JP7403192B2 - スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する方法、及びそれを行うコンピューティングシステム - Google Patents

Description

本発明は、スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する方法、及びそれを行うコンピューティングシステムに関する。

病理学又は病理科で行われる主な業務の１つは、患者の生体画像（例えば、患者である生体組織スライド）を読み、特定疾病の状態や兆候を判断する診断を行うことである。このような診断は、長年にわたって経験豊富な医療従事者の経験と知識に依存する方法である。最近の傾向は、生体組織スライドの代わりに、これをデジタルイメージングによって生成したスライド画像を読み取る方法がますます増加している。

一方、ほとんどの診断実務では、病理学者が顕微鏡と測定ツール（例えば、定規）によりスライド画像で組織のサイズを手動で測定する方式を主に用いているが、スライド画像上における生体組織は直線状ではなく非常に不規則な曲線状を有しているため、組織を測定する病理学者によって組織のサイズが異なるように測定される場合があり、同じ病理学者が同じ組織を測定するにもかかわらず、測定ごとに組織のサイズが異なる場合があるという問題がある。すなわち、生体スライド画像による病理診断（例えば、前立腺癌の組織検査など）において、生体組織や病変が現れる病変組織のサイズは非常に重要な要素として扱われるにもかかわらず、組織のサイズを正確に測定することが非常に難しいという問題がある。

本発明はこのような問題を解決しようとする発明であり、本発明が達成しようとする技術的課題は、スライド画像に含まれた生体組織の長さを正確かつ客観的に測定する方法を提供することである。

本発明の一態様によると、スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する方法であって、コンピューティングシステムが、前記スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割するステップ（ここで、前記複数のパッチのそれぞれは、前記スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）と、前記コンピューティングシステムが、前記スライド画像に対応するグラフを生成するステップ（ここで、前記グラフは、前記複数のパッチのうち生体組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右又は対角線方向に互いに隣接した任意の２つのパッチに生体組織がわたっている場合、前記互いに隣接した２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結される）と、前記グラフに含まれた各エッジに関して、前記エッジの重み値を設定するステップ、２以上のノードを含む前記グラフの連結成分（ｃｏｎｎｅｃｔｅｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）のそれぞれに対して、前記連結成分に含まれたすべてのノード対の間の最短経路を検出し、検出されたすべてのノード対の間の最短経路のうちで長さの最も長い最長の最短経路を判断するステップと、前記グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、前記スライド画像に含まれた生体組織の長さを算出するステップと、を含む方法が提供される。

一実施形態において、前記エッジの重み値を設定することは、以下の［数１］によって前記エッジの重み値Ｗを算出することを含んでいてもよい。

［数１］
Ｗ＝Ａ／｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝
（ここで、ｖ１及びｖ２は、前記エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には

であり、Ｅ（ｘ）は、前記グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数である。）

一実施形態において、前記スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であり、前記エッジの重み値を設定することは、以下の［数２］によって前記エッジの重み値Ｗを算出することを含んでもよい。

［数２］
Ｗ＝Ａ／［｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝×｛Ｃ（ｖ１）×Ｃ（ｖ２）｝］
（ここで、ｖ１及びｖ２は、前記エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には

であり、Ｅ（ｘ）は、前記グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数であり、Ｃ（ｙ）は、前記グラフ上のノードｙに対応するパッチが病変組織を含んでいない場合には１、含んでいる場合にはαである（ここで、αは１より大きい所定の実数である）。）

一実施形態において、前記複数のパッチを２値化するステップと、２値化された前記複数のパッチのそれぞれについて、２値化された前記パッチの各エッジライン及び各角に生体組織を表すピクセルがあるか否かに基づいて、前記パッチに隣接したパッチに生体組織がわたっているか否かを判断するステップと、を含んでいてもよい。

一実施形態において、前記スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であり、前記スライド画像に含まれた生体組織領域をマスキングしたティッシュマスクを生成するステップと、前記スライド画像に含まれた病変組織をマスキングした病変マスクを作成するステップと、前記ティッシュマスク及び前記病変マスクに基づいて、前記複数のパッチに生体組織又は病変組織が含まれるか否かを判断するステップと、をさらに含んでいてもよい。

本発明の他の態様によると、スライド画像に含まれた病変組織の長さを測定する方法であって、コンピューティングシステムが、前記スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割するステップ（ここで、前記複数のパッチのそれぞれは、前記スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）と、前記コンピューティングシステムが、前記スライド画像に対応するグラフを生成するステップ（ここで、前記グラフは、前記複数のパッチのうち病変組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右又は対角線方向に互いに隣接した任意の２つのパッチに病変組織がわたっている場合、前記互いに隣接した２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結される）と、前記グラフに含まれた各エッジに関して、前記エッジの重み値を設定するステップ、２以上のノードを含む前記グラフの連結成分（ｃｏｎｎｅｃｔｅｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）のそれぞれに対して、前記連結成分に含まれたすべてのノード対の間の最短経路を検出し、検出されたすべてのノード対の間の最短経路のうちで長さの最も長い最長の最短経路を判断するステップと、前記グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、前記スライド画像に含まれた病変組織の長さを算出するステップと、を含む方法が提供される。

本発明の他の態様によると、データ処理装置にインストールされ、上述の方法を行うために記録されたコンピュータプログラムが提供される。

本発明の他の態様によると、コンピューティングシステムであって、プロセッサと、コンピュータプログラムを記憶するメモリと、を含み、前記コンピュータプログラムは、前記プロセッサによって実行される場合、前記コンピューティングシステムに前記の方法を実行させるコンピューティングシステムが提供される。

本発明の他の態様によると、スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する方法を行うコンピューティングシステムであって、前記スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割する分割モジュール（ここで、前記複数のパッチのそれぞれは、前記スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）と、前記スライド画像に対応するグラフを生成するグラフ生成モジュール（ここで、前記グラフは、前記複数のパッチのうち生体組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右又は対角線方向に互いに隣接した任意の２つのパッチに生体組織がわたっている場合、前記互いに隣接した２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結される）と、前記グラフに含まれた各エッジに関して、前記エッジの重み値を設定する重み値設定モジュール、２以上のノードを含む前記グラフの連結成分（ｃｏｎｎｅｃｔｅｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）のそれぞれに対して、前記連結成分に含まれたすべてのノード対の間の最短経路を検出し、検出されたすべてのノード対の間の最短経路のうちで長さの最も長い最長の最短経路を判断する最短経路判断モジュールと、前記グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、前記スライド画像に含まれた生体組織の長さを算出する算出モジュールと、を含むコンピューティングシステムが提供される。

一実施形態において、前記重み値設定モジュールは、下記［数３］によって前記エッジの重み値Ｗを算出することができる。

［数３］
Ｗ＝Ａ／｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝
（ここで、ｖ１及びｖ２は、前記エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には

であり、Ｅ（ｘ）は、前記グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数である。）

一実施形態において、前記スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であり、前記重み値設定モジュールは、下記［数４］によって前記エッジの重み値Ｗを算出することができる。

［数４］
Ｗ＝Ａ／［｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝×｛Ｃ（ｖ１）×Ｃ（ｖ２）｝］
（ここで、ｖ１及びｖ２は、前記エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には

であり、Ｅ（ｘ）は、前記グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数であり、Ｃ（ｙ）は、前記グラフ上のノードｙに対応するパッチが病変組織を含んでいない場合は１、含んでいる場合はαである（ここで、αは１より大きい所定の実数である）。）

一実施形態において、前記複数のパッチを２値化する画像処理モジュールと、２値化された前記複数のパッチのそれぞれについて、２値化された前記パッチの各エッジライン及び各角に生体組織を表すピクセルがあるか否かに基づいて、前記パッチに隣接したパッチに生体組織がわたっているか否かを判断する判断モジュールと、をさらに含んでいてもよい。

一実施形態において、前記スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であり、前記スライド画像に含まれた生体組織領域をマスキングしたティッシュマスクを生成し、前記スライド画像に含まれた病変組織をマスキングした病変マスクを生成する画像処理モジュールと、前記ティッシュマスク及び前記病変マスクに基づいて、前記複数のパッチに生体組織又は病変組織が含まれるか否かを判断する判断モジュールと、をさらに含んでいてもよい。

本発明の他の態様によると、スライド画像に含まれた病変組織の長さを測定する方法を行うコンピューティングシステムであって、前記スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割する分割モジュール（ここで、前記複数のパッチのそれぞれは、前記スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）と、前記スライド画像に対応するグラフを生成するグラフ生成モジュール（ここで、前記グラフは、前記複数のパッチのうち病変組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右又は対角線方向に互いに隣接した任意の２つのパッチに病変組織がわたっている場合、前記互いに隣接した２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結される）と、前記グラフに含まれた各エッジに関して、前記エッジの重み値を設定する重み値設定モジュール、２以上のノードを含む前記グラフの連結成分（ｃｏｎｎｅｃｔｅｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）のそれぞれに対して、前記連結成分に含まれたすべてのノード対の間の最短経路を検出し、検出されたすべてのノード対の間の最短経路のうちで長さの最も長い最長の最短経路を判断する最短経路判断モジュールと、前記グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、前記スライド画像に含まれた病変組織の長さを算出する算出モジュールと、を含むコンピューティングシステムが提供される。

本発明の技術的思想によると、スライド画像に含まれた生体組織又は病変組織の長さを正確かつ客観的に測定する方法を提供することができる。

本発明の詳細な説明で引用される図面をより十分に理解するために、各図面の簡単な説明が提供される。
本発明の一実施形態による生体組織長測定方法の一例を示すフローチャートである。 本発明の一実施形態による生体組織長測定方法の具体的な実施過程を説明するための図である。 本発明の一実施形態による生体組織長測定方法の具体的な実施過程を説明するための図である。 本発明の一実施形態による生体組織長測定方法の具体的な実施過程を説明するための図である。 本発明の一実施形態による生体組織長測定方法の具体的な実施過程を説明するための図である。 本発明の一実施形態による生体組織長測定方法の具体的な実施過程を説明するための図である。 本発明の一実施形態による生体組織長測定方法の具体的な実施過程を説明するための図である。 本発明の一実施形態による生体組織長測定方法の具体的な実施過程を説明するための図である。 本発明の一実施形態によるコンピューティングシステムがグラフのエッジを生成する方法を説明するための図である。 生成されるグラフが２つ以上の連結要素を含む例を説明するための図である。 グラフに含まれる各エッジの重み値を設定する実施形態について説明するための図である。 本発明の一実施形態によるコンピューティングシステムの概略構成を示すブロック図である。 本発明の一実施形態によるコンピューティングシステムが生体スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する過程の一例を示す図である。 本発明の一実施形態によるコンピューティングシステムが生体スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する過程の一例を示す図である。 本発明の一実施形態によるコンピューティングシステムが生体スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する過程の一例を示す図である。 本発明の一実施形態によるコンピューティングシステムが生体スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する過程の一例を示す図である。 本発明の一実施形態によるコンピューティングシステムが生体スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する過程の一例を示す図である。

本発明は、様々な変換を加えることができ、様々な実施形態を有してもよいので、特定の実施形態を図面に示し、詳細な説明に詳細に説明する。しかしながら、これは本発明を特定の実施形態に限定することを意図するものではなく、本発明の精神及び技術的範囲に含まれるすべての変換、等価物から代替物を含むことを理解されたい。本発明の説明において、関連する公知技術の具体的な説明が本発明の要旨を不明瞭にすると判断される場合、その詳細な説明は省略する。

第１、第２などの用語は様々な構成要素を説明するために使用することができるが、上記構成要素は上記用語によって限定されるべきではない。上記用語は、ある構成要素を他の構成要素から区別する目的でのみ使用される。

本出願で使用される用語は、単に特定の実施形態を説明するために使用されたものであり、本発明を限定することを意図していない。単数の表現は、文脈上明らかに異なるように意味しない限り、複数の表現を含む。

本明細書において、「含む」又は「有する」などの用語は、本明細書に記載の特徴、数、ステップ、動作、構成要素、部品、又はそれらを組み合わせたものが存在することを指定するものであり、１つ又はそれ以上の他の特徴、数、ステップ、動作、構成要素、部品、又はそれらを組み合わせたものの存在又は追加の可能性を事前に除外しないことを理解されたい。

また、本明細書において、ある構成要素が他の構成要素にデータを「伝送」する場合、構成要素は、他の構成要素に直接データを伝送することもでき、少なくとも１つの別の構成要素を介して、データを他の構成要素に伝送することもできることを意味する。逆に、ある構成要素が他の構成要素にデータを「直接伝送」する場合、構成要素からまた他の構成要素を介することなく他の構成要素にデータを伝送することを意味する。

以下、添付の図面を参照して本発明の実施形態を中心に本発明を詳細に説明する。各図に示されている同じ参照符号は同じ部材を示す。

本発明の一実施形態によるコンピューティングシステムは情報処理装置であってもよい。コンピューティングシステム１００は、デスクトップコンピュータ、ラップトップコンピュータ、サーバなどの処理システムであってもよく、携帯電話、衛星電話、無線電話、ＳＩＰ（Ｓｅｓｓｉｏｎ Ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ Ｐｒｏｔｏｃｏｌ）、ＷＬＬ（Ｗｉｒｅｌｅｓｓ Ｌｏｃａｌ Ｌｏｏｐ）ステーション、スマートフォン、タブレットＰＣ、ＰＤＡ（Ｐｅｒｓｏｎａｌ Ｄｉｇｉｔａｌ Ａｓｓｉｓｔａｎｔ）などのハンドヘルド装置を含む処理装置であってもよい。

コンピューティングシステムは、スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する方法（以下、「生体組織長測定方法」という）を行うことができる。

図１は、コンピューティングシステムが行う生体組織長測定方法の一例を示すフローチャートである。

コンピューティングシステムはスライド画像を受信してもよい（Ｓ１００）。スライド画像は、生体組織を撮影した画像であってもよい。例えば、スライド画像は、所定の疾患（例えば癌）の病変の有無を判断するために生体組織を撮影した病理スライド画像であってもよい。

コンピューティングシステムは、スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割してもよい（Ｓ１１０）。複数のパッチのそれぞれは、スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれであってもよい（ここで、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）。

複数のパッチのそれぞれは、同じサイズの正方形の形態であってもよい。

図２ａはスライド画像の一例を示す図であり、図２ｂは、図２ａのスライド画像をパッチに分割したものを表す一例を示す図である。コンピューティングシステム１００が図２ａに示すようなスライド画像１０を入力される場合、分割モジュール１１０は、これを図２ｂに示すように、５×８の格子状２０に分割して４０個のパッチ（例えば２１）を形成することができる。スライドの各パッチ（例えば、２１）は同じサイズを有してもよい。

コンピューティングシステムは、スライド画像で生体組織を検出することができ、実施形態によって、スライド画像で所定の疾患による病変を含む生体組織である病変組織を検出することができる（Ｓ１２０）。本明細書において、画像に含まれた生体組織を検出するとは、当該画像のうち生体組織が撮影された領域を検出するか、又は当該画像を構成する複数のパッチのうち生体組織が撮影された領域を含むパッチを判断することを意味し、画像に含まれた病変組織を検出するとは、当該画像のうち病変組織が撮影された領域を検出するか、又は当該画像を構成する複数のパッチのうち病変組織が撮影されたパッチを判断することを意味することができる。

一実施形態において、コンピューティングシステムは、コンピュータビジョンに関連する技術である画像二値化によってスライド画像に含まれた生体組織を検出することができる。より具体的には、コンピューティングシステムは、スライド画像に対するノイズフィルタリング及び／又はミディアンブラーなどの前処理を行い、それをグレースケールに変換し、変換された画像に対する境界化（ｔｈｒｅｓｈｏｌｄｉｎｇ）を行うことによって、画素を所定の境界値に基づいて区分することによって二値化を行うことができる。実施形態によって、コンピューティングシステムは、スライド画像を分割したパッチごとに２値化を行うことができ、このようにして図２ｂのパッチ２０を２値化した結果を図２ｃに示す。

これに加えて、コンピューティングシステムが生体組織を検出する様々な実施形態があり得る。例えば、コンピューティングシステムは、生体組織を検出できるように予め学習された人工知能ネットワークを用いて、スライド画像に含まれた生体組織を検出することができる。

一方、コンピューティングシステムは、上述の２値化技術又は予め学習された人工知能ネットワークを用いてスライド画像から病変組織を検出することができる。

また図１を参照すると、コンピューティングシステムは、スライド画像に対応するグラフ（特に無方向グラフ）を生成することができる（Ｓ１３０）。

より具体的には、コンピューティングシステムは、グラフのノードを生成することができる。コンピューティングシステムは、スライド画像を構成する各パッチに対応するノードを生成することができる（Ｓ１３１）。図２ｄは、図２ｂのパッチ２０のそれぞれに対応するノード４０を示す図である。

さらに、コンピューティングシステムは、グラフのエッジを生成することができる。コンピューティングシステムは、上下、左右、又は対角線方向に互いに隣接する任意の２つのパッチに生体組織がわたっている場合、互いに隣接する２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結することができる。

例えば、コンピューティングシステムは、パッチの上／下／左／右のエッジラインをスキャンして、パッチに隣接したパッチに生体組織がわたっているか否かを判断することができる。すなわち、コンピューティングシステムは、パッチの各エッジラインをスキャンし、該当エッジラインの少なくとも一部に生体組織を表すピクセルが形成されている場合、該当エッジを共有する隣接パッチとそのパッチに生体組織がわたっていると判断することができる。

図３は、コンピューティングシステムがグラフのエッジを生成する方法を説明するための図である。図３ａはスライド画像の各パッチを示し、図３ｂは図３ａのパッチの一部である（２，２）番目のパッチ、（２，３）番目のパッチ、（３，２）番目のパッチ、及び（３，３）番目のパッチが示されており、図３ｃは、図３ｂに対応するノード、及びコンピューティングシステムによって生成された各ノードのエッジを示す。

図３ｂの例において、（２，２）番目のパッチには、上端、下端、右側のエッジラインに生体組織を示す画素（太線で示されている）が形成されているので、コンピューティングシステムは（２，２）番目のパッチとその上に隣接する（１，２）番目のパッチ、（２，２）番目のパッチとその下に隣接する（３，２）番目のパッチ、（２，２）番目のパッチとその右に隣接する（２，３）番目のパッチに生体組織がわたっていると判断することができ、図３ｃに示すように、ノード（２：２）とノード（１：２）をエッジで連結し、ノード（２：２）とノード（３：２）をエッジで連結し、ノード（２：２）とノード（２：３）をエッジで連結してもよい。

また、コンピューティングシステムは、パッチの各角とそれに面する対角線方向隣接パッチの角に生体組織を表すピクセルが形成されている場合、両方のパッチに生体組織がわたっていると判断することができる。

図３ｂの例において、（２，２）番目のパッチの右下端の角と、これと対向する（３，３）番目のパッチの左上端の角に生体組織を表すピクセルが形成されているので、コンピューティングシステムは図３ｃに示すように、（２，２）番目のパッチに対応するノード（２：２）と、（３，３）番目のパッチに対応するノード（３：３）とをエッジで連結することができる。

同様に、コンピューティングシステムは、ノード（２：３）、ノード（３：２）、及びノード（３：３）のエッジを判断することができる。

上述のように図３ｄのノードをエッジで連結したグラフ５０が図２ｅに示されている。一方、コンピューティングシステムは、他のどのノードとも連結されていない独立ノードを除去してスライドに対応するグラフを生成してもよく、図２ｅのグラフから独立ノードが除去されたグラフ６０が図２ｆに示されている。

一方、スライド画像によっては、コンピューティングシステムが生成するグラフが２つ以上の連結要素を含んでいてもよい。仮に、スライド画像が図４ａに示すようなパッチで構成されている場合、コンピューティングシステムは図４ｂのグラフから独立ノードを除去し、図４ｃに示すように２つの連結要素を含むグラフを生成することができる。

また図１を参照すると、コンピューティングシステムは、グラフに含まれる各エッジの重み値を設定することができ（Ｓ１４０）、これについて図５を参照して説明する。図５の例において、各ノードの配置はそれに対応するパッチの配置と同じであると仮定する。

一実施形態において、コンピューティングシステムは、上下左右に隣接したパッチに対応するノードを連結するエッジの場合、重み値を１に設定し、対角線方向に隣接したパッチに対応するノードを連結するエッジの場合には重み値を

に設定することができ、その例を図５ａに示す。図５ａに示すように、エッジ（Ｖ１，Ｖ２）、（Ｖ１，Ｖ３）、（Ｖ３，Ｖ４）は、該当エッジが上下又は左右に隣接したパッチに対応するノードを連結しているため、重み値が１に設定され、エッジは対角線方向に隣接したパッチに対応するノードを連結しているため、重み値が

に設定される。

別の実施形態では、コンピューティングシステムは、エッジによって連結される２つのノードのそれぞれの隣接ノードの数をさらに考慮して重み値を設定することができる（ここで、隣接ノードは該当ノードとエッジを介して連結されているノードであり、隣接ノードの数は、該当ノードが有しているエッジの数と同じである。）これは、後で説明する最長の最短経路が可能なかぎり生体組織の中間を通過できるようにするためである。隣接ノードの数を考慮した重み値設定方法では、下記［数１］によりエッジの重み値Ｗを決定することができ、その例を図５ｂに示す。

［数１］
Ｗ＝Ａ／｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝
（ここで、ｖ１及びｖ２は、エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には

であり、Ｅ（ｘ）は、ノードｘに連結されたエッジの数（つまり、ノードｖの隣接ノードの数である）である）

図５ｂに示すように、ノードＶ１は４つの隣接ノード（すなわち、４つのエッジ）を有し、ノードＶ２は１つの隣接ノードを有し、ノードＶ３は３つの隣接ノードを有し、ノードＶ４は、２つの隣接ノードを有するとすると、図５ｂの各エッジは、次のような重み値を有してもよい。

一方、スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部が病変組織である場合、コンピューティングシステムは、エッジによって連結された２つのノードに対応するパッチが病変組織を含むか否かをさらに考慮して重み値を設定することができる。生体組織が病変組織を含む場合、必ず病変組織を含めて生体組織の長さを測定しなければならないためである。

パッチが病変組織を含むか否かを考慮した重み値設定方法では、下記［数２］によりエッジの重み値Ｗを決定することができ、その例を図５ｃに示す。

［数２］
Ｗ＝Ａ／｛Ｃ（ｖ１）＊Ｃ（ｖ２）｝
（ここで、ｖ１及びｖ２は、エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には

であり、Ｃ（ｘ）は、グラフ上の任意のノードｖに対応するパッチが病変組織を含んでいない場合は１、含んでいる場合はαである（ここで、αは１より大きい所定の実数であり、以下ではαが２であると仮定する））

図５ｃに示すように、ノードＶ１及びＶ４に病変組織が含まれている場合、図５ｃの各エッジは以下の重み値を有してもよい。

一方、他の実施形態では、コンピューティングシステムは、隣接ノードの数とパッチが病変組織を含むか否かを考慮して重み値を設定してもよい。この場合、コンピューティングシステムは、以下の［数４］によってエッジの重み値Ｗを決定することができ、その例を図５ｄに示す。

［数４］
Ｗ＝Ａ／｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝／｛Ｃ（ｖ１）×Ｃ（ｖ２）｝
ノードＶ１及びＶ４に病変組織が含まれており、各ノードの隣接ノードの数が図５ｄのようであるとすると、図５ｄの各エッジは次のような重み値を有してもよい。

また図１を参照すると、コンピューティングシステムは、２つ以上のノードを含むグラフの連結成分のそれぞれについて、連結成分に含まれるすべてのノード対の間の最短経路を検出し、検出されたすべてのノード対の間の最短経路のうち最も長さの長い最長の最短経路を判断することができる（Ｓ１５０）。

一実施形態において、コンピューティングシステムは、Ｆｌｏｙｄ－Ｗａｒｓｈａｌｌアルゴリズムを用いて最長の最短経路を判断することができる。すなわち、コンピューティングシステムは、連結成分に含まれる各ノード対の間の最短経路を算出し、そのうち最も長い距離を有する最短経路である最長の最短経路を判断することができる。図２ｇは、図２ｆに示すグラフの最長の最短経路を示す図である。

また図１を参照すると、コンピューティングシステムは、グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいてスライド画像に含まれた生体組織の長さを算出することができる。

一実施形態において、コンピューティングシステムは、各連結成分の最長の最短経路上のすべてのエッジの長さを、該当エッジによって連結される２つのノードに対応するパッチの配置に従って１又は

に設定し、各最長の最短経路の長さを再計算した後、再計算された長さに上下又は左右に隣接したパッチ間の実際の距離を掛けることによって、生体組織の実際の長さを算出することができる。

一実施形態において、コンピューティングシステムは、各連結成分の最長の最短経路の距離をすべて合計し、合計された値に基づいて生体組織全体の長さを算出し、それをコンピューティングシステムの外部に出力することができる。別の実施形態において、コンピューティングシステムは、すべての連結成分の最長の最短経路のそれぞれの距離に基づいて、スライド画像に含まれた生体組織に含まれる各断片の長さを算出し、それをコンピューティングシステムの外部に出力してもよい。

図６は、本発明の一実施形態によるコンピューティングシステム１００の概略構成を示すブロック図である。

図６を参照すると、コンピューティングシステム１００は、分割モジュール１１０、グラフ生成モジュール１２０、重み値設定モジュール１３０、最短経路判断モジュール１４０、算出モジュール１５０を含んでいてもよい。さらに、コンピューティングシステム１００は、画像処理モジュール１６０、判断モジュール１７０、及び／又は診断モジュール１８０をさらに含んでいてもよい。実施形態によって、コンピューティングシステム１００は、図６に示される構成のうちの一部のみを含んでもよく、それより多くの構成を含んでいてもよい。例えば、コンピューティングシステム１００は、ネットワークを介して外部システムと通信できる少なくとも１つの通信モジュール、又はコンピューティングシステム１００に含まれる他の構成要素の機能及び／又はリソースを制御できる制御モジュール、各種情報を記憶できる記憶モジュール、ユーザとインターフェースして、外部から情報を受け取ったり外部に情報を出力することができる入出力モジュールなどをさらに含んでいてもよい。

コンピューティングシステム１００は、本発明の技術的思想を実現するために必要なハードウェアリソース及び／又はソフトウェアを備えることができ、必ずしも１つの物理的構成要素を意味するか、又は１つの装置を意味するわけではない。すなわち、コンピューティングシステム１００は、本発明の技術的思想を実現するために備えられたハードウェア及び／又はソフトウェアの論理的結合を意味することができ、必要に応じては互いに離隔した装置にインストールされ、各機能を行うことによって本発明の技術的思想を実現するための論理構成の集合として実現されてもよい。さらに、コンピューティングシステム１００は、本発明の技術的思想を実現するための各機能又は役割によって別々に実現される構成の集合を意味してもよい。

本明細書においてモジュールとは、本発明の技術的思想を行うためのハードウェアと、ハードウェアを駆動するためのソフトウェアとの機能的、構造的結合を意味してもよい。例えば、モジュールは、所定のコードと、所定のコードが実行されるためのハードウェアリソースの論理的な単位を意味することができ、必ずしも物理的に連結されたコードを意味するか、又は一種のハードウェアを意味するものではないことは、本発明の技術分野における平均的専門家は容易に推論できる。

分割モジュール１１０は、スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割することができる。このとき、複数のパッチのそれぞれは、スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり（Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）、同一サイズの正方形の形態であってもよい。

スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であってもよく、診断モジュール１８０は、スライド画像又は複数のパッチのそれぞれに所定の疾患による病変があるか否かを判断してもよい。あるいは、診断モジュール１８０は、スライド画像又は複数のパッチのそれぞれにおいて病変組織を検出することができる。

一実施形態において、画像処理モジュール１６０は複数のパッチを２値化することができ、判断モジュール１７０は２値化された複数のパッチのそれぞれに対して、２値化されたパッチの各エッジライン及び各角に生体組織を表すピクセルが存在するか否かに基づいて、パッチに隣接したパッチに生体組織がわたっているか否かを判断することができる。

別の実施形態では、画像処理モジュール１６０は、スライド画像に含まれた生体組織領域をマスキングしたティッシュマスクを生成し、スライド画像に含まれた病変組織をマスキングした病変マスクを生成することができ、判断モジュール１７０は、ティッシュマスク及び病変マスクに基づいて、複数のパッチに生体組織又は病変組織が含まれるか否かを判断することができる。

一方、グラフ生成モジュール１２０は、スライド画像に対応するグラフを生成することができる。グラフ生成モジュール１２０が生成するグラフは、複数のパッチのうち生体組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右又は対角線方向に互いに隣接する任意の２つのパッチに生体組織がわたっている場合、互いに隣接する２つのパッチに対応する２つのノードをエッジで連結することができる。

重み値設定モジュール１３０は、グラフに含まれる各エッジについて、エッジの重み値を設定してもよい。

一実施形態において、重み値設定モジュール１３０は、以下の［数５］によってエッジの重み値Ｗを算出することができる。

［数５］
Ｗ＝Ａ／｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝
（ここで、ｖ１及びｖ２は、エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には

であり、Ｅ（ｘ）は、グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数である）
別の一実施形態において、重み値設定モジュールは、下記［数６］によってエッジの重み値Ｗを算出することができる。

［数６］
Ｗ＝Ａ／［｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝×｛Ｃ（ｖ１）×Ｃ（ｖ２）｝］
（ここで、ｖ１及びｖ２は、エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には

であり、Ｅ（ｘ）は、グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数であり、Ｃ（ｙ）は、グラフ上のノードｙに対応するパッチが病変組織を含んでいない場合は１、含んでいる場合はαである（ここで、αは１より大きい所定の実数である））

一方、最短経路判断モジュール１４０は、２つ以上のノードを含むグラフの連結成分のそれぞれについて、連結成分に含まれた全てのノード対の間の最短経路を検出し、検出された全てのノード対の間の最短経路のうち長さの最も長い最長の最短経路を判断することができ、算出モジュール１５０は、グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、スライド画像に含まれた生体組織の長さを算出することができる。

図７は、コンピューティングシステムが生体スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する過程の一例を示す図である。

図７ａに示すようなスライド画像が入力されると、コンピューティングシステム１００は、図７ｂに示すように、スライド画像に含まれた生体組織領域をマスキングしたティッシュマスクを生成し、図７ｃに示すように、スライド画像に含まれた病変組織をマスキングした病変マスクを生成することができる。

コンピューティングシステム１００は、スライド画像を複数のパッチに分割し、スライド画像に対応するグラフを図７ｄのように生成することができる。

その後、コンピューティングシステムは、図７ｄのグラフ内の各連結要素の最長の最短経路を判断することができる。図７ｅには、各連結要素の最長の最短経路がスライド画像に重なって示されている。

一方、上述した生体組織の長さ測定方法は、非常に容易に病変組織の長さを測定する方法として応用することができる。すなわち、本発明の一実施形態による病変組織の長さ測定方法を行うために、コンピューティングシステムは、スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割することができる（ここで、複数のパッチのそれぞれは、スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）。

コンピューティングシステムは、スライド画像に対応するグラフを生成することができる。このとき、グラフは、複数のパッチのうち病変組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右又は対角線方向に互いに隣接する任意の２つのパッチに病変組織がわたっている場合、互いに隣接する２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結することができる。

さらに、コンピューティングシステムは、グラフに含まれる各エッジについて、エッジの重み値を設定することができる。この場合、コンピューティングシステムは、エッジによって連結された２つのノードの隣接ノードの数を考慮して該当エッジの重み値を設定することができ、これに関しては上述した通りである。

コンピューティングシステムは、２つ以上のノードを含むグラフの連結成分の各々に対して、連結成分に含まれるすべてのノード対の間の最短経路を検出し、検出されたすべてのノード対の間の最短経路のうち長さの最も長い最長の最短経路を判断することができる。

コンピューティングシステムは、グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、スライド画像に含まれた病変組織の長さを算出することができる。

一方、実施形態によって、コンピューティングシステム１００は、少なくとも１つのプロセッサと、プロセッサによって実行されるプログラムを記憶するメモリとを含んでいてもよい。プロセッサは、シングルコアＣＰＵ又はマルチコアＣＰＵを含んでいてもよい。メモリは、高速ランダムアクセスメモリを含むことができ、１つ以上の磁気ディスク記憶装置、フラッシュメモリデバイス、又は他の不揮発性固体状態メモリデバイスなどの不揮発性メモリを含んでいてもよい。プロセッサ及び他の構成要素によるメモリへのアクセスは、メモリコントローラによって制御することができる。

一方、本発明の一実施形態による生体組織／病変組織の長さ測定方法は、コンピュータ読み取り可能なプログラム命令の形態で実現され、コンピュータ読み取り可能な記録媒体に記憶することができる。コンピュータが読み取り可能な記録媒体は、コンピューティングシステムによって読み取ることができるデータが記憶されるあらゆる種類の記録装置を含む。

記録媒体に記録されるプログラム命令は、本発明のために特別に設計及び構成されたものであってもよく、ソフトウェア分野の当業者に公知として使用可能なものであってもよい。

コンピュータで読み取り可能な記録媒体の例には、ハードディスク、フロッピーディスク、磁気テープなどの磁気媒体（ｍａｇｎｅｔｉｃ ｍｅｄｉａ）、ＣＤ－ＲＯＭ、ＤＶＤなどの光記録媒体（ｏｐｔｉｃａｌ ｍｅｄｉａ）、フロプティカルディスク（ｆｌｏｐｔｉｃａｌ ｄｉｓｋ）などの磁気光学媒体（ｍａｇｎｅｔｏ－ｏｐｔｉｃａｌ ｍｅｄｉａ）、及びＲＯＭ、ＲＡＭ、フラッシュメモリなどのプログラム命令を記憶して行うように特別に構成されたハードウェア装置が含まれる。また、コンピュータが読み取り可能な記録媒体は、ネットワークで連結されたコンピューティングシステムに分散され、分散方式でコンピュータが読み取り可能なコードを記憶して行うことができる。

プログラム命令の例には、コンパイラによって作成されるような機械語コードだけでなく、インタプリタなどを用いて電子的に情報を処理する装置、例えばコンピュータによって実行され得る高級言語コードも含まれる。

上述のハードウェア装置は、本発明の動作を行うために１つ以上のソフトウェアモジュールとして動作するように構成することができ、その逆も同様である。

上述した本発明の説明は例示のためのものであり、本発明が属する技術分野の通常の知識を有する者であれば本発明の技術的思想や必須の特徴を変更することなく他の具体的な形態に容易に変形が可能であることが理解できるであろう。したがって、上記で説明した実施形態はすべての点で例示的なものであり、限定的なものではないと理解すべきである。例えば、単一の形態で説明されている各構成要素は分散して実施することができ、同様に分散されたものと記載されている構成要素も組み合わせた形で実施することができる。

本発明の範囲は、上記の詳細な説明よりは後述の特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲の意味及び範囲及びその均等概念から導き出される全ての変更又は変形された形態が本発明の範囲に含まれるものと解釈されるべきである。

スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する方法、及びそれを行うコンピューティングシステム。

Claims (14)

1. スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する方法であって、
   コンピューティングシステムが、前記スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割するステップ（ここで、前記複数のパッチのそれぞれは、前記スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）と、
   前記コンピューティングシステムが、スライド画像に対応するグラフを生成するステップ（ここで、前記グラフは、前記複数のパッチのうち生体組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右、又は対角線方向に互いに隣接する任意の２つのパッチに生体組織がわたっている場合、前記互いに隣接する２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結される）と、
   前記グラフに含まれる各エッジについて、前記エッジの重み値を設定するステップと、
   ２つ以上のノードを含む前記グラフの連結成分（ｃｏｎｎｅｃｔｅｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）のそれぞれについて、前記連結成分に含まれた全てのノード対の間の最短経路を検出し、検出された全てのノード対の間の最短経路のうちで長さの最も長い最長の最短経路を判断するステップと、
   前記グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、前記スライド画像に含まれた生体組織の長さを算出するステップと、
   を含む、方法。
2. 前記エッジの重み値を設定するステップは、
   下記［数１］によって前記エッジの重み値Ｗを算出するステップを含む、請求項１に記載の方法。
   ［数１］
   Ｗ＝Ａ／｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝
   （ここで、ｖ１及びｖ２は、前記エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には
   

   

   であり、Ｅ（ｘ）は、前記グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数である）
3. 前記スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であり、
   前記エッジの重み値を設定するステップは、
   下記［数２］によって前記エッジの重み値Ｗを算出するステップを含む、請求項１に記載の方法。
   ［数２］
   Ｗ＝Ａ／［｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝×｛Ｃ（ｖ１）×Ｃ（ｖ２）｝］
   （ここで、ｖ１及びｖ２は、前記エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には
   

   

   であり、Ｅ（ｘ）は、前記グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数であり、Ｃ（ｙ）は、前記グラフ上のノードｙに対応するパッチが病変組織を含んでいない場合には１、含んでいる場合にはαである（ここで、αは１より大きい所定の実数である））
4. 前記複数のパッチを二値化するステップと、
   ２値化された前記複数のパッチのそれぞれについて、２値化された前記パッチの各エッジライン及び各角に生体組織を表すピクセルが存在するか否かに基づいて、前記パッチに隣接したパッチに生体組織がわたっているか否かを判断するステップと、
   をさらに含む、請求項１に記載の方法。
5. 前記スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であり、
   前記スライド画像に含まれた生体組織領域をマスキングしたティッシュマスクを生成するステップと、
   前記スライド画像に含まれた病変組織をマスキングした病変マスクを生成するステップと、
   前記ティッシュマスク及び前記病変マスクに基づいて、前記複数のパッチに生体組織又は病変組織が含まれるか否かを判断するステップと、
   をさらに含む、請求項１に記載の方法。
6. スライド画像に含まれた病変組織の長さを測定する方法であって、
   コンピューティングシステムが、前記スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割するステップ（ここで、前記複数のパッチのそれぞれは、前記スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）と、
   前記コンピューティングシステムが、スライド画像に対応するグラフを生成するステップ（ここで、前記グラフは、前記複数のパッチのうち病変組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右、又は対角線方向に互いに隣接する任意の２つのパッチに病変組織がわたっている場合、前記互いに隣接する２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結される）と、
   前記グラフに含まれる各エッジについて、前記エッジの重み値を設定するステップと、
   ２つ以上のノードを含む前記グラフの連結成分（ｃｏｎｎｅｃｔｅｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）のそれぞれに対して、前記連結成分に含まれたすべてのノード対の間の最短経路を検出し、検出されたすべてのノード対の間の最短経路のうちで長さの最も長い最長の最短経路を判断するステップと、
   前記グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、前記スライド画像に含まれた病変組織の長さを算出するステップと、
   を含む、方法。
7. データ処理装置にインストールされ、請求項１又は請求項６に記載の方法を行うために記録されたコンピュータプログラム。
8. コンピューティングシステムであって、
   プロセッサと、
   コンピュータプログラムを格納するメモリと、
   を含み、
   前記コンピュータプログラムは、前記プロセッサによって実行されると、前記コンピューティングシステムが請求項１ないし請求項６のいずれか一項に記載の方法を行うことを可能にする、コンピューティングシステム。
9. スライド画像に含まれた生体組織の長さを測定する方法を行うコンピューティングシステムであって、
   前記スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割する分割モジュール（ここで、前記複数のパッチのそれぞれは、前記スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）と、
   
   前記スライド画像に対応するグラフを生成するグラフ生成モジュール（ここで、前記グラフは、前記複数のパッチのうち生体組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右、又は対角線方向に互いに隣接する任意の２つのパッチに生体組織がわたっている場合、前記互いに隣接する２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結される）と、
   前記グラフに含まれる各エッジについて、前記エッジの重み値を設定する重み値設定モジュールと、
   ２つ以上のノードを含む前記グラフの連結成分（ｃｏｎｎｅｃｔｅｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）のそれぞれに対して、前記連結成分に含まれたすべてのノード対の間の最短経路を検出し、検出されたすべてのノード対の間の最短経路のうちで長さの最も長い最長の最短経路を判断する最短経路判断モジュールと、
   前記グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、前記スライド画像に含まれた生体組織の長さを算出する算出モジュールと、
   を含む、コンピューティングシステム。
10. 前記重み値設定モジュールは、
    下記［数３］により前記エッジの重み値Ｗを算出する、請求項９に記載のコンピューティングシステム。
    ［数３］
    Ｗ＝Ａ／｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝
    （ここで、ｖ１及びｖ２は、前記エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には
    

    

    であり、Ｅ（ｘ）は、前記グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数である）
11. 前記スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であり、
    前記重み値設定モジュールは、
    下記［数４］により前記エッジの重み値Ｗを算出する、請求項９に記載のコンピューティングシステム。
    ［数４］
    Ｗ＝Ａ／［｛Ｅ（ｖ１）×Ｅ（ｖ２）｝×｛Ｃ（ｖ１）×Ｃ（ｖ２）｝］
    （ここで、ｖ１及びｖ２は、前記エッジによって連結される２つのノードであり、Ａは、ノードｖ１及びｖ２のそれぞれに対応するパッチが上下又は左右に隣接する場合には１、対角線方向に隣接する場合には
    

    

    であり、Ｅ（ｘ）は、前記グラフ上のノードｘに連結されたエッジの数であり、Ｃ（ｙ）は、前記グラフ上のノードｙに対応するパッチが病変組織を含んでいない場合は１、含んでいる場合はαである（ここで、αは１より大きい所定の実数である））
12. 前記複数のパッチを２値化する画像処理モジュールと、
    ２値化された前記複数のパッチのそれぞれについて、２値化された前記パッチの各エッジライン及び各角に生体組織を表すピクセルが存在するか否かに基づいて、前記パッチに隣接したパッチに生体組織がわたっているか否かを判断する判断モジュールと、
    をさらに含む、請求項９に記載のコンピューティングシステム。
13. 前記スライド画像に含まれた生体組織の少なくとも一部は病変組織であり、
    前記スライド画像に含まれた生体組織領域をマスキングしたティッシュマスクを生成し、前記スライド画像に含まれた病変組織をマスキングした病変マスクを生成する画像処理モジュールと、
    前記ティッシュマスク及び前記病変マスクに基づいて、前記複数のパッチに生体組織又は病変組織が含まれるか否かを判断する判断モジュールと、
    をさらに含む、請求項９に記載のコンピューティングシステム。
14. スライド画像に含まれた病変組織の長さを測定する方法を行うコンピューティングシステムであって、
    前記スライド画像を所定のサイズを有する複数のパッチに分割する分割モジュール（ここで、前記複数のパッチのそれぞれは、前記スライド画像をＮ×Ｍ格子に分割したもののいずれか１つであり、Ｎ及びＭはそれぞれ２以上の整数である）と、
    前記スライド画像に対応するグラフを生成するグラフ生成モジュール（ここで、前記グラフは、前記複数のパッチのうち病変組織を含むパッチのそれぞれに対応するノードを含み、上下、左右、又は対角線方向に互いに隣接する任意の２つのパッチに病変組織がわたっている場合、前記互いに隣接する２つのパッチに対応する２つのノードはエッジで連結される）と、
    前記グラフに含まれる各エッジについて、前記エッジの重み値を設定する重み値設定モジュールと、
    ２つ以上のノードを含む前記グラフの連結成分（ｃｏｎｎｅｃｔｅｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）のそれぞれについて、前記連結成分に含まれた全てのノード対の間の最短経路を検出し、検出された全てのノード対の間の最短経路のうちで長さの最も長い最長の最短経路を判断する最短経路判断モジュールと、
    前記グラフを構成する連結成分それぞれの最長の最短経路に基づいて、前記スライド画像に含まれた病変組織の長さを算出する算出モジュールと、
    を含む、コンピューティングシステム。