparation of Expression Vector:

프라이머 CYH1 : 5'-CGC GTA GTT AAY GTN CCN AAR AC-3',Primer CYH1: 5'-CGC GTA GTT AAY GTN CCN AAR AC-3 ',

프라이머 CYH4 : 5'-GCC TGG CCY TTY TGY TTY TTN TC-3'을 합성하고, 실시예 2에서 추출한 피치아 시페리의 게놈 DNA와 PCR 반응시켜 약 300bp의 L41 유전자 단편을 분리하였고, 이 PCR 산물을 실시예 1의 방법으로 라벨링하여 프로브를 제작하였다.Primer CYH4: 5'-GCC TGG CCY TTY TGY TTY TTN TC-3 'was synthesized and subjected to PCR reaction with genomic DNA of Peachiaferi extracted in Example 2 to isolate the L41 gene fragment of about 300bp, this PCR product Probe was prepared by labeling by the method of Example 1.

피치아 시페리의 게놈 DNA와 서던블럿하였을 때, 제한효소 EcoRⅠ으로 처리한 게놈 DNA의 1.9kb 위치에서 밴드가 확인되었고, 1.9kb 크기의 EcoRⅠ DNA 단편을 추출하여 플라스미드 pBluescript KS+에 삽입하여 플라스미드 pCYH1.9를 제작하였다.When blotting with genomic DNA of Pchia ciferi, a band was identified at the position of 1.9 kb of genomic DNA treated with restriction enzyme EcoR I, and the 1.9 kb EcoR I DNA fragment was extracted and inserted into plasmid pBluescript KS +. 9 was produced.

프라이머 CH-f : GGT CAA ACC AAA CCA GTT TTC와,Primer CH-f: GGT CAA ACC AAA CCA GTT TTC,

프라이머 CH-r : ATG GAA AAC TTG TTT GGT TTG ACC를 합성하고,Primer CH-r: synthesizes ATG GAA AAC TTG TTT GGT TTG ACC,

유니버셜 프라이머(universal primer)와 프라이머 CH-r의 조합과, 리벌스 프라이머(reverse primer)와 프라이머 CH-f의 조합으로 Pfu DNA 중합효소를 이용하여 pCYH1.9을 주형으로 하는 PCR을 행하여 1.2kb와 0.7kb 크기의 PCR 산물을 확보하였다. 두 PCR 산물을 주형으로 유니버셜 프라이머와 리벌스 프라이머만을 사용하여 다시 PCR을 행하였다. 이렇게 하여 L41 유전자에서 56번 아미노산인 프롤린이 글루타민으로 치환된 상태인 플라스미드 pCYH1.9r를 제작하였다.The combination of the universal primer and the primer CH-r and the combination of the reverse primer and the primer CH-f were carried out by PCR using pfu DNA polymerase as a template for pCYH1.9 to 1.2kb and A PCR product of 0.7 kb size was obtained. Both PCR products were subjected to PCR again using only universal primers and regression primers as templates. Thus, plasmid pCYH1.9 r was prepared in which the proline amino acid 56 in the L41 gene was substituted with glutamine.

프라이머 18R : 5'-CAA TAA TTG CAA TGC TCT ATC CCC AGC ACG-3',Primer 18R: 5'-CAA TAA TTG CAA TGC TCT ATC CCC AGC ACG-3 ',

프라이머 26F : 5'-GGA TAT GGA TTC TTC ACG GTA ACG TAA CTG-3'를 합성하고, 실시예 2에서 추출한 피치아 시페리의 게놈 DNA와 PCR 반응시켜 6.0kb의 PCR 산물을 분리하였고, 이 PCR 산물을 실시예 1의 방법으로 라벨링하여 프로브를 제작하였다.Primer 26F: 5'-GGA TAT GGA TTC TTC ACG GTA ACG TAA CTG-3 'was synthesized and subjected to PCR reaction with genomic DNA of Peachiaferi extracted in Example 2 to isolate a 6.0 kb PCR product. The product was labeled by the method of Example 1 to prepare a probe.

피치아 시페리의 게놈 DNA와 서던블럿하였을 때, 제한효소 XhoⅠ으로 처리한 9kb 위치에서 밴드가 확인되었다. 밴드 위치에서 DNA를 추출한 다음 플라스미드 pBluescript KS+에 삽입하여 라이브러리를 만들었다. 서던블럿을 재차 수행하여 9kb 크기의 리보좀 DNA 단편을 함유하는 플라스미드 prDX9.0를 선별하였다.When Southern blot with genomic DNA of Peachia ciperi, a band was identified at the 9kb position treated with restriction enzyme XhoI. DNA was extracted from the band position and inserted into the plasmid pBluescript KS + to make a library. Southern blot was performed again to select plasmid prDX9.0 containing a 9 kb ribosomal DNA fragment.

플라스미드 prDX9.0을 제한효소 HindⅢ/EcoRⅠ으로 처리하여 얻은 1.4kb의 리보좀 DNA의 EcoRⅤ 위치에, 플라스미드 pCYH1.9r을 제한효소 EcoRⅠ/Klenow으로 처리하여 얻은 1.9kb의 CYHr유전자를 연결하여 플라스미드 prHEC1.9F를 제작하였다.Plasmid prHEC1 was linked to the 1.9 kb CYH r gene obtained by treatment of the plasmid pCYH1.9 r with the restriction enzyme EcoRI / Klenow to the EcoRV position of 1.4 kb ribosome DNA obtained by treatment of the plasmid prDX9.0 with the restriction enzyme HindIII / EcoRⅠ. .9F was produced.

실시예 5에서 제작한 플라스미드 pGAL2를 제한효소 EcoRⅤ와 XbaⅠ으로 처리하여 2.9kb 크기의 GAPDH 프로모터/LCB2 유전자를 분리하였고, 제한효소 Eco47Ⅲ와 XbaⅠ으로 처리하여 개환한 플라스미드 prHEC1.9F에 삽입하여 플라스미드 prACGL2를 제작하였다.The plasmid pGAL2 prepared in Example 5 was treated with restriction enzymes EcoRV and XbaI to isolate a 2.9 kb GAPDH promoter / LCB2 gene. The plasmid prACGL2 was inserted into plasmid prHEC1.9F, which was opened by treatment with restriction enzymes Eco47III and XbaI. Produced.

이상에서 제작한 플라스미드 prACGL2는 리보좀 DNA, CYHr유전자(L41), GAPDH 프로모터 유전자 및 LCB2 유전자의 순서로 연결되어 있는 형태이다.The plasmid prACGL2 produced in the above form is connected in the order of ribosomal DNA, CYH r gene (L41), GAPDH promoter gene and LCB2 gene.

이 플라스미드 prACGL2는 한국과학기술연구원 생명공학연구소내 유전자은행에 부다페스트 조약하의 규정에 따라 1998년 6월 25일자로 국제기탁하여 수탁번호 KCTC-0498BP호를 부여받았다.The plasmid prACGL2 was deposited internationally on June 25, 1998 to the Gene Bank of the Korea Institute of Science and Technology, under the provisions of the Treaty of Budapest, and was assigned accession number KCTC-0498BP.

또, 실시예 5에서 제작한 플라스미드 pGAL2를 제한효소 EcoRⅤ와 XbaⅠ으로 처리하여 얻은 2.9kb 크기의 LCB2 유전자를, 제한효소 Eco47Ⅲ와 XbaⅠ으로 처리하여 개환한 플라스미드 pCYH1.9r에 삽입하여 플라스미드 pCHGL2를 제작하였다. 이 플라스미드를 제한효소 EcoRⅤ/XbaⅠ/Klenow로 처리하여 얻은 4.6kb의 크기의 CYHr/GAPDH 프로모터/LCB2 유전자를, 플라스미드 prDX9.0을 제한효소 HindⅢ/EcoRⅠ으로 처리하여 얻은 1.4kb의 리보좀 DNA의 EcoRⅤ 위치에 삽입하여 플라스미드 prHECGL2를 제작하였다.In addition, a 2.9 kb LCB2 gene obtained by treating the plasmid pGAL2 prepared in Example 5 with the restriction enzymes EcoRV and XbaI was inserted into a plasmid pCYH1.9 r that was opened by treatment with the restriction enzymes Eco47III and XbaI to prepare plasmid pCHGL2. It was. This plasmid was treated with the restriction enzyme EcoRV / XbaI / Klenow, and the 4.6kb sized CYH r / GAPDH promoter / LCB2 gene was treated with plasmid prDX9.0 with the restriction enzyme HindIII / EcoRⅠ. Insertion into position produced the plasmid prHECGL2.

이상에서 제작한 플라스미드 prHECGL2는 플라스미드 prACGL2의 LCB2 유전자 뒤에 800bp 크기의 리보좀 DNA를 더 포함하고 있는 형태이다. 즉, 플라스미드 prHECGL2는 리보좀 DNA, CYHr유전자(L41), GAPDH 프로모터 유전자, LCB2 유전자 및 리보좀 DNA의 순서로 연결되어 있는 형태이다.The plasmid prHECGL2 produced above is a form further including 800 bp ribosomal DNA after the LCB2 gene of plasmid prACGL2. That is, the plasmid prHECGL2 is in the form of being linked in the order of ribosomal DNA, CYH r gene (L41), GAPDH promoter gene, LCB2 gene and ribosomal DNA.

이 플라스미드 prHECGL2는 한국과학기술연구원 생명공학연구소내 유전자은행에 부다페스트 조약하의 규정에 따라 1998년 8월 10일자로 국제기탁하여 수탁번호 KCTC-0511BP호를 부여받았다.The plasmid prHECGL2 was deposited internationally on August 10, 1998, under the provisions of the Budapest Treaty to the Gene Bank of the Institute of Biotechnology, Korea Research Institute of Science and Technology, and was granted accession number KCTC-0511BP.

플라스미드 prACGL2와 prHECGL2의 차이점은 형질전환시 플라스미드 prACGL2는 플라스미드 pBluescript KS+ 유전자(대장균용 벡터 유전자)가 피치아 시페리 유래의 유전자와 함께 삽입되는 반면에, prHECGL2는 피치아 시페리 유래의 유전자만 삽입되는 차이점이 있다.The difference between plasmids prACGL2 and prHECGL2 is that during transformation, the plasmid prACGL2 is inserted with the plasmid pBluescript KS + gene (E. coli vector gene) along with the gene from Pchia ciferi, whereas prHECGL2 is inserted only from the Pchia ciferi There is a difference.

<실시예 7> 형질전환 :Example 7 Transformation:

클래스와 피터의 방법{Klass & Peter, Curr. Genet., 25, 305, 1994}에 따라, YEPD 배지 100㎖에서 600㎚에서의 흡광도 1.5까지 배양한 피치아 시페리 KFCC-10937을 원심분리하여 회수한 후, 25mM의 DTT를 첨가한 50mM의 인산완충액(pH7.5) 40㎖에 37℃에서 15분간 분산시켰다. 빙냉의 안정액(270mM의 수크로스, 10mM의 트리스-Cl(pH7.5), 1mM의 MgCl2) 100㎖로 2회 세척한 후, 안정액 1㎖에 현탁하였다.Classes and Peter's Method {Klass & Peter, Curr. Genet., 25, 305, 1994}, 50 mM phosphoric acid added with 25 mM DTT after centrifugation and recovery of Peachyferi KFCC-10937 incubated in 100 mL of YEPD medium to absorbance at 600 nm. 40 mL of buffer (pH7.5) was dispersed for 15 minutes at 37 ° C. After washing twice with 100 ml of an ice-cold stabilizer (270 mM sucrose, 10 mM Tris-Cl (pH 7.5), 1 mM MgCl 2 ), the suspension was suspended in 1 ml of the stabilizer.

실시예 6의 플라스미드 prACGL2는 제한효소 ApaⅠ으로, 플라스미드 prHECGL2는 제한효소 ApaⅠ과 ScaⅠ으로 처리하여 개환한 다음, 0.5㎍씩을 TE 5㎕에 녹인 후 현탁액 50㎕와 혼합하여 얼음 위에서 10분간 방치하고, 0.2㎜의 전기자극용 큐베트(electroporation cuvette, Bio-Rad사 제품)로 옮겼다. Gean-pulser Ⅱ(Bio-Rad사 제품)를 사용하여, 전압 500V, 정전용량 50㎌, 저항 800Ω의 조건으로 전기자극을 가한 다음, 다시 안정액 0.5㎖에 현탁시켰다. 여기에 YEPD 배지 2㎖를 첨가하여 25℃에서 5시간 배양한 후, 시클로헥시미드 10㎍/㎖을 첨가한 YEPD 고체배지에 도말하여 25℃에서 4~5일간 배양하였다. 플라스미드 ㎍당 103개의 집락이 형성되었고, 그중 직경이 큰 집락을 4개씩 선발하였다.Plasmid prACGL2 of Example 6 was opened by treatment with restriction enzymes Apa I, plasmid prHECGL2 with restriction enzymes Apa I and Sca I, dissolved in 0.5 µl of 5 µl each, mixed with 50 µl of suspension and left on ice for 10 minutes, 0.2 The electrode was transferred to an electroporation cuvette of mm, manufactured by Bio-Rad. Using Gean-pulser II (manufactured by Bio-Rad), electrical stimulation was applied under conditions of a voltage of 500 kV, a capacitance of 50 kV and a resistance of 800 kV, and then suspended in 0.5 ml of a stabilizer. After 2 ml of YEPD medium was added thereto and incubated at 25 ° C. for 5 hours, plated onto YEPD solid medium to which 10 μg / ml of cycloheximide was added and incubated at 25 ° C. for 4 to 5 days. 10 3 colonies were formed per μg of plasmid, of which 4 large colonies were selected.

선발한 형질전환체 집락 각각을 시클로헥시미드 5㎍/㎖ 첨가한 YEPD 배지에 접종하여 25℃에서 18~20시간 진탕배양한 다음, 원심분리하여 세포를 회수하여 1.5㎖ 튜브에 옮겼다. 세포를 STES 용액(0.5M NaCl, 0.01M EDTA, 1% SDS in 0.2M 트리스-Cl, pH7.6) 30㎕에 현탁한 후, 지름 0.4㎜의 유리알을 0.8 부피만큼 첨가한 다음, 5분간 교반하고, TE 완충액(1mM EDTA in 10mM 트리스-Cl, pH8.0) 200㎕과 페놀/클로로포름/이소아밀알콜(25:24:1) 200㎕을 첨가하여 2분간 교반한 후, 12,000rpm에서 원심분리하였다. 상등액에 2.5배 부피의 에탄올을 첨가하여 게놈 DNA를 침전시키고, 건조하였다.Each of the selected transformant colonies was inoculated in YEPD medium to which 5 µg / ml of cycloheximide was added, shaken and cultured at 25 ° C. for 18 to 20 hours, and the cells were collected by centrifugation and transferred to a 1.5 ml tube. The cells were suspended in 30 µl of STES solution (0.5 M NaCl, 0.01 M EDTA, 1% SDS in 0.2 M Tris-Cl, pH7.6), and then 0.8 volume glass beads of 0.4 mm diameter were added, followed by stirring for 5 minutes. Then, 200 µl of TE buffer (1 mM EDTA in 10 mM Tris-Cl, pH8.0) and 200 µl of phenol / chloroform / isoamyl alcohol (25: 24: 1) were added thereto, followed by stirring for 2 minutes, followed by centrifugation at 12,000 rpm. It was. Genomic DNA was precipitated by adding 2.5 times the volume of ethanol to the supernatant and dried.

게놈 DNA 2~3㎍을 증류수 50㎕에 녹이고, 제한효소 HindⅢ, EcoRⅠ, XbaⅠ으로 각각 처리한 다음, 0.8% 아가로스 겔로 전기영동하였다. DIG로 표시된 L41 유전자, LCB2 유전자, GAPDH 프로모터 유전자와 각각 서던블럿하여 밴드를 확인하였다(도 4). 형질전환체의 게놈 DNA에 약 4~5 카피의 유전자들이 존재함을 확인하였다. 플라스미드 prACGL2 형질전환체들 중 하나를 골라 형질전환체 2라 명명하였고, 플라스미드 prHECGL2 형질전환체들 중 하나를 골라 형질전환체 3이라 명하였다.2 to 3 µg of genomic DNA was dissolved in 50 µl of distilled water, treated with restriction enzymes Hind III, EcoR I and Xba I, respectively, and then electrophoresed with 0.8% agarose gel. The bands were confirmed by Southern blotting with L41 gene, LCB2 gene, and GAPDH promoter gene, respectively, labeled with DIG (FIG. 4). About 4-5 copies of the genes were found in the genomic DNA of the transformant. One of the plasmid prACGL2 transformants was selected and named transformant 2, and one of the plasmid prHECGL2 transformants was selected and named transformant 3.

<비교예 1> 플라스미드 prACL2에 의해 형질전환된 형질전환체 1 :Comparative Example 1 Transformant 1 Transformed by Plasmid prACL2

플라스미드 prACL2를 제한효소 ApaⅠ으로 처리하여 개환한 다음, 실시예 7의 방법으로 모균주 KFCC-10937에 형질전환시켜 형질전환체 1을 선발하였다.After opening the plasmid prACL2 by restriction enzyme ApaI, transformant 1 was selected by transforming the parent strain KFCC-10937 by the method of Example 7.

<비교예 2> 모균주 KFCC-10937의 TAPS 생산 :<Comparative Example 2> Production of TAPS of the parent strain KFCC-10937:

모균주 KFCC-10937를 YGM 최적배지{글리세롤 100g/ℓ, 효모 추출물 2g/ℓ, KNO33g/ℓ, (NH4)2SO40.5g/ℓ, MgSO4·7H2O 0.3g/ℓ, NaCl 0.5g/ℓ, CSL 3g/ℓ, LS-300 1g/ℓ} 100㎖에 접종하여 25℃에서 4일간 250rpm으로 배양한 후, 4℃에서 2일간 정치시킨 다음, 클로로포름/메탄올을 1:1로 혼합한 용매 4부피를 첨가하여 층을 분리시킨 다음, TAPS를 추출하였다.The parent strain KFCC-10937 was YGM optimal medium {glycerol 100g / l, yeast extract 2g / l, KNO 3 3g / l, (NH 4 ) 2 SO 4 0.5g / l, MgSO 4 · 7H 2 O 0.3g / l, Inoculated in 100g NaCl 0.5g / L, CSL 3g / L, LS-300 1g / L incubated at 250rpm for 4 days at 25 ℃, then left for 2 days at 4 ℃, then chloroform / methanol 1: 1 Four volumes of solvents were added to separate the layers, and then TAPS was extracted.

TAPS는 ELSD(electron light scanning detector)를 이용하여 HPLC로 분석하였다. 용매로 이소옥탄과 THF/포름산(100:1.5)의 희석비율을 9:1, 7:3, 9:1로 변화시켰다.TAPS was analyzed by HPLC using an electron light scanning detector (ELSD). The dilution ratio of isooctane and THF / formic acid (100: 1.5) was changed to 9: 1, 7: 3, and 9: 1 as solvents.

<실시예 8 및 비교예 3> 형질전환체 1 및 2의 TAPS 생산 :Example 8 and Comparative Example 3 TAPS Production of Transformants 1 and 2:

실시예 7에서 선발한 형질전환체 2 및 비교예 1에서 선발한 형질전환체 1 각각을 비교예 2의 조건으로 배양하여, TAPS를 추출하였다.Each of transformant 2 selected in Example 7 and transformant 1 selected in Comparative Example 1 were cultured under the conditions of Comparative Example 2, and TAPS was extracted.

실시예 8 및 비교예 2, 3의 결과는 표 1에 나타내었다.The results of Example 8 and Comparative Examples 2 and 3 are shown in Table 1.

KFCC-10937와 형질전환체 1, 2의 TAPS 생산성 비교Comparison of TAPS Productivity between KFCC-10937 and Transformants 1 and 2 모균주KFCC-10937Mother strain KFCC-10937 형질전환체 1(prACL2)Transformant 1 (prACL2) 형질전환체 2(prACGL2)Transformant 2 (prACGL2) 2배 증식시간 (시간)2 times growth time (hours) 1.51.5 1.51.5 1.51.5 생물체량(biomass) 농도 (g/ℓ)Biomass concentration (g / ℓ) 41.641.6 43.643.6 40.140.1 TAPS (㎎/ℓ)TAPS (mg / l) 52065206 74447444 1093310933 TAPS 특이수율 (㎎/gdw)TAPS specific yield (mg / gdw) 125.1125.1 170.7170.7 272.6272.6 용적생산성 (㎎ TAPS/ℓ/hr)Volumetric productivity (mg TAPS / ℓ / hr) 54.254.2 77.577.5 113.9113.9

<실시예 9 및 비교예 4> 형질전환체 3의 TAPS 생산 :Example 9 and Comparative Example 4 TAPS Production of Transformant 3:

실시예 7에서 선발한 형질전환체 3 및 모균주 KFCC-10937을 YMGL 배지{효모 추출물 3g/ℓ, 맥아 추출물 3g/ℓ, 글리세롤 30g/ℓ}에서 배양하여 비교예 2의 조건으로 TAPS를 추출하였다.The transformant 3 selected from Example 7 and the parent strain KFCC-10937 were cultured in YMGL medium {yeast extract 3g / l, malt extract 3g / l, glycerol 30g / l} to extract TAPS under the conditions of Comparative Example 2. .

실시예 9 및 비교예 4의 결과는 표 2에 나타내었다.The results of Example 9 and Comparative Example 4 are shown in Table 2.

KFCC-10937와 형질전환체 3의 TAPS 생산성 비교Comparison of TAPS Productivity between KFCC-10937 and Transformant 3 모균주KFCC-10937Mother strain KFCC-10937 형질전환체 3(prHECGL2)Transformant 3 (prHECGL2) TAPS (㎎/㎖)TAPS (mg / ml) 0.2000.200 0.4200.420 TAPS (g/g cell)TAPS (g / g cell) 0.0120.012 0.0270.027

표 2의 결과로부터 비교할 수 있는 바와 같이, YMGL 배지를 사용한 경우 YGM 최적 배지를 사용한 경우에 비하여 절대 생산량은 감소하였으나, 모균주에 대한 형질전환체 3의 상대적 생산량은 2.1배에 이른다.As can be compared from the results of Table 2, the use of YMGL medium decreased the absolute production compared to the use of YGM optimal medium, but the relative yield of transformant 3 for the parent strain was 2.1 times.

본 발명에 의해 제공되는 플라스미드 prACGL2는, 고효율로 형질전환을 유도하는 0.6kb 크기의 리보좀 DNA와, 항생제 시클로헥시미드에 대해 저항성을 갖는 CYHr(L41) 유전자, 글리세르알데히드-3-인산 탈수소효소(GAPDH) 프로모터 유전자, 및 TAPS 생합성에 관여하는 세린 팔미토일 트랜스퍼라제를 코딩하는 LCB2 유전자가 순서대로 연결되어 있는 형태이고, 플라스미드 prHECGL2는 플라스미드 prACGL2의 LCB2 유전자 뒤에 800bp 크기의 리보좀 DNA를 더 포함하고 있는 형태로서, 모균주에의 형질전환 효율이 높으며, 이들 플라스미드에 의해 형질전환된 형질전환체는, GAPDH 프로모터 유전자에 의해 LCB2 유전자의 발현이 증폭되어 모균주 KFCC-10937에 비하여 최소 2.1배의 TAPS 생산능을 갖고 있다.The plasmid prACGL2 provided by the present invention is a 0.6kb ribosome DNA that induces transformation with high efficiency, a CYH r (L41) gene, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogen, which is resistant to the antibiotic cycloheximide. The enzyme (GAPDH) promoter gene and the LCB2 gene encoding the serine palmitoyl transferase involved in TAPS biosynthesis are sequentially linked, and the plasmid prHECGL2 further contains 800 bp ribosomal DNA after the LCB2 gene of plasmid prACGL2. In the present invention, the transformation efficiency to the parent strain is high, and the transformants transformed with these plasmids have a TAPS of at least 2.1 times that of the parent strain KFCC-10937 due to the amplification of the LCB2 gene expression by the GAPDH promoter gene. Has production capacity

<서열목록><Sequence list>

서열 번호 : 1SEQ ID NO: 1

서열의 길이 : 3296bpSequence length: 3296bp

서열의 타입 : 핵산 및 아미노산Type of sequence: nucleic acids and amino acids

쇄의 수 : 2본쇄Number of chains: 2 prints

토폴로지 : 선형Topology: linear

분자의 타입 : 게놈 DNAType of molecule: genomic DNA

기원origin

생물명 : 피치아 시페리(Pichia ciferrii)Biology: Pichia ciferrii

주명 : ATCC 14091Main Name: ATCC 14091

서열의 특징Characteristic of the sequence

특징을 나타내는 기호 : CDSCharacteristic symbols: CDS

존재 위치 : 765 .. 2453Presence location: 765 .. 2453

특징을 결정하는 방법 : EHow to determine the features: E

서열 번호 : 2SEQ ID NO: 2

서열의 길이 : 1928bpSequence length: 1928bp

서열의 타입 : 핵산 및 아미노산Type of sequence: nucleic acids and amino acids

쇄의 수 : 2본쇄Number of chains: 2 prints

토폴로지 : 선형Topology: linear

분자의 타입 : 게놈 DNAType of molecule: genomic DNA

기원origin

생물명 : 피치아 시페리(Pichia ciferrii)Biology: Pichia ciferrii

주명 : ATCC 14091Main Name: ATCC 14091

서열의 특징Characteristic of the sequence

특징을 나타내는 기호 : CDSCharacteristic symbols: CDS

존재 위치 : 907 .. 1911Presence Location: 907 .. 1911

특징을 결정하는 방법 : EHow to determine the features: E

특징을 나타내는 기호 : 프로모터Characteristic symbols: promoter

존재 위치 : 1 .. 906Presence Location: 1 .. 906

특징을 결정하는 방법 : EHow to determine the features: E

Claims (11)

피치아 시페리(Pichia ciferrii) 유래의 글리세르알데히드-3-인산 탈수소효소(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)를 코딩하는, 서열 2에 기재된 GAPDH 유전자.The GAPDH gene according to SEQ ID NO: 2 encoding glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase derived from Pichia ciferrii. 제 1항 기재의 GAPDH 유전자로부터 분리된, 서열 2에 기재된 GAPDH 프로모터 유전자.The GAPDH promoter gene of SEQ ID NO: 2 isolated from the GAPDH gene of claim 1. 피치아 시페리 유래의 리보좀 DNA, 항생제 시클로헥시미드(cycloheximide)에 대해 저항성을 갖는 CYHr유전자, 제 2항 기재의 GAPDH 프로모터 유전자, 및 피치아 시페리 유래의 세린 팔미토일 트랜스퍼라제(serine palmitoyl transferase)를 코딩하는 LCB2 유전자를 포함하는 플라스미드.Ribosome DNA derived from pichia ciferi, CYH r gene resistant to antibiotic cycloheximide, GAPDH promoter gene according to claim 2, and serine palmitoyl transferase derived from pichia ciferi a plasmid comprising an LCB2 gene encoding transferase). 제 3항에 있어서, 제 2도에 기재된 제한효소지도를 갖는 플라스미드 prACGL2(KCTC-0498BP)임을 특징으로 하는 플라스미드.The plasmid according to claim 3, which is the plasmid prACGL2 (KCTC-0498BP) having the restriction enzyme map shown in FIG. 제 3항에 있어서, LCB2 유전자 뒤에 800bp 크기의 피치아 시페리 유래의 리보좀 DNA를 더 포함함을 특징으로 하는 플라스미드.4. The plasmid according to claim 3, further comprising ribosomal DNA derived from pichia ciferi of 800 bp after the LCB2 gene. 제 5항에 있어서, 제 3도에 기재된 제한효소지도를 갖는 플라스미드 prHECGL2(KCTC-0511BP)임을 특징으로 하는 플라스미드.The plasmid according to claim 5, which is plasmid prHECGL2 (KCTC-0511BP) having a restriction map as shown in FIG. 제 6항에 기재된 플라스미드 prHECGL2를 제한효소 ApaⅠ과 ScaⅠ으로 처리하여 개환한 후 피치아 시페리에 형질전환하는 것을 특징으로 하는 대장균용 벡터 유전자를 포함한 외래 유전자의 삽입을 배제할 수 있는 형질전환 방법.The transformation method which can exclude the insertion of the foreign gene containing the vector gene for Escherichia coli which is transfected after opening by processing the plasmid prHECGL2 of Claim 6 with restriction enzymes ApaI and ScaI. 제 3항에 기재된 플라스미드로 형질전환된 피치아 시페리.Peachia ciperi transformed with the plasmid according to claim 3. 제 5항에 기재된 플라스미드로 형질전환된 피치아 시페리.Peachia ciperi transformed with the plasmid according to claim 5. 제 8항에 기재된 형질전환체 피치아 시페리를 배양하여, 배양액으로부터 테트라아세틸 피토스핑고신(tetraacetyl phytosphingosine)을 추출함을 특징으로 하는 테트라아세틸 피토스핑고신의 생산방법.A method for producing tetraacetyl phytosphingosine, comprising culturing the transformant pichia ciferi according to claim 8, and extracting tetraacetyl phytosphingosine from the culture. 제 9항에 기재된 형질전환체 피치아 시페리를 배양하여, 배양액으로부터 테트라아세틸 피토스핑고신을 추출함을 특징으로 하는 테트라아세틸 피토스핑고신의 생산방법.A method for producing tetraacetyl phytosphingosine, comprising culturing the transformant pichia ciferi according to claim 9, and extracting tetraacetyl phytosphingosine from the culture solution.
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