JPH0319688A - テイコ抵抗性を与える配列 - Google Patents

テイコ抵抗性を与える配列

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JPH0319688A
JPH0319688A JP2129334A JP12933490A JPH0319688A JP H0319688 A JPH0319688 A JP H0319688A JP 2129334 A JP2129334 A JP 2129334A JP 12933490 A JP12933490 A JP 12933490A JP H0319688 A JPH0319688 A JP H0319688A
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dna
dalbaheptide
teiko
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Maurizio Denaro
マウリツイオ・デナーロ
Rolando Lorenzetti
ローランド・ロレンツエツテイ
Mariacristina Anna Moroni
マリアクリステイーナ・アンナ・モロニ
Margherita Amalia Sosio
マルゲリタ・アマリア・ソシオ
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Gruppo Lepetit SpA
Lepetit SpA
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 本発明は、適切なベクターにより感受性微生物宿主中へ
の形質転換のとき、ダルバヘプチド抗生物質に対する抵
抗性を与えることができる、新規なDNA断片または小
断片に関する。
これらのダルバヘプチド抗生物質は、時にはグ7 リコベブチド抗生物質と定義され、主としてダラム陽性
バクテリアに対して活性である抗バクテリア因子の1つ
のクラスであり、そして次のものを包含する:増加する
数の因子、例えば、パンコマイシン(米国特許第3,0
67,099号)、リストセチン(米国特許第4,08
3,964号)、アポバルンン(米国特許第3,338
.786号および米国特許第4,322,343号)、
テイコプラニン(米国特許第4,239,751号およ
び米国特許第4,542,018号)、アクタプラニン
(米国特許第3,8 1 6,6 1 8号および米国
特許第4.537,715号) 、AAD−2 1 6
またはアルダシン(米国特許第4,548,974号)
、AM374(米国特許第3.803.306号)、A
477(米国特許第3,928,571号)、A409
26 (欧州特許出願(EP−A)177,882号)
、A41030 (米国特許第4,537,770号)
 、AAD−609 <欧州特許出願(EP−A)2 
1 8,4 1 6号)、およびA33512b (米
国特許第4.0 2 9,’7 6 9)号。
構造的観点から、これらの抗生物質7つのアミノ酸から
構成され、それらの5つが絶えずアリルーおよびアリー
ルメチルアミノ酸である、コアのへブタベブチド構造に
より特性決定され、前記構造は共通の作用機構、すなわ
ち、細胞壁の合戒の1または2以上の中間体のD−アラ
ニルーDアラニンの末端との特異的複合化、の決定因子
である。アリールおよび/またはアリールメチル部分は
、たいていの場合において、○−グリコシド結合により
結合した数個の糖単位を有する。しばしは、これらの糖
は所定のダルバヘプチドに典型的である[参照、F.パ
レンチ(Parenti)おJ:びB.カバレリ(Ca
valleri):rダルバヘプチドとしてパンコマイ
シンーリストセチン様グリコベプチドを命名する提案(
P r o p osalu   to   name
   t he   vancomycin−rist
ocetin  likeglycopeptides
  as  dalbaheptides)J.The
  Journalof  Antibiotics,
Vol.42.No.  12、 pp.  1882
−1883、 December   +9897  
ダルバヘプチドの共通の「作用機構」は、増殖するバク
テリアの細胞壁のUDP−N−アセチルムラニルペンタ
ペブチドへそれらが結合し、こうしてベブチドアグリノ
J冫の重合を障害することを包含する。他の細胞壁阻害
因子と同様に、ダルバヘプチド抗生物質は活性に増殖す
る病原体に対してのみ殺バクテリア性である。
また、このクラスには、選択的部分的ハイブリダイゼー
ションまたは他の化学的修飾の方法により得られる、前
述の物質の誘導体が包含される。
例えば、テイコプラニンアグリコンおよびンユードアグ
リコンは、A.マラバルバ(Malabarba)ら、
J.Ant ibiot ics,37、988(19
g4)、39、1430(]986)、および欧州特許
出願(EP−A)301,247号に記載されている。
テイコブラニン化合物のカルポキンエステル誘導体は、
A.マラバルバ(Malabarba)ら、J.Ant
 ib.40,10 1572 (1987)に記載されているが、カルボキ
ンアミド類は欧州特許出願(EP−A)218,099
号、WO8 8/0 6 6 0 0,欧州特許出願公
開第352.538号および欧州特許出願第89122
874.4号に記載されている。
上に定義した抗生物質のいずれをも、ならびにそれらの
誘導体はこの出願において「ダルバヘプチド抗生物質」
と呼ぶ。この定義は、もちろん、将来抗微生物性物質の
この膨張するクラスに添加されそして前述と同一の特徴
共有する物質を包含する。
本発明の目的は、適当なベクターにより感受性微生物宿
主中への形質転換のときグルバヘプチド抗生物質に対す
る抵抗性を与えることができるDNA配列である。
前述したように、本発明のDNA物質により与えられる
抵抗性は単一の物質に対して特異的ではないが、効率は
程度が異なることがあるが、ダルバヘプチド抗生物質に
向けられる。このような抵抗性の機構はこれまで証明さ
れてきていない場合11 でさえ、わずかの実験を下に表し、本発明の配列により
与えられる抵抗作用が形質転換された細胞においてそれ
自体発現する可能な方法を示す。
いずれの場合においても、本発明の開示は作用の機構ま
たはそれに対する理論に限定されることを意図しない。
便宜上、上に定義した本発明の本発明のDNA配列は、
「テイコーRを与える配列」と呼ぶ。
本発明の特定の目的は、「テイコーRを与える配列」を
提供することであり、その由来源はダルバヘグチド抗生
物質を産生ずる微生物である。
このようなテイコーRを与える配列の1例は、アクチノ
プラネス・テイコミセチクス(Actinoplane
s  te+chomyceticu s)ATCC3
 1 ].2 1のゲノムからのDNA制限断片として
得ることができる、約2614bpのB a m H 
I断片中に含有される。
この断片は、ダルバヘプチド抗生物質の所定の産生体(
すなわち、テイコプラニンを産生ずるアクチノプラネス
・テイコミセチクス(Actinoplanes   
LeichomyceticuS)ATCC31121
)(以後、A.teichomyceticus   
ATCC3]121)のゲノムから誘導されるが、また
、他のダルバヘプチド抗生物質に対する抵抗性を与える
ことができる。
本発明のDNA断片は、こうして、A.teichom
yceticus)ATCC31121のゲノムのB 
a m H lの処理により得ることができる2614
bpのDNA断片、この断片を含有するDNA配列、そ
の小断片(subfragment)または、培地の低
い厳格さにおいて上のBamHI断片と有意の程度に、
またはそれから誘導可能なブローブとハイブリダイゼー
ションするDNA配列であり、そして感受性微生物宿主
中への形質転換のときダルバヘプチド抗生物質に対ずる
抵抗性を与えることかできる。
したがって、本発明は、また、高い厳格さの条件下に、
前述の制限断片またはその小断片とハイブリダイゼーシ
ョンし、そして感受性微生物宿主中への形質転換のとき
タルバヘプチド抗生物質に対する抵抗性を与える能力を
維持する、DNA配列を包含する。
すべての上のDNA配列は、ティコ−Rを与える配列の
本発明の定義に包含され、したかってa)アクチノブラ
不ス・テイコミセチクス(AcLinoplanest
eichomycet icus)ATCC3] 12
1のゲノムのBamHIの処理により得ることができる
2 6 ]. 4 bpのDNA断片、その小断片(s
ubfragment)またはそれを含有するDNA配
列、これらは感受性微生物宿主中への形質転換のときダ
ルバヘプチド(dalbaheptide)抗生物質に
対する抵抗性を与えることができる、b)感受性微生物
宿主中への形質転換のときダルバヘプチド抗生物質に対
する抵抗性を与えることができ、そしてa)に前述のD
NA断片とハイブリダイゼーションする、核酸配列、 C)a)に述べた断片とハイブリダイゼーションし、そ
して感受性微生物宿主中への形質転換のI4 ときダルバヘプチド抗生物質に対する抵抗性を与えるこ
とかできる、DNAインサートの部分、および d)a)またはb)に定義したDNA配列に対する遺伝
コードのディジェ不レイション(degenerati
on)の結果、ディジェネレイト(degenerat
e)L、そして感受性微生物宿主中への形質転換のとき
ダルバヘプチド抗生物質に対する抵抗性を与えることが
できる、DNA配列、 を包含する。
テイコーRを与える配列は、感受性微生物宿主中への形
質転換のときダルバヘプチド抗生物質に対するテイコー
R仲介抵抗性を与えるベクターの構成において使用する
ことができる。
次の定義は、普通に理解され、そしてこの分野において
使用されるが、ここで便宜上報告する表現に関する. 「組み換えDNAクローニングベクター」または「ベク
ター」は自律的に複製または組み込む因15 子であり、次のものを包含するが、これらに限定されな
い,プラスミド、コスミド、7アージなど。
「制限断片」は、DNAを1または2以」二の制限酵素
で消化することによって得られる線状DNA配列である
「核酸配列」は、DNAまたはRNAの自然、合或また
は混合した由来の、任意の長さのポリヌクレオチド配列
である。こうして、この定義は特にcDNAを包含する
「感受性宿主細胞」または「感受性微生物宿主」は、そ
れが抵抗性を与える配列で形質転換されないかぎり、所
定の抗生物質の存在下に増殖することができない宿主細
胞である。
「形質転換体」は、形質転換を行った、受容体宿主細胞
であるが、「形質転換」は、遺伝子型を変化させそして
受容体細胞において変化を生ずる、受容体宿主細胞中へ
のDNAの導入である。
「宿主細胞」は、そのための形質転換ベクタが知られて
いるか、あるいはこの分野における知識に基づいて案出
することができる、既知の原核または真核の微生物のい
ずれであることもできる。
こうして、それは噛乳動物、鳥類、両生類、酵母菌、お
よびバクテリアおよび植物の由来の細胞を包含する。宿
主の好ましい群は、アクチノミセタレス(Actino
mycetales)の目およびス1・レプ]・ミセス
(StreptomyceS)、アクチノプライ・ス(
Actinoplanes)、アミコラトブシス(Am
ycolatopsis)、ノカルジア(nocarc
lia)、アクチノマズラ(Act inomadu+
゜a)またはキブデロスボルンギウム(Kibdelo
sporngium)の属に属するバクテリア菌株によ
り代表される。
微生物宿主の最も好ましい群の1つは、ダルバヘプチド
抗生物質を産生ずる微生物、例えば、上に報告したダル
バヘプチド抗生物質の産生体により代表される。
用語「ハイブリダイゼーション」を使用するとき、核酸
のハイブリダイゼーション、すなわち、2つの一本鎖の
ポリヌクレオチドが二本鎖の分子クローニングを、2つ
の鎖において相補的塩基の間の水素結合で、形成する方
法を意図する。ハイブリタイゼーンヨンはDNAおよび
R N Aの両者の相補的鎖の間で実施して、二重らせ
んのDNA、二重らせんのRNAまたは二重らせんのD
NARNAのハイブリッド分子を産生ずることができる
。この方法は、標識したDNAまたはRNAブローブと
のハイブリダイゼーションにより特異的DNA配列を同
定することができる。ハイブリダイゼーションの条件は
、時には、使用する緩衝化生理的塩類溶液、すなわち、
一般に塩化ナ1・リウム/クエン酸プ川・リウム溶液(
普通に、SSC)、の濃度に依存して、「低」、「高」
または「中コの厳格さと定性される。とくに、「中〜低
の厳格さ」はIXssc (すなわち、0.15モルの
塩化ナトリウムおよび0.Q15モルのクエン酸ナトリ
ウムの溶液)の範囲の濃度を呼ぶが、「高の厳格さ」は
約0.1〜0.5XSSCの範囲の濃度を呼び、約0.
2XSSC (すなわち、0.03モルの塩化ナ1・リ
ウムおよび0.003モルのクエ18 ン酸ナトリウム)は少なくともある場合において好まし
い。
本発明のテイコーRを与える配列を使用して、適当なテ
イコーR含有ベクターにより感受性微生物宿主中への形
質転換のときダルバヘプチド抗生物質に対する選択可能
な抵抗性を与えることができる。例えば、選択マーカー
、例えば、チオストレプトン抵抗性遺伝子を有するスト
レブトマイセスナリビダンス(Streptomyce
sividans)(例えば、菌株S.Iividan
!3,John  Innes  Collectio
n  No.3131中に含有されるもの)についての
プラスミドベクターを使用して、テイコRを与える配列
を適当な制限部位に挿入して、2つの抵抗マーカーをも
つプラスミドを得ることができる:チオストレブトン(
thioR)またはテイコプラニンまたは他のダルバヘ
プチド抗生物質(teicoR)。次いで、新規なプラ
スミドを、テイコブラニン抵抗性遺伝子内の少なくとも
1つの認識部位を有する制限酵素で消化して直I9 線化し、こうして複製の由来および変更しないチオスト
レプトンに対する抵抗性を残すことができる。これによ
り、ダルバヘプチド抗生物質に対するteicoR仲介
抵抗性を破壊する外来DNAの挿入が可能となり、こう
してキメラブラスミドで形質転換された有機体をダルバ
ヘプチド抗生物質、例えば、テイコブラニンに対ずる同
時の感受性および他のマーカー(例えば、チオス]・レ
プ1・ン)に対する抵抗性について選択可能とする。テ
イコーRを与える配列が前述のB a m H I制限
断片である場合、この場合において便利に使用できる内
部の制限部位はSstl制限部位である(参照、第1図
)。
本発明の他の実施態様に従い、テイコーRを与える配列
は、適当なベクターを経て、A.teichomyce
ticus菌株中に、または他のダルバヘプチド抗生物
質産生菌株、例えば、上に列挙した抗生物質の産生体中
に導入することができる。産生体菌株のこの形質転換は
、その抗微生物産生物に対する菌株の抵抗性を与えるか
、あるいはより可能なことには、その程度を増加するこ
とによって、抗生物質の産生収率を改良することができ
る。多くの場合において、事実、抗生物質を産生ずる殺
微生物のプロセスの効率は、高い濃度のそれ自体の産生
物に対する産生体菌株の感受性により制限される[参照
、K.カタギリ(Katagiri)、J.AnLib
iot+cs,7、45−52 (1954)]。これ
はと〈に抵抗の機構が抗生物質の酵素仲介不活性化を含
まないときである。なぜなら、それはテイコーR仲介抵
抗性ついてと思われるからである。
抗生物質産生微生物はそれら自身の産生物に対する抵抗
性の種々の機構を発生した:これらの機構の多くは研究
されかつ完全に特性決定されてきている[参照、例えは
、E.クンドリ・冫フエ(Cundliffe)、Br
it.Med.Bull.40、6167 (1984
)] 。しかしながら、ダルバヘプチド抗生物質につい
て、抵抗性の特定の機構は産生菌株においてこれまで記
載されてきていない。これらの抗生物質に対する臨床的
分離物の抵抗性は出現しつつあり [K.L.ロウフ(
Rouf f)、CI in.Microbo1.Ne
wslett.lly  I  4、1989]そして
いくつかの伝達可能な抵抗性はすでに記載されている[
C.D.  ンユレス(Schlaes)、Antim
icrob.AgenLsChemother.33、
l98−203、1989およびR.レクレルク(Le
clercq)ら、  Antimicrob.Age
nLs    Chemother.33、10−15
、1.989]が、それらの作用の機構はまだ明らかに
されきていない。これらの抗生物質のバクテリアの標的
は細胞壁であるので、排除機構のだめの抵抗性はある著
者らにより「理解することが困難である」と考えられた
[参照、R.レクレルク(Leclercq)ら、An
t imicrob.Agents  Chemoth
er.33、10−15、1989およびD.グリーン
ウッド(Greenwood)、J.AnLimicr
ob.Chemother.21、suppl.A.1
  13、22 1988]  。
本発明のテイコーRを与える配列、例えば、前述のBa
mHI制限断片またはその小断片の他の使用は、このよ
うなDNA配列をプローブとして、適当なハイブリダイ
ゼーション条件下に、を使用して、A.teichom
yceticus  ATCC31121以外のダルバ
ヘプチド抗生物質の産生体のゲノムから対応する領域を
取り出すことにJ:って表される。
これらのDNA配列は、いったん分離されると、感受性
微生物宿主を形質転換するために使用して、それにダル
バヘプチド抗生物質に対する抵抗性を与えることができ
る。それらの特徴にかんがみて、これらのDNA配列は
、当業者とって明らかなように、テイコーRを与える配
列の本発明の定義に包含される。例えば、上に定義した
、ダルバヘプチド抗生物質の産生体菌株の遺伝子バンク
を、それ自体既知の方法において調製し、そして本発明
のテイコーRを与える配列を任意の既知の方法、例えば
、ザザンプロット、ドットプロットまたは23 他の適当な手順に従って使用してスクリーニングするこ
とができる。プローブと中〜低の厳格さ(例えば、IX
SSC以上)においてノ)イブリダイゼーションするす
べてのクローンを、感受性宿主中でダルバヘプチド抗生
物質に対する抵抗性を与えるそれらの能力について分析
することができる。次いで、ダルバヘプチド抗生物質に
対する抵抗性を与える陽性のクローン中に存在するDN
Aインサートは、ティコ−Rを与える配列ついて前述の
ように、使用することができ、そして事実ティコ−Rを
与える配列の定義により包含される。
本発明の配列の他の適用はブローブとしてそれを使用し
て、中〜低の厳格さの条件下に臨床的分離物中の同様な
DNA配列の存在について検出することである。この試
験に対ずる陽性は、分離物中のこの種類の抵抗性の存在
を示すことができ、こうして試験した菌株が、このクラ
スの抗生物質に対するテイコーR型抵抗性を発生するこ
とができるか、あるいはすでに発生した可能性を示唆す
る。
本発明のテイコーRを与える配列は、A.Leicho
myce L icus  ATCC31 121のD
NA抽出物から、特定の制限酵素(例えば、BamHI
)で部分的消化し、ダルバヘプチド抗生物質に対する自
然に感受性の所定の宿主細胞について既知のベクターに
結合し、ダルバヘプチド抗生物質に対する抵抗性を獲得
した形質転換された細胞を選択し、そして獲得した抵抗
性の原因であるDNA配列を分離することによって調製
することができる。単一工程の方法は、それ自体既知の
技術により実施され、それらの技術は、当業者によりこ
の開示中に含有される情報に基づいて容易に反復するこ
とができるので、ここで詳細に述べる必要はないであろ
う。
本発明のテイコーRを与える配列を調製する他の方法は
、また本発明の開示にかんがみて、当業者とって明らか
であり、そして配列、例えば、上のA.teichom
yceticusのBamH r断片またはその小断片
、例えば、SstlKpnlの内部の断片を使用して、
それと中〜低の厳格さ(またはこれより高い厳格さ)に
おいてハイブリダイゼーンヨンしそしてテイコーRを与
える能力を有するDNA配列を取り出すことを包含する
。また、合成プローブは、普通の方法により、必要に応
じて、テイコーR配列またはその部分を配列決定した後
、調製することができる。
テイコーRを与える配列を調製する他の方法は、RNA
配列をcDNA中にコピーし、次いでこれを、通常形質
転換技術または同様な既知の技術に従い、使用してテイ
コーR仲介抵抗性を与える。
形質転換しない宿主と比較して、本発明のテイコーRを
与える配列で形質転換された宿主のい〈つかの抗生物質
に対する感受性を評価することによって、形質転換体は
他のダルバヘプチド抗生物質に対する交差抵抗性を示す
と同時に、他の抗生物質に対ずる同一レベルの感受性を
維持することを理解することができる。これらの実験は
、液体または固体の両者の増殖培地中で通常手順に従い
実施することができる。
さらに、普通の手順により、また、本発明のテ26 イコーR配列で形質転換された宿主は、ダルバヘプチド
抗生物質に暴露したとき、HPLC分析により明らかな
ように、検出可能な方法でそれを化学的に修飾しないこ
と評価することができる。
このような形質転換体へのダルバヘプチド抗生物質の結
合アッセイを実施することによって、通常結合条件下に
、全細胞による標的抗生物質の結合の減少を示すデータ
が得られる。
実施例 次の実施例によって、本発明をさらに説明する以下の節
において報告または言及した分子生物学の方法およびプ
ロトコルの多くは、それ自体知られており、そして当業
者のバックグラウンドの知識の一部分である。それらは
多数の参考文献およびマニュアル、例えば、次のものに
報告されている+D.A.ホプウッド(Hopwood
)ら、ステプトマイセスの遺伝子操作(Genetic
Manupulation  of  Strepto
myces):実験室のマニュアル(A  Labor
atory  Manual)、The27 John  Innes  foudation.ノウ
ィッチ(Norwich)、U.K.(1985);T
. マ=アチス(Man i a t i s)ら、モ
レキュラー・クローニング(Molecular  C
loning)、:実験室のマニュアル(A  Lab
oratory  Manual)、C.S.H.La
boratorys コールド・スプリング+ハーバー
(Cold  SpringHarbor)、ニューヨ
ーク(1982)および分子生物学における現在のプロ
トコル(Current  Protocols  i
n  Molecular  Biology)、Gr
eenePublishing  Associate
sand  Wiley−1nterscience1
ニューヨーク(1987)。退屈な、時間消費するおよ
び当業者にとおて表面的な、これ゛の既知の技術の長た
らしい報告を回避するために、既知のプロトコルおよび
方法の両者の所定の参考文献およびマニュアルをもっぱ
ら引用する。便宜上、前述のマニュアルを、それぞれ、
「ホブウソド」、「マニアチス」および「現在のプロト
コル」と呼ぶ。
実施例1・ティコ−Rを与えるDNA配列の分離 置1 アクチノプラネス・テイコミセチクス(Actinop
lanes  teichomyceticus)AT
CC31121の完全なゲノムDNAを、ホブウッド(
参照、pp79−80および152−153)および現
在のプロトコル(参照、の存在下に節I、ユニット3.
1およびことに3.1.1〜3.1.4)に記載されて
いる手順に従い、分離し、制限エンドヌクレアーゼB 
a m H 1で部分的に消化し、モしてスクロース勾
配の遠心により大きさに従い分画した。これらのプロ]
・フルに導入した唯一の変化は、分離工程において使用
したリソチーム溶液か2mg/mcの代わりに5mg/
rrlでありそしてリゾチーム処理して菌糸体のインキ
コベーション時間が30分の代わりに2時間であること
である。
1.2 次いで、分画した2.5〜l Q k. bの断片を}
3glII直線化、ホスファクーゼ処理したブラスミド
p13702c普通に入手可能であり、そしてS.Ii
vidansを含有した、J o h nInns  
Collection  3131;その制限地図はh
e,pp.292−293に報告されている)と結合し
た。この結合工程は本質的にボプウソド(pp.154
−157)に従い約l:5のベクター:インザーl・の
比で実施したplJ702の直線化およびホスファター
ゼ処理は通常の手順に従い実施した、参照、ホプウ・7
ドpp.158−159、164および284−285
, 1.3 次いで、得られた結合混合物を使用して、S.I iv
idans66原3 形質体を形質転換した(参照、例えば、ホブウ・ンドp
pl2−14、+10−1118よび230、それ以上
の技術的または方法の詳細について)。
30 チオステプ1・冫(25mg/な)で選択後、約110
00の形質転換体が得られ、これらは組み換えブラスミ
ドを含有した。S.lividans66は、John
  Inns  CollectiOnにおいて受け入
れ番号1326で受託されている。
1.4 これらの形質転換体の胞子懸濁液を、テイコプラニン抵
抗性について選択するために低い密度で配置した;1つ
のクローンを20mg/(2の抗生物質の存在下に増殖
する能力について選択した。
このクローン中に存在するプラスミドをpTRl68と
命名した。
実施例2:選択したプラスミドがテイコーRを与える配
列を含有することの確証 2.1 プラスミドpTR168を上で得られた細胞から抽出し
(ホブウッド、p.85−91)そしてS.Iivid
ans66原形質体の形質転換に使用した(実施例1 
3に記載する方法に従う)。
3l チオス]・レプトン抵抗性形質転換体の95%より多く
は、また、テイコプラニンに対して抵抗性であり、テイ
コブラニン抵抗性はpTR 1 6 8に結合されたこ
とが実証された。
2.2 プラスミドの制限地図は、その末端に2つのXho11
部位を含有する2614bpの長さのインサート(参照
、第1図)を明らかにし、それらの部位はBglIIお
よびBamHT粘着末端の接合により由来した、1つS
ma T部位、Sst■、Apar、Sma I,Pv
u I IおよびKpnlについて制限部位であり、そ
して明らかにBamHI、Bglll,Clal、Ec
oRI,EcoRV,Ps t I、Sph I,Xh
o Tについての制限部位ではなかった。
2.3 」二に報告した約1.5kbのテイコーRを与える配列
の内部のSstlおよびKpn I断片を分離し、放射
線標識し、そして既知の手順に従い種々の制限酵素(K
pn I−Ss t r;BamHI,Pstl;Pv
ull、およびBgllI)で消化したA.teich
omyceticus  A′rCC31l2lのゲノ
ムのDNAとのザザンブロソ1・ハイブリダイゼーンヨ
ンにおいて使用した(実施例1.1において報告したよ
うに)。ハイブリダイゼーンヨンは普通の方法において
、膜の製造業者の使用説明書にまた記載されているよう
に、実施する。ブローブの放射線標識はランダムオリゴ
ヌクレオチドープライムド合成(現在のプロトコル、3
.5.8、3.5.9)に従い行ったが、ゲノムのDN
Aは、すでに上に報告した手順に従う制限後、トリスー
アセテート緩衝液中で1%のアガロースで電気泳動で分
離し、そしてナイロン膜」二に移した。さらに詳しくは
、分離されたDNAを含有するゲルを0.4Nl7:1
NaOHO,6モルのNaC l中で30分間室温にお
いてインキユベーションしてDNAを変性し、次いで1
.5モルのNaCI−0.5モルのトリスーH Cp 
H 7 . 5とともlこ30分間インキユベーション
してそれを中和し、そしてIOXssc (1−5モル
のNaCI−0.15モルのクエン酸ナ1・リウム)中
で調製したナイロン膜(Gene  Screen  
Plus.NEN)j:に移した。移送はI oXsS
C中で一夜続け、次いで膜を空気乾燥し、紫外線処理し
、そして標識したブローブとのハイブリダイゼーンヨン
を既知の手順に従い65°Cにおいて実施し、ここで既
知の手順はこの膜をloml2の1%のドデンル硫酸ナ
トリウム、1モルのNaCl、]%のデンハル1・溶液
およびlO%のデキス1・ラン硫酸の溶液で、密閉可能
なプラスチックバッグ内で処理し、次いでこのバングを
密閉し、そして一定に撹拌しながら少なくとも15分間
65°Cにおいてインキコベーションすることよる予備
ハイブリダイゼーションを包含する。次いで、0 5〜
lmQの変性ザケ精子DNA(≧I 0 0 tt g
/mQ )および変性標識したブローブ(最終濃度≦l
Ong/m0.または1〜4Xl05dmp/mff)
の溶液を添加した。再密閉したバッグを一定に撹拌しな
がら約16時間65゜Cにおいてインキユベーションし
た。過剰のブ一34 ローブを0.2XSSCで65゜Cにおいて洗浄除去し
た。
得られた結果から、プローブは、2つのバンドが検出さ
れるPvu I r消化したDNAを除外して、常に消
化したDNA調製物の各々lこつき1つのみのDNA制
限断片とハイブリダイゼーションしすることが示される
。これらの結果は、プローブ内の1つの部位を有する使
用した制限酵素のうちでPvu I Iが唯一のもので
あることを考慮すると、pTR168中のインサートが
A.teichomyceticus  ATCC31
121中に独特部位として存在するという仮説と一致す
る。
実施例3:ティコグラニン抵抗性を与えるプラスミドp
TR 1 6 8のヌクレオチド配列全体のDNAセグ
メントをジデオキシ連鎖停止方法により、「現在のプロ
トコル」 (節7、I1〜6.5)に記載されている手
順に従い配列決定した。この目的で、標識DNAポリメ
ラーゼ配列決定キット(United  States
  B一35 iochemical   Corporation,
米国オハイオ州タレブランド)を使用した(TAQue
ncee;Tag  DNAボリメラーゼ配列決定シス
テム;TAQuenceを使用してステップ・パイ・ス
テソプのプロトコル、第1版、1 9 8 9)。
第2図において、矢印は、配列決定分析に7アジM13
mpl8およびMl 3mp I 9 (R.M.デイ
ル(Dale)、B.A. マククルーレ(McClu
re)およびJ.P.ホウチンス(Houchins)
、Plasmid  13、3m−41、1985)中
にクローニングしたDNA制限断片および配列決定した
DNA領域の向きおよび程度を示す。
多数の矢印は、プライマーとして適当なオリゴヌクレオ
チドを使用して配列決定したDNA断片を示す。配列の
分析は、他のアクチノミセテスが有する範囲と同一範囲
内ある75.4%のG −1− C含量を示す。配列は
SEQ  ID  No.Iと表示する「配列のリスト
」の下に報告する。
実施例4:形質転換した宿主および形質転換しない宿主
のいくつかの抗生物質に対する感受性4.1 plJ702またはテイコーRを与えるpTR168を
収容するS.]ividans66を、アンチバイオダ
ラム(an t i b i ogram)ディスクの
アッセイによりいくつかの抗生物質に対するそれらの感
受性について試験した。標準の5mmのアンチバイオダ
ラムディスク(BBL、米国マリイランド州コツケイス
ビレ)を標準する菌株の密な胞子懸濁液上に堆積し、そ
して阻害ゾンを28℃において2日のインキュベーショ
ン後に測定した。結果を下表■に報告する。
期待されるように、2つの菌株の間の唯一の差は、テイ
コーRを与えるpTR168を含有する細胞の増殖を阻
害しない、テイコプラニンを使用して見いだされた。
表■ 親のプラスミドplJ702または組み換えブラスミド
168を収容するS.lividansへの既知の抗生
物質の活性の比較 *一国際単位 38 4.2 両者の菌株は、また、寒天平板上でそれらのダルバヘプ
チド抗生物質に対する抵抗性について試験した。
パンコマイシン、テイコプラニンおよび抗生物質A40
926をこの試験において使用した。
S.lividansは、100mg/4のパンコマイ
シンを含有する平板上でさえ増殖したので、パンコマイ
シンに対して顕著に抵抗性であると思われる。pTR 
1 6 8を含有する細胞は、100%の平板培養の効
率で、100mg/ffのテイコプラニンまたは50m
g/4のA/4 0 9 26の存在下に増殖したが、
pIJ702を収容する菌株は3.2mg/4のいずれ
の抗生物質によっても阻害された。
これらのデータが示唆するように、pTRl68により
を与えられる抵抗性はダルバヘプチド抗生物質について
特異的であり、そしてテイコプラニンに限定されない。
実施例5:親または組み換え体のpTR 1 6 83
9 プラスミドを有するS.Iividansについてのテ
イコブラニン結合アッセイ 5.1 テイコプラニンの化学的修飾は、抵抗性(pTR168
)または感受性(pIJ702)のS,l ivida
ns培養物の上澄み液を、抗生物質との18時間までの
濃縮後、H P L C分析(参照、リバ(R i v
a)E.ら、クロマトグラフイア(Chromatog
raphia)、1987、24、295−301)に
より検出されなかった。
しかしながら、より少ないテイコブラニンが感受性細胞
の培養物から回収された。これはあたかもこれらの細胞
が抵抗性のものよりも抗生物質に結合したかのようであ
った。
5.2 plJ702を有するStreotimyceS  l
ividans(以後、S.Iividans  pl
J702と表示ずる)または組み換えプラスミドpTR
 1 6 8を有するS.Iividans (以後、
S.I ividansRpTRl68と表示する)を
、306Clこおいて後期の対数期に増殖させた。各培
養物の2つのアリコー1・を遠心した,上澄み液および
沈澱の再懸濁液を使用して、次の混合物を調製した: A)  S.lividans(plJ702)十それ
自身の上澄み液 B)  S.Iividans(plJ702)+s.
l ividansR(pTR168)からの上澄み液 C)S.l ividansR(pTR168)十それ
自身の上澄み液 E)S.l ividansR(pTR168)+s.
l ividans (plJ702)からの上澄み液
各混合物Iこ、10mg/(lの3H標識したテイコブ
ラニン(37kBq)を添加し、次いで30゜Cにおい
て撹拌しながらインキユベーションした。
合計の組み込まれた放射能を抗生物質の添加の時に決定
した。次いで、インキユベーションした培養物を遠心し
、そして上澄み液の放射能を決定し浄し、そして洗浄溶
液の放射能を細胞に結合したままであるものと一緒に決
定した。
下表2に示すように、感受性細胞は培地中に存在するテ
イコプラニンの約1/2と結合した。上澄み液源に無関
係に、非常にわずかの抗生物質は洗浄により除去された
。抵抗性細胞は、いずれの上澄み液中においても、有意
の量の抗生物質と結合しなかった。
表2 テイコプラニン結合アッセイ 値は合計の組み込まれた放射能の百分率として表わす:
各欄の合計は、サンプリングおよび計数における変動性
のために、正確に100%ではない42 5.3 他のテイコブラニン結合実験は、既知の受容体結合イム
ノアッセイに従い実施した(RASA;コルチ(Cor
ti)ら、1987、CIin.Chemi.39/9
、1615−1618)。
pIJ702、pTRI68を収容するS.}1vid
ansの培養物、または接種しないブロスを0.15〜
4.8mg/I2のテイコブラニンの存在下に30°C
において1時間インキユベーションした。遠心後、上澄
み液中に残留するテイコフラニンの量をRASAにより
決定した。便宜上、この方法の簡単な説明を下に報告す
る。(参照、また、欧州特許出願公開第221282号
)。
この方法は、アルブミンーエブシロンーアミノ力ブロイ
ルーD−アラニルーD−アラニンで被覆したマイクロタ
イタープレート上へのテイコプラニンの選択的吸着およ
び抗テイコブラニン抗体との反応に基づく。次いで、複
合体を、抗一抗テイコグラニン抗体とのインキュベーシ
ョンおよび07エニレンジアミンとの発色性顕色反応に
より/13 検出する。テイコプラニンをアッセイするために、試料
を20%の血清、20%のS/ビスブロスおよび40%
のRASA緩衝液(PBS−BTS :リン酸塩緩衝液
+0 .5 mQのツイーン20/12、3gのBSA
/Q,および20%の血清)中でl:5に希釈した。マ
イクロタイターブレー1・の各ウェルを、前以てアルブ
ミンーエプシロンーアミノノノブロイルーD−アラニル
ーD−アラニンで被覆し(コルチ(Corei)ら、上
を参照)、これらのウェルにO.lm(2の希釈した試
料を添加し、そして蓋をした湿った箱内で30゜Cにお
いて2時間インキユベーションした。次いで、プレート
を8回PBS−T (PBS,0.5m(lのツイーン
20を添加した)で洗浄し、次いでPBS−BT(上の
PBS−BTSにおけるようであるが、20%の血清を
含有しない)中でl:250に希釈したウサギ抗テイコ
プラニン抗血清の0.1を添加した。反応を室温におい
て1時間続けた。洗浄後、0.1ml2のウサギ■gG
に対するベルオキシダーゼ接合特異的ヤギ抗体(1:5
00に希釈した)を各中で分散させ、室温において1時
間放置した。洗浄後、015mQの発色性ベルオキシダ
ーゼ溶液(1.g/ffの0−フェニレンジアミンおJ
:び3 5ミリモル/cLの酸素ベルオキンダーゼ、0
.1モルのクエン酸ナl・リウム緩衝液pH5)を添加
した。30゜Cにおいて30分後、反応を0.05m(
lの硫酸の添加により停止した。492nmにおける吸
収をタイタイテク・ムルチスカン+ 7才1・メーター
(Flow  Laboratories)で決定した
。標準を同一方法でlO,40、およびl 6 0 n
 g/m(lのテイコブラニンを使用して調製した。合
計結合および比結合を、それぞれ、希釈緩衝液中のlO
mg/mffのテイコブラニン、および希釈緩衝液単独
で決定した。再び、感受性細胞は抵抗性細胞より効率的
に抗生物質と結合した。試験したすべての濃度について
、テイコブラニンの85%より多くはpTR168を収
容する細胞の上澄み液中に残ったが、pTJ702を収
容する細胞を使用したときわずかに25%が残留した。
,データが示すように、pTR l 6 8が誘発した
抵抗性は細胞へのテイコブラニンの結合の減少ど相関関
係をもつ。
配列のリスト SEQ   ID   No.  1 配列の型          ヌクレオチド配列の長さ
   :2614塩基対 鎖            :二本 1〜ボロジー   二線状 分子の型          ゲノムのDNA由来源の
有機体 :アクチノプラネス・テイコミセチクス(Ac
tinoplanes  teichomycetic
us)ATCC31121中間の実験源  :S.I 
ividansブラスミドpTR168 性質           :テイコプラニン抵抗性を
与える遺伝子を含有する。
46 47 GGA’l’CCGGTT GCCTCGCGTA CGGCGCCGGA TGATGGTCGG TCGCCGCCGT TGGTGGCCAG GGCGATGCAG GGGCGTACGG CGTCTCGGCA GGCCGAGGAC CGCGCAGTTC CGACACGGCC GACCACGCTG GGAGGGCAAG CTACCTGGCC CCACTTCATC TGTGCGGCGC CCTGCTCAAC GCGGCACGGC GGGCCGGATC CGCCGTGGCC CGCCACCTGT CκTCGTGCTG CGACGCGGTC CTGGGGCGAG CCCGGCCGAC CGGGTACGGG CACCGGCTGG CGTCCGGCCG GGCGAGGCCG GGGCTGTCCC GGGCTGGCCG CTGGCCCAGG AACCTCGTCG 入CGTTGAGCG GGCGCCGGTG AAGGCGGAGC TACGGCCACA GAGGCGGTGG ACGCCGGAGC ACCGGCAAGA TCGACCACGT CGCGCGGTGG ACCGACCTGG GGCGACCCCG GTGCGCGACT TCGAGCTCGG CCGAGCAGGT GGTGGACGCC GCAAG入CCCT GCACCGACGT CCGCGCTGTA TCGACGCGAG GCGCCTACTG CCGCCGAGCT ACCTGCGCGG TGGTCTCCGC CCCTGGGGCA CGATCGGCAC GGGTCGCCGA GCGGTCCGCG CATCGGCTCC ACCTGCTCGG CCAGCGCCCG CGCAACTGGT GGTGCCGGGC CGACCGCTCG GGCCCGCACC CGATCCCGGC GAGCGTGGTG GGTGGTCGCG CCACCGGGGC CGTCGGCGGC GCAGCCCCGG GCGCAGCGGC GCGCTCGCAC CGACGAGCGG CGCGCTGGAG GGTCTTCGCC GCACGCCGAG CGCCCGCTCG GACGAGGTGC CGTGACCCGC CGCGGCCGGC GGCCGCGGGC GGCGCGGGCA TACGACGTGC GGCGCCCGCC GTGCCGCACC GAGCGCTACT GTGGGCGGCG GTACCGGTGA AAGACCGGGG GCGGTGCTCT TACGGCGAG入 ACCGAGCAGA GAGAGCTCCG GTCGGCACCG GGACGCCTCG GTGGTCGCCC CTGCTCGCCG GAACGCAAAC CAGGAGGCCG GTCACCGCGA CCGGACGTGG TGACCACCAC TGATCGGCCC GGGCCGTCGT TGGTGCTGTC GCCGCCGGTT GATCGACCAC TCCACCTGCC CGAACCTGCC GCGACACCGA TCGCCCGCTG TCGCCGCCAG GCCGGCGGCメ GCTTCACGCT CCGGGCACCT ACTACGGCCT 60 120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 960 1020 1080 1工40 1200
【図面の簡単な説明】
第1図は、アクチノブラ不ス・テイコミセチクス (A
ctinoplanes     teichomyc
eticus)ATCC31121のゲノムのDNAの
2614bpのBamHI  DNA断片の制限地図で
ある。 それは、BglIIおよびBamHIの粘着末端の接合
により由来した、その末端に2つのxhor1部位を含
有するインサートを明らかにする。 関連する制限部位のみが地図の図面に報告されている。 内部のSstlおよびKpnl認識部位の間の黒色の線
は、サザンハイプリダイゼーションのだめのブローブ硫
酸アンモニウム使用した断片を示す(参照、実施例2)
。 第2図1よ、配列決定の厳格さを示す。 49

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、ヌクレオチド配列からなり、前記ヌクレオチド配列
    は、 a)アクチノプラネス・テイコミセチクス(Actin
    oplanes teichomyceticus)A
    TCC31121のゲノムのBamHIの処理により得
    ることができる2614bpのDNA断片、その小断片
    (subfragment)またはそれを含有するDN
    A配列、これらは感受性微生物宿主中への形質転換のと
    きダルバヘプチド(dalbaheptide)抗生物
    質に対する抵抗性を与えることができる、 b)感受性微生物宿主中への形質転換のときダルバヘプ
    チド抗生物質に対する抵抗性を与えることができ、そし
    てa)に前述のDNA断片とハイブリダイゼーションす
    る、核酸配列、 c)a)に述べた断片とハイブリダイゼーションし、そ
    して感受性微生物宿主中への形質転換のときダルバヘプ
    チド抗生物質に対する抵抗性を与えることができる、D
    NAインサートの部分、および d)a)またはb)に定義したDNA配列に対する遺伝
    コードのディジェネレイション(degenerati
    on)の結果、デイジエネレイト(degenerat
    e)し、そして感受性微生物宿主中への形質転換のとき
    ダルバヘプチド抗生物質に対する抵抗性を与えることが
    できる、DNA配列、 から選択されることを特徴とするテイコーRを与える配
    列。 2、感受性微生物宿主中への形質転換のときダルバヘプ
    チド抗生物質に対する抵抗性を与えることができる、ア
    クチノプラネス・テイコミセチクス(Actinopl
    anes teichomyceticus)ATCC
    31121のゲノムのBamHIの処理により得ること
    ができる2614bpのDNA断片、その小断片または
    それを含有するDNA配列であるテイコーRを与える配
    列。 3、感受性微生物宿主中への形質転換のときダルバヘプ
    チド抗生物質に対する抵抗性を与えることができ、そし
    てアクチノプラネス・テイコミセチクス(Actino
    planes teichomyceticus)AT
    CC31121のゲノムのBamHIの処理により得る
    ことができる2614bpのDNA断片、その小断片ま
    たはそれを含有するDNA配列とハイブリダイゼーショ
    ンする核酸配列であるテイコーRを与える配列。 4、感受性微生物宿主中への形質転換のときダルバヘプ
    チド抗生物質に対する抵抗性を与えることができ、アク
    チノプラネス・テイコミセチクス(Actinopla
    nes teichomyceticus)ATCC3
    1121のゲノムのBamHIの処理により得ることが
    できる2614bpのDNA断片、その小断片またはそ
    れを含有するDNA配列とハイブリダイゼーションする
    DNAインサートの部分であるテイコーRを与える配列
    。 5、その由来源がアクチノプラネス・テイコミセチクス
    (Actinoplanes teichomycet
    icus)ATCC31121以外のダルバヘプチド抗
    生物質を産生する微生物である、上記第1項の節a)、
    c)またはd)記載のテイコーRを与える配列。 6、次の式 ▲数式、化学式、表等があります▼ を有するテイコーRを与えるDNA分離物またはダルバ
    ヘプチド抗生物質に対する抵抗性を与えることができる
    その断片。 7、上記第1、2、3、4、5および6項記載のテイコ
    ーRを与える配列からなる、微生物宿主の形質転換に適
    した組み換えプラスミド。 8、上記第7項記載の組み換えプラスミドで形質転換さ
    れた微生物宿主細胞。 9、ダルバヘプチド抗生物質の産生体である、上記第8
    項記載の微生物細胞。 10、上記第8項記載の形質転換された宿主細胞を適当
    な培地中で増殖させ、それからテイコーRを与える配列
    を回収および分離することからなる、上記第1、2、3
    、4、5および6項記載のテイコーRを与える配列を調
    製する方法。 11、工程: a)ダルバヘプチド抗生物質の産生体である微生物のゲ
    ノムからDNAの分画を抽出し、それを特定の制限酵素
    で部分的に消化し、 b)前記制限断片を感受性宿主細胞のための直線化ベク
    ターに結合し、そして c)前記形質転換された細胞を獲得した抵抗性により選
    択し、そしてテイコーRを与える配列をそれらから分離
    する、 からなる、上記第1、2、3、4、5および6項記載の
    テイコーRを与える配列を調製する方法。 12、微生物はアクチノプラネス・テイコミセチクス(
    Actinoplanes teichomyceti
    cus)ATCC31121である、そして消化酵素は
    BamHIである、上記第11項記載の方法。 13、微生物細胞のゲノムから、対応する領域、または
    それらを含有するインサートを検出し、分離し、または
    精製するための、上記第1、2、3、4、5および6項
    記載のテイコーRを与える配列の使用。 14、微生物はダルバヘプチド抗生物質の産生体である
    、上記第13項記載の使用。 15、ダルバヘプチド抗生物質に対する微生物宿主の抵
    抗性を導入または増加するための、上記第1、2、3、
    4、5および6項記載のテイコーRを与える配列の使用
    。 16、微生物細胞はダルバヘプチド抗生物質の産生体で
    ある、上記第15項記載の使用。17、上記第1、2、
    3、4、5および6項記載の標識したテイコーR配列に
    より表されるプローブを、核酸分画とハイブリダイゼー
    ションさせ、そして必要に応じて前記プローブとハイブ
    リダイゼーションする核酸断片を分離することからなる
    、ダルバヘプチド抗生物質に対する抵抗性を与えること
    ができる核酸配列、またはそれを含有するインサートを
    分離し、同定し、または精製するための、上記第1、2
    、3、4、5および6項記載のテイコーRを与える配列
    の使用。
JP2129334A 1989-05-23 1990-05-21 テイコ抵抗性を与える配列 Pending JPH0319688A (ja)

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EP89109273 1989-05-23
EP89109273.6 1989-05-23

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US4935340A (en) * 1985-06-07 1990-06-19 Eli Lilly And Company Method of isolating antibiotic biosynthetic genes

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