KR102022248B1 - Method for enhancing saponin of Kalopanax septemlobus cell - Google Patents

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Abstract

본 발명은 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법에 관한 것으로서, 상세하게는 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법 및 이를 이용하여 제조된 기존 음나무 세포에 비하여 사포닌 생산성이 높은 음나무 세포 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법은 대량증식이 어려운 음나무를 비-배발생 캘러스 유도 및 배양함에 의하여 음나무 세포의 사포닌 생성을 증진시킬 수 있다. 본 발명의 음나무 세포 조성물은 음나무 사포닌이 증진되어 사포닌을 활성성분으로 하는 약제, 기능성 식품 및 화장품의 원료성분으로서 유용성이 우수하다.
The present invention relates to a method for enhancing saponin production of lacquer cells, and more particularly, to a method for enhancing saponin production of lacquer cells and a saponin cell composition having a higher saponin productivity than conventional lacquer cells prepared using the same.
Saponin production enhancement method of the Rhizome cells of the present invention can enhance saponin production of Rhizoblast cells by inducing and culturing non-embryonic callus of Rhizophyllum which is difficult to grow large. The tree cell composition of the present invention is excellent in usefulness as a raw material component of drugs, functional foods and cosmetics having saponin as an active ingredient with enhanced saponin.

Description

음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법 {Method for enhancing saponin of Kalopanax septemlobus cell}Method for enhancing saponin production in yeast cells {Method for enhancing saponin of Kalopanax septemlobus cell}

본 발명은 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법에 관한 것으로서, 상세하게는 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법 및 이를 이용하여 제조된 기존 음나무 세포에 비하여 사포닌 생산성이 높은 음나무 세포 조성물에 관한 것이다.The present invention relates to a method for enhancing saponin production of lacquer cells, and more particularly, to a method for enhancing saponin production of lacquer cells and a saponin cell composition having a higher saponin productivity than conventional lacquer cells prepared using the same.

음나무(Kalopanax septemlobus)는 한방에서 해동으로, 그 수피는 해동피로 불리워져 오는 약용식물이다. 두릅나무과(Araliaceae)에 속하는 수고 20∼25m의 낙엽활엽교목으로 전국 산야에 산재되어 분포하는 낙엽교목이다. Kalopanax septemlobus is a medicinal plant that is called thawing in Chinese medicine and its bark is called thawing blood. It is a deciduous broad-leaved arborescent tree of 20-25m, belonging to Araliaceae .

음나무의 주요 약리성분은 칼로파낙스사포닌 A(kalopanaxsaponin A), 칼로파낙스사포닌 B 등의 사포닌이며, 특히 음나무의 사포닌은 인삼의 사포닌과 비슷한 작용이 있어서 음나무는 인삼 대용품으로도 사용되어 왔다. The main pharmacological components of Yin tree are saponins such as kalopanaxsaponin A and Kalpanax saponin B. In particular, Yin tree saponins have a similar action to ginseng saponins, and Yin tree has been used as a substitute for ginseng.

음나무의 약리활성으로는 진해, 항염증, 강장 작용, 혈당저하 작용 등이 알려져 있으며, 음나무 및 이로부터 유래되는 조성물을 약제, 기능성 식품 및 화장품으로 활용하는 기술의 개발이 시도되고 있다 (등록특허 10-0588448호).The pharmacological activity of Yin-Tak is known as antitussive, anti-inflammatory, tonic action, hypoglycemic action, and the development of technology to utilize Yin-Tum and its composition as a medicine, functional food, and cosmetics has been attempted. -0588448).

음나무는 종자번식에 의한 증식이 가능하나 중복휴면(double dormancy) 종자로 2년 발아 특성이 있어 당년 발아율이 평균 8% 내외로 매우 낮은바, 이를 극복하고자 무성번식이 가능한 음나무 신품종이 개발되고, 또한 대량으로 음나무 종묘를 생산하는 방법이 개발된 바 있다 (등록특허 10-0365491호, 등록특허 10-0767050호). Mine can be grown by seed propagation, but double dormancy seeds have germination characteristics for 2 years, so germination rate is very low at around 8% on average. There has been developed a method for producing seedlings in large quantities (registered patent 10-0365491, registered patent 10-0767050).

그러나 음나무의 약리성분인 사포닌의 생성을 증진시키는 기술은 개발된 바 없다. However, no technology has been developed to enhance the production of saponin, a pharmacological component of Yin.

본 발명의 목적은 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법을 제공하는 것이다.It is an object of the present invention to provide a method for enhancing saponin production of yeast cells.

본 발명의 또 다른 목적은 상기 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법에 의해 제조된, 통상의 음나무 세포에 비해 사포닌 생산성이 증진된 음나무 세포 조성물을 제공하는 것이다. It is still another object of the present invention to provide a saponin cell composition having improved saponin productivity compared to conventional saponin cells, prepared by the saponin production-promoting method of the sapling cells.

본 발명의 또 다른 목적은 상기 음나무 세포 조성물 또는 이의 추출물을 포함하는 피부 외용제 조성물을 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide a composition for external application of skin comprising the above-mentioned tree cell composition or extract thereof.

상기 본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은In order to achieve the object of the present invention, the present invention

ⅰ) 음나무의 종자를 살균하여 도정하는 단계;Iii) sterilizing and seeding seeds of the tree;

ⅱ) 상기 도정된 종자로부터 비-배발생(non-embryogenic) 캘러스를 유도하는 단계; 및Ii) inducing a non-embryogenic callus from said seed; And

ⅲ) 비-배발생 캘러스를 선별하여 배양하는 단계를 포함하고,Iii) selecting and culturing the non-embryonic callus,

상기 비-배발생 캘러스 유도는 옥신류 식물성장호르몬을 4 ~ 5μM 이상으로 포함하는 배지에서 배양된 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법을 제공한다. The non-embryogenic callus induction provides a method for enhancing saponin production of yeast cells cultured in a medium containing 4 to 5 μM or more of auxin plant growth hormone.

본 발명에서 '캘러스(callus)'는 식물체의 조직배양시 외식편 (外植片)을 배지 위에 치상하고 적정 배양조건에서 배양하면 일정한 체제를 이루고 있는 세포괴를 형성하는데 이 세포괴를 의미한다. In the present invention, 'callus' refers to the cell mass in which the explants on the culture of the plant are cultured on the medium and cultured under the appropriate culture conditions to form a cell structure having a certain structure.

본 발명에서 '비-배발생(non-embryogenic) 캘러스'는 상기 캘러스가 배형성 능력을 가지지 않는 캘러스를 의미한다. In the present invention, 'non-embryogenic callus' refers to a callus in which the callus does not have an embryogenic capacity.

단계 i): 음나무 종자 준비Step i): Preparing Seed Seeds

음나무의 종자를 살균하여 도정하여 제공한다. Sterilize seed of wood and provide it.

종자는 성숙 종자 또는 미성숙 종자를 사용할 수 있다. 성숙 종자의 성숙배에서 유도된 캘러스는 비-배발생 캘러스 유도가 잘 이루어지는 장점이 있다. 따라서 성숙된 종자만을 선별하여 비-배발생 캘러스 유도에 사용할 수도 있다. 미성숙 종자를 사용할 경우는 비-배발생 외에도 배발생 캘러스로의 유도가 동시에 이루어지나, 증식 속도가 빠른 장점이 있다. Seeds may use mature or immature seeds. Callus derived from mature embryos of mature seeds has the advantage that non-embryogenic callus induction is well performed. Therefore, only mature seeds can be selected and used for induction of non-embryogenic callus. When immature seeds are used, induction into embryogenic callus is simultaneously performed in addition to non-embryonic development, but has an advantage of rapid growth rate.

종자의 살균은, 70% 에탄올에 30초~1분 담그어서 살균하고, 2% 차아염소산나트륨(NaOCl) 용액으로 20~30분 동안 표면 소독 후, 무균 증류수로 3~5회 헹구어서 수행할 수 있다. Seed sterilization can be performed by soaking in 70% ethanol for 30 seconds to 1 minute, sterilizing the surface with 2% sodium hypochlorite (NaOCl) solution for 20-30 minutes, and then rinsing with sterile distilled water 3 to 5 times. have.

종자의 도정은 현미경 혹은 돋보기 하에서 종피를 제거하거나, 그 외 통상의 방법으로 수행할 수 있다. Seeding of seeds may be carried out by removing the epidermis under a microscope or magnifying glass, or by any other conventional method.

단계 ⅱ) 비-Step ii) non- 배발생Embryonic development 캘러스Callus 유도 Judo

단계 i)로부터의 도정된 종자로부터 비-배발생 캘러스를 유도한다. A non-embryogenic callus is derived from the seeded seed from step i).

비-배발생 캘러스 유도에 사용될 수 있는 배지는 WPM(woody plant medium), MS(Murashige & Skoog), B5(Gamborg's B5), 더잔(Durzan), SH(Schenk & Hildebrandt), White, DKW(Driver-Kuniyuk-Walnut), GD(Gresshoff & Doy), LP(Quoirin & Lepiovre) 배지 등이며, 바람직하게는 WPM(woody plant medium) 배지를 사용한다. Media that can be used to induce non-embryogenic callus include WPM (woody plant medium), MS (Murashige & Skoog), B5 (Gamborg's B5), Durzan, SH (Schenk & Hildebrandt), White, DKW (Driver- Kuniyuk-Walnut (Gunis-Walnut), GD (Gresshoff & Doy), LP (Quoirin & Lepiovre) medium and the like, preferably WPM (woody plant medium) medium is used.

비-배발생 캘러스 유도를 위한 배지에는 옥신류 식물성장호르몬을 4 ~ 5 μM 포함하는 것이 바람직하다. 캘러스 유도용 배지에 옥신류 식물성장호르몬이 4 μM 미만으로 포함하면 캘러스 유도 효율이 낮아지거나, 세포의 발달 스위치에 충분히 강한 스트레스가 부여되지 않아서 배발생(embryogenic) 캘러스의 유도의 빈도가 높아질 수 있고, 5 μM 초과로 포함하면 캘러스가 유도되기 전에 종자배가 고사되는 문제가 발생할 수 있다. 가장 바람직하게는 옥신류 식물성장호르몬이 4.4 μM 로 포함된다.It is preferable that the medium for induction of non-embryogenic callus contains 4-5 μM of auxin plant growth hormone. When the callus induction medium contains less than 4 μM of auxin plant growth hormone, callus induction efficiency may be decreased, or the frequency of induction of embryogenic callus may be increased due to insufficient stress on the cell development switch. Inclusion of more than 5 μM may cause the seed seed to die before the callus is induced. Most preferably, Auxin plant growth hormone is contained in 4.4 μM.

본 발명에서 사용될 수 있는 '옥신류 식물성장호르몬'으로는 2,4-디클로로페녹시아세트산(2-4-Dichlorophenoxyacetic acid; 2,4-D) 등이 있다. 'Oxin-type plant growth hormone' that can be used in the present invention includes 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2-4-Dichlorophenoxyacetic acid; 2,4-D) and the like.

하기 실시예에서와 같이, 도정된 음나무 종자를 4 ~ 5 μM 2,4-디클로로페녹시아세트산(2,4-D)와 함께 3% 슈크로스, 0.3% 젤라이트 (gelrite)가 포함된 WPM(woody plant medium) 배지에 치상하여 캘러스를 유도할 수 있다. 이때 24~26℃의 어두운 배양실에서 3~6주간 배양하여 음나무 비-배발생 캘러스를 유도할 수 있다.As in the examples below, the inverted planter seeds were treated with 4-5 μM 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D) with WPM containing 3% sucrose, 0.3% gelrite ( woody plant medium) can be dentured to induce callus. At this time it can be incubated for 3-6 weeks in a dark culture room of 24 ~ 26 ℃ can induce the non-embryonic callus.

단계 ⅲ): 비-배발생 캘러스 배양Step iii): non-embryonic callus culture

비-배발생 캘러스를 선별하여 배양함에 의해서, 사포닌 생산성이 증진된 음나무 세포를 대량으로 얻는다. By selecting and culturing the non-embryonic callus, a large amount of nematode cells with enhanced saponin productivity are obtained.

비-배발생 캘러스의 선별은 형태학적 특성에 의해 용이하게 수행될 수 있다 (도 1). 비-배발생 캘러스는 하얗고 반투명이며 (도 1a), 이에 비하여 배발생 캘러스는 황갈색(도 1b)이어서 육안으로 쉽게 구별될 수 있다. The selection of non-embryonic callus can be easily performed by morphological characteristics (FIG. 1). The non-embryogenic callus is white and translucent (FIG. 1A), whereas the embryogenic callus is tan (FIG. 1B) and can be easily distinguished with the naked eye.

또한 비-배발생 캘러스는 세포구조 특성에 의해서도 구별될 수 있다. 비-배발생 캘러스의 세포는 크고, 액포(空胞)가 많으며, 작은 핵을 갖고 길쭉한 구조를 갖는 반면에 (도 2a, 도 2b), 배발생 캘러스는 두드러진 핵 및 밀도가 높은 세포질을 가진 조직화된 구조를 보인다 (도 2c, 도 2d). Non-embryonic callus can also be distinguished by cell structure characteristics. The cells of non-embryogenic callus are large, vacuole, have small nuclei and have an elongated structure (FIGS. 2A, 2B), whereas embryogenic callus is organized with prominent nuclei and dense cytoplasm. The structure is shown (Fig. 2c, Fig. 2d).

비-배발생 캘러스 배양은 상기와 같은 방식으로 선별된 비-배발생 캘러스 만을 취하여 배양배지에 치상하여 pH 5.0~6.0 및 24~26℃의 어두운 배양실에서 3~6 주간 배양한다. 상기 배양조건으로 배양시 본 발명의 음나무 세포의 사포닌 생합성 관련 효소들의 발현량이 현저하게 증진되어 결과적으로 사포닌 생성이 촉진될 수 있다. Non-embryogenic callus culture is taken in culture medium by taking only non-embryogenic callus selected in the above manner and incubated for 3-6 weeks in dark culture room at pH 5.0-6.0 and 24-26 ° C. When cultured under the above culture conditions, the expression level of saponin biosynthesis-related enzymes of the lacquer cells of the present invention can be significantly enhanced, and as a result, saponin production can be promoted.

본 발명에서 비-배발생 캘러스의 배양 배지는 WPM(woody plant medium), MS(Murashige & Skoog), B5(Gamborg's B5), 더잔(Durzan), SH(Schenk & Hildebrandt), White, DKW(Driver-Kuniyuk-Walnut), GD(Gresshoff & Doy), LP(Quoirin & Lepiovre) 배지 등이며, 바람직하게는 WPM 배지를 사용한다.In the present invention, the culture medium of the non-embryogenic callus is WPM (woody plant medium), MS (Murashige & Skoog), B5 (Gamborg's B5), Durzan, SH (Schenk & Hildebrandt), White, DKW (Driver- Kuniyuk-Walnut, GD (Gresshoff & Doy), LP (Quoirin & Lepiovre) medium, and the like. Preferably, WPM medium is used.

본 발명에서 캘러스 유도 배지에 포함된 옥신류 식물성장호르몬은 비-배발생 캘러스 배양시 파괴되어, 최종 음나무 세포에는 거의 포함되지 않게 된다.In the present invention, auxin plant growth hormone contained in callus induction medium is destroyed in non-embryogenic callus culture, so that it is hardly included in the final cell.

본 발명의 또 다른 목적에 따라서, 상기 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법에 의해 제조된, 사포닌 생산성이 증진된 음나무 세포 조성물을 제공한다.According to still another object of the present invention, there is provided a saponin productivity-promoting saponin cell composition prepared by the saponin production-promoting method of the sapling cells.

본 발명에 따른 음나무 세포 조성물은 사포닌을 활성성분으로 하는 약제, 기능성 식품 및 화장품의 원료성분으로 사용될 수 있다. The tree cell composition according to the present invention can be used as a raw material of drugs, functional foods and cosmetics containing the active ingredient saponin.

본 발명의 또 다른 목적에 따라서, 상기 음나무 세포 조성물 또는 이의 추출물을 포함하는 피부 외용제 조성물을 제공한다. According to another object of the present invention, there is provided a topical composition for skin comprising the above cell composition or extract thereof.

본 발명에서 상기 추출물은 상기 음나무 세포 조성물을 유기용매를 이용하여 추출한 것일 수 있다. 상기 추출에 사용될 수 있는 유기용매로는 아세톤, 에틸아세테이트, 디에틸에테르, 글리세린, 에틸렌글리콜, 프로필렌글리콜, 부틸렌글리콜, 벤젠, 클로로포름, 헥산 및 탄소수 1~4의 알코올 등이 사용될 수 있다. 이들은 단독 또는 2종 이상 혼합하여 사용될 수 있다.In the present invention, the extract may be extracted by using the organic solvent cell composition. As the organic solvent that can be used for the extraction may be used acetone, ethyl acetate, diethyl ether, glycerin, ethylene glycol, propylene glycol, butylene glycol, benzene, chloroform, hexane and alcohol having 1 to 4 carbon atoms. These can be used individually or in mixture of 2 or more types.

상기 피부 외용제 조성물에 포함된 사포닌은 피부염증의 치료, 개선, 예방 및 완화효과, 항산화 효과, 미백 및 피부톤 개선 효과가 우수할 수 있다.Saponin contained in the external preparation composition for skin may be excellent in the treatment, improvement, prevention and alleviation of skin inflammation, antioxidant effect, whitening and skin tone improvement.

본 발명의 음나무 세포의 사포닌 생성 증진방법은 대량증식이 어려운 음나무를 비-배발생 캘러스 유도 및 배양함에 의하여 음나무 세포의 사포닌 생성을 증진시킬 수 있다. Saponin production enhancement method of the Rhizome cells of the present invention can enhance saponin production of Rhizoblast cells by inducing and culturing non-embryonic callus of Rhizophyllum which is difficult to grow large.

본 발명의 음나무 세포 조성물은 음나무 사포닌이 증진되어 사포닌을 활성성분으로 하는 약제, 기능성 식품 및 화장품의 원료성분으로서 유용성이 우수하며, 본 발명에 따른 피부 외용제 조성물은 음나무 사포닌이 증진되어 피부염증의 치료, 개선, 예방 및 완화효과, 항산화 효과, 미백 및 피부톤 개선 효과를 가질 수 있다.The cell composition of the present invention is excellent in usefulness as a raw material of pharmaceuticals, functional foods and cosmetics with the active ingredient of saponin as the saponin is enhanced, and the external composition for skin according to the present invention is enhanced with the saponin of the tree to treat skin inflammation. It can have the effect of improving, preventing and relieving, antioxidant effect, whitening and skin tone.

도 1은 본 발명에 따라 유도된 음나무의 비-배발생 캘러스(도 1a)의 형태를 보여주는 사진이다.
도 2는 본 발명에 따라 유도된 음나무의 비-배발생의 세포 조직 및 초미세구조를 광학 현미경 및 TEM으로 관찰 촬영한 사진이다 (도 2a, 도 2b; Nu - 핵, V - 액포).
도 3은 본 발명에 따른 음나무 비-배발생 캘러스(NEC)와 비교예의 음나무 배발생 캘러스(EC)의 유전자 온톨로지(GO) 분류와 각 카테고리 유니진의 백분율을 나타낸 그래프이다.
도 4는 본 발명에 따른 음나무 비-배발생 캘러스(NEC)와 비교예의 음나무 배발생 캘러스(EC)의 유전자 온톨로지(GO) 농축 분석의 클러스터 히트맵을 나타낸다.
도 5는 본 발명에 따른 음나무 비-배발생 캘러스(NEC)와 비교예의 음나무 배발생 캘러스(EC)의 사포닌 생합성과 관련된 5종 주요 효소의 유니진의 발현을 비교한 그래프이다 (SE - 스쿠알렌 에폭시다제; CYP450s - 시토크롬 P450; GTs - UDP-글리코실 트랜스퍼라제).
1 is a photograph showing the shape of the non-embryonic callus (FIG. 1A) of the Yin-induced wood according to the present invention.
Figure 2 is a photograph taken by optical microscopy and TEM of the non-embryonic cell tissue and ultrastructure of the U. erysipelas induced in accordance with the present invention (Fig.
Figure 3 is a graph showing the gene ontology (GO) classification and the percentage of each category of the unigeneous embryogenic callus (NEC) of the present invention and the negative embryogenic callus (EC) of the comparative example according to the present invention.
Figure 4 shows the cluster heat map of the gene ontology (GO) enrichment analysis of the negative tree embryogenic callus (NEC) according to the invention and the negative tree embryogenic callus (EC) of the comparative example.
Figure 5 is a graph comparing the expression of the unigene of the five major enzymes related to saponin biosynthesis of the lactome non-embryonic callus (NEC) according to the present invention and the lactose embryogenic callus (EC) of the comparative example (SE-squalene epoxidase CYP450s-cytochrome P450; GTs-UDP-glycosyl transferase).

이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 구체적인 실시예를 통하여 본 발명의 구성 및 효과를 보다 상세히 설명하기로 한다. 그러나 하기 실시예는 본 발명을 보다 명확하게 이해시키기 위하여 예시한 것일 뿐이며, 본 발명의 권리범위가 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다. Hereinafter, the configuration and effects of the present invention will be described in more detail with reference to specific examples in order to help understanding of the present invention. However, the following examples are only illustrated to more clearly understand the present invention, and the scope of the present invention is not limited by the following examples.

실시예Example

실시예 1: 음나무 세포의 사포닌 생성 증진Example 1 Enhancement of Saponin Production of Cells

<음나무 종자 준비 및 비-배발생 캘러스 유도><Industrial Seed Preparation and Non-Evening Callus Induction>

개화기의 음나무 꽃봉오리로부터 미성숙 종자를 수확하였다. 1분 동안 70% 에탄올에 담그고 2% 차아염소산나트륨(NaOCl)으로 20분 동안 표면 소독한 다음, 무균 증류수로 5회 헹구었다. 현미경 혹은 돋보기 하에서 종피를 제거하여 종자를 도정하였다. Immature seeds were harvested from the flowering buds of the flowering period. Soaked in 70% ethanol for 1 minute, surface sterilized with 2% sodium hypochlorite (NaOCl) for 20 minutes, then rinsed five times with sterile distilled water. Seeds were planted by removing the epidermis under a microscope or magnifying glass.

도정된 음나무 종자를 3% 슈크로스, 0.3% 젤라이트 및 4.4 μM 2,4-디클로로페녹시아세트산(2,4-D)을 포함하는 WPM(woody plant medium) 배지인 캘러스 유도 배지가 담긴 10 X 2cm 플라스틱 페트리디쉬에 치상하여 어두운 배양실에서 25±1℃로 유지면서 3주간의 배양하여 비-배발생 캘러스를 유도하였다. 유도된 캘러스는 대부분 하얗고 반투명인 형태를 보이는 비-배발생 캘러스였으며(도 1a), 황갈색의 형태를 보이는 배발생 캘러스(도 1b)도 일부 유도되어 있었다. Milled seedlings were 10 × containing callus induction medium, a woody plant medium (WPM) medium containing 3% sucrose, 0.3% zeolite and 4.4 μM 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D). The non-embryogenic callus was induced by incubating for 3 weeks in a dark culture chamber while wound on a 2 cm plastic Petri dish. Induced callus was mostly non-embryogenic callus showing a white and translucent form (FIG. 1A), and some of the embryogenic callus showing a yellowish brown form (FIG. 1B) were also induced.

<음나무 비-배발생 캘러스 배양> <Gum non-embryonic callus culture>

하얗고 반투명인 형태를 보이는 비-배발생 캘러스를 선별하여 취한 후 WPM(woody plant medium) 배양배지에 치상하여 pH 5.0~6.0 및 24~26℃의 어두운 배양실에서 3~6 주간 배양하여, 사포닌 생산성이 증진된 음나무 세포를 대량으로 제조하였다. Non-embryogenic callus showing white and translucent morphology was screened and collected on a WPM (woody plant medium) culture medium and incubated in dark culture room at pH 5.0 ~ 6.0 and 24 ~ 26 ℃ for 3 ~ 6 weeks, resulting in saponin productivity. Enhancement yeast cells were prepared in bulk.

실시예Example 2: 음나무 비- 2: tree rain- 배발생Embryonic development 캘러스Callus 조직 관찰 Tissue observation

본 발명에 따른 음나무 비-배발생 캘러스와 비교예로서 음나무 배발생 캘러스를 광학현미경과 TEM으로 조직학적 관찰하여 비교하여 그 결과를 도 2에 나타냈다. As a comparative example, the malt embryogenic callus according to the present invention is compared with histological observation by optical microscopy and TEM, and the results are shown in FIG. 2.

구체적으로는 본 발명에 따른 음나무 비-배발생 캘러스와 비교예로서 음나무 배발생 캘러스를 각각 실온에서 24시간 동안 0.05M 인산 완충액(pH 6.8)으로 완충된 2.5% 글루타르 알데하이드 및 1.6% 파라포름알데하이드를 함유하는 고정 용액에 고정시킨 시료를 알코올 계열에서 탈수시킨 다음 Yeung (1999)에 따라 Technovit 7100 (Kulzer, Germany)에 인베드하였다. 그리고 나서 Autocut rotary microtome (RM 2165, Leica, Wetzlar GmbH, Germany)에 일회용 텅스텐 나이프로 연속 3㎛ 절편을 생성한 후, 각 절편을 톨루이딘 블루 O로 15분 동안 염색하였다. 그리고 나서 각 절편은 Leica DMR 광학현미경을 사용하여 검사하고 디지털 카메라 (Leica DC 300F) 및 Leica Application Suite 소프트웨어로 기록하였다 (도 2a: 비-배발생 캘러스 조직, 도 2c: 배발생 캘러스 조직). Specifically, 2.5% glutar aldehyde and 1.6% paraformaldehyde buffered with the non-embryonic callus according to the present invention and as the comparative example, the x-ray embryogenic callus with 0.05M phosphate buffer (pH 6.8) for 24 hours at room temperature, respectively. Samples immobilized in a fixed solution containing were dehydrated in alcohol series and then embedded in Technovit 7100 (Kulzer, Germany) according to Yeung (1999). A continuous 3 μm sections were then made on an Autocut rotary microtome (RM 2165, Leica, Wetzlar GmbH, Germany) with a disposable tungsten knife, and each section was stained with toluidine blue O for 15 minutes. Each section was then examined using a Leica DMR optical microscope and recorded with a digital camera (Leica DC 300F) and Leica Application Suite software (FIG. 2A: non-embryonic callus tissue, FIG. 2C: embryogenic callus tissue).

초미세구조(ultrastructural) 분석을 위하여, 내부 세포의 발달은 상대적으로 늦었지만 대사 활동이 높은 캘러스의 외층의 세포가 쉽게 배아를 형성할 수 있기 때문에, 캘러스 표면 세포를 사용하였다. 본 발명에 따른 음나무 비-배발생 캘러스와 비교예로서 음나무 배발생 캘러스의 표면 세포를 각각 0.05 M 소듐 카코딜레이트 버퍼(sodium cacodylate buffer)로 pH 7.2로 조정한 2% 글루타르 알데히드 용액에 예비고정하고 동일한 완충액에서 1% OsO4에 고정시키고, 탈수시키고, 수지 및 EPON 812에 순차적으로 인베드하였다. 그리고 나서 MT-X 울트라미이크로톰(ultramicrotome (RMC, Tucson, AZ, USA))으로 얻은 극미세 절편을 우라닐 아세테이트로 염색하고 이어서 시트르산납으로 염색하였다. 이미지 관찰 및 기록은 LIBRA 120 투과전자현미경 (Carl Zeiss, Germany)을 사용하여 수행하였고 그 결과를 도 2b(비-배발생 캘러스) 및 도 2d(배발생 캘러스)에 나타냈다.For ultrastructural analysis, callus surface cells were used because inner cell development was relatively slow but cells of the outer layer of callus with high metabolic activity could easily form embryos. Preliminary fixation of the surface cells of the Rhizome embryogenic callus according to the present invention and 2% glutaraldehyde solution adjusted to pH 7.2 with 0.05 M sodium cacodylate buffer, respectively, as a comparative example And fixed in 1% OsO 4 in the same buffer, dehydrated and sequentially embedded in resin and EPON 812. The ultrafine sections obtained with MT-X ultramicrotome (RMC, Tucson, AZ, USA) were then stained with uranyl acetate followed by lead citrate. Image observation and recording was performed using a LIBRA 120 transmission electron microscope (Carl Zeiss, Germany) and the results are shown in FIG. 2B (non-embryogenic callus) and FIG. 2D (embryonic callus).

도 1에 나타난 바와 같이, 음나무 비-배발생 캘러스 (NEC)는 하얗고 잘 부서지며 반투명한 반면에, 배발생 캘러스 (EC)는 황갈색, 부드럽고 콤팩트하였다. As shown in FIG. 1, Nerve non-embryonic callus (NEC) was white, well broken and translucent, whereas embryonic callus (EC) was tan, soft and compact.

도 2에 나타난 바와 같이, 세포 구조 측면에서 볼 때, 음나무 비-배발생 캘러스 (NEC)의 세포는 크고, 고도로 액포성(空胞性)이고, 작은 핵을 가지고 길쭉하게 구성되어 있었고 (도 2의 a, c), 배발생 캘러스 (EC)는 두드러진 핵 및 밀도가 높은 세포질을 가진, 작고 등축성의 세포 덩어리를 갖는 보다 조직화된 구조를 보였다 (도 2의 b 및 d).As shown in FIG. 2, in terms of cellular structure, the cells of the Rhizome non-embryonic callus (NEC) were large, highly vacuole and elongated with small nuclei (FIG. 2). a, c), embryogenic callus (EC) showed a more organized structure with a small, isometric cell mass, with a pronounced nucleus and a dense cytoplasm (FIG. 2 b and d).

실시예 3: 파이로시퀀싱 및 디노보(de novo) 어셈블리 분석Example 3: Pyro Sequencing and De novo Assembly Analysis

음나무 비-배발생 캘러스와 비교예로서 음나무 배발생 캘러스의 454 파이로시퀀싱 기술을 사용한 전사체 비교분석을 수행하였다. A transcript comparison analysis was performed using the 454 pyro sequencing technique of yeast embryogenic callus as a comparative example.

<RNA 추출, cDNA 라이브러리 구축 및 454 파이로시퀀싱>RNA Extraction, cDNA Library Construction, and 454 Pyro Sequencing

세틸트리메틸암모늄 브로마이드(cetyltrimethylammonium bromide; CTAB) 방법을 사용하여 음나무 비-배발생 캘러스와 비교예로서 음나무 배발생 캘러스 각각의 세포의 총 RNA를 추출한 후, RNeasy 컬럼 (Qiagen Ltd., Crawley, UK)으로 클린업했다. 총 RNA의 품질은 NanoDrop 분광 광도계 (Thermo, Wilmington, USA)를 사용하여 결정하였고, 260:280의 비율이 1.9에서 2.1 사이인 RNA 샘플을 분석을 위해 선택하였다. The total RNA of each cell of the Rhizome embryogenic callus as a comparative example was extracted using the cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) method, followed by RNeasy column (Qiagen Ltd., Crawley, UK). Clean up. Total RNA quality was determined using NanoDrop spectrophotometer (Thermo, Wilmington, USA) and RNA samples with a ratio of 260: 280 between 1.9 and 2.1 were selected for analysis.

Dynabeads mRNA Purification Kit와 Magnetic Particle Concentrator (MPC) (Invitrogen, Carlsbad, USA)를 사용하여 다음과 같이 음나무 비-배발생 캘러스와 비교예로서 음나무 배발생 캘러스 세포에 대한 각각의 cDNA 라이브러리를 구축하였다: Dynabeads mRNA Purification Kit and Magnetic Particle Concentrator (MPC) (Invitrogen, Carlsbad, USA) were used to construct respective cDNA libraries for leukogenic embryogenic callus and leukogenic embryogenic callus cells as a comparative example as follows:

이중 가닥 cDNAs는 cDNA 합성 시스템 키트와 400μm "무작위" Roche 프라이머(Roche, Mannheim, Germany)를 사용하여 단편 200ng의 mRNA로부터 합성하였다. 이중 가닥 cDNA의 양말단을 신속 라이브러리 (RL) 예비 키트 (Invitrogen, Carlsbad, USA)를 사용하여 복구하였다. 어댑터 연결은 1 ㎕ MID 어댑터와 1 ㎕ RL 리가제의 반응에 의해 25℃에서 10분 동안 수행하였다. AMPure XP Beads와 사이징 용액 (Beckman Coulter, CA, USA)을 사용하여 작은 단편을 제거했다. 일회용 큐벳용 TBS 380 Fluorometer를 사용하여 라이브러리 정량을 수행했다. cDNA 라이브러리의 품질은 Agilent2100 Bioanalyzer™(Agilent Technologies, CA, USA)의 High Sensitivity Chip을 사용하여 평균 단편 크기를 결정하여 평가했다. Double stranded cDNAs were synthesized from 200 ng of mRNA using a cDNA synthesis system kit and 400 μm “random” Roche primers (Roche, Mannheim, Germany). The sock end of the double stranded cDNA was repaired using the Rapid Library (RL) preliminary kit (Invitrogen, Carlsbad, USA). Adapter ligation was performed at 25 ° C. for 10 minutes by reaction of 1 μl MID adapter and 1 μl RL ligase. Small fragments were removed using AMPure XP Beads and a sizing solution (Beckman Coulter, CA, USA). Library quantitation was performed using a TBS 380 Fluorometer for disposable cuvettes. The quality of the cDNA library was evaluated by determining the average fragment size using a High Sensitivity Chip from Agilent2100 Bioanalyzer ™ (Agilent Technologies, CA, USA).

<시퀀스 트리밍(trimming), 디노보 전사체(transcriptome) 어셈블리><Sequence trimming, de novo transcriptome assembly>

상기에서 합성된 2종의 cDNA 템플릿을 에멀젼 PCR (emPCR)에 의해 증폭하였고 454 GS-FLX Titanium 플랫폼에서의 cDNA 파이로시퀀싱을 다음과 같이 수행하였다: The two cDNA templates synthesized above were amplified by emulsion PCR (emPCR) and cDNA pyrosequencing on the 454 GS-FLX Titanium platform was performed as follows:

사용자 PerlScript, SeqClean (http : //compbio.dfci. harvard.edu) 및 RepeatMasker (http://www.repeatmasker.org) 프로그램을 사용하여 어셈블리를 위한 시퀀스를 준비했다. 시퀀싱 오류로 인해 잘못된 어셈블리가 생성될 수 있기 때문에 엄격한 필터링 프로세스를 적용했다. 즉 낮은 품질의 판독(reads)은 Phred 품질 스코어가 15 이하인 컷오프 값에서 제거하였으며 그 후 라이브러리 어댑터 시퀀스, 폴리 A/T 스트레치 및 낮은 복잡성 영역을 제거하였다. 마지막으로 짧은 판독 (길이가 50 염기 미만)을 걸러냈다. 상기와 같이 전처리된 서열은 MIRA (버전 3.2.1) 등을 사용하여 어셈블리하였다. The sequences for assembly were prepared using the user PerlScript, SeqClean (http://compbio.dfci.harvard.edu) and RepeatMasker (http://www.repeatmasker.org) programs. We applied a rigorous filtering process because sequencing errors can create invalid assemblies. That is, low quality reads were removed from cutoff values with a Phred quality score of 15 or less, followed by library adapter sequences, poly A / T stretch and low complexity regions. Finally we filtered out short readings (less than 50 bases in length). The pretreated sequences were assembled using MIRA (version 3.2.1) and the like.

이 cDNA의 파이로시퀀싱은 음나무 비-배발생 캘러스(NEC)로부터 269,692개의 원시 판독(raw reads)과 배발생 캘러스(EC로)부터의 281,714개의 원시 판독을 생성하였다(표 1).Pyro sequencing of this cDNA produced 269,692 raw reads from Infertile Calligenic Callus (NEC) and 281,714 raw reads from Embryonic Callus (in EC) (Table 1).

  배발생Embryonic development 비-배발생Non-embryogenesis Sequencing Sequencing Total number of raw readsTotal number of raw reads 281,714281,714 269,692269,692 Total length of sequencing reads Total length of sequencing reads 91,158,58691,158,586 86,620,00486,620,004 Average read length (bp)Average read length (bp) 323.6323.6 321.2321.2 Maximum read length (bp)Maximum read length (bp) 927927 942942 TrimmingTrimming Total number of raw readsTotal number of raw reads 204,164204,164 168,065168,065 Total length of sequencing reads Total length of sequencing reads 66,133,22166,133,221 54,494,25754,494,257 Average read length (bp)Average read length (bp) 323.9323.9 324.2324.2 Maximum read length (bp)Maximum read length (bp) 740740 751751 De Novo De novo AssemblyAssembly All assembled unigenesAll assembled unigenes 80,28080,280 63,12863,128 Number of contig (by MIRA)Number of contig (by MIRA) 25,84125,841 20,52120,521 Number of reads assembledNumber of reads assembled 149,725149,725 125,459125,459 The sequence depthThe sequence depth 5.85.8 6.16.1 Average length of contigs (bp)Average length of contigs (bp) 749.1749.1 745.0745.0 N50 of contigs (bp)N50 of contigs (bp) 827827 817817 Number of contig with >500bp Number of contig with> 500 bp 19,07719,077 15,20315,203 Number of singletonsNumber of singletons 54,44054,440 42,60742,607 Average length of singletons (bp)Average length of singletons (bp) 248.1248.1 245.5245.5 AnnotationAnnotation NCBI-NRNCBI-NR 45,832 45,832 35,194 35,194 UniProtUniProt 47,714 47,714 38,890 38,890 COGCOG 42,919 42,919 37,55737,557 All annotated unigenesAll annotated unigenes 48,97448,974 39,90039,900

<주석(Annotation)><Annotation>

위에서 어셈블리된 유니진은 E-value 1e-5의 역치를 갖는 BLASTX 알고리즘을 사용하여 COG, UniProtKB 및 NCBI-NR과 같은 3가지 데이터베이스에 대한 서열과 비교하여 주석처리를 수행하였고, 그 결과 음나무 비-배발생 캘러스의 경우 39,900개와 배발생 캘러스의 경우 48,974개를 확인하였다 (표 1). Unijin assembled above was annotated using the BLASTX algorithm with a threshold of E-value 1e-5 compared to the sequences for three databases, such as COG, UniProtKB, and NCBI-NR, resulting in a non-negative non- 39,900 embryogenic callus and 48,974 embryogenic callus were identified (Table 1).

<유전자 온톨로지 (GO) 분류>Gene Ontology (GO) Classification

GO-기반 기능 분류는 분자 기능, 생물학적 과정 및 세포 성분 온톨로지에 따라 Blast2GO 프로그램을 사용하여, 각 어셈블리된 유니진이 세 가지 주요 GO 범주와 35 가지 하위 범주로 할당될 수 있었고, 그 결과를 도 3에 나타내었다. GO-based functional classification uses the Blast2GO program according to molecular function, biological process, and cellular component ontology, allowing each assembled Unigene to be assigned to three main GO categories and 35 subcategories, and the results are shown in FIG. Indicated.

상기 표 1 및 도 3으로부터 음나무 비-배발생 캘러스와 비교예로서 음나무 배발생 캘러스 세포는 전사체(유전자)가 차등 발현된다는 것을 확인할 수 있다. 특히 생물학적 프로세스가 가장 두드러졌다. From Table 1 and FIG. 3, it can be confirmed that the transcripts (genes) are differentially expressed in the Rhizome non-embryonic callus cells and the Rhizome embryogenic callus cells as a comparative example. In particular, biological processes were most prominent.

실시예 4: 차등 발현된 유전자(DEGs)의 동정과 특성 규명Example 4 Identification and Characterization of Differential Expressed Genes (DEGs)

상기에서 차등 발현된 유전자(DEGs)를 다음과 같이 확인하고 농축(enrichment) 분석하였다. The differentially expressed genes (DEGs) were identified as follows and analyzed by enrichment.

유니진은 그들의 접근번호에 의해 클러스터하였고 각 유니진에 상응하는 판독의 합계 또한 정량화하였다. 라이브러리 크기와 유전자 길이의 차이에 따라 판독의 수를 정규화했다. 차등 발현된 유전자(DEGs)의 확인은: 1) NEC와 EC 라이브러리 간의 유전자 발현의 차이와 2) 그 차이의 유의 수준을 취함으로써 수행하였다. 차등 발현된 유전자가 풍부하게 농축된 GO 항목(term)의 농축 분석은 다중 검사를 위한 Benjamini-Hochberg 수정된 초고지(hypergeometric) 검정법에 의해 결정하였다. 모든 DEGs는 주석을 기반으로 GO 항목으로 맵핑되었고, NooKaew 등이 개발한 방법을 사용하여 농축된 GO 항목의 조정된 p-값으로 전환후, R 프로그램의 히트맵 기능을 사용하여 히트맵을 완성하였고, 그 결과를 표 2와 도 4에 나타냈다. Unijins clustered by their access number and also quantified the sum of readings corresponding to each unijin. The number of reads was normalized according to the difference in library size and gene length. Identification of differentially expressed genes (DEGs) was performed by 1) taking the difference in gene expression between the NEC and EC libraries and 2) taking the significance level of the difference. Concentration analysis of GO term enriched in differentially expressed genes was determined by Benjamini-Hochberg modified hypergeometric assay for multiple testing. All DEGs were mapped to GO entries based on annotations, converted to adjusted p-values of the concentrated GO items using a method developed by NooKaew et al. The results are shown in Table 2 and FIG. 4.

CategoryCategory 유니진 수Unijin number GO-IDGO-ID GO-termGO-term ECEC NECNEC Biological processBiological process GO:0008152GO: 0008152 Metabolic processMetabolic process 19,73519,735 16,51016,510 GO:0050896GO: 0050896 Response to stimulusResponse to stimulus 8,6848,684 7,4487,448 GO:0009987GO: 0009987 Cellular processCellular process 15,45615,456 12,09412,094 GO:0032502GO: 0032502 Developmental processDevelopmental process 5,6195,619 4,0924,092 GO:0065007GO: 0065007 Biological regulationBiological regulation 7,5117,511 5,8605,860 GO:0000003GO: 0000003 ReproductionReproduction 3,3963,396 2,4142,414 GO:0032501GO: 0032501 Multicellular organismal processMulticellular organismal process 5,4375,437 3,9593,959 GO:0071840GO: 0071840 Cellular component organization or biogenesisCellular component organization or biogenesis 5,0785,078 3,7123,712 GO:0051179GO: 0051179 LocalizationLocalization 4,8974,897 4,2664,266 GO:0023052GO: 0023052 SignalingSignaling 2,7342,734 2,3032,303 GO:0040007GO: 0040007 GrowthGrowth 1,2451,245 1,0281,028 GO:0008283GO: 0008283 Cell proliferationCell proliferation 353353 219219 GO:0016265GO: 0016265 DeathDeath 391391 405405 GO:0051704GO: 0051704 Multi-organism processMulti-organism process 314314 220220 GO:0016032GO: 0016032 Viral reproductionViral reproduction 6363 4646 Molecular functionMolecular function GO:0005488GO: 0005488 BindingBinding 18,27018,270 15,03515,035 GO:0003824GO: 0003824 Catalytic activityCatalytic activity 17,19517,195 14,93414,934 GO:0005215GO: 0005215 Transporter activityTransporter activity 2,0922,092 1,7821,782 GO:0005198GO: 0005198 Structural molecule activityStructural molecule activity 1,0191,019 782782 GO:0001071GO: 0001071 Nucleic acid binding transcription factor activityNucleic acid binding transcription factor activity 704704 544544 GO:0030234GO: 0030234 Enzyme regulator activityEnzyme regulator activity 384384 333333 GO:0009055GO: 0009055 Electron carrier activityElectron carrier activity 379379 445445 GO:0060089GO: 0060089 Molecular transducer activityMolecular transducer activity 424424 346346 GO:0004872GO: 0004872 Receptor activityReceptor activity 148148 146146 GO:0016209GO: 0016209 Antioxidant activityAntioxidant activity 161161 195195 GO:0045735GO: 0045735 Nutrient reservoir activityNutrient reservoir activity 2828 1212 GO:0045182GO: 0045182 Translation regulator activityTranslation regulator activity 1414 1818 GO:0031386GO: 0031386 Protein tagProtein tag 00 33 Cellular componentsCellular components GO:0005623GO: 0005623 CellCell 25,75625,756 20,92620,926 GO:0043226GO: 0043226 OrganelleOrganelle 19,33019,330 15,48315,483 GO:0016020GO: 0016020 MembraneMembrane 6,6646,664 5,7105,710 GO:0032991GO: 0032991 Macromolecular complexMacromolecular complex 6,1616,161 4,8684,868 GO:0005576GO: 0005576 Extracellular regionExtracellular region 1,3331,333 1,3111,311 GO:0031974GO: 0031974 Membrane-enclosed lumenMembrane-enclosed lumen 2,6412,641 1,8951,895 GO:0031012GO: 0031012 Extracellular matrixExtracellular matrix 66 33

상기 표 2와 도 3에 나타난 바와 같이, 디지털 발현 프로파일링 분석은 13,766 DEGs를 확인하였으며, 그 중 4,895 및 5,820개의 유전자가 각각 EC 및 NEC에서 특이적으로 발현되었다. 나머지 3,051 DEGs는 공통적으로 발현되었지만 두 개의 라이브러리 사이에는 발현 수준이 2배 이상 차이가 있었다 (p <0.001). 13,766 DEGs를 이용한 유전자 농축 분석 결과, 35개의 GO 항목이 EC와 NEC 사이에 유의한 차이를 보였다 (p <0.001) (도 4).As shown in Table 2 and FIG. 3, digital expression profiling analysis identified 13,766 DEGs, of which 4,895 and 5,820 genes were specifically expressed in EC and NEC, respectively. The remaining 3,051 DEGs were expressed in common but there was a more than twofold difference in expression levels between the two libraries (p <0.001). As a result of gene enrichment analysis using 13,766 DEGs, 35 GO items showed a significant difference between EC and NEC (p <0.001) (FIG. 4).

특히 이차대사 과정에 관여하는 유전자(GO: 0019748)는 NEC에서 특이적이거나 과발현되었음을 확인할 수 있다 (도 4).In particular, genes involved in the secondary metabolic process (GO: 0019748) can be confirmed that the specific or overexpressed in NEC (Fig. 4).

더 구체적으로 확인하고자 EC에 비하여 NEC에서 많이 발현되는 10가지 전사체를 검정하여 표 3에 나타내었다.To confirm in more detail, 10 transcripts expressed much in NEC compared to EC were assayed and shown in Table 3.

Contig IDContig ID Annotation IDAnnotation ID No of readsNo of reads DescriptionDescription ECEC NECNEC EPT001TT0427C001067EPT001TT0427C001067 ACN96317ACN96317 33 949949 Class 1 chitinaseClass 1 chitinase EPT001TT0427C011401EPT001TT0427C011401 AAC62510AAC62510 1One 219219 Metallothionein-1-likeMetallothionein-1-like EPT001TT0427C011059EPT001TT0427C011059 AEY75220AEY75220 1One 195195 Cytochrome P450 Cytochrome P450 EPT001TT0427C013752EPT001TT0427C013752 YP_005090323YP_005090323 22 126126 Putative p-coumarate 3-hydroxylasePutative p-coumarate 3-hydroxylase EPT001TT0427C001895EPT001TT0427C001895 ACD45060ACD45060 1One 123123 Beta-1,3-glucanaseBeta-1,3-glucanase EPT001TT0427C001116EPT001TT0427C001116 XP_002517441XP_002517441 1One 113113 ATP binding proteinATP binding protein EPT001TT0427C000406EPT001TT0427C000406 XP_002264896XP_002264896 22 109109 Root phototropism protein 2Root phototropism protein 2 EPT001TT0427C013102EPT001TT0427C013102 JN604544JN604544 1One 106106 Cytochrome P450 Cytochrome P450 EPT001TT0427C000759EPT001TT0427C000759 XM_002264642XM_002264642 1One 9999 Beta-glucosidase 46-likeBeta-glucosidase 46-like EPT001TT0427C002999EPT001TT0427C002999 ACL31667ACL31667 1One 7676 4-coumarate coenzyme A ligase4-coumarate coenzyme A ligase

표 3에 나타낸 바와 같이, NEC에서는 두 개의 시토크롬 P450, 추정 p-쿠마레이트 3- 히드록실라제 및 4-쿠마레이트 보효소 A 리가제 등의 이차대사 과정에 관여하는 여러 유전자, 산화 스트레스 관련 유전자가 EC에 비하여 현저하게 높게 발현되었음을 알 수 있다.As shown in Table 3, in NEC, several genes involved in secondary metabolic processes, such as two cytochrome P450s, putative p-coumarate 3-hydroxylase and 4-coumarate coenzyme A ligase, and oxidative stress-related genes are identified. It can be seen that the expression is significantly higher than the EC.

실시예 4: RT-qPCR에 의한 유전자 발현 확인Example 4: Confirmation of Gene Expression by RT-qPCR

음나무 사포닌의 생합성 경로에 다음과 같다: Biosynthetic pathways of cypress saponins are as follows:

Figure 112017102697984-pat00001
Figure 112017102697984-pat00001

음나무 사포닌의 합성에서 첫번째 단계는 스쿠알렌 에폭시다제(Squalene epoxidase)에 의해 촉매되고, 후속 단계는 시토크롬 P450 (Cytochrome P450; CYP) 효소 및 UDP-글리코실 트랜스퍼라제 (GT)에 의한 트리테르펜 골격의 후속 산화 및 글리코실화로부터 각각 합성된다. CYP는 광범위한 생합성 경로에서 유기 물질의 산화를 촉매하는 모노옥시게나제의 크고 다양한 수퍼패밀리이다. CYP는 트리테르펜 스카폴드(triterpene scaffold; 사포게닌이라고 불리는 사포닌의 아글리콘 부분)의 기능화에 핵심적인 역할을 한다. The first step in the synthesis of saponin saponins is catalyzed by Squalene epoxidase and the subsequent step is subsequent oxidation of the triterpene backbone by cytochrome P450 (CYP) enzyme and UDP-glycosyl transferase (GT) And glycosylation, respectively. CYP is a large and diverse superfamily of monooxygenases that catalyze the oxidation of organic materials in a wide range of biosynthetic pathways. CYP plays a key role in the functionalization of triterpene scaffolds (the aglycone portions of saponins called saponins).

따라서 음나무 사포닌의 생합성 경로에 관여하는 상기 스쿠알렌 에폭시다제, 시토크롬 P450 (CYP) 효소 및 UDP-글리코실 트랜스퍼라제 (GT)에 해당하는 5가지 전사체의 발현량을 NEC와 EC에서 비교분석하였다. Therefore, the expression levels of the five transcripts corresponding to the squalene epoxidase, cytochrome P450 (CYP) enzyme, and UDP-glycosyl transferase (GT), which are involved in the biosynthetic pathway of Japanese saponin, were compared in NEC and EC.

<RNA 분리 및 실시간 PCR 분석><RNA isolation and real time PCR analysis>

총 RNA는 TRI 시약 (Molecular Research Center, USA)을 사용하여 추출하였고, 실시간 정량 PCR (RT-qPCR) 프라이머는 Primer3 프로그램 (http: // fokker.wi.mit.edu)에 의해 표 4와 같이 디자인하여 사용하였다. Total RNA was extracted using TRI reagents (Molecular Research Center, USA), and real-time quantitative PCR (RT-qPCR) primers were designed as shown in Table 4 by the Primer3 program (http://fokker.wi.mit.edu). Was used.

Contig IDContig ID DescriptionDescription ForwardForward ReverseReverse EPT001TT0427C001363EPT001TT0427C001363 Squalene epoxidase2 (SE2) mRNASqualene epoxidase2 (SE2) mRNA TTTTTTCATAATGGCCGTTTCATTTTTTTCATAATGGCCGTTTCAT TTTCCATTTTTGGCCTTGTATTGTTTCCATTTTTGGCCTTGTATTG EPT001TT0427C001289EPT001TT0427C001289 UDP-glucosyltransferase, putative, mRNAUDP-glucosyltransferase, putative, mRNA TTTTGGCTAGCCTTTGTTCACTTTTTTGGCTAGCCTTTGTTCACTT TTTGGAAGGCGGTCAATATTTCTTTTGGAAGGCGGTCAATATTTCT EPT001TT0427C000589EPT001TT0427C000589 Cytochrome P450 mRNA, complete cdsCytochrome P450 mRNA, complete cds ATTGTTGATTGAGGTGGTGGAAGATTGTTGATTGAGGTGGTGGAAG ATACTCATCCCCGTGACATACTCATACTCATCCCCGTGACATACTC EPT001TT0427C001063EPT001TT0427C001063 Cytochrome P450 mRNACytochrome P450 mRNA AAAACTCCCCAAAGAATGTAGGGAAAACTCCCCAAAGAATGTAGGG AAAGTTCAAAAGTCTCCGCGTTAAAAGTTCAAAAGTCTCCGCGTTA EPT001TT0427C007998EPT001TT0427C007998 Cytochrome P450 mRNACytochrome P450 mRNA ATAGATAGATGCACTGCGAGGATATAGATAGATGCACTGCGAGGAT ATTAGTCTTGCTCCGATTCATTGATTAGTCTTGCTCCGATTCATTG

유전자 발현 수준은 2-△△Ct 방법으로 결정하였다. 첫번째 가닥 cDNA는 PrimeScript RT Reagent Kit(Takara, Japan)로 합성하였고 RT-qPCR은 SYBR Green PCR Master Mix (BioRad laboratories, USA)를 사용하여 제조자의 지시에 따라 수행하였다. RT-qPCR은 DNA Engine OpticonTM 연속 형광 검출 시스템 (MJ Research Inc., Walthan, MA)을 사용하여 수행하였다.Gene expression levels were determined by the 2-ΔΔCt method. The first strand cDNA was synthesized with PrimeScript RT Reagent Kit (Takara, Japan) and RT-qPCR was performed using the SYBR Green PCR Master Mix (BioRad laboratories, USA) according to the manufacturer's instructions. RT-qPCR was performed using a DNA Engine Opticon Continuous Fluorescence Detection System (MJ Research Inc., Walthan, Mass.).

각 PCR 혼합물은 cDNA 1 ㎕, 2 x SYBR Green PCR 마스터 믹스 10 ㎕, 최종 PCR 반응 믹스 20 ㎕에서 각 PCR 프라이머 (10 μM) 1 ㎕, nuclease-free water 7 ㎕를 포함하도록 하였다. 증폭을 위한 사이클링 조건은 95℃에서 30분, 40℃에서 30초, 60℃에서 30초, 72℃에서 30초의 40 사이클로 하였고, 그 결과를 도 5a~도 5c에 나타냈다. Each PCR mixture was made to contain 1 μl of cDNA, 10 μl of 2 × SYBR Green PCR master mix, 1 μl of each PCR primer (10 μM) and 7 μl of nuclease-free water in 20 μl of the final PCR reaction mix. Cycling conditions for amplification were 40 cycles of 30 minutes at 95 ℃, 30 seconds at 40 ℃, 30 seconds at 60 ℃, 30 seconds at 72 ℃, the results are shown in Figures 5a to 5c.

도 5a~도 5c에 나타난 바와 같이, NEC에서 스쿠알렌 에폭시다제(Squalene epoxidase)는 10배 이상 발현이 증진되었고, 3종의 시토크롬 P450(CYP) 중 2종은 NEC에서만 발현이 확인되고, 나머지 1종의 경우도 발현이 현저히 증진되었으며, UDP-글리코실 트랜스퍼라제(GT)도 NEC에서 발현이 3배 이상 증진되었음이 확인된다. 결과적으로 NEC의 음나무 세포에서는 사포닌의 생산성이 현저히 증진됨을 알 수 있다. As shown in Figures 5a to 5c, Squalene epoxidase is more than 10 times the expression in NEC, two of the three cytochrome P450 (CYP) is confirmed only in NEC, the other one In addition, the expression was significantly enhanced, UDP-glycosyl transferase (GT) also confirmed that more than three times the enhanced expression in the NEC. As a result, it can be seen that the productivity of saponin is significantly enhanced in NEC cells.

<110> National Institute of Forest Science <120> Method for enhancing saponin of Kalopanax septemlobus cell <130> P-10183 <160> 10 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Squalene epoxidase2 (SE2) mRNA forward primer <400> 1 ttttttcata atggccgttt cat 23 <210> 2 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Squalene epoxidase2 (SE2) mRNA reverse primer <400> 2 tttccatttt tggccttgta ttg 23 <210> 3 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> UDP-glucosyltransferase mRNA forward primer <400> 3 ttttggctag cctttgttca ctt 23 <210> 4 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> UDP-glucosyltransferase mRNA reverse primer <400> 4 tttggaaggc ggtcaatatt tct 23 <210> 5 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cytochrome P450 mRNA 1 forward primer <400> 5 attgttgatt gaggtggtgg aag 23 <210> 6 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cytochrome P450 mRNA 1 reverse primer <400> 6 atactcatcc ccgtgacata ctc 23 <210> 7 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cytochrome P450 mRNA 2 forward primer <400> 7 aaaactcccc aaagaatgta ggg 23 <210> 8 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cytochrome P450 mRNA 2 reverse primer <400> 8 aaagttcaaa agtctccgcg tta 23 <210> 9 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cytochrome P450 mRNA 3 forward primer <400> 9 atagatagat gcactgcgag gat 23 <210> 10 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cytochrome P450 mRNA 3 reverse primer <400> 10 attagtcttg ctccgattca ttg 23 <110> National Institute of Forest Science <120> Method for enhancing saponin of Kalopanax septemlobus cell <130> P-10183 <160> 10 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Squalene epoxidase2 (SE2) mRNA forward primer <400> 1 ttttttcata atggccgttt cat 23 <210> 2 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Squalene epoxidase2 (SE2) mRNA reverse primer <400> 2 tttccatttt tggccttgta ttg 23 <210> 3 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> UDP-glucosyltransferase mRNA forward primer <400> 3 ttttggctag cctttgttca ctt 23 <210> 4 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> UDP-glucosyltransferase mRNA reverse primer <400> 4 tttggaaggc ggtcaatatt tct 23 <210> 5 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> Cytochrome P450 mRNA 1 forward primer <400> 5 attgttgatt gaggtggtgg aag 23 <210> 6 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> Cytochrome P450 mRNA 1 reverse primer <400> 6 atactcatcc ccgtgacata ctc 23 <210> 7 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> Cytochrome P450 mRNA 2 forward primer <400> 7 aaaactcccc aaagaatgta ggg 23 <210> 8 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> Cytochrome P450 mRNA 2 reverse primer <400> 8 aaagttcaaa agtctccgcg tta 23 <210> 9 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> Cytochrome P450 mRNA 3 forward primer <400> 9 atagatagat gcactgcgag gat 23 <210> 10 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> Cytochrome P450 mRNA 3 reverse primer <400> 10 attagtcttg ctccgattca ttg 23

Claims (8)

음나무 세포의 사포닌 생성 관련 효소들의 발현을 증진시키는 방법으로, 상기 방법은
ⅰ) 음나무의 종자를 살균하여 도정하는 단계;
ⅱ) 상기 도정된 종자를 옥신류 식물성장호르몬이 4~5 μM로 포함된 배지에서 배양하여 캘러스를 유도하는 단계; 및
ⅲ) 비-배발생(non-embryogenic) 캘러스를 선별하여 배양배지에 치상하여 pH 5.0~6.0 및 24~26 ℃의 어두운 배양실에서 3~6 주간 배양하는 단계를 포함하고,
상기 사포닌 생성 관련 효소들은 스쿠알렌 에폭시다제, 시토크롬 P450, 및 UDP-글리코실 트랜스퍼라제인 것인 방법.
In a method for enhancing the expression of saponin production-related enzymes in the cell,
Iii) sterilizing and seeding seeds of the tree;
Ii) inducing callus by culturing the seed sown in a medium containing 4-5 μM of auxin plant growth hormone; And
Iii) selecting a non-embryogenic callus and placing it on the culture medium to incubate for 3 to 6 weeks in a dark culture room at pH 5.0 to 6.0 and 24 to 26 ℃,
The saponin production related enzymes are squalene epoxidase, cytochrome P450, and UDP-glycosyl transferase.
제 1항에 있어서, 옥신류 식물성장호르몬은 2,4-디클로로페녹시아세트산 인 것을 특징으로 하는 음나무 세포의 사포닌 생성 관련 효소들의 발현을 증진시키는 방법.
The method of claim 1, wherein the auxin plant growth hormone is 2,4-dichlorophenoxyacetic acid.
제 1항에 있어서, 비-배발생 캘러스 유도는 4.4 μM 2,4-디클로로페녹시아세트산(2,4-D), 3% 슈크로스, 0.3% 젤라이트를 함유하는 WPM(woody plant medium) 배지에 치상하여 이루어지는 것을 특징으로 하는 음나무 세포의 사포닌 생성 관련 효소들의 발현을 증진시키는 방법.
The method of claim 1, wherein the non-embryogenic callus induction is woody plant medium (WPM) medium containing 4.4 μM 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D), 3% sucrose, 0.3% gelite. A method for enhancing the expression of saponin production-related enzymes of a lactose cell, which is made in tooth.
제 1항에 따른 방법에 의해 음나무 세포의 사포닌 생성 관련 효소들의 발현이 증진된 음나무 세포 조성물로,
상기 사포닌 생성 관련 효소들은 스쿠알렌 에폭시다제, 시토크롬 P450, 및 UDP-글리코실 트랜스퍼라제인 것인 음나무 세포 조성물.
According to claim 1 by the method according to claim 1 to increase the expression of saponin production-related enzymes in the cell
The saponin production-related enzymes are squalene epoxidase, cytochrome P450, and UDP-glycosyl transferase will be.
삭제delete 제 4항에 따른 음나무 세포 조성물 또는 이의 추출물을 포함하는 식품.
Food comprising the cell composition of claim 4 or an extract thereof.
제 4항에 따른 음나무 세포 조성물 또는 이의 추출물을 포함하는 화장품.Cosmetics comprising the wooden cell composition according to claim 4 or an extract thereof. 삭제delete
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