KR100868248B1 - Novel peptide probes for diagnosing anthrax infection - Google Patents

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Abstract

본 발명은 탄저 (Anthrax) 감염 진단 탐침으로서 펩타이드를 스크리닝하는 방법, 및 이로부터 얻어진 펩타이드에 관한 것이다. 보다 구체적으로, 본 발명은 파지 디스플레이를 이용한 높은 특이성과 높은 친화력을 갖는 탄저 방어항원(protective antigen, 이하 'PA'라 한다) 단백질과 특이적으로 결합하는 펩타이드(PA-binding peptides)를 스크리닝하는 방법, 및 이를 통하여 발굴된 탄저 감염 진단 탐침으로서의 펩타이드에 관한 것이다. The present invention relates to a method for screening a peptide as an anthrax infection diagnostic probe, and to a peptide obtained therefrom. More specifically, the present invention is a method for screening peptides (PA-binding peptides) that specifically binds to an anthrax protective antigen (PA) protein having high specificity and affinity using phage display And a peptide as an anthrax infection diagnostic probe discovered therethrough.

본 발명에 따르면, 기존의 항체나 엡타머 (aptamer)를 이용한 진단방식과 차별화될 뿐 아니라, 펩타이드의 물리화학적 안정성을 이용하여 다양한 나노바이오 센서 (Nanobiosensor)와도 연계가능한 스크리닝 방법, 및 신규한 탄저 감염 진단 탐침을 제공할 수 있다. According to the present invention, a screening method that can be differentiated from a conventional diagnosis method using an antibody or an aptamer, as well as linking with various nanobiosensors using a physicochemical stability of a peptide, and a novel anthrax infection Diagnostic probes may be provided.

탄저, 방어항원, 펩타이드, 파지 디스플레이 Anthrax, protective antigen, peptide, phage display

Description

탄저 감염 진단용 신규한 펩타이드 탐침{Novel peptide probes for diagnosing anthrax infection}Novel peptide probes for diagnosing anthrax infection

도 1(a)는 PA 단백질과 결합하는 펩타이드를 스크리닝하기 위해 대장균에서 유전자 재조합을 이용하여 생산한 탄저 방어항원 단백질을 Ni이 결합된 96 웰 플레이트에 재조합 단백질의 카복시 말단의 6 히스티딘 태그를 이용하여 방향성 있게 플레이트 바닥으로 향하게 결합시킨 상태를 도시한 도면이다. Figure 1 (a) is an anthracite antigen protein produced by genetic recombination in Escherichia coli for screening peptides binding to the PA protein using a 6- histidine tag of the carboxy terminus of the recombinant protein in a 96-well plate bound to Ni It is a figure showing the state bonded to the plate bottom directionally.

또한, 도 1(b)는 결합 유무를 확인하고자 PA 인식 항체를 이용한 ELISA 실험결과를 도시한 그래프로서, PA가 결합하였음을 확인할 수 있었다. In addition, Figure 1 (b) is a graph showing the results of ELISA experiments using a PA recognition antibody to confirm the binding, it was confirmed that the PA binding.

도 2는 PA와 결합하는 펩타이드를 스크리닝하기 위한 M13 파지 스크리닝의 계획도이다. 2 is a schematic of M13 phage screening for screening peptides that bind to PA.

도 3은 PA에 대해 높은 특이성 및 결합력을 가진 펩타이드가 발현된 파지를 검출하기 위한 5단계 바이오패닝 조건을 정리한 도표이다. FIG. 3 is a table summarizing five-step biopanning conditions for detecting phage expressing peptides having high specificity and binding ability to PA.

도 4는 도 3의 5단계 바이오패닝을 통하여 얻은 PA와 결합하는 파지를 증폭하여 DNA를 분리정제 후 염기서열 분석을 실시하여 파지표면에 발현된 펩타이드의 아미노산 서열을 비교 분석하고 상동성을 바탕으로 유사계통도를 작성한 결과를 도 시한 도면이다. Figure 4 is amplification of phage binding to PA obtained through the five-step biopanning of Figure 3 to perform DNA sequencing after separation and purification by comparing the amino acid sequence of the peptide expressed on the phage surface and based on homology Figures showing the results of creating the pseudo-system diagram.

도 5는 상동성 분석결과 분류된 19개군 가운데 특정 1개군의 서열분석을 도시한 도면이다. FIG. 5 is a diagram illustrating sequencing of a specific one group out of 19 groups classified as a result of homology analysis.

도 6은 19개 군의 대표 펩타이드 발현 파지를 증폭한 뒤 농도를 측정하여 PA와 결합력을 분석한 그래프이다. Figure 6 is a graph analyzing the binding force and PA by amplifying the representative peptide expression phage of 19 groups and then measuring the concentration.

도 7은 PA와 결합하는 펩타이드의 결합부위 선별을 위한 계획도이다. 7 is a schematic diagram for selecting binding sites of peptides that bind to PA.

도 8은 도 7에 따라 플레이트 표면에 PA63을 남기고 19개군의 펩타이드를 넣어주어 결합한 펩타이드를 ELISA를 이용하여 확인한 결과를 도시한 도면이다. FIG. 8 is a diagram showing the result of confirming the binding peptide by ELISA, leaving PA63 on the surface of the plate according to FIG.

도 9는 본 발명을 통하여 얻은 탄저 방어항원 (PA)와 결합하는 펩타이드의 결합위치, 펩타이드 아미노산 서열 및 결합력을 정리한 도면이다. 9 is a view summarizing the binding position, peptide amino acid sequence and binding force of the peptide that binds to anthrax defense antigen (PA) obtained through the present invention.

본 발명은 탄저(Anthrax) 감염 진단 탐침으로서 펩타이드를 스크리닝하는 방법, 및 이로부터 얻어진 펩타이드에 관한 것이다. 보다 구체적으로, 본 발명은 파지 디스플레이를 이용한 높은 특이성과 높은 친화력을 갖는 탄저 방어항원 단백질과 특이적으로 결합하는 펩타이드를 스크리닝하는 방법, 및 이를 통하여 발굴된 탄저 감염 진단 탐침으로서의 펩타이드에 관한 것이다. The present invention relates to a method for screening a peptide as an anthrax infection diagnostic probe, and to a peptide obtained therefrom. More specifically, the present invention relates to a method for screening a peptide that specifically binds to anthrocyte defense antigen protein having high specificity and high affinity using phage display, and a peptide as an anthrax infection diagnostic probe discovered through the same.

일반적으로, 탄저는 그람 양성 간균인 탄저균(Bacillus anthracis)에 의하여 주로 가축에게 감염되나 사람에게도 발병하는 인수 공통 감염성 질환이다. In general, anthrax is a Gram-positive bacillus, Bacillus anthracis ) is a common infectious disease that is primarily infected by livestock but also by humans.

상기 탄저균은 오래 전부터 생물학 무기로 개발되어 왔는데, 최근에는 실전에도 배치될 정도가 되어 1990년 걸프전 때와 1998년에 재외주둔 미군에 탄저 백신이 접종되는 사태에 이르러 일반인에게도 주요 관심사로 대두되고 있다. The anthrax has been developed as a biological weapon for a long time, and has recently been deployed in practice, and has been a major concern for the general public following the invasion of anthrax vaccine in the Gulf War in 1990 and the US military stationed in 1998.

탄저균 감염에 의해서 발생하는 탄저병은 매우 치사율이 높은 것으로 알려져 있는데 치료방법은 다른 세균 감염질환과 마찬가지로 세 가지 접근방법이 가능하다. Anthrax caused by anthrax infections is known to have a very high mortality rate. There are three approaches for treatment, like other bacterial infections.

첫째는 탄저균 감염을 사전에 봉쇄하는 예방접종이고 둘째는 감염된 탄저균을 항생제로 무력화시키는 것이고 셋째는 감염된 탄저균이 분비하는 주요 병 독소를 해독시키는 것이다. The first is vaccination to prevent anthrax infections, the second is to neutralize the infected anthrax with antibiotics, and the third is to detox the major disease toxins secreted by the infected anthrax.

일단 감염되면 항생제와 해독제를 투여하여 병균과 병독소를 동시에 무력화시키는 것이 가장 이상적이나 현재 일반적으로 항생제에 비해 해독제의 개발이 미미해 주로 항생제에 의존하는 형편이다. 우리 나라에도 이를 법정 전염병으로 분류하여 대응하고 있으며, 실제 국내에서도 가축 및 폐사우의 식육을 섭취함 사망한 사례가 보고된바 있음으로써 탄저에 대한 방제의 필요성이 대두되었다.Once infected, antibiotics and antitoxins are best used to neutralize germs and toxins at the same time, but currently the development of antidotes is less than that of antibiotics. In Korea, this is classified as a staggering epidemic, and in Korea, there have been reports of the death of livestock and lung meat. The need for control of anthrax has emerged.

탄저병 균을 죽이는 항생제는 이미 개발돼 있지만 이 약물은 이미 생성된 탄저 독소에는 전혀 영향을 미치지 못하는 단점을 가지고 있다. 그리고 탄저병 백 신의 경우에도 부작용 문제 때문에 광범위한 사용이 어려운 형편이다. 더욱이 높은 치사율을 보이는 탄저의 경우 질병 발병 초기단계에서 발견하여 이에 대한 대중적 치료가 매우 중요하다. 또한 국내 육류소비량의 절반이상이 생물학적 테러위험성(탄저)이 높은 미국 의존적 수입경로를 감안할 때 축산물 수입에 대한 철저한 검역시스템 도입이 절실하다. 그러나 질병증상이 나타나지 않는 감염초기 및 진행기의 가축의 가공물의 경우 질병 원인균의 농도가 매우 낮아 진단 여부가 매우 어려우며 많은 양의 검역이 어렵다. Anthrax bacteria Killing antibiotics have already been developed, but the drug has the disadvantage of having no effect on the already produced anthrax toxin. Have. In addition, anthrax vaccines are difficult to use extensively because of side effects. Moreover, anthrax with a high mortality rate is found at an early stage of disease development and public treatment is very important. In addition, a thorough quarantine system for livestock imports is urgently needed, since more than half of domestic meat consumption is a US-dependent import route with a high risk of biological terrorism. However, in the early and advanced stages of livestock products without disease symptoms, the concentration of disease-causing bacteria is very low, making it difficult to diagnose and large amount of quarantine.

이같은 탄저균의 병원성은 독소 생성 능력과 협막 형성에 의해 결정되는 것으로 알려져 있다. The pathogenicity of anthrax is known to be determined by toxin production and capsular formation.

이중 탄저의 독소 생성 능력에 영향을 주는 단백질은 방어항원 (protective antigen, PA), 부종요소 (edema factor, EF). 치사요소 (lethal factor, LF) 임이 알려져 이들에 대한 연구가 진행 중이다. 이들 각각은 독성을 나타내지 못하나, 방어항원 (PA)과 부종요소 (EF)가 결합하여 부종독소 (EdTx, edema toxin)를 형성하고, 방어항원 (PA)과 치사요소 (LF)가 결합하여 치사독소 (LeTx, ethal toxin)를 형성한다. Proteins that affect the toxin-producing ability of anthrax are protective antigen (PA) and edema factor (EF). It is known to be a lethal factor (LF), and research on them is ongoing. Each of them is not toxic, but defense antigen (PA) and edema factor (EF) combine to form edema toxin (EdTx, edema toxin), and defense antigen (PA) and lethal factor (LF) bind to lethal toxin (LeTx, ethal toxin).

여기서 PA는 대식세포와 같은 감염 세포주 표면의 수용체 단백질 (ATR)에 결합한 후 단백질 분해효소 (furin family protease)에 의해 PA20과 PA63으로 잘리는데, 이중 PA63이 헵타머화되면서 LF 혹은 EF와 결합하여 이를 세포 내로 운반시키는 독소 단백질 운반체 (Toxin delivery channel)의 역할을 수행하는 것이 널리 보고되어 있다. Here, PA binds to receptor proteins (ATRs) on the surface of infected cell lines, such as macrophages, and is then cut into PA20 and PA63 by furin family proteases, of which PA63 binds to LF or EF as heptamers It has been widely reported to play the role of a toxin delivery channel to transport into.

이들 복합체는 엔도시토시스 기전으로 세포 내로 들어가고 엔도좀의 pH가 낮아지면 PA63 헵타머의 구조적 변화가 생기며 엔도좀 멤브레인에 기공을 형성하고 결과적으로 LF 혹은 EF는 세포질로 유리되어 독성효과를 나타내게 된다. 그러므로 PA는 탄저의 질병 예방과 치료법을 위한 관심 있는 대상이라 할 수 있다. 따라서 탄저 독소를 저해하는 다양한 접근 방법들은 PA에 의거해 많은 연구들이 진행 중이다. These complexes enter into cells through the endocytosis mechanism, and when the pH of the endosomes decreases, structural changes of PA63 heptamers occur, forming pores in the endosomal membrane, and as a result, LF or EF is released into the cytoplasm and has a toxic effect. Therefore, PA is an interesting target for the prevention and treatment of anthrax. Thus, various approaches to inhibiting anthrax toxin are under study by the PA.

그러나, 높은 감도, 신속성, 현장 적응성을 지닌 진단 킷트 혹은 높은 물리화학적 안정성, 민감도, 특이성, 응용성등의 특성을 지닌 탐지물질 (diagnostic probe)은 아직까지 제시된 바 없다. However, no diagnostic probes with high sensitivity, rapidity, field adaptability, or diagnostic probes with high physicochemical stability, sensitivity, specificity, and applicability have been proposed.

한편, 진단 대상체를 진단하기 위한 가장 보편적인 방법으로는 PCR (Polymerase Chain Reaction)을 이용하는 것으로서, 진단 대상체가 지니는 고유한 유전자를 분석한 뒤 이를 시험관내 (in vitro) 증폭하여 소량의 진단 대상체를 분석한다. Meanwhile, the most common method for diagnosing a diagnosis subject is PCR (Polymerase Chain Reaction), which analyzes a unique gene of the subject and then in vitro ( in in vitro ) to analyze small amounts of diagnostic subjects.

그리고 유전자가 지니는 고유한 염기서열을 이용하여 진단 대상체 만의 고유한 염기서열을 대상으로 하고, 또한 근래의 휴먼 게놈 프로젝트 등을 통한 광범위한 유전자 정보 데이터베이스 확보를 통하여 그 활용범위를 확대할 수 있다. In addition, by using the unique nucleotide sequence of the gene to target the unique nucleotide sequence of the diagnosis target only, and the scope of use can be expanded by securing a comprehensive genetic information database through the recent human genome project.

또한 증폭하여 얻은 유전자를 대상으로 이들의 유전적 변이를 다양한 탐침을 이용해 확인하는 SSCP (Single-strand conformation polymorphism), RFLP (Restriction fragment length polymorphism), AFLP (Amplified fragment length polymorphism) 방법들과 연계하여 유용한 정보를 제공하고 있다. It is also useful in conjunction with SSCP (Single-strand conformation polymorphism), RFLP (Restriction fragment length polymorphism), and AFLP (Amplified fragment length polymorphism) methods to identify genetic variants of amplified genes with various probes. Information is provided.

이러한 PCR을 이용하는 진단 방법에는 진단 대상체 만이 지니는 고유한 염기서열을 소량으로 얻는 데에 높은 감도를 가지는 장점을 지니지만 시료 전처리 및 현장적응성에 대한 어려움 등의 문제점은 진단시스템으로써 한계를 보여주는 단점이 있다. The diagnostic method using the PCR has the advantage of having a high sensitivity in obtaining a small amount of unique nucleotide sequence only for the diagnosis subject, but problems such as difficulty in sample preparation and in-field adaptation have limitations as a diagnostic system. .

더욱이 병원체, 바이러스 등의 외부 요인 진단이 아닌 사람의 질병진단에 있어서는 생명체가 가지는 염색체상의 변형보다 단백질 레벨에서의 변화가 많은 점을 감안할 때 진단 대상체로써 단백질의 중요성이 부각되어지고 있으므로 PCR만을 이용한 진단 방법은 적당하다고 할 수 없기에 이를 극복할 수 있는 관련연구와 접목시킬 필요성이 있다. Furthermore, in the diagnosis of human disease, not the diagnosis of external factors such as pathogens and viruses, the importance of protein as a diagnostic subject is highlighted in view of the fact that the change in protein level is greater than the chromosomal modification of living organisms. Since the method is not suitable, it is necessary to combine it with related research that can overcome it.

이러한 측면에서 근래의 ELISA (Enzyme-Linked Immunosorption Assay) 방법은 질병으로 유발된 특정 단백질의 발현양 증가 및 변화를 판단한다. 이러한 특정 단백질의 인식을 위해서 이들과 특이적 결합을 하는 항체를 진단 탐침으로 사용하여 혈액, 소변등의 생체 검체로부터 진단 대상체를 분리하고 이를 효소-항체를 이용한 반응 (ECL)을 이용한다. In this regard, the recent Enzyme-Linked Immunosorption Assay (ELISA) method determines the increase and change in the expression level of a specific protein caused by disease. For the recognition of these specific proteins, antibodies that bind specifically to them are used as diagnostic probes to isolate diagnostic subjects from biological samples such as blood and urine, and to use enzyme-antibody reactions (ECLs).

그러나 나노몰 수준의 반응감도는 생체 내 작용점인 단백질을 대상으로 하는 장점에도 불구하고 PCR 진단법에 비한 낮은 민감도를 가짐으로 써 이를 극복할 수 있는 많은 관련연구가 진행 중이다. However, despite the merits of targeting nanomolecular reactions in vivo, many related researches are underway to overcome this problem because they have lower sensitivity than PCR diagnostics.

최근에는 현재의 진단방법(PCR, ELISA)을 기초로 NT 기술이 접목된 표면 증강 라만 분광분석법 (SERS) 및 바이오-바코드 기술이 개발되어짐으로써 펨토몰 수준의 진단 대상체 분석이 실험적으로 가능함을 보여 주었다. Recently, surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) and bio-barcode techniques have been developed based on the current diagnostic methods (PCR, ELISA), demonstrating that femtomol levels can be analyzed experimentally. .

두 방법은 모두 라만 분광분석이 갖는 신호적 특성 (좁은 라만 밴드; 습기, 산소 및 담금자에 낮은 민감도; 낮은 광표백도)과 형광분석에 상응하는 높은 민감도를 금속 나노입자를 이용한 신호증폭을 이루어 펨토몰 (10-15M) 수준의 진단대상체 인식이 가능해짐으로써 혈액 등의 손쉬운 검체 시료를 이용한 암 진단 (Prostate specific antigen, PSA)에 대한 접근법을 제안하였다. Both methods have femto signal amplification using metal nanoparticles with the signal characteristics of Raman spectroscopy (narrow Raman band; low sensitivity to moisture, oxygen and soak; low photobleaching) and high sensitivity corresponding to fluorescence analysis. By recognizing the mole (10 -15 M) level of the target object, an approach for prostate specific antigen (PSA) using easy specimens such as blood was proposed.

기존의 방법은 바이오 마커 (진단대상체)를 인식하는 항체를 이용한 시스템을 토대로 하는데 이는 항체의 물리, 화학적 구조는 크기적 제한으로 인한 결합수의 제한 및 여러 가지의 화학적 반응 하에서 구조변성으로 인한 불안정성을 보임으로써 근래의 NT 기술과의 접목에 제한을 갖는다. 따라서 항체가 가지는 특이성 및 결합력을 가지는 저분자 탐침 (small molecular probe)의 개발은 이러한 제한을 극복하는 차세대 진단물질의 근간이 될 것으로 기대된다. Existing methods are based on a system using antibodies that recognize biomarkers (diagnostics), which suggest that the physical and chemical structure of the antibody is limited in the number of bonds due to size limitations and instability due to structural denaturation under various chemical reactions. By showing, there is a limit to the integration with modern NT technology. Therefore, the development of small molecular probes having specificity and binding ability of antibodies is expected to be the basis of the next generation diagnostic material that overcomes these limitations.

근래의 뉴클레오티드 엡타머는 이러한 항체 대체 진단 탐침으로써 많은 연구 가 되고 있음은 잘 알려져 있다. 기존의 항체 및 엡타머를 이용한 진단 시스템 기술과 차별화된 새로운 저분자 진단 탐침 (Diagnostic probe)의 개발은 차세대 지단 시스템 개발을 위한 기술적 토대가 될 뿐만 아니라 신기술 선점에 있어 매우 중요하다. It is well known that nucleotide eptamers have recently been studied as such antibody replacement diagnostic probes. The development of new low molecular diagnostic probes, which is differentiated from the existing diagnostic system technology using antibodies and epsilers, is not only a technical foundation for the development of the next generation of altitude systems but also very important in preempting new technologies.

이에 본 발명자들은 현재 탄저균 진단을 위하여 사용되는 항체를 대체할 수 있는 새로운 진단 물질로써 펩타이드를 동정해내고, 이를 새로운 탐지물질로 제안하기에 이르렀다. Therefore, the present inventors have identified a peptide as a new diagnostic material that can replace the antibody currently used for diagnosing anthrax, and have come to propose it as a new detection material.

즉, 본 발명의 목적은 탄저균 감염 진단을 위한 탄저 독소단백질을 인식하고 특이적으로 결합하는 펩타이드를 스크리닝하는 방법을 제공하려는데 있다. That is, an object of the present invention is to provide a method for screening a peptide that recognizes and specifically binds anthrax toxin protein for diagnosing anthrax infection.

본 발명의 다른 목적은, 상기 방법에 의해 발굴된 펩타이드를 탄저 감염 저분자 진단 탐침의 용도로서 제공하려는데 있다. Another object of the present invention is to provide a peptide discovered by the method as a use of anthrax infection small molecule diagnostic probe.

상기와 같은 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 기존의 탄저 독성을 나타내는 독소 운반 단백질을 진단 대상으로 하여 항원-항체반응에 상응하는 결합력을 갖춘 펩타이드를 선별한 다음 이들의 결합 지역을 PA 단백질의 작용 부위별로(PA20 및 PA63) 구별한다. In order to achieve the above object, the present invention is to select a peptide having a binding capacity corresponding to the antigen-antibody reaction in the diagnosis target toxin transport protein exhibiting anthrax toxicity, and then the binding region of the action of the PA protein Distinguish by site (PA20 and PA63).

즉, 파지 디스플레이 라이브러리 스크리닝을 실시하여 PA에 결합하는 펩타이드를 선별 후 이들의 결합지역 및 결합력을 분석하여 탐침으로서의 수행력을 확인 하며, 이때 파지는 통상적으로 입수가능한 phage λ나 M13 등의 박테리오파지를 사용할 수 있으며, 이중에서 M13을 사용하는 것이 보다 바람직하다. In other words, phage display library screening is performed to screen peptides that bind to PA and then analyze their binding regions and binding forces to confirm their performance as probes, and phage can be used with bacteriophages such as phage λ or M13, which are commonly available. Among them, it is more preferable to use M13.

그 결과, 탄저 감염 진단 탐침으로써 저분자 펩타이드로서 8종을 규명할 수 있었다. 하기에 나타낸 아미노산 서열은 아미노 말단부터 나타내는 것으로, L은 루신, S는 세린, T는 트레오닌, A는 알라닌, H는 히스티딘, P는 프롤린, F는 페닐알라닌, M은 메티오닌, R은 아르기닌, N은 아스파라긴, Y는 티로신, V는 발린, Q는 글루타민, I는 이소루신, G는 글리신, D는 아스파르트산, K는 리신, W는 트립토산, X는 기타 불명확한 아미노산을 의미한다. As a result, eight types of low molecular peptides could be identified as anthrax infection diagnostic probes. The amino acid sequences shown below are from the amino terminus, where L is leucine, S is serine, T is threonine, A is alanine, H is histidine, P is proline, F is phenylalanine, M is methionine, R is arginine, N is Asparagine, Y is tyrosine, V is valine, Q is glutamine, I is isoleucine, G is glycine, D is aspartic acid, K is lysine, W is tryptic acid, X is other unknown amino acids.

구체적인 아미노산 서열은 다음과 같다: Specific amino acid sequences are as follows:

P1: LSHNQTIQQDSD P1: LSHNQTIQQDSD

이때, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 두번째 아미노산인 S가 T로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. At this time, the second amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 is characterized in that consisting of the amino acid substituted by T.

또한, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 다섯번째 아미노산인 Q가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. In addition, the fifth amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 is characterized in that consisting of the amino acid substituted by L.

또한, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 일곱번째 아미노산인 I이 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. In addition, the seventh amino acid I of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 is characterized in that consisting of the amino acid substituted by L.

또한, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 열번째 아미노산인 D가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. In addition, the tenth amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 is characterized in that consisting of the amino acid substituted by A.

나아가, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 두번째 아미노산인 S가 T로 및/또는 다섯번째 아미노산인 Q가 L로 및/또는 일곱번째 아미노산인 I가 L로 및/또는 열번째 아미노산인 D가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 포함한다. Further, the second amino acid S in the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 is T and / or the fifth amino acid Q is L and / or the seventh amino acid I is L and / or D is the tenth amino acid. Includes those consisting of amino acids substituted with A.

P2: HKHAHNYRLPXSP2: HKHAHNYRLPXS

상기 서열목록 2로 표시되는 아미노산 서열 HKHAHNYRLPXS 중 일곱번째 아미노산인 Y가 T로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. A seventh amino acid of the amino acid sequence HKHAHNYRLPXS represented by SEQ ID NO: 2 is characterized by consisting of an amino acid substituted by T.

P3: TPYYWHHHHIPPP3: TPYYWHHHHIPP

P4: QSPVNHHYHYHIP4: QSPVNHHYHYHI

P5: GHKPQVHRHTHIP5: GHKPQVHRHTHI

이때, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 첫번째 아미노산인 G가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. At this time, the first amino acid of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 is characterized in that consisting of the amino acid substituted by A.

또한, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 두번째 아미노산인 H가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. In addition, the second amino acid of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 is characterized in that consisting of the amino acid substituted by L.

나아가, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 열두번째 아미노산인 I가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. Further, the twelfth amino acid I of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 is characterized by consisting of an amino acid substituted by L.

P6: LMPTPHHRLFPMP6: LMPTPHHRLFPM

P7: ALHPHRTPHHHHP7: ALHPHRTPHHHH

P8: NAYKHHHPPVFYP8: NAYKHHHPPVFY

또한, 상술한 8종의 펩타이드 중 P1, P5, P7, P8의 4종은 PA20에 결합한 것을 확인할 수 있었으며, 나머지 4종에 해당하는 P2, P3, P4, P6은 PA63에 결합한 것을 확인할 수 있었다(도 9 참조). In addition, four of the above-mentioned eight peptides P1, P5, P7, P8 was confirmed that the binding to PA20, the remaining four species of P2, P3, P4, P6 was confirmed that the binding to PA63 ( 9).

이같은 펩타이드는 엡타머와 달리 항체와 같은 아미노산으로 구성되므로 다양한 조합의 특이성을 나타낼 수 있다. 또한 단순한 3차원적 구조로 인한 높은 물리, 화학적 안정성은 다양한 나노 센서 칩과의 연계 및 현장 적용성이 우수한 Kit개발 큰 장점을 가질 수 있을 것으로 기대한다. Since such peptides are composed of amino acids, such as antibodies, unlike epsamers, they can exhibit the specificity of various combinations. In addition, the high physical and chemical stability due to the simple three-dimensional structure is expected to have great advantages in connection with various nano sensor chips and development of excellent kits in the field.

이하, 본 발명의 구성 및 효과를 나타내기 위하여 실시예에 의거하여 보다 상세하게 설명하고자 하나, 이는 본 발명의 이해를 돕기 위한 것일 뿐 본 발명의 범위를 이에 한정하고자 하는 것은 아니다. Hereinafter, one or more exemplary embodiments will be described in detail in order to show the structure and effects of the present invention.

<실시예><Example>

실시예Example 1:  One: PAPA 단백질의 대량 생산 및 분리법 Mass production and isolation of proteins

탄저균주 (Bacillus anthracis sterne)의 게놈성 DNA를 분리한 뒤 PA 유전자를 PCR을 통하여 증폭한 하여 이를 박테리아 발현벡터인 pET22b에 삽입한 뒤 박테리아에서 PA의 대량발현 시 발생하는 단백질 소멸을 억제하기 위하여 생산되는 PA를 박테리아의 periplasmic 영역에 전위시키고자 아미노 말단부위에 leader 시퀀스로 PelB 유전자를 삽입하였다. After genomic DNA of Bacillus anthracis sterne is isolated, PA gene is amplified by PCR and inserted into pET22b, a bacterial expression vector, which is produced to suppress protein disappearance during mass expression of PA in bacteria. In order to transpose the PA into the periplasmic region of the bacterium, the PelB gene was inserted as a leader sequence at the amino terminal.

이렇게 클로닝한 PA 발현 플라스미드를 발현숙주인 BL21(DE3)에 형질전환시킨 뒤 0.5 mM IPTG, 18℃ 조건하에서 PA 생산을 유도하였다. 그리고 박테리아 세포를 원심분리를 통하여 수획하여 단백질의 용해도를 조사하여 본 결과 대부분의 단백질이 불용성인 것을 확인할 수 있었다. The cloned PA expression plasmid was transformed into BL21 (DE3), an expression host, to induce PA production under conditions of 0.5 mM IPTG and 18 ° C. And bacterial cells were harvested by centrifugation to examine the solubility of the protein was confirmed that most of the protein is insoluble.

따라서 PA 분리정제를 위하여 세포 내 불용성 단백질만을 얻어낸 뒤 이를 변성 조건 (6M 구아니딘-HCl)에서 용해시킨 뒤 Ni-세파로오스 칼럼을 통과시켜 PA 단백질을 결합시킨 뒤에 변성된 PA를 되접힘시키기 (Refolding) 위하여 칼럼에 결합된 상태로 선형 구배 (Linear gradient) (우레아의 저감 농도)를 통하여 서서히 변성체를 제거시켜가며 PA를 되접힘시키고 500 mM 이미다졸 선형 구배 하에 용출시켰다. Therefore, in order to separate and purify the PA, only the insoluble protein in the cell was obtained and dissolved in denaturing conditions (6M guanidine-HCl), and passed through a Ni-Sepharose column to bind the PA protein, followed by refolding the denatured PA. The PA was refolded and eluted under a 500 mM imidazole linear gradient while slowly denatured through a linear gradient (reduced concentration of urea) while bound to the column.

얻어낸 단백질은 PBS (137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4, pH 7.4) 용액에서 투석하여 과량의 이미다졸을 제거하였고, 이를 통해 얻은 단백질의 정제도를 SDS/PAGE를 통하여 확인하였으며 Bradford 반응액을 이용하여 양을 확인한 결과 3 mg/L 단백질을 얻을 수 있었다. The obtained protein was dialyzed in PBS (137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na 2 HPO 4 , 2 mM KH 2 PO 4 , pH 7.4) solution to remove excess imidazole, and the degree of purification of the obtained protein was determined by SDS. It was confirmed by / PAGE and 3 mg / L protein was obtained by using the Bradford reaction solution to confirm the amount.

그런 다음 PA 단백질의 되접힘 여부확인을 위하여 트립신 처리를 수행하였다. (-) PA의 경우 트립신 처리를 하였을 때 20 kDa 과 63 kDa의 특이적인 2개의 단편이 발생함이 나타남으로 위의 방법으로 분리 정제한 PA 단백질을 트립신으로 처리하여 같은 결과가 나오는지를 확인함으로써 변성 정제 후 단백질의 구조가 정상적으로 돌아왔는지(refolding) 확인하였다. Then, trypsin treatment was performed to check whether the PA protein was folded back. In the case of (-) PA, trypsin treatment resulted in two specific fragments of 20 kDa and 63 kDa. Denatured by treating the PA protein purified by the above method with trypsin to see if the same result is obtained. After purification, it was checked whether the structure of the protein was normally refolded.

트립신 처리 결과 PA20 과 PA63의 두개의 단백질 단편이 생김을 확인하였다. Trypsin treatment resulted in two protein fragments, PA20 and PA63.

실시예Example 2:  2: M13M13 파지  scrap paper 펩타이드Peptide 라이브러리 스크리닝 - 파지 디스플레이 Library Screening-Phage Display

우선 유전자 재조합 단백질을 제조시 96-웰 플레이트에 고정시키기 위해서 PA 유전자 카복시 말단에 6 히스티딘 태그가 결합된 상태로 발현될 수 있게 클로닝 하여 플레이트 표면에 Ni이온이 배위 결합으로 고정되어 있는 Ni-Sorb 플레이트 (Qiagen)를 사용하여 카복시 말단이 플레이트 바닥으로 향하게 결합시킴으로써 특이적 방향성을 가진 상태로 PA 단백질을 고정시킴으로써, M13 파지 랜덤 펩타이드 라이브러리 (12 아미노산)를 이용한 스크리닝시 보다 높은 특이성 및 결합지역 분석을 용이하게 디자인하였다. 그 결합을 도 1에서 분석하였다. First, in order to fix a recombinant protein to a 96-well plate, a Ni-Sorb plate in which Ni ions are fixed by coordination bonds is cloned so that it can be expressed with 6 histidine tags bound to the end of the PA gene carboxy. Using (Qiagen) to fix the PA protein with specific orientation by binding the carboxy terminus toward the bottom of the plate, facilitating higher specificity and binding site analysis when screening with M13 phage random peptide library (12 amino acids) Designed to be. The binding was analyzed in FIG. 1.

구체적으로, 도 1(a)에서는 PA 단백질과 결합하는 펩타이드를 스크리닝하기 위해 대장균에서 유전자 재조합을 이용하여 생산한 탄저 방어항원 단백질을 Ni이 결합된 96 웰 플레이트 (Qiagen)에 재조합 단백질의 카복시 말단의 6 히스티딘 태그를 이용하여 방향성 있게 플레이트 바닥으로 향하게 결합시킴을 확인할 수 있었다. Specifically, in Figure 1 (a) to screen the peptides that bind to the PA protein, anthrax defense antigen protein produced by genetic recombination in Escherichia coli in the carboxy terminus of the recombinant protein in a Ni-coupled 96 well plate (Qiagen) 6 histidine tag was used to directionally bind to the bottom plate.

상기 결합 유무를 확인하고자 PA 인식 항체를 이용한 ELISA 실험결과 도 1(b)에서 보듯이, PA가 결합하였음을 확인하였다. As a result of ELISA experiment using PA recognition antibody to confirm the binding, as shown in FIG.

분리 정제한 PA 단백질을 플레이트 표면에 결합시킨 뒤 M13 파지 펩타이드 라이브러리 (약 27억개의 서로 다른 아미노산 서열을 지닌 12개 아미노산으로 구성된 펩타이드가 M13 파지 g3 minor coat 단백질에 융합된 라이브러리)를 넣어 주어 결합시킨 뒤 다양한 결합 시간 및 세척조건을 통하여 높은 친화력으로 결합하는 펩타이드 발현 파지를 선별하였다. 이에 대한 스크리닝 계획 및 각각의 반응조건은 각각 도 2 및 3에 나타내었다. The isolated and purified PA protein was bound to the surface of the plate, and then incorporated into the M13 phage peptide library (a library consisting of 12 amino acids having about 2.7 billion different amino acid sequences fused to M13 phage g3 minor coat protein). Peptide expression phages were then selected that bind with high affinity through various binding times and washing conditions. Screening schemes and respective reaction conditions are shown in FIGS. 2 and 3, respectively.

구체적으로, 도 2는 PA와 결합하는 펩타이드 스크리닝을 위한 M13 파지 스크리닝의 계획도인 것으로, M13 파지표면에 12개 아미노산으로 구성된 펩타이드 라이 브러리가 발현된 파지 라이브러리를 96 웰 플레이트 표면에 고정된 PA에 넣고 다양한 조건으로 세척한 뒤 결합된 파지를 용출하여 얻었다.  Specifically, FIG. 2 is a schematic diagram of M13 phage screening for peptide binding to PA. The phage library expressing a peptide library consisting of 12 amino acids on the M13 phage surface was expressed in a PA immobilized on a 96 well plate surface. Put and washed under various conditions to obtain the bound phage eluted.

얻은 파지는 대장균에 감염시켜 증폭하여 다시 PA와 결합시킨 뒤 보다 높은 강도의 세척 조건 및 짧은 반응 시간 등의 조건으로 강한 결합파지를 찾는 과정을 반복하였다 (biopanning). The resulting phages were infected with E. coli, amplified and combined with PA again, and the process was repeated to find strong binding phages under conditions such as higher washing conditions and shorter reaction times (biopanning).

또한, 도 3은 PA에 대해 높은 특이성 및 결합력을 가진 펩타이드가 발현된 파지를 검출하기 위한 5단계 바이오패닝 조건을 도표화한 것으로, 매 단계마다 보다 강한 세척조건, 짧은 결합시간으로 변화시켰으며, 이에 따라 다르게 5회 바이오패닝을 실시하여 PA에 결합하는 펩타이드를 가진 파지를 확보하였다. In addition, FIG. 3 is a table of five-step biopanning conditions for detecting phages expressing peptides having high specificity and binding ability to PA. Each step was changed to stronger washing conditions and shorter binding time. Differently, biopanning was performed five times to obtain phage having peptides that bind to PA.

이와 같이 하여 얻어진 파지를 증폭한 뒤 80여 개의 파지 플라그를 선택하여 M13 파지 게놈성 DNA (단일 스트랜드화 원형 DNA)를 분리 정제하여 유전자 염기서열을 확인하여 파지 표면 단백질 (gp3 minor coat 단백질)에 발현되어 PA와 결합한 펩타이드의 아미노산 디스플레이된 펩타이드 아미노산 염기서열을 추론하였다. After amplifying the phages thus obtained, 80 phage plaques were selected, M13 phage genomic DNA (single stranded circular DNA) was isolated and purified, the gene sequence was confirmed and expressed on the phage surface protein (gp3 minor coat protein). The amino acid displayed peptide amino acid sequence of the peptide bound to PA was deduced.

이를 Clustal X 서열 분석 프로그램을 통하여 상호간 상동성을 바탕으로 한 유사계통도를 작성하여 모두 19개의 군을 정리하였으며 그 결과를 도 4에 정리하였다. Through this Clustal X sequencing program, a similar system based on mutual homology was created and all 19 groups were arranged and the results are summarized in FIG. 4.

또한 각 군의 펩타이드의 아미노산 상동성 분석 결과, 상동성 분석결과 분류 된 19개군 가운데 특정 1개군의 서열분석을 나타낸 도 5에서 확인할 수 있듯이, 같은 군에 속하는 펩타이드의 서열에서는 높은 유사성을 관찰할 수 있으며 색깔로 표시된 아미노산은 같은 군내의 펩타이드에서 모두 보존되어 있음을 확인하였다. 이는 이들 아미노산 PA와 해당 펩타이드와의 결합에 있어 중요한 작용을 하는 잔기에 해당함을 시사한다. In addition, as shown in FIG. 5 showing the sequence analysis of a specific one group among 19 groups classified as a result of amino acid homology analysis of each group of peptides, high similarity can be observed in the sequences of peptides belonging to the same group. The colored amino acids were found to be conserved in all peptides in the same group. This suggests that these amino acids PA correspond to residues that play an important role in the binding of the peptides.

실시예Example 3:  3: PAPA 와 결합하는 Combined with 펩타이드의Peptide 결합력 분석  Binding force analysis

스크리닝한 펩타이드의 결합력 분석을 위하여 각각의 펩타이드가 발현된 파지를 증폭한 뒤 titering을 통하여 파지 용액의 농도를 결정한 뒤 PA가 결합된 플레이트에 농도별로 넣어주어 결합한 파지의 양을 측정함으로써 해당 펩타이드의 결합력을 추론하였다. For analyzing the binding capacity of the screened peptides, amplify the phage expressing each peptide, determine the concentration of phage solution through titering, and put the concentration into the PA-bound plate by measuring the amount of bound phage. Was deduced.

PA가 결합된 플레이트에 파지를 넣어준 뒤 세척하여 파지 표면 단백질을 인식하는 항체를 이용한 ELISA를 수행하였다. 해당 농도에 따르는 ELISA 신호강도를 표시하여 이를 포화곡선에 맞추어 외견상 Kd 값을 결정하였다. Phage was put on a plate to which PA was bound, followed by washing to perform ELISA using an antibody that recognizes phage surface protein. The ELISA signal intensity according to the concentration was indicated and the apparent Kd value was determined according to the saturation curve.

그 결과, 도 6에서 보는 바와 같이, 19개 펩타이드 군 가운데 11개 펩타이드는 피코몰 범위의 결합력을 보여주고 있으며 일부 펩타이드는 20 pM 이하의 우수한 결합력을 보여줌으로써 기존의 항체-항원 반응의 결합력에 상응하는 결합력을 확인할 수 있었다. As a result, as shown in FIG. 6, 11 peptides among 19 peptide groups showed a picomolar binding capacity, and some peptides showed excellent binding strength of 20 pM or less, corresponding to the binding capacity of the existing antibody-antigen response. The binding force could be confirmed.

실시예Example 4:  4: PAPA 와 결합하는 Combined with 펩타이드의Peptide 결합지역 분석 Combined Area Analysis

PA는 탄저독성을 나타내기 위한 독소운반 단백질의 역할을 수행함에 있어 감염 대상 세포주 표면에 결합 후 단백질 가수 분해 효소에 의하여 아미노 말단 부위 (PA20) 및 카복시 말단 (PA63)의 형태로 전환되어야 그 기능을 할 수 있음이 알려져 있다. In the role of toxin-carrying protein for showing anthrax toxicity, PA must be converted to the amino terminal region (PA20) and carboxy terminal (PA63) by proteolytic enzymes after binding to the cell line of infection. It is known that it can be done.

따라서 본 발명에서는 도 7에 도시한 계획도에 기초하여 동정한 PA 결합 펩타이드의 각각의 해당 부위에 따른 결합지역 분석을 실시하여 다양한 목적으로 이용 할 수 있는 자료를 구축하였다. Therefore, in the present invention, by performing the binding region analysis according to the respective sites of the identified PA binding peptide based on the plan shown in Figure 7 to build a data that can be used for various purposes.

구체적으로, (-) PA의 경우 트립신 처리를 하였을 때 20 kDa 과 63 kDa의 특이적인 두 개의 단편이 발생함이 알려져 있음으로 분리 정제한 PA단백질을 도 1(a)에서 나타낸 바와 같이 고정시킨 뒤 트립신 처리하고 이를 세척하여 PA20을 제거하여 PA63단백질만을 플레이트에 고정한 상태에서 19개군의 펩타이드가 발현된 파지를 넣어 주어 결합여부를 판별하였다. 특히, 도 8에 나타낸 것과 같이, 플레이트 표면에 PA63을 남기고 19개군의 펩타이드를 넣어주어 결합하는 펩타이드를 도 6에서 설명한 ELISA를 이용하여 확인한 결과, 펩타이드는 PA63지역에 결합하는 것이며, 반응이 나타나지 않는 것은 PA20지역에 결합하는 것으로 추론할 수 있다Specifically, in the case of (-) PA, it is known that two specific fragments of 20 kDa and 63 kDa are generated when trypsin treatment is performed. After fixing the purified PA protein as shown in FIG. Trypsin treatment and washing to remove the PA20 to determine the binding by inserting phages expressed in 19 groups of peptides in the state fixed only to the PA63 protein on the plate. In particular, as shown in FIG. 8, the peptide was bound to the PA63 region by using the ELISA described in FIG. 6 as a result of confirming the peptide binding to 19 groups of peptides while leaving PA63 on the plate surface as shown in FIG. 8. Can be deduced by binding to the PA20 region.

이러한 본 발명을 통하여 얻은 PA단백질과 결합하는 펩타이드 가운데 피코 몰(10-12M) 범위의 우수한 결합력을 갖는 8종의 펩타이드의 아미노산 서열 및 이들의 결합부위에 대한 정보를 도 9에 나타내었다. 9 shows information about amino acid sequences and binding sites of eight peptides having excellent binding strengths in the range of picomolar (10-12 M) among the peptides binding to PA proteins obtained through the present invention.

구체적으로, 도 9는 본 발명을 통하여 얻은 탄저 방어항원 (PA)와 결합하는 펩타이드의 결합위치 및 결합력에 관한 도면으로서, 본 발명에서는 PA과 결합하는 펩타이드가 표면단백질과 함께 발현된 M13 파지를 이용하여 이들의 결합력을 도 6에 나타낸 바와 같이 측정하였고 도 7에 나타낸 바와 같이 이들을 PA20 및 PA63 지역으로 결합위치를 구분하였다. Specifically, Figure 9 is a view of the binding position and binding capacity of the peptides that bind to the anthrax defense antigen (PA) obtained through the present invention, in the present invention using the M13 phage peptide is expressed with a surface protein binding to PA Their binding force was measured as shown in FIG. 6, and they were divided into PA20 and PA63 regions as shown in FIG. 7.

이를 정리하였으며 결합 펩타이드의 아미노산 서열을 해당 펩타이드 발현 파지의 유전자를 분석하여 확인하여 나타내었다. 그 결과 해당하는 8종의 펩타이드의 아미노산 서열목록은 다음과 같다:The amino acid sequence of the binding peptide was shown by analyzing the gene of the peptide expression phage. As a result, the amino acid sequence listing of the corresponding eight peptides is as follows:

P1: LSHNQTIQQDSD P1: LSHNQTIQQDSD

이때, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 두번째 아미노산인 S가 T로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 포함한다. At this time, the second amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 includes an amino acid substituted with T.

또한, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 다섯번째 아미노산인 Q가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 포함한다. In addition, the fifth amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 includes Q is composed of amino acids substituted with L.

또한, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 일곱번째 아미노산인 I가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 포함한다. In addition, the seventh amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 includes the amino acid substituted with L.

또한, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 열번째 아미노산인 D가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 포함한다. In addition, the 10th amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 includes D is an amino acid substituted with A.

나아가, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 두번째 아미노산인 S가 T로 및/또는 다섯번째 아미노산인 Q가 L로 및/또는 일곱번째 아미노산인 I가 L로 및/또는 열번째 아미노산인 D가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 포함한다. Further, the second amino acid S in the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 is T and / or the fifth amino acid Q is L and / or the seventh amino acid I is L and / or D is the tenth amino acid. Includes those consisting of amino acids substituted with A.

P2: HKHAHNYRLPXSP2: HKHAHNYRLPXS

상기 서열목록 2로 표시되는 아미노산 서열 HKHAHNYRLPXS 중 일곱번째 아미노산인 Y가 T로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. A seventh amino acid of the amino acid sequence HKHAHNYRLPXS represented by SEQ ID NO: 2 is characterized by consisting of an amino acid substituted by T.

P3: TPYYWHHHHIPPP3: TPYYWHHHHIPP

P4: QSPVNHHYHYHIP4: QSPVNHHYHYHI

P5: GHKPQVHRHTHIP5: GHKPQVHRHTHI

이때, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 첫번째 아미노산인 G가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. At this time, the first amino acid of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 is characterized in that consisting of the amino acid substituted by A.

또한, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 두번째 아미노산인 H가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. In addition, the second amino acid of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 is characterized in that consisting of the amino acid substituted by L.

나아가, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 열두번 째 아미노산인 I가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 한다. Furthermore, the twelfth amino acid of amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 is characterized by consisting of amino acids substituted with L.

P6: LMPTPHHRLFPMP6: LMPTPHHRLFPM

P7: ALHPHRTPHHHHP7: ALHPHRTPHHHH

P8: NAYKHHHPPVFYP8: NAYKHHHPPVFY

또한, 상술한 8종의 펩타이드 중 P1, P5, P7, P8의 4종은 PA20에 결합한 것을 확인할 수 있었으며, 나머지 4종에 해당하는 P2, P3, P4, P6은 PA63에 결합한 것을 확인할 수 있었다(도 9 참조). In addition, four of the above-mentioned eight peptides P1, P5, P7, P8 was confirmed that the binding to PA20, the remaining four species of P2, P3, P4, P6 was confirmed that the binding to PA63 ( 9).

결과적으로, 유전자 재조합을 이용하여 대량 생산한 탄저 방어항원 단백질을 플레이트 표면에 Ni이온이 배위결합으로 고정되어 있는 96웰 플레이트에 단백질의 카복시 말단의 6 히스티딘 태그를 이용하여 결합시킨 뒤 램덤 펩타이드 라이브러리(12 아미노산)가 파지표면에 발현된 M13를 이용하여 탄저 방어항원에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 발굴하였다. As a result, the anthrax-antigen protein produced in large quantities using genetic recombination was bound to a 96-well plate in which Ni ions were coordinated to the plate surface using 6 histidine tags at the carboxy terminus of the protein, followed by a random peptide library ( Peptides specifically binding to anthrax defense antigen were identified using M13 expressed on the phage surface.

이는 기존의 항체나 엡타머를 이용한 진단방식과 차별화 되며 펩타이드의 물리, 화학적 안정성을 이용한 다양한 나노바이오 센서와 연계가 가능할 것으로 기대할 수 있다. This can be expected to be differentiated from the existing diagnostic methods using antibodies or epsamers, and can be linked to various nanobio sensors using the physical and chemical stability of peptides.

본 발명에 따르면, 탄저 진단 탐침으로써 탄저독소 단백질인 PA와 특이적으 로 결합하는 펩타이드를 발굴하고 이들의 아미노산 서열 및 결합특성 분석함으로써 이에 대한 자료를 확보하였다. According to the present invention, as an anthrax diagnostic probe, peptides that specifically bind to anthrax toxin protein PA were identified and their data were obtained by analyzing their amino acid sequence and binding properties.

상기 펩타이드 탐침은 뉴클레오타이드 엡타머와 달리 항체와 같은 아미노산으로 구성되어 보다 다양한 조합의 특이성을 가지며 단순한 3차원적 구조로 인한 높은 물리, 화학적 안정성으로 다양한 신호증폭 방법의 연구에 큰 도움이 될 수 있을 것으로 기대된다. The peptide probe is composed of amino acids such as antibodies, unlike nucleotide aptamers, and may be of great help in the study of various signal amplification methods due to its high physical and chemical stability due to its simple three-dimensional structure. It is expected.

이를 통한 보다 높은 민감도를 가지는 진단법확보를 통하여 질병의 조기진단 및 모니터링 시스템 구축하여 대사성질환, 암, 감염성질환등에 대한 높은 기대효과를 창출할 것으로 예상된다. It is expected that the early diagnosis and monitoring system of diseases will be established through the establishment of diagnostic methods with higher sensitivity, which will create high expected effects on metabolic diseases, cancers and infectious diseases.

더 나아가 본 기술은 진단 기술의 자산화로 국가 기술 경쟁력 확보 및 차세대 미래형 비즈니스 창출에도 일조할 것으로 판단된다.Furthermore, this technology is expected to contribute to securing national technological competitiveness and creating next-generation future business through the assetization of diagnostic technology.

<110> IUCF-HYU (Industry-University Cooperation Foundation Hanyang University) <120> A method for screening peptides as a diagnostic probe for anthrax infection and the resulting novel peptides specifically recognizing anthrax protective antigen <130> DP20070022 <160> 8 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide for act as a diagnostic probe <400> 1 Leu Ser His Asn Gln Thr Ile Gln Gln Asp Ser Asp 1 5 10 <210> 2 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 2 His Lys His Ala His Asn Tyr Arg Leu Pro Xaa Ser 1 5 10 <210> 3 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screended peptide to act as a diagnostic probe <400> 3 Thr Pro Tyr Tyr Trp His His His His Ile Pro Pro 1 5 10 <210> 4 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 4 Gln Ser Pro Val Asn His His Tyr His Tyr His Ile 1 5 10 <210> 5 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 5 Gly His Lys Pro Gln Val His Arg His Thr His Ile 1 5 10 <210> 6 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 6 Leu Met Pro Thr Pro His His Arg Leu Phe Pro Met 1 5 10 <210> 7 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 7 Ala Leu His Pro His Arg Thr Pro His His His His 1 5 10 <210> 8 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide tp act as a diagnostic probe <400> 8 Asn Ala Tyr Lys His His His Pro Pro Val Phe Tyr 1 5 10 <110> Industry-University Cooperation Foundation Hanyang University (UCU-HYU) <120> A method for screening peptides as a diagnostic probe for anthrax          infection and the resulting novel peptides specifically          recognizing anthrax protective antigen <130> DP20070022 <160> 8 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide for act as a diagnostic probe <400> 1 Leu Ser His Asn Gln Thr Ile Gln Gln Asp Ser Asp   1 5 10 <210> 2 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 2 His Lys His Ala His Asn Tyr Arg Leu Pro Xaa Ser   1 5 10 <210> 3 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screended peptide to act as a diagnostic probe <400> 3 Thr Pro Tyr Tyr Trp His His His His Ile Pro Pro   1 5 10 <210> 4 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 4 Gln Ser Pro Val Asn His His Tyr His Tyr His Ile   1 5 10 <210> 5 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 5 Gly His Lys Pro Gln Val His Arg His Thr His Ile   1 5 10 <210> 6 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 6 Leu Met Pro Thr Pro His His Arg Leu Phe Pro Met   1 5 10 <210> 7 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide to act as a diagnostic probe <400> 7 Ala Leu His Pro His Arg Thr Pro His His His His   1 5 10 <210> 8 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Screened peptide tp act as a diagnostic probe <400> 8 Asn Ala Tyr Lys His His His Pro Pro Val Phe Tyr   1 5 10  

Claims (21)

삭제delete 삭제delete 삭제delete 탄저 독소단백질 방어항원과 특이적으로 결합하여, 탄저 감염 진단 저분자 피코몰 탐침으로 작용하는 진단용 펩타이드 탐침에 있어서, 상기 펩타이드의 아미노산 서열은 서열목록 1로 표시되는 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.In a diagnostic peptide probe that specifically binds to anthrax toxin protein protective antigen and functions as a low molecular picomol probe for diagnosing anthrax infection, the amino acid sequence of the peptide consists of amino acids represented by SEQ ID NO: 1. . 제4항에 있어서, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 두번째 아미노산인 S가 T로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.The diagnostic peptide probe according to claim 4, wherein S, the second amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1, consists of an amino acid substituted with T. 제4항에 있어서, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 다섯번째 아미노산인 Q가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.The diagnostic peptide probe of claim 4, wherein Q, which is the fifth amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1, consists of an amino acid substituted by L. 제4항에 있어서, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 일곱번째 아미노산인 I이 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.The diagnostic peptide probe of claim 4, wherein I, the seventh amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1, consists of an amino acid substituted by L. 제4항에 있어서, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 열번째 아미노산인 D가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침. 5. The diagnostic peptide probe of claim 4, wherein D, the tenth amino acid of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1, consists of an amino acid substituted by A. 6. 제4항에 있어서, 상기 서열목록 1로 표시되는 아미노산 서열 LSHNQTIQQDSD 중 두번째 아미노산인 S가 T로, 다섯번째 아미노산인 Q가 L로, 일곱번째 아미노산인 I가 L로, 열번째 아미노산인 D가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침. The amino acid sequence of the amino acid sequence LSHNQTIQQDSD represented by SEQ ID NO: 1 is S is T, the fifth amino acid Q is L, the seventh amino acid I is L, and the tenth amino acid D is A. Diagnostic peptide probe, characterized in that consisting of amino acids substituted by. 탄저 독소단백질 방어항원과 특이적으로 결합하여, 탄저 감염 진단 저분자 피코몰 탐침으로 작용하는 진단용 펩타이드 탐침에 있어서, 상기 펩타이드의 아미노산 서열은 서열목록 2로 표시되는 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.In a diagnostic peptide probe that specifically binds to anthrax toxin protein protective antigen and functions as a low molecular picomol probe for diagnosing anthrax infection, the amino acid sequence of the peptide consists of amino acids represented by SEQ ID NO: 2. . 제10항에 있어서, 상기 서열목록 2로 표시되는 아미노산 서열 HKHAHNYRLPXS 중 일곱번째 아미노산인 Y가 T로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침. The diagnostic peptide probe according to claim 10, wherein Y, the seventh amino acid of the amino acid sequence HKHAHNYRLPXS represented by SEQ ID NO: 2 consists of an amino acid substituted with T. 탄저 독소단백질 방어항원과 특이적으로 결합하여, 탄저 감염 진단 저분자 피코몰 탐침으로 작용하는 진단용 펩타이드 탐침에 있어서, 상기 펩타이드의 아미노산 서열은 서열목록 3으로 표시되는 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.In a diagnostic peptide probe that specifically binds to anthrax toxin protein protective antigen and acts as a low molecular picomol probe for diagnosing anthrax infection, the amino acid sequence of the peptide consists of amino acids represented by SEQ ID NO: 3. . 탄저 독소단백질 방어항원과 특이적으로 결합하여, 탄저 감염 진단 저분자 피코몰 탐침으로 작용하는 진단용 펩타이드 탐침에 있어서, 상기 펩타이드의 아미노산 서열은 서열목록 4로 표시되는 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.In a diagnostic peptide probe that specifically binds to anthrax toxin protein protective antigen and acts as a low molecular picomol probe for diagnosing anthrax infection, the amino acid sequence of the peptide consists of amino acids represented by SEQ ID NO: 4. . 탄저 독소단백질 방어항원과 특이적으로 결합하여, 탄저 감염 진단 저분자 피코몰 탐침으로 작용하는 진단용 펩타이드 탐침에 있어서, 상기 펩타이드의 아미노산 서열은 서열목록 5로 표시되는 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침. In a diagnostic peptide probe that specifically binds to anthrax toxin protein protective antigen and acts as a low molecular picomol probe for diagnosing anthrax infection, the amino acid sequence of the peptide is a diagnostic peptide probe comprising an amino acid represented by SEQ ID NO: 5 . 제14항에 있어서, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 첫번째 아미노산인 G가 A로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침. The diagnostic peptide probe according to claim 14, wherein G, which is the first amino acid of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5, consists of an amino acid substituted with A. 제14항에 있어서, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 두번째 아미노산인 H가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.15. The diagnostic peptide probe according to claim 14, wherein H, the second amino acid of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 consists of an amino acid substituted by L. 제14항에 있어서, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 열두번째 아미노산인 I가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.The diagnostic peptide probe according to claim 14, wherein I, the twelfth amino acid of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 consists of an amino acid substituted by L. 제14항에 있어서, 상기 서열목록 5로 표시되는 아미노산 서열 GHKPQVHRHTHI 중 첫번째 아미노산인 G가 A로, 두번째 아미노산인 H가 L로, 열두번째 아미노산인 I가 L로 치환된 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침. The amino acid sequence of the amino acid sequence GHKPQVHRHTHI represented by SEQ ID NO: 5 consists of amino acids in which G is A, H is L, L is 12, and I is L. Diagnostic Peptide Probes. 탄저 독소단백질 방어항원과 특이적으로 결합하여, 탄저 감염 진단 저분자 피코몰 탐침으로 작용하는 진단용 펩타이드 탐침에 있어서, 상기 펩타이드의 아미노산 서열은 서열목록 6으로 표시되는 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.In a diagnostic peptide probe that specifically binds to anthrax toxin protein protective antigen and acts as a low molecular picomol probe for diagnosing anthrax infection, the amino acid sequence of the peptide is a diagnostic peptide probe comprising an amino acid represented by SEQ ID NO: 6 . 탄저 독소단백질 방어항원과 특이적으로 결합하여, 탄저 감염 진단 저분자 피코몰 탐침으로 작용하는 진단용 펩타이드 탐침에 있어서, 상기 펩타이드의 아미노산 서열은 서열목록 7로 표시되는 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.In a diagnostic peptide probe that specifically binds to anthrax toxin protein protective antigen and functions as a low molecular picomol probe for diagnosing anthrax infection, the amino acid sequence of the peptide is a diagnostic peptide probe comprising an amino acid represented by SEQ ID NO: 7. . 탄저 독소단백질 방어항원과 특이적으로 결합하여, 탄저 감염 진단 저분자 피코몰 탐침으로 작용하는 진단용 펩타이드 탐침에 있어서, 상기 펩타이드의 아미노산 서열은 서열목록 8로 표시되는 아미노산으로 이루어진 것을 특징으로 하는 진단용 펩타이드 탐침.In a diagnostic peptide probe that specifically binds to anthrax toxin protein protective antigen and acts as a low molecular picomol probe for diagnosing anthrax infection, the amino acid sequence of the peptide consists of amino acids represented by SEQ ID NO: 8. .
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