KR102598992B1 - Isobutanol and polyhydroxybutyrate simultaneous production strain and use thereof - Google Patents

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Abstract

본 발명은 이소부탄올(isobutanol) 및 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 동시 생산 균주 및 이의 이용에 관한 것이다.
본 발명에 따른 이소부탄올(isobutanol) 및 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 동시 생산 균주는 배양 배지와 세포 덩어리를 동시에 활용하여 경제적이고, 증가된 세포 활성 및 더 빠른 포도당 이용을 나타내고, 균주의 견고성이 향상되고, 유전자 삭제 없이 발효 중에 아세테이트 축적을 줄일 수 있고, 최종 산물을 분리하기 위한 추가 공정이 필요하지 않은 바, 이소부탄올 및 PHB의 산업 생산에 적용될 수 있다.
The present invention relates to strains that simultaneously produce isobutanol and polyhydroxybutyrate (PHB) and their use.
The strain for simultaneous production of isobutanol and polyhydroxybutyrate (PHB) according to the present invention is economical by simultaneously utilizing culture medium and cell mass, exhibits increased cell activity and faster glucose utilization, and robustness of the strain. This is improved, can reduce acetate accumulation during fermentation without gene deletion, and does not require additional processes to separate the final product, so it can be applied to the industrial production of isobutanol and PHB.

Description

이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트 동시 생산 균주 및 이의 이용{Isobutanol and polyhydroxybutyrate simultaneous production strain and use thereof}Isobutanol and polyhydroxybutyrate simultaneous production strain and use thereof {Isobutanol and polyhydroxybutyrate simultaneous production strain and use thereof}

본 발명은 이소부탄올(isobutanol) 및 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 동시 생산 균주 및 이의 이용에 관한 것이다.The present invention relates to strains that simultaneously produce isobutanol and polyhydroxybutyrate (PHB) and their use.

이소부탄올(isobutanol)은 분기 사슬 지방족 C4 알코올(branched-chain aliphatic C4 alcohol)로, 일반적으로 가솔린 혼합 원료 및 부틸 고무, 윤활제 및 폴리에스테르 합성의 전구체로 사용된다. 이 화학 물질은 에탄올보다 에너지 용량이 높고 물과의 혼화성이 낮기 때문에 가장 강력한 탄화수소 연료 중 하나로 간주되어 파이프 라인과 연료 공급 인프라에서 부식을 덜 유발한다. 합성 이소부탄올 생산 오페론은 대장균(Escherichia coli, E. coli), 사카로미세스 세레비시에(Saccharomyces cerevisiae, S. cerevisiae), 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum, C. glutamicum), 랄스토니아 유트로파(Ralstonia eutropha, R. eutropha), 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis, B. subtilis), 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida, P. putida) 및 자이모나스 모빌리스(Zymomonas mobilis, Z. mobilis) 등이 있다. Isobutanol is a branched-chain aliphatic C4 alcohol, commonly used as a gasoline blending material and as a precursor in the synthesis of butyl rubber, lubricants, and polyester. This chemical is considered one of the most potent hydrocarbon fuels because it has a higher energy capacity than ethanol and is less miscible with water, causing less corrosion in pipelines and fuel delivery infrastructure. The synthetic isobutanol production operon is Escherichia coli , E. coli , Saccharomyces cerevisiae , S. cerevisiae , Corynebacterium glutamicum , C. glutamicum , and Ralstonia. Eutropha ( Ralstonia eutropha , R. eutropha ), Bacillus subtilis ( B. subtilis ), Pseudomonas putida ( P. putida ), and Zymomonas mobilis ( Z. mobilis ), etc. There is.

그 동안 이소부탄올 생산의 미생물 공정을 최적화하기 위한 몇 가지 접근법이 시도되었다. 발효의 경우, 휘발성을 이용하여 이소부탄올을 수집하기 위해 현장 제거 접근법을 적용하였다. 세포 성장이 8g/L 이상의 알코올 농도에 의해 방해되기 때문에 E. coli에서 이소부탄올에 대한 내성을 높이기 위해 전사 및 진화 연구가 수행되었으며, 세포에서 NAD(P)H 수준 조작; 단백질 공학을 사용하여 α-케토이소발레레이트 탈탄산효소의 아미노산 잔기 변형; 셀로비오스, 단백질 폐기물 또는 아세테이트와 같은 포도당 이외의 탄소원을 활용하기 위해 여러 유전자의 발현 통합; 최적의 생산을 위한 플럭스 균형 달성; 등을 포함하여 여러 가지 대사 공학 연구가 수행되었다.Several approaches have been attempted to optimize the microbial process for isobutanol production. For fermentation, an in situ removal approach was applied to collect isobutanol using its volatility. Because cell growth is hindered by alcohol concentrations above 8 g/L, transcriptional and evolutionary studies have been performed to increase tolerance to isobutanol in E. coli , manipulating NAD(P)H levels in cells; Modifying amino acid residues of α-ketoisovalerate decarboxylase using protein engineering; Integration of expression of multiple genes to utilize carbon sources other than glucose, such as cellobiose, protein waste, or acetate; Achieving flux balance for optimal production; Several metabolic engineering studies have been performed, including:

한편, 폴리하이드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB)는 E. coliR. eutropha와 같은 다양한 종류의 미생물에서 최대 80 %의 농도로 세포 내 축적되는 탄소 저장 바이오 폴리머이다. PHB는 다른 모노머로 적절히 변형될 때 유리한 기계적, 생분해성 및 조직 적합성 특성으로 인해 임플란트 재료로 사용 및 용기 생산을 포함하여 광범위한 잠재적 응용 분야를 가지고 있다. 이러한 귀중한 특성에도 불구하고 PHB의 사용은 높은 생산 비용으로 인해 산업 수준에서 제한되었다. Meanwhile, polyhydroxybutyrate (PHB) is a carbon storage biopolymer that accumulates intracellularly at concentrations of up to 80% in various types of microorganisms such as E. coli and R. eutropha . PHB has a wide range of potential applications, including use as an implant material and container production, due to its advantageous mechanical, biodegradability and histocompatibility properties when appropriately modified with different monomers. Despite these valuable properties, the use of PHB has been limited at the industrial level due to its high production costs.

이에, 많은 연구자들은 저비용 기질을 사용한 PHB 생산에 초점을 맞추었다. 폴리머가 세포에 저장되기 때문에 경제적 균형을 달성하기 위해 추가 분리 공정없이 다른 가치있는 세포 외 화학 물질을 생산할 수 있는 가능성을 조사하기 위해 공동 생산 전략이 조사되었다. 이전 연구에서는 다른 미생물을 포함하는 발효 공정에서 PHB를 저장 생화학 물질로 사용하였을 때 공동 생산 전략에 긍정적인 영향을 미치는 것을 확인하였다(Li, T., et al. 2017. Co-production of microbial polyhydroxyalkanoates with other chemicals. Metab. Eng. 43, 29-36.). Accordingly, many researchers have focused on PHB production using low-cost substrates. Since the polymers are stored in cells, co-production strategies have been investigated to investigate the possibility of producing other valuable extracellular chemicals without additional separation processes to achieve an economic balance. In a previous study, it was confirmed that using PHB as a storage biochemical in a fermentation process involving other microorganisms had a positive effect on the co-production strategy (Li, T., et al. 2017. Co-production of microbial polyhydroxyalkanoates with other chemicals. Metab. Eng. 43, 29-36.).

그러나, 여전히 미생물에 의한 바이오연료 및 바이오폴리머 생산은 심각한 지속적인 환경 문제와 지구 온난화를 야기하는 문제점이 있다. 또한, 남은 바이오매스의 사용, 최종 산물 분리와 관련된 문제 및 생산 비용을 포함하여 바이오연료 및 바이오폴리머 생산을 위한 최적의 바이오 산업 공정을 달성하기까지는 아직까지 많은 장애물들이 남아 있다.However, biofuel and biopolymer production by microorganisms still has serious and persistent environmental problems and causes global warming. Additionally, many obstacles remain to achieve optimal bioindustrial processes for biofuel and biopolymer production, including the use of leftover biomass, problems associated with final product separation, and production costs.

이러한 배경 하에서, 본 발명자들은 대장균을 모델 유기체로 선택하고 PHB와 이소부탄올을 동시에 생산하도록 대사 공학적으로 설계한 결과, 배양 배지와 세포 덩어리를 동시에 활용하여 경제적이고, 증가된 세포 활성 및 더 빠른 포도당 이용을 나타내고, 균주의 견고성이 향상되고, 유전자 삭제 없이 발효 중에 아세테이트 축적을 줄일 수 있고, 최종 산물을 분리하기 위한 추가 공정이 필요하지 않은 균주를 개발하여, 이를 이소부탄올 및 PHB의 산업적 생산에 적용할 수 있음을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다. Against this background, the present inventors selected Escherichia coli as a model organism and metabolically engineered it to produce PHB and isobutanol simultaneously, resulting in economical, increased cell activity and faster glucose utilization by simultaneously utilizing culture medium and cell mass. By developing a strain that exhibits improved strain robustness, can reduce acetate accumulation during fermentation without gene deletion, and does not require additional processes to isolate the final product, it can be applied to the industrial production of isobutanol and PHB. The present invention was completed by confirming that it is possible.

본 발명의 목적은 이소부탄올(isobutanol) 합성 오페론, 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 합성 오페론 및 pntAB 유전자를 발현하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트 동시 생산 균주를 제공하는 것이다. The purpose of the present invention is to provide a strain that simultaneously produces isobutanol and polyhydroxybutyrate, expressing the isobutanol synthesis operon, the polyhydroxybutyrate (PHB) synthesis operon, and the pntAB gene.

본 발명의 다른 목적은 i) 상기 균주를 배지에서 배양하는 단계; 및 ii) 상기 배양된 배지 및 균주로부터 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트를 회수하는 단계;를 포함하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트 동시 생산 방법을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is i) culturing the strain in a medium; and ii) recovering isobutanol and polyhydroxybutyrate from the cultured medium and strain.

본 발명의 또 다른 하나의 목적은 상기 균주 및 이의 배양액을 포함하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트 동시 생산용 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a composition for simultaneous production of isobutanol and polyhydroxybutyrate, comprising the above strain and its culture medium.

이를 구체적으로 설명하면 다음과 같다. 한편, 본 발명에서 개시된 각각의 설명 및 실시형태는 각각의 다른 설명 및 실시 형태에도 적용될 수 있다. 즉, 본 발명에서 개시된 다양한 요소들의 모든 조합이 본 발명의 범주에 속한다. 또한, 하기 기술된 구체적인 서술에 의하여 본 발명의 범주가 제한된다고 볼 수 없다.This is explained in detail as follows. Meanwhile, each description and embodiment disclosed in the present invention may also be applied to each other description and embodiment. That is, all combinations of the various elements disclosed in the present invention fall within the scope of the present invention. Additionally, the scope of the present invention cannot be considered limited by the specific description described below.

상기 목적을 달성하기 위한 본 발명의 하나의 양태는 이소부탄올(isobutanol) 합성 오페론, 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 합성 오페론 및 pntAB 유전자를 발현하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트 동시 생산 균주를 제공한다. One aspect of the present invention for achieving the above object is to produce a strain simultaneously producing isobutanol and polyhydroxybutyrate, which expresses the isobutanol synthesis operon, the polyhydroxybutyrate (PHB) synthesis operon, and the pntAB gene. to provide.

본 발명의 목적상, 상기 이소부탄올 합성 오페론은 alsS, kivD, ilvC, ilvD 유전자 및 이들의 조합으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상일 수 있고, 일예로, alsS, kivD, ilvCilvD 유전자를 포함하는 오페론일 수 있다. 상기 PHB 합성 오페론은 bktB, phaB, phaC 유전자 및 이들의 조합으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상일 수 있고, 일예로, bktB, phaB phaC 유전자를 포함하는 오페론일 수 있다.For the purpose of the present invention, the isobutanol synthesis operon may be any one or more selected from the group consisting of alsS , kivD , ilvC , ilvD genes and combinations thereof, for example, including alsS , kivD , ilvC and ilvD genes. It may be an operon. The PHB synthesis operon may be any one or more selected from the group consisting of bktB , phaB , phaC genes, and combinations thereof. For example, it may be an operon containing bktB , phaB , and phaC genes.

즉, 본 발명의 균주의 하나의 예시로써, 상기 균주는 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB phaC 유전자를 발현하는 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.That is, as an example of the strain of the present invention, the strain may express alsS , kivD , ilvC , ilvD , pntAB , bktB , phaB , and phaC genes, but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, 아세토락테이트 신타제(acetolactate synthase)는 분지쇄 아미노산의 합성에서 첫 단계를 촉매하는 효소이다. 구체적으로, 본 발명의 아세토락테이트 신타제는 아세토락테이트 합성효소 또는 alsS와 혼용하여 사용될 수 있다. 본 발명에서 상기 아세토락테이트 신타제는 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank에서 그 서열을 얻을 수 있다. 구체적으로 alsS에 의해 코딩되는 아세토락테이트 신타제 활성을 갖는 단백질 또는 폴리펩티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term acetolactate synthase is an enzyme that catalyzes the first step in the synthesis of branched chain amino acids. Specifically, the acetolactate synthase of the present invention can be used interchangeably with acetolactate synthase or alsS. In the present invention, the sequence of the acetolactate synthase can be obtained from GenBank of NCBI, a known database. Specifically, it may be a protein or polypeptide having acetolactate synthase activity encoded by alsS , but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, 알파-케토이소발레레이트 디카르복실라아제(alpha-ketoisovalerate decarboxylase)는 발린과 류신 생합성의 중간 화합물인 알파-케토이소발레레이트에 대해 가장 높은 친화성을 나타내는 비-산화 티아민 디포스페이트(non-oxidative thiamin diphosphate, ThDP) 의존성 알파-케토산 탈탄산효소이다. 구체적으로, 본 발명의 알파-케토이소발레레이트 디카르복실라아제는 알파-케토이소발레레이트 탈탄산효소 또는 kivD와 혼용하여 사용될 수 있다. 본 발명에서 상기 알파-케토이소발레레이트 디카르복실라아제는 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank에서 그 서열을 얻을 수 있다. 구체적으로 kivD에 의해 코딩되는 알파-케토이소발레레이트 디카르복실라아제 활성을 갖는 단백질 또는 폴리펩티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term alpha-ketoisovalerate decarboxylase is a non-oxidizing enzyme that exhibits the highest affinity for alpha-ketoisovalerate, an intermediate compound in valine and leucine biosynthesis. It is a thiamine diphosphate (non-oxidative thiamin diphosphate, ThDP) dependent alpha-keto acid decarboxylase. Specifically, alpha-ketoisovalerate decarboxylase of the present invention can be used interchangeably with alpha-ketoisovalerate decarboxylase or kivD. In the present invention, the sequence of alpha-ketoisovalerate decarboxylase can be obtained from GenBank of NCBI, a known database. Specifically, it may be a protein or polypeptide having alpha-ketoisovalerate decarboxylase activity encoded by kivD , but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, 케톨산 리덕토이소머라제(ketol-acid reductoisomerase)는 (R)-2,3-디히드록시-3-메틸부티레이트[(R)-2,3-dihydroxy-3-methylbutanoate] 및 NADP+로부터 (S)-2-히드록시-2-메틸-3-옥소부타노에이트[(S)-2-hydroxy-2-methyl-3-oxobutanoate], NADPH(Nicotinamide-adenine dinucleotide phosphate) 및 H+을 생산하는 효소이다. 구체적으로, 본 발명의 케톨산 리덕토이소머라제는 ilvC와 혼용하여 사용될 수 있다. 본 발명에서 상기 케톨산 리덕토이소머라제는 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank에서 그 서열을 얻을 수 있다. 구체적으로 ilvC에 의해 코딩되는 케톨산 리덕토이소머라제 활성을 갖는 단백질 또는 폴리펩티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term ketol-acid reductoisomerase refers to (R)-2,3-dihydroxy-3-methylbutyrate [(R)-2,3-dihydroxy-3-methylbutanoate] and (S)-2-hydroxy-2-methyl-3-oxobutanoate [(S)-2-hydroxy-2-methyl-3-oxobutanoate], Nicotinamide-adenine dinucleotide phosphate (NADPH), and H+ from NADP+. It is an enzyme that produces Specifically, ketol acid reductoisomerase of the present invention can be used interchangeably with ilvC. In the present invention, the sequence of the ketol acid reductoisomerase can be obtained from GenBank of NCBI, a known database. Specifically, it may be a protein or polypeptide having ketol acid reductoisomerase activity encoded by ilvC , but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, 디히드록시산 데히드라타제(dihydroxyacid dehydratase)는 분지쇄 아미노산 생합성 경로의 핵심 단계를 촉매하는 효소이다. 구체적으로, 본 발명의 디히드록시산 데히드라타제는 디히드록시산 탈수효소 또는 ilvD와 혼용하여 사용될 수 있다. 본 발명에서 상기 아세토락테이트 신타제는 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank에서 그 서열을 얻을 수 있다. 구체적으로 ilvD에 의해 코딩되는 디히드록시산 데히드라타제 활성을 갖는 단백질 또는 폴리펩티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term dihydroxyacid dehydratase is an enzyme that catalyzes a key step in the branched chain amino acid biosynthesis pathway. Specifically, the dihydroxy acid dehydratase of the present invention can be used interchangeably with dihydroxy acid dehydratase or ilvD. In the present invention, the sequence of the acetolactate synthase can be obtained from GenBank of NCBI, a known database. Specifically, it may be a protein or polypeptide having dihydroxy acid dehydratase activity encoded by ilvD , but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, 피리딘 뉴클레오타이드 트랜스 하이드로게나제(pyridine nucleotide transhydrogenase)는 분지쇄 아미노산의 합성에서 첫 단계를 촉매하는 촉매이다. 구체적으로, 본 발명의 피리딘 뉴클레오타이드 트랜스 하이드로게나제는 피리딘 뉴클레오타이드 트랜스수소화효소 또는 pntAB와 혼용하여 사용될 수 있다. 본 발명에서 상기 피리딘 뉴클레오타이드 트랜스 하이드로게나제는 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank에서 그 서열을 얻을 수 있다. 구체적으로 pntAB에 의해 코딩되는 피리딘 뉴클레오타이드 트랜스 하이드로게나제 활성을 갖는 단백질 또는 폴리펩티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term pyridine nucleotide transhydrogenase is a catalyst that catalyzes the first step in the synthesis of branched chain amino acids. Specifically, pyridine nucleotide transhydrogenase of the present invention can be used interchangeably with pyridine nucleotide transhydrogenase or pntAB. In the present invention, the sequence of the pyridine nucleotide trans hydrogenase can be obtained from NCBI's GenBank, a known database. Specifically, it may be a protein or polypeptide having pyridine nucleotide trans hydrogenase activity encoded by pntAB , but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, 베타-케토티올라제(beta-ketothiolase)는 케톤 아세토 아세틸 CoA(ketone acetoacetyl CoA)를 아세틸-CoA로 분해하고, 이소류신 이화 경로에서 2-메틸아세토아세틸-CoA(2-methylacetoacetyl-CoA)를 프로피온산(propionic acid)으로 전환시키는 효소이다. 구체적으로, 본 발명의 베타-케토티올라제는 미토콘드리아 아세토아세틸-CoA 티올라제(mitochondrial acetoacetyl-CoA thiolase, MAT) 또는 bktB와 혼용하여 사용될 수 있다. 본 발명에서 상기 베타-케토티올라제는 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank에서 그 서열을 얻을 수 있다. 구체적으로 bktB에 의해 코딩되는 베타-케토티올라제 활성을 갖는 단백질 또는 폴리펩티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term beta-ketothiolase decomposes ketone acetoacetyl CoA into acetyl-CoA and produces 2-methylacetoacetyl-CoA in the isoleucine catabolism pathway. It is an enzyme that converts CoA) into propionic acid. Specifically, beta-ketothiolase of the present invention can be used interchangeably with mitochondrial acetoacetyl-CoA thiolase (MAT) or bktB. In the present invention, the sequence of the beta-ketothiolase can be obtained from GenBank of NCBI, a known database. Specifically, it may be a protein or polypeptide with beta-ketothiolase activity encoded by bktB , but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, 아세토아세틸-CoA 리덕타제(acetoacetyl-CoA reductase)는 (R)-3-히드록시아실-CoA[(R)-3-hydroxyacyl-CoA] 및 NADP+로부터 3-옥소아실-CoA(3-oxoacyl-CoA), NADPH 및 H+을 생산하는 효소이다. 구체적으로, 본 발명의 아세토아세틸-CoA 리덕타제는 아세토아세틸-CoA 환원효소 또는 phaB와 혼용하여 사용될 수 있다. 본 발명에서 상기 아세토아세틸-CoA 리덕타제는 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank에서 그 서열을 얻을 수 있다. 구체적으로 phaB에 의해 코딩되는 아세토아세틸-CoA 리덕타제 활성을 갖는 단백질 또는 폴리펩티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term acetoacetyl-CoA reductase (acetoacetyl-CoA reductase) refers to 3-oxoacyl-CoA (from (R)-3-hydroxyacyl-CoA [(R)-3-hydroxyacyl-CoA] and NADP + 3-oxoacyl-CoA), an enzyme that produces NADPH and H+. Specifically, acetoacetyl-CoA reductase of the present invention can be used interchangeably with acetoacetyl-CoA reductase or phaB. In the present invention, the sequence of the acetoacetyl-CoA reductase can be obtained from GenBank of NCBI, a known database. Specifically, it may be a protein or polypeptide having acetoacetyl-CoA reductase activity encoded by phaB , but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, 폴리(3-히드록시부티레이트)폴리머라제[poly(3-hydroxybutyrate) polymerase]는 아실기를 전이하는 활성을 갖는 효소이다. 구체적으로, 본 발명의 폴리(3-히드록시부티레이트)폴리머라제는 폴리(3-하이드록시부티레이트)중합효소 또는 phaC와 혼용하여 사용될 수 있다. 본 발명에서 상기 폴리(3-히드록시부티레이트)폴리머라제는 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank에서 그 서열을 얻을 수 있다. 구체적으로 phaC에 의해 코딩되는 폴리(3-히드록시부티레이트)폴리머라제 활성을 갖는 단백질 또는 폴리펩티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term poly(3-hydroxybutyrate) polymerase is an enzyme that has the activity of transferring an acyl group. Specifically, poly(3-hydroxybutyrate)polymerase of the present invention can be used interchangeably with poly(3-hydroxybutyrate)polymerase or phaC. In the present invention, the sequence of the poly(3-hydroxybutyrate)polymerase can be obtained from GenBank of NCBI, a known database. Specifically, it may be a protein or polypeptide with poly(3-hydroxybutyrate)polymerase activity encoded by phaC , but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 상기 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB 및 phaC의 각 단백질(또는 폴리펩티드)은 각각 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10, 서열번호 12, 서열번호 14 또는 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 것일 수 있다. 구체적으로, 본 발명의 alsS는 서열번호 2의 아미노산 서열, kivD는 서열번호 4의 아미노산 서열, ilvC는 서열번호 6의 아미노산 서열, ilvD는 서열번호 8의 아미노산 서열, pntAB는 서열번호 10의 아미노산 서열, bktB는 서열번호 12의 아미노산 서열, phaB는 서열번호 14의 아미노산 서열, phaC는 서열번호 16의 아미노산 서열을 각각 가지거나, 포함하거나, 이루어지거나, 상기 아미노산 서열로 필수적으로 이루어질 수 있다.In the present invention, each protein (or polypeptide) of alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB and phaC is SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, It may include the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, or SEQ ID NO: 16. Specifically, of the present invention, alsS is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, kivD is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, ilvC is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, ilvD is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, and pntAB is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10. , bktB may have, include, or consist of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12, phaB may have the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and phaC may have, include, or consist of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16, respectively, or may consist essentially of the above amino acid sequences.

본 발명에서 용어, "폴리뉴클레오티드"는 뉴클레오티드 단위체(monomer)가 공유결합에 의해 길게 사슬모양으로 이어진 뉴클레오티드의 중합체(polymer)로 일정한 길이 이상의 DNA 또는 RNA 가닥으로서, 보다 구체적으로는 상기 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 단편을 의미한다.In the present invention, the term "polynucleotide" refers to a strand of DNA or RNA of a certain length or more, which is a polymer of nucleotides in which nucleotide monomers are connected in a long chain by covalent bonds. More specifically, the term "polynucleotide" refers to a strand of DNA or RNA that encodes the protein. refers to a polynucleotide fragment.

본 발명의 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB 및 phaC를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10, 서열번호 12, 서열번호 14 또는 서열번호 16으로 기재된 아미노산 서열을 코딩하는 염기서열을 포함할 수 있다. Polynucleotides encoding alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB and phaC of the present invention are SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: It may include a base sequence encoding the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14 or SEQ ID NO: 16.

본 발명의 일 예로, 상기 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB 및 phaC의 단백질을 코딩하는 각 유전자, 즉, alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB phaC 유전자는 각각 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9, 서열번호 11, 서열번호 13 또는 서열번호 15의 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 것일 수 있다. 구체적으로, 본 발명의 alsS를 코딩하는 유전자는 서열번호 1의 폴리뉴클레오티드 서열, kivD를 코딩하는 유전자는 서열번호 3의 폴리뉴클레오티드 서열, ilvC를 코딩하는 유전자는 서열번호 5의 폴리뉴클레오티드 서열, ilvD를 코딩하는 유전자는 서열번호 7의 폴리뉴클레오티드 서열, pntAB를 코딩하는 유전자는 서열번호 9의 폴리뉴클레오티드 서열, bktB를 코딩하는 유전자는 서열번호 11의 폴리뉴클레오티드 서열, phaB를 코딩하는 유전자는 서열번호 13의 폴리뉴클레오티드 서열, phaC를 코딩하는 유전자는 서열번호 15의 폴리뉴클레오티드 서열을 각각 가지거나, 포함하거나, 이루어지거나, 상기 폴리뉴클레오티드 서열로 필수적으로 이루어질 수 있다.As an example of the present invention, each gene encoding the proteins alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB and phaC, that is, alsS , kivD , ilvC , ilvD , pntAB , bktB , phaB and phaC genes are each It may include a polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, or SEQ ID NO: 15. Specifically, the gene encoding alsS of the present invention is the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, the gene encoding kivD is the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, and the gene encoding ilvC is the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, ilvD. The coding gene is the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 7, the gene encoding pntAB is the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 9, the gene encoding bktB is the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 11, and the gene encoding phaB is the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 13. The polynucleotide sequence, the gene encoding phaC, may have, include, or consist of the polynucleotide sequence of SEQ ID NO: 15, or may consist essentially of the polynucleotide sequence.

본 발명의 폴리뉴클레오티드는 코돈의 축퇴성(degeneracy) 또는 본 발명의 단백질을 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여, 본 발명의 단백질의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩 영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있다. 구체적으로, 본 발명의 폴리뉴클레오티드는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9, 서열번호 11, 서열번호 13 또는 서열번호 15의 서열과 상동성 또는 동일성이 70% 이상, 75% 이상, 6% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 및 99% 이상인 염기서열을 가지거나 포함하거나, 또는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9, 서열번호 11, 서열번호 13 또는 서열번호 15의 서열과 상동성 또는 동일성이 70% 이상, 75% 이상, 6% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 및 99% 이상인 염기서열로 이루어지거나 필수적으로 이루어질 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. The polynucleotide of the present invention has various variations in the coding region within the range of not changing the amino acid sequence of the protein of the present invention, taking into account codon degeneracy or preferred codons in organisms intended to express the protein of the present invention. Transformations can occur. Specifically, the polynucleotide of the present invention has 70% homology or identity with the sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, or SEQ ID NO: 15. or more than 75%, more than 6%, more than 85%, more than 90%, more than 95%, more than 96%, more than 97%, more than 98%, and more than 99% of the base sequence, or SEQ ID NO: 1 , SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, or SEQ ID NO: 15 with at least 70%, 75%, 6%, or 85% homology or identity. It may consist of, or consist essentially of, more than 90%, more than 95%, more than 96%, more than 97%, more than 98%, and more than 99% of base sequences, but is not limited thereto.

또한, 본 발명의 폴리뉴클레오티드는 공지의 유전자 서열로부터 제조될 수 있는 프로브, 예를 들면, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열의 전체 또는 일부에 대한 상보 서열과 엄격한 조건 하에 하이드리드화할 수 있는 서열이라면 제한없이 포함될 수 있다. 상기 "엄격한 조건(stringent condition)"이란 폴리뉴클레오티드 간의 특이적 혼성화를 가능하게 하는 조건을 의미한다. 이러한 조건은 문헌(J. Sambrook et al.,Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F.M. Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York, 9.50-9.51, 11.7-11.8 참조)에 구체적으로 기재되어 있다. 예를 들어, 상동성 또는 동일성이 높은 폴리뉴클레오티드끼리, 70% 이상, 75% 이상, 6% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상의 상동성 또는 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드끼리 하이브리드화하고, 그보다 상동성 또는 동일성이 낮은 폴리뉴클레오티드끼리 하이브리드화하지 않는 조건, 또는 통상의 써던 하이브리드화(southern hybridization)의 세척 조건인 60℃, 1ХSSC, 0.1% SDS, 구체적으로 60℃, 0.1ХSSC, 0.1% SDS, 보다 구체적으로 68℃, 0.1ХSSC, 0.1% SDS에 상당하는 염 농도 및 온도에서, 1회, 구체적으로 2회 내지 3회 세정하는 조건을 열거할 수 있다.In addition, the polynucleotide of the present invention is without limitation as long as it is a probe that can be prepared from a known genetic sequence, for example, a sequence capable of hydriding under strict conditions with a complementary sequence to all or part of the polynucleotide sequence of the present invention. may be included. The “stringent condition” refers to conditions that enable specific hybridization between polynucleotides. These conditions are described in J. Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F.M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York, 9.50-9.51, 11.7-11.8). For example, among polynucleotides with high homology or identity, 70% or more, 75% or more, 6% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, Or, conditions in which polynucleotides with 99% or more homology or identity hybridize with each other and polynucleotides with lower homology or identity do not hybridize, or 60°C, which is the washing condition for normal southern hybridization, Washing once, specifically 2 to 3 times, at a salt concentration and temperature equivalent to 1ХSSC, 0.1% SDS, specifically 60°C, 0.1ХSSC, 0.1% SDS, more specifically 68°C, 0.1ХSSC, 0.1% SDS. Conditions can be listed.

혼성화는 비록 혼성화의 엄격도에 따라 염기 간의 미스매치(mismatch)가 가능할지라도, 두 개의 핵산이 상보적 서열을 가질 것을 요구한다. 용어, "상보적"은 서로 혼성화가 가능한 뉴클레오티드 염기 간의 관계를 기술하는데 사용된다. 예를 들면, DNA에 관하여, 아데닌은 티민에 상보적이며 시토신은 구아닌에 상보적이다. 따라서, 본 발명의 폴리뉴클레오티드는 또한 실질적으로 유사한 핵산 서열뿐만 아니라 전체 서열에 상보적인 단리된 핵산 단편을 포함할 수 있다.Hybridization requires that the two nucleic acids have complementary sequences, although mismatches between bases may be possible depending on the stringency of hybridization. The term “complementary” is used to describe the relationship between nucleotide bases that are capable of hybridizing to each other. For example, with respect to DNA, adenine is complementary to thymine and cytosine is complementary to guanine. Accordingly, polynucleotides of the invention may also include substantially similar nucleic acid sequences as well as isolated nucleic acid fragments that are complementary to the entire sequence.

구체적으로, 본 발명의 폴리뉴클레오티드와 상동성 또는 동일성을 가지는 폴리뉴클레오티드는 55℃의 Tm 값에서 혼성화 단계를 포함하는 혼성화 조건을 사용하고 상술한 조건을 사용하여 탐지할 수 있다. 또한, 상기 Tm 값은 60℃, 63℃ 또는 65℃일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니고 그 목적에 따라 당업자에 의해 적절히 조절될 수 있다.Specifically, polynucleotides having homology or identity with the polynucleotide of the present invention can be detected using hybridization conditions including a hybridization step at a Tm value of 55°C and using the conditions described above. Additionally, the Tm value may be 60°C, 63°C, or 65°C, but is not limited thereto and may be appropriately adjusted by a person skilled in the art depending on the purpose.

상기 폴리뉴클레오티드를 혼성화하는 적절한 엄격도는 폴리뉴클레오티드의 길이 및 상보성 정도에 의존하고 변수는 해당기술분야에 잘 알려져 있다(예컨대, J. Sambrook et al., 상동).The appropriate stringency to hybridize the polynucleotide depends on the length of the polynucleotide and the degree of complementarity, variables that are well known in the art (e.g., J. Sambrook et al., supra).

또한, 본 발명의 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB 및 phaC는 상기 서열번호 2, 서열번호 4, 서열번호 6, 서열번호 8, 서열번호 10, 서열번호 12, 서열번호 14 또는 서열번호 16으로 기재된 아미노산 서열과 적어도 70%, 75%, 6%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5%, 99.7% 또는 99.9% 이상의 상동성 또는 동일성을 가지는 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 또한, 이러한 상동성 또는 동일성을 가지며 본 발명의 단백질에 상응하는 효능을 나타내는 아미노산 서열이라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환, 보존적 치환 또는 부가된 아미노산 서열을 갖는 단백질도 본 발명의 범위 내에 포함됨은 자명하다. In addition, alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB and phaC of the present invention are SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14 or At least 70%, 75%, 6%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5%, 99.7% or 99.9% homology with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16 Alternatively, it may contain an amino acid sequence having identity. In addition, proteins with amino acid sequences in which some sequences are deleted, modified, substituted, conservatively substituted, or added are also included within the scope of the present invention, as long as they have such homology or identity and show efficacy corresponding to the protein of the present invention. is self-explanatory.

예를 들어, 상기 아미노산 서열 N-말단, C-말단 그리고/또는 내부에 본 발명의 단백질의 기능을 변경하지 않는 서열 추가 또는 결실, 자연적으로 발생할 수 있는 돌연변이, 잠재성 돌연변이 (silent mutation) 또는 보존적 치환을 가지는 경우이다.For example, addition or deletion of sequences at the N-terminus, C-terminus and/or within the amino acid sequence that do not alter the function of the protein of the present invention, mutations that may occur naturally, silent mutations or preservation. This is the case with enemy substitution.

상기 "보존적 치환(conservative substitution)"은 한 아미노산을 유사한 구조적 및/또는 화학적 성질을 갖는 또 다른 아미노산으로 치환시키는 것을 의미한다. 이러한 아미노산 치환은 일반적으로 잔기의 극성, 전하, 용해도, 소수성, 친수성 및/또는 양친매성(amphipathic nature)에서의 유사성에 근거하여 발생할 수 있다. 통상적으로, 보존적 치환은 단백질 또는 폴리펩티드의 활성에 거의 영향을 미치지 않거나 또는 영향을 미치지 않을 수 있다.The term “conservative substitution” means replacing one amino acid with another amino acid having similar structural and/or chemical properties. These amino acid substitutions may generally occur based on similarity in polarity, charge, solubility, hydrophobicity, hydrophilicity and/or amphipathic nature of the residues. Typically, conservative substitutions may have little or no effect on the activity of the protein or polypeptide.

본 발명에서 용어, '상동성 (homology)' 또는 '동일성 (identity)'은 두 개의 주어진 아미노산 서열 또는 염기 서열 상호간 유사한 정도를 의미하며 백분율로 표시될 수 있다. 용어 상동성 및 동일성은 종종 상호교환적으로 이용될 수 있다.In the present invention, the term 'homology' or 'identity' refers to the degree of similarity between two given amino acid sequences or base sequences and can be expressed as a percentage. The terms homology and identity can often be used interchangeably.

보존된(conserved) 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드의 서열 상동성 또는 동일성은 표준 배열 알고리즘에 의해 결정되며, 사용되는 프로그램에 의해 확립된 디폴트 갭 페널티가 함께 이용될 수 있다. 실질적으로, 상동성을 갖거나(homologous) 또는 동일한(identical) 서열은 일반적으로 서열 전체 또는 일부분과 중간 또는 높은 엄격한 조건(stringent conditions)에서 하이브리드할 수 있다. 하이브리드화는 폴리뉴클레오티드에서 일반 코돈 또는 코돈 축퇴성을 고려한 코돈을 함유하는 폴리뉴클레오티드와의 하이브리드화 역시 포함됨이 자명하다.The sequence homology or identity of a conserved polynucleotide or polypeptide is determined by standard alignment algorithms, and may be used with a default gap penalty established by the program used. Substantially homologous or identical sequences are generally capable of hybridizing to all or part of a sequence under moderate or high stringent conditions. It is obvious that hybridization also includes hybridization with a polynucleotide containing a common codon or a codon taking codon degeneracy into account.

임의의 두 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드 서열이 상동성, 유사성 또는 동일성을 갖는지 여부는, 예를 들어, Pearson et al (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85]: 2444에서와 같은 디폴트 파라미터를 이용하여 "FASTA" 프로그램과 같은 공지의 컴퓨터 알고리즘을 이용하여 결정될 수 있다. 또는, EMBOSS 패키지의 니들만 프로그램(EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite, Rice et al., 2000, Trends Genet. 16: 276-277)(버전 5.0.0 또는 이후 버전)에서 수행되는 바와 같은, 니들만-운치(Needleman-Wunsch) 알고리즘(Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol. Biol. 48: 443-453)이 사용되어 결정될 수 있다(GCG 프로그램 패키지 (Devereux, J., et al, Nucleic Acids Research 12: 387 (1984)), BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, [S.] [F.,] [ET AL, J MOLEC BIOL 215]: 403 (1990); Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop, [ED.,] Academic Press, San Diego,1994, 및 [CARILLO ETA/.](1988) SIAM J Applied Math 48: 1073을 포함한다). 예를 들어, 국립 생물공학 정보 데이터베이스 센터의 BLAST, 또는 ClustalW를 이용하여 상동성, 유사성 또는 동일성을 결정할 수 있다.Whether any two polynucleotide or polypeptide sequences have homology, similarity, or identity can be determined, for example, by Pearson et al (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85]: It can be determined using a known computer algorithm such as the "FASTA" program using default parameters as in 2444. Or, as performed in the Needleman program in the EMBOSS package (EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite, Rice et al., 2000, Trends Genet. 16: 276-277) (version 5.0.0 or later), It can be determined using the Needleman-Wunsch algorithm (Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol. Biol. 48: 443-453) (GCG program package (Devereux, J., et al, Nucleic Acids Research 12: 387 (1984)), BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, [S.] [F.,] [ET AL, J MOLEC BIOL 215]: 403 (1990); Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop , [ed.,] Academic Press, San Diego, 1994, and [CARILLO ETA/.] (1988) SIAM J Applied Math 48: 1073. For example, BLAST from the National Center for Biotechnology Information Database, or ClustalW can be used to determine homology, similarity, or identity.

폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드의 상동성, 유사성 또는 동일성은, 예를 들어, Smith and Waterman, Adv. Appl. Math (1981) 2:482 에 공지된 대로, 예를 들면, Needleman et al. (1970), J Mol Biol. 48:443과 같은 GAP 컴퓨터 프로그램을 이용하여 서열 정보를 비교함으로써 결정될 수 있다. 요약하면, GAP 프로그램은 두 서열 중 더 짧은 것에서의 기호의 전체 수로, 유사한 배열된 기호(즉, 뉴클레오티드 또는 아미노산)의 수를 나눈 값으로 정의할 수 있다. GAP 프로그램을 위한 디폴트 파라미터는 (1) 이진법 비교 매트릭스(동일성을 위해 1 그리고 비-동일성을 위해 0의 값을 함유함) 및 Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas Of Protein Sequence And Structure, National Biomedical Research Foundation, pp. 353-358 (1979)에 의해 개시된 대로, Gribskov et al(1986) Nucl. Acids Res. 14: 6745의 가중된 비교 매트릭스 (또는 EDNAFULL (NCBI NUC4.4의 EMBOSS 버전) 치환 매트릭스); (2) 각 갭을 위한 3.0의 페널티 및 각 갭에서 각 기호를 위한 추가의 0.10 페널티 (또는 갭 개방 패널티 10, 갭 연장 패널티 0.5); 및 (3) 말단 갭을 위한 무 페널티를 포함할 수 있다.Homology, similarity or identity of polynucleotides or polypeptides is defined in, for example, Smith and Waterman, Adv. Appl. Math (1981) 2:482, see, for example, Needleman et al. (1970), J Mol Biol. This can be determined by comparing sequence information using a GAP computer program such as 48:443. In summary, a GAP program can be defined as the total number of symbols in the shorter of the two sequences divided by the number of similarly aligned symbols (i.e., nucleotides or amino acids). The default parameters for the GAP program are (1) a binary comparison matrix (containing values 1 for identity and 0 for non-identity) and Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas Of Protein Sequence And Structure, National Biomedical Research Foundation , pp. 353-358 (1979), Gribskov et al (1986) Nucl. Acids Res. 14: Weighted comparison matrix of 6745 (or EDNAFULL (EMBOSS version of NCBI NUC4.4) permutation matrix); (2) a penalty of 3.0 for each gap and an additional 0.10 penalty for each symbol in each gap (or a gap opening penalty of 10 and a gap extension penalty of 0.5); and (3) no penalty for end gaps.

본 발명의 균주가 발현하는 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB, phaC 및 이들의 조합으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 단백질은 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB 또는 phaC을 코딩하는 폴리뉴클레오티드, 즉, alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB phaC 유전자를 포함하는 벡터를 통해 도입된 것일 수 있다.Any one or more proteins selected from the group consisting of alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB, phaC and combinations thereof expressed by the strain of the present invention are alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB Alternatively, it may be introduced through a vector containing a polynucleotide encoding phaC, that is, alsS , kivD , ilvC , ilvD , pntAB , bktB , phaB , and phaC genes.

본 발명의 벡터는 적합한 숙주 내에서 목적 폴리펩티드를 발현시킬 수 있도록 적합한 발현조절영역(또는 발현조절서열)에 작동 가능하게 연결된 상기 목적 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 염기서열을 포함하는 DNA 제조물을 포함할 수 있다. 상기 발현조절영역은 전사를 개시할 수 있는 프로모터, 그러한 전사를 조절하기 위한 임의의 오퍼레이터 서열, 적합한 mRNA 리보좀 결합부위를 코딩하는 서열, 및 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열을 포함할 수 있다. 벡터는 적당한 숙주세포 내로 형질전환된 후, 숙주 게놈과 무관하게 복제되거나 기능할 수 있으며, 게놈 그 자체에 통합될 수 있다.The vector of the present invention may include a DNA preparation containing the base sequence of a polynucleotide encoding the target polypeptide operably linked to a suitable expression control region (or expression control sequence) to enable expression of the target polypeptide in a suitable host. You can. The expression control region may include a promoter capable of initiating transcription, an optional operator sequence for regulating such transcription, a sequence encoding a suitable mRNA ribosome binding site, and a sequence regulating termination of transcription and translation. After transformation into a suitable host cell, the vector can replicate or function independently of the host genome and can be integrated into the genome itself.

본 발명에서 사용되는 벡터는 특별히 한정되지 않으며, 당업계에 알려진 임의의 벡터를 이용할 수 있다. 통상 사용되는 벡터의 예로는 천연 상태이거나 재조합된 상태의 플라스미드, 코스미드, 바이러스 및 박테리오파지를 들 수 있다. 예를 들어, 파지 벡터 또는 코스미드 벡터로서 pWE15, M13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A, 및 Charon21A 등을 사용할 수 있으며, 플라스미드 벡터로서 RSF계, P15A계, pDZ계, pBR계, pUC계, pBluescriptII계, pGEM계, pTZ계, pCL계 및 pET계 등을 사용할 수 있다. 구체적으로는 pRSFDuet-1, pACYCDuet-1, pDZ, pDC, pDCM2, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC 벡터 등을 사용할 수 있다.The vector used in the present invention is not particularly limited, and any vector known in the art can be used. Examples of commonly used vectors include plasmids, cosmids, viruses, and bacteriophages in a natural or recombinant state. For example, as phage vectors or cosmid vectors, pWE15, M13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A, and Charon21A can be used, and as plasmid vectors, RSF, P15A, and pDZ series can be used. , pBR-based, pUC-based, pBluescriptII-based, pGEM-based, pTZ-based, pCL-based, pET-based, etc. can be used. Specifically, pRSFDuet-1, pACYCDuet-1, pDZ, pDC, pDCM2, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC vectors, etc. can be used.

일례로 세포 내 염색체 삽입용 벡터를 통해 목적 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 염색체 내로 삽입할 수 있다. 상기 폴리뉴클레오티드의 염색체 내로의 삽입은 당업계에 알려진 임의의 방법, 예를 들면, 상동재조합(homologous recombination)에 의하여 이루어질 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다. 상기 염색체 삽입 여부를 확인하기 위한 선별 마커(selection marker)를 추가로 포함할 수 있다. 상기 선별 마커는 벡터로 형질전환된 세포를 선별, 즉 목적 핵산 분자의 삽입 여부를 확인하기 위한 것으로, 약물 내성, 영양 요구성, 세포 독성제에 대한 내성 또는 표면 폴리펩티드의 발현과 같은 선택가능 표현형을 부여하는 마커들이 사용될 수 있다. 선택제(selective agent)가 처리된 환경에서는 선별 마커를 발현하는 세포만 생존하거나 다른 표현 형질을 나타내므로, 형질전환된 세포를 선별할 수 있다.For example, a polynucleotide encoding a target polypeptide can be inserted into a chromosome using a vector for intracellular chromosome insertion. Insertion of the polynucleotide into the chromosome may be accomplished by any method known in the art, for example, homologous recombination, but is not limited thereto. A selection marker may be additionally included to confirm whether the chromosome has been inserted. The selection marker is used to select cells transformed with a vector, that is, to confirm the insertion of the target nucleic acid molecule, and to display selectable phenotypes such as drug resistance, auxotrophy, resistance to cytotoxic agents, or expression of surface polypeptides. Markers that provide may be used. In an environment treated with a selective agent, only cells expressing the selection marker survive or show other expression traits, so transformed cells can be selected.

본 발명에서 용어 "형질전환"은 표적 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터를 숙주세포 혹은 미생물 내에 도입하여 숙주세포 내에서 상기 폴리뉴클레오티드가 코딩하는 폴리펩티드가 발현할 수 있도록 하는 것을 의미한다. 형질전환된 폴리뉴클레오티드는 숙주세포 내에서 발현될 수 있기만 한다면, 숙주세포의 염색체 내에 삽입되어 위치하거나 염색체 외에 위치하거나 상관없이 이들 모두를 포함할 수 있다. 또한, 상기 폴리뉴클레오티드는 목적 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 및/또는 RNA를 포함한다. 상기 폴리뉴클레오티드는 숙주세포 내로 도입되어 발현될 수 있는 것이면, 어떠한 형태로도 도입될 수 있다. 예를 들면, 상기 폴리뉴클레오티드는 자체적으로 발현되는데 필요한 모든 요소를 포함하는 유전자 구조체인 발현 카세트(expression cassette)의 형태로 숙주세포에 도입될 수 있다. 상기 발현 카세트는 통상 상기 폴리뉴클레오티드에 작동 가능하게 연결되어 있는 프로모터(promoter), 전사 종결신호, 리보좀 결합부위 및 번역 종결신호를 포함할 수 있다. 상기 발현 카세트는 자체 복제가 가능한 발현 벡터 형태일 수 있다. 또한, 상기 폴리뉴클레오티드는 그 자체의 형태로 숙주세포에 도입되어 숙주세포에서 발현에 필요한 서열과 작동 가능하게 연결되어 있는 것일 수도 있으며, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the term “transformation” refers to introducing a vector containing a polynucleotide encoding a target polypeptide into a host cell or microorganism so that the polypeptide encoding the polynucleotide can be expressed within the host cell. As long as the transformed polynucleotide can be expressed in the host cell, it can include both of these, regardless of whether it is inserted into the chromosome of the host cell or located outside the chromosome. Additionally, the polynucleotide includes DNA and/or RNA encoding the polypeptide of interest. The polynucleotide can be introduced in any form as long as it can be introduced and expressed into a host cell. For example, the polynucleotide can be introduced into the host cell in the form of an expression cassette, which is a genetic structure containing all elements necessary for self-expression. The expression cassette may typically include a promoter, a transcription termination signal, a ribosome binding site, and a translation termination signal that are operably linked to the polynucleotide. The expression cassette may be in the form of an expression vector capable of self-replication. Additionally, the polynucleotide may be introduced into the host cell in its own form and operably linked to a sequence required for expression in the host cell, but is not limited thereto.

또한, 상기에서 용어 "작동 가능하게 연결"된 것이란 본 발명의 목적 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 전사를 개시 및 매개하도록 하는 프로모터 서열과 상기 폴리뉴클레오티드 서열이 기능적으로 연결되어 있는 것을 의미한다.In addition, the term "operably linked" as used herein means that the polynucleotide sequence is functionally linked to a promoter sequence that initiates and mediates transcription of the polynucleotide encoding the target protein of the present invention.

본 발명의 균주는 본 발명의 단백질, 상기 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오티드, 또는 본 발명의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터를 포함할 수 있다.The strain of the present invention may contain a protein of the present invention, a polynucleotide encoding the protein, or a vector containing the polynucleotide of the present invention.

본 발명에서 용어, "균주(또는, 미생물)"는 야생형 미생물이나 자연적 또는 인위적으로 유전적 변형이 일어난 미생물을 모두 포함하며, 외부 유전자가 삽입되거나 내재적 유전자의 활성이 강화되거나 불활성화되는 등의 원인으로 인해서 특정 기작이 약화되거나 강화된 미생물로서, 목적하는 폴리펩티드, 단백질 또는 산물의 생산을 위하여 유전적 변형(modification)을 포함하는 미생물일 수 있다.In the present invention, the term "strain (or microorganism)" includes both wild-type microorganisms and microorganisms that have undergone natural or artificial genetic modification, and can be caused by insertion of foreign genes or enhanced or inactivated activity of intrinsic genes. It is a microorganism whose specific mechanism is weakened or strengthened, and may be a microorganism that includes genetic modification for the production of a desired polypeptide, protein, or product.

본 발명의 균주는 본 발명의 단백질, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 및 본 발명의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터 중 어느 하나 이상을 포함하는 균주; 본 발명의 단백질 또는 본 발명의 폴리뉴클레오티드를 발현하도록 변형된 균주; 본 발명의 단백질, 또는 본 발명의 폴리뉴클레오티드를 발현하는 균주 (예컨대, 재조합 균주); 또는 본 발명의 단백질 활성을 갖는 균주 (예컨대, 재조합 균주)일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The strain of the present invention is a strain containing any one or more of the protein of the present invention, the polynucleotide of the present invention, and the vector containing the polynucleotide of the present invention; Strains modified to express proteins of the invention or polynucleotides of the invention; A strain (e.g., a recombinant strain) expressing a protein of the invention, or a polynucleotide of the invention; Alternatively, it may be a strain (e.g., a recombinant strain) having the protein activity of the present invention, but is not limited thereto.

본 발명의 균주는 이소부탄올 및 PHB 동시 생산능을 가진 균주일 수 있다.The strain of the present invention may be a strain capable of producing isobutanol and PHB simultaneously.

본 발명의 균주는 자연적으로 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB 또는 phaC을 가지고 있거나 이소부탄올 또는 PHB 생산능을 가지고 있는 미생물, 또는 alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB 또는 phaC을 가지고 있지 않거나 이소부탄올 또는 PHB 생산능이 없는 모균주에 본 발명의 단백질 또는 이를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 (또는 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터)가 도입되거나 및/또는 이소부탄올 및 PHB 동시 생산능이 부여된 미생물일 수 있으나 이에 제한되지 않는다. The strain of the present invention is a microorganism that naturally has alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB or phaC or has the ability to produce isobutanol or PHB, or alsS, kivD, ilvC, ilvD, pntAB, bktB, phaB Or, the protein of the present invention or a polynucleotide (or a vector containing the polynucleotide) encoding the same is introduced into a parent strain that does not have phaC or is incapable of producing isobutanol or PHB, and/or is given the ability to simultaneously produce isobutanol and PHB. It may be a microorganism, but is not limited thereto.

일 예로, 본 발명의 균주는 본 발명의 폴리뉴클레오티드 또는 본 발명의 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터로 형질전환되어, 본 발명의 단백질을 발현하는 세포 또는 미생물로서, 본 발명의 목적상 본 발명의 균주는 본 발명의 단백질을 포함하여 이소부탄올 및 PHB를 동시 생산할 수 있는 미생물을 모두 포함할 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 균주는 천연의 야생형 미생물 또는 이소부탄올 또는 PHB를 생산하는 미생물에 본 발명의 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 도입됨으로써 상기 단백질이 발현되어, 이소부탄올 및 PHB 동시 생산능이 부여된 재조합 균주일 수 있다. 상기 이소부탄올 및 PHB 동시 생산능이 부여된 재조합 균주는, 천연의 야생형 미생물 또는 비변형 미생물 (즉, 본 발명의 단백질을 발현하지 않는 미생물)에 비하여 이소부탄올 및 PHB을 동시 생산하는 균주일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 그 예로, 상기 이소부탄올 및 PHB 동시 생산 여부를 비교하는 대상 균주인, 이소부탄올 합성 오페론을 포함하는 벡터 pRSFISO를 포함하는 BLISO 균주일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.As an example, the strain of the present invention is a cell or microorganism that is transformed with a vector containing a polynucleotide encoding the polynucleotide of the present invention or a polynucleotide encoding the protein of the present invention and expresses the protein of the present invention. The strain of the invention may include all microorganisms capable of simultaneously producing isobutanol and PHB, including the protein of the invention. For example, the strain of the present invention expresses the protein by introducing a polynucleotide encoding the protein of the present invention into a natural wild-type microorganism or a microorganism that produces isobutanol or PHB, and is given the ability to simultaneously produce isobutanol and PHB. It may be a recombinant strain. The recombinant strain endowed with the ability to simultaneously produce isobutanol and PHB may be a strain that simultaneously produces isobutanol and PHB compared to a natural wild-type microorganism or an unmodified microorganism (i.e., a microorganism that does not express the protein of the present invention). It is not limited to this. An example of this may be the BLISO strain containing the vector pRSFISO containing the isobutanol synthesis operon, which is the target strain for comparing the simultaneous production of isobutanol and PHB, but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, "비변형 미생물"은 미생물에 자연적으로 발생할 수 있는 돌연변이를 포함하는 균주를 제외하는 것이 아니며, 야생형 균주 또는 천연형 균주 자체이거나, 자연적 또는 인위적 요인에 의한 유전적 변이로 형질이 변화되기 전 균주를 의미할 수 있다. 예를 들어, 상기 비변형 미생물은 본 명세서에 기재된 단백질이 도입되지 않거나 도입되기 전의 균주를 의미할 수 있다. 상기 "비변형 미생물"은 "변형 전 균주", "변형 전 미생물", "비변이 균주", "비변형 균주", "비변이 미생물" 또는 "기준 미생물"과 혼용될 수 있다.In the present invention, the term "non-modified microorganism" does not exclude strains containing mutations that may occur naturally in microorganisms, and is either a wild-type strain or a natural strain itself, or a strain that has a genetic mutation due to natural or artificial factors. It may refer to the strain before change. For example, the unmodified microorganism may refer to a strain in which the protein described herein is not introduced or before the protein is introduced. The “non-modified microorganism” may be used interchangeably with “pre-transformed strain”, “pre-transformed microorganism”, “non-mutated strain”, “non-modified strain”, “non-mutated microorganism” or “reference microorganism”.

본 발명의 또 다른 일 예로, 본 발명의 미생물은 이소부탄올 및 PHB를 동시 생산할 수 있는 미생물이라면 특별히 제한되지 않으나, 코리네박테리움 속 미생물 또는 에스케리키아 속 미생물일 수 있다. 상기 코리네박테리움 속 미생물은 구체적으로, 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum), 코리네박테리움 암모니아게네스(Corynebacterium ammoniagenes), 브레비박테리움 락토퍼멘텀(Brevibacterium lactofermentum), 브레비박테리움 플라범(Brevibacterium flavum), 코리네박테리움 써모아미노게네스(Corynebacterium thermoaminogenes), 코리네박테리움 에피션스(Corynebacterium efficiens) 등일 수 있다.As another example of the present invention, the microorganism of the present invention is not particularly limited as long as it is a microorganism capable of simultaneously producing isobutanol and PHB, but may be a microorganism of the genus Corynebacterium or a microorganism of the genus Escherichia. The microorganisms in the Corynebacterium genus are specifically, Corynebacterium glutamicum , Corynebacterium ammoniagenes , Brevibacterium lactofermentum , and Brevibacter. It may be Brevibacterium flavum , Corynebacterium thermoaminogenes , Corynebacterium efficiens , etc.

상기 에스케리키아 속 미생물은 구체적으로, 에스케리키아 알베르티(Escherichia albertii), 에스케리키아 콜라이(Escherichia coli), 에스케리키아 페르구소니(Escherichia fergusonii), 에스케리키아 헤르마니(Escherichia hermannii), 에스케리키아 불네리스(Escherichia vulneris)등일 수 있으며, The microorganisms of the Escherichia genus are specifically, Escherichia albertii , Escherichia coli, Escherichia fergusonii , Escherichia hermannii , S. It may be Escherichia vulneris , etc.

더욱 구체적으로는, 본 발명의 미생물은, 에스케리키아 콜라이일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.More specifically, the microorganism of the present invention may be Escherichia coli, but is not limited thereto.

본 발명의 미생물에서 폴리뉴클레오티드의 일부 또는 전체의 변형은 (a) 미생물 내 염색체 삽입용 벡터를 이용한 상동 재조합 또는 유전자가위(engineered nuclease, e.g., CRISPR-Cas9)을 이용한 유전체 교정 및/또는 (b) 자외선 및 방사선 등과 같은 빛 및/또는 화학물질 처리에 의해 유도될 수 있으나 이에 제한되지 않는다. 상기 유전자 일부 또는 전체의 변형 방법에는 DNA 재조합 기술에 의한 방법이 포함될 수 있다. 예를 들면, 목적 유전자와 상동성이 있는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 뉴클레오티드 서열 또는 벡터를 상기 미생물에 주입하여 상동 재조합(homologous recombination)이 일어나게 함으로써 유전자 일부 또는 전체의 결손이 이루어질 수 있다. 상기 주입되는 뉴클레오티드 서열 또는 벡터는 우성 선별 마커를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. Modification of part or all of the polynucleotide in the microorganism of the present invention is (a) homologous recombination using a vector for chromosome insertion into the microorganism or genome editing using engineered nuclease (e.g., CRISPR-Cas9) and/or (b) It may be induced by, but is not limited to, light and/or chemical treatment, such as ultraviolet rays and radiation. The method of modifying part or all of the gene may include a method using DNA recombination technology. For example, a nucleotide sequence or vector containing a nucleotide sequence homologous to the gene of interest is injected into the microorganism to cause homologous recombination, thereby causing deletion of part or all of the gene. The injected nucleotide sequence or vector may include, but is not limited to, a dominant selection marker.

본 발명의 일 구현예에서, 이소부탄올 합성 오페론(alsS, kivD, ilvC, ilvD)을 포함하는 균주에 PHB 합성 오페론(bktB, phaB, phaC)을 도입하여 이소부탄올 및 PHB 동시 생산 균주를 제작한 결과, 세포 성장은 PHB 합성 오페론에 의해 활성화되었고(도 1A), 조작된 대장균에서 이소부탄올 생산은 약 1.6 배(1.14g/L) 증가하였다(도 1B). In one embodiment of the present invention, a strain producing isobutanol and PHB simultaneously was produced by introducing the PHB synthesis operon ( bktB , phaB , phaC ) into a strain containing the isobutanol synthesis operon ( alsS , kivD , ilvC , ilvD ). , cell growth was activated by the PHB synthesis operon (Figure 1A), and isobutanol production was increased approximately 1.6-fold (1.14 g/L) in the engineered E. coli (Figure 1B).

또한, PHB 합성 오페론에 의해 E. coli에 부여된 이소부탄올 생산성은 일반적으로 세포 성장에 비례하며, PHB 합성 오페론은 세포 활성을 활성화하는 것으로 나타났다(도 3). Additionally, the isobutanol productivity conferred to E. coli by the PHB synthesis operon is generally proportional to cell growth, and the PHB synthesis operon was shown to activate cell activity (Figure 3).

상기 결과를 통해 PHB 합성 오페론의 발현이 이소부탄올 생산을 향상시켰음을 확인하였다. The above results confirmed that expression of the PHB synthetic operon improved isobutanol production.

또한, 생합성 경로에서 보조 인자 분포는 바이오매스 축적과 대사 산물 생성의 균형을 맞추는 데 중요하며, 전자 전달 사슬과 TCA(tricarboxylic acid) 회로를 비롯하여 산화 환원 균형을 유지하는 것과 관련된 많은 경로가 존재한다. 이소부탄올 경로의 IlvC 및 ADH와 PHB 합성 경로의 PhaB는 NAD(P)H를 각각의 반응에 대한 보조 인자로 활용하는 것으로 알려져 있다. 따라서 이소부탄올과 PHB 합성 오페론 모두의 과발현은 산화 환원 불균형으로 이어질 수 있으며, 이는 다시 생산성을 제한할 수 있는 바, 보조 인자 형성의 원동력으로써 과발현할 유전자를 선별하였다.Additionally, the distribution of cofactors in biosynthetic pathways is important for balancing biomass accumulation and metabolite production, and there are many pathways involved in maintaining redox balance, including the electron transport chain and the tricarboxylic acid (TCA) cycle. IlvC and ADH in the isobutanol pathway and PhaB in the PHB synthesis pathway are known to utilize NAD(P)H as a cofactor for each reaction. Therefore, overexpression of both the isobutanol and PHB synthesis operons may lead to redox imbalance, which in turn may limit productivity, and genes to be overexpressed were selected as the driving force for cofactor formation.

이와 관련하여, 본 발명의 일 구현예에서, pntAB가 세포 성장과 이소부탄올(2.7g/L) 및 PHB 합성(0.52g/L)을 촉진하는 데 적극적인 역할을 하는 것으로 분석되어 이소부탄올 및 PHB 공동 생산에 적합함을 확인하였으며(도 4), 이소부탄올 합성 오페론 및 PHB 합성 오페론과 함께 균주 내에서 발현되었다.In this regard, in one embodiment of the present invention, pntAB was analyzed to play an active role in promoting cell growth and isobutanol (2.7 g/L) and PHB synthesis (0.52 g/L), resulting in isobutanol and PHB co-production. It was confirmed to be suitable for production (Figure 4), and was expressed in the strain together with the isobutanol synthesis operon and the PHB synthesis operon.

한편, 본 발명의 일 구현예에서, 본 발명의 이소부탄올 및 PHB 공동 생산 균주(BLpLISOpntAB)는 더 빠른 세포 성장과 더 높은 수율을 나타내었다(도 6A). 이소부탄올과 PHB 생산량은 각각 약 2.4g/L와 0.25g/L로 벡터 pRSFISO만을 포함하는 BLISO 균주보다 2 배 더 높았다(도 6B). 더욱이, 포도당 소비는 약간 더 빠르고 완전했으며, BLpLISOpntAB 균주의 배양에서 0.5g/L 미만의 아세테이트 축적이 유지되었다(도 6C, D). Meanwhile, in one embodiment of the present invention, the isobutanol and PHB co-producing strain (BLpLISOpntAB) of the present invention showed faster cell growth and higher yield (Figure 6A). Isobutanol and PHB production were approximately 2.4 g/L and 0.25 g/L, respectively, which were two times higher than that of the BLISO strain containing only the vector pRSFISO (Figure 6B). Moreover, glucose consumption was slightly faster and more complete, and acetate accumulation was maintained below 0.5 g/L in cultures of the BLpLISOpntAB strain (Figure 6C,D).

이러한 결과는 이소부탄올 및 PHB 공동 생산 균주가 견고함을 나타내었다. PHB 합성 경로는 PHB 생산을 위해 아세틸-CoA를 사용하는데, 이는 포도당이 유일한 탄소원일 때 아세테이트 오버 플로우(overflow)를 방지하였다. These results indicated that the isobutanol and PHB co-producing strains were robust. The PHB synthesis pathway uses acetyl-CoA for PHB production, which prevented acetate overflow when glucose was the only carbon source.

더욱이, 배양 배지에서 낮은 아세테이트 농도의 유지는 포도당 소비에 의해 입증된 바와 같이 포도당의 이용을 증가시켰다. 그 결과 대장균의 높은 대사 활성과 세포 성장으로 인해 이소부탄올 및 PHB 공동 생산에 유리함을 확인하였다.Moreover, maintaining low acetate concentrations in the culture medium increased the utilization of glucose as evidenced by glucose consumption. As a result, it was confirmed that the high metabolic activity and cell growth of E. coli are advantageous for the co-production of isobutanol and PHB.

또한, 균주의 삼투성 쇼크를 촉진할 수 있는 에탄올(40g/L), 이소프로판올(20g/L), 이소부탄올(10g/L), n-부탄올(10g/L)을 포함한 용매 독성 테스트를 수행한 결과, 발효 말기에 바이오매스의 양과 관련하여 PHB 모듈 시스템에 의해 세포 성장이 증가하였으며, 따라서 PHB 합성이 이소부탄올 스트레스에 대한 조작된 대장균의 내성을 증가시킬 수 있음을 확인하였다.In addition, solvent toxicity tests were performed including ethanol (40 g/L), isopropanol (20 g/L), isobutanol (10 g/L), and n-butanol (10 g/L), which can promote osmotic shock of the strain. As a result, cell growth was increased by the PHB module system in relation to the amount of biomass at the end of fermentation, thus confirming that PHB synthesis can increase the resistance of engineered E. coli to isobutanol stress.

즉, 본 발명에 따른 이소부탄올 및 PHB 공동 생산 균주는 증가된 세포 활성, 더 빠른 포도당 이용, 배양 배지에서의 더 낮은 아세테이트 축적을 나타냄을 확인하였다.That is, it was confirmed that the isobutanol and PHB co-producing strain according to the present invention exhibited increased cell activity, faster glucose utilization, and lower acetate accumulation in the culture medium.

본 발명의 다른 하나의 양태는 i) 본 발명의 균주를 배지에서 배양하는 단계; 및 ii) 상기 배양된 배지 및 균주로부터 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트를 회수하는 단계;를 포함하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트(PHB) 동시 생산 방법을 제공한다. Another aspect of the present invention includes i) culturing the strain of the present invention in a medium; and ii) recovering isobutanol and polyhydroxybutyrate from the cultured medium and strain; providing a method for simultaneous production of isobutanol and polyhydroxybutyrate (PHB).

본 발명에서, 용어 "배양"은 본 발명의 균주를 적당히 조절된 환경 조건에서 생육시키는 것을 의미한다. 본 발명의 배양과정은 당업계에 알려진 적당한 배지와 배양조건에 따라 이루어질 수 있다. 이러한 배양 과정은 선택되는 균주에 따라 당업자가 용이하게 조정하여 사용할 수 있다. 구체적으로 상기 배양은 회분식, 연속식 및/또는 유가식일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the term “culture” means growing the strain of the present invention under appropriately controlled environmental conditions. The culture process of the present invention can be carried out according to appropriate media and culture conditions known in the art. This culture process can be easily adjusted and used by a person skilled in the art depending on the strain selected. Specifically, the culture may be batch, continuous, and/or fed-batch, but is not limited thereto.

본 발명에서 용어, "배지"는 본 발명의 균주를 배양하기 위해 필요로 하는 영양물질을 주성분으로 혼합한 물질을 의미하며, 생존 및 발육에 불가결한 물을 비롯하여 영양물질 및 발육인자 등을 공급한다. 구체적으로, 본 발명의 균주의 배양에 사용되는 배지 및 기타 배양 조건은 통상의 미생물의 배양에 사용되는 배지라면 특별한 제한 없이 어느 것이나 사용할 수 있으나, 본 발명의 균주를 적당한 탄소원, 질소원, 인원, 무기화합물, 아미노산 및/또는 비타민 등을 함유한 통상의 배지 내에서 호기성 조건 하에서 온도, pH 등을 조절하면서 배양할 수 있다. In the present invention, the term "medium" refers to a material that is mainly mixed with nutrients necessary for cultivating the strain of the present invention, and supplies nutrients and growth factors, including water, which are essential for survival and growth. . Specifically, the medium and other culture conditions used for cultivating the strain of the present invention can be any medium used for cultivating ordinary microorganisms without particular limitation, but the strain of the present invention can be grown with an appropriate carbon source, nitrogen source, personnel, and inorganic substances. It can be cultured under aerobic conditions in a typical medium containing compounds, amino acids, and/or vitamins, while controlling temperature, pH, etc.

본 발명에서 상기 탄소원으로는 글루코오스, 사카로오스, 락토오스, 프룩토오스, 수크로오스, 말토오스 등과 같은 탄수화물; 만니톨, 소르비톨 등과 같은 당 알코올, 피루브산, 락트산, 시트르산 등과 같은 유기산; 글루탐산, 메티오닌, 리신 등과 같은 아미노산 등이 포함될 수 있다. 또한, 전분 가수분해물, 당밀, 블랙스트랩 당밀, 쌀겨울, 카사버, 사탕수수 찌꺼기 및 옥수수 침지액 같은 천연의 유기 영양원을 사용할 수 있으며, 구체적으로는 글루코오스 및 살균된 전처리 당밀(즉, 환원당으로 전환된 당밀) 등과 같은 탄수화물이 사용될 수 있으며, 그 외의 적정량의 탄소원을 제한 없이 다양하게 이용할 수 있다. 이들 탄소원은 단독으로 사용되거나 2 종 이상이 조합되어 사용될 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the carbon source includes carbohydrates such as glucose, saccharose, lactose, fructose, sucrose, maltose, etc.; Sugar alcohols such as mannitol, sorbitol, etc., organic acids such as pyruvic acid, lactic acid, citric acid, etc.; Amino acids such as glutamic acid, methionine, lysine, etc. may be included. Additionally, natural organic nutrient sources such as starch hydrolyzate, molasses, blackstrap molasses, rice bran, cassava, bagasse and corn steep liquor can be used, specifically glucose and sterilized pre-treated molasses (i.e. converted to reducing sugars). Carbohydrates such as molasses) can be used, and various other carbon sources in an appropriate amount can be used without limitation. These carbon sources may be used alone or in combination of two or more types, but are not limited thereto.

상기 질소원으로는 암모니아, 황산암모늄, 염화암모늄, 초산암모늄, 인산암모늄, 탄산안모늄, 질산암모늄 등과 같은 무기질소원; 글루탐산, 메티오닌, 글루타민 등과 같은 아미노산, 펩톤, NZ-아민, 육류 추출물, 효모 추출물, 맥아 추출물, 옥수수 침지액, 카세인 가수분해물, 어류 또는 그의 분해생성물, 탈지 대두 케이크 또는 그의 분해 생성물 등과 같은 유기 질소원이 사용될 수 있다. 이들 질소원은 단독으로 사용되거나 2 종 이상이 조합되어 사용될 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.The nitrogen source includes inorganic nitrogen sources such as ammonia, ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium acetate, ammonium phosphate, anmonium carbonate, and ammonium nitrate; Organic nitrogen sources such as amino acids such as glutamic acid, methionine, and glutamine, peptone, NZ-amine, meat extract, yeast extract, malt extract, corn steep liquor, casein hydrolyzate, fish or its decomposition products, defatted soybean cake or its decomposition products, etc. can be used These nitrogen sources may be used individually or in combination of two or more types, but are not limited thereto.

상기 인원으로는 인산 제1칼륨, 인산 제2칼륨, 또는 이에 대응되는 소디움-함유 염 등이 포함될 수 있다. 무기화합물로는 염화나트륨, 염화칼슘, 염화철, 황산마그네슘, 황산철, 황산망간, 탄산칼슘 등이 사용될 수 있으며, 그 외에 아미노산, 비타민 및/또는 적절한 전구체 등이 포함될 수 있다. 이들 구성성분 또는 전구체는 배지에 회분식 또는 연속식으로 첨가될 수 있다. 그러나, 이에 한정되는 것은 아니다.The agent may include monopotassium phosphate, dipotassium phosphate, or a corresponding sodium-containing salt. Inorganic compounds may include sodium chloride, calcium chloride, iron chloride, magnesium sulfate, iron sulfate, manganese sulfate, and calcium carbonate, and may also include amino acids, vitamins, and/or appropriate precursors. These components or precursors can be added to the medium batchwise or continuously. However, it is not limited to this.

본 발명의 균주의 배양 중에 수산화암모늄, 수산화칼륨, 암모니아, 인산, 황산 등과 같은 화합물을 배지에 적절한 방식으로 첨가하여, 배지의 pH를 조정할 수 있다. 또한, 배양 중에는 지방산 폴리글리콜 에스테르와 같은 소포제를 사용하여 기포 생성을 억제할 수 있다. 또한, 배지의 호기 상태를 유지하기 위하여, 배지 내로 산소 또는 산소 함유 기체를 주입하거나 혐기 및 미호기 상태를 유지하기 위해 기체의 주입 없이 혹은 질소, 수소 또는 이산화탄소 가스를 주입할 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.During cultivation of the strain of the present invention, the pH of the medium can be adjusted by adding compounds such as ammonium hydroxide, potassium hydroxide, ammonia, phosphoric acid, sulfuric acid, etc. to the medium in an appropriate manner. Additionally, during culturing, foam generation can be suppressed by using an antifoaming agent such as fatty acid polyglycol ester. In addition, to maintain the aerobic state of the medium, oxygen or oxygen-containing gas can be injected into the medium, or to maintain the anaerobic and microaerobic state, nitrogen, hydrogen, or carbon dioxide gas can be injected without gas injection, and is limited to this. That is not the case.

또한, 본 발명의 배지는 효모 추출물을 0.1%v/v 내지 1%v/v로 포함할 수 있고, 구체적으로 0.1%v/v 내지 0.6%v/v, 보다 구체적으로 0.3%v/v로 포함할 수 있다.Additionally, the medium of the present invention may contain yeast extract at 0.1%v/v to 1%v/v, specifically 0.1%v/v to 0.6%v/v, more specifically 0.3%v/v. It can be included.

상기 효모 추출물은 영양소가 풍부하기 때문에, 본 발명의 일 구현예에서는 세포 성장과 이소부탄올 역가가 배지에 첨가된 효모 추출물 농도에 비례하였다(도 4A 및 B). 0.3 %v/v 효모 추출물에서는 각각 1.4 및 0.2 g/L의 이소부탄올과 PHB가 생산되었으나 이러한 수준은 효모 추출물 농도가 0.3 %v/v보다 높았을 때 점차 감소하였다(도 4B). 따라서 이소부탄올과 PHB 공동 생산을 위한 효모 추출물 농도는 0.1%v/v 내지 0.6%v/v, 구체적으로 0.3%v/v가 최적 조건임을 확인하였다.Because the yeast extract is rich in nutrients, in one embodiment of the present invention, cell growth and isobutanol titer were proportional to the yeast extract concentration added to the medium (FIG. 4A and B). 0.3 %v/v yeast extract produced 1.4 and 0.2 g/L of isobutanol and PHB, respectively, but these levels gradually decreased when the yeast extract concentration was higher than 0.3 %v/v (Figure 4B). Therefore, it was confirmed that the optimal yeast extract concentration for co-production of isobutanol and PHB is 0.1%v/v to 0.6%v/v, specifically 0.3%v/v.

본 발명의 배양에서 배양온도는 20 내지 40℃, 구체적으로는 25 내지 37℃를 유지할 수 있고, 약 10 내지 160 시간 동안 배양할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. In the culture of the present invention, the culture temperature can be maintained at 20 to 40°C, specifically 25 to 37°C, and culture can be performed for about 10 to 160 hours, but is not limited thereto.

본 발명의 배양에 의하여 생산된 이소부탄올은 배지 중으로 분비되고, PHB는 세포 내에 잔류할 수 있다.Isobutanol produced by the culture of the present invention is secreted into the medium, and PHB may remain in the cells.

본 발명의 이소부탄올 및 PHB 생산 방법은, 본 발명의 균주를 준비하는 단계, 상기 균주를 배양하기 위한 배지를 준비하는 단계, 또는 이들의 조합(순서에 무관, in any order)을, 예를 들어, 상기 배양하는 단계 이전에, 추가로 포함할 수 있다. The isobutanol and PHB production method of the present invention includes preparing the strain of the present invention, preparing a medium for culturing the strain, or a combination thereof (in any order), for example , may be additionally included before the culturing step.

상기 방법은, 상기 배양된 배지 또는 균주로부터 이소부탄올 및 PHB를 회수할 수 있다.The method can recover isobutanol and PHB from the cultured medium or strain.

상기 회수는 본 발명의 미생물의 배양 방법, 예를 들어 회분식, 연속식 또는 유가식 배양 방법 등에 따라 당해 기술 분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 목적하는 IMP를 수집(collect)하는 것일 수 있다. 예를 들어, 원심분리, 여과, 결정화 단백질 침전제에 의한 처리(염석법), 추출, 초음파 파쇄, 한외여과, 투석법, 분자체 크로마토그래피(겔여과), 흡착크로마토그래피, 이온교환 크로마토그래피, 친화도 크로마토그래피 등의 각종 크로마토그래피, HPLC 또는 이들의 방법을 조합하여 사용될 수 있으며, 당해 분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 배지 또는 미생물로부터 목적하는 이소부탄올 및 PHB를 회수할 수 있다.The recovery may be to collect the desired IMP using a suitable method known in the art according to the method of cultivating the microorganism of the present invention, for example, a batch, continuous or fed-batch culture method. For example, centrifugation, filtration, crystallization, treatment with protein precipitants (salting out), extraction, ultrasonic disruption, ultrafiltration, dialysis, molecular sieve chromatography (gel filtration), adsorption chromatography, ion exchange chromatography, affinity. Various chromatographies such as chromatography, HPLC, or a combination of these methods can be used, and the desired isobutanol and PHB can be recovered from the medium or microorganisms using suitable methods known in the art.

구체적으로, 이소부탄올을 배지로부터 회수하고, 폴리히드록시 부티레이트를 균주로부터 회수할 수 있다.Specifically, isobutanol can be recovered from the medium and polyhydroxybutyrate can be recovered from the strain.

본 발명의 일 구현예에서, PHB와 이소부탄올은 발효 과정에서 각각 다른 위치(각각 세포 내 및 세포 외)에서 발견되었다(도 2). In one embodiment of the present invention, PHB and isobutanol were found in different locations (intracellular and extracellular, respectively) during the fermentation process (Figure 2).

즉, 본 발명에 따른 이소부탄올 및 PHB 공동 생산 균주는 발효가 완료되었을 때 PHB와 이소부탄올을 분리하기 위한 추가 공정이 필요하지 않음을 확인하였다.In other words, it was confirmed that the isobutanol and PHB co-producing strain according to the present invention does not require an additional process to separate PHB and isobutanol when fermentation is completed.

또한, 본 발명의 이소부탄올 및 PHB 생산 방법은, 추가적으로 정제 단계를 포함할 수 있다. 상기 정제는 당해 기술분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여, 수행할 수 있다. 일 예에서, 본 발명의 이소부탄올 및 PHB 생산 방법이 회수 단계와 정제 단계를 모두 포함하는 경우, 상기 회수 단계와 정제 단계는 순서에 상관없이 연속적 또는 비연속적으로 수행되거나, 동시에 또는 하나의 단계로 통합되어 수행될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.Additionally, the isobutanol and PHB production method of the present invention may additionally include a purification step. The purification can be performed using a suitable method known in the art. In one example, when the method for producing isobutanol and PHB of the present invention includes both a recovery step and a purification step, the recovery step and the purification step may be performed sequentially or discontinuously in any order, simultaneously or in one step. It may be performed in an integrated manner, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 하나의 양태는 본 발명의 균주 및 이의 배양액을 포함하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트(PHB) 동시 생산용 조성물을 제공한다.Another aspect of the present invention provides a composition for simultaneous production of isobutanol and polyhydroxybutyrate (PHB), comprising the strain of the present invention and its culture medium.

여기에서 사용되는 용어는 전술한 바와 같다.The terms used here are the same as described above.

상기 조성물은 본 발명의 균주 및 이의 배양액을 포함하며, 추가로 상기 균주의 이소부탄올 및 PHB 동시 생산을 증대시킬 수 있을 구성을 제한 없이 포함할 수 있다.The composition includes the strain of the present invention and its culture medium, and may further include without limitation components that can increase the simultaneous production of isobutanol and PHB by the strain.

본 발명에 따른 이소부탄올(isobutanol) 및 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 동시 생산 균주는 배양 배지와 세포 덩어리를 동시에 활용하여 경제적이고, 증가된 세포 활성 및 더 빠른 포도당 이용을 나타내고, 균주의 견고성이 향상되고, 유전자 삭제 없이 발효 중에 아세테이트 축적을 줄일 수 있고, 최종 산물을 분리하기 위한 추가 공정이 필요하지 않은 바, 이소부탄올 및 PHB의 산업 생산에 적용될 수 있다.The strain for simultaneous production of isobutanol and polyhydroxybutyrate (PHB) according to the present invention is economical by simultaneously utilizing culture medium and cell mass, exhibits increased cell activity and faster glucose utilization, and robustness of the strain. This is improved, can reduce acetate accumulation during fermentation without gene deletion, and does not require additional processes to separate the final product, so it can be applied to the industrial production of isobutanol and PHB.

도 1은 이소부탄올(isobutanol) 생산에 대한 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 합성 오페론의 영향을 나타낸 도이다. BLISO 및 BLpLISO 균주는 이소부탄올 및 세포 성장에 대한 비교 분석을 위해 72 시간 동안 배양되었다. A: 형질전환된 대장균(Escherichia coli, E. coli)의 세포 성장에 대한 PHB 오페론의 효과. B: 이소부탄올 생산성에 대한 PHB 오페론의 효과. 오차 막대는 3 회 반복 실험의 표준 편차를 나타낸다.
도 2는 이소부탄올 및 PHB 공동 생산 방법의 모식도이다.
도 3은 BL21(DE3) 및 BLpL의 성장 프로파일링을 나타낸 도이다.
도 4는 다양한 효모 추출물 농도를 사용하여 형질전환된 E. coli에서 이소부탄올 및 PHB 공동 생산을 위한 최적 농도를 확인한 결과이다. A: 배양 배지에서 다양한 양의 효모 추출물의 존재 하에서 형질전환된 E. coli의 세포 성장. B: 배양 배지에서 다양한 양의 효모 추출물 존재 하에서 형질전환된 대장균의 이소부탄올 및 PHB 생산성. 오차 막대는 3 회 반복 실험의 표준 편차를 나타낸다.
도 5는 이소부탄올 및 PHB 공동 생산에 대한 보조 인자 공학의 효과를 확인한 도이다. A: 이소부탄올 및 PHB 생산 경로에서 NAD(P)H 비용. B, C, D: 형질전환된 E. coli의 세포 성장 (B), 이소부탄올 생산성 (C) 및 PHB 생산성 (D)에 대한 보조 인자 공학의 효과. 오차 막대는 3 회 반복 실험의 표준 편차를 나타낸다.
도 6은 플라스크 배양 중 BLISO 및 BLpLISOpntAB 균주의 이소부탄올 및 PHB 생산능을 나타낸 도이다. BLISO 및 BLpLISOpntAB 균주는 72 시간 동안 배양되었으며, 세포 성장 (A), 이소부탄올 및 PHB 생산 (B), 잔류 포도당 검출 (C) 및 시간 경과에 따른 아세테이트 함량을 분석하였다. 오차 막대는 3 회 반복 실험의 표준 편차를 나타낸다.
도 7은 용매 스트레스 하에서 BLISO 및 BLpLISOpntAB 균주의 성장 곡선을 확인한 도이다. 에탄올 (A), 이소프로판올 (B), 이소부탄올 (C) 또는 n-부탄올 (D)에 의한 스트레스 하에서 BLISO 및 BLpLISOpntAB 균주 성장을 비교하였다. 약어: EtOH, Ethanol; IPA, 이소프로판올; IBOH, 이소 부탄올; NBA, N-부탄올. 오차 막대는 3 회 반복 실험의 표준 편차를 나타낸다.
Figure 1 is a diagram showing the effect of the polyhydroxybutyrate (PHB) synthesis operon on isobutanol production. BLISO and BLpLISO strains were cultured for 72 h for comparative analysis of isobutanol and cell growth. A: Effect of PHB operon on cell growth of transformed Escherichia coli ( E. coli ). B: Effect of PHB operon on isobutanol productivity. Error bars represent the standard deviation of three replicate experiments.
Figure 2 is a schematic diagram of the co-production method of isobutanol and PHB.
Figure 3 is a diagram showing growth profiling of BL21(DE3) and BLpL.
Figure 4 shows the results of confirming the optimal concentration for co-production of isobutanol and PHB in E. coli transformed using various yeast extract concentrations. A: Cell growth of transformed E. coli in the presence of various amounts of yeast extract in culture medium. B: Isobutanol and PHB productivity of transformed E. coli in the presence of various amounts of yeast extract in culture medium. Error bars represent the standard deviation of three replicate experiments.
Figure 5 is a diagram confirming the effect of cofactor engineering on isobutanol and PHB co-production. A: NAD(P)H cost in isobutanol and PHB production pathways. B, C, D: Effect of cofactor engineering on cell growth (B), isobutanol productivity (C) and PHB productivity (D) of transformed E. coli . Error bars represent the standard deviation of three replicate experiments.
Figure 6 is a diagram showing the isobutanol and PHB production capacity of BLISO and BLpLISOpntAB strains during flask culture. BLISO and BLpLISOpntAB strains were cultured for 72 h and analyzed for cell growth (A), isobutanol and PHB production (B), residual glucose detection (C), and acetate content over time. Error bars represent the standard deviation of three replicate experiments.
Figure 7 is a diagram confirming the growth curves of BLISO and BLpLISOpntAB strains under solvent stress. Growth of BLISO and BLpLISOpntAB strains was compared under stress by ethanol (A), isopropanol (B), isobutanol (C), or n-butanol (D). Abbreviations: EtOH, Ethanol; IPA, isopropanol; IBOH, isobutanol; NBA, N-butanol. Error bars represent the standard deviation of three replicate experiments.

이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 실시예를 들어 상세하게 설명하기로 한다. 다만 하기의 실시예는 본 발명의 내용을 예시하는 것일 뿐 본 발명의 범위가 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 실시예는 당업계에서 평균적인 지식을 가진 자에게 본 발명을 보다 완전하게 설명하기 위해 제공되는 것이다.Hereinafter, the present invention will be described in detail through examples to aid understanding. However, the following examples only illustrate the content of the present invention and the scope of the present invention is not limited to the following examples. Examples of the present invention are provided to more completely explain the present invention to those skilled in the art.

실시예 1. 이소부탄올(isobutanol) 및 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 동시 생산 균주 제작Example 1. Preparation of strains for simultaneous production of isobutanol and polyhydroxybutyrate (PHB)

1-1. 이소부탄올 합성 오페론을 포함하는 균주 제작1-1. Construction of strains containing the isobutanol synthesis operon

모든 대장균(Escherichia coli, E. coli)은 LB(lysogeny broth) 배지에서 배양하였다. 플라스미드 구축을 위해, 열충격(heatshock) 방법을 사용하였고 E. coli DH5α를 클로닝 숙주로 사용하였다. 모든 PCR 반응 및 라이게이션(ligation)은 nPfu-Forte DNA 중합 효소 및 T4 DNA 리가아제를 사용하여 수행되었다. All Escherichia coli ( E. coli ) were cultured in LB (lysogeny broth) medium. To construct the plasmid, the heatshock method was used and E. coli DH5α was used as a cloning host. All PCR reactions and ligation were performed using nPfu-Forte DNA polymerase and T4 DNA ligase.

pRSFISO를 구축하기 위해, ATG로 변형된 TTG를 갖는 시작 코돈을 사용하여 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis, B. subtilis) 168로부터 alsS(acetolactate synthase)(서열번호 1)를 서열번호 23 및 서열번호 24의 프라이머 쌍을 이용하여 증폭시켰다. 그런 다음 pRSFDuet-1과 증폭된 alsS를 BamHI 및 SacI로 분해하고 라이게이션시켰다. 다음으로, 락토코커스 락티스 아종 락티스(Lactococcus lactis subsp. lactis KF147, L. lactis subsp. lactis KF147)로부터 kivD(alpha-ketoisovalerate decarboxylase)(서열번호 3)를 서열번호 25 및 서열번호 26의 프라이머 쌍을 이용하여 증폭하고, NdeI 및 XhoI 위치에 추가로 클로닝하였다. E. coli MG1655를 주형으로 한 ilvC(ketol-acid reductoisomerase)(서열번호 5)를 서열번호 27 및 서열번호 28의 프라이머 쌍을 이용하여 증폭한 후 SacI와 SalI 제한 효소를 이용하여 도입하고, ilvD(dihydroxyacid dehydratase)(서열번호 7)를 서열번호 29 및 서열번호 30의 프라이머 쌍을 이용하여 증폭한 후 SalI와 NotI 제한 효소를 이용하여 도입하였다. 이를 통해, pRSFDuet-1에 B. subtilis 168의 alsS, L. lactis subsp. lactis KF147의 kivD, 및 E. coli MG1655의 ilvCD(ilvC ilvD)를 포함하는 이소부탄올 합성 경로가 도입된 벡터 pRSFISO가 제작되었다.To construct pRSFISO, use a start codon with TTG modified to ATG in Bacillus subtilis ( B. subtilis ) From 168, alsS (acetolactate synthase) (SEQ ID NO: 1) was amplified using the primer pair of SEQ ID NO: 23 and SEQ ID NO: 24. Then, pRSFDuet-1 and amplified alsS were digested with BamHI and SacI and ligated. Next, kivD (alpha-ketoisovalerate decarboxylase) (SEQ ID NO: 3) from Lactococcus lactis subsp. lactis KF147, L. lactis subsp. lactis KF147 was prepared using the primer pair of SEQ ID NO: 25 and SEQ ID NO: 26. It was amplified using and further cloned into NdeI and XhoI sites. ilvC (ketol-acid reductoisomerase) (SEQ ID NO: 5) using E. coli MG1655 as a template was amplified using the primer pair of SEQ ID NO: 27 and SEQ ID NO: 28, then introduced using SacI and SalI restriction enzymes, and ilvD ( dihydroxyacid dehydratase (SEQ ID NO: 7) was amplified using the primer pair of SEQ ID NO: 29 and SEQ ID NO: 30 and then introduced using SalI and NotI restriction enzymes. Through this, alsS of B. subtilis 168 and L. lactis subsp were added to pRSFDuet-1 . The vector pRSFISO was constructed into which the isobutanol synthesis pathway was introduced, including kivD from lactis KF147 and ilvCD ( ilvC and ilvD) from E. coli MG1655.

다음으로, 보조 인자 변조 시스템의 생성을 위해 pACYCDuet-1 플라스미드와 서열번호 31 및 서열번호 32의 프라이머 쌍과 서열번호 39 및 서열번호 40의 프라이머 쌍을 사용하여, E. coli MG1655의 pntAB(pyridine nucleotide transhydrogenase)(서열번호 9) 및 L. lactis subsp. lactis KF147의 noxE(NADH oxidase)(서열번호 21)를 각각 증폭 후 BamHI 및 SacI 제한 효소를 사용하여 pACYCDuet-1에 각각 클로닝하여 벡터 pHM55 및 pHS12을 제작하였다. 또한, 캔디다 보이디니(Candida boidinii, C. boidinii)의 fdh(formate dehydrogenase)(서열번호 17)를 서열번호 35 및 서열번호 36의 프라이머 쌍을 이용하여 증폭 후 NdeI 및 XhoI 부위에서 pACYCDuet-1에 도입하여 벡터 pHS13을 제작하였다.Next, for the generation of the cofactor modulation system, the pACYCDuet-1 plasmid and the primer pair of SEQ ID NO: 31 and SEQ ID NO: 32 and the primer pair of SEQ ID NO: 39 and SEQ ID NO: 40 were used to generate the pntAB (pyridine nucleotide) of E. coli MG1655. transhydrogenase) (SEQ ID NO: 9) and L. lactis subsp. NoxE (NADH oxidase) (SEQ ID NO: 21) of lactis KF147 was amplified and cloned into pACYCDuet-1 using BamHI and SacI restriction enzymes, respectively, to construct vectors pHM55 and pHS12. In addition, fdh (formate dehydrogenase) (SEQ ID NO: 17) of Candida boidinii ( Candida boidinii , C. boidinii ) was amplified using the primer pair of SEQ ID NO: 35 and SEQ ID NO: 36, and then introduced into pACYCDuet-1 at NdeI and XhoI sites. Vector pHS13 was created.

다음으로, 서열번호 35 및 서열번호 36의 프라이머 쌍과 서열번호 37 및 서열번호 38의 프라이머 쌍을 사용하여, E. coli MG1655의 fdh 또는 yfjB(NAD kinase)(서열번호 19)를 각각 증폭 후 pHM55의 NdeI 및 XhoI 부위에 각각 도입하여 조합 벡터 pHS14 및 pHS16을 제작하였다.Next, using the primer pair of SEQ ID NO: 35 and SEQ ID NO: 36 and the primer pair of SEQ ID NO: 37 and SEQ ID NO: 38, fdh or yfjB (NAD kinase) (SEQ ID NO: 19) of E. coli MG1655 was amplified, respectively, and then amplified at pHM55. Combination vectors pHS14 and pHS16 were constructed by introducing them into the NdeI and XhoI sites, respectively.

상기에서 제작된 벡터를 E. coli BL21(DE3)로 형질전환하여, 이소부탄올 및 PHB 생산을 위한 형질전환체를 제작하였다. 각 형질전환체는 5%(w/v%) 글루코스와 0.3%(w/v%) 효모 추출물을 포함하는 M9 최소 배지에서 0.1mM IPTG(Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside)와 함께 초기 pH 6.8로 배양되었다. 분취량(aliquot)은 간헐적으로 배양물에서 제거되고 수확되었다. 포도당과 유기산은 UV-vis와 굴절률 검출기가 있는 고압 액체 크로마토그래피로 정량화되었다. 이소 부탄올의 정량화를 위해 FID(flame ionization detector)를 사용하는 가스 크로마토그래피 분석(GC-FID)을 수행하였다. The vector constructed above was transformed into E. coli BL21(DE3) to produce transformants for isobutanol and PHB production. Each transformant was incubated with 0.1mM Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG) in M9 minimal medium containing 5% (w/v%) glucose and 0.3% (w/v%) yeast extract at an initial pH of 6.8. was cultured. Aliquots were removed from the culture intermittently and harvested. Glucose and organic acids were quantified by high-pressure liquid chromatography with UV-vis and refractive index detectors. Gas chromatographic analysis (GC-FID) using a flame ionization detector (FID) was performed to quantify isobutanol.

1-2. 이소부탄올 합성 오페론을 포함하는 균주에 PHB 합성 오페론 도입1-2. Introduction of the PHB synthesis operon into a strain containing the isobutanol synthesis operon.

실시예 1-1에서 제작된 형질전환체에 랄스토니아 유트로파(Ralstonia eutropha, R. eutropha) H16의 trc 프로모터 하의 bktB(beta-ketothiolase)(서열번호 11), phaB(acetoacetyl-CoA reductase)(서열번호 13) 및 phaC(poly(3-hydroxybutyrate) polymerase)(서열번호 15)를 각각 서열번호 33 및 서열번호 34의 프라이머 쌍, 서열번호 41 및 서열번호 42의 프라이머 쌍과, 서열번호 43 및 서열번호 44의 프라이머 쌍을 이용하여 증폭시키고, 증폭된 상기 각 유전자를 포함하는 이소부탄올 합성 경로 유전자를 포함하는 벡터 pLW487를 도입하여 PHB 합성 오페론 및 이소부탄올 합성 오페론을 모두 포함하는 균주(벡터 pLW487 및 pRSFISO를 포함하는 BLpL 균주, 벡터 pLW487, pRSFISO 및 pACYCDuet-1을 포함하는 BLpLISOACYC 균주, 벡터 pLW487, pRSFISO 및 pHS12을 포함하는 BLpLISOn 균주, 벡터 pLW487, pRSFISO 및 pHS13을 포함하는 BLpLISOfdh 균주, 벡터 pLW487, pRSFISO 및 pHS14을 포함하는 BLpLISOfp 균주, 벡터 pLW487, pRSFISO 및 pHS16을 포함하는 BLpLISOyp 균주, 벡터 pLW487, pRSFISO 및 pHM55을 포함하는 BLpLISOpntAB 균주)를 제작하고, PHB 합성 오페론이 이소부탄올 생산에 미치는 영향을 확인하였다. bktB (beta-ketothiolase) (SEQ ID NO: 11) and phaB (acetoacetyl-CoA reductase) under the trc promoter of Ralstonia eutropha ( R. eutropha ) H16 in the transformant prepared in Example 1-1. (SEQ ID NO: 13) and phaC (poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (SEQ ID NO: 15) with the primer pair of SEQ ID NO: 33 and SEQ ID NO: 34, the primer pair of SEQ ID NO: 41 and SEQ ID NO: 42, and SEQ ID NO: 43 and It was amplified using the primer pair of SEQ ID NO: 44, and vector pLW487 containing the isobutanol synthesis pathway genes including each of the amplified genes was introduced to create a strain containing both the PHB synthesis operon and the isobutanol synthesis operon (vectors pLW487 and BLpL strain containing pRSFISO, BLpLISOACYC strain containing vectors pLW487, pRSFISO and pACYCDuet-1, BLpLISOn strain containing vectors pLW487, pRSFISO and pHS12, BLpLISOfdh strain containing vectors pLW487, pRSFISO and pHS13, vectors pLW487, pRSFISO and BLpLISOpp strain containing pHS14, BLpLISOyp strain containing vectors pLW487, pRSFISO and pHS16, BLpLISOpntAB strain containing vectors pLW487, pRSFISO and pHM55) were constructed, The effect of the PHB synthetic operon on isobutanol production was confirmed.

상기 균주를 각각 배양한 결과, 세포 성장은 R. eutropha H16의 추가 PHB 합성 오페론에 의해 활성화되었고(도 1A), 조작된 대장균에서 이소부탄올 생산은 약 1.6 배(1.14g/L) 증가하였다(도 1B). As a result of culturing each of the above strains, cell growth was activated by the additional PHB synthesis operon of R. eutropha H16 (Figure 1A), and isobutanol production was increased approximately 1.6-fold (1.14 g/L) in the engineered E. coli (Figure 1A). 1B).

PHB와 이소부탄올은 발효 과정에서 각각 다른 위치(각각 세포 내 및 세포 외)에서 발견되었다(도 2). 이 특성으로 인해 발효가 완료되었을 때 산물을 분리하기 위한 추가 공정이 필요하지 않음을 확인하였다. PHB and isobutanol were found in different locations (intracellular and extracellular, respectively) during the fermentation process (Figure 2). Due to this property, it was confirmed that no additional process to separate the product was required when fermentation was completed.

또한, PHB 합성 오페론에 의해 E. coli에 부여된 이소부탄올 생산성은 일반적으로 세포 성장에 비례하며, PHB 합성 오페론은 세포 활성을 활성화하는 것으로 나타났다(도 3). Additionally, the isobutanol productivity conferred to E. coli by the PHB synthesis operon is generally proportional to cell growth, and the PHB synthesis operon was shown to activate cell activity (Figure 3).

상기 결과를 통해 PHB 합성 오페론의 발현이 이소부탄올 생산을 향상시켰음을 알 수 있다. The above results show that expression of the PHB synthetic operon improved isobutanol production.

여기에서 개시된 플라스미드 및 균주는 하기 표 1과 같다.The plasmids and strains disclosed herein are shown in Table 1 below.

실시예 2. PHB와 이소부탄올 공동 생산을 위한 최적의 효모 추출물 농도 분석Example 2. Analysis of optimal yeast extract concentration for co-production of PHB and isobutanol

PHB 합성은 배지의 질소원에 의해 결정적으로 영향을 받으며, 특히 세포가 질소 제한 성장기에 들어가면 PHB 합성 오페론이 활성화되고 고분자 생산이 시작된다. 반면에 효모 추출물과 같은 질소가 풍부한 화합물은 최적의 이소부탄올 생산을 위해 필요하다. 즉, PHB와 이소부탄올 모두 질소원에 민감하기 때문에 생산에 필요한 효모 추출물의 농도를 최적화하였다. PHB synthesis is critically influenced by the nitrogen source in the medium, and especially when cells enter the nitrogen-limited growth phase, the PHB synthesis operon is activated and polymer production begins. On the other hand, nitrogen-rich compounds such as yeast extract are required for optimal isobutanol production. In other words, since both PHB and isobutanol are sensitive to nitrogen sources, the concentration of yeast extract required for production was optimized.

그 결과, 효모 추출물은 영양소가 풍부하기 때문에 세포 성장과 이소부탄올 역가는 배지에 첨가된 효모 추출물 농도에 비례하였다(도 4A 및 B). 0.3 %v/v 효모 추출물에서는 이전 방법(Bhatia, S.K., et al. 2019. Poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate) production from engineered Ralstonia eutropha using synthetic and anaerobically digested food waste derived volatile fatty acids. Int. J. Biol. Macromol. 133, 1-10.)을 사용한 GC-FID에 의해 확인된 바와 같이 각각 1.4 및 0.2 g/L의 이소부탄올과 PHB가 생산되었으나 이러한 수준은 효모 추출물 농도가 0.3 %v/v보다 높았을 때 점차 감소하였다(도 4B). 따라서 이소부탄올과 PHB 공동 생산을 위한 효모 추출물 농도는 이후 실시예에서 0.3 %v/v으로 사용되었다.As a result, because yeast extract is rich in nutrients, cell growth and isobutanol titer were proportional to the yeast extract concentration added to the medium (Figure 4A and B). In 0.3%v/v yeast extract, the previous method (Bhatia, S.K., et al. 2019. Poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate) production from engineered Ralstonia eutropha using synthetic and anaerobically digested food waste derived volatile fatty acids. Int 1.4 and 0.2 g/L of isobutanol and PHB, respectively, were produced as confirmed by GC-FID using J. Biol. Macromol. 133, 1-10.), but these levels were achieved at a yeast extract concentration of 0.3%v When it was higher than /v, it gradually decreased (Figure 4B). Therefore, the yeast extract concentration for co-production of isobutanol and PHB was used as 0.3%v/v in the subsequent examples.

실시예 3. PHB 및 이소 부탄올 공동 생산을 위한 보조 인자 공학에 의한 NADP(H) 조작Example 3. NADP(H) manipulation by cofactor engineering for co-production of PHB and isobutanol

이소부탄올과 PHB 합성의 대사 경로에는 각각 2 mol과 1 mol의 NAD(P)H가 필요하였다(도 5A). 구체적으로 이소부탄올 경로의 IlvC 및 ADH와 PHB 합성 경로의 PhaB는 NAD(P)H를 각각의 반응에 대한 보조 인자로 활용하는 것으로 알려져 있다. 따라서 이소부탄올과 PHB 합성 오페론 모두의 과발현은 산화 환원 불균형으로 이어질 수 있으며, 이는 다시 생산성을 제한할 수 있다. The metabolic pathways of isobutanol and PHB synthesis required 2 mol and 1 mol of NAD(P)H, respectively (Figure 5A). Specifically, IlvC and ADH in the isobutanol pathway and PhaB in the PHB synthesis pathway are known to utilize NAD(P)H as a cofactor for each reaction. Therefore, overexpression of both isobutanol and PHB synthetic operons may lead to redox imbalance, which in turn may limit productivity.

많은 잠재적 후보 중에서 C. boidiniifdh, E. colipntAByfjB, L. lactis subsp. lactis KF147의 H2O-forming noxE가 보조 인자 형성의 원동력으로써 과발현되었다. Among many potential candidates, fdh from C. boidinii , pntAB and yfjB from E. coli , L. lactis subsp. HO-forming noxE from lactis KF147 was overexpressed as a driving force for cofactor formation.

보조 인자 재생 시스템의 단일 또는 조합 발현을 적용하여 세포 성장과 이소부탄올 및 PHB 생산을 조사한 결과, 결과적으로 모든 균주의 세포 성장이 증가하였으나 BLpLISOpntAB 및 BLpLISOnoxE 균주의 경우 특히 높았다(도 5B). Applying single or combined expression of the cofactor regeneration systems to examine cell growth and isobutanol and PHB production resulted in increased cell growth for all strains, but was especially high for the BLpLISOpntAB and BLpLISONoxE strains (Figure 5B).

fdh의 경우, 발현 결과 이소부탄올과 PHB 합성이 감소했기 때문에 이소부탄올과 PHB 생산에 해로운 영향을 주는 것으로 분석되었다(도 5C, D). 또한, fdhnoxE를 발현하는 균주를 제외한 모든 균주에서는 이소부탄올 생산이 증가하였다(도 4C). In the case of fdh , it was analyzed to have a detrimental effect on isobutanol and PHB production because the expression resulted in a decrease in isobutanol and PHB synthesis (Figure 5C, D). In addition, isobutanol production increased in all strains except those expressing fdh and noxE (Figure 4C).

noxE의 경우, 유전자 산물은 NADH 대 NAD+ 비율을 조작하여 전자 전달 사슬의 제한된 기능을 보완함으로써 포도당 활용을 활성화하는 것으로 알려져 있으며, 이는 아세틸-CoA 생성에 대한 대사 흐름을 유도하여 PHB 생산을 증가시킬 수 있다. 따라서, noxE는 세포 성장의 견고성을 증가시키는 것처럼 보였지만 이소부탄올 역가는 증가시키지 않았으며, 이는 noxE가 NAD+를 주요 산물로 생성하기 때문으로 분석되었다. 그러나 이러한 형태의 보조인자는 이소부탄올 생산을 위한 바람직한 공급원이 아니므로 세포 성장과 PHB 생산만을 증가시켰다.In the case of noxE , the gene product is known to activate glucose utilization by manipulating the NADH to NAD+ ratio to compensate for the limited function of the electron transport chain, which can increase PHB production by directing metabolic flux toward acetyl-CoA production. there is. Therefore, noxE seemed to increase the robustness of cell growth but did not increase isobutanol titer, which was analyzed to be because noxE produces NAD+ as its main product. However, this form of cofactor was not a desirable source for isobutanol production and only increased cell growth and PHB production.

결론적으로, pntAB가 세포 성장과 이소부탄올(2.7g/L) 및 PHB 합성(0.52g/L)을 촉진하는 데 적극적인 역할을 하는 것으로 분석되어 이소부탄올 및 PHB 공동 생산에 적합함을 확인하였다.In conclusion, pntAB was found to play an active role in promoting cell growth and isobutanol (2.7 g/L) and PHB synthesis (0.52 g/L), confirming that it is suitable for co-production of isobutanol and PHB.

실시예 5. PHB 및 보조 인자 공학에 의한 세포 활성 증가에 따른 이소부탄올 생산Example 5. Isobutanol production due to increased cell activity by PHB and cofactor engineering

세포 성장, 이소부탄올 및 PHB 생산, 포도당 소비 및 아세테이트 축적을 모니터링하기 위해 이소부탄올 및 PHB의 공동 생산을 수행하였다. Co-production of isobutanol and PHB was performed to monitor cell growth, isobutanol and PHB production, glucose consumption and acetate accumulation.

배양 72 시간 동안, BLpLISOpntAB 균주는 더 빠른 세포 성장과 더 높은 수율을 나타내었다(도 6A). 이소부탄올과 PHB 생산량은 각각 약 2.4g/L와 0.25g/L로 벡터 pRSFISO만을 포함하는 BLISO 균주보다 2 배 더 높았다(도 6B). 더욱이, 포도당 소비는 약간 더 빠르고 완전했으며, BLpLISOpntAB 균주의 배양에서 0.5g/L 미만의 아세테이트 축적이 유지되었다(도 6C, D). During 72 hours of culture, the BLpLISOpntAB strain showed faster cell growth and higher yield (Figure 6A). Isobutanol and PHB production were approximately 2.4 g/L and 0.25 g/L, respectively, which were two times higher than that of the BLISO strain containing only the vector pRSFISO (Figure 6B). Moreover, glucose consumption was slightly faster and more complete, and acetate accumulation was maintained below 0.5 g/L in cultures of the BLpLISOpntAB strain (Figure 6C,D).

이러한 결과는 이소부탄올 및 PHB 공동 생산 균주가 견고함을 나타내었다. PHB 합성 경로는 PHB 생산을 위해 아세틸-CoA를 사용하는데, 이는 포도당이 유일한 탄소원일 때 아세테이트 오버 플로우(overflow)를 방지하였다. These results indicated that the isobutanol and PHB co-producing strains were robust. The PHB synthesis pathway uses acetyl-CoA for PHB production, which prevented acetate overflow when glucose was the only carbon source.

더욱이, 배양 배지에서 낮은 아세테이트 농도의 유지는 포도당 소비에 의해 입증된 바와 같이 포도당의 이용을 증가시켰다. 그 결과 대장균의 높은 대사 활성과 세포 성장으로 인해 이소부탄올 및 PHB 공동 생산에 유리함을 확인하였다.Moreover, maintaining low acetate concentrations in the culture medium increased the utilization of glucose as evidenced by glucose consumption. As a result, it was confirmed that the high metabolic activity and cell growth of E. coli are advantageous for the co-production of isobutanol and PHB.

실시예 6. PHB 합성 경로 발현에 의해 증가된 이소부탄올 내성 검정Example 6. Increased isobutanol tolerance assay by PHB synthesis pathway expression

균주의 삼투성 쇼크를 촉진할 수 있는 에탄올(40g/L), 이소프로판올(20g/L), 이소부탄올(10g/L), n-부탄올(10g/L)을 포함한 용매 독성 테스트를 수행하였다. Solvent toxicity tests were performed including ethanol (40 g/L), isopropanol (20 g/L), isobutanol (10 g/L), and n-butanol (10 g/L), which can promote osmotic shock of the strain.

그 결과, 도입된 유전자에 의한 대사적 부담으로 인해 초기 단계에서는 성장 속도가 저하되었지만, PHB를 생산하는 균주의 성장은 용매 쇼크 조건에서도 배양 시간이 진행됨에 따라 현저하게 높은 수준을 유지하였다(도 7A-D). 그러나 n-부탄올이 존재하는 경우 BLISO 균주의 경우에 비해 세포 성장이 5 일 동안 심각하게 제한되거나 중단되었다. As a result, although the growth rate was slowed in the early stages due to the metabolic burden caused by the introduced gene, the growth of the PHB-producing strain maintained a significantly high level as the culture time progressed even under solvent shock conditions (Figure 7A -D). However, in the presence of n-butanol, cell growth was severely restricted or stopped for 5 days compared to that for the BLISO strain.

다음으로, 특정 시점(100 시간)에서, 콜로니 형성 단위의 수를 확인하여 PHB 합성 오페론이 세포 성장을 활성화했는지 또는 바이오매스를 생성하는지를 분석한 결과, 실제로 생균 수는 PHB 합성 오페론에 의해 증가하지 않았지만(표 2), PHB 축적으로 인한 바이오매스 증가로 인해 광학 밀도의 증가가 발생하였다. Next, at a specific time point (100 hours), we analyzed whether the PHB synthesis operon activated cell growth or biomass production by determining the number of colony forming units, and found that, in fact, the number of viable cells was not increased by the PHB synthesis operon. (Table 2), an increase in optical density occurred due to an increase in biomass due to PHB accumulation.

전반적으로, 발효 말기에 바이오매스의 양과 관련하여 PHB 모듈 시스템에 의해 세포 성장이 증가하였으며, 따라서 PHB 합성이 이소부탄올 스트레스에 대한 조작된 대장균의 내성을 증가시킬 수 있음을 확인하였다. Overall, cell growth was increased by the PHB modular system in relation to the amount of biomass at the end of fermentation, thus confirming that PHB synthesis can increase the tolerance of engineered E. coli to isobutanol stress.

상기 결과를 통해 본 발명에 따른 이소부탄올 및 PHB 공동 생산 균주는 증가된 세포 활성, 더 빠른 포도당 이용, 배양 배지에서의 더 낮은 아세테이트 축적 및 최종 산물을 분리하기 위한 추가 공정이 필요하지 않음을 확인하였다.The above results confirmed that the isobutanol and PHB co-producing strain according to the present invention has increased cell activity, faster glucose utilization, lower acetate accumulation in the culture medium, and does not require additional processing to separate the final product. .

상기 실시예의 결과로부터, 본 발명에 따른 이소부탄올 및 PHB 동시 생산 균주는 배양 배지와 세포 덩어리를 동시에 활용하여 경제적이고, 증가된 세포 활성 및 더 빠른 포도당 이용을 나타내고, 균주의 견고성이 향상되고, 유전자 삭제 없이 발효 중에 아세테이트 축적을 줄일 수 있고, 최종 산물을 분리하기 위한 추가 공정이 필요하지 않은 바, 이소부탄올 및 PHB의 산업적 생산에 적용될 수 있다.From the results of the above examples, the isobutanol and PHB co-producing strain according to the present invention is economical by simultaneously utilizing culture medium and cell mass, exhibits increased cell activity and faster glucose utilization, improves strain robustness, and has It can be applied to the industrial production of isobutanol and PHB, as it can reduce acetate accumulation during fermentation without deletion and does not require additional processes to separate the final product.

이상의 설명으로부터, 본 발명이 속하는 기술 분야의 당업자는 본 발명이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 이와 관련하여, 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적인 것이 아닌 것으로 이해해야만 한다. 본 발명의 범위는 상기 상세한 설명보다는 후술하는 특허 청구범위의 의미 및 범위 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 발명의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.From the above description, those skilled in the art to which the present invention pertains will be able to understand that the present invention can be implemented in other specific forms without changing its technical idea or essential features. In this regard, the embodiments described above should be understood in all respects as illustrative and not restrictive. The scope of the present invention should be construed as including the meaning and scope of the patent claims described below rather than the detailed description above, and all changes or modified forms derived from the equivalent concept thereof are included in the scope of the present invention.

<110> KOREA INSTITUTE OF SCIENCE AND TECHNOLOGY <120> Isobutanol and polyhydroxybutyrate simultaneous production strain and use thereof <130> KPA201307-KR <160> 44 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 1713 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> alsS <400> 1 atgacaaaag caacaaaaga acaaaaatcc cttgtgaaaa acagaggggc ggagcttgtt 60 gttgattgct tagtggagca aggtgtcaca catgtatttg gcattccagg tgcaaaaatt 120 gatgcggtat ttgacgcttt acaagataaa ggacctgaaa ttatcgttgc ccggcacgaa 180 caaaacgcag cattcatggc ccaagcagtc ggccgtttaa ctggaaaacc gggagtcgtg 240 ttagtcacat caggaccggg tgcctctaac ttggcaacag gcctgctgac agcgaacact 300 gaaggagacc ctgtcgttgc gcttgctgga aacgtgatcc gtgcagatcg tttaaaacgg 360 acacatcaat ctttggataa tgcggcgcta ttccagccga ttacaaaata cagtgtagaa 420 gttcaagatg taaaaaatat accggaagct gttacaaatg catttaggat agcgtcagca 480 gggcaggctg gggccgcttt tgtgagcttt ccgcaagatg ttgtgaatga agtcacaaat 540 acgaaaaacg tgcgtgctgt tgcagcgcca aaactcggtc ctgcagcaga tgatgcaatc 600 agtgcggcca tagcaaaaat ccaaacagca aaacttcctg 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Ala Trp Arg Thr Asn Leu Pro 100 105 110 Tyr Arg Phe Ala Ala Ala Phe Tyr Leu Leu Asn Ala Arg Ala Leu Thr 115 120 125 Glu Leu Ala Asp Ala Val Glu Ala Asp Ala Lys Thr Arg Gln Arg Ile 130 135 140 Arg Phe Ala Ile Ser Gln Trp Val Asp Ala Met Ser Pro Ala Asn Phe 145 150 155 160 Leu Ala Thr Asn Pro Glu Ala Gln Arg Leu Leu Ile Glu Ser Gly Gly 165 170 175 Glu Ser Leu Arg Ala Gly Val Arg Asn Met Met Glu Asp Leu Thr Arg 180 185 190 Gly Lys Ile Ser Gln Thr Asp Glu Ser Ala Phe Glu Val Gly Arg Asn 195 200 205 Val Ala Val Thr Glu Gly Ala Val Val Phe Glu Asn Glu Tyr Phe Gln 210 215 220 Leu Leu Gln Tyr Lys Pro Leu Thr Asp Lys Val His Ala Arg Pro Leu 225 230 235 240 Leu Met Val Pro Pro Cys Ile Asn Lys Tyr Tyr Ile Leu Asp Leu Gln 245 250 255 Pro Glu Ser Ser Leu Val Arg His Val Val Glu Gln Gly His Thr Val 260 265 270 Phe Leu Val Ser Trp Arg Asn Pro Asp Ala Ser Met Ala Gly Ser Thr 275 280 285 Trp Asp Asp Tyr Ile Glu His Ala Ala Ile Arg Ala Ile Glu Val Ala 290 295 300 Arg Asp Ile Ser Gly Gln Asp Lys Ile Asn Val Leu Gly Phe Cys Val 305 310 315 320 Gly Gly Thr Ile Val Ser Thr Ala Leu Ala Val Leu Ala Ala Arg Gly 325 330 335 Glu His Pro Ala Ala Ser Val Thr Leu Leu Thr Thr Leu Leu Asp Phe 340 345 350 Ala Asp Thr Gly Ile Leu Asp Val Phe Val Asp Glu Gly His Val Gln 355 360 365 Leu Arg Glu Ala Thr Leu Gly Gly Gly Ala Gly Ala Pro Cys Ala Leu 370 375 380 Leu Arg Gly Leu Glu Leu Ala Asn Thr Phe Ser Phe Leu Arg Pro Asn 385 390 395 400 Asp Leu Val Trp Asn Tyr Val Val Asp Asn Tyr Leu Lys Gly Asn Thr 405 410 415 Pro Val Pro Phe Asp Leu Leu Phe Trp Asn Gly Asp Ala Thr Asn Leu 420 425 430 Pro Gly Pro Trp Tyr Cys Trp Tyr Leu Arg His Thr Tyr Leu Gln Asn 435 440 445 Glu Leu Lys Val Pro Gly Lys Leu Thr Val Cys Gly Val Pro Val Asp 450 455 460 Leu Ala Ser Ile Asp Val Pro Thr Tyr Ile Tyr Gly Ser Arg Glu Asp 465 470 475 480 His Ile Val Pro Trp Thr Ala Ala Tyr Ala Ser Thr Ala Leu Leu Ala 485 490 495 Asn Lys Leu Arg Phe Val Leu Gly Ala Ser Gly His Ile Ala Gly Val 500 505 510 Ile Asn Pro Pro Ala Lys Asn Lys Arg Ser His Trp Thr Asn Asp Ala 515 520 525 Leu Pro Glu Ser Pro Gln Gln Trp Leu Ala Gly Ala Ile Glu His His 530 535 540 Gly Ser Trp Trp Pro Asp Trp Thr Ala Trp Leu Ala Gly Gln Ala Gly 545 550 555 560 Ala Lys Arg Ala Ala Pro Ala Asn Tyr Gly Asn Ala Arg Tyr Arg Ala 565 570 575 Ile Glu Pro Ala Pro Gly Arg Tyr Val Lys Ala Lys Ala 580 585 <210> 17 <211> 1095 < 212> DNA <213> Unknown <220> <223> fdh <400> 17 atgaaaattg ttctggtgct gtatgatgcc ggcaaacatg cggccgatga agaaaaactg 60 tacggctgca ccgaaaacaa actgggtatc gcaaattggc tgaaagatca gggtcacgaa 120 ctgattacca cgag tgataa agaaggcggt aacagcgtgc tggatcagca tatcccggat 180 gccgatatta tcattaccac gccgtttcac ccggcatata tcacgaaaga acgcattgat 240 aaagcgaaaa aactgaaact ggtggttgtg gcgggcgttg gttctgatca tatcgatctg 300 gattacatta accagaccgg caagaaaatt agcgttctgg aagtgacggg tagcaatgtt 360 gtgtctgtgg cagaacacgt tgtgatgacc atgctggttc tggtgcgtaa ctttgttccg 420 gcgcatgaac agatcattaa tcacgatt gg gaagtggcag cgatcgcgaa agatgcctat 480 gatattgaag gcaaaaccat cgcgacgatt ggcgccggtc gtatcggtta ccgcgttctg 540 gaacgtctgg tgccgttcaa cccgaaagaa ctgctgtatt acgattatca ggccctgccg 600 aaagatgcag aagaaaaagt tggcgcgcgt cgcgtggaaa atatcgaaga actggttgcc 660 caggcagata ttgttaccgt gaacgcgccg ctgcacgcgg gcacgaaagg tctgatcaac 720 aaagaactgc tgagcaaatt caaaaaaggc gcgtggctgg ttaataccgc acgcggtgcg 780 atttgtgttg ccgaagatgt ggccgcagcg ctggaaagcg gtcagctgcg tggttatggc 840 ggtgatgtgt ggttcccgca gcc ggcaccg aaagatcatc cgtggcgtga tatgcgcaac 900 aaatatggcg ccggtaatgc aatgaccccg cactacagcg gcaccacgct ggatgcacag 960 acccgctatg cccagggcac gaaaaacatt ctggaatctt tctttaccgg taaattcgat 1020 taccgtccgc agg atatcat tctgctgaat ggcgaatatg tgacgaaagc gtacggtaaa 1080 cacgataaaa aatta 1095 <210> 18 <211> 365 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> fdh <400> 18 Met Lys Ile Val Leu Val Leu Tyr Asp Ala Gly Lys His Ala Ala Asp 1 5 10 15 Glu Glu Lys Leu Tyr Gly Cys Thr Glu Asn Lys Leu Gly Ile Ala Asn 20 25 30 Trp Leu Lys Asp Gln Gly His Glu Leu Ile Thr Thr Ser Asp Lys Glu 35 40 45 Gly Gly Asn Ser Val Leu Asp Gln His Ile Pro Asp Ala Asp Ile Ile 50 55 60 Ile Thr Thr Pro Phe His Pro Ala Tyr Ile Thr Lys Glu Arg Ile Asp 65 70 75 80 Lys Ala Lys Lys Leu Lys Leu Val Val Val Ala Gly Val Gly Ser Asp 85 90 95 His Ile Asp Leu Asp Tyr Ile Asn Gln Thr Gly Lys Lys Ile Ser Val 100 105 110 Leu Glu Val Thr Gly Ser Asn Val Val Ser Val Ala Glu His Val Val 115 120 125 Met Thr Met Leu Val Leu Val Arg Asn Phe Val Pro Ala His Glu Gln 130 135 140 Ile Ile Asn His Asp Trp Glu Val Ala Ala Ile Ala Lys Asp Ala Tyr 145 150 155 160 Asp Ile Glu Gly Lys Thr Ile Ala Thr Ile Gly Ala Gly Arg Ile Gly 165 170 175 Tyr Arg Val Leu Glu Arg Leu Val Pro Phe Asn Pro Lys Glu Leu Leu 180 185 190 Tyr Tyr Asp Tyr Gln Ala Leu Pro Lys Asp Ala Glu Glu Lys Val Gly 195 200 205 Ala Arg Arg Val Glu Asn Ile Glu Glu Leu Val Ala Gln Ala Asp Ile 210 215 220 Val Thr Val Asn Ala Pro Leu His Ala Gly Thr Lys Gly Leu Ile Asn 225 230 235 240 Lys Glu Leu Leu Ser Lys Phe Lys Lys Gly Ala Trp Leu Val Asn Thr 245 250 255 Ala Arg Gly Ala Ile Cys Val Ala Glu Asp Val Ala Ala Ala Leu Glu 260 265 270 Ser Gly Gln Leu Arg Gly Tyr Gly Gly Asp Val Trp Phe Pro Gln Pro 275 280 285 Ala Pro Lys Asp His Pro Trp Arg Asp Met Arg Asn Lys Tyr Gly Ala 290 295 300 Gly Asn Ala Met Thr Pro His Tyr Ser Gly Thr Thr Leu Asp Ala Gln 305 310 315 320 Thr Arg Tyr Ala Gln Gly Thr Lys Asn Ile Leu Glu Ser Phe Phe Thr 325 330 335 Gly Lys Phe Asp Tyr Arg Pro Gln Asp Ile Ile Leu Leu Asn Gly Glu 340 345 350 Tyr Val Thr Lys Ala Tyr Gly Lys His Asp Lys Lys Leu 355 360 365 <210> 19 <211> 879 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> yfjB(nadK) <400> 19 atgaataatc atttcaagtg tattggcatt gtgggacacc cacggcaccc cactgcactg 60 acaacacatg aaatgctcta ccgctggctg tgcacaaaag gttacgaggt catcgttgag 120 caacaaatcg ctcacgaact gcaactgaag aatgtgaaaa ctggcacgct cgcggagatt 180 gggcaactag ctgatctcgc ggtagtcgtt ggtggcgacg gtaatatgct gggcgcggca 240 cgcacactcg cccgttacga tattaaagtt attggaatca accgtggcaa cctgggtttc 300 ctgactgacc ttgaccccga taacgcccag caacagttag ccgatgtgct ggaaggccac 360 tacatcagcg agaaacgttt tttgctggaa gcgcaagtct gtcagcaaga ttgccagaaa 420 cgcatcagca ccgcgata aa tgaagtggtg cttcatccag gcaaagtggc gcatatgatt 480 gagttcgaag tgtatatcga cgagatcttt gcgttttctc agcgatctga tggactaatt 540 atttcgacgc caacaggctc caccgcctat tccctctctg caggcggtcc tattctgacc 600 ccctctctgg at gcgattac cctggtgccc atgttcccgc atacgttgtc agcacgacca 660 ctggtcataa acagcagcag cacgatccgt ctgcgttttt cgcatcgccg taacgacctg 720 gaaatcagtt gcgacagcca gatagcactg ccgattcagg aaggtgaaga tgtcctgatt 780 cgtcgctgtg attaccatct gaatctgatt catccgaaag attacagtta tttcaacaca 840 ttaagcacca agctcggctg gtcaaaaaaa tt attctaa 879 <210> 20 <211> 292 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> yfjB(nadK) <400 > 20 Met Asn Asn His Phe Lys Cys Ile Gly Ile Val Gly His Pro Arg His 1 5 10 15 Pro Thr Ala Leu Thr Thr His Glu Met Leu Tyr Arg Trp Leu Cys Thr 20 25 30 Lys Gly Tyr Glu Val Ile Val Glu Gln Gln Ile Ala His Glu Leu Gln 35 40 45 Leu Lys Asn Val Lys Thr Gly Thr Leu Ala Glu Ile Gly Gln Leu Ala 50 55 60 Asp Leu Ala Val Val Gly Gly Asp Gly Asn Met Leu Gly Ala Ala 65 70 75 80 Arg Thr Leu Ala Arg Tyr Asp Ile Lys Val Ile Gly Ile Asn Arg Gly 85 90 95 Asn Leu Gly Phe Leu Thr Asp Leu Asp Pro Asp Asn Ala Gln Gln Gln 100 105 110 Leu Ala Asp Val Leu Glu Gly His Tyr Ile Ser Glu Lys Arg Phe Leu 115 120 125 Leu Glu Ala Gln Val Cys Gln Gln Asp Cys Gln Lys Arg Ile Ser Thr 130 135 140 Ala Ile Asn Glu Val Val Leu His Pro Gly Lys Val Ala His Met Ile 145 150 155 160 Glu Phe Glu Val Tyr Ile Asp Glu Ile Phe Ala Phe Ser Gln Arg Ser 165 170 175 Asp Gly Leu Ile Ser Thr Pro Thr Gly Ser Thr Ala Tyr Ser Leu 180 185 190 Ser Ala Gly Gly Pro Ile Leu Thr Pro Ser Leu Asp Ala Ile Thr Leu 195 200 205 Val Pro Met Phe Pro His Thr Leu Ser Ala Arg Pro Leu Val Ile Asn 210 215 220 Ser Ser Ser Thr Ile Arg Leu Arg Phe Ser His Arg Arg Asn Asp Leu 225 230 235 240 Glu Ile Ser Cys Asp Ser Gln Ile Ala Leu Pro Ile Gln Glu Gly Glu 245 250 255 Asp Val Leu Ile Arg Arg Cys Asp Tyr His Leu Asn Leu Ile His Pro 260 265 270 Lys Asp Tyr Ser Tyr Phe Asn Thr Leu Ser Thr Lys Leu Gly Trp Ser 275 280 285 Lys Lys Leu Phe 290 <210> 21 <211> 1341 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> noxE <400> 21 atgaaaatcg tagttatcgg tacgaaccac gcaggcattg ctacagcaaa tacatttaatt 60 gatcaatatc caggccatga gattgttatg attgaccgga acagta atat gagttacttg 120 gggtgtggaa cagctatttg ggtcggaaga caaattgaaa aaccagatga gctgttttat 180 gccaaagcag aagatttga aaaaaagggga gtaaagatat taacagaaac agaagtttca 240 gaaattgact ttactaataa aatgatttat gccaagtcaa aaactggaga aaagattaca 300 gaaagttatg ataaactcgt tctggcaaca ggttcacgtc caattattcc taacttgcca 360 ggaaaagatc ttaaaggcat tcatttttta aaactttttc aagaagggca agccattgac 420 gaagagtttg ctaagaatga tgtgaaacgg attgctgtga ttggtgctgg ttatattggg 480 acagaaattg ctgaagctgc caaacgtcgt ggaaaagaag tcctactttt tgat gcagaa 540 agtacttcac ttgcttcata ttatgatgaa gagtttgcta aagggatgga tgaaaatctt 600 gcccaacatg gaattgaact ccattttggg gaattagctc aagagtttaa ggcaaatgaa 660 gaaggtcatg tatcacagat tgtaactaat aaatcaactt atgatgttga cctcgttat 720 aactgtattg gctttacagc caatagtgca ttggctggtg aacatttaga aacctttaaa 78 0 aatggagcaa tcaaagtgaa taaacatcaa caaagtagtg acccagatgt ttatgctgta 840 ggagatgttg ccacaatcta ttctaatgcg ttacaagact tcacctacat tgcccttgcc 900 tcaaacgctg ttcgctcagg gattgttgct ggtcataata ttggaggaaa atcaatagag 960 tctgttggtg tacaaggttc taatggaatc tctatttttg gctacaatat gacttctacg 1020 ggcttgtcgg ttaaagctgc taaaaaaatc ggcctagaag tttcatttag tgattttgaa 1080 gataagcaaa aagcatggtt ccttcatgaa aataatgata gtgtgaaaat tcgtatcgtt 1140 tatgaaacaa aaagtcgcag aattattggt gctcaacttg ctagcaagag tgaaataatt 1200 gca ggaaata ttaatatgtt tagtttagct attcaagaaa agaaaacgat tgatgaatta 1260 gccttacttg atttattttt cttaccacac ttcaatagtc catataatta catgactgtt 1320 gcagctttaa atgcaaaata a 1341 <210> 22 <211> 446 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> noxE <400> 22 Met Lys Ile Val Val Ile Gly Thr Asn His Ala Gly Ile Ala Thr Ala 1 5 10 15 Asn Thr Leu Ile Asp Gln Tyr Pro Gly His Glu Ile Val Met Ile Asp 20 25 30 Arg Asn Ser Asn Met Ser Tyr Leu Gly Cys Gly Thr Ala Ile Trp Val 35 40 45 Gly Arg Gln Ile Glu Lys Pro Asp Glu Leu Phe Tyr Ala Lys Ala Glu 50 55 60 Asp Phe Glu Lys Lys Gly Val Lys Ile Leu Thr Glu Thr Glu Val Ser 65 70 75 80 Glu Ile Asp Phe Thr Asn Lys Met Ile Tyr Ala Lys Ser Lys Thr Gly 85 90 95 Glu Lys Ile Thr Glu Ser Tyr Asp Lys Leu Val Leu Ala Thr Gly Ser 100 105 110 Arg Pro Ile Ile Pro Asn Leu Pro Gly Lys Asp Leu Lys Gly Ile His 115 120 125 Phe Leu Lys Leu Phe Gln Glu Gly Gln Ala Ile Asp Glu Glu Phe Ala 130 135 140 Lys Asn Asp Val Lys Arg Ile Ala Val Ile Gly Ala Gly Tyr Ile Gly 145 150 155 160 Thr Glu Ile Ala Glu Ala Ala Lys Arg Arg Gly Lys Glu Val Leu Leu 165 170 175 Phe Asp Ala Glu Ser Thr Ser Leu Ala Ser Tyr Tyr Asp Glu Glu Phe 180 185 190 Ala Lys Gly Met Asp Glu Asn Leu Ala Gln His Gly Ile Glu Leu His 195 200 205 Phe Gly Glu Leu Ala Gln Glu Phe Lys Ala Asn Glu Glu Gly His Val 210 215 220 Ser Gln Ile Val Thr Asn Lys Ser Thr Tyr Asp Val Asp Leu Val Ile 225 230 235 240 Asn Cys Ile Gly Phe Thr Ala Asn Ser Ala Leu Ala Gly Glu His Leu 245 250 255 Glu Thr Phe Lys Asn Gly Ala Ile Lys Val Asn Lys His Gln Gln Ser 260 265 270 Ser Asp Pro Asp Val Tyr Ala Val Gly Asp Val Ala Thr Ile Tyr Ser 275 280 285 Asn Ala Leu Gln Asp Phe Thr Tyr Ile Ala Leu Ala Ser Asn Ala Val 290 295 300 Arg Ser Gly Ile Val Ala Gly His Asn Ile Gly Gly Lys Ser Ile Glu 305 310 315 320 Ser Val Gly Val Gln Gly Ser Asn Gly Ile Ser Ile Phe Gly Tyr Asn 325 330 335 Met Thr Ser Thr Gly Leu Ser Val Lys Ala Ala Lys Lys Ile Gly Leu 340 345 350 Glu Val Ser Phe Ser Asp Phe Glu Asp Lys Gln Lys Ala Trp Phe Leu 355 360 365 His Glu Asn Asn Asp Ser Val Lys Ile Arg Ile Val Tyr Glu Thr Lys 370 375 380 Ser Arg Arg Ile Ile Gly Ala Gln Leu Ala Ser Lys Ser Glu Ile Ile 385 390 395 400 Ala Gly Asn Ile Asn Met Phe Ser Leu Ala Ile Gln Glu Lys Lys Thr 405 410 415 Ile Asp Glu Leu Ala Leu Leu Asp Leu Phe Phe Leu Pro His Phe Asn 420 425 430 Ser Pro Tyr Asn Tyr Met Thr Val Ala Ala Leu Asn Ala Lys 435 440 445 <210> 23 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> alsS F <400> 23 ctctctggat ccgatgacaa aagcaacaaa agaac 35 <210> 24 <211> 34 <212> DNA <213> Artificial sequence <220> <223> ALSS R <400> 24 CTCTGAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 34 <210> 25 <211> 34 <212> DNA <213> IVD F <400> 25 CTCTGAGC TCCCTAGAGAG ctttcgtttt catg 34 <210> 26 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> kivD R <400> 26 ctctctctcg agttatgatt tattttgttc agc 33 <210> 27 <211> 49 <212> DNA < 213> Artificial Sequence <220> <223> ilvC F <400> 27 ctctctgagc tcaaggagat ataccatggc taactacttc aatacactg 49 <210> 28 <211> 32 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ilvC R <400> 28 ctctctgtcg acttaacccg caacagcaat ac 32 <210> 29 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ilvD F <400> 29 ctctctgtcg acaaggagat ataccatgcc taagtaccgt tcc 43 <210> 30 <2 11> 32 < 212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ilvD R <400> 30 ctctctgcgg ccgcttaacc ccccagtttc ga 32 <210> 31 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pntAB F <400> 31 ctctctggat ccgatgcgaa ttggcatacc aagag 35 <210> 32 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pntAB R <400> 32 ctctctgagc tcttacagag ctttcaggat tgcatc 36 <210> 3 3 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> bktB F <400> 33 ctctctggat ccgatggcga ccggcaaagg cgc 33 <210> 34 <211> 32 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> bktB R <400> 34 ctctctacta gttcagccca tatgcaggcc gc 32 <210> 35 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> fdh F <400> 35 ctctctcata tgatgaaaat tgttctggtg ctgtatg 37 <21 0> 36 < 211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> fdh R <400> 36 ctctctctcg agtaattttt tatcgtgttt accgtacgc 39 <210> 37 <211> 38 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> < 223> yfjB(nadK) F <400> 37 ctctctggat ccgatgaata atcatttcaa gtgtattg 38 <210> 38 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> yfjB(nadK) R <400> 38 ctctctgagc tcttaga ata atttttttga ccagc 35 <210> 39 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> noxE F <400> 39 ctctctggat ccgatgaaaa tcgtagttat cgg 33 <210> 40 <211> 33 <212> DNA < 213> Artificial Sequence <220> <223> noxE R <400> 40 ctctctgagc tcttattttg catttaaagc tgc 33 <210> 41 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> phaB F <400> 41 GGCAGAATTC GCACTCAGC GCATTGTA TGT 33 <210> 42 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial sequence <210> 43 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> phaC F <400> 43 tacgaagctt atggcgaccg gcaaaggcgc 30 <210> 44 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> phaC R<400> 44 tggcggatcc tcatgccttg gctttgacg 29

Claims (11)

alsS, kivD, ilvC, ilvD 유전자 및 이들의 조합으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 이소부탄올(isobutanol) 합성 오페론, bktB, phaB, phaC 유전자 및 이들의 조합으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 폴리히드록시 부티레이트(polyhydroxybutyrate, PHB) 합성 오페론 및 pntAB 유전자를 발현하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트 동시 생산 균주로서,
상기 균주는 에스케리키아 콜라이(Escherichia coli)인 것인, 균주.
an isobutanol synthesis operon that is at least one selected from the group consisting of alsS, kivD, ilvC, ilvD genes and combinations thereof; a polyhydride that is at least one selected from the group consisting of bktB, phaB, phaC genes and combinations thereof A strain that simultaneously produces isobutanol and polyhydroxybutyrate, expressing polyhydroxybutyrate (PHB) synthetic operon and pntAB gene,
The strain is Escherichia coli.
삭제delete 삭제delete 삭제delete 제1항에 있어서, 상기 각 유전자는 각각 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5, 서열번호 7, 서열번호 9, 서열번호 11, 서열번호 13 및 서열번호 15의 폴리뉴클레오티드 서열로 구성된 것인, 균주.
The method of claim 1, wherein each gene consists of polynucleotide sequences of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, and SEQ ID NO: 15. , strain.
삭제delete 삭제delete i) 제1항 또는 제5항의 균주를 배지에서 배양하는 단계; 및
ii) 상기 배양된 배지 및 균주로부터 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트를 회수하는 단계;를 포함하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트 동시 생산 방법.
i) cultivating the strain of claim 1 or 5 in a medium; and
ii) recovering isobutanol and polyhydroxybutyrate from the cultured medium and strain; A method for simultaneously producing isobutanol and polyhydroxybutyrate.
제8항에 있어서, 상기 단계 i)의 배지는 효모 추출물을 0.1%v/v 내지 1%v/v로 포함하는 것인, 방법.
The method of claim 8, wherein the medium of step i) contains yeast extract at 0.1%v/v to 1%v/v.
제8항에 있어서, 상기 단계 ii)는 이소부탄올을 배지로부터 회수하고, 폴리히드록시 부티레이트를 균주로부터 회수하는 것인, 방법.
The method of claim 8, wherein in step ii), isobutanol is recovered from the medium and polyhydroxybutyrate is recovered from the strain.
제1항 또는 제5항의 균주 및 이의 배양액을 포함하는, 이소부탄올 및 폴리히드록시 부티레이트 동시 생산용 조성물.A composition for simultaneous production of isobutanol and polyhydroxybutyrate, comprising the strain of claim 1 or 5 and its culture medium.
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Chem. Rev. 2013, vol. 113, pp. 4611-4632.
Dyes and Pigments 2020, 173: 107889.
Metabolic Engineering 2014, 23, vol. pp. 78-91.

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