JPWO2020055931A5 - - Google Patents
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Description
さらなる態様は、本明細書中に開示の医薬組成物をそれを必要とする患者に投与することを含む、がんを処置する方法に関する。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
抗原提示細胞（ＡＰＣ）を調製する方法であって、
（ａ）複数の単球および／または未熟樹状細胞をペプチドのライブラリーと、前記単球および／または未熟樹状細胞がペプチドの前記ライブラリーの１つまたはそれより多くを内在化するのに適切な条件下の培地中で接触させる工程であって、ここで、ペプチドの前記ライブラリーが抗原のペプチド断片を含み、ここで、前記ペプチドが、前記単球および／または未熟樹状細胞によるタンパク質分解性プロセシングならびにクラスＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ Ｉ）および／またはクラスＩＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ ＩＩ）から選択される少なくとも１つの細胞表面タンパク質複合体上へのその後の負荷に適切である、接触させる工程；および
（ｂ）前記単球および／または未熟樹状細胞を、１またはそれを超えるサイトカインおよび／または成長因子の存在下で、前記単球の分化および／または前記未熟樹状細胞の成熟抗原提示樹状細胞への成熟を誘導し、それにより、ＡＰＣを調製するのに適切な条件下にて培養する工程
を含む、方法。
（項目２）
前記ライブラリーが、５またはそれを超えるか、８またはそれを超えるか、１０またはそれを超えるか、１５またはそれを超えるか、２０またはそれを超えるか、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、１０～１５、５～１０、５～１５、５～２０、８～１０、８～１５、８～２０、１０～２０、１５～２０、１０～１００、１０～１５０、１０～２００、または２００アミノ酸より長い長さを有する複数のペプチドを含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
ペプチドの前記ライブラリーが、１つを超える抗原の断片を含む、項目１に記載の方法。
（項目４）
ペプチドの前記ライブラリーが、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６つの抗原の断片を含む、項目１に記載の方法。
（項目５）
工程（ａ）が、前記単球および／または未熟樹状細胞を、ペプチドの２またはそれを超えるライブラリーと接触させることを含み、ここで、ペプチドの各ライブラリーが異なる抗原の断片を含む、項目１に記載の方法。
（項目６）
工程（ａ）が、前記単球および／または未熟樹状細胞を、ペプチドの１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６ライブラリーと接触させることを含む、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記抗原が腫瘍関連抗原である、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記抗原がウイルス腫瘍関連抗原である、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記抗原が、腫瘍関連抗原、ウイルス腫瘍関連抗原、またはその両方である、項目４に記載の方法。
（項目１０）
ペプチドの前記ライブラリーが、腫瘍関連抗原由来のペプチドのライブラリー、ウイルス腫瘍関連抗原由来のペプチドのライブラリー、またはその両方を含む、項目６に記載の方法。
（項目１１）
（ｃ）前記ＡＰＣがＭＨＣ ＩおよびＭＨＣ ＩＩから選択される少なくとも１つの細胞表面タンパク質複合体上に前記ペプチドを負荷するのに適切な条件下の培地中で、前記ＡＰＣをペプチドのライブラリーと接触させる工程であって、ここで、ペプチドの前記ライブラリーが抗原のペプチド断片を含む、接触させる工程、および
（ｄ）必要に応じて、工程（ｃ）を１回または複数回繰り返す工程
をさらに含む、前記項目のいずれかに記載の方法。
（項目１２）
工程（ｃ）で使用したペプチドの前記ライブラリーが、５またはそれを超えるか、８またはそれを超えるか、１０またはそれを超えるか、１５またはそれを超えるか、２０またはそれを超えるか、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２３、２５、１０～１５、５～１０、５～１５、５～２０、５～２５、８～１０、８～１５、８～２５、１０～２５、１５～２５、１０～１００、１０～１５０、１０～２００、または２００アミノ酸より長い長さを有する複数のペプチドを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
工程（ｃ）で使用したペプチドの前記ライブラリーが、１つを超える抗原のペプチド断片を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１４）
工程（ｃ）で使用したペプチドの前記ライブラリーが、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６つの抗原の断片を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１５）
工程（ｃ）が、前記ＡＰＣをペプチドの２またはそれを超えるライブラリーと接触させることを含み、ここで、ペプチドの各ライブラリーが異なる抗原の断片を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１６）
工程（ｃ）が、前記ＡＰＣを、ペプチドの１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６ライブラリーと接触させることを含む、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
工程（ｃ）のペプチドの前記単数または複数のライブラリーの少なくとも１つが、工程（ａ）のペプチドの前記単数または複数のライブラリーの少なくとも１つと同一である、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
工程（ｃ）のペプチドの前記単数または複数のライブラリーの少なくとも１つが、工程（ａ）のペプチドの前記単数または複数のライブラリーの少なくとも１つと異なる、項目１６に記載の方法。
（項目１９）
工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーが、腫瘍関連抗原、ウイルス腫瘍関連抗原、またはその両方のペプチド断片を含む、項目１１に記載の方法。
（項目２０）
工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーが、腫瘍関連抗原の断片を含むペプチドのライブラリー、ウイルス腫瘍関連抗原の断片を含むペプチドのライブラリー、またはその両方を含む、項目１６に記載の方法。
（項目２１）
工程（ａ）が、培地中で前記単球および／または未熟樹状細胞を第１の濃度のペプチドのライブラリーと接触させることを含み、工程（ｃ）が、培地中で前記ＡＰＣを第２の濃度のペプチドのライブラリーと接触させることを含み、ここで、前記第１の濃度が、前記第２の濃度と同一であるか、より高いか、またはより低い、項目１１に記載の方法。
（項目２２）
前記ペプチドが、ＰＲＡＭＥ、ＳＳＸ２、ＮＹ－ＥＳＯ－１、サバイビン、ＷＴ－１、およびＭＡＲＴからなる群から選択される１またはそれを超える腫瘍関連抗原の断片を含む、項目１に記載の方法。
（項目２３）
前記ＡＰＣを複数のＴ細胞と、前記Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な条件下で接触させ、それにより、前記ＡＰＣによって提示された抗原に特異的なプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を含むＴ細胞の集団が産生される、接触させる工程をさらに含む、項目１～１０のいずれか１項に記載の方法。
（項目２４）
工程（ａ）および／または工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーの少なくとも１つの存在下で、前記ＡＰＣを前記複数のＴ細胞と接触させる、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
Ｔ細胞の集団を、前記Ｔ細胞の増殖を誘導するのに適切な条件下にて１またはそれを超えるサイトカインおよび／または成長因子の存在下で培養する工程をさらに含む、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
Ｔ細胞の前記集団を、工程（ａ）および／または工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーの少なくとも１つの存在下で培養する、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
Ｔ細胞の前記集団を、前記Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な前記ＡＰＣの存在下で培養する工程をさらに含む、項目２５に記載の方法。
（項目２８）
前記ＡＰＣを前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞と接触させる工程を１回または複数回繰り返す、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を前記ＡＰＣと共培養する、項目２５に記載の方法。
（項目３０）
抗原特異的Ｔ細胞を調製する方法であって、
（ａ）複数の単球および／または未熟樹状細胞をペプチドのライブラリーと、前記単球および／または未熟樹状細胞が前記ペプチドの１つまたはそれより多くを内在化するのに適切な条件下の培地中で接触させる工程であって、ここで、ペプチドの前記ライブラリーが抗原のペプチド断片を含み、ここで、前記ペプチドが、前記単球および／または未熟樹状細胞によるタンパク質分解性プロセシングならびにクラスＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ Ｉ）および／またはクラスＩＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ ＩＩ）から選択される少なくとも１つの細胞表面タンパク質複合体上へのその後の負荷に適切である、接触させる工程；
（ｂ）前記単球および／または未熟樹状細胞を、１またはそれを超えるサイトカインおよび／または成長因子の存在下で、前記単球の分化および／または前記未熟樹状細胞の成熟抗原提示樹状細胞への成熟を誘導し、それにより、ＡＰＣを調製するのに適切な条件下にて培養する工程；
（ｃ）複数のＴ細胞を前記ＡＰＣと、Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な条件下で接触させ、それにより、前記ＡＰＣによって提示された抗原に特異的なプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を含むＴ細胞の集団が調製される、接触させる工程；
（ｄ）工程（ｃ）で調製されたＴ細胞の前記集団をＡＰＣと、前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を刺激するための条件下で接触させる工程；および
（ｅ）必要に応じて、工程（ｄ）を１回または複数回繰り返す工程
を含む、方法。
（項目３１）
工程（ｃ）が、前記複数のＴ細胞を前記ＡＰＣとペプチドのライブラリーの存在下で培養することを含む、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーが工程（ａ）のペプチドの前記ライブラリーと同一である、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーが工程（ａ）のペプチドの前記ライブラリーと異なる、項目３１に記載の方法。
（項目３４）
工程（ｄ）が、Ｔ細胞の前記集団を前記ＡＰＣとペプチドのライブラリーの存在下で培養することを含む、項目３０に記載の方法。
（項目３５）
工程（ｄ）のペプチドの前記ライブラリーが、工程（ａ）のペプチドの前記ライブラリーと同一である、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
工程（ｄ）のペプチドの前記ライブラリーが、工程（ａ）で使用したペプチドの前記ライブラリーと異なる、項目３４に記載の方法。
（項目３７）
項目１～２２のいずれか１項に記載の方法に従って調製されたＡＰＣの集団を含む組成物であって、前記ＡＰＣが、プロセシングされたペプチドが負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体を含み、ここで、好ましくは、前記プロセシングされたペプチドが、前記ＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体上の提示前に、例えばｉＤＣによってｉｎ ｖｉｖｏで短縮されている、組成物。
（項目３８）
前記プロセシングされたペプチドが、ペプチドの前記ライブラリー中のペプチドより長さが短く、好ましくは、８アミノ酸長未満、１０アミノ酸長未満、１２アミノ酸長未満、１５アミノ酸長未満、５アミノ酸長と１５アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１０アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１２アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１４アミノ酸長との間、または８アミノ酸長と１５アミノ酸長との間である、項目３７に記載の組成物。
（項目３９）
ペプチドの前記ライブラリー（例えば、ＴＡＡ）由来のペプチドで負荷された複数のｍＤＣをさらに含む、項目３７に記載の組成物。
（項目４０）
項目１～２２のいずれか１項に記載の方法にしたがって調製したＡＰＣの集団を含む組成物であって、ＡＰＣの前記集団が、プロセシングされたペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体、ならびにペプチドの前記ライブラリー由来のペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体を含み、ここで、好ましくは、前記組成物が、ＴＡＡで負荷された複数のｍＤＣをさらに含む、組成物。
（項目４１）
項目２３～３６のいずれか１項に記載の方法に従って調製されたプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞の集団を含む組成物であって、前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞が、プロセシングされたペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体を含む、組成物。
（項目４２）
項目２３～３６のいずれか１項に記載の方法に従って調製されたプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞の集団を含む組成物であって、前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞が、プロセシングされたペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体、ならびにペプチドの前記ライブラリー由来のペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体を含む、組成物。
（項目４３）
プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞の前記集団が、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、および／または細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）を含む、項目４１または４２に記載の組成物。
（項目４４）
項目４１または４２に記載の組成物および薬学的に許容され得る担体または賦形剤を含む治療組成物。
（項目４５）
項目４４に記載の治療組成物をそれ必要とする患者に投与することを含む、がんを処置する方法。
（項目４６）
組成物であって、
少なくとも２つの異なる長さを有する第１の複数のペプチドを提示するＡＰＣの第１の集団であって、ここで、好ましくは、前記第１の複数のペプチドが、ＡＰＣの前記第１の集団における提示前に、例えばｉＤＣによってｉｎ ｖｉｖｏで短縮されている、ＡＰＣの第１の集団；および
均一の長さを有する第２の複数のペプチドを提示するＡＰＣの第２の集団
を含む、組成物。
（項目４７）
ＡＰＣの前記第１の集団およびＡＰＣの前記第２の集団が約１：１の比で存在する、項目４７に記載の組成物。
（項目４８）
単球由来ＡＰＣの拡大された集団を含む組成物であって、ここで、各ＡＰＣが同一抗原由来のペプチドで負荷された少なくとも１つのＭＨＣ複合体を含み、ここで、集団として、前記ＡＰＣが、前記抗原由来の複数のペプチドで負荷された複数のＭＨＣ複合体を含み、前記複数のペプチドが異なる長さである、組成物。
（項目４９）
前記複数のペプチドの各々が、５またはそれを超えるアミノ酸、６またはそれを超えるアミノ酸、７またはそれを超えるアミノ酸、８またはそれを超えるアミノ酸、１０またはそれを超えるアミノ酸、１５またはそれを超えるアミノ酸、２０またはそれを超えるアミノ酸、５アミノ酸と１０アミノ酸との間、５アミノ酸と１５アミノ酸との間、５アミノ酸と２０アミノ酸との間、６アミノ酸と１０アミノ酸との間、または６アミノ酸と２０アミノ酸との間の長さを有する、項目４８に記載の組成物。
（項目５０）
集団として、前記ＡＰＣが、第２の抗原由来の複数のペプチドで負荷された第２の複数のＭＨＣ複合体をさらに含み、前記第２の複数のペプチドが同一の長さを有する、項目４８または４９に記載の組成物。
（項目５１）
前記第１の抗原および前記第２の抗原が同一の抗原である、項目５０に記載の組成物。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
抗原提示細胞（ＡＰＣ）を調製する方法であって、
（ａ）複数の単球および／または未熟樹状細胞をペプチドのライブラリーと、前記単球および／または未熟樹状細胞がペプチドの前記ライブラリーの１つまたはそれより多くを内在化するのに適切な条件下の培地中で接触させる工程であって、ここで、ペプチドの前記ライブラリーが抗原のペプチド断片を含み、ここで、前記ペプチドが、前記単球および／または未熟樹状細胞によるタンパク質分解性プロセシングならびにクラスＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ Ｉ）および／またはクラスＩＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ ＩＩ）から選択される少なくとも１つの細胞表面タンパク質複合体上へのその後の負荷に適切である、接触させる工程；および
（ｂ）前記単球および／または未熟樹状細胞を、１またはそれを超えるサイトカインおよび／または成長因子の存在下で、前記単球の分化および／または前記未熟樹状細胞の成熟抗原提示樹状細胞への成熟を誘導し、それにより、ＡＰＣを調製するのに適切な条件下にて培養する工程
を含む、方法。
（項目２）
前記ライブラリーが、５またはそれを超えるか、８またはそれを超えるか、１０またはそれを超えるか、１５またはそれを超えるか、２０またはそれを超えるか、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、１０～１５、５～１０、５～１５、５～２０、８～１０、８～１５、８～２０、１０～２０、１５～２０、１０～１００、１０～１５０、１０～２００、または２００アミノ酸より長い長さを有する複数のペプチドを含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
ペプチドの前記ライブラリーが、１つを超える抗原の断片を含む、項目１に記載の方法。
（項目４）
ペプチドの前記ライブラリーが、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６つの抗原の断片を含む、項目１に記載の方法。
（項目５）
工程（ａ）が、前記単球および／または未熟樹状細胞を、ペプチドの２またはそれを超えるライブラリーと接触させることを含み、ここで、ペプチドの各ライブラリーが異なる抗原の断片を含む、項目１に記載の方法。
（項目６）
工程（ａ）が、前記単球および／または未熟樹状細胞を、ペプチドの１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６ライブラリーと接触させることを含む、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記抗原が腫瘍関連抗原である、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記抗原がウイルス腫瘍関連抗原である、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記抗原が、腫瘍関連抗原、ウイルス腫瘍関連抗原、またはその両方である、項目４に記載の方法。
（項目１０）
ペプチドの前記ライブラリーが、腫瘍関連抗原由来のペプチドのライブラリー、ウイルス腫瘍関連抗原由来のペプチドのライブラリー、またはその両方を含む、項目６に記載の方法。
（項目１１）
（ｃ）前記ＡＰＣがＭＨＣ ＩおよびＭＨＣ ＩＩから選択される少なくとも１つの細胞表面タンパク質複合体上に前記ペプチドを負荷するのに適切な条件下の培地中で、前記ＡＰＣをペプチドのライブラリーと接触させる工程であって、ここで、ペプチドの前記ライブラリーが抗原のペプチド断片を含む、接触させる工程、および
（ｄ）必要に応じて、工程（ｃ）を１回または複数回繰り返す工程
をさらに含む、前記項目のいずれかに記載の方法。
（項目１２）
工程（ｃ）で使用したペプチドの前記ライブラリーが、５またはそれを超えるか、８またはそれを超えるか、１０またはそれを超えるか、１５またはそれを超えるか、２０またはそれを超えるか、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２３、２５、１０～１５、５～１０、５～１５、５～２０、５～２５、８～１０、８～１５、８～２５、１０～２５、１５～２５、１０～１００、１０～１５０、１０～２００、または２００アミノ酸より長い長さを有する複数のペプチドを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
工程（ｃ）で使用したペプチドの前記ライブラリーが、１つを超える抗原のペプチド断片を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１４）
工程（ｃ）で使用したペプチドの前記ライブラリーが、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６つの抗原の断片を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１５）
工程（ｃ）が、前記ＡＰＣをペプチドの２またはそれを超えるライブラリーと接触させることを含み、ここで、ペプチドの各ライブラリーが異なる抗原の断片を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１６）
工程（ｃ）が、前記ＡＰＣを、ペプチドの１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６ライブラリーと接触させることを含む、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
工程（ｃ）のペプチドの前記単数または複数のライブラリーの少なくとも１つが、工程（ａ）のペプチドの前記単数または複数のライブラリーの少なくとも１つと同一である、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
工程（ｃ）のペプチドの前記単数または複数のライブラリーの少なくとも１つが、工程（ａ）のペプチドの前記単数または複数のライブラリーの少なくとも１つと異なる、項目１６に記載の方法。
（項目１９）
工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーが、腫瘍関連抗原、ウイルス腫瘍関連抗原、またはその両方のペプチド断片を含む、項目１１に記載の方法。
（項目２０）
工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーが、腫瘍関連抗原の断片を含むペプチドのライブラリー、ウイルス腫瘍関連抗原の断片を含むペプチドのライブラリー、またはその両方を含む、項目１６に記載の方法。
（項目２１）
工程（ａ）が、培地中で前記単球および／または未熟樹状細胞を第１の濃度のペプチドのライブラリーと接触させることを含み、工程（ｃ）が、培地中で前記ＡＰＣを第２の濃度のペプチドのライブラリーと接触させることを含み、ここで、前記第１の濃度が、前記第２の濃度と同一であるか、より高いか、またはより低い、項目１１に記載の方法。
（項目２２）
前記ペプチドが、ＰＲＡＭＥ、ＳＳＸ２、ＮＹ－ＥＳＯ－１、サバイビン、ＷＴ－１、およびＭＡＲＴからなる群から選択される１またはそれを超える腫瘍関連抗原の断片を含む、項目１に記載の方法。
（項目２３）
前記ＡＰＣを複数のＴ細胞と、前記Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な条件下で接触させ、それにより、前記ＡＰＣによって提示された抗原に特異的なプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を含むＴ細胞の集団が産生される、接触させる工程をさらに含む、項目１～１０のいずれか１項に記載の方法。
（項目２４）
工程（ａ）および／または工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーの少なくとも１つの存在下で、前記ＡＰＣを前記複数のＴ細胞と接触させる、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
Ｔ細胞の集団を、前記Ｔ細胞の増殖を誘導するのに適切な条件下にて１またはそれを超えるサイトカインおよび／または成長因子の存在下で培養する工程をさらに含む、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
Ｔ細胞の前記集団を、工程（ａ）および／または工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーの少なくとも１つの存在下で培養する、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
Ｔ細胞の前記集団を、前記Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な前記ＡＰＣの存在下で培養する工程をさらに含む、項目２５に記載の方法。
（項目２８）
前記ＡＰＣを前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞と接触させる工程を１回または複数回繰り返す、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を前記ＡＰＣと共培養する、項目２５に記載の方法。
（項目３０）
抗原特異的Ｔ細胞を調製する方法であって、
（ａ）複数の単球および／または未熟樹状細胞をペプチドのライブラリーと、前記単球および／または未熟樹状細胞が前記ペプチドの１つまたはそれより多くを内在化するのに適切な条件下の培地中で接触させる工程であって、ここで、ペプチドの前記ライブラリーが抗原のペプチド断片を含み、ここで、前記ペプチドが、前記単球および／または未熟樹状細胞によるタンパク質分解性プロセシングならびにクラスＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ Ｉ）および／またはクラスＩＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ ＩＩ）から選択される少なくとも１つの細胞表面タンパク質複合体上へのその後の負荷に適切である、接触させる工程；
（ｂ）前記単球および／または未熟樹状細胞を、１またはそれを超えるサイトカインおよび／または成長因子の存在下で、前記単球の分化および／または前記未熟樹状細胞の成熟抗原提示樹状細胞への成熟を誘導し、それにより、ＡＰＣを調製するのに適切な条件下にて培養する工程；
（ｃ）複数のＴ細胞を前記ＡＰＣと、Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な条件下で接触させ、それにより、前記ＡＰＣによって提示された抗原に特異的なプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を含むＴ細胞の集団が調製される、接触させる工程；
（ｄ）工程（ｃ）で調製されたＴ細胞の前記集団をＡＰＣと、前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を刺激するための条件下で接触させる工程；および
（ｅ）必要に応じて、工程（ｄ）を１回または複数回繰り返す工程
を含む、方法。
（項目３１）
工程（ｃ）が、前記複数のＴ細胞を前記ＡＰＣとペプチドのライブラリーの存在下で培養することを含む、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーが工程（ａ）のペプチドの前記ライブラリーと同一である、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
工程（ｃ）のペプチドの前記ライブラリーが工程（ａ）のペプチドの前記ライブラリーと異なる、項目３１に記載の方法。
（項目３４）
工程（ｄ）が、Ｔ細胞の前記集団を前記ＡＰＣとペプチドのライブラリーの存在下で培養することを含む、項目３０に記載の方法。
（項目３５）
工程（ｄ）のペプチドの前記ライブラリーが、工程（ａ）のペプチドの前記ライブラリーと同一である、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
工程（ｄ）のペプチドの前記ライブラリーが、工程（ａ）で使用したペプチドの前記ライブラリーと異なる、項目３４に記載の方法。
（項目３７）
項目１～２２のいずれか１項に記載の方法に従って調製されたＡＰＣの集団を含む組成物であって、前記ＡＰＣが、プロセシングされたペプチドが負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体を含み、ここで、好ましくは、前記プロセシングされたペプチドが、前記ＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体上の提示前に、例えばｉＤＣによってｉｎ ｖｉｖｏで短縮されている、組成物。
（項目３８）
前記プロセシングされたペプチドが、ペプチドの前記ライブラリー中のペプチドより長さが短く、好ましくは、８アミノ酸長未満、１０アミノ酸長未満、１２アミノ酸長未満、１５アミノ酸長未満、５アミノ酸長と１５アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１０アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１２アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１４アミノ酸長との間、または８アミノ酸長と１５アミノ酸長との間である、項目３７に記載の組成物。
（項目３９）
ペプチドの前記ライブラリー（例えば、ＴＡＡ）由来のペプチドで負荷された複数のｍＤＣをさらに含む、項目３７に記載の組成物。
（項目４０）
項目１～２２のいずれか１項に記載の方法にしたがって調製したＡＰＣの集団を含む組成物であって、ＡＰＣの前記集団が、プロセシングされたペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体、ならびにペプチドの前記ライブラリー由来のペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体を含み、ここで、好ましくは、前記組成物が、ＴＡＡで負荷された複数のｍＤＣをさらに含む、組成物。
（項目４１）
項目２３～３６のいずれか１項に記載の方法に従って調製されたプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞の集団を含む組成物であって、前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞が、プロセシングされたペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体を含む、組成物。
（項目４２）
項目２３～３６のいずれか１項に記載の方法に従って調製されたプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞の集団を含む組成物であって、前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞が、プロセシングされたペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体、ならびにペプチドの前記ライブラリー由来のペプチドで負荷された複数のＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩ複合体を含む、組成物。
（項目４３）
プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞の前記集団が、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、および／または細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）を含む、項目４１または４２に記載の組成物。
（項目４４）
項目４１または４２に記載の組成物および薬学的に許容され得る担体または賦形剤を含む治療組成物。
（項目４５）
項目４４に記載の治療組成物をそれ必要とする患者に投与することを含む、がんを処置する方法。
（項目４６）
組成物であって、
少なくとも２つの異なる長さを有する第１の複数のペプチドを提示するＡＰＣの第１の集団であって、ここで、好ましくは、前記第１の複数のペプチドが、ＡＰＣの前記第１の集団における提示前に、例えばｉＤＣによってｉｎ ｖｉｖｏで短縮されている、ＡＰＣの第１の集団；および
均一の長さを有する第２の複数のペプチドを提示するＡＰＣの第２の集団
を含む、組成物。
（項目４７）
ＡＰＣの前記第１の集団およびＡＰＣの前記第２の集団が約１：１の比で存在する、項目４７に記載の組成物。
（項目４８）
単球由来ＡＰＣの拡大された集団を含む組成物であって、ここで、各ＡＰＣが同一抗原由来のペプチドで負荷された少なくとも１つのＭＨＣ複合体を含み、ここで、集団として、前記ＡＰＣが、前記抗原由来の複数のペプチドで負荷された複数のＭＨＣ複合体を含み、前記複数のペプチドが異なる長さである、組成物。
（項目４９）
前記複数のペプチドの各々が、５またはそれを超えるアミノ酸、６またはそれを超えるアミノ酸、７またはそれを超えるアミノ酸、８またはそれを超えるアミノ酸、１０またはそれを超えるアミノ酸、１５またはそれを超えるアミノ酸、２０またはそれを超えるアミノ酸、５アミノ酸と１０アミノ酸との間、５アミノ酸と１５アミノ酸との間、５アミノ酸と２０アミノ酸との間、６アミノ酸と１０アミノ酸との間、または６アミノ酸と２０アミノ酸との間の長さを有する、項目４８に記載の組成物。
（項目５０）
集団として、前記ＡＰＣが、第２の抗原由来の複数のペプチドで負荷された第２の複数のＭＨＣ複合体をさらに含み、前記第２の複数のペプチドが同一の長さを有する、項目４８または４９に記載の組成物。
（項目５１）
前記第１の抗原および前記第２の抗原が同一の抗原である、項目５０に記載の組成物。
Claims (26)
- 抗原提示細胞（ＡＰＣ）を調製するｉｎ ｖｉｔｒｏの方法であって、
（ａ）複数の単球および／または未熟樹状細胞をペプチドのライブラリーと、前記単球および／または未熟樹状細胞が前記ペプチドの１つまたはそれより多くを内在化するのに適切な条件下の培地中で接触させる工程であって、ここで、ペプチドの前記ライブラリーが抗原のペプチド断片を含み、ここで、前記ペプチドが、前記単球および／または未熟樹状細胞によるタンパク質分解性プロセシングならびに１またはそれを超えるクラスＩおよび／またはクラスＩＩ主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ）上へのその後の負荷に適切である、接触させる工程；および
（ｂ）前記単球および／または未熟樹状細胞を、１またはそれを超えるサイトカインおよび／または成長因子の存在下で、前記単球の分化および／または前記未熟樹状細胞の成熟抗原提示樹状細胞への成熟を誘導し、それにより、ＡＰＣを調製するのに適切な条件下にて培養する工程
を含む、ｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。 - ペプチドの前記ライブラリーが、５またはそれを超えるか、８またはそれを超えるか、１０またはそれを超えるか、１５またはそれを超えるか、２０またはそれを超えるか、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、１０～１５、５～１０、５～１５、５～２０、８～１０、８～１５、８～２０、１０～２０、１５～２０、１０～１００、１０～１５０、１０～２００、または２００アミノ酸より長い長さを有する複数のペプチドを含む、請求項１に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- 工程（ａ）が、前記単球および／または未熟樹状細胞を、ペプチドの２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６のライブラリーと接触させることを含み、ここで、ペプチドの各ライブラリーが異なる抗原のペプチド断片を含む、請求項１または２に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- ペプチドの１つまたは複数の前記ライブラリーが、腫瘍関連抗原由来のペプチドのライブラリー、ウイルス腫瘍関連抗原由来のペプチドのライブラリー、またはその両方を含む、請求項１～３のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- （ｃ）前記ＡＰＣが１またはそれを超えるクラスＩおよび／またはクラスＩＩ ＭＨＣ上に前記ペプチドを負荷するのに適切な条件下の培地中で、前記ＡＰＣをペプチドのライブラリーと接触させる工程であって、ここで、ペプチドの前記ライブラリーが抗原のペプチド断片を含む、接触させる工程、および
（ｄ）必要に応じて、工程（ｃ）を１回または複数回繰り返す工程
をさらに含む、請求項１～４のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。 - 工程（ｃ）で使用したペプチドの前記ライブラリーが、５またはそれを超えるか、８またはそれを超えるか、１０またはそれを超えるか、１５またはそれを超えるか、２０またはそれを超えるか、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２３、２５、１０～１５、５～１０、５～１５、５～２０、５～２５、８～１０、８～１５、８～２５、１０～２５、１５～２５、１０～１００、１０～１５０、１０～２００、または２００アミノ酸より長い長さを有する複数のペプチドを含む、請求項５に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- 工程（ｃ）が、前記ＡＰＣをペプチドの２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２～５、２～１０、３～１０、４～１０、５～１０、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、または少なくとも６のライブラリーと接触させることを含み、ここで、ペプチドの各ライブラリーが異なる抗原のペプチド断片を含む、請求項５または６に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- 工程（ｃ）のペプチドの複数の前記ライブラリーの少なくとも１つが、工程（ａ）のペプチドの複数の前記ライブラリーの少なくとも１つと同一である；あるいは
工程（ｃ）のペプチドの複数の前記ライブラリーの少なくとも１つが、工程（ａ）のペプチドの複数の前記ライブラリーの少なくとも１つと異なる、請求項５～７のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。 - 工程（ｃ）のペプチドの複数の前記ライブラリーが、腫瘍関連抗原のペプチド断片を含むペプチドのライブラリー、ウイルス腫瘍関連抗原のペプチド断片を含むペプチドのライブラリー、またはその両方を含む、請求項７または８に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- 工程（ａ）において使用される前記培地中の前記ペプチドの濃度が、工程（ｃ）において使用される前記培地中の前記ペプチドの濃度と同一であるか、より高いか、またはより低い、請求項５～９のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- 工程（ａ）において使用される前記ペプチドが、ＰＲＡＭＥ、ＳＳＸ２、ＮＹ－ＥＳＯ－１、サバイビン、ＷＴ－１、およびＭＡＲＴからなる群から選択される１またはそれを超える腫瘍関連抗原のペプチド断片を含む、請求項１～１０のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- 抗原特異的Ｔ細胞を調製するｉｎ ｖｉｔｒｏの方法であって、前記ｉｎ ｖｉｔｒｏの方法は、
（ｉ）請求項１～１１のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法を使用してＡＰＣを調製する工程；
（ｉｉ）前記ＡＰＣを複数のＴ細胞と、前記Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な条件下で接触させ、それにより、前記ＡＰＣによって提示された抗原に特異的なプライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞を含むＴ細胞の集団が産生される、接触させる工程
を含む、ｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。 - 工程（ａ）および／または工程（ｃ）のペプチドの複数の前記ライブラリーの少なくとも１つの存在下で、前記ＡＰＣを前記複数のＴ細胞と接触させる、請求項１２に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- Ｔ細胞の前記集団を、
（ａ）前記Ｔ細胞の増殖を誘導するのに適切な条件下にて１またはそれを超えるサイトカインおよび／または成長因子；
（ｂ）工程（ａ）および／または工程（ｃ）のペプチドの複数の前記ライブラリーの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｃ）前記Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な条件下の前記ＡＰＣ
の存在下で培養する工程をさらに含む、請求項１２または１３に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。 - 工程（ｉｉ）が、前記ＡＰＣを、前記Ｔ細胞の抗原プライミングおよび／または抗原特異的活性化に適切な条件下で前記プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞と１回または複数回接触させる工程をさらに含む、請求項１２～１４のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
- 請求項１～１１のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法に従って調製されたかまたか得ることができるＡＰＣの集団を含む組成物。
- 前記ライブラリー中の複数の前記ペプチドが、１またはそれを超えるクラスＩおよび／またはクラスＩＩ ＭＨＣ上の提示前に工程（ａ）の間に前記細胞によって短縮されており、それにより、前記クラスＩおよび／またはクラスＩＩ ＭＨＣ上で提示されたプロセシングされたペプチドが産生され、必要に応じて、ペプチドの前記ライブラリー中の前記ペプチドよりも短い前記プロセシングされたペプチドが、８アミノ酸長未満、１０アミノ酸長未満、１２アミノ酸長未満、１５アミノ酸長未満、５アミノ酸長と１５アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１０アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１２アミノ酸長との間、８アミノ酸長と１４アミノ酸長との間、または８アミノ酸長と１５アミノ酸長との間である、請求項１６に記載の組成物。
- ＡＰＣの前記集団が、ペプチドの１つまたは複数の前記ライブラリー由来の１またはそれを超えるペプチドで負荷された複数のクラスＩおよび／またはクラスＩＩ ＨＭＣをさらに含む、請求項１６または１７に記載の組成物。
- ペプチドの前記ライブラリー由来の１またはそれを超えるペプチドで負荷された複数の成熟樹状細胞をさらに含む、請求項１６～１８のいずれか１項に記載の組成物。
- 請求項１２～１５のいずれか１項に記載のｉｎ ｖｉｔｒｏの方法に従って調製されたかまたは得ることができる、プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞の集団を含む組成物。
- プライミングされたおよび／または活性化されたＴ細胞の前記集団が、ＣＤ４ ＋ Ｔ細胞、ＣＤ８ ＋ Ｔ細胞、および／または細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）を含む、請求項２０に記載の組成物。
- 請求項２０または２１に記載の組成物および薬学的に許容され得る担体または賦形剤を含む治療組成物。
- がんを処置する方法における使用のための請求項２２に記載の治療組成物であって、前記方法は、前記治療組成物をそれを必要とする患者に投与することを含む、治療組成物。
- 組成物であって、
少なくとも２つの異なる長さを有する第１の複数のペプチドを提示するＡＰＣの第１の集団；および
均一の長さを有する第２の複数のペプチドを提示するＡＰＣの第２の集団
を含み、
必要に応じて、前記第１の複数のペプチドが、８アミノ酸長未満、１０アミノ酸長未満、１２アミノ酸長未満、または１５アミノ酸長未満であり；
さらに必要に応じて、ＡＰＣの前記第１の集団およびＡＰＣの前記第２の集団が約１：１の比で存在する、組成物。 - 単球由来ＡＰＣの拡大された集団を含むｅｘ ｖｉｖｏ組成物であって、ここで、各ＡＰＣが同一抗原由来のペプチドで負荷された少なくとも１つのＭＨＣを含み、ここで、集団として、前記ＡＰＣが、前記抗原由来の複数のペプチドで負荷された複数のＭＨＣを含み、前記複数のペプチドが異なる長さであり、必要に応じて、前記複数のペプチドの各々が、５またはそれを超えるアミノ酸、６またはそれを超えるアミノ酸、７またはそれを超えるアミノ酸、８またはそれを超えるアミノ酸、１０またはそれを超えるアミノ酸、１５またはそれを超えるアミノ酸、２０またはそれを超えるアミノ酸、５アミノ酸と１０アミノ酸との間、５アミノ酸と１５アミノ酸との間、５アミノ酸と２０アミノ酸との間、６アミノ酸と１０アミノ酸との間、または６アミノ酸と２０アミノ酸との間の長さを有する、ｅｘ ｖｉｖｏ組成物。
- 集団として、前記ＡＰＣが、第２の抗原由来の第２の複数のペプチドで負荷された第２の複数のＭＨＣをさらに含み、前記第２の複数のペプチドが同一の長さを有し、必要に応じて、前記第１の抗原および前記第２の抗原が同一の抗原である、請求項２５に記載のｅｘ ｖｉｖｏ組成物。
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