KR101111351B1 - Pre-stained protein size marker based on synthetic nonionic hydrophilic polymers - Google Patents
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Abstract
본 발명은 미리 염색된 단백질 크기 마커에 관한 것으로, 보다 상세하게는 합성 비이온성의 친수성 고분자에 기반한 미리 염색된 단백질 크기 마커에 관한 것이다. 본 발명에서 제시하는 방법에 의하면, 미리 염색된 크기 마커의 원재료로 통상 이용되던 단백질들 대신에 보다 용이하게 확보 가능하고 단순한 분자 구조를 가진 물질인 합성 비이온성의 친수성 고분자를 원재료로 사용할 수 있어, 미리 염색된 단백질 크기 마커의 원재료 확보가 용이해지며 제조 공정 제어 또한 용이해지는 효과를 얻을 수 있다. The present invention relates to prestained protein size markers, and more particularly to prestained protein size markers based on synthetic nonionic hydrophilic polymers. According to the method proposed in the present invention, synthetic nonionic hydrophilic polymers, which are more easily secured and have a simple molecular structure, can be used as raw materials instead of proteins commonly used as raw materials for pre-stained size markers. It is easy to secure the raw material of the pre-stained protein size marker and control the manufacturing process.
미리 염색된 단백질 크기 마커, 합성 비이온성의 친수성 고분자 Prestained Protein Size Markers, Synthetic Nonionic Hydrophilic Polymers
Description
본 발명은 미리 염색된 단백질 크기 마커에 관한 것으로, 보다 상세하게는 합성 비이온성의 친수성 고분자에 기반한 미리 염색된 단백질 크기 마커에 관한 것이다. The present invention relates to prestained protein size markers, and more particularly to prestained protein size markers based on synthetic nonionic hydrophilic polymers.
단백질 크기 마커(protein size marker)는, 일반적으로 모든 바이오 관련 연구 및 개발에 있어서의 단백질의 확인 및 분석을 위해 실시하는 전기영동(electrophoresis)에서 젤(gel) 상의 목적 단백질의 크기를 추정하기 위한 목적으로 사용되어 지는 제품이다. 초기에 개발된 단백질 크기 마커는 전기영동이 끝난 후 젤에 있는 단백질의 염색(staining) 과정을 통하여 목적 단백질과 단백질 크기 마커를 함께 가시화(visualization)시키는 방법으로 이용되었다. 그 후 목적 단백질의 크기 추정에서의 편리성 제공 외에 전기영동 시에 전기영동의 실시간(real-time) 진행 정도를 관찰(monitoring)하기 위한 수단(tool)으로 사용하기 위한 목적으로 미리 염색된 단백질 크기 마커(pre-stained protein size marker)가 개발되게 되었다. 염색이 되어 있지 않은 일반적인 단백질 크기 마커(unstained protein size marker)와는 달리 미리 염색된 단백질 크기 마커는 단백질 크기 마커를 구성하는 단백질들이 색을 내는 화학물질(즉, 염료)로 염색이 되어 있다. 따라서 미리 염색된 단백질 크기 마커는 별도의 염색 과정 없이도 그 자체가 색을 갖고 있기 때문에 전기영동 때부터 개별 구성 밴드(band)가 보이게 된다. 이러한 미리 염색된 단백질 크기 마커는 전기영동 시의 전기영동의 실시간 관찰 외에도 전기영동 한 젤을 이용한 웨스턴 블럿팅(western blotting)에서의 전기적 이동(electro-transfer) 단계에서 젤로부터 멤브레인(membrane)으로의 단백질 이동(transfer) 정도를 추정하는 데에도 이용된다.Protein size markers are aimed at estimating the size of a target protein on gels in electrophoresis, which is typically performed for identification and analysis of proteins in all bio-related research and development. It is used as a product. Initially developed protein size markers were used to visualize the target protein and protein size markers together by staining the protein in the gel after electrophoresis. Prestained protein size for later use as a tool for monitoring the real-time progress of electrophoresis during electrophoresis in addition to providing convenience in estimating the size of the target protein Marker (pre-stained protein size marker) has been developed. Unlike unstained protein size markers (unstained protein size markers), prestained protein size markers are stained with chemicals (ie dyes) that color the proteins that make up the protein size marker. Therefore, the prestained protein size markers have their own color even without a separate staining process, so that individual constituent bands are visible from the electrophoresis. These prestained protein size markers, in addition to the real-time observation of electrophoresis during electrophoresis, can be transferred from gel to membrane in an electro-transfer step in western blotting using electrophoretic gels. It is also used to estimate the degree of protein transfer.
종래의 미리 염색된 단백질 크기 마커의 제조에는 일반적인 단백질 크기 마커에서와 같이 원재료로 단백질을 사용하여 제조한다. 이러한 원재료 단백질들은 천연에서 추출(extraction)되어 이용되거나 보다 효과적으로는 재조합단백질 생산기술(recombinant protein expression)을 통하여 생산한 후 분리?정제하여 사용한다. 통상의 경우 단백질 크기 마커는 다양한 크기의 단백질 밴드로 구성되기 때문에 이러한 다양한 크기의 단백질 밴드를 제공하기 위해서는 당연히 다양한 크기의 단백질들이 원재료로 활용되어야만 한다. Conventional pre-stained protein size markers are prepared using the protein as raw material, as in conventional protein size markers. These raw proteins are extracted and used in nature, or more effectively, they are produced through recombinant protein expression and then separated and purified. In general, since the protein size marker is composed of protein bands of various sizes, in order to provide such protein bands of various sizes, proteins of various sizes must be used as raw materials.
단백질의 경우 크기가 다른 것은 그 종류가 달라져야만 가능하다. 이런 이유로 종래의 단백질 크기 마커의 제조에 사용되는 단백질 원재료는 하나의 단백질 크기 마커의 제조에도 여러 개가 사용되어야만 했다. 이러한 서로 다른 종류의 단백질들을 준비하는 데에는 각 단백질마다 그 단백질에 적합한 생산 및 분리/정제 공정이 적용되어야 하고 이에 따른 부담은 상당하였다. 특히 최종 제조되는 단백질 크기 마커의 성능이 원재료 단백질의 정제 수준에 크게 의존하기 때문에 이들 원재료 단백질들의 정제 정도는 매우 중요하다. 그런데, 세포 배양체(cell culture) 또는 천연물질(natural source)로부터 단백질을 정제하는 것은 이것들이 처음부터 다른 단백질들을 다양하게 포함하고 있기 때문에 상당히 어려운 작업이다. 이에 따라 통상적으로 이에는 많은 비용 및 시간을 필요로 한다. 또한 이것들로부터 특정 단백질을 분리/회수하는 것은 복잡하고 어려운 과정들로 이루어지는 것이 일반적이기 때문에 특정 단백질의 회수 수율(yield)도 높지 않다. In the case of proteins, different sizes are possible only if the types are different. For this reason, several protein raw materials used to prepare conventional protein size markers had to be used for the production of one protein size marker. To prepare these different kinds of proteins, each protein had to be subjected to a production and separation / purification process suitable for that protein, and the burden was considerable. In particular, since the performance of the final protein size marker is highly dependent on the level of purification of the raw protein, the degree of purification of these raw proteins is very important. By the way, purifying proteins from cell cultures or natural sources is a very difficult task since they contain a variety of other proteins from the beginning. This typically requires a lot of money and time. In addition, the recovery / recovery of specific proteins is not high, since it is common for complex and difficult processes to separate / recover specific proteins from them.
한편, 기본적으로 단백질은 다양한 종류의 아미노산의 중합체이기 때문에 단백질에 따라 염료가 부가될 수 있는 작용기(functional group)의 종류도 다양하게 되고 그 개수도 천차만별이다. 이러한 단백질마다의 작용기의 종류의 차이로 인하여 단백질에 같은 염료를 부가시킨다 하더라도 그 결과는 판이할 수밖에 없으며 개별 단백질마다 적절한 조건을 설정한 후 적용하여야 한다. 또한 작용기의 수도 단백질 간에 다르고 그 수가 단백질 한 분자 당 상당히 많다는 것도 염료 부가반응 제어 측면에서는 바람직하지 않다. 사소한 반응 조건의 차이에서 단백질 한 분자에 결합한 염료의 수가 크게 달라지게 되어 결과적으로 같은 한 가지 단백질에서 출발했다 하더라도 염료가 부가된 단백질/염료 복합체(complex)는 매우 다양하게 된다. 단백질을 미리 염색된 단백질 크기 마커의 원재료로 사용하는 종래 의 경우에서는 대부분, 단백질의 전체에 대하여 무작위적으로 염료를 결합시킨다. 이럴 경우 균일한 종류(즉, 단백질 한 분자 당 결합한 염료의 수가 일정한 것)만을 얻는 데는 한계가 있게 되고 통상적으로 여러 종류의 단백질/염료 복합체가 공존하게 된다. 이러한 다양한 복합체는 전기영동에서 움직이는 양태가 서로 다르게 되기 때문에 결국 단백질 크기 마커의 밴드를 보다 퍼지게 한다. On the other hand, since proteins are basically polymers of various kinds of amino acids, there are various kinds of functional groups to which dyes can be added depending on proteins, and the number of them varies widely. Even if the same dye is added to the protein due to the difference in the functional group of each protein, the result is inevitable and should be applied after setting appropriate conditions for each protein. It is also undesirable from the standpoint of dye addition reaction control that the number of functional groups varies between proteins and that the number is quite large per molecule of protein. Due to the difference in the reaction conditions, the number of dyes bound to one molecule of protein varies greatly, and as a result, the protein / dye complex to which the dye is added varies even if the same protein is started. In the conventional case of using a protein as a raw material of a prestained protein size marker, dyes are randomly bound to the whole protein. In this case, there is a limit in obtaining only a uniform type (that is, a constant number of dyes bound per molecule of protein), and usually several kinds of protein / dye complexes coexist. These different complexes eventually lead to more spreading of the bands of protein size markers because of their differing behavior in electrophoresis.
또한, 단백질에 염료를 효율적으로 부가시키기 위해서는 단백질이 갖고 있던 고유의 입체구조를 풀어주어야 한다. 이를 단백질 변성이라 한다. 이러한 단백질 변성은 다양한 방식으로 구현될 수 있지만 단백질 크기 마커와 관련하여서는 단백질 변성에 계면활성제와 열을 이용하는 변성 방식이 널리 이용된다. 그러나 단백질은 상당히 복잡한 물질이고 그 종류마다 차이가 크기 때문에 각 단백질마다 변성되는 정도의 차이가 다르게 된다. 이러한 단백질의 변성 정도가 일정하게 달성되어야만 이를 이용한 염료 부가 반응의 결과가 일정할 수 있다. 그러나 단백질 변성 정도를 일정하게 제어하는 것은 현실적으로 매우 어렵다. In addition, in order to efficiently add dyes to proteins, the inherent conformation of proteins must be released. This is called protein denaturation. Such protein denaturation can be implemented in a variety of ways, but with regard to protein size markers, denaturation methods using surfactants and heat for protein denaturation are widely used. However, because proteins are quite complex substances and their kinds vary greatly, the degree of degeneration of each protein is different. The degree of denaturation of these proteins must be consistently achieved so that the result of the dye addition reaction using them can be constant. However, controlling the degree of protein denaturation in reality is very difficult in reality.
이러한 단백질을 미리 염색된 단백질 크기 마커 제조의 원재료로 사용함에 따라 발생하는 단점을 해결하기 위해서는 단백질과는 완전히 다른 새로운 소재에 기반한 미리 염색된 단백질 크기 마커의 개발이 필요하다.In order to solve the drawbacks of using these proteins as raw materials for the preparation of pre-stained protein size markers, it is necessary to develop pre-stained protein size markers based on new materials completely different from proteins.
본 발명자들은 미리 염색된 단백질 크기 마커의 제조를 위한 원료물질로 단백질을 배제한 비-단백질 소재로부터 찾고자 노력한 결과, 합성 비이온성의 친수성 고분자를 이용한 미리 염색된 단백질 크기 마커를 제조하는 방법을 개발함으로써 본 발명을 완성하였다. The present inventors have tried to find a protein-free non-protein material as a raw material for the production of pre-stained protein size markers. The invention has been completed.
본 명세서 전체에 걸쳐 다수의 논문 및 특허문헌이 참조되고 그 인용은 괄호 내에 표시되어 있다. 인용된 논문 및 특허문헌의 개시 내용은 그 전체로서 본 명 세서에 참조로 삽입되어 본 발명이 속하는 기술 분야의 수준과 본 발명의 내용이 보다 명확하게 설명된다.Throughout this specification, numerous papers and patent documents are referenced and their citations are indicated in parentheses. The disclosures of cited papers and patent documents are incorporated by reference into the specification as a whole, and the level of the technical field to which the present invention belongs and the contents of the present invention are more clearly explained.
따라서 본 발명은 이러한 종래기술의 문제점과 과거로부터 요청되어온 기술적 과제를 해결하는 것을 목적으로 한다. Therefore, an object of the present invention is to solve the problems of the prior art and the technical problem that has been requested from the past.
본 발명의 목적은 합성 비이온성의 친수성 고분자를 원재료로 한 미리 염색된 단백질 크기 마커의 제조 방법을 제공하는 것이다.It is an object of the present invention to provide a method for producing prestained protein size markers based on synthetic nonionic hydrophilic polymers.
본 발명의 또 다른 목적은 합성 비이온성의 친수성 고분자를 원재료로 한 미리 염색된 단백질 크기 마커를 제공하는 것이다. It is still another object of the present invention to provide a prestained protein size marker based on synthetic nonionic hydrophilic polymers.
상기와 같은 본 발명의 과제를 해결하기 위하여, 본 발명은 비-단백질 성분 중에서 합성 비이온성의 친수성 고분자를 원재료로 한 미리 염색된 단백질 크기 마커 및 그것의 제조 방법을 제공한다.In order to solve the problems of the present invention as described above, the present invention provides a prestained protein size marker based on a synthetic nonionic hydrophilic polymer among non-protein components and a method for producing the same.
상기 합성 비이온성의 친수성 고분자는 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 여러 가지의 합성 고분자들로부터 선택되어질 수 있으며, 이에 국한되지 않지만, 폴리에틸렌글리콜, 폴리프로필렌글리콜, 폴리에틸렌프로필렌글리콜, 폴리부틸렌글리콜, 폴리프로필렌부틸렌글리콜, 및 폴리에틸렌 옥시드로 이루어진 군에서 선택되는 것이 바람직하다. 특히 폴리에틸렌글리콜은 이미 당분야에서 다른 여러 가지의 목적으로 널리 사용되고 있어 친숙하고, 상업적으로 이용 가능한 분자량의 범위가 다양하고, 옥시에틸렌 골격이 본 발명의 적용에 적합한 친수성 성질을 갖고 있기 때문에 가장 바람직하다 할 수 있다.The synthetic nonionic hydrophilic polymer may be selected from various synthetic polymers according to a method that can be easily carried out by those skilled in the art, but is not limited thereto. , Polypropylene glycol, polyethylene propylene glycol, polybutylene glycol, polypropylene butylene glycol, and polyethylene oxide is preferably selected from the group consisting of. In particular, polyethylene glycol is the most preferred since it is already widely used for various purposes in the art and has a wide range of familiar, commercially available molecular weights, and an oxyethylene skeleton has hydrophilic properties suitable for application of the present invention. can do.
상기 합성 비이온성의 친수성 고분자들은 친수성이라는 공통의 특징을 가지며 비록 전하를 갖고 있지 않은 중성의 고분자체(neutral polymer without charge)이지만 통상의 전기영동 조건(즉, standard Laemmli SDS-PAGE condition) 하에서는 SDS(Sodium Dodecyl Sulfate)와 같은 이온성 계면활성제들(ionic surfactants)과 반응(interaction)하여 음전하(negative charge)를 갖는 복합체(complex)를 형성할 수 있다(J. Phys. Chem. B 108: 8960-8969, 2004). 이러한 음전하를 갖는 복합체는 전기영동 시의 전기장(electric field)에서는 젤(gel) 속에서 이동할 수 있다 (Electrophoresis 28: 2801-2807, 2007). 본 발명은 이러한 성질을 이용하는 것이다. SDS 외에 다른 이온성 계면활성제들(ionic surfactants)이 상기의 효과를 나타낼 수 있지만 통상의 전기영동에서는 SDS를 계면활성제로 널리 사용하므로 특별한 이유가 없다면 SDS를 사용하는 것이 바람직하다. The synthetic nonionic hydrophilic polymers have a common feature of hydrophilicity, and although they are neutral polymers without charge, they are classified under normal electrophoresis conditions (ie, standard Laemmli SDS-PAGE conditions). It can react with ionic surfactants such as sodium dodecyl sulfate to form a complex with negative charge (J. Phys. Chem. B 108: 8960-8969 , 2004). These negatively charged complexes can migrate in gels in the electric field of electrophoresis (Electrophoresis 28: 2801-2807, 2007). The present invention utilizes these properties. In addition to SDS, other ionic surfactants may exhibit the above effect, but in general electrophoresis, SDS is widely used as a surfactant, and thus, SDS is preferable unless there is a specific reason.
상기의 합성 비이온성의 친수성 고분자들은 구조상 선형(linear)이거나 가지형(branched)일 수가 있다. 가지형도 일종의 복잡한 구조이라고 할 수 있으므로 제조의 용이성 등을 고려할 때 선형이 본 발명에 가장 바람직한 고분자의 구조라 할 수 있다.The synthetic nonionic hydrophilic polymers may be linear or branched in structure. Since the branched form is also a kind of complicated structure, the linear is the most preferable structure of the polymer in consideration of the ease of manufacture and the like.
상기의 합성 비이온성의 친수성 고분자가 단백질 크기 마커의 원재료로 사용되기 위해서는 단백질 크기 마커를 구성하는 여러 밴드에 적합한 몇 종류의 다른 크기(분자량)를 갖도록 제조되어야 한다. 합성 비이온성의 친수성 고분자의 경우에는 단백질에서처럼 이를 달성하기 위해서 그 종류를 바꿀 필요는 없다. 단지 그것의 중합도(degree of polymerization)만을 조절함으로써 같은 단량체(monomer)로 구성된 여러 분자량의 고분자들을 제조할 수 있다. 이는 고분자 합성에 익숙한 당업자라면 용이하게 실시할 수 있으므로 이에 대한 자세한 설명은 생략한다.In order to use the synthetic nonionic hydrophilic polymer as a raw material of the protein size marker, the synthetic nonionic hydrophilic polymer should be prepared to have several different sizes (molecular weights) suitable for the various bands constituting the protein size marker. For synthetic nonionic hydrophilic polymers, there is no need to change their type to achieve this, as with proteins. By controlling only its degree of polymerization, polymers of different molecular weights composed of the same monomer can be prepared. This can be easily carried out by those skilled in the art of polymer synthesis, so a detailed description thereof will be omitted.
그런데 각 해당 밴드의 원재료로 사용되어질 합성 비이온성의 친수성 고분자는 가급적 좁은 범위에서 분자량의 분포를 가져야 한다. 통상적으로 고분자 제조에서는 완벽하게 중합도를 제어하는 것이 어렵기 때문에 한 번의 반응에서 합성된 고분자들 간에는 약간의 분자량 차이가 발생한다. 이를 다분산성(polydispersity)이라 한다. 본 발명을 원활히 구현하기 위해서는, 허용 정도에 대한 특별한 제한은 없으나 그 분자량의 분포 범위가 좁으면 좁을수록 좋다. 분자량 분포가 좁을수록(낮은 다분산성을 가질수록) 이를 원재료로 사용하여 최종 제조되는 미리 염색된 단백질 크기 마커에서의 해당 밴드가 퍼지지 않게 되어 결과적으로 미리 염색된 단백질 크기 마커의 성능이 좋아진다. 미리 염색된 단백질 크기 마커의 성능으로는 밴드의 뚜렷함과 예리함을 들 수 있다. 밴드가 퍼질수록 상기 성능들은 떨어지게 된다. 최근은 고분자 합성 기술이 크게 진보하여 제조되는 합성 고분자의 분자량 크기의 범위를 상당히 좁게 제어할 수 있다. 이러한 합성되는 고분자의 분자량 제어 기술은 고분자 합성에 익숙한 당업자라면 용이하게 실시할 수 있으므로 이에 대한 자세한 설명은 생략한다.However, synthetic nonionic hydrophilic polymers to be used as raw materials of the respective bands should have a molecular weight distribution in the narrow range as much as possible. In general, it is difficult to control the degree of polymerization completely in the production of polymers, so there is a slight molecular weight difference between the polymers synthesized in one reaction. This is called polydispersity. In order to implement the present invention smoothly, there is no particular limitation on the degree of tolerance, but the narrower the distribution range of the molecular weight, the better. The narrower the molecular weight distribution (the lower the polydispersity), the less the spread of the corresponding bands in the pre-stained protein size markers that are finally produced using this as a raw material, resulting in better performance of the pre-stained protein size markers. The performance of prestained protein size markers is the sharpness and sharpness of the bands. As the band spreads, the performances fell. In recent years, the polymer synthesis technology has been greatly advanced, and the range of the molecular weight size of the synthetic polymer produced can be controlled very narrowly. Since the molecular weight control technology of the polymer to be synthesized can be easily carried out by those skilled in the art of polymer synthesis, a detailed description thereof will be omitted.
미리 염색된 단백질 크기 마커를 제조하기 위해서는 상기의 합성 비이온성의 친수성 고분자에 염료를 결합시켜야 한다. 이를 위해서는 보통의 합성 비이온성의 친수성 고분자 자체는 염료와의 반응성이 떨어지기 때문에 염료와 반응할 수 있는 작용기를 상기의 합성 비이온성의 친수성 고분자에 도입시켜야 한다. 이러한 과정을 활성화(activation)라 한다. 상기 활성화는 합성 비이온성의 친수성 고분자의 중간이나 말단 어느 곳이나 그 대상 위치로 선택할 수 있다. 그러나 실제 구현을 위해서는 제조법상의 이유로 말단이 가장 좋은 도입 위치이다. 이러한 화학 작용기를 도입하는 방식으로 구현되는 활성화는 유기화학에 익숙한 당업자라면 용이하게 실시할 수 있으므로 이에 대한 자세한 설명은 생략한다. In order to prepare prestained protein size markers, dyes must be bound to the synthetic nonionic hydrophilic polymers. For this purpose, since the general synthetic nonionic hydrophilic polymer itself is inferior in reactivity with the dye, a functional group capable of reacting with the dye should be introduced into the synthetic nonionic hydrophilic polymer. This process is called activation. The activation can be selected at the target position anywhere in the middle or at the end of the synthetic nonionic hydrophilic polymer. However, for practical implementation the terminal is the best introduction position for manufacturing reasons. Activation implemented by introducing such chemical functional groups can be easily performed by those skilled in the art of organic chemistry, and thus a detailed description thereof will be omitted.
참고로, 폴리에틸렌글리콜(Polyethylene glycol, PEG)을 활성화 시키는 방법에 대하여 간단히 설명하면, 메톡시폴리에틸렌글리콜로부터 단일 작용기를 갖는 유도체를 합성할 수 있다(Pharmaceutical Science & Technology Today 1: 352-356, 1998). 폴리에틸렌글리콜의 한쪽 히드록시기(hydroxy group)를 메칠에테르기(methyl ether group)로 치환시키고, 나머지 한쪽 히드록시기에 친전자성 물질(electrophile)을 함유한 작용기를 결합시킴으로 한 쪽 말단만이 활성화된 폴리에틸렌글리콜을 제조할 수 있다(Pharmaceutical Science & Technology Today 1: 352-356, 1998). 양 쪽 말단의 활성화도 유사하다. For reference, a brief description of a method of activating polyethylene glycol (PEG) can be used to synthesize derivatives having a single functional group from methoxy polyethylene glycol (Pharmaceutical Science & Technology Today 1: 352-356, 1998). . By replacing one hydroxy group of polyethylene glycol with a methyl ether group and bonding a functional group containing an electrophile to the other hydroxy group, polyethylene glycol having only one terminal activated (Pharmaceutical Science & Technology Today 1: 352-356, 1998). Activation at both ends is similar.
합성 비이온성의 친수성 고분자의 말단에 작용기를 도입할 경우에도 양 말단에 도입하거나 한 쪽 말단에만 도입할 수 있다. 한 쪽 말단에만 작용기를 도입한 합성 비이온성의 친수성 고분자를 원재료로 사용하는 경우는 염료가 부가될 수 있는 위치가 하나뿐이므로 염료 부가 반응의 제어가 보다 용이하나(즉, 염료가 부가 되든지 안 되든지의 두 경우만 존재) 합성 비이온성의 친수성 고분자 한 분자당 부가될 수 있는 염료가 하나밖에 되지 않으므로 결과적으로 같은 염료를 사용할 경우에 두 개의 염료가 부가되는 경우에 비하여 당연히 발색 정도가 약하다는 단점이 있다. 양쪽 말단에 활성화 그룹을 도입한 합성 비이온성의 친수성 고분자를 원재료로 사용하는 경우는 염료가 부가될 수 있는 위치가 둘이므로 염료 부가 반응의 제어가 하나뿐일 때에 비하여 어려워 일정한 산물(product)을 얻고자 하는 목적에서는 변수가 보다 존재하는 단점이 있지만(즉, 염료가 하나 부가된 경우, 염료가 둘 부가된 경우, 및 염료가 부가되지 않은 경우의 세 가지 경우가 존재) 합성 비이온성의 친수성 고분자 한 분자 당 부가될 수 있는 염료의 수가 한 쪽 말단만을 이용하는 경우에 비해 많기 때문에 보다 강력한 발색이 가능하다. 이런 서로간의 장단점이 존재하기 때문에 합성 비이온성의 친수성 고분자의 활성화를 위한 화학 작용기의 도입 시에 한쪽 말단에만 적용할지 양 말단 모두에 적용할 지는 실시자의 선택에 전적으로 의존하게 된다.Even when a functional group is introduced at the terminal of the synthetic nonionic hydrophilic polymer, it may be introduced at both ends or only at one end. When using a synthetic nonionic hydrophilic polymer having a functional group only at one end as a raw material, the dye addition reaction is easier to control because there is only one position where dye can be added (ie, whether dye is added or not). There is only one dye that can be added per molecule of synthetic nonionic hydrophilic polymer. As a result, when using the same dye, the degree of color development is weaker than when two dyes are added. have. When using a synthetic nonionic hydrophilic polymer having an activation group at both ends as a raw material, since there are two positions where dye can be added, it is difficult to control a dye addition reaction, thereby obtaining a constant product. For the purposes of this study, there are disadvantages in that there are more variables (ie, when one dye is added, two dyes are added, and three dyes are not added). Since the number of dyes that can be added per molecule is large compared to the case where only one end is used, more powerful color development is possible. Because of these mutual strengths and weaknesses, the application of chemical functional groups for the activation of synthetic nonionic hydrophilic polymers depends entirely on the choice of practitioner, whether it is applied to one end or both ends.
참고로 발색 정도를 보다 강화시키기 위해 복수개의 염료들을 미리 고분자체에 결합시켜 제조한 염료 공여체를 한 번에(en bloc) 한 쪽 말단에 부가시킬 수도 있다. 이렇게 될 경우 합성 비이온성의 친수성 고분자의 한 쪽 말단을 이용함에도 불구하고 염료를 하나만 부가시킬 경우에 비하여 훨씬 강화된 발색 정도를 확보할 수 있다. 이러한 기술은 염료 관련 분야에서 널리 알려져 있으므로 이에 대한 자세한 관련 설명 제시는 생략한다.For reference, in order to further enhance the color development, a dye donor prepared by combining a plurality of dyes in advance with a polymer may be added at one end at an end (en bloc). In this case, even though one end of the synthetic nonionic hydrophilic polymer is used, much enhanced color development can be obtained than when only one dye is added. Such techniques are well known in the dye-related art and therefore detailed descriptions thereof are omitted.
이러한 활성화를 통하여 작용기가 도입된 합성 비이온성의 친수성 고분자를 합성 비이온성의 친수성 고분자의 유도체라 통상적으로 지칭한다. 이러한 유도체는 공지의 방법을 이용하여 매우 다양하게 준비될 수 있다. 이에 대한 상세한 설명을 생략하는 대신에 활성화된 폴리에틸렌글리콜 유도체의 대표적인 예 몇 개를 제시하도록 하겠다. 폴리에틸렌글리콜 유도체로는 PEG-엔-하이드록시석신이미드-활성화된 에스테르(PEG-N-hydroxysuccinimide-activated esters), PEG-에폭사이드(PEG-epoxide), PEG-트레실레이트(PEG-tresylate), PEG-카보닐 이미다졸(PEG-carbonyl imidazole), PEG-니트로페닐 카보네이트(PEG-nitrophenyl carbonates), PEG-알데하이드(PEG-aldehyde), PEG-아민(PEG-amine), PEG-이소시아나이트(PEG-isocyanate), PEG-하드라지드(PEG-hydrazide) 등이 있다. Synthetic nonionic hydrophilic polymers into which functional groups are introduced through such activation are commonly referred to as derivatives of synthetic nonionic hydrophilic polymers. Such derivatives can be prepared in a wide variety of ways using known methods. Instead of omitting detailed descriptions, some representative examples of activated polyethylene glycol derivatives will be presented. Polyethylene glycol derivatives include PEG-N-hydroxysuccinimide-activated esters, PEG-epoxide, PEG-tresylate, PEG-carbonyl imidazole, PEG-nitrophenyl carbonates, PEG-aldehydes, PEG-amines, PEG-isocyanates -isocyanate), PEG-hydrazide and the like.
상기 활성화된 합성 비이온성의 친수성 고분자에의 염료 부가에 이용될 수 있는 염료로는 일반적인 염료나 형광 염료가 모두 이용될 수 있다. 사용 가능한 일반적인 염료의 예로는 이에 국한되지 않지만, Caledon SF, Cassulfon, Indigo, Imperon, Levafix, Procion, Remazol, Sirius (이상, 상표명) 등을 들 수 있다. 또한, 형광 염료로는 이에 국한되지 않지만 Dansyl, Fluorescein, Texas Red, Cascade Blue, Cascade Yellow, Erythrosin, Coumarin, NBD, Pacific Blue, PyMPO, Pyrene, Phycoerythrin, Cy2, Cy3, Cy5, Cy7, NBD-Phallacidin (이상, 상표명) 등을 들 수 있다.As a dye that can be used for dye addition to the activated synthetic nonionic hydrophilic polymer, both general dyes and fluorescent dyes can be used. Examples of common dyes that can be used include, but are not limited to, Caledon SF, Cassulfon, Indigo, Imperon, Levafix, Procion, Remazol, Sirius (trade name), and the like. Fluorescent dyes also include but are not limited to Dansyl, Fluorescein, Texas Red, Cascade Blue, Cascade Yellow, Erythrosin, Coumarin, NBD, Pacific Blue, PyMPO, Pyrene, Phycoerythrin, Cy2, Cy3, Cy5, Cy7, NBD-Phallacidin ( The above is a brand name).
이러한 염료를 활성화된 합성 비이온성의 친수성 고분자의 유도체에 부가시키기 위해서는 합성 비이온성의 친수성 고분자의 활성화 부위와 결합할 수 있는 작용기를 가진 형태로 상기 염료도 준비되어야 한다. 이를 위해 염료들은 다양한 유 도체의 형태로 준비된다. 예를 들어, 석씨니미딜 에스테르(succinimidyl esters), 이소티오시아네이트(isothiocyanates), 카르복실산(carboxylic acids), 술포닐 클로라이드(sulfonyl chlorides) 등의 형태의 유도체들이 선택적으로 사용될 수 있다. 이러한 유도체의 제조도 유기화학에 익숙한 당업자라면 용이하게 실시할 수 있으므로 이에 대한 자세한 설명은 생략한다. In order to add such a dye to the derivative of the activated synthetic nonionic hydrophilic polymer, the dye must also be prepared in a form having a functional group capable of binding to an active site of the synthetic nonionic hydrophilic polymer. To this end, dyes are prepared in the form of various derivatives. For example, derivatives in the form of succinimidyl esters, isothiocyanates, carboxylic acids, sulfonyl chlorides and the like may optionally be used. The preparation of such derivatives can also be easily carried out by those skilled in the art of organic chemistry, and thus a detailed description thereof will be omitted.
그런데, 이러한 염료의 유도체는 아무 형태로 제조되어서는 안 되고 반드시 합성 비이온성의 친수성 고분자 유도체와 반응할 수 있는 형태이어야 한다. 이는 염료와 합성 비이온성의 친수성 고분자 유도체와의 결합에 이용하고자 하는 화학결합(chemical bond)의 종류가 결정되면 자연스럽게 결정될 수 있다. 이는 유기화학에 익숙한 당업자라면 용이하게 실시할 수 있으므로 이에 대한 자세한 설명은 생략한다. 참고로, 다양한 염료 유도체들이 상업적으로 판매되고 있다. 따라서 적절한 것을 선택하여 사용하면 된다.However, derivatives of these dyes should not be prepared in any form, but must be in a form capable of reacting with a synthetic nonionic hydrophilic polymer derivative. This can be naturally determined when the type of chemical bond to be used for bonding the dye with the synthetic nonionic hydrophilic polymer derivative is determined. This can be easily carried out by those skilled in the art of organic chemistry, so a detailed description thereof will be omitted. For reference, various dye derivatives are sold commercially. Therefore, you may select the appropriate one.
합성 비이온성의 친수성 고분자 유도체와 염료 유도체와의 결합에 이용 가능한 화학반응은, 예를 들어, 축합반응(condensation), 아실화 반응(acylation), 에스테르화 반응(esterification), 리덕티브 알킬레이션(reductive alkylation) 등 많은 유기화학반응들에 의해 달성될 수 있다. 이도 유기화학에 익숙한 당업자라면 용이하게 실시할 수 있으므로 이에 대한 자세한 설명은 생략한다.Chemical reactions that can be used to bond synthetic nonionic hydrophilic polymer derivatives with dye derivatives include, for example, condensation, acylation, esterification, and reductive alkylation. It can be achieved by many organic chemical reactions such as alkylation). This can be easily carried out by those skilled in the art of organic chemistry, so a detailed description thereof will be omitted.
본 발명은 종래의 단백질 소재 기반의 미리 염색된 단백질 크기 마커 제조를 대체할 수 있는 기술을 제공하며, 종래 기술에 비하여 보다 용이한 방법으로 미리 염색된 단백질 크기 마커의 대량 생산에 적합하게 원재료를 확보할 수 있는 수단을 제공해 줄 수 있다. 또한 미리 염색된 단백질 크기 마커의 각 밴드를 구성하는 물질을 보다 균일하게 제조할 수 있어 최종 미리 염색된 단백질 크기 마커의 성능을 개선시킬 수 있다. 구체적으로, 본 발명에 따라 합성 비이온성의 친수성 고분자를 종래의 단백질을 대체하여 사용하면, 단백질 변성 단계를 배제 시킬 수 있으며, 단백질을 사용한 경우에 비하여 염료가 부가될 위치로의 접근이 용이해져 반응 효율이 개선되며, 다수의 염료 부가 위치가 존재하고 이러한 부가 위치들을 구성하는 화학 작용기가 다양한 단백질의 사용에 비해 일정한 제한된 수의 염료 부가 위치를 제공하고 이에 더하여 구성하는 화학 작용기의 반응성이 동일하기 때문에 염료 부가 반응의 제어가 용이하며, 염료가 부가된 복합체의 분리/정제도 용이해 진다. 특히 미리 염색된 단백질 크기 마커가 바이오 관련 연구 및 개발에서 가장 흔하게 사용되는 제품이란 점과 미리 염색된 단백질 크기 마커의 사용이 일반화되고 있는 연구 분위기를 고려할 때 산업적 활용을 크게 기대할 수 있다. The present invention provides a technique that can replace the production of a pre-stained protein size marker based on a conventional protein material, and secures the raw material suitable for mass production of a pre-stained protein size marker in an easier way than the conventional technology It can provide a means to do it. In addition, the material constituting each band of the prestained protein size marker can be prepared more uniformly, thereby improving the performance of the final prestained protein size marker. Specifically, by using a synthetic nonionic hydrophilic polymer according to the present invention in place of a conventional protein, a protein denaturation step can be eliminated, and access to a position to which a dye will be added becomes easier as compared to the case where a protein is used. The efficiency is improved, because there are multiple dye addition sites and the chemical functionalities that make up these additional positions provide a certain limited number of dye addition sites compared to the use of various proteins and in addition the reactivity of the constituent chemical functionalities is the same The dye addition reaction can be easily controlled, and the separation / purification of the dye-added complex is facilitated. In particular, industrial use can be expected in consideration of the fact that prestained protein size marker is the most commonly used product in bio-related research and development, and the research atmosphere in which the use of prestained protein size marker is becoming common.
상기한 바와 같이, 본 발명은 비-단백질 소재인 합성 비이온성의 친수성 고분자를 원재료로 한 미리 염색된 단백질 크기 마커를 제공하는 것이다. As described above, the present invention provides a prestained protein size marker based on a synthetic nonionic hydrophilic polymer which is a non-protein material.
이하, 본 발명의 내용을 보다 상세하게 설명하지만, 해당 기술 분야의 숙련된 당업자라면 본 발명의 사상 및 영역으로부터 벗어나지 않는 범위 내에서 본 발명을 다양하게 수정 및 변경시킬 수 있음을 이해할 수 있을 것이다.Hereinafter, the content of the present invention will be described in more detail, but it will be understood by those skilled in the art that the present invention may be variously modified and changed without departing from the spirit and scope of the present invention.
본 발명의 하기 실시예에서는 합성 비이온성의 친수성 고분자의 활성화된 형 태로 PEG-아민이 사용되고, 염료로는 Remazole 염료가 사용되며, 합성 비이온성의 친수성 고분자 유도체와 염료의 결합에는 아미노 그룹과 비닐 설폰(vinyl-sulfone) 그룹 간의 축합 반응이 활용되고 있으나, 이는 본 발명의 이해를 위해 제공되는 하나의 예에 불과하며 본 발명이 이에 국한되지 않음은 당연하다.In the following examples of the present invention, PEG-amine is used as an activated form of a synthetic nonionic hydrophilic polymer, a Remazole dye is used as a dye, and an amino group and vinyl sulfone are used to bond the synthetic nonionic hydrophilic polymer derivative and the dye. Although condensation reactions between (vinyl-sulfone) groups are utilized, this is only one example provided for understanding the present invention, and the present invention is not limited thereto.
참고로, 하기 실시예를 제시함에 있어, 합성 비이온성의 친수성 고분자 유도체에 염료를 부가시킨 후 이를 분리/정제한 용액을 편의상 “1차 고분자/염료 복합체 용액”으로 지칭하고, 이러한 여러 종류의 “1차 고분자/염료 복합체 용액”을 혼합하여 제조되는 용액을 “2차 고분자/염료 복합체 용액”으로 지칭하고, 이렇게 제조된 “2차 고분자/염료 복합체 용액”을 통상의 전기영동에서 사용하는 시료 로딩 완충액(sample loading buffer)과 혼합하여 제조된 용액을 “미리 염색된 단백질 크기 마커 용액”으로 지칭하겠다.For reference, in the following examples, a solution in which a dye is added to a synthetic nonionic hydrophilic polymer derivative and then separated / purified is referred to as a “primary polymer / dye complex solution” for convenience. A solution prepared by mixing the "primary polymer / dye complex solution" is referred to as "secondary polymer / dye complex solution", and the sample loading using the "secondary polymer / dye complex solution" thus prepared in conventional electrophoresis Solutions prepared by mixing with sample loading buffer will be referred to as “prestained protein size marker solution”.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 보다 구체적으로 설명하지만, 이들 실시예는 본 발명의 예시일 뿐이며 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples, but these Examples are merely illustrative of the present invention, and the scope of the present invention is not limited to these Examples.
실시예Example 1: 합성 1: synthetic 비이온성의Nonionic 친수성 고분자 유도체와 염료 유도체의 결합 Combination of Hydrophilic Polymer Derivatives and Dye Derivatives
상업적으로 활용 가능한 PEG-아민 (분자량: 20,000; P1AM-20, 선바이오, 한국)을 구매하여 합성 비이온성의 친수성 고분자 유도체로 이용하였다. 상기 PEG-아민을 pH 11인 125 mM Na2CO3 완충액(buffer)에 최종 PEG 농도가 20 mg/ml이 되게 녹였다. 이를 “PEG 용액”이라 지칭하겠다. 또 염료 유도체로는 비닐 설폰반응성 염료(vinyl-sulfone reactive dye)인 Remazol Brilliant Blue R special (DyStar로부터 구입), Remazol Brilliant Orange 3R spec gran (Dystar로부터 구입), Remazol Brilliant Red F3B gran (Dystar로부터 구입)와 Uniblue A sodium salt (Sigma로부터 구입)를 사용하였으며, 이들 각각을 물에 최종적으로 400 mg/ml이 되게 녹여 사용하였다. 이렇게 준비된 용액은 “염료 용액”으로 지칭하겠다. 상기 제조된 PEG 용액과 각 염료 용액을 부피비로 5 : 1 이 되게 혼합한 후, 이를 60℃ 항온조에 30분 방치하여 염료 유도체가 PEG-아민에 부가되게 하였다. 부가 반응이 종료된 후 이를 항온조에서 꺼내어 상온에서 20분 방치하여 반응액을 상온까지 식혔다. 이렇게 하여 얻어진 PEG 유도체에 염료가 부가된 결합체의 용액을 제조하였다.Commercially available PEG-amine (molecular weight: 20,000; P1AM-20, Sunbio, Korea) was purchased and used as a synthetic nonionic hydrophilic polymer derivative. The PEG-amine was dissolved in 125
실시예Example 2: 1차 고분자/염료 복합체 용액의 제조 2: Preparation of Primary Polymer / Dye Complex Solution
실시예 1에서 제조된 PEG 유도체에 염료가 부가된 결합체의 용액에는 반응하지 않고 남은 많은 미반응의 염료 유도체가 포함되어 있다. “1차 고분자/염료 복합체 용액”은 상기 PEG 유도체에 염료가 부가된 결합체의 용액에서 미반응된 염료 유도체를 제거해 줌으로써 얻을 수 있다. 이에는 다양한 분리 정제법이 활용될 수 있지만, 당분야에서 널리 이용되는 방법인 젤-여과법(gel-filtration)의 사용이 가장 용이하다. 이러한 젤-여과법은 화학 및 생물학 분야에서 다양한 목적으로 활용되고 있는 공지의 기술이다. 본 실시예에서 사용한 젤-여과법을 간략히 제시하면 다음과 같다. 통상 상업적으로 이용 가능한 Sephadex G-25 (Amersham Bioscience)를 구매하여 물에 최종 10%(w/v)가 되도록 부유 시켰다. 이를 하루 정도 상온 또는 냉장 보관하면서 Sephadex G-25 가루가 충분히 부풀게 하였다. 그 다음 이를 냉장 보관하면서 사용하였다. 실제 분리 단계에서는 상기 Sephadex G-25 부유액을 spin-column용 tube(Prober, 인트론바이오테크놀로지)에 부어 원심분리를 통하여 물을 제거한 후 사용하였다. 이렇게 물이 제거된 Sephadex G-25 column에 실시예 1에서 제조된 PEG 유도체에 염료가 부가된 결합체의 용액을 600 μl를 첨가하고 이를 400× g 수준에서 2분간 원심분리하였다. 이를 통하여 얻어진 여과액을 새로운 Sephadex G-25 column에 가한 후 원심분리를 추가로 실시하였다. 이와 같은 단계를 원심분리 후에도 Sephadex G-25 column의 충진제(packed matrix)가 염료의 색을 거의 띄지 않을 때까지 반복하였다. 이를 통하여 “1차 고분자/염료 복합체 용액”을 얻었다. The solution of the binder to which the dye was added to the PEG derivative prepared in Example 1 contained many unreacted dye derivatives which remained unreacted. A "primary polymer / dye complex solution" can be obtained by removing unreacted dye derivative from a solution of a binder in which dye is added to the PEG derivative. Various separation and purification methods can be used for this, but gel-filtration, which is a method widely used in the art, is most easily used. Such gel-filtration is a known technique that is utilized for various purposes in chemistry and biology. The gel-filtration method used in this example is briefly shown as follows. Commercially available Sephadex G-25 (Amersham Bioscience) was purchased and suspended in water to a final 10% (w / v). This was enough to swell Sephadex G-25 powder for one day at room temperature or refrigerated. It was then used while refrigerated. In the actual separation step, the Sephadex G-25 suspension was poured into a spin-column tube (Prober, Intron Biotechnology) and used after removing water through centrifugation. Thus, 600 μl of the solution of the conjugate to which the dye was added to the PEG derivative prepared in Example 1 was added to the Sephadex G-25 column from which water was removed, and this was centrifuged at 400 × g for 2 minutes. The filtrate thus obtained was added to a new Sephadex G-25 column and further centrifuged. This step was repeated even after centrifugation until the packed matrix of the Sephadex G-25 column had almost no color of the dye. Through this, a "primary polymer / dye complex solution" was obtained.
실시예Example 3: 미리 염색된 단백질 크기 3: prestained protein size 마커Marker 용액의 제조 Preparation of the solution
실시예 2에서 얻어진 “1차 고분자/염료 복합체 용액”을 이용하여 “미리 염색된 단백질 크기 마커 용액”을 제조하였다. 이를 위해 실시예 2에서 얻어진 각 “1차 고분자/염료 복합체 용액”에 같은 부피의 시료 로딩 완충액(4% SDS, 125 mM Tris-HCl, 10 mM EDTA, 100 mM DTT, 60% glycerol, pH 6.8)을 가하여 여러 종류의 “미리 염색된 단백질 크기 마커 용액”을 제조 하였다. 이 때 사용한 시료 로딩 완충액은 통상 당분야에서 사용되는 시료 로딩 완충액의 농도의 2배이고 이렇게 시료 로딩 완충액을 “1차 고분자/염료 복합체 용액”에 동량 섞게 되면 최종적으로는 통상 당분야에서 사용되는 시료 로딩 완충액의 농도와 같게 된다. 참고로, 상기 시료 로딩 완충액에서 일부 조성을 변경하는 것은 당분야에서는 매우 당연한 사실이다. "Pre-stained protein size marker solution" was prepared using the "primary polymer / dye complex solution" obtained in Example 2. To this end, each of the “primary polymer / dye complex solutions” obtained in Example 2 had the same volume of sample loading buffer (4% SDS, 125 mM Tris-HCl, 10 mM EDTA, 100 mM DTT, 60% glycerol, pH 6.8). Several kinds of "pre-stained protein size marker solution" were prepared by adding the same. In this case, the sample loading buffer used is twice the concentration of the sample loading buffer used in the art, and when the same amount of the sample loading buffer is mixed with the “primary polymer / dye complex solution”, the sample loading usually used in the art is finally obtained. It will be equal to the concentration of the buffer. For reference, it is very natural in the art to change some of the compositions in the sample loading buffer.
실시예Example 4: 전기영동을 통한 성능 조사 4: Investigate performance by electrophoresis
실시예 3에서 제조된 “미리 염색된 단백질 크기 마커 용액”들을 단백질 분석을 위해 사용하는 실험법인 일반적인 전기영동을 통하여 성능을 조사해 보았다. 전기영동은 12% SDS-PAGE 젤을 사용하여 하였으며, 전기영동에서 사용한 전기영동용 완충액(electrophoresis buffer)은 통상 단백질 분석용 전기영동에서 사용하는 트리스-글리신(Tris-Glycine) 완충액을 사용하였다. 염료 유도체로 Remazol Brilliant Blue R special을 사용한 경우의 결과가 도 1에, 염료 유도체로 Remazol Brilliant Red F3B gran을 사용한 경우의 결과가 도 2에, 염료 유도체로 Remazol Brilliant Orange 3R spec gran을 사용한 경우의 결과가 도 3에, 염료 유도체로 Uniblue A sodium salt를 사용한 경우의 결과가 도 4에 제시되어 있다.The performance of the pre-stained protein size marker solution prepared in Example 3 was examined through general electrophoresis, an experimental method used for protein analysis. Electrophoresis was performed using a 12% SDS-PAGE gel, and electrophoresis buffer used in electrophoresis was used as Tris-Glycine buffer, which is usually used in electrophoresis for protein analysis. The result of using Remazol Brilliant Blue R special as a dye derivative is shown in FIG. 1, and the result of using Remazol Brilliant Red F3B gran as a dye derivative is shown in FIG. 2, and the result of using Remazol Brilliant Orange 3R spec gran as a dye derivative. 3, the results of using Uniblue A sodium salt as a dye derivative are shown in FIG.
도 1 내지 도 4의 결과로부터, 일차적으로 소망하던 PEG와 염료 간의 결합이 달성되었음을 확인할 수 있으며 또한, 본 발명의 방법에 따라 제조된 미리 염색된 단백질 크기 마커가 통상 단백질 기반의 미리 염색된 단백질 크기 마커와 마찬가지로 전기영동 방식에서 이동할 수 있음을 확인할 수 있다. 미리 염색된 단백질 크기 마커로 사용되기 위해서 가장 중요한 점은 단백질 분석 목적의 전기영동에서 분석하고자 하는 단백질과 같은 방향으로 이동할 수 있어야 한다는 점이다.From the results of Figures 1 to 4, it can be seen that the binding between the desired PEG and the dye was achieved first, and the prestained protein size markers prepared according to the method of the present invention are usually protein based prestained protein size. As with the marker, it can be seen that the electrophoresis can be moved. In order to be used as a prestained protein size marker, the most important point is that the electrophoresis for protein analysis purposes must be able to move in the same direction as the protein to be analyzed.
실시예Example 5: 전기적 이동법에서의 성능 조사 5: Investigate performance in electrophoresis
실시예 3에서 제조된 염료 유도체로 Remazol Brilliant Blue R special을 이용하여 제조된 “미리 염색된 단백질 크기 마커 용액”을 통상적으로 단백질 분석을 위해 사용하는 실험법인 전기영동 후에 이어서 실시하는 전기적 이동 법(electro-transfer)을 통하여 성능을 조사해 보았다. 전기적 이동은 멤브레인 블랏팅(membrane blotting)이라고 하는 일반적 방법의 핵심 단계인데, 전기영동을 통하여 젤에서 분리된 단백질들이 전기장 하에서 멤브레인으로 이동시키는 것을 지칭한다. 본 실시예에서 사용된 전기적 이동법에서는 널리 사용되는 PVDF(polyvinylidene fluoride) 멤브레인을 사용했으며, 통상의 이동 완충액(transfer buffer; 2.9 g/L glycine, 5.8 g/L Tris, 0.37 g/L SDS, 200 ml/L methanol)을 사용하여 300 mA 조건에서 2 시간 실시하였다. 그 결과가 도 5에 제시되어 있다.As a dye derivative prepared in Example 3, an electrophoresis method performed after electrophoresis, which is an experimental method in which “prestained protein size marker solution” prepared using Remazol Brilliant Blue R special, is commonly used for protein analysis, is performed. -transfer) to examine the performance. Electrophoresis is a key step in a general method called membrane blotting, which refers to the transfer of proteins separated from the gel to the membrane under an electric field by electrophoresis. In the electrophoresis method used in the present embodiment, a widely used polyvinylidene fluoride (PVDF) membrane was used, and a conventional transfer buffer (2.9 g / L glycine, 5.8 g / L Tris, 0.37 g / L SDS, 200) was used. ml / L methanol) was used for 2 hours at 300 mA. The results are shown in FIG.
도 5의 결과로부터, 본 발명의 방법에 따라 제조된 미리 염색된 단백질 크기 마커가 소망한 대로 전기적 힘에 의해 전기영동 젤로부터 멤브레인으로 이동됨을 확인할 수 있었다. 또한, 이동된 미리 염색된 단백질 크기 마커의 고분자/염료 복합체가 멤브레인에 잘 결합(binding) 함도 확인할 수 있었다. 이로부터 본 발명의 방법에 따라 제조된 미리 염색된 단백질 크기 마커가 멤브레인 블랏팅에도 효과적으로 활용될 수 있음을 확인할 수 있었다. From the results of FIG. 5, it was confirmed that the prestained protein size markers prepared according to the method of the present invention were moved from the electrophoretic gel to the membrane by electrical force as desired. It was also confirmed that the polymer / dye complex of the moved prestained protein size marker binds well to the membrane. From this, it can be seen that the prestained protein size marker prepared according to the method of the present invention can be effectively used for membrane blotting.
실시예Example 6: 여러 종류의 고분자/염료 복합체가 포함된 미리 염색된 단백질 크기 6: Prestained protein size with several polymer / dye complexes 마커Marker
실시예 1부터 실시예 3까지의 방법에 따라, 사용하는 PEG의 분자량을 다양화하면서 여러 크기를 함께 가진 고분자/염료 복합체가 포함된 미리 염색된 단백질 크기 마커를 제조하였다. 실시예 1과 실시예 2에서 제시한 방법에 따라 분자량이 12kDa, 20kDa인 2종의 PEG-아민을 사용하여 각각을 Remazol Brilliant Blue R special 또는 Remazol Brilliant Orange 3R spec gran로 염색하여 4 종류의 “1차 고분자/염료 복합체 용액”을 제조하였다. 이들 4종류의 “1차 고분자/염료 복합체 용액” 중에 염료 유도체로 Remazol Brilliant Blue R special을 사용하여 제조한 “1차 고분자/염료 복합체 용액”을 부피비로 3.5 : 2.4 (20kDa PEG-아민으로부터 제조된 “1차 고분자/염료 복합체 용액”: 12kDa PEG-아민으로부터 제조된 “1차 고분자/염료 복합체 용액”)로 혼합하여 2종류의 PEG/염료 복합체가 포함된 “2차 고분자/염료 복합체 용액”을 제조하였다. 한편, 이들 4종류의 “1차 고분자/염료 복합체 용액” 중에 염료 유도체로 Remazol Brilliant Orange 3R spec gran을 사용하여 제조한 “1차 고분자/염료 복합체 용액”을 부피비로 3.5 : 2.4 (20kDa PEG-아민으로부터 제조된 “1차 고분자/염료 복합체 용액”: 12kDa PEG-아민으로부터 제조된 “1차 고분자/염료 복합체 용액”)로 혼합하여 2종류의 PEG/염료 복합체가 포함된 또 하나의 “2차 고분자/염료 복합체 용액”을 제조하였다. 이를 실시예 3에서와 같이 동부피의 시료 로딩 완충액과 혼합하여 2종류의 “미리 염색된 단백질 크기 마커 용액”을 제조하였다. 이를 실시예 4와 같은 방식으로 조사한 결과가 도 6에 제시되어 있다.According to the method of Example 1 to Example 3, prestained protein size markers including polymer / dye complexes having various sizes were prepared while varying the molecular weight of the PEG used. According to the method described in Examples 1 and 2, two PEG-amines having a molecular weight of 12 kDa and 20 kDa were respectively stained with Remazol Brilliant Blue R special or Remazol Brilliant Orange 3R spec granules, respectively. Primary polymer / dye complex solution ”. Among these four types of "primary polymer / dye complex solution", "primary polymer / dye complex solution" prepared using Remazol Brilliant Blue R special as a dye derivative was prepared from 3.5: 2.4 (20kDa PEG-amine by volume ratio). “Primary polymer / dye complex solution”: “Primary polymer / dye complex solution” prepared from 12 kDa PEG-amine) to mix “secondary polymer / dye complex solution” containing two PEG / dye complexes Prepared. Meanwhile, the "primary polymer / dye complex solution" prepared by using Remazol Brilliant Orange 3R spec gran as a dye derivative in these four types of "primary polymer / dye complex solution" was used in a volume ratio of 3.5: 2.4 (20 kDa PEG-amine). "Primary polymer / dye complex solution" prepared from: "primary polymer / dye complex solution" prepared from 12 kDa PEG-amine) and another "secondary polymer containing two PEG / dye complexes" / Dye complex solution ". This was mixed with eastern blood sample loading buffer as in Example 3 to prepare two kinds of "pre-stained protein size marker solution". The result of investigating this in the same manner as in Example 4 is shown in FIG. 6.
또한 상기의 서로 다른 염료 유도체를 사용하여 제조한 “1차 고분자/염료 복합체 용액”들을 서로 혼합하여서도 “미리 염색된 단백질 크기 마커 용액”을 제조해 보았다. 염료 유도체로 Remazol Brilliant Blue R special을 사용하여 12 kDa PEG를 염색하여 준비한 “1차 고분자/염료 복합체 용액”과 염료 유도체로 Remazol Brilliant Orange 3R spec gran을 사용하여 20 kDa PEG를 염색하여 준비한 “1차 고분자/염료 복합체 용액”을 부피비로 3.5 : 2.4로 혼합하여 “2차 고분자/염료 복합체 용액”을 제조하였다. 이를 실시예 3에서와 같이 동부피의 시료 로딩 완충액과 혼합하여 “미리 염색된 단백질 크기 마커 용액”을 제조하였다. 이를 실시예 4와 같은 방식으로 조사한 전기영동 결과가 도 7에 제시되어 있다.In addition, a "pre-dyed protein size marker solution" was prepared by mixing the "primary polymer / dye complex solution" prepared using the above-described different dye derivatives. The "primary polymer / dye complex solution" prepared by dyeing 12 kDa PEG using Remazol Brilliant Blue R special as a dye derivative and the "primary" prepared by staining 20 kDa PEG using Remazol Brilliant Orange 3R spec granule as dye derivative The polymer / dye complex solution ”was mixed at a volume ratio of 3.5: 2.4 to prepare a“ secondary polymer / dye complex solution ”. This was mixed with eastern blood sample loading buffer to prepare a “pre-stained protein size marker solution”. Electrophoresis results of this investigation in the same manner as in Example 4 are shown in FIG. 7.
이로부터 본 발명의 방법을 따르면 다양한 크기의 밴드를 가진 “미리 염색된 단백질 크기 마커”의 제조가 가능함을 확인할 수 있다. From this it can be seen that according to the method of the present invention it is possible to prepare a "pre-stained protein size marker" having a band of various sizes.
이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술 하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.Having described the specific part of the present invention in detail, it is apparent to those skilled in the art that such a specific technology is only a preferred embodiment, and the scope of the present invention is not limited thereto. Therefore, the substantial scope of the present invention will be defined by the appended claims and equivalents thereof.
도 1은 염료 유도체로 Remazol Brilliant Blue R special을 이용하여 본 발명에 따라 제조한 미리 염색된 단백질 크기 마커를 전기영동을 통하여 조사한 결과이다. 레인 M은 단백질 기반의 미리 염색된 단백질 크기 마커이고, 레인 1-4는 본 발명에 따라 제조된 미리 염색된 단백질 크기 마커를 유사한 양을 로딩한 결과이다. 실제 로딩한 양은 정확한 확인을 위하여 과량을 사용하였다. 1 is a result of the electrostaining of the prestained protein size marker prepared according to the present invention using Remazol Brilliant Blue R special as a dye derivative. Lane M is a protein based prestained protein size marker and lanes 1-4 are the result of loading similar amounts of prestained protein size markers prepared according to the present invention. The actual loading amount was used in excess for accurate identification.
도 2는 염료 유도체로 Remazol Brilliant Red F3B gran을 이용하여 본 발명의 방법에 따라 제조한 미리 염색된 단백질 크기 마커를 전기영동을 통하여 조사한 결과이다. 레인 M은 단백질 기반의 미리 염색된 단백질 크기 마커이고, 레인 1 및 2는 본 발명에 따라 제조된 미리 염색된 단백질 크기 마커를 서로 다른 양을 젤에 로딩한 결과이다. 실제 로딩한 양은 정확한 확인을 위하여 과량을 사용하였다. FIG. 2 shows the results of electrophoresis of prestained protein size markers prepared according to the method of the present invention using Remazol Brilliant Red F3B gran as a dye derivative. Lane M is a protein based prestained protein size marker, and
도 3은 염료 유도체로 Remazol Brilliant Orange 3R spec gran을 이용하여 본 발명의 방법에 따라 제조한 미리 염색된 단백질 크기 마커를 전기영동을 통하여 조사한 결과이다. 레인 M은 단백질 기반의 미리 염색된 단백질 크기 마커이고, 레인 1-4는 본 발명에 따라 제조된 미리 염색된 단백질 크기 마커를 서로 다른 양을 젤에 로딩한 결과이다. 실제 로딩한 양은 정확한 확인을 위하여 과량을 사용하였다. Figure 3 shows the results of electrophoresis of prestained protein size markers prepared according to the method of the present invention using a Remazol Brilliant Orange 3R spec gran as a dye derivative. Lane M is a protein based prestained protein size marker and lanes 1-4 are the result of loading different amounts of gel onto the prestained protein size markers prepared according to the invention. The actual loading amount was used in excess for accurate identification.
도 4는 염료 유도체로 Uniblue A sodium salt를 이용하여 본 발명의 방법에 따라 제조한 미리 염색된 단백질 크기 마커를 전기영동을 통하여 조사한 결과이다. 레인 M은 단백질 기반의 미리 염색된 단백질 크기 마커이고, 레인 1-4는 본 발명에 따라 제조된 미리 염색된 단백질 크기 마커를 서로 다른 양을 젤에 로딩한 결과이다. 실제 로딩한 양은 정확한 확인을 위하여 과량을 사용하였다. FIG. 4 shows the results of electrophoresis of prestained protein size markers prepared according to the method of the present invention using Uniblue A sodium salt as a dye derivative. Lane M is a protein based prestained protein size marker and lanes 1-4 are the result of loading different amounts of gel onto the prestained protein size markers prepared according to the invention. The actual loading amount was used in excess for accurate identification.
도 5는 염료 유도체로 Remazol Brilliant Blue R special을 이용하여 본 발명의 방법에 따라 제조한 미리 염색된 단백질 크기 마커를 전기영동 후 전기적 이동법을 통하여 멤브레인으로 이동시킨 결과이다. 본 발명의 미리 염색된 단백질 크기 마커를 전기영동하여 준비한 젤을 사용하여 전기적 이동법으로 본 발명의 미리 염색된 단백질 크기 마커를 멤브레인으로 이동시켰다. FIG. 5 shows the result of dye pre-stained protein size markers prepared according to the method of the present invention using Remazol Brilliant Blue R special as a dye derivative, followed by electrophoresis and transfer to the membrane. The prestained protein size marker of the invention was transferred to the membrane by electrophoresis using a gel prepared by electrophoresis of the prestained protein size marker of the invention.
도 6은 전기영동을 통하여 본 발명의 미리 염색된 단백질 크기 마커 (2 종류의 PEG/염료 복합체가 포함된 것)를 조사한 결과이다. (A) 12kDa, 20kDa인 2종의 PEG-아민을 사용하여 각각을 Remazol Brilliant Blue R special로 염색하여 제조한 미리 염색된 단백질 크기 마커. (B) 12kDa, 20kDa인 2종의 PEG-아민을 사용하여 각각을 Remazol Brilliant Orange 3R spec gran으로 염색하여 제조한 미리 염색된 단백질 크기 마커. 도 6의 (A) 및 (B) 모두에서, 레인 M은 단백질 기반의 미리 염색된 단백질 크기 마커이고, 레인 1은 본 발명에 따라 제조된 미리 염색된 단백질 크기 마커를 젤에 로딩한 결과이다. Figure 6 is the result of examining the prestained protein size marker (containing two PEG / dye complexes) of the present invention by electrophoresis. (A) Prestained protein size markers prepared by staining each with Remazol Brilliant Blue R special using two PEG-amines, 12kDa and 20kDa. (B) Prestained protein size markers prepared by staining each with Remazol Brilliant Orange 3R spec gran using two PEG-amines of 12 kDa and 20 kDa. In both Figures 6 (A) and (B), lane M is a protein based prestained protein size marker, and
도 7은 전기영동을 통하여 본 발명의 미리 염색된 단백질 크기 마커 (2 종류의 PEG에 서로 다른 염료의 복합체가 포함된 것)를 조사한 결과이다. 12kDa인 PEG-아민은 Remazol Brilliant Blue R special로 염색하였고 20kDa인 PEG-아민은 Remazol Brilliant Orange 3R spec gran로 염색하였다. 레인 M은 단백질 기반의 미리 염색된 단백질 크기 마커이고, 레인 1은 본 발명의 방법에 따라 제조된 미리 염 색된 단백질 크기 마커를 젤에 로딩한 결과이다. 7 is a result of examining the prestained protein size markers (complexes of different dyes in two kinds of PEG) of the present invention by electrophoresis. PEG-amine 12kDa was stained with Remazol Brilliant Blue R special and PEG-amine 20kDa was stained with Remazol Brilliant Orange 3R spec granules. Lane M is a protein based pre-stained protein size marker, and
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