KR100426544B1 - Method for extracting viral nucleic acids from serum or plasma and compositions therefor - Google Patents
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Abstract
본 발명은 인간이나 동물의 혈청 또는 혈장으로부터 바이러스의 핵산을 추출하는 방법 및 그 방법에 사용되는 조성물에 관한 것으로, 본 발명에 따른 방법은 다이싸이오쓰레이톨과 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르를 함유하는 핵산 추출용 조성물을 바이러스 핵산을 추출하고자 하는 혈청이나 혈장과 혼합하고, 상기 혼합물을 가열한 후 냉각하고, 이를 원심분리하여 핵산을 추출하는 단계를 포함한다. 본 발명은 또한 상기 바이러스 핵산의 추출에 사용되는 핵산 추출용 조성물을 제공한다.The present invention relates to a method for extracting a nucleic acid of a virus from human or animal serum or plasma, and to a composition used in the method. The extract composition is mixed with serum or plasma to extract the viral nucleic acid, the mixture is heated and cooled, and centrifuged to extract the nucleic acid. The present invention also provides a nucleic acid extracting composition used for the extraction of the viral nucleic acid.
Description
본 발명은 인간이나 동물의 혈청 또는 혈장으로부터 바이러스의 핵산을 추출하는 방법과 그 추출 방법에 사용되는 핵산 추출용 조성물에 관한 것으로, 상세하게는 다이싸이오쓰레이톨(Dithiothreithol, DTT)과 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르(Ethylphenolpolyethyleneglycoether, Nonidet P40)를 함유하는 핵산 추출용 조성물을 바이러스 핵산을 추출하고자 하는 혈청이나 혈장과 혼합하고, 그 혼합물을 가열하고 냉각한 후 원심분리하는 단계를 포함하는, 인간이나 동물의 혈청 또는 혈장으로부터 바이러스의 핵산을 추출하는 방법 및 그 추출 방법에 사용되는 핵산 추출용 조성물에 관한 것이다.The present invention relates to a method for extracting a nucleic acid of a virus from the serum or plasma of humans or animals, and a composition for extracting nucleic acids used in the extraction method, in detail, Dithiothreithol (DTT) and ethyl phenol polyethylene Human or animal serum, comprising mixing a composition for extracting nucleic acids containing glycoether (Ethylphenolpolyethyleneglycoether, Nonidet P40) with serum or plasma to extract viral nucleic acids, heating and cooling the mixture and centrifuging the mixture Or it relates to a method for extracting a nucleic acid of a virus from plasma and a composition for extracting nucleic acids used in the extraction method.
사람 또는 동물의 혈액에는 많은 바이러스가 존재할 수 있다. 그 중피시알(PCR: Polymerase Chain Reaction (중합효소연쇄반응)) 법을 이용하여 혈액 내의 백혈구 또는 적혈구가 아닌 혈청 및 혈장을 사용하여 진단할 수 있는 바이러스는 A형 간염 바이러스 (HAV), B형 간염 바이러스(HBV), C형 간염 바이러스(HCV), D형 간염 바이러스(HDV), E형 간염 바이러스(HEV), G형 간염 바이러스(HGV), 에이즈 바이러스(HIV), 루벨라 바이러스(Rubella), 인푸루엔자 바이러스(Influenza) 등이 있다. 이때 피시알을 수행하기 위해서는 반드시 해당 바이러스의 핵산, 즉 DNA 또는 RNA를 추출하여야만 바이러스 검사를 할 수 있다.Many viruses can be present in the blood of humans or animals. Viruses that can be diagnosed using serum and plasma rather than leukocytes or erythrocytes in the blood using the polymerase chain reaction (PCR) method are hepatitis A virus (HAV) and type B. Hepatitis Virus (HBV), Hepatitis C Virus (HCV), Hepatitis D Virus (HDV), Hepatitis E Virus (HEV), Hepatitis G Virus (HGV), AIDS Virus (HIV), Rubella Virus (Rubella) , Influenza virus. At this time, in order to perform fish, the virus must be extracted only if the nucleic acid, ie, DNA or RNA, of the virus is extracted.
종래에, 원핵세포와 진핵세포 또는 복잡한 생물 샘플로부터 핵산을 추출하기 위해 전통적으로 사용해 온 것은 페놀과 클로로포름과 같은 유기 용매이다. 이를 사용한 핵산추출은 단백질 분해효소로 효소학적으로 소화하고, 이온 계면활성제로 세포를 깬 다음, 페놀이나 페놀/클로로포름 혼합물로 핵산을 추출한다. 상기 추출에 따라 유기용매 상과 물 상이 분리되고, 물 쪽으로 분배된 핵산을 알콜로 침전시킴으로써 추출된 핵산을 분리할 수 있다. 그러나 페놀이나 페놀/클로로포름 혼합물은 인간 피부를 파괴하고 위험한 폐기물로 간주되므로, 조심스럽게 다루어야 하고 잘 폐기해야 한다. 게다가 추출 과정은 시간이 많이 들고 번거로운 과정이다. Marmur는 J.Mol. Biol. 3:208- 218 (1961)에서 효소처리, 계면활성제 첨가, 그리고 페놀 또는 페놀/클로로포름과 같은 유기 용매를 사용하여 원핵생물에서 DNA를 추출하고 정제하는 과정에 대해 기술하였다.Conventionally, organic solvents such as phenol and chloroform have traditionally been used to extract nucleic acids from prokaryotic and eukaryotic or complex biological samples. Nucleic acid extraction using the enzyme is digested enzymatically with proteolytic enzymes, cells are broken with ionic surfactant, and nucleic acid is extracted with phenol or phenol / chloroform mixture. According to the extraction, the organic solvent phase and the water phase are separated, and the extracted nucleic acid can be separated by precipitating the nucleic acid distributed toward the water with alcohol. However, phenol or phenol / chloroform mixtures destroy human skin and are considered hazardous wastes and should be handled with care and disposed of well. In addition, the extraction process is time consuming and cumbersome. Marmur is J. Mol. Biol. 3: 208-218 (1961) describes the process of extracting and purifying DNA from prokaryotes using enzyme treatment, surfactant addition, and organic solvents such as phenol or phenol / chloroform.
한편, 케이오트로픽 염(chaotrophic salt)은 뉴클레이즈(nuclease)와 프로테이즈(protease)를 저해한다는 사실로 인하여, 세포를 깨서 용액 상으로 핵산을 분비시키는 경우, 구아니디움 싸이오시아네이트(GnSCN)와 같은 케이오트로픽 물질을 널리 사용하고 있다. 이에 대해, Chirgwin 등은 Biochemistry 18:5294-5 299(1979)에서 구아니디움 싸이오시아네이트(Guanidium thiocyanate) 와 2-메캅토에탄올(mercaptoethanol) 하에서 세포를 균질화하고, 에탄올 침전이나 세슘클로라이드(CsCl) 침전에 의해 RNA를 분리하는 것을 기재하고 있다. 그러나, 이온 계면 활성제와 케이오트로프는 양립할 수 없고, 높은 몰농도의 염을 사용할 때 핵산은 수상(aqueous phase)으로 쉽게 분리되기 어렵기 때문에, 이 케이오트로픽 염으로부터 핵산을 분리하기가 어렵다는 것이 밝혀졌다.On the other hand, due to the fact that chaotrophic salts inhibit nuclease and protease, guanidium thiocyanate (GnSCN) when breaking cells and secreting nucleic acids in solution Kiotropic materials such as) are widely used. In contrast, Chirgwin et al. Homogenized cells under guanidium thiocyanate and 2-mercaptoethanol in Biochemistry 18: 5294-5 299 (1979), and either ethanol precipitation or cesium chloride (CsCl). The isolation of RNA by precipitation is described. However, it has been found that ionic surfactants and kiotrops are incompatible and that nucleic acids are difficult to separate into the aqueous phase when using high molar concentrations of salts, making it difficult to separate nucleic acids from these kiotropic salts. lost.
핵산 분리 과정 동안에 뉴클레이즈를 효과적으로 저해하는 능력은 특히 시작 물질이 혈액과 같이 복잡한 경우에 매우 중요하다. Brownhill 등은 Biochem.J.73:434(1959)에서 벤토나이트(bentonite)가 뉴클레이즈의 저해제임을 보고하였고, Fraenkel-Conrat 등은 Virology 14:54-58(1961)에서 토바코 모자이크 바이러스를 정제하는 과정에서 리보뉴클레이즈를 저해하기 위해 벤토나이트를 사용하는 방법을 개발하였다. 이후 연구원들은 RNA를 정제하는 과정에서 리보뉴클레이즈 활성을 감소하기 위하여 벤토나이트와 페놀과 클로로포름을 혼합하여 사용하는 것을 보고하였다.The ability to effectively inhibit nucleases during the nucleic acid isolation process is particularly important when the starting material is complex, such as blood. Brownhill et al. Reported that bentonite was an inhibitor of nuclease in Biochem. J. 73: 434 (1959), and Fraenkel-Conrat et al. Purified the tobacco mosaic virus in Virology 14: 54-58 (1961). We have developed a method to use bentonite to inhibit ribonuclease. The researchers then reported the use of bentonite in combination with phenol and chloroform to reduce ribonuclease activity in the purification of RNA.
그러나 상기의 방법들 중 페놀이나 페놀/클로로포름과 같은 독성 물질을 사용하는 경우에는 생명체나 환경에 위험한 영향을 미치게 되고, 케이오트로픽 물질을 사용하는 경우에는 이들 물질로부터 핵산을 분리하기가 용이하지 않다. 그 밖에도 상기의 방법들을 사용하는 경우에는 그 추출 과정에 시간과 노력의 소비가 많다는 문제점이 있었다.However, the use of toxic substances such as phenol or phenol / chloroform in the above methods have a dangerous effect on life or the environment, and when using a kiotropic substance, it is not easy to separate nucleic acids from these substances. In addition, in the case of using the above methods, there was a problem that the extraction process consumes a lot of time and effort.
본 발명은 상기와 같은 문제점을 해결하여 비세포성 생체액, 바람직하게는 혈장이나 혈청으로부터 바이러스 핵산을 간단하고 신속하게 추출하기 위한 핵산 추출용 조성물을 제공하는 것을 그 목적으로 한다.It is an object of the present invention to provide a composition for extracting nucleic acids for simple and rapid extraction of viral nucleic acids from non-cellular biological fluids, preferably plasma or serum.
본 발명은 또한, 상기 핵산 추출용 조성물을 이용하여, 비세포성 생체액, 바람직하게는 혈장이나 혈청으로부터 바이러스 핵산을 간단하고 신속하게 추출하는 방법을 제공하는 것을 그 목적으로 한다.Another object of the present invention is to provide a method for simply and quickly extracting viral nucleic acid from a non-cellular biological fluid, preferably plasma or serum, using the nucleic acid extracting composition.
본 발명은 또한, 상기 방법에 의해 간단하고 신속하게 추출되는 핵산을 피시알에 적용함으로써, 용이하게 바이러스의 핵산을 진단하는 방법을 제공하는 것을 그 목적으로 한다.Another object of the present invention is to provide a method for easily diagnosing a nucleic acid of a virus by applying a nucleic acid extracted simply and quickly by the above method to a fish.
도 1은 B형 간염 바이러스의 피시알(PCR) 결과 사진이다.Figure 1 is a picture of the results of fish (PCR) of hepatitis B virus.
도 2는 C형 간염 바이러스의 피시알(PCR) 결과 사진이다.Figure 2 is a picture of the results of PCAL (PCR) of hepatitis C virus.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명의 한 측면은 다이싸이오쓰레이톨, 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르 및/또는 비이온계 계면활성제인 폴리옥시에틸렌소르비탄모노라우레이트 또는 폴리옥시에틸렌소르비탄모노오레이트를 함유하는, 혈액으로부터 핵산을 추출하기 위한 핵산 추출용 조성물을 제공한다.In order to achieve the above object, one aspect of the present invention is a polythioethylene sorbitan monolaurate or polyoxyethylene sorbitan monooleate which is dithiothitol, ethyl phenol polyethylene glycol ether and / or nonionic surfactant It provides a nucleic acid extracting composition for extracting a nucleic acid from the blood containing.
상기 조성물은 바람직하게, 인간 또는 동물의 혈청 또는 혈장으로부터 바이러스 핵산을 추출하는데 사용할 수 있다.The composition can preferably be used to extract viral nucleic acids from serum or plasma of humans or animals.
상기 조성물로 추출 가능한 바이러스는 A형 간염 바이러스 (HAV), B형 간염 바이러스(HBV), C형 간염 바이러스(HCV), D형 간염 바이러스(HDV), E형 간염 바이러스(HEV), G형 간염 바이러스(HGV), 에이즈 바이러스(HIV), 루벨라 바이러스(Rubella), 및 인푸루엔자 바이러스(Influenza) 등을 들 수 있으나, 반드시 이에 제한되지는 않는다.Viruses that can be extracted with the composition are hepatitis A virus (HAV), hepatitis B virus (HBV), hepatitis C virus (HCV), hepatitis D virus (HDV), hepatitis E virus (HEV), hepatitis G Viruses (HGV), AIDS virus (HIV), Rubella virus (Rubella), and Influenza virus (Influenza), and the like, but are not necessarily limited thereto.
구체적으로, 상기 조성물은 1몰의 다이싸이오쓰레이톨을 0.5∼5.0 부피%로 함유하고, 10% 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르를 0.5∼5.0 부피%로 함유한다.Specifically, the composition contains 0.5 mol% to 5.0 mol% of 1 mol dithiothreitol, and 0.5 mass% to 5.0 volume% of 10% ethylphenol polyethylene glycol ether.
상기 조성물이 폴리옥시에틸렌소르비탄모노라우레이트 또는 폴리옥시에틸렌소르비탄모노오레이트를 더 포함하는 경우, 이들의 최종 농도는 각각 0.5∼5.0 부피%인 것이 바람직하다.When the composition further comprises polyoxyethylene sorbitan monolaurate or polyoxyethylene sorbitan monoorate, their final concentration is preferably 0.5 to 5.0% by volume, respectively.
바이러스 핵산이 DNA인 경우에는 상기 조성물을 증류수에 희석하고, 바이러스 핵산이 RNA인 경우에는 상기 조성물을 디이피시(DEPC: Diethyl Pyrocarbonate) 처리된 증류수에 희석하는 것이 바람직하다.When the viral nucleic acid is DNA, it is preferable to dilute the composition in distilled water, and when the viral nucleic acid is RNA, the composition is diluted in diethyl water treated with Diethyl Pyrocarbonate (DEPC).
바이러스 핵산이 RNA인 경우 디이피시를 처리한 증류수를 사용하는 이유는, RNA분해효소는 여러 가지 처리에도 안정하나 디이피시를 처리하면 그 활성이 제거되기 때문에, 추출되는 RNA의 안정성을 위하여 사용한다.If the viral nucleic acid is RNA, the reason for using distilled water treated with Dipci is that RNA degrading enzyme is stable for various treatments, but its activity is removed when Dipci is treated, so it is used for the stability of the extracted RNA.
본 발명의 다른 측면에 따르면, 바이러스 핵산을 추출하고자 하는 혈청 또는 혈장을 상술한 본 발명에 따른 핵산 추출용 조성물과 혼합하고, 혼합된 용액을 가열하고, 가열한 용액을 냉각하고, 냉각된 용액을 원심분리하는 단계를 포함하여 구성되는, 혈청 또는 혈장으로부터 바이러스 핵산을 추출하는 방법이 제공된다.According to another aspect of the present invention, the serum or plasma to be extracted from the nucleic acid is mixed with the nucleic acid extracting composition according to the present invention described above, the mixed solution is heated, the heated solution is cooled, and the cooled solution is Provided are methods for extracting viral nucleic acids from serum or plasma, comprising centrifugation.
상기한 바와 같이, 본 발명에 따라 혈청 또는 혈장으로부터 바이러스 핵산을 추출하는 방법은, 종래 단백질 분해 효소로 분해하는 과정 대신, 간단히 본 발명에 따르는 핵산 추출용 조성물을 혈청 또는 혈장과 혼합하여 가열하는 단계로 대체할 수 있고, 그 후 별도 추출액의 첨가 없이, 상기 가열된 용액을 냉각 및 원심분리함으로써 그로부터 바로 핵산을 추출할 수 있는 방법으로서, 핵산 추출을 위한 전체 공정을 대단히 간소화하고, 그에 따른 시간 및 노력을 절약할 수 있도록 하는 방법이다.As described above, the method for extracting the viral nucleic acid from the serum or plasma according to the present invention, instead of the process of digesting with a conventional proteolytic enzyme, simply mixing the heating nucleic acid extract composition according to the invention with serum or plasma and heating And extracting nucleic acids directly therefrom by cooling and centrifuging the heated solution without the addition of a separate extract, which greatly simplifies the overall process for nucleic acid extraction, and thus time and This is a way to save effort.
상기 본 발명에 따른 방법에서, 혈청 또는 혈장과 핵산 추출용 조성물의 혼합액을 가열하는 단계는 80∼120℃의 온도에서 2∼10분간 가열하고, 상기 원심분리하는 단계는 10,000∼15,000rpm에서 2∼10분간 원심분리하는 것이 바람직하다.In the method according to the present invention, the step of heating the mixture of serum or plasma and nucleic acid extraction composition is heated for 2 to 10 minutes at a temperature of 80 ~ 120 ℃, the centrifugation step is 2 ~ at 10,000 ~ 15,000rpm Centrifugation for 10 minutes is preferred.
이하, 본 발명을 실시예를 들어 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail with reference to Examples.
하기 실시예는 본 발명의 이해를 돕기 위하여 제공되는 것일 뿐 본 발명이 하기의 실시예에 한정되는 것은 아니다.The following examples are provided only to aid the understanding of the present invention, and the present invention is not limited to the following examples.
하기의 실시예에서 특별한 언급이 없는 경우에는 상온에서 실시한 것이다.Unless otherwise specified in the following examples, it is carried out at room temperature.
실시예 1Example 1
(바이러스 DNA 핵산 추출용 조성물의 제조)(Preparation of composition for extracting viral DNA nucleic acid)
하기의 다이싸이오쓰레이톨은 0.01M 초산 나트륨(pH 5.2)에 녹인 후 필터로 걸러서 사용하였다. 초산 나트륨은 초산 나트륨을 3차 증류수에서 초산으로 pH를 5.2로 맞춘 후 고압 멸균하여 사용하였다.The following dithiothitol was dissolved in 0.01 M sodium acetate (pH 5.2) and used by filtration. Sodium acetate was used by autoclaving after adjusting the pH of the sodium acetate to acetic acid in tertiary distilled water to 5.2.
하기의 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르는 단백질 용해와 Taq 중합효소(Polymerase)를 안정화하는 역할을 하는 것으로서, 10% 원액을 사용하였다.The following ethyl phenol polyethylene glycol ether is to stabilize protein dissolution and Taq polymerase (Polymerase), 10% stock solution was used.
하기의 폴리옥시에틸렌소르비탄모노라우레이트와 폴리옥시에틸렌소르비탄모노오레이트는 비이온계 계면활성제이며, 원액을 사용하였다.The following polyoxyethylene sorbitan monolaurate and polyoxyethylene sorbitan monolaurate are nonionic surfactants, and a stock solution was used.
실시예 1-1Example 1-1
1M의 다이싸이오쓰레이톨 10㎕, 및 10%의 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르 원액 10㎕를 증류수에 희석하여, 전체 부피를 1000㎕로 만든 후 동결시켰다.10 μl of 1M dithiothreitol and 10 μl of 10% ethylphenol polyethyleneglycoether stock solution were diluted in distilled water to make a total volume of 1000 μl and frozen.
실시예1-2Example 1-2
1M의 다이싸이오쓰레이톨 10㎕, 10%의 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르 원액 10㎕, 및 폴리옥시에틸렌소르비탄모노라우레이트(Polyoxyethylene sorbi tan monolaurate,Tween 20) 원액 10㎕를 증류수에 희석하여 전체 부피를 1000㎕로 만든 후 동결시켰다.Dilute 10M of 1M dithiothritol, 10µl of 10% ethylphenolpolyethyleneglycoether stock solution, and 10µl of polyoxyethylene sorbi tan monolaurate (Tween 20) stock in distilled water. Was made to 1000 μl and then frozen.
실시예 1-3Example 1-3
1M의 다이싸이오쓰레이톨 10㎕, 10%의 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르 원액 10㎕, 및 폴리옥시에틸렌소르비탄모노오레이트(Polyoxyethylene sorbitan monooleate, Tween 80) 원액 10㎕를 증류수에 희석하여 전체 부피를 1000㎕로 만든 후 동결시켰다.Dilute 10M of 1M dithiothreitol, 10µl of 10% ethylphenolpolyethyleneglycoether stock solution, and 10µl of polyoxyethylene sorbitan monooleate (Tween 80) stock in distilled water. After making 1000 μl and frozen.
실시예 2Example 2
(바이러스 RNA 핵산 추출용 조성물의 제조)(Preparation of a composition for extracting a viral RNA nucleic acid)
실시예 2-1Example 2-1
1M의 다이싸이오쓰레이톨 10㎕, 및 10%의 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르원액 10㎕를 디이피시 처리한 증류수에 희석하여 전체 부피를 1000㎕로 만든 후 동결시켰다.10 μl of 1M dithiothreitol and 10 μl of 10% ethylphenol polyethyleneglycoether stock were diluted in distilled water to make a total volume of 1000 μl and frozen.
실시예 2-2Example 2-2
1M의 다이싸이오쓰레이톨 10㎕, 10%의 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르 원액 10㎕, 및 폴리옥시에틸렌소르비탄모노라우레이트 10㎕를 디이피시 처리한 증류수에 희석하여 전체 부피를 1000㎕로 만든 후 동결시켰다.After diluting 10 µl of 1M dithiothitol, 10 µl of 10% ethylphenol polyethylene glycol ether, and 10 µl of polyoxyethylene sorbitan monolaurate in distilled water, the total volume was changed to 1000 µl. Frozen.
실시예 2-3Example 2-3
1M의 다이싸이오쓰레이톨 10㎕, 10%의 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르 원액 10㎕, 및 폴리옥시에틸렌소르비탄모노오레이트 원액 10㎕를 디이피시 처리한 증류수에 희석하여 전체 부피를 1000㎕로 만든 후 동결시켰다.10 μl of 1 M dithiothitol, 10 μl of 10% ethylphenol polyethylene glycol ether, and 10 μl of polyoxyethylene sorbitan monooleate were diluted in distilled water to make a total volume of 1000 μl. And then frozen.
실시예 3Example 3
(바이러스 핵산의 추출 방법)(Extraction method of viral nucleic acid)
1) B형 간염 바이러스 및 C형 간염 바이러스에 감염된 환자의 혈액을 채취하고, 이를 원심분리하여 적혈구, 백혈구 등의 고형분을 제거한 혈청 또는 혈장에, 동량의 상기 실시예에서 제조된 핵산 추출용 조성물을 넣어 잘 섞었다.1) The blood of a patient infected with hepatitis B virus and hepatitis C virus is collected and centrifuged to remove serum or plasma solids such as red blood cells, leukocytes, and the like. Put well and mix well.
2) 상기 혈청 또는 혈장 및 핵산 추출용 조성물의 혼합액이 들어 있는 용기를, 온도를 95℃로 맞추어 놓은 수조에 넣어 2분간 가열하였다.2) The container containing the liquid mixture of the said serum or plasma and the nucleic acid extracting composition was put into the water tank which adjusted the temperature to 95 degreeC, and it heated for 2 minutes.
3) 가열된 혼합액을 꺼내어 준비된 얼음에서 냉각하였다.3) The heated mixed solution was taken out and cooled in the prepared ice.
4) 13,000rpm에서 4분간 원심 분리하여 분리된 상층액을 얻었다.4) The separated supernatant was obtained by centrifuging for 4 minutes at 13,000 rpm.
실시예 4Example 4
(피시알)(Fish)
위와 같은 과정을 통하여 얻은 상층액 중 일부를 피시알에 사용하거나, 또는 피시알 반응액을 위의 용기에 바로 첨가하여 피시알을 시행하였다.A portion of the supernatant obtained through the above process was used for fish or the fish was added by directly adding the fish solution to the container.
피시알의 조성 및 반응 조건은 아래의 표와 같았다.The composition and reaction conditions of the fish were as shown in the table below.
실시예 4-1: B형 간염 바이러스의 피시알 Example 4-1 : Fishes of Hepatitis B Virus
표 1은 B형 간염 바이러스의 피시알의 조성 및 반응 조건에 관한 것이다.Table 1 relates to the composition and reaction conditions of the fishes of the hepatitis B virus.
[표 1] B형 간염 바이러스의 피시알 조성 및 반응 조건[Table 1] Fish Composition and Reaction Conditions of Hepatitis B Virus
실시예 4-2: C형 간염 바이러스의 알티-피시알 Example 4-2 Alti-pisal of Hepatitis C Virus
표 2는 C형 간염 바이러스의 피시알 조성 및 반응 조건에 관한 것이다. C형 간염바이러스의 피시알은 알티-피시알(RT-PCR)로 RNA로부터 리버스 트랜스크립테이즈를 사용하여 피시알을 수행하였다.Table 2 relates to fish's composition and reaction conditions of hepatitis C virus. Fishes of hepatitis C virus were subjected to fishes using reverse transcriptase from RNA with Alti-Pisal (RT-PCR).
[표 2] 알티-피시알 조성 및 반응 조건TABLE 2 Alti-Phial Composition and Reaction Conditions
상기의 방법에 의해 피시알을 수행하고 그 결과를 아가로스 젤(agarose gel)전기영동을 통하여 알아보았다. 전기 영동의 조건은 2% 아가로스 젤에서 100V, 3분간 전기영동을 하였다.Fish was carried out by the above method and the result was examined through agarose gel electrophoresis. Electrophoresis was performed at 100V, 3 minutes in 2% agarose gel.
전기 영동을 한 후 밴드의 유무를 통하여 B형 간염바이러스나 C형 간염바이러스의 핵산이 추출되었는지의 여부를 관찰하였다.After electrophoresis, the presence or absence of the band was examined whether the nucleic acid of hepatitis B virus or hepatitis C virus was extracted.
상기의 과정에 의해 바이러스의 핵산이 분리된 결과를 도 1과 2에서 나타내고 있다.The results of separating the nucleic acid of the virus by the above process are shown in Figs.
도 1에서는 B형 간염바이러스의 피시알 결과 사진을 보여준다. M은 ФX 174/Hae Ⅲ의 분자량 표준 마커를 나타내고, 1-10 레인은 256bp의 HBV 양성 검체이고 11-15 레인은 B형 간염바이러스 음성검체를 나타낸다. 도 1에서 나타난 바와 같이 본 발명을 사용하여 DNA를 추출하고, DNA 바이러스인 B형 간염 바이러스의 피시알을 시행하여 보았더니, 10개의 양성(1-10번)에서 모두 양성이 나타났으며, 음성 대조군 5개(11번-15번)에서는 음성의 결과를 보였다.Figure 1 shows a picture of the results of the fish hepatitis B virus. M represents the molecular weight standard marker of ФX 174 / Hae III, lanes 1-10 represent HBV positive samples of 256 bp and hepatitis B virus negative samples 11-15. As shown in FIG. 1, DNA was extracted using the present invention, and when a fish virus of hepatitis B virus, which is a DNA virus, was tested, all of them were positive in 10 positive (No. 1-10) and negative. Five controls (No. 11-15) showed negative results.
또한, 도 2에서는 C형 간염바이러스의 피시알 결과 사진을 나타낸다. 도 2에서 나타난 바와 같이 본 발명을 사용하여 RNA를 추출하고, RNA 바이러스인 에이치씨브이(HCV)의 피시알을 시행하여 보았더니, 10개(1번-10번)의 양성에서 모두 양성이 나타났으며, 음성 대조군 5개(11번-15번)에서는 음성의 결과를 보였다.In addition, Fig. 2 shows a picture of the results of the hepatitis C virus fish. As shown in FIG. 2, RNA was extracted using the present invention, and HCV (HCV), which was RNA virus, was used to examine all 10 positive cells. 5 negative controls (No. 11-15) showed negative results.
상기 실시예에 따른 핵산 추출용 조성물을 사용하여 바이러스의 핵산을 추출하는데 소요되는 시간은 5-10분 정도였다. 이는 일반적으로 사용하는 상품화된 추출 키트, 예를 들어 Molecular Research Center, Inc.의 TRI REAGENT BD 키트를 사용하여 RNA를 추출하는 경우 약 60분 이상 소요되고 DNA를 추출하는 경우 약 30분이상 소요되는 것에 비하면, 약 1/8 정도의 시간에 핵산을 추출할 수 있는 방법이다. 따라서, 본 발명에 따른 핵산의 추출 방법은 추출 과정이 빠르고 간단하여 기술 및 오염에 의한 결과의 이상을 최소화 할 수가 있고, 핵산 분해 효소에 대한 영향도 상대적으로 적게 받아 전체적으로 양호한 핵산을 얻을 수 있는 장점도 있다.The time required to extract the nucleic acid of the virus using the nucleic acid extracting composition according to the embodiment was about 5-10 minutes. This takes about 60 minutes or more for RNA extraction using commercially available extraction kits such as the TRI REAGENT BD kit from Molecular Research Center, Inc. and 30 minutes or more for DNA extraction. In comparison, the nucleic acid can be extracted in about 1/8 time. Therefore, the nucleic acid extraction method according to the present invention has the advantage that the extraction process is quick and simple to minimize the abnormality of the results due to technology and contamination, and the overall good nucleic acid can be obtained due to the relatively small influence on the nucleic acid enzyme. There is also.
한편, 핵산 추출시 다이싸이오쓰레이톨, 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르 및 폴리옥시에틸렌소르비탄모노라우레이트 또는 폴리옥시에틸렌소르비탄모노오레이트의 상기 세 가지 물질을 모두 사용한 경우 효과가 가장 좋았고, 다이싸이오쓰레이톨과 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르를 혼합하여 사용하는 경우에도 핵산 추출이 용이하지만, 다이싸이오쓰레이톨과 에틸페놀폴리에틸렌글리코에테르와 폴리옥시에틸렌소르비탄모노라우레이트를 함께 사용한 경우에 명확한 상층액을 얻을 수 있었다.On the other hand, when all three of the above materials of dithio thritol, ethyl phenol polyethylene glycoether and polyoxyethylene sorbitan monolaurate or polyoxyethylene sorbitan monoorate were used to extract the nucleic acid, the most effective Nucleic acid extraction is easy even when a mixture of ostoleitol and ethyl phenol polyethylene glycol ether is used. Could get
상기 본 발명의 구성에 따르면, 단순히 본 발명에 따른 핵산 추출용 조성물을 혈청 또는 혈장과 혼합하여 가열하고, 이를 냉각한 후 원심분리하여 상층액을 직접 피시알 반응에 적용시킴으로써, 혈청 또는 혈장으로부터 핵산, 특히 질병과 관련된 바이러스 핵산의 존재 여부를 간단하고 신속하게 판단할 수 있다.According to the constitution of the present invention, the nucleic acid extracting composition according to the present invention is simply mixed with serum or plasma, heated, cooled and centrifuged, and the supernatant is directly applied to the PSI reaction. In particular, the presence or absence of viral nucleic acids associated with disease can be determined simply and quickly.
또한, 본 발명에 따른 핵산 추출 방법은 그 절차가 간단할 뿐만 아니라 핵산분해효소에의 노출 시간도 줄여서, 핵산의 안정화에 기여하여 보다 완전한 핵산 서열을 갖는 핵산의 수율을 높일 수 있다.In addition, the nucleic acid extraction method according to the present invention not only simplifies the procedure but also reduces the exposure time to nuclease, thereby contributing to stabilization of the nucleic acid, thereby increasing the yield of nucleic acid having a more complete nucleic acid sequence.
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