KR102367090B1 - Apparatus and method for numerical refocusing of photoacoustic microscopy based on super-resolution convolution neural network - Google Patents
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Abstract
본 발명은 광음향 현미경 영상 재초점 장치 및 방법에 관한 것으로, 본 발명에 따르면 영상을 일정한 초점 흐림 영상으로 변환하여 CNN 기반의 초해상도 방법을 사용함으로써 다양한 흐림 정도의 영상을 복원할 수 있고, 광학 렌즈의 초점 변화나 배율 변화 없이도 최적의 영상을 획득할 수 있는 효과가 있다.The present invention relates to a photoacoustic microscope image refocusing apparatus and method. According to the present invention, an image of various degrees of blur can be restored by converting an image into a constant defocus image and using a CNN-based super-resolution method, and optical There is an effect of obtaining an optimal image without changing the focus or magnification of the lens.
Description
본 발명은 광음향 현미경의 영상 개선에 관한 것으로, 특히 합성곱 신경망 기반의 초해상도 기술을 이용한 영상 재초점 기술에 관한 것이다.The present invention relates to image improvement of a photoacoustic microscope, and more particularly, to an image refocusing technique using a super-resolution technique based on a convolutional neural network.
광음향 현미경(PAM: Photoacoustic Microscophy)은 광음향 효과를 이용하여 생체 내의 다양한 내인성 조영제에 대한 영상을 획득하는 장치이다. 광음향 현미경은 초음파 영상 기법과 광학 영상 기법의 장점들만 취사선택 할 수 있는 장점이 있다. 광음향 현미경을 이용하여 광음향 영상을 획득할 때 높은 해상도의 영상을 얻기 위해서는 높은 개구수의 대물렌즈를 채용해야 하는데 대물렌즈가 커질수록 초점이 유지되는 축상 길이(Rayleigh length)가 감소하는 관계가 있다. 따라서 광음향 현미경의 해상도가 매우 높은 경우에 축상 길이는 매우 짧아지게 되어 시료의 축상 위치가 영상 획득에 있어 민감한 매개변수로 작용하게 된다. 따라서 다양한 요인으로 시료의 위치가 축상 길이 내에 놓이지 못하는 경우에는 초점이 흐려지는 문제가 발생하게 된다.A photoacoustic microscope (PAM) is a device that acquires images of various endogenous contrast agents in a living body by using a photoacoustic effect. The photoacoustic microscope has the advantage of being able to select only the advantages of the ultrasound imaging technique and the optical imaging technique. When acquiring a photoacoustic image using an optoacoustic microscope, a high numerical aperture objective lens must be employed to obtain a high-resolution image. there is. Therefore, when the resolution of the photoacoustic microscope is very high, the axial length becomes very short, and the axial position of the sample acts as a sensitive parameter in image acquisition. Therefore, if the position of the sample cannot be placed within the axial length due to various factors, a problem of blurred focus occurs.
이와 같은 문제를 해결하기 위해 다양한 방법들이 개발되어 시도되어 왔다. 초점을 맞추기 위해 초점 위치를 바꾸는 경우에는 배율의 변화가 발생할 수 있는 단점이 있고, 현미경 광학계나 시료의 위치를 축상에서 변경하는 경우에는 이를 조절하기 위한 정밀한 기계적인 장치가 추가로 필요하고 시간도 오래 걸린다는 문제가 있다.In order to solve this problem, various methods have been developed and tried. When changing the focus position to focus, there is a disadvantage that a change in magnification may occur. There is a problem with taking
본 발명의 발명자들은 이러한 종래 기술의 광음향 현미경의 초점 문제를 해결하기 위해 연구 노력해 왔다. 광음향 현미경의 초점 위치를 바꾸거나 축상 위치를 조절하지 않고도 초점이 맞지 않는 영상에 대해 알고리즘 기반의 영상 개선 방법을 적용함으로써 초점이 맞는 영상을 얻을 수 있는 장치 및 방법을 완성하기 위해 많은 노력 끝에 본 발명을 완성하기에 이르렀다.The inventors of the present invention have made research efforts to solve the focus problem of the prior art photoacoustic microscope. After much effort to complete a device and method that can obtain a focused image by applying an algorithm-based image enhancement method to an out-of-focus image without changing the focal position of the photoacoustic microscope or adjusting the axial position came to the conclusion of the invention.
이 성과는 정부(과학기술정보통신부)의 재원으로 한국연구재단의 지원을 받아 수행된 연구임 (No. 2020R1F1A105199411).This achievement is a research conducted with the support of the National Research Foundation with the funding of the government (Ministry of Science and ICT) (No. 2020R1F1A105199411).
This work was supported by the National Research Foundation of Korea(NRF) grant funded by the Korea government(MSIT) (No. 2020R1F1A105199411).This work was supported by the National Research Foundation of Korea (NRF) grant funded by the Korea government (MSIT) (No. 2020R1F1A105199411).
본 발명의 목적은 고해상도 광음향 현미경을 이용해 획득한 초점이 맞지 않는 영상을 초점 위치 조절이나 광학계 또는 시료의 이동 없이도 수치적 계산만으로 초점이 맞는 영상으로 복원할 수 있는 장치 및 방법을 제공하는 것이다.An object of the present invention is to provide an apparatus and method capable of restoring an out-of-focus image obtained using a high-resolution photoacoustic microscope to a focused image only by numerical calculation without adjusting the focal position or moving the optical system or the sample.
한편, 본 발명의 명시되지 않은 또 다른 목적들은 하기의 상세한 설명 및 그 효과로부터 용이하게 추론 할 수 있는 범위 내에서 추가적으로 고려될 것이다.On the other hand, other objects not specified in the present invention will be additionally considered within the range that can be easily inferred from the following detailed description and effects thereof.
본 발명에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치는,A photoacoustic microscope image refocusing device according to the present invention,
광음향 현미경으로 획득한 영상의 초점 흐림 정도를 판별하는 초점 흐림 판별부; 상기 판별한 흐림 정도에 따라 상기 영상을 미리 정해진 일정한 흐림 정도로 변환하는 초점 변환부; 상기 일정한 흐림 정도로 변환된 영상을 미리 정해진 해상도로 변환하는 해상도 변환부; 및 상기 해상도 변환된 영상을 초해상도(Super-Resolution) 변환하는 초해상도 변환부;를 포함한다.Defocus determination unit for determining the degree of defocusing of the image acquired by the photoacoustic microscope; a focus conversion unit converting the image to a predetermined degree of blur according to the determined degree of blur; a resolution converter for converting the image converted to a certain degree of blur to a predetermined resolution; and a super-resolution converter converting the resolution-converted image to a super-resolution (Super-Resolution).
본 발명의 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치는,Photoacoustic microscope image refocusing apparatus according to another embodiment of the present invention,
광음향 현미경으로 획득한 영상의 초점 흐림 정도를 판별하는 초점 흐림 판별부; 상기 영상을 미리 정해진 해상도로 변환하는 해상도 변환부; 및 상기 해상도 변환된 영상의 초점 흐림 정도에 따라 각각 다른 흐림 정도를 해상도 복원하는 복수의 초해상도 변환부;를 포함한다.Defocus determination unit for determining the degree of defocusing of the image acquired by the photoacoustic microscope; a resolution converter converting the image to a predetermined resolution; and a plurality of super-resolution converters for reconstructing resolutions of different degrees of blur according to the degree of blur of the resolution-converted image.
본 발명의 또 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치는,Photoacoustic microscope image refocusing apparatus according to another embodiment of the present invention,
광음향 현미경으로 획득한 영상을 미리 정해진 해상도로 변환하는 해상도 변환부; 상기 해상도 변환된 영상을 각각 다른 흐림 정도에 따라 해상도 복원하는 복수의 초해상도 변환부; 및 상기 복수의 초해상도 변환된 영상 각각에 대해 선예도를 개선하는 복수의 선예도 계산부;를 포함한다.a resolution converter for converting an image acquired with a photoacoustic microscope into a predetermined resolution; a plurality of super-resolution converters for reconstructing the resolution-converted image according to different degrees of blur; and a plurality of sharpness calculators for improving sharpness of each of the plurality of super-resolution converted images.
상기 초점 변환부는 상기 영상의 초점을 상기 광음향 현미경에서 발생하는 최대 초점 흐림 정도로 변환하는 것을 특징으로 한다.The focus converter converts the focus of the image to a degree of maximum defocusing generated in the photoacoustic microscope.
상기 해상도 변환부는 상기 영상을 상기 영상의 해상도보다 낮은 해상도로 다운샘플링(Down Sampling)하는 것을 특징으로 한다.The resolution converter down-samples the image to a resolution lower than the resolution of the image.
또한 상기 초해상도 변환부는 합성곱 신경망(Convolution Neural Network) 기반의 SRGAN(Super-Resolution Generative Adversarial Network) 방법으로 미리 학습되어 상기 영상을 초해상도 변환하는 것을 특징으로 한다.In addition, the super-resolution conversion unit is pre-learned by a SRGAN (Super-Resolution Generative Adversarial Network) method based on a convolutional neural network, and it is characterized in that the super-resolution conversion of the image is performed.
바람직하게는 상기 초해상도 변환부는 상기 영상에 단일 영상 초해상도(Single Image Super Resolution)방법을 적용하여 상기 영상을 초해상도 변환하는 것이 좋다.Preferably, the super-resolution conversion unit may apply a single image super-resolution (Single Image Super Resolution) method to the image to perform super-resolution conversion of the image.
본 발명에 따른 광음향 현미경 영상의 재초점 방법은,The method of refocusing a photoacoustic microscope image according to the present invention,
광음향 현미경으로 획득한 영상의 초점 흐림 정도를 판별하는 초점 흐림 판별 단계; 상기 판별한 흐림 정도에 따라 상기 영상을 미리 정해진 일정한 흐림 정도로 변환하는 초점 변환 단계; 상기 일정한 흐림 정도로 변환된 영상을 미리 정해진 해상도로 변환하는 해상도 변환 단계; 및 상기 해상도 변환된 영상을 초해상도(Super-Resolution) 변환하는 초해상도 변환 단계;를 포함한다.Defocusing determination step of determining the degree of defocusing of the image acquired by the photoacoustic microscope; a focus conversion step of converting the image to a predetermined degree of blur according to the determined degree of blur; a resolution conversion step of converting the image converted to a certain degree of blur to a predetermined resolution; and a super-resolution conversion step of converting the resolution-converted image to a super-resolution (Super-Resolution).
본 발명의 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상의 재초점 방법은,A method of refocusing a photoacoustic microscope image according to another embodiment of the present invention,
광음향 현미경으로 획득한 영상의 초점 흐림 정도를 판별하는 초점 흐림 판별 단계; 상기 영상을 미리 정해진 해상도로 변환하는 해상도 변환 단계; 및 상기 해상도 변환된 영상의 초점 흐림 정도에 따라 각각 다른 흐림 정도를 해상도 복원하는 초해상도 변환 단계;를 포함한다.Defocusing determination step of determining the degree of defocusing of the image acquired by the photoacoustic microscope; a resolution conversion step of converting the image to a predetermined resolution; and a super-resolution conversion step of reconstructing resolutions of different degrees of blur according to the degree of defocusing of the resolution-converted image.
본 발명의 또 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상의 재초점 방법은,A method of refocusing a photoacoustic microscope image according to another embodiment of the present invention,
광음향 현미경으로 획득한 영상을 미리 정해진 해상도로 변환하는 해상도 변환 단계; 상기 해상도 변환된 영상을 각각 다른 흐림 정도에 따른 복수의 해상도 복원 영상을 생성하는 초해상도 변환 단계; 및 상기 복수의 초해상도 변환된 영상 각각에 대해 선예도를 개선하는 복수의 선예도 계산 단계;를 포함한다.A resolution conversion step of converting an image acquired with a photoacoustic microscope to a predetermined resolution; a super-resolution conversion step of generating a plurality of resolution-reconstructed images according to different degrees of blur from the resolution-converted image; and a plurality of sharpness calculation steps of improving sharpness for each of the plurality of super-resolution converted images.
상기 초점 변환 단계는 상기 영상의 초점을 상기 광음향 현미경에서 발생하는 최대 초점 흐림 정도로 변환하는 것을 특징으로 한다.The focus conversion step is characterized in that the focus of the image is converted to a degree of maximum defocusing generated in the photoacoustic microscope.
또한 상기 해상도 변환 단계는 상기 영상을 상기 영상의 해상도보다 낮은 해상도로 다운샘플링(Down Sampling)하는 것을 특징으로 한다.In addition, the resolution conversion step is characterized in that the down-sampling of the image to a resolution lower than the resolution of the image.
상기 초해상도 변환단계는 SRGAN 방법으로 미리 학습된 합성곱 신경망(Convolution Neural Network)에 의해 상기 영상을 초해상도 변환할 수 있다.In the super-resolution conversion step, the image may be converted to super-resolution by a convolutional neural network trained in advance by the SRGAN method.
바람직하게는 상기 초해상도 변환단계는 상기 영상에 단일 영상 초해상도(Single Image Super Resolution)방법을 적용하여 상기 영상을 초해상도 변환하는 것이 좋다.Preferably, in the super-resolution conversion step, the image is converted to super-resolution by applying a single image super-resolution (Single Image Super Resolution) method to the image.
본 발명에 따르면 광음향 현미경의 광학계 또는 기계적인 움직임 제어 장치 등의 교체나 추가 없이도 초점이 맞지 않는 영상을 개선할 수 있는 효과가 있다.According to the present invention, there is an effect that an image out of focus can be improved without replacement or addition of an optical system or a mechanical motion control device of a photoacoustic microscope.
또한 합성곱 신경망 기반의 초해상도 기술을 사용함으로써 보다 정확한 초점 향상 영상을 획득할 수 있는 장점도 있다.In addition, there is an advantage in that a more accurate focus-enhanced image can be obtained by using a super-resolution technology based on a convolutional neural network.
한편, 여기에서 명시적으로 언급되지 않은 효과라 하더라도, 본 발명의 기술적 특징에 의해 기대되는 이하의 명세서에서 기재된 효과 및 그 잠정적인 효과는 본 발명의 명세서에 기재된 것과 같이 취급됨을 첨언한다.On the other hand, even if it is an effect not explicitly mentioned herein, it is added that the effects described in the following specification expected by the technical features of the present invention and their potential effects are treated as described in the specification of the present invention.
도 1은 본 발명의 바람직한 어느 실시예에 따른 광음향 현미경 영상의 개선 전/후 영상의 예를 나타낸다.
도 2는 본 발명의 바람직한 어느 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치의 개략적인 구조도이다.
도 3은 본 발명의 바람직한 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치의 개략적인 구조도이다.
도 4는 본 발명의 바람직한 또 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치의 개략적인 구조도이다.
도 5는 본 발명의 바람직한 어느 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 방법의 개략적인 흐름도이다.
도 6는 본 발명의 바람직한 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 방법의 개략적인 흐름도이다.
도 7은 본 발명의 바람직한 또 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 방법의 개략적인 흐름도이다.
※ 첨부된 도면은 본 발명의 기술사상에 대한 이해를 위하여 참조로서 예시된 것임을 밝히며, 그것에 의해 본 발명의 권리범위가 제한되지는 아니한다1 shows an example of an image before/after improvement of a photoacoustic microscope image according to a preferred embodiment of the present invention.
2 is a schematic structural diagram of a photoacoustic microscope image refocusing apparatus according to a preferred embodiment of the present invention.
3 is a schematic structural diagram of a photoacoustic microscope image refocusing apparatus according to another preferred embodiment of the present invention.
4 is a schematic structural diagram of a photoacoustic microscope image refocusing apparatus according to another preferred embodiment of the present invention.
5 is a schematic flowchart of a method for refocusing a photoacoustic microscope image according to a preferred embodiment of the present invention.
6 is a schematic flowchart of a method for refocusing a photoacoustic microscope image according to another preferred embodiment of the present invention.
7 is a schematic flowchart of a method for refocusing a photoacoustic microscope image according to another preferred embodiment of the present invention.
※ It is revealed that the accompanying drawings are exemplified as a reference for understanding the technical idea of the present invention, and the scope of the present invention is not limited thereby
이하, 도면을 참조하여 본 발명의 다양한 실시예가 안내하는 본 발명의 구성과 그 구성으로부터 비롯되는 효과에 대해 살펴본다. 본 발명을 설명함에 있어서 관련된 공지기능에 대하여 이 분야의 기술자에게 자명한 사항으로서 본 발명의 요지를 불필요하게 흐릴 수 있다고 판단되는 경우에는 그 상세한 설명을 생략한다. Hereinafter, the configuration of the present invention guided by various embodiments of the present invention and effects resulting from the configuration will be described with reference to the drawings. In the description of the present invention, if it is determined that related known functions are obvious to those skilled in the art and may unnecessarily obscure the gist of the present invention, the detailed description thereof will be omitted.
'제1', '제2' 등의 용어는 다양한 구성요소를 설명하는데 사용될 수 있지만, 상기 구성요소는 위 용어에 의해 한정되어서는 안 된다. 위 용어는 하나의 구성요소를 다른 구성요소로부터 구별하는 목적으로만 사용될 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 권리범위를 벗어나지 않으면서 '제1구성요소'는 '제2구성요소'로 명명될 수 있고, 유사하게 '제2구성요소'도 '제1구성요소'로 명명될 수 있다. 또한, 단수의 표현은 문맥상 명백하게 다르게 표현하지 않는 한, 복수의 표현을 포함한다. 본 발명의 실시예에서 사용되는 용어는 다르게 정의되지 않는 한, 해당 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 통상적으로 알려진 의미로 해석될 수 있다.Terms such as 'first' and 'second' may be used to describe various elements, but the elements should not be limited by the above terms. The above term may be used only for the purpose of distinguishing one component from another. For example, without departing from the scope of the present invention, a 'first component' may be termed a 'second component', and similarly, a 'second component' may also be termed a 'first component'. can Also, the singular expression includes the plural expression unless the context clearly dictates otherwise. Unless otherwise defined, terms used in the embodiments of the present invention may be interpreted as meanings commonly known to those of ordinary skill in the art.
이하, 도면을 참조하여 본 발명의 다양한 실시예가 안내하는 본 발명의 구성과 그 구성으로부터 비롯되는 효과에 대해 살펴본다.Hereinafter, the configuration of the present invention guided by various embodiments of the present invention and effects resulting from the configuration will be described with reference to the drawings.
도 1은 본 발명의 바람직한 어느 실시예에 따라 재초점 방법을 수행한 전/후 영상의 예를 나타낸다.1 shows an example of an image before/after performing a refocusing method according to a preferred embodiment of the present invention.
재초점 전 영상(2)은 시료가 축상 위치에 있지 않은 경우 초점이 맞지 않은 흐릿한 영상이 획득된다. 이 영상은 초점이 맞지 않아 영상의 내용을 확인할 수 없는 문제가 있다.As for the pre-refocus image (2), an out-of-focus blurry image is obtained when the sample is not in an axial position. This video has a problem that it is not possible to check the contents of the video because it is out of focus.
본 발명에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치(1)는 물리적인 재촬영 없이 합성곱 신경망(CNN: Convolution Neural Network) 기반의 수치적 재초점 방법을 이용하여 영상을 가공하여 초점이 개선된 영상(3)을 복원해 낼 수 있다.The photoacoustic microscope
광음향 현미경 영상 재초점 장치(1)의 구성 및 재초점 방법은 이하에서 자세히 설명하기로 한다.The configuration and refocusing method of the photoacoustic microscope
도 2는 본 발명의 바람직한 어느 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치의 개략적인 구조도이다.2 is a schematic structural diagram of a photoacoustic microscope image refocusing apparatus according to a preferred embodiment of the present invention.
본 발명에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치(10)는 초점 흐림 판별부(110), 초점 변환부(120), 해상도 변환부(130) 및 초해상도 변환부(140)를 포함한다. The photoacoustic microscope
광음향 현미경 영상 재초점 장치(10)는 복수의 하드웨어/소프트웨어 장비를 포함하여 구성될 수 있다. 하드웨어 장비로는 하나 이상의 프로세서 유닛과 하나 이상의 메모리를 포함하는 전자장치, 영상처리장치 등이 포함되고, 소프트웨어 장비로는 광음향 현미경 영상을 가공하여 사용자에게 제공하는 구성과 관련되는 데이터 매니지먼트, 데이터베이스 관리, 데이터 처리, 데이터 송수신 등에 관한 일체의 프로세스를 처리하는 복수의 소프트웨어를 포함한다.The photoacoustic microscope
초점 흐림 판별부(110)는 광음향 현미경을 이용해서 촬영한 영상의 초점 흐림 정도를 판별한다. The
광음향 현미경은 광음향 효과(Photoacoustic effect)에 기반한 시각화 방법을 사용한다. 광음향 효과는 세포가 빛을 흡수하면 온도가 상승하면서 음파(Acoustic Wave)를 내보내는 현상을 의미한다. 광음향 현미경은 이 발생하는 음파를 이용하여 고해상도 이미지를 얻는다.The photoacoustic microscope uses a visualization method based on the photoacoustic effect. The photoacoustic effect refers to a phenomenon in which a cell absorbs light and emits acoustic waves as the temperature rises. Photoacoustic microscopes use these generated sound waves to obtain high-resolution images.
광음향 현미경은 음향 해상도 광음향 현미경(AR-PAM: Acoustic Resolution PAM)과 광학 해상도 광음향 현미경(OR-PAM: Optical Resolution PAM)으로 구분된다.The photoacoustic microscope is classified into an acoustic resolution photoacoustic microscope (AR-PAM) and an optical resolution photoacoustic microscope (OR-PAM: Optical Resolution PAM).
AR-PAM은 넓은 영역에 빛을 조사하여 발생하는 초음파를 수신하기 때문에 영상의 해상도가 초음파 트랜스듀서의 해상도에 의존한다.Since AR-PAM receives ultrasound generated by irradiating light over a wide area, the resolution of the image depends on the resolution of the ultrasound transducer.
OR-PAM은 시료에 빛을 집속(focusing)하여 광음향 효과를 유도하기 때문에 OR-PAM에서는 빛이 집속된 정도에 따라 해상도가 증가한다. 따라서 높은 해상도를 얻기 위해서는 높은 개구수의 대물렌즈를 채용해야 하는데 그러면 초점이 유지되는 축상 길이는 짧아지게 되는 것이다.Since OR-PAM induces a photoacoustic effect by focusing light on a sample, in OR-PAM, the resolution increases according to the concentration of light. Therefore, in order to obtain high resolution, it is necessary to employ a high numerical aperture objective lens, and then the axial length at which the focus is maintained becomes shorter.
일반적인 광학 현미경은 시료가 초점위치로부터 멀어지면 회절현상에 따라 영상이 흐려지지만 OR-PAM은 가우시안(Gaussian) 흐림에 따라 영상이 흐려지게 된다. 시료에 조사되는 광학 빔 스폿 크기(Beam spot size)가 초점위치로부터 멀어지는 정도에 따라 가우시안 함수의 형태로 증가하게 된다. 따라서 이 현상을 이용하여 초점 흐림 판별부(110)는 영상의 흐려짐 정도를 계산할 수 있다.In a general optical microscope, when the sample moves away from the focal point, the image becomes blurred according to diffraction, but in OR-PAM, the image becomes blurred according to the Gaussian blur. The optical beam spot size irradiated to the sample increases in the form of a Gaussian function according to the degree to which it moves away from the focal point. Therefore, using this phenomenon, the
초점 흐림 판별부(110)는 신경망 구조를 가진다. 신경망 구조의 한 예로 CNN이 사용될 수 있다. 초점 흐림 판별부(110)는 초점이 흐려진 영상을 입력받아 One Hot Encoding 형태의 출력을 생성한다. One Hot Encoding이란 분류하고자 하는 카테고리 중 확률이 가장 높은 값을 1로, 나머지 값들은 0으로 만드는 것을 의미한다. 따라서 초점 흐림 판별부(110)에 의해 구별되는 초점 흐림 정도는 일정한 개수로 미리 정의되어 있다.The
흐림 정도에 따른 흐려진 영상은 다음과 같이 계산 또는 표현될 수 있다.A blurred image according to the degree of blur may be calculated or expressed as follows.
여기서 는 지면 진리 영상(Ground Truth Image)이고, 는 표준편차가 인 가우시안 함수이며 는 합성곱(convolution) 연산을 나타낸다. 따라서 는 초점이 정확한 지면 진리 영상에 가우시안 함수가 합성곱 되어 초점 흐림 정도가 인 흐려진 영상이 되는 것이다.here is the Ground Truth Image, is the standard deviation is a Gaussian function denotes a convolution operation. therefore is a convolutional Gaussian function to a ground truth image with an accurate focus, so that the degree of defocus is This will result in a blurred image.
초점 흐림 판별부(110)의 CNN은 위와 같이 초점 흐림 정도가 흐려진 영상들에 의해 학습되어 초점 흐림 정도를 판별하게 된다.The CNN of the
초점 변환부(120)는 초점 흐림 판별부(110)에서 판별한 초점 흐림 정도에 따라 영상의 초점을 변환한다.The
초해상도 변환부(140)는 일정한 흐림 정도에서 초해상도로 영상을 복원하도록 설계된다. 따라서 초점 변환부(120)는 초해상도 변환부(140)에서 복원 가능한 흐림 정도로 영상의 초점을 변환한다. 지정된 초점 흐림 정도는 광음향 현미경에서 발생할 수 있는 최대의 초점 흐림 정도일 수 있다.The
해상도 변환부(130)는 초점 흐림 정도가 변환된 영상을 낮은 해상도로 변환한다. 즉 해상도를 낮추는 다운샘플링(Downsampling)이 영상에 적용된다. 대상 영상은 초점 흐림도가 최대로 적용된 상태이므로 이미 저주파수 대역의 이미지 신호만 포함하고 있다. 따라서 다운샘플링에 의해서 고주파수 대역의 이미지 신호가 손실되지 않는다고 가정할 수 있다.The
초해상도 변환부(140)는 마지막으로 초점흐림과 다운샘플링이 적용된 영상에 딥러닝 기반의 초해상도(Super-resolution) 방법을 적용하여 영상을 복원한다. 초해상도 방법은 단일 입력 영상의 해상도를 향상시키는 단일 이미지 초해상도 방법(Single Image Super Resolution)이 사용될 수 있다.The
초해상도 변환부(140)는 딥러닝 기반의 초해상도 방법을 사용한다. 일반적으로 초해상도 방법은 Nearest Neighbor, Bilinear, Bicubic 등의 간단한 보간법(Interpolation)을 사용해 왔으나 본 발명의 초해상도 변환부(140)는 합성곱 신경망(CNN: Convolution Neural Network) 기반의 SRGAN 방법을 사용하여 다운샘플링 된 영상을 복원한다.The
초해상도 변환부(130)에서 사용하는 초해상도 방법은 SRGAN(Super-Resolution Generative Adversarial Network) 방법이 사용될 수 있다.The super-resolution method used by the
도 8은 본 발명에 따른 초해상도 변환부를 SRGAN 방법에 의해 훈련하기 위한 개략적인 구조도를 나타낸다.8 shows a schematic structural diagram for training a super-resolution converter according to the present invention by the SRGAN method.
입력부(810)로 광음향 현미경의 초점위치에 정확히 시료가 놓인 영상(Raw Image)이 입력되면 이는 지면 진리 영상(GT Image)으로 사용된다. 지면 진리 영상은 구별부(860)에도 전달되어 구별부(860)가 지면 진리 영상에 대해 참값(D(x)=1)을 가지도록 훈련된다. 구별부(860) 역시 CNN이 사용될 수 있다.When an image (Raw Image) in which the sample is placed exactly at the focal position of the photoacoustic microscope is input to the
지면 진리 영상은 초점 변환부(820)에서 특정 초점 흐림 정도로 변환되고, 초점 흐림 변환된 영상은 다시 해상도 변환부(830)에서 원래 이미지보다 해상도를 낮추는 다운샘플링이 수행됨으로써 훈련 영상(Training Image)으로 만들어진다.The ground truth image is converted to a specific degree of defocus by the
훈련 영상은 초해상도 변환부(840)에서 고해상도 영상인 가짜 영상(Fake Image)으로 만들어진다.The training image is made into a fake image that is a high-resolution image in the
가짜 영상은 구별부(850)로 입력되어 가짜 영상에 대한 손실함수(GAN Loss, 860)를 출력한다. 이 손실함수(860)의 출력은 다시 초해상도 변환부(840)와 구별부(850)로 입력되어, 구별부(860)가 가짜 영상에 대해 지면 진리 영상과 같은 참값을 출력하도록 초해상도 변환부(840)가 최적화 되며, 손실함수(860)의 출력이 거짓(0)이 되도록 구별부(860)가 최적화 되며 반복적인 학습이 수행된다.The fake image is input to the
다시 도 2로 돌아와서 SRGAN에 의해 학습된 초해상도 변환부(140)는 특정한 초점 흐림 정도의 영상을 지면 진리 영상과 유사한 수준으로 초해상도 복원이 가능한 효과가 있다.Returning to FIG. 2 again, the
도 3은 본 발명의 바람직한 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치의 개략적인 구조도이다.3 is a schematic structural diagram of a photoacoustic microscope image refocusing apparatus according to another preferred embodiment of the present invention.
도 2의 예와 달리 광음향 현미경 영상 재초점 장치(20)는 초점 흐림 판별부(210), 해상도 변환부(220) 및 복수의 초해상도 변환부(231, 232, 233)를 포함한다.Unlike the example of FIG. 2 , the photoacoustic microscope
초점 흐림 판별부(210)는 광음향 현미경을 이용해서 촬영한 영상의 초점 흐림 정도를 판별한다.The
초점 흐림 판별부(210)를 거친 영상에 대해 도 2의 실시예와는 달리 초점 변환을 실시하지 않고 해상도 변환부(220)에 의해 영상을 낮은 해상도로 변환한다. 도 2의 실시예와 마찬가지로 이미 초점이 흐려진 영상이기 때문에 낮은 해상도로 변환해도 손실이 없다고 가정한다.Unlike the embodiment of FIG. 2 , the image that has passed through the
다운샘플링된 영상은 초점 흐림 정도에 따라 제1 초해상도 변환부(231) 내지 제n 초해상도 변환부(233) 중 하나로 입력된다. 초점 흐림 판별부(210)에서 판단한 초점 흐림 정도에 따라 알맞은 초해상도 변환부에 입력되어 영상이 복원된다. 초해상도 변환부(231, 232, 233)는 CNN 기반의 SRGAN 방법에 의해 학습됨은 동일하다. 도 2의 실시예와 달리 초점 변환이 이루어지지 않고 초점에 따른 초해상도 변환부가 선택되므로 초점 변환부가 존재하지 않는다.The down-sampled image is input to one of the
도 4는 본 발명의 바람직한 또 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치의 개략적인 구조도이다.4 is a schematic structural diagram of a photoacoustic microscope image refocusing apparatus according to another preferred embodiment of the present invention.
광음향 현미경 영상 재초점 장치(30)는 해상도 변환부(310), 복수의 초해상도 변환부(321, 322, 323) 및 복수의 선예도 계산부(331, 332, 333)를 포함한다.The photoacoustic microscope
광음향 현미경 영상 재초점 장치(30)는 해상도 변환부(310)에서 영상을 다운샘플링 한 후 초점 흐림 정도에 따라 선예도를 계산한다.The photoacoustic microscope
초해상도 변환부(321, 322, 323)는 영상의 초점 흐림 정도에 따른 초해상도 변환을 병렬로 수행한다. 따라서 초점 흐림 정도를 판단하거나 초점 흐림 정도를 변환할 필요가 없다. 초해상도 변환부(321, 322, 323)는 앞의 예와 마찬가지로 SRGAN 방법에 의해 학습되는 것을 특징으로 한다.The
초해상도 변환부(321)에 의해 초해상도 변환이 실시된 영상은 다시 선예도 계산부(331, 332, 333)를 거친다. 선예도(Sharpness) 계산부(331, 332, 333)에 의해 선예도가 개선된 영상들 중 선예도가 가장 높은 영상을 결과 영상으로 선택함으로써 초점이 흐려진 영상에 대한 복원이 완료된다.The image on which the super-resolution conversion is performed by the
도 5는 본 발명의 바람직한 어느 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 방법의 개략적인 흐름도이다.5 is a schematic flowchart of a method for refocusing a photoacoustic microscope image according to a preferred embodiment of the present invention.
우선 광음향 현미경에 의해 획득한 영상에 대해 영상의 초점이 흐려진 정도를 판단한다(S10). 본 발명에 따른 초해상도 변환은 일정한 초점을 가진 영상에 대해서만 개선 효과를 가지므로 일정한 흐림 정도로 변환하기 위해 현재 흐려진 정도를 판단하는 것이다.First, the degree of defocusing of the image acquired by the photoacoustic microscope is determined (S10). Since the super-resolution conversion according to the present invention has an improvement effect only on an image having a certain focus, the current degree of blur is determined in order to convert to a certain degree of blur.
초점이 흐려진 정도가 판단되면 초해상도 변환을 위한 초점 흐림 영상으로 초점을 변환한다(S20). 초해상도 변환이 가능한 흐림 정도로 변환하는 것이다. 본 발명의 실시예에서는 최대 초점 흐림 정도로 설정할 수 있다.When the degree of defocusing is determined, the defocused image is converted into a defocused image for super-resolution conversion (S20). It is converted to a degree of blur that can be converted to super-resolution. In an embodiment of the present invention, the maximum degree of defocusing may be set.
최대로 초점이 흐려진 영상에 대해 저해상도 영상으로 변환이 실시된다(S30). 초점이 최대로 흐려진 상태에서는 고주파 성분이 없으므로 저해상도 영상으로 다운샘플링이 되어도 영상에는 손실이 발생하지 않는다고 가정할 수 있다.Conversion to a low-resolution image is performed on the image out of focus to the maximum (S30). Since there is no high-frequency component in the state in which the focus is maximally defocused, it can be assumed that there is no loss in the image even when downsampling to a low-resolution image.
다운샘플링 된 영상에 대해 마지막으로 초해상도 영상 변환이 실시된다(S40). 초해상도 변환은 CNN 기반의 SRGAN 방법이 사용될 수 있다.Finally, super-resolution image conversion is performed on the down-sampled image (S40). For super-resolution transformation, a CNN-based SRGAN method may be used.
도 6은 본 발명의 바람직한 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 방법의 개략적인 흐름도이다.6 is a schematic flowchart of a method for refocusing a photoacoustic microscope image according to another preferred embodiment of the present invention.
이하의 광음향 현미경 영상 재초점 방법은 하나 이상의 프로세서 및 메모리를 포함하는 광음향 현미경 영상 재초점 장치에 의해 수행될 수 있다.The following optoacoustic microscope image refocusing method may be performed by an optoacoustic microscope image refocusing apparatus including one or more processors and a memory.
영상 초점 흐림 정도를 판단하고(S110) 저해상도 영상으로 다운샘플링 하는 단계(S120)는 도 5의 실시예와 같다.The step of determining the degree of image defocusing (S110) and downsampling to a low-resolution image (S120) is the same as the embodiment of FIG. 5 .
초해상도 영상 변환 단계에서는 영상 초점 흐림 정도에 따라 영상을 초해상도 영상으로 변환한다(S130). 즉, 일정한 흐림 정도의 영상만 변환하는 것이 아니라 다양한 흐림 정도의 영상에 대해 초해상도 영상 변환을 적용할 수 있다. 이를 위해 초해상도 영상 변환 단계는 복수의 초점 영상에 대해 병렬로 진행될 수 있다.In the super-resolution image conversion step, the image is converted into a super-resolution image according to the degree of image defocusing (S130). That is, the super-resolution image conversion may be applied to images of various degrees of blur, rather than converting only an image of a certain degree of blur. To this end, the super-resolution image conversion step may be performed in parallel with respect to a plurality of focus images.
도 7은 본 발명의 바람직한 또 다른 실시예에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 방법의 개략적인 흐름도이다.7 is a schematic flowchart of a method for refocusing a photoacoustic microscope image according to another preferred embodiment of the present invention.
도 5 또는 도 6의 실시예와 달리 영상 초점의 흐림 정도를 판단하지 않고 저해상도 영상으로의 변환이 이루어진다(S210).Unlike the embodiment of FIG. 5 or FIG. 6 , the image is converted into a low-resolution image without determining the degree of blur of the focus ( S210 ).
다운샘플링 된 영상은 초해상도 영상으로 변환이 이루어진다(S220).The down-sampled image is converted into a super-resolution image (S220).
초해상도 영상으로 변환이 이루어진 영상은 원래 다양한 초점 거리를 가지는 영상이었을 것이므로 복수의 선예도 계산 단계를 거친다(S230).Since the image converted to the super-resolution image must have originally been an image having various focal lengths, a plurality of sharpness calculation steps are performed (S230).
복수의 선예도 계산에 의해 복수의 선예도 개선 결과 영상이 도출되면 이 중 가장 선예도가 높은 영상, 즉 초점이 맞는 영상에 가장 가까운 영상을 복원 영상으로 선택할 수 있다.When a plurality of sharpness improvement images are derived by calculating a plurality of sharpness, an image having the highest sharpness, that is, an image closest to an image in focus may be selected as the restored image.
이상과 같은 본 발명에 따른 광음향 현미경 영상 재초점 장치 및 방법에 따르면 영상을 일정한 초점 흐림 영상으로 변환하여 CNN 기반의 초해상도 방법을 사용함으로써 다양한 흐림 정도의 영상을 복원할 수 있고, 광학 렌즈의 초점 변화나 배율 변화 없이도 최적의 영상을 획득할 수 있는 효과가 있다.According to the photoacoustic microscope image refocusing apparatus and method according to the present invention as described above, it is possible to restore images of various degrees of blur by converting an image into a constant defocus image and using a CNN-based super-resolution method, and There is an effect of obtaining an optimal image without changing the focus or magnification.
본 발명의 보호범위가 이상에서 명시적으로 설명한 실시예의 기재와 표현에 제한되는 것은 아니다. 또한, 본 발명이 속하는 기술분야에서 자명한 변경이나 치환으로 말미암아 본 발명이 보호범위가 제한될 수도 없음을 다시 한 번 첨언한다.The protection scope of the present invention is not limited to the description and expression of the embodiments explicitly described above. In addition, it is added once again that the protection scope of the present invention cannot be limited due to obvious changes or substitutions in the technical field to which the present invention pertains.
Claims (14)
상기 판별한 흐림 정도에 따라 상기 영상을 미리 정해진 일정한 흐림 정도로 변환하되, 상기 영상의 초점을 상기 광음향 현미경의 최대 초점 흐림 정도로 변환하는 초점 변환부;
상기 일정한 흐림 정도로 변환된 영상을 미리 정해진 해상도로 변환하는 해상도 변환부; 및
상기 해상도 변환된 영상을 초해상도(Super-Resolution) 변환하는 초해상도 변환부;를 포함하며,
상기 초점 흐림 판별부는 입력된 상기 영상에 대해 초점 흐림 정도가 구별된 다수개의 출력을 One Hot Encoding 형태로 생성하는 신경망 구조로 구현되고, 하기 식에 따라 계산되는 흐려진 영상을 이용하여 학습되는, 광음향 현미경 영상 재초점 장치.
(여기서, 는 지면 진리 영상(Ground Truth Image)이고, _는 표준편차가 인 가우시안 함수이며, 는 합성곱(convolution) 연산을 나타고, 는 초점이 정확한 지면 진리 영상에 가우시안 함수가 합성곱 되어 초점 흐림 정도가 인 흐려진 영상)
a defocus determination unit receiving an image previously acquired by a photoacoustic microscope and determining a degree of defocusing of the input image;
a focus converter converting the image to a predetermined degree of blur according to the determined degree of blur, and converting the focus of the image to the degree of maximum blur of the photoacoustic microscope;
a resolution converter for converting the image converted to a certain degree of blur to a predetermined resolution; and
It includes; a super-resolution conversion unit for converting the resolution-converted image to a super-resolution (Super-Resolution),
The defocus determination unit is implemented with a neural network structure that generates a plurality of outputs with different degrees of defocusing for the input image in the form of One Hot Encoding, and is learned using the blurred image calculated according to the following equation, photoacoustic Microscopic imaging refocusing device.
(here, is the Ground Truth Image, _ is the standard deviation is a Gaussian function, represents a convolution operation, is a convolution of a Gaussian function on a ground truth image with an accurate focus, so that the degree of defocus is (blurred video)
상기 해상도 변환부는 상기 영상을 상기 영상의 해상도보다 낮은 해상도로 다운샘플링(Down Sampling)하는 것을 특징으로 하는, 광음향 현미경 영상 재초점 장치.
According to claim 1,
The resolution converter down-sampling the image to a resolution lower than the resolution of the image, characterized in that the photoacoustic microscope image refocusing device.
상기 초해상도 변환부는 합성곱 신경망(Convolution Neural Network) 기반의 SRGAN(Super-Resolution Generative Adversarial Network) 방법으로 미리 학습되어 상기 영상을 초해상도 변환하는 것을 특징으로 하는, 광음향 현미경 영상 재초점 장치.
According to claim 1,
The super-resolution conversion unit is pre-learned by the SRGAN (Super-Resolution Generative Adversarial Network) method based on a convolutional neural network, characterized in that the super-resolution conversion of the image, a photoacoustic microscope image refocusing device.
상기 초해상도 변환부는 상기 영상에 단일 영상 초해상도(Single Image Super Resolution)방법을 적용하여 상기 영상을 초해상도 변환하는 것을 특징으로 하는, 광음향 현미경 영상 재초점 장치.
According to claim 1,
The super-resolution converter applies a single image super-resolution (Single Image Super Resolution) method to the image, characterized in that the super-resolution conversion of the image, photoacoustic microscope image refocusing device.
광음향 현미경에 의해 기 획득된 영상에 대한 초점 흐림 정도를 판별하는 초점 흐림 판별 단계;
상기 판별한 흐림 정도에 따라 상기 영상을 미리 정해진 일정한 흐림 정도로 변환하되, 상기 영상의 초점을 상기 광음향 현미경의 최대 초점 흐림 정도로 변환하는 초점 변환 단계;
상기 일정한 흐림 정도로 변환된 영상을 미리 정해진 해상도로 변환하는 해상도 변환 단계; 및
상기 해상도 변환된 영상을 초해상도(Super-Resolution) 변환하는 초해상도 변환 단계;를 포함하며,
상기 초점 흐림 판별 단계는 입력된 상기 영상에 대해 초점 흐림 정도가 구별된 다수개의 출력을 One Hot Encoding 형태로 생성하는 신경망 구조를 이용하여 수행되고, 상기 신경망 구조는 하기 식에 따라 계산되는 흐려진 영상을 이용하여 학습되는, 광음향 현미경 영상 재초점 방법.
(여기서, 는 지면 진리 영상(Ground Truth Image)이고, _는 표준편차가 인 가우시안 함수이며, 는 합성곱(convolution) 연산을 나타고, 는 초점이 정확한 지면 진리 영상에 가우시안 함수가 합성곱 되어 초점 흐림 정도가 인 흐려진 영상)
A method of refocusing an optoacoustic microscope image performed by an optoacoustic microscope image refocusing device comprising one or more processors, the method comprising:
Defocusing determination step of determining the degree of defocusing of the image previously acquired by the photoacoustic microscope;
a focus conversion step of converting the image to a predetermined degree of blur according to the determined degree of blur, and converting the focus of the image to the degree of maximum blur of the photoacoustic microscope;
a resolution conversion step of converting the image converted to a certain degree of blur to a predetermined resolution; and
Including; a super-resolution conversion step of converting the resolution-converted image to a super-resolution (Super-Resolution)
The defocus determination step is performed using a neural network structure that generates a plurality of outputs with different degrees of defocus for the input image in the form of One Hot Encoding, and the neural network structure is a blurred image calculated according to the following equation An optoacoustic microscope image refocus method that is learned using
(here, is the Ground Truth Image, _ is the standard deviation is a Gaussian function, represents a convolution operation, is a convolutional Gaussian function to a ground truth image with an accurate focus, so that the degree of defocus is (blurred video)
상기 해상도 변환 단계는 상기 영상을 상기 영상의 해상도보다 낮은 해상도로 다운샘플링(Down Sampling)하는 것을 특징으로 하는, 광음향 현미경 영상 재초점 방법.
9. The method of claim 8,
The resolution conversion step is characterized in that the down-sampling of the image to a lower resolution than the resolution of the image, photoacoustic microscope image refocusing method.
상기 초해상도 변환단계는 SRGAN 방법으로 미리 학습된 합성곱 신경망(Convolution Neural Network)에 의해 상기 영상을 초해상도 변환하는 것을 특징으로 하는, 광음향 현미경 영상 재초점 방법.
9. The method of claim 8,
In the super-resolution conversion step, the photoacoustic microscope image refocusing method, characterized in that the super-resolution conversion of the image by a convolutional neural network learned in advance by the SRGAN method.
상기 초해상도 변환 단계는 상기 영상에 단일 영상 초해상도(Single Image Super Resolution)방법을 적용하여 상기 영상을 초해상도 변환하는 것을 특징으로 하는, 광음향 현미경 영상 재초점 방법.9. The method of claim 8,
The super-resolution conversion step is characterized in that the super-resolution conversion of the image by applying a single image super-resolution (Single Image Super Resolution) method to the image, photoacoustic microscope image refocusing method.
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2020
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