KR19990022176A - 특정 식품을 오염시키는 내열성 미생물의 검출 방법 - Google Patents

특정 식품을 오염시키는 내열성 미생물의 검출 방법 Download PDF

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앙마누엘 에뿌즈 따데이 샤르자브제
로버트 오프레르
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피. 로비숑
윌뜨라 쁘로쁘로 뉘뜨리시옹 엥뒤스뜨리 러쉐르쉐
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Abstract

본 발명은 리보좀 유닛의 내부 전사 스페이서 (ITS) 상에 포함된 서열, 즉 비소클라미스 니베아에 대해서 ITS1 상에서 상응 서열 1 및 ITS2 상에서 상응 서열 2, 네오사르토리아 피스케리에 대해서 ITS1 상에서 상응 서열 3 및 ITS2 상에서 상응 서열 4, 지고사카로마이세스 베일리에 대해서 ITS1 상에서 상응 서열 5 및 ITS2 상에서 상응 서열 6을 프라이머로 사용하여 표적화된 미생물의 게놈 DNA의 증폭에 의한 비소클라미스 니베아, 네오사르토리아 피스케리 및 지고사카로마이세스 베일리의 검출 방법에 관한 것이다.

Description

특정 식품을 오염시키는 내열성 미생물의 검출 방법
본 발명은 식품, 특히 과일 기재 식품에서 특정 식품을 오염시키는 내열성 진균 미생물의 신속한 검출 방법에 관한 것이다.
더 구체적으로, 연구된 미생물은 필라멘트성 진균인 비소클라미스 니베아 (Byssochlamyces nivea) 및 네오사르토리아 피스케리 (Neosartorya fischeri), 및 효모인 지고사카로마이세스 베일리 (Zygosaccharomyces bailli)이다.
이 식품 오염원들은 과일 기재 식품에서 발생되어서, 특히 비소클라마이스 니베아의 경우에는 식품에 플라스틱 또는 방부제 형태의 불유쾌한 표시를 남기고, 네오사르토리아 피스케리의 경우는 진균독의 부패 및 발생에 기인하고, 지고사카로마이세스 베일리는 기체를 형성한다.
이 미생물들은 특히 포자 형태이고, 식품 산업에서 사용되는 통상의 멸균 처리 후에도 지속될 수 있는 매우 높은 내열성을 보인다.
이 미생물들을 검출하는 현존 시험들은 선택 인자로서 필라멘트성 잔균의 내열성 또는 당업계에서 흔히 사용되는 벤조간과 같은 방부제에 대한 효모의 내성을 이용하여 선택적 배지의 시료를 변경하는 것으로 이루어진다. 그러나, 이러한 형태의 검출법은 배양, 상당히 긴 배양, 즉 몇일 내지 몇주 배양에 관여하고, 이들은 오염될 수 있는 식품의 장기간의 보관에 관여하기 때문에, 이는 이들을 식품 분야에서 실질적으로 사용할 수 없게 한다.
따라서, 이러한 미생물들의 매우 신속한 검출을 가능하게 하는 검출법에 대한 연구가 진행 중이고, 채취된 생성물이 다음 단계에서 계속 처리될 수 있는 지를 신속히 알아내기 위하여 최대 몇시간 내에 상기 시험을 수행할 수 있다.
따라서, 본 발명은 리보좀 유닛의 내부 전사된 스페이서 (ITS) 상에 포함된 한쌍의 서열, 즉
-비소클라미스 니베아에 대해서
- ITS1 상에서 상응 서열 1 및
- ITS2 상에서 상응 서열 2,
-네오사르토리아 피스케리에 대해서
- ITS1 상에서 상응 서열 3 및
- ITS2 상에서 상응 서열 4,
-지고사카로마이세스 베일리에 대해서
- ITS1 상에서 상응 서열 5 및
- ITS2 상에서 상응 서열 6
을 프라이머로 사용하여 표적화된 미생물의 게놈 DNA의 증폭에 의한 비소클라미스 니베아, 네오사르토리아 피스케리 및 지고사카로마이세스 베일리의 검출 방법을 제안한다.
ITS1 및 ITS2 서열에서, 더 구체적으로
- 비소클라미스 니베아에 있어서, 서열 7 및 8,
- 네오사르토리아 피스케리에 있어서, 서열 9 및 10,
- 지고사카로마이세스 베일리에 있어서, 서열 11 및 12가 선택될 것이다.
사용될 수 있는 증폭 방법 중에서, 소위 PCR (폴리머라제 연쇄 반응법)을 특히 사용할 것이다.
실시예에서 특히 보고된 시험은 이 프라이머들은 완벽하게 식별하여서, 목적하는 미생물과 매우 유사하고, 관련 미생물 간의 구별을 가능하게 한다.
또한, 본 발명은 과일 함유 시료를 예비처리하여서 포자 또는 세포를 방출 및 농축하고, Taq 폴리머라제의 길항제의 작용을 감소 또는 억압하고, 포자 또는 세포로부터 DNA를 추출하는 것으로 이루어진, 식품, 특히 과일 기재 식품, 더 구체적으로 딸기 기재 식품에서 상기 미생물들의 검출 방법에 관한 것이다.
더 구체적으로, 고체 생성물 함유 시료를 셀룰라제/헤미셀룰라제의 혼합물을 사용하여 처리하여서 이들을 액화한 후, 여과하고, DNA가 추출될 수 있는 세포 함유 생성물을 얻을 수 있는 조건 하에서 원심분리하였다.
시료는 종종 Taq 폴리머라제의 길항제를 함유하기 때문에, 페놀-클로로포름을 사용하여 시료를 희석하거나 또는 처리하고, 알코올로 침전시켜서 길항제의 활성을 감소시킬 수 있는 단계를 요구한다.
비록, 본 발명은 더 구체적으로 식품용이지만, 또한 식품과 전혀 관련되지 않은 다른 시료에 존재하는 미생물을 검출하는데에도 사용될 수 있다.
마지막으로, 본 발명은, 상기한 바대로, 프라이머 및 이 프라이머를 사용하는 검출용 키트에 관한 것이다.
본 발명의 다른 특징 및 잇점은 하기 실시예를 통해 나타날 것이다.
실시예 1- DNA의 추출 및 증폭 방법
(I) 5 mm2의 진균 균사체, 105의 진균 포자 또는 106의 효모 세포를 사용함:
- 스크류-탑 마이크로튜브 (1.5 ㎖의 에펜도르프형)에서 20 mM EDTA, 0.8% SDS를 함유하는 pH 8.5의 50 mM 트리스 완충액 200 ㎕에서 미생물을 현탁시키고, 여기에 유리 비드(직경이 0.25-0.5 mm) 100 ㎕를 가하고,
- 최대 진동수로 1분 동안 볼텍싱하고,
- 100℃(끓는 물)에서 15분 동안 혼합물을 인큐베이션하고,
* 포자 처리를 위하여, 볼텍싱 및 인큐베이션을 대신해서
- 액체 N2에서 동결시키고, 100℃에서 5분 동안 비등시키고,
- 액체 N2에서 재동결시키고, 100℃에서 10분 동안 비등시키고,
- 10,000 g에서 1분간 원심분리 (벤취 원심분리기)하고,
- 상등액을 회수하고,
- 상등액을 물로 10배 희석하였다.
이 희석된 상등액을 증폭에 직접 사용한다.
(II) 20 mM 트리스-HCl pH8.5, 16 mM (NH4)2SO4, 2.5 mM MgCl2, 150 ㎍의 소혈청 알부민, dNTP 각각 0.2μM 및 프라이머 올리고뉴클레오티드 각각 100 μM를 함유하는 최종 부피 25 ㎕에서 증폭을 수행하였다. Taq DNA 폴리머라제 (바이오텍, 바이오시스템사, 프랑스)의 2 유닛을 반응에 사용하였다. 증폭 반응을 페르킨 엘머 2400 열순환기 (페르킨 엘머사, 미국)에서 하기의 방법으로 수행하였다.
-지고사카로마이세스, 비소클라미스 및 네오사르토리아에 있어서,
· 94℃에서 15초
· 58℃에서 10초
· 72℃에서 20초
이 사이클을 30분 반복하였다. 이어서, 72℃에서 5분간 말단 연장하였다.
(III) 얻은 생성물을 1xTBE 완충액, 1 ㎍/㎖의 에티듐브로마이드, 0.8% 아가로즈의 성분을 지닌 전기영동 겔 상에서 이동시킨 후, UV 하에 가시화하였다.
실시예 2
검출용 균주와 유사한 다양한 균주에 대해서 본 발명에 따른 방법을 사용하여 얻은 결과는 청구된 일련의 프라이머에 의해 제공된 우수한 식별능을 보였고, 하기와 같다.
사용된 프라이머:
- 비소클라미스 니베아에 대해서 서열번호 7 및 8,
- 네오사르토리아 피스케리에 대해서 서열번호 9 및 10,
- 지고사카로마이세스 베일리에 대해서 서열번호 11 및 12.
아스퍼질러스 푸미가투스 (A. fumigatus)는 네오사르토리아 피스케리의 무성 (asexual) 형태이기 때문에, 프로브에 반응한다는 점에 유의한다.
네오사르토리아 피스케리에 대해 특이적인 프라이머 올리고뉴클레오티드
균주 T ℃ PCR 반응도
아스퍼질러스(Aspergillus) 플로리포르미스(floriformis) M 93 2663 57 ℃ 음성
아스퍼질러스(Aspergillus) 푸미가투스(fumigatus) M 70 665 57 ℃ 양성
아스퍼질러스(Aspergillus) 푸미가투스(fumigatus) M 88 2521 57 ℃ 양성
비소클라미스(Byssochlamys) 니베아(nivea) M 90 1496 57 ℃ 음성
비소클라미스(Byssochlamys) 니베아(nivea) M 93 2932 57 ℃ 음성
에메리켈라(Emericella) 니둘란스(nidulans) M 88 2519 57 ℃ 음성
에메리켈라(Emericella) 니둘란스 변형 아크리스타타(nidulans var. acristata) M 84 2558 57 ℃ 음성
에메리켈라(Emericella) 니둘란스 변형 덴타타(nidulans var. dentata) M 84 2556 57 ℃ 음성
에메리켈라(Emericella) 니둘란스 변형 라타(nidulans var. lata) M 68 1987 57 ℃ 음성
에메리켈라(Emericella) 니둘란스 변형 시누라타(nidulans var. shinulata) M 84 9557 57 ℃ 음성
유페니실륨(Eupenicillium) 브레펠디아눔(brefeldianum) M 89 2573 57 ℃ 음성
유로티움(Eurotium) 암스텔로다미(amstelodami) M 50 142 57 ℃ 음성
유로티움(Eurotium) 암스텔로다미(amstelodami) M 88 2536 57 ℃ 음성
유로티움(Eurotium) 레펜스(repens) M 66 2534 57 ℃ 음성
마리아네(Mariannae) 엘레강스(elegans) M 95 3777 57 ℃ 음성
모나스커스(Monascus) 루베르(ruber) M 65 1079 57 ℃ 음성
네오사르토리아(Neosartoria) 페넬리아(fennelliae) M 93 2982 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 페넬리아(fennelliae) M 95 3781 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 페넬리아(fennelliae) M 95 3780 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 슈도피스케리(pseudofischeri) M 93 2986 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 슈도피스케리(pseudofischeri) M 95 3784 57 ℃ 양성
균주 T ℃ PCR 반응도
네오사르토리아(Neosartoria) 피스케리 변형 스피노사(fischeri var. spinosa) M 92 2924 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 피스케리 변형 스피노사(fischeri var. spinosa) M 93 2935 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 히라츠카(hiratsukae) M 95 3782 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 콰드리신타(quadricincta) M 93 2984 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 콰드리신타(quadricincta) M 95 3786 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 스파둘라타(spathulata) M 93 2978 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 스파둘라타(spathulata) M 93 2979 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 스트라메니아(stramenia) M 93 2985 57 ℃ 양성
네오사르토리아(Neosartoria) 타테노이(tatenoi) M 95 3783 57 ℃ 양성
페실로마이세스(Paecilomyces) 카르네우스(carneus) M 52 907 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 카르네우스(carneus) M 95 3776 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 엘레강스(elegans) M 79 1670 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 파리노수스(farinosus) M 75 3028 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 푸모소-로제우스(fumoso-roseus) M 52 597 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 인플라투스(inflatus) M 57 1387 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 자바니쿠스(javanicus) M 69 3302 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 자바니쿠스(javanicus) M 90 2684 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 릴라시누스(lilacinous) M 2689 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 릴라시누스(lilacinous) M 70 3099 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 마르콴디(marquandii) M 50 85 57 ℃ 음성
균주 T ℃ PCR 반응도
페실로마이세스(Paecilomyces) 니페토데스(niphetodes) M 79 3238 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 니페토데스(niphetodes) M 95 3778 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 바리오티(variotii) M 93 3701 57 ℃ 음성
페실로마이세스(Paecilomyces) 졸레니아(zolerniae) M 93 3648 57 ℃ 음성
페니실륨(Penicillium) 크리소게눔(chrysogenum) M 47 673 57 ℃ 음성
페니실륨(Penicillium) 이슬라디쿰(islandicum) M 73 2233 57 ℃ 음성
페니실륨(Penicillium) 이슬라디쿰(islandicum) M 73 2233 57 ℃ 음성
페니실륨(Penicillium) 푸르푸로게눔(purpurogenum) M 90 2600 57 ℃ 음성
페니실륨(Penicillium) 바리아빌레(variabile) M 78 3162 57 ℃ 음성
페니실륨(Penicillium) 비리디카툼(viridicatum) M 88 2485 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 바실리포르미스(bacilliformis) M 88 1497 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 바실리포르미스(bacilliformis) M 88 2511 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 바실리포르미스(bacilliformis) M 90 1493 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 바실리포르미스(bacilliformis) M 90 2646 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 바실리포르미스(bacillisporus) M 88 2511 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 플라부스(flavus) M 83 1179 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 플라부스(flavus) M 88 2481 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 플라부스(flavus) M 89 1489 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 플라부스(flavus) M 93 2944 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 헬리쿠스 변형 헬리쿠스(helicus var. helicus) M 88 2510 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) 루테우스(luteus) M 61 1858 57 ℃ 음성
균주 T ℃ PCR 반응도
탈라로마이세스(Talaromyces) sp. M 92 2885 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) sp. M 92 2887 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Talaromyces) sp. M 92 2888 57 ℃ 음성
탈라로마이세스(Thermoascus) 크루스타세우스(crustaceus) M 88 2540 57 ℃ 음성
파리 자연사 국립 박물관으로 부터 얻은 균주
지고사카로마이세스 베일리에 대해 특이적인 프라이머 올리고뉴클레오티드
균주 T ℃ PCR 반응도
칸디다(Cadndida) 인콘스피쿠아(inconspicua) M E 10 50 ℃ 음성
칸디다(Cadndida) 마그놀리아(magnoliae) M E14 50 ℃ 양성
칸디다(Cadndida) 모기(mogii) M 95 3795 55 ℃ 양성
클라비스포라(Clavispora) 루지타니아(lusitaniae) M E9 50 ℃ 음성
클라비스포라(Clavispora) 루지타니아(lusitaniae) SIAS 58 ℃ 음성
사이토플로바시듐(Cytofilobasidium) ME 13 50 ℃ 음성
데바리오마이세스(Debaryomyces) 한세니(hansenii) SIAS 59 ℃ 음성
데바리오마이세스(Debaryomyces) 한세니(hansenii) M E18 50 ℃ 음성
하이포피키아(Hypopichia) M E6 50 ℃ 음성
클루이베로마이세스(Kluyvermyces) 마르시아누스 변형 락티스(marxianus var. lactis) M 95 3788 55 ℃ 음성
클루이베로마이세스(Kluyvermyces) 마르시아누스 변형 락티스(marxianus var. lactis) M 95 3789 55 ℃ 음성
클루이베로마이세스(Kluyvermyces) 마르시아누스 변형 마르시아누스(marxianus var. marxianus) M 95 3790 55 ℃ 음성
클루이베로마이세스(Kluyvermyces) 마르시아누스 변형 마르시아누스(marxianus var. marxianus) M 95 3791 55 ℃ 음성
클루이베로마이세스(Kluyvermyces) 마르시아누스 변형 락티스(marxianus var. lactis) P 8 57 ℃ 음성
모니리엘라(Moniliella) M E 2 50 ℃ 음성
피키아(Pichia) 아모말라(anomala) M E 12 50 ℃ 음성
피키아(Pichia) 아모말라(anomala) SIAS 58 ℃ 음성
피키아(Pichia) 페르만탄스(fermantans) SIAS 58 ℃ 음성
피키아(Pichia) 구일리에르몬디(guilliermondii) SIAS 58 ℃ 음성
균주 T ℃ PCR 반응도
피키아(Pichia) 구일리에르몬디(guilliermondii) M E 17 50 ℃ 음성
피키아(Pichia) 파스토리스(pastoris) M 95 3792 55 ℃ 음성
피키아(Pichia) 파스토리스(pastoris) M 95 3793 55 ℃ 음성
로도툴롤라(Rhodotulora) 무실라기노사(mucilaginosa) M E 15 50 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 바야누스(bayanus) M 95 3796 55 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 바야누스(bayanus) P 562 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 바야누스(bayanus) P 563 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 캡슐라리스(capsularis) M 95 3807 55 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) H 5035 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) H 5090 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) H 5130 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) H 5160 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) H 5200 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) H 5334 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) M E 16 50 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) P 1 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) P 575 57 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 세레비지에(cerevisiae) SIAS 58 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 엑시구스(exiguus) M 95 3797 55 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 클루이베르(kluyver) M 95 3798 55 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 루드위기(ludwigii) M 95 3806 55 ℃ 음성
균주 T ℃ PCR 반응도
사카로마이세스(Saccharomyces) 세르바지(servazii) M 95 3799 55 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 스텔라우스(stellatus) M 95 3803 55 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 스텔라우스(stellatus) M 95 3804 55 ℃ 음성
사카로마이세스(Saccharomyces) 우니스포루스(unisporus) M 95 3805 55 ℃ 음성
시조사카로마이세스(Schyzosaccharomyces) 폼베(pombe) H 5096 57 ℃ 음성
내삼투성 균주(Osmophilic strain) H 11 077 57 ℃ 음성
내삼투성 균주(Osmophilic strain) H 37 080 57 ℃ 음성
토룰라스포라(Torulaspora) 델브루키(delbruckii) M 95 3794 55 ℃ 음성
토룰라스포라(Torulaspora) 델브루키(delbruckii) P L121 57 ℃ 음성
토룰라스포라(Torulaspora) 델브루키(delbruckii) SIAS 58 ℃ 음성
트리코스포룸(Trichosporum) 캐피타툼(capitatum) SIAS 50 ℃ 음성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 90 2638 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 90 2639 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2895 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2896 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2897 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2899 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2900 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2901 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2902 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2903 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2904 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2905 55 ℃ 양성
균주 T ℃ PCR 반응도
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2906 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2907 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2908 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2909 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2911 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2912 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2913 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2914 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2915 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2916 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2917 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2918 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2920 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2921 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2922 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M 92 2923 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) M E 11 55 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 베일리(bailii) PL443 58 ℃ 양성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 비스포루스(bisporus) DBVPG 6382 58 ℃ 음성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 시드리(cidri) DBVPG 6385 55 ℃ 음성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 페르멘타티(fermentati) DBVPG 6297 55 ℃ 음성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 플로렌티누스(florentinus) DBVPG 6186 55 ℃ 음성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 마이크로엘립소이데스(microellipsoides) DBVPG 6188 55 ℃ 음성
균주 T ℃ PCR 반응도
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 므라키(mrakii) DBVPG 6289 55 ℃ 음성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 룩시(rouxii) MUCL 30008 55 ℃ 음성
지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 룩시(rouxii) SIAS 58 ℃ 음성
균주 공급원:
DBVPG: 페르기아 식물학과(Department of Plant Biology, Perugia) (이태리)
H: 호데베르(Heudebert Company) 사
M: 파리 자연 역사 국립 박물관 (Paris National Museum of Natural History)
MUCL: 루베잉 카톨릭 대학의 진균 컬쳐 콜렉션 (Fungus Culture Collection of the Catholic University of Louvains)
P: 페르노드-리카르드(Pernod-Richard) 사
SIAS: 시아스(SIAS) 사 (프랑스)
〈서열표〉
(1) 일반적 정보 :
(i) 출원인:
(A) 명칭: UNIR
(B) 거리: 뤼 뒤 벡 46
(C) 도시: 파리
(E) 국가: 프랑스
(F) 우편 번호: 75007
(iii) 서열수: 12
(2) 서열 1에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 186 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 2에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 187 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 3에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 183 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 4에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 176 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 5에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 279 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 6에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 237 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 7에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 25 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 8에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 25 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 9에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 25 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 10에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 27 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 11에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 25 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:
(2) 서열 12에 대한 정보:
(i) 서열 특징:
(A) 길이: 25 염기쌍
(B) 유형: 뉴클레오티드
(C) 가닥수: 단일
(D) 토폴로지: 선형
(ii) 분자 형태: DNA (게놈)
(xi) 서열 설명:

Claims (7)

  1. 리보좀 유닛의 내부 전사 스페이서 (ITS) 상에 포함된 서열, 즉
    -비소클라미스 니베아에 대해서
    - ITS1 상에서 상응 서열 1 및
    - ITS2 상에서 상응 서열 2,
    -네오사르토리아 피스케리에 대해서
    - ITS1 상에서 상응 서열 3 및
    - ITS2 상에서 상응 서열 4,
    -지고사카로마이세스 베일리에 대해서
    - ITS1 상에서 상응 서열 5 및
    - ITS2 상에서 상응 서열 6
    을 프라이머로 사용하여 표적화된 미생물의 게놈 DNA의 증폭에 의한 비소클라미스 니베아, 네오사르토리아 피스케리 및 지고사카로마이세스 베일리의 검출 방법.
  2. 제1항에 있어서, ITS1 및 ITS2 서열에 있어서, 더 구체적으로 비소클라미스 니베아에 대해서 서열 7 및 8, 네오사르토리아 피스케리에 대해서 서열 9 및 10 및 지고사카로마이세스 베일리에 대해서 서열 11 및 12를 선택하는 것을 특징으로하는 방법.
  3. 제1항 또는 2항에 있어서, 증폭을 PCR 방법에 의해 수행하는 것을 특징으로하는 방법.
  4. 제1항 내지 3항 중 어느 한 항에 있어서, 식품, 특히 과일 기재 식품, 더 구체적으로 딸기 기재 식품에서 상기 미생물들을 검출하는데 있어서, 포자 또는 세포를 방출 및 농축시키고, Taq 폴리머라제의 길항제의 작용을 감소 또는 억압하고, 그리고 포자 또는 세포로부터 DNA를 추출하기 위하여 과일 함유 시료를 예비처리하는 방법.
  5. 제4항에 있어서, 과일 함유 시료를 셀룰라제/헤미셀룰라제의 혼합물을 사용하여 처리하여 이들을 액화한 후, 여과하고, DNA가 추출될 수 있는 세포 함유 생성물을 얻을 수 있는 조건 하에서 원심분리하는 것을 특징으로하는 방법.
  6. 서열 1 내지 12의 서열로부터 선택된 서열을 갖는 프라이머.
  7. 제6항의 프라이머를 포함하는 것을 특징으로하는, 제3항 내지 5항의 방법을 수행하기 위한 DNA의 증폭에 의한 검출용 키트.
KR1019970708655A 1995-06-02 1996-05-31 특정 식품을 오염시키는 내열성 미생물의 검출 방법 KR19990022176A (ko)

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Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6242178B1 (en) * 1997-07-30 2001-06-05 Centers For Disease Control And Prevention Nucleic acid probes for detecting Candida species
US6080543A (en) * 1997-12-08 2000-06-27 E. & J. Gallo Winery Detection of fungal pathogens
FR2781812B1 (fr) * 1998-07-30 2002-12-20 Lallemand Sa Procede d'identification specifique de levures
DE10344057B3 (de) * 2003-09-23 2005-06-09 Vermicon Ag Verfahren zum spezifischen Schnellnachweis getränkeschädlicher Mikroorganismen
EP1772522A1 (en) * 2005-10-04 2007-04-11 Nederlandse Organisatie Voor Toegepast-Natuurwetenschappelijk Onderzoek Tno Control of preservation by biomarkers
WO2009145279A1 (ja) * 2008-05-28 2009-12-03 花王株式会社 耐熱性菌類の検出方法
US9102987B2 (en) 2008-05-29 2015-08-11 Kao Corporation Method of detecting paecilomyces variotii
US8748093B2 (en) 2008-11-11 2014-06-10 Kao Corporation Method of detecting fungi belong to genus Geosmithia
JP5654265B2 (ja) * 2010-06-03 2015-01-14 花王株式会社 ビソクラミス属に属する菌類の検出方法
JP5820658B2 (ja) * 2011-08-10 2015-11-24 花王株式会社 ネオサルトリア属真菌の検出方法

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS5130139B2 (ko) * 1972-08-10 1976-08-30
US4683195A (en) * 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
CA2025181A1 (en) * 1989-10-12 1991-04-13 William G. Weisburg Nucleic acid probes and methods for detecting fungi

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