JPWO2021050948A5 - - Google Patents

Download PDF

Info

Publication number
JPWO2021050948A5
JPWO2021050948A5 JP2022516320A JP2022516320A JPWO2021050948A5 JP WO2021050948 A5 JPWO2021050948 A5 JP WO2021050948A5 JP 2022516320 A JP2022516320 A JP 2022516320A JP 2022516320 A JP2022516320 A JP 2022516320A JP WO2021050948 A5 JPWO2021050948 A5 JP WO2021050948A5
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
item
nucleic acid
recombinant nucleic
domain
sequence
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2022516320A
Other languages
Japanese (ja)
Other versions
JP2022548866A (en
Publication date
Application filed filed Critical
Priority claimed from PCT/US2020/050503 external-priority patent/WO2021050948A1/en
Publication of JP2022548866A publication Critical patent/JP2022548866A/en
Publication of JPWO2021050948A5 publication Critical patent/JPWO2021050948A5/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Description

[0047] 別の態様では、本開示は、医薬品として又は医薬品の調製に使用するための、
組換え核酸、ベクター、改変T細胞、又は医薬組成物を提供する。
参照による組み込み
[0048] 本明細書で言及される刊行物、特許、及び特許出願はすべて、個別の刊行物、特許、又は特許出願がそれぞれ具体的かつ個別に参照により本明細書に組み込まれた場合と同様に、参照により本明細書に組み込まれる。
本願は以下の発明を包含する。
[項目1] (a)T細胞受容体(TCR)融合タンパク質(TFP)をコードする配列であって、
(i)以下:
(1)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、及び
(2)膜貫通ドメイン
を含むTCRサブユニットと
(ii)抗原結合ドメインを含む抗体と
を含む前記配列と、
(b)TCR定常ドメインをコードする配列であって、前記TCR定常ドメインが、TCRγ定常ドメイン若しくはTCRδ定常ドメインである前記配列か、又はTCRγ定常ドメイン及びTCRδ定常ドメインをコードする配列とを含み、
前記TCRサブユニット及び前記抗体が機能的に連結されており、
かつ
内因性TCRの機能的破壊を含む改変T細胞で発現すると前記TFPがTCR複合体に機能的に組み込まれる、組換え核酸。
[項目2] (a)T細胞受容体(TCR)融合タンパク質(TFP)をコードする配列であって、
(i)以下:
(1)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、
(2)膜貫通ドメイン
を含むTCRサブユニットと
(ii)抗体又はその断片に結合できる結合リガンド又はその断片と
を含む前記配列と、
(b)TCR定常ドメインをコードする配列であって、前記TCR定常ドメインが、TCRγ定常ドメイン若しくはTCRδ定常ドメインである前記配列か、又はTCRγ定常ドメイン及びTCRδ定常ドメインをコードする配列とを含み、
前記TCRサブユニット及び結合リガンド又はその断片は機能的に連結されており、かつ
内因性TCRの機能的破壊を含む改変T細胞で発現すると前記TFPがTCR複合体に機能的に組み込まれる、組換え核酸。
[項目3] 前記TCRサブユニットが、TCRα、TCRβ、TCRγ、若しくはTCRδの細胞内ドメイン、又はCD3ε、CD3γ、若しくはCD3δの細胞内シグナル伝達ドメインからの刺激ドメインを含む細胞内ドメインをさらに含む、項目1又は項目2に記載の組換え核酸。
[項目4] 前記TCR定常ドメインが、TCRδ定常ドメインである、項目1~3のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目5] 前記TCRδ定常ドメインが、配列番号20、配列番号22、配列番号243、若しくは配列番号265、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目4に記載の組換え核酸。
[項目6] 前記細胞内ドメインが、TCRγの細胞内ドメインである、項目3~5のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目7] 前記TCRδ定常ドメインをコードする前記配列が、前記TCRδ定常ドメインをコードする前記配列に機能的に連結されている第2の抗原結合ドメイン又はリガンド結合ドメインをさらにコードする、項目3~5のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目8] 前記第2の抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインが、前記TFPの前記抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインと同一のもの又は異なるものである、項目7に記載の組換え核酸。
[項目9] 前記第2の抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインが、前記TCRδ定常ドメインをコードする前記配列にリンカーを介して機能的に連結されている、項目7に記載の組換え核酸。
[項目10] 前記TCR定常ドメインが、TCRγ定常ドメインである、項目1~3のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目11] 前記TCRγ定常ドメインが、配列番号21若しくは配列番号155、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目10に記載の組換え核酸。
[項目12] 前記細胞内ドメインが、TCRδの細胞内ドメインである、項目10又は11に記載の組換え核酸。
[項目13] 前記TCRγ定常ドメインをコードする前記配列が、前記TCRγ定常ドメインをコードする前記配列に機能的に連結されている第2の抗原結合ドメイン又はリガンド結合ドメインをさらにコードする、項目8~12のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目14] 前記第2の抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインが、前記TFPの前記抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインと同一のもの又は異なるものである、項目13に記載の組換え核酸。
[項目15] 前記第2の抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインが、前記TCRγ定常ドメインをコードする前記配列にリンカーを介して機能的に連結されている、項目13に記載の組換え核酸。
[項目16] 前記組換え核酸が、TCRγ定常ドメイン及びTCRδ定常ドメインをコードする配列を含む、項目1~3のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目17] 前記TCRγ定常ドメインが、配列番号21若しくは配列番号155、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目16に記載の組換え核酸。
[項目18] 前記TCRγ定常ドメインをコードする前記配列が、さらにTCRγ可変ドメインをコードし、その結果、全TCRγドメインをコードする、項目16又は17に記載の組換え核酸。
[項目19] 前記全TCRγドメインが、γ9又はγ4である、項目18に記載の組換え核酸。
[項目20] 前記全TCRγドメインが、配列番号255、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目18又は19に記載の組換え核酸。
[項目21] 前記TCRδ定常ドメインが、配列番号20、配列番号22、配列番号243、若しくは配列番号265、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目16~20のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目22] 前記TCRδ定常ドメインをコードする前記配列が、さらにTCRδ可変ドメインをコードし、その結果、全TCRδドメインをコードする、項目16~21のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目23] 前記全TCRδドメインが、δ2又はδ1である、項目22に記載の組換え核酸。
[項目24] 前記全TCRδ定常ドメインが、配列番号256、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目22又は23に記載の組換え核酸。
[項目25] 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ε、CD3γ、又はCD3δである、項目16~24のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目26] 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3εである、項目16~25のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目27] 少なくとも1つのリーダー配列及び少なくとも1つのリンカーをさらに含む、項目1~26のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目28] TCRα定常ドメインの一部、TCRβドメインの一部、又はその両方をさらに含む、項目27に記載の組換え核酸。
[項目29] 前記配列が、5’から3’方向に、第1のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー、TRDC遺伝子配列、切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、及びTRGC遺伝子配列を含む、項目1に記載の組換え核酸。
[項目30] 前記配列が、5’-3’方向に、第1のリーダー配列、TRDC遺伝子配列、切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー配列、及びTRGC遺伝子配列を含む、項目1に記載の組換え核酸。
[項目31] 前記配列が、5’-3’方向に、第1のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、第1のリンカー配列、TRDC遺伝子配列、切断可能なリンカー、第2のリーダー配列、第2の抗原結合ドメイン配列、第2のリンカー配列、及びTRGC遺伝子配列を含む、項目1に記載の組換え核酸。
[項目32] 前記配列が、5’-3’方向に、第1のリーダー配列、TRDC遺伝子配列、第1の切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、TRGC遺伝子配列、第2の切断可能なリンカー配列、第3のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー配列、及びCD3ε遺伝子配列を含む、項目1に記載の組換え核酸。
[項目33] 前記配列が、5’-3’方向に、第1のリーダー配列、第1の抗原結合ドメイン配列、第1のリンカー配列、TRDC遺伝子配列又はその断片、TRAC遺伝子配列又はその断片、切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、第2の抗原結合ドメイン配列、第2のリンカー配列、TRGC遺伝子配列又はその断片、及びTRBC遺伝子配列又はその断片を含む、項目1に記載の組換え核酸。
[項目34] 前記配列が、配列番号1に示されるポリペプチドをコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目35] 前記配列が、配列番号2に示されるポリペプチドをコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目36] 前記配列が、配列番号3に示されるポリペプチドをコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目37] 前記配列が、配列番号4に示されるポリペプチドをコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目38] 前記配列が、配列番号5に示されるポリペプチドをコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目39] 前記配列が、配列番号242の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目40] 前記配列が、配列番号244の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目41] 前記配列が、配列番号245の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目42] 前記配列が、配列番号246の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目43] 前記配列が、配列番号248の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目44] 前記配列が、配列番号250の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目45] 前記配列が、配列番号252の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目46] 前記配列が、配列番号257の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目47] 前記配列が、配列番号263の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目48] 前記配列が、配列番号264の配列をコードする、項目1~33のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目49] 前記結合リガンドが、前記抗体のFcドメインと結合できる、項目1に記載の組換え核酸。
[項目50] 前記結合リガンドが、IgG1抗体を選択的に結合できる、項目1に記載の組換え核酸。
[項目51] 前記結合リガンドが、IgG4抗体に特異的に結合できる、項目1に記載の組換え核酸。
[項目52] 前記抗体又はその断片が細胞表面抗原に結合する、項目1に記載の組換え核酸。
[項目53] 前記抗体又はその断片が、マウス、ヒト、又はヒト化されたものである、項目1に記載の組換え核酸。
[項目54] 前記抗体又はその断片が腫瘍細胞の表面にある細胞表面抗原に結合する、項目1に記載の組換え核酸。
[項目55] 前記結合リガンドが、単量体、二量体、三量体、四量体、五量体、六量体、七量体、八量体、九量体、又は十量体を含む、項目1に記載の組換え核酸。
[項目56] 前記結合リガンドが抗体又はその断片を含まない、項目1に記載の組換え核酸。
[項目57] 前記結合リガンドが、CD16結合ポリペプチド又はその断片を含む、項目56に記載の組換え核酸。
[項目58] 前記結合リガンドが、CD16結合ポリペプチドを含む、項目56に記載の組換え核酸。
[項目59] 前記結合リガンドがヒトのものであるか、又はヒト化されている、項目1に記載の組換え核酸。
[項目60] 前記結合リガンドが結合できる抗体又はその断片をコードする核酸配列をさらに含む、項目1に記載の組換え核酸。
[項目61] 前記抗体又はその断片が細胞から分泌可能である、項目60に記載の組換え核酸。
[項目62] (a)T細胞受容体(TCR)融合タンパク質(TFP)をコードする配列であって、
(i)以下:
(1)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、及び
(2)膜貫通ドメイン
を含むTCRサブユニットと
(ii)細胞の表面に発現する受容体又はポリペプチドに結合するリガンド又はその断片を含む抗原結合ドメインと
を含む前記配列と、
(b)TCR定常ドメインをコードする配列であって、前記TCR定常ドメインが、TCRγ定常ドメイン若しくはTCRδ定常ドメインである前記配列か、又はTCRγ定常ドメイン及びTCRδ定常ドメインをコードする配列とを含み、
前記TCRサブユニット及び前記抗原結合ドメインは機能的に連結されており、
かつ
内因性TCRの機能的破壊を含む改変T細胞で発現すると前記TFPがTCR複合体に機能的に組み込まれる、組換え核酸。
[項目63] 前記TCRサブユニットが、TCRα、TCRβ、TCRγ、若しくはTCRδの細胞内ドメイン、又はCD3ε、CD3γ、若しくはCD3δの細胞内シグナル伝達ドメインからの刺激ドメインを含む細胞内ドメインをさらに含む、項目62に記載の組換え核酸。
[項目64] 少なくともTCRα定常ドメインをコードする部分配列、TCRβ定常ドメインをコードする部分配列、又はTCRα定常ドメインとTCRβ定常ドメイン両方の部分配列をさらに含む、項目1~63のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目65] 前記抗原結合ドメインがリガンドを含む、項目62に記載の組換え核酸。
[項目66] 前記リガンドが細胞の受容体に結合する、項目62に記載の組換え核酸。
[項目67] 前記リガンドが、細胞の表面に発現する前記ポリペプチドに結合する、項目62に記載の組換え核酸。
[項目68] 細胞の表面に発現する前記受容体又はポリペプチドが、ストレス応答受容体又はポリペプチドを含む、項目62に記載の組換え核酸。
[項目69] 細胞の表面に発現する前記受容体又はポリペプチドが、MHCクラスI関連糖タンパク質である、項目62に記載の組換え核酸。
[項目70] 前記MHCクラスI関連糖タンパク質が、MICA、MICB、RAET1E、RAET1G、ULBP1、ULBP2、ULBP3、ULBP4、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目69に記載の組換え核酸。
[項目71] 前記抗原結合ドメインが、単量体、二量体、三量体、四量体、五量体、六量体、七量体、八量体、九量体、又は十量体を含む、項目62に記載の組換え核酸。
[項目72] 前記抗原結合ドメインが、前記リガンド又はその断片の単量体又は二量体を含む、項目71に記載の組換え核酸。
[項目73] 前記リガンド又はその断片が、単量体、二量体、三量体、四量体、五量体、六量体、七量体、八量体、九量体、又は十量体を含む、項目62に記載の組換え核酸。
[項目74] 前記リガンド又はその断片が単量体又は二量体である、項目73に記載の組換え核酸。
[項目75] 前記抗原結合ドメインが抗体又はその断片を含まない、項目62に記載の組換え核酸。
[項目76] 前記抗原結合ドメインが可変領域を含まない、項目62に記載の組換え核酸。
[項目77] 前記抗原結合ドメインがCDRを含まない、項目62に記載の組換え核酸。
[項目78] 前記リガンド又はその断片が、ナチュラルキラーグループ2D(NKG2D)リガンド又はその断片である、項目62に記載の組換え核酸。
[項目79] T細胞で発現すると、前記TCR定常ドメインが機能的TCR複合体に組み込まれる、項目1~78のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目80] 前記TCR定常ドメインが、T細胞で発現すると前記TFPを組み込む前記機能的TCR複合体と同じ機能的TCR複合体に組み込まれる、項目1~79のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目81] 前記TFPをコードする配列及び前記TCR定常ドメイン(複数可)をコードする配列が、同じ核酸分子内に含まれている、項目1~80のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目82] 前記コードされるTFP及び前記コードされるTCR定常ドメインが、第1のリンカー配列によって機能的に連結されている、項目1~81のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目83] 前記第1のリンカーが、プロテアーゼ切断部位を含む、項目82に記載の組換え核酸。
[項目84] 前記プロテアーゼ切断部位が、2A、例えばT2A又はP2A切断部位である、項目83に記載の組換え核酸。
[項目85] 前記TFPをコードする配列及び前記TCR定常ドメインをコードする配列が、異なる核酸分子内に含まれている、項目1~84のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目86] 前記TFPの、前記TCRサブユニットと、前記抗体ドメイン、前記抗原結合ドメイン、若しくは前記結合リガンド、又はそれらの断片とが、第2のリンカー配列によって機能的に連結されている、項目1~85に記載の組換え核酸。
[項目87] 前記第2のリンカー配列が、(G S) (式中、n=1~4)を含む、項目86に記載の組換え核酸。
[項目88] 前記膜貫通ドメインが、CD3ε、CD3γ、CD3δ、TCRα、TCRβ、TCRδ、又はTCRγからのTCR膜貫通ドメインである、項目1~87のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目89] 前記細胞内ドメインが、CD3εのみ、CD3γのみ、CD3δのみ、TCRαのみ、TCRβ、TCRγ、又はTCRδに由来する、項目3~61及び63~88のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目90] 前記TCRサブユニットが、(i)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、(ii)TCR膜貫通ドメイン、及び(iii)TCR細胞内ドメインを含み、(i)、(ii)、及び(iii)のうち少なくとも2つは同じTCRサブユニット由来である、項目1~89のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目91] 前記TCR細胞外ドメインが、TCRγ鎖、TCRδ鎖、CD3εTCRサブユニット、CD3γTCRサブユニット、CD3δTCRサブユニット、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列からなる群から選択される、タンパク質の細胞外ドメイン又はその一部を含む、項目1~90のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目92] 前記TCRサブユニットが、TCRγ鎖又はTCRδ鎖の、(i)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、(ii)TCR膜貫通ドメイン、及び(iii)TCR細胞内ドメインを含む、項目91に記載の組換え核酸。
[項目93] 前記TCR細胞外ドメインが、TCRγ鎖若しくはTCRδ鎖の定常ドメインの細胞外部分、その機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目92に記載の組換え核酸。
[項目94] 前記TCRサブユニットが、(i)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、(ii)TCR膜貫通ドメイン、及び(iii)TCR細胞内ドメインを含み、δ定常ドメイン又はその断片であるか、又はそれらを含む、項目92又は93に記載の組換え核酸。
[項目95] 前記δ定常ドメインが、配列番号20、配列番号22、配列番号243、若しくは配列番号265、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を有する、項目94に記載の組換え核酸。
[項目96] (i)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、(ii)TCR膜貫通ドメイン、及び(iii)TCR細胞内ドメインを含む、前記TCRサブユニットが、γ定常ドメインであるか、又はそれを含む、項目92又は93に記載の組換え核酸。
[項目97] 前記γ定常ドメインが、配列番号21若しくは配列番号155、それらの機能的断片の配列、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を有する、項目96に記載の組換え核酸。
[項目98] 前記TFPの細胞外ドメインは、γ鎖又はδ鎖の可変ドメインを含まない、項目94~97のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目99] 前記TCRサブユニットが、CD3ε、CD3γ、若しくはCD3δの細胞内シグナル伝達ドメインから選択されるタンパク質の刺激ドメイン、又はそれらに対して少なくとも1つの修飾を有するアミノ酸配列を含むTCR細胞内ドメインを含む、項目3~61及び63~88のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目100] 前記TFPのTCRサブユニットが、CD3εの細胞外、膜貫通、及び細胞内ドメインを含む、項目99に記載の組換え核酸。
[項目101] 前記CD3εのTCRサブユニットが、配列番号258、その機能的断片の配列、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目100に記載の組換え核酸。
[項目102] 前記TFP、前記TCRγ定常ドメイン、前記TCRδ定常ドメイン、及びそれらの任意の組み合わせが、内因性TCR複合体及び/又は少なくとも1つの内因性TCRポリペプチドと機能的に相互作用できる、項目1~101のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目103] (a)前記TCR定常ドメインはTCRγ定常ドメインであり、TCRδ、CD3ε、CD3γ、CD3δ、若しくはそれらの組み合わせの内因性サブユニットを含むTCR複合体に前記TFPが機能的に統合されるか;
(b)前記TCR定常ドメインはTCRδ定常ドメインであり、TCRγ、CD3ε、CD3γ、CD3δ、若しくはそれらの組み合わせの内因性サブユニットを含むTCR複合体に前記TFPが機能的に統合されるか;又は
(c)前記TCR定常ドメインはTCRγ定常ドメイン及びTCRδ定常ドメインであり、CD3ε、CD3γ、CD3δ、若しくはそれらの組み合わせの内因性サブユニットを含むTCR複合体に前記TFPが機能的に統合される、項目1~102のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目104] 前記少なくとも1つだが20以下の修飾が、細胞シグナル伝達を媒介するアミノ酸の修飾、又は前記TFPへのリガンド結合に応答してリン酸化されるアミノ酸の修飾を含む、項目1~103のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目105] 前記抗体が抗体断片である、項目1、3~61、及び85~104のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目106] 前記抗体断片が、scFv、単一ドメイン抗体ドメイン、V ドメイン、又はV ドメインである、項目105に記載の組換え核酸。
[項目107] 抗原結合ドメインが、抗CD19結合ドメイン、抗B細胞成熟抗原(BCMA)結合ドメイン、抗メソテリン(MSLN)結合ドメイン、抗CD20結合ドメイン、抗CD70結合ドメイン、抗79b結合ドメイン、抗HER2結合ドメイン、抗PMSA結合ドメイン、抗MUC16結合ドメイン、抗CD22結合ドメイン、抗PD-L1結合ドメイン、抗BAFF又はBAFF受容体結合ドメイン、抗ネクチン-4結合ドメイン、抗TROP-2結合ドメイン、抗GPC3結合ドメイン、及び抗ROR-1結合ドメインからなる群から選択される、項目1、3~61、及び85~106のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目108] 前記抗MSLN結合ドメインが、配列番号60のCDR1、配列番号61のCDR2、及び配列番号62のCDR3を含む、項目107に記載の組換え核酸。
[項目109] 前記抗MSLN結合ドメインが、配列番号63のCDR1、配列番号64のCDR2、及び配列番号65のCDR3を含む、項目107に記載の組換え核酸。
[項目110] 前記抗MSLN結合ドメインが、配列番号66のCDR1、配列番号67のCDR2、及び配列番号68のCDR3を含む、項目107に記載の組換え核酸。
[項目111] 前記抗MSLN結合ドメインが、配列番号69、配列番号70、又は配列番号71の配列に対して少なくとも約80%の配列同一性を有する配列を含む、項目107に記載の組換え核酸。
[項目112] 前記抗CD19結合ドメインが、配列番号73の軽鎖CDR1、配列番号75のCDR2、及び配列番号77のCDR3を含む、項目107に記載の組換え核酸。
[項目113] 前記抗CD19結合ドメインが、配列番号79の重鎖CDR1、配列番号81のCDR2、及び配列番号83のCDR3を含む、項目107に記載の組換え核酸。
[項目114] 前記抗CD19結合ドメインが、配列番号85の配列に対して少なくとも約80%の配列同一性を有する軽鎖可変領域、及び/又は配列番号87の配列に対して少なくとも約80%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む、項目107に記載の組換え核酸。
[項目115] TCRα膜貫通ドメインをコードする配列をさらに含む、項目1~114のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目116] TCRβ膜貫通ドメインをコードする配列をさらに含む、項目1~114のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目117] TCRα膜貫通ドメインをコードする配列及びTCRβ膜貫通ドメインをコードする配列をさらに含む、項目1~114のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目118] (a)T細胞受容体(TCR)融合タンパク質(TFP)をコードする配列であって、
(i)以下:
(1)マウスTCRα又はマウスTCRβの細胞外ドメインの少なくとも一部、及び
(2)マウスTCRα又はマウスTCRβの膜貫通ドメイン
を含むTCRサブユニットと
(ii)抗原結合ドメインを含む抗体又はその断片と
を含む前記配列と、
(b)TCR定常ドメイン(複数可)をコードする配列であって、前記TCR定常ドメインが、マウスTCRα定常ドメイン若しくはマウスTCRβ定常ドメインである前記配列か、又はマウスTCRα定常ドメインとマウスTCRβ定常ドメインをコードする配列とを含み、
前記TCRサブユニット及び前記抗体は機能的に連結されており、
かつ
内因性TCRの機能的破壊を含む改変T細胞で発現すると前記TFPがTCR複合体に機能的に組み込まれる、組換え核酸。
[項目119] (a)T細胞受容体(TCR)融合タンパク質(TFP)をコードする配列であって、
(i)以下:
(1)マウスTCRα又はマウスTCRβの細胞外ドメインの少なくとも一部、及び
(2)マウスTCRα又はマウスTCRβの膜貫通ドメイン
を含むTCRサブユニットと
(ii)抗体又はその断片に結合可能である結合リガンド又はその断片と
を含む前記配列と、
(b)TCR定常ドメイン(複数可)をコードする配列であって、前記TCR定常ドメインが、マウスTCRα定常ドメイン若しくはマウスTCRβ定常ドメインである前記配列か、又はマウスTCRα定常ドメインとマウスTCRβ定常ドメインをコードする配列とを含み、
前記TCRサブユニット及び結合リガンド又はその断片は機能的に連結されており、
かつ
内因性TCRの機能的破壊を含む改変T細胞で発現すると前記TFPがTCR複合体に機能的に組み込まれる、組換え核酸。
[項目120] 前記TCRサブユニットが、マウスTCRα又はマウスTCRβの細胞内ドメインを含む、項目118又は119に記載の組換え核酸。
[項目121] 前記TCR定常ドメインが、TCRα定常ドメインである、項目118又は120のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目122] 前記TCRα定常ドメインが、配列番号17、配列番号142、配列番号143、配列番号146、若しくは配列番号207、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目121に記載の組換え核酸。
[項目123] 前記TCRα定常ドメインが、マウスTCRα定常ドメインを含む、項目121に記載の組換え核酸。
[項目124] 前記マウスTCRα定常ドメインが、マウスTCRα定常ドメインのアミノ酸2~137を含む、項目123に記載の組換え核酸。
[項目125] 前記マウスTCRα定常ドメインが、配列番号146のアミノ酸2~137を含む、項目124に記載の組換え核酸。
[項目126] 前記マウスTCRα定常ドメインが、配列番号207の配列を含む、項目124に記載の組換え核酸。
[項目127] 前記マウスTCRα定常ドメインが、配列番号146のアミノ酸82~137を含む、項目123に記載の組換え核酸。
[項目128] 前記マウスTCRα定常ドメインが、配列番号17の配列を含む、項目127に記載の組換え核酸。
[項目129] 前記細胞内ドメインが、TCRβの細胞内ドメインである、項目122~128のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目130] 前記TCRα定常ドメインをコードする前記配列が、前記TCRα定常ドメインをコードする前記配列に機能的に連結されている第2の抗原結合ドメイン又はリガンド結合ドメインをさらにコードする、項目121~129のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目131] 前記第2の抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインが、前記TFPの前記抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインと同一のもの又は異なるものである、項目130に記載の組換え核酸。
[項目132] 前記第2の抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインが、前記TCRα定常ドメインをコードする前記配列にリンカーを介して機能的に連結されている、項目130に記載の組換え核酸。
[項目133] 前記TCR定常ドメインが、TCRβ定常ドメインである、項目118~120のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目134] 前記TCRβ定常ドメインが、配列番号18、配列番号148、配列番号149、配列番号152、若しくは配列番号209、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目133に記載の組換え核酸。
[項目135] 前記TCRβ定常ドメインが、マウスTCRβ定常ドメインを含む、項目134に記載の組換え核酸。
[項目136] 前記マウスTCRβ定常ドメインが、前記マウスTCRβ定常ドメインのアミノ酸2~173を含む、項目134に記載の組換え核酸。
[項目137] 前記マウスTCRβ定常ドメインが、配列番号152のアミノ酸2~173を含む、項目134に記載の組換え核酸。
[項目138] 前記マウスTCRβ定常ドメインが、配列番号209を含む、項目134に記載の組換え核酸。
[項目139] 前記TCRβ定常ドメインが、配列番号152のアミノ酸123~173を含む、項目134に記載の組換え核酸。
[項目140] 前記TCRβ定常ドメインが、配列番号18を含む、項目134に記載の組換え核酸。
[項目141] 前記細胞内ドメインが、TCRαの細胞内ドメインである、項目133~140のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目142] 前記TCRβ定常ドメインをコードする前記配列が、前記TCRβ定常ドメインをコードする前記配列に機能的に連結されている第2の抗原結合ドメイン又はリガンド結合ドメインをさらにコードする、項目118~141のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目143] 前記第2の抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインが、前記TFPの前記抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインと同一のもの又は異なるものである、項目142に記載の組換え核酸。
[項目144] 前記第2の抗原結合ドメイン又は前記リガンド結合ドメインが、前記TCRβ定常ドメインをコードする前記配列にリンカーを介して機能的に連結されている、項目142に記載の組換え核酸。
[項目145] 前記組換え核酸が、TCRα定常ドメイン及びTCRβ定常ドメインをコードする配列を含む、項目118~120のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目146] 前記TCRα定常ドメインが、配列番号17、配列番号142、配列番号143、配列番号146、若しくは配列番号207、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目145に記載の組換え核酸。
[項目147] 前記TCRβ定常ドメインが、配列番号18、配列番号148、配列番号149、配列番号152、若しくは配列番号209、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目145又は146に記載の組換え核酸。
[項目148] 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ε、CD3γ、又はCD3δである、項目118~147のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目149] 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3εである、項目118~147のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目150] 前記配列が、5’から3’方向に、第1のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー、TRAC遺伝子配列、切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、及びTRBC遺伝子配列を含む、項目145に記載の組換え核酸。
[項目151] 前記配列が、5’から3’方向に、第1のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー、TRAC遺伝子配列、切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、及びTRBC遺伝子配列を含む、項目145に記載の組換え核酸。
[項目152] 前記配列が、5’から3’方向に、第1のリーダー配列、TRAC遺伝子配列、切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー、及びTRBC遺伝子配列を含む、項目145に記載の組換え核酸。
[項目153] 前記配列が、5’から3’方向に、第1のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー、TRAC遺伝子配列、切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー、及びTRBC遺伝子配列を含む、項目145に記載の組換え核酸。
[項目154] 前記配列が、5’-3’方向に、第1のリーダー配列、TRAC遺伝子配列、第1の切断可能なリンカー配列、第2のリーダー配列、TRBC遺伝子配列、第2の切断可能なリンカー配列、第3のリーダー配列、抗原結合ドメイン配列、リンカー配列、及びCD3ε遺伝子配列を含む、項目145に記載の組換え核酸。
[項目155] 前記配列が、配列番号10に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目156] 前記配列が、配列番号204に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目157] 前記配列が、配列番号206に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目158] 前記配列が、配列番号210に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目159] 前記配列が、配列番号211に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目160] 前記配列が、配列番号217に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目161] 前記配列が、配列番号218に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目162] 前記配列が、配列番号219に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目163] 前記配列が、配列番号220に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目164] 前記配列が、配列番号259に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目165] 前記配列が、配列番号261に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目166] 前記配列が、配列番号262に示されるポリペプチドをコードする、項目115~154のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目167] 少なくとも1つのリーダー配列及び少なくとも1つのリンカーをさらに含む、項目115~166のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目168] 前記結合リガンドが、前記抗体のFcドメインと結合できる、項目119~167のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目169] 前記結合リガンドが、IgG1抗体を選択的に結合できる、項目119~167のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目170] 前記結合リガンドが、IgG4抗体に特異的に結合できる、項目119~167のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目171] 前記抗体又はその断片が細胞表面抗原に結合する、項目118、及び120~170のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目172] 前記抗体又はその断片が、マウス、ヒト、又はヒト化されたものである、項目118及び120~170のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目173] 前記抗体又はその断片が腫瘍細胞の表面にある細胞表面抗原に結合する、項目118及び120~170のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目174] 前記結合リガンドが、単量体、二量体、三量体、四量体、五量体、六量体、七量体、八量体、九量体、又は十量体を含む、項目119~167のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目175] 前記結合リガンドが、抗体又はその断片を含まない、項目119~167のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目176] 前記結合リガンドが、CD16結合ポリペプチド又はその断片を含む、項目175に記載の組換え核酸。
[項目177] 前記結合リガンドがCD16結合ポリペプチドを含む、項目175に記載の組換え核酸。
[項目178] 前記結合リガンドがヒトのものであるか、又はヒト化されている、項目119~167のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目179] 前記結合リガンドが結合できる抗体又はその断片をコードする核酸配列をさらに含む、項目119~167のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目180] 前記抗体又はその断片が細胞から分泌できる、項目118及び120~170のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目181] (a)T細胞受容体(TCR)融合タンパク質(TFP)をコードする配列であって、
(i)以下:
(1)マウスTCRα又はマウスTCRβの細胞外ドメインの少なくとも一部、及び
(2)マウスTCRα又はマウスTCRβの膜貫通ドメイン
を含むTCRサブユニットと
(ii)細胞の表面に発現する受容体又はポリペプチドに結合するリガンド又はその断片を含む抗原結合ドメインと
を含む前記配列と、
(b)TCR定常ドメインをコードする配列であって、前記TCR定常ドメインが、マウスTCRα定常ドメイン若しくはマウスTCRβ定常ドメインである前記配列か、又はマウスTCRα定常ドメインとマウスTCRβ定常ドメインをコードする配列とを含み、
前記TCRサブユニット及び前記抗原結合ドメインは機能的に連結されており、
かつ
内因性TCRの機能的破壊を含む改変T細胞で発現すると前記TFPがTCR複合体に機能的に組み込まれる、組換え核酸。
[項目182] 前記TCRサブユニットが、マウスTCRα又はマウスTCRβの細胞内ドメインを含む、項目181に記載の組換え核酸。
[項目183] 前記細胞外ドメインが、TCRα定常ドメイン若しくはTCRβ定常ドメインの細胞外部分、又はその断片を含む、項目118~182のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目184] 少なくともTCRγ定常ドメインをコードする部分配列、TCRδ定常ドメインをコードする部分配列、又はTCRγ定常ドメイン及びTCRδ定常ドメイン両方の部分配列をさらに含む、項目118~183のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目185] 前記抗原結合ドメインがリガンドを含む、項目181~184のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目186] 前記リガンドが細胞の受容体に結合する、項目185に記載の組換え核酸。
[項目187] 前記リガンドが、細胞の表面に発現する前記ポリペプチドに結合する、項目185に記載の組換え核酸。
[項目188] 細胞の表面に発現する前記受容体又はポリペプチドが、ストレス応答受容体又はポリペプチドを含む、項目185に記載の組換え核酸。
[項目189] 細胞の表面に発現する前記受容体又はポリペプチドが、MHCクラスI関連糖タンパク質である、項目185に記載の組換え核酸。
[項目190] 前記MHCクラスI関連糖タンパク質が、MICA、MICB、RAET1E、RAET1G、ULBP1、ULBP2、ULBP3、ULBP4、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目189に記載の組換え核酸。
[項目191] 前記抗原結合ドメインが、単量体、二量体、三量体、四量体、五量体、六量体、七量体、八量体、九量体、又は十量体を含む、項目185に記載の組換え核酸。
[項目192] 前記抗原結合ドメインが、前記リガンド又はその断片の単量体又は二量体を含む、項目191に記載の組換え核酸。
[項目193] 前記リガンド又はその断片が、単量体、二量体、三量体、四量体、五量体、六量体、七量体、八量体、九量体、又は十量体を含む、項目185に記載の組換え核酸。
[項目194] 前記リガンド又はその断片が単量体又は二量体である、項目193に記載の組換え核酸。
[項目195] 前記抗原結合ドメインが抗体又はその断片を含まない、項目185に記載の組換え核酸。
[項目196] 前記抗原結合ドメインが可変領域を含まない、項目185に記載の組換え核酸。
[項目197] 前記抗原結合ドメインがCDRを含まない、項目185に記載の組換え核酸。
[項目198] 前記リガンド又はその断片が、ナチュラルキラーグループ2D(NKG2D)リガンド又はその断片である、項目185に記載の組換え核酸。
[項目199] T細胞で発現すると、前記TCR定常ドメインが機能的TCR複合体に組み込まれる、項目118~198のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目200] 前記TCR定常ドメインが、T細胞で発現すると前記TFPを組み込む前記機能的TCR複合体と同じ機能的TCR複合体に組み込まれる、項目199のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目201] 前記TFPをコードする配列及び前記TCR定常ドメイン(複数可)をコードする配列が、同じ核酸分子内に含まれている、項目118~200のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目202] 前記TFP及び前記TCR定常ドメインが、第1のリンカー配列によって機能的に連結されている、項目118~200のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目203] 前記第1のリンカーが、プロテアーゼ切断部位を含む、項目202に記載の組換え核酸分子。
[項目204] 前記プロテアーゼ切断部位が、2A、例えばT2A又はP2A切断部位である、項目203に記載の組換え核酸分子。
[項目205] 前記TFPをコードする配列及び前記TCR定常ドメイン(複数可)をコードする配列が、異なる核酸分子内に含まれている、項目118~200のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目206] 前記TFPの、前記TCRサブユニットと、前記抗体ドメイン、前記抗原結合ドメイン、若しくは前記結合リガンド、又はそれらの断片とが、第2のリンカー配列によって機能的に連結されている、項目118~205のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目207] 前記第2のリンカー配列が、(G S) (式中、n=1~4)を含む、項目206に記載の組換え核酸。
[項目208] 前記膜貫通ドメインが、TCRα又はTCRβ、例えば、マウスTCRα又はTCRβからのTCR膜貫通ドメインである、項目118~207のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目209] 前記TCRサブユニットが、(i)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、(ii)TCR膜貫通ドメイン、及び(iii)TCRα又はTCRβのTCR細胞内ドメインを含む、項目118~207のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目210] 前記TCR細胞外ドメインが、TCRα鎖若しくはTCRβ鎖、例えばマウスのTCRα鎖若しくはTCRβ鎖の定常ドメインの細胞外部分、その機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目118~207のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目211] 前記TCRサブユニットが、TCRα鎖若しくはTCRβ鎖、例えばマウスのTCRα鎖若しくはTCRβ鎖の膜貫通ドメイン、その機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、膜貫通ドメインを含む、項目118~207のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目212] 前記TCRサブユニットが、TCRα鎖若しくはTCRβ鎖、例えばマウスのTCRα鎖若しくはTCRβ鎖のTCR細胞内ドメイン、又はそれに対して少なくとも1つの修飾を有するアミノ酸配列を含む、項目118~207のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目213] 前記TCRサブユニットが、(i)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、(ii)TCR膜貫通ドメイン、及び(iii)TCR細胞内ドメインを含み、α定常ドメインであるか、又はそれを含む、項目118~207のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目214] 前記α定常ドメインが、配列番号17、配列番号142、配列番号143、配列番号146、若しくは配列番号207の配列、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列、例えば配列番号146のアミノ酸2~137を含む、項目213に記載の組換え核酸。
[項目215] (i)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、(ii)TCR膜貫通ドメイン、及び(iii)TCR細胞内ドメインを含む、コードされるTCRが、β定常ドメインであるか、又はそれを含む、項目118~207のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目216] 前記β定常ドメインが、配列番号18、配列番号148、配列番号149、配列番号152、若しくは配列番号209の配列、それらの機能的断片、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列、例えば配列番号152のアミノ酸2~173を含む、項目215に記載の組換え核酸。
[項目217] 前記TCRサブユニットの前記細胞外ドメインが、α鎖又はβ鎖の可変ドメインを含まない、項目215又は216に記載の組換え核酸。
[項目218] 前記TCRサブユニットが、CD3ε、CD3γ、若しくはCD3δの細胞内シグナル伝達ドメインから選択されるタンパク質の刺激ドメイン、又はそれらに対して少なくとも1つの修飾を有するアミノ酸配列を含むTCR細胞内ドメインを含む、項目1~217のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目219] 前記TFPのTCRサブユニットが、CD3εの細胞外、膜貫通、及び細胞内ドメインを含む、項目218に記載の組換え核酸。
[項目220] 前記CD3εのTCRサブユニットは、配列番号258、その機能的断片の配列、又は少なくとも1つだが20以下の修飾を有するそのアミノ酸配列を含む、項目218又は219に記載の組換え核酸。
[項目221] 前記TFP、前記TCRα定常ドメイン、前記TCRβドメイン、及びそれらの任意の組み合わせが、内因性TCR複合体及び/又は少なくとも1つの内因性TCRポリペプチドと機能的に相互作用できる、項目1~220のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目222] (a)前記TCR定常ドメインはTCRα定常ドメインであり、CD3ε、CD3γ、CD3δ、若しくはそれらの組み合わせの内因性サブユニットを含むTCR複合体に前記TFPが機能的に統合されるか;
(b)前記TCR定常ドメインはTCRβ定常ドメインであり、CD3ε、CD3γ、CD3δ、若しくはそれらの組み合わせの内因性サブユニットを含むTCR複合体に前記TFPが機能的に統合されるか;又は
(c)前記TCR定常ドメインはTCRα定常ドメイン及びTCRβ定常ドメインであり、前記TFPが、CD3ε、CD3γ、CD3δ、若しくはそれらの組み合わせの内因性サブユニットを含むTCR複合体に機能的に統合される、項目1~221のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目223] 前記少なくとも1つだが20以下の修飾が、細胞シグナル伝達を媒介するアミノ酸の修飾、又は前記TFPへのリガンド結合に応答してリン酸化されるアミノ酸の修飾を含む、項目220~222のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目224] 前記抗体が抗体断片である、項目118及び120~180のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目225] 前記抗体断片が、scFv、単一ドメイン抗体ドメイン、V ドメイン、又はV ドメインである、項目224に記載の組換え核酸。
[項目226] 抗原結合ドメインが、抗CD19結合ドメイン、抗B細胞成熟抗原(BCMA)結合ドメイン、抗メソテリン(MSLN)結合ドメイン、抗CD20結合ドメイン、抗CD70結合ドメイン、抗79b結合ドメイン、抗HER2結合ドメイン、抗PMSA結合ドメイン、抗MUC16結合ドメイン、抗CD22結合ドメイン、抗PD-L1結合ドメイン、抗BAFF又はBAFF受容体結合ドメイン、抗ネクチン-4結合ドメイン、抗TROP-2結合ドメイン、抗GPC3結合ドメイン、及び抗ROR-1結合ドメインからなる群から選択される、項目118及び120~180のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目227] 前記抗MSLN結合ドメインが、配列番号60のCDR1、配列番号61のCDR2、及び配列番号62のCDR3を含む、項目226に記載の組換え核酸。
[項目228] 前記抗MSLN結合ドメインが、配列番号63のCDR1、配列番号64のCDR2、及び配列番号65のCDR3を含む、項目226に記載の組換え核酸。
[項目229] 前記抗MSLN結合ドメインが、配列番号66のCDR1、配列番号67のCDR2、及び配列番号68のCDR3を含む、項目226に記載の組換え核酸。
[項目230] 前記抗MSLN結合ドメインが、配列番号69、配列番号70、又は配列番号71の配列に対して少なくとも約80%の配列同一性を有する配列を含む、項目226に記載の組換え核酸。
[項目231] 前記抗CD19結合ドメインが、配列番号73の軽鎖CDR1、配列番号75のCDR2、及び配列番号77のCDR3を含む、項目226に記載の組換え核酸。
[項目232] 前記抗CD19結合ドメインが、配列番号79の重鎖CDR1、配列番号81のCDR2、及び配列番号83のCDR3を含む、項目226に記載の組換え核酸。
[項目233] 前記抗CD19結合ドメインが、配列番号85の配列に対して少なくとも約80%の配列同一性を有する軽鎖可変領域、及び/又は配列番号87の配列に対して少なくとも約80%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む、項目226に記載の組換え核酸。
[項目234] 前記核酸が、DNA及びRNAからなる群から選択される、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目235] 前記核酸がmRNAである、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目236] 前記核酸がcircRNAである、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目237] 前記組換え核酸が核酸類似体を含み、前記核酸類似体は前記組換え核酸のコード配列にはない、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目238] 前記核酸類似体が、2’-O-メチル、2’-O-メトキシエチル(2’-O-MOE)、2’-O-アミノプロピル、2’-デオキシ、T-デオキシ-2’-フルオロ、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、2’-O-ジメチルアミノエチル(2’-O-DMAOE)、2’-O-ジメチルアミノプロピル(2’-O-DMAP)、T-O-ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’-O-DMAEOE)、2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)修飾、ロックド核酸(LNA)、エチレン核酸(ENA)、ペプチド核酸(PNA)、1’,5’-アンヒドロヘキシトール核酸(HNA)、モルホリノ、メチルホスホン酸ヌクレオチド、チオールホスホン酸ヌクレオチド、及び2’-フルオロN3-P5’-ホスホロアミダイトからなる群から選択される、項目237に記載の組換え核酸。
[項目239] リーダー配列をさらに含む、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目240] プロモーター配列をさらに含む、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目241] ポリ(A)尾部をコードする配列をさらに含む、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目242] 3’UTR配列をさらに含む、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目243] 前記核酸が、単離された核酸又は天然に存在しない核酸である、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸。
[項目244] 前記核酸がin vitro転写した核酸である、先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸分子。
[項目245] 先行項目のいずれか1項に記載の組換え核酸を含むベクター。
[項目246] 前記ベクターが、DNA、RNA、プラスミド、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター(AAV)、ラウス肉腫ウイルス(RSV)ベクター、又はレトロウイルスベクターからなる群から選択される、項目245に記載のベクター。
[項目247] 前記ベクターがAAV6ベクターである、項目245又は246に記載のベクター。
[項目248] プロモーターをさらに含む、項目245~247のいずれか1項に記載のベクター。
[項目249] 前記ベクターがin vitro転写したベクターである、項目245~248のいずれか1項に記載のベクター。
[項目250] 項目1~244のいずれか1項に記載の組換え核酸又は項目245~249のいずれか1項に記載のベクターを含む改変T細胞であって、前記改変T細胞は内因性TCRの機能的破壊を含む、前記改変T細胞。
[項目251] 項目1~244のいずれか1項に記載の核酸の前記TFPをコードする前記配列、又はTFPをコードする項目1~244のいずれか1項に記載の前記核酸の前記配列によってコードされる前記TFPを含む改変T細胞であって、前記改変T細胞は内因性TCRの機能的破壊を含む、前記改変T細胞。
[項目252] 項目1~244のいずれか1項に記載のTFPをコードする前記配列、又はTFPをコードする項目1~244のいずれか1項に記載の前記核酸の前記配列によってコードされる前記TFPを含む、改変同種T細胞。
[項目253] 前記T細胞がTCR定常ドメインをコードする異種配列をさらに含み、前記TCR定常ドメインは、TCRγ定常ドメイン、TCRδ定常ドメイン、又はTCRγ定常ドメイン及びTCRδ定常ドメインである、項目250~252のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目254] 前記T細胞がTCR定常ドメインをコードする異種配列をさらに含み、前記TCR定常ドメインは、TCRα定常ドメイン、TCRβ定常ドメイン、又はTCRα定常ドメインとTCRβ定常ドメインである、項目250~253のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目255] 前記TCR定常ドメイン、例えば、前記TCRα定常ドメイン、前記TCRβ定常ドメイン、又は前記TCRα定常ドメイン及び前記TCRβ定常ドメインが、マウスTCRγ定常ドメイン、例えば、マウスTCRα定常ドメイン、マウスTCRβ定常ドメイン、又はマウスTCRα定常ドメインとマウスTCRβ定常ドメインである、項目254に記載の改変T細胞。
[項目256] 機能的に破壊される前記内因性TCRが、内因性TCRα鎖、内因性TCRβ鎖、又は内因性TCRα鎖と内因性TCRβ鎖である、項目250~255のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目257] 機能的に破壊された前記内因性TCRが、未改変の対照T細胞のものと比較して、MHCペプチド複合体への結合が減少する、項目250~256のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目258] 前記機能的破壊が、前記内因性TCRをコードする遺伝子の破壊である、項目250~257のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目259] 前記内因性TCRをコードする遺伝子の前記破壊が、T細胞のゲノム由来の前記内因性TCRをコードする前記遺伝子の配列の除去である、項目258に記載の改変T細胞。
[項目260] 前記T細胞が、CD4細胞、CD8細胞、ナイーブT細胞、メモリー幹T細胞、セントラルメモリーT細胞、二重陰性T細胞、エフェクターメモリーT細胞、エフェクターT細胞、Th0細胞、Tc0細胞、Th1細胞、Tc1細胞、Th2細胞、Tc2細胞、Th17細胞、Th22細胞、α/βT細胞、γ/δT細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、造血幹細胞、及び多能性幹細胞から選択されるヒトT細胞である、項目250~259のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目261] 前記T細胞がCD8 T細胞又はCD4 T細胞である、項目250~260のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目262] 前記T細胞が同種T細胞である、項目250~261のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目263] 細胞内シグナル伝達ドメインからの陽性シグナルを含む第2のポリペプチドと会合した、抑制分子の少なくとも一部を含む第1のポリペプチドを含む抑制分子をコードする核酸をさらに含む、項目250~262のいずれか1項に記載の改変T細胞。
[項目264] 前記抑制分子が、PD1の少なくとも一部を含む第1のポリペプチドと、共刺激ドメイン及び一次シグナル伝達ドメインを含む第2のポリペプチドとを含む、項目263に記載の改変T細胞。
[項目265] (a)項目250~264のいずれか1項に記載の改変T細胞と、
(b)薬学的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
[項目266] 項目250~264のいずれか1項に記載の改変T細胞を作製する方法であって、
(a)TCRα鎖、TCRβ鎖、又はTCRα鎖とTCRβ鎖をコードする内因性TCR遺伝子を破壊し、それにより内因性TCR遺伝子の機能的破壊を含んだT細胞を作製することと、
(b)内因性TCR遺伝子の機能的破壊を含んだT細胞に、項目1~244のいずれか1項に記載の組換え核酸又は項目245~249のいずれか1項に記載のベクターを形質導入することを含む、前記方法。
[項目267] 前記破壊が、TCRα鎖、TCRβ鎖、又はTCRα鎖とTCRβ鎖をコードする内因性遺伝子を標的とするヌクレアーゼタンパク質、又はヌクレアーゼタンパク質をコードする核酸配列をT細胞に形質導入することを含む、項目266に記載の方法。
[項目268] 項目250~264のいずれか1項に記載の改変T細胞を作製する方法であって、内因性TCR遺伝子の機能的破壊を含んだT細胞に、項目1~244のいずれか1項に記載の組換え核酸又は項目245~249のいずれか1項に記載のベクターを形質導入することを含む、前記方法。
[項目269] 内因性TCR遺伝子の機能的破壊を含んだ前記T細胞が、TCRα鎖、TCRβ鎖、又はTCRα鎖とTCRβ鎖をコードする内因性TCR遺伝子の機能的破壊を含んだT細胞である、項目268に記載の方法。
[項目270] 前記T細胞がヒトT細胞である、項目266~269のいずれか1項に記載の方法。
[項目271] 内因性TCR遺伝子の機能的破壊を含んだ前記T細胞が、未改変の対照T細胞のものと比較して、MHC-ペプチド複合体への結合が減少する、項目266~270のいずれか1項に記載の方法。
[項目272] 前記ヌクレアーゼが、メガヌクレアーゼ、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)、CRISPR/Casヌクレアーゼ、又はmegaTALヌクレアーゼである、項目267~271のいずれか1項に記載の方法。
[項目273] 前記組換え核酸又は前記ベクターに含まれる前記配列が、前記切断部位で前記内因性TCRサブユニット遺伝子に挿入され、前記内因性TCRサブユニット遺伝子への前記配列の前記挿入により前記内因性TCRサブユニットが機能的に破壊される、項目266~272のいずれか1項に記載の方法。
[項目274] 前記ヌクレアーゼがメガヌクレアーゼである、項目267~271のいずれか1項に記載の方法。
[項目275] 前記メガヌクレアーゼが第1のサブユニット及び第2のサブユニットを含み、前記第1のサブユニットは前記認識配列の第1の認識半部位に結合し、前記第2のサブユニットは前記認識配列の第2の認識半部位に結合する、項目274に記載の方法。
[項目276] 前記メガヌクレアーゼが、リンカーを含む一本鎖メガヌクレアーゼであり、前記リンカーは前記第1のサブユニットと前記第2のサブユニットとを共有結合する、項目275に記載の方法。
[項目277] 治療を必要とする対象におけるがんの治療方法であって、項目265に記載の治療有効量の医薬組成物を前記対象に投与することを含む、前記方法。
[項目278] 治療を必要とする対象におけるがんの治療方法であって、(a)項目266~276のいずれか1項に記載の方法に従って作製される改変T細胞と、(b)薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物を前記対象に投与することを含む、前記方法。
[項目279] 治療を必要とする対象におけるがんの治療方法であって、(a)項目266~276のいずれか1項に記載の方法に従って作製される改変T細胞と、(b)薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物を前記対象に投与することを含む、前記方法。
[項目280] 前記改変型T細胞が同種異系T細胞である、項目277~279のいずれか1項に記載の方法。
[項目281] 有効量の未改変の対照T細胞を投与した対象と比較して、前記対象において放出されるサイトカインが少ない、項目277~280のいずれか1項に記載の方法。
[項目282] 項目1~244のいずれか1項に記載の組換え核酸又は項目245~249のいずれか1項に記載のベクターを含む有効量の改変T細胞を投与した対象と比較して、前記対象において放出されるサイトカインが少ない、項目277~281のいずれか1項に記載の方法。
[項目283] 前記方法が、前記医薬組成物の有効性を増加させる薬剤と組み合わせて前記医薬組成物を投与することを含む、項目277~282のいずれか1項に記載の方法。
[項目284] 前記方法が、前記医薬組成物に付随する1つ以上の副作用を改善する薬剤と組み合わせて前記医薬組成物を投与することを含む、項目277~283のいずれか1項に記載の方法。
[項目285] 前記がんが固形癌、リンパ腫、又は白血病である、項目277~284のいずれか1項に記載の方法。
[項目286] 前記がんが、腎細胞癌、乳癌、肺癌、卵巣癌、前立腺癌、結腸癌、子宮頸癌、脳癌、肝臓癌、膵臓癌、腎臓癌、及び胃癌からなる群から選択される、項目277~285のいずれか1項に記載の方法。
[項目287] 項目1~244に記載のTFPを発現する有効量の自己T細胞を投与した対象と比較して、前記対象において放出されるサイトカインが少ない、項目277~286のいずれか1項に記載の方法。
[項目288] 前記方法が、移植片対宿主病を誘発しない、項目277~287のいずれか1項に記載の方法。
[項目289] 項目1~244に記載のTFPを発現する有効量の自己T細胞を投与した対象と比較して、前記対象が移植片対宿主病を発症するリスクが低減される、項目277~288のいずれか1項に記載の方法。
[項目290] 医薬品として又は医薬品の調製に使用するための、項目1~244のいずれか1項に記載の組換え核酸、項目245~249のいずれか1項に記載のベクター、項目250~264のいずれか1項に記載の改変T細胞、又は項目265に記載の医薬組成物。
[0047] In another aspect, the present disclosure provides for use as a medicament or in the preparation of a medicament.
Recombinant nucleic acids, vectors, modified T cells, or pharmaceutical compositions are provided.
Inclusion by reference
[0048] All publications, patents, and patent applications mentioned herein are mentioned as if each individual publication, patent, or patent application was specifically and individually incorporated by reference herein. , incorporated herein by reference.
This application includes the following inventions.
[Item 1] (a) A sequence encoding a T cell receptor (TCR) fusion protein (TFP),
(i) Below:
(1) At least a portion of the TCR extracellular domain, and
(2) Transmembrane domain
TCR subunits containing
(ii) an antibody containing an antigen-binding domain;
said array comprising;
(b) a sequence encoding a TCR constant domain, the TCR constant domain comprising the above sequence which is a TCRγ constant domain or a TCRδ constant domain, or a sequence encoding a TCRγ constant domain and a TCRδ constant domain;
the TCR subunit and the antibody are operably linked;
and
A recombinant nucleic acid which, when expressed in an engineered T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR, functionally incorporates said TFP into a TCR complex.
[Item 2] (a) A sequence encoding a T cell receptor (TCR) fusion protein (TFP),
(i) Below:
(1) at least a portion of the TCR extracellular domain;
(2) Transmembrane domain
TCR subunits containing
(ii) a binding ligand or fragment thereof capable of binding to the antibody or fragment thereof;
said array comprising;
(b) a sequence encoding a TCR constant domain, the TCR constant domain comprising the above sequence which is a TCRγ constant domain or a TCRδ constant domain, or a sequence encoding a TCRγ constant domain and a TCRδ constant domain;
the TCR subunit and the binding ligand or fragment thereof are operably linked, and
A recombinant nucleic acid which, when expressed in an engineered T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR, functionally incorporates said TFP into a TCR complex.
[Item 3] The item wherein the TCR subunit further comprises an intracellular domain comprising an intracellular domain of TCRα, TCRβ, TCRγ, or TCRδ, or a stimulatory domain from an intracellular signaling domain of CD3ε, CD3γ, or CD3δ. 1 or the recombinant nucleic acid according to item 2.
[Item 4] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 3, wherein the TCR constant domain is a TCRδ constant domain.
[Item 5] The TCRδ constant domain comprises SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 243, or SEQ ID NO: 265, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof having at least one but no more than 20 modifications. Recombinant nucleic acid according to item 4.
[Item 6] The recombinant nucleic acid according to any one of items 3 to 5, wherein the intracellular domain is an intracellular domain of TCRγ.
[Item 7] Items 3 to 3, wherein the sequence encoding the TCRδ constant domain further encodes a second antigen-binding domain or a ligand-binding domain that is operably linked to the sequence encoding the TCRδ constant domain. 5. The recombinant nucleic acid according to any one of 5.
[Item 8] The recombinant nucleic acid according to item 7, wherein the second antigen-binding domain or the ligand-binding domain is the same as or different from the antigen-binding domain or the ligand-binding domain of the TFP.
[Item 9] The recombinant nucleic acid according to item 7, wherein the second antigen-binding domain or the ligand-binding domain is operably linked to the sequence encoding the TCRδ constant domain via a linker.
[Item 10] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 3, wherein the TCR constant domain is a TCRγ constant domain.
[Item 11] The recombinant nucleic acid according to item 10, wherein the TCRγ constant domain comprises SEQ ID NO: 21 or SEQ ID NO: 155, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof with at least one but no more than 20 modifications.
[Item 12] The recombinant nucleic acid according to item 10 or 11, wherein the intracellular domain is an intracellular domain of TCRδ.
[Item 13] Items 8 to 8, wherein the sequence encoding the TCRγ constant domain further encodes a second antigen-binding domain or a ligand-binding domain that is operably linked to the sequence encoding the TCRγ constant domain. 12. The recombinant nucleic acid according to any one of 12.
[Item 14] The recombinant nucleic acid according to item 13, wherein the second antigen-binding domain or the ligand-binding domain is the same as or different from the antigen-binding domain or the ligand-binding domain of the TFP.
[Item 15] The recombinant nucleic acid according to item 13, wherein the second antigen-binding domain or the ligand-binding domain is operably linked to the sequence encoding the TCRγ constant domain via a linker.
[Item 16] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 3, wherein the recombinant nucleic acid comprises a sequence encoding a TCRγ constant domain and a TCRδ constant domain.
[Item 17] The recombinant nucleic acid according to item 16, wherein the TCRγ constant domain comprises SEQ ID NO: 21 or SEQ ID NO: 155, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof with at least one but no more than 20 modifications.
[Item 18] The recombinant nucleic acid according to item 16 or 17, wherein the sequence encoding the TCRγ constant domain further encodes a TCRγ variable domain, and thus encodes the entire TCRγ domain.
[Item 19] The recombinant nucleic acid according to item 18, wherein the entire TCRγ domain is γ9 or γ4.
[Item 20] The recombinant nucleic acid according to item 18 or 19, wherein the entire TCRγ domain comprises SEQ ID NO: 255, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof with at least one but no more than 20 modifications.
[Item 21] The TCRδ constant domain comprises SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 243, or SEQ ID NO: 265, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof having at least one but no more than 20 modifications. The recombinant nucleic acid according to any one of items 16 to 20.
[Item 22] The recombinant nucleic acid according to any one of items 16 to 21, wherein the sequence encoding the TCRδ constant domain further encodes a TCRδ variable domain, and thus encodes the entire TCRδ domain.
[Item 23] The recombinant nucleic acid according to item 22, wherein the entire TCR δ domain is δ2 or δ1.
[Item 24] The recombinant nucleic acid according to item 22 or 23, wherein the entire TCRδ constant domain comprises SEQ ID NO: 256, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof with at least one but no more than 20 modifications.
[Item 25] The recombinant nucleic acid according to any one of items 16 to 24, wherein the intracellular signal transduction domain is CD3ε, CD3γ, or CD3δ.
[Item 26] The recombinant nucleic acid according to any one of items 16 to 25, wherein the intracellular signal transduction domain is CD3ε.
[Item 27] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 26, further comprising at least one leader sequence and at least one linker.
[Item 28] The recombinant nucleic acid according to item 27, further comprising a part of the TCRα constant domain, a part of the TCRβ domain, or both.
[Item 29] The sequence includes, in the 5' to 3' direction, a first leader sequence, an antigen-binding domain sequence, a linker, a TRDC gene sequence, a cleavable linker sequence, a second leader sequence, and a TRGC gene sequence. The recombinant nucleic acid according to item 1, comprising:
[Item 30] The sequence includes, in the 5'-3' direction, a first leader sequence, a TRDC gene sequence, a cleavable linker sequence, a second leader sequence, an antigen-binding domain sequence, a linker sequence, and a TRGC gene sequence. The recombinant nucleic acid according to item 1, comprising:
[Item 31] The sequence includes, in the 5'-3' direction, a first leader sequence, an antigen-binding domain sequence, a first linker sequence, a TRDC gene sequence, a cleavable linker, a second leader sequence, a second The recombinant nucleic acid according to item 1, comprising an antigen-binding domain sequence of , a second linker sequence, and a TRGC gene sequence.
[Item 32] The sequences include, in the 5'-3' direction, a first leader sequence, a TRDC gene sequence, a first cleavable linker sequence, a second leader sequence, a TRGC gene sequence, a second cleavable linker sequence. The recombinant nucleic acid according to item 1, comprising a linker sequence, a third leader sequence, an antigen-binding domain sequence, a linker sequence, and a CD3ε gene sequence.
[Item 33] The sequence includes, in the 5′-3′ direction, a first leader sequence, a first antigen-binding domain sequence, a first linker sequence, a TRDC gene sequence or a fragment thereof, a TRAC gene sequence or a fragment thereof, The recombinant according to item 1, comprising a cleavable linker sequence, a second leader sequence, a second antigen-binding domain sequence, a second linker sequence, a TRGC gene sequence or a fragment thereof, and a TRBC gene sequence or a fragment thereof. Nucleic acid.
[Item 34] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 1.
[Item 35] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 2.
[Item 36] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 3.
[Item 37] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 4.
[Item 38] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 5.
[Item 39] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 242.
[Item 40] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 244.
[Item 41] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 245.
[Item 42] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 246.
[Item 43] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 248.
[Item 44] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 250.
[Item 45] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 252.
[Item 46] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 257.
[Item 47] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 263.
[Item 48] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 33, wherein the sequence encodes the sequence of SEQ ID NO: 264.
[Item 49] The recombinant nucleic acid according to item 1, wherein the binding ligand is capable of binding to the Fc domain of the antibody.
[Item 50] The recombinant nucleic acid according to item 1, wherein the binding ligand is capable of selectively binding an IgG1 antibody.
[Item 51] The recombinant nucleic acid according to item 1, wherein the binding ligand can specifically bind to an IgG4 antibody.
[Item 52] The recombinant nucleic acid according to item 1, wherein the antibody or fragment thereof binds to a cell surface antigen.
[Item 53] The recombinant nucleic acid according to item 1, wherein the antibody or fragment thereof is mouse, human, or humanized.
[Item 54] The recombinant nucleic acid according to item 1, wherein the antibody or fragment thereof binds to a cell surface antigen on the surface of a tumor cell.
[Item 55] The binding ligand is a monomer, dimer, trimer, tetramer, pentamer, hexamer, heptamer, octamer, nonamer, or decamer. The recombinant nucleic acid according to item 1, comprising:
[Item 56] The recombinant nucleic acid according to item 1, wherein the binding ligand does not include an antibody or a fragment thereof.
[Item 57] The recombinant nucleic acid according to item 56, wherein the binding ligand comprises a CD16-binding polypeptide or a fragment thereof.
[Item 58] The recombinant nucleic acid according to item 56, wherein the binding ligand comprises a CD16 binding polypeptide.
[Item 59] The recombinant nucleic acid according to item 1, wherein the binding ligand is human or humanized.
[Item 60] The recombinant nucleic acid according to item 1, further comprising a nucleic acid sequence encoding an antibody or a fragment thereof to which the binding ligand can bind.
[Item 61] The recombinant nucleic acid according to item 60, wherein the antibody or fragment thereof can be secreted from cells.
[Item 62] (a) A sequence encoding a T cell receptor (TCR) fusion protein (TFP),
(i) Below:
(1) At least a portion of the TCR extracellular domain, and
(2) Transmembrane domain
TCR subunits containing
(ii) an antigen-binding domain comprising a ligand or a fragment thereof that binds to a receptor or polypeptide expressed on the surface of a cell;
said array comprising;
(b) a sequence encoding a TCR constant domain, the TCR constant domain comprising the above sequence which is a TCRγ constant domain or a TCRδ constant domain, or a sequence encoding a TCRγ constant domain and a TCRδ constant domain;
the TCR subunit and the antigen binding domain are operably linked;
and
A recombinant nucleic acid which, when expressed in an engineered T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR, functionally incorporates said TFP into a TCR complex.
[Item 63] The TCR subunit further comprises an intracellular domain comprising an intracellular domain of TCRα, TCRβ, TCRγ, or TCRδ, or a stimulatory domain from an intracellular signaling domain of CD3ε, CD3γ, or CD3δ. 62. The recombinant nucleic acid according to 62.
[Item 64] According to any one of items 1 to 63, further comprising at least a partial sequence encoding a TCRα constant domain, a partial sequence encoding a TCRβ constant domain, or a partial sequence of both a TCRα constant domain and a TCRβ constant domain. recombinant nucleic acids.
[Item 65] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the antigen-binding domain comprises a ligand.
[Item 66] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the ligand binds to a cellular receptor.
[Item 67] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the ligand binds to the polypeptide expressed on the surface of a cell.
[Item 68] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the receptor or polypeptide expressed on the surface of cells comprises a stress response receptor or polypeptide.
[Item 69] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the receptor or polypeptide expressed on the surface of cells is an MHC class I-related glycoprotein.
[Item 70] The recombinant nucleic acid according to item 69, wherein the MHC class I-related glycoprotein is selected from the group consisting of MICA, MICB, RAET1E, RAET1G, ULBP1, ULBP2, ULBP3, ULBP4, and combinations thereof.
[Item 71] The antigen-binding domain is a monomer, dimer, trimer, tetramer, pentamer, hexamer, heptamer, octamer, nonamer, or decamer. 63. The recombinant nucleic acid according to item 62, comprising:
[Item 72] The recombinant nucleic acid according to item 71, wherein the antigen-binding domain comprises a monomer or dimer of the ligand or a fragment thereof.
[Item 73] The ligand or fragment thereof is a monomer, dimer, trimer, tetramer, pentamer, hexamer, heptamer, octamer, nonamer, or decamer. 63. The recombinant nucleic acid according to item 62, comprising:
[Item 74] The recombinant nucleic acid according to item 73, wherein the ligand or fragment thereof is a monomer or a dimer.
[Item 75] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the antigen-binding domain does not include an antibody or a fragment thereof.
[Item 76] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the antigen-binding domain does not include a variable region.
[Item 77] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the antigen-binding domain does not contain CDRs.
[Item 78] The recombinant nucleic acid according to item 62, wherein the ligand or fragment thereof is a natural killer group 2D (NKG2D) ligand or a fragment thereof.
[Item 79] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 78, wherein the TCR constant domain is incorporated into a functional TCR complex when expressed in a T cell.
[Item 80] The recombinant according to any one of items 1 to 79, wherein the TCR constant domain is incorporated into the same functional TCR complex that incorporates the TFP when expressed in a T cell. Nucleic acid.
[Item 81] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 80, wherein the sequence encoding the TFP and the sequence encoding the TCR constant domain(s) are contained within the same nucleic acid molecule. .
[Item 82] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 81, wherein the encoded TFP and the encoded TCR constant domain are operably linked by a first linker sequence.
[Item 83] The recombinant nucleic acid according to item 82, wherein the first linker includes a protease cleavage site.
[Item 84] The recombinant nucleic acid according to item 83, wherein the protease cleavage site is a 2A, eg, T2A or P2A cleavage site.
[Item 85] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 84, wherein the TFP-encoding sequence and the TCR constant domain-encoding sequence are contained in different nucleic acid molecules.
[Item 86] The TCR subunit of the TFP and the antibody domain, the antigen-binding domain, or the binding ligand, or a fragment thereof are operably linked by a second linker sequence. 1-85.
[Item 87] The second linker sequence is (G 4 S) n (wherein n=1-4).
[Item 88] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 87, wherein the transmembrane domain is a TCR transmembrane domain from CD3ε, CD3γ, CD3δ, TCRα, TCRβ, TCRδ, or TCRγ.
[Item 89] The recombinant according to any one of items 3 to 61 and 63 to 88, wherein the intracellular domain is derived from only CD3ε, only CD3γ, only CD3δ, only TCRα, TCRβ, TCRγ, or TCRδ. Nucleic acid.
[Item 90] The TCR subunit includes (i) at least a portion of a TCR extracellular domain, (ii) a TCR transmembrane domain, and (iii) a TCR intracellular domain, (i), (ii), and Recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 89, wherein at least two of (iii) are derived from the same TCR subunit.
[Item 91] The TCR extracellular domain comprises a TCRγ chain, a TCRδ chain, a CD3εTCR subunit, a CD3γTCR subunit, a CD3δTCR subunit, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof having at least one but not more than 20 modifications. 91. The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 90, comprising an extracellular domain of a protein or a part thereof selected from the group consisting of:
[Item 92] Item 91, wherein the TCR subunit comprises (i) at least a portion of a TCR extracellular domain, (ii) a TCR transmembrane domain, and (iii) a TCR intracellular domain of a TCR γ chain or a TCR δ chain. Recombinant nucleic acid described in.
[Item 93] According to item 92, the TCR extracellular domain comprises an extracellular portion of a constant domain of a TCR γ chain or a TCR δ chain, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof having at least one but not more than 20 modifications. recombinant nucleic acids.
[Item 94] Whether the TCR subunit includes (i) at least a portion of a TCR extracellular domain, (ii) a TCR transmembrane domain, and (iii) a TCR intracellular domain, and is a δ constant domain or a fragment thereof. , or the recombinant nucleic acid according to item 92 or 93, comprising the same.
[Item 95] The δ constant domain has SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 243, or SEQ ID NO: 265, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof with at least one but no more than 20 modifications. Recombinant nucleic acid according to item 94.
[Item 96] The TCR subunit comprising (i) at least a portion of a TCR extracellular domain, (ii) a TCR transmembrane domain, and (iii) a TCR intracellular domain is or is a gamma constant domain. 94. The recombinant nucleic acid according to item 92 or 93, comprising:
[Item 97] The recombinant according to item 96, wherein the γ constant domain has the sequence of SEQ ID NO: 21 or SEQ ID NO: 155, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof with at least one but not more than 20 modifications. Nucleic acid.
[Item 98] The recombinant nucleic acid according to any one of items 94 to 97, wherein the extracellular domain of TFP does not include a γ chain or δ chain variable domain.
[Item 99] A TCR intracellular domain in which the TCR subunit comprises a stimulatory domain of a protein selected from the intracellular signaling domains of CD3ε, CD3γ, or CD3δ, or an amino acid sequence having at least one modification thereto. The recombinant nucleic acid according to any one of items 3-61 and 63-88, comprising:
[Item 100] The recombinant nucleic acid according to item 99, wherein the TCR subunit of TFP comprises the extracellular, transmembrane, and intracellular domains of CD3ε.
[Item 101] The recombinant nucleic acid according to item 100, wherein the TCR subunit of CD3ε comprises SEQ ID NO: 258, a sequence of a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof having at least one but not more than 20 modifications.
[Item 102] The TFP, the TCRγ constant domain, the TCRδ constant domain, and any combination thereof are capable of functionally interacting with an endogenous TCR complex and/or at least one endogenous TCR polypeptide. The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 101.
[Item 103] (a) The TCR constant domain is a TCRγ constant domain, and the TFP is functionally integrated into a TCR complex comprising endogenous subunits of TCRδ, CD3ε, CD3γ, CD3δ, or a combination thereof. mosquito;
(b) said TCR constant domain is a TCRδ constant domain, and said TFP is functionally integrated into a TCR complex comprising endogenous subunits of TCRγ, CD3ε, CD3γ, CD3δ, or a combination thereof; or
(c) the TCR constant domain is a TCRγ constant domain and a TCRδ constant domain, and the TFP is functionally integrated into a TCR complex comprising endogenous subunits of CD3ε, CD3γ, CD3δ, or a combination thereof; The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 102.
[Item 104] Items 1 to 103, wherein the at least one but not more than 20 modifications include modifications of amino acids that mediate cell signal transduction or modifications of amino acids that are phosphorylated in response to ligand binding to the TFP. The recombinant nucleic acid according to any one of the above.
[Item 105] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1, 3 to 61, and 85 to 104, wherein the antibody is an antibody fragment.
[Item 106] The antibody fragment is an scFv, a single domain antibody domain, a V H domain or V L The recombinant nucleic acid according to item 105, which is a domain.
[Item 107] The antigen binding domain is an anti-CD19 binding domain, an anti-B cell maturation antigen (BCMA) binding domain, an anti-mesothelin (MSLN) binding domain, an anti-CD20 binding domain, an anti-CD70 binding domain, an anti-79b binding domain, an anti-HER2 binding domain binding domain, anti-PMSA binding domain, anti-MUC16 binding domain, anti-CD22 binding domain, anti-PD-L1 binding domain, anti-BAFF or BAFF receptor binding domain, anti-nectin-4 binding domain, anti-TROP-2 binding domain, anti-GPC3 The recombinant nucleic acid according to any one of items 1, 3-61, and 85-106, selected from the group consisting of a binding domain, and an anti-ROR-1 binding domain.
[Item 108] The recombinant nucleic acid according to item 107, wherein the anti-MSLN binding domain comprises CDR1 of SEQ ID NO: 60, CDR2 of SEQ ID NO: 61, and CDR3 of SEQ ID NO: 62.
[Item 109] The recombinant nucleic acid according to item 107, wherein the anti-MSLN binding domain comprises CDR1 of SEQ ID NO: 63, CDR2 of SEQ ID NO: 64, and CDR3 of SEQ ID NO: 65.
[Item 110] The recombinant nucleic acid according to item 107, wherein the anti-MSLN binding domain comprises CDR1 of SEQ ID NO: 66, CDR2 of SEQ ID NO: 67, and CDR3 of SEQ ID NO: 68.
[Item 111] The recombinant nucleic acid of item 107, wherein the anti-MSLN binding domain comprises a sequence having at least about 80% sequence identity to the sequence SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70, or SEQ ID NO: 71. .
[Item 112] The recombinant nucleic acid according to item 107, wherein the anti-CD19 binding domain comprises light chain CDR1 of SEQ ID NO: 73, CDR2 of SEQ ID NO: 75, and CDR3 of SEQ ID NO: 77.
[Item 113] The recombinant nucleic acid according to item 107, wherein the anti-CD19 binding domain comprises heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 79, CDR2 of SEQ ID NO: 81, and CDR3 of SEQ ID NO: 83.
[Item 114] The anti-CD19 binding domain has a light chain variable region that has at least about 80% sequence identity to the sequence SEQ ID NO: 85 and/or has at least about 80% sequence identity to the sequence SEQ ID NO: 87. 108. The recombinant nucleic acid of item 107, comprising heavy chain variable regions having sequence identity.
[Item 115] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 114, further comprising a sequence encoding a TCRα transmembrane domain.
[Item 116] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 114, further comprising a sequence encoding a TCRβ transmembrane domain.
[Item 117] The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 114, further comprising a sequence encoding a TCRα transmembrane domain and a sequence encoding a TCRβ transmembrane domain.
[Item 118] (a) A sequence encoding a T cell receptor (TCR) fusion protein (TFP),
(i) Below:
(1) at least a part of the extracellular domain of mouse TCRα or mouse TCRβ, and
(2) Transmembrane domain of mouse TCRα or mouse TCRβ
TCR subunits containing
(ii) an antibody or a fragment thereof containing an antigen-binding domain;
said array comprising;
(b) a sequence encoding a TCR constant domain(s), wherein said TCR constant domain is a mouse TCRα constant domain, a mouse TCRβ constant domain, or a mouse TCRα constant domain and a mouse TCRβ constant domain; and a coding sequence;
the TCR subunit and the antibody are operably linked;
and
A recombinant nucleic acid which, when expressed in an engineered T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR, functionally incorporates said TFP into a TCR complex.
[Item 119] (a) A sequence encoding a T cell receptor (TCR) fusion protein (TFP),
(i) Below:
(1) at least a part of the extracellular domain of mouse TCRα or mouse TCRβ, and
(2) Transmembrane domain of mouse TCRα or mouse TCRβ
TCR subunits containing
(ii) a binding ligand or fragment thereof capable of binding to the antibody or fragment thereof;
said array comprising;
(b) a sequence encoding a TCR constant domain(s), wherein said TCR constant domain is a mouse TCRα constant domain, a mouse TCRβ constant domain, or a mouse TCRα constant domain and a mouse TCRβ constant domain; and a coding sequence;
the TCR subunit and the binding ligand or fragment thereof are operably linked;
and
A recombinant nucleic acid which, when expressed in an engineered T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR, functionally incorporates said TFP into a TCR complex.
[Item 120] The recombinant nucleic acid according to item 118 or 119, wherein the TCR subunit comprises an intracellular domain of mouse TCRα or mouse TCRβ.
[Item 121] The recombinant nucleic acid according to any one of Item 118 or 120, wherein the TCR constant domain is a TCRα constant domain.
[Item 122] The TCRα constant domain is SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 146, or SEQ ID NO: 207, a functional fragment thereof, or an amino acid thereof having at least one but not more than 20 modifications. 122. A recombinant nucleic acid according to item 121, comprising the sequence.
[Item 123] The recombinant nucleic acid according to item 121, wherein the TCRα constant domain comprises a mouse TCRα constant domain.
[Item 124] The recombinant nucleic acid according to item 123, wherein the mouse TCRα constant domain comprises amino acids 2 to 137 of the mouse TCRα constant domain.
[Item 125] The recombinant nucleic acid according to item 124, wherein the mouse TCRα constant domain comprises amino acids 2 to 137 of SEQ ID NO: 146.
[Item 126] The recombinant nucleic acid according to item 124, wherein the mouse TCRα constant domain comprises the sequence of SEQ ID NO: 207.
[Item 127] The recombinant nucleic acid according to item 123, wherein the mouse TCRα constant domain comprises amino acids 82-137 of SEQ ID NO: 146.
[Item 128] The recombinant nucleic acid according to item 127, wherein the mouse TCRα constant domain comprises the sequence of SEQ ID NO: 17.
[Item 129] The recombinant nucleic acid according to any one of items 122 to 128, wherein the intracellular domain is an intracellular domain of TCRβ.
[Item 130] Items 121 to 121, wherein the sequence encoding the TCRα constant domain further encodes a second antigen binding domain or a ligand binding domain that is operably linked to the sequence encoding the TCRα constant domain. 129. The recombinant nucleic acid according to any one of 129.
[Item 131] The recombinant nucleic acid according to item 130, wherein the second antigen-binding domain or the ligand-binding domain is the same as or different from the antigen-binding domain or the ligand-binding domain of the TFP.
[Item 132] The recombinant nucleic acid according to item 130, wherein the second antigen-binding domain or the ligand-binding domain is operably linked to the sequence encoding the TCRα constant domain via a linker.
[Item 133] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 120, wherein the TCR constant domain is a TCRβ constant domain.
[Item 134] The TCRβ constant domain is SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 149, SEQ ID NO: 152, or SEQ ID NO: 209, a functional fragment thereof, or an amino acid thereof having at least one but not more than 20 modifications. 134. A recombinant nucleic acid according to item 133, comprising the sequence.
[Item 135] The recombinant nucleic acid according to item 134, wherein the TCRβ constant domain comprises a mouse TCRβ constant domain.
[Item 136] The recombinant nucleic acid according to item 134, wherein the mouse TCRβ constant domain comprises amino acids 2 to 173 of the mouse TCRβ constant domain.
[Item 137] The recombinant nucleic acid according to item 134, wherein the mouse TCRβ constant domain comprises amino acids 2 to 173 of SEQ ID NO: 152.
[Item 138] The recombinant nucleic acid according to item 134, wherein the mouse TCRβ constant domain comprises SEQ ID NO: 209.
[Item 139] The recombinant nucleic acid according to item 134, wherein the TCRβ constant domain comprises amino acids 123-173 of SEQ ID NO: 152.
[Item 140] The recombinant nucleic acid according to item 134, wherein the TCRβ constant domain comprises SEQ ID NO: 18.
[Item 141] The recombinant nucleic acid according to any one of items 133 to 140, wherein the intracellular domain is an intracellular domain of TCRα.
[Item 142] Items 118 to 142, wherein said sequence encoding said TCRβ constant domain further encodes a second antigen binding domain or ligand binding domain operably linked to said sequence encoding said TCRβ constant domain. 142. The recombinant nucleic acid according to any one of 141.
[Item 143] The recombinant nucleic acid according to item 142, wherein the second antigen-binding domain or the ligand-binding domain is the same as or different from the antigen-binding domain or the ligand-binding domain of the TFP.
[Item 144] The recombinant nucleic acid according to item 142, wherein the second antigen-binding domain or the ligand-binding domain is operably linked to the sequence encoding the TCRβ constant domain via a linker.
[Item 145] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 120, wherein the recombinant nucleic acid comprises sequences encoding a TCRα constant domain and a TCRβ constant domain.
[Item 146] The TCRα constant domain is SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 146, or SEQ ID NO: 207, a functional fragment thereof, or an amino acid thereof having at least one but not more than 20 modifications. 146. A recombinant nucleic acid according to item 145, comprising the sequence.
[Item 147] The TCRβ constant domain is SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 149, SEQ ID NO: 152, or SEQ ID NO: 209, a functional fragment thereof, or an amino acid thereof having at least one but not more than 20 modifications. 147. A recombinant nucleic acid according to item 145 or 146, comprising the sequence.
[Item 148] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 147, wherein the intracellular signaling domain is CD3ε, CD3γ, or CD3δ.
[Item 149] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 147, wherein the intracellular signaling domain is CD3ε.
[Item 150] The sequence includes, in a 5' to 3' direction, a first leader sequence, an antigen-binding domain sequence, a linker, a TRAC gene sequence, a cleavable linker sequence, a second leader sequence, and a TRBC gene sequence. 146. The recombinant nucleic acid according to item 145, comprising:
[Item 151] The sequence includes, in the 5' to 3' direction, a first leader sequence, an antigen-binding domain sequence, a linker, a TRAC gene sequence, a cleavable linker sequence, a second leader sequence, and a TRBC gene sequence. 146. The recombinant nucleic acid according to item 145, comprising:
[Item 152] The sequence includes, in the 5' to 3' direction, a first leader sequence, a TRAC gene sequence, a cleavable linker sequence, a second leader sequence, an antigen-binding domain sequence, a linker, and a TRBC gene sequence. 146. The recombinant nucleic acid according to item 145, comprising:
[Item 153] The sequence includes, in the 5' to 3' direction, a first leader sequence, an antigen-binding domain sequence, a linker, a TRAC gene sequence, a cleavable linker sequence, a second leader sequence, an antigen-binding domain sequence, 146. The recombinant nucleic acid of item 145, comprising a linker and a TRBC gene sequence.
[Item 154] The sequences include, in the 5'-3' direction, a first leader sequence, a TRAC gene sequence, a first cleavable linker sequence, a second leader sequence, a TRBC gene sequence, a second cleavable linker sequence. 146. The recombinant nucleic acid of item 145, comprising a linker sequence, a third leader sequence, an antigen binding domain sequence, a linker sequence, and a CD3ε gene sequence.
[Item 155] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 10.
[Item 156] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 204.
[Item 157] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 206.
[Item 158] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 210.
[Item 159] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 211.
[Item 160] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 217.
[Item 161] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 218.
[Item 162] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 219.
[Item 163] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 220.
[Item 164] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 259.
[Item 165] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 261.
[Item 166] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 154, wherein the sequence encodes the polypeptide shown in SEQ ID NO: 262.
[Item 167] The recombinant nucleic acid according to any one of items 115 to 166, further comprising at least one leader sequence and at least one linker.
[Item 168] The recombinant nucleic acid according to any one of items 119-167, wherein the binding ligand is capable of binding to the Fc domain of the antibody.
[Item 169] The recombinant nucleic acid according to any one of items 119 to 167, wherein the binding ligand is capable of selectively binding an IgG1 antibody.
[Item 170] The recombinant nucleic acid according to any one of items 119 to 167, wherein the binding ligand is capable of specifically binding to an IgG4 antibody.
[Item 171] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 and 120 to 170, wherein the antibody or fragment thereof binds to a cell surface antigen.
[Item 172] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 and 120 to 170, wherein the antibody or fragment thereof is mouse, human, or humanized.
[Item 173] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 and 120-170, wherein the antibody or fragment thereof binds to a cell surface antigen on the surface of a tumor cell.
[Item 174] The binding ligand is a monomer, a dimer, a trimer, a tetramer, a pentamer, a hexamer, a heptamer, an octamer, a nonamer, or a decamer. The recombinant nucleic acid according to any one of items 119 to 167, comprising:
[Item 175] The recombinant nucleic acid according to any one of items 119 to 167, wherein the binding ligand does not include an antibody or a fragment thereof.
[Item 176] The recombinant nucleic acid according to item 175, wherein the binding ligand comprises a CD16 binding polypeptide or a fragment thereof.
[Item 177] The recombinant nucleic acid of item 175, wherein the binding ligand comprises a CD16 binding polypeptide.
[Item 178] The recombinant nucleic acid according to any one of items 119 to 167, wherein the binding ligand is human or humanized.
[Item 179] The recombinant nucleic acid according to any one of items 119 to 167, further comprising a nucleic acid sequence encoding an antibody or fragment thereof to which the binding ligand can bind.
[Item 180] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 and 120-170, wherein the antibody or fragment thereof can be secreted from a cell.
[Item 181] (a) A sequence encoding a T cell receptor (TCR) fusion protein (TFP),
(i) Below:
(1) at least a part of the extracellular domain of mouse TCRα or mouse TCRβ, and
(2) Transmembrane domain of mouse TCRα or mouse TCRβ
TCR subunits containing
(ii) an antigen-binding domain comprising a ligand or a fragment thereof that binds to a receptor or polypeptide expressed on the surface of a cell;
said array comprising;
(b) a sequence encoding a TCR constant domain, wherein the TCR constant domain is a mouse TCRα constant domain or a mouse TCRβ constant domain, or a sequence encoding a mouse TCRα constant domain and a mouse TCRβ constant domain; including;
the TCR subunit and the antigen binding domain are operably linked;
and
A recombinant nucleic acid which, when expressed in an engineered T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR, functionally incorporates said TFP into a TCR complex.
[Item 182] The recombinant nucleic acid according to item 181, wherein the TCR subunit comprises an intracellular domain of mouse TCRα or mouse TCRβ.
[Item 183] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 182, wherein the extracellular domain comprises an extracellular portion of a TCRα constant domain or a TCRβ constant domain, or a fragment thereof.
[Item 184] According to any one of items 118 to 183, further comprising at least a partial sequence encoding a TCRγ constant domain, a partial sequence encoding a TCRδ constant domain, or a partial sequence of both a TCRγ constant domain and a TCRδ constant domain. recombinant nucleic acids.
[Item 185] The recombinant nucleic acid according to any one of items 181 to 184, wherein the antigen-binding domain comprises a ligand.
[Item 186] The recombinant nucleic acid according to item 185, wherein the ligand binds to a cellular receptor.
[Item 187] The recombinant nucleic acid according to item 185, wherein the ligand binds to the polypeptide expressed on the surface of a cell.
[Item 188] The recombinant nucleic acid according to item 185, wherein the receptor or polypeptide expressed on the surface of cells comprises a stress response receptor or polypeptide.
[Item 189] The recombinant nucleic acid according to item 185, wherein the receptor or polypeptide expressed on the surface of cells is an MHC class I-related glycoprotein.
[Item 190] The recombinant nucleic acid of item 189, wherein the MHC class I-related glycoprotein is selected from the group consisting of MICA, MICB, RAET1E, RAET1G, ULBP1, ULBP2, ULBP3, ULBP4, and combinations thereof.
[Item 191] The antigen-binding domain is a monomer, dimer, trimer, tetramer, pentamer, hexamer, heptamer, octamer, nonamer, or decamer. 186. The recombinant nucleic acid according to item 185, comprising:
[Item 192] The recombinant nucleic acid according to item 191, wherein the antigen-binding domain comprises a monomer or dimer of the ligand or a fragment thereof.
[Item 193] The ligand or fragment thereof is a monomer, a dimer, a trimer, a tetramer, a pentamer, a hexamer, a heptamer, an octamer, a nonamer, or a decamer. 186. The recombinant nucleic acid according to item 185, comprising:
[Item 194] The recombinant nucleic acid according to item 193, wherein the ligand or fragment thereof is a monomer or a dimer.
[Item 195] The recombinant nucleic acid according to item 185, wherein the antigen-binding domain does not include an antibody or a fragment thereof.
[Item 196] The recombinant nucleic acid according to item 185, wherein the antigen-binding domain does not include a variable region.
[Item 197] The recombinant nucleic acid according to item 185, wherein the antigen-binding domain does not contain CDRs.
[Item 198] The recombinant nucleic acid according to item 185, wherein the ligand or fragment thereof is a natural killer group 2D (NKG2D) ligand or a fragment thereof.
[Item 199] The recombinant nucleic acid of any one of items 118-198, wherein when expressed in a T cell, the TCR constant domain is incorporated into a functional TCR complex.
[Item 200] The recombinant nucleic acid of any one of item 199, wherein the TCR constant domain is incorporated into the same functional TCR complex that incorporates the TFP when expressed in a T cell.
[Item 201] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 200, wherein the sequence encoding the TFP and the sequence encoding the TCR constant domain(s) are contained within the same nucleic acid molecule. .
[Item 202] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 200, wherein the TFP and the TCR constant domain are operably linked by a first linker sequence.
[Item 203] The recombinant nucleic acid molecule according to item 202, wherein the first linker includes a protease cleavage site.
[Item 204] The recombinant nucleic acid molecule according to item 203, wherein the protease cleavage site is a 2A, eg, T2A or P2A cleavage site.
[Item 205] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 200, wherein the TFP-encoding sequence and the TCR constant domain(s)-encoding sequence are contained within different nucleic acid molecules. .
[Item 206] The TCR subunit of the TFP and the antibody domain, the antigen-binding domain, or the binding ligand, or a fragment thereof are operably linked by a second linker sequence. The recombinant nucleic acid according to any one of 118 to 205.
[Item 207] The second linker sequence is (G 4 S) n (wherein n=1-4).
[Item 208] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 207, wherein the transmembrane domain is a TCR transmembrane domain from TCRα or TCRβ, for example from mouse TCRα or TCRβ.
[Item 209] The TCR subunit of items 118 to 207, wherein the TCR subunit comprises (i) at least a portion of a TCR extracellular domain, (ii) a TCR transmembrane domain, and (iii) a TCR intracellular domain of TCRα or TCRβ. The recombinant nucleic acid according to any one of the above.
[Item 210] The TCR extracellular domain is the extracellular portion of the constant domain of the TCRα chain or TCRβ chain, such as a mouse TCRα chain or TCRβ chain, a functional fragment thereof, or a functional fragment thereof having at least one but not more than 20 modifications. Recombinant nucleic acid according to any one of items 118-207, comprising an amino acid sequence.
[Item 211] The TCR subunit comprises the transmembrane domain of a TCRα or TCRβ chain, such as a mouse TCRα or TCRβ chain, a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof having at least one but no more than 20 modifications. , a transmembrane domain.
[Item 212] The TCR subunit of items 118 to 207, wherein the TCR subunit comprises the TCR intracellular domain of a TCR α chain or TCR β chain, such as a mouse TCR α chain or TCR β chain, or an amino acid sequence having at least one modification thereto. The recombinant nucleic acid according to any one of the above.
[Item 213] The TCR subunit comprises (i) at least a portion of a TCR extracellular domain, (ii) a TCR transmembrane domain, and (iii) a TCR intracellular domain, and is or is an α constant domain. The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 207, comprising:
[Item 214] The α constant domain has the sequence SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 146, or SEQ ID NO: 207, a functional fragment thereof, or at least one but not more than 20 modifications. Recombinant nucleic acid according to item 213, comprising its amino acid sequence, eg amino acids 2-137 of SEQ ID NO: 146.
[Item 215] The encoded TCR comprising (i) at least a portion of the TCR extracellular domain, (ii) the TCR transmembrane domain, and (iii) the TCR intracellular domain is or is a β-constant domain. The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 to 207, comprising:
[Item 216] The β constant domain has the sequence SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 149, SEQ ID NO: 152, or SEQ ID NO: 209, a functional fragment thereof, or at least one but not more than 20 modifications. Recombinant nucleic acid according to item 215, comprising its amino acid sequence, eg amino acids 2-173 of SEQ ID NO: 152.
[Item 217] The recombinant nucleic acid according to item 215 or 216, wherein the extracellular domain of the TCR subunit does not include an α chain or a β chain variable domain.
[Item 218] A TCR intracellular domain in which the TCR subunit comprises a stimulatory domain of a protein selected from the intracellular signaling domains of CD3ε, CD3γ, or CD3δ, or an amino acid sequence having at least one modification thereto. The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 217, comprising:
[Item 219] The recombinant nucleic acid according to item 218, wherein the TCR subunit of TFP comprises the extracellular, transmembrane, and intracellular domains of CD3ε.
[Item 220] The recombinant nucleic acid according to item 218 or 219, wherein the TCR subunit of CD3ε comprises SEQ ID NO: 258, a sequence of a functional fragment thereof, or an amino acid sequence thereof having at least one but not more than 20 modifications. .
[Item 221] Item 1, wherein the TFP, the TCRα constant domain, the TCRβ domain, and any combination thereof are capable of functionally interacting with an endogenous TCR complex and/or at least one endogenous TCR polypeptide. -220.
[Item 222] (a) The TCR constant domain is a TCRα constant domain, and the TFP is functionally integrated into a TCR complex comprising endogenous subunits of CD3ε, CD3γ, CD3δ, or a combination thereof;
(b) said TCR constant domain is a TCRβ constant domain, and said TFP is functionally integrated into a TCR complex comprising endogenous subunits of CD3ε, CD3γ, CD3δ, or a combination thereof; or
(c) the TCR constant domains are TCRα constant domains and TCRβ constant domains, and the TFP is functionally integrated into a TCR complex comprising endogenous subunits of CD3ε, CD3γ, CD3δ, or a combination thereof; The recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 221.
[Item 223] Items 220 to 222, wherein the at least one but not more than 20 modifications include modifications of amino acids that mediate cell signal transduction or modifications of amino acids that are phosphorylated in response to ligand binding to the TFP. The recombinant nucleic acid according to any one of the above.
[Item 224] The recombinant nucleic acid according to any one of items 118 and 120 to 180, wherein the antibody is an antibody fragment.
[Item 225] The antibody fragment is an scFv, a single domain antibody domain, a V H domain or V L 225. The recombinant nucleic acid according to item 224, which is a domain.
[Item 226] The antigen binding domain is an anti-CD19 binding domain, anti-B cell maturation antigen (BCMA) binding domain, anti-mesothelin (MSLN) binding domain, anti-CD20 binding domain, anti-CD70 binding domain, anti-79b binding domain, anti-HER2 binding domain, anti-PMSA binding domain, anti-MUC16 binding domain, anti-CD22 binding domain, anti-PD-L1 binding domain, anti-BAFF or BAFF receptor binding domain, anti-nectin-4 binding domain, anti-TROP-2 binding domain, anti-GPC3 Recombinant nucleic acid according to any one of items 118 and 120-180, selected from the group consisting of a binding domain, and an anti-ROR-1 binding domain.
[Item 227] The recombinant nucleic acid according to item 226, wherein the anti-MSLN binding domain comprises CDR1 of SEQ ID NO: 60, CDR2 of SEQ ID NO: 61, and CDR3 of SEQ ID NO: 62.
[Item 228] The recombinant nucleic acid according to item 226, wherein the anti-MSLN binding domain comprises CDR1 of SEQ ID NO: 63, CDR2 of SEQ ID NO: 64, and CDR3 of SEQ ID NO: 65.
[Item 229] The recombinant nucleic acid according to item 226, wherein the anti-MSLN binding domain comprises CDR1 of SEQ ID NO: 66, CDR2 of SEQ ID NO: 67, and CDR3 of SEQ ID NO: 68.
[Item 230] The recombinant nucleic acid of item 226, wherein the anti-MSLN binding domain comprises a sequence having at least about 80% sequence identity to the sequence SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70, or SEQ ID NO: 71. .
[Item 231] The recombinant nucleic acid according to item 226, wherein the anti-CD19 binding domain comprises light chain CDR1 of SEQ ID NO: 73, CDR2 of SEQ ID NO: 75, and CDR3 of SEQ ID NO: 77.
[Item 232] The recombinant nucleic acid according to item 226, wherein the anti-CD19 binding domain comprises heavy chain CDR1 of SEQ ID NO: 79, CDR2 of SEQ ID NO: 81, and CDR3 of SEQ ID NO: 83.
[Item 233] The anti-CD19 binding domain has a light chain variable region that has at least about 80% sequence identity to the sequence SEQ ID NO: 85 and/or has at least about 80% sequence identity to the sequence SEQ ID NO: 87. 227. A recombinant nucleic acid according to item 226, comprising a heavy chain variable region having sequence identity.
[Item 234] The recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items, wherein the nucleic acid is selected from the group consisting of DNA and RNA.
[Item 235] The recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items, wherein the nucleic acid is mRNA.
[Item 236] The recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items, wherein the nucleic acid is circRNA.
[Item 237] The recombinant nucleic acid of any one of the preceding items, wherein the recombinant nucleic acid comprises a nucleic acid analog, and the nucleic acid analog is not in the coding sequence of the recombinant nucleic acid.
[Item 238] The nucleic acid analogue is 2'-O-methyl, 2'-O-methoxyethyl (2'-O-MOE), 2'-O-aminopropyl, 2'-deoxy, T-deoxy- 2'-fluoro, 2'-O-aminopropyl (2'-O-AP), 2'-O-dimethylaminoethyl (2'-O-DMAOE), 2'-O-dimethylaminopropyl (2'- O-DMAP), T-O-dimethylaminoethyloxyethyl (2'-O-DMAEOE), 2'-O-N-methylacetamide (2'-O-NMA) modification, locked nucleic acid (LNA), ethylene nucleic acid (ENA), peptide nucleic acid (PNA), 1',5'-anhydrohexitol nucleic acid (HNA), morpholino, methylphosphonate nucleotide, thiolphosphonate nucleotide, and 2'-fluoroN3-P5'-phosphoramidite. The recombinant nucleic acid according to item 237, selected from the group consisting of.
[Item 239] The recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items, further comprising a leader sequence.
[Item 240] The recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items, further comprising a promoter sequence.
[Item 241] The recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items, further comprising a sequence encoding a poly(A) tail.
[Item 242] The recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items, further comprising a 3'UTR sequence.
[Item 243] The recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items, wherein the nucleic acid is an isolated nucleic acid or a non-naturally occurring nucleic acid.
[Item 244] The recombinant nucleic acid molecule according to any one of the preceding items, wherein the nucleic acid is an in vitro transcribed nucleic acid.
[Item 245] A vector comprising the recombinant nucleic acid according to any one of the preceding items.
[Item 246] The vector is selected from the group consisting of DNA, RNA, plasmid, lentiviral vector, adenoviral vector, adeno-associated virus vector (AAV), Rous sarcoma virus (RSV) vector, or retroviral vector. Vector according to item 245.
[Item 247] The vector according to item 245 or 246, wherein the vector is an AAV6 vector.
[Item 248] The vector according to any one of items 245 to 247, further comprising a promoter.
[Item 249] The vector according to any one of items 245 to 248, wherein the vector is an in vitro transcribed vector.
[Item 250] A modified T cell comprising the recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 244 or the vector according to any one of items 245 to 249, wherein the modified T cell has an endogenous TCR. The modified T cell comprising functional disruption of.
[Item 251] The sequence encoding the TFP of the nucleic acid according to any one of items 1 to 244, or encoded by the sequence of the nucleic acid according to any one of items 1 to 244 encoding TFP. said modified T cell comprising said TFP, said modified T cell comprising functional disruption of an endogenous TCR.
[Item 252] The sequence encoding TFP according to any one of items 1 to 244, or the sequence encoded by the sequence of the nucleic acid according to any one of items 1 to 244 encoding TFP. Modified allogeneic T cells containing TFP.
[Item 253] The T cell further comprises a heterologous sequence encoding a TCR constant domain, and the TCR constant domain is a TCRγ constant domain, a TCRδ constant domain, or a TCRγ constant domain and a TCRδ constant domain. The modified T cell according to any one of the above.
[Item 254] The T cell further comprises a heterologous sequence encoding a TCR constant domain, and the TCR constant domain is a TCRα constant domain, a TCRβ constant domain, or a TCRα constant domain and a TCRβ constant domain. The modified T cell according to any one of the above.
[Item 255] The TCR constant domain, for example, the TCRα constant domain, the TCRβ constant domain, or the TCRα constant domain and the TCRβ constant domain, is a mouse TCRγ constant domain, for example, a mouse TCRα constant domain, a mouse TCRβ constant domain, or the modified T cell according to item 254, which is a mouse TCRα constant domain and a mouse TCRβ constant domain.
[Item 256] The endogenous TCR that is functionally disrupted is an endogenous TCRα chain, an endogenous TCRβ chain, or an endogenous TCRα chain and an endogenous TCRβ chain, according to any one of items 250 to 255. modified T cells.
[Item 257] According to any one of items 250 to 256, wherein the functionally disrupted endogenous TCR has reduced binding to MHC peptide complexes compared to that of an unmodified control T cell. Modified T cells as described.
[Item 258] The modified T cell according to any one of items 250 to 257, wherein the functional disruption is disruption of a gene encoding the endogenous TCR.
[Item 259] The modified T cell according to item 258, wherein the disruption of the gene encoding the endogenous TCR is the removal of the sequence of the gene encoding the endogenous TCR from the genome of the T cell.
[Item 260] The T cell is a CD4 cell, a CD8 cell, a naive T cell, a memory stem T cell, a central memory T cell, a double negative T cell, an effector memory T cell, an effector T cell, a Th0 cell, a Tc0 cell, Th1 cells, Tc1 cells, Th2 cells, Tc2 cells, Th17 cells, Th22 cells, α/β T cells, γ/δ T cells, natural killer (NK) cells, natural killer T (NKT) cells, hematopoietic stem cells, and pluripotent The modified T cell according to any one of items 250 to 259, which is a human T cell selected from stem cells.
[Item 261] The T cell is CD8 + T cells or CD4 + The modified T cell according to any one of items 250 to 260, which is a T cell.
[Item 262] The modified T cell according to any one of items 250 to 261, wherein the T cell is an allogeneic T cell.
[Item 263] An item further comprising a nucleic acid encoding an inhibitory molecule comprising a first polypeptide comprising at least a portion of the inhibitory molecule associated with a second polypeptide comprising a positive signal from an intracellular signaling domain. The modified T cell according to any one of Nos. 250 to 262.
[Item 264] The modified T cell according to item 263, wherein the inhibitory molecule comprises a first polypeptide comprising at least a portion of PD1 and a second polypeptide comprising a costimulatory domain and a primary signaling domain. .
[Item 265] (a) The modified T cell according to any one of items 250 to 264,
(b) a pharmaceutically acceptable carrier.
[Item 266] A method for producing the modified T cell according to any one of items 250 to 264, comprising:
(a) disrupting an endogenous TCR gene encoding a TCRα chain, a TCRβ chain, or a TCRα chain and a TCRβ chain, thereby producing a T cell containing a functional disruption of the endogenous TCR gene;
(b) Transducing a T cell containing a functionally disrupted endogenous TCR gene with the recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 244 or the vector according to any one of items 245 to 249 The method described above, comprising:
[Item 267] The disruption transduces the T cell with a nuclease protein, or a nucleic acid sequence encoding a nuclease protein, that targets the TCRα chain, the TCRβ chain, or the endogenous genes encoding the TCRα and TCRβ chains. The method of item 266, comprising:
[Item 268] A method for producing a modified T cell according to any one of items 250 to 264, comprising adding any one of items 1 to 244 to a T cell containing functional disruption of an endogenous TCR gene. The method described above, comprising transducing the recombinant nucleic acid according to item 245 or the vector according to any one of items 245 to 249.
[Item 269] The T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR gene is a T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR gene encoding a TCRα chain, a TCRβ chain, or a TCRα chain and a TCRβ chain. , the method described in item 268.
[Item 270] The method according to any one of items 266 to 269, wherein the T cell is a human T cell.
[Item 271] The method of items 266 to 270, wherein said T cell containing a functional disruption of an endogenous TCR gene has reduced binding to MHC-peptide complexes compared to that of an unmodified control T cell. The method described in any one of the above.
[Item 272] According to any one of items 267 to 271, wherein the nuclease is a meganuclease, a zinc finger nuclease (ZFN), a transcription activator-like effector nuclease (TALEN), a CRISPR/Cas nuclease, or a megaTAL nuclease. Method described.
[Item 273] The sequence contained in the recombinant nucleic acid or the vector is inserted into the endogenous TCR subunit gene at the cleavage site, and the insertion of the sequence into the endogenous TCR subunit gene 273. The method of any one of items 266-272, wherein the sexual TCR subunit is functionally disrupted.
[Item 274] The method according to any one of items 267 to 271, wherein the nuclease is a meganuclease.
[Item 275] The meganuclease includes a first subunit and a second subunit, the first subunit binds to a first recognition half site of the recognition sequence, and the second subunit binds to a first recognition half site of the recognition sequence. 275. The method of item 274, wherein the method binds to a second recognition half site of the recognition sequence.
[Item 276] The method of item 275, wherein the meganuclease is a single-stranded meganuclease that includes a linker, and the linker covalently bonds the first subunit and the second subunit.
[Item 277] A method of treating cancer in a subject in need of treatment, the method comprising administering to the subject a therapeutically effective amount of the pharmaceutical composition according to Item 265.
[Item 278] A method for treating cancer in a subject in need of treatment, comprising (a) modified T cells produced according to the method according to any one of items 266 to 276, and (b) a pharmaceutically and a carrier acceptable to said subject.
[Item 279] A method for treating cancer in a subject in need of treatment, the method comprising (a) modified T cells produced according to the method according to any one of items 266 to 276, and (b) pharmaceutical and a carrier acceptable to said subject.
[Item 280] The method according to any one of items 277 to 279, wherein the modified T cell is an allogeneic T cell.
[Item 281] The method of any one of items 277-280, wherein less cytokines are released in the subject compared to a subject to which an effective amount of unmodified control T cells is administered.
[Item 282] Compared to a subject to whom an effective amount of modified T cells containing the recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 244 or the vector according to any one of items 245 to 249 was administered, 282. The method of any one of items 277-281, wherein less cytokines are released in the subject.
[Item 283] The method of any one of items 277-282, wherein the method comprises administering the pharmaceutical composition in combination with an agent that increases the effectiveness of the pharmaceutical composition.
[Item 284] The method of any one of items 277-283, wherein the method comprises administering the pharmaceutical composition in combination with an agent that ameliorates one or more side effects associated with the pharmaceutical composition. Method.
[Item 285] The method according to any one of items 277 to 284, wherein the cancer is solid cancer, lymphoma, or leukemia.
[Item 286] The cancer is selected from the group consisting of renal cell carcinoma, breast cancer, lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, colon cancer, cervical cancer, brain cancer, liver cancer, pancreatic cancer, kidney cancer, and gastric cancer. The method according to any one of items 277 to 285.
[Item 287] According to any one of items 277 to 286, less cytokines are released in the subject compared to a subject to which an effective amount of autologous T cells expressing TFP according to items 1 to 244 is administered. Method described.
[Item 288] The method of any one of items 277-287, wherein the method does not induce graft-versus-host disease.
[Item 289] Items 277 to 289, wherein the risk of the subject developing graft-versus-host disease is reduced compared to a subject to which an effective amount of autologous T cells expressing TFP according to items 1 to 244 is administered. 288. The method of any one of 288.
[Item 290] Recombinant nucleic acid according to any one of items 1 to 244, vector according to any one of items 245 to 249, items 250 to 264 for use as a pharmaceutical or in the preparation of a pharmaceutical. or the pharmaceutical composition according to item 265.

Claims (1)

(a)T細胞受容体(TCR)融合タンパク質(TFP)をコードする配列であって、
(i)以下:
(1)TCR細胞外ドメインの少なくとも一部、及び
(2)膜貫通ドメイン
を含むTCRサブユニットと
(ii)抗原結合ドメインを含む抗体と
を含む前記配列と、
(b)TCR定常ドメインをコードする配列であって、前記TCR定常ドメインが、TCRγ定常ドメイン若しくはTCRδ定常ドメインである前記配列か、又はTCRγ定常ドメイン及びTCRδ定常ドメインをコードする配列とを含み、
前記TCRサブユニット及び前記抗体が機能的に連結されており、
かつ
内因性TCRの機能的破壊を含む改変T細胞で発現すると前記TFPがTCR複合体に機能的に組み込まれる、組換え核酸。
(a) a sequence encoding a T cell receptor (TCR) fusion protein (TFP),
(i) Below:
(1) at least a portion of a TCR extracellular domain; and (2) a TCR subunit comprising a transmembrane domain; and (ii) an antibody comprising an antigen-binding domain.
(b) a sequence encoding a TCR constant domain, the TCR constant domain comprising the aforementioned sequence which is a TCRγ constant domain or a TCRδ constant domain, or a sequence encoding a TCRγ constant domain and a TCRδ constant domain;
the TCR subunit and the antibody are operably linked;
and a recombinant nucleic acid which, when expressed in a modified T cell comprising a functional disruption of an endogenous TCR, functionally incorporates said TFP into a TCR complex.
JP2022516320A 2019-09-12 2020-09-11 Compositions and methods for TCR reprogramming using fusion proteins Pending JP2022548866A (en)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201962899563P 2019-09-12 2019-09-12
US62/899,563 2019-09-12
US202062971682P 2020-02-07 2020-02-07
US62/971,682 2020-02-07
PCT/US2020/050503 WO2021050948A1 (en) 2019-09-12 2020-09-11 Compositions and methods for tcr reprogramming using fusion proteins

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2022548866A JP2022548866A (en) 2022-11-22
JPWO2021050948A5 true JPWO2021050948A5 (en) 2023-09-20

Family

ID=74866684

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2022516320A Pending JP2022548866A (en) 2019-09-12 2020-09-11 Compositions and methods for TCR reprogramming using fusion proteins

Country Status (10)

Country Link
EP (1) EP4028033A4 (en)
JP (1) JP2022548866A (en)
KR (1) KR20220078607A (en)
CN (1) CN114828862A (en)
AU (1) AU2020344628A1 (en)
BR (1) BR112022004458A2 (en)
CA (1) CA3154287A1 (en)
IL (1) IL291236A (en)
MX (1) MX2022002984A (en)
WO (1) WO2021050948A1 (en)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2023091420A2 (en) * 2021-11-16 2023-05-25 TCR2 Therapeutics Inc. Compositions and methods for t cell engineering
WO2023133296A2 (en) * 2022-01-07 2023-07-13 Sorrento Therapeutics, Inc. Engineered pd-l1-targeting gamma delta t cell receptors
WO2024039576A2 (en) * 2022-08-19 2024-02-22 Memorial Sloan-Kettering Cancer Center T cell receptors targeting ras mutations and uses thereof

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011059836A2 (en) * 2009-10-29 2011-05-19 Trustees Of Dartmouth College T cell receptor-deficient t cell compositions
DK2771357T3 (en) * 2011-10-28 2018-10-29 Regeneron Pharma Genetically modified T cell receptor mice
AU2016342041B2 (en) * 2015-10-23 2021-12-02 Eureka Therapeutics, Inc. Antibody/T-cell receptor chimeric constructs and uses thereof
GB201604494D0 (en) * 2016-03-16 2016-04-27 Immatics Biotechnologies Gmbh Transfected T-Cells and T-Cell receptors for use in immunotherapy against cancers
IL292551B2 (en) * 2016-10-07 2023-10-01 Tcr2 Therapeutics Inc Compositions and methods for t-cell receptors reprogramming using fusion proteins
US11851491B2 (en) * 2016-11-22 2023-12-26 TCR2 Therapeutics Inc. Compositions and methods for TCR reprogramming using fusion proteins
CN110234343A (en) * 2016-12-21 2019-09-13 T细胞受体治疗公司 Engineered T cell for treating cancer
WO2018232020A1 (en) * 2017-06-13 2018-12-20 TCR2 Therapeutics Inc. Compositions and methods for tcr reprogramming using fusion proteins
WO2019118508A1 (en) * 2017-12-12 2019-06-20 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Genetically modified immune cells targeting ny-eso-1 and methods of use thereof
WO2019133443A1 (en) * 2017-12-28 2019-07-04 Janux Therapeutics, Inc. Modified t cell receptors
EP3765039A4 (en) * 2018-03-09 2021-12-08 TCR2 Therapeutics Inc. Compositions and methods for tcr reprogramming using fusion proteins

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Zhang et al. Engineering car-t cells
US11001621B1 (en) Trifunctional T cell-antigen coupler and methods and uses thereof
Batlevi et al. Novel immunotherapies in lymphoid malignancies
JP7404279B2 (en) T cell antigen couplers with various construct optimizations
US11878035B2 (en) T cell-antigen coupler with various construct optimizations
KR20210043623A (en) Chimeric antigen receptor and CAR-T cells that bind to HLA-DR
JPWO2021108661A5 (en)
Cruz-Ramos et al. CAR-T cell and personalized medicine
TW201930589A (en) Immunocompetent cell that expresses a cell surface molecule specifically recognizing human mesothelin, il-7 and ccl19
JP2022548866A (en) Compositions and methods for TCR reprogramming using fusion proteins
JPWO2019173693A5 (en)
CA3145223A1 (en) Composition and method for adoptive immunotherapy
JPWO2021050948A5 (en)
EP3710470A1 (en) Il-33 secreting immunoresponsive cells and uses thereof
Sasu et al. T cell redirecting therapies for cancer treatment
TWI790162B (en) Novel t cell receptors and immune therapy using the same
JP2023553049A (en) CAR T cells for treating autoimmune diseases derived from CD19+, CD20+, or CD22+ tumors or B cells
CA3198363A1 (en) Methods and compositions comprising pd1 chimeric polypeptides
WO2022150379A1 (en) Nk cell engager molecules and methods of use
JPWO2019226946A5 (en)
KR20220040489A (en) T cell receptors and methods of use thereof
Turazzi BAFF RECEPTOR (BAFF-R) CAR-REDIRECTED T CELLS: A NOVEL TOOL TO TREAT HIGH RISK B-CELL ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA (B-ALL)