JP7526677B2 - 機械学習システムによって低血糖の率を予測すること - Google Patents
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Description
本出願は、2018年6月22日に出願された米国特許仮出願第62/689,005号の利益を主張し、同出願の内容全体が参照により本明細書に組み入れられる。
1.人口統計学
a.これらの共変量の振り返り期間は8年である。
2.社会経済学
b.これらの共変量の振り返り期間は8年である。
3.併存症
c.これらの共変量の振り返り期間は、(可逆的/急性的な状態では)1年から(不可逆的/慢性的な状態では)8年の範囲にわたる。
d.併存症カテゴリ内の別個の共変量としてのチャールソン併存疾患指数(CCI)スコア。CCIは、指標前期間と関連付けられた、糖尿病合併症を含む、患者の併存症状態の尺度である(糖尿病合併症カテゴリを含む)。
4.糖尿病合併症
e.これらの共変量の振り返り期間は8年である。
5.糖尿病疾病状態
a.これらの共変量の振り返り期間は、前低血糖事象では1年、データセット中の既知の期間の糖尿病では8年である。
6.医薬品使用
a.これらの共変量の振り返り期間は1年である。
1.医師専門性:
f.振り返り期間は、「医師専門性」共変量についてのすべての利用可能なデータであり、「医師の最も一般に処方されるインスリン」では2年である。
2.前の平均低血糖事象費用
g.この共変量の振り返り期間は1年である。
1.マーカ間の距離が定義される:
a.各マーカは、マーカが真または偽である患者のセットを含むベクトルと関連付けられる。
b.この場合、マーカ間の距離はベクトル間のジャッカード距離になる。
2.次に、これらの距離に基づいたクラスタが生成された:
a.距離行列に基づいた階層クラスタリングが実行されて、クラスタ階層が得られた。クラスタ間の平均距離が、クラスタを階層的にリンクするために使用された。
3.クラスタを抽出するための階層のレベルが定義される:
a.「不一致」法が、階層のどのレベルでクラスタを抽出したいのかを決定するために使用された。「不一致」は、リンクされているクラスタにおける平均距離の不一致を指す:大きい値は、クラスタがリンクされるべきではないことを示唆する。
4.多くの患者治療が「示す」クラスタが選択される:
a.形成された1500個のクラスタのうち、ほとんどの患者治療によって示された100個が選択された。
b.患者治療は、指標日付の前の1年間に患者に、クラスタを構成した診断、手順、または処方(たとえば、マーカ)のいずれがあった場合に、クラスタを「示す」と言われた。
5.クラスタの医学的合理化:
a.臨床エキスパートがその後、得られたクラスタを医学的論理に関して検査して、教師なしクラスタ生成に使用されるパラメータを有効にする。
1.複数のタイプの基礎インスリンを用いた治療:すなわち、同じ患者に対して別の治療開始の(前または後の)1週間以内に開始する患者治療。
2.指標日付前の365日のうち270日よりも長い任意の非活動の期間がある患者治療(非活動は、データセット中の関連テーブルにタイムスタンプ付きデータがないこととして定義される)。
3.治療期間が1日未満である患者治療。
1.ICD-9および10低血糖診断コード
2.検査室血漿グルコースレベルが≦70mg/dL
3.筋肉内グルカゴンの投与
4.NLP出力
1.低血糖ICD-9または10診断コードがデフォルトで重度である(ICD-9 249.30;250.30;250.31;251.0;ICD-10 E08.641;E09.641;E10.641;E11.641;E13.641;E15)。
2.低血糖のICDコードに、入院時診断、退院時治療の主な理由、または入院時に存在、としてフラグが立てられている。
3.低血糖開始日が救急部(ED)訪問または入院患者入院と同じ日に生じている。
4.血漿グルコース測定値が<54mg/dLである。
5.筋肉内グルカゴンが投与された。
6.低血糖のNLP言及に、重症度用語(たとえば「重度の」)および属性(たとえば、「緊急」)を含む、重症度の記述子が付随している。
7.NLP低血糖事象が(ED)訪問または入院患者入院と同じ日に起きている。
1.事象が訪問表とリンクされ、訪問タイプがEDではない場合(工程202)。
2.低血糖事象が自然言語処理によって識別されるだけではない(工程204)。
3.事象は診断表を使用して見つけられる(工程206)。
4.診断は「退院診断」、「入院診断」、または「入院時に存在」として印付けられる。
1.低血糖事象がNLPによって識別されるだけではない(工程204)。
2.事象が診断表を使用して見つけられた場合、診断は「退院診断」、「入院診断」、または「入院時に存在」として印付けられない(工程206)。
3.事象がPTIDを使用して訪問表とリンクされ、訪問タイプが入院患者であり、低血糖事象日が訪問開始日マイナス1日と訪問終了日プラス1日の間にある(これは、データセットに正確な日付一致がないことが多いことを考慮して、低血糖事象を訪問とリンクするための緩衝域を与えるものである)(工程208)。
1.事象がPTIDを使用して訪問表とリンクされ、訪問タイプはEDであり、低血糖事象日は、訪問開始日マイナス1日と訪問終了日プラス1日の間にある(工程202)。
2.事象は、自然言語処理だけを用いて識別される(工程204)。
3.事象は、診断表を使用して識別される場合にはNLPだけを用いて識別されず、診断は、退院診断、入院診断、または入院時に存在、として印付けされず、訪問表とのリンクが行われない(工程206)。
Claims (23)
- コンピューティングデバイスで実行される方法であって:
機械学習システムを使用して、真性糖尿病と診断された患者の医療記録を示すデータを受け取ること、該受け取りは、病院の記録や医師の記録を含むが、これに限らない人口統計についての情報を含む、複数の異なる源から得られる複数の異なるデータを得ることを含む、と;
該機械学習システムを使用して低血糖事象の予測率を決定することであって、機械は、複数の該患者の医療記録と、それぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを用いて訓練される、決定することと;
患者についての低血糖事象の予測率を生成することと
を含む、前記コンピューティングデバイスで実行される方法。 - 医療記録は同じタイプの基礎インスリンを使用する複数の該患者のものである、請求項1に記載のコンピューティングデバイスで実行される方法。
- 第2の機械学習システムを使用して低血糖事象の第2の予測率を決定することであって、第2の機械は、第2の複数の患者の医療記録と、それぞれの第2の患者についての対応する低血糖事象の率とを示す、受け取ったデータを用いて訓練され、第2の複数の患者のそれぞれは第2のタイプの基礎インスリンを使用し、該第2のタイプの基礎インスリンは第1のタイプの基礎インスリンと異なる、決定することと;
請求項1または2に記載の予測率を第2の予測率と比較することと
をさらに含む、請求項1または2に記載のコンピューティングデバイスで実行される方法。 - 異なるタイプの基礎インスリンの比較に基づいて患者のための異なるタイプの基礎インスリンを推奨することをさらに含む、請求項3に記載のコンピューティングデバイスで実行される方法。
- 第2の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを請求項1に記載のコンピュ
ーティングデバイスで使用される機械学習システムに提供することによって第2の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することと;
低血糖事象の予測率に相関されるデータ中の1つまたはそれ以上の共変量を、該データおよび低血糖事象の複数の予測率に基づいて、特定することと;
1つまたはそれ以上の共変量および対応する低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと
をさらに含む、請求項1に記載のコンピューティングデバイスで実行される方法。 - 第2の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを請求項1に記載のコンピューティングデバイスで使用される機械学習システムに提供することによって第2の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することであって、第2の複数の患者のそれぞれは同じ共変量を有する、決定することと;
共変量および対応する低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと
をさらに含む、請求項1に記載のコンピューティングデバイスで実行される方法。 - コンピュータプログラム命令が符号化された非一時的なコンピュータ可読媒体であって、命令は、1つまたはそれ以上のコンピュータによって実行されると該1つまたはそれ以上のコンピュータに:
機械学習システムを使用して、真性糖尿病と診断された患者の医療記録を示すデータを受け取ること、該受け取りは、病院の記録や医師の記録を含むが、これに限らない人口統計についての情報を含む、複数の異なる源から得られる複数の異なるデータを得ることを含む、と;
該機械学習システムを使用して低血糖事象の予測率を決定することであって、機械は、複数の該患者の医療記録と、それぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを用いて訓練される、決定することと;
患者についての低血糖事象の予測率を生成することと
を含む動作を実行させる、前記非一時的なコンピュータ可読媒体。 - 医療記録は同じタイプの基礎インスリンを使用する複数の該患者のものである、請求項7に記載の非一時的なコンピュータ可読媒体。
- 動作は:
第2の機械学習システムを使用して低血糖事象の第2の予測率を決定することであって、第2の機械は、第2の複数の患者の医療記録と、それぞれの第2の患者についての対応する低血糖事象の率とを示す、受け取ったデータを用いて訓練され、第2の複数の患者のそれぞれは第2のタイプの基礎インスリンを使用し、該第2のタイプの基礎インスリンは第1のタイプの基礎インスリンと異なる、決定することと;
請求項1または2に記載の予測率を第2の予測率と比較することと
をさらに含む、請求項7または8に記載の非一時的なコンピュータ可読媒体。 - 動作は、異なるタイプの基礎インスリンの比較に基づいて患者のための異なるタイプの基礎インスリンを推奨することをさらに含む、請求項7~9のいずれか1項に記載の非一時的なコンピュータ可読媒体。
- 動作は:
第2の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを請求項7に記載の1つまたはそれ以上のコンピュータで使用される機械学習システムに提供することによって第2の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することと;
低血糖事象の予測率に相関されるデータ中の1つまたはそれ以上の共変量を、該データおよび低血糖事象の複数の予測率に基づいて、特定することと;
1つまたはそれ以上の共変量および対応する低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと
をさらに含む、請求項7に記載の非一時的なコンピュータ可読媒体。 - 動作は:
第2の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを請求項7に記載の1つまたはそれ以上のコンピュータで使用される機械学習システムに提供することによって第2の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することであって、第2の複数の患者のそれぞれは同じ共変量を有する、決定することと;
共変量および対応する低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと
をさらに含む、請求項7に記載の非一時的なコンピュータ可読媒体。 - システムであって:
1つまたはそれ以上のコンピュータと、命令を記憶する1つまたはそれ以上の記憶デバイスとを含み、命令は、1つまたはそれ以上のコンピュータによって実行されると該1つまたはそれ以上のコンピュータに:
機械学習システムを使用して、真性糖尿病と診断された患者の医療記録を示すデータを受け取ること、該受け取りは、病院の記録や医師の記録を含むが、これに限らない人口統計についての情報を含む、複数の異なる源から得られる複数の異なるデータを得ることを含む、と;
該機械学習システムを使用して低血糖事象の予測率を決定することであって、機械は、複数の該患者の医療記録と、それぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを用いて訓練される、決定することと;
患者についての低血糖事象の予測率を生成することと
を含む動作を実行させるように動作可能である、前記システム。 - 医療記録は同じタイプの基礎インスリンを使用する複数の該患者のものである、請求項13に記載のシステム。
- 動作は:
第2の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応する受け取ったデータを機械学習システムに提供することによって第2の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することと;
低血糖事象の予測率に相関されるデータ中の1つまたはそれ以上の共変量を、該データおよび低血糖事象の複数の予測率に基づいて特定することと;
1つまたはそれ以上の共変量および対応する低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと
をさらに含む、請求項13に記載のシステム。 - コンピュータシステムによって実行される方法であって、該方法は:
真性糖尿病と診断された患者の医療記録を示すデータを受けることと;
患者の医療記録を示すデータを使用してモデル入力を生成することと;
第1の複数の患者の医療記録とそれぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを含む第1の訓練データを使用して訓練された第1の機械学習モデルを使用してモデル入力を処理することにより低血糖事象の第1の予測率を決定することであって、第1の複数の患者のそれぞれは第1のタイプのインスリンを使用する、ことと;
第2の複数の患者の医療記録とそれぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを含む第2の訓練データを使用して訓練された第2の機械学習モデルを使用してモデル入力を処理することにより低血糖事象の第2の予測率を決定することであって、第2の複数の患者のそれぞれは第2のタイプのインスリンを使用し、該第2のタイプのイ
ンスリンは第1のタイプのインスリンと異なり、第2の複数の患者は第1の複数の患者と異なる、ことと;
第1の予測率を第2の予測率と比較することと;
患者のために比較に基づいたインスリン治療を推奨することと
を含む前記方法。 - 第3の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを機械学習モデルの1つに提供することによって第3の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することと;
第3の低血糖事象の予測率に相関されるデータ中の1つまたはそれ以上の共変量を、該データおよび低血糖事象の複数の予測率に基づいて、特定することと;
1つまたはそれ以上の共変量および対応する第3の低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと、
をさらに含む、請求項16に記載の方法 - 第3の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを機械学習モデルの一つに提供することによって第3の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することであって、第3の複数の患者のそれぞれは同じ共変量を有することと;
共変量および第3の対応する低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと
をさらに含む、請求項16に記載の方法。 - コンピュータプログラム命令が符号化された非一時的なコンピュータ可読媒体であって、命令は、1つまたはそれ以上のコンピュータによって実行されると該1つまたはそれ以上のコンピュータに:
真性糖尿病と診断された患者の医療記録を示すデータを受けることと;
患者の医療記録を示すデータを使用してモデル入力を生成することと;
第1の複数の患者の医療記録とそれぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを含む第1の訓練データを使用して訓練された第1の機械学習モデルを使用してモデル入力を処理することにより低血糖事象の第1の予測率を決定することであって、第1の複数の患者のそれぞれは第1のタイプのインスリンを使用する、ことと;
第2の複数の患者の医療記録とそれぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを含む第2の訓練データを使用して訓練された第2の機械学習モデルを使用してモデル入力を処理することにより低血糖事象の第2の予測率を決定することであって、第2の複数の患者のそれぞれは第2のタイプのインスリンを使用し、該第2のタイプのインスリンは第1のタイプのインスリンと異なり、第2の複数の患者は第1の複数の患者と異なる、ことと;
第1の予測率を第2の予測率と比較することと;
患者のために比較に基づいたインスリン治療を推奨することと
を含む動作を実行させる、前記非一時的なコンピュータ可読媒体。 - 動作は:
第3の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを機械学習モデルの一つに提供することによって第3の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することと;
第3の低血糖事象の予測率に相関されるデータ中の1つまたはそれ以上の共変量を、該データおよび低血糖事象の複数の予測率に基づいて、特定することと;
1つまたはそれ以上の共変量および対応する第3の低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと、
をさらに含む、請求項19に記載の非一時的コンピュータ可読媒体。 - 動作は:
第3の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを機械学習モデルの一つに提供することによって第3の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することであって、第3の複数の患者のそれぞれは同じ共変量を有する、決定することと;
共変量および第3の対応する低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと
をさらに含む、請求項20に記載の非一時的なコンピュータ可読媒体。 - システムであって、
1つまたはそれ以上のコンピュータと、命令を記憶する1つまたはそれ以上の記憶デバイスを含み、命令は、1つまたはそれ以上のコンピュータによって実行されると該1つまたはそれ以上のコンピュータに:
真性糖尿病と診断された患者の医療記録を示すデータを受けることと;
患者の医療記録を示すデータを使用してモデル入力を生成することと;
第1の複数の患者の医療記録とそれぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを含む第1の訓練データを使用して訓練された第1の機械学習モデルを使用してモデル入力を処理することにより低血糖事象の第1の予測率を決定することであって、第1の複数の患者のそれぞれは第1のタイプのインスリンを使用する、ことと;
第2の複数の患者の医療記録とそれぞれの患者についての対応する低血糖事象の率とを示すデータを含む第2の訓練データを使用して訓練された第2の機械学習モデルを使用してモデル入力を処理することにより低血糖事象の第2の予測率を決定することであって、第2の複数の患者のそれぞれは第2のタイプのインスリンを使用し、該第2のタイプのインスリンは第1のタイプのインスリンと異なり、第2の複数の患者は第1の複数の患者と異なる、ことと;
第1の予測率を第2の予測率と比較することと;
患者のために比較に基づいたインスリン治療を推奨することと
を含む動作を実行させるように動作可能である、前記システム。 - 動作は:
第3の複数の患者のそれぞれの医療記録に対応するデータを機械学習モデルの一つに提供することによって第3の複数の患者についての低血糖事象の複数の予測率を決定することと;
第3の低血糖事象の予測率に相関されるデータ中の1つまたはそれ以上の共変量を、該データおよび低血糖事象の複数の予測率に基づいて特定することと;
1つまたはそれ以上の共変量および対応する第3の低血糖事象の予測率を特定する報告を生成することと
をさらに含む、請求項22に記載のシステム。
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