KR101886379B1 - Method for detecting rapidly yeast growing in presence of a carbonic acid and detection kit - Google Patents

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Abstract

The present invention relates to a method for rapidly detecting yeast capable of growing in the presence of carbonic acid using a real-time PCR technique and a detection kit and, more specifically, to a real-time PCR technique using primer sets of SEQ ID NOs: 1 to 3 and probes of SEQ ID NOs: 4 to 8. By using the real-time PCR, it is possible to rapidly detect Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces spp., Zygosaccharomyces spp., and Dekkera spp. which are yeast strains capable of growing in the presence of carbonic acid.

Description

탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법 및 검출키트{Method for detecting rapidly yeast growing in presence of a carbonic acid and detection kit}Technical Field [0001] The present invention relates to a method for rapidly detecting a yeast capable of growing in a carbonic acid condition,

본 발명은 Real-Time PCR 기법을 이용한 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법 및 검출키트에 관한 것으로, 보다 구체적으로 서열번호 1 내지 3의 프라이머 세트, 및 서열번호 4 내지 8의 프로브를 이용한 Real-Time PCR 기법에 관한 것이다. 이는 Real-Time PCR를 이용하여, 탄산 조건에서 생장 가능한 효모 균주인 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae ), 시조사카로마이세스 속 균주( Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주( Dekkera spp.)를 동시에 신속하게 검출할 수 있다.The present invention relates to a rapid detection method and a detection kit for yeast capable of growing in a carbonic acid condition using a Real-Time PCR technique, more specifically, to a primer set of SEQ ID Nos: 1 to 3 and a Real -Time PCR technique. Using Real-Time PCR, the Saccharomyces cerevisiae strain Saccharomyces , a yeast strain capable of growing under carbonic acid conditions, cerevisiae), my process in a progenitor strain Saccharomyces (Schizosaccharomyces spp .), Zygosaccharomyces spp ., and Te Keraton spp (Dekkera spp .) can be simultaneously detected quickly.

탄산음료는 제품의 특성상 산도가 높고 산소량이 희박하다. 이런 조건에서 생장할 수 있는 미생물은 몇 없으며, 대표적으로는 효모가 해당된다. 현재 900여종의 효모가 분류학상으로 존재하나 모든 효모가 탄산조건에서 생장 가능한 것은 아니다. 탄산음료가 탄산 조건 내에서 생장이 가능한 효모에 의해 오염이 될 경우 제품의 팽창 및 이취유발, 제품의 변색 등의 문제가 발생할 수 있다.Carbonated beverages have high acidity and low oxygen content due to the nature of the product. There are few microorganisms that can grow under these conditions, and yeast is a typical example. Currently, there are about 900 kinds of yeast, but not all yeast can grow under carbonation conditions. If the carbonated beverage is contaminated by a yeast capable of growing in a carbonated condition, problems such as swelling of the product, generation of odor and discoloration of the product may occur.

데이븐포트(Davenport)는 청량음료 제조 공장에서 검출 가능한 효모를 총 4개의 그룹으로 효모를 나누었다. 그룹 1은 내 삼투압성(탄산 조건), 강한 발효력, 보존료에 대한 저항성을 가지는 효모로 데케라 아노말라(Dekkera anomala ), 데케라 브루쉘렌시스(Dekkera bruxellensis ), 데케라 나데내시스( Dekkera naardenensis ), 사카로마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae ), 사카로마이세스 폼베 (Schizosaccharomyces pombe ), 자이고사카로마이세스 바일리( Zygosaccharomyces bailii), 자이고사카로마이세스 비스포러스( Zygosaccharomyces bisporus ), 자이고사카로마이세스 렌터스( Zygosaccharomyces lentus ), 자이고사카로마이세스 로우시(Zygosaccharomyces rouxii )가 포함된다. Davenport divides yeast into four groups of yeast that can be detected in a soft drink manufacturing plant. Group 1 is a yeast strain resistant to osmotic pressure (carbonic conditions), strong fermentation ability, and preservatives. Dekkera anomala), having Mosquera Brewer swelren sheath (Dekkera bruxellensis), having Mosquera or denae sheath (Dekkera naardenensis ), Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces pombe , Zygosaccharomyces cerevisiae , A bar with a point (Zygosaccharomyces bailii), Jai Mai Kosaka access Service porous (Zygosaccharomyces bisporus ), Zygosaccharomyces Rentas ( Zygosaccharomyces lentus ), Zygosaccharomyces Include low when (Zygosaccharomyces rouxii).

여기서, 그룹 1에 해당하는 효모는 제품 내 1개의 세포(Cell)에만 존재하여도 제품에서 생장이 가능하여 제품의 팽창 및 이취유발, 제품의 변색 등의 문제 일으킬 수 있다. 그룹 2, 그룹 3, 그룹 4는 공장의 위생 관리에 대한 지표 세균으로 제품에서 생장은 불가능한 효모들을 나눈 것이다. Here, even if the yeast belonging to Group 1 exists only in one cell in the product, it is possible to grow the product, which may lead to swelling and odor generation of the product and discoloration of the product. Group 2, Group 3 and Group 4 are indicator bacteria for hygienic management of factories, divided by yeast, which is impossible to grow in the product.

한편, 한국 등록특허 제10-1562491호, 제10-1498768호는 Real-time PCR을 이용한 특정 균주의 검출방법에 관한 것으로, Real-time PCR(Polymerase chain reaction) 은 thermal cycler와 분광 형광 광도계가 일체화된 장치로, 실시간으로 PCR 증폭산물의 생성과정을 모니터링 하여 타겟 DNA(target DNA)의 양을 분석하는 장비이다. Real-time PCR은 PCR 증폭 산물의 확인을 위한 전기 영동이 필요 없으며, 증폭이 지수함수적으로 일어나는 영역에서 증폭 산물량을 비교하여 보다 정확한 정량이 가능한 신속성과 정량성이 뛰어난 방법이다. 실제로, 유전자 발현, gene copy assay, genotyping, 등에서 시료에 있는 타겟 유전자(target gene)에 대한 정확한 양 측정에 이용되는 중요한 수단(tool)이라 할 수 있다.Korean Patent No. 10-1562491 and No. 10-1498768 relate to a method for detecting a specific strain using real-time PCR. In a real-time PCR (polymerase chain reaction), a thermal cycler and a spectroscopic fluorescence spectrometer are integrated It is a device that analyzes the amount of target DNA (target DNA) by monitoring the production process of PCR amplification product in real time. Real-time PCR does not require electrophoresis for confirmation of PCR amplification products, and it is a method that is more rapid and quantitative that can quantify more precisely by comparing amplification products in the region where amplification occurs exponentially. Indeed, it is an important tool used for accurate quantification of target genes in samples from gene expression, gene copy assays, genotyping, and so on.

상기 언급한 그룹 1에 해당하는 효모는 원재료 및 제조 라인에 존재 하지 않도록 확실히 관리 하여야 한다. 위의 효모들은 원료와 라인 스왑을 통해 PDA 배지 등에서 배양가능하나 형태학적으로 동정이 불가능하고, 배지에서 생장한 효모 콜리니(Colony)의 수가 많을 경우 모든 콜로니(Colony)의 유전동정을 실시하기에 시간과 비용이 많이 들어 위생관리 방안으로 현실적이지 못하다. 따라서 탄산 조건에서 생장 가능한 효모를 한번에 정성 검사할 수 있는 Real-time PCR법을 개발하여 제조공장에서 효율적으로 위생관리 할 수 있는 방안을 마련하고자 한다.The yeast of Group 1 mentioned above should be controlled so as not to exist in the raw materials and the production line. The above yeasts can be cultured on PDA medium through raw material and line swap. However, when the number of yeast colonies grown on the medium is not morphologically identifiable, all the colonies are identified. It is not realistic as hygiene management plan because it is time and expense. Therefore, we have developed a real-time PCR method that can qualitatively test the yeast that can grow in carbonic acid condition at once.

이에 본 발명자들은 탄산 조건에서 생장 가능한 효모를 동시에 검출할 수 있는 새로운 프라이머 세트를 제작하고, 이를 바탕으로 특이적인 프로브를 디자인하여 Real-time PCR을 수행한 결과, 탄산 조건에서 생장 가능한 4종의 효모인 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae ), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주( Zygosaccharomyces spp.), 테케라 속 균주( Dekkera spp.)의 존재 유무를 동시에 정확하게 확인 가능함을 알게 되어 본 발명을 완성하였다. Therefore, the present inventors prepared a new primer set capable of simultaneously detecting yeast capable of growing under carbonic acid conditions, and designed a specific probe on the basis of the prepared primer set. As a result, real-time PCR was carried out. As a result, In Saccharomyces cerevisiae strains ( Saccharomyces cerevisiae), my process in a progenitor strain Saccharomyces (Schizosaccharomyces spp.), my process in strain with Xi Kosaka (Zygosaccharomyces spp.), and Te Keraton spp (Dekkera spp .) at the same time can be confirmed accurately. Thus, the present invention has been completed.

따라서, 본 발명은 탄산 조건에서 생장 가능한 4종의 효모를 동시에 신속 검출하는 방법을 제공하는 것이다. Accordingly, the present invention provides a method for rapidly detecting four yeasts capable of growing under carbonic acid conditions.

또한, 본 발명은 탄산 조건에서 생장 가능한 4종의 효모의 검출키트를 제공하는데 있다.In addition, the present invention is to provide a kit for detecting four yeasts capable of growing under carbonic acid conditions.

위와 같은 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 (a) 시료(sample)로부터 유전체 DNA를 추출하는 단계; (b) 상기 추출된 유전체 DNA, 서열번호 1 내지 3의 프라이머 세트, 및 서열번호 4 내지 8의 프로브를 포함하는 실시간 중합효소연쇄반응(Real-Time Polymerase Chain Reaction)액을 제조하는 단계; 및 (c) 실시간 중합효소연쇄반응을 수행하는 단계를 포함하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법을 제공한다. In order to solve the above-mentioned problems, the present invention provides a method for producing a DNA probe, comprising the steps of: (a) extracting a genomic DNA from a sample; (b) preparing a real-time polymerase chain reaction solution containing the extracted genomic DNA, the primer set of SEQ ID NOS: 1 to 3, and the probes of SEQ ID NOS: 4 to 8; And (c) performing a real-time PCR reaction under carbonic acid conditions.

또한 본 발명은 서열번호 1 내지 3의 프라이머 세트 및 서열번호 4 내지 8의 프로브를 포함하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 검출키트를 제공한다.The present invention also provides a kit for detecting yeast capable of growing under carbonic acid conditions, comprising the primer set of SEQ ID NOS: 1 to 3 and the probes of SEQ ID NOS: 4 to 8.

본 발명은 탄산음료 등 탄산 조건에서도 생장 가능한 대표적인 효모 균주로서, 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae ), 시조사카로마이세스 속 균주( Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주( Dekkera spp.)의 존재 유무를 신속하게 확인할 수 있어, 탄산식품 내에 오염균의 존재 유무를 확인하는데 유용하게 이용할 수 있다.The present invention is a representative yeast strain capable of growing under carbonic conditions such as carbonated beverages. Saccharomyces cerevisiae strain Saccharomyces cerevisiae), my process in a progenitor strain Saccharomyces (Schizosaccharomyces spp .), Zygosaccharomyces spp ., and Te Keraton spp (Dekkera spp .) in the carbonated food can be quickly checked, and thus it can be usefully used for confirming the presence or absence of contaminants in the carbonated food.

도 1은 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)에 속하는 효묘군의 서열 상동성 분석 결과이다.
도 2는 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae)에 대한 Real-time PCR 시험결과이다.
도 3은 테케라 속 균주(Dekkera spp.)에 대한 Real-time PCR 시험결과이다.
도 4는 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .)에 대한 Real-time PCR 시험결과이다.
도 5는 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .)에 대한 Real-time PCR 시험결과이다.
도 6은 종래의 검출방법인 논문(APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Dec. 2003, p. 7430-7434)에 기재된 방법을 이용하여 검출한 것으로, 테케라 속 균주(Dekkera spp.)에 대한 Real-time PCR 시험결과이다.
도 7은 종래의 검출방법인 논문(APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Nov. 2005, p. 6823-6830)에 기재된 방법을 이용하여 검출한 것으로, 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae)에 대한 Real-time PCR 시험결과이다.
Figure 1 is a schematic representation of the Saccharomyces cerevisiae strain cerevisiae), my process in a progenitor strain Saccharomyces (Schizosaccharomyces spp . ) , And Zygosaccharomyces spp . , And & lt ; RTI ID = 0.0 & gt ; Dekkera strain spp .).
Fig. 2 is a graph showing the activity of Saccharomyces cerevisiae strain S. cerevisiae ) were tested for real-time PCR.
Fig. 3 shows the results obtained by measuring spp .).
Fig. 4 is a graph showing the activity of the strain Shizosaccharomyces spp . ) In the real-time PCR.
FIG. 5 is a graph showing the activity of the strain Zygosaccharomyces spp . ) In the real-time PCR.
FIG. 6 is a graph showing the results of real-time PCR for Dekkera spp ., Which was detected using the method described in APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY (Dec. 2003, p. 7430-7434) Test results.
FIG. 7 shows the results of detection using Saccharomyces cerevisiae strain ( Saccharomyces cerevisiae), which was detected using the method described in the prior art (APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Nov. 2005, p. 6823-6830) S. cerevisiae ).

이하, 본 발명을 하나의 구현 예로서 더욱 상세하게 설명하면 다음과 같다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail as an embodiment.

본 발명은 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주( Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)로 이루어진 군으로부터 선택된 1종 이상의 탄산 조건에서 생장 가능한 효모를 신속하게 검출하기 위해, (a) 시료(sample)로부터 유전체 DNA를 추출하는 단계; (b) 상기 추출된 유전체 DNA, 서열번호 1 내지 3의 프라이머 세트, 및 서열번호 4 내지 8의 프로브를 포함하는 실시간 중합효소연쇄반응(Real-Time Polymerase Chain Reaction)액을 제조하는 단계; 및 (c) 실시간 중합효소연쇄반응을 수행하는 단계를 제공한다.The present invention relates to a strain of Saccharomyces cerevisiae cerevisiae), my process in a progenitor strain Saccharomyces (Schizosaccharomyces spp . ) , Zygosaccharomyces spp . , And Dekkera strain . spp) extracting genomic DNA from, (a) sample (sample) in order to rapidly detect a possible growth of yeast from one or more conditions selected from the group consisting of carbonate; (b) preparing a real-time polymerase chain reaction solution containing the extracted genomic DNA, the primer set of SEQ ID NOS: 1 to 3, and the probes of SEQ ID NOS: 4 to 8; And (c) performing a real-time PCR reaction.

본 발명에서 사용하는 용어인 “프라이머”란 짧은 자유 3'말단 수산화기를 가지는 핵산 서열로 상보적인 주형(template)과 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 핵산 서열을 의미한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응을 위한 시약(DNA 중합효소 또는 역전사 효소) 및 상이한 4가지 dNTP(deoxynucleoside triphospate)의 존재 하에서 DNA합성을 개시할 수 있다.As used herein, the term " primer " refers to a nucleic acid sequence having a short free 3 'terminal hydroxyl group that can form base pairs with a complementary template and serves as a starting point for template strand copying Quot; means a short nucleic acid sequence. Primers can initiate DNA synthesis in the presence of reagents (DNA polymerase or reverse transcriptase) for polymerisation and four different dNTPs (deoxynucleoside triphospate) at appropriate buffer solutions and temperatures.

프라이머는 DNA 합성의 개시점으로 작용하는 프라이머의 기본 성질을 변화시키지 않는 추가의 특징을 혼입할 수 있다.Primers can incorporate additional features that do not alter the primer's basic properties that serve as a starting point for DNA synthesis.

본 발명에서 상기 서열번호 1 내지 3의 염기서열을 포함하는 프라이머는 각각 서열 상동성이 95% 이상인 염기서열을 포함하는 개념이다. 예를 들어, 프라이머가 20bp인 경우, 20bp 중 2개 이상 틀리면 용융 온도(melting temperature)의 감소가 5도 이상이 되므로 결과가 좋지 않게 나타나지만, 1개만 틀릴 경우에는 PCR 과정에서 열처리(annealing) 온도를 약간 내려 실험할 경우 동등한 결과를 얻을 수 있기 때문이다.In the present invention, the primers comprising the nucleotide sequences of SEQ ID NOS: 1 to 3 each include a nucleotide sequence having a sequence homology of 95% or more. For example, when the primer is 20 bp, two or more of the 20 bp errors result in a poorer melting temperature than 5 ° C. However, if only one is wrong, the annealing temperature If you experiment a little down, you will get equal results.

본 발명의 프라이머는 포스포르아미다이트 고체 지지체 방법, 또는 기타 널리 공지된 방법을 사용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이러한 핵산 서열은 또한 당해 분야에 공지된 많은 수단을 이용하여 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 비제한적인 예로는 메틸화, "캡화", 천연 뉴클레오타이드 하나 이상의 동족체로의 치환, 및 뉴클레오타이드 간의 변형, 예를 들면, 하전 되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)로의 변형이 있다. 핵산은 하나 이상의 부가적인 공유 결합된 잔기, 예를 들면, 단백질(예: 뉴클레아제, 독소, 항체, 시그날 펩타이드, 폴리-L-리신 등), 삽입제(예: 아크리딘, 프소랄렌 등), 킬레이트화제(예: 금속, 방사성금속, 철, 산화성 금속 등), 및 알킬화제를 함유할 수 있다.The primers of the present invention can be chemically synthesized using the phosphoramidite solid support method, or other well-known methods. Such nucleic acid sequences may also be modified using many means known in the art. Non-limiting examples of such modifications include, but are not limited to, methylation, " capping ", substitution of one or more natural nucleotides into homologues, and modifications between nucleotides, such as uncharged linkers such as methylphosphonate, phosphotriester, (E.g., phosphoramidate, carbamate, etc.) or charged linkages (e.g., phosphorothioate, phosphorodithioate, etc.). The nucleic acid can be in the form of one or more additional covalently linked residues such as a protein such as a nuclease, a toxin, an antibody, a signal peptide, a poly-L-lysine, an intercalator such as acridine, ), Chelating agents (e.g., metals, radioactive metals, iron, oxidizing metals, etc.), and alkylating agents.

또한, 본 발명의 프라이머 핵산 서열은 필요한 경우, 분광학적, 광화학적, 생화학적, 면역화학적 또는 화학적 수단에 의해 직접적으로 또는 간접적으로 검출 가능한 표지를 포함할 수 있다. 표지의 예로는, 효소 (예를 들어, 호스래디쉬 퍼옥시다제, 알칼린 포스파타아제), 방사성 동위원소(예를 들어, 32P), 형광성 분자, 화학그룹(예를 들어, 바이오틴) 등이 있다.In addition, the primer nucleic acid sequences of the present invention may, if necessary, comprise markers detectable directly or indirectly by spectroscopic, photochemical, biochemical, immunochemical or chemical means. Examples of labels include enzymes (e.g., horseradish peroxidase, alkaline phosphatase), radioactive isotopes (e.g., 32P), fluorescent molecules, chemical groups (e.g., biotin) have.

본 발명에서“프로브”란 염기서열과 특이적으로 결합할 수 있는 수개 내지 수백 개의 염기로 이루어진 핵산단편을 의미하며 라벨링되어 있어 특정 핵산 존재여부를 확인 할 수 있다. 프로브는 올리고뉴클레오타이드프로브, 단쇄 DNA 프로브, 이중쇄 DNA 프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있고 비오틴, FITC, 로다민, DIG 등으로 표지되거나 방사선 동위 원소 등으로 표지될 수 있다.In the present invention, " probe " means a nucleic acid fragment consisting of several to several hundred bases capable of specifically binding to a nucleotide sequence and is labeled to confirm the presence or absence of a specific nucleic acid. The probe can be produced in the form of an oligonucleotide probe, a short-chain DNA probe, a double-stranded DNA probe, an RNA probe, etc., and can be labeled with biotin, FITC, rhodamine, DIG or the like or labeled with radioisotope.

본 발명의 프로브는 5` 말단에 형광발색제(fluorescent reporter dye)가 표지되고 3` 말단에는 소광제(quencher)가 표지될 수 있다. In the probe of the present invention, a fluorescent reporter dye may be labeled at the 5 'end and a quencher may be labeled at the 3' end.

더욱 바람직하게는 상기 5'-말단에 표지되는 형광발색체는 6-카르복시플루오레세인 (6-carboxyfluorescein, FAM), 헥사클로로-6-카르복시플루오레세인 (hexachloro-6-carboxyfluorescein, HEX), 테트라클로로-6-카르복시플루오레세인(tetrachloro-6-carboxyfluorescein), 및 Cyanine-5 (Cy5)으로 이루어진 군에서 선택된다.More preferably, the fluorescent substance labeled at the 5'-end is selected from the group consisting of 6-carboxyfluorescein (FAM), hexachloro-6-carboxyfluorescein (HEX) Tetrachloro-6-carboxyfluorescein, and Cyanine-5 (Cy5).

상기 3'-말단에 표지되는 소광제는 Black Hole Quencher 1 (BHQ-1), Black Hole Quencher 2 (BHQ-2), Black Hole Quencher 3(BHQ-3), 5-Carboxytetramethylrhodamine (TAMRA), deep dark Quencher 1 (DDQ1), EBQ 및 deep dark Quencher 2(DDQ2)로 이루어진 군에서 선택된다.The quenching agents labeled at the 3'-end were: Black Hole Quencher 1 (BHQ-1), Black Hole Quencher 2 (BHQ-2), Black Hole Quencher 3 (BHQ-3), 5-Carboxytetramethylrhodamine Quencher 1 (DDQ1), EBQ and deep dark Quencher 2 (DDQ2).

프로브의 5'-말단 및 3'-말단에 표지된 각각의 형광물질은 상호 간섭 현상을 나타내는 것 일 수 있다. 이에 따라, 프로브가 시료에 존재하는 표적 염기서열에 결합된 상태에서는 3'-말단의 형광물질 에너지에 의해 5'-말단의 형광물질이 억제되어 발색이 제한되고, 중합효소 연쇄반응의 수행시 프로브가 분해되면서 5'-말단의 형광물질이 유리되면서 3'-말단의 형광물질에 의한 억제가 해제되어 형광물질이 발색 반응을 하게 된다.Each fluorescent substance labeled at the 5'-end and the 3'-end of the probe may exhibit a mutual interference phenomenon. Thus, in the state where the probe is bound to the target base sequence existing in the sample, the fluorescent substance at the 5'-end is inhibited by the fluorescent energy of the 3'-terminal and the color development is restricted. In the case of performing the polymerase chain reaction, End of the fluorescent substance is liberated and the inhibition by the fluorescent substance at the 3'-terminal is released, so that the fluorescent substance undergoes the color development reaction.

본 발명에서의 서열번호 1은 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .)를 증폭하기 위한 프라이머이고, 서열번호 2는 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)를 증폭하기 위한 프라이머이고, 서열번호 3은 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .)를 증폭하기 위한 프라이머이다.In the present invention, SEQ ID NO: 1 represents Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces sp. spp . ), And The strain Zygosaccharomyces spp . ), SEQ ID NO: 2 is a primer for amplifying the Saccharomyces cerevisiae strain ( Saccharomyces S. cerevisiae , Zygosaccharomyces sp. spp . ) , And Mosquera, Te, and primers for amplifying sp (Dekkera spp.), The SEQ ID NO: 3 primer for amplifying My process sp (Schizosaccharomyces spp.) To a progenitor saccharide.

아울러, 본 발명에서의 서열번호 4는 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae)를 검출하기 위한 프로브인 것이고, 서열번호 5는 테케라 속 균주(Dekkera spp.)를 검출하기 위한 프로브인 것이고, 서열번호 6 및 7은 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .)를 검출하기 위한 프로브이다.In addition, SEQ ID NO: 4 of the present invention will in the probe for detecting the three Levy MY process jiae strains (Saccharomyces cerevisiae) as a saccharide, SEQ ID NO: 5 is Te Mosquera sp (Dekkera spp .), SEQ ID NOS: 6 and 7 are probes for detection of Schizosaccharomyces sp. spp . ).

또한 본 발명 서열번호 1 내지 3의 프라이머 세트 및 서열번호 4 내지 8의 프로브를 포함하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 검출키트를 제공한다.Also provided is a detection kit for a yeast capable of growing under a carbonic acid condition comprising the primer set of SEQ ID NOs: 1 to 3 and the probes of SEQ ID NOs: 4 to 8 of the present invention.

본 발명의 상기 키트는 서열번호 1 내지 3의 프라이머 및 서열번호 4 내지 8의 프로브 이외에 PCR 조성물에 사용되는 성분을 사용할 수 있으며, 이러한 조성물의 성분의 비제한적인 예로는 반응용 완충용액, dNTPs, Mg2+이온, DNA 중합효소가 포함될 수 있다.The kit of the present invention can use the components used in the PCR composition in addition to the primers of SEQ ID NOs: 1 to 3 and the probes of SEQ ID NOS: 4 to 8. Examples of the components of the composition include reaction buffer solutions, dNTPs, Mg2 + ions, and DNA polymerase.

상기 반응용 완충용액은 1∼10mM TrisHCl, 10∼40mM KCl(pH 9.0)을 사용할 수 있으며, 상기 dNTPs는 dATP, dTTP, dGTP, dCTP 중에서 선택된 어느 하나 이상을 사용할 수 있다.The buffer solution for reaction may be 1 to 10 mM TrisHCl, 10 to 40 mM KCl (pH 9.0), and the dNTPs may be selected from dATP, dTTP, dGTP, and dCTP.

상기 키트에는 실험상의 편의, 안정화 및 반응성 향상을 위해 안정화제 및/또는 비반응성 염료 등를 포함할 수 있다.The kit may include stabilizers and / or non-reactive dyes for improving experimental convenience, stabilization, and reactivity.

본 발명에 따른 검출방법 및 검출키트는 탄산음료 등 탄산 조건에서도 생장 가능한 대표적인 효모로서, 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)의 존재 유무를 동시에 신속하게 확인할 수 있어, 탄산식품 내에 탄산오염균의 존재 유무를 높은 민감도와 특이성으로 검출할 수 있다.The detection method and the detection kit according to the present invention are representative yeasts capable of growing under carbonic conditions such as carbonated beverages. Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces sp. spp . ) , Zygosaccharomyces strain spp . ) , And Dekkera strain spp .) can be detected at the same time, and the presence or absence of carbonic acid contaminants in the carbonated food can be detected with high sensitivity and specificity.

이하, 실시예, 실험예 및 비교예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 예에 의해 제한되지 않는다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples, Experimental Examples and Comparative Examples. These examples are provided only for illustrating the present invention more specifically, and the scope of the present invention is not limited by these examples according to the gist of the present invention.

실시예Example 1: 표적 유전자의  1: 상동성Homology 분석 analysis

사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)를 동시에 검출을 위해 large subunit ribosomal RNA 유전자를 표적유전자로 선정하고 각각의 대표적인 효모균의 표준서열의 상동성 분석을 실시하였으며 그 결과는 도 1에 나타낸 바와 같고, 상세한 서열정보는 하기 표 1에 나타낸 바와 같다. Saccharomyces cerevisiae strains cerevisiae), my process in a progenitor strain Saccharomyces (Schizosaccharomyces spp . ) , Zygosaccharomyces spp . , & Lt ; RTI ID = 0.0 > And Dekkera strain spp .) was selected for the detection of large subunit ribosomal RNA gene as a target gene and the homology analysis of the standard sequence of each representative yeast was performed. The results are shown in FIG. 1, and detailed sequence information is shown in the following Table 1 As shown in Fig.

서열 정보Sequence information NameName Accession numberAccession number NameName Accession numberAccession number DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis DQ406715DQ406715 SaccharomycesSaccharomyces cerevisiae cerevisiae KP070750KP070750 DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis DQ406716DQ406716 SaccharomycesSaccharomyces cerevisiae  cerevisiae KP966895KP966895 DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107599KY107599 SaccharomycesSaccharomyces cerevisiae cerevisiae KX377686KX377686 DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107603KY107603 SaccharomycesSaccharomyces
uvarumround
KX588256KX588256
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107604KY107604 ZygosaccharomycesZygosaccharomyces
bailiibailii
FR690851FR690851
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107605KY107605 ZygosaccharomycesZygosaccharomyces
lentuslentus
KY110250KY110250
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107608KY107608 ZygosaccharomycesZygosaccharomyces
mellismellis
LN849086LN849086
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107610KY107610 ZygosaccharomycesZygosaccharomyces
rouxiirouxii
KX377686KX377686
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107613KY107613 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
AB566264AB566264
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107614KY107614 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
EU523635EU523635
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KY107615KY107615 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
KT767194KT767194
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis AM850055AM850055 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
KY109594KY109594
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis FR853167FR853167 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
KY109596KY109596
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis HE964967HE964967 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
KY109598KY109598
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis HF547277HF547277 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
XR 845621XR 845621
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis JX094787JX094787 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
XR 845623XR 845623
DekkeraDekkera bruxellensis bruxellensis KM236198KM236198 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
XR 845625XR 845625
DekkeraDekkera anomalaanomala U84244U84244 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
japonicusjaponicus
XR 845627XR 845627
DekkeraDekkera anomalaanomala FJ805786FJ805786 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
cryophiluscryophilus
GU470882GU470882
DekkeraDekkera anomalaanomala KY107597KY107597 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
octosporusoctosporus
KY109599KY109599
DekkeraDekkera anomalaanomala KF790763KF790763 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
octosporusoctosporus
KY109560KY109560
DekkeraDekkera anomalaanomala KF790781KF790781 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
octosporusoctosporus
KY109561KY109561
DekkeraDekkera anomalaanomala KF790784KF790784 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
octosporusoctosporus
XR 001203012XR 001203012
DekkeraDekkera anomalaanomala KF790801KF790801 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
octosporusoctosporus
XR 001203016XR 001203016
DekkeraDekkera anomalaanomala KY107595KY107595 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
pombepumice
JQ804983JQ804983
DekkeraDekkera anomalaanomala KY107596KY107596 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
pombepumice
KF278469KF278469
DekkeraDekkera anomalaanomala KY107598KY107598 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
pombepumice
KP190156KP190156
SaccharomycesSaccharomyces cerevisiae cerevisiae KX588255KX588255 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
pombepumice
LC021488LC021488
SaccharomycesSaccharomyces cerevisiae cerevisiae KM885965KM885965 schizosaccharomycesschizosaccharomyces
pombepumice
LC170432LC170432

실시예Example 2:  2: 프라이머primer  And 프로브의Of the probe 제작 making

탄산 조건에서 생존하는 균주의 검출을 위한 프라이머 세트의 합성은 ㈜바이오니아(대한민국, 대전)의 올리고 합성 서비스를 이용하여 합성하였고, 형광 프로브의 경우 FAM, CY5, EBQ로 수식하였고, 100 pmole 농도로 TE 버퍼로 조정하여 증폭 실험 전까지 냉장보관 하였다.The synthesis of the primer set for the detection of the strains which survived under the carbonic acid condition was synthesized using oligo synthesis service of Bioneer (Daejeon, Korea). In the case of the fluorescent probe, it was modified with FAM, CY5 and EBQ, Buffer and refrigerated until the experiment.

이때 프라이머와 프로브 서열의 Tm 값 분석은 IDT사에서 제공하는 web-based 프로그램인 oligoanalyzer 3.1을 이용하였다. At this time, the Tm value of primer and probe sequence was analyzed using oligoanalyzer 3.1, a web-based program provided by IDT.

프라이머primer 서열번호SEQ ID NO: 염기서열*(5’-> 3‘)Sequence * (5 '-> 3') 명칭designation 길이Length GC%GC% TmTm 1One CAAGTASAGTGATSGAAAGATGAAAAGAACCAAGTASAGTGATSGAAAGATGAAAAGAAC SaScZyDe forward primerSaScZyDe forward primer 3030 36.736.7 56.156.1 22 AACYGATGCTGGCCCAGTAACYGATGCTGGCCCAGT SaZyDe reverse primerSaZyDe reverse primer 1818 58.358.3 58.558.5 33 CRRAAACTGATGCTGACCTACCCRRAAACTGATGCTGACCTACC Sc reverse primerSc reverse primer 2222 5050 55.755.7 * S: C/G, Y: C/T, R: A/G, K: G/T* S: C / G, Y: C / T, R: A / G, K: G / T

프로브Probe 서열번호SEQ ID NO: 5’ 수식5 'formula 염기서열*(5’-> 3‘)Sequence * (5 '-> 3') 3‘ 수식3 'formula 길이Length GC%GC% TmTm 비고
(특이성)
Remarks
(Specificity)
44 FAMFAM AGGGGAATCTCGCATTTCAGGGGAATCTCGCATTTC EBQEBQ 1818 5050 52.252.2 Sa probeSa probe 55 CY5CY5 CTCGTGGATGGGTGCACCCTCGTGGATGGGTGCACC EBQEBQ 1818 66.766.7 58.858.8 De probeDe probe 66 FAMFAM AGACAGTGCACTCTGAACCTAAGACAGTGCACTCTGAACCTA EBQEBQ 2121 47.647.6 55.455.4 Sc-1 probeSc-1 probe 77 FAMFAM AGRCKATGCACTCTGAACCTGTAGRCKATGCACTCTGAACCTGT EBQEBQ 2222 5050 58.258.2 Sc-2 probeSc-2 probe 88 CY5CY5 TGRGGGAATCTCGCAGCTCTGRGGGAATCTCGCAGCTC EBQEBQ 1919 60.560.5 58.358.3 Zy probeZy probe * S: C/G, Y: C/T, R: A/G, K: G/T* S: C / G, Y: C / T, R: A / G, K: G / T

실시예Example 3:  3: 프라이머primer  And 프로브의Of the probe 특이도 확인 Identification of specificity

(1) 미생물로부터 유전체 DNA 추출(1) Extraction of genomic DNA from microorganisms

탄소 조건에서 생장 가능한 효모 유전자 증폭실험을 위해 하기 표 2에 표기된 효모를 생물자원센터(대한민국, 정읍)로부터 분양받았다. 제공하는 정보에 따라 배양 후 진올(대한민국, 서울)사의 DNA 추출키트를 이용하여 추출하고 실험 전까지 냉장보관 하였다. For yeast gene amplification experiments that can be grown under carbon conditions, the yeasts listed in Table 2 below were purchased from the BRC (Jeongeup, Korea). After culturing according to the provided information, DNA extraction kit of Jinol (Seoul, Korea) was used to extract and refrigerated until the experiment.

특이도 실험을 위한 균주Strain for specificity experiment 순번turn 균주명Strain name KCTC numberKCTC number 1One DekkeraDekkera anomalaanomala 75287528 22 DekkeraDekkera bruxellensisbruxellensis 75327532 33 DekkeraDekkera bruxellensisbruxellensis 1733717337 44 SchizosaccharomycesSchizosaccharomyces pombepumice 2725927259 55 SchizosaccharomycesSchizosaccharomyces pombepumice var.  there is. pombepumice 75227522 66 ZygosaccharomycesZygosaccharomyces bailiibailii 75397539 77 ZygosaccharomycesZygosaccharomyces lentuslentus 1763317633 88 ZygosaccharomycesZygosaccharomyces rouxiirouxii 1774817748 99 SaccharomycesSaccharomyces cerevisiaecerevisiae 1729817298

(2) Real-Time (2) Real-Time PCRPCR 수행( Perform( 프라이머primer  And 프로브의Of the probe 성능평가) Performance evaluation)

상기 실시예 2에서 준비한 표 2 및 3의 프라이머 및 프로브와 실시예 3에서 준비한 분양받은 표 4의 미생물의 유전체 DNA를 이용하여, 하기 표 5의 반응 조성액을 조제하여 사용하였다. 2X Real-time PCR Master Mix는 제이에스바이오테크사의 제품을 사용하였다. 분석기기는 파이오니아사(pioneer, 한국)의 Exicycler 96 real-time PCR 장비를 이용하여 진행하였다. 준비된 반응 조성액은 하기 표 6의 온도 조건으로 40번 반복하여 실험을 진행하였으며, 음/양성 판정은 Ct 값 기준으로 확인하였다.Using the primers and probes of Tables 2 and 3 prepared in Example 2 and the DNA fragments of the microorganisms of Table 4 prepared in Example 3, the reaction composition liquid of Table 5 was prepared and used. The 2X Real-time PCR Master Mix was a product of JEES Biotech. The analytical instrument was performed using Exicycler 96 real-time PCR instrument from Pioneer (Korea). The prepared reaction mixture solution was repeated 40 times under the temperature condition shown in Table 6 below, and the negative / positive determination was confirmed based on the Ct value.

Real-Time PCR 실험을 위한 반응 조성액Reaction formulation for Real-Time PCR 구 성 물Composition 첨 가 량Additive amount 2X Real-time PCR Master Mix2X Real-time PCR Master Mix 10 ul10 μl Forward Primer(100uM)Forward Primer (100 uM) 0.1 ul0.1 μl Revers Primer(100uM)Revers Primer (100 uM) 0.1 ul0.1 μl Probe (100uM)Probe (100 uM) 0.05 ul0.05 μl Template DNATemplate DNA 1 ul1 μl Nucelase Free WaterNucelase Free Water 8.75 ul8.75 μl Total VolumeTotal Volume 20 ul20 μl

DenaturationDenaturation 95 ℃, 5 min95 ° C, 5 min 40 cycles40 cycles DenaturationDenaturation 95 ℃, 15 sec95 ° C, 15 sec Annealing & Extension
(Data collection)
Annealing & Extension
(Data collection)
58 ℃, 60 sec58 ° C, 60 sec

DenaturationDenaturation 95 ℃, 5 min95 ° C, 5 min 40 cycles40 cycles DenaturationDenaturation 95 ℃, 60 sec95 ° C, 60 sec AnnealingAnnealing 58 ℃, 45 sec58 C, 45 sec ExtensionExtension 72 ℃, 7 sec72 ° C, 7 sec

DenaturationDenaturation 95 ℃, 10 min95 ° C, 10 min 40 cycles40 cycles DenaturationDenaturation 95 ℃, 15 sec95 ° C, 15 sec AnnealingAnnealing 60 ℃, 60 sec60 ° C, 60 sec

이에 대한 결과는 도 2 내지 도 5에 나타내었다.The results are shown in Figs. 2 to 5.

도 2는 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae)에 대한 Real-time PCR 시험결과를, 도 3은 테케라 속 균주(Dekkera spp.)에 대한 Real-time PCR 시험결과를, 도 4는 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp.)에 대한 Real-time PCR 시험결과를, 도 5는 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .)에 대한 Real-time PCR 시험결과를 나타낸 것이다.Fig. 2 is a graph showing the activity of Saccharomyces cerevisiae strain cerevisiae ), Fig. 3 shows the result of real-time PCR test on the genus Tekkera ( Dekkera spp.) the Real-time PCR test results for, 4 progenitor saccharide as MY process sp (Schizosaccharomyces spp.) the Real-time PCR test results. Fig. 5 is my process in strains with Xi Kosaka for (Zygosaccharomyces spp . ).

실시예Example 4: 특이도 비교평가 4: Specificity comparison evaluation

본 발명에서 고안된 실험조건의 특이도 비교평가를 위해 선행연구 결과(APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Dec. 2003, p. 7430-7434)를 토대로 실험을 진행하였다. 구체적으로, 프라이머(DBRUXF 5-G GATGGGTGCACCTGGTTTACAC-3, DBRUXR 5-GAAGGGCCACATTCACGAACCCCG-3')를 사용하여 실시예 3에서 적용한 동일한 DNA를 주형으로 사용하였다. 온도조건은 표 7의 조건으로 ABI 7500 fast 장비에 적용하여 실험을 진행하였으며, 형광확인을 위해 1X SybrGreen master mix를 첨가하였고, 적용된 미생물 DNA는 실시예 3에서 적용된 동일한 DNA를 주형으로 사용하였으며, 증폭 결과는 도 6과 같았다. Experiments were conducted based on the results of previous studies (APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Dec. 2003, p. 7430-7434) for the comparative evaluation of the specificity of experimental conditions designed in the present invention. Specifically, the same DNA used in Example 3 was used as a template using primers (DBRUXF 5-G GATGGGTGCACCTGGTTTACAC-3, DBRUXR 5-GAAGGGCCACATTCACGAACCCCG-3 '). The temperature condition was applied to the ABI 7500 fast instrument under the condition of Table 7, and 1X SybrGreen master mix was added for fluorescence confirmation. The same microbe DNA as that used in Example 3 was used as a template, The results are shown in Fig.

또한, 본 발명에서 고안된 실험조건의 특이도 비교평가를 위해 선행연구 결과(APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Nov. 2005, p. 6823-6830)를 토대로 실험을 진행하였다. 구체적으로, SC1d (5'-ACATATGAAGTATGTTTCTATATAACGGGTG-3') and SC1r (5'-TGGTGCTGGTGCGGATCTA-3')) 프라이머를 사용하여 표 8의 온도조건에서 형광확인을 위해 1X SybrGreen master mix 첨가하여 실험 진행하였으며, 적용된 미생물 DNA는 실시예 3에서 적용된 동일한 DNA를 주형으로 사용하였고, 증폭 결과는 도 7과 같았다. 도 6 및 도 7의 결과를 통해, 탄산 조건에서 생장 가능한 효모 균주 뿐만 아니라 다른 효모 균주의 증폭이 확인되었다.In addition, experiments were conducted based on the results of previous studies (APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Nov. 2005, p. 6823-6830) for the comparative evaluation of the specificity of experimental conditions designed in the present invention. Specifically, 1X SybrGreen master mix was added to confirm the fluorescence under the temperature condition of Table 8 using primers SC1d (5'-ACATATGAAGTATGTTTCTATATAACGGGTG-3 ') and SC1r (5'-TGGTGCTGGTGCGGATCTA-3' The microorganism DNA used the same DNA as used in Example 3 as a template, and the amplification result was as shown in FIG. 6 and 7, amplification of yeast strains capable of growing under carbonic conditions as well as other yeast strains was confirmed.

결국, 상기 실시예 3 및 실시예 4의 실험 결과를 통해, 본 발명에 따른 검출방법에서 고안된 프라이머, 프로브 조건의 특이도가 더 우수함을 확인하였다.As a result, it was confirmed that the specificity of the primer and probe conditions designed in the detection method according to the present invention is better than those of the third and fourth embodiments.

따라서, 본 발명은 탄산음료 등 탄산 조건에서도 생장 가능한 대표적인 효모로서, 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)의 존재 유무를 신속하게 확인할 수 있어, 탄산식품 내에 오염균의 존재 유무를 확인하는데 유용하게 이용될 수 있다.Therefore, the present invention is a representative yeast that can be grown under carbonic conditions such as carbonated beverages, and Saccharomyces cerevisiae strain cerevisiae), my process in a progenitor strain Saccharomyces (Schizosaccharomyces spp . ) , Zygosaccharomyces spp . , And Dekkera strain spp .) in the carbonated foods can be quickly confirmed, and it can be usefully used to confirm the presence or absence of contaminants in the carbonated food.

<110> Lotte Chilsung Beverage Co.,Ltd. <120> Method for detecting rapidly yeast growing in presence of a carbonic acid and detection kit <130> DP-2017-0113 <160> 8 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SaScZyDe forward primer <400> 1 caagtasagt gatsgaaaga tgaaaagaac 30 <210> 2 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SaZyDe reverse primer <400> 2 aacygatgct ggcccagt 18 <210> 3 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Sc reverse primer <400> 3 crraaactga tgctgaccta cc 22 <210> 4 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Sa probe <400> 4 aggggaatct cgcatttc 18 <210> 5 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> De probe <400> 5 ctcgtggatg ggtgcacc 18 <210> 6 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Sc-1 probe <400> 6 agacagtgca ctctgaacct a 21 <210> 7 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Sc-2 probe <400> 7 agrckatgca ctctgaacct gt 22 <210> 8 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Zy probe <400> 8 tgrgggaatc tcgcagctc 19 <110> Lotte Chilsung Beverage Co., Ltd. <120> Method for detecting rapidly growing in presence of a          carbonic acid and detection kit <130> DP-2017-0113 <160> 8 <170> Kopatentin 1.71 <210> 1 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SaScZyDe forward primer <400> 1 caagtasagt gatsgaaaga tgaaaagaac 30 <210> 2 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SaZyDe reverse primer <400> 2 aacygatgct ggcccagt 18 <210> 3 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Sc reverse primer <400> 3 crraaactga tgctgaccta cc 22 <210> 4 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Sa probe <400> 4 aggggaatct cgcatttc 18 <210> 5 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> De probe <400> 5 ctcgtggatg ggtgcacc 18 <210> 6 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Sc-1 probe <400> 6 agacagtgca ctctgaacct a 21 <210> 7 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Sc-2 probe <400> 7 agrckatgca ctctgaacct gt 22 <210> 8 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Zy probe <400> 8 tgrgggaatc tcgcagctc 19

Claims (9)

하기 단계를 포함하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법:
(a) 시료(sample)로부터 유전체 DNA를 추출하는 단계;
(b) 상기 추출된 유전체 DNA, 서열번호 1 내지 3의 프라이머 세트, 및 서열번호 4 내지 8의 프로브를 포함하는 실시간 중합효소연쇄반응(Real-Time Polymerase Chain Reaction)액을 제조하는 단계; 및
(c) 실시간 중합효소연쇄반응을 수행하는 단계;를 포함하며,
상기 탄산 조건에서 생장 가능한 효모는 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp.), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp.), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)인, 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법.
A method for rapid detection of a yeast capable of growing in a carbonic acid condition comprising the steps of:
(a) extracting a genomic DNA from a sample;
(b) preparing a real-time polymerase chain reaction solution containing the extracted genomic DNA, the primer set of SEQ ID NOS: 1 to 3, and the probes of SEQ ID NOS: 4 to 8; And
(c) performing a real-time PCR reaction,
Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces spp. , Zygosaccharomyces spp. , And the like can be used as the yeast capable of growing under the carbonic acid condition . A method for the rapid detection of yeast capable of growing under carbonic conditions, which is Dekkera spp .
제 1 항에 있어서,
상기 검출방법은 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp.), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp.), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)를 동시에 검출하는 것을 특징으로 하는, 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법.
The method according to claim 1,
The detection method includes the steps of: Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces spp. , Zygosaccharomyces spp. , And A method for the rapid detection of a yeast capable of growing under carbonic conditions, characterized by simultaneously detecting Dekkera spp .
제 1 항에 있어서, 상기 서열번호 1은 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp.), 및 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp.)를 증폭하기 위한 프라이머이고,
서열번호 2는 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp .), 테케라 속 균주(Dekkera spp.)를 증폭하기 위한 프라이머이고,
서열번호 3은 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .)를 증폭하기 위한 프라이머인 것을 특징으로 하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법.
The method according to claim 1, wherein said SEQ ID NO: 1 is Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces spp. , And & lt ; RTI ID = 0.0 &gt; The strain Zygosaccharomyces spp .),
SEQ ID NO: 2 is Saccharomyces cerevisiae strain cerevisiae ), The strain Zygosaccharomyces spp . ), And A primer for amplifying the Dekkera spp .
SEQ ID NO: 3 is a strain of the genus Schizosaccharomyces spp.) the rapid detection method capable of growing the yeast in acid conditions, which is characterized in that the primer for amplification.
제 1 항에 있어서, 상기 서열번호 4는 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae)를 검출하기 위한 프로브인 것이고,
서열번호 5는 테케라 속 균주(Dekkera spp.)를 검출하기 위한 프로브인 것이고,
서열번호 6 및 7은 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp .)를 검출하기 위한 프로브인 것을 특징으로 하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법.
The method according to claim 1, wherein the sequence number 4 is a probe for detecting Saccharomyces cerevisiae ,
SEQ ID NO: 5 is a strain of the genus TEKERA spp .),
SEQ ID NOS: 6 and 7 show that the strain Shizosaccharomyces spp . Wherein the probe is a probe for detecting yeast.
제 1 항에 있어서, 상기 프로브는 5` 말단에 형광발색제(fluorescent reporter dye)가 표지되고 3` 말단에는 소광제(quencher)가 표지된 것을 특징으로 하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법.
The method according to claim 1, wherein the probe is labeled with a fluorescent reporter dye at the 5 'end and a quencher at the 3' end.
제 5 항에 있어서, 상기 형광발색제는 6-카르복시플루오레세인(6-carboxyfluorescein, FAM), 헥사클로로-6-카르복시플루오레세인(hexachloro-6-carboxyfluorescein, HEX), 테트라클로로-6-카르복시플루오레세인(tetrachloro-6-carboxyfluorescein), 및 Cyanine-5(Cy5)으로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법.
The method of claim 5, wherein the fluorescent colorant is selected from the group consisting of 6-carboxyfluorescein (FAM), hexachloro-6-carboxyfluorescein (HEX), tetrachloro-6-carboxyfluorescein Tetrachloro-6-carboxyfluorescein, and Cyanine-5 (Cy5). 2. The method of claim 1, wherein the yeast is selected from the group consisting of tetrachloro-6-carboxyfluorescein and Cyanine-5.
제 5 항에 있어서, 상기 소광제는 Black Hole Quencher 1(BHQ-1), Black Hole Quencher 2 (BHQ-2), Black Hole Quencher 3(BHQ-3), 5-Carboxytetramethylrhodamine (TAMRA), deep dark Quencher 1 (DDQ1), EBQ 및 deep dark Quencher 2(DDQ2)로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 탄산 조건에서 생장 가능한 효모의 신속한 검출방법.
6. The method of claim 5, wherein the quencher is selected from the group consisting of Black Hole Quencher 1 (BHQ-1), Black Hole Quencher 2 (BHQ-2), Black Hole Quencher 3 (BHQ-3), 5-Carboxytetramethylrhodamine 1 (DDQ1), EBQ, and deep dark quencher 2 (DDQ2).
서열번호 1 내지 3의 프라이머 세트 및 서열번호 4 내지 8의 프로브를 포함하는, 탄산 조건에서 생장 가능한 효모인 사카로마이세스 세레비지애 균주(Saccharomyces cerevisiae), 시조사카로마이세스 속 균주(Schizosaccharomyces spp.), 자이고사카로마이세스 속 균주(Zygosaccharomyces spp.) 테케라 속 균주(Dekkera spp.)의 검출키트.
A Saccharomyces cerevisiae strain, a Schizosaccharomyces spp . Strain , which is a yeast capable of growing in a carbonic acid condition, comprising the primer set of SEQ ID Nos. 1 to 3 and the probes of SEQ ID Nos: 4 to 8 , .), my process in strains with Xi Kosaka (Zygosaccharomyces spp.) And Detection kit of Dekkera spp .
제 8 항에 있어서, 상기 키트는 반응용 완충용액, dNTPs, Mg2+이온, 및 DNA 중합효소를 포함하는 검출키트.9. The detection kit according to claim 8, wherein the kit comprises a buffer solution for reaction, dNTPs, Mg2 + ions, and a DNA polymerase.
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