JPWO2019079781A5 - - Google Patents

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本開示の他の態様は、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドを提供し、当該オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含む。当該センス鎖はGACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号8)に規定される配列を含み、当該アンチセンス鎖はUUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号5.1)に規定される配列を含み、アンチセンス鎖及びセンス鎖はそれぞれ、1つ以上の2’‐フルオロ及び2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含み、当該アンチセンス鎖の5’ヌクレオチドの糖の4’‐炭素はホスフェート類似体を含み、当該センス鎖は1つ以上のN‐アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされる。 Other aspects of the present disclosure provide oligonucleotides for reducing expression of hepatitis B virus surface antigen (HBsAg) mRNA, the oligonucleotides comprising a sense strand forming a duplex region with an antisense strand. The sense strand comprises the sequence set forth in GACAAAAUCCUCCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC (SEQ ID NO: 8), the antisense strand comprises the sequence set forth in UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG (SEQ ID NO: 5.1), and the antisense and sense strands each comprise one or more 2'-fluoro and 2'-O-methyl modified nucleotides and at least one phosphorothioate linkage. wherein the 4'-carbon of the 5' nucleotide sugar of the antisense strand contains a phosphate analogue, and the sense strand is conjugated to one or more N-acetylgalactosamine (GalNAc) moieties.

本明細書では、B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)mRNAの発現を低下させるためのオリゴヌクレオチドが更に提供される。当該オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、当該オリゴヌクレオチド中で:当該センス鎖はGACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号8)に規定される配列を含み、3、8~10、12、13及び17位にある2’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26、及び31~36位にある2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、当該センス鎖は、1つ以上のN‐アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされる;当該アンチセンス鎖はUUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号5.1)に規定される配列を含み、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位にある2’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位にあるO‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも3つのホスホロチオエートヌクレオチド間での結合を含み、当該アンチセンス鎖における5’‐ヌクレオチドの糖の4’‐炭素はホスフェート類似体を含み、当該センス鎖は、1位と2位のヌクレオチド間にホスホロチオエート結合を含む。 Further provided herein are oligonucleotides for reducing expression of hepatitis B virus surface antigen (HBsAg) mRNA.当該オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、当該オリゴヌクレオチド中で:当該センス鎖はGACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号8)に規定される配列を含み、3、8~10、12、13及び17位にある2'‐フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26、及び31~36位にある2'‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、当該センス鎖は、1つ以上のN‐アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされる;当該アンチセンス鎖はUUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号5.1)に規定される配列を含み、2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位にある2'‐フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位にあるO‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも3つのホスホロチオエートヌクレオチド間での結合を含み、当該アンチセンス鎖における5'‐ヌクレオチドの糖の4'‐炭素はホスフェート類似体を含み、当該センス鎖は、1位と2位のヌクレオチド間にホスホロチオエート結合を含む。

いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは2’‐修飾を含む。いくつかの実施形態では、2’修飾は:2’‐アミノエチル、2’‐フルオロ、2’‐O‐メチル、2’‐O‐メトキシエチル、及び2’‐デオキシ‐2’‐フルオロ‐β‐d‐アラビノ核酸:から選択される修飾である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの全ヌクレオチドは修飾ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、当該少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合はホスホロチオエート結合である。アンチセンス鎖における5’‐ヌクレオチドの糖の4’‐炭素はホスフェート類似体を含む。 In some embodiments the oligonucleotide comprises at least one modified nucleotide. In some embodiments, modified nucleotides include 2'-modifications. In some embodiments, the 2' modification is a modification selected from: 2'-aminoethyl, 2'-fluoro, 2'-O-methyl, 2'-O-methoxyethyl, and 2'-deoxy-2'-fluoro-β-d-arabinonucleic acid. In some embodiments, all nucleotides of the oligonucleotide are modified nucleotides. In some embodiments the oligonucleotide comprises at least one modified internucleotide linkage. In some embodiments, the at least one modified internucleotide linkage is a phosphorothioate linkage. The 4'-carbon of the 5'-nucleotide sugar in the antisense strand contains a phosphate analogue.

デオキシリボヌクレオチド:本明細書で使用しているように、用語「デオキシリボヌクレオチド」は、リボヌクレオチドと比較して、そのペントース糖の2’位でヒドロキシルの代わりに水素を有するヌクレオチドを指す。修飾デオキシリボヌクレオチドは、糖、ホスフェート基もしくは塩基中での修飾もしくは置換、又は糖、ホスフェート基もしくは塩基の修飾もしくは置換を含む、2’位置以外の原子の1つ以上の修飾又は置換を有するデオキシリボヌクレオチドである。 Deoxyribonucleotide: As used herein, the term "deoxyribonucleotide" refers to a nucleotide that has a hydrogen in place of a hydroxyl at the 2' position of its pentose sugar as compared to a ribonucleotide. Modified deoxyribonucleotides are deoxyribonucleotides that have one or more modifications or substitutions of atoms other than the 2' position, including modifications or substitutions in the sugar, phosphate group or base, or modifications or substitutions of the sugar, phosphate group or base.

肝細胞:本明細書で使用しているように、用語「肝細胞(単数又は複数)」は、肝臓の実質組織の細胞を指す。これらの細胞は、肝臓の質量のおよそ70~85%を占め、血清アルブミン、フィブリノーゲン、及び凝固因子のプロトロンビン群(因子3及び4を除く)を産生する。肝細胞系譜細胞のマーカーには、トランスチレチン(Ttr)、グルタミン合成酵素(Glul)、肝細胞核因子1a(Hnf1a)、及び肝細胞核因子4a(Hnf4a)が挙げられるが、これらに限定されるものではない。成熟肝細胞のマーカーには、チトクロームP450(Cyp3a11)、フマリルアセト酢酸ヒドラーゼ(Fah)、グルコース6‐ホスフェート(G6p)、アルブミン(Alb)、及びOC2‐2F8が挙げられるが、これらに限定されるものではない。例えば、Huchら、(2013年)、Nature、494(7436):247~250を参照されたい。肝細胞マーカーに関するその内容は、参照により本明細書に援用される。 Hepatocyte: As used herein, the term “hepatocyte(s)” refers to cells of the parenchyma of the liver. These cells make up approximately 70-85% of the mass of the liver and produce serum albumin, fibrinogen, and the prothrombin group of clotting factors (except factors 3 and 4). Markers of hepatocyte lineage cells include, but are not limited to, transthyretin (Ttr), glutamine synthase (Glul), hepatocyte nuclear factor 1a (Hnf1a), and hepatocyte nuclear factor 4a (Hnf4a). Markers of mature hepatocytes include, but are not limited to, cytochrome P450 (Cyp3a11), fumarylacetoacetate hydrolase (Fah), glucose 6- phosphate (G6p), albumin (Alb), and OC2-2F8. See, eg, Huch et al. (2013) Nature 494(7436):247-250. Its content regarding hepatocyte markers is incorporated herein by reference.

ループ:本明細書で使用しているように、用語「ループ」は、互いに十分に相補的である核酸の2つの逆平行領域により両側が挟まれた核酸(例えば、オリゴヌクレオチド)の不対領域を指し、これにより適切なハイブリダイゼーション条件下で(例えば、ホスフェート緩衝液中、細胞中)、不対領域の両側を挟む2つの逆平行領域がハイブリダイズし、二重鎖(「ステム」と称する)を形成する。 Loop: As used herein, the term "loop" refers to an unpaired region of a nucleic acid (e.g., an oligonucleotide) flanked by two antiparallel regions of nucleic acid that are sufficiently complementary to each other such that under appropriate hybridization conditions (e.g., in a phosphate buffer, in cells), the two antiparallel regions flanking the unpaired region hybridize to form a duplex (referred to as a "stem").

修飾ヌクレオチド:本明細書で使用しているように、用語「修飾ヌクレオチド」は、アデニンリボヌクレオチド、グアニンリボヌクレオチド、シトシンリボヌクレオチド、ウラシルリボヌクレオチド、アデニンデオキシリボヌクレオチド、グアニンデオキシリボヌクレオチド、シトシンデオキシリボヌクレオチド及びチミジンデオキシリボヌクレオチドから選択される、対応の参照ヌクレオチドと比較して1つ以上の化学修飾を有するヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、天然には存在しないヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドはその糖、核酸塩基及び/又はホスフェート基中の1つ以上の化学修飾を有する。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは対応する参照ヌクレオチドにコンジュゲートされた1つ以上の化学部分を有する。典型的には、修飾ヌクレオチドは、修飾ヌクレオチドが存在する核酸に1つ以上の望ましい特性を与える。例えば、修飾ヌクレオチドは、熱安定性、分解耐性、ヌクレアーゼ耐性、溶解性、生物学的利用能、生物活性、免疫原性低下等を改善し得る。 Modified nucleotide: As used herein, the term "modified nucleotide" refers to a nucleotide having one or more chemical modifications compared to the corresponding reference nucleotide selected from adenine ribonucleotides, guanine ribonucleotides, cytosine ribonucleotides, uracil ribonucleotides, adenine deoxyribonucleotides, guanine deoxyribonucleotides, cytosine deoxyribonucleotides and thymidine deoxyribonucleotides. In some embodiments, modified nucleotides are non-naturally occurring nucleotides. In some embodiments, a modified nucleotide has one or more chemical modifications in its sugar, nucleobase and/or phosphate groups. In some embodiments, a modified nucleotide has one or more chemical moieties conjugated to the corresponding reference nucleotide. Typically, modified nucleotides impart one or more desirable properties to the nucleic acid in which they are present. For example, modified nucleotides can improve thermostability, degradation resistance, nuclease resistance, solubility, bioavailability, bioactivity, reduced immunogenicity, and the like.

ホスフェート類似体:本明細書で使用しているように、用語「ホスフェート類似体」は、ホスフェート基の静電特性及び/又は立体特性を模倣する化学部分を指す。いくつかの実施形態では、ホスフェート類似体は、酵素的除去を受けることが多い5’‐ホスフェートの代わりにオリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオチドに位置する。いくつかの実施形態では、5’ホスフェート類似体は、ホスファターゼ耐性結合を含む。ホスフェート類似体の例には、5’メチレンホスホネート(5’‐MP)及び5’‐(E)‐ビニルホスホネート(5’‐VP)などの5’ホスホン酸が挙げられる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端ヌクレオチドの糖の4’炭素位置にホスフェート類似体(「4’‐ホスフェート類似体」と称する)を有する。4’‐ホスフェート類似体の例はオキシメチルホスホネートであり、ここではオキシメチル基の酸素原子は、糖部分(例えば、その4’‐炭素で)又はその類似体に結合する。例えば、2016年9月2日出願の米国仮出願第62/383,207号明細書、及び2016年9月12日出願の米国仮出願第62/393,401号明細書を参照されたい。ホスフェート類似体に関するこれらのそれぞれの内容は参照により本明細書に援用される。オリゴヌクレオチドの5’末端用に他の修飾が開発されている(例えば、国際公開第2011/133871号明細書、米国特許第8,927,513号明細書、及びPrakashら、(2015年)、Nucleic Acids Res.、43(6):2993~3011を参照されたい。ホスフェート類似体に関するこれらのそれぞれの内容は参照により本明細書に援用される)。 Phosphate analogue: As used herein, the term “ phosphate analogue” refers to chemical moieties that mimic the electrostatic and/or steric properties of a phosphate group. In some embodiments, the phosphate analog is located at the 5' terminal nucleotide of the oligonucleotide in place of the 5'- phosphate , which often undergoes enzymatic removal. In some embodiments, the 5' phosphate analogue comprises a phosphatase-resistant linkage. Examples of phosphate analogs include 5' phosphonic acids such as 5' methylene phosphonate (5'-MP) and 5'-(E)-vinyl phosphonate (5'-VP). In some embodiments, oligonucleotides have a phosphate analogue (referred to as a "4'- phosphate analogue") at the 4' carbon position of the sugar of the 5' terminal nucleotide. An example of a 4'- phosphate analogue is an oxymethylphosphonate, where the oxygen atom of the oxymethyl group is attached to the sugar moiety (eg at its 4'-carbon) or analogue thereof. See, for example, US Provisional Application No. 62/383,207, filed September 2, 2016, and US Provisional Application No. 62/393,401, filed September 12, 2016. The contents of each of these regarding phosphate analogues are incorporated herein by reference. Other modifications have been developed for the 5′ end of oligonucleotides (see, for example, WO 2011/133871, US Pat. No. 8,927,513, and Prakash et al. (2015) Nucleic Acids Res., 43(6):2993-3011, the contents of each of which regarding phosphate analogs are incorporated herein by reference). cited).

相補性の領域:本明細書で使用しているように、用語「相補性の領域」は、例えば、ホスフェート緩衝液中、細胞中などの適切なハイブリダイゼーション条件下でのヌクレオチドの2つの配列間でハイブリダイゼーションを可能にするヌクレオチドの逆平行配列に十分相補的である核酸(例えば、二本鎖オリゴヌクレオチド)のヌクレオチド配列を指す。 Region of Complementarity: As used herein, the term “region of complementarity” refers to a nucleotide sequence of a nucleic acid (e.g., a double-stranded oligonucleotide) that is sufficiently complementary to an antiparallel sequence of nucleotides to allow hybridization between the two sequences of nucleotides under suitable hybridization conditions, such as in a phosphate buffer, in a cell, etc.

リボヌクレオチド:本明細書で使用しているように、用語「リボヌクレオチド」は、その2’位にヒドロキシル基を含むそのペントース糖としてリボースを有するヌクレオチドを指す。修飾リボヌクレオチドは、リボース、ホスフェート基又は塩基の修飾又は置換などの、2’位以外の原子の1つ以上の修飾又は置換を有するリボヌクレオチドである。 Ribonucleotide: As used herein, the term "ribonucleotide" refers to a nucleotide having ribose as its pentose sugar containing a hydroxyl group at its 2' position. Modified ribonucleotides are ribonucleotides that have one or more modifications or substitutions of atoms other than the 2'-position, such as ribose, phosphate group or base modifications or substitutions.

いくつかの実施形態では、HBsAg mRNAの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と共に二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、センス鎖は配列番号6~8.1のいずれか1つに規定される配列を含み、アンチセンス鎖は配列番号4~5.1のいずれか1つに規定される配列を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は2’‐フルオロ及び2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、N‐アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされる。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は2’‐フルオロ及び2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の5’‐ヌクレオチドの糖の4’‐炭素はホスフェート類似体を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖及びセンス鎖のそれぞれは、2’‐フルオロ及び2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、アンチセンス鎖の5’‐ヌクレオチドの糖の4’‐炭素はホスフェート類似体を含み、センス鎖はN‐アセチルガラクトサミン(GalNAc)部分にコンジュゲートされる。 In some embodiments, the oligonucleotide for reducing HBsAg mRNA expression comprises a sense strand that forms a duplex region with the antisense strand, the sense strand comprising a sequence set forth in any one of SEQ ID NOs:6-8.1, and the antisense strand comprising a sequence set forth in any one of SEQ ID NOs:4-5.1. In some embodiments, the sense strand comprises 2'-fluoro and 2'-O-methyl modified nucleotides and at least one phosphorothioate internucleotide linkage. In some embodiments, the sense strand is conjugated to N-acetylgalactosamine (GalNAc) moieties. In some embodiments, the antisense strand comprises 2'-fluoro and 2'-O-methyl modified nucleotides and at least one phosphorothioate internucleotide linkage. In some embodiments, the 4'-carbon of the 5'-nucleotide sugar of the antisense strand comprises a phosphate analogue. In some embodiments, each of the antisense and sense strands comprises 2′-fluoro and 2′-O-methyl modified nucleotides and at least one phosphorothioate internucleotide linkage, the 4′-carbon of the 5′-nucleotide sugar of the antisense strand comprises a phosphate analogue, and the sense strand is conjugated to an N-acetylgalactosamine (GalNAc) moiety.

いくつかの実施形態では、配列番号4~5.1のいずれか1つに規定される配列を含むアンチセンス鎖は、2、3、5、7、8、10、12、14、16、及び19位に2’‐フルオロ修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、1、4、6、9、11、13、15、17、18、及び20~22位に2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は3つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は1位と2位のヌクレオチド間で、2位と3位のヌクレオチド間で、3位と4位のヌクレオチド間で、20位と21位のヌクレオチド間で、21位と22位のヌクレオチド間でホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの態様では、アンチセンス鎖の5’‐ヌクレオチドの糖の4’‐炭素はホスフェート類似体を含む。
ii.二本鎖オリゴヌクレオチド
In some embodiments, the antisense strand comprising the sequence set forth in any one of SEQ ID NOS: 4-5.1 comprises 2'-fluoro modified nucleotides at positions 2, 3, 5, 7, 8, 10, 12, 14, 16, and 19. In some embodiments, the antisense strand comprises 2'-O-methyl modified nucleotides at positions 1, 4, 6, 9, 11, 13, 15, 17, 18, and 20-22. In some embodiments, the antisense strand comprises three phosphorothioate internucleotide linkages. In some embodiments, the antisense strand comprises phosphorothioate internucleotide linkages between nucleotides 1 and 2, between nucleotides 2 and 3, between nucleotides 3 and 4, between nucleotides 20 and 21, and between nucleotides 21 and 22. In some embodiments, the 4'-carbon of the 5'-nucleotide sugar of the antisense strand comprises a phosphate analogue.
ii. double-stranded oligonucleotide

オリゴヌクレオチドは、特異性、安定性、送達、生物学的利用能、ヌクレアーゼ分解耐性、免疫原性、塩基対合特性、RNA分布及び細胞取り込み、並びに治療又は研究用途に関連する他の特徴を改善又は制御するために様々な方法で修飾してもよい。例えば、Bramsenら、Nucleic Acids Res.、2009年、37、2867~2881;Bramsen及びKjems(Frontiers in Genetics、3(2012年):1~22)を参照されたい。従って、いくつかの実施形態では、本開示のオリゴヌクレオチドは1つ以上の好適な修飾を含んでもよい。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、その塩基(又は核酸塩基)、糖(例えば、リボース、デオキシリボース)、又はホスフェート基に修飾を有する。 Oligonucleotides may be modified in a variety of ways to improve or control specificity, stability, delivery, bioavailability, resistance to nuclease degradation, immunogenicity, base-pairing properties, RNA distribution and cellular uptake, and other characteristics relevant to therapeutic or research applications. See, eg, Bramsen et al., Nucleic Acids Res. 2009, 37, 2867-2881; Bramsen and Kjems (Frontiers in Genetics, 3 (2012): 1-22). Thus, in some embodiments, oligonucleotides of the present disclosure may contain one or more suitable modifications. In some embodiments, a modified nucleotide has modifications to its base (or nucleobase), sugar (eg, ribose, deoxyribose), or phosphate group.

いくつかの実施形態では、末端の3’末端基(例えば、3’‐ヒドロキシル)はホスフェート基又は他の基であり、これは、例えば、リンカー、アダプターもしくは標識を結合するために、又は別の核酸へのオリゴヌクレオチドを直接結合するために使用できる。
b.5’末端ホスフェート
In some embodiments, the terminal 3′ terminal group (e.g., 3′-hydroxyl) is a phosphate group or other group, which can be used, for example, to attach a linker, adapter or label, or to directly attach an oligonucleotide to another nucleic acid.
b. 5' terminal phosphate

いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの5’末端ホスフェート基はアルゴノート2との相互作用を促進する。しかし、5’ ホスフェート基を含むオリゴヌクレオチドは、ホスファターゼ又は他の酵素により分解されやすく、インビボでの生物学的利用能が制限される可能性がある。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、このような分解に耐性がある5’ホスフェートの類似体を含む。いくつかの実施形態では、ホスフェート類似体はオキシメチルホスホネート、ビニルホスホネート、又はマロニルホスホネートであってもよい。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド鎖の5’末端は天然5’‐ホスフェート基の静電特性及び立体特性を模倣する化学的部分(「ホスフェート模倣体」)に結合している(例えば、Prakashら、(2015年)、Nucleic Acids Res.、Nucleic Acids Res.2015年3月31日;43(6):2993~3011、ホスフェート類似体に関するその内容は参照により本明細書に援用される)。5’末端に結合可能な多くのホスフェート模倣体が開発されている(例えば、米国特許第8,927,513号明細書参照。リン酸類似体に関するその内容は参照により本明細書に援用される)。オリゴヌクレオチドの5’末端について、他の修飾も開発されている(例えば、国際公開第2011/133871号参照。ホスフェート類似体に関するその内容は参照により本明細書に援用される)。特定の実施形態では、ヒドロキシル基はオリゴヌクレオチドの5’末端に結合する。 In some embodiments, the 5' terminal phosphate group of the oligonucleotide facilitates interaction with Argonaute-2. However, oligonucleotides containing a 5' phosphate group are susceptible to degradation by phosphatases or other enzymes, which can limit their bioavailability in vivo. In some embodiments, oligonucleotides include 5' phosphate analogs that are resistant to such degradation. In some embodiments, the phosphate analog can be oxymethylphosphonate, vinylphosphonate, or malonylphosphonate. In certain embodiments, the 5′ end of the oligonucleotide chain is attached to a chemical moiety (“ phosphate mimetic”) that mimics the electrostatic and steric properties of the natural 5′- phosphate group (eg, Prakash et al. (2015) Nucleic Acids Res. Nucleic Acids Res. 2015 Mar 31;43(6):2993-3011). , the content of which regarding phosphate analogues is incorporated herein by reference). A number of phosphate mimetics have been developed that can be attached to the 5' terminus (see, eg, US Pat. No. 8,927,513, the contents of which regarding phosphate analogues are incorporated herein by reference). Other modifications have also been developed for the 5' end of oligonucleotides (see, eg, WO2011/133871, the content of which regarding phosphate analogues is incorporated herein by reference). In certain embodiments, a hydroxyl group is attached to the 5' end of the oligonucleotide.

いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは糖の4’‐炭素位置にホスフェート類似体(「4’‐ホスフェート類似体」と称する)を有する。例えば、2016年9月2日出願の「4’‐Phosphate Analogs and Oligonucleotides Comprising the Same」と題された米国仮出願第62/383,207号、及び2016年9月12日出願の「4’‐Phosphate Analogs and Oligonucleotides Comprising the Same」と題された米国仮出願第62/393,401を参照されたい。ホスフェート類似体に関するその内容はそれぞれ参照により本明細書に援用される。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは5’末端ヌクレオチドに4’‐ホスフェート類似体を含む。いくつかの実施形態では、ホスフェート類似体はオキシメチルホスホネートであり、ここではオキシメチル基の酸素原子が糖部分(例えば、その4’炭素で)又はその類似体に結合している。他の実施形態では、4’‐ホスフェート類似体は、チオメチルホスホネート又はアミノメチルホスホネートであり、ここではチオメチル基の硫黄原子又はアミノメチル基の窒素原子は糖部分又はその類似体の4’‐炭素に結合している。特定の実施形態では、4’‐ホスフェート類似体はオキシメチルホスホネートである。いくつかの実施形態では、オキシメチルホスホネートは、式‐O‐CH2‐PO(OH)2又は‐O‐CH2‐PO(OR)2で表され、式中、Rは独立して、H、CH3、アルキル基、CH2CH2CN、CH2OCOC(CH33、CH2OCH2CH2Si(CH33、又は保護基から選択される。特定の実施形態では、アルキル基はCH2CH3である。より典型的には、Rは独立して、H、CH3、又はCH2CH3から選択される。 In some embodiments, oligonucleotides have a phosphate analogue (referred to as a "4'- phosphate analogue") at the 4'-carbon position of the sugar. See, for example, U.S. Provisional Application No. 62/383,207 entitled "4'-Phosphate Analogs and Oligonucleotides Composing the Same," filed September 2, 2016, and "4'-Phosphate Analogs and Oli," filed September 12, 2016. See U.S. Provisional Application No. 62/393,401, entitled "Gonucleotides Composing the Same". Each of its contents relating to phosphate analogues is incorporated herein by reference. In some embodiments, oligonucleotides provided herein include a 4'- phosphate analogue at the 5' terminal nucleotide. In some embodiments, the phosphate analogue is an oxymethylphosphonate, where the oxygen atom of the oxymethyl group is attached to the sugar moiety (eg, at its 4' carbon) or analogue thereof. In other embodiments, the 4'- phosphate analogue is a thiomethylphosphonate or aminomethylphosphonate, wherein the sulfur atom of the thiomethyl group or the nitrogen atom of the aminomethyl group is attached to the 4'-carbon of the sugar moiety or analogue thereof. In certain embodiments, the 4'- phosphate analogue is oxymethylphosphonate. In some embodiments, the oxymethylphosphonate has the formula -O-CH2 - PO ( OH)2 or -O-CH2 -PO (OR )2 , where R is independently H, CH3 , an alkyl group, CH2CH2CN , CH2OCOC ( CH3 ) 3 , CH2OCH2CH2Si ( CH3 ) 3 , or from a protecting group. selected. In certain embodiments , an alkyl group is CH2CH3 . More typically , R is independently selected from H, CH3 , or CH2CH3 .

特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドに結合したホスフェート類似体はメトキシホスホネート(MOP)である。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドに結合したホスフェート類似体は5’モノ‐メチル保護MOPである。いくつかの実施形態では、ホスフェート類似体を含む以下のウリジンヌクレオチド:

Figure 2019079781000016
を、例えば、ガイド(アンチセンス)鎖の最初の位置で使用してもよく、この修飾ヌクレオチドは[Meホスホネート‐4O‐mU]又は5’‐メトキシ,ホスホネート‐4’オキシ‐2’‐O‐メチルウリジンと称する。
c.修飾ヌクレオシド間結合 In certain embodiments, the phosphate analog attached to the oligonucleotide is methoxyphosphonate (MOP). In certain embodiments, the phosphate analog attached to the oligonucleotide is a 5' mono-methyl protected MOP. In some embodiments, the following uridine nucleotides with phosphate analogs:
Figure 2019079781000016
may be used, for example, at the first position of the guide (antisense) strand, and this modified nucleotide is referred to as [Mephosphonate-4O-mU] or 5'-methoxy,phosphonate-4'oxy-2'-O-methyluridine.
c. Modified internucleoside linkage

いくつかの実施形態では、ホスフェート修飾又は置換により、少なくとも1つ(例えば、少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、又は少なくとも5つ)の修飾ヌクレオチド間結合を含むオリゴヌクレオチドが生じ得る。いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのいずれか1種は、1~10個(例えば、1~10個、2~8個、4~6個、3~10個、5~10個、1~5個、1~3個、又は1~2個)の修飾ヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのいずれか1種は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10個の修飾ヌクレオチド間結合を含む。 In some embodiments, phosphate modifications or substitutions can result in oligonucleotides containing at least one (eg, at least one, at least two, at least three, or at least five) modified internucleotide linkages. In some embodiments, any one of the oligonucleotides disclosed herein comprises 1-10 (e.g., 1-10, 2-8, 4-6, 3-10, 5-10, 1-5, 1-3, or 1-2) modified internucleotide linkages. In some embodiments, any one of the oligonucleotides disclosed herein comprises 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10 modified internucleotide linkages.

いくつかの実施形態では、可逆的に修飾されたヌクレオチドは、グルタチオン感受性部分を含む。典型的には、核酸分子は環状ジスルフィド部分で化学的に修飾されており、ヌクレオチド間二ホスフェート結合により生じた負電荷を遮蔽し、細胞の取り込み及びヌクレアーゼ耐性を改善する。当初Traversa Therapeutics社(「Traversa」)に認められた米国公開出願第2011/0294869号明細書、Solstice Biologics社(「Solstice」)のPCT公開第WO2015/188197号明細書、Meadeら、Nature Biotechnology、2014年、32:1256~1263(「Meade」)、Merck Sharp&Dohme社のPCT公開第WO2014/088920号明細書を参照されたい。これらはそれぞれ、このような修正の開示について参照により組み込まれる。ヌクレオチド間二ホスフェート結合のこの可逆的修飾は、サイトゾル(例えば、グルタチオン)の還元環境により細胞内で切断されるように設計している。初期の例には、細胞内で切断可能であると報告されているホスホトリエステル修飾の中和が挙げられる(Dellingerら、J.Am.Chem.Soc.2003年、125:940~950)。 In some embodiments, the reversibly modified nucleotide comprises a glutathione sensitive moiety. Typically, nucleic acid molecules are chemically modified with cyclic disulfide moieties to mask the negative charge created by the internucleotide diphosphate linkage, improving cellular uptake and nuclease resistance. U.S. Published Application No. 2011/0294869 originally granted to Traversa Therapeutics, Inc. (“Traversa”); Solstice Biologies, Inc. (“Solstice”) PCT Publication No. WO2015/188197; 2014, 32:1256-1263 (“Meade”), Merck Sharp & Dohme PCT Publication No. WO 2014/088920. each of which is incorporated by reference for disclosure of such modifications. This reversible modification of the internucleotide diphosphate bond is designed to be cleaved intracellularly by the reducing environment of the cytosol (eg, glutathione). Early examples include the neutralization of phosphotriester modifications reported to be intracellularly cleavable (Dellinger et al., J. Am. Chem. Soc. 2003, 125:940-950).

オリゴヌクレオチドの使用を容易にするために、様々な製剤が開発されている。例えば、分解を最小化し、送達及び/もしくは取り込みを容易にし、又は製剤中のオリゴヌクレオチドに別の有益な特性を提供する製剤を使用して、オリゴヌクレオチドを被験体又は細胞環境に送達することが可能となる。いくつかの実施形態では、HBV抗原(例えば、HBsAg)の発現を低減するためのオリゴヌクレオチド(例えば、一本鎖又は二本鎖オリゴヌクレオチド)を含む組成物が本明細書で提供される。このような組成物は、被験体の標的細胞の直接的環境又は全身のいずれかに投与されると、オリゴヌクレオチドの十分な量が細胞に入り、HBV抗原発現を低減するように適切に処方できる。本明細書で開示しているように、様々な好適なオリゴヌクレオチド製剤のいずれかを使用して、HBV抗原を低減するためのオリゴヌクレオチドを送達することが可能となる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ホスフェート緩衝生理食塩水、リポソーム、ミセル構造、及びカプシドなどの緩衝液中に処方する。
Various formulations have been developed to facilitate the use of oligonucleotides. For example, oligonucleotides can be delivered to a subject or cellular environment using formulations that minimize degradation, facilitate delivery and/or uptake, or provide other beneficial properties to the oligonucleotides in the formulation. In some embodiments, provided herein are compositions comprising oligonucleotides (eg, single-stranded or double-stranded oligonucleotides) for reducing expression of HBV antigens (eg, HBsAg). Such compositions can be suitably formulated so that when administered either in the immediate environment of target cells or systemically in a subject, a sufficient amount of the oligonucleotides will enter the cells to reduce HBV antigen expression. As disclosed herein, any of a variety of suitable oligonucleotide formulations can be used to deliver oligonucleotides for reducing HBV antigens. In some embodiments, oligonucleotides are formulated in buffers such as phosphate buffered saline, liposomes, micellar structures, and capsids.

Claims (38)

アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであって、
前記センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号8)で規定される配列からなり、かつ3、8~10、12、13及び17位の2’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位及び2位のヌクレオチドの間のホスホロチオエート結合を含み、
前記センス鎖上の前記‐GAAA‐配列の前記各ヌクレオチドが、一価のGalNac部分とコンジュゲートされており、
前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号5.1)で規定される配列からなり、かつ2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位と2位、2位と3位、3位と4位、20位と21位、及び21位と22位のヌクレオチド間にホスホロチオエート結合を含み、そして
前記アンチセンス鎖の5’‐ヌクレオチドの糖の4’‐炭素が、メトキシホスホネート(MOP)を含むことを特徴とするオリゴヌクレオチド。
An oligonucleotide comprising a sense strand forming a duplex region with the antisense strand,
The sense strand consists of the sequence defined by GACAAAAAUCCUCCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC (SEQ ID NO: 8), and 2'-fluoro modified nucleotides at positions 3, 8-10, 12, 13 and 17; containing an ate bond,
each said nucleotide of said -GAAA- sequence on said sense strand is conjugated with a monovalent GalNac moiety;
said antisense strand consists of the sequence defined by UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG (SEQ ID NO: 5.1) and is 2'-fluoro modified nucleotides at positions 2, 3, 5, 7, 8, 10, 12, 14, 16 and 19; and phosphorothioate linkages between nucleotide positions 3, 3 and 4, 20 and 21, and 21 and 22, and the 4'-carbon of the 5'-nucleotide sugar of said antisense strand comprises a methoxyphosphonate (MOP).
前記アンチセンス鎖の前記5’‐ヌクレオチドが、以下の構造:

Figure 2019079781000001
を有する、請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。
The 5'-nucleotide of the antisense strand has the following structure:

Figure 2019079781000001
The oligonucleotide of claim 1, having
前記‐GAAA‐モチーフが、以下の構造:

Figure 2019079781000002
を含み、式中:
Lが、結合、クリックケミストリーハンドル、又は長さが1~20の連続的な共有結合原子のリンカーであって、置換及び非置換アルキレン、置換及び非置換アルケニレン、置換及び非置換アルキニレン、置換及び非置換ヘテロアルキレン、置換及び非置換ヘテロアルケニレン、置換及び非置換ヘテロアルキニレン、並びにこれらの組み合わせから成る群より選択されるリンカーであり、そして
Xが、O、S又はNである、請求項1又は2に記載のオリゴヌクレオチド。
The -GAAA- motif has the following structure:

Figure 2019079781000002
contains, in the formula:
3. The oligonucleotide of claim 1 or 2, wherein L is a bond, a click chemistry handle, or a linker of 1 to 20 consecutive covalent atoms in length and is a linker selected from the group consisting of substituted and unsubstituted alkylene, substituted and unsubstituted alkenylene, substituted and unsubstituted alkynylene, substituted and unsubstituted heteroalkylene, substituted and unsubstituted heteroalkenylene, substituted and unsubstituted heteroalkynylene, and combinations thereof, and X is O, S, or N.
Lが、アセタールリンカーである、請求項3に記載のオリゴヌクレオチド。 4. The oligonucleotide of Claim 3, wherein L is an acetal linker. Xが、Oである、請求項3又は4に記載のオリゴヌクレオチド。 5. The oligonucleotide of claim 3 or 4, wherein X is O. 前記‐GAAA‐配列が、以下の構造:

Figure 2019079781000003
を含む、請求項1~5のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド。
The -GAAA- sequence has the following structure:

Figure 2019079781000003
The oligonucleotide according to any one of claims 1 to 5, comprising
アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含むオリゴヌクレオチドであって、
前記センス鎖が、GACAAAAAUCCUCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC(配列番号8)で規定される配列からなり、かつ3、8~10、12、13及び17位の2’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、1、2、4~7、11、14~16、18~26及び31~36位の2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位と2位の前記ヌクレオチド間にある1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、
前記センス鎖の前記‐GAAA‐配列の前記各ヌクレオチドが、一価のGalNac部分とコンジュゲートされており、
前記‐GAAA‐配列が、以下の構造:

Figure 2019079781000004
を含み、そして
前記アンチセンス鎖が、UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG(配列番号5.1)で規定される配列からなり、かつ2、3、5、7、8、10、12、14、16及び19位の2’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、1、4、6、9、11、13、15、17、18及び20~22位の2’‐O‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに1位と2位、2位と3位、3位と4位、20位と21位、及び21位と22位のヌクレオチド間のホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、そして、
前記アンチセンス鎖の5’‐ヌクレオチドが、以下の構造:

Figure 2019079781000005

を有することを特徴とするオリゴヌクレオチド。
An oligonucleotide comprising a sense strand forming a duplex region with the antisense strand,
said sense strand consists of the sequence defined by GACAAAAAUCCUCCACAAUAAGCAGCCGAAAGGCUGC (SEQ ID NO: 8), and 2'-fluoro modified nucleotides at positions 3, 8-10, 12, 13 and 17; containing a phosphorothioate internucleotide linkage,
each said nucleotide of said -GAAA- sequence of said sense strand is conjugated with a monovalent GalNac moiety;
The -GAAA- sequence has the following structure:

Figure 2019079781000004
wherein the antisense strand consists of the sequence defined by UUAUUGUGAGGAUUUUUGUCGG (SEQ ID NO: 5.1), and 2'-fluoro modified nucleotides at positions 2, 3, 5, 7, 8, 10, 12, 14, 16 and 19; comprising phosphorothioate internucleotide linkages between nucleotides at positions 2, 2 and 3, 3 and 4, 20 and 21, and 21 and 22; and
The 5'-nucleotide of said antisense strand has the following structure:

Figure 2019079781000005

An oligonucleotide characterized by having
請求項1~7のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを含むことを特徴とする組成物。 A composition comprising an oligonucleotide according to any one of claims 1-7. 対イオンを含む請求項8に記載の組成物。 9. The composition of claim 8, comprising a counterion. 薬学的に許容可能な担体を含む請求項8又は9に記載の組成物。 10. A composition according to claim 8 or 9, comprising a pharmaceutically acceptable carrier. 賦形剤を含む請求項8~10のいずれか1項に記載の組成物。 A composition according to any one of claims 8-10, comprising an excipient. ホスフェート緩衝生理食塩水を含む請求項8~11のいずれか1項に記載の組成物。 A composition according to any one of claims 8 to 11, comprising phosphate buffered saline. 細胞内のB型肝炎ウイルス(HBV)表面抗原(HBsAg)の発現を低減するインビトロ方法であって、請求項1~7のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを、前記細胞に送達する工程を含むことを特徴とする方法。 An in vitro method for reducing expression of hepatitis B virus (HBV) surface antigen (HBsAg) in a cell, comprising delivering an oligonucleotide according to any one of claims 1 to 7 to said cell. 前記細胞が、肝細胞である、請求項13に記載の方法。 14. The method of claim 13, wherein said cells are hepatocytes. 前記オリゴヌクレオチドが、前記細胞内で該オリゴヌクレオチドを発現するように遺伝子操作された導入遺伝子の形態で送達される、請求項13又は14に記載の方法。 15. The method of claim 13 or 14, wherein said oligonucleotide is delivered in the form of a transgene genetically engineered to express said oligonucleotide within said cell. 患者においてHBV感染を治療するための薬剤の製造における、請求項1~7のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、又は請求項8~12のいずれか1項に記載の組成物の使用。 Use of an oligonucleotide according to any one of claims 1-7 or a composition according to any one of claims 8-12 in the manufacture of a medicament for treating HBV infection in a patient . 前記オリゴヌクレオチド又は組成物が、前記患者に対して皮下投与されるものである、請求項16に記載の使用。 17. Use according to claim 16, wherein said oligonucleotide or composition is administered subcutaneously to said patient . 前記オリゴヌクレオチド又は組成物が、前記患者に対して静脈内で投与されるものである、請求項16に記載の使用。 17. Use according to claim 16, wherein said oligonucleotide or composition is administered intravenously to said patient . 前記薬剤が、薬学的に許容可能な担体を含み、前記薬学的に許容可能な担体が、水を含む溶媒又は分散媒である、請求項18に記載の使用。 19. Use according to claim 18, wherein the medicament comprises a pharmaceutically acceptable carrier, and the pharmaceutically acceptable carrier is a solvent or dispersion medium comprising water. 二本鎖オリゴヌクレオチドであって、
センス鎖:
5’ mG-S-mA-fC-mA-mA-mA-mA-fA-fU-fC-mC-fU-fC-mA-mC-mA-fA-mU-mA-mA-mG-mC-mA-mG-mC-mC-[ademG-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-mG-mG-mC-mU-mG-mC 3’と、
アンチセンス鎖:
5’ [MePhosphonate-4O-mU]-S-fU-S-fA-S-mU-fU-mG-fU-fG-mA-fG-mG-fA-mU-fU-mU-fU-mU-mG-fU-mC-S-mG-S-mG 3’と、
を含み、
ここで、
ヌクレオシド間の「-」は、ホスホロジエステルヌクレオシド間結合を意味し、
ヌクレオシド間の「-S-」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を意味し、
mAは、2’-O-メチルアデノシンリボヌクレオシドを意味し、
mGは、2’-O-メチルグアノシンリボヌクレオシドを意味し、
mCは、2’-O-メチルシチジンリボヌクレオシドを意味し、
mUは、2’-O-メチルウリジンリボヌクレオシドを意味し、
fAは、2’-フルオロアデノシンデオキシリボヌクレオシドを意味し、
fGは、2’-フルオログアノシンデオキシリボヌクレオシドを意味し、
fCは、2’-フルオロシチジンデオキシリボヌクレオシドを意味し、
fUは、2’-フルオロウリジンデオキシリボヌクレオシドを意味し、
[ademG-GalNAc]は、

Figure 2019079781000006
を意味し、
[ademA-GalNAc]は、

Figure 2019079781000007

を意味し、そして、
[MePhosphonate-4O-mU]は、

Figure 2019079781000008
を意味することを特徴とする二本鎖オリゴヌクレオチド。
A double-stranded oligonucleotide,
sense strand:
5' mG-S-mA-fC-mA-mA-mA-mA-fA-fU-fC-mC-fU-fC-mA-mC-mA-fA-mU-mA-mA-mG-mC-mA-mG-mC-mC-[ademG-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-mG-mG-mC -mU-mG-mC 3′ and
Antisense strand:
5' [MePhosphonate-4O-mU]-S-fU-S-fA-S-mU-fU-mG-fU-fG-mA-fG-mG-fA-mU-fU-mU-fU-mU-mG-fU-mC-S-mG-S-mG 3';
including
here,
"-" between nucleosides means a phosphorodiester internucleoside linkage,
internucleoside "-S-" means a phosphorothioate internucleoside linkage,
mA means 2′-O-methyladenosine ribonucleoside;
mG means 2'-O-methylguanosine ribonucleoside;
mC means 2′-O-methylcytidine ribonucleoside;
mU means 2′-O-methyluridine ribonucleoside;
fA means 2′-fluoroadenosine deoxyribonucleoside;
fG means 2'-fluoroguanosine deoxyribonucleoside;
fC means 2′-fluorocytidine deoxyribonucleoside;
fU means 2′-fluorouridine deoxyribonucleoside;
[ademG-GalNAc]

Figure 2019079781000006
means
[ademA-GalNAc]

Figure 2019079781000007

means and
[MePhosphonate-4O-mU] is

Figure 2019079781000008
A double-stranded oligonucleotide, characterized in that it means
二本鎖オリゴヌクレオチドのナトリウム塩であって、前記二本鎖オリゴヌクレオチドが、
センス鎖:
5’ mG-S-mA-fC-mA-mA-mA-mA-fA-fU-fC-mC-fU-fC-mA-mC-mA-fA-mU-mA-mA-mG-mC-mA-mG-mC-mC-[ademG-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-mG-mG-mC-mU-mG-mC 3’と、
アンチセンス鎖:
5’ [MePhosphonate-4O-mU]-S-fU-S-fA-S-mU-fU-mG-fU-fG-mA-fG-mG-fA-mU-fU-mU-fU-mU-mG-fU-mC-S-mG-S-mG 3’と、
を含み、
ここで、
ヌクレオシド間の「-」は、ホスホロジエステルヌクレオシド間結合を意味し、
ヌクレオシド間の「-S-」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を意味し、
mAは、2’-O-メチルアデノシンリボヌクレオシドを意味し、
mGは、2’-O-メチルグアノシンリボヌクレオシドを意味し、
mCは、2’-O-メチルシチジンリボヌクレオシドを意味し、
mUは、2’-O-メチルウリジンリボヌクレオシドを意味し、
fAは、2’-フルオロアデノシンデオキシリボヌクレオシドを意味し、
fGは、2’-フルオログアノシンデオキシリボヌクレオシドを意味し、
fCは、2’-フルオロシチジンデオキシリボヌクレオシドを意味し、
fUは、2’-フルオロウリジンデオキシリボヌクレオシドを意味し、
[ademG-GalNAc]は、

Figure 2019079781000009
を意味し、
[ademA-GalNAc]は、

Figure 2019079781000010
を意味し、そして、
[MePhosphonate-4O-mU]は、

Figure 2019079781000011
を意味することを特徴とする二本鎖オリゴヌクレオチドのナトリウム塩。
A sodium salt of a double-stranded oligonucleotide, the double-stranded oligonucleotide comprising:
sense strand:
5' mG-S-mA-fC-mA-mA-mA-mA-fA-fU-fC-mC-fU-fC-mA-mC-mA-fA-mU-mA-mA-mG-mC-mA-mG-mC-mC-[ademG-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-[ademA-GalNAc]-mG-mG-mC -mU-mG-mC 3′ and
Antisense strand:
5' [MePhosphonate-4O-mU]-S-fU-S-fA-S-mU-fU-mG-fU-fG-mA-fG-mG-fA-mU-fU-mU-fU-mU-mG-fU-mC-S-mG-S-mG 3';
including
here,
"-" between nucleosides means a phosphorodiester internucleoside linkage,
internucleoside "-S-" means a phosphorothioate internucleoside linkage,
mA means 2′-O-methyladenosine ribonucleoside;
mG means 2'-O-methylguanosine ribonucleoside;
mC means 2′-O-methylcytidine ribonucleoside;
mU means 2′-O-methyluridine ribonucleoside;
fA means 2′-fluoroadenosine deoxyribonucleoside;
fG means 2'-fluoroguanosine deoxyribonucleoside;
fC means 2′-fluorocytidine deoxyribonucleoside;
fU means 2′-fluorouridine deoxyribonucleoside;
[ademG-GalNAc]

Figure 2019079781000009
means
[ademA-GalNAc]

Figure 2019079781000010
means and
[MePhosphonate-4O-mU] is

Figure 2019079781000011
A sodium salt of a double-stranded oligonucleotide, characterized in that it means
次式、



の構造を有する、二本鎖オリゴヌクレオチド。
the following formula,



A double-stranded oligonucleotide having the structure of
請求項20~22のいずれか1項に記載の二本鎖オリゴヌクレオチドを含む組成物。 A composition comprising the double-stranded oligonucleotide of any one of claims 20-22. 対イオンを更に含む、請求項23に記載の組成物。 24. The composition of claim 23, further comprising a counterion. 前記対イオンが、Na+対イオンである、請求項24に記載の組成物。 25. The composition of claim 24, wherein said counterion is a Na+ counterion. 薬学的に許容可能な担体を更に含む、請求項23記載の組成物。 24. The composition of Claim 23, further comprising a pharmaceutically acceptable carrier. 前記薬学的に許容可能な担体が、水である、請求項26に記載の組成物。 27. The composition of claim 26, wherein said pharmaceutically acceptable carrier is water. Na+対イオン及び水を更に含む、請求項23に記載の組成物。 24. The composition of claim 23, further comprising Na+ counterions and water. 患者において慢性B型肝炎感染を治療するための薬剤の製造のための、請求項20~22のいずれか1項に記載の二本鎖オリゴヌクレオチド、又は請求項23~28のいずれか1項に記載の組成物の使用。 Use of the double-stranded oligonucleotide of any one of claims 20-22 or the composition of any one of claims 23-28 for the manufacture of a medicament for treating chronic hepatitis B infection in a patient. 前記薬剤が、前記患者に対して皮下投与されるものである、請求項29に記載の使用。 30. Use according to claim 29, wherein said medicament is administered subcutaneously to said patient. 前記患者が、HBVe-抗原(HBeAg)陽性患者である、請求項16~19、29及び30のいずれか1項に記載の使用。 Use according to any one of claims 16-19, 29 and 30, wherein said patient is an HBVe-antigen (HBeAg) positive patient. 前記HBeAg陽性患者が、血清HBV表面抗原(HBsAg)>1,000IU/mLを有する、請求項31に記載の使用。 32. Use according to claim 31, wherein said HBeAg positive patient has serum HBV surface antigen (HBsAg)>1,000 IU/mL. 前記患者が、HBeAg陰性患者である、請求項16~19、29及び30のいずれか1項に記載の使用。 Use according to any one of claims 16-19, 29 and 30, wherein said patient is an HBeAg negative patient. 前記HBeAg陰性患者が、血清HBsAg>500IU/mLを有する、請求項33に記載の使用。 34. Use according to claim 33, wherein said HBeAg negative patient has serum HBsAg>500 IU/mL. 前記患者が、血清HBV DNA>20,000IU/mLを有する、請求項16~19、29及び30のいずれか1項に記載の使用。 Use according to any one of claims 16-19, 29 and 30, wherein said patient has serum HBV DNA>20,000 IU/mL. 細胞内のB型肝炎ウイルス(HBV)表面抗原(HBsAg)の発現を低減するインビトロ方法であって、請求項20~22のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドを、前記細胞に送達する工程を含むことを特徴とする方法。 23. An in vitro method of reducing expression of hepatitis B virus (HBV) surface antigen (HBsAg) in a cell, comprising delivering to said cell an oligonucleotide according to any one of claims 20-22. 前記細胞が、肝細胞である、請求項36に記載の方法。 37. The method of claim 36, wherein said cells are hepatocytes. 前記オリゴヌクレオチドが、前記細胞内で該オリゴヌクレオチドを発現するように遺伝子操作された導入遺伝子の形態で送達される、請求項36又は37に記載の方法。 38. The method of claim 36 or 37, wherein said oligonucleotide is delivered in the form of a transgene genetically engineered to express said oligonucleotide in said cell.
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Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP7353276B2 (en) 2017-10-20 2023-09-29 ディセルナ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド How to treat hepatitis B infection
WO2021067744A1 (en) * 2019-10-02 2021-04-08 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Chemical modifications of small interfering rna with minimal fluorine content
CN114867856A (en) * 2019-12-19 2022-08-05 豪夫迈·罗氏有限公司 Use of SARAF inhibitors for the treatment of hepatitis B virus infection
MX2022007908A (en) * 2019-12-24 2022-07-21 Hoffmann La Roche Pharmaceutical combination of a therapeutic oligonucleotide targeting hbv and a tlr7 agonist for treatment of hbv.
WO2022026387A1 (en) * 2020-07-27 2022-02-03 Aligos Therapeutics, Inc. Hbv binding oligonucleotides and methods of use
IL300340A (en) 2020-08-05 2023-04-01 Hoffmann La Roche Oligonucleotide treatment of hepatitis b patients
CN114940991B (en) * 2021-04-13 2023-02-03 厦门甘宝利生物医药有限公司 RNA inhibitor for inhibiting hepatitis B virus gene expression and application thereof
WO2022223515A2 (en) * 2021-04-19 2022-10-27 Novo Nordisk A/S Compositions and methods for inhibiting nuclear receptor subfamily 1 group h member 3 (nr1h3) expression
WO2023083906A2 (en) 2021-11-11 2023-05-19 F. Hoffmann-La Roche Ag Pharmaceutical combinations for treatment of hbv
CA3235672A1 (en) * 2021-11-29 2023-06-01 Shanghai Argo Biopharmaceutical Co., Ltd. Compositions and methods for inhibiting expression of hepatitis b virus (hbv) protein
EP4201947A1 (en) 2021-12-22 2023-06-28 F. Hoffmann-La Roche AG Process for the backbone deprotection of oligonucleotides containing a terminal alkyl phosphonate group
WO2023116764A1 (en) * 2021-12-23 2023-06-29 苏州瑞博生物技术股份有限公司 Nucleic acid, composition and conjugate containing same, and use of same, composition and conjugate

Family Cites Families (37)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20040127446A1 (en) 1992-05-14 2004-07-01 Lawrence Blatt Oligonucleotide mediated inhibition of hepatitis B virus and hepatitis C virus replication
IL151928A0 (en) 2000-03-30 2003-04-10 Whitehead Biomedical Inst Rna sequence-specific mediators of rna interference
JP4095895B2 (en) 2000-12-01 2008-06-04 マックス−プランク−ゲゼルシャフト ツール フォーデルング デル ヴィッセンシャフテン エー.ヴェー. Short RNA molecules that mediate RNA interference
US20050159378A1 (en) 2001-05-18 2005-07-21 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of Myc and/or Myb gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
WO2003040395A2 (en) 2001-11-07 2003-05-15 Applera Corporation Universal nucleotides for nucleic acid analysis
EP2314691A3 (en) 2002-11-14 2012-01-18 Dharmacon, Inc. Fuctional and hyperfunctional siRNA
CN1257284C (en) * 2003-03-05 2006-05-24 北京博奥生物芯片有限责任公司 Method of blocking expression of hepatitis B virus
US20070265220A1 (en) 2004-03-15 2007-11-15 City Of Hope Methods and compositions for the specific inhibition of gene expression by double-stranded RNA
WO2007030167A1 (en) 2005-09-02 2007-03-15 Nastech Pharmaceutical Company Inc. Modification of double-stranded ribonucleic acid molecules
EP1979485A2 (en) 2006-01-31 2008-10-15 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Self-complementary parvoviral vectors, and methods for making and using the same
DK2094086T3 (en) * 2006-11-08 2013-11-25 Veritas Bio LLC SUBMITTING IN VIVO OF DOUBLE-STRENGTH RNA TO A TARGET CELL
CN101755049B (en) 2007-05-29 2014-03-12 约翰内斯堡威特沃特斯兰德大学 Primary micro RNA expression cassette
ES2708944T3 (en) 2008-09-22 2019-04-12 Dicerna Pharmaceuticals Inc Compositions and methods for the specific inhibition of gene expression by DSRNA having modifications
EP3067359A1 (en) 2008-09-23 2016-09-14 Scott G. Petersen Self delivering bio-labile phosphate protected pro-oligos for oligonucleotide based therapeutics and mediating rna interference
US20100249214A1 (en) 2009-02-11 2010-09-30 Dicerna Pharmaceuticals Multiplex dicer substrate rna interference molecules having joining sequences
CA3151965A1 (en) 2008-12-18 2010-07-15 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Extended dicer substrate agents and methods for the specific inhibition of gene expression
WO2011005860A2 (en) 2009-07-07 2011-01-13 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 5' phosphate mimics
EA201290152A1 (en) * 2009-10-16 2012-12-28 Глаксо Груп Лимитед ANTISMINAL INHIBITORS OF HEPATITIS B VIRUS (HBV)
US9725479B2 (en) 2010-04-22 2017-08-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. 5′-end derivatives
KR102072631B1 (en) * 2010-08-17 2020-02-03 시르나 쎄러퓨틱스 인코퍼레이티드 RNA INTERFERENCE MEDIATED INHIBITION OF HEPATITIS B VIRUS (HBV) GENE EXPRESSION USING SHORT INTERFERING NUCLEIC ACID (siNA)
RU2667524C2 (en) * 2011-04-21 2018-09-21 Ионис Фармасьютикалз, Инк. Modulation of hepatitis b virus (hbv) expression
CN113430196A (en) * 2011-06-30 2021-09-24 箭头药业股份有限公司 Compositions and methods for inhibiting gene expression of hepatitis b virus
WO2013063313A1 (en) 2011-10-25 2013-05-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of gccr expression
AU2013356383B2 (en) 2012-12-06 2017-08-31 Merck Sharp & Dohme Corp. Disulfide masked prodrug compositions and methods
TW201437368A (en) * 2012-12-14 2014-10-01 Dicerna Pharmaceuticals Inc Methods and compositions for the specific inhibition of CKAP5 by double-stranded RNA
CN103333890B (en) 2012-12-21 2015-04-15 厦门成坤生物技术有限公司 RNA interference preparation used for treating viral hepatitis B
GB201408623D0 (en) * 2014-05-15 2014-07-02 Santaris Pharma As Oligomers and oligomer conjugates
US20170114341A1 (en) 2014-06-06 2017-04-27 Solstice Biologics, Ltd. Polynucleotide constructs having bioreversible and non-bioreversible groups
CN104059916A (en) 2014-06-17 2014-09-24 湖北医药学院附属太和医院 Sequence of hepatitis B virus (HBV) specific microRNA like siRNA (msiRNA) and application thereof
WO2016030863A1 (en) * 2014-08-29 2016-03-03 Glaxosmithkline Intellectual Property Development Limited Compounds and methods for treating viral infections
JOP20200092A1 (en) * 2014-11-10 2017-06-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc HEPATITIS B VIRUS (HBV) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
EP3865576A1 (en) 2014-12-15 2021-08-18 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Ligand-modified double-stranded nucleic acids
WO2016183009A2 (en) * 2015-05-08 2016-11-17 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for the specific inhibition of antithrombin 3 (at3) by double-stranded rna
CA2991639A1 (en) 2015-08-07 2017-02-16 Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. Rnai therapy for hepatitis b virus infection
JOP20170161A1 (en) 2016-08-04 2019-01-30 Arrowhead Pharmaceuticals Inc RNAi Agents for Hepatitis B Virus Infection
HRP20231063T1 (en) * 2017-10-13 2023-12-22 Novo Nordisk Health Care Ag Methods and compositions for inhibiting expression of ldha
JP7353276B2 (en) 2017-10-20 2023-09-29 ディセルナ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド How to treat hepatitis B infection

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