JPH1132772A - Heat-stable ribonuclease h and dna coding for the enzyme - Google Patents

Heat-stable ribonuclease h and dna coding for the enzyme

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JPH1132772A
JPH1132772A JP9198960A JP19896097A JPH1132772A JP H1132772 A JPH1132772 A JP H1132772A JP 9198960 A JP9198960 A JP 9198960A JP 19896097 A JP19896097 A JP 19896097A JP H1132772 A JPH1132772 A JP H1132772A
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dna
protein
amino acid
acid sequence
ribonuclease
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JP9198960A
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Japanese (ja)
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Shigenori Kanetani
茂則 金谷
Mitsuru Haruki
満 春木
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Mitsubishi Chemical Corp
Original Assignee
Mitsubishi Chemical Corp
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide the subject new DNA composed of a DNA coding for a protein having a specific amino acid sequence and heat-stable ribonuclease activity and usable e.g. for the production of the above enzyme useful as a reagent for genetic engineering, diagnosis of abnormality of gene, etc. SOLUTION: This new DNA codes for a protein composed of an amino acid sequence expressed by the formula or a protein composed of an amino acid sequence of the formula wherein one or several amino acids are depleted, substituted or added and having a heat-stable ribonuclease activity comparable to that of the protein of the formula. The DNA is useful e.g. for the production of a heat-stable ribonuclease for genetic engineering reagents such as a cycling probe reagent or diagnostic agents for the abnormality of gene, etc. The new DNA can be produced from ultra-high thermophilic archaebacteria Pyrococcus sp.KOD1 strain by the cloning by shot gun cloning method using a ribonuclease- dependent temperature-sensitive E.coli mutant as a host.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、耐熱性リボヌクレ
アーゼH及びそれをコードするDNAに関する。
The present invention relates to a thermostable ribonuclease H and a DNA encoding the same.

【0002】[0002]

【従来の技術】リボヌクレアーゼHは、DNA/RNA
ハイブリッドのRNA鎖のみを加水分解するので、cD
NA合成の際の鋳型RNAの除去に利用される等、遺伝
子工学用試薬として利用されている。また、リボヌクレ
アーゼHは、最近になって、遺伝子異常の診断法として
注目されているサイクリングプローブ法においても使用
されるものである。
BACKGROUND OF THE INVENTION Ribonuclease H is a DNA / RNA
Since only the hybrid RNA strand is hydrolyzed, cD
It is used as a reagent for genetic engineering, for example, used for removing template RNA during NA synthesis. Ribonuclease H is also used in the cycling probe method, which has recently attracted attention as a diagnostic method for genetic abnormalities.

【0003】サイクリングプローブ法は、両端がDNA
で中央部がRNAでできているDNA−RNA−DNA
鎖をプローブとして用い、変異型DNAを検出する方法
である。DNA−RNA−DNA鎖のRNA部分は、標
的DNAの変異部分に相補的になるように作成されてお
り、このプローブをDNAサンプルと対合させる。リボ
ヌクレアーゼHは、このプローブと変異型DNAが2本
鎖を形成したときはそのDNA/RNAハイブリッド領
域を基質として認識しプローブをRNA部分で切断す
る。一方、このプローブが野生型DNAと2本鎖を形成
したときにはDNA/RNAハイブリッドが完全には形
成されないので、このプローブはリボヌクレアーゼHに
より切断されない。従って、切断されたプローブの断片
を検出することによりDNAサンプル中に変異型DNA
が存在するかどうかを調べることができる。変異型DN
Aの量がごく微量であったとしても、サーマルサイクラ
ーにより一連の反応を繰り返せば、プローブを何回でも
切断できるので、プローブ断片が蓄積することになり、
結果としてその検出が可能となる。この方法では、サー
マルサイクラーを用いるので、耐熱性リボヌクレアーゼ
Hを使用することが極めて有利である。
[0003] The cycling probe method uses DNA at both ends.
DNA-RNA-DNA in the center of which is made of RNA
In this method, a mutant DNA is detected using a strand as a probe. The RNA portion of the DNA-RNA-DNA strand is prepared so as to be complementary to the mutated portion of the target DNA, and this probe is paired with the DNA sample. When the probe and the mutant DNA form a double strand, ribonuclease H recognizes the DNA / RNA hybrid region as a substrate and cleaves the probe at the RNA portion. On the other hand, when this probe forms a double strand with wild-type DNA, a DNA / RNA hybrid is not completely formed, and therefore, this probe is not cleaved by ribonuclease H. Therefore, by detecting the fragment of the cleaved probe, the mutant DNA is contained in the DNA sample.
Can be checked to see if it exists. Mutant DN
Even if the amount of A is very small, if a series of reactions is repeated by a thermal cycler, the probe can be cut any number of times, so that probe fragments will accumulate,
As a result, its detection becomes possible. In this method, since a thermal cycler is used, it is extremely advantageous to use thermostable ribonuclease H.

【0004】耐熱性リボヌクレアーゼHとしては、高度
好熱菌Thermus thermophilus HB8由来のものが知られて
いる(Nucleic Acids Research, 19, 4443-4449(199
1))。しかしながら、さらに耐熱性に優れるリボヌクレ
アーゼHが得られれば、サイクリングプローブ法用試薬
等として一層有用である。
[0004] As the thermostable ribonuclease H, those derived from the thermophilic bacterium Thermus thermophilus HB8 are known (Nucleic Acids Research, 19, 4443-4449 (199).
1)). However, if ribonuclease H having more excellent heat resistance can be obtained, it is more useful as a reagent for a cycling probe method and the like.

【0005】[0005]

【発明が解決しようとする課題】本発明は、耐熱性に優
れたリボヌクレアーゼH及びそれをコードするDNAを
得ることを課題とする。
An object of the present invention is to obtain ribonuclease H having excellent heat resistance and a DNA encoding the same.

【0006】[0006]

【課題を解決するための手段】本発明者らは、超好熱始
原菌Pyrococcus sp. KOD1株より、リボヌクレアーゼH
遺伝子をクローニングすることに成功し、本発明を完成
するに至った。
Means for Solving the Problems The inventors of the present invention prepared a ribonuclease H from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus sp. Strain KOD1.
The gene was successfully cloned, and the present invention was completed.

【0007】すなわち本発明は、以下の(a)又は
(b)のタンパク質をコードするDNA(以下、本発明
DNAともいう)を提供する。 (a)配列番号2のアミノ酸配列からなるタンパク質 (b)配列番号2のアミノ酸配列において1若しくは数
個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸
配列からなり、かつ(a)のタンパク質と同等の耐熱性
のリボヌクレアーゼH活性を有するタンパク質
That is, the present invention provides a DNA encoding the following protein (a) or (b) (hereinafter, also referred to as the DNA of the present invention). (A) a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 (b) consisting of an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and equivalent to the protein of (a) With heat-resistant ribonuclease H activity

【0008】本発明DNAは、好ましくは、配列番号2
のアミノ酸配列からなるタンパク質をコードする。本発
明DNAとして、具体的には、上記(a)又は(b)の
タンパク質をコードする以下の(c)又は(d)の塩基
配列を有するDNAが挙げられる。 (c)配列番号1に示す塩基配列における塩基番号18
1〜864の塩基配列を有するDNA (d)(c)のDNAの塩基配列に相補的な塩基配列を
有するDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダ
イズするDNA
[0008] The DNA of the present invention preferably comprises SEQ ID NO: 2.
Encodes a protein consisting of the amino acid sequence of Specific examples of the DNA of the present invention include a DNA having the following base sequence (c) or (d), which encodes the protein (a) or (b). (C) base number 18 in the base sequence shown in SEQ ID NO: 1
DNA having a base sequence of 1 to 864 DNA that hybridizes under stringent conditions with DNA having a base sequence complementary to the base sequence of the DNA of (d) and (c)

【0009】また、本発明は、以下の(a)又は(b)
のタンパク質からなる耐熱性リボヌクレアーゼH(以
下、本発明酵素ともいう)を提供する。 (a)配列番号2のアミノ酸配列からなるタンパク質 (b)配列番号2のアミノ酸配列において1若しくは数
個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸
配列からなり、かつ(a)のタンパク質と同等の耐熱性
のリボヌクレアーゼH活性を有するタンパク質
Further, the present invention provides the following (a) or (b)
Heat-stable ribonuclease H (hereinafter, also referred to as the enzyme of the present invention) comprising the protein of the present invention. (A) a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 (b) consisting of an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and equivalent to the protein of (a) With heat-resistant ribonuclease H activity

【0010】本発明酵素は、好ましくは、配列番号2の
アミノ酸配列からなるタンパク質からなる。Thermus th
ermophilus HB8等の好熱菌(高度好熱菌)の生育至適温
度が80℃前後であるのに対し、超好熱菌の生育至適温
度は90℃前後であるので、超好熱菌に由来する本発明
酵素は、好熱菌由来のリボヌクレアーゼHよりも高い耐
熱性を有することが期待される。
The enzyme of the present invention preferably comprises a protein having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. Thermus th
The optimum temperature for the growth of thermophiles (extreme thermophiles) such as ermophilus HB8 is around 80 ° C, while the optimum temperature for the growth of hyperthermophiles is around 90 ° C. The derived enzyme of the present invention is expected to have higher thermostability than ribonuclease H derived from thermophilic bacteria.

【0011】[0011]

【発明の実施の形態】以下、本発明を詳細に説明する。
本発明DNAは、耐熱性に優れたリボヌクレアーゼH
(以下、RNaseHともいう)、すなわち、以下の
(a)又は(b)のタンパク質をコードする。 (a)配列番号2に示すアミノ酸配列を有するタンパク
質をコードするDNA (b)配列番号2に示すアミノ酸配列において1若しく
は数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミ
ノ酸配列から成り、かつ(a)のタンパク質と同等の耐
熱性のRNaseH活性を有するタンパク質
DESCRIPTION OF THE PREFERRED EMBODIMENTS The present invention will be described below in detail.
The DNA of the present invention is a ribonuclease H having excellent heat resistance.
(Hereinafter, also referred to as RNaseH), that is, encodes the following protein (a) or (b): (A) a DNA encoding a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2; (b) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, and ( A protein having RNaseH activity having the same thermostability as the protein of a)

【0012】アミノ酸残基の置換、欠失又は挿入は、部
位特異的突然変異などの公知の方法によって塩基配列に
ヌクレオチドの置換、欠失、挿入などの変異を導入する
ことによって生じさせることができる。RNaseH活
性の測定方法及びその耐熱性の評価方法は公知であり
(例えば、J. Biol. Chem. 266, 6038-6044(1991)及び
J. Biol. Chem. 267, 21535-21542(1992)参照)、この
耐熱性のRNaseH活性を実質的に害さない1以上の
アミノ酸残基の置換、欠失又は挿入を当業者は容易に選
択することができる。
Substitution, deletion or insertion of an amino acid residue can be caused by introducing a mutation such as nucleotide substitution, deletion or insertion into a nucleotide sequence by a known method such as site-directed mutation. . A method for measuring RNase H activity and a method for evaluating its heat resistance are known (for example, J. Biol. Chem. 266, 6038-6044 (1991) and
J. Biol. Chem. 267, 21535-21542 (1992)), one of ordinary skill in the art readily selects substitutions, deletions or insertions of one or more amino acid residues that do not substantially impair the thermostable RNaseH activity. be able to.

【0013】好ましくは、(b)のタンパク質のアミノ
酸配列は、(a)のタンパク質のアミノ酸配列と80%
以上、さらに好ましくは90%以上の相同性を有する。
また、タンパク質の構造の一部を、自然又は人工の突然
変異によって耐熱性のRNaseH活性を実質的に変え
ずに変化させることも可能である。本発明DNAのコー
ドするタンパク質は、上記(a)のタンパク質の同種変
異型に相当する構造を有するタンパク質も包含する。
[0013] Preferably, the amino acid sequence of the protein of (b) is 80% different from the amino acid sequence of the protein of (a).
The homology is at least 90% or more.
In addition, a part of the structure of the protein can be changed by a natural or artificial mutation without substantially changing the thermostable RNaseH activity. The protein encoded by the DNA of the present invention also includes a protein having a structure corresponding to the homologous variant of the above-mentioned protein (a).

【0014】本発明DNAの具体例としては、上記
(a)又は(b)のタンパク質をコードする以下の
(c)又は(d)の塩基配列を有するDNAが挙げられ
る。 (c)配列番号1に示す塩基配列における塩基番号18
1〜864の塩基配列からなるDNA (d)このDNAの塩基配列に相補的な塩基配列を有す
るDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズ
するDNA
Specific examples of the DNA of the present invention include a DNA having the following base sequence (c) or (d), which encodes the protein (a) or (b). (C) base number 18 in the base sequence shown in SEQ ID NO: 1
DNA consisting of a base sequence of 1 to 864 (d) DNA which hybridizes with a DNA having a base sequence complementary to the base sequence of this DNA under stringent conditions

【0015】ここでストリンジェントな条件とは、いわ
ゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイ
ブリッドが形成されない条件をいう。この条件を明確に
数値化することは困難であるが、一例を示せば、相同性
が高い核酸同士、例えば完全にマッチしたハイブリッド
のTmから該Tmより10℃低い温度までの範囲の温
度、あるいは80%以上の相同性を有するDNA同士が
ハイブリダイズし、それより相同性が低い核酸同士がハ
イブリダイズしない条件が挙げられる。
Here, the stringent conditions refer to conditions under which a so-called specific hybrid is formed and a non-specific hybrid is not formed. Although it is difficult to clearly quantify these conditions, as an example, nucleic acids having high homology, for example, a temperature ranging from Tm of a perfectly matched hybrid to a temperature 10 ° C. lower than the Tm, or A condition is such that DNAs having homology of 80% or more hybridize and nucleic acids having lower homology do not hybridize.

【0016】上述のように、RNaseH活性の測定方
法及びその耐熱性の評価方法は公知であり、上記(c)
のDNAの塩基配列に相補的な塩基配列を有するDNA
とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDN
Aからこの耐熱性のRNaseH活性を有するタンパク
質をコードするDNA(すなわち上記(d)のDNA)
を、当業者は容易に選択することができる。
As described above, a method for measuring RNase H activity and a method for evaluating its heat resistance are known and are described in the above (c).
Having a nucleotide sequence complementary to the nucleotide sequence of the DNA
That hybridizes under stringent conditions with DNA
A to DNA encoding the heat-resistant protein having RNase H activity (ie, the DNA of (d) above)
Can be easily selected by those skilled in the art.

【0017】本発明DNAは、好ましくは配列番号2に
示すアミノ酸配列をコードするものであり、さらに好ま
しくは上記(c)のDNAである。本発明DNAは、2
本鎖であっても1本鎖であってもよく、また、RNAと
2本鎖を形成してもよい。
The DNA of the present invention preferably encodes the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, and is more preferably the DNA of the above (c). The DNA of the present invention is 2
It may be single-stranded or single-stranded, or may form double-stranded with RNA.

【0018】本発明DNAは、本発明により後記実施例
に示すようにその塩基配列の一つ(配列番号1)が決定
されたので、この配列に基づいて合成することが可能で
ある。また、この塩基配列に基づいて作成したオリゴヌ
クレオチドプライマー又はプローブを用いたPCR又は
ハイブリダイゼーションによって超好熱始原菌染色体D
NAから得ることもできる。あるいは、超好熱始原菌の
cDNAライブラリーを、上記塩基配列の全部又は一部
を有するポリヌクレオチドをプローブとしてスクリーニ
ングすることによっても得ることができる。
The DNA of the present invention can be synthesized based on one of its base sequences (SEQ ID NO: 1) determined by the present invention, as shown in the Examples below. The hyperthermophilic primordial chromosome D is obtained by PCR or hybridization using oligonucleotide primers or probes prepared based on this base sequence.
It can also be obtained from NA. Alternatively, the cDNA library of the hyperthermophilic archaeon can be obtained by screening using a polynucleotide having all or a part of the above nucleotide sequence as a probe.

【0019】本発明酵素は、本発明DNAがコードす
る、以下の(a)又は(b)のタンパク質である。 (a)配列番号2のアミノ酸配列からなるタンパク質 (b)配列番号2のアミノ酸配列において1若しくは数
個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸
配列からなり、かつ(a)のタンパク質と同等の耐熱性
のRNaseH活性を有するタンパク質
The enzyme of the present invention is the following protein (a) or (b) encoded by the DNA of the present invention. (A) a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 (b) consisting of an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and equivalent to the protein of (a) Heat-resistant RNase H-active protein

【0020】上述のように、この耐熱性のRNaseH
活性を実質的に害さない1以上のアミノ酸残基の置換、
欠失又は置換は当業者であれば容易に選択することがで
きる。
As described above, this heat-resistant RNase H
Substitution of one or more amino acid residues that does not substantially impair activity;
Deletions or substitutions can be readily selected by those skilled in the art.

【0021】好ましくは、(b)のタンパク質のアミノ
酸配列は、(a)のタンパク質のアミノ酸配列と80%
以上、さらに好ましくは90%以上の相同性を有する。
また、本発明酵素には、タンパク質の構造の一部が、自
然又は人工の突然変異によって耐熱性のRNaseH活
性を実質的に変えずに変化した、配列番号2に示すアミ
ノ酸配列を有するポリペプチドの同種変異型に相当する
構造を有するタンパク質も包含される。
Preferably, the amino acid sequence of the protein (b) is 80% different from the amino acid sequence of the protein (a).
The homology is at least 90% or more.
Further, the enzyme of the present invention includes a polypeptide having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 in which a part of the structure of the protein is changed by a natural or artificial mutation without substantially changing the thermostable RNaseH activity. A protein having a structure corresponding to the homologous variant is also included.

【0022】配列番号2のアミノ酸配列は、大腸菌をは
じめとする種々の生物由来のRNaseHIIのアミノ酸
配列とホモロジーを有し、特に、メタン菌(Methanococc
us jyannaschii)のRNaseHIIのアミノ酸配列と3
8%のホモロジーを有するので、本発明酵素は、RNa
seHIIであると考えられる。
The amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 has homology to the amino acid sequences of RNase HII derived from various organisms including Escherichia coli.
us jyannaschii) RNase HII amino acid sequence and 3
Since the enzyme of the present invention has 8% homology,
It is considered to be seHII.

【0023】本発明酵素は、本発明DNAを細胞に導入
して形質転換された細胞を得、形質転換された細胞を、
好適な培地で培養し、本発明酵素を培養物中に生成蓄積
させ、その培養物から該酵素を採取することによって製
造することができる。
The enzyme of the present invention is obtained by introducing the DNA of the present invention into a cell to obtain a transformed cell.
It can be produced by culturing in a suitable medium, producing and accumulating the enzyme of the present invention in the culture, and collecting the enzyme from the culture.

【0024】本発明DNAの細胞への導入は、公知の発
現ベクターに本発明DNAを挿入して組換えプラスミド
を構築し、この組換えプラスミドを導入することによっ
て行うことができる。
The DNA of the present invention can be introduced into cells by inserting the DNA of the present invention into a known expression vector, constructing a recombinant plasmid, and introducing the recombinant plasmid.

【0025】細胞及び発現ベクターとしては、外来タン
パク質の発現に通常用いられる宿主−ベクター系を使用
することができ、例としては、大腸菌等の原核細胞とそ
れに適した発現ベクター(例えば、大腸菌MIC3001株と
ベクターpJLA503)、哺乳類細胞等の真核細胞とそれに
適した発現ベクターの組み合わせが挙げられる。培地や
培養条件は、用いる細胞に合わせて適宜選択される。
As the cell and the expression vector, a host-vector system usually used for the expression of a foreign protein can be used. For example, prokaryotic cells such as E. coli and an expression vector suitable therefor (for example, E. coli MIC3001 strain) And the vector pJLA503), eukaryotic cells such as mammalian cells, and suitable expression vectors. The medium and culture conditions are appropriately selected according to the cells used.

【0026】本発明酵素は、単独に発現させてもよい
し、他のタンパク質との融合タンパク質として発現させ
てもよい。また、本発明酵素は全長を発現させてもよい
し、一部を部分ペプチドとして発現させてもよい。
The enzyme of the present invention may be expressed alone, or may be expressed as a fusion protein with another protein. Further, the enzyme of the present invention may be expressed in its full length, or may be partially expressed as a partial peptide.

【0027】培養物とは、培地および当該培地中の細胞
であり、培養物からの本発明酵素の採取は、上記の本発
明酵素の活性等を指標にして、菌体破砕、硫安分画、陰
イオン交換クロマトグラフィーなどの公知のタンパク質
の精製手段によって行うことができる。また、本発明酵
素は耐熱性であるため、宿主由来のタンパク質等を熱処
理により変性させることで精製が容易になるので、精製
において熱処理を行うことが好ましい。精製方法の一例
としては、培養により得られた細胞を超音波処理により
破砕し、得られた抽出液を90℃で15分間熱処理した
後、硫安分画(70%飽和の硫安で沈殿)を行い、次い
でDE-52カラム等を用いる陰イオン交換クロマトグラフ
ィーを行う方法が挙げられる。
The culture is a medium and cells in the medium. The enzyme of the present invention can be collected from the culture by using the above-mentioned activity of the enzyme of the present invention as an index to disrupt cells, fractionate ammonium sulfate, It can be performed by known protein purification means such as anion exchange chromatography. In addition, since the enzyme of the present invention is heat-resistant, purification can be easily performed by denaturing a host-derived protein or the like by heat treatment. Therefore, heat treatment is preferably performed in the purification. As an example of a purification method, cells obtained by culturing are disrupted by sonication, and the obtained extract is heat-treated at 90 ° C. for 15 minutes, and then subjected to ammonium sulfate fractionation (precipitation with 70% saturated ammonium sulfate). Followed by anion exchange chromatography using a DE-52 column or the like.

【0028】[0028]

【実施例】以下、本発明を実施例によりさらに具体的に
説明する。
EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described more specifically with reference to examples.

【0029】[0029]

【実施例1】耐熱性RNaseHをコードするDNAの
クローニング (1)ショットガンクローニング 超好熱始原菌Pyrococcus sp. KOD1株由来のRNase
HをコードするDNAを取得するために、ショットガン
クローニングを行った。ショットガンクローニングの宿
主としては、RNaseH依存性温度感受性変異株であ
る大腸菌MIC3001株を用いた。この菌株においてはRN
aseHI遺伝子が欠損しておりRecB遺伝子も温度
感受性の遺伝子に置き換えられているので、この菌株は
30℃では生育するものの42℃では生育できない。し
かしながら、42℃でも活性を有するRNaseHやR
ecBタンパク質をコードするDNAを含むプラスミド
で形質転換されると、MIC3001株は温度感受性ではなく
なり、42℃でも生育可能となる。
[Example 1] Cloning of DNA encoding thermostable RNase H (1) Shotgun cloning RNase derived from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus sp. KOD1 strain
Shotgun cloning was performed to obtain DNA encoding H. As a host for shotgun cloning, Escherichia coli MIC3001 strain, an RNaseH-dependent temperature-sensitive mutant, was used. In this strain, RN
Since the aseHI gene has been deleted and the RecB gene has been replaced by a temperature-sensitive gene, this strain grows at 30 ° C but cannot grow at 42 ° C. However, RNaseH or R
When transformed with a plasmid containing DNA encoding ecB protein, strain MIC3001 is no longer temperature sensitive and can grow at 42 ° C.

【0030】Pyrococcus sp. KOD1株(Gene 166, 139-1
43(1995)、大阪大学工学部 物質・生命工学専攻 森川
正章助教授より恵与)から染色体DNAを調製し、調製
した染色体DNAを制限酵素BamHI又はHindIIIで切断し
た後、得られた断片をpBR322の対応する制限酵素部位に
挿入することにより、様々な挿入断片を持つプラスミド
の混合物を得た。これらの組換えプラスミドを用いて大
腸菌MIC3001株(三菱化学生命科学研究所 主任研究員
板谷光泰氏より恵与)を形質転換した。形質転換体を
42℃と30℃とにおいて各々インキュベートし、コロ
ニーの生育数を調べた。その結果、制限酵素としてBamH
Iを用いた場合に、42℃のプレートに11個のコロニ
ーの生育が見られた。30℃では約5000個のコロニーが
生育したので、温度感受性の相補率は約0.2%であっ
た。これらの11個のコロニーからプラスミドを抽出し
た後、様々な制限酵素による切断パターンを調べた。そ
の結果、得られたコロニーに由来のpBR322に挿入されて
いるDNA断片は、全て同じものでそのサイズは約3k
bpであった(以下、これらのプラスミドをpBR30
00と呼ぶ)。
Pyrococcus sp. KOD1 strain (Gene 166, 139-1)
43 (1995), Associate Professor Masaaki Morikawa, Department of Materials and Biotechnology, Faculty of Engineering, Osaka University) After preparing chromosomal DNA, cutting the prepared chromosomal DNA with restriction enzymes BamHI or HindIII, and obtaining the resulting fragment with Thus, a mixture of plasmids having various insertion fragments was obtained by insertion into the restriction enzyme sites. Escherichia coli MIC3001 strain (Mr. Mitsutaya Itaya, Senior Researcher, Mitsubishi Chemical Life Science Research Institute) was transformed with these recombinant plasmids. Transformants were incubated at 42 ° C. and 30 ° C., respectively, and the number of colonies grown was determined. As a result, BamH
When I was used, 11 colonies grew on the plate at 42 ° C. Since about 5000 colonies grew at 30 ° C., the complementation rate of the temperature sensitivity was about 0.2%. After extracting plasmids from these 11 colonies, the cleavage patterns by various restriction enzymes were examined. As a result, the DNA fragments inserted into pBR322 derived from the obtained colonies were all the same and had a size of about 3 k.
bp (hereinafter, these plasmids are called pBR30
00).

【0031】(2)DNAの塩基配列決定 pBR3000に挿入されているDNA断片の塩基配列
を決定した。決定された塩基配列及びその塩基配列から
予想されるアミノ酸配列を配列番号1に、アミノ酸配列
のみを配列番号2に示す。この塩基配列から予想される
タンパク質のアミノ酸残基数は228、分子量は257
99、等電点は5.4である。
(2) Determination of base sequence of DNA The base sequence of the DNA fragment inserted into pBR3000 was determined. The determined nucleotide sequence and the amino acid sequence predicted from the nucleotide sequence are shown in SEQ ID NO: 1, and only the amino acid sequence is shown in SEQ ID NO: 2. The number of amino acid residues of the protein predicted from this nucleotide sequence is 228, and the molecular weight is 257.
The isoelectric point is 5.4.

【0032】公知のアミノ酸配列に対するホモロジー検
索の結果、各種の輸送タンパク質、及び、RNaseH
IIと相同性が高いことが判明した。特に、同じ始原菌で
あるメタン細菌(Methanococcus jannaschii)においてR
NaseHIIと考えられているオープンリーディングフ
レームの配列と38%のホモロジーを有する。
As a result of homology search for known amino acid sequences, various transport proteins and RNaseH
It was found that the homology with II was high. In particular, in the same archaeon, methane bacteria (Methanococcus jannaschii), R
It has 38% homology with the sequence of the open reading frame thought to be NaseHII.

【0033】[0033]

【実施例2】耐熱性リボヌクレアーゼHの製造 (1)大量生産系の構築 実施例1で得られたpBR3000を鋳型DNAとし、NdeIの
制限酵素部位を含む5'-プライマー(TTAGGAGGTGAACATAT
GAAGATAGCGGGCATTGACGAGGC(配列番号3)、NdeI部位にア
ンダーラインを付記)とSalIの制限酵素部位を含む3'-
プライマー(GCGCGGTCGACCCTCGCGGCTGCCAGTTTTGCAT(配
列番号4)、SalI部位にアンダーラインを付記)とによ
り約720bpのDNA断片をPCR反応により増幅した。
PCR反応は市販のGene Amp Kit(Takara)の説明書に従
って行った。得られた約720bpのDNA断片を制限酵素N
deIとSalIとで切断した後、消化物を1.0%アガロースゲ
ル電気泳動にかけ、約720bpのDNA断片を切り出し抽
出して精製した。
Example 2 Production of Thermostable Ribonuclease H (1) Construction of Mass Production System Using pBR3000 obtained in Example 1 as a template DNA, a 5′-primer containing a NdeI restriction enzyme site (TTAGGAGGTGAA CATAT)
G AAGATAGCGGGCATTGACGAGGC (SEQ ID NO: 3; underlined at NdeI site) and 3'- including SalI restriction enzyme site
A primer (GCGCG GTCGAC CCTCGCGGCTGCCAGTTTTGCAT (SEQ ID NO: 4), underlined at the SalI site) was used to amplify a DNA fragment of about 720 bp by PCR.
The PCR reaction was performed according to the instructions of a commercially available Gene Amp Kit (Takara). The obtained DNA fragment of about 720 bp was digested with restriction enzyme N.
After digestion with deI and SalI, the digest was subjected to 1.0% agarose gel electrophoresis, and a DNA fragment of about 720 bp was cut out and extracted for purification.

【0034】次に、このようにして得られたDNA断片
を、大腸菌での発現ベクターpJLA503(Medac社(ドイツ)
より購入)にサブクローニングし、発現ベクターを構築
した。pJLA503においては、バクテリオファージラムダ
プロモーターPRとPLとからの転写が、温度感受性リプ
レッサーclts857の制御を受けているので、30〜32℃で
はこれらのプロモーターの下流に挿入した遺伝子の発現
は抑制されるのに対して、40〜42℃では遺伝子発現が誘
導される。プラスミドpJLA503をNdeIとSalIとで消化
し、約4.9kbのDNA断片を0.7%アガロースゲル電気泳
動により精製した後、上記約720bpのDNA断片とライ
ゲーションすることにより環化した。ライゲーションは
市販のライゲーションキット(Takara)を用い、添付の説
明書に従って行った。このようにして得られたプラスミ
ドpJAL700Kで大腸菌MIC3001株を形質転換し、耐熱性リ
ボヌクレアーゼHを大量発現する形質転換体MIC3001/pJ
AL700Kを得た。
Next, the thus obtained DNA fragment was used to transform the expression vector pJLA503 in Escherichia coli (Medac, Germany).
Subclone) to construct an expression vector. In PJLA503, transcription from the bacteriophage lambda promoter P R and P L is, since under the control of the temperature-sensitive repressor cl Ts857, expression of the gene was inserted downstream of 30 to 32 ° C. At these promoters In contrast, at 40-42 ° C, gene expression is induced. Plasmid pJLA503 was digested with NdeI and SalI, and a DNA fragment of about 4.9 kb was purified by 0.7% agarose gel electrophoresis, and then ligated with the above DNA fragment of about 720 bp for cyclization. Ligation was performed using a commercially available ligation kit (Takara) according to the attached instructions. Escherichia coli MIC3001 was transformed with the thus obtained plasmid pJAL700K, and a transformant MIC3001 / pJ expressing a large amount of thermostable ribonuclease H was transformed.
I got AL700K.

【0035】(2)精製 大腸菌形質転換体MIC3001/pJAL700Kを、100μg/lのアン
ピシリンを含むLB培地400 ml中、30℃で振盪培養し
た。培養液の600 nmにおける吸光度が0.5になった時点
で、培養温度を42℃に上げ、更に、4時間振盪培養を続
け、次いで遠心して集菌した。得られた菌体を、2 mM E
DTAを含む20 mMトリス塩酸緩衝液(pH 7.5)40 mlに懸濁
した後、氷中で超音波処理により菌体を破砕した。30,0
00rpmで30分間遠心して得た遠心上清(粗抽出液)を90
℃で15分間熱処理した後、最終濃度が70%飽和となるよ
うに硫安を加え、氷中30分間攪拌した後、30,000rpmで3
0分間遠心して沈殿を集めた。この沈殿を10 mlの5 mMト
リス塩酸緩衝液(pH 8.0)に溶かした後、同緩衝液に対し
て4℃で一晩透析した。その後、同緩衝液で平衡化した
DE-52カラムにかけた。本酵素はこの条件ではDE-52カラ
ムを素通りした。素通り画分を1 mM EDTAを含む10 mMト
リス塩酸緩衝液(pH 8.0)に対し4℃で一晩透析した。そ
の後、同緩衝液で平衡化したDE-52カラムにかけると本
酵素はカラムに吸着したので、NaCl濃度を0.5 Mまで直
線的に上昇させることにより、DE-52カラムから耐熱性
リボヌクレアーゼHを溶出させた。活性画分を集め、1
mM EDTA及び150 mM NaClを含む10 mMトリス塩酸緩衝液
(pH 8.0)に対して透析し、精製標品とした。精製標品は
15%SDS-PAGEで単一バンドを与えた。精製収量は、20〜
30 mg/l培養液であった。ゲル濾過でも精製標品は単一
ピークを与え、推定分子量は34,000であった。この値
は、SDS-PAGEから推定される分子量27,000に近いので、
本酵素は、単量体(モノマー)として機能することが示
唆された。本酵素の活性をトリチウムラベルしたM13-DN
A/RNAを基質として37℃で測定したところ、高度好熱菌T
hermus thermophilus HB8由来のRNaseHIと比較
して、約50%の比活性を示した。活性測定は公知の方法
(J. Biol. Chem. 266, 6038-6044(1991))により行っ
た。
(2) Purification The E. coli transformant MIC3001 / pJAL700K was shake-cultured at 30 ° C. in 400 ml of LB medium containing 100 μg / l ampicillin. When the absorbance of the culture at 600 nm reached 0.5, the culture temperature was raised to 42 ° C., and the culture was continued with shaking for 4 hours and then centrifuged to collect the cells. The obtained cells were added to 2 mM E
After suspending in 40 ml of 20 mM Tris-HCl buffer (pH 7.5) containing DTA, the cells were disrupted by sonication in ice. 30,0
Centrifuge the supernatant (crude extract) obtained by centrifugation at 00 rpm for 30 minutes for 90 minutes.
After heating at 15 ° C for 15 minutes, ammonium sulfate was added to a final concentration of 70% saturation, and the mixture was stirred in ice for 30 minutes, and then stirred at 30,000 rpm for 3 minutes.
The precipitate was collected by centrifugation for 0 minutes. The precipitate was dissolved in 10 ml of 5 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0) and dialyzed against the same buffer at 4 ° C. overnight. Then, equilibrated with the same buffer
Loaded on DE-52 column. The enzyme passed through the DE-52 column under these conditions. The flow-through fraction was dialyzed overnight at 4 ° C. against 10 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0) containing 1 mM EDTA. Then, the enzyme was adsorbed on the DE-52 column equilibrated with the same buffer, and the NaCl concentration was linearly increased to 0.5 M to elute the thermostable ribonuclease H from the DE-52 column. I let it. Collect the active fraction, 1
10 mM Tris-HCl buffer containing mM EDTA and 150 mM NaCl
(pH 8.0) to obtain a purified sample. The purified sample is
A single band was given on 15% SDS-PAGE. Purification yield is 20 ~
It was a 30 mg / l culture solution. The purified sample also gave a single peak by gel filtration, with an estimated molecular weight of 34,000. Since this value is close to the molecular weight of 27,000 estimated from SDS-PAGE,
This enzyme was suggested to function as a monomer. M13-DN with tritium-labeled activity of this enzyme
When measured at 37 ° C using A / RNA as a substrate, T
It showed about 50% specific activity as compared to RNase HI derived from hermus thermophilus HB8. Activity measurement is a known method
(J. Biol. Chem. 266, 6038-6044 (1991)).

【0036】[0036]

【発明の効果】本発明によれば、新規な耐熱性リボヌク
レアーゼH及びそれをコードするDNAが提供される。
耐熱性リボヌクレアーゼHは、サイクリングプローブ法
用試薬等の遺伝子工学用試薬や診断薬として極めて有用
である。
According to the present invention, a novel thermostable ribonuclease H and a DNA encoding the same are provided.
Thermostable ribonuclease H is extremely useful as a reagent for genetic engineering such as a reagent for the cycling probe method and a diagnostic agent.

【0037】[0037]

【配列表】[Sequence list]

配列番号:1 配列の長さ:867 配列の型:核酸 鎖の数:2本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:Pyrococcus sp. 株名:KOD1 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:181..867 配列 CGATAGCGCT GATGGTAAGT TCTGACTTCA GGAAGGTTCT CGGAATAAGT CTACTCCTAA 60 CTCTGACCGT CCAGCTTACC TCAGTGGTTC TTGCCTACTT CACCGCCATA CCCCCAAGTG 120 GTATAGCCAC GATAATGCTG GGCATTGTCT ATGGTGCACT CTTATTTAGG AGGTGAACCA 180 ATG AAG ATA GCG GGC ATT GAC GAG GCC GGG AGG GGG CCA GTT ATC GGA 228 Met Lys Ile Ala Gly Ile Asp Glu Ala Gly Arg Gly Pro Val Ile Gly 1 5 10 15 CCA ATG GTG ATA GCG GCG GTT GTG GTG GAT GAG AAT AGC CTC CCA AAG 276 Pro Met Val Ile Ala Ala Val Val Val Asp Glu Asn Ser Leu Pro Lys 20 25 30 CTC GAA GAA CTG AAG GTC AGG GAC TCT AAA AAA CTG ACA CCA AAG AGA 324 Leu Glu Glu Leu Lys Val Arg Asp Ser Lys Lys Leu Thr Pro Lys Arg 35 40 45 CGG GAG AAG CTT TTC AAT GAA ATA CTC GGA GTT TTA GAT GAT TAT GTA 372 Arg Glu Lys Leu Phe Asn Glu Ile Leu Gly Val Leu Asp Asp Tyr Val 50 55 60 ATT CTT GAA TTG CCT CCC GAT GTC ATT GGT TCC AGG GAG GGC ACG CTC 420 Ile Leu Glu Leu Pro Pro Asp Val Ile Gly Ser Arg Glu Gly Thr Leu 65 70 75 80 AAC GAG TTC GAG GTT GAG AAC TTC GCG AAG GCC CTG AAC TCG CTC AAG 468 Asn Glu Phe Glu Val Glu Asn Phe Ala Lys Ala Leu Asn Ser Leu Lys 85 90 95 GTA AAG CCC GAT GTA ATC TAC GCT GAC GCG GCT GAC GTT GAC GAG GAA 516 Val Lys Pro Asp Val Ile Tyr Ala Asp Ala Ala Asp Val Asp Glu Glu 100 105 110 CGC TTT GCG AGA GAG CTT GGG GAG AGG CTG AAC TTC GAG GCT GAA GTC 564 Arg Phe Ala Arg Glu Leu Gly Glu Arg Leu Asn Phe Glu Ala Glu Val 115 120 125 GTT GCG AAG CAC AAG GCC GAC GAC ATC TTT CCC GTC GTC TCA GCT GCT 612 Val Ala Lys His Lys Ala Asp Asp Ile Phe Pro Val Val Ser Ala Ala 130 135 140 TCA ATC CTC GCC AAG GTT ACA AGG GAC AGG GCG GTT GAA AAG CTC AAA 660 Ser Ile Leu Ala Lys Val Thr Arg Asp Arg Ala Val Glu Lys Leu Lys 145 150 155 160 GAA GAG TAC GGG GAG ATA GGC TCT GGC TAC CCA AGC GAC CCA AGA ACG 708 Glu Glu Tyr Gly Glu Ile Gly Ser Gly Tyr Pro Ser Asp Pro Arg Thr 165 170 175 AGG GCT TTT CTT GAG AAC TAT TAT CGG GAG CAC GGT GAG TTT CCG CCG 756 Arg Ala Phe Leu Glu Asn Tyr Tyr Arg Glu His Gly Glu Phe Pro Pro 180 185 190 ATA GTT AGG AAG GGC TGG AAG ACG CTG AAG AAG ATA GCA GAA AAA GTT 804 Ile Val Arg Lys Gly Trp Lys Thr Leu Lys Lys Ile Ala Glu Lys Val 195 200 205 GAG AGC GAG AAA AAG GCC GAA GAA AGG CAG GCT ACT CTT GAC CGC TAC 852 Glu Ser Glu Lys Lys Ala Glu Glu Arg Gln Ala Thr Leu Asp Arg Tyr 210 215 220 TTT CGG AAG GTC TGA 867 Phe Arg Lys Val 225 SEQ ID NO: 1 Sequence length: 867 Sequence type: nucleic acid Number of strands: double-stranded Topology: linear Sequence type: Genomic DNA Origin Organism name: Pyrococcus sp. Strain name: KOD1 Sequence characteristics Symbol: CDS Location: 181.8.867 Sequence CGATAGCGCT GATGGTAAGT TCTGACTTCA GGAAGGTTCT CGGAATAAGT CTACTCCTAA 60 CTCTGACCGT CCAGCTTACC TCAGTGGTTC TTGCCTACTT CACCGCCATA CCCCCAAGTG 120 GTATAGCCAC GATAATGCTC AGGATGCTGAT GATT AGG Lys Ile Ala Gly Ile Asp Glu Ala Gly Arg Gly Pro Val Ile Gly 1 5 10 15 CCA ATG GTG ATA GCG GCG GTT GTG GTG GAT GAG AAT AGC CTC CCA AAG 276 Pro Met Val Ile Ala Ala Val Val Val Asp Glu Asn Ser Leu Pro Lys 20 25 30 CTC GAA GAA CTG AAG GTC AGG GAC TCT AAA AAA CTG ACA CCA AAG AGA 324 Leu Glu Glu Leu Lys Val Arg Asp Ser Lys Lys Leu Thr Pro Lys Arg 35 40 45 CGG GAG AAG CTT TTC AAT GAA ATA CTC GGA GTT TTA GAT GAT TAT GTA 372 Arg Glu Lys Leu Phe Asn Glu Ile L eu Gly Val Leu Asp Asp Tyr Val 50 55 60 ATT CTT GAA TTG CCT CCC GAT GTC ATT GGT TCC AGG GAG GGC ACG CTC 420 Ile Leu Glu Leu Pro Pro Asp Val Ile Gly Ser Arg Glu Gly Thr Leu 65 70 75 80 AAC GAG TTC GAG GTT GAG AAC TTC GCG AAG GCC CTG AAC TCG CTC AAG 468 Asn Glu Phe Glu Val Glu Asn Phe Ala Lys Ala Leu Asn Ser Leu Lys 85 90 95 GTA AAG CCC GAT GTA ATC TAC GCT GAC GCG GCT GAC GTT GAC GAG GAA 516 Val Lys Pro Asp Val Ile Tyr Ala Asp Ala Ala Asp Val Asp Glu Glu 100 105 110 CGC TTT GCG AGA GAG CTT GGG GAG AGG CTG AAC TTC GAG GCT GAA GTC 564 Arg Phe Ala Arg Glu Leu Gly Glu Arg Leu Asn Phe Glu Ala Glu Val 115 120 125 GTT GCG AAG CAC AAG GCC GAC GAC ATC TTT CCC GTC GTC TCA GCT GCT 612 Val Ala Lys His Lys Ala Asp Asp Ile Phe Pro Val Val Ser Ala Ala 130 135 140 TCA ATC CTC GCC AAG GTT ACA AGG GAC AGG GCG GTT GAA AAG CTC AAA 660 Ser Ile Leu Ala Lys Val Thr Arg Asp Arg Ala Val Glu Lys Leu Lys 145 150 155 160 GAA GAG TAC GGG GAG ATA GGC TCT GGC TAC CCA AGC GAC CCA AGA ACG 708 Glu Glu Tyr Gly Glu Ile Gly Ser Gly Tyr Pro Ser Asp Pro Arg Thr 165 170 175 AGG GCT TTT CTT GAG AAC TAT TAT CGG GAG CAC GGT GAG TTT CCG CCG 756 Arg Ala Phe Leu Glu Asn Tyr Tyr Arg Glu His Gly Glu Phe Pro Pro 180 185 190 ATA GTT AGG AAG GGC TGG AAG ACG CTG AAG AAG ATA GCA GAA AAA GTT 804 Ile Val Arg Lys Gly Trp Lys Thr Leu Lys Lys Ile Ala Glu Lys Val 195 200 205 GAG AGC GAG AAA AAG GCC GAA GAA AGG CAG GCT ACT CTT GAC CGC TAC 852 Glu Ser Glu Lys Lys Ala Glu Glu Arg Gln Ala Thr Leu Asp Arg Tyr 210 215 220 TTT CGG AAG GTC TGA 867 Phe Arg Lys Val 225

【0038】配列番号:2 配列の長さ:228 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Met Lys Ile Ala Gly Ile Asp Glu Ala Gly Arg Gly Pro Val Ile Gly 1 5 10 15 Pro Met Val Ile Ala Ala Val Val Val Asp Glu Asn Ser Leu Pro Lys 20 25 30 Leu Glu Glu Leu Lys Val Arg Asp Ser Lys Lys Leu Thr Pro Lys Arg 35 40 45 Arg Glu Lys Leu Phe Asn Glu Ile Leu Gly Val Leu Asp Asp Tyr Val 50 55 60 Ile Leu Glu Leu Pro Pro Asp Val Ile Gly Ser Arg Glu Gly Thr Leu 65 70 75 80 Asn Glu Phe Glu Val Glu Asn Phe Ala Lys Ala Leu Asn Ser Leu Lys 85 90 95 Val Lys Pro Asp Val Ile Tyr Ala Asp Ala Ala Asp Val Asp Glu Glu 100 105 110 Arg Phe Ala Arg Glu Leu Gly Glu Arg Leu Asn Phe Glu Ala Glu Val 115 120 125 Val Ala Lys His Lys Ala Asp Asp Ile Phe Pro Val Val Ser Ala Ala 130 135 140 Ser Ile Leu Ala Lys Val Thr Arg Asp Arg Ala Val Glu Lys Leu Lys 145 150 155 160 Glu Glu Tyr Gly Glu Ile Gly Ser Gly Tyr Pro Ser Asp Pro Arg Thr 165 170 175 Arg Ala Phe Leu Glu Asn Tyr Tyr Arg Glu His Gly Glu Phe Pro Pro 180 185 190 Ile Val Arg Lys Gly Trp Lys Thr Leu Lys Lys Ile Ala Glu Lys Val 195 200 205 Glu Ser Glu Lys Lys Ala Glu Glu Arg Gln Ala Thr Leu Asp Arg Tyr 210 215 220 Phe Arg Lys Val 225SEQ ID NO: 2 Sequence length: 228 Sequence type: amino acid Topology: linear Sequence type: peptide sequence Met Lys Ile Ala Gly Ile Asp Glu Ala Gly Arg Gly Pro Val Ile Gly 1 5 10 15 Pro Met Val Ile Ala Ala Val Val Val Asp Glu Asn Ser Leu Pro Lys 20 25 30 Leu Glu Glu Leu Lys Val Arg Asp Ser Lys Lys Leu Thr Pro Lys Arg 35 40 45 Arg Glu Lys Leu Phe Asn Glu Ile Leu Gly Val Leu Asp Asp Tyr Val 50 55 60 Ile Leu Glu Leu Pro Pro Asp Val Ile Gly Ser Arg Glu Gly Thr Leu 65 70 75 80 Asn Glu Phe Glu Val Glu Asn Phe Ala Lys Ala Leu Asn Ser Leu Lys 85 90 95 Val Lys Pro Asp Val Ile Tyr Ala Asp Ala Ala Asp Val Asp Glu Glu 100 105 110 Arg Phe Ala Arg Glu Leu Gly Glu Arg Leu Asn Phe Glu Ala Glu Val 115 120 125 Val Ala Lys His Lys Ala Asp Asp Ile Phe Pro Val Val Ser Ala Ala 130 135 140 Ser Ile Leu Ala Lys Val Thr Arg Asp Arg Ala Val Glu Lys Leu Lys 145 150 155 160 Glu Glu Tyr Gly Glu Ile Gly Ser Gly Tyr Pro Ser Asp Pro Arg Thr 165 170 175 Arg Ala Phe Leu Glu Asn Tyr Tyr Arg Glu His Gly Glu Phe Pro Pro 180 185 190 Ile Val Arg Lys Gly Trp Lys Thr Leu Lys Lys Ile Ala Glu Lys Val 195 200 205 Glu Ser Glu Lys Lys Ala Glu Glu Arg Gln Ala Thr Leu Asp Arg Tyr 210 215 220 Phe Arg Lys Val 225

【0039】配列番号:3 配列の長さ:41 配列の型:核酸 鎖の数:1本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 TTAGGAGGTG AACATATGAA GATAGCGGGC ATTGACGAGG C 41SEQ ID NO: 3 Sequence length: 41 Sequence type: Number of nucleic acid strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA sequence TTAGGAGGTG AACATATGAA GATAGCGGGC ATTGACGAGG C 41

【0040】配列番号:4 配列の長さ:34 配列の型:核酸 鎖の数:1本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列 GCGCGGTCGA CCCTCGCGGC TGCCAGTTTT GCAT 34SEQ ID NO: 4 Sequence length: 34 Sequence type: Number of nucleic acid strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA sequence GCGCGGTCGA CCCTCGCGGC TGCCAGTTTT GCAT 34

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI (C12N 9/22 C12R 1:19) ──────────────────────────────────────────────────の Continued on front page (51) Int.Cl. 6 Identification code FI (C12N 9/22 C12R 1:19)

Claims (5)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 以下の(a)又は(b)のタンパク質を
コードするDNA。 (a)配列番号2のアミノ酸配列からなるタンパク質 (b)配列番号2のアミノ酸配列において1若しくは数
個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸
配列からなり、かつ(a)のタンパク質と同等の耐熱性
のリボヌクレアーゼH活性を有するタンパク質
1. A DNA encoding the following protein (a) or (b): (A) a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 (b) consisting of an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and equivalent to the protein of (a) With heat-resistant ribonuclease H activity
【請求項2】 配列番号2のアミノ酸配列からなるタン
パク質をコードするDNA。
2. A DNA encoding a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
【請求項3】 以下の(c)又は(d)の塩基配列を有
する請求項1又は2に記載のDNA。 (c)配列番号1に示す塩基配列における塩基番号18
1〜864の塩基配列を有するDNA (d)(c)のDNAの塩基配列に相補的な塩基配列を
有するDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダ
イズするDNA
3. The DNA according to claim 1, which has the following nucleotide sequence (c) or (d). (C) base number 18 in the base sequence shown in SEQ ID NO: 1
DNA having a base sequence of 1 to 864 DNA that hybridizes under stringent conditions with DNA having a base sequence complementary to the base sequence of the DNA of (d) and (c)
【請求項4】 以下の(a)又は(b)のタンパク質か
らなる耐熱性リボヌクレアーゼH。 (a)配列番号2のアミノ酸配列からなるタンパク質 (b)配列番号2のアミノ酸配列において1若しくは数
個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸
配列からなり、かつ(a)のタンパク質と同等の耐熱性
のリボヌクレアーゼH活性を有するタンパク質
4. A thermostable ribonuclease H comprising a protein of the following (a) or (b): (A) a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 (b) consisting of an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and equivalent to the protein of (a) With heat-resistant ribonuclease H activity
【請求項5】 配列番号2のアミノ酸配列からなるタン
パク質からなる耐熱性リボヌクレアーゼH。
5. A thermostable ribonuclease H comprising a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
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