KR102573089B1 - Novel Biomarkers for Predicting Susceptibility to nonalcoholic fatty liver disease treatment agent and Uses Thereof - Google Patents
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Abstract
본 발명의 비알콜성 지방간 치료제인 OCA에 대한 감수성 예측용 바이오 마커를 이용하면, 개개의 환자의 상기 감수성을 치료 개시 전에 확실하게 판정할 수 있어, 불필요한 약물 투여를 최소화하고 치료 효율을 높일 수 있다.Using the biomarker for predicting susceptibility to OCA, a non-alcoholic fatty liver treatment agent of the present invention, it is possible to reliably determine the susceptibility of each patient before starting treatment, thereby minimizing unnecessary drug administration and increasing treatment efficiency. .
Description
본 발명은 비 알콜성 지방간 치료제에 대한 감수성 예측을 위한 바이오 마커 및 이의 용도에 관한 것이다.The present invention relates to a biomarker for predicting susceptibility to non-alcoholic fatty liver treatment and its use.
지방간 질환(fatty liver disease)이란, 지방간이라고도 불리며 간세포에 지방(트리글리세리드 등)이 이상 축적되는 것에 기인하여 간장애를 초래하는 질환이다. 지방간 질환의 초기 병태는 간세포에 지방 침착만을 인정하는 단순성 지방간이며, 그 후에 지방간염(간섬유증을 포함), 또한 간경변이나 간세포암으로 병태가 진행되는 것이 알려져 있다. 일반적으로, 간장에 지방이 침착되는 원인으로서는, 알콜성 섭취, 비만, 당뇨병, 지질대사 이상, 약제(스테로이드, 테트라사이클린 등), Cushing 증후군, 중독(황린 등), 고도의 영양 장애 등을 들 수 있다.Fatty liver disease (fatty liver disease), also called fatty liver, is a disease that causes liver failure due to abnormal accumulation of fat (triglyceride, etc.) in hepatocytes. It is known that the initial condition of fatty liver disease is simple fatty liver in which only fat deposition is recognized in hepatocytes, and then the condition progresses to steatohepatitis (including liver fibrosis), further cirrhosis, or hepatocellular carcinoma. In general, causes of fat deposition in the liver include alcohol consumption, obesity, diabetes, abnormal lipid metabolism, drugs (steroids, tetracycline, etc.), Cushing's syndrome, addiction (yellow phosphorus, etc.), and severe nutritional disorders. there is.
지방간 질환의 원인은 크게 알콜성과 비알콜성으로 나누어지며, 전자를 원인으로 하는 간 질환을 알콜성 지방간 질환(알콜성 간장해라고도 불린다), 후자를 원인으로 하는 간 질환을 비알콜성 지방간 질환(nonalcoholic fatty liver disease: NAFLD)이라고 부른다.The causes of fatty liver disease are largely divided into alcoholic and non-alcoholic. Liver disease caused by the former is alcoholic fatty liver disease (also called alcoholic liver disease), and liver disease caused by the latter is non-alcoholic fatty liver disease ( It is also called nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD).
비알콜성 지방간 질환이란, 간에 유해할 정도로 인정되는 알콜성 섭취 병력이 없음에도 불구하고 간 조직 검사에서 알콜성 간염의 특징적인 소견인 지방성 변화(fatty change, steatosis)와 소엽성간염(lobular hepatitis,steatohepatitis)등을 나타내는 경우를 말한다. 간의 병리소견은 단순 지방간(Non-Alcoholic Fatty Liver,NAFL)으로부터 지방간염(Non-Alcoholic Steatohepatits, NASH), 지방간염과 동반된 섬유화증, 간경변증 등의 다양한 스펙트럼을 나타내는데, 비알콜성 지방간 질환은 이 모두를 포함하는 의미로 사용된다.Non-alcoholic fatty liver disease is defined as fatty change (steatosis), lobular hepatitis, and fatty change (steatosis), which are characteristic findings of alcoholic hepatitis in a liver biopsy, despite the absence of a history of alcohol intake that is recognized as harmful to the liver. steatohepatitis). Pathological findings of the liver show a diverse spectrum from simple fatty liver (Non-Alcoholic Fatty Liver, NAFL) to Non-Alcoholic Steatohepatits (NASH), fibrosis accompanied by steatohepatitis, and cirrhosis. It is used in the sense of including all.
이러한 비알콜성 지방간 질환에서는 대부분 인슐린 저항성, 비만, 당뇨병 및 고지혈증을 동반하고 있다. 이러한 합병증이 존재하는 경우에는, 우선 그 치료를 실시하는 것이 필요하다. 비알콜성 지방간질환에 대한 치료의 원칙은, 식사 요법이나 운동요법 등의 생활 습관의 개선이지만, 확실하게 실행하는 것은 어려운 것이 현실이다. 비알콜성 지방간염에 있어서는, 간경변간세포암으로 진전될 가능성이 높은 점에서, 보다 적극적인 약물 치료가 필요하다. 비알콜성 지방간염의 병태 발증진행에 중요하다고 생각되고 있는 산화 스트레스나 인슐린 저항성 등의 개선을 목표로 한 치료도 시도되고 있지만, 충분한 과학적 근거가 확립된 치료법이 없는 것이 현실이다.Most of these non-alcoholic fatty liver diseases are accompanied by insulin resistance, obesity, diabetes, and hyperlipidemia. When such a complication exists, it is necessary to treat it first. The principle of treatment for non-alcoholic fatty liver disease is lifestyle improvement such as diet therapy and exercise therapy, but it is difficult to reliably implement it in reality. In non-alcoholic steatohepatitis, since the possibility of progressing to cirrhosis hepatocellular carcinoma is high, more aggressive drug treatment is required. Treatments aimed at improving oxidative stress and insulin resistance, which are considered important for the pathological development of non-alcoholic steatohepatitis, have also been attempted, but the reality is that there is no treatment for which sufficient scientific evidence has been established.
현재, 전 세계적으로 서구화된 식습관으로 높은 유병률을 갖는 비알콜성 지방간 질환의 치료를 위한 유일한 약물로 Obeticholic acid은(OCA)가 임상 진행 중에 있으나, OCA는 23%의 낮은 치료 반응율을 보이는 것으로 알려져 있다. 이에, OCA 치료 반응이 높을 것으로 예상되는 환자군을 선별하여 불필요한 약물 투여를 최소화하고 약물 치료 중에 치료 반응을 모니터링 할 수 있는 방법의 개발이 필요한 실정이다.Currently, obeticholic acid (OCA) is in clinical progress as the only drug for the treatment of non-alcoholic fatty liver disease, which has a high prevalence due to westernized eating habits worldwide, but OCA is known to show a low treatment response rate of 23%. . Accordingly, it is necessary to develop a method capable of selecting a patient group expected to have a high response to OCA treatment, minimizing unnecessary drug administration, and monitoring the treatment response during drug treatment.
이러한 상황 하에서, 본 발명자들은 비알콜성 지방간 환자들이 비알콜성 지방간 치료제인 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성이 다르게 나타나는 원인을 규명하고 감수성을 예측할 수 있는 방법을 개발하기 위하여, Obeticholic acid(OCA)의 비알콜성 지방간에서의 감수성을 예측하는 바이오 마커로서 Cyp7b1(Cytochrome P450 Family 7 Subfamily B Member 1) 유전자 및/또는 이의 단백질의 활성 양상을 분석하였고, 그 결과, 간 조직에서 Cyp7b1 유전자 및/또는 단백질의 활성 양상에 따라 Obeticholic acid(OCA)의 약물 감수성으로 인한 간 섬유화 억제 정도가 상이한 것을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.Under this circumstance, the inventors of the present invention identified the causes of different susceptibility to Obeticholic acid (OCA), a non-alcoholic fatty liver treatment, in non-alcoholic fatty liver patients, and developed a method for predicting the sensitivity, Obeticholic acid (OCA) As a biomarker predicting susceptibility in non-alcoholic fatty liver, the activity of the Cyp7b1 (Cytochrome P450 Family 7 Subfamily B Member 1) gene and / or its protein was analyzed, and as a result, the Cyp7b1 gene and / or protein in liver tissue The present invention was completed by confirming that the degree of inhibition of liver fibrosis due to the drug sensitivity of obeticholic acid (OCA) is different depending on the activity aspect of.
따라서, 본 발명의 목적은 비알콜성 지방간 치료제인 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성 예측용 바이오 마커를 제공하는 데 있다.Accordingly, an object of the present invention is to provide a biomarker for predicting sensitivity to obeticholic acid (OCA), a non-alcoholic fatty liver treatment agent.
또한, 본 발명의 다른 목적은 비알콜성 지방간 치료제인 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성 예측용 조성물을 제공하는 데 있다.In addition, another object of the present invention is to provide a composition for predicting sensitivity to obeticholic acid (OCA), a non-alcoholic fatty liver treatment agent.
또한, 본 발명의 또 다른 목적은 비알콜성 지방간 치료제인 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성 예측용 키트를 제공하는 데 있다.In addition, another object of the present invention is to provide a kit for predicting sensitivity to obeticholic acid (OCA), a non-alcoholic fatty liver treatment agent.
또한, 본 발명의 또 다른 목적은 비알콜성 지방간 치료제인 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성 예측을 위한 정보 제공 방법을 제공하는 데 있다.In addition, another object of the present invention is to provide a method for providing information for predicting sensitivity to obeticholic acid (OCA), a non-alcoholic fatty liver treatment agent.
이하, 본 발명에 대하여 보다 상세히 설명한다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail.
본 발명의 일 양태에 따르면, 본 발명은 Cyp7b1(Cytochrome P450 Family 7 Subfamily B Member 1) 유전자; 또는 이의 단백질을 포함하는, 비알콜성 지방간 치료제인 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성 예측용 바이오 마커 또는 바이오 마커 조성물을 제공한다.According to one aspect of the present invention, the present invention Cyp7b1 (Cytochrome P450 Family 7 Subfamily B Member 1) gene; Or it provides a biomarker or biomarker composition for predicting susceptibility to obeticholic acid (OCA), a non-alcoholic fatty liver treatment comprising a protein thereof.
본 발명은 비알콜성 지방간 치료제인 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성 예측용 바이오 마커로써 Cyp8b1(Cytochrome P450 Family 8 Subfamily B Member 1) 유전자; 또는 이의 단백질을 추가로 포함할 수 있다. The present invention is a Cyp8b1 (Cytochrome P450 Family 8 Subfamily B Member 1) gene as a biomarker for predicting sensitivity to obeticholic acid (OCA), a non-alcoholic fatty liver treatment; Or it may further include a protein thereof.
본 발명의 가장 큰 특징은 Cyp7b1 및/또는 Cyp8b1 유전자의 활성 및 이의 산물인 활성형 단백질을 바이오 마커로 이용하여 OCA에 대한 감수성을 예측하는 것이다.The greatest feature of the present invention is to predict susceptibility to OCA by using the activity of the Cyp7b1 and/or Cyp8b1 gene and its product, the active protein, as a biomarker.
본 발명의 바이오 마커는 비알콜성 지방간 환자의 비알콜성 지방간 치료제인 OCA에 대한 감수성 지표가 될 수 있으며, OCA에 대한 감수성 마커로서의 정확성 및 신뢰도도 탁월하므로 비알콜성 지방간 치료에 이용될 수 있다.The biomarker of the present invention can be a sensitivity indicator for OCA, a non-alcoholic fatty liver treatment for non-alcoholic fatty liver patients, and can be used for non-alcoholic fatty liver treatment because it has excellent accuracy and reliability as a sensitivity marker for OCA. .
본 명세서에서 사용되는 용어 "감수성"은 개개의 환자의 비알콜성 지방간 치료를 위한 특정약물이 효과를 나타내는 지 여부를 의미한다.As used herein, the term "susceptibility" means whether a specific drug for the treatment of non-alcoholic fatty liver of an individual patient exhibits an effect.
본 명세서에서 감수성을 언급하면서 사용되는 용어 "민감성"은 해당 약물에 대하여 민감하게 반응하여 약물의 효능이 작용하는 것을 의미하고, 본 명세서 내에서 감수성과 혼용된다.The term "sensitivity" used herein while referring to sensitivity means that the efficacy of a drug works by reacting sensitively to a corresponding drug, and is used interchangeably with sensitivity within the present specification.
본 명세서에서 감수성을 언급하면서 사용되는 용어 "저항성"은 해당 약물에 대하여 민감하게 반응하지 아니하여 약물의 효능이 작용하지 않는 것을 의미한다.The term "resistance" used herein while referring to sensitivity means not reacting sensitively to a corresponding drug so that the efficacy of the drug does not work.
예컨대, 상기 OCA는 비알콜성 지방간 환자에 따라 효과를 나타내는 경우와 효과를 나타내지 않는 경우가 있다. 이와 같은 개개의 환자의 비알콜성 지방간에 대해 OCA가 효과를 나타내는 지 여부를 감수성이라고 한다. 따라서, 본 발명에 따라 치료 개시 전에 효과를 기대할 수 있는 환자(반응자)와, 효과를 기대할 수 없는 환자(무반응자)를 예측할 수 있으면, 유효성과 안전성이 높은 화학 요법이 실현될 수 있다.For example, the OCA may or may not show an effect depending on non-alcoholic fatty liver patients. Whether or not OCA exhibits an effect on non-alcoholic fatty liver of such an individual patient is referred to as sensitivity. Therefore, if it is possible to predict patients for whom an effect can be expected (responders) and patients for whom no effect can be expected (non-responders) before the start of treatment according to the present invention, chemotherapy with high efficacy and safety can be realized.
본 명세서에서 사용되는 용어 "예측"은 본원에서 대상 환자가 약물 또는 약물 세트에 대해 유리하게 또는 불리하게 반응할 가능성을 지칭하는데 사용된다. 한 실시 양태에서, 예측은 이러한 반응의 정도에 관한 것이다. As used herein, the term "prediction" is used herein to refer to the likelihood that a subject patient will respond favorably or unfavorably to a drug or set of drugs. In one embodiment, the prediction relates to the extent of this response.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 바이오 마커는 Cyp7b1 유전자 또는 이의 단백질이 연관된 생합성 경로에 포함된 다른 유전자 및 생산물을 더 포함할 수 있다. 구체적으로 Cyp7b1는 답즙산 생합성(Bile acid synthesis) 경로 중 CDCA (Chenodeoxycholic acid)를 최종산물로 생산하는 Acidic pathway에 관여하는 것으로 알려져 있다. 이에 따라, 상기 Acidic pathway에 관여하는 유전자 및 최종산물인 CDCA를 바이오 마커로 더 포함할 수 있다.According to a preferred embodiment of the present invention, the biomarker of the present invention may further include other genes and products included in the biosynthetic pathway associated with the Cyp7b1 gene or its protein. Specifically, Cyp7b1 is known to be involved in the acidic pathway producing CDCA (Chenodeoxycholic acid) as an end product among bile acid synthesis pathways. Accordingly, the gene involved in the acidic pathway and the end product CDCA may be further included as biomarkers.
본 발명에서는, 본 바이오 마커인 Cyp7b1 유전자의 발현 수준 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준이 정상에 비하여 고발현 또는 고활성화된 경우, OCA에 대한 민감성이 있는 것으로 판정하고; 상기 Cyp7b1 유전자의 발현 수준 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준이 정상에 비하여 저발현 또는 저활성화된 경우, OCA에 대한 저항성이 있는 것으로 판정할 수 있다.In the present invention, when the expression level of the Cyp7b1 gene or its protein expression or activity level, which is the present biomarker, is higher than normal, it is determined that there is sensitivity to OCA; When the expression level of the Cyp7b1 gene or the expression or activity level of its protein is lower than normal, it can be determined that there is resistance to OCA.
본 발명세서 또한, 상기 Cyp7b1 유전자의 발현 수준 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준이 Cyp8b1 유전자의 발현 수준 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준보다 높을수록 OCA에 대한 민감성이 높게 나타나며, 구체적으로, Cyp7b1:Cyp8b1의 비율이 5 이상, 바람직하게는 6 이상일 때, OCA에 대한 민감성이 높은 것으로 판단할 수 있다. 여기서, Cyp8b1는 Neutral pathway에 포함되어 담즙산(bile acids)을 생성하는데 주된 역할을 하는 Cytochrom p450 familys(Cyp7a1, Cyp8b1 및 Cyp27a1) 중 하나를 의미한다. In the present invention, as the expression level of the Cyp7b1 gene or its protein expression or activity level is higher than the expression level of the Cyp8b1 gene or its protein expression or activity level, the sensitivity to OCA is higher. Specifically, Cyp7b1:Cyp8b1 When the ratio is 5 or more, preferably 6 or more, it can be determined that the sensitivity to OCA is high. Here, Cyp8b1 refers to one of the Cytochrom p450 familys (Cyp7a1, Cyp8b1, and Cyp27a1) that play a major role in generating bile acids by being involved in the neutral pathway.
본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 Cyp7b1 및/또는 Cyp8b1 유전자 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준을 측정하는 제제를 포함하는, OCA에 대한 감수성예측용 조성물을 제공한다.According to another aspect of the present invention, the present invention is Cyp7b1 and / or Cyp8b1 gene expression level; Or it provides a composition for predicting susceptibility to OCA, including an agent for measuring the expression or activity level of its protein.
본 명세서에서 사용되는 용어 "비알콜성 지방간"은 직장암, 결장암 및 항문암을 통칭하는 것을 의미한다.As used herein, the term "non-alcoholic fatty liver" refers to rectal cancer, colon cancer, and anal cancer.
본 명세서에서 특별한 언급이 없는 한, 본 명세서에서 사용되는 표현 "유전자의 발현 수준; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성 수준 측정"은 해당 시료 내에서 검출하고자 하는 대상을 검출하는 것을 의미한다. Unless otherwise specified herein, the expression "expression level of a gene; or measurement of the protein expression or activity level of the gene" used herein means detecting a target to be detected in a corresponding sample.
본 발명에서, 검출하고자 하는 대상은 시료 내 해당 유전자의 mRNA 및/또는 단백질이다. 즉, 유전자의 전사 산물인 RNA 또는 유전자 산물인 단백질(바람직하게는, 활성형)을 검출함으로써 상기 유전자의 발현 여부를 확인 할 수 있다.In the present invention, an object to be detected is mRNA and/or protein of a corresponding gene in a sample. That is, it is possible to determine whether the gene is expressed by detecting RNA, which is a transcription product of a gene, or protein (preferably, an active form), which is a gene product.
RNA 또는 단백질의 검출은 통상적으로는 시료부터 RNA 또는 단백질을 추출하여, 추출물 중의 RNA 또는 단백질을 검출함으로써 실시할 수 있다. 이러한 RNA 또는 단백질의 검출은 면역분석학적 방법, 하이브리드화 반응 및 증폭반응에 의해 측정될 수 있으나, 이에 제한되지 않고 당업계에 공지된 다양한 기술을 이용하여 용이하게 실시될 수 있다.Detection of RNA or protein can usually be performed by extracting RNA or protein from a sample and detecting RNA or protein in the extract. Detection of such RNA or protein may be measured by immunoassay methods, hybridization reactions, and amplification reactions, but is not limited thereto and can be easily performed using various techniques known in the art.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 유전자 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자의 mRNA에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍 또는 프로브를 포함한다.In addition, according to a preferred embodiment of the present invention, the agent for measuring the gene expression level includes an antisense oligonucleotide, a primer pair or a probe that specifically binds to the mRNA of the gene.
상기 mRNA의 발현 여부를 측정하는 제제는 상기 유전자에 특이적인 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍, 프로브 및 이들의 조합으로 이루어진 군에서 선택된다. 즉, 핵산의 검출은 유전자를 암호화하는 핵산 분자 또는 상기 핵산 분자의 상보물에 하이브리드화되는 하나 이상의 올리고뉴클레오타이드 프라이머를 사용하는 증폭반응에 의해 수행될 수 있다.The agent for measuring the expression of the mRNA is selected from the group consisting of antisense oligonucleotides specific to the gene, primer pairs, probes, and combinations thereof. That is, detection of a nucleic acid may be performed by an amplification reaction using one or more oligonucleotide primers that hybridize to a nucleic acid molecule encoding a gene or a complement of the nucleic acid molecule.
예컨대, 프라이머를 이용한 mRNA의 검출은 PCR과 같은 증폭 방법을 사용하여 유전자 서열을 증폭한 다음 당 분야에 공지된 방법으로 유전자의 증폭 여부를 확인함으로써 수행될 수 있다.For example, mRNA detection using primers can be performed by amplifying a gene sequence using an amplification method such as PCR, and then confirming whether the gene is amplified by a method known in the art.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 단백질의 발현 또는 활성 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 펩타이드 또는 뉴클레오티드를 포함한다.In addition, according to a preferred embodiment of the present invention, the agent for measuring the expression or activity level of the protein includes an antibody, peptide or nucleotide that specifically binds to the protein.
상기 단백질의 발현 또는 활성 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 대하여 특이적으로 결합하는 항체를 의미하고, 다클론 항체, 단클론 항체, 재조합 항체 및 이들의 조합을 모두 포함한다.An agent for measuring the expression or activity level of the protein refers to an antibody that specifically binds to the protein, and includes polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, recombinant antibodies, and combinations thereof.
상기 항체는 다클론 항체, 단클론 항체, 재조합 항체 및 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라 및 항체 분자의 기능적인 단편, 예를 들어, Fab, F(ab'), F(ab')2및 Fv를 모두 포함한다. 항체 생산은 본 발명이 속하는 분야에 널리 공지된 기술을 이용하여 용이하게 제조할 수 있고, 제조되어 상업적으로 판매되는 항체를 이용할 수 있다.Such antibodies include polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, recombinant antibodies and complete forms having two full-length light chains and two full-length heavy chains, as well as functional fragments of antibody molecules, such as Fab, F(ab' ), F(ab')2 and Fv. Antibody production can be easily prepared using techniques well known in the field to which the present invention pertains, and commercially available antibodies can be used.
본 발명의 조성물은 상술한 유전자의 발현 여부를 측정하는 제제뿐만 아니라, 항원-항체 복합체의 형성을 정량 또는 정성적으로 측정 가능하게 하는 라벨, 면역학적 분석에 사용되는 통상적인 도구, 시약 등을 더 포함할 수 있다. The composition of the present invention further includes not only agents for measuring the expression of the above-described genes, but also labels that enable quantitative or qualitative measurement of the formation of antigen-antibody complexes, conventional tools and reagents used in immunological analysis, and the like. can include
항원-항체 복합체의 형성을 정성 또는 정량적으로 측정 가능하게 하는 라벨에는 효소, 형광물, 리간드, 발광물, 미소입자(microparticle), 산화환원 분자 및 방사선 동위원소 등이 있으며, 반드시 이로 제한되는 것은 아니다. 검출 라벨로 이용 가능한 효소에는 β-글루쿠로니다제, β-D-글루코시다제, β-D-갈락토시다제, 우레아제, 퍼옥시다아제, 알칼라인포스파타아제, 아세틸콜린에스테라제, 글루코즈옥시다제, 헥소키나제와 GDPase, RNase, 글루코즈옥시다제와루시페라제, 포스포프럭토키나제, 포스포에놀피루베이트카복실라제, 아스파르테이트아미노트랜스페라제, 포스페놀피루베이트데카복실라제, β-라타마제 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 형광물에는 플루오레신, 이소티오시아네이트, 로다민, 피코에리테린, 피코시아닌, 알로피코시아닌, o-프탈데히드, 플루오레스카민 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 리간드에는바이오틴 유도체 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 발광물에는 아크리디늄에스테르, 루시페린, 루시퍼라아제 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 미소입자에는 콜로이드 금, 착색된 라텍스 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 산화환원 분자에는 페로센, 루테늄착화합물, 바이올로젠, 퀴논, Ti 이온, Cs 이온, 디이미드, 1,4-벤조퀴논, 하이드로퀴논, K4W(CN)8, [Os(bpy)3]2+, [RU(bpy)3]2+, [MO(CN)8]4-등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 방사선동위원소에는 3H, 14C, 32P, 35S, 36Cl, 51Cr, 57Co, 58Co, 59Fe, 90Y, 125I, 131I, 186Re 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. Labels capable of qualitatively or quantitatively measuring the formation of antigen-antibody complexes include, but are not limited to, enzymes, fluorescent substances, ligands, luminescent substances, microparticles, redox molecules, and radioisotopes. . Enzymes available as detection labels include β-glucuronidase, β-D-glucosidase, β-D-galactosidase, urease, peroxidase, alkaline phosphatase, acetylcholinesterase, glucoseoxy Multiple drugs, hexokinase and GDPase, RNase, glucose oxidase and luciferase, phosphofructokinase, phosphoenolpyruvate carboxylase, aspartate aminotransferase, phosphophenolpyruvate decarboxylase, β- Latamase and the like, but are not limited thereto. Fluorescent substances include fluorescein, isothiocyanate, rhodamine, phycoerytherin, phycocyanin, allophycocyanine, o-phthalaldehyde, fluorescamine, and the like, but are not limited thereto. Ligands include biotin derivatives and the like, but are not limited thereto. Luminescent substances include acridinium ester, luciferin, luciferase, and the like, but are not limited thereto. Microparticles include, but are not limited to, colloidal gold, colored latex, and the like. Redox molecules include ferrocene, ruthenium complex, biologen, quinone, Ti ion, Cs ion, diimide, 1,4-benzoquinone, hydroquinone, K4W(CN)8, [Os(bpy)3]2+, [ RU(bpy)3]2+, [MO(CN)8]4-, etc., but are not limited thereto. Radioactive isotopes include, but are not limited to, 3H, 14C, 32P, 35S, 36Cl, 51Cr, 57Co, 58Co, 59Fe, 90Y, 125I, 131I, and 186Re.
상기 도구 또는 시약의 일 예로, 적합한 담체, 용해제, 세정제, 완충제, 안정화제 등이 포함되나 이에 제한되지 않는다. 표지물질이 효소인 경우에는 효소 활성을 측정할 수 있는 기질 및 반응 정지제를 포함할 수 있다. 담체는 가용성 담체, 불용성 담체가 있고, 가용성 담체의 일 예로 당 분야에서 공지된 생리학적으로 허용되는 완충액, 예를 들어 PBS가 있고, 불용성 담체의 일 예로 폴리스틸렌, 폴리에틸렌, 폴리프로필렌, 폴리에스테르, 폴리아크릴로니트릴, 불소 수지, 가교 덱스트란, 폴리사카라이드, 기타 종이, 유리, 금속, 아가로오스 및 이들의 조합일 수 있다.Examples of such tools or reagents include, but are not limited to, suitable carriers, solubilizers, detergents, buffers, stabilizers, and the like. When the labeling substance is an enzyme, it may include a substrate capable of measuring enzyme activity and a reaction terminator. The carrier includes a soluble carrier and an insoluble carrier, and an example of the soluble carrier is a physiologically acceptable buffer known in the art, such as PBS, and an example of the insoluble carrier is polystyrene, polyethylene, polypropylene, polyester, poly acrylonitrile, fluororesins, cross-linked dextran, polysaccharides, other papers, glass, metals, agarose, and combinations thereof.
본 발명의 조성물은 상술한 바이오 마커를 이용하므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.Since the composition of the present invention uses the aforementioned biomarkers, redundant descriptions thereof are omitted to avoid excessive complexity of the present specification.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 조성물을 포함하는, OCA에 대한 감수성예측용 키트를 제공한다.According to another aspect of the present invention, the present invention provides a kit for predicting susceptibility to OCA, including the composition.
상기 키트에는 상기 유전자의 발현; 또는 상기 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준을 측정하는 제제뿐만 아니라, 면역학적 분석에 사용되는 당 분야에서 일반적으로 사용되는 도구, 시약 등이 포함될 수 있다. The kit includes expression of the gene; Alternatively, tools and reagents commonly used in the art used for immunological analysis may be included, as well as preparations for measuring the expression or activity level of the protein thereof.
상기 도구 또는 시약의 일 예로, 적합한 담체, 검출 가능한 신호를 생성할 수 있는 표지 물질, 발색단(chromophores), 용해제, 세정제, 완충제, 안정화제 등이 포함되나 이에 제한되지 않는다. 표지물질이 효소인 경우에는 효소 활성을 측정할 수 있는 기질 및 반응 정지제를 포함할 수 있다. 담체는 가용성 담체, 불용성 담체가 있고, 가용성 담체의 일 예로 당 분야에서 공지된 생리학적으로 허용되는 완충액, 예를 들어 PBS가 있고, 불용성 담체의 일 예로 폴리스틸렌, 폴리에틸렌, 폴리프로필렌, 폴리에스테르, 폴리아크릴로니트릴, 불소 수지, 가교 덱스트란, 폴리사카라이드, 라텍스에 금속을 도금한 자성 미립자와 같은 고분자, 기타 종이, 유리, 금속, 아가로오스 및 이들의 조합일 수 있다. Examples of such tools or reagents include, but are not limited to, suitable carriers, labeling substances capable of generating a detectable signal, chromophores, solubilizers, detergents, buffers, stabilizers, and the like. When the labeling substance is an enzyme, it may include a substrate capable of measuring enzyme activity and a reaction terminator. The carrier includes a soluble carrier and an insoluble carrier, and an example of the soluble carrier is a physiologically acceptable buffer known in the art, such as PBS, and an example of the insoluble carrier is polystyrene, polyethylene, polypropylene, polyester, poly polymers such as acrylonitrile, fluororesin, crosslinked dextran, polysaccharide, latex-coated magnetic microparticles, other paper, glass, metal, agarose, and combinations thereof.
본 발명의 키트는 상술한 바이오 마커 및 조성물을 구성으로 포함하므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.Since the kit of the present invention includes the aforementioned biomarkers and compositions, redundant descriptions thereof are omitted to avoid excessive complexity of the present specification.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 According to another aspect of the present invention, the present invention
(a) 대상으로부터 생물학적 시료를 준비하는 단계; (a) preparing a biological sample from the subject;
(b) 상기 생물학적 시료 내 Cyp7b1 유전자의 발현 수준; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성 수준을 측정하는 단계; 및 (b) the expression level of the Cyp7b1 gene in the biological sample; Or measuring the expression or activity level of the protein of the gene; and
(c) (b) 단계에서 측정한 수준 확인 결과에 기초하여 상기 대상의 OCA에 대한 감수성을 판정하는 단계;(c) determining the susceptibility of the subject to OCA based on the result of checking the level measured in step (b);
를 포함하는 OCA에 대한 감수성 예측을 위한 정보 제공 방법을 제공한다.Provides an information providing method for predicting susceptibility to OCA, including.
본 발명의 상기 방법은, 대상 환자로부터 생물학적 시료를 획득하고, 상기 시료 내에서 상술한 유전자로 이루어지는 그룹으로부터 선택되는 1개 또는 복수개 유전자의 발현 여부를 측정한 후, 정상 시료와 비교하여, 기재된 유전자 또는 단백질의 발현 또는 활성이 억제되었거나 감소한 경우에, 당해 시료가 OCA에 대하여 감수성이 있다라고 판정; 및 기재된 유전자 또는 단백질의 발현 또는 활성이 증가되었거나 향상된 경우에, 당해 시료가 OCA에 대하여 저항성이 있다라고 판정하는 공정을 포함하여 이루어진다.The method of the present invention obtains a biological sample from a subject patient, measures the expression of one or a plurality of genes selected from the group consisting of the above-described genes in the sample, compares the expression with a normal sample, and or when the expression or activity of the protein is suppressed or reduced, determining that the sample is susceptible to OCA; and a step of judging that the sample is resistant to OCA when the expression or activity of the described gene or protein is increased or improved.
본 발명의 상기 방법은 시료 내에서의 특정 유전자 또는 단백질의 발현(바람직하게는, 활성형) 여부를 OCA에 대한 감수성의 지표로 하는 점을 특징으로 한다.The method of the present invention is characterized in that the expression (preferably, active form) of a specific gene or protein in a sample is used as an indicator of sensitivity to OCA.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 (c) 단계에서 Cyp7b1 유전자의 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준이 정상에 비하여 고발현 또는 고활성화된 경우, 대상의 COA에 대한 감수성(민감성)이 있는 것으로 판정한다. According to a preferred embodiment of the present invention, the expression level of the Cyp7b1 gene in step (c); Or, if the expression or activity level of the protein is higher than normal or high, it is determined that the subject has sensitivity (sensitivity) to COA.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 (c) 단계에서 Cyp7b1 유전자의 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준이 정상에 비하여 저발현 또는 저활성화된 경우, 대상의 OCA에 대한 저항성이 있는 것으로 판정한다.According to a preferred embodiment of the present invention, the expression level of the Cyp7b1 gene in step (c); Or, if the expression or activity level of its protein is low or low compared to normal, it is determined that the subject has resistance to OCA.
본 명세서에서 상기 유전자들의 발현 수준을 언급하면서 사용되는 용어 "저발현" 또는 "저활성"은 바이오 마커가 비정상 프로세스, 질환 혹은 개체 내 기타 병태를 나타내거나 이의 징후인 경우, 건강하거나 정상인 개체 또는 비교 대상인 개체로부터 획득된 생물학적 시료에서 검출되는 바이오 마커의 값 혹은 수준 범위 보다 낮은 생물학적 시료 내의 바이오 마커의 값 혹은 수준을 지칭한다. 또한, 바이오 마커의 "정상" 발현 수준 혹은 값과 비교해서 "차동(differential) 수준" 혹은 "차동 값"을 지니거나 "상이하게 발현된" 것으로서 지칭될 수 있으며, 발현에 있어서 정량적 차이뿐만 아니라 정성적 차이의 둘 모두를 포함한다.As used herein, the term "low expression" or "low activity" when referring to the expression level of the genes means that a biomarker indicates or is indicative of an abnormal process, disease, or other condition in an individual, a healthy or normal individual or a comparison. It refers to a value or level of a biomarker in a biological sample that is lower than a value or level range of a biomarker detected in a biological sample obtained from a target individual. It may also be referred to as having a "differential level" or "differential value" or "differently expressed" compared to a "normal" expression level or value of a biomarker, and may be referred to as a quantitative as well as a quantitative difference in expression. Include both sexual differences.
본 명세서에서 사용되는 용어 "생물학적 시료"란 본 발명의 바이오 마커의 발현이 검출될 수 있는 개체로부터 얻어지는 모든 시료를 의미한다. As used herein, the term "biological sample" refers to any sample obtained from a subject in which the expression of the biomarker of the present invention can be detected.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 생물학적 시료는 타액(saliva), 생검(biopsy), 혈액, 피부 조직, 액체 배양물, 분변 및 소변으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나이며, 특별히 이에 제한되지 않고, 본 발명의 기술분야에서 통상적으로 사용되는 방법으로 처리하여 준비될 수 있다.According to a preferred embodiment of the present invention, the biological sample is any one selected from the group consisting of saliva, biopsy, blood, skin tissue, liquid culture, feces and urine, but is not particularly limited thereto, It may be prepared by treatment by a method commonly used in the technical field of the present invention.
본 발명의 방법은 상술한 바이오 마커를 이용하여 감수성이 있는 것으로 판정하므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.Since the method of the present invention is determined to be sensitive using the above-described biomarkers, duplicate descriptions are omitted to avoid excessive complexity in the present specification.
본 발명의 비알콜성 지방간 치료제인 OCA에 대한 감수성 예측용 바이오 마커를 이용하면, 개개의 환자의 상기 감수성을 치료 개시 전에 확실하게 판정할 수 있어, 불필요한 약물 투여를 최소화하고 치료 효율을 높일 수 있다.Using the biomarker for predicting susceptibility to OCA, a non-alcoholic fatty liver treatment agent of the present invention, it is possible to reliably determine the susceptibility of each patient before starting treatment, thereby minimizing unnecessary drug administration and increasing treatment efficiency. .
도 1a는 마우스를 대상으로 한 OCA 치료 효과를 확인하는 전체 실험 과정을 나타내는 모식도이다.
도 1b 내지 1d는 Vehicle과 OCA를 8주간 투여한 마우스의 평균 몸무게, 간 조직 무게를 비교한 데이터이다.
도 1e 내지 1g는 OCA 처리 전 후, OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)간의 간 내 지방량(Steatosis)과 염증(inflammation)이 감소하는 것을 조직병리학적 비교한 데이터이다.
도 1h는 OCA 처리 후, OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR) 간의 마우스 몸무게 및 간 무게를 비교한 데이터이다.
도 1i 내지 1l은 OCA 처리 후, OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR) 간의 마우스의 Serum에서 간 손상의 지표인 ALT 및 AST와 Total Cholesterol를 측정한 결과를 비교한 것이다.
도 2a는 OCA의 표적유전자인 Nr1h4(FXR) 및 Nr0b2(SHP)을 OCA 반응 군(R)과 비 반응군(NR)에서 mRNA 발현량을 비교한 결과이다.
도 2b는 bile acid synthesis의 2가지 경로 중 Neutral pathway에 포함되어 bile acids를 생성하는데 주된 역할을 하는 Cytochrom p450 familys(Cyp7a1, Cyp8b1 및 Cyp27a1)의 mRNA 발현의 차이를 비교한 데이터이다.
도 2c는 bile acid synthesis의 2가지 경로 중 Acidic pathway에 포함되어 bile acids를 생성하는데 주된 역할을 하는 Cytochrom p450 familys(Cyp7b1, Cyp46a1 및 Cyp39a1)의 mRNA 발현의 차이를 비교한 데이터이다.
도 2d는 Acidic pathway가 진행하기 위한 콜레스테롤 흡수를 돕는 역할을 하는 StarD1의 발현 양상을 OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)에서 비교한 것이다.
도 2e 내지 도 2f는 OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)에서 Neutral pathway 및 Acidic pathway에 관여하는 Cytochrom p450 familys(Cyp7a1, Cyp8b1, Cyp7b1, 및 Cyp39a1)의 발현 양상을 비교한 것이다
도 2g는 전체 OCA를 투여한 마우스에서 각각의 Cytochrom p450 familys 유전자 발현을 평균 이상 발현과 평균 이하 발현으로 나누어, 각각 OCA 반응군(R)에 해당하는 마우스와 OCA 비 반응군(NR)에 해당하는 마우스의 비율을 나타낸 데이터이다.
도 2h 내지 도 2j는 간 내 bile acid composition을 조사한 결과이다.
도 2k는 OCA 반응군(R)에서 Acidic pathway의 대사산물의 유의한 증가가 Cyp7b1과 Cyp39a1에 의한 것인지 알아보기 위해, MCA와 Cyp7b1, Cyp39a1의 상관관계를 분석한 결과이다.
도 3a은 OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)에서의 PCA plot을 통해 샘플간의 유사성을 보여주는 결과이다.
도 3b는 OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)에서 유전자적 차이를 알아보기 위해 GSEA Analysis 결과이다.
도 3c는 HALL MARKER에서 BILE ACID METABOLISM의 발현 차이를 Heat map으로 표현한 데이터이다.
도 3d는 Bile acid synthesis와 관련된 Cytochrom p450 familys의 mRNA Seq.으로 비교한 결과이다.
도 3e는 OCA 투여전, 조직 생검한 간 조직에서의 Cyp8b1과 Cyp7b1의 단백질 발현을 비교한 결과이다.
도 3f 내지 도 3h는 OCA 투여 전, 조직 생검한 간 조직에서의 OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)에서 bile acid composition의 량을 비교한 결과이다.
도 3i 내지 도 3l은 OCA 투여전, 혈청에서의 OCA 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)에서 bile acid composition의 량을 비교한 결과이다.
도 4a-4b는 Human Hepatic Stellate Cell인 LX2 Cell에 siCyp7b1과 siCyp8b1을 이용하여 각 pathway를 억제한 후, TGFβ1 (10ng/ml)로 24h동안 유도하여, 간 내 섬유화와 비슷한 환경으로 유도함으로써 OCA의 효과를 비교한 결과이다.
도 4c 내지 도 4e는 도 4a와 동일한 조건에서, 간 섬유화와 관련된 TGFβ1, Collagen1 및 Fibronectin의 유전자 발현을 비교한 결과이다.
도 5는 Cyp7b1 및 Cyp8b1의 발현 비에 따른 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)에서 반응률을 비교한 결과이다.Figure 1a is a schematic diagram showing the entire experimental process for confirming the effect of OCA treatment on mice.
1b to 1d are data comparing average body weight and liver tissue weight of mice administered with Vehicle and OCA for 8 weeks.
Figures 1e to 1g are histopathological comparisons of the decrease in the amount of fat (Steatosis) and inflammation (inflammation) in the liver between an OCA responder group (R) and a non-responder group (NR) before and after OCA treatment.
Figure 1h is data comparing the body weight and liver weight of mice between an OCA responder group (R) and a non-responder group (NR) after OCA treatment.
1i to 1l compare the results of measuring ALT and AST, which are indicators of liver damage, and total cholesterol in serum of mice between an OCA responder group (R) and a non-responder group (NR) after OCA treatment.
Figure 2a is a result of comparing the mRNA expression levels of OCA target genes Nr1h4 (FXR) and Nr0b2 (SHP) in the OCA responder group (R) and non-responder group (NR).
FIG. 2B is data comparing mRNA expression differences of Cytochrom p450 familys (Cyp7a1, Cyp8b1, and Cyp27a1), which are included in the neutral pathway among the two pathways of bile acid synthesis and play a major role in producing bile acids.
FIG. 2c is data comparing the difference in mRNA expression of Cytochrom p450 familys (Cyp7b1, Cyp46a1, and Cyp39a1), which are included in the acidic pathway among the two pathways of bile acid synthesis and play a major role in producing bile acids.
Figure 2d is a comparison of the expression pattern of StarD1, which serves to help cholesterol absorption for the acidic pathway to proceed, in the OCA responder group (R) and the non-responder group (NR).
Figures 2e to 2f compare the expression patterns of Cytochrom p450 familys (Cyp7a1, Cyp8b1, Cyp7b1, and Cyp39a1) involved in the neutral pathway and acidic pathway in the OCA responder group (R) and non-responder group (NR).
Figure 2g divides the expression of each Cytochrom p450 familys gene into above-average expression and below-average expression in mice administered with total OCA, and mice corresponding to the OCA responder group (R) and OCA non-responder group (NR), respectively. It is data showing the ratio of mice.
2h to 2j are the results of examining bile acid composition in the liver.
2k is a result of analyzing the correlation between MCA, Cyp7b1, and Cyp39a1 in order to determine whether a significant increase in acidic pathway metabolites in the OCA responder group (R) was caused by Cyp7b1 and Cyp39a1.
Figure 3a is a result showing the similarity between samples through the PCA plot in the OCA responder group (R) and non-responder group (NR).
Figure 3b is a GSEA analysis result to determine the genetic difference between the OCA responder group (R) and non-responder group (NR).
Figure 3c is data expressing the expression difference of BILE ACID METABOLISM in HALL MARKER as a heat map.
Figure 3d is a result of comparison with mRNA Seq. of Cytochrom p450 familys related to bile acid synthesis.
3E is a comparison result of protein expression of Cyp8b1 and Cyp7b1 in liver tissue biopsied before OCA administration.
3f to 3h show results of comparing the amount of bile acid composition in an OCA responder group (R) and a non-responder group (NR) in liver tissues obtained by tissue biopsy before OCA administration.
3I to 3L show the results of comparing the amount of bile acid composition in the OCA responder group (R) and the non-responder group (NR) in serum before OCA administration.
4a-4b shows the effect of OCA by inhibiting each pathway using siCyp7b1 and siCyp8b1 in LX2 Cell, which is a Human Hepatic Stellate Cell, and then inducing it with TGFβ1 (10 ng/ml) for 24 h, inducing an environment similar to liver fibrosis is the result of comparing
Figures 4c to 4e are the results of comparison of gene expression of TGFβ1, Collagen1, and Fibronectin associated with liver fibrosis under the same conditions as in Figure 4a.
5 is a result of comparing response rates in a responder group (R) and a non-responder group (NR) according to the expression ratio of Cyp7b1 and Cyp8b1.
이하 하나 이상의 구체예를 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 하나 이상의 구체예를 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, one or more specific examples will be described in more detail through examples. However, these examples are intended to illustrate one or more specific examples, and the scope of the present invention is not limited to these examples.
실시예 1: 비알콜성 지방간 질환 마우스 모델에서 OCA 투여 효과 비교Example 1: Comparison of OCA administration effect in non-alcoholic fatty liver disease mouse model
비알콜성지방간질환 마우스 모델을 유도하기 위해, Western diet(D12079B)를 총 24주간 공급하였으며, 공급 일 12주차에 간 조직 생검을 실시하였다. 이 때의 간 조직을 조직병리학적 관찰인 NAS(NAFLD Activity Score)을 통하여 지방간으로 유도되는 마우스만을 선별하여 실험에 계속적으로 사용하였으며, 유도가 되지 않은 마우스는 Sacrifice하였다. (간 조직 생검 후, 4주간의 회복기 동안 NAS 및 mRNA Sequence을 진행하였다.) 지방간으로 유도된 마우스들은 무작위로 Vehicle 군(n=10)과 OCA 투여 군(n=20)에 8주간 5mg/kg/day로 경구 투여하였다(도 1a). In order to induce a non-alcoholic fatty liver disease mouse model, Western diet (D12079B) was supplied for a total of 24 weeks, and liver tissue biopsy was performed on the 12th week of feeding. Liver tissue at this time was used continuously in the experiment by selecting only mice that were induced to fatty liver through NAS (NAFLD Activity Score), a histopathological observation, and mice that were not induced were sacrificed. (After liver tissue biopsy, NAS and mRNA sequence were performed during the 4-week recovery period.) Fatty liver-induced mice were randomly assigned to the Vehicle group (n=10) and the OCA-administered group (n=20) with 5 mg/kg for 8 weeks. /day was orally administered (Fig. 1a).
8주간의 약물투여 후, Sacrifice하여 각 군에서 간 조직의 NAS를 통하여 OCA 투여 군을 치료반응이 나타난 군(OCA R; NAS≤2) 과 치료반응이 나타나지 않은 군(OCA NR; NAS≥3)을 나누어 비교 분석하였다. After 8 weeks of drug administration, sacrifice was performed and the OCA administered group through the NAS of the liver tissue in each group showed a therapeutic response (OCA R; NAS≤2) and a non-therapeutic response (OCA NR; NAS≥3) were divided and analyzed for comparison.
그 결과, Vehicle과 OCA를 8주간 투여한 마우스의 평균 몸무게를 시간 별로 비교한 데이터로 두 군 간의 몸무게는 차이가 없었다 (도 1b). 그러나 8주간의 약물 투여 후, 마우스의 간 조직의 무게는 Vehicle군에 비하여 OCA Treatment군에서 유의하게 감소되어짐을 확인하였다 (도 1c-d). 이러한 결과는 간 내 지방량(Steatosis)과 염증(inflammation)이 감소하는 것을 조직병리학적으로도 일관된 결과를 보여주었으며, NAS 결과에 기반하여 OCA에 치료반응이 나타난 OCA R군과 치료반응이 나타나지 않은 OCA NR군을 나누어 비교하였을 때, OCA R군은 36.84%, OCA NR군은 63.16%로 나타났다 (도 1e-f). As a result, the average body weight of mice administered with Vehicle and OCA for 8 weeks was compared over time, and there was no difference in body weight between the two groups (FIG. 1b). However, after 8 weeks of drug administration, it was confirmed that the weight of the liver tissue of mice was significantly reduced in the OCA treatment group compared to the vehicle group (Fig. 1c-d). These results showed a consistent histopathological result of a decrease in the amount of fat in the liver (steatosis) and inflammation (inflammation). When the NR group was divided and compared, the OCA R group was 36.84% and the OCA NR group was 63.16% (Fig. 1e-f).
각 군의 마우스 몸무게와 간 무게를 비교하였을 때, 몸무게는 각 군에서 변화가 없는 것을 보여주었으나 간 무게는 OCA 치료반응 군(OCA R)에서 유의하게 감소하였다 (도 1h). 다음은 마우스의 Serum에서 간 손상의 지표인 ALT와 AST를 측정하였는데, OCA R에서 ALT가 감소하는 경향을 보여주었으나 AST는 변화가 없었다. 또한 Total Cholesterol이 OCA NR군과 R군에서 모두 Vehicle군에 비하여 유의하게 감소하는 것을 보여주었으나, Triglyceride는 변화가 없었다.(도 1i-l). When the body weight and liver weight of mice in each group were compared, body weight showed no change in each group, but liver weight significantly decreased in the OCA treatment response group (OCAR) (FIG. 1h). Next, ALT and AST, which are indicators of liver damage, were measured in Serum of mice. ALT showed a tendency to decrease in OCAR, but AST did not change. In addition, total cholesterol showed a significant decrease in both the OCA NR and R groups compared to the Vehicle group, but there was no change in triglyceride (Fig. 1i-l).
실시예 2: OCA를 투여한 결과, 반응 군과 비 반응 군 마우스에서의 담즙산 생합성 경로에 관여하는 유전자 및 단백질의 활성 여부 비교Example 2: Comparison of activity of genes and proteins involved in the bile acid biosynthetic pathway in mice of a responder group and a non-responder group as a result of OCA administration
OCA 약물의 효과가 다르게 나타나는 원인이 표적유전자의 발현에 따라 달라질 것으로 예상하였다. OCA의 표적유전자인 Nr1h4(FXR), Nr2b1(RXRα), Nr0b2(SHP)을 각 군에서 mRNA 발현으로 비교하였을 때, 두 군 간의 유의한 차이가 나타나지 않았다. (도 2a). 우리는 OCA의 또 다른 표적 유전자인 Cyp7a1의 mRNA 발현의 차이를 조사하였으며, Cyp7a1은 bile acid synthesis에 관여하는 enzyme으로 알려져 있어, bile acid synthesis의 2가지 경로 중 Neutral pathway에 포함되어 bile acids를 생성하는데 주된 역할을 한다.It was expected that the cause of the different effects of OCA drugs would depend on the expression of the target gene. When the mRNA expression of the target genes of OCA, Nr1h4 (FXR), Nr2b1 (RXRα), and Nr0b2 (SHP), was compared in each group, there was no significant difference between the two groups. (Fig. 2a). We investigated the difference in mRNA expression of Cyp7a1, another target gene of OCA. Cyp7a1 is known to be an enzyme involved in bile acid synthesis. plays a major role
OCA NR군과 OCA R군에서 두 군 간의 차이는 나타나지 않았지만, Neutral pathway에 포함되어진 Cytochrom p450 familys가 OCA R군에서 감소하는 경향을 보였다 (도 2b). (Cyp27a1은 Acidic에도 포함되어진다.)Although there was no difference between the two groups in the OCA NR and OCA R groups, Cytochrom p450 family members involved in the neutral pathway tended to decrease in the OCA R group (Fig. 2b). (Cyp27a1 is also included in Acidic.)
Bile acid는 두 가지 경로에서 만들어지는 산물에 의해서 조성이 달라지는데, 우리는 또 다른 경로인 Acidic pathway에 관여하는 Cytochrom p450 familys의 유전자 발현을 비교하였다. 도 2c에서와 같이, Acidic pathway에 관여하는 Cytochrom p450 familys의 유전자적 발현이 OCA R군에서 증가하였다.The composition of bile acid differs depending on the products produced in the two pathways. We compared the gene expression of Cytochrom p450 familys involved in another pathway, the Acidic pathway. As shown in Figure 2c, the gene expression of Cytochrom p450 familys involved in the acidic pathway was increased in the OCA R group.
이러한 Acidic pathway는 미토콘드리아에서 StarD1에 의하여 콜레스테롤을 흡수하여 Acidic pathway가 진행되는데, OCA R군에서 StarD1이 유전자 발현에서 유의하게 증가함을 보여주었다 (도 2d).This acidic pathway proceeds by absorbing cholesterol by StarD1 in the mitochondria, and it was shown that StarD1 significantly increased in gene expression in the OCA R group (FIG. 2d).
위의 결과들이 단백질 발현에서도 동일한 발현을 나타내는지 조사하였다. 두 군에서 Cyp7a1, Cyp8b1, Cyp39a1은 단백질 발현 차이가 나타나지 않았으며, Cyp7b1만이 유의한 차이를 보여주었다. Vehicle군과 유사하게, OCA NR군은 OCA R군에 비해 유의하게 감소하는 결과를 보여주었다 (도 2e-f). It was investigated whether the above results showed the same expression in protein expression. In the two groups, Cyp7a1, Cyp8b1, and Cyp39a1 showed no difference in protein expression, and only Cyp7b1 showed a significant difference. Similar to the Vehicle group, the OCA NR group showed significantly decreased results compared to the OCA R group (Fig. 2e-f).
그리고, 전체 OCA를 투여한 마우스에서 각각의 Cytochrom p450 familys 유전자 발현을 평균 이상 발현과 평균 이하 발현으로 나누어, 각각 OCA R군에 해당하는 마우스와 OCA NR군에 해당하는 마우스의 비율을 비교하였다. Cyp7b1과 Cyp39a1 유전자의 평균이상 발현이 OCA R 마우스 중 71%와 86%를 차지하였고, 그에 반해 평균 이상으로 발현된 마우스 중 OCA NR 마우스는 각각 25%와 17%를 차지하였다 (도 2g). 이러한 데이터는 Cyp7b1과 Cyp39a1의 발현이 증가된 마우스에서 OCA 치료 반응 군에 영향을 미쳤을 것으로 판단되었다. In addition, the expression of each Cytochrom p450 familys gene in the mice administered with all OCA was divided into above-average expression and below-average expression, respectively, and the ratio of mice corresponding to the OCA R group and OCA NR group was compared. Above-average expression of the Cyp7b1 and Cyp39a1 genes accounted for 71% and 86% of the OCAR mice, whereas among the above-average expression of the OCA NR mice, they accounted for 25% and 17%, respectively (Fig. 2g). These data suggest that mice with increased expression of Cyp7b1 and Cyp39a1 may have an effect on the OCA treatment response group.
다음은, 위의 결과를 바탕으로 간 내 bile acid composition을 조사하였다. 간 내 Acidic pathway의 대사산물인 CDCA, MCAs가 OCA R군에서 유의하게 증가하는 것을 확인하였으며, 간 내 Total bile acid가 OCA R군에서 유의하게 증가하였다 (도 2h-j). OCA R군에서 Acidic pathway의 대사산물의 유의한 증가가 Cyp7b1과 Cyp39a1에 의한 것인지 알아보기 위해, MCA와 Cyp7b1, Cyp39a1의 correlation을 분석하였다. Cyp7b1과 a-MCA, b-MCA, w-MCA에서는 양의 상관관계를 보여주었으며, 유의한 결과를 보여주었으나, Cyp39a1은 그렇지 못하였다(도 2k).Next, bile acid composition in the liver was investigated based on the above results. It was confirmed that CDCA and MCAs, metabolites of the acidic pathway in the liver, were significantly increased in the OCA R group, and total bile acid in the liver was significantly increased in the OCA R group (FIG. 2h-j). To determine whether the significant increase in acidic pathway metabolites in the OCA R group was caused by Cyp7b1 and Cyp39a1, the correlation between MCA, Cyp7b1, and Cyp39a1 was analyzed. Cyp7b1 and a-MCA, b-MCA, and w-MCA showed positive correlations and significant results, but Cyp39a1 did not (FIG. 2k).
위의 데이터들을 종합하면, OCA R군에서 Cyp7b1에 의한 Acidic pathway의 활성이 OCA NR군에 비해 증가함을 확인할 수 있었다. Summarizing the above data, it was confirmed that the acidic pathway activity by Cyp7b1 increased in the OCA R group compared to the OCA NR group.
실시예 3: OCA를 투여하기 전, 반응 군과 비 반응 군 마우스에서의 담즙산 생합성 경로에 관여하는 유전자 및 단백질의 활성 여부 비교Example 3: Comparison of activity of genes and proteins involved in the bile acid biosynthetic pathway in responder and non-responder mice before OCA administration
OCA 치료 반응 군과 비 치료반응 군에서의 차이를 OCA 약물 투여 전, 간 조직 생검을 이용하여 mRNA Sequencing을 통해 알아보기 위해 분석하였다(도 3a-d). 그 결과, 먼저 각 개체의 PCA plot을 통해 샘플간의 유사성을 보여주는 결과로 Vehicle에서 OCA NR, OCA R으로 유사성이 나타났다(도 3a). OCA NR군과 OCA R군에서 유전자적으로 차이를 알아보기 위해 GSEA Analysis를 진행하였는데, HALL MARKER로는 BILE ACID METABOLISM과 GENE ONTOLOGY 에서는 GTPASE REGULATORY ACITIVTY, PROTEIN SERIN THREONINE KINASE ACTIVITY가 확인되었다. 다음은 HALL MARKER에서 BILE ACID METABOLISM의 발현 차이를 Heat map으로 표현한 데이터로, OCA R군과 OCA NR군의 차이는 약물 투여 전에서부터 나타난 것을 간접적으로 확인하였다(도 3b-c). Bile acid synthesis와 관련된 Cytochrom p450 familys의 mRNA Seq.으로 비교한 결과로, Cyp8b1이 OCA NR군에 비해 OCA R군에서 낮은 발현을 보였다(도 3d). 우리는 이러한 결과가 단백질에서도 나타나는지 조사하기 위해, 약물 투여전, 조직생검한 간 조직에 Cyp8b1과 Cyp7b1의 단백질 발현을 비교하였다. OCA NR군에서는 Cyp8b1의 발현이 유의하게 높은 발현을 하였으나 OCA R군에서는 낮은 발현을 보여주었고, Cyp7b1의 발현은 상반된 결과를 보여주었다(도 3e). 위의 결과대로 OCA R군에서 Neutral pathway의 마지막 단계인 Cyp8b1의 단백질 발현이 감소하나, Acidic pathway의 마지막 단계인 Cyp7b1의 단백질 발현이 증가할 때, 이들의 대사산물인 Bile acid composition도 동일한 결과를 보여주었다(도 3e-h). 우리는 간 내 Total Bile acids가 OCA R군에서 많은 것을 확인하였으나, Serum에서는 Acidic bile acids와 Total Bile acids가 반대로 감소하는 것을 확인하였으며, 조서의 비를 보았을 때, OCA NR군에서는 T-CA가 많은 비를 차지하였으며, OCA R군에서는 MCAs와 DCA가 많은 비를 차지하였다(도 3i-l).The difference between the OCA treatment response group and the non-response group was analyzed to find out through mRNA sequencing using liver tissue biopsies before OCA drug administration (Fig. 3a-d). As a result, first, as a result of showing the similarity between the samples through the PCA plot of each individual, the vehicle showed similarity to OCA NR and OCA R (Fig. 3a). GSEA analysis was conducted to find out the genetic differences between the OCA NR group and the OCA R group. As for the HALL MARKER, BILE ACID METABOLISM and GTPASE REGULATORY ACITIVTY and PROTEIN SERIN THREONINE KINASE ACTIVITY were confirmed in GENE ONTOLOGY. The following is data expressing the difference in expression of BILE ACID METABOLISM in HALL MARKER as a heat map, indirectly confirming that the difference between the OCA R group and the OCA NR group appeared before drug administration (Fig. 3b-c). As a result of comparison with mRNA Seq. of Cytochrom p450 familys related to bile acid synthesis, the expression of Cyp8b1 was lower in the OCA R group than in the OCA NR group (Fig. 3d). We compared the protein expression of Cyp8b1 and Cyp7b1 in liver tissue biopsied before drug administration to investigate whether these results also appeared in proteins. The expression of Cyp8b1 was significantly high in the OCA NR group, but low in the OCA R group, and the expression of Cyp7b1 showed conflicting results (FIG. 3e). As the result above, in the OCA R group, the protein expression of Cyp8b1, the last step of the neutral pathway, decreased, but when the protein expression of Cyp7b1, the last step of the acidic pathway, increased, their metabolite, bile acid composition, also showed the same result. (Fig. 3e-h). We confirmed that Total Bile Acids in the liver were high in the OCA R group, but in Serum, Acidic Bile Acids and Total Bile Acids decreased inversely. In the OCA R group, MCAs and DCA accounted for a high ratio (Fig. 3i-l).
이 결과를 종합건대, OCA 투여 전 간 내 Cyp7b1이 높은 발현을 나타내는 경우, OCA 투여했을 때 반응이 우수함을 확인할 수 있었다.Taken together, it was confirmed that when Cyp7b1 was highly expressed in the liver before OCA administration, the response was excellent when OCA was administered.
실시예 4: Cyp7b1 및 Cyp8b1 유전자 발현 억제를 통한 OCA의 치료반응 효과 비교Example 4: Comparison of treatment response effects of OCA through inhibition of Cyp7b1 and Cyp8b1 gene expression
In vivo에서의 결과를 통해, 우리는 Human Hepatic Stellate Cell인 LX2 Cell에 siCyp7b1과 siCyp8b1을 이용하여 각 pathway를 억제한 후, TGFβ1 (10ng/ml)로 24h동안 유도하여, 간 내 섬유화와 비슷한 환경으로 유도하여 OCA의 효과를 비교하였다. Through in vivo results, we inhibited each pathway using siCyp7b1 and siCyp8b1 in LX2 Cell, a human hepatic stellate cell, and then induced it with TGFβ1 (10 ng/ml) for 24 h, resulting in an environment similar to liver fibrosis. induced and compared the effect of OCA.
먼저, Woundhealing assay를 통해 TGFβ1에 의한 세포의 증식 및 활성화를 비교하였다. Normal에 비해 TGFβ1을 처리한 LX2 Cell에서 세포 증식 및 활성화를 보여주었으나 OCA 100nM을 추가 처리한 군에서는 이를 억제하는 것을 보여주었다. Normal, siCyp7b1 및 siCyp8b1에서는 유사한 결과를 보여주었으나, siC7b1+TGFb1와 siC8b1+TGFβ1에서는 상반되는 결과가 나타났다. siC7b1에 TGFb1을 처리한 군에서는 더 많은 세포 증식을 보여주었으나 siC8b1에 TGFb1을 처리한 군에서는 그렇지 않았다. 여기에 각각 OCA 100nM을 처리하였을 때, siC8b1+TGFβ1+OCA가 세포 증식을 억제해주며, siC7b1+TGFβ1+OCA는 TGFβ1+OCA보다 그 효과를 폐쇄시키는 것을 보여주었다 (도 4a-b).First, cell proliferation and activation by TGFβ1 were compared through woundhealing assay. Compared to normal, TGFβ1-treated LX2 Cell showed cell proliferation and activation, but OCA 100nM additionally treated group showed suppression. Normal, siCyp7b1 and siCyp8b1 showed similar results, but siC7b1 + TGFb1 and siC8b1 + TGFβ1 showed conflicting results. The group treated with siC7b1 and TGFb1 showed more cell proliferation, but not the group treated with siC8b1 and TGFb1. When 100 nM of OCA was treated here, siC8b1+TGFβ1+OCA inhibited cell proliferation, and siC7b1+TGFβ1+OCA blocked the effect more than TGFβ1+OCA (FIGS. 4a-b).
위와 동일한 조건으로 유전자 발현을 비교한 결과, TGFβ1에 의해 TGFβ1, Collagen1, Fibronectin의 유전자발현을 유의하게 증가시켰고, 여기에 siCyp8b1+OCA 에서는 위의 유전자 발현을 감소시켰으나 siCyp7b1+OCA 투여 군에서는 감소시키지 못하였다. 단백질 발현에서는 FN-1이 TGFβ1+OCA군에 비해 siCyp7b1+TGFβ1+OCA, siCyp8b1+TGFβ1+OCA에서 낮은 발현을 보여주었으나, Collagen1에서는 나타나지 않았다.(도 4c-e) .As a result of comparing gene expression under the same conditions as above, gene expression of TGFβ1, Collagen1, and Fibronectin was significantly increased by TGFβ1, and the above gene expression was decreased in siCyp8b1+OCA, but not in the siCyp7b1+OCA administration group. did In terms of protein expression, FN-1 showed lower expression in siCyp7b1 + TGFβ1 + OCA and siCyp8b1 + TGFβ1 + OCA than in the TGFβ1 + OCA group, but not in Collagen1 (FIG. 4c-e).
이러한 결과를 통하여, Acidic pathway의 Cyp7b1의 억제가 OCA 효과에 영향을 미치는 것을 확인하였다. Through these results, it was confirmed that the inhibition of Cyp7b1 in the acidic pathway affects the OCA effect.
실시예 5: Cyp7b1 및 Cyp8b1의 발현 비에 따른 반응 군(R)과 비 반응 군(NR)에서 반응률 비교Example 5: Comparison of response rates in the responder group (R) and the non-responder group (NR) according to the expression ratio of Cyp7b1 and Cyp8b1
위의 결과들을 통해, Bile acids 대사에 관여하는 단백질의 발현 양상이 OCA 약물 반응에 영향을 미치는 점을 확인하였고, 우리는 보다 정확한 결과를 얻기 위해서 Bile acids 관련 단백질들의 발현 비율에 따른 반응군(R), 비반응군(NR)의 상관관계를 확인하고자 다음과 같이 분석하였다.Through the above results, it was confirmed that the expression pattern of proteins involved in bile acids metabolism affects the OCA drug response, and in order to obtain more accurate results, we developed a response group (R ), and the non-responder (NR) were analyzed as follows to confirm the correlation.
전체 OCA를 투여한 마우스의 각각의 개체에서 Cyp7b1/Cyp8b1의 ratio를 Response군과 Non-Response군으로 나누어 비교하였다. 두 군에서는 유의한 차이를 보여주었다. ratio가 5이하일 때 대부분의 Non-Response군이 이에 해당되며, 6 이상일 때, Response군이 이에 해당되었다 (도 5a).The ratio of Cyp7b1/Cyp8b1 in each individual of mice administered with total OCA was divided into Response group and Non-Response group and compared. The two groups showed a significant difference. When the ratio was 5 or less, most of the Non-Response group corresponded to this, and when it was 6 or more, the Response group corresponded to this (FIG. 5a).
마지막으로, 36.84%의 Response rate에 해당되는 마우스는 대부분 평균 이상의 Cyp7b1발현을 나타낼 때 71%, 평균 이하의 Cyp8b1발현을 나타낼 때 57%, 이들의 ratio가 6 이상일 때는 80%에 해당되었다(도 5b). Finally, most of the mice with a response rate of 36.84% were 71% with above-average Cyp7b1 expression, 57% with below-average Cyp8b1 expression, and 80% when their ratio was 6 or higher (Fig. 5b). ).
따라서, Cyp7b1 및 Cyp8b1의 발현 비가 OCA약물에 대한 환자의 반응여부를 예측할 수 있는 마커로 이용할 수 있음을 확인할 수 있었다.Accordingly, it was confirmed that the expression ratio of Cyp7b1 and Cyp8b1 can be used as a marker for predicting whether a patient responds to an OCA drug.
Claims (13)
상기 Cyp7b1 유전자의 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준이 정상에 비하여 고발현 또는 고활성화된 경우, Obeticholic acid(OCA)에 대한 민감성이 있는 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 비 알콜성 지방간 질환 치료제 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성 예측용 바이오 마커 조성물.The method according to claim 1, wherein the expression level of the Cyp7b1 gene; Or, if the expression or activity level of its protein is low expression or low activation compared to normal, it is determined that there is resistance to obeticholic acid (OCA),
the expression level of the Cyp7b1 gene; Or, if the expression or activity level of its protein is higher than normal, it is predicted that there is sensitivity to Obeticholic acid (OCA), to non-alcoholic fatty liver disease treatment Obeticholic acid (OCA) A biomarker composition for predicting susceptibility to
(a) 대상으로부터 생물학적 시료를 준비하는 단계;
(b) 상기 생물학적 시료 내에 Cyp7b1(Cytochrome P450 Family 7 Subfamily B Member 1) 유전자의 발현 수준; 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준을 확인하는 단계; 및
(c) 상기 (b) 단계의 결과를 기반으로 하여, 대상의 비 알콜성 지방간 치료제 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성을 판정하는 단계.Method for providing information for predicting sensitivity to obeticholic acid (OCA), a non-alcoholic fatty liver disease treatment comprising the following steps:
(a) preparing a biological sample from the subject;
(b) the expression level of the Cyp7b1 (Cytochrome P450 Family 7 Subfamily B Member 1) gene in the biological sample; Checking the expression or activity level of its protein; and
(c) based on the result of step (b), determining the sensitivity of the subject to obeticholic acid (OCA), a treatment for non-alcoholic fatty liver disease.
상기 Cyp7b1 유전자의 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 또는 활성 수준이 정상에 비하여 고발현 또는 고활성화된 경우, Obeticholic acid(OCA)에 대한 민감성이 있는 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 비 알콜성 지방간 질환 치료제 Obeticholic acid(OCA)에 대한 감수성 예측을 위한 정보 제공 방법.10. The method of claim 9, wherein step (c) is performed by determining the expression level of the Cyp7b1 gene; Or, if the expression or activity level of its protein is low expression or low activation compared to normal, it is determined that there is resistance to obeticholic acid (OCA),
the expression level of the Cyp7b1 gene; Or, if the expression or activity level of its protein is higher than normal, it is predicted that there is sensitivity to Obeticholic acid (OCA), to non-alcoholic fatty liver disease treatment Obeticholic acid (OCA) A method for providing information for predicting susceptibility to
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KR1020200162812A KR102573089B1 (en) | 2020-11-27 | 2020-11-27 | Novel Biomarkers for Predicting Susceptibility to nonalcoholic fatty liver disease treatment agent and Uses Thereof |
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Gastroenterology, 2017, 152권, 페이지 1462-1476 |
Hepatology Communications, 2017, 1권, 10호, 페이지 1002-1004 |
Liver Res Open J, 2015, 1권, 2호, 페이지 32-40 |
Pharmacology Research & Perspectives, 2017, 5권, 4호, e00329, 페이지 1-11 |
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