JP7460907B2 - シミュレーションプログラム、シミュレーション方法およびシミュレーションシステム - Google Patents
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Description
[第1の実施の形態]
第1の実施の形態を説明する。
第1の実施の形態のシミュレーションシステム10は、心臓の拍動のような周期的な運動のシミュレーションを行う。シミュレーションシステム10は、単一の筐体のクライアントコンピュータまたはサーバコンピュータであってもよいし、複数の筐体のサーバコンピュータを含んでもよい。シミュレーションシステム10は、以下に説明する処理の一部または全部を並列的に実行する分散処理システムであってもよい。また、シミュレーションシステム10は、クラウドシステムやデータセンタの計算資源であってもよい。シミュレーションシステム10を、情報処理システムと言うこともできる。
次に、第2の実施の形態を説明する。
第2の実施の形態のシミュレーション装置は、人体の血行動態のシミュレーションを行う。血行動態シミュレーションは、心臓を中心とする血流のシミュレーションである。血行動態シミュレーションを、循環動態シミュレーションなどと言うこともある。
シミュレーション装置100は、CPU101、RAM102、HDD103、画像インタフェース104、入力インタフェース105、媒体リーダ106および通信インタフェース107を有する。シミュレーション装置100が有するこれらのユニットは、バスに接続されている。CPU101は、第1の実施の形態の演算装置12に対応する。RAM102またはHDD103は、第1の実施の形態の記憶装置11に対応する。
分散処理システムは、計算ノード31~34を含む複数の計算ノード、管理ノード35およびストレージノード36を有する。計算ノード31~34は、複数のプロセスまたは複数のスレッドを並列に実行する。例えば、計算ノード31~34は、大規模連立方程式の解を反復法によって求める求解演算が複数のスレッドに分割された場合における、当該複数のスレッドを並列に実行する。管理ノード35は、計算ノード31~34にプロセスやスレッドを割り当て、並列処理を制御する。ストレージノード36は、計算ノード31~34によって使用されるデータを記憶する。計算ノード31~34、管理ノード35およびストレージノード36は、例えば、ネットワークに接続されている。
図4は、血行動態シミュレーションに用いるモデルの例を示す図である。
シミュレーション装置100は、モデル140を記憶する。モデル140は、三次元モデル141および周囲モデル142を含む。三次元モデル141は、人体の心臓の左心室および右心室を表す心室モデルである。三次元モデル141は、1分間に60回といった一定周期の拍動を表現するように作成される。周囲モデル142は、心臓の心室の外側であって、血液を循環させるための人体の主な部位を表す循環系モデルである。具体的には、周囲モデル142は、大動脈、大静脈、肺動脈、肺静脈、左心房および右心房を表す。心室から送出された血液が心室の外部を経由して再び心室に戻るという血液循環が表現されるように、三次元モデル141と周囲モデル142とが結合して使用される。
キャパシタ142-9および抵抗142-1に着目すると、この区間の体積流量FAOが数式(1)のように算出される。体積流量は、ある面を単位時間当たりに通過する流体の体積である。変数名の上に付したドットは、時間についての一階微分を表す。抵抗142-7に着目すると、体積流量FAOは数式(2)のようにも算出される。よって、数式(1)と数式(2)から、これらのパラメータおよび変数の間に成立する関係が規定される。また、抵抗142-1、キャパシタ142-10および抵抗142-2に着目すると、この区間の体積流量の保存から数式(3)の関係が成立する。
図5は、有限要素モデルを説明するための図である。
三次元モデル141として、図5に示すような有限要素モデル144が使用される。なお、三次元モデル141の要素(メッシュ)は三次元の四面体であるものの、図5では説明を簡単にするため、要素を二次元の三角形として記載している。
グラフ151は、心室容積と心室圧の組の時間変化を示すPV(Pressure-Volume)ループを表したグラフである。曲線151-1は、開ループ(オープンループ)のモデルから算出された左心室の心室容積および心室圧を示す。曲線151-2は、開ループのモデルから算出された右心室の心室容積および心室圧を示す。曲線151-3は、閉ループ(クローズドループ)のモデルから算出された左心室の心室容積および心室圧を示す。曲線151-4は、閉ループのモデルから算出された右心室の心室容積および心室圧を示す。
グラフ152は、血液量の時間変化を表す時系列データである。曲線152-1は、大静脈の血液量を表しており、キャパシタ142-10の電荷量QVに対応する。曲線152-2は、肺静脈の血液量を表しており、キャパシタ142-12の電荷量QPVに対応する。曲線152-1,152-2に示すように、電荷量Qv,QPVの初期値が10秒後の収束値から乖離しているため、電荷量Qv,QPVの収束が遅くなっている。
グラフ153は、仮のシミュレーションによって算出される心室容積の時間変化を表す時系列データである。曲線153-1は、左心室の心室容積を表す。曲線153-2は、右心室の心室容積を表す。図8の例ではグラフ153に9拍分の心室容積が記載されているが、最初の所定拍数(例えば、3拍)分の心室容積を抽出できればよい。
グラフ154は、仮のシミュレーションによって算出される心室圧の時間変化を表す時系列データである。曲線154-1は、左心室の心室圧を表す。曲線154-2は、右心室の心室圧を表す。図9の例ではグラフ154に9拍分の心室圧が記載されているが、最初の所定拍数(例えば、3拍)分の心室圧を抽出できればよい。なお、仮のシミュレーションでは、前述のグラフ152が示す電荷量Qv,QPVのように、所定拍数分の電荷量QA,QV,QPA,QPV,QRA,QLAも抽出しておく。
三次元モデル141を簡略化することでモデル140aが得られる。モデル140aは、三次元モデル141と置換された簡易モデル143と、周囲モデル142とを含む。周囲モデル142は、モデル140aでもそのまま使用される。簡易モデル143は、有限要素モデルを近似する電気回路モデルであり、キャパシタ143-1,143-2を含む。キャパシタ143-1は、右心室に対応する可変キャパシタである。キャパシタ143-2は、左心室に対応する可変キャパシタである。
フーリエ係数テーブル135は、数式(17)に出現するフーリエ係数の数値を示す。フーリエ係数テーブル135は、次数n、振幅Anおよび位相ρnを対応付けている。次数nは、0次から12次までの13通りである。振幅Anとして、0次の振幅A0から12次の振幅A12までの13個の振幅が登録されている。位相ρnとして、1次の位相ρ1から12次の位相ρ12までの12個の位相が登録されている。
図12は、シミュレーション装置の機能例を示すブロック図である。
シミュレーション装置100は、メッシュデータ記憶部121およびパラメータ記憶部122を有する。これらの記憶部は、例えば、RAM102またはHDD103の記憶領域を用いて実現される。また、シミュレーション装置100は、三次元シミュレーション部123、簡易シミュレーション部124、指標算出部125、パラメータ推定部126、初期値決定部127および可視化部128を有する。これらの処理部は、例えば、CPU101が実行するプログラムを用いて実現される。
節点テーブル131およびメッシュテーブル132は、心臓の心室の形状を示すメッシュデータであり、メッシュデータ記憶部121に記憶される。節点テーブル131は、節点番号と座標とを対応付けた複数のレコードを記憶する。節点番号は、節点を識別する識別子である。座標は、節点の位置を示すX座標、Y座標およびZ座標の組である。メッシュテーブル132は、メッシュ番号と節点番号とを対応付けた複数のレコードを記憶する。メッシュ番号は、四面体の要素(メッシュ)を識別する識別子である。節点番号は、四面体の4つの頂点に相当する4つの節点の節点番号を列挙したものである。
パラメータテーブル133は、パラメータ記憶部122に記憶される。パラメータテーブル133は、パラメータとその値(パラメータ値)とを対応付けた複数のレコードを含む。パラメータには、周囲モデル142の抵抗値RA,RV,RPA,RPV,RTR,RPU,RC,RMI、キャパシタンスCA,CV,CPA,CPVおよびエラスタンスERA,ELAが含まれる。また、パラメータには、三次元モデル141の重力密度ρ,ρfなど、前述の基礎方程式に出現する各種のパラメータが含まれる。
時系列データテーブル134は、指標算出部125によって生成される。時系列データテーブル134は、10個の指標の所定周期分(例えば、3拍分)の時系列データを記憶する。10個の指標は、左心室容積VLV、右心室容積VRV、左心室圧PLV、右心室圧PRVおよび電荷量QA,QV,QPA,QPV,QRA,QLAである。時系列データテーブル134は、所定の時間刻みで、これら10個の指標の数値を列挙する。
図16は、シミュレーションの手順例を示すフローチャートである。
(S10)シミュレーション装置100は、メッシュデータ、三次元モデル141のパラメータ値および周囲モデル142のパラメータ値を取得する。
(S21)パラメータ推定部126は、所定条件を満たす評価値が得られた時点(例えば、誤差が閾値未満になった時点、または、相関係数が閾値を超えた時点)における簡易モデル143のパラメータ値を、最適なパラメータ値と決定する。初期値決定部127は、ステップS17と同じ周囲モデル142のパラメータ値、周囲モデル142の初期値、および、簡易モデル143の初期値を指定する。また、初期値決定部127は、パラメータ推定部126が決定した簡易モデル143のパラメータ値を指定する。
(S23)初期値決定部127は、左心室容積VLV、右心室容積VRV、左心室圧PLVおよび右心室圧PRVの最新の一周期分の時系列データを抽出する。初期値決定部127は、ここで抽出した時系列データと直前の一周期分の時系列データとの間の類似度を示す評価値を算出する。例えば、上記の4つの評価指標の評価値の平均を全体の評価値とする。評価値は、例えば、誤差または相関係数である。なお、直前の一周期分の時系列データがまだ無い場合は、ステップS24の判断がNOになる。
(S26)可視化部128は、ステップS12の三次元モデル141のパラメータ値、周囲モデル142のパラメータ値、および、周囲モデル142の初期値のうち、周囲モデル142の初期値をステップS25で抽出された値に変更する。
(S28)可視化部128は、三次元シミュレーション部123の実行結果から、左心室容積VLV、右心室容積VRV、左心室圧PLVおよび右心室圧PRVの最新の一周期分の時系列データを生成する。各時刻の左心室容積VLVおよび右心室容積VRVは、各四面体の体積を合算することで算出することができる。各時刻の左心室圧PLVおよび右心室圧PRVは、心室出口の節点に対応付けられた変数である圧力の値に相当する。
第2の実施の形態のシミュレーション装置100によれば、三次元モデル141と接続される周囲モデル142の変数に、収束後の値に近似する適切な初期値をシミュレーション開始時点で代入することが可能となる。よって、三次元モデル141および周囲モデル142を用いた血行動態シミュレーションが収束するまでの所要周期数を少なく抑えることができる。そのため、血行動態シミュレーションの計算量を削減でき、所要時間を短縮することができる。また、適切な初期値を求めるために使用する簡易モデル143は、三次元モデル141よりも変数が大幅に少ない。このため、簡易モデル143および周囲モデル142を用いたシミュレーションは短時間で完了することが可能である。そのため、簡易モデル143および周囲モデル142を用いたシミュレーションを追加しても、トータルの計算量は削減され、トータルの所要時間を短縮できる。
11 記憶装置
12 演算装置
13,14,15 モデル
16a,16b 状態値
17 特徴量
Claims (11)
- コンピュータに、
周期的な運動を行う第1の部位を示す第1のモデルと、前記第1の部位に接続されており前記周期的な運動の影響を受ける第2の部位を示す第2のモデルとを取得し、
前記第2のモデルに含まれる変数の初期値として第1の状態値を割り当て、前記第1のモデルおよび前記第2のモデルと前記第1の状態値とを用いて、前記周期的な運動のシミュレーションを所定周期数分実行して、前記所定周期数分の特徴量を算出し、
前記所定周期数分の特徴量に基づいて、前記第1のモデルより変数が少なく前記第1のモデルと置換可能な第3のモデルを生成し、
前記第3のモデルおよび前記第2のモデルを用いて、前記周期的な運動のシミュレーションを所定の収束条件が満たされるまで継続して実行し、前記所定の収束条件が満たされた周期において前記第2のモデルに含まれる変数がもつ第2の状態値を抽出する、
処理を実行させるシミュレーションプログラム。 - 前記コンピュータに更に、
前記第2のモデルに含まれる変数の初期値として前記第2の状態値を割り当て、前記第1のモデルおよび前記第2のモデルと前記第2の状態値とを用いて、前記周期的な運動のシミュレーションを実行する、処理を実行させる
請求項1記載のシミュレーションプログラム。 - 前記所定の収束条件は、最新の周期の特徴量と前記最新の周期から1つ前の周期の特徴量との差が、閾値未満であることである、
請求項1記載のシミュレーションプログラム。 - 前記第3のモデルの生成では、前記所定周期数分の特徴量と、前記第3のモデルおよび前記第2のモデルを用いて前記周期的な運動のシミュレーションを前記所定周期数分実行した結果との間の差に基づいて、前記第3のモデルのパラメータの値を修正する、
請求項1記載のシミュレーションプログラム。 - 前記第2のモデルは、キャパシタを含む電気回路を示す電気回路モデルであり、
前記第1の状態値および前記第2の状態値は、前記キャパシタの電荷量に対応する、
請求項1記載のシミュレーションプログラム。 - 前記第1のモデルは、複数の節点と前記複数の節点の間を接続する複数のエッジとを含み、前記複数の節点それぞれに変数が割り当てられる有限要素モデルであり、
前記第2のモデルおよび前記第3のモデルは、電気回路を示す電気回路モデルである、
請求項1記載のシミュレーションプログラム。 - 前記周期的な運動のシミュレーションは、前記第1の部位と前記第2の部位との間で流体を循環させる運動のシミュレーションである、
請求項1記載のシミュレーションプログラム。 - 前記所定周期数分の特徴量は、前記第1の部位の容積の時間変化を示す第1の時系列データと、前記第1の部位の圧力の時間変化を示す第2の時系列データとを含む、
請求項1記載のシミュレーションプログラム。 - 前記第1の部位は、心臓の少なくとも一部分であり、
前記第2の部位は、前記心臓の外部の血管を含む、
請求項1記載のシミュレーションプログラム。 - コンピュータが、
周期的な運動を行う第1の部位を示す第1のモデルと、前記第1の部位に接続されており前記周期的な運動の影響を受ける第2の部位を示す第2のモデルとを取得し、
前記第2のモデルに含まれる変数の初期値として第1の状態値を割り当て、前記第1のモデルおよび前記第2のモデルと前記第1の状態値とを用いて、前記周期的な運動のシミュレーションを所定周期数分実行して、前記所定周期数分の特徴量を算出し、
前記所定周期数分の特徴量に基づいて、前記第1のモデルより変数が少なく前記第1のモデルと置換可能な第3のモデルを生成し、
前記第3のモデルおよび前記第2のモデルを用いて、前記周期的な運動のシミュレーションを所定の収束条件が満たされるまで継続して実行し、前記所定の収束条件が満たされた周期において前記第2のモデルに含まれる変数がもつ第2の状態値を抽出する、
シミュレーション方法。 - 周期的な運動を行う第1の部位を示す第1のモデルと、前記第1の部位に接続されており前記周期的な運動の影響を受ける第2の部位を示す第2のモデルとを記憶する記憶装置と、
前記第2のモデルに含まれる変数の初期値として第1の状態値を割り当て、前記第1のモデルおよび前記第2のモデルと前記第1の状態値とを用いて、前記周期的な運動のシミュレーションを所定周期数分実行して、前記所定周期数分の特徴量を算出し、前記所定周期数分の特徴量に基づいて、前記第1のモデルより変数が少なく前記第1のモデルと置換可能な第3のモデルを生成し、前記第3のモデルおよび前記第2のモデルを用いて、前記周期的な運動のシミュレーションを所定の収束条件が満たされるまで継続して実行し、前記所定の収束条件が満たされた周期において前記第2のモデルに含まれる変数がもつ第2の状態値を抽出する演算装置と、
を有するシミュレーションシステム。
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