JP7841771B2 - 高腫大循環癌関連マクロファージ様細胞(caml)を有する対象における多臓器転移性疾患及び全生存期間及び無増悪生存期間を予測する方法 - Google Patents
高腫大循環癌関連マクロファージ様細胞(caml)を有する対象における多臓器転移性疾患及び全生存期間及び無増悪生存期間を予測する方法Info
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Description
(a)約14~64μmの大きな非定型倍数体核(atypical polyploid nucleus)又は単一細胞内の複数の核
(b)約20~300μmの細胞サイズ
(c)紡錘形、オタマジャクシ形、円形、長円形、2本脚、2本脚以上、細い脚、及び無定形からなる群から選択される形態学的形状
(d)CD14陽性表現型
(e)CD45発現
(f)EpCAM発現
(g)ビメンチン発現
(h)PD-L1発現
(i)単球性CD11Cマーカー発現
(j)内皮CD146マーカー発現
(k)内皮CD202bマーカー発現
(l)内皮CD31マーカー発現
本明細書で定義される詳細な構成及び要素等の事項は、本発明の包括的な理解を補助するために提示しているに過ぎない。したがって、本発明の範囲及び思想から逸脱することなく、本明細書に記載された実施形態を様々に変更及び修正できることは、当業者にとって明らかである。
本明細書で定義するように、癌腫に関連するCTCは、多くのサイトケラチン(cytokeratin:CK)を発現する。CK8、CK18、及びCK19は、CTCによって最も一般的に発現され、診断において使用されるサイトケラチンであるが、調査は、これらのマーカーのみに限定する必要はない。固形腫瘍CTCの表面は、通常、上皮細胞接着分子(epithelial cell adhesion molecule:EpCAM)を発現する。しかしながら、この発現は、一様ではなく、一貫しているわけでもない。CTCは、CD45を発現しないが、これは、CD45が白血球マーカーであるためである。CTCやCAML等の腫瘍関連細胞を同定するアッセイでは、CK8、CK18、及びCK19等の固形腫瘍に関連するマーカーに対する抗体、あるいは、CD45やDAPIに対する抗体を用いれば十分である。染色技術を形態学と組み合わせることによって、病理学的に定義可能なCTC(pathologically-definable CTC:PDCTC)、アポトーシスCTC、CAMLを同定できる[3]。
・DAPIで染色された「癌様」核。核は、通常大きく、ドットパターンを有する。ただし、細胞分裂中は、例外である。核が凝縮していることもある。
・CK8、CK18、及びCK19の1つ又は複数の発現。上皮癌からのCTCは、通常、少なくともCK8、CK18、CK19を発現する。サイトケラチンは、糸状パターンを有する。
・CD45の発現の欠如。
・劣化した核。
・CK8、CK18、CK19の1つ又は複数の発現。全てのサイトケラチンのパターンが糸状ではなく、一部又は全体が斑点状に断片化されている。
・CD45発現の欠如。
本明細書で定義するように、本発明の方法で使用される循環細胞は「CAML」と称することができる。「循環細胞」への各言及は、CAMLと同義であり、「CAML」への各言及は、循環細胞と同義である。CAMLと呼ぶ場合も「循環細胞」と称する場合も、これらの細胞は、以下の特徴の1つ又は複数を有する。
・CAMLは、大きな非定型倍数体核又は複数の個別核を有し、多くの場合、細胞内に散在しているが、拡大した融合核小体(enlarged fused nucleoli)が共通している。CAMLの核のサイズは、一般的に直径約10μm~約70μm、より一般的には、直径約14μm~約64μmである。
・多くの癌において、CAMLはその疾患の癌マーカーを発現する。例えば、上皮性癌に関連するCAMLは、CK8、CK18又はCK19、ビメンチン等を発現する。マーカーは、通常、拡散しているか、液胞及び/又は摂取物質と関連している。どのマーカーの染色パターンも細胞全体に略均一に拡散している。肉腫、神経芽細胞腫、黒色腫の場合、CK8、CK18、CK19の代わりに、癌に関連する他のマーカーを使用できる。
・CAMLは、CD45陽性又はCD45陰性でありえ、本発明は、両方のタイプのCAMLの使用を包含する。
・CAMLは、大きく、長径が約20μmから約300μmである。
・CAMLは、紡錘形、オタマジャクシ形、円形、長円形、2本脚、2本脚以上、細い脚、または無定形等、多数の異なる形態学的形状で見出される。
・癌腫由来のCAMLは、通常、拡散したサイトケラチンを有する。
・CAMLがEpCAMを発現している場合、EpCAMは、通常、細胞全体に拡散しているか、液胞及び/又は摂取物質と関連しており、細胞全体に亘って略均一であるが、腫瘍によっては、EpCAMの発現が非常に低いか全くないため、全てのCAMLがEpCAMを発現するわけではない。
・CAMLがマーカーを発現している場合、そのマーカーは、通常、細胞全体に拡散しているか、液胞及び/又は摂取物質と関連しており、細胞全体に略均一であるが、全てのCAMLが同じマーカーを同じ強度で発現するわけではない。
・CAMLは、しばしば腫瘍由来のマーカーと関連するマーカーを発現し、例えば、腫瘍が前立腺癌由来でPSMAを発現する場合、そのような患者からのCAMLもPSMAを発現する。別の例として、原発腫瘍が膵臓由来でPDX-1を発現する場合、そのような患者からのCAMLもPDX-1を発現する。更なる例として、癌由来の原発腫瘍又はCTCがCXCR-4を発現している場合、そのような患者からのCAMLもCXCR-4を発現する。
・癌由来の原発腫瘍又はCTCが薬物標的のバイオマーカーを発現している場合、そのような患者からのCAMLも薬物標的のバイオマーカーを発現する。このような免疫療法のバイオマーカーの例は、PD-L1である。
・CAMLは、単球マーカー(例えば、CD11c、CD14)や内皮マーカー(例えば、CD146、CD202b、CD31)を発現する。
・CAMLは、Fc断片を結合する能力を有する。
発明の概要において示唆したように、本発明は、対象における多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患の発症を予測又は診断する方法に係る。当該方法は、癌に罹患している対象等の対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが約100μm以上である場合、対象は、多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患を発症すると予測する。
また、本発明は、CAML細胞サイズに基づいて、癌に罹患している対象の全生存期間(OS)及び/又は無増悪生存期間(PFS)を予測する方法に係る。この方法は、癌に罹患している対象等の対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが約100μm以上である場合、当該対象は、同じ癌又は類似の癌に罹患しているが対応するサンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが約100μm以上でない対象よりも、OSが短く及び/又はPFSが短いと予測する。このように、より大きなサイズのCAMLを有する対象のOS及び/又はPFSは、より小さなサイズのCAMLを有する対象のOS及び/又はPFSよりも少ない又は短いと予測する。いくつかの局面において、癌は、多臓器転移又は多巣転移性疾患である。
(a)約14~64μmの大きな非定型倍数体核又は単一細胞内の複数の核
(b)約20~300μmの細胞サイズ
(c)紡錘形、オタマジャクシ形、円形、長円形、2本脚、2本脚以上、細い脚、及び無定形からなる群から選択される形態学的形状
(d)CD14陽性表現型
(e)CD45発現
(f)EpCAM発現
(g)ビメンチン発現
(h)PD-L1発現
(i)単球性CD11Cマーカー発現
(j)内皮CD146マーカー発現
(k)内皮CD202bマーカー発現
(l)内皮CD31マーカー発現
実験#1
方法. 転移性(m)の、m乳癌(n=58)、m肺癌(n=34)、m前立腺癌(n=39)、m腎癌(n=20)の患者151人をプロスペクティブに集めた。末梢血は、転移性癌に対する新たな治療を開始する前に採取した。7.5mLの血液から標準的なCellSieve技術に従ってCAMLを単離した後、ZenBlueを用いて画像化/測定した。多臓器転移は、2つ以上の遠隔臓器への転移又は脳への転移と定義した。単因子分散解析(analysis of variance:ANOVA)を用いて、多臓器転移患者と単臓器転移患者におけるheCAMLの存在を比較した。単変量解析及び多変量解析を行い、heCAMLに対するPFS及びOS、並びに既知の全ての臨床パラメータを評価した。
方法. ステージI(n=19)、ステージII(n=31)、ステージIII(n=65)、ステージIV(n=160)を含む乳癌(n=58)、肺癌(n=47)、前立腺癌(n=47)、膵癌(n=29)、食道癌(n=28)、腎癌(n=20)、大腸癌(n=15)、肝臓癌(n=9)、肉腫(n=22)の患者275人をプロスペクティブに集めた。末梢血は、新規治療開始前に採取した。7.5mLの血液から標準的なCellSieve(登録商標)技術に従って細胞を単離した後、ZenBlueを用いて画像化及び測定した。多臓器転移は、2つ以上の遠隔臓器への転移又は脳への転移と定義した。単因子ANOVAを行って、多臓器転移患者と単臓器転移患者におけるheCAMLの存在を比較した。単変量解析及び多変量解析を行い、heCAMLに対するPFS及びOS、並びに既知の全ての臨床パラメータを評価した。
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2. International Patent Application Publication No. WO 2013/181532, dated December 5, 2013.
3. Adams, D. L., et al., Cytometric characterization of Circulating Tumor Cells captured by microfiltration and their correlation to the CellSearchR CTC test. Cytometry Part A 2015; 87A:137-144.
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8. Zhu P, et al., Detection of Tumor-Associated Cells in Cryopreserved Peripheral Blood Mononuclear Cell Samples for Retrospective Analysis, J of Translational Medicine, 2016, 14:198. DOI: 10.1186/s12967-016-0953-2.
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10. Steeg, P. et al. Tumor Metastasis: Mechanistic Insights and Clinical Challenges. Nature Medicine. 12 (2006).
11. Valastyan, S. et al. Tumor Metastasis: Molecular Insights and Evolving Paradigms. Cell 147 (2011).
<付記事項>
[付記事項1]
対象における多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患を診断する方法であって、前記方法は、癌に罹患している対象等の対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、前記サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが約100μm以上である場合、前記対象は、多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患を有すると診断する、前記方法。
[付記事項2]
対象における多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患の発症を予測する方法であって、前記方法は、癌に罹患している対象等の対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、前記サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが約100μm以上である場合、前記対象は、多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患を発症すると予測する、前記方法。
[付記事項3]
癌に罹患している対象の全生存期間(OS)及び/又は無増悪生存期間(PFS)を予測する方法であって、前記方法は、癌に罹患している対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、前記サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが約100μm以上である場合、前記対象は、同じ癌又は類似の癌に罹患しているが対応するサンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが約100μm以上であるということを充足しない対象よりも、OSが短く及び/又はPFSが短いと予測する、前記方法。
[付記事項4]
癌に罹患している対象のOS及び/又はPFSを予測する方法であって、前記方法は、癌に罹患している対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、前記サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが約100μm以上である場合、前記対象のOS及び/又はPFSは、癌に罹患しているがサイズが約100μm以上のCAMLがない対象よりも、少ない又は短いと予測する、前記方法。
[付記事項5]
前記OS及び/又はPFSは、少なくとも12箇月である、付記事項3又は付記事項4に記載の方法。
[付記事項6]
前記OS及び/又はPFSは、少なくとも24箇月である、付記事項3又は付記事項4に記載の方法。
[付記事項7]
前記生体サンプルのサイズが5~15mLである、付記事項1から付記事項4のいずれか一項に記載の方法。
[付記事項8]
前記CAMLは、
(a)約14~64μmの大きな非定型倍数体核又は単一細胞内の複数の核
(b)約20~300μmの細胞サイズ
(c)紡錘形、オタマジャクシ形、円形、長円形、2本脚、2本脚以上、細い脚、及び無定形からなる群から選択される形態学的形状
の特徴を有する、付記事項1から付記事項4のいずれか一項に記載の方法。
[付記事項9]
前記CAMLは、
(d)CD14陽性表現型
(e)CD45発現
(f)EpCAM発現
(g)ビメンチン発現
(h)PD-L1発現
(i)単球性CD11Cマーカー発現
(j)内皮CD146マーカー発現
(k)内皮CD202bマーカー発現
(l)内皮CD31マーカー発現
のうちの一つ以上の特徴を有する、付記事項8に記載の方法。
[付記事項10]
前記生体サンプルの供給源は、末梢血、血液、リンパ節、骨髄、脳脊髄液、組織、及び尿のうちの1つ又は複数である、付記事項1から付記事項4のいずれか一項に記載の方法。
[付記事項11]
前記生体サンプルは、肘正中静脈血、下大静脈血、大腿静脈血、門脈血、又は頸静脈血である、[付記事項10]に記載の方法。
[付記事項12]
前記癌は、固形腫瘍、ステージI癌、ステージII癌、ステージIII癌、ステージIV癌、癌腫、肉腫、神経芽細胞腫、黒色腫、上皮細胞癌、乳癌、前立腺癌、肺癌、膵臓癌、大腸癌、腎癌、肝臓癌、頭頸部癌、腎臓癌、卵巣癌、食道癌、又は他の固形腫瘍癌である、付記事項1から付記事項4のいずれか一項に記載の方法。
[付記事項13]
前記CAMLは、サイズ排除法、免疫捕捉、赤血球溶解、白血球枯渇、FICOLL、電気泳動、誘電泳動、フローサイトメトリー、磁気浮遊、及び各種マイクロ流体チップ、又はこれらの組み合わせからなる群から選択される1つ又は複数の手段を用いて、前記判定ステップのために前記生体サンプルから単離される、付記事項1から付記事項4のいずれか一項に記載の方法。
[付記事項14]
前記CAMLは、マイクロフィルターを用いるサイズ排除法を用いて生体サンプルから単離される、付記事項13に記載の方法。
[付記事項15]
前記マイクロフィルターは、約5μmから約20μmの範囲の孔径を有する、付記事項14に記載の方法。
[付記事項16]
前記マイクロフィルターの孔は、円形、レーストラック形、楕円形、正方形、及び長方形の孔形状を有する、付記事項15に記載の方法。
[付記事項17]
前記マイクロフィルターは、精密な孔形状と均一な孔分布を有する、付記事項15に記載の方法。
[付記事項18]
前記CAMLは、物理的サイズに基づく選別、流体力学的サイズに基づく選別、グループ化、トラッピング、免疫捕捉、大きな細胞の濃縮、又はサイズに基づく小さな細胞の排除を介するマイクロ流体チップを使用して単離される、[付記事項13]に記載の方法。
[付記事項19]
前記CAMLは、CellSieve(登録商標)低圧精密濾過アッセイを用いて、前記判定ステップのために前記生体サンプルから単離される、付記事項1から付記事項4のいずれか一項に記載の方法。
Claims (19)
- 生体サンプルをアッセイする方法であって、前記方法は、癌に罹患している対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、前記生体サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが100μm以上である場合、前記対象は、多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患を有する可能性が高いと示す、前記方法。
- 対象における多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患の発症を予測するための情報を提供する方法であって、前記方法は、癌に罹患している対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、前記生体サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが100μm以上である場合、前記対象は、多臓器転移及び/又は多巣転移性疾患を発症すると予測する情報を提供する、前記方法。
- 癌に罹患している対象の全生存期間(OS)及び/又は無増悪生存期間(PFS)を予測するための情報を提供する方法であって、前記方法は、癌に罹患している対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、前記生体サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが100μm以上である場合、前記対象は、同じ癌又は類似の癌に罹患しているが対応するサンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが100μm以上であるということを充足しない対象よりも、OSが短く及び/又はPFSが短いと予測する情報を提供する、前記方法。
- 癌に罹患している対象のOS及び/又はPFSを予測するための情報を提供する方法であって、前記方法は、癌に罹患している対象からの生体サンプル中のCAMLのサイズを判定することを含み、前記生体サンプル中の少なくとも1つのCAMLのサイズが100μm以上である場合、前記対象のOS及び/又はPFSは、癌に罹患しているがサイズが100μm以上のCAMLがない対象よりも、少ない又は短いと予測する情報を提供する、前記方法。
- 前記OS及び/又はPFSは、少なくとも12箇月である、請求項3又は請求項4に記載の方法。
- 前記OS及び/又はPFSは、少なくとも24箇月である、請求項3又は請求項4に記載の方法。
- 前記生体サンプルのサイズが5~15mLである、請求項1から請求項4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記CAMLは、
(a)14~64μmの大きな非定型倍数体核又は単一細胞内の複数の核
(b)20~300μmの細胞サイズ
(c)紡錘形、オタマジャクシ形、円形、長円形、2本脚、2本脚以上、細い脚、及び無定形からなる群から選択される形態学的形状
の特徴を有する、請求項1から請求項4のいずれか一項に記載の方法。 - 前記CAMLは、
(d)CD14陽性表現型
(e)CD45発現
(f)EpCAM発現
(g)ビメンチン発現
(h)PD-L1発現
(i)単球性CD11Cマーカー発現
(j)内皮CD146マーカー発現
(k)内皮CD202bマーカー発現
(l)内皮CD31マーカー発現
のうちの一つ以上の特徴を有する、請求項8に記載の方法。 - 前記生体サンプルの供給源は、末梢血、血液、リンパ節、骨髄、脳脊髄液、組織、及び尿のうちの1つ又は複数である、請求項1から請求項4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記生体サンプルは、肘正中静脈血、下大静脈血、大腿静脈血、門脈血、又は頸静脈血である、請求項10に記載の方法。
- 前記癌は、固形腫瘍、ステージI癌、ステージII癌、ステージIII癌、ステージIV癌、癌腫、肉腫、神経芽細胞腫、黒色腫、上皮細胞癌、乳癌、前立腺癌、肺癌、膵臓癌、大腸癌、腎癌、肝臓癌、頭頸部癌、腎臓癌、卵巣癌、食道癌、又は他の固形腫瘍癌である、請求項1から請求項4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記CAMLは、サイズ排除法、免疫捕捉、赤血球溶解、白血球枯渇、FICOLL、電気泳動、誘電泳動、フローサイトメトリー、磁気浮遊、及び各種マイクロ流体チップ、又はこれらの組み合わせからなる群から選択される1つ又は複数の手段を用いて、前記CAMLのサイズを判定するために前記生体サンプルから単離される、請求項1から請求項4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記CAMLは、マイクロフィルターを用いるサイズ排除法を用いて生体サンプルから単離される、請求項13に記載の方法。
- 前記マイクロフィルターは、5μmから20μmの範囲の孔径を有する、請求項14に記載の方法。
- 前記マイクロフィルターの孔は、円形、レーストラック形、楕円形、正方形、及び長方形の孔形状を有する、請求項15に記載の方法。
- 前記マイクロフィルターは、精密な孔形状と均一な孔分布を有する、請求項15に記載の方法。
- 前記CAMLは、物理的サイズに基づく選別、流体力学的サイズに基づく選別、グループ化、トラッピング、免疫捕捉、大きな細胞の濃縮、又はサイズに基づく小さな細胞の排除を介するマイクロ流体チップを使用して単離される、請求項13に記載の方法。
- 前記CAMLは、CellSieve(登録商標)低圧精密濾過アッセイを用いて、前記CAMLのサイズを判定するために前記生体サンプルから単離される、請求項1から請求項4のいずれか一項に記載の方法。
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