JP7390381B2 - サンプルの処理方法 - Google Patents

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Description

本発明は、サンプルの孤立した領域を液体で処理する方法に関する。
病理組織学的診断を行うためには、切除した組織を顕微鏡で観察する。近年の個人向け医療や分子生物学的手法の進歩に伴い、治療法の決定のためにこれらの組織切片をさらに調査し、場合によっては組織の特定の領域(いわゆるAOI:area of interest、関心領域)を区分けして分析することがある。例えば、がん治療に最適な薬剤、または薬剤の組み合わせ、を決定することを目的とする腫瘍サンプルの分析では、腫瘍細胞と正常細胞とが混ざったものから腫瘍細胞を分離し、続いて、凍結され、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)された腫瘍組織の切片から、核酸、タンパク質、その他の細胞内要素や分子を抽出して精製する必要があり得る。現在、組織切片は、スライドや組織ブロックの表面から機械的に関心領域を削り取って採取するか、あるいはレーザーキャプチャ微小切開(LCM)やその関連技術を用いて組織切片から分離している。組織切片はその後、化学的、および生化学的手法を用いて、脱パラフィン化、細胞溶解、および精製などの工程を経る。小さいAOIについては、鋭利なナイフなどを使った機械的な削り取りでは、一般的に三次元的な位置精度が低く、加えて、周囲の細胞や分子による汚染の影響を受けやすくなる。LCMはより小さな領域に有効であるが、高価であり、臨床の作業の一環としては不向きである。
本発明の目的は、サンプル、特に、例えば顕微鏡スライド上の組織切片の関心領域の表面上に提供された生物学的サンプルの局所的な関心領域、または準備されたサンプルの局所的な関心領域、例えばパラフィンに埋め込まれた組織切片の関心領域を、後続の分析ステップの準備として、自動化された方法で特に処理する代替装置および代替方法を提供することである。
この目的は、ピペットチップに取り付け可能なピペットチップ拡張部(pipette tip extension)によって解決される。ピペットチップ拡張部は、近位端と、遠位端と、近位端と遠位端との間に延びる外壁とを含む。外壁は、外側と内側を有し、外壁の内側によって画定される内側の空洞を取り囲む。外壁は、近位端に、ピペットチップを挿入するための受容孔(reception aperture)を形成する。外壁はさらに、遠位端に吐出孔(dispense aperture)を形成する。ピペットチップ拡張部は、外壁の内側に配置され、内部の空洞に突出する1つまたは複数の間隔要素(distance element)をさらに含む。この1つまたは複数の間隔要素は、流体取り込み領域が、外壁の内側に隣接することを達成するように寸法設定されている。流体取り込み領域は、吐出孔から受容孔まで延びている。流体取り込み領域は、受容孔において周囲の大気と流体連通している。
1つまたは複数の間隔要素は、ピペットチップ拡張部がピペットチップに取り付けられたときに、少なくとも1つの内部チャネルまたは流体取り込み領域の形成を可能にするように構成されている。各間隔要素は、ピペットチップ拡張部に挿入されるピペットチップが、ピペットチップ拡張部の内壁に対して、ある定義された距離に配置されることを確かにし、それによって、挿入されたピペットチップとピペットチップ拡張部の内側との間に流体取り込み領域を形成することを可能にし、挿入されたピペットチップがピペットチップ拡張部の外壁の内側に完全に当接することを防止することができる。そのため、間隔要素は、ピペットチップ拡張部の内側の空洞を、間隔要素とピペットチップ拡張部の内壁との間に位置する流体取り込み領域に分割するスペーサとして機能する。
挿入されたピペットチップの外面とピペットチップ拡張部の内面との間にチャネルを形成するために、挿入されたピペットチップを外壁の内面から離すためには、1つの間隔要素で十分である。このチャネルは、ピペットチップとピペットチップ拡張部の間を移動する流体を取り込むことができる。挿入されたピペットチップを取り囲むチャネルまたは流体取り込み領域が望まれる場合には、2つ以上の間隔要素を使用することが好ましいかもしれない。1つの間隔要素を使用する場合も、より多くの間隔要素を使用する場合も、間隔要素が周回して延びないので、ピペットチップ拡張部が受容孔に向かって閉じられることはない。以下では、間隔要素は、複数形と単数形の記載を区別せずに入れ替え可能で使用して説明する。
間隔要素は、内側の空洞を、液体取り込み領域に隣接し、ピペットチップ拡張部の中心軸に沿って間隔要素の停止面に隣接しているピペットチップ収容領域(hosting area)と、挿入されたピペットチップの後の位置に対応している領域とに分割する。各間隔要素の深さは、それぞれの間隔要素がピペットチップ拡張部の内壁から中心軸(medial axis)に向かって突出している長さに対応し、特に、液体取り込み領域に取り込まれる液体の量を規定することができる。さらに、液体取り込み領域は、挿入されたピペットチップの外壁とピペットチップ拡張部の内壁によって制限される。
例示的な実施形態では、ピペットチップ拡張部は、化学的に不活性な材料、例えば、ポリプロピレン、ポリエチレン、またはフルオロエラストマなどのプラスチックポリマ、またはガラス、またはアルミニウムやスチールなどの金属であってもよい。プラスチックは、化学的に不活性であり、製造コストが比較的安く、わずかに変形可能であるという利点がある。これにより、ピペットチップ拡張部をピペットチップに摩擦嵌めで取り付けることができ、また一方、ピペットチップ拡張部を顕微鏡スライドの表面などに置いたときに、例えば、表面にシール接続することができる。また、使い捨てとして使用するには好ましい素材である。しかし、ピペットチップ拡張部を、例えば、タングとグルーブの接続による締まり嵌めによって取り付けること、および/または、ピペットチップ拡張部の遠位端に、顕微鏡スライドの表面などの表面にシール接続を可能にするシール要素を装備することも可能である。他の適切な化学的不活性材料は、ポリテトラフルオロエチレンである。
別の例示的な実施形態では、受容孔は、ピペットチップ拡張部の中心軸に直交して見たときに円形の断面を有していてもよいし、偏った断面を有していてもよい。受容孔は、例えば、プラスチック材料で作られた使い捨てのピペットチップや、金属で作られたいわゆる固定ピペットチップの挿入を可能にするために適している。
さらなる例示的な実施形態では、ピペットチップ拡張部の受容孔の内径は6mmでもよく、受容孔に入るべきピペットチップの先端の外径は約1mmであってもよい。このような拡張部は、例えば、約5mmの外径を有する使い捨てのピペットチップがピペットチップ拡張部の受容孔内に収まるように使用される場合や、約4mmの外径を有する固定チップが使用される場合に適している。受容孔の内径および/または外壁の内側の間の空間は、1つまたは複数の間隔要素によって制御することができる。
本発明において述べる限りでは、使い捨てピペットチップは、例えば、液体処理装置によって自動的に取り込まれる、および/または排出される可能性のあるピペットチップである。このチップは、多くの場合、プラスチック材料で作られており、液体処理装置への接続は、チップと装置との間の摩擦嵌め接続を達成するために、プラスチックをわずかに変形させることによって実現されてもよい。
本発明において述べる限りでは、固定されたピペットチップは、液体処理装置に機械的にフォームフィットで接続され、例えば、装置にねじ止めされる。取付けおよび取外しは、通常手動で行われなければならない。固定ピペットチップは、安定した形状を確保するために金属で作られることが多い。
ピペットチップ拡張部の近位端にある受容孔は、使用中は少なくとも部分的に開いており、したがって、例えば、カバー、シール、それが取り付けられているピペットチップ、またはそれらの組み合わせ、によって完全には閉じられていない。周囲の大気に対して開放されたままであることにより、液体がピペットチップから付属のピペットチップ拡張部の流体取り込み領域に吐出される際に、圧力の均等化が十分であることが確保される。
さらに例示的な実施形態では、ピペットチップ拡張部の遠位端にある吐出孔は、ピペットチップ拡張部の中心軸に直交して見たときに、それぞれ円形の形状または円形の断面を有していてもよい。しかし、吐出孔の断面は、円形から外れていてもよく、例えば、楕円形や三角形であってもよいし、他の形状、例えば、多角形であってもよい。吐出孔の形状および/またはサイズは、例えば、ピペットチップ拡張部の特定の用途または使用に適合させてもよく、例えば、対処すべき組織切片の特定の関心領域に適合させてもよい。例示的に、本質的に円形の形状を有する吐出孔の特に好適なサイズとして、1.65mmの直径を有してもよい。適切な直径は、0.2mmから7mmの範囲、特に1mmから2mmの範囲である。
別の例示的な実施形態では、間隔要素は、例えば、内側のバーであってもよいが、ピペットチップ拡張部の外壁の内側にある他のタイプの突出部も可能であり、例えば、ノーズのように、また、直線状や蛇型や波型のような様々な形態のバーも可能である。異なる種類や形状の突起部を組み合わせることも可能である。不規則な形状は、ピペットチップ拡張部に導入される液体に追加の混合効果を与えるのに特に適している。ピペットチップ拡張部の内腔に液体取り込み領域を形成するのに適していれば、外壁の内側に1つだけ内側間隔要素を設けることも可能かもしれない。間隔要素が1つだけ使用される場合、ピペットチップ収容領域は、ピペットチップ拡張部の中心軸に対して偏心していてもよい。多くの間隔要素を使用することも可能であり、これにより、ピペットチップ拡張部の内部空洞内のピペットチップ収容領域および流体取り込み領域の位置をより正確に定義することができる。しかし、複数の間隔要素を使用することで、ピペットチップ拡張部の内部空洞内でのピペットチップの位置が偏心することが許容される。特に、ピペットチップ拡張部の内部形状に応じて各間隔要素の深さを調整することで、ピペットチップがピペットチップ拡張部内に中心的に配置されるか、または偏心的に配置されるかを定義することができる。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、少なくとも1つ以上の間隔要素が、ピペットチップ拡張部の中心軸の方に向けられる停止面を提供してもよい。間隔要素の停止面は、本発明における記述の中では、ピペットチップ拡張部がピペットチップに取り付けられたときに、ピペットチップによって当接される接触点または接触面である。したがって、停止面は、流体取り込み領域とピペットチップ収容領域との間の特定の位置における境界を決める。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、外壁の内側にある1つまたは複数の間隔要素は、ピペットチップ拡張部の近位領域からピペットチップ拡張部の遠位領域に向かう方向に延びている。間隔要素は、例えば、同じ幅または異なる幅の内側バーとして構成され、および/または、幅よりも近位端から遠位端への方向に沿ってより細長くなっており、ここで、幅とは横方向に沿った寸法である。少なくとも2つ以上の細長い間隔要素の使用は、ピペットチップ拡張部内でのピペットチップの正確な位置決めに特に適している。例えば、互いに交互に、および/または近位端から遠位端に向かう方向に沿って交互に、不規則な配列で配置された多数の短い間隔要素が可能であり、より長くて外壁の内側に規則的な配列で配置された少ない数の間隔要素が可能であり、またはそれらの混合も可能である。追加または代替案として、ピペットチップ上でのピペットチップ拡張部の保持力を高めるために、例えば2成分射出成型方法が適用されてもよいエラストマプラスチック材料を間隔要素上に設けることが想定される。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、間隔要素は、ピペットチップ拡張部の近位領域からピペットチップ拡張部の遠位領域まで本質的に連続して延びている。このような配置は、例えばインナーバーとして構成されている間隔要素に特に適しており、例えば射出成型プロセスにおける製造プロセスの簡素化を可能にする。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、間隔要素は、例えばピペットチップ拡張部の上から下に向かって、ピペットチップ拡張部の近位端に対して同一平面上に配置されるか、またはピペットチップ拡張部の近位端に対してオフセットして配置される。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、間隔要素の停止面が一緒に、挿入されたピペットチップが当接することができる、すなわち挿入されたピペットチップと整列させることができる共通の停止面を内部空洞内に形成する。特に、間隔要素は、共通の停止面がピペットチップ拡張部の遠位端に向かって中心軸に近づくように寸法設定されている。共通の停止面は、ピペットチップ収容領域と流体取り込み領域の境界線それぞれの定義に貢献する。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ拡張部の外壁は、ピペットチップ拡張部の下端に向かって先細りになる周壁である。外壁は、ピペットチップ拡張部の形状および外寸を画定してもよく、例えば、長円形の中空体であって、少なくとも部分的に円錐状に、例えば遠位端の領域で先細りするか、または全体的に先細りしてもよい。また、ピペットチップは、軸対称な形状であってもよいが、非軸対称な形状も可能である。例示的に、長さ60mmの容積200μl(マイクロリットル)のピペットチップを使用して、100μlの液体を吐出および/または吸引する場合には、30mmの長さのピペットチップ拡張部が適している。外壁は、全長にわたって先細りになっていてもよいし、または、ピペットチップ拡張部の好ましくは近位端に位置する例えば円筒形の部分を含んでいてもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、各間隔要素の停止面は、外壁の内側に本質的に平行である。このことは、ピペットチップ拡張部の外壁が、挿入されるピペットチップの外壁に形状が適合している場合、すなわち、両方の壁、すなわちピペットチップ拡張部の外壁とピペットチップの外壁が、組み立てられたときに互いに平行に配置されている場合に、特に有利である。
例えば、間隔要素の数や各間隔要素の深さを、ピペットチップ拡張部を取り付けるピペットチップの外径寸法に適合させることは、特に有用である。この適合は、例えば、ピペットチップの外径寸法、および/または挿入されたピペットチップとピペットチップ拡張部との間の意図される摩擦を考慮して行うことができ、これは、きつい摩擦嵌めを意図するか、または、緩い挿入のみを意図するかに依存する。さらに、これらのパラメータを、ピペットチップ拡張部の液体取り込み領域に取り込まれるべき液体の量に適合させることも有用である。例えば、ピペットチップ拡張部の取り込み容積は、ピペットチップ拡張部が取り付けられようとするピペットチップの公称容積に対応してもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ拡張部の外壁、特に外壁の内側は、ピペットチップ拡張部に挿入されるピペットチップの外側の形状、すなわち外壁の形状に適合した形状を有する。「適合した」とは、特に、ピペットチップ拡張部の外壁の少なくとも一部が、ピペットチップの外形に類似した形状を、異なる寸法、好ましくはより大きな寸法、で示すことを意味する。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ拡張部は、ピペットチップ拡張部内のピペットチップの挿入深さを制御するための狭窄要素(constriction element)を含む。狭窄要素は、挿入されたピペットチップの遠位端とピペットチップ拡張部の遠位端との間に、ある隙間高さを有する隙間を画定する。ピペットチップ拡張部は、ピペットチップ拡張部とピペットチップの両方の遠位端が本質的に同じ方向を向くような状態でピペットチップに取り付けられる。同じことが、ピペットチップ拡張部およびピペットチップの近位端にも当てはまる。
狭窄要素は、ピペットチップ拡張部がピペットチップに取り付けられるときに、ピペットチップの挿入深さを制限することができるストッパ要素として機能する。特に、挿入されたピペットチップの遠位端が、ピペットチップ拡張部の遠位端と同一平面上に配置されたり、ピペットチップ拡張部の吐出孔から突出したりすることを防止する。本発明により、ピペットチップの挿入をピペットチップ拡張部の内部空洞内の定義された深さに制限することで、ピペットチップが挿入されたときに、その挿入が狭窄要素で停止するまでに発生する隙間、または対応する隙間高さ、が定義される。
例えば、ピペットチップを狭窄要素を利用して制御しながら挿入した際に発生する隙間高さは、例えば0.1mm~1mmとなる。
本発明において述べる限りでは、隙間とは、ピペットチップ拡張部とピペットチップが組み立てられたときに発生する、ピペットチップ拡張部の遠位端とピペットチップの遠位端との間の空間のことである。この隙間は、ピペットチップの内側の空洞とピペットチップ拡張部の流体取り込み領域との間の流体連通手段として機能し、また、流体取り込み領域の一部でもある。ピペットチップ拡張部の遠位端を、組織切片を有する顕微鏡スライドの表面などの表面上に置く際に、拡張部の吐出孔を表面で閉じることにより、隙間をピペットチップ拡張部の遠位端に向かって制限することができる。ピペットチップ拡張部の吐出孔が閉じていると、ピペットチップの内部空洞とピペットチップ拡張部の間で流体の流れが可能となる。ピペットチップの遠位端の内部形状に応じて、液体の量と流量が影響をうける。流量が多ければ、特に組織への液体のせん断応力が最大となってしまうが、一方で、液体が、ピペットチップ拡張部の吐出孔で覆われた対象組織の表面上の完全な領域に接触することを確実にするためには、流量が十分でなければならない。
狭窄要素は、ピペットチップ拡張部の内部空洞に配置されてもよいし、本明細書に例示的に記載されているように他の場所に配置されてもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、狭窄要素は、以下のうちの少なくとも1つによって形成される。
- ピペットチップ拡張部の中心軸に向けられた1つまたは複数の間隔要素の停止面またはその一部、および/または、
- 1つまたは複数の間隔要素の遠位端であって、各遠位端は、ピペットチップ拡張部の中心軸に向かって間隔要素の追加の突出部であり、ピペットチップの遠位端に当接を提供し、ピペットチップの遠位端をピペットチップ拡張部の遠位端からオフセットして位置決めし、オフセットは隙間高さに対応する、および/または、
- ピペットチップ拡張部の遠位領域でピペットチップ拡張部の中心軸に向かって突出し、ピペットチップの遠位端のための当接を提供する、外壁の内側、および/または、
- ピペットチップ拡張部の中心軸に対して横方向に延びる1つ以上の支持バー。
狭窄要素は、例えば、間隔要素の他の部分によっても形成することができる。
狭窄要素が、1つ以上の間隔要素またはその一部の停止面によって形成されている場合、間隔要素の寸法は、ピペットチップがピペットチップ拡張部に挿入されたときに、ピペットチップの遠位端がピペットチップ拡張部の遠位端に到達していないときに、ピペットチップが停止面に当接し、内部空洞内の最終位置に来るように適合されている。この場合、特に、間隔要素の深さが、間隔要素がどれだけ内部空洞に突出するかを定義し、その深さを使用して隙間高さを定義してもよい。
狭窄要素が1つ以上の間隔要素の遠位端によって形成される場合(間隔要素の遠位端とは、ピペットチップ拡張部の遠位端と本質的に同じ方向を向いている端である)、間隔要素の遠位端は、ピペットチップ拡張部の遠位端に対してオフセットして配置され、内部空洞を内部空洞の最小の横方向拡張幅に制限することができる。これは、例えば、間隔要素の遠位端が、内部空洞に向かってさらに延びる追加の突出部を含むことで達成され得る。この追加の突出部は、挿入されたピペットチップの遠位端と当接し得るように構成されており、ピペットチップをピペットチップ拡張部内の定義された挿入深さに保つことができる。その結果としての挿入されたピペットチップの最終位置では、その遠位端がピペットチップ拡張部の遠位端に対してオフセットして位置決めされる。このオフセットは、隙間高さに対応し、ピペットチップと、取り付けられたピペットチップ拡張部との間の流体連通を可能にする。
狭窄要素が、少なくともピペットチップ拡張部の遠位領域で遠位端に向かって、かつピペットチップ拡張部の中心軸に向かって先細りになっている外壁の内側によって形成されている場合、外壁の内側は、ピペットチップの遠位端が置かれることを可能とする深さの突出部を構成する。
狭窄要素が、ピペットチップ拡張部の中心軸に対して横方向に延びる1つ以上の支持バーによって形成されている場合、支持バーは、本質的にピペットチップ拡張部の内部空洞の直径全体にわたって延びており、例えば、支持リングの形をしている。このような支持バーは、ピペットチップ拡張部の遠位端領域に配置されてもよいし、遠位端と同一平面上に配置されて、吐出孔の完全な断面延長上に本質的に延びていてもよい。例えば、挿入されたピペットチップの遠位端を、ピペットチップ拡張部の吐出孔から定義された高さにオフセットして位置決めするには、1本の支持バーで十分かもしれない。しかし、遠位端のピペットチップ拡張部の全断面にわたって交差するように配置された2本以上の支持バーが提供されることも可能である。
また、1つのピペットチップ拡張部の中に、構成の異なる複数の狭窄要素を設けることで、1つのピペットチップ拡張部を異なる種類のピペットチップで使用することを可能にすることも考えられる。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、狭窄要素は、ピペットチップ拡張部の中心軸に対して横方向に延びる支持バーによって形成されており、支持バーは、流体透過性のふるい状(sieve-like)構造を形成しており、それは外壁の内側に接合されるか、または内側バーの延長である。
狭窄要素を使用することで、ピペットチップ拡張部内でのピペットチップの挿入深さを物理的な構造によって制御できるという利点があり、この物理的な構造は、ピペットチップ拡張部に提供されても、ピペットチップに提供されても、またはインサートとして別途提供されてもよい。挿入深さの制御は、ピペットチップがピペットチップ拡張部内に配置されたときに、その遠位端の下に隙間を残すことを確かにすることができる。この隙間によれば、ピペットチップ拡張部の吐出孔が、例えば、準備されたサンプル自体またはサンプルが提供された表面の一部によって閉じられたときに、液体がピペットチップから隙間を越えて輸送され、サンプルがピペットチップ拡張部の流体取り込み領域に入ることが可能になる。隙間は、ピペットチップの内部空洞とピペットチップ拡張部の流体取り込み領域との間の流体連通手段として機能する。有利な一実施形態では、間隔要素は、ピペットチップ拡張部の内側に沿って連続的な流体取り込み領域が生成されるように配置されており、これは、好ましくは孤立したチャネルが生成されず、生成された各流体取り込み領域が他の流体取り込み領域と流体連通されていることを意味する。これにより、ピペットチップとピペットチップ拡張部の間を、そしてサンプル上を移動する液体が均質に保たれる。
狭窄要素は、ピペットチップをピペットチップ拡張部に制御下で挿入するために不可欠ではなく、挿入深さは挿入に使われる力のみによって制御可能かもしれないが、狭窄要素は、ピペットチップ拡張部またはピペットチップの製造における寸法公差や、個々の組織の表面特性のばらつきなどによる生成された隙間高さのばらつきを排除するために、サンプル上の再現可能な流域(すなわち、再現可能な隙間高さ)を確保するための追加の安全手段である。追加または代替手段として、ピペットチップ上でのピペットチップ拡張部の保持力を向上させるために、例えばエラストマプラスチック材料を2成分射出成型工程によって狭窄要素上に提供することが予見され得る。
矛盾しない限り、言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ拡張部は、細長いバーとして構成された少なくとも2つの間隔要素、好ましくは少なくとも3つの間隔要素、を含む。例えば、間隔要素は、等距離に配置されていてもよいし、非対称な方法で配置されていてもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、外壁は、ピペットチップ拡張部の遠位端が、例えば表面上に、またはサンプル内に置かれたときに、吐出孔を密封するためのシールを遠位端で構成する。例示的に、ピペットチップ拡張部の遠位端は、例えば、エラストマプラスチックなどのエラストマ材料でオーバーモールドされていてもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、シールは、ピペットチップ拡張部の遠位端において、オーバーモールドされた、または、取り付け可能なシールとして提供される、別個の材料によって提供される。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ拡張部は、2つの部分から構成され、2つの部分は、
- 受容孔を提供する上部の第1の部分と、
- 吐出孔を提供する下部の第2の部分と、を含み、
第1の部分と第2の部分は、一緒に差し込まれてピペットチップ拡張部を形成してもよく、
第2の部分は、シール材料で作られる。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、第1の部分は、1つまたは複数の間隔要素をさらに含み、第2の部分は、ピペットチップの挿入深さを制御するための狭窄要素をさらに含む。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ拡張部は、2つのピペットチップを受け入れるための2つのピペットチップ収容領域を含む。ピペットチップ収容領域は、それぞれ1つのピペットチップを受け入れるように構成されている。この構成では、ピペットチップ拡張部は、ピペットチップ収容領域ごとに、サンプル上の1つの個別の領域を処理するように構成されている。ピペットチップ拡張部は、2つのシールを含んでもよく、各シールは、各ピペットチップ収容領域の吐出孔、言い換えれば、挿入されたときの各ピペットチップの吐出孔を、それぞれ個別に取り囲んでいる。
本発明のさらなる態様は、本発明によるピペットチップ拡張部と、当該技術分野で知られている少なくとも1つのピペットチップとを含むアセンブリに関する。
本発明の別の態様は、上述のような少なくとも1つのピペットチップ拡張部と、1つまたは複数のピペットチップ拡張部を収納および/または保持するためのキャリアと、を含むアセンブリに関する。キャリアは、1つ以上の収容部位を含み、各収容部位は、1つのピペットチップ拡張部を保持および/または収納するために形成されている。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、キャリアの少なくとも1つの収容部位、好ましくは各収容部位が、収容部位に格納されたピペットチップ拡張部に挿入されたときにピペットチップの遠位端によって当接されることができるストッパを含む。ストッパは、収容部位に収納されているときに、吐出孔を通ってピペットチップ拡張部の内部空洞内に延びる狭窄要素として機能し、それによって、挿入されたピペットチップの遠位端とピペットチップ拡張部の遠位端との間の隙間高さを規定することができる。
このように、本実施形態では、狭窄要素はピペットチップ拡張部内にではなく、対応するキャリアに配置されている。
本発明のさらに別の態様は、ピペットチップに関する。ピペットチップは、外側と内側とを有し、外周壁の内側によって画定される内部空洞を囲む周方向の外周壁によって生成される。周方向の外壁は、ピペット操作デバイスに取り付けるための近位部を有し、近位部は近位孔を含む。周方向の外壁は、液体の入口および/または出口としての遠位孔を含む遠位部と、その間にある中間部とをさらに含む。ピペットチップは、外壁の外側に1つ以上の間隔要素をさらに含み、各間隔要素は、外壁の中間セクションまたは遠位セクションに配置され、外壁から離れて突出している。
言い換えて定義すると、ピペットチップは、近位端と、遠位端と、近位端と遠位端の間に位置し、遠位端に向かって先細りになっている円周方向の外壁と、を含む。外壁は、外側と内側とを有し、外壁の内側によって画定される内部空洞を囲んでいる。外壁は、近位端に、ピペット操作デバイスに取り付け可能な受容孔を形成し、遠位端に、液体を吸引したり吐出したりするための吐出孔を形成する。ピペットチップは、外壁の外側に1つまたは複数の間隔要素をさらに含む。各間隔要素は、ピペットチップの外壁の外側から外向きに向いた停止面を提供してもよい。間隔要素は、ピペットチップの遠位端に取り付けられたピペットチップ拡張部が、当然ピペットチップの遠位部である1つまたは複数の間隔要素に当接し得るように、外壁の、ある高さに配置される。
例示的な実施形態では、ピペットチップは、化学的に不活性な材料、例えば、ポリエチレンやポリプロピレンなどのプラスチックポリマ、または、ステンレス鋼やアルミニウムなどの金属であってもよい。プラスチックには、化学的に不活性であること、製造コストが比較的安価であること、若干の変形が可能であることなどの利点がある。プラスチック製のピペットチップは、先に定義したように、使い捨てのピペットチップとしても知られており、一般的には、汚染のリスクが高いサンプルに使用される。しかし、ピペットチップは、化学的に不活性な他の材料、例えば金属で作られていてもよい。金属製のピペットチップは、前に定義したように、固定チップとしても知られている。それらは、通常繰り返し使用され、異なる応用と応用の間に洗浄される。
例示的な実施形態では、受容孔は、ピペットチップ拡張部の中心軸に対して直交して見たときに、円形の断面を有する。受容孔は、ピペットチップをピペット操作デバイスに流体的に接続するように構成されており、例えば、液体処理デバイスのピペットコーンを受容するため、またはピペット操作ヘッド内に挿入されるために構成される。吐出孔は、ピペットチップの中心軸に対して直交する方向から見て、それぞれ円形形状または円形状の断面を有していてもよい。吐出孔は、ある量の流体を放出したり受け取ったりするように構成されている。
本発明において述べる限りでは、流体は、例えば、液体サンプル、試薬、緩衝液(buffer)など、あらゆるタイプの液体または気体であってもよい。また、流体は、異なる液体の混合物(例えば、エマルジョン)、異なる気体の混合物、液体と気体の混合物(すなわち、エアロゾル)、または、液体と当該液体中に分散された固体の混合物(すなわち、懸濁液)でもよい。固体粒子は、例えば、砂のような研磨粒子であってもよいし、磁気ビート(magnetic beats)であってもよい。しかし、流体は液体または気体であることが好ましい。
1つ以上の間隔要素は、ピペットチップがピペットチップ拡張部に挿入されたときに、ピペットチップとピペットチップ拡張部との間に内部チャネルまたは流体取り込み領域を形成できるように構成される。ピペットチップ拡張部は、近位端と、遠位端と、近位端と遠位端との間に延びる外壁とを含む。外側と内側を有する外壁は、外壁の内側によって画定される内部空洞を取り囲んでいる。外壁は、近位端に、ピペットチップを挿入するための受容孔を形成する。さらに、外壁は、遠位端に吐出孔を形成する。例えば、ピペットチップ拡張部は、既に説明したようなピペットチップ拡張部と同様に設計されているが、間隔要素を含んでいない。各間隔要素は、ピペットチップ拡張部に挿入されるピペットチップが、ピペットチップ拡張部の内壁に対して、ある定義された距離に配置されることを確かにし、それによって、挿入されたピペットチップとピペットチップ拡張部の内側との間に流体取り込み領域を形成することを可能にし、挿入されたピペットチップがピペットチップ拡張部の外壁の内側に完全に当接することを防止する。このように、間隔要素は、ピペットチップ拡張部の内部空洞に流体取り込み領域を形成することができるスペーサとして機能する。このような流体取り込み領域は、ピペットチップの間隔要素、ピペットチップの外面、およびピペットチップ拡張部の内壁によって形成される。各間隔要素の深さは、それぞれの間隔要素がピペットチップの外壁の外側から突出する長さに対応し、特に、液体取り込み領域に取り込まれ得る液体の量を規定してもよい。
例示的な実施形態では、間隔要素は、例えば、外側のバーであってもよいが、ピペットチップの外壁の外側にある他のタイプの突出部、例えば、ノーズのようなものも可能であり、また、直線状のバーや蛇型や波形のバーのような様々な形態も可能である。また、異なる種類や形状の突起部の組み合わせも可能である。不規則な形状は、ピペットチップに取り付けられたピペットチップ拡張部に導入される液体に追加の混合効果を与えるために特に適している。
例示的な実施形態では、ピペットチップに取り付けられたピペットチップ拡張部の内部空洞に流体取り込み領域を形成するのに適している限り、外壁の外側に間隔要素が1つだけ提供されることもあり得る。1つの間隔要素のみを使用する場合、ピペットチップは、取り付けられているピペットチップ拡張部の中心軸に対して偏心して配置されてもよい。また、多くの間隔要素を使用することも可能であり、これにより、装着されたピペットチップ拡張部内でのピペットチップのより正確な位置決めが可能となる。多くの間隔要素を使用することで、ピペットチップ拡張部内でのピペットチップの偏心した位置決めも可能になる。特に、取り付けられるピペットチップ拡張部の内側の形状に応じて各間隔要素の深さを調整することで、ピペットチップがピペットチップ拡張部内で中心的に配置されるか、または中心をはずれて配置されるかを定義してもよい。
ピペットチップの間隔要素の停止面は、本発明において述べる限りでは、取り付けられたピペットチップ拡張部の内壁が当接する接触点または接触面である。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、外壁の外側にある間隔要素は、ピペットチップの中間部からピペットチップの遠位部に向かう方向に延びる。間隔要素は、例えば、同じ幅または異なる幅の外側のバーとして、および/または、幅よりも近位端から遠位端への方向に沿ってより細長い外側のバーとして構成され、幅とは横方向に沿った寸法である。間隔要素は、ピペットチップの延長部からピペットチップの間隔を空けるのに適している場合、ピペットチップの近位領域からピペットチップの遠位領域に向かってさらに延びていてもよい。少なくとも2つ以上の細長い間隔要素を使用することは、先に述べた間隔要素と同様に、ピペットチップ拡張部内でピペットチップを正確に位置決めするために特に適している。例えば、互いに交互に不規則な配列で、および/または近位端から遠位端に向かう方向に沿って、配置された多数の短い間隔要素が可能であり、あるいは、より長く、外壁の内側に規則的な配列で配置された少数の間隔要素が可能であり、あるいは、それらの混合物も可能である。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、間隔要素はピペットチップの遠位領域まで本質的に連続して延びる。このような配置は、例えば内側のバーとして構成されている間隔要素に特に適しており、例えば射出成形プロセスなどの製造プロセスの簡素化を可能にしている。間隔要素は、ピペットチップの近位端に対して、例えばピペットチップの上から下まで、面一で配置されていてもよいし、ピペットチップの近位端に対してオフセットして配置されていてもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、1つ以上の間隔要素が、外壁から離れる方向を向いた停止面を提供し、間隔要素の停止面は、一緒に、取り付けられたピペットチップ拡張部によって当接されることができる共通の停止面を形成する。共通の停止面は、取り付けられたピペットチップ拡張部の内側に当接し、取り付けられたピペットチップ拡張部内にピペットチップを密接に着座させることができ得る。共通の停止面は、ピペットチップ収容領域および流体取り込み領域の境界の定義にそれぞれ貢献する。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップの外壁は、ピペットチップの下端に向かって先細りになる周壁である。外壁は、ピペットチップの外側、大まかな形状、および内側の寸法を画定してもよい。例えば、外壁は、ピペットチップに本質的に長円形の中空体の形態を与えてもよく、例えば、遠位端の領域において、少なくとも部分的に円錐形に先細りするか、または全体的に先細りしてもよい。外壁は、全長にわたって規則的な方法で、または明確な段差で先細りになっていてもよく、さらに、例えば円筒形の部分を含んでもよい。また、ピペットチップは、軸対称な形状であってもよいが、非軸対称な形状も可能である。ピペットチップの内部形状は、特に公称液体量に適合しており、また、ピペットチップが使用されるピペットまたはピペット操作デバイスの特殊な動作要件に適合していてもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、各間隔要素の停止面は、ピペットチップの外壁の外側と本質的に平行である。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップは、使い捨てピペットチップとして、または固定ピペットチップとして使用するように構成される。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップは、ピペットチップ拡張部内のピペットチップの挿入深さを制限するように構成された1つまたは複数の狭窄要素を含む。
本発明の別の態様は、少なくとも1つの間隔要素を含むピペットチップと、ピペットチップ拡張部とを含むアセンブリに関する。このアセンブリのピペットチップ拡張部は、近位端と、遠位端と、ピペットチップ拡張部の近位端と遠位端との間に延びる外壁とを含む。ピペットチップ拡張部の外壁は、外側と内側とを有し、ピペットチップ拡張部の外壁の内側によって画定される内部空洞を囲む。さらに、ピペットチップ拡張部の外壁は、近位端に、ピペットチップを挿入するための受容孔を形成し、遠位端に、吐出孔を形成する。例えば、ピペットチップ拡張部は、既に説明したようなピペットチップ拡張部と同様に設計されているが、間隔要素を含んでいない。ピペットチップ拡張部は、ピペットチップの遠位端を、ピペットチップ拡張部の近位端にある受容孔から挿入することにより、例えば、ピペットチップ拡張部の内側がピペットチップの間隔要素に接するまで、ピペットチップの遠位端に取り付けることができる。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、アセンブリのピペットチップ拡張部の外壁は、ピペットチップ拡張部に挿入されるピペットチップの外側の形状に適合する形状を有する。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップおよび/またはピペットチップ拡張部は、ピペットチップ拡張部へのピペットチップの挿入深さを制御するための狭窄要素を含み、狭窄要素は、挿入されたピペットチップの遠位端とピペットチップ拡張部の遠位端との間に、ある隙間高さを有する隙間を定義する。
狭窄要素は、ピペットチップがピペットチップ拡張部に挿入されるときに、ピペットチップの挿入深さを制限することができるストッパ要素として機能する。特に、挿入されたピペットチップの遠位端が、ピペットチップ拡張部の遠位端と同一平面上に配置されたり、ピペットチップ拡張部の吐出孔から突出したりすることを防止する。本発明により、ピペットチップの挿入をピペットチップ拡張部の内部空洞内の定義された深さに制限することで、ピペットチップが挿入されたときに、その挿入が狭窄要素で停止するまでに発生する隙間、または対応する隙間高さ、が定義される。ピペットチップを狭窄要素を利用して制御しながら挿入した際に発生する隙間高さは、例えば0.1mm~1mmとなる。
ピペットチップを挿入した際に発生する隙間は、ピペットチップの内部空洞とピペットチップ拡張部の内部空洞との間の流体的接続を提供する。1つ以上の狭窄要素を提供して隙間高さを制御することで、ピペットチップと、取り付けられたピペットチップ拡張部との間の流体の流れを制御することが可能となる。流体の流れを制御するためのもう1つの方法は、前述のように、吐出孔のサイズを制御することである。後述する別の実施形態では、ピペットチップ拡張部の遠位端で吐出孔を閉じることで隙間を閉じ、このとき、遠位端は、組織切片を固定化した顕微鏡スライドの表面などの表面にシール状態で置かれる。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、狭窄要素は、以下のうちの少なくとも1つによって形成される。
- ピペットチップの間隔要素の停止面。
- ピペットチップ拡張部の遠位領域でピペットチップ拡張部の中心軸に向かって突出し、ピペットチップの遠位端のための当接を提供するピペットチップ拡張部の外壁の内側。
- ピペットチップ拡張部の中心軸に対して横方向に延びる、ピペットチップ拡張部の1つまたは複数の支持バー。
狭窄要素が間隔要素の停止面によって形成されている場合、間隔要素の寸法は、ピペットチップがピペットチップ拡張部に挿入されたときに、ピペットチップが停止面とピペットチップ拡張部の内壁に当接し、ピペットチップの遠位端がピペットチップ拡張部の遠位端に到達していない内部空洞内の最終位置に来るように適合されている。この場合、特に、間隔要素の深さが、間隔要素が内部空洞にどれだけ突出しているかを定義し、その深さを使用して隙間高さを定義してもよい。
狭窄要素が、少なくともピペットチップ拡張部の遠位領域で遠位端に向かって、かつピペットチップ拡張部の中心軸に向かって先細りになっているピペットチップ拡張部の外壁の内側によって形成されている場合、外壁の内側は、ピペットチップの遠位端が置かれることを可能とする深さの突出部を構成する。
狭窄要素が、ピペットチップ拡張部の中心軸に対して横方向に延びる1つ以上の支持バーによって形成されている場合、支持バーは、本質的にピペットチップ拡張部の内部空洞の断面延長部全体にわたって延びており、例えば、支持リングの形をしている。このような支持バーは、ピペットチップ拡張部の遠位端領域に配置されてもよいし、遠位端と同一平面上に配置されて、吐出孔の完全な断面延長上に本質的に延びていてもよい。例えば、挿入されたピペットチップの遠位端を、ピペットチップ拡張部の吐出孔から定義された高さにオフセットして位置決めするには、1本の支持バーで十分かもしれない。しかし、遠位端のピペットチップ拡張部の全断面にわたって交差するように配置された2本以上の支持バーが提供されることも可能である。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、狭窄要素は、ピペットチップ拡張部の中心軸に対して横方向に延びるピペットチップ拡張部の支持バーによって形成されており、支持バーは、流体透過性のふるい状構造を形成しており、それは外壁の内側に接合されるか、または内側バーの延長である。
狭窄要素を使用することで、ピペットチップ拡張部内でのピペットチップの挿入深さを物理的な構造によって制御できるという利点があり、この物理的な構造は、ピペットチップ拡張部に提供されても、ピペットチップに提供されても、またはインサートとして別途提供されてもよい。挿入深さの制御は、ピペットチップがピペットチップ拡張部内に配置されたときに、その遠位端の下に隙間を残すことを確かにするために重要である。この隙間によれば、ピペットチップ拡張部の吐出孔が、例えば、準備されたサンプル自体またはサンプルが提供された表面の一部によって閉じられたときに、液体がピペットチップから隙間を越えて輸送され、サンプルがピペットチップ拡張部の流体取り込み領域に入ることが可能になる。
隙間は、ピペットチップの内部空洞とピペットチップ拡張部の流体取り込み領域との間の流体連通手段として機能する。有利な一実施形態では、間隔要素は、ピペットチップ拡張部の内側に沿って連続的な流体取り込み領域が生成されるように配置されており、これは、好ましくは孤立したチャネルが生成されず、生成された各流体取り込み領域が他の流体取り込み領域と流体連通されていることを意味する。これにより、ピペットチップとピペットチップ拡張部の間を、そしてサンプル上を移動する液体が均質に保たれる。
狭窄要素は、ピペットチップをピペットチップ拡張部に制御下で挿入するために不可欠ではなく、挿入深さは挿入に使われる力のみによって制御可能かもしれないが、狭窄要素は、ピペットチップ拡張部またはピペットチップの製造における寸法公差や、個々の組織の表面特性のばらつきなどによる生成された隙間高さのばらつきを排除するために、サンプル上の再現可能な流域(すなわち、再現可能な隙間高さ)を確保するための追加の安全手段である。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ拡張部とピペットチップの両方が、それぞれ少なくとも1つの間隔要素を含んでいる。ピペットチップ拡張部の間隔要素とピペットチップの間隔要素は、組み立てられた状態で、すべての間隔要素を含むピペットチップ拡張部を含むアセンブリと、および/または、すべての間隔要素を含むピペットチップを含むアセンブリと、機能性が同等になるように、互いに適合されていることが好ましい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、アセンブリは、少なくとも1つのピペットチップ拡張部と、1つまたは複数のピペットチップ拡張部を収納および/または保持するためのキャリアと、を含む。キャリアは、1つ以上の収容部位を含み、各収容部位は、1つのピペットチップ拡張部を保持および/または収納するために形成されている。
キャリアの少なくとも1つの収容部位は、収容部位に収納されたピペットチップ拡張部に挿入されたときにピペットチップの遠位端が当接可能なストッパを含んでもよい。ストッパは、ピペットチップ拡張部が収容部位に収納および/または保持されているときに、吐出孔を通ってピペットチップ拡張部の内部空洞に延びる狭窄要素としての役割を果たし、それによって、挿入されたピペットチップの遠位端とピペットチップ拡張部の遠位端との間の隙間高さを定義する。ピペットチップがキャリアに収納されたピペットチップ拡張部に挿入されると、ピペットチップは最終位置でキャリアのストッパに当接し、ピペットチップ拡張部の吐出孔の上に定義された隙間高さが発生する。
本発明のさらなる態様は、液体を吸引および/または吐出するためのピペットチップと、ピペットチップに取り付けられたピペットチップ拡張部との間に間隔を空けるためのインサートに関する。インサートは、ピペットチップとそれに取り付けられたピペットチップ拡張部との間に流体取り込み領域を確立するように寸法設定された1つ以上の間隔要素を含み、流体取り込み領域は、取り付けられたピペットチップ拡張部の近位端で周囲の大気と、およびピペットチップの遠位端に隣接するピペットチップの内部空洞と、流体的に接続される。上述の間隔要素に類似して、1つ以上の間隔要素は、周回しないように構成され、言い換えれば、間隔要素またはその組み合わせは、間隔を空けなければならないピペットチップ拡張部の内側の完全な円周上に延在せず、ピペットチップに取り付けられたときに、ピペットチップ拡張部を近位端に向かって開いたままにする。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、インサートは、間隔要素を保持する1つまたは複数の接続リングを含み、接続リングは、間隔要素の深さよりも小さい深さを有し、または、接続リングは、ピペットチップ拡張部の近位端のための取付台であり、取付台は、ピペットチップ拡張部の近位端の受容孔よりも大きい直径を有する。
本発明のさらなる態様は、液体を吸引および/または吐出するためのピペットチップ、ピペットチップ拡張部、および1つまたは複数の間隔要素を含むアセンブリに関する。
ピペットチップは、近位端と、遠位端と、近位端と遠位端との間に延在し、遠位端に向かって先細りとなる円周方向の外壁とを含む。外壁は、外側と内側とを有し、外壁の内側によって画定される内部空洞を取り囲む。外壁は、近位端に、ピペット操作デバイスに取り付けるための近位開口部を形成し、遠位端に、液体を吸引および/または吐出するための吐出孔を形成する。
ピペットチップ拡張部は、近位端と、遠位端と、近位端と遠位端との間に延びる外壁とを含む。外壁は、外側と内側を有し、外壁の内側によって画定される内部空洞を取り囲む。外壁は、近位端に、ピペットチップを挿入するための受容孔を形成し、遠位端に、吐出孔を形成する。ピペットチップ拡張部は、ピペットチップの遠位端に取り付けられるように構成されている。
1つまたは複数の間隔要素が、ピペットチップを取り付けられたピペットチップ拡張部から離すように構成されている。1つ以上の間隔要素は、ピペットチップ拡張部の外壁の内側とピペットチップの外壁の外側との間に流体取り込み領域を設けるように寸法設定されており、流体取り込み領域は、ピペットチップ拡張部の吐出孔からピペットチップ拡張部の受容孔まで延びており、流体取り込み領域は、受容孔では周囲の大気と、およびピペットチップの遠位開口部に隣接するピペットチップの内部空洞と流体連通している。
ピペットチップ、ピペットチップ拡張部、および1つまたは複数の間隔要素は、矛盾しない限り、先に述べた実施形態のいずれか1つに従って構成され、互いに組み合わされてもよい。例えば、矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう実施形態のうちの任意の他のものと組み合わせてもよい本発明の一実施形態において、1つ以上の間隔要素は、ピペットチップ拡張部によって、ピペットチップによって、および/または上述の実施形態のインサートによって提供されてもよい。
例えば、インサートは、1つ以上の間隔要素を含む。インサートは、間隔要素がピペットチップ拡張部の外壁の内側に当接するように、ピペットチップ拡張部の内側の空洞に、例えば摩擦嵌めで挿入されるように構成されてもよい。また、インサートは、間隔要素がピペットチップの外壁の外側に当接するように、ピペットチップの外壁に取り付け可能に構成されることも可能である。さらに、インサートは、ピペットチップがピペットチップ拡張部に挿入されたときに、ピペットチップをピペットチップ拡張部から離し、ピペットチップの外壁の外側とピペットチップ拡張部の外壁の内側の両方に接するように構成される。インサートを使用することで、ピペットチップ、ピペットチップ拡張部、およびインサートが組み立てられる際に、ピペットチップ拡張部の内側とピペットチップの外側の間に流体の取り込み領域が形成される。
本発明に係るインサートは、前述したようなピペットチップ拡張部の任意の実施形態および/またはピペットチップの任意の実施形態と組み合わせることができる。間隔要素は、インサートのみに配置することも、ピペットチップ拡張部および/またはピペットチップに追加して配置することもできる。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、1つまたは複数の間隔要素は、ピペットチップの遠位端へのピペットチップ拡張部の摩擦嵌め取り付けを提供するように構成される。摩擦嵌めによる取付けは、例えば、使用される間隔要素の寸法を適合させることによって、および/または提供される間隔要素の数によって、および/またはピペットチップの外側とピペットチップ拡張部の内側との間に1つまたは複数の間隔要素を配置することによって達成され得る。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、アセンブリは、ピペットチップの遠位開口部を介してピペットチップ拡張部の受容孔において、ピペットチップの内部空洞、ピペットチップ拡張部の内部空洞、および周囲の大気の間に連続的な流体連通を提供するように構成される。これにより、挿入されたピペットチップによって占有されていないピペットチップ拡張部の内部空洞は、第1の流体リザーバ(reservoir)を構成し、ピペットチップの内部空洞は、第2の流体リザーバを構成し、それらは互いに流体連通している。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、アセンブリは、ピペットチップ拡張部内のピペットチップの挿入深さを制御するための狭窄要素を含み、狭窄要素は、挿入されたピペットチップの遠位端とピペットチップ拡張部の遠位端との間の隙間高さを規定する。上述したように、狭窄要素は、ピペットチップ拡張部によって、間隔要素によって、および/またはピペットチップによって提供され得る。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、アセンブリは、一体的に形成されたワークピースとして、または、例えばアセンブリの使用前に組み立てられる複数の部品で形成されたワークピースとして構成されてもよい。
アセンブリが一体的に形成されたワークピースとして構成されている場合、アセンブリは、例えば、射出成形によって単一のワークピースとして製造されてもよいし、または、アセンブリは、例えば、接着または溶接によって互いに接続された複数の部品として製造されてもよい。アセンブリが複数の部品で構成されている場合、それぞれの部品は別々に製造され、例えば実験台や他の作業台の上で組み立てられて使用される。これには、必要な実施形態の前に組み立てられるという利点がある。
本発明のさらなる態様は、ピペットチップ拡張部を使用する方法に関する。方法は、上述のような1つまたは複数の間隔要素を含むピペットチップ拡張部を提供するステップを含む。さらに、ピペットチップ拡張部が適応されるピペットチップを提供する。サンプルを処理するために、液体がピペットチップに吸引される。ピペットチップは、ピペットチップが液体で満たされているときに、ピペットチップ拡張部に挿入されるが、最初にピペットチップをピペットチップ拡張部に挿入し、その後、アセンブリで液体を吸引することも可能である。次に、ピペットチップ拡張部の遠位端をサンプルに当て、ピペットチップ拡張部の遠位端でサンプルの、ある領域を残りの領域から分離する。例えば、ピペットチップ拡張部をサンプル上に配置する際の圧力や、サンプルが配置される対応する表面を調整したり、ピペットチップ拡張部の遠位端にシール材を設けたりすることで、シール効果を発生させることができる。
方法は、さらに、ピペットチップから液体を吐出するステップを含み、それによって、ピペットチップから、サンプルの孤立領域を越えて、ピペットチップ拡張部の内側の空洞にあるピペットチップ拡張部の流体取り込み領域に液体の流れを生成し、流体取り込み領域は、ピペットチップ拡張部の外壁の内側と間隔要素によって、挿入されたピペットチップの外側によって、および吐出口の下の平坦な表面によって定義される。
もう1つの方法は、液体をピペットチップに戻して吸引することで、サンプルの孤立領域に逆方向の液体の流れを作ることである。
本方法は、1つ以上の距離を含むピペットチップ拡張部と、一般的に入手可能な使い捨てのピペットチップとを用いて実施してもよい。あるいは、本方法は、上述したような構成のピペットチップ拡張部、間隔要素、およびピペットチップを含むアセンブリ、またはそれらの構成の組み合わせを用いて実施してもよい。
本発明のさらなる態様は、サンプルの孤立領域を液体で処理する方法に関する。
本方法は、以下のステップを含む。
- 第1の流体リザーバを使ってサンプルの孤立領域を生成するステップであって、第1の流体リザーバは、第2の流体リザーバの遠位端を囲み、サンプルの孤立領域は、サンプルの残りの領域に対してシールされるステップと、
- サンプルの孤立領域を第2の流体リザーバと流体連通させるステップと、
- 第2の流体リザーバから第1の流体リザーバに流体を吐出し、それによって孤立領域でサンプル上に第1の方向の流体の流れを発生させるステップと、
- 第1の流体リザーバから第2の流体リザーバに流体を吸引し、それによって孤立領域でサンプル上に第2の方向の流体の流れを発生させるステップ。
本方法は、サンプルの孤立領域での処理を提供しつつ、同じ流体の繰り返し使用を可能にする。これにより、限られた量の液体を用いて、局所的によく定義された制限された処理を行うことができる。例えば、液体中のサンプルの特定の部分を収集することを目的とする場合、本方法は、そのような局所的に特定の処理を可能にし、明確に定義された容積の液体中でそのような部分を収集し、濃縮することができる。液体がサンプルの孤立領域上に導かれている間に、液体が少なくとも1回、前後に移動する(これは、ここで述べられるにあたり、双方向の移動として理解される)2つの流体リザーバを提供することにより、濃縮が行われるように、同じ流体容積でサンプル部分を繰り返し収集することができる。
本方法では、第2の流体リザーバから全量の流体を吐出して、全量の流体がサンプルの孤立領域に接触できるようにすることが可能である。しかし、流体として液体を使用する場合に、例えばピペットチップからの空気がサンプル上に吸い上げられることを避けるために、流体の一部を第2の流体リザーバ内に残すことも可能である。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、本方法は、第2の流体リザーバから第1の流体リザーバに流体を吐出した後に、以下のステップのうち1つまたは複数を含む。
- サンプルの孤立領域を一定時間、流体に浸漬させるステップであり、それにより、浸漬の間、流体は、流体流れを適用することなく、サンプルの孤立領域に接触するステップ、および/または、
- 第2の流体リザーバと第1の流体リザーバとの間で流体の吸引と吐出を連続して行うステップであり、それによってサンプルの孤立領域を双方向の流体流れに繰り返し晒すステップ、および/または、
- サンプルと動作可能に接触している加熱装置および/または冷却装置を用いて、サンプルの孤立領域を温度処理、特に加熱ステップおよび/または冷却ステップに晒すステップであり、それによって流体をサンプルの温度に適合させるステップ。
浸漬工程は、使用する液体で一定時間以上の培養を行うことを目的とする場合に特に適している。例えば、細胞溶解(cell lysis)試薬を用いてサンプルの細胞溶解反応を行う場合には、浸漬工程が適している。
アッセイおよび/またはサンプルの要求に応じて、任意の浸漬時間が適切であり得る。例として挙げると、手順の経済性を重視する場合、浸漬時間は10分を超えないようにすることができる。浸漬工程は、ピペットチップから全量の液体を吐出した後に適用してもよいし、液体の一部だけを吐出した後に適用してもよい。
第2の流体リザーバと第1の流体リザーバの間で流体の吸引と吐出を連続して行う工程では、サンプルの孤立領域が双方向の流体の流れに繰り返し晒されることになる。これにより、流体とサンプルの孤立領域との相互作用が強化され、例えば、流体を用いて採取されるサンプルからの成分の産量を増加させたり、採取されたサンプル自体の産量を増加させたりすることを補助し得る。繰り返しの回数は、状況やアッセイプロトコルなどに応じて選択してもよい。
サンプルの孤立領域に温度処理を施すことで、流体をサンプルの温度に適応させることができる。このことは、例えば、サンプルが凍結ホルマリン固定されたパラフィン包埋組織切片であり、このサンプルに対して核酸抽出を行う場合に特に望まれる。この場合、組織の温度をパラフィンの融点以上に上げる必要があるかもしれず、典型的な病理組織用パラフィンでは約56℃である。しかし、代替的に、または追加的に、流体を温度に応じて調整してもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、本方法は、第1の流体リザーバから第2の流体リザーバへの流体の吸引の後に、以下のステップのうちの1つ以上を含む。
- 第1の流体リザーバを使ってサンプルの第2の孤立領域を生成し、第1の流体リザーバは第2の流体リザーバの遠位端を連続的に囲み、第2の流体リザーバはさらに流体を含み、サンプルは同じサンプルまたは別のサンプルである、前に定義したようにサンプルの第2の孤立領域を処理するステップ、および/または、
- 第1の流体リザーバを第3の流体リザーバと交換し、第3の流体リザーバの構成は、サンプルの残りの領域に対して孤立した、およびシールされた領域のサイズに関して、および/または第2の流体リザーバから第1または第3の流体リザーバに吐出することができる流体の量に関して、第1の流体リザーバの構成とは異なる、前に定義したように、サンプルの第2の孤立領域に双方向の流体流れを適用するステップ、および/または、
- 第2の流体リザーバから第1の流体リザーバを取り外すステップ、および/または、
- さらなる処理のために、第2の流体リザーバから流体容器に流体を吐出するステップ。
第2の孤立領域を生成し、この領域を上述のような双方向の流体の流れで少なくとも1回処理する場合、サンプルまたはサンプル成分のさらなる濃縮は、同じ流体を使用することによって達成できる。これは、例えば、収集または分離されるべき成分がそれぞれ一般的に少量しか発生せず、同じタイプのサンプルが利用可能である場合に、特に有利となり得る。
さらに、第2の孤立領域を同じ液体で処理することも可能であるが、異なるサイズの関心領域を処理することも可能である。これは、第1の流体リザーバを、孤立領域の大きさに応じて異なる第3の流体リザーバと交換することで実現できる。サイズを小さくしたり大きくしたり、異なる形状を適用したりすることができる。このステップにより、より大きな関心領域全体、または他の方法では対処が困難な形状を有する関心領域のサンプルまたは成分を収集することを可能とし得る。
第1の流体リザーバを第2の流体リザーバから取り外すステップは、第2の流体リザーバが遠位端で第1の流体リザーバから解放されることが必要または望まれる任意の時点で実施することができる。同じことが、第2の流体リザーバに取り付けられている第3またはさらなる流体リザーバにも適用される。
第2の流体リザーバから流体容器に流体を吐出するステップは、流体を後の他のあらゆる処理ステップにも利用可能とする。流体容器は、液体用の任意のタイプの容器であってよく、例えば、チューブ、マイクロプレート、その他、の実験装置の一部である液体用の容器が挙げられる。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、流体の吐出および/または流体の吸引は、第2のリザーバ内に存在する流体の全体積で、および/または第2のリザーバ内に存在する流体の部分的な体積で行われる。上述したように、流体の一部のみを移動させることは、空気の吸い込みを避けるために有利であり得る。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、サンプルは、以下を含むグループから選択される。
- 組織、好ましくは、組織学的分析のために準備された組織、
- 組織切片、好ましくは、顕微鏡スライドの表面などの表面に提供される組織切片、
- 細胞またはその細胞培養物であって、細菌細胞、菌類細胞、植物細胞、動物細胞、および/またはヒト細胞を含むもの、および、
- 組織、組織切片、細胞および/または細胞培養物の、1つまたは複数の構成要素。
組織は、例えば、ホルマリン固定、グルタルアルデヒド固定、凍結保存、アルコール固定、またはその他の利用可能な固定方法で、組織の構造や成分を保存し、病理学的分析などの後の分析に備えて処理された、サンプルとなる生物から分離された組織でもよい。また、組織は、さらなる分析の対象となる組織の一部分であってもよい。組織またはその一部は、パラフィン、またはその他の包埋媒体に提供されてもよい。さらに、組織は、例えば、顕微鏡スライドなど、その後の組織切片の作成に必要な手段で、キャリア上に提供されてもよい。組織は、微生物、植物、動物、ヒトなどから分離されたものであってもよい。
組織切片とは、例えば、特定の細胞タイプや細胞背景を含む、関心がある組織の切片である。組織切片は、例えば、癌細胞を含む、または含まない有機組織を含む患者のプローブのような、分離された組織から生成される。典型的な組織切片の厚さは、例えば、5μmから30μmである。より薄い、またはより厚い切片も可能であり、厚い切片も組織の一部とみなすことができる。組織切片は、通常、パラフィンなどの包埋媒体、または凍結切片用の包埋媒体に入れて提供され、切片を作成する前に、組織は固定ステップによって保存されることが好ましい。しかし、組織を固定することなく直接凍結することも可能である。
細胞は、分析の対象となる原核細胞または真核細胞のいずれでもよい。これらは、例えば、古細菌の細胞を含む細菌細胞であってもよい。例として、細菌細胞は、大腸菌細胞、または標準的な実験室でのアッセイに使用される他の細胞、あるいは、例えば、病気に関与する他の細菌細胞でもよい。また、細胞は、例えば出芽酵母(Saccharomyces Cerevisiae)細胞などの真菌細胞であってもよい。また、細胞は、例えば植物、動物、ヒトなどの真核生物に由来する細胞であってもよい。
サンプル細胞の細胞培養とは、生物の外部にある培養液または栄養溶液中またはその上で、細胞または細胞集団を培養することである。細胞培養液は、培養される細胞の要件およびアッセイの要件に合わせて使用される。例えば、細菌細胞は、いわゆる寒天プレートの形をした半固体または固体の細胞培養培地で培養することができる。また、動物やヒトの細胞の培養に一般的に用いられる液体培地で細胞を培養することも知られている。細胞培養の細胞は、初代細胞(生物から直接生成されたもの)であっても、細胞株(不死化された細胞)であってもよい。
組織、組織切片、細胞、および/または細胞培養物の成分は、例えば、タンパク質、核酸、炭水化物、脂肪酸を含む成分、ビタミン、ホルモン、細胞の他の成分、および/またはこれらの組み合わせであってもよい。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、流体は、以下のものを含むグループから選択される液体である。
- 1つまたは複数のサンプルを培養および/または維持および/または保存するための緩衝液または細胞培養液。
- サンプルを処理するための試薬、好ましくは細胞溶解反応、染色反応、結合反応を行うための試薬、または埋込媒体を除去するための試薬。
細胞培養液とは、細胞または細胞集団の短期または長期の培養に適した培地である。
緩衝液とは、pHを安定化させる成分を含む試薬で、例えば塩水溶液に含まれている。例としては、HEPES-(Hydroxyethylpiperazin-Ethansulfonic acid)緩衝液、natriumdihydrogenatephosphate緩衝液、TRISベース(Tris(hydroxymethyl)-aminomethane)緩衝液などがある。
細胞溶解反応を行うための試薬としては、例えば、プロテイナーゼKを含む緩衝液、Quick Extract FFPE DNA extraction solution(Illumina Quick Extract FFPE DNA extraction kitから)、またはIon AmpliSeq Direct FFPE DANN kitからの直接試薬が挙げられる。
染色反応のための試薬は、臓器、細胞タイプ、またはその成分を染色するためのいかなる試薬でもよい。確立された染色技術は、例えば、抗体、臭化エチジウムなどの核酸へのインターカレーション試薬、好塩基性、好酸性、好中性などの構造を検出するための他の染色試薬などを用いた免疫組織学的な染色が挙げられる。
結合反応を行うための試薬には、例えば、抗体、および/または磁気ビーズなどが含まれ得る。
例えばパラフィン包埋の除去などの、包埋媒体の除去用の試薬としては、キシレン、鉱油、シクロヘキサンなどの有機溶剤が考えられる。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、サンプルは、顕微鏡スライド上に提供された組織切片であり、流体は、細胞溶解反応を行うための液体であり、以下を含むグループ群から選択される組織切片の1つまたは複数の成分を採取するための液体である。
- 核酸、
- 蛋白質、
- 炭水化物、脂肪酸、ビタミン、および/またはホルモンを含む成分、またはその他の細胞化合物、および/または、
- それらの組み合わせ。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、組織切片は、生体組織検査または切除された腫瘍からのホルマリン固定、パラフィン包埋組織切片である。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、方法ステップの1つまたは複数が、ピペッタを使用して手動で、または液体処理ワークステーションを使用して自動的に実行される。
ピペッタは、実験室の人員が手動で使用するための手持ちピペットである。手動で使用することにより、実際の状況に合わせて個別に選択した手順で分析を行うことができるという利点がある。
液体処理ワークステーションを使用して本方法を自動的に実行することは、多数のサンプルを一貫した品質と基準で正確に処理できるという利点がある。液体処理ワークステーションは、通常、1つまたは複数のコントローラの制御下にあり、コントローラは、例えば、ピペット操作ロボット、使用する液体、吸引、吐出、混合、その他のピペット操作ステップ、ピペットや容器などの動きを制御する。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、
- 第1の流体リザーバは、ピペットチップの遠位端に取り付け可能に構成されたピペットチップ拡張部によって提供され、ピペットチップ拡張部は、近位端と、遠位端と、近位端と遠位端との間に延びる外壁とを含み、外壁は、近位端において、ピペットチップを挿入するための受容孔を形成し、遠位端において、吐出孔を形成し、
- 第2の流体リザーバは、液体を吐出および/または吸引するためにピペットチップによって提供され、
ピペットチップの遠位端をピペットチップ拡張部の受容孔からピペットチップ拡張部に挿入することによって、ピペットチップ拡張部がピペットチップに取り付けられており、
ピペットチップ拡張部とピペットチップとの間の流体連通は、ピペットチップをピペットチップ拡張部から離間させる少なくとも1つの間隔要素によって生成される。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ、ピペットチップ拡張部、および少なくとも1つの間隔要素は、複数の部品で形成された、または1つの一体型ワークピースとして形成された機能的アセンブリを形成する。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、少なくとも1つの間隔要素は、ピペットチップ拡張部の外壁の内側とピペットチップの外壁の外側との間に流体取り込み領域を確立するように寸法設定されており、流体取り込み領域は、ピペットチップ拡張部の吐出孔からピペットチップ拡張部の受容孔まで延びており、流体取り込み領域は、受容孔において周囲の大気と、およびピペットチップの遠位開口部に隣接するピペットチップの内部空洞と、流体連通している。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、少なくとも1つの間隔要素は以下によって提供される。
- ピペットチップ拡張部、および/または、
- ピペットチップ、および/または、
- 別個のインサート。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、少なくとも1つの間隔要素は、ピペットチップの遠位端へのピペットチップ拡張部の摩擦嵌め取り付けを提供するように構成される。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップは、使い捨てピペットチップおよび固定ピペットチップを含むグループから選択される。
矛盾しない限り、言及された、または言及されるであろう他の実施形態のいずれとも組み合わせることができる本発明の一実施形態では、ピペットチップ、ピペットチップ拡張部、および少なくとも1つの間隔要素は、ピペットチップ拡張部内のピペットチップの挿入深さを制御するための少なくとも1つの狭窄要素を含むアセンブリを形成し、狭窄要素は、挿入されたピペットチップの遠位端とピペットチップ拡張部の遠位端との間の隙間高さを規定する。
上記のような方法は、本明細書に記載された任意の実施形態における、本明細書に記載されたピペットチップ拡張部のうちの1つを、本明細書に記載された一実施形態におけるピペットチップと、本明細書に記載された少なくとも1つの間隔要素と一緒に用いて実施されることが特に好適である。ピペットチップ拡張部、ピペットチップ、および間隔要素の構成は、本明細書に記載のアセンブリを形成するために相互に適合されてもよい。
本発明の実施形態は、図を参照しながら以下でより詳細に説明される。これらは例示を目的としたものであり、限定的であると解釈されるべきものではない。
図1Aは、ピペットチップ拡張部の模式的三次元側面図であり、特に、近位の受容孔、および内側バーとして構成された3つの間隔要素が示される。 図1Bは、図1Aのピペットチップ拡張部の近位端の模式図であり、図中の断面に基づいて図1Cおよび図1Dの断面図が描かれる。 図1Cは、図1Aのピペットチップ拡張部の、断面C-Cにおける模式的断面図であり、1つの内側バーの停止面の全面が見える。 図1Dは、図1Aのピペットチップ拡張部の、断面D-Dにおける模式的断面図であり、1つの内側バーが断面で切り取られ、もう1つの内側バーの側面が見える。 図2Aは、バーとして構成された間隔要素を含むピペットチップ拡張部の実施形態の近位端の模式図であり、内側バーは近位端と同一平面上に配置されている。 図2Bは、バーとして構成された間隔要素を含むピペットチップ拡張部の別の実施形態の近位端の模式図であり、内側バーは近位端に対してオフセットされて配置されている。 図3Aは、ピペットチップ拡張部の一実施形態の遠位端の模式図であり、ピペットチップ拡張部の遠位端は、吐出孔と、および遠位端まで延びて狭窄要素をそこに形成する間隔要素としての内側バーとを含む。 図3Bは、図3Aのピペットチップ拡張部の遠位端の模式図である。 図4Aは、ピペットチップ拡張部のさらなる実施形態の遠位端の模式図であり、遠位端は、吐出孔と、狭窄要素を形成するふるい状の支持バーとを含む。 図4Bは、図4Aのピペットチップ拡張部の遠位端の模式的平面図である。 図5Aは、ピペットチップ拡張部、ピペットチップ、および間隔要素を含むアセンブリの模式的三次元側面図であり、ピペットチップ拡張部が間隔要素を含む。 図5Bは、図5Aのアセンブリの模式的断面図である。 図5Cは、アセンブリの一実施形態の部品の模式的三次元側面図であり、ピペットチップが間隔要素を含む。 図5Dは、アセンブリのさらなる実施形態の部品の模式的三次元側面図であり、間隔要素は別個のインサートによって提供される。 図6Aは、ピペットチップ拡張部の一実施形態の遠位端の模式図であり、間隔要素は、ピペットチップの挿入深さを制御するための狭窄要素として機能する。 図6Bは、ピペットチップ拡張部の一実施形態の模式図であり、ピペットチップがピペットチップ拡張部に挿入され、狭窄要素はキャリアによって提供される。 図6Cは、ピペットチップが狭窄要素を含む例示的な実施形態の模式図である。 図6Dは、複数部品によるピペットチップ拡張部の一実施形態の模式図であり、下側の第2の部分が狭窄要素を提供する。 図6Eは、図6Cのピペットチップ拡張部が組み立てられた状態を示す。 図7は、吐出孔を備え、それぞれが使い捨てのピペットチップが挿入された一実施形態の同一のピペットチップ拡張部であり、左手のピペットチップ拡張部は未だ流体で充填されておらず、右手のピペットチップ拡張部は流体処理ワークステーションに動作的に接続されて流体で充填されており、サンプル切片を提供する表面上に置かれた後、流体が使い捨てピペットチップから吐出された後である。 図8は、吐出孔、ふるい状の狭窄要素、および挿入された使い捨てのピペットチップを備えた別の実施形態の同一のピペットチップ拡張部であり、左手のピペットチップ拡張部は未だ流体で充填されておらず、右手のピペットチップ拡張部は流体処理ワークステーションに動作的に接続されて流体で充填されており、サンプル切片を提供する表面上に置かれた後、流体が使い捨てピペットチップから吐出された後である。 図9は、顕微鏡スライド上に固定化された組織切片の顕微鏡写真であり、4つの関心領域が、特に本発明のピペットチップ拡張部の使用により処理されており、拡大図は、未処理組織に囲まれた2つの処理済み領域(溶解領域)を示す。 図10は、間隔要素と、使い捨てのピペットチップである挿入されたピペットチップを含むピペットチップ拡張部の一実施形態の模式図である。 図11Aは、ピペットチップ拡張部の一実施形態の近位端の模式図であり、外形や、ピペットチップ収容領域と流体取り込み領域の配置の変形例を示す。 図11Bは、ピペットチップ拡張部の一実施形態の近位端の模式図であり、外形や、ピペットチップ収容領域と流体取り込み領域の配置の変形例を示す。 図11Cは、ピペットチップ拡張部の一実施形態の近位端の模式図であり、外形や、ピペットチップ収容領域と流体取り込み領域の配置の変形例を示す。 図11Dは、ピペットチップ拡張部の一実施形態の近位端の模式図であり、外形や、ピペットチップ収容領域と流体取り込み領域の配置の変形例を示す。 図12Aは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図12Bは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図12Cは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図12Dは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図12Eは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図12Fは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図12Gは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図12Hは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図12Iは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の吐出孔の模式図であり、吐出孔形状の変形例を示す。 図13Aは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の模式図であり、外壁の内側を示す。 図13Bは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の模式図であり、外壁の内側を示す。 図13Cは、ピペットチップ拡張部の様々な実施形態の模式図であり、外壁の内側を示す。 図14は、サンプルの処理のために2つのピペットチップを収容するように構成されたピペットチップ拡張部の一実施形態の模式的断面図である。 図15は、液体でサンプルを処理する例示的な方法の概略の模式図である。 図16は、サンプルの処理方法の工程のダイヤグラムである。 図17は、サンプルの処理方法のさらなる特定の工程のダイヤグラムである。 図18は、サンプルの処理方法のさらなる特定の、追加の、および任意の工程のダイヤグラムである。
図1A~図1Dは、ピペットチップ拡張部1の例示的な実施形態を模式図で示している。ピペットチップ拡張部1は、近位端2と遠位端3とを含む。外壁4は、近位端2と遠位端3との間に延びている。外側5と内側6とを含む外壁4は、内部空洞7を囲んでいる。中心軸11は、近位端2から遠位端3に向かって、長手方向に延びている。したがって、内部空洞7は、中心軸に直交し、中心軸から離れる方向に見たときに、外壁4の内側6によって区切られている。
近位端2では、外壁4が受容孔8を形成し、遠位端3では、外壁4が吐出孔14を形成している。以下の図に示すように、受容孔8は、ピペットチップ拡張部1がピペットチップ12に取り付けられるべきときに、ピペットチップ12を受け入れるように構成されている。受容孔8の直径は、特に、ピペットチップ12が端部位置でピペットチップ拡張部1に導入されたときの同じ高さのピペットチップ12の直径よりも大きい。その結果、ピペットチップ12の外側は、ピペットチップ拡張部1の外壁4の内側6に接触せず、代わりに、ピペットチップ拡張部1は、ピペットチップ12の外側がピペットチップ拡張部1の内側6から間隔を空けているピペットチップ拡張部1内のピペットチップ12の座部を提供する1つまたは複数の間隔要素9を含む。ピペットチップ12が1つの接触点でピペットチップ拡張部の内側6に接触することは可能かもしれないが、ピペットチップ12の残りの外側は、1つ以上の間隔要素9によってピペットチップ拡張部1の内側6から離間している。あり得る座部は、図11Aから11Dにおいても説明されている。
図1Aでは、ピペットチップ拡張部1の三次元側面図が示されている。この図は、特に、受容孔8を有する近位端2を示している。図示されているピペットチップ拡張部1は、この場合、3つの間隔要素9を含んでいる。各間隔要素9は、細長いバーとして構成されており、このバーは、外壁4から内部空洞7内に突出しており、この場合、中心軸11に向かって突出している。図示の実施形態では、各バーは、近位端2に対して同一平面上に配置されており、ピペットチップ拡張部1の近位端2からそのほぼ遠位端3まで連続的に延びている(図1Cおよび1D参照)。
この場合、3本のバーのそれぞれは、停止面10を含む。この停止面10は、この場合、ピペットチップ拡張部1の中心軸11の方を向いているバーの表面である。停止面10のサイズは、間隔要素の形状および寸法によって決定され、それは、バーの場合、長さ、深さ、および幅である(例えば、図13C参照)。停止面10は、ピペットチップによって当接されることができ、ピペットチップ拡張部1内のピペットチップ12の安全な座部を提供する。
図示のピペットチップ拡張部1は、近位部では外壁4が中空の円筒を形成し、中間部および遠位部では外壁4が遠位端3に向かって先細りになっている。細長いバーの寸法は、外壁4の形状で決まるピペットチップ拡張部1の形状に適合されて、各バーの停止面10が外壁4の内側6と平行に延びるようになっている(図1D)。
図1Bは、図1Aのピペットチップ拡張部の近位端2を示す模式図である。この場合はバーである間隔要素9は、本実施形態では、外壁4の一部として形成されている。しかし、後述するように、間隔要素9は、別個のインサート16として、または挿入されるピペットチップ12の一部として提供されてもよい。図1Bに示す実施形態では、間隔要素9は、近位端2から遠位端3に向かって延びている。各間隔要素9について、近位端2から内部空洞7および中心軸11の方を向いている表面までのエッジが加えて示されている。この図から、吐出孔14に向かうこの表面の延びも見えている。この表面は、ピペットチップ12によって当接され、ピペットチップ12がピペットチップ拡張部1にさらに挿入されるのを防止するストッパを提供することができ、この表面は、停止面10とも呼ばれる。上から見ると、3つの間隔バーの遠位端は、吐出孔14の中に投影される。図1Cおよび1Dに示された断面図が基にしている断面の表示が示されている。
図1Cは、図1Bに示す断面C-Cに基づく概略断面図である。この図面は、図1Aのピペットチップ拡張部1を通る縦断面を示しており、間隔要素9として使用されるバーの1つを正面から見た図である。その図では、バーの停止面10が見える。内側のバーは、近位端と同じ面から始まり、ピペットチップ拡張部1のほぼ全長にわたって延びている。しかし、内側のバーは、ピペットチップ拡張部の遠位端3まで達することなく、遠位端3まで隙間高さhを有する隙間を残している。このピペットチップ拡張部1の遠位端3は、図6Aに高倍率で示されており、そこでは隙間高さhも示されている。
図1Dは、図1Bに示す断面D-Dに基づく模式的断面図である。この図面は、図1Aのピペットチップ拡張部1を通る縦断面を示しており、切断されるバーの1つが正面から見えており(左側)、およびバーの1つの側面が見えている。
図2Aは、ピペットチップ拡張部1の近位端2を模式的に示しており、この近位端2は、3つの間隔要素9が近位端2と同一平面上に配置されている図1Aに示すピペットチップ拡張部の近位端2の実施形態に本質的に対応している。
図2Bは、別の実施形態におけるピペットチップ拡張部1の近位端2を模式的に示している。ピペットチップ拡張部1も、3つの間隔要素9を含んでおり、この間隔要素は、この実施形態では、細長いバーとして構成されている。図示の実施形態では、バーは、ピペットチップ拡張部1の遠位端3に向かってオフセットして配置されている。言い換えれば、各バーの近位端は、ピペットチップ拡張部1の近位端2から離間している。間隔要素9は、外壁4と一体的に形成されていてもよいし、外壁4の内側6に取り付けられた別個の部品であってもよい。
図3Aは、ピペットチップ拡張部1の遠位端3の長手方向の断面の一部を拡大して模式的に示している。この部分で見えている間隔要素9は、細長いバーとして構成されている。ピペットチップ拡張部1がそれに取り付けられているときにピペットチップ12が当接するバーの表面も、正面から完全に見える。この表面は、ピペットチップ12がピペットチップ拡張部1の中に移動したときに、ピペットチップ拡張部1の内側6に向かってピペットチップ12の位置を制限するので、停止面10と呼ばれる。
バーは、吐出孔14に向かって延びているが、遠位端3に対してオフセットして配置されている。遠位端3に向かうオフセットの長さは、ピペットチップ12がピペットチップ拡張部1に挿入され、ピペットチップ12の遠位端30が間隔要素9の遠位端と同一平面に配置されたときに発生する隙間高さhに対応してもよい(図6A参照)。この場合、間隔要素9の遠位端は、内部空洞l1の可能な限り小さい横方向の拡張幅を生成し、この拡張幅では、挿入プロセス中にピペットチップの遠位端がそれ以上通過することができず、それによって、ピペットチップ拡張部1の遠位端3に向かうさらなる挿入が制限される。
しかし、狭窄機能は、必ずしも遠位端において間隔要素によって提供されるのではなく、近位端2に少し近い位置で提供されてもよい。ピペットチップ12がピペットチップ拡張部の遠位端2に向かって押し付けられる力は、挿入深さおよび結果として生じる隙間高さhにも影響を与え、これは、適用される圧力に応じて狭窄要素がわずかに変形可能である場合に、十分に高い挿入力は、狭窄要素位置を超えてピペットチップ12の遠位端30を押し付ける可能性があるからである。
ピペットチップ拡張部1の遠位端3は、シール部15を含み、ピペットチップ拡張部の遠位端3がサンプルを提供する表面に押し付けられたとき、または準備されたサンプルに押し込まれたときに、吐出孔14をシールする。シール部15は、単に、表面または準備されたサンプルに接触するピペットチップ拡張部の最も遠位の部分であってもよい。シール効果は、例えば、ピペットチップ拡張部1の遠位端3が例えば顕微鏡スライドの表面などの剛性のある表面に接触したときに、最遠位端の材料がわずかに変形することによって向上し得る。ピペットチップ拡張部1の遠位端3は、例えば、顕微鏡スライドの剛性表面に接触するまで、組織切片の組織に食い込むことができる。しかし、シール効果は必ずしも100%である必要はなく、例えば、周囲の組織も「シール効果」を提供することができるので、ピペットチップ拡張部1の遠位端3が単に生物学的サンプル、特に準備されたサンプルに押し付けられる、または十分な深さで押し込まれるだけで十分であり得る。
図3Aに示すようなシール部15の大きさは、この場合、ピペットチップ拡張部1の遠位端3の形状にも影響される。この例では、示されたシール部15に隣接して傾斜部が使用されている。
図3Bは、3つの間隔要素9を有する図3Aに示すピペットチップ拡張部1の遠位端3を模式的に示す図である。この図では、3つの間隔要素の吐出孔14への延びと、異なる傾斜面を有するピペットチップの別の部分とを見ることができる。
図4Aは、ピペットチップ拡張部1の遠位端3の別の実施形態を模式図で示している。この場合、遠位端3は、吐出孔14の上方に、狭窄要素13を形成するふるい状の支持バー16を含んでいる。細長い間隔要素9の停止面10も正面から見えている。図4Bは、図4Aの遠位端3を模式的に示している。
支持バー16は、ピペットチップ拡張部1の中心軸11に対して横方向に延びている。図示の実施形態では、遠位端において流体透過性のふるい構造を形成している。支持バー16は、ピペットチップ12がピペットチップ拡張部1の遠位端3に向かってさらに挿入され、ピペットチップ12の遠位端30とピペットチップ拡張部1の遠位端3との間に隙間が生じることを防止する狭窄要素として機能する。このふるい状の構成により、ピペットチップ12から吐出された液体が、いずれにせよ吐出孔14の上の生成された隙間に流入し得ることが保証される。
図5Aは、ピペットチップ拡張部1、ピペットチップ12、および間隔要素9を含むアセンブリの模式的な三次元側面図である。図示の実施形態では、間隔要素9は、ピペットチップ拡張部1によって提供される。ピペットチップ拡張部1は、ピペットチップ12の遠位端30に取り付けられている。使用されるピペットチップ12は、この場合、近位部35に補強バーを含む使い捨てのピペットチップ12であり、この補強バーは、使い捨てのピペットチップ12が、例えば液体処理ワークステーション25のピペット22に取り付けられるときに、安定化効果を提供し、それは当技術分野で周知である。
使用されるピペットチップ拡張部1は、図1A~図1Dに本質的に記載されているピペットチップ拡張部に対応しており、ピペットチップ拡張部1の近位端2から遠位端3に向かって連続的に延び、遠位端3に向かってオフセットして終わるバーとして構成された3つの間隔要素9を含んでいる。各細長いバーの中心軸11に面した表面は、挿入されたピペットチップ12の停止面10として機能し、全ての停止面10は一緒にピペットチップ拡張部1の「共通の」停止面を形成し、ピペットチップ拡張部1内でのピペットチップ12の位置を規定する。
間隔要素9によって、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7の一部が保存される。これらの部分は、ピペットチップ拡張部1の吐出孔14が閉じられたときに、ピペットチップ12からの流体または液体で満たされることができる流体取り込み領域として機能する。間隔要素9は、ピペットチップ拡張部1の本実施形態において、ピペットチップ拡張部1内へのピペットチップ12の挿入を狭窄する手段としてさらに機能する。これにより、ピペットチップ12の遠位端30とピペットチップ拡張部1の遠位端との間に隙間が形成されることが保証される。次に、遠位端3を有するピペットチップ拡張部1を適切な表面に置くことによって、ピペットチップ拡張部の吐出孔14が閉じられると、ピペットチップ12からの液体は、隙間を介して、ピペットチップ12とピペットチップ拡張部1との間の残りの空洞に移動することができる。
図5Bは、図5Aに示されたアセンブリを貫く、示された断面A-Aに基づいた模式的断面図である。右手の間隔バーは切断されて示されており、一方、左手には流体取り込み領域31の一部が見えている。ピペットチップ12の遠位端30とピペットチップ拡張部の遠位端3との間の隙間を介してピペットチップ12の内部空洞38から、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7のうちピペットチップ12によって占有されていない部分への流体経路が、ここでは特に見えている。内部空洞7のこの占有されていない部分は、隙間と共に、流体取り込み領域31を形成する。
流体取り込み領域31は、ピペットチップ12の遠位端30を介してピペットチップ12の内部空洞38と流体連通しており、加えて、ピペットチップ拡張部1の近位端2において周囲の大気と流体連通している。これにより、アセンブリが表面19上に置かれ、ピペットチップ拡張部の吐出孔14が表面、および/またはその上に置かれた組織によって閉じられたときに、液体20がピペットチップ12の内部空洞38とピペットチップ拡張部の内部空洞7との間で移動することができる。これにより、移動された液体20が連続的に表面に接触することも、または、その上に組織または組織切片が置かれている場合には、連続的に組織に接触することも保証される。図7および8も参照のこと。使用される液体20に応じて、ピペットチップ拡張部1の吐出孔14の下の非常に限定された領域で、表面または組織上で反応が引き起こされる可能性があり、これは図9に関連して説明される。
図5Cは、アセンブリの3つの構成要素の代替的な実施形態を三次元図で示している。ここでは、ピペットチップ12は、間隔要素9を含んでいる。示されているのは、この場合、基本的な構造が当技術分野で知られている使い捨てのピペットチップ12である。ピペットチップ12は、ピペットに取り付けるための近位開口部33を有する近位端29と、吸引および/または吐出された液体20の入口/出口としての遠位開口部34を有する遠位端30と、近位端29と遠位端30との間に延びる外壁28とを含む。
ピペットチップ12は、近位端29および近位開口部33の周囲に補強された近位部35を含んでいる。この補強により、ピペットチップ12が近位開口部33を用いて吸引および/または吐出用のピペットに取り付けられたときに、ピペットチップ12の変形が防止される。ピペットチップ12は、ここでは補強のために、近位端29における円周方向の厚み増大部を有しており、長手方向に沿った補強の領域は近位部35と名付けられる。例えば補強リブなどの、他のまたは追加の補強構造も可能である。
補強構造を有する近位部35に隣接する部分は、ここでは中間部36と名付けられ、遠位部37が後に続く。中間部36および遠位部37は、吸引された液体を収容するためのピペットチップ12の部分セクションである。これらの形状は、例えば、液体の量および/または種類、あるいは使用されるピペット操作デバイスの要件など、さまざまな要件に応じて変化し得る。ここに示されているピペットチップは、中間部36および遠位部38を経て遠位端30まで連続的に先細りしている。
ピペットチップ12は、細長いバーとして構成された多数の間隔要素9を含んでいる。目視できるのは、中間部36および遠位部37において、ピペットチップ12の近位端29から遠位端30に向かう方向に延びる2つのバーである。間隔要素9は、ピペットチップ12の外側に配置されている。ピペットチップ12上のそれらの位置は、ピペットチップ拡張部1がピペットチップ12の遠位端30に取り付けられたときに、間隔要素9がピペットチップ拡張部1の内側6に接して、ピペットチップ12の外側とピペットチップ拡張部1の内側との間に流体取り込み領域31を確立するように選択される。
また、図示の実施形態では、間隔要素9は、ピペットチップ12がピペットチップ拡張部1に挿入されたときに、ピペットチップのストッパとして本来機能することで十分であり得る。この場合、間隔要素9は、間隔要素がピペットチップ拡張部1の内側6に当接するときに、ピペットチップ12をピペットチップ拡張部1内に大きく押し込むことができないように寸法設定されている。したがって、間隔要素9は、ピペットチップ12の遠位端30がピペットチップ拡張部1の遠位端3にまだ到達していないときに摩擦接続が生成されるように、また、組み立て時に、ピペットチップ12の遠位端30とピペットチップ拡張部1の遠位端との間の隙間の生成が許容されるように寸法設定される。本明細書に記載されているような追加の狭窄要素13は、ピペットチップ拡張部1および/またはピペットチップ12によって提供されるなどの追加的または代替的に提供されてもよい。
図5Dは、アセンブリの3つの構成要素のさらなる代替実施形態の三次元側面図を模式的に示している。アセンブリはまた、ピペットチップ拡張部1と、間隔要素9と、ピペットチップ12とを含んでいる。この場合、間隔要素9は、インサート17によって提供される。このインサートは、ピペットチップ拡張部1とピペットチップ12との間に配置されるように適合されており、組み立てられたときにピペットチップ12とピペットチップ拡張部1との間に流体取り込み領域を確立するように構成されている。図示のインサートは、3つの間隔要素9を含み、これらはここでは接続リング39によって接続されている。この場合、接続リング39は、インサート17の近位端に配置されている。接続リング39は、さらに、間隔要素9の間の空間と周囲の大気との流体連通を確保しながら、ピペットチップ拡張部1の近位端2に配置されるように構成されている。
図6Aは、図1Aによるピペットチップ拡張部1の遠位端の状況を示す模式的断面図をより高い倍率で示している。この実施形態では、間隔要素9は、ピペットチップ拡張部1によって提供され、ピペットチップの挿入深さを制御するための狭窄要素13として機能する。ピペットチップ12は、ピペットチップ拡張部1に既に挿入されて示されている。ピペットチップ12の外側は、間隔要素9の対応する停止面10に当接している。間隔要素9は、ピペットチップ12が、その遠位端30がピペットチップ拡張部の遠位端3にまだ到達していないときに、挿入中に停止され、隙間高さhの隙間が形成されるように構成されている。この場合、間隔要素9は、その寸法に基づいて、遠位端3の領域において、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7の最小横方向拡張幅lを規定する。この最小横方向拡張幅lは、単独でピペットチップ12の挿入を狭窄することができるが、例えば、間隔要素9の残りの部分の寸法と組み合わせてもよい。
加えて、吐出孔14の横方向拡張幅lが示されている。この横方向拡張幅lは、基本的に、ピペットチップ拡張部1の遠位端3における外壁4の寸法によって定義される。吐出孔の横方向拡張幅lのサイズは、図6Cおよび6Dに関して定義されるように、変化してもよい。例えば、変化する標準的な吐出孔14を有する異なるピペットチップ拡張部1を提供することが可能であり、または、交換可能な遠位端部3を有するピペットチップ拡張部1を提供することが可能であり、そのような交換可能な遠位端部3のそれぞれが、異なる吐出孔14を有してもよい。
図6Bは、ピペットチップ拡張部1と、ピペットチップ拡張部1に挿入されるピペットチップ12とを含むアセンブリを示し、ピペットチップ拡張部は間隔要素9を含む。ピペットチップ拡張部1は、キャリア18の収容部位24内に配置される。キャリア18は、1つまたは複数のピペットチップ拡張部を収納するように構成されている。この例では、ピペットチップ12の挿入深さは、キャリア18によって提供される狭窄要素13によって制御される。
図6Bは、挿入されたピペットチップ12およびキャリア18とともに、ピペットチップ拡張部1の代替的な実施形態を模式的に示している。ピペットチップ拡張部1は、間隔要素9を含んでおり、そのうちの2つは、この断面図で見ることができるが、それ自体は断面されておらず、正面から横方向に見えている。この実施形態では、間隔要素9は、先に説明した実施形態よりも、ピペットチップ拡張部1の遠位端3に向かって遠くに延びていない。これらの間隔要素9は、特に、ピペットチップが間隔要素9に突き当たるときに、ピペットチップ拡張部1内にピペットチップ12の安全な座部を提供するように構成されている。好ましくは、ピペットチップ拡張部1内のピペットチップ12の座部は、摩擦嵌め接続によって提供される。間隔要素9が、ピペットチップ12の挿入深さを規制するための狭窄機能を提供することは予見されない。
1つのピペットチップ拡張部1は、キャリア18の相補的な収容部位24に挿入されることが示されている。 図6Bには、2つの収容部位24が部分的に示されている。キャリア18は、主に、1つまたは複数のピペットチップ拡張部1を格納するために構成されている。このために、キャリア18は、1つ以上の収容部位24を含んでおり、各収容部位24は、1つのピペットチップ拡張部1を受け入れるようにその形状および寸法が適合されている。収容部位24に挿入されたピペットチップ拡張部1は、例えば、液体処理ワークステーション25のピペット22に結合されたピペットチップ12によって、例えば自動的にピックアップされ得るような方法でキャリア18によって提示される。1つのキャリア18が、例えば1つの、または複数の列に8個または12個の収容部位24を構成することが可能である。
図示のキャリア18は、加えてストッパ23を含み、このストッパ23は、ピペットチップ12のピペットチップ拡張部1への挿入深さを制御する狭窄要素13として機能する。ストッパ23は、それぞれのケースにおいて、収容部位24の底部に配置されている。このように、本実施形態では、狭窄要素13は、キャリア18によって提供され、それぞれの収容部位24に挿入されたピペットチップ拡張部1の吐出孔14を介して到達する突起として構成されている。それぞれの収容部位24のピペットチップ拡張部1に挿入されるピペットチップ12は、その遠位端30がキャリア18のストッパ23に当接すると停止する。この状況は、左手の収容部位24について示されており、一方、ストッパ23のより良い表示のために、右手の収容部位24はピペット無しで示されている。したがって、ストッパ23は、高さの観点から、ピペットチップ12の最終位置を規定する。次のステップで、取り付けられたピペットチップ拡張部1と共にピペットチップ12をキャリア18から遠ざけると、ピペットチップ12は、摩擦によってそこに保持されているので、最終位置に留まる。
図6Cは、ピペットチップ12によって狭窄要素13が提供される別の例示的な実施形態を三次元側面図で模式的に示している。図示の実施形態では、ピペットチップは、肩部を含んでおり、この肩部は、ピペットチップ拡張部1の近位端に当接するように構成されているので、狭窄要素13として機能する。肩部は、ピペットチップ12とピペットチップ拡張部1との間で液体20を移動させる際の圧力の均等化を可能にするために、ピペットチップ12のZ-方向、すなわちピペットチップ12の中心軸に対して直交する方向に、一周連続はしていない。肩部は、ピペットチップ拡張部1の近位端2が例えば不連続な表面、例えば空気を逃がすことができるように切り欠いた表面を有する場合、周方向に一周連続していてもよい。肩部は、ピペットチップ12の外壁28の単純で離散的な突出部であってもよいし、リブ状のバーとして構成されていてもよい。例示的に、このような肩部を構成するピペットチップ12に関する上面図が側面図の上に示されている。しかし、例えば、インサート17が1つ以上の間隔要素9を提供するために使用される場合に、インサート17がピペットチップ12の挿入深さを制限するための狭窄要素を構成することも可能である。
図6Dは、第1の上側部分1.1と第2の下側部分1.2を含む2個の部品のピースとして構成されているピペットチップ拡張部1の模式的断面図である。本実施形態では、第1の部分1.1は、特に間隔要素9と受容孔8を含み、一方、ここでは下側部分である第2の部分1.2は、吐出孔14と狭窄要素13を含む。この場合、狭窄要素13は、遠位領域の外壁4の厚みを増したものである。図6Eに示すように、挿入されたピペットチップ12は、狭窄要素13に当接し、ピペットチップ12のさらなる挿入が抑止される。この場合の第2の下側部分1.2は、取り付け可能な部品として提供されており、例えば特定の関心領域に必要な場合には、例えば吐出孔14の別の横方向拡張幅または直径lを構成する別の下側部分1.2と交換することができる。
特に、図6Cと図6Dに示されたピペットチップ拡張部1を比較すると、下部1.2を交換可能で使用するこの原理がわかる。狭窄要素13は、その構造から見て同じままであるが、図6Dに示すピペットチップ拡張部1の下側部分1.2の吐出孔14の横方向拡張幅lは、図6Cに示すピペットチップ拡張部1の吐出孔14の横方向拡張幅lよりも顕著に小さくなっている。
図7は、それぞれが内部空洞7に挿入されたピペットチップ12を有する2つの同一のピペットチップ拡張部1を、模式的な概要図で示している。この実施形態では、ピペットチップ拡張部1は、細長いバーとして構成された少なくとも3つの間隔要素9を含んでいる。このバーは、挿入されたピペットチップ12にその停止面で当接しており、ピペットチップ12の挿入深さも少なくとも部分的に制限している。ピペットチップの遠位端30とピペットチップ拡張部の遠位端3との間の隙間は、ピペットチップ拡張部1とピペットチップ12との左手のアセンブリの状況について高倍率でハイライトされている。
右側の対応するアセンブリは、サンプル切片21の上に置かれている様子が示されており、このサンプル切片21は、この場合、顕微鏡スライドの表面19上に提供されている。ピペットチップ拡張部1の遠位端3は、サンプル切片21および/または表面19によって周囲の大気に対して本質的にシールされており、形成された隙間が、間隔要素9、外壁4の内側6、およびピペットチップ12の外側の間で、ピペットチップ12の内部空洞と流体取り込み領域31とを流体連通させるようになっている。流体取り込み領域31には、隙間を含めて液体20が存在する。液体20は、間隔要素9の近位端の上方に達しており、ピペットチップ拡張部1の近位端2で周囲の大気と流体連通している。この開放的な構成により、ピペットチップ拡張部の吐出孔14がシールされているときに、ピペットチップ12とピペットチップ拡張部1との間での液体の移動が可能となる。
アセンブリのピペットチップ12は、液体処理ワークステーション25のピペット22に取り付けられることが示されている。ピペット22は、液体処理ワークステーション25のピペット操作ヘッド27の一部であり、このピペット操作ヘッド27は、順にコントローラの制御下にある。この場合、ピペットチップ12のピペットチップ拡張部1への移動、および摩擦嵌め接続、ならびに顕微鏡スライドへの移動、その中での位置決め、および吐出ステップおよび/または吸引ステップなどのピペット操作ステップは、液体処理ワークステーション25の制御下で実施され得る。
図8は、さらなる実施形態における、それぞれが内部空洞7に挿入されたピペットチップ12を有する2つの同一のピペットチップ拡張部1を模式的に概観図で示している。この実施形態では、ピペットチップ拡張部1は、細長いバーとして構成され、挿入されたピペットチップ12がその停止面で当接している少なくとも3つの間隔要素9を含む。さらに、本実施形態のピペットチップ拡張部1は、狭窄要素13として支持バー16を含み、この支持バー16は、遠位端3においてふるい状の構造を形成し、この場合、ピペットチップ12の挿入深さを制限し、隙間の形成を可能にする。ピペットチップの遠位端30とピペットチップ拡張部の遠位端3との間のこの隙間は、ここでも、ピペットチップ拡張部1とピペットチップ12との左手のアセンブリの状況について高倍率でハイライトされている。見て分かるように、この実施形態でも、隙間は、間隔要素9、外壁4の内側6、およびピペットチップ12の外側の間で、ピペットチップ12の内部空洞と流体取り込み領域31との流体連通を提供している。
右側のアセンブリは、図7に示した右側のアセンブリと同様に、顕微鏡スライドの表面19とその上に配置されたサンプル切片21によってシールされている。また、図7と同様に、ピペットチップ拡張部1は、その液体取り込み領域31に液体20が充填されている。液体処理ワークステーション25の対応する要素への接続は、図7の説明と同様である。
図9は、Amsbio,LLCから購入したマウスの腎臓のホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)切片の顕微鏡画像(部品番号MP-901)の概観であり、選択した領域の高倍率画像を下に示す。各画像には対応する縮尺バーが示されている。
図5Aに示すようなアセンブリが、組織切片の処理に使用されている。組織切片を含むスライドは、以下のプロトコルに従って処理された。
65℃に予熱された金属ブロックの上にスライドを置く。
核酸抽出液(品番QE09050、Lucigen Corp.)50μlの、テカン社の200μl標準使い捨てピペットチップ(品番30057814、Tecan Systems,Inc.)を用いた吸引を、液体処理デバイス(Cavro(登録商標) Omni Flex)を用いて行う。
ピペットチップとピペットチップ拡張部を組み立てる。アセンブリを組織切片の上に下ろし、それによってピペットチップ拡張部の吐出孔を閉じ、以下の液体処理を行う。
1. ピペットチップから25μlをアセンブリの液体取り込み部に吐出し、それによって液体を組織切片上に移動させる。
2. 組織の上と液体取り込み部内で液体を30秒間保持する。
3. ピペットチップから液体取り込み部に20μlを吐出し、500ミリ秒待つ。
4. 20μlをピペットチップに吸い戻し、500ミリ秒待つ。
5. ステップ3.と4.を5回繰り返す。
6. ステップ2.から5.を4回繰り返す。
この処理のあと、液体全量をピペットチップに吸い上げる。
組織切片からアセンブリ内のピペットチップを持ち上げる。
組織切片のさらに3つの領域で液体処理を繰り返す。
上の顕微鏡写真は、上述の液体処理を行った後の組織の断面の概観である。処理された4つの領域は黒い丸で見える。下の画像は、白丸内の領域をより拡大したものである。どちらの画像でも、「FFPE組織」と表示された未処理の組織領域と、「溶解領域」と表示された処理領域の間には、明確な境界線ができている。高倍率の画像から、液体処理によって表面に変化が生じていることがわかる。液体処理によって、パラフィン包埋されていた組織や組織成分が処理液に抽出されたと結論づけられ得る。
処理した部分に残る構造物は、顕微鏡スライドのガラスを除けば、抽出液を蒸発させた後に残ったパラフィン残渣、取り除かれなかった細胞の破片、および/または固形物などであると考えられる。
図9は、ピペットチップとのアセンブリで使用されるピペットチップ拡張部の可能な実施形態の1つを用いて、例示的に実施された方法の結果を示している。所望の応用に応じて、他の実施形態を使用することができる。プロトコルは、例えば、分析の目的に応じて変化し得る。
図10は、少なくとも1つの間隔要素9を含むピペットチップ拡張部1の断面の模式図であり、この間隔要素9は、ピペットチップ拡張部1内に固定ピペットチップ12を配置するように適合されている。固定ピペットチップ12は、典型的な形状を有するものとしてここで示されており、細長く薄い遠位部分は、サイドカットとして右側に示されている間隔要素9に当接される。例えば、使い捨てのピペットチップが使用されるか、または固定チップが使用されるか、にかかわらず、ピペットチップ拡張部1は、その構成において、安定した安全な座部を提供するように適合される。挿入深さは、前述の狭窄要素13によって追加的に制御されてもよいし、例えば、単にピペットチップ12を挿入するために使用される力によって制御されてもよい。
図11Aから図11Dは、ピペットチップ拡張部1の様々な変形例の概略断面図である。変形例は、外壁4によって決まる外形、間隔要素9の数、寸法および構成、ならびに流体取り込み領域31およびピペットチップ収容領域32のサイズおよび位置に対するそれらの影響において異なる。ピペットチップ拡張部1の中心軸11は、鎖線で示されている。
ピペットチップ収容領域32とは、ここでは、ピペットチップ拡張部1が本質的に円形の断面を有するピペットチップ12に取り付けられ、ピペットチップ12が間隔要素9に接したときに、ピペットチップ12によって占有されるピペットチップ拡張部1の内部空洞7内の領域または空間として理解される。ピペットチップ12が挿入される可能性のある位置またはその外側の境界線は、ピペットチップ収容領域32の円形の境界線として示されている。
流体取り込み領域31は、ここではシェード付き領域として示されており、これは、ピペットチップ12が挿入され、吐出孔14が例えば表面19によって閉じられている場合に、この領域が液体20で満たされる可能性があることを示す。前に説明および図示したように、流体取り込み領域31、すなわちピペットチップ拡張部1の内部空洞7は、ピペットチップ拡張部1の近位端において、覆われたり、何らかの方法で閉じられたりしない。これにより、挿入されたピペットチップ12と残りの空洞7または流体取り込み領域31との間で液体が移動する際の圧力補償が可能となる。液体は、例えば、間隔要素9がピペットチップ拡張部1の近位端に対してオフセットして配置されている場合には、間隔要素9を浸漬させる可能性がある。
図11Aは、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7内のピペットチップ収容領域32の本質的に同心円状である配置を示す。ピペットチップ拡張部1の断面は円形状であり、3つの間隔要素9が内側6の外周に規則的に分布している。各間隔要素9は、外壁4の突出部として形成された台形状のバーとして構成されており、各バーは基本的に同じ構成を有している。液体20を取り込み得る領域、即ち、流体取り込み領域31は、外壁4の内側6、間隔要素9、及び、組み立て時にはピペットチップ12の外側によって限定される。
図11Bは、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7内のピペットチップ収容領域32の偏心した配置を示している。ピペットチップ拡張部1の断面は、円形の形状を有している。4つの間隔要素9が、外壁4の内側6の周囲に規則的に配置されて設けられている。2つの間隔要素9は、類似した台形の形状であることが例示的に示されており、一方、残りの2つの間隔要素9は、台形の要素よりも内部空洞6内にあまり突出しない半円形の形状を有している。間隔要素9のこの非対称な構成によって、ピペットチップ12は、それ自身の中心軸に対して中心から外れた位置に配置されることになり、その結果、流体取り込み領域31は、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7内でも非対称に分配される。
図11Cは、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7内のピペットチップ収容領域32の同心円状の配置を示しており、ピペットチップ拡張部1は楕円形の断面を有している。それぞれが四角のバーとして構成された4つの間隔要素9が設けられており、これらは外壁4の内側6の周囲にわたって規則的に分布している。ピペットチップ12の同心円状の位置は、間隔要素9の構成によって可能となり、2つのバーが他の2つのバーよりも内側の空洞7の中に、中心軸11に向かってさらに突出し、それによって外壁4から中心軸11に向かう距離の差を相殺する。間隔要素9の深さを調整することで(図13Cも参照)、流体取り込み領域31の容積も調整することができる。
図11Dは、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7内のピペットチップ収容領域32の同心円状の配置を示しており、ピペットチップ拡張部1は、正方形状の断面を有している。それぞれが四角のバーとして構成された4つの間隔要素9が設けられており、これらは外壁4の4つの内側6上に規則的に分布している。ピペットチップ12の同心円状の位置は、間隔要素9の構成によって可能となり、すべてのバーが内側の空洞7の中へ同じ長さだけ中心軸11に向かって突出している。
図12A~Iは、ピペットチップ拡張部1の外壁4によって形成される吐出孔14の例示的に異なる形状を断面図で示している。例示的に示されているのは、円形の断面(図12A)、楕円形の断面(図12B)、2つの楕円形の断面(図12C)、正方形(図12D)もしくは四角形(図12E)の断面、三角形の断面(図12F)、シャムロック形の断面(図12G)、1つ(図12H)または複数(図示せず)のくぼみを有する四角形の形状、または八角形の断面(図12I)である。
これらの図は、吐出孔14の形状が、特定の所望の用途または想定される関心領域のサイズ、例えば異なる組織の特定の部分に適合され得ることを示している。また、形状は、例えば、特定の形状を必要としたり、少なくとも有利にしたりする他の要件に適合させることができる。例えば、図14に示すように、ピペットチップ拡張部1が2つのピペットチップ12を取り込むように構成されている場合には、2つの楕円形の形状が望ましいかもしれない。ここでは明確に示されていないが、例えば非対称の形状を有する他の断面も可能である。
図13A~図13Cは、ピペットチップ拡張部1の外壁4の内側6と、間隔要素9の例示的な異なる実施形態を模式的に示す図である。
図13Aは、細長いバーとして構成され、ピペットチップ拡張部1の外壁4の近位端と同一平面上に配置された間隔要素9を示している。このバーは、近位端2から遠位端3に向かって延びており、外壁4の内側6の外周に沿った寸法に対応する幅「a」を有し、長手方向の寸法に対応する長さ「b」を有し、内部空洞7に向かって中心軸11の方へ突出している寸法に対応する深さ「c」を有している。深さa、長さb、および幅cの説明は、間隔要素9一般に適用することができる。
図13Bは、2つの間隔要素9を含む外壁4の内側6を示している。上側の間隔要素9は、近位端2に対してオフセットして配置されており、その長さbよりも大きい幅を有している。この断面図では評価できないが、上側の間隔要素9は、延長が一周連続しておらず、ピペットチップ拡張部1の近位端2において、提供された流体取り込み領域31と周囲の大気との間の流体連通を可能にするために、外壁4の内側6の少なくとも一部が開いたままになっている。下部間隔要素9は、上部間隔要素9と同様に構成されているが、さらに、その遠位端に、ピペットチップ拡張部1の中心軸11に向かって追加の突出部が設けられている。この追加の突出部は、ピペットチップ12の遠位端30に対して当接することができる構造として機能し、ピペットチップ拡張部1内でのピペットチップ12の挿入深さを制限する。これにより、追加の突出部は、狭窄要素13として機能し、ピペットチップ拡張部1の内部空洞7内でのピペットチップ12の位置の決定に貢献する。
図13Cは、間隔要素9の異なる構成を模式的に示している。示されているすべての間隔要素9は、周壁4の近位端2に対してオフセットして配置されている。示されているのは、たとえば細長いバーとして、または円筒形の突起として構成されている間隔要素9である。異なる構成の間隔要素9を組み合わせて、ピペットチップ拡張部1内の特定のピペットチップ12の所望の座部を実現することが可能である。例えば、多数の細長いバーを、近位端2から遠位端3に向かって同一線上に配置してもよい。このような分布は、特に、処理された組織からの溶解物質の部分を有する液体20の混合効果を達成するために有利であり得る。また、単純な細長い寸法とは別に、蛇のような突出などの変わった形態も可能であり得る。
より遠位の部分には、ピペットチップ12の挿入深さを制御するための追加の狭窄要素13が示されている。左側には、図13Bにも示されているように、その遠位端に追加の突出部を有する間隔バーが示されている。右側には、外壁6の内側から直接延びる単純な突出部である単一の狭窄要素13が示されており、この狭窄要素は、ピペットチップ12の遠位端30に当接することができるストッパまたは停止面を同様に提供することができる。
流体取り込み領域31に対応する内側の隙間の形状は、使用する間隔要素9の形状と外壁4の形状それぞれの調整により調整することができる。例えば、少量の液体20のみを使用する場合には、流体取り込み領域31を最小化することが特に望ましい場合がある。この場合、潜在的な流体の堰き止め効果を最小化するために、間隔要素の形状に特に注意する必要がある。
図14は、2つのピペットチップ12を受け入れるように構成されたピペットチップ拡張部1を極端に概略的に示している。この例示的な実施形態では、ピペットチップ拡張部は、著しく厚みを増した外壁4を含み、そこには、2つの別個の受容孔8と2つの内部空洞7とが設けられ、各内部空洞7は、ここではそれぞれのピペットチップ12によって占有される個々のピペットチップ収容領域32を構成する。各空洞において、それぞれのピペットチップ12は、間隔要素9によって外壁4の内側6から離間している。各内部空洞7について、断面図において、間隔要素9の1つが見えており、断面されて示されている。
ピペットチップ拡張部1は、遠位端3に2つの追加のシール15を含んでいる。各シール15は、吐出孔14の1つを囲む。この構成では、2つのピペットチップ12のそれぞれがサンプル上の個々の領域を処理するために使用され得るので、サンプル上の隣接領域の同時処理が可能である。また、ここでは図示していないが、ピペットチップ収容領域32をさらに増やすことも可能である。
図15は、例示的な方法の一連のステップを非常に模式的に示したものである。示されているのは、すでに液体20を含んでいるピペットチップ12と、間隔要素9を含んでいるピペットチップ拡張部1である。ピペットチップ拡張部1をピペットチップ12に取り付けるために、ピペットチップ12は、その受容孔8を通してピペットチップ拡張部1に挿入されてもよい。例えば、ピペットチップ12は、自動液体処理ワークステーションのピペットに取り付けられ、ピペットチップ拡張部1の中に自動的に移動することができる。このような移動の方向は矢印で示されており、対応する液体処理ワークステーション25はこの図では示されていない。ピペットチップ12とピペットチップ拡張部1との組み立ては、もちろん、ピペットチップ拡張部1をピペットチップ12の遠位端30に移動させることによって、または、ピペットチップ12とピペットチップ拡張部1との両方を相互に移動させることによって行われてもよい。組み立てのステップは、ブロック矢印で示されている。
ピペットチップ拡張部1には、異なる高さに配置された2つの間隔要素9が示されている。上側の間隔要素9は、ピペットチップ拡張部1の近位端2と同一平面上に配置され、下側の間隔要素9は、ピペットチップ拡張部1の下半分に配置される。間隔要素9は、切断されて示されている。ここでは見えないが、いずれにしても間隔要素9は、円周方向に一周連続して延びて近位端2を閉鎖するのではなく、ピペットチップ拡張部の近位端2を周囲の大気に向かって本質的に開いたままにするように構成されている。
ピペットチップ拡張部1、ピペットチップ12、および間隔要素9を含むアセンブリが、次にサンプルの上に配置される。この図では、サンプルは、顕微鏡スライドの上面19に固定化されたサンプル切片21である。図示されているピペットチップ拡張部1は、遠位端3にシール部15を含んでおり、このシール部15は、この場合、ピペットチップ拡張部1の遠位端3が、例えば、サンプルの表面および/またはサンプルのためのキャリア表面によってシール的に閉じられることを保証することができる一周連続したシールである。シール部15の特質は、ピペットチップ拡張部1が使用されるサンプルの特質に適合させてもよい。例えば、深く凍結した組織サンプルのブロックをピペットチップ拡張部1で処理する場合、あたかもペトリ皿上の細胞培養物や寒天プレート上の細菌コロニーを処理する場合のように、異なる材料を使用してもよい。シール効果は、ピペットチップ拡張部1、間隔要素9、およびピペットチップ12のアセンブリをサンプル上に配置し、その上に保持する力加減によって追加的または代替的に制御することができる。
ピペットチップ拡張部1がアセンブリの他の部材と共にサンプル上に配置され、シール部15および/または外壁4の遠位端によってシールして囲まれたピペットチップ拡張部1の吐出孔14内に所望の関心領域が配置されると、液体20がピペットチップ12からアセンブリによって生成された流体取り込み領域31に吐出される。これにより、隙間および流体取り込み領域31を介して、吐出孔14内またはその下に位置するサンプル上に流体の流れが生成される。吐出孔14は、サンプル21および/または表面19によって閉じられているので、ピペットチップ12がピペットチップ拡張部1に挿入されているときにも、ピペットチップ拡張部1が近位端2で開いたままであることが不可欠であり、これにより、液体20がピペットチップ12から吐出されるときに圧力補償が可能となり、サンプル21上に流体の流れが生成され得る。これは、例えば、前述したように、間隔要素9の構成によって達成されてもよい。
ピペットチップ12とピペットチップ拡張部1の流体取り込み領域31(曲がった二重矢印で示される)との間の液体20の繰り返しの移動によって、ピペットチップ拡張部の吐出孔14の下のサンプル上の流体の流れを任意に維持することができる。ピペットチップ12の液体の吐出と吸引の繰り返しによる液体の移動は、この種の液体の移動が異なる成分を効果的に混合するのに適していることから、ここでは混合とも呼ばれる。本ケースでは、液体の混合は想定されていないが、サンプルの表面上で連続的な流れを維持することで、サンプルは継続的に液体20の影響を受け、混合効果が得られる可能性はある。これにより、サンプルの成分がサンプルから分離され、液体20に取り込まれる可能性があり、これは、液体の、変化したわずかに濃いハッチングによって示される。また、組織成分の分離を促進するような液体20を使用すると、さらに効果が高まる。使用する液体20を選択することで、液体の所望の効果を、吐出孔14の下方/内部の特定の関心領域に特に向けることができる。
緩衝液や細胞培養液など、サンプルを維持、培養、及び/又は保存するための液体が特に適している。緩衝液としては、HEPES(Hydroxyethylpiperazin-Ethansulfonic acid)緩衝液、Natrium2hydrogenatephosphate緩衝液、TRIS(Tris(hydroxymethyl)-aminomethane)に基づく緩衝液などが例示される。細胞培養液としては、例えば、ヒトおよび/または動物の細胞を培養するためのDulbeccoのModified Eagleの媒体(DMEM)などの真核細胞培養用の液体や、細菌細胞を培養するためのライソジニーブロス(LB培地)などの微生物培養用の培地が適している。
他の適切な液体20は、例えば、サンプルを処理するための試薬である。処理は、例えば、細胞溶解反応、染色反応、結合反応、および/または、包埋媒体またはその一部の除去のための除去/溶解、例えば、凍結およびホルマリン固定パラフィン包埋組織切片の脱パラフィン化ステップ、または、例えば、対応する電気泳動ゲルからタンパク質または核酸を抽出するための抽出反応であってもよい。
液体の混合型移動の代わりに、またはそれに加えて、浸漬ステップも可能である(ここでは図示せず)。このような浸漬ステップでは、ピペットチップ12から液量の全量または一部のみをサンプル上に吐出して、吐出孔14の下の、またはその中のサンプルをそれぞれ完全に覆うか、または湿らせる。液体20は、例えば培養の目的でそこに放置されてもよく、一定の時間が経過した後、液体は再びピペットチップ12に吸引されてもよく、あるいは、例えばさらなる後続の混合ステップのために、流体取り込み領域31に移動されてもよい。
吐出孔14の下方またはその中のサンプルの領域に液体の流れを適用した後、その後の方法ステップのために、液体をピペットチップ12に吸引して戻すことができる。そのような後続のステップは、例えば、図15の最後のステップとして示されているように、液体20を別の容器20またはチューブに移すことであってもよい。図15にも示されているように、ピペットチップ拡張部1をピペットチップ12の遠位端30に留めておくことも可能であるし、あるいは、例えば手動で、または液体処理ワークステーション25の排出システムによって自動的に、ピペットチップ拡張部1を事前に除去することも可能である。
加えて、または代わりに、サンプルからの液体や成分の望まれる処理に応じて、例えば、同じサンプルの別の領域にアセンブリを配置することもできる。
図16は、サンプルを処理する方法の一例のフローチャートを模式的に示している。この方法は、以下のステップを含んでいてもよい。
- 第1の流体リザーバを使ってサンプルの孤立領域を生成するステップ。第1の流体リザーバは、第2の流体リザーバの遠位端を囲む。サンプルの孤立領域は、第1の流体リザーバによって、例えば第1の流体リザーバの遠位端によって、サンプルの残りの領域に対してシールされる。
- サンプルの孤立領域を、第2の流体リザーバと流体連通させるステップ。
- 第2の流体リザーバから第1の流体リザーバに流体を吐出し、それによって、孤立領域でサンプル上に第1の方向の流体流れを生成するステップ。
- 第1の流体リザーバから第2の流体リザーバに流体を吸引し、それによって、孤立領域でサンプル上に第2の方向の流体流れを生成するステップ。
双方向の流体の流れを利用することで、例えば液体などの流体の影響力を高めることができる。これは、例えば、サンプルの成分やサンプル自体を制限された量の液体で収集する場合に有利である。例えば、組織サンプルの核酸を組織サンプルから抽出する場合、核酸が少量しか得られないことがしばしば問題となり、典型的には、適度な濃度で核酸を得られるようにするために、例えば沈殿ステップなどの濃縮ステップが必要となる。特に、双方向の流体の流れを繰り返し適用することにより、例えば成分の分離に使用される液体20の量を増やす必要なく、液体によって収集される成分の量を著しく増加させることができる。
図17は、サンプルを処理するための、さらに特定された方法ステップのフローチャートを模式的に示している。本明細書に記載の方法は、例えば、顕微鏡スライドの平坦な表面などの表面19上に固定化されているサンプル切片21を処理することを特に目指している。第2のリザーバと流体連通している第1の流体リザーバによってサンプルの孤立領域を生成できるようにするために、ピペットチップ12が追加で設けられてもよく、またピペットチップ拡張部1、および少なくとも1つの間隔要素9も追加で設けられてもよい。
ピペットチップ12、ピペットチップ拡張部1、および少なくとも1つの間隔要素9は、本方法を実施するのに適した機能ユニットを形成するために組み立てられる。任意で、1つまたは複数の狭窄要素13が提供されてもよい。アセンブリの各要素の構成は、これまでの説明に従って選択することができ、異なる要素を自由に構成し、必要に応じて任意の組み合わせにすることができる。
液体20は、好ましくは自動液体処理ワークステーション25を使用して、ピペットチップによって吸引される。液体20は、別個の要素を組み立てる前に吸引してもよいが、アセンブリが既に形成されているときに液体20を吸引することも可能である(図示せず)。
アセンブリはサンプルに移動され、本明細書に記載されている方法では、顕微鏡スライド上のサンプル切片21に移動される。その後、アセンブリは、サンプル切片21または顕微鏡スライド上の、それぞれ所望の関心領域に配置される。ピペットチップ拡張部1の遠位端3が、この場合、表面に触れるか、またはサンプルにある深さだけ食い込んだときに、ピペットチップ拡張部の遠位端によってシール効果が確立され、関心領域またはその一部が周囲のサンプルから孤立する。さらに、孤立領域は、ピペットチップ12と流体連通しており、特にピペットチップ12の内部空洞と流体連通している。ピペットチップ12から液体20を吐出することにより、液体20は、サンプルの孤立領域を経由してピペットチップ拡張部1に移動する。サンプルの孤立領域は、ここで液体20に晒され、液体20は、ピペットチップ拡張部1に晒された後に、さらなるステップのために収集される。
図18は、さらに特定された、付加的および任意の方法ステップのフローチャートを模式的に示している。任意に、例えば、液体20は、いわゆる混合動作8(吸引と吐出ステップの繰り返し)によって、ピペットチップ12とピペットチップ拡張部1との間を繰り返し移動してもよい。これにより、サンプルは繰り返し同じ液体にさらされることになり、例えば、液体中のサンプルの成分を濃縮することができる。また、任意で、液体20を移動させることなく、液体20をサンプルに晒す、浸漬ステップがある。孤立したサンプル領域を所望の時間および/または所望の液体20の流体流れに晒した後、液体をピペットチップ12に吸引して戻す。ピペットチップ12内に液体を戻したら、さらなる処理ステップを実施してもよい。例えば、ピペットチップ拡張部1の遠位端3を他の領域にシールして配置し、上述した1つ以上のステップを繰り返すことにより、別のサンプル領域または別のサンプルまたは関心領域をそれぞれ同じ液体で処理することができる。これにより、液体20は、追加のサンプル成分によって濃縮されてもよい。
しかし、液体20をまだ含んだままのアセンブリを、容器やチューブなどの実験用容器22に移動し、その容器に液体20を吐出するようにしてもよい。任意のステップでは、サンプルの処理後すぐに、液体20を容器22に吸引する前に、ピペットチップからピペットチップ拡張部を取り外してもよく、あるいは、少なくとも液体20が容器22に吐出されるまで、ピペットチップ拡張部1、間隔要素9およびピペットチップ12は組み立てられたままでもよい。
図15から図18の例で説明した方法に関して、方法のステップは、合理的かつ望ましい場合には、別の順序で実施してもよい。また、追加の任意のステップも可能である。方法ステップを実施するために、ピペットチップ12は、例えば、手動ピペッタや、上述のように自動液体処理ワークステーション25のピペットに取り付けられる。
1 ピペットチップ拡張部
1.1 ピペットチップ拡張部の第1の部分
1.2 ピペットチップ拡張部の第2の部分
2 ピペットチップ拡張部の近位端
3 ピペットチップ拡張部の遠位端
4 ピペットチップ拡張部の外壁
5 外壁の外側
6 外壁の内側
7 ピペットチップ拡張部の内部空洞
8 ピペットチップ拡張部の受容孔
9 間隔要素
10 間隔要素の停止面
11 ピペットチップ拡張部の中心軸
12 ピペットチップ
13 狭窄要素
14 ピペットチップ拡張部の吐出孔
15 シール部
16 支持バー
17 インサート
18 キャリア
19 表面
20 液体
21 サンプル切片
22 ピペット
23 キャリアのストッパ
24 キャリアの収容領域
25 液体処理ワークステーション
26 液体処理ワークステーションのコントローラ
27 液体処理ワークステーションのピペット操作ヘッド
28 ピペットチップの外壁
29 ピペットチップの近位端
30 ピペットチップの遠位端
31 流体取り込み領域
32 ピペットチップ収容領域
33 ピペットチップの近位開口部
34 ピペットチップの遠位開口部
35 ピペットチップの近位部
36 ピペットチップの中間部
37 ピペットチップの遠位部
h 隙間高さ
ピペットチップ拡張部の内部空洞の横方向拡張幅
吐出孔の横方向拡張幅
a 間隔要素の幅
b 間隔要素の長さ
c 間隔要素の深さ

Claims (16)

  1. 液体で組織切片の細胞内要素や分子を抽出する方法であって、
    前記方法は、
    前記組織切片を顕微鏡スライド上に提供するステップと、
    - 第1の流体リザーバを使って前記組織切片の孤立表面領域を生成するステップを含み、
    前記第1の流体リザーバは、第2の流体リザーバの遠位端を囲み、
    前記組織切片の孤立表面領域は、前記組織切片の残りの領域に対してシールされ、
    前記方法はさらに、
    - 前記組織切片の孤立表面領域を、前記第2の流体リザーバと流体連通させるステップと、
    - 前記第2の流体リザーバから前記第1の流体リザーバに液体の全体積または液体の部分的な体積を吐出し、それによって、前記孤立表面領域で前記組織切片上に第1の方向の流体流れを発生させるステップと、
    - 液体の全体積または液体の部分的な体積を前記第2の流体リザーバと前記第1の流体リザーバとの間で吸引と吐出を連続して行い、液体を混合するステップと、
    - 前記孤立表面領域を一定時間、液体に浸漬させるステップと、
    を含み、
    浸漬の間、液体は、流体流れを適用することなく前記組織切片の孤立領域と接触し、
    前記方法はさらに、
    - 前記第1の流体リザーバから前記第2の流体リザーバに液体を吸引し、それによって、前記孤立表面領域で前記組織切片上に第2の方向の流体流れを発生させるステップと、
    を含む、方法。
  2. 前記第2の流体リザーバから前記第1の流体リザーバに前記液体を吐出した後に、
    - 前記組織切片と動作可能に接触している加熱装置および/または冷却装置を用いて、前記組織切片の孤立領域を加熱ステップおよび/または冷却ステップに晒すステップであり、それによって前記液体を前記組織切片の温度に適合させるステップ、
    のうち1つまたは複数を含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記第1の流体リザーバから前記第2の流体リザーバへの前記液体の吸引の後に、
    - 前記第1の流体リザーバを使って組織切片の第2の孤立領域を生成し、前記第1の流体リザーバは前記第2の流体リザーバの遠位端を連続的に囲み、前記第2の流体リザーバはさらに前記液体を含み、前記組織切片は同じ組織切片または別の組織切片である、請求項1定義したように前記組織切片の第2の孤立領域を処理するステップ、
    および/または、
    - 前記第1の流体リザーバを第3の流体リザーバと交換し、前記第3の流体リザーバの構成は、前記組織切片の残りの領域に対して孤立するおよびシールされる領域のサイズに関して、および/または前記第2の流体リザーバから前記第1または第3の流体リザーバに吐出することができる液体の量に関して、前記第1の流体リザーバの構成とは異なる、請求項1に定義したように、前記組織切片の第2の孤立領域を処理するステップ、
    および/または、
    - 前記第2の流体リザーバから前記第1の流体リザーバを取り外すステップ、
    および/または、
    - さらなる処理のために、前記第2の流体リザーバから流体容器に前記液体を吐出するステップ、
    のうちの1つ以上を含む、請求項1に記載の方法。
  4. 前記液体の吐出および/または前記液体の吸引は、前記第2の流体リザーバ内に存在する液体の全体積で、および/または前記第2の流体リザーバ内に存在する液体の部分的な体積で行われる、
    請求項1に記載の方法。
  5. 前記組織切片は、
    - 組織学的分析のために準備された組織、
    - 顕微鏡スライドの表面などの表面に提供される組織切片、
    - 細胞またはその細胞培養物であって、細菌細胞、菌類細胞、植物細胞、動物細胞、および/またはヒト細胞を含むもの、
    および、
    - 組織、組織切片、細胞および/または細胞培養物の1つまたは複数の構成要素、
    を含むグループから選択される、
    請求項1に記載の方法。
  6. 前記液体は、
    - 1つまたは複数の組織切片を培養および/または維持および/または保存するための緩衝液または細胞培養液、
    - 前記組織切片を処理するための試薬、細胞溶解反応、染色反応、結合反応を行うための試薬、または埋込媒体を除去するための試薬、
    を含むグループから選択される、
    請求項1に記載の方法。
  7. 前記液体は、細胞溶解反応を行うため、および前記組織切片の1つまたは複数の成分を採取するための液体であり、
    - 核酸、
    - 蛋白質、
    - 炭水化物、脂肪酸、ビタミン、および/またはホルモンを含む成分、またはその他の細胞化合物、および/または、
    - それらの組み合わせ、
    を含むグループから選択される、
    請求項1に記載の方法。
  8. 前記組織切片は、生体組織検査または切除された腫瘍からのホルマリン固定、パラフィン包埋組織切片である、
    請求項7に記載の方法。
  9. 前記方法のステップの1つまたは複数が、ピペッタを使用して手動で、または液体処理ワークステーションを使用して自動的に実行される、
    請求項1~8のいずれか1つに記載の方法。
  10. - 前記第1の流体リザーバは、ピペットチップの遠位端に取り付け可能に構成されたピペットチップ拡張部によって提供され、前記ピペットチップ拡張部は、近位端と、遠位端と、前記近位端と前記遠位端との間に延びる外壁とを含み、前記外壁は、前記近位端においてピペットチップを挿入するための受容孔を形成し、前記遠位端において吐出孔を形成し、
    - 前記第2の流体リザーバは、液体を吐出および/または吸引するためにピペットチップによって提供され、
    前記ピペットチップの遠位端を前記ピペットチップ拡張部の受容孔から前記ピペットチップ拡張部に挿入することによって、前記ピペットチップ拡張部が前記ピペットチップに取り付けられており、
    前記ピペットチップ拡張部と前記ピペットチップとの間の流体連通は、前記ピペットチップを前記ピペットチップ拡張部から離間させる少なくとも1つの間隔要素によって生成される、
    請求項1に記載の方法。
  11. 前記ピペットチップ、前記ピペットチップ拡張部、および前記少なくとも1つの間隔要素は、複数の部品で形成された、または1つの一体型ワークピースとして形成された機能的アセンブリを形成する、
    請求項10に記載の方法。
  12. 前記少なくとも1つの間隔要素は、前記ピペットチップ拡張部の前記外壁の内側と前記ピペットチップの外壁の外側との間に流体取り込み領域を確立するように寸法設定されており、前記流体取り込み領域は、前記ピペットチップ拡張部の前記吐出孔から前記ピペットチップ拡張部の前記受容孔まで延びており、前記流体取り込み領域は、前記受容孔において周囲の大気と、および前記ピペットチップの遠位開口部に隣接する前記ピペットチップの内部空洞と、流体連通している、
    請求項10に記載の方法。
  13. 前記少なくとも1つの間隔要素は、
    - 前記ピペットチップ拡張部、および/または、
    - 前記ピペットチップ、および/または、
    - 別個のインサート、
    によって提供される、
    請求項10に記載の方法。
  14. 前記少なくとも1つの間隔要素は、前記ピペットチップの前記遠位端への前記ピペットチップ拡張部の摩擦嵌め取り付けを提供するように構成される、
    請求項10に記載の方法。
  15. 前記ピペットチップは、使い捨てピペットチップおよび固定ピペットチップを含むグループから選択される、
    請求項10に記載の方法。
  16. 前記ピペットチップ、前記ピペットチップ拡張部、および前記少なくとも1つの間隔要素は、前記ピペットチップ拡張部内の前記ピペットチップの挿入深さを制御するための少なくとも1つの狭窄要素を含むアセンブリを形成し、前記狭窄要素は、挿入された前記ピペットチップの前記遠位端と前記ピペットチップ拡張部の前記遠位端との間の隙間高さを規定する、
    請求項10に記載の方法。
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