KR100794218B1 - 63 Methods Of Screening Anticancer Agent By Using DNp63 Promoter - Google Patents

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Abstract

본 발명은 DNp63의 프로모터를 이용한 항암제 스크리닝 방법에 관한 것으로서, 상피 세포 유래 암세포에서 잠재적인 항암제의 접촉에 의해 DNp63 단백질의 발현을 유도하는 것을 특징으로 하는 DNp63 프로모터, 이를 포함하는 재조합 벡터, 상기 재조합벡터를 이용한 스크리닝 방법 및 키트에 관한 것이다.The present invention relates to a method for screening an anticancer agent using a promoter of DNp63, wherein the DNp63 promoter, a recombinant vector comprising the same, and the recombinant vector, which induce expression of a DNp63 protein in contact with a potential anticancer agent in epithelial cell-derived cancer cells It relates to a screening method and kit using.

DNp63의 프로모터, 항암제, 스크리닝 방법DNp63 promoters, anticancer agents, screening methods

Description

DNp63의 프로모터를 이용한 항암제 스크리닝 방법{Methods Of Screening Anticancer Agent By Using DNp63 Promoter}Method of Screening Anticancer Agent by Using DNp63 Promoter

도 1은 본 발명에서 클로닝되어진 DNp63 프로모터 사이트의 위치를 보인다.Figure 1 shows the location of the DNp63 promoter site cloned in the present invention.

도 2는 ET-유전자 재조합이 이루어지는 과정을 보인다.2 shows the process by which ET-gene recombination is performed.

도 3은 본 발명에 사용한 벡터 pBACe3.6 플라스미드의 개열 지도이다.3 is a cleavage map of the vector pBACe3.6 plasmid used in the present invention.

도 4는 ET-유전자 재조합에 사용되어지는 pGETrec 벡터의 개열지도이다.4 is a cleavage map of the pGETrec vector used for ET-gene recombination.

도 5는 카세트로 사용하는 IRES-NLS-GFP-Km을 가진 부분이다.5 is a part having IRES-NLS-GFP-Km used as a cassette.

도 6은 카세트가 삽입되어지는 pEGRP-C1 벡터의 개열지도이다.6 is a cleavage map of the pEGRP-C1 vector into which a cassette is inserted.

도 7은 클로닝한 후 50bp의 암 서열이 있는 프라이머로 PCR 후 얻은 ER-유전자 재조합을 위한 카세트이다.7 is a cassette for ER-gene recombination obtained after PCR with a primer with a cancer sequence of 50 bp after cloning.

도 8은 확립된 재조합 벡터는 상피암세포 특이적으로 발현을 한다는 것을 보인다. DNp63 과발현 상피암세포주인 ME180 세포와 음성 대조군으로 DNp63을 발현하지 않는 암세포주인 HeLa 세포에서 확인하였다.8 shows that the established recombinant vector expresses epithelial cancer cells specifically. ME180 cells, which are DNp63 overexpressing epithelial cancer cell lines, and HeLa cells, which are cancer cell lines that do not express DNp63 as a negative control, were identified.

도 9는 확립된 재조합 벡터는 TGF-β 처리전에는 발현정도가 미약하지만, 처리후에 GFP의 밝기가 확연히 증가하는 것을 통해, 세포신호 특이적으로 발현이 조절됨을 보인다.9 shows that the established recombinant vector has a weak expression level before TGF-β treatment, but the expression of GFP is significantly regulated through the increase in the brightness of GFP after the treatment.

인간의 암의 80%가 상피세포유래의 암이며, 암이 줄기세포에서 유전자 변형으로 유래할 것이라는 생각에 근거, 특이적으로 줄기세포와 암세포에서만 발현되고, 분화시 발현이 억제된다고 알려진 △Np63α의 기능이 매우 중요시 될 수 있다. 또한 △Np63α가 세포의 증식과 사멸에서 p53의 기능을 억제하는 기능을 하고 있으며, 과발현시 암발생 조절 유전자로서의 기능을 하게 되어, 줄기세포에서의 p53와 △Np63α의 양적 균형이 세포의 증식과 분화를 조절할 것으로 생각된다. 따라서 △Np63α의 단백질 수준에서의 안정성 및 세포내에서의 위치가 암발생 유전자로서의 기능에 매우 중요하게 작용할 것이라 유추된다.80% of human cancers are epithelial cell-derived cancers. Based on the idea that cancers may be derived from stem cells, they are specifically expressed in stem cells and cancer cells, and the expression of ΔNp63α is known to be inhibited during differentiation. Functionality can be very important. In addition, ΔNp63α has a function of inhibiting the function of p53 in the proliferation and death of cells, and functions as a gene for regulating cancer during overexpression. As a result, quantitative balance of p53 and ΔNp63α in stem cells promotes cell proliferation and differentiation. It is thought to control. Therefore, it is inferred that stability and protein position of ΔNp63α will play a very important role in functioning as a cancer gene.

DNp63은 암발생 억제제인 p53의 상동체로써 TAp63의 ORF(open reading frame : 유전자 발현 부위)내부에 프로모터(전사조절부위)가 있어서 TAp63과 다른 기능을 하는 단백질로 발현된다. 이렇게 발현된 DNp63은 TAp63과는 달리 아미노 말단의 전사활성도메인이 없는 형태로, p53의 안타고니스트(antagonist)로 작용하는 암발생 유전자으로 상피암세포에서 특이적으로 발현된다. 핵단백질인 단백질 p63은 염색체 3q에 위치하고 있고, p53과 상동성을 가지고 있는 것으로 보인다. p53 단백질은 암발생억제 유전자로 세포 주기와 세포의 사멸의 조절에 중요한 다기능성의 DNA-결합 단백질을 가지고 있다. p63은 세가지의 아이소폼으로 존재한다. 각각은 두개의 선택적인 프로모터에 의해서 두 그룹의 전사체를 만든다. 첫 번째는 p53과 같이 N-말단 전사 활성 도메인을 가지고 있는 전체 길이의 단백질을 암호화 하고 있다. 이것은 세포사멸을 일으킬 수 있다. 두 번째는 트렁케이트된 단백질을 암호화 하고 있고, N-말단 전사활성 도메인이 없다(△Np63). △Np63은 우성의 네가티브한 방식으로 p53에 의한 그리고/또는 전체 길이의 p63 전사활성을 억제한다.DNp63 is a homologue of p53, a cancer-causing inhibitor, and is expressed as a protein having a function different from that of TAp63 due to a promoter (transcriptional regulatory region) inside the ORF of the TAp63. DNp63, which is expressed in this manner, does not have an amino-terminus transcriptional activity domain, unlike TAp63, and is specifically expressed in epithelial cancer cells as a cancer generating gene that functions as an antagonist of p53. Nuclear protein p63 is located on chromosome 3q and appears to have homology with p53. p53 protein is a cancer suppressor gene that contains a multifunctional DNA-binding protein that is important for regulating cell cycle and cell death. p63 exists in three isoforms. Each produces two groups of transcripts by two selective promoters. The first encodes a full-length protein with an N-terminal transcriptional active domain, such as p53. This can cause cell death. The second encodes a truncated protein and lacks the N-terminal transcriptional activity domain (ΔNp63). ΔNp63 inhibits p53 transcriptional activity by and / or full length of p53 in a dominant negative manner.

미국특허출원 US20020094547A1(발명의 명칭: Differential diagnosis of cancer and other conditions based on expression of p63) 발명은 p63의 유전자 산물, 이 유전자를 포함하는 핵산, mRNA 그리고 이 유전자를 포함하는 cDNA에 관한 것이고, 이 유전자 및 이 유전자의 산물을 암같은 어떤 질병의 치료 또는 진단에 사용하는 것에 관한 것이다. 이 발명은 이와 같은 진단 및 치료 방법이 사용되어지는 키트에 관한 것이다. 상기 미국특허출원에서는 분화되어진 폐암세포와 비분화된 폐암세포에서 p63의 유전자 또는 단백질을 측정함으로써 구별할 수 있는 방법이 제안되었다. p63이 없는 것은 비분화된 폐암 세포인 것을 나타낸다고 제시하고 있다.US patent application US20020094547A1 (differential diagnosis of cancer and other conditions based on expression of p63) The invention relates to a gene product of p63, a nucleic acid comprising this gene, mRNA and a cDNA comprising the gene. And the use of products of this gene in the treatment or diagnosis of certain diseases such as cancer. The present invention relates to kits in which such diagnostic and therapeutic methods are used. In the US patent application, a method that can be distinguished by measuring a gene or protein of p63 in differentiated lung cancer cells and undifferentiated lung cancer cells has been proposed. The absence of p63 suggests that it is an undifferentiated lung cancer cell.

국제특허출원 WO04048520A2(발명의 명칭: REDD1, A Transcriptional Target of p63 and p53, and method of use therefor)에서는 REDD1이라는 p53-의존적인 DNA 손상 반응과 p63 매개 상피세포의 분화의 조절과 관련되어 있는 공통 전사 타켓에 대하여 기술하고 있다.In international patent application WO04048520A2 (name of invention: REDD1, A Transcriptional Target of p63 and p53, and method of use therefor), the common transcription associated with the regulation of p53-dependent DNA damage response called REDD1 and the differentiation of p63 mediated epithelial cells It describes the target.

유럽 특허출원 EA0003326B1(발명의 명칭: Method of cancer treating)에서는 인간의 암을 치료하기위한 방법으로 유기의 비단백 화합물을 p53 패밀리의 인간 단백질에 접촉시킨 후 안정화시키고, 상기 안정화된 단백질을 상기 단백질의 야생형의 활동에 참여하는 하나 또는 그 이상의 단백질과 접촉시키는 것을 특징으로 하는 암치료방법이 개시되어져 있다. European patent application EA0003326B1 (name of the invention: Method of cancer treating) is a method for treating human cancer, in which organic nonprotein compounds are contacted with human proteins of the p53 family and then stabilized, and the stabilized proteins are Disclosed is a method for treating cancer characterized by contact with one or more proteins participating in wild-type activity.

미국 특허출원 US6479285(발명의 명칭: p53 as a regulator of cell differentiation)에서는 p53의 활성을 억제하는 방법이 제공되어지고 있으며 이들 조직을 분화에서 p53관련 블록을 극복할 수 있는 물질을 찾기 위한 스크리닝 도구로 사용되어질 수 있다고 보고 하였다. 그러나 DNp63의 발현정도로 항암제의 스크리닝에 이용한 적은 없었다. US patent application US6479285 (named p53 as a regulator of cell differentiation) provides a method of inhibiting the activity of p53 and screens these tissues as a screening tool to find substances that can overcome p53-related blocks in differentiation. It can be used. However, the expression level of DNp63 has not been used for screening of anticancer drugs.

본 발명자들은 DNp63의 발현정도로 항암제의 스크리닝에 이용될 수 있는 것을 발견하고 본 발명을 완성하였다. The present inventors have found that the expression level of DNp63 can be used for the screening of anticancer agents and completed the present invention.

본 발명은 DNp63 프로모터를 이용하여 항암제를 스크리닝하는 방법을 제공하고자 한다.The present invention seeks to provide a method for screening anticancer agents using the DNp63 promoter.

본 발명은 상피 세포 유래 암세포에서 잠재적인 항암제의 접촉에 의해 DNp63 단백질의 발현을 유도하는 것을 특징으로 하는 서열번호 1을 가진 것을 특징으로 하는 DNp63 프로모터에 관한 것이다.The present invention relates to a DNp63 promoter characterized by having SEQ ID NO: 1 which induces expression of the DNp63 protein by contact of a potential anticancer agent in epithelial cell derived cancer cells.

본 발명은 상기 프로모터와 발현을 확인하기 위한 리포터 유전자를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암제 스크리닝을 하기 위한 재조합벡터에 관한 것이다.The present invention relates to a recombinant vector for screening an anticancer agent comprising a reporter gene for confirming expression with the promoter.

본 발명은 보다 구체적으로, 상기 리포터 유전자가 녹색 형광 단백질(GFP)인 것을 특징으로 하는 항암제 스크리닝을 하기 위한 재조합벡터에 관한 것이다.More specifically, the reporter gene relates to a recombinant vector for screening an anticancer agent, characterized in that the green fluorescent protein (GFP).

본 발명은 상기 재조합 벡터로 형질전환되어진 항암제 스크리닝을 하기 위한 상피 세포 유래의 암세포에 관한 것이다.The present invention relates to cancer cells derived from epithelial cells for screening anticancer agents transformed with the recombinant vector.

본 발명은 상기 재조합벡터를 상피 세포 유래 암세포에 형질전환시키는 단계;The present invention comprises the steps of transforming the recombinant vector into epithelial cell-derived cancer cells;

잠재적인 항암물질을 상기 암세포에 접촉시키는 단계;Contacting the potential anticancer substance with the cancer cell;

상기 암세포에서 리포터의 발현양을 측정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암물질 스크리닝 방법에 관한 것이다.It relates to an anticancer substance screening method comprising the step of measuring the expression amount of the reporter in the cancer cells.

본 발명은 상기 재조합벡터로 형질전환된 상피 유래 암세포;The present invention is epithelial-derived cancer cells transformed with the recombinant vector;

잠재적인 항암물질을 상기 암세포에 접촉시키는 용기; 및A container for contacting the cancer cell with a potential anticancer substance; And

상기 암세포에서 녹색 형광 단백질의 발현양을 측정하는 장치를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암제 진단 키트에 관한 것이다.It relates to an anticancer drug diagnostic kit comprising a device for measuring the expression amount of green fluorescent protein in the cancer cells.

제 1 양태로, 상피 세포 유래 암세포에서 잠재적인 항암제의 접촉에 의해 DNp63 단백질의 발현을 유도하는 것을 특징으로 하는 서열번호 1을 가진 것을 특징으로 하는 DNp63 프로모터에 관한 것이다.In a first aspect, the present invention relates to a DNp63 promoter having SEQ ID NO: 1 which induces expression of the DNp63 protein by contact of a potential anticancer agent in epithelial cell-derived cancer cells.

본 발명에 따라 잠재적인 항암제란 암세포를 사멸시키기에 효과적인 물질을 말한다. Potential anticancer agents according to the present invention refer to substances effective for killing cancer cells.

제 2 양태로 본 발명은본 발명은 상기 프로모터와 발현을 확인하기 위한 리포터 유전자를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암제 스크리닝을 하기 위한 재조합발현 벡터에 관한 것이다.In a second aspect, the present invention relates to a recombinant expression vector for screening an anticancer agent, comprising a promoter gene for confirming expression with the promoter.

본 발명에서 사용되는 벡터라는 용어는 또다른 핵산을 그것에 결합시켜 이송시킬 수 있는 핵산 분자를 의미한다. 발현벡터란 용어는 상기 벡터에 의해 운반되는 각 재조합형 유전자에 의해 암호화되는 단백질을 합성시킬 수 있는 플라스미드, 코스미드 또는 파아지를 포함한다. 바람직한 벡터는 그것이 결합된 핵산을 자기 복제 및 발현시킬 수 있는 벡터이다. The term vector, as used herein, refers to a nucleic acid molecule capable of binding and transferring another nucleic acid thereto. The term expression vector includes plasmids, cosmids or phages capable of synthesizing proteins encoded by each recombinant gene carried by the vector. Preferred vectors are vectors capable of self-replicating and expressing the nucleic acid to which they are bound.

제 3 양태로 본 발명은 상기 재조합 벡터로 형질전환된 상피 세포 유래 암세포에 관한 것이다.In a third aspect, the present invention relates to epithelial cell-derived cancer cells transformed with the recombinant vector.

본 발명에서 사용되는 '형질전환'이란 용어는 외래 DNA 또는 RNA가 세포에 흡수되어 세포의 유전형이 변화되는 것을 말한다.The term 'transformation' used in the present invention means that foreign DNA or RNA is absorbed into a cell and the genotype of the cell is changed.

적합한 상피 세포 유래 암세포로는 HeLa 세포, HaCAT, ZR-75-1, 또는 ME180이 포함되나, 이들로 제한되는 것은 아니다.Suitable epithelial cell derived cancer cells include, but are not limited to, HeLa cells, HaCAT, ZR-75-1, or ME180.

제 4 양태로 상기 재조합벡터를 상피 세포 유래 암세포에 형질전환시키는 단계;Transforming the recombinant vector into epithelial cell-derived cancer cells in a fourth aspect;

잠재적인 항암물질을 상기 암세포에 접촉시키는 단계;Contacting the potential anticancer substance with the cancer cell;

상기 암세포에서 리포터의 발현양을 측정하는 것을 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암물질 스크리닝 방법에 관한 것이다.It relates to an anticancer substance screening method comprising the step of measuring the expression amount of the reporter in the cancer cells.

암세포에서 프로모터의 발현을 확인하는 방법은 리포터 유전자를 이용하여 할 수 있다. 리포터 유전자는 특정한 유전자로 제한되지 않는다. 용이하게 측정할 수 있는 생성물을 발현하는 어떠한 유전자라도 이용되어질 수 있다. 적합한 리포터 유전자는 본 기술분야에서 숙련된 전문가에게 잘 알려져 있다. 리포터 유전자의 예로는 CAT(클로람페니콜 아세틸 트랜스퍼라아제), 루시퍼라아제, 베타-갈락토시다아제와 같은 다른 효소검출시스템; 세균성 루시퍼라아제, 알칼리성 포스파타제 및 녹색형광물질(GFP)이 포함되나 이들로 제한되는 것은 아니다. 리포터 유전자의 검출은 본 기술분야에서 숙련된 전문가에게 잘 알려져 있다. 리포터 유전자가 그의 효소활성에 의해 검출되는 경우에는, 일반적으로 효소를 그의 적절한 기질과 함께 제공하고, 반응생성물(예를들어 루시퍼라아제에 의해 생성된 빛)을 검출하는 단계를 포함한다. 검출은 리포터 유전자 생성물의 존재 또는 부재를 간단히 검출하는 단계를 포함할 수 있다. 또 다른 방법으로는 리포터 유전자 생성물의 발현 레벨의 정량화를 포함할 수도 있다. 정량화하는 방법은 절대적 정량화일 수 있거나, 하우스키핑 유전자의 발현 레벨에 비교하여 정량화 할 수 있다. 이러한 검출은 수동으로 수행될 수 있거나, 고처리량(high-throughput)선별 시스템에서와 같이 자동으로 수행될 수 있다.The method of confirming the expression of a promoter in cancer cells can be performed using a reporter gene. Reporter genes are not limited to specific genes. Any gene that expresses a product that can be easily measured can be used. Suitable reporter genes are well known to those skilled in the art. Examples of reporter genes include other enzyme detection systems such as CAT (chloramphenicol acetyl transferase), luciferase, beta-galactosidase; Bacterial luciferase, alkaline phosphatase and green fluorescent material (GFP) are included, but are not limited to these. Detection of reporter genes is well known to those skilled in the art. When a reporter gene is detected by its enzymatic activity, it generally comprises providing the enzyme with its appropriate substrate and detecting the reaction product (eg the light produced by luciferase). Detection can include simply detecting the presence or absence of the reporter gene product. Another method may include quantification of the expression level of the reporter gene product. The method of quantification can be absolute quantification or can be quantified compared to the expression level of the housekeeping gene. Such detection may be performed manually or may be performed automatically as in a high-throughput screening system.

유전자 발현의 존재, 부재 또는 정량화에 대한 고처리량 시험방법은 본 기술분야에서 숙련된 전문가에게 잘 알려져 있다. 예를들어, 미국특허 제 5,559,410호에는 단백질에 대한 고처리량 선별방법이 기술되어 있고, 미국 특허 제 5,585,635호에는 핵산결합에 대한 고처리량 선별방법이 기술되어 있다. 또한 미국특허 제 5,576,220호 및 5,541,061호에는 리간드/항체 결합에 대한 고처리량 선별 방법이 기술되어 있다.High throughput test methods for the presence, absence or quantification of gene expression are well known to those skilled in the art. For example, US Pat. No. 5,559,410 describes a high throughput screening method for proteins and US Pat. No. 5,585,635 describes a high throughput screening method for nucleic acid binding. U.S. Patents 5,576,220 and 5,541,061 also describe high throughput screening methods for ligand / antibody binding.

제 5 양태로 본 발명은 △Np63α 유전자와 이를 확인할 수 있는 리포터 유전자를 벡터에 클로닝시키는 단계;In a fifth aspect, the present invention provides a method comprising cloning a ΔNp63α gene and a reporter gene capable of identifying the same into a vector;

상기 클론된 벡터를 상피 세포 유래 암세포에 형질전환하여 발현시키는 단계;Transforming the cloned vector into epithelial cell-derived cancer cells and expressing the cloned vector;

상기 암세포에 잠재 물질을 접촉시키는 단계; 및Contacting the latent substance with the cancer cell; And

△Np63α 유전자의 위치가 핵에서 세포질로의 이동을 확인하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암제 스크리닝 방법에 관한 것이다.The position of the ΔNp63α gene relates to a method for screening an anticancer agent comprising the step of confirming migration from the nucleus to the cytoplasm.

제 6 양태로 본 발명은 상기 재조합벡터로 형질전환된 상피 유래 암세포;In a sixth aspect the present invention is epithelial-derived cancer cells transformed with the recombinant vector;

잠재적인 항암물질을 상기 암세포에 접촉시키는 용기; 및A container for contacting the cancer cell with a potential anticancer substance; And

상기 암세포에서 녹색 형광 단백질의 발현양을 측정하는 장치를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암제 진단 키트에 관한 것이다.It relates to an anticancer drug diagnostic kit comprising a device for measuring the expression amount of green fluorescent protein in the cancer cells.

이하, 본 발명을 실시예에 의하여 더욱 상세하게 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것으로 본 발명의 내용이 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. However, the following examples are illustrative of the present invention, and the content of the present invention is not limited by the following examples.

본 발명자들은 도 1과 같이 상피암세포에서 특이적으로 발현하는 DNp63의 promoter 부분을 포함한 약 150kb의 p63 쥐(Mus musculus) 게놈 DNA를 가지고 있는 pBACe3.6에서 보전되어진 프로모터(약 56Kb)를 복어, 쥐, 및 인간에서 찾았다. DNp63은 척추동물에서 발현되며, 복어(fugu)의 경우 사람과 비교했을 때, 동일한 유전자와 조절인자를 가지고 있다. 또한, 인간 게놈에 비해 1/10의 염기서열을 가지고 있어서, 유전자비교를 통해 진화적으로 보존된 염기서열을 찾아내는데 이점이 있다. 이렇게 찾아낸 56Kb의 프로모터 뒤에 내부 리보솜 진입 사이트(internal ribosomal entry site; IRES)를 포함한 GFP(Green Fluorescence Protein)을 ET-유전자재조합기술로 재조합 벡터를 확립했다. The inventors of the present invention have a promoter (about 56Kb) stored in pBACe3.6 having about 150kb of p63 Mus musculus genomic DNA containing a promoter portion of DNp63 that is specifically expressed in epithelial cancer cells. , And in humans. DNp63 is expressed in vertebrates and fugu has the same genes and regulators as compared to humans. In addition, since it has a nucleotide sequence of 1/10 of the human genome, there is an advantage in finding an evolutionarily conserved nucleotide sequence through gene comparison. The recombinant vector was established by the ET-gene recombination technique using GFP (Green Fluorescence Protein) including the internal ribosomal entry site (IRES) behind the 56 Kb promoter.

ET-유전자 재조합은 도 2와 같이 삽입하고자 하는 DNA 조각의 5'- 및 3'-부위에, 삽입위치의 5' 및 3' 에 해당하는 약 50bp의 상동성 암(arm)을 부착하여, 상동성 암(arm)부위의 유전자 재조합에 의하여 DNA조각이 의도된 부위의 BAC 플라스미드 위치에 삽입하는 신기술로, 100kb이상의 기존의 제한효소 절단-연결을 통한 서브클로닝이 불가능한 경우에 사용 된다ET-gene recombination is attached to 5'- and 3'-site of the DNA fragment to be inserted as shown in Figure 2, by attaching a homologous arm of about 50bp corresponding to 5 'and 3' of the insertion position, A new technology that inserts DNA fragments into the BAC plasmid site at the intended site by gene recombination of the same-arm arm, and is used when subcloning through existing restriction enzyme cleavage linkage of more than 100 kb is impossible.

RET/ET 유전자 재조합에서는 목적의 DNA 분자가 람다 파아지로부터의 Reda/Redb 또는 Rac 프로파아지의 RecE/RecT의 파아지 유래의 단백질을 발현하고 있는 대장균에서 정확하게 상동성의 유전자재조합에 의해서 바뀌어진다. RecE와 Reda는 5'에서 3'으로의 엑소뉴클라아제의 활성이 있으며 RecT와 Redb는 DNA 어닐링 단백질이다. 유전자 재조합은 상동성이 있는 부분을 통하여 이루어진다. 상동성이 있는 유전자 부분을 임의적으로 정할 수 있기 때문에 두개의 DNA 분자 사이의 유전적 정보를 정확하고, 특이적으로 교환할 수 있다.In RET / ET recombination, the DNA molecule of interest is modified by homologous genetic recombination in Escherichia coli expressing a protein derived from Reda / Redb from a lambda phage or a phage derived from RecE / RecT from a Rac phage. RecE and Reda have 5 'to 3' exonuclease activity and RecT and Redb are DNA annealing proteins. Genetic recombination occurs through homologous moieties. The homology to gene parts can be arbitrarily determined, allowing accurate and specific exchange of genetic information between two DNA molecules.

[실시예 1] 재조합 벡터의 제조Example 1 Preparation of Recombinant Vector

벡터 pBACe3.6을 이용하였다. sacBII 유전자를 포지티브 선택마커로 삽입하였다. Bacillus amyloliquefaciens에서 얻어진 sacBII유전자는 Nat Sternberg's P1 벡터로부터 유도되었다. sacBII 유전자의 독성은 다당류에서 유도된 과당이 폴리과당(레반)으로 전환되어짐으써 생긴다. 이것은 대장균에는 독성이 있다. 클로닝 벡터와 재조합 클론은 sacBII 유전자를 가지고 있지 않으므로 설탕에 저항성이 있게 된다. 따라서 바람직하지 못한 클론은 설탕에 민감하기 때문에 설탕을 포함하는 배지에서는 콜로니를 형성할 수 없다. (참고문헌: Fregen, E et al. (1999) A modular, positive selection bacterial artificial chromosome vector with multiple cloning site. Genomics 58: 250-253)Vector pBACe3.6 was used. The sacBII gene was inserted as a positive selection marker. The sacBII gene obtained from Bacillus amyloliquefaciens was derived from Nat Sternberg's P1 vector. Toxicity of the sacBII gene is caused by the conversion of fructose derived from polysaccharides to polyfructose (leban). It is toxic to E. coli. Cloning vectors and recombinant clones do not carry the sacBII gene, making them resistant to sugar. Therefore, undesirable clones are susceptible to sugar and thus cannot form colonies in a medium containing sugar. (Ref. Fregen, E et al. (1999) A modular, positive selection bacterial artificial chromosome vector with multiple cloning site.Genomics 58: 250-253)

pBACe3.6의 EcoRI로 인서트(insert)가 들어갔으며, p63 게놈 DNA 서열이 들어간 클론번호는 329J23 대장균이다. 프로모터의 서열은 서열목록 1과 같다.An insert was inserted into EcoRI of pBACe3.6, and the clone number containing the p63 genomic DNA sequence is 329J23 Escherichia coli. The sequence of the promoter is shown in SEQ ID NO: 1.

ET-유전자 재조합에 사용되어진 pGETrec 플라스미드의 개열지도를 도 4에 나타내었다. pGETrec 벡터는 ET 유전자 재조합을 하기 위한 효소인 RecE, RecT를 발현하는 벡터이며, 아라비노스 유도 시스템에 의해 단백질을 과량발현시킨다. 유도는 IPTG(최종농도 = 1 mM)을 사용하며, 3시간 동안 유도시키 DH10B 세균을 전기천공법(electrophoration)용 컨피턴트 세포를 만들어서 사용하였다.A cleavage map of the pGETrec plasmid used for ET-gene recombination is shown in FIG. 4. The pGETrec vector is a vector expressing RecE and RecT, which are enzymes for ET gene recombination, and overexpress the protein by the arabinose induction system. Induction was performed using IPTG (final concentration = 1 mM), and DH10B bacteria were used to make competent cells for electrophoresis by induction for 3 hours.

다음으로 카세트로 사용하는 부분인 IRES-NLS-GFP-Km을 가진 벡터의 제조하였다. IRES-NLS-GFP는 pBS/KS 벡터에 들어있는 것을 사용하였다(참고: Emma Dormand 1999). 사용되어진 카세트 부분에 대한 모식도를 도 5에 나타내었다. 상기 카세트를 EcoRI, SalI으로 잘라내고, pEGFP-C1 벡터(클론테크)의 MCS(다중 클로닝 부분)에 서브-클로닝하였다. 사용되어진 pEGFP-C1 벡터의 정보를 도 6에 나타내었다. 클로닝후에 50bp의 암(포워드: TGCCCTCTCTCCATCCCCTGCCATTCCCTCCAACACAGATTACCCGGGC(서열목록 2), 리버스: GCCCAGAAACCATATTGTTTTGTTAAATATTATTTGGTGATGTCTAGGA(서열목록 3) ) 서열이 있는 프라이머로 PCR 후, 얻어진 ET-유전자 재조합을 위한 카세트는 도 7과 같다. 상기 방법으로 얻어진 카세트 400ng을 pGETrec을 유도시킨후 컨피턴트 세포를 만든 DH10B 대장균주에 전기천공법으로 형질전환시켰다. Next, a vector having IRES-NLS-GFP-Km, which was used as a cassette, was prepared. IRES-NLS-GFP was used in the pBS / KS vector (Emma Dormand 1999). A schematic diagram of the cassette portion used is shown in FIG. 5. The cassette was cut out with EcoRI, SalI and sub-cloned into the MCS (multiple cloning portion) of the pEGFP-C1 vector (Clontech). Information on the pEGFP-C1 vector used is shown in FIG. 6. After cloning the primers for ET-gene recombination after PCR with primers with 50 bp of cancer (forward: TGCCCTCTCTCCATCCCCTGCCATTCCCTCCAACACAGATTACCCGGGC (SEQ ID NO: 2), reverse: GCCCAGAAACCATATTGTTTTGTTAAATATTATTTGGTGATGTCTAGGA (SEQ ID NO: 3)) after cloning. 400 ng of the cassette obtained by the above method was induced by pGETrec and transformed into DH10B Escherichia coli, which produced the competent cells, by electroporation.

[실시예 2] 확립된 재조합 벡터가 상피암세포 특이 발현 확인Example 2 Established Recombinant Vector Confirms Epithelial Cancer Cell Specific Expression

본 연구자들이 확립한 재조합 벡터는 DNp63 프로모터 뒤에 IRES-GFP가 삽입되어있다. GFP(Excitation maximum = 488 nm; emission maximum = 507 nm)는 특정 흡광도에서 녹색 파장을 발산해서 현미경 상에서 쉽게 확인할 수 있는 장점이 있고, IRES는 업스트림의 DNp63의 프로모터 특이적으로 GFP의 발현 정도를 조절한다. In our recombinant vector, IRES-GFP is inserted after DNp63 promoter. GFP (Excitation maximum = 488 nm; emission maximum = 507 nm) has the advantage that it can be easily identified under a microscope by emitting a green wavelength at a specific absorbance, and IRES regulates the expression of GFP specifically in the promoter of DNp63 upstream. .

확립된 재조합 벡터는 상피암세포 특이적으로 발현을 한다는 것을 DNp63 과발현 상피암세포주인 ME180 세포와 음성 대조군으로 DNp63을 발현하지 않는 암세포주인 HeLa 세포에서 확인했다(도 8 참조). It was confirmed that the established recombinant vector specifically expresses epithelial cancer cells in ME180 cells, a DNp63 overexpressing epithelial cancer cell line, and HeLa cells, a cancer cell line not expressing DNp63 as a negative control (see FIG. 8).

도 8에서 볼 수 있듯이, DNp63을 과발현하고 있는 암세포주인 ME180에서는 발현정도가 높다는 것을 GFP를 통해 확인할 수 있었다. 그러나, HeLa 세포에서는 GFP가 발현되지 않는 것으로 볼 때, 세포주 특이적으로 재조합 벡터가 발현조절 된다는 것을 확인할 수 있었다.As can be seen in Figure 8, it was confirmed through the GFP that the expression level is high in the cancer cell line ME180 overexpressing DNp63. However, when HeLa cells do not express GFP, it was confirmed that recombinant vectors are specifically regulated in cell lines.

[실시예 3] 항암제 스크리닝에 이용가능한 DNp63 유전자의 프로모터 기능확인Example 3 Confirmation of Promoter Function of DNp63 Gene Available for Anticancer Screening

또한, 세포 특이적으로 발현되는 DNp63 유전자의 프로모터는 세포전달신호에서 발현 정도가 조절되어야만 앞으로 항암제 스크리닝에 이용할 수 있을 것이다. 본 실험실에서는 TGF-β 신호에 대해 DNp63의 발현 정도가 증가하는 것을 확인한 바있다. 이를 바탕으로 이 재조합 벡터가 TGF-β 신호에 대해 GFP의 밝기가 증가하는 지를 HME(human mammary epithelial) 세포에서 확인했다. In addition, the promoter of DNp63 gene, which is specifically expressed in the cell, may be used for anticancer drug screening only when the expression level in the cell signal is controlled. In our laboratory, it was confirmed that the expression level of DNp63 is increased with respect to TGF-β signal. Based on this, it was confirmed in human mammary epithelial (HME) cells that the recombinant vector increased GFP brightness for TGF-β signal.

도 9의 결과에서 확인할 수 있듯이, 확립된 재조합 벡터는 TGF-β 처리전에는 발현정도가 미약하지만, 처리후에 GFP의 밝기가 확연히 증가하는 것을 통해, 세포신호 특이적으로 발현이 조절됨을 보인다.As can be seen from the results of FIG. 9, the established recombinant vector has a weak expression level before TGF-β treatment, but it shows that the expression of GFP is specifically controlled through the increase in the brightness of GFP after the treatment.

DNp63은 상피암세포에서 특이적으로 발현하는 지표유전자이며, 이 유전자의 특정 전사조절 부위만을 가진, 본 발명에 따른 재조합 벡터는 형광을 띄는 단백질을 발현하고 있어서, 육안으로 쉽게 발현유무를 확인할 수 있어 간편하다. 또한, 위에서 확인할 수 있듯이, 세포주 특이적으로, 신호전달체계 특이적으로 발현이 조절됨을 보임으로써, 상피암세포의 지표유전자인 DNp63의 발현정도가 항암제의 작용유무를 판단하는 기준이 될 수 있음을 시사한다. 즉, 재조합 벡터를 가진 상피암세포에서 형광을 띄는 단백질인 GFP의 발현이 저해되는 물질은 항암제로써의 가능성이 있을 것이며, 이전의 항암제 스크리닝에 사용했던, 방법들 보다 실험방법이 간단하고, 비용부담도 적고, 확인하는 시간도 짧은 장점이 있어, 앞으로 다량의 항암물질을 스크리닝에 사용 가능하다. DNp63 is an indicator gene specifically expressed in epithelial cancer cells, and the recombinant vector according to the present invention, which has only a specific transcriptional regulatory region of this gene, expresses a fluorescent protein, and thus can be easily identified with the naked eye. Do. In addition, as can be seen from the above, the expression of the cell line-specific and signaling system-specific expression is controlled, suggesting that the expression level of DNp63, an index gene of epithelial cancer cells, may be a criterion for judging the action of anticancer drugs. do. In other words, substances that inhibit the expression of GFP, a fluorescent protein in epithelial cancer cells with recombinant vectors, may be useful as anticancer agents, and the test method is simpler and more cost-effective than those previously used for screening anticancer agents. It has little advantage and short time to check, so a large amount of anticancer substance can be used for screening in the future.

또한, DNp63은 상피암세포 발현 줄기세포의 지표유전자로 강력히 의심되기 때문에, 만일 DNp63의 발현을 특이적으로 없애는 항암물질은 암의 줄기세포의 생육을 억제함으로써 기존에 문제가 되었던, 암의 재발을 막을 수 있는 획기적인 항암제를 스크리닝하는데 사용가능한 재조합 벡터이다.In addition, since DNp63 is strongly suspected as an indicator gene for epithelial cancer cell expressing stem cells, anti-cancer substances that specifically eliminate the expression of DNp63 prevent the cancer from recurring by inhibiting the growth of stem cells. Recombinant vector usable for screening breakthrough anticancer agents.

서열목록 전자파일 첨부Attach sequence list electronic file

Claims (7)

삭제delete 삭제delete 서열번호 1의 DNp63 프로모터와 상기 프로모터 발현을 확인하기 위한 리포터 유전자를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암제 스크리닝을 하기 위한 pBACe3.6 재조합벡터.PBACe3.6 recombinant vector for screening an anticancer agent comprising a DNp63 promoter of SEQ ID NO: 1 and a reporter gene for confirming the promoter expression. 제 3 항에 있어서, 상기 리포터 유전자가 녹색 형광 단백질(GFP)인 것을 특징으로 하는 항암제 스크리닝을 하기 위한 재조합벡터.4. The recombinant vector for screening anticancer agents according to claim 3, wherein the reporter gene is a green fluorescent protein (GFP). 제 3 항에 따른 재조합 벡터로 형질전환되어진 항암제 스크리닝을 하기 위한 암세포.Cancer cells for screening anticancer agent transformed with the recombinant vector according to claim 3. 제 3 항에 따른 재조합벡터를 상피 유래 암세포에 형질전환시키는 단계;Transforming the recombinant vector according to claim 3 into epithelial-derived cancer cells; 잠재적인 항암물질을 상기 암세포에 접촉시키는 단계;Contacting the potential anticancer substance with the cancer cell; 상기 암세포에서 리포터의 발현양을 측정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암물질 스크리닝 방법.Anticancer substance screening method comprising the step of measuring the expression amount of the reporter in the cancer cells. 제 4 항에 따른 재조합벡터로 형질전환된 상피 유래 암세포;Epithelial-derived cancer cells transformed with the recombinant vector according to claim 4; 잠재적인 항암물질을 상기 암세포에 접촉시키기 위한 용기; 및A container for contacting said cancer cell with a potential anticancer substance; And 상기 암세포에서 녹색 형광 단백질의 발현양을 측정하는 장치를 포함하는 것을 특징으로 하는 항암제 진단 키트.Anti-cancer drug diagnostic kit comprising a device for measuring the expression amount of the green fluorescent protein in the cancer cells.
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