JP7462574B2 - ジオキセタン化合物及び微生物検出のためのそれらの使用 - Google Patents
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Description
、酵素不安定基でマスキングされて、ルシフェラーゼの存在下での光放出を、同じく酵素不安定基上で作用する酵素が存在する状況で、制限することができる。例えばMasuda-Nishimuraらは、D-ルシフェリン-6-O-ベータ-D-ガラクトピラノシドを発光原基質として用いた大腸菌群の検出を報告した(Masuda-Nishimura et al. (2000), Letters in Applied Microbiology, 30: 130-135)。
Hananya, N., Gutkin, S., Bauer, CR., Shabat, D., ACS Central Sci., 2017, 4, 349-58)は、酵素不安定基(enzyme-labile groups)でマスキングされていて酵素活性の検出に適する、水性条件下での使用に適した化学発光ジオキセタンプローブを開示している。
」の条件下で微生物を検出するための化学発光プローブの開発は、プローブと、酵素不安
定性保護基を脱離するのに必要となる微生物の酵素と、化学発光反応の環境(即ち、微生物を含む培地)との複雑な相互作用のため、特に困難な課題である。微生物の検出のための適切な化学発光プローブは、(i)検出される微生物にとって非毒性でなければならず、(ii)水性培地中で高度な安定性を有さなければならず、(iii)所与の培地中で強い化学発光シグナルを発生することができなければならず、(iv)酵素不安定性保護基を脱離する酵素の部位(例えば、グラム陰性菌のペリプラズム空間、内膜の外面又は内面、サイトゾルなど)に到達することができなければならない。その上、明白な理由として、微生物の検出のための化学発光プローブは、安価で、かつ利便性がなければならない。
酸化から生じた過酸化水素の指標、又は栄養素、基質、代謝産物若しくは試薬酵素による作用の副生成物の役割を担う無機リン酸塩の検出を利用した、バクテリア、バクテリア断片(例えば、LPS、内毒素)、ウイルス、真菌及び他の病原体をはじめとする微生物の有無の検出、定量及び同定に用いられ得る化学発光プローブ(及び方法)が、提供されなければならない。
R1は、酵素不安定基、及び式-B(Z)(Z’)又は-B(Z’’)3 -Kat+を有するホウ素含有基から選択される分析物応答基であり;
Z及びZ’は、独立して、R4及びOR5から選択され、
ここでR4は、-OH、-O-Kat+、任意に置換されたC1~C4アルキル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルキル、任意に置換されたC2~C4アルケニル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルケニル、任意に置換されたC2~C4アルキニル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルキニル、任意に置換されたC5~C6アリール、任意に置換されたC5~C6ヘテロアリール、任意に置換されたC6~C10アラルキル、及び任意に置換されたC6~C10ヘテロアラルキルからなる群から選択され、
R5は、-H、任意に置換されたC1~C4アルキル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルキル、任意に置換されたC2~C4アルケニル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルケニル、任意に置換されたC2~C4アルキニル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルキニル、任意に置換されたC5~C6アリール、任意に置換されたC5~C6ヘテロアリール、任意に置換されたC6~C10アラルキル、及び任意に置換されたC6~C10ヘテロアラルキルからなる群から選択されるか、又は
2個のR4、2個のR5、若しくは1個のR4と1個のR5が、介在する原子と一緒になって、5~7員の任意に置換された複素環、好ましくは飽和されていて任意に置換された複素環を形成しており;
Z’’は、F、Cl、Br、Iから選択され、好ましくはZ’’は、Fであり;
Kat+は、有機又は無機のカチオン、好ましくアルカリ金属カチオンであり;
Lは、分析物応答基R1での分析物の作用の際に、式Iで示される化合物の残り部分から放出される自壊性リンカー基であり、Lは、ペプチド、好ましくは細胞貫通ペプチド、エンドリジン又はタンパク質により任意に機能化されており;
R1が、酵素不安定基である場合、nは1で、mは1であるか、又はnは0で、mは1であり;
R1が、-B(Z)(Z’)又は-B(Z’’)3 -Kat+である場合、n及びmは、両者とも0又は両者とも1であり;
R1が、
RA及びRCは、独立して、H、F、Cl、Br、I、CF3及びR2-Q-から、好ましくはH、Cl及びR2-Qから選択されるか、又はRA及びRCの一方は、RBと一緒になって、中心芳香族環のπ系を延長する任意に置換された環若しくは複素環構造を形成しており、他方は、H若しくはR2-Q-であるが;
但し、RA及びRCの両方がHではないことを条件とし、
RBは、Hであるか、又はRA及びRCの一方と一緒になって、前記任意に置換された環若しくは複素環構造を形成しており;
Qは、式Iで示される化合物の中心芳香族環のπ系と共役されたπ系を含む基であり;
R2は、シアノ、ニトロ、スルホキシド、スルホン、任意に置換されたアリール、任意に置換されたアルケニル、
ここでYは、H、任意に置換されたC1~C12アルキル又はアルカリ金属イオンであ
り、
Y’及びY’’は、独立して、H及び任意に置換されたC1~C12アルキルから選択されるか、又は窒素原子と一緒になって、任意に置換された複素環構造、好ましくは任意に置換されたマレイミド基を形成しており;
R3は、H、F、Cl、Br、I、CF3又はR2-Q-であるが、
但し、R3が、R2-Q-である場合、RA及びRCの少なくとも一方、好ましくはRAが、H、F、Cl、Br、I又はCF3、好ましくはClであることを条件とし;
RDは、直鎖状又は分枝状C1~C18アルキル又はC3~C7シクロアルキルから選択され;
RE及びRFは、独立して、分枝状C3~C18アルキル若しくはC3~C7シクロアルキルから選択されるか、又はREとRFが、付着された炭素原子と一緒になって、任意に置換された縮合環、スピロ環若しくは多環を形成している)で示される化合物を提供する。
様、並びに他の目的、利点及び特色は、以下の本発明の詳細な記載及び実施例から明白となろう。
R1は、酵素不安定基、及び式-B(Z)(Z’)又は-B(Z’’)3 -Kat+を有するホウ素含有基から選択される分析物応答基であり;
Z及びZ’は、独立して、R4及びOR5から選択され、
ここでR4は、-OH、-O-Kat+、任意に置換されたC1~C4アルキル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルキル、任意に置換されたC2~C4アルケニル、任意
に置換されたC2~C4ヘテロアルケニル、任意に置換されたC2~C4アルキニル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルキニル、任意に置換されたC5~C6アリール、任意に置換されたC5~C6ヘテロアリール、任意に置換されたC6~C10アラルキル、及び任意に置換されたC6~C10ヘテロアラルキルからなる群から選択され、
R5は、-H、任意に置換されたC1~C4アルキル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルキル、任意に置換されたC2~C4アルケニル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルケニル、任意に置換されたC2~C4アルキニル、任意に置換されたC2~C4ヘテロアルキニル、任意に置換されたC5~C6アリール、任意に置換されたC5~C6ヘテロアリール、任意に置換されたC6~C10アラルキル、及び任意に置換されたC6~C10ヘテロアラルキルからなる群から選択されるか、又は
2個のR4、2個のR5、若しくは1個のR4と1個のR5が、介在する原子と一緒になって、5~7員の任意に置換された複素環、好ましくは飽和されていて任意に置換された複素環を形成しており;
Z’’は、F、Cl、Br、Iから選択され、好ましくはZ’’は、Fであり;
Kat+は、有機又は無機のカチオン、好ましくアルカリ金属カチオンであり;
Lは、分析物応答基R1での分析物の作用の際に、式Iで示される化合物の残り部分から放出される自壊性リンカー基であり、Lは、ペプチド、好ましくは細胞貫通ペプチド、エンドリジン又はタンパク質により任意に機能化されており;
R1が、酵素不安定基である場合、nは1で、mは1であるか、又はnは0で、mは1であり;
R1が、-B(Z)(Z’)又は-B(Z’’)3 -Kat+である場合、n及びmは、両者とも0又は両者とも1であり;
R1が、
RA及びRCは、独立して、H、F、Cl、Br、CF3及びR2-Q-から、好ましくはH、Cl及びR2-Qから選択されるか、又はRA及びRCの一方は、RBと一緒になって、中心芳香族環のπ系を延長する任意に置換された環若しくは複素環構造を形成しており、他方は、H若しくはR2-Q-であるが;
但し、RA及びRCの両方がHではないことを条件とし、
RBは、Hであるか、又はRA及びRCの一方と一緒になって、前記任意に置換された環若しくは複素環構造を形成しており;
Qは、式Iで示される化合物の中心芳香族環のπ系と共役されたπ系を含む基であり;
R2は、シアノ、ニトロ、スルホキシド、スルホン、任意に置換されたアリール、任意に置換されたアルケニル、
ここでYは、H、任意に置換されたC1~C12アルキル又はアルカリ金属イオンであり、
Y’及びY’’は、独立して、H及び任意に置換されたC1~C12アルキルから選択されるか、又は窒素原子と一緒になって、任意に置換された複素環構造、好ましくは任意に置換されたマレイミド基を形成しており;
R3は、H、F、Cl、Br、I、CF3又はR2-Q-であるが、
但し、R3が、R2-Q-である場合、RA及びRCの少なくとも一方、好ましくはRAが、H、F、Cl、Br、I又はCF3、好ましくはClであることを条件とし;
RDは、直鎖状又は分枝状C1~C18アルキル又はC3~C7シクロアルキルから選択され;
RE及びRFは、独立して、分枝状C3~C18アルキル若しくはC3~C7シクロアルキルから選択されるか、又はREとRFが、付着された炭素原子と一緒になって、任意に置換された縮合環、スピロ環若しくは多環を形成している)
CH2)0~4O(CH2)0~1Ph;Roで置換され得る-CH=CHPh;Roで置換され得る-(CH2)0~4O(CH2)0~1-ピリジル;-NO2;-CN;-N3;-(CH2)0~4N(Ro)2;-(CH2)0~4N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)C(S)Ro;-(CH2)0~4N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)C(S)NRo 2;-(CH2)0~4N(Ro)C(O)ORo;-N(Ro)N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)N(Ro)C(O)ORo;-(CH2)0~4C(O)Ro;-C(S)Ro;-(CH2)0~4C(O)ORo;-(CH2)0~4C(O)SRo;-(CH2)0~4C(O)OSiRo 3;-(CH2)0~4OC(O)Ro;-OC(O)(CH2)0~4SRo-;-(CH2)0~4SC(O)Ro;-(CH2)0~4C(O)NRo 2;-C(S)NRo 2;-C(S)SRo;-SC(S)SRo、-(CH2)0~4OC(O)NRo 2;-C(O)N(ORo)Ro;-C(O)C(O)Ro;-C(O)CH2C(O)Ro;-C(NORo)Ro;-(CH2)0~4SSRo;-(CH2)0~4S(O)2Ro;-(CH2)0~4S(O)2ORo;-(CH2)0~4OS(O)2Ro;-S(O)2NRo 2;-(CH2)0~4S(O)Ro;-N(Ro)S(O)2NRo 2;-N(Ro)S(O)2Ro;-N(ORo)Ro;-C(NH)NRo 2;-P(O)2Ro;-P(O)Ro 2;-OP(O)Ro 2;-OP(O)(ORo)2;-SiRo 3;-(C1~4直鎖状又は分枝状アルキレン)O-N(Ro)2;又は-(C1~4直鎖状又は分枝状アルキレン)C(O)O-N(Ro)2(ここで各Roは、独立して、水素、C1~6アルキル、-CH2Ph、-O(CH2)0~1Ph、-CH2-(5~6員ヘテロアリール環)、又は独立して窒素、酸素若しくは硫黄から選択されるヘテロ原子を0~4個有する5~6員飽和、部分的に不飽和若しくはアリール環であるか、又は上記定義にもかかわらず、Roの2回の独立した出現は、介在する原子(複数可)と一緒になって、窒素、酸素若しくは硫黄から独立して選択される0~4個のヘテロ原子を有する3~12員飽和、部分的に不飽和、若しくはアリール単環若しくは二環を形成している);或いは=O、=S、=NNRo 2、=NNHC(O)Ro、=NNHC(O)ORo、=NNHS(O)2Ro、=NRo、=NORo、-O(C(Ro 2))2~3O-、又は-S(C(Ro 2))2~3S-であり、ここでRoの各独立した出現は、水素、C1~6アルキル、又は窒素、酸素若しくは硫黄から独立して選択されるヘテロ原子を0~4個有する非置換の5~6員飽和、部分的に不飽和若しくはアリール環から選択される。
定の分析物を用いて脱離(少なくとも一部)又は修飾され得る基を意味し、ここで、脱離又は修飾は発光が惹起されるようなものである。好ましくはnが1である場合(即ち、リンカー基Lが存在する場合)、この分析物応答基への分析物の作用が、分析物応答基R1を-OH又は-NH2部分に変換して(Lが基Xを含む場合、部分「X-R1」は、好ましくは-OH又は-NH2部分に変換されて)、リンカー基「L」の脱離、例えば1,6-脱離が惹起される。nが0である場合(即ち、リンカー基Lが存在しない場合)、この分析物応答基R1への分析物の作用が、分析物応答基R1を-OH又は別の酸性基に変換することが好ましい(mが1である場合、部分「O-R1」は、-OH又は別の酸性基に変換される)。
Cl、Br、Iである。
子収率に影響を及ぼし得ることが示された。
ファ-D-ガラクトピラノシジル、アルファ-D-グルコピラノシジル、ベータ-D-グ
ルコピラノシジル、ベータ-D-グルクロニル、ベータ-D-グルクロニルナトリウム塩、n-アセチル-ベータ-D-ガラクトサミニジル、N-アセチルノイラミニジル、セロビオシジル、アルファ-D-リボフラノシジル、ベータ-D-リボフラノシジル、コリンホスホリル、-NO2、ステアロイル、パルミトイル、オレオイル、リノレイル、Tos-L-アラニル、アルファ-マンノシル、ベータ-マンノシル、アルファ-フコシル、ベータ-フコシル、アルファ-イデウロノシル(ideuronosyl)、ベータ-イデウロノシル
、アルファ-(オリゴ)マルトエシル((oligo)maltoesyl)、式-B(Z)(Z’)を有する基(式中Z及びZ’は、上記に定義された通りである)、-B(Z’’)3 -Kat+、オキサリルエステル、SucOMe-Arg-Pro-チロシニル、ベータ-ラクタマーゼ不安定基、好ましくはベータ-ラクタム系抗生物質、より好ましくはペニシリン、第一~五世代のセファロスポリン、セファマイシン、又はカルバペネム、Ac-QLQ-、Ac-FQLQ-、Ac-EFQLQ-、Ac-DEFQLQ-からなる群から選択される。
有する基であり、式中、好ましくは、Z及びZ’の少なくとも一方はOR5であり、より好ましくは、Z及びZ’の両方はOR5であるか、又は式-B(Z)(Z')を有する基
は、好ましくは-B(OH)2、-BF3 -Kat+、
発光をクエンチしないことが見出された。いずれかの理論に拘束されるのを望むものではないが、この驚くべき現象の理由が、発光が惹起される前に、一般的に、リンカーLが式Iで示される化合物の残り部分から切除されるという事実であると考えられる。したがって一態様において、Lは、ペプチド(好ましくは細胞透過ペプチド)、エンドリジン、又はタンパク質で機能化されている。別の態様において、Lは、ペプチド(好ましくは細胞透過ペプチド)、エンドリジン、又はタンパク質で機能化されていない。
(RG)2-、好ましくは-N+(CH3)2-又は-NH-であり、R1が-B(Z)
(Z’)又は-NO2である場合には、Xは、存在せず、X’は、S、O、NH及びNRGから選択され、Xは、R1に結合している。
検出に特に適することが立証されている。
化合物の残りの部分に結合したアミノ酸部分をいう。アミノ酸が、1個より多くのカルボン酸基を含む場合、前記カルボン酸の各々が、このアミノ酸をジオキセタン化合物の残りの部分に結合されていてもよい。好ましくは、アミノ酸が1個より多くのカルボン酸を含む場合、それは、アルファ-カルボン酸基によってジオキセタン化合物の残りの部分に結合している。
タミックアシジル、好ましくはL-ピログルタミックアシジル、アルギニニル(R-)、
アスパラギニル(N-)、アスパルティックアシジル(aspartic acidyl)(D-)、シ
ステイニル(C-)、グルタミニル(Q-)、グルタミックアシジル(E-)、グリシニル(G-)、ヒスチジニル(H-)、イソロイシニル(I-)、ロイシニル(L-)、リシニル(K-)、メチオニニル(M-)、フェニルアラニル(F-)、プロリニル(P-)、セリニル(S-)、トレオニニル(T-)、トリプトファニル(W-)、チロシニル(Y-)、及びバリニル(V-)である。
方法であることが理解されなければならない。
特に本発明は、バクテリア、バクテリア断片(例えば、LPS、内毒素)、ウイルス、真菌及び他の病原体をはじめとする微生物の有無の検出、定量及び同定のための、第一の形態に記載された式Iで示される化合物の使用に関する。より詳細には本発明は、適切な分子プローブへの代謝酵素、試薬酵素若しくは参照酵素の作用の化学発光的指標、試薬酵素による細菌代謝産物若しくは栄養素の酵素的酸化から生じた過酸化水素の指標、又は栄養素、基質、代謝産物若しくは試薬酵素による作用の副生成物の役割を担う無機リン酸塩の検出を利用した、バクテリア、バクテリア断片(例えば、LPS、内毒素)、ウイルス、真菌及び他の病原体をはじめとする微生物の有無の検出、定量及び同定のための、第一の形態に記載された式Iで示される化合物の使用に関する。
好ましくはラゴウイルス、ノロウイルス、サポウイルス、ネボウイルス、レコウイルス、より好ましくはノロウイルスからなる群から選択される。
ロピル、ブチル、イソブチル、又はtert-ブチルである)で示される化合物である。好ましくは、Yは、-H又は任意に置換されたC1~C12アルキルであり、この任意に置換されたC1~C12アルキルは、好ましくはメチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、又はtert-ブチルである。より好ましくは、Yは、-H又はメチルである。好ましくは式VIIa、VIIb又はVIIIa、より好ましくはVIIb又はVIIIa、さらにより好ましくはVIIIaで示される化合物が、用いられる。
・ディフィシル;カンジダ・アルビカンス;プレボテラ;シゲラ、アピラーゼ含有微生物、好ましくはシゲラ;レジオネラ・ニューモフィラ;及びカリシウイルス科のウイルス、
好ましくはラゴウイルス、ノロウイルス、サポウイルス、ネボウイルス、レコウイルス、より好ましくはノロウイルスからなる群から選択される。
生育基質、栄養素及び代謝産物の検出は、病原体の間接的な検出を可能にする。
この態様において、R1は、好ましくは第一の形態に定義された-B(Z)(Z’)又は-BF3 -Kat+であり、他の置換基は、同じく第一の形態にも定義されている。
るように、式Iで示される化合物が添加される。
より好ましくは0.08μg未満、さらにより好ましくは0.07μg未満、さらにより好ましくは0.065μg未満、さらにより好ましくは0.04~0.06μg、さらにより好ましくは0.045~0.055μg、最も好ましくは約0.05μgの量で用いられる。
、より好ましくは10~30μM、より好ましくは15~25μM、より好ましくは18~22μM、より好ましくは19~21μMの最終濃度で存在するように、式Iで示される化合物が、媒体に添加される。
ポウイルス、ネボウイルス、レコウイルス、より好ましくはノロウイルスからなる群から選択される。
5μM、より好ましくは7~13μM、より好ましくは9~11μMの最終濃度で存在するように、式Iで示される化合物が添加される。
ファ-D-グルコシダーゼ活性の検出を通した、滅菌工程のモニタリングのための方法に関する。
ンドポイント及びオンライン検出に、そしてそれらの抗生物質感受性検査に用いられてもよい。
一般的方法:
全ての反応は、特に記載のない限り、室温で実施された。化学物質及び溶媒は、A.R.グレード(A.R. grade)であるか、又は標準的な技術により精製された。薄層クロマトグラフィー(TLC):シリカゲルプレートMerck 60 F254:化合物は、UV光の照射により視覚化された。カラムクロマトグラフィー(FC):シリカゲルMerc
k 60(粒度0.040~0.063mm)、溶離液がカッコ内に示される。逆相高速液体クロマトグラフィー(RP-HPLC):C18 5u、250×4.6mm、溶離
液がカッコ内に示される。分取RP-HPLC:C18 5u、250×21mm、溶離
液がカッコ内に示される。蛍光及び化学発光は、Molecular Devices Spectramax i3xで記録された。
特に記載のない限り、全ての化学物質が、Merk及びBiosynth AGから購
入され、受け取ったままの状態で使用された。
略語.AcOH - 酢酸、MeCN - アセトニトリル、DCM - ジクロロメタン、DMF - N,N’-ジメチルホルムアミド、EtOAc - 酢酸エチル、Hex - ヘキサン、MeOH-メタノール、TFA - トリフルオロ酢酸、THF -テトラヒドロフラン、TIPSCl - トリイソプロピルシリルクロリド。
1.76 (dt, J = 15.1, 7.5 Hz, 2H), 1.50 - 1.18 (m, 8H), 0.97 - 0.82 (m, 3H)。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 173.75, 150.68, 133.71, 129.49, 121.78, 65.50, 34.48, 31.72, 29.16, 29.14, 29.11, 28.98, 25.01, 22.67, 14.13。
濾過されて溶媒が減圧下で蒸発され、化合物1b(185mg、64%収率)をオフホワイト色の固体として生成した。この化合物は、さらに精製されることなく反応された。1H
NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.38 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.00 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 4.45 (s, 2H), 2.54 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 1.74 (dt, J = 15.1, 7.5 Hz, 2H), 1.44 - 1.24 (m, 8H), 0.90 (t, J = 6.9 Hz, 3H)。13C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 172.35, 150.33,
133.73, 129.82, 129.40, 121.93, 121.68, 43.20, 34.36, 34.28, 31.62, 30.71, 29.03, 28.88, 24.90, 22.57, 14.04。
D., ACS Central Sci., 2017, 4, 349-58に従って調製)(30mg、0.08mmol
、1.1当量)が、アルゴン雰囲気下で脱水DMFに溶解され、0℃に冷却された。水素化ナトリウム(6.4mg、0.16mmol、2.2当量)が添加され、反応物が室温まで昇温された。15分間撹拌した後、化合物1b(26mg、0.07mmol、1当量)が添加され、反応物をRP-HPLC(水中の90-100%ACN、20分)によ
りモニタリングされた。完了したら、反応混合物が減圧下で蒸発されて濃縮されて、粗生成物が分取RP-HPLC(水中の95-100%ACN、20分)により精製されて、化合物1d(18mg、45%収率)を白色固体として生成した。1H NMR (400 MHz, DMSO) δ 7.78 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 7.75 (d, J = 10.5 Hz, 1H), 7.48 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 7.17 - 7.05 (m, 3H), 6.58 (d, J = 16.1 Hz, 1H), 4.96 (d, J = 12.9 Hz, 2H), 3.21 (s, 3H), 3.17 (s, 2H), 2.56 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 1.92 (dd, J = 34.0, 9.0 Hz, 4H), 1.82 - 1.55 (m, 10H), 1.37 - 1.14 (m, 8H), 0.89 - 0.80 (m, 3H)。13C NMR (101 MHz, DMSO) δ 172.09, 159.35, 153.04, 150.78, 139.79, 137.52, 133.86, 130.71, 130.06, 129.93, 129.00, 128.20, 126.30, 122.28, 75.34, 56.92, 36.88, 33.89, 32.83, 31.53, 29.46, 28.78, 28.12, 27.98, 24.75, 22.51, 14.31。
20分)により精製されて、化合物IIa(15mg、79%収率)をオフホワイト色の固体として生成した。1H NMR (400 MHz, DMSO) δ 7.94 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.79 (d,
J = 8.4 Hz, 1H), 7.73 (d, J = 16.1 Hz, 1H), 7.49 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 7.13 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 6.63 (d, J = 16.1 Hz, 1H), 4.92 (q, J = 10.9 Hz, 2H), 3.11 (s, 3H), 2.88 (s, 1H), 2.56 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 2.22 (d, J = 11.5 Hz, 1H), 1.89 (d,
J = 3.8 Hz, 1H), 1.77 - 1.50 (m, 19H), 1.46 (d, J = 11.8 Hz, 1H), 1.40 - 1.16 (m, 8H), 0.90 - 0.80 (m, 3H)。13C NMR (126 MHz, DMSO) δ 172.35, 167.74, 154.08, 151.18, 136.97, 134.67, 133.84, 132.01, 130.34, 129.10, 127.38, 126.70, 123.90, 122.50, 111.79, 96.02, 75.65, 50.03, 36.48, 34.07, 33.89, 33.68, 32.44, 32.26, 31.71, 31.48, 30.43, 29.60, 26.10, 25.77, 22.64, 14.54。
24;観測値:499.4[M+H]+。
ルエンスルホン酸ピリジニウム(pyridinium p-toluene sulfonic acid)(39mg、0.153mmol、0.45当量)が添加された。反応物がTLC(20:80 EtOAc:Hex)を介してモニタリングされ、完了したら、反応物がEt2Oで希釈された。この有機層が5%NaHCO3で洗浄され、その後、ブラインで洗浄された。有機層が分離され、Na2SO4で脱水されて濾過され、溶媒が減圧下で蒸発された。粗生成物が、シリカゲルのカラムクロマトグラフィー(15:85 EtOAc:Hex)により精製されて、化合物1b(150mg、77%収率)を透明油状物として生成した。
:Hex)により精製されて、化合物1d(37mg、60%収率)を白色固体として生成した。C24H35ClO11PのMS(ES+): m/z計算値:530.19;観測
値:553.5[M+Na]+。
がDCMで希釈され、飽和NaHCO3で洗浄された。有機層が分離され、Na2SO4で脱水されて濾過され、溶媒が減圧下で蒸発されて、1fの化合物を産出し、さらに精製されることなく使用された。C25H39ClO13PSのMS(ES+):m/z計算値:610.18;観測値:633.26[M+Na]+。化合物1f及び化合物1g(Green, O., Eilon, T., Hananya, N., Gutkin, S., Bauer, CR., Shabat, D., ACS Central Sci., 2017, 4, 349-58に従って調製)(288mg、0.74mmol、1.3当量)が脱水DMFに溶解されて、K2CO3が添加された(197mg、1.43mmol、2.5当量)。反応物が、TLC(30:70EtOAc:Hex)及びRP-HPLC(水中に70-100%ACN、20分)によりモニタリングされた。完了したら、溶媒が減圧下で除去された。粗生成物が、シリカゲルのカラムクロマトグラフィー(75:25 EtOAc:Hex)により精製されて、化合物1h(231mg、2ステップで45%収率)を白色泡状物として生成した。C46H60ClO14PのMS(ES+)
:m/z計算値:902.34;観測値:925.60[M+Na]+。
1:4に添加され、得られた懸濁液が0℃で撹拌された。24時間後に、溶媒がエタノールでの蒸発により除去された。粗生成物が分取RP-HPLC(15-70%ACN、炭酸アンモニウム15mM緩衝液、20分)により精製されて、化合物IIIa(0.7mg、6%収率)をオフホワイト色の固体として生成した。C35H42ClO15PのMS(ES-):m/z計算値:768.19;観測値:767.5[M-H]-。
g、84%として生成した; 1H NMR (300 MHz, CDCl3) δ ppm 1.60 - 2.03 (m, 12 H) 2.12 (br s, 1 H) 3.33 (br s, 1 H) 3.37 (s, 3 H) 3.86 (s, 3 H) 4.70 (ddq, J = 8.5, 5.7, 1.3, Hz, 4 H) 5.02 (m, 2 H) 5.28 - 5.47 (m, 4 H) 5.93 - 6.06 (m, 2 H) 6.51 (d, J = 16.2 Hz, 1 H) 7.13 (dd, J = 8.1, 0.5 Hz, 1 H) 7.27 - 7.31 (m, 2 H) 7.49 (d, J = 8.1 Hz, 1 H) 7.53 (d, J = 8.3 Hz, 2 H) 7.98 (d, J = 16.2 Hz, 1 H)。
1H NMR (300 MHz, D2O) δ ppm 1.53 - 1.95 (m, 13 H) 3.05 (br s, 1 H) 3.25 (br s, 3 H) 4.98 (br s, 2 H) 6.44 (br d, J = 16.0 Hz, 1 H) 7.10 (br d, J = 7.8 Hz, 3 H)
7.37 (br d, J = 8.0 Hz, 2 H) 7.45 - 7.63 (m, 2 H)。
ナトリウム原子(複数可)が水素と交換されて、当業者に公知の手段、例えばイオン交換により「OH」基を産出してもよい。
1H NMR (400 MHz, CD3OD) δ ppm 1.40 (br. s., 2 H) 1.52 (d, J = 10.8 Hz, 1 H) 1.62 - 1.89 (m, 7 H) 2.00 (br. s., 2H) 2.40 (d, J = 12.5 Hz, 1 H) 2.96 (br. s., 1 H) 3.18 (s, 3 H) 6.58 (d, J = 16.1 Hz, 1 H) 7.24 (d, J = 7.8 Hz, 2 H) 7.40 (d, J = 8.4 Hz, 2 H) 7.72 (d, J = 8.3 Hz, 1 H) 7.78 (d, J = 15.9 Hz, 1 H) 7.84 (d, J =
8.4 Hz, 1 H)。[コメント:ベンジル基の2Hピークは、CD3OD中のH2Oピークに
隠れている]
ィルター(0.45mm)に通された。この透明溶液がMPLCポンプ(Labomatic MD80/100)により気液混合セル(Peschl Ultraviolet)に送り出され、酸素(1.0バール)と混合された。その後、この酸素飽和溶液が室温で連続流れの中で、LEDランプ(625nm、novaLIGHT FLED 100-625、Peschl Ultraviolet)で照射された。混合物が250mLの丸底フラスコに回収され、溶液が窒素で連続的にパージされた。得られた反応混合物が20mL EtOAcで希釈され、短いシリカパッドで濾過されて、EtOAc/MeOH(120mL、9:1)で洗浄された。濾液が遮光の下、室温で濃縮され、得られた固体残渣がEt2Oで研和された。生成化合物Vaがオフホワイト色の固体(32mg、0.046mmol、61%)として単離された。
1H NMR (400 MHz, CDCl3) δppm 1.29 - 1.39 (m, 3 H), 1.46 (d, J = 13.1 Hz, 1 H), 1.57 - 2.1 (m, 12 H), 2.32 (d, J = 13.1 Hz, 1 H), 3.02 (br. s, 1 H), 3.21 (s, 3 H), 3.68 (br. s, 1 H), 3.72 - 3.80 (m, 4 H), 3.83 - 4.07 (m, 3 H), 4.13 (br. s, 1 H), 4.80 - 4.91 (m, 2 H), 4.93 (d, J = 7.5 Hz, 1 H) , 6.36 (dd, J = 16.2, 5.2 Hz, 1 H), 7.02 (d, J = 8.7, 2 H), 7.32 (d, J = 6.4 Hz, 2 H), 7.52 (dd, J = 7.9, 3.4 Hz, 1 H), 7.74 (dd, J = 16.1, 5.4 Hz, 1 H), 7.89 (d, J = 8.5 Hz, 1 H)。
1)により精製されて、トリフラート2(5.05g、97%)を無色油状物として生成した。
製されて、ボロン酸(boronate)3(3.83g、83%)をオフホワイト色の固体として生成した。
アルゴン雰囲気下で、無水DMF(15mL)中の市販のメロペネム中間体2(2.6g、6.8mmol)の溶液に、TBDMSCl(4.0g、27.1mmol)及びイ
ミダゾール(2.8g、40.8mmol)が添加された。得られた混合物が室温で5時間撹拌された。酢酸エチル(50mL)での希釈の後、溶液が水(20mL×3回)及びブライン(20mL×1回)で逐次、洗浄された。有機層がNa2SO4で脱水され、濃縮された。残渣がシリカゲルのカラムクロマトグラフィーにより精製されて、表題化合物3を白色固体(3.3g、98%)として生成した。C23H32N4NaO7Si[M+Na]+のMS(ES+)m/z計算値527.2、観測値527.4。
カルボキシレート(4)
アルゴン下の丸底フラスコに、ZnCl2(無水、20mg、0.15mmol)、化合物3(2.4g、4.8mmol)、Rh2(OAc)4(21.5mg、0.05mmol)及びCH2Cl2(無水、15mL)を添加し、その後、化合物3の消失まで(TLCによりモニタリング)90分間、加熱還流された。得られた混合物が-50℃に冷却され、トリエチルアミン(235μL、1.7mmol)とジイソプロピルアミン(680μL、4.8mmol)の混合物が滴加され、次にTf2O(850μL、5.0mmol)が緩やかに添加された。その懸濁液が-50℃で60分間撹拌され、ジクロロメタンを溶離液として用いた短いシリカゲルカラムでのクロマトグラフィーにより精製されて、所望の化合物4を白色固体として生成した(2.5g、85%)。C24H32F3N2O9SSi[M+Na]+のMS(ES+)m/z計算値609.1、観測値609.4。
エノールエーテル5 (Green, O., Eilon, T., Hananya, N., Gutkin, S., Bauer, CR., Shabat, D., ACS Central Sci., 2017, 4, 349-58に従って調製)(500mg、1.
3mmol)が3mL脱水DMFに溶解されて、0℃に冷却された。K2CO3(195mg、1.4mmol)が添加され、その溶液が0℃で10分間撹拌された後、化合物6(Karton-Lifshin N.,Albertazzi L.,Bendikov M.,Baran PS.,Shabat D.,J Am Chem Soc., 2012, 134(50), 20412-20参照)(536.6mg、1.6mmol)が添加された。反応混合物が室温で30分間撹拌され、TLCによりモニタリングされた。完了後に、反応混合物がEtOAc(30ml)で希釈され、飽和NH4Cl(10ml)で洗浄された。有機層が分離され、ブラインで洗浄されて、Na2SO4で脱水され、減圧下で蒸発された。粗生成物がシリカゲルのカラムクロマトグラフィーにより精製されて、表題化合物7を白色固体(661mg、81%)として生成した。C35H42BClNaO6[M+Na]+のMS(ES+)m/z計算値627.2、観測値627.5。
ルボキシレート(8)
CH2Cl2(2mL)とDMF(1.1mL)の混合物中のピナコールボロン酸7(304mg、0.50mmol)及びビニルトリフラート4(304mg、0.50mmol)の溶液に、Pd(dba)2(14mg、0.02mmol)及び3M 水性K2CO3(0.5mL,、1.5mmol)を添加された。混合物は37℃で2.5時間撹
拌され、TLCによりモニタリングされた。完了後に、反応混合物がEtOAc(20ml)で希釈され、飽和NH4Cl(10ml)で洗浄された。有機層が分離され、ブラインで洗浄され、Na2SO4で脱水されて、減圧下で蒸発された。粗生成物がシリカゲルのカラムクロマトグラフィーにより精製されて、表題化合物8(358mg、76%)を生成した。C52H62ClN2O10Si[M+Na]+のMS(ES+)m/z計算値937.4、観測値937.8。
室温でN-メチルピロリジノン/DMF(1:3、0.7mL)中の8(350mg、0.4mmol)の溶液にフッ化水素アンモニウム(150mg、2.8mmol)が添加されて、得られた反応混合物が室温で72時間撹拌された(TLCによりモニタリング)。その後、反応物が酢酸エチル(40mL)で希釈され、水及びブラインで洗浄された。Na2SO4で脱水され、減圧濃縮された後、残渣がシリカゲルのカラムクロマトグラフィーにより精製されて、表題化合物9(290.6mg、73%)を生成した。C46H48ClN2O10[M+Na]+のMS(ES+)m/z計算値823.4、観測値823.6。
0]ヘプタ-2-エン-2-カルボン酸(10)
20℃で、DME 0.5mL中の化合物7(20mg、0.02mmol)の溶液に、0.2mLリン酸緩衝液(0.35M、pH6.0)及び活性化亜鉛粉末が添加された。その後、反応混合物が同じ温度で1時間撹拌された。沈殿物が0.22μM PTFEシリンジフィルターで除去され、濾液がCH3CN-H2O(30mmol NH4HCO3緩衝水、CH3CNは30%緩衝水を含有)を移動相とする分取RP-HPLCを用いて精製された。C39H42ClNNaO8[M+Na]+のMS(ES+)m/z計算値710.2、観測値710.5。
オキソプロパ-1-エン-1-イル)-3-((1r,3r,5S,7S)-4’-メトキシスピロ[アダマンタン-2,3’-[1,2]ジオキセタン]-4’-イル]フェノキシ)メチル)フェニル)-6-((R)-1-ヒドロキシエチル)-4-メチル-7-オキソ-1-アザビシクロ[3.2.0]ヘプタ-2-エン-2-カルボン酸(1)
エノールエーテル10及び数ミリグラムのメチレンブルーが、15mlDCMに溶解された。黄色光で20分間照射されながら、酸素がその溶液にバブリングされた。反応物は、RP-HPLCによりモニタリングされた。完了後に、反応混合物が減圧下で蒸発されて濃縮された。粗生成物がCH3CN-H2O(30mmol NH4HCO3緩衝水、CH3CNは30%緩衝水を含有)を移動相とする分取RP-HPLCにより精製され、化合物VIIaを白色固体(3mg、30%)として生成した。C39H42ClNNaO10[M+Na]+のMS(ES+)m/z計算値742.2、観測値742.5。
=2/1))。反応混合物が200mL水により洗浄され、次に0.2M NaOH溶液の200mLで2回洗浄された。有機層がNa2SO4で脱水され、濾過されてロータリーエバポレータにより濃縮された。残渣(およそ23g)が、シリカゲルの短いプラグ(
h=45mm、d=100mm)を用いてDCMでの溶出により精製された。無色で果実香の油状(20.9g/96%収率)の形態の生成物が、さらに精製されることなく次の合成ステップで用いられた。
プリレート(20.9g/92.5mmol/1当量)が添加され、次にNBS(19.84g/111.5mmol/1.25当量)が添加された。懸濁液がオイルバス(100℃)内で15分間撹拌された。オイルバスが除去されて、AIBN(915mg/5.6mmol/5mol%)が一度に添加された。集中的な還流(intensive reflux)により反応が開始し、およそ2分後に、還流がかなり穏やかになったら、混合物が再度、高温の加熱バスに浸漬された。20分後のTLC(石油エーテル/AcOEt=10/1)は、完全な変換を示した。反応混合物が、冷却水で15℃に冷却された。この温度で、混合物がS3フリット(S3 fritt)で濾過され、DCM 10mLで洗浄され、濾液が真空濃縮された。未加工の生成物(27.7g/99%収率)が、精製されることなく次の合成ステップで用いられた。
無水THFに溶解された。反応混合物が80℃で2時間撹拌され、モニタリングされ、完了したら溶媒が減圧下で蒸発された。粗生成物がシリカゲルカラム(Hex:EtOAc
65:35)に通されて、1.73g(83%収率)の白色固体が得られ、さらに精製されることなく次のステップに持ち込まれた。
70:30)に通されて、1.84g(89%収率)の白色固体が得られ、さらに精製されることなく次のステップに持ち込まれた。
り、900mg(47%収率)の白色固体を生成した。
DCMに溶解された。その後、黄色光を照射されながら、酸素が溶液にバブリングされた。反応物がRP-HPLCによりモニタリングされた。完了したら(10分)、溶媒が減圧濃縮され、生成物が分取RP-HPLC(水中のACNの勾配、0.1% TFA)により精製された。生成物が、白色固体(36mg、67%)として得られた。
化合物IIaを用いたブタ肝臓エステラーゼ活性の酵素アッセイ
化合物IIaが、10%v/vジメチルスルホキシドを含有するリン酸緩衝生理食塩水(pH7.4)に最終濃度62.5μMになるように添加された。アッセイ混合物が室温で20分間プレインキュベートされ、その後、種々の酵素濃度を含有する1:5v/vのブタ肝臓エステラーゼ溶液が添加され、発光モードのSpectraMax M5リーダーにより発光が室温で20分間記録された。アッセイは、総液容量0.25mLで黒色マイクロタイタープレート内で実施された。20分の測定期間内のブタ肝臓エステラーゼ濃度及び最大RLU(相対光単位)値が、2桁を超える正の直線的相関を呈した。図1は、この実施例の結果を示す。
化合物IIaを用いたサルモネラ・エンテリカの検出
シトロバクター・フロインディATCC8090(C.f.、C8E陰性)大腸菌ATCC25922(E.c.、C8E陰性)、サルモネラ・ティフィムリウム(D)ATCC14028(S.T.、サルモネラ・エンテリカssp. I ser.ティフィムリウム
、C8E陽性)、サルモネラ・エンテリティディス(D)ATCC13076(S.E.1、サルモネラ・エンテリカssp.エンテリカser.エンテリティディス、C8E陽性)及びサルモネラ・エンテリティディスRKI 05/07992(S.E.2、サルモネラ・エンテリカssp. エンテリカser.エンテリティディス、C8E陽性)が、栄養ブロス(5g/l ペプトン、5g/l NaCl、2g/L 酵母エキス、1g/l 牛
肉エキス、pH7.4)中で17時間培養され、その後、滅菌生理食塩水(0.9% NaCl)で段階希釈された。同様の細胞濃度の全菌株が、栄養ブロスと共に三連試験管に接種された。加えて、滅菌生理食塩水中のS.E.2細胞のさらなる希釈物が、三連試験管に接種された。滅菌生理食塩水が、陰性対照試験管に添加された。37℃及び150rpmでの養成の6時間後に、試料が培養液(0.205mL)から取り出され、白色マイクロタイタープレート内のジメチルスルホキシド中の化合物IIa溶液45μLと混合された。化合物IIaの最終濃度は10μMであり、ジメチルスルホキシドの最終濃度は15%v/vであった。光放出が、発光検出システムを具備されたプレートリーダーで記録された。化学発光基質の添加後27~30分の期間の平均RLU(相対的光単位)値が、比
較された(表3)。同様の接種密度105CFU/mLでは、検査されたサルモネラ菌株は、シトロバクター・フロインディの35~60倍の光放出及び大腸菌の65~111倍の光放出を示した。滅菌対照に比較したシグナルノイズ比2に示される通り、インキュベーションの6時間後に、10CFU/mLのサルモネラ・エンテリティディスを検出することが可能であった。
化合物IIIaを用いたPI-PLC活性の酵素アッセイ
化合物IIIaが、1%v/v ジメチルスルホキシドを含有するリン酸緩衝生理食塩水(pH7.4)に、最終濃度10μMになるように添加された。種々の濃度のホスファチジルイノシトール特異的なホスホリパーゼC(PI-PLC)が添加され、発光が室温で記録された(表4)。アッセイは、白色マイクロタイタープレート内で総液体容量0.25mLで実施された。20分の測定期間内のPI-PLCの濃度及び最大RLU(相対的光単位)値は、2桁を超える正の相関を呈した。
化合物IIIaを用いたリステリア・モノサイトゲネスの検出
リステリア・モノサイトゲネスATCC7644(L.m.1、PI-PLC陽性)、リ
ステリア・モノサイトゲネス(4b)ATCC19115(L.m.2、PI-PLC陽性)
、リステリア・イノキュア(Listeria innocua)(6a) ATCC33090(L.i.、PI-PLC陰性)及び大腸菌ATCC25922(E.c.、PI-PLC陰性)が、M
52ブロス(1.35g/L リン酸二水素カリウム、9.6g/L リン酸水素二ナトリウム、1.11g/L ピルビン酸ナトリウム、6g/L 酵母エキス、17g/L トリプトン、3g/L phytone、5g/L 塩化ナトリウム、2.5g/L グルコース、pH7.3)中で19時間培養され、その後、滅菌生理食塩水(0.9% N
aCl)で段階希釈された。同様の細胞濃度の全菌種が、M52ブロスと共に三連試験管に接種された。加えて、滅菌生理塩水中のL.m.2細胞のさらなる希釈物が、三連試験管に接種された。滅菌生理食塩水が、陰性対照の試験管に添加された。37℃及び150rpmでの培養の6時間後に、試料が培養液から取り出され(0.99mL)、白色マイクロタイタープレート内でジメチルスルホキシド中の化合物IIIa溶液1μLと混合された。化合物IIIaの最終濃度は10μMであり、ジメチルスルホキシドの最終濃度は1%v/vであった。光放出が、発光検出システムを具備されたプレートリーダーで記録された。化学発光基質の添加後16~20分の平均RLU(相対的光単位)値が、比較された(表5)。同様の接種密度105CFU/mLで、検査されたリステリア・モノサイトゲネス菌株がリステリア・イノキュアの311~361倍の光放出を示し、大腸菌の1465~1702倍の光放出を示した。滅菌対照に比較したシグナルノイズ比2に示される通り、インキュベーションの6時間後に、103CFU/mLのリステリア・モノサイトゲネスを検出することが可能であった。
化合物IIaとカプリル酸4-メチルウンベリフェリルを用いたサルモネラ・エンテリカ検出の比較(図2)
サルモネラ・エンテリティディスRKI05/07992が、栄養ブロス(5g/l
ペプトン、5g/l NaCl、2g/L 酵母エキス、1g/l 牛肉エキス、pH7.4)中で20時間(37℃、150rpm)培養され、その後、リン酸緩衝生理食塩水で段階希釈された。細胞懸濁液が、ジメチルスルホキシド(アッセイでの最終濃度15%)及び化合物IIa(最終濃度10μM)又はカプリル酸4-メチルウンベリフェリル(MUCAP、最終濃度0.1mM)のいずれかを含有するリン酸緩衝生理食塩水と1:1v/vで混合された。アッセイはマイクロプレートで実施され、総液体容量は0.2mLであった。光放出及び蛍光(励起360nm、発光455nm)は、SpectraMax M5(Molecular Devices、米国カリフォルニア州サニーベール)
プレートリーダーで記録された。未希釈の培養液の細胞濃度は、光学密度(600nm)から推定された。結論:サルモネラ・エンテリカの検出限界は、MUCAPの代わりに化合物IIaを用いた場合には、625分の1となった。
図2は、発光原性化合物IIa(白い記号)又は蛍光基質MUCAP(黒い記号)のい
ずれかを用いたサルモネラ・エンテリカの検出限界を示す。
化合物IVaを用いたスタフィロコッカス・アウレウスの検出
スタフィロコッカス・アウレウスATCC29213(S.a.、ホスファターゼ陽性)
及びスタフィロコッカス・ヘモリチカス(Staphylococcus haemolyticus)RKI06-
01354(S.h.、弱いホスファターゼ活性)が、栄養ブロス(5g/l ペプトン、
5g/l NaCl、2g/L 酵母エキス、1g/l 牛肉エキス、pH7.4)中で17時間培養され、その後、滅菌生理食塩水(0.9%NaCl)で段階希釈された。同様の細胞濃度のS.a.及びS.h.が、栄養ブロスと共に三連試験管に接種された。加えて、滅菌生理食塩水中のS.a.細胞のさらなる4種の希釈系列が、三連試験管に接種された。滅菌生理食塩水が、陰性対照の試験管に添加された。37℃及び150rpmでの培養の6時間後に、試料が培養液から取り出され(0.196mL)、白色マイクロタイタープレート内でジメチルスルホキシド中の化合物IVa溶液4μLと混合された。化合物IVaの最終濃度は10μMであり、ジメチルスルホキシドの最終濃度は2%v/vであった。光放出が、発光検出システムが具備されたプレートリーダーで記録された。化学発光基質の添加後15~20分の期間の平均RLU(相対的光単位)値が、比較された(表6)。結論:スタフィロコッカス・アウレウスは、化合物IVaを用いて高感度で検出され得る。
化合物IVaを用いた乳の低温殺菌のモニタリング
UHT全乳(乳1)及び低温殺菌された全乳(乳2)が、スイスのスーパーマーケットから得られた。子ウシ腸由来のアルカリホスファターゼ(AP)が、0.5U/mLの最終濃度で乳試料に添加された。ポリプロピレン試験管中の三重測定の乳試料(アルカリホスファターゼが添加されている)が水浴中、70℃で20分間加熱され、同様の参照試料が室温で保存された。白色マイクロタイタープレート内で、2:1v/v検出ミックス(20μM 化合物IVa、100mM トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン塩酸塩
pH9.7、1mM 塩化マグネシウム、室温で20分間、プレインキュベートされている)を添加することにより、加熱及び非加熱の乳試料のアルカリホスファターゼ活性が分析された。発光がSpectraMax M5プレートリーダーで記録され、総アッセイ容量は0.3mLであった。低温殺菌された乳試料の平均RLU(相対的光単位)値は、室温で保存された試料に比較して8分の1~10分の1であった(図3:化合物IVaを用いた乳中のアルカリホスファターゼ活性への低温殺菌の効果の化学発光分析。3回の反復実験の平均値及び標準偏差)。非添加の乳中の残留するアルカリホスファターゼ活性
を検出することも可能であり、測定されたRLU値は、UHT乳(乳1)中のアルカリホスファターゼ活性が低温殺菌乳(乳2)のものより低いことを示した。
化合物IVaを用いたメチシリン耐性スタフィロコッカス・アウレウス(MRSA)の検出
メチシリン及びオキサシリンなどのペニシリン誘導体への耐性がある菌株メチシリン耐性スタフィロコッカス・アウレウスATCC33592(MRSA)、及びメチシリン感
受性スタフィロコッカス・アウレウスATCC29213(MSSA)が、栄養ブロス(
5g/L ペプトン、5g/L 塩化ナトリウム、2g/L 酵母エキス、1g/L 肉エキス、pH7.4)中で、37℃で一晩培養され、滅菌生理食塩水で希釈された。MRSA及びMSSA菌株が、最終濃度10μMの化合物IVaを含有する栄養ブロス中でおよそ106CFU/mLで接種された。各菌株で、1つの培養液はオキサシリン(20m
g/L最終濃度)を追加され、1つの培養液は抗生物質を追加されなかった。試験管培養液は、37℃及び150rpmでインキュベートされた。滅菌対照(10μMの化合物IVaを含む栄養ブロス)が、並行してインキュベートされた。培養試料(白色マイクロタイタープレート内の0.2mL)の発光が、SpectraMax M5プレートリーダーで6時間、規則的な間隔で記録された(図4:オキサシリン抗生物質の存在下及び非存在下でのMRSA及びMSSAの培養における発光生成)。発光強度のタイムコースは、MRSA菌株はオキサシリンの存在下及び非存在下の両方で増殖するが、MSSA菌株は、抗生物質含まない培養のみで発光の増加を呈することを示した。生育培養液と非生育培養液は、インキュベーションの1時間後に識別され得た。
結論:化合物IVa及び関連する化合物は、短時間(1~2時間)でのメチシリン耐性S.アウレウス(MRSA)の検出に適する。
化合物Vaを用いた大腸菌の検出及びD-ルシフェリン-6-O-ベータ-D-ガラクトピラノシドとの比較
大腸菌ATCC25922(E.c.、ベータ-ガラクトシダーゼ陽性)及びサルモネラ
・エンテリティディスRKI05/07992(S.E.、ベータ-ガラクトシダーゼ陰性)が、栄養ブロス中で17時間培養され、その後、滅菌生理食塩水(0.9% NaCl)で段階希釈された。希釈された細胞懸濁液が、完全(full-strength)LB培地(1
0g/L トリプトン、5g/L 酵母エキス、5g/L NaCl)又は超純水で1:20v/vに希釈されたLB培地(LB 1:20)のいずれかと共に試験管に1:100v/vで接種された。全ての培地が、ベータ-ガラクトシダーゼの誘導のために1mM
IPTGを含有した。滅菌生理食塩水が、陰性対照の試験管に添加された。37℃及び150rpmでの培養の6時間後に、試料(0.255mL)が、培養液から取り出され、白色マイクロタイタープレート内でエタノール中の化合物Vaの原液45μLと混合された。化合物Vaの最終濃度は20μMであり、エタノールの最終濃度は15%v/vであった。光放出が、SpectraMax M5プレートリーダーで記録された。化学発光基質の添加後9~10分の期間の平均RLU(相対光単位)値が、比較された(表VIa)。比較のために、同一の大腸菌菌株が予め培養され、同様の方法で希釈され、その後、希釈されたミュラー・ヒントンブロス(MH1:20、20mMリン酸緩衝液pH7.2で1:20v/vに希釈された完全培地)に接種された。培地は、1mM IPTGが補充された。37℃及び150rpmでの養成の6時間後に、培養試料(45μL)がマイクロタイタープレートに移され、2%w/v ドデシル-トリメチルアンモニウムブロミド、1mM D-ルシフェリン-6-O-ベータ-D-ガラクトピラノシド(市販品、
Biosynth Cat.No.L-8600)及び10mM 塩化マグネシウムを含有する10倍溶解試薬 5μLと混合された。溶解、及びD-ルシフェリン-6-O-ベータ-D-ガラクトピラノシドとの反応は、37℃で1時間行われた。その後、0.2mLのルシフェラーゼアッセイミックスが添加された(5:1 v/v)。アッセイミックスは、62.5mM トリス酢酸塩(pH7.8)、12.5mM 硫酸マグネシウム、2.5g/L ウシ血清アルブミン、7.5mM D/L-システイン、1.25mM エチレンジアミン四酢酸塩、25μM ピロリン酸ナトリウム、10g/L シクロデキストリン、1.25mM アデノシン5-三リン酸塩及び13.1μg/mLの市販のホタル(Photinus pyralis)由来ルシフェラーゼ(組換え体)を含有した。光放出は、SpectraMax M5プレートリーダーで記録された。測定の開始2分の平均相対光単位(RLU)が、表VIbに示される。
D-ルシフェリン-6-O-フェニル-カプリレートを用いたサルモネラ・エンテリカの検出
D-ルシフェリン-6-O-フェニル-カプリレートが、当業者に公知の手順に従って合成された。サルモネラ・エンテリティディスRKI05/07992(S.E.、サルモ
ネラ・エンテリカssp.エンテリカser.エンテリティディス、C8エステラーゼ陽性)が、栄養ブロス(5g/L ペプトン、5g/L NaCl、2g/L 酵母エキス、
1g/L 酵母エキス、pH7.4)中で16時間培養され、その後、滅菌生理食塩水(
0.9%NaCl)で段階希釈された。希釈された細胞懸濁液が、試験管内で、0.1mM D-ルシフェリン-6-O-フェニル-カプリレートを含有する栄養ブロスに1:100v/vで接種された。37℃及び150rpmでの培養の6.5時間後に、試料(50μL)が培養液から取り出され、マイクロタイタープレート内で0.2mLのルシフェラーゼアッセイミックス(実施例9に記載された組成)と混合された。ドデシルトリメチルアンモニウムブロミドなどの細胞溶解試薬の使用は、必要でなかった(データは示されない)。光放出が、発光検出システムを具備されたプレートリーダーで記録された。ルシフェラーゼアッセイミックスの添加後最初の3分の平均RLU(相対光単位)値が、比較された(表VII)。
グルコースオキシダーゼと組み合わせた化合物VIaを用いた大腸菌の培養上清中のグルコースの検出
大腸菌ATCC25922が、栄養ブロス(5g/L ペプトン、5g/L NaCl
、2g/L 酵母エキス、1g/L 酵母エキス、pH7.4)中で16時間養成された。細胞が、遠心分離(13’000×g、2分)により培養上清から分離された。種々の濃度のグルコースが、水中の100倍濃縮原液から培養上清に添加され、同様の量の水が、陰性対照に添加された。第二の陰性対照もまた、5mMグルコースを含有したが、グルコースオキシダーゼは含有しなかった。グルコースを含む、又は含まない培養上清(0.1mL)が、白色マイクロタイタープレート内で、40μM 化合物VIaを含有するHEPES緩衝液0.1mL(100mM、pH7.0)と混合され、過酸化水素及び1mg/mLの市販のアスペルギルス・ニガー由来グルコースオキシゲナーゼと反応された。発光のタイムコースが、SpectraMax M5プレートリーダーで20分間記録され、結果が図5に示されている(過酸化水素で惹起される発光基質の化合物VIaをグルコースオキシダーゼ(GOX)と組み合わせて使用した大腸菌培養上清中の直接のグルコース検出)。化合物VIa及びグルコースオキシダーゼが存在する場合も、グルコースの存在が、連続的な発光増加につながった。増加率は、グルコース濃度と正の相関を示した。
化合物VIIaを用いたのカルバペネム耐性菌の検出
カルバペネム耐性菌の菌株シュードモナス・エルギノーサRKI48/09(IMP-2)(P.a.-ImpR)及びクレブシエラ・ニューモニエRKI92/08(KPC-2)(K.p.-ImpR)が、それぞれ8mg/L及び4mg/mL イミペネムを
添加されたトリプチケースソイ寒天上で培養された。カルバペネム感受性菌株大腸菌ATCC25922(E.c.)が、トリプチケースソイ寒天上で養成された。イミペネムを含む、及び含まない栄養ブロス(組成及びpHについてはこれまでの実施例を参照。15mL試験管内に3mL)に、寒天プレートからイミペネム耐性菌及び感受性菌が接種された。試験管培養液が、37℃及び150rpmで6時間インキュベートされた。培養試料(0.255mL)が、白色マイクロタイタープレートのウェルに移され、エタノール中の化合物VIIaの原液45μLと混合された。化合物VIIa、エタノール及びジメチルスルホキシドの最終濃度は、それぞれ10μM、14%v/v及び1%v/vであった。発光が、化合物VIIaの添加後にプレートリーダーで30分間記録された。測定期間の最大発光シグナル(相対光単位)が、表VIIに示される。
異なる置換基RA、RB及びRCを含む化合物の発光特性
化合物A、化合物B及び化合物Cの化学発光動力学特性及び放出される全ての光が、PBS緩衝溶液(10%DMSO)中、pH7.4、[1μM]で決定された。
化合物A及びBの化学発光動力学特性が、図6Aで比較され(挿入:最初の2時間を拡大);化合物A及びBで放出された全ての光が、図6Bで比較されている。
化合物A及びCの化学発光動力学特性が、図7Aで比較され;化合物A及びCで放出された全ての光が、図7Bで比較されている。
Claims (21)
- 式Iで示される化合物。
R1は、アセチル、ブチリル、オクタノイル、ノナノイル、ミオイノシトールホスホリル、ホスホリル、アミノアシジル(amino acidyl)基、L-ピログルタミックアシジル(L-pyroglutamic acidyl)、ジペプチジル基、トリペプチジル基、ベータ-D-ガラクト
ピラノシジル、アルファ-D-ガラクトピラノシジル、アルファ-D-グルコピラノシジル、ベータ-D-グルコピラノシジル、ベータ-D-グルクロニル、ベータ-D-グルクロニルナトリウム塩、n-アセチル-ベータ-D-ガラクトサミニジル、N-アセチルノイラミニジル、セロビオシジル、アルファ-D-リボフラノシジル、ベータ-D-リボフラノシジル、コリンホスホリル、-NO2、ステアロイル、パルミトイル、オレオイル、リノレイル、Tos-L-アラニル、アルファ-マンノシル、ベータ-マンノシル、アルファ-フコシル、ベータ-フコシル、アルファ-イドロノシル、ベータ-イドロノシル、アルファ-(オリゴ)マルトシル、オキサリルエステル、SucOMe-Arg-Pro-チロシニル、ベータ-ラクタマーゼ不安定基、第一~五世代のセファロスポリン、セファマイシン、カルバペネム、Ac-QLQ-、Ac-FQLQ-、Ac-EFQLQ-、
及びAc-DEFQLQ-から選択される酵素不安定基、並びに式-B(Z)(Z’)又は-B(Z’’)3 -Kat+を有するホウ素含有基から選択される分析物応答基であり;
Z及びZ’は、独立して、R4及びOR5から選択され、
ここでR4は、-OH、-O-Kat+、C1~C4アルキル、C2~C4ヘテロアルキル、C2~C4アルケニル、C2~C4ヘテロアルケニル、C2~C4アルキニル、C2~C4ヘテロアルキニル、C5~C6アリール、C5~C6ヘテロアリール、C6~C10アラルキル、及びC6~C10ヘテロアラルキルから選択され、
R5は、-H、C1~C4アルキル、C2~C4ヘテロアルキル、C2~C4アルケニル、C2~C4ヘテロアルケニル、C2~C4アルキニル、C2~C4ヘテロアルキニル、C5~C6アリール、C5~C6ヘテロアリール、C6~C10アラルキル、及びC6~C10ヘテロアラルキルから選択されるか、又は
2個のR4、2個のR5、若しくは1個のR4と1個のR5が、介在する原子と一緒になって、5~7員の複素環を形成しており;
Z’’は、F、Cl、Br、及びIから選択され;
Kat+は、有機又は無機のカチオンであり;
Lは、
但し、
R1が、酵素不安定基である場合、nは1で、mは1であるか、又はnは0で、mは1であり;
R1が、-B(Z)(Z’)又は-B(Z’’)3 -Kat+である場合、n及びmは、両者とも0又は両者とも1であり;
R1が、酵素不安定基
RA及びRCの一方は、RBと一緒になって、
R2は、シアノ、ニトロ、スルホキシド、スルホン、アリール、アルケニル、
ここでYは、H、C1~C12アルキル又はアルカリ金属イオンであり、
Y’及びY’’は、独立して、H及びC1~C12アルキルから選択されるか、又は窒素原子と一緒になって、複素環構造を形成しており;
R3は、H、F、Cl、Br、I、CF3又はR2-Q-であり;
Qは、式Iで示される化合物の中心芳香族環のπ系と共役されたπ系を含む基であり;
但し、R3が、R2-Q-である場合、RA及びRCの一方が、Hであることを条件とし;
RDは、直鎖状又は分枝状C1~C18アルキル又はC3~C7シクロアルキルから選択され;
RE及びRFは、独立して、分枝状C3~C18アルキル若しくはC3~C7シクロアルキルから選択されるか、又はREとRFが、結合された炭素原子と一緒になって、縮合環、スピロ環若しくは多環を形成しており;
R G は、独立して、C1~C12アルキルから選択される) - 標的分析物、標的微生物又は標的代謝産物の検出のための、請求項1~5のいずれか1項に記載の化合物の使用。
- 標的微生物の検出のための、請求項6に記載の使用。
- 前記標的微生物がバクテリアである、請求項7に記載の使用。
- 前記微生物が、サルモネラ(Salmonella);サルモネラ・エンテリカ(Salmonella enterica);リステリア(Listeria);S.アウレウス(S. aureus);大腸菌(E. coli)
;カルバペネム耐性菌;カンピロバクター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni);C.コリ(C. coli);C.ラリ(C. lari);バチルス(Bacillus);スタフィロコッカス(Staphylococcus);クロストリジウム(Clostridium);マイコバクテリウム・ツベルク
ローシス(Mycobacterium tuberculosis);クロストリジウム・パーフリンゲンス(Clostridium perfringens);S.アガラクティエ(S. agalactiae);カンジダ属菌(Candida spp.);グラム陰性菌;酵母;カビ;シュードモナス・エルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa);エンテロコッカス(Enterococci);ストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcus pyogenes);シトロバクター(Citrobacter);大腸菌群(Coliform);クロ
ノバクター・サカザキ(Cronobacter sakazakii);MRSA;VRE;ゲオバチルス・
ステアロサーモフィルス(Geobacillus stearothermophilus);リステリア属菌(Listeria spp.);ESBL生成エンテロバクター;ビブリオ(Vibrio);クロストリジウム・
ディフィシル(Clostridium difficile);カンジダ・アルビカンス(Candida albicans
);プレボテラ(Prevotella);シゲラ(Shigella);アピラーゼ含有微生物;レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophilia);及びカリシウイルス科(Caliciviridae)のウイルスから選択される、請求項6~8のいずれか1項に記載の使用。 - 前記リステリアがリステリア・モノサイトゲネス(Listeria monocytogenes)であり;前記カルバペネム耐性菌がシュードモナス・エルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa)又はクレブシエラ・ニューモニエ(Klebsiella pneumonia)であり;前記アピラーゼ含有微生物がシゲラ(Shigella)であり;前記カリシウイルス科(Caliciviridae)のウイルス
がラゴウイルス(Lagovirus)、ノロウイルス(Norovirus)、サポウイルス(Sapovirus
)、ネボウイルス(Nebovirus)、及びレコウイルス(Recovirus)から選択される、請求項9に記載の使用。 - (i)生育基質、栄養素、及び代謝産物の酵素的酸化による前記生育基質、栄養素、及
び/又は代謝産物の検出のための;
(ii)カブトガニC因子の検出を利用したバクテリア内毒素の検出のための;
(iii)乳製品の低温殺菌の検査のための;
(iv)微生物における抗生物質耐性を検査するための;
(v)無機リン酸塩の検出のための;
(vi)滅菌工程のモニタリングのための;又は
(vii)バクテリアの抗生物質耐性のエンドポイント及びオンライン検出のため、及び抗生物質感受性検査のための、
請求項6~11のいずれか1項に記載の使用。 - 前記滅菌工程のモニタリングが、指標生物ゲオバチルス・ステアロサーモフィルスのアルファ-D-グルコシダーゼ活性の検出を通して行われる、請求項12に記載の使用。
- 標的微生物の検出のための化合物の使用であって、
前記化合物が式Iに示される化合物である、使用。
R 1 は、アセチル、ブチリル、オクタノイル、ノナノイル、ミオイノシトールホスホリル、ホスホリル、アミノアシジル(amino acidyl)基、L-ピログルタミックアシジル(L-pyroglutamic acidyl)、ジペプチジル基、トリペプチジル基、ベータ-D-ガラクト
ピラノシジル、アルファ-D-ガラクトピラノシジル、アルファ-D-グルコピラノシジル、ベータ-D-グルコピラノシジル、ベータ-D-グルクロニル、ベータ-D-グルクロニルナトリウム塩、n-アセチル-ベータ-D-ガラクトサミニジル、N-アセチルノイラミニジル、セロビオシジル、アルファ-D-リボフラノシジル、ベータ-D-リボフラノシジル、コリンホスホリル、-NO 2 、ステアロイル、パルミトイル、オレオイル、リノレイル、Tos-L-アラニル、アルファ-マンノシル、ベータ-マンノシル、アルファ-フコシル、ベータ-フコシル、アルファ-イドロノシル、ベータ-イドロノシル、アルファ-(オリゴ)マルトシル、オキサリルエステル、SucOMe-Arg-Pro-チロシニル、ベータ-ラクタマーゼ不安定基、第一~五世代のセファロスポリン、セファマイシン、カルバペネム、Ac-QLQ-、Ac-FQLQ-、Ac-EFQLQ-、及びAc-DEFQLQ-から選択される酵素不安定基、並びに式-B(Z)(Z’)又は-B(Z’’) 3 - Kat + を有するホウ素含有基から選択される分析物応答基であり;
Z及びZ’は、独立して、R 4 及びOR 5 から選択され、
ここでR 4 は、-OH、-O - Kat + 、C1~C4アルキル、C2~C4ヘテロアルキル、C2~C4アルケニル、C2~C4ヘテロアルケニル、C2~C4アルキニル、C2~C4ヘテロアルキニル、C5~C6アリール、C5~C6ヘテロアリール、C6~C10アラルキル、及びC6~C10ヘテロアラルキルから選択され、
R 5 は、-H、C1~C4アルキル、C2~C4ヘテロアルキル、C2~C4アルケニ
ル、C2~C4ヘテロアルケニル、C2~C4アルキニル、C2~C4ヘテロアルキニル、C5~C6アリール、C5~C6ヘテロアリール、C6~C10アラルキル、及びC6~C10ヘテロアラルキルから選択されるか、又は
2個のR 4 、2個のR 5 、若しくは1個のR 4 と1個のR 5 が、介在する原子と一緒になって、5~7員の複素環を形成しており;
Z’’は、F、Cl、Br、及びIから選択され;
Kat + は、有機又は無機のカチオンであり;
Lは、
但し、
R 1 が、酵素不安定基である場合、nは1で、mは1であるか、又はnは0で、mは1であり;
R 1 が、酵素不安定基
R 1 が、-B(Z)(Z’)又は-B(Z’’) 3 - Kat + である場合、n及びmは、両者とも0又は両者とも1であり;
R A 及びR C は、独立して、H及びR 2 -Q-から選択され、但し、R A 及びR C の両方がHではないことを条件とし;
R B は、Hであり;
R 2 は、シアノ、ニトロ、スルホキシド、スルホン、アリール、アルケニル、
ここでYは、H、C1~C12アルキル又はアルカリ金属イオンであり、
Y’及びY’’は、独立して、H及びC1~C12アルキルから選択されるか、又は窒素原子と一緒になって、複素環構造を形成しており;
R 3 は、H、F、Cl、Br、I、CF 3 又はR 2 -Q-であるが、
Qは、式Iで示される化合物の中心芳香族環のπ系と共役されたπ系を含む基であり;
R D は、直鎖状又は分枝状C1~C18アルキル又はC3~C7シクロアルキルから選択され;
R E 及びR F は、独立して、分枝状C3~C18アルキル若しくはC3~C7シクロアルキルから選択されるか、又はR E とR F が、結合された炭素原子と一緒になって、縮合環、スピロ環若しくは多環を形成しており;
R G は、独立して、C1~C12アルキルから選択される) - 前記標的微生物がバクテリアである、請求項14~17のいずれか一項に記載の使用。
- 前記標的微生物が、サルモネラ(Salmonella);サルモネラ・エンテリカ(Salmonella
enterica);リステリア(Listeria);S.アウレウス(S. aureus);大腸菌(E. coli);カルバペネム耐性菌;カンピロバクター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni);
C.コリ(C. coli);C.ラリ(C. lari);バチルス(Bacillus);スタフィロコッカス(Staphylococcus);クロストリジウム(Clostridium);マイコバクテリウム・ツベ
ルクローシス(Mycobacterium tuberculosis);クロストリジウム・パーフリンゲンス(Clostridium perfringens);S.アガラクティエ(S. agalactiae);カンジダ属菌(Candida spp.);グラム陰性菌;酵母;カビ;シュードモナス・エルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa);エンテロコッカス(Enterococci);ストレプトコッカス・ピオゲネス
(Streptococcus pyogenes);シトロバクター(Citrobacter);大腸菌群(Coliform)
;クロノバクター・サカザキ(Cronobacter sakazakii);MRSA;VRE;ゲオバチ
ルス・ステアロサーモフィルス(Geobacillus stearothermophilus);リステリア属菌(Listeria spp.);ESBL生成エンテロバクター;ビブリオ(Vibrio);クロストリジ
ウム・ディフィシル(Clostridium difficile);カンジダ・アルビカンス(Candida albicans);プレボテラ(Prevotella);シゲラ(Shigella);アピラーゼ含有微生物;レ
ジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophilia);及びカリシウイルス科(Caliciviridae)のウイルスから選択される、請求項14~17のいずれか1項に記載の使用。 - 前記リステリアがリステリア・モノサイトゲネス(Listeria monocytogenes)であり;前記カルバペネム耐性菌がシュードモナス・エルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa)又はクレブシエラ・ニューモニエ(Klebsiella pneumonia)であり;前記アピラーゼ含有微生物がシゲラ(Shigella)であり;前記カリシウイルス科(Caliciviridae)のウイルス
がラゴウイルス(Lagovirus)、ノロウイルス(Norovirus)、サポウイルス(Sapovirus
)、ネボウイルス(Nebovirus)、及びレコウイルス(Recovirus)から選択される、請求項19に記載の使用。
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