JP7464800B2 - 小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法及びシステム - Google Patents

小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法及びシステム Download PDF

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Description

本発明は、医療情報技術分野に属し、特に小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法及びシステムに関する。
病院の電子化プロセスの発展に伴い、大量の医学知識は、電子カルテの形式で様々な医療情報システムに記憶される。これらのデータは、医者の臨床実践の蓄積により生成され、豊富な臨床経験知識を含む。その中からこれらの医学知識を自動的に認識し、医療健康サービスをインテリジェント化することは、重要な意味を有する。医療イベント認識は、電子カルテテキストから医療イベントを認識し且つ構造化して表示することを目的とし、それらは、医療イベント種別、関与する医療因子及びそれに対応する種別等を含む。イベント認識により得られた情報は、複雑で多様化した医学知識を深く説明可能である。
近年、イベント認識の方法は、主にルールに基づく方法と深層学習に基づく方法とに分けられる。ルールに基づく方法に基づき、イベント認識テンプレートを人為的又は半自動的に定義し、テキストとルールについてマッチングを行ってイベントを認識する。深層学習技術の発展に伴い、畳み込みニューラルネットワーク、循環ニューラルネットワーク、注意力ネットワーク等の深層学習モデルの医療イベント認識における応用が徐々に増加する。深層学習イベント認識モデルは、一般的にイベントトリガ単語を認識することで対応するイベントを認識し、次に、対応するイベントから関連するイベント因子を認識する。
小サンプル弱ラベル付け条件で、遠隔教師あり方法は、知識ライブラリを用いてデータを自動的にラベル付けし、トレーニングサンプルの迅速な拡張を実現することができ、関係認識タスクに広く応用される。それとともに、メタ学習方法は、モデル化の点から、モデルに事前知識を利用させ、学習タスクの過程を習得させることにより、モデルの小サンプル弱ラベル付け条件での認識性能を向上させる。
現在の医療イベント認識が直面する主な問題は、小サンプル弱ラベル付けであり、従来の方法は、この問題をうまく解決できていない。まず、ルールに基づく方法は、人為的にイベント認識ルールを定義する必要がある。医療イベント認識のルール体系は、構築されにくく、ルールに基づく方法は、凡化性が低く、カバーできるイベントの状況が少ない。また、異なる病院の電子カルテのフォーマットの差異が大きく、且つルールを定義するプロセスが主観的であり、異なる専門家が異なるルールを制定し、統一の医療イベントルール体系を作成することが困難である。
その一方、深層学習に基づく方法は、一般的に大量のラベル付けコーパスを必要とし、現在医療分野に公開されているイベントデータセットが少なく、医学背景知識を持つ人員が大量のテキストをラベル付けし、且つラベル付けプロセスにおいてイベントに対して一致性チェックを行う等が必要であるため、所要な人件費が大きい。深層学習方法に関し、現在のイベント認識は、一般的にトリガ単語を判断する方式でイベント認識を行うが、医療分野における様々なイベントが複雑であり、1つのトリガ単語で1つの医療イベントを表すことが困難であり、トリガ単語を判断する方式により医療イベントを効果的に認識することができない。
本発明の目的は、現在の医療イベント認識方法の不足に対し、小サンプル弱ラベル付け条件において遠隔教師あり方法とメタ学習とを融合する医療イベント認識方法及びシステムを提供することである。
本発明は、主に以下の2通りの方法により小サンプル弱ラベル付け問題を解決する。まず、本発明は、遠隔教師あり方法を利用し、医療イベントライブラリを構築することにより中国語電子カルテテキストへの自動ラベル付けを実現し、サンプル量が少ない場合にサンプルデータを効果的に拡張し、モデルの小サンプルに対する認識の凡化性を向上させる。その一方、本発明は、少サンプル学習分野におけるメタ学習方法を用いて医療因子及びイベントを認識する。事前知識を十分に利用することにより、医療イベント認識方法の凡化性が低く、ルールが統一されにくく、大量の人件費を必要とするという問題を効果的に解決し、医療イベント認識結果の正確性を向上させるとともに、提供されたイベント認識方法は、優れた拡張可能性を有し、大量の電子カルテテキストの大規模な抽出に役立つ。医療イベント認識に関し、医療分野イベントが複雑であり、そのトリガ単語が定義されにくいことを考慮し、本発明は、医療因子を優先的に認識し、医療因子を利用して医療イベントを認識する。
本発明の目的は、以下の解決手段によって実現される。
本発明の一態様は、小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法を提供する。当該方法は、
医療イベントライブラリの構築及びデータのラベル付けを行うステップ一と、
医療因子及びイベントのメタ学習を行うステップ二と、
医療因子を認識するステップ三と、
医療イベントを認識するステップ四とを含み、
前記ステップ一では、専門家知識に基づいて、医療イベント種別と各種別に対応する医療因子とを含む医療イベントライブラリを定義して構築し、医療イベントライブラリに基づいて遠隔教師あり方法を用いて中国語電子カルテテキストに対して医療因子のラベル付けを行い、医療因子認識モデルのトレーニングデータを生成し、
前記ステップ二は、サブステップ2.1~サブステップ2.4を含み、
前記サブステップ2.1では、各分野に公開された中国語イベント及び因子ラベル付けコーパスをトレーニングセットとして選択してサンプリングし、対応するトレーニング―サポートセット及びトレーニング―検索セットを複数回のサンプリングによって取得し、
前記サブステップ2.2では、トレーニング―サポートセットに基づいて、対応するイベント及び因子のプロトタイプ表現を構築し、
前記サブステップ2.3では、因子及びイベントのプロトタイプ表現に基づいて、トレーニング―検索セットサンプルとプロトタイプ表現の距離類似度スコアを算出し、実際結果及び認識結果に基づいてメタ学習モデルの損失を算出し、前記メタ学習モデルのパラメータを更新し、
前記サブステップ2.4では、小サンプル医療因子及びイベントデータセットをテストセットとし、対応するテスト―サポートセット及びテスト―検索セットをサンプリングによって取得し、トレーニングによって得られたメタ学習モデルをテスト―サポートセットにおいて更にトレーニングして医療因子及びイベントメタ学習モデルを取得し、
前記ステップ三は、サブステップ3.1~サブステップ3.4を含み、
前記サブステップ3.1では、中国語電子カルテテキストの系列エンコーダモデルをトレーニングし、テキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得し、
前記サブステップ3.2では、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られた医療因子断片について、取得された文字レベルの意味ベクトル表現に基づいて、医療因子断片の特徴表現を算出し、
前記サブステップ3.3では、医療因子断片の特徴表現に基づいて、意味類似度を用いて医療因子断片を分類し、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片について、負サンプリングサンプルを構築し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて医療因子種別の重みを取得し、
前記サブステップ3.4では、医療因子種別の重みに基づいて、医療因子と負サンプリングサンプルとの医療因子認識モデルにおける損失を算出し、前記医療因子認識モデルのパラメータを更新し、
前記ステップ四は、サブステップ4.1~サブステップ4.3を含み、
前記サブステップ4.1では、医療イベントライブラリに基づいて各種別の医療イベントにおける医療因子の共起性及びイベント関連性特徴を算出し、専門家が医療イベント種別中の医療因子種別について採点した状況と組み合わせ、各種別の医療イベントの医療因子重要度スコアを取得し、
前記サブステップ4.2では、医療因子認識モデルから出力された中国語電子カルテテキストに存在する医療因子断片を基に、医療因子重要度スコアと組み合わせ、各種別の医療イベントの確率分布を取得し、
前記サブステップ4.3では、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて、中国語電子カルテテキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコアを算出し、ステップ4.2における各種別の医療イベントの確率分布と組み合わせ、対応する医療イベント種別を計算によって取得する。
更に、前記ステップ一では、前記医療イベントライブラリのデータは、小サンプル医療因子及びイベントデータセットと外部医学資源とに由来し、前記医療イベント種別は、個人基本情報イベント、家族疾患イベント、過去疾患イベント、投薬イベント、アレルギーイベント、手術イベント、症状イベント、治療イベント及び診断イベントを含む。
更に、前記ステップ一では、医療因子ライブラリを構築してから医療イベントライブラリを構築し、
前記医療因子ライブラリの構築過程は、
小サンプル医療因子及びイベントデータセットにおける2回以上現れた医療因子を対応する医療因子種別に応じて対応する種別の医療因子ライブラリに加えるステップa)と、
公開された高品質の外部医学資源の一部を選別して処理して対応する医療因子ライブラリに加えるステップb)とを含み、
前記医療イベントライブラリの構築において、小サンプル医療因子及びイベントデータセットにおけるラベル付けの小サンプル医療イベント及び医療因子種別を統計し、各ラベル付けのイベント及び因子について、対応関係を確立して記憶記録を行う。
更に、前記ステップ一では、遠隔教師あり方法を用いて医療因子をラベル付けすることは、処理a)と、処理b)と、処理c)と、を含み、
前記処理a)では、中国語電子カルテテキスト
Figure 0007464800000001
に対して無効文字のクリア、大文字小文字変換、句読点変換、文分割処理を行い、
前記処理b)では、中国語電子カルテテキスト
Figure 0007464800000002
について、医療因子ライブラリを用いてマッチングを行い、疾患、薬物、症状、手術、原因、治療、診断との7種別に属さない医療因子について、医療因子ライブラリにマッチングする方法でラベル付けすることなく、ルールに基づく方式でラベル付け及び抽出を行い、
前記処理c)では、医療因子ライブラリにおける医療因子の最大断片長さ
Figure 0007464800000003
を統計し、遠隔教師あり方法でラベル付けするときに断片の最大長さを
Figure 0007464800000004
と規定し、マッチングによって得られた医療因子断片テキストに対して断片ラベル付けの方式でラベル付けを行い、医療因子としてマッチングされていない他のテキスト断片を負サンプルとしてラベル付けし、ラベル付けされたサンプルを
Figure 0007464800000005
と記し、サンプル断片を
Figure 0007464800000006
と記し、
Figure 0007464800000007
は、サンプル断片
Figure 0007464800000008
のテキスト
Figure 0007464800000009
における開始位置と終了位置をそれぞれ示し、
Figure 0007464800000010
は、サンプルに対応する種別である。
更に、前記ステップ2.2において、トレーニング―サポートセットに基づいて、対応するイベント及び因子のプロトタイプ表現を構築することは、各種別のサンプルの意味ベクトルを高次元の特徴空間に投影し、各サンプルの特徴を次元に応じて加算平均して種別のプロトタイプ表現とすることを含む。
更に、前記ステップ2.3において、距離類似度スコアは、Bregmanダイバージェンス
Figure 0007464800000011
と余弦類似度スコア
Figure 0007464800000012
との2つの部分を含み、
Bregmanダイバージェンス
Figure 0007464800000013
は、
Figure 0007464800000014
にて求められ、
Figure 0007464800000015
は、ユークリッド距離の計算関数であり、
Figure 0007464800000016
は、因子又はイベントサンプル
Figure 0007464800000017
の特徴表現であり、
Figure 0007464800000018
は、種別
Figure 0007464800000019
のプロトタイプ表現であり、
余弦類似度スコア
Figure 0007464800000020
は、
Figure 0007464800000021
にて求められ、
Figure 0007464800000022
は、種別
Figure 0007464800000023
の特徴表現であり、
Figure 0007464800000024
は、トレーニングパラメータであり、
サンプル
Figure 0007464800000025
が種別
Figure 0007464800000026
に属する距離類似度スコア
Figure 0007464800000027

Figure 0007464800000028
により求め、
Figure 0007464800000029
は、トレーニングパラメータであり、
サンプル
Figure 0007464800000030
が種別
Figure 0007464800000031
として予測される確率
Figure 0007464800000032

Figure 0007464800000033
により求め、
Figure 0007464800000034
は、トレーニング―検索セット
Figure 0007464800000035
中の何れかの種別であり、
トレーニング―検索セットにおけるサンプル種別の実際結果及び認識結果に基づいて、メタ学習モデルの損失を算出し、Adamアルゴリズムで逆伝播を行ってパラメータを更新し、メタ学習モデルの損失関数
Figure 0007464800000036

Figure 0007464800000037
により求める。
更に、前記ステップ三において、遠隔教師あり方法でラベル付けされた医療因子を用いて医療因子認識モデルをトレーニングすることは、具体的に、
入力された中国語電子カルテテキストを
Figure 0007464800000038
(ただし、
Figure 0007464800000039
は、入力されたテキスト長さである)と記し、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られたサンプルを
Figure 0007464800000040
と記し、サンプル断片を
Figure 0007464800000041
と記し、
Figure 0007464800000042
は、サンプル断片
Figure 0007464800000043
のテキスト
Figure 0007464800000044
における開始位置と終了位置をそれぞれ示し、
Figure 0007464800000045
は、サンプルに対応する種別であり、
系列エンコーダモデルを用いてテキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得し、即ち、医療因子の認識時に、テキスト
Figure 0007464800000046
について、系列エンコーダモデルを介して各文字の意味ベクトル
Figure 0007464800000047
を取得し、
サンプル
Figure 0007464800000048
について、サンプル断片
Figure 0007464800000049
の特徴表現
Figure 0007464800000050

Figure 0007464800000051
により求め、
Figure 0007464800000052
は、ベクトルのつなぎ合わせを示し、
Figure 0007464800000053
は、ベクトルの対応する位置における要素の内積演算を示し、
サンプル断片の特徴表現を非線形変換し、サンプルが各種別に属する確率分布
Figure 0007464800000054

Figure 0007464800000055
により求めて出力し、
Figure 0007464800000056
は、トレーニングパラメータであり、
Figure 0007464800000057
の出力次元は、サンプル種別数であり、
Figure 0007464800000058
とし、
Figure 0007464800000059
にて示され、
Figure 0007464800000060
は、サンプル断片
Figure 0007464800000061
が種別
Figure 0007464800000062
に属する確率を示す。
更に、前記ステップ三では、全てのサンプルセットを
Figure 0007464800000063
とし、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片数を
Figure 0007464800000064
とし、
Figure 0007464800000065
個のサンプルをランダムにサンプリングして負サンプリングサンプルセット
Figure 0007464800000066
(ただし、
Figure 0007464800000067
)を構成し、負サンプリングサンプルセットを医療因子及びイベントメタ学習モデルに送り込み、負サンプリングサンプル
Figure 0007464800000068
が各種別の医療因子に属する確率を取得し、確率値を重み
Figure 0007464800000069
とし、
Figure 0007464800000070
と示し、
Figure 0007464800000071
は、予測されたサンプル種別であり、合計
Figure 0007464800000072
種別の医療因子があるとすると、グローバル損失関数
Figure 0007464800000073

Figure 0007464800000074
に構成し、
損失関数
Figure 0007464800000075
を用いて勾配逆伝播を経て医療因子認識モデルのパラメータを更新する
更に、医療因子を医療イベントの基本次元とし、複数の専門家が同時に医療因子について採点したとし、専門家
Figure 0007464800000076
が医療イベント種別
Figure 0007464800000077
中の医療因子種別
Figure 0007464800000078
について採点したスコアが
Figure 0007464800000079
であり、スコアが整数であり且つ同一の専門家が各医療因子について採点したスコアが必ず異なると規定し、スコアの値範囲を
Figure 0007464800000080
とし、
Figure 0007464800000081
は、医療イベント種別
Figure 0007464800000082
中の医療因子種別の総数であり、最終の医療イベント種別
Figure 0007464800000083
中の医療因子種別
Figure 0007464800000084
の正規化された専門家スコア
Figure 0007464800000085

Figure 0007464800000086
により求め、
Figure 0007464800000087
は、専門家数であり、医療因子種別
Figure 0007464800000088
の医療イベント種別
Figure 0007464800000089
における最終重要度スコア
Figure 0007464800000090

Figure 0007464800000091
により求め、
入力された中国語電子カルテテキストを
Figure 0007464800000092
と記し、
Figure 0007464800000093
は、入力されたテキスト長さであり、医療因子認識モデルの予測によって得られた医療因子を
Figure 0007464800000094
と記し、
Figure 0007464800000095
は、テキストにおける医療因子数であり、医療イベント種別が合計Η個あるとし、医療因子重要度スコアと組み合わせ、テキスト
Figure 0007464800000096
が医療イベント種別
Figure 0007464800000097
に属する確率分布
Figure 0007464800000098

Figure 0007464800000099
により求め、
中国語電子カルテテキスト
Figure 0007464800000100
を医療因子及びイベントメタ学習モデルに送り込み、テキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコア
Figure 0007464800000101
を算出し、距離類似度スコアと医療イベントの確率分布とを組み合わせ、テキスト
Figure 0007464800000102
が医療イベント種別
Figure 0007464800000103
に属するスコア
Figure 0007464800000104

Figure 0007464800000105
により求め、スコアが最も高い医療イベント種別
Figure 0007464800000106
を最終テキスト
Figure 0007464800000107
の医療イベントとし、
Figure 0007464800000108
と示す。
本発明の別の態様は、小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識システムを提供する。当該システムは、
医療イベントライブラリ構築及びデータラベル付けモジュールと、医療因子及びイベントメタ学習モジュールと、医療因子認識モジュールと、医療イベント認識モジュールとを備え、
前記医療イベントライブラリ構築及びデータラベル付けモジュールは、専門家知識に基づいて、医療イベント種別と各種別に対応する医療因子とを含む医療イベントライブラリを定義して構築し、医療イベントライブラリに基づいて遠隔教師あり方法を用いて中国語電子カルテテキストに対して医療因子のラベル付けを行い、医療因子認識モデルのトレーニングデータを生成し、
前記医療因子及びイベントメタ学習モジュールは、各分野に公開された中国語イベント及び因子ラベル付けコーパスをトレーニングセットとして選択してサンプリングし、対応するトレーニング―サポートセット及びトレーニング―検索セットを複数回のサンプリングによって取得し、トレーニング―サポートセットに基づいて対応するイベント及び因子のプロトタイプ表現を構築し、トレーニング―検索セットサンプルとプロトタイプ表現の距離類似度スコアを算出し、実際結果及び認識結果に基づいてメタ学習モデルの損失を算出し、前記メタ学習モデルのパラメータを更新し、小サンプル医療因子及びイベントデータセットをテストセットとし、対応するテスト―サポートセット及びテスト―検索セットをサンプリングによって取得し、トレーニングによって得られたメタ学習モデルをテスト―サポートセットにおいて更にトレーニングして医療因子及びイベントメタ学習モデルを取得し、
前記医療因子認識モジュールは、中国語電子カルテテキストの系列エンコーダモデルをトレーニングし、テキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得し、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られた医療因子断片について、医療因子断片の特徴表現を算出し、意味類似度を用いて医療因子断片を分類し、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片について、負サンプリングサンプルを構築し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて医療因子種別の重みを取得し、医療因子と負サンプリングサンプルとの医療因子認識モデルにおける損失を算出し、医療因子認識モデルのパラメータを更新し、
前記医療イベント認識モジュールは、医療イベントライブラリに基づいて各種別の医療イベントにおける医療因子の共起性及びイベント関連性特徴を算出し、専門家が医療イベント種別中の医療因子種別について採点した状況と組み合わせ、各種別の医療イベントの医療因子重要度スコアを取得し、医療因子認識モデルから出力された中国語電子カルテテキストに存在する医療因子断片を基に、各種別の医療イベント確率分布を取得し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて中国語電子カルテテキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコアを算出し、各種別の医療イベント確率分布と組み合わせ、対応する医療イベント種別を取得する。
本発明は、以下の有利な作用効果を有する。
1.医療イベントライブラリを構築し、遠隔教師あり方法を用いて、小サンプル弱ラベル付け条件での医療因子に対する自動ラベル付けを実現する。
2.複数の次元から医療因子及びイベントメタ学習モデルを構築し、小サンプル弱ラベル付け条件において医療イベント認識モデルの凡化性が悪くてラベル付けデータが不足である問題を解決する。
3.医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて負サンプリングを行い、ラベルなし医療因子を低い範囲に抑制し、遠隔教師あり方法によるラベル漏れ問題を減少させ、医療因子認識モデルの性能を向上させる。
4.医療イベントライブラリ及び専門家知識に基づいて医療因子重要度を算出し、医療因子重要度と医療因子及びイベントメタ学習モデルとを用いて医療イベントに対して分類認識を行い、医療イベントのトリガ単語が定義されにくい問題を解決する。
本発明の実施例に関わる小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法のフローチャートである。 本発明の実施例に関わる医療因子及びイベントのメタ学習の実現形態のブロック図である。 本発明の実施例に関わる医療因子の認識の実現形態のブロック図である。 本発明の実施例に関わる医療イベントの認識の実現形態のブロック図である。 本発明の実施例に関わる小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識システムの構成ブロック図である。
本発明の上記目的、特徴及びメリットがより明白且つ分かりやすくなるように、以下では、図面を参照しながら本発明の具体的な実施形態について詳細に説明する。
本発明が十分に理解されるように以下の説明において詳細が多く記述されているが、本発明は、更に、ここで記述された形態と異なる形態で実施され得る。当業者は、本発明の要旨に反しない場合に、類似する拡張を行うことができる。したがって、本発明は、以下に開示された具体的な実施例に限定されない。
本発明において、医療イベントは、中国語電子カルテテキストにおいて治療過程に重要な影響を有する一連の医学的状態変化の集合を指す。1つの医療イベントは、医療イベント種別と、医療因子と、医療因子種別とを含む。例えば、テキスト「腹痛3か月余り、10日間重くなる」に対して、それは、患者の症状の変化を記述するイベントであり、医療イベント種別は、症状であり、医療因子は、「腹痛」(医療因子種別:症状)、「3か月余り」(医療因子種別:時間)、「10日間重くなる」(医療因子種別:傾向)である。
小サンプル弱ラベル付け条件は、モデル学習時に少量の限られたラベル付けデータと大量のラベルなしデータがあり、且つラベル付けデータが完全ではなく、ノイズが存在する状況を指す。
メタ学習は、新たなタスクを習得する能力をモデルに取得させることを目指し、モデルに対して、事前知識を取得した上で新たなタスクを迅速に学習させ得ることを指す。メタ学習は、まず、複数回のトレーニングタスクを構築し、次に毎回のトレーニングタスクにおいてタスクに対応するデータを構築してトレーニングを行う。メタ学習は、関数を見つけることを目標とし、関数を出力することができ、関数は、新たなタスクを良く学習することができる。
断片ラベル付けは、テキスト中の全ての可能なテキスト断片を配列し、対応する医療イベントライブラリにおける断片を対応する種別としてラベル付けし、他の断片を負サンプルとしてラベル付けすることを指す。
ラベル付けなしの医療因子は、下記のことを指す。遠隔教師ありでラベル付けしたときに、医療イベントライブラリが全ての医療因子をカバーすることが不可能であるため、ラベル付けの結果は、医療イベントライブラリにない医療因子を見逃す。医療イベントライブラリでカバーされていないこれらの医療因子は、ラベル付けなしの医療因子と呼ばれる。
図1に示すように、本実施例に関わる小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法は、以下のステップを含む。
ステップ一では、医療イベントライブラリの構築及びデータのラベル付けを行う。即ち、専門家知識に基づいて、医療イベント種別と各種別に対応する医療因子とを含む医療イベントライブラリを定義して構築し、医療イベントライブラリのデータは、小サンプル医療因子及びイベントデータセットと、外部医学資源等とに由来し、医療イベントライブラリに基づいて遠隔教師あり方法を用いて中国語電子カルテテキストに対して医療因子のラベル付けを行い、医療因子認識モデルのトレーニングデータを生成する。
(1)医療イベントライブラリの構築
(1.1)医療イベント及び対応医療因子の定義:大量の中国語電子カルテテキストの特点に応じて、専門医者の指導の下で、9種の汎用の医療イベント種別、即ち、個人基本情報イベント、家族疾患イベント、過去疾患イベント、投薬イベント、アレルギーイベント、手術イベント、症状イベント、治療イベント、診断イベントを初歩的に定義する。また、各種のイベントについて、対応する医療因子を定義する。例えば、個人基本情報イベントにおいて、性別、年齢、身長、体重、婚姻状況、喫煙歴、飲酒歴をイベントの因子として定義する。症状イベントにおいて、症状、時間、頻度、傾向、再発状況、原因をイベント因子として定義する。更に例えば、過去疾患イベントにおいて、疾患、時間、治療方法をイベント因子として定義する。医療イベント及び因子の具体的な定義は、以下の表に示される。
Figure 0007464800000109
(1.2)医療因子ライブラリの構築:小サンプル弱ラベル付け条件において少ないラベル付けの医療イベント及び因子があることを考慮し、本発明では、公開された高品質の医学コーパスを導入して医療因子ライブラリを構築する。医療因子ライブラリは、主に7種の医療因子、即ち、疾患、薬物、症状、手術、原因、治療、診断を含む。医療因子ライブラリの具体的な構築過程は、以下のようになる。
a)小サンプル医療因子及びイベントデータセットにおける2回以上現れた医療因子を対応する医療因子種別に応じて対応する種別の医療因子ライブラリに加える。
b)上記方法では非常に少ない医療因子のみが取得され得るため、本発明では、現在公開された高品質の外部医学資源の一部を選別して処理して対応する医療因子ライブラリに加える。医学資源をクローリングし且つ情報に対して認識及び整理を行うことにより、医療因子ライブラリを取得する。
c)上記7種の種別、例えば、如:時間、性別、年齢、身長、体重、頻度、傾向、喫煙歴、飲酒歴に属さない医療因子について、本発明では、医療因子ライブラリにマッチングする方法でラベル付けすることなく、ルールに基づく方式でラベル付け及び抽出を行う。
(1.3)医療イベントライブラリの構築:小サンプル医療因子及びイベントデータセットにおけるラベル付けの小サンプル医療イベント及び医療因子種別を統計し、各ラベル付けのイベント及び因子について、対応関係を確立して記憶記録を行う。
例えば、小サンプル医療因子及びイベントデータが集中する家族疾患イベント「類似する患者が家族にない。父は、亡くなり、死因:自然死。母は、5年肝硬変している。兄弟姉妹の健康状況:7人の兄弟姉妹、1人の姉と1人の弟が肝癌で亡くなり、1人の姉が脳出血である。」について、対応する医療イベントライブラリを確立して統計し、下の表に示す。
Figure 0007464800000110
(2)遠隔教師あり方法を用いて医療因子をラベル付けする
ヒューリスティックな仮定に基づいて、医療因子断片が医療因子ライブラリにおいてある種別の医療因子としてラベル付けされた場合に、ラベル付けなしの中国語電子カルテテキスト中の当該因子断片は、何れも対応する種別の医療因子としてラベル付けされる。具体的な自動ラベル付けのステップは、下記のようになる。
a)中国語電子カルテテキスト
Figure 0007464800000111
に対して無効文字のクリア、大文字小文字変換、句読点変換、文分割処理等の前処理操作を行う。
b)中国語電子カルテテキスト
Figure 0007464800000112
について、医療因子ライブラリを用いてマッチングを行い、7種別に属さない医療因子、例えば、時間、性別、年齢等の情報について、ルールに基づく方式でマッチングを行う。
c)医療因子ライブラリにおける医療因子の最大断片長さ
Figure 0007464800000113
を統計し、遠隔教師あり方法でラベル付けするときに断片の最大長さを
Figure 0007464800000114
と規定する。マッチングによって得られた医療因子断片テキストに対して断片ラベル付けの方式でラベル付けを行い、医療因子としてマッチングされていない他のテキスト断片を負サンプルとしてラベル付けする。ラベル付けされたサンプルを
Figure 0007464800000115
と記し、サンプル断片を
Figure 0007464800000116
と記し、
Figure 0007464800000117
は、サンプル断片
Figure 0007464800000118
のテキスト
Figure 0007464800000119
における開始位置と終了位置をそれぞれ示し、
Figure 0007464800000120
は、サンプルに対応する種別である。
例えば、テキスト「突発上腹部疼痛3か月、摂食後嘔吐を伴う。」について、症状断片セット{「上腹部疼痛」、「疼痛」、「嘔吐」}、原因断片セット{「摂食後」}、時間断片セット{「3か月」}をマッチングによって取得する。本発明は、「上腹部疼痛」、「疼痛」を症状としてラベル付けし、「摂食後」を原因としてラベル付けし、「嘔吐」を症状としてラベル付けし、「3か月」を時間としてラベル付けするなど。マッチングされていない他の断片は、例えば、「突」を負サンプルとしてラベル付けし、「発上」を負サンプルとしてラベル付けする。
ステップ二では、医療因子認識モデル及び医療イベント認識モデルの小サンプル弱ラベル付け条件での学習能力を向上させるように、医療因子及びイベントのメタ学習を行い、主に以下の4つのステップを含む。
2.1では、各分野(医療分野に限定されない。医療分野イベント認識データが限られているから)に高品質に公開された中国語イベント及び因子ラベル付けコーパスをトレーニングセットとして選択してサンプリングし、対応するトレーニング―サポートセット及びトレーニング―検索セットを複数回のサンプリングによって取得する。
2.2では、トレーニング―サポートセットに基づいて、対応するイベント及び因子のプロトタイプ表現を構築する。具体的に、各種別のサンプルの意味ベクトルを高次元の特徴空間に投影し、各サンプルの特徴を次元に応じて加算平均して種別のプロトタイプ表現とする。
2.3では、因子及びイベントのプロトタイプ表現に基づいて、トレーニング―検索セットサンプルとプロトタイプ表現の距離類似度スコアを算出し、実際結果及び認識結果に基づいてメタ学習モデルの損失を算出し、前記メタ学習モデルのパラメータを更新する。
2.4では、小サンプル医療因子及びイベントデータセットをテストセットとし、対応するテスト―サポートセット及びテスト―検索セットをサンプリングによって取得し、トレーニングによって得られたメタ学習モデルをテスト―サポートセットにおいて更にトレーニングして医療因子及びイベントメタ学習モデルを取得し、図2に示される。
具体的な実施の詳細は、下記のようになる。
a)小サンプル弱ラベル付け条件において、小サンプル医療因子及びイベントデータセットトレーニング医療イベント認識モデルをそのまま使用すると、ラベル付けデータが少なく過ぎて深刻なオーバーフィッティングを引き起こす。メタ学習方法では、他の分野の大量のラベル付けコーパスを用いて、小サンプルデータのみを含むトレーニングタスクを複数構築し、小サンプルデータにおいて新たなタスクを迅速に習得する能力を有するモデルをトレーニングして取得する。
b)サンプリング小サンプル医療因子及びイベントデータセット中のサンプルをテストセットとし、
Figure 0007464800000121
と記し、
Figure 0007464800000122
中の医療因子及びイベントが合計N種別があるとし、各種別にT個のサンプルがある。サンプルを3:2で更にサポートセット
Figure 0007464800000123
と検索セット
Figure 0007464800000124
とに区分し、
Figure 0007464800000125
での各種別にK個のサンプルがあるとし、
Figure 0007464800000126
のメタ学習タスクを構築する。医療因子及びイベントラベル付けコーパスが少ないため、本発明では、各分野の高品質に公開された中国語イベント及び因子ラベル付けコーパスをトレーニングセットとし、
Figure 0007464800000127
と記し、
Figure 0007464800000128
でのイベント及び因子種別と医療イベント及び因子種別とが異なる。
Figure 0007464800000129
を用いて
Figure 0007464800000130
のメタ学習モデルをトレーニングする。テストセットサンプル構造過程に基づいて、トレーニングセット
Figure 0007464800000131
からM回サンプリングし、毎回N種別のサンプルをサンプリングし、各種のサンプルに関し、K個のサンプルをサポートセット
Figure 0007464800000132
としてサンプリングし、
Figure 0007464800000133
中の同じ種別のサンプル数を検索セット
Figure 0007464800000134
としてサンプリングする。
Figure 0007464800000135
及び
Figure 0007464800000136
を用いてM回のメタ学習モデルトレーニングを行うことにより、メタ学習モデルを
Figure 0007464800000137
条件において医療因子及びイベント認識タスクを迅速に習得する能力を持たせる。得られたメタ学習モデルを更に医療因子及びイベントサンプルサポートセット
Figure 0007464800000138
においてトレーニングして医療因子及びイベントメタ学習モデルを取得する。
c)因子及びイベントメタ学習モデルは、系列エンコーダモデルと分類モデルとによって構成される。系列エンコーダモデルは、双方向自己注意言語モデル(BERT)であることが好ましい。系列エンコーダモデルは、入力されたテキスト
Figure 0007464800000139
を意味ベクトル
Figure 0007464800000140
に符号化し、
Figure 0007464800000141
は、入力されたテキスト長さであり、
Figure 0007464800000142
は、第
Figure 0007464800000143
個の文字であり、次に、
Figure 0007464800000144
関数を用いて因子及びイベントの特徴を算出し、因子又はイベントサンプルを
Figure 0007464800000145
とし、
Figure 0007464800000146
をサンプル長さをとすると、その特徴表現は、
Figure 0007464800000147
であり、
Figure 0007464800000148
は、トレーニングパラメータである。
そして、分類モデルにおいて
Figure 0007464800000149
中のN個の種別サンプルについてプロトタイプモデル化を行い、種別
Figure 0007464800000150
に関し、
Figure 0007464800000151
を種別
Figure 0007464800000152
のサンプルセットとし、種別
Figure 0007464800000153
のプロトタイプ表現は、
Figure 0007464800000154
は、
Figure 0007464800000155
にて求められ、
Figure 0007464800000156
中の各因子及びイベントとプロトタイプ表現
Figure 0007464800000157
の距離類似度スコアを算出し、距離類似度スコアは、Bregmanダイバージェンス
Figure 0007464800000158
と余弦類似度スコア
Figure 0007464800000159
との2つの部分を含む。
Bregmanダイバージェンスは、ユークリッド距離であってもよく、即ち、
Figure 0007464800000160
にて求められ、
Figure 0007464800000161
は、ユークリッド距離の計算関数である。
それとともに、因子及びイベントと種別
Figure 0007464800000162
の余弦類似度スコア
Figure 0007464800000163
を算出し、
Figure 0007464800000164
を種別
Figure 0007464800000165
の特徴表現として選択し、
Figure 0007464800000166
は、トレーニングパラメータであり、
Figure 0007464800000167
にて求められ、サンプル
Figure 0007464800000168
が種別
Figure 0007464800000169
に属する距離類似度スコア
Figure 0007464800000170

Figure 0007464800000171
により求め、スコアが大きいほど、サンプル
Figure 0007464800000172
は、種別
Figure 0007464800000173
に類似する。
Figure 0007464800000174
は、トレーニングパラメータであり、一般的に(0,1)とし、本発明では、2つの側面を考慮し、距離類似度スコアをより全面的且つ正確に算出することができる。
サンプル
Figure 0007464800000175
が種別
Figure 0007464800000176
として予測される確率
Figure 0007464800000177

Figure 0007464800000178
により求め、
Figure 0007464800000179
は、
Figure 0007464800000180
中の何れかの種別である。
Figure 0007464800000181
中のサンプル種別の実際結果及び認識結果に基づいて、メタ学習モデルの損失を算出し、Adamアルゴリズムで逆伝播を行ってパラメータを更新し、メタ学習モデルの損失関数
Figure 0007464800000182

Figure 0007464800000183
により求め、上記過程を合計M回行い、予めトレーニングされた医療因子及びイベントメタ学習モデルをトレーニングによって取得する。
d)取得された予めトレーニングされた医療因子及びイベントメタ学習モデルを引き続き
Figure 0007464800000184
においてトレーニングし、モデルのパラメータを最適化し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを取得する。認識時に、
Figure 0007464800000185
中の医療因子及びイベントサンプルを医療因子及びイベントメタ学習モデルに送り込み、対応する種別を取得する。
ステップ三、医療因子の認識:系列エンコーダモデル及び負サンプリング方法に基づいて、医療因子に対して分類認識を行い、主に以下の4つのステップを含む。
3.1では、中国語電子カルテテキストの系列エンコーダモデルをトレーニングし、テキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得し、系列エンコーダモデルは、双方向自己注意言語モデル(BERT)であることが好ましい。
3.2では、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られた医療因子断片について、取得された文字レベルの意味ベクトル表現に基づいて、医療因子断片の特徴表現を算出する。
3.3では、医療因子断片の特徴表現に基づいて、意味類似度を用いて医療因子断片を分類し、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片について、負サンプリングサンプルを構築し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて医療因子種別の重みを取得する。
3.4では、医療因子種別の重みに基づいて、医療因子と負サンプリングサンプルとの医療因子認識モデルにおける損失を算出し、医療因子認識モデルのパラメータを更新し、図3に示される。
具体的な実施の詳細は、下記のようになる。
a)遠隔教師あり方法でラベル付けされた医療因子を用いて医療因子認識モデルをトレーニングする
入力された中国語電子カルテテキストを
Figure 0007464800000186
と記し、
Figure 0007464800000187
は、入力されたテキスト長さである。遠隔教師あり方法でラベル付けして得られたサンプルを
Figure 0007464800000188
と記し、サンプル断片を
Figure 0007464800000189
と記し、
Figure 0007464800000190
は、サンプル断片
Figure 0007464800000191
のテキスト
Figure 0007464800000192
における開始位置と終了位置をそれぞれ示し、
Figure 0007464800000193
は、サンプルに対応する種別である。
双方向自己注意言語モデルを用いてテキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得する。双方向自己注意言語モデルは、トレーニングと同時にテキストの正方向と逆方向のコンテキスト情報を用いてトレーニングを行い、テキストの意味ベクトルを非常に良好に表すことができる。双方向自己注意言語モデルにおけるネットワークの入力は、1つ上の階層のネットワーク自己注意メカニズムの出力に由来する。
医療因子の認識時に、テキスト
Figure 0007464800000194
について、双方向自己注意言語モデルによってその各文字の意味ベクトル
Figure 0007464800000195
を取得する。
次に、サンプル
Figure 0007464800000196
について、サンプル断片
Figure 0007464800000197
の特徴表現
Figure 0007464800000198

Figure 0007464800000199
により求め、
Figure 0007464800000200
は、ベクトルのつなぎ合わせを示し、
Figure 0007464800000201
は、ベクトルの対応する位置における要素の内積演算を示す。
最後に、サンプル断片の特徴表現を非線形変換し、サンプルが各種別に属する確率分布
Figure 0007464800000202

Figure 0007464800000203
により求めて出力し、
Figure 0007464800000204
は、トレーニングパラメータであり、
Figure 0007464800000205
の出力次元は、サンプル種別数であり、
Figure 0007464800000206
とし、即ち、
Figure 0007464800000207
にて示され、
Figure 0007464800000208
は、サンプル断片
Figure 0007464800000209
が種別
Figure 0007464800000210
に属する確率を示す。
b)医療因子及びイベントメタ学習モデルに基づいて負サンプリングを行ってラベルなし医療因子断片の影響を軽減する
遠隔教師あり方法でデータをラベル付けする時に、構築された医療イベントライブラリと使用されるルールが限られた医療因子断片のみをカバーでき、全ての医療因子をカバーできず、真の医療因子断片が負サンプルとしてラベル付けされる場合もあり、これらの医療因子としてラベル付けされていない断片が医療因子認識モデルの結果へ大きな影響を与える。本発明では、トレーニング時に、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片に対して負サンプリングを行うとともに、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いてサンプリングサンプルの種別重みを取得することにより、医療因子認識モデルの小サンプル弱ラベル付け条件での凡化性を向上させる。
全てのサンプルセットを
Figure 0007464800000211
とし、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片数を
Figure 0007464800000212
とし、
Figure 0007464800000213
個のサンプルをランダムにサンプリングし、負サンプリングサンプルセット
Figure 0007464800000214
を構成し、
Figure 0007464800000215
とする。負サンプリングサンプルセットを医療因子及びイベントメタ学習モデルに送り込み、負サンプリングサンプル
Figure 0007464800000216
が各種別の医療因子に属する確率を取得し、当該確率値作為重み
Figure 0007464800000217

Figure 0007464800000218
と示し、
Figure 0007464800000219
は、予測されたサンプル種別であり、合計
Figure 0007464800000220
種別の医療因子があるとすると、構造グローバル損失関数
Figure 0007464800000221

Figure 0007464800000222
に構成し、この損失関数を用いて勾配逆伝播を経て医療因子認識モデルのパラメータを更新する。
ステップ四、医療イベント認識:医療因子重要度と医療イベントの距離類似度スコアに基づいて、医療イベントに対して分類認識を行い、主に以下の3つのステップを含む。
4.1では、医療イベントライブラリに基づいて各種別の医療イベントにおける医療因子の共起性及びイベント関連性特徴を算出し、複数の専門家が医療イベント種別中の医療因子種別について採点した状況と組み合わせ、各種別の医療イベントの医療因子重要度スコアを取得する。
4.2では、医療因子認識モデルから出力された中国語電子カルテテキストに存在する医療因子断片を基に、医療因子重要度スコアと組み合わせ、各種別の医療イベントの確率分布を取得する。
4.3では、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて、中国語電子カルテテキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコアを算出し、ステップ4.2における各種別の医療イベントの確率分布と組み合わせ、対応する医療イベント種別を計算によって取得し、図4に示される。
具体的な実施の詳細は、下記のようになる。
医療イベントテキストの意味が複雑であり、形式も統一されにくく、医療イベントのトリガ単語が定義されにくい問題を考慮し、本発明では、医療因子に基づいて医療イベントを認識する。それとともに、小サンプル弱ラベル付け条件でのモデルの凡化性及び正確性を向上させるために、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて中国語電子カルテテキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコアの側面から医療イベントをモデル化して認識する。
a)医療イベントライブラリ及び専門家の採点状況を用いて医療因子重要度スコアを算出し、同一の医療イベントにおいて、異なる医療因子の重要度合いが異なる。例えば、症状イベントに関し、時間、頻度等の医療因子よりも、症状は、重要因子であり、また、1つの医療イベントの記述テキストが全ての定義の医療因子をカバーできないことは、一般的である。医療因子を用いて医療イベントを認識するときに、構築された医療イベントライブラリ及び専門家の採点状況に基づいて各種別の医療イベントにおける異なる医療因子の重要度スコアを算出し、医療因子認識モデルから出力された医療因子断片と組み合わせて医療イベントを認識する。
b)構築された医療イベントライブラリについて、医療因子種別
Figure 0007464800000223
の医療イベント種別
Figure 0007464800000224
における共起性スコア
Figure 0007464800000225

Figure 0007464800000226
により求め、
Figure 0007464800000227
は、医療イベントライブラリにおいて医療因子種別
Figure 0007464800000228
と医療イベント種別
Figure 0007464800000229
とがともに現れた回数を表し、
Figure 0007464800000230
は、医療イベントライブラリにおいて医療イベント種別
Figure 0007464800000231
が現れた回数を表す。
医療因子と医療イベントの関連性スコアを算出し、異なる医療因子種別と医療イベント関連性を区分する。同一の種別医療因子が非常に多い医療イベント種別に現れた場合に、当該類医療因子と各種別の医療イベントとの関連性が悪いと考えられる。
Figure 0007464800000232
と示し、
Figure 0007464800000233
は、医療因子種別
Figure 0007464800000234
と医療イベント種別
Figure 0007464800000235
の関連性スコアを表し、
Figure 0007464800000236
は、医療イベントライブラリにおいて医療因子種別
Figure 0007464800000237
が現れた回数を表す。
医療因子種別
Figure 0007464800000238
の医療イベント種別
Figure 0007464800000239
における重要度スコア
Figure 0007464800000240

Figure 0007464800000241
により求める。
c)医学専門家の指導の下で、具体的なルールを定めて医療因子の重要度スコアを更に算出する。医療因子を医療イベントの基本次元とし、複数の専門家が同時に医療因子について採点したとし、専門家数を
Figure 0007464800000242
とする。専門家
Figure 0007464800000243
が医療イベント種別
Figure 0007464800000244
中の医療因子種別
Figure 0007464800000245
について採点したスコアを
Figure 0007464800000246
とし、スコアが整数であり且つ同一の専門家が各医療因子について採点したスコアが必ず異なると規定し、スコアの値範囲を
Figure 0007464800000247
とし、
Figure 0007464800000248
は、医療イベント種別
Figure 0007464800000249
中の医療因子種別の総数である。最終の医療イベント種別
Figure 0007464800000250
中の医療因子種別
Figure 0007464800000251
の正規化された専門家スコア
Figure 0007464800000252

Figure 0007464800000253
により求める。例えば、投薬イベントに関し、3人の専門家が採点に参加することを例とし、3人の専門家は、それぞれ医療因子について採点し、下記のようになる。
Figure 0007464800000254
複数の専門家の採点状況に基づいて、各投薬イベント中薬物、投薬方式、時間のスコアを算出して
Figure 0007464800000255
という結果を得る。
医療因子種別
Figure 0007464800000256
の医療イベント種別
Figure 0007464800000257
における最終重要度スコア
Figure 0007464800000258

Figure 0007464800000259
により求める。
d)入力された中国語電子カルテテキストを
Figure 0007464800000260
と記し、
Figure 0007464800000261
は、入力されたテキスト長さであり、医療因子認識モデルの予測によって得られた医療因子を
Figure 0007464800000262
と記し、
Figure 0007464800000263
は、テキストにおける医療因子数であり、医療イベント種別が合計Η個あるとする。医療因子重要度スコアと組み合わせ、テキスト
Figure 0007464800000264
が医療イベント種別
Figure 0007464800000265
に属する確率分布
Figure 0007464800000266

Figure 0007464800000267
により求める。
e)中国語電子カルテテキスト
Figure 0007464800000268
を医療因子及びイベントメタ学習モデルに送り込み、テキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコア
Figure 0007464800000269
を算出し、距離類似度スコアと医療イベントの確率分布とを組み合わせ、テキスト
Figure 0007464800000270
が医療イベント種別
Figure 0007464800000271
に属するスコア
Figure 0007464800000272

Figure 0007464800000273
により求め、スコアが最も高い医療イベント種別
Figure 0007464800000274
を最終テキスト
Figure 0007464800000275
の医療イベントとし、
Figure 0007464800000276
と示す。
本発明の別の態様は、小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識システムを提供し、図5に示すように、当該システムは、医療イベントライブラリ構築及びデータラベル付けモジュールと、医療因子及びイベントメタ学習モジュールと、医療因子認識モジュールと、医療イベント認識モジュールとを備える。
医療イベントライブラリ構築及びデータラベル付けモジュールは、専門家知識に基づいて、医療イベント種別と各種別に対応する医療因子とを含む医療イベントライブラリを定義して構築し、医療イベントライブラリに基づいて遠隔教師あり方法を用いて中国語電子カルテテキストに対して医療因子のラベル付けを行い、医療因子認識モデルのトレーニングデータを生成する。当該モジュールの実施は、上記ステップ一を参照可能である。
医療因子及びイベントメタ学習モジュールは、各分野に公開された中国語イベント及び因子ラベル付けコーパスをトレーニングセットとして選択してサンプリングし、対応するトレーニング―サポートセット及びトレーニング―検索セットを複数回のサンプリングによって取得し、トレーニング―サポートセットに基づいて対応するイベント及び因子のプロトタイプ表現を構築し、トレーニング―検索セットサンプルとプロトタイプ表現の距離類似度スコアを算出し、実際結果及び認識結果に基づいてメタ学習モデルの損失を算出し、前記メタ学習モデルのパラメータを更新し、小サンプル医療因子及びイベントデータセットをテストセットとし、対応するテスト―サポートセット及びテスト―検索セットをサンプリングによって取得し、トレーニングによって得られたメタ学習モデルをテスト―サポートセットにおいて更にトレーニングして医療因子及びイベントメタ学習モデルを取得する。当該モジュールの実施は、上記ステップ二を参照可能である。
医療因子認識モジュールは、中国語電子カルテテキストの系列エンコーダモデルをトレーニングし、テキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得し、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られた医療因子断片について、医療因子断片の特徴表現を算出し、意味類似度を用いて医療因子断片を分類し、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片について、負サンプリングサンプルを構築し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて医療因子種別の重みを取得し、医療因子と負サンプリングサンプルとの医療因子認識モデルにおける損失を算出し、医療因子認識モデルのパラメータを更新する。当該モジュールの実施は、上記ステップ三を参照可能である。
医療イベント認識モジュールは、医療イベントライブラリに基づいて各種別の医療イベントにおける医療因子の共起性及びイベント関連性特徴を算出し、専門家が医療イベント種別中の医療因子種別について採点した状況と組み合わせ、各種別の医療イベントの医療因子重要度スコアを取得し、医療因子認識モデルから出力された中国語電子カルテテキストに存在する医療因子断片を基に、各種別の医療イベント確率分布を取得し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて中国語電子カルテテキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコアを算出し、各種別の医療イベント確率分布と組み合わせ、対応する医療イベント種別を取得する。当該モジュールの実施は、上記ステップ四を参照可能である。
また、システムは、医療イベント種別を表示するための認識結果表示モジュールを更に備える。
本発明は、小サンプル弱ラベル付け条件において大規模の中国語電子カルテテキストにおける医療イベント及び因子の自動認識を実現し、従来のイベント認識方法及びシステムの凡化性が悪く、ルールが統一されにくく、大量の人件費を必要とするという問題を解決する。また、本発明は、医療イベントのトリガ単語が定義されにくい問題を解決し、医療イベントを効果的に認識することができる。
上述したのは、本発明の好適な実施形態に過ぎない。本発明が好ましい実施例で上述されたが、これらの実施例は、本発明を限定するものではない。当業者であれば、本発明の技術的解決手段の範囲から逸脱することなく、上記開示された方法及び技術内容を利用して本発明の技術的解決手段に対して多くの可能な変動及び修飾を行い、又は同等変化の等価実施例に修正することができる。したがって、本発明の技術的解決手段の内容から逸脱せず、本発明の技術的思想に基づいて以上の実施例に対して行われたいかなる簡単な修正、均等変化及び修飾は、いずれも依然として本発明の技術的解決手段の保護範囲内に含まれる。

Claims (9)

  1. 医療イベントライブラリ構築及びデータラベル付けモジュールと、医療因子及びイベントメタ学習モジュールと、医療因子認識モジュールと、医療イベント認識モジュールとを備える小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識システムが実行する小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法であって、
    前記医療イベントライブラリ構築及びデータラベル付けモジュールが医療イベントライブラリの構築及びデータのラベル付けを行うステップ一と、
    前記医療因子及びイベントメタ学習モジュールが医療因子及びイベントのメタ学習を行うステップ二と、
    前記医療因子認識モジュールが医療因子を認識するステップ三と、
    前記医療イベント認識モジュールが医療イベントを認識するステップ四とを含み、
    前記ステップ一では、専門家知識に基づいて、医療イベント種別と各種別に対応する医療因子とを含む医療イベントライブラリを定義して構築し、医療イベントライブラリに基づいて遠隔教師あり方法を用いて中国語電子カルテテキストに対して医療因子のラベル付けを行い、医療因子認識モデルのトレーニングデータを生成し、
    前記ステップ二は、サブステップ2.1~サブステップ2.4を含み、
    前記サブステップ2.1では、各分野に公開された中国語イベント及び因子ラベル付けコーパスをトレーニングセットとして選択してサンプリングし、対応するトレーニング―サポートセット及びトレーニング―検索セットを複数回のサンプリングによって取得し、
    前記サブステップ2.2では、トレーニング―サポートセットに基づいて、対応するイベント及び因子のプロトタイプ表現を構築し、
    前記サブステップ2.3では、因子及びイベントのプロトタイプ表現に基づいて、トレーニング―検索セットサンプルとプロトタイプ表現の距離類似度スコアを算出し、実際結果及び認識結果に基づいてメタ学習モデルの損失を算出し、前記メタ学習モデルのパラメータを更新し、
    前記サブステップ2.4では、小サンプル医療因子及びイベントデータセットをテストセットとし、対応するテスト―サポートセット及びテスト―検索セットをサンプリングによって取得し、トレーニングによって得られたメタ学習モデルをテスト―サポートセットにおいて更にトレーニングして医療因子及びイベントメタ学習モデルを取得し、
    前記ステップ三は、サブステップ3.1~サブステップ3.4を含み、
    前記サブステップ3.1では、中国語電子カルテテキストの系列エンコーダモデルをトレーニングし、テキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得し、入力された中国語電子カルテテキストを
    Figure 0007464800000277
    (ただし、
    Figure 0007464800000278
    は、入力されたテキスト長さである)と記し、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られたサンプルを
    Figure 0007464800000279
    と記し、サンプル断片を
    Figure 0007464800000280
    と記し、
    Figure 0007464800000281
    は、サンプル断片
    Figure 0007464800000282
    のテキスト
    Figure 0007464800000283
    における開始位置と終了位置をそれぞれ示し、
    Figure 0007464800000284
    は、サンプルに対応する種別であり、
    前記サブステップ3.2では、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られた医療因子断片について、取得された文字レベルの意味ベクトル表現に基づいて、医療因子断片の特徴表現を算出し、医療因子の認識時に、テキスト
    Figure 0007464800000285
    について、系列エンコーダモデルを介して各文字の意味ベクトル
    Figure 0007464800000286
    を取得し、
    サンプル
    Figure 0007464800000287
    について、サンプル断片
    Figure 0007464800000288
    の特徴表現
    Figure 0007464800000289

    Figure 0007464800000290
    により求め、
    Figure 0007464800000291
    は、ベクトルのつなぎ合わせを示し、
    Figure 0007464800000292
    は、ベクトルの対応する位置における要素の内積演算を示し、
    サンプル断片の特徴表現を非線形変換し、サンプルが各種別に属する確率分布
    Figure 0007464800000293

    Figure 0007464800000294
    により求めて出力し、
    Figure 0007464800000295
    は、トレーニングパラメータであり、
    Figure 0007464800000296
    の出力次元は、サンプル種別数であり、
    Figure 0007464800000297
    とし、
    Figure 0007464800000298
    にて示され、
    Figure 0007464800000299
    は、サンプル断片
    Figure 0007464800000300
    が種別
    Figure 0007464800000301
    に属する確率を示し、
    前記サブステップ3.3では、医療因子断片の特徴表現に基づいて、意味類似度を用いて医療因子断片を分類し、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片について、負サンプリングサンプルを構築し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて医療因子種別の重みを取得し、
    前記サブステップ3.4では、医療因子種別の重みに基づいて、医療因子と負サンプリングサンプルとの医療因子認識モデルにおける損失を算出し、前記医療因子認識モデルのパラメータを更新し、
    前記ステップ四は、サブステップ4.1~サブステップ4.3を含み、
    前記サブステップ4.1では、医療イベントライブラリに基づいて各種別の医療イベントにおける医療因子の共起性及びイベント関連性特徴を算出し、専門家が医療イベント種別中の医療因子種別について採点した状況と組み合わせ、各種別の医療イベントの医療因子重要度スコアを取得し、
    前記サブステップ4.2では、医療因子認識モデルから出力された中国語電子カルテテキストに存在する医療因子断片を基に、医療因子重要度スコアと組み合わせ、各種別の医療イベントの確率分布を取得し、
    前記サブステップ4.3では、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて、中国語電子カルテテキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコアを算出し、ステップ4.2における各種別の医療イベントの確率分布と組み合わせ、対応する医療イベント種別を計算によって取得することを特徴とする小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法。
  2. 前記ステップ一では、前記医療イベントライブラリのデータは、小サンプル医療因子及びイベントデータセットと外部医学資源とに由来し、前記医療イベント種別は、個人基本情報イベント、家族疾患イベント、過去疾患イベント、投薬イベント、アレルギーイベント、手術イベント、症状イベント、治療イベント及び診断イベントを含むことを特徴とする請求項1に記載の小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法。
  3. 前記ステップ一では、医療因子ライブラリを構築してから医療イベントライブラリを構築し、
    前記医療因子ライブラリの構築過程は、
    小サンプル医療因子及びイベントデータセットにおける2回以上現れた医療因子を対応する医療因子種別に応じて対応する種別の医療因子ライブラリに加えるステップa)と、
    公開された高品質の外部医学資源の一部を選別して処理して対応する医療因子ライブラリに加えるステップb)とを含み、
    前記医療イベントライブラリの構築において、小サンプル医療因子及びイベントデータセットにおけるラベル付けの小サンプル医療イベント及び医療因子種別を統計し、各ラベル付けのイベント及び因子について、対応関係を確立して記憶記録を行うことを特徴とする請求項2に記載の小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法。
  4. 前記ステップ一では、遠隔教師あり方法を用いて医療因子をラベル付けすることは、処理a)と、処理b)と、処理c)と、を含み、
    前記処理a)では、中国語電子カルテテキスト
    Figure 0007464800000302
    に対して無効文字のクリア、大文字小文字変換、句読点変換、文分割処理を行い、
    前記処理b)では、中国語電子カルテテキスト
    Figure 0007464800000303
    について、医療因子ライブラリを用いてマッチングを行い、疾患、薬物、症状、手術、原因、治療、診断との7種別に属さない医療因子について、医療因子ライブラリにマッチングする方法でラベル付けすることなく、ルールに基づく方式でラベル付け及び抽出を行い、
    前記処理c)では、医療因子ライブラリにおける医療因子の最大断片長さ
    Figure 0007464800000304
    を統計し、遠隔教師あり方法でラベル付けするときに断片の最大長さを
    Figure 0007464800000305
    と規定し、マッチングによって得られた医療因子断片テキストに対して断片ラベル付けの方式でラベル付けを行い、医療因子としてマッチングされていない他のテキスト断片を負サンプルとしてラベル付けし、ラベル付けされたサンプルを
    Figure 0007464800000306
    と記し、サンプル断片を
    Figure 0007464800000307
    と記し、
    Figure 0007464800000308
    は、サンプル断片
    Figure 0007464800000309
    のテキスト
    Figure 0007464800000310
    における開始位置と終了位置をそれぞれ示し、
    Figure 0007464800000311
    は、サンプルに対応する種別であることを特徴とする請求項3に記載の小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法。
  5. 前記ステップ2.2において、トレーニング―サポートセットに基づいて、対応するイベント及び因子のプロトタイプ表現を構築することは、各種別のサンプルの意味ベクトルを高次元の特徴空間に投影し、各サンプルの特徴を次元に応じて加算平均して種別のプロトタイプ表現とすることを含むことを特徴とする請求項1に記載の小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法。
  6. 前記ステップ2.3において、距離類似度スコアは、Bregmanダイバージェンス
    Figure 0007464800000312
    と余弦類似度スコア
    Figure 0007464800000313
    との2つの部分を含み、
    Bregmanダイバージェンス
    Figure 0007464800000314
    は、
    Figure 0007464800000315
    にて求められ、
    Figure 0007464800000316
    は、ユークリッド距離の計算関数であり、
    Figure 0007464800000317
    は、因子又はイベントサンプル
    Figure 0007464800000318
    の特徴表現であり、
    Figure 0007464800000319
    は、種別
    Figure 0007464800000320
    のプロトタイプ表現であり、
    余弦類似度スコア
    Figure 0007464800000321
    は、
    Figure 0007464800000322
    にて求められ、
    Figure 0007464800000323
    は、種別
    Figure 0007464800000324
    の特徴表現であり、
    Figure 0007464800000325
    は、トレーニングパラメータであり、
    サンプル
    Figure 0007464800000326
    が種別
    Figure 0007464800000327
    に属する距離類似度スコア
    Figure 0007464800000328

    Figure 0007464800000329
    により求め、
    Figure 0007464800000330
    は、トレーニングパラメータであり、
    サンプル
    Figure 0007464800000331
    が種別
    Figure 0007464800000332
    として予測される確率
    Figure 0007464800000333

    Figure 0007464800000334
    により求め、
    Figure 0007464800000335
    は、トレーニング―検索セット
    Figure 0007464800000336
    中の何れかの種別であり、
    トレーニング―検索セットにおけるサンプル種別の実際結果及び認識結果に基づいて、メタ学習モデルの損失を算出し、Adamアルゴリズムで逆伝播を行ってパラメータを更新し、メタ学習モデルの損失関数
    Figure 0007464800000337

    Figure 0007464800000338
    により求めることを特徴とする請求項5に記載の小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法。
  7. 前記ステップ三では、全てのサンプルセットを
    Figure 0007464800000339
    とし、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片数を
    Figure 0007464800000340
    とし、
    Figure 0007464800000341
    個のサンプルをランダムにサンプリングして負サンプリングサンプルセット
    Figure 0007464800000342
    (ただし、
    Figure 0007464800000343
    )を構成し、負サンプリングサンプルセットを医療因子及びイベントメタ学習モデルに送り込み、負サンプリングサンプル
    Figure 0007464800000344
    が各種別の医療因子に属する確率を取得し、確率値を重み
    Figure 0007464800000345
    とし、
    Figure 0007464800000346
    と示し、
    Figure 0007464800000347
    は、予測されたサンプル種別であり、合計
    Figure 0007464800000348
    種別の医療因子があるとすると、グローバル損失関数
    Figure 0007464800000349

    Figure 0007464800000350
    に構成し、
    損失関数
    Figure 0007464800000351
    を用いて勾配逆伝播を経て医療因子認識モデルのパラメータを更新することを特徴とする請求項1に記載の小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法。
  8. 前記ステップ四では、構築された医療イベントライブラリについて、医療因子種別
    Figure 0007464800000352
    の医療イベント種別
    Figure 0007464800000353
    における重要度スコア
    Figure 0007464800000354

    Figure 0007464800000355
    により求め、
    Figure 0007464800000356
    は、医療因子種別
    Figure 0007464800000357
    の医療イベント種別
    Figure 0007464800000358
    における共起性スコアであり、
    Figure 0007464800000359
    は、医療因子種別
    Figure 0007464800000360
    と医療イベント種別
    Figure 0007464800000361
    との関連性スコアであり、
    医療因子を医療イベントの基本次元とし、複数の専門家が同時に医療因子について採点したとし、専門家
    Figure 0007464800000362
    が医療イベント種別
    Figure 0007464800000363
    中の医療因子種別
    Figure 0007464800000364
    について採点したスコアが
    Figure 0007464800000365
    であり、スコアが整数であり且つ同一の専門家が各医療因子について採点したスコアが必ず異なると規定し、スコアの値範囲を
    Figure 0007464800000366
    とし、
    Figure 0007464800000367
    は、医療イベント種別
    Figure 0007464800000368
    中の医療因子種別の総数であり、最終の医療イベント種別
    Figure 0007464800000369
    中の医療因子種別
    Figure 0007464800000370
    の正規化された専門家スコア
    Figure 0007464800000371

    Figure 0007464800000372
    により求め、
    Figure 0007464800000373
    は、専門家数であり、医療因子種別
    Figure 0007464800000374
    の医療イベント種別
    Figure 0007464800000375
    における最終重要度スコア
    Figure 0007464800000376

    Figure 0007464800000377
    により求め、
    入力された中国語電子カルテテキストを
    Figure 0007464800000378
    と記し、
    Figure 0007464800000379
    は、入力されたテキスト長さであり、医療因子認識モデルの予測によって得られた医療因子を
    Figure 0007464800000380
    と記し、
    Figure 0007464800000381
    は、テキストにおける医療因子数であり、医療イベント種別が合計Η個あるとし、医療因子重要度スコアと組み合わせ、テキスト
    Figure 0007464800000382
    が医療イベント種別
    Figure 0007464800000383
    に属する確率分布
    Figure 0007464800000384

    Figure 0007464800000385
    により求め、
    中国語電子カルテテキスト
    Figure 0007464800000386
    を医療因子及びイベントメタ学習モデルに送り込み、テキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコア
    Figure 0007464800000387
    を算出し、距離類似度スコアと医療イベントの確率分布とを組み合わせ、テキスト
    Figure 0007464800000388
    が医療イベント種別
    Figure 0007464800000389
    に属するスコア
    Figure 0007464800000390

    Figure 0007464800000391
    により求め、スコアが最も高い医療イベント種別
    Figure 0007464800000392
    を最終テキスト
    Figure 0007464800000393
    の医療イベントとし、
    Figure 0007464800000394
    と示すことを特徴とする請求項1に記載の小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識方法。
  9. 小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識システムであって、
    医療イベントライブラリ構築及びデータラベル付けモジュールと、医療因子及びイベントメタ学習モジュールと、医療因子認識モジュールと、医療イベント認識モジュールとを備え、
    前記医療イベントライブラリ構築及びデータラベル付けモジュールは、専門家知識に基づいて、医療イベント種別と各種別に対応する医療因子とを含む医療イベントライブラリを定義して構築し、医療イベントライブラリに基づいて遠隔教師あり方法を用いて中国語電子カルテテキストに対して医療因子のラベル付けを行い、医療因子認識モデルのトレーニングデータを生成し、
    前記医療因子及びイベントメタ学習モジュールは、各分野に公開された中国語イベント及び因子ラベル付けコーパスをトレーニングセットとして選択してサンプリングし、対応するトレーニング―サポートセット及びトレーニング―検索セットを複数回のサンプリングによって取得し、トレーニング―サポートセットに基づいて対応するイベント及び因子のプロトタイプ表現を構築し、トレーニング―検索セットサンプルとプロトタイプ表現の距離類似度スコアを算出し、実際結果及び認識結果に基づいてメタ学習モデルの損失を算出し、前記メタ学習モデルのパラメータを更新し、小サンプル医療因子及びイベントデータセットをテストセットとし、対応するテスト―サポートセット及びテスト―検索セットをサンプリングによって取得し、トレーニングによって得られたメタ学習モデルをテスト―サポートセットにおいて更にトレーニングして医療因子及びイベントメタ学習モデルを取得し、
    前記医療因子認識モジュールは、中国語電子カルテテキストの系列エンコーダモデルをトレーニングし、テキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得し、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られた医療因子断片について、医療因子断片の特徴表現を算出し、意味類似度を用いて医療因子断片を分類し、医療因子認識モデルがトレーニング中に予測した全ての非医療因子断片について、負サンプリングサンプルを構築し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて医療因子種別の重みを取得し、医療因子と負サンプリングサンプルとの医療因子認識モデルにおける損失を算出し、医療因子認識モデルのパラメータを更新し、
    遠隔教師あり方法でラベル付けされた医療因子を用いて医療因子認識モデルをトレーニングすることは、
    入力された中国語電子カルテテキストを
    Figure 0007464800000395
    (ただし、
    Figure 0007464800000396
    は、入力されたテキスト長さである)と記し、遠隔教師あり方法でラベル付けして得られたサンプルを
    Figure 0007464800000397
    と記し、サンプル断片を
    Figure 0007464800000398
    と記し、
    Figure 0007464800000399
    は、サンプル断片
    Figure 0007464800000400
    のテキスト
    Figure 0007464800000401
    における開始位置と終了位置をそれぞれ示し、
    Figure 0007464800000402
    は、サンプルに対応する種別であり、
    系列エンコーダモデルを用いてテキストの文字レベルの意味ベクトル表現を取得し、医療因子の認識時に、テキスト
    Figure 0007464800000403
    について、系列エンコーダモデルを介して各文字の意味ベクトル
    Figure 0007464800000404
    を取得し、
    サンプル
    Figure 0007464800000405
    について、サンプル断片
    Figure 0007464800000406
    の特徴表現
    Figure 0007464800000407

    Figure 0007464800000408
    により求め、
    Figure 0007464800000409
    は、ベクトルのつなぎ合わせを示し、
    Figure 0007464800000410
    は、ベクトルの対応する位置における要素の内積演算を示し、
    サンプル断片の特徴表現を非線形変換し、サンプルが各種別に属する確率分布
    Figure 0007464800000411

    Figure 0007464800000412
    により求めて出力し、
    Figure 0007464800000413
    は、トレーニングパラメータであり、
    Figure 0007464800000414
    の出力次元は、サンプル種別数であり、
    Figure 0007464800000415
    とし、
    Figure 0007464800000416
    にて示され、
    Figure 0007464800000417
    は、サンプル断片
    Figure 0007464800000418
    が種別
    Figure 0007464800000419
    に属する確率を示し、
    前記医療イベント認識モジュールは、医療イベントライブラリに基づいて各種別の医療イベントにおける医療因子の共起性及びイベント関連性特徴を算出し、専門家が医療イベント種別中の医療因子種別について採点した状況と組み合わせ、各種別の医療イベントの医療因子重要度スコアを取得し、医療因子認識モデルから出力された中国語電子カルテテキストに存在する医療因子断片を基に、各種別の医療イベント確率分布を取得し、医療因子及びイベントメタ学習モデルを用いて中国語電子カルテテキストと各種別の医療イベントの距離類似度スコアを算出し、各種別の医療イベント確率分布と組み合わせ、対応する医療イベント種別を取得することを特徴とする小サンプル弱ラベル付け条件での医療イベント認識システム。
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