JPH09313188A - Gene of hepatitis g virus - Google Patents

Gene of hepatitis g virus

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JPH09313188A
JPH09313188A JP8138934A JP13893496A JPH09313188A JP H09313188 A JPH09313188 A JP H09313188A JP 8138934 A JP8138934 A JP 8138934A JP 13893496 A JP13893496 A JP 13893496A JP H09313188 A JPH09313188 A JP H09313188A
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JP
Japan
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hepatitis
virus
sequence
seq
dna
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JP8138934A
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Japanese (ja)
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Kazuaki Chayama
一彰 茶山
Hiromitsu Kumada
博光 熊田
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Individual
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a novel hepatitis G virus gene which is the genome RNA of hepatitis G virus having a specific base sequence, enables easy detection of hepatitis G virus and is useful in the elucidation on the relation to hepatopathy and as a diagnostic agent and the like. SOLUTION: This gene is a novel genome RNA of hepatitis G virus having the base sequence represented by the formula. A primer is set on the basis of the base sequence of a complementary DNA or a homologous DNA and hepatitis G virus can be readily detected and the relation of the virus to hepatopathy will be elucidated by using the primer. Further, this primer can be used as a diagnostic agent for hepatitis G. This hepatitis G virus gene is obtained by separating the genomic RNA of hepatitis G virus from the serum of a patient complicated with hepatitis non A, non B, and non C and liver cell carcinoma in a usual manner, synthesizing cDNA using the RNA as a template, further preparing a cDNA library and cloning the cDNA library with the PCR technique using a primer specific to the helicase region of the virus genome.

Description

【発明の詳細な説明】Detailed Description of the Invention

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、G型肝炎ウイルス
遺伝子、G型肝炎ウイルス蛋白質及びそれらの用途に関
する。
TECHNICAL FIELD The present invention relates to hepatitis G virus gene, hepatitis G virus protein, and uses thereof.

【0002】[0002]

【従来の技術】G型肝炎ウイルス(GBVウイルスと称
することがある)は最近発見されたフラビウイルス族の
1種のRNAウイルスであり、現在GBV−A、GBV
−B、GBV−Cの3種類の存在が報告されている。A
〜E型の肝炎ウイルスだけでは説明のつかない肝炎があ
ることから、非A〜E型肝炎の病因としてG型肝炎ウイ
ルスについて検討がなされている。
BACKGROUND OF THE INVENTION Hepatitis G virus (sometimes referred to as GBV virus) is a recently discovered RNA virus of the flavivirus family, and is currently GBV-A and GBV.
The existence of three types of -B and GBV-C has been reported. A
Since there are hepatitises that cannot be explained only by ~ E hepatitis virus, hepatitis G virus has been studied as a cause of non-AE hepatitis.

【0003】GBV−A、GBV−Bは感染実験に使用
されたタマリンの血清から検出されたが、これまでにヒ
トからのゲノムの検出の報告はない。
GBV-A and GBV-B were detected in the sera of tamarin used in infection experiments, but there has been no report of detection of the genome from humans so far.

【0004】GBV−Cのゲノムの検出は、アメリカに
おいてはSimons等 (Nature Medicine 1: 564-569, 199
5) により行われた。すなわち、GBV−A、GBV−
Bに対する抗体陽性者の血清から、ヘリカーゼに相当す
る部位を増幅する縮重プライマー (degenerate primer)
を用いたボリメラーゼチェインリアクション (PCR)
によって、ヒトのGBV−Cゲノムが検出された。しか
し、彼らが検出した症例のうち、慢性肝炎が明らかな症
例は4例であり、このウイルスと肝障害の関係について
の詳細は未だ明らかにされていない。
The detection of the GBV-C genome is carried out by the method of Simons et al. (Nature Medicine 1: 564-569, 199) in the United States.
5) That is, GBV-A, GBV-
Degenerate primer that amplifies a site corresponding to helicase from the serum of an antibody-positive person against B
Polymerase Chain Reaction (PCR)
Detected the human GBV-C genome. However, among the cases detected by them, there are four cases in which chronic hepatitis is clear, and the details of the relationship between this virus and liver damage have not been clarified yet.

【0005】最近、日本においてはYoshiba 等により、
検索した6例の非A、非B、非C型劇症肝炎患者のうち
3例からGBV−Cゲノムを検出されたという報告がな
され(Lancet 346: 1131-1132, 1995)、この疾患とウイ
ルスとの関連が注目されている。しかしながら、この検
出は、G型肝炎ウイルスゲノム中、変異の生じやすいヘ
リカーゼ領域から誘導されたプライマーを用いるPCR
により、ヘリカーゼ領域の塩基配列を決定したのみであ
り、他の領域の配列は解明されていない。
Recently, in Japan, Yoshi et al.
It was reported that the GBV-C genome was detected in 3 of the 6 non-A, non-B, non-C fulminant hepatitis patients searched (Lancet 346: 1131-1132, 1995). The relationship with However, this detection is carried out by PCR using primers derived from the helicase region, which is prone to mutation, in the hepatitis G virus genome.
, The base sequence of the helicase region was only determined, and the sequences of other regions have not been elucidated.

【0006】G型肝炎ウイルスを検出し、日本人におけ
る肝障害との関連をさらに検討するためには、日本に主
に存在するG型肝炎ウイルスゲノムの塩基配列を決定し
て構造を解明することが望まれる。また、ウイルスの検
出のためには、上述のヘリカーゼ領域のような変異の起
きやすい部位のみでなく、5'末端非翻訳領域のような変
異の少ない高度に保存された領域の解明も望まれる。
In order to detect the hepatitis G virus and further investigate the relationship with the liver damage in Japanese, it is necessary to determine the nucleotide sequence of the hepatitis G virus genome mainly present in Japan and elucidate the structure. Is desired. In addition, in order to detect viruses, it is desired to elucidate not only the sites where mutations are likely to occur, such as the above-mentioned helicase region, but also highly conserved regions with few mutations, such as the 5'terminal untranslated region.

【0007】[0007]

【発明が解決しようとする課題】上記のように、非A〜
E型肝炎の原因ウイルスとしてのG型肝炎ウイルスの分
離、同定は重要な課題であり、特に日本に存在するウイ
ルスについての検討が望まれている。
As described above, non-A ~
Isolation and identification of hepatitis G virus as a causative virus of hepatitis E is an important issue, and it is particularly desired to study viruses existing in Japan.

【0008】従って、本発明の目的は、G型肝炎ウイル
ス遺伝子を分離し、その塩基配列を決定し、この塩基配
列を利用して、肝炎患者血清からのG型肝炎ウイルスの
検出を行う方法を提供することである。また、G型肝炎
ウイルス蛋白質、及びそれを用いたG型肝炎ウイルスの
検出を行う方法を提供することである。
Therefore, an object of the present invention is to isolate a hepatitis G virus gene, determine its nucleotide sequence, and utilize this nucleotide sequence to detect a hepatitis G virus in the serum of hepatitis patients. Is to provide. Another object is to provide a hepatitis G virus protein and a method for detecting hepatitis G virus using the hepatitis G virus protein.

【0009】[0009]

【課題を解決するための手段】本発明者らは、非A、非
B、非C型肝疾患患者の血清中から、G型肝炎ウイルス
ゲノムを分離し、そのヘリカーゼ領域、5'末端非翻訳領
域、コア〜エンベロープ領域、ポリメラーゼ領域の一部
の塩基配列を決定して、本発明を完成するに至った。
The present inventors isolated the hepatitis G virus genome from the sera of patients with non-A, non-B, and non-C liver diseases, and isolated its helicase region, 5'end untranslated. The present invention has been completed by determining the base sequences of a part of the region, core-envelope region, and polymerase region.

【0010】すなわち、本発明は、配列番号1、5、
9、13または17の塩基配列を有するG型肝炎ウイルスゲ
ノムRNA、配列番号2、6、10、14または18の塩基配
列を有する前記G型肝炎ウイルスゲノムRNAに相補的
なDNA、および配列番号3、7、11、15または19の塩
基配列を有する、前記G型肝炎ウイルスゲノムRNAに
相同的なDNAである。また、配列番号4、8、12また
は16で表されるアミノ酸配列をコードする塩基配列を有
するDNAである。
That is, according to the present invention, SEQ ID NOs: 1, 5 and
Hepatitis G virus genomic RNA having a nucleotide sequence of 9, 13 or 17, DNA complementary to the hepatitis G virus genomic RNA having a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, 6, 10, 14 or 18, and SEQ ID NO: 3 DNA having a nucleotide sequence of 7, 11, 15 or 19 and being homologous to the hepatitis G virus genomic RNA. In addition, it is a DNA having a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4, 8, 12 or 16.

【0011】さらに、本発明により、配列番号4、8、
12または16で表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド
からなるG型肝炎ウイルス蛋白質も提供される。
Furthermore, according to the present invention, SEQ ID NOs: 4, 8 and
There is also provided a hepatitis G virus protein consisting of a polypeptide containing the amino acid sequence represented by 12 or 16.

【0012】また、本発明は、前記G型肝炎ウイルスゲ
ノムRNAに相補的なDNAを組み込んだ組換え体DN
A、および前記組換え体DNAにより形質転換された形
質転換体であり、さらに、前記形質転換体を培養し、得
られる培養物からG型肝炎ウイルス蛋白質を分離するこ
とを特徴とするG型肝炎ウイルス蛋白質の生産方法にも
関する。
The present invention also provides a recombinant DN in which a DNA complementary to the hepatitis G virus genomic RNA is incorporated.
A and a transformant transformed with the recombinant DNA, further culturing the transformant, and separating the hepatitis G virus protein from the resulting culture, hepatitis G It also relates to a method for producing viral proteins.

【0013】さらに、本発明は、前記G型肝炎ウイルス
ゲノムRNAに相補的なDNA、あるいはRNAに相同
的なDNAの塩基配列に基づいて設定されたプライマー
を用いて、G型肝炎ウイルスを検出する方法を提供す
る。
Furthermore, the present invention detects hepatitis G virus using a primer set based on the nucleotide sequence of DNA complementary to the hepatitis G virus genomic RNA or DNA homologous to RNA. Provide a way.

【0014】また本発明は、G型肝炎ウイルス蛋白質の
少なくとも一部を抗原として用いる抗原抗体反応によ
り、あるいは該抗原に対する抗体を用いる抗原抗体反応
によりG型肝炎ウイルスを検出することを特徴とするG
型肝炎ウイルスの検出方法である。
Further, the present invention is characterized in that hepatitis G virus is detected by an antigen-antibody reaction using at least a part of hepatitis G virus protein as an antigen, or an antigen-antibody reaction using an antibody against the antigen.
It is a method for detecting hepatitis C virus.

【0015】さらに、本発明は、前記蛋白質の少なくと
も一部、あるいは前記蛋白質に対する抗体を有効成分と
して含むG型肝炎診断剤である。
Furthermore, the present invention is a diagnostic agent for hepatitis G containing at least a part of the protein or an antibody against the protein as an active ingredient.

【0016】さらに、本発明は、前記蛋白質の少なくと
も一部を有効成分として含むG型肝炎ワクチンである。
Further, the present invention is a hepatitis G vaccine containing at least a part of the above protein as an active ingredient.

【0017】ここで、「G型肝炎ウイルスゲノムRNA
に相同的なDNA」とは、DNA塩基配列において、対
応するRNA塩基配列中のウラシル (U) をチミン
(T) に置換した以外は全て同一の配列であることを意
味する。
Here, "hepatitis G virus genomic RNA
"DNA homologous to" means that in the DNA base sequence, uracil (U) in the corresponding RNA base sequence is
All have the same sequence except that they are replaced with (T).

【0018】以下、本発明を詳細に説明する。Hereinafter, the present invention will be described in detail.

【0019】G型肝炎ウイルスゲノムRNAの塩基配列
の決定 まず、本発明者等は、非A、非B、非C型肝炎、肝硬
変、肝癌と考えられた症例を対象とし、患者血清中より
G型肝炎ウイルスゲノムRNAを分離し、その塩基配列
を決定した。症例は、HBS 抗原についてはRIA法
で、HVC抗体は第2世代の抗体で陰性を確認したもの
である。
Nucleotide sequence of hepatitis G virus genomic RNA
Determination of the first, the present inventors have non A, non-B, non-C hepatitis, targeted cirrhosis, cases that were considered hepatoma, separating the hepatitis G virus genome RNA from patient serum, the nucleotide sequence It was determined. Cases, for HB S antigen RIA method, HVC antibody is confirming the negative in the second generation antibodies.

【0020】G型肝炎ウイルスゲノムRNA分離、クロ
ーニングおよび塩基配列の決定は以下のようにして行っ
た。
Hepatitis G virus genomic RNA was isolated, cloned, and the nucleotide sequence was determined as follows.

【0021】ウイルスゲノムRNAはグアニジン法で抽
出したものを使用し、逆転写酵素およびランダムプライ
マーを用いて単鎖のcDNA (G型肝炎ウイルスゲノム
RNAに相補的なDNA) を合成し、Yoshiba 等、Lanc
et 346: 1131-1132, 1995 に記載の縮重プライマーを使
用したPCRにより、cDNAを増幅した。このプライ
マーは、Simons等により報告されたGBV−Cのヘリカ
ーゼ領域に由来する塩基配列を有する。増幅したcDN
A断片の検出は、アガロース電気泳動後、臭化エチジウ
ムを用いた染色により行った。期待された大きさ (expe
cted size)を有し、陽性と考えられたDNA断片をアガ
ロースゲルから回収し、プラスミドベクターpBluescrip
t でクローニングし、ジデオキシ法で塩基配列を決定し
た。クローニングは、後出の実施例に詳細に記載したよ
うに、増幅したcDNA断片を適宜制限酵素で消化して
プラスミドに導入した後、大腸菌に組み込み、得られた
組み換え体を培養してcDNA含有プラスミドを単離す
ることにより、G型肝炎ウイルスcDNAをクローニン
グした。
The viral genomic RNA extracted by the guanidine method was used to synthesize a single-stranded cDNA (DNA complementary to the hepatitis G virus genomic RNA) using reverse transcriptase and random primers. Lanc
The cDNA was amplified by PCR using degenerate primers as described in et 346: 1131-1132, 1995. This primer has a nucleotide sequence derived from the helicase region of GBV-C reported by Simons et al. Amplified cDNA
The A fragment was detected by agarose electrophoresis and then staining with ethidium bromide. Expected size (expe
DNA fragment having a cted size) and considered to be positive was recovered from an agarose gel and used as a plasmid vector pBluescrip.
It was cloned at t and the nucleotide sequence was determined by the dideoxy method. As described in detail in the Examples below, cloning is performed by digesting the amplified cDNA fragment with a suitable restriction enzyme and introducing it into a plasmid, incorporating it into E. coli, culturing the obtained recombinant, and culturing the cDNA-containing plasmid. Was isolated to clone the hepatitis G virus cDNA.

【0022】上記のようにしてcDNAについて塩基配
列を決定した結果を、配列表の配列番号2として示す。
この配列番号2の塩基配列から、G型肝炎ウイルスゲノ
ムRNAの配列を導き、配列番号1として示す。配列番
号3はG型肝炎ウイルスゲノムRNAに相同的なDNA
の塩基配列を示す。
The result of determining the nucleotide sequence of the cDNA as described above is shown as SEQ ID NO: 2 in the sequence listing.
The sequence of hepatitis G virus genomic RNA was derived from the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 and is shown as SEQ ID NO: 1. SEQ ID NO: 3 is a DNA homologous to hepatitis G virus genomic RNA
The nucleotide sequence of

【0023】これらは、GBV−Cのヘリカーゼ領域に
相当する塩基配列である。配列番号3の相同的DNAを
Simons等の報告によるアメリカ型のプロトタイプと比較
すると、GBV−Cと77%の相同性を有している。
These are base sequences corresponding to the helicase region of GBV-C. The homologous DNA of SEQ ID NO: 3
It has 77% homology with GBV-C when compared to the American type prototype reported by Simons et al.

【0024】さらに、配列番号2より導いた、G型肝炎
ウイルス蛋白質をコードする推定アミノ酸配列を配列番
号4に示す。アミノ酸配列の比較で97%の相同性を示
す。
Further, the deduced amino acid sequence encoding the hepatitis G virus protein derived from SEQ ID NO: 2 is shown in SEQ ID NO: 4. Amino acid sequence comparison shows 97% homology.

【0025】G型肝炎ウイルスゲノムのヘリカーゼ領域
以外の部分の塩基配列決定は、GB肝炎ウイルスゲノム
の一部に相同的あるいは相補的と考えられるプライマー
を用いてPCRにより遺伝子cDNAを増幅し、ヘリカ
ーゼ領域で行ったのと同様にクローニングすることによ
り行った。このようにして下記の部分の塩基配列を決定
した。カッコ内の%は、上記と同様にアメリカ型プロト
タイプのGBV−Cと比較した時の相同性である。
To determine the nucleotide sequence of the portion other than the helicase region of the hepatitis G virus genome, a gene cDNA is amplified by PCR using a primer considered to be homologous or complementary to a portion of the GB hepatitis virus genome, and the helicase region is amplified. It was carried out by cloning in the same manner as was carried out in. In this way, the base sequence of the following portion was determined. The% in parentheses is the homology when compared to the American prototype GBV-C as above.

【0026】コア〜エンベロープ領域 配列番号5:RNA 配列番号6:cDNA 配列番号7:相同的DNA(87%) 配列番号8:アミノ酸 (93%)ポリメラーゼ領域の一部 配列番号9:RNA 配列番号10:cDNA 配列番号11:相同的DNA(88%) 配列番号12:アミノ酸 (100 %)ポリメラーゼ領域の一部 配列番号13:RNA 配列番号14:cDNA 配列番号15:相同的DNA(86%) 配列番号16:アミノ酸 (93%)5'末端非翻訳領域 配列番号17:RNA 配列番号18:cDNA 配列番号19:相同的DNA(89%) 配列番号17で示される5'末端非翻訳領域は、変異が少な
く、高度に保存された領域であるため、この配列に基づ
いて設定したプライマーを用いれば、G型肝炎ウイルス
の検出が有利に行える。
Core-Envelope region SEQ ID NO: 5: RNA SEQ ID NO: 6: cDNA SEQ ID NO: 7: Homologous DNA (87%) SEQ ID NO: 8: Amino acid (93%) Part of polymerase region SEQ ID NO: 9: RNA SEQ ID NO: 10 : CDNA SEQ ID NO: 11: Homologous DNA (88%) SEQ ID NO: 12: Amino acid (100%) Part of polymerase region SEQ ID NO: 13: RNA SEQ ID NO: 14: cDNA SEQ ID NO: 15: Homologous DNA (86%) SEQ ID NO: 16: amino acid (93%) 5'terminal untranslated region SEQ ID NO: 17: RNA SEQ ID NO: 18: cDNA SEQ ID NO: 19: homologous DNA (89%) The 5'terminal untranslated region shown in SEQ ID NO: 17 has a mutation. Since it is a small number and highly conserved region, hepatitis G virus can be advantageously detected by using a primer set based on this sequence.

【0027】被検サンプルからのG型肝炎ウイルスの検
上記のようにして、本発明者らにより明らかにされたG
型肝炎ウイルスゲノムRNAの塩基配列を利用すれば、
被検サンプルからG型肝炎ウイルスの検出を容易に行う
ことができる。
Detection of hepatitis G virus from test sample
Out as described above, it revealed by the present inventors G
Using the base sequence of hepatitis B virus genomic RNA,
The hepatitis G virus can be easily detected from the test sample.

【0028】ウイルス検出のための、患者血清からのc
DNAサンプルは次のようにして調製する。即ち、少量
の血清に対し、約5倍量のグアニジン溶液を加え、混和
した後、フェノール抽出を行い、抽出されたRNAをエ
タノールにより沈澱させる。このようにして得られたウ
イルスゲノムRNAを鋳型として、例えば、逆転写酵素
及びランダムプライマーを用いてcDNAを合成する。
逆転写酵素としては、MMLV逆転写酵素、AMV逆転
写酵素、TthDNAポリメラーゼ等が使用できる。
C from patient sera for virus detection
The DNA sample is prepared as follows. That is, about 5 times the amount of guanidine solution was added to a small amount of serum and mixed, and then phenol extraction was performed, and the extracted RNA was precipitated with ethanol. Using the thus obtained viral genomic RNA as a template, cDNA is synthesized using, for example, reverse transcriptase and random primers.
As the reverse transcriptase, MMLV reverse transcriptase, AMV reverse transcriptase, Tth DNA polymerase and the like can be used.

【0029】上記で得られたcDNAについて、本発明
のG型肝炎ウイルスゲノムRNAの塩基配列に基づいた
プライマーを用いて、PCRにより特定の領域を増幅す
る。具体的には、配列番号2、6、10、14または18に示
されるG型肝炎ウイルスゲノムRNAに相補的なDNA
の配列、あるいは配列番号3、7、11、15または19に示
されるG型肝炎ウイルスゲノムRNAに相同的なDNA
の配列に基づいて設定されたプライマーにより、G型肝
炎ウイルスゲノムRNAに特異的な一定部分を増幅させ
ることにより、あるいはさらに必要により適宜制限酵素
処理することにより、G型肝炎ウイルスの検出を行うこ
とができる。
A specific region of the cDNA obtained above is amplified by PCR using a primer based on the nucleotide sequence of the hepatitis G virus genomic RNA of the present invention. Specifically, a DNA complementary to the hepatitis G virus genomic RNA shown in SEQ ID NO: 2, 6, 10, 14 or 18.
Or a DNA homologous to the hepatitis G virus genomic RNA shown in SEQ ID NO: 3, 7, 11, 15 or 19
Detection of hepatitis G virus by amplifying a certain portion specific to hepatitis G virus genomic RNA with a primer set based on the sequence of You can

【0030】プライマーの設定に仕方により、cDNA
の一定部分の増幅が可能かどうかをみることにより、ウ
イルス検出或いは変異を調べることができる。また、適
宜プライマーでの増幅後、特異的制限酵素での切断のパ
ターンを調べることによりウイルスの検出、あるいは変
異の有無をみることができる。
Depending on how the primers are set, the cDNA
Viruses can be detected or mutations can be examined by checking whether or not a certain portion of A. can be amplified. In addition, the presence or absence of mutation can be checked by examining the pattern of cleavage with a specific restriction enzyme after amplification with appropriate primers.

【0031】プライマーとしては、適宜長さ、例えば17
〜35塩基の長さの合成DNAで、G型肝炎ウイルスゲノ
ムRNAに相同な配列のものと、相補的な配列のものと
の組合わせであればよい。例えば、配列番号20〜29で示
される塩基配列を有するDNAからなるプライマー等が
例示できる。実施例4で使用した配列番号20〜23のもの
が特に好ましい。これらのプライマーは、例えばアプラ
イドバイオシステムズ(ABI) 社製DNA自動合成機
等を用いて合成すればよい。
The primer has an appropriate length, for example, 17
A synthetic DNA having a length of ˜35 bases, which has a sequence homologous to the hepatitis G virus genomic RNA and a complementary sequence, may be used. For example, a primer or the like composed of DNA having the nucleotide sequence represented by SEQ ID NOs: 20 to 29 can be exemplified. Those of SEQ ID NOs: 20-23 used in Example 4 are particularly preferred. These primers may be synthesized using, for example, an automated DNA synthesizer manufactured by Applied Biosystems (ABI).

【0032】PCRによるDNAの増幅は常法に従い、
DNAを熱変性し、これにプライマーをアニールさせ、
次いで耐熱性ポリメラーゼ、dNTP (dATP、 dGTP 、dCT
P、dTTP) を添加し、DNA鎖を伸長させる。この熱変
性、プライマーのアニーリング、DNA鎖の伸長の工程
を繰り返すことにより目的の領域を増幅できる。
Amplification of DNA by PCR is carried out according to a conventional method.
Heat denature the DNA, anneal the primer to it,
Next, thermostable polymerase, dNTP (dATP, dGTP, dCT
(P, dTTP) is added to extend the DNA chain. The region of interest can be amplified by repeating the steps of heat denaturation, primer annealing, and DNA chain extension.

【0033】増幅したcDNA、あるいは増幅し、適宜
制限酵素で処理したcDNA断片は、アガロースゲル電
気泳動、ポリアクリルアミド電気泳動等の電気泳動後、
臭化エチジウム染色等の手段で分別、検出できる。使用
するプライマーの種類により、現われるバンドの位置が
異なる。
The amplified cDNA, or the cDNA fragment amplified and treated with a restriction enzyme as appropriate, is subjected to agarose gel electrophoresis, polyacrylamide gel electrophoresis, etc.
It can be separated and detected by means such as ethidium bromide staining. The position of the band that appears depends on the type of primer used.

【0034】別の方法として、ウイルスRNAに相補的
なDNA、RNAまたは合成オリゴヌクレオチドなどを
プローブとして用い、これをマイクロタイタープレート
に固相化してウイルスRNAを捕捉することができる。
即ち、上記のプレートに、デタージェント、プロテアー
ゼなどで処理してウイルスRNAを露出させた被検血清
を反応させ、緩衝液で洗浄し、ウイルスRNAと相補的
な別のDNA、RNAまたは合成オリゴヌクレオチドを
ハイブリダイズさせ、例えば分岐鎖DNAによるシグナ
ル増幅のような手段を用いて検出することができる。
As another method, DNA, RNA or synthetic oligonucleotide complementary to viral RNA can be used as a probe, which can be immobilized on a microtiter plate to capture the viral RNA.
That is, the above-mentioned plate is treated with a test serum exposed to viral RNA by treatment with detergent, protease or the like, washed with a buffer, and another DNA, RNA or synthetic oligonucleotide complementary to viral RNA is added. Can be hybridized and detected using means such as signal amplification with branched-chain DNA.

【0035】また、これらのウイルスと相補的なDN
A、RNA、または合成オリゴヌクレオチドは、血液、
肝臓から抽出したウイルスRNAやそのcDNAを用い
たPCRによる増幅産物をドットブロット、サザンブロ
ット、ノーザンブロット、その他のメンブレンなどに結
合させた核酸を検出するためのプローブとして使用する
ことができる。
In addition, DN complementary to these viruses
A, RNA, or synthetic oligonucleotides
The amplification product by PCR using viral RNA extracted from liver or its cDNA can be used as a probe for detecting nucleic acid bound to dot blot, Southern blot, Northern blot, or other membranes.

【0036】上記のような操作で得られるG型肝炎ウイ
ルスRNAのcDNAについて、さらにクローニングし
て塩基配列を決定する場合には、前に記載した塩基配列
の決定方法を用いればよい。即ち、PCR増幅し、分別
したDNAを適当な制限酵素(例えば、EcoRI、Bam
HI、HindIII等) によって切り出すか、或いは平滑末
端化し、次いで同一の制限酵素で切断した、或いは平滑
末端化したクローニングベクターに挿入し、これを形質
転換可能な宿主に導入することにより形質転換させ、テ
トラサイクリン耐性又はアンピシリン耐性によって目的
とする組換え体DNAをクローニングすることができ
る。
When the cDNA of hepatitis G virus RNA obtained by the above operation is further cloned to determine the base sequence, the method for determining the base sequence described above may be used. That is, DNA amplified by PCR and separated is treated with an appropriate restriction enzyme (eg EcoRI, Bam).
HI, HindIII, etc.) or blunt-ended, and then inserted into a cloning vector cleaved with the same restriction enzyme or blunt-ended, and introduced into a transformable host for transformation, The recombinant DNA of interest can be cloned by tetracycline resistance or ampicillin resistance.

【0037】ベクターDNAとしては、M13ファージベ
クター等のファージベクター、pUC18、pUC19等プ
ラスミドベクター等を、宿主としては大腸菌、酵母等を
用いることができる。
As the vector DNA, a phage vector such as M13 phage vector, a plasmid vector such as pUC18, pUC19, etc. can be used, and E. coli, yeast, etc. can be used as a host.

【0038】このようにしてクローニングされた組換え
体DNAから塩基配列を決定すればよい。すなわち、既
に得たテトラサイクリン耐性又はアンピシリン耐性のト
ランスフォーマントの中から、求めるクローンをコロニ
ーハイブリダイゼーションによって二次スクリーニング
する。このコロニーハイブリダイゼーションによって陽
性を示したクローンのヌクレオチド配列を、通常の塩基
配列決定法、例えば、サンガー法、マキサム−ギルバー
ト法等によって決定することができる。
The nucleotide sequence may be determined from the recombinant DNA thus cloned. That is, among the obtained tetracycline-resistant or ampicillin-resistant transformants, the desired clone is secondarily screened by colony hybridization. The nucleotide sequence of a clone showing a positive result by this colony hybridization can be determined by a usual nucleotide sequencing method, for example, Sanger method, Maxam-Gilbert method, or the like.

【0039】G型肝炎ウイルス蛋白質 次に、G型肝炎ウイルス蛋白質の発現について説明す
る。塩基配列の決定の項で述べた方法により、得られた
クローンからG型肝炎ウイルス蛋白質をコードする遺伝
子の全部又は一部を切り出し、これを適当なプロモータ
ー、エンハンサー等の下流につないだ後、適当な宿主に
導入して形質転換を行う。プロモーターとしてはLacZ、
Ptac、LacI等が挙げられ、宿主としては、XLI-Blue、TB
1 、JM107等が挙げられる。
Hepatitis G Virus Protein Next, the expression of hepatitis G virus protein will be described. All or part of the gene encoding the hepatitis G virus protein was excised from the obtained clone by the method described in the section for determining the nucleotide sequence, ligated to the downstream of an appropriate promoter, enhancer, etc., and then It is introduced into a suitable host and transformed. LacZ as a promoter,
Ptac, LacI, etc. are mentioned, and as a host, XLI-Blue, TB
1, JM107 and the like.

【0040】本発明のG型肝炎ウイルス蛋白質を得るに
は、前記形質転換体を一般に使用されている培地で培養
し、通常行われている方法によって精製すればよい。培
地としては、例えばアンピシリンを含むLB培地、TB
培地、2XYT培地等が挙げられる。遺伝子の発現を効
率良くするためには、必要に応じて上記培地にイソプロ
ピル−1−チオ−β−D−ガラクトシド (IPTG)、
グルコース等を添加することもできる。
To obtain the hepatitis G virus protein of the present invention, the transformant may be cultured in a generally used medium and purified by a commonly used method. Examples of the medium include LB medium containing ampicillin, TB
Examples of the medium include 2XYT medium. In order to improve the gene expression efficiently, isopropyl-1-thio-β-D-galactoside (IPTG),
Glucose or the like can also be added.

【0041】培養は、通常37℃で6〜7時間行い、必要
により通気や攪拌を行うこともできる。培養後、菌体を
集め、例えば緩衝液に懸濁させた後、凍結、融解処理、
煮沸処理等を行った後、遠心分離により上清液を得る。
Culturing is usually carried out at 37 ° C. for 6 to 7 hours, and if necessary, aeration and stirring can be carried out. After culturing, the bacterial cells are collected and suspended in, for example, a buffer solution, and then frozen and thawed,
After boiling treatment and the like, centrifugation is performed to obtain a supernatant.

【0042】得られた上清液からのG型肝炎ウイルス蛋
白質の分離、精製は、通常知られている蛋白質の精製方
法に従えばよい。例えば、塩析法、遠心分離法、各種ク
ロマトグラフィー、電気泳動等を適当に組み合わせて精
製が行われる。
Separation and purification of the hepatitis G virus protein from the obtained supernatant may be carried out according to commonly known protein purification methods. For example, salting out, centrifugation, various chromatographies, electrophoresis and the like are appropriately combined for purification.

【0043】各種クロマトグラフィーとしては、ゲルろ
過、イオン交換クロマトグラフィー、逆相クロマトグラ
フィー、アフィニティークロマトグラフィー等が挙げら
れる。また、精製品の純度及びおよその分子量の確認は
SDS (ラウリル硫酸ナトリウム) ポリアクリルアミド
ゲル電気泳動法、ウエスタンブロット法等を用いて行わ
れる。精製された蛋白質のアミノ酸配列の解析は、気相
プロテインシークエンサーを用いた自動エドマン分析法
等によって行うこともできる。
Examples of various chromatographies include gel filtration, ion exchange chromatography, reverse phase chromatography, affinity chromatography and the like. The purity and the approximate molecular weight of the purified product are confirmed by SDS (sodium lauryl sulfate) polyacrylamide gel electrophoresis, Western blotting and the like. Analysis of the amino acid sequence of the purified protein can also be performed by an automated Edman analysis method using a gas phase protein sequencer.

【0044】上記の方法によって製造された本発明のG
型肝炎ウイルス蛋白質は、G型肝炎の診断薬、或いはG
型肝炎ウイルスワクチン等として用いることができる。
本発明のG型肝炎ウイルス蛋白質を用いて、次に述べる
ようにしてG型肝炎ウイルス抗体を検出することができ
る。
G of the present invention produced by the above method
Hepatitis C virus protein is a diagnostic agent for hepatitis G or G
It can be used as a hepatitis C virus vaccine.
Using the hepatitis G virus protein of the present invention, hepatitis G virus antibodies can be detected as described below.

【0045】まず、マイクロタイタープレートにG型肝
炎ウイルス蛋白質を固相化し、これに被検血清を加えて
反応させ、緩衝液により洗浄し、G型肝炎ウイルス蛋白
質に結合した抗体に、アルカリフォスファイターゼ又は
ペンオキシダーゼなどで標識した抗ヒトイムノグロブリ
ン (IgG) 抗体を反応させ、緩衝液により洗浄後、発
色基質を加え、デンシトメーターにより吸光度の変化を
検出することにより、抗体を検出することができる。
First, a hepatitis G virus protein was immobilized on a microtiter plate, test serum was added to the solid phase, and the mixture was washed with a buffer solution. The antibody bound to the hepatitis G virus protein was treated with an alkaline phosphite. The antibody can be detected by reacting with an anti-human immunoglobulin (IgG) antibody labeled with zease or pen oxidase, washing with a buffer solution, adding a chromogenic substrate, and detecting the change in absorbance with a densitometer. it can.

【0046】また、G型肝炎ウイルス蛋白質に対する抗
体を用いて、G型肝炎ウイルス抗原を検出するには、以
下のようにする。
Further, the detection of hepatitis G virus antigen using an antibody against hepatitis G virus protein is carried out as follows.

【0047】まず、上記G型肝炎ウイルス蛋白質を用い
てラット等の動物を免疫することによりモノクローナル
抗体を2種類以上作製する。これらの抗体の一つをマイ
クロタイタープレートに固相化し、これに被検血清を加
えて反応させ、緩衝液で洗浄し、結合したウイルス抗原
に別のモノクローナル抗体を反応させ、再度緩衝液によ
り洗浄する。これに抗ラットマウスイムノグロブリン
(IgG) 抗体を反応させ、緩衝液により洗浄後、発色
基質を加え、デンシトメーターにより吸光度の変化を検
出することにより、抗体を検出することができる。
First, two or more kinds of monoclonal antibodies are prepared by immunizing an animal such as a rat with the hepatitis G virus protein. Immobilize one of these antibodies on a microtiter plate, add test serum to it, react with it, wash with a buffer, react the bound viral antigen with another monoclonal antibody, and wash again with a buffer. To do. Anti-rat mouse immunoglobulin
The antibody can be detected by reacting it with (IgG) antibody, washing with a buffer solution, adding a chromogenic substrate, and detecting a change in absorbance with a densitometer.

【0048】本発明のG型肝炎ウイルス蛋白質をG型肝
炎ワクチンとして投与する場合、通常は注射 (皮下又は
筋肉) によって投与される。その投与量は、動物か人間
かによって、また年齢、投与経路、投与回数により異な
り、広範囲に変えることができるが、一般には0.01〜1
μg/kg体重/日である。本発明のG型肝炎ワクチンは、
有効成分であるG型肝炎ウイルス蛋白質を適切な希釈剤
及び薬理学的に使用し得る担体との組成物として投与で
きる。投与は1日1回で1〜6カ月間に数回投与すれば
よい。
When the hepatitis G virus protein of the present invention is administered as a hepatitis G vaccine, it is usually administered by injection (subcutaneous or intramuscular). The dose varies depending on whether it is an animal or a human, age, route of administration and frequency of administration, and can be varied over a wide range, but generally 0.01 to 1
μg / kg body weight / day. The hepatitis G vaccine of the present invention is
The hepatitis G virus protein as an active ingredient can be administered as a composition with a suitable diluent and a pharmacologically usable carrier. The administration may be once a day, and may be administered several times within 1 to 6 months.

【0049】また、本発明のG型肝炎ワクチンには、安
定剤、緩衝剤、保存剤、等張化剤等の添加剤を含有し、
通常単位投与量アンプルもしくは多投与量容器又はチュ
ーブの状態で提供される。上記の組成物は使用する際に
適当な担体、例えば発熱物質不含の滅菌した水で再溶解
させる粉体であってもよい。
The hepatitis G vaccine of the present invention also contains additives such as stabilizers, buffers, preservatives, tonicity agents,
It is usually provided in a unit dose ampoule or multi-dose container or tube. The composition may be in powder form for reconstitution with a suitable carrier, eg, pyrogen-free, sterile water, when used.

【0050】[0050]

【実施例】以下、本発明を実施例により更に具体的に説
明する。但し、本発明はこれら実施例に限定されない。
EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described more specifically with reference to examples. However, the present invention is not limited to these examples.

【0051】[0051]

【実施例1】G型肝炎ウイルスゲノムRNAの分離 非A、非B、非C型肝硬変合併肝細胞癌の患者の血清10
0 μL に対し、4.2Mチオシアン酸グアニジン、0.1M Tri
s-HCl(pH7.5)、0.5 %N−ラウリルサルコシル溶液を42
5 μL 、2−メルカプトエタノールを4μL 添加後、30
分間転倒混和した。
Example 1 Separation of Hepatitis G Virus Genome RNA Serum of a patient with hepatocellular carcinoma with non-A, non-B, non-C liver cirrhosis 10
For 0 μL, 4.2M guanidine thiocyanate, 0.1M Tri
42% s-HCl (pH 7.5), 0.5% N-lauryl sarcosyl solution
After adding 5 μL and 4-μL of 2-mercaptoethanol,
Mix by tumbling for minutes.

【0052】その後、4:1に混和したフェノール−ク
ロロホルム液で3回、クロロホルムで1回抽出し、除蛋
白を行った後、エタノール沈殿を行った。該沈殿を70
%、100 %のエタノールでそれぞれ洗い、得られたペレ
ットを精製済みのG型肝炎ウイルスゲノムRNAとして
用いた。
Thereafter, the mixture was extracted 3 times with a 4: 1 mixed phenol-chloroform solution and once with chloroform to remove proteins, followed by ethanol precipitation. 70 of the precipitate
% And 100% ethanol respectively, and the resulting pellets were used as purified hepatitis G virus genomic RNA.

【0053】[0053]

【実施例2】G型肝炎ウイルス遺伝子のクローニングおよび塩基配列
の決定 (1) G型肝炎ウイルス遺伝子のクローニング 実施例1で得られたゲノムRNAに、50mM Tris-HCl(pH
8.3)、75mM KCl、10mMDTT、3mM MgCl2、1mM dNTPsミ
ックス (dATP, dCTP, dGTP, dTTPからなる4種デオキシ
ヌクレオシド三リン酸; TOYOBO社製) 、60μg/mlランダ
ムプライマー (TAKARA社製) 、10U/ml M-MLV逆転写酵素
(GIBCO BRL 社製) の各溶液を加えて総量20μL にし
た。次いで、得られた溶液について42℃で30分間逆転写
反応を行い、cDNAを得た。
Example 2 Cloning and nucleotide sequence of hepatitis G virus gene
Genomic RNA obtained in the decision (1) Cloning Example 1 of hepatitis G virus gene, 50mM Tris-HCl (pH
8.3), 75 mM KCl, 10 mM DTT, 3 mM MgCl 2 , 1 mM dNTPs mix (4 types of deoxynucleoside triphosphates consisting of dATP, dCTP, dGTP, dTTP; manufactured by TOYOBO), 60 μg / ml random primer (manufactured by TAKARA), 10U / ml M-MLV reverse transcriptase
Each solution (manufactured by GIBCO BRL) was added to make a total volume of 20 μL. Next, the resulting solution was subjected to reverse transcription reaction at 42 ° C. for 30 minutes to obtain cDNA.

【0054】次に、このcDNAを鋳型とし、Yoshiba
等、Lancet 346: 1131-1132, 1995に記載の、G型肝炎
ウイルスゲノムのヘリカーゼ領域に特異的なプライマー
(配列番号30、31) を用いてPCR反応による増幅を行
った。反応は、上記cDNA溶液1〜5μL に対して10
mM Tris-HCl(pH8.0)、50mM KCl、1.5 mM MgCl2、0.1%Tr
iton X-100 、0.2 mM dNTP 、センス側およびアンチセ
ンス側プライマーを各4μg/ml、並びに、30U/ml Taq D
NAポリメラーゼ (パーキンエルマーシータス社製) を加
え、総量25μL で行った。このサンプルを、94℃で4分
を1サイクル、94℃で30秒、53℃で1分及び72℃で1分
を1サイクルとしてこれを40サイクル、72℃で7分を1
サイクル行った。
Next, using this cDNA as a template, Yoshiba
Et al., Lancet 346: 1131-1132, 1995, primers specific for the helicase region of the hepatitis G virus genome.
(SEQ ID NOS: 30, 31) were used for amplification by PCR reaction. The reaction is 10 times for 1-5 μL of the above cDNA solution.
mM Tris-HCl (pH8.0), 50 mM KCl, 1.5 mM MgCl 2 , 0.1% Tr
iton X-100, 0.2 mM dNTP, 4 μg / ml each of sense and antisense primers, and 30 U / ml Taq D
NA polymerase (manufactured by Perkin Elmer Cetus) was added, and the total amount was 25 μL. This sample was cycled at 94 ° C for 4 minutes for 1 cycle, 94 ° C for 30 seconds, 53 ° C for 1 minute and 72 ° C for 1 minute as 40 cycles, and 72 ° C for 7 minutes as 1 cycle.
Cycled.

【0055】PCR産物を1〜3%アガロースゲルにて
泳動し、エチジウムブロマイド染色により紫外線下に可
視化したバンドを切り出し、QIAEX,ゲル抽出キット(QIA
GEN)を用いて期待された泳動度のDNA断片を回収し
た。
The PCR product was electrophoresed on a 1-3% agarose gel, the band visualized under ultraviolet light was cut out by staining with ethidium bromide, and the QIAEX gel extraction kit (QIAEX) was used.
GEN) was used to recover the DNA fragment with the expected mobility.

【0056】次に、DNAの末端をそろえ (制限酵素Ec
oRI 及びBamHI で処理) または平滑化したM13ファージ
ベクターに挿入し、組換え体プラスミドを得た。この組
換え体を用いて大腸菌JM109 を形質転換させ、12〜16時
間培養してプラークを形成させることによりG型肝炎ウ
イルスcDNA断片を組み込んだファージを得た。
Next, the ends of the DNA are aligned (restriction enzyme Ec
(treated with oRI and BamHI) or inserted into a blunted M13 phage vector to obtain a recombinant plasmid. Escherichia coli JM109 was transformed with this recombinant and cultured for 12 to 16 hours to form plaques, whereby phages incorporating the hepatitis G virus cDNA fragment were obtained.

【0057】(2) 塩基配列の決定 上記の方法で得たファージを大腸菌JM105 に感染させ、
十分に増殖させた後、菌体を分離し、ポリエチレングリ
コールを用いてファージを回収した。その後、フェノー
ルとクロロホルムとを4:1に混合した溶液で2回、ク
ロロホルムで1回抽出することでファージの1本鎖DN
Aを回収した。これを用いて、Sangarらのジデオキシ法
によりDNAの塩基配列を決定した。
(2) Determination of nucleotide sequence Escherichia coli JM105 was infected with the phage obtained by the above method,
After sufficiently proliferating, bacterial cells were separated, and phages were recovered using polyethylene glycol. Then, the solution was mixed with phenol and chloroform at a ratio of 4: 1 twice and once with chloroform to extract single-stranded DN of the phage.
A was collected. Using this, the nucleotide sequence of DNA was determined by the dideoxy method of Sangar et al.

【0058】その結果を配列番号2に示す。配列番号2
の配列より、本発明のG型肝炎ウイルスゲノムRNAヘ
リカーゼ領域の配列を決定することができ、その結果を
配列番号1に示す。また、配列番号1より、G型肝炎ウ
イルスゲノムRNAに相同的なDNAの塩基配列を決定
することができ、その結果を配列番号3に示す。更に、
配列番号2より、G型肝炎ウイルス蛋白質をコードする
推定アミノ酸配列を決定することができる。この場合、
G型肝炎ウイルス蛋白質をコードしていると考えられる
部分は、配列番号2の塩基配列のうち、2〜100 番目の
99個の塩基配列であると考えられ、該塩基配列から推定
されるアミノ酸配列を、配列番号4に示す。
The result is shown in SEQ ID NO: 2. SEQ ID NO: 2
The sequence of the hepatitis G virus genomic RNA helicase region of the present invention can be determined from the sequence No. 1, and the result is shown in SEQ ID NO: 1. Further, from SEQ ID NO: 1, the nucleotide sequence of DNA homologous to hepatitis G virus genomic RNA can be determined, and the result is shown in SEQ ID NO: 3. Furthermore,
From SEQ ID NO: 2, the deduced amino acid sequence encoding the hepatitis G virus protein can be determined. in this case,
The portion that is considered to encode the hepatitis G virus protein is the 2nd to 100th nucleotides in the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2.
The amino acid sequence considered to be 99 nucleotide sequences and deduced from the nucleotide sequence is shown in SEQ ID NO: 4.

【0059】さらに、cDNAを増幅させるためのプラ
イマーを下記のプライマーに変えて上記と同じ操作を行
い、G型肝炎ウイルスゲノムRNAの他の領域について
も塩基配列を決定した。
Further, the primers for amplifying cDNA were changed to the following primers and the same operation as above was carried out to determine the nucleotide sequences of other regions of hepatitis G virus genomic RNA.

【0060】配列番号32、33に示す塩基配列を有するプ
ライマーを用い、配列番号6に示すcDNA配列を決定
した。これより配列番号5のRNA配列および配列番号
7の相同的なDNA配列が決定された。推定アミノ酸配
列は配列番号8に示す通りである。この配列はコア〜エ
ンベロープ領域と考えられる。
Using the primers having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 32 and 33, the cDNA sequence shown in SEQ ID NO: 6 was determined. From this, the RNA sequence of SEQ ID NO: 5 and the homologous DNA sequence of SEQ ID NO: 7 were determined. The deduced amino acid sequence is as shown in SEQ ID NO: 8. This sequence is considered to be the core-envelope region.

【0061】配列番号34、35に示す塩基配列を有するプ
ライマーを用い、配列番号10に示すcDNA配列を決定
した。これより配列番号9のRNA配列および配列番号
11の相同的なDNA配列が決定された。推定アミノ酸配
列は配列番号12に示す通りである。この配列はポリメラ
ーゼ領域の一部と考えられる。
Using the primers having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 34 and 35, the cDNA sequence shown in SEQ ID NO: 10 was determined. From this, the RNA sequence of SEQ ID NO: 9 and SEQ ID NO:
Eleven homologous DNA sequences were determined. The deduced amino acid sequence is as shown in SEQ ID NO: 12. This sequence is considered part of the polymerase region.

【0062】配列番号36、37に示す塩基配列を有するプ
ライマーを用い、配列番号14に示すcDNA配列を決定
した。これより配列番号13のRNA配列および配列番号
15の相同的なDNA配列が決定された。推定アミノ酸配
列は配列番号16に示す通りである。この配列もポリメラ
ーゼ領域の一部と考えられる。
Using the primers having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 36 and 37, the cDNA sequence shown in SEQ ID NO: 14 was determined. From this, the RNA sequence of SEQ ID NO: 13 and SEQ ID NO:
Fifteen homologous DNA sequences were determined. The deduced amino acid sequence is shown in SEQ ID NO: 16. This sequence is also considered to be part of the polymerase region.

【0063】配列番号38、39に示す塩基配列を有するプ
ライマーを用い、配列番号18に示すcDNA配列を決定
した。これより配列番号17のRNA配列および配列番号
19の相同的なDNA配列が決定された。この配列は5'末
端非翻訳領域と考えられる。
Using the primers having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 38 and 39, the cDNA sequence shown in SEQ ID NO: 18 was determined. From this, the RNA sequence of SEQ ID NO: 17 and SEQ ID NO:
Nineteen homologous DNA sequences were determined. This sequence is considered to be the 5'end untranslated region.

【0064】[0064]

【実施例3】蛋白質の発現の確認 (1) 蛋白質の発現および精製 上記の塩基配列の決定に用いた方法と同様にして、G型
肝炎遺伝子断片を宿主菌XL1-Blue中のpMAL-C2 にクロー
ニングした。IPTGを用いて、宿主菌XL1-Blue中のpM
AL-C2 にクローニングされたG型肝炎ウイルスヘリカー
ゼ遺伝子断片の発現を誘導し、37℃にて3〜4時間培養
した後、遠心チューブに移し、12000rpm、30秒間 (4
℃) 遠心することにより大腸菌の培養液から集菌し、50
mM Tris-HCl(pH7.4)を用いて洗浄後、1×Column buffe
r (10 mMリン酸ナトリウム、0.5M塩化ナトリウム、1mM
アジ化ナトリウム、10mMβ−メルカプトエタノール及び
1mMEGTA を含む) に溶解し、凍結 (−20℃) 、融解を
2回繰り返した後、100 ℃で5分間加熱し、発現蛋白質
を得た。
Example 3 Confirmation of Expression of Protein (1) Expression and Purification of Protein The hepatitis G gene fragment was added to pMAL-C2 in the host strain XL1-Blue in the same manner as in the method used for determining the nucleotide sequence described above. Cloned. PM in host strain XL1-Blue using IPTG
The expression of hepatitis G virus helicase gene fragment cloned in AL-C2 was induced, cultured at 37 ° C for 3 to 4 hours, and then transferred to a centrifuge tube, 12000 rpm, 30 seconds (4
(° C) Collect the cells from the E. coli culture solution by centrifugation and
After washing with mM Tris-HCl (pH 7.4), 1 x Column buffe
r (10 mM sodium phosphate, 0.5 M sodium chloride, 1 mM
It was dissolved in sodium azide, 10 mM β-mercaptoethanol and 1 mM EGTA), frozen (-20 ° C) and thawed twice, and then heated at 100 ° C for 5 minutes to obtain an expressed protein.

【0065】2.5 ×10cmのカラムにアミロース樹脂をつ
め、8倍量の1×Column buffer にて洗浄したものに、
1ml/分の速度で発現タンパク質の粗抽出物を注入す
る。さらに8倍量の1×Column buffer で洗浄した後、
Column buffer に10mMマルトースを加えた溶液を流し、
タンパクを抽出した。
Amylose resin was packed in a 2.5 × 10 cm column and washed with 8 times the amount of 1 × Column buffer.
Inject crude extract of expressed protein at a rate of 1 ml / min. After washing with 8 times more 1 × Column buffer,
Pour the solution containing 10 mM maltose into the column buffer,
The protein was extracted.

【0066】(2) 蛋白質の発現の確認 次に、(1) で得られた蛋白についてSDS−ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動を行い、分子量の大きさによって
分けた後、ウエスタンブロットによりナイロン膜に蛋白
を転写した。同じ患者の抗血清を1次抗体、アルアカリ
ホスファターゼをラベルした抗ヒト1gG抗体を2次抗体
として、発現した蛋白の検出を行った。ヘリカーゼ蛋白
とマルトース結合蛋白との融合蛋白と考えられる46.5キ
ロダルトンのバンドが検出された。
(2) Confirmation of expression of protein Next, the protein obtained in (1) was subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, and the protein was separated on the nylon membrane by Western blotting after separating by molecular weight. It was transcribed. The expressed protein was detected by using the antiserum of the same patient as the primary antibody and the anti-human 1gG antibody labeled with alakaliphosphatase as the secondary antibody. A band of 46.5 kilodalton, which is considered to be a fusion protein of helicase protein and maltose binding protein, was detected.

【0067】[0067]

【実施例4】患者血清100 μL から得られたcDNA20
μL のうち5μL を用いて以下のPCR反応を行った。
プライマーとして、配列番号20〜23に示す塩基配列を有
するDNAを合成して使用した。
Example 4 cDNA 20 obtained from 100 μL of patient serum
The following PCR reaction was performed using 5 μL of the μL.
As a primer, DNA having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 20 to 23 was synthesized and used.

【0068】反応はnestedPCR法にて行った。1stP
CR反応液は、滅菌蒸留水15μL に10×PCRバッファ
ー [500mM KCl,100mM Tris-HCl(pH8.8), 15mM MgCl2、1
% Triton X-100] 2.5μL 、10mM dNTP[N=A,C,T,G] 0.5
μL 、Taq DNApolymerase [5000 units/ml;和光社
製] 0.15μL 、およびプライマーとして配列番号20およ
び22 [各0.1 μg/μL]を各1.0 μL 加えたものとした。
The reaction was performed by the nested PCR method. 1stP
The CR reaction solution was prepared by adding 15 μL of sterile distilled water to 10 × PCR buffer [500 mM KCl, 100 mM Tris-HCl (pH 8.8), 15 mM MgCl 2 , 1
% Triton X-100] 2.5 μL, 10 mM dNTP [N = A, C, T, G] 0.5
μL, Taq DNA polymerase [5000 units / ml; manufactured by Wako] 0.15 μL, and SEQ ID NOS: 20 and 22 [each 0.1 μg / μL] were added in an amount of 1.0 μL.

【0069】反応チューブ(0.5μL)に、上記反応液とc
DNAとを入れ、流動パラフィン2滴を加え、94℃に加
温したサーマルサイクラーにセットした。1stPCR反
応のサイクルは、94℃4分間の後、94℃1分間、53℃2
分間、72℃ 1.5分間を30サイクル行い、最後に72
℃で7分間インキュベートし、4℃にて保存した。
In a reaction tube (0.5 μL), add the above reaction solution and c
DNA was added, 2 drops of liquid paraffin was added, and the mixture was set in a thermal cycler heated to 94 ° C. The cycle of the 1st PCR reaction is 94 ° C for 4 minutes, then 94 ° C for 1 minute, and 53 ° C for 2 minutes.
For 30 minutes at 72 ° C for 1.5 minutes.
Incubated at 7 ° C for 7 minutes and stored at 4 ° C.

【0070】2ndPCR反応液は、滅菌蒸留水を18μL
に、プライマーを配列番号21および23に変更したものを
使用した。反応チューブに2nd反応液と1stPCR産物
2μL とを入れ、1stPCRと同様に流動パラフィンを
滴下した。2ndPCR反応のサイクルは、1stPCRの
30サイクルを35サイクルに変更して実施した。
18 μL of sterile distilled water was used for the 2nd PCR reaction solution.
The primers with the changed SEQ ID NOS: 21 and 23 were used. The 2nd reaction solution and 2 μL of the 1st PCR product were placed in a reaction tube, and liquid paraffin was added dropwise as in the 1st PCR. The cycle of the 2nd PCR reaction is
The 30 cycles were changed to 35 cycles.

【0071】G型肝炎ウイルスは、2ndPCR産物5μ
L を3%アガロースゲルにより電気泳動後、エチジウム
ブロマイド染色を行ったときの121 bpバンドの有無によ
り、その存否を判定することができる。
Hepatitis G virus is the second PCR product 5 μ
The presence or absence can be determined by the presence or absence of the 121 bp band when L is electrophoresed on a 3% agarose gel and then stained with ethidium bromide.

【0072】非A非B非C型肝炎患者血清、非A非B非
C型肝硬変患者血清、および健常人血清を用いて上記試
験を行った結果を図1に示す。
FIG. 1 shows the results of the above-mentioned test using non-A non-B non-C hepatitis patient serum, non-A non-B non-C non-C liver cirrhosis patient serum, and normal human serum.

【0073】[0073]

【発明の効果】本発明により、G型肝炎ウイルスゲノム
RNAの5'末端非翻訳領域、ヘリカーゼ領域、コア〜エ
ンベロープ領域、およびポリメラーゼ領域の塩基配列が
解明され、特に、変異の少ない5'末端非翻訳領域につい
ても塩基配列が決定されたので、この塩基配列を利用し
てG型肝炎ウイルスの検出が容易に行える。G型肝炎ウ
イルスは非A、非B、非C型肝癌の原因ウイルスとし
て、重要視されており、本発明によりG型肝炎ウイルス
の検出が容易に行えることは非常に有用である。また、
本発明のG型肝炎ウイルス蛋白質は、G型肝炎の診断
剤、G型肝炎ワクチン等として有用である。
INDUSTRIAL APPLICABILITY According to the present invention, the nucleotide sequences of the 5'terminal untranslated region, helicase region, core-envelope region, and polymerase region of hepatitis G virus genomic RNA have been elucidated. Since the nucleotide sequence of the translation region was also determined, the hepatitis G virus can be easily detected using this nucleotide sequence. The hepatitis G virus is regarded as important as a causative virus for non-A, non-B, and non-C liver cancer, and it is very useful that the present invention can easily detect the hepatitis G virus. Also,
The hepatitis G virus protein of the present invention is useful as a diagnostic agent for hepatitis G, hepatitis G vaccine, and the like.

【0074】[0074]

【配列表】[Sequence list]

配列番号:1 配列の長さ:100 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic RNA 配列 G GAG CGG AUG CGG ACC GGU AGG CAC CUC GUG UUU UGU CAC UCA AAG GCG 49 Glu Arg Met Arg Thr Gly Arg His Leu Val Phe Cys His Ser Lys Ala 5 10 15 GAG UGC GAG CGC CUG GCC GGU CAG UUU UCC UCU AGG GGG GUG AAC GCC 97 Glu Cys Glu Arg Leu Ala Gly Gln Phe Ser Ser Arg Gly Val Asn Ala 20 25 30 AUU 100 Ile 33 配列番号:2 配列の長さ:100 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to Genomic RNA 配列 AATGGCGTTC ACCCCCCTAG AGGAAAACTG ACCGGCCAGG CGCTCGCACT CCGCCTTTGA 60 GTGACAAAAC ACGAGGTGCC TACCGGTCCG CATCCGCTCC 100 配列番号:3 配列の長さ:100 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (Genomic RNA と相同な DN
A) 配列 GGAGCGGATG CGGACCGGTA GGCACCTCGT GTT
TTGTCAC TCAAAGGCGG AGTGCGAGCG 60 CCTGGCCGGT CAGTTTTCCT CTAGGGGGGT GAA
CGCCATT 100 配列番号:4 配列の長さ:33 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Glu Arg Met Arg Thr Gly Arg His Leu Val Phe Cys His Ser Lys Ala 5 10 15 Glu Cys Glu Arg Leu Ala Gly Gln Phe Ser Ser Arg Gly Val Asn Ala 20 25 30 Ile 33 配列番号:5 配列の長さ:412 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類: Genomic RNA 配列 A AGC CUU CGG GUG AGG GCG GGU GGC AUA UUC UUU UCC UUA CCG AUC AUG 49 Ser Leu Arg Val Arg Ala Gly Gly Ile Phe Phe Ser Leu Pro Ile Met 5 10 15 GCA GUC CUU CUG CUU CUC UUC GUU GUG CAG GCC GGG GCC AUU CUG GCC 97 Ala Val Leu Leu Leu Leu Phe Val Val Gln Ala Gly Ala Ile Leu Ala 20 25 30 CCG GCC ACA CAU GCU UGU GGA GCG AAU GGG CAA UAU UUC CUC ACG AAU 145 Pro Ala Thr His Ala Cys Gly Ala Asn Gly Gln Tyr Phe Leu Thr Asn 35 40 45 UGC UGU GCC UUA GAG GAC AUA GGG UUC UGC CUG GAG GGU GGA UGC CUU 193 Cys Cys Ala Leu Glu Asp Ile Gly Phe Cys Leu Glu Gly Gly Cys Leu 50 55 60 GUG GCC UUG GGC UGC ACA AUU UGU ACU GAC CGU UGC UGG CCA CUG UAU 241 Val Ala Leu Gly Cys Thr Ile Cys Thr Asp Arg Cys Trp Pro Leu Tyr 65 70 75 80 CAG GCG GGU UUG GCC GUG CGG CCU GGC AAG UCC GCC GCC CAG UUG GUC 289 Gln Ala Gly Leu Ala Val Arg Pro Gly Lys Ser Ala Ala Gln Leu Val 85 90 95 GGG GAA CUC GGA AGC CUU UAC GGG CCC UUA UCG GUG UCC GCC UAC GUG 337 Gly Glu Leu Gly Ser Leu Tyr Gly Pro Leu Ser Val Ser Ala Tyr Val 100 105 110 GCG GGC AUC UUA GGG CUU GGG GAG GUC UAU UCG GGG GUC CUU ACC AUC 385 Ala Gly Ile Leu Gly Leu Gly Glu Val Tyr Ser Gly Val Leu Thr Ile 115 120 125 GGG GUG GCG UUG ACG CGC CGG GUC UAC 412 Gly Val Ala Leu Thr Arg Arg Val Tyr 130 135 配列番号:6 配列の長さ:412 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to Genomic RNA 配列 GTAGACCCGG CGCGTCAACG CCACCCCGAT GGTAAGGACC CCCGAATAGA CCTCCCCAAG 60 CCCTAAGATG CCCGCCACGT AGGCGGACAC CGATAAGGGC CCGTAAAGGC TTCCGAGTTC 120 CCCGACCAAC TGGGCGGCGG ACTTGCCAGG CCGCACGGCC AAACCCGCCT GATACAGTGG 180 CCAGCAACGG TCAGTACAAA TTGTGCAGCC CAAGGCCACA AGGCATCCAC CCTCCAGGCA 240 GAACCCTATG TCCTCTAAGG CACAGCAATT CGTGAGGAAA TATTGCCCAT TCGCTCCACA 300 AGCATGTGTG GCCGGGGCCA GAATGGCCCC GGCCTGCACA ACGAAGAGAA GCAGAAGGAC 360 TGCCATGATC GGTAAGGAAA AGAATATGCC ACCCGCCCTC ACCCGAAGGC TT 412 配列番号:7 配列の長さ:412 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (Genomic RNA と相同な DNA) 配列 AAGCCTTCGG GTGAGGGCGG GTGGCATATT CTTTTCCTTA CCGATCATGG CAGTCCTTCT 60 GCTTCTCTTC GTTGTGCAGG CCGGGGCCAT TCTGGCCCCG GCCACACATG CTTGTGGAGC 120 GAATGGGCAA TATTTCCTCA CGAATTGCTG TGCCTTAGAG GACATAGGGT TCTGCCTGGA 180 GGGTGGATGC CTTGTGGCCT TGGGCTGCAC AATTTGTACT GACCGTTGCT GGCCACTGTA 240 TCAGGCGGGT TTGGCCGTGC GGCCTGGCAA GTCCGCCGCC CAGTTGGTCG GGGAACTCGG 300 AAGCCTTTAC GGGCCCTTAT CGGTGTCCGC CTACGTGGCG GGCATCTTAG GGCTTGGGGA 360 GGTCTATTCG GGGGTCCTTA CCATCGGGGT GGCGTTGACG CGCCGGGTCT AC 412 配列番号:8 配列の長さ:137 配列の型:アミノ酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Ser Leu Arg Val Arg Ala Gly Gly Ile Phe Phe Ser Leu Pro Ile Met 5 10 15 Ala Val Leu Leu Leu Leu Phe Val Val Gln Ala Gly Ala Ile Leu Ala 20 25 30 Pro Ala Thr His Ala Cys Gly Ala Asn Gly Gln Tyr Phe Leu Thr Asn 35 40 45 Cys Cys Ala Leu Glu Asp Ile Gly Phe Cys Leu Glu Gly Gly Cys Leu 50 55 60 Val Ala Leu Gly Cys Thr Ile Cys Thr Asp Arg Cys Trp Pro Leu Tyr 65 70 75 80 Gln Ala Gly Leu Ala Val Arg Pro Gly Lys Ser Ala Ala Gln Leu Val 85 90 95 Gly Glu Leu Gly Ser Leu Tyr Gly Pro Leu Ser Val Ser Ala Tyr Val 100 105 110 Ala Gly Ile Leu Gly Leu Gly Glu Val Tyr Ser Gly Val Leu Thr Ile 115 120 125 Gly Val Ala Leu Thr Arg Arg Val Tyr 130 135 137 配列番号:9 配列の長さ:244 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類: Genomic RNA 配列 G AUU CGA CGG ACC UCA UGC UAC AAG UUG CUA CGC CAG CAA AUA CUC UCU 49 Ile Arg Arg Thr Ser Cys Tyr Lys Leu Leu Arg Gln Gln Ile Leu Ser 5 10 15 GCA GCU GUA GCU GAG CCC UAC UAC GUG GAU GGC AUA CCC GUC UCA UGG 97 Ala Ala Val Ala Glu Pro Tyr Tyr Val Asp Gly Ile Pro Val Ser Trp 20 25 30 GAA GCU GAC GCG CGA GCG CCG GCG AUG GUC UAC GGU CCU GGC CAA AGU 145 Glu Ala Asp Ala Arg Ala Pro Ala Met Val Tyr Gly Pro Gly Gln Ser 35 40 45 GUC ACC AUU GAC GGA GAG CGC UAC ACC CUU CCG CAC CAG CUG CGG AUG 193 Val Thr Ile Asp Gly Glu Arg Tyr Thr Leu Pro His Gln Leu Arg Met 50 55 60 CGG AAU GUG GCC CCU UCU GAG GUU UCA UCC GAG GUC AGC AUC GAG AUU 241 Arg Asn Val Ala Pro Ser Glu Val Ser Ser Glu Val Ser Ile Glu Ile 65 70 75 80 GGG 244 Gly 81 配列番号:10 配列の長さ:244 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to Genomic RNA 配列 CCCAATCTCG ATGCTGACCT CGGATGAAAC CTCAGAAGGG GCCACATTCC GCATCCGCAG 60 CTGGTGCGGA AGGGTGTAGC GCTCTCCGTC AATGGTGACA CTTTGGCCAG GACCGTAGAC 120 CATCGCCGGC GCTCGCGCGT CAGCTTCCCA TGAGACGGGT ATGCCATCCA CGTAGTAGGG 180 CTCAGCTACA GCTGCAGAGA GTATTTGCTG GCGTAGCAAC TTGTAGCATG AGGTCCGTCG 240 AATC 244 配列番号:11 配列の長さ:244 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (Genomic RNA と相同な DNA) 配列 GATTCGACGG ACCTCATGCT ACAAGTTGCT ACGCCAGCAA ATACTCTCTG CAGCTGTAGC 60 TGAGCCCTAC TACGTGGATG GCATACCCGT CTCATGGGAA GCTGACGCGC GAGCGCCGGC 120 GATGGTCTAC GGTCCTGGCC AAAGTGTCAC CATTGACGGA GAGCGCTACA CCCTTCCGCA 180 CCAGCTGCGG ATGCGGAATG TGGCCCCTTC TGAGGTTTCA TCCGAGGTCA GCATCGAGAT 240 TGGG 244 配列番号:12 配列の長さ:81 配列の型:アミノ酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Ile Arg Arg Thr Ser Cys Tyr Lys Leu Leu Arg Gln Gln Ile Leu Ser 5 10 15 Ala Ala Val Ala Glu Pro Tyr Tyr Val Asp Gly Ile Pro Val Ser Trp 20 25 30 Glu Ala Asp Ala Arg Ala Pro Ala Met Val Tyr Gly Pro Gly Gln Ser 35 40 45 Val Thr Ile Asp Gly Glu Arg Tyr Thr Leu Pro His Gln Leu Arg Met 50 55 60 Arg Asn Val Ala Pro Ser Glu Val Ser Ser Glu Val Ser Ile Glu Ile 65 70 75 80 Gly 81 配列番号:13 配列の長さ:121 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic RNA 配列 C AUC UUG GGC GAU CCG GGG CGG GUU GCC AAG GCG GUG CUG GGG GGG GCU 49 Ile Leu Gly Asp Pro Gly Arg Val Ala Lys Ala Val Leu Gly Gly Ala 5 10 15 UAC GCC UUC CAG UAC ACC CCA AAC CAG CGG GUU AGG GAG AUG CUG AAA 97 Tyr Ala Phe Gln Tyr Thr Pro Asn Gln Arg Val Arg Glu Met Leu Lys 20 25 30 CUG UGG GAG UCA AAG AAA ACU CCG 121 Leu Trp Glu Ser Lys Lys Thr Pro 35 40 配列番号:14 配列の長さ:121 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to Genomic RNA 配列 CGGAGTTTTC TTTGACTCCC ACAGTTTCAG CATCTCCCTA ACCCGCTGGT TTGGGGTGTA 60 CTGGAAGGCG TAAGCCCCCC CCAGCACCGC CTTGGCAACC CGCCCCGGAT CGCCCAAGAT 120 G 121 配列番号:15 配列の長さ:121 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (Genomic RNA と相同な DN
A) 配列 CATCTTGGGC GATCCGGGGC GGGTTGCCAA GGC
GGTGCTG GGGGGGGCTT ACGCCTTCCA 60 GTACACCCCA AACCAGCGGG TTAGGGAGAT GCT
GAAACTG TGGGAGTCAA AGAAAACTCC 120 G
121 配列番号:16 配列の長さ:40 配列の型:アミノ酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:タンパク質 配列 Ile Leu Gly Asp Pro Gly Arg Val Ala Lys Ala Val Leu Gly Gly Ala 5 10 15 Tyr Ala Phe Gln Tyr Thr Pro Asn Gln Arg Val Arg Glu Met Leu Lys 20 25 30 Leu Trp Glu Ser Lys Lys Thr Pro 35 40 配列番号:17 配列の長さ:204 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic RNA 配列 AUAGGUGGGU CUUAAGGGUU GGUUAAGGUC CCUCUGGCGC UUGUGGCGAG AAAGCGCACG 60 GUCCACAGGU GUUGGUCCUA CCGGUGUAAU AAGGACCCGA CGUCAGGCUC GUCGUUAAAC 120 CGAGCCCGUU ACCCACCUGG GCAAACAACG CCCACGUACG GCCCACGUCG CCCUUCAAUG 180 UCUCUCUUGA CCAAUAGGCU UAGC 204 配列番号:18 配列の長さ:204 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to Genomic RNA 配列 GCTAAGCCTA TTGGTCAAGA GAGACATTGA AGGGCGACGT GGGCCGTACG TGGGCGTTGT 60 TTGCCCAGGT GGGTAACGGG CTCGGTTTAA CGACGAGCCT GACGTCGGGT CCTTATTACA 120 CCGGTAGGAC CAACACCTGT GGACCGTGCG CTTTCTCGCC ACAAGCGCCA GAGGGACCTT 180 AACCAACCCT TAAGACCCAC CTAT 204 配列番号:19 配列の長さ:204 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (Genomic RNA と相同な DNA) 配列 ATAGGTGGGT CTTAAGGGTT GGTTAAGGTC CCTCTGGCGC TTGTGGCGAG AAAGCGCACG 60 GTCCACAGGT GTTGGTCCTA CCGGTGTAAT AAGGACCCGA CGTCAGGCTC GTCGTTAAAC 120 CGAGCCCGTT ACCCACCTGG GCAAACAACG CCCACGTACG GCCCACGTCG CCCTTCAATG 180 TCTCTCTTGA CCAATAGGCT TAGC 204 配列番号:20 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 CACTATAGGT GGGTCTTAAG 20 配列番号:21 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 GCGCACGGTC CACAGGTGTT 20 配列番号:22 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 GCCTATTGGT CAAGAGAGAC 20 配列番号:23 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 GGGCGACGTG GACCGTACGT 20 配列番号:24 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 TCGGGTGAGG GCGGGTGGCA 20 配列番号:25 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 ACCGATCATG GCAGTCCTTC 20 配列番号:26 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 GTACGTGGGC GTTGTTTGCC 20 配列番号:27 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 CCCGCCTGAT ACAGTGGCCA 20 配列番号:28 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 ACCCGGCGCG TCAACGCCAC 20 配列番号:29 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 GCTTGTGGAG CGAATGGGCA 20 配列番号:30 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 TCYTTGATGA TDGAACTGTC 20 (Y=T or C, D=A, G, or T) 配列番号:31 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 TATGGGCATG GHATHCCYCT 20 (H=A, C, or T, Y=C or T) 配列番号:32 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 TACAGCCGGG GTAGCCCAAG 20 配列番号:33 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 CACGTCAGGT TCGGGACCGG 20 配列番号:34 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 GTGACCCCTA CCCACGTGGT 20 配列番号:35 配列の長さ:23 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 AGTTCTGAGT CTTCAGTCTC CGT 23 配列番号:36 配列の長さ:24 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 GGACTTCCGG ATAGCTGAGA AGCT 24 配列番号:37 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 GCGTCCACAC AGATGGCGCA 20 配列番号:38 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 CGGTCATCCT GGTAGCCACT 20 配列番号:39 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 (合成DNA) 配列 TGGTCCTTGT CAACTCGCCG 20
SEQ ID NO: 1 Sequence length: 100 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Genomic RNA sequence G GAG CGG AUG CGG ACC GGU AGG CAC CUC GUG UUU UGU CAC UCA AAG GCG 49 Glu Arg Met Arg Thr Gly Arg His Leu Val Phe Cys His Ser Lys Ala 5 10 15 GAG UGC GAG CGC CUG GCC GGU CAG UUU UCC UCU AGG GGG GUG AAC GCC 97 Glu Cys Glu Arg Leu Ala Gly Gln Phe Ser Ser Arg Gly Val Asn Ala 20 25 30 AUU 100 Ile 33 SEQ ID NO: 2 Sequence Length: 100 Sequence Type: Nucleic Acid Number of Strands: Single Strand Topology: Linear Sequence Type: cDNA to Genomic RNA Sequence AATGGCGTTC ACCCCCCTAG AGGAAAACTG ACCGGCCAGG CGCTCGCACT CCGCCTTTGA 60 GTGACAAAAC ACGAGGTGCC TACCGGTCCG CATCCGCTCC 100 SEQ ID NO: 3 Sequence length: 100 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (DN homologous to genomic RNA)
A) Sequence GGAGCGGATG CGGACCGGTA GGCCACCTCGT GTT
TTGTCAC TCAAAGGCGG AGTGCGAGCG 60 CCTGGCCGGT CAGTTTTCCT CTAGGGGGGT GAA
CGCCAT 100 SEQ ID NO: 4 Sequence length: 33 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Protein sequence Glu Arg Met Arg Thr Gly Arg His Leu Val Phe Cys His Ser Lys Ala 5 10 15 Glu Cys Glu Arg Leu Ala Gly Gln Phe Ser Ser Arg Gly Val Asn Ala 20 25 30 Ile 33 SEQ ID NO: 5 Sequence length: 412 Sequence type: Nucleic acid Strand number: Single strand Topology: Direct Chain type: Genomic RNA sequence A AGC CUU CGG GUG AGG GCG GGU GGC AUA UUC UUU UCC UUA CCG AUC AUG 49 Ser Leu Arg Val Arg Ala Gly Gly Ile Phe Phe Ser Leu Pro Ile Met 5 10 15 GCA GUC CUU CUG CUU CUC UUC GUU GUG CAG GCC GGG GCC AUU CUG GCC 97 Ala Val Leu Leu Leu Leu Phe Val Val Gln Ala Gly Ala Ile Leu Ala 20 25 30 CCG GCC ACA CAU GCU UGU GGA GCG AAU GGG CAA UAU UUC CUC ACG AAU 145 Pro Ala Thr His Ala Cys Gly Ala Asn Gly Gln Tyr Phe Leu Thr Asn 35 40 45 UGC UGU GCC UUA GAG GAC AUA GGG UUC UGC CUG GAG GGU GGA UGC CUU 193 Cys Cys Ala Leu Glu Asp Ile Gly Phe Cys Leu Glu Gly Gly Cys Leu 50 55 60 GUG GCC UUG GGC UGC ACA AUU UGU ACU GAC CGU UGC UGG CCA CUG UAU 241 Val Ala Leu Gly Cys Thr Ile Cys Thr Asp Arg Cys Trp Pro Leu Tyr 65 70 75 80 CAG GCG GGU UUG GCC GUG CGG CCU GGC AAG UCC GCC GCC CAG UUG GUC 289 Gln Ala Gly Leu Ala Val Arg Pro Gly Lys Ser Ala Ala Gln Leu Val 85 90 95 GGG GAA CUC GGA AGC CUU UAC GGG CCC UUA UCG GUG UCC GCC UAC GUG 337 Gly Glu Leu Gly Ser Leu Tyr Gly Pro Leu Ser Val Ser Ala Tyr Val 100 105 110 GCG GGC AUC UUA GGG CUU GGG GAG GUC UAU UCG GGG GUC CUU ACC AUC 385 Ala Gly Ile Leu Gly Leu Gly Glu Val Tyr Ser Gly Val Leu Thr Ile 115 120 125 GGG GUG GCG UUG ACG CGC CGG GUC UAC 412 Gly Val Ala Leu Thr Arg Arg Val Tyr 130 135 SEQ ID NO: 6 Sequence length: 412 Sequence type: Number of nucleic acid chains : Single strand Topology: Linear Sequence type: cDNA to Genomic RNA sequence GTAGACCCGG CGCGTCAACG CCACCCCGAT GGTAAGGACC CCCGAATAGA CCTCCCCAAG 60 CCCTAAGATG CCCGCCACGT AGGCGGACAC CGATAAGGGC CCGTA AAGGC TTCCGAGTTC 120 CCCGACCAAC TGGGCGGCGG ACTTGCCAGG CCGCACGGCC AAACCCGCCT GATACAGTGG 180 CCAGCAACGG TCAGTACAAA TTGTGCAGCC CAAGGCCACA AGGCATCCAC CCTCCAGGCA 240 GAACCCTATG TCCTCTAAGG CACAGCAATT CGTGAGGAAA TATTGCCCAT TCGCTCCACA 300 AGCATGTGTG GCCGGGGCCA GAATGGCCCC GGCCTGCACA ACGAAGAGAA GCAGAAGGAC 360 TGCCATGATC GGTAAGGAAA AGAATATGCC ACCCGCCCTC ACCCGAAGGC TT 412 SEQ ID NO: 7 SEQ Length: 412 sequences Type: Nucleic Acid Number of Strands: Single Strand Topology: Linear Sequence Type: Other Nucleic Acid (DNA homologous to Genomic RNA) Sequence AAGCCTTCGG GTGAGGGCGG GTGGCATATT CTTTTCCTTA CCGATCATGG CAGTCCTTCT 60 GCTTCTCT GTTGTGCACAGGTCGGTCGCAT GATGGCTGCAA TGA TCTGCCTGGA 180 GGGTGGATGC CTTGTGGCCT TGGGCTGCAC AATTTGTACT GACCGTTGCT GGCCACTGTA 240 TCAGGCGGGT TTGGCCGTGC GGCCTGGCAA GTCCGCCGCC CAGTTGGTCG GGGAACTCGG TC AGCCCTACTACCT CTGG CCATCTTAGCTGG GT GGCGTTGACG CGCCGGGTCT AC 412 SEQ ID NO: 8 Sequence Length: 137 Sequence Type: Amino Acid Number of Chains: Single Strand Topology: Linear Sequence Type: Protein Sequence Ser Leu Arg Val Arg Ala Gly Gly Ile Phe Phe Ser Leu Pro Ile Met 5 10 15 Ala Val Leu Leu Leu Leu Phe Val Val Gln Ala Gly Ala Ile Leu Ala 20 25 30 Pro Ala Thr His Ala Cys Gly Ala Asn Gly Gln Tyr Phe Leu Thr Asn 35 40 45 Cys Cys Ala Leu Glu Asp Ile Gly Phe Cys Leu Glu Gly Gly Cys Leu 50 55 60 Val Ala Leu Gly Cys Thr Ile Cys Thr Asp Arg Cys Trp Pro Leu Tyr 65 70 75 80 Gln Ala Gly Leu Ala Val Arg Pro Gly Lys Ser Ala Ala Gln Leu Val 85 90 95 Gly Glu Leu Gly Ser Leu Tyr Gly Pro Leu Ser Val Ser Ala Tyr Val 100 105 110 Ala Gly Ile Leu Gly Leu Gly Glu Val Tyr Ser Gly Val Leu Thr Ile 115 120 125 Gly Val Ala Leu Thr Arg Arg Val Tyr 130 135 137 SEQ ID NO: 9 Sequence length: 244 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Genomic RNA Sequence G AUU CGA CGG ACC UCA UGC UAC AAG UUG CUA CGC CAG CAA AUA CUC UCU 49 Ile Arg Arg Thr Ser Cys Tyr Lys Leu Leu Arg Gln Gln Ile Leu Ser 5 10 15 GCA GCU GUA GCU GAG CCC UAC UAC GUG GAU GGC AUA CCC GUC UCA UGG 97 Ala Ala Val Ala Glu Pro Tyr Tyr Val Asp Gly Ile Pro Val Ser Trp 20 25 30 GAA GCU GAC GCG CGA GCG CCG GCG AUG GUC UAC GGU CCU GGC CAA AGU 145 Glu Ala Asp Ala Arg Ala Pro Ala Met Val Tyr Gly Pro Gly Gln Ser 35 40 45 GUC ACC AUU GAC GGA GAG CGC UAC ACC CUU CCG CAC CAG CUG CGG AUG 193 Val Thr Ile Asp Gly Glu Arg Tyr Thr Leu Pro His Gln Leu Arg Met 50 55 60 CGG AAU GUG GCC CCU UCU GAG GUU UCA UCC GAG GUC AGC AUC GAG AUU 241 Arg Asn Val Ala Pro Ser Glu Val Ser Ser Glu Val Ser Ile Glu Ile 65 70 75 80 GGG 244 Gly 81 SEQ ID NO: 10 Sequence length: 244 Sequence type: Nucleic acid chain Number of: Single-stranded Topology: Linear Sequence type: cDNA to Genomic RNA sequence CCCAATCTCG ATGCTGACCT CGGATGAAAC CTCAGAAGGG GCCACATTCC GCATCCGCAGAG CTCTTGTGCGGA AGGGTGTAGC GCTCTCCGTC AATGGTGACA CTT TGGCCAG GACCGTAGAC 120 CATCGCCGGC GCTCGCGCGT CAGCTTCCCA TGAGACGGGT ATGCCATCCA CGTAGTAGGG 180 CTCAGCTACA GCTGCAGAGA GTATTTGCTG GCGTAGCAAC TTGTAGCATG AGGTCCGTCG 240 AATC 244 SEQ ID NO: 11 Sequence length: 244 Sequence type: Nucleotide sequence number: 244 Sequence type: Nucleotide sequence type: 244 sequence type: Nucleic acid sequence type: 244 other nucleic acid (Genomic RNA homologous DNA) sequence GATTCGACGG ACCTCATGCT ACAAGTTGCT ACGCCAGCAA ATACTCTCTG CAGCTGTAGC 60 TGAGCCCTAC TACGTGGATG GCATACCCGT CTCATGGGAA GCTGACGCGC GAGCGCCGGC 120 GATGGTCTAC GGTCCTGGCC AAAGTGTCAC CATTGACGGA GAGCGCTACA CCCTTCCGCA 180 CCAGCTGCGG ATGCGGAATG TGGCCCCTTC TGAGGTTTCA TCCGAGGTCA GCATCGAGAT 240 TGGG 244 SEQ ID NO: 12 length of sequence : 81 Sequence type: Amino acid Number of chains: Single strand Topology: Linear Sequence type: Protein sequence Ile Arg Arg Thr Ser Cys Tyr Lys Leu Leu Arg Gln Gln Ile Leu Ser 5 10 15 Ala Ala Val Ala Glu Pro Tyr Tyr Val Asp Gly Ile Pro Val Ser Trp 20 25 30 Glu Ala Asp Ala Arg Ala Pro Ala Met Va l Tyr Gly Pro Gly Gln Ser 35 40 45 Val Thr Ile Asp Gly Glu Arg Tyr Thr Leu Pro His Gln Leu Arg Met 50 55 60 Arg Asn Val Ala Pro Ser Glu Val Ser Ser Glu Val Ser Ile Glu Ile 65 70 75 80 Gly 81 SEQ ID NO: 13 Sequence length: 121 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Genomic RNA sequence C AUC UUG GGC GAU CCG GGG CGG GUU GCC AAG GCG GUG CUG GGG GGG GCU 49 Ile Leu Gly Asp Pro Gly Arg Val Ala Lys Ala Val Leu Gly Gly Ala 5 10 15 UAC GCC UUC CAG UAC ACC CCA AAC CAG CGG GUU AGG GAG AUG CUG AAA 97 Tyr Ala Phe Gln Tyr Thr Pro Asn Gln Arg Val Arg Glu Met Leu Lys 20 25 30 CUG UGG GAG UCA AAG AAA ACU CCG 121 Leu Trp Glu Ser Lys Lys Thr Pro 35 40 SEQ ID NO: 14 Sequence length: 121 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single-stranded topology : Type of linear sequence: cDNA to Genomic RNA sequence CGGAGTTTTC TTTGACTCCC ACAGTTTCAG CATCTCCCTA ACCCGCTGGT TTGGGGTGTA 60 CTGGAAGGCG TAAGCCCCCC CCAGCACCGC CTTGGCAACC CGCCCCGGAT CGCC CAAGAT 120 G 121 SEQ ID NO: 15 Sequence length: 121 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (DN homologous to Genomic RNA
A) Sequence CATCTTGGGC GATCCGGGGC GGGTTGCCAA GGC
GGTGCTG GGGGGGGGCTT ACGCCTTCCA 60 GTACACCCCA AACCAGCGGG TTAGGGAGAT GCT
GAAACTG TGGGAGTCAA AGAAAACTCC 120 G
121 SEQ ID NO: 16 Sequence length: 40 Sequence type: Amino acid Number of chains: Single strand Topology: Linear Sequence type: Protein sequence Ile Leu Gly Asp Pro Gly Arg Val Ala Lys Ala Val Leu Gly Gly Ala 5 10 15 Tyr Ala Phe Gln Tyr Thr Pro Asn Gln Arg Val Arg Glu Met Leu Lys 20 25 30 Leu Trp Glu Ser Lys Lys Thr Pro 35 40 SEQ ID NO: 17 Sequence length: 204 Sequence type: Number of nucleic acid strands : single strand topology: linear sequence type: Genomic RNA sequence AUAGGUGGGU CUUAAGGGUU GGUUAAGGUC CCUCUGGCGC UUGUGGCGAG AAAGCGCACG 60 GUCCACAGGU GUUGGUCCUA CCGGUGUAAU AAGGACCCGA CGUCAGGCUC GUCGUUAAAC 120 CGAGCCCGUU ACCCACCUGG GCAAACAACG CCCACGUACG GCCCACGUCG CCCUUCAAUG 180 UCUCUCUUGA CCAAUAGGCU UAGC 204 SEQ ID NO: 18 SEQ length: 204 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: cDNA to Genomic RNA sequence GCTAAGCCTA TTGGTCAAGA GAGACATTGA AGGGCGACGT GGGCCGTACG TGGGCGTTGT 60 TTGCCC AGGT GGGTAACGGG CTCGGTTTAA CGACGAGCCT GACGTCGGGT CCTTATTACA 120 CCGGTAGGAC CAACACCTGT GGACCGTGCG CTTTCTCGCC ACAAGCGCCA GAGGGACCTT 180 AACCAACCCT TAAGACCCAC CTAT 204 SEQ ID NO: 19 Sequence length: 204 Sequence type: Nucleotide type: Nucleotide type: Nucleotide type Nucleic acid (DNA homologous to Genomic RNA) sequence ATAGGTGGGT CTTAAGGGTT GGTTAAGGTC CCTCTGGCGC TTGTGGCGAG AAAGCGCACG 60 GTCCACAGGT GTTGGTCCTA CCGG: ATAAGGACCCGA CGTCAGGCTC GTCGTTCGAC sequence: CGTCAGCCTC: CCTGCA CCAC: CCTGCA: CCTGC: CCGTCA: CCGT: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence CACTATAGGT GGGTCTTAAG 20 SEQ ID NO: 21 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence GCGCACGGTC CACAGGTG TT 20 SEQ ID NO: 22 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence GCCTATTGGT CAAGAGAGAC 20 SEQ ID NO: 23 Sequence Length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence GGGCGACGTG GACCGTACGT 20 SEQ ID NO: 24 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence TCGGGTGAGG GCGGGTGGCA 20 SEQ ID NO: 25 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence ACCGATCATG GCAGTCCTTC 20 SEQ ID NO: 26 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear sequence type : Other nucleic acid (synthetic DNA) sequence GTACGTGGG C GTTGTTTGCC 20 SEQ ID NO: 27 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) sequence CCCGCCTGAT ACAGTGGCCA 20 SEQ ID NO: 28 Sequence Length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence ACCCGGCGCG TCAACGCCAC 20 SEQ ID NO: 29 Sequence length: 20 Sequence type : Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence GCTTGTGGAG CGAATGGGCA 20 SEQ ID NO: 30 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single Chain topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence TCYTTGATGA TDGAACTGTC 20 (Y = T or C, D = A, G, or T) SEQ ID NO: 31 Sequence length: 20 Sequence type : Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid ( Synthetic DNA) Sequence TATGGGCATG GHATHCCYCT 20 (H = A, C, or T, Y = C or T) SEQ ID NO: 32 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) Sequence TACAGCCGGG GTAGCCCAAG 20 SEQ ID NO: 33 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid ( Synthetic DNA) Sequence CACGTCAGGT TCGGGACCGG 20 Sequence Number: 34 Sequence Length: 20 Sequence Type: Nucleic Acid Number of Strands: Single Strand Topology: Linear Sequence Type: Other Nucleic Acid (Synthetic DNA) Sequence GTGACCCCTA CCCACGTGGT 20 Sequence Number: 35 Sequence Length: 23 Sequence Type: Nucleic Acid Number of Strands: Single Strand Topology: Linear Sequence Type: Other Nucleic Acid (Synthetic DNA) Sequence AGTTCTGAGT CTTCAGTCTC CGT 23 SEQ ID NO: 36 Sequence Length : 24 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Direct Chain type of sequence: Other nucleic acid (synthetic DNA) sequence GGACTTCCGG ATAGCTGAGA AGCT 24 SEQ ID NO: 37 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other Nucleic Acid (Synthetic DNA) Sequence GCGTCCACAC AGATGGCGCA 20 SEQ ID NO: 38 Sequence Length: 20 Sequence Type: Nucleic Acid Number of Strands: Single Strand Topology: Linear Sequence Type: Other Nucleic Acid (Synthetic DNA) Sequence CGGTCATCCT GGTAGCCACT 20 SEQ ID NO: 39 Sequence length: 20 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Single strand Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid (synthetic DNA) sequence TGGTCCTTGT CAACTCGCCG 20

【図面の簡単な説明】[Brief description of drawings]

【図1】配列番号20、22および21、23を用いてnestedP
CRによりG型肝炎ウイルスゲノムRNAの検出を行っ
た結果を示すアガロールゲル電気泳動図である。
FIG. 1: Nested P using SEQ ID NOs: 20, 22 and 21, 23
It is an agarol gel electrophoresis figure which shows the result of having detected hepatitis G virus genomic RNA by CR.

【符号の説明】[Explanation of symbols]

1:サイズマーカー (φ×174 DNA/Hae III) 2:陽性者血清 3:陰性者血清 4:陰性者血清 5:陰性コントロール(蒸留水) 6:陽性者血清 7:陰性者血清 8:陽性者血清 9:陽性者血清 10:陽性者血清 1: Size marker (φ × 174 DNA / Hae III) 2: Positive sera 3: Negative sera 4: Negative sera 5: Negative control (distilled water) 6: Positive sera 7: Negative sera 8: Positives Serum 9: Positive serum 10: Positive serum

─────────────────────────────────────────────────────
─────────────────────────────────────────────────── ───

【手続補正書】[Procedure amendment]

【提出日】平成8年6月3日[Submission date] June 3, 1996

【手続補正1】[Procedure amendment 1]

【補正対象書類名】図面[Document name to be amended] Drawing

【補正対象項目名】図1[Correction target item name] Fig. 1

【補正方法】変更[Correction method] Change

【補正内容】[Correction contents]

【図1】 FIG.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C07K 16/10 C07K 16/10 C12N 1/21 C12N 1/21 C12P 21/02 C12P 21/02 C C12Q 1/68 7823−4B C12Q 1/68 A 1/70 7823−4B 1/70 G01N 33/53 G01N 33/53 D 33/569 33/569 L 33/576 33/576 Z //(C12N 15/09 ZNA C12R 1:92) (C12N 1/21 C12R 1:19) (C12P 21/02 C12R 1:19) ─────────────────────────────────────────────────── ─── Continuation of the front page (51) Int.Cl. 6 Identification code Office reference number FI Technical display location C07K 16/10 C07K 16/10 C12N 1/21 C12N 1/21 C12P 21/02 C12P 21/02 C C12Q 1/68 7823-4B C12Q 1/68 A 1/70 7823-4B 1/70 G01N 33/53 G01N 33/53 D 33/569 33/569 L 33/576 33/576 Z // (C12N 15 / 09 ZNA C12R 1:92) (C12N 1/21 C12R 1:19) (C12P 21/02 C12R 1:19)

Claims (14)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 配列番号1、5、9、13または17で表さ
れる塩基配列を有するG型肝炎ウイルスゲノムRNA。
1. A hepatitis G virus genomic RNA having a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1, 5, 9, 13 or 17.
【請求項2】 配列番号2、6、10、14または18で表さ
れる塩基配列を有する、請求項1記載のG型肝炎ウイル
スゲノムRNAに相補的なDNA。
2. The DNA complementary to the hepatitis G virus genomic RNA according to claim 1, which has the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2, 6, 10, 14 or 18.
【請求項3】 配列番号3、7、11、15または19で表さ
れる塩基配列を有する、請求項1記載のG型肝炎ウイル
スゲノムRNAに相同的なDNA。
3. The DNA homologous to the hepatitis G virus genomic RNA according to claim 1, which has the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3, 7, 11, 15 or 19.
【請求項4】 配列番号4、8、12または16で表される
アミノ酸配列を含むポリペプチドからなるG型肝炎ウイ
ルス蛋白質。
4. A hepatitis G virus protein comprising a polypeptide containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4, 8, 12 or 16.
【請求項5】 配列番号4、8、12または16で表される
アミノ酸配列をコードする塩基配列を有するDNA。
5. A DNA having a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4, 8, 12 or 16.
【請求項6】 請求項2または5記載のDNAを組み込
んだ組換え体DNA。
6. A recombinant DNA incorporating the DNA according to claim 2 or 5.
【請求項7】 請求項6記載の組換え体DNAにより形
質転換された形質転換体。
7. A transformant transformed with the recombinant DNA according to claim 6.
【請求項8】 請求項7記載の形質転換体を培養し、得
られる培養物から請求項4記載の蛋白質を分離すること
を特徴とする請求項4記載の蛋白質の生産方法。
8. The method for producing a protein according to claim 4, which comprises culturing the transformant according to claim 7 and separating the protein according to claim 4 from the obtained culture.
【請求項9】 請求項2または3記載のDNAの塩基配
列に基づいて設定されたプライマーを用いて、G型肝炎
ウイルスを検出する方法。
9. A method for detecting hepatitis G virus using a primer set based on the nucleotide sequence of the DNA according to claim 2 or 3.
【請求項10】 請求項4記載の蛋白質の少なくとも一
部を抗原として用いる抗原抗体反応によりG型肝炎ウイ
ルスを検出することを特徴とする、G型肝炎ウイルスの
検出方法。
10. A method for detecting hepatitis G virus, which comprises detecting hepatitis G virus by an antigen-antibody reaction using at least a part of the protein according to claim 4 as an antigen.
【請求項11】 請求項4記載の蛋白質に対する抗体を
用いる抗原抗体反応によりG型肝炎ウイルスを検出する
ことを特徴とする、G型肝炎ウイルスの検出方法。
11. A method for detecting hepatitis G virus, which comprises detecting hepatitis G virus by an antigen-antibody reaction using an antibody against the protein according to claim 4.
【請求項12】 請求項4記載の蛋白質の少なくとも一
部を有効成分として含むG型肝炎診断剤。
12. A hepatitis G diagnostic agent comprising at least a part of the protein according to claim 4 as an active ingredient.
【請求項13】 請求項4記載の蛋白質に対する抗体を
有効成分として含むG型肝炎診断剤。
13. A hepatitis G diagnostic agent comprising an antibody against the protein of claim 4 as an active ingredient.
【請求項14】 請求項4記載の蛋白質の少なくとも一
部を有効成分として含むG型肝炎ワクチン。
14. A hepatitis G vaccine containing at least a part of the protein according to claim 4 as an active ingredient.
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