KR102129584B1 - Insertion method of target genes in linearized vectors - Google Patents
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Abstract
본 발명은 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법에 관한 것이다. 구체적으로, 본 발명에 따른 방법은, 다양한 아형에 의해 다양한 유전자 서열을 갖는 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자를 서열에 비의존적으로 클로닝할 수 있을 뿐만 아니라, 종래의 클로닝 방법에서 수행되는 제한효소 처리, 용출(elution) 및 결찰(ligation) 등과 같은 과정을 생략할 수 있어, 목적 유전자가 삽입된 벡터를 쉽고 경제적으로 제조하는데 유용하게 사용될 수 있다.The present invention relates to a method for inserting a target gene into a linear vector. Specifically, the method according to the present invention can not only clone the target gene of the influenza virus having various gene sequences by various subtypes in sequence, but also restriction enzyme treatment and elution performed in the conventional cloning method ( Since processes such as elution and ligation can be omitted, it can be usefully used to easily and economically produce a vector into which a target gene has been inserted.
Description
본 발명은 목적 유전자를 벡터에 삽입하는 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 PCR 반응을 이용하여 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method of inserting a target gene into a vector, and more particularly, to a method of inserting a target gene of an influenza virus into a linear vector using a PCR reaction.
유전자 클로닝은, 목적 유전자를 자기 복제능력을 갖는 벡터에 결합하여 대장균 등의 숙주에 도입하여 증식시킴으로써 동일한 유전자 집단을 대량으로 만드는 기술을 의미한다.Gene cloning refers to a technique in which a target gene is coupled to a vector having self-replicating ability and introduced into a host such as E. coli to multiply to make the same gene population in large quantities.
유전자 클로닝은 중합효소연쇄반응(PCR) 등을 이용하여 증폭된 목적 유전자를 DNA 리가아제(ligase)를 사용하여 복제 개시점과 항생제의 선택 표식을 갖는 벡터에 결합하여 대장균 세포 안에 도입한 후, 항생제 내성을 조사함으로써 클로닝된 세포를 선별하는 방법으로 수행된다.Gene cloning combines a target gene amplified with a polymerase chain reaction (PCR) with a vector having a replication initiation point and a vector having a marker for selection of an antibiotic using DNA ligase, and then introduces it into E. coli cells, This is done by selecting cloned cells by examining resistance.
이와 같은 통상의 클로닝 방법은 현대 생명공학의 기초를 이루고 있으며, 인간게놈 프로젝트가 완성된 이후에 비약적인 발전을 달성하고 있다. 그러나 종래의 유전자 조작 방법은, 삽입(insert) DNA 및 벡터의 내부를 절단하지 않고, 동일 인식부위를 갖는 제한효소를 사용하여 절단하는 것과 같은 제한이 있다.This conventional cloning method forms the basis of modern biotechnology, and has achieved rapid development after the human genome project was completed. However, the conventional genetic manipulation method has limitations such as cutting using a restriction enzyme having the same recognition site without cutting the inside of the inserted DNA and the vector.
1990년대 이후, 특정 염기 서열을 인식하여 DNA 단편 간의 재조합을 유도하는 서열 특이적인 유전자 재조합 효소를 이용한 유전자 조작 기술에 대한 관심이 증대되고 있다. 특히, 특정 DNA 서열을 인식하는 유전자 인테그라제(integrase)를 이용하여 유전자를 클로닝하는 게이트웨이 시스템이 개발되어, 대량의 유전자를 빠르고 쉽게 클로닝하는데 사용되고 있다.Since the 1990s, interest in gene manipulation technology using sequence-specific gene recombinases that recognize specific base sequences and induce recombination between DNA fragments has increased. In particular, a gateway system for cloning a gene using a gene integrase that recognizes a specific DNA sequence has been developed, and has been used to clone large amounts of genes quickly and easily.
게이트웨이 시스템은 통상적인 제한효소-연결 반응과 동일하게 세포 외의 유전자 조작에 의해 실시되지만, LR 크로나제(clonase) 및 BP 크로나제를 이용하는 신규한 클로닝 방법이다. 그러나, 게이트웨이 시스템은 통상적인 유전자 조작 방법을 이용하여 목적 유전자를 벡터에 클로닝하고, 클로닝된 벡터에 존재하는 특이적 재조합 서열과 그 서열을 인식하는 크로나제의 상동 재조합 방법으로 상기 목적 유전자를 다른 발현 벡터로 유전자를 이동시키는 방법이라는 점에서 시간과 노력이 많이 소요된다. 이와 관련하여, 대한민국 특허등록 제10-0751587호는 RecE/T 및 Redα/β와 같은 박테리아의 재조합효소(recombinase)에 의해 매개된 상동성 재조합 방법을 이용한 DNA 서브클로닝 방법을 개시하고 있다.The gateway system is carried out by extracellular genetic manipulation in the same manner as a conventional restriction enzyme-linked reaction, but is a novel cloning method using LR lonase and BP chromase. However, the gateway system clones the target gene into a vector using a conventional genetic manipulation method, and expresses the target gene differently by a homologous recombination method of a specific recombination sequence present in the cloned vector and a chromase that recognizes the sequence. It takes a lot of time and effort in that it is a method of transferring a gene into a vector. In this regard, Korean Patent Registration No. 10-0751587 discloses a DNA subcloning method using homologous recombination methods mediated by bacterial recombinases such as RecE/T and Redα/β.
한편, 인플루엔자 A 바이러스는 9개의 구조 단백질로 이루어져 있고, 조절 기능을 갖는 2개의 비구조 단백질을 갖는다. 바이러스 게놈의 분절화된 특성을 이용하여, 하나의 세포에 여러 바이러스가 혼성 감염되면 유전자 재집합(genetic reassortment)이 이루어질 수 있다. 인플루엔자 A 바이러스는 이의 표면에 제시되는 상이한 헤마글루티닌(hemagglutinin, HA)과 뉴라미니다제(neuraminidase, NA)에 의해 다양한 종류의 아형으로 분류되며, 각각의 아형은 다른 병리적 특성을 갖는다. 또한, 인플루엔자 바이러스는 다중 돌연변이 및 진화로 인해, 매 유행기마다 상이한 아형을 발달시킨다. 하나의 돌연변이에 의해서도 인플루엔자 바이러스가 특히 공격적으로 변할 수 있기 때문에, 이와 같은 다양한 아형의 인플루엔자 바이러스에 대한 지속적인 연구가 요구된다.On the other hand, influenza A virus is composed of nine structural proteins, and has two non-structural proteins having regulatory functions. By using the fragmented nature of the viral genome, multiple re-infection of multiple viruses in a cell can result in genetic reassortment. Influenza A virus is classified into various types of subtypes by different hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) presented on its surface, and each subtype has different pathological properties. In addition, influenza viruses develop different subtypes at each epidemic due to multiple mutations and evolution. Since influenza virus can be changed particularly aggressively by a single mutation, continuous research on various types of influenza virus is required.
본 발명의 목적은 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법을 제공하는 것이다.It is an object of the present invention to provide a method for inserting a target gene into a linear vector.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자, 하기 일반식 1로 표시되는 염기서열로 구성되는 정방향 프라이머 및 일반식 2로 표시되는 염기서열로 구성되는 역방향 프라이머를 포함하는 PCR 반응액을 변성(denaturation), 어닐링(annealing) 및 연신(elongation)시키는 단계; 상기 변성, 어닐링 및 연신된 PCR 반응액에 선형 벡터를 첨가하는 단계; 및 상기 선형 벡터가 첨가된 PCR 반응액을 변성, 어닐링 및 연신시키는 단계를 포함하는 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법을 제공한다:In order to achieve the above object, the present invention is a PCR reaction solution comprising a target gene of the influenza virus, a forward primer composed of the base sequence represented by the following
[일반식 1][Formula 1]
5'- X1 - Y1 -3'5'- X1-Y1 -3'
[일반식 2][Formula 2]
5'- X2 - Y2 -3'5'- X2-Y2 -3'
상기 일반식 1 및 2에서, X1 및 X2는 선형 벡터의 5' 말단 각각으로부터 15 내지 30개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이고,In the
Y1 및 Y2는 인플루엔자 바이러스 목적 유전자의 3' 말단으로부터 1 내지 15개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이다.Y1 and Y2 are polynucleotides composed of base sequences complementary to 1 to 15 base sequences from the 3'end of the influenza virus target gene.
본 발명에 따른 방법은, 다양한 아형에 의해 다양한 유전자 서열을 갖는 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자를 서열에 비의존적으로 클로닝할 수 있을 뿐만 아니라, 종래의 클로닝 방법에서 수행되는 제한효소 처리, 용출(elution) 및 결찰(ligation) 등과 같은 과정을 생략할 수 있어, 목적 유전자가 삽입된 벡터를 쉽고 경제적으로 제조하는데 유용하게 사용될 수 있다.The method according to the present invention can not only clone the target gene of the influenza virus having various gene sequences by various subtypes independently of the sequence, but also restriction enzyme treatment, elution, and restriction enzyme performed in the conventional cloning method. Since a process such as ligation can be omitted, it can be usefully used to easily and economically produce a vector into which a target gene has been inserted.
도 1은 본 발명의 일 실시예에서 인플루엔자 A 바이러스의 유전자를 삽입할 pHW2000 벡터의 구조 및 ORF(open reading frame) 부분을 나타내는 모식도이다(pIICMV: pol II 프로모터, pIh: pol I 프로모터, tI: pol I 터미네이터, aIIBGH: 인간 사이토메갈로바이러스 및 폴리아데닐 신호, Ctr: 8개 단편(segment)의 보존된 말단 영역).
도 2는 본 발명의 일 실시예에서 PCR 반응을 이용하여 pHW2000 벡터를 선형 벡터로 제작하는 과정을 나타내는 모식도이다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에서 제작된 선형 벡터의 구조를 나타내는 그림(A) 및 제작된 선형 벡터를 아가로즈 겔 전기영동으로 확인한 결과를 나타내는 사진이다(B).
도 4는 본 발명의 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법을 나타내는 모식도이다.
도 5는 본 발명에 따른 방법으로 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자가 삽입된 플라스미드(A) 및 상기 플라스미드를 NCOI 제한효소로 절단한 산물(B)을 아가로즈 겔 전기영동으로 확인한 결과를 나타내는 사진이다.
도 6은 본 발명에 따른 PCR 반응을 이용하여 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법을 전체적으로 보여주는 모식도이다.Figure 1 is a schematic diagram showing the structure of the pHW2000 vector and the ORF (open reading frame) portion to insert the gene of the influenza A virus in one embodiment of the present invention (p II CMV: pol II promoter, p Ih : pol I promoter, t I : pol I terminator, a II BGH: human cytomegalovirus and polyadenyl signals, Ctr: conserved terminal region of 8 segments).
2 is a schematic diagram showing the process of producing a pHW2000 vector as a linear vector using a PCR reaction in one embodiment of the present invention.
3 is a picture showing the structure of the linear vector produced in one embodiment of the present invention (A) and a photograph showing the result of confirming the produced linear vector by agarose gel electrophoresis (B).
4 is a schematic diagram showing a method of inserting a target gene of the present invention into a linear vector.
Figure 5 is a photograph showing the results of confirming by agarose gel electrophoresis of the plasmid (A) in which the target gene of the influenza virus is inserted by the method according to the present invention and the product (B) obtained by cutting the plasmid with NCOI restriction enzyme.
6 is a schematic diagram showing the method of inserting a target gene of an influenza virus into a linear vector using the PCR reaction according to the present invention.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.
본 발명은 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자, 하기 일반식 1로 표시되는 염기서열로 구성되는 정방향 프라이머 및 일반식 2로 표시되는 염기서열로 구성되는 역방향 프라이머를 포함하는 PCR 반응액을 변성(denaturation), 어닐링(annealing) 및 연신(elongation)시키는 단계; 상기 변성, 어닐링 및 연신된 PCR 반응액에 선형 벡터를 첨가하는 단계; 및 상기 선형 벡터가 첨가된 PCR 반응액을 변성, 어닐링 및 연신시키는 단계를 포함하는 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법을 제공한다:The present invention denaturation, annealing a PCR reaction solution comprising a target gene of the influenza virus, a forward primer composed of the base sequence represented by the following
[일반식 1][Formula 1]
5'- X1 - Y1 -3'5'- X1-Y1 -3'
[일반식 2][Formula 2]
5'- X2 - Y2 -3'5'- X2-Y2 -3'
상기 일반식 1 및 2에서, X1 및 X2는 선형 벡터의 5' 말단 각각으로부터 15 내지 30개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이고,In the
Y1 및 Y2는 인플루엔자 바이러스 목적 유전자의 3' 말단으로부터 1 내지 15개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이다.Y1 and Y2 are polynucleotides composed of base sequences complementary to 1 to 15 base sequences from the 3'end of the influenza virus target gene.
본 발명의 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법은, 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자, 하기 일반식 1로 표시되는 염기서열로 구성되는 정방향 프라이머 및 일반식 2로 표시되는 염기서열로 구성되는 역방향 프라이머를 포함하는 PCR 반응액을 변성(denaturation), 어닐링(annealing) 및 연신(elongation)시키는 단계를 제공한다:The method of inserting the target gene of the present invention into a linear vector includes a target gene of the influenza virus, a forward primer composed of the base sequence represented by the following
[일반식 1][Formula 1]
5'- X1 - Y1 -3'5'- X1-Y1 -3'
[일반식 2][Formula 2]
5'- X2 - Y2 -3'5'- X2-Y2 -3'
상기 일반식 1 및 2에서, X1 및 X2는 선형 벡터의 5' 말단 각각으로부터 15 내지 30개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이고,In the
Y1 및 Y2는 인플루엔자 바이러스 목적 유전자의 3' 말단으로부터 1 내지 15개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이다.Y1 and Y2 are polynucleotides composed of base sequences complementary to 1 to 15 base sequences from the 3'end of the influenza virus target gene.
상기 인플루엔자 바이러스는 조류 또는 포유동물을 숙주로하는 인플루엔자 바이러스일 수 있다. 예를 들어, 상기 조류 또는 포유동물은 인간, 닭, 오리, 돼지, 개, 물개, 흰담비, 박쥐 등을 포함할 수 있다. 또한, 상기 인플루엔자 바이러스는 A형 인플루엔자 바이러스일 수 있다.The influenza virus may be an avian or mammalian host influenza virus. For example, the birds or mammals may include humans, chickens, ducks, pigs, dogs, seals, ferrets, bats, and the like. In addition, the influenza virus may be a type A influenza virus.
본 발명에 따른 방법에서 상기 목적 유전자는 인플루엔자 바이러스의 PB2(polymerase basic protein 2), PB1(polymerase basic protein 1), PA(polymerase acidic protein), HA(hemagglutinin), NP(nucleoprotein), NA(neuraminidase), M(matrix protein) 및 NS(nonstructural protein) 유전자로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상일 수 있다. 구체적으로, 상기 목적 유전자는 인플루엔자 바이러스의 PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M 및 NS 유전자일 수 있다.In the method according to the present invention, the target gene is PB2 (polymerase basic protein 2), PB1 (polymerase basic protein 1), PA (polymerase acidic protein), HA (hemagglutinin), NP (nucleoprotein), NA (neuraminidase) of influenza virus , M (matrix protein) and NS (nonstructural protein) may be any one or more selected from the group consisting of genes. Specifically, the target gene may be PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M and NS genes of the influenza virus.
상기 일반식 1로 표시되는 염기서열로 구성되는 정방향 프라이머는 목적 유전자를 구성하는 이중가닥(double strand)에서 안티센스 가닥의 3' 말단에 결합할 수 있고, 상기 일반식 2로 표시되는 염기서열로 구성되는 역방향 프라이머는 목적 유전자를 구성하는 이중 나선에서 센스 가닥의 3' 말단에 결합할 수 있다. 상기 용어, "안티센스 가닥(anti-sense strand)"은 이중가닥의 DNA 중, mRNA를 전사하는데 주형이 되는 가닥으로서, mRNA와 상보적인 염기서열을 갖는 가닥을 의미한다. 또한, 상기 용어, "센스 가닥(sense strand)"은 이중가닥의 DNA 중, 티민(T) 대신 우라실(U)이 존재하는 것을 제외하고, mRNA와 동일한 염기서열을 갖는 가닥을 의미한다.The forward primer composed of the nucleotide sequence represented by the
상기 일반식 1 및 2에서 X1 및 X2는 선형 벡터의 5' 말단 각각으로부터 15 내지 30개, 17 내지 30개, 18 내지 30개, 15 내지 28개, 17 내지 28개, 18 내지 28개, 15 내지 26개, 17 내지 26개 또는 18 내지 26개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 구체적으로, 상기 일반식 1에서 X1은 선형 벡터 센스 가닥의 5' 말단으로부터 15 내지 30개, 17 내지 30개, 18 내지 30개, 15 내지 28개, 17 내지 28개, 18 내지 28개, 15 내지 26개, 17 내지 26개 또는 18 내지 26개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 한편, 상기 일반식 2에서 X2는 선형 벡터 안티센스 가닥의 5' 말단으로부터 15 내지 30개, 17 내지 30개, 18 내지 30개, 15 내지 28개, 17 내지 28개, 18 내지 28개, 15 내지 26개, 17 내지 26개 또는 18 내지 26개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다.In
또한, 상기 일반식 1 및 2에서 Y1 및 Y2는 인플루엔자 바이러스 목적 유전자의 3' 말단으로부터 1 내지 15개, 1 내지 14개, 1 내지 13개, 2 내지 15개, 2 내지 14개 또는 2 내지 13개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 구체적으로, 상기 일반식 1에서 Y1은 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자 안티센스 가닥의 3' 말단으로부터 1 내지 15개, 1 내지 14개, 1 내지 13개, 2 내지 15개, 2 내지 14개 또는 2 내지 13개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 한편, 상기 일반식 2에서 Y2는 인플루엔자 바이러스의 목적 유전자 센스 가닥의 3' 말단으로부터 1 내지 15개, 1 내지 14개, 1 내지 13개, 2 내지 15개, 2 내지 14개 또는 2 내지 13개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다.In addition, in the
일례로, 상기 일반식 1로 표시되는 염기서열로 구성되는 정방향 프라이머 및 일반식 2로 표시되는 염기서열로 구성되는 역방향 프라이머는 서열번호 17 내지 32 및 서열번호 43 내지 50으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 구체적으로, 인플루엔자 바이러스의 PB2 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 17 및 18로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, PB1 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 19 및 20으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, PA 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 21 및 22로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, HA 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 23 및 24로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, NP 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 25 및 26으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, NA 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 27, 28 및 43 내지 50으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, M 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 29 및 30으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, 및 NS 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 31 및 32로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드일 수 있다.In one example, the forward primer consisting of the base sequence represented by the
본 발명에 따른 방법에서, 상기 PCR 반응액은 통상의 기술분야에 잘 알려진 방법에 따라 제조될 수 있다. 일례로, 상기 PCR 반응액은 DNA 중합효소(DNA polymerase), dNTP 등과 함께 PCR 반응에 필요한 완충액 및 시약을 포함할 수 있고, 이들의 양 또한 통상의 기술자가 필요에 따라 적절히 조절할 수 있다.In the method according to the present invention, the PCR reaction solution may be prepared according to methods well known in the art. For example, the PCR reaction solution may include a DNA polymerase, dNTP, etc., and buffers and reagents required for the PCR reaction, and the amount of these may be appropriately adjusted by a person skilled in the art as necessary.
본 명세서에서 사용된 용어, "변성(denaturation) 단계"는 이중가닥 구조인 DNA를 고온에 노출시켜, 단일가닥으로 해리시키는 과정을 의미한다. 또한, 상기 용어 "어닐링(annealing) 단계"는 단일가닥으로 해리된 센스 및 안티센스 DNA에 정방향 및 역방향 프라이머가 각각 결합하는 과정을 의미한다. 나아가, 상기 용어, "연신(elongation) 단계"는 상기 결합된 정방향 및 역방향 프라이머 각각의 3' 말단으로부터 DNA 중합효소가 작용하여 뉴클레오티드를 연장시키는 과정을 의미한다. 상기 변성, 어닐링 및 연신 단계는 통상의 기술분야에 알려진 온도 및 시간 하에서 수행될 수 있고, 상기 온도 및 시간은 필요에 따라 적절히 변형될 수 있다.As used herein, the term "denaturation (denaturation) step" refers to the process of dissociating into a single strand by exposing the double-stranded DNA to high temperatures. In addition, the term "annealing (annealing) step" means a process in which forward and reverse primers are bound to sense and antisense DNA dissociated into single strands, respectively. Furthermore, the term, "elongation step" refers to a process in which DNA polymerase acts from the 3'end of each of the bound forward and reverse primers to extend nucleotides. The denaturing, annealing and stretching steps may be performed under temperature and time known in the art, and the temperature and time may be appropriately modified as necessary.
본 발명에 따른 방법에서, 변성 단계 이전에 필요에 따라 초기 변성 단계가 추가로 수행될 수 있으며, 초기 변성을 위한 온도 및 시간 또한 통상의 기술분야에 알려진 바와 같이 수행될 수 있다.In the method according to the invention, an initial denaturation step may be additionally carried out as necessary before the denaturation step, and the temperature and time for the initial denaturation can also be performed as known in the art.
상기 단계에서 PCR 반응액을 변성, 어닐링 및 연신시키는 단계는 20 내지 30회, 22 내지 30회, 24 내지 30회, 20 내지 28회, 22 내지 28회, 24 내지 28회, 20 내지 26회, 22 내지 26회 또는 24 내지 26회 반복될 수 있다.The step of denaturing, annealing and stretching the PCR reaction solution in the above step is 20 to 30 times, 22 to 30 times, 24 to 30 times, 20 to 28 times, 22 to 28 times, 24 to 28 times, 20 to 26 times, It can be repeated 22 to 26 times or 24 to 26 times.
또한, 본 발명의 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법은, 상기 변성, 어닐링 및 연신된 PCR 반응액에 선형 벡터를 첨가하는 단계를 제공한다.In addition, the method of inserting the target gene of the present invention into a linear vector provides a step of adding a linear vector to the denatured, annealed and stretched PCR reaction solution.
상기 선형 벡터는, 발현 벡터에서 목적 유전자를 삽입할 위치를 기준으로 양쪽에 상보적으로 결합하는 하기 일반식 3으로 표시되는 염기서열로 구성되는 정방향 프라이머 및 일반식 4로 표시되는 염기서열로 구성되는 역방향 프라이머를 사용하여 PCR 반응으로 수득될 수 있다:The linear vector is composed of a forward primer composed of the base sequence represented by the following
[일반식 3][Formula 3]
5'- A1 - B1 -3'5'- A1-B1 -3'
[일반식 4][Formula 4]
5'- A2 - B2 -3'5'- A2-B2 -3'
상기 일반식 3 및 4에서, A1 및 A2는 목적 유전자의 5' 말단 각각으로부터 1 내지 15개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이고,In the
B1 및 B2는 발현 벡터에서 목적 유전자를 삽입할 위치를 기준으로 양쪽 3' 말단 각각으로부터 35 내지 55개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이다.B1 and B2 are polynucleotides composed of base sequences complementary to 35 to 55 base sequences from each of the 3'ends on the basis of the position to insert the target gene in the expression vector.
상기 일반식 3으로 표시되는 염기서열로 구성되는 정방향 프라이머는 발현 벡터를 구성하는 이중가닥(double strand)에서 안티센스 가닥의 3' 말단에 결합할 수 있고, 상기 일반식 4로 표시되는 염기서열로 구성되는 역방향 프라이머는 발현 벡터를 구성하는 이중 나선에서 센스 가닥의 3' 말단에 결합할 수 있다.The forward primer composed of the nucleotide sequence represented by the
상기 일반식 3 및 4에서 A1 및 A2는 목적 유전자의 5' 말단 각각으로부터 1 내지 15개, 1 내지 14개, 1 내지 13개, 2 내지 15개, 2 내지 14개 또는 2 내지 13개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 구체적으로, 상기 일반식 3에서 A1은 목적 유전자 센스 가닥의 5' 말단으로부터 1 내지 15개, 1 내지 14개, 1 내지 13개, 2 내지 15개, 2 내지 14개 또는 2 내지 13개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 한편, 상기 일반식 3에서 A2는 목적 유전자 안티센스 가닥의 5' 말단으로부터 1 내지 15개, 1 내지 14개, 1 내지 13개, 2 내지 15개, 2 내지 14개 또는 2 내지 13개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다.In the
한편, 상기 일반식 3 및 4에서 B1 및 B2는 발현 벡터의 3' 말단 각각으로부터 35 내지 55개, 38 내지 55개, 40 내지 55개, 35 내지 52개, 38 내지 52개, 40 내지 52개, 35 내지 50개, 38 내지 50개 또는 40 내지 50개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 구체적으로, 상기 일반식 3에서 B1은 발현 벡터의 안티센스 가닥의 3' 말단으로부터 35 내지 55개, 38 내지 55개, 40 내지 55개, 35 내지 52개, 38 내지 52개, 40 내지 52개, 35 내지 50개, 38 내지 50개 또는 40 내지 50개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 한편, 상기 일반식 4에서 B2는 발현 벡터의 센스 가닥의 3' 말단으로부터 35 내지 55개, 38 내지 55개, 40 내지 55개, 35 내지 52개, 38 내지 52개, 40 내지 52개, 35 내지 50개, 38 내지 50개 또는 40 내지 50개의 염기서열에 상보적인 염기서열로 구성된 폴리뉴클레오티드일 수 있다.Meanwhile, in the
일례로, 상기 일반식 3으로 표시되는 염기서열로 구성되는 정방향 프라이머 및 일반식 4로 표시되는 염기서열로 구성되는 역방향 프라이머는 서열번호 1 내지 16 및 서열번호 35 내지 42으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 구체적으로, 인플루엔자 바이러스의 PB2 유전자를 위한 벡터의 프라이머는 서열번호 1 및 2로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, PB1 유전자를 위한 벡터의 프라이머는 서열번호 3 및 4로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, PA 유전자를 위한 벡터의 프라이머는 서열번호 5 및 6으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, HA 유전자를 위한 벡터의 프라이머는 서열번호 7 및 8로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, NP 유전자를 위한 벡터의 프라이머는 서열번호 9 및 10으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, NA 유전자를 위한 벡터의 프라이머는 서열번호 11, 12 및 35 내지 42로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, M 유전자를 위한 벡터의 프라이머는 서열번호 13 및 14로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, 및 NS 유전자를 위한 벡터의 프라이머는 서열번호 15 및 16으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드일 수 있다.As an example, the forward primer composed of the base sequence represented by the
상기 선형 벡터를 수득하기 위한 PCR 반응은 통상적인 방법으로 수행될 수 있으며, 필요에 따라 적절히 변형될 수 있다. 수득된 선형 벡터는 통상의 기술자에 의해 적절한 양으로 첨가될 수 있다.The PCR reaction to obtain the linear vector can be carried out by conventional methods, and can be appropriately modified as necessary. The obtained linear vector can be added in an appropriate amount by a person skilled in the art.
아울러, 본 발명의 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법은, 상기 선형 벡터가 첨가된 PCR 반응액을 변성, 어닐링 및 연신시키는 단계를 제공한다.In addition, the method of inserting the target gene of the present invention into a linear vector provides a step of denaturing, annealing and stretching the PCR reaction solution to which the linear vector is added.
상기 단계에서, 변성, 어닐링 및 연신 단계는 상술한 바와 같은 특징을 가질 수 있다. 상기 변성, 어닐링 및 연신 단계는 5 내지 15회, 7 내지 15회, 9 내지 15회, 5 내지 13회, 7 내지 13회, 9 내지 13회, 5 내지 11회, 7 내지 11회 또는 9 내지 11회 반복될 수 있다.In this step, denaturation, annealing and stretching steps can have the features described above. The denaturation, annealing and stretching steps are 5 to 15 times, 7 to 15 times, 9 to 15 times, 5 to 13 times, 7 to 13 times, 9 to 13 times, 5 to 11 times, 7 to 11 times, or 9 to 9 times. It can be repeated 11 times.
또한, 본 발명에 따른 방법은 변성, 어닐링 및 연신 단계가 완료된 후, 추가 연신(final elongation) 단계를 더 포함할 수 있다. 이때, 추가 연신을 위한 온도 및 시간 또한 통상의 기술분야에 알려진 바와 같이 수행될 수 있다.In addition, the method according to the present invention may further include a final elongation step after the denaturation, annealing and stretching steps are completed. At this time, the temperature and time for further stretching can also be performed as is known in the art.
이하, 본 발명을 하기 실시예에 의해 상세히 설명한다, 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 이들에 의해 본 발명이 제한되는 것은 아니다. 본 발명의 청구범위에 기재된 기술적 사상과 실질적으로 동일한 구성을 갖고 동일한 작용 효과를 이루는 것은 어떠한 것이라도 본 발명의 기술적 범위에 포함된다.Hereinafter, the present invention will be described in detail by the following examples, provided that the following examples are only for illustrating the present invention, and the present invention is not limited by them. Any thing that has substantially the same configuration and the same operation and effect as the technical idea described in the claims of the present invention is included in the technical scope of the present invention.
실시예 1. 선형 벡터의 제조Example 1. Preparation of linear vectors
pHW2000 벡터의 ORF(open reading frame) 부분에 인플루엔자 A 바이러스의 모든 유전자를 삽입할 수 있도록 다음과 같은 방법으로 선형 벡터를 제조하였다(도 1).A linear vector was prepared in the following manner to insert all genes of the influenza A virus into the ORF (open reading frame) portion of the pHW2000 vector (FIG. 1).
먼저, pHW2000 벡터(Dr. Robert G. Webster, St. Jude Children's Research Hospital)를 주형으로, 유니버셜 벡터 프라이머를 사용하여 인플루엔자 A 바이러스의 유전자 각각에 대한 선형 벡터를 PCR 산물로서 수득하였다(도 2).First, using the pHW2000 vector (Dr. Robert G. Webster, St. Jude Children's Research Hospital) as a template, universal vectors primers were used to obtain linear vectors for each gene of the influenza A virus as PCR products (FIG. 2).
구체적으로, PCR 반응에는 교정 기능(proofreading function)이 있고, HF 완충액(New England BioLabs, Germany)에 넣어진 퓨전 중합효소(Phusion Polymerase)를 사용하였다. PCR 반응물은 2 ㎕의 퓨전 중합효소, 4 ㎕의 5 pmol 정방향 및 역방향 프라이머, 10 ㎕의 10× HF 완충액, 10 ㎕의 2 mM dNTP, 1 ㎕의 50 mM MgCl2, 및 100 ng의 빈 pHW2000 벡터를 포함하는 혼합물에, 증류수를 첨가하여 총 100 ㎕로 준비하였다. 사용된 프라이머의 서열 및 PCR 조건은 각각 하기 표 1 및 2에 나타내었고, 프라이머는 pHW2000 벡터의 Ctr(conserved terminal region), uni 12 및 uni 13을 포함하도록 제작하였다.Specifically, the PCR reaction has a proofreading function, and a fusion polymerase (Phusion Polymerase) in HF buffer (New England BioLabs, Germany) was used. PCR reactions include 2 μl of fusion polymerase, 4 μl of 5 pmol forward and reverse primers, 10 μl of 10×HF buffer, 10 μl of 2 mM dNTP, 1 μl of 50 mM MgCl 2 , and 100 ng of empty pHW2000 vector To the mixture containing, distilled water was added to prepare a total of 100 μl. The sequence and PCR conditions of the primers used are shown in Tables 1 and 2, respectively, and the primers were constructed to include the conserved terminal region (Ctr),
이후, PCR 산물에 존재하는 벡터는 1 ㎕(10 unit)의 DPN1을 첨가하여 2시간 동안 반응시킴으로써 제거하였다. PCR 산물은 QIAquick® Gel Extraction Kit(Qiagen, USA)를 사용하여 제조사의 프로토콜의 따라 정제하였다. 정제된 PCR 산물을 아가로스 겔에 전기영동하여 확인한 결과를 도 3B에 나타내었다.Then, the vector present in the PCR product was removed by adding 1 μl (10 units) of DPN1 and reacting for 2 hours. PCR products were purified using the QIAquick® Gel Extraction Kit (Qiagen, USA) according to the manufacturer's protocol. Fig. 3B shows the results of electrophoresis of the purified PCR product on an agarose gel.
도 3B에 나타낸 바와 같이, 인플루엔자 A 바이러스의 PB2(polymerase basic protein 2), PB1(polymerase basic protein 1), PA(polymerase acidic protein), HA(hemagglutinin), NP(nucleoprotein), NA(neuraminidase), M(matrix protein) 및 NS(nonstructural protein) 단백질을 클로닝할 수 있는, 약 3 kb 크기의 선형 pHW2000 벡터를 확인하였다.As shown in Figure 3B, influenza A virus PB2 (polymerase basic protein 2), PB1 (polymerase basic protein 1), PA (polymerase acidic protein), HA (hemagglutinin), NP (nucleoprotein), NA (neuraminidase), M A linear pHW2000 vector having a size of about 3 kb, capable of cloning (matrix protein) and nonstructural protein (NS) proteins, was identified.
실시예 2. 인플루엔자 A 바이러스의 선형 cDNA 준비Example 2. Linear cDNA preparation of influenza A virus
선형 벡터에 클로닝하기 위한 인플루엔자 A 바이러스의 각각 단백질을 암호화하는 유전자를 다음과 같은 방법으로 준비하였다.Genes encoding each protein of the influenza A virus for cloning in a linear vector were prepared in the following manner.
먼저, A/Puerto Rico/8/1934(H1N1, PR8) 바이러스로부터 통상적인 방법으로 인플루엔자 A 바이러스의 RNA를 분리하였다. 분리된 38 ㎕의 바이러스 RNA에 5 ㎕의 2 mM DNTP를 첨가하고, 여기에 하기 표 3에 기재된 2 ㎕의 uni12-CPEC(G) 또는 uni12-CPEC(A) 프라이머를 첨가하여 RT-PCR을 위한 혼합물을 준비하였다.First, RNA of the influenza A virus was isolated from the A/Puerto Rico/8/1934 (H1N1, PR8) virus by a conventional method. 5 μl of 2 mM DNTP was added to the isolated 38 μl of viral RNA, and 2 μl of uni12-CPEC(G) or uni12-CPEC(A) primers shown in Table 3 below were added to RT-PCR. The mixture was prepared.
상기 혼합물을 65℃에서 5분 방치한 뒤, 빠르게 얼음위로 옮겨 두었다. 혼합물이 식은 뒤, 2 ㎕의 10× HF 완충액 및 1 ㎕의 M-MLV 역전사 중합효소(reverse transcriptase)를 첨가하고, 37℃에서 1시간 동안 반응시켰다. 첨가된 중합효소의 불활성화를 위해, 72℃에서 10분 동안 더 반응시킨 뒤, 제조된 cDNA를 -80℃에서 사용할때까지 보관하였다.The mixture was left at 65° C. for 5 minutes and then quickly transferred onto ice. After the mixture cooled, 2 μl of 10×HF buffer and 1 μl of M-MLV reverse transcriptase were added and reacted at 37° C. for 1 hour. For inactivation of the added polymerase, after further reacting at 72°C for 10 minutes, the prepared cDNA was stored until use at -80°C.
실시예 3. 원-팟 PCR 클로닝(one-pot PCR cloning, OPPC)Example 3. One-pot PCR cloning (OPPC)
인플루엔자 A 바이러스의 유전자 각각을, 각각의 유전자를 위한 선형 벡터에 다음과 같이 클로닝하였다.Each gene of the influenza A virus was cloned into a linear vector for each gene as follows.
구체적으로, 5 ㎕의 10× HF 완충액, 5 ㎕의 2 mM dNTP, 1 ㎕의 50 mM MgCl2, 2 ㎕의 5 pmol 정방향 및 역방향 프라이머, 6 ㎕의 실시예 2에서 수득된 cDNA 및 1 ㎕의 퓨전 중합효소를 혼합하고, 최종 부피가 45 ㎕가 되도록 증류수를 넣어 PCR 반응물을 준비하였다. 이때, 프라이머는 상기 표 3에 기재된 프라이머(서열번호 17 내지 32)를 사용하였다. 또한, PCR 반응은 하기 표 4에 기재된 바와 같이 수행하였으며, 변성-어닐링-연신 단계를 25회 반복한 뒤, 실시예 1에서 제조된 300 ng의 선형 벡터를 첨가하고, 이를 10회를 더 반복하였다(도 4).Specifically, 5 μl of 10×HF buffer, 5 μl of 2 mM dNTP, 1 μl of 50 mM MgCl 2 , 2 μl of 5 pmol forward and reverse primer, 6 μl of cDNA obtained in Example 2 and 1 μl The fusion polymerase was mixed and PCR reaction was prepared by adding distilled water to a final volume of 45 µl. At this time, primers (SEQ ID NOs: 17 to 32) described in Table 3 were used. In addition, the PCR reaction was performed as described in Table 4 below, after the denaturation-annealing-stretching step was repeated 25 times, the linear vector of 300 ng prepared in Example 1 was added, and this was repeated 10 times. (Figure 4).
반응이 끝난 뒤, 수득된 PCR 산물을 5 ㎕ 취하여, 통상적인 방법으로 대장균에 형질전환하였다. 수득된 콜로니를 이용하여 콜로니 PCR을 수행하고, 동시에 상기 콜로니로부터 플라스미드를 분리하여 NCOI 효소로 이를 절단하고 전기영동하여 실시예 2에서 수득된 cDNA가 클로닝되었는지 확인하였다. 이때, 대조군으로서 일반적인 A/Puerto Rico/8/1934(H1N1, PR8) 바이러스의 각 유전자가 클로닝된 pHW2000 벡터를 동일하게 콜로니 PCR 및 NCOI 효소 절단하여 비교하였다. 그 결과, 수득된 콜로니 수 및 클로닝이 확인된 콜로니 수를 하기 표 5에, NCOI 효소로 절단한 플라스미드의 아가로스 겔 전기영동 결과 사진을 도 5에 나타내었다.After the reaction was completed, 5 µl of the obtained PCR product was taken and transformed into E. coli by a conventional method. Colony PCR was performed using the obtained colonies, and at the same time, plasmids were separated from the colonies, cut with NCOI enzyme, and electrophoresed to confirm whether the cDNA obtained in Example 2 was cloned. At this time, as a control group, each gene of the general A/Puerto Rico/8/1934 (H1N1, PR8) virus was cloned and compared by colony PCR and NCOI enzyme digestion. As a result, the number of colonies obtained and the number of colonies in which cloning was confirmed are shown in Table 5, and a photo of agarose gel electrophoresis of the plasmid cut with the NCOI enzyme is shown in FIG. 5.
(nt)Length
(nt)
(ng)Vector sheep
(ng)
표 5에 나타난 바와 같이, 인플루엔자 A 바이러스의 PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M 및 NS 단백질을 암호화하는 유전자가 63% 이상의 비율로 선형 벡터에 클로닝되었다. 또한, 도 5에 나타난 바와 같이, 제조된 플라스미드의 밴드 크기(도 5A) 및 상기 플라스미드를 NCOI로 절단한 경우에 나타나는 밴드 크기(도 5B)를 대조군과 비교함으로써, 인플루엔자 A 바이러스의 PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M 및 NS 단백질을 암호화하는 유전자가 클로닝됨을 확인하였다.As shown in Table 5, genes encoding the PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M and NS proteins of the influenza A virus were cloned into linear vectors at a rate of 63% or more. In addition, as shown in Figure 5, by comparing the band size of the prepared plasmid (Fig. 5A) and the band size (Fig. 5B) when the plasmid was cut with NCOI, compared to the control group, PB2, PB1 of influenza A virus, It was confirmed that genes encoding PA, HA, NP, NA, M and NS proteins were cloned.
실시예 4. 재조합 인플루엔자 A 바이러스의 생산Example 4. Production of recombinant influenza A virus
인플루엔자 A 바이러스의 PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M 및 NS 단백질을 각각 발현하는 플라스미드를 이용하여 재조합 인플루엔자 A 바이러스를 다음과 같은 방법으로 생산하였다.Recombinant influenza A virus was produced by the following method using plasmids expressing PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M and NS proteins of influenza A virus, respectively.
먼저, HEK-293T(ATCC) 및 MDCK(ATCC) 세포주를 통상적인 방법으로 배양하여 준비하고, 준비된 HEK-293T 및 MDCK 세포를 3:1의 부피비로 혼합하여 6-웰 플레이트에서 공배양하였다. 여기에 실시예 3에서 수득된 인플루엔자 A 바이러스의 PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M 및 NS 단백질을 발현하는 플라스미드를 각각 1 ㎕ 씩 취하여 공-형질감염시켰다. 구체적으로, 1 ng의 8종류의 단백질을 발현하는 플라스미드를 182 ㎕의 opti-MEM 및 18 ㎕의 TransIT-LT1 형질감염 제제와 혼합하고, 상온에서 45분 동안 방치하였다. 그 후, 상기 혼합물에 800 ㎕의 opti-MEM 배지를 첨가하여, 상기 공배양한 HEK-293T 및 MDCK 세포에 처리하였다. 형질감염 18시간 후, 플레이트이 배양액을 1%의 항생제가 포함된 1 ㎖의 opti-MEM 배지로 교체하고, 형질감염 24시간 후, 1 ㎍/㎖의 TPCK-트립신이 포함된 1 ㎖의 opti-MEM 배지를 첨가하였다. 이를 48시간 동안 배양한 뒤, 상기 배양액의 상층액을 취하여 10일령의 SPF(specific pathogen free) 계태아 종란(embryonated chicken egg)에 주입하고, 이를 48 내지 72시간 동안 배양하였다. HA 테스트를 수행하여 재조합 바이러스가 성장하는 것을, RT-PCR을 수행하여 바이러스의 서열을 확인하였다.First, HEK-293T (ATCC) and MDCK (ATCC) cell lines were prepared by culturing in a conventional manner, and the prepared HEK-293T and MDCK cells were mixed at a volume ratio of 3:1 and co-cultured in a 6-well plate. Here, 1 µl of plasmids expressing PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M and NS proteins of the influenza A virus obtained in Example 3 were taken and co-transfected. Specifically, 1 ng of plasmid expressing 8 kinds of protein was mixed with 182 μl of opti-MEM and 18 μl of TransIT-LT1 transfection preparation, and allowed to stand at room temperature for 45 minutes. Thereafter, 800 μl of opti-MEM medium was added to the mixture, and the co-cultured HEK-293T and MDCK cells were treated. After 18 hours of transfection, the plate was replaced with 1 ml opti-MEM medium containing 1% antibiotic, and 24 hours after transfection, 1 ml opti-MEM containing 1 μg/ml TPCK-trypsin. Medium was added. After culturing it for 48 hours, the supernatant of the culture was taken and injected into a 10-day-old SPF (specific pathogen free) embryonated chicken egg, which was cultured for 48 to 72 hours. The HA test was performed to confirm the growth of the recombinant virus, and RT-PCR was performed to confirm the sequence of the virus.
그 결과, 본 발명에 따른 방법으로 제조된 PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M 및 NS 단백질을 각각 발현하는 플라스미드를 이용하여 재조합 인플루엔자 A 바이러스를 생산할 수 있었고, 생산된 인플루엔자 A 바이러스의 서열은 상기 플라스미드의 제조에 사용된 염기서열과 동일하였다.As a result, it was possible to produce recombinant influenza A virus using plasmids expressing PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M and NS proteins, respectively, prepared by the method according to the present invention. The sequence was identical to the base sequence used in the preparation of the plasmid.
실시예 5. 다양한 아형의 인플루엔자 A 바이러스를 이용한 OPPCExample 5. OPPC using various subtypes of influenza A virus
다양한 아형의 인플루엔자 A 바이러스를 이용하여 OPPC를 다음과 같이 수행하였다. 먼저, A/duck/Korea/436/2014(W436, H1N8), A/duck/Korea/369/2008(W369, H2N3), A/duck/Korea/538/2016(W538, H3N8), A/duck/Korea/137/2006(W137, H4N4), A/duck/Korea/562/2016(W562, H5N3), A/duck/Korea/502/2015(W502, H6N2), A/duck/Korea/557/2016(W557, H7N7), A/duck/Korea/563/2016(W563, H8N6), A/duck/Korea/233/2007(W233, H9N2), A/duck/Korea/530/2016(W530, H10N4), A/duck/Korea/552/2016(W552, H11N9), A/duck/Korea/373/2008(W373, H12N5), A/Environment/Korea/W468/2015 (W468, H5N8) 또는 A/Korea/CNH1/2016 (CNH1, H1N1) 바이러스는 국내 야생 철새의 분변에서 분리하였다. 분리된 바이러스들을 이용하여 상기 서술한 바와 동일한 조건 및 방법으로 PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M 및 NS 단백질을 각각 발현하는 플라스미드를 제조하였다. 이때, HA 및 NA 유전자의 아형과 상기 유전자를 위한 선형 벡터의 제조에는 상기 표 1 및 3에 기재된 프라이머를 사용하였으며, NA 유전자의 N3, N6, N7 및 N9 아형에 대해서만 하기 표 6(선형 벡터용 프라이머) 및 7(바이러스 유전자용 프라이머)에 기재된 프라이머를 사용하였다.OPPC was performed as follows using various subtypes of influenza A virus. First, A/duck/Korea/436/2014(W436, H1N8), A/duck/Korea/369/2008(W369, H2N3), A/duck/Korea/538/2016(W538, H3N8), A/duck /Korea/137/2006(W137, H4N4), A/duck/Korea/562/2016(W562, H5N3), A/duck/Korea/502/2015(W502, H6N2), A/duck/Korea/557/ 2016(W557, H7N7), A/duck/Korea/563/2016(W563, H8N6), A/duck/Korea/233/2007(W233, H9N2), A/duck/Korea/530/2016(W530, H10N4 ), A/duck/Korea/552/2016(W552, H11N9), A/duck/Korea/373/2008(W373, H12N5), A/Environment/Korea/W468/2015 (W468, H5N8) or A/Korea /CNH1/2016 (CNH1, H1N1) virus was isolated from feces of domestic wild migratory birds. The isolated viruses were used to prepare plasmids expressing PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M and NS proteins, respectively, under the same conditions and methods as described above. At this time, the primers described in Tables 1 and 3 above were used for the production of the linear vector for the subtypes of the HA and NA genes, and only for the N3, N6, N7, and N9 subtypes of the NA gene, Table 6 below (for linear vectors) Primers) and 7 (primers for viral genes) were used.
상기 제조된 플라스미드에 PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M 및 NS 단백질을 발현하는 유전자가 클로닝되었는지와, 이들 플라스미드를 이용하여 재조합 인플루엔자 A 바이러스를 생산할 수 있는지를 확인하여 하기 표 8에 나타내었다.In Table 8 below, it was confirmed whether the genes expressing PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M, and NS proteins were cloned into the prepared plasmid, and whether these recombinant plasmids could be used to produce recombinant influenza A virus. Shown.
상기 표 8에 나타난 바와 같이, 본 발명에 따른 방법으로 다양한 아형의 인플루엔자 A 바이러스의 유전자를 경제적으로 클로닝할 수 있었고, 상기로부터 제조된 각각의 플라스미드와 A/Puerto Rico/8/34 바이러스의 나머지 7개 유전자 플라스미드를 이용하여 재조합 인플루엔자 A 바이러스가 생산되는 것을 확인하였다.As shown in Table 8, it was possible to economically clone genes of various subtypes of influenza A virus by the method according to the present invention, and the rest of each plasmid and A/Puerto Rico/8/34 virus prepared from the above 7 It was confirmed that a recombinant influenza A virus was produced using a dog gene plasmid.
따라서, 본 발명에 따른 방법은 쉽고 경제적으로 바이러스 유전자를 클로닝하는데 사용될 수 있음을 확인하였다.Therefore, it was confirmed that the method according to the present invention can be used to clone viral genes easily and economically.
<110> Chungbuk National University Industry-Academic Cooperation Foundation <120> INSERTION METHOD OF TARGET GENES IN LINEARIZED VECTORS <130> DP-2018-0221-KR <160> 50 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 49 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB2 forward <400> 1 aaacgacctt gtttctacta ataacccggc ggcccaaaat gccgactcg 49 <210> 2 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB2 reverse <400> 2 gacctgcttt cgctcccccc caacttcgga ggtcgaccag tactccggtt a 51 <210> 3 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB1 forward <400> 3 aaatgccttg tttctactaa taacccggcg gcccaaaatg ccgactcg 48 <210> 4 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB1 reverse <400> 4 tgcctgcttt cgctcccccc caacttcgga ggtcgaccag tactccggtt a 51 <210> 5 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PA forward <400> 5 aagtaccttg tttctactaa taacccggcg gcccaaaatg ccgactcg 48 <210> 6 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PA reverse <400> 6 gtacctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 7 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HA forward <400> 7 aaaacaccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 8 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HA reverse <400> 8 cccctgcttt cgctcccccc caacttcgga ggtcgaccag tactccggtt a 51 <210> 9 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NP forward <400> 9 aaaataccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 10 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NP reverse <400> 10 taccctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 11 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA forward <400> 11 aaaaaactcc ttgtttctac taataacccg gcggcccaaa atgccgactc g 51 <210> 12 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA reverse <400> 12 actcctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 13 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M forward <400> 13 aaaaactacc ttgtttctac taataacccg gcggcccaaa atgccgactc g 51 <210> 14 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M reverse <400> 14 ctacctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 15 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NS forward <400> 15 aaaacaccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 16 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NS reverse <400> 16 caccctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 17 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB2 1F <400> 17 aagttggggg ggagcgaaag caggtc 26 <210> 18 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB2 2341R <400> 18 ggttattagt agaaacaagg tcgttt 26 <210> 19 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB1 1F <400> 19 aagttggggg ggagcgaaag caggca 26 <210> 20 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB1 2341R <400> 20 ggttattagt agaaacaagg cattt 25 <210> 21 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PA 1F <400> 21 aagttggggg ggagcgaaag caggtac 27 <210> 22 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PA 2341R <400> 22 ggttattagt agaaacaagg tactt 25 <210> 23 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HA 1F <400> 23 aagttggggg ggagcaaaag cagggg 26 <210> 24 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HA 890R <400> 24 ggttattagt agaaacaagg gtgtttt 27 <210> 25 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NP 1F <400> 25 aagttggggg ggagcaaaag cagggta 27 <210> 26 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NP 1565R <400> 26 ggttattagt agaaacaagg gtattttt 28 <210> 27 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA 1F <400> 27 aagttggggg ggagcaaaag caggagt 27 <210> 28 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA 1413R <400> 28 ggttattagt agaaacaagg agtttttt 28 <210> 29 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M 1F <400> 29 aagttggggg ggagcaaaag caggtag 27 <210> 30 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M 1027R <400> 30 ggttattagt agaaacaagg tagttttt 28 <210> 31 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NS 1F <400> 31 aagttggggg ggagcaaaag cagggtg 27 <210> 32 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NS 890R <400> 32 ggttattagt agaaacaagg gtgtttt 27 <210> 33 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> uni12-CPEC(G) <400> 33 cgaagttggg ggggagcgaa agcagg 26 <210> 34 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> uni12-CPEC(A) <400> 34 cgaagttggg ggggagcaaa agcagg 26 <210> 35 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N3 forward <400> 35 aaaaagcacc ttgtttctac taataacccg gcggcccaaa atgccgactc g 51 <210> 36 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N3 reverse <400> 36 gcacctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 37 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N6 forward <400> 37 aaaacaccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 38 <211> 58 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N6 reverse <400> 38 cattttcacc ctgctttcgc tcccccccaa cttcggaggt cgaccagtac tccggtta 58 <210> 39 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N7 forward <400> 39 aaaacaccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 40 <211> 62 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N7 reverse <400> 40 cattctcaat caccctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt 60 ta 62 <210> 41 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N9 forward <400> 41 aagacccttg tttctactaa taacccggcg gcccaaaatg ccgactcg 48 <210> 42 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N9 reverse <400> 42 gaccctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 43 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N3 1F <400> 43 aagttggggg ggagcaaaag caggtgc 27 <210> 44 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N3 1420R <400> 44 ggttattagt agaaacaagg agcttttt 28 <210> 45 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N6 1F <400> 45 aagttggggg ggagcaaaag cagggtgaaa atg 33 <210> 46 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N6 890R <400> 46 ggttattagt agaaacaagg gtgtttt 27 <210> 47 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N7 1F <400> 47 aagttggggg ggagcaaaag cagggtgatt gagaatg 37 <210> 48 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N7 890R <400> 48 ggttattagt agaaacaagg gtgtttt 27 <210> 49 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N9 1F <400> 49 aagttggggg ggagcaaaag cagggtc 27 <210> 50 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N9 1473R <400> 50 ggttattagt agaaacaagg gtctt 25 <110> Chungbuk National University Industry-Academic Cooperation Foundation <120> INSERTION METHOD OF TARGET GENES IN LINEARIZED VECTORS <130> DP-2018-0221-KR <160> 50 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 49 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB2 forward <400> 1 aaacgacctt gtttctacta ataacccggc ggcccaaaat gccgactcg 49 <210> 2 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB2 reverse <400> 2 gacctgcttt cgctcccccc caacttcgga ggtcgaccag tactccggtt a 51 <210> 3 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB1 forward <400> 3 aaatgccttg tttctactaa taacccggcg gcccaaaatg ccgactcg 48 <210> 4 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB1 reverse <400> 4 tgcctgcttt cgctcccccc caacttcgga ggtcgaccag tactccggtt a 51 <210> 5 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PA forward <400> 5 aagtaccttg tttctactaa taacccggcg gcccaaaatg ccgactcg 48 <210> 6 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PA reverse <400> 6 gtacctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 7 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HA forward <400> 7 aaaacaccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 8 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HA reverse <400> 8 cccctgcttt cgctcccccc caacttcgga ggtcgaccag tactccggtt a 51 <210> 9 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NP forward <400> 9 aaaataccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 10 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NP reverse <400> 10 taccctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 11 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA forward <400> 11 aaaaaactcc ttgtttctac taataacccg gcggcccaaa atgccgactc g 51 <210> 12 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA reverse <400> 12 actcctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 13 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M forward <400> 13 aaaaactacc ttgtttctac taataacccg gcggcccaaa atgccgactc g 51 <210> 14 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M reverse <400> 14 ctacctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 15 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NS forward <400> 15 aaaacaccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 16 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NS reverse <400> 16 caccctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 17 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB2 1F <400> 17 aagttggggg ggagcgaaag caggtc 26 <210> 18 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB2 2341R <400> 18 ggttattagt agaaacaagg tcgttt 26 <210> 19 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB1 1F <400> 19 aagttggggg ggagcgaaag caggca 26 <210> 20 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PB1 2341R <400> 20 ggttattagt agaaacaagg cattt 25 <210> 21 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PA 1F <400> 21 aagttggggg ggagcgaaag caggtac 27 <210> 22 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PA 2341R <400> 22 ggttattagt agaaacaagg tactt 25 <210> 23 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HA 1F <400> 23 aagttggggg ggagcaaaag cagggg 26 <210> 24 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> HA 890R <400> 24 ggttattagt agaaacaagg gtgtttt 27 <210> 25 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NP 1F <400> 25 aagttggggg ggagcaaaag cagggta 27 <210> 26 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NP 1565R <400> 26 ggttattagt agaaacaagg gtattttt 28 <210> 27 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA 1F <400> 27 aagttggggg ggagcaaaag caggagt 27 <210> 28 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA 1413R <400> 28 ggttattagt agaaacaagg agtttttt 28 <210> 29 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M 1F <400> 29 aagttggggg ggagcaaaag caggtag 27 <210> 30 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> M 1027R <400> 30 ggttattagt agaaacaagg tagttttt 28 <210> 31 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NS 1F <400> 31 aagttggggg ggagcaaaag cagggtg 27 <210> 32 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NS 890R <400> 32 ggttattagt agaaacaagg gtgtttt 27 <210> 33 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> uni12-CPEC(G) <400> 33 cgaagttggg ggggagcgaa agcagg 26 <210> 34 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> uni12-CPEC(A) <400> 34 cgaagttggg ggggagcaaa agcagg 26 <210> 35 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N3 forward <400> 35 aaaaagcacc ttgtttctac taataacccg gcggcccaaa atgccgactc g 51 <210> 36 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N3 reverse <400> 36 gcacctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 37 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N6 forward <400> 37 aaaacaccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 38 <211> 58 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N6 reverse <400> 38 cattttcacc ctgctttcgc tcccccccaa cttcggaggt cgaccagtac tccggtta 58 <210> 39 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N7 forward <400> 39 aaaacaccct tgtttctact aataacccgg cggcccaaaa tgccgactcg 50 <210> 40 <211> 62 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N7 reverse <400> 40 cattctcaat caccctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt 60 ta 62 <210> 41 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N9 forward <400> 41 aagacccttg tttctactaa taacccggcg gcccaaaatg ccgactcg 48 <210> 42 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N9 reverse <400> 42 gaccctgctt tcgctccccc ccaacttcgg aggtcgacca gtactccggt ta 52 <210> 43 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N3 1F <400> 43 aagttggggg ggagcaaaag caggtgc 27 <210> 44 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N3 1420R <400> 44 ggttattagt agaaacaagg agcttttt 28 <210> 45 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N6 1F <400> 45 aagttggggg ggagcaaaag cagggtgaaa atg 33 <210> 46 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N6 890R <400> 46 ggttattagt agaaacaagg gtgtttt 27 <210> 47 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N7 1F <400> 47 aagttggggg ggagcaaaag cagggtgatt gagaatg 37 <210> 48 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N7 890R <400> 48 ggttattagt agaaacaagg gtgtttt 27 <210> 49 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N9 1F <400> 49 aagttggggg ggagcaaaag cagggtc 27 <210> 50 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NA N9 1473R <400> 50 ggttattagt agaaacaagg gtctt 25
Claims (8)
2) 상기 단계 1)의 변성, 어닐링 및 연신된 PCR 반응액에 도 1에 도시된 개열지도를 갖는 pHW2000의 선형 벡터를 첨가하는 단계; 및
3) 상기 단계 2)의 pHW2000 선형 벡터가 첨가된 PCR 반응액을 서열번호 17 내지 32 및 서열번호 43 내지 50으로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머를 이용하여 변성, 어닐링 및 연신시키는 단계를 포함하는 목적 유전자를 선형 벡터에 삽입하는 방법:
상기 인플루엔자 A 바이러스의 유전자는 PB2(polymerase basic protein 2), PB1(polymerase basic protein 1), PA(polymerase acidic protein), HA(hemagglutinin), NP(nucleoprotein), NA(neuraminidase), M(matrix protein) 및 NS(nonstructural protein) 유전자로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상이며,
PB2 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 17 및 18로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, PB1 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 19 및 20으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, PA 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 21 및 22로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, HA 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 23 및 24로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, NP 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 25 및 26으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, NA 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 27, 28 및 43 내지 50으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이며, M 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 29 및 30으로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고, 및 NS 유전자를 위한 프라이머는 서열번호 31 및 32로 기재된 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드이고,
상기 pHW2000의 선형 벡터 중, PB2 유전자를 위한 선형 벡터는 서열번호 1 및 2로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머로 증폭되고, PB1 유전자를 위한 선형 벡터는 서열번호 3 및 4로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머로 증폭되며, PA 유전자를 위한 선형 벡터는 서열번호 5 및 6으로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머로 증폭되고, HA 유전자를 위한 선형 벡터는 서열번호 7 및 8로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머로 증폭되며, NP 유전자를 위한 선형 벡터는 서열번호 9 및 10으로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머로 증폭되고, NA 유전자를 위한 선형 벡터는 서열번호 11, 12 및 35 내지 42로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머로 증폭되며, M 유전자를 위한 선형 벡터는 서열번호 13 및 14로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머로 증폭되고, NS 유전자를 위한 선형 벡터는 서열번호 15 및 16으로 기재된 염기서열로 구성되는 프라이머로 증폭된다.
1) Denaturation, annealing and elongation of a PCR reaction solution comprising a primer consisting of a target gene of influenza A virus, a nucleotide sequence of SEQ ID NOs: 17 to 32 and SEQ ID NOs: 43 to 50 step;
2) adding a linear vector of pHW2000 having a cleavage map shown in FIG. 1 to the modified, annealed and stretched PCR reaction solution of step 1); And
3) the purpose of the step of denaturing, annealing and stretching the PCR reaction solution to which the pHW2000 linear vector of step 2) is added using primers consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 17 to 32 and SEQ ID NOs: 43 to 50 To insert a gene into a linear vector:
The influenza A virus genes include PB2 (polymerase basic protein 2), PB1 (polymerase basic protein 1), PA (polymerase acidic protein), HA (hemagglutinin), NP (nucleoprotein), NA (neuraminidase), and M (matrix protein). And a non-structural protein (NS) gene.
The primer for the PB2 gene is a polynucleotide composed of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 17 and 18, the primer for the PB1 gene is a polynucleotide composed of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 19 and 20, and the primer for the PA gene is It is a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 21 and 22, the primer for the HA gene is a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 23 and 24, and the primer for the NP gene is shown in SEQ ID NO: 25 and 26 It is a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence described, the primer for the NA gene is a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 27, 28 and 43 to 50, the primer for the M gene is shown in SEQ ID NO: 29 and 30 It is a polynucleotide consisting of a sequence, and the primer for the NS gene is a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NOs: 31 and 32,
Among the linear vectors of pHW2000, the linear vector for the PB2 gene is amplified with a primer consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NOS: 1 and 2, and the linear vector for the PB1 gene consists of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 3 and 4. Amplified with a primer, the linear vector for the PA gene is amplified with a primer consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NOs: 5 and 6, and the linear vector for the HA gene is a primer consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NOS: 7 and 8. Amplified, the linear vector for the NP gene is amplified with a primer consisting of the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NOs: 9 and 10, and the linear vector for the NA gene consists of the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NOs: 11, 12 and 35 to 42 Amplified with a primer, the linear vector for the M gene is amplified with a primer consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NOs: 13 and 14, and the linear vector for the NS gene is a primer consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 15 and 16. Is amplified.
The method of claim 1, wherein the step of denaturing, annealing, and stretching the PCR reaction solution of step 1) is repeated 20 to 30 times, wherein the target gene is inserted into a linear vector.
The method of claim 1, wherein the step of denaturing, annealing, and stretching the PCR reaction solution of step 3) is repeated 5 to 15 times, wherein the target gene is inserted into a linear vector.
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