JPH06510981A - 46キロダルトンhmfg分化抗原結合特異性と第5及び第8凝固因子軽鎖ホモロジーとを有するポリペプチド - Google Patents

46キロダルトンhmfg分化抗原結合特異性と第5及び第8凝固因子軽鎖ホモロジーとを有するポリペプチド

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 46キロダルトンHMFG分化抗原結合特異性と第V及び第■凝固因子軽鎖ホモ ロジーとを有するポリペプチド 技術分野 本発明は、46キロダルトン(kD)のHMFG分化抗原の抗体結合特異性を有 するポリペプチド、それをコードするポリヌクレオチド及びポリリボヌクレオチ ド、抗ポリペプチド抗体、このポリペプチドとこれをコードするDNA及びRN Aとを検出する方法、このポリペプチドを発現する細胞を画像化する方法、この ポリペプチドに抗体が結合することによる生物流体中のポリペプチドの存在を検 出する方法、このポリペプチドを発現する標的細胞への治療剤の生体内及び生体 外(ex vivo)供給(derivery)方法、このポリペプチドと少な くとも1つの他のポリペプチドとの融合タンパク質、このポリペプチドをコード する標識化ポリヌクレオチド及びポリリボヌクレオチド並びに相補的DNAシー クエンス、標識化プローブとのハイブリダイゼーションによるRNA及びDNA の検出方法、このポリペプチドによる予防接種方法、並びに、アンチセンスDN Aによる乳癌の治療方法に関する。
技術背景 ヒト母乳脂肪球(HMFG)は、ポリクローナル及びモノクローナル抗体の調製 に用いられる抗原物質の供給源として広く使用されており、これは、乳房上皮細 胞表面及びその抗原成分のプロセッシングの研究と同様に、乳癌の診断において 、広範囲の使用が認められてきた。
非乳房組織による適当な吸収の後に、ヒト乳房上皮細胞の表面抗原(IME−A gs)を同定することが発見されていたポリクローナル抗血清が、最初に調製さ れた。この抗血清(抗HME)は、正常乳房上皮細胞及び乳癌に対して高い特異 性を有した。主としてヒト母乳脂肪球の3成分が同定され、それは、各々150 kD、70k D、46kDの分子量を有していた。
モノクローナル抗体は、1980年にまず、HMFGに対して作成された。高分 子量ムチン様糖タンパク質てあり、非浸透性糖タンパク質(non−penet ratingglycoprotein ; N P G P )ど称される、 乳房上皮細胞表面のそれまで未知の成分を同定するために、これらの抗体は適用 されていた。この後者の成分は、マウスにおいて特に抗原性を示した。乳房腫瘍 と同様にHMFGに対して調製されたモノクローナル抗体の大部分は、このムチ ン複合体の異なるエピトープに対して特異性を有することか発見された。より少 数では、モノクローナル抗体が、HMGFの70k D及び46kDに対して調 製された。
NPGPの高い免疫原性の理由は、ムチンに対するポリクローナル及びモノクロ ーナル抗体を共に用いたkgtll乳房細胞ライブラリーから選択されたcDN Aクローンの特性決定により、最近、解明されてきている。これらのc DNA クローンは、高い保存性を有する60bp (塩基対)の縦列反復の長い配列か らなる。
20アミノ酸反復の結果物は、いくつかの抗ムチン抗体に対するエピトープを含 んでいる。
この反復は、ジェノミックレベルでは見かけ上、不安定である。これは、この高 分子量ムチンにおける遺伝子、RNA及びタンパク質レベルで見受けられる、観 察された冬型性によって説明され得る。ムチン生成物のcDNAクローニングの 関する初期の報告は、コアタンパク質が約68k Dの分子量を有することを示 唆した。しかし、mRNAは約170kDから230k Dのタンパク質を十分 コードする長さであることが発見された。より最近では、よりゆるやかなデグリ コシル化(deglycosylation)法を用いて、コアタンパク質は約 200k Dの分子量を有することが同定された。
注目は、主としてその高い免疫原性のために、NPGPムチン複合体の研究及び 使用にも向けられている。従って、モノクローナル抗体の多くは、それに対して 調製された。しかし、HMFGのより小さい成分も、また、乳房上皮細胞の表面 において重要な分子であると思われる。それらは、抗HME抗体によって証明さ れるような乳房特異性を有している。
46kD及び70kDのHME抗原は、乳癌患者の血清において認められ、従っ て、血清アッセイにおける乳癌のマーカーとして使用することができる。更に、 この70kD成分は、無傷(intact)のムチン複合体と共に精製されるこ とが見出され、ジスルフィド結合によってNPGPムチン複合体と結合している ことが報告されており、この表面ムチン複合体のリンカ−となり得るタンパク質 にさせている。
この系のより小さい成分に対するモノクローナル抗体は殆ど調製されていない。
ムチン分子は内部の反復構造のために、見かけ上、より抗原性である。HMFG のこの46k D成分は、乳癌患者の血清中に認められる。この46kD抗原に 対するモノクローナル抗体を用いて、循環性免疫複合体が乳癌患者において発見 され、この循環性46kD抗原における増加は、腫瘍負荷の増加と関連している と認められた。ムチン糖タンパク質の構造は、最近cDNAクローニングによっ て同定され、部分的シーフェンスが70k D抗原について報告されている。
しかし、46kD抗原の構造及びその機能については、正常上皮細胞膜、乳汁形 成及び乳房腫瘍発生において、他の膜成分と共に、ごくわずかしか知られていな い。現在までに、約46kDポリペプチド成分についてのシーフェンスも、それ をコートするDNA及びRNAについても、知られていない。
発明の開示 本発明は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び 第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対してホモロジーを有するポリペ プチドに関する。
本発明は、また、融合タンパク質に関し、これは、約46kDのHMFG分化抗 原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの 軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド:及びこれに結合する二次抗原ポ リペプチド、を含む。
更に本発明の一部は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は 第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有す るポリペプチド又はこれの機能的断片に対して、特異性を有する抗体である。
また、約46k DのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第V lll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチ ド又はこれの機能的断片の、生物試料における存在を検出する方法が、ここで提 供され、これは、 このポリペプチドを含むと思われる生物試料を提供すること、抗体−ポリペプチ ド複合体を形成するために有効な条件下で、約46kDのHMFG分化抗原の抗 体結合特異性及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に 対するホモロジーを有するポリペプチド又はこれの機能的断片に対して特異性を 有する抗体を、ポリペプチドの結合に有効な量で、これに添加すること、及び これらの間で形成された、如何なる複合体の存在をも判定すること、を含む。
また、本発明の一部は、上皮細胞の生物試料における存在を判定する方法であり 、これは、 約46k DのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第Vlll 凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又は これの機能的断片を運ぶ上皮起源の細胞を含むと思われる、生物試料を提供する こと。
抗体−細胞ポリベブチト複合体を形成するために有効な条件下で、上述したポリ ペプチドに対する特異性を有する抗体を、ポリペプチドの結合に有効な量で、ニ オ1に添加すること、及び、 これらの間で形成された、如何なる複合体の存在をも判定すること、を含む。
また、被検者において、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/ 又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを 有するポリペプチドを発現する細胞を、生体内にて画像化する方法が、ここで提 供され、この方法は、 抗体−細胞ポリペプチト複合体を形成するために、このポリペプチド又はこれの 機能的断片を発現している細胞を有すると思われる被検者の体内領域へ、供給す るために有効な条件下で、約46kDのHMFG分化抗原の特異性及び/又は第 V及び第V[11凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有する 抗体を、ポリペプチド又はこれの機能的断片の結合に有効な量で、被検者に投与 すること。
このポリペプチドに対する結合部位よりも他の部位でこの抗体に結合することが できる検出可能な標識を、その被検者に投与すること:及び形成された如何なる 複合体とも付随した標識の被検者の身体における存在を検また本発明の一部は、 約46k DのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第Vll l凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又 はこれの機能的断片によって、被検者に生体内にて予防接種する方法であり、こ の方法は、 ポリペプチド、これの機能的断片又はこのポリペプチド又はこれの機能的断片を 運ぶ細胞に対して、被検者に予防接種するために効果的な量及び条件下で、約4 6kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第Vlll凝固 因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はこれ の機能的断片を、被検者に対して投与することを含む。
更に他の方法は、生物試料において、約46k DのHMFG分化抗原に対して 特異性を有する抗体の存在を検出するために、ここに提供され、これは、この抗 体を含むと思われる試料を提供すること:抗体−ボリベプチト複合体を形成する ために効果的な条件下で、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び /又は第V及び第VI[l凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジー を有するポリペプチド又はこれの機能的断片を、抗体の結合に有効な量で、これ に添加すること:及びこれらの間で形成された如何なる複合体の存在をも判定す ることを含む。
本発明は、また、生物試料において、約46kDのHMFG分化抗原に対して特 異性を有する抗体の存在を検出する第2の方法に関し、これは、この抗体を含む と思われる試料を提供すること:抗体−融合タンバク質複合体を形成するために 有効な条件下で、本発明の融合タンパク質を、抗体の結合に有効な量で、これに 添加すること:抗体−融合タンバク質−抗体複合体を形成するために有効な条件 下で、抗二次ポリペプチド抗体を、二次ポリペプチドの結合に有効な量で、これ に添加すること 及び これらの間で形成された、如何なる抗体−融合タンパク質−抗体複合体の存在を も判定すること を含む。
また、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第V 111凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチ ド又はこれの機能的断片を発現している、患者の標的細胞へ、治療剤を生体内に て供給する方法がここで提供され、この方法は、約46kDのHMFG分化抗原 の抗体結合特異性及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽 鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はこれの機能的断片に対して特異 性を有する抗体に、そのポリペプチドの結合部位よりも他の部位で、治療剤を結 合すること;及びこの細胞の周囲に到達するために有効な条件下で、抗体結合化 治療剤を、治療的に有効な量で、標的細胞を運ぶと思われる被検者に投与するこ と:及び細胞のポリペプチドに結合するため、抗体に治療剤を運ばせることを含 む。
更に、本発明の一部は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/ 又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対してホモロジーを 有するポリペプチド又はこれの機能的断片を発現する標的細胞へ、治療剤を生体 外にて供給する方法であり、この方法は、 被検者から標的細胞を含むと思われる生物試料を得ること:そのポリペプチドの 結合部位よりも他の部位で、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及 び/又は第V及び第VII[凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジ ーを有するポリペプチド又はこれの機能的断片に対して特異性を有する抗体に、 治療剤を結合すること:抗体−細胞ポリペブチト複合体の形成を促進させるため に有効な条件下で、試料に、抗体結合化治療剤を添加すること、及び被検者にこ の試料を戻すこと を含む。
本発明は、また、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第 V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対してホモロジーを有する ポリペプチド又はこれの機能的断片をコートするポリヌクレオチドに関する。
また、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第V lll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対してホモロジーを有するポリペプチ ド又はこれの機能的断片をコードするポリリボヌクレオチドも、ここで提供され る。
また、本発明の一部は、本発明の融合タンパク質又はこれの機能的断片に結合す る抗体をコードする、ポリヌクレオチド及びポリリボヌクレオチドである。
本発明は、また、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第 V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有する ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド又はこれの機能的断片に相補的なり NAシークエンスに関する。
本発明は、また、試料中において、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活 性及び/又は第V及び第VII[凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモ ロジーを有するポリペプチド又はこれの機能的断片をコードするポリヌクレオチ ドシーフェンスの存在を検出する方法に関し、この方法は、ポリヌクレオチドを 含むと思われる試料を提供すること;この試料中に存在する二本鎖ポリヌクレオ チドを融解すること:試料中に存在し、少なくとも15塩基の相補的シーフェン スを有する如何なるポリヌクレオチドともハイブリダイゼーションするために有 効な条件下で、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及 び第V111固因子の少なくとも1つの軽鎖又はこれの機能的断片に対してホモ ロジーを有するポリペプチドをコートするポリヌクレオチドに対して相補的であ り、ハイブリダイゼーションに有効な量のDNAシークエンスを、標識化形態に おいて、これに添加すること;及び このDNA−相補的ポリヌクレオチドハイブリッドの存在を検出することを含む 。
試料中において、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第 V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有する ポリペプチド又はこれの機能的断片をコードするRNAシークエンスの存在を検 出する方法もまた、本発明により提供され、この方法は、このRNAを含むと思 われる試料を提供すること:試料中に存在し、少なくとも15塩基の相補的シー フェンスを有する如何なるRNAともハイブリダイゼーションするために有効な 条件下で、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び 第V[I[凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペ プチド又はこれの機能的断片をコートするポリヌクレオチドを、標識形態におい て、ハイブリダイゼーションに有効な量で、これに添加すること;及び このポリヌクレオチド−RNAハイブリッドの存在を検出することを含む。
試料中において、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第 V及び*VI11凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有する ポリペプチド又はこれの機能的断片をコードするRNAシークエンスの存在を検 出する方法も、また包含され、この方法は、このRNAを含むと思われる試料を 提供すること:少なくとも15塩基の相補的シーフェンスを有する如何なるRN Aともハイブリダイゼーションするために有効な条件下で、約46kDのHMF G分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第V[I+凝固因子の少なくと も1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はこれの機能的断片を コードするポリリボヌクレオチドに相補的なポリリボヌクレオチドを、標識形態 において、ハイブリダイゼーションするために有効な量で、これに添加すること ;及びこの相補的ポリリボヌクレオチド−RNAハイブリッドの存在を検出する ことを含む。
試料中において、約46k DのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は 第V及び第Vll[凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有す るポリペプチド又はこれの機能的断片をコードするDNAシークエンスの存在を 検出する方法も、またここで提供され、この方法は、このDNAを含むと思われ る試料を提供すること:試料中において、二本鎖ポリヌクレオチドを融解するこ と:試料中に存在し、少なくとも15塩基の相補的シーフェンスを有する如何な るDNAともハイブリダイゼーションするために有効な条件下で、約46kDの HMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第V[[I凝固因子の少 なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はこれの機能的 断片をコートするRNAシークエンスを、標識形態において、ハイブリダイゼー ションするために有効な量で、これに添加すること:及び試料中において、この DNA−RNAハイブリッドの存在を検出することを含む。
更に、本発明の一部は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/ 又は第V及び第Vl11凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを 有するポリペプチドをコードする約■5から2000塩基のポリヌクレオチド又 はこれの機能的断片に対する、アンチセンスシーフェンスを含むDNAセグメン トである。
そのうえ、乳癌の治療を必要とする患者において、治療する方法であり、この方 法は、上述のアンチセンスDNAを治療的に有効な量で含む配合物を、この患者 に投与することを含む。
本発明は、また、免疫アッセイキットに関し、これは、約46kDのHMFG分 化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第VII[凝固因子の少なくとも1 つの軽鎖に対するホモロジーを有する提供されたポリペプチド又はこれの機能的 断片に対して特異性を育するモノクローナル抗体:及び抗−抗体免疫グロブリン 、 を別々の容器に含む。
更に、本発明の一部は、抗体検出キットであり、これは、約46kDのHMFG 分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第VI[r凝固因子の少なくとも 1つの軽鎖に対するホモロジーを有する提供されたポリペプチド又はこれの機能 的断片;及び 抗−抗体免疫グロブリン、 を別々の容器に含む。
融合タンパク質キットも、またここで提供され、これは、約46kDのHMFG 分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第V[[[凝固因子の少なくとも 1つの軽鎖に対してホモロジーを有するポリペプチド又はこれの機能的断片と、 これに結合されるこれの二次抗体的ポリペプチド又は断片とを含む融合タンパク 質。
抗二次ポリペブチトボリクローナル又はモノクローナル抗体:及び抗−抗体免疫 グロブリン、 を別々の容器に含む。
また、抗乳癌治療キットも、本発明により包含され、これは、約46kDのHM FG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第VIl[凝固因子の少なく とも1つの軽鎖に対するホモロジーを有し提供されたポリペプチドに対して、特 異性を有するモノクローナル抗体、及び免疫毒素及び放射性核種からなる群より 選ばれた抗癌治療剤、を別々の容器中に含む。
本発明のより完全な理解及びこれの意図された多くの利点は、添付の図と関連し て考慮した場合に、後述の詳細な説明を参照してより理解され、たやすく認めら れるであろう。
図面の簡単な説明 図は、ヒト癌細胞株におけるBA46−.1特異的mRNAの発現を示している 。
全RNA (20μg/レーン)は、 1.4%アガロースゲルに流し、プロッ トしてBA46−1cDNAクローンから作成された2tp標識化RNAとハイ ブリダイゼーションした。他のレーンにおける試料の内容は、次の通りである: a)A549(肺)l b)BT20 (乳房); c)ELLG (乳房); d)Raji(リンパ細胞)+ e)SKBR3(乳房): f)SKOV3  (卵巣);g)MDA−MB−361(乳房); h)MDA−MB−331( 乳房); 1)HeLa (子宮類)+ j)H3578T (乳房);k)H T29(結腸); I)PanC1(膵11):m)〜fCF7(乳房)。露光 は、増感紙を用いて16時間であった。
その他、現発明の利点及び特色は、後述の考察により当業者には明らかとなるで あろう。
i&善の発明実施態様 本発明は、乳癌の検出、診断及び治療に有用な技術の改良を希求することから生 した。
本研究は、HMFG系における約46kDのポリペプチド成分の一部分をコード するcDNAクローン(BA46−1)の単離、及びこのHMFG系における約 46kD成分と結合するモノクローナル抗体を必要とする。β−ガラクトシダー ゼをも含む融合タンパク質の部分をコードし、BA46−1 ラムダ/gtll  クローンから作成された、BA46−1 cDNAに対して、これらのモノク ローナル抗体は特異性を有し、これと結合する。
BA46−1 cDNAのヌクレオチド及びこれから推定されたアミノ酸シーク エンスは、下記実施例7の表1に示される。この部分的シーフェンスは、約25 k Dの理論的分子量を有する約217アミノ酸の長さであり、完全なタンパク 質のC末端を表している。このシーフェンスでは、N一連結グリコシル化反応が 可能な部位が4個存在する。このシーフェンスは、アスパラギン及びロイシンに 富む。C末端から始まり、このヌクレオチドシーフェンスは、切断とポリアデニ ル化のためのポリ(A)に先行するAATATAコンセンサスシークエンスを含 むmRNAの3′末端まで伸びている。
FSTNSCAN (PCGENE)を用いたEMBLデータベースにおけるシ ーフェンスとこのヌクレオチドシーフェンスとの比較は、ヒト血清第V及び第V l11因子並びにプロティンCとの広範なホモロジーをもっことを明らかにした 。しかし、推定されたタンパク質シークエンスは第V及び第Vl11因子とのみ 同一性を共有し、ヌクレオチドルベルのホモロジーは介在シーフェンスにあるも のであったため、プロティンCとは同一性を共存していなかった(表2参照)。
BA46は第V因子と約43%の同一性を、第V[II因子とは約38%の同一 性を有する。表2に示した第V及び第Vlll因子領域は約47%の同一性を共 有する。
約46k Dのタンパク質の推定されるアミノ酸シークエンスの分析結果は、グ リコリル化タンパク質のものと一致した。しかしこのタンパク質の機能は不明の ままである。この凝固因子とのホモロジーは、第Vl11因子の軽鎖のCI、C 2領域に認められ得る。第V[11因子の軽鎖のこの領域に結合するヒトの抗体 は、リン脂質どの相互反応を妨げることによってこの因子を抑制する。第VII [因子のこの領域はり゛/脂賀の結合に関係しているので、約46kDのタンパ ク質の相同領域が同様な役割を果を二し得るということは十分にあり得る。
また他の異なるタンパク質における共有ドメインの出現は、エクソンシ?ツフリ ングによるものかもしわない。このC末端は、約46kDのタンパク質の新規な ′ア′/カー′シークエンスとして機能し得、また、成長する母乳脂肪滴表面に 見いだされるリン脂質へのムチン及び/又は細胞膜の結合に関係し得る。あるい は1、−の相同なンークエンスは、形質膜表面でのムチン複合体のアッセンブリ に関係し得る。
本明細書で提供される一重鎖RNAプローブは、cDNA挿入部に見いだされる ORFと相補的である。すなわち、ラムダ/gt11ベクター中のβ−ガラクト シダーゼDNAシークエンスとインフレームである。相補鎖プローブのみが、上 皮細胞株の特異的な2.2kb(キロ塩基)mRNAに結合するので、このこと は、このORFがBA46−1遺伝子のセンス鎖を表していること示す。
ラムダ/gtll クローンにより発現されるBA46−1のβ−ガラクトシダ ーゼ融合タンパク質は、乳癌患者から得られる血清において、約46kDのHM FGポリペプチド成分又はその断片の存在をアッセイするために有用である。こ の融合タンパク質は、また、二次生成モノクローナル及びポリクローナル抗体生 成のための免疫原としても有用である。これらの抗体は、他の出願では、この抗 原の組織分布を及びそのmRNAの合成とどのように関連しているかを更に研究 するために、改良免疫アッセイを提供するために、並びに、約46kDの抗原ポ リペプチドを精製し、性状を調べるために用いられ得る。
約46kDのタンパク質に対して生成されたいくつかのモノクローナル抗体は、 HMFC膜及び乳癌膜物質における放射性免疫結合アッセイによって、この分子 に存在する各エピトープを検出することができる。これらのモノクローナル抗体 は、正常な乳房組織も、他の正常な試験された組織も免疫組織学的に染色しない 。
しかし、それらのいくつかは、49の乳癌のうち24を弱く染め、試験された他 のすへての癌では陰性である。いくつかの乳癌が、約46kDの抗原成分に対す る非常に高いレベルのmRNAをもつので、融合タンパク質に対して作成された 抗体は、約46k Dの抗原成分を免疫組織病理学的に検出することに対して、 異なった及びおそらくは改良さねた特異性を有することが可能であろう。
本研究において、eDNAを用いたノザンプロットは、この抗原のmRNAが、 調へた9の乳癌細胞株のうち8に、及び非乳癌の癌細胞株のいくつかに存在する ことを明瞭に示した。しかし、この抗原のRNAは、リンパ系細胞株(Raji )においてはるかに低いレベルで存在する。癌細胞株において検出される約2. 2kbのRNAの発現量には1著な違いが観察される。肺細胞(A549) 、 卵巣細胞(SKOV3)及び2つの乳房細胞株(Ell−G及びH3578T) は、他ノ癌細胞株よりもこの転写物をはるかに大量に蓄積させている。特定の遺 伝子、例えば乳癌及び他の癌におけるHer 2/neu及びEGFレセプター の過剰発現は予後と相関性がある。癌における約46kDタンパク質の過剰発現 は、発症と非常によい相関性を示すかもしれない。約46kDの抗原成分は、従 って、上皮特異性を示す。しかしこれは、この分子の特定のエピトープが、より 強い乳房特異性を有しないだろうという、ことを示すものではない。のみならず 、悪性度に関連する多くの細胞抗原の発現調節逸脱が、しばしば存在することが 知られているので、非乳房の癌におけるこの抗原のmRNAの発現は、この抗原 が、実際に発現されること、又はこれらの上皮性腫瘍の細胞に対する相当物であ る正常上皮細胞において、この抗原が見いだされることを、意味するものではな い。
この分子のcDNAの一部分をクローニングすることは、そのコード化ポリペプ チドシークエンスを更に推定することを可能とした。更にまた、既知のアミノ酸 シークエンスからの組み換えタンパク質又は合成ペプチドの合成も、このポリペ プチドの特異的エピトープに対する新生成モノクローナル抗体の調製も可能とな った。より強い乳房特異性をもつように選択し得る融合タンパク質に対して、ポ リクローナル及びモノクローナル抗体を更に調製することが、また、本発明の融 合DNA及び融合タンパク質によって可能である。実際、HMFG膜系は、正常 乳房上皮細胞の頂端表面の精製部分を正確に表している。従って、HMFC膜の 主要な分子種である約46kD成分は、また、正常乳房上皮細胞の頂端表面の主 要な及び、おそらくは重要な成分を表している。
HMFC系の約46kDポリペプチド成分のcDNAクローンは、その対応する ポリペプチドのアミノ酸シークエンスの推定を可能にした。これらcDNAクロ ーンは、また、新規生成モノクローナル抗体の調製も可能にした。この抗体は、 乳癌の免疫療法に使用するために十分な特異性、特異性の組織学的検査並びに診 断及び予後判定能のための免疫組織病理学上の十分な染色性能、更に乳癌診断用 及び乳癌初期検出のためのスクリーニング用血清検査の構築だめの乳癌患者血清 における、約46kDのHMFC;ペプチド成分又はその機能的断片の同定能を 有している。
従って、本発明は、約46k DのHMFC分化抗原の抗体結合特異性及び/又 は第V及びVlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを存す るポリペプチドを提供する。ある好ましい具体例では、このポリペプチドは、約 46kDのHM F G抗原分子の生物活性を有し、更により好ましくは、この ペプチドは、46kDのHMFC分化抗原又はこれの抗体結合機能的断片を含む 。
本発明のポリペプチドは、約90から500アミノ酸の長さで、好ましくは約2 0から450アミノ酸の長さて、更により好ましくは、約220から420アミ ノ酸の長さとし得る。
他の好ましい具体例では、このポリペプチドは、表2に示すアミノ酸シークエン ス又はこれの抗体結合機能的断片を有し、好ましくは約5から100アミノ酸の 長さて、より好ましくは15から50アミノ酸の長さである。特に好ましいもの は、抗46k DのHMFG分化抗原抗体によって認識される特異的エピトープ に対応するアミノ酸シークエンスである。
また本明細書において、医薬組成物が提供され、これは、抗体の結合に有効な量 の上記のポリペプチド:及び医薬的に許容できる担体 を含む。
この医薬組成物は、ヒトを含む動物に投与することを目的とするものである。
好ましい用量は、好ましくは約0.1からiooom g、より好ましくは10 から500m gのポリペプチドを含む。医薬的に許容できるいずれの担体も、 この組成物の調製に用いることができる。適切な担体及び他の添加剤の例は、特 に、香料、保存剤、着色剤、食塩水のような塩類溶液、油類又は固形物である。
しかし、このポリペプチドを加水分解しない如何なる液体又は固体の担体もまた 好適である。この医薬組成物は、ポリペプチドそれ自体と同様に、冷蔵及び/又 は冷凍下で最もよく保存できる。ポリペプチド及び医薬組成物は、目的場所への 輸送のために真空乾燥し、滅菌容器に詰めることもできる。組成物は、約0.0 1−99.99重量%、好ましくは約0.1−10重量%のポリペプチドを含み 、残りは担体であってもよい。
また本明細書において、融合タンパク質が提供され、これは、上記のポリペプチ ド:及び 本発明のポリペプチドに作用的に連結若しくは結合された二次抗原ポリペプチド 又はその抗体結合機能的断片 を含んでいる。
融合タンパク質は、一般には、二次抗原ポリペプチドの抗体結合機能的断片に結 合された、本発明のポリペプチドの抗体結合機能的断片から構成される。この本 発明のポリペプチド断片及びこの二次ポリペプチド断片は、それぞれ、約6から 700アミノ酸の長さ及びIOから1500アミノ酸の長さで、好ましくは、そ れぞれ約15から100アミノ酸の長さ及び200から400アミノ酸の長さで ある。しかし、それらの抗体結合機能が保存されている限り、これより大きい又 は小さい、他のサイズのポリペプチド及び/又はその断片も用いることができる 。
当業界で既知の哺乳類による抗体形成を誘発する抗原として機能する限り、如何 なるポリペプチドも二次抗原ポリペプチドとして好適である。二次抗原ポリペプ チドは、同定に有用及び/又は融合タンパク質に有用である、その他の特性に基 づいて更に選択され得る。例としては、二次抗原ポリペプチドは、例えばβ−ガ ラクトシダーゼ又はその機能的断片のようなタンパク質とし得る。しかし、他の 如何なる二次抗原ポリペプチドも、それに対する抗体が得られ得る限り用いられ 得る。例えば、バクチリオフ了−ジT7の遺伝子lOも用いることができる。
本発明のポリペプチド及び融合タンパク質は共に、当業界で既知の方法によって 調製され得る。例えば、ポリペプチドは合成により調製することができ、またそ れをコードし且つベクターにクローニングすることができ、発現可能な宿主に挿 入することができるDNAフラグメントを、発現させることによって生成するこ ともてきる(マルストン(Marston)、 F、 A、 、DNA Clo ning: A Prectical Approach、プローブy −(G lover)、 P編、IRLブレス社刊、ロンドン、3巻、59−88(+9 87) )。融合タンパク質は、2つのポリペプチドのアミノ酸シークエンスを コートするシーフェンスを含む組み換えDNAを提供することによって調製され 得る。このDNAはベクターにクローニングして、宿主中で発現させ得る。
また、本発明の一部は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体との結合特異性及 び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジ ーを有するポリペプチドに対して特異性を有する抗体である。
抗体を得る方法は当業界で既知であり、ここに記載する必要はない。特に好まし いものは、モノクローナル抗体である。特異的なポリペプチドに対するモノクロ ーナル抗体の調製方法もまた、当業界で既知であり、ここに詳細に記載する必要 はない。
生物学的に純粋なポリペプチド又はその断片に対して得られた抗体は、このポリ ペプチドに対する親和性及び/又は特異性が増強されている。典型的には、親和 性は約10−8から10−5で、ある場合には10−8よりも高い。
本発明の特に好ましい具体例では、この抗体は、第VII[凝固因子(軽鎖)の C1及び/又はC2領域に対する親和性もまた有する。また別の好ましい具体例 は、本発明の抗体がそのFabフラグメントである場合であり、その保存された 結合能力を有する。更に、好ましいものは、抗体の単−鎖又は上記の機能をもっ Fabフラグメント及びその機能的断片である。
また本明細書は医薬組成物が提供され、これは、約46kDの分化抗原の抗体結 合特異性及び/又はHMFG系の第V及び第Vl11凝固因子の少なくとも1つ の軽鎖に対するホモロジーを育する、提供されたポリペプチドに対して、約10 −10から10−5の親和性を有する、ポリペプチドの結合に有効な量の抗体: 及び 医薬的に許容できる担体 を含む。
典型的には、抗体は、約0.001から10.000m g 、より好ましくは 10から500m gの量で提供される。上記に示したように、医薬的に許容で きる如何なる担体も用いることができる。更に、他の成分、例えば、特に放射性 核種、化学療法剤、インターフェロン、例えばリシンのA鎖、アブリンのA鎖の ような毒物、食塩水、保存料、香料、着色剤並びに緩衝剤を、当業界で知られて いるように、この組成物に含むことができる。医薬組成物の調製は、加水分解の 生じない条件下で、ポリペプチド又は抗体を医薬的に許容できる担体と共に混合 し、その後真空乾燥して、滅菌容器に詰めるか又は滅菌溶液として提供すること によって、当業界で知られているように実施することができる。
また本発明の部分は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は 第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有す るペプチド又はその機能的断片の、生物試料における存在を検出する方法であり 、この方法は、 ポリペプチドを含むと思われる生物試料を提供すること;抗体−ポリペプチド複 合体を形成するために有効な条件下で、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結 合特異性及び/又は第V及び第V111凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対す るホモロジーを有するポリペプチドに対して、特異性を有する抗体を、ポリペプ チドの結合に有効な量でそれに添加すること:及び形成された如何なる複合体の 存在をも判定することを含む。
この方法は、例えば動物細胞、細胞抽出物又は体液のような生物試料において、 このポリペプチドの存在を検出するために好適である。典型的には、如何なる体 液もこの中に含まれる。例えば、血清、血漿、尿、膨水、組織生検、注射針吸入 物である。
試料は、例えば、金属、非特異的タンパク質、脂肪、核酸及び同様物の干渉を避 けるため、予め処理しておいてもよい。
また生物試料は、ポリペプチド濃度が約0.0001から10mg/m1、より 好ましくは、約0.001からO,Img/mlの範囲にあるように希釈しても よい。抗体は、試料に対して約0.0001から1.Omg/mlの量で、より 好ましくは、試料に対して約0001からO,I mg/mIの量で、当業界で 知られたように添加され得る。
アッセイについての他の条件は以下のようにすることができる。試料を均質化し 、粒子状物質及び脂肪性物質を除去するために遠心してもよい。ディタージ工ン トは、膜を溶解し、脂肪性物質を可溶化し、バックグランドを下げるために添加 され得る。更に、抗体の非特異的結合を減少させるために、例えばウシ血清アル ブミンのようなキャリアタンパク質を、更に干渉性二価金属イオンを除去するた めにキレート剤を加えてもよい。
抗体とポリペプチドとの間で形成される如何なる複合体の存在の判定は、当業界 で既知の種々の方法によって行われ得る。例示すれば、標識された抗体−ポリペ プチド二重複合体を形成するための、標識化抗−抗体免疫グロブリンの追添加で ある。標識は放射性標識、蛍光標識、酵素標識又は、後でアビジン、ストレプト アビジン若しくは磁気ビーズの結合体として検出されるようにビオチンでもよい 。このステップの後、複合体に結合した標識量を、当業界で既知の方法によって 算出することができる。
更に本発明では、上皮細胞の生物試料中における存在を判定する方法が提供され 、これは、 約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第Vl11凝 固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はこ れの機能的断片を運ぶ上皮起源の細胞を含むと思われる生物試料を提供すること 。
抗体−細胞ポリペプチド複合体を形成するために有効な条件下で、約46kD分 化抗原の抗体結合特異性及び/又はHMFG系の第V及び第Vlll凝固因子の 少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを存するポリペプチドに対して、特異 性を有する抗体を、ポリペプチドの結合に有効な量で、これに添加すること:及 び形成された如何なる複合体の存在をも判定すること、を含む。
この方法は、例えば骨髄試料のような生物試料に対して特に好適である。しかし 、その他の起源の試料についても実施し得る。このステップは、一般には、上記 に記載したように実施でき、上皮細胞の存在の判定は、既に記載したように抗体 と共に形成された如何なる複合体の、定性的又は定量的のいずれかの同定によっ て行うことができる。
またこの検出は、約46kDのタンパク質をコードするリボ核酸(RNA)の存 在を、表1に示したようなシーフェンスに基づいた核酸プローブと、PCRとし て知られている当業界で既知の方法(エーリッヒ(Erlich)、H,A、  PCRtechn。
1ogy: Pr1nciples and Applications fo r DNA Amplification、 1989. Xトック トンプレス(Stockton Press)社刊)とを用いてアッセイするこ とによって行うこともできる。
またここで提供されるものは、被検者において、HMFG系の約46kD分化抗 原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの 軽鎖に対するホモロジーを存するポリペプチドを発現している細胞を、生体内に て画像化する方法であり、この方法は、 抗体−細胞ポリペプチド複合体を形成するために、このポリペプチドを発現して いる細胞を有すると思われる被験者の体内領域へ、供給するために有効な条件下 で、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第V[ [[凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド に対して特異性を有する抗体を、ポリペプチドの結合に有効な量で、被検者に投 与すること: このポリペプチドの結合部位よりも他の部位で抗体と結合することができる検出 可能な標識を、その被験者に投与すること:及び被験者の体内に形成された、如 何なる複合体にも付随する標識の存在を検出す抗体の投与は、約0.5から50 mg/m1.より好ましくは約5から20mg/mlの濃度で実施することがで きる。総量が約lOから50m1の抗体組成物は、如何なる一時にも投与され得 る。投薬方法は単回投与でもよく、また、被験者の細胞中のポリペプチド又はそ の機能的断片の存在を継続的に抑制するために、継続して抗体を投与することも できる。従って、抗体組成物の反復投与もまた考慮される。
抗体は、上記に記載したように医薬組成物として、又は適切と思われるその他の 如何なる形懇においても投与することができる。抗体の投与は、特に静脈内、腹 腔内、洞内、リンパ管内、腫瘍内及び筋肉内投与により実施され得る。適切なそ の他のルートも、この抗体のペプチド結合を加水分解しないものであれば用いら れ得る。
検出可能な標識の投与は、標識された抗−抗体免疫グロブリン又はそれの結合機 能的断片を提供し、その後、この複合体に結合した標識の量をめることによって 実施さね得る。これらの手技は当業界で既知であり、ここで更に詳細に記載する 必要はない。
更に本明細書で提供されるものは、約46kDのHMFG分化抗原に対する親和 性を有する抗体の、生物試料における存在を検出する方法であり、この方法は、 抗体を含むと思われる試料を提供すること:抗体−細胞ポリペプチド複合体が形 成されるために有効な条件下で、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異 性及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモ ロジーを有するポリペプチドを、抗体の結合に有効な量で、これに添加すること ;及び 形成された如何なる複合体の存在をも判定すること、を含む。
上記に記載した方法は、哺乳類の体内にそのようなポリペプチドが存在する結果 として、生成された哺乳類における抗体の存在を検出するために、本発明のポリ ペプチドを利用する。試料は、試料の他のタンパク質及び/又は成分の干渉を除 外するために、上記に記載したように処理することができる。血液の場合は、ま ず血清を得、それから、以下のように血清を処理する。
非特異反応を抑制するために、正常ヒト又はウシ血清は添加されてもよく、及び /又はウシ血清アルブミン(BSA)が用いられ得る。
ポリペプチドは、試料当たり約o、ooootから1.0mg/ml、より好ま しくは約0.0001から0.Img/mlの量で試料に添加される。しかしこ の量販外でも適切である限り用いることができる。試料における抗体の量は希釈 によって調節することができる。試料における抗体の至適範囲は、約0.000 01から0.1mg/ml、より好ましくは約0.0001から0.0Img/ m+である。しかし他の量も用いられ得る。この方法のステップは、上述のよう に実施され、抗体−ポリペプチド複合体の存在の判定が含まれる。アッセイ条件 、例えばpH1温度などは、一般に当業界で知られているようなものである。
試料において約46kDのHMFG分化抗原に対する親和性を有する抗体の、存 在を検出する方法も、また提供され、この方法は、抗体を含むと思われる試料を 提供する:抗体−融合タンバク質複合体が形成されるために有効な条件下で、約 46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第V[[I凝 固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はそ れの機能的断片と、二次抗原ポリペプチド又はそれの抗体結合機能的断片とを互 いに結合して含む融合タンパク質を、抗体の結合に有効な量で、これに添加する こと;抗体−融合タンパク質−抗体複合体が形成されるために有効な条件下で、 抗二次ポリペプチド抗体を、二次ポリペプチドの結合に有効な量で、これに添加 すること:及び 如何なる抗体−融合タンパク質−抗体複合体の存在をも判定すること、を含む。
先に記載した方法の場合のように、この方法も、好ましくはモノクローナル抗体 を用いて実施される。試料に添加される抗体の量は、好ましくは試料当たりo、 ooootからO,1mg/ml、より好ましくはo、ootから0.01mg /mlである。
しかし他の量も用られ得る。先の例のように、試料は、融合タンパク質の添加の 前に処理し得る。1例としては、試料を希釈して、干渉成分を除去することであ る。これらのステップは、当業界で知られているように実施され、ここで更に詳 細に記載する必要はない。
またここで提供されるものは、約46k DのHMFG分化抗原の抗体結合特異 性及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモ ロジーを有するポリペプチド又はその機能的断片で、被験者に生体内にて予防接 種する方法であり、この方法は、 予防接種される被験者に、上述の46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性 及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロ ジーを有するポリペプチド又はその機能的断片を、このポリペプチド、その機能 的断片、又はこのポリペプチド若しくはその機能的断片を運ぶ細胞に対して、被 験者に予防接種させるために有効な量及び条件下で投与することを含む。この生 体内での方法は、上述の特性をもつポリペプチド又はそれを運ぶ細胞に対して、 癌患者に予防接種するために用いられ得る。このようにして、このポリペプチド 又はこのポリペプチドを運ぶ細胞に対する免疫反応の惹起を患者に誘発させる。
予防接種用ポリペプチドは、約0.1から100mg/ml、より好ましくは約 2から50mg/m+の量で被験者に投与され得る。典型的には、いずれの用量 も約0゜1から50m1、より好ましくは2から10m1の予防接種用ポリペプ チドから成るであろう。予防接種剤は、約6カ月まで、時には1年を越える期間 、継続的に投与することができる。より長い期間も、本発明の予防接種に含まれ る。
また、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第Vl ll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド を発現している、患者体内の標的細胞に、治療用薬剤を生体内にて供給する方法 が、ここで提供され、この方法は、 約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第VII[ 凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有する提供されたポリペ プチドに対して特異性を有するモノクローナル抗体に、ポリペプチド結合部位よ りも他の部位で治療剤を結合させること: この細胞の周囲にこの薬剤を供給するために有効な条件下で、抗体結合化治療薬 剤を治療的に有効な量で、標的細胞を運ぶと思われる被験者に、投与すること、 及び この治療薬を運ぶ抗体に、この細胞に薬剤の効果を及ぼさせるため、細胞のポリ ペプチドと結合させること、 を含む。
この生体内での方法は、上皮細胞の癌、例えば乳癌に罹患している癌患者の治療 に用いられ得る。
この治療剤は、当業界で既知のいずれの抗癌剤でもよい。治療薬剤の例は、放射 性核種、化学療法剤、例えばリシンのA鎖、アブリンのAiJIのような毒物等 である。しかし、他のものも用いることができる。治療剤は、当業界で既知の方 法で抗体に結合させることができる。より具体的には、+311のような放射性 核種か、チロシンのようなアミノ酸の酸化によって、又はキレート剤を介して付 加された0Yによって抗体に結合され、この結合物は、ヒト乳癌をもつヒトに静 注又は腹腔内注射により投与され、従ってこの腫瘍の増殖は抑制される(例えば マウスについては・セリア−=(Ceriani)ら、Cancer Res、  (1988) 48.4664−4672)。
抗体結合化治療剤は、約1から100mg組成物/m+、より好ましくは約2か ら20mg組成物/mlの量で被験者に投与され得る。典型的には、いずれの用 量も、抗体結合化治療剤含有組成物の約1から50m1、より好ましくは約2か ら10m1から成るものであろう。治療剤は、単回投与の抗体結合薬剤として投 与することもでき、又は、約6カ月までの期間、及び時には1年を越える期間に わたって継続的に投与することもできる。より長い期間も本発明の治療に含まれ る。
また、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第vo i凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチドを 発現している標的細胞に、治療剤を生体外にて供給させる方法も、ここで提供さ れ、この方法は、 標的細胞を含むと思われる生物試料を被験者から得ること;約46k DのHM FG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第vrt+凝固因子の少な( とも1つの軽鎖に対するホモロジーを有する提供されたポリペプチドに対して、 特異性を有するモノクローナル抗体に、ポリペプチド結合部位よりも他の部位で 治療剤を結合させること:抗体−細胞ポリペプチド複合体の形成を促進させるた めに有効な条件下で、抗体結合化治療剤を、試料に添加すること;この細胞に薬 剤の効果を及ぼさせること:及びこの被験者にこの試料を戻すこと、 を含む。
被験者に試料を戻す前に、非結合抗体も、細胞溶解を惹起する補体の存在下で試 料に添加されてもよい。
一般に、この方法のステップは、特に生物学的試料の調製、抗体への治療薬剤の 結合と同様、試料への抗体結合化治療剤の添加については、上記に記載したよう に実施することができる。被験者に試料を戻すことに関しては、当業界で既知の 方法によって行うことができる。例えば、既に処理を施した試料は、静脈内、洞 内、腹腔内、腫瘍内ルートにより無菌的形態で被験者に戻すことができる。しか し、当業界で既知の他のルートもまた用いられ得る。
また、本発明の約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V 及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポ リペプチド又はその結合機能的断片をコードするポリヌクレオチドも、ここで提 供される。このポリヌクレオチドは、このポリヌクレオチドのコード鎖を含む二 本鎖DNA又は−木繊DNAのいずれかとして提供される。このポリヌクレオチ ドの断片は、約15から2000塩基、より好ましくは約30から300塩基か らなる。
また、上述のポリヌクレオチドのコード鎖に相補的なりNAシークエンスも、こ こで提供される。
上述の二本鎖及び−木繊のDNAは、共に標識された形態でも提供される。標識 化は放射性元素、例えば′!P、14C,”H等を用いて、当業界で知られた通 りに実施され得る。しかし他の放射性核種も用いられ得る。
特に好ましいものは、本明細書の表1に示したDNAシークエンスを有するポリ ヌクレオチド、又はその断片若しくはDNAシークエンスであって、約9から2 000塩基、より好ましくは約18から200塩基を含むものである。しかし他 のサイズの断片も用いられ得、また本明細書の範囲に含まれる。
また本発明の一部をなすものは、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異 性及び/又は第V及び@Vl11凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモ ロジーを有するポリペプチド又はその断片をコードするポリリボヌクレオチドで ある。
これは、このポリペプチドに対するコードRNAである。
このポリリボヌクレオチドシーフェンスは、約9から3000塩基のサイズ、よ り好ましくは約18から300塩基の長さの断片であり得る。しかし他の断片サ イズもこの中に含まれる。
また別に本発明の部分をなすものは、上記のポリリボヌクレオチドのシーフェン スに対して相補的なシーフェンスを有するポリリボヌクレオチドの非コード鎖で ある。このポリリボヌクレオチドシーフェンスは、コード鎖RNA又は対応する DNAの非コード鎖とハイブリダイゼーションすることができる。特に好ましい 具体例では、該ポリリボヌクレオチドは標識された形態で提供される。
本発明のまた別の部分は、互いに結合された、約46k DのHMFG分化抗原 の抗体結合特異性及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽 鎖に対するホモロジーをもつポリペプチドと、二次抗原ポリペプチド又はその抗 体結合機能的断片と、を含も融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドであ る。
このポリヌクレオチドは約400から4000塩基の長さで、より好ましくは約 500から1400塩基の長さとし得る。しかし他のサイズのポリヌクレオチド も、ここに含まれる。
またここで提供されるものは、互いに結合した、約46kDのHMFG分化抗原 の抗体結合特異性及び/又は第V及び第VIl[I固因子の少なくとも1つの軽 鎖に対するホモロジーを有するポリペプチドと、二次抗原ポリペプチド又はその 抗体結合機能的断片と、を含む融合タンパク質をコードするポリリボヌクレオチ ドである。また、この融合タンパク質をコードするRNAのシーフェンスと相補 的であるポリリボヌクレオチドも提供される。
融合タンパク質をコードするこのポリリボヌクレオチドは、約400から400 0塩基、より好ましくは約500から1400塩基の長さである。その断片は、 約9から100、より好ましくは約15から70塩基の長さである。
また本発明の別の部分は、約15から4000塩基、より好ましくは約50から 1800塩基の長さの、本発明の融合タンパク質又はその機能的断片をコードす るポリヌクレオチドである。融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、 二本lDNA又は一本MDNAとして提供され、これは融合タンパク質のコード 鎖と、非コードDNA鎖に対応するシーフェンスを包含する二次ポリヌクレオチ ド又はこれの断片とを包含するうここで提供される後者のポリヌクレオチドは、 融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドに対して、相補的なりNAシーク エンスを含むポリヌクレオチドである。この融合タンパク質をコードするDNA 及びRNAンークエンスは共に、標識形態で提供され得る。特に有用な標識は、 ttp及び当業界で既知の池のffflである。DNA及びRNAは、当業界で 既知の方法により標識化される。
また、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第Vl ll凝固因子−の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチ ドをコートするポリヌクレオチドシーフェンスの、試料における存在を検出する 方法も、ここて提供され、この方法は、 このポリヌクレオチ1−を含むと思われる試料を提供すること:試す1中に存在 する二本鎖DNAを融解すること:/j7なくとも15塩基の相補的シークエン スを有する如何なるポリヌクレオチドもハイブリダイズさせるために有効な条件 下で、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドのコード鎖に相補的 な標識DNAシークエンスを、標識形態において、ハイブリダイゼーションに有 効な量で添加すること:及び#kDNA−相補的ポリヌクレオチドハイブリッド の存在を検出すること、を含む。
二の方法に付される試料は、生物試料とすることもてき、また検査室で生成した 試料でもよい。ポリヌクレオチドが局在する細胞を含んでいる試料の場合は、細 胞を溶解する必要があり、場合によって、残余物質からDNAを単離する必要が ある。これは、当業界で既知の方法で実施される。
試¥1は、その中に存在する二本鎖ポリヌクレオチドシーフェンスを融解するた めに、更に希釈及び/又はtIII2され得る。融解ステップは、当業界で既知 の方法で実施される。一般には、試料は、タンパク質を変性させ、RNA5e( リボヌクレアーゼ)活性を阻害するために、4Mのグアニジニウムイソチオシア ネート中で細胞を溶解させることによって調製される。抽出物を塩化セシウム濃 度勾配遠も・法に付し、RNA、DNA及びタンパク質はそれらの相対密度に従 い分離さt1乞DNA及びRNAは、有機溶媒で抽出され、70%エタノールで 沈殿させて4tlすることによって、更に精製される(サムブロック(Samb rook)ら、MolecularCloning: A Laborator y Manual、第二N (+989) 、:+−ルドスブ審Jングハーバー 研究所出版、ニューヨーク州)。融解は、試料の温度を、このDNAのTmより 杓20°C上昇させることにより、又はpH12より高(することによって達成 さiする。
約46kDのHM F G分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第Vl ll凝固因子、の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチ ドをコードするポリヌクレオチドのコード鎖に相補的な標識化DNAが、ハイブ リッドゼ−7・ヨンに有効な員で、融解されたDNAに添加される。DNA−D NAセグメントのハイブリダイゼーションに適した条件は、当業界で既知である 。厳しさの度合いは、ハイブリダイゼーションを所望する相補的シーフェンスの 数により決定される。より厳しい条件が用いられる場合には、一般に、プローブ とのより高い相補性をもつDNAシークエンスで、ハイプリダイ懺−ションが生 じるであろう。
従って、低い相補性をもつシーフェンスを検出するために緩やかな条件を所望す るときは、条件をそれにつれて変更することができる。一般に、この条件は以下 の通りである。
全般的な条件は変更可能であるが、一般的には以下の通りである。ナトリウムイ オン濃度は約IM、pHは約5−9、温度は約65℃又はブローブシークエンス とその相補鎖とのデユーブレックスDNAの融解温度より、20℃低い温度であ る(ブリラテン(Bretten)、 R,ら、(1974) Methods  in Enzymolozy、 29.363 ;サムブロックら、前掲書) 。
DNA−相補的ポリヌクレオチド標識化ハイブリッドは、当業界で既知の方法で 検出できる。典型的には、二本鎖DNAを制限酵素で処理し、異なるサイズの鎖 に分離するためゲル電気泳動にかける。ゲルは特別に調製したフィルターにプロ ットされ、ハイブリダイズされ、その後このフィルターは、これの画像を得るた めに十分な時間、感光プレートに露光される。このプレートは現像され、種々の 断片が分析される。二重鎖標識化ハイブリッドの存在をより定性的に検出するた めには、制限酵素未処理のDNAはフィルター上にプロットされ得、ハイブリダ イズして感光プレートにされ得る。このプレートを現像して放射性標識の存在を 検出する。
またここで提供されるものは、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合活性及 び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジ ーを有するポリペプチド又はその断片をコードする、試料中におけるRNAンー クエンスの存在を検出する方法であり、これは、このRNAを含むと思われる試 料を提供すること:少なくとも約15塩基の相補的シーフェンスを有する如何な るRNAをもハイブリダイズさせるために有効な条件下で、約46k DのHM FG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第Vlll凝固因子の少なく とも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチドをコードする標識化ポ リヌクレオチドのコード鎖を、−木繊の形懸において、ハイブリダイゼーション に有効な量で、これに添加すること:及び 該ポリヌクレオチド−RNAハイブリッドの存在を検出すること、を含む。
本質的には、上記の方法は、先に述べたDNAシークエンスの存在の検出方法と 同様な手法で実施できるが、試料中に含まれるRNAが実質的に分解されないこ とを、確信できるように注意する必要がある。一般的にRNAを検出する場合に は、下記の処置が更に必要である。
RNA5eインヒビターの使用及び実験器具のジエチルピロカーボネートによる 前処置は、如何なる夾雑RNA5eをも不活性化する。一般に、RNA:RNA ハイブリッドはDNA:DNAハイブリッドよりも安定であるので、ハイブリダ イゼーションはより厳格に実施される。例えば、ハイブリダイゼーションは50 %ホルムアミドにおいて、65℃で実施され得る。DNAデユーブレックスのT mは、添加されたホルムアミド1%当たり、約0.72℃低下する(サムブロッ クら、前掲書、カセイ(Casey)、 J、及びダヴイッドソン(David son)、N、 (1977) Nucl。
Ac1ds、 Res、 、 4.1539−1552 参照)。
RNAが細胞内に含まれる場合は、細胞はリボ核酸を露出するために溶解されな ければならない。これはディタージェント溶解のような当業界で既知の方法によ って実施され、この場合はその後プロテアーゼで処理することもできる。
また本発明の別の部分は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び /又は第V及び第Vl[I凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジー を有するポリペプチド又はその断片をコードする、RNAシークエンスの試料に おける存在を検出する方法であり、この方法は、RNAを含むと思われる試料を 提供すること:少なくとも約15塩基の相補的シーフェンスを有するRNAとハ イブリダイズさせるために有効な条件下で、約46kDのHMFG分化抗原の抗 体結合特異性及び/又は第V及び第Vl11凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に 対するホモロジーを有する提供されたポリペプチドをコードするポリリボヌクレ オチドシーフェンスの少なくとも一部に対して相補的な標識化オリゴヌクレオチ ドを、ハイブリダイゼーションに有効な量で、これに添加すること:及び該ポリ リボヌクレオチド−RNAハイブリッドの存在を検出すること、を含む。
この方法は、一般的には、先に述べた2つの方法と同様な方法で実施されるが、 ただしこの場合は試料及びプローブに存在するRNAシークエンスの如何なる分 解も生じないように、注意をする必要がある。RNA−RNAハイブリダイゼー ションの条件は当業界で既知である。一般的に、用いられる条件は、温度が約6 5°Cで、更にホルムアミドは約50%である(上記の通り)。
RNAが細胞内に含まれる場合は、細胞を溶解してRNAを露出させなければな らない。
また本発明の一部は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又 は第V及び第V[[I凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有 するポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドの、試料における 存在を検出する方法であり、この方法は、 このポリヌクレオチドを含むと思われる試料を提供すること:この試料に存在す る二本鎖ポリヌクレオチドを融解すること:少なくとも!5塩基の相補的シーフ ェンスを有する如何なるポリヌクレオチドと抗体結合特異性及び/又は第V及び 第V[[[凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを存するポリペ プチドをコードする標識化RNAシークエンスを、ハイブリダイゼーションに有 効な量で、これに添加すること;及び該RNA−相補的ポリヌクレオチドハイブ リッドの存在を検出すること、を含む。
ポリヌクレオチドが細胞内にある場合は、細胞を溶解してDNAを露出させ得る 。
本発明のまた別の一部は、約46k DのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及 び/又は第V及び第Vl11凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジ ーを有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドのコード鎖に対するアン チセンスシーフェンスを含む約200から3000ヌクレオチドのDNAセグメ ントである。
より好ましくは、このDNAセグメントは約100がら1000ヌクレオチドを 持ち得る。
アンチセンスシーフェンスの概念は当業界で既知である。標的タンパク質をコー トするメツセンジャーRNAに相補的である合成オリゴヌクレオチドは調製され 得る。このオリゴヌクレオチド又は化学的に修飾されたその同等物が細胞に添加 される。オリゴヌクレオチドは標的mRNAに結合し、従って標的タンパク質の 翻訳を抑制する(マーカスーセクラ(Markus−3ekura)、 C,J 、 Techniques forusing Antisense Olig onucleotides to 5tudy Gene Expressio n、 (198W) Analytical Biochemistry 、 172.289−295 )。
また別にアンチセンスRNAはセンスRNAの翻訳の阻止に用いられる。アンチ センスRNAは、対象遺伝子が翻訳方向に関して逆向きにある標的遺伝子のコピ ーを有する、ウィルス又はプラスミドDNAベクターから生成される。この逆方 向遺伝子を標的細胞ゲノムに導入するための担体として、ウィルスが用いられ得 る(アイザント(Izant)、J、G 及びワインドマツプ(Weintmu b)、H,(1985)Science 229.345−352)。
アンチセンスDNAセグメントの断片もまたここで提供され、それらは約15か ら100塩基、より好ましくは30から50塩基を含み得る。アンチセンスシー フェンスは、当業界で既知の方法、例えば以下のようにして得ることができる。
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、生物学的有効期間を延長するため、細胞内 ・\の透過性を増強するため及び標的への結合を強めるために、それらのリン酸 部分を修飾して作成される。例えば、オリゴメチルホスホネート(ミラー(Mi  I 1er)。
P、S、、ラブ4 (Reddy)、 M、P、 、ムラカミ、A、ブレイク( Blake)、に、R,、リン(min)、S、B、、アゲリス(Agris) 、 C,H,、(+986)、Biochemistry 25.5092−5 097)又はオリゴホスホロチオネート(ラブランンエ(Laplanche) 、L、 A、、ジェームス(James)、T、L、、バラエル(Poweil )、 C,、ウィルソン(Wilson)、 W、 D、、ウズナシスキ(Il znanski)、 B、、ステック(Stec)、W、J、、サマーズ(Su mmers)、 M、F 。
及びシン(Zon)、 G、 (1986) Nucleic Ac1ds R es、、14.9081−9093)である。あるいは、標的遺伝子は、ウィル スベースの真核細胞系発現ベクターに逆方向で挿入され、哺乳類細胞に導入され 得る(J、サムブロックら、前掲書参照)。
また本発明の部分は医薬組成物であって、約46kDのl(MFG分化抗原の抗 体結合特異性もつポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドのコ ード鎖に対する、治療的に有効な量のアンチセンスDNAシーフェンスと、医薬 的に許容できる担体と、 を含むものである。
この組成物は、種々の量で提供され得る。典型的に、アンチセンスDNAは、約 0.01から99.99重量%、より好ましくは約0.1から20重量%の量で 提供され得、残りは担体及び/又は他の既知の添加物とし得る。医薬的に許容で きる担体は、DNAを分解しない、如何なる担体でもよい。担体及び他の添加物 の例は、緩衝食塩溶液、ヒト血清アルブミン及び同様物とし得る。しかし他のも のもまた用いることができる。この医薬組成物は、当業界で知られているように 、アンチセンスDNAを担体と混合することによって調製され、凍結乾燥して滅 菌容器に詰められ得る。組成物は冷蔵及び/又は冷凍して保存してもよい。
乳癌治療を必要としている被験者のこのような治療方法も、本発明により提供さ れる。この方法は、約46kDのHMFG分化抗原の抗体結合特異性もつポリペ プチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドのコード鎖に対するアンチセ ンスDNAシーフェンスを治療的に有効な量で含む組成物を被験者に投与するこ とを含む。
この方法は、医薬組成物において、約5から800mgのアンチセンスDNA、 より好ましくは、20から200mgのアンチセンスDNAを投与することによ って実施され得る。この組成物は、非経口的、静脈内又は胸腔内ルートによって 投与され得る。しかし他の投与経路もまた用いることができる。
また本発明の部分は、免疫アッセイキットであり、これは、約46kDのHMF G分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第Vl11凝固因子の少なくとも 1つの軽鎖に対するホモロジーを有する、提供されたポリペプチドに対して特異 性を有するモノクローナル抗体と、抗−抗体免疫グロブリンと、 を別々の容器に含む。
二の免疫アッセイキットは、ここで提供された種々の方法の実施に用いられ得る 。モノクローナル抗体及び抗−抗体免疫グロブリンは、約0.001m gから 100g、より好ましくは、約0.01mgからIgの量で提供され得る。抗− 抗体免疫グロブリンは、ポリクローナル免疫グロブリン、プロティンA若しくは プロティンG又はそれの機能的断片でもよく、それは使用前に当業界で既知の方 法で標識されていてもよい。
またこの中で提供されるものは、抗体検出キットで、約46kDのHMFG分化 抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第v111凝固因子の少なくとも1つ の軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチドと、抗−抗体免疫グロブリンと 、 を別々の容器に含む。
この抗−抗体免疫グロブリンは使用前に標識されていてもよい。
またこの中で提供されるものは、融合タンパク質キットで、これは、約46kD のHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第v111凝固因子の 少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチドと、二次抗原ポ リペプチド又はその抗体結合機能的断片とが、互いに結合した融合タンパク質と 、 抗−二次ポリペプチドモノクローナル抗体と、抗−抗体免疫グロブリンと、 を別々の容器に含む。
融合タンパク質は、約0.001m gから100g、より好ましくは、約0. 01mgからIgの量て無菌形態で提供され得る。また、抗−二次ポリペプチド モノクローナル抗体は、約0. OOIm gから100g、より好ましくは、 約0.01mgからIgの量で無菌形態で提供され得る。抗−抗体免疫グロブリ ンは、約0.001m gから100g、より好ましくは、約0.OImgから Igの量で、別の容器にて提供され得る。キット全体は輸送及び保存のために包 装され得る。
またここで提供されるものは、抗乳癌治療キットで、これは、約46kDのHM FG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第V1]1凝固因子の少なく とも1つの軽鎖に対するホモロジーを有する提供されたポリペプチドに対して特 異性を有するモノクリ−ナル抗体λ、免疫毒素及び放射性核種からなる群より選 ばれる抗癌治療薬ど、を別々の容器に含む。
このモノクローナル抗体は、約1から20g、より好ましくは、約2から10g の量で無菌形態で提供される。抗体は凍結乾燥し、包装され得る。この治療剤は 、如何なる既知の抗癌治療剤でもよい。例えば、特にこの薬削は、アブリンのA M、リンノのA鎖、免疫毒素、化学療法剤並びにIII ■及び16Y放射性核 種であり得る。
本発明をこれまて一般的に説明してきたが、これらは、特定の実施例を参照して 、よりよく理解されるであろう。本明細書に含まれるそのような実施例は説明の ためのものであって、特に断らない限り、本発明又はその具体化を制限すること を意図するものではない。
実施例 ヒト乳房cDNAライブラリーはクローンチック(Clontech :Pa1 o Atro、 カリフォルニア州)から入手した。妊@8カ月の期間に、十分 に分化した組織と乳汁分泌能力を示し、乳房切除中で切除された成人乳房組織か ら抽出されたRNAから、このライブラリーは調製された。この組織からの、オ リゴ−dTで用意されたcDNAは、ラムダ/gtllのEcoR1部位に挿入 された。ブレーティング及びモノクローナル抗体によるライブラリーのスクリー ニングは、基本的には、ヤング及びデーヴイスにより記載されたように(ヤング 、 R,A、及びデーヴイス、R,W、 (+983)、Proc、Nat’1 .Acad、Sci、、USA、、80.1194−1198)行った。このラ イブラリーは、モノクローナル抗体であるMc3、Mc8Mc15及びMe2O (ピーダーリン(Peterson)、J、 A、ら、(1990)、 Hyb ridoma 9.221−235)のカクテルてスクリーニングされ、これら の全てがヒト母乳脂肪球の46kD成分に結細胞株は、後期対数期まで増殖し、 全細胞RNAは、チャーウィン(Chi rgwi n)らの方法(チャーウィ ン、J、M、、プルライビラ(PrZybyla)、A、E、 、?クトナルト 、R,J 及びルッター(Rutter)、 W、J、 (1979) Bio chemistry、18゜5294−5299)により調製した。RNAは、 グリオキシル化され、電気泳動され、トーマス(トーマス、P、ニトロセルロー スに転移された、変性RNAと小DNA断片のハイブリダイゼーション。Pro c、 Natol、 Acad、 Sci、 、 USA、 、 77、520 1−5205)に従ってプロットされ、RNAはUV照射を用いてナイロン(バ イオダイン(Bio−dyne))フィルターに結合した。
1本鎖RNAプローブは、製造業者(プロメガ(Promega))に従って、 SF3とT7RNAポリメラーゼを用いて試験官内で作成され、800 Ci/ mmolの(”P)UTP (アマジャム)の取込みにより標識化された。RN AプロットへのRNAプローブのハイブリダイゼーションは、70°C10,I  X5SC10,1%SDSにおいて行った。プロットは、増感紙を用いて、− 80°CてX線フィルム(コダックX−AR)に露光した。
実施例3.DNA配列決定 大量バクテリオファージDNA調製は、ファージ溶解物から作成され、Eco  RI消化cDNA介在部は、−膜性(サムブロック(Sambrook)、J、  、フリップ(Fritsch) 、D、及びマニアティス、 T、 (199 0) Mo1ecular Cloning:ALaboratory Man ual/5econd edition、コールドスプリングハーバ−研究所出 版、コールドスプリングハーバ−、ニューヨーク州)に従って、pGEM3 ( プロメガ、マジソン、ウィスコンシン州)にサブクローニングした。
pGEMa中の介在部のジデオキシ配列決定は、製造業者(USB、クリーブラ ンド、オハイオ州)のプロトコールに従い、T7又はSP6プロモーターシーク エンス・プライマー(プロメガ)を用いて、直接、プラスミドDNA上で、修飾 T7DNAポリメラーゼ(シークエナーゼ)により行った。このシーフェンスは 、介在部の両鎖の配列決定により確認された。
実施例4: 結果 ラムダ/gt11の乳汁分泌乳房cDNAライブラリーからの約lXl0@プラ ークのスクリーニング後、15の陽性プラークが選択された。最も長いcDNA であるBA46−1は、1271bpの長さであった。第2のcDNAクローン は、1384bpに及ぶ3′末端シークエンスデータを示し、ポリアデニル化部 位を含んでいた。
一連の陽性ラムダ/gtoクローンは、Y1089を温厚するために用いられ、 誘導された細胞抽出物中に含まれた融合タンパク質の結果物は、スクリーニング カクテル中に含まれる各モノクローナル抗体との反応性をドツトプロットによっ て解析された。
Mc8、Mc15及びMe2Oは、全ての陽性ラムダ/gtll温厚抽出物に結 合したが、対照ラムダ/gtll抽出物には結合しない(図示されていない)こ とが認められた。しかし、Mc3はどの溶解物にも結合せず、このエピトープは 、グリコジル化、二次構造を必要とするか又はこのライブラリーに存在しないB A46−1 cDNA介在部の各鎖を示す1本鎖RNAプローブは、Gem3に サブクローニングして、T7又はSP6ボリメラーゼにより試験官内で転写する ことによって調製された。
いくつかの癌細胞株がBΔ46−1特異的RNAのために研究され、これには5 つの乳房株及びリンパ細胞株が含まれた。本特許に添付している図に示されるよ うに、2.2kbの1本鎖RNAは、試験された殆どの癌細胞株において、容易 に検出された。このRNAは、またRa j t、5KBR3及びPANCIに おいても検出されたが、図に示すにはより長く露光を必要とする程、より低しル ベルで癌細胞株において検出された2、2kbの一本鎖RNAの観察された発現 レベルにおいて考慮すべき変動がみられた。肺(A548T) 、卵巣(SKO V3)及び2つの乳房(Ell−G及びHS578T)細胞株は、他の癌細胞株 よりも、10−50倍多くこの転写物が蓄積した。乳房及び他の癌において、H er 2/neu及びEGFレセプターのような、特定の遺伝子の過剰発現が、 それ以前に予後と相関していること(スラモン(Slamon)、 D、 J、  、ゴールドフィン、Wl、ジコーンズ、J、 A、 、ホールト、J、A、  、ウォン、S、 G、 、キース、D。
El、レーヴイン、 W、J、、スチュアート、S、G、、1−ドヴ(Udov e)、 J 、、ユーリッヒ(U!1richi) 、 A、及びプレス、 M 、 F、 (1989) 5cience、244.707−712) (ディ ッキンソ:/、R,B、 、ベイッ(Bates)、S、E、 、vクマナウエ イQlcManaway) 、M、E、及びリップマン(Lippman) 、  M、E、 (1986) Cancer Res、。
46、1707−1713)が注目されるべきである。
実施例6. 特異性研究 cDNAを選択するために使用された抗体が乳癌に特異性を有していても(ピー タ−フン、J、A、ら、(1990) l(ybridoma 9.221−2 35) 、約46kDのタンパク質をコートしている約2.2kbのRNAフラ グメントの発現が、多くの異なる癌細胞株において起こる。認められた乳房特異 性の欠失は、正常組織においてではなく、癌におけるこの遺伝子の膜制御&0( de−regulation)に起因し得る。あるいは、正常上皮組織が約46 kDのタンパク質を発現し得るが、例えば糖付加における変異によって、このタ ンパク質の乳房細胞型中で、さらされるエピトープをブロックするように加工さ れるかもしれない。
HMF Gの高分子量ムチン様タンパク質は、また、非乳癌において発現してい るが、例えば膵臓における変性プロセッシングは、乳房においてよりも異なる抗 原性部位にさらすようにする(ラン化an) 、 M、S、 、ホーリンワース (Hol l ingworth)、 M、 A、及びメツツガ−(Metzg ar) 、 T、S、 (1990) Cancer Res、、50゜299 7−3001)。
実施例7;DNAシークエンスの研究 ヌクレオチドとBA46−1及びBA46−2cDNAの誘導されるアミノ酸混 成シークエンスは、下記の表1に示されている。
表1・BA46−1 cDNAのDNAシークエンス及び誘導されるアミノ酸シ ークエンス n一連結グリコリル化可能部位は下線を付しである。
部分的シーフェンスは、217アミノ酸の長さてあり、約24k Dの理論的分 子量に合成され、これは完全なタンパク質のC末端を表す。ここには、4ケ所の n一連結グリコシル化可能部位がある。このシーフェンスは、アスパラギン及び ロイFSTNSCAN (PCGENE)を用いたEMBLデータベースに対し て、ヌクレオチドシーフェンスの対比は、ヒト血清第V及び第VIr[因子とプ ロティンCとに広域ホモロジーを示した。
しかし、ヌクレオチドレベルのホモロジーが介在シーフェンスにおいてであった ので、誘導されるタンパク質シークエンスは、下記の表2に示すように、プロテ ィンCてはなく、第V及び第VIr[因子にのみ同一性を共育した。
表2=誘導されるBA46−1アミノ酸シークエンスとC末端ヒト血清第V及び 第Vl11因子との比較 矢印はC1及び02反復部の結合を示す。
因子Vに対して約4396、及び因子■111に対して約3896の同一性が、 BΔ46にあった。表2にお(lる第V及び第V111因子の領域は、約479 6の同一性を共有する。
”JQ9ユ アミノ酸シークエンスの研究約46kDタンパク質の誘導されるア ミノ酸シークエンスの解析は、グリコジル化タンパク質としての説明と一致する 。しかし、このタンパク質の機能は知られていないつ、二の約46kDタンパク 質が第V及び第Vlll因子の両方にホモロジーを有するので、これらの血清凝 固因子と共通の先祖タンパク質があるかもじれない。
ホモロジーは、因子Vll+の軽鎖のCI、C2領域(7941M1.スキヤン デラ(Scandella)、 D 及びホイヤー(lloyer)、 L、  M、 (+989) J、Cl1n、 Invest、、83.P978− 1984)にある。
アライらは、因子Vlllで処理した血友病者からの、この軽鎖のこの領域に結 合するヒトの抗体は、リン脂質と因子■111との相互作用を妨げることにより 因子v111を阻害することを示した。この領域がリン脂質の結合に密接な関係 を持っているので、約46kDIタンパク質における同様の役割を果たずらしい 。
従って、このC末端タンパク質は、この46kDタンパク質に対する新しい゛ア ンカー”シーフェンスとして振る舞い得るか、又は成長している乳汁脂肪滴の表 面上におけるリン脂質へのムチン/膜の結合に関連する可能性もあるだろう(ロ ング(Long)、C,A、及びパラトン(Patton) 、S、 (+97 8) J、Dairy Sci、、61゜1392−1399)、多分、形v! 膜表面でのムチン複合体のアッセンブリに関連する。
本発明がここで十分に説明されたので、本明細書中に記載されたように、本発明 の精神及び範囲を逸脱することなく、ここに多くの変換及び修正が行われ得るこ とは、一般的な当業者にとって明らかであろう。
jS− rIGU!伍 1 補正書の写しく翻訳文)提出書(特許法第184条の8)平成5年5月6日

Claims (51)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及 び第VIII凝固因子の1つの軽鎖の少なくとも一部に対するホモロジーを有す るポリペプチド。
  2. 2.約46キロダルトンのHMFG分化抗原又はその抗体結合機能的断片である 、請求の範囲1に記載のポリペプチド。
  3. 3.約46キロダルトンのHMFG抗原の生物活性及び/又は第V及び第VII I凝固因子の1つの軽鎖の少なくとも一部に対するホモロジーを有する、請求の 範囲1に記載のポリペプチド。
  4. 4.表2に示したアミノ酸シークエンス又はその抗体結合機能的断片を有する、 5から50アミノ酸である、請求の範囲1に記載のポリペプチド。
  5. 5.抗体の結合に有効な量の請求の範囲1に記載のポリペプチドと、医薬的に許 容できる担体と、 を含む医薬組成物。
  6. 6.請求の範囲1に記載のポリペプチドと、それに結合した二次抗原ポリペプチ ド又はその抗体結合機能的断片と、を含む融合タンパク質。
  7. 7.該二次抗原ポリペプチドが、β−ガラクトシダーゼの抗体結合活性又はその 機能的断片を有する、請求の範囲6に記載の融合タンパク質。
  8. 8.請求の範囲1に記載のポリペプチド又はその機能的断片に対して特異性を有 する抗体。
  9. 9.モノクローナル抗体である、請求の範囲8に記載の抗体。
  10. 10.その単一鎖を含む請求の範囲8に記載の抗体。
  11. 11.そのFabフラグメント又はその単一鎖を含む、請求の範囲8に記載の抗 体。
  12. 12.ポリペプチドの結合に有効な量の、請求の範囲8に記載の抗体と、医薬的 に許容できる担体と、 を含む医薬組成物。
  13. 13.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V 及び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポ リペプチド又はその機能的断片の、生物試料における存在を検出する方法であっ て、該ポリペプチドを含むと思われる生物試料を提供すること;抗体一ポリペプ チド複合体を形成するために有効な条件下で、請求の範囲8に記載の抗体を、ポ リペプチドとの結合に有効な量で、それに添加すること;及びそれらの間で形成 された如何なる複合体の存在をも判定すること、を含む、当該ペプチド検出方法 。
  14. 14.該試料が動物細胞、細胞抽出物又は体液を含む、請求の範囲13に記載の 方法。
  15. 15.上皮細胞の生物試料における存在を判定する方法であって、約46キロダ ルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第VIII凝固因 子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はその機 能的断片を運ぶ上皮起源の細胞を含むと思われる生物試料を提供すること;抗体 −細胞ポリペプチド複合体形成に有効な条件下で、請求の範囲8の抗体をポリペ プチドとの結合に有効な量で、それに添加すること;及びそれらの間で形成され た如何なる複合体の存在をも判定すること、を含む、当該上皮細胞判定方法。
  16. 16.該生物試料が骨髄試料を含む、請求の範囲14に記載の方法。
  17. 17.上皮細胞の生物試料における存在を判定する方法であって、約46キロダ ルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第VIII凝固因 子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はその機 能的断片を運ぶ上皮起源の細胞を含むと思われる生物試料を提供すること;それ からRNAを露出させるために、該試料に含まれる如何なる細胞をも溶解するこ と; それに対して少なくとも約15塩基の相補的シークエンスを有する如何なるRN Aをもハイブリダイズさせるために有効な条件下で、一本鎖の形態における請求 の範囲28に記載のポリヌクレオチドのコード鎖を、ハイブリダイゼーションに 有効な量で、それに添加すること;及び該ポリヌクレオチドーRNAハイブリッ ドの存在を検出すること、を含む、当該上皮細胞判定方法。
  18. 18.上皮細胞の生物試料における存在を判定する方法であって、約46キロダ ルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及び第VIII凝固因 子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチド又はその機 能的断片を運ぶ上皮起源の細胞を含むと思われる生物試料を提供すること;それ らからRNAを露出させるために、該試料に含まれる如何なる細胞をも溶解する こと; 少なくとも約15塩基の相補的シークエンスを有するRNAをそれに対してハイ ブリダイズさせるために有効な条件下で、請求の範囲31に記載のポリリボヌク レオチドシークエンスの少なくとも一部に相補的なオリゴリボヌクレオチドを、 ハイブリダイゼーションに有効な量で、それに添加すること;及び該ポリリボヌ クレオチドーRNAハイブリッドの存在を検出すること、を含む、当該上皮細胞 判定方法。
  19. 19.被験者において、約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合特異 性及び/又は第V及び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモ ロジーを有するポリペプチドを発現している細胞を、生体内にて画像化する方法 であって、 約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第 VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプ チドを発現している細胞を有すると思われる被験者の体内領域に、それを有効に 供給させる条件下で、抗体一細胞ポリペプチド複合体を形成させるために、ポリ ペプチドとの結合に有効な量で、請求の範囲8の抗体を被験者に投与すること; 該ポリペプチドに対する結合部位よりも他の部位で該抗体と結合し得る、検出可 能な標識を該被験者に投与すること;及び該被験者の体内に形成された如何なる 複合体に付随する標識の存在をも検出すること、 を含む、当該生体内細胞画像化方法。
  20. 20.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V 及び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポ リペプチド又は該ポリペプチドを運ぶ細胞に対して、被検者に生体内にて予防接 種する方法であって、該ポリペプチド、その結合機能的断片又は該ポリペプチド 若しくはその機能的断片を運ぶ細胞に対して、被検者に予防接種するために有効 な量及び条件で、請求の範囲4に記載のポリペプチドを、被験者に投与すること を含む、当該生体内予防接種方法。
  21. 21.約46キロダルトンのHMFG分化抗原に対する親和性を有する抗体の生 物試料における存在を検出する方法であって、該抗体を含むと思われる試料を提 供すること;抗体−ポリペプチド複合体を形成するために有効な条件下で、請求 の範囲1に記載のポリペプチドを抗体結合に有効な量で、それに添加すること; 及びそれの間で形成された如何なる複合体の存在をも判定すること、を含む、当 該抗体検出方法。
  22. 22.試料において約46キロダルトンのHMFG分化抗原に対する、親和性を 有する抗体の存在を検出する方法であって、該抗体を含むと思われる試料を提供 すること:抗体−融合タンパク質複合体を形成するために有効な条件下で、請求 の範囲6に記載の融合タンパク質を、抗体結合に有効な量で、それに添加するこ と;抗体−融合タンパク質−抗体複合体を形成するために有効な条件下で、抗二 次ポリペプチド抗体を、二次ポリペプチドとの結合に有効な量で、それに添加す ること;及び 形成された如何なる抗体−融合タンパク質−抗体複合体の存在をも判定すること 、 を含む、当該抗体検出方法。
  23. 23.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及 び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリ ペプチドを発現している、標的細胞へ治療剤を生体内にて供給する方法であって 、治療剤を、該ポリペプチドの結合部位よりも他の部位において、請求の範囲8 記載の抗体に結合させること; 該標的細胞を運ぶる思われる被検者に、該細胞の周囲へ該薬剤を供給するために 有効な条件下で、治療的に有効な量の抗体結合化治療剤を投与すること;及び該 治療剤を運ぶ抗体に、細胞に該治療剤の効果を及ぼさせるために、該細胞のポリ ペプチドと結合させること、 を含む、当該治療剤生体内供給方法。
  24. 24.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及 び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリ ペプチドを発現している、標的細胞に治療剤を生体外にて供給させる方法であっ て、標的細胞を含むと思われる生物試料を被検者から得ること;治療薬剤を、該 ポリペプチドの結合部位よりも他の部位において、請求の範囲8に記載の抗体に 結合させること; 抗体−細胞ポリペプチド複合体の形成の促進に有効な条件下で、該抗体結合化治 療剤を該サンプルに添加すること; 該細胞に該薬剤の効果を及ぼさせること;及び該試料を該被検者に戻すこと、 を含む、当該治療剤生体外供給方法。
  25. 25.請求の範囲1に記載のポリペプチド又はその断片をコードするポリヌクレ オチド
  26. 26.請求の範囲25に記載のポリヌクレオチドのコード鎖に対して相補的であ るDNAシークエンス。
  27. 27.表2に示したDNAシークエンス又はその断片を有する請求の範囲25に 記載のポリヌクレオチド。
  28. 28.標識された形態にある請求の範囲25に記載のポリヌクレオチド。
  29. 29.標識された形態にある請求の範囲26に記載のDNAシークエンス。
  30. 30.請求の範囲1に記載のポリペプチド又はその断片をコードするポリリボヌ クレオチド。
  31. 31.標識された形態にある請求の範囲30に記載のポリリボヌクレオチド。
  32. 32.請求の範囲30に記載のポリリボヌクレオチドのシークエンスに対して相 補的なシークエンスを有するポリリボヌクレオチド。
  33. 33.標識された形態にある請求の範囲32に記載のポリリボヌクレオチド。
  34. 34.請求の範囲6に記載の融合タンパク質をコードするポリデオキシリボヌク レオチド。
  35. 35.請求の範囲6に記載の融合タンパク質をコードするポリリボヌクレオチド 。
  36. 36.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及 び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対してホモロジーを有するポリ ペプチドをコードするポリヌクレオチドシークエンスの、試料における存在を検 出する方法であって、 該ポリヌクレオチドを含むと思われる試料を提供すること;該試料中に存在する 二本鎖ポリヌクレオチドを融解すること;それに対して少なくとも15塩基の相 補的シークエンスを有する如何なるポリヌクレオチドをもハイプリダイズさせる ために有効な条件下で、請求の範囲29に記載のDNAシークエンスを、ハイブ リダイゼーシヨンに有効な量でそれに添加すること;及び 該DNA−相補的ポリヌクレオチドハイブリッドの存在を検出すること、を含む 、当該ポリヌクレオチドシークエンス検出方法。
  37. 37.該ポリヌクレオチドが細胞内に含まれる場合に、細胞からポリヌクレオチ ドを露出させるために、細胞を溶解することを更に含む、請求の範囲36に記載 の方法。
  38. 38.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及 び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリ ペプチド又はその断片をコードする、試料におけるRNAシークエンスの存在を 検出する方法であって、 該RNAを含むと思われるサンプルを提供すること;それ対して少なくとも約1 5塩基の相補的シークエンスを有する如何なるRNAをもハイブリダイズさせる ために有効な条件下で、一本鎖形態における、請求の範囲28に記載のポリヌク レオチドシークエンスのコード鎖を、ハイブリダイゼーションに有効な量でそれ に添加すること;及び該ポリヌクレオチドーRNAハイブリッドの存在を検出す ること、を含む、当該RNAシークエンス検出方法。
  39. 39.該RNAが細胞内に含まれる場合に、細胞からRNAを露出させるために 、細胞を溶解することを更に含む、請求の範囲38に記載の方法。
  40. 40.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及 び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリ ペプチド又はその断片をコードするRNAシークエンスの、試料における存在を 検出する方法であって、 該RNAを含むと思われる試料を提供すること;少なくとも約15塩基の相補的 シークエンスを有するRNAをそれに対してハイブリダイズさせるために有効な 条件下で、請求の範囲31に記載のポリリボヌクレオチドシークエンスの少なく とも一部に対して相補的なオリゴリボヌクレオチドを、ハイブリダイゼーション に有効な量でそれに添加すること;及び該ポリリボヌクレオチドーRNAハイブ リッドの存在を検出すること、を含む、当該RNAシークエンス検出方法。
  41. 41.該RNAが細胞内に含まれる場合に、細胞からRNAを露出させるために 、細胞を溶解することを更に含む、請求の範囲40に記載の方法。
  42. 42.約46キロダルトンのHMFG分化抗原の抗体結合活性及び/又は第V及 び第VIII凝固因子の少なくとも1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリ ペプチド又はその断片をコードするポリヌクレオチドシークエンスの、試料にお ける存在を検出する方法であって、 該ポリヌクレオチドを含むと思われる試料を提供すること;該試料に存在する二 本鎖ポリヌクレオチドを融解すること:少なくとも15塩基の相補的シークエン スを有する如何なるポリヌクレオチドをもそれに対してハイブリダイズさせるた めに有効な条件下で、請求の範囲31に記載のRNAシークエンスを、ハイブリ ダイゼーシヨンに有効な量でそれに添加すること;及び 該RNA−相補的ポリヌクレオチドハイブリッドの存在を検出すること、を含む 、当該ポリヌクレオチドシークエンス検出方法。
  43. 43.該ポリヌクレオチドが細胞内に含まれる場合に、細胞からポリヌクレオチ ドを露出させるために、細胞を溶解することを更に含む、請求の範囲42に記載 の方法。
  44. 44.約15から2000ヌクレオチドである請求の範囲25に記載のポリヌク レオチドのコード鎖に対するアンチセンスシークエンスを含む、DNAセグメン ト。
  45. 45.治療的に有効な量の請求の範囲44に記載のアンチセンスDNAシークエ ンスと、 医薬的に許容できる担体と、 を含む医薬組成物。
  46. 46.請求の範囲44に記載のアンチセンスDNAセグメントを治療的に有効な 量で含む組成物を、被検者に投与することを含む、乳癌治療を必要とする被検者 の乳癌の治療方法。
  47. 47.該組成物が、非経口的、静脈内及び胸腔内経路から成る群より選ばれる経 路によって投与される、請求の範囲46に記載の方法。
  48. 48.請求の範囲9に記載のモノクローナル抗体と、抗−抗体免疫グロブリンと 、 を別々の容器に含む免疫アッセイキット。
  49. 49.請求の範囲1に記載のポリペプチドと、抗−抗体免疫グロブリンと、 を別々の容器に含む抗体検出キット。
  50. 50.請求の範囲6に記載の融合タンパク質と、約46キロダルトンのHMFG 分化抗原の抗体結合特異性及び/又は第V及び第VIII凝固因子の少なくとも 1つの軽鎖に対するホモロジーを有するポリペプチドに対して特異性を有するモ ノクローナル抗体と、抗−第二ポリペプチドモノクローナル抗体と、抗−抗体免 疫グロブリンと、 を別々の容器に含む融合タンパク質キット。
  51. 51.請求の範囲9に記載のモノクローナル抗体と、免疫毒素及び放射性核種か ら成る群から選ばれる抗癌治療剤と、を別々の容器に含む抗乳癌治療キット。
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