JPH02465A - 新菌株 - Google Patents

新菌株

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JPH02465A
JPH02465A JP63265213A JP26521388A JPH02465A JP H02465 A JPH02465 A JP H02465A JP 63265213 A JP63265213 A JP 63265213A JP 26521388 A JP26521388 A JP 26521388A JP H02465 A JPH02465 A JP H02465A
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アレン・カー
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デービッド・アレン・ジョーンズ
Bruce G Clare
ブルース・ガーネット・クレア
Maarten H Ryder
マーテン・ハーム・ライダー
Stephen K Farrand
スティーブン・ケンドール・ファーランド
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 (産業上の利用分野) 本発明はアゲ「1バクテリウム・ラジオバクター(Δ 
robacterium  radiobak−±t2
− r )  K 84のミコ、−タント株および該株
を用いて植物の病気を抑制する方法に閏イる。
(従来の技術) アゲ「1ハクテリ・′ツム・ラジオバクターに8,1は
、土壌中に生息するパテリアであり、アグロバクテリウ
ム・ラジオバクターのツメファシェンス(Lumefa
ciens)種により引き起こされる植物病であるクラ
ウンゴール(crown  gall)の生物学的抑制
のために、商業的に使用される非病原性の土壌生息バク
テリアである。このツメファシェンスは、傷口を通って
植物体内に侵入し、無調節な細胞分裂を誘発し、大きな
こぶ(gall)の形成を引き起こす。
オーストラリアにおいては、アーモンド、桃およびバラ
がクラウンゴールにより最も甚大な被害を受ける作物で
ある。最近まで、クラウンゴールの満足すべき抑制は、
栽培植物の栽培材料を、アグロバクテリウム・ラジオバ
クターに84の細胞Qi液に浸漬することにより達成さ
れていた。アグロバクテリウム・ラジオバクターに84
の作用は、A、ツメファシェンスの抑制に関与する抗住
物竹であるアグロシン84の合成によることが分かって
きた。
アグロシン抑制システムは有効ではあったが、野外での
抑制の失敗例も生じている。感受性株によるプラスミド
pAgK84 (これはアグロシン84抗生物質の合成
の遺伝子およびこれに対する免疫性をコードする遺伝子
を含んでいる)の獲得が最近報告されている。このこと
は、充分に1lli発住能を持ったアグロシン84−耐
性株の出現を引き起こしうる。このことはまた、pAg
K84を明らかにプラスミドの移動および伝達により、
他のアゲロバクチリアに感染させうるという他の報告と
も一致する。上記抑制の失敗例は、クラウンゴールの生
物学的抑制を継続的に成功させるためには、重大な脅威
である。
(発明が解決しようとする問題点) 従って、本発明の目的は、前記従来技術に関連する問題
点を克服し、または少なくとも軽減することである。
(問題点を解決する手段) 本発明で用いる材料の入手先と若干の用語の定義は次の
とおりである。
アグロバクテリウム・ラジオバクターに84株は、NC
PPB (英国、ハンチング・グリーン(Hatchi
n  Green)、ハーペンデン(Ilarpend
en)  L5 2BD)に2407の寄託番号で寄託
されており、また、PDDCCにュージーランド、DS
IR、プライベート・バッグ(Private  Ba
g)、オークランド(Auckland))に3379
の寄託番号で寄託されている。この株は、また次の市販
経路からも入手可能である:オーストラリア、私書13
61. ウォイ・ウォイ、ニュー・サウス・ウェールズ
(Way  Way、New  5outh  Wai
es)、3356のRooL  Nodule  Pt
y、Lim1Ledおよび米国、カリホルニア、オリン
ダ(Orinda)のAgB i o  Ch em 
(EPA9録番号No、38087−2)。
プラスミドpAgK84は、上記アグロバクテリウム・
ラジオバクターに84株中に存在している。
アグロバクテリウム C58NT1株は アグロバクテ
リウム C58株からワトソン(WaLson)ら、J
、Bacteriol、、123゜255−26.+ 
(+9853の方法に従って得られる。アグロバクテリ
ウム C18株は、オランダ国、デ・ミトフ 3−58
4  シーエッチ ュトレヒト (Da  Mitho
f  3−584  CHUTRECHT)のファバー
ゲン・コレクション(Phabagen  Co11e
cti。
n)の分子細胞生物学部(DeparLmenLof 
 Mo1ecular  Ce1l  Bi。
roBy)から入手可能である6約、C58NT1株は
、米国ワシントン 98195. シアトル。
ユニバーシティ・オブ・ワシントンのDeparLme
nL  of  Microbiologyand  
[mmunology等の多くの研究室から分譲を受け
ることもできる。
プラスミドρBR325は、米国、コネチカット 06
510.ニューヘブン、私凹笛3333゜333セダー
ストリート(Cedar  5LrccL)、エール(
Yale)ユニバーシティの大腸閉141伝子ストック
センター(E、coli  Genetic 5toc
k Cer+ter)ヒト遺伝子部(DeparLme
nL  a(Human  GeneLies)等の多
くの実験室から入手できる。
本明細書において、「コインテグレート」の用語は二種
またはそれ以上のプラスミドの共有結合(物)を意味す
る。「トランスコンシュガント」の用語は、二つの細菌
株の交配(クロス)の結果プラスミドを受は取った細菌
をいう、[ミニ調製物」の用語は、小規82培養即ち通
常10m!また6よそれ以下の培養から抽出したDNA
に対応する。
本発明の第一の観点じおいては、抗生物質アグロシン8
4の合成をコードするが、伝達領域の限定的欠損により
伝達が阻止されるように修飾された遺伝子を含むプラス
ミドが提供される。
本発明のプラスミドは、プラスミドpAgK84の誘導
体でありうる0本発明のプラスミドはEc o Rlフ
ラグメントのDlおよび[1が、PAgk131から実
質的に完全に除去されていることを特徴とし得る。プラ
スミドp A B K 84の制限酵素地図は第1図に
示す。
従って、本発明の好ましい態様においては、PΔgK8
4ΔE c o RI  D i 十Hとして本明細書
に記載されているプラスミドpAgK]026およびそ
の誘導体が提供される。
本発明の他の態様によれば、抗生物質アグロシン84の
合成をコードし、伝達(トランスファー)領域の欠損に
より伝達が阻止されるように修飾された遺伝子を含むプ
ラスミドを持つアグロバクテリウム・・ラジオバクター
に84の非病原性株、その誘導体およびミュータントが
提供される。
上記の株は、植物病のクラウンゴールを生物学的に抑制
するために適当な蚊補であることが、理解されるであろ
う。そのような株は、伝達領域の実質的部分が削除され
ていることを除けば、アグロバクテリウム・ラジオバク
ターに8.1株の全ての1.?徴を保持している。その
ため、アグロシン84に感受性の病原性菌株がプラスミ
ドの移動むよび伝j?によると思われるプラスミドp 
A 、、 K 84の伝播による免疫を獲得する危険性
が減少または消失する。
好ましい態様では、アグロバクテリウム・ラジオバクタ
ーK 8 、Iの非病原性株は、プラスミドpAgK8
4の誘導体であるプラスミドを含む。
従って、好ましい態様では、アグロバクテリウム・ラジ
オバクターに84の非病原性株に1026、その誘導体
およびミュータントが提供され、そのサンプルはオース
トラリア国、サウスオーストラリア、アゾレードのアゾ
レード大学、植物病理学部(Plant  PaLho
logy  DeparLmenL)のカルチャーコレ
クションに保存され−Cいる。
本発明の別の態様では、抗生物質アグロシン84の合成
をコードするが、伝W’pM域を失うことにより伝達が
阻11二されるように修飾された遺伝子を含むプラスミ
ドの製造方法が提供され、該方法はニ プラスミドPΔgK 84およびii!i当なプラスミ
ドクローニングベクターを用意し: 該プラスミドクローニングベクターにブラスミ1” p
 A [K 84のBam1llフラグメントのB 1
を挿入し;そして 挿入フラグメントを制限酵素EcoRIと接触させて、
EcoRIフラグメントのDlおよびHを削除する; ことよりなる。
適するプラスミドクローニングベクターは、プラスミド
pBR325である。このプラスミドの13 a m 
HIフラグメントBlからE c o Rlフラグメン
ト)Iおよび+1が削除されたとき形成されるプラスミ
ドは、プラスミドpMHR100と命名され、そのサン
プルはアゾレード大学、植物病理学部(PIanL  
Pathology  Dapartment)のカル
チャーコレクシジンに保存されている。プラスミドpM
HR100は、削ド↑のそれぞれ側にプラスミドpAg
K84の約3.7kbおよび0.5kbが残っているこ
とを特徴とする。従って、本発明の好ましい態様も二お
いては、ブラスミ)”pMllRlooおよびイの誘導
体が提供される。
後の挿入に適当なサイズのフラグメントを与えるため、
削除の一方の側のP A g K 8 /Iの0.5k
b部分は、pAgK84のBamHIフラグメントCの
クローンからのEcoR1フラグメントD2を付加して
、約3.3kbに増大させてもよい。
従って、本発明のさらに別の態様においては、本発明の
方法はさらに、pAgK84のBamHIのフラグメン
トCを含むプラスミドを用意し、そして削除の一方の側
に残っているpAgK84の約0.5kb残存部分にE
coR1フラグメントD2を付加し、該残存部分を約3
.3kbに増大させることも含む。
適当なりローンはプラスミドpDAJ101と命名され
て、オーストラリア国、サウスオーストラリア、アゾレ
ードのアゾレード大学、植物病理学部(PIanL  
Pathology  DeparLmenL)のカル
チャーコレクションに保存されているものである。混合
クローンはpDAJI02と命名され、そのサンプルは
アゾレード大学、植物病理学部(Plant  PaL
hology  Department)のカルチャー
コレクションに保存されている。従って、本発明のさら
に別の態様においては、プラスミドpDAJ102が提
供される。
本発明の態様によれば、プラスミドを製造する方法は更
に、 抗生物質耐性マーカーを伝達領域の近くに挿入されて有
するプラスミドpAgK84を宿している第一のアグロ
バクテリウム株; プラスミドpAgK84を欠損した第二のアグロバクテ
リウム・ラジオバクターに84株:および 伝達領域の限定的削除により伝達が阻止されるように修
飾された、pAgK8〆1の伝達領域を含ムフラスミド
クローニングベクターpBR325を宿している、大腸
菌(Escherichiacoli)株を用意し; 抗生物質アグロシン日ぺの合成をコードし、EcoR]
フラグメントのDlおよびHの削除によって抗生物質耐
性マーカー株へと修飾された遺伝子を含むプラスミドク
ローニングベクターを、移動および伝達させ;そして プラスミドpAgK84を持っていないアグロバクテリ
ウム・ラジオバクターに84株へ結合して、コインテグ
レートを伝達することを含む。
この観点によれば、本発明の方法はさらに上記トランス
コンシュガントを、削除−マーカー交換に付することも
含む。
第一アグロバクテリウム・ラジオバクターの株は、伝達
(Tra)eff域のすぐ外側にTn5挿入片を含んで
よい、この挿入片は抗生物質マーカーとしてJ!I能す
るカナマイシン耐性を付与する。アグロバクテリウムの
C58NT1株を使用することができる。
得られたTra−プラスミドはこのように形成された株
の中で安定であり、そして正常なアグロシン84の生産
を示すと理解されるであろう。
こうして形成されたプラスミドはρA3KI026と命
名され、p A g K 8 t1ΔEcoRI  D
1+Hである。上記抗生物質耐性を宿すアグロバクテリ
ウム・ラジオバクターに84の株はKIO26と命名さ
れ、そのサンプルは、アゾレードのアゾレード大学、植
物病理学部(P l a n L  PaLholog
y  Department)のカルチャーコレクショ
ンに保存されている。
上記のとおり、伝達を阻止するように修飾されたアグロ
バクテリウム・ラジオバクターに84株は、植物のクラ
ウンゴール病の抑制のため使用できる。従って、本発明
のさらに別の観点によれば、植物のクラウンゴール病を
抑制する方法が提供され、該方法は: 処理が求められる植物材料;および アグロシン84の合成をコードし、伝達領域の欠111
により伝達が阻止されるように修飾された遺伝子を含む
プラスミドを含む、非病原性のアグロバクテリウム・ラ
ジオバクターに84株を用意し; 前記植物材料を、アグロバクテリウム・ラジオバクター
K 84の該非病原性株と直接または間接的に接触させ
る、 ことよりなる。
処理を求められる植物u$14には、種子、市、成長中
の作物が含まれる0作物は任意の種類のものであってよ
く、核果類、サクラ(Prunus)種、ゲーンベリー
(cane  berry)類、ニシキギ(euony
mus)属、タレマチス(c l ema t i s
)属および柿属であってよい。
アーモンド、ベカン、ウォルナフト、ポイセンベリー(
boysenberry)およびラズベリ、核果類(桃
、チェリー、プラムおよびアプリコツトを含む)、およ
びバラの木が特に好ましい。
植物祠t+は、アグロバクテリウム・ラジオバクターに
8.1の株の細胞g<液に漬けることにより、S4株と
接触させてよい。
アグロバクテリウム・ラジオバクターに84の株は、1
1;1記のK102G株であってよい。
以下に本発明を実施例および図面にもとすいて、より詳
細に説明する。しかしながら、以下の記載は説明のため
のものであり、本発明の一般的範囲の限定のためのもの
と解釈すべきではない。
第1図は、伝達領域(Tra  region)、アグ
ロシン生産領域およびアグロシン免疫領域を示す、pA
gK84のBamHIおよびE c o R1制限酵素
地図である。
第2図は、Tra領域とA−バーラップする削除を含む
中間体プラスミドPDAJ102の造成工程図である。
BおよびEは挿入片のB a m H1およびE c 
o RIエンドをそれぞれ示す、EはCm辺伝子内のE
coR1部位を示すためにも用いられている。
第3図は、pAgK1026の造成の説明図である。説
明の便宜のため、欠を員−マーカカー交換へと導く相同
(ホモロガス)な組み換え現象は、先ずIEcoRIフ
ラグメントD2で生じて共組み込み体(コインテグレー
ト)を形成し、次いでその後E c o 111フラグ
メントBまたはl?に生じてそれが解離するように示さ
れているが、しかし、逆の順序でこれらが生じてもよい
第71し1は、p A g K I O26の造成に関
与した各プラスミドのEcoR1消化物を示す、これら
のフラグメントは、0.7%アガロースゲル上の電気泳
動により、1OOV、3時間で分離された。
泳動レーンの1と8とはHind[[Iで消化しまたラ
ムダファージのDNAを含んでおり;レーン2はK 8
.1株からのpAgK8/1;レーン3はA28株から
のpAgK84 : :Tn5A28 ;レーンノ1は
K1023株からのρD、AJI02;レーン5はK1
024株からのpAgK84 : :Tn5A28 :
 : pDAJ 102 ;レーン6はK1025株か
らのPAKK84 : :Tn5A28 : : PD
、AJ]02;レーン7はK1026株からのpへgK
1026を含む、レーン2,6.7は、p、A t K
 811 bからの制限フラグメントのハックグラウン
ドも含む。バンド/l−CはpAgK84のlミc o
 RIフラグメントA−Cを;バンドDは、レーン2で
はpΔgKB/lのE c o RlフラグメンI−A
 −cを含むがレーン3−7ではり 2のみを含む;ハ
ンドLi −KはPΔgK84のF、coRIフラグメ
ントFミーKを;バンドLは、E c o R1部位を
持たない1゛05を含むpA);に84のECo RI
フうグメントD1を;バンドMは、13 a mH1部
位によってpへgK84のBamHlフラグメントB1
内に含まれるEcoRIフラグメントBの一部に結合し
たp B R325のEcoRIBamlllの大フラ
グメントを含むrミc o R1フラグメントを含む。
第5図は、アグロバクテリウムのに8,1株、K434
株およびに1026株の中に含まれるプラスミドの説明
図である。未消化プラスミドを0゜7%アガロースゲル
上で100V、3時間の電気泳動により分離した。レー
ンlおよび5は未消化うJ、ダファージDNAを含む:
レーン2はに8/1株からの1ラスミド;レーン3ばK
 434 株カラのプラスミド;レーン4はに1026
株からのプラスミドである。バンドAは未知プラスミド
;バンドBはl1lALK84b (ツバリン異化プラ
スミド);ハンドCはpA[K84.バンドDはpAじ
K1026である。
第6図は、アグロバクテリウムに84株およびに102
6株によるアグロシン84の生産のバイオアッセイの説
明図である。アグロシンの生産は、ストニエルズ培地(
Stonier  s  medium)のに198オ
ーバーレイの増殖を抑制するゾーンとして示されている
第7図は、pAgK84およびその遺伝子工学的削除誘
導体であるpAgK1026の伝達能力を説明する図で
ある。pAgK1026を含むに1027株およびpA
gK84を含むに102B株をに518株と接合(ma
te)させ、この接合混合物の10倍段階希釈列のlO
μl小滴を、トランスコンシュガントの選択のための培
地にスポットした。
底 pAgK84のBamH1ライブラリーを作成するため
、pAgK84のBamHl消化フラグメントを、Ba
mHlで切断しておいたpBR325に連結(ライゲー
ト)シ、大腸1iHBIoIを形質転換した。形質転換
体を回収するため、LB″X天上で110 pg /s
lアンピシリン(八ρ)および25μg/■1のクロラ
ムフェニコール(Cm)への耐性で選択し、そしてLB
寒天上で10μg/lテトラサイクリン(Tc)への感
受性で選U”s ’−tた;何故なら、pBR325の
BamH1部位へのクローニングは、テトラサイクリン
耐性遺伝子を不活性化するからである。p A g K
 84のT r a pi域がオーバーラツプする二つ
のクローン、 pBR325:  :BamHI   
 Bl  (K840株中)およびpBR325: :
BamHI  C(K1008株中)(第2図参照)が
、プラスミドのミニ調製物をBamjll、EcoRI
およびSmalでの単独および同時消化することにより
同定された。
削除の発生をおこさせるため、pBI’?325::B
amHI  BI  DNAの/Iagを1単位(7)
EcoRlで1時間部分消化し、アガロースゲル電気泳
動で消化度をチエツクした後、1.5μgを再度連結(
religate)L、その中から0.15μgを大腸
菌HBIOIへの形質転換に用いた。形質転換体は、L
B寒天上で25ag/ m IのCmに対する抵抗で選
択し、クロラムフェニコール耐性遺伝子の中のpBR3
25のEc。
R1部位を含む削除物が復帰していないことを確認した
。形質転換体は、EcoRlで消化したプラスミドミニ
調製物のアガロースゲル電気泳動で、EcoR1フラグ
メントの消失をスクリーニングした。一つの削除誘導体
であるpHMRIoo(K I OO7株中)(第2図
参照)は、隣接したEcoR1フラグメントのDlおよ
びH(全部で5.9kb)を欠fitしていたが、Ec
oRIフラグメントのFおよびBamHrフラグメント
Blの中に含まれるEcoRIフラグメントBの一部(
全部で3.7kb)を欠損の一方の側に保持しており、
BamHIフラグメントB1内のEc。
R1フラグメントD2の一部(0,5kb)を他の側に
保持していた:このことは、BamHl、EcoRlお
よびSma Iによるプラスミドミニ調製物の単独もし
くは同時消化物をアガロース電気泳動で分析して確認し
た。EcoR1フラグメントD2の065kb部分は、
相同組換え(ホモロガス・リコンビネーション)による
削除−マーカー交換を行うには不充分であることが確認
され、そのため後記するように、pBR325: :B
amHI  CからのEcoR1フラグメントD2の残
部を付加して、3.3kbに増加させた。
pBR325::Bamjll  CをBamHIおよ
びEcoRIで切断して5つのフラグメントを生じさせ
、これらを7ガロースゲル電気泳動で分離した。pBR
325の大部分、即ちテトラサイクリン耐性遺伝子のB
amH[部位からクロラムフェニコール耐性遺伝子中の
ECQR1部位まで、を含む1.4kbフラグメント、
およびBam111フラグメントC中に含まれるIEc
oR1フラグメントD2の一部である2、8kbフラグ
メントを回収した。この4.4kbフラグメントをホス
ファターゼで処理し、2.8kbフラグメントへ連結(
I image) し、大腸12i1113101へ形
質転換した。形質転換体をL B寒天Fで、40μg/
mlのAPに対する耐性で選択し、得られたプラスミド
pDAJloI  (K1022株中)(第2図参照)
の同定は、BamHIおよびEccRIでプラスミドミ
ニ調製物をCP、独もしくは同時消化してアガロースゲ
ル電気泳動を行って確認した。
次いで、pMHRlooをBamHIで切断して2つの
フラグメントを生じさせ、これらをアガロースゲル電気
泳動で分離した。削除物を担う4゜2kbBamHlフ
ラグメントBlを回収し、Ba m HIで切断しホス
ファターゼで処理しておいたpDAJloIに連結し、
HBIOI内に形質転換した。形質転換体をL B寒天
−にで40μ8/1のApに対する耐性で選択し、Ba
mH+フラグメン) B l挿入片の向きを、EcoR
lで消化したプラスミドのミニ調製物のアガロースゲル
電気泳動でチエツクした。これにより、pl)AJ+0
2 (K1023株中)(第2図参照)が得られ、これ
はr尤c o RIフラグメントI) 2が再構成され
たため、削除物の両側に相同組換えによる削除マーカー
交換を可能にするに充分なりNAを有していた。
ρDAJ102は、大腸菌から接合により、三親接合で
pAgK84 : :Tn5A28を担うアゲ[+バク
テリウムA28株に伝達させた。相同組み換えで形成さ
れたコインテグレートpAgK84::Tn5A28:
:pDAJ102(第3図参114j)を担うトランス
コンシュガントであるに1024株は、大腸菌のドナー
株およびヘルパー株が成゛aできないYAM−ヒで、1
00μg/−1カルベニシリン(carbenicil
lin:  Cb)および50μg/麟lカナマイシン
(Km)への耐性で選Iノ<シて回収し、そして[7,
c o R1で消化したプラスミドミニ調製物のアガロ
ースゲル電気泳動で、共組み込み物の存在をチエツクし
た。
A28T05挿入片は、削除でカバーされる領域の中に
存在したが、Tra領域のちょうど外側であり(第3図
参WO1従ってコインテグレートはT r a ’であ
った。
このコインテグレートを二親性接合用株KI025の中
のアグロバクテリウムに434株に接合で伝達し、コイ
ンテグレートを含むトランスコンシュガントを、次亜種
(biova「)2レシピエンドは成育できるが次亜種
lドナーは成育出来ない0.2%酒石酸ナトリウム含有
ベルガーソンズ(Bergerson’  s)培地で
、200μg/mlKmに対する耐性で選択して回収し
、コインテグレートの存在を未消化およびEcoRI消
化したプラスミドのミニ調製物のアガロースゲル電気泳
動でチエツクした。K1025株は、液体YEBで非選
択的に3回サブカルチャーして増殖さゼ、YEB寒天に
約150〜200コロニ/プレートのコロニー密度でブ
レーティングし、次いでYEB寒天および200μg 
/ miのKmを含むY rE !3寒天にレプリカ・
ブレーティングした。
削除−マーカー交換を起こすための相同組み換え(第3
図参照)でコインテグレートが解がされた、K1026
株(K I 025から天然に生じたカナマイシン感受
性誘導体)は、約700010ニのレプリカから1つ得
られた。K1026株中のpAgK84  EcoRI
  Dl+Hである、pA[KI026の同定は、Ec
oRIで消化したプラスミドニミ調製物のアガロースゲ
ル電気泳動で確認した。
K1026株中の、p A g K 1026と命名し
た1:記ミュータント株は、EcoRI消化(第4図)
および未消化(第5図)のプラスミドニミ調製物で確認
した。後者からは、K1026株かに84株のプラスミ
ド補鎖(plasmid  c。
mplement)を維持していることも、確認された
K1026株からベクターおよびTn5配列が完全に消
失していることは、該ベクターに70われているcb耐
性および′「n5に担われているKm及びストレプトマ
イシン(Sm)耐性が消失していることから、准潤され
る。
K8A株およびK1026株は、生産するアグロシンの
尾を手足Vするために、これら2株の細胞を同数用いて
、アグロシン8 、Iの生産を試験した、K1026株
はアグロシン84を生産しく第6図参照)、pAgK1
026が祖先であるpAgK84のアグロシン84生合
成能を保持していることを示唆した。更にまた、K84
株およびに1026株の阻止サイズは同程度であり(第
6図参照)、両者が同程度の量のアグロシン84を生産
していることを示唆した。この結果は、PAgJ102
6がpAgK84のものと同じコピー数を維持している
ことを間接的に証明するものである;何故なら、シム(
Shim)ら(19B7)はコピー数の増加したp A
 [K 84ミユータントは、アグロシン84の生産量
が相応して増大することを見出しているからである。
プラスミドの安定性および伝達能力を調べるため、pA
gK84およびpAgKI026の両者をpBR325
のCm1fi伝子およびcbz伝子で次のように標識し
た。pBR325: :BamHI Cを、三親性接合
でに100B株からKIO26およびに84の両株に伝
達し、pBR325::BamHI  Cと夫々p A
 g K l 026およびpA[K84との共組み込
み体(コインテグレート)を、相同組み換えで形成した
。pAgK1021;::pBR325::BamHI
  Cを含むトランスコンシュガントK1027株、お
よびPΔgKB4::pBR325::BamHICを
含むトランスコンシュガントに102B株は、ドナー大
腸菌およびヘルパー大腸菌が成育できないYMA上で、
l OOpg /slのCmおよび500 pg /m
lのcbに対する耐性で選択して回収し、そしてEco
RI消化物を用いて夫々のコインテグレートの存在をチ
エツクした(データは示されていない)。
プラスミドの安定性をアッセイするため、K1027株
およびに102B株を、前記のようにして非選択的に1
0回サブカルチャーし、約40コロニー/プレートのコ
ロニー密度でYEB寒天上にブレーティングした。得ら
れたコロニーは、YE B寒天および100 μg/m
lのCmおよび5゜(1#g/+mlのcbを含むYE
B寒天に複写(rep l i ca)ブレーティング
した。に1027株については、ブレーティングした1
412レプリカの中からCmおよび/またはcbに感受
性の28コロニーが回収され、10回のサブカルチャー
で1.98%のマーカー損失を示した。同様に、K10
28株については、ブレーティングした1834レプリ
カの中からCmおよび/またはcbに感受性の35コロ
ニーが回収され、10回のサブカルチャーで1.91%
のマーカー川失を示し、K1027株の結果と有意な相
違はなかった(p=0.87)、抗生物質感受性の単離
コロニーをアグロシン84の生産に関してアッセイし、
全てがこの抗生物質を生産することが判明し、各コロニ
ーともにアグロシンプラスミドを失っていないことが示
された。これらのコロニーは、アグロバタテリウム内で
独立に複製できないpBR325::Bam14 Cの
1B失を同時に伴うコインテグレートの解Nfによって
、そのマーカーを失ったものであろう、従って、10回
のサブカルチャー後にもpAgK1026またはpA 
、、 K 84のI11失は無く、このことからpAg
K+02(iは、先祖のρへgKB4の安定性を保持し
ていると示唆される。
プラスミドの伝達能をアッセイするため、K1027株
およびK1028株を、後記[材料および方法]の項に
示すように、0.2%ツバリン(nopa I 1ne
)を含むベティ7ト(Petit’s)寒天上での二親
性液滴接合によりに518にクロスさせた。ドナーとレ
シピエンドの両株は、ツバリン異化プラスミドのpAg
K84bを有するため、使用した接合培地で共に成育出
来る。ドナーの数は、50 pg /mlのCmを含む
NA上で決定し、レシピエンドの数は50μB/mlの
りフ7ンビシン(R4f)を含むNA上で、そしてトラ
ンスコンシュガントの数は、50μ8/−1のRi f
、 50μg /mlのCmおよびtooμR/slの
cbを含むNA上で決定した。KI027がドナーであ
るときは、クロス体からトランスコンシュガントは全<
W察されなかった(第7図参照)、この試験では、伝達
頻度(トランスミッション・フリークエンシー)として
ドナー当たり<3. 84 x I O−’、そしてレ
シピエンド当たり<1.96xlO−’が得られた。に
102Bがドナーであるとき番よ、多くのトランスコン
シュガントが観察され(第7図参照)、伝達頻度(1−
ランスミッション・フリークエンシー)としてドナー当
たり3.34XlO−’、そしてレシピエンド当たり3
.96XlO−’が得られた。明らかに、pAgK10
26はpAgK84のTra−ミュータントである。
アグロシン84に感受性のアグロバクテリウム・ツメフ
ァシェンス 次亜種−2のに2T株で誘発されるクラウ
ンゴールをlfl? illするため、アグロバクテリ
ウム・ラジオバクター・次亜種−2のに84株およびK
1026株を用いて、アーモンドの苗の根を処理した。
鉢試験の前に、K27培養物は、?−/カートニー瓶(
MaeCartneyboLLIe)90本の中のl0
m1イースト・マニトール寒天(YMA)斜面に新たに
サブカルチャーし、K84およびに1026の培養物は
、200m1薬用平容器内の40+IYMA斜而に新た
にサブカルチャーした。全ての培養物は25°Cで31
1間成ftさセた。
7−’E71”i領製 次に、新鮮なアーモンドの挿(カルチバー・チャレスト
ン(Cultivar  Challeston))を
、UC鉢用ミックスを入れた直径2Cjcmの鉢に一抹
一粒ずつ蒔き、湿潤状態に保持した。L′Iiは3〜4
週間後に出現した。鉢試験に先立ち、一つのバッチの苗
は2月間、そしてもう一つのバッチのi5はlO月間成
育させた。鉢試験の2日前に、移植後の蒸散による水分
損失から来るストレスを軽減するため、mの葉を相当に
刈り取った。
土」良−の−調型 90抹の直径25ca+のポット内で、厚さ2cmの検
反チップの層のトに無滅菌砂上を鉢当たり10KfXR
,tiAした。この土壌に、処理したアーモンドのWを
植えかえる2日前に、K27の3日培養物90本各々を
塩素を含まない水500+++1に懸濁させ、一つのポ
ット当たり培養−本づつを土壌に性別した0次いでこの
懸濁物を土壌の10cmの深さまで混ぜ込み、水でしみ
こませた。に27の懸濁物は、光学的測定で約2XIO
’細胞をml当たり含むと推定され、土壌に均一に分散
したと仮定すると、最終濃度はIgあたり約106細胞
である。に27の実際の土壌中の分布は試験しなかった
アー二%乙下−面−gりき理 に8/iおよびKI026の3日培養物を、塩素を含ま
ない水5Pに懸濁させた。この懸濁物は、光学密度によ
る測定で、I m l ”Aたり約10’の細胞を含ん
でいた。アーモンド苗をポットから抜き、土壌を根から
穏やかに振り落とし、主根および側根を約20cmwの
長さにトリムした。この植物を組頭より少し上まで、水
、K8,1またはKIO26の懸濁液のいずれかに、約
10秒間浸漬した。
その後植物を一本一抹ずつ、予めに27で感染さゼで水
を注いだ土壌に植えかえた。根−に〇に8.1またはK
1026の分布は調べなかった。
この植物を屋久で7月間1し、1987年6月(初冬)
から1988年1月(真夏)まで、6週間置きに適当な
肥料を施した。次に、植物をポットから取り出し、根か
ら土壌を軽く振り払い、根を静水に繰り返し浸漬して洗
浄した。根のこぶ(ゴール)の数を各植物ごとに記録し
た。
i9人−荻久少イーヱ盈−上 鉢試験は6本づつの植物を15列に配置して15連で行
った。各列は3種類の処理即ち、水、K84およびKI
026を6本の4jY@/jに無作為に割り当て、その
際、各2本の苗の4令が2月および]5月となるように
した。各列の間には隙間をおかず、また各列内のポット
の間にも隙間をあけないようにした。バクテリアのポッ
トとポットの間の感染を防止する手段は特に設けなかっ
たが、それが問題となることは無いように見えた。
統4V分11 データには偏りが存在し、パラメーター変換後も非正規
分布を示し、変動係数のようなパラメーターへ変換して
分析するのは不適当であったため、データはパラメータ
ーにf模することなく、クルスカル〜ウナリス(Kru
ska l −Wa I I iS)テストで分析した
。クルスカルーウォリステストは、2月および10月の
苗に関し別々に行い、三種の処理間の比較およびに84
処理とKI026処理の間の比較を行った。
K84処理およびKI026処理した10月の苗各5本
から、接頭から10cm以内の根5gを切り取った。各
根サンプルを滅菌した2回蒸留水にいれて、激しく振と
うし、4°Cに3時間保持したのち、再度激しく振とう
した。緩衝塩溶液でl/10およびl/100に希釈し
、アグロバクテリウム・次亜種2を単離するため、各希
釈物の10μmの液滴をニュー・アンド・カー培地(N
ewan  Kerr  medium)プレート上に
置いた。これらのフ゛レートは25°Cで4日インキエ
ヘートした。
水で処理した5木の10月4の各々からのt〜2 gの
「健全なJこふ5個をもぎとり、1,5%次亜塩素酸ナ
トリウムに2分間浸漬し、そして滅菌2回ノに留水で濯
いだ0次いで、この表面未感染こぶを、1ostの2回
蒸留水に入れてつぶした。。
この混合物を11℃で3時間放置し、激しく振とうし、
そして上清を2ル一プ分採取してニュー・アンド・カー
培地に、直線状に塗り、このプレートを前記同様にイン
キュベートした。同様にして、K84またはKJO26
で処理した0、75.−の「健全なJこぶ8個をそれぞ
れ採取した。
回収された全ての単離物は、ニュー・アンド・カー培地
に直線状に塗り、得られた単一コロニから単離された純
粋培養物は、後続の試験に使用するためYMA斜面に維
持した。
アグロシン811のバイオアッセイは、カーおよびティ
(Kerr  and  IILay)により改良され
たストニュル(Stonier)(7)77法で行った
1回収されたアグロバクテリウムは、K198をインデ
イケータ−として使用し、回収された細菌をプロデュー
サーとして使用するアグロシンのバイオアッセイ系で、
アグロシンの生産能を試験した。このに19Bは、K2
7と同じアグロシン感受性T1−プラスミドを宿してい
る、A。
ツメファシェンスの次亜種!株である。アグロシンを生
産しなかった株は、次に該株をインデイケータ−とし、
KI026をプロデューサーとして用いるアグロシンの
バイオアッセイ系で、アグロシンの感受性について試験
した。
回収されたアグロバクテリウムは、6週令のトマトm(
カルチバー・ルーダ・ド・マーマント:cultiva
r  Rougc  de Marmande)に、多
数の穿刺接種して狂瘍形成能を試験した。接種物はYA
M斜面上の3[]培養物からJffiした。、2ル一プ
分のバクテリアを採取し、滅l?7医留水1簿1に3濁
させた。火炎で滅菌した針をこの懸濁液に浸液し、この
針でトマトの茎を各細菌株につき5回突き!すした。
IQI [れたアゲロバクチ1ウムのプラスミドA埜 回収されたアグロバクテリウムからのプラスミドのミニ
調製は、ファランド(Farrand)らの記載した方
法で行い、プラスミドの含有型はマニアチス(Mani
aLis)らの記載したアガロースゲル電気泳動で調べ
た。
↑l+L果 鎌試騒 に84またはK1026で処理した苗の根には、こぶは
稀にしか若しくは全く存在しなかったが、水で処理した
ものでは頻繁にこぶが存在した(第1表参!L’! )
。この相違は統計的確認が不要である稈に明白であった
。しかしながら、クルスカルウォリステストを用いて、
3種の処理を比較すると、イ1゛意差が確認された(2
月1°ηおよび10月^°1のそれぞれに関し、H(タ
イ(ties)にコ14整)=29.00および3,1
.02であり、両1■ともにp<0.001)、に84
処理およびに1026処理の結果の類似性もまた、統計
的確認を不要とする程に明白であった。然し、これら2
種の処理間の比較をするため、再びタルスカルーウォリ
ステストを用い、類似性を確認した(2月苗および10
0月苗それぞれに関し、H(タイ((ies)に調整)
=0.41および0.35であり、両画ともにQ、5<
p<0.7)。
したアゲロバクー ラム に84またはKI026で処理した植物の根から回収さ
れたアグロバクテリウムは、アグロシン産生性−非j!
11瓜性アグロバクテリウムおよびアグロシン感受性−
腫瘍性アグロバクテリウムのみであった(第2表参照)
、非腫瘍性株の全ておよび腫1a性株の一部サンプル(
各処理から5株)について、プラスミド含有量を分析し
た。に84およびKI026は、各々3つのプラスミド
(大型潜在プラスミドPAtK84a、それより小型の
ツバリン異化プラスミドpAtK81b、および更に小
型のアグロシン84プラスミドの夫々pAgK84およ
びpAgK1026)を含んでいたが、こねに対してに
27は2つのプラスミド(ρA(K84aより若干大型
の潜在プラスミドpALK27、およびρA L K 
84 aとp A L K 84bの中間のサイズのT
1プラスミドp T i K 27 )を含んでいた。
このプラスミド分析結果は、非腫瘍性株はもしに84処
理植物から得られるときはに84に相当し、もしKI0
26処理植物から得られるときはに1026に相当する
こと、および腫i5性株はに27に相当すること(デー
タは示していない)を意味する。に84またはK102
6のに27に対する数の比率は植物体によって大きな変
動があったが、全体としてに27の数が多いことは明ら
かであった(第2表参照)。
同様に、KH2またはに1026で処理した植物の根に
出現した少数のこぶからは、K8,1またはKI026
、およびに27のみしか回収されなかった(第2表参照
)、に8,1またはに1026とに27との数の比率に
は、2様式の偏りが認められ、8つのこぶの5つは殆ど
全てに8,1またはKI026のみであり、8つのうf
)2つは殆ど全てに27を含んでいた。これとは対照的
に、水で処理した植物の根のこぶからはに27のみしか
回収されなかった。
鉢試験の結果から明らかなとおり、K1026はクラウ
ンゴールの抑ル1のためにに8Aと同程度に有効であっ
た0回収データから、KH2と比較してKI026は根
においてコロニーを形成して生存する同等の能力、およ
びこぶにコロニーを形成して刺激性アグロバクテリウム
と置き変わる能力を持つことも明らかである。従って、
K1026はその先祖であるに8,1の生態学的能力を
留めていると思われる。
KH2またはKI026で処理した植物のユニのこぶ中
のに84またはKl 026とに27との集団比率に、
明白な二様式の偏りが存在したことは、興味深い、に8
4およびKl 026の両者ともに、K27−誘発こぶ
で合成されるオパインであるツバリン(opines 
 nopalinC)およびアグロシンピン(aHro
cinopine)を利用している。従って、オパイン
説(opine  concept)と一致して、KH
2またはに1026が過剰に存在するこぶは、これらの
こぶではに8,1またはKI026がコロニー化し、同
時にに27(アグロシンビンの存在下では、アグロシン
84に対してより感受性になる)に置換したことを反映
しているものであろう。
K27が過剰に存在したこぶは、おそらくコロニー化の
機会を消失した場合を反映しているものであろう。
さらにに84またはに1026のいずれも、KH2また
はK1026で処理した植物の、K27による共コロニ
ー化を阻止しないことも興味深く、実際、KH2または
に1026に対して過剰のに27が存在した。さらにま
た、K27の過剰にもかかわらず、非常に僅かなこぶの
みが誘発された。
根でのコロニー化および増殖の抑制なしの腫瘍形成の抑
制という、この明白なyシ現象は驚くべきことである。
第1表 アーモンド苗を水、アグロバクテリウム・ラジオバクタ
ーに8.1株の=C液またはアグロバクテリウム・ラジ
オバクターに1026の懸濁液で処理した場合の、A、
ツメファシェンスに27株により誘発されるクラウンゴ
ールに対する効果。
第2表 に84またはKI026で処理された10月アモンド、
l、′i′の根から、および水、K84またはに102
6で処理された10月アーモンド【■の根のこぶから回
収され、そしてアグロシンの産生および感受性に関して
調べられたアグロバクテリウムの敗 2月 水  12 に84 14 に102612 10J1  水   15 に84 15 KI02615 9.33 0.21 0.33 46.33 0.20 0.67 7.5 3−23 こぶ 根のこぶ 根のこぶ 最後に、本発明の範囲を外れることなく、種々の修正お
よび/また番よ変更法が可能であることは、理解されよ
う。
【図面の簡単な説明】
第1図は、伝達領域(Tra  region)、アグ
ロシン生産領域およびアグロシン免疫;f[J!iを示
す、p A g K 84のBamH[およびE c 
o R1制限酵素地図である。 第2図は、Tra領域とオーバーラツプする削除を含む
中間体プラスミドPDAJ102の造成工程図である。 第3図は、pAgK1026の造成の工程図である。 第4図は、pAgK1026の造成に関与したプラスミ
ドのEcoRI消化物の電気泳動図である。 第5図は、アグロバクテリウムのに84株、K434株
およびK1026株の中に含まれるプラスミドを説明す
る電気泳動図である。 第6図は、アグロバクテリウム、K84株およびに10
26株によるアグロシン84の生産のパイオア7セイの
説明図である。 第7図は、PへgK84およびその遺伝子工学的削除誘
導体であるpAgK+026の伝達能力の比較図である
。 図面の浄ご(′内容に変更なし) 17パロシ〉ブj1 で) 手 続 補 正 書(犬べ) 昭和63年特。′1願第26521’3号2、を明の6
称 新菌株 3゜ 捕Wをする石 1+件との関係  特許出ぬ11人 住所

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、抗生物質アグロシン(agrocin)84の合成
    をコードし、伝達領域の限定的欠損により伝達が阻止さ
    れるように修飾された遺伝子を含むプラスミド。 2、プラスミドが、プラスミドpAgK84からEco
    R1フラグメントのD1およびHが実質的に完全に除去
    された誘導体である、請求項1記載のプラスミド。 3、プラスミドpAgK1026またはその誘導体であ
    る、請求項2記載のプラスミド。4、伝達領域の欠損に
    より伝達が阻止されるように修飾された、アグロシン8
    4の合成コード遺伝子を含むプラスミドを持つ、アグロ
    バクテリウム・ラジオバクター(¥Agrobacte
    rium¥¥radiobacter¥)K84の非病
    原性株。 5、プラスミドが、プラスミドpAgK84からEco
    R1フラグメントのD1およびHを実質的に除去した誘
    導体である、請求項4記載の非病原性株、その誘導体な
    らびに突然変異体。 6、アグロバクテリウム・ラジオバクター(¥Agro
    bacterium¥¥radiobacter¥)K
    84の非病原性株であるK1026株、その誘導体なら
    びに突然変異体。 7、プラスミドpAgK84および適当なプラスミドク
    ローニングベクターを用意し;プラスミドpAgK84
    のBamH I フラグメントのB1を該プラスミドクロ
    ーニングベクターに挿入し;そして 挿入したフラグメントを制限酵素EcoR1と接触させ
    てEcoR1フラグメントのD1およびHを削除するこ
    とよりなる; 抗生物質アグロシン(agrocin)84の合成をコ
    ードし、伝達領域の欠損により伝達が阻止されるように
    修飾された遺伝子を含むプラスミドの製造方法。 8、プラスミドクローニングベクターが、プラスミドp
    BR325である、請求項7記載の方法。 9、EcoR1フラグメントのD1およびHがBamH
    I フラグメントのB1から除去されたとき生じるプラ
    スミドがプラスミドpMHR100であり、該プラスミ
    ドpMHR100においてプラスミドpAgK84の約
    3.7kbおよび0.5kb部分が削除の夫々の側に残
    されている、請求項8記載の方法。 10、pAgK84のBamH I フラグメントCを含
    むプラスミドを用意し、そして削除の一方の側に残って
    いるpAgK84の約0.5kbの残存部分にEcoR
    1フラグメントD2を加えて、該残存部分を約3.3k
    bに増加させる、請求項9記載の方法。 11、形成された組合わせプラスミドクローンがpDA
    J102である、請求項10記載の方法。 12、さらに、 伝達領域の近くに挿入された抗生物質耐性マーカーを含
    むプラスミドpAgK84を宿す第一のアグロバクテリ
    ウム株、 プラスミドpAgK84を欠損している第二のアグロバ
    クテリウム・ラジオバクター株、および伝達領域の限定
    的削除により伝達が阻止されるように修飾されたpAg
    K84の伝達領域を含むプラスミドクローニングベクタ
    ーpBR325を宿している大腸菌(Escheric
    hiacoli)株、 を用意し; 該限定的欠損を有するプラスミドクローニングベクター
    を抗生物質耐性マーカー株に移動および伝達させ; このコインテグレートを接合によってプラスミドpAg
    K84を欠くアグロバクテリウム・ラジオバクターK8
    4株に伝達し;そして このトランスコンジュカントを削除マーカー交換に付す
    る; ことから成る、請求項7記載のプラスミドの製造方法。 13、第一のアグロバクテリウム・ラジオバクターの株
    が、伝達(Tra)領域のすぐ外側にTn5挿入片を有
    し、該挿入片は該株にカナマイシン耐性を与えるもので
    ある、請求項12記載の方法。 14、クラウンゴール病の抑制処理を受けるべき植物材
    料、および 伝達領域の削除によって伝達が阻止されるように修飾さ
    れたアグロシン84の合成コード遺伝子を含むプラスミ
    ドを持つ、アグロバクテリウム・ラジオバクターK84
    の非病原性株またはその誘導体もしくはミュータントを
    用意し;そして、上記植物材料を上記非病原性のアグロ
    バクテリウム・ラジオバクターK84株と、直接的また
    は間接的に接触させる; ことよりなる、植物のクラウンゴール病の抑制方法。 15、プラスミドが、プラスミドpAgK84からEc
    oR1フラグメントのDlおよびHが実質的に除去され
    た誘導体またはその誘導体もしくはミュータントである
    、請求項14記載の方法。 16、植物材料が、種子、苗および成長中の作物である
    、請求項16記載の方法。 17、作物が、核果の木、サクラの種、ケインベリー(
    caneberry)類、ニシキギ属(euonymu
    s)、クレマチス属(clematis)および柿属(
    Persimon)から選択される、請求項16記載の
    方法。 18、植物材料を、アグロバクテリウム・ラジオバクタ
    ーK84の株の細胞懸濁液に浸漬して該株と接触させる
    、請求項15記載の方法。 19、アグロバクテリウム・ラジオバクターK84の株
    がK1026株である、請求項18記載の方法。
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