KR102140810B1 - Converting ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd using beta-xylosidase from Paenibacillus woosongensis - Google Patents
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Abstract
본 발명은 패니바실러스 우송엔시스 유래 베타-자일로시다제를 이용한 진세노사이드 Rb3의 진세노사이드 Rd로의 전환에 관한 것으로, 구체적으로 패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) 유래 베타-자일로시다제(beta-xylosidase)를 진세노사이드 Rb3와 반응시키는 것을 특징으로 하는 진세노사이드 Rd 제조방법, 및 상기 베타-자일로시다제를 포함하는 진세노사이드 Rb3의 진세노사이드 Rd 전환용 효소 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 방법에 따르면 진세노사이드 Rb3로부터 우수한 생리활성을 갖는 진세노사이드 Rd를 매우 효율적으로 생산할 수 있다. 또한 본 발명의 효소 조성물을 이용하면 진세노사이드 Rb3로부터 진세노사이드 Rd로의 전환을 매우 효율적이며 용이하게 수행할 수 있다.The present invention relates to the conversion of ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd using beta- xylosidase derived from Panicillus usongensis , specifically, beta- xylosidase (beta) derived from Paenibacillus woosongensis -xylosidase) is a method for producing ginsenoside Rd, characterized in that it reacts with ginsenoside Rb3, and an enzyme composition for ginsenoside Rb conversion of ginsenoside Rb3 containing the beta-xyloxidase.
According to the method of the present invention, ginsenoside Rd having excellent physiological activity can be produced very efficiently from ginsenoside Rb3. In addition, when the enzyme composition of the present invention is used, conversion of ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd can be performed very efficiently and easily.
Description
본 발명은 패니바실러스 우송엔시스 유래 베타-자일로시다제를 이용한 진세노사이드 Rb3의 진세노사이드 Rd로의 전환에 관한 것으로, 구체적으로 패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) 유래 베타-자일로시다제(beta-xylosidase)를 진세노사이드 Rb3와 반응시키는 것을 특징으로 하는 진세노사이드 Rd 제조방법, 및 상기 베타-자일로시다제를 포함하는 진세노사이드 Rb3의 진세노사이드 Rd 전환용 효소 조성물에 관한 것이다.The present invention relates to the conversion of ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd using beta- xylosidase derived from Panicillus usongensis , specifically, beta- xylosidase (beta) derived from Paenibacillus woosongensis -xylosidase) is a method for producing ginsenoside Rd, characterized in that it reacts with ginsenoside Rb3, and an enzyme composition for ginsenoside Rb conversion of ginsenoside Rb3 containing the beta-xyloxidase.
사포닌은 식물계에 널리 존재하는 배당체에서 당이 아닌 부분이 여러 고리화합물로 이루어진 물질을 의미한다. 인삼 또는 홍삼에 주요 생리활성 성분으로 포함된 사포닌 성분인, 트리테르펜사포닌(triterpene saponin)은 타 식물에서 발견된 사포닌과는 화학 구조가 상이하므로 이러한 인삼 사포닌을 타 식물계 사포닌과 구별하기 위해서 인삼(ginseng) 배당체(glycoside)란 의미로 진세노사이드(ginsenoside)라고 부른다.Saponin refers to a substance composed of several cyclic compounds in a non-sugar part of a glycoside widely present in the plant world. Triterpene saponin, a saponin component contained in ginseng or red ginseng as a main bioactive component, has a different chemical structure from saponins found in other plants, so to differentiate these ginseng saponins from other plant-based saponins, ginseng ) Glycoside is called ginsenoside.
진세노사이드는 아글리콘(aglycone)의 구조에 따라 프로토파낙사이다이올계(protopanaxadiol-type, PPD 타입) 진세노사이드, 프로토파낙사트라이올계 (protopanaxatriol-type, PPT 타입) 진세노사이드 및 올레아놀린산계(oleanolic acid-type) 진세노사이드의 세 가지로 분류될 수 있다. 이러한 세 그룹은 다시, 화합물 구조 중 고리의 3번 탄소, 6번 탄소 및 20번 탄소 위치에 글리코시딕 결합(glycosicid bond)에 의해 부착되는 당 부위(sugar moieties)의 위치 및 수에 따라 분류된다. 현재, 40여종 이상의 진세노사이드들이 분리되었고, 이들 대부분은 PPD 타입의 진세노사이드이다. PPD 타입의 진세노사이드에는 Rb1, Rb2, Rb3, Rc, Rd, 지페노사이드 XVII(gypenoside XVII), 화합물 O(compound O), 화합물 Mc1(compound Mc1), F2, 화합물 Y(compound Y), 화합물 Mc(compound Mc), Rg3, Rh2, C-K가 포함된다. PPT 타입의 진세노사이드에는 Re, Rg1, Rf, Rg2, Rh1 등이 포함된다.Ginsenosides are protopanaxadiol-type (PPD type) ginsenosides, protopanaxatriol-type (PPT type) ginsenosides and oleanolic acid based on the structure of aglycone (oleanolic acid-type) It can be classified into three types of ginsenosides. These three groups are again classified according to the position and number of sugar moieties attached by glycosicid bonds to the 3, 6, and 20 carbon positions of the ring in the compound structure. . Currently, more than 40 ginsenosides have been isolated, most of which are PPD type ginsenosides. Ginsenosides of PPD type include Rb1, Rb2, Rb3, Rc, Rd, gypenoside XVII, compound O, compound Mc1, compound Mc1, F2, compound Y (compound Y), compound Mc (compound Mc), Rg3, Rh2, CK. Ginsenosides of the PPT type include Re, Rg1, Rf, Rg2, Rh1, and the like.
이러한 진세노사이드 중 진세노사이드 Rd는 항암 효과, 항산화 효과, 동맥경화증 치유, 신경보호효과 등 여러 가지 약제학적 효능을 가지고 있는 것으로 알려졌다. 이와 관련하여, 진세노사이드 Rd는 신경 줄기 세포의 별아교세포로의 분화를 촉진시키고(Shi et al., 2005), 저산소증/재산소화에 의한 타이로신 키나아제 단백질의 활성화를 억제하고(Dou et al., 2001), 노화-촉진 마우스에서 노화-연관성 산화 손상을 감소시키며(Yokozawa et al., 2004), 마우스에서 카인산(kainic acid)-유도 폐사를 감소시키고(Lee et al., 2003), 혈관 평활근 세포에서의 수용체- 및 저장-작동적 Ca2+ 채널을 통한 칼슘 진입을 차단하는(Guan et al., 2006) 등의 우수한 생리활성이 보고된 바 있다.Among these ginsenosides, ginsenoside Rd is known to have various pharmaceutical effects such as anti-cancer effect, antioxidant effect, arteriosclerosis treatment, and neuroprotective effect. In this regard, ginsenoside Rd promotes differentiation of neural stem cells into astrocytes (Shi et al., 2005), inhibits the activation of tyrosine kinase protein by hypoxia/reoxygenation (Dou et al., 2001), reducing aging-associated oxidative damage in aging-promoting mice (Yokozawa et al., 2004), reducing kainic acid-induced mortality in mice (Lee et al., 2003), and vascular smooth muscle Good physiological activity has been reported, such as blocking calcium entry through receptor- and storage-operating Ca 2+ channels in cells (Guan et al., 2006).
기존에 이러한 PPD 타입의 메이저 진세노사이드로부터 진세노사이드 Rd를 생산할 수 있는 몇 가지 방법이 알려져 있으나, 기존의 방법 이외에 새로운 방법을 개발하여 생산방법을 다양화할 필요가 있으며, 또한 보다 효율적으로 진세노사이드 Rd를 생산할 수 있는 방법이 필요하다.Several methods for producing ginsenoside Rd from the major ginsenosides of this PPD type are known, but it is necessary to develop new methods and diversify the production method in addition to the existing methods, and also more efficient ginsenosides We need a way to produce side Rd.
이에 본 발명자들은 진세노사이드 Rd를 생산할 수 있는 새롭고 효율적인 방법을 연구하였으며, 이의 결과 패니바실러스 우송엔시스 유래 베타-자일로시다제가 진세노사이드 Rb3를 진세노사이드 Rd로 매우 효율적으로 전환할 수 있음을 확인하고 본 발명을 완성하게 되었다.Accordingly, the present inventors studied a new and efficient method for producing ginsenoside Rd, and as a result, the beta-xylosidase derived from Panicillus usongensis can convert ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd very efficiently. Upon confirmation, the present invention has been completed.
따라서 본 발명의 주된 목적은 진세노사이드 Rd를 효율적으로 생산할 수 있는 새로운 방법을 제공하는데 있다.Therefore, the main object of the present invention is to provide a new method for efficiently producing ginsenoside Rd.
본 발명의 다른 목적은 상기 방법을 보다 용이하게 적용할 수 있도록 하는 수단을 제공하는데 있다.Another object of the present invention is to provide a means that makes it easier to apply the method.
본 발명의 한 양태에 따르면, 본 발명은 패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) 유래 베타-자일로시다제(beta-xylosidase)를 진세노사이드 Rb3와 반응시키는 것을 특징으로 하는 진세노사이드 Rd 제조방법을 제공한다.According to an aspect of the present invention, the present invention is a method for producing ginsenoside Rd, characterized in that beta-xylosidase derived from Paenibacillus woosongensis is reacted with ginsenoside Rb3. to provide.
본 발명의 진세노사이드 Rd 제조방법에 있어서, 상기 베타-자일로시다제는 서열번호 1의 아미노산 서열로 이루어지거나, 상기 서열의 N-말단 또는 C-말단에 태그(tag)를 포함하여 이루어지는 것이 바람직하다.In the method for producing ginsenoside Rd of the present invention, the beta-xyloxidase is composed of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, or that the tag comprises a tag at the N-terminal or C-terminal of the sequence desirable.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) 유래 베타-자일로시다제(beta-xylosidase)를 포함하는 진세노사이드 Rb3의 진세노사이드 Rd 전환용 효소 조성물을 제공한다.According to another aspect of the present invention, the present invention provides an enzyme composition for converting ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd, including beta-xylosidase derived from Paenibacillus woosongensis do.
본 발명의 효소 조성물에 있어서, 상기 베타-자일로시다제는 서열번호 1의 아미노산 서열로 이루어지거나, 상기 서열의 N-말단 또는 C-말단에 태그(tag)를 포함하여 이루어지는 것이 바람직하다.In the enzyme composition of the present invention, the beta-xyloxidase is preferably made of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, or preferably comprises a tag at the N-terminal or C-terminal of the sequence.
본 발명의 방법에 따르면 진세노사이드 Rb3로부터 우수한 생리활성을 갖는 진세노사이드 Rd를 매우 효율적으로 생산할 수 있다. 또한 본 발명의 효소 조성물을 이용하면 진세노사이드 Rb3로부터 진세노사이드 Rd로의 전환을 매우 효율적이며 용이하게 수행할 수 있다.According to the method of the present invention, ginsenoside Rd having excellent physiological activity can be produced very efficiently from ginsenoside Rb3. In addition, when the enzyme composition of the present invention is used, conversion of ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd can be performed very efficiently and easily.
도 1은 진세노사이드 Rb3에 패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) 유래 베타-자일로시다제(beta-xylosidase)를 반응(24시간)시킨 후 반응산물을 TLC(Thin Layer Chromatography)로 분석한 결과이다. Std. : 각 진세노사이드의 표준물질, 1 : 진세노사이드 Rb3(기질), 2 : 반응산물.
도 2는 진세노사이드 Rb3에 패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) 유래 베타-자일로시다제(beta-xylosidase)를 반응(24시간)시킨 후 반응산물을 HPLC(High Performance Liquid Chromatography)로 분석한 결과이다. A : 진세노사이드 Rb3(기질), B : 반응산물.
도 3은 진세노사이드 Rb3와 Rb2가 혼합된 기질에 패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) 유래 베타-자일로시다제(beta-xylosidase)를 반응(24시간)시킨 후 반응산물을 HPLC(High Performance Liquid Chromatography)로 분석한 결과이다. A : 진세노사이드 Rb3 및 Rb2 혼합기질, B : 반응산물.1 is a result of analyzing the reaction product by TLC (Thin Layer Chromatography) after reacting (24 hours) beta-xylosidase derived from Paenibacillus woosongensis to ginsenoside Rb3. . Std. : Standard substance of each ginsenoside, 1: ginsenoside Rb3 (substrate), 2: reaction product.
FIG. 2 shows a result of analyzing a reaction product (24 hours) by beta-xylosidase from Paenibacillus woosongensis to ginsenoside Rb3, and analyzing the reaction product by HPLC (High Performance Liquid Chromatography). to be. A: ginsenoside Rb3 (substrate), B: reaction product.
3 is reacted (24 hours) with beta-xylosidase from Paenibacillus woosongensis on a substrate mixed with ginsenoside Rb3 and Rb2 (24 hours), and then the reaction product is HPLC (High Performance Liquid) Chromatography). A: Ginsenoside Rb3 and Rb2 mixed substrate, B: reaction product.
본 발명의 진세노사이드 Rd 제조방법은 패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) 유래 베타-자일로시다제(beta-xylosidase)를 진세노사이드 Rb3와 반응시키는 것을 특징으로 한다.The method for producing ginsenoside Rd of the present invention is characterized by reacting beta-xylosidase derived from Paenibacillus woosongensis with ginsenoside Rb3.
본 발명에서 베타-자일로시다제는 패니바실러스 우송엔시스의 배양물로부터 정제 등의 과정을 통해 수득하거나, 상기 패니바실러스 우송엔시스의 유전체로부터 베타-자일로시다제 유전자를 클로닝하고 이를 이종발현시키는 방법으로 수득할 수 있다. 이종발현방법으로는 예를 들어, 대장균 발현 시스템을 이용할 수 있다.In the present invention, beta-xylosidase is obtained through a process such as purification from a culture of Panicillus usongensis, or a method for cloning and expressing a heterologous beta-xyloxidase gene from the genome of Panicillus usongensis Can be obtained. As a heterologous expression method, for example, an E. coli expression system can be used.
상기 패니바실러스 우송엔시스는 KCTC 등의 생물자원센터로부터 분양받을 수 있다.The panicillus Woosong Ensis can be distributed from biological resource centers such as KCTC.
본 발명에서 상기 베타-자일로시다제는 바람직하게는 패니바실러스 우송엔시스 KCTC 3953T 균주로부터 유래된 것으로 서열번호 1의 아미노산 서열로 이루어진 것이거나, 혹은 이 서열의 N-말단 또는 C-말단에 태그(tag)를 포함하여 이루어지는 것이 좋다. 이때 태그는 예를 들어 단백질의 정제 등의 용이성을 위한 GST(Glutathione S-transferase) 서열 또는 다수개의 히스티딘(Histidine)이 연결된 형태의 서열 등을 이용할 수 있다.In the present invention, the beta-xyloxidase is preferably derived from the Ph. Bacillus usongensis KCTC 3953 T strain, consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, or tagging the N-terminal or C-terminal of this sequence It is good to include (tag). In this case, for example, a GST (Glutathione S-transferase) sequence for ease of purification of a protein, or the like, or a sequence in which a plurality of histidines are linked may be used.
패니바실러스 우송엔시스 KCTC 3953T 균주의 유전체에서 베타-자일로시다제를 암호화하는 서열은 서열번호 2와 같다.The sequence encoding beta-xylosidase in the genome of the Ph. aureus Usongensis KCTC 3953 T strain is shown in SEQ ID NO: 2.
본 발명에서는 상기와 같은 베타-자일로시다제를 진세노사이드 Rb3와 반응시켜 진세노사이드 Rd를 제조하는데, 상기 진세노사이드 Rb3는 정제된 상태로 이용하거나 진세노사이드 Rb3가 함유된 조사포닌(crude saponin)의 형태로 이용할 수 있다.In the present invention, ginsenoside Rd is prepared by reacting the above beta-xylosidase with ginsenoside Rb3, wherein ginsenoside Rb3 is used in a purified state or irradiated with ginsenoside Rb3 ( crude saponin).
상기 베타-자일로시다제와 진세노사이드 Rb3를 접촉시키는 방법으로 상기 반응을 유도할 수 있는데, 이때 반응 pH는 6 ~ 8인 것이 바람직하며, 반응 온도는 30 ~ 40℃인 것이 바람직하고, 보다 바람직하게는 pH 6.5 ~ 7.5 및 30 ~ 37℃인 것이 좋다. 예를 들어, 상기 베타-자일로시다제와 진세노사이드 Rb3(또는 진세노사이드 Rb3가 함유된 조사포닌)를 상기 pH 조건을 유지할 수 있는 완충액이 함유된 용액에 첨가하고 상기 온도를 유지할 수 있는 항온기에 투입하여 유지하는 방법으로 상기와 같은 반응을 유도할 수 있다.The reaction can be induced by contacting the beta-xyloxidase with ginsenoside Rb3, wherein the reaction pH is preferably 6 to 8, and the reaction temperature is preferably 30 to 40°C, more Preferably, the pH is preferably 6.5 to 7.5 and 30 to 37°C. For example, the beta-xylosidase and ginsenoside Rb3 (or ginsenoside Rb3-containing sapononin) can be added to a solution containing a buffer capable of maintaining the pH condition and capable of maintaining the temperature. It is possible to induce the above-described reaction by injecting and maintaining the thermostat.
상기 조사포닌은 고려인삼, 화기삼, 죽절삼을 포함한 여타인삼의 잎 및 뿌리로부터 주정을 사용하여 추출하는 방법으로 얻을 수 있고, 보다 바람직하게는 다공성 수지를 이용하여 당 및 protopanaxatriol 계열의 진세노사이드 등을 제거하여 사용하는 것이 좋다.The irradiation saponin can be obtained by using a method of extraction from the leaves and roots of other ginseng, including Korean ginseng, ginseng ginseng, bamboo ginseng, and more preferably, sugar and protopanaxatriol-based ginsenosides using a porous resin. It is good to use by removing.
본 발명의 효소 조성물은 진세노사이드 Rb3를 진세노사이드 Rd로 전환시키는 것을 보다 용이하게 적용할 수 있도록 하는 것으로, 상기 베타-자일로시다제를 함유하는 것을 특징으로 한다.The enzyme composition of the present invention is to make it easier to apply conversion of ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd, and is characterized by containing the beta-xyloxidase.
본 발명의 효소 조성물은 진세노사이드 Rb3 또는 이 Rb3가 함유된 조사포닌에 첨가하는 방법으로 사용할 수 있다. 첨가 후 진세노사이드 Rb3를 진세노사이드 Rd로 전환시키기 위한 반응을 유도하는 방법은 위에서 설명한 바와 같은 기준을 적용할 수 있다.The enzyme composition of the present invention can be used as a method of adding to ginsenoside Rb3 or irradiated saponin containing Rb3. The method for inducing a reaction for converting ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd after addition may apply the criteria as described above.
본 발명의 효소 조성물에는 상기 베타-자일로시다제 이외에도 효소활성을 안정적으로 유지할 수 있도록 하기 위한 완충제, 또는 부형제 등의 첨가제를 포함할 수 있으며, 동일 또는 유사한 효소활성을 갖는 다른 효소도 추가로 포함될 수 있을 것이다.The enzyme composition of the present invention may include additives such as buffers or excipients to stably maintain enzymatic activity in addition to the beta-xyloxidase, and further include other enzymes having the same or similar enzymatic activity Will be able to.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하기로 한다. 이들 실시예는 단지 본 발명을 예시하기 위한 것이므로, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지는 않는다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail through examples. Since these examples are only for illustrating the present invention, the scope of the present invention is not to be construed as being limited by these examples.
[실시예][Example]
1. 베타-자일로시다제의 제조1. Preparation of beta-xyloxidase
1-1. 재조합 발현벡터 및 형질전환 미생물 제작1-1. Production of recombinant expression vectors and transforming microorganisms
패니바실러스 우송엔시스(Paenibacillus woosongensis) KCTC 3953T 균주로부터 베타-자일로시다제를 스크리닝하였으며, 이를 XylPw로 명명하였다.Beta-Xylosidase was screened from the Paenibacillus woosongensis KCTC 3953 T strain, which was named XylPw.
구체적으로, KCTC 3953T 균주로부터 게놈 DNA를 추출하고, 상기 게놈 DNA를 주형으로 사용하여 정방향 프라이머(서열번호 3)와 역방향 프라이머(서열번호 4)를 이용하여 중합효소 연쇄반응(PCR)을 실시하였다(표 1 참조).Specifically, genomic DNA was extracted from the KCTC 3953T strain, and polymerase chain reaction (PCR) was performed using the forward primer (SEQ ID NO: 3) and the reverse primer (SEQ ID NO: 4) using the genomic DNA as a template ( See Table 1).
상기 PCR 반응으로 증폭된 단편을 글루타티온 S-트랜스퍼라제 유전자가 삽입되어 있는 플라스미드 벡터 pGEX4T-1(GE Healthcare, USA)에 EzCloning Kit(Enzynomics)를 이용하여 삽입하여, 재조합 발현벡터 GST-XylPw를 제작하였다. 상기 재조합 발현벡터를 통상적인 형질전환 방법에 의하여 대장균 BL21(DE3) 균주에 형질전환(transformation)시켜 형질전환 균주를 제작하였다.The fragment amplified by the PCR reaction was inserted into the plasmid vector pGEX4T-1 (GE Healthcare, USA) into which the glutathione S-transferase gene was inserted, using an EzCloning Kit (Enzynomics), thereby producing a recombinant expression vector GST-XylPw. . The recombinant expression vector was transformed into E. coli BL21 (DE3) strain by a conventional transformation method to prepare a transformed strain.
1-2. 베타-자일로시다제의 발현1-2. Beta-Xylosidase Expression
베타-자일로시다제를 대량 생산하기 위하여, 상기 실시예 1-1의 형질전환 균주를 앰피실린(ampicillin)이 첨가된 LB 배지 100㎖가 들어있는 삼각플라스크에 접종하여 600nm에서의 흡광도가 0.6이 될 때까지 37℃의 진탕배양기에서 200rpm으로 종균배양을 실시하였다. 가용성 단백질의 발현여부를 여러 온도(18, 22, 25, 30, 37℃)에 따라 확인하기 위하여 여기에 IPTG(isopropyl-beta-D-thiogalactoside)를 최종 0.1mM 농도가 되도록 첨가하여 베타-자일로시다제의 대량 발현을 유도하였다. 균주가 정체기(stationary phase)에 들었을 때, 균주의 배양액을 6,000xg로 4℃에서 10분 동안 원심분리하여 균체를 수득하고, 100mM 인산나트륨 버퍼(Sodium phosphate buffer, pH 7.0)를 첨가하여 현탁한 후, 세포를 파쇄기(sonicator)로 파쇄하였다. 세포 파쇄물을 다시 13,000xg로 4℃에서 15분 동안 원심분리한 다음 상등액을 수득하고, 상등액 중의 베타-자일로시다제를 SDS-PAGE로 확인하였다.To mass-produce beta-xyloxidase, the transformed strain of Example 1-1 was inoculated into an Erlenmeyer flask containing 100 ml of LB medium to which ampicillin was added, and the absorbance at 600 nm was 0.6. Seed culture was carried out at 200 rpm in a shaking incubator at 37° C. until. To confirm the expression of the soluble protein according to various temperatures (18, 22, 25, 30, 37°C), IPTG (isopropyl-beta-D-thiogalactoside) was added to the final 0.1 mM concentration to beta-xyl. Mass expression of sidase was induced. When the strain is in a stationary phase, the culture medium of the strain is centrifuged at 6,000xg at 4°C for 10 minutes to obtain a cell, and suspended by adding 100 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0). , Cells were crushed with a sonicator. The cell lysate was centrifuged again at 13,000xg for 15 minutes at 4°C to obtain a supernatant, and beta-xyloxidase in the supernatant was confirmed by SDS-PAGE.
2. 베타-자일로시다제의 진세노사이드 전환 능력 평가 및 분석2. Evaluation and analysis of ginsenoside conversion ability of beta-xyloxidase
진세노사이드 Rb1, Rb2, Rb3 또는 Rc를 0.1 ~ 2%(w/v)로 인산 버퍼 0.1M(pH 7.0)에 용해한 후, 베타-자일로시다제가 함유된 상기 실시예 1-2의 상등액을 전체부피의 1/20 ~ 1/4로 첨가하고, pH 7.0, 30 ~ 37℃의 조건에서 반응시켰다. 전체 반응기간 동안의 샘플을 적절한 간격으로 수거하여, 수용액-포화된 n-부탄올 동량 부피를 첨가함으로써 반응을 종결시켰다. n-부탄올 분획을 건조하여 증발시키고, 잔류물을 CH3OH에 용해시켜 TLC 및 HPLC로 분석하였다. 이의 결과 진세노사이드들(Rb1, Rb2, Rc, Rd) 중 진세노사이드 Rb3가 Rd로 전환되었다(도 1 및 도 2 참조).After dissolving ginsenoside Rb1, Rb2, Rb3 or Rc in 0.1M to 2% (w/v) in phosphate buffer 0.1M (pH 7.0), the supernatant of Example 1-2 containing beta-xyloxidase was added. It was added at 1/20 to 1/4 of the total volume, and reacted under conditions of pH 7.0 and 30 to 37°C. Samples were collected at appropriate intervals for the entire reaction period, and the reaction was terminated by adding an equivalent volume of aqueous solution-saturated n-butanol. The n-butanol fraction was dried to evaporate, and the residue was dissolved in CH 3 OH and analyzed by TLC and HPLC. As a result, ginsenosides Rb3 of ginsenosides (Rb1, Rb2, Rc, Rd) were converted to Rd (see FIGS. 1 and 2).
3. 베타-자일로시다제를 이용한 진세노사이드 Rd 대량 생산3. Mass production of ginsenoside Rd using beta-xyloxidase
3-1. 베타-자일로시다제를 포함하는 효소액 획득3-1. Acquisition of enzyme solution containing beta-xyloxidase
100g 단위의 미량 진세노사이드들을 생산하기 위한 효소액을 대량으로 얻기 위해서는 10L 단위의 발효기(fermentor)에서 형질전환된 균주를 배양해야하므로, 하기와 같은 과정을 수행하였다.In order to obtain a large amount of enzyme solution for producing 100 g of trace ginsenosides, a strain transformed in a fermentor of 10 L must be cultured, and the following process was performed.
본배양에 앞서, 전날 500ml 플라스크에 앰피실린이 함유된 LB 배지에 상기 실시예 1-1의 형질전환 균주를 접종하여 전배양하고, 다음날 6L의 LB 배지가 담긴 10L 발효기에 전배양액을 첨가하는 방법으로 접종하여 600nm에서의 흡광도가 3이 될 때까지 37℃의 진탕배양기에서 500rpm으로 배양하였다. 베타-자일로시다제의 발현을 유도하기 위해서 발효기의 온도를 30℃로 낮추고, 균체의 추가 성장을 원활히 하기 위하여 글루코스 용액(600g/L) 200 ~ 500ml를 첨가하였고, 여기에 1M 인산나트륨 버퍼 300 ~ 500ml를 첨가하여 안정적인 pH 조건을 꾀하였다. 또한 여기에 최종 IPTG 농도가 0.1mM이 되도록 첨가하여 베타-자일로시다제의 대량 발현을 유도하였다. 20 ~ 36시간 동안 이를 배양하여 균주가 정체기(stationary phase)에 들었을 때 상기 균주의 배양액을 6,000xg로 4℃에서 15분 동안 원심분리하여 균체 200g을 얻을 수 있었다(30g/L 전후). 수득된 균체에 100mM 인산나트륨 버퍼(Sodium phosphate buffer, pH 7.0)를 첨가하여 현탁한 다음, 균체를 파쇄기(sonicator)로 파쇄하였다. 균체파쇄물을 다시 13,000xg로 4℃에서 15분 동안 원심분리하여 수용성으로 발현된 베타-자일로시다제가 함유되어 있는 효소액을 대량으로 획득하였다.Prior to the main culture, a method of adding a pre-culture solution to a 10 L fermenter containing 6 L of LB medium the next day by inoculating the transformed strain of Example 1-1 into LB medium containing ampicillin in a 500 ml flask the day before And incubated at 500 rpm in a 37°C shake incubator until the absorbance at 600 nm was 3. In order to induce the expression of beta-xyloxidase, the temperature of the fermenter was lowered to 30°C, and 200-500 ml of a glucose solution (600 g/L) was added to facilitate further growth of the cells, and 1M sodium phosphate buffer 300 A stable pH condition was sought by adding ~ 500 ml. In addition, the final IPTG concentration was added so that it was 0.1 mM, thereby inducing large-scale expression of beta-xyloxidase. By culturing this for 20 to 36 hours, when the strain was put into a stationary phase, the culture medium of the strain was centrifuged at 6,000xg at 4°C for 15 minutes to obtain 200 g of the cells (before and after 30g/L). The obtained cells were suspended by adding 100 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0), and then the cells were crushed with a sonicator. The cell lysate was centrifuged again at 13,000xg at 4°C for 15 minutes to obtain a large amount of an enzyme solution containing water-soluble beta-xyloxidase.
3-2. 진세노사이드 Rd의 대량 생산3-2. Mass production of ginsenoside Rd
상기 실시예 3-1에서 대량으로 얻어진 효소액 2L에 최대 농도 1%(w/v)인 PPD type 진세노사이드 Rb2와 Rb3 혼합물 6L를 37℃의 온도에서 150rpm으로 교반시키면서 48시간 반응시켰다. 반응을 중단시키고 전환된 진세노사이드 Rd를 회수하기 위하여 주정을 70%(v/v)가 되도록 첨가하여 재조합 효소는 불활성시켜 다운시키고, 진세노사이드 Rd는 용해시켰다. 용해된 진세노사이드는 다시 알콜 농도를 낮추어 HP20 다공성 수지로 흡착한 후 물로 세척하고 80%(v/v) 에탄올을 이용하여 탈착시킨 후 감압식 회전 증발기로 용매를 제거하여 순도 높은 진세노사이드 Rd를 획득할 수 있었다. 최종적으로 진세노사이드 Rb2와 Rb3 혼합물 60g을 반응시켜서 42g의 진세노사이드 Rd가 함유된 반응물을 얻을 수 있었다. HPLC 분석결과 진세노사이드 Rd의 순도는 크로마토그램의 면적비 비율상 52.3%였다(도 3 참조).6 L of a mixture of PPD type ginsenoside Rb2 and Rb3 having a maximum concentration of 1% (w/v) in 2 L of the enzymatic solution obtained in a large amount in Example 3-1 was reacted for 48 hours while stirring at a temperature of 37°C at 150 rpm. In order to stop the reaction and recover the converted ginsenoside Rd, the alcohol was added in an amount of 70% (v/v) to inactivate the recombinant enzyme, and the ginsenoside Rd was dissolved. The dissolved ginsenoside is again lowered in alcohol concentration, adsorbed with HP20 porous resin, washed with water, desorbed using 80% (v/v) ethanol, and then removed with a vacuum rotary evaporator to obtain high purity ginsenoside Rd. Could be obtained. Finally, 60 g of the ginsenoside Rb2 and Rb3 mixture was reacted to obtain a reactant containing 42 g of ginsenoside Rd. As a result of HPLC analysis, the purity of ginsenoside Rd was 52.3% in the ratio of the area ratio of the chromatogram (see FIG. 3).
3-3. 98% 순도의 진세노사이드 Rd 생산3-3. Ginsenoside Rd production with 98% purity
상기 실시예 3-2에서 얻어진 진세노사이드 Rd의 순도를 높이기 위하여 Habon사의 Prep-HPLC 시스템을 이용하였다. 40%(v/v)의 ACN에 상기 실시예 3-2의 최종반응물 22g을 녹여서 동일조건의 용매(ACN 40%)를 400ml/min 속도로 ODS 태산 DAC 컬럼(100 φ x 500 mm)으로 분취하여 크로마토그램의 면적비 비율상 순도 98%의 진세노사이드 Rd 8.3g을 획득할 수 있었다.Habon's Prep-HPLC system was used to increase the purity of ginsenoside Rd obtained in Example 3-2. Dissolve 22 g of the final reactant of Example 3-2 in 40% (v/v) ACN to collect the solvent (ACN 40%) under the same conditions with an ODS Taesan DAC column (100 φ x 500 mm) at a rate of 400 ml/min. Thus, it was possible to obtain 8.3 g of ginsenoside Rd having a purity of 98% in terms of the area ratio of the chromatogram.
<110> AceEMzyme co., Ltd. <120> Converting ginsenoside Rb3 to ginsenoside Rd using beta-xylosidase from Paenibacillus woosongensis <130> PA-D18323 <160> 4 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 474 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Paenibacillus woosongensis <400> 1 Met Thr Lys Gln Gly Leu Asn Pro Tyr Leu Pro Ser Trp Glu Tyr Val 1 5 10 15 Pro Asp Gly Glu Pro His Val Phe Asn Asp Arg Val Tyr Val Tyr Gly 20 25 30 Ser His Asp Arg Phe Asn Gly His Ala Phe Cys Leu Asn Asp Tyr Val 35 40 45 Cys Trp Ser Ala Pro Val Ala Asp Leu Ala Asp Trp Arg Tyr Glu Gly 50 55 60 Val Ile Tyr Lys Lys Thr Asp Asp Pro Leu Asn Pro Asp Gly Ser Met 65 70 75 80 Cys Leu Tyr Ala Pro Asp Val Thr Val Gly Pro Asp Gly Arg Tyr Tyr 85 90 95 Leu Tyr Tyr Val Leu Asp Lys Val Pro Ile Val Ser Val Ala Val Cys 100 105 110 Asp Ser Pro Ala Gly Glu Tyr Glu Phe Tyr Gly Tyr Val Arg Tyr Ser 115 120 125 Asp Gly Thr Arg Leu Gly Glu Arg Gln Gly Asp Glu Pro Gln Phe Asp 130 135 140 Pro Ala Val Leu Thr Glu Gly Glu Phe Thr Tyr Leu Tyr Thr Gly Phe 145 150 155 160 Cys Ala Ile Gly Asp Lys Ser Arg Lys Gly Ala Met Ala Thr Val Leu 165 170 175 Gly Arg Asp Met Leu Thr Ile Val Glu Glu Pro Val Phe Val Ala Pro 180 185 190 Ser Glu Pro Tyr Ser Lys Gly Ser Gly Phe Glu Gly His Glu Phe Phe 195 200 205 Glu Ala Pro Ser Ile Arg Lys Arg Gly Asp Thr Tyr Tyr Leu Ile Tyr 210 215 220 Ser Ser Val Val Met His Glu Leu Cys Tyr Ala Thr Ser Pro Phe Pro 225 230 235 240 Thr Lys Gly Phe Thr Tyr Gln Gly Val Ile Val Ser Asn Asn Asp Leu 245 250 255 His Ile Asp Ser Tyr Lys Pro Ala Asp Lys Pro Met Tyr Tyr Gly Gly 260 265 270 Asn Asn His Gly Gly Ala Val Glu Ile Gln Gly Gln Trp Tyr Ile Phe 275 280 285 Tyr His Arg His Thr Asn Gly Thr Ala Phe Ser Arg Gln Gly Cys Met 290 295 300 Glu Pro Ile Ser Phe Arg Glu Asp Gly Thr Ile Pro Gln Val Glu Met 305 310 315 320 Thr Ser Cys Gly Pro Asn Gly Gly Pro Leu Ala Gly Arg Gly Glu Tyr 325 330 335 Pro Ala Tyr Leu Ala Cys Asn Leu Phe Cys Lys Asp Glu Glu Leu Tyr 340 345 350 Thr Gly Gly Phe Gly Ala Ser Gly Ala Trp Met Asp Ser Arg Phe Pro 355 360 365 Lys Ile Thr Gln Asp Gly Lys Asp Gly Asp Glu Glu Met Gly Tyr Ile 370 375 380 Ala Asn Met Thr Asp Ser Ala Thr Ala Gly Phe Lys Tyr Phe Asp Cys 385 390 395 400 His Gly Ile Arg Arg Met Thr Ile Gln Val Arg Gly Tyr Cys Arg Gly 405 410 415 Ala Phe Glu Ile Lys Thr Ala Trp Asn Gly Pro Val Leu Gly Thr Ile 420 425 430 Pro Val Glu Phe Ser Asn Val Trp Lys Pro Tyr Ser Thr Glu Leu Val 435 440 445 Ile Pro Asp Gly Ile Gln Ala Leu Tyr Phe Thr Tyr Thr Gly Met Gly 450 455 460 Ser Ala Ser Leu Ala Ser Phe Thr Leu Glu 465 470 <210> 2 <211> 1425 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> Paenibacillus woosongensis <400> 2 atgacaaaac aaggtttgaa tccatatctt ccatcctggg aatacgttcc tgacggggag 60 ccgcatgttt ttaacgacag ggtttatgtt tacggctccc atgatcgctt taacggacat 120 gctttttgtt taaacgacta tgtatgctgg tcagcacccg tagcagattt ggcggactgg 180 cggtatgaag gtgtgattta caaaaaaaca gacgatccgc ttaatccgga cggcagcatg 240 tgtctgtatg caccggatgt caccgtggga cctgatggac ggtactatct gtactatgtc 300 ctagataagg ttcccattgt ttcggttgcc gtctgtgact ctccagctgg tgaatatgag 360 ttctatggct atgtgagata ttcggatgga acacgtctag gagaaagaca gggcgatgag 420 cctcaatttg atcctgccgt gctgacagaa ggggaattca cttatctgta taccggcttt 480 tgtgccatcg gggacaaatc aagaaaaggg gccatggcca cggtgctcgg ccgggatatg 540 ctcaccatcg tggaagaacc ggtgtttgtt gcgccaagcg aaccgtacag caagggcagc 600 ggatttgaag gacatgagtt tttcgaggcg ccatccatca ggaagcgagg cgatacttat 660 tatctgatct attcttcggt tgtcatgcat gagttgtgtt atgcgaccag cccatttccg 720 acaaagggct ttacatatca gggagtcatt gtaagcaata atgatcttca tattgattct 780 tataaaccag ctgacaaacc gatgtattac ggaggcaata accatggcgg tgctgtggaa 840 attcaggggc aatggtacat tttctatcac aggcatacca atggtaccgc atttagccgc 900 caggggtgta tggagcccat ttcattccgg gaggacggaa cgatccctca ggtggagatg 960 acctcctgtg gcccgaacgg agggccgctt gcagggcgcg gcgaatatcc tgcatatttg 1020 gcatgcaacc tgttttgtaa agacgaagag ctgtatacag gaggttttgg cgcttccggg 1080 gcatggatgg acagccggtt tccgaaaata acccaggatg gaaaagacgg cgatgaggag 1140 atgggatata tcgccaatat gacggattcg gctacggcgg 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Gly Phe Thr Tyr Gln Gly Val Ile Val Ser Asn Asn Asp Leu 245 250 255 His Ile Asp Ser Tyr Lys Pro Ala Asp Lys Pro Met Tyr Tyr Gly Gly 260 265 270 Asn Asn His Gly Gly Ala Val Glu Ile Gln Gly Gln Trp Tyr Ile Phe 275 280 285 Tyr His Arg His Thr Asn Gly Thr Ala Phe Ser Arg Gln Gly Cys Met 290 295 300 Glu Pro Ile Ser Phe Arg Glu Asp Gly Thr Ile Pro Gln Val Glu Met 305 310 315 320 Thr Ser Cys Gly Pro Asn Gly Gly Pro Leu Ala Gly Arg Gly Glu Tyr 325 330 335 Pro Ala Tyr Leu Ala Cys Asn Leu Phe Cys Lys Asp Glu Glu Leu Tyr 340 345 350 Thr Gly Gly Phe Gly Ala Ser Gly Ala Trp Met Asp Ser Arg Phe Pro 355 360 365 Lys Ile Thr Gln Asp Gly Lys Asp Gly Asp Glu Glu Met Gly Tyr Ile 370 375 380 Ala Asn Met Thr Asp Ser Ala Thr Ala Gly Phe Lys Tyr Phe Asp Cys 385 390 395 400 His Gly Ile Arg Arg Met Thr Ile Gln Val Arg Gly Tyr Cys Arg Gly 405 410 415 Ala Phe Glu Ile Lys Thr Ala Trp Asn Gly Pro Val Leu Gly Thr Ile 420 425 430 Pro Val Glu Phe Ser Asn Val Trp Lys Pro Tyr Ser Thr Glu Leu Val 435 440 445 Ile Pro Asp 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Claims (4)
A beta-xylosidase derived from Paenibacillus woosongensis consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or including a tag at the N-terminus or C-terminus of the sequence. Enzyme composition for ginsenoside Rd conversion of ginsenoside Rb3 containing.
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Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
AMND | Amendment | ||
X091 | Application refused [patent] | ||
AMND | Amendment | ||
X701 | Decision to grant (after re-examination) | ||
GRNT | Written decision to grant |