KR19980702853A - Amphiphilic Peptides and Analogs thereof - Google Patents

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KR19980702853A
KR19980702853A KR1019970706260A KR19970706260A KR19980702853A KR 19980702853 A KR19980702853 A KR 19980702853A KR 1019970706260 A KR1019970706260 A KR 1019970706260A KR 19970706260 A KR19970706260 A KR 19970706260A KR 19980702853 A KR19980702853 A KR 19980702853A
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만모한 바쿠
샤일 페이텔
피터 이안 스토트
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에스제이에드워즈
유니레버엔.브이.
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Abstract

본 발명은 양친매성 펩티드 및 그의 유사체에 관한 것이다. 명세서는 분자를 세가지 방식으로 정의하고 다음의 군으로부터 선택된 서열들로 이루어지는 개선된 항미생물성 펩티드가 향상된 항미생물 특성을 가짐을 개시한다:The present invention relates to amphipathic peptides and analogs thereof. The specification defines molecules in three ways and discloses improved antimicrobial peptides having improved antimicrobial properties, consisting of sequences selected from the following groups:

+-++--++--+--++, +-++--++---+--++, ++-+++-++-+++--, ++-+++-++-++++-++--, ++-+++-++--++--++-, --++--++-++--++-++, ++++-+++--+--++, ++-+++++++-++-++--, 여기에서 +는 소수성 아미노산 잔기를 표시하며, -는 친수성 아미노산 잔기를 표시한다. 활성 펩티드의 구체적인 서열이 나타나 있다. 명세서는 또한 규칙(이것에 의하여 본 발명의 범위 내에 속하는 펩티드를 동정한다)을 정의하는 두 개의 일반식을 개시한다.+-++-++-+-++, +-++-++ --- +-++, ++-+++-++-+++-, + +-+++-++-++++-++-, ++-+++-++-++-++-,-++-++-++- -++-++, ++++-+++-+-++, ++-+++++++-++-++-, where + represents a hydrophobic amino acid residue And-represents a hydrophilic amino acid residue. The specific sequence of the active peptide is shown. The specification also discloses two general formulas defining rules, whereby identifying peptides falling within the scope of the present invention.

Description

양친매성 펩티드 및 그의 유사체Amphiphilic Peptides and Analogs thereof

펩티드는 아미노산의 중합체이다. 약 20개 정도의 천연적인 아미노산이 존재하며, 이들은 그의 화학적 성질이 다소 다르다. 펩티드 분자 내에서 특수한 아미노산 서열을 배열함으로써, 촉매로서의 활성(예를 들면, 효소)으로부터 화학적 전령(예를 들면, 인슐린과 같은 펩티드 호르몬)에 이르기까지 매우 광범위한 화학적 기능성을 나타내는 펩티드를 얻는 것이 가능하다. 펩티드 서열에서의 작은 변화가 분자의 기능성면에서의 중대한 결과를 낳을 수 있다고 알려져 있다. 특별한 펩티드의 합성은 관련 서열을 갖는 핵산 분자에 의하여 지시될 수 있는 것으로 알려져 있다.Peptides are polymers of amino acids. There are about 20 natural amino acids, which differ somewhat in their chemistry. By arranging specific amino acid sequences within peptide molecules, it is possible to obtain peptides that exhibit a very wide range of chemical functionality, ranging from activity as a catalyst (eg enzymes) to chemical messengers (eg peptide hormones such as insulin). . Small changes in peptide sequences are known to have significant consequences on the functionality of molecules. It is known that the synthesis of particular peptides can be directed by nucleic acid molecules having related sequences.

양친매성 펩티드는 소수성 특성의 일부 영역 및 친수성 특성의 다른 일부 영역을 제공하는 아미노산 구조에 의하여 특징지워진다. 이러한 펩티드는 세포의 생활 과정을 변형시키기 위하여 살아 있는 세포의 막과 상호작용할 수 있는 것으로 여겨진다. 수많은 양친매성 펩티드는 천연적으로 존재하며, 다른 양친매성 펩티드는 합성 방법에 의하여 생산되어 왔다.Amphiphilic peptides are characterized by amino acid structures that provide some regions of hydrophobic properties and other regions of hydrophilic properties. It is believed that such peptides can interact with the membranes of living cells to modify the life processes of the cells. Many amphipathic peptides exist naturally, and other amphiphilic peptides have been produced by synthetic methods.

국제 출원 제92/01462호는 표적 세포의 성장을 억제하기 위한 양친매성 펩티드를 개시한다. 이 펩티드는 소수성 및 친수성 아미노산 잔기 둘다에 의하여 구성된다. 아미노산의 소수성 및 친수성의 균형은 아이젠버그(Eisenberg) 등이 인용한 소수성 값(hydrophobicity value)에 관한 문헌[Nature 1982 299, 제371면]에 의하여 기술될 수 있다. 소수성 잔기는 0보다 큰 값을 갖는 반면 친수성 잔기는 0보다 작은 값을 갖는다.International application 92/01462 discloses amphipathic peptides for inhibiting growth of target cells. This peptide is composed of both hydrophobic and hydrophilic amino acid residues. The balance of hydrophobicity and hydrophilicity of amino acids can be described by the literature on hydrophobicity values cited by Eisenberg et al. (Nature 1982 299, p. 371). Hydrophobic residues have a value greater than zero while hydrophilic residues have a value less than zero.

편의를 위하여, 이들 값의 일부를 연관된 아미노산 잔기를 나타내는데 사용하는 코드와 함께 아래 표 1에 나타내었다.For convenience, some of these values are shown in Table 1 below along with the codes used to indicate associated amino acid residues.

value 잔기Residue 0.530.250.610.540.730.16-0.18-0.26-0.62-0.69-1.1-1.760.530.250.610.540.730.16-0.18-0.26-0.62-0.69-1.1-1.76 L=로이신A=알라닌F=페닐알라닌V=발린I=이소로이신G=글리신T=트레오닌S=세린E=글루타메이트Q=글루타민K=리신R=아르기닌L = leucine A = alanine F = phenylalanine V = valine I = isoleucine G = glycine T = threonine S = serine E = glutamate Q = glutamine K = lysine R = arginine

국제 출원 제92/01462호에서는, 소수성 잔기는 +에 의하여 표시하고, 친수성 잔기는 -로 표시하는 표기법을 사용하여 ++-++--++--+--, -++--+--++--++, +-++--++--+--++--+ 및 +-++--++--+--++--+의 서열을 갖는 펩티드를 개시한다. 개시된 특수한 펩티드에는 LKLLKKLLKKLKKLLKKL의 서열을 가진 펩티드가 포함된다. 리(Lee) 등은 Biochimica et Biophysica Acta 862 (1986) 제211-219면에서 다음의 구조를 갖는 양친매성 항미생물성 펩티드를 개시한다: Ac-(LARL)1-4-NHCH3, Ac-(LLARL)2-3-NHCH3, Ac-(ARL)3-4-NHCH3및 Ac-(LAKL)2-3-NHCH3. 이 분야의 개론적인 논평은 Biochimica et Biophysica Acta 1197 (1994) 제109-131면에 제시되어 있다.In International Application No. 92/01462, hydrophobic residues are denoted by + and hydrophilic residues are denoted by-++-++-++-+-,-++-+ -++-++, +-++-++-+-++-+ and +-++-++-+-++-+ Peptides are disclosed. Specific peptides disclosed include peptides having a sequence of LKLLKKLLKKLKKLLKKL. Lee et al. Disclose an amphiphilic antimicrobial peptide having the following structure in Biochimica et Biophysica Acta 862 (1986) pages 211-219: Ac- (LARL) 1-4 -NHCH 3 , Ac- ( LLARL) 2-3 -NHCH 3 , Ac- (ARL) 3-4 -NHCH 3 and Ac- (LAKL) 2-3 -NHCH 3 . Introductory commentary in this area is provided in Biochimica et Biophysica Acta 1197 (1994), pages 109-131.

알려져 있는 몇 개의 양친매성 펩티드의 서열에도 불구하고, 이들 펩티드가 특히 고도의 항미생물 활성을 가진 것을 동정하기는 어렵다고 입증되었다. 이론상, 각 가능한 펩티드를 힘들게 합성하여 세균, 진균(fungi) 및 다른 미생물에 대하여 시험하고, 또 주어진 적절한 길이의 수많은 가능한 아미노산 서열을 평가하여야 하는 중에 상당히 긴 시간이 소요될 것이다. 따라서, 합성에 비용이 많이 드는 분자의 생체외(in-vitro) 기능성 시험에만 기초한 규명 외의 다른 규명에 의하여 효과적일 것으로 기대되는 이들 펩티드를 동정하고 규명할 필요가 있다.Despite the sequence of several amphiphilic peptides known, it has proven difficult to identify these peptides, particularly with high antimicrobial activity. In theory, it would take quite a long time while each possible peptide would be difficult to synthesize and test for bacteria, fungi and other microorganisms, and to evaluate the numerous possible amino acid sequences of a given appropriate length. Thus, there is a need to identify and identify those peptides that are expected to be effective by other than just identification based on in-vitro functional testing of molecules that are expensive to synthesize.

발명의 간단한 설명Brief description of the invention

우리는 다음 그룹으로부터 선택된 서열들로 이루어지는 개선된 양친매성 항미생물성 펩티드가 제조될 수 있음을 확인하였다:We have found that improved amphipathic antimicrobial peptides can be prepared consisting of sequences selected from the following groups:

+-++--++--+--++,+-++-++-+-++,

+-++--++---+--++,+-++-++ --- +-++,

++-+++-++-+++--,++-+++-++-+++-,

++-+++-++-++++-++--,++-+++-++-++++-++-,

++-+++-++--++--++-,++-+++-++-++-++-,

--++--++-++--++-++,-++-++-++-++-++,

++++-+++--+--++,++++-+++-+-++,

++-+++++++-++-++--,++-+++++++-++-++-,

++--++--++-++--++-++,++-++-++-++-++-++,

++--++-++--++-++,++-++-++-++-++,

++--+--++--++-++,++-+-++-++-++,

-++---++-++--++-++, 및-++ --- ++-++-++-++, and

++--++--+--++--++-++.++-++-+-++-++-++.

이 중, +는 소수성 아미노산 잔기를 표시하며, -는 친수성 아미노산 잔기를 표시한다.Of these, + represents hydrophobic amino acid residues, and-represents hydrophilic amino acid residues.

특히, 우리는 다음 서열을 갖는 펩티드에서 유용성을 발견하였다.In particular, we found utility in peptides having the following sequence:

(MB_00) 서열 번호 1 LKLLKKLLKKLKKLL,(MB_00) SEQ ID NO: 1 LKLLKKLLKKLKKLL,

(MB_18) 서열 번호 2 LKALKKLAKKKLKKLA,(MB_18) SEQ ID NO: 2 LKALKKLAKKKLKKLA,

(MB_21) 서열 번호 3 FASLLGKALKALAKQ,(MB_21) SEQ ID NO: 3 FASLLGKALKALAKQ,

(MB_36) 서열 번호 4 FASLLGKALKALLAKLAKQ,(MB_36) SEQ ID NO: 4 FASLLGKALKALLAKLAKQ,

(MB_37) 서열 번호 5 FASLLGKLAKKLAKKALK,(MB_37) SEQ ID NO: 5 FASLLGKLAKKLAKKALK,

(MB_47) 서열 번호 6 QKAASRLLRALSKLLEAF,(MB_47) SEQ ID NO: 6 QKAASRLLRALSKLLEAF,

(CM_1) 서열 번호 7 LALLKVLLRKIKKAL,(CM_1) SEQ ID NO: 7 LALLKVLLRKIKKAL,

(CM_3) 서열 번호 8 ALKAALLAILKIVRVIKK,(CM_3) SEQ ID NO: 8 ALKAALLAILKIVRVIKK,

(MC_03) 서열 번호 9 AASKAAKTLAKLLSSLLKLL,(MC_03) SEQ ID NO: 9 AASKAAKTLAKLLSSLLKLL,

(MC_04) 서열 번호 10 LLKKLLRAASKALSLL,(MC_04) SEQ ID NO: 10 LLKKLLRAASKALSLL,

(MC_05) 서열 번호 11 AAKKLSKLLKTLLKLL,(MC_05) SEQ ID NO: 11 AAKKLSKLLKTLLKLL,

(MC_08) 서열 번호 12 KALKKKLLKLASSKKTAL,(MC_08) SEQ ID NO: 12 KALKKKLLKLASSKKTAL,

(MC_10) 서열 번호 13 AASKALRTASRLARSLLTLL.(MC_10) SEQ ID NO: 13 AASKALRTASRLARSLLTLL.

상기 서열 중, L=로이신, A=알라닌, F=페닐알라닌, V=발린, I=이소로이신, G=글리신, K=리신, S=세린, E=글루타메이트, Q=글루타민, T=트레오닌 및 R=아르기닌이다.Among the above sequences, L = leucine, A = alanine, F = phenylalanine, V = valine, I = isoleucine, G = glycine, K = lysine, S = serine, E = glutamate, Q = glutamine, T = threonine and R Arginine.

우리는 또한, 전하, 친수성/지방친화성 균형, 소수성 모멘트 및 펩티드의 양친매성에 해당하는 차원들에 대한 벡터 분석을 통하여 효과적인 항미생물성 펩티드와 효과적이지 않은 펩티드가 식별된다는 것과, 이로써 효과적인 펩티드는 양친매성 차원의 반시계 방향과 전하 차원의 시계 방향인 영역에 놓이게 됨을 확정하였다.We also found that effective antimicrobial and ineffective peptides were identified through vector analysis of the dimensions corresponding to charge, hydrophilic / lipophilic balance, hydrophobic moment, and amphiphilicity of the peptides, whereby It is determined that the film is placed in the counterclockwise direction of the amphipathic dimension and the clockwise direction of the charge dimension.

나아가서, 우리는 펩티드의 특정 물리적 성질을 특정 미생물에 대한 그의 생물학적 활성과 관련짓는 등식에 의하여 효과적인 펩티드와 효과적이지 않은 펩티드가 식별됨을 결정하였다.Furthermore, we determined that by identifying the peptides that correlate specific physical properties with their biological activity against a particular microorganism, effective and ineffective peptides are identified.

상기에 논의된 바와 같이, 매우 많은 수의 가능한 펩티드가 10-30 아미노산의 사슬 길이를 가질 수 있는 것으로 평가될 것이다. 우리는 효과적인 항미생물 특성을 갖는 펩티드에 관한 일반적인 법칙이 무엇인지를 결정하였고, 하기에서 더 상세히 논의되는 바와 같이, 이 법칙을 만족하는 펩티드와 효과적인 항미생물성을 갖는 펩티드 사이에 강한 상관관계가 나타난다는 것을 밝혔다. 역으로, 이 법칙의 범위 밖의 성질을 보이는 펩티드의 다수는 효과적인 항미생물성을 나타내지 않는 것으로 보인다.As discussed above, it will be appreciated that a very large number of possible peptides can have a chain length of 10-30 amino acids. We have determined what the general rule for peptides with effective antimicrobial properties is, and as discussed in more detail below, there is a strong correlation between peptides that meet this law and peptides with effective antimicrobial properties. Said. Conversely, many of the peptides exhibiting properties outside the scope of this law do not appear to exhibit effective antimicrobial properties.

따라서, 본 발명은 S. 아우레우스 ATCC 6538에 대한 예측 로그살균값 (LS aureus)이 5보다 크고, LS aureus가 등식 LS aureus= y[25] * (4.8362068) + (3.5316215)에 의하여 주어지는 10-30 개 아미노산 잔기의 길이를 갖는 항미생물성 펩티드에까지 확장된다.Thus, the present invention provides that the predicted log sterilization value (L S aureus ) for S. aureus ATCC 6538 is greater than 5, and L S aureus is equal to the equation L S aureus = y [25] * (4.8362068) + (3.5316215). Extended to antimicrobial peptides having a length of 10-30 amino acid residues.

상기 식 중,In the above formula,

상기 식 중,In the above formula,

z1= 소수성 및 친수성 값의 합계z 1 = sum of hydrophobic and hydrophilic values

z2= 전하 쌍극자의 Y 성분z 2 = Y component of the charge dipole

z3= 음전하의 합계z 3 = sum of negative charges

z4= 사인 곡선에 적합한 근사값z 4 = Approximate value for sine curve

z5= 전하 쌍극자의 X 성분z 5 = X component of the charge dipole

z6= 제곱 곡선에 적합한 근사값z 6 = Approximate fit to square curve

본 발명은 E. 콜라이 ATCC 11229에 대한 예측 로그 살균값 (LE coli)이 4보다 크고, LE coli가 등식 LE coli= y[27] * (4.41875) + (3.615)에 의하여 주어지는 10-30 개 아미노산 잔기의 길이를 갖는 항미생물성 펩티드에까지 확장된다.The present invention provides a logarithmic sterilization value (L E coli ) for E. coli ATCC 11229 that is greater than 4, and that L E coli is given by the equation L E coli = y [27] * (4.41875) + (3.615). Extends to antimicrobial peptides having a length of 30 amino acid residues.

상기 식 중,In the above formula,

z0은 LS aureus,z 0 is L S aureus ,

z1은 분자량,z 1 is the molecular weight,

z2는 Z-평면에서 소수성 쌍극자 모멘트의 계수(modulus),z 2 is the modulus of the hydrophobic dipole moment in the Z-plane,

z3은 소수성 용매 접근가능한 표면,z 3 is a hydrophobic solvent accessible surface,

z4는 알파 나선 축으로부터 8 Å 단위보다 큰 원자의 수,z 4 is the number of atoms greater than 8 μs from the alpha helix axis,

z5는 선회(gyration)의 2D 직경 (Rxy)z 5 is the 2D diameter (R xy ) of the gyration

상기 언급한 등식이 복잡한 것 같지만, 이것은 임의의 특정한 펩티드가 법칙의 범위에 속하는지 여부를 결정하기 위한 단순한 컴퓨터 작업이다. 등식은 소위 신경망의 등식이며, 일반적인 유형은 이 분야에 종사하는 당업자에게 잘 알려져 있다.Although the equations mentioned above seem complicated, this is a simple computer task to determine whether any particular peptide is within the scope of the law. Equations are the so-called equations of neural networks, and the general type is well known to those skilled in the art.

하기에서 상세히 논의되고 실시예에 의하여 입증되는 바와 같이, 주어진 법칙으로 이 법칙을 따르고 결국 중요한 항미생물성을 나타낼 것으로 기대되는 서열을 찾는 것이 가능하다. 그리하여 잠재적 항미생물성으로 동정된 펩티드의 합성은 측정된 항미생물성에 기초한 펩티드의 합성 및 바람직한 분자의 선정보다 상당히 단순한 작업이다.As discussed in detail below and demonstrated by the examples, it is possible to find sequences that are expected to follow this law with a given law and eventually exhibit significant antimicrobial properties. Thus, the synthesis of peptides identified as potentially antimicrobial is a considerably simpler task than the synthesis of peptides based on the measured antimicrobial and selection of preferred molecules.

본 발명은 양친매성 펩티드(amphiphilic peptide) 및 그의 유사체에 관한 것이다.The present invention relates to amphiphilic peptides and analogs thereof.

본 명세서에서는 다음의 용어가 사용된다.In the present specification, the following terms are used.

분자량이란 달톤(g/몰)으로 표시한 펩티드의 분자량이다Molecular weight is the molecular weight of the peptide expressed in daltons (g / mol).

소수성 용매 접근가능한 표면(Å의 제곱)은 SYBYL [TM] 분자 모형 패키지(예. TRISPOS [TM])를 사용하여 결정한다. 친수성 용매 접근가능한 표면(Å의 제곱)은 SYBYL [TM] 분자 모형화 패키지(예. TRISPOS [TM])를 사용하여 결정한다.Hydrophobic solvent accessible surfaces (square of K) are determined using the SYBYL [TM] molecular model package (eg TRISPOS [TM]). Hydrophilic solvent accessible surface (square of power) is determined using SYBYL [TM] molecular modeling package (eg TRISPOS [TM]).

전하 쌍극자의 X- 및 Y- 성분은, z-축은 분자의 장축 즉, 알파-나선의 축을 따르고 y 축은 벡터 p의 z-축에 직각인 평면 내로 투사되어 정렬되도록, 분자를 정렬한 후 SYBYL로부터 얻어질 수 있다.The X- and Y-components of the charge dipole are from SYBYL after aligning the molecules such that the z-axis is along the long axis of the molecule, i.e., the axis of the helix, and the y axis is projected and aligned into a plane perpendicular to the z-axis of the vector p. Can be obtained.

상기에서, P = HiCi의 소수성 잔기들의 합이고, 여기에서In the above, P = H i C i is the sum of the hydrophobic residues, where

Ci= 각 잔기의 알파-탄소의 무게 중심이고,C i = center of gravity of the alpha-carbon of each residue,

Hi= 아이젠버그에 따른 잔기의 소수성이다.H i = hydrophobicity of the residue according to Eisenberg.

음전하의 합계란 pH 7.0에서 잔기 상의 음전하의 합계이다.The sum of negative charges is the sum of the negative charges on the residues at pH 7.0.

XY-평면의 소수성 쌍극자 모멘트는 벡터 H+-H-의 합이다. 여기에서,Hydrophobic dipole moment is a vector in the XY- plane H + -H - the sum of. From here,

H+= HiCi XY의 소수성 잔기들의 합이고,H + = sum of hydrophobic residues of H i C i XY ,

H-= HiCi XY의 친수성 잔기들의 합이다.H - is the sum of the hydrophilic moiety of the i = H C i XY.

소수성 및 친수성 값의 합계는 아이젠버그(씨트. 울트라(cit. ultra))에 따른 소수성 및 친수성 값의 합계이다.The sum of the hydrophobic and hydrophilic values is the sum of the hydrophobic and hydrophilic values according to Eisenberg (cit. Ultra).

Z-평면에서의 소수성 쌍극자 모멘트의 계수. 이 소수성 쌍극자 모멘트 Hz는 다음 식에 의하여 주어진다.Coefficient of hydrophobic dipole moment in the Z-plane. This hydrophobic dipole moment H z is given by the following equation.

Hz= Hz +- Hz - H z = H z + - H z -

상기 식 중, Hz +는 전체 소수성 아미노산 중에서 (Hi* Zi)의 합이고, Hz -는 전체 친수성 아미노산 중에서 (-Hi* Zi)의 합이며, Hi는 아미노산 i의 아이젠버그(씨트. 울트라) 소수성이고, Zi는 아미노산 i의 C-알파 탄소 원자의 z 좌표값이며, Å의 단위로 표시되며 좌표는 상기 기술된 바와 같이 즉, Z-축이 분자의 장축쪽이 되도록 분자를 정렬한 좌표계를 사용한다.In the above formula, H z + is the sum of (H i * Z i ) among all hydrophobic amino acids, H z is the sum of (-H i * Z i ) among all hydrophilic amino acids, and H i is the eigen of amino acid i Is bug (c. Ultra) hydrophobic, Z i is the z-coordinate of the C-alpha carbon atom of amino acid i, expressed in units of 되며 and the coordinates are described above, i.e. the Z-axis is the long axis side of the molecule. Use a coordinate system in which the molecules are aligned as much as possible.

알파 나선의 축으로부터 8Å 단위 이상인 수많은 원자를 SYBYL로부터 얻을 수 있으며, 이것은 간단한 수이다.Numerous atoms from SYBYL can be obtained from SYBYL that are at least 8 ms from the axis of the alpha helix.

사인 곡선에 적합한 근사값 Ssin은 다음의 최소의 제곱 등식에 의하여 주어진다.The approximation S sin, which is suitable for a sine curve, is given by the following least squares equation:

Ssin= Minθi N[Hi- sin(100i-θ)]2}/NS sin = Min θi N [H i -sin (100i-θ)] 2 } / N

상기 식 중, N은 펩티드의 수이고, Ssin은 출발값 θ를 변화시킴으로써 얻어질 수 있는 최소값이며, 여기에서 Hi는 잔기에 대한 소수성의 가장 큰 양의 값 및 가장 큰 음의 값이 각각 1 및 -1로 설정되도록 표준화시킨 경우에서의 값이다.Wherein N is the number of peptides and S sin is the minimum value that can be obtained by changing the starting value θ, where H i is the largest positive value and the largest negative value of the hydrophobicity for the residue, respectively This is the value when normalized to be set to 1 and -1.

제곱 곡선에 적합한 근사값 Ssqr은 다음의 최소의 제곱 등식에 의하여 주어진다.An approximation S sqr that fits the square curve is given by the following least squares equation:

Ssqr= Minθi N{0.5 * [sign(Hi)- sign(sin(100i-θ))]2}}S sqr = Min θi N {0.5 * [sign (H i )-sign (sin (100i-θ))] 2 }}

상기 식 중, N은 아미노산 잔기의 수이고, Hi는 예를 들어 Ssqr이 출발값 θ를 변화시킴으로써 얻어질 수 있는 최소값인 소수성 값이다.Wherein N is the number of amino acid residues and H i is a hydrophobic value, for example S sqr is the minimum value that can be obtained by changing the starting value θ.

선회(gyration) 직경(Rxyz)은 분자의 구(sphericalness)의 알려진 측정치이다. 선회의 2D 직경(Rxy)은 알파 나선 축을 내려다 보았을 때 펩티드가 얼마나 원형으로 보이는지에 관한 것이다.The gyration diameter (R xyz ) is a known measure of the sphericalness of the molecule. The 2D diameter of the pivot (R xy ) relates to how circular the peptide looks when looking down the alpha helix axis.

Rxy 2= Σi N[Xi 2+ Yi 2])/N)R xy 2 = Σ i N [X i 2 + Y i 2 ]) / N)

상기 식 중, Xi 및 Yi는 원자 I의 좌표이다. N은 펩티드 내 원자의 수이다. 이 값은 E. 콜라이 균의 외막을 통한 분자의 확산의 용이함에 관련된 것으로 여겨진다.In the formula, Xi And YiIs the coordinate of atom I. N is the number of atoms in the peptide. This value is believed to be related to the ease of diffusion of molecules through the outer membrane of E. coli.

사용된 소프트웨어는 SYBYL 6.2판(실리콘 그래픽스 [TM] 파우어 첼린지 [TM] 상에서 실행되는 R400판)이었다. 펩티드는 생중합체 모듈을 사용하여 조립하였고, 알파 나선 형상의 개개의 펩티드는 BIOPOLYMER BUILD M1SEQUENCE ALPHA_HELIX라는 명령어를 사용하여 조립하였다. 이어서, BIOPOLYMER ADDH M1(*) ESSENTIAL_ONLY라는 명령어를 사용하여 수소 원자를 첨가하였다. 펩티드는 이어서, 앞서 구체화된 바와 같이 방향을 준 후, 다음의 명령어를 사용하여 단백질 구조를 다듬었다.The software used was version SYBYL 6.2 (R400 running on Silicon Graphics [TM] Powder Challenge [TM]). Peptides were assembled using a biopolymer module, and individual peptides in alpha helix shape were assembled using the command BIOPOLYMER BUILD M1SEQUENCE ALPHA_HELIX. Subsequently, hydrogen atoms were added using the command BIOPOLYMER ADDH M1 ( * ) ESSENTIAL_ONLY. The peptide was then oriented as specified above, and then the protein structure was refined using the following command.

BIOPOLYMER ADD_SIDECHAINS M1(*)BIOPOLYMER ADD_SIDECHAINS M1 ( * )

BIOPOLYMER FIX_AND_GROUPS M1 NEUTRALBIOPOLYMER FIX_AND_GROUPS M1 NEUTRAL

BIOPOLYMER ADDH M1(*) ALLBIOPOLYMER ADDH M1 ( * ) ALL

전하는 가스타이거-후켈(Gasteiger-Huckel) 방법을 사용하여 계산하였다. 상기에 언급한 모든 계산은 컴퓨터 기술을 사용하여 자동화될 수 있다.The charge was calculated using the Gastiger-Huckel method. All of the calculations mentioned above can be automated using computer technology.

사용된 포스필드(forcefield)는 엠. 클락(M. Clark), 알.디.크레이머(R. D. Cramer) 3세 및 엔. 반 옵덴보쉬(N. van Opdenbosch)[J. Comp. Chem, Vol 10, p982-1012 (1989)]에 의하여 보고되고, Sybyl 이론 안내서의 부록 2에 기술된 바와 같이 SYBYL 6.0 발매를 위하여 수정된 트리포스 5.2 포스필드였다.The forcefield used is M. M. Clark, R. D. Cramer, III and N. N. van Opdenbosch [J. Comp. Chem, Vol 10, p982-1012 (1989), and Triforce 5.2 Forcefield modified for the release of SYBYL 6.0 as described in Appendix 2 of the Sybyl Theory Guide.

상기로부터, 본 발명에 따른 펩티드를 정의하는데 사용된 변수들은 주어진 펩티드 구조에서 간단히 결정될 수 있고 펩티드의 실제 물리적 변수를 측정하는 것은 전혀 불필요함을 알 수 있다. 이 과정은 컴퓨터에 의하여 수행될 수 있다. 10-30 아미노산을 갖는 한정된 수의 펩티드 분자가 있다고 주어진 경우, 이들 펩티드 각각의 서열 및 변수를 결정하고 이어서 펩티드가 상기 요구되는 값 이상으로 E. 콜라이 또는 S. 아우레우스에 대한 예측 로그살균값을 갖는지 여부를 결정하는 것은 컴퓨터에 의한 단순한 작업이다.From the above, it can be seen that the variables used to define the peptides according to the invention can simply be determined in a given peptide structure and it is not necessary to measure the actual physical parameters of the peptides at all. This process can be performed by a computer. Given that there are a limited number of peptide molecules with 10-30 amino acids, the sequence and parameters of each of these peptides are determined and then the predicted log sterilization value for E. coli or S. aureus above that required for the peptide. Determining whether or not there is a simple task by the computer.

상기에 언급한 펩티드는 양친매성 항미생물성 펩티드로서 특히 적합한 몇가지 부가적인 특징을 갖는다.The aforementioned peptides have some additional features that are particularly suitable as amphiphilic antimicrobial peptides.

D-아미노산의 나선이 효과적일 것으로 생각되지만, 펩티드는 일반적으로 L-배열이다.While helixes of D-amino acids are believed to be effective, peptides are generally L-configuration.

본 발명에 따른 펩티드는, 그의 한 면은 친수성이 우세하고 다른 면은 소수성이 우세한 두 개의 뚜렷한 면을 가진다는 점에서 그의 2차 구조가 우세하게 알파-나선형이고 측면 방향으로 양친매성이다.The peptides according to the invention are predominantly alpha-helical and amphiphilic in their secondary structure in that one side has two distinct aspects that are predominantly hydrophilic and the other is hydrophobic.

펩티드는 12-26개, 바람직하게 13-20개, 가장 바람직하게는 15-18개의 아미노산 잔기를 가지며 비교적 짧다. 이들 비교적 짧은 사슬 길이는 혈낭종 독성(haematotoxicity)의 위험을 감소시키는 것으로 여겨진다.The peptide is relatively short with 12-26, preferably 13-20, most preferably 15-18 amino acid residues. These relatively short chain lengths are believed to reduce the risk of hematopoietic toxicity.

바람직하게, 펩티드에는 염기성 아미노산, 특히 리신 및 아르기닌이 풍부하다. 바람직한 태양에서, 존재하는 아미노산 잔기 수의 15-50%는 리신 또는 아르기닌이다.Preferably, the peptide is rich in basic amino acids, in particular lysine and arginine. In a preferred embodiment, 15-50% of the number of amino acid residues present is lysine or arginine.

바람직하게, 펩티드는 소위 베타-회전 형성자, 특히 이소-로이신, 티로신 및 발린이 부족하다. 발명의 바람직한 태양에서, 존재하는 아미노산 잔기 수의 20% 미만이 이소-로이신, 티로신 또는 발린이다.Preferably, the peptide lacks so-called beta-rotating formers, in particular iso-leucine, tyrosine and valine. In a preferred embodiment of the invention, less than 20% of the number of amino acid residues present are iso-leucine, tyrosine or valine.

이소-로이신, 티로신 또는 발린 잔기 수에 대한 리신 또는 아르기닌 잔기 수의 수치 비율은 1이상인 것이 바람직하다.The numerical ratio of the number of lysine or arginine residues to the number of iso-leucine, tyrosine or valine residues is preferably at least one.

바람직하게, 펩티드는 알파-나선 형성자, 특히 리신, 알라닌 및 글루타민이 풍부하다. 아미노산 잔기 수의 50% 이상이 리신, 알라닌 또는 글루타민인 것이 바람직하다.Preferably, the peptide is rich in alpha-helix formers, in particular lysine, alanine and glutamine. It is preferred that at least 50% of the number of amino acid residues is lysine, alanine or glutamine.

바람직하게, 전체의 전하의 순량은 양이어서, 분자는 pH 7.00에서 양이온이다.Preferably, the net amount of charge in total is positive so that the molecule is a cation at pH 7.00.

바람직하게, 시스타인, 프롤린 및 히스티딘과 같은 특수한 아미노산들은 우세하지 않다. 발명의 태양에서, 이들 아미노산은 전형적으로 존재하지 않는다.Preferably, special amino acids such as cysteine, proline and histidine are not predominant. In an aspect of the invention, these amino acids are typically absent.

바람직하게, 펩티드는 0.15 내지 -0.34의 양친매성을 갖는다. N개 잔기를 가진 펩티드에 대한 양친매성은 1-N으로부터의 Hn(소수성 면)의 합계에서 1-N으로부터의 Hn(친수성 면)의 합계를 뺀 것으로서 얻는다: 여기에서 Hn는 아이젠버그에 의하여 주어진 바와 같은 n번째 잔기의 수적인 소수성이다.Preferably, the peptide has an amphipathy of 0.15 to -0.34. Amphiphilicity for a peptide with N residues is obtained by subtracting the sum of H n (hydrophilic side) from 1-N from the sum of H n (hydrophobic side) from 1-N: where H n is Eisenberg Is the hydrophobicity of the nth residue as given by.

바람직하게, 펩티드는 0.25 내지 0.5의 소수성 모멘트를 갖는다. 소수성 모멘트는 총 잔기 수로 나눈 개개 잔기의 소수성 모멘트의 벡터 합으로부터 유래된 스칼라량이다. N개 잔기를 가진 펩티드에 대한 소수성 모멘트는 다음 식에 의하여 얻는다.Preferably, the peptide has a hydrophobic moment of 0.25 to 0.5. The hydrophobic moment is the scalar amount derived from the vector sum of the hydrophobic moments of the individual residues divided by the total number of residues. The hydrophobic moment for the peptide having N residues is obtained by the following formula.

(1/N){[ΣN i=1Hi.sin(δi)]2+ [ΣN i=1Hi.cos(δi)]2}1/2 (1 / N) {[Σ N i = 1 H i .sin (δ i )] 2 + [Σ N i = 1 H i .cos (δ i )] 2 } 1/2

상기 식 중, N은 잔기 수이고, Hi는 i번째 잔기의 소수성이고 δi는 연속되는 잔기의 단위 벡터들 사이의 각, 즉 100도이다.Wherein N is the number of residues, H i is the hydrophobicity of the i th residue and δ i is the angle between the unit vectors of consecutive residues, ie 100 degrees.

바람직하게, 펩티드는 아미노산 13-20의 길이인 Ls5 및 Le5 둘다를 갖고, 로이신, 알라닌, 페닐알라닌, 발린, 이소로이신, 글리신, 세린, 글루타민, 글루타메이트 및 아르기닌 중에 적어도 세 개의 잔기로 구성된다. 더욱 바람직하게는 상기에 열거한 것 외의 기타 아미노산은 존재하지 않는다. 가장 바람직한 아미노산은 S. 아우레우스 (Ls는 약 5 이상이다) 및 E. 콜라이(Le는 약 4 이상이다) 둘다에 대하여 높은 활성을 보이는 것들이며, 이들은 다음의 하나로 구성되는 서열을 갖는다.Preferably, the peptide has both L s 5 and L e 5 in length of amino acids 13-20 and consists of at least three residues of leucine, alanine, phenylalanine, valine, isoleucine, glycine, serine, glutamine, glutamate and arginine do. More preferably, no other amino acids other than those listed above are present. Most preferred amino acids are those which show high activity against both S. aureus (L s is at least about 5) and E. coli (L e is at least about 4), which have a sequence consisting of .

(MB_00) 서열 번호 1 LKLLKKLLKKLKKLL,(MB_00) SEQ ID NO: 1 LKLLKKLLKKLKKLL,

(MB_18) 서열 번호 2 LKALKKLAKKKLKKLA,(MB_18) SEQ ID NO: 2 LKALKKLAKKKLKKLA,

(MB_21) 서열 번호 3 FASLLGKALKALAKQ,(MB_21) SEQ ID NO: 3 FASLLGKALKALAKQ,

(MB_36) 서열 번호 4 FASLLGKALKALLAKLAKQ,(MB_36) SEQ ID NO: 4 FASLLGKALKALLAKLAKQ,

(MB_37) 서열 번호 5 FASLLGKLAKKLAKKALK,(MB_37) SEQ ID NO: 5 FASLLGKLAKKLAKKALK,

(CM_1) 서열 번호 7 LALLKVLLRKIKKAL,(CM_1) SEQ ID NO: 7 LALLKVLLRKIKKAL,

(CM_3) 서열 번호 8 ALKAALLAILKIVRVIKK.(CM_3) SEQ ID NO: 8 ALKAALLAILKIVRVIKK.

상기에서 L=로이신, A=알라닌, F=페닐알라닌, V=발린, I=이소로이신, G=글리신, K=리신, S=세린, E=글루타메이트, Q=글루타민 및 R=아르기닌이다.Where L = leucine, A = alanine, F = phenylalanine, V = valine, I = isoleucine, G = glycine, K = lysine, S = serine, E = glutamate, Q = glutamine and R = arginine.

바람직하게 펩티드는 3-5 아미노산 잔기로 구성된 올리고머의 동종중합체가 아니다.Preferably the peptide is not a homopolymer of an oligomer consisting of 3-5 amino acid residues.

본 발명은 또한 본 발명의 하나 이상의 펩티드로 구성된 물질의 조성물 및 단독으로 또는 다른 항미생물성 물질 및 처리(열 또는 압력을 가하는 것을 포함한다)와 복합되는 항미생물성(바람직하게는 항균성 또는 항진균성) 조성물로서의 그의 용도에 관한 것이다. 전술한 조성물들은 멸균, 부패 방지, 보존 및 기타 위생 공정에서의 유용성이 밝혀져 있다. 본 발명의 펩티드가 세균이나 진균의 살균이 필요한 많은 상황에서 적용될 것이라는 것은 숙련된 연구자에게 명백할 것이다.The invention also provides antimicrobial (preferably antimicrobial or antifungal) compositions of matter comprising one or more peptides of the invention and in combination with other antimicrobial materials and treatments (including applying heat or pressure). ) And its use as a composition. The aforementioned compositions have found utility in sterilization, anti-corruption, preservation and other sanitary processes. It will be apparent to the skilled investigator that the peptides of the present invention will be applied in many situations that require the sterilization of bacteria or fungi.

본 발명의 또 다른 측면에 따라, 청구범위 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 따른 펩티드로 이루어진 조성물로 표면을 처리하는 단계로 이루어진 표면 멸균을 위한 방법이 있다.According to another aspect of the invention, there is a method for surface sterilization, comprising the step of treating a surface with a composition consisting of a peptide according to any one of claims 1-4.

본 출원에 개시된 펩티드는 메리필드(Merifield)의 단계적인 방법에 의하여 생체외에서 합성되었지만, 펩티드의 합성을 지시할 수 있는 핵산 분자를 사용하여 생체내에서 합성에 의하여 펩티드를 생성할 수 있다고 생각된다. 본 출원에 개시된 펩티드를 암호화하는 DNA 분자를 생산하고, 세포가 대사 생성물로서 펩티드 또는 그의 전구체를 생산할 수 있도록 상기 DNA 분자를 세포 내로 도입하는 것은 당분야의 범위 내이다.While the peptides disclosed in this application have been synthesized ex vivo by Merifield's stepwise method, it is contemplated that the peptides can be produced in vivo by using nucleic acid molecules capable of directing the synthesis of the peptides. It is within the scope of the art to produce DNA molecules encoding peptides disclosed herein and to introduce such DNA molecules into cells such that the cells can produce peptides or precursors thereof as metabolic products.

본 발명이 더 잘 이해될 수 있도록, 이하에서는 함께 제출되는 도면에 관하여 기술하겠다.BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS In order that the present invention may be better understood, the following description will be made with reference to the accompanying drawings.

도 1: 펩티드의 총 전하, 친수성/지방친화성 균형(HLB), 소수성 모멘트(상기에 기술된 바와 같다) 및 양친매성(상기 기술된 바와 같다)에 상응하는 차원 상에서의 SAS/RGSYS (TM) 벡터 분석 방법 (내부적 펼침)이다.1: SAS / RGSYS (TM) on dimensions corresponding to total charge, hydrophilic / lipophilic balance (HLB), hydrophobic moment (as described above) and amphipathic (as described above) of the peptide Vector analysis method (internal unfolding).

하기 표 2에 제시된 펩티드는 메리필드 고체상 합성에 의하여 제조되었다[알. 비. 메리필드(Merifield), J. Am. Chem. Soc. (1963) 85권 2149면].The peptides shown in Table 2 below were prepared by Merrifield solid phase synthesis [Al. ratio. Merifield, J. Am. Chem. Soc. (1963) Vol. 85, page 2149].

이들 펩티드의 실제의 세균 활성은 밤새 영양 브로스(옥소이드 (TM) Nr. 2)에서 배양한 그람 음성 세균(대장균(Escherichia coli) ATCC 11229) 및 그람 양성 세균(스타필로코커스 아우레우스(Staphylococcus aureus) ATCC 6538) 둘다를 사용하여 총 생균 집계 기법에 의해 결정하였다. 세포를 수확하고 링거 용액에 현탁하여 106-108의 초기 세포수를 얻었다. 세포를 96-웰 미세적정 플레이트에 무균하에서 펩티드와 함께 인큐베이트하고 관련 대조구를 두었다. 펩티드의 농도는 0.1-1㎎/㎖이었다. 세균 둘다의 경우에서(E.콜라이 및 S.아우레우스), 로그살균값을 결정하였다. 측정된 로그살균값을 하기 표 2에 나타내었다.The actual bacterial activity of these peptides was found in Gram-negative bacteria (Escherichia coli ATCC 11229) and Gram-positive bacteria (Staphylococcus aureus) cultured overnight in nutrient broth (Oxoid (TM) Nr. 2). ATCC 6538), both using a total probiotic counting technique. The cells were harvested and suspended in Ringer's solution to obtain an initial cell number of 10 6 -10 8 . Cells were incubated with peptides aseptically in 96-well microtiter plates and placed the relevant controls. The concentration of peptide was 0.1-1 mg / ml. In both bacteria (E. coli and S. aureus), log sterilization values were determined. The measured log sterilization values are shown in Table 2 below.

펩티드의 총 전하, 친수성/지방친화성 균형(HLB), 소수성 모멘트(상기에 기술된 바와 같다) 및 양친매성(상기 기술된 바와 같다)에 상응하는 차원 상에서의 SAS/RGSYS (TM) 벡터 분석 방법 (내부적 펼침)에 의하여 결과를 분석하였다. 이 분석은 어떤 다수의 펩티드가 효과적인 항미생물성일 것인를 예측하는데 이들 변수가 사용될 수 있음을 보여주었다. 결과를 도 1에 나타내었다. 도 1에서, AMP는 양친매성, EC는 E.콜라이에 대한 로그살균값, STPH는 S.아우레우스에 대한 로그살균값, HM은 소수성 모멘트, CH는 총 양전하 및 HLB는 친수성/지방친화성 균형이다.Method of SAS / RGSYS (TM) vector analysis on dimensions corresponding to total charge, hydrophilic / lipophilic balance (HLB), hydrophobic moment (as described above) and amphipathic (as described above) of peptides The results were analyzed by (internal unfold). This analysis showed that these variables could be used to predict which multiple peptides would be effective antimicrobial. The results are shown in FIG. In Figure 1, AMP is amphiphilic, EC is log sterilization value for E. coli, STPH is log sterilization value for S. aureus, HM is hydrophobic moment, CH is total positive charge and HLB is hydrophilic / fat-affinity Balance.

하기의 표 2는 열거된 펩티드에 관하여 E.콜라이 및 S.아우레우스에 대한 측정된 로그살균값(액트로서 표시) 및 예측 로그살균값(프리로서 표시) 사이의 상관관계를 보여준다. 예측값은 본 발명에 의하여 제공된 등식으로 결정되었다. 예측값과 측정값이 매우 양호하게 일치되는 것을 볼 수 있다. S.아우레우스에 대하여 5 이상의 예측 로그살균값 또는 E.콜라이에 대하여 4 이상의 로그살균값을 보이는 펩티드는 본 발명의 실시예이고, 다른 실시예들은 비교되는 것이며, 구조상의 비교적 작은 변화가 분자의 항미생물 활성에 관하여 중대한 결과를 가질 수 있음을 보여준다.Table 2 below shows the correlation between measured log sterilization values (expressed as acts) and predicted log sterilization values (expressed as frees) for E. coli and S. aureus for the listed peptides. The predicted value was determined by the equation provided by the present invention. It can be seen that the predicted and measured values agree very well. Peptides with a predictive log sterilization value of at least 5 for S. aureus or at least 4 log sterilization values for E. coli are examples of the invention, other examples are compared, and relatively small changes in the structure Can have significant consequences for antimicrobial activity.

코드 MB_nn (서열 번호 )에 의하여 동정된 샘플은 본 발명에 의하여 제공된 예측 등식을 참조하지 않고 가능한 항미생물성으로 동정된 펩티드였다. 코드 MC_nn (서열 번호 )에 의하여 동정된 샘플은 그의 서열이 높은 예측 활성을 보인 펩티드였다. 이들 분자를 메리필드 고체상 합성 방법을 사용하여 합성하였고, S.아우레우스에 대한 분자의 실제 활성을 결정하였다. 이들 분자의 예측값과 측정값 사이에 양호한 상관관계가 있음을 볼 수 있다. 컴퓨터-보조 방법을 사용하여 실시예 중 CM-n (서열 번호 ) 시리즈의 서열에 도달하였다. 이들 중에 예측된 항미생물 활성 및 기대된 항미생물 활성 사이에 또한 높은 상관관계가 있음을 볼 수 있다.Samples identified by the code MB_nn (SEQ ID NO) were peptides identified as antimicrobial as possible without reference to the predictive equation provided by the present invention. The sample identified by the code MC_nn (SEQ ID NO:) was a peptide whose sequence showed high predictive activity. These molecules were synthesized using the Merrifield solid phase synthesis method and the actual activity of the molecules against S. aureus was determined. It can be seen that there is a good correlation between the predicted and measured values of these molecules. Computer-assisted methods were used to reach the sequences of the CM-n (SEQ ID NO) series in the Examples. It can be seen among these that there is also a high correlation between the antimicrobial activity expected and the antimicrobial activity expected.

발명의 명칭: 양친매성 펩티드 및 그의 유사체Name of Invention: Amphiphilic Peptides and Analogs thereof

서열의 수: 13Number of sequences: 13

서열 번호에 대한 정보 No. 1Information about sequence number One

서열 특징:Sequence feature:

길이: 15 아미노산Length: 15 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 1Sequence Description: SEQ ID NO: One

서열 번호에 대한 정보 No. 2Information about sequence number 2

서열 특징:Sequence feature:

길이: 16 아미노산Length: 16 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 2Sequence Description: SEQ ID NO: 2

서열 번호에 대한 정보 No. 3Information about sequence number 3

서열 특징:Sequence feature:

길이: 15 아미노산Length: 15 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 3Sequence Description: SEQ ID NO: 3

서열 번호에 대한 정보 No. 4Information about sequence number 4

서열 특징:Sequence feature:

길이: 19 아미노산Length: 19 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 4Sequence Description: SEQ ID NO: 4

서열 번호에 대한 정보 No. 5Information about sequence number 5

서열 특징:Sequence feature:

길이: 18 아미노산Length: 18 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 5Sequence Description: SEQ ID NO: 5

서열 번호에 대한 정보 No. 6Information about sequence number 6

서열 특징:Sequence feature:

길이: 18 아미노산Length: 18 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 6Sequence Description: SEQ ID NO: 6

서열 번호에 대한 정보 No. 7Information about sequence number 7

서열 특징:Sequence feature:

길이: 15 아미노산Length: 15 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 7Sequence Description: SEQ ID NO: 7

서열 번호에 대한 정보 No. 8Information about sequence number 8

서열 특징:Sequence feature:

길이: 18 아미노산Length: 18 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 8Sequence Description: SEQ ID NO: 8

서열 번호에 대한 정보 No. 9Information about sequence number 9

서열 특징:Sequence feature:

길이: 20 아미노산Length: 20 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 9Sequence Description: SEQ ID NO: 9

서열 번호에 대한 정보 No. 10Information about sequence number 10

서열 특징:Sequence feature:

길이: 16 아미노산Length: 16 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 10Sequence Description: SEQ ID NO: 10

서열 번호에 대한 정보 No. 11Information about sequence number 11

서열 특징:Sequence feature:

길이: 16 아미노산Length: 16 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 11Sequence Description: SEQ ID NO: 11

서열 번호에 대한 정보 No. 12Information about sequence number 12

서열 특징:Sequence feature:

길이: 18 아미노산Length: 18 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 12Sequence Description: SEQ ID NO: 12

서열 번호에 대한 정보 No. 13Information about sequence number 13

서열 특징:Sequence feature:

길이: 20 아미노산Length: 20 amino acids

유형: 아미노산Type: Amino Acid

형태: 선형Form: Linear

분자 유형: 단백질Molecular Type: Protein

서열 묘사: 서열 번호 No. 13Sequence Description: SEQ ID NO: 13

Claims (5)

다음의 군으로부터 선택된 서열로 이루어지는 양친매성 항미생물성 펩티드.Amphiphilic antimicrobial peptides consisting of sequences selected from the following groups. +-++--++--+--++,+-++-++-+-++, +-++--++---+--++,+-++-++ --- +-++, ++-+++-++-+++--,++-+++-++-+++-, ++-+++-++-++++-++--,++-+++-++-++++-++-, ++-+++-++--++--++-,++-+++-++-++-++-, --++--++-++--++-++,-++-++-++-++-++, ++++-+++--+--++,++++-+++-+-++, ++-+++++++-++-++--,++-+++++++-++-++-, ++--++--++-++--++-++,++-++-++-++-++-++, ++--++-++--++-++,++-++-++-++-++, ++--+--++--++-++,++-+-++-++-++, -++---++-++--++-++, 및-++ --- ++-++-++-++, and ++--++--+--++--++-++.++-++-+-++-++-++. 상기에서, +는 소수성 아미노산 잔기를 표시하고, -는 친수성 아미노산 잔기를 표시한다.In the above, + denotes a hydrophobic amino acid residue and-denotes a hydrophilic amino acid residue. 제1항에 있어서, 다음의 군으로부터 선택된 서열을 갖는 펩티드.The peptide of claim 1 having a sequence selected from the group: 서열 번호 1 LKLLKKLLKKLKKLL,SEQ ID NO: 1 LKLLKKLLKKLKKLL, 서열 번호 2 LKALKKLAKKKLKKLA,SEQ ID NO: 2 LKALKKLAKKKLKKLA, 서열 번호 3 FASLLGKALKALAKQ,SEQ ID NO: 3 FASLLGKALKALAKQ, 서열 번호 4 FASLLGKALKALLAKLAKQ,SEQ ID NO: 4 FASLLGKALKALLAKLAKQ, 서열 번호 5 FASLLGKLAKKLAKKALK,SEQ ID NO: 5 FASLLGKLAKKLAKKALK, 서열 번호 6 QKAASRLLRALSKLLEAF,SEQ ID NO: 6 QKAASRLLRALSKLLEAF, 서열 번호 7 LALLKVLLRKIKKAL,SEQ ID NO: 7 LALLKVLLRKIKKAL, 서열 번호 8 ALKAALLAILKIVRVIKK,SEQ ID NO: 8 ALKAALLAILKIVRVIKK, 서열 번호 9 AASKAAKTLAKLLSSLLKLL,SEQ ID NO: 9 AASKAAKTLAKLLSSLLKLL, 서열 번호 10 LLKKLLRAASKALSLL,SEQ ID NO: 10 LLKKLLRAASKALSLL, 서열 번호 11 AAKKLSKLLKTLLKLL,SEQ ID NO: 11 AAKKLSKLLKTLLKLL, 서열 번호 12 KALKKKLLKLASSKKTAL,SEQ ID NO: 12 KALKKKLLKLASSKKTAL, 서열 번호 13 AASKALRTASRLARSLLTLL.SEQ ID NO: 13 AASKALRTASRLARSLLTLL. 상기 서열 중, L=로이신, A=알라닌, F=페닐알라닌, V=발린, I=이소로이신, G=글리신, K=리신, S=세린, E=글루타메이트, Q=글루타민, T=트레오닌 및 R=아르기닌이다.Among the above sequences, L = leucine, A = alanine, F = phenylalanine, V = valine, I = isoleucine, G = glycine, K = lysine, S = serine, E = glutamate, Q = glutamine, T = threonine and R Arginine. S. 아우레우스 ATCC 6538에 대한 예측 로그 살균값 (LS aureus)이 5보다 크고, LS aureus를 등식 LS aureus= y[25] * (4.8362068) + (3.5316215)에 의하여 얻는, 10-30 개 아미노산 잔기의 길이를 갖는 항미생물성 펩티드.The predicted log sterilization value (L S aureus ) for S. aureus ATCC 6538 is greater than 5 and L S aureus is obtained by the equation L S aureus = y [25] * (4.8362068) + (3.5316215). Antimicrobial peptide having a length of 30 amino acid residues. 상기 식 중,In the above formula, 상기 식 중,In the above formula, z1= 소수성 및 친수성 값의 합계z 1 = sum of hydrophobic and hydrophilic values z2= 전하 쌍극자의 Y 성분z 2 = Y component of the charge dipole z3= 음전하의 합계z 3 = sum of negative charges z4= 사인 곡선에 적합한 근사값z 4 = Approximate value for sine curve z5= 전하 쌍극자의 X 성분z 5 = X component of the charge dipole z6= 제곱 곡선에 적합한 근사값z 6 = Approximate fit to square curve E. 콜라이 ATCC 11229에 대한 예측 로그 살균값 (LE coli)이 4보다 크고, LE coli를 등식 LE coli= y[27] * (4.41875) + (3.615)에 의하여 얻는, 10-30 개 아미노산 잔기의 길이를 갖는 항미생물성 펩티드.10-30, the predicted log sterilization value (L E coli ) for E. coli ATCC 11229 is greater than 4 and L E coli is obtained by the equation L E coli = y [27] * (4.41875) + (3.615) An antimicrobial peptide having a length of amino acid residues. 상기 식 중,In the above formula, z0은 LS aureus,z 0 is L S aureus , z1은 분자량,z 1 is the molecular weight, z2는 Z-평면에서 소수성 쌍극자 모멘트의 계수(modulus),z 2 is the modulus of the hydrophobic dipole moment in the Z-plane, z3은 소수성 용매 접근가능한 표면,z 3 is a hydrophobic solvent accessible surface, z4는 알파 나선 축으로부터 8 Å 단위보다 큰 원자의 수,z 4 is the number of atoms greater than 8 μs from the alpha helix axis, z5는 선회(gyration)의 2D 직경 (Rxy)z 5 is the 2D diameter (R xy ) of the gyration 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 따른 펩티드로 이루어진 조성물로 표면을 처리하는 단계를 포함하는 표면 멸균을 위한 방법.A method for surface sterilization comprising treating a surface with a composition consisting of the peptide according to any one of claims 1 to 4.
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