JPWO2020092379A5 - - Google Patents
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Description
等価物
本開示は、その詳細な説明と併せて説明されているが、前述の説明は、添付の特許請求の範囲によって定義される本発明の範囲を例示しており、制限しないことが意図されていることを理解されたい。他の態様、利点、及び改編は、以下の特許請求の範囲の範囲内である。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
対象をがん治療の候補として特定する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリを取得、提供、または生成し、ここで、前記ライブラリの各細菌細胞またはビーズは、異なる腫瘍抗原を含むことと；
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させ、ここで、前記ＡＰＣは前記細菌細胞またはビーズを内在化することと；
ｃ）前記ＡＰＣを前記対象由来のリンパ球と、１つ以上のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で、接触させることと；
ｄ）１つ以上のリンパ球が、１つ以上のＡＰＣによって提示される１つ以上の腫瘍抗原によって活性化されるか、またはそれに対して反応しないかを、例えば、１つ以上の免疫メディエーターの発現及び／または分泌のレベル（例えば、対照に対するレベルの増減）を評価すること（例えば、検出または測定すること）によって決定することと；
ｅ）１つ以上の腫瘍抗原を刺激抗原及び／または阻害性抗原として特定することと；
ｆ）対象の反応プロファイルを表す阻害性抗原に対する刺激性抗原の数の比率を生成することと；
ｇ）対象の反応プロファイルと標的反応プロファイルと比較して、がん治療の開始、継続、変更、中止、または非開始の候補対象として前記対象を選択することと、
を含む前記方法。
（項目２）
項目１に記載の方法であって、
ｈ）前記細菌細胞またはビーズを標的対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させ、ここで、前記ＡＰＣは前記細菌細胞またはビーズを内在化することと；
ｉ）前記ＡＰＣを前記標的対象由来のリンパ球と、１つ以上のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で、接触させることと；
ｊ）１つ以上のリンパ球が、１つ以上のＡＰＣによって提示される１つ以上の腫瘍抗原によって活性化されるか、またはそれに対して反応しないかを、例えば、１つ以上の免疫メディエーターの発現及び／または分泌のレベル（例えば、対照に対するレベルの増減）を評価すること（例えば、検出または測定すること）によって決定することと；
ｋ）１つ以上の腫瘍抗原を刺激抗原及び／または阻害性抗原として特定することと；
ｌ）前記標的反応プロファイルを表す、阻害性抗原に対する刺激性抗原の数の比率を生成することと、
を含む方法によって前記標的反応プロファイルを生成することをさらに含む、前記方法。
（項目３）
前記標的反応プロファイルが、がんに対して少なくとも１つの有益な反応を示すか、または以前に示した１つ以上の標的対象に由来する、項目１または項目２に記載の方法。
（項目４）
前記標的反応プロファイルが、少なくとも１００：１、５０：１、２０：１、１０：１、５：１、２：１、１．５：１、１．４：１、１．２：１、１．１：１、０．９：１、０．８：１、０．７：１、０．６：１、または０．５：１である、阻害性抗原の数に対する刺激性抗原の数の比率を含む、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記有益な反応が、がん治療または治療の組み合わせに対するポジティブな臨床反応を含む、項目３に記載の方法。
（項目６）
前記有益な反応が、がんに対する自発性の反応を含む、項目３に記載の方法。
（項目７）
前記有益な反応には、がんのクリアランス、例えば、がんのクリアランスに関連する１つ以上の臨床的測定のレベルを含む、項目３に記載の方法。
（項目８）
前記有益な反応は、例えば、定義された期間（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２週間、または少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２か月間、または少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２年間）にわたる、がんの再燃、再発、及び／または転移の欠如を含む、項目３に記載の方法。
（項目９）
前記有益な反応が、ポジティブながん予後を含む、項目３に記載の方法。
（項目１０）
前記有益な反応が、がん治療または治療の組み合わせに対する１つ以上の毒性反応及び／または副作用（例えば、１つ以上の測定可能な毒性反応または副作用）の欠如を含む、項目３に記載の方法。
（項目１１）
前記標的反応プロファイルが、がんに対して１つ以上の有害及び／または非有益な反応を示すか、または以前に示した１つ以上の標的対象に由来する、項目１または項目２に記載の方法。
（項目１２）
前記標的反応プロファイルが、５：１、２：１、１．５：１、１．４：１、１．２：１、１．１：１、０．９：１、０．８：１、０．７：１、０．６：１、０．５：１、０．２５：１、０．１２５：１、０．０１：１、または０．００１：１未満である、阻害性抗原の数に対する刺激性抗原の数の比率を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記有害及び／または非有益な反応が、がん治療または治療の組み合わせに対するネガティブな臨床反応及び／または反応の不全を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１４）
前記有害及び／または非有益な反応が、がんのクリアランスの欠如、例えば、がんのクリアランスの欠如に関連する１つ以上の臨床的測定のレベルを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１５）
前記有害及び／または非有益な反応が、がんの少なくとも１回の再燃、再発、及び／または転移を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１６）
前記有害及び／または非有益な反応には、ネガティブながんの予後を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１７）
前記有害及び／または非有益な反応には、がん治療または治療の組み合わせに対する１つ以上の毒性反応及び／または副作用（例えば、１つ以上の測定可能な毒性反応及び／または副作用）を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１８）
がん治療またはがん治療の組み合わせの開始のための前記候補対象を選択することをさらに含む、項目１～１７のいずれかに記載の方法。
（項目１９）
がん治療またはがん治療の組み合わせの継続のための前記候補対象を選択することをさらに含む、項目１～１７のいずれかに記載の方法。
（項目２０）
前記対象の反応プロファイルが、少なくとも１００：１、５０：１、２０：１、１０：１、５：１、２：１、１．５：１、１．４：１、１．２：１、１．１：１、０．９：１、０．８：１、０．７：１、０．６：１、または０．５：１である、阻害性抗原の数に対する刺激性抗原の数の比率を含む場合、前記対象を候補対象として選択することを含む、項目１８または項目１９に記載の方法。
（項目２１）
がん治療の変更のための前記候補対象を選択することをさらに含む、項目１～１７のいずれかに記載の方法。
（項目２２）
がん治療の中止または非開始のための前記候補対象を選択することをさらに含む、項目１～１７のいずれかに記載の方法。
（項目２３）
前記対象の反応プロファイルが、５：１、２：１、１．５：１、１．４：１、１．２：１、１．１：１ ０．９：１、０．８：１、０．７：１、０．６：１、０．５：１、０．２５：１、０．１２５：１、０．０１：１、または０．００１：１未満である阻害性抗原の数に対する刺激性抗原の数の比率を含む場合、がん治療の変更、中止、及び／または非開始のための候補対象として、前記対象を選択することを含む、項目２１または２２に記載の方法。
（項目２４）
前記がん治療または治療の組み合わせを前記対象に施すことをさらに含む、項目１８～２０のいずれか１項に記載の方法。
（項目２５）
前記候補対象に施された前記がん治療を変更することをさらに含む、項目２１～２３のいずれか１項に記載の方法。
（項目２６）
前記候補対象に対する前記がん治療を中止すること、または開始しないことをさらに含む、項目２１～２３のいずれか１項に記載の方法。
（項目２７）
がん治療の候補として対象を特定する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリを取得、提供、または生成し、ここで、前記ライブラリの各細菌細胞またはビーズは、異なる腫瘍抗原を含むことと；
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させ、ここで、前記ＡＰＣは前記細菌細胞またはビーズを内在化することと；
ｃ）前記ＡＰＣを前記対象由来のリンパ球と、１つ以上のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で、接触させることと；
ｄ）１つ以上のリンパ球が、１つ以上のＡＰＣによって提示される１つ以上の腫瘍抗原によって活性化されるか、またはそれに対して反応しないかを、例えば、１つ以上の免疫メディエーターの発現及び／または分泌のレベル（例えば、対照に対するレベルの増減）を評価すること（例えば、検出または測定すること）によって決定することと；
ｅ）１つ以上の腫瘍抗原を刺激抗原及び／または阻害性抗原として特定することと；
ｆ）刺激性抗原の数を阻害性抗原の数と比較することと；
ｇ）がん治療の開始、継続、変更、中止、または非開始の候補対象として前記対象を選択することと、を含む前記方法。
（項目２８）
がん治療またはがん治療の組み合わせの開始のための前記候補対象を選択することをさらに含む、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
がん治療またはがん治療の組み合わせの継続のための前記候補対象を選択することをさらに含む、項目２７に記載の方法。
（項目３０）
前記刺激性抗原の数が少なくとも１つ（例えば、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、またはそれ以上）であり、かつ前記阻害性抗原の数がゼロである場合、前記対象を候補対象として選択することを含む、項目２８または項目２９に記載の方法。
（項目３１）
がん治療の変更のための前記候補対象を選択することをさらに含む、項目２７に記載の方法。
（項目３２）
がん治療の中止または非開始のための前記候補対象を選択することをさらに含む、項目２７に記載の方法。
（項目３３）
前記刺激性抗原の数がゼロであり、かつ前記阻害性抗原の数が少なくとも１つ（例えば、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、またはそれ以上）である場合、前記対象を候補対象として選択することを含む、項目３１または項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記がん治療またはがん治療の組み合わせを前記候補対象に施すことをさらに含む、項目２８～３０のいずれか１項に記載の方法。
（項目３５）
前記候補対象に施された前記がん治療を変更することをさらに含む、項目３１～３３のいずれか１項に記載の方法。
（項目３６）
前記候補対象に対する前記がん治療を中止すること、または開始しないことをさらに含む、項目３１～３３のいずれか１項に記載の方法。
EQUIVALENTS While the present disclosure has been described in conjunction with the detailed description thereof, the foregoing description is intended to illustrate, and not limit, the scope of the invention, which is defined by the appended claims. It should be understood that Other aspects, advantages, and modifications are within the scope of the following claims.
In certain embodiments, for example, the following are provided:
(Item 1)
A method of identifying a subject as a candidate for cancer treatment, comprising:
a) obtaining, providing or generating a library comprising bacterial cells or beads comprising a plurality of tumor antigens, wherein each bacterial cell or bead of said library comprises a different tumor antigen;
b) contacting said bacterial cells or beads with antigen presenting cells (APCs) from said subject, wherein said APCs internalize said bacterial cells or beads;
c) contacting the APCs with lymphocytes from the subject under conditions suitable for activation of the lymphocytes by tumor antigens presented by one or more APCs;
d) whether one or more lymphocytes are activated by or unresponsive to one or more tumor antigens presented by one or more APCs, e.g. determining by assessing (e.g., detecting or measuring) the level of expression and/or secretion (e.g., increase or decrease in level relative to control);
e) identifying one or more tumor antigens as stimulatory and/or inhibitory antigens;
f) generating a ratio of the number of stimulatory antigens to inhibitory antigens representing the response profile of the subject;
g) comparing the subject's response profile and a target response profile to select the subject as a candidate subject for initiation, continuation, modification, discontinuation, or non-initiation of cancer therapy;
The above method comprising
(Item 2)
The method of item 1, wherein
h) contacting said bacterial cells or beads with antigen presenting cells (APCs) from a target subject, wherein said APCs internalize said bacterial cells or beads;
i) contacting said APCs with lymphocytes from said target subject under conditions suitable for activation of lymphocytes by tumor antigens presented by one or more APCs;
j) whether one or more lymphocytes are activated by or unresponsive to one or more tumor antigens presented by one or more APCs, e.g. determining by assessing (e.g., detecting or measuring) the level of expression and/or secretion (e.g., increase or decrease in level relative to control);
k) identifying one or more tumor antigens as stimulatory and/or inhibitory antigens;
l) generating a ratio of the number of stimulatory antigens to inhibitory antigens representing said target response profile;
the method further comprising generating the target response profile by a method comprising:
(Item 3)
3. The method of item 1 or item 2, wherein said target response profile is derived from one or more target subjects exhibiting or previously exhibiting at least one beneficial response to cancer.
(Item 4)
said target response profile is at least 100:1, 50:1, 20:1, 10:1, 5:1, 2:1, 1.5:1, 1.4:1, 1.2:1, 1 .1:1, 0.9:1, 0.8:1, 0.7:1, 0.6:1, or 0.5:1 number of stimulatory antigens to number of inhibitory antigens 4. The method of item 3, comprising a ratio.
(Item 5)
4. The method of item 3, wherein said beneficial response comprises a positive clinical response to a cancer treatment or combination of treatments.
(Item 6)
4. The method of item 3, wherein said beneficial response comprises a spontaneous response to cancer.
(Item 7)
4. The method of item 3, wherein said beneficial response comprises cancer clearance, eg, the level of one or more clinical measures associated with cancer clearance.
(Item 8)
Said beneficial response is for example for a defined period of time (for example at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 weeks or at least 1, 2, 3, 4 , 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 months, or for at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 years) 4. The method of item 3, comprising absence of relapse, recurrence, and/or metastasis of
(Item 9)
4. The method of item 3, wherein said beneficial response comprises a positive cancer prognosis.
(Item 10)
4. The method of item 3, wherein said beneficial response comprises absence of one or more toxic responses and/or side effects (e.g., one or more measurable toxic responses or side effects) to a cancer treatment or combination of treatments. .
(Item 11)
3. The method of claim 1 or 2, wherein said target response profile exhibits one or more adverse and/or non-beneficial responses to cancer or is derived from one or more previously demonstrated target subjects. Method.
(Item 12)
wherein said target response profile is 5:1, 2:1, 1.5:1, 1.4:1, 1.2:1, 1.1:1, 0.9:1, 0.8:1, less than 0.7:1, 0.6:1, 0.5:1, 0.25:1, 0.125:1, 0.01:1, or 0.001:1 of inhibitory antigen 12. A method according to item 11, comprising the ratio of number of stimulatory antigens to number.
(Item 13)
12. The method of item 11, wherein said adverse and/or non-beneficial response comprises a negative clinical response and/or failure to respond to a cancer treatment or combination of treatments.
(Item 14)
12. A method according to item 11, wherein said adverse and/or non-beneficial reaction comprises levels of one or more clinical measures associated with lack of clearance of cancer, eg, lack of clearance of cancer.
(Item 15)
12. The method of item 11, wherein said adverse and/or non-beneficial reactions include at least one relapse, recurrence, and/or metastasis of cancer.
(Item 16)
12. The method of item 11, wherein said adverse and/or non-beneficial reactions include negative cancer prognosis.
(Item 17)
said adverse and/or non-beneficial reactions include one or more toxic reactions and/or side effects (e.g., one or more measurable toxic reactions and/or side effects) to a cancer treatment or combination of treatments; 12. The method of item 11.
(Item 18)
18. The method of any of items 1-17, further comprising selecting said candidate subject for initiation of cancer therapy or a combination of cancer therapies.
(Item 19)
18. The method of any of items 1-17, further comprising selecting said candidate subject for continuation of cancer therapy or a combination of cancer therapies.
(Item 20)
said subject's response profile is at least 100:1, 50:1, 20:1, 10:1, 5:1, 2:1, 1.5:1, 1.4:1, 1.2:1, The number of stimulatory antigens to the number of inhibitory antigens that is 1.1:1, 0.9:1, 0.8:1, 0.7:1, 0.6:1, or 0.5:1 20. The method of item 18 or item 19, comprising selecting said subject as a candidate subject if it comprises a ratio of .
(Item 21)
18. The method of any of items 1-17, further comprising selecting said candidate subject for alteration of cancer therapy.
(Item 22)
18. The method of any of items 1-17, further comprising selecting said candidate subject for discontinuation or non-initiation of cancer therapy.
(Item 23)
The subject's response profile is 5:1, 2:1, 1.5:1, 1.4:1, 1.2:1, 1.1:1 0.9:1, 0.8:1, Number of inhibitory antigens less than 0.7:1, 0.6:1, 0.5:1, 0.25:1, 0.125:1, 0.01:1, or 0.001:1 23. A method according to item 21 or 22, comprising selecting said subject as a candidate subject for modification, discontinuation and/or non-initiation of cancer therapy when comprising the ratio of the number of stimulatory antigens to the number of stimulatory antigens.
(Item 24)
21. The method of any one of items 18-20, further comprising administering said cancer treatment or combination of treatments to said subject.
(Item 25)
24. The method of any one of items 21-23, further comprising altering the cancer therapy administered to the candidate subject.
(Item 26)
24. The method of any one of items 21-23, further comprising stopping or not starting said cancer treatment for said candidate subject.
(Item 27)
A method of identifying a subject as a candidate for cancer therapy, comprising:
a) obtaining, providing or generating a library comprising bacterial cells or beads comprising a plurality of tumor antigens, wherein each bacterial cell or bead of said library comprises a different tumor antigen;
b) contacting said bacterial cells or beads with antigen presenting cells (APCs) from said subject, wherein said APCs internalize said bacterial cells or beads;
c) contacting the APCs with lymphocytes from the subject under conditions suitable for activation of the lymphocytes by tumor antigens presented by one or more APCs;
d) whether one or more lymphocytes are activated by or unresponsive to one or more tumor antigens presented by one or more APCs, e.g. determining by assessing (e.g., detecting or measuring) the level of expression and/or secretion (e.g., increase or decrease in level relative to control);
e) identifying one or more tumor antigens as stimulatory and/or inhibitory antigens;
f) comparing the number of stimulatory antigens to the number of inhibitory antigens;
g) selecting said subject as a candidate subject for initiation, continuation, modification, cessation, or non-initiation of cancer therapy.
(Item 28)
28. The method of item 27, further comprising selecting said candidate subject for initiation of cancer therapy or a combination of cancer therapies.
(Item 29)
28. The method of item 27, further comprising selecting said candidate subject for continuation of cancer therapy or a combination of cancer therapies.
(Item 30)
The number of said stimulatory antigens is at least one (e.g., at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, or more) and the number of said inhibitory antigens is zero 30. The method of item 28 or item 29, comprising selecting said subject as a candidate subject, if any.
(Item 31)
28. The method of item 27, further comprising selecting said candidate subject for alteration of cancer therapy.
(Item 32)
28. The method of item 27, further comprising selecting said candidate subject for discontinuation or non-initiation of cancer therapy.
(Item 33)
The number of said stimulatory antigens is zero and the number of said inhibitory antigens is at least one (e.g., at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, or more) 33. The method of item 31 or item 32, comprising selecting said subject as a candidate subject, if any.
(Item 34)
31. The method of any one of items 28-30, further comprising administering said cancer therapy or combination of cancer therapies to said candidate subject.
(Item 35)
34. The method of any one of items 31-33, further comprising altering the cancer therapy administered to the candidate subject.
(Item 36)
34. The method of any one of items 31-33, further comprising stopping or not starting said cancer treatment for said candidate subject.
Claims (36)
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリを取得、提供、または生成し、ここで、前記ライブラリの各細菌細胞またはビーズは、異なる腫瘍抗原を含むことと；
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させ、ここで、前記ＡＰＣは前記細菌細胞またはビーズを内在化することと；
ｃ）前記ＡＰＣを前記対象由来のリンパ球と、１つ以上のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で、接触させることと；
ｄ）１つ以上のリンパ球が、１つ以上のＡＰＣによって提示される１つ以上の腫瘍抗原によって活性化されるか、またはそれに対して反応しないかを、例えば、１つ以上の免疫メディエーターの発現及び／または分泌のレベル（例えば、対照に対するレベルの増減）を評価すること（例えば、検出または測定すること）によって決定することと；
ｅ）１つ以上の腫瘍抗原を刺激抗原及び／または阻害性抗原として特定することと；
ｆ）対象の反応プロファイルを表す阻害性抗原に対する刺激性抗原の数の比率を生成することと；
ｇ）対象の反応プロファイルと標的反応プロファイルと比較することと、
を含み、前記対象の反応プロファイルと前記標的反応プロファイルとの前記比較が、前記指標であり、前記指標は、がん治療の開始、継続、変更、中止、または非開始の候補対象として前記対象が選択されるべきであることを示す、前記方法。 A method of providing an indication of a subject as a candidate for cancer therapy, comprising:
a) obtaining, providing or generating a library comprising bacterial cells or beads comprising a plurality of tumor antigens, wherein each bacterial cell or bead of said library comprises a different tumor antigen;
b) contacting said bacterial cells or beads with antigen presenting cells (APCs) from said subject, wherein said APCs internalize said bacterial cells or beads;
c) contacting the APCs with lymphocytes from the subject under conditions suitable for activation of the lymphocytes by tumor antigens presented by one or more APCs;
d) whether one or more lymphocytes are activated by or unresponsive to one or more tumor antigens presented by one or more APCs, e.g. determining by assessing (e.g., detecting or measuring) the level of expression and/or secretion (e.g., increase or decrease in level relative to control);
e) identifying one or more tumor antigens as stimulatory and/or inhibitory antigens;
f) generating a ratio of the number of stimulatory antigens to inhibitory antigens representing the response profile of the subject;
g) comparing the response profile of the subject to the target response profile;
wherein the comparison of the subject's response profile and the target response profile is the indicator, wherein the indicator is whether the subject is a candidate subject for initiation, continuation, modification, discontinuation, or non-initiation of cancer treatment The method above indicating that it should be selected .
ｈ）前記細菌細胞またはビーズを標的対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させ、ここで、前記ＡＰＣは前記細菌細胞またはビーズを内在化することと；
ｉ）前記ＡＰＣを前記標的対象由来のリンパ球と、１つ以上のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で、接触させることと；
ｊ）１つ以上のリンパ球が、１つ以上のＡＰＣによって提示される１つ以上の腫瘍抗原によって活性化されるか、またはそれに対して反応しないかを、例えば、１つ以上の免疫メディエーターの発現及び／または分泌のレベル（例えば、対照に対するレベルの増減）を評価すること（例えば、検出または測定すること）によって決定することと；
ｋ）１つ以上の腫瘍抗原を刺激抗原及び／または阻害性抗原として特定することと；
ｌ）前記標的反応プロファイルを表す、阻害性抗原に対する刺激性抗原の数の比率を生成することと、
を含む方法によって前記標的反応プロファイルを生成することをさらに含む、前記方法。 2. The method of claim 1, wherein
h) contacting said bacterial cells or beads with antigen presenting cells (APCs) from a target subject, wherein said APCs internalize said bacterial cells or beads;
i) contacting said APCs with lymphocytes from said target subject under conditions suitable for activation of lymphocytes by tumor antigens presented by one or more APCs;
j) whether one or more lymphocytes are activated by or unresponsive to one or more tumor antigens presented by one or more APCs, e.g. determining by assessing (e.g., detecting or measuring) the level of expression and/or secretion (e.g., increase or decrease in level relative to control);
k) identifying one or more tumor antigens as stimulatory and/or inhibitory antigens;
l) generating a ratio of the number of stimulatory antigens to inhibitory antigens representing said target response profile;
the method further comprising generating the target response profile by a method comprising:
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリを取得、提供、または生成し、ここで、前記ライブラリの各細菌細胞またはビーズは、異なる腫瘍抗原を含むことと；
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させ、ここで、前記ＡＰＣは前記細菌細胞またはビーズを内在化することと；
ｃ）前記ＡＰＣを前記対象由来のリンパ球と、１つ以上のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で、接触させることと；
ｄ）１つ以上のリンパ球が、１つ以上のＡＰＣによって提示される１つ以上の腫瘍抗原によって活性化されるか、またはそれに対して反応しないかを、例えば、１つ以上の免疫メディエーターの発現及び／または分泌のレベル（例えば、対照に対するレベルの増減）を評価すること（例えば、検出または測定すること）によって決定することと；
ｅ）１つ以上の腫瘍抗原を刺激抗原及び／または阻害性抗原として特定することと；
ｆ）刺激性抗原の数を阻害性抗原の数と比較することと；
を含み、前記刺激性抗原の数と阻害性抗原の数との比較が、前記指標であり、前記指標は、がん治療の開始、継続、変更、中止、または非開始の候補対象として前記対象が選択されるべきであることを示す、前記方法。 A method of providing an indication of a subject as a candidate for cancer therapy, comprising:
a) obtaining, providing or generating a library comprising bacterial cells or beads comprising a plurality of tumor antigens, wherein each bacterial cell or bead of said library comprises a different tumor antigen;
b) contacting said bacterial cells or beads with antigen presenting cells (APCs) from said subject, wherein said APCs internalize said bacterial cells or beads;
c) contacting the APCs with lymphocytes from the subject under conditions suitable for activation of the lymphocytes by tumor antigens presented by one or more APCs;
d) whether one or more lymphocytes are activated by or unresponsive to one or more tumor antigens presented by one or more APCs, e.g. determining by assessing (e.g., detecting or measuring) the level of expression and/or secretion (e.g., increase or decrease in level relative to control);
e) identifying one or more tumor antigens as stimulatory and/or inhibitory antigens;
f) comparing the number of stimulatory antigens to the number of inhibitory antigens;
wherein a comparison of the number of stimulatory antigens and the number of inhibitory antigens is the index, and the index is the subject as a candidate subject for initiation, continuation, modification, discontinuation, or non-initiation of cancer therapy is to be selected .
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