JPWO2016158719A1 - 画像処理方法、制御プログラムおよび画像処理装置 - Google Patents
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Abstract
Description
関連出願の相互参照
以下に示す日本出願の明細書、図面および特許請求の範囲における開示内容は、参照によりその全内容が本書に組み入れられる:
特願2015−071655(2015年3月31日出願)。
13 撮像部(画像取得手段)
14 制御部
141 CPU(検出手段)
142 インターフェース部(出力手段、受付手段)
CR 円形領域
Sp、Sp1〜Sp9 スフェロイド
W ウェル
WP ウェルプレート
Claims (10)
- スフェロイドが撮像された原画像から、前記スフェロイドに対応するオブジェクトを含む対象領域を特定する工程と、
円形分離度フィルタ演算により、前記対象領域内で分離度の値が最大となる円形領域を検出する工程と、
前記円形分離度フィルタ演算により算出される前記円形領域の分離度に比例する値を、当該円形領域により特定される前記スフェロイドの丸みを示す指標値として出力する工程と
を備える画像処理方法。 - 前記円形分離度フィルタ演算では、前記対象領域内における中心の位置および直径の少なくとも一方が複数段階に変更設定され、設定ごとに前記分離度が求められる請求項1に記載の画像処理方法。
- 前記対象領域内の各画素について、当該画素の画素値と前記対象領域の平均画素値との差分を求め、該差分を当該画素の画素値とする差分画像において前記円形分離度フィルタ演算を行う請求項1または2に記載の画像処理方法。
- 前記円形領域の分離度の値を、前記円形領域内の画素の平均画素値で正規化した値を前記指標値とする請求項1ないし3のいずれかに記載の画像処理方法。
- 前記対象領域を特定するためのユーザからの設定入力を受け付け、該設定入力に応じて前記対象領域が特定される請求項1ないし4のいずれかに記載の画像処理方法。
- 画像処理により前記原画像から前記スフェロイドに対応するオブジェクトを検出する工程を備え、その検出結果に基づき前記対象領域が特定される請求項1ないし4のいずれかに記載の画像処理方法。
- 請求項1ないし6のいずれかに記載の画像処理方法の各工程を、コンピュータに実行させる制御プログラム。
- スフェロイドが撮像された原画像を取得する画像取得手段と、
前記原画像のうち前記スフェロイドに対応するオブジェクトを含む対象領域内で、円形分離度フィルタ演算を実行し、分離度の値が最大となる円形領域を検出する検出手段と、
前記円形分離度フィルタ演算により算出される前記円形領域の分離度に比例する値を、当該円形領域により特定される前記スフェロイドの丸みを示す指標値として出力する出力手段と
を備える画像処理装置。 - 前記原画像から前記対象領域を特定するための設定入力をユーザから受け付ける受付手段を備える請求項8に記載の画像処理装置。
- 前記画像取得手段は、試料を撮像して前記原画像を取得する撮像部を有する請求項8または9に記載の画像処理装置。
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JP2013137635A (ja) * | 2011-12-28 | 2013-07-11 | Dainippon Screen Mfg Co Ltd | 画像表示装置および画像表示方法 |
WO2014038025A1 (ja) * | 2012-09-05 | 2014-03-13 | Scivax株式会社 | 細胞の上皮性維持に作用する物質のスクリーニング方法 |
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