JPS63210653A - Medium membrane for electrophoresis - Google Patents

Medium membrane for electrophoresis

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JPS63210653A
JPS63210653A JP62043702A JP4370287A JPS63210653A JP S63210653 A JPS63210653 A JP S63210653A JP 62043702 A JP62043702 A JP 62043702A JP 4370287 A JP4370287 A JP 4370287A JP S63210653 A JPS63210653 A JP S63210653A
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Mitsuru Sugihara
充 杉原
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Abstract

PURPOSE:To provide a satisfactory resolving power in a wide range of molecular weight of a nucleic base fragments, by giving a gradient in the layer thickness to a gel medium layer containing a polyacrylic amide water gel and a carbamoyl group as the modifying agent. CONSTITUTION:A spacer plate 1 with a gradually varying thickness of a section along the direction of electrophoresis is fixed at both ends of a polyethylene terephthalate (PET) support with the surface thereof subjected to an ultraviolet irradiation treatment. Moreover, the work is covered with a PET cover sheet along the spacer plate 1 and the outside of the cover sheet is fixed with an aluminum plate so as to respond to changes in the thickness of the spacer plate 1, whereby a mold is formed. An aqueous solution for forming acrylic amide gels containing, for instance, urea as the modifying agent is run into the mold and irradiated with light from a high-pressure mercury lamp to cause a cross-linked polymerization. This provides a gel medium membrane having a satisfactory resolving power in a wide range of molecular weight of nucleic base fragments.

Description

【発明の詳細な説明】 [産業上の利用分野] 本発明は核酸(DNA、 RNA)塩基配列決定のため
に用いられるポリアクリルアミド系水性ゲルからなる電
気泳動用ゲル媒体に関するものであり、さらに詳しくは
、核酸塩基フラグメントの低分子量部分から高分子量部
分まで広い分子量範囲にわたって良好な分離性能を有す
るように予め定められ制御されたゲル媒体の膜厚勾配(
膜厚グラジェント)を有する電気泳動用媒体膜に関する
ものである。
[Detailed Description of the Invention] [Industrial Application Field] The present invention relates to an electrophoretic gel medium made of polyacrylamide-based aqueous gel used for nucleic acid (DNA, RNA) base sequencing. is a predetermined and controlled thickness gradient of the gel medium (
The present invention relates to an electrophoretic medium membrane having a thickness gradient).

[従来の技術] 化学分解法、ジデオキシ法等による核酸(DNA。[Conventional technology] Nucleic acid (DNA) by chemical decomposition method, dideoxy method, etc.

RNA)の塩基配列決定法においてはポリアクリルアミ
ド系水性ゲル電気泳動用媒体膜(以下、ポリアクリルア
ミドゲル膜又は、単に、ゲル膜ということがある)を用
いたスラブ電気泳動が必須の操作になっている。近年で
は電気泳動分析が頻繁に利用されるようになっている。
Slab electrophoresis using a polyacrylamide aqueous gel electrophoresis medium membrane (hereinafter sometimes referred to as polyacrylamide gel membrane or simply gel membrane) has become an essential operation in the base sequencing method of RNA). There is. In recent years, electrophoretic analysis has become frequently used.

そしてジデオキシ法の発達により、核酸フラグメントの
高分子量部分まで精度よく分離できるポリアクリルアミ
ドゲル膜の要請が高まってきた。
With the development of the dideoxy method, there has been an increasing demand for polyacrylamide gel membranes that can accurately separate even high-molecular-weight portions of nucleic acid fragments.

一方、核酸の塩基配列決定のために、核酸塩基フラグメ
ントをその分子量の違いにより電気泳動分離する場合9
通常の厚さ一定のポリアクリルアミドゲル膜では9分離
したフラグメントのバンドの間隔が低分子量部分では広
く、高分子量部分では狭くなる。このため核酸フラグメ
ントの高分子量部分の分離が悪くなる。そこで低分子量
部分から高分子量部分まで広い分子量範囲にわたって均
等に良好な分離性能を得るために、電気泳動方向にポリ
アクリルアミド濃度、緩衝液濃度に勾配をもたせたポリ
アクリルアミドゲル膜(グラジェントゲル膜)が使用さ
れている。例えば特開昭6O−235819(EP 0
159694A)にはポリアクリルアミド濃度(ゲル濃
度又は孔径サイズ)勾配を有するポリアクリルアミドゲ
ル電気泳動用媒体膜を、アクリルアミドと架橋剤を含む
水溶液の薄層を支持体の表面で電子ビーム等の電離放射
線を用いて架橋重合させて製造する方法及び装置が記載
されている。
On the other hand, in order to determine the base sequence of nucleic acids, when nucleobase fragments are electrophoretically separated depending on their molecular weight9
In a normal polyacrylamide gel membrane having a constant thickness, the interval between bands of nine separated fragments is wide in the low molecular weight part and narrow in the high molecular weight part. As a result, separation of high molecular weight portions of nucleic acid fragments becomes poor. Therefore, in order to obtain uniformly good separation performance over a wide molecular weight range from low molecular weight parts to high molecular weight parts, a polyacrylamide gel membrane (gradient gel membrane) is used that has a gradient in polyacrylamide concentration and buffer concentration in the electrophoresis direction. is used. For example, Japanese Patent Application Laid-Open No. 6O-235819 (EP 0
159694A), a polyacrylamide gel electrophoresis medium membrane having a polyacrylamide concentration (gel concentration or pore size) gradient is used, and a thin layer of an aqueous solution containing acrylamide and a crosslinking agent is applied to the surface of the support by ionizing radiation such as an electron beam. A method and apparatus for crosslinking polymerization using the method and apparatus are described.

この方法に用いられる装置及び濃度勾配をゲル膜中に発
現させるための電子ビーム等のコントロール法はきわめ
て複雑である。一般にグラジェントゲル膜は製造するの
に手数がかかり、11度勾配の再現性が悪く、!!造に
失敗することが多く、均一なグラジェントを有する多数
のゲル膜を製造し難いという欠点があった。さらに、ポ
リアクリルアミドゲル濃度の違いによって膨潤率が異な
るので。
The equipment used in this method and the method of controlling electron beams and the like to create a concentration gradient in the gel film are extremely complicated. In general, gradient gel membranes are time-consuming to manufacture, and the reproducibility of 11 degree gradients is poor. ! However, this method has the drawback that it is difficult to produce a large number of gel films with a uniform gradient. In addition, the swelling ratio differs depending on the polyacrylamide gel concentration.

分離した核酸フラグメント像を有する電気泳動実施後の
ゲル膜を支持体から剥離する操作時にゲル膜が変形しや
すいという欠点もあった。
There was also a drawback that the gel membrane was easily deformed during the operation of peeling the gel membrane containing the separated nucleic acid fragment image from the support after electrophoresis.

一方2通常ゲル膜を作製する場合、2枚の平面ガラスの
間にゲル膜を形成するため、望みの漸次的変化の勾配を
もたせることが難しかったので。
On the other hand, when producing a 2-regular gel film, it is difficult to create the desired gradual change gradient because the gel film is formed between two flat glasses.

膜厚勾配ゲル膜は従来使用されていなかった。Thickness gradient gel membranes have not previously been used.

[発明の目的] 本発明の目的は核酸(DNA、 RNA)の塩基配列決
定のために用いられるポリアクリルアミド系水性ゲル電
気泳動用媒体(以下、ゲル媒体ということがある)にお
いて、核酸フラグメントの低分子量部分から高分子量部
分までほぼ同等な良好な高分離性能を持つように厚さグ
ラジェントを有するゲル媒体膜を提供することである。
[Object of the invention] The object of the present invention is to reduce the amount of nucleic acid fragments in a polyacrylamide-based aqueous gel electrophoresis medium (hereinafter sometimes referred to as gel medium) used for base sequencing of nucleic acids (DNA, RNA). It is an object of the present invention to provide a gel medium membrane having a thickness gradient so as to have approximately the same good high separation performance from a molecular weight portion to a high molecular weight portion.

本発明の他の目的は濃度グラジェントゲル膜に比べて膨
潤による変形の少ない厚さグラジェントを有するゲル媒
体膜を提供することである。
Another object of the present invention is to provide a gel media membrane having a thickness gradient that is less deformed by swelling than concentration gradient gel membranes.

[発明の構成] 本発明は、アクリルアミド系化合物と架橋剤が水の存在
下に架橋重合してなるポリアクリルアミド系水性ゲル及
び変性剤として少なくとも1個のカルバモイル基を含む
化合物を含む電気泳動用ゲル媒体からなる層を平面状支
持体と平面状カバーシートとの間に設けてなる電気泳動
用媒体膜において、前記ゲル媒体層が予め定められた漸
次的な厚さの変化(層厚勾配)を有する電気泳動用媒体
膜である。
[Structure of the Invention] The present invention provides an aqueous polyacrylamide gel obtained by crosslinking polymerization of an acrylamide compound and a crosslinking agent in the presence of water, and an electrophoresis gel containing a compound containing at least one carbamoyl group as a denaturing agent. In an electrophoretic medium membrane in which a layer of a medium is provided between a planar support and a planar cover sheet, the gel medium layer exhibits a predetermined gradual change in thickness (layer thickness gradient). This is an electrophoresis medium membrane having the following properties.

[発明の構成の詳細な説明] ゲル媒体に用いることができるアクリルアミド系化合物
(単量体)の例としては、アクリルアミド。
[Detailed Description of the Structure of the Invention] An example of an acrylamide compound (monomer) that can be used in the gel medium is acrylamide.

N−メチルアクリルアミド、 N、N−ジメチルアクリ
ルアミド、N−(ヒドロキシメチル)アクリルアミド。
N-methylacrylamide, N,N-dimethylacrylamide, N-(hydroxymethyl)acrylamide.

ジアセトンアクリルアミド等のアクリルアミドホモログ
がある。これらの化合物は単独で、または2種以上を組
合せて用いることができる。これらの化合物のうちでは
アクリルアミドが好ましく。
There are acrylamide homologs such as diacetone acrylamide. These compounds can be used alone or in combination of two or more. Among these compounds, acrylamide is preferred.

またアクリルアミドと他のアクリルアミド系化合物の1
種以上との併用も好ましい。
Also, 1 of acrylamide and other acrylamide-based compounds.
It is also preferable to use it in combination with more than one species.

架橋剤としてはr E Iectrophoresis
J2(4)、213−2l9(1981)、同誌2−(
4)、220−228(1981)等に記載の二官能性
架橋剤化合物、特開昭61−2058等に記載の三官能
性以上の架橋剤化合物を用いることができる。二官能性
架橋剤の具体例として、 N、N’−メチレンビスアク
リルアミド(B I S) ; N、N’−プロピレン
ビスアクリルアミド(PBA);ジアクリルアミドジメ
チルエーテル(DAE);1,2−ジアクリルアミドエ
チレングリコール(D E G) ;エチレンウレアビ
スアクリルアミド(E U B) ;エチレンジアクリ
レート(EDA);N、N’−ジアリルタルタルジアミ
ド(D A T D );N、N’−ビスアクリリルシ
スタミン(BAC)がある。三官能性架橋剤の具体例と
して、 1,3.5− )リアクリロイルへキサヒドロ
−3−トリアジン(TAHT); )リアリルシアヌレ
ート(TAC);)リアリルイソシアヌレート(TA 
IC)等がある。これらの架橋剤のうちではBISとT
AHTが好ましい。架橋剤は2種以上を組合わせて用い
ることもできる。
As a crosslinking agent, rE Iectrophoresis
J2(4), 213-2l9 (1981), same magazine 2-(
4), 220-228 (1981) and the like, and trifunctional or higher-functional crosslinking compounds as described in JP-A-61-2058 and the like can be used. Specific examples of bifunctional crosslinking agents include: N,N'-methylenebisacrylamide (BIS); N,N'-propylenebisacrylamide (PBA); diacrylamide dimethyl ether (DAE); 1,2-diacrylamide ethylene Glycol (DEG); Ethyleneureabisacrylamide (EUB); Ethylene diacrylate (EDA); N,N'-diallyltartardiamide (DATD); N,N'-bisacrylycystamine ( BAC). Specific examples of trifunctional crosslinking agents include 1,3.5-)lyacryloylhexahydro-3-triazine (TAHT);)lylylcyanurate (TAC);)lylyl isocyanurate (TA
IC) etc. Among these crosslinkers, BIS and T
AHT is preferred. Two or more types of crosslinking agents can also be used in combination.

架橋剤の量は、単量体と架橋剤の合計重量に対して約1
w%から約30w%、好ましくは約2w%から約low
%の範囲で用いられる。
The amount of crosslinking agent is approximately 1% based on the total weight of monomer and crosslinking agent.
w% to about 30w%, preferably about 2w% to about low
Used in the range of %.

ゲル媒体にはアガロースを添加することができる。アガ
ロースとしては、特開昭55−5730 、特開昭55
−110946 、特表昭57−502098 、特開
昭59−126236等に記載の低電気浸透性アガロー
ス、中電気浸透性アガロース、高電気浸透性アガロース
のいずれも用いることができる。アガロースの添加量は
単量体と架橋剤を含む水性ゲルの容積に対して約0.2
豐/V%から約2.0豐/V%、好ましくは約0.九/
V%から約1.2豐/V%の範囲である。
Agarose can be added to the gel medium. As for agarose, JP-A-55-5730, JP-A-55
Any of the low electroosmotic agarose, medium electroosmotic agarose, and high electroosmotic agarose described in Japanese Patent Application Laid-Open No. 57-126236, Japanese Patent Application Laid-Open No. 59-110946, etc. can be used. The amount of agarose added is approximately 0.2 to the volume of the aqueous gel containing the monomer and crosslinking agent.
% to about 2.0 %/V, preferably about 0.0%/V. Nine/
V% to about 1.2 F/V%.

ゲル媒体には水溶性ポリマーを添加することができる。Water-soluble polymers can be added to the gel medium.

水溶性ポリマーとしては、特開昭59−126238、
特開昭60−60548等に記載の分子量約1万から約
100万の範囲の付加重合型または縮重合型の水溶性の
非イオン性ポリマー、特開昭61−18852等に記載
のビニルスルホニル基等含有の架橋性アクリルアミド系
コポリマー、特願昭61−214878に記載の水溶性
セルロース誘導体を用いることができる。付加重合型の
水溶性の非イオン性ポリマーの例としてポリアクリルア
ミド、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドンが
ある。縮重合型の水溶性の非イオン性ポリマーの例とし
てポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール
Examples of water-soluble polymers include JP-A-59-126238;
Addition polymerization or condensation polymerization type water-soluble nonionic polymers with a molecular weight ranging from about 10,000 to about 1 million as described in JP-A No. 60-60548, etc., vinyl sulfonyl groups as described in JP-A-61-18852, etc. A crosslinkable acrylamide copolymer containing the like, a water-soluble cellulose derivative described in Japanese Patent Application No. 61-214878 can be used. Examples of addition polymerizable water-soluble nonionic polymers include polyacrylamide, polyvinyl alcohol, and polyvinylpyrrolidone. Polyethylene glycol and polypropylene glycol are examples of condensation type water-soluble nonionic polymers.

ポリ−N−ビニルピロリドンがある。架橋性アクリルア
ミド系コポリマーの例として、N([3−(ビニルスル
ホニル)プロパンアミドコメチルコアクリルアミド−ア
クリルアミドコポリマー; N−[[3−(2−クロロ
エチルスルホニル)プロパンアミド]メチル]アクリル
アミド−アクリルアミド−N−(1,1−ジメチル−3
−オキソブチル)アクリルアミドコポリマーがある。水
溶性セルロース誘導体の例としてメチルセルロース、エ
チルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロ
キシプロピルメチルセルロース、ヒドロキシブチルメチ
ルセルロース等の水溶性セルロースエーテルがある。こ
れらの水溶性ポリマーのうちではポリアクリルアミド、
ポリエチレングリコール、 N−[[3−(ビニルスル
ホニル)プロパンアミドコメチルコアクリルアミド−ア
クリルアミドコポリマーが好ましい。水溶性ポリマーの
添加量は、付加重合型または縮重合型の水溶性の非イオ
ン性ポリマーの場合、単量体と架橋剤の合計重量に対し
て約2v%から約100ν%、好ましくは約5−%から
約50讐%の範囲、架橋性アクリルアミド系コポリマー
の場合、アクリルアミド系化合物の重量に対して約1−
%から約50誓%、好ましくは約5%から約40ν%の
範囲である。
There is poly-N-vinylpyrrolidone. Examples of crosslinkable acrylamide copolymers include N([3-(vinylsulfonyl)propanamide comethylcoacrylamide-acrylamide copolymer; N-[[3-(2-chloroethylsulfonyl)propanamide]methyl]acrylamide-acrylamide-N -(1,1-dimethyl-3
-oxobutyl)acrylamide copolymers. Examples of water-soluble cellulose derivatives include water-soluble cellulose ethers such as methylcellulose, ethylcellulose, hydroxyethylcellulose, hydroxypropylmethylcellulose, and hydroxybutylmethylcellulose. Among these water-soluble polymers, polyacrylamide,
Polyethylene glycol, N-[[3-(vinylsulfonyl)propanamidocomethylcoacrylamide-acrylamide copolymers are preferred. In the case of an addition polymerization type or condensation polymerization type water-soluble nonionic polymer, the amount of the water-soluble polymer added is about 2v% to about 100ν%, preferably about 5% based on the total weight of the monomer and crosslinking agent. -% to about 50%, in the case of crosslinkable acrylamide-based copolymers, about 1-% to about 50% by weight of the acrylamide-based compound.
% to about 50%, preferably about 5% to about 40v%.

ゲル媒体には核酸フラグメントの高分子量部分の泳動像
バンド幅の広がりと分離像の歪の発生防止の目的でグリ
セロールをゲル媒体の容積に対して約0.1豐/V%〜
約1.0冒/V%の範囲で添加することができる。また
湿潤剤としてグリセロール、エチレングリコール等のポ
リオール化合物をゲル媒体の容積に対して約1.0豐/
V%〜約40w/v%の範囲で添加することができる。
Glycerol is added to the gel medium in an amount of approximately 0.1%/V% based on the volume of the gel medium for the purpose of widening the electrophoretic image band width of the high molecular weight portion of the nucleic acid fragment and preventing distortion of the separated image.
It can be added in a range of about 1.0 V/V%. In addition, a polyol compound such as glycerol or ethylene glycol is added as a wetting agent at a rate of about 1.0 ton/to the volume of the gel medium.
It can be added in a range of V% to about 40 w/v%.

アガロース及び/又は水溶性ポリマー、あるいはグリセ
ロール、エチレングリコール等のポリオール化合物をゲ
ル媒体に添加する時期は通常単量体と架橋剤を水に溶解
する時からポリアクリルアミド系水性ゲルの形成時まで
の間が好ましい。
Agarose and/or water-soluble polymers or polyol compounds such as glycerol or ethylene glycol are added to the gel medium usually between the time the monomers and crosslinker are dissolved in water and the time the polyacrylamide-based aqueous gel is formed. is preferred.

ゲル媒体にはノニオン性、アニオン性又は両性界面活性
剤を添加することができる。界面活性剤の例として。
Nonionic, anionic or amphoteric surfactants can be added to the gel medium. As an example of surfactants.

C3F17SO2N  (CH2CH20)+4−HE
t 等のノニオン性界面活性剤。
C3F17SO2N (CH2CH20)+4-HE
Nonionic surfactants such as t.

Na03S−CHCOOCH2CH(Et)CaH9「 CH2C00CH2CH(Et)C4H9等のアニオン
性界面活性剤。
Anionic surfactant such as Na03S-CHCOOCH2CH(Et)CaH9 CH2C00CH2CH(Et)C4H9.

e C1、H23CON H−(CH2)3−N” −CH
2COO〜e 等の両性界面活性剤がある。界面活性剤の添加量は、単
量体と架橋剤を含む水性ゲルの容積に対して、ノニオン
性又はカチオン性界面活性剤の場合。
e C1, H23CON H-(CH2)3-N" -CH
There are amphoteric surfactants such as 2COO-e. The amount of surfactant added is based on the volume of the aqueous gel containing the monomer and crosslinking agent, in the case of nonionic or cationic surfactant.

約I X 10−’から約5XIO−1豐/V%、好ま
しくは約lXl0’−3から約I X 10−2豐/V
%の範囲、アニオン性界面活性剤の場合、約lXl0−
4から約5X10−2冒lV%、好ましくは約lXl0
−3から約5X10−2豐/V%の範囲である。
from about I x 10-' to about 5XIO-1 ton/V%, preferably from about 1X10'-3 to about I x 10-2 ton/V
% range, for anionic surfactants approximately lXl0-
4 to about 5X10-2 affected lV%, preferably about lXl0
-3 to about 5.times.10@-2 %/V.

変性剤としては少なくとも1個のカルバモイル基をもつ
化合物が用いられる。その具体例として尿素、ホルムア
ミド等がある。変性剤の添加量は単量体と架橋剤を含む
水性ゲルの容積に対して約40%dlv%から約60w
/v%の範囲である。変性剤として尿素を用いる場合に
は、単量体と架橋剤を含む水性ゲル10100Oに対し
約6モル(約3608)から飽和溶解量(約420g)
まで、好ましくは約7モルから飽和溶解量までの範囲で
用いられる。変性剤は添加量が多いので、その添加時期
は通常単量体と架橋剤を含む諸成分を水に溶解、する時
が好ましい。
A compound having at least one carbamoyl group is used as the modifier. Specific examples include urea and formamide. The amount of the modifier added is about 40% dlv% to about 60w based on the volume of the aqueous gel containing the monomer and crosslinking agent.
/v% range. When using urea as a denaturing agent, the saturated dissolution amount (approximately 420 g) ranges from approximately 6 mol (approximately 3608) to 10,100 O of aqueous gel containing monomers and crosslinking agent.
It is preferably used in a range from about 7 mol to a saturated dissolution amount. Since a large amount of the modifier is added, it is usually preferable to add the modifier at a time when the various components including the monomer and the crosslinking agent are dissolved in water.

ゲル媒体には公知のp)I緩衝剤を含有させて電気泳動
実施時のpH値を8.0から9.0の範囲に調節するこ
とができる。用いうるpH緩衝剤としては9日本化学会
膳「化学便覧基礎編」(東京、丸善■、 1966年発
行) 1312−1320頁r R、M、 C、Daw
son et a1編rData for B ioc
hemical Re5earchJ第5earchJ
rd at the C1arendonPress、
1969年発行)476−508頁、r B ioch
emistryJ5.46?頁以降(1966年)、r
 Analytical B iochemistry
J旧11,300−310頁(1980年)等に記載の
p)l緩衝剤系がある。 pt+緩衝剤の具体例として
、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン(Tris
) ; N、N−ビス(2−ヒドロキシエチル)グリシ
ン(Bicine);N−2−ヒドロキシピペラジン−
、N’−2−ヒドロキシプロパン−3−スルホン酸Na
塩又はに塩等;N−2−ヒドロキシエチルピペラジン−
N’−3−スルホン酸Na塩又はに塩等; N−[)リ
ス(ヒドロキシメチル)メチル]−3−アミノプロパン
スルホン酸Na塩又はに塩等;及びこれらのいずれかと
必要により組合せられる酸、アルカリ又は塩がある。好
ましいpH緩衝剤系の例としてTris−硼酸−EDT
A・2Na塩(pt(8,2〜8.3用組成)がある。
The gel medium can contain a known p)I buffer to adjust the pH value during electrophoresis to a range of 8.0 to 9.0. As a pH buffering agent that can be used, 9 Japanese Chemical Society Zen "Chemical Handbook Basic Edition" (Tokyo, Maruzen ■, published in 1966) pp. 1312-1320 r R, M, C, Daw
son et a1 rData for B ioc
chemical Re5earchJ5th
rd at the C1arendonPress,
Published in 1969) pp. 476-508, r Bioch
emistryJ5.46? Pages onwards (1966), r
Analytical Biochemistry
There is a p)l buffer system described in J. Old 11, pp. 300-310 (1980). As a specific example of pt+buffer, tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris
); N,N-bis(2-hydroxyethyl)glycine (Bicine); N-2-hydroxypiperazine-
, N'-2-hydroxypropane-3-sulfonic acid Na
Salt or salt, etc.; N-2-hydroxyethylpiperazine-
N'-3-sulfonic acid Na salt or salt, etc.; N-[)lis(hydroxymethyl)methyl]-3-aminopropanesulfonic acid Na salt or salt, etc.; and an acid optionally combined with any of these; There are alkalis or salts. An example of a preferred pH buffer system is Tris-boric acid-EDT.
There is A.2Na salt (pt (composition for 8.2 to 8.3)).

ゲル媒体は予め定められた厚さの膜において実質的に無
色透明であることが泳動像の検出または読取りに一般的
に好ましい。
It is generally preferred for the gel medium to be substantially colorless and transparent at a predetermined thickness for the detection or reading of electrophoretic images.

ゲル媒体は、実質的に電気不伝導性で水不浸透性の平滑
な表面のシート状(フィルム状、又は平板状)支持体又
はカバーシートの上に予め定められた。制御された漸次
的な厚さの変化を有する層又は膜として設けられる。実
質的に電気不伝導性で水不浸透性の平滑な表面のシート
状支持体又はカバーシートとして公知のガラス板、有機
ポリマーシート等を用いることができる。有機ポリマー
シートの具体例としてポリエチレンテレフタレート、ビ
スフェノールAのポリカルボネート、ポリスチレン、セ
ルロースエステル(例、セルロースジアセテート、セル
ローストリアセテート、セルロースアセテートプロピオ
ネート等)等のポリマーからなる厚さ約5OLImから
約2nv 、好ましくは約80umから約500IJ1
1の範囲の透明な、すなわち波長的200n11から約
900nmの範囲内の少なくとも一部の範囲の波長の電
磁輻射線を透過させる平滑な表面を有するシート状物又
は平板状物がある。有機ポリマー支持体又はカバーシー
トを用いる場合にはその表面を親水化しゲル膜との接着
を良好にするために、紫外線照射、グロー放電処理、コ
ロナ放電処理、火焔処理、電子線照射、ケミカルエツチ
ング。
The gel medium is predetermined on a substantially electrically non-conductive, water-impermeable, smooth-surfaced sheet-like (film-like or planar) support or cover sheet. It is provided as a layer or film with a controlled gradual change in thickness. Known glass plates, organic polymer sheets, and the like can be used as the substantially electrically nonconductive, water-impermeable, smooth-surfaced sheet-like support or cover sheet. Specific examples of organic polymer sheets include polyethylene terephthalate, polycarbonate of bisphenol A, polystyrene, cellulose esters (e.g., cellulose diacetate, cellulose triacetate, cellulose acetate propionate, etc.), and the thickness is about 5 OLIm to about 2 nv. , preferably from about 80 um to about 500 IJ1
There is a sheet or plate having a smooth surface that is transparent, ie transparent to electromagnetic radiation in a wavelength range of at least part of the wavelength range from 200n11 to about 900nm. When an organic polymer support or cover sheet is used, ultraviolet irradiation, glow discharge treatment, corona discharge treatment, flame treatment, electron beam irradiation, and chemical etching are performed to make the surface hydrophilic and improve adhesion to the gel film.

電解エツチング等の公知の表面処理方法を適用すること
ができる。有機ポリマー支持体又はカバーシートの表面
には必要に応じて特開昭59〜164950゜特開昭5
9−212753.特開昭60−194349.特開昭
60−239658 、特開昭60−244850.特
開昭61−14557等に記載の下塗層または接着層を
設けてその上に設けられるゲル媒体層と支持体又はカバ
ーシートとの接着を強固にすることができる。また、後
述するように、予め定められた漸次的な厚さ変化を有す
る平面状支持体又はカバーシートを用いることもできる
Known surface treatment methods such as electrolytic etching can be applied. The surface of the organic polymer support or cover sheet may be coated with JP-A-59-164950° as required.
9-212753. JP-A-60-194349. JP 60-239658, JP 60-244850. An undercoat layer or an adhesive layer as described in JP-A No. 61-14557 and the like can be provided to strengthen the adhesion between the gel medium layer provided thereon and the support or cover sheet. It is also possible to use a planar support or cover sheet with a predetermined gradual thickness change, as described below.

ゲル媒体は前述の諸成分とラジカル重合開始剤組成物を
含む水溶液(以下、ゲル形成液ということがある)を平
面状支持体又はカバーシートの上に層状又は膜状に流延
または塗布し2分子状酸素の不存在下で、必要により紫
外線又は可視光の照射及び/又は加熱して、単量体(ア
クリルアミド系化合物)と架橋剤とが架橋重合したポリ
アクリルアミド系水性ゲル媒体層又は膜として製造され
用いられる。
The gel medium is prepared by casting or coating an aqueous solution (hereinafter sometimes referred to as gel-forming liquid) containing the above-mentioned components and a radical polymerization initiator composition on a planar support or cover sheet in a layer or film form. A polyacrylamide-based aqueous gel medium layer or film in which a monomer (acrylamide-based compound) and a cross-linking agent are cross-linked and polymerized by irradiation with ultraviolet rays or visible light and/or heating if necessary in the absence of molecular oxygen. Manufactured and used.

アクリルアミド系化合物(単量体)と架橋剤は。Acrylamide compound (monomer) and crosslinking agent.

水溶液または水分散液として水に溶解または分散させて
おき、水中で両者を架橋重合させて、架橋重合した水性
ゲル媒体を形成させる。本明細書においては特にことわ
らないかぎり、(水に)溶解と(水に)分散の両者を含
めて単に(水に)溶解といい。
It is dissolved or dispersed in water as an aqueous solution or an aqueous dispersion, and the two are crosslinked and polymerized in water to form a crosslinked and polymerized aqueous gel medium. In this specification, unless otherwise specified, the term simply "dissolved (in water)" includes both dissolution (in water) and dispersion (in water).

水溶液と水分散液の両者を含めて単に水溶液という。溶
媒または分散媒としては、水だけでなく。
Both aqueous solutions and aqueous dispersions are simply referred to as aqueous solutions. Water is not the only solvent or dispersion medium.

所望により加えられる有機溶媒を含む水−有機溶媒混合
物をも包含する。
Also included are water-organic solvent mixtures with optionally added organic solvents.

ラジカル重合開始剤組成物としてはr E Iectr
o−phOreSiSJ2(4)、213−219(1
981)、同誌Z(4)、220−228(1981)
、特開昭59−126236 、青水、永井編r最新電
気泳動法J(1973年発行)等に記載の低温ラジカル
重合開始剤組成物のうちから適宜に選択して用いること
ができる。ラジカル重合開始剤組成物の例として、β−
(ジメチルアミノ)プロピオニトリル(DMDPN)−
ペルオクソニ硫酸アンモニウム混合物; N、N、N’
、N’−テトラメチルエチレンジアミン(TEMED)
−ペルオクソニ硫酸アンモニウム混合物;TEMED−
リボフラビン混合物;TEMED−リボフラビン−過酸
化水素混合物:リボフラビンーベルオクソニ硫酸アンモ
ニウム混合物;リボフラビン−過酸化水素混合物(リボ
フラビン等の光増感剤併用の場合には紫外線又は可視光
の照射を併用する)等がある。ラジカル重合剤組成物の
添加量は単量体と架橋剤の合計重量に対して約0.3ν
%から約5.0w%、好ましくは約0.5ν%から約3
.0−%の範囲である。
As a radical polymerization initiator composition, r E Iectr
o-phOreSiSJ2(4), 213-219(1
981), same magazine Z (4), 220-228 (1981)
, JP-A-59-126236, Aomizu and Nagai, eds., Latest Electrophoresis Method J (published in 1973), and the like can be appropriately selected from the low-temperature radical polymerization initiator compositions. As an example of the radical polymerization initiator composition, β-
(dimethylamino)propionitrile (DMDPN)-
Ammonium peroxonisulfate mixture; N, N, N'
, N'-tetramethylethylenediamine (TEMED)
-Ammonium peroxonisulfate mixture; TEMED-
Riboflavin mixture; TEMED-riboflavin-hydrogen peroxide mixture: riboflavin-beroxonisulfate mixture; riboflavin-hydrogen peroxide mixture (when used in combination with a photosensitizer such as riboflavin, irradiation with ultraviolet or visible light is used), etc. There is. The amount of the radical polymerization agent composition added is approximately 0.3ν based on the total weight of the monomer and crosslinking agent.
% to about 5.0 w%, preferably about 0.5 ν% to about 3
.. It is in the range of 0-%.

ゲル媒体はゲル濃度としてS 、 Hjerten :
 rAr−chives of B iochemis
try and B 1ophysicsJ l、(S
uppl、)、!47−151(1962)に記載の定
義に従って表示して、単量体、架橋剤および水からなる
ゲル媒体の容積に対して、単量体と架橋剤の合計量が約
3w/v%から約30w/v%の範囲で用いられる。
The gel medium has a gel concentration of S, Hjerten:
rAr-chives of Biochemis
try and B 1 physics J l, (S
uppl,),! 47-151 (1962), the total amount of monomer and crosslinking agent is from about 3 w/v % to about It is used in a range of 30 w/v%.

ゲル形成液を平面状支持体(又はカバーシート)の表面
上で架橋重合させる際には、ゲル形成液の流延塗布とそ
の後の架橋重合を窒素ガス雰囲気中等の分子状酸素の不
存在下で実施するか、あるいは流延塗布したゲル形成液
の表面上に直ちにカバー用フィルム、シートまたは板等
の被覆材料で覆い架橋重合させることが好ましい。この
目的に使用される被覆材料としては前述の平面状支持体
と同様な素材からなるものを用いることができる。
When cross-linking and polymerizing the gel-forming liquid on the surface of a planar support (or cover sheet), the gel-forming liquid is cast and then cross-linked in the absence of molecular oxygen, such as in a nitrogen gas atmosphere. It is preferable to carry out crosslinking polymerization by immediately covering the surface of the gel-forming solution that has been carried out or cast and coated with a covering material such as a cover film, sheet, or plate. The coating material used for this purpose may be made of the same material as the above-mentioned planar support.

カバー用フィルムが有機ポリマーフィルムである場合、
その厚さは約300Lffl+以下であり、実用的な範
囲としては約4L1111から約20OLIff+、好
ましくは約約4umから約100LJII+である。被
覆材料がガラス板の場合。
If the cover film is an organic polymer film,
Its thickness is about 300Lffl+ or less, with a practical range of about 4L1111 to about 20OLIff+, preferably about 4um to about 100LJII+. When the covering material is a glass plate.

その厚さは支持体として用いる平面状ガラス板と同様な
厚さのものを用いることができる。
The thickness of the support may be the same as that of the flat glass plate used as the support.

一般的にゲル媒体膜の厚さ勾配は、電気泳動実施後に核
酸の高分子フラグメント側に厚く、低分子フラグメント
側に薄くなるような勾配を設けるのが原則であるが、目
的により他の勾配配置を採用することができることはい
うまでもない。本発明のゲル媒体膜の特徴をなすゲル膜
の厚さ勾配(曲線又は直線)は、サンプル注入端部から
の距離に対して、直線、ゆるく折れた直線、指数関数。
Generally speaking, the thickness gradient of the gel medium membrane is created so that after electrophoresis, the gradient is thicker on the side of the high-molecular-weight fragments of nucleic acids and thinner on the side of the low-molecular-weight fragments, but other gradient arrangements may be used depending on the purpose. Needless to say, it is possible to adopt The gel film thickness gradient (curve or straight line), which is a feature of the gel medium film of the present invention, is a straight line, a gently bent straight line, or an exponential function with respect to the distance from the sample injection end.

対数関数、懸垂線、追跡線、放物線、双曲線、楕円、3
次曲線等の関数で表される漸次的変化の曲線の一部分、
その他の任意の漸次的変化の曲線又は曲線と直線の組合
せ等で表される勾配をもたせることができるが、電気泳
動方向に沿って距離とともに漸次的に単調に増加させる
。途中から増加させる。あるいは一度減少させた後増加
させるように設けるのが好ましい。変化させる厚さの範
囲は約50−から約5開、好ましくは約80umから約
100〇−の範囲である。なお、サンプル注入部分の形
状は、長方形状、正方形状、三角形状(シャークスティ
ース状)1円形状等公知の形状から選択して設けること
ができる。
Logarithmic function, catenary line, trace line, parabola, hyperbola, ellipse, 3
A portion of a curve of gradual change expressed by a function such as the following curve,
The gradient may be represented by any other gradual curve or combination of a curve and a straight line, but increases gradually and monotonically with distance along the direction of electrophoresis. Increase from the middle. Alternatively, it is preferable to decrease the amount once and then increase it. The range of thicknesses to be varied is from about 50 um to about 5 um, preferably from about 80 um to about 1000 um. The shape of the sample injection portion can be selected from known shapes such as a rectangular shape, a square shape, a triangular shape (sharks teeth shape), and a circular shape.

ゲル媒体に膜厚勾配を設ける方法としては、平面状支持
体に予め定められた。制御された漸次的な厚さ変化(層
厚勾配又は膜厚勾配)にほぼ相当する厚さ変化を有する
スペーサ板を固定し、スペーサ板にそってカバー用被覆
材料(シート状物)で覆ったモールド内部にゲル形成液
を流し込み架橋重合させる方法、予め定められた漸次的
な厚さ変化に相当する厚さ変化を有する平面状支持体く
又はカバーシート)の表面に一定厚さのスペーサー板を
固定し、スペーサ板にそってカバー用被覆材料(支持体
ンで覆ったモールド内部にゲル形成液を流し込み架橋重
合させる方法、予め定められた漸次的な厚さ変化に相当
する厚さ変化を有する平面状支持体(又はカバーシート
)の表面にゲル形成液を流延し、窒素ガス雰囲気中等の
分子状酸素の不存在下で架橋重合させる方法、予め定め
られた漸次的な厚さ変化に対応するように、単位時間当
りの流量を制御(ゲル膜厚さの薄い領域では流量を少く
、厚さの厚い領域では流量を多くする)しながら、平面
状支持体(又はカバーシート)の表面にゲル形成液を流
延塗布し、窒素ガス雰囲気中等の分子状酸素の不存在下
で架橋重合させる方法等を適用することができる。予め
定められた漸次的厚さ変化を有する平面状支持体は、モ
ールドカスティング法、ケミカルエツチング法、切削法
等の公知の技術により調製されたものを用いることがで
きる。流量を制御しながら支持体(又はカバーシート)
に流延塗布する場合には、スペーサー板の厚さ変化は必
ずしもゲル膜の予め定められた漸次的な厚さ変化に相当
していなくともよい。また、ゲル媒体の膜厚勾配をゲル
膜の幅全体に設けずに。
A method for providing a film thickness gradient in the gel medium was predetermined on a planar support. A spacer plate with a thickness change approximately corresponding to a controlled gradual thickness change (layer thickness gradient or film thickness gradient) was fixed and covered with a covering material (sheet-like material) along the spacer plate. A method of pouring a gel-forming liquid into a mold and cross-linking polymerizing it, a spacer plate of a constant thickness is placed on the surface of a flat support (or a cover sheet) having a thickness change corresponding to a predetermined gradual thickness change. A method of cross-linking and polymerizing a gel-forming liquid by pouring it into a mold covered with a covering material (support material) along a spacer plate, and having a thickness change corresponding to a predetermined gradual thickness change. A method in which a gel-forming solution is cast on the surface of a planar support (or cover sheet) and cross-linked and polymerized in the absence of molecular oxygen, such as in a nitrogen gas atmosphere, which corresponds to a predetermined gradual thickness change. While controlling the flow rate per unit time (lower the flow rate in areas where the gel film is thinner, and increase the flow rate in areas where the gel film is thicker), A method such as casting a gel-forming solution and crosslinking polymerization in the absence of molecular oxygen such as in a nitrogen gas atmosphere can be applied.A planar support having a predetermined gradual thickness change can be used. , mold casting method, chemical etching method, cutting method, etc. can be used.The support (or cover sheet) can be used while controlling the flow rate.
In the case of cast coating, the change in the thickness of the spacer plate does not necessarily have to correspond to a predetermined gradual change in the thickness of the gel film. Also, without providing a film thickness gradient of the gel medium across the width of the gel film.

サンプルを電気泳動させるレーンの領域より僅かに広い
幅の領域にだけレーンの数に対応させて設け、残余の領
域は実質的に厚さ一定にすることもてきる。この態様は
漸次的厚さ変化を有する平面状支持体又はカバーシート
を用いる態様において有利に実施できる。
It is also possible to provide only an area corresponding to the number of lanes with a width slightly wider than the area of the lane in which the sample is electrophoresed, and the remaining area to have a substantially constant thickness. This embodiment can advantageously be implemented in embodiments using planar supports or cover sheets with gradual thickness changes.

本発明のゲル媒体膜は公知のポリアクリルアミド系水性
ゲル媒体膜と同様にして調製することができる。また9
本発明のゲル媒体膜は前述の諸文献や特許明細書等に記
載の公知の方法に従って。
The gel media membrane of the present invention can be prepared in the same manner as known polyacrylamide-based aqueous gel media membranes. Also 9
The gel medium membrane of the present invention is prepared according to the known methods described in the above-mentioned literatures and patent specifications.

水平型および垂直型スラブm気泳動法等に用いることが
できる。
It can be used in horizontal and vertical slab m pneumophoresis methods.

堕工至■ 実施例1及び比較例1 表面を紫外線照射処理した厚さ180um、サイズ20
Cm X 40cmの長方形の無色透明ポリエチレンテ
レフタレー)(PET)シート(支持体)の長辺に沿っ
た両縁辺部に第1〜3図の電気泳動方向に沿う断面模式
図に示す3種の漸次的な厚さ変化を有する幅10關のス
ペーサー板(本発明)及び同じ幅で一定厚さ200um
のスペーサー板(比較例)をそれぞれ固定し、スペーサ
ー板に沿って厚さ1100uのPETシート(カバーシ
ート)で覆い、さらにカバーシートの外側を20cII
IX 40cmの長方形のアルミニウム板でスペーサー
の厚さ変化に応するように固定してポリアクリルアミド
水性ゲル電気泳動用媒体層調製用モールドを形成した。
Example 1 and Comparative Example 1 Surface treated with ultraviolet irradiation, thickness 180um, size 20
The three types of gradual gradients shown in the cross-sectional schematic diagrams along the electrophoresis direction in Figures 1 to 3 were placed on both edges along the long sides of a Cm x 40 cm rectangular colorless transparent polyethylene terephthalate (PET) sheet (support). A spacer plate with a width of 10 degrees with a thickness change of 10 degrees (the present invention) and a constant thickness of 200 um with the same width.
spacer plates (comparative example) are each fixed, covered with a 1100u thick PET sheet (cover sheet) along the spacer plates, and further covered with a 20cII plate on the outside of the cover sheet.
A mold for preparing a medium layer for polyacrylamide aqueous gel electrophoresis was formed by fixing the spacer with a rectangular aluminum plate of 40 cm in a manner corresponding to the change in thickness of the spacer.

各モールドの中に第1表に記載の組成のアクリルアミド
ゲル形成用水溶液を流し込み2周囲温度25℃で各ゲル
形成液に100W高圧水銀灯を10cmの距離から照射
しつつ10分静置し2枚のPETシートの間で架橋重合
させて厚さグラジェントを有する本発明のポリアクリル
アミド水性ゲル電気泳動用媒体膜3種■■■と厚さ一定
の比較用ゲル膜■を形成した。
Pour an aqueous solution for forming an acrylamide gel with the composition shown in Table 1 into each mold.2 At an ambient temperature of 25°C, each gel forming solution was irradiated with a 100W high-pressure mercury lamp from a distance of 10cm and left to stand for 10 minutes. Three kinds of polyacrylamide aqueous gel electrophoresis media membranes of the present invention having a thickness gradient were formed by cross-linking polymerization between PET sheets, and a comparative gel membrane having a constant thickness was formed.

■第1図の超偏平V字形断面、厚さ最大(泳動方向始端
部と終端部)300Lffrl、最小(泳動方向中央部
)50um ■第2図の超偏平楔形断面、厚さ最小(泳動方向始端部
)150umから直線状に増加して最大(泳動方向終端
部)300um ■第3図の超偏平楔形断面、厚さ最小(泳動方向始端部
)150umから指数関数状に増加して最大(泳動方向
終端部)300um ■一定の厚さ200um 得られた4種のゲル膜を用いてDNA塩基配列解析の実
験をM13−mp8DNAに対してジデオキシ法により
調製されたDNAフラグメントサンプルを用いて常法に
従い実施した。その結果9本発明の厚さグラジェントゲ
ル膜では読み取り可能な塩基フラグメントの範囲は次の
とおりであった。
■ Ultra-flat V-shaped cross section in Figure 1, maximum thickness (starting end and end in migration direction) 300Lffrl, minimum (middle part in migration direction) 50 um ■ Ultra-flat wedge-shaped cross section in Figure 2, minimum thickness (starting end in migration direction) ) The thickness increases linearly from 150 um to a maximum of 300 um (at the end in the migration direction). ■The ultra-oblate wedge-shaped cross section in Figure 3, the thickness increases exponentially from 150 um at the minimum (starting end in the migration direction) to a maximum (in the migration direction). Terminating part) 300 um ■Constant thickness 200 um Using the four types of gel membranes obtained, DNA base sequence analysis experiments were carried out according to standard methods using DNA fragment samples prepared by the dideoxy method for M13-mp8 DNA. did. As a result, the range of readable base fragments in the 9-thickness gradient gel membrane of the present invention was as follows.

ゲル膜060〜240番 ゲル膜060〜215番 ゲル膜060〜240番 かつ各レーンでの塩基フラグメントの泳動像の幅と間隔
は読み取れる範囲内で極端に狭まることはなかった。
Gel films 060 to 240 Gel films 060 to 215 Gel films 060 to 240 and the widths and intervals of the electrophoretic images of base fragments in each lane did not become extremely narrow within the readable range.

それに対して従来技術である厚さ一定のゲル膜■ではそ
の読み取り可能範囲は60〜200番で、各レーンでの
塩基フラグメントの泳動像の幅と間隔は低分子量部分か
ら高分子量部分に至るにつれて次第に狭まっていた。
On the other hand, in the conventional gel membrane (2) with a constant thickness, the readable range is from 60 to 200, and the width and interval of the electrophoretic image of the base fragment in each lane changes as it goes from the low molecular weight part to the high molecular weight part. It was gradually narrowing down.

この結果から本発明の厚さグラジェントを有するポリア
クリルアミド水性ゲル電気泳動用媒体膜は核酸塩基フラ
グメントの低分子量部分から高分子量部分まで広い分子
量範囲にわたってほぼ一様にレーンでの間隔が維持され
ていて良好な分離が得られ、かつ読み取り可能な塩基フ
ラグメントの数が多く、精度の高いDNA塩基配列解析
を行うことができることが明らかになった。
These results show that the polyacrylamide aqueous gel electrophoresis medium membrane with the thickness gradient of the present invention maintains almost uniform lane spacing over a wide molecular weight range from the low molecular weight part of the nucleobase fragment to the high molecular weight part. It has become clear that good separation can be obtained using this method, and a large number of readable base fragments can be obtained, making it possible to perform DNA base sequence analysis with high accuracy.

旦工至亘 第 1 表 ゲル形成液の成分 且アガロース:低電気浸透度、ゲル化温度36℃Tri
s: )リス(ヒドロキシメチル)アミノメタン実施例
2及び比較例2 表面を紫外線照射処理した厚さ1BOLIII+、サイ
ズ20CII+ X 4QC1lIの長方形の無色透明
PETシート(支持体)の長辺に沿った縁辺部に一定厚
さ300LIT+で幅10關×長さ40cmのスペーサ
ー板を接着固定した。この支持体の上に実施例1の第1
表に記載の組成のゲル形成液を、ゲル形成液膜の厚さが
150LIITlから300umになるような範囲で流
量を制御して支持体上のゲル形成液膜の厚さを変化させ
なから流延塗布し、各ゲル形成液膜に500Wキセノン
放電灯を照射しつつ窒素ガス雰囲気中で架橋重合させ、
ついでゲル膜の上に厚さ631Jmでサイズ20Cm 
X 40cmの無色透明PETシートをカバーシー1ト
として密着積層して、第1図ないし第3図に示したスペ
ーサー板の断面の厚さ変化にほぼ等しい厚さ変化(膜厚
勾配)を有するポリアクリルアミド水性ゲル膜3種(本
発明のゲル膜)を調製した。
Table 1: Components of gel-forming solution and agarose: low electro-osmosis, gelation temperature 36°C Tri
s: ) Lis(hydroxymethyl)aminomethane Example 2 and Comparative Example 2 Edges along the long sides of a rectangular colorless transparent PET sheet (support) with a thickness of 1BOLIII+ and a size of 20CII+ x 4QC1I whose surface was treated with ultraviolet irradiation. A spacer plate having a constant thickness of 300 LIT+ and having a width of 10 cm and a length of 40 cm was fixed by adhesive. On this support, the first
The gel-forming liquid having the composition listed in the table is flowed without changing the thickness of the gel-forming liquid film on the support by controlling the flow rate within a range such that the thickness of the gel-forming liquid film is from 150 LIITl to 300 um. The gel-forming liquid film was then cross-linked and polymerized in a nitrogen gas atmosphere while irradiating each gel-forming liquid film with a 500W xenon discharge lamp.
Then, on top of the gel film, a film with a thickness of 631 Jm and a size of 20 cm was applied.
X 40 cm colorless transparent PET sheets are closely laminated as a cover sheet to form a polyester film having a thickness change (film thickness gradient) approximately equal to the thickness change in the cross section of the spacer plate shown in Figures 1 to 3. Three types of acrylamide aqueous gel membranes (gel membranes of the present invention) were prepared.

一方、ゲル形成液の流量を、ゲル形成液膜の厚さが20
0Ijfflになるように一定にしたほかは上記と同様
にして一定の厚さ200umのゲル膜(比較例2)を調
製した。
On the other hand, the flow rate of the gel-forming liquid was changed to 20% when the thickness of the gel-forming liquid film was 20
A gel film having a constant thickness of 200 um (Comparative Example 2) was prepared in the same manner as above except that the thickness was kept constant at 0Ijffl.

得られた4種のゲル膜を用いて実施例1と同様にしてD
NAフラグメントの泳動像の読み取り実験を実施したと
ころ、実施例1及び比較例1と同様の結果が得られた。
D was prepared in the same manner as in Example 1 using the four types of gel films obtained.
When an experiment was carried out to read the electrophoretic images of NA fragments, the same results as in Example 1 and Comparative Example 1 were obtained.

【図面の簡単な説明】[Brief explanation of the drawing]

第1図〜第3図は実施例1の本発明の厚さグラジェント
を有するゲル膜1〜3を形成するために用いたスペーサ
ー板の電気泳動方向に沿う漸次的な厚さ変化(膜厚勾配
)を示す断面模式図である。 第1図:超偏平V字形断面、厚さ最大(泳動方向始端部
と終端部)300um、最小(泳動方向中央部)150
−9長さ40cmのスペーサー板(ゲル膜■調製用)第
2図:超偏平楔形断面、厚さ最小(泳動方向始端部)1
50umから直線状に増加して最大(泳動方向終端部)
300um、長さ40cn+のスペーサー板(ゲル膜■
調製用) 第3図:超偏平楔形断面、厚さ最小(泳動方向始端部)
150umから指数関数状に増加して最大(泳動方向終
端部)300um、長さ40c+nのスペーサー板(ゲ
ル膜■調製用) 特許出願人 富士写真フィルム株式会社第1図 厚さ変化:超偏平V字形 第2図 厚さ変化:直線状に増加 第3図 厚さ変化二指数間数状に増大 長さ4000 手続補正書(自発)
Figures 1 to 3 show gradual thickness changes (film thickness FIG. Figure 1: Ultra-flat V-shaped cross section, maximum thickness (starting end and terminal end in migration direction) 300 um, minimum (middle part in migration direction) 150 um
-9 Spacer plate with a length of 40 cm (for gel film ■ preparation) Figure 2: Ultra-oblate wedge-shaped cross section, minimum thickness (starting end in migration direction) 1
Increases linearly from 50um to maximum (at end of migration direction)
300um, length 40cn+ spacer plate (gel film■
(for preparation) Figure 3: Ultra-oblate wedge-shaped cross section, minimum thickness (starting end in migration direction)
Spacer plate increasing exponentially from 150 um to a maximum of 300 um (at the end in the migration direction) and having a length of 40c+n (for gel film preparation) Patent applicant: Fuji Photo Film Co., Ltd. Figure 1 Thickness change: Ultra-flat V-shape Figure 2: Thickness change: increases linearly Figure 3: Thickness changes: increases numerically between two exponentials Length: 4000 Procedural amendment (voluntary)

Claims (6)

【特許請求の範囲】[Claims] (1)アクリルアミド系化合物と架橋剤が水の存在下に
架橋重合してなるポリアクリルアミド系水性ゲル及び変
性剤として少なくとも1個のカルバモイル基を含む化合
物を含む電気泳動用ゲル媒体からなる層を平面状支持体
と平面状カバーシートとの間に設けてなる電気泳動用媒
体膜において、前記ゲル媒体層が予め定められた漸次的
な厚さの変化(層厚勾配)を有することを特徴とする電
気泳動用媒体膜。
(1) A layer consisting of an aqueous polyacrylamide gel obtained by crosslinking polymerization of an acrylamide compound and a crosslinking agent in the presence of water and a gel medium for electrophoresis containing a compound containing at least one carbamoyl group as a denaturing agent. The gel medium layer has a predetermined gradual thickness change (layer thickness gradient) in the electrophoresis medium membrane provided between a shaped support and a planar cover sheet. Media membrane for electrophoresis.
(2)前記支持体と前記カバーシートがいずれも有機ポ
リマーからなるシート状物である特許請求の範囲第1項
に記載の電気泳動用媒体膜。
(2) The electrophoretic medium membrane according to claim 1, wherein the support and the cover sheet are both sheet-like materials made of organic polymers.
(3)前記支持体と前記カバーシートがいずれもポリエ
チレンテレフタレートからなるシート状物である特許請
求の範囲第2項に記載の電気泳動用媒体膜。
(3) The electrophoretic medium membrane according to claim 2, wherein the support and the cover sheet are both sheet-like materials made of polyethylene terephthalate.
(4)前記少なくとも1個のカルバモイル基を含む化合
物が尿素である特許請求の範囲第1項に記載の電気泳動
用媒体膜。
(4) The electrophoretic medium membrane according to claim 1, wherein the compound containing at least one carbamoyl group is urea.
(5)前記ゲル媒体にさらにアガロースが含まれる特許
請求の範囲第1項に記載の電気泳動用媒体膜。
(5) The electrophoresis medium membrane according to claim 1, wherein the gel medium further contains agarose.
(6)前記ゲル媒体にさらに水溶性ポリマーが含まれる
特許請求の範囲第5項に記載の電気泳動用媒体膜。
(6) The electrophoretic medium membrane according to claim 5, wherein the gel medium further contains a water-soluble polymer.
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Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5518604A (en) * 1995-04-07 1996-05-21 Brandeis University Buffer shaping device
JP2009156767A (en) * 2007-12-27 2009-07-16 National Institute Of Advanced Industrial & Technology Protein array substrate
JP2020012662A (en) * 2018-07-13 2020-01-23 浜松ホトニクス株式会社 Electrophoretic method, electrophoresis system, and storage container for electrophoresis

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS59164950A (en) * 1983-03-11 1984-09-18 Fuji Photo Film Co Ltd Medium material for electrophoresis
JPS59171848A (en) * 1983-03-18 1984-09-28 Fuji Photo Film Co Ltd Medium for electrophoresis
JPS60224050A (en) * 1984-04-20 1985-11-08 Fuji Photo Film Co Ltd Support for supporting medium for electrophoresis
JPS6243703A (en) * 1985-08-21 1987-02-25 Fanuc Ltd Numerical control system

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS59164950A (en) * 1983-03-11 1984-09-18 Fuji Photo Film Co Ltd Medium material for electrophoresis
JPS59171848A (en) * 1983-03-18 1984-09-28 Fuji Photo Film Co Ltd Medium for electrophoresis
JPS60224050A (en) * 1984-04-20 1985-11-08 Fuji Photo Film Co Ltd Support for supporting medium for electrophoresis
JPS6243703A (en) * 1985-08-21 1987-02-25 Fanuc Ltd Numerical control system

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5518604A (en) * 1995-04-07 1996-05-21 Brandeis University Buffer shaping device
JP2009156767A (en) * 2007-12-27 2009-07-16 National Institute Of Advanced Industrial & Technology Protein array substrate
JP2020012662A (en) * 2018-07-13 2020-01-23 浜松ホトニクス株式会社 Electrophoretic method, electrophoresis system, and storage container for electrophoresis

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