KR101576053B1 - Biomarker for diagnosis of ovarian cancer cells - Google Patents

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Abstract

본 발명은 체내의 SRA1의 레벨 측정에 의한 난소암의 진단 방법에 관한 것이다. 특히, 난소암 진단에 필요한 정보를 제공하기 위해, 환자의 시료로부터 얻은 RNA에서 SRA1 lnc RNA의 레벨을 상대적으로 측정하는 것을 특징으로 한다.The present invention relates to a method for diagnosing ovarian cancer by measuring the level of SRA1 in the body. In particular, the present invention is characterized in that the level of SRA1 lnc RNA is relatively measured in the RNA obtained from the patient's sample in order to provide information necessary for diagnosing ovarian cancer.

Description

난소암 진단용 바이오마커{BIOMARKER FOR DIAGNOSIS OF OVARIAN CANCER CELLS}{BIOMARKER FOR DIAGNOSIS OF OVARIAN CANCER CELLS}

본 발명은 체내의 SRA1의 레벨 측정에 의한 난소암의 진단 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method for diagnosing ovarian cancer by measuring the level of SRA1 in the body.

여성의 생식기는 크게 외부생식기와 골반 내에 존재하는 내부생식기로 구분할 수 있는데, 내부생식기는 구체적으로 질, 자궁, 난관, 난소 등을 말한다. 이중 난소는 쌍을 이루어 존재하며, 여성의 생식능력을 담당하는 기관으로서 여성호르몬을 분비하고 매달 난자를 배출하는 역할을 한다. 난소에서 분비하는 여성호르몬은 에스트로젠과 프로게스테론으로 여성으로서의 특성을 나타나게 한다.Female genitalia can be divided into external genitalia and internal genitalia in the pelvis. Internal genitalia refers specifically to vagina, uterus, fallopian tubes, ovaries and the like. Dual ovaries are present in pairs and are responsible for female reproductive capacity, releasing female hormones and discharging eggs every month. Female hormones secreted from the ovaries are estrogen and progesterone, which are characteristic of women.

난소암은 가장 일반적인 여성질환 중 하나로서 부인과 암의 약 20%를 차지하고 있으며, 대부분 환자에게서 가장 늦게 진단되는 암 중 하나이다. 암이 발생한 후 복강 내 전이가 일어날 때까지 증상이 전혀 없는 경우가 대부분이어서 처음 진단 시 약 2/3에서 이미 진행된 상태(3기 이상)로 발견되기 때문에 여성 생식기에서 발생하는 부인암 중 가장 예후가 나쁜 암으로 알려져 있다. 효과적인 스크리닝 방법이 없어서, 난소암을 진단받은 여성들은 이미 상당히 암이 진행된 상태가 대부분이어서 생존 확률이 매우 낮다.Ovarian cancer is one of the most common female diseases, accounting for about 20% of gynecologic cancers, and is one of the most diagnosed cancers most often in patients. The majority of cases with no symptoms until the intra-abdominal metastasis after cancer have occurred are found in about two-thirds of cases at the initial diagnosis (more than three months). Therefore, the most common prognosis of female gynecologic cancer It is known as bad cancer. Because there is no effective screening method, women who have been diagnosed with ovarian cancer already have a considerable degree of cancer progression, and the probability of survival is very low.

난소암은 증상이 미미하여 약 60% 정도가 이미 상당히 진행된 상태에서 병원을 찾게 되므로, 증상이 없더라도 1년에 한 번 정도는 반드시 정기적인 부인암 검진을 받는 것이 조기진단의 지름길이다. 산부인과 의사가 내진을 하여 난소가 커져 있는지 혹이 만져지는지 등을 확인하고 필요하다고 여겨지면 초음파 검사로 난소의 혹을 검사한다. 또한 단순한 양성 물혹인지 암인지를 감별하기 위해 혈액검사로 CA125라는 종양 표지인자를 확인하기도 한다. 현재 난소암 진단용 마커로는 CA125가 알려져 있으며, 혈청 CA125는 난소암의 선별, 양성과 악성 난소 덩어리간의 구별 및 예후에 사용되어 왔다 (Zurawski, V. R. et al., Int J. Cancer, 42:677-80, 1988; Vasilev S.A et al., Obstet Gynecol. 71:751-6, 1988; Rubin S.C. et al., Am J Obstet Gynecol. 160:667-71, 1989; Bridgewater J.A. et al., J. Clin Oncol. 17:501-8, 1999). 그러나 상기 CA125는 단지 I기 난소암 여성의 약 1/2에서만 상승되는 경향이 있기 때문에 단일 마커로서 한계가 있다. 이에 일반적으로 초음파 검사와 CA125 검출의 두 검사를 병행하고는 있으나, 난소암을 진단하기 위한 효과적인 진단방법은 아직 개발되어 있지 않은 실정이다.About 60% of ovarian cancers are very rare, so if you have any symptoms, it is a good idea to have regular gynecological cancer screening once a year. The obstetrician will perform an earthquake to check whether the ovary is enlarged or touched, and if it is deemed necessary, the ovarian hump is checked by ultrasound. A blood test can also identify a tumor marker called CA125 to differentiate between benign and malignant tumors. Currently, CA125 is known as a diagnostic marker for ovarian cancer, and serum CA125 has been used for the differentiation and prognosis of ovarian cancer among benign and malignant ovarian masses (Zurawski, VR et al., Int. J. Cancer, 42: 677- 80, 1988; Vasilev SA et al., Obstet Gynecol. 71: 751-6, 1988; Rubin SC et al., Am J Obstet Gynecol. 160: 667-71, 1989; Bridgewater JA et al., J. Clin Oncol 17: 501-8,1999). However, CA125 is limited as a single marker because it tends to be elevated only in about half of women with stage I ovarian cancer. In general, both ultrasonography and CA125 detection are performed in parallel, but effective diagnostic methods for diagnosing ovarian cancer have not been developed yet.

이에 따라 CA15-3, CA19-9, OVX1, 리소포스파드산(LPA) 및 암배아 항원(CEA) 등과 같은 새로운 난소암 마커들이 제시되고 있으나, 이들 역시 난소암을 정확하게 진단하기에 충분하지 않기 때문에 현재에는 오직 CA125와 초음파 촬영술을 함께 병행하는 방법만이 이용되고 있다.New ovarian cancer markers such as CA15-3, CA19-9, OVX1, lysophosphatidic acid (LPA) and cancer embryo antigen (CEA) have been proposed, but these are also not sufficient to accurately diagnose ovarian cancer Currently, only CA 125 and ultrasonography are used together.

난소암의 진단 결과로 나타난 확산 정도에 따라 치료 방법이 달라짐으로, 이러한 병기의 판단이 중요하다. 병기는 다음과 같이 분류된다. 1기, 암이 한쪽 또는 양쪽의 난소에만 머물러 있는 상태; 2기, 난소 주위 (난관, 자궁, 직장, 방광 등)의 복막으로 암이 전이한 상태; 3기, 난소 주위 (골반내)의 복막과 상복부와 후복막 림프절로 전이한 상태; 4기, 암이 복강 밖으로 전이하거나 간장으로 전이한 상태. 1, 2기의 경우에는 수술로 완전히 절제할 수 있지만 3, 4기에는 수술만으로는 완전히 제거할 수 없으므로, 진행성 암으로 정의된다.The diagnosis of ovarian cancer depends on the degree of spread of the disease. Stages are classified as follows. 1 st stage, the cancer stays in only one or both ovaries; Stage 2, cancer metastasis to the peritoneum of the ovary (tubal, uterine, rectal, bladder, etc.); Stage 3, metastasis to the peritoneum of the ovary (in the pelvis), to the epigastric and posterior peritoneal lymph nodes; Fourth, the cancer metastasized into the abdominal cavity or into the liver. In cases 1 and 2, the tumor can be completely removed by surgery, but in cases 3 and 4, it can not be completely removed by surgery alone. Therefore, it is defined as advanced cancer.

단백질의 합성에 직접 관여하는 RNA는 mRNA, tRAN, rRNA 등이 있다. 반면, 논코딩 RNA (non-coding RNAs)는 DNA에서 전사되었지만 단백질을 합성하지 않는 RNA이다. 발견된 논코딩 RNA의 종류도 micro RNA, siRNA, piRNA 등등 여러가지가 있는데, 이들 중 핵산의 길이가 200 이상인 것을 long non-coding RNA 줄여서 lncRNA라고 하고, 200 이하는 small ncRNAs (20-200 nt)라고 한다. nc RNAs의 기능 및 임상적 중요도에 대한 분석에 의하여 유전자 조절의 주요 인자이고, 일반 및 암 세포 표현형에 영향을 미침을 밝혀냈다. 최근 데이터에 따르면 3000 이상의 인간 long invervening non-clding RNA(lincRNAs)와 대부분의 long ncRNAs는 DNA-결합 단백질과 결합되어, multiple gene의 발현을 후성적으로 (epigenetically) 조절함을 보여주었다. lncRNA의 전사는 외부 온코제닉 자극 및 DNA 손상에 대한 반응으로 유전자 활성을 조절하는 것으로 알려졌다. 이러한 발견은 인간 질병, 특히 암과 lncRNA의 관련성을 시사하는 것이다. Lnc RNA는 암 생성과정 및 암 전이과정에서 새롭게 동정된 조절자로 인식되고 있다. 이러한 RNA의 기능 및 이러한 발현 메커니즘이 알려져 있지는 않지만, 최근 연구에 따르면 인간 암과 질병에 중요한 열쇠가 됨을 암시하고 있다.RNA directly involved in protein synthesis includes mRNA, tRAN, and rRNA. Non-coding RNAs, on the other hand, are RNAs that are transcribed from DNA but do not synthesize proteins. There are many kinds of non-coding RNAs, such as microRNA, siRNA, piRNA, etc. Among them, long non-coding RNAs with a length of 200 or more are referred to as lncRNAs and less than 200 are small ncRNAs (20-200 nt) do. nc RNAs is a major factor in gene regulation and influences general and cancer cell phenotypes by analysis of their function and clinical significance. Recent data indicate that over 3,000 human long invervening non-clding RNAs (lincRNAs) and most long ncRNAs are associated with DNA-binding proteins and epigenetically regulate the expression of multiple genes. Transcription of lncRNA is known to modulate gene activity in response to external oncogenic stimuli and DNA damage. This finding suggests a link between human disease, particularly cancer and lncRNA. Lnc RNA is recognized as a newly identified modulator in cancer development and cancer metastasis. Although the function of these RNAs and their mechanisms of expression are unknown, recent studies suggest that they are key to human cancer and disease.

스테로이드 수용체 액티베이터(steroid receptor activator: SRA) RNA는 non-coding RNA로서 작용하는 독특한 공-조절자(coregulator)이다. SRA는 핵 수용체(nuclear receptor: NRs), myogenic differentiation 1 (MyoD) 및 공억제제(corepressors)와 같은 더 큰 다양한 단백질과 기능적으로 결합하여 공-조절자 복합체의 어셈블리/안정성에 대한 스캐폴드로서 lncRNA가 작용하도록 하는 것으로 보고되었다. SRA RNA는 유방, 난소 및 방광 암생성 및 전이 동안 과발현된다고 보고되고 있다.
Steroid receptor activator (SRA) RNA is a unique co-modulator that acts as a non-coding RNA. SRA is a nuclear receptor (NRs), myogenic differentiation 1 < / RTI > (MyoD) and co-inhibitors (corepressors) to allow lncRNA to act as a scaffold for the assembly / stability of co-regulator complexes. SRA RNA has been reported to be overexpressed during breast, ovarian, and bladder cancer generation and metastasis.

이에 본 발명자들은 난소암을 조기에 정확하게 진단할 수 있는 새로운 진단 방법을 개발하고자 연구한 결과, 난소암의 경우 SRA1이 정상군에서보다 난소암 세포에서 확연히 상승함을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다. Accordingly, the present inventors have studied to develop a new diagnostic method capable of accurately diagnosing ovarian cancer early, and as a result, they confirmed that SRA1 in ovarian cancer is significantly elevated in ovarian cancer cells than in normal group.

따라서, 본 발명의 목적은 난소암 진단을 위한 새로운 바이오마커를 제공하는 것이다.Accordingly, an object of the present invention is to provide a novel biomarker for diagnosis of ovarian cancer.

상기와 같은 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 SRA1의 레벨을 측정함으로써 난소암을 진단하는 방법을 제공한다.
In order to achieve the above object, the present invention provides a method of diagnosing ovarian cancer by measuring the level of SRA1.

또한, 본 발명은 난소암 진단에 필요한 정보를 제공하기 위해, 환자의 시료로부터 RNA를 추출하여 SRA1 lnc RNA의 레벨을 검출하는 방법에 관한 것이다.
The present invention also relates to a method for detecting the level of SRA1 lnc RNA by extracting RNA from a patient's sample in order to provide information necessary for diagnosis of ovarian cancer.

상기에서 SRA1 lnc RNA의 상대적인 레벨이 측정되는 것을 특징으로 한다.
Wherein the relative level of SRA1 lnc RNA is measured.

상기 시료는 혈액, 혈청, 혈장, 림프액, 뇌척수액, 복수, 요 및 조직 생검으로 구성되는 그룹 중에서 선택되는 것을 특징으로 한다.
Wherein the sample is selected from the group consisting of blood, serum, plasma, lymph fluid, cerebrospinal fluid, ascites, urine and tissue biopsy.

본 발명은 다음의 단계를 포함하는 난소암의 진단에 필요한 정보를 제공하기 위한 방법이다:The present invention is a method for providing information necessary for diagnosis of ovarian cancer including the following steps:

(i) 시료를 채취하는 단계; (i) collecting a sample;

(ii) 시료에서 RNA를 추출하는 단계; (ii) extracting RNA from the sample;

(iii) 추출된 RNA에서 SRA1 lnc RNA를 증폭하는 단계; 및(iii) amplifying SRA1 lnc RNA in the extracted RNA; And

(iv) 정상군의 SRA1의 레벨과 시료의 SRA1 lnc RNA의 레벨을 비교하는 단계.
(iv) comparing the level of the normal group of SRA1 with the level of the SRA1 lnc RNA of the sample.

상기 RNA는 lncRNA인 것을 특징으로 한다.Wherein the RNA is lncRNA.

상기 추출된 RNA를 증폭하는 단계는 PCR를 이용할 수 있다.The step of amplifying the extracted RNA may use PCR.

상기 PCR에서 SRA1 lncRNA의 증폭 조건은 95°C 에서 3분간 초기 변성; 95°C에서 15초간 변성, 60°C에서 60초간 어닐링 및 72°C에서 60초간 신장(elongation)의 40 사이클; 그리고 72°C에서 5분간 최종 신장을 특징으로 한다.
The amplification conditions of SRA1 lncRNA in this PCR were initial denaturation at 95 ° C for 3 minutes; 40 cycles of denaturation at 95 ° C for 15 seconds, annealing at 60 ° C for 60 seconds, and elongation at 72 ° C for 60 seconds; And final elongation at 72 ° C for 5 minutes.

상기 PCR에 사용되는 PCR 프라이머 서열은 서열번호 1 내지 4에서 선택될 수 있다.
The PCR primer sequences used in the PCR may be selected from SEQ ID NOs: 1-4.

서열번호 1: 5′-CTCCCTTCTTACCACCACCA-3′(sense), SEQ ID NO: 1: 5'-CTCCCTTCTTACCACCACCA-3 '(sense),

서열번호 2: 5′-TGCAGATACACAGGGAGCAG-3′ (antisense); SEQ ID NO: 2: 5'-TGCAGATACACAGGGAGCAG-3 '(antisense);

서열번호 3: U6, 5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′(sense), SEQ ID NO: 3: U6 , 5'-CTCGCTTCGGCAGCACA-3 '(sense)

서열번호 4: 5′-AACGCTTCAGGAATTTGCGT-3′ (antisense).
SEQ ID NO: 4: 5'-AACGCTTCAGGAATTTGCGT-3 '(antisense).

본 발명의 다른 양태로서, 서열번호 5로 표시되는 siRNA를 포함하는 난소암 치료용 조성물을 제공할 수 있다.As another aspect of the present invention, a composition for treating ovarian cancer comprising siRNA represented by SEQ ID NO: 5 can be provided.

서열번호 5: 5' -CUC AUA ACA UGC AUU UCA AUU- 3'SEQ ID NO: 5: 5 '-CUC AUA ACA UGC AUU UCA AUU-3'

상기 서열번호 5로 표시되는 siRNA는 SRA1 lncRNA를 차단하는 것을 특징으로 한다.
The siRNA represented by SEQ ID NO: 5 is characterized by blocking SRA1 lncRNA.

따라서, 본 발명은 난소암을 진단할 수 있는 새로운 방법을 제공한다. 본 발명은 SRA1이 난소암을 진단할 수 있는 새로운 바이오마커를 제공한다.
Thus, the present invention provides a novel method for diagnosing ovarian cancer. The present invention provides a novel biomarker capable of diagnosing ovarian cancer by SRA1.

도 1은 인간 난소암에서 발현되는 SRA1의 레벨을 보여주는 그래프이다.
도 2는 다양한 난소암 세포주에서 발현되는 SRA1의 레벨을 보여주는 그래프이다.
도 3은 SRA1 유전자 특이적 siRNA와 음성 대조구 siRNA가 형질주입된 세포의 성장을 보여주는 그래프이다.
도 4는 난소암 세포에서의 SRA1의 이동과 침습을 보여주는 사진으로서, (a)는 상기 siRNA가 형질주입된 세포의 이동을 측정하기 위한 wound healing 분석의 결과를 보여주는 사진이고, (b)는 마트리겔 침습 분석의 결과를 보여주는 사진이다.
도 5는 SRA1 녹다운이 MMP9와 VEGF 발현을 감소시키는 실험결과를 나타내는 사진과 그래프이며, (a)와 (b)는 각각 MMP-9 및 VEGF 발현에 대한 웨스턴 블롯 분석 사진과 그래프이다.
Figure 1 is a graph showing the level of SRA1 expressed in human ovarian cancer.
Figure 2 is a graph showing the level of SRA1 expressed in various ovarian cancer cell lines.
FIG. 3 is a graph showing the growth of cells transfected with SRA1 gene-specific siRNA and negative control siRNA.
FIG. 4 is a photograph showing the migration and invasion of SRA1 in ovarian cancer cells. FIG. 4 (a) is a photograph showing the results of wound healing analysis for measuring the migration of cells transfected with the siRNA, This is a photograph showing the result of the Rigel invasion analysis.
FIG. 5 is a photograph and a graph showing the results of experiments in which SRA1 knockdown decreases MMP9 and VEGF expression, and (a) and (b) are photographs and graphs of western blot analysis for MMP-9 and VEGF expression, respectively.

이하, 본 발명을 실시예에 의하여 상세히 설명한다.
Hereinafter, the present invention will be described in detail with reference to examples.

본 발명은 일반적으로 난소암과 관련된 바이오마커에 관한 것이다. The present invention relates generally to biomarkers associated with ovarian cancer.

본 발명은 SRA1 발현이 난소암 조직 또는 세포에서 정상 조직에 비하여 높은 수준으로 발현됨을 발견함에 기초한다. 특히, SRA1은 암 세포에서의 전이와 관련성이 높아서 난소암의 전이를 진단하는 특이적 마커로서 역할을 할 수 있을 것이다.
The present invention is based on the discovery that expression of SRA1 is expressed at a higher level in ovarian cancer tissues or cells than normal tissues. In particular, SRA1 is highly associated with metastasis in cancer cells and may serve as a specific marker for diagnosing ovarian cancer metastasis.

본 발명에서 사용된 용어 난소암 진단 마커란 난소암 조직 및 세포에서 발현되고 이의 발현 여부를 확인함으로써 난소암의 발병을 확인할 수 있는 물질, 바람직하게는 정상 조직과 난소암 조직에서 유의한 차이를 보이는 단백질 또는 mRNA 등과 같은 유기 생체 분자를 의미한다. 본 발명에서 암 진단 마커는 난소암 조직 및 세포에서만 특이적으로 정상 세포에 비하여 훨씬 더 발현이 증가하는 SRA1의 lncRNA이며, 이를 공지된 검출방법, 예를 들어, PCR에 따른 증폭 및 추출 및 확인 방법을 통해 확인함으로써 난소암을 진단할 수 있다.
The term " ovarian cancer diagnostic marker " used in the present invention means a substance which is expressed in ovarian cancer tissues and cells and confirmed its expression, thereby showing a significant difference in a substance capable of confirming the onset of ovarian cancer, preferably normal and ovarian cancer tissues Quot; means an organic biomolecule such as protein or mRNA. In the present invention, the cancer diagnostic marker is lncRNA of SRA1 that expresses much more specifically than normal cells only in ovarian cancer tissues and cells, and it can be detected by a known detection method, for example, amplification, , The diagnosis of ovarian cancer can be made.

본 발명에서 사용된 용어 생물학적 시료 또는 시료는 혈액 및 생물학적 기원의 기타 액상 시료, 생검 표본, 조직배양과 같은 고형 조직 시료 또는 이로부터 유래된 세포가 포함된다. 보다 구체적으로 예를 들면 이에 한정되지는 않으나 조직, 추출물, 세포 용해물, 전혈, 혈장, 혈청, 침, 안구액, 뇌척수액, 땀, 뇨, 젖, 복수액, 활액, 복막액 등일 수 있다. 상기 시료는 동물, 바람직하게는 포유동물, 가장 바람직하게는 인간으로부터 수득될 수 있다. 상기 시료는 검출에 사용하기 전에 전처리할 수 있다. 예를 들어, 여과, 증류, 추출, 농축, 방해 성분의 불활성화, 시약의 첨가 등을 포함할 수 있다. 또한, 상기 시료로부터 핵산 및 단백질을 분리하여 검출에 사용할 수 있다.
The term biological samples or samples used in the present invention include blood and other liquid samples of biologic origin, biopsy specimens, solid tissue samples such as tissue culture, or cells derived therefrom. More specifically, it may be a tissue, an extract, a cell lysate, a whole blood, a plasma, a serum, a saliva, an ophthalmic solution, a cerebrospinal fluid, a sweat, a urine, a milk, a plural liquid, a synovial fluid, a peritoneal fluid and the like. The sample can be obtained from an animal, preferably a mammal, most preferably a human. The sample can be pretreated prior to use in detection. For example, it may include filtration, distillation, extraction, concentration, inactivation of interfering components, addition of reagents, and the like. Further, nucleic acid and protein can be separated from the sample and used for detection.

본 발명의 일 실시예에서는 난소암에서 SRA1의 발현이 증가됨을 확인하였다. SRA1 lncRNA의 발현을 난소암 조직(n=14) 및 상응하는 정상 조직(n=16)에서 qRT-PCR를 이용하여 측정한 결과, 난소암 조직에서 SRA1 발현은 비종양 조직에서 보다 3.5 배 정도 높이 나타났으며 (도 1), 이는 난소암에서 SRA1의 발현이 비조절됨을 의미하는 것이다.
In one embodiment of the present invention, SRA1 expression was increased in ovarian cancer. The expression of SRA1 lncRNA was measured by qRT-PCR in ovarian cancer tissues (n = 14) and corresponding normal tissues (n = 16). The expression of SRA1 in ovarian cancer tissues was 3.5 times higher (Fig. 1), indicating that SRA1 expression is unregulated in ovarian cancer.

또한, 본 발명의 다른 실시예에서는 OVCA429 세포에 siSRA1을 형질주입하여 세포 증식의 여부를 관찰하였다. 즉, 난소암에서 SRA1의 기능적 역할을 결정하기 위하여, siRNA을 이용하여 SRA1 발현을 하향 조절시켰다. 이를 위하여, OVCAR3, SKOV3, TOV112D, OVCA433, 및 OVCA429 난소암 세포주에서 SRA1발현을 qRT-PCR를 이용하여 우선 측정하였다. 도 2에 나타난 바와 같이, SRA1 발현은 OVCA429, TOV112D, SKOV3 세포에서 OVCA433 및 OVCAR3 세포에서보다 더 높다. 따라서, SRA1 발현이 높게 나타난 OVCA429 세포가 SRA1 녹다운에 사용된다. SRA1 유전자 특이적 siRNA의 효율을 평가하기 위하여, 세포를 24 시간동안 SRA1 siRNA로 형질주입하였고 그 결과, SRA1 RNA 발현이 60% 감소하였다 (도 3A). 이후 난소암 세포 성장에서 SRA1의 역할을 연구하기 위하여, siSRA1이 형질주입된 OVCA429 세포가 CCK-8 분석에 사용되었다. 음성 대조구 siRNA와 비교하여 siSRA1을 형질주입한 OVCA429 세포에서 siSRA1 형질주입 후 72 시간 및 96 시간에서 세포 성장을 감소시켰다 (도 3B). 이러한 결과는 SRA1이 난소암 세포의 증식과 관련이 있음을 보여준다.
In another embodiment of the present invention, siSRA1 was transfected into OVCA429 cells to observe cell proliferation. In other words, to determine the functional role of SRA1 in ovarian cancer, SRA1 expression was down-regulated using siRNA. For this purpose, SRA1 expression was first measured in ovarian cancer cell lines OVCAR3, SKOV3, TOV112D, OVCA433, and OVCA429 using qRT-PCR. As shown in Figure 2, SRA1 expression is higher in OVCA429, TOV112D, SKOV3 cells than in OVCA433 and OVCAR3 cells. Thus, OVCA429 cells with high SRA1 expression are used in SRA1 knockdown. To evaluate the efficiency of SRA1 gene-specific siRNA, cells were transfected with SRA1 siRNA for 24 hours, resulting in a 60% reduction in SRA1 RNA expression (Figure 3A). To investigate the role of SRA1 in ovarian cancer cell growth, siSRA1 transfected OVCA429 cells were used for CCK-8 analysis. In comparison with negative control siRNA, cell growth was reduced at 72 hours and 96 hours after siSRA1 transfection in OVCA429 cells transfected with siSRA1 (Fig. 3B). These results show that SRA1 is involved in the proliferation of ovarian cancer cells.

또한, 본 발명은 또다른 실시예에서는 SRA1에 의한 난소암 세포의 이동 및 침습에 관한 역할을 확인하였다. 세포의 이동 및 침습에 대한 SRA1의 기능적 역할을 결정하기 위하여, siSRA1-형질주입된 세포를 상처 치유 및 마트리젤 침습 분석에 각각 이용하였다. 상처 폐쇄(closure)의 넓이는 siRNA negative control (siNC)-형질주입된 세포보다 siSRA1-형질주입된 세포에서 더 크다 (도 4A). 따라서, SRA1의 하향 조절은 난소암 세포의 이동을 감소시켰다. SRA1의 녹다운은 OVCA429 세포 침습을 95% 이상 저해하였다 (도 4B). 이러한 결과는 SRA1이 난소암 세포의 이동 및 침습을 증가시킨다는 것을 보여준다.
In addition, the present invention confirms the role of SRA1 in ovarian cancer cell migration and invasion in another embodiment . To determine the functional role of SRA1 on cell migration and invasion, siSRA1-transfected cells were used for wound healing and matrigel invasion assays, respectively. The extent of wound closure is greater in siRNA-infected cells than in siRNA negative control (siNC) -transfected cells (Fig. 4A). Thus, downregulation of SRA1 reduced the migration of ovarian cancer cells. The knockdown of SRA1 inhibited OVCA429 cell invasion by 95% or more (FIG. 4B). These results indicate that SRA1 increases the migration and invasion of ovarian cancer cells.

난소암 세포주에서의 In ovarian cancer cell lines SRA1SRA1 발현 측정 Expression measurement

<1-1> 난소암 세포주 준비<1-1> Preparation of ovarian cancer cell line

<1-1-1> 인간 조직
<1-1-1> Human tissue

난소암 샘플은 2007년 내지 2012년 사이에 연세 세브란스 병원에서 수술받은 14명의 여성 환자로부터 획득하였다. 병존하는 부인과 암을 가진 환자의 시편은 이 연구에서 배제하였다. 무종양 조직(n=16)을 대조군으로 확보하였다. 모든 시편은 액상 질소에서 급냉하여 RNA 추출시까지 -80도에서 보존하였다. 본 연구는 헬싱키 선언의 기초에 따라 수행되었고, 연세 세브란스 병원 윤리 위원회에 의하여 승인을 받았다.
Ovarian cancer samples were obtained from 14 female patients who underwent surgery at Yonsei Severance Hospital between 2007 and 2012. Specimens from patients with coexisting gynecologic cancers were excluded from this study. (N = 16) as a control group. All specimens were quenched in liquid nitrogen and stored at -80 ° C until RNA extraction. This study was conducted on the basis of the Helsinki Declaration and was approved by the Yonsei Severance Hospital Ethics Committee.

<1-1-2> 세포 배양
<1-1-2> Cell culture

인간 상피 난소암 세포주 OVCAR3, OVCA433, OVCA429, TOV112D 및 SKOV3를 Dulbecco's Modified Eagle Medium에 배양하고, HEK293 세포를 RPMI-1640 medium (Gibco-BRL, Gaithersburg, MD, USA)에서 배양하였다. 배양 배지는 10% (vol/vol) 태아 소 혈청 및 페니실린/스트렙토마이신을 첨가하였다. 모든 세포주는 5% CO2 및 95% 공기의 습윤화된 대기에서 37°C로 유지하였다. 모든 실험에 사용된 세포의 계대수는 20계대를 넘기지 않았다.
Human epithelial ovarian cancer cell lines OVCAR3, OVCA433, OVCA429, TOV112D and SKOV3 were cultured in Dulbecco's Modified Eagle Medium and HEK293 cells were cultured in RPMI-1640 medium (Gibco-BRL, Gaithersburg, MD, USA). The culture medium was supplemented with 10% (vol / vol) fetal bovine serum and penicillin / streptomycin. All cell lines were maintained at 37 ° C in a humidified atmosphere of 5% CO 2 and 95% air. The number of cells used in all experiments did not exceed 20 passages.

<1-2> 정량적 실시간 폴리머라아제 연쇄 반응(qRT-PCR)
<1-2> Quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR)

SRA1 lncRNA의 농도를 측정하였다. TRIzol® reagent (Invitrogen Corp., Carlsbad, CA, USA)를 이용하여 OVCA429 세포주 및 난소암 샘플 및 무종양 조직 샘플(100 mg)로부터 전체 RNA를 추출하고, 역전사 시약 키트(Invitrogen)를 사용하여 전체 RNA 중 2 μg를 역전사하여 cDNA를 만들었다. SYBR® Green Real-time PCR Kit (TOYOBO Co. Ltd, Osaka, Japan)를 이용하여, SYBR® Green master PCR mix 10 μl, 각 순방향 및 역방향 프라이머 5 pmole, 희석된 cDNA 주형 1 μl, 및 적절한 양의 멸균 증류수를 함유하는 20-μl 반응부피에서 qRT-PCR를 수행하였다. SRA1 lncRNA의 증폭 조건은 다음과 같다: 95°C 에서 3분간 초기 변성; 95°C에서 15초간 변성, 60°C에서 60초간 어닐링 및 72°C에서 60초간 신장(elongation)의 40 사이클; 그리고 72°C에서 5분간 최종 신장 단계를 ABI StepOnePlus Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)에서 qRT-PCR을 수행하였다. 모든 정량화는 U6로 수행하였다. PCR 프라이머 서열은 다음과 같다: SRA1 : 5′-CTCCCTTCTTACCACCACCA-3′(sense), 5′-TGCAGATACACAGGGAGCAG-3′ (antisense); and U6, 5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′(sense), 5′-AACGCTTCAGGAATTTGCGT-3′ (antisense). 상대적 유전자 발현은 2△△CT 방법을 이용하여 분석하였고, 그 결과는 대조군에 있어서 변화의 정도로서 표현되었다. qRT-PCR 실험은 적어도 3회 반복하였다.
The concentration of SRA1 lncRNA was measured. Total RNA was extracted from OVCA429 cell line and ovarian cancer samples and a tumor tissue sample (100 mg) using TRIzol® reagent (Invitrogen Corp., Carlsbad, Calif., USA) and total RNA was extracted using a reverse transcription reagent kit (Invitrogen) 2 &lt; / RTI &gt; of the cDNA was reverse transcribed to generate cDNA. 10 μl of SYBR® Green master PCR mix, 5 pmoles of each forward and reverse primer, 1 μl of diluted cDNA template, and the appropriate amount of template DNA using SYBR® Green Real-time PCR Kit (TOYOBO Co. Ltd, Osaka, Japan) QRT-PCR was performed in a 20-μl reaction volume containing sterile distilled water. The amplification conditions for SRA1 lncRNA were as follows: initial denaturation at 95 ° C for 3 min; 40 cycles of denaturation at 95 ° C for 15 seconds, annealing at 60 ° C for 60 seconds, and elongation at 72 ° C for 60 seconds; The final extension step at 72 ° C for 5 min was performed by qRT-PCR in the ABI StepOnePlus Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA). All quantification was performed with U6. The PCR primer sequences are: SRA1 : 5'-CTCCCTTCTTACCACCACCA-3 '(sense), 5'-TGCAGATACACAGGGAGCAG-3'(antisense); and U6 , 5'-CTCGCTTCGGCAGCACA-3 '(sense), 5'-AACGCTTCAGGAATTTGCGT-3' (antisense). Relative gene expression was analyzed using the 2 △ ΔCT method and the results were expressed as the degree of change in the control group. The qRT-PCR experiment was repeated at least 3 times.

SRA1 lncRNA의 발현은 난소암 조직(n=14) 및 상응하는 정상 조직(n=16)에서 qRT-PCR를 이용하여 측정하였다. 그 결과, 난소암 조직에서 SRA1 발현은 비종양 조직에서 보다 3.5 배 정도 나타난다 (도 1). 이는 난소암에서 SRA1의 발현이 비조절됨을 시사하는 것이다.
Expression of SRA1 lncRNA was measured using qRT-PCR in ovarian cancer tissues (n = 14) and corresponding normal tissues (n = 16). As a result, SRA1 expression in ovarian cancer tissues is about 3.5 times higher than in non-tumor tissues (Fig. 1). This suggests that the expression of SRA1 is unregulated in ovarian cancer.

난소암 세포주에서 세포 증식 분석Cell proliferation assay in ovarian cancer cell line

<2-1> 소 간섭(Small interfering) RNA (siRNA) 형질주입(transfection)
<2-1> Small interfering RNA (siRNA) transfection

SRA1 siRNA (siSRA1) 및 음성 대조구 siRNA (siNC)를 Bioneer (Daejeon, Korea)에서 구입하였다. OVCA429 세포 (3×105 cells/well)를 6-well 플레이트에 접종하고, G-Fectin Kit (Genolution Pharmaceuticals Inc.,Seoul, Korea)를 이용하여 siRNA 20 nM으로 형질주입하였다. 이러한 siRNA-형질주입된 세포를 생체외 실험 분석하기 위하여 형질주입한지 48 시간 후에 이용하였다. SAR1 siRNA의 표적 서열은 다음과 같다: siRNA, 5' -CUC AUA ACA UGC AUU UCA AUU -3'
SRA1 siRNA (siSRA1) and negative control siRNA (siNC) were purchased from Bioneer (Daejeon, Korea). OVCA429 cells (3 × 10 5 cells / well) were inoculated into 6-well plates and transfected with 20 nM siRNA using G-Fectin Kit (Genolution Pharmaceuticals Inc., Seoul, Korea). These siRNA-transfected cells were used 48 hours after transfection for in vitro experiment analysis. The target sequence of SAR1 siRNA is as follows: siRNA, 5'-CUC AUA ACA UGC AUU UCA AUU -3 '

<2-2> 난소암 세포주에서 SRA1 녹다운에 의한 세포 증식 분석
<2-2> Analysis of cell proliferation by SRA1 knockdown in ovarian cancer cell line

세포 증식을 Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay (Dojindo Laboratories, Kumamoto, Japan)을 이용하여 평가하였다. OVCA429 세포(1×104 cells/well)를 100 μL의 완전배지에서 96-well 평평한 바닥 플레이트에 접종하였다. 세포를 밤새 항온처리하여 세포를 부착시켜 회수하고, siNC 또는 siSRA1로 24, 48, 72 및 96 시간동안 형질주입시켰다. CCK-8 용액(10 μL)를 각 웰에 첨가하고, 세포를 추가 2시간 동안 항온처리하였다. 흡수율을 450 nm에서 마이크로플레이트 리더를 사용하여 측정하였다. 독립적 실험을 3회 반복 수행하였다.
Cell proliferation was evaluated using Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay (Dojindo Laboratories, Kumamoto, Japan). OVCA429 cells (1 × 10 4 cells / well) were inoculated into 96-well flat bottom plates in 100 μL complete medium. The cells were incubated overnight by incubation with cells, and transfected with siNC or siSRA1 for 24, 48, 72 and 96 hours. CCK-8 solution (10 [mu] L) was added to each well, and the cells were incubated for an additional 2 hours. Absorbance was measured at 450 nm using a microplate reader. Independent experiments were repeated three times.

난소암에서 SRA1의 기능적 역할을 결정하기 위하여, siRNA을 이용하여 SRA1 발현을 하향 조절시켰다. 이를 위하여, OVCAR3, SKOV3, TOV112D, OVCA433, 및 OVCA429 난소암 세포주에서 SRA1발현을 qRT-PCR를 이용하여 우선 측정하였다. 도 2에 나타난 바와 같이, SRA1 발현은 OVCA429, TOV112D, SKOV3 세포에서 OVCA433 및 OVCAR3 세포에서보다 더 높다. 따라서, SRA1 발현이 높게 나타난 OVCA429 세포가 SRA1 녹다운에 사용된다. SRA1 유전자 특이적 siRNA의 효율을 평가하기 위하여, 세포를 24 시간동안 SRA1 siRNA로 형질주입하였고 그 결과, SRA1 RNA 발현이 60% 감소하였다 (도 3A). 이후 난소암 세포 성장에서 SRA1의 역할을 연구하기 위하여, siSRA1이 형질주입된 OVCA429 세포가 CCK-8 분석에 사용되었다. 음성 대조구 siRNA와 비교하여 siSRA1을 형질주입한 OVCA429 세포에서 siSRA1 형질주입 후 72 시간 및 96 시간에서 세포 성장을 감소시켰다 (도 3B). 이러한 결과는 SRA1이 난소암 세포의 증식과 관련이 있음을 보여준다.
In order to determine the functional role of SRA1 in ovarian cancer, SRA1 expression was down-regulated using siRNA. For this purpose, SRA1 expression was first measured in ovarian cancer cell lines OVCAR3, SKOV3, TOV112D, OVCA433, and OVCA429 using qRT-PCR. As shown in Figure 2, SRA1 expression is higher in OVCA429, TOV112D, SKOV3 cells than in OVCA433 and OVCAR3 cells. Thus, OVCA429 cells with high SRA1 expression are used in SRA1 knockdown. To evaluate the efficiency of SRA1 gene-specific siRNA, cells were transfected with SRA1 siRNA for 24 hours, resulting in a 60% reduction in SRA1 RNA expression (Figure 3A). To investigate the role of SRA1 in ovarian cancer cell growth, siSRA1 transfected OVCA429 cells were used for CCK-8 analysis. In comparison with negative control siRNA, cell growth was reduced at 72 hours and 96 hours after siSRA1 transfection in OVCA429 cells transfected with siSRA1 (Fig. 3B). These results show that SRA1 is involved in the proliferation of ovarian cancer cells.

난소암 세포주에서 Ovarian cancer cell line SRA1SRA1 에 의한 세포 Cells by 이동능Mobile ability 측정 Measure

siNC 또는 siSRA1 (3×105 cells/well)가 형질주입된 OVCA429 세포를 혈청함유 배지를 갖는 6-well 배양 플레이트에 접종하고, 세포 밀도가 약 90% confluence 하도록 배양하였다. 혈청-함유 배지를 제거하고, 세포를 24 시간동안 혈청을 주입하지 않았다. 세포 밀도가 약 100% confluence되면, 멸균 200-μL 피펫 팁으로 단일층을 스크래칭하여 인공의 균등한 상처를 만들었다. 스크래칭 후, 세포를 무혈청 배지로 세척하였다. 상처로 세포가 이동하는 사진을 현미경을 이용하여 0, 24 그리고 48 시간에 촬영하였다. 상기 분석을 3회 반복 수행하였다.
OVCA429 cells transfected with siNC or siSRA1 (3 × 10 5 cells / well) were inoculated on a 6-well culture plate with serum-containing medium and cultured to a cell density of about 90% confluence. The serum-containing medium was removed and the cells were not injected with serum for 24 hours. When the cell density was about 100% confluent, a monolayer was scrunched with a sterile 200-μL pipette tip to create an artificial equivalent wound. After scratching, the cells were washed with serum-free medium. Photographs of cell migration into the wound were taken at 0, 24 and 48 hours using a microscope. The analysis was repeated three times.

세포의 이동 및 침습에 대한 SRA1의 기능적 역할을 결정하기 위하여, siSRA1-형질주입된 세포를 상처 치유 분석에 이용하였다. 상처 폐쇄(closure)의 넓이는 siNC-형질주입된 세포보다 siSRA1-형질주입된 세포에서 더 크다(도 4A). 따라서, SRA1의 하향 조절은 난소암 세포의 이동을 감소시켰다. 이러한 결과는 SRA1이 난소암 세포의 이동능을 증가시킨다는 것을 보여준다.
To determine the functional role of SRA1 for cell migration and invasion, siSRA1-transfected cells were used for wound healing assays. The extent of wound closure is greater in siSRA1-transfected cells than siNC-transfected cells (Fig. 4A). Thus, downregulation of SRA1 reduced the migration of ovarian cancer cells. These results show that SRA1 increases the ability of ovarian cancer cells to migrate.

난소암 세포주에서 Ovarian cancer cell line SRA1SRA1 에 의한 세포 Cells by 침습능Invasiveness 분석 analysis

매트리겔 침습 분석(Matrigel invasion assay)을 BD Biocoat Matrigel Invasion Chamber (pore size: 8 mm, 24-well; BD Biosciences, Bedford, MA, USA)를 사용하여 수행하였다. siSRA1-형질주입된 세포 및 siNC-형질주입된 OVCA429 세포 (5×104cell/plate)를 무혈청 배지에서 상층 챔버에서 플레이트하고, 완전 배지를 하층 챔버에 첨가하였다. 매트리겔 침습 챔버를 48 시간동안 37°C에서 5% CO2 하에서 수행하였다. 비침습 세포를 면봉을 이용하여 상층 챔버에서 제거하였다. 필터의 아래측면에 포어를 통하여 침습하는 세포를 염색하였다 (Diff Quik, Sysmes, Kobe, Japan). 그리고 이것들을 헤모사이토미터를 이용하여 계수하였다. 상기 분석을 3회 이상 반복하였다.
Matrigel invasion assays were performed using a BD Biocoat Matrigel Invasion Chamber (pore size: 8 mm, 24-well; BD Biosciences, Bedford, MA, USA). siSRA1-transfected cells and siNC-transfected OVCA429 cells (5 x 10 4 cells / plate) were plated in serum-free medium in the upper chamber and complete medium was added to the lower chamber. A matrigel invasion chamber for 48 hours at 37 ° C 5% CO 2 Lt; / RTI &gt; Non-invasive cells were removed from the upper chamber using a cotton swab. Cells invading through the pore were stained on the lower side of the filter (Diff Quik, Sysmes, Kobe, Japan). And these were counted using a hemocytometer. The analysis was repeated three more times.

세포의 침습에 대한 SRA1의 기능적 역할을 결정하기 위하여, siSRA1-형질주입된 세포를 마트리젤 침습 분석에 이용하였다. 음성 대조구 siRNA와 비교하여 SRA1을 형질주입한 OVCA429 세포에서 세포 침습을 95% 이상 저해하였다 (도 4B). 이러한 결과는 SRA1이 난소암 세포의 침습을 증가시킨다는 것을 보여준다.
To determine the functional role of SRA1 on cell invasion, siSRA1-transfected cells were used for matrigel invasion assays. Inhibited cell invasion by 95% or more in OVCA429 cells transfected with SRA1 as compared to negative control siRNA (Fig. 4B). These results show that SRA1 increases the invasion of ovarian cancer cells.

난소암 세포주에서 Ovarian cancer cell line SRA1SRA1 에 의한  On by MMPMMP -9 및 -9 and VEGFVEGF 발현 조절 Regulation of expression

OVCA429 세포를 siNC 또는 siSRA1를 이용하여 48 시간동안 형질주입시킨 후, 차가운 0.01 M PBS (pH 7.2)로 세척하고, 프로테아제 저해제가 첨가된 라이시스 버퍼(50 mM Tris-HCl [pH 7.4], 150 mM 식염수, 1% NonidetP-40, 및 0.1% 나트륨 도데실 설페이트[SDS])로 용해시켰다. 단백질 농도는 Bio-Rad protein assay reagent를 이용하여 Bradford method (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA)에 따라 측정하였다. 샘플을 5분동안 끓이고, 10% SDS-폴리아크릴아미드 젤에서 전기영동시키고, 폴리비닐리덴 디플루오라이드 멤브레인(Millipore, Billerica, MA, USA)으로 이동시켰다. 이후 5% 탈지분유가 포함된 0.1% Tween 20을 함유하는 1× Tris 완충된 식염수(TBST; pH7.6) 용액에서 1시간동안 실온에서 반응시켰다. 그리고 계속 교반하면서 4°C 에서 밤새 1차 항체와 함께 반응시켰다. 사용된 1차 항체는 마우스 항-인간 VEGF 항체(1:1000 희석; BD Biosciences), 토끼 항-인간 MMP-9 항체(1:1000 희석; Cell Signaling, Beverly, MA, USA), 및 마우스 항-인간 β-액틴 항체(1:10000 dilution; Sigma, St. Louis, MO, USA)를 포함한다. 멤브레인을 1× TBST로 3회 세척하고, 호스래디쉬 퍼시다제-컨쥬게이트된 항-토끼 2차 항체(1:3000 희석; Abcam, Cambridge, MA, USA) 또는 항-마우스 2차 항체(1:3000 희석; Abcam)와 함께 1 시간동안 실온에서 계속 교반하에 항온처리시켰다. 이후 1× TBST로 3회 세척하였다. 단백질을 enhanced chemiluminescence system (ECL™; Amersham, Little Chalfont, UK)을 이용하여 시각화시키고, 밴드 강도를 Luminescent Image Analyzer (LAS-4000 mini, Fujifilm, Uppsala, Sweden)를 이용하여 정량화하였다. VEGF 및 MMP-9 발현은 β-액틴의 발현으로 평균화되었다. siSRA1-형질전환된 세포에서 VEGF 및 MMP-9 발현은 siNC-형질주입된 세포의 백분율(100%)로 표현된다.
OVCA429 cells were transfected with siNC or siSRA1 for 48 hours, washed with cold 0.01 M PBS (pH 7.2), lysed with protease inhibitor (50 mM Tris-HCl [pH 7.4], 150 mM Saline, 1% Nonidet P-40, and 0.1% sodium dodecyl sulfate [SDS]). Protein concentrations were determined by the Bradford method (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA) using the Bio-Rad protein assay reagent. Samples were boiled for 5 minutes, electrophoresed in 10% SDS-polyacrylamide gel, and transferred to a polyvinylidene difluoride membrane (Millipore, Billerica, MA, USA). The cells were then reacted for 1 hour at room temperature in 1 × Tris buffered saline (TBST; pH 7.6) solution containing 0.1% Tween 20 containing 5% skimmed milk powder. And reacted with the primary antibody overnight at 4 ° C with continued stirring. The primary antibodies used were mouse anti-human VEGF antibody (1: 1000 dilution; BD Biosciences), rabbit anti-human MMP-9 antibody (1: 1000 dilution; Cell Signaling, Beverly, Mass., USA) Human β-actin antibody (1: 10000 dilution; Sigma, St. Louis, Mo., USA). Membranes were washed 3 times with 1 x TBST and incubated with horseradish pericase-conjugated anti-rabbit secondary antibody (1: 3000 dilution; Abcam, Cambridge, MA, USA) or anti- 3000 dilution; Abcam) for 1 hour at room temperature. And then washed three times with 1 x TBST. Proteins were visualized using an enhanced chemiluminescence system (ECL ™; Amersham, Little Chalfont, UK) and band intensities were quantified using a Luminescent Image Analyzer (LAS-4000 mini, Fujifilm, Uppsala, Sweden). VEGF and MMP-9 expression were averaged by expression of [beta] -actin. Expression of VEGF and MMP-9 in siSRA1-transformed cells is expressed as a percentage of siNC-transfected cells (100%).

MMP-9 및 VEGF는 이동과 침습을 증진함으로써 암의 진행에 중요한 역할을 한다. 따라서, 이러한 단백질의 발현 수준에 미치는 SRA1의 효과는 OVCA429 세포에서 결정된다. MMP-9 및 VEGF 단백질 발현은 siNC-형질주입된 세포에서 보다 siSRA1-형질주입된 세포에서 훨씬 더 낮았다 (도 5A와 5B). 모두 고려하여 볼때, 이러한 결과들은 SRA1가 MMP-9 및 VEGF 발현의 상향 조절을 통하여 난소암 세포의 이동 및 침습을 증진시킴을 보여주는 것이다. MMP-9 and VEGF play an important role in cancer progression by promoting migration and invasion. Thus, the effect of SRA1 on the expression level of these proteins is determined in OVCA429 cells. MMP-9 and VEGF protein expression was much lower in siSRA1-transfected cells than in siNC-transfected cells (FIGS. 5A and 5B). Taken together, these results demonstrate that SRA1 promotes ovarian cancer cell migration and invasion through upregulation of MMP-9 and VEGF expression.

<110> Industry-Academic Cooperation Foundation, Yonsei University <120> BIOMAREKR FOR DIAGNOSIS OF OVARIAN CANCER CELLS <130> 4635 <160> 5 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for PCR <400> 1 ctcccttctt accaccacca 20 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for PCR <400> 2 tgcagataca cagggagcag 20 <210> 3 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for PCR <400> 3 ctcgcttcgg cagcaca 17 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for PCR <400> 4 aacgcttcag gaatttgcgt 20 <210> 5 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> si RNA <400> 5 cucauaacau gcauuucaau u 21 <110> Industry-Academic Cooperation Foundation, Yonsei University <120> BIOMAREKR FOR DIAGNOSIS OF OVARIAN CANCER CELLS <130> 4635 <160> 5 <170> Kopatentin 2.0 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for PCR <400> 1 ctcccttctt accaccacca 20 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for PCR <400> 2 tgcagataca cagggagcag 20 <210> 3 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for PCR <400> 3 ctcgcttcgg cagcaca 17 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for PCR <400> 4 aacgcttcag gaatttgcgt 20 <210> 5 <211> 21 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> siRNA <400> 5 cucauaacau gcauuucaau u 21

Claims (9)

난소암 진단에 필요한 정보를 제공하기 위해, 환자의 시료로부터 얻은 RNA에서 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1) long non-coding RNA의 레벨을 검출하는 방법.
A method for detecting the level of homo sapiens steroid receptor activator 1 (SRA1) long non-coding RNA in RNA from a patient's sample to provide information needed to diagnose ovarian cancer.
제1항에 있어서,
상기에서 정상군의 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1)의 레벨을 기준으로 하는 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1) long non-coding RNA의 상대적인 레벨이 측정되는 것을 특징으로 하는 방법.
The method according to claim 1,
Wherein the relative level of the homo sapiens steroid receptor activator 1 (SRA1) long non-coding RNA based on the level of the normal group of homo sapiens steroid receptor activator 1 (SRA1) is measured.
삭제delete 제1항에 있어서, 다음의 단계를 포함하는 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1) long non-coding RNA의 레벨을 검출하는 방법:
(i) 환자의 시료에서 RNA를 추출하는 단계;
(ii) 추출된 RNA에서 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1) long non-coding RNA을 증폭하는 단계; 및
(iii) 정상군의 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1)의 레벨과 시료의 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1) long non-coding RNA의 레벨을 비교하는 단계.
The method according to claim 1, wherein the level of long non-coding RNA is detected in a homo sapiens steroid receptor activator 1 (SRA1) comprising the steps of:
(i) extracting RNA from a sample of a patient;
(ii) amplifying homo sapiens steroid receptor activator 1 (SRA1) long non-coding RNA from the extracted RNA; And
(iii) comparing the level of the homo sapiens steroid receptor activator 1 (SRA1) in the normal group with the level of the homo sapiens steroid receptor activator 1 (SRA1) long non-coding RNA in the sample.
제4항에 있어서, 상기 추출된 RNA를 증폭하는 단계는 PCR를 이용하는 방법.
5. The method of claim 4, wherein amplifying the extracted RNA is performed using PCR.
제5항에 있어서, 상기 PCR에서 SRA1 lncRNA의 증폭 조건은 95°C 에서 3분간 초기 변성; 95°C에서 15초간 변성, 60°C에서 60초간 어닐링, 및 72°C에서 60초간 신장(elongation)의 40 사이클; 그리고 72°C에서 5분간 최종 신장을 특징으로 하는 방법.
6. The method according to claim 5, wherein the amplification conditions of SRA1 lncRNA in the PCR are initial denaturation at 95 ° C for 3 minutes; 40 cycles of denaturation at 95 ° C for 15 seconds, annealing at 60 ° C for 60 seconds, and elongation at 72 ° C for 60 seconds; And a final elongation at 72 ° C for 5 minutes.
제6항에 있어서, 상기 PCR에 사용되는 PCR 프라이머 서열은 다음 서열번호 1 내지 4에서 선택되는 하나 또는 그 이상인 것을 특징으로 하는 방법.

서열번호 1: 5′-CTCCCTTCTTACCACCACCA-3′(sense),
서열번호 2: 5′-TGCAGATACACAGGGAGCAG-3′ (antisense);
서열번호 3: 5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′(sense),
서열번호 4: 5′-AACGCTTCAGGAATTTGCGT-3′ (antisense).
7. The method according to claim 6, wherein the PCR primer sequence used in the PCR is one or more selected from the following SEQ ID NOS: 1 to 4.

SEQ ID NO: 1: 5'-CTCCCTTCTTACCACCACCA-3 '(sense),
SEQ ID NO: 2: 5'-TGCAGATACACAGGGAGCAG-3 '(antisense);
SEQ ID NO: 3: 5'-CTCGCTTCGGCAGCACA-3 '(sense)
SEQ ID NO: 4: 5'-AACGCTTCAGGAATTTGCGT-3 '(antisense).
서열번호 5로 표시되는 siRNA를 포함하는 난소암 치료용 조성물.
서열번호 5: 5' -CUC AUA ACA UGC AUU UCA AUU -3'
A composition for treating ovarian cancer, comprising the siRNA represented by SEQ ID NO: 5.
SEQ ID NO: 5: 5 '-CUC AUA ACA UGC AUU UCA AUU -3'
제8항에 있어서, 상기 서열번호 5로 표시되는 siRNA는 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1) long non-coding RNA를 차단하는 것을 특징으로 하는 난소암 치료용 조성물.9. The composition for treating ovarian cancer according to claim 8, wherein the siRNA represented by SEQ ID NO: 5 blocks homo sapiens steroid receptor activator 1 (SRA1) long non-coding RNA.
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