JPS63109781A - recA蛋白様蛋白と抗recA蛋白様蛋白単クロ−ン抗体とを併用した簡便なDル−プ生成法 - Google Patents
recA蛋白様蛋白と抗recA蛋白様蛋白単クロ−ン抗体とを併用した簡便なDル−プ生成法Info
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- JPS63109781A JPS63109781A JP25499386A JP25499386A JPS63109781A JP S63109781 A JPS63109781 A JP S63109781A JP 25499386 A JP25499386 A JP 25499386A JP 25499386 A JP25499386 A JP 25499386A JP S63109781 A JPS63109781 A JP S63109781A
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Landscapes
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
〔産業上の利用分野〕
本発明は、閉環状二重鎖DNAにDループ構造を形成す
る方法に関する。更に詳しくはrecA蛋白様蛋白と抗
rec A蛋白様蛋白単クローン抗体とを併用するDル
ーズの形成方法に関する。
る方法に関する。更に詳しくはrecA蛋白様蛋白と抗
rec A蛋白様蛋白単クローン抗体とを併用するDル
ーズの形成方法に関する。
Dループは、第1図に示すように、互いに共通の塩基配
列をもつ二重鎖DNAと単鎖DNAとから形成される複
合体である。二重鎖DNAの一方の鎖と単鎖DNAとの
間で塩基対を作りへテロ二重鎖と呼ばれる二重11構造
を作り、一方相手を失った二重鎖D N Aの他方の鎖
がループ状になっている。このDループは、クローニン
グした遺伝子の任意の部分に突然変異を導入する技術に
用いられている(Shortle et al、 (
1980) Proc、 Natl。
列をもつ二重鎖DNAと単鎖DNAとから形成される複
合体である。二重鎖DNAの一方の鎖と単鎖DNAとの
間で塩基対を作りへテロ二重鎖と呼ばれる二重11構造
を作り、一方相手を失った二重鎖D N Aの他方の鎖
がループ状になっている。このDループは、クローニン
グした遺伝子の任意の部分に突然変異を導入する技術に
用いられている(Shortle et al、 (
1980) Proc、 Natl。
Acad、 Sci、USA 77: 5375. G
reen and Tibbetts(1980) P
roc、Natl、 Acad、 Sci、 USA
77: 2455)。
reen and Tibbetts(1980) P
roc、Natl、 Acad、 Sci、 USA
77: 2455)。
また、この構造を高い頻度で作ることができれば、遺伝
子の構造研究、遺伝子診断などに役立つ特別な塩基配列
をもつDNAを拾い出す技術などが実現できる。端の全
(無い、いわゆる閉環状二重鎖DNAで天然に存在する
型のものは右巻きの(負の)超ラセンを持っている。こ
の負の超ラセンを持つ閉環状二重鎖DNAの上のDルー
プは、通常の二重ラセンと同じ程度の高度の安定性を持
つ。
子の構造研究、遺伝子診断などに役立つ特別な塩基配列
をもつDNAを拾い出す技術などが実現できる。端の全
(無い、いわゆる閉環状二重鎖DNAで天然に存在する
型のものは右巻きの(負の)超ラセンを持っている。こ
の負の超ラセンを持つ閉環状二重鎖DNAの上のDルー
プは、通常の二重ラセンと同じ程度の高度の安定性を持
つ。
遺伝子のクローニングの多くに用いられるプラスミドも
その殆どが負の超ラセンをもつ閉環状二重鎖DNAであ
り、Dループ形成を利用した技術を考える時、その対象
となるDNAは殆どの場合、負の超ラセンをもつ閉環状
二重鎖DNAである。
その殆どが負の超ラセンをもつ閉環状二重鎖DNAであ
り、Dループ形成を利用した技術を考える時、その対象
となるDNAは殆どの場合、負の超ラセンをもつ閉環状
二重鎖DNAである。
一方、端を持つ二重1! D N Aの上のDループは
非常に不安定である。
非常に不安定である。
〔発明が解決しようとする問題点〕
大腸菌のrec A蛋白や他生物のrec A蛋白類似
蛋白は、Dループ生成の反応を、ATPの助けによって
10万〜100万倍も加速する。即ち、これらの蛋白を
利用すると、ごく微量のDNAを用いて、短時間で高い
収率でDループを作らせる事ができる。(柴田武彦(1
986)。rec A蛋白によるDNA組換え反応、醸
造協会誌81:86)ところが、単離状態では非常に安
定な閉環状二重鎖DNA上のDループは、反応液の中で
は、Dループ形成を行うrec A蛋白そのものの働き
によって、形成の後、二重鎖DNAと単鎖DNAとに解
離されてしまう。そこで、高い収率で閉環状二重鎖DN
Aの上にDループを得るには、rec A蛋白の量また
は、反応の時間を、用いる2種類のDNAの量に応じて
厳密に調節しなければならない。この特性は、rec
A蛋白によるDループ形成を技術として利用する場合、
非常に不利である。
蛋白は、Dループ生成の反応を、ATPの助けによって
10万〜100万倍も加速する。即ち、これらの蛋白を
利用すると、ごく微量のDNAを用いて、短時間で高い
収率でDループを作らせる事ができる。(柴田武彦(1
986)。rec A蛋白によるDNA組換え反応、醸
造協会誌81:86)ところが、単離状態では非常に安
定な閉環状二重鎖DNA上のDループは、反応液の中で
は、Dループ形成を行うrec A蛋白そのものの働き
によって、形成の後、二重鎖DNAと単鎖DNAとに解
離されてしまう。そこで、高い収率で閉環状二重鎖DN
Aの上にDループを得るには、rec A蛋白の量また
は、反応の時間を、用いる2種類のDNAの量に応じて
厳密に調節しなければならない。この特性は、rec
A蛋白によるDループ形成を技術として利用する場合、
非常に不利である。
そこで本発明はこのようなrec A蛋白様蛋白の持つ
特性を改良し、容易にDループを形成する方法を提供す
ることを目的とする。
特性を改良し、容易にDループを形成する方法を提供す
ることを目的とする。
本発明は、閉環状二重鎖DNAと該二重鎖DNAと共通
の塩基配列を有する単鎖DNA断片とをrec A蛋白
様蛋白と抗recA蛋白様蛋白単クローン抗体とで処理
することからなる閉環状二重IJI D N AにDル
ープ構造を形成する方法に関する。
の塩基配列を有する単鎖DNA断片とをrec A蛋白
様蛋白と抗recA蛋白様蛋白単クローン抗体とで処理
することからなる閉環状二重IJI D N AにDル
ープ構造を形成する方法に関する。
以下本発明について説明する。
本発明において用いる閉環状二重鎖DNAとしては、既
知、未知を問わずいかなる閉環状二重鎖DNAであって
もよい。また、単鎖DNA断片は、該二重鎖D N A
と共通の塩基配列を有するものであれば、DNAの大き
さ等に特に制限はない。
知、未知を問わずいかなる閉環状二重鎖DNAであって
もよい。また、単鎖DNA断片は、該二重鎖D N A
と共通の塩基配列を有するものであれば、DNAの大き
さ等に特に制限はない。
本発明に用いるrecA蛋白様蛋白としては、例えば大
腸菌rec A蛋白並びに類似蛋白であるT4ファージ
由来のuvs X蛋白、枯草菌由来のrec蛋白及び黒
穂菌(Ustilago)由来のrec l蛋白等を挙
げることができる。これらの蛋白は例えば(rec A
;5hibata et al、 (1983)
!Jethods in Enzymologyloo
:197. uvsX ;Yonesaki et a
l、 (1985)εur。
腸菌rec A蛋白並びに類似蛋白であるT4ファージ
由来のuvs X蛋白、枯草菌由来のrec蛋白及び黒
穂菌(Ustilago)由来のrec l蛋白等を挙
げることができる。これらの蛋白は例えば(rec A
;5hibata et al、 (1983)
!Jethods in Enzymologyloo
:197. uvsX ;Yonesaki et a
l、 (1985)εur。
J、 Biochem、 148:127. rec蛋
白;Lovett andRoberts (1985
) J、Biol、 Chem、260:3305゜r
ec 1;Kmiec and Hollman (1
9B2) Ce1l 29:3677 〕の記載に基い
て単離することができる。
白;Lovett andRoberts (1985
) J、Biol、 Chem、260:3305゜r
ec 1;Kmiec and Hollman (1
9B2) Ce1l 29:3677 〕の記載に基い
て単離することができる。
また抗recΔ蛋白様蛋白単クローン抗体の代表例とし
ては、ARM193が挙げられ、例えば牧野らの方法(
Makinoら(1985) J、Biol、Chem
、260:15402)によって入手することができる
。
ては、ARM193が挙げられ、例えば牧野らの方法(
Makinoら(1985) J、Biol、Chem
、260:15402)によって入手することができる
。
rec A蛋白に対して作った単クローン抗体はそれぞ
れ、rec A蛋白のもつ多種類の活性に対して様々な
異なる挙動を示す(Makinoら(1985)J、
Biol、 Chem、260 :15402)。その
中の一群の単クローン抗体(たとえばARM193)は
、recA蛋白によるDループ形成の反応をあまり阻害
しないが、recA蛋白による閉環状二重鎖DNA上の
Dルーズの解離反応を強く阻害する。
れ、rec A蛋白のもつ多種類の活性に対して様々な
異なる挙動を示す(Makinoら(1985)J、
Biol、 Chem、260 :15402)。その
中の一群の単クローン抗体(たとえばARM193)は
、recA蛋白によるDループ形成の反応をあまり阻害
しないが、recA蛋白による閉環状二重鎖DNA上の
Dルーズの解離反応を強く阻害する。
そこで、recA蛋白による負の超ラセンをもつ閉環状
二重鎖DNAと単鎖DNAとを基質とするDループ形成
反応の系に、この抗体くたとえばA R!、(193)
をrecA蛋白に対して十分量加えると、Dループの解
離を抑え、高い収率でDループを得ることができるよう
になる。この場合、rec A蛋白の量は単に単鎖DN
Aに対して十分量で有れば良く(予測されるDNA量に
対し余分に加えるだけで良い)、また反応時間も30分
もあれば十分であり、抗体を使わない時のような蛋白量
、時間の厳密な調節は不要となる。
二重鎖DNAと単鎖DNAとを基質とするDループ形成
反応の系に、この抗体くたとえばA R!、(193)
をrecA蛋白に対して十分量加えると、Dループの解
離を抑え、高い収率でDループを得ることができるよう
になる。この場合、rec A蛋白の量は単に単鎖DN
Aに対して十分量で有れば良く(予測されるDNA量に
対し余分に加えるだけで良い)、また反応時間も30分
もあれば十分であり、抗体を使わない時のような蛋白量
、時間の厳密な調節は不要となる。
以下本発明を実施例により説明する。
実施例
1、材 料
(1) recA蛋白、3Hで標識したファージfd
複製中間体(RFI)DNA(負の超ラセンをもつ閉環
状二重鎖DNA)、ファージfdのファージ粒子の単鎖
DNAの断片;これらは柴田ら(1933)Metho
ds in Enzymolosy、 vol、
IQQ。
複製中間体(RFI)DNA(負の超ラセンをもつ閉環
状二重鎖DNA)、ファージfdのファージ粒子の単鎖
DNAの断片;これらは柴田ら(1933)Metho
ds in Enzymolosy、 vol、
IQQ。
pp、197の記述にしたがって調製した。
(2)抗rec A蛋白単クローン抗体;ΔRM193
を!Jakino et al、 (1985) J、
Biol、Chem、 260:15402の記述
にしたがってアフィニティークロマトによって調製して
用いた。
を!Jakino et al、 (1985) J、
Biol、Chem、 260:15402の記述
にしたがってアフィニティークロマトによって調製して
用いた。
2、反応液
31 mM Tris−HCjl!緩衝液(pH7,5
)、13m1化マグネシウム、1.8mM ジチオスレ
イトール、88μ/−牛血清アルブミン、1.3mMA
TPSATP再生系(7,8mM リン酸クレアチン、
リン酸タレアチンキナーゼ)、3.7μM(ヌクレオチ
ド残基で> [311] fd RF I DNA
。
)、13m1化マグネシウム、1.8mM ジチオスレ
イトール、88μ/−牛血清アルブミン、1.3mMA
TPSATP再生系(7,8mM リン酸クレアチン、
リン酸タレアチンキナーゼ)、3.7μM(ヌクレオチ
ド残基で> [311] fd RF I DNA
。
0.40μM (ヌクレオチド残基で)fd単鎖DNA
断片、0.50 μM recA蛋白、0.50 /、
fM ARM193゜反応液の体積は21p12〜0.
2ml。
断片、0.50 μM recA蛋白、0.50 /、
fM ARM193゜反応液の体積は21p12〜0.
2ml。
3、反 応
ATP、塩化マグネシウム、単鎖DNA、二重鎖DNA
5ATP再生系を除いた反応液の中で、rec A蛋白
とARM 193とを37度で5分間保温した。次に、
塩化マグネシウム、2種類のDNA5ATP再生系(A
TPは無し)を加え、さらに2分間37度で保温した。
5ATP再生系を除いた反応液の中で、rec A蛋白
とARM 193とを37度で5分間保温した。次に、
塩化マグネシウム、2種類のDNA5ATP再生系(A
TPは無し)を加え、さらに2分間37度で保温した。
Dループ形成反応はATPを添加することによって開始
した。第2図に示した時間、37度で保温した後、20
μβずつサンプルとして採取した。
した。第2図に示した時間、37度で保温した後、20
μβずつサンプルとして採取した。
採取したサンプルはEDTAと5arkosylとによ
って処理し、蛋白を除いた後、Dループアッセイ(柴田
ら(1983)Methods in Enzymol
osy、vol。
って処理し、蛋白を除いた後、Dループアッセイ(柴田
ら(1983)Methods in Enzymol
osy、vol。
100 、 pp、 197 )によって、できたD
ループの量を測定した。できたDループの量は、Dルー
プとなったRFIDNAの反応系に加えたRFI DN
Aに対する百分率で表した。第2図において・は上記の
反応によってできたDループの量を示す。Oは抗体(A
RM193)を加えなかった時のDループの量の時間変
化を示す。閣は上記の反応系のfdのファージ単鎖D
N A断片をφx174のファージ単鎖DNA断片に置
き換えた場合を示す。φX174とfdとは互いに相同
な塩基配列は持たないので、Dループはできない。口は
φX174の単鎖DNA断片を用い、更に、ARM19
3を除いた場合を示す。
ループの量を測定した。できたDループの量は、Dルー
プとなったRFIDNAの反応系に加えたRFI DN
Aに対する百分率で表した。第2図において・は上記の
反応によってできたDループの量を示す。Oは抗体(A
RM193)を加えなかった時のDループの量の時間変
化を示す。閣は上記の反応系のfdのファージ単鎖D
N A断片をφx174のファージ単鎖DNA断片に置
き換えた場合を示す。φX174とfdとは互いに相同
な塩基配列は持たないので、Dループはできない。口は
φX174の単鎖DNA断片を用い、更に、ARM19
3を除いた場合を示す。
抗体が無い場合には一度できたDループが反応時間の経
過と共に完全に解離されてしまうが、抗体ARM 19
3が有る場合には、10分で50%の閉環状二重鋼D
N AがDループになり、1時間経過してもそのままの
量を保っている。
過と共に完全に解離されてしまうが、抗体ARM 19
3が有る場合には、10分で50%の閉環状二重鋼D
N AがDループになり、1時間経過してもそのままの
量を保っている。
第1図はDループを形成している閉環状二重鋼DNAを
示し、第2図は、実施例の結果であるDループ形成の経
時変化を示す。 単鎖DNA1fi−片 閉環状二M鎖DNA
示し、第2図は、実施例の結果であるDループ形成の経
時変化を示す。 単鎖DNA1fi−片 閉環状二M鎖DNA
Claims (4)
- (1)閉環状二重鎖DNAと該二重鋼DNAと共通の塩
基配列を有する重鎖DNA断片とをrecA蛋白様蛋白
と抗recA蛋白様蛋白単クローン抗体で処理すること
からなる閉環状二重鎖DNAにDループ構造を形成する
方法。 - (2)recA蛋白様蛋白が大腸菌recA蛋白である
特許請求の範囲第(1)項記載の方法。 - (3)recA蛋白様蛋白がT4ファージ由来のuvs
X蛋白、枯草菌由来のrec蛋白又は黒穂菌(Usti
lago)由来のrec1蛋白である特許請求の範囲第
(1)項記載の方法。 - (4)抗recA蛋白様蛋白単クローン抗体がARM1
93である特許請求の範囲第(1)項記載の方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP25499386A JPS63109781A (ja) | 1986-10-27 | 1986-10-27 | recA蛋白様蛋白と抗recA蛋白様蛋白単クロ−ン抗体とを併用した簡便なDル−プ生成法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP25499386A JPS63109781A (ja) | 1986-10-27 | 1986-10-27 | recA蛋白様蛋白と抗recA蛋白様蛋白単クロ−ン抗体とを併用した簡便なDル−プ生成法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPS63109781A true JPS63109781A (ja) | 1988-05-14 |
Family
ID=17272719
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP25499386A Pending JPS63109781A (ja) | 1986-10-27 | 1986-10-27 | recA蛋白様蛋白と抗recA蛋白様蛋白単クロ−ン抗体とを併用した簡便なDル−プ生成法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JPS63109781A (ja) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH04117237A (ja) * | 1990-09-05 | 1992-04-17 | Nippon Fillester Co Ltd | 採卵装置 |
EP0687738A1 (en) * | 1993-12-28 | 1995-12-20 | Daikin Industries, Ltd. | IN-SITU HYBRIDIZATION METHOD USING RecA PROTEIN AND RecA PROTEIN HAVING MARKER OR LIGAND FOR USE IN SAID METHOD |
US7229767B2 (en) | 2001-03-27 | 2007-06-12 | University Of Delaware | Genomics applications for modified OLIGO nucleotides |
-
1986
- 1986-10-27 JP JP25499386A patent/JPS63109781A/ja active Pending
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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