KR102110038B1 - 비만 진단을 위한 마이크로RNA let-7a 또는 let-7f 바이오마커 및 이의 용도 - Google Patents

비만 진단을 위한 마이크로RNA let-7a 또는 let-7f 바이오마커 및 이의 용도 Download PDF

Info

Publication number
KR102110038B1
KR102110038B1 KR1020180075522A KR20180075522A KR102110038B1 KR 102110038 B1 KR102110038 B1 KR 102110038B1 KR 1020180075522 A KR1020180075522 A KR 1020180075522A KR 20180075522 A KR20180075522 A KR 20180075522A KR 102110038 B1 KR102110038 B1 KR 102110038B1
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
obesity
microrna
group
present
expression level
Prior art date
Application number
KR1020180075522A
Other languages
English (en)
Other versions
KR20200002237A (ko
Inventor
류성호
권순효
배윤위
최철원
Original Assignee
순천향대학교 산학협력단
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 순천향대학교 산학협력단 filed Critical 순천향대학교 산학협력단
Priority to KR1020180075522A priority Critical patent/KR102110038B1/ko
Publication of KR20200002237A publication Critical patent/KR20200002237A/ko
Application granted granted Critical
Publication of KR102110038B1 publication Critical patent/KR102110038B1/ko

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/178Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA

Abstract

본 발명은 비만 진단을 위한 바이오마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 구체적으로 비만을 진단할 수 있는 마이크로RNA인 let-7a 또는 let-7f를 포함하는 마커 조성물, 상기 let-7a 또는 let-7f의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는 비만 진단용 조성물 및 키트, 상기 마커를 이용하여 비만을 진단하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 microRNAs는 정상군 내에서도 정상대조군에 비해 경계군에서 발현이 유의하게 증가하였는바 상기 microRNAs를 이용하여 비만을 조기에 진단할 수 있으며, 비만 및 관련 합병증 질환의 예방 또는 치료용 물질의 표적, 및 개발을 위한 바이오마커로써 유용하게 이용할 수 있을 것이다.

Description

비만 진단을 위한 마이크로RNA let-7a 또는 let-7f 바이오마커 및 이의 용도{Biomarker let-7a or let-7f for diagnosing obesity and use thereof}
본 발명은 비만 진단을 위한 바이오마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 구체적으로 비만을 진단할 수 있는 마이크로RNA인 let-7a 또는 let-7f를 포함하는 마커 조성물, 상기 let-7a 또는 let-7f의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는 비만 진단용 조성물 및 키트, 상기 마커를 이용하여 비만을 진단하는 방법에 관한 것이다.
비만은 체내에 지방조직이 과다한 상태로 정신 및 사회적 요인, 유전, 질병, 약물 등의 다양한 원인에 의해 발생하며, 특히 현대에 들어서는 과다한 열량 섭취 또는 고지방 식이에 의한 비만의 유병률이 증가하고 있는 추세이다. 2010년 세계 보건기구(WHO)에 따르면, 과체중 성인 인구는 전 세계적으로 약 16억 명, 비만인은 약 4억 명으로 집계되었으며, 매년 260만 명이 비만과 과체중으로 사망한다고 보고된바 있다. 국내의 경우에도 보건복지부와 질병관리본부에 의한 보고에 따르면 성인 비만율은 계속적으로 증가하고 있는 추세이며, 2010년을 기준으로 전체인구의 약 30.8%(남자 36.3%, 여자 24.8%)로 나타났다. 이처럼 비만 인구는 전 세계적으로 계속적으로 증가하고 있으며, 이에 따른 의료비 부담도 증가하고 있는 추세이다.
비만은 지속되면 다양한 합병증을 유발할 수 있기 때문에 그 심각성이 더욱 크게 인식되고 있다. 구체적으로 비만은 고혈압, 고지혈증, 당뇨병 등의 대사증후군, 지방간, 관절 이상, 및 암 발병 위험을 증가시킨다고 알려져 있으며, 2010년 세계보건기구에서 발표한 바에 따르면, 정상 체중인 사람에 비해 비만인 사람에게서 고혈압, 당뇨병, 이상지질혈증이 동반될 위험이 2배 이상(고혈압 2.5배, 당뇨병 2배, 고콜레스테롤혈증 2.3배, 고중성지질혈증 2.4배) 높게 나타난다고 보고되어 있다. 상기 질환들 이외에도 여성의 경우 체지방이 과다하면 성호르몬의 균형이 깨져 심한 경우 불임증을 초래할 수 있고, 자궁내막암과 유방암의 위험성이 높아진다고 알려져 있다. 더불어 비만은 신체적인 질환뿐만 아니라 사회적 고립감이나 소외, 자신감 결여, 및 우울감과 같은 정신적 질환을 유발할 수 있으므로 비만의 예방 및 치료에 대한 필요성은 매우 중요하게 인식되고 있다. 따라서 비만과 관련 합병증을 예방하기 위해서 비만을 조기에 진단하고 관리하는 것이 매우 중요하다.
비만은 키와 체중을 통해 측정할 수 있고, 캘리퍼를 이용해 피부주름의 두께를 측정함으로써 진단할 수 있다. 비만의 정도를 수치화하여 진단하는 방법으로는 이상체중법(Modified Broca's method)과 체질량지수(Body mass index; BMI)가 이용되고 있다. 체질량지수는 체중을 신장의 제곱으로 나눈 것으로, 서양의 경우 30 이상, 인종간의 차이를 고려하여 우리나라의 경우에는 25 이상을 비만으로 진단한다. 그러나 이러한 진단방법은 한정된 신체적 특성에만 의존하는 방법이기 때문에 이들 척도만으로는 비만을 정확히 진단하는데 어려움이 있다. 이에, 본 발명자들은 비만의 조기진단을 위해 비만 정도가 높아질수록 발현수준이 특이적으로 증가하는 비만 특이적 바이오마커를 발굴함으로써 본 발명을 완성하였다.
상기와 같은 종래의 문제점을 해결하기 위하여, 본 발명자들은 정상군과 비만군에 해당하는 대상자들의 혈청을 채취하고 이로부터 엑소좀(exosome) RNA를 분리한 후 NGS 분석을 통해 엑소좀 마이크로RNA의 발현수준을 비교분석한 결과, 비만수준이 높아질수록 발현수준이 유의하게 증가하는 마이크로RNAs를 발견하였는바, 이에 기초하여 본 발명을 완성하였다.
이에, 본 발명은 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f를 포함하는, 비만 진단용 마커 조성물을 제공하는 것을 목적으로 한다.
또한, 본 발명은 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 비만 진단용 조성물 및 상기 조성물을 포함하는 비만 진단용 키트를 제공하는 것을 다른 목적으로 한다.
또한, 본 발명은 피검체 유래의 생물학적 시료에서 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f의 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 비만 진단을 위한 정보제공방법을 제공하는 것을 또 다른 목적으로 한다.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당업자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
상기와 같은 본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f를 포함하는, 비만 진단용 마커 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 비만 진단용 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 비만 진단용 조성물을 포함하는 비만 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 일구현예로, 상기 let-7a는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다.
본 발명의 다른 구현예로, 상기 let-7f는 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현예로, 상기 let-7a 또는 let-7f의 발현을 측정하는 제제는 상기 microRNA에 상보적으로 결합하는 센스 및 안티센스 프라이머, 또는 프로브일 수 있다.
또한, 본 발명은 피검체 유래의 생물학적 시료에서 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f의 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 비만 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.
본 발명의 일구현예로, 상기 생물학적 시료는 혈액 또는 혈청 유래 엑소좀일 수 있다.
본 발명의 다른 구현예로, 상기 let-7a 또는 let-7f의 발현수준은 차세대 염기서열 분석(Next generation sequencing; NGS), 중합효소연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR), 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection assay; RPA), 마이크로어레이(microarray), 및 노던 블롯팅(northern blotting)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 방법을 통해 측정될 수 있다.
본 발명자들은 정상군 및 비만군의 혈액에서 분리한 엑소좀 내에 포함된 microRNA를 분석한 결과, 정상군에 비해 비만군으로 갈수록 발현수준이 유의하게 증가하는 비만 특이적 microRNA인 let-7a 및 let-7f를 동정하였다. 상기 동정된 microRNAs는 정상군 내에서도 정상대조군에 비해 정상과 비만의 경계군에서 발현이 유의하게 증가하였는바 상기 microRNAs를 이용하여 비만을 조기에 진단할 수 있으며, 비만 및 관련 합병증 질환의 예방 또는 치료용 물질의 표적, 및 개발을 위한 바이오마커로써 유용하게 이용할 수 있을 것이다.
도 1a는 정상군 및 비만군 대상자들의 혈청에서 분리한 엑소좀 내 microRNAs의 발현수준을 분석한 결과이고, 도 1b는 상기 도 1a의 결과를 바탕으로 다차원척도법(MDS) 분석을 실시한 결과이다.
도 2는 도 1b에서 확인된 정상군에 포함되는 정상대조군(normal) 및 정상과 비만의 경계군(middle)에 해당하는 대상자들에 대하여 연령(age), 신장(height), 체중(weight), 및 체질량지수(BMI)를 측정하여 비교한 결과이다.
도 3a는 경계군을 제외하고 정상대조군 및 비만군 대상자들의 혈청에서 분리한 엑소좀 내 microRNAs의 발현수준을 분석한 결과이고, 도 3b는 상기 도 3a의 결과를 바탕으로 다차원척도법(MDS) 분석을 실시한 결과이다.
도 4는 정상대조군(normal)과 비만군(obese), 또는 정상대조군(normal)과 경계군(middle) 간의 hsa-let-7a-3p(도 4a) 및 hsa-let-7f-1-3p(도 4b)의 발현수준을 측정하여 비교한 결과이다.
본 발명자들은 비만의 진단을 위한 유전자 마커를 발굴하기 위해 예의 연구한 결과, 비만 진단에 이용할 수 있는 바이오마커로 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f를 발견함으로써 본 발명을 완성하였다.
이에, 본 발명은 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f를 포함하는, 비만 진단용 마커 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 비만 진단용 조성물 및 상기 진단용 조성물을 포함하는 비만 진단용 키트를 제공한다.
본 발명자들은 실시예를 통해 비만의 진단을 위한 바이오마커로써 상기 let-7a 및 let-7f를 발굴하였다.
본 발명의 일실시예에서는, 정상군 및 BMI 25 이상의 비만군에 해당하는 대상자들을 모집하고 이들의 혈청을 제공받아 혈청으로부터 엑소좀을 분리하여 엑소좀 내 microRNA의 발현수준을 비교분석하였다(실시예 1 참조).
본 발명의 다른 실시예에서는, 정상군과 및 비만군에서 차이가 있는 microRNA를 분석한 결과 51개의 microRNA에서 발현수준에 유의한 차이가 있는 것을 확인하였고, 또한 상기 microRNA 발현수준 결과를 이용하여 다차원척도법으로 분석한 결과 2차원 상에서 상기 정상군과 비만 군 중간에 경계군이 나타나는 것을 관찰하였다. 상기 정상군에서 정상대조군과 경계군에 해당하는 대상자들의 정보를 분석한 결과 연령, 신장, 체중에서 유의한 차이가 있으며 체질량지수(BMI) 23을 기준으로 확연한 차이가 나타나는 것을 확인하였다(실시예 2-1 참조).
본 발명의 또 다른 실시예에서는, 상기 경계군을 제외하고 정상대조군 및 비만군 대상자들의 혈청 유래 엑소좀 내에 72개의 microRNA의 수준에 차이가 있는 것을 확인하였다(실시예 2-2 참조). 나아가 상기 결과들을 종합하여 분석함으로써 정상대조군에 비해 경계군에서 발현이 유의하게 증가하고 비만군에서는 더 높은 수준으로 발현이 증가하는 microRNA로써 hsa-let-7a-3p 또는 hsa-let-7f-1-3p를 최종적으로 동정하였다(실시예 2-3 참조).
본 발명에 있어서, 상기 let-7a, 보다 바람직하게 hsa-let-7a-3p는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 let-7f, 보다 바람직하게 hsa-let-7f-1-3p는 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다.
본 발명에서 사용되는 용어, “진단(diagnosis)”이란 넓은 의미로는 환자의 병의 실태를 모든 면에 걸쳐서 판단하는 것을 의미한다. 판단의 내용은 병명, 병인, 병형, 경중, 병상의 상세한 양태, 및 합병증의 유무 등이다. 본 발명에서 진단은 비만의 발병 여부 및 진행단계 수준 등을 판단하는 것이다.
본 발명에 있어서, 상기 let-7a 또는 let-7f의 발현을 측정하는 제제는 상기 microRNA에 상보적으로 결합하는 센스 및 안티센스 프라이머, 또는 프로브일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 사용되는 용어, “프라이머”란 DNA 합성의 기시점이 되는 짧은 유전자 서열로써, 진단, DNA 시퀀싱 등에 이용할 목적으로 합성된 올리고뉴클레오티드를 의미한다. 상기 프라이머들은 통상적으로 15 내지 30 염기쌍의 길이로 합성하여 사용할 수 있으나, 사용 목적에 따라 달라질 수 있으며, 공지된 방법으로 메틸화, 캡화 등으로 변형시킬 수 있다.
본 발명에서 사용되는 용어, “프로브”란 효소 화학적인 분리정제 또는 합성과정을 거쳐 제작된 수 염기 내지 수백 염기길이의 mRNA와 특이적으로 결합할 수 있는 핵산을 의미한다. 방사성 동위원소나 효소 등을 표지하여 mRNA의 존재 유무를 확인할 수 있으며, 공지된 방법으로 디자인하고 변형시켜 사용할 수 있다.
본 발명의 진단용 키트는 분석 방법에 적합한 한 종류 또는 그 이상의 다른 구성성분 조성물, 용액 또는 장치로 구성된다.
예컨대, 본 발명의 키트는 PCR을 수행하기 위해, 분석하고자 하는 시료로부터 유래된 게놈 DNA, 본 발명의 마커 유전자에 대해 특이적인 프라이머 세트, 적당량의 DNA 중합 효소, dNTP 혼합물, PCR 완충용액 및 물을 포함하는 키트일 수 있다. 상기 PCR 완충용액은 KCl, Tris-HCl 및 MgCl2를 함유할 수 있다. 이외에 PCR 산물의 증폭 여부를 확인할 수 있는 전기영동 수행에 필요한 구성 성분들이 본 발명의 키트에 추가로 포함될 수 있다.
또한, 본 발명의 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는 마커 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 데옥시뉴클레오티드(dNTPs), Taq-폴리머레이즈 및 역전사 효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다.
본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 피검체 유래의 생물학적 시료에서 마이크로RNA(microRNA) let-7a 또는 let-7f의 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 비만 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.
상기 피검체 유래의 생물학적 시료는 조직, 세포, 전혈, 혈액, 타액, 객담, 뇌척수액 또는 뇨 등을 포함할 수 있고, 보다 바람직하게는 혈액 또는 혈청 유래 엑소좀일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 방법에 따라 피검자 유래 시료에서 분리한 엑소좀 내 let-7a 또는 let-7f의 발현수준이 정상인보다 높을 경우 비만으로 판정할 수 있다.
상기 microRNAs의 발현수준은 당업계에 알려진 통상적인 방법으로 중합효소연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR), 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection assay; RPA), 마이크로어레이(microarray), 또는 노던 블롯팅(northern blotting)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 방법을 통해 측정될 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 하기 실시예에 의해 본 발명의 내용이 한정되는 것은 아니다.
[실시예]
실시예 1. 실험준비 및 실험방법
1-1. 분석 대상 모집
본 발명자들은 비만을 조기에 진단하고 비만 및 관련 합병증의 발병을 예방하기 위한 비만 진단용 바이오마커를 발굴하기 위해, 각각 정상군 및 비만군(obese, BMI 25 이상)에 해당하는 대상자들을 모집하였고, 이들로부터 혈청 샘플을 채취하여 그룹 간 차이를 나타내는 생체지표를 찾고자 하였다. 이를 위해, 각각 정상군 33명 및 비만군 16명을 대상으로 혈청을 제공받았다.
1-2. 혈청으로부터 RNA 분리 및 서열분석 수행
상기 실시예 1-1에서 정상군 및 비만군에 해당하는 대상자들로부터 채취한 혈청 샘플에 대하여 Exoquick(SBI, USA)을 사용해 엑소좀(exosome)을 분리하였고, 상기 분리된 엑소좀으로부터 Qiagen miRNeasy kit을 이용하여 총 RNA를 추출하였으며, 추출된 총 RNA의 질은 Agilent RNA Bioanalyzer를 이용해 제조사의 지시에 따라 측정하였다.
이후 상기 분리된 RNA를 이용하여 마크로젠사에서 Takara SMARTer smRNA for illumina kit을 사용하여 라이브러리를 제작한 후 Hiseq 2500으로 차세대 염기서열 분석(NGS)을 실시하여 microRNA를 검출하였다.
실시예 2. 비만 진단용 miRNA 발굴
2-1. 정상군(정상대조군 및 경계군) vs. 비만군의 발현수준에 차이가 있는 miRNA 분석
먼저, 본 발명자들은 상기 정상군 33명과 비만군 16명(BMI 25이상)의 혈액 유래 엑소좀에서 발현수준의 차이가 나는 miRNA를 동정하기 위하여, 상기 실시예 1-1 및 1-2의 방법에 따라 각 대상자들에서 채취한 혈청으로부터 엑소좀을 분리하고 이에 포함되어 있는 miRNA의 발현수준을 비교하였다.
그 결과, 도 1a에 나타낸 바와 같이 정상군과 비만군 사이에 51개의 miRNA에서 발현수준의 차이를 나타난 것을 히트맵(Heatmap) 분석을 통해서 확인하였다. 또한, 정상군과 비만군에 대하여 다차원척도법(MDS)을 통해 개별 샘플에 대한 변화량을 도출하여 이를 시각화하여 분석한 결과, 도 1b에 나타낸 바와 같이 비만군에서 나타나는 2차원상의 공간적 위치와 정상군에서 나타나는 2차원상의 공간적 위치가 두개의 그룹으로 확연하게 구분되지 않고 비만군과 정상군의 중간에 해당하는 경계군이 나타나는 것을 확인하였다. 따라서 상기 도 1a와 도 1b의 결과를 참고하여 정상군을 정상대조군(normal)과 경계군(middle)으로 구분하였다.
나아가 상기 정상대조군과 경계군의 대상자들에 대한 정보를 분석한 결과, 도 2에 나타낸 바와 같이 정상대조군에 비해 경계군의 연령(age)이 유의하게 낮았고, 신장(height)과 체중(weight)은 유의하게 높은 것을 확인하였다. 또한, 비만의 대표적인 지표인 체질량지수(BMI)를 비교한 결과 평균적으로 경계군에서 더 높게 나타났으며 BMI 지수 23을 기준으로 분류하였을 때 정상대조군은 거의 90%에 가까운 대상자들이 23 미만으로 나타난 반면, 경계군에서는 절반 이상이 23을 초과하는 것으로 나타났다.
이러한 결과는 2018년 대한비만학회 ‘2018 비만진료지침’에서 기존의 한국인 BMI 25이상을 비만으로 보던 기준에서 BMI 23에서 24.9를 ‘비만 전 단계’로 추가한 것과도 일맥상통하는 결과로 볼 수 있다.
2-2. 정상대조군 vs. 비만군의 발현수준에 차이가 있는 miRNA 분석
상기 결과에 더하여, 본 발명자들은 경계군을 제외하고 정상대조군으로 분류된 18명과 비만군 16명을 대상으로 이들 그룹 간의 혈액 유래 엑소좀에서 발현수준의 차이가 나는 miRNA를 동정하기 위하여, 상기 실시예 1-1 및 1-2의 방법에 따라 각 대상자들에서 채취한 혈청 유래 엑소좀에 포함되어 있는 miRNA의 발현수준을 비교하였다.
그 결과, 도 3a에 나타낸 바와 같이 72개의 miRNA에서 발현 변화가 나타난 것을 히트맵 분석을 통해서 확인하였다. 또한, 상기 분석 결과를 실시예 2-1의 방법과 동일하게 다차원척도법(MDS)으로 분석한 결과, 도 3b에 나타낸 바와 같이 도 1b의 결과와는 다르게 비만군에서 나타나는 2차원상의 공간적 위치와 정상대조군에서 나타나는 2차원상의 공간적 위치가 두개의 그룹으로 확연하게 구분되는 것을 확인하였다.
2-3. 비만 진단용 hsa-let-7a-3p 및 hsa-let-7f-1-3p 바이오마커 발굴
상기 실시예 결과들로부터, 정상대조군에서 경계군, 비만군으로 갈수록 발현수준이 유의적으로 변화한 microRNA 결과를 비교분석하였다. 그 결과, 하기 표 1에 나타낸 바와 같이 hsa-let-7a-3p 또는 hsa-let-7f-1-3p가 정상인에서 비만수준이 증가할수록 발현이 현저히 증가하는 것을 확인하였다. 또한, 도 4a 및 도 4b에 나타낸 바와 같이 정상대조군(normal)과 비만군(obese), 또는 정상대조군(normal)과 경계군(middle) 그룹 간의 hsa-let-7a-3p 및 hsa-let-7f-1-3p의 발현이 유의한 차이를 나타내는 것을 확인하였다.
따라서 상기 결과들은 hsa-let-7a-3p 또는 hsa-let-7f-1-3p를 비만의 진단을 위한 바이오마커로 유용하게 이용될 수 있음을 보여주는 것이다.
비만 관련 miRNA Obese/normal Normal/middle
hsa-let-7a-3p 8.27 -3.97
hsa-let-7f-1-3p 7.23 -3.35
상기 진술한 본 발명의 설명은 예시를 위한 것이며, 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 본 발명의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야만 한다.
<110> Soonchunhyang University Industry Academy Cooperation Foundation <120> Biomarker let-7a or let-7f for diagnosing obesity and use thereof <130> PD18-064 <160> 2 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 21 <212> RNA <213> hsa-let-7a-3p <400> 1 cuauacaauc uacugucuuu c 21 <210> 2 <211> 22 <212> RNA <213> hsa-let-7f-1-3p <400> 2 cuauacaauc uauugccuuc cc 22

Claims (13)

  1. 삭제
  2. 삭제
  3. 삭제
  4. 마이크로RNA(microRNA) let-7a-3p 또는 let-7f-1-3p의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 비만 진단용 조성물.
  5. 제4항에 있어서,
    상기 let-7a-3p는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 비만 진단용 조성물.
  6. 제4항에 있어서,
    상기 let-7f-1-3p는 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 비만 진단용 조성물.
  7. 제4항에 있어서,
    상기 let-7a-3p 또는 let-7f-1-3p의 발현수준을 측정하는 제제는 상기 microRNA에 상보적으로 결합하는 센스 및 안티센스 프라이머, 또는 프로브인 것을 특징으로 하는, 비만 진단용 조성물.
  8. 제4항의 조성물을 포함하는, 비만 진단용 키트.
  9. 피검체 유래의 혈청 유래 엑소좀 시료에서 마이크로RNA(microRNA) let-7a-3p 또는 let-7f-1-3p의 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 비만 진단을 위한 정보제공방법.
  10. 제9항에 있어서,
    상기 let-7a-3p는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.
  11. 제9항에 있어서,
    상기 let-7f-1-3p는 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.
  12. 삭제
  13. 제9항에 있어서,
    상기 let-7a-3p 또는 let-7f-1-3p의 발현수준은 차세대 염기서열 분석(Next generation sequencing; NGS), 중합효소연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR), 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection assay; RPA), 마이크로어레이(microarray), 및 노던 블롯팅(northern blotting)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 방법을 통해 측정되는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.
KR1020180075522A 2018-06-29 2018-06-29 비만 진단을 위한 마이크로RNA let-7a 또는 let-7f 바이오마커 및 이의 용도 KR102110038B1 (ko)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020180075522A KR102110038B1 (ko) 2018-06-29 2018-06-29 비만 진단을 위한 마이크로RNA let-7a 또는 let-7f 바이오마커 및 이의 용도

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020180075522A KR102110038B1 (ko) 2018-06-29 2018-06-29 비만 진단을 위한 마이크로RNA let-7a 또는 let-7f 바이오마커 및 이의 용도

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20200002237A KR20200002237A (ko) 2020-01-08
KR102110038B1 true KR102110038B1 (ko) 2020-05-12

Family

ID=69154539

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020180075522A KR102110038B1 (ko) 2018-06-29 2018-06-29 비만 진단을 위한 마이크로RNA let-7a 또는 let-7f 바이오마커 및 이의 용도

Country Status (1)

Country Link
KR (1) KR102110038B1 (ko)

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Cell (2011) 147(1):81-94
PNAS (2011) 108(52):21075-21080
The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism (2014) 99(9):E1681-E1685

Also Published As

Publication number Publication date
KR20200002237A (ko) 2020-01-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR102110039B1 (ko) 비만 진단을 위한 마이크로RNA-26b 또는 마이크로RNA-4449 바이오마커 및 이의 용도
KR101987358B1 (ko) 신규한 간암 진단용 바이오 마커 및 이의 용도
KR20170035932A (ko) 위암 진단용 microrna 바이오마커
JP6092655B2 (ja) テスト体液サンプルの分類方法
CN109477145A (zh) 炎症性肠病的生物标志物
KR102178922B1 (ko) 당뇨병성 신증 진단을 위한 마이크로RNA let-7 또는 마이크로RNA-150 바이오마커 및 이의 용도
JP2017184642A (ja) 認知症マーカー、それを用いた認知症の評価方法、評価試薬および評価キット
WO2007037611A1 (en) Markers for predicting the response of a patient with acute myeloid leukemia to anti-cancer drugs
KR102096498B1 (ko) 대장암 진단 또는 재발 예측을 위한 마이크로RNA-4732-5p 및 이의 용도
KR102492149B1 (ko) 난소암 진단 또는 감별진단을 위한 마이크로rna-1246 및 이의 용도
US9195796B2 (en) Malignancy-risk signature from histologically normal breast tissue
KR102178919B1 (ko) 당뇨병성 신증 진단을 위한 마이크로rna 바이오마커 및 이의 용도
WO2013130465A2 (en) Gene expression markers for prediction of efficacy of platinum-based chemotherapy drugs
KR102110038B1 (ko) 비만 진단을 위한 마이크로RNA let-7a 또는 let-7f 바이오마커 및 이의 용도
KR102165841B1 (ko) 당뇨병 진단을 위한 마이크로RNA let-7b 또는 마이크로RNA-664a 바이오마커 및 이의 용도
EP4112745A1 (en) Biomarkers for predicting a patient&#39;s response to bcg therapy, methods and uses based thereon
CN111808966B (zh) miRNA在诊断乳腺癌患病风险的应用
KR102096499B1 (ko) 대장암 진단 또는 재발 예측을 위한 마이크로rna-3960 및 이의 용도
KR20130098669A (ko) 위암의 림프절 전이 진단 마커로서의 혈청 miRNA
KR20210024986A (ko) 신장이식 후 항체 매개성 거부반응의 진단을 위한 소변 엑소좀 유래 miRNA 유전자 바이오마커 및 이의 용도
KR102110050B1 (ko) 당뇨병 진단을 위한 마이크로rna-423 또는 마이크로rna-424 바이오마커 및 이의 용도
KR102546809B1 (ko) 자궁경부암의 급성 종양 반응 진단을 위한 정보 제공 방법
KR102478811B1 (ko) 멀티플렉스 pcr 플랫폼 기반의 알츠하이머 질환 진단을 위한 신규한 마커 조성물 및 이의 용도
KR102349630B1 (ko) 알츠하이머 질환의 진단을 위한 Eef1a1의 용도
KR102005146B1 (ko) 악성중피종 진단용 바이오마커 및 이의 용도

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
E701 Decision to grant or registration of patent right
GRNT Written decision to grant