JPH09224644A - Pcr装置 - Google Patents
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- JPH09224644A JPH09224644A JP3472396A JP3472396A JPH09224644A JP H09224644 A JPH09224644 A JP H09224644A JP 3472396 A JP3472396 A JP 3472396A JP 3472396 A JP3472396 A JP 3472396A JP H09224644 A JPH09224644 A JP H09224644A
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Abstract
て、大量のサンプルの反応を同時もしくは連続的に処理
可能な自動装置を提供する。特に、PCR法のように、
多段階に加熱温度を変化させる必要のある反応に適する
ような反応装置を提供する。 【解決手段】 反応液供与部、反応器密閉部、加熱部を
設け、それぞれを運送手段が連結しており、場合によっ
て反応液回収部及び測定部を有する反応装置である。特
に、加熱部は複数のプレ−ト状の加熱ブロックからなる
もの、螺旋状に移動する空隙を有した加熱ブロックから
なるもの、及び複数の水浴からなるものを開発した。
Description
パク質工学、細胞工学、免疫等の生化学関連分野におい
て、比較的微量の溶液で加熱を行う各種反応、例えば酵
素反応、免疫反応、化学反応等、特にPCR法を行う場
合に使用する反応装置に関する。
野で酵素、抗体を利用した反応による目的物質の増幅、
活性測定は広く用いられている。これらの実験操作には
通常、容量1.5mlから2.0ml程度の微量試験
管、または容量0.2ml程度のマイクロプレ−トウェ
ルが用いられている。
サンプル高速処理、自動化が要求される場合これら実験
室レベルの反応器では、反応器の開閉が自動化になじみ
にくい、反応器が識別しにくい、サンプル数が限定され
る等の問題点がある。また、マイクロプレ−トウェルで
は蓋に密閉手段がないためPCR(Polymeras
e Chain Reaction)のような高温の反
応になじみにくい。また、微量試験管を反応器として用
いる場合反応後の生成物を光学的に測定する場合、別の
キュベットに移し替えるという操作が新たに発生する。
酸を増幅させる手段である。具体的には、反応器内に、
増幅させようとする標的核酸、例えば、標的DNA;標
的DNAと特異的に結合する少なくとも2種のオリゴヌ
クレオチドプライマ−;緩衝液;酵素;dATP,dC
TP,dGTP,dTTPのようなデオキシリボヌクレ
オチド3りん酸等を加えて、95℃前後でのDNAの
1本鎖への変性、50℃前後での1本鎖DNAとプラ
イマ−とのアニ−リング、70℃前後でのDNAポリ
メラ−ゼによるDNAの伸長反応、の3段階の反応を、
加熱温度を変化させることにより繰り返して、所望量の
標的DNAが得られるまで増幅させるものである。
類、配列、長さ等により変化するため上記の温度には限
られないが、単に加熱温度を変化させる操作のみでDN
Aを大量に、かつ生物的要因に左右されずに増幅できる
ため、クロ−ニングに替わる核酸増幅法として広く用い
られている。
溶液を用いる酵素、免疫等の生化学関連の反応系におい
て臨床検査、大規模生化学研究のように大量のサンプル
の反応を同時もしくは連続的に処理可能な反応液の供
与、反応器の密閉、温度制御、反応溶液の加熱、光学測
定、サンプルの識別を連続的に行う自動装置を提供する
ものである。特に、PCR法のように、多段階に加熱温
度を変化させる必要のある反応に適するような反応装置
を提供することにある。
は、微量溶液の充填、密閉、回収操作が容易で一つの空
隙を有する包装単位が連続した反応器を提供することで
あり、その反応器を使用して連続反応を円滑に実施し得
るような加熱装置を提供する。
に、少なくとも一個の凹部が設けられた基材とフィルム
からなり、前記フィルムが前記基材に熱溶着または圧着
されることにより前記凹部を密着する事が可能な反応器
であり、医薬品の包装形態であるプレススル−パック
(PTP)等に類似した構造のものである。
有する空隙を少なくとも一個有する反応器からなり前記
開口部が熱溶着、圧着または凹凸嵌合により閉塞されて
前記空隙を密閉する事が可能である反応器であり、これ
は、例えば、医薬品の包装形態であるユニットド−ス点
眼薬包装体やポ−ションパック等に類似した構造のもの
である。両反応器とも反応単位は所望量だけ設定するこ
とが可能である。
に行うべく、反応液供与部、反応器密閉部、加熱部、反
応液回収部及び運送手段からなり、場合によって分光測
定部、ID記録部、ID読みとり部分を有する(図
1)。以下に各部分の詳細を記す。
4に示すように、各試薬をディスペンサ−により順次空
隙に滴下していく。吐出時間等の吐出条件は試薬の粘性
等の正常により最適化される。
反応器にすでに試薬の一部が収納されており、更に個別
に試薬を追加するような場合、例えばPCR反応におい
て塩基、酵素等の必須の溶液はあらかじめ反応器に収納
されており、更に標的DNA、プライマ−を追加で反応
溶液に加えるような場合は、反応器の密閉部分を穿刺し
て試薬を加える。従ってこのような場合はノズルの先端
が鋭利であることが好ましい。
で同一試薬、またサンプルに応じた個々の試薬を同時に
複数サンプルに吐出する事も可能である。反応液のは予
めプログラムされていて、反応単位に設置されたIDコ
−ドで所望の構成成分を所望量加えることも可能であ
る。
可塑性樹脂、接着剤、粘着剤が塗布、あるいは成型品の
凹凸嵌合により圧着、熱圧着により密閉可能なように設
計されている。
性樹脂が融解する温度の熱を発する治具が所望の部分を
圧迫する。この場合、ヒ−トシ−ラ−は治具形状により
反応器一単位ごと、あるいは複数の反応器を同時に熱融
着する事が可能である。一般的に、酵素等の変性、加熱
による不適当な反応開始を避けるため、ヒ−トシ−ラ−
の熱で反応器の液温上昇を防止するよう、空隙部分の近
傍に加熱部分が来ないよう治具が設計される。
の場合、反応器は開口部等を圧迫し密閉することができ
る。熱融着の場合と同様圧着は個々に所望の密閉部分を
圧迫する、もしくは複数反応単位を同時に圧着する事も
可能である。圧迫の際に空隙部分を圧迫し反応器を破裂
させないような治具形状が考慮されなければならない。
件による反応場を提供する。加熱部分は加熱ブロック、
恒温室、恒温水浴等が考えられる。反応時間は、反応器
が、加熱ブロックと接触する時間あるいは加熱ブロック
内に設けられた反応器が移動可能な空間を通過する時
間、又は恒温室、水浴中に存在する時間、または移動し
ながら通過する時間によって決定される。反応条件が複
数の段階的な反応の場合にはそれぞれの反応条件の加熱
ブロック、恒温室、水浴が設けられる。
複数の反応条件に設定された加熱ブロックがサイクル的
に反応器に接触する。あるいは、上述の反応場を一定速
度で循環することでサイクル反応が進行する。このよう
なサイクル反応の場合の加熱部を例示する。
サイクル反応の数の倍数存在し、図に示すように、運搬
手段により第一反応(加熱ブロックA)の上に反応器が
設置されると、他の反応単位から切り離され、反応器が
一定時間、一連の反応の加熱ブロック(A,B,C)を
移動することによりサイクル反応が行われる。この一連
の加熱ブロックの循環または反応器の循環は進行方向に
垂直で循環しながら、加熱ブロック群は進行方向に移動
していく。切断された次の反応器は新たな加熱ブロック
群に供与され同じく加熱ブロック群内を循環することに
より反応が進行していく(図6a)。又、プレ−ト状の
加熱ブロックが、中心軸に取り付けられ、中心軸を中心
として回転するようにする方法もある。(図6b)加熱
ブロック群の構成ブロック数、加熱温度、サイクル数は
反応に応じて任意に設定可能である。なお、運搬手段と
しては、例えば吸着による運搬が可能である。
応に一定サイクル供されながら、装置内を移動してい
く。この加熱ブロック群内の循環運動、加熱ブロック群
の進行方向は任意の方向に設定できる。
い)で内部に反応器が螺旋状に移動する空隙を有した加
熱ブロックにおいて、サイクル反応の一連の反応条件の
数だけ、反応時間の比に応じて円周部分の領域が決定さ
れ、一定温度に加熱される。空隙は円柱状の側面を螺旋
状に設けられており、サイクル反応全体の反応時間に応
じて反応速度が設定される。反応器は空隙の一端から、
加熱ブロックに入り所望のサイクル分だけ加熱ブロック
を経た後、加熱ブロックを脱出する。なお、反応器を螺
旋状に移動させる手段としては、反応器を連結させその
最上部の反応器を引き上げる方法、あるいは円筒形を反
対方向に振動を与えながら回転させる方法等がある。
設定された、一定温度の水浴を反応器のラインが通過す
るように設定されている。ラインは水浴を反応のサイク
ル数に応じて循環して通過するよう設定されている。一
サイクルを構成する反応時間の比率は、水浴中のライン
の長さに比例し、一サイクル全体の反応時間はラインの
速度により調整可能である。また水浴内のラインの長さ
は水浴内に設けられたアキュ−ムレ−タ−の位置により
調整可能である。以上のような構成で必要な数だけ所望
の反応条件の場を提供できる。
の反応溶液を回収し電気泳動等の次の反応に供与され
る。次の操作まで一旦保存する場合や臨床検査のように
反応終了後の溶液が不要な場合は回収操作は行われな
い。
一部を貫通させ反応溶液を吸引させる方法(図9)と空
隙を圧迫させ開口部から反応液を取り出す方法がある。
後者の場合反応器の一部をくびれさせ弱い力で開口でき
るような手段を設けていてもよい。回収した溶液はシリ
ンジ状のサンプラ−で所望の次の操作部位に供与される
か、あるいは後者の場合は個々の反応器を所望の部位ま
で持っていき圧迫して反応溶液を供与する。いずれの方
法でも回収操作は一包装単位ずつでも複数の包装単位で
おこなっても良い。
分光学的にモニタリングするのに用いられる。この場合
には反応器が光学測定可能なように光透過可能で光路長
が一定であることが要求される。図10に示すように反
応器のラインの一部に暗室を設け特定波長の光を入射す
る発光部と受光部を設ける。可視光の光源としてはタン
グステンランプが主に用いられフィルタ−、プリズム等
により特定波長の光が選択される。受光部には光電子増
倍管が用いられる。また光ファイバ−プロ−ブを用いた
多波長同時測光システムを用いても良い。また、個々の
サンプルの認識のためバ−コ−ドやナンバリングを設置
してもよい。この場合バ−コ−ドは剥離紙のついたロ−
ルの状態で提供され、感熱ラベルもしくは熱転写等によ
り印字され、ライン上の特定の反応器に貼付されてい
く。ナンバリングの場合はインクジェット等が用いられ
る。またバ−コ−ドの読みとりとしてライン上の所望の
部位に半導体レ−ザ−の読みとり部を設けてもよい。
るが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではな
い。
製の直径580μmの半球状のウェルを幅方向に12
個、等間隔に設けた幅80mmの長方形、厚さ700μ
mのシ−ト状成型品を真空成形で作成し、ウェル部分を
のぞく成型品の全面にアクリル系粘着剤を塗布した。カ
バ−フィルムは2軸延伸ポリプロピレンフィルムを用い
た。以下のようなPCR反応装置を作成した。
り以下の各部分を通過するように設定した。反応液供与
部分として幅方向のウェルに滴下できるように設定した
12連ディスペンサを3組設定し、第一組目には20m
MTris−塩酸(pH8.3)3mM塩化マグネシウ
ム0.02%ゼラチンdATP,dCTP,dGTP,
dTTPをそれぞれ400μmol/100μl,Ta
qDNAポリメラ−ゼ6unit/100μlからなる
溶液各25μlをウェルに滴下できるよう設定し、第二
組目のディスペンサにはオルニチントランスカルバミラ
−ゼ遺伝子の第3エクソンを含む106bpの前後20
merずつの2種のプライマ−それぞれ500pmol
/100μl含む溶液を各10μlウェルに滴下できる
ように設定した。
生児の血液含浸濾紙を0.85%生理食塩水に浸績して
得られた白血球をフェノ−ル抽出して得られたDNA全
量を生理食塩水に溶解したサンプルをサンプラ−より1
サンプルずつ各40μl滴下できるように設定した。各
ウェルの識別のためディスペンサの次に感熱転写でバ−
コ−ドを印字できるよう設定した。
ンプルを10列分同時に130℃、荷重2Kg/cm2で、
10秒間圧着できるヒ−トシ−ラ−を設定した。またヒ
−トシ−ルした120ウェル分のサンプルはヒ−トシ−
ル直後加熱部分の第一ブロックに収納されるよう設定し
た。加熱部分は図6(b)に示す装置を作成した。加熱
ブロックAは94℃1.5分、Bは43℃2分、Cは7
3℃2分に設定した。加熱を30サイクル繰り返してP
CRを行った。この1組の加熱ブロックを30組準備
し、ヒ−トシ−ル後のサンプルが順次加熱反応に供与さ
れるよう設定した。反応終了後の溶液はマイクロシリン
ジで全量回収され、電気泳動の所定のウェルに供与され
るよう設定した。サンプルの認識のため、マイクロシリ
ンジの手前にバ−コ−ドリ−ダ−を設置した。
応を開始した。各反応溶液とブランクとしてPCR反応
前の混合溶液をDNAマ−カ−(λファ−ジDNA/H
indIII分解物)とともに0.8%DNAアガロ−ス
ゲル電気泳動に供与しエチジウムブロマイド染色を行っ
たところ、PCR反応後の溶液では106bp付近にオ
ルニチントランスカルバミラ−ゼと考えられるDNA断
片が目視検出された。反応前の溶液では確認されなかっ
た。
伸ポリプロピレンフィルム/アクリル系接着剤/無延伸
ポリプロピレンフィルムの複合フィルムを図3に示すよ
うに等間隔に開口部と空隙を形成するようはりあわせ
た。空隙の大きさは20mm×25mm×10μlであ
った。
り以下の各部分を通過するように設定した。反応液供与
部分として3本のディスペンサを3組設定し、1本目に
は20mMTris−塩酸(pH8.3)、3mM塩化
マグネシウム、0.02%ゼラチンdATP,dCT
P,dGTP,dTTPをそれぞれ400μmole/
100μl,TaqDNAポリメラ−ゼ6unit/1
00μlからなる溶液各25μlをウエルに滴下できる
よう設定し、2本目のディスペンサにはオルニチントラ
ンスカルバミラ−ゼ遺伝子の第3エクソンを含む106
bpの前後20merずつの2種のプライマ−それぞれ
500pmole/100μl含む溶液を各10μlウ
ェルに滴下できるように設定した。3本目のディスペン
サには50μlの新生児の血液含浸濾紙を0.85%生
理食塩水に浸漬して得られた白血球をフェノ−ル抽出し
て得られたDNA全量を生理食塩水に溶解したサンプル
をサンプラ−より1サンプルずつ各40μl滴下できる
ように設定した。各ウェルの識別のためディスペンサに
よるDNAサンプル供与直後にインクジェットでナンバ
リングできるよう設定した。
ンプルを10列分同時に130℃、荷重2Kg/cm2で、
10秒間圧着できるヒ−トシ−ラ−を設定した。加熱部
分は図8に示す装置を設定した。水浴Aは94℃で、B
は43℃、Cは73℃に設定した。アキュ−ムレ−タ−
で各水浴中のラインがそれぞれ1.5m,2m,2mで
各水浴を15回通過するよう設定した。装置全体の搬送
速度は1m/分であった。
応を開始した。反応後の溶液は密閉したまま、電気泳動
に供与するまで冷蔵保存した。
クロシリンジで全量取り出し、ブランクとしてPCR反
応前の混合溶液をDNAマ−カ−(λファ−ジDNA/
HindIII分解物)とともに0.8%DNAアガロ−
スゲル電気泳動に供与しエチジウムブロマイド染色を行
ったところ、PCR反応後の溶液では106bp付近に
オルニチントランスカルバミラ−ゼと考えられるDNA
断片が目視検出された。反応前の溶液では確認されなか
つた。
応前の混合溶液、DNAマ−カ−をアガロ−スゲル電気
泳動に供与し、エチジウムブロマイド染色を行った結
果、PCR反応ごの溶液では106bp付近にオルニチ
ントランスカルバミラ−ゼと考えられるDNA断片が目
視検出された。反応前の溶液では確認されなかった。各
ウェルのサンプルのエチジウムブロマイド染色の蛍光強
度はいずれも同程度であった。
て、従来反応液供与、反応器密閉、加熱、反応液回収を
それぞれ別個に行っていたのを連続的に行えるようにな
った。従って、迅速に、且つ的確に多数の反応を同時に
実施することができ、多数の反応デ−タを必要とするP
CR等において非常に有益な効果を奏するものである。
す。
図を示す。
Claims (14)
- 【請求項1】 ポリメラ−ゼ連鎖反応(PCR)装置に
おいて、装置が反応液供与部、反応器密閉部、加熱部を
設け、それぞれを運送手段が連結してなる反応装置。 - 【請求項2】 加熱部が、複数のプレ−ト状の加熱ブロ
ックからなり、各加熱ブロックが所定の温度に設定さ
れ、反応器を順次所定の温度で加熱するようにした請求
項1に記載の反応装置。 - 【請求項3】 加熱部が、反応器が螺旋状に移動する空
隙を有した加熱ブロックであり、螺旋部分の異なる位置
で所定の温度に設定され、反応器を順次所定の温度で加
熱するようにした請求項1に記載の反応装置。 - 【請求項4】 加熱部が複数の水浴からなり、各水浴は
所定の温度及び/又は所定の水浴時間に設定され、反応
器を順次所定の温度で加熱するようにした請求項1に記
載の反応装置。 - 【請求項5】 測定部を有する請求項1に記載の反応装
置。 - 【請求項6】 反応液回収部を有する請求項1に記載の
反応装置。 - 【請求項7】 供与部のノズルが鋭利である請求項1に
記載の反応液供与部。 - 【請求項8】 加熱ブロックを移動するようにした請求
項3に記載の反応装置。 - 【請求項9】 反応器を移動するようにした請求項3に
記載の反応装置。 - 【請求項10】 加熱ブロックの移動が一軸を中心とし
た円運動によるものである請求項8に記載の反応装置。 - 【請求項11】 反応器の移動が反応器を吸着すること
により行う請求項9に記載の反応装置。 - 【請求項12】 反応器の移動を、螺旋状体が反応器の
進行方向と逆に回転し、かつ振動を伴ったものによる請
求項4に記載の反応装置。 - 【請求項13】 プレ−ト状の加熱ブロックが、複数の
ベルトコンベア上に載置された請求項2に記載の反応装
置。 - 【請求項14】 プレ−ト状の加熱ブロックが、中心軸
に取り付けられ、中心軸を中心として回転するようにし
た請求項2に記載の反応装置。
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